2007年5月8日:开始营运台北到花莲间的路线,并创下该区间最快行车时间纪录。2007年6月25日:原行驶东部干线通勤时段的1062次太鲁阁列车,因不售站票导致通勤旅客无法上车或强行搭车,造成乘车秩序混乱,故从当日起与1064次自强号互换车型。2008年2月2日:第二批进口的TEMU1000型倾斜式电车,将于2008年春节以加班车的方式行驶台北至员林间的直达太鲁阁列车,该加班车创下台铁有史以来于此区间最短行车时间的纪录。2008年2月25日:2008年春节期间以加班车方式行驶的花莲至员林(后因员林站进行高架化工程无法提供车辆长时间停靠,自2009年10月27日起延驶至田中)间的太鲁阁列车改为定期班次,每天来回各一班。2008年3月1日:台铁宣布日后将提供一列太鲁阁列车作为包车使用,供机关团体、公司行号搭配旅游及商务行程使用,称为“太鲁阁专车”;但是,逢周五六日或连续假日时,太鲁阁列车将会全数上线营运,此时是无法包车的。