曾获兰州军区戍边先进个人、新疆军区优秀基层主官等奖项,荣立二等功1次、三等功5次。2015年获第19届“中国青年五四奖章”。2021年2月,中央军委授予祁发宝“卫国戍边英雄团长”荣誉称号。2021年5月,军队全国道德模范评选表彰活动组委会办公室公示为军队“第八届全国道德模范”候选人(新时代卫国戍边英雄群体成员)。2021年6月28日,党中央决定,授予祁发宝“全国优秀共产党员”称号。2021年7月,第八届全国道德模范候选人公示:祁发宝被评为敬业奉献模范候选人。