由于高山峡谷区气候垂直变化显著,所以植物种类繁多,从热带植物或亚热带植物一直到高山寒温带的植物,都可以见到。其中,仅种子植物就有10000多种。此外,横断山区的农作物也丰富多样,我国所能种植的农作物,一般都可以在这里栽培。