由于巴曲酶是一种纤维蛋白酶样蛋白分解酶,可选择性地分解纤维蛋白原,而对纤维蛋白以外的凝血因子及血小板数量及功能无影响以及对出血时间无影响,敌对人体的危险性极小。毒性极低,在临床应用时出现出血的危险性小。急性毒性实验研究:采用雌雄兼有的小鼠和大鼠静脉注射和口服给药。小鼠和大鼠静脉注射的LD50值分别为192-210及105-145BU/kg,其口服给药的LD50值分别为2000和1000BU/kg以上,未测出具体值。