有不少人曾报道说发现了巨齿鲨,经检验,都是将姥鲨、鲸鲨等体型大的鲨鱼误看成巨齿鲨。其灭绝原因据猜测是因为大约150万年前,地球的水循环出现了变化,上升流减少,由于食物缺乏,大量的鲸死亡了,多样化的鲸品种变少,巨齿鲨找不到足够的食物,渐渐灭绝了。那时候已经进化出了我们人类,并且我们的祖先已经处在直立人(180万年前进化出来)阶段了,但可惜我们的祖先当时未能发展出制作下海的交通工具,因此在人类与巨齿鲨生存年代有交界的短暂的50万年里,我们的祖先未能目睹巨齿鲨骇人的王者风采。经过漫长的岁月,像其他生物一样,也有可能逐步进化成别的鲨鱼。