2009年6月8日正式划归西安火车站接管。 　　此次施工主要是对站台、地道、线路等基础设施进行改扩建。拆除现有的长400米、宽6米、高0.3米的低站台,新建一个长500米、宽11.5米、高1.25米的高站台;将原有的4条到发的铁路股道增加至5条;增加旅客列车的上水设备;并新建一个地下通道方便旅客进出站;将200米旅客候车风雨棚延长至500米;在原有两个售票窗口的基础上,再新增建两个售票窗口。站西安南站改扩建工程完工后,可以最大限度满足18对列车的通行需要,旅客日发送量将由现在的100余人陡增至2万人以上,将分流部分客流。因为已纳入火车站管理体系,西安南站已经成为西安站的一个窗口。