戊二醛主要通过其两个活泼的醛基来杀灭微生物;其活性受pH 和温度等因素的影响; 戊二醛在酸性条件下, 其单体水解成一水化合物、二水化合物, 环状的半乙缩醛和类似乙缩醛的多聚体,它们之间相互平衡; 由于酸性水溶液中只存在少量的戊二醛单体, 因此其生物活性较差;但在酸性条件下, 戊二醛的聚合作用较慢,这样酸性戊二醛较稳定,可储存较长的时间。在酸性条件下,提高温度可产生更多的自由醛基,从而提高其生物学活性。