1、体格检查:应按序全面检查,有无黄疸,以确定或排除肝胆疾病等;有无心脑血管病、甲状腺及胶原病之体征,以确立或排除胃肠外疾病所致消化不良,详细的腹部体查,可以找出是否具有肝、胆、胃、十二指肠等部位疾病的线索,从而做进一步检查。2、一般实验室检查:三大常规可发现有无尿糖、尿蛋白或粪潜血;血化验如血糖、BUN、电解质亦很重要。必要时查肝功能、肝炎及肿瘤标记物。3、特殊检查:胃镜、X线检查、胃液分析、超声检查、CT或MRI,心电图ECG检查;食管pH测定、胃排空试验、胃电图、十二指肠、胃反流试验(钡餐或核素法查)、胃、十二指肠测压、内镜等,可根据病人病史、体查、实验室检查之线索选择一种或几种特殊检查,以确定消化不良系何器质性病变抑或FD。