《南极条约》第3条鼓励同对南极洲具有科学或技术兴趣的联合国专门机构及其他国际组织建立合作的工作关系。在签订《南极条约》时,气象观测是最主要的南极科研活动,在南极建立气象站能提高南半球远程天气预报的准确度。[8]协商国关于南极的知识有限,需要与专业的国际组织开展合作来认识南极,因此南极条约体系最先与联合国专门机构世界气象组织(World Meteorological Organization, WMO)建立合作关系。
尽管《南极条约》鼓励与联合国专门机构建立合作关系,但是在实践中协商国却极力排除联合国的参与。[9]