北京儿童医院承担着北京护校中专、首都医科大学本科生、硕士生、博士生的培养任务,并设有博士后流动站,受卫生部委托承担着全国儿科进修医生培训工作。同时,北京儿童医院还是全国卫生专业技术人员儿科主治医师主任委员单位和儿科副主任医师命题组组长单位。近3年医院承担着包括“十五”攻关和国家自然基金在内的65项科研课题,并多次获国家级、省部级科研奖。北京儿童医院不仅在国内享有很高的声誉,而且在国际儿科界也有广泛影响。