复旦大学附属
中山医院:擅长肝癌的综合治疗、心血管病、呼吸内科,尤其是肝移植全国领先。
华山医院:以神经外科、神经内科、皮肤科、骨科(尤其是手外科)为特长,江苏路分部是乳腺专科。
华东医院:老年病特色。
复旦大学附属儿科医院:主体已搬到闵行区顾戴路,小儿外科国内知名,分离过多例连体婴儿。
复旦大学附属肿瘤医院:肿瘤科、病理科沪上领先。
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院(五官科医院):眼科、眼视光、眼外伤、耳鼻喉各种疾病。
复旦大学附属妇产科医院(红房子医院):不孕不育。
复旦大学附属公共卫生临床中心:原来的上海市传染病医院,收治各种法定传染病。
上海交通大学医学院附属
瑞金医院:血液科、烧伤科、内分泌科最强,肾脏科、消化科、感染科也在沪上前列。
仁济医院:以消化内科、风湿免疫科、神经外科、妇产科见长,也是上海人类精子库所在地。
新华医院:综合性医院,但儿科名扬全国,小儿心血管、小儿血液、小儿外科等在全国一流,水平远高于儿童专科医院。成人方面,心血管、消化、神经内科为重点学科。
上海儿童医学中心:新华医院下属的儿童专科医院,擅长儿童先天性心脏病手术。
上海交大附属上海市儿童医院:静安区北京西路,在普陀区建有新院,遗传病、小儿泌尿较有优势。
上海市第一人民医院:眼科、眼底病、中医消化病、泌尿外科、心外科、器官移植处于前列。
上海市第六人民医院:在糖尿病、断肢再植(骨显微外科)、超声医学等领域名扬全国。
上海市第九人民医院:以口腔科、整复外科、关节外科为重点,是整形领域的领头羊。
上海交大附属上海市胸科医院,徐家汇附近,在肺癌、心肺功能障碍、胸部积水等方面实力强。
上海市精神卫生中心:下属上海市心理咨询中心,精神疾病、心理咨询等方面实力不错。
国际和平妇幼保健院:徐家汇衡山路,开展试管婴儿,不孕不育、妇女保健较强。
上海中医药大学附属
龙华医院:擅长中医治疗恶性肿瘤、骨退行性病变、肾病、风湿病、乳腺病、脾胃病、呼吸病等,其中以中医外科和中医肿瘤最为出名。
曙光医院:卢湾和浦东张江都有,擅长中医肝病、骨伤科、中医肾病、糖尿病、脾胃病。
岳阳中西医结合医院:针灸推拿、中医妇科、中医血液科比较好。
市中医医院,位于闸北区芷江中路,中医儿