靶向治疗前需要进行基因检测,查找突变的基因,从而选择合适的药物。但是在基因检测报告上,不仅仅有基因突变的类型,还有一项重要的参考项目: 突变丰度 。 基因突变丰度是什么呢?丰度值的高低有统一标准吗?丰度值高好还是低好呢?想知道这些问题,一起看下今天的文章吧。 1 基因突变丰度是什么? 拿到一份基因检测的报告,我们常常可以看到一项参考数值:丰度,这个数据令很多病友不解,“丰度”究竟是什么呢?以肺癌中最常见的EGFR突变为例: “丰度”可以简要理解为 EGFR突变频率占总的DNA中的浓度 ,也有学者将丰度定义为 EGFR突变和野生型拷贝的比值 ,目前没有明确的定义。 2 为什么不同的患者突变丰度不同? 不同的患者基因检测的突变丰度会有很大的差异,这种差异主要与 肿瘤异质性 相关,过去我们认为同一个体中肿瘤细胞是相同的,基因相同、空间结构也相同;然而,随着检测技术逐渐精准化,我们才发现 同一份样本组织中,肿瘤细胞的基因、蛋白等各个结构并不一致 。 这种特征更通俗而言,可以用一句古语表达 “一母生九子,九子各不同” ,原来定居的肿瘤细胞不断演变出不同的后代。同一部位肿瘤会产生不同的基因表达,不同部位的肿瘤表达又有可能出现新的改变,不同人之间又会有区别, 从 宏 观 上看 是 人和人 不同, 微观 上看 肿瘤和肿瘤 也不同。 也就造成了不同的患者即使具有相同的基因突变,彼此之间突变的丰度也会有所不同,进而表现为对于同一种药物的反应也不同。 3 高、低丰度判断标准 早期,丰度高低的定义与 基因检测方法敏感性 有关,如 直接测序法 需要 EGFR突变频率 达到 20%-30% 才能发现,而 ARMS检测 只需要 EGFR突变频率 达到 1% 即可检测到。只要检测到突变即为 高丰度 。但这种定义过于笼统化,不具有区分性。 但目前对于基因检测的丰度高低值判断仍旧没有统一的区间标准。 不同的测序方法 、 不同的检测公司 会有不同的数值设定。 4 基因突变丰度高可能提示TKI治疗效果好 有中国学者发现 EGFR突变丰度可以预测EGFR- TKI治疗晚期非小细胞肺癌的疗效 。研究选取了100个样本,其中有51例EGFR突变患者丰度较高,18例EGFR突变患者丰度较低,31例患者携带野生型EGFR。 将这100例患者同时进行 直接DNA测序 和 ARMS检测 , 两种方法检测均为阳性则为EGFR突变 高丰度 ; ARMS检测阳性、直接DNA测序为阴性则为 低丰度 ; 二者均为阴性则为携带 野生型EGFR 。 所有患者均接受吉非替尼治疗,检测标本肿瘤细胞超过50%。