毛果芸香碱具有水溶和脂溶的双相溶解度,故其滴眼液的通透性良好。1%滴眼液滴眼后10~30min出现缩瞳作用,持续时间达4~8h以上。降眼压作用的达峰时间约为75min,持续4~14h(和浓度有关)。眼药膜降眼压作用的达峰时间为1.5~2h。食物可减少毛果芸香碱的吸收率和吸收范围。用于缓解口干的症状时,20min起效,单次使用作用持续3~5h,多次使用可持续10h以上。母体化合物的清除半衰期为0.76~1.35h。毛果芸香碱可能在神经元突触处失活,也很可能在血浆中失活。毛果芸香碱及其失活代谢物随尿排出。