多肽营养缺乏时,胸腺等组织萎缩,T细胞的生长受到影响。细胞免疫功能下降不仅表现为T细胞数量减少,而且机能也发生障碍。体液免疫是指内B淋巴细胞参与形成的免疫。人体缺乏肽蛋白营养时,外周血中B细胞的数量几乎无变化。功能实验表明无论肽营养的障碍的程度如何,血清的浓度正常或略高,尤其是伴有感染时略高,在缺乏肽时免疫球蛋白的产生受影响而减少,因而对抗体的防御机能有着重要意义。严重肽蛋白营养缺乏者,嗜中性白细胞总数不变,但其功能不变。细胞的趋化性正常或略减慢,吞噬活动正常,只是对细胞内吞入的微生物的杀伤能力减弱。如果及时补充肽,一两周后吞噬细胞功能可逐渐恢复。多肽活性营养缺乏时某些非特异性防御能力也有显著变化,如血浆,眼泪,唾液及其他分泌物中溶菌酶活性降低,粘膜上皮细胞组织变形,粘膜补获和纤毛运动改变,干扰素生成减少等,都可影响宿主的易感染性。