植物神经紊乱是非器质性病变,在诊断植物神经紊乱时需要排除机体其它系统的器质性病变,因为植物神经紊乱涉及机体多个系统,如心血管系统、呼吸系统、消化系统、内分泌系统、代谢系统、泌尿生殖系统等,所以在诊断植物神经紊乱之前需要做相关的检查,如血常规生化全项的检查、头颅核磁共振、腹部的超声、腹部CT检查、胃肠镜检查、吹气试验检查以及心脏的彩超检查、24小时动态心电图检查,必要时行心脏的冠状动脉造影检查。排除器质性病变以后,必要的体格检查也需要进行,如卧立位试验检查、发汗试验、竖毛反射以及皮肤划痕试验,之后根据其临床典型的症状,如体位性低血压、胸闷、憋气、心慌、濒死感、胃痛、胃胀、呕吐,以及女子的月经不调、男子遗精、失眠、健忘、四肢麻木,伴随的症状有紧张、焦虑、恐惧等来确诊植物神经紊乱。