南川区矿藏资源较多,主要有煤、铝土矿、含钾岩石、耐火粘土、石灰石、硫铁矿以及锂、镓、铀、锗、方解石、大理石、水晶、铜矿、石棉、石膏、石英砂等。以煤最多,表内地质总贮量为2亿多吨。其次为铝土矿,表内贮量为2500多万吨,表外贮量300多万吨,贮量大,品质好,属优质高铝低硅矿床。硫铁矿贮量为6500多万吨,开发价值大。铝土矿也是重庆优势矿产之一,在全国位居第六位。截止到2004年,南川市铝土矿储量高达5000多万吨,品位高,是国内最好的铝土矿之一。南川区野生动物有野猪、野羊、猴、獐、狐、獾、刺猬、水獭、旱獭、虎、豹、狸等,全市动物资源有523多种。国家重点保护动物34种,濒危动物69种。