人手工操作失误的可能性是存在的。
我不知道这个系统具体的操作细节,但会不会有这样的可能性,就是您两人同行,其中一个是对的另一个乘机人的信息是错的。
办check in的时候工作人员碰巧拿的是你同行人的护照,然后看到订单上二人同行就一起办了(而没有核对你的姓名)。
过安检的时候就应该是工作人员开小差了。