科学大多只能解释现象的本身,而不能解释为什么会产生这样的现象。例如牛顿只是发现了地心的吸引力,但至今没人说明地球为什么会有吸引力。而且以感官和仪器的方式去观察,自己是一种先假设了人类习惯的认知原则与经验为基准坐标,所以这种方式所观察到的成果都是一种假象或相对的知识,绝非绝对真理。因此自然科学的发展也就局限于现象的范围,即用现象解释现象,未能深入现象后面的本质,不能如实照见事物缘起无自性的实相。另一方面,社会科学也主要依赖于人的分别念,它没有佛教中熄灭妄念断除偏执的禅观方法和发心修法,因此依靠分别念的研究工作犹如火堆上面的不断上升的烟,离火越来越远,越来越分散,最后不知源于何处。因此社会科学也不能了解事物的本质真理。更何况在广阔无边的宇宙世界中,各种各样现象无穷无尽,科学未知的事物数也数不清。