参考資料(2)-2 Bisulphite PCR解析で用いたプライマー配列

Gene	Target	Primer sequence (5'-3')	Amplicon (bp)	Annealing	Restriction Enzyme	Accession No.	chromosomal location
H19	BS	H19 F2	TATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTT	220	57	Taq1	AF125183	11p15.5
H19 R1	ATAAATATCCTATTCCCAAATAACCCC	Mu1
SNP	hH19DMR sF1	AGGTTGGGGAGATGGGAGGAGATAC	395	68
hH19DMR sR1	GTGGATAATGCCCGACCTGAAGATC
GTL2	BS	GTL2 BSF1	GGGTTGGGTTTTGTTAGTTGTTTGT	459	57	Taq1	AL117190	14q32
GTL2 BSR1	ACAATTTAACAACAACTTTCCCTCCAAA	Nru1
ZDBF2	BS	ZDBF2 BSF1	GTTTTGTTAGTTAGTGGAAATA	210	57	Taq1	AC007383	2q33.3
ZDBF2 BSR1	AAAATAATAATTACCTAAAAATAAAAAC
DIRAS3	BS	DIRAS3 BSF1	TGTTGTTTTGTTTGATATTTGTGTT	349	57	Taq1	AF202543	1p31
DIRAS3 BSR1	CCTTAAACTTCTAAACTAACCCCTC
SNP	DIRAS3 SF1	ACTTACCTTTCTCGGAGGCACG	321	65
DIRAS3 SR1	AACAGTTCCTCCCCAACCTGTAAAC
NAP1L5	BS	NAP1L5 BS2F1	TGATAGTGGGAAGTTAGTTAAGTGT	348	57	Taq1	AC108065	4q21-q22
NAP1L5 BS2R1	AAAATCTAAAACTCCTCAACCATC
SNP	NAP1L5 SF1	GCTGTCACAGTCTCCACCCTGC	202	66
FAM50B	BS	FAM50B cBSF1	GGGTTTTGAGGAGAGTGTTAGGTTTT	334	57	Taq1	Y18504	6p25.2
FAM50B cBSR1	AAAACTCTCTAAATAACCACAACAACTTAC
SNP	FAM50B SF1	CAGGTAATGTTCACGAGACGCCACAG	218	67
FAM50B SR1	GGGGCTCCTGTTTTCACGCTGTG
ZAC	BS	ZAC F	GGGTAGTYGTGTTTATAGTTTAGTA	152	57	Taq1	AL109755	6q24-q25
ZAC R	CRAACACCCAAACACCTACCCTA
GRB10	BS	GRB10 BSF2	GTTAGGGGTTTGYYGGTAGAAAAT	245	55	Taq1	AC004920	7p12.2
GRB10 BSR2	CCAATCCCTCRAAAACTAA
SNP	GRB10 SF1	GAACGCGCTAGCACGAAAAGC	185	69
PEG10	BS	PEG10 BSF1	TTTAGTTTGGTTAGTTTAGTATTAGTATTT	395	55	Taq1	AC069292	7q21
PEG10 BSR1	AAAAATAAAATCCCACACCTAAAC
PEG1	BS	hPEG1 BSF1	AATTTTAATTATTTGATGAGTTATGAG	275	57	Taq1	AB045582	7q32
hPEG1 BSR1	ATATTTTCAAATTTCAAATAACAAC
SNP	PEG1DMR sF2	GTATCACGGTGGCGGAGTC	315	61
PEG1DMR sR2	ATGAGCGGAGACAATAAGCCAAAC
INPP5Fv2	BS	INPP5Fv2 BS4F1	TAGGAATTTTAATTATAAGTTTTGTAA	203	55	Taq1	AL133461	10q26.11
INPP5Fv2 BS4R2	AATACAAACAACTATTAAACCTC
LIT1	BS	LIT1 F	TTTTGGTAGGATTTTGTTGAGGAGT	307	57	Taq1	U90095	11p15
LIT1 R	CCTCACACCCAACCAATACCTC
RB1	BS	RB1 BSF2	GTGAAAGTGGGTTTTGGGTAGTTTG	241	59	Taq1	AL392048	13q14.2
RB1 BSR1	CTTAAACATTTCCAAAACTACCCTACC
SNP	RB1 SF1	CCGCCGCCTCTACGTTCCTTTTG	480	68	Taq1	U41384	15q11.2
RB1 SR1	CCTAGACGCTGACCATTCCCACAAAG
SNRPN	BS	hSNRPN BSF1	AGGAGGTTATGGTAGTGGATTAGG	383	59	Hha1	U41384	15q11.2
hSNRPN BSR1	CACCACAATAAACAAACCAAATAAC
SNP	SNRPN-DMR sF3	ACCGAGGCGAGGAGGCTATG	335	68
SNRPN-DMR sR3	GACTGTGCTACTGCCCTTCTG
ZNF597	BS	ZNF597 BSF1	GTTTTTTGATAGGAGTTGTAGAAAG	254	57	Taq1	AC025283	16p13.3
ZNF597 BSR1	CAACACTCCAAATACTACAAATCCTC
SNP	ZNF597 SF1	CGGGTGGGGAATGCCTTCTTCAAG	409	67	Taq1	AC011487	19q13.42
ZNF597 SR1	GAGAACTTCGACCAATCAAAGGGCAGG
ZNF331	BS	ZNF331 BSF2	GTYGGGTTTTGTGTGTTTGTATAT	270	57	Taq1	AC006115	19q13.4
ZNF331 BSR1	ATCCCRCCACCCCCTAAAACCAAC
SNP	ZNF331 SF2	CGTGTCAGTGTGTCCGCGTGTCA	456	69	Taq1	AC006115	19q13.4
ZNF331 SR2	GGCTGCGTCACTGGTGCAAACG
PEG3	BS	PEG3 BS2F3	GGTTTGTGATTGGTTAGTATAGAAGTT	227	55	Taq1	AC006115	19q13.4
PEG3 BS2R0	CTCACCTCACCTCAATACTACRCAAC
SNP	PEG3-DMR sF1	CTGTGCCCACTCTCGGACTG	342	66
PEG3-DMR sR1	CACCTCGGTGCAGAAGTCTGG
PSIMCT-1	BS	PSIMCT-1 BSF1	GGATGTAGTTGGATATATTTTTTTT	328	55	Taq1	AL110115	20q11.2
PSIMCT-1 BSR1	ACTTATCAAACCCTACTATTTCAAAC
NNAT	BS	NNAT BS2F1	TTTTAGTTAGTGGGGTTTTTTGTATT	365	55	Taq1	AL109614	20q11.2-q12
NNAT BS2R1	CATTACACCTCCATCTACTACTACTAT
SNP	NNAT S2F1	TCAAACAGCCCAGCGTCAACCTTTG	237	61	Taq1	AL031681	20q13.12
NNAT S2R1	ACCTCTTTCCAGCAAGCTGCCTG
L3MBTL	BS	L3MBTL BSF0	GTGTAGTTTGGAAGTGTTTTTTG	331	55	Taq1	AL031681	20q13.12
L3MBTL BSR1	AAACCAACTCAAACCTAAAACAC
NESPAS	BS	NESPAS BSF1	AGTAAAGTTTTTTTAGGGAGTAGTTG	312	55	Taq1	AJ251760	20q13.32
NESPAS BSR1	AACAAACTATAATAAAACCTAAAAACTAA
SNP	NESPAS SF1	CATGGTATTTATCTGTGGGTTCAG	287	62	Taq1	AF246983	20q13.3
NESPAS SR1	GCAGGTGCTCTCTTGTTTATG
GNAS1A	BS	GNAS1A BSF1	GTGTGAGTGTATTTTATTTATATGTAAGT	236	55	Taq1	AF246983	20q13.3
GNAS1A BSR1	AACAAAATCTATTTACCCCTCAAAC
SNP	GNAS1A SF1	GCTGCCTTGCGTGTGAGTGC	251	67	Taq1	AF246983	20q13.3
GNAS1A SR1	CGGATGGCAGGAGTCTGTTTACC
LINE-1	BS	LINE-1 BSF1	TTGAGTTGTGGTGGGTTTTATTTAG	413	50	Taq1	X58075	20q13.3
LINE-1 BSR1	TCATCTCACTAAAAATACCAAACA
Alu	BS	Alu BSF	GATCTTTTTATTAAAATATAAAATTAGT	152	43	Mbo1	U14568	20q13.3
Alu BSR	GATCCCAAACTAAAATACAATAA