一代讲述的就是Gordon Freeman杀死Nihilanth从Combine手中解放Xen的故事。游戏的结尾,Gordon’s Sponsor把Gordon放入了“Slow-time-warp”,打算等危机出现时再次将Gordon唤醒。 Gordon Freema从Combine手中解放了Xen引起了Combine的注意并了解到了地球的存在。Combine考虑到,既然人类能够接管一个在它们控制之下的世界,那么人类必然会对他们的存在构成威胁。于是Combine决定抢先向地球发动战争。Combine找到了Gordon Freeman在Xen上传送的入口,这让Combine入侵地球的计划变得水到渠成。