桉树因为桉树的经济价值与栽植成活率较高,在中国南方被大量种植,使得当地植物种类趋于单一化,打破了当地原有的生态平衡。此外,桉树本身带有的挥发性芳香油有驱虫作用,虽有经济价值,但会破壞种植地区生物链,造成鸟类等生物数量减少。不过这些问题主要源自于人工造林的方式。在中国,人工林多为单一树种的纯林,并且在造林前常通过砍伐原有树木、炼山烧山、施用除草剂等方式除去原有物种,使得生物多样性遭到破坏,虫害和火灾易于发生。桉树人工林所面临的问题是各类人工林同样面临的问题。