睡醒以后眼睛疼痛有可能是以下几种原因:1、睑腺炎:睑腺炎是睑板腺感染,由金黄色葡萄球菌感染比较多见,引起睑板腺急性炎症,表现为眼睑局部的疼痛、红肿、皮肤温度升高。2、暴露性角膜炎:睡醒以后眼睛疼痛,有可能是发生了暴露性角膜炎,表现为眼睛疼痛,特别是在上睑下垂矫正术后,睑裂闭合不全,或者是外伤引起了眼睑列缺损、闭合不全等情况,在睡眠以后,睑裂不能闭合遮盖角膜,这样形成暴露性角膜炎,表现睡醒以后眼睛疼痛。3、青光眼:青光眼发作以后,往往也会表现为眼睛疼痛,建议及时到医院眼科进行就诊,以明确眼压的情况,如果诊断为青光眼,则需要及时的进行药物、激光或手术的治疗方法,进行积极治疗。