6月30日
旅美棒球選手倪福德獲得球團通知升上美國職棒大聯盟，成為首位登上大聯盟的中華職棒本土球員。

6月29日
行政院審核縣市改制合併升格案，核定通過臺北縣、臺中市縣、高雄市縣升格為直轄市，臺南市縣亦因考量其為為台灣歷史文化重鎮，亦獲准升格為直轄市。中國時報自由時報
民進黨立院黨團召開座談會針對放寬美國牛肉進口規定表示：反對國民黨開放高狂牛病風險的帶骨美國牛肉進口，也質疑為何國民黨在民進黨執政時、反對民進黨政府開放不帶骨、30月齡內，相當安全的美國牛肉進口。[ 中國時報][ 自由時報]NOWnews
陳水扁寫了一封求救信給馬英九，信中重點在於希望法務部能重新考量，能放已承認做偽證的陳幸妤出國。不然陳幸妤會發瘋，或自殺，或帶著3個小孩一起死。吳淑珍：不知道，不要問我。總統府：未收到。王清峰：依法辦理。 胡忠信：是911恐嚇信才對！姚立明：兒福聯盟應積極介入瞭解，必要時應強制安置3個小孩。[ 中國時報]自由時報nownews
麥當勞因為油炸用油抽驗結果品質過低（起因於換油頻率過低、會造成高致癌性）而道歉。TVBS

6月28日

6月27日
第20屆金曲獎流行音樂類頒獎典禮於台北小巨蛋舉行，最佳國語專輯《不想放手》、最佳年度歌曲《稻香》、最佳國語男女歌手周杰倫、陳珊妮、最佳台語男女歌手翁立友、黃乙玲、最佳樂團五月天、最佳演唱組合南王姐妹花、最佳新人盧廣仲。中國時報自由時報

6月26日

6月25日
流行音樂之王 麥可傑克森逝世 享年50歲

6月24日

6月23日
共11個縣市提出的7件縣市改制合併升格案，內政部於晚間公佈審核結果。台中縣市、高雄市縣、臺北縣等5個縣市獲得通過，桃園、彰化、雲林嘉義等4個縣遭到駁回；台南縣市則因審查小組無法形成共識，將會同其他核准案件報請行政院核定。yam天空新聞─中央社１２３４
中研院陳建仁院士等人研究團隊的研究結果顯示，染上B型肝炎的婦女，懷孕生子會減少B肝的傷害。自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌143.74點／成交價：6197.47點／成交量：新台幣915.56億元

6月22日
行政院主計處公布上月失業率為5.82%，失業人數為63.3萬人，雙雙再創歷史新高。自由時報
台北地檢署偵辦前總統陳水扁家庭洗錢疑案，分別傳喚陳水扁長女陳幸妤、女婿趙建銘，以及陳水扁長子陳致中出庭，三人均坦承在特偵組偵辦期間作偽證，以換取檢方減少其刑。yam天空新聞─中央社１２３４
美國在台協會（AIT）位於台北市內湖的駐台辦事處新址，上午舉行揭示典禮，包括立法院院長王金平、行政院副院長邱正雄、台北市長郝龍斌等政商界人士皆到場與會。yam天空新聞─中央社
中央氣象局於上午8時30分解除輕度颱風蓮花的海上陸上颱風警報。yam天空新聞─中央社
今日加權股價指數收盤行情：
 上漲110.06點／成交價：6341.21點／成交量：新台幣955.45億元

6月21日
台北縣政府消保官楊舜惠會同衛生局人員，突擊檢查縣內七家大型連鎖速食餐廳，針對店家是否每天更換油炸油、以及油品中是否含有毒性物質進行稽查。自由時報

6月20日
中央氣象局於晚間11時30分發布輕度颱風蓮花的海上陸上颱風警報，陸上警戒區域為澎湖、金門，海上警戒區域為台灣海峽、巴士海峽及東沙島海面。自由時報

6月19日
中央氣象局於晚間8時30分發布輕度颱風蓮花的海上颱風警報，警戒區域為台灣海峽南部、巴士海峽及東沙島海面。yam天空新聞─中央社１２
中油依據浮動油價機制，傍晚宣布調漲汽柴油批售價格，明日凌晨零時起，各類汽油每公升調漲0.7元、柴油調漲0.9元。台塑石化隨後跟進，明日凌晨1時起，汽油每公升調漲0.7元，柴油每公升調漲0.9元。yam天空新聞─中央社１２
今日加權股價指數收盤行情：
 上漲86.62點／成交價：6231.15點／成交量：新台幣829.68億元

6月18日
南台灣於凌晨1時17分發生芮氏規模5.1有感地震，震央位於嘉義縣大埔地震站北偏東方22.4公里處，震源深度6.6公里，屬於淺層地震，最大震度為嘉義市5級。所幸各地無災情傳出。yam天空新聞─中央社
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌51.38點／成交價：6144.53點／成交量：新台幣949.18億元

6月17日
衛生署公布2008年十大死因排行榜，癌症連續27年名列榜首，排名第四及第九的肺炎及自殺標準化死亡率均較前年增加，其餘均減少。yam天空新聞─中央社１２
嫁到新竹縣寶山鄉沈家的大陸籍配偶文小娟，疑因不適應夫家生活等因素，五年前涉嫌毒死婆婆沈李勤妹未被發現，今年三、四月再向丈夫沈春爐的食物下毒，所幸沈姓男子大難不死，經由家屬追查後遭警方逮捕移送法辦。中國時報自由時報

6月16日
台鐵實施年度大改點，除縮短區間車行車時間外，也增加西部幹線直達列車及東部幹線、南迴線運能。yam天空新聞─中央社自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌4.75點／成交價：6220.81點／成交量：新台幣1092.17億元

6月15日
中國廣東省東莞市設廠投資的台商林玉騰、邵正吉甥舅遭員工殺害，凶嫌已遭當地公安逮捕。自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌222.67點／成交價：6225.56點／成交量：新台幣1126.33億元

6月14日
法務部調查局針對在臺北縣市31件銷售的素食進行檢測，驗出27件含有肉品成分，比例超過5成。民視

6月13日

6月12日
攸關國內再生能源產業發展的《再生能源發展條例》，正式在立法院院會中三讀通過。yam天空新聞─中央社１２３４
核三廠在下午發生廠區外圍的變壓器起火燃燒的意外，所幸無放射性物質外洩，也沒有人員傷亡，核三廠仍維持正常供電。這是核三廠自1980年啟用以來的第三次火警。yam天空新聞─中央社１２３
立法院院會三讀通過《國營國際機場園區股份有限公司設置條例》，准許交通部設立機場公司，並明文規定機場公司由政府獨資經營。yam天空新聞─中央社
立法院院會三讀通過通過《學校法人及其所屬私立學校教職員退休撫卹離職資遣條例》，未來私立學校教職員將可比照公立學校按月領退休金，估計國庫每年將支出新台幣16.2億元。yam天空新聞─中央社１２
中油依據浮動油價機制，傍晚宣布調漲汽柴油批售價格，明日凌晨零時起，各類汽油每公升調漲0.3元、柴油調漲0.2元。台塑石化隨後跟進，明日凌晨1時起，汽油每公升調漲0.3元，柴油每公升調漲0.2元。yam天空新聞─中央社１２
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌119.14點／成交價：6448.23點／成交量：新台幣1288.49億元

6月11日
行政院院會通過《所得稅法》修正草案，取消軍人及國中小教職人員薪資所得免稅的規定，若立法院如期審議過關，預計最快將在民國99年元旦起實施，估計影響約卅五萬人。中國時報自由時報
高鐵台北至板橋間路段，上午發生轉轍器故障的意外，台北至板橋段一度停駛達5小時，預估約2萬人次的旅客受到影響。自由時報
台鐵宣布自6月中旬起每週五和每週日增加一班北上半直達車自強號，行車時間3個半小時，6月30日前搭乘票價大優惠，台南到台北只要549元。自由時報

6月10日
馬英九總統與國民黨主席吳伯雄，下午在國民黨中常會後共同召開記者會，除了宣布吳伯雄將不續任黨主席外，並同時宣佈馬英九總統將參選下屆黨主席選舉。yam天空新聞─中央社１２
中央研究院地科所的研究團隊在英國自然期刊發表的論文指出，研究結果顯示，經常侵襲台灣的颱風會引發慢地震，釋放出斷層內累積的壓力，減少大地震發生的頻率。自由時報

6月9日
立法院院會三讀通過《臺灣地區與大陸地區人民關係條例》修正案，大幅鬆綁現行大陸籍配偶來台相關規定。大陸籍配偶依親居留階段即可在台工作，對於遺產繼承及繼承月退俸等權力也放寬，未來大陸籍配偶取得台灣身分證（投票權）時間將由八年縮短為六年，且過去在台團聚期間，可轉換併計居留期間，提早取得身分證。中國時報自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌213.63點／成交價：6414.39點／成交量：新台幣1591.16億元

6月8日
中央健康保險局總經理朱澤民，在未被告知的情形之下，遭到衛生署以「免除其職」名義撤換。yam天空新聞－中央社中國時報自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌228.72點／成交價：6628.02點／成交量：新台幣1473億元

6月7日
大都會客運一名陳姓司機，晚間駕駛270路公車行經台北市研究院路二段時，疑因為高速駕駛造成車輛失控，蛇行連撞2名婦人後撞進路旁攤販才停下，造成2名婦人不治身亡。中國時報自由時報

6月6日
外交部傍晚宣布，為了有效運用外交資源，將關閉駐約翰尼斯堡辦事處，駐箇郎總領事館，駐委內瑞拉、駐玻利維亞與駐孟加拉代表處等五個駐外館處。中國時報
今日加權股價指數收盤行情：
 上漲89.64點／成交價：6856.74點／成交量：新台幣943.35億元

6月5日
高雄捷運「公開辦理六標」弊案，高雄高分院二審宣判，認定不適用政府採購法，前工務局長吳孟德改依背信罪判處有期徒刑一年六月並減刑為九月，前捷運局長周禮良等六人獲判無罪。中國時報自由時報
攸關運動彩券盈餘使用的《運動彩券發行條例》在立法院院會三讀通過，未來運彩盈餘的10％提供社福支出，其餘的90％則將專供國內體育運動發展之用。yam天空新聞─中央社１２自由時報
中油依據浮動油價機制，傍晚宣布調漲汽柴油批售價格，明日凌晨零時起，各類汽油每公升調漲0.5元、柴油調漲0.3元。台塑石化隨後跟進，明日凌晨1時起，汽油每公升調漲0.6元，柴油每公升調漲0.5元。yam天空新聞─中央社自由電子報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌18.96點／成交價：6767.10點／成交量：新台幣1217.97億元

6月4日
馬英九總統率領的158人訪問團，傍晚自桃園國際機場出發返抵國門，結束為期10天的「久睦專案」友邦訪問之旅。自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌107.08點／成交價：6786.06點／成交量：新台幣1590.07億元

6月3日
九十八學年度第一次國中基本學力測驗的考生成績單於今日發放，本次基測的PR值對照量尺分數表亦同步公佈，預估滿分人數將超過30人，較去年增加一倍。自由時報１２３
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌55.94點／成交價：6893.14點／成交量：新台幣1562.03億元

6月2日
2009年台北國際電腦展自本日起連續五天在台北世界貿易中心展覽一館、展覽三館、南港展覽館及台北國際會議中心同步登場，本屆主題「M.O.V.E.」以行動通訊為重點，共有1712家廠商參展，產品涵蓋資訊、通訊等各項電腦技術產品。yam天空新聞─中央社１２
今年的夏季電價開始實施，6月到9月底止一連四個月，家庭用電超過基本度110度以上，將按照級距不等而有不同的漲幅。yam天空新聞─中廣yam天空新聞─TVBS
今日加權股價指數收盤行情：
 下跌5.02點／成交價：6949.08點／成交量：新台幣2321.9億元

6月1日
臺北縣新莊市昨晚發生流彈殺人案，在貿易公司工作的36歲男子黃國賓，騎機車載妻子行經新莊市環河路返家途中，因不明原因遭到流彈擊中，子彈從黃的右上臂貫穿胸腔，送醫後仍傷重不治。警方正全力調查中。中國時報自由時報
菸品健康捐新標準上路，每包香菸的健康捐從10元調高到20元，部分製菸業者亦同步調漲菸品價格以反映成本。中國時報自由時報
今日加權股價指數收盤行情：
 上漲63.66點／成交價：6954.10點／成交量：新台幣2018.53億元