锈菌的多型性指锈菌有多种不同类型的 孢子。典型的产生5种,即性孢子、 锈孢子、夏孢子、 冬孢子和 担孢子。由它们引起植物受害部产生的小疱点,有的为黄色至 铁锈色(夏孢子堆),有的为黑色(冬孢子堆),有的为白色或黄色( 性孢子器),有的则为黄色的疱状、杯状或毛状物( 锈孢子器)。这5种孢子发生在同一寄主植物上的称同宗寄主,如菜豆锈病菌。5种孢子发生在分类地位极不相近的两种植物上才能完成生活史的称转主寄主,如小麦秆锈病菌夏孢子和冬孢子发生在小麦上,性孢子和锈孢子发生在 小檗上。不典型的锈菌生活史内缺少一二种类型的 孢子,但也有同宗寄主与转主寄主之别,如梨锈病菌无夏孢子, 冬孢子发生在 桧柏上,性孢子及 锈孢子发生在梨上。 锈菌的专化性和 变异性表现在同一种锈菌对不同属的植物有不同的致病性,并可因此而分为不同的专化型。如为害禾谷类作物的禾柄锈菌,至少有9个专化型;为害 小麦的是其中一个专化型。各种专化型又根据对同一种作物不同品种的致病性,分为不同的 生理小种。为害小麦的禾柄锈菌已经鉴定出300多个生理小种。