协议是当事人双方意思表示一致的约定,如果乙方不同意则双方达不成协议,因此双方不可能形成分居协议。能证明夫妻分居的常见证据:1、一方在外居住的房屋租赁合同;2、双方签订的夫妻分居书面协议,一定是要书面的,口头协议必须对方承认;3、一方向另一方发出的书面分居文书,最好是用快件性质邮寄,在备注栏里注明“分居”,并且保留邮寄凭证,从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间;4、双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实;5、人证也可以,比如双方都认识的朋友或者亲戚,不过因为证人往往和为其作证的一方有利害关系及分居是夫妻“私事”,所以单独的证人证言难为法院采信,要辅佐以其他的证据。注意婚姻法上的“分居”跟普通人们对分居的理解有不同,能够成为离婚理由的分居满两年必须是因感情不和导致的,因在两地工作形成的分居不能成为离婚的理由。