肛瘘本身不是严重性疾病,不治疗的话有一部分病例基本保持原状,不好不坏呈静止状态,负责的肛瘘或炎性肠病合并肛瘘时会比较严重。1.症状反复,病灶可扩大蔓延:这种情况下可以使单纯肛瘘发展为复杂肛瘘,使低位肛瘘发展为高位肛瘘,从而增加手术的难度和创伤。2.导致直肠狭窄影响正常排便:肛瘘内口周围黏膜组织反复感染,炎性刺激可致炎性增生,呈隆起的条索,时间长了可引起肠腔的狭窄,造成排便困难。3.癌变:少数病程较长的复杂肛瘘或炎性肠病合并的肛瘘有一定的癌变概率。