东部箱龟背甲长15~18cm,东部箱龟体长4~81/2"(10~21.6cm)。腹甲具有可活动的铰链关节,使得它可以与背甲紧密地闭合在一起。背甲高隆,具有棱突;颜色和图案多变。腹甲通常与背甲等长,茶色至深棕色、黄色、橙色或橄榄色;不具花纹,或有少量深色的小点。雄龟往往长着红色的眼睛,腹甲后部内陷;而雌龟的眼睛呈略微泛黄的棕色。
三趾箱龟一般成龟背甲13-15厘米,龟壳一般呈啡或橄榄色,间中长有黄色条纹或斑点。腹甲呈土褐色;皮肤呈啡或灰色,头及前肢长有红、橙、黄或白色。典型的三趾箱龟,其后脚只有三个趾头,但是会有例外的状况。三趾箱龟的背甲花色为细碎放射状的小黄点,背甲的底色是橄蓝色或土黄色,也有的个体背甲上并没有小小的黄色班点分布。三趾箱龟公龟的体色个人认为偏红色或橘色居多,相当鲜艳漂亮。而在体型方面,三趾是常见的卡箱龟之中较为娇小的一种,有时腹甲十到十一公分的母龟就可以产卵了。
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