澳门特区海关组织架构包括领导层、行动管理厅、口岸监察厅、知识产权厅、海上监察厅、资讯通讯厅、行政财政厅、内部审查办公室等。澳门特区海关于2001年11月1日正式运作,11月6日举行成立典礼及海关大楼揭幕礼。每年11月6日为海关成立纪念日。澳门海关海上监察厅负责澳门习惯水域的巡逻工作,透过与广东省公安边防总队和广东省海警总队的合作和联系,打击偷渡和走私活动。海关船队有巡逻船9艘及巡逻快艇22艘。1623年葡萄牙向澳门派驻第一支部队,1974年葡萄牙发生4.25革命,葡新政府宣布放弃殖民主义,承认澳门是中国的领土,1975年底,驻澳门葡军全部撤离。葡军撤离后,在原驻澳门葡军司令部的基础上,成立了既负责澳门防务也负责维持社会治安的澳门保安部队,并由葡军现役军官负责组建保安部队的上层机构和各个分支单位,1999年底,最后一批在澳门担任公职的葡军军人撤离澳门。