微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢完全もしくは部分糞便細菌叢、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスであって、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに入れるステップとを含む方法によって作製される、送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。実質的なまたは完全な無酸素環境を前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中に作り出すステップをさらに含む、請求項1に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに、組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構を組み込むことかつまたは、前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、酸素捕捉材料を含むか、それでコーティングされているかつまたは前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中の空気を窒素およびまたは1種もしくは複数の他の不活性非反応性ガスで完全にまたは実質的に置き換えることによって、前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、実質的なまたは完全な無酸素になっている、請求項2に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を入れるステップの前に無菌であるか細菌を含まない、請求項1から3のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、部分的に、実質的なまたは完全な嫌気的環境を模擬しているか、作り出している、請求項1から4のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、ヒトまたは動物で使用するために製造、ラベリングまたは製剤化されている、請求項1から5のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記動物使用が獣医学的使用のためである、請求項6に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。貯蔵、凍結、噴霧乾燥、フリーズドライまたは凍結乾燥前に、安定剤またはグリセロールが、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢に加えられているか、混合されている、請求項1から7のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として初めに製造または製剤化されているか、または液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として最終送達のために再製剤化されている、請求項1から8のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記糞便材料の粗い粒子状物質または非細菌叢物質を均質化、遠心分離およびまたは濾過することによって、またはプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィーによって、または免疫沈降によって、前記糞便細菌叢が前記糞便試料中の粗い粒子状物質から分離されているように、前記糞便細菌叢が処理されている、請求項1から9のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢が、凍結乾燥、フリーズドライ、凍結または加工されて粉末になっている、請求項1から10のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記糞便細菌叢が、疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは前記糞便細菌叢が、正常な、健康な、または野生型の糞便細菌叢集団を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる、請求項1から11のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記実質的に単離または精製された糞便細菌叢が、少なくとも約90単離されているか、もしくは純粋であるか、または10以下の非糞便細菌叢材料を有する糞便細菌叢の分離株である、請求項1から12のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢が、繰り返しまたは複数回の移植、投与、送達または注入のために製剤化または検量されている、請求項1から13のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。食塩水、培地、消泡剤、界面活性剤、滑沢剤、酸中和剤、マーカー、細胞マーカー、薬物、抗生物質、造影剤、分散剤、緩衝液もしくは緩衝剤、甘味剤、脱苦味剤、着香剤、pH安定剤、酸性化剤、防腐剤、脱甘味剤、着色剤、少なくとも1種のビタミン、ミネラルおよびもしくは栄養補助食品またはプレバイオティック栄養素のうちの1種または複数をさらに含む、請求項1から14のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。請求項1から15のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、容器またはデバイスを含む製造品。微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便試料完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスに入れ、実質的なまたは完全な無酸素環境を前記容器またはデバイス中で作り出すステップとを含む、請求項1から16のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを作製する方法。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療する方法であって、それを必要とする個体に、請求項1から15のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは請求項16に記載の製造品を介して、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を投与するステップを含む方法。前記感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態が、炎症性腸疾患、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎、膵臓不全、毒物もしくは毒素もしくは感染への曝露、毒素媒介旅行者下痢、中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウム感染、Cパーフリンジェンスウェルチもしくはクロストリジウムディフィシレ感染、神経学的状態、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症、大発作痙攣または小発作痙攣を含む、請求項18に記載の方法。微生物相全体部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物を含む、送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。添加剤または流体、食塩水、緩衝液、緩衝剤もしくは培地または流体グルコースセロビオース寒天培地をさらに含む、請求項20に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。糞便細菌叢を包含が、ヒトまたは動物糞便材料から単離または精製されている、請求項20または21に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記糞便細菌叢を包含が、遠心分離機、血球分離機、カラムまたはイムノアフィニティーカラムの使用を含む方法またはプロトコールを使用して単離または精製されているか、または前記糞便細菌叢が、前記糞便材料の粗い粒子状物質または非細菌叢物質を均質化、遠心分離およびまたは濾過することを含む方法によって、またはプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィーによって、または免疫沈降によって、単離または精製されている、請求項20から23のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体前記実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢または前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢が、前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中で実質的なまたは完全な無酸素環境にある、請求項20から23のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに、組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構を組み込むことかつまたは、前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、酸素捕捉材料を含むか、それでコーティングされているかつまたは前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中の空気を窒素およびまたは1種もしくは複数の他の不活性非反応性ガスで完全にまたは実質的に置き換えることによって、送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、実質的なまたは完全な無酸素になっている、請求項20から24のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体前記実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢または前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢が、実質的なまたは完全な嫌気的環境にある、請求項20から25のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、ヒトまたは動物で使用するために製造、ラベリングまたは製剤化されている、請求項20から26のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記動物使用が獣医学的使用のためである、請求項27に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。貯蔵または凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥または凍結乾燥前に、安定剤またはグリセロールが、前記微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む前記組成物に加えられているか、または混合されている、請求項20から28のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として初めに製造または製剤化されているか、または液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として最終送達のために再製剤化されている、請求項20から29のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む前記組成物が、粉末の形態で凍結乾燥、フリーズドライされているか、または凍結されている、請求項20から30のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体、または前記糞便細菌叢が、疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは前記微生物相全体、または糞便細菌叢が正常な、健康な、または野生型の糞便細菌叢集団を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる、請求項20から31のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。食塩水、培地、消泡剤、界面活性剤、滑沢剤、酸中和剤、マーカー、細胞マーカー、薬物、抗生物質、造影剤、分散剤、緩衝液または緩衝剤、甘味剤、脱苦味剤、着香剤、pH安定剤、酸性化剤、防腐剤、脱甘味剤およびまたは着色剤、ビタミン、ミネラルおよびまたは栄養補助食品またはプレバイオティック栄養素のうちの1種または複数から選択される添加物をさらに含む、請求項20から32のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。実質的に単離または精製された糞便細菌叢が、少なくとも約90単離されているか、もしくは純粋であるか、または約10以下の非糞便細菌叢材料を有する糞便細菌叢の分離株である、請求項20から34のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。前記微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む前記組成物が、繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量されている、請求項20から34のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する方法であって、それを必要とする個体に、請求項20から36のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを介して、前記微生物相全体、前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む前記組成物を投与するステップを含む方法。前記感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態が、便秘、炎症性腸疾患、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎、膵臓不全、毒物もしくは毒素もしくは感染への曝露、毒素媒介旅行者下痢、中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウム感染、Cパーフリンジェンスウェルチもしくはクロストリジウムディフィシレ感染、神経学的状態、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症または多発性硬化症、大発作痙攣または小発作痙攣を含む、請求項36に記載の方法。請求項1から15のいずれか一項に記載の糞便材料または組成物を送達するためのデバイスであって、図1Bまたは図2に図示されているデバイスまたは軟性管または均等物の近位末端に作動可能に接続されている出口開口部を含むバッグまたは容器と、前記軟性管または均等物の遠位末端の開閉バルブもしくは均等物またはオブデュレータースクリュートップと、前記バッグまたは容器中の材料を、前記軟性管または均等物を通して、遠位末端から、または開閉バルブもしくは均等物から移動させるためのポンプまたは手動ポンプとを含むデバイスまたは請求項1から15のいずれか一項に記載の糞便材料または組成物をさらに含む、またはのデバイスを含むデバイス。微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢完全もしくは部分糞便細菌叢、非糞便細菌叢材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢またはそれらの組成物を含み、請求項38に記載のデバイスのバッグまたは容器と構造的に同じか、または類似しているバッグまたは容器。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびもしくは予防するか、またはその症状を軽減もしくは遅延させるか、または便秘を改善、治療およびもしくは予防するか、腹痛、非特異的腹痛または下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するか、または脊椎関節症、脊椎関節炎または仙腸骨炎腎炎症候群腸または腸管要素を有する炎症性または自己免疫性状態狼瘡過敏性腸症候群または大腸炎潰瘍性大腸炎またはクローン大腸炎便秘自閉症変性神経疾患筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症またはパーキンソン病ミオクローヌジストニースタイナート病近位筋筋緊張性ミオパシー自己免疫疾患関節リウマチまたは若年性特発性関節炎慢性疲労症候群良性筋痛性脳脊髄炎慢性疲労免疫機能不全症候群慢性感染性単核細胞症流行性筋痛性脳脊髄炎肥満低血糖、前糖尿病性症候群、I型糖尿病またはII型糖尿病特発性血小板減少性紫斑病急性または慢性アレルギー性反応皮疹、発疹、蕁麻疹または慢性蕁麻疹およびあるいは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を予防するか、またはその症状を軽減もしくは遅延させるか、またはそれを有する個体を改善もしくは治療する方法であって、それを必要とする個体に、請求項1から15のいずれか一項に記載の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは請求項16に記載の製造品を介して、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を単回、繰り返しまたは複数回の投与、送達または注入で投与するステップを含む方法。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する際に使用するための、または便秘を改善、治療およびまたは予防するための、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するために使用するための、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するための、または便秘を改善、治療およびまたは予防するための、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するための医薬の調製における、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の使用。感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する際に、または便秘を改善、治療およびまたは予防するために、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するために、糞便材料または微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を送達するための、請求項38に記載のデバイスの使用。定義下記は、本発明の理解および記載に役立ち得るいくつかの定義である。これらは、一般的な定義として意図されており、本発明の範囲をそれらの用語のみに限定するものでは決してなく、下記の記載のより良好な理解のために記載されている。文脈により別に解釈すべき、または明確に逆に述べられている場合を除き、単一の整数、ステップまたは要素として本明細書に記載されている本発明の整数、ステップまたは要素は、記載されている整数、ステップまたは要素の単数形および複数形の両方を明らかに包含する。本明細書全体を通して、文脈により別に解釈すべき場合を除き、含むという用語または含むもしくは含むことなどの変形形態は、述べられているステップもしくは要素もしくは整数またはステップもしくは要素もしくは整数の群を包含することを意味するが、任意の他のステップもしくは要素もしくは整数または要素もしくは整数の群を排除することを意味しないと理解されるであろう。したがって、この明細書の内容において、含むことという用語は、~を主に包含するが、必ずしもそれだけではないことを意味する。本発明の第1の態様では、微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢全部もしくは一部糞便細菌叢、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む、送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスであって、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を前記送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに入れるステップとを含む方法によって作製される、送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを提供する。本発明の第2の態様では、第1の態様の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、容器またはデバイスを含む製造品を提供する。本発明の第3の態様では、微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、組成物、製造品、容器またはデバイスに入れ、前記容器またはデバイスにおいて実質的なまたは完全な無酸素環境を作り出すステップとを含む、第1または第2の態様による送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを作製する方法を提供する。本発明の第4の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するための方法であって、それを必要とする個体に、第1の態様の送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは第2の態様の製造品を介して、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を投与するステップを含む方法を提供する。本発明の第5の態様では、微生物相全体部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物を含む送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを提供する。本発明の第6の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する方法であって、それを必要とする個体に、第5の態様による送達ビヒクル、製剤、組成物、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを介して、前記微生物相全体、前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む前記組成物を投与するステップを含む方法を提供する。本発明の第7の態様では、糞便材料または第1の態様の組成物を送達するためのデバイスであって、図1Bまたは図2に図示されているデバイスまたは次を含むデバイス軟性管または均等物の近位末端に作動可能に接続されている出口開口部を含むバッグまたは容器、軟性管または均等物の遠位末端の開閉バルブもしくは均等物またはオブデュレータースクリュートップおよび前記バッグまたは容器中の材料を、前記軟性管または均等物を介して、遠位末端から、または開閉バルブもしくは均等物から移動させるためのポンプまたは手動ポンプまたは糞便材料または第1の態様の組成物をさらに含む、またはのデバイスを含むデバイスを提供する。本発明の第8の態様では、微生物相全体処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢完全もしくは部分糞便細菌叢、非糞便細菌叢材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢またはそれらの組成物を含む、バッグまたは容器を提供するが、その際、前記バッグまたは容器は、第7の態様のデバイスのバッグまたは容器と構造的に同じか、または類似している。本発明の第9の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、またはその症状を軽減または遅延させるか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するか、またはその症状を予防または軽減または遅延するか、または脊椎関節症、脊椎関節炎または仙腸骨炎腎炎症候群腸または腸管要素を有する炎症性または自己免疫性状態狼瘡過敏性腸症候群または大腸炎潰瘍性大腸炎またはクローン大腸炎便秘自閉症変性神経疾患筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症またはパーキンソン病ミオクローヌジストニースタイナート病近位筋筋緊張性ミオパシー自己免疫疾患関節リウマチまたは若年性特発性関節炎慢性疲労症候群良性筋痛性脳脊髄炎慢性疲労免疫機能不全症候群慢性感染性単核細胞症流行性筋痛性脳脊髄炎肥満低血糖、前糖尿病性症候群、I型糖尿病またはII型糖尿病特発性血小板減少性紫斑病急性または慢性アレルギー性反応皮疹、発疹、蕁麻疹または慢性蕁麻疹およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を有する個体を改善または治療する方法であって、それを必要とする個体に、第1の態様の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは第2の態様の製造品を介して、前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、前記完全もしくは部分糞便細菌叢試料、前記非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を単回、繰り返しまたは複数回の投与、送達または注入で投与するステップを含む方法を提供する。本発明の第10の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療する際に使用するための、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を提供する。本発明の第11の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療するための医薬の調製における、微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の使用を提供する。本発明の第12の態様では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療する際の、糞便材料または微生物相全体、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢試料、完全もしくは部分糞便細菌叢試料、非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を送達するための第7の態様のデバイスの使用を提供する。代替の実施形態では、本発明は、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離された糞便細菌叢を含む送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイスを含む組成物およびそれらを作製および使用する方法を提供する。代替の実施形態では、本発明は、処理済みもしくは未処理の糞便試料、または微生物相全体を含む試料、または完全もしくは部分糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む組成物および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、前記微生物相全体、または完全もしくは部分糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む組成物を、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに入れ、場合によって、実質的なまたは完全な無酸素環境を前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスにおいて作り出すステップとを含み、場合によって、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を入れるステップの前に無菌であるか細菌を含まない方法によって作製される処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、微生物相全体、およびまたは部分的に、実質的にもしくは完全に単離された糞便細菌叢を含む、送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに、組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構を組み込むことかつまたは、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、酸素捕捉材料を含むか、それでコーティングされているかつまたは前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中の空気が完全に、または実質的に窒素およびまたは1種または複数の他の不活性非反応性ガスで置き換えられていることによって、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、実質的なまたは完全な無酸素になっている、の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが部分的に、実質的なまたは完全な嫌気的環境を模擬している、またはの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスがヒトまたは動物で使用するために製造、ラベリングまたは製剤化されている、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記動物使用が獣医学的使用のためである、の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス貯蔵または凍結、噴霧乾燥、フリーズドライまたは凍結乾燥前に、安定剤またはグリセロールが、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、微生物相全体、または部分的に、実質的にまたは完全に単離された糞便細菌叢に加えられているか、または混合されている、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として初めに製造または製剤化されているか、または最終送達のために液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として再製剤化されている、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス糞便材料の粗い粒子状物質または非細菌叢物質を均質化、遠心分離およびまたは濾過することによって、またはプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィー、免疫沈降によって、前記糞便細菌叢が糞便試料中の粗い粒子状物質から分離されているように、前記糞便試料が処理されている、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、微生物相全体、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢が凍結乾燥、フリーズドライもしくは凍結または加工されて粉末になっている、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス前記糞便細菌叢を包含が、疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは前記糞便細菌叢が正常な、健康な、または野生型の糞便細菌叢集団を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス実質的に単離または精製された糞便細菌叢または微生物相全体が少なくとも約90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、995、996、997、998または999単離されているか、もしくは純粋であるか、または約01、02、03、04、05、06、07、08、09または10以下の非糞便細菌叢材料を有する糞便細菌叢の分離株である、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスまたは前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の量が繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量されており、ここで、場合によって、繰り返しまたは複数回の投与、送達、注入または移植プロトコールは、初めの約10日間は毎日、第2回目は毎日約10日間、第3回目は毎日、次いで第4回目は毎日場合によっては毎週行う注入を含み、次いで、場合によって組織診が正常に戻るまで、第2回目以上は毎週の注入を維持する、からのいずれかの送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを提供する。代替の実施形態では、本発明の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスは食塩水、培地、消泡剤、界面活性剤、滑沢剤、酸中和剤、マーカー、細胞マーカー、薬物、抗生物質、造影剤、分散剤、緩衝液または緩衝剤、甘味剤、脱苦味剤、着香剤、pH安定剤、酸性化剤、防腐剤、脱甘味剤およびまたは着色剤少なくとも1種のビタミン、ミネラルおよびまたは栄養補助食品またはプレバイオティック栄養素、オリゴフルクトース、イヌリン、ガラクトオリゴ糖、キシロオリゴ糖、ポリデキストロース、単糖、タガトースおよびまたはマンノオリゴ糖を含むをさらに含む。代替の実施形態では、本発明は、本発明の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製品、容器またはデバイスを含む製造品を提供する。代替の実施形態では、本発明は、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、微生物相全体、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを作製する方法を提供し、その方法は処理済みもしくは未処理の糞便試料、または完全もしくは部分糞便細菌叢を含む組成物、微生物相全体、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢および送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを用意するステップと、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、前記微生物相全体、または完全もしくは部分糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を含む組成物を、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスに入れ、実質的なまたは完全な無酸素環境を前記容器またはデバイス中で作り出すステップとを含む方法前記送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイスに、組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構を組み込むことによって、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、実質的なまたは完全な無酸素になっておりかつまたは、前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが、酸素捕捉材料を含むか、それでコーティングされておりかつまたは前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイス中の空気が完全に、または実質的に窒素およびまたは1種または複数の他の不活性非反応性ガスで置き換えられている、の方法前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが部分的に、実質的なまたは完全な嫌気的環境を模擬している、またはの方法前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスがヒトまたは動物で使用するために製造、ラベリングまたは製剤化されている、からのいずれかの方法前記動物使用が獣医学的使用のためである、の方法貯蔵またはフリーズドライ、噴霧乾燥、凍結または凍結乾燥前に、プレバイオティクス、安定剤またはグリセロールが、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または部分的に、実質的にまたは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢に加えられているか、または混合されているからのいずれかの方法前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスが液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として初めに製造または製剤化されているか、または最終送達のために液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として再製剤化されている、からのいずれかの方法糞便材料の粗い粒子状物質または非細菌叢物質を均質化、遠心分離およびまたは濾過することによって、またはプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィー、免疫沈降によって、前記糞便細菌叢が糞便試料中の粗い粒子状物質から分離されているように、前記糞便試料が処理されている、からのいずれかの方法前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢が凍結乾燥、フリーズドライまたは凍結または加工されて粉末になっている、からのいずれかの方法前記糞便細菌叢が疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは前記糞便細菌叢が正常な、健康な、または野生型の糞便細菌叢集団を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる、からのいずれかの方法または前記処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢に、または処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または本発明の非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物を単離または精製、貯蔵、凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥、凍結乾燥、輸送、再構成およびまたは送達するために使用される液体または溶液に、食塩水、培地、消泡剤、界面活性剤、滑沢剤、酸中和剤、マーカー、細胞マーカー、薬物、抗生物質、造影剤、分散剤、緩衝液または緩衝剤、甘味剤、脱苦味剤、着香剤、pH安定剤、酸性化剤、防腐剤、脱甘味剤およびまたは着色剤、およびまたは少なくとも1種のビタミン、ミネラルおよびまたは栄養補助食品、およびまたはプレバイオティック栄養素、オリゴフルクトース、イヌリン、ガラクトオリゴ糖、キシロオリゴ糖、ポリデキストロース、単糖、タガトースおよびまたはマンノオリゴ糖を含むを加えるステップをさらに含むからのいずれかの方法微生物相全体、実質的に単離または精製された糞便細菌叢が少なくとも約90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、995、996、997、998または999単離されているか、もしくは純粋であるか、または約01、02、03、04、05、06、07、08、09または10以下の非糞便細菌叢材料を有する糞便細菌叢の分離株である、からのいずれかの方法または前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の量が繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量されており、ここで、場合によって、繰り返しまたは複数回の投与、送達、注入または移植プロトコールは、初めの約10日間は毎日、第2回目は毎日約10日間、第3回目は毎日、次いで第4回目は毎日場合によっては毎週行う注入を含み、次いで、場合によって組織診が正常に戻るまで、第2回目以上は毎週の注入を維持する、からのいずれかの方法である。代替の実施形態では、本発明は、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、または便秘を改善、安定化、治療およびまたは予防するか、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療する方法を提供し、その方法は、それを必要とする個体に、本発明の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは本発明の製造品を投与するステップを含む。代替の実施形態では、本発明は、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する方法を提供し、その方法は、それを必要とする個体に、本発明の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは本発明の製造品またはその内容物、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎、膵臓不全、毒物もしくは毒素もしくは感染への曝露、毒素媒介旅行者下痢、中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウム感染、Cパーフリンジェンスウェルチもしくはクロストリジウムディフィシレ感染、神経学的状態、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症、大発作痙攣または小発作痙攣を含む。代替の実施形態では、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の量を繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量するかまたは前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を繰り返しまたは複数回の注入で送達するが、ここで、場合によって、繰り返しまたは複数回の投与、送達、注入または移植プロトコールは、初めの約10日間は毎日、第2回目は毎日約10日間、第3回目は毎日、次いで第4回目は毎日場合によっては毎週行う注入を含み、次いで、場合によって組織診が正常に戻るまで、第2回目以上は毎週の注入を維持する。代替の実施形態では、本発明は、下記を含む送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスを提供する微生物相全体、部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含み、場合によって添加剤もしくは流体、食塩水、緩衝液、緩衝剤もしくは培地もしくは流体グルコースセロビオース寒天培地をさらに含む組成物前記微生物相全体、または前記糞便細菌叢がヒトまたは動物糞便材料から単離または精製されている、の組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記微生物相全体、または糞便細菌叢が、遠心分離機、血球分離機、カラムまたはイムノアフィニティーカラムの使用を含む方法またはプロトコールを使用して単離または精製されているか、または糞便材料の粗い粒子状物質または非細菌叢物質を均質化、遠心分離およびまたは濾過することを含む方法によって、またはプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィー、免疫沈降によって、微生物相全体、または前記糞便細菌叢が単離または精製されている、またはの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品微生物相全体、または実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢が組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品中で実質的なまたは完全な無酸素環境にある、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製品、容器またはデバイスに、組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構を組み込むことによって、前記組成物、容器またはデバイス、製剤、または製造品が、実質的なまたは完全な無酸素になっておりかつまたは、前記送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイスが、酸素捕捉材料を含むか、それでコーティングされておりかつまたは前記送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイス中の空気が完全に、または実質的に窒素およびまたは1種または複数の他の不活性非反応性ガスで置き換えられている、の送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイス微生物相全体、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢が実質的なまたは完全な嫌気的環境にある、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記送達ビヒクル、製剤、容器またはデバイスがヒトまたは動物で使用するために製造、ラベリングまたは製剤化されている、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記動物使用が獣医学的使用のためである、の組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品貯蔵または凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥または凍結乾燥前に、安定剤またはグリセロールが、微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物に加えられているか、または混合されている、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記組成物、容器またはデバイス、製剤または製造品が液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として初めに製造または製剤化されているか、または最終送達のために液剤、懸濁剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、半固形剤、錠剤、サシェ剤、トローチ剤もしくはカプセル剤として、または経腸製剤として再製剤化されている、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記微生物相全体、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物が粉末形態に凍結乾燥、フリーズドライまたは凍結されている、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品前記微生物相全体、または前記糞便細菌叢が疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは微生物相全体、または糞便細菌叢が、正常な、健康な、または野生型の糞便細菌叢集団を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品または微生物相全体、前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物に、または処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢を単離または精製、貯蔵、凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥、凍結乾燥、輸送、再構成およびまたは送達するために使用される液体または溶液に食塩水、培地、消泡剤、界面活性剤、滑沢剤、酸中和剤、マーカー、細胞マーカー、薬物、抗生物質、造影剤、分散剤、緩衝液または緩衝剤、甘味剤、脱苦味剤、着香剤、pH安定剤、酸性化剤、防腐剤、脱甘味剤およびまたは着色剤、およびまたは少なくとも1種のビタミン、ミネラルおよびまたは栄養補助食品、およびまたはプレバイオティック栄養素、糞便細菌叢または糞便細菌の安定性、増殖およびまたは活性を刺激する任意の成分を含むか、または場合によって、ポリオール、フルクトオリゴ糖、オリゴフルクトース、イヌリン、ガラクトオリゴ糖、キシロオリゴ糖、ポリデキストロース、単糖、タガトースおよびまたはマンノオリゴ糖を含むを加えるステップをさらに含む、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品実質的に単離または精製された糞便細菌叢が、少なくとも約90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、995、996、997、998または999単離されているか、または純粋であるか、または約01、02、03、04、05、06、07、08、09または10以下の非糞便細菌叢材料を有する微生物相全体、または糞便細菌叢の分離株である、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品または前記微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の量が繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量されており、ここで、場合によって、繰り返しまたは複数回の投与、送達、注入または移植プロトコールは、初めの約10日間は毎日、第2回目は毎日約10日間、第3回目は毎日、次いで第4回目は毎日場合によっては毎週行う注入を含み、次いで、場合によって組織診が正常に戻るまで、第2回目以上は毎週の注入を維持する、からのいずれかの組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品。代替の実施形態では、本発明は、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する方法を提供し、その方法は、それを必要とする個体に、本発明の組成物、容器もしくはデバイス、製剤または製造品を投与するステップを含む。方法の代替の実施形態では、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態は、炎症性腸疾患、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎、膵臓不全、毒物もしくは毒素もしくは感染への曝露、毒素媒介旅行者下痢、中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウム感染、Cパーフリンジェンスウェルチもしくはクロストリジウムディフィシレ感染、神経学的状態、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症、大発作痙攣または小発作痙攣を含む。代替の実施形態では、本発明は、感染、疾患、治療、中毒または腸機能不全要素もしくは副作用を有する状態を改善、安定化、治療およびまたは予防する方法またはその症状を軽減または遅延する方法、または便秘を改善、治療およびまたは予防する方法、腹痛、非特異的腹痛もしくは下痢、薬物副作用もしくは心理学的状態もしくはクローン病、毒物、毒素もしくは感染が原因の下痢、毒素媒介旅行者下痢またはクロストリジウムもしくはCパーフリンジェンスウェルチもしくはCディフィシレ感染またはクロストリジウム感染に関連した偽膜性大腸炎を治療する方法または脊椎関節症、脊椎関節炎または仙腸骨炎腎炎症候群狼瘡、過敏性腸症候群または潰瘍性大腸炎もしくはクローン大腸炎などの大腸炎などの腸または腸管要素を有する炎症性または自己免疫性状態便秘、自閉症筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症またはパーキンソン病などの変性神経疾患ミオクローヌジストニー関節リウマチまたは若年性特発性関節炎などの自己免疫疾患慢性疲労症候群肥満低血糖、前糖尿病性症候群、I型糖尿病またはII型糖尿病特発性血小板減少性紫斑病皮疹、発疹、蕁麻疹または慢性蕁麻疹などの急性または慢性アレルギー性反応およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を予防、その症状を軽減もしくは遅延させるか、それを有する個体を改善、安定化もしくは治療する方法を提供し、その方法はそれを必要とする個体に、本発明の送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器もしくはデバイスまたは本発明の製造品を単回、繰り返しまたは複数回の投与、送達または注入で投与するステップを含む。代替の実施形態では、微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢の量を、繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量するかまたは微生物相全体、前記処理済みもしくは未処理の糞便試料、または前記部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を繰り返しまたは複数回の注入で送達するが、ここで、場合によって、繰り返しまたは複数回の投与、送達、注入または移植プロトコールは、初めの約10日間は毎日、第2回目は毎日約10日間、第3回目は毎日、次いで第4回目は毎日場合によっては毎週行う注入を含み、次いで、場合によって組織診が正常に戻るまで、第2回目以上は毎週の注入を維持する。代替の実施形態では、本発明は、本発明の組成物または微生物相全体、または糞便材料を送達するためのデバイスを提供し、そのデバイスは図1または図2に図示されているデバイスまたはその均等物または軟性管または均等物の近位末端に作動可能に接続されている出口開口部を含むバッグまたは容器を含む材料からなり、場合によって、前記バッグまたは容器は、静脈内様バッグであり、場合によって、前記バッグまたは容器は、前記バッグをスタンドに懸垂させておける、例えば、内視鏡の上に設置懸垂させておけるアタッチメントを有し、場合によって、前記バッグまたは容器は、開閉バルブまたは均等物を介して、全てのガスまたは空気をバッグから除去し得る負圧デバイスに作動可能に接続されており、場合によって、前記バッグまたは容器は、開閉バルブまたは均等物を介して、出口開口部を介してバッグをフラッシュするための流体供給源または貯蔵容器に作動可能に接続されており、場合によって、前記流体供給源または貯蔵容器は正圧下にあり、場合によって、軟性管または均等物は、管の遠位部分から近位部分への、または管の後からバッグまたは容器への材料の逆洗を防ぐための少なくとも1個のクリップまたは閉鎖バルブまたは逆止め弁を含む軟性管または均等物の遠位末端の開閉バルブまたは均等物またはオブデュレータースクリュートップ、および場合によって、結腸鏡もしくは内視鏡ルアーロックポートまたは均等物に取り付けるためのルアーロックチップ、および場合によって、浣腸管もしくはデバイスまたは均等物に取り付けるための浣腸管チップ場合に遠位開口部を閉鎖するための安全デバイスまたは安全クリップをさらに含むおよび前記バッグまたは容器中の材料を、前記軟性管または均等物を介して、遠位末端から、または開閉バルブもしくは均等物から移動させるためのポンプまたは手動ポンプまたは糞便材料または本発明の組成物をさらに含む、またはのデバイスを含む。代替の実施形態では、本発明は、微生物相全体、または処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離された糞便細菌叢、または本発明の組成物、部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含む組成物を含む製剤を含み、場合によって、添加剤もしくは流体、食塩水、緩衝液、緩衝剤もしくは培地もしくは流体グルコースセロビオース寒天培地をさらに含むバッグまたは容器を提供し、前記バッグまたは容器は、本発明のデバイスのバッグまたは容器と構造的に同じか、または類似しており、場合によって、バッグの内部は、実質的なまたは完全な無酸素環境であるか、またはバッグの内部は、実質的なまたは完全な嫌気的環境に類似している。代替の実施形態では、特異的抗Cディフィシレ経口抗体を本発明の組成物を単離もしくは精製、貯蔵、凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥、凍結乾燥、輸送、再構成およびまたは送達するために使用される溶液に加えることができる。製品とこれらの特異的抗Cディフィシレ経口抗体との組合せは、製品の根絶機構を増強する。本発明の1つまたは複数の実施形態の詳細を、添付の図面および下記の記載において示す。本発明の他の特徴、対象および利点は、記載および図面ならびに特許請求の範囲から明らかであろう。本明細書に挙げられている全ての公報、特許、特許公開は、全ての目的について参照によって明らかに本明細書に援用される。本明細書に示されている図面は、本発明の実施形態を例示するものであって、特許請求の範囲によって包含されるとおりの本発明の範囲を制限することを意図したものではない。様々な図面における同様の参照記号は、同様の要素を示している。多様な本発明の例示的な実施形態をこれから詳細に参照するが、その実施例が、添付の図面に示されている。次の詳細な説明は、読者が本発明の態様および実施形態のある種の詳細をより良好に理解するように提供されるものであって、本発明の範囲を制限するものと解釈されるべきではない。代替の実施形態では、本発明は、糞便細菌叢移植のための処理済みおよびまたは単離糞便材料を含む組成物、例えば製剤および医薬調剤、製造品ならびに容器および送達ビヒクルならびにデバイスおよび送達物質を提供する。一実施形態では、糞便細菌叢を含む本発明の処理済みおよびまたは単離糞便材料を、異なる個体間で、例えばヒトとヒトの間で、または動物間で移植する。一実施形態では、本発明の処理済み糞便材料を、それを採取した個体と同じ個体に戻し移植して、例えば薬物治療後、または例えば結腸を包含する胃腸管の瀉下を誘発する起立潅注後に結腸で再増殖させる。本発明は、腸疾患または感染を改善、安定化または治療する方法を提供し、その方法は、本発明の送達ビヒクル、製剤、製造品または容器もしくはデバイスを例えば糞便細菌製剤療法、糞便輸注、糞便移植またはヒトプロバイオティック点滴として使用するステップを含む。代替の実施形態では、本発明は、任意の感染、腸疾患または腸機能不全要素を有する状態、例えば中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウムディフィシレ感染、炎症性腸疾患、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎または膵臓不全を改善、安定化、治療または予防する方法を提供する。例えば一実施形態では、抗生物質はCディフィシレおよびその芽胞を根絶しないので、処理済みおよびまたは単離糞便細菌叢を含む本発明の送達ビヒクル、製剤、製造品または容器もしくはデバイスは、感染または疾患個体、例えば患者または動物の結腸に注入すると、Cディフィシレを改善、安定化または根絶することができる。代替の実施形態では、ドナーから得られた糞便細菌叢は、感染または疾患レシピエントの欠けているか、または不適切な糞便細菌叢、例えば細菌のうちの一部、実質的に全てまたは全てを含む。本発明は任意の特定の作用機序によって限定されることはないが、一部の実施形態では、これは、感染またはこの感染に関連する偽膜性大腸炎を改善または根絶するドナーからレシピエントへの感染個体の糞便細菌叢の一部、実質的に全てまたは全ての均等物の移動である。代替の実施形態では、本発明の組成物、例えば製剤および医薬調剤ならびにデバイス、送達物質、送達ビヒクル、製造品、容器およびデバイスは、糞便細菌叢成分の、それを必要とする個体、例えば感染、疾患、瀕死の患者への安全な移植を可能にし、したがって、レシピエントまたは患者に送達するための一貫して安全で依然として機能性の細菌叢をもたらす。代替の実施形態では、本発明は、長期の貯蔵寿命を有し得る標準化された新鮮な糞便細菌叢を製造するための信頼可能な方法を提供する。例えば一実施形態では、糞便細菌叢を含む送達ビヒクル、製剤、医薬調剤、製造品、容器またはデバイスは、実質的なまたは完全な無酸素環境を含む。他の実施形態では、プレバイオティック栄養素などの栄養素を、本発明の組成物を単離または精製、貯蔵、凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥、凍結乾燥、輸送、再構成およびまたは送達するために使用される溶液に加えることができる。プレバイオティック栄養素は、糞便細菌叢、例えば細菌の安定性、増殖およびまたは活性を刺激する任意の成分であってよく例えば代替の実施形態では、ポリオール、フルクトオリゴ糖、オリゴフルクトース、イヌリン、ガラクトオリゴ糖、キシロオリゴ糖、ポリデキストロース、タガトースなどの単糖およびまたはマンノオリゴ糖を、本発明を実施するためのプレバイオティクスとして使用する。一実施形態では、プレバイオティクスを、その単離または精製、凍結、フリーズドライ、噴霧乾燥、溶液中での再構成などの後の糞便細菌叢に対するショックを防ぐために加える。代替の実施形態では、本発明の組成物、例えば送達ビヒクル、製剤および医薬調剤、製造品または容器もしくはデバイスの成分は、例えばCディフィシレ感染およびまたはこの感染に関連する偽膜性大腸炎を改善およびまたは根絶することができるように、微生物相全体、またはバクテロイデス属およびまたはファーミキューテス属を多数含む。代替の実施形態では、本発明の組成物、例えば送達ビヒクル、製剤および医薬調剤、製造品または容器もしくはデバイスは、大腸炎および便秘などの、治療するのがより困難な条件を有する個体において、例えば患者または動物において反復使用するために利用可能であってよい。代替の実施形態では、本発明の組成物、例えば送達ビヒクル、製剤および医薬調剤、製造品または容器もしくはデバイスの成分は、選択された細菌種、例えばバクテロイデス属、ファーミキューテス属、バチルススリンギエンシスを含む。細菌種は、血球分離またはプラズマフェレシスによって分離することができる。代替の実施形態では、選択された細菌種、例えばバクテロイデス属、ファーミキューテス属、バチルススリンギエンシスを組成物、例えば送達ビヒクル、製剤および医薬調剤、製造品または容器もしくはデバイスの成分に、細菌の野生型を含有するように細菌種を含む強化濃度として加えることができる。代替の実施形態では、本発明の組成物を、糞便スラリー、食塩水または緩衝懸濁液として、経口送達用の飲料中などで製剤化することができる。代替の実施形態では、本発明の組成物は、浣腸用製品、噴霧乾燥製品、再構成浣腸剤、小さなカプセル製品、小児に投与するのに適した小さなカプセル製品、バルブシリンジ、食塩水添加を伴う家庭用浣腸剤に適したバルブシリンジ、粉末製品、酸素欠乏サシェ中の粉末製品、例えばバルブシリンジもしくは浣腸剤に加えることができる酸素欠乏サシェ中の粉末製品またはヨーグルトまたは牛乳などの適切な担体媒体を備えた容器に取り付けることができ、例えば子供用の投薬として直接組み込み、与えることができるデバイス中の噴霧乾燥製品として製剤化することができる。一実施形態では、本発明の組成物は、スクリュートップリッドを介して担体媒体に直接送達することができ、その際、糞便材料はリッドに懸垂されており、リッドをねじると、担体媒体へとまっすぐ放出される。代替の実施形態では、本発明の組成物を送達する方法は、腸への、食塩水または緩衝液に懸濁された浣腸液を介しての、飲料中で経口での、経鼻十二指腸管を介する小腸注入点滴を介しての、胃瘻造設術を介しての、または結腸鏡を使用することによる糞便スラリーの使用を包含する。一部の実施形態では、結腸鏡を介して送達して、任意の結腸病理の可能な限り近くに注入し、それを検出することが有利であり得る。代替の実施形態では、方法、本発明の組成物および方法で使用される糞便細菌叢は、疾患または感染についてスクリーニングまたは試験された個体から初めに得られ、かつまたは糞便細菌叢は、正常な、健康な、または正常で代表的な野生型糞便細菌叢集団例えばバクテロイデス属およびまたはファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシスなどの他の糞便細菌叢の正常な補体を有するとスクリーニングされた個体から初めに得られる。一実施形態では、ドナー糞便材料中の細菌叢種または種の欠損に応じて、または所望の効果を達成するために、1種または複数の追加の種、例えばバクテロイデス属、ファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシス種を、送達される製品に、製品を製造する際に初めに、または送達の時点で加え、例えば1種または複数の追加の種を個体に投与する前に、例えば散剤、凍結乾燥物または凍結乾燥組成物を送達のために再構成する際に混合するかまたは1種または複数の追加の種を同時投与することができる。これらの追加の細菌叢種はドナーから直接単離または精製することができるか、または加える前にinvitroで一時拡張することができるか、または純粋な培養から、例えばATTCストックから出来してよい。例えば一部の用途では、例えば所望の効果または治療結果を達成するために、増大量の1種または複数の糞便細菌叢種の送達を使用し、例えば送達される製品、または完全もしくは部分糞便細菌叢を含む組成物、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢を、ドナーから直接単離されていてよいか、または純粋な培養などから出来してよい1種または複数の追加の種、例えばバクテロイデス属、ファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシス種で増強する。一部の実施形態では、例えば別の感染または疾患にレシピエントが感染することを回避するために、ドナーの選択が非常に重要である。代替の実施形態では、ドナーおよびレシピエントの種類、例えばヒトまたは動物に応じて、ドナーを少なくとも例えばレトロウイルス肝炎A、B、およびまたはCサイトメガロウイルスエプスタインバーウイルス、検出可能な寄生虫およびまたは細菌性病原体について試験する。代替の実施形態では、本発明は、1つまたは複数の健康なドナーからの採取を初めに含む移植用の糞便細菌叢を調製する方法を提供する。代替の実施形態では、新鮮な糞便を、一実施形態では、適切に無酸素の適切な容器を含む本発明の糞便採取デバイスを介して輸送する。例示的な適切な糞便採取デバイス1が、図1Aに示されている。図1Aは、糞便を含有し、糞便を受けるためのスロット2を包含する本発明の例示的な容器を示している。次いで、容器をバッグ3、適切には使い捨ての漏れ止めジップロックシーリングバッグに入れることができる。代替の実施形態では、例えば容器に組み込み式またはクリップオン式酸素捕捉機構、例えば米国特許第7541091号に記載されている例えば酸素捕捉ペレットを組み込むことによって、容器を無酸素にすることができる。他の実施形態では、容器自体を酸素捕捉材料、例えば精製および改変層状粘土を酸素捕捉鉄性能強化担体として使用し活性な鉄をポリマーに直接分散させている例えば02BLOCKまたは均等物によって記載されている酸素捕捉鉄、によって製造する。一実施形態では、例えば、1種または複数の不飽和オレフィン系ホモポリマーまたはコポリマー1種または複数のポリアミドホモポリマーまたはコポリマー1種または複数のポリエチレンテレフタレートホモポリマーまたはコポリマーを有し酸素捕捉活性を示すポリマーブレンドを記載している米国特許出願公開第20110045222号に記載されているとおり、容器自体を製造するか、または容器をコーティングするために、またはペレットとして加えるために、酸素捕捉ポリマーを使用する。一実施形態では、例えば、ポリエステル、コポリエステルエーテルおよび酸化触媒を含み、その際、コポリエステルエーテルがポリを含むポリエーテルセグメントを含む組成物を記載している米国特許出願公開第20110008554号に記載されているとおり、容器自体を製造するか、または容器をコーティングするために、またはペレットとして加えるために、酸素捕捉ポリマーを使用する。一実施形態では、例えば、ポリマーマトリックス中の分散鉄塩粒子および酸素捕捉微粒子を有する酸素捕捉フィルムを記載している米国特許出願公開第201000255231号に記載されているとおり、容器自体を製造するか、または容器をコーティングするために、またはペレットとして加えるために、酸素捕捉ポリマーを使用する。別法では、酸素捕捉機構に加えて、またはそれに代えて、容器中の空気を窒素およびまたは他の不活性非反応性ガスまたはガスに置き換える。代替の実施形態では、容器は、嫌気的環境を部分的に、実質的にまたは完全に模擬している。代替の実施形態では、糞便を、漏れることも臭うこともなく、嫌気的環境をなお維持する審美的に許容可能な容器に保持する。代替の実施形態では、容器は、糞便細菌叢を受ける前は無菌である。代替の実施形態では、容器を室温未満に維持し、例えば、その調製、輸送およびまたは例えば糞便バンクで、または移植を行う場所で貯蔵する大部分の間または全ての間、冷蔵する。例えば、加工糞便バンクに送達されたら、低温室、低温容器または冷蔵庫に貯蔵して、細菌叢代謝を最小限にする。代替の実施形態では、糞便の細菌細胞の破壊を防ぐために、凍結はしない。代替の実施形態では、グリセロールなどの安定剤を採集およびまたは貯蔵される材料に加える。一実施形態では、糞便を液体窒素または任意の同様の冷却剤で急激に凍結して、例えば、加工を待っている間、長期間にわたって貯蔵することができるようにする。代替の実施形態では、糞便を、上述のとおり様々な病原体について試験する。代替の実施形態では、感染因子についてクリアしたら、それを均質化および濾過して、材料の大きな粒子を除去する。代替の実施形態では、それを所望の体積まで細分するが、例えばそれは、5ccから3リットル以上の間であってよい。例えば一実施形態では、容器は、適切な耐酸素性プラスチック、例えば金属被覆ポリエチレンテレフタレートポリエステルフィルムまたは金属被覆MYLARに保持されていてよい50グラムの糞便を含む。代替の実施形態では、図1Bに示されているとおり、糞便材料が保持されている例示的な治療用ビヒクル10および装置は、例えば、そのセットに取り付けられている手動ポンプ12を備えている静脈内様供与セット11である。適切には、バッグ11は、ガス不透過性である金属被覆されているMYLARである。装置の管全体をルアーロック機構13によって結腸鏡生検チャンネルに取り付けると、手動ポンプ12によって、プラスチック製デバイスの上部にある液化糞便の内容物を容易に前方にポンプ供給することが可能である。この方法では、結腸鏡または腸鏡でも、送達機構となるであろう。この実施形態では、これを通常、結腸に任意の距離で、別法では盲腸に入れるであろう。代替の実施形態では、材料を末端回腸または所望の場合にはより上へ入れる。代替の実施形態では、これを、十二指腸またはそれ以下に、腸鏡を用いて注入することができる。代替の実施形態では、Cディフィシレを、注入された糞便試料または処理済み糞便で改善または根絶する。他の代替の実施形態が図1に示されている。この実施形態では、治療用ビヒクル送達システム20は、食塩水22および本発明の糞便細胞23を包含するIV様バッグ21を包含する。手動ポンプ24およびルアーロック25に加えて、送達システムは、フラッシングポート26、クリップ27およびルアーロック取付を備えた浣腸チップ28を備えている。代替の実施形態では、移植物質を均質化および布ごしにかける。代替の実施形態では、この処理済み材料を容器、例えば、経鼻胃管または経鼻十二指腸管に取り付けることができ、内容物を例えば胃、十二指腸または遠位空腸に注入することができるバッグに入れる。別法では、それを、容器、例えば、浣腸として用意されている浣腸チップに取り付けることができるバッグに保持することができる。代替の実施形態では、非細菌成分を分離し、凍結または凍結乾燥させることができ、長期の貯蔵寿命を有する安定な製品を製造するために、糞便を均質化し、粗い粒子状物質から濾過することができる。代替の実施形態では、次いで、顕微鏡的繊維非生存物質を細菌から分離する。例えば細菌のサイズへと小さくなっていくフィルターサイズを用いての繰り返し濾過を例えば包含するいくつかの方法を使用することができる。一実施形態では、種々のフィルターを使用して、細菌種を単離する。これは、例えばガーゼを用いる濾過の雑な技術を使用し、種々のサイズの濾過膜を利用して、精製された細菌を得る本発明の技術よりも劣るWilliamsによってWO2011033310A1号において使用されている技術とは異なる。一実施形態では、糞便全体を濾過するための濾過手順を適切に使用して、ほぼ100細菌の最高濃度を達成する。一実施形態では、濾過手順は、当初清澄化のためにガラス繊維デプスフィルターを適切に使用する2ステップ手順である。一実施形態では、糞便を正圧下で濾過する。一実施形態では、これは、30ミクロンPVDFフィルターを備えた組合せまたはサンドウィッチ配置を使用するであろう。一実施形態では、このサンドウィッチ手順によって、産物を正圧下で濾過する。後に、一実施形態では、膜濃度を、濾液の体積を減らすための他のステップとして使用することができる。一実施形態では、これは、フリーズドライまたは噴霧乾燥の前に窒素カバー下で行うことができる。濾過のために使用することができる別の膜には、これらに限られないが、ナイロンフィルター、硝酸セルロースフィルター、PESフィルター、テフロンフィルター、混合セルロースエステルフィルター、ポリカーボネートフィルター、ポリプロピレンフィルター、PVCフィルターまたは石英フィルターが包含される。様々なこれらの組合せを使用して、凍結、噴霧乾燥または凍結乾燥の準備が整った、固体および液体が除去されている高純度の細菌を得ることができる。凍結のために、代替の実施形態では、細菌を液体中に保持して、解凍の際に細胞が破裂することを防ぐ。これは、様々な安定剤、例えばグリセロールおよび適切な緩衝液およびまたはエチレングリコールを包含してよい。代替の実施形態では、凍結保護では、使用される安定剤に応じて、約20から60の間の安定剤の最終濃度を使用するこれは、さもないとタンパク質構造を破壊するであろう氷の結晶の形成を予防することによって、タンパク質を安定化させるのに役立つ。代替の実施形態では、生存している細菌の破壊を低減するのに役立つ安定剤には、スキムミルク、エリトリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトースおよび他のポリオールが包含される。デキストランおよびポリエチレングリコールなどのポリマーも、糞便細菌細胞を安定化させるために使用することができる。適切な量の細菌叢を安定剤と混合することによって、それを、解凍した後に患者に注入する適切な施設まで輸送するために使用される容器中でスナップ凍結し、凍結したままにすることが可能である。代替の実施形態では、微生物相全体、または単離およびまたは処理済み糞便材料およびまたは細菌叢を凍結乾燥もしくはフリーズドライすることができるか、または製品を凍結させることができる。代替の実施形態では、フリーズドライによって、細胞の大部分を生存したままにし、粉末に穏やかに微細化することができる製品の粉末化形態を製造することが可能である。粉末または凍結乾燥もしくはフリーズドライされた細菌叢または分離株を次いで、カプセル封入して、担体、例えば錠剤、ゲルタブ剤、丸剤またはカプセル剤、例えば腸溶コーティングされたカプセル剤にするか、または消化のためにオイル充填カプセル剤に入れることができる。別法では、フリーズドライまたは凍結乾燥された製品または粉末を、個体に送達する前に、例えば流体、例えば食塩水、緩衝液などの無菌流体または流体グルコースセロビオース寒天培地などの培地中で再構成することができる。代替の実施形態では、微生物相全体、または単離およびまたは処理済み糞便材料およびまたは細菌叢を噴霧乾燥させることができる。一実施形態では、噴霧乾燥は、フリーズドライまたは凍結乾燥よりも好ましい。代替の実施形態では、微生物相全体、または単離およびまたは処理済み糞便材料およびまたは細菌叢に、正常な動物細菌叢に由来している野生型細菌およびまたは組換え処理された細菌、例えば自己防衛または改善効果を有するタンパク質、小分子または炭水化物を合成し得る組換え微生物または適切なシグナル、例えば消化によって送達される化学物質を与えられると自己破壊し得る組換え微生物を補足する。代替の実施形態では、移植製品を含む本発明の組成物を、注入によって、例えば直腸、人工肛門を介して、または上部胃腸管から下へと送達するか、または坐剤丸剤、錠剤またはカプセル封入形態で、例えば腸溶被覆された段階的放出カプセル剤または錠剤で、例えば添加剤を添加して使用することができる。代替の実施形態では、移植製品を、坐剤として投与して、直腸において高濃度を得る。一実施形態では、移植製品を含む本発明の組成物を個体に送達する前、その間、およびまたはその後に、または送達のために、もしくはその間に、流体、例えば食塩水、緩衝液などの無菌流体または流体グルコースセロビオース寒天培地などの培地中で貯蔵する。代替の実施形態では、本発明の組成物および方法を使用して、様々な胃腸状態、例えばCディフィシレ感染、Cパーフリンジェンスウェルチおよび他のクロストリジウム感染、過敏性腸症候群、便秘、回腸嚢炎、クローン病および顕微鏡大腸炎パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症および多発性硬化症などの神経学的状態、大発作痙攣または小発作痙攣を改善、安定化、予防およびまたは治療する。一実施形態では、神経学的状態を、カプセル封入または凍結材料によって治療する。代替の実施形態では、大腸炎患者では、炎症性腸疾患および過敏性腸症候群を抑制し、回復させるために、反復投与が必要である。代替の実施形態では、粗製の収集糞便を濾過およびまたは均質化し、次いで、その細菌細胞をプラズマフェレシス、遠心分離、血球分離、カラムクロマトグラフィー、免疫沈降によって分離する。血球分離装置の使用を包含する遠心分離は、混合物を分離するために遠心力を必要とするプロセスである。遠心分離では、最もちゅう密な成分が回転プレートの外側に飛ばされる一方で、残りの成分は、軸へと移動する。高速で移動するガラスプレートの間で平らにした製品を回転させることによって、重力の効果が高まる。糞便が適切に希釈し、回転サイクルに乗り、細胞の収集が遠心分離で周辺でのみ生じるように、遠心分離または血球分離を設定することができる。代替の実施形態では、野生型細菌細胞を包含を例えば遠心分離、血球分離、プラズマフェレシスなどによって分離または精製し、凍結保護剤を使用して凍結させる。代替の実施形態では、この材料を、次いで結腸鏡、経鼻十二指腸管または経鼻胃管を介して注入するために使用することができる容器、例えばバッグ中で凍結させる。代替の実施形態では、これを凍結したまま、例えば20°C以下で施設に送達することができる。別法では、遠心分離材料を凍結乾燥させることができかつ液剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、丸剤、カプセル剤もしくは錠剤で、または例えば結腸鏡を介して浣腸剤または注入セットとして後で再構成するための坐剤で使用することができる。一実施形態では、凍結保護剤はトレハロースである。トレハロースはまた、再構成する際の成分として、または噴霧乾燥またはフリーズドライの前の追加の薬剤としても機能し得る。代替の実施形態では、本発明の組成物を含む液剤、ゲル剤、ゲルタブ剤、丸剤、カプセル剤または錠剤は、例えば持続感染、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、自己免疫腎疾患、例えば腎炎、重症閉塞症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群および本明細書に記載されている他の状態などの慢性およびまたは免疫状態を治療、安定化、改善または予防するためには長期間、例えば毎日を基本として長期間、例えば1週間、2週間、3週間もしくは4週間または数ヶ月以上かかり得る。微生物相全体の調製または培養代替の実施形態では、本発明の組成物は、個体もしくは種、例えばヒトまたは他の哺乳動物の微生物相全体または実質的に全体を含む調剤、製剤、培養物もしくは培養抽出物または分離株を含む。代替の実施形態では、本発明は、様々な感染、疾患または状態を予防するか、その症状を軽減するか、改善するか、安定化するか、または治療するための組成物および方法を提供し、それらは、これらの微生物相全体または実質的に全体調剤を投与するステップ例えば脊椎関節症、脊椎関節炎または仙腸骨炎腎炎症候群狼瘡、過敏性腸症候群または潰瘍性大腸炎もしくはクローン大腸炎などの大腸炎などの腸または腸管要素を有する炎症性または自己免疫性状態便秘、自閉症筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症またはパーキンソン病などの変性神経疾患ミオクローヌジストニー関節リウマチまたは若年性特発性関節炎などの自己免疫疾患慢性疲労症候群肥満低血糖、前糖尿病性症候群、I型糖尿病またはII型糖尿病特発性血小板減少性紫斑病皮疹、発疹、蕁麻疹または慢性蕁麻疹などの急性または慢性アレルギー性反応およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を予防するか、その症状を軽減するか、改善するか、安定化するか、または治療するために微生物相全体または実質的に全体調剤を投与するステップを含む。代替の実施形態では、本発明は、例えば便秘、炎症性腸疾患、クローン病、肝性脳症、腸炎、大腸炎、過敏性腸症候群、線維筋痛症、慢性疲労症候群、うつ病、注意欠陥多動障害、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、旅行者下痢、小腸細菌過剰増殖、慢性膵臓炎、膵臓不全、毒物もしくは毒素もしくは感染への曝露、毒素媒介旅行者下痢、中毒、偽膜性大腸炎、クロストリジウム感染、Cパーフリンジェンスウェルチもしくはクロストリジウムディフィシレ感染、神経学的状態、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、自閉症、筋萎縮性側索硬化症または多発性硬化症、大発作痙攣または小発作痙攣を含む様々な感染、疾患または状態を予防するか、その症状を軽減するか、改善するか、または治療するために、これらの微生物相全体または実質的に全体調剤を投与するための組成物および方法を提供する。本発明は何ら特定の作用機序に限定されないが、本発明の処理済みもしくは未処理の糞便試料、または本発明の完全もしくは部分糞便細菌叢試料を含む組成物、または本発明の部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢は、レシピエントに注入されると、腸でコロニーを形成する。一実施形態では、ヒト細菌叢を濾過することによって、かつまたは回転もしくは遠心分離、プラズマフェレシス、血球分離、カラムクロマトグラフィーまたは免疫沈降などによって、ほぼ純粋か、または実質的に純粋か、または純粋な糞便細菌叢を抽出して、これらの糞便細菌叢調剤を製造する。代替の実施形態では、本発明の組成物を、同時に培養された微生物相全体培養することによって調製する。一実施形態では、微生物相全体培養試料を例えば液体として、またはフリーズドライまたは凍結製品として製剤化する。一実施形態では、これらの調剤は、非細菌叢材料、例えば糞便試料、例えば未加工のヒト糞便には通常存在する非吸収性成分を何ら含有しない。一実施形態では、未加工の糞便を治療薬または製剤へと製造する。一実施形態では、本発明は、適切なドナーから糞便試料を採取することによって、哺乳動物、例えばヒトの細菌叢全体を培養する方法を提供する。一実施形態では、適切なドナーは、病原体を有さない個体である例えば一態様では、試料を正常で、病原体を何ら含まないと分類されているドナーから採取する。一実施形態では、独立療法として、または他の療法と合わせて、痩せ型のドナーからの細菌を、肥満患者において肥満を治療するために使用することもできる。代替の実施形態では、培養を約2、3、4、5、6、7または8日以上、完全に、または実質的に完全に嫌気的条件下で実施する。例えば非選択的腸微生物相培地を使用して、標準的な培養手順を使用することができ、一実施形態では、約368°Cの体温でインキュベートする。酸素が欠如しており、窒素、二酸化炭素および水素を含有する雰囲気を使用することができる。GMMの組成物の濃度の変化を伴う種々のGMMを使用することができる。次いで、コロニーまたは培養細菌叢を、例えば無菌スクレーパーで掻き取ることによって採集する。例えばグリセロール、システインまたは牛乳などの例えば凍結沈澱物を使用して、採集されたコロニーまたは培養細菌叢を例えば、約80°C以下で凍結させることができる。次いで、そのような培養を分取して、一度のみ使用することができる。一実施形態では、方法は、例えばGMMに類似の脂質培地中で再培養することを含み得る。この培地全体を、例えばシステインを含むグリセロールを使用して再び凍結させることができかつ、一実施形態では、凍結またはフリーズドライさせたままであってよい。これによって、約108から約1010CFUを製造することができる。代替の実施形態では、培養された細菌の粉末、乾燥、凍結、フリーズドライもしくは液体または他の形態を、浣腸剤、食品または食品サプリメントまたは製剤として製剤化およびまたは使用することができるか、またはカプセル剤、錠剤、ゲルタブ剤など送達して、腸細菌叢を再コロニー形成させるか、または別法では、もしくは治療的にコロニー形成させることができる。代替の実施形態では、培養された細菌を微生物相全体の培養物または試料または製剤に加える。例えば一実施形態では、第1の投与または初めの毎日の製剤は、微生物相全体製剤のみを含む一方で他の実施形態では、第1の投与または初めの毎日の製剤は、微生物相全体と追加の培養細菌、例えば培養プロバイオティック細菌との両方を含む。代替の実施形態では、頻度の低い製剤または投薬は、微生物相全体のみを含む一方で他の実施形態では、微生物相全体と追加の培養細菌、例えば培養プロバイオティック細菌との両方を含む。代替の実施形態では、所望の効果または治療結果を達成するために、追加の培養細菌は、ドナーから直接単離されるか、純粋な培養などから出来してよいバクテロイデス属、ファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシス種である。代替の実施形態では、増大量の1種または複数の糞便細菌叢種の送達を使用し、例えば送達される微生物相全体製品を1種または複数の追加の種、例えばバクテロイデス属、ファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシス種で増強する。複数回または繰り返し注入または投与代替の実施形態では、処理済みもしくは未処理の糞便試料、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または本発明のヒト微生物相全体の培養物、または微生物相全体、またはそれらの組合せを包含する本発明の組成物を、繰り返しまたは複数回の送達または注入のために製剤化または検量する。本発明の方法の代替の実施形態では、例えばヒト微生物相全体から部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または微生物相全体、またはそれらの組合せを、繰り返しまたは複数回の送達または注入によって送達または投与する。したがって本発明は、永続的に回復させるのが困難な腸細菌叢感染または状態を治療、安定化もしくは改善するか、または永続的に回復させるのが困難な腸細菌叢感染を特徴とする状態を治療または改善するための組成物および方法を提供する。複数回の繰り返し注入によって、永続的に回復させるのが困難な腸細菌叢感染または状態を克服し得ることが発見された。代替の実施形態では、本発明の方法およびまたは組成物を実施する際に、複数回または繰り返し糞便細菌叢移植によって、例えば病原性およびまたは外来細菌株を有する個体における原因となっている頑強で進行性の細菌叢感染または慢性状態を克服することができる。感染性細菌の除去が不十分であると、進行性の元の症状が戻り得る。細菌は時によって分割せず、多くは身体の湿潤表面にバイオフィルムで生存し得ることが知られている。第二に、細菌は、芽胞形成の間欠的な時間で根絶するのがさらに困難であり得る芽胞を有する。また、細胞内および細胞外であり得る細菌の休眠形態も存在し、その場合、それらは、休眠形態が分割しているのでなければ、根絶するのはさらにより困難である。最終的には、それらが存在する腸壁細胞が腸内腔に入り、細菌叢を再感染させるまで、細胞内細菌を待つこともある。代替の実施形態では、本発明の方法の複数回または繰り返し腸細菌叢注入は、細胞、バイオフィルムなどの内部で保護されている生存可能な細菌を死滅させるか、または別段に不活性化させるために必要とされることがあり、必要とされてよい。代替の実施形態では、本発明の方法の複数回または繰り返し腸細菌叢注入は、内腔により近い陰窩へと移動して、そこで、糞便流に入り、個体または患者を再感染させる細菌細胞を死滅させるか、または別段に不活性化させるために必要とされることがあり、必要とされてよい。加えて、代替の実施形態では、本発明の方法およびまたは組成物の複数回または繰り返し糞便細菌叢移植は、脊椎関節症、脊椎関節炎または仙腸骨炎腎炎症候群狼瘡、過敏性腸症候群または潰瘍性大腸炎もしくはクローン大腸炎などの大腸炎などの腸または腸管要素を有する炎症性または自己免疫性状態便秘、自閉症筋萎縮性側索硬化症、多発性硬化症またはパーキンソン病などの変性神経疾患ミオクローヌジストニー関節リウマチまたは若年性特発性関節炎などの自己免疫疾患慢性疲労症候群肥満低血糖、前糖尿病性症候群、I型糖尿病またはII型糖尿病特発性血小板減少性紫斑病皮疹、発疹、蕁麻疹または慢性蕁麻疹などの急性または慢性アレルギー性反応およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を予防するか、安定化するか、その症状を軽減するか、改善するか、またはそれを有する個体を治療するのに有効である。代替の実施形態では、本発明を、ヒト濾過糞便の反復浣腸、経鼻十二指腸管または経鼻胃管を介しての反復注入を包含する本発明の方法または組成物の使用によって実行する。代替の実施形態では、本発明の方法または組成物は、様々な製剤を製剤化または使用し、例えば凍結抽出糞便細菌材料を、香料添加飲料として懸濁させるか、またはNDまたはNG管に入れるか、または浣腸剤として挿入することができる。代替の実施形態では、抽出細菌である野生型をフリーズドライさせ、粉末に形成し次いでそれらを、例えば腸溶コーティングされたカプセル剤、錠剤、液剤などとして摂取することができる。代替の実施形態では、これらの本発明の製品を初め、毎日、次いで、徐々に低い頻度で、および一部の実施形態では、最終的に数週間毎に1回または1ヶ月毎に摂取、注入または投与する。代替の実施形態では、培養細菌を、部分的に、実質的に、または完全に精製または単離された糞便細菌叢に加えて、またはそれと共に使用することができる。例えば一実施形態では、第1の投与または初めの毎日の製剤は、部分的に、大部分、または完全に精製または単離された糞便細菌叢のみを含む一方で他の実施形態では、第1の投与または初めの毎日の製剤は、部分的に、大部分、または完全に精製または単離された糞便細菌叢と培養細菌、例えば培養プロバイオティック細菌との両方を含む。代替の実施形態では、頻度の低い製剤または投薬は、部分的に、大部分、または完全に精製または単離された糞便細菌叢のみを含む一方で他の実施形態では、部分的に、大部分、または完全に精製または単離された糞便細菌叢と培養細菌との両方を含むかまたは他の実施形態では、培養細菌、例えば培養プロバイオティック細菌のみを含む。代替の実施形態では、所望の効果または治療結果を達成するために、培養細菌は、ドナーから直接単離されていてよいか、または純粋な培養などから出来してよいバクテロイデス属およびまたはファーミキューテス属種およびまたはバチルススリンギエンシスである。代替の実施形態では、増大量の1種または複数の糞便細菌叢種の送達を使用し、例えば送達される製品を、1種または複数の追加の種、例えばバクテロイデス属およびまたはファーミキューテス属およびまたはバチルススリンギエンシスで増強する。代替の実施形態では、当業者によって決定されるとおりの十分な効力のために、製剤を毎日か、または毎日ではないが、代わりに反復して長期間、例えばかなり多い用量で組み込む。代替の実施形態では、繰り返しまたは複数回の注入、投与または移植プロトコールは、例えば過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎もしくはクローン大腸炎などの大腸炎、便秘、自閉症、多発性硬化症などの変性神経疾患、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、関節リウマチ、慢性疲労症候群、肥満、糖尿病、II型糖尿病、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫疾患、慢性蕁麻疹およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を治療するためには、ほぼ最初の10日間は毎日行われる注入、およびその後は第2回目の毎日の別の投薬または製剤を約10日間、場合によって、引き続き、別に第3回目の毎日次いで場合によって、別の第4回目の毎日、毎週、または毎月の投薬または製剤、次いで場合によって、組織診が正常に戻るか、または他の治療パラメーターまたは目標が達成されるまで、別の投薬または製剤をさらに毎日、毎週、毎月の送達または注入を維持することを含む。代替の実施形態では、例えば過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎もしくはクローン大腸炎などの大腸炎、便秘、自閉症、多発性硬化症などの変性神経疾患、パーキンソン病、ミオクローヌスジストニー、関節リウマチ、慢性疲労症候群、肥満、糖尿病、II型糖尿病、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫疾患、慢性蕁麻疹およびまたは不眠症または慢性不眠症、大発作痙攣または小発作痙攣を治療するためには、繰り返しまたは複数回の注入、投与または移植を、第1製剤を毎日初めの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15日間第2の投薬または製剤を毎日、後続の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15日間以上次いで場合によって、第3の引き続きの投薬または製剤を毎日次いで場合によって第4の投薬または製剤を毎日または毎週用いて行いかつ次いで場合によって、例えば組織診が正常または治療または回復に関する他の適切なパラメーターに戻るまで、毎週または毎月の注入を維持する。当業者、例えば医師または獣医師は、個体の改善を評価し、本発明のこの繰り返し投与実施形態における正確で適切な投薬または投与頻度を決定することができる。代替の実施形態では、これらの例示的なプロトコールはまた、バイオフィルム芽胞、休眠形態および細胞内細菌の問題点に対処することができるような波で腸へと押し流されるであろう培養プロバイオティック細菌を注入または摂取するためにも使用することができる。まとめると、代替の実施形態では、本発明は、本明細書に記載されている糞便細菌叢を複数回繰り返し注入することによって、永続的に回復させるのが困難な腸細菌叢感染を治療、安定化もしくは改善するか、または永続的に回復または制御するのが困難な腸細菌叢感染を特徴とするか、またはそれに関連する状態を治療または改善するための組成物および方法を提供する。代替の実施形態では、本発明の糞便微生物相移植組成物および方法は、クロストリジウム、例えばCディフィシレが感染因子である状態に加えて、上記で列挙されたより困難な状態において有効である。代替の実施形態では、繰り返しまたは反復注入が、治癒、安定化または長期緩解を得るためには重要である。本発明の組成物を送達するためのデバイス本発明はまた、本発明の組成物を送達するためのデバイスを提供し、例えば例示的な送達デバイスを、図1Bに図示する。代替の実施形態では、本発明のデバイスはまた、下記を含むか、または下記からなってよい軟性管または均等物の近位末端に作動可能に接続されている出口開口部を含むバッグまたは容器を含む材料からなり、場合によって、前記バッグまたは容器は、静脈内様バッグであり、場合によって、前記バッグまたは容器は、前記バッグをスタンドに懸垂させておける、例えば、内視鏡の上に設置懸垂させておけるアタッチメントを有し、場合によって、前記バッグまたは容器は、開閉バルブまたは均等物を介して、全てのガスまたは空気をバッグから除去し得る負圧デバイスに作動可能に接続されており、場合によって、前記バッグまたは容器は、開閉バルブまたは均等物を介して、出口開口部を介してバッグをフラッシュするための流体供給源または貯蔵容器に作動可能に接続されており、場合によって、前記流体供給源または貯蔵容器は正圧下にあり、場合によって、軟性管または均等物は、管の遠位部分から近位部分への、または管の後からバッグまたは容器への材料の逆洗を防ぐための少なくとも1個のクリップまたは閉鎖25バルブまたは逆止め弁を含む軟性管または均等物の遠位末端の開閉バルブまたは均等物またはオブデュレータースクリュートップ、および場合によって、結腸鏡もしくは内視鏡ルアーロックポートまたは均等物に取り付けるためのルアーロックチップ、および場合によって、浣腸管もしくはデバイスまたは均等物に取り付けるための浣腸管チップ場合に遠位5開口部を閉鎖するための安全デバイスまたは安全クリップをさらに含むおよび前記バッグまたは容器中の材料を、前記軟性管または均等物を介して、遠位末端から、または開閉バルブもしくは均等物から移動させるためのポンプまたは手動ポンプ。代替の実施形態では、本発明のデバイスは、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、または部分的に、実質的にまたは完全に単離された糞便細菌叢、または本発明の組成物、例えば部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含み、場合によって、添加剤もしくは流体、食塩水、緩衝液、緩衝剤または培地もしくは流体グルコースセロビオース寒天培地をさらに含む組成物をさらに含む。一実施形態では、本発明は、処理済みもしくは未処理の糞便細菌叢、または部分的に、実質的にもしくは完全に単離された糞便細菌叢、または本発明の組成物、例えば部分的に、実質的にもしくは完全に単離もしくは精製された糞便細菌叢、または非糞便細菌叢糞便材料から実質的にもしくは完全に精製された糞便細菌叢を含み、場合によって、添加剤または流体、食塩水、緩衝液、緩衝剤または培地もしくは流体グルコースセロビオース寒天培地をさらに含む組成物を含むバッグまたは容器を提供し、前記バッグまたは容器は、本発明のデバイスのバッグまたは容器と構造的に同じか、または類似しており、例えば本明細書に記載されている軟性管または均等物などの近位末端に作動可能に接続されている出口開口部を含むバッグまたは容器である。本発明を、下記の実施例を参照してさらに記載するがしかしながら、これは、本発明をそのような実施例に限定するものと理解されるべきではない。本発明の例示的な方法本発明の一例示的手順は、健康なドナーに当初由来する本発明の処理済みまたは単離糞便細菌叢を含む浣腸剤での5日から10日の治療を伴う。別法では、患者は、僅か1回の治療の後に回復し得る。一実施形態では、ドナーについての最良の選択は、幅広い一連の細菌および寄生虫因子について試験された近親者である。浣腸剤を調製し、必要な全ての注意を保証するために病院環境内で投与する。本発明の例示的なプロバイオティック注入はまた、経鼻胃管を介して投与し、細菌を小腸に直接送達することもできる。これら2つの方法を合わせて、所望の結果を達成することができる。手順の1年後までは、通常の検査を必要とすべきである。一実施形態では、医学的治療の前に、自己糞便試料を患者から得て、それを冷蔵庫内で貯蔵するか、凍結乾燥させるか、またはフリーズドライさせるか、または同等のようにする。その後に、患者が感染、例えばCディフィシレ感染を展開したら、試料を食塩水で調製し、濾過する。濾液をフリーズドライさせ、生じた固体をカプセル剤、例えば腸溶コーティングされたカプセル剤に封入することができる。カプセル剤の投与によって、患者自身の結腸細菌叢を再生させ、感染、例えばCディフィシレを撲滅することができる。一実施形態では、試料を、経鼻プローブを介して十二指腸に送達する。一実施形態では、本発明の方法は、健康なドナーから新鮮なヒト細菌叢を採集し、それを集中研究所に運び、長期寿命が与えられるように加工し、病原体についてチェックし、細菌の代謝活性を低下させるために温度制御を維持し、酸素ショックに関して制御し、均質化された標準化細菌叢の貯蔵施設を開発し、遠方の病院へと細菌叢を運送して、例えば急性偽膜性大腸炎、重症のCディフィシレ感染、敗血症または他の匹敵する状態を有する患者を治療することを含む。一実施形態では、本発明の製品は、調整糞便組成物である。糞便を採集し、酸素を吸着または吸収する材料で空気を最大限抜き取るか、または窒素または不活性か、または嫌気性細菌叢を損なわない他のガスで排気し、それを充填することができる嫌気的容器に迅速に入れることを必要とする。それを、糞便も漏らさず、また嫌気的状況をもたらしているガスも漏らさない審美的に許容可能な容器に保持しなければならない。中央バンクに送達されたら、糞便を、代謝を低下させるために低温室に貯蔵することができるが、糞便中に含有される細菌細胞の水膨張破壊を防ぐために凍結させることはできない。一実施形態では、グリセロールなどの抗酸化剤およびまたは材料を加えて、低温下での細菌の安定化に役立て、それらが貯蔵の間および輸送の間に破壊されるのを防ぐ。一実施形態では、製品は、糞便約10ccから3リットルの間の体積として、または体積で貯蔵含有されている。一実施形態では、それを、300cc容器中で貯蔵し、適切な耐酸素材料、例えばプラスチック製、耐酸素性またはガス不透過性ポリエチレンテレフタレートポリエステルフィルムまたは金属被覆MYLARまたはアルミニウム被覆MYLAR中に保持し、これを、結腸鏡に取り付けられるはずの供与セットを介してポンプに取り付けることができ、結腸鏡を介して、遠位小腸に、または上部結腸末端回腸に投与して、クロストリジウムディフィシレ感染を克服することができる。中央細菌叢供給研究所またはバンク一実施形態では、研究所が、次のようにヒト細菌叢を供給する機能を果たす1糞便を特殊な容器に採集し、中央細菌叢加工ユニットに到着するまで嫌気的に低温で保持する。2加工ユニット内で、グリセロール、可能な場合には抗酸化剤および他の特殊な防腐剤を包含する特殊な添加物を加え、低温に保持し、均質化し、適切な、ただしガス不透過性ポリエチレンテレフタレートポリエステルフィルムまたはアルミニウム被覆MYLARなどの多少より厚い製品を備えた静脈内様バッグに分取する。これによって、酸素が移入すること、窒素が逃げること、および投与スタッフによって臭気が検知されることを防ぐ。次いで、バッグを、細菌を凍結させない温度で貯蔵すると、糞便移植を実施する病院までクーラー内で輸送する準備は整っている。3バッグを取り付けられた供与セットと共に供給して、それが病院スタッフによって取り扱われないようにする。それに、逆止め弁を備えた血液タイプポンプを取り付ける。静脈内様バッグには、バッグをIV流体スタンドに懸垂させることができ、内視鏡の上に設置懸垂させておけるアタッチメントが存在する。次いで、内視鏡操作者は、オブデュレータースクリュートップを外し、内視鏡ルアーロックポート上でルアーロックチップに取り付け、生検鉗子チャンネルを介して、結腸鏡または内視鏡のチップで注入する。チップが圧力下で外れる場合には、安全デバイスを取り付ける。次いで、製品が供与セットから、供与セットに伴う圧力機構で流れ出すと、空気が排出され、空気が管から排出されたら、次いで投与ポンプを使用して、糞便のみを患者の結腸へと投与し、例えば多少の食塩水でフラッシュする。4次いで、内視鏡操作者は、結腸鏡を抜き取り、患者の頭を下げ足を上げさせて、空気および液体を吸収させ、患者が早期に排便しないようにする。こうすると、例えばGrehanらがJofClinicalGastroenterologyに記載しているとおり、細菌は温度を回復し、自ら腸壁に付着し始める。本発明のいくつかの実施形態を記載した。しかしながら、本発明の意図および範囲を逸脱することなく、様々な変更形態を成すことができることは理解されるであろう。したがって、他の実施形態は、次の請求項の範囲に包含される。