前排左四为英国代表亨利·麦克马洪
由于麦克马洪线并不是一条画在地理分界线上的边界,有多达7处河流穿过该地区,非常容易引起边界争议。英国此举给中印关系、中缅关系在日后留下极大隐患。因为印度和缅甸是获利方,所以印度、缅甸都觉得应该继承前殖民地疆界,认为麦克马洪线是既定的历史疆界;但中华人民共和国和之前的中华民国两政权都不承认其国际法效力。中国与英属印度双方一直存在争议,直至1947年印度独立和1949年中华人民共和国成立,这个边境问题一直都是悬而未决。1951年,印军率先发难,占领达旺,并且驱逐西藏地方官员,而达旺是第六世达赖喇嘛仓央嘉措出生地。到1953年,印度已经占了藏南全部9万平方公里的领土,而且直到今天,印度政府仍是第十四世达赖喇嘛及藏独的庇护者。由于印度政府强烈要求获得全部争议地区的主权,即使中国政府极力克制,但在印度方面一再咄咄逼人的情况下,最终导致1962年的中印边界战争。中国出兵反击,击破了各路印军,歼灭了印军3个旅,攻占了麦克马洪线以南的地区,印度不愧是跳舞的民族,战斗力极差,即使背后有美国及苏联的支持,还是战败。为了表达诚意,中国随后如对越反击战一样,单方面撤退到战争前的控制线,希望能开展和平边界谈判。但印度依然认定麦克马洪线就是既定国界,因此再度出兵占领藏南,导致目前印度实际控制麦克马洪线以南的藏南地区。1987年印度国会通过法令,正式在藏南这一中印争议地区建立阿鲁纳恰尔邦,并且仿效沙俄侵略东北之法,移民30万屯居在这个争议的边境上,这使得中国以后即使获得这些疆土,如何处理这些移民将会是个大麻烦。麦克马洪线途经许多高寒、偏僻的山区高原地带,这些地方中印双方都没有安排长期驻军,只是派遣巡逻队定期巡逻。虽然双方均尊重实际控制线并建立了沟通制度,但由修路或军队巡逻而引起的边境对峙和冲突也时有发生。
西段克什米尔区域最近这次爆发的冲突就发生在中印西段边境,古拉达克王国的地方。