医院除设有创伤骨科、脊柱外科、关节外科、矫形骨科、手显微外科、风湿骨病科、中医骨伤科、运动康复科等骨科特色科室外,还附设急诊科、综合内科、综合外科、中医科、心血管内科等科室,承担所在地区常见病、多发病的防治和急诊工作,同时也为骨科临床会诊提供了便利条件。作为安徽首家大型骨科医院,东南骨科医院还担负着本市工伤、交通事故、运动损伤及其他意外伤害的急救任务。 医院与“120”台并网,设有专门急救抢救室、急救手术室、急救照像室、急救化验室、重症监护室(ICU),形成一整套规范化、程序化的现代医学抢救系统。