DNA微阵列技术的主要流程:①芯片的制备:DNA芯片的制备方法有光引导原位合成法、化学喷射法、接触式点涂法、原位DNA控制合成、非接触微机械印刷法TOPSPOT和软光刻复制等。已能将40万种不同的DNA分子放在1 cm2的芯片上。②样品的制备:包括样品DNA或RNA的分离提纯和用PCR技术对靶基因片段扩增以及对靶基因标记。③杂交反应:选择合适的反应条件使生物分子间的反应处于最适反应条件。芯片杂交属固-液相杂交,影响杂交的有诸多因素,其中包括:靶标浓度、探针浓度、杂交双方的序列组成、盐浓度、温度及洗涤条件。④芯片信号的检测与分析:样品中靶基因与固定在芯片上的探针发生特异性杂交而结合在芯片上的不同点,荧光素分子受特定波长的激发光照射出特定波长的荧光。通过特定的扫描仪获取杂交后的信号,用于芯片扫描的芯片扫描仪有:激光共聚焦扫描芯片和CCD芯片扫描仪,得到的数据用一个专门处理系统来对其进行处理,包括芯片数据的统计分析和生物学分析、芯片数据库积累和管理、芯片表达基因的国际互联网上检索和表达基因数据库分析等。DNA微阵列技术最突出的特点就是可一次性检测多种样品,获得多种基因的差别表达图谱,已成功地运用cDNA微阵列同时检测l万多个基因的表达。因此,DNA微阵列是对不同材料中的多个基因表达模式进行平行对比分析的一种高产出的、新的基因分析方法。与传统研究基因差异表达的方法相比,它具有微型化、快速、准确、灵敏度高,以及在同一芯片上同时大信息量平行检测的优势。