前列腺左右叶受男性激素影响,中叶受女性激素影响。在胚胎发育过程中,中叶如受过多雌激素水平影响,将导致前列腺发育异常,呈女性生殖系统改变,其中前列腺囊发展成前列腺囊囊肿,即真性前列腺囊肿。苗勒管囊肿和真性前列腺囊肿均为先天性前列腺囊肿,多位于中线。先天性前列腺囊肿常伴有尿道下裂、隐睾、肾发育不全等先天性疾病。
前列腺潴留性囊肿多因坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻,逐渐使腺泡上皮变厚,终至发生潴留性囊肿。多由于炎症导致前列腺的导管或腺管闭塞、前列腺的分泌物贮积而形成。前列腺腺管开口于精阜两侧;射精管开口于前列腺囊后外侧。故前列腺潴留性囊肿、射精管囊肿及其它继发性囊肿多发生于前列腺四周。