温凉湿润的海洋性季风气候,夏季凉爽,冬季寒冷,最热月8月平均气温北部10℃,南部17℃;最冷月2月平均气温-6~-7℃,最低气温-25℃。年降水量600~1000毫米,夏季稍多,约占年降水量的30~40%。受千岛寒流影响,太平洋侧较冷,持续多雾;对马暖流则使南部岛屿西侧温暖。冬季,受阿留申低压的吸引,气旋频繁过境,经常有暴风雪,有时一天降雪深度可达1.5米。河流短小湍急,水量丰富,秋季水位较高。湖泊主要为火口湖和湖。