胆总管囊肿术后的寿命还需要根据术前是否出现严重合并症,手术的时机,以及术后是否出现严重并发症来决定。胆总管囊肿目前的手术治疗方式较为成熟,也较为安全,大部分患者手术以后可以获得长期生存,部分患者还可以类似正常人群的生存期,可以达到30年、40年,甚至更长。目前研究已发现,手术越早,效果越好,儿童期进行手术可以减少术后并发症的发生。但是如果胆总管囊肿已经出现反复发作的胆管炎,甚至引起肝硬化或者出现胆总管癌变,这时进行手术一方面出现术后并发症可能性增大,甚至有可能需要多次手术处理。另一方面癌变后进行手术,会明显影响生存期,5年生存率不足30%。