进行输尿管镜手术患者出现后遗症,即并发症或手术合并症,若患者输尿管镜手术顺利,一般不会留下后遗症。若不慎出现后遗症,则可能结局较差,如成功输尿管镜手术将结石取净后,患者出现继发性泌尿系统感染,甚至高热引起感染性休克,此类情况多为患者原来存在感染性结石或本身严重感染有关。因此,临床上需注意早期患者是否出现继发感染情况。远期常见并发症为无输尿管狭窄,一般与输尿管镜手术无关。结石长期刺激可引起输尿管息肉或瘢痕形成,手术取出输尿管结石后结石因素去除,但输尿管本身瘢痕形成,可造成输尿管狭窄引起肾积水。因此,远期需注意有无肾积水病变。