连州市主要河流有星子河,发源于大东山脉,发源地近处建有一个大型的潭岭水库。保安河、东陂河发源于北部簸箕山脉,还有连南瑶族自治县的三江河,流经本市连州镇高车墩村附近汇入连江。连州市属中亚热带季风气候区,一年四季受季风影响。冬半年(10月~次年3月)盛行东北季风;夏半年(4月~9月)盛行夏季风,主要是西南风。在东亚季风环流背景制约下,连州市冬季常吹偏北风,气候干冷;夏季常吹偏南风,由于暖湿气流盛行,气候高温多雨。另外,由于地形(南岭山脉)的影响,具有明显的“春暖迟、秋寒早”的山区气候特征。直接影响连州市气候和天气变化的大、中尺度天气系统:冬春季主要是极地大陆高压及其前沿的冷锋,夏秋季主要是副热带高压和热带气旋(台风)等。