白莲洞遗址上部出土的哺乳动物共15种,皆为现生种;下部红色堆积中出土的哺乳动物化石共18种,其中绝灭动物有犀、大熊猫、剑齿象和真象等,且这些动物化石与人牙化石一起出自不含螺壳的较低层位中。白莲洞遗址下部为含化石智人的“大熊猫—剑齿象动物群”。上部堆积之上为含原始陶片的钙华板层,为新石器时代早期的堆积。上部灰黄色堆积中含较多螺壳,文化遗物有刃部磨制的石斧,大量的砾石石器,穿孔砾石。下部堆积物中,含少量螺壳,最下层无螺壳。第一期文化出土了人牙化石2枚、人类用火遗迹2处及各类石制品207件。人牙石化程度较深,齿冠表面呈淡黄色,光泽较好,齿根表面有黑色铁锰质的斑点,牙齿保存状况颇佳,除齿根局部有缺失外,齿冠均完整,表现出一定的原始性,为晚期智人的代表。石制品可分为燧石和砾石两大类,以燧石质石器居多,包括砍砸器、刮削器以及有使用痕迹的石片、石叶、断块等。颇具特色的“白莲洞式打片法”,即由砾石断面上用锤击法取得圆形石片,其周围仍保留一圈或部分砾石的岩皮。第二期文化出土了石锤、砍砸器、刮削器、切割器、尖状器、雕刻器以及有使用痕迹的石片、石叶、石核、断块等。燧石制品依然居于主要地位。第三期文化出土了骨角器2件、各类石制品47件。石器绝大多数为砾石工具,砾石工具中不乏砾石石片制品,燧石制品出土量极少。石制品包括石锤、砍砸器、刮削器、穿孔石器、尖状器、切割器以及有使用痕迹的石片、石核等。