新疆生产建设兵团和新疆军区同属新疆自治区管理,但新疆生产建设兵团也是中央直属省部级单位,而新疆军区仅是副大军区级,由中国人民解放军陆军领导。所以新疆生产建设兵团在级别上要高于新疆军区。