瑶海区辖原东市区和平路、胜利路、大通路、铜陵路、七里站、三里街、车站、明光路、红光9个街道。从原郊区划入城东1个乡,七里塘、大兴2个镇,长淮、方庙2个街道。从原郊区划入杏花村镇板桥、望城店2个村,板桥河以东区域归七里塘镇管辖。从肥东县划入磨店乡(位于肥东县西部与合肥市原郊区接壤处,面积近50平方千米,人口2.6万人);将肥东县龙岗镇所辖的三合、刘大郢、油坊、大彭、罗岗、马岗、王岗、史城8个村和新站、大店2个居委会划归大兴镇管辖。调整后,瑶海区辖城东、磨店2个乡,七里塘、大兴2个镇,和平路、胜利路、大通路、铜陵路、七里站、三里街、车站、明光路、红光、长淮、方庙11个街道。面积142.90平方千米,人口36.53万人,其中非农业人口28.82万人。区人民政府驻明光路57号(原东市区人民政府驻地)。
1998年,东市区辖胜利路街道、车站街道、三里街街道、花冲街道、东七街道、大通路街道、和平路街道、明光路街道、红光街道。
2000年,东市区辖9个街道。 根据第五次人口普查数据:全区总人口249125人,其中各街道人口(人): 明光路街道 23556 车站街道 19969 胜利路街道 13263 三里街街道 36042 铜陵路街道 41341 七里站街道 29289 红光街道 34313 和平路街道 21675 大通路街道 29677
2002年底,瑶海区辖:胜利路街道、车站街道、三里街街道、花冲街道、东七街道、大通路街道、和平路街道、明光路街道、红光街道、七里塘镇、大兴镇、城东乡、磨店乡。
?年,瑶海区辖9个街道、2个镇、2个乡,34个村、51个社区居委会:七里站街道、铜陵路街道、三里街街道、车站街道、明光路街道、胜利路街道、大通路街道、和平路街道、红光街道、七里塘镇、大兴镇、城东乡、磨店乡。
2004年,撤销城东乡设立城东街道办事处。2004年底,瑶海区辖12个街道、2个镇、1个乡(包括由新站开发区管辖的长淮街道、方庙街道、七里塘镇)。