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诺模图出镜率很高,用于多因素cox或logstic模型的可视化展示。

0.输入数据

需要病人临床信息和生存信息表格,如下
rm(list = ls()) load("ph.Rdata") head(ph)## sample_id gender age T N M stage event time ## TCGA-MP-A4T4-01A TCGA-MP-A4T4-01A female 68 2 1 0 2 1 2617 ## TCGA-05-4250-01A TCGA-05-4250-01A female 79 3 1 0 3 1 121 ## TCGA-64-5774-01A TCGA-64-5774-01A male 60 2 0 0 1 0 2676 ## TCGA-97-7937-01A TCGA-97-7937-01A male 65 2 0 NA 1 0 564 ## TCGA-97-A4M6-01A TCGA-97-A4M6-01A female 45 1 0 0 1 0 568 ## TCGA-44-A4SU-01A TCGA-44-A4SU-01A female 67 1 0 NA 1 1 409 ## fp ## TCGA-MP-A4T4-01A -0.005061199 ## TCGA-05-4250-01A 0.286351686 ## TCGA-64-5774-01A 0.389468347 ## TCGA-97-7937-01A 0.098764940 ## TCGA-97-A4M6-01A -0.325363900 ## TCGA-44-A4SU-01A -0.183674628

1.简约诺模图

使用rms包里的cph函数建模,nomogram函数画图
library(rms) dd