医院拥有一批老一辈著名学术专家和保健专家:普外科专家吴蔚然 教授(名誉院长)、心血管病专家钱贻简教授(名誉院长)、中医名家李辅仁教授、神经内科专家王新德教授、许贤豪教授、蒋景文教授、口腔医学专家韩宗琦教授、栾文民教授、骨科专家黄公怡教授、放射学专家李果珍教授、核医学专家屈婉莹教授等。还拥有一批中青年学术带头人和技术骨干,在医院的学科建设中发挥着重要作用。为了更好地发挥北京医院专家优势和专科特色,医院先后成立了特需医疗部,成立了多个研究治疗中心,有高血压心血管病诊疗中心、帕金森病椎体外系诊疗中心、神经免疫疾病和肌病诊疗中心、脑认知研究中心、关节外科诊疗中心、瑞东糖尿病中西医结合研治中心、瑞尔种植牙研究中心、乳腺疾病诊疗中心、肿瘤治疗中心、疑难病诊疗和会诊中心、疼痛治疗中心等。中心由著名专家出诊,为患者进行诊断并提供周全的治疗方案。