囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的。建议能够到正规医院就诊,行腹腔镜等治疗方法进行治疗为佳。如果巧克力囊肿并不是很大,卵巢能够正常排卵。是可以怀孕的。希望我的解答能够帮助到你。