通常情况下,常见的肛瘘可四种分类方法,即按病变程度划分、按病变深浅划分、按内外口划分、按病理划分等。按病程程度划分,主要以单纯性肛瘘、复杂性肛瘘为主,其中单纯性肛瘘是针对一条瘘管,且内外口直通肛瘘;复杂性肛瘘是针对瘘管与外口在两条或者两条以上,但是内口为一个或者多个肛瘘。按病变深浅划分,由低位肛瘘与高位肛瘘组成,其中低位肛瘘针对瘘管管道处于外括肌深层之下的肛瘘;高位肛瘘针对瘘管导管处于外括肌深层之上,内口在齿线以上。按内外口划分,主要包括内盲瘘、外盲瘘以及内外瘘,其中内盲瘘指对于内口而外口没有的肛瘘;外盲瘘针对只有外口没有内口的肛瘘;内外瘘指针对内口、外口以及瘘管均有的肛瘘。