在杂交试验中,基因型专指所研究的、与分离现象有关的基因组合,如孟德尔遗传定律中纯种高茎豌豆(DD)、杂种高茎豌豆(Dd)和纯种矮茎豌豆(dd)就是控制豌豆叶叶茎长短的基因型。基因型一般不能直接看到,需要通过杂交(测交)试验从表现型来推知。基因型根据其显性是否完全分为完全显性和不完全显性,显性不完全时,基因型与表现型一致。例如,假设基因T,t决定金鱼的透明性这一性状,其表现型为透明金鱼、普通金鱼和五花鱼的金鱼,它们的基因型分别是TT、Tt、和tt;显性完全时,基因型与表现型不一致,例如,纯种高茎豌豆的基因型是DD,杂种高茎豌豆的基因型是Dd而基因型为dd的是纯种矮茎豌豆。在这种情况下,必须通过测交试验(孟德尔遗传定律一、二),根据后代的表现,才能推知高茎豌豆的基因型是DD还是Dd。以高茎豌豆与纯种矮茎豌豆杂交,如果测交后代都是高茎豌豆,便可推知它的亲本的基因型是DD;反之如果测交后代中高茎和矮茎各占一半,那就证明它的亲本的基因型是Dd。