1778年1月底,与弗里多林和阿罗伊西亚·韦伯去基尔希海姆波兰登宫廷;3月23日,到达巴黎,创作《D大调第三十一(“巴黎”)交响曲》(K.297);7月3日,莫扎特的母亲在巴黎去世;9月26日,离开巴黎返回萨尔茨堡,途经斯特拉斯堡、曼海姆、凯泽斯劳滕和慕尼黑。1779年1月中旬,抵达萨尔茨堡;1月17日,被任命为萨尔茨堡宫廷管风琴师。1780年11月,独自去慕尼黑。1781年1月29日,正歌剧《克里特王伊多梅纽斯》(K.366)在慕尼黑首演,父亲和姐姐也到慕尼黑观看了演出;3月16日,应萨尔茨堡科洛雷多大主教之命到达维也纳,并与大主教发生争吵;5月初,迁居到契齐琳·韦伯家;6月8日,莫扎特辞去萨尔茨堡的职务。1782年4月开始,参加男爵斯维腾的音乐小组(研究巴赫、亨德尔);7月16日,歌剧《后宫诱逃》(K.384)在维也纳首演;8月4日,莫扎特康斯坦策·韦伯结婚。1783年7月底,与康斯坦策一同前往萨尔茨堡看望父亲;10月30日,在返程途中抵达林茨,并创作《C大调第三十六(“林茨”)交响曲》(K.425);11月底,回到维也纳。1784年,参与多场音乐会演出;12月14日,加入维也纳共济会“慈善会”。1785年,签订多场音乐会合约;同年,父亲利奥波德来访维也纳;同年,完成题献给作曲家约瑟夫·海顿的《六首弦乐四重奏》。1786年5月1日,歌剧《费加罗的婚礼》(K.492)在维也纳首演。1787年1月8日至月中,第一次去布拉格,并举行了《D大调第三十八(“布拉格”)交响曲》(K.504)的首演;10月1日至11月中旬,第二次去布拉格;10月29日,歌剧《唐·璜》在布拉格首演;12月7日,被任命为奥匈帝国宫廷王室乐师。1788年,创作了《降E大调第三十九交响曲》《g小调第四十交响曲》《C大调第四十一(“朱庇特”)交响曲》。1789年4月8日,与K.利希诺夫斯基去柏林,途经布拉格、德累斯顿、莱比锡,来到波茨坦。1790年1月26日,歌剧《女人心》(K.588)在维也纳首演;9月,应邀去美因河畔法兰克福参加利奥波德二世的加冕礼,去时经美因茨,返程经曼海姆与慕尼黑。1791年5月9日,被确定为圣·斯特凡大教堂乐队副乐长(无薪俸);8月底至9月中,去布拉格;9月6日,歌剧《狄托的仁慈》(K.621)在布拉格首演;9月30日,歌剧《魔笛》在席卡内德租用的、处于维登城关的“自由之所”剧院首演;同年,创作了《安魂曲》,未完成;11月20日,卧病不起;12月5日,去世;12月6日,根据死亡登记簿的记载,被藏于维也纳圣·马克斯墓地。1862年,莫扎特所创作的六百多首音乐作品被路德维希·冯·克歇尔按照年份列举和编号整理成作品编目,后来又被阿尔弗雷德·爱因斯坦等人重新编定,但“克歇尔”和“K”成为了检索莫扎特的通用编号。