伊莱在复活后发现爱莉克斯失踪才意识到之前G-man对他说的“意想不到的结局/Unforeseen Consequence”是什么意思。随后对戈登喊出经典的“快点醒来,戈登!”并气愤的告诉戈登:“她(爱莉克斯)不见了,那个混蛋(G-man)还有他那些不可预见的代价,我就知道会这么发展,如果让我逮到那个家伙,我一定会把他宰了!”随后阿狗出现给戈登带来了撬棍,“现在,又有活要干了”。玩家在结尾彩蛋中作为戈登·弗里曼重新拿上伊莱递给他的撬棍。此时游戏正式结束....《半衰期:爱莉克斯》结尾彩蛋明示了在不久的将来Valve将推出《半衰期2:第三章》或是《半衰期3》。打破不数3的格局,让我们一起期待撬棍经典武器,在事故发生后一部电梯前获得。(在BMS中改为卡在某个门上面)格洛克17半自动手枪(高清版为一把M9贝雷塔)17发9mm弹夹,备弹有250发,与9mmAR的弹药共用,半自动射击精准度高,全自动射击适合近距离战斗,右键射速快,精准度极差。SPAS-12霰弹枪可容纳8发散弹,备弹125发,副攻击可一次发射两发散弹,在多人游戏中更加实用。(细节:该散弹枪与防护服上显示的HUD不符,HUD上显示的是一把伊萨卡M37;在lambda核心顶部,一名科学家手里拿着把银色的散弹枪,那把是半衰期1测试版的SPAS-12)MP5冲锋枪+M203榴弹发射器(高清版为M4A1+M203)有着50发大容量弹夹,发射和手枪一样的9mm子弹,但是命中率很差,且威力较低,可以发射一枚触发式榴弹,榴弹备弹10坆。十字弓弩5发弩箭夹,备弩箭50坆,可开启瞄准镜,攻击力极强,但是有很大延迟,而且装弹夹很慢。手持蜂巢(又名“外星突击步枪”)可以自己不断产生“子弹”,就是自动回复弹药,最多8发,外星步兵标准装备,普通攻击射速较慢,但是有制导功能,副攻击射速快但是无法制导。激光拌雷可携带5颗激光拌雷,安置后无法拆除,一旦触及激光就爆炸,单人游戏中用处较小,还是多人游戏常用。可以装在墙上垫脚以到达比较难跳上去的地方。炸药包可携带5个遥控炸药包,可以当做手雷或拌雷使用。手雷可携带10颗手雷,手雷即使砸到敌人身上也能照成很低微的伤害,可以用来吸引藤怪注意力。RPG可以使用激光制导的火箭,5发备用火箭,主要用来对付鱼鹰,阿帕奇和海军陆战队的APC,主战坦克等。左轮(.357)左轮手枪,和别的游戏一样,高威力,高精准,子弹少,一次性容纳6发子弹,36发备弹,射速慢。T型光束粒子炮(高斯枪)使用贫铀作为能量,可携带100点电池,与胶子枪共用,左键不聚能直接攻击,右键可聚能,如果过量聚能的话会“漏电”伤害玩家,聚能后光束可穿墙,还可以“高斯跳”,多人游戏很常用的技巧。胶子炮可以将目标瞬间撕扯碎片,是次于高斯枪的半衰期1第二大神器,副攻击纯属装饰。蛇鲨可携带15只可爱的蛇鲨,扔出去可以吸引敌人注意力和攻击敌人,过一段时间就会爆炸,如果它们找不到目标,就会转回头攻击你。