13人是在2001年4月23日至6月29日之间到达美国的。抵达之后,他们立即分散到全美各地,一般居住在比较偏远的城郊,并且都改了英文名字。在随后的数个月时间里,他们主要在美国的8个州活动。上午8时46分,两架美国空军F-15鹰式战斗机从马萨诸塞州空军基地紧急升空前往拦截美国航空公司11次航班,但空军飞行员不知道美国航空公司11次航班的正确位置,东北防空司令部(NEADS)在接下来的数分钟设法确定有关飞机位置。纽约消防局对袭击做出反应是在上午8时46分,也就是第一架飞机撞击第一座世贸中心塔楼那一刻。纽约消防局第一消防大队大队长在附近街区目睹了第一次撞击,他也是第一位到达现场的指挥员。大约上午8时50分,他按照纽约市消防局的预案,在世贸中心第一座塔楼的大厅内设立了灭火指挥部。当电视转播镜头推近到世贸大楼一角时,滚滚浓烟中隐约可见求救者。大约上午9时,消防局长接管担任事故总指挥。因为不断掉下的残骸和其他安全因素,他将灭火指挥部从世贸中心1号塔楼大厅转移到西街对面的一处场所,一条8车道的高速公路。指挥员考虑到了塔楼可能会发生有限的、局部的倒塌,但没有想到它们会完全倒塌。灭火指挥部转移到西街后,仍有一些消防指挥员留在1号塔楼大厅内,组成了在建筑内进行灭火的战斗单位的灭火指挥部,他们留在大厅内是十分必要的,这样他们就可以利用一些重要的建筑系统,例如警报控制系统、电梯和通信系统。几分钟内,消防指挥员就决定集中力量进行营救和撤离。他们派遣消防队员进入楼内帮助数百名被困在电梯、楼梯间和房间内,以及因受伤而无法撤离的人员。他们还命令消防队员确定各层人员全部撤离。与此同时,紧急医疗服务组织指挥官也开始划定区域,集结救护车,对伤员进行鉴别归类、治疗并送往医院。紧急医疗服务现场指挥员助理在灭火指挥部中担任全部紧急医疗服务的指挥,向灭火指挥部报告情况。上午9时03分,第二架飞机撞击2号塔楼,指挥员们立即调集另外的消防分队,并从1号塔楼调派消防分队。随着动员升级,调度员命令所有回应的消防分队到世贸中心附近上级指挥员指定的集结地点报到。然而,当这些消防分队接近指定区域时,许多分队并没有到指定区域报到,而是直接进入两座塔楼大厅或事故区域的其他地点。结果,上级指挥员不能准确掌握所有消防分队的具体位置。另外,集结失败导致消防分队在进入塔楼大厅之前,不能得到必要的信息和准确方位。