神舟三号飞船发射之后,有专家又“发现”一个不安全因素:在进行大气层外救生时,由于运载火箭燃料未用尽,而火箭与飞船的分离速度又不够,有可能造成空中“追尾”事故。万一爆炸,可能直接危及飞船与航天员的安全。戚发轫听了这个议论后,先是回了一句玩笑话:“车辆追尾,责任可在后面的车呦”。话虽这样说,事儿还得认真研究。为了避免这个万一,就要增加火箭与飞船的分离速度,而这一改变,要涉及到飞船推进系统、数管系统、制导导航和控制系统的一系列软件和硬件状态,“工程”不小。当工程总体最终决定要解决这一万一时,戚发轫立即组织科技人员对飞行程序、飞行软件等进行了修改,竭力阻止火箭与飞船在空中“接吻”。后经多次仿真和试验验证,直到万一的“追尾”永远不会出现。