香蕉冠腐病的主要病原菌为亚粘团串珠镰孢(Fusarium moniliformevar.subglutinans)、半裸镰孢霉(F.semitectum)、导管镰孢霉(F.aquaeductuum)和弯喙镰孢霉(F.camptoceras)。这4种镰刀菌均从伤口侵入,均属伤痍菌。香蕉去轴分梳以后,切口处留下大面积伤口,成为病原菌的入侵点。香蕉运输过程中,由于长期沿用的传统采收、包装、运输等环节常导致果实伤痕累累,加上夏秋季节北运车厢内高温高湿,常导致果实大量腐烂。