水蛭肽属于生物化学与分子生物学(一级学科);氨基酸、多肽与蛋白质(二级学科)水蛭肽(hirulog)是以水蛭素为模板设计出的肽类凝血酶抑制剂,其氨基酸数目与顺序也因设计者的不同而不同。最初的水蛭肽是由Maraganore等设计的,具有20个氨基酸残基,含有2个结构域(domain)和一个连结区。其中C端是由水蛭素羧基末端衍化来的,能与凝血酶的催化反应位点紧密结合。在水蛭肽的设计中由三部分组成:水蛭素羧端10肽、凝血酶催化活性位点的特异识别序列和二者间的功能连接桥。