据长江委发布的水资源公报,2011年共有342.1亿吨工业废水和城市污水排入长江流域河道,约占长江入海水量(近1亿吨)的4%。全流域河流水质劣于Ⅲ类的河长占总评价河长(56701.6千米)的29.7%,主要超标项目为氨氮、总磷、五日生化需氧量、高锰酸盐指数和化学需氧量等。虽然劣Ⅲ类河长比例五年来逐步减少,但部分水体污染仍然十分严重。劣Ⅲ类水体主要集中在城市江段岸边和部分支流,全流域二级水资源区当中以太湖流域、湖口以下干流和乌江流域水质最差,达到Ⅲ类水质的河长比例分别仅为16.2%、36.2%和50.4%,其余地区均在65%以上。长江流域水质总体来看,干流好于支流、干流非汛期略好于汛期、支流汛期略好于非汛期。[27]