目的对引起聊城地区手足口病(HFMD)流行的肠道病毒CVA16进行生物学分析,掌握其基因特征,为聊城地区手足口病的防控提供病原学资料。方法对2010~2013年聊城市各辖区采集手足口病患儿标本采用Real-time PCR法检测肠道病毒CVA16,用人横纹肌瘤(RD)细胞对核酸检测阳性标本进行病毒分离,对分离到的CVA16病毒分离株采用RT-PCR方法进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar和MEGA 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树。结果 2010~2013年聊城市各辖区共送检手足口病标本862份,639份标本检测为通用肠道病毒核酸阳性,其中CVA16阳性标本181份,分离到109株毒株;对毒株进行基因序列分析显示,2010~2013年聊城市流行的CVA16病毒株为B1基因型,2010和2011年为B1a和B1b两种基因亚型共循环,2012和2013年为B1b型,不同毒株VP1区基因序列在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为91.0%~97.0%和98.3%~100%,与近源的亚型代表株相比,聊城市优势毒株的氨基酸变异一般发生在VP1第23位(L→M(本文共计6页)......[继续阅读本文]