肠系膜上动脉栓塞一经确诊,应该立即恢复血容量,应用广谱抗生素,纠正引起肠系膜上动脉栓塞的可能病因,比如说心律失常、充血性心衰或者血容量不足等等,如果确诊肠系膜上动脉栓塞,应该经导管立即给于罂粟碱灌注,一般是从60毫克作为初始剂量,然后每小时30到60毫克持续输注12到48小时。溶栓治疗对于肠系膜上动脉栓塞也是有效的,药物有链激酶、尿激酶和阻滞性纤溶酶原激活剂,如果肠系膜上动脉栓塞患者出现腹膜刺激症时,应该进行剖腹探查。外科干预包括切除坏死和穿孔的肠段栓子摘除,血管成形,内膜切除和旁路手术等等。如果在手术时,对某些肠段能否存活不能肯定,应该进行第二次手术。