作为第一完成人主持的研究项目于2000年、2006年和2011年三次获得国家科技进步二等奖,并获2010年教育部科技进步一等奖;1999年卫生部科技进步—二等奖、1998年教育部科技进步三等奖等,并获中国青年科技奖、国家自然科学基金会通用汽车中国科技成就奖、全国留学回国人员成就奖等。并先后获得上海市“十大杰出青年”、卫生部有突出贡献中青年专家、教育部“跨世纪优秀人才”、全国优秀院长等殊荣:被入选国家人事部“百千万人才工程”,是国务院颁发的政府特殊津贴获得者。