豪猪亚目（学名：Hystricomorpha）在历史上曾有过许多含义。广义上是指所有具有豪猪型颧弓－咬肌结构（Zygomasseteric system）的啮齿目动物（跳鼠类除外），包括豪猪下目（Hystricognathi）、栉趾鼠科（Ctenodactylidae）、鳞尾松鼠科（Anomaluridae）、跳兔科（Pedetidae）。分子及形态学研究表明，将鳞尾松鼠科与跳兔科列入其中是有争议的。根据Carleton与Musser的研究，这两科被分为鳞尾松鼠亚目（Anomaluromorpha）。

豪猪亚目（又被称为Entodacrya或Ctenohystrica）的现代定义是指将栉趾鼠与豪猪下目联系起来的分类学假设。支持这一说法有很多形态学以及分子系统发生学的证据。如果此假说是真实的，那传统观点中的松鼠形亚目将被推翻，成为一个并系群。

豪猪类动物，或至少是豚鼠小目中的成员，有时会被认为是非啮齿类。不过大多数分子与遗传学研究都表明啮齿动物是单系群。而支持啮齿类为多系群的证据被认为是源自长枝吸引（long branch attraction）的现象。

豪猪类动物于渐新世早期出现于南美洲，这里此前的陆地哺乳动物只有后兽下纲、贫齿总目、南蹄目。豪猪类是从非洲横渡大西洋到达南美洲的。同一类型的迁徙还发生在灵长目中，这些都发生于南北美洲生物大迁徙之前。不过这些说法至今尚存争议。

分类 
以下的分类是根据Marivaux等人对早期啮齿类化石进行的支序分类学分析而来的。他们的研究支持豪猪亚目假说，并表明McKenna与Bell定义的先松鼠亚目（Sciuravida）是多系群，因而并不成立。

豪猪亚目 Hystricomorpha
梳齿鼠总科 Ctenodactyloidea
梳齿鼠科 Ctenodactylidae
†科 Tammquammyidae
硅藻鼠科 Diatomyidae
†豫鼠科 Yuomyidae
†馕鼠科 Chapattimyidae
演化支 Hystricognathiformes
†查干鼠科 Tsaganomyidae
豪猪下目 Hystricognathi
†俾路支鼠科 Baluchimyinae
豪猪科 Hystricidae
菲奥鼠小目（非洲豪猪类）Phiomorpha
†长尾菲奥鼠科 Myophiomyidae
†钻石鼠科 Diamantomyidae
†菲奥鼠科 Phiomyidae
†肯尼亚鼠科 Kenyamyidae
岩鼠科 Petromuridae
蔗鼠科 Thryonomyidae
滨鼠科 Bathyergidae
†似滨鼠科 Bathyergoididae
豚鼠小目（南美豪猪类）Caviomorpha
美洲豪猪总科 Erethizontoidea
美洲豪猪科 Erethizontidae
豚鼠总科 Cavioidea
†头刺豚鼠科 Cephalomyidae
刺豚鼠科 Dasyproctidae
兔豚鼠科 Cuniculidae
†始豚鼠科 Eocardiidae
花背豚鼠科 Dinomyidae
豚鼠科 Caviidae
八齿鼠总科 Octodontoidea
八齿鼠科 Octodontidae
栉鼠科 Ctenomyidae
棘鼠科 Echimyidae
海狸鼠科 Myocastoridae
硬毛鼠科 Capromyidae
†海地岛鼠科 Heptaxodontidae
毛丝鼠总科 Chinchilloidea
毛丝鼠科 Chinchillidae
†新绒鼠科 Neoepiblemidae
华毛鼠科 Abrocomidae

参考文献

Bergsten, J. 2005. A review of long-branch attraction. Cladistics, 21:163-193.
Cao, Y., Adachi, J., Yano, T. and Hasegawa, M. 1994. Phylogenetic place of guinea pigs: No support of the rodent-polyphyly hypothesis from maximum-likelihood analyses of multiple protein sequences. Molecular Biology and Evolution, 11: 593-604.
Carleton, M. D. and G. G. Musser. 2005. Order Rodentia. Pp745–752 in Mammal Species of the World A Taxonomic and Geographic Reference (D. E. Wilson and D. M. Reeder eds.). Baltimore, Johns Hopkins University Press.
D'Erchia, A., Gissi, C., Pesole, G., Saccone, C. and Arnason, U. 1996. The guinea-pig is not a rodent. Nature, 381 (6583): 597-600.
Flynn, J. J., Wyss, A. R., Croft, D. A., and Charrier, R. 2003. The Tinguiririca Fauna, Chile: biochronology, paleoecology, biogeography, and a new earliest Oligocene South American Land Mammal ‘Age’. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 195:229-259.
Graur, D., Hide, W. and Li, W. 1991. Is the guinea-pig a rodent? Nature, 351: 649-652.
Huchon, D. E. J. P. Douzery. 2001. From the Old World to the New World: A molecular chronicle of the phylogeny and biogeography of hystricognath rodents. Molecular Phylogenetics and Evolution, 20:238-251.
Kuma, K. and Miyata, T. 1994. Mammalian phylogeny inferred from multiple protein data. Japanese Journal of Genetics, 69 (5): 555-66.
Landry, S. O. J. 1999. A proposal for a new classification and nomenclature for the glires. Mitt. Mus. Nat. Kd. Berl. Zool. Reihe, 75:283-316.
Lin, Y-H, et al. 2002. Four new mitochondrial genomes and the increased stability of evolutionary trees of mammals from improved taxon sampling. Molecular Biology and Evolution, 19: 2060-2070.
Marivaux, L., M. Vianey-Liaud, and J.-J. Jaeger. 2004. High-level phylogeny of early Tertiary rodents: dental evidence. Zoological Journal of the Linnean Society, 142:105-134.
Marivaux, L. J. L. Welcomme, M. Vianey-Liaud, and J.J. Jaeger. 2002. The role of Asia in the origin and diversification of hystricognathous rodents. Zoologica Scripta, 31:225-239.
McKenna, Malcolm C., and Bell, Susan K. 1997. Classification of Mammals Above the Species Level. Columbia University Press, New York, 631 pp. ISBN 0-231-11013-8
Reyes, A., Pesole, G. and Saccone, C. 2000. Long-branch attraction phenomenon and the impact of among-site rate variation on rodent phylogeny. Gene, 259 (1-2): 177-87.
Reyes, A., Gissi, C., Catzeflis, F., Nevo, E. Pesole, G. and Saccone, C. 2004. Congruent mammalian trees from mitochondrial and nuclear genes using Bayesian methods. Molecular Biology and Evolution, 21 (2): 397-403.
Robinson-Rechavi, M., Ponger, L. and Mouchiroud, D. 2000. Nuclear gene LCAT supports rodent monophyly. Molecular Biology and Evolution, 17: 1410-1412.
Sullivan, J. and Swofford, D.L. 1997. Are guinea pigs rodents? the importance of adequate models in molecular phylogenetics. Journal of Mammalian Evolution, 4: 77-86.

啮齿目