益生菌多为厌氧菌,不耐酸、高温(不能高于40度)和碱性环境,对外界环境极为敏感,在加工、运输、存储过程中稳定性差易失活,丧失功能。另外,益生菌若要对人体产生有益作用,必须先通过胃环境才能达到肠道,但在胃酸和胆汁的作用下,大部分益生菌会死亡,最终使得体内没有足够的益生菌发挥作用,达不到保健和治疗的目的,所以很多益生菌产品要求在饭前服用(饭前胃酸相对较少,饭后胃酸会增多)。为确保益生菌能抵抗胃酸而顺利到达肠道定殖,世界各顶级研究机构进行了大量的研究后认为,将益生菌进行微胶囊包埋是目前最有效的一种方法。