输尿管囊肿一般在前期没有比较明显的临床症状。但是随着囊肿的逐渐增大,囊肿会阻塞输尿管,引起排尿不畅,会导致上尿路的积水。此时,病人大多会有腰部的胀痛感。一般囊肿阻塞输尿管也会引起尿路梗阻,而此时尿路梗阻会继发性的引起尿路感染。这时候就可能会出现排尿不畅、尿流中断、排尿困难、尿潴留、尿路结石等。如果再严重,甚至还会出现血尿。