下列为 Smith et al. 所提出的完整分类架构:松叶蕨纲Psilotopsida瓶尔小草目Ophioglossales瓶尔小草科Ophioglossaceae(包含阴地蕨科Botrychiaceae、七指蕨科Helminthostachyaceae)松叶蕨目Psilotales松叶蕨科Psilotaceae(包含二囊松叶蕨科Tmesipteridaceae)木贼纲Equisetopsida木贼目Equisetales木贼科Equisetaceae合囊蕨纲Marattiopsida合囊蕨目Marattiales合囊蕨科Marattiaceae(包含莲座蕨科Angiopteridaceae、天星蕨科Christenseniaceae、多孔蕨科Danaeaceae、Kaulfussiaceae)真蕨纲Pteridopsida紫萁目Osmundales紫萁科Osmundaceae膜蕨目Hymenophyllales膜蕨科Hymenophyllaceae(包含Trichomanaceae)里白目Gleicheniales里白科Gleicheniaceae(包含Dicranopteridaceae、羽叶里白科Stromatopteridaceae)双扇蕨科Dipteridaceae(包含燕尾蕨科Cheiropleuriaceae)马顿蕨科Matoniaceae沙草蕨目Schizaeales海金沙科Lygodiaceae密穗蕨科Anemiaceae(包含Mohriaceae)沙草蕨科Schizaeaceae槐叶苹目Salviniales苹科Marsileaceae(包含Pilulariaceae)槐叶苹科Salviniaceae(包含满江红科Azollaceae)桫椤目Cyatheales伞序蕨科Thyrsopteridaceae偏环蕨科Loxomataceae垫囊蕨科Culcitaceae瘤足蕨科Plagiogyriaceae金毛狗蕨科Cibotiaceae桫椤科Cyatheaceae(包含Alsophilaceae、Hymenophyllopsidaceae)蚌壳蕨科Dicksoniaceae(包含毛囊蕨科Lophosoriaceae)蚌沙蕨科Metaxyaceae水龙骨目Polypodiales鳞始蕨科Lindsaeaceae(包含Cystodiaceae、Lonc