题主你想说的到底是分公司(对应总公司),还是子公司(对应母公司)?
如果是子公司,那么是不行的,《公司法》规定,子公司具有法人资格,独立承担民事责任,子公司中标这一经济活动是独立于母公司的,母公司不能代替子公司开具发票。子公司如果只是小规模纳税人,不能独立开具增值税专用发票,可以凭合同和合作方相关业务证明,到当地税局代开增值税发票。
如果是分公司,《公司法》规定,分公司不具有法人资格,不独立承担民事责任。因此分公司参与投标活动需要活动总公司授权,该经济活动最终的民事责任由总公司承担,分公司在受权的前提下可以总公司名义订立中标合同,开具增值税专用发票。