在过去 1.4 万年中,经过不断地驯化,产生了400多种犬。每一种都具有独特的体格、皮毛颜色以及习性。为了发现造成犬的特定性状的基因突变,2009 年 Akey等分析了 10 个品种共 275 头家犬的基因组。此前的研究发现带来产生地特定特性的基因,诸如达克斯犬的短腿。他们分析了一系列品种的犬,从而确定数个世纪的选择性育种对于整个犬基因组的影响。这组作者扫描了将近 300 头犬的遗传记录,包括小猎犬、博德牧羊犬、杰克罗素 犬、沙皮犬以及标准贵妇犬,并确定了选择性育种如何影响了这些动物的基因组。作者发现了155 个不同的遗传位置可能在产生纯种犬的特性方面起到了作用,并提出这些信息可能为找到产生特定品种形状的基因提供线索。例如,这组科学家提出不同版本的 HAS2 基因可能为沙皮犬带来了它的独特的褶皱或光滑的外皮。相对于犬外貌特性的研究,生理特性的研究比较少。2012 年 Chen 等对犬和狼的嗅觉受体基因家族进行分类及测序分析,发现由于驯养导致的生殖隔离,犬和狼中嗅觉受体基因进化的方向不一致,中国乡村犬中嗅觉受体基因序列比较保守。Lindblad-Toh和Erik Axelsson一起对来自世界各地的12条狼,以及代表14个不同品种的60只狗进行了全基因组测序。研究小组最终拿出了一个包含36个区域,总共122个基因的名单。其中一半的区域包含脑基因。其中有6个区域,10个基因与脂肪和淀粉消化相关。具体来说,狗携带了额外拷贝的淀粉酶基因,相比于狼同类,它们现在生成这种蛋白的量要多28倍。此外,狗生成的麦芽糖酶-葡糖淀粉酶要多12倍,这是因为该酶基因发生了数个突变。第三种基因SGLT1突变提高了肠道糖吸收蛋白的功能。