1985年,中国国民党革命委员会广西壮族自治区委员会在广西邕宁县蒲庙镇创办邕江大学,获得专科学历教育的资格。1990年,邕江大学从邕宁县迁入南宁市北湖路石头岭。2009年7月,在南宁市委、市政府的支持下,南宁威宁投资集团有限责任公司与民革广西区委合作共办邕江大学。2010年,新校园在南宁五象新区开土动工。2011年,五象新区新校园建造完成,邕江大学校址从南宁市北湖路石头岭搬迁至南宁五象新区。2012年11月23日,教育部正式下文批准邕江大学升格为本科高校并更名为南宁学院。2013年1月,学院被教育部遴选为国家应用技术大学试点高校。6月,学院参与发起组建应用技术大学(学院)联盟,成为全国首批35个联盟成员与理事单位。10月,学院获教育部批准可面向港澳台地区招收本科生。12月,学院被教育部认定为非营利性民办高校并成为非营利性民办高校57个联盟成员之一。2014年3月,广西科技大学与学院签署对口支援协议。11月,学院获得“广西第二批动漫人才培养基地”命名与授牌。2015年4月,学院顺利获批成为“教育部-中兴通讯ICT产教融合创新基地”。2017年1月,广西自治区学位委员会同意学院新增为学士学位授权单位,同意交通运输、电气工程及其自动化、计算机科学与技术、工商管理、会计学等5个专业为学士学位授权点。