主要原因在于,早已并入四川大学的原华西医科大学曾使用“四川医学院”这一名称,“川医”成为知名医学品牌。四川大学认为泸州医学院更名四川医科大学后,易造成校名认知混淆,引发侵权争议。
争议存续半年多之后,原泸州医学院再度申请更名,改为“西南医科大学”。这一结果又遭到地处重庆的第三军医大学和西南医院的反对,反对改名的研究员和医生认为,泸州医学院的改名行为严重侵害了“西南医院”和“西南临床医学院”的相关权益。