终于,在1856年的8月,“天京事变”爆发了。在洪秀全的密令下,韦昌辉连夜率3000亲兵赶回天京,在燕王秦日纲的配合下,把东王府杀了个鸡犬不留,二万多太平军将士身首异处,尸体丢在秦淮河中,河水被染成了红色。接着洪秀全反戈一击,又把韦昌辉杀死。整个天京血流成河,尸横遍野。太平天国天京事变之后,傅善祥下落不明。一说在乱军中傅善祥也被杀死,尸体被抛入大江之中,随水东流而去。傅善祥的去向,有四种版本:其一、最为流行的说法的是,身为东王府地位最高的女官傅善祥在乱军中也被杀死,尸体被抛入大江之中,东流而去。一代才女从此香消玉陨,从此人世间空留下一段说不尽的凄惨佳话。其二、美貌多情的傅善祥有幸逃脱了这场劫难,但没有忘记东王的恩爱,于是组织东王府的残余人马与翼王石达开联合攻打北王府,为杨秀清复仇。据说,还有一块古碑为证。其三、天京事变中被北王韦昌辉下狱,被洪宣娇派人营救,后嫁于太平天国慕王谭绍光。谭在苏州被手下加害的消息传到天京后,傅善祥因此忧郁而死。其四、傅善祥与在东王府里从事文牍工作的何震川渐生了爱意,两人在太平天国失败后,双双隐姓埋名,住在上海的小里弄里。