三神器在日本历史上通常是上任天皇传给下任天皇。偶尔也有通过各种手段争夺的时候,如南北朝时期,北朝后小松天皇用下任天皇继承权做交换,诱骗南朝后龟山天皇交出所保有的三神器,南朝天皇在交出三神器后退位,但皇统最后却由后小松天皇的儿子继承,到此日本南北朝的分裂合而为一。三神器在日本青少年漫画与游戏中是经常被采用的故事背景和典故出处,如《拳皇》(格斗天王)、《高达 SEED DESTINY》虚构国家欧普的机动战士ORB-01 Akatsuki、《ONE PIECE》的波尔萨利诺(黄猿)、《东方Project》的上白泽慧音,《火影忍者》中的大蛇丸的草稚剑,宇智波鼬的八尺琼勾玉等等。此外,《神奇宝贝》中的“湖之众神”由克希、艾姆利多、亚克诺姆亦是参考三神器而来。