从19世纪末20世纪初开始,穆斯林当中的一批先进分子目睹这种状况,感到痛心疾首,产生了忧患意识,责任感、使命感、危机感促使他们面对现实,思考问题,寻找出路。他们认为,导致穆斯林贫穷落后的原因是多方面的,既有外因,也有内因。外因如清朝统治者的民族歧视、政治压迫、经济剥削、军事高压,尤其是对历次起义的残酷镇压,把劫后余生的穆斯林从内地月巴沃的土地(如八百里秦川)和繁华的城市,赶到贫瘠的边远山区,使他们祖祖辈辈解决不了温饱问题,使他们总是为生存而奔波,根本顾不上发展。至于内因,正如上面提到,由于受到历代统治“汉化”政策的威胁和影响,由于受到历次起义失败后的残酷打击,使他们对汉文化产生逆反心理、抵触心理、甚至恐惧心理,一提汉文化,不分青红皂白,一概拒绝,一概排斥。从而导致与主流文化的绝缘。与主流文化绝缘的结果,使自己无法享受主流文化的精华,使自己得不到应有的养分,使自己总是处在边缘状态。有鉴于此,穆斯林的先进分子提出改良经堂教育,主张中阿(中阿并授,是指中文(汉文)和阿文并授,培养既有阿拉伯文、波斯文和伊斯兰教各科知识,又具备扎实的汉文化修养的新型人才)并授。开启民智,唤醒民众,提高科学文化素质等主张。为此,掀起了设学校、创社团、办报刊、搞研究和派留学生的热潮,在社会上产生了广泛的影响,著名汉族学者顾颉刚先生热情称赞它是“近代中国回教徒第一次自觉发动的文化运动”创设社会团体 团体是促进一项事业的组织保证。因此从清末民初开始,穆斯林当中的有识之士非常重视创立社团。20世纪前半期(1900~1949年),全国各省范围的穆斯林社团达100多个。这些组织发起最早的应算1906年由穆斯林知识分子童琮在镇江创立的“东亚穆民教育总会”;影响最大的是1938年2月成立于武昌,由白崇禧任总理事长的“中国回民救国协会”;活动时间最长的是1913年由蔡大愚、马邻翼创设的兰州回教劝学所”。 这个时期的穆斯林社团按其职能来划分的,主要有三种类型:教育团体、学术团体、救国团体。 教育团体是穆斯林有识之士有感于穆斯林教育落后而设立的,以图振兴穆斯林教育,提高穆斯林文化素质。南方镇江的童琮创立“东亚穆民教育总会”,“欲为中国全体回教谋教育普及”,开立教育团体之先河。同期,北方杨仲明阿訇在京设立“清真教育会”。留日穆斯林学生则组织了“留东清真教育会”,探讨穆斯林教育发展的大计。然而这时的社团还处在艰苦的探索阶段,各种限制尚未解除。民国建立,中国才有了结社的自由。王浩然阿訇于1912年7月率先在京成立第一家全国性组织——“中国回教促进会”。该会以“联合国内回民,发扬回教教义,提高回民认识,增进回民福利”为宗旨,深得孙中山先生的赞赏和支持。王浩然阿訇在考察中东各国后,深感“世界大势非注意教育不足以图存”,大声疾呼要重视教育,发展教育,引起各地穆斯林的共鸣和响应。1913年,蔡大愚、马邻翼创立“兰州回教劝学所”(后扩大为“甘肃全省回民教育促进委员会”),并在各县设立分会,兴办新式教育,培养新型人才。1921年,马麒在青海成立“宁海回教促进会”,提出其宗旨为“促进回教青年学生教育,并阐发回教真谛”。后来该会先后改名,为“青海省回教教育促进会”、“青海省回教促进会”。1931年,马步芳任会长后,扩大了该会的分支机构,在贵德、湟中、化隆、大通、门源、民和、循化、。互助、湟源、乐都、同仁、共和等县,分别成立了该会分会,以推动新式教育的发展。1929年9月陕西也成立了“中国回教公会陕西分会”。1934年,陕西又成立了“西北回教文化促进会”以“阐明回教教义,以文化活力融合回汉情感,使回民向心力集中于国家”为宗旨。1933年,在南京成立了“中国回民教育促进委员会”。一时间,教育社团遍布各地,提倡教育的气氛空前浓厚。这为发展穆斯林教育做了舆论准备,并提供了组织保障。 这个时期出现的第二类社团是学术团体,是与教育类社团紧密相关的。中国穆斯林的学术活动向来是零散的个人行为,没有人力、物力、财力等方面的保障。用这种零散研究的方式,虽也出现了前文谈到的明末清初和后来云南地区汉文译著的繁荣,但在一个专制制度之下,这种个人的努力往往会受到环境、财力、物力和社会氛围的限制。有鉴于此,民国时期的穆斯林有识之土,利用出版、结社之自由,创立学术团体,集中力量进行学术研究。1913年、1917年,在北平先后成立了“清真学会”和“清真学社”,旨在“阐明学理,研究学术各宗旨,藉联回教之感情,共勖学问之进步。”1922年,王静斋留学埃及攻读伊斯兰教各科经典,回国时带来600多种学术典籍,潜心研读,带动了国内学术研究之风。1925年,由哈德成、伍特公、沙善余等人发起,在上海成立了全国性学术团体——“中国回教学会”。该会以“阐明教义、提倡教育、联络中外同教情谊”为宗旨。设文牍、交际、编辑、教育、调查、会议、庶务、宣讲等八股,分工负责。并成立学会所属的“编辑委员会”,编辑、发行会刊。此后,各地也竟相仿效,纷纷设立团体。1929年北平各大学穆斯林学生联合创立“伊斯兰学友会”。1933年上海成立“中国回教宣传所”。第二年,太原成立“伊斯兰布道会”,上海成立“中国回教文化协会”。1938年又成立“上海伊斯兰妇女协会”。同年,桂林成立“中国回教文化学会”。其中1931年成立于南京,以“联络感情,研究学术,促进教务,服务社会”为宗旨的“中国回教青年学会”还设有专门的“回民学术研究会”。这些学会、研究会等,积极开展伊斯兰教学术研究活动,编辑、发行学术刊物,为繁荣伊斯兰文化,促进穆斯林与汉族之间的交流与沟通,起到了较大作用。