截至2016年4月,学校设置有14个学院,开设54个本科专业。院系设置玉溪师范学院文学院玉溪师范学院商学院玉溪师范学院外国语学院玉溪师范学院体育学院玉溪师范学院数学与信息技术学院玉溪师范学院教师教育学院玉溪师范学院物理与电子工程学院玉溪师范学院法学院玉溪师范学院美术学院玉溪师范学院音乐学院玉溪师范学院国际文化学院玉溪师范学院继续教育中心、高等职业技术学院专业设置院系专业学制商学院国际经济与贸易4信息管理与信息系统(高职本科)4旅游管理(高职本科)4文学院财务管理4汉语言文学4汉语国际教育4新闻学4外国语学院英语4泰语4数学与信息技术学院数学与应用数学4信息与计算科学4计算机科学与技术4信息管理与信息系统4教育技术学4体育学院体育学类4体育教育(*五年制转段)2(专科)资源环境学院化学4应用化学4生物科学4地理科学4环境科学4土地资源管理4人文地理与城乡规划4应用生物科学4教育学院小学教育4学前教育4物理与电子工程学院物理学4电子信息工程4通信工程4电气工程及其自动化4自动化4法学院法学4社会工作4思想政治教育4美术学院美术学类4设计学类4音乐学院音乐学4据学校官网2019年3月显示,学校现有省级高校一流学科1个(美术学),省级二类重点学科3 个(环境化学、人文地理学、环境科学与工程),省级重点培育学科1个(数学),省级硕士授权点建设学科3 个(美术学、体育学、化学),初步形成了学科建设引领专业发展的趋势。