फाइबोनैचि संख्याओं को मर्ज सॉर्ट एल्गोरिदम के बहुकलीय संस्करण में प्रयुक्त किया जाता है, जिसमें एक ना छांटी गई सूची को दो सूचियों में विभाजित किया जाता है, जिनकी लंबाई अनुक्रमिक फाइबोनैचि संख्याओं के अनुरूप है - जहां सूची को ऐसे विभाजित किया जाता है कि दोनों भागों की लंबाई समुचित अनुपात φ में हैं. द आर्ट ऑफ़ कम्प्यूटर प्रोग्रामिंग में बहुकलीय मर्ज सार्ट के एक टेप-ड्राइव कार्यान्वयन को वर्णित किया गया है. फाइबोनैचि संख्याएं, फाइबोनैचि ढेर डाटा संरचना के विश्लेषण में आती हैं.