游戏剧情以下文字译自Quake2用户手册。Quake4的剧情紧接着Quake2,讲述同一次远征中另一名士兵的故事。 德克萨斯下午火辣辣的太阳下,长长的阴影绝望的撕扯着你沾满尘土的作战靴。举起手遮挡刺目的阳光,你第一千次眯起眼睛看着前方的队伍。在荒原上这队伍几乎无限长的伸展开去,最终消失在地平线上一艘巨大运兵船的阴影中。不久,你就将要踏上这船的跳板,爬进你的单人舱位,穿越星际,然后降落在离这个达拉斯陨石坑周围的漫天黄沙和破碎的废墟数光年远的某个地方。你唾了一口,揉着眼睛,在十月的阳光下开始回想起那些恶心的怪物第一次发动攻击的情景。它们的登陆舱就像无数燃烧的陨石砸在地球上,然后,令人难以置信的半生物半机械的异形...这些丑陋恶心的生化人...它们的船舱还仍然在重入大气层的高温下红热着,而这些怪物已然如蝗虫一般涌出。它们杀死或抓走了所有活着的东西。我们本以为Strogg是觊觎着这颗行星上的资源:矿石,金属和水之类的东西。但是它们飞船上的储藏设施确凿无疑的显示了Strogg真正认为是资源的东西:血肉构成的肢体和器官,用来改造成新的生化人,以及,当然,作为食物。队伍慢慢移动了。又移动了。终于移进了飞船的阴影中。大军从这里开始分开,重新按照各单位进行编组。"靠,我搞不来这破玩意儿,这他妈是做什么用的?""别着急,哥们。"值勤军官笑着说"我们都能搞几个Strogg脑袋带回家当战利品,我保证。""你,士兵3585。"军官的声音把你从回忆中拽回来。"发什么愣,到底进不进去?"你爬进看起来跟棺材差不多的马克9A着陆舱:光滑,黑暗,这经过特殊设计的着陆舱对于Strogg的防空系统是隐形的。一个技术人员开始关上强化的舱门。"好好睡,士兵。用不了6个半小时你就又能看见太阳了。当心,呵呵,那时可就不是我们的太阳了。"(咣当) 周围的一切陷入黑暗,除了你面前的显示屏发着轻柔的光。这种场面你在模拟训练课上早就作过不下十次了。没什么好紧张的,只不过是睡上几个钟头,养精蓄锐,然后光荣的时刻就到来了。只不过这一次是来真的。这也是思考的好时候。你还记得你第一天的正式训练,你的指挥官谈论这些该死的杂种如何来到地球和其他邻近的殖民地。通过我们最好的卫星和长程扫描仪,我们终于了解了它们是如何用这么短的时间穿越数光年的距离来到这里的。Strogg使用类似黑洞的时空门作为它们的高速通道。我们仍然不清楚是否它们创造了