东北抗日联军第5军的前身是东北反日联合军第5军。1935年1月,中共吉东省委决定将民众抗日武装绥宁反日同盟军改编为东北反日联合军第5军。军长周保中,副军长柴世荣,政治部主任胡仁,参谋长张建东。军部设在宁安县八道河子。5军编有2个师7个团,共936人。1师师长李荆璞,政治部主任关书范。2师师长傅显明,副师长姜振荣,政治部主任李光林,参谋长陈翰章。5军成立后经过一年多的游击战争,队伍得到了发展,游击区得到了扩大,成为中国共产党领导的一支抗日武装力量。1936年3月正式组建东北抗日联军第5军。下辖3个师。军长周保中,副军长柴世荣,政治部主任胡仁,参谋长张建东。1师师长李荆璞,副师长姜振荣,政治部主任关书范,参谋长张镇华。2师师长傅显明,后任王光宇,政治部主任李光林,后任季青,参谋长陶净非,后任陈翰章。3师师长李文彬,副师长张镇华,政治部主任王效明,后任季青。1937年初,第5军转战中东铁路以北地区,开辟了依兰、方正、富锦、宝清、勃利等大片游击区,队伍发展到3000余人。1937年10月第5军编入东北抗日联军第2路军,周保中任第2路军总指挥兼5军军长。1941年3月5军改编为第2路军第5支队,抗联第5军番号取消。抗联第5军是东北抗日联军的主力部队,产生周保中这样的民族英雄和“八女投江”那样的英雄群体。东北抗日联军第6军的前身是工农红军33军汤原民众反日游击队。1932年10月10日,中共汤原中心县委创建了汤原民众反日游击队,这支部队被中共满洲省委授予了中国工农红军33军汤原民众反日游击队番号,李福臣任队长。但不久遭土匪袭击而失败。后几经挫折,于1933年11月,在中共汤原中心县委领导下,重建了汤原反日游击队,中国工农红军第33军番号取消。1934年10月汤原反日游击队扩编为汤原反日游击总队。戴鸿宾为总队长,夏云杰为政委,李仁根为参谋长。同月,汤原另一支民众抗日武装文武队在队长冯治纲的率领下加入汤原反日游击总队。汤原反日游击总队与当地的义勇军联合作战,给日伪军以沉重打击,创建了太平川抗日根据地。到1935年12月汤原反日游击总队已发展到700多人的一支抗日武装。1935年12月赵尚志率领东北人民革命军第3军军部和1个团到达汤原,帮助汤原反日游击总队改编为东北人民革命军第6军。夏云杰任军长,李兆麟任代理政治部主任,冯治纲任参谋长。下辖4个团。1团团长王秀芝,2团团长戴鸿宾,政治部主任裴敬天,3团团长冯治纲(兼),政治部主任周云峰,4团团长张传福,政治部主任徐文斌。1936年9月,东北人民革命军第6军正式编为东北抗联第6军,下辖7个团,全军1500人。1936年11月26日,6军军长夏云杰在战斗中牺牲,戴鸿宾任代理军长。1937年2月2日中共北满临时省委决定戴鸿宾为东北抗联第6军军长。并将6军原有的7个团扩编为5个师。1师师长马德山,政治部主任徐光海。2师师长张传福,政治部主任张兴德,参谋长韩铁汉。3师师长兼政治部主任周云峰,继任王明贵。4师师长戴鸿宾(兼),政治部主任吴玉光。5师师长刘振声,政治部主任高玉斌,参谋长邱金海。1939年5月,6军编入编入抗联第3路军。1940年4月,抗联缩编,路军以下设支队,6军的番号取消,部队分别编入抗联第3、6、9和12支队。