航管楼位于航站楼中轴线正北方向上的航管楼指挥塔台,全高70.34米,利用滑模施工工艺连续浇筑而成,其通信导航设备在机场主降方向设Ⅱ类仪表着陆系统,次降方向设Ⅰ类仪表着陆系统,设置的多普勒气象雷达及气象自动观测系统、高低功率测距仪,多普勒全向信标导航遥控系统等。一期航站楼改扩建工程及站坪二期续建工程2003年12月26日,由海南美兰国际机场股份有限公司出资4.34亿元人民币,兴建海口美兰国际机场航站楼及站坪二期续建工程。该工程于2005年12月22日通过了国家行业验收,并于2005年12月31日零时投入使用。从而使机场航站楼总面积达9.93万平方米,站坪总面积达38.4万平方米,站坪机位33个,可同时停放3架B747型飞机、16架B767以下机型的飞机和14架B737机型飞机,年旅客吞吐量达930万人次,高峰小时旅客吞吐量可达4349人次。