截至2015年6月,南平市站为中型站,采用线侧平式布局及上进下出的组织流线;主体建筑地上三层、地下一层,采用钢筋混凝土框架结构,候车大厅屋盖为钢网架结构,雨棚采用有站台柱钢结构、现浇钢筋混凝土组合屋盖。售票区位于左侧的就是人工售票区;候车大厅中,有安检设备,上下两层的候车座位,2个检票区中通往站台的检票闸机。截至2015年12月,南平市站站前广场北侧武夷客运总站,枢纽站主站房一层面积达到1.4万平方米,可同时容纳5000人候车,设有15个人工售票窗口和5台自助售票取票机。