孢子纲的动物都是营寄生生活的,无运动器,或只在生活史的一定阶段以鞭毛或伪足为运动器,这可说明孢子虫与鞭毛虫和肉足虫的亲缘关系。孢子纲动物很多具有顶复合器(apical com-plex)结构,因此近年来有学者将具有顶复合器的孢子虫另列为顶复体门(Apicomplexa)(原孢子纲的微孢子虫、粘孢子虫也分别立为门)。顶复合器包括类锥体、极环、棒状体、微线体等结构。对这些胞器的功能还不很了解,有人认为类锥体、棒状体和微线体等与寄生虫侵入寄主细胞有关。营养方式为异养。生活史复杂,有无性世代与有性世代的两个世代的交替,这2个世代多数在2个寄主体内进行,无性世代在脊椎动物(或人)的体内,有性世代在无脊椎动物体内进行。也有些种类在同一寄主体内进行。