内切酶和外切酶的区别是水解位置不同。核酸内切酶是一类能从DNA分子中间水解磷酸二酯键,从而切断双链DNA的核酸水解酶。核酸外切酶是一类能从多核苷酸链抄的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。切点要求不同核酸内切酶的切点大多很严格,要求专一的核苷酸顺序,即识别顺序。而核酸外切酶的切点要求比较低。