小辣椒最主要的病害为病毒病,常见有花叶、黄化、坏死、畸形等四种症状。由于近年来持续高温干旱,小辣椒的前期黄化和后期畸形表现最为突出,其典型症状及最有效的控制方法是:黄化,病株从嫩尖开始变黄,然后出现有很多落叶,落花和落果。如果在田间发现病株,及时用克毒宝与辣椒菌立杀等量混合后再加40%氧化乐果1500倍液、0.3%磷酸二氢钾、1%尿素隔5-7天喷1次,共喷雾3次,症状即消失,植株恢复正常生长;畸形,病株变形,如叶片变成线状,即蕨叶,或植株矮小,分枝极多,呈丛枝状。用高锰酸钾750倍液加0.3%磷酸二氢钾0.1%,硫酸锌隔5-7天喷雾1次,共喷3次,防效达90%以上。