兰州新区下辖中川园区、秦川园区、西岔园区三个正县级行政管理区。三区管辖永登、皋兰两县中川镇、秦川镇、上川镇、树屏镇、西岔镇和水阜乡6个乡镇,73个行政村。对原永登县中川镇、秦川镇、皋兰县西岔镇进行托管。