塔吉克斯坦全境属典型的大陆性气候,春、冬两季雨雪较多;夏、秋季干燥少雨,年降水量月150-250毫米。
地处山区,境内山地和高原占90%,其中约一半在海拔3000米以上,有“高山国”之称。北部山脉属天山山系,中部属吉萨尔-阿尔泰山系,东南部为冰雪覆盖的帕米尔高原,最高的为共产主义峰,海拔为7495米。北部是费尔干纳盆地的西缘,西南部有瓦赫什谷地、吉萨尔谷地和喷赤谷地等。国家位于中亚的东南部,面积143100平方公里。素有“山地之国”的称号,山区占总面积的93%。一半以上的地区海拔高于3000米,只有不足7%的可耕地。