亲本不是把形态结构直接传递至子代,而是把遗传性状以密码的形式编在DNA上,并储存于细胞核中。这类发育是来自父母双方的遗传信息,在一定的时间和空间表现出来的过程,也就是把基因型转化为表现型的过程。个体发育的基本过程生物多样性决定发育过程的多样性,植物和动物的胚胎发育过程有很大的差异[见胚胎发育(植物)],无脊椎动物和脊椎动物的胚胎发育也不尽相同[见胚胎发育(无脊椎动物)、胚胎发育(脊椎动物)]。脊椎动物的发育包括三个阶段。第一阶段是由受精卵通过卵裂形成许多细胞,这些细胞先组成单层上皮形成囊胚,再经过一系列复杂的原肠形成运动,成为原肠胚。第二阶段包括神经胚形成、器官原基的建成和器官发生等过程。通过这一阶段形成体内的各个器官,如肢芽,眼,心脏等。第三阶段是由上述两阶段产生的小型结构格局逐渐增长到其成体的大小,其中还包括一系列退行性的变化即衰老的过程。这3个阶段彼此都有部分交叉与重叠,不能截然分开。