花椰菜分青梗和白梗两大类。青梗花椰菜脆甜可口,是品质育种的重要目标,但是引起花梗颜色变化的色素积累机理尚不清楚。对青梗和白梗花椰菜转录组进行分析研究,以期为花椰菜花梗颜色的色素积累形成机理、重要功能基因的分析与挖掘以及花椰菜品种改良提供一定的理论依据。以青梗花椰菜‘庆农65天’和白梗花椰菜‘神龙特大120天’的花梗为试验材料,提取RNA进行转录组测序,建立青梗和白梗花椰菜转录组数据库,将测序得到的数据,剔除接头和低质量的读序,有效数据进行合理组装,使用生物学分析软件对得到的Unigene进行基因功能分类、功能注释以及目标代谢通路的分子生物学分析,比较分析青梗和白梗花椰菜中基因表达的差异。