截至2016年12月,昆明南站总建筑面积334736.5平方米。其中,站房建筑面积119998.6平方米,无站台柱雨棚77148平方米,进出站楼梯等构筑物2000.6平方米,出站层换乘空间69998.1平方米。昆明南站主要由四大部分组成,分别是:北雨棚、南雨棚、站房、西广场、东广场。其中,两个雨棚分别位于站房的左右两侧,雨棚下边是站台和铁轨;两个广场分别位于广场的前后;站房是昆明南站的主建筑。昆明南站共设32个检票口,144台检票进站闸机。