少女月经长时间不干净,在青春期少女中非常多见,主要是下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节功能不完善。月经的形成是下丘脑垂体分泌的激素使卵巢的卵泡生长、排卵,分泌的雌激素、孕激素作用在子宫内膜。青春期女性初潮后需要1.5-6年时间,下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节功能才能完善,建立稳定的月经周期性调节机制。这段时期由于下丘脑-垂体-卵巢轴尚未成熟,分泌的激素不能使卵泡发育成熟、排卵,而且又处于生理与心理的急剧变化及情绪多变,感情脆弱的时期,而此时发育不健全的下丘脑-垂体-卵巢轴,更容易受到内外环境多因素影响。