无论在党委还是政府序列中,秘书长都是领导,而办公厅(室)主任只是部门一把手。比如在省委这一级,尽管副秘书长们只是正厅或者副厅级干部,但是他们仍和省委常委一样,排在省委领导序列。省委办公厅副主任尽管也是副厅级干部,但只是办公厅领导。
秘书长的工作重点不是办公厅机关工作自身,而是党委或者政府的工作筹划、活动协调、日常运转,比如党委或政府重大活动规划、主要领导活动安排、重点工作计划、各种重大方案制定和实施、重大政策复核等。各级政府办公厅(室)最为典型,一个副秘书长对口保障一名政府领导,协助这名政府领导负责一块工作,联系几个政府部门。
办公厅主任主要职责就是办公厅的行政事务、文字文件运转、后勤服务保障等。但因为办公厅本身就带有承上启下、居中协调的性质,所以有些地方秘书长兼任办公厅主任,更多的地方是让办公厅主任充任常务副秘书长。
当然,两者也不是不能合二为一。特别是在二线的人大、政协,秘书长、副秘书长和办公厅主任、副主任分设,更多的还是为了多安排人,实际意义不大。