皮脂腺囊肿的发病原因主要是因为皮脂腺排泄管阻塞,从而导致皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀,因此形成了潴留性囊肿。皮脂腺囊肿的囊内一般是白色凝乳状皮脂腺分泌物,并不是是一般意义上的真性肿瘤。
组织病理检查时可见皮脂腺发生了囊性变,囊内充满白色粉膏状的皮脂腺分泌物、破碎的皮脂腺细胞以及大量胆固醇结晶,这些内容物一般还会带有恶臭味。囊壁外层是纤维结缔组织,内层则是上皮细胞构成。当囊肿破裂时,周围可能会出现异物巨细胞。