SREBPs具有“碱性螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链”(basic helix-loop-helix-leucine zipper, bHLH-ZIP)结构,是bHLH-ZIP蛋白系列的一种。bHLH-ZIP蛋白包含一系列能特异性地和含E盒(e box, CANNTG)的DNA结合的蛋白质,例如:调节免疫球蛋白基因翻译的TFE3,致肿瘤蛋白Myc等。SREBPs虽是bHLH-ZIP蛋白中的一种,但又不同于其他的bHLH-ZIP蛋白。一方面,SREBPs分子量大,含1140个左右的氨基酸残基;另一方面,SREBPs不识别E盒(e box)而特定地识别SRE-1中直接重复的“CAC”序列。
迄今为止,发现有两种SREBPs。一种称SREBP-1,另一种称SREBP-2。SREBP-1又由于其mRNA剪接方式的不同,以三种功能上完全相同,组成上略有不同的形式大量存在,这三种形式的蛋白分别称为SREBP-1a、SREBP-1b、SREBP-1c。其中,SREBP-1a是SREBP-1的主要存在形式,故本文以SREBP-1a为例来描述SREBP-1。SREBP-1a含1147个氨基酸残基。分子量为125kD。至今,还没有发现SREBP-2存在多种不同的剪接后蛋白。SREBP-2含1141个氨基酸残基,分子量为121kD,与SREBP-1a之间有47%的同源性,含高度保守的bHLH-ZIP区,和SREBP-1a的bHLH-ZIP区有71%的一致性。但是SREBP-2含有不同SREBP-1a的谷氨酸富集区(在121个氨基酸残基中含多于27%的谷氨酸残基。SREBP-1a和SREBP-2的氨基酸序列和功能域结构之间的比较参见图7-10(A、B、C)。
图7-10 A:SREBP-2和SREBP-1a氨基酸序列之间的比较
“--”表示二者的相同部分
图7-10 B:SREBP-2和SREBP-1a的bHLH区(粗横线所示)的比较