1932年闸北堂毁于日本侵略者的炮火中。1936年重建,1937年8月13日,闸北堂再次毁于日本帝国主义的炮火中,直至1947年重新建造。
新中国诞生后,闸北堂基督教信徒参加基督教“三自”爱国运动,实现了梦寐以求的教会自立。1958年,闸北区基督教不同宗派的教会实施联合,境内16处教堂合并于闸北堂,实现中国教会的合一。
一段时间,教会活动被迫停止,闸北堂被工厂占用。1981年下半年教会收回闸北堂,经过整修于1982年7月复堂。1987年10月又新修建了小礼堂及办公楼。1996年,为满足彭浦地区基督教信徒的宗教需求,又在临汾路1555号建造了闸北堂分堂“灵泉堂”。
闸北堂百余年的历程伴随着国家和民族的兴衰,与国家和民族的命运休戚相关。
上海市基督教闸北堂创建120周年感恩礼拜,于2008年11月16日在修缮一新的闸北堂隆重举行。
目前,城市基督教堂建筑普遍高档,而县、乡镇、村级基督教堂基础设施相差较大。基督教堂逐渐成为人们旅游、休闲之地。教堂管理要做好“爱国爱教、知法守法、团结稳定、管理规范、活动有序、教风端庄、安全整洁、服务社会”八个方面的工作,为构建平安中国、和谐教堂作出努力。