黄帝部落战胜合并炎帝部落期间,九黎部落一直在不断的袭扰。于是黄帝又率领自己强大的骑兵和战车部队迎战。由于九黎部落使用的是金属装备,战争初期,黄帝与蚩尤九战而九不胜。最后黄帝使用战鼓和鸣锣,使九黎部落慌乱并且崩溃。又在沙尘暴的掩护以及指南车的帮助下,在涿鹿(今河北省涿鹿县)击败并斩杀了蚩尤。这就是传说中著名的涿鹿之战。
九黎部落战败后也纷纷解体,大部分并入炎黄部落,融入华夏。一部分西逃形成古羌族,一部分南逃形成了苗族和瑶族。残留北方的九黎族人后期曾建立了两个黎国,一个在今山西长治县,商末被周文王所灭;另一个在今山东郓城县,后为晋国所灭,其子孙后以国名为姓,而姓黎;更多的黎人沦为奴隶,至西周时尚有黎民之称。