1587年2月8日上午10点,苏格兰玛丽的头颅被砍下。当第二天处死玛丽的消息传到伦敦,全城钟声开始响起,庆祝的烟火在街道施放,伴随着庆祝的庆典和宴席,伊丽莎白女王还在同西班牙大使在郊外狩猎。直到傍晚回宫,伊丽莎白女王才被这一消息震惊,也对君主被枢密院蒙蔽越权而愤怒,紧急采取应对措施。
面对天主教各国的责难,伊丽莎白把责任推到枢密院以示清白。她立即写信给苏格兰詹姆士六世,解释情况,说自己虽然迫于枢密院的压力签了死刑状,却无意执行,然而却被枢密院在自己不知情的情况下送出。然后她又以泄密渎职和藐视王权的罪名把直接责任人戴维森关在伦敦塔。把主导者伯利和沃尔辛厄姆也共同关进监狱。但这也只是做做样子,因为各种利益关系就此作罢。尽管如此,政府运作却因女王对枢密院的震怒而瘫痪数月,政务也几近停摆。
枢密院能对玛丽死刑瞒天过海,自主行事,表明伊丽莎白女王的政权内部信息网络太弱,也表明枢密院的地位已经和君主处于平行的独立地位,以及重臣们对枢密院体制的效忠已超过对女王的忠诚。在这种情况下,对戴维森的审判就演变成了伊丽莎白政权内部对英格兰君主专制或君臣共治体制的公开辩论。
英格兰那些男性重臣对女性统治的鄙视和忧虑,形成了鄙视女性的传统,带来了女王统治的危机。对女王施政的普遍不满以及男性重臣对女性无能的质疑,促使他们采取行动,以信息操控女王的决策权,强化幕僚们的自我定位和抵抗权,实践共治。但是伊丽莎白女王却却没有轻易就范,她一方面通过演讲,言明女性统治者享有与男性君主同样的权威,另一方面她压制任何企图限制女王权力的学说和行动。
就这样在伊丽莎白一世长达半个世纪的女性统治过程中,象征君主专制的王权政治正转化成君主与官僚政府共治的近代君主共和的国家政治。在这种权力转移的过渡阶段中,女王与枢密院争夺政策主导权,势必无法和谐共处。因此,玛丽之死并非只是她悲剧人生的落幕,而是揭露了在伊丽莎白统治的盛世下,君臣为争夺政权领导权而相互倾轧,宣告了相对弱势的君权与宫廷衰落时代的来临。