目前并不知道其真正的致病原因,不过多数文献认为此病有遗传倾向(常见于鱼鳞癣患者),且好发于有过敏性或异位性体质者、或营养不良者(特别是维生素A缺乏的人);若加上环境的湿度低、空气干燥,以及焦油、油脂等某些刺激物,也可能导致较常出现。毛孔角化是一种先天基因导致的体质。有专家表示,具有这种体质的人,毛囊周围的角质会增厚,导致毛囊口被过厚的角质堵塞,造成一粒粒的小凸起。一些具有异位性皮肤炎、鱼鳞癣的患者,通常也患有毛孔角化症。冬天时的症状会更为严重,因为和毛孔角化与角质变厚有关,所以当气候较干燥寒冷时,角质增厚的情形会加重,也就使症状变得更加明显。除了先天体质因素外,也有报告指出与维生素A缺乏有关。缺乏维生素A会引起全身性的干燥,而干燥就加剧了毛孔角化的症状。