本頁面列出了病毒的分類，包含病毒以及類病毒、普利昂蛋白、卫星病毒等亞病毒因子。

由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代，因此在種別的定義上與一般生物有所不同。

概论

ICTV 分类法
國際病毒分類委員會（英文：International Committee on Taxonomy of Viruses，簡稱 ICTV）是国际微生物学联合会（英文：International Union of microgical Societies）发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构，在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分類單元。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：
 Realm（-viria）
亚域 Subrealm（-vira）
界 Kingdom（-viriae）
亚界 Subkingdom（-virites）
门 Phylum（-viricota）
亚门 Subphylum（-viricotina）
纲 Class（-viricetes）
亚纲 Subclass（-viricetidae）
目 Order（-virales）
亚目 Suborder（-virineae）
科 Family（-viridae）
亚科 Subfamily（-virinae）
属 Genus（-virus）
亚属 Subgenus（-virus）
种 Species

物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。
ICTV 2020版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、39个纲、59个目、8个亚目、189个科、136个亚科、2224个属、70个亚属与9110个种。除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认。

巴尔的摩分类法

诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

 第一类是双链 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
 第二类是单链 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
 第三类是双链RNA病毒（如呼腸孤病毒）
 第四类是（+）单链RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披盖病毒）
 第五类是（-）单链RNA病毒（如正黏液病毒、炮彈病毒）
 第六类是单链RNA反转录病毒（如反转录病毒）
 第七类是双链 DNA 反转录病毒（如肝病毒）
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链 DNA 病毒，且不含有反转录酶。

ICTV 2020版病毒分类表
此套分類系统与细胞生物分类系统有许多共同特征，如分類單元结构，但也存在一些差异，比如所有分类名称都使用斜体，这与国际藻类、真菌和植物命名法及国际动物命名法不同。

A型DNA病毒域 Adnaviria
齐利希病毒界 Zilligvirae 1门
杆状病毒门 Taleaviricota 1纲
线状病毒纲 Tokiviricetes 2目
细带病毒目 Ligamenvirales 2科
脂毛噬菌体科 Lipothrixviridae 4属
古噬菌体科 Rudiviridae 7属
第一病毒目 Primavirales 1科
三层病毒科 Tristromaviridae 2属

雙鏈去氧核糖核酸病毒域 Duplodnaviria
香港病毒界 Heunggongvirae 2门
衣壳病毒门 Peploviricota 1纲
疱疹病毒纲 Herviviricetes 1目
皰疹病毒目 Herpesvirales 3科
异疱疹病毒科 Alloherpesviridae 4属
疱疹病毒科 Herpesviridae 3亚科、1种
軟體動物疱疹病毒科 Malacoherpesviridae 2属
尾噬菌体门 Uroviricota 1纲
有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
有尾噬菌体目 Caudovirales 14科、1属
埃凯曼病毒科 Ackermannviridae 2亚科、7属
自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae 9亚科、70属
蔡斯噬菌体科 Chaseviridae 2亚科
德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae 3亚科、4属
德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae 4亚科、9属
格兰噬菌体科 Guelinviridae 1亚科、2属
代列尔噬菌体科 Herelleviridae 5亚科、7属、1种
肌尾噬菌体科 Myoviridae 5亚科、153属
短尾噬菌体科 Podoviridae 3亚科、44属、1种
朗特里噬菌体科 Rountreeviridae 2亚科、2属
萨拉玛噬菌体科 Salasmaviridae 3亚科、4属
斯基托噬菌体科 Schitoviridae 8亚科、14属
长尾噬菌体科 Siphoviridae 22亚科、299属
佐贝尔噬菌体科 Zobellviridae 1亚科、6属
百合病毒属 Lilyvirus 1种

單鏈去氧核糖核酸病毒域 Monodnaviria 
包含4界
洛布病毒界 Loebvirae 1门
霍夫奈病毒门 Hofneiviricota 1纲
纤维噬菌体纲 Faserviricetes 1目
微管噬菌体目 Tubulavirales 3科
丝状噬菌体科 Inoviridae 21属
保利诺噬菌体科 Paulinoviridae 2属
短杆状噬菌体科 Plectroviridae 3属
桑格病毒界 Sangervirae 1门
菲克斯病毒门 Phixviricota 1纲
小噬菌体纲 Malgrandaviricetes 1目
微噬菌体目 Petitvirales 1科
微小噬菌体科 Microviridae 2亚科
称徳病毒界 Shotokuvirae 2门
科萨特病毒门 Cossaviricota 3纲
松弛病毒纲 Mouviricetes 1目
普林病毒目 Polivirales 1科
二分 DNA 病毒科 Bidnaviridae 1属
乳多空病毒纲 Papovaviricetes 2目
SE 多瘤病毒目 Sepolyvirales 1科
多瘤病毒科 Polyomaviridae 6属、5种
楚尔豪森病毒目 Zurhausenvirales 1科
乳頭瘤病毒科 Papillomaviridae 2亚科
第五病毒纲 Quintoviricetes 1目
小病毒目 Piccovirales 1科
细小病毒科 Parvoviridae 3亚科
单环编码病毒门 Cressdnaviricota 2纲：编码复制相关蛋白的环状单链 DNA 病毒（Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses，CRESS DNA viruses）
精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae 3属
圆环病毒目 Cirlivirales 1科
圆环病毒科 Circoviridae 2属
CRESS亚基因组目 Cremevirales 1科
小环状 DNA 病毒科 Smacoviridae 12属
多基因病毒目 Mulpavirales 2科
丝囊病毒科 Metaxyviridae 1属
矮缩病毒科 Nanoviridae 2属
圆形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
圆形病毒科 Redondoviridae 1属
Rep 单链编码病毒纲 Repensiviricetes 1目
基因植物真菌病毒目 Geplafuvirales 2科
双生病毒科 Geminiviridae 14属
类双生病毒科 Genomoviridae 10属
特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1门
嗜盐病毒门 Saleviricota 1纲
凌乱病毒纲 Huolimaviricetes 1目
盐藻病毒目 Haloruvirales 1科
嗜盐菌多形病毒科 Pleolipoviridae 3属

核糖病毒域 Riboviria
包含2界、2科、4属
正 RNA 病毒界 Orthornavirae 5门、2科、1属
双链 RNA 病毒门 Duplornaviricota 3纲
克里莫提病毒纲 Chrymotiviricetes 1目
加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4科
金色病毒科 Chrysoviridae 2属
巨大双分 RNA 病毒科 Megabirnaviridae 1属
四组分病毒科 Quadriviridae 1属
整体病毒科 Totiviridae 5属
呼肠孤病毒纲 Resentoviricetes 1目
呼肠孤病毒目 Reovirales 1科
呼肠孤病毒科 Reoviridae 2亚科
维达弗病毒纲 Vidaverviricetes 1目
明迪奇病毒目 Mindivirales 1科
囊状噬菌体科 Cystoviridae 1属
黄色病毒门 Kitrinoviricota 4纲
阿尔法病毒超群纲 Alsuviricetes 3目
戊肝病毒目 Hepelivirales 4科
阿尔法四体病毒科 Alphatetraviridae 2属
甜菜坏死黄脉病毒科 Benyviridae 1属
戊型肝炎病毒科 Hepeviridae 2属
风疹病毒科 Matonaviridae 1属
马特利病毒目 Martellivirales 7科
雀麦花叶病毒科 Bromoviridae 6属
长线形病毒科 Closteroviridae 4属、7种
内源病毒科 Endornaviridae 2属
北岛病毒科 Kitaviridae 3属
梅奥病毒科 Mayoviridae 2属
披膜病毒科 Togaviridae 1属
植物杆状病毒科 Virgaviridae 7属
芜菁黄花叶病毒目 Tymovirales 5科
阿尔法线形病毒科 Alphaflexiviridae 6属
贝塔线形病毒科 Betaflexiviridae 2亚科
德尔塔线形病毒科 Deltaflexiviridae 1属
伽马线形病毒科 Gammaflexiviridae 1属
芜菁黄花叶病毒科 Tymoviridae 3属、2种
黄病毒超群纲 Flasuviricetes 1目
黄热病毒目 Amarillovirales 1科
黄病毒科 Flaviviridae 4属
MAG 病毒纲 Magsaviricetes 1目
野田村病毒目 Nodamuvirales 2科
野田村病毒科 Nodaviridae 2属
西奈-卤病毒科 Sinhaliviridae 1属
塔卢卡病毒纲 Tolucaviricetes 1目
番茄丛矮病毒目 Tolivirales 2科
香石竹斑驳病毒样四体病毒科 Carmotetraviridae 1属
番茄丛矮病毒科 Tombusviridae 3亚科、1属
光滑裸露病毒门 Lenarviricota 4纲
二十病毒纲 Amabiliviricetes 1目
元素病毒目 Wolframvirales 1科
裸露 RNA 病毒科 Narnaviridae 1属
豪厄尔镇病毒纲 Howeltoviricetes 1目
板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
线粒体病毒科 Mitoviridae 1属
光滑病毒纲 Leviviricetes 2目、9属
诺顿辛德病毒目 Norzivirales 4科 
阿特金斯病毒科 Atkinsviridae 56属
杜因病毒科 Duinviridae 6属
菲尔斯病毒科 Fiersviridae 185属
索尔斯皮格曼病毒科 Solspiviridae 24属
蒂莫西病毒目 Timlovirales 2科
布鲁门塔尔病毒科 Blumeviridae 31属
施泰茨病毒科 Steitzviridae 117属
病毒属 Chimpavirus 1种
病毒属 Hohglivirus 1种
病毒属 Mahrahovirus 1种
病毒属 Meihzavirus 1种
病毒属 Nicedsevirus 1种
病毒属 Sculuvirus 1种
病毒属 Skrubnovirus 1种
病毒属 Tetipavirus 1种
病毒属 Winunavirus 1种
密病毒纲 Miaviricetes 1目
欧尔里病毒目 Ourlivirales 1科
博图欧尔密病毒科 Botourmiaviridae 4属
負核糖病毒門 Negarnaviricota 2亚门
简单病毒亚门 Haploviricotina 4纲
春秋病毒纲 Chunqiuviricetes 1目
穆病毒目 Muvirales 1科
秦病毒科 Qinviridae 1属
米尔恩病毒纲 Milneviricetes 1目
蛇状病毒目 Serpentovirales 1科
蛇形病毒科 Aspiviridae 1属
单荆病毒纲 Monjiviricetes 2目
荆楚病毒目 Jingchuvirales 5科
病毒科 Aliusviridae 2属 
楚病毒科 Chuviridae 14属
病毒科 Crepuscuviridae 1属     
病毒科 Myriaviridae 1属    
病毒科 Natareviridae 1属 
单股反链病毒目 Mononegavirales 11科
节肢动物病毒科 Artoviridae 2属
玻那病毒科 Bornaviridae 3属
丝状病毒科 Filoviridae 6属
李氏蜘蛛病毒科 Lispiviridae 1属
真菌单分子负链 RNA 病毒科 Mymonaviridae 9属
尼亚米病毒科 Nyamiviridae 7属
副黏液病毒科 Paramyxoviridae 4亚科、3属
肺病毒科 Pneumoviridae 2属
弹状病毒科 Rhabdoviridae 3亚科、7属
阳光病毒科 Sunviridae 1属
新城蚊子病毒科 Xinmoviridae 1属
允常病毒纲 Yunchangviricete 1目
勾践病毒目 Goujianvirales 1科
越病毒科 Yueviridae 1属
复杂病毒亚门 Polyploviricotina 2纲
艾略特病毒纲 Ellioviricetes 1目
布尼亚病毒目 Bunyavirales 12科
沙状病毒科 Arenaviridae 4属
甲壳类林肯病毒科 Cruliviridae 1属
费莫病毒科 Fimoviridae（无花果花叶病毒科）1属
汉坦病毒科 Hantaviridae 4亚科
利什曼原虫布尼亚病毒科 Leishbuviridae 1属
多足类湖北病毒科 Mypoviridae 1属
内罗病毒科 Nairoviridae 7属
泛布尼亚病毒科 Peribunyaviridae 4属
幻影病毒科 Phasmaviridae 6属
白纤病毒科 Phenuiviridae 20属
番茄斑萎病毒科 Tospoviridae 1属
武汉蜈蚣病毒科 Wupedeviridae 1属
流感病毒纲 Insthoviricetes 1目
分割病毒目 Articulavirales 2科
罗非鱼病毒科 Amnoonviridae 1属
正粘病毒科 Orthomyxoviridae 7属
小 RNA 病毒超群门 Pisuviricota 3纲
双链-小双节 RNA 病毒纲 Duplopiviricetes 1目
双链RNA病毒目 Durnavirales 5科
混合病毒科 Amalgaviridae 2属
弯曲病毒科 Curvulaviridae 1属
低毒性病毒科 Hypoviridae 1属
分体病毒科 Partitiviridae 5属、15种
小双节病毒科 Picobirnaviridae 1属
小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes 3目
網巢病毒目 Nidovirales（嵌套病毒目）8亚目
深海病毒亚目 Abnidovirineae 1科
深海病毒科 Abyssoviridae 1亚科
亚目 Arnidovirineae 4科
動脈炎病毒科 Arteriviridae 6亚科
科 Cremegaviridae 1亚科
科 Gresnaviridae 1亚科
科 Olifoviridae 1亚科
冠狀病毒亚目 Cornidovirineae 1科
冠狀病毒科 Coronaviridae 2亚科
海洋病毒亚目 Mesnidovirineae 2科
科 Medioniviridae 2亚科
中等嵌套病毒科 Mesoniviridae 1亚科
亚目 Monidovirineae 1科
科 Mononiviridae 1亚科
亚目 Nanidovirineae 2科
科 Nanghoshaviridae 1亚科
科 Nanhypoviridae 1亚科
桿狀網巢病毒亚目 Ronidovirineae 2科
真桿狀網巢病毒科 Euroniviridae 2亚科
桿狀網巢病毒科 Roniviridae 1亚科
亚目 Tornidovirineae 1科
科 Tobaniviridae 4亚科
微小核糖核酸病毒目 Picornavirales 8科
杯状病毒科 Caliciviridae 11属
双顺反子病毒科 Dicistroviridae 3属
傳染性軟腐病病毒科 Iflaviridae 1属
海洋 RNA 病毒科 Marnaviridae 7属
小核糖核酸病毒科 Picornaviridae 68属
多顺反子类小 RNA 病毒科 Polycipiviridae 3属
伴生豇豆病毒科 Secoviridae 1亚科、5属、1种
红火蚁病毒科 Solinviviridae 2属
南方菜豆花叶病病毒目 Sobelivirales 3科
囊孢虫RNA病毒科 Alvernaviridae 1属
杯状 RNA 病毒科 Barnaviridae 1属
南方菜豆花叶一品红病毒科 Solemoviridae 4属、7种
星状-马铃薯病毒纲 Stelpaviricetes 2目
马铃薯病毒目 Patatavirales 1科
马铃薯 Y 病毒科 Potyviridae 12属、3种
星状病毒目 Stellavirales 1科
星状病毒科 Astroviridae 2属
双 RNA 病毒科 Birnaviridae 7属
复制酶置换四体病毒科 Permutotetraviridae 1属
葡萄孢菌病毒属 Botybirnavirus 1种
副RNA病毒界 Pararnavirae 1门
酶录转逆病毒门 Artverviricota 1纲
逆转录病毒纲 Revtraviricetes 2目
布隆伯病毒目 Blubervirales 1科
嗜肝 DNA 病毒科 Hepadnaviridae 5属
反转录病毒目 Ortervirales 5科
贝勒-保罗病毒科 Belpaoviridae 1属
花椰菜花叶病毒科 Caulimoviridae 11属
转座病毒科 Metaviridae 2属
伪病毒科 Pseudoviridae 3属、1种
逆转录病毒科 Retroviridae 2亚科
多真菌病毒科 Polymycoviridae 1属
小节肢动物病毒科 Sarthroviridae 1属
烟草坏死卫星病毒属 Albetovirus 3种
绿萝卫星病毒属 Aumaivirus 1种
黍花叶卫星病毒属 Papanivirus 1种
烟草花叶卫星病毒属 Virtovirus 1种

核酶病毒域 Ribozyviria
三角病毒科 Kolmioviridae 8属

多变去氧核糖核酸病毒域 Varidnaviria
包含2界
班福病毒界 Bamfordvirae 2门
核质病毒门 Nucleocytoviricota 2纲
巨病毒纲 Megaviricetes 3目
藻类病毒目 Algavirales 1科
藻類去氧核糖核酸病毒科 Phycodnaviridae 6属
模拟病毒目 Imitervirales 1科
拟菌病毒科 Mimiviridae 2属
PIMAS病毒目 Pimascovirales 3科
囊泡病毒科 Ascoviridae 2属
虹彩病毒科 Iridoviridae 2亚科
马赛病毒科 Marseilleviridae 1属、2种
痘疹病毒纲 Pokkesviricetes 2目
阿福病毒目 Asfuvirales 1科
非洲豬瘟病毒科 Asfarviridae 1属
克希特恩病毒目 Chitovirales 1科
痘病毒科 Poxviridae 2亚科
质粒前体病毒门 Preplasmiviricota 2纲
独特病毒纲 Maveriviricetes 1目
依赖病毒目 Priklausovirales 1科
大病毒依赖科 Lavidaviridae 2属
聚整合转座子病毒纲 Polintoviricetes 1目
正聚整合转座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
腺整合转座子病毒科 Adintoviridae 2属
保护病毒纲 Tectiliviricetes 4目、1科
塔钟病毒目 Belfryvirales 1科
塔螺病毒科 Turriviridae 1属
卡拉马病毒目 Kalamavirales 1科
复层噬菌体科 Tectiviridae 5属
罗韦病毒目 Rowavirales 1科
腺病毒科 Adenoviridae 6属
比尼亚病毒目 Vinavirales 1科
覆盖噬菌体科 Corticoviridae 1属
奥托吕科斯病毒科 Autolykiviridae 2属
海尔维蒂病毒界 Helvetiavirae（瑞士病毒）1门
分隔病毒门 Dividoviricota 1纲
莱塞病毒纲 Laserviricetes 1目
西班牙盐盒菌病毒目 Halopanivirales 3科
病毒科 Matshushitaviridae 1属
病毒科 Simuloviridae 1属 
球脂状病毒科 Sphaerolipoviridae 1属

地位未定种类
地位未定纲: 
纳尔达病毒纲 Naldaviricetes 1目、1科
勒乏病毒目 Lefavirales 3科
杆状病毒科 Baculoviridae 4属
肥大唾腺炎病毒科 Hytrosaviridae（线头病毒科）2属
裸杆状病毒科 Nudiviridae 4属
線極病毒科 Nimaviridae 1属

地位未定科:
阿尔法卫星病毒科 Alphasatellitidae 3亚科
瓶状病毒科 Ampullaviridae 1属
指环病毒科 Anelloviridae 31属
鳄梨日斑类病毒科 Avsunviroidae 3属
双尾病毒科 Bicaudaviridae 1属
棒状病毒科 Clavaviridae 1属
芬兰湖病毒科 Finnlakeviridae 1属
微小纺锤形噬菌体科 Fuselloviridae 2属
球状病毒科 Globuloviridae 1属
滴狀病毒科 Guttaviridae 2属
嗜盐纺锤形噬菌体科 Halspiviridae 1属
卵形病毒科 Ovaliviridae 1属
芽生噬菌体科 Plasmaviridae 1属
多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2属
带球病毒科 Portogloboviridae 1属
马铃薯纺锤形块茎类病毒科 Pospiviroidae 5属
嗜热圈形病毒科 Spiraviridae 1属
奇古菌纺锤形噬菌体科 Thaspiviridae 1属
番茄曲叶卫星病毒科 Tolecusatellitidae 2属

地位未定属: 
沟鞭藻 DNA 病毒属 Dinodnavirus 1种
壶菌病毒属 Rhizidiovirus 1种

亞病毒因子（Subviral Agents）

衛星（Satellites）
 卫星病毒 Satellite virus
 单链核糖核酸卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
 双链 DNA 卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
未定属
Satellite nucleic acid
Single-stranded satellite DNA
Double-stranded satellite RNA
Single-stranded satellite RNA
RNA satellite
未定属

類病毒（Viroids）
Pospiviroidae
Pospiviroid
Hostuviroid
Cocadviroid
Apscaviroid
Coleviroid
未定属
Avsunviroidae
Avsunviroid
Pelamoviroid
Elaviroid
未定科

朊毒體（Prions）
Mammal-prion
Fungi-prion

干扰缺损病毒（Defective Interfering）
 缺损干扰 RNA Defective Interfering RNA
 Defective interfering particle

参考文献 

 
生物分类
界級分類學列表