1946年初,菲律宾财长季里诺向总统罗哈斯建议占领南沙群岛中部分岛屿。同年9月11日,季里诺又以外长身份致函时任盟军总司令的麦克阿瑟,提出由菲律宾兼并南沙群岛的要求,但被美国否决。
1948年9月,季里诺成为菲律宾总统,他下令国防部长派遣海军准将安德拉达赴太平岛及其附近区域视察。而部分内阁成员也附和季里诺,建议将南沙群岛归并菲律宾版图。当时中华人民共和国与菲律宾还没有建交,但中国外交部于1956年5月29日发表严正声明:“南海上的太平岛和南威岛,以及它们附近的一些小岛,统称南沙群岛。这些岛屿向来是中国领土的一部分。中华人民共和国对这些岛屿具有无可争辩的合法主权。”此后,中国政府多次发表声明,重申中国对包括西沙群岛、南沙群岛在内的南海诸岛享有合法主权,绝不容许任何国家以任何借口和任何方式加以侵犯。
1992年,菲律宾前国家安全顾问戈勒斯声称黄岩岛是菲律宾国土,挑起争端。从1993年起,菲律宾对该岛进行勘测、考察和巡逻。50年代初,驻菲苏比克湾的美国军队无视中国主权,擅自将黄岩岛开辟成为靶场。1977年10月、1978年6月,中国科学院南海海洋研究所的科研队还登上岛进行考察活动。
1997年开始,菲方多次出动军舰和军用飞机在黄岩岛及其附近海域对民间组织的无线电探险活动进行跟踪、监视和干扰。4月30日,菲国两位众议员公然搭乘海军舰艇登上黄岩岛,他们在岛上竖旗立碑,并对中方人员进行拦堵和恫吓。1980年后,菲律宾政府将黄岩岛划在其200海里专属经济区内,但由于当时黄岩岛由驻菲美军实际控制,菲律宾并未提出主权要求。
1994年10月18日菲国家地图和资源信息部及1994年11月18日菲业余无线电协会向美国业余无线电协会出具的文件中,均确认“菲领土边界和主权是由1898年12月10日巴黎条约第三款所规定,黄岩岛位于菲领土边界之外”。
1994年《联合国海洋法公约》有关专属经济区的法规颁布实施后,菲律宾政府以黄岩岛位于其200海里专属经济区内为理由,宣称对黄岩岛拥有海洋管辖权,后来又改为对黄岩岛拥有主权。
1997年,菲律宾海军毁坏了中国主权标志。1997年4月30日,中国无线电运动协会组织的中美日无线电探险队登上黄岩岛进行无线电探险活动期间菲律宾多次出动军舰和军用飞机对此进行跟踪、监视和干扰。1997年5月20日,一艘菲律宾海军巡逻艇在黄岩岛外11千米处拘捕了一艘准备航行到马绍尔群岛的中国渔船,拘留了21位中国渔民。1997年8月5日,菲律宾和美国联合在黄岩岛附近举行飞机和战舰的实战演习。
1998年1—3月,来自海南省琼海市潭门镇的琼海00473和00372号以及中远渔313和311号四艘渔船在两个月时间内,相继在黄岩岛海域被菲海军拦截,51位渔民同样遭到“非法入境”的指控,被菲拘押近半年时间。
1999年5月23日,中国一艘渔船在黄岩岛遭菲军舰追击并被撞沉,导致11名渔民落水。据报道,菲海军在追赶渔船时,曾使用机枪扫射。中国外交部发言人就此向菲提出严正抗议和交涉。1999年6月,菲律宾教育部在新版地图中将黄岩岛,连同整个南沙群岛列入版图。8 月,菲政府把“南沙群岛是菲律宾领土”列为修宪的内容,试图以法律的形式进行领土扩张。
2000年1月6日,菲海军又在黄岩岛公然驱逐中国正常作业的六艘渔船。1997年以来,菲海军在黄岩岛抓捕好几批中国渔民,都以“非法入境”、“非法捕捞”等莫须有的罪名将他们移交司法机关处理。2000年5月28日,菲海军开枪射杀一名中国渔船船长。
2001年5月底、6月初,中国大陆在西沙群岛进行军事演习,禁止船只进入西沙附近海域。越南就此演习表示抗议,并重申其对南海西沙与南沙群岛之主权。2001年9月,《詹氏国防周刊》报道中国大陆新建20至24艘海军巡逻舰只,主要负责执行包括南沙群岛附近海域的巡护任务。为了避免引起扩充南海军事存在的指控,这批新建造的巡逻船将交由海关部门使用,但船上人员系属人民解放军海军的官兵。
2009年1月28日,菲律宾参议院三读(即最后一读)通过了2699号法案,即“制定菲律宾领海基线的法案”,该法案将中国所有的两处岛屿划为菲律宾所属岛屿。2009年2月18日,中华人民共和国外交部就菲律宾国会通过“领海基线法案”发表声明。国防部新闻发言人耿雁生就中国海军针对南海问题的态度作出了回应称中国军队将密切配合渔政、海监等部门共同维护国家的海洋权益。
2009年3月10日菲律宾总统阿罗约不顾中国的反对,正式签署“领海基线法”,将中国的南沙部分岛礁和黄岩岛划入菲领土。中国驻菲大使馆11日对此表示强烈反对和严正抗议。接下来,这一法案将被提交联合国审议。
2012年4月10日菲律宾海军巴拉望号在海南省三沙市黄岩岛海域抓捕12艘中国渔船上的中国渔民,正当菲律宾海军在中国渔船上抓捕渔民时,中国海监船75号和海监船84号抵达,阻止菲律宾海军带走中国渔民和渔船,随后中国渔政船和菲律宾海军护卫舰开始对峙。
注意事项
中菲两国在岛上都没有永久设施或主权标志。中国主权标志于1997年被菲军非法破坏。到2008年以前,黄岩岛地区还是被菲律宾海军非法控制。旅游潜水(1998)和业余无线电探险(1994,1995,1997 和2007)也是允许的,但会受到菲律宾海军的非法监视