植物水通道蛋白是一个超家族,根据氨基酸序列同源性和亚细胞定位可以划分为四个家族:质膜内在蛋白PIP、液泡膜内在蛋白TIP、类Nodulin26膜内在蛋白NIP和小的基本膜内在蛋白SIP。PIP被分为两个亚家族:PIP1和PIP2。从序列水平看,与PIP2亚家族成员相比,PIP1亚家族成员有一个长的N末端和短的C末端。PIP1和PIP2亚家族成员在功能上也存在差异。在爪蟾卵母细胞中异源表达时,与PIP2蛋白相比,PIP1表现没有或具较低的水通道活性。植物水通道蛋白的活性可能受门控机制调控。影响门控行为的因子可能包括磷酸化、异源基因化、pH、Ca2+、渗透压、溶质梯度和温度。