肚脐两边疼的原因有很多,常见的原因有:1、泌尿系统疾病,比如双侧泌尿系结石尤其是输尿管结石,会引起双侧肚脐两侧疼痛不适,甚至会腰痛、恶心、呕吐等。2、妇科疾病,比如双侧附件炎症、卵巢囊肿蒂扭转、输卵管妊娠、盆腔炎、子宫肌瘤等。3、急慢性胃肠炎,肠道炎症时可以刺激肠壁神经,导致肚脐两边甚至是脐周疼痛不适。4、急性阑尾炎,当发生阑尾炎发生时一般会有典型的肚脐周围疼痛,转移性右下腹部疼痛,最后固定在麦氏点疼痛。5、发生肠梗阻或者肠道肿瘤等,当肠道尤其是横结肠管腔变窄,便块通不过肠腔刺激肠壁神经时,会导致肚脐两侧疼痛。