昭慧法师为推动佛学教育,于1998年初在桃园县成立弘誓文教基金会,任第一届董事长,婉拒出任南投县副县长之职。同时致力于保护野生动物和佛教发展事业,1993—1999年任关怀生命协会创会理事长,弘扬佛法护生的精神,推动教内信众与社会力量,促使“立法院”通过《野生动物保育法》与《动物保护法》。2000年初,倡导佛诞放假运动,得到台湾佛教界的积极响应和共同努力,使当局作出农历四月初八日为佛诞节的决定。昭慧法师在致力弘扬佛学、培育僧才、发展社会公益事业和佛教事业的同时,也从事著作,佛学著作有《如是我思》、《佛教伦理学》、《律学今诠》、《初期唯识思想》等书,散文创作有《悲情观音》、《人间佛教播种者——印顺法师》、《敢向高楼撞晚钟》、《人间佛教试炼场》、《大载沉吟》等。然而最使昭慧法师出名的,是她推动了台湾佛教界颇具影响的多次运动,并始终处于事件的风口浪尖。前者如杯葛“思凡”剧、捍卫台北七号公园观音佛像,后者如废除《八敬法》等。