一是PCR扩增的特异性和效率。经过PCR条件优化后能否获得特异性条带,即无目的条带之外的多余条带。另外,PCR产物的量是否足够,即无不出带和条带很弱的现象。二是以DNA为模板设计引物时,PCR扩增产物是否与预期PCR产物大小相当。如果差距太大(大于100bp),有可能是错配产物,三是是否形成引物二聚体带。
我们结合引物最终评估和测序的结果可以对引物设计的成败做出判定,为我们以后进行引物设计积累宝贵的经验。