1974年——1976年,在吉林大山林场知青。1976年——1980年,沈阳药科大学药学系就读。1980年——1985年,哈尔滨医科大学攻读硕士研究生,获药学硕士学位。1985年——1988年,同济医科大学(现华中科技大学同济医学院)攻读博士研究生,药理学博士学位。1990年——1992年,日本筑波Eisai研究所药理学博士后。1992年——1995年,哈尔滨医科大学药理学专业教师。1995年——1996年,加拿大蒙特利尔心脏病研究所作为访问学者。2001年—— 2018年,哈尔滨医科大学校长、党委副书记。(期间,2009年12月,当选中国工程院院士。)2017年5月3日,在黑龙江省第十二次党代表大会上选举杨宝峰为黑龙江省出席党的十九大代表。学术兼职中国药理学会心血管药理学专业委员会主任委员。省部共建生物医药国家重点实验室培育基地主任。2018年10月15日,哈尔滨医科大学召开全校干部大会,宣布张学任哈尔滨医科大学校长、党委副书记。上述信息表明杨宝峰已不再担任哈尔滨医科大学校长、党委副书记职务。