全县辖3个区,1个镇、29个乡(其中5个民族乡)。1992年11月12日,根据撤区、并乡、建镇的精神,县政府撤销博凹乡建制,原博凹乡行政区域转为乔瓦镇建制。2006年全县辖3个区、1个镇、28个乡(其中5个民族乡)、9个相当于乡级的牧场。2006年,木里藏族自治县辖3个区、1个镇、28个乡、9个牧场。区乡(镇)面积(平方千米)村(个村民小组(个)瓦厂区工委388031152桃坝乡196418　　博科乡337422宁朗乡608312依吉乡261315俄亚纳西族乡591628水洛乡1343627牦牛坪乡237318屋脚蒙古族乡307212博瓦区工委402452307乔瓦镇241326项脚蒙古族乡142319李子坪乡198321列瓦乡105419芽租乡179429下麦地乡117324西秋乡135315克尔乡251318白碉苗族乡380426三桷垭乡352525倮波乡471525卡拉乡1239727后所乡214533茶布朗区工委534829114沙湾乡653428东孜乡308318固增苗族乡472419麦日乡625413东朗乡574312唐央乡1251425博窝乡805314麦地龙乡6604152011年末辖区总人口137262人,其中常住人口12.9万人,城镇化率12.02%。总人口中,男性70077人,占51.05%;女性67185人,占48.95%。18岁以下39961人,占29.11%;18-60岁83420人,占60.7%;60岁以上13881人,占10.19%。木里藏族自治县人口统计表(2006年)区乡(镇)总人口(人)瓦厂区工委33163桃坝乡5872博科乡4882宁朗乡2164依吉乡3285俄亚纳西族乡5778水洛乡5604牦牛坪乡3341屋脚蒙古族乡2237博瓦区工委71072乔瓦镇17580项脚蒙古族乡3204李子坪乡3715列瓦乡4140芽租乡3693下麦地乡3461西秋乡3206克尔乡4075白碉苗族乡6074三桷垭乡5086倮波乡5492卡拉乡5068后所乡6278茶布朗区工委25490沙湾乡4877东孜乡3378固增苗族乡3403麦日乡2781东朗乡2439唐央乡4261博窝乡1829麦地龙乡252