2011年,上海交通大学“世界一流大学研究中心”发布2011年“中国·两岸四地大学排名”,澳门科技大学位列第82位。2013年,上海交通大学“世界一流大学研究中心”发布2013年“中国·两岸四地大学排名”,澳门科技大学位列第72位。2014年,上海交通大学“世界一流大学研究中心”发布2014年“中国·两岸四地大学排名”,澳门科技大学位列第57位。2015年,上海交通大学“世界一流大学研究中心”发布2015年“中国·两岸四地大学排名”,澳门科技大学位列第46位,澳门地区第1位。2016年,上海交通大学世界一流大学研究中心和上海软科联合发布的2016年“中国·两岸四地大学排名”,澳门科技大学位列第32位,澳门地区第1位,名次比上一年大幅提升14名。