外形蛇体细长,分为头、躯干和尾三部分,无四肢或在低等蛇类横裂的泄殖孔两侧有爪状的后肢遗迹。周身被鳞。头部形状各异,鼻孔位于吻侧,但终生海栖的海蛇科(Hydrophidae)种类则居于吻背,并有瓣膜支配启闭,适于长时间潜水泅泳。眼球外有保护性的透明皮肤,瞳孔圆形、垂直椭圆形或水平椭圆形,无活动性眼睑,晶体几呈圆球形;穴居地下的盲蛇类,眼已十分退化,甚至被鳞所掩而成一隐约可见的黑点。舌细长分叉,藏于口腔的舌鞘中。前颌骨(仅蟒科蛇类具齿)、上颌骨、腭骨、翼骨和齿骨上附生着齿尖后弯的牙齿,然而齿的大小、数目及其结构则随不同蛇种而异,故为蛇目分类中的重要依据之一。通常,蛇具有3种不同齿型:齿内无沟、无管的实性无毒牙;附生在上颌骨前部或后部的前沟牙(眼镜蛇科、海蛇科等)、后沟牙(游蛇科的花条蛇、水蛇、林蛇等);着生于上颌骨前端的管牙(蝮科)。沟牙和管牙以导管与位于眼后皮下的毒腺连通。尾部明显地短于头体长。