2013年1月,医院荣获“全国卫生系统先进集体”荣誉称号;2014—2018年,医院连续五年荣获“中国医疗机构最佳雇主”荣誉称号;2018年荣获“人文爱心医院”荣誉称号;2020年荣获浙江省人民政府质量创新奖,全国抗击新冠肺炎疫情先进集体等荣誉称号。2018年全国三级公立医院绩效考核国家监测考核结果排名,邵逸夫医院在全国2398家三级公立医院中居全国综合性医院第11名,进入全国参评医院仅有1%的A++序列;2019年度复旦大学医院管理研究所“中国医院综合排行榜”全国第78位,上升23位,科研学术得分8.28,位列全国第37位,上升64位,均为全国进步最快的医院。