海口站至海安南站的运行区间为粤海铁路的火车渡轮航线,由配备火车栈桥的海口南港、位于海安的北港和“粤海铁1号”、“粤海铁2号”两艘客滚船组成,客滚船主甲板共有四股轨道,可装载货运列车车厢40节或客运列车车厢18节。列车在上轮渡前在编组场被拆解成四段,然后分别被推上船,这个过程共需要几十分钟。推到轮渡上的列车将被轨道边的固定装置固定在铁轨上,然后渡轮将穿越琼州海峡,开向对岸。粤海铁路南北两港间距离为12.5海里,两港间已设立专门的航道,航道宽1500米,航行时间约1小时。