教育依据《社会态度调查报告》,包括同性恋者在内的性少数者平均教育程度略低于非性少数者。这可能是因为前者肄业、退学或辍学的比例高于非性少数者。同性恋者退学、肄业等可能与学校里的恐同欺凌(基于同性恋/双性恋恐惧心理而对同性恋/双性恋者施加的欺凌)有关,而恐同欺凌则常常导致学生出勤率下降、成绩退步甚至过早辍学。《教育部门应对恐同欺凌》显示,在我国香港地区,有42%的同性恋者、双性恋者和跨性别学生曾遭受过恐同欺凌。此外,基于性倾向和社会性别认同的欺凌常常被主流媒体忽视,学校当局也关注甚少。2016年,来自性别平权公益机构同语的一项针对包括同性恋者在内的性与性别少数学生的研究显示,有40.64%的学生曾遭遇过校园欺凌,形式包括被恐同言论攻击、被强行出柜(“出柜”意味着向外界公开自己的性倾向或性别认同)、被迫改变衣着打扮或言谈举止、被冷漠对待和被老师/同学性骚扰等。因校园欺凌而导致成绩下降学生的占22.96%,试图自杀的学生有8.71%,自残的学生有7.85%,对他人发起肢体或语言攻击的则有15.32%。在报告了曾收到欺凌的受访者中,仅有18.32%观察到有人公开支持性少数学生,而表示完全无人提供帮助的比例是19.32%,剩下的受访者则观察到有人私下支持性少数学生或不清楚情况 。《国别报告》显示,总体而言,中国的全面性教育仍比较薄弱。