当清军两千多人抵达朝鲜时,日本参照1882年《济物浦条约》,也以保护日商财产生命及公使馆为名向朝鲜派兵,而且规模巨大,持续不断。中方发现苗头不对,动议中日两国同时撤兵。但日本有备而来,根本不再理睬中国动议。日本此时目标就是要借这个机会大打出手,一举驱除中国在朝鲜的势力。
东学党起义平息后,日军并没有在朝鲜继续留驻的理由,朝鲜政府也希望中日两国尽快撤军。但日人此时节外生枝,提议中日两国政府携手共同改革朝鲜内政,以避免东学党之类事件再次发生。日本清楚中国政府不会答应这样的要求,因为这意味着中国承认朝鲜不再是自己的单一属国,承认日本对朝鲜拥有相当控制权。