1949年航道长1249公里,其中常年通航里程仅268公里。50年代,佛子岭、梅山、响洪甸、磨子潭、龙河口水库和淠史杭沟通综合利用工程相继建成后,淠河、史河、杭埠河,先后断航。1966年以后,增辟淠史杭人工渠和水库航道977公里。1970年,区内航道长1512里,其中通航里程652公里。1985年,航道减到1029公里,其中常年通航里程391公里。至2013年,境内有7条较大河流,水运通航里程1029公里,常年可通航50—100吨级轮驳船。