维吾尔人的祖先是回纥人。回纥是突厥人的一支。突厥被唐朝灭亡后,突厥各部都纷纷西迁,在西迁过程中留下了很多突厥部落。唐代时期居住在西域的突厥部落主要包括回纥、葛逻禄、沙陀等。回纥就是今天维吾尔人的祖先。