Silviase/jgov_v1.4_full_ann huggingface dataset:
職員の区分	職務の級	1級	2級	3級	4級	5級	6級
号俸	俸給月額	俸給月額	俸給月額	俸給月額	俸給月額	俸給月額
1	150,700	200,800	247,100	269,000	315,800	360,100
2	151,900	202,600	248,700	270,800	318,000	362,700
3	153,100	204,400	250,300	272,600	320,300	365,200
4	154,300	206,100	251,900	274,300	322,500	367,800
5	155,300	207,800	253,300	276,100	324,800	369,900
6	156,800	209,600	254,700	278,300	326,800	372,400
7	158,200	211,400	256,200	280,600	329,000	374,800
8	159,600	213,100	257,700	282,900	331,200	377,300
9	160,900	215,000	259,000	285,000	333,300	379,800
10	162,300	216,500	260,500	287,200	335,500	382,500
11	163,700	218,000	262,000	289,500	337,600	385,100
12	165,200	219,500	263,200	291,700	339,800	387,800
13	166,700	221,000	264,500	293,700	341,800	390,200
14	168,200	222,600	266,400	296,000	343,800	392,500
15	169,700	224,200	268,200	298,300	345,900	394,700
16	171,200	225,800	270,100	300,600	347,900	397,100
17	172,800	227,200	271,800	302,700	349,800	398,900
18	174,600	228,800	273,700	305,000	351,800	400,900
19	176,300	230,300	275,600	307,200	353,700	402,800
20	178,000	231,800	277,400	309,500	355,600	404,600
21	179,600	233,100	279,000	311,700	357,600	406,500
22	181,300	234,600	280,800	313,800	359,500	408,300
23	183,000	236,000	282,500	316,000	361,500	410,100
24	184,700	237,600	284,300	318,100	363,400	412,000
25	186,300	239,100	286,200	320,200	365,400	413,800
26	188,100	240,800	287,900	322,200	367,300	415,300
27	189,900	242,400	289,700	324,300	369,300	416,800
28	191,600	244,100	291,500	326,300	371,300	418,400
29	193,400	245,600	293,100	328,300	372,800	420,000
30	194,900	247,000	294,800	330,400	374,600	421,300
31	196,400	248,500	296,500	332,400	376,400	422,600
32	197,800	250,000	298,100	334,500	378,000	423,800
33	199,300	251,500	299,700	336,300	379,800	425,000
34	200,600	252,800	301,300	338,200	381,200	426,300
35	201,900	254,200	302,800	340,200	382,700	427,600
36	203,200	255,600	304,400	342,100	384,300	428,800
37	204,500	257,000	306,100	343,600	385,700	430,000
38	205,900	258,800	307,600	345,500	386,900	430,800
39	207,300	260,400	309,200	347,400	388,100	431,600
40	208,700	262,100	310,800	349,200	389,200	432,400
41	209,700	263,600	312,200	351,100	390,300	433,000
42	210,900	265,300	313,800	352,900	391,500	433,700
43	212,000	266,900	315,400	354,700	392,700	434,400
44	213,200	268,500	316,900	356,400	393,800	435,100
45	214,100	270,200	318,200	358,200	394,500	435,900
46	215,200	271,800	319,400	359,600	395,200	436,700
47	216,300	273,500	320,600	361,100	395,900	437,100
48	217,300	275,200	321,800	362,500	396,600	437,800
49	218,300	276,700	322,800	363,500	397,200	438,300
50	219,400	278,300	323,800	364,600	397,800	438,700
51	220,600	279,900	324,700	365,700	398,300	439,100
52	221,400	281,400	325,700	366,800	398,700	439,500
53	222,300	283,100	326,600	367,700	399,100	439,900
54	223,400	284,600	327,300	368,300	399,400	440,300
55	224,300	286,000	328,100	369,100	399,700	440,700
56	225,300	287,500	328,900	369,900	400,000	441,000
57	226,200	289,000	329,500	370,700	400,300	441,300
58	227,100	290,400	330,000	371,500	400,600	441,700
59	228,100	291,900	330,600	372,300	400,900	442,000
60	229,100	293,400	331,100	373,100	401,200	442,300
61	230,100	294,700	331,600	374,000	401,500	442,600
62	231,200	296,200	331,800	374,700	401,800
63	232,200	297,600	332,400	375,400	402,100
64	233,100	299,100	333,000	376,100	402,400
65	234,000	300,300	333,300	376,400	402,700
66	235,100	301,600	333,800	377,000	403,000
67	236,300	302,800	334,300	377,600	403,300
68	237,500	304,100	334,800	378,300	403,600
69	238,500	305,100	335,300	378,700	403,800
70	239,600	306,200	335,800	379,400	404,100
71	240,700	307,400	336,200	380,000	404,400
72	241,700	308,600	336,700	380,600	404,700
73	242,500	309,900	336,900	381,000	404,900
74	243,600	310,600	337,400	381,600	405,200
75	244,700	311,300	337,900	382,200	405,500
76	245,800	311,900	338,400	382,800	405,700
77	246,700	312,700	338,700	383,200	405,900
78	247,700	313,400	339,100	383,700
79	248,700	314,100	339,600	384,200
80	249,700	314,800	340,000	384,800
81	250,700	315,100	340,200	385,300
82	251,500	315,400	340,500	385,700
83	252,500	316,000	341,000	386,100
84	253,500	316,300	341,400	386,500
85	254,300	316,700	341,700	386,700
86	255,100	317,000	342,000	386,900
87	256,000	317,400	342,500	387,200
88	256,900	317,700	342,900	387,500
89	257,600	318,200	343,200	387,700
90	258,400	318,600	343,600	388,000
91	259,200	318,900	344,000	388,300
92	260,000	319,200	344,200	388,500
93	260,700	319,700	344,500	388,700
94	261,400	320,100
95	261,900	320,300
96	262,600	320,700
97	263,300	321,100
98	264,000	321,500
99	264,700	321,900
100	265,400	322,300
101	265,900	322,500
102	266,400	322,800
103	266,800	323,100
104	267,300	323,400
105	267,400	323,800
106	267,700	324,000
107	268,000	324,300
108	268,300	324,700
109	268,700	325,100
110	269,000	325,400
111	269,400	325,800
112	269,700	326,100
113	270,000	326,400
114	270,300	326,800
115	270,600	327,100
116	271,000	327,300
117	271,300	327,400
118	271,600	327,800
119	272,000	328,200
120	272,400	328,600
121	272,600	328,800
122	272,800
123	273,200
124	273,500
125	273,700
126	274,000
127	274,400
128	274,800
129	275,000
130	275,400
131	275,800
132	276,100
133	276,300
134	276,600
135	277,000
136	277,300
137	277,500
138	277,800
139	278,100
140	278,400
141	278,600
142	278,800
143	279,000
144	279,300
145	279,700
146	279,900
147	280,200
148	280,500
149	280,800
150	281,000
151	281,300
152	281,500
153	281,800
再任用職員	199,200	238,700	253,000	286,100	312,800	354,500

備考 この表は、障害者支援施設、児童福祉施設等で人事院の指定するものに勤務し、入所者の指導、保育、介護等の業務に従事する職員で人事院規則で定めるものに適用する。
職員の区分	職務の級	1 級	2 級	3 級
号俸	俸給月額	俸給月額	俸給月額
1	円	円	円
2	325,300	426,200	479,000
3	327,300	430,600	484,600
4	329,400	434,600	490,100
331,400	438,700	495,500
5	333,500	442,500	500,800
6	335,500	446,400	506,000
7	337,500	449,700	511,100
8	339,600	453,200	515,800
9	341,700	456,700	519,300
10	343,600	460,100	522,100
11	345,600	463,000	524,900
12	347,700	465,700	527,500
13	349,800	468,100	529,600
14	351,700	470,400	531,600
15	353,700	472,300	533,300
16	355,600	474,000	535,100
17	357,400	475,300	536,700
18	359,300	476,600	538,100
19	361,100	477,500	539,100
20	362,800	478,500	540,300
21	364,700	479,300	541,200
22	366,600	480,100
23	368,400	480,300
24	370,300
25	372,000
26	373,700
27	375,500
28	377,200
29	378,600
30	380,300
31	382,000
32	383,500
33	385,300
34	386,600
35	388,000
36	389,500
再任用職員以外の職員	37	390,800
38	391,900
39	393,000
40	394,000
41	395,000
42	396,100
43	397,100
44	398,000
45	398,800
46	399,200
47	399,600
48	399,900
49	400,200
50	400,500
51	400,800
52	401,100
53	401,400
54	401,700
55	402,000
56	402,300
57	402,600
58	402,900
59	403,200
60	403,500
61	403,700
62	404,000
63	404,300
64	404,600
65	404,800
66	405,100
67	405,400
68	405,700
69	405,900
70	406,200
71	406,500
72	406,700
73	406,900
74	407,200
75	407,500
76	407,700
77	407,900
再任用職員	322,100	423,300	478,100

備考 この表は、行政の特定の分野における高度の専門的な知識経験に基づく調査、研究、情報の分析等を行うことにより、政策の企画及び立案等を支援する業務に従事する職員で人事院規則で定めるものに適用する。
号 俸	俸 給 月 額
1	705,000
2	760,000
3	817,000
4	894,000
5	964,000
6	1,034,000
7	1,106,000
8	1,174,000

備考 この表は、事務次官、外局の長、試験所又は研究所の長、病院又は療養所の長その他の官職を占める職員で人事院規則で定めるものに適用する。
号俸	俸 給 月 額
1	392,000
2	452,000
3	514,000
4	594,000
5	691,000
6	789,000

号俸	俸 給 月 額
1	326,000
2	362,000
3	390,000

別記第7

号俸	俸 給 月 額
1	370,000
2	418,000
3	470,000
4	531,000
5	606,000
6	708,000
7	828,000
4

平成25年行政事業レビュージート(文部科学省)
事業名	革新的細胞解析研究プログラム(セルイノベーション)	担当部局庁	研究振興局	作成責任者
事業開始・終了(予定)年度	平成21年度～	担当課室	ライフサイエンス課	ライフサイエンス課長板倉康洋
会計区分	一般会計	政策・施策名	科学技術の戦略的重点化X-1 ライフサイエンス分野の研究開発の重点的推進及び倫理的課題等への取組
根拠法令(具体的な条項も記載)	-	関係する計画、通知等	新たなライフサイエンス研究の構築と展開(平成21年12月ライフサイエンス委員会)、第4期科学技术基本計画(平成23年8月閣議決定)
事業の目的(目指す姿を簡潔に。3行程度以内)	近年急速に性能が向上している高速のシーケンサー等を活用して、従来なし得なかった大規模・多面的な遺伝情報解析や細胞情報の経時・連続計測等の手法を駆使し、細胞・生命プログラム解読に挑むとともに、生命現象の統合的理解や医学・薬学等幅広い研究分野へ波及効果を与えること等を目的とする。
事業概要(5行程度以内。別添可)	本プログラムは、革新的な解析能力を持つ高速シーケンサーを整備した「シーケンス拠点」と、多様かつ大量のデータを取扱う「データ解析」拠点を構築し、細胞機能解析研究を行うとともに、次世代シーケンサーを利用して従来の技術で取得不可能だった細胞情報を取得するための革新的な技術開発を行うものである。※平成23年度までは事業中にターゲットタンパク研究プログラムとセルイノベーションの2つのプログラムが存在していたが、ターゲットタンパク研究プログラムは平成23年度に終了した。(従って下記の予算額・執行額は平成23年度までは両プログラムの合計額を記す。)
実施方法	□直接実施 ■委託・請負 □補助 □負担 □交付 □貸付 □その他
予算額・執行額(単位:百万円)	22年度	23年度	24年度	25年度	26年度要求
予算の状況	当初予算	5,170	2,144	852	772
補正予算	-	-	-	-
線越し等	△5	5	-	-
計	5,165	2,149	852	772
執行額	5,153	2,144	851
執行率(%)	99.8%	99.8%	99.9%
成果目標及び成果実績(アウトカム)	成果指標	単位	22年度	23年度	24年度	目標値(年度)
細胞・生命プログラムの解明に向けて解析した細胞種の数	成果実績	(件)	109	175	144	-
達成度	%	-	-	-
活動指標及び活動実績(アウトブット)	活動指標	単位	22年度	23年度	24年度	25年度活動見込
機関数及び課題数	活動実績(当初見込み)	機関数課題数	1312	1312	1011	-
単位当たりコスト	85(百万円/機関)	算出根拠	85(百万円/機関)＝(平成24年度執行額:852百万円)/(実施機関数:10)
平成25・26年度予算内訳	費目	25年度当初予算	26年度要求	主な増減理由
諸謝金	0.3百万円
職員旅費	0.4百万円
委員等旅費	0.3百万円
庁費	0.3百万円
科学技術試験委託費	770.4百万円

計	772百万円	※表示単位未満四捨五入の関係で、積み上げと合計は一致しない。
事業所管部局による点検
項 目	評価	評価に関する説明
国必要投性入の	広く国民のニーズがあるか。国費を投入しなければ事業目的が達成できないのか。	○	•第4期科学技術基本計画(平成23年8月19日閣議決定(4.(2),iii)))の「安全で有効性の高い治療の実現」に資する施策であり、シーケンサー技術等を活用し、大規模・多面的な遺伝情報解析等を行い、医学・菓学等の研究分野への波及効果等を目指す本事業は、優先度が高く、国が責任を持って実施する必要性がある。
地方自治体、民間等に委ねることができない事業なのか。	○
明確な政策目的(成果目標)の達成手段として位置付けられ、優先度の高い事業となっているか。	○
事業の効率性	競争性が確保されているなど支出先の選定は妥当か。	○	•実施課題を公募し、外部有識者から構成される課題選考委員会による書面審査、ヒアリング審査を経て厳格に選考している。•プログラムディレクター、プログラムオフィサー制度を導入し、実施機関に研究内容に即して厳格に精査し資金を配分しており、適切に契約を行っている。•また、費目・使途が事業目的に即しているか等について、現地における確認等も含む額の確定調査を実施している。
受益者との負担関係は妥当であるか。	—
単位当たりコストの水準は妥当か。	○
資金の流れの中間段階での支出は合理的なものとなっているか。	—
費目・使途が事業目的に即し真に必要なものに限定されているか。	○
不用率が大きい場合、その理由は妥当か。(理由を右に記載)	—
事業の有効性	事業実施に当たって他の手段・方法等が考えられる場合、それと比較してより効果的あるいは低コストで実施できているか。	○	•本事業は国の委託事業として実施する政策課題対応型の研究開発である。また、成果目標を達成するために必要な活動実績(実施機関数、課題数)を充たしている。•本事業の成果として、多数の細胞の基本原理を解明に成功するとともに、超微量試料のシーケンス技術、パイオセンサー及び細胞可視化技術等、優れた技術が創出されている。特にエピゲノム解析技術は国際エピゲノムコンソーシアム(IHEC)で標準解析技術に採用され、国内外の研究者に広く活用されている。また、本事業で整備したシーケンス拠点は実施機関及び外部機関に対し広く共用することにより、十分に活用している。また、データ解析拠点で開発された解析ツール、データベースは国内外のライフサイエンス研究者に広く活用されている。
活動実績は見込みに見合ったものであるか。	○
整備された施設や成果物は十分に活用されているか。	○
重複排除	類似の事業がある場合、他部局・他府等と適切な役割分担を行っているか。(役割分担の具体的な内容を各事業の右に記載)	—
事業番号	類似事業名	所管府省・部局名

点検結果	○本事業の実施により、これまでに医学・菓学の波及効果をもたらす発生・分化、がんなどに関わる多数の細胞機能の基本原理等の解明に成功している。また、極めて有用性の高い微少試料によるシーケンス技術、パイオセンサー及び細胞可視化技術等の技術開発に成功している。○平成25年度は、これまでに開発した超微量試料のシーケンス技術等を最大限に活用し、細胞機能の解析、基本原理の解明をより一層推進しつつ、これまでの基礎研究及び技術開発の成果の普及を推進する予定である。○本事業は、平成25年度をもって終了するが、本事業の今後の在り方については、外部有識者による事後評価結果(平成25年7月取りまとめ予定)等を踏まえ検討する予定である。○本事業は、明確な目標・計画に沿って国の委託事業として実施する政策課題対応型の研究開発であり、支出先の使途の適切性及び効率性について、プログラムディレクター、プログラムオフィサー制度等を活用しつつ、厳格に管理している。また、全ての委託契約について、支出先・使途を把握し、備品が適切に購入され、活用されているか等について、現地における確認等も含む額の確定調査を実施している。○成果目標の達成に向けた進捗管理については、プログラムディレクター、プログラムオフィサーによる毎年度の内部評価コメントの実施機関への通知及び実施機関におけるサイトビジットによる指導助言等により、効率的効果的な事業の推進に努めている。
外部有識者の所見
行政事業レビュー推進チームの所見
所見を踏まえた改善点/概算要求における反映状況
備考
<政策評価書>○政策評価書記載ページ:http://www.mext.go.jp/a_menu/hyouka/kekka/1291037.htm<関連ホームページ等>○事業のホームページ:http://www.cell-innovation.org/事業の目的や詳細な研究内容の紹介○データ解析拠点のホームページ:http://cell-innovation.nig.ac.jp/ゲノム等の解析ツールを集めたパイプラインを提供。
関連する過去のレビューシートの事業番号
平成22年	0266	平成23年	0249	平成24年	0264
費目·使途(「資金の流れにおいてプロックごとに最大の金額が支出されている者について記載する。費目と使途の双方で実情が分かるように記載)	A.大学共同利用機関法人情報システム研究機構	E.
費目	使途	金額(百万円)	費目	使途	金額(百万円)
外注費	プログラム開発等	71
人件費	研究補助者の雇用	20
物品費	データ管理・解析システム	1
旅費	国内旅費、外国旅費	1
間接経費	直接経費の30%	28

計	121	計	0
B.(独)科学技术衞振興機構	F.
費目	使途	金額(百万円)	費目	使途	金額(百万円)
委託費	支援業務委託費	18

計	18	計	0
C.	G.
費目	使途	金額(百万円)	費目	使途	金額(百万円)

計	0	計	0
D.	H.
費目	使途	金額(百万円)	費目	使途	金額(百万円)

計	0	計	0
## 支出先上位10者リスト

A.

支出先	業務概要	支出額(百万円)	入札者数	落札率
1	大学共同利用機関法人情報・システム研究機構	データ解析拠点の構築と情報研究開発	121	企画競争	-
2	独立行政法人理化学研究所	次世代シーケンサー拠点整備及び運営	104	企画競争	-
3	独立行政法人理化学研究所	細胞比率制御ネットワークと細胞ヘブ学習則の解明	102	企画競争	-
4	国立大学法人東京大学	初期発生における雌雄染色体コリオグラフィーについての革新的研究	93	企画競争	-
5	国立大学法人東京大学	次世代シーケンサーを活用した前立腺がんと乳がんの細胞制御システム機構の解明	60	企画競争	-
6	国立大学法人東京大学	細胞がん化シグナルネットワークの統合システム解析	46	企画競争	-
7	国立大学法人東京大学	データ解析拠点の構築と情報研究開発	45	企画競争	-
8	国立大学法人東京大学	細胞解析研究革新のための高性能エピゲノムシークエンス技術の開発	42	企画競争	-
9	国立大学法人京都大学	細胞がん化シグナルネットワークの統合システム解析	38	企画競争	-
10	学校法人埼玉医科大学 埼玉医科大学	神経細胞機能に着目した、ミトコンドリア呼吸鎖異常を起こす遺伝子変異の系統的な探索	37	企画競争	-

支出先	業務概要	支出額(百万円)	入札者数	落札率
1	独立行政法人科学技術振興機構	革新的細胞解析研究プログラム(セルノベーションにおける課題の採択における研究の評価、事業の管理等の事務を支援。	18	企画競争	-

B.
# 革新的細胞解析研究プログラム（セルイノベーション）

## 事業目的

近年急速に性能が向上している高速のシーケンサー等を活用して、従来なしえなかった大規模・多面的な遺伝情報解析や細胞情報の経時・連続計測等の手法を駆使し、細胞・生命プログラム解読に挑む。これにより、生命現象の統合的理解、医学・薬学等の産業への貢献することを目指す。

## 事業概要

## 〇シーケンス拠点、データ解析拠点整備

・大量かつ多面的なゲノム情報の統合解析により細胞・生命プログラムを解明するために、革新的な解析能力を持つ次世代シーケンサーを整備したシーケンス拠点と大量データを扱うデータ解析拠点を構築。

☐ 先導研究

・遺伝子の働きの変化、細胞内の情報の伝わり方等について、従来なしえなかった多種多様な大量遺伝子情報解析を行うとともに、細胞情報の経時・連続計測やシステムバイオロジー研究等の手法を駆使し、がん等の細胞・生命プログラム解読に向けた先導研究を推進する。

## 先導研究 大学等

・がん等に関わる細胞の機能の基本原理や高次生命活動機構の解明・次世代シーケンサーを活用した細胞機能解析

## オールジャパンのチーム体制の

## 構築

拠点と先導研究の積極的な連携を加速

## データ解析拠点

・大量情報の一元管理

・データ解析技術の開発

・データ共有、データ公開

## 情報・システム研究機構

## シーケンス拠点 理化学研究所

・最先端の次世代シーケンサーを整備

・研究コミュニティ一等に開かれた拠点

※シーケンス利用技術開発は、運営費交付金で実施し、本プログラムを支援。
## 平成25年度の運営体制図

## プログラムの推進

・プログラムの進捗管理・実施者への指導・助言

・内部評価等の実施及びプログラムの運営方針に係る助言・提言等

## プログラムの運営

・プログラムの運営状況の把握・指導

・年間スケジュールの企画、検討

・プログラムの円滑な運営に必要な事項の検討

【メンバー】

PO、有識者、実施者

文部科学省主体

实施者等主体

文部科学省

(事務局)

PDCAサイクルを着実に実施するため、①毎年度の全課題を対象とした成果発表会におけるヒアリング等の実施、②PD・POによる詳細な内部評価の実施、③サイトビジットなどを通じたPD・POによる進捗状況の把握等により、次年度以降の資源配分等を含めた研究計画の見直し等を行い、適切なプログラムの運営を行った。
# セルイノベーション PD/POマネージメント

## 1 各種委員會

・拠点ワーキンググループ:プログラムの円滑な運営等の目的で、年間スケジュールの企画、検討、プログラム運営状況の把握、両拠点の活動の進め方、進捗状況の把握等を行う。平成22年度から運営委員会に発展的に改組、平成21年度は2回開催

·運營委員會:平成22年度、5回、平成23年度、3回、平成24年度、3回、計13回開催

・実施者会議:プログラム実施者間の意見交換を行うことを目的とし、各年度ごと1回開催

・協力機関選定ワーキンググループ:協力機関の選定を目的とし平成22年度2回開催

·倫理ワーキンググループ:プログラムのヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理について検討することを目的に平成23年度に設置、平成23年度、3回、平成24年度1回、計4回開催

## 2 成果発表会: 研究実施者の情報交換及び研究者間の交流を図るために年1回開催

平成22年度(2日間) 東レ総合研修センター 参加者79名

平成23年度(1日) 東京大学医科学研究所、参加者83名

平成24年度（2日間）沖縄科学技術大学院大学、参加者56名

3 サイトビジット: PD/POが両拠点に導入された機器資源の有効活用や先導研究の進捗状況について把握するとともに、研究者間の交流や情報共有を行うことを目的として実施した。

シーケンス拠点 平成21年11月26日、理化学研究所 参加者18名

データ解析拠点 平成22年5月28日、国立遺伝学研究所 参加者35名

シーケンス拠点 平成22年8月25日、理化学研究所 参加者41名

先導研究 平成23年5月～6月 先導研究機関 10か所(含 分担研究機関)

4 両拠点/PO打合せ: 拠点のプログラム運営において、シーケンス事業の進捗状況や課題等について、定期的にPOに報告して議論し、先導研究側とも連絡と取り、円滑なプログラム運営を行った。年平均4～5回開催した。また、プログラム運営の状況に応じてPD/POからプログラムメンバーに向けて「要請文書」を発信した。

5 中間評価を受けての組み直し、シークエンス量の柔軟な対応：シークエンス拠点でのシークエンスにかかる経費は、各先導研究に年度ごと割り当てるのではなく、年度初めに各先導研究のシークエンス希望を取り、まずその年度の半量から3／4量程度のシークエンス量の割り当てを年度初めに行い、先導研究の進捗度をそれを3か月から半年間隔でモニターして、シークエンス量の割り当ての見直しを行った。これにより、サンプル調整の遅れなどで当初のシークエンス予定がこなせないグループのシークエンス予算を、進捗の速いグループのシークエンスに回すなど、効率的な予算執行ができた。
## シーケンス拠点利用状況

拠点の保有するシーケンサ

機種	Heliscope	HiSeq2500	Genome Analyzer IIx	SOLiD 4	GS FLX+	GS Jr
メーカー	Helicos Biosciences	Illumnia	Life Technologies	Roche
DNAの増幅方法	増幅無し	ブリッジPCR	エマルジョンPCR
シーケンス法	合成法	合成法	連結法	パイロシケンス法
リード長	平均35 bp	2 x 100 bp	2 x 150 bp	2 x 50 bp	最頻長 1000 bp	最頻長 400 bp
データ量/ラン	21-35 Gb	600 Gb	85-95 Gb	80-100 Gb	700 Mb	35 Mb
解析時間	8日間	約11日間	約14日間	約16日間	10時間	10時間
平成21年度補正予算で措置	4	4	2
理化学研究所交付金で措置	1	2	2	1	1
写真

先導研究からの合計依頼数(H21～H24)、アプリケーション別、シーケンサ機種別

シーケンサ	アプリケーション	ChIP-seq (MeDIP-seq)	RNA-seq	CAGE	small RNA	DNA-seq (genome, bisulfite, exsome)	合計
Helicos	sample	15	10	123	148
request	2	1	9	12
illumina (GAIlx, HiSeq2000)	sample	338	466	8	155	200	1167
request	41	59	1	15	24	140
SOLiD4	sample	92	27	119
request	14	2	16
GS FLX+	sample	2	2
request	1	1
合計	sample	353	568	131	155	229	1436
request	43	74	10	15	27	169

協力機関からの合計依頼数(H23-H24)

アプリケーション	依頼件数	サンプル数
Genome-seq	2	2
Exome	2	8
DNA-seq	3	12
RNA-seq	2	37
合計	9	59

拠点が独自に開発した技術(CAGE)を先導研究に優先して提供

先導研究からの サンプル数の推移(個)

同依頼件数の推移(件)

同データ生産量の推移(Gbase)
## データ解析拠点の利用状況

## ☑ 計算機利用狀況

Hitachi BS320

Server: 10 blades

OS: RedHat Linux 5

CPU: 20CPU (80core)

Xeon X5570

Memory Total: 344GB

DISK: 300TB

拠点サービス運用システム

HP ProLiant 460/490 Server: 30 blades OS: RedHat Linux 5 CPU: 60 CPU (120 core) Xeon 5570 Memory Total: 3240 GB

【用途】·Web公開

·データベース運用

·各種運用ステム

Fujitsu T5440

Server: 1 server

OS: Solaris 10

CPU: 4CPU (32core)

UltraSparc T2 Plus

Memory: 512GB

配列解析パイプラインステムデータ解析システム

【特徴】・72～512GBの大容量メリ

【用途】・マッピング

・アセンブル

・各種解析ツールの利用

利用状況(平成25年5月27日時点)

解析用ストレージ 86TB(78%)

運用ストレージ 39TB(13%)

汎用ストレージ 572TB(58%)

利用状況(前回 平成23年)

解析用ストレージ 59TB(54%)

運用ストレージ 21TB(7%)

汎用ストレージ 296TB(30%)

## ■NGS $ ^{※1} $ 関連情報発信用Webサイト(NGS Surfer's Wiki $ ^{※2} $ )のアクセス統計

アクセス回数(リクエストページ数)推移

アクセス数組織別トップ10

#	組織ドメイン	アクセス数
1	東京大学	76,064
2	お茶の水女子大学	45,243
3	京都大学	39,635
4	理化学研究所	35,562
5	東京工業大学	20,250

#	組織ドメイン	アクセス数
6	金沢大学	30,996
7	農業・食品産業技術総合研究機構	14,932
8	奈良先端科学技術大学院大学	10,120
9	東北大学	9,669
10	大阪大学	9,356

■施設・設備・公開ツール／データベースの利用状況

利用施設、データベース等	利用者数	内産業界の利用者数	ページアクセス数
NGSデータ解析プラットホーム環境(ハードウェア)	40	0	—
NGSデータ解析プラットホーム環境(ソフトウェア:Maser,Genome Explorer,CONG,gGraph,iGene)	301	3	193,825
NGS surfer 's wiki（注:「利用者」は編集権限登録者とする）	142	21	3,788,352

## ■先導および外部協力研究機関への対応状況

機関	項目	平成22年	平成23年	平成24年	総計
先導研究	解析サンプル数	286	595	369	1,250
解析数	2,010	8,641	8,881	19,532
メール対応	485	439	350	1,274
協力機関	解析サンプル数	1	28	259	288
解析数	0	771	4,431	5,202
メール対応	39	274	364	677
合計	解析サンプル数	287	623	628	1,538
解析数	2,010	9,412	13,312	24,734
メール対応	524	713	714	1,951

■データ解析拠点Webサイトへの海外からのアクセス数(国・地域別)

## $ ^{※} $ 1:NGS

次世代シーケンサー（Next Generation Sequencing）の略。新しい原理にもとづく配列解読装置（シーケンサー）で配列解読の超高速化，大量解読化を可能とした。

## $ ^{※} $ 2 : NGS Surfer’s Wiki

データ解析拠点が運営する次世代シーケンサーのデータ解析のための情報共有サイト。解析方法のQ&Aやツールの各種情報等を提供している。
## エピゲノム解析の技術開発

## 世界最高感度のメチローム解析技術 PBAT法 東京大学 伊藤隆司

·100万細胞とPCR増幅が必要だった全ゲノムバイサルファイトシーケンシングが、僅か1000細胞からPCRなしで実行可能

·PCRの排除によって、データの質も格段に向上

・これまで不可能だったメチローム解析を続々と実現！

・産業界や海外も含めて幅広く技術移転

IHEC(国際エピゲノムコンソーシアム)にて標準技術として採用

PBAT法によるメチローム解析の応用へ(共同研究)

少数細胞(1万個)からのChIP-seq技術の確立

東京大学 白髭克彥

・1万細胞でも100万細胞の場合の94%の部位を網羅

## 細胞イメージングの技術開発

## FRETバイオセンサーの技術開発 京都大学 松田道行

·FRETバイオセンサーの作成法を一新

蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)の原理で細胞内状態をモニター出来るバイオセンサーの作成法を一新。従来のトライ・アンド・エラー法の百倍の効率。多様なFRETバイオセンサーを使った新たな薬剤スクリーニングシステムや、システムバイオロジーへ展開

· FRETバイオセンサーを発現するTGマウス

生きたまま、マウスの細胞での情報伝達分子の細胞内活性状態が観察できる => 新たな薬物作用態解析システム

・情報伝達分子の細胞内活性状態が細胞ごとで揺ぐことを同定　一細胞制御が困難となる可能性

左: 正常マウス

右: FRET発現TGマウス

細胞個別的解析のためのFucciプローブの技術開発 理化学研究所 宮脇敦史

・細胞周期進行を可視化できる蛍光プローブFucciを開発・改良

·第二、三、四世代Fucci

·Fucciを発現する細胞、マウスを作製

B 低濃度（<1μM）エトポシド

• 第二世代Fucciを恒常的に発現する癌細胞を用いて、抗癌剤の作用を再評価する実験系を確立。

- 1細胞のリアルタイムイメージングで、抗癌剤に対する細胞の反応の差異が解析可能
# セルイノベーションで開発された技術(2)

## 単一細胞由来mRNA網羅的定量解析の技術開発

## 磁気ビーズ法による網羅的定量分析用サンプルの作製 (株)日立製作所 神原秀記

## 単一細胞レベルの極微量mRNA(2pg)

·高いcDNA合成効率(85%以上)が実現

・前反応溶液の洗浄除去が可能

・チューブ等へのcDNA吸着ロスの回避

充分量のDNA（1μg以上）を少ない偏り（2倍以内）で増幅する事に成功

## 次世代シーケンサーによる評価

・磁気ビーズ法により、多細胞での測定と同レベルの遺伝子数を同定・7Kb 以下の遺伝子で、多細胞での遺伝子発現量測定値と同等の相関が確認され、磁気ビーズ法の有効性が確認された。

高精度1細胞RNA-seq法（Quartz-seq）の開発

理化学研究所・上田泰己

・単一細胞相当量のRNA(10 pg)サンプルで、定量性や感度の再現性を評価して、高精度の1細胞RNA-Seq法(Quartz-Seq)を開発

- Quartz-Seq法を用いて、胚性幹(ES)細胞と原始内胚葉(PrE)細胞について、1細胞シーケンス解析を実施

Mutual information

・高い定量性により、細胞状態マーカー遺伝子の細胞ごとの発現ばらつきが検出可能
## セルイノベーションの成果(論文・特許)

## 論文件数

論文発表の総数は300報にのぼり、うちインパクトファクター5以上の論文が117報を占め、研究活動の活性や水準の高さが示された。

## 著名なジャーナルへの論文発表件数

雑誌名	件数	Impact Factor $ ^{*} $
Nat Rev Mol Cell Biol	1報	39.12
Nature	4報	36.40
Annu Rev Biochem	1報	34.32
Cell	2報	32.40
Nat Immunol	1報	26.00
Cell Stem Cell	1報	25.42
Nat Med	2報	22.46
Immunity	2報	21.63
Mol Cell	1報	14.18
Dev Cell	1報	14.03

## 特許件数

件名	件数	備考
関連特許	15件	国内	8	国外
PCT	6

## 主な特許出願の例

発明の名称	発明者	出願登録区分	出願番号	出願日	出願区分
蛍光共鳴エネルギー移動の原理に基づく一分子型FRETバイオセンサーを最適化するためのリンカー	小松直貴、青木一洋、上岡裕治、幸長弘子、稲岡芳恵、櫻井敦朗、他	出願	特願2010-215738	2010年9月27日	国内
糖代謝、脂質代謝、肥満、及び寿命を制御する制御遺伝子、及びタンパク質、並びにスクリーニング方法	井上聡・池田和博	出願	PCT/JP2011/050331	2011年1月12日	PCT
細胞増殖抑制剤及びそのスクリーニング方法	高山賢一・井上聡	出願	PCT/JP2011/57376	2011年3月25日	PCT
細胞採取システム	白井正敬、角田弘之、松永浩子、他	出願	P2011-087235	2011年4月11日	国内
蛍光共鳴エネルギー移動の原理に基づく一分子型FRETバイオセンサーのリンカー	松田道行、他	出願	ST022-10P	2010年9月27日	PCT

*Impact Factorは2012年11月現在のもの
# セルイノベーション特許戦略(産業移転)

## セルイノベーションで開発された技術を利用した製品化及び委託事業

### 1. Fucci蛍光プローブ(特許化済): 理化学研究所 宮脇敦史

・Fucci蛍光プローブを国内外のバイオ企業(3社)にて製品化

・Fucciを安定に発現した細胞株、トランスジェニックマウス及びゼブラフィッシュは理化学研究所等のバイオリソースセンターより、供給可能

・Fucciを利用した論文数(宮脇グループ:14報)、Fucciを引用した論文数(221報、2013年5月)

・Fucciの医療・産業への利用

i)前臨床的動物実験、癌の浸潤、転移やiPS細胞、ES細胞の分化に関連した評価系の構築

ii)創薬分野で細胞周期制御に関連する薬のスクリーニング、バリデーションに役立つ技術となる

### 2. FRETバイオセンサー:京都大学 松田道行

・EVリンカーを用いたFRETバイオセンサーの(国際)特許申請及び製品化

・FRETバイオセンサー数(世界全体で250以上作成され、その内、京都大学が約50を占める)

・京都大が作成したFRETバイオセンサーを引用した論文数：787報

·配布先:786研究室

・医療等への応用：

i) FRETバイオセンサーを安定に発現させた細胞株の作成と薬剤スクリーニング

ii) トランスジェニックマウスの開発と個体レベルでの利用

### 3. ChIP-Seq用に使用する抗体の製品化;東京大学 白髭克彦

4. PBAT法による受託解析事業の開始(2社、1社は検討中)：東京大学 伊藤隆司
# セルイノベーション 人材育成

## 講習会の開催

1 シーケンサー利用技術講習会: 平成21年12月から平成24年1月までに、理化学研究所 横浜研究所において計9回にわたり、シーケンサー利用技術についての講習会を行った。(参加者のべ,160名、第5回はインターネット中継も行った。) 講習内容は、次世代シーケンサーのライブラリー調製法についての講義と実習が中心であり、データ解析拠点やシーケンサーメーカーの専門家が講習を担当した。

2 データ解析技術講習会: 平成25年3月、国立遺伝学研究所において、データ解析技術講習会「次世代シーケンスデータの解析とプラットフォーム」を開催し、RNA-Seq.、ChiP-Seq.、BS-Seq、Re-sequence.等の、データ解析について講義と実習を行った。(参加者14名、うちプログラム内、9名)

3 若手実務担当者会議: 若手研究者を主な対象者とし、シーケンス技術の情報共有及び拠点と先導の情報交換と交流を目的とする。なお、幹事担当者は全国レベルでこの様な会合を発展させ、「NGS現場の会」を立ち上げて、現在会長に就任している。平成23年1月25日、平成24年2月1日、ともに参加者25名

## 本プログラムに参加した人材のキャリアパス

プログラム参加時の身分（人）	現在の身分（人）
学生	ポスドク	特任職員	常勤職員（大学・独法等）	常勤職員（企業等）	その他
学生	14	4	2	1	2	5
ポスドク	45	21	2	16	2	4
特任職員	24	18	3	3
常勤職員（大学・独法等）	95	1	85	1	8
常勤職員（企業等）	10	1	9

## 本プログラムの経験を生かしたキャリアパスの例

氏名	参加時の職位	現在の職位	·本プログラムに、データ解析拠点分担宮野チームで助教として参画。細胞統合解析パイプラインCellipを開発し、このソフトウェア一の改良やユーザビリティの向上に大きな貢献をした。·Cellipはデータ解析拠点のサーバ一に導入され、データ解析拠点の体制を推進するとともに、細胞・生命プログラムの統合的理解を目的とした先導研究において、実験データとコンピュータ解析をつなぐ共通性・汎用性の高い基盤ソフトウェア一としてさらに開発が進められている。·現在は、国立大学にて教授に就任している。
研究者A	国立大学	国立大学教授
データ解析拠点分担宮野チーム	助教
氏名	参加時の職位	現在の職位	·本プログラムに、研究者Bは先導A-03の上田グループで専門職研究員として参画。研究者Cは先導A-03上田グループに基礎特別研究員として参画。·両名は、1細胞レベルで再現性、定量性に優れた新規RNA-Seq法(Quartz-Seq)の技術開発に中心的な役割を担うとともに論文成果(英国Genome Biology誌)としてまとめ上げた。·その成果により、個々の細胞間に存在する遺伝子発現の不均一性を高精度に解析して評価することが可能になった。·現在は同じ研究ユニットにてユニットリーダ及び上級研究員に就任し、研究を継続している。
研究者B	独法研究所	独法研究所
先導研究A上田グループ	専門職研究員	ユニットリーダ一
研究者C	独法研究所	独法研究所
先導研究A上田グループ	基礎特別研究員	上級研究員
# セルイノベーション 情報発信

### 1. 公開セミナーの開催

アカデミア、一般に向けて公開セミナーを開催し、セルイノベーションの現状の解説、本研究プログラムの目的及び顕著な成果等を紹介。

平成21年度キックオフ・セミナー	平成21年度国際シンポジウム	平成22年度公開セミナー	平成23年度公開セミナー
開催日時	平成21年10月30日(金)9時～17時30分	平成22年3月29日(月)10時30分～17時30分	平成22年11月3日(水)13時～17時30分	平成24年1月31日(火)13時～17時55分
開催会場	東京ガーデンパレス	東京国際フォーラム	TEPIAホール	TEPIAホール
参加人員	230名	120名	142名	177名

### 2. ホームページの開設

プログラムの広報サイトとして、イベントの告知、ニュースレターの掲載や、プログラム関連情報の発信を行っている。また、プログラム関係者向けに限定した資料閲覧、年次予定ページなどを設置した。(http://www.cell-innovation.org/)

### 3. セルイノベーション パンフレット／ニュースレターの発行・配布

パンフレット: プログラムの研究内容や取り組み、推進体制などについてまとめている。

ニュースレター: 研究の紹介や国際会議等に関連するトピックスニュースを掲載。NO1-NO6を発行した。

### 4. 分子生物学会での展示

日本分子生物学会で、パネル展示に出展。平成21年から平成24年まで、4回プログラム等の資料の配布と当ホームページのデモの実施、また、ポスターの展示では、プログラムの紹介と進捗、今後期待される成果について紹介した。

### 5. 産学連携勉強会(JBA)

本プログラムへの理解と産業応用を推進することを狙いとし、(一財)バイオインダストリー協会主催の勉強会を開催した。第1回「セルイノベーションと現代疾患」、第2回「セルイノベーションデータ解析拠点における研究動向」、第3回「セルイノベーションの次世代シーケンサー拠点」、第4回「セルイノベーションにおける革新的研究」、各回30-40名の参加があった。

### 6. 高校生向けアウトリーチ活動

宮城県立仙台第一高校、岡山県立朝日高校による東京大学分子細胞生物学研究所(白髭克彦)の見学
セルイノベーションプログラム研究課題一覧

代表研究者	代表機関	研究課題
シーケンス拠点	(平成25年3月現在)
林崎 良英	独立行政法人理化学研究所	次世代シーケンサー拠点整備及び運営

データ解析拠点

五條堀 孝	大学共同利用機関法人情報・システム研究機構	データ解析拠点の構築と情報研究開発
分担研究	分担研究者	分担機関	サブテーマ
豊田 哲郎	独立行政法人理化学研究所	オミックス統合解析による高精度センシング技術の開発、および、イメージ解析のアノテーションDB構築への対応
宮野 悟	国立大学法人東京大学	イン・シリコ細胞システム解析のための技術開発
見原 明	国立大学法人東京大学	セルイノベーションにおける動向調査業務並びに研究推進業務

先導研究A

松田 道行	国立大学法人京都大学	細胞がん化シグナルネットワークの統合システム解析
分担研究	分担研究者	分担機関	サブテーマ
秋山 徹	国立大学法人東京大学	遺伝子発現解析を基盤とする細胞がん化シグナルのシステム解析・時系列リン酸化プロテオミクスによる癌細胞増殖浸潤制御システムの解明
岡田 真里子	独立行政法人理化学研究所	シグナル転写ネットワークのインフォマティクス解析
井上 聡	国立大学法人東京大学	次世代シーケンサーを活用した前立腺がんと乳がんの細胞制御システム機構の解明
分担研究	分担研究者	分担機関	サブテーマ
堀江 公仁子	学校法人埼玉医科大学	ホルモン治療抵抗性モデルがん細胞の作製と乳がん臨床検体におけるホルモン受容体標的因子群の発現機能解析
間野 博行	学校法人自治医科大学	乳がん細胞におけるマイクロRNA発現プロファイルの網羅的解析
## セルイノベーションプログラム研究課題一覧

代表研究者	代表機関	研究課題
先導研究A	(平成25年3月現在)
上田 泰己	独立行政法人理化学研究所	細胞比率制御ネットワークと細胞ヘブ学習則の解明
白髭 克彦	国立大学法人東京大学	初期発生における雌雄染色体コリオグラフィーについての革新的研究
分担研究	分担研究者	分担機関	サブテーマ
岸本 健雄	国立大学法人東京工業大学	ライブイメージングと細胞生物学的手法による雌雄染色体コリオグラフィーの研究

岡崎 康司	学校法人埼玉医科大学 埼玉医科大学	神経細胞機能に着目した、ミトコンドリア呼吸鎖異常を起こす遺伝子変異の系統的な探索
萩原 正敏	国立大学法人京都大学	網羅的スプライシング暗号解析に基づくRNA 病の解明と治療技術の探索
分担研究	分担研究者	分担機関	サブテーマ
大野 欽司	国立大学法人名古屋大学	エクソン特異的アレイ・CLIPによるスプライシング制御配列の網羅的解析
細谷 孝充	国立大学法人東京医科歯科大学	スプライシング操作化合物の開発

## 先導研究B

宮脇 敦史	独立行政法人理化学研究所	細胞個別的シーケンス解析のための光学的サンプリング技術の開発
伊藤 隆司	国立大学法人東京大学	細胞解析研究革新のための高性能エピゲノムシークエンス技術の開発
神原 秀記	株式会社日立製作所	単一細胞由来mRNAの網羅的定量分析用前処理技術の開発
事業 NO 4
論点等説明シート
担 当 局	研究振興局
事 業 名	革新的細胞解析研究プログラム
論 点 等
○事業の成果は上がっているのか（成果のうち発展させるべき事項はあるのか）。その成果を国内の研究者に広めるべきではないか。○投入された研究費用が効率的に活用されているか。○今後の技術開発への支援の在り方はどうするのか。
## 第3節

# 情報通信と社会生活

## ユビキタスネット社会の深化

## （１）インターネットの浸透

平成18年のインターネットの人口普及率は68.5%、利用人口は8,754万人（対前年比2.6％増）と推定される（図表1-3-1）。

また、インターネットに接続する際に利用する機器を見ると、パソコンと携帯電話・PHSの両方を利用する人が6,099万人（前年比25.4％増）と最も多く、パソコンのみ利用している人が1,627万人（前年比2.6％増）携帯電話・PHSのみの人が688万人（前年比64.2％減）となっている。平成17年との比較で大きく変化した点としては、携帯電話・PHSのみの利用者が大幅に減少した一方、パソコンと携帯電話・PHSの両方の利用者が増加したことがある。その背景としては、加入者系光ファイバ網（FTTH）の普及を背景に、コンテンツもテキストや静止画から音声や動画へと大容量化が進んだことが挙げられる。携帯電話・PHSのみでの利用だけでは、このような大容量のコンテンツを利用したサービスを満足に享受することができない利用者が増加し、パソコンを併用することによって、利用するサービスごとにパソコンと携帯電話・PHSとを使い分ける傾向が高まったことが考えられる（図表1-3-2）。

図表1-3-1 インターネット利用者数及び人口普及率の動向

インターネット利用人口 人口普及率

（出典）総務省「通信利用動向調査（世帯編）」