2006年6月,北京大学软件与微电子学院通过了教育部组织的国家示范性软件学院的验收评估,综合排名第一。2007年1月北京大学软件与微电子学院通过了教育部组织的国家集成电路人才培养基地中期评估。“北京大学示范性软件学院建设” 于2004年获得北京大学教学成果一等奖、北京市教学成果一等奖,于2005年又获得高等教育国家级教学成果一等奖引。2011年国务院学位委员会下发了《关于下达工程博士专业学位授予单位名单的通知》(学位【2011】72号文件)。