咖啡长期喝的副作用有,肠胃疾病,因为咖啡里面的一些成分会使患者的胃里面的胃酸分泌过多,甚至还会刺激到胃黏膜。如果喝得过多或者是长期喝,是会导致出现胃溃疡,尤其是空腹喝咖啡的时候,对胃的损伤是最大的。如果本身就有胃病或者是肠胃比较敏感,那么喝咖啡是会导致,加重病情的。