南京财经大学在武书连编制的《中国大学评价》中得排名为:2009年中国大学各学科100强:(南财)经济学33管理学592015中国大学经济学最佳专业排行榜100强2015中国大学经济学四星级以上专业排行榜2016年6月14日,艾瑞深中国校友会网《2016中国大学评价研究报告》公布2016中国大学最佳专业排行榜800强,南京财经大学排名第326。2016年06月27日,2016中国大学教师水平排行榜公布,南京财经大学排名第279位。2018年02月26日,世界大学学术排名(ARWU)发布2018“中国最好大学排名”,南京财经大学排名第115名。2018年7月,全国首次专业学位水平评估结果公布,南京财经大学的工商管理专业为B-,会计专业为C+。