2008年5月15日:大量增发定期班车。2008年10月24日:因东部干线假日的运能严重不足,逢周五到周日时一日将增开4班次。2009年5月30日:由花莲开往台北的1069车次太鲁阁号,才出发没多久,就在丰川路段撞上疑似穿越铁轨的男子,男子当场死亡。2010年9月20日:1087车次南下太鲁阁号列车,从台中丰原站出发后不到3分钟,在丰南段撞上1名林姓女子,女子当场死亡。2010年12月22日起,新时刻表标示变更为太鲁阁列车。2011年10月10日:第282次由彰化往花莲的太鲁阁号在台中市圆通南路平交道,撞翻一辆闯越平交道载有大批冷冻鹅肉的货车,货车司机逃过一劫没受伤。2012年1月17日:第278次由田中开往花莲在埔心车站南方幸福水泥平交道撞上闯越平交道的砂石车,火车车头全毁,司机身亡,并导致假日班次只能以其他车种代替。