肛瘘用药多以控制局部感染、促进窦道愈合为主, 0.5%甲硝唑、生理盐水冲洗瘘管后,用生物蛋白胶自外口注入是治疗肛瘘的保守方法,但效果多不理想,需通过手术进行治疗才能痊愈。肛瘘的发病是由内而外的,原发病灶在肛管直肠附近,且肛瘘由内口,外口,瘘管组成。药物的治疗只是针对感染有效,以控制症状为主,不能到达使肛瘘的内口、外口以及瘘管闭合的目的。因此,药物治疗并不能使肛瘘病症痊愈。局部堵塞法无创伤无痛苦,对单纯性肛瘘可采用,但治愈率较低。