加拉巴哥群島 (厄瓜多屬) 在世界動物地理分區上屬於新熱帶區。約有160種鳥類被記錄，其中約25種為特有種。

企鵝目 Sphenisciformes 
 企鵝科 Spheniscidae
加拉帕戈斯企鵝 - Spheniscus mendiculus (Galápagos Penguin) ※特有種 / Endangered

鷿鷈目 Podicipediformes 
 鷿鷈科 Podicipedidae
斑嘴巨鸊鷉 - Podilymbus podiceps (Pied-billed Grebe) ※迷鳥

鸌形目 Procellariiformes 
 信天翁科 Diomedeidae

漂泊信天翁 - Diomedea exulans (Wandering Albatross)
加岛信天翁 - Phoebastria irrorata (Waved Albatross) ※繁殖特有種 / Vulnerable
黑脚信天翁 - Phoebastria nigripes(Black-footed Albatross) ※迷鳥 / Endangered
黑眉信天翁 - Thalassarche melanophris (Black-browed Albatross)

 水薙鳥科 Procellariidae
巨鹱 - Macronectes giganteus (Antarctic Giant Petrel) ※迷鳥 / Vulnerable
Macronectes halli (Hall's Giant Petrel) ※迷鳥 / Near-threatened
银灰暴风鹱 - Fulmarus glacialoides (Southern Fulmar)
海角鹱 - Daption capense (Cape Petrel)
鳞斑圆尾鹱 - Pterodroma inexpectata (Mottled Petrel) ※Near-threatened
暗腰圆尾鹱 - Pterodroma phaeopygia (Galápagos Petrel) ※繁殖特有種 / Critically endangered
库氏圆尾鹱 - Pterodroma cookii (Cook's Petrel) ※Endangered
Pterodroma defilippiana (Defilippe's Petrel) Vulnerable
厚嘴圆尾鹱 - Pterodroma leucoptera (Gould's Petrel) ※迷鳥
鸽锯鹱 - Pachyptila desolata (Antarctic Prion) ※迷鳥
黑风鹱 -Procellaria parkinsoni (Parkinson's Petrel) ※迷鳥 / Vulnerable
粉脚鹱 - Puffinus creatopus (Pink-footed Shearwater) ※Vulnerable
肉足鹱 - Puffinus carneipes (Flesh-footed Shearwater) ※迷鳥
曳尾鹱 - Puffinus pacificus (Wedge-tailed Shearwater) ※迷鳥
灰背鹱 - Puffinus bulleri (Buller's Shearwater) ※Vulnerable
灰剪水鹱 - Puffinus griseus (Sooty Shearwater) ※Near-threatened
奥杜邦氏鹱 - Puffinus lherminieri (Audubon's Shearwater)

 海燕科 Hydrobatidae
黄蹼洋海燕 - Oceanites oceanicus (Wilson's Storm-Petrel)
白臀洋海燕 - Oceanites gracilis (White-vented Storm-Petrel) ※Data deficient
白脸海燕 - Pelagodroma marina (White-faced Storm-Petrel) ※迷鳥
白腹舰燕 - Fregetta grallaria (White-bellied Storm-Petrel) ※迷鳥
Nesofregetta fuliginosa (Polynesian Storm-Petrel) Vulnerable
加岛叉尾海燕 - Oceanodroma tethys (Wedge-rumped Storm-Petrel)
哈考氏叉尾海燕 - Oceanodroma castro (Band-rumped Storm-Petrel)
白腰叉尾海燕 - Oceanodroma leucorhoa (Leach's Storm-Petrel)
乌叉尾海燕 - Oceanodroma markhami (Markham's Storm-Petrel) ※迷鳥 / Data deficient
美洲黑叉尾海燕 - Oceanodroma melania (Black Storm-Petrel) ※迷鳥

鵜形目 Pelecaniformes 
 熱帶鳥科 Phaethontidae
紅嘴熱帶鳥 - Phaethon aethereus (Red-billed Tropicbird)

 鵜鶘科 Pelecanidae
褐鹈鹕 - Pelecanus occidentalis (Brown Pelican)

 鰹鳥科 Sulidae
蓝脚鲣鸟 - Sula nebouxii (Blue-footed Booby)
藍臉鰹鳥 - Sula dactylatra (Masked Booby)
橙嘴藍臉鰹鳥 Sula granti (Nazca Booby)
紅腳鰹鳥 - Sula sula (Red-footed Booby)
褐鲣鸟 (白腹鰹鳥) - Sula leucogaster (Brown Booby) ※迷鳥

 鸕鷀科 Phalacrocoracidae

Phalacrocorax harrisi (Flightless Cormorant) ※特有種 / Endangered

 軍艦鳥科 Fregatidae
丽色军舰鸟- Fregata magnificens (Magnificent Frigatebird)
小軍艦鳥 - Fregata minor (Great Frigatebird)

鸛形目 Ciconiiformes 
 鷺科 Ardeidae
大蓝鹭 - Ardea herodias (Great Blue Heron)
大白鷺 - Ardea alba (Great Egret)
三色鹭 - Egretta tricolor (Tricolored Heron)
小蓝鹭 - Egretta caerulea (Little Blue Heron)
雪鹭 - Egretta thula (Snowy Egret)
小白鷺 - Egretta garzetta (Little Egret)
黃頭鷺 - Bubulcus ibis (Cattle Egret)
綠簑鷺 - Butorides striata (Striated Heron)
夜鷺 - Nycticorax nycticorax (Black-crowned Night-Heron) ※迷鳥
黄顶夜鹭 - Nyctanassa violacea (Yellow-crowned Night-Heron)

紅鸛目 Phoenicopteriformes 
 紅鸛科 Phoenicopteridae
大红鹳 - Phoenicopterus ruber (Caribbean Flamingo)

雁形目 Anseriformes 
 雁鴨科 Anatidae
红嘴树鸭 - Dendrocygna autumnalis (Black-bellied Whistling-Duck) ※迷鳥
白脸针尾鸭 - Anas bahamensis (White-cheeked Pintail)
蓝翅鸭 - Anas discors (Blue-winged Teal)
花脸硬尾鸭 - Nomonyx dominica (Masked Duck)

隼形目 Falconiformes 
 鶚科 Pandionidae
魚鷹 - Pandion haliaetus (Osprey)

 鷹科 Accipitridae

加岛鵟 - Buteo galapagoensis (Galápagos Hawk) ※特有種 / Vulnerable

 隼科 Falconidae
遊隼 - Falco peregrinus (Peregrine Falcon)

鶴形目 Gruiformes 
 秧雞科 Rallidae
加岛南美田鸡 - Laterallus spilonotus (Galápagos Rail) ※特有種 / Vulnerable
黑脸田鸡 - Porzana carolina (Sora) ※迷鳥
斑嘴田鸡 - Neocrex erythrops (Paint-billed Crake)
紫青水鸡 - Porphyrio martinica (Purple Gallinule) ※迷鳥
黑水鸡 - Gallinula chloropus (Common Moorhen)

鴴形目 Charadriiformes 
 蠣鴴科 Haematopodidae
美洲蛎鹬 - Haematopus palliatus (American Oystercatcher)

 反嘴鴴科 Recurvirostridae
Himantopus mexicanus (Black-necked Stilt)

 鴴科 Charadriidae
太平洋金斑鴴 - Pluvialis fulva (Pacific Golden-Plover) ※迷鳥
美洲金斑鴴 - Pluvialis dominica (American Golden-Plover) ※迷鳥
灰斑鴴 - Pluvialis squatarola (Black-bellied Plover)
半蹼鸻 - Charadrius semipalmatus (Semipalmated Plover)
厚嘴鸻 - Charadrius wilsonia (Wilson's Plover)
双领鸻 - Charadrius vociferus (Killdeer) ※迷鳥

 鷸科 Scolopacidae
短嘴半蹼鹬 - Limnodromus griseus (Short-billed Dowitcher)
棕塍鹬 - Limosa haemastica (Hudsonian Godwit) ※迷鳥
云石塍鹬 - Limosa fedoa (Marbled Godwit)
中杓鹬 - Numenius phaeopus (Whimbrel)
大黄脚鹬 - Tringa melanoleuca (Greater Yellowlegs)
小黄脚鹬 - Tringa flavipes (Lesser Yellowlegs)
孤鹬 - Tringa solitaria (Solitary Sandpiper)
斑鹬 - Actitis macularia (Spotted Sandpiper)
灰鹬 - Heterosceles incanus (Wandering Tattler)
半蹼白翅鹬 - Catoptrophorus semipalmatus (Willet)
翻石鹬 - Arenaria interpres (Ruddy Turnstone)
黑翻石鹬 - Arenaria melanocephala (Black Turnstone) ※迷鳥
滨浪鹬 - Aphriza virgata (Surfbird)
红腹滨鹬 - Calidris canutus (Red Knot) ※迷鳥
三趾濱鷸 - Calidris alba (Sanderling)
半蹼滨鹬 - Calidris pusilla (Semipalmated Sandpiper)
西滨鹬 - Calidris mauri (Western Sandpiper)
姬滨鹬 - Calidris minutilla (Least Sandpiper)
白腰滨鹬 - Calidris fuscicollis (White-rumped Sandpiper) ※迷鳥
黑腰滨鹬 - Calidris bairdii (Baird's Sandpiper)
斑胸滨鹬 - Calidris melanotos (Pectoral Sandpiper) ※迷鳥
高蹻鹬 - Calidris himantopus (Stilt Sandpiper) ※迷鳥
饰胸鹬 - Tryngites subruficollis (Buff-breasted Sandpiper) ※Near-threatened
赤斑瓣蹼鹬 - Phalaropus tricolor (Wilson's Phalarope)
红颈瓣蹼鹬 - Phalaropus lobatus (Red-necked Phalarope)
灰瓣蹼鹬 - Phalaropus fulicarius (Red Phalarope)

 賊鷗科 Stercorariidae
南極賊鷗 - Stercorarius maccormicki (South Polar Skua) ※迷鳥
大賊鷗 - Stercorarius skua (Great Skua)
中贼鸥 - Stercorarius pomarinus (Pomarine Jaeger) ※迷鳥
賊鷗 - Stercorarius parasiticus (Parasitic Jaeger) ※迷鳥
长尾贼鸥 - Stercorarius longicaudus (Long-tailed Jaeger) ※迷鳥

 鷗科 Laridae
环嘴鸥 - Larus delawarensis (Ring-billed Gull)
黑背鸥 - Larus dominicanus (Kelp Gull) ※迷鳥
小黑头鸥 - Larus philadelphia (Bonaparte's Gull) ※迷鳥
岩鸥 - Larus fuliginosus (Lava Gull) ※特有種 / Vulnerable
笑鸥 - Larus atricilla (Laughing Gull)
弗朗氏鸥 - Larus pipixcan (Franklin's Gull)
叉尾鸥 - Xema sabini (Sabine's Gull)
燕尾鸥 - Creagrus furcatus (Swallow-tailed Gull) ※繁殖特有種

 燕鷗科 Sternidae
王凤头燕鸥 - Sterna maxima (Royal Tern)
燕鷗 - Sterna hirundo (Common Tern)
北极燕鸥 - Sterna paradisaea (Arctic Tern)
烏領燕鷗 - Sterna fuscata (Sooty Tern)
黑浮鸥 - Chlidonias niger (Black Tern) ※迷鳥
白顶黑燕鸥 - Anous stolidus (Brown Noddy)
白燕鸥 - Gygis alba (White Tern)

鴿形目 Columbiformes 
 鳩鴿科 Columbidae

斑颊哀鸽 - Zenaida auriculata (Eared Dove) ※迷鳥
加岛哀鸽 - Zenaida galapagoensis (Galápagos Dove) ※特有種

鵑形目 Cuculiformes 
 杜鵑科 Cuculidae
黑嘴美洲鹃 - Coccyzus erythropthalmus (Black-billed Cuckoo) ※迷鳥
乌嘴美洲鹃 - Coccyzus melacoryphus (Dark-billed Cuckoo)
滑嘴犀鹃 - Crotophaga ani (Smooth-billed Ani) ※外來種
沟嘴犀鹃 - Crotophaga sulcirostris (Groove-billed Ani) ※迷鳥

鴞形目 Strigiformes 
 草鴞科 Tytonidae
倉鴞 - Tyto alba (Barn Owl)

 鴟鴞科 Strigidae
短耳鸮 - Asio flammeus (Short-eared Owl)

夜鷹目 Caprimulgiformes 
 夜鷹科 Caprimulgidae
美洲夜鹰 - Chordeiles minor (Common Nighthawk) ※迷鳥

雨燕目 Apodiformes 
 雨燕科 Apodidae
烟囱刺尾雨燕 - Chaetura pelagica (Chimney Swift) ※迷鳥

佛法僧目 Coraciiformes 
 翠鳥科 Alcedinidae
带鱼狗 - Ceryle alcyon (Belted Kingfisher)

雀形目 Passeriformes 
 霸鶲科 Tyrannidae
朱红霸鹟 - Pyrocephalus rubinus (Vermilion Flycatcher)
加岛蝇霸鹟 - Myiarchus magnirostris (Galápagos Flycatcher) ※特有種

 燕科 Hirundinidae
紫崖燕 - Progne subis (Purple Martin)
静崖燕 - Progne modesta (Galápagos Martin) ※特有種 / Vulnerable
灰沙燕 - Riparia riparia (Bank Swallow)
红石燕 - Petrochelidon pyrrhonota (Cliff Swallow) ※迷鳥
家燕 - Hirundo rustica (Barn Swallow)

 太平鳥科 Bombycillidae
雪松太平鸟 - Bombycilla cedrorum (Cedar Waxwing)

 嘲鶇科 Mimidae
（於2007年全部Nesomimus屬的雀鳥歸入Mimus屬）mimus parvulus (Galápagos Mockingbird) 異名Nesomimus parvulus ※特有種
三斑嘲鸫 - Mimus trifasciatus (Charles Mockingbird) 異名Nesomimus trifasciatus ※特有種 / Critically endangeredMimus macdonaldi (Hood Mockingbird) 異名Nesomimus macdonaldi ※特有種 / VulnerableMimus melanotis (San Cristobal Mockingbird) 異名Nesomimus melanotis ※特有種 / Endangered

 林鶯科 Parulidae
黄色林莺 - Dendroica petechia (Yellow Warbler)

 蕉森鶯科 Coerebidae
蕉森莺 - Coereba flaveola (Bananaquit)

 裸鼻雀科 Thraupidae
玫红比蓝雀 Piranga rubra (Summer Tanager) ※迷鳥

 鵐科 Emberizidae

大嘴地雀 - Geospiza magnirostris (Large Ground-Finch) ※特有種
勇地雀 - Geospiza fortis (Medium Ground-Finch) ※特有種
小地雀 - Geospiza fuliginosa (Small Ground-Finch) ※特有種
尖嘴地雀 - Geospiza difficilis (Sharp-beaked Ground-Finch) ※特有種
仙人掌地雀 - Geospiza scandens (Common Cactus-Finch) ※特有種
大仙人掌地雀 - Geospiza conirostris (Large Cactus-Finch) ※特有種
素食树雀 - Camarhynchus crassirostris (Vegetarian Finch) ※特有種
红木树雀 - Camarhynchus heliobates (Mangrove Finch) ※特有種 / Critically endangered
大树雀 - Camarhynchus psittacula (Large Tree-Finch) ※特有種
小树雀 - Camarhynchus parvulus (Small Tree-Finch) ※特有種
查理树雀 - Camarhynchus pauper (Medium Tree-Finch) ※特有種 / Vulnerable
鴷形树雀 - Camarhynchus pallidus (Woodpecker Finch) ※特有種
莺雀 - Certhidea olivacea (Warbler Finch) ※特有種

 美洲雀科 Cardinalidae
玫胸白翅斑雀 - Pheucticus ludovicianus (Rose-breasted Grosbeak) ※迷鳥

 擬黃鸝科 Icteridae
长刺歌雀 - Dolichonyx oryzivorus'' (Bobolink)

參見 
 鸟类传统分类系统
 Howard-Moore鳥類分類系統
 Clements鳥類分類系統
 Sibley-Ahlquist鳥類分類系統