惠阳区辖原县级惠阳市的淡水、永湖、良井、平潭、沙田、霞涌、澳头、秋长、新圩、镇隆等10个镇。区人民政府驻淡水镇金惠大道。原惠阳市所辖的陈江、潼湖、潼桥、沥林、水口、马安、横沥、矮陂、芦洲、大岚等10个镇划归惠州市惠城区管辖。辖10个镇(淡水、永湖、良井、平潭、沙田、霞涌、澳头、秋长、新圩、镇隆)。
2003年6月撤市设区,实际管辖淡水、秋长2个街道办,新墟、镇隆、沙田、永湖、良井、平潭等6个镇和惠阳经济开发区,102个行政村,区域总面积915.54平方公里,全区常住人口55.80万人,户籍人口35.33万人,惠阳中心城区由淡水、秋长、沙田和经济开发区组成,规划范围约160平方公里,新墟、镇隆、永湖、良井、平潭5个镇为独立镇。
2005年12月31日,辖4个街道(淡水、霞涌、澳头、秋长)、6个镇(永湖良井平潭沙田新圩镇隆)。
2006年4月28日,惠阳区淡水镇、秋长镇两镇举行撤镇设街道办事处挂牌仪式。(原惠阳地区的内容详见:惠阳地区[6])
惠阳县的县城,因建置和历史原因多次变迁。东晋时代的欣乐县、酉平县,南朝宋的安怀县,南朝齐的怀安县等古县城原址不详。建归善县初无县城,移至城东白鹤峰(今惠阳卫生学校处),南汉迁至惠州府城,明朝初由河南岸(今惠城区河南岸镇)迁回白鹤峰,明永乐年间又迁回府城。明万历六年(1578)迁入东平,将民城变成县城。建国初,县城设在淡水镇,1950年4月县城迁回惠州镇。1990年3月县城再次迁回淡水镇。新县城淡水镇经过几年的建设,至1994年,总面积83平方公里,城区面积18平方公里,辖有拾围、新桥、桥背、土湖、洋纳、古屋、石桥、淡环、东华等9个管理区和万顺、东风、张屋、前进、桥东、河背、松岭、上塘、上圩、南四、坝尾、排坊、草洋、司前、红星等15个居民委员会,有居民83409人。