在形态计量学的研究中,首先是对样品质量要求较高,例如制片过程中组织的收缩、膨胀与挤压、切片厚度与方向,特别是切片染色技术,染色是使组织或细胞各成分能染成不同色泽而便于识别,提高待测成分图像的可测性及其内在组分的表达性,使待测成分的色彩和亮度明显清晰地区别于它的背景。采用常规染色、特殊染色以及免疫组织化学染色,可对不同着色的成分及反应物作形态定量测定;利用免疫组织化学和原位杂交技术使病灶染色,再作形态定量测量。其次是要找出特征结构参数或定量指标,可先检测组织或细胞的各种可测参数或根据待测成分的形态特点设计一些参数,再用统计学方法筛选出有用的参数作定量测定。