阿富汗的河流大部分是内陆河,多注入沙漠和湖泊。主要河流有阿姆河、喀布尔河、赫尔曼德河和哈里河等。河水主要来源于雨雪。阿富汗矿藏资源丰富,但基本未开发。据估测,阿富汗的能矿资源价值超过3万亿美元。至2014年已发现1400多处矿藏,包括铁、络铁、铜、铅、锌、镍、锂、铍、金、银、白金、钯、滑石、大理石、重晶石、宝石和半宝石、盐、煤、铀、石油和天然气等。著名矿藏包括哈吉加克铁矿、艾娜克铜矿、巴米扬煤矿、赫拉特锂矿、阿姆达利亚油气田、阿富汗-塔吉克盆地油气田等。天然气储量约为1500亿立方米,煤矿储量约1亿吨。盐储量3亿吨,青金石储量1300吨,铁矿储量17亿吨,铜矿石储量5亿吨。因运输困难和资金缺乏,仅天然气、煤、盐、铬得到少量开采。(2016年)据阿方介绍,阿富汗煤炭储量大约超过4亿吨,铁矿储量约为100亿吨,铜金钼矿3000万吨、铜2000万吨、大理石300亿立方、天然气1.18万亿—19.15万亿立方米,石油3.91亿—35.6亿桶,凝析油气1.26亿—13.3亿桶。这些储量有待进一步勘探确认。