韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。今天给大家分享两个快捷画韦恩图的工具。Draw Venn Diagram
网址:
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
打开首页是这样的:
左侧输入数据,这里既可以导入文件,也可以直接输入组合的列表,如果输入框不够,可以点击"Add"添加新的输入框。
右侧可填写对应组合的名称。
例如我要取两个数据集的交集基因,那就分别上传两个文件,并且命好名字,最后点击提交就可以了。
接着就是下载结果:
首先是输入数据的统计情况,之后是得到的维恩图,有两种格式(PNG和SVG)可以下载,最后是各区域的基因列表,此文件可以导出。
BioVenn
网址:
http://www.biovenn.nl/index.php
BioVenn只能绘制3维及以下的韦恩图,不过圆圈的大小可以随数据集大小而变化,并且对图片的编辑选项也更多,更能映射到Ensembl gene ID。
打开首页如下,框选部分为按照实际的项目情况填写图片标题、副标题和3个数据集名称。(注意:该软件只能进行 2 组以及 3 组之间的比较)
打开 OTU 丰度表,若组内有多个重复,可以求和,然后筛选出和大于 0 的OTU,并将 OTU 名称输入 ID set 框内,或选择 txt 文件导入(excel 格式不识别)。
点击 Embedded SVG 矢量图生成即可,由于矢量图清晰度比较高,建议生成 SVG 格式。
修改参数后生成如下维恩图,图中文字可以直接拖拽。
Bio-Venn 提供的在线绘图方式简单易懂,只需要在文本框中输入这些标识符的列表,并按下提交按钮即可。颜色和文本大小等参数可以通过 web 界面轻松调整,文本的位置可以根据“拖放”原则进行调整,输出的维恩图可以显示为嵌入在web应用程序中的SVG或PNG图像,或者作为一个独立的 SVG 或PNG 图像。
好了,今天小编就先给大家介绍这两款简单易用的韦恩图绘图工具,希望对您的科研能有所帮助!
来源:互联网