ऑपरेटिंग सिस्‍टम की पुर्नस्‍थापना ऑपरेटिंग सिस्टम को पुनः इंस्टाल करना वायरस हटाने का एक अलग तरीका है। इसमें साधारण रूप से OS विभाजन की पुनः फोर्मेटिंग और इसके मूल माध्यम से OS को इंस्टाल करना शामिल है। या एक साफ़ बेकअप छवि के साथ विभाजन की कल्पना (imaging) की जा सकती है (उदाहरण के लिए Ghost (Ghost) या Acronis (Acronis) के साथ लिया गया) .