阿卡波糖会有胃肠道反应。阿卡波糖可以延缓碳水化合物在小肠中的吸收。碳水化合物分解后产生的一些碳水化合物在小肠中的停留时间延长,被肠道细菌分解后气体产生增加,引起胃肠胀气,肠鸣,腹泻,腹胀,腹痛等,导致部分患者因不耐受而停药。所以服药时应从小剂量开始,慢慢增加。