柠檬树修剪的时期各不相同。在我国柠檬产区,柠檬修剪一年四季都可以进行,但修剪的重点和目的不同。冬、春季修剪,是柠檬采果后到第二年春季春梢萌发前进行的修剪。无冻害产区,可在采后结合果园清园进行、修剪宜早;有冻害产区,可在春季气温回升后至春梢萌发前进行修剪。需要更新的老树、衰弱树和重剪促梢的树,也可在春夏抽梢时回缩修剪。
生长期修剪,是在柠檬春梢抽发后至采果前的各项修剪。又分为夏季修剪和花期修剪等。夏季修剪以抹芽、摘心和短剪为主,主要目的是控制其枝梢的生长势,促进果实生长发育。花期主要是疏去部分无叶花枝,减少花量和养分消耗,达到保果的目的。生长期修剪要特别注意剪后在剪口处喷布杀菌剂消毒,否则容易引发流胶病等多种病害。

柠檬树修剪的注意事项: