如果怀疑特殊的细菌或者病原菌的感染,也可以通过在支气管镜下做灌洗,取出深部的肺泡灌洗液,做病原学检查。包括细菌、结核、真菌等相关的微生物鉴定来知道到底属于哪一种病原微生物感染导致的疾病,从而针对性地选择抗生素的治疗。除了检查方面的作用以外,支气管镜有一些治疗的价值,可以通支气管镜治疗的疾病。目前有尘肺、肺泡蛋白沉积症,还有重症的支气管哮喘的患者,如果在药物控制没有办法情况下,可以做支气管镜下热成形术。这都是近几年来发展比较好的一些新的技术,而且是微创的技术,也给广大的患者带来了更多的选择。