保留7个乡镇不变:蓬东乡等。原舟白、县坝两乡合并设立舟白镇;原濯水镇、濯西乡、蒲花乡合并设立新的濯水镇;原金溪乡、平溪乡合并设立金溪镇;原黑溪乡、白合乡合并设立黑溪镇;原鹅池乡、学堂乡合并设立鹅池镇;原黄溪乡、新民乡合并设立黄溪镇;原南海乡、后坝乡合并设立小南海镇;原黎水、新花两乡合并设立黎水镇;邻鄂乡改为邻鄂镇;原西泡乡并入沙坝乡;原早化乡并入金洞乡;原杨柳乡、新安乡并入水市乡;原寨子乡并入冯家镇;原官庄乡并入马喇镇;原梨弯乡并入两河镇。2005年,黔江区辖3个街道、15个镇、12个乡:城东街道、城南街道、城西街道、两河镇、石会镇、黑溪镇、黄溪镇、黎水镇、金溪镇、马喇镇、濯水镇、石家镇、鹅池镇、正阳镇、舟白镇、小南海镇、冯家镇、邻鄂镇、中塘乡、蓬东乡、沙坝乡、白石乡、杉岭乡、太极乡、水田乡、白土乡、金洞乡、五里乡、水市乡、新华乡。2007年6月11日,黔江区将两河镇更名为阿蓬江镇,其管辖区域和镇政府驻地不变。调整后,黔江区辖3个街道、15个镇、12个乡:城东街道、城南街道、城西街道、正阳镇、舟白镇、小南海镇、冯家镇、邻鄂镇、阿蓬江镇、石会镇、黑溪镇、黄溪镇、黎水镇、金溪镇、马喇镇、濯水镇、石家镇、鹅池镇、中塘乡、蓬东乡、沙坝乡、白石乡、杉岭乡、太极乡、水田乡、白土乡、金洞乡、五里乡、水市乡、新华乡。2009年,黔江区撤销舟白镇、正阳镇、冯家镇,设立舟白街道、正阳街道、冯家街道。调整后,黔江区辖6个街道、12个镇、12个乡:城东街道、城南街道、城西街道、舟白街道、正阳街道、冯家街道、小南海镇、邻鄂镇、阿蓬江镇、石会镇、黑溪镇、黄溪镇、黎水镇、金溪镇、马喇镇、濯水镇、石家镇、鹅池镇、中塘乡、蓬东乡、沙坝乡、白石乡、杉岭乡、太极乡、水田乡、白土乡、金洞乡、五里乡、水市乡、新华乡。