根据《个人所得税法》和《个人所得税实施条例》规定,职工工资薪金所得,扣除应有个人缴纳的社会保险费和住房公积金,减除费用3500元后,适用超额累进税率,缴纳个人所得税。职工应纳个人所得税税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数=(扣除三险一金后月收入-扣除标准3500元)×适用税率—速算扣除数。职工工资仅2000元,远未达到纳税起点,公司所谓代扣个人所得税,实际上是克扣劳动者工资为己有,劳动者可以向税务机关反映,可以向劳动监察投诉,也可以申请劳动争议仲裁维权。