他一共结过两次婚。说起李谷一老公肖卓能,他是我国开国元勋海军司令肖劲光的儿子,原山东政协副主席,担任中国海洋技术总公司总经理,女儿是肖一。李谷一的婚姻十分幸福,与老公恩爱几十年从未发生争吵。夫妇两人都已年近七旬的老人了,但仍然坚持在各自的岗位上辛勤耕耘。夫妇两做人一直都很低调,有关女儿肖一的信息知道者甚微。
外界一直有传闻说李谷一攀龙附凤才嫁给肖卓能,但事实却并非如此,李谷一并非贪图钱财和名利才嫁给了肖卓能,而是因为“真爱”,因为肖卓能对李谷一的情爱和痴迷。至今为止,肖卓能的手里铃声都是李谷一那首《边疆泉水清又纯》,几十年的爱情终究谱出的是一个恩爱幸福的爱情故事。肖卓能对于李谷一的喜爱,最早源自于他是李谷一的歌迷,而且谁也不认识谁。