水产无脊椎动物的胶原主要可分为两类,类Ⅰ型及类Ⅴ型胶原,均相当于脊椎动物的Ⅰ型胶原。其中类Ⅰ型胶原比较富含有丙氨酸和糖结合型的羟赖氨酸,广泛的存在于软体动物的各种器官中,包括:乌贼类的皮和头盖软骨、章鱼的皮鲍的肌肉和外套膜等。类Ⅴ型胶原是丙氨酸含量比较少、富含糖结合型羟赖氨酸,已从矶海葵的中胶层、节足动物虾类和蟹类的肌肉及皮下膜以及原索动物罗氏石勃卒的肌膜体中分离出来。与脊椎动物相比,水产无脊椎动物的胶原显著难溶,富含于羟赖氨酸,尤其是糖结合型含量多,而且纤维的直径小于50nm。有人对海参胶原研究发现,刺参体壁含蛋白 3.3%,其中70%为胶原蛋白。氨基酸分析,胶原富含丙氨酸和羟脯氨酸,但羟赖氨酸含量较少,SDS电泳及SP凝胶柱分析发现其胶原组成为(α1)2α2。还有人从仿刺参(S.japonicus)提取胶原蛋白,利用 EDTA 和 Tris-HCl 浸泡溶涨,用氢氧化钠除去杂质和非胶原蛋白,采用胃蛋白酶促溶提取粗制胶原,通过盐析和透析获取精致胶原蛋白,并进一步利用 Sephacryl S-300 HR 凝胶过滤和 DEAE-52 阴离子交换除去多糖,获取胶原蛋白纯品。SDS-PAGE 电泳表明胶原分子的组成为 (α1)3,且α链类似于脊椎动物Ⅰ型胶原的α1链,热收缩温度为57℃,低于牛皮胶原5℃。还有人对采自日本Senzaki 海湾的Stomolopus meleagri水母的外伞组织进行了分析。整个中胶层被分成三部分,利用醋酸首先将冻干的水母中胶层分为酸溶性蛋白和酸不溶性物质,利用NaCl溶液将酸溶性蛋白分为酸溶性胶原蛋白和酸溶性非胶原蛋白,而不溶入醋酸的中胶层经胃蛋白酶处理后大多变为可溶性的胶原质。然后利用氨基酸分析仪对分离得到的三部分的组成分别进行分析。发现该水母外伞中胶原蛋白含量很高,大约占干重的 46.4%。经 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其胶原蛋白是由三个独特α 链组成,按照它们的移动位置分别分别确定为 α1、α3、α2链。氨基酸分析表明S.meleagri 水母外伞胶原质中甘氨酸含量最高,每1000个氨基酸残基含有309个甘氨酸,其次为谷氨酸、脯氨酸和丙氨酸,分别为98、82和82个残基,羟基脯氨和羟基赖氨酸数也较高,分别为40和27。