贝壳的微观结构主要通过薄片法进行研究。研究表明,贝壳的基本结构主要分为三部分,最外层是由硬质蛋白组成的角质层;中间为方解石或文石晶体组成的棱柱层,主要为贝壳提供硬度和耐溶蚀性;最 内 层 为珍珠层,主要为贝壳提供硬度和韧性,一般由方解石或文石等CaCO3矿物(无机相)和有机质(有机相)组成。在地质学意义上,贝壳是化石中最常见的保存方式。他们通常用于确定地质形成的系统进化,地层的确切年代及贝类种群的分类。因此,贝壳的结构研究具有重要的意义。