胚胎学上,透明隔源于原始终板,始于妊娠10一12周,其发育与胼胝体、前联合的发育有着复杂的联系。随着胼胝体的纵向生长,位于胼胝体与前联合之间的联合板进行性地伸展、变薄,在2个侧脑室之间形成一个膜状物,即透明隔的功能。透明隔的骨架组织中含有一定数量的胶质细胞,一些散在的神经元和神经纤维。这些神经纤维构成了海马和下丘脑之间的重要联系。透明隔是中继下丘脑到海马、杏仁核、缰核和脑干网状结构的内脏信息的相关中心及边缘系统到脑干网状结构的重要环路。