1986年10月,党的十二届六中全会前后,邓小平、陈云、李先念同志共同约定“一齐退下来”,而且是一退到底,即退出中央委员会,不再担任任何职务。彭真、邓颖超、徐向前、聂荣臻同志也要求“全退”。据薄一波说,对邓小平、陈云、李先念同志全退的要求,尤其是对邓小平同志“全退”的要求,许多同志表示不能接受,特别是老同志。后来,经过中央政治局反复讨论酝酿,并征求多方意见,才决定邓小平、陈云、李先念3人“半退”,即退出党的中央委员会,但仍担任一定职务——邓小平担任中央军委主席,陈云担任中顾委主任,李先念担任全国政协主席;彭真、邓颖超、徐向前、聂荣臻“全退”,即退出党的中央委员会,不再担任任何职务。1987年11月10日,中共第十三次全国代表大会选举产生了新一届中央顾问委员会。这次换届,退出31人,增补59人,共200人。中顾委主任为陈云,副主任为薄一波、宋任穷。在党的第十三次全国代表大会上,在三老“半退”、四老“全退”的带动下,中央和各省、市、自治区又有一批老干部退出第一线的领导岗位,增选为中顾委委员和各省、市、自治区的顾问委员会委员,一批年轻干部走上了一线领导岗位。从十三大以后,薄一波就吩咐下去,要逐步减少中顾委的活动。1989年9月,邓小平明确提出十四大以后不再设立顾问委员会。1991年上半年,陈丕显同志在上海看望了陈云同志。陈云要陈丕显同志回京后向薄一波、宋任穷同志转达他的意见。陈云同志说:“我十四大以后不再干了,我考虑了,决定了。至于一波、任穷同志干不干,中顾委以后还设立不设立,请他们研究。”薄一波和宋任穷听了陈云的意见后,共同表示,他们两人也都要退下来,十四大以后不再设立中央顾问委员会,并把意见向陈云同志作了报告。十四大召开前夕,薄一波让中顾委办公厅起草中顾委向十四大的工作报告。报告除了总结五年来的工作外,还根据薄一波的指示,在报告中写了这样一段话:“鉴于党的干部离休、退休制度已全面建立并正在顺利执行,实现新老干部的合作与交替已取得预期的进展;鉴于中顾委已历时两届,委员们的年事都很高了,已基本上完成了作为一种过渡性组织的任务,为此我们建议,党的第十四次全国代表大会后可以不再设立中央顾问委员会。”大家对中顾委五年来的工作没有提出异议,但对十四大以后不再设立中央顾问委员会的建议则反应强烈。多数委员主张中顾委再保留一段时间。第二天上午继续讨论,意见仍不统一。于是,在(1991年)10月8日下午举行的全体会议上,薄一波作了一个颇具说服力的讲话。关于十四大以后不再设立中顾委的问题,他说:这是我要讲的最重要的问题。我们改革开放的总设计师邓小平同志考虑这件事不是现在,而是两年前。当时,他从北戴河回来,请尚昆同志通知我:一波,你要考虑十四大取消中顾委,有什么意见?我表示,我没有意见。中央和小平同志怎样考虑决定,我就怎样执行。出于遵守纪律,没有对别人讲。我估计,尚昆同志不只对我,也对中央常委讲过小平同志的意见,直到十四大前,小平同志又严肃地讲:中顾委必须撤销。薄一波接着讲述了陈云同志托陈丕显同志带话给他和宋任穷,以及他们的表态等情况。然后薄一波语重心长地说:“小平同志讲了话,陈云同志讲了话,他们两位先后是十二届、十三届的中顾委主任,中央又作了决定。面对这个严肃的问题,我和任穷同志只有执行,不可能有别的想法。”薄一波提出:“为了把这个问题解决得好一些,体面一些,我们还是主动提出撤销中顾委为好。”对薄一波的讲话,大家鼓掌表示赞同。薄一波接着说:“听到大家的掌声,表示大家同意,这件事就这么定了。”会场又一次响起掌声。1992年10月9日,薄一波主持第九次也是最后一次中顾委全体会议。会上一致通过了中顾委向十四大的工作报告。