波密县水资源十分丰富,除降水量和地下水外 ,主要河流年均流量31.5亿平方米,其中可开发装机总容量77万千瓦,并且多分布于峡谷,水头高,水流急,落差大,已开发利用4100千瓦。有草场面积3384平方公里,占总面积的20.14%,其中可利用草场2944平方公里,占87%,其中本县实际耕种53123亩。另外,裸岩,石砾占3550平方公里,其他占35.6平方公里。矿种有砂金、铁矿、水晶矿、石灰岩、石膏等40余种。野生动物80余种,其中被国家列为重点保护的动物的有獐子、梅花鹿、熊、罴、金丝猴、豹、羚羊、小熊猫、小獭、黑颈鹤等20余种。共400余种。其中高级食用菌松茸年产量80吨,50%已加工出口日本。中草药材资源如天麻、虫草、贝母、知母、党参、茯苓、大黄已部分开发利用。各种树木80余种,其中云杉、高山松、华山松、高山栎、柏树、杨树、桦树、樟树、椿树、乔松、铁杉、毛竹为常见的经济价值高的种类,原始森林中的云冷杉多数生长180年以上,树高70-80米,树胸径超过2米,一般单株蓄积量达30立方米以上。草地植物200余种,其中藜科、蔷薇科、豆科、龙胆科、菊科、乔本科、莎草科植物为草地主要植被,大部分为优质牧草。经济林木主要核桃、花椒、苹果、沙棘、葡萄、水蜜桃、漆树、毛树、毛桃等,都有利于进行开发利用。