HBeAg是乙肝患者传染性强弱的一个主要血清学指标,按理应该可以作为乙肝患者抗病毒疗效的观察指标,实际上也有很多人在这样做,但由于乙肝病毒基因组的前C区常易出现点突变,使得HBeAg表达的缺失,此时血清HBeAg测定为阴性,但病原体仍大量存在。因此,HBeAg也不能作为乙肝患者抗病毒疗效观察的指标。在乙肝两对半中,真正有定量测定价值的只有抗HBs,但这种测定也不是用于临床乙肝患者疗效观察,而是用于人群乙肝疫苗注射效果的判断,也就是说,当某人注射疫苗后,如外周血中抗HBs定量超过10mU/ml,则说明受免疫者具有对乙肝病毒免疫力,免疫力及持续时间与抗HBs含量高低应成正比。