口蹄疫病毒在pH7.5~8.0环境中稳定,改变环境的酸碱度,就可杀灭病毒。传统的消毒方法有10~20克/升的氢氧化钠、10毫升/升的甲醛溶液、50~500克/升的碳酸盐等浸泡或喷洒污染物,在低温时可加入100克/升的氯化纳,这些消毒剂的腐蚀性和刺激性强。后来发展了氯制剂、碘制剂、酚制剂等消毒剂,20世纪70年代后过氧乙酸用于口蹄疫的消毒,它是一种酸性氧化剂,挥发性很强,可用于低温消毒。近年来,有机氯和有机酸广泛用于口蹄疫的消毒,这类消毒剂腐蚀性小,消毒效果好。