脚内侧骨头突出可能是先天脚部骨骼发育导致的。其后天因素可能是由于长期穿不合适的鞋子对脚部骨骼造成挤压或者因为外伤导致骨骼骨折、脱位引起的。当骨骼外伤治愈不完善,留有后遗症,引起局部骨骼增生也会导致以上现象。经常剧烈运动和负重的人群,容易引起肌腱炎,也会导致脚内侧骨头突出。