长期服用奥美拉唑肠溶胶囊有一定的副作用,其可以长期抑酸,从而刺激胃黏膜,甚至可以诱发胃息肉的出现,也可以诱导胃萎缩。所以,用药都是有一定的疗程,不能长期使用。