世界动物卫生组织(OIE)规定,禽流感病毒的检测采用鸡胚病毒分离培养及致病力测定。中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局和国家标准化管理委员会联合发布了6项有关禽流感病毒检测的国家标准,其中针对H5N1亚型的有《H5亚型禽流感病毒荧光RT-PCR检测方法》、《H5亚型禽流感病毒NASBA检测方法》。美国CombiMatrix 公司研制一种基于半导体的DNA芯片,芯片上有针对A型流感病毒所有亚型的血凝素和神经氨酸酶的特异性寡核苷酸探针。