很难弄清楚人为什么要睡觉的一个原因是,很难将睡眠完全隔离开来研究。睡眠剥夺是这方面研究的最常见的方法,但是剥夺动物的睡眠会破坏其许多其他的生物系统。很难说身体状况的改变只是因为睡眠不足导致的,而不是其他生物系统导致的。很难弄清楚人为什么要睡觉的另一个原因是大脑在睡眠的两个主要阶段可能做了两件不同的事情。人在睡眠时,会在“非快速眼动”(眼球没有快速转动)和“快速眼动”(眼球快速转动)。相比之下,大脑在“快速眼动”睡眠期间的电活动看起来很像一个人醒着的时候,只不过身体的肌肉像是瘫痪了。