由于谷氨酰转肽酶在肝内主要存在于肝内胆管上皮和肝细胞浆中,肝外胆管和肝内梗阻时,就会造成谷氨酰转肽酶排泄受阻,随胆汁返流入血,致使血清谷氨酰转肽酶异常除了肝脏外,体内如肾、肺、睾丸、心、脑、肌肉也都含有谷氨酰转肽酶,因此当肾盂肾炎、大叶性肺炎、乙型脑炎、心肌炎、胆囊炎、血吸虫病等,都会造成谷氨酰转肽酶的异常。药物过敏,以及药源性或中毒性肝损害都能够造成谷氨酰转肽酶异常的。患有胆囊及胰腺疾病、胆管阻塞,因为谷氨酰转肽酶是从胆管排泄的,以上疾病也可导致谷氨酰转肽酶异常。