1946年1月16日,内蒙古东部地区的上层王公,召开了东蒙古人民代表大会,宣告成立东蒙古人民自治政府。这个政府由三种不同政治倾向的人组成。一部分上层分子,依靠国民党政权,力图把自治运动限制在南京国民政府许可的范围内;另一部分较进步的上层分子,愿意接受中国共产党的领导,反对国民党统治,实现真正的人民民主和民族平等。第三种倾向的居多数,他们反对国民党的统治,又害怕自治运动的发展影响自身的地位,幻想走改良主义道路。东蒙古自治政府在它的施政纲领中提出了实行民族自治,打破封建特权制度,提倡男女平等,发展工业,保护和奖励私人工商业等政策,然而三种政治力量对这些政策的理解却是各不相同的。内蒙古西部自治运动的领导权在中共掌握之中,内蒙古东部自治运动则掌握在封建上层分子手中,其内部又意见分歧,矛盾重重。统一东西部自治运动,把内蒙古自治运动引向中共领导的正确道路,就成为内蒙古自治运动联合会成立后的当务之急。