袁腾飞认为自己被出版商“恶意”陷害,出版商回复称这是“泼脏水”。随后这份处理意见被网友发现并广为流传。至于网上传言袁被拘留,袁的律师表示应该不属实。2015年5月,有媒体指出在袁腾飞《袁腾飞讲美国史》书中,第233页内容与方舟子的文章从头到尾高度重合,除了文章开篇一样,两篇文章的结构和语句也高度相似。随后方舟子在某社交媒体上称:“袁腾飞讲美国史,就是抄袭。这篇文章就是抄我的,只是添油加醋虚构了一些细节,把历史当小说讲。”袁腾飞并未对此事作出回应。