南投县在明郑时期属天兴县(注:今台南市以北均属之),后属北路安抚司。康熙二十二年(1683年)隶属于福建省台湾府诸罗县。雍正元年(1723年)增设彰化县,本县隶属之。至乾隆二十四年(1759年)正式设县丞。光绪十三年(1887年)福建、台湾分治,台湾正式改制为台湾省,这时的南投行政区属台湾府台湾县,县丞驻南投。同时云林县衙设在竹山,管辖云林县。
1894年(光绪二十年)甲午战争,清廷战败,遂于第二年(1895年)将台、澎割让日本,日本殖民统治期间几经改制后,南投行政区隶属台中州,分设南投郡、竹山郡、新高郡、能高郡。1945年日本战败,战后初期本县仍属台中县辖。
1950年10月台湾当局实施地方自治,调整全省行政区,于是南投自台中县划出单独设县,并于是年10月21日设立南投县政府,此为南投县之诞生。县治设于南投镇。
行政区划
1981年12月25日