现陆军第39集团军下辖:
军直部队:军直通信团、军直工兵团、军直防化团、陆军航空兵第9团、特种作战团
机械化步兵第116师(驻辽宁大石桥):346团、347团、装甲团、炮兵团、高炮团
摩托化步兵第115师(驻辽宁盖州):343团、345团、装甲团、炮兵团、高炮团
机械化步兵第190旅(驻辽宁本溪)
机械化步兵第202旅
装甲第3旅
炮兵旅
防空旅(驻辽宁抚顺)

荣誉单位

中国人民解放军第39集团军曾被授予荣誉称号的单位有:
红军师——步兵第116师(344旅)
红军团——步兵第115师第343团、步兵第116师第347团
道峰山营——步兵第190师第569团第3营
钢铁七连——步兵第116师第347团第7连
神枪手四连——步兵第116师第348团第4连

主要指挥

历任军长

刘震(1948.11-1950.03)
吴信泉(1950.03-1953.04)
张竭诚(代53.06-1956.07)
张竭诚(1956.07-1957.09)
王东保(1957.10-1964.08)
张峰(1964.08-1969.08)
朱恒兴(1969.08-1981.06)
张杰(1981.06-1983.05)
徐惠滋(1983.05-1985.03)
傅秉耀(1985.08-1990.06)
罗有礼(1990.06-1996.07)
王建民(1996.07-1999.04)
阎丰(1999.04-2002.10)
艾虎生(2002.10-2007.09)
潘良时(2007.09-2014)
张旭东(2014—)

历任政委

吴法宪(1948.11-1949.04)
吴信泉(1949.04-1950.03)
徐斌洲(1950.03-1951.07)
李雪三(1951.07-1952.07)
吴信泉(兼52.07-1953.04)
石瑛(代53.05-1954.10)
石瑛(1954.10-1956.04)
李少元(1956.04-1964.08)
陈绍昆(1964.08-1969.08)
彭仲韬(1969.09-1978.05)
李兆书(1978.05-1983.05)
宋克达(1983.05-1985.06)
张海天(1985.08-1986.03)
马盛林(1986.03-1990.06)
谭乃达(1990.06-1992.11)
李栋恒(1993.02-1996.04)
符廷贵(1996.04-2001.07)
陈国令(2001.07-2004.12)
张烈英(2004.12-2010.12)
张书国(2010.12-)