东京都大致上分为东京特别区(东京23区,也就是旧东京市所属范围)、多摩地方,以及由伊豆诸岛与小笠原诸岛等离岛所组成的岛屿区等三个地域。东京和东京都是从属关系,东京都的范围比东京大,就像日本的县下面有很多市一样,只是叫法不一样。
京都就跟东京没关系了,京都是一个市。
日本的区域划分是按都道府县划分的,都就是东京都,府就是大阪府和京都府。
详细情况去维基百科查吧,很详细。