由于肛门处有括约肌,其收缩能力比较强,不能强行插入,否则容易引起肛裂。不安全的肛交和其他不安全的性行为一样,有传播性病的风险,特别是艾滋病病毒。肛交即使是在双方没有性传播疾病的前提下进行也会带来一些健康上的风险。由于阴道自身会分泌润滑液来辅助性交,而肛门和直肠并不会自身分泌润滑液,一般这点可使用人体润滑剂、使用安全的道具或使用安全套来减低不适感。但是,直肠内衬的上皮黏膜组织极易在异物插入过程以及性交过程中的磨擦受到损伤,即使是在熟练的操作和正确与妥善使用辅助工具如润滑剂与安全套的情况下,无论是否有不舒适甚至疼痛的感觉,仍然会造成许多肉眼所看不见的小伤口.