परिवार के सदस्यों से अज्ञात, मधुबाला वेंट्रिकुलर सेप्टल दोष के साथ पैदा हुई थी, जो कि एक जन्मजात हृदय विकार है जिसका उस समय कोई इलाज नहीं था। किंवदंती के अनुसार, एक प्रतिष्ठित मुस्लिम फ़कीर ने भविष्यवाणी की थी कि मधुबाला बड़ी होकर प्रसिद्धि और भाग्य अर्जित करेंगी, लेकिन एक दुखी जीवन व्यतीत करेंगी और कम उम्र में ही मर जाएंगी।