中华人民共和国成立后,该监狱直属中央人民政府公安部(后来成为中华人民共和国公安部)管辖,改为“北京战犯管理所”。这里关押的100多名高级战犯共分为13个小组。其中邱行湘任第一组组长,组员有杜聿明、宋希濂、康泽、王陵基、范汉杰、廖耀湘、陈林达等人。这里关押的原国民党战犯还有黄维、陈长捷、文强、沈醉、郑庭笈等人。起初功德林属公安部直辖。后来,一些高级战犯陆续获得特赦,功德林遂改由北京市公安局管辖,并成立了接济救护站,接济走失的呆傻人员,或来北京办事一时失去经济来源的人员,留他们暂住这里,并免费提供食宿,设法同他们的亲友取得联系,或由其亲友将其接走,或由政府派人将其送回家。如今,功德林路已成为新康路。