楚雄市境内河流分属 元江、 金沙江两大水系。元江上游的礼社江,从南华县入境,穿越市境西南部,支流有马龙河、三街河、白衣河、五街河、邑舍河、碧鸡河、自雄河;金沙江水系有其支流龙川江从吕合入境,自西向东流经东瓜、鹿城、苍岭,再由西向北出境,是楚雄市坝区的主要河流。主要支流有紫甸河、西静河、河前河、寨子小河、青龙河、苍岭小河。截至2012年,楚雄市境内主要矿藏资源有 煤、金、 铜、铅锌、 石灰石、大理石、矿泉水、石油、天然气等。其中,褐煤储量1.1亿吨、无烟煤储量4200万吨、金矿石储量239.8万吨、铜矿石储量13.4万吨、铅锌矿石储量87万吨。