截至2016年3月,学校有自治区级重点实验室3个、省级工程技术研究中心1个、广西高校人文社科重点研究基地1个、广西高校重点实验室6个、钦州市重点实验室7个;有广西院士工作站1个(海洋类)、省级博士后创新实践基地1个、广西校地校企共建科技创新平台2个、广西高校高水平创新团队2个,国家级科技特派员创业培训基地1个,广西自治区高校重点实验室培育基地1个,广西高校重点研究机构2个。自治区级重点实验室(3个):北部湾海洋生物资源保护与开发重点实验室、北部湾石油天然气资源有效利用重点实验室、广西临海机械装备设计制造与控制实验室省级工程技术研究中心(1个):广西船舶数字化设计与先进制造工程技术研究中心广西高校人文社科重点研究基地(1个):北部湾港口物流与园区经济研究基地广西院士工作站(1个):海洋生态环境省级博士后创新实践基地(1个):钦州市博士后创新实践基地广西自治区高校重点实验室培育基地(1个):广西临海机械装备设计制造与控制实验室广西高校重点研究机构(2个):北部湾海洋保护与开发利用实验室、北部湾人文研究中心广西高校重点实验室(6个):北部湾特色海产品资源开发与高值化利用实验室、广西北部湾海岸科学与工程实验室、北部湾现代港口物流实验室、北部湾石油天然气资源有效利用重点实验室、广西临海机械装备设计制造及控制重点实验室培育基地、北部湾海洋文化研究中心广西高校高水平创新团队(2个):广西油气精细化利用及安全控制团队、船舶数字化设计制造工程技术团队广西校地校企共建科技创新平台(2个):钦州坭兴陶艺传承与开发、北部湾海洋资源保护与开发利用钦州市重点实验室(7个):钦州市油气资源精细化利用与安全控制重点实验室、钦州市大数据资源利用重点实验室、钦州市船舶先进设计制造重点实验室、钦州市海洋食品营养与安全重点实验室、钦州市电子产品检测重点实验室、钦州市现代港口物流重点实验室、钦州市坭兴陶窑变工艺研究重点实验室