酶抑制剂的结构往往与其天然底物的结构类似,根据修饰天然底物设计抑制剂,首先要分析和决定与酶结合时分子各部分所起作用,是结合,是相斥还是与结合没有关系的;其次要知道结合部位对相邻位阻的耐受程度。然后取代各功能基以调节与酶相互作用的强弱。
酶抑制剂可分为可逆性的和不可逆性的两大类。(1)通过非共价键与酶结合的抑制剂为可逆性抑制剂。(2)通过共价键与酶结合的抑制剂为不可逆性抑制剂,结合很紧密,与酶结合后不受透析或稀释等浓度改变的影响。