2014年5月7日,龙南县公安局将该案移送龙南县人民检察院审查起诉,同年11月10日,龙南县人民检察院以该案事实不清、证据不足为由,将案卷退回至龙南县公安局。2014年11月27日,龙南县公安局以在侦查过程中发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任为由,将该案移送被告龙南县质量技术监督局。2015年1月16日,被告龙南县质量技术监督局作出并送达(龙)质技监罚告字[2015]第2—001号《行政处罚告知书》,告知将对原告廖伟鉴给予以下行政处罚:1、没收违法所得叁万玖仟元整;2、并处人民币陆拾伍万元整付款;罚没合计陆拾捌万玖仟元整。同时告知原告廖伟鉴享有陈述、申辩和要求公开听证的权利。原告廖伟鉴于2015年1月19日向被告申请公开听证。
2015年1月21日,被告龙南县质量技术监督局作出(龙)质监案移字[2015]2-001号《案件移送书》,以涉案的豆芽属于食用农产品、应由农业行政主管部门负责其质量安全监督管理为由,将该案移送龙南县农业和粮食局调查处理。龙南县农业和粮食局以该案不属于《中华人民共和国农产品质量安全法》调整范围为由,不予接收。随后,被告龙南县质量技术监督局就廖伟鉴生产的豆芽属于食用农产品还是经过加工制作的食品、案件的处理由哪个部门负责、是否适用《中华人民共和国食品安全法》第八十五条第一项及《江西省质量技术监督行政处罚自由裁量权参照执行标准》第二十二条分别向龙南县法制办、龙南县人民政府、赣州市食品药品监督管理局进行请示。