《百年孤独》中的孤独症结有三方面:一是外来殖民文化对马孔多现有的文化基础造成的紊乱、二是爱情的缺失、三是难以摆脱的宿命论——布恩迪亚家族所有叫奥雷里亚诺都性格孤僻,但头脑敏锐,富于洞察力;所有叫何塞·阿尔卡蒂奥的都性格冲动,富于事业心,但命中注定带着悲剧色彩[60]。而这种孤独的症结正是加西亚·马尔克斯努力所唤醒和反抗的灵性之一。在《百年孤独》中,马尔克斯所要唤醒的灵性就是马孔多在紊乱的文化中消亡之后重获独立和自由、布恩迪亚家族在孤独中死亡后重获新生和“团结”。