"クメジマミナミボタルDrilasterkumejimensisに由来するルシフェラーゼ。配列番号1に記載のアミノ酸配列、配列番号1に記載のアミノ酸配列と80以上の相同性を示すアミノ酸配列、および配列番号31に記載のアミノ酸配列と80以上の相同性を示すアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む請求項1に記載のルシフェラーゼ。配列番号1に記載のアミノ酸配列を含むルシフェラーゼよりも高い発光強度でルシフェリンを発光させる請求項1または2に記載のルシフェラーゼ。配列番号1に記載のアミノ酸配列を含むルシフェラーゼに対して、4.9倍以上の強度で前記ルシフェリンを発光させる請求項1から3のいずれか1項に記載のルシフェラーゼ。請求項1から4の何れか1項に記載のルシフェラーゼであって、配列番号1に記載されるアミノ酸配列の2番目のアスパラギンに対応するアミノ酸残基がアスパラギン酸であること、および配列番号1に記載されるアミノ酸配列の424番目のイソロイシンに対応するアミノ酸残基がロイシンであることの少なくとも1つを満足するアミノ酸配列を有するルシフェラーゼ。前記ルシフェラーゼは、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する変異型ルシフェラーゼである請求項1から5のいずれか1項に記載のルシフェラーゼ。請求項1から6の何れか1項に記載のルシフェラーゼをコードする塩基配列を含む核酸。配列番号2または配列番号32に示される塩基配列を含む請求項7に記載の核酸。前記ルシフェラーゼの遺伝子のコドンが哺乳類における発現に最適化された請求項7または8に記載の核酸。本発明の目的は、新規ルシフェラーゼを提供することにある。本発明の一態様に係るルシフェラーゼは、クメジマミナミボタルDrilasterkumejimensisに由来する。本発明によれば、高い発光強度を示すルシフェラーゼが提供されるため、発光像を撮像するために必要な露出時間を短縮することができ、且つ従来よりも時間分解能が高い経時的観察が可能となる。本発明の実施形態は、クメジマミナミボタルDrilasterkumejimensisに由来するルシフェラーゼに関する。ルシフェラーゼとは、一般に、発光が生じる化学反応を触媒する酵素を指す。当該酵素の基質となる物質はルシフェリンと呼ばれる。ATPの存在下、ルシフェラーゼの触媒作用により、ルシフェリンが化学変化を起こす際に発光する。現在、ルシフェラーゼは、ホタルに由来するものおよびバクテリアに由来するものが取得されている。実施形態に係るルシフェラーゼも、上述の通り定義されるルシフェラーゼと同義であるが、後述するホタルから初めて取得された新規のルシフェラーゼである。実施形態に関してルシフェリンとは、好ましくは、ホタルルシフェラーゼの基質となるホタルルシフェリンを意味する。より好ましくは、ホタルルシフェリンとはD-ルシフェリンである。実施形態に係るルシフェラーゼは、クメジマミナミボタルDrilasterkumejimensisに由来する。クメジマミナミボタルとは、節足動物門昆虫綱コウチュウ目ホタル科ミナミボタル属に属すホタルである。なお、ここにいう由来するとは、クメジマミナミボタルが有する野生型のルシフェラーゼに加えて、その変異体をも含むことを意味する。実施形態に係るルシフェラーゼによれば、既知のルシフェラーゼと比較して高い発光強度が得られる。従って、実施形態に係るルシフェラーゼは、タンパク質のイメージングのためのレポーターとして利用する場合に特に有利な効果を奏する。すなわち、実施形態に係るルシフェラーゼは、少量でも高い発光強度を提供できるため、発現量が低いタンパク質の良好な検出を可能とする。また、実施形態に係るルシフェラーゼは、得られる発光強度が高いことにより検出に必要な露出時間を短縮できる。このため、実施形態に係るルシフェラーゼを経時的観察のためのレポーターとして利用すれば、撮影に必要な時間を短くすることが可能となり、よりリアルタイムに近い観察が可能となる。すなわち、時間分解能が高い経時的観察が可能となる。実施形態に係るルシフェラーゼの一例は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むルシフェラーゼである。当該ルシフェラーゼは、クメジマミナミボタルから得られた野生型のルシフェラーゼである。この明細書および特許請求の範囲では、当該ルシフェラーゼを、野生型ルシフェラーゼ、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼまたは野生型クメジマミナミボタル由来ルシフェラーゼ等と称する。図1は、実施形態に係る野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼを用いた場合に得られたルシフェリンの発光スペクトルを示す。この図に示されるとおり、実施形態に係る野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、pH8.0および7.5において、それぞれ最大発光波長を557および560nmに有する。また、pH7.0において、最大発光波長を560nmに有し、610nm付近により小さなピークを有する。また、pH6.5および6.0において、それぞれ、最大発光波長を592および613nmに有する。ここで最大発光波長とは、ルシフェラーゼが誘起するルシフェリンの発光を測定することによって得られるスペクトルにおいて、発光強度が最大となる波長を意味する。実施形態に係るルシフェラーゼは、クメジマミナミボタルから取得された野生型のルシフェラーゼだけでなく、野生型ルシフェラーゼのアミノ酸配列の一部に変異が生じた変異型のルシフェラーゼを含む。ここでは、このようなルシフェラーゼを、変異型ルシフェラーゼ、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼまたは変異型クメジマミナミボタル由来ルシフェラーゼ等と称する。そのような変異は、ルシフェラーゼの酵素活性を向上させる変異であってよい。すなわち、そのような変異は、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼよりも高い発光強度をもたらす変異であってよい。例えば、実施形態に係る変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼを用いた場合に達成される発光強度は、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼを用いた場合に達成される発光強度の1.5倍以上、1.8倍以上、2.0倍以上、4倍以上または5倍以上であり得る。図3は、HeLa細胞中での野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼおよびPhotinuspyralisルシフェラーゼ以下、P.ピラリスルシフェラーゼという。によるルシフェリンの発光強度を比較したグラフを示す。この図から、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、P.ピラリスルシフェラーゼの2.04倍の発光強度を、また変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼはP.ピラリスルシフェラーゼの4.94倍の発光強度を達成できることがわかる。このように、実施形態に係るルシフェラーゼを用いた場合は、従来のホタルルシフェラーゼを用いた場合と比較して、より高い発光強度を達成できる。実施形態に係るクメジマミナミボタルに由来する野生型ルシフェラーゼにより、既存のP.ピラリスルシフェラーゼによる発光強度の2.0倍以上の発光強度が得られる。また、実施形態に係る変異型クメジマミナミボタルに由来するルシフェラーゼにより、既存のP.ピラリスルシフェラーゼによる発光強度の3.0倍以上の発光強度が得られる。好ましくは、P.ピラリスルシフェラーゼによる発光強度の3.5倍以上、4.0倍以上、4.5倍以上、4.8倍以上、4.9倍以上の発光強度が得られる。発光強度の向上をもたらす変異の例は、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼのアミノ酸配列配列番号1における424番目のイソロイシンIをロイシンLに置換する変異I424Lである。あるいは、上記の変異は、配列番号1とは異なるアミノ酸配列を有するタンパク質に対しても導入することができる。例えば、そのようなタンパク質のアミノ酸配列と配列番号1との対応関係を考慮して変異を導入することができる。そのようなタンパク質にI424L変異を導入したい場合、配列番号1と導入の対象とするタンパク質の配列とを比較して、配列番号1に示されるアミノ酸配列の424番目のIに対応するアミノ酸残基を決定し、当該アミノ酸をLに置換することでI424L変異を導入することができる。ここにおいて対応するアミノ酸残基は、例えば相同性検索といった公知の技術を利用して決定することができる。実施形態に係る変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの一例は、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有するルシフェラーゼである。変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ配列番号1に対して、I424LおよびN2Dの変異を導入して得られた変異型ルシフェラーゼである。ここで、N2Dの変異は、以下で説明するKozak配列付加に伴うものである。変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼを用いた場合に達成され得る発光強度は、例えば、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ配列番号1を用いた場合に達成され得る発光強度の1.5倍以上、好ましくは、1.8倍以上、より好ましくは、2.0倍以上である。また、実施形態は、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して更なる変異を導入したものも含む。例えば、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して、さらなる発光強度の向上を目的として、さらなる変異を導入したものを含む。あるいは、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して、発光強度の向上とは別の目的、例えば、可溶性の向上、分解に対する耐性の向上等を目的として、さらなる変異を導入したものを含む。具体的には、実施形態は、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼのアミノ酸配列配列番号31との間で一定の相同性を示すアミノ酸配列を含むルシフェラーゼである。ここにおいて、アミノ酸配列における一定の相同性とは、例えば、75以上、80以上、85以上、90以上、95以上、96以上、97以上、98以上または99以上の相同性である。また、好ましくは、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して更なる変異が導入された変異型ルシフェラーゼのアミノ酸配列は、配列番号31に示されるアミノ酸配列の1から20のアミノ酸が変異したものであり、1から15のアミノ酸が変異したものであり、1から10のアミノ酸が変異したものであり、1から5のアミノ酸が変異したものであり、1から4のアミノ酸が変異したものであり、1から3のアミノ酸が変異したものであり、1または2のアミノ酸が変異したものである。好ましくは、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して更なる変異が導入された変異型ルシフェラーゼでは、I424Lの変異が維持されている。すなわち、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼに対して更なる変異が導入された変異型ルシフェラーゼのアミノ酸配列において、424番目のアミノ酸またはそれに対応するアミノ酸がロイシンである。ここにおいて対応するアミノ酸は、例えば相同性検索といった公知の技術を利用して決定することができる。実施形態に係る変異型ルシフェラーゼのその他の例は、実験的な操作性を向上させる変異が導入された変異型ルシフェラーゼである。たとえば、野生型ルシフェラーゼが哺乳細胞内において低い可溶性を示す場合、実施形態に係る変異型ルシフェラーゼは、その可溶性を高める変異が導入されたルシフェラーゼである。変異型ルシフェラーゼとは、実施形態に係るルシフェラーゼの特徴、すなわち従来のルシフェラーゼと比較して高い発光強度が得られる限りにおいて、ルシフェラーゼのアミノ酸配列に変異、例えば、アミノ酸の置換、欠失および/または付加等が生じたルシフェラーゼであってよい。この変異とは、野生型ルシフェラーゼのアミノ酸配列の1以上のアミノ酸の変異または1から数個のアミノ酸の変異であり、好ましくは、野生型ルシフェラーゼのアミノ酸配列の1から20のアミノ酸の変異、1から15のアミノ酸の変異、1から10のアミノ酸の変異、1から5のアミノ酸の変異、1から4のアミノ酸の変異、1から3のアミノ酸の変異、1または2のアミノ酸の変異である。好ましくは、当該変異型ルシフェラーゼのアミノ酸配列は、野生型ルシフェラーゼのアミノ酸配列との間で75以上、80以上、85以上、90以上、95以上、96以上、97以上、98以上または99以上の相同性を有する。本発明の他の実施形態は、上記実施形態に係るルシフェラーゼをコードする塩基配列を含む核酸に関する。すなわち、当該核酸は、クメジマミナミボタルに由来するルシフェラーゼ遺伝子を含む核酸である。実施形態において、核酸とは、例えばDNAまたはRNAを指す。また、実施形態において、ルシフェラーゼの遺伝子とは、主として、mRNAに転写される領域、すなわち構造遺伝子を意味する。実施形態に係るルシフェラーゼをコードする塩基配列を含む核酸の一例は、配列番号2に示される塩基配列を含む核酸である。この配列を有する遺伝子は、クメジマミナミボタルからクローニングされており、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼをコードする。実施形態に係るルシフェラーゼをコードする塩基配列を含む核酸の別の例は、配列番号2または32に示される塩基配列を含む核酸である。配列番号32の配列を有する遺伝子は変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼをコードする。変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、クメジマミナミボタルからクローニングされた野生型の塩基配列に対して変異を導入することで得られる配列である。実施形態に係る核酸は、野生型ルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を含む核酸であっても、そこにおいて変異が生じた変異型ルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を含む核酸であってもよい。ここにおいて、変異型ルシフェラーゼ遺伝子とは、コードされたルシフェラーゼが、実施形態に係るルシフェラーゼの特徴、すなわち従来のルシフェラーゼと比較して高い発光強度が得られる限りにおいて、塩基配列中の特定の塩基、たとえば数個の塩基の置換、欠失および/または付加等を受けた遺伝子であってよい。また、塩基配列の変異には、コードされるアミノ酸配列に変化が生じない変異が含まれる。すなわち、実施形態に係る核酸には、野生型ルシフェラーゼをコードする変異型ルシフェラーゼ遺伝子を含む核酸が含まれる。そのようなコードされるアミノ酸配列に変化が生じない変異の一例は、遺伝子中に存在する特定の制限酵素の認識配列を無効にする変異である。この変異によって、遺伝子を含む核酸は当該制限酵素によって切断されなくなるものの、当該遺伝子は変異前と同じアミノ酸配列を有するタンパク質をコードできる。このような変異は、制限酵素の認識配列を構成するコドンを、異なる塩基配列の同義コドンに変換することで達成できる。このような変異は、遺伝子組み換えに使用する制限酵素の認識配列が当該遺伝子中に存在する場合に有用である。この場合、予め遺伝子中の認識配列を無効にしておくことで、制限酵素で処理した場合に遺伝子を含む核酸が断片化することを防ぐことができ、結果として組み換えが容易になる。特定の制限酵素の認識配列を無効にした例は、配列番号3に示される塩基配列である。当該塩基配列は、クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列からBamHIおよびEcoRIの認識配列を無効にしたものである。そのようなコードされるアミノ酸配列に変化が生じない変異の別の例は、遺伝子のコドンを特定の生物種における発現に最適化させる変異である。ここにいう最適化とは、核酸に含まれる遺伝子のコドンを、特定の生物種においてコドン出現頻度が高いコドンに代えることを意味する。最適化を行った場合、特定の生物種における遺伝子の発現は、最適化をしない場合に比べて高まる。実施形態に係るルシフェラーゼ遺伝子はホタルから取得されたものであるため、当該遺伝子を導入しようとする生物種が分類学的にホタルから遠い程、最適化の効果はより高いと考えられる。実施形態において特定の生物種とは、例えば細菌細胞、酵母細胞および哺乳細胞である。更に哺乳細胞は、例えばマウスの細胞、サルの細胞およびヒトの細胞である。実施形態に係るコドンが最適化されたルシフェラーゼをコードする塩基配列を含む核酸の一例は、配列番号3に示される塩基配列を含む核酸である。当該核酸は、BamHIおよびEcoRIの認識配列が無効にされており、且つ哺乳細胞における発現にコドンが最適化されている。実施形態に係る核酸は、Kozak配列が付与されたルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を含む核酸を含む。Kozak配列とは、開始コドンとその前後の複数の塩基配列から成る配列であり、Kozak配列が存在することで、その遺伝子の発現量が増大することがわかっている。Kozak配列は、生物種または生物群ごとに共通配列が見出されている。実施形態に係るKozak配列を含む核酸は、それを導入する生物種に対応したKozak配列を有する。例えば哺乳細胞に導入される場合、核酸は、Kozak配列としてgccrccatgg配列番号5rはグアニンまたはアデニンを意味するの配列を含む。Kozak配列を付与するルシフェラーゼ遺伝子は、野生型遺伝子であってもよいが、上述のようなコドンの最適化を行った変異型遺伝子であってもよい。本発明のさらに他の実施形態はこれらの核酸を含むベクターに関する。当該ベクターには、ルシフェラーゼをコードする核酸以外に、発現を調節するための配列またはマーカー遺伝子の配列を含む核酸等を含んでよい。また、本発明のさらに他の実施形態は発光プローブに関する。当該発光プローブは、野生型のルシフェラーゼを含むものでもよいが、変異型ルシフェラーゼを含むものでもよい。特に、公知の技術によって、発光プローブとしての利用に適した改変を加えたものが好ましい。さらに実施形態は、上記発光プローブを用いた種々の試料インビボ、インビトロに関する種々の使用イメージング、測光等に有効に適用できる。本発明のさらに他の実施形態は、実施形態に係るルシフェラーゼを利用して細胞内の機能を解析する方法に関する。当該方法は、実施形態に係るルシフェラーゼを細胞内に導入する工程、および前記ルシフェラーゼが誘起するルシフェリンの発光をイメージング装置により検出する工程を含む。例えば、DNA中の特定の発現調節領域の下流に実施形態に係るルシフェラーゼ遺伝子を導入し、ルシフェラーゼの発現を、それが誘起するルシフェリンの発光の有無によって検出することで、発現調節領域の機能を調べることが可能である。本発明のさらに他の実施形態は、上記実施形態に係るルシフェラーゼを利用して細胞内タンパク質を解析する方法に関する。当該方法は、実施形態に係るルシフェラーゼと解析の対象とするタンパク質とから成る融合タンパク質を細胞内に導入する工程;および、前記ルシフェラーゼが誘起するルシフェリンの発光をイメージング装置により検出する工程を含む。当該方法は、解析の対象とするタンパク質の細胞内の局在の観察、および、その局在の時間変化の観察タイムラプスを含む。また、当該方法は、タンパク質の局在だけでなく、そのタンパク質が単に発現したか否かの確認をも含む。使用される細胞に特別な限定はなく、細胞のイメージングの分野において通常使用できる細胞であってよい。また、解析の対象とするタンパク質も特別に限定はなく、研究の目的に応じたタンパク質を選択することができる。当該タンパク質は、使用する細胞内に本来存在するタンパクであってよく、または細胞内に本来存在しない異種性のまたは改変したタンパク質であってよい。融合タンパク質を細胞内に導入する場合、既知の導入方法を使用することができる。1つの方法は、細胞外で精製した融合タンパク質を細胞内に直接導入する方法である。例えば、マイクロインジェクション法によって融合タンパク質を細胞内に直接注入することができる。または、融合タンパク質を含む培養液にて細胞をインキュベートさせて、エンドサイトーシスによって融合タンパク質を細胞に取り込ませることができる。また別の方法は、まず融合タンパク質をコードする塩基配列を含む核酸を導入し、その後細胞内で融合タンパク質を発現させる方法である。例えば、当該核酸を含む発現ベクターを、リン酸カルシウム法、リポフェクション法またはエレクトロポレーション法等によって細胞内に導入し、発現ベクターから融合タンパク質を発現させることができる。ここにおいて、融合タンパク質の遺伝子は、実施形態に係るルシフェラーゼ遺伝子と解析の対象とするタンパク質の遺伝子とを含む遺伝子であり、ここにおいて、ルシフェラーゼ遺伝子とタンパク質遺伝子とは、それぞれ正常に翻訳されるよう連結されている。ルシフェリンの発光をイメージング装置により検出する工程は、既知の検出方法を使用することができる。例えば、ルシフェラーゼを含む融合タンパク質を発現する細胞に、ルシフェリン、ATPおよびMg2イオン等を適宜与えてルシフェラーゼにルシフェリンの発光反応を誘起させ、発生した発光をイメージング装置により検出することができる。イメージング装置とは、例えば発光を捉えるためのフィルターを備えた顕微鏡である。顕微鏡を使用することで、細胞内における発光の位置を特定して、この情報をもとにタンパク質の局在を特定することが可能となる。また、イメージング装置として、経時的に撮像できる機能を備えた顕微鏡を使用することができ、この顕微鏡によって経時的観察も可能となる。[実施例1:クメジマミナミボタル由来のルシフェラーゼ遺伝子のクローニング]1.材料材料として沖縄県久米島で採集したクメジマミナミボタルDrilasterkumejimensisの幼虫を用いた。2.トータルRNAの抽出とcDNAの合成ホタルの幼虫からハサミを用いて発光器を切り取った。組織および細胞のホモジナイズ用のビーズを含むチューブであるLysingMatrixDチューブMP-Biomedicals社に、採取した発光器および1mLのトータルRNA抽出試薬TRIzolReagentインビトロジェン社を入れた。このチューブを組織細胞破砕装置FastPrep24MP-Biomedicals社またはFastPrepFP100AMP-Biomedicals社に装着し、振動速度6.5m/sおよび振動時間45秒の条件で、ホタルの発光器を試薬中にて破砕した。完了後、チューブを破砕装置から取り出し、30分間氷上に置いた。その後、もう一度同じ条件で破砕を実施した。次に、トータルRNA抽出試薬TRIzolReagentの説明書に従って、破砕した溶液からトータルRNAの分離精製を行った。得られたmRNA溶液100μlを、エタノール沈殿法によって沈殿濃縮した。次に、完全長cDNA合成試薬GeneRacerインビトロジェン社をマニュアルに従って使用して、沈殿濃縮したトータルRNAから完全長cDNAを合成した。得られたcDNA溶液20μlをホタル完全長cDNAライブラリーとして以下の遺伝子実験に用いた。3.ホタルルシフェラーゼ遺伝子の5’末端側の同定3-1.RapidAmplificationofcDNAEndRACE法に用いるプライマーの作製クメジマミナミボタルのルシフェラーゼ遺伝子のクローニングをPolymerasechainreactionPCR法によって行った。このPCRに使用するプライマーは、既知の近縁生物由来のルシフェラーゼ遺伝子のアミノ酸配列に基づいて、以下の通り作製した。ホタルルシフェラーゼにおいてよく保存されているアミノ酸領域を確認するために、既に公開されている10種類のホタルルシフェラーゼのアミノ酸配列を、配列情報解析ソフトウェアDNASISPro日立ソフトウェアエンジニアリング株式会社を用いて比較した。比較に用いた近縁生物は、ラムフィリスノクティルカLampyrisnoctiluca登録番号CAA61668、ルキオラクルシアタLuciolacruciata登録番号P13129、ルキオララテラリスLuciolalateralis登録番号Q01158、ルキオラミングレリカLuciolamingrelica登録番号Q26304、ホタリアパルヴラHotariaparvula登録番号AAC37253、フォティヌスピラリスPhotinuspyralis登録番号BAF48390、フォトゥリスペンシルヴァニカPhoturispennsylvanica登録番号Q27757、ピロコエリアミヤコPyrocoeliamiyako登録番号AAC37254、ピロコエリアルファPyrocoeliarufa登録番号AAG45439およびラハゴフタルムスオーバイRhagophthalmusohbai登録番号BAF34360である。その結果、ホタルルシフェラーゼのC末端側440残基付近に位置するL-I-K-Y-K-G-Y-Q-V配列番号6のアミノ酸配列がよく保存されていることがわかった。この9つのアミノ酸配列をコードするコドンから塩基配列を予測し、5’末端RACEPCRに用いる12種類のホタルルシフェラーゼ特異的混合プライマーを設計した。このプライマーの名称および配列は以下の通りであるプライマー配列中のY、RおよびNは混合塩基を示す:flexLuc5-ATA5’-ACYTGRTANCCYTTATATTTAAT-3’:配列番号7、flexLuc5-ATG5’-ACYTGRTANCCYTTATATTTGAT-3’:配列番号8、flexLuc5-ATT5’-ACYTGRTANCCYTTATATTTTAT-3’:配列番号9、flexLuc5-ACA5’-ACYTGRTANCCYTTATACTTAAT-3’:配列番号10、flexLuc5-ACG5’-ACYTGRTANCCYTTATACTTGAT-3’:配列番号11、flexLuc5-ACT5’-ACYTGRTANCCYTTATACTTTAT-3’:配列番号12、flexLuc5-GTA5’-ACYTGRTANCCYTTGTATTTAAT-3’:配列番号13、flexLuc5-GTG5’-ACYTGRTANCCYTTGTATTTGAT-3’:配列番号14、flexLuc5-GTT5’-ACYTGRTANCCYTTGTATTTTAT-3’:配列番号15、flexLuc5-GCA5’-ACYTGRTANCCYTTGTACTTAAT-3’:配列番号16、flexLuc5-GCG5’-ACYTGRTANCCYTTGTACTTGAT-3’:配列番号17、flexLuc5-GCT5’-ACYTGRTANCCYTTGTACTTTAT-3’:配列番号18。これらのプライマーの合成はライフテクノロジーズジャパン株式会社に委託して行った。3-2.5’-RACEPCRによる、ホタルルシフェラーゼ遺伝子の5’末端側のクローニング上述の通り作製したホタル完全長cDNAライブラリーを鋳型として用い、上述の通り作製した12種類の特異的混合プライマーおよび5’末端特異的プライマーであるGeneRacer5’Primer5’-CGACTGGAGCACGAGGACACTGA-3’:配列番号19およびGeneRacer5’NestedPrimer5’-GGACACTGACATGGACTGAAGGAGTA-3’:配列番号20を用いて5’-RACEPCRを行った。GeneRacer5’PrimerおよびGeneRacer5’NestedPrimerは、完全長cDNA合成試薬GeneRacerキットインビトロジェン社に含まれているものを使用した。5’-RACEPCRによって効率的にルシフェラーゼ遺伝子を増幅させるため、一度PCRによって増幅した遺伝子を鋳型にし、内側のプライマー対でさらに特異的に遺伝子増幅させるnestedPCRを行った。PCRにはポリメラーゼEx-Taqタカラバイオ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。一度目のPCRとして、上述の通り作製した12種類の特異的混合プライマーのいずれかとGeneRacer5’Primerとから成る12通りのプライマー対を用いてルシフェラーゼ遺伝子を増幅した。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μl、最終濃度が1.0μMの12種類プライマーの内1つおよび最終濃度が0.3μMのGeneRacer3’Primerを含む10μlのPCR反応溶液を作製し、そこへホタル完全長cDNAライブラリー溶液を0.2μl加えた。なお、ホタル完全長cDNAライブラリー溶液の濃度は未定量であった。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、45°C30秒および72°C90秒を30サイクル繰り返し、最後に72°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1トリス酢酸緩衝液TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。12の反応溶液の全てにおいてわずかに遺伝子増幅が認められたため、これらのPCR反応溶液を鋳型としてそれぞれnestedPCR反応を次の通り実施した。nestedPCRとして、一度目のPCRで使用した12種類プライマーのうちの4つとGeneRacer3’NestedPrimerとから成る4通りのプライマー対を用いてルシフェラーゼ遺伝子の増幅を行った。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μl、最終濃度が1.0μMの12種類プライマーの内1つおよび最終濃度が0.3μMのGeneRacer3’Primerを含む10μlのPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型として1度目のPCR反応溶液を滅菌水で10倍希釈した溶液を1.0μl加えた。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、45°C30秒および72°C90秒を30サイクル繰り返し、最後に72°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。約1.4kbp付近に効率よく遺伝子が増幅したプライマーの組み合わせ条件を確認した。3-3.5’-RACEで増幅した遺伝子の塩基配列の決定5’-RACEで増幅した遺伝子の塩基配列を読み取るため、ゲル抽出によるPCR産物の精製、サブクローニングおよびダイレクトシークエンスを実施した。詳細を以下に示す。約1.4kbp付近に効率よく遺伝子が増幅したプライマーの組み合わせでPCR最終容量20μlを実施し、ゲル抽出の手法を用いて目的とする遺伝子片を回収した。ゲル抽出はWizardSVGelandPCRClean-UpSystemプロメガ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。TAクローニングの手法を用いて、ゲルから抽出したPCR産物のサブクローニングを実施した。TAクローニングはpGEM-TEasyVectorSystemプロメガ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。その後、このベクターDNAを大腸菌TOP10株またはDH5α株に形質転換し、青白スクリーニングの手法を用いてインサートポジティブコロニーを選択した。選択されたコロニーをダイレクトコロニーPCRに供し、遺伝子が導入されていることを確認した。ダイレクトコロニーPCRには、M13-F-29Primer5’-CACGACGTTGTAAAACGAC-3’:配列番号21とM13Reverse5’-GGATAACAATTTCACAGG-3’:配列番号22とから成るプライマー対を用いた。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μl、最終濃度がそれぞれ0.2μMのプライマー対を含む10μlのPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型として少量の大腸菌コロニーを加えた。PCR反応は、最初に94°C1分間の熱変性を行った後、94°C30秒、50°C30秒および72°C2分を25サイクル繰り返し、最後に72°C2分間の伸長反応を行った。PCR反応後、2μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。増幅が確認できたPCR反応溶液について、ダイレクトシークエンシング法を用いてその遺伝子の塩基配列の決定を行った。PCR産物精製キットExoSAP-ITGEヘルスケアバイオサイエンスを用いて、PCR反応溶液に含まれる余剰なdNTPおよびプライマーを除去し、PCRダイレクトシークエンシングのための鋳型を調製した。BigDyeTerminatorv3.1CycleSequencingKitアプライドバイオシステムズを用いて、この鋳型を含むシークエンシング反応溶液を調製し、サーマルサイクラーを用いてシークエンシング反応を行った。PCR産物の精製およびシークエンシングはそれぞれマニュアルに従って実施した。シークエンシング反応後、反応産物の精製を次の通りに行った。反応溶液に2.5倍量の100エタノールを加え、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。次に、上清を取り除いた後、70エタノールを加えて沈殿を洗浄し、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。最後に、上清を取り除いた後、沈殿を乾燥させた。精製した沈殿にHi-DiFormamideアプライドバイオシステムズを15μl加え、溶解させた。この溶液を94°C2分間の熱変性させ、更に氷上で急冷して、塩基配列を決定するためのサンプルとした。このサンプルをAppliedBiosystems3130xlジェネティックアナライザアプライドバイオシステムズを用いて塩基配列を読み取った。塩基配列の解析方法はマニュアルに従って実施した。シークエンシングによって得られた遺伝子配列を、配列情報解析ソフトウェアDNASISProのシークエンス連結機能を用いて解析した。この配列をNationalCenterforBiotechnologyInformationNCBIが提供するblastxサーチを利用して相同性検索を実施し、既知ホタルルシフェラーゼの塩基配列と高い相同性を示すことを確認した。以上の実験および解析で得られた塩基配列を新規ホタルルシフェラーゼ遺伝子の5’末端側であると決定した。4.ホタルルシフェラーゼ遺伝子の3’RacePCRおよび完全長cDNAの取得4-1.3’RacePCRに用いるプライマーの設計5’RacePCRの実験で得られたホタルルシフェラーゼ遺伝子の5’末端側非翻訳領域の配列を基にして、3’RACEに用いるプライマーおよびNestedPCRに用いるプライマーを作成した。プライマーの合成はライフテクノロジーズジャパン株式会社に委託した。4-2.ホタルルシフェラーゼ遺伝子の完全長cDNA取得のための3’RacePCR上述の通り作成したホタル完全長cDNAライブラリーを鋳型として用い、目的とするホタルルシフェラーゼの5’末端側非翻訳領域の塩基配列から作製したプライマーACTTATTCGTACCTTGTCCATTGGCならびにGeneRacer3’Primer5’-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACG-3’:配列番号26およびGeneRacer3’NestedPrimer5’-CGCTACGTAACGGCATGACAGTG-3’:配列番号27を用いて3’-RACEPCRを行った。GeneRacer3’PrimerおよびGeneRacer3’NestedPrimerは、完全長cDNA合成試薬GeneRacerキットインビトロジェン社に含まれているものを使用した。3’-RACEPCRによって効率的にルシフェラーゼ遺伝子を増幅させるため、一度PCRによって増幅した遺伝子を鋳型にし、内側のプライマー対でさらに特異的に遺伝子増幅させるnestedPCRを行った。PCRにはポリメラーゼEx-Taqタカラバイオ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。一度目のPCRとして、5’末端側非翻訳領域の塩基配列から作製したプライマーとGeneRacer3’Primerとから成るプライマー対を用いてルシフェラーゼ遺伝子の増幅を行った。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μlおよび最終濃度がそれぞれ0.3μMのプライマーを含む20μlのPCR反応溶液を作製し、そこへホタル完全長cDNAライブラリー溶液を0.4μl加えた。なお、ホタル完全長cDNAライブラリー溶液の濃度は未定量であった。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、50°C30秒および72°C2分を30サイクル繰り返し、最後に72°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。わずかに遺伝子増幅が認められたため、このPCR反応溶液を鋳型としてそれぞれnestedPCR反応を実施した。NestedPCRとして、NestedPCR用のプライマーACTTATTCGTACCTTGTCCATTGGCATGAA:配列番号25とGeneRacer3’NestedPrimer5’-CGCTACGTAACGGCATGACAGTG-3’:配列番号27とから成るプライマー対を用いてルシフェラーゼ遺伝子の増幅を行った。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μlおよび最終濃度がそれぞれ0.3μMのプライマーを含む20μlのNestedPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型として1度目のPCR反応溶液を滅菌水で10倍希釈した溶液を1.0μl加えた。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、50°C30秒および72°C2分を30サイクル繰り返し、最後に72°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。約2kbp付近に効率よく遺伝子が増幅していることを確認した。4-3.3’-Raceで増幅した遺伝子の塩基配列の決定3’-RACEで増幅した遺伝子の塩基配列を読み取るため、ゲル抽出によるPCR産物の精製、サブクローニングおよびダイレクトシークエンスを実施した。詳細を以下に示す。約2kbp付近に効率よく遺伝子が増幅したプライマーの組み合わせでPCR最終容量20μlを実施し、ゲル抽出の手法を用いて目的とする遺伝子片を回収した。ゲル抽出はWizardSVGelandPCRClean-UpSystemプロメガ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。TAクローニングの手法を用いて、ゲルから抽出したPCR産物のサブクローニングを実施した。TAクローニングはpGEM-TEasyVectorSystemプロメガ株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。その後、このベクターDNAを大腸菌TOP10株またはDH5α株に形質転換し、青白スクリーニングの手法を用いてインサートポジティブコロニーを選択した。選択されたコロニーをダイレクトコロニーPCRに供し、遺伝子が導入されていることを確認した。ダイレクトコロニーPCRには、M13-F-29Primer5’-CACGACGTTGTAAAACGAC-3’:配列番号21とM13Reverse5’-GGATAACAATTTCACAGG-3’:配列番号22とから成るプライマー対を用いた。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μl、最終濃度がそれぞれ0.2μMのプライマー対を含む10μlのPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型として少量の大腸菌コロニーを加えた。PCR反応は、最初に94°C1分間の熱変性を行った後、94°C30秒、50°C30秒および72°C2分を25サイクル繰り返し、最後に72°C2分間の伸長反応を行った。PCR反応後、2μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。増幅が確認できたPCR反応溶液について、ダイレクトシークエンシング法を用いてその遺伝子の塩基配列の決定を行った。PCR産物精製キットExoSAP-ITGEヘルスケアバイオサイエンスを用いて、PCR反応溶液に含まれる余剰なdNTPおよびプライマーを除去し、PCRダイレクトシークエンシングのための鋳型を調製した。BigDyeTerminatorv3.1CycleSequencingKitアプライドバイオシステムズを用いて、この鋳型を含むシークエンシング反応溶液を調製し、サーマルサイクラーを用いてシークエンシング反応を行った。シークエンスに用いたプライマーはベクタープライマーまたは遺伝子特異的なプライマーを用いた。PCR産物の精製およびシークエンシングはそれぞれマニュアルに従って実施した。シークエンシング反応後、反応産物の精製を次の通りに行った。反応溶液に2.5倍量の100エタノールを加え、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。次に、上清を取り除いた後、70エタノールを加えて沈殿を洗浄し、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。最後に、上清を取り除いた後、沈殿を乾燥させた。精製した沈殿にHi-DiFormamideアプライドバイオシステムズを15μl加え、溶解させた。この溶液を94°C2分間の熱変性させ、更に氷上で急冷して、塩基配列を決定するためのサンプルとした。このサンプルをAppliedBiosystems3130xlジェネティックアナライザアプライドバイオシステムズを用いて塩基配列を読み取った。塩基配列の解析方法はマニュアルに従って実施した。シークエンシングによって完全長ホタルルシフェラーゼ遺伝子を獲得した。この遺伝子の塩基配列を配列番号2ATGAATATGGAAGATAAAAATGTTGTACACGGACCTGCATCATTTTATCCTGTTGATGATGGAACTGCAGGACAACAACTACATAAAACTATTTTAAGATATGCTCAGTTACCTGGTACTATAGCTTTTACGGATGCACATACTGAACAAAACCTAACATATGCAGAATATTTTGATCTTACTTGTCGTTTGGCTGAAAGTATGAAGAGATACGGACTTGGTCTAAAACATGCAATAGCAGTTTGTAGTGAAAATAGTTTAAATTTTTTTGCACCGGTAATTGCTGCATTGTATTTGGGCGTAGCTGTTGCTCCAACAAATGATATTTACAATGAACGGGAACTATATAATAGTTTAAATATTTCACAACCCACAATAGTATTTTGTTCCAAAAGAGCCTTACTTAAAATTATGGAAGTTCAGAAGAAATTGCCAGTTATTCAAAAAATTATAGTCCTAGATCATAAAGAAGACTTTCAAGGATTACATTCAATGCATTCGTTTATTAAGCATTATTTACCATCACACTTTAACGAACATGATTTTAAACCTGAAGAATTTGACCGCAATGATCAAGTGGCACTAATAATGAATTCCTCTGGATCTACAGGTTTACCAAAGGGAGTTATGTTAACACACAAAAACGTTGTTGTTAGATTTTCTCATTGCAAAGACCCTGTATTTGGGAATCAAATTATTCCCGATACTGCAATTTTAACGGTAATTCCTTTCCACCACGGTTTTGGTATGTTTACAACATTGGGTTATTTGACCTGCGGATTTCGTATTGTCGTAATGCATAAATTTGAAGAAGAACTATTTTTAAGATCACTTCAAGATTATAAAATTCAAAGTGCATTACTAGTTCCAACTTTATTTTCATTCTTTGCAAAAAGTACTTTAGTAGATAAATATGACTTGTCGAATCTAAAAGAAATAGCTTCCGGTGGTGCACCTCTCGCTAAAGAAGTTGGAGAAGCAGTTGCAAAACGATTTAAACTTCCTGGAGTTAGACAAGGTTATGGATTGACCGAAACGACATCAGCGGTAATAATTACTCCTGAAGGTGAAGATAAAGCAGGCTCTACAGGAAAAGTAGTACCATTTTTCTCTGCTAAAATTATTGATCTTGACACACGTCAAAGTCTGGGACCACATCAAAAAGGCGAACTATGTCTTAAAGGTGATATGATTATGAAAGGTTATGCAAATAATCCTGAGGCCACAAATGCATTAATTGATAAAGATGGATGGTTGCATTCAGGCGATATTGCATACTATGATGAAGATGGACATTTTTTCATAGTAGATCGATTGAAATCGTTAATTAAATATAAAGGTTATCAGGTTGCACCAGCTGAATTAGAATCTGTACTTTTGCAACATCCTTATATCTTTGATGCTGGTGTAACTGGAATTCCTGATGAAGTTGCTGGCGAACTACCCGCTGCTTGTGTTGTCCTTGAAAAAGGCAAACATTTAACGGAAAAGGAAGTAATGGATTATGTTGCAAGTCAAGTTTCTTCATCGAAGAAGTTGCGTGGAGGAGTGCGTTTTATAGATGAAATACCTAAAGGTCTCACTGGAAAGATAGATAGCAGAGGTCTGAAAGAAATTCTTAAAAGACCACAGTCCAAAATGTAAとする。この塩基配列配列番号2をアミノ酸へと翻訳した配列を配列番号1MNMEDKNVVHGPASFYPVDDGTAGQQLHKTILRYAQLPGTIAFTDAHTEQNLTYAEYFDLTCRLAESMKRYGLGLKHAIAVCSENSLNFFAPVIAALYLGVAVAPTNDIYNERELYNSLNISQPTIVFCSKRALLKIMEVQKKLPVIQKIIVLDHKEDFQGLHSMHSFIKHYLPSHFNEHDFKPEEFDRNDQVALIMNSSGSTGLPKGVMLTHKNVVVRFSHCKDPVFGNQIIPDTAILTVIPFHHGFGMFTTLGYLTCGFRIVVMHKFEEELFLRSLQDYKIQSALLVPTLFSFFAKSTLVDKYDLSNLKEIASGGAPLAKEVGEAVAKRFKLPGVRQGYGLTETTSAVIITPEGEDKAGSTGKVVPFFSAKIIDLDTRQSLGPHQKGELCLKGDMIMKGYANNPEATNALIDKDGWLHSGDIAYYDEDGHFFIVDRLKSLIKYKGYQVAPAELESVLLQHPYIFDAGVTGIPDEVAGELPAACVVLEKGKHLTEKEVMDYVASQVSSSKKLRGGVRFIDEIPKGLTGKIDSRGLKEILKRPQSKMとする。配列番号1および配列番号2について、NCBIが提供するblastxまたはblastpサーチを利用して相同性検索を実施した。それぞれの検索で既知ホタルルシフェラーゼの塩基配列と高い相同性を示すことを確認した。以上の実験および解析で得られた塩基配列を新規ホタルルシフェラーゼ遺伝子の完全長cDNA配列であると決定した。以下、この新規のルシフェラーゼを野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼと称する。[実施例2:野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの酵素学的なパラメータの測定]1.野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子のタンパク質発現野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子を大腸菌でタンパク質発現させるため、pRSET-Bベクターインビトロジェンに導入した。遺伝子発現ベクターの構築は標準的な方法に従い以下のように実験を実施した。1-1.野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子の制限酵素認識部位の改変上述の通り決定した塩基配列によれば、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子はBamHIおよびEcoRIの制限酵素認識配列を含む。ルシフェラーゼのアミノ酸配列を維持しつつ、これらの塩基配列におけるこれらの認識配列を除去する遺伝子改変を実施した。この処理は、後述するルシフェラーゼ遺伝子の発現ベクターへの導入を容易にするために行った。遺伝子変異の導入は、多比良和誠編遺伝子の機能阻害実験法―簡単で確実な遺伝子機能解析から遺伝子治療への応用まで羊土社、2001年発行、p.17-25に示される方法に従った。変異導入後の配列は、配列番号3に示される塩基配列である。1-2.野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子の遺伝子発現ベクターへの導入ルシフェラーゼ遺伝子を、pRSET-Bベクターの制限酵素サイトBamHI-EcoRI間に導入するため、開始コドンおよびその前に制限酵素BamHI認識配列GGATCCを含むプライマー、並びに終止コドンおよびその後ろに制限酵素EcoRI認識配列GAATTCを含むプライマーを作成した。このプライマー対を用いて、ルシフェラーゼ遺伝子の両端に上述の制限酵素認識部位を含んだ断片の増幅を行った。PCRにはポリメラーゼKOD-Plus-東洋紡績株式会社を用いて、マニュアルに従って実施した。最終濃度が等倍の10×PCRBuffer、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が1.0mMのMgSO4、最終濃度が0.02U/μlのTOYOBOKOD-Plus-1U/μl、最終濃度がそれぞれ0.3μMのプライマー対を含む20μlのPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型としてBamHIとEcoRI認識配列を持たないルシフェラーゼ遺伝子の溶液を0.4μl加えた。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、55°C30秒および68°C2分を30サイクル繰り返し、最後に68°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。遺伝子増幅が認められたため、このPCR反応溶液を通常のエタノール沈殿法により沈殿濃縮し、制限酵素処理用10×HBufferを4μl、制限酵素BamHI東洋紡績株式会社および制限酵素EcoRI東洋紡績株式会社を各2μlならびに滅菌脱イオン水32μlを加えて溶解し、37°Cで2時間保温して制限酵素処理した。その後、この反応溶液をエタノール沈殿法により沈殿濃縮した後、滅菌脱イオン水に溶解した。この溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色を行った。紫外線照射下において確認されるDNAバンドを含むゲルを、ナイフを用いて切り出した。この切り出したゲルからWizardRSVGelandPCRClean-UpSystemプロメガを用いてDNAを抽出した。これらの操作はマニュアルに従って実施した。その後、LigationPackニッポンジーンをマニュアルに従って用いて、あらかじめ同様の方法で制限酵素BamHIと制限酵素EcoRIで処理したpRSET-Bベクターに抽出したDNAを導入した。このベクターDNAを大腸菌JM109DE3株に形質転換し、コロニーを形成させた。得られたコロニーを鋳型としてダイレクトコロニーPCRを実施し、pRSET-Bに導入したルシフェラーゼ遺伝子を増幅した。ダイレクトコロニーPCRは、T7promoterPrimer5’-TAATACGACTCACTATAGGG-3’:配列番号28およびT7ReversePrimer5’-CTAGTTATTGCTCAGCGGTGG-3’:配列番号29のプライマー対を用いて行った。最終濃度が等倍の10×ExTaqBuffer20mMMg2plus、最終濃度が各0.2mMのdNTPMixture各2.5mM、最終濃度が0.05U/μlのTaKaRaExTaq5U/μlおよび最終濃度がそれぞれ0.2μMのプライマーを含む10μlのPCR反応溶液を作製し、そこへ鋳型として少量の大腸菌コロニーを加えた。PCR反応は、最初に94°C2分間の熱変性を行った後、94°C30秒、50°C30秒および72°C2分を25サイクル繰り返し、最後に72°C5分間の伸長反応を行った。PCR反応後、1μlのPCR反応溶液を、1TAEアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射下で増幅遺伝子のバンドを観察した。増幅が確認できたPCR反応溶液について、ダイレクトシークエンシング法を用いてその遺伝子の塩基配列の決定を行った。PCR産物精製キットExoSAP-ITを用いて、PCR反応溶液に含まれる余剰なdNTPおよびプライマーを除去し、PCRダイレクトシークエンシングのための鋳型を調製した。BigDyeTerminatorv3.1CycleSequencingKitを用いて、この鋳型を含むシークエンシング反応溶液を調製し、サーマルサイクラーを用いてシークエンシング反応を行った。シークエンスには、ベクタープライマーまたは遺伝子特異的なプライマーを用いた。PCR産物の精製およびシークエンシングはそれぞれマニュアルに従って実施した。シークエンシング反応後、反応産物の精製を次の通りに行った。反応溶液に2.5倍量の100エタノールを加え、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。次に、上清を取り除いた後、70エタノールを加えて沈殿を洗浄し、遠心機を用いて核酸を沈殿させた。最後に、上清を取り除いた後、沈殿を乾燥させた。精製した沈殿にHi-DiFormamideアプライドバイオシステムズを15μl加え、溶解させた。この溶液を94°C2分間の熱変性させ、更に氷上で急冷して、塩基配列を決定するためのサンプルとした。このサンプルをAppliedBiosystems3130xlジェネティックアナライザを用いて塩基配列を読み取り、正常に遺伝子発現ベクターpRSET-Bに導入されていることを確認した。2.発光タンパク質の精製JM109DE3を含む大腸菌溶液50μlにルシフェラーゼ発現ベクター0.5μlを添加し、氷上で10分、その後42°Cで1分、最後に氷上で2分インキュベートした。その後、大腸菌溶液50μlをSOC培地200μlに加えた。その大腸菌/SOC培地混合溶液を37°Cで20分間振とうしながらインキュベートした。インキュベート後のサンプル100μlをLB培地プレート100μg/mlアンピシリンを含むにストリークし、37°Cで一晩インキュベートした。翌日得られたコロニーをピックアップし、500mlスケールのLB培地で培養した。培養は37°Cで24時間、18°Cで24時間行った。合計48時間の培養の後、遠心分離で菌体を回収し、0.1MTris-HCl溶液pH8.0に再度懸濁して超音波破砕した。菌体破砕液を遠心分離15000rpm、10分し、沈査を除去して上清を回収した。ベッドボリューム2mlのカラムにNi-Agar懸濁液500μlと0.1MTris-HCl2mlを加え、カラムを平衡化した。回収した上清をカラムに添加し、自然落下させた。上清の全量がカラムを通過するまでの間の操作は全て4°Cの条件で行った。25mMイミダゾール/0.1MTris-HCl溶液2mlでカラムを洗浄した。洗浄後のカラムに500mMイミダゾール/0.1MTris-HCl溶液を2ml加え、ルシフェラーゼを溶出した。溶出されたサンプルをゲルろ過カラムPD-10GEヘルスケアでろ過し、脱塩した。脱塩後のサンプルをVivaspin6ザルトリウスで限界ろ過し、濃縮されたサンプルにグリセリンを添加して、50グリセリン溶液とした。保存は-20°Cで行った。3.発光スペクトルの測定測定のための装置としてLumiFlSpectroCaptureATTOを用い、0.1Mクエン酸/0.1MNa2HPO4bufferpH6.0-8.0に1mMD-ルシフェリン、2mMATPおよび4mMMgCl2を含む溶液に、精製酵素を1μg/mlから10μg/mlの間の最終濃度で添加し、酵素添加後15秒経過時点で発光スペクトルを測定した。測定結果を図1に示す。図1より、取得された野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、pH8.0の環境において、557nm付近に最大発光波長を有することが示された。また、pH7.5において、560nm付近に最大発光波長を有することが示された。さらに、pH7.0において560nm付近に最大発光および610nm付近により小さなピークを有することが示された。また、さらに、pH6.5および6.0において、それぞれ、592nm付近および613nm付近に最大発光波長を有することが示された。4.速度論的解析4-1.D-ルシフェリンおよびATPの濃度の決定D-ルシフェリン溶液中のD-ルシフェリン濃度およびATP溶液中のATP濃度を以下の通りに決定した。UV-VisibleSpectrometerHitachiを用いて、D-ルシフェリン溶液およびATP溶液の紫外可視吸収スペクトルを測定し、この測定結果と以下のε値とから濃度を算出した。D-ルシフェリン:λmax328nm、ε18200、pH5.0ATP:λmax259nm、ε15400、pH7.0。測定はそれぞれ10回ずつ行い、吸光度の平均値を濃度算出に用いた。このように濃度を決定したD-ルシフェリン溶液およびATP溶液を用いて、以下のKm値算出を行った。4-2.D-ルシフェリンに対するKm値の測定様々なD-ルシフェリン濃度の環境下において、得られたルシフェラーゼによる発光の強度を測定した。測定結果に基づいて、D-ルシフェリンに対するKm値を決定した。D-ルシフェリンを0.1MTris-HClpH8.0に添加して、異なる濃度の12種類のDールシフェリン溶液を作製した。これらの溶液は、D-ルシフェリンの終濃度がそれぞれ0.625、1.25、2.5、5、10、20、40、80、160、320、480および640μMとなるようにD-ルシフェリンを含む。これらのD-ルシフェリン溶液を96穴マイクロプレートに50μlずつ分注した。各種精製ルシフェラーゼ、4mMATPおよび8mMMgSO4を含む0.1MTris-HClpH8.0溶液をルミノメーターの標準ポンプに接続し、当該溶液をウェルに50μl添加すると同時に測定を行った。測定にはLuminescensorATTOを使用した。測定は各ルシフェリン濃度について3回ずつ行った。得られたフォトンカウント値のピーク強度を初速度Vとして、ルシフェリン濃度Sに対してプロットした。このプロットにミカエリスメンテン型のカーブフィッティングを行い、Km値を算出した。カーブフィッティングは非線形の最小二乗法で行い、パラメータの探索にはニュートン法を用いた。4-3.ATPに対するKm値の測定様々なATP濃度の環境下において、得られたルシフェラーゼによる発光の強度を測定した。測定結果に基づいて、ATPに対するKm値を決定した。ATPを0.1MTris-HClpH8.0に添加して、異なる濃度の12種類のATP溶液を作製した。これらの溶液は、ATPの終濃度がそれぞれ5、10、20、40、80、160、320、480、640、800、1280、1600および1920μMとなるようにATPを含む。これらのATP溶液をそれぞれ96穴マイクロプレートに50μlずつ分注した。各種精製ルシフェラーゼ、1mMD-ルシフェリン、8mMMgSO4を含む0.1MTris-HClpH8.0溶液をルミノメーターの標準ポンプに接続し、当該溶液をウェルに50μl添加すると同時に測定を行った。測定は各ATP濃度について3回ずつ行った。得られたフォトンカウント値のピーク強度を初速度Vとして、ATP濃度Sに対してプロットした。このプロットにミカエリスメンテン型のカーブフィッティングを行い、Km値を算出した。カーブフィッティングは非線形の最小二乗法で行い、パラメータの探索にはニュートン法を用いた。上記のようにして決定されたD-ルシフェリンに対するKm値およびATPに対するKm値を表1に示す。表1には、同様に測定した既知のルシフェラーゼの各Km値も示される。GL3とは既知のホタル由来のルシフェラーゼである。また、ELuc、CBGおよびCBRとは既知のコメツキムシ由来のルシフェラーゼである。これらの既知のルシフェラーゼは市販されるものを使用した。さらに、これらの結果について、縦軸をATPに対するKm値とし、横軸をD-ルシフェリンに対するKm値としてプロットした図を、図2として示す。[実施例3:変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの作製とHeLa細胞内における発光強度および発光スペクトルの比較]変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼを発現する変異型遺伝子を作製した。哺乳細胞における発現に最適化した遺伝子配列番号4に対し、以下の変異を任意の組合せで導入した。アミノ酸配列上424番目のイソロイシンをロイシンに置換する変異I424Lそれぞれの変異の導入のために、以下の5種のプライマーを用いた。I424L変異:PpyI423L-4_I424LGCACAGCGGCGACcTgGCCTACTACGACGAG:配列番号30、変異の導入は文献の記載に基づいて行ったAsakoSawanoandAtsushiMiyawaki,NucleicAcidsResearch,2000,Vol.28,No.16。変異導入後にシーケンサーを用いて配列を読み取り、目的とする変異がクメジマミナミボタルルシフェラーゼ遺伝子に導入されていることを確認した。作製した変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼは、N2DおよびI424Lの変異を有する。変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼのアミノ酸配列は配列番号31に記載され、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼをコードする遺伝子の塩基配列は配列番号32に記載される。次に、野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ、および変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼによる細胞内での発光強度について、P.ピラリスルシフェラーゼと比較した。野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの遺伝子を含む核酸配列番号2、および変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの遺伝子を含む核酸配列番号32に対してKozak配列を付与した。なお、これらの配列は、哺乳細胞における発現に対してコドン最適化されている。その後、pF9ACMVhRLucneoFlexivectorPromegaのマルチクローニングサイトのSgfIおよびPmeIのサイト間に挿入した。pF9Aベクターは内部コントロールとしてウミシイタケルシフェラーゼ遺伝子hRLucをベクター配列に含んでおり、マルチクローニングサイトに挿入された発光遺伝子による発光強度をウミシイタケルシフェラーゼによる発光強度との比として算出することが可能である。得られた2種のプラスミドを、48穴のプレートに播種したHeLa細胞にそれぞれリポフェクション法で遺伝子導入し、24時間後PBSで細胞を洗浄した。Dualglowkit米国Promega社製の説明書に従って、48穴プレートの各ウェルに2mMD-ルシフェリン/CO2IndependentMediumInvitrogenを200μlずつ添加し、25°C、各ウェルあたり1秒間測定の条件でLuminescensorATTOを用いて120分間発光強度を測定した。90分経過時点の発光強度を野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの発光強度とした。比較実験を実施し、90分経過時点の発光強度を野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼの発光強度とした。各ウェル内の培養液を除去した後、PBSで各ウェルを3回洗浄した。次に各ウェルに10μMセレンテラジン/CO2IndependentMediumを500μlずつ添加し、25°C、各ウェルあたり1秒間測定の条件でLuminescensorを用いて30分間発光強度を測定した。セレンテラジン添加後、10分経過時点の発光強度を内部コントロールであるウミシイタケルシフェラーゼによる発光強度とした。野生型クメジマミナミボタルルシフェラーゼ、変異体1、変異体2およびP.ピラリスルシフェラーゼLuc2ルシフェラーゼ、プロメガ社による発光強度をウミシイタケルシフェラーゼによる発光強度でそれぞれ除算した値を算出し、その値を各ルシフェラーゼの発光強度としてグラフ化した。図3には、野生型ルシフェラーゼ、変異型ルシフェラーゼ及びP.ピラリスルシフェラーゼによる90分経過時点における発光強度を、内部コントロールであるウミシイタケルシフェラーゼによる10分経過時点における発光強度でそれぞれ除算して得られた発光強度比を示す。図3に示されるように、野生型クメジマミナミボタルによって得られた発光強度は、P.ピラリスルシフェラーゼによる発光強度と比較して2.04倍高かった。変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼによって得られた発光強度は、P.ピラリスルシフェラーゼによる発光強度と比較して4.94倍高かった。また、変異型クメジマミナミボタルルシフェラーゼによって得られた発光強度は、野生型クメジマミナミボタルによって得られた発光強度と比較して、2倍以上高かった。変異の導入によってクメジマミナミボタルルシフェラーゼの発光強度が増大することが示された。また、HeLa細胞に発現させた野生型および変異型ルシフェラーゼの発光スペクトルを実施例2と同様に測定した。ルシフェリン濃度は20mMで、温度25°Cおよび37°Cで測定した。図4に野生型ルシフェラーゼの、図5に変異型ルシフェラーゼの測定結果を示す。図4および5から、温度は25°Cから37°Cと上昇するにつれて、野生型ルシフェラーゼでは最大波長が585nmから598nmへと、変異型ルシフェラーゼでは564nmから577nmへと、長波長側にシフトしていることがわかった。この結果は、図1に示した高pHから低pHへ変化したときのスペクトル変化と同様の結果であった。"