"本明細書中に記載される発明。本発明の目的は、α-シヌクレインSNCAの発現を阻害するための組成物、およびこれらの組成物を使用する方法を提供することである。本発明の態様は、α-シヌクレインSNCAの発現を阻害するための組成物、およびこれらの組成物を使用する方法に関する。1つの態様において、本発明は、SNCAの発現を阻害する薬剤を投与することによって対象を治療する方法を特徴とする。好ましい実施形態において、対象はヒトなどの哺乳動物、例えば、神経変性障害を有するか、または神経変性障害を発症するリスクがあると診断された対象である。この阻害は、任意のレベルで、例えば、転写レベル、翻訳レベル、または翻訳後修飾として実施可能である。SNCA発現を阻害する薬剤には、SNCARNAを標的とするiRNA剤、リボザイム、およびアンチセンス分子、ジンクフィンガータンパク質、ならびに抗体または天然に存在するポリペプチドもしくは合成ポリペプチド、または低分子好ましい実施形態において、SNCAタンパク質に結合しかつこれを阻害するものが含まれる。特に好ましい実施形態において、阻害剤は、SNCA核酸、例えば、SNCARNAを標的とするiRNA剤である。このiRNA剤は、SNCARNAのヌクレオチド配列に相補的なアンチセンス鎖と、該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分相補的なセンス鎖とを有する。1つの実施形態において、このiRNA剤は、生物学的試料中でiRNA剤を安定化する修飾を含む。例えば、修飾iRNA剤は、分解に対する感受性がより低く、例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる切断に対する感受性がより低い。このiRNA剤は、例えば、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含み得る。このiRNA剤は、該ジヌクレオチドを少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、または少なくとも5個含み得る。1つの実施形態において、2’-修飾ヌクレオチドは2’-O-メチル化ヌクレオチドである。別の実施形態において、iRNA剤はホスホロチオエートを含む。別の実施形態において、本発明のiRNA剤のアンチセンス鎖は配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態において、iRNA剤のセンス鎖は配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列を含む。なお別の実施形態において、iRNA剤のアンチセンス鎖は、配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列と部分的に一致し、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致する。同様に、iRNA剤のセンス鎖は、配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列と部分的に一致可能であり、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は野生型SNCA核酸を標的とし、さらに別の実施形態において、本発明のiRNA剤はSNCAの多型または突然変異を標的とする。例えば、本発明のiRNA剤は、SNCAのオープンリーディングフレームのコドンにおけるA53T変異、A30P変異、またはE46K変異に対応する突然変異を標的とし得る。ある実施形態において、本発明のiRNA剤はSNCAの3’UTRまたは5’UTRを標的とする。ある実施形態において、本発明のiRNA剤はSNCAのスプライシングされたアイソフォームを標的とする。例えば、本発明のiRNA剤は、128アミノ酸のアイソフォームの発現をダウンレギュレーションするためにエキソン2とエキソン4との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、またはiRNA剤が112アミノ酸のアイソフォームを標的とするためにエキソン4とエキソン6との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよい。ある実施形態において、対象例えば、ヒトは、SNCA遺伝子の多重化例えば、二重化または三重化、またはParkin遺伝子もしくはユビキチンカルボキシ末端ヒドロラーゼL1UCHL1遺伝子の遺伝的変異を有する。別の実施形態において、対象はシヌクレイン症を有すると診断される。シヌクレイン症は、α-シヌクレインモノマーの蓄積によって特徴付けられる。iRNA剤は、パーキンソン病PD、アルツハイマー病、多系統萎縮症、レーヴィ小体痴呆、または網膜障害、例えば、網膜症を有すると診断された患者に投与可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は、少なくとも21ヌクレオチド長であり、センスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含み、アンチセンスRNA鎖は25ヌクレオチド長以下であり、iRNA剤の二本鎖領域は18~25ヌクレオチド長である。iRNA剤は、1~4対の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部をさらに含んでもよく、この非対合ヌクレオチドは少なくとも1つのホスホロチオエート結合ジヌクレオチドを有してもよい。このヌクレオチド突出部は、例えば、iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にあってよい。別の態様において、本発明は、SNCA核酸、例えば、SNCARNAを標的とするiRNA剤を特徴とする。iRNA剤は、SNCARNAのヌクレオチド配列に相補的なアンチセンス鎖と、該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分相補的なセンス鎖とを有する。1つの実施形態において、iRNA剤は生物学的試料中でiRNA剤を安定化する修飾を含む。例えば、修飾iRNA剤は分解に対して感受性がより低く、例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる切断に対して感受性が低い。1つの実施形態において、iRNA剤は、ホスホロチオエート、または2’-O-メチル化2’-O-Meヌクレオチドを含む。iRNA剤は、例えば、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含み得る。iRNA剤は、該ジヌクレオチドを少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、または少なくとも5個含み得る。1つの実施形態において、2’-修飾ヌクレオチドは2’-O-メチル化ヌクレオチドである。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は少なくとも21ヌクレオチド長であり、センスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含み、該アンチセンスRNA鎖は25ヌクレオチド長以下であり、iRNA剤の二本鎖領域は18~25ヌクレオチド長である。iRNA剤は、1~4対の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部をさらに含んでもよく、この非対合ヌクレオチドは少なくとも1つのホスホロチオエート結合ジヌクレオチドを有してもよい。このヌクレオチド突出部は、例えば、iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にあってよい。別の実施形態において、本発明のiRNA剤のアンチセンス鎖は配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列を含む表1を参照のこと。別の実施形態において、本発明のiRNA剤のセンス鎖は配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列を含む表1を参照のこと。さらに別の実施形態において、iRNA剤のアンチセンス鎖は、配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列と部分的に一致し、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致する。同様に、iRNA剤のセンス鎖は、配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列と部分的に一致可能であり、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は野生型SNCA核酸を標的とし、さらに別の実施形態において、iRNA剤は、SNCAの多型または突然変異を標的とする。例えば、iRNA剤は、SNCAオープンリーディングフレームのコドンにおけるA53T変異、A30P変異、またはE46K変異に対応する突然変異を標的とし得る図1Bを参照のこと。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAの5’UTRまたは3’UTRを標的とする。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAのスプライシングされたアイソフォームを標的とする。例えば、iRNA剤は、128アミノ酸のアイソフォームの発現をダウンレギュレーションするためにエキソン2とエキソン4との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、または112アミノ酸のアイソフォームを標的とするためにエキソン4とエキソン6との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよい。SNCA遺伝子は、神経変性疾患の治療方法のための標的であり得る。1つの実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチド、リボザイム、またはジンクフィンガータンパク質を使用して遺伝子発現を阻害することが可能であり、またはSNCAポリペプチドを標的とするために抗体もしくは低分子を使用することも可能である。SNCAの発現および活性をダウンレギュレーションするために治療法を組み合わせて使用してもよい。別の態様において、本発明は、薬学的組成物であって、本明細書に記載される阻害剤、例えば、SNCARNAを標的とするiRNA剤、リボザイム、またはアンチセンス核酸、好ましくはSNCAタンパク質に結合しかつこれを阻害する抗体または天然ポリペプチドもしくは合成ポリペプチドあるいは低分子と、薬学的に許容可能な担体との組成物を特徴とする。特に好ましい実施形態において、本発明の薬学的組成物は、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤および薬学的に許容可能な担体を含む。このiRNA剤は、SNCARNAのヌクレオチド配列に対して相補的なアンチセンス鎖と、該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分相補的なセンス鎖とを有する。1つの実施形態において、本発明の薬学的組成物のiRNA剤は、生物学的試料中でiRNA剤を安定化する修飾を含む。例えば、修飾iRNA剤は、分解に対して感受性がより低く、例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる切断に対して感受性がより低い。iRNA剤は、例えば、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含み得る。iRNA剤は、該ジヌクレオチドを少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、または少なくとも5個含み得る。1つの実施形態において、2’-修飾ヌクレオチドは2’-O-メチル化ヌクレオチドである。別の実施形態において、iRNA剤はホスホロチオエートを含む。別の実施形態において、本発明の薬学的組成物のiRNA剤は、少なくとも21ヌクレオチド長であり、センスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含み、該アンチセンスRNA鎖は25ヌクレオチド長以下であり、iRNA剤の二本鎖領域は18~25ヌクレオチド長である。該組成物のiRNA剤は、1~4対の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部をさらに含んでもよく、この非対合ヌクレオチドは少なくとも1つのホスホロチオエート結合ジヌクレオチドを有してもよい。このヌクレオチド突出部は、例えば、iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にあってよい。別の実施形態において、本発明の薬学的組成物のiRNA剤のアンチセンス鎖は配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態において、薬学的組成物のiRNA剤のセンス鎖は配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態において、このiRNA剤のアンチセンス鎖は、配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列と部分的に一致し、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致する。同様に、iRNA剤のセンス鎖は、配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列と部分的に一致可能であり、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は野生型SNCA核酸を標的とし、なお別の実施形態において、iRNA剤は、SNCAの多型または突然変異を標的とする。例えば、iRNA剤は、SNCAオープンリーディングフレームのコドンにおけるA53T変異、A30P変異、またはE46K変異に対応する突然変異を標的とし得る。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAの3’UTRまたは5’UTRを標的とする。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAのスプライシングされたアイソフォームを標的とする。例えば、iRNA剤は、128アミノ酸のアイソフォームの発現をダウンレギュレーションするためにエキソン2とエキソン4との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、または112アミノ酸のアイソフォームを標的とするためにエキソン4とエキソン6との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよい。別の態様において、本発明は、対象例えば、ヒトなどの哺乳動物対象の細胞中のSNCAまたはSNCARNAの量を低減する方法を特徴とする。この方法は、SNCAの発現を阻害する薬剤と細胞を接触させる工程を包含する。阻害は、任意のレベルで、例えば、転写レベル、翻訳レベル、または翻訳後修飾として実施可能である。SNCA発現を阻害する薬剤には、SNCARNAを標的とするiRNA剤およびアンチセンス分子、ならびに抗体または天然に存在するポリペプチドもしくは合成ポリペプチド、または低分子好ましい実施形態において、SNCAタンパク質に結合しかつこれを阻害するものが含まれる。特に好ましい実施形態において、SNCARNAは、対象の細胞をiRNA剤と接触させることによって低減される。1つの実施形態において、iRNA剤は、生物学的試料中でiRNA剤を安定化する修飾を含む。例えば、修飾iRNA剤は分解に対して感受性がより低く、例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる切断に対して感受性がより低い。iRNA剤は、例えば、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである5少なくとも1つの’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含み得る。iRNA剤は、該ジヌクレオチドを少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、または少なくとも5個含み得る。1つの実施形態において、2’-修飾ヌクレオチドは2’-O-メチル化ヌクレオチドである。別の実施形態において、iRNA剤はホスホロチオエートを含む。別の実施形態において、本発明の薬学的組成物のiRNA剤のアンチセンス鎖は配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態において、本発明の薬学的組成物のiRNA剤のセンス鎖は配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態において、iRNA剤のアンチセンス鎖は、配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列と部分的に一致し、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致する。同様に、iRNA剤のセンス鎖は、配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列と部分的に一致可能であり、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は野生型SNCA核酸を標的とし、なお別の実施形態において、iRNA剤は、SNCAの多型または突然変異を標的とする。例えば、iRNA剤は、SNCAのオープンリーディングフレームのコドンにおける変異A53T、A30P、またはE46K変異に対応する突然変異を標的とし得る。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAの3’UTRまたは5’UTRを標的とする。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAのスプライシングされたアイソフォームを標的とする。例えば、iRNA剤は、128アミノ酸のアイソフォームの発現をダウンレギュレーションするためにエキソン2とエキソン4との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、または112アミノ酸のアイソフォームを標的とするためにエキソン4とエキソン6との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよい。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は少なくとも21ヌクレオチド長であり、センスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含み、該アンチセンスRNA鎖は25ヌクレオチド長以下であり、このiRNA剤の二本鎖領域は18~25ヌクレオチド長である。本発明のiRNA剤は、1~4対の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部をさらに含んでもよく、この非対合ヌクレオチドは少なくとも1つのホスホロチオエート結合ジヌクレオチドを有してもよい。このヌクレオチド突出は、例えば、iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にあってよい。別の態様において、本発明は、iRNA剤を作製する方法を特徴とする。この方法は、SNCAmRNAのヌクレオチド配列から18~25ヌクレオチド長のヌクレオチド配列を選択する工程と、iRNA剤を合成する工程とを包含する。iRNA剤のセンス鎖は、SNCARNAから選択されたヌクレオチド配列を含み、アンチセンス鎖は該センス鎖にハイブリダイズするために十分相補的である。1つの実施形態において、この方法は、本明細書に記載されるように、対象例えば、ヒト対象などの哺乳動物対象にiRNA剤を投与する工程を包含する。別の態様において、本発明は、SNCA発現を阻害する能力について、薬剤、例えば、低分子低分子とは、好ましくは分子量が3,000ダルトン未満、より好ましくは2,000ダルトン未満、さらにより好ましくは1000ダルトン未満、アンチセンス、リボザイム、iRNA剤、またはタンパク質、ポリペプチド、もしくはペプチド、例えば、ジンクフィンガータンパク質などの本明細書に記載される種類の薬剤例えば、SNCAまたはSNCA核酸を標的とする薬剤を評価する方法を特徴とする。本発明は、候補薬剤を提供する工程と、その候補薬剤がSNCA発現を変化させる例えば、阻害するか否かを、例えば、本明細書に記載の試験系のうち1つまたは複数の使用によって決定する工程とを包含する。好ましい実施形態において、本発明の方法は、第1の試験系において薬剤を評価する工程と、所定のレベルの変化が観察される場合、第2の、好ましくは異なる試験系において該候補剤を評価する工程とを包含する。特に好ましい実施形態において、この第2の試験系は、動物に候補薬剤を投与する工程と、該動物におけるSNCA発現に対する候補薬剤の効果を評価する工程とを包含する。好ましい実施形態では、2つの試験系が使用され、第1の試験系が高スループット系であり、例えば、このような実施形態において、第1または最初の試験は、第2の、好ましくは動物の系よりも、少なくとも100倍、1,000倍、または10,000倍多くの化合物をスクリーニングするために使用される。試験系は、標的分子例えば、SNCA、SNCA核酸例えば、RNAまたはDNAと候補薬剤を、好ましくはinvitroで接触させる工程と、相互作用、例えば、標的への候補薬剤の結合または標的の修飾例えば、標的内に共有結合を作製もしくは標的内の共有結合を破壊することによるが存在するか否かを決定する工程とを包含し得る。修飾は、SNCA発現を変化させる能力と相関する。試験系は、細胞と候補薬剤を接触させる工程と、SNCA発現の変化を評価する工程とを包含し得る。例えば、この試験系は、SNCAまたはSNCARNAを内在性遺伝子または外来性構築物から発現し得る細胞と候補薬剤を接触させる工程と、SNCAまたはSNCARNAのレベルを評価する工程とを包含し得る。別の実施形態において、試験系は、SNCA制御領域例えば、マーカータンパク質例えば、GFPなどの蛍光タンパク質などの異種配列に連結されたSNCA制御領域であって、その構築物は、染色体構築物でもエピソーム性構築物のいずれでもよいからRNAまたはタンパク質を発現する細胞と、候補薬剤を接触させる工程、RNAまたはタンパク質のレベルに対する効果を決定する工程を含み得る。本発明の試験系はまた、組織試料、例えば、脳組織試料例えば、薄片もしくは切片、眼組織試料、または神経試料を含む他の試料を候補薬剤とinvitroで接触させる工程、およびSNCAまたはSNCARNAのレベルを評価する工程を包含し得る。本発明の試験系は、動物にinvivoで候補薬剤を投与する工程、およびSNCAまたはSNCARNAのレベルを評価する工程を包含し得る。これらのいずれにおいても、SNCA発現に対する候補薬剤の効果は、SNCA遺伝子の発現を、所定の標準、例えば、未処理の細胞、組織、または動物などの対照と比較する工程を包含し得る。SNCA遺伝子の発現は、例えば、候補薬剤との接触の前後で比較可能である。本発明の方法は、iRNA剤がSNCA遺伝子の発現を阻害するために有用であるか否かを決定することを可能にする。1つの実施形態において、SNCA遺伝子の発現は、SNCAのRNAレベルを調べる方法例えば、ノーザンブロット分析、RT-PCR、またはRNAse保護アッセイまたはSNCAのタンパク質レベルを調べる方法例えば、ウェスタンブロット法によって評価可能である。1つの実施形態において、例えば、第2の試験として、本発明の薬剤を、哺乳動物、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒト、またはヒト以外の霊長類に投与し、この動物を薬剤の効果についてモニターする。例えば、脳組織または眼の組織などの動物の組織を、SNCA発現に対する薬剤の効果について調べる。該組織を、例えば、SNCARNAおよび/またはタンパク質の存在について調べてもよい。1実施形態では、この動物を観察して、認知的症状の改善または安定化をモニターする。薬剤は、任意の方法によって、例えば、経口的に、またはクモ膜下腔内もしくは実質への注射、例えば、脳への立体視による注射によって動物に投与可能である。特に好ましい実施形態において、本発明は、SNCA核酸を標的とするiRNA剤、例えば、本明細書に記載のiRNA剤を評価する方法を特徴とする。この方法は、SNCA核酸例えば、SNCARNAを標的とするiRNA剤を提供する工程と;SNCA遺伝子を含み、かつ発現可能である細胞とiRNA剤を接触させる工程と;SNCAの発現に対するiRNA剤の効果を、例えば、SNCA遺伝子の発現を対照と比較することによって例えば、細胞中で評価する工程とを包含する。SNCA遺伝子の発現は、例えば、細胞とiRNA剤を接触させる前後で比較可能である。この方法により、iRNA剤がSNCA遺伝子の発現を阻害するために有用であるか否かを決定することを可能となる。例えば、iRNA剤が、例えば所定の基準値と比較して例えば、細胞と該iRNA剤を接触させる前のSNCARNAまたはタンパク質の量と比較して、発現を所定の量例えば、10、25、50、75、または90低減し得る場合、該iRNA剤はSNCA遺伝子の発現を阻害するために有用であると決定可能である。SNCA遺伝子は内在的に発現されてもよいし外来性として発現されてもよい。本発明の特徴である方法および組成物、例えば、本明細書に記載される神経変性障害を治療するための方法およびiRNA剤は、本明細書に記載される任意の投薬量および/または製剤で、かつ本明細書に記載される任意の投与経路を用いて使用可能である。α-シヌクレインポリペプチドは、脳におけるその存在に加えて、網膜および視神経を含む眼組織中において見出されている。したがって、本明細書に記載される組成物および方法は、網膜症を含むがこれに限定されない眼または眼組織のシヌクレイン症を治療するために適している。したがって、1つの態様において、本発明は、眼または眼組織におけるSNCAの発現を阻害する薬剤を投与することによって対象を治療する方法を特徴とする。好ましい実施形態において、この対象はヒトなどの哺乳動物、例えば、眼のシヌクレイン症例えば、網膜症を有するか、または発症するリスクがあると診断された対象である。阻害は、任意のレベルで、例えば、転写レベル、翻訳レベル、または翻訳後修飾としてもたらされることが可能である。SNCA発現を阻害する薬剤は、SNCARNAを標的とするiRNA剤およびアンチセンス分子、ならびに抗体または天然に存在するポリペプチドもしくは合成ポリペプチド、または低分子好ましい実施形態においては、SNCAタンパク質に結合しかつこれを阻害するものを含む。特に好ましい実施形態において、阻害剤は、SNCA核酸、例えば、SNCARNAを標的とするiRNA剤である。該iRNA剤は、SNCARNAのヌクレオチド配列に相補的なアンチセンス鎖と、該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分相補的なセンス鎖とを有する。1つの実施形態において、iRNA剤は、生物学的試料中でiRNA剤を安定化する修飾を含む。例えば、修飾iRNA剤は、分解に対して感受性がより低く、例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる切断に対して感受性がより低い。iRNA剤は、例えば、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含み得る。iRNA剤は、該ジヌクレオチドを少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、または少なくとも5個含み得る。1つの実施形態において、2’-修飾ヌクレオチドは2’-O-メチル化ヌクレオチドである。別の実施形態において、iRNA剤はホスホロチオエートを含む。別の実施形態において、iRNA剤のアンチセンス鎖は配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態において、iRNA剤のセンス鎖は配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態において、iRNA剤のアンチセンス鎖は、配列番号6、16、18、20、22、または24のヌクレオチド配列と部分的に一致し、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致する。同様に、iRNA剤のセンス鎖は、配列番号5、15、17、19、21、または23のヌクレオチド配列と部分的に一致可能であり、例えば、少なくとも1個、5個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、または24個のヌクレオチドが一致可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は野生型SNCA核酸を標的とし、さらに別の実施形態において、iRNA剤は、SNCAの多型または突然変異を標的とする。例えば、iRNA剤は、SNCAのオープンリーディングフレームのコドンにおけるA53T変異、A30P変異、またはE46K変異に対応する突然変異を標的とし得る。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAの3’UTRまたは5’UTRを標的とする。ある実施形態において、iRNA剤はSNCAのスプライシングされたアイソフォームを標的とする。例えば、iRNA剤は、128アミノ酸のアイソフォームの発現をダウンレギュレーションするためにエキソン2とエキソン4との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、112アミノ酸のアイソフォームを標的とするためにエキソン4とエキソン6との間のスプライシングジャンクションを標的としてもよい。ある実施形態において、対象例えば、ヒトは、SNCA遺伝子の多重化例えば、二重化または三重化、またはParkin遺伝子もしくはユビキチンカルボキシ末端ヒドロラーゼL1UCHL1遺伝子の遺伝的変異を有する。別の実施形態において、対象はシヌクレイン症を有すると診断される。シヌクレイン症は、α-シヌクレインモノマーの蓄積によって特徴付けられる。iRNA剤は、パーキンソン病PD、アルツハイマー病、多系統萎縮症、レーヴィ小体痴呆、および網膜障害例えば、網膜症を有すると診断された患者に投与可能である。別の実施形態において、本発明のiRNA剤は、少なくとも21ヌクレオチド長であり、センスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含み、該アンチセンスRNA鎖は25ヌクレオチド長以下であり、iRNA剤の二本鎖領域は18~25ヌクレオチド長である。iRNA剤は、1~4対の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部をさらに含んでもよく、この非対合ヌクレオチドは少なくとも1つのホスホロチオエート結合ジヌクレオチドを有してもよい。このヌクレオチド突出部は、例えば、iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にあってよい。実質的に同一な配列は、標的遺伝子に対して十分相同な領域を含み、かつiRNA剤またはそのフラグメントが標的遺伝子のダウンレギュレーションを仲介可能なだけ十分な長さのヌクレオチド数を有する。したがって、このiRNA剤は、標的のRNA転写物例えば、SNCA転写物に対して少なくとも部分的に、またはある実施形態においては完全に相補的な領域であるか、またはそのような領域を含む。iRNA剤と標的との間の完全な相補性が存在する必要性はないが、両者の一致は、iRNA剤またはその切断産物が、例えば、標的RNA例えば、mRNAのRNAi切断による配列特異的サイレンシングをもたらすために十分でなければならない。標的鎖との相補性、または相同性の程度は、アンチセンス鎖において最も重要である。完全な相補性が、特にアンチセンス鎖において望まれることが多いのに対して、ある実施形態は、特にアンチセンス鎖において、1つ以上であるが、好ましくは6、5、4、3、2個またはそれ未満の標的RNAに対するミスマッチを含み得る。特にアンチセンス鎖におけるこのミスマッチは、末端領域において最も許容されやすく、存在する場合は、5’末端および/または3’末端から例えば6、5、4、または3ヌクレオチド以内の末端領域中に特にあることが好ましい。センス鎖は、分子の全体的な二本鎖の性質を維持するためにアンチセンス鎖と十分に相補性でありさえすればよい。RNA剤は、本明細書において使用される場合、非修飾RNA、修飾RNA、またはヌクレオシド代用物であり、これらのすべてが本明細書において記載されている。多数の修飾RNAおよびヌクレオシド代用物が記載されるが、好ましい例には、非修飾RNAよりもヌクレアーゼ分解に対して耐性の高いものが含まれる。好ましい例には、2’糖修飾、一本鎖突出部好ましくは3’一本鎖突出部における修飾、または、特に一本鎖の場合、1つまたは複数のリン酸基もしくは1つまたは複数のリン酸基アナログを含む5’修飾を有するものが含まれる。iRNA剤干渉iRNA剤は、本明細書において使用される場合、標的遺伝子、好ましくは内在性または病原体の標的RNAの発現をダウンレギュレーション可能なRNA剤である。理論によって束縛されることは望まないが、iRNA剤は、当該分野においてRNAiと呼ばれることもある標的mRNAの転写後切断、または転写前もしくは翻訳前のメカニズムを含む多数のメカニズムのうち1つ以上によって作用する可能性がある。iRNA剤は、一本鎖を含んでもよいし、または二本以上の鎖を含んでもよく、例えば、iRNA剤は二本鎖のiRNA剤であってもよい。iRNA剤が一本鎖である場合、1つまたは複数のリン酸基または1つまたは複数のリン酸基アナログを含む5’修飾を含むことが特に好ましい。iRNA剤は、本明細書において短い干渉RNAsiRNAまたはdsRNAとも呼ばれる。SNCA核酸を標的とするiRNA剤は、抗SNCAiRNA剤と呼ばれ得る。本発明の1つまたは複数の実施形態の詳細は、添付の図面および以下の説明において示される。本発明の他の特徴、目的、および利点は、この説明から、および特許請求の範囲から明らかである。本願は、すべての引用された参考文献、特許、および特許出願の全体を、すべての目的のために本願明細書に援用する。例えば、本発明は以下を提供する:項目1α-シヌクレインSNCARNAのヌクレオチド配列に対して相補的なアンチセンス鎖、および該アンチセンス鎖に対してハイブリダイズするために十分に相補的なセンス鎖からなる、iRNA剤。項目2生物学的試料中におけるiRNA剤の安定性の増大を引き起こす修飾を含んでなる請求項1に記載のiRNA剤。項目3ホスホロチオエートまたは2’-OMe’修飾を含んでなる項目1に記載のiRNA剤。項目4ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目5前記アンチセンス鎖が、配列番号6、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、および配列番号24からなる群から選択される配列を含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目6前記iRNA剤のセンス鎖が、配列番号5、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、および配列番号23から群から選択される配列を含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目7前記アンチセンス鎖がSNCARNAの多型に対して相補的である配列を含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目8前記アンチセンス鎖が、SNCARNAの5’非翻訳領域UTRまたは3’UTRのヌクレオチド配列に対して相補的な配列を含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目9前記iRNA剤が少なくとも21ヌクレオチド長であり、かつ該iRNAの二本鎖領域が約18~25ヌクレオチド長である、項目1に記載のiRNA剤。項目10dsRNAのアンチセンスRNA鎖が25ヌクレオチド長以下である、項目1に記載のiRNA剤。項目111~4個の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部を含んでなる、項目1に記載のiRNA剤。項目12前記ヌクレオチド突出部がiRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にある、項目11に記載のiRNA剤。項目13ヒトを治療する方法であって、神経変性障害を有するか、または神経変性障害を発症するリスクがあると診断されたヒトを同定する工程、ならびにα-シヌクレインSNCARNAのヌクレオチド配列に対して相補的なアンチセンス鎖、および該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分に相補的なセンス鎖からなるiRNA剤を投与する工程からなる方法。項目14前記iRNA剤が、生物学的試料中における該iRNA剤の安定性の増大を引き起こす修飾を含んでなる、項目13に記載の方法。項目15前記iRNA剤がホスホロチオエートまたは2’-OMe修飾を含んでなる項目13に記載の方法。項目16前記iRNA剤が、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または、5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含んでなる、項目13に記載の方法。項目17前記アンチセンス鎖が、配列番号6、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、および配列番号24からなる群から選択される配列を含んでなる、項目13に記載の方法。項目18前記iRNA剤のセンス鎖が、配列番号5、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、および配列番号23からなる群から選択される配列を含んでなる、請求項13に記載の方法。項目19前記iRNA剤のアンチセンス鎖がSNCARNAの多型に対して相補的な配列を含んでなる、項目13に記載の方法。項目20前記iRNA剤のアンチセンス鎖がSNCARNAの5’UTRまたは3’UTRのヌクレオチド配列に対して相補的な配列を含んでなる、項目13に記載の方法。項目21前記ヒトがParkin遺伝子またはユビキチンカルボキシ末端ヒドロラーゼL1UCHL1遺伝子中に遺伝子変異を有する、項目13に記載の方法。項目22前記ヒトがSNCAの遺伝子の多重化を有する、項目13に記載の方法。項目23ヒトがSNCAの遺伝子の二重化を有する、項目22に記載の方法。項目24ヒトがSNCAの遺伝子の三重化を有する、項目22に記載の方法。項目25前記神経変性障害がシヌクレイン症である、項目13に記載の方法。項目26前記神経変性障害がパーキンソン病である、項目13に記載の方法。項目27前記神経変性障害がアルツハイマー病、多系統萎縮症、またはレーヴィ小体痴呆である、項目13に記載の方法。項目28前記iRNA剤が少なくとも21ヌクレオチド長であり、かつ該iRNA剤の二本鎖領域が約18~25ヌクレオチド長である、項目13に記載の方法。項目29前記iRNA剤のアンチセンスRNA鎖が25ヌクレオチド長以下である、項目13に記載の方法。項目30前記iRNA剤が1~4個の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部を含んでなる、項目13に記載の方法。項目31前記ヌクレオチド突出部が前記iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にある、項目30に記載の方法。項目32α-シヌクレイン遺伝子を標的とするiRNA剤、および薬学的に許容可能な担体からなる薬学的組成物であって、前記iRNA剤は、α-シヌクレインSNCARNAのヌクレオチド配列に対して相補的なアンチセンス鎖、および該アンチセンス鎖に対してハイブリダイズするために十分に相補的なセンス鎖からなることを特徴とする、薬学的組成物。項目33前記iRNA剤が、生物学的試料中における該iRNA剤の安定性の増大を引き起こす修飾をさらに含んでなる、項目32に記載の薬学的組成物。項目34前記iRNA剤がホスホロチオエートまたは2’-OMe修飾をさらに含んでなる、請求項32に記載の薬学的組成物。項目35前記iRNA剤が、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドを含んでなる、項目32に記載の薬学的組成物。項目36前記iRNAのアンチセンス鎖が、配列番号6、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、および配列番号24からなる群から選択される配列を含んでなる、項目32に記載の薬学的組成物。項目37前記iRNA剤のセンス鎖が、配列番号5、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、および配列番号23からなる群から選択される配列を含んでなる、請求項32に記載の薬学的組成物。項目38前記iRNA剤がホスホロチオエートまたは2’-OMe修飾を含んでなる、項目32に記載の薬学的組成物。項目39前記iRNA剤が少なくとも21ヌクレオチド長であり、かつ該iRNA剤の二本鎖領域が約18~25ヌクレオチド長である、項目32に記載の薬学的組成物。項目40前記iRNA剤のアンチセンスRNA鎖が25ヌクレオチド長以下である、項目32に記載の薬学的組成物。項目41前記iRNA剤が1~4個の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部を含んでなる、項目32に記載の薬学的組成物。項目42前記ヌクレオチド突出部が前記iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にある、項目41に記載の薬学的組成物。項目43対象の細胞中のSNCARNAの量を低減する方法であって、α-シヌクレインSNCARNAのヌクレオチド配列に対して相補的なアンチセンス鎖、および該アンチセンス鎖に対してハイブリダイズするために十分に相補的なセンス鎖からなるiRNA剤と細胞を接触させる工程を包含する方法。項目44前記iRNA剤が、生物学的試料中における該iRNA剤の安定性の増大を引き起こす修飾をさらに含む、項目43に記載の方法。項目45前記iRNA剤がホスホロチオエートまたは2’-OMe修飾をさらに含む、項目43に記載の方法。項目46前記iRNA剤は、ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-アデニン-3’5’-UA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-グアニン-3’5’-UG-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-アデニン-3’5’-CA-3’ジヌクレオチド、または5’-ウリジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-ウリジン-ウリジン-3’5’-UU-3’ジヌクレオチド、または5’-シチジンが2’-修飾ヌクレオチドである少なくとも1つの5’-シチジン-シチジン-3’5’-CC-3’ジヌクレオチドをさらに含んでなる、項目43に記載の方法。項目47前記iRNA剤が、配列番号6、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、および配列番号24からなる群から選択される配列を含んでなるアンチセンス鎖を含む、項目43に記載の方法。項目48前記iRNA剤が、配列番号5、配列番号15、配列番号17、配列番号19、配列番号21、および配列番号23からなる群から選択される配列を含んでなるセンス鎖を含む、項目43に記載の方法。項目49前記iRNA剤がSNCARNAの多型に対して相補的な配列を含んでなるアンチセンス鎖を含む、項目43に記載の方法。項目50前記iRNA剤が少なくとも21ヌクレオチド長であり、かつ該iRNA剤の二本鎖領域が約18~25ヌクレオチド長である、項目43に記載の方法。項目51前記iRNA剤のアンチセンスRNA鎖が25ヌクレオチド長以下である、項目43に記載の方法。項目52前記iRNA剤が1~4個の非対合ヌクレオチドを有するヌクレオチド突出部を含んでなる、項目43に記載の方法。項目53前記ヌクレオチド突出部が前記iRNA剤のアンチセンス鎖の3’末端にある、項目52に記載の方法。項目54iRNA剤を作製する方法であって、SNCAmRNAのヌクレオチド配列から18~25ヌクレオチド長のヌクレオチド配列を選択する工程、およびiRNA剤のセンス鎖が選択されたヌクレオチド配列からなり、かつアンチセンス鎖が該センス鎖にハイブリダイズするために十分に相補的であることを特徴とするiRNA剤を合成する工程を含む方法。項目55前記iRNA剤を対象に投与する工程をさらに含む、項目54に記載の方法。項目56前記対象がシヌクレイン症を有すると診断される、項目55に記載の方法。項目57前記対象がパーキンソン病、アルツハイマー病、多系統萎縮症、またはレーヴィ小体痴呆を有すると診断される、項目55に記載の方法。項目58前記対象がヒトである、項目55に記載の方法。項目59SNCA核酸を標的とするiRNA剤を評価する方法であって、アンチセンス配列がSNCAmRNAのヌクレオチド配列に対して相補的であり、かつセンス鎖が該アンチセンス鎖にハイブリダイズするために十分に相補的であるiRNA剤を供給する工程;SNCA遺伝子を含む細胞に該iRNA剤を接触させる工程;細胞に該iRNA剤を接触させる前と細胞に該iRNA剤を接触させた後のSNCA遺伝子の発現を比較する工程;ならびに該iRNA剤がSNCA遺伝子の発現を阻害するために有用であるか否かを決定する工程であって、細胞中に存在するSNCAのRNAまたはタンパク質の量が、細胞にiRNA剤を接触させる前の量よりも少ない場合に該iRNAが有用であることを特徴とする工程、を含む方法。項目60前記比較工程が、ノーザンブロット、ウェスタンブロット、RT-PCR、およびRNAse保護アッセイからなる群から選択される方法を実行することからなる、項目59に記載の方法。項目61SNCAの発現を阻害する能力について薬剤を評価する方法であって、候補薬剤を供給する工程、および該薬剤が動物におけるSNCAの発現を減少させるか否かを決定する工程を含む方法。項目62第1の試験系で薬剤を評価する前工程、および所定のレベルの変化が見られる場合には、前記動物中で該候補薬剤を評価する工程を含む、項目61に記載の方法。項目632つの試験系を使用し、第1の試験系が、第2の動物の系よりも少なくとも100倍多い化合物をスクリーニングするために使用される高スループット系である、項目62に記載の方法。項目64第1の試験系が、SNCA標的、SNCARNA標的、またはDNA標的と候補薬剤を接触させ、標的との相互作用が存在するか否かを決定することを含む試験系;細胞と候補薬物とを接触させ、SNCA発現の変化を評価することを含む試験系;候補薬剤をinvitroで組織試料と接触させ、SNCAまたはSNCARNAのレベルを評価することを含む試験系から選択される、項目62に記載の方法。項目65前記第1の系が、SNCAまたはSNCARNAを内在性遺伝子または外来構築物から発現可能な細胞と前記候補薬剤を接触させる工程、およびSNCAまたはSNCARNAのレベルを評価する工程を含む、項目64に記載の方法。項目66前記第1の系が、SNCA制御領域からRNAまたはタンパク質を発現可能な細胞と前記候補薬剤を接触させる工程、およびRNAまたはタンパク質のレベルに対する効果を決定する工程を含む、項目64に記載の方法。項目67前記第1の系が、異種マーカータンパク質に結合したSNCA制御領域からRNAまたはタンパク質を発現可能な細胞と前記候補薬剤を接触させる工程を含む、項目64に記載の方法。項目68前記動物を薬剤の効果についてモニターする、項目61に記載の方法。項目69脳組織または眼組織をSNCA発現に対する薬剤の効果について試験する、項目68に記載の方法。項目70前記決定する工程が、ノーザンブロット、ウェスタンブロット、RT-PCR、およびRNAse保護アッセイからなる群より選択される方法を実行することを含む、項目61に記載の方法。項目71前記薬剤が、低分子、アンチセンスオリゴヌクレオチド、リボザイム、またはタンパク質、ポリペプチド、もしくはペプチドである、項目61に記載の方法。二本鎖dsRNAは、RNA干渉RNAiとして知られる過程を通してmRNAの配列特異的サイレンシングをもたらす。この過程は、哺乳動物および他の脊椎動物を含めた、広範な種々の生物に存在する。dsRNAの21~23ntフラグメントが、例えば、RNAの分解を引き起こすことによるRNAサイレンシングの配列特異的メディエーターであることが実証されてきた。理論によって束縛されることは望まないが、これらの21~23ntフラグメント中に存在する、特定の長さのフラグメントにすぎない分子シグナルが、RNAiを仲介する細胞因子を発動している可能性がある。本明細書に記載されるものは、これらの21~23ntフラグメントおよび他のiRNA剤を調製および投与するための方法、ならびに遺伝子の機能、および特にSNCA遺伝子の機能を特異的に不活性化するための、前記21~23ntフラグメントおよび他のiRNA剤の使用についてである。iRNA剤または同一もしくは類似の性質を有する組換え生産もしくは化学合成されたオリゴヌクレオチドの使用により、哺乳動物細胞中でサイレンシングするために特定のmRNAを標的とすることが可能となる。さらに、より長いdsRNAフラグメントも、例えば以下に記載されるように使用可能である。哺乳動物細胞において、長いdsRNAは、有害であることの多いインターフェロン応答を誘導し得るが、短いdsRNAsRNAは、少なくとも細胞および宿主に対して有害なほどはインターフェロン応答を誘発しない。特に、sRNA剤中のiRNA剤の鎖の長さは、例えば、有害なインターフェロン応答を誘導しないように十分に短く、31、30、28、25、または23nt未満であり得る。したがって、哺乳動物細胞へのsRNA剤の組成物例えば、本明細書に記載されるように製剤化された組成物の投与は、インターフェロン応答を回避しながら標的遺伝子の発現をサイレンシングするために使用され得る。さらに、個別の種類のiRNA剤の使用により、例えば、対立遺伝子についてヘテロ接合の対象において、標的遺伝子の一方の対立遺伝子を選択的に標的とすることが可能である。さらに、1つの実施形態において、哺乳動物細胞は、インターフェロン応答の構成成分例えば、dsRNAで活性化されるプロテインキナーゼPKRを破壊するiRNA剤で処理される。このような細胞は、標的RNAに相補的な配列を含み、前記処理がなければインターフェロン応答を誘発しうる長さを有する第2のiRNA剤で処理することができる。代表的な実施形態において、対象は、ウシ、ウマ、マウス、ラット、イヌ、ブタ、ヤギ、または霊長類などの哺乳動物である。より好ましい実施形態において、対象はヒトであり、例えば、健常人、あるいは疾患もしくは障害を有するか、疾患もしくは障害を有すると診断されるか、または疾患もしくは障害を有する素因がある人である。特に、ヒトはSNCA遺伝子の過剰発現と関連した疾患もしくは障害、またはα-シヌクレインタンパク質の凝集によって特徴付けられる疾患もしくは障害を有し得る。iRNA剤によって仲介されるサイレンシングは、iRNA剤組成物の投与後数日間持続し得るので、多くの場合において、組成物の投与は1日当たり1回未満の頻度とすることが可能であり、また場合によっては、治療計画全体について1回のみとすることが可能である。α-シヌクレインα-シヌクレインタンパク質は主として細胞質中に見出されるが、核へも局在化している。ドーパミン作動性ニューロンにおいては、α-シヌクレインは膜結合型である。このタンパク質は、軸索のシナプス前部領域に通常局在している可溶性モノマーである。このタンパク質は、神経変性シヌクレイン症における細胞内容物の主要な成分であるフィラメント状凝集物を形成し得る。α-シヌクレインタンパク質は、シヌクレイン症によって特徴付けられる多数の疾患と関連がある。3つの点突然変異A53T、A30P、およびE46K、ならびにSNCAの二重化現象および三重化現象は、常染色体優性のパーキンソン病家族性PD、FPDとも呼ばれると関連がある。A53T変異およびA30P変異は、invitroにおけるプロトフィブリル形成を促進するSNCAタンパク質の立体構造の変化を引き起こす。三重化現象は、SNCAタンパク質の2倍の過剰発現を生じる。α-シヌクレインは、FPDおよび特発性PDに特徴的な細胞質内容物であるレーヴィ小体の主要な線維成分であり、そしてパーキンソン病の脳の黒質は、線維状のα-シヌクレインを特徴としている。アルツハイマー病患者においては、SNCAペプチドは、アルツハイマー病を有する患者の脳におけるアミロイドプラークの主要な成分である。細胞の細胞質におけるα-シヌクレインの凝集は、該タンパク質の過剰発現、タンパク質分解の阻害、または該タンパク質の構造に影響を与える突然変異を含む多数のメカニズムによって引き起こされる可能性があり、このタンパク質が自己会合する傾向を増大させている。SNCA遺伝子産物は、PDなどの神経変性疾患の治療方法のための標的であり得る。この治療方法は、iRNA剤を用いてSNCA核酸を標的とすることを含み得る。代替例として、または加えて、遺伝子発現を阻害するためにアンチセンスRNAを使用してもよいし、または抗体もしくは低分子を使用してSNCA核酸を標的としてもよい。一般的に、アンチセンスRNA、抗SNCA抗体、または低分子は、例えば、本明細書に記載される任意の方法または組成物によって、iRNA剤の代わりに使用可能である。SNCAの発現および活性を下方制御するための治療の組み合わせも使用可能である。SNCA遺伝子の配列決定から、プロモーター内にジヌクレオチド反復配列REP1を含む共通のバリアントが明らかになった。REP1は集団間で長さが異なり、かつ特定の対立遺伝子バリアントはPDのリスクの増加と関連しているクルーガーらKruegeretal.、AnnNeurol.第45巻、611~7ページ、1999年。SNCAのREP1遺伝子座は、正常な遺伝子発現のために必要であるタッチマンらTouchmanetal.、GenomeRes.第11巻、78~86ページ、2001年。異なるREP1の対立遺伝子間のSNCA遺伝子発現のレベルは、3倍の範囲にわたって有意に変化し、このことは、特定の遺伝子型とPDのリスク増加との関連性がSNCAの遺伝子の過剰発現の結果である可能性があることを示唆しているチバ-ファレックChiba-FalekおよびヌスバウムNussbaum、HumMolGenet.第10巻、3101~9ページ、2001年。SNCA遺伝子のREP1遺伝子座における対立遺伝子内バリエーションの機能的分析は、対立遺伝子の全体の長さが転写調節において主要な役割を果たすことを暗示し;配列が不均一性であっても、長さにより規定される対立遺伝子に基づく遺伝学的関連研究を混乱させることはなさそうであるチバ-ファレックらChiba-Faleketal.、HumGenet.第113巻、426~31ページ、2003年。PDのまれな原因としてのSNCA遺伝子三重化という最近の発見は、該遺伝子のプロモーター中の多型が、遺伝子の過剰発現の同じメカニズムを介して感受性を付与するという観察と一致しているシングレトンらSingletonetal.、Science第302巻、841ページ、2003年。3つのSNCAスプライシングバリアントが同定されている図1Aを参照のこと。全長140アミノ酸型のタンパク質が最も豊富である。128アミノ酸型はエキソン3を欠き、そして112アミノ酸型はエキソン5を欠く。本発明のiRNAは、SNCAのあらゆるアイソフォームを標的とし得る。iRNAは、すべての既知のアイソフォームを効果的に標的とするために共通のエキソン例えば、エキソン2、4、6、または7を標的とし得る。iRNA剤はスプライシングジャンクションを標的としてもよいし、または特定のアイソフォームを標的とするために選択的スプライシングを受けるエキソンを標的としてもよい。例えば、112アミノ酸のアイソフォームを標的とするために、iRNA剤は、エキソン4/エキソン6のスプライシングジャンクションと部分的に一致するmRNA配列を標的とし得る。128アミノ酸のタンパク質アイソフォームを標的とするために、iRNA剤は、エキソン2/エキソン4ジャンクションと部分的に一致するmRNA配列を標的とし得る。パーキンソン病の治療PDまたは任意の他のα-シヌクレイン関連障害を有する任意の患者が、本明細書に記載される方法または組成物を用いる治療のための候補である。好ましくは、患者は末期ではなく例えば、患者は2年間以上の平均余命を有する、そして好ましくは、患者はパーキンソン病の最終段階すなわち、ホーンHoehnおよびヤールYahrの段階5には達していない。前駆症状を有する対象もまた、抗SNCA剤例えば、抗SNCAiRNA剤、アンチセンスオリゴヌクレオチド、リボザイム、ジンクフィンガータンパク質、抗体、または低分子を用いる治療のための候補であり得る。1つの実施形態において、前駆症状を有する候補は、リスク-要因プロファイリングおよび機能的神経画像化例えば、フルオロドーパおよびポジトロン放出断層撮影によるのいずれかまたは両方によって同定される。例えば、この候補は、リスク-要因プロファイリング、その後の機能的神経画像化によって同定可能である。任意の遺伝子型を有する個体が治療のための候補である。ある実施形態において、患者は、その患者がPDを発症するリスクを増大させる特定の遺伝子変異を有する。例えば、SNCA遺伝子多重化例えば、SNCA遺伝子の二重化または三重化を有する個体は、PDを発症するリスクが増大しており、iRNA剤を用いる治療のための候補である。さらに、SNCAにおける機能獲得性突然変異gainoffunctionmutationは、個体がPDを発症するリスクを増大させ得る。SNCAREP1遺伝子型例えば、REP11対立遺伝子のヘテロ接合またはホモ接合の遺伝子型を有する個体は、このような治療のための候補であり得る。REP11対立遺伝子についてホモ接合の個体はSNCAを過剰発現する。UCHL-1、parkin、またはSNCAの遺伝子における突然変異を有する個体は、PDのリスクが増大しており、かつ抗SNCAiRNA剤を用いる治療のための候補であり得る。特に、UCHL-1遺伝子またはparkin遺伝子における突然変異は、遺伝子またはタンパク質の活性の減少を引き起こす。Tau遺伝子型例えば、Tau遺伝子における突然変異またはTauハプロタイプ例えば、H1ハプロタイプなどを有する個体もまた、PDを発症するリスクを有している。他の遺伝的なリスク因子には、遺伝子MAPT、DJ1、PINK1、およびNURR1における突然変異、および遺伝子SNCA、parkin、MAPT、およびNAT2を含むいくつかの遺伝子における多型が含まれる。PDの非遺伝性の例えば、環境的なリスク要因には、年齢例えば、30歳、35歳、40歳、45歳、または50歳を超える年代、性別男性は一般的に女性よりも高いリスクを有する、除草剤への曝露、重金属への曝露、および頭部の外傷が含まれる。一般的に、ユビキチンプロテアソーム経路を破壊する、もしくはより特異的にプロテアソームを阻害する、またはミトコンドリア機能を破壊する、または酸化的ストレスを生じる、またはα-シヌクレインの凝集および繊維化を促進する内在性および外因性の因子が、ヒトがPDを発症するリスクを増大させる可能性があり、かつPDの病因に寄与し得る。1つの実施形態において、iRNA剤はPDを有する対象において野生型SNCAを標的とするために使用可能である。他の神経変性障害の治療シヌクレイン症によって特徴付けられる任意の疾患多系統萎縮症、レーヴィ小体痴呆、およびアルツハイマー病を含むが、本明細書に記載される阻害剤例えば、SNCAを標的とする薬剤を用いて治療可能である。あらゆる遺伝子型の個体が治療のための候補である。ある実施形態において、患者は、シヌクレイン症発症リスクを増大させる特定の遺伝子突然変異を有する。1つの実施形態において、iRNA剤は、神経変性障害を有する対象中で野生型SNCAを標的とするために使用可能である。個体が、特定の環境因子の結果としてシヌクレイン症を発症する可能性がある。例えば、酸化的ストレス、特定の除草剤例えば、24Dおよびオレンジ剤、細菌感染、および頭部外傷は、PDを発症するリスクの増加と関連付けられており、シヌクレイン症についての個体のリスクを決定する決定要因であり得る。これらの要因および本明細書に開示される他の要因は、抗SNCA治療についての候補対象のリスクプロファイルを評価する際に考慮されうる。iRNA剤の設計および選択候補iRNA剤は、遺伝子ウォーキング分析を実行することによって設計可能である。転写される領域の全体または一部に対応する、重複し、隣接し、または近接しているが間隔のあいた複数の候補薬剤を作製し試験することが可能である。各iRNA剤について、標的遺伝子の発現をダウンレギュレーションする能力に関して試験および評価することが可能である後述する候補iRNA剤の評価を参照のこと。iRNA剤は、配列情報および所望の特徴に基づいて合理的に設計可能である。例えば、iRNA剤は、候補二重鎖の相対的融解温度に従って設計可能である。一般的に、二重鎖は、アンチセンス鎖の3’末端よりもアンチセンス鎖の5’末端において低い融解温度を有することになる。合理的設計についてのこの要素および他の要素は、以下においてより詳細に議論される例えば、パリンドローム非対称性およびZ-X-Y、ならびに二本鎖末端安定性の差次的修飾およびワトソン-クリック以外の対合と記された節を参照のこと。SNCARNAを標的とするiRNA剤は、表1のsiRNAのうちいずれかの配列を有し得る。特に、iRNA剤は、SNCA2、7もしくは7s、または8もしくは8s1もしくは8s2の配列を有するとよいが、これらは、invivoおよびinvitroにおいてSNCA遺伝子をサイレンシングするために最も有効であることが見出された。候補iRNA剤の評価抗SNCAiRNA剤候補は、SNCA遺伝子の発現をダウンレギュレーションする能力について評価可能である。例えば、候補iRNA剤が提供され、かつSNCA遺伝子を発現する細胞と接触させることが可能である。候補iRNA剤との接触の前後のSNCA遺伝子の発現レベルが比較可能である。標的SNCA遺伝子は、細胞中の、内在性遺伝子でも外来遺伝子でもよい。SNCA遺伝子から発現されるRNAまたはタンパク質の量がiRNA剤との接触後に低くなることが測定されれば、該iRNA剤がSNCA遺伝子の発現をダウンレギュレーションすると結論付けることができる。細胞中のSNCARNAまたはタンパク質のレベルは、所望される任意の方法によって決定可能である。例えば、SNCARNAのレベルは、ノーザンブロット分析、ポリメラーゼ連鎖反応と共役した逆転写反応RT-PCR、またはRNAse保護アッセイによって決定可能である。タンパク質のレベルはウェスタンブロット分析によって決定可能である。iRNA剤は、invitroの系およびinvivoの系のうち少なくともいずれかにおいて試験可能である。例えば、標的遺伝子またはそのフラグメントを、プラスミド上のレポーター遺伝子に融合させることが可能である。このプラスミドで、iRNA剤候補とともに細胞をトランスフェクションすればよい。iRNA剤の効力は、レポーター遺伝子の発現をモニターすることによって評価可能である。このレポーター遺伝子は、例えば、蛍光またはinsituハイブリダイゼーション法などによってinvivoでモニター可能である。例示的な蛍光レポーター遺伝子には、緑色蛍光タンパク質およびルシフェラーゼが含まれるがこれらに限定されない。レポーター遺伝子の発現は、上記のような、ノーザンブロット、RT-PCR、RNAse保護アッセイ、またはウェスタンブロット分析によってモニターすることもできる。抗SNCAiRNA剤の効力は、哺乳動物の細胞株例えば、哺乳動物の神経細胞株、例えばヒト神経芽細胞腫の細胞株などにおいて試験可能である。例えば、抗SNCAiRNA剤の効力を試験するために有用な細胞株は、ニューロン性の表現型を有するもの神経芽細胞腫、ニューロンに分化した褐色細胞腫、および初代ニューロン培養物または非ニューロン性の細胞株例えば、腎臓、筋肉、または卵巣の細胞である。神経芽細胞腫の細胞株には、BE2-M17、SH-SY5Yいずれもヒト、およびN2aマウスが挙げられる。BE2-M17細胞は、α-シヌクレイン症に罹患したヒト脳のドーパミン作動性ニューロンを生化学的に模倣する。対照には、1例えば、内在性または外来の、標的ではないオフターゲットのRNAまたはタンパク質の発現と比較することによって、標的遺伝子の発現の減少についてアッセイし、iRNAの効力および特異性を試験すること;および2非機能性のiRNA剤を投与することによって、標的遺伝子の発現に対する効果の特異性を試験することが含まれる。非機能性の対照iRNA剤は、a細胞中で発現されない遺伝子を標的とするもの;bナンセンス配列例えば、試験iRNAを乱雑化スクランブルしたものであるもの;またはc標的遺伝子に対して相補的な配列を有するが、遺伝子発現をサイレンシングする能力を欠くことが事前の実験によってわかっているものであってよい。アッセイには、iRNA剤によるサイレンシング効果の安定性および時間をモニターするための、かつ分裂中の細胞と分裂していない細胞とを比較してモニターするための経時的実験が含まれる。おそらく、分裂中の細胞においては、dsRNAは時間の経過とともに希釈され、したがってサイレンシング効果の期間が減少する。この意味するところは、invivoでは投薬量を調整しなければならないこと、および/またはサイレンシング効果を維持するためにiRNA剤をより頻繁に投与しなければならないことである。分裂していない細胞をモニターするためには、血清の使用を中止して細胞を分裂停止させればよい。ニューロンは分裂終了細胞であり、したがって神経細胞は、神経系の障害例えば、神経変性障害の治療のための治療用組成物において使用するためのiRNA剤例えば、抗SNCAiRNA剤の安定性をアッセイするために適している。iRNA剤候補を、種間の交差反応性について評価することも可能である。例えば、異なる種例えば、マウス対ヒトから誘導された細胞株、または異なる種から単離された生物学的試料例えば、血清または組織抽出物を、標的iRNA剤および候補iRNA剤でトランスフェクションすることが可能である。異なる種由来の細胞についてiRNA剤の効力を決定すればよい。iRNA剤の安定性試験、修飾、および再試験候補のiRNA剤は、該iRNA剤が対象の身体に導入される場合などの、エンドヌクレアーゼまたはエキソヌクレアーゼによる切断に対する感受性に関して評価することができる。修飾、特に切断例えば、対象の体内に見出される成分による切断に感受性を有する部位を同定するための方法を利用可能である。この成分例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼは、特定の組織、器官、または体液例えば、血液、血漿、または血清などの身体の特定の領域に特異的であり得る。身体の特定の領域におけるエンドヌクレアーゼまたはエキソヌクレアーゼによる切断のいずれかに感受性を有する、iRNA剤中の部位は、身体の他の領域における切断に対しては耐性である可能性がある。例示的な方法には:1対象の体内に存在する物質、および好ましくは治療用dsRNAが導入される身体のコンパートメント治療剤が直接導入されるコンパートメント例えば、循環系ならびに治療剤が最終的に標的とするコンパートメントがあるが、場合によっては例えば、眼および脳、2つのコンパートメントは同じである中に存在する成分が、dsRNA例えば、iRNA剤を切断する時点を決定する工程、および2dsRNA中の、例えば、エンドヌクレアーゼ、エキソヌクレアーゼ、またはその両方による1つまたは複数の切断部位を同定する工程が含まれる。任意選択で、この方法はさらに、このような部位における切断を阻害するために修飾されたRNAを提供する工程を包含する。これらの工程は、以下のアッセイのうち1つ以上を使用することによって達成可能である。ia候補のdsRNA剤例えば、iRNA剤を試験物質例えば、生体物質と接触させる工程、bサイズに基づくアッセイ例えば、ゲル電気泳動を使用して、iRNA剤が切断されるか否かを決定する工程。好ましい実施形態では、経時変化が測定され、異なる時間インキュベートされた多数の試料がサイズに基づくアッセイに供される。好ましい実施形態では、候補のdsRNAは標識されない。この方法は、全体を染色するstainsall方法であり得る。iia放射標識された候補dsRNA例えば、iRNA剤を供給する工程;b試験物質と候補dsRNAを接触させる工程、cサイズに基づくアッセイ例えば、ゲル電気泳動を使用して、iRNA剤が切断されるか否かを決定する工程。好ましい実施形態では、経時変化が測定されるが、その場合は多数の試料が異なる時間インキュベートされてサイズに基づくアッセイに供される。好ましい実施形態において、測定は、フラグメント中に存在するヌクレオチド数の決定が可能な条件下でなされる。例えば、インキュベートされた試料は、切断産物の長さを決定可能にするマーカーを有するゲルで泳動される。このゲルは、ラダー状の消化物である標準品を含んでもよい。センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかを標識してもよい。好ましくは、一方の鎖のみが特定の実験において標識される。標識は、5’末端、3’末端、または内部の位置に組み込むことが可能である。フラグメントの長さおよびしたがって切断部位は、上記のラダー、およびRNAseT1などの部位特異的エンドヌクレアーゼを用いたマッピングに基づくフラグメントのサイズから決定可能である。iii任意の方法例えば、上記のうちの1つによって生じたフラグメントは質量分析法によって分析可能である。試験物質とiRNA剤を接触させた後、iRNA剤を、例えば、フェノール-クロロホルム抽出とその後の沈殿処理によって精製例えば、部分精製可能である。次いで、液体クロマトグラフィーを使用してフラグメントを分離可能であり、そして質量分析法を使用して各フラグメントの分子量を決定することができる。このことにより、切断のメカニズム、例えば、5’または3’エキソヌクレアーゼ切断などの直接的なリン酸の切断によるか、または環状リン酸の形成を介して2’OHによって仲介されるかを決定することができる。2つ以上のdsRNA例えば、抗SNCAiRNA剤を評価することが可能である。この評価を用いて、治療用iRNA剤に使用する配列を選択することが可能である。例えば、評価することによって、対象の体内の関連するコンパートメント中に存在する物質例えば、酵素によって切断される最適な通常最小の数の部位を有する配列を選択することが可能になる。最適化された配列を選択するために、2つ以上のdsRNA候補を評価すればよい。例えば、2つ以上の候補を評価し、最適な特性を有するもの例えば、切断部位がより少ないものを選択することが可能である。切断部位に関する情報は、修飾例えば、切断を減少させるための修飾のためのバックボーンの原子、糖、または塩基を選択するために使用可能である。例示的な修飾には、本明細書に記載される修飾などの、エンドヌクレアーゼによる分解を阻害する修飾が含まれる。特に好ましい修飾には:2’-修飾、例えば、センス鎖またはアンチセンス鎖とりわけセンス鎖のUへの2’OMe部分の付与;バックボーンの修飾、例えば、リン酸バックボーン内のOのSへの置換を伴う修飾、例えば、特にアンチセンス鎖のUまたはAまたはその両方へのホスホロチオエート修飾の付与;UからC5アミノリンカーへの置換;AからGへの置換配列の変化はセンス鎖上に配置されアンチセンス鎖上には配置されないことが好ましい;および2’位、6’位、7’位、または8’位の修飾、が含まれる。好ましい実施形態は、これらの修飾のうち1つ以上がセンス鎖上に存在するがアンチセンス鎖上には存在しない実施形態、またはアンチセンス鎖が有するこのような修飾がより少ない実施形態である。例示的な修飾には、エキソヌクレアーゼによる分解を阻害する修飾も含まれる。エキソヌクレアーゼによる分解を阻害する修飾の例は本明細書において見出され得る。特に好ましい修飾には:2’-修飾、例えば、3’突出部の例えば3’末端3’末端とは、文脈から示されるように、分子の3’位の原子または最も3’側の構成部分、例えば最も3’側のPまたは2’位を意味するへの2’OMe部分の付与;バックボーンの修飾、例えば、PからSへの置換を伴う修飾、例えば、ホスホロチオエート修飾の付与、または3’突出部の例えば、3’末端におけるメチル化Pの使用;2’-修飾の組み合わせ、例えば、2’OMe部分およびバックボーンの修飾例えば、PからSへの置換を伴う修飾、例えば、ホスホロチオエート修飾の供給、または3’突出部の例えば3’末端におけるメチル化Pの使用の付与;3’アルキルを用いる修飾;3’突出部の例えば3’末端における脱塩基ピロリジンを用いる修飾;ナプロキセン、イブプロフェン、または分解を阻害する他の部分を用いる3’末端の修飾、が挙げられる。これらの方法は、治療用の抗SNCAiRNA剤を選択およびまたは最適化するために使用可能である。該方法は、修飾されていない候補dsRNA、または修飾例えば、分解を阻害する修飾、dsRNA分子を標的化する修飾、またはハイブリダイゼーションを調節する修飾を含む候補dsRNA例えば、候補iRNA剤を評価するために使用可能である。このような修飾は本明細書に記載されている。切断アッセイは、修飾または非修飾候補の標的をサイレンシングする能力を決定するためのアッセイと組み合わせることが可能である。例えば、標的または標的でない配列をサイレンシングする能力を評価するために候補を任意選択で試験してもよいし、切断に対する感受性を評価してもよいし、修飾候補を作製するために候補dsRNAを例えば、本明細書に記載されるように、例えば、分解を阻害するために修飾してもよいし、サイレンシング能力および分解に抵抗する能力のうち一方または両方について修飾体を試験してもよいであろう。この手法を繰り返しても良い。修飾は、一度に1つ導入してもよいし、まとめて導入してもよい。iRNA剤がサイレンシングする能力をモニターするために、細胞を用いる方法を使用することもできる。これに続いて、活性を確認するために、異なる方法、例えば、動物全体を用いる方法を実施可能である。試験物質とは、生体物質、例えば、生物学的試料、組織抽出物もしくは調製物、血清、dsRNAを修飾例えば、切断することが知られている既知の酵素またはその他の分子例えば、エンドヌクレアーゼをいう。試験物質は、RNAi剤が曝露されることになる体内コンパートメントに存在し得る。例えば、神経組織に例えば、脳または脊髄に直接的に投与されるiRNA剤については、試験物質は脳組織抽出物または脊髄液であり得る。眼に直接的に供給されるiRNA剤は、眼の抽出物とともにインキュベートすればよい。invivo試験SNCA遺伝子の発現を阻害することができると同定されたiRNA剤は、動物モデル例えば、マウスまたはラットなどの哺乳動物のモデルにおいてinvivoでの機能性について試験可能である。例えば、iRNA剤を動物に投与して、該iRNA剤の生体内分布、安定性、およびSNCA遺伝子の発現を阻害する能力に関して評価可能である。iRNA剤は、例えば注射によって標的組織に直接投与されてもよいし、またはヒトに投与されるのと同じ様式で動物モデルに投与されてもよい。例えば、iRNA剤が脳の標的領域に例えば、皮質、黒質、淡蒼球、または海馬に直接注射され、一定時間の後に脳が採取され組織薄片が薬剤の分布について試験されてもよい。iRNA剤はまた、その細胞内分布についても評価可能である。この評価は、iRNA剤が細胞に取り込まれたか否かを決定することを包含し得る。この評価は、iRNA剤の安定性例えば、半減期を決定することを包含し得る。invivoでのiRNA剤の評価は、追跡可能なマーカー例えば、フルオレセイン[その他]などの蛍光マーカー;32P、33P、もしくは3Hなどの放射活性標識;金粒子;または免疫組織化学法のための抗原粒子と複合体化されたiRNA剤の使用によって容易となりうる。生体内分布をモニターするために有用なiRNA剤は、invivoでの遺伝子サイレンシング活性を欠いていてもよい。例えば、iRNA剤は、その動物には存在しない遺伝子を標的としてもよく例えば、マウスに注射されるiRNA剤がルシフェラーゼを標的としていてもよい、またはiRNA剤がいかなる遺伝子も例えば、内在性のいかなる遺伝子も標的としないナンセンス配列を有していてもよい。iRNAの局在化/生体内分布は、iRNA剤に結合された追跡可能な標識、例えば、上記の追跡可能な薬剤などによってモニター可能である。iRNA剤は、SNCA発現をダウンレギュレーションする能力に関して評価可能である。invivoでのSNCA発現のレベルは、例えばinsituハイブリダイゼーションによって、またはiRNA剤に曝露させる前後に組織からRNAを単離することによって測定可能である。SNCARNAは、RT-PCR、ノーザンブロット、またはRNAase保護アッセイを含むがこれらに限定されない任意の所望の方法によって検出可能である。代替として、または追加として、SNCA遺伝子の発現を、抗SNCAiRNA剤で処理された組織抽出物についてウェスタンブロット分析を実行することによってモニターすることが可能である。抗SNCAiRNA剤は、マウスのPDモデルで試験することが可能であり、該モデルは、例えば、ヒトSNCA遺伝子の野生型コピーを有するマウスマスリアらMasliahetal.、Science第287巻、1265~1269ページ、2000年、または変異型ヒトSNCAを有するマウスリッチフィールドらRichfieldetal.、Exp.Neurol.第175巻、35~48ページ、2002年;ジアソンらGiassonetal.、Neuron第34巻、521~533ページ、2002年;リーらLeeetal.、ProcNatlAcad.Sci.第99巻、8968~8973ページ、2002年である。上記変異型マウスは、A53T変異、A30P変異、またはE46K変異を発現するヒトSNCA遺伝子を有していてもよい。治療処理されたマウスモデルを、PDに関連する症状の減少について観察すればよい。iRNAの化学RNAiを仲介する単離iRNA剤例えば、RNA分子二本鎖;一本鎖が本明細書中に記載される。このiRNA剤は、対象者の内在性SNCA遺伝子に関連するRNAiを好適に仲介する。iRNA剤は、該iRNA剤またはそのフラグメントが標的遺伝子のダウンレギュレーションを仲介することが可能であるように、標的遺伝子に対して十分な相同性の領域を含み、かつヌクレオチドの長さが十分であるべきである。説明を簡略化するために、本明細書中では、用語ヌクレオチドまたはリボヌクレオチドは、RNA剤の1つ以上のモノマーサブユニットを指すために使用されることがある。本明細書中において、用語リボヌクレオチドまたはヌクレオチドを使用するとき、修飾RNAまたはヌクレオチド代用物の場合においては、修飾ヌクレオチド、または1つ以上の位置での代用物で置換した部分をも意味し得ることが本明細書中で理解されよう。したがって、iRNA剤は、少なくとも部分的に、およびある実施形態においては完全に、標的RNAに相補的な領域であるか、またはその領域を含む。iRNA剤と標的との間の完全な相補性が存在することは必ずしも必要ではないが、その一致は、iRNA剤またはその切断産物が、例えば、標的RNA例えば、mRNAのRNAi切断によって、配列特異的に発現を抑制することを可能にするために十分でなくてはならない。標的鎖との相補性、または相同性の程度は、アンチセンス鎖において最も重大である。特に、アンチセンス鎖における完全な相補性が望ましいことが多いが、ある実施形態は、特にアンチセンス鎖において、1つ以上であるが好ましくは6個、5個、4個、3個、2個、またはそれより少ないミスマッチ標的RNAに関してを含むことが可能である。特にアンチセンス鎖におけるミスマッチは、末端領域において最も寛容性が高く、存在する場合、好ましくは末端領域において、例えば、5’末端および/または3’末端の6ヌクレオチド以内、5ヌクレオチド以内、4ヌクレオチド以内、または3ヌクレオチド以内である。センス鎖は、該分子の二本鎖全体の性質を維持するために十分なだけのアンチセンス鎖との相補性があればよい。iRNA剤の一本鎖領域は、修飾されるかまたはヌクレオシド代用物を含むことが多く、例えば、ヘアピン構造の対合していない領域例えば、2つの相補性領域をつなぐ領域は、修飾またはヌクレオシド代用物を有し得る。iRNA剤の3’末端もしくは5’末端のうち一方または両方を、例えば、エキソヌクレアーゼに対して安定化するために修飾すること、またはアンチセンスsRNA剤をRISCに優先的に入れるための修飾することも好ましい。修飾は、C3またはC6、C7、C12アミノリンカー、チオールリンカー、カルボキシルリンカー、非ヌクレオチド性スペーサーC3、C6、C9、C12、無塩基、トリエチレングリコール、ヘキサエチレングリコール、特殊なビオチン、あるいは、ホスホルアミダイトとして提供され、かつ別のDMT保護されたヒドロキシル基を有し、RNA合成の際に複数のカップリングを可能にするフルオレセイン試薬を含むことが可能である。本明細書中の他所で議論するように、iRNA剤は修飾されるか、またはヌクレオチド代用物に加えてリボース置換モノマーサブユニットRRMSを含むことが多いであろう。RRMSはリボヌクレオチドのリボース糖を、別の部分、例えば糖質以外の好ましくは環式の担体で置換する。RRMSについては後に詳細に説明する。iRNA剤には以下のものが含まれる:インターフェロン応答を誘発するために十分に長い分子これはダイサーDicer、ベルンシュタインらBernsteinetal.、2001.Nature、409:363~366によって切断され、RISCRNAi誘導性サイレンシング複合体に入る;およびインターフェロン応答を誘発しないために十分に短い分子この分子もまたDicerによって切断されることが可能であり、かつ/またはRISCに入る、例えば、RISCに入ることを可能にするサイズである分子、例えば、Dicer切断産物に類似する分子。インターフェロン応答を誘発しない十分に短い分子は、本明細書中では、sRNA剤または短いiRNA剤と呼ばれる。sRNA剤または短いiRNA剤は、本明細書中で使用される場合、iRNA剤、例えば、ヒト細胞において有害なインターフェロン応答を誘導しない十分に短い二本鎖RNA剤または一本鎖RNA剤をいい、例えば、同RNA剤は、60ヌクレオチド対未満、しかし好ましくは、50、40、または30ヌクレオチド対未満の二本鎖領域を有する。このsRNA剤またはその切断産物は、例えば、標的RNA好ましくは、内在性または病原性の標的RNAに関してRNAiを誘導することによって、標的遺伝子をダウンレギュレーションすることが可能である。sRNA剤の各々の鎖は、30、25、24、23、22、21、または20ヌクレオチド長以下であり得る。鎖は、好ましくは、少なくとも19ヌクレオチド長である。例えば、各々の鎖は21から25の間のヌクレオチド長であり得る。好ましいsRNA剤は、17、18、19、29、21、22、23、24、または25ヌクレオチド対の二本鎖、および1つ以上の突出部、好ましくは2~3ヌクレオチドの1つまたは2つの3’突出部を有する。標的RNAに対する相同性および標的遺伝子をダウンレギュレーションする能力に加えて、iRNA剤は好ましくは以下の特性の1つ以上を有する:1以下のRNA剤の節において示される式1、2、3、または4のものである;2一本鎖である場合、1つ以上のリン酸基または1つ以上のリン酸基アナログを含む5’修飾を有する;3非常に多数またはすべてのヌクレオシドが修飾されているにもかかわらず、正確な塩基対を形成可能であり、例えば標的RNAの切断によって標的のダウンレギュレーションを可能にするために十分な、相同な標的RNAとの二本鎖構造を形成することが可能なように、正しい三次元構造にある塩基または修飾塩基を提供することが可能なアンチセンス鎖を有する;4非常に多数またはすべてのヌクレオシドが修飾されているにもかかわらず、なおRNA様の特性を有する。すなわち、リボヌクレオチドに基づく含量では独占的でなく、または部分的でさえあるにも関わらす、RNA分子の全体的な構造、化学的特性および物理的特性を有する。例えば、iRNA剤は、例えば、すべてのヌクレオチド糖が2’ヒドロキシルの代わりに例えば2’フルオロを含むセンス鎖および/またはアンチセンス鎖を含むことが可能である。このデオキシリボヌクレオチド含有剤は、なおRNA様の特性を示すことが予測されうる。理論によって束縛されることを望まないが、電気的に陰性のフッ素は、リボースのC2’位に結合されたときに軸方向に配向する傾向がある。このフッ素の空間的な優先傾向は、ひいては、糖のC3’内部にくぼみを形成させる。これは、RNA分子中で観察されるのと同じくぼみ形成様式であり、RNAに特徴的なAファミリー型ヘリックスを生じる。さらに、フッ素は良好な水素結合のアクセプターであるので、RNA構造を安定化させることが知られている水分子と同じ水素結合相互作用に関与することが可能である。一般的には、糖の2’位で修飾された部分は、デオキシリボヌクレオチドのH部分よりも、リボヌクレオチドのOH部分により特徴的であるH結合に入ることができることが好ましい。好ましいiRNA剤は:その糖の全体、またはその糖の少なくとも50、75、80、85、90、または95において、C3’内部にくぼみを示し;iRNA剤の十分量の糖においてC3’内部のくぼみを示し、RNAに特徴的なAファミリー型ヘリックスを生じることが可能であり;C3’内部のくぼみ構造ではない20個、10個、5個、4個、3個、2個、または1個以下の糖を有する。これらの制限はアンチセンス鎖において特に好ましい;5修飾の性質にかかわらず、およびRNA剤が、特に突出部または他の一本鎖領域内にデオキシヌクレオチドまたは修飾デオキシヌクレオチドを含むことが可能であるとしても、DNA分子、あるいは、分子中のヌクレオチドの50、60、もしくは70より多く、または二本鎖領域のヌクレオチドの50、60、または70より多くがデオキシリボヌクレオチド、あるいは2’位がデオキシである修飾デオキシリボヌクレオチドである任意の分子は、RNA剤の定義から除外することが好ましい。一本鎖iRNA剤は、本明細書中で使用される場合、単一の分子から作られているiRNA剤である。これは、鎖内の対合によって形成される二本鎖領域を含んでもよく、例えば、該領域はヘアピン構造またはパン-ハンドル構造であってもよいし、これを含んでもよい。一本鎖iRNA剤は、標的分子に関してアンチセンスであることが好ましい。好ましい実施形態において、一本鎖iRNA剤は5’がリン酸化されるか、または5’プライム末端にホスホリルアナログを含む。5’リン酸修飾は、RISCが仲介する遺伝子サイレンシングと適合性であるものを含む。適切な修飾には以下が含まれる:5’一リン酸HO2OP-O-5’;5’二リン酸HO2OP-O-PHOO-O-5’;5’三リン酸HO2OP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’グアノシンキャップ7-メチル化または非メチル化7m-G-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’アデノシンキャップAppp、および任意の修飾または非修飾ヌクレオチドキャップ構造N-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’一チオリン酸ホスホロチオエート;HO2SP-O-5’;5’一ジチオリン酸ホスホロジチオエート;HOHSSP-O-5’、5’ホスホロチオール酸HO2OP-S-5’;酸素/硫黄置換一リン酸、二リン酸、および三リン酸の任意のさらなる組合せ例えば、5’-α-チオ三リン酸、5’-γ-チオ三リン酸など、5’ホスホルアミデートHO2OP-NH-5’、HONH2OP-O-5’、5’アルキルホスホン酸R=アルキル=メチル、エチル、イソプロピル、プロピルなど、例えば、RPOHO-O-5’-、OH2OP-5’-CH2、5’アルキルエーテルホスホン酸R=アルキルエーテル=メトキシメチルMeOCH2‐、エトキシメチルなど、例えば、RPOHO-O-5’-。これらの修飾はまた、二本鎖iRNAのアンチセンス鎖とともに使用されることも可能である。一本鎖iRNA剤は、該一本鎖iRNA剤がRISCに入ることが可能であり、かつRISCの仲介による標的mRNAの切断に関与することが可能であるように、十分に長くあるべきである。一本鎖iRNA剤は、少なくとも14ヌクレオチド長、およびより好ましくは、少なくとも15、20、25、29、35、40、または50ヌクレオチド長である。一本鎖iRNA剤は好ましくは、200、100、または60ヌクレオチド長未満である。ヘアピンiRNA剤は、17、18、19、29、21、22、23、24、または25ヌクレオチド対に等しいか、または少なくとも17、18、19、29、21、22、23、24、または25ヌクレオチド対の二本鎖領域を有する。この二本鎖領域の長さは、好ましくは、200、100、または50ヌクレオチド対以下である。二本鎖領域の好ましい範囲は、15~30、17~23、19~23、および19~21ヌクレオチド対長である。ヘアピンは、好ましくは、一本鎖突出部または末端好ましくはヘアピンのアンチセンス側の好ましくは3’末端の非対合領域を有する。好ましい突出部は2~3ヌクレオチド長である。二本鎖dsiRNA剤は、本明細書中で使用される場合、鎖間のハイブリダイゼーションにより二本鎖構造を形成することが可能である、1本より多くの鎖、好ましくは2本の鎖を含むiRNA剤である。二本鎖iRNA剤のアンチセンス鎖は、14、15、16、17、18、19、25、29、40、または60ヌクレオチド長に等しいか、または少なくとも14、15、16、17、18、19、25、29、40、または60ヌクレオチド長であるべきである。これは、200、100、または50ヌクレオチド長以下であるべきである。好ましい範囲は、17~25、19~23、および19~21ヌクレオチド長である。二本鎖iRNA剤のセンス鎖は、14、15、16、17、18、19、25、29、40、または60ヌクレオチド長に等しいか、または少なくとも14、15、16、17、18、19、25、29、40、または60ヌクレオチド長であるべきである。これは、200、100、または50ヌクレオチド長以下であるべきである。好ましい範囲は、17~25、19~23、および19~21ヌクレオチド長である。二本鎖iRNA剤の二本鎖部分は、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、29、40、または60ヌクレオチド対長に等しいか、または少なくとも14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、29、40、または60ヌクレオチド対長であるべきである。これは、200、100、または50ヌクレオチド対長以下であるべきである。好ましい範囲は、15~30、17~23、19~23、および19~21ヌクレオチド対長である。多くの実施形態において、dsiRNA剤は、内在性分子によって例えば、ダイサーDicerによって切断されてより小さなdsiRNA剤例えば、sRNA剤を生じることが可能であるように十分に大きい。二本鎖iRNA剤のアンチセンス鎖およびセンス鎖の一方または両方を修飾することが望ましい可能性がある。ある場合において、これらの鎖は同じ修飾または同じクラスの修飾を有するが、他の場合において、センス鎖およびアンチセンス鎖は異なる修飾を有し、例えば、ある場合において、センス鎖のみが修飾されることが望ましい。センス鎖のみを、例えばセンス鎖を不活性化するために修飾することが望ましい可能性があり、例えば、センス鎖は、センス鎖を不活性化し、かつ活性なsRNA/タンパク質またはRISCの形成を妨害するために修飾されることが可能である。これは、センス鎖の5’リン酸化を妨害する修飾によって、例えば、5’-O-メチルリボヌクレオチドを用いる修飾によって達成されることが可能であるニーケネンらNykaenenetal.、2001ATPrequirementsandsmallinterferingRNAstructureintheRNAinterferencepathwayCell107、309~321を参照のこと。例えば、単に5’OHをO-MeではなくHによって置換する、リン酸化を妨害する他の修飾もまた使用可能である。代替例として、大きなかさ高い基が5’リン酸基に付加され、これがホスホジエステル結合に転換されてもよいが、これは、ホスホジエステラーゼがこのような結合を切断し、かつ機能的sRNA5’末端を遊離することが可能であるので、より望ましくない可能性がある。アンチセンス鎖修飾は、5’リン酸化ならびに本明細書中で議論される他の5’修飾のいずれか、特に単鎖iRNA分子に関する節において上記に議論された5’修飾を含む。dsiRNA剤が分子の一方または両方の末端で一本鎖領域または不対合領域を含むように、センス鎖およびアンチセンス鎖が選択されることが好ましい。したがって、dsiRNA剤は、好ましくは突出部例えば、1つまたは2つの5’または3’突出部であるが好ましくは2~3ヌクレオチドの3’突出を含むように対合したセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む。多くの実施形態は3’突出部を有する。好ましいsRNA剤は一本鎖突出部、好ましくは、各々の末端に1ヌクレオチド長または好ましくは2もしくは3ヌクレオチド長の3’突出部を有する。この突出部は、ある鎖が他の鎖よりも長い結果であってもよいし、または、ずれを有する同じ長さの2つの鎖の結果であってもよい。5’末端は好ましくはリン酸化される。二本鎖領域についての好ましい長さは、例えば、上記に議論したsRNA剤の範囲において、15から30の間のヌクレオチド長、最も好ましくは18、19、20、21、22、および23ヌクレオチド長である。sRNA剤は、長さおよび構造が、長いdsRNAからの天然のDicer処理産物に類似する可能性がある。sRNA剤の2つの鎖が結合される例えば、共有結合される実施形態もまた含まれる。ヘアピン、または必要とされる二本鎖領域を提供する他の一本鎖構造物、および好ましくは3’突出部もまた、本発明の範囲内にある。dsiRNA剤およびsRNA剤を含む、本明細書に記載される単離iRNA剤は、標的RNA、例えば、mRNA、例えば、タンパク質をコードする遺伝子の転写物のサイレンシングを仲介することが可能である。便宜上、このようなmRNAは、本明細書中ではサイレンシングされるmRNAとも呼ばれる。このような遺伝子はまた、標的遺伝子ともいわれる。一般的に、サイレンシングされるRNAは内在性遺伝子、例えばSNCA遺伝子である。本明細書中で使用される場合、語句RNAiを仲介するとは、配列特異的な様式で、標的RNAをサイレンシングする能力をいう。理論によって束縛されることを望まないが、サイレンシングは、RNAiの機構またはプロセスおよびガイドRNA例えば、21~23ヌクレオチドのsRNA剤を使用すると考えられる。本明細書中で使用される場合、特異的にハイブリダイズ可能であるおよび相補的は、安定かつ特異的な結合が本発明の化合物と標的RNA分子の間に起こるような、十分な程度の相補性を示すために使用される用語である。特異的結合は、特異的結合が望ましい条件下で、すなわち、インビボアッセイもしくは治療的処置の場合においては生理学的条件下で、またはインビトロアッセイの場合においてはそのアッセイが実行される条件下で、オリゴマー化合物の非標的配列への非特異的結合を回避するために十分な程度の相補性を必要とする。非標的配列は、一般的には、少なくとも5ヌクレオチド異なる。1つの実施形態において、iRNA剤は、iRNA剤が標的mRNAによってコードされるタンパク質の産生をサイレンシングするように、標的RNA例えば、標的SNCAのmRNAに十分に相補的である。別の実施形態において、iRNA剤は、標的RNAに対して厳密に相補的でありRRMS含有サブユニットを除外する、例えば、標的RNAおよびiRNA剤は、好ましくは、厳密に相補的な領域におけるワトソン-クリック塩基対から独占的に構成されるハイブリッドを形成するようにアニールする。十分に相補的な標的RNAは、標的RNAに厳密に相補的である内部領域例えば、少なくとも10ヌクレオチドの領域を含み得る。さらに、ある実施形態において、iRNA剤は、単一ヌクレオチドの違いを特異的に区別する。この場合において、iRNA剤は、厳密な相補性が単一ヌクレオチドの違いの領域例えば、7ヌクレオチド以内の領域において見出される場合のみにRNAiを仲介する。本明細書中で使用される場合、用語オリゴヌクレオチドは、核酸分子RNAまたはDNA、好ましくは、100、200、300、または400未満の長さのヌクレオチドをいう。本明細書中で議論されるRNA剤は、その他の点では未修飾のRNA、ならびに、例えば、効力を改善するために修飾されたRNA、およびヌクレオシド代用物のポリマーを含む。未修飾のRNAとは、核酸の成分、すなわち、糖、塩基、およびリン酸の部分が、天然に存在する、好ましくは人体において天然に存在するのと同じかまたは実質的に同じである分子をいう。当該分野では、修飾RNAのような、まれなまたは一般的でないが天然に存在するRNAについて言及されており、例えば、リンバックらLimbachetal.、1994、NucleicAcidsRes.22:2183~2196を参照されたい。しばしば修飾RNAと呼ばれる明らかに一般的には転写後修飾の結果によるからである、このようなまれなまたは一般的でないRNAは、本明細書中で使用される場合には用語非修飾RNAの範囲内にある。修飾RNAは、本明細書中で使用される場合、1つ以上の核酸の成分、すなわち、糖、塩基、およびリン酸の部分が、天然に存在するものと異なる、好ましくは人体において存在するものと異なる分子をいう。これらは修飾RNAと呼ばれるが、当然、修飾されているのでRNAではない分子を含むことになる。ヌクレオシド代用物は、リボリン酸バックボーンが、塩基が正しい空間的関連において提示されることを可能にする非リボリン酸構築物で置き換えられている分子であり、その結果、ハイブリダイゼーションは、リボリン酸バックボーンの場合に見られるのと実質的に同様である例えば、リボリン酸バックボーンの非荷電模倣物。上記のすべての例が本明細書中で議論される。以下の議論の多くが一本鎖分子に言及する。本発明の多くの実施形態において、二本鎖iRNA剤例えば、部分的に二本鎖のiRNA剤が必要とされるかまたは好ましい。したがって、以下に記載される一本鎖構造から作られる二本鎖構造例えば、2つの別々の分子が接触して二本鎖領域を形成する場合、または二本鎖領域が分子内対合例えば、ヘアピン構造によって形成される場合は本発明の範囲内に含まれることが理解される。好ましい長さは本明細書中の他の箇所に記載される。核酸は、サブユニットまたはモノマーのポリマーであるので、以下に記載される修飾の多くが核酸内で反復される位置に存在する例えば、塩基、またはリン酸部分、またはリン酸部分の非結合Oの修飾。ある場合において、修飾は、核酸中の対象の位置のすべてに存在するが、しかし、多くの場合および実際上大部分においてはそうではない。例として、修飾は、3’または5’末端にのみ存在する可能性があり、末端領域例えば、末端ヌクレオチドの位置または鎖の最後の2、3、4、5、もしくは10ヌクレオチドにのみ存在する可能性がある。修飾は、二本鎖領域、一本鎖領域、または両方において存在する可能性がある。修飾は、RNAの二本鎖領域中にのみ存在する可能性もあるし、またはRNAの一本鎖領域にのみ存在する可能性もある。例えば、非結合O位置のホスホロチオエート修飾が、一方の末端にのみもしくは両方の末端に存在してもよいし、末端領域例えば、末端ヌクレオチド上の位置に、または鎖の最後の2、3、4、5、もしくは10ヌクレオチドにのみ存在してもよいし、または二本鎖および一本鎖の領域、特に末端に存在することも可能である。5’末端一方または両方がリン酸化されることも可能である。ある実施形態において、一本鎖突出部例えば、5’もしくは3’突出部、もしくはその両方において、例えば、安定性を増強すること、突出部に特定の塩基を含ませること、または修飾ヌクレオチドもしくはヌクレオチド代用物を含めることが特に好ましい。例えば、突出部にプリンヌクレオチドを含めることが望ましいことがあり得る。ある実施形態において、3’または5’の突出部における塩基のすべてまたはいくつかの塩基が、例えば、本明細書中に記載される修飾を用いて修飾される。修飾は、例えば、リボース糖の2’OH基での修飾の使用、例えば、リボヌクレオチドの代わりとしてのデオキシリボヌクレオチド例えば、デオキシチミジンの使用、およびリン酸基中での修飾例えば、ホスホチオエート修飾が含まれうる。突出部は、標的配列と相同である必要はない。修飾およびヌクレオチド代用物は以下に議論される。式1において上記に提示されるバックボーンはリボ核酸の部分を表す。基本成分はリボース糖、塩基、末端リン酸、およびヌクレオチド間リン酸リンカーである。塩基は天然に存在する塩基例えば、アデニン、ウラシル、グアニン、またはシトシンであり、糖は非修飾2’ヒドロキシルリボース糖示されているとおり、およびW、X、およびZはすべてOであり、式1は天然に存在する非修飾オリゴリボヌクレオチドを表す。非修飾オリゴリボヌクレオチドは、ある適用においては最適には満たない可能性があり、例えば、非修飾オリゴリボヌクレオチドは、例えば、細胞ヌクレアーゼによる分解を受ける傾向があり得る。ヌクレアーゼは核酸のホスホジエステル結合を加水分解することが可能である。しかし、上記のRNA成分の1つ以上への化学修飾は改善された特性を付与することが可能であり、例えば、オリゴリボヌクレオチドをヌクレアーゼに対してより安定性にすることが可能である。未修飾のオリゴリボヌクレオチドはまた、iRNA剤にリガンドまたは他の部分を結合するためのつなぎ止め部分を提供するという観点で最適に満たない可能性がある。修飾核酸およびヌクレオチド代用物は、以下の1つ以上を含むことが可能である:i変化、例えば、非結合リン酸酸素XおよびYの一方もしくは両方の置換、および/または結合リン酸酸素WおよびZの1つ以上の置換リン酸が末端位置にある場合、位置WまたはZの1つは、天然に存在するリボ核酸中ではさらなるエレメントにリン酸を結合しない。しかし、用語の単純化のために、他に注記される場合以外は、核酸の5’末端のW位置および核酸の3’末端のZ位置は、本明細書中で使用される用語結合リン酸酸素の範囲内にある;ii変化、例えば、リボース糖の構成成分例えば、リボース糖上の2’ヒドロキシルの置換、またはリボース糖の、リボース以外の構造例えば、本明細書中に記載されるようなものによる大規模置換;iiiリン酸部分括弧Iの、リンを含まないdephosphoリンカーによる大規模置換;iv天然に存在する塩基の修飾または置換;vリボース-リン酸バックボーン括弧IIの置換または修飾;viRNAの3’末端または5’末端の修飾、例えば、末端リン酸基の除去、修飾、もしくは置換、または構成部分の結合例えば、RNAの3’末端または5’末端のいずれかへの蛍光標識部分の結合。用語置換、修飾、変化などは、この文脈で使用される場合、任意の工程の限定を意味するものではなく、例えば、修飾とは、標準のまたは天然に存在するリボ核酸を用いて開始しかつそれを修飾して修飾リボ核酸を産生しなくてはならないことを意味するものではなく、修飾されたとは、単に天然に存在する分子との違いを意味する。当然のことであるが、ある化学的実体の実際の電子的構造を、たった1つの標準的な型すなわち、ルイス構造によって十分に表すことは可能ではない。理論によって束縛されることを望まないが、実際の構造は、その代わりに、共鳴型または共鳴構造として集合的に知られる、2つ以上の標準的な型のある混合物または加重平均であり得る。共鳴構造は、個別の化学的実体ではなく、紙の上でのみ存在する。これらは、特定の化学的実体についての結合電子および非結合電子の配置または局在においてのみ、互いに異なる。1つの共鳴構造が他よりもより高い程度でハイブリッドに寄与することが可能であり得る。したがって、本発明の実施形態について記載かつ図示される説明は、特定の種類の実体についての主要な共鳴型として当該分野で認識されているものに関してなされる。例えば、任意のホスホロアミデート非結合酸素の窒素による置換が、上記の図においてはX=OおよびY=Nによって表される。リン酸基の置換リン酸基は、リン酸以外のものを含む接続部によって置換されることが可能である上記の式1中の括弧Iを参照のこと。理論によって束縛されることを望まないが、荷電したホスホジエステル基はヌクレアーゼ分解における反応中心なので、この基を中性の構造模倣物で置換することは、ヌクレアーゼ安定性の増強を付与するはずであると考えられている。この場合も理論によって束縛されることを望まないが、ある態様において、荷電したリン酸基が中性部分によって置換される変化を導入することが望ましい可能性がある。リン酸基を置換することが可能である部分の例には以下が含まれる:シロキサン、カーボネート、カルボキシメチル、カルバメート、アミド、チオエーテル、エチレンオキサイドリンカー、スルホネート、スルホンアミド、チオホルムアセタール、ホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、およびメチレンオキシメチルイミノ。好ましい置換には、メチレンカルボニルアミノ基およびメチレンメチルイミノ基が含まれる。候補修飾は以下のように評価されることが可能である。リボリン酸バックボーンの置換リン酸リンカーおよびリボース糖が、ヌクレアーゼ耐性のヌクレオシドまたはヌクレオチドの代用物によって置換されるオリゴヌクレオチド模倣バックボーンを構築することも可能である上記の式1の括弧IIを参照のこと。理論によって束縛されることを望まないが、反復して荷電したバックボーンが存在しなければ、ポリアニオンを認識するタンパク質例えば、ヌクレアーゼへの結合が減少すると考えられている。再度、理論によって束縛されることを望まないが、ある態様において、塩基が中性の代用バックボーンによって連結される変化を導入することが望ましい可能性がある。例には、モルホリノ、シクロブチル、ピロリジン、およびペプチド核酸PNAなどのヌクレオシド代用物が含まれる。好ましい代用物はPNA代用物である。候補修飾は以下に記載されるように評価されることが可能である。末端修飾オリゴヌクレオチドの3’末端および5’末端が修飾されることが可能である。このような修飾は、分子の3’末端、5’末端、または両方の末端においてなされ得る。該修飾は、末端のリン酸全体または末端リン酸基の1つ以上の原子の修飾または置換を含むことが可能である。例えば、オリゴヌクレオチドの3’末端および5’末端が、他の機能的分子実体、例えば標識部分例えば、ピレン、TAMRA、フルオレセイン、Cy3色素もしくはCy5色素などの蛍光団または保護基例えば、硫黄、ケイ素、ホウ素、もしくはエステルを含む基などに複合体化することが可能である。前記機能的分子実体は、リン酸基および/またはスペーサーを介して糖に結合することが可能である。スペーサーの末端原子は、リン酸基の結合原子または糖のC-3’もしくはC-5’のO、N、S、もしくはC基を接続または置換することが可能である。代替的には、スペーサーは、ヌクレオチド代用物例えば、PNAの末端原子を接続または置換することが可能である。これらのスペーサーまたはリンカーは、例えば、-CH2n-、-CH2nN-、-CH2nO-、-CH2nS-、OCH2CH2OnCH2CH2OH例えば、n=3または6、無塩基糖、アミド、カルボキシ、アミン、オキシアミン、オキシイミン、チオエーテル、ジスルフィド、チオ尿素、スルホンアミド、またはモルホリノなど、またはビオチン試薬およびフルオレセイン試薬を含み得る。スペーサー/リン酸‐機能的分子実体-スペーサーリン酸という配列構造が、iRNA剤の2つの鎖の間に介在するとき、この配列構造は、ヘアピン型RNA剤中のヘアピンRNAループの代わりに機能することが可能である。3’末端は-OH基であり得る。理論に束縛されることを望まないが、特定の部分の複合体化は、輸送、ハイブリダイゼーションおよび特異性についての特性を改善することが可能であると考えられている。再度、理論に束縛されることを望まないが、ヌクレアーゼ耐性を改善する末端の変化を導入することが望ましい可能性がある。末端修飾の他の例には、色素、インターカレート剤例えば、アクリジン、架橋剤例えば、ソラレン、マイトマイシンC、ポルフィリンTPPC4、テキサフィリン、サッフィリン、多環式芳香族炭化水素例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン、人工エンドヌクレアーゼ例えば、EDTA、親油性担体例えば、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-Oヘキサデシルグリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-オレオイルリトコール酸、O3-オレオイルコール酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジンおよびペプチド複合体例えば、アンテナペディアペプチド、Tatペプチド、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、PEG例えば、PEG-40K、MPEG、[MPEG]2、ポリアミノ、アルキル、置換アルキル、放射線標識マーカー、酵素、ハプテン例えば、ビオチン、輸送/吸収促進剤例えば、アスピリン、ビタミンE、葉酸、合成リボヌクレアーゼ例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン-イミダゾール複合体、テトラアザマクロ環のEu3複合体が含まれる。末端修飾は、本明細書中の他の箇所で議論される理由を含む多くの理由のために、活性を調節するために、または分解に対する耐性を調節するために、加えられることが可能である。活性を調節するために有用である末端修飾には、リン酸またはリン酸アナログによる5’末端の修飾が含まれる。例えば、好ましい態様において、iRNA剤、とりわけアンチセンス鎖は、5’リン酸化されてもよいし、または5’プライム末端にリン酸基アナログを含んでもよい。5’リン酸修飾には、RISC介在性の遺伝子サイレンシングと適合可能であるものが含まれる。適切な修飾には以下が含まれる:5’一リン酸HO2OP-O-5’;5’二リン酸HO2OP-O-PHOO-O-5’;5’三リン酸HO2OP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’-グアノシンキャップ7-メチル化または非メチル化7m-G-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’-アデノシンキャップAppp、および任意の修飾または非修飾ヌクレオチドキャップ構造N-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’一チオリン酸ホスホロチオエート;HO2SP-O-5’;5’一ジチオリン酸ホスホロジチオエート;HOHSSP-O-5’、5’-ホスホロチオール酸HO2OP-S-5’;酸素/硫黄置換一リン酸、二リン酸、および三リン酸の任意のさらなる組合せ例えば、5’-α-チオ三リン酸、5’-γ-チオ三リン酸など、5’-ホスホルアミデートHO2OP-NH-5’、HONH2OP-O-5’、5’-アルキルホスホン酸R=アルキル=メチル、エチル、イソプロピル、プロピルなど、例えば、RPOHO-O-5’、OH2OP-5’-CH2、5’-アルキルエーテルホスホン酸R=アルキルエーテル=メトキシメチルMeOCH2、エトキシメチルなど、例えば、RPOHO-O-5’。末端修飾はまた、分布をモニターするためにも有用でありうるが、このような場合において、付加される好ましい基には、蛍光団例えば、フルオレセインまたはAlexa色素例えば、Alexa488が含まれる。末端修飾はまた、取り込みを増強するために有用でありうるが、このために有用な修飾にはコレステロールが含まれる。末端修飾はまた、RNA剤を別の部分に架橋するために有用でありうるが、このための有用な修飾にはマイトマイシンCが含まれる。iRNA剤の評価iRNA剤候補例えば、修飾されたiRNA剤を評価することが可能である。一般的な手法について以下に説明するが、SNCAのiRNA剤により特異的な方法については本明細書中の他所において議論する。一般に、そのRNA剤または修飾分子および対照分子を適切な条件に曝露すること、ならびに選択された特性の存在について評価することによって、選択された特性を試験することが可能である。例えば、分解剤に対する耐性は以下のようにして評価されることが可能である。候補修飾RNAおよび好ましくは対照分子、通常は非修飾型は、分解的な条件、例えば、分解剤例えば、ヌクレアーゼを含む環境に曝露されることが可能である。例えば、生物学的試料を使用することが可能であり、該試料は、例えば、治療的使用、例えば、血液または細胞画分例えば、無細胞ホモジネートまたは破砕された細胞において遭遇しうる環境と類似の生物学的試料である。次いで、候補および対照を、多数のアプローチのいずれかによって、分解に対する耐性について評価することが可能である。例えば、候補および対照を、例えば、放射性標識もしくは酵素標識または蛍光標識例えば、Cy3もしくはCy5などを用いて、好ましくは、曝露の前に標識することが可能である。対照RNAおよび修飾されたRNAを、分解剤、および場合によっては対照例えば、不活化された例えば、熱不活化された分解剤とともにインキュベートすることが可能である。次いで、物理学的パラメータ例えば、修飾分子および対照分子のサイズを決定する。これらは、物理学的方法によって例えば、ポリアクリルアミドゲル電気泳動またはサイズ分画カラムによって、その分子がその元々の長さを維持していたかを評価するために決定してもよいし、または機能的に評価することも可能である。代替的には、ノーザンブロット分析を使用して、未標識の修飾分子の長さをアッセイすることが可能である。機能的アッセイもまた、候補剤を評価するために使用することが可能である。機能的アッセイは、修飾が、遺伝子発現をサイレンシングする分子の能力を変化させるか否かを決定するために、最初に、または初期の非機能的アッセイ例えば、分解に対する耐性についてのアッセイの後で適用することが可能である。例えば、細胞例えば、マウスまたはヒトの細胞などの哺乳動物細胞を、蛍光タンパク質例えば、GFPを発現するプラスミドおよびその蛍光タンパク質をコードする転写物に相同である候補RNA剤で同時トランスフェクトすることが可能である例えば、国際公開公報第00/44914号パンフレットを参照されたい。例えば、GFPmRNAに相同である修飾dsRNAは、トランスフェクションに候補dsRNAを含めなかった対照細胞例えば、RNA剤を加えられなかった対照、および/または非修飾RNAを加えられなかった対照と比較して、細胞の蛍光の減少についてモニターすることによって、GFP発現を阻害する能力についてアッセイすることが可能である。遺伝子発現に対する候補剤の効力は、修飾dsRNA剤および非修飾dsRNA剤の存在下での細胞の蛍光を比較することによって評価可能である。標的RNAレベルに対する修飾RNA剤の効果は、陰性対照と比較して、標的mRNAのレベルの減少についてアッセイするノーザンブロットによって、または標的タンパク質のレベルの減少についてアッセイするウエスタンブロット分析によって確認可能である。対照は、RNA剤が添加されない細胞、および/または非修飾RNAが添加される細胞を含むことが可能である。好ましいiRNA剤好ましいRNA剤は以下の構造を有する以下の式2を参照のこと:上記の式2を参照すると、R1、R2、およびR3は、各々独立して、Hすなわち、脱塩基ヌクレオチド、アデニン、グアニン、シトシン、およびウラシル、イノシン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、ヌバラリン、ツベルシジン、イソグアニシン、2-アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6-メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2-プロピルおよび他のアルキル誘導体、5-ハロウラシルおよび5-ハロシトシン、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、6-アゾウラシル、6-アゾシトシン、および6-アゾチミン、5-ウラシルプソイドウラシル、4-チオウラシル、5-ハロウラシル、5-2-アミノプロピルウラシル、5-アミノアリルウラシル、8-ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシル、および他の8-置換アデニンおよびグアニン、5-トリフルオロメチルおよび他の5-置換ウラシルおよびシトシン、7-メチルグアニン、5-置換ピリミジン、6-アザピリミジンおよびN-2,N-6、およびO-6置換プリン2-アミノプロピルアデニンを含む、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、ジヒドロウラシル、3-デアザ-5-アザシトシン、2-アミノプリン、5-アルキルウラシル、7-アルキルグアニン、5-アルキルシトシン、7-デアザアデニン、7-デアザグアニン、N6,N6-ジメチルアデニン、2,6-ジアミノプリン、5-アミノ-アリル-ウラシル、N3-メチルウラシル、置換1,2,4-トリアゾール、2-ピリジノン、5-ニトロインドール、3-ニトロピロール、5-メトキシウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸、5-メトキシカルボニルメチルウラシル、5-メチル-2-チオウラシル、5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウラシル、5-メチルアミノメチル-2-チオウラシル、3-3-アミノ-3-カルボキシプロピルウラシル、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、N4-アセチルシトシン、2-チオシトシン、N6-メチルアデニン、N6-イソペンチルアデニン、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、N-メチルグアニン、またはO-アルキル化塩基である。R4、R5、およびR6は、各々独立して、OR8、OCH2CH2OmCH2CH2OR8;OCH2nR9;OCH2nOR9、H;ハロ;NH2;NHR8;NR82;NHCH2CH2NHmCH2CH2NHR9;NHCOR8;シアノ;メルカプト;SR8;アルキル-チオ-アルキル;アルキル、アラルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アルケニル、アルキニルこれらの各々は、場合により、ハロ、ヒドロキシ、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリル、アリール、アラルキル、アルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテロシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、ジヘテロアリールアミノ、アシルアミノ、アルキルカルバモイル、アリールカルバモイル、アミノアルキル、アルコキシカルボニル、カルボキシ、ヒドロキシアルキル、アルカンスルホニル、アルカンスルホンアミド、アレンスルホンアミド、アラルキルスルホンアミド、アルキルカルボニル、アシルオキシ、シアノ、またはウレイドで置換されてもよいであるか;または、R4、R5、およびR6は、R7と一緒に組み合わさって、糖の2’位および4’位の炭素の間の[-O-CH2-]共有結合架橋を形成する。A1は;H;OH;OCH3;W1;脱塩基ヌクレオチドであるか;または存在せず、好ましいA1は、とりわけアンチセンス鎖に関して、以下の:5’一リン酸HO2OP-O-5’;5’二リン酸HO2OP-O-PHOO-O-5’;5’三リン酸HO2OP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’-グアノシンキャップ7-メチル化または非メチル化7m-G-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’-アデノシンキャップAppp、および任意の修飾または非修飾ヌクレオチドキャップ構造N-O-5’-HOOP-O-HOOP-O-PHOO-O-5’;5’一チオリン酸ホスホロチオエート;HO2SP-O-5’、5’一ジチオリン酸ホスホロジチオエート;HOHSSP-O-5’、5’-ホスホロチオール酸HO2OP-S-5’;酸素/硫黄置換一リン酸、二リン酸、および三リン酸の任意のさらなる組合せ例えば、5’-α-チオ三リン酸、5’-γ-チオ三リン酸など、5’-ホスホルアミデートHO2OP-NH-5’、HONH2OP-O-5’、5’-アルキルホスホン酸R=アルキル=メチル、エチル、イソプロピル、プロピルなど、例えば、RPOHO-O-5’-、OH2OP-5’-CH2、5’-アルキルエーテルホスホン酸R=アルキルエーテル=メトキシメチルMeOCH2-、エトキシメチルなど、例えば、RPOHO-O-5’-から選択される。A2はであり、A3はであり;かつA4は;H;Z4;逆向きのヌクレオチド;脱塩基ヌクレオチドであるか;または存在しない。W1は、OH、CH2nR10、CH2nNHR10、CH2nOR10、CH2nSR10、OCH2nR10、OCH2nOR10、OCH2nNR10、OCH2nSR10、OCH2nSSCH2nOR10、OCH2nCOOR10、NHCH2nR10;NHCH2nNR10;NHCH2nOR10、NHCH2nSR10;SCH2nR10、SCH2nNR10、SCH2nOR10、SCH2nSR10OCH2CH2OmCH2CH2OR10;OCH2CH2OmCH2CH2NHR10;NHCH2CH2NHmCH2CH2NHR10;Q-R10、O-Q-R10、N-Q-R10、S-Q-R10、または-O-である。W4は、O、CH2、NH、またはSである。X1、X2、X3、およびX4は、各々独立して、OまたはSである。Y1、Y2、Y3、およびY4は、各々独立して、OH、O-、OR8、S、Se、BH3-、H、NHR9、NR92、アルキル、シクロアルキル、アラルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、これらの各々が場合によっては置換されてもよい。Z1、Z2、およびZ3は、各々独立して、O、CH2、NH、またはSである。Z4は、OH、CH2nR10、CH2nNHR10、CH2nOR10、CH2nSR10、OCH2nR10、OCH2nOR10、OCH2nNR10、OCH2nSR10、OCH2nSSCH2nOR10、OCH2nCOOR10、NHCH2nR10;NHCH2nNR10;NHCH2nOR10、NHCH2nSR10;SCH2nR10、SCH2nNR10、SCH2nOR10、SCH2nSR10OCH2CH2OmCH2CH2OR10;OCH2CH2OmCH2CH2NHR10;NHCH2CH2NHmCH2CH2NHR10;Q-R10、O-Q-R10、N-Q-R10、S-Q-R10である。xは、本明細書中に記載されるRNA剤の長さを満足するように選択され、5~100である。R7はHであるか、またはR4、R5、またはR6と一緒に組み合わさって糖の2’位および4’位の炭素の間に[-O-CH2-]共有結合架橋を形成する。R8は、アルキル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アミノ酸、または糖であり;R9は、NH2、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテロシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、ジヘテロアリールアミノ、またはアミノ酸であり;およびR10はH;蛍光団例えば、ピレン、TAMRA、フルオレセイン、Cy3色素もしくはCy5色素;硫黄、ケイ素、ホウ素、もしくはエステルの保護基;インターカレート剤例えば、アクリジン、架橋剤例えば、ソラレン、マイトマイシンC、ポルフィリンTPPC4、テキサフィリン、サッフィリン、多環式芳香族炭化水素例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン、人工エンドヌクレアーゼ例えば、EDTA、親油性担体コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-Oヘキサデシルグリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-オレオイルリトコール酸、O3-オレオイルコール酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジンおよびペプチド複合体例えば、アンテナペディアペプチド、Tatペプチド、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、PEG例えば、PEG-40K、MPEG、[MPEG]2、ポリアミノ;アルキル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール;放射線標識マーカー、酵素、ハプテン例えば、ビオチン、輸送/吸収促進剤例えば、アスピリン、ビタミンE、葉酸、合成リボヌクレアーゼ例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン-イミダゾール複合体、テトラアザマクロ環のEu3複合体;またはRNA剤である。mは0~1,000,000であり、かつnは0~20である。Qは、脱塩基性の糖abasicsugar、アミド、カルボキシ、オキシアミン、オキシイミン、チオエーテル、ジスルフィド、チオ尿素、スルホンアミドもしくはモルホリノ、ビオチン、またはフルオレセイン試薬からなる群より選択されるスペーサーである。リン酸基全体が置換されている好ましいRNA剤は以下の構造を有する以下の式3を参照のこと:式3を参照すると、A10-A40はL-G-Lであり;A10およびA40のうち少なくともいずれかは存在しなくてもよい。ここでLはリンカーであり、一方または両方のLは存在していても存在していなくてもよく、かつCH2CH2g;NCH2g;OCH2g;SCH2gからなる群より選択される。Gは、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチル、カルバメート、アミド、チオエーテル、エチレンオキサイドリンカー、スルホネート、スルホンアミド、チオホルムアセタール、ホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、およびメチレンオキシメチルイミノからなる群より選択される官能基である。R10、R20、およびR30は、各々独立して、Hすなわち、脱塩基ヌクレオチド、アデニン、グアニン、シトシン、およびウラシル、イノシン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、ヌバラリン、ツベルシジン、イソグアニシン、2-アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6-メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2-プロピルおよび他のアルキル誘導体、5-ハロウラシルおよび5-ハロシトシン、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、6-アゾウラシル、6-アゾシトシン、および6-アゾチミン、5-ウラシルプソイドウラシル、4-チオウラシル、5-ハロウラシル、5-2-アミノプロピルウラシル、5-アミノアリルウラシル、8-ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシル、および他の8-置換アデニンおよびグアニン、5-トリフルオロメチルおよび他の5-置換ウラシルおよびシトシン、7-メチルグアニン、5-置換ピリミジン、6-アザピリミジン、およびN-2,N-6、およびO-6置換プリン2-アミノプロピルアデニンを含む、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、ジヒドロウラシル、3-デアザ-5-アザシトシン、2-アミノプリン、5-アルキルウラシル、7-アルキルグアニン、5-アルキルシトシン、7-デアザアデニン、7-デアザグアニン、N6,N6-ジメチルアデニン、2,6-ジアミノプリン、5-アミノ-アリル-ウラシル、N3-メチルウラシル置換1,2,4-トリアゾール、2-ピリジノン、5-ニトロインドール、3-ニトロピロール、5-メトキシウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸、5-メトキシカルボニルメチルウラシル、5-メチル-2-チオウラシル、5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウラシル、5-メチルアミノメチル-2-チオウラシル、3-3-アミノ-3-カルボキシプロピルウラシル、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、N4-アセチルシトシン、2-チオシトシン、N6-メチルアデニン、N6-イソペンチルアデニン、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、N-メチルグアニン、またはO-アルキル化塩基である。R40、R50、およびR60は、各々独立して、OR8、OCH2CH2OmCH2CH2OR8;OCH2nR9;OCH2nOR9、H;ハロ;NH2;NHR8;NR82;NHCH2CH2NHmCH2CH2R9;NHCOR8;;シアノ;メルカプト;SR7;アルキル-チオ-アルキル;アルキル、アラルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アルケニル、アルキニルこれらの各々は、場合により、ハロ、ヒドロキシ、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリル、アリール、アラルキル、アルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテロシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、ジヘテロアリールアミノ、アシルアミノ、アルキルカルバモイル、アリールカルバモイル、アミノアルキル、アルコキシカルボニル、カルボキシ、ヒドロキシアルキル、アルカンスルホニル、アルカンスルホンアミド、アレンスルホンアミド、アラルキルスルホンアミド、アルキルカルボニル、アシルオキシ、シアノ、またはウレイド基で置換されてもよいであり;または、R40、R50、およびR60は、R70と一緒に組み合わさって、糖の2’位および4’位の炭素の間の[-O-CH2-]共有結合架橋を形成する。xは、本明細書中に記載されるRNA剤の長さを満足するように選択され、5~100である。R70はHであるか、またはR40、R50、またはR60と一緒に組み合わさって、糖の2’位および4’位の炭素の間の[-O-CH2-]共有結合架橋を形成する。R8は、アルキル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アミノ酸、または糖であり;R9は、NH2、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテロシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、ジヘテロアリールアミノ、またはアミノ酸である、mは0~1,000,000であり、nは0~20であり、かつgは0~2である。好ましいヌクレオシド代用物は以下の構造を有する以下の式4を参照のこと:Sは、モルホリノ、シクロブチル、ピロリジン、およびペプチド核酸からなる群より選択される。Lはリンカーであり、かつCH2CH2g;NCH2g;OCH2g;SCH2g;-COCH2n-からなる群より選択されるか、または存在していなくてもよい。Mは、アミド結合;スルホンアミド;スルフィン酸;リン酸基;本明細書中に記載されるような修飾リン酸基であるか;または存在していなくてもよい。R100、R200、およびR300は、各々独立して、Hすなわち、脱塩基ヌクレオチド、アデニン、グアニン、シトシン、およびウラシル、イノシン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、ヌバラリン、ツベルシジン、イソグアニシン、2-アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6-メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2-プロピルおよび他のアルキル誘導体、5-ハロウラシルおよび5-ハロシトシン、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、6-アゾウラシル、6-アゾシトシン、および6-アゾチミン、5-ウラシルプソイドウラシル、4-チオウラシル、5-ハロウラシル、5-2-アミノプロピルウラシル、5-アミノアリルウラシル、8-ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシル、および他の8-置換アデニンおよびグアニン、5-トリフルオロメチルおよび他の5-置換ウラシルおよびシトシン、7-メチルグアニン、5-置換ピリミジン、6-アザピリミジンおよびN-2,N-6、およびO-6置換プリン2-アミノプロピルアデニンを含む、5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン、ジヒドロウラシル、3-デアザ-5-アザシトシン、2-アミノプリン、5-アルキルウラシル、7-アルキルグアニン、5-アルキルシトシン、7-デアザアデニン、7-デアザグアニン、N6,N6-ジメチルアデニン、2,6-ジアミノプリン、5-アミノ-アリル-ウラシル、N3-メチルウラシル置換1,2,4-トリアゾール、2-ピリジノン、5-ニトロインドール、3-ニトロピロール、5-メトキシウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸、5-メトキシカルボニルメチルウラシル、5-メチル-2-チオウラシル、5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウラシル、5-メチルアミノメチル-2-チオウラシル、3-3-アミノ-3-カルボキシプロピルウラシル、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、N4-アセチルシトシン、2-チオシトシン、N6-メチルアデニン、N6-イソペンチルアデニン、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、N-メチルグアニン、またはO-アルキル化塩基である。xは、本明細書中に記載されるRNA剤の長さを満足するように選択され、5~100であり;gは0~2である。ヌクレアーゼ耐性モノマーRNA、例えばiRNA剤に、ヌクレアーゼ耐性モノマーNRMを組み入れることが可能である。例えば、本発明は、本明細書に記載のiRNA剤、例えばパリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書に記載の遺伝子、例えばSNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本明細書に記載の構成様式もしくは構造を有するiRNA剤、本明細書に記載の両親媒性送達剤と結合したiRNA剤、本明細書に記載の薬剤送達モジュールと結合したiRNA剤、本明細書に記載のように投与されるiRNA剤、または本明細書に記載のように製剤化されたiRNA剤であって、NRMも取り込むiRNA剤を含む。iRNA剤は、例えば、対象の体内に見られるヌクレアーゼ例えばエンドヌクレアーゼまたはエキソヌクレアーゼによる分解を阻害するように修飾されたモノマーを含みうる。これらのモノマーをここではNRM、またはヌクレアーゼ耐性促進モノマーもしくはヌクレアーゼ耐性促進修飾体と称する。多くの場合、これらの修飾は、iRNA剤の他の特性、例えばタンパク質例えば輸送タンパク質例えば血清アルブミンもしくはRISCRNA誘導サイレシング複合体の構成メンバーと相互作用する能力、または最初の配列と2番目の配列が相互に二本鎖を形成もしくは別の配列、例えば標的分子と二本鎖を形成する能力という特性も同様に調節する。理論に縛られることは望まないが、iRNA剤の糖、塩基および/またはリン酸バックボーンの修飾体は、エンドヌクレアーゼ耐性およびエキソヌクレアーゼ耐性を増強し、さらに輸送タンパク質およびRISC複合体の1つまたは複数の機能的要素との相互作用を亢進すると考えられる。好ましい修飾体は、エキソヌクレアーゼ耐性およびエンドヌクレアーゼ耐性を高め、したがって、RISC複合体と相互作用する前のiRNA剤の半減期を延長するが、同時に、RISC複合体におけるエンドヌクレアーゼの活性に対してはiRNA剤を耐性にしない修飾体である。繰り返すが、いかなる理論にも縛られることは望まないが、上記修飾をアンチセンス鎖の3’末端および/もしくは5’末端またはこれらの近くに配置することにより、上記に描写される好ましいヌクレアーゼ耐性の基準を満たすiRNA剤が生じると考えられる。やはり繰り返すが、いかなる理論にも縛られることは望まないが、修飾を、例えばセンス鎖の中央に配置することにより、オフターゲットの可能性が比較的低いiRNA剤が作製可能と考えられる。本明細書に記載の修飾を、例えばiRNA剤などの、本明細書に記載の任意の二本鎖RNAおよびRNA様分子へ組み込むことが可能である。iRNA剤はハイブリッド形成したセンス鎖およびアンチセンス鎖からなる二本鎖を含むことができ、この場合アンチセンス鎖および/またはセンス鎖は、本明細書に記載される1つまたは複数の修飾を含むことが可能である。アンチセンス鎖は、3’末端および/もしくは5’末端、ならびに/または鎖のいずれかの末端から1~6ヌクレオチド、例えば1~5、1~4、1~3、1~2ヌクレオチドにある1つもしくは複数の位置に修飾を含むことが可能である。センス鎖は、3’末端および/もしくは5’末端、ならびに/または鎖の両末端の間にある介入位置のいずれか1つに修飾を含むことが可能である。また、iRNA剤は、ハイブリッド形成した2つのアンチセンス鎖からなる二本鎖を含むことが可能である。第1および/または第2のアンチセンス鎖は、本明細書に記載の1つまたは複数の修飾を含むことが可能である。したがって、1つおよび/または両方のアンチセンス鎖は、3’末端および/もしくは5’末端、ならびに/または鎖のいずれかの末端から1~6ヌクレオチド、例えば1~5、1~4、1~3、1~2ヌクレオチドにある1つもしくは複数の位置に修飾を含むことが可能である。以降に特定の構造について述べる。上記により描写される好ましいヌクレアーゼ耐性の基準を満たすiRNA剤を作製するために有用と考えられる修飾は、以下に記すような、糖、塩基および/またはリン酸バックボーンについての1つまたは複数の化学的および/または立体化学的修飾を含むことが可能である:iキラルSpチオエート。したがって、好ましいNRMは、通常は酸素によって占められる非架橋位置、例えば位置XのSpまたはRpにヘテロ原子を含む特定のキラル型の修飾リン酸基について富化された、または前記修飾リン酸基について純粋なヌクレオチド二量体を含む。また、Xの原子にはS、Se、Nr2またはBr3が考えられる。XがSならば、富化された、またはキラル型について純粋なSpとの結合が好ましい。富化とは好ましい型が少なくとも70、80、90、95または99であることを意味する。そのようなNRMについては以下により詳細に記載する;ii糖、塩基および/またはリン酸バックボーン部分もしくは修飾リン酸バックボーン部分のリン原子への1つまたは複数のカチオン基の結合。したがって、好ましいNRMは、末端にカチオン基で誘導体化されたモノマーを含む。アンチセンス配列の5’末端は、末端-OHまたはリン酸基を有する必要があるので、前記のNRMは、アンチセンス配列の5’末端では使用されないことが好ましい。このカチオン基は、水素結合形成およびハイブリッド形成との干渉を最少化する塩基上の位置、例えばもう一方の鎖の相補的塩基と相互作用する面から離れた位置例えばピリミジンの5’位またはプリンの7位で結合しなければならない。これらについては以下により詳細に述べる;iii末端での非リン酸結合。したがって、好ましいNRMは、例えば切断に対する耐性がリン酸結合よりも大きくなる4原子の結合などの、非リン酸結合を含む。例として、3’CH2-NCH3-O-CH2-5’および3’CH2-NH-O=-CH2-5’が挙げられる。iv3’架橋チオリン酸塩および5’架橋チオリン酸塩。したがって、好ましいNRMは前記の構造を含むことが可能である。vL-RNA、2’-5’結合、逆向きの結合、α-ヌクレオシド。したがって、他の好ましいNRMに含まれるものは、LヌクレオシドおよびL-ヌクレオシド由来のヌクレオチド二量体;2’-5’リン酸塩、非リン酸塩および修飾リン酸塩の結合、例えばチオリン酸塩、ホスホルアミデートおよびホウ素化リン酸塩;逆向きの結合、例えば3’-3’または5’-5’結合を有する二量体;糖の1’位にα結合を有するモノマー、例えば本明細書に記載のα結合を有する構造が挙げられる;vi結合基。したがって、好ましいNRMは、例えば標的結合部分、または、例えば糖、塩基もしくはバックボーンを通してモノマーと結合する、本明細書に記載の結合リガンドを含むことが可能である。vi脱塩基結合。したがって、好ましいNRMは、例えば本明細書に記載されるような脱塩基モノマー例えば核酸塩基のないモノマー、本明細書に記載されるような芳香族モノマーもしくは複素環式モノマー、または多複素環式芳香族モノマーを含むことが可能である;vii5’-ホスホネートおよび5’-ホスフェート型プロドラッグ。したがって、好ましいNRMは、好ましくは末端部位例えば5’位に、リン酸基の1つまたは複数の原子が保護基により誘導体化されているモノマーを含み、この1つまたは複数の保護基は、対象の体内成分、例えばカルボキシエステラーゼまたは対象の体内に存在する酵素の作用により除去される。例えば、カルボキシエステラーゼが保護分子を切断する結果チオエートアニオンが生じ、チオエートアニオンがリン酸塩のOに隣接する炭素を攻撃する結果として保護されていないリン酸塩が生じるリン酸プロドラッグ。1つまたは複数の異なるNRM修飾をiRNA剤またはiRNA剤の配列中に導入することが可能である。NRM修飾は、配列またはiRNA剤に2回以上使用することが可能である。一部のNRMはハイブリッド形成を妨げるので、取り込む総数は、許容可能なレベルのiRNA剤の二本鎖形成が維持されるものでなければならない。一部の実施形態において、NRM修飾は、対象の所望の配列または遺伝子を標的としない配列センス鎖またはセンス配列の末端切断部位または切断領域へ導入される。このことによりオフターゲットによるサイレンシングを低減しうる。キラルSpチオエート修飾は、1つもしくは両方の非結合XおよびYリン酸酸素および/または1つもしくは複数の結合WおよびZリン酸酸素の変更例えば置換を含みうる。下記の式Xは2つの糖/糖代用物‐塩基部分SB1およびSB2が結合しているリン酸塩部分を表す。特定の実施形態において、リン酸バックボーン部分の非結合リン酸酸素XおよびYの1つは次のいずれか1つ:S、Se、BR3Rは水素、アルキル、アリールなど、Cすなわち、アルキル基、アリール基など、H、NR2Rは水素、アルキル、アリールなど、またはORRはアルキルまたはアリールと置換可能である。非修飾リン酸基のリン原子はアキラルである。しかし、非結合酸素の1つを上記の原子または原子群の1つと置換することにより、リン原子がキラル化される。いいかえれば、このように修飾されたリン酸基内のリン酸原子は立体中心である。立体中心のリン原子はR配置ここではRpまたはS配置ここではSpを有することが可能である。したがって、立体中心のリン原子の60がRp配置を有するとき、残る40の立体中心のリン原子はSp配置を有することになる。一部の実施形態において、リン酸非結合酸素が他の原子または原子群で置換されているリン酸基を有するiRNA剤は、立体中心の原子の少なくとも約50例えば立体中心の原子の少なくとも約60、同原子の少なくとも約70、同原子の少なくとも約80、同原子の少なくとも約90、同原子の少なくとも約95、同原子の少なくとも約98、同原子の少なくとも約99がSp配置を有する立体中心リン原子の集団を含むことが可能である。あるいは、リン酸非結合酸素が他の原子または原子群で置換されているリン酸基を有するiRNA剤は、立体中心の原子の少なくとも約50例えば立体中心の原子の少なくとも約60、同原子の少なくとも約70、同原子の少なくとも約80、同原子の少なくとも約90、同原子の少なくとも約95、同原子の少なくとも約98、同原子の少なくとも約99がRp配置を有する立体中心リン原子の集団を含むことが可能である。他の実施形態において、立体中心リン原子の集団がSp配置を有し、かつRp配置を有する立体中心リン原子を実質的に含まないことが可能である。さらに他の実施形態において、立体中心リン原子の集団がRp配置を有し、かつSp配置を有する立体中心リン原子を実質的に含まないことが可能である。本明細書では、Rp配置を有する立体中心リン原子を実質的に含まないという句は、Rp配置を有する立体中心リン原子を含む部分が当技術分野で公知の従来の方法キラルHPLC、キラルシフト試薬を使用した1HNMR分析などにより検出できないことを意味する。本明細書では、Sp配置を有する立体中心リン原子を実質的に含まないという句は、Sp配置を有する立体中心リン原子を含む部分が当技術分野で公知の従来の方法キラルHPLC、キラルシフト試薬を使用した1HNMR分析などにより検出できないことを意味する。好ましい実施形態において、修飾iRNA剤はホスホロチオエート基、すなわちリン酸の非結合酸素がイオウ原子と置換されているリン酸基を含む。特に好ましい実施形態において、ホスホロチオエートの立体中心リン原子の集団はSp配置を有し、かつRp配置を有する立体中心リン原子を実質的に含まないことが可能である。ホスホロチオエートを、二量体例えば式X-1および式X-2を使用してiRNA剤に組み込むことが可能である。前者は、鎖の3’末端にホスホロチオエートを導入するために使用することができ、後者は鎖の5’末端または例えばいずれかの末端から1、2、3、4、5または6つ目のヌクレオチドの位置に修飾を導入するために使用する。上記の式で、Yは2-シアノエトキシでよく、WおよびZはOでよく、R2’は、例えば糖にC-3末端構造を付与しうる置換基、例えばOH、F、OCH3でよく、DMTはジメトキシトリチルであり、塩基は天然の塩基でも、通常でない塩基でも、または普遍的な塩基でもよい。X-1およびX-2は、キラル試薬を使用して、または基本的にRp配置だけを有するすなわち、実質的にSp配置を含まないもしくはSp配置だけを有するすなわち、実質的にRp配置を含まない立体中心リン原子の集団を有するホスホロチオエート含有二量体を生じさせることが可能な配位性制御基を使用して調製可能である。あるいは、二量体が、約50がRp配置を有し、原子の約50がSp配置を有する立体中心リン原子の集団を有するように調整することが可能である。Rp配置の立体中心リン原子を有する二量体を特定し、例えば酵素的分解および/または通常のクロマトグラフィ法を使用してSp配置の立体中心リン構造を有する二量体から分離することが可能である。カチオン基また、修飾は、糖、塩基および/またはリン酸バックボーン部分もしくは修飾リン酸バックボーン部分のリン原子への1つまたは複数のカチオン基の結合を含むことも可能である。カチオン基は、天然の塩基、通常でない塩基または普遍的な塩基上で置換可能な任意の原子に結合可能である。好ましい位置は、ハイブリッド形成を妨げない、すなわち塩基対形成に必要な水素結合の相互作用を妨げない位置である。カチオン基は、例えば糖のC2’位、または環状もしくは非環状の糖代用物中の類似の位置を介して結合することが可能である。カチオン基は、例えばO-AMINEAMINE=NH2;アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテルシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノまたはジヘテロアリールアミノ、エチレンジアミン、ポリアミノ由来のプロトン化アミノ基、例えばOCH2nAMINE例えばAMINE=NH2;アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテルシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノまたはジヘテロアリールアミノ、エチレンジアミン、ポリアミノなどのアミノアルコキシ、アミノ例えばNH2;アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテルシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、ジヘテロアリールアミノまたはアミノ酸、またはNHCH2CH2NHnCH2CH2-AMINE例えばAMINE=NH2;アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ヘテルシクリル、アリールアミノ、ジアリールアミノ、ヘテロアリールアミノまたはジヘテロアリールアミノを含むことが可能である。非リン酸結合また、修飾は鎖の5’末端および3’末端のうち少なくともいずれかに非リン酸結合を組み込むことが可能である。リン酸基を置換することが可能な非リン酸結合の例には、メチルホスホン酸、ヒドロキシルアミノ、シロキサン、炭酸、カルボキシメチル、カルバミン酸、アミド、チオエーテル、エチレンオキシドリンカー、スルホン酸、スルホンアミド、チオホルムアセタール、ホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾおよびメチレンオキシメチルイミノを含む。好ましい置換体は、メチルホスホン酸基およびヒドロキシルアミノ基を含む。3’架橋チオリン酸および5’架橋チオリン酸塩;ロックトRNA、2’-5’結合、逆向きの結合、α-ヌクレオシド;結合基;脱塩基結合;ならびに5’ホスホン酸および5’リン酸プロドラッグ上記の式Xについて言及すると、修飾はリン酸バックボーン部分の架橋または結合リン酸酸素WおよびZのうちの1つの置換体を含むことが可能である。XまたはYのうち1つだけを変更する状況とは違い、ホスホロジチオエートのリン原子の中心はアキラルであり立体中心リン原子を含むiRNA剤の形成を妨げる。また、修飾は、1番目の糖の2’位と2番目の糖の5’位を経るリン酸基または修飾リン酸基を介して2つの糖を結合することを含むことが可能である。同様に考えられるのは、1番目の糖と2番目の糖がそれぞれの3’位を通してそれぞれ結合する逆向きの結合である。また、修飾RNAは、C-1’で核酸塩基を欠く脱塩基性の糖を含むことも可能である。糖基は、リボースにおける対応する炭素とは反対の立体化学的配置を有する炭素を1つまたは複数含むことも可能である。したがって、修飾iRNA剤は、糖として、例えばアラビノースを含むヌクレオチドを含むことが可能である。上記修飾のもう1つのサブセットでは、天然の塩基、通常でない塩基または普遍的な塩基はα-配置を有することが可能である。また、修飾体は、L-RNAを含むことが可能である。また、修飾は例えばPOO-2-X-C5’-糖X=CH2、CF2、CHFなどの5’-ホスホン酸および例えばPO[OCH2CH2SCOR]2CH2C5’-糖などの5’ホスホン酸プロドラッグを含むことが可能である。後者の場合、プロドラッグ基は、最初にカルボキシエステラーゼで始まる作用を介して分解される可能性がある。分子内SN2置換を介した残るエチルチオレート基は、エピスルフィドとして分離され、非誘導体化リン酸基を生じることが可能である。また、修飾は、本明細書の他の場所に記載した結合基を追加することも含むことが可能であり、結合基は結合可能な任意のアミノ基を介してiRNA剤へ結合されることが好ましい。ヌクレアーゼ耐性の修飾には、末端のみに配置することが可能な修飾といかなる位置でも配置可能な修飾とがある。通常、ハイブリッド形成を抑制することが可能な修飾は、末端領域でのみ使用することが好ましく、対象の配列または遺伝子を標的とする配列の切断部位または切断領域では使用しないことが好ましい。iRNA剤の2つの配列間で十分なハイブリッド形成が維持されるという条件であれば、センス配列のどの位置においても使用することが可能である。一部の実施形態では、オフターゲットのサイレンシングを最小化することが可能なため、対象の配列または遺伝子を標的としない配列の切断位置または切断領域にNRMを配することが望ましい。さらに、本明細書に記載のiRNA剤は、iRNA剤の他方の配列と二本鎖構造を形成しない突出部を有することが可能である。これは突出部ではあるが、それ自体と、またはiRNA剤のもう一方の配列以外の別の核酸と、ハイブリッド形成する。ほとんどの場合、ヌクレアーゼ耐性促進修飾は、その配列が対象の配列を標的にするか多くの場合、アンチセンス配列と呼ばれる、対象の配列を標的にしないか多くの場合、センス配列と呼ばれるにより配置が異なる。配列が対象の配列を標的にするならば、エンドヌクレアーゼによる切断を妨害または阻害する修飾は、RISCの仲介による切断を受ける領域、例えば切断部位または切断領域に挿入すべきではないエルバッシャーら[Elbashiretal.]、2001年、GenesandDev.15:188[参照により本願に援用]に記載されるとおりである。標的の切断は、およそ20もしくは21ntのガイドRNAのほぼ中央またはガイド配列に相補的な最初のヌクレオチドの10もしくは11ヌクレオチド上流で起きる。本明細書では、切断部位とは、標的上または標的とハイブリッド形成するiRNA剤の鎖上の、切断部位の両側のヌクレオチドを指す。切断領域は、切断部位のヌクレオチドとその両方向の1、2または3ヌクレオチドを意味する。そのような修飾は、対象の配列を標的とする配列または標的としない配列の末端領域、例えば末端、または末端の2、3、4もしくは5位の位置へ導入することが可能である。iRNA剤は以下から選択した第1鎖および第2鎖を有することが可能である。配列を標的とせず、かつ3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とせず、かつ5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とせず、かつ3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有し、さらに5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とせず、切断部位または切断領域にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とせず、切断部位または切断領域にNRM修飾を有し、かつ、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾と、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾と、あるいは3’末端および5’末端の両方から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾とのうち1つまたは複数を有する第1鎖と、配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖、配列を標的とし、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましい、配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有し、さらに5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖、配列を標的とし、好ましくは切断部位または切断領域にNRM修飾が存在しない第2鎖、配列を標的とし、切断部位または切断領域のNRM修飾、ならびに、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、あるいは3’末端および5’末端の両方から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾のうち1つまたは複数が存在しない第2鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましい。また、iRNA剤は2つの配列を標的とすることも可能であり、次から選択される第1鎖および第2鎖を有することが可能である。配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とし、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましい、配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有し、さらに5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第1鎖、配列を標的とし、好ましくは切断部位または切断領域にNRM修飾が存在しない第1鎖、配列を標的とし、切断部位または切断領域のNRM修飾、ならびに、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、あるいは3’末端および5’末端の両方から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾のうち1つまたは複数が存在しない第1鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましいと、配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖、配列を標的とし、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましい、配列を標的とし、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有し、さらに5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置にNRM修飾を有する第2鎖、配列を標的とし、好ましくは切断部位または切断領域にNRM修飾が存在しない第2鎖、配列を標的にし、切断部位または切断領域のNRM修飾、ならびに、3’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、5’末端から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾、あるいは3’末端および5’末端の両方から1、2、3、4、5もしくは6位の位置または1、2、3、4、5もしくは6位以内の位置のNRM修飾のうち1つまたは複数が存在しない第2鎖5’末端の修飾は、末端よりむしろアンチセンス鎖の5’末端から1、2、3、4、5または6位離れた位置が好ましい。リボース模倣体RNA、例えばiRNA剤に、リボース模倣体を組み込むことが可能である。さらに本発明は、リボース模倣体および本願明細書に記載する他の構成要素を有するiRNA剤を含む。例えば本発明は、本願明細書に記載するiRNA剤、例えばパリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本願明細書に記載する遺伝子、例えばSNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本願明細書に記載する構成様式または構造を有するiRNA剤、本願明細書に記載する両親媒性送達物質と結合したiRNA、本願明細書に記載する薬剤送達モジュールと結合したiRNA、本願明細書に記載するように投与されるiRNA剤、または本願明細書に記載するように製剤化されたiRNA剤であって、リボース模倣体も組み込まれたiRNA剤を含む。したがって、本発明の1態様は、効率を増大させ、かつ/あるいはiRNA剤にヌクレアーゼ耐性を与えることが可能である、第2ヒドロキシル基を含むiRNA剤を特徴とする。ヌクレアーゼ、例えば細胞ヌクレアーゼは、核酸のホスホジエステル結合を加水分解し、核酸の部分的または完全な分解をもたらすことが可能である。第2ヒドロキシル基は、この修飾を欠くiRNAと比べて、iRNA剤がヌクレアーゼ分解を受ける傾向を低下させることによって、iRNA剤にヌクレアーゼ耐性を与える。理論によって縛られることは望まないが、iRNA剤上の第2ヒドロキシル基の存在が3’リボースのヒドロキシル基の構造上の模倣体として働くことによって、iRNA剤が分解を受けにくくなると考えられる。第2ヒドロキシル基は、2つの他の炭素および水素によって置換された炭素原子と結合しているOH基を指す。上記のようにヌクレアーゼ耐性を与える第2ヒドロキシル基は、任意の非環式炭素含有基の一部であってもよい。ヒドロキシル基は、任意の環式炭素含有基の一部であってもよく、以下の条件、すなわち1ヒドロキシル基と末端リン酸基の間にリボース部分が存在しないこと、または2該ヒドロキシル基は塩基と結合した糖部分には存在しないこと、のうち1つまたは複数に見合うことが好ましい。ヒドロキシル基は、iRNA剤の末端リン酸基のリンから、少なくとも2結合化学結合2個の位置にある例えば、少なくとも3結合離れて、少なくとも4結合離れて、少なくとも5結合離れて、少なくとも6結合離れて、少なくとも7結合離れて、少なくとも8結合離れて、少なくとも9結合離れて、少なくとも10結合離れている。好ましい実施形態では、末端リン酸基のリンと第2ヒドロキシル基の間に5つの介在結合が存在する。末端リン酸基のリンと第2ヒドロキシル基の間に5つの介在結合を有する、好ましいiRNA剤送達モジュールは、以下の構造を有する以下の式Yを参照:式Yに言及すると、AはiRNA剤であり、本明細書に記載する任意のiRNA剤を含む。iRNA剤は、リン酸基のWと直接的あるいは間接的に例えばスペーサーまたはリンカーを介して結合することが可能である。これらのスペーサーまたはリンカーは、例えば-CH2n-、-CH2nN-、-CH2nO-、-CH2nS-、OCH2CH2OnCH2CH2OH例えば、n=3または6、脱塩基性の糖、アミド、カルボキシ、アミン、オキシアミン、オキシイミン、チオエーテル、ジスルフィド、チオ尿素、スルホンアミド、もしくはモルホリノ、またはビオチン試薬およびフルオレセイン試薬を含むことが可能である。iRNA剤は、非修飾状態例えば、W、X、Y、およびZがOであるの末端リン酸基または修飾されている末端リン酸基を有し得る。修飾されているリン酸基では、WおよびZは独立にNH、OまたはSであってよく;XおよびYは独立にS、Se、BH3-、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、H、O、O-、アルコキシまたはアミノアルキルアミノ、アリールアミノなどを含むであってよい。W、XおよびZがOであり、YがSであることが好ましい。R1およびR3はそれぞれ独立に、水素;またはC1~C100アルキルであり、C1~C100アルキルは任意選択でヒドロキシル、アミノ、ハロ、リン酸または硫酸基で置換されており、かつ/あるいは任意選択でN、O、S、アルケニルまたはアルキニルが挿入されていてもよい。R2は水素;またはC1~C100アルキルであり、C1~C100アルキルは任意選択でヒドロキシル、アミノ、ハロ、リン酸または硫酸基で置換されており、かつ/あるいは任意選択でN、O、S、アルケニルまたはアルキニルが挿入されていてもよく;あるいはnが1であるとき、R2がR4またはR6と合わさって5~12原子の環を形成してもよい。R4は水素;またはC1~C100アルキルであり、C1~C100アルキルは任意選択でヒドロキシル、アミノ、ハロ、リン酸または硫酸基で置換されており、かつ/あるいは任意選択でN、O、S、アルケニルまたはアルキニルが挿入されていてもよく;あるいはnが1であるとき、R4がR2またはR5と合わさって5~12原子の環を形成してもよい。R5は水素、またはC1~C100アルキルであり、C1~C100アルキルは任意選択でヒドロキシル、アミノ、ハロ、リン酸または硫酸基で置換されており、かつ/あるいは任意選択でN、O、S、アルケニルまたはアルキニルが挿入されていてもよく;あるいはnが1であるとき、R5がR4と合わさって5~12原子の環を形成してもよい。R6は水素、またはC1~C100アルキルであり、C1~C100アルキルは任意選択でヒドロキシル、アミノ、ハロ、リン酸または硫酸基で置換されており、かつ/あるいは任意選択でN、O、S、アルケニルまたはアルキニルが挿入されていてもよく、あるいはnが1であるとき、R6がR2と合わさって6~10原子の環を形成してもよい。R7は水素、C1~C100アルキル、またはCOCH2qCONHR9であり;Tは水素または官能基であり;nおよびqはそれぞれ独立に1~100であり;R8はC1~C10アルキルまたはC6~C10アリールであり;かつR9は水素、C1~C10アルキル、C6~C10アリールまたは固形支持体物質である。好ましい実施形態は、以下のiRNA剤送達モジュールのサブセットの1つまたは複数を含むことが可能である。RNAi剤送達モジュールの1つのサブセットでは、Aは該RNA剤の末端3’または5’リボース糖の炭素を介して、直接的あるいは間接的に結合することが可能である。RNAi剤送達モジュールの他のサブセットでは、X、WおよびZがOであり、YがSである。RNAi剤送達モジュールのさらに他のサブセットでは、nは1であり、R2とR6が合わさって6原子を含む環を形成し、R4とR5が合わさって6原子を含む環を形成する。環系はトランス-デカリンであることが好ましい。例えば、このサブセットのRNAi剤送達モジュールは、式Y-1の化合物を含むことが可能である:官能基は例えば、標的化ターゲティング基例えばステロイドまたは糖質、レポーター基例えばフルオロフォア、または標識同位元素で標識された部分であってよい。標的化基は、タンパク質結合物質、内皮細胞標的化基例えばRGDペプチドおよび模倣体、癌細胞標的化基例えば葉酸ビタミンB12、ビオチン、骨細胞標的化基例えばビスホスホネート、ポリグルタミン酸、ポリアスパラギン酸、多価マンノース例えばマクロファージ試験用、ラクトース、ガラクトース、N-アセチル-ガラクトサミン、モノクローナル抗体、糖タンパク質、レクチン、メラノトロピン、またはチロトロピンをさらに含むことが可能である。当業者によって理解され得るように、本明細書中の式の化合物を合成する方法は当業者には明らかであろう。合成した化合物を反応混合物から分離し、カラムクロマトグラフィ、高速液体クロマトグラフィ、または再結晶化などの方法によってさらに精製することが可能である。さらに、様々な合成工程を他の順序または順番で行って、所望の化合物を与えることも可能である。本明細書に記載した化合物を合成する際に有用な、合成化学変換および保護基に関する方法保護および脱保護は当分野で知られており、例えばアールラロックR.Larock、ComprehensiveOrganicTransformations、VCHPublishers1989;ティーダブリューグリーンT.W.GreeneおよびピーエムジーワッツP.G.M.Wuts、ProtectiveGroupsinOrganicSynthesis、第2版、JohnWileyandSons1991;エルファイザーL.FieserおよびエムファイザーM.Fieser、FieserandFieser’sReagentsforOrganicSynthesis、JohnWileyandSons1994;およびエルパクエッテL.Paquette、ed.、EncyclopediaofReagentsforOrganicSynthesis、JohnWileyandSons1995、ならびにその後続版に記載されたものなどを含む。リボース置換モノマーサブユニットiRNA剤の1つまたは複数の特性を最適化することが可能ないくつかの方法で、iRNA剤を修飾することが可能である。RNA物質、例えばiRNA剤はリボース置換モノマーサブユニットRRMS、例えば本明細書中に記載されたRRMSなどを含むことが可能である。さらに、iRNA剤は、RRMSおよび本願明細書に記載する他の構成要素を有することができる。例えば本発明は、本願明細書に記載のiRNA剤、例えばパリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本願明細書に記載の遺伝子、例えば腎臓中で活性がある遺伝子を標的とするiRNA剤、本願明細書に記載の構成様式または構造を有するiRNA剤、本願明細書に記載の両親媒性送達物質と結合したiRNA、本願明細書に記載の薬剤送達モジュールと結合したiRNA、本願明細書に記載のように投与されるiRNA剤、または本願明細書に記載のように製剤化されるiRNA剤であって、RRMSも取り込むiRNA剤、を含む。iRNA剤の1つまたは複数のリボヌクレオチドサブユニットのリボース糖は、他の構成部分、例えば非糖質の好ましくは環式の担体で置換することが可能である。サブユニットのリボース糖がこのように置換されているリボヌクレオチドサブユニットを、本願明細書ではRRMSと呼ぶ。環式担体は炭素環系すなわち、すべての環原子が炭素原子であってもよいし、あるいはヘテロ環系すなわち、1つまたは複数の環原子がヘテロ原子、例えば窒素、酸素、イオウであってもよい。環式担体は単環系であってよく、あるいは2つ以上の環、例えば縮合環を含むことも可能である。環式担体は完全に飽和な環系であってよく、あるいはそれは1つまたは複数の二重結合を含むことも可能である。担体はさらに、i少なくとも2つのバックボーン結合点およびii少なくとも1つの連結部結合点を含む。本願明細書で使用するバックボーン結合点は、官能基、例えばヒドロキシル基、または一般的に、バックボーン例えばリボ核酸のリン酸バックボーンまたはイオウを含むなどの修飾リン酸バックボーンへの担体の取り込みに利用可能かつ好適な結合を指す。本願明細書で使用する連結部結合点は、環式担体の構成環原子、例えば炭素原子またはヘテロ原子バックボーン結合点を提供する原子とは異なるものであって、選択した構成部分と結合する原子を指す。選択した構成部分は、例えばリガンド例えば標的化部分または送達成分、またはiRNA剤の物理的性質例えば親油性を変える構成部分であってよい。場合によっては、選択した成分は、介在する連結部によって環式担体と結合する。したがって選択した成分は、官能基例えばアミノ基を含むか、または一般的に、他の化学的実体例えば該構成環に対するリガンドの取り込みまたは連結に適した結合を与えることになる。本願明細書に記載する1つまたは複数のRRMSを、RNA剤例えばiRNA剤中へ取り込むことによって、特に適切な実体と連結された場合、1つまたは複数の新しい性質を該RNA剤に与え、かつ/あるいは該RNA分子の1つまたは複数の既存の性質を変化させ、高め、あるいは調節することが可能である。例えば、親油性またはヌクレアーゼ耐性のうち1つまたは複数を変化させることが可能である。本願明細書に記載する1つまたは複数のRRMSをiRNA剤中へ取り込むことによって、特にRRMSが適切な実体と連結された場合、標的mRNAに対するiRNA剤の結合親和性を調節する例えば増大させることが可能であり、iRNA剤の二重らせん形の形状を変化させることが可能であり、分布を変化させることや、iRNA剤を身体の特定部分に向けることが可能であり、あるいは例えばRISC形成時および鎖の分離時の核酸結合タンパク質との相互作用を改変することが可能である。したがって、1態様では、本発明は、好ましくは第1鎖および第2鎖を含むiRNA剤であって、式R-1を有する少なくとも1つのサブユニットが前記鎖のうち少なくとも1つの中に取り込まれているiRNA剤を特徴とする。式R-1を参照すると、XはNCOR7、NR7またはCH2であり;YはNR8、O、S、CR9R10であるかまたは存在せず、かつZはCR11R12であるかまたは存在しない。R1、R2、R3、R4、R9、およびR10のそれぞれは独立にH、ORa、ORb、CH2nORa、またはCH2nORbである、ただし、R1、R2、R3、R4、R9、およびR10の少なくとも1つはORaまたはORbであり、かつR1、R2、R3、R4、R9、およびR10の少なくとも1つはCH2nORa、またはCH2nORbでありRRMSが末端に存在するとき、R1、R2、R3、R4、R9、およびR10の1つはRaを含み、かつ1つはRbを含み;RRMSが内部に存在するとき、R1、R2、R3、R4、R9、およびR10のうち2つがそれぞれRbを含む;さらに、ORaはCH2nORbとともにのみ存在し、CH2nORaはORbとともにのみ存在することが好ましいものとする。R5、R6、R11、およびR12のそれぞれは独立にH、任意選択で1~3個のR13で置換されたC1~C6アルキル、またはCONHR7であり;あるいは、R5およびR11が一体となって、任意選択でR14により置換されたC3~C8シクロアルキルをなす。R7はNRcRdで置換されたC1~C20アルキルであり;R8はC1~C6アルキルであり;R13はヒドロキシ、C1~C4アルコキシ、またはハロであり;かつR14はNRcR7である。Raはであり;かつRbはである。AとCのそれぞれは独立にOまたはSである。BはOH、O-、またはである。RcはHまたはC1~C6アルキルであり;RdはHまたはリガンドであり;nは1~4である。好ましい実施形態では、リボースはピロリン骨格で置換され、かつXはNCOR7またはNR7であり、YはCR9R10であり、かつZは存在しない。他の好ましい実施形態では、リボースはピペリジン骨格で置換され、かつXはNCOR7またはNR7であり、YはCR9R10であり、かつZはCR11R12である。他の好ましい実施形態では、リボースはピペラジン骨格で置換され、かつXはNCOR7またはNR7であり、YはNR8であり、かつZはCR11R12である。他の好ましい実施形態では、リボースはモルホリノ骨格で置換され、かつXはNCOR7またはNR7であり、YはOであり、かつZはCR11R12である。他の好ましい実施形態では、リボースはデカリン骨格で置換され、かつXはCH2であり;YはCR9R10であり;かつZはCR11R12であり;かつR5およびR11は一体となってC6シクロアルキルをなす。他の好ましい実施形態では、リボースはデカリン/インダン骨格で置換され、かつXはCH2であり;YはCR9R10であり;かつZはCR11R12であり;かつR5およびR11は一体となってC5シクロアルキルをなす。他の好ましい実施形態では、リボースはヒドロキシプロリン骨格で置換される。本願明細書に記載するRRMSは、本願明細書に記載する任意の二本鎖RNA様分子、例えばiRNA剤に取り込ませることが可能である。iRNA剤は、ハイブリダイズしたセンス鎖とアンチセンス鎖とからなる二本鎖を含むことが可能であり、このときアンチセンス鎖および/またはセンス鎖は、本願明細書に記載する1つまたは複数のRRMSを含むことが可能である。RRMSは、二本鎖iRNA剤の一方または両方の鎖の中の1つまたは複数の個所に導入することが可能である。RRMSは、センス鎖の3’または5’端またはその近く1、2、または3位以内に配置されてもよいし、あるいはアンチセンス鎖の3’端またはその近く2または3位以内に配置されてもよい。いくつかの実施形態では、RRMSはアンチセンス鎖の5’端またはその近く1、2、または3位以内にはないことが好ましい。RRMSは内部に存在してもよく、アンチセンスが標的と結合するのに重要ではない領域中に位置することが好ましいであろう。1実施形態では、iRNA剤は、アンチセンス鎖の3’端または3’端から1、2、もしくは3位以内にRRMSを有することが可能である。1実施形態では、iRNA剤は、アンチセンス鎖の3’端または3’端から1、2、もしくは3位以内およびセンス鎖の3’端または3’端から1、2、もしくは3位以内に、RRMSを有することが可能である。1実施形態では、iRNA剤は、アンチセンス鎖の3’端または3’端から1、2、または3位以内にRRMSを、およびセンス鎖の5’端にRRMSを有することが可能であり、この場合両方のリガンドがiRNA剤の同じ端に位置する。いくつかの実施形態では、2つのリガンドが連結され、好ましくは、それぞれの鎖上のリガンドは疎水性の構成部分である。理論によって縛られることは望まないが、疎水性リガンドが対になることにより、分子間のファン-デル-ワールス相互作用によって、iRNA剤を安定化させることが可能であると考えられる。1実施形態では、iRNA剤は、アンチセンス鎖の3’端または3’端から1、2、または3位以内にRRMSを、かつセンス鎖の5’端にRRMSを有することが可能であり、この場合両方のRRMSが、各RRMSとリガンド上の別々の位置との結合によって、同じリガンド例えばコール酸を共有することが可能である。2つの隣接するRRMS間で共有されるリガンドを、本願明細書ではヘアピンリガンドと呼ぶ。他の実施形態では、iRNA剤は、センス鎖の3’端にRRMSを、かつセンス鎖の内部位置にRRMSを有することが可能である。iRNA剤は、センス鎖の内部位置にRRMSを有することが可能であり;あるいはアンチセンス鎖の内部位置にRRMSを有することが可能であり;あるいはセンス鎖の内部位置にRRMSを、かつアンチセンス鎖の内部位置にRRMSを有することも可能である。好ましい実施形態では、iRNA剤は第1配列および第2配列を含み、該配列は同じ鎖上に位置する2つの配列ではなく2つの別個の分子であり、例えば生理的条件下、例えばヘリカーゼまたは他の巻き戻し酵素と接触しない生理的条件下でハイブリダイズするおよびそれによって二本鎖領域を形成するために互いに十分な相補性を有することが好ましい。dsiRNA剤が分子の一端または両端に一本鎖領域または非対合領域を含むように、第1配列および第2配列を選択することが好ましい。したがって、dsiRNA剤は、好ましくは突出部を含むように対合した第1配列および第2配列を含み、該突出部は例えば1つまたは2つの5’または3’突出部であり、ただし好ましくは2~3ヌクレオチドの3’突出部である。大部分の実施形態は3’突出部を有する。好ましいsRNA剤は、それぞれの端に1ヌクレオチド長あるいは好ましくは2または3ヌクレオチド長の一本鎖突出部、好ましくは3’突出部を有する。これらの突出部は、1本の鎖が他方より長い結果でもよいし、あるいは同じ長さの2本の鎖がずれた結果でもよい。5’端はリン酸化されていることが好ましい。連結されるもの広く様々なもの実体を、iRNA剤に、例えばRRMSの担体に連結させることが可能である。以下にRRMSと関連付けて実施例を記載するが、該RRMSは単に好ましいものであるにすぎず、実体は他の地点においてiRNA剤に結合させることも可能である。好ましい実体は、神経細胞、例えばSNCAを発現している神経細胞を標的とする実体である。好ましい構成部分はリガンドであり、リガンドはRRMSの担体と、好ましくは共有結合により、直接的あるいは介在する連結部を介して間接的に結合される。好ましい実施形態では、リガンドは介在する連結部を介して担体に結合される。前に論じたように、リガンドまたは連結部に連結されたリガンドは、RRMSモノマーが伸長する鎖に取り込まれるときにRRMSモノマー上に存在していてもよい。いくつかの実施形態では、前駆体RRMSモノマーを伸長する鎖に取り込ませた後に、前駆体RRMSにリガンドを取り込ませることが可能である。例を挙げれば、例えばアミノ末端を有する連結部を備えたすなわちリガンドが結合していないRRMSモノマー、例えばTAP-CH2nNH2を、伸長するセンスまたはアンチセンス鎖に取り込ませることが可能である。後の操作において、すなわち前駆体モノマーを鎖に取り込ませた後、続いて、求電子基例えばペンタフルオロフェニルエステルまたはアルデヒド基を有するリガンドを、リガンドの求電子基と前駆体RRMSの連結部の末端求核基とのカップリングによって、前駆体RRMSと結合させることが可能である。好ましい実施形態では、リガンドは、同リガンドが取り込まれたiRNA剤の分布、標的指向性または寿命を変化させる。好ましい実施形態では、リガンドは、例えばこのようなリガンドが存在しない分子種と比較して、選択された標的、例えば分子、細胞または細胞種、コンパートメント、例えば細胞または器官のコンパートメント、組織、器官または身体の領域に関する高い親和性をもたらす。例えば、好ましい実施形態では、リガンドにより脳内などの神経細胞に対する選択性が向上することになる。好ましいリガンドは、二本鎖の核酸における二本鎖の対合には関与しないであろう。好ましいリガンドは、輸送、ハイブリダイゼーション、および特異性を向上させることが可能であり、生成する天然または修飾オリゴリボヌクレオチド、または本願明細書に記載するモノマーおよび/または天然もしくは修飾リボヌクレオチドの任意の組合せを含んでなるポリマー分子の、ヌクレアーゼ耐性を向上させることも可能である。一般的なリガンドとしては、例えば取り込みを増大させるための治療用調節物質;例えば分布を調べるための診断用化合物またはレポーター基;架橋剤;およびヌクレアーゼ耐性を与える構成部分が挙げられる。一般例には、脂質、ステロイド、ビタミン、糖、タンパク質、ペプチド、ポリアミン、およびペプチド模倣体がある。リガンドには、天然に存在する物質、例えばタンパク質例えば、ヒト血清アルブミンHSA、低密度リポタンパク質LDL、またはグロブリン;糖質例えば、デキストラン、プルラン、キチン、キトサン、イヌリン、シクロデキストリンまたはヒアルロン酸;または脂質などが挙げられる。リガンドは、合成ポリマー、例えば合成ポリアミノ酸などの、組換え分子または合成分子であってもよい。ポリアミノ酸の例には、ポリリシンPLL、ポリL-アスパラギン酸、ポリL-グルタミン酸、スチレン-無水マレイン酸コポリマー、ポリL-ラクチド-コ-グリコリドコポリマー、ジビニルエーテル-無水マレイン酸コポリマー、N-2-ヒドロキシプロピルメタクリルアミドコポリマーHMPA、ポリエチレングリコールPEG、ポリビニルアルコールPVA、ポリウレタン、ポリ2-アクリル酸エチル、N-イソプロピルアクリルアミドポリマー、またはポリホスファジンがある。ポリアミンの例には、ポリエチレンイミン、ポリリシンPLL、スペルミン、スペルミジン、ポリアミン、プソイドペプチド-ポリアミン、ペプチド模倣ポリアミン、デンドリマーポリアミン、アルギニン、アミジン、プロタミン、カチオン性脂質、カチオン性ポルフィリン、ポリアミンの第四級塩、またはαらせん状ペプチドがある。リガンドは、標的化基、例えば細胞または組織を標的とする物質、例えばレクチン、糖タンパク質、脂質またはタンパク質、例えば神経細胞などの特定の細胞種と結合する抗体も含み得る。リガンドの他の例には、染料、インターカレート剤例えばアクリジン、架橋剤例えばソラレン、マイトマイシンC、ポルフィリンTPPC4、テキサフィリン、サフィリン、多環式芳香族炭化水素例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン、人工エンドヌクレアーゼ例えばEDTA、親油性分子、例えば、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-Oヘキサデシルグリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メンソール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-オレオイルリトコール酸、O3-オレオイルコール酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン、およびペプチド複合体例えば、アンテナペディアペプチド、Tatペプチド、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、PEG例えばPEG-40K、MPEG、[MPEG]2、ポリアミノ、アルキル、置換アルキル、放射標識マーカー、酵素、ハプテン例えばビオチン、輸送/吸収促進物質例えばアスピリン、ビタミンE、葉酸、合成リボヌクレアーゼ例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン-イミダゾール複合体、テトラアザマクロ環のEu3複合体、ジニトロフェニル、HRP、またはAPがある。1実施形態では、リガンドによりiRNA剤が血液脳関門を通り抜けやすくなる可能性がある。リガンドはタンパク質例えば糖タンパク質またはペプチドであってよく、例えば共通のリガンドに関する特異的親和性を有する分子、または抗体例えば神経細胞などの特定の細胞種と結合する抗体であってよい。リガンドは、ホルモンおよびホルモン受容体も含み得る。リガンドは、脂質、レクチン、糖質、ビタミン、補因子、多価ラクトース、多価ガラクトース、N-アセチル-ガラクトサミン、N-アセチル-グルコサミン多価マンノース、または多価フコースなどの、非ペプチドの分子種も含み得る。リガンドは、例えば細胞の細胞骨格を破壊することによって、例えば細胞の微小管、マイクロフィラメント、および/または中間径フィラメントを破壊することによって、細胞内へのiRNA剤の取り込みを増大させることが可能な物質、例えば薬物であってよい。薬物は例えば、タキソンtaxon、ビンクリスチン、ビンブラスチン、サイトカラシン、ノコダゾール、ジャプラキノライドjaplakinolide、ラトランクリンA、ファロイジン、スウィンホライドA、インダノシンindanocine、またはミオセルビンmyoservinであってよい。リガンドは、例えば炎症応答を活性化させることによって、細胞内へのiRNA剤の取り込みを増大させることが可能である。このような効果を有すると思われる例示的なリガンドには、腫瘍壊死因子αTNFα、インターロイキン-1β、またはγインターフェロンがある。1態様では、リガンドは脂質または脂質系分子である。このような脂質または脂質系分子は、血清タンパク質、例えばヒト血清アルブミンHSAと結合することが好ましい。HSA結合リガンドは、身体の標的組織、例えば肝臓以外の標的組織に、本発明の複合体を分布させることが可能である。好ましくは、標的組織は脳である。HSAと結合することが可能である他の分子も、リガンドとして使用することが可能である。例えば、ネプロキシンまたはアスピリンを使用することが可能である。脂質または脂質系リガンドは、a複合体の分解に対する耐性を増大させること、b標的細胞または細胞膜への標的指向性または輸送を増大させることが可能であり、かつ/あるいはc血清タンパク質、例えばHSAとの結合を調節するために使用することが可能である。脂質系リガンドを使用して、本発明の複合体と標的組織の結合を調節する、例えば制御することが可能である。例えば、HSAとさらに強く結合する脂質または脂質系リガンドは、肝臓に対する標的指向性が低くなると思われ、したがって身体から除去されにくくなると思われる。好ましい実施形態では、脂質系リガンドはHSAと結合する。リガンドは、本発明の複合体が好ましくは非腎臓組織に分布するような十分な親和性で、HSAと結合することが好ましい。しかしながら、その親和性は、HSAとリガンドとの結合が不可逆的であるほど強くはないことが好ましい。他の態様では、リガンドは、標的細胞、例えば増殖細胞によって取り込まれる構成部分、例えばビタミンである。これらのリガンドは、望ましくない細胞増殖、例えば悪性または非悪性型の細胞増殖、例えば癌細胞の増殖によって特徴付けられる疾患を治療するのに非常に有用である。例示的なビタミンには、ビタミンA、E、およびKがある。他の例示的なビタミンには、Bビタミン、例えば葉酸、B12、リボフラビン、ビオチン、ピリドキサール、あるいは癌細胞によって取り込まれるその他のビタミンまたは栄養素がある。HSAおよび低密度リポタンパク質LDLも含まれる。他の態様では、リガンドは、細胞透過性物質、好ましくはらせん状の細胞透過性物質である。該物質は両親媒性であることが好ましい。例示的な物質は、tatまたはアンテナペディアなどのペプチドである。該物質がペプチドである場合、ペプチジル模倣体、インバートマー、非ペプチド結合または偽ペプチド結合、およびD-アミノ酸の使用を含めて、該ペプチドを改変することが可能である。らせん状物質は、親油性および撥油性の相を好ましくは有する、αらせん状物質であることが好ましい。リガンドは、ペプチドまたはペプチド模倣体であってよい。ペプチド模倣体本願明細書ではオリゴペプチド模倣体とも呼ぶは、天然のペプチドと類似した一定の3次元構造にフォールディング可能な分子である。ペプチドおよびペプチド模倣体と、iRNA剤が結合することによって、細胞の認識および吸収を高めることなどにより、iRNAの薬物動態学的分布に影響を与えることが可能である。ペプチドまたはペプチド模倣体の構成部分は、約5~50アミノ酸長、例えば約5、10、15、20、25、30、35、40、45、または50アミノ酸長であってよい例えば表3を参照。ペプチドまたはペプチド模倣体は、例えば細胞透過性ペプチド、カチオン性ペプチド、両親媒性ペプチド、または疎水性ペプチド例えば、主にTyr、TrpまたはPheから構成されるであってよい。ペプチド部分は、デンドリマーペプチド、制約型constrainedペプチドまたは架橋ペプチドであってよい。ペプチド部分は、L-ペプチドでもD-ペプチドでもよい。他の代替例では、ペプチド部分は、疎水性の膜移行配列MTSを含むことが可能である。例示的な疎水性MTS含有ペプチドは、アミノ酸配列AAVALLPAVLLALLAP配列番号46を有するRFGFである。疎水性MTSを含むRFGF類似体例えば、アミノ酸配列AALLPVLLAAP配列番号47も、標的化部分であり得る。ペプチド部分は、ペプチド、オリゴヌクレオチド、およびタンパク質を含めた大きな極性分子を、細胞膜を横切って運ぶことができる送達ペプチドであってよい。例えば、HIVTatタンパク質由来の配列GRKKRRQRRRPPQ配列番号48、およびショウジョウバエのアンテナペディアタンパク質由来の配列RQIKIWFQNRRMKWKK配列番号49は、送達ペプチドとして機能しうることが見出されている。ペプチドまたはペプチド模倣体は、ファージディスプレイライブラリー、または1ビーズ1化合物OBOCコンビナトリアルライブラリーから同定されたペプチドなど、DNAのランダムな配列によってコードされてもよいラムらLametal.、Nature、354:82~84、1991。取り込まれたモノマーユニットを介してiRNA剤と連結したペプチドまたはペプチド模倣体は、アルギニン-グリシン-アスパラギン酸RGDペプチド、またはRGD模倣体などの、細胞標的化ペプチドであることが好ましい。ペプチド部分の長さは、約5アミノ酸~約40アミノ酸の範囲であってよい。ペプチド部分は、安定性を増大させるため、あるいは立体構造上の特性を得るためなどの、構造的改変を有し得る。以下に記載する任意の構造的改変を、使用することが可能である。細胞透過性ペプチドは、細胞、例えばヒト細胞などの哺乳動物の細胞を透過することが可能である。細胞透過性ペプチドは、核局在化シグナルNLSをも含み得る。例えば、細胞透過性ペプチドは、HIV-1gp41の融合ペプチドドメインとSV40大型T抗原のNLSとに由来するMPGなどの、2部分の両親媒性ペプチドであってよいシメオニらSimeonietal.、Nucl.AcidsRes.31:2717~2724、2003。1実施形態では、RRMSに連結される標的化ペプチドは、両親媒性のαらせん状ペプチドであってよい。例示的な両親媒性のαらせん状ペプチドには、セクロピン、ライコトキシン、パラダキシン、ブフォリン、CPF、ボンビニン様ペプチドBLP、カテリシディン、セラトトキシン、S.clavaペプチド、メクラウナギ腸管の抗菌性ペプチドHFIAP、マガイニン、ブレビニン-2、ダーマセプチン、メリチン、プレウロシディン、H2Aペプチド、アフリカツメガエルのペプチド、エスカレンチン-1、およびカエリンがあるが、これらだけには限られない。らせんの安定性を完全に保つために、いくつかの要因を考慮することが好ましいであろう。例えば、らせん安定化残基を最大数使用し例えばleu、ala、またはlys、らせん不安定化残基を最小数とする例えばプロリン、または環状モノマーユニット。キャップ構造の残基も考えられる例えば、GlyはNキャップ構造残基の例であり、かつ/あるいはC末端アミド化を使用して、らせんを安定化させるための特別なH結合を与えることが可能である。i±3、あるいはi±4位離れた、正反対の電荷を有する残基間の塩架橋の形成によって、安定性をもたらす可能性がある。例えば、リシン、アルギニン、ホモ-アルギニン、オルニチンまたはヒスチジンなどのカチオン性残基は、アニオン性の残基、グルタミン酸またはアスパラギン酸と、塩架橋を形成することが可能である。ペプチドおよびペプチド模倣体のリガンドには、天然または修飾ペプチド、例えばDまたはLペプチド;α、β、またはγペプチド;N-メチルペプチド;アザペプチド;1つまたは複数のアミドを有するペプチド、すなわち1つまたは複数の尿素、チオ尿素、カルバメート、またはスルホニル尿素結合で置換されたペプチド結合;または環状ペプチドを有するリガンドがある。iRNA剤を作製するための方法iRNA剤は、修飾塩基または非天然塩基、例えば本願明細書に記載の塩基を含むことが可能である。さらに、iRNA剤は、修飾または非天然塩基および本願明細書に記載するその他の要素を有することができる。例えば本発明は、本願明細書に記載するiRNA剤、例えばパリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本願明細書に記載する遺伝子、例えばSNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本願明細書に記載する構成様式または構造を有するiRNA剤、本願明細書に記載する両親媒性送達物質と結合したiRNA、本願明細書に記載する薬剤送達モジュールと結合したiRNA、本願明細書に記載するように投与されるiRNA剤、または本願明細書に記載するように製剤化されるiRNA剤であって、修飾または非天然塩基も取り込むiRNA剤を含む。オリゴヌクレオチドペプチド複合体の合成および精製は、確立されている方法によって実施することが可能である。例えば、テゥルーフェルトらTrufertetal.、Tetrahedron、52:3005、1996;およびManoharan、OligonucleotideConjugatesinAntisenseTechnology、AntisenseDrugTechnology、ed中、エスティークルーク、マルセルデッカー、インコーポレイティッド社S.T.Crooke、MarcelDekker,Inc.、2001を参照のこと。本発明の1実施形態では、ペプチド模倣体を修飾して、明確で特異的な好ましい立体構造をとる制約型ペプチドを作製することが可能であり、該立体構造によってペプチドの効力および選択性を増大させることが可能である。例えば、制約型ペプチドはアザペプチドであってよいGante、Synthesis、405~413、1989。アミノ酸側鎖の構造を変えずに、アミノ酸のα-炭素を窒素原子で置換することによって、アザペプチドが合成される。例えば、ヒドラジンをカルボニルドナー、例えばクロロギ酸フェニルと反応させることなどによって、伝統的なペプチド合成カップリング法においてヒドラジンを使用することによって、アザペプチドを合成することが可能である。本発明の1実施形態では、ペプチドまたはペプチド模倣体例えば、RRMSに連結されるペプチドまたはペプチド模倣体は、N-メチルペプチドであってよい。N-メチルペプチドはN-メチルアミノ酸から構成されるが、N-メチルアミノ酸はペプチドのバックボーン中に追加のメチル基を与えることによってタンパク質分解酵素による切断に対する他の耐性手段を与える可能性がある。N-メチルペプチドは、当分野で知られている方法によって合成することが可能である例えば、リンドグレンらLindgrenetal.、TrendsPharmacol.Sci.21:99、2000;CellPenetratingPeptides:ProcessesandApplications、Langel、ed.、CRCPress、BocaRaton、FL、2002;フィッシェらFischeetal.、Bioconjugate.Chem.12:825、2001;ワンダーらWanderetal.、J.Am.Chem.Soc.、124:13382、2002を参照。例えば、AntペプチドまたはTatペプチドが、N-メチルペプチドであってもよい。本発明の1実施形態では、ペプチドまたはペプチド模倣体例えば、RRMSに連結されるペプチドまたはペプチド模倣体は、β-ペプチドであってよい。β-ペプチドは、溶液中でらせん、プリーツシート、ターンおよびヘアピンなどの安定した2次構造を形成する。β-ペプチドの環状誘導体は、固体状態で折りたたまれてナノチューブになりうる。β-ペプチドは、タンパク質分解酵素による分解に対して耐性がある。β-ペプチドは、当分野で知られている方法によって合成することが可能である。例えば、AntペプチドまたはTatペプチドは、β-ペプチドであってもよい。本発明の1実施形態では、ペプチドまたはペプチド模倣体例えば、RRMSに連結されるペプチドまたはペプチド模倣体は、オリゴカルバメートであってよい。オリゴカルバメートペプチドは、カルバメートトランスポーターによって促進される輸送経路により細胞内に内在化する。例えば、AntペプチドまたはTatペプチドが、オリゴカルバメートであってもよい。本発明の1実施形態では、ペプチドまたはペプチド模倣体例えば、RRMSに連結されるペプチドまたはペプチド模倣体は、ペプチド模倣体のアミド結合が尿素部分で置換されているオリゴ尿素複合体またはオリゴチオ尿素複合体であってよい。アミド結合の置換によって、タンパク質分解酵素、例えば胃腸間内でのタンパク質分解酵素による分解に対する高い耐性が与えられる。1実施形態では、オリゴ尿素複合体を、経口送達において使用するためにiRNA剤と連結させる。オリゴ尿素ペプチド模倣体のそれぞれの繰り返しユニット中のバックボーンは、天然アミノ酸と比較して1炭素原子だけ広がる可能性がある。1炭素原子の広がりによって、例えばペプチドの安定性および親油性が増大する可能性がある。したがってオリゴ尿素ペプチドは、iRNA剤が細菌細胞壁の通過を目的とするとき、あるいは神経障害の治療などのためにiRNA剤が血液-脳関門を横断しなければならないときに、有利である可能性がある。1実施形態では、受容体との高い親和性を生み出すために、水素結合ユニットをオリゴ尿素ペプチドに結合させる。例えば、AntペプチドまたはTatペプチドが、オリゴ尿素複合体またはオリゴチオ尿素複合体であってもよい。本発明のdsRNAペプチド複合体は、iRNA剤上の様々な位置に存在するRRMSと関連付ける、例えば連結させることが可能である。例えばペプチドを、センス鎖上またはアンチセンス鎖上のいずれかにおいて末端に結合させてもよいし、ペプチドをビス結合1つのペプチドが各端で連結され、一端がセンス鎖に結合し、一端がアンチセンス鎖に結合する。他の選択肢では、ペプチドは、短いヘアピン構造のiRNA剤のループ中など、内部に結合し得る。さらに他の選択肢では、ペプチドはペプチド-担体複合体などの複合体と関連付けられてもよい。ペプチド-担体複合体は、生体系および/または細胞に送達するためなどの1つまたは複数のiRNA剤を内包しうる少なくとも1つの担体分子と、担体複合体を特定の組織または細胞種に対して指向させるためなどの、前記担体分子の外側に連結されたペプチド部分とから構成される。担体複合体は、該複合体の外側に追加の標的化分子、または細胞への送達を助ける細胞融合剤を担持することも可能である。担体内に被包される1つまたは複数のiRNA剤を、担体の内部への物質の送達を助けることが可能な親油性分子と結合させてもよい。担体分子または担体構造物は、例えばミセル、リポソーム例えばカチオン性リポソーム、ナノ粒子、ミクロスフェア、または生分解性ポリマーであってよい。ペプチド部分は、ジスルフィド結合、酸不安定結合、ペプチド系結合、オキシアミノ結合またはヒドラジン結合などの様々な結合によって、担体分子と連結することが可能である。例えば、ペプチド系結合はGFLGペプチドであってよい。いくつかの結合は個々の利点を有し、その利点または欠点を、標的組織または目的とする用途に応じて考慮することが可能である。例えば、ペプチド系結合は血流中では安定性があるが、リソソーム中では酵素による切断を受けやすい。定義用語ハロは、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素の任意の基を指す。用語アルキルは、示した数の炭素原子を含む直鎖または分岐鎖の炭化水素鎖を指す。例えば、C1~C12アルキルとは、該基が1個~12個の炭素原子をその中に有することが可能であることを示す。用語ハロアルキルは、1つまたは複数の水素原子がハロによって置換されているアルキルを指し、すべての水素がハロによって置換されているアルキル部分例えばペルフルオロアルキルを含む。アルキルおよびハロアルキル基は、任意選択でO、N、またはSが挿入されていてもよい。用語アラルキルは、アルキル水素原子がアリール基によって置換されているアルキル部分を指す。アラルキルは、2つ以上の水素原子がアリール基によって置換されている基を含む。アラルキルの例には、ベンジル、9-フルオレニル、ベンズヒドリル、およびトリチル基がある。用語アルケニルは、2~8個の炭素原子を含み1つまたは複数の二重結合を有することを特徴とする、直鎖または分岐鎖の炭化水素鎖を指す。典型的なアルケニルの例には、アリル、プロペニル、2-ブテニル、3-ヘキセニルおよび3-オクテニル基があるが、これらだけには限られない。用語アルキニルは、2~8個の炭素原子を含み1つまたは複数の三重結合を有することを特徴とする、直鎖または分岐鎖の炭化水素鎖を指す。典型的なアルキニルのいくつかの例は、エチニル、2-プロピニル、および3-メチルブチニル、およびプロパルギルである。sp2およびsp3炭素が、任意選択で、それぞれアルケニル基およびアルキニル基の結合点として作用してもよい。用語アルコキシは、-O-アルキル基を指す。用語アミノアルキルは、アミノで置換されたアルキルを指す。用語メルカプトは、-SH基を指す。用語チオアルコキシは、-S-アルキル基を指す。用語アルキレンは、2価アルキルすなわち-R-、例えば-CH2-、-CH2CH2-、および-CH2CH2CH2-を指す。用語アルキレンジオキソは、構造-O-R-O-Rはアルキレンを表すの2価の分子種を指す。用語アリールは、置換可能な任意の環原子を置換基によって置換することが可能な、芳香族単環、2環、または3環炭化水素環系を指す。アリール部分の例には、フェニル、ナフチル、およびアントラセニルがあるが、これらだけには限られない。本願明細書で使用する用語シクロアルキルは、置換可能な任意の環原子を置換基によって置換することが可能な、3~12個の炭素を有する飽和環状、2環、3環、または多環炭化水素基を含む。本願明細書に記載するシクロアルキル基は、縮合環も含み得る。縮合環は、共通の炭素-炭素結合を共有する環である。シクロアルキル部分の例には、シクロヘキシル、アダマンチル、およびノルボルニルがあるが、これらだけには限られない。用語ヘテロシクリルは、非芳香族3~10員の単環、8~12員の2環、または11~14員の3環の環系であって、単環の場合1~3個のヘテロ原子、2環の場合1~6個のヘテロ原子、または3環の場合1~9個のヘテロ原子を有し、前記ヘテロ原子がO、N、またはSから選択されることを特徴とする環系例えば炭素原子と、単環、2環、または3環である場合、N、OまたはSのヘテロ原子それぞれ1~3個、1~6個、または1~9個であり、置換可能な任意の環原子を置換基によって置換することが可能な環系を指す。本願明細書に記載するヘテロシクリル基は、縮合環も含み得る。縮合環は、共通の炭素-炭素結合を共有する環である。ヘテロシクリルの例には、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロピラニル、ピペリジニル、モルホリノ、ピロリニルおよびピロリジニルがあるが、これらだけには限られない。用語ヘテロアリールは、芳香族5~8員の単環、8~12員の2環、または11~14員の3環の環系であって、単環の場合1~3個のヘテロ原子、2環の場合1~6個のヘテロ原子、または3環の場合1~9個のヘテロ原子を有し、前記ヘテロ原子がO、N、またはSから選択されることを特徴とする環系例えば炭素原子と、単環、2環、または3環である場合、N、OまたはSのヘテロ原子それぞれ1~3個、1~6個、または1~9個であり、置換可能な任意の環原子を置換基によって置換することが可能な環系を指す。用語オキソは、炭素と結合している場合はカルボニルを形成し、窒素と結合している場合はN-オキシドを形成し、イオウと結合している場合はスルホキシドまたはスルホンを形成する酸素原子を指す。用語アシルは、いずれも置換基によってさらに置換することが可能な、アルキルカルボニル、シクロアルキルカルボニル、アリールカルボニル、ヘテロシクリルカルボニル、またはヘテロアリールカルボニル置換基を指す。用語置換基は、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロシクリル、ヘテロシクロアルケニル、シクロアルケニル、アリール、またはヘテロアリール基上で該基の任意の原子について置換された基を指す。適切な置換基には、制限を設けるものではないが、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシ、シアノ、ニトロ、アミノ、SO3H、硫酸、リン酸、ペルフルオロアルキル、ペルフルオロアルコキシ、メチレンジオキシ、エチレンジオキシ、カルボキシル、オキソ、チオオキソ、イミノアルキル、アリール、アラルキル、SOnアルキルnは0~2、SOnアリールnは0~2、SOnヘテロアリールnは0~2、SOnヘテロシクリルnは0~2、アミンモノ-、ジ-、アルキル、シクロアルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、およびこれらの組合せ、エステルアルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、アミドモノ-、ジ-、アルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、およびこれらの組合せ、スルホンアミドモノ-、ジ-、アルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、およびこれらの組合せ、非置換アリール、非置換ヘテロアリール、非置換ヘテロシクリル、および非置換シクロアルキルがある。1態様では、基上の置換基は独立に、前述の置換基のいずれか1つ、またはいずれかのサブセットである。用語アデニニル、シトシニル、グアニニル、チミニル、およびウラシリルなどは、アデニン、シトシン、グアニン、チミン、およびウラシルの基を指す。本願明細書で使用する通常でない核酸塩基は、以下のいずれか1つを含むことが可能である:2-メチルアデニニル、N6-メチルアデニニル、2-メチルチオ-N6-メチルアデニニル、N6-イソペンテニルアデニニル、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニニル、N6-シス-ヒドロキシイソペンテニルアデニニル、2-メチルチオ-N6-シス-ヒドロキシイソペンテニルアデニニル、N6-グリシニルカルバモイルアデニニル、N6-トレオニルカルバモイルアデニニル、2-メチルチオ-N6-トレオニルカルバモイルアデニニル、N6-メチル-N6-トレオニルカルバモイルアデニニル、N6-ヒドロキシノルバリルカルバモイルアデニニル、2-メチルチオ-N6-ヒドロキシノルバリルカルバモイルアデニニル、N6,N6-ジメチルアデニニル、3-メチルシトシニル、5-メチルシトシニル、2-チオシトシニル、5-ホルミルシトシニル、N4-メチルシトシニル、5-ヒドロキシメチルシトシニル、1-メチルグアニニル、N2-メチルグアニニル、7-メチルグアニニル、N2,N2-ジメチルグアニニル、N2,7-ジメチルグアニニル、N2,N2,7-トリメチルグアニニル、1-メチルグアニニル、7-シアノ-7-デアザグアニニル、7-アミノメチル-7-デアザグアニニル、プソイドウラシリル、ジヒドロウラシリル、5-メチルウラシリル、1-メチルプソイドウラシリル、2-チオウラシリル、4-チオウラシリル、2-チオチミニル5-メチル-2-チオウラシリル、3-3-アミノ-3-カルボキシプロピルウラシリル、5-ヒドロキシウラシリル、5-メトキシウラシリル、ウラシリル5-オキシ酢酸、ウラシリル5-オキシ酢酸メチルエステル、5-カルボキシヒドロキシメチルウラシリル、5-カルボキシヒドロキシメチルウラシリルメチルエステル、5-メトキシカルボニルメチルウラシリル、5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウラシリル、5-アミノメチル-2-チオウラシリル、5-メチルアミノメチルウラシリル、5-メチルアミノメチル-2-チオウラシリル、5-メチルアミノメチル-2-セレノウラシリル、5-カルバモイルメチルウラシリル、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシリル、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウラシリル、3-メチルウラシリル、1-メチル-3-3-アミノ-3-カルボキシプロピルプソイドウラシリル、5-カルボキシメチルウラシリル、5-メチルジヒドロウラシリル、または3-メチルプソイドウラシリル。パリンドロームRNA、例えばiRNA剤は、本願明細書に記載するパリンドローム構造を有することが可能である。例えば、本発明のiRNA剤は、2つ以上のRNA領域を標的とすることが可能である。例えばiRNA剤は、互いにハイブリダイズするのに十分相補的な第1配列および第2配列を含むことが可能である。第1配列はSNCAのRNAの第1の標的配列と相補的であってよく、第2配列はSNCAのRNAの第2の標的配列と相補的であってよい。第1の標的配列と第2の標的配列は、少なくとも1ヌクレオチド異なっているとよい。iRNA剤の第1配列および第2配列が異なるRNA鎖上にあり、かつ第1配列と第2配列の間のミスマッチを、50、40、30、20、10、5、または1未満とすることができる。iRNA剤の第1配列および第2配列が同じRNA鎖上にあり、かつ関連実施形態では、該iRNA剤の50、60、70、80、90、95より多く、あるいは1が、2分子の形態であってもよい。iRNA剤の第1配列と第2配列が、互いに完全に相補的であってもよい。第1の標的RNA領域と第2の標的RNA領域は、第1配列および第2配列の変異体、例えばSNCA遺伝子の第1および第2の対立遺伝子によってコードされる転写物上に存在してもよい。配列の変異は、例えば突然変異、または多型性であってよい。第1の標的RNA領域が、第2の標的RNA領域と比べてヌクレオチドの置換、挿入、または欠失を含むことも可能であり、あるいは第2の標的RNA領域が、第1の標的領域の突然変異体または変異体であることも可能である。本発明の組成物は、iRNA剤分子の混合物を含むことが可能である。例えば、1つのiRNA剤は、互いにハイブリダイズするのに十分相補的な第1配列および第2配列を含むことが可能であり、さらに第1配列は第1の標的RNA領域と相補的であり、第2配列は第2の標的RNA領域と相補的である。この混合物は、互いにハイブリダイズするのに十分相補的な第3配列および第4配列を含む、少なくとも1つの他の種類のiRNA剤を含むことも可能であり、この場合第3配列は第3の標的RNA領域と相補的であり、第4配列は第4の標的RNA領域と相補的である。さらに、第1配列または第2配列は、第3配列または第4配列と、互いにハイブリダイズすることが可能であるほど十分相補的であってもよい。第1配列と第2配列は同じRNA鎖上に存在しても異なるRNA鎖上に存在してもよく、第3配列と第4配列は同じRNA鎖上に存在しても異なるRNA鎖上に存在してもよい。iRNA剤は、SNCAの第1の変異体RNA標的領域と相補的な第1配列、およびSNCAの第2の変異体RNA標的領域と相補的な第2配列を含むことが可能である。第1および第2の変異体RNA標的領域は、標的SNCA遺伝子の対立遺伝子変異、突然変異例えば点突然変異、または多型を含んでいてもよい。標準的なワトソン-クリック以外の二本鎖構造。標準的なワトソン-クリック以外の二本鎖構造RNA、例えばiRNA剤は、別のモノマー、例えば別の鎖上のモノマーと標準的なワトソンクリック以外の対合を形成することができるモノマーを包含することができる。二本鎖のモノマー間の標準的なワトソン-クリック以外の対合の使用は、二本鎖のすべて又は一部の融解を制御多くの場合は促進するのに使用することができる。iRNA剤は、選択された位置又は制約された位置にモノマーを包含することができ、その結果、iRNA剤二本鎖における例えば、二本鎖iRNA剤の2つの別個の分子間での第1のレベルの安定性、及びiRNA剤の配列と別の配列分子例えば、対象者における標的配列又はオフターゲット標的ではない配列との間の二本鎖における第2のレベルの安定性をもたらす。場合によっては、第2の二本鎖は、例えばiRNA剤のアンチセンス配列と標的mRNAとの間の二本鎖において、比較的高いレベルの安定性を有する。この場合、1つ又はそれ以上のモノマー、iRNA剤におけるモノマーの位置、及び標的配列本明細書中では、選択パラメータ又は制約パラメータと称することもあるの選択は、iRNA剤二本鎖が比較的低い会合の自由エネルギーを有するメカニズム又は理論により拘束されることを望まないが、このことはRISCに関しては二本鎖iRNA剤の解離を促進することにより有効性に寄与すると考えられる一方で、標的指向性のアンチセンス配列とその標的配列との間で形成される二本鎖が、比較的高い会合の自由エネルギーを有するメカニズム又は理論により拘束されることを望まないが、このことはアンチセンス配列と標的RNAとの会合を促進することにより有効性に寄与すると考えられるようになされる。他の場合では、第2の二本鎖は、例えばiRNA剤のセンス配列とオフターゲットmRNAとの間の二本鎖において、比較的低いレベルの安定性を有する。この場合、1つ又はそれ以上のモノマー、iRNA剤におけるモノマーの位置、及びオフターゲット配列の選択は、iRNA剤二本鎖が比較的高い会合の自由エネルギーを有する一方で、標的指向性のセンス配列とそのオフターゲット配列との間で形成される二本鎖が、比較的低い会合の自由エネルギーを有するメカニズム又は理論により拘束されることを望まないが、センス鎖とオフターゲット配列から形成される二本鎖の解離を促進することにより、オフターゲット配列をサイレンシングするレベルを低減すると考えられるようになされる。したがって、iRNA剤内の二本鎖に関する第1の安定性、ならびにiRNA剤由来の配列と別のRNA、例えば標的mRNAとの間で形成される二本鎖に関する第2の安定性を有するという特性は、iRNA剤の構造において固有のものである。上述のように、この特性は、選択された位置又は制約された位置の1つ又はそれ以上のモノマーの慎重な選択、選択された位置又は制約された位置を設定するための二本鎖における位置の選択、及び標的配列の配列例えば、標的とされるべき標的遺伝子の特定の領域の選択により達成され得る。これらの要件を満たすiRNA剤配列は、本明細書中では制約配列と称することもある。制約パラメータ又は選択パラメータは、例えば、検査により、あるいはコンピュータ支援方法により達成することができる。パラメータの使用により、例えば二本鎖の安定性又は相対安定性に関して所望の結果が得られるように、標的配列及び特定のモノマーを選択することができる。したがって、別の態様では、本発明は、第1の標的領域を標的とする第1の配列及び第2の標的領域を標的とする第2の配列を包含するiRNA剤を特徴とする。第1の配列及び第2の配列は、例えば生理学的条件下で例えば、生理学的条件下であるが、ヘリカーゼ又は他の巻き戻し酵素とは接触しない条件下で互いにハイブリダイズするのに十分な相補性を有する。iRNA剤の二本鎖領域では、選択された位置又は制約された位置で、第1の標的領域が第1のモノマーを有し、第2の標的領域が第2のモノマーを有する。第1のモノマー及び第2のモノマーは、相補的位置又は対応する位置を占める。一方のモノマー、及び好ましくは両方のモノマーが、第1の配列と第2の配列との間での二本鎖に寄与するモノマーの対合の安定性が、第1の配列又は第2の配列と標的配列との間での対合の安定性と異なるように選択される。通常、モノマーは、iRNA剤配列と標的RNA二本鎖との間の二本鎖におけるモノマーとその相補的モノマーとの対合により保有されるであろう解離の自由エネルギー及びTmよりも、低い解離の自由エネルギー及び低いTmを有するiRNA剤二本鎖における対合をモノマーが形成するように選択される標的配列の選択も同様に要求され得る。モノマーに与えられる制約は、選択部位に、あるいは2個以上の選択部位に適用され得る。例えば、iRNA剤二本鎖において、2個以上であるが、3個未満、4個未満、5個未満、6個未満又は7個未満の部位に制約が適用され得る。制約部位又は選択部位は、iRNA剤二本鎖の多数の位置に存在することができる。例えば、制約部位又は選択部位は、二本鎖の配列の3’末端又は5’末端の一方から3位、4位、5位又は6位以内の位置に存在することができる。制約部位又は選択部位は、二本鎖領域の中央に存在することもでき、例えば、制約部位又は選択部位は、二本鎖の領域の末端から4位以上、5位以上、6位以上又は7位以上の位置であり得る。幾つかの実施形態では、iRNA剤の二本鎖領域は、選択部位又は制約部位単数又は複数のほかに、ミスマッチを有する。好ましくは、iRNA剤の二本鎖領域は、標準的なワトソン-クリック対を形成しないか、又はハイブリダイズしない1個以下、2個以下、3個以下、4個以下又は5個以下の塩基を有する。突出部については、本明細書中の他の箇所で詳述しているが、好ましくは約2ヌクレオチド長である。突出部は、標的とされる遺伝子配列に対して相補的であってもよいし、又は他の配列でもよい。TTは、突出部の好ましい配列である。第1のiRNA剤配列及び第2のiRNA剤配列はまた、例えばヘアピンを形成するための追加の塩基により、あるいは他の非塩基リンカーにより連結させることもできる。モノマーは、第1のモノマー及び第2のモノマーが天然に存在するリボヌクレオチド又は天然に存在する塩基を有する修飾リボヌクレオチドであるように、かつ、相補的部位を占有する場合、対合もせず実質的レベルのH結合も有さないか、又は非標準的ワトソン-クリック対合を形成して非標準的なH結合のパターンを形成する通常、標準的なワトソン-クリック対合で見られるよりも低い解離の自由エネルギーを有するか、あるいはそうでなければ予め選択した値の会合の自由エネルギー未満であるか、例えば標準的な対合の会合の自由エネルギーよりも低い会合の自由エネルギーとなるように対合するように選択することができる。iRNA剤の配列の一方又は両方が標的と二本鎖を形成する場合、第1の又は第2のモノマーは、標的上の相補的位置にある塩基と標準的なワトソン-クリック対合を形成するか、あるいはiRNA剤における対合で見られるよりも高い解離の自由エネルギー及び高いTmを有する非標準的なワトソン-クリック対を形成する。古典的なワトソン-クリック対は、以下の通りである:A-T、G-C及びA-U。非標準的なワトソン-クリック対合は、当該技術分野で既知であり、U-U、G-G、G-Aトランス、G-Aシス及びGUを挙げることができる。配列の一方又は両方におけるモノマーの選択は、モノマーが対合をしないか、あるいは他方の配列の対応するモノマーとの対を形成し、その対が安定性を最小限にする例えば、一方の配列の選択部位のモノマーと他方の配列の対応する部位のモノマーとの間で形成されるH結合は、一方又は両方の配列のモノマーと各々の標的配列とにより形成されるH結合よりも安定性が劣るようになされる。一方又は両方の鎖のモノマーの選択はまた、鎖とその標的配列により作製される二本鎖の一方又は両方における安定性を促進するように為される。例えば、1つ又はそれ以上のモノマー及び標的配列の選択は、選択位置又は制約位置で、iRNA剤二本鎖中でH結合が形成されないか、もしくは非標準的な対合が形成されるか、あるいはそうでなければ予め選択した値の会合の自由エネルギー未満であるか、又は例えば標準的な対合の会合の自由エネルギーよりも低い会合の自由エネルギーを付与するように対合するが、一方又は両方の配列が各々の標的と二本鎖を形成する場合は、選択部位又は制約部位での対合は標準的なワトソン-クリック対であるようにすることができる。このようなモノマーを含むことにより、以下の1つ又はそれ以上の効果、すなわち:iRNA剤二本鎖を不安定化すること、センス配列と意図されない標的配列オフターゲット配列と称することもあるとの間の相互作用を不安定化すること、配列と意図される標的との間の相互作用は不安定化されないこと、を有することになる。天然に存在しないモノマー又は修飾モノマー単数又は複数の選択は、天然に存在しないモノマー又は修飾モノマーがiRNA剤の選択位置又は制約位置に配置される場合は第1の解離の自由エネルギーを示し、かつそれらの一方又は両方が天然に存在するモノマーと対合する場合は、対が第2の解離の自由エネルギーを示す通常、第2の解離の自由エネルギーは、第1のモノマーと第2のモノマーの対合の解離の自由エネルギーよりも高いように実施することができる。例えば、第1のモノマー及び第2のモノマーが相補的位置を占める場合、第1のモノマー及び第2のモノマーは、対合もせず、実質的レベルのH結合も有さないか、又は、該モノマーの一方が天然に存在するモノマーと形成するよりも弱い結合を形成して、その二本鎖の安定性を低減するが、その二本鎖が解離すると、少なくとも一方の鎖は標的と二本鎖を形成し、標的との二本鎖においては、選択モノマーは安定性を促進する例えばモノマーは、標的配列中の天然に存在するモノマーと、iRNA剤において形成される対合よりも安定な対を形成する。このような対の例は、2-アミノA、及びU又はTの2-チオピリミジン類縁体のいずれかである。iRNA剤の相補的位置に配置される場合、これらのモノマーはほとんど対合せず、安定性は最小限となる。しかしながら、2-アミノAと天然に存在する標的のUとの間で二本鎖が形成されるか、あるいは、2-チオUと天然に存在する標的のAとの間、又は2-チオTと天然に存在する標的のAとの間で二本鎖が形成され、比較的高い解離の自由エネルギーを有し、かつより安定となる。標準的なワトソン-クリック以外の対合という用語は、本明細書中で使用する場合、二本鎖の第1の配列の第1のモノマーと第2の配列の対応する位置の第2のモノマーとの間での対合であって、下記のうち1つまたはそれ以上が事実であるものを指す:1該2つのモノマーの間に本質的に対合が存在しない、例えばモノマー間に有意なレベルのH結合が存在しないか、あるいはモノマー間の結合が二本鎖の安定性に対していかなる有意な寄与もしていない、2該モノマーが、天然に存在する塩基を有する非標準的なモノマー対である、すなわち、A-T、A-U又はG-C以外であり、かつ該モノマーは、モノマー間のH結合を形成するが、概して形成されるH結合パターンは、標準的な対合により形成される結合よりも弱い、あるいは3該モノマーの少なくとも1つは天然に存在しない塩基を包含し、かつモノマー間で形成されるH結合は、好ましくは、標準的な対合すなわちA-T、A-U、G-Cのうち1つ又はそれ以上により形成される結合よりも弱い。オフターゲットという用語は、本明細書中で使用する場合、サイレンシングされるべき配列以外の配列を指す。普遍的塩基:ワイルドカード;形状に基づいた相補性ジフルオロトルエンとアデニンとの間の塩基対の、二本鎖の多重部位における複製:逆シーケンシングによる確認Bistrandedmultisitereplicationofabasepairbetweendifluorotolueneandadenineconfirmationbyinversesequencing、リウ、ディー;モラン、エス;クール、イー.ティーLiu,D.;Moran,S;Kool,E.T.、Chem.Biol.、1997年、第4巻、919~926ページDNAポリメラーゼIのクレノウ断片による3’末端プルーフリーディングにおける末端塩基対水素結合の重要性Importanceofterminalbasepairhydrogenbondingin3endproofreadingbytheKlenowfragmentofDNApolymeraseI、モラレス、ジェー.シー;クール、イー.ティーMorales,J.C;Kool,E.T.、Biochemistry、2000年、第39巻、2626~2632ページ水素結合を伴わない選択的かつ安定なDNA塩基対合SelectiveandstableDNAbasepairingwithouthydrogenbonds、マトレイ、ティー、ジェー;クール、イー、ティーMatray,T.J;Kool,E.T.、J.Am.Chem.Soc.,1998年、第120巻、6191~6192ページチミンに関する無極性同配体であるジフルオロトルエンは、DNA複製において特異的かつ効率的にアデニンをコードするDifluorotolueneanonpolarisostereforthyminecodesspecificallyandefficientlyforadenineinDNAreplication、モラン、S;レン、アール.エックス.-エフ;ラムネイアイブイ、エス;クール、イー.ティーMoran,S.Ren,R.X.-F;RumneyIV,S;Kool,E.T.、J.Am.Chem.Soc.、1997年、第119巻、2056~2057ページデオキシアデノシンに関する複製可能な無極性同配体の構造及び塩基対特性Structureandbasepairingpropertiesofreplicablenonpolarisosterefordeoxyadenosine、グクキアン、ケー.エム;モラレス、イー.ティーGuckian,K.M.;Morales,J.C.;Kool,E.T.、Org.Chem.、1998年、第63巻9653~9656ページハイブリダイゼーション、複製及び鎖終結用の普遍的塩基Universalbasesforhybridizationreplicationandchaintermination、バーガー、エム;ウー.ワイ.;オガワ、エー.ケー.;マクミン、ディー.エル.;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.Berger,M.;Wu.Y.;Ogawa,A.K.;McMinn,D.L.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、NucleicAcidsRes.、2000年、第28巻、2911~2914ページ1.遺伝子アルファベットの拡大に対する取り組み:非天然の疎水性塩基対による情報保存及び複製EffortstowardexpansionofthegeneticalphabetInformationstorageandreplicationwithunnaturalhydrophobicbasepairs、オガワ、エー.ケー.;ウー.ワイ.;マクミン、ディー.エル.;リウ、ジェー.;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.Ogawa,A.K.;Wu.Y.;McMinn,D.L.;Liu,J.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、J.Am.Chem.Soc.、2000年、第122巻、3274~3287ページ。2.動力学的選択性の増大による非天然塩基対の合理的設計Rationaldesignofanunnaturalbasepairwithincreasedkineticselectivity、オガワ、エー.ケー.;ウー.ワイ.;バーガー、エム;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.Ogawa,A.K.;Wu.Y.;Berger,M.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、J.Am.Chem.Soc.、2000年、第122巻、8803~8804ページ遺伝子アルファベットの拡大に対する取り組み:3つの塩基対によるDNAの複製EffortstowardexpansionofthegeneticalphabetreplicationofDNAwiththreebasepairs、タエ、イー.エル.;ウー.ワイ.;キシア、ジー.;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.Tae,E.L.;Wu.Y.;Xia,G.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、J.Am.Chem.Soc.、2001年、第123巻、7439~7440ページ1.遺伝子アルファベットの拡大に対する取り組み:塩基間疎水性相互作用の最適化EffortstowardexpansionofthegeneticalphabetOptimizationofinterbasehydrophobicinteractions、ウー.ワイ.;オガワ、エー.ケー.;バーガー、エム;マクミン、ディー.エル.;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.Wu.Y.;Ogawa,A.K.;Berger,M.;McMinn,D.L.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、J.Am.Chem.Soc.、2000年、第122巻、7621~7632ページ。2.遺伝子アルファベットの拡大に対する取り組み:非常に安定な自己対合疎水性塩基のDNAポリメラーゼ認識EffortstowardexpansionofthegeneticalphabetDNApolymeraserecognitionofahighlystableselfpairinghydrophobicbase、マクミン、ディー.エル.;オガワ、エー.ケー.;ウー.ワイ.;リウ、ジェー.;シュルツ、ピー.ジー.;ロメスベルグ、エフ.イー.McMinn,D.L.;Ogawa,A.K.;Wu.Y.;Liu,J.;Schultz,P.G.;Romesberg,F.E.、J.Am.Chem.Soc.、1999年、第121巻、11585~11586ページ非水素結合及び非形状相補的塩基対を含有する安定なDNA二本鎖:安定性決定因子としての鎖間スタッキングAstableDNAduplexcontaininganonhydrogenbondingandnonshapecomplementarybasecoupleInterstrandstackingasthestabilitydeterminingfactor、ボロッツチー、シー.;ハベルリー、エー.;ロイマン、シーBrotschi,C.;Harberli,A.;Leumann,C、J.、Angew.Chem.Int.Ed.、2001年、第40巻、3012~3014ページ2,2’-ビピリジンリガンドシド:二本鎖内金属錯体によりDNAを修飾するための新規構成単位22BipyridineLigandosideAnovelbuildingblockformodifyingDNAwithintraduplexmetalcomplexes、ワイツマン、エイチ.;トル、ワイWeizmann,H.;Tor,Y.、J.Am.Chem.Soc.、2001年、第123巻、3375~3376ページ副溝の水和は、DNA二本鎖の安定性に重要であるMinorgroovehydrationiscriticaltothestabilityofDNAduplexes、ラン、ティー.;マクロウグリン、エル.ダブリュLan,T.;McLaughlin,L.W.、J.Am.Chem.Soc.、2000年、第122巻、6512~6513ページ隣接天然塩基の選択性に対する普遍的塩基である3-ニトロピロールの影響EffectsoftheUniversalbase3nitropyrroleontheselectivityofneighboringnaturalbases、オリバー、ジェー.エス.;パーカー、ケー.エー.;サッグス、ジェー.ダブリュ.Oliver,J.S.;Parker,K.A.;Suggs,J.W、OrganicLett.、2001年、第3巻、1977~1980ページ。2.DNA二本鎖及び三本鎖の安定性に対する1-2’-デオキシ-β-D-リボフラノシル-3-ニトロピロール残基の影響Effectsofthe13nitropyrrolresidueonthestabilityofDNAduplexesandtriplexes、アモソバ、オー,;ジョージジェー.;フレスコ、ジェー.アール.Amosova,O.;GeorgeJ.;Fresco,J.R.、NucleicAcidsRes.、1997年、第25巻、1930~1934ページ。3.普遍的ヌクレオシド:1-2’-デオキシ-β-D-リボフラノシル-3-ニトロピロールによる合成、構造及びデオキシリボ核酸シーケンシングSynthesisstructureanddeoxyribonucleicacidsequencingwithauniversalnucleosides13nitropyrrol、バーグストロム、ディー.イー.;ツァング、ピー.;トマ、ピー.エイチ.;アンドリュース、ピー.シー.;ニコルズ、アール.Bergstorm,D.E.;Zhang,P.;Toma,P.H.;Andrews,P.C.;Nichols,R.、J.Am.Chem.Soc.、1995年、第117巻、1201~1209ページ一般的な三本鎖DNA認識スキームを対象とするモデル研究:有機溶媒中でCG塩基対を結合する新規DNA塩基ModelstudiesdirectedtowardageneraltriplexDNArecognitionschemeanovelDNAbasethatbindsaCGbasepairinanorganicsolvent、ジマーマン、エス.シー.;シュミット、ピー.Zimmerman,S.C.;Schmitt,P.、J.Am.Chem.Soc.、1995年、第117巻、10769~10770ページ普遍的光切断DNA塩基:ニトロピペロニル2’-デオキシリボシドAuniversalphotocleavableDNAbasenitropiperonyl2deoxyriboside、J.Org.Chem.、2001年、第66巻、2067~2071ページ2-アシルアミノ-1,8-ナフチリジンによる単一グアニンバルジの認識Recognitionofasingleguaninebulgeby2acylamino18naphthyridine、ナカタニ、ケー.;サンド、エス.;サイトー、アイ.Nakatani,K.;Sando,S.;Saito,I.、J.Am.Chem.Soc.、2000年、第122巻、2172~2177ページ。b.GCダブレットの光酸化により明らかであるような単一グアニンバルジへの2-アミノ-1,8-ナフチリジンの特異的結合Specificbindingof2amino18naphthyridineintosingleguaninebulgeasevidencedbyphotooxidationofGCdoublet、ナカタニ、ケー.;サンド、エス.;ヨシダ、ケー.;サイトー、アイ.Nakatani,K.;Sando,S.;Yoshida,K.;Saito,I.、Bioorg.Med.Chem.Lett.、2001年、第11巻、335~337ページ他の普遍的塩基は、下記式を有することができる:式中、Qは、N又はCR44であり、Q’は、N又はCR45であり、Qは、N又はCR47であり、Q’’’は、N又はCR49であり、Qivは、N又はCR50であり、R44は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリルであるか、あるいはR45と一体となって-OCH2O-を形成し、R45は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリルであるか、あるいはR44又はR46と一体となって-OCH2O-を形成し、R46は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリルであるか、あるいはR45又はR47と一体となって-OCH2O-を形成し、R47は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリルであるか、あるいはR46又はR48と一体となって-OCH2O-を形成し、R48は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリルであるか、あるいはR47と一体となって-OCH2O-を形成し、R49、R50、R51、R52、R53、R54、R57、R58、R59、R60、R61、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70、R71及びR72はそれぞれ独立して、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C2~C6アルキニル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリル、NCOR17、又はNCOR0から選択され、R55は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C2~C6アルキニル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリル、NCOR17、又はNCOR0であるか、あるいはR56と一体となって縮合芳香環を形成し、該縮合芳香環は任意選択で置換されていてもよく、R56は、水素、ハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C2~C6アルキニル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリル、NCOR17、又はNCOR0であるか、あるいはR55と一体となって縮合芳香環を形成し、該縮合芳香環は任意選択で置換されていてもよく、R17は、ハロ、NH2、NHRb、又はNRbRcであり、Rbは、C1~C6アルキル又は窒素保護基であり、RCは、C1~C6アルキルであり、R0は、任意選択でハロ、ヒドロキシ、ニトロ、保護ヒドロキシ、NH2、NHRb、又はNRbRc、C1~C6アルキル、C2~C6アルキニル、C6~C10アリール、C6~C10ヘテロアリール、C3~C8ヘテロシクリル、NCOR17、又はNCOR0で置換されたアルキルである。普遍的塩基の例として以下のものが挙げられる:非対称的な修飾RNA、例えばiRNA剤は、本明細書中に記載するように、かつ2004年3月8日付けで出願された国際出願第PCT/US04/07070号これは、参照により本明細書に援用されるに記載されるように、非対称的に修飾することができる。さらに、本発明は、非対称的な修飾及び本明細書中に記載する別の構成要素を有するiRNA剤を包含する。例えば、本発明は、本明細書中に記載するiRNA剤、例えば、パリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書中に記載する遺伝子例えば、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本明細書中に記載する構成様式又は構造を有するiRNA剤、本明細書中に記載する薬物送達モジュールと結合されたiRNA、本明細書中に記載するように投与されるiRNA剤、又は本明細書中に記載するように製剤化されるiRNA剤であって、非対称的な修飾も取り入れるiRNA剤を包含する。非対称的に修飾されたiRNA剤とは、鎖が他方の鎖上に存在しない修飾を有するiRNA剤である。非対称的な修飾とは、一方の鎖上に見られるが、他方の鎖上には見られない修飾である。任意の修飾、例えば本明細書中に記載する任意の修飾は、非対称的な修飾として存在し得る。非対称的な修飾により、修飾に伴う任意の望ましい特性、例えば本明細書中で論述した特性を付与することができる。例えば、非対称的な修飾は、分解に対する耐性、半減期の変更をもたらすこともできるし、iRNA剤に特定の標的例えば、特定の組織を指向させることもできるし、鎖のその相補体又は標的配列に対する親和性を調節例えば、増大又は低減することもできるし、あるいは末端部分の修飾例えば、キナーゼ又はRISC機構の経路に関与する他の酵素による修飾を妨害又は促進することもできる。ある修飾について1つの特性を有するものとして指定しても、該修飾が他の特性を有していないことを意味するわけではない例えば、安定化を促進する修飾として言及される修飾が、標的化も増強することもありうる。理論又はいかなる特定の機構モデルによっても拘束されることは望まないが、非対称的な修飾は、iRNA剤をセンス鎖及びアンチセンス鎖の異なるすなわち非対称的機能という観点で最適化させることが可能であると考えられる。例えば、両方の鎖がヌクレアーゼ耐性を増大するように修飾されてもよいが、変更によってはRISC活性が阻害され得るため、これらの変更をセンス鎖に関して選択してもよい。さらに、一部の修飾、例えば標的化部分は、例えばRISC複合体の切断活性を妨害しうる大きな嵩高い基を付加することができるので、そのような修飾はセンス鎖に配置されることが好ましい。したがって、標的化部分、特に嵩高い標的化部分例えば、コレステロールは、センス鎖に優先的に付加される。一実施形態では、バックボーンのリン酸をSで置換する非対称的修飾、例えばホスホロチオエート修飾がアンチセンス鎖に存在し、かつ2’修飾、例えば2’OMeがセンス鎖に存在する。標的化部分は、iRNA剤のセンス鎖の5’又は3’末端のいずれか又は両方に存在し得る。好ましい例では、アンチセンス鎖においてはバックボーンのPがSで置き換えられ、2’OMeがセンス鎖に存在し、標的化部分がiRNA剤のセンス鎖の5’又は3’末端のいずれかに付加される。好ましい実施形態では、非対称的に修飾されたiRNA剤は、アンチセンス鎖上では見られない修飾をセンス鎖上に有し、アンチセンス鎖は、センス鎖上では見られない修飾を有する。鎖はそれぞれ、1つ又はそれ以上の非対称的修飾を包含し得る。例を挙げると、一方の鎖は、iRNA剤に対して第1の特性を付与する第1の非対称的修飾を包含することができ、他方の鎖は、iRNAに対して第2に特性を付与する第2の非対称的修飾を有することができる。例えば、一方の鎖、例えばセンス鎖は、iRNA剤が組織を標的とするような修飾を有することができ、他方の鎖、例えばアンチセンス鎖は、標的遺伝子配列とのハイブリダイゼーションを促進する修飾を有する。幾つかの実施形態では、両方の鎖が同じ特性を最適化するように、例えば核酸分解に対する耐性を増大させるように修飾することができるが、例えば修飾がさらに他の特性に影響を及ぼすという理由で、センス鎖及びアンチセンス鎖に関して異なる修飾が選ばれる。例えば、一部の変更は、RISC活性に影響を及ぼし得るため、これらの修飾はセンス鎖について選ばれる。ある実施形態では、一方の鎖は、非対称的な2’修飾、例えば2’OMe修飾を有し、他方の鎖は、リン酸バックボーンの非対称的修飾、例えばホスホロチオエート修飾を有する。したがって、一実施形態では、アンチセンス鎖が非対称的な2’OMe修飾を有し、センス鎖が非対称的なホスホロチオエート修飾を有するあるいは、その逆でもよい。特に好ましい実施形態では、本発明のiRNA剤は、センス鎖上に非対称的な2’-Oアルキル、好ましくは2’-OMe修飾を、アンチセンス鎖には非対称的なバックボーンのP修飾、好ましくはホスホロチオエート修飾を有する。1つ又は多数の2’-OMe修飾が存在することができ、例えば、センス鎖の少なくとも2個、3個、4個、5個又は6個のサブユニットを2’-OMe修飾することができる。1つ又は多数のホスホロチオエート修飾が存在することができ、例えば、アンチセンス鎖の少なくとも2個、3個、4個、5個又は6個のサブユニットをホスホロチオエート修飾することができる。センス鎖上に多数の2’-OMe修飾及びアンチセンス鎖上に多数のホスホロチオエート修飾が存在するiRNA剤を有することが好ましい。一方又は両方の鎖上のすべてのサブユニットを前記のように修飾することもできる。両方の鎖上の多数の非対称的修飾の特に好ましい実施形態は、長さが約20~21サブユニット、好ましくは19サブユニットの二本鎖領域、及び長さが約2サブユニットの1個又は2個の3’突出部を有する。非対称的な修飾は、ヌクレアーゼ、例えばエンドヌクレアーゼによる分解に対する耐性を促進するのに有用である。iRNA剤は、分解に対する耐性を促進する1つ又はそれ以上の非対称的修飾を包含することができる。好ましい実施形態では、アンチセンス鎖上の修飾は、標的のサイレンシングを妨害しない修飾、例えば標的の切断を妨害しない修飾である。鎖上のすべてではないにしても、ほとんどの部位が、エンドヌクレアーゼによる分解に対してある程度弱い。相対的に弱い部位を特定し、分解を阻害する非対称的修飾を挿入することができる。多くの場合、iRNA剤におけるUA部位の非対称的修飾を提供することが望ましく、場合によっては、両方の鎖上のUA配列に非対称的修飾を提供することが望ましい。エンドヌクレアーゼによる分解を阻害する修飾の例は、本明細書中に見出すことができる。特に好適な修飾としては、2’位修飾例えば特にセンス鎖上のUへの2’OMe部分の付与、バックボーンの修飾例えば、特にアンチセンス鎖上のU若しくはA又はその両方についてリン酸バックボーンのOをSで置き換えること例えば、ホスホロチオエート修飾の提供による修飾、UをC5アミノリンカーで置き換えること、AをGで置き換えること配列の変更は、センス鎖上に位置し、アンチセンス鎖上には位置しないことが好ましい、及び2’、6’、7’又は8’位の修飾が挙げられる。好ましい実施形態は、1つ又はそれ以上のこれらの修飾がセンス鎖上に存在するが、アンチセンス鎖上には存在しない実施形態、あるいはアンチセンス鎖のほうがこのような修飾の数が少ない実施形態である。非対称的な修飾は、エキソヌクレアーゼによる分解を阻害するために使用することができる。非対称的な修飾としては、一方の鎖のみが修飾されるもの、ならびに両方が修飾されるものを挙げることができる。好ましい実施形態では、アンチセンス鎖上の修飾は、標的のサイレンシングを妨害しない修飾、例えば標的の切断を妨害しない修飾である。幾つかの実施形態は、センス鎖上、例えば3’突出部の例えば3’末端に、及びアンチセンス鎖上、例えば3’突出部の例えば3’末端に、非対称的修飾を有する。修飾により異なるサイズの構成部分が導入される場合、大きいほうがセンス鎖上に存在することが好ましい。修飾により異なる電荷の構成部分が導入される場合、より大きな電荷を有する部分がセンス鎖上に存在することが好ましい。エキソヌクレアーゼによる分解を阻害する修飾の例は、本明細書中に見出すことができる。特に好適な修飾としては、2’位修飾例えば3’突出部の例えば3’末端への2’OMe部分の提供3’末端とは、文脈により示されるように、分子の3’位の原子、又は最も3’側の構成部分、例えば最も3’側のP又は2’位を意味する、例えばPをSで置き換えること例えば、ホスホロチオエート修飾の提供もしくは3’突出部の例えば3’末端におけるメチル化Pの使用によるバックボーンの修飾、2’位修飾の組合せ例えば、2’OMe部分の提供と、例えばPをSで置き換えること例えば、ホスホロチオエート修飾の提供もしくは3’突出部の例えば3’末端におけるメチル化Pの使用によるバックボーンの修飾との組合せ、3’アルキルによる修飾、3’突出部の例えば3’末端における脱塩基ピロリジンによる修飾、ナプロキセン、イブプロフェン又はその他の分解を阻害する構成部分による3’末端の修飾が挙げられる。好ましい実施形態は、1つ又はそれ以上のこれらの修飾がセンス鎖上に存在するが、アンチセンス鎖上には存在しないもの、あるいはアンチセンス鎖のほうがこのような修飾の数が少ない実施形態である。標的化に影響を及ぼす修飾、例えば本明細書中に記載する修飾を、非対称的修飾として提供することが可能である。例えば標的の切断を阻害することにより、サイレンシングを阻害し得る標的化修飾は、センス鎖の非対称的修飾として提供され得る。体内分布を変化させる構成部分例えばコレステロールは、センス鎖における1つ又はそれ以上例えば、2つの非対称的修飾として提供され得る。比較的大きな分子量例えば400、500又は1,000ダルトンを上回る分子量を有する構成部分を導入する標的化修飾、あるいは電荷を有する構成部分例えば、2つ以上の正電荷又は1つの負電荷を有する構成部分を導入する標的化修飾は、センス鎖上に配置させることができる。鎖のその相補体又は標的に対する親和性を調節する例えば、増大又は低下させる修飾、例えば本明細書中に記載する修飾は、非対称的修飾として提供され得る。これらの修飾としては、5メチルU、5メチルC、プソイドウリジン、ロックト核酸、2チオU及び2-アミノ-Aが挙げられる。幾つかの実施形態では、これらの1つ又はそれ以上がアンチセンス鎖上に提供される。iRNA剤は、センス鎖及びアンチセンス鎖を有する規定構造を有し、多くの場合例えば2又は3ヌクレオチドの短い一本鎖の突出部が、一方又は両方の3’末端に存在する。非対称的な修飾を、例えばiRNA内に選択的に位置させることにより、このような構造の活性を最適化するのに使用することができる。例えば、センス鎖の5’末端及びアンチセンス鎖の3’末端により規定されるiRNA剤の末端領域は、機能にとって重要である。この領域は、末端の2個、3個又は4個のヌクレオチド対と任意の3’突出部とを含むことができる。好ましい実施形態では、以下、すなわち:センス鎖のキナーゼ活性化を阻害するセンス鎖5’末端の修飾例えば、キナーゼ分子を標的とする複合体の結合、又は5’エキソヌクレアーゼによる分解に対して保護的に作用する修飾の使用など、又はセンス鎖とアンチセンス鎖との間の結合を増強することにより分子のこの末端にある緊密な構造を促進する、いずれか一方の鎖、好ましくはセンス鎖の修飾、のうち1つ又はそれ以上をもたらす非対称的修飾が使用される。センス鎖の3’末端及びアンチセンス鎖の5’末端により規定されるiRNA剤の末端領域もまた機能にとって重要である。この領域は、末端の2個、3個又は4個のヌクレオチド対と任意の3’突出部とを含むことができる。好ましい実施形態は、センス鎖とアンチセンス鎖との間の結合を減少させることにより分子のこの末端にある開放的な構造を促進する、いずれか一方の鎖、好ましくはセンス鎖の非対称的修飾を包含する。このような修飾としては、分子を標的とする複合体を配置すること、あるいはセンス鎖のこの領域におけるヌクレアーゼ耐性を促進する修飾が挙げられる。キナーゼ活性化を阻害するアンチセンス鎖の修飾は、好ましい実施形態では回避される。センス鎖に非対称的に配置される例示的な修飾としては、以下のものが挙げられる。aバックボーン修飾例えば、バックボーンのPの修飾であって、PをSで置き換えること、又はアルキル若しくはアリル例えば、Meで置換されたP、及びジチオエートS-P=Sを含む;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するのに使用することができる;b2’-Oアルキル例えば、2’-OMe、3’-Oアルキル例えば、3’-OMe末端及び内部位置の少なくともいずれかを修飾;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するため、又はアンチセンス鎖へのセンス鎖の結合を増強するために使用することができ、3’位修飾は、RISCによるセンス鎖活性化を回避するためにセンス鎖の5’末端で使用することができる;c2’~5’結合2’-H、2’-OH及び2’-OMeによるもの、及びP=O又はP=Sによるもの;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するため、又はアンチセンス鎖へのセンス鎖の結合を阻害するために使用することもできるし、あるいはRISCによるセンス鎖活性化を回避するためにセンス鎖の5’末端で使用することもできる;dL糖例えば、2’-H、2’-OH及び2’-OMeを有する2’L-リボース、L-アラビノース;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するため、又はアンチセンス鎖へのセンス鎖の結合を阻害するために使用することもできるし、あるいはRISCによるセンス鎖活性化を回避するためにセンス鎖の5’末端で使用することもできる;e修飾糖例えば、ロックト核酸LNA、ヘキソース核酸HNA及びシクロヘキセン核酸CeNA;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するため、又はアンチセンス鎖へのセンス鎖の結合を阻害するために使用することもできるし、あるいはRISCによるセンス鎖活性化を回避するためにセンス鎖の5’末端で使用することもできる;f核酸塩基修飾例えば、C-5修飾ピリミジン、N-2修飾プリン、N-7修飾プリン、N-6修飾プリン;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するために、又はアンチセンス鎖へのセンス鎖の結合を促進するために使用することができる;gカチオン基及び双性イオン基末端にあることが好ましい;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するために使用することができる;h複合体基末端位置にあることが好ましい、例えば、ナプロキセン、ビオチン、コレステロール、イブプロフェン、葉酸、ペプチド及び糖質;これらの修飾は、ヌクレアーゼ耐性を促進するため、又は分子を標的化するために使用することもできるし、あるいはRISCによるセンス鎖活性化を回避するためにセンス鎖の5’末端で使用することもできる。アンチセンス鎖に非対称的に配置される例示的な修飾としては、以下のものが挙げられる:aバックボーン修飾例えば、バックボーンのPの修飾であって、PをSで置き換えること、又はアルキル若しくはアリル例えば、Meで置換されたP、及びジチオエートS-P=Sを含む;b2’-Oアルキル例えば、2’-OMe末端位置を修飾;c2’~5’結合2’-H、2’-OH及び2’-OMeによるもの例えば、3’末端での末端修飾;P=O又はP=Sによる好ましくは3’末端の修飾;これらの修飾は、キナーゼ活性のようなRISC酵素活性を妨害し得るため、5’末端領域からは排除されることが好ましい;dL糖例えば、2’-H、2’-OH及び2’-OMeを有するL-リボース、L-アラビノース;例えば、3’末端での末端修飾;例えばP=O又はP=Sによる好ましくは3’末端の修飾;これらの修飾は、キナーゼ活性を妨害し得るため、5’末端領域から排除されることが好ましい;e修飾糖例えば、LNA、HNA及びCeNA;これらの修飾は、センス鎖とアンチセンス鎖との間の対合の望ましくない増強に寄与し得るが、多くの場合は5’領域において緩い構造を有することが好ましいので、さらに該修飾はキナーゼ活性を妨害し得るので、5’末端領域からは排除されることが好ましい;f核酸塩基修飾例えば、C-5修飾ピリミジン、N-2修飾プリン、N-7修飾プリン、N-6修飾プリン;gカチオン基及び双性イオン基末端にあることが好ましい;糖の2’位、糖の3’位にあるカチオン基及び双性イオン基;核酸塩基修飾例えば、C-5修飾ピリミジン、N-2修飾プリン、N-7修飾プリン、N-6修飾プリンとしてのカチオン基及び双性イオン基;複合体基末端位置にあることが好ましい、例えば、ナプロキセン、ビオチン、コレステロール、イブプロフェン、葉酸、ペプチド及び糖質であって、但し、嵩高い基又は概してRISC活性を阻害する基はあまり好ましくないはずである。アンチセンス鎖の5’-OHは、活性を促進するように遊離型に保たれるべきである。幾つかの好ましい実施形態では、ヌクレアーゼ耐性を促進する修飾は、3’末端、特に3’突出部に包含されるべきである。別の態様では、本発明は、iRNA剤を最適化する方法、例えば安定化する方法を特徴とする。該方法は、活性を有する配列を選択すること、該配列に1つ又はそれ以上の非対称的な修飾を導入することを包含し、非対称的な修飾の導入によりiRNA剤の特性が最適化されるが、活性の減少はもたらされない。活性の減少とは、予め選択されたレベルの減少よりも小さい減少とすることができる。好ましい実施形態では、活性の減少とは、修飾が導入されないこと以外は同じiRNAと比較した場合に、5、10、20、40又は50未満の減少であることを意味する。活性は、例えば、invivo又はinvitroで測定することができ、いずれにおける結果も、所要の活性維持を実証するのに十分である。最適化される特性は、本明細書中に記載する任意の特性、特に本明細書中の非対称的な修飾に関するセクションで論述する特性であり得る。修飾は、任意の非対称的な修飾、例えば、本明細書中の非対称的な修飾に関するセクションで記載する非対称的な修飾であり得る。特に好ましい非対称的な修飾は、特にセンス配列における2’-Oアルキル修飾例えば2’-OMe修飾、及びアンチセンス鎖におけるバックボーンのOの修飾、特にホスホロチオエート修飾である。好ましい実施形態では、センス配列が選択されて非対称的な修飾が付与される一方で、他の実施形態ではアンチセンス配列が選択されて非対称的な修飾が付与される。幾つかの実施形態では、センス配列及びアンチセンス配列がともに選択され、それぞれ1つ又はそれ以上の非対称的な修飾が付与される。多数の非対称的な修飾が、センス配列及びアンチセンス配列の一方又は両方に導入され得る。配列は、少なくとも2個、4個、6個、8個又はそれ以上の修飾を有することができ、配列のすべてのモノマー又は実質的にすべてのモノマーを修飾することができる。Z-X-Y構成様式RNA、例えばiRNA剤は、本明細書中に記載するようなZ-X-Y構成様式又は構造を有することができる。さらに、iRNA剤は、Z-X-Y構造及び本明細書中に記載する別の構成要素を有することができる。例えば、本発明は、本明細書中に記載するiRNA剤、例えばパリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書中に記載する遺伝子例えば、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本明細書中に記載する両親媒性送達剤と結合されたiRNA、本明細書中に記載する薬物送達モジュールと結合されたiRNA、本明細書中に記載するように投与されるiRNA剤、又は本明細書中に記載するように製剤化されるiRNA剤であって、Z-X-Y構築様式も取り入れるiRNA剤を包含する。したがって、iRNA剤は、第1のセグメントであるZ領域、第2のセグメントであるX領域、及び任意選択で第3の領域であるY領域:Z-X-Yを有することができる。一方ではZ及び/又はYの一方又は両方、かつ他方ではXにおけるサブユニットを修飾することが望ましい場合がある。場合によっては、サブユニットは、同じ修飾又は同じ種類の修飾を有するが、Z及び/又はYにおいて施される修飾は、Xにおいて施される修飾と異なる場合のほうが多い。Z領域は通常、iRNA剤の末端を包含する。Z領域の長さは多様であり得るが、通常2~14個、より好ましくは2~10個のサブユニットの長さである。通常、Z領域は一本鎖状であるすなわちZ領域は、別の鎖の塩基と塩基対合しないが、幾つかの実施形態では、自己会合して、例えばループ構造を形成し得る。このような構造は、鎖の末端が折り返して鎖内二本鎖を形成することにより形成され得る。例えば、通常2個又はそれ以上の対合しないサブユニットでできた折り返し領域又は接続領域を有する2個、3個、4個、5個又はそれ以上の鎖内塩基対が生じ得る。これは、鎖の一方の末端で生じてもよいし両末端で生じてもよい。Z領域の典型的な実施形態は、一本鎖突出部、例えば本明細書の他の箇所に記載する長さの突出部である。したがって、Z領域は、3’又は5’末端の一本鎖でもよいし、又は3’又は5’末端の一本鎖を包含していてもよい。Z領域はセンス鎖でもアンチセンス鎖でもよいが、アンチセンスである場合には、領域は3-突出部であることが好ましい。Z領域における典型的なサブユニット間結合としては、P=O、P=S、S-P=S、P-NR2及びP-BR2が挙げられる。キラルP=X式中、Xは、S、N又はBであるのサブユニット間結合もまた存在することができる。他の好ましいZ領域サブユニット修飾同様に本明細書中の他の箇所で論述としては、3’-OR、3’SR、2’-OMe、3’-OMe及び2’OH修飾ならびに構成部分、α立体配置の塩基、ならびに2’アラビノ修飾を挙げることができる。X領域は多くの場合、一本鎖iRNA剤の場合には一本鎖の対応する領域とともに、あるいは二本鎖のiRNA剤の場合には他方の鎖の対応する領域とともに、二本鎖状をなしている。X領域の長さは多様であり得るが、通常10~45個、より好ましくは15~35個のサブユニットである。特に好ましい領域Xは、17個、18個、19個、29個、21個、22個、23個、24個又は25個のヌクレオチド対を包含するが、他の適切な長さは、本明細書中の他の箇所で記載されており、それらを使用することができる。典型的なX領域のサブユニットとしては、2’-OHサブユニットが挙げられる。典型的な実施形態では、サブユニット間リン酸結合が好ましい一方で、ホスホロチオエート又は非リン酸結合は存在しない。X領域において好ましい他の修飾としては、結合を改善するための修飾例えば、核酸塩基修飾、カチオン性核酸塩基修飾、及びC-5修飾ピリミジン例えば、アリルアミンが挙げられる。幾つかの実施形態は、4個又はそれ以上の連続した2’OHサブユニットを有する。ホスホロチオエートの使用は好ましくないこともあるが、4個未満の連続した2’OHサブユニットを結合する場合に使用することもできる。Y領域は概して、Z領域に関して記載されたパラメータに準ずる。しかしながら、X領域及びZ領域は同じである必要はなく、異なる種類及び異なる数の修飾が存在することができ、実際、一方は通常3’突出部であり、一方は通常5’突出部である。好ましい実施形態では、iRNA剤は、2’OHが例えば2’-OMe又は他のアルキルで置換されたリボヌクレオシドをそれぞれが有するY及び/又はZ領域、ならびに2’-OHが非置換のままである少なくとも4個の連続したリボヌクレオシドサブユニットを含むX領域を有する。iRNA剤のサブユニット結合サブユニット間の結合は、例えば分解に対する耐性を促進するために修飾されてもよい。このような修飾の数多くの例が本明細書中に開示されており、その一例がホスホロチオエート結合である。これらの修飾は、領域X、Y及びZのいずれかのサブユニット間に付与することができる。しかしながら、それらの修飾は最小限に抑えられることが好ましく、特に連続した修飾結合は回避されることが好ましい。好ましい実施形態では、iRNA剤は、2’OHが例えば2’-OMeで置換されたリボヌクレオシドをそれぞれが有するY及びZ領域、ならびに2’-OHが非置換のままである少なくとも4個の連続したサブユニット例えば、リボヌクレオシドサブユニットを含むX領域を有する。上述のように、iRNA剤のサブユニット結合は、例えば分解に対する耐性を促進するために修飾されてもよい。これらの修飾は、領域Y、X及びZのいずれかのサブユニット間に付与することができる。しかしながら、修飾は最小限に抑えられることが好ましく、特に連続した修飾結合は回避されることが好ましい。したがって、好ましい実施形態では、iRNA剤のサブユニット結合のすべてが修飾されるわけではなく、より好ましくは、ホスホジエステル結合以外の結合により連結された連続サブユニットの最大数は、2個、3個又は4個である。特に好ましいiRNA剤は、サブユニットがそれぞれ修飾結合すなわちRNA及びDNAで天然に見られるホスホジエステル結合と比較した場合に分解に対して結合を安定化するように修飾された結合により結合された4個又はそれ以上の連続したサブユニット、例えば2’-ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを持たない。領域Xにおける上記修飾を最小限に抑えることが特に好ましい。したがって、好ましい実施形態では、Xにおけるヌクレオシドサブユニット結合のそれぞれがホスホジエステル結合であるか、あるいは領域Xのサブユニット結合が修飾される場合、このような修飾は最小限に抑えられる。例えば、Y及び/又はZ領域は、分解に対して安定化されたサブユニット間結合を包含することができるが、このような修飾はX領域では最小限に抑えられ、特に連続した修飾は最小限に抑えられる。したがって、好ましい実施形態ではホスホジエステル結合以外で結合される連続したサブユニットの最大数は、2個、3個又は4個である。特に好ましいX領域は、サブユニットがそれぞれ修飾結合すなわちRNA及びDNAで天然に見られるホスホジエステル結合と比較した場合に分解に対して結合を安定化するように修飾された結合により結合された4個又はそれ以上の連続したサブユニット、例えば2’-ヒドロキシルリボヌクレオシドサブユニットを持たない。好ましい実施形態では、Y及び/又はZは、ホスホロチオエート結合を含まないが、一方又は両方が他の修飾、例えばサブユニット結合の他の修飾を含有してもよい。好ましい実施形態では、領域X、あるいは場合によっては全iRNA剤が、同一の2’部分を有する3個以下又は4個以下のサブユニットを有する。好ましい実施形態では、領域X、あるいは場合によっては全iRNA剤が、同一のサブユニット結合を有する3個以下又は4個以下のサブユニットを有する。好ましい実施形態では、1つ又はそれ以上のホスホロチオエート結合又はサブユニット結合の他の修飾がY及び/又はZ中に存在するが、このような修飾結合は、2’位修飾例えば、2’-O-アルキル部分を有する隣接した2つのサブユニット例えばヌクレオシドを結合しない。例えば、Y及び/又はZにおけるすべての隣接した2’-O-アルキル部分は、ホスホロチオエート結合以外の結合により接続される。好ましい実施形態では、Y及び/又はZのそれぞれが独立して、2’位修飾を有する隣接したヌクレオシドなどのサブユニット例えば、2’-O-アルキルヌクレオシドの間に1つだけホスホロチオエート結合を有する。Y及び/又はZにおいて、2’修飾を有する隣接したヌクレオシドなどのサブユニット例えば、2’-O-アルキルヌクレオシドがもう1組存在する場合、この第2の組は、ホスホロチオエート結合以外の結合、例えばホスホロチオエート結合以外の修飾結合により接続される。好ましい実施形態では、Y及び/又はZのそれぞれが独立して、2’位修飾を有するヌクレオシドなどのサブユニット例えば、2’-O-アルキルヌクレオシドの隣接した対を結合する2個以上のホスホロチオエート結合を有するが、2’位修飾を有するヌクレオシドなどのサブユニット例えば、2’-O-アルキルヌクレオシドの隣接したサブユニットのうち少なくとも1対は、ホスホロチオエート以外の結合、例えばホスホロチオエート結合以外の修飾結合により結合される。好ましい実施形態では、Y及び/又はZにおける隣接したサブユニットに関する上述の制限の1つが、Xにおけるサブユニットに関する制限と組み合わされる。例えば、1つ又はそれ以上のホスホロチオエート結合又はサブユニット結合の他の修飾がY及び/又はZ中に存在するが、このような修飾結合は、2’修飾例えば、2’-O-アルキル部分を有するヌクレオシドなど、2つの隣接したサブユニットを結合しない。例えば、Y及び/又はZのあらゆる隣接した2’-O-アルキル部分は、ホスホロチオエート結合以外の結合により接続される。さらに、X領域は、3個以下又は4個以下の同一のサブユニット例えば同一の2’部分を有するサブユニットを有するか、あるいはX領域は、3個以下又は4個以下の同一のサブユニット結合を有するサブユニットを有する。Y領域及び/又はZ領域は、少なくとも1個、好ましくは2個、3個又は4個の本明細書中に開示する修飾を包含することができる。このような修飾は、独立して、本明細書中に記載する任意の修飾例えば、ヌクレアーゼ耐性サブユニット、修飾塩基を有するサブユニット、修飾サブユニット間結合を有するサブユニット、修飾糖を有するサブユニット、及び別の構成部分例えば、標的化部分に連結されたサブユニットから選ぶことができる。好ましい実施形態では、2個以上のこのようなサブユニットが存在し得るが、幾つかの実施形態では、1個以下、2個以下、3個以下又は4個以下のこのような修飾が行われるか、又は連続して行われることが好ましい。好ましい実施形態では、修飾の頻度は、Y及び/又はZとXとの間で異なり、例えば、修飾は、Y及び/又はZとXとのうち一方に存在し、他方には存在しない。X領域は、本明細書中に開示する少なくとも1個、好ましくは2個、3個又は4個の修飾を包含することができる。このような修飾は、独立して、本明細書中に記載する任意の修飾から例えば、ヌクレアーゼ耐性サブユニット、修飾塩基を有するサブユニット、修飾サブユニット間結合を有するサブユニット、修飾糖を有するサブユニット、及び別の構成部分例えば、標的化部分に連結されたサブユニットから選ぶことができる。好ましい実施形態では、2個以上のこのようなサブユニットが存在し得るが、幾つかの実施形態では、1個以下、2個以下、3個以下又は4個以下のこのような修飾が行われるか、又は連続して行われることが好ましい。RRMS本明細書中の他の箇所に記載するは、二本鎖のiRNA剤の一方又は両方の鎖の1つ又はそれ以上の部位に導入することができる。RRMSは、Y及び/又はZ領域においては、センス鎖の3’若しくは5’末端又はその付近末端から1、2又は3位以内に、あるいはアンチセンス鎖の3’末端又はその付近末端から2又は3位以内に配置させることができる。幾つかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’末端又はその付近5’末端から1、2又は3位以内にRRMSを有していないことが好ましい。RRMSをX領域に配置することも可能であり、好ましくはセンス鎖に、あるいは標的に対するアンチセンス鎖の結合に重要でないアンチセンス鎖の領域に配置されることになる。末端における二本鎖の安定性の差次的修飾一態様では、本発明は、末端における二本鎖の安定性の差次的修飾DMTDSを有することができるiRNA剤を特徴とする。さらに、本発明は、DMTDS及び本明細書中に記載する別の構成要素を有するiRNA剤を包含する。例えば、本発明は、本明細書中に記載するiRNA剤、例えば、パリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書中に記載する遺伝子例えば、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本明細書中に記載する構成様式又は構造を有するiRNA剤、本明細書中に記載する両親媒性送達剤と結合されたiRNA、本明細書中に記載する薬物送達モジュールと結合されたiRNA、本明細書中に記載するように投与されるiRNA剤、又は本明細書中に記載するように製剤化されるiRNA剤であって、DMTDSも取り入れるiRNA剤を包含する。iRNA剤は、アンチセンス鎖二本鎖の5’末端の領域において、該二本鎖が解離又は融解する傾向を増大させること二本鎖の会合の自由エネルギーを減少させることにより最適化することができる。このことは、例えば、アンチセンス鎖の5’末端の領域に、二本鎖が解離又は融解する傾向を増大させるサブユニットを含めることにより達成することができる。また、5’末端の領域に、二本鎖が解離又は融解する傾向を増大させるリガンドを結合することにより達成することもできる。理論により拘束されることを望まないが、その効果は、ヘリカーゼのような酵素の作用を促進すること、例えばアンチセンス鎖の5’末端に近接した酵素の作用を促進することに起因し得る。本発明者等はまた、アンチセンス鎖二本鎖の3’末端の領域において、該二本鎖が解離又は融解する傾向を減少させること二本鎖の会合の自由エネルギーを増大させることにより最適化することができることも発見した。このことは、例えばアンチセンス鎖の3’末端の領域に、二本鎖が解離又は融解する傾向を減少させるサブユニットを含めることにより達成することができる。また、5’末端の領域に、二本鎖が解離又は融解する傾向を減少させるリガンドを結合することにより達成することもできる。二本鎖の5’末端が解離する傾向を増大させる修飾は、単独で、あるいは本明細書中に記載する他の修飾と、例えば二本鎖の3’末端が解離する傾向を減少させる修飾と併用して使用することができる。同様に、二本鎖の3’末端が解離する傾向を減少させる修飾は、単独で、あるいは本明細書中に記載する他の修飾と、例えば二本鎖の5’末端が解離する傾向を増大させる修飾と併用して使用することができる。二本鎖のAS5’末端の安定性の減少サブユニット対は、解離又は融解を促進するそれらの傾向に基づいて順位付けすることができる例えば、特定の対の会合又は解離の自由エネルギーに関して、最も簡単なアプローチは、個々の対ごとに対を検査することであるが、次の同類又は同様の分析もまた使用することができる。解離を促進するという観点では、A:Uは、G:Cよりも好ましく、G:Uは、G:Cよりも好ましく、I:Cは、G:Cよりも好ましくI=イノシン;ミスマッチ、例えば非標準的な対合すなわち標準的対合以外の対合本明細書中の他の箇所に記載するようなものは、標準的なA:T、A:U、G:C対よりも好ましく;普遍的塩基を含む対合は、標準的な対合よりも好ましい。典型的なdsiRNA剤は、以下の通りに図示することができる:Sはセンス鎖を示し、ASはアンチセンス鎖を示し、R1は任意選択のかつ好ましくない5’センス鎖突出部を示し、R2は任意選択のしかし、好ましい3’センス突出部を示し、R3は任意選択のしかし、好ましい3’アンチセンス突出部を示し、R4は任意選択のかつ好ましくない5’アンチセンス突出部を示し、Nはサブユニットを示し、[N]は、さらなるサブユニット対が存在し得ることを示し、Pxは、センス鎖のNxとアンチセンス鎖のNxとの対を示す。突出部は、P図では示していない。幾つかの実施形態では、本明細書中の他の箇所に記載するように、3’AS突出部は領域Zに相当し、二本鎖領域は領域Xに相当し、3’S鎖突出部は領域Yに相当する。図は、最大又は最小の長さを暗に示すことを意味するものではなく、長さに関するガイダンスは、本明細書中の他の箇所に提供される。二本鎖を形成する傾向を減少させる対合が、AS鎖の5’末端で二本鎖の1個又はそれ以上の位置において使用されることが好ましい。末端の対AS鎖に関しては最も5’側の対は、P-1と称され、それに続く二本鎖内の対合の位置AS鎖から見ると3’方向に向かっていくは、P-2、P-3、P-4、P-5等と称される。二本鎖形成を調節する修飾を施すための好ましい領域は、P-5~P-1、より好ましくはP-4~P-1、さらに好ましくはP-3~P-1である。P-1の修飾は特に好ましく、単独でも、あるいは他の位置複数可例えば、上記に同定された位置のいずれかの修飾複数可との併用でもよい。上述の領域の1つに存在する少なくとも1個、より好ましくは2個、3個、4個又は5個の対は、独立に、以下の群:A:UG:UI:Cミスマッチな対、例えば非標準的な対、すなわち標準的な対以外の対、あるいは普遍的塩基を含む対合から選ばれることが好ましい。好ましい実施形態では、解離を促進する対合を達成するのに必要とされるサブユニットの変更はセンス鎖で行われるが、幾つかの実施形態では、該変更がアンチセンス鎖で行われる。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対が、解離を促進する対である。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、A:Uである。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、G:Uである。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、I:Cである。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、ミスマッチな対、例えば、非標準的な対、すなわち標準的な対以外の対である。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、普遍的塩基を含む対である。二本鎖のAS3’末端の安定性の増大サブユニット対は、安定性を促進し、かつ解離又は融解を阻害するそれらの傾向に基づいて順位付けすることができる例えば、特定の対合の会合又は解離の自由エネルギーに関して、最も簡単な手法は、個々の対ごとに対を検査することであるが、次の同類又は同様の分析もまた使用することができる。二本鎖の安定性を促進するという観点では、G:Cは、A:Uよりも好ましく、ワトソン-クリックの対合A:T、A:U、G:Cは、非標準的な対合、すなわち標準的な対合以外の対合よりも好ましく、安定性を増大させる類縁体は、ワトソン-クリックの対合A:T、A:U、G:Cよりも好ましく、2-アミノ-A:Uは、A:Uよりも好ましく、2-チオU又は5Me-チオ-U:Aは、U:Aよりも好ましく、G-クランプ4個の水素結合を有するCの類縁体:Gは、C:Gよりも好ましく、グアナジニウム-G-クランプ:Gは、C:Gよりも好ましく、プソイドウリジン:Aは、U:Aよりも好ましく、結合を増強する糖修飾、例えば2’位修飾例えば、2’F、ENA又はLNAは、非修飾部分よりも好ましく、二本鎖の安定性を増強するために一方又は両方の鎖上に存在することができる。二本鎖を形成する傾向を増大させる対合が、二本鎖の1つ又はそれ以上の位置でAS鎖の3’末端で使用されることが好ましい。末端の対AS鎖から見て最も3’側の対は、P1と称され、これに続く二本鎖の対合の位置AS鎖から見て5’方向に向かっていくは、P2、P3、P4、P5等と称される。二本鎖形成を調節する修飾を施すための好ましい領域は、P5~P1、より好ましくはP4~P1、さらに好ましくはP3~P1である。P1での修飾は特に好ましく、単独でも、あるいは他の位置複数可例えば、上記に同定された位置のいずれかの修飾複数可と併用されてもよい。上述の領域に存在する少なくとも1個、より好ましくは2個、3個、4個又は5個の対は、独立して、以下の群:G:Cワトソン-クリックの対合A:T、A:U、G:Cを上回って安定性を増大させる類縁体を有する対2-アミノ-A:U2-チオU又は5Me-チオ-U:AG-クランプ4個の水素結合を有するCの類縁体:Gグアナジニウム-G-クランプ:Gプソイドウリジン:A一方又は両方のサブユニットが、結合を増強する糖修飾、例えば2’位修飾例えば、2’F、ENA又はLNAを有する対から選ばれることが好ましい。好ましい実施形態では、P-1~P-4における少なくとも2個又は3個の対は、二本鎖の安定性を促進する対である。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、G:Cである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、ワトソン-クリックの対合を上回って安定性を増大させる類縁体を有する対である。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、2-アミノ-A:Uである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、2-チオU又は5Me-チオ-U:Aである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、G-クランプ:Gである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、グアニジニウム-G-クランプ:Gである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、プソイドウリジン:Aである。好ましい実施形態では、P1~P4における少なくとも2個又は3個の対は、一方又は両方のサブユニットが、結合を増強する糖修飾、例えば2’位修飾例えば、2’F、ENA又はLNAを有する対である。G-クランプ及びグアニジニウムG-クランプについては、以下の参照文献で論述されている。ホルムズ及びガイトHolmesandGait、2’-O-メチルG-クランプ含有オリゴヌクレオチドの合成及びHIV-1Tat-TAR相互作用のそれらの阻害、Nucleotides、NucleotidesNucleicAcids、第22巻:1259~1262ページ、2003年、ホルムズらHolmesetal.、2’-O-メチルG-クランプリボヌクレオシド類縁体を含有するオリゴヌクレオチドによるinvitroでの及び細胞におけるヒト免疫不全ウイルス1型Tat依存性トランス活性化の立体阻害、NucleicAcidsResearch、第31巻:2759~2768ページ、2003年、ワイルズらWilds,etal.、合成三環式シトシン類縁体:グアニジニウムG-クランプによるグアノシンの認識に関する構造基盤、HelveticaChimicaActa、第86巻:966~978ページ、2003年、ラジェエエフらRajeev,etal.、三環式シトシン類縁体を含有する高親和性ペプチド核酸オリゴマー、OrganicLetters、第4巻:4395~4398ページ、2002年、アウシンらAusin,etal.、アミノ-及びグアニジノ-G-クランプPNAモノマーの合成、OrganicLetters、第4巻:4073~4075ページ、2002年、マイヤーらMaieretal.、三環式シトシン類縁体フェノキサジン及び9-2-アミノエトキシフェノキサジンG-クランプを含有するオリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性及びそれらのヌクレアーゼ耐性特性の由来phenoxazineandoriginsoftheirnucleaseresistanceproperties、Biochemistry、第41巻:1323~7ページ、2002年、フラナガンらFlanagan,etal.、アンチセンスオリゴヌクレオチドに対する増強された効力を付与するシトシン類縁体、ProceedingsOfTheNationalAcademyOfSciencesOfTheUnitedStatesOfAmerica、第96巻:3513~8ページ、1999年。二本鎖のAS5’末端の安定性の減少と二本鎖のAS3’末端の安定性の増大とを同時に行うこと上述のように、iRNA剤は、二本鎖のAS5’末端の安定性を減少させ、かつ二本鎖のAS3’末端の安定性を増大させるように修飾することができる。このことは、二本鎖のAS5’末端における1つ又はそれ以上の安定性を減少させる修飾を、二本鎖のAS3’末端における1つ又はそれ以上の安定性を増加させる修飾と組み合わせることにより達成することができる。したがって、好ましい実施形態は、P-5~P-1、より好ましくはP-4~P1、さらに好ましくはP3~P1における修飾を包含する。P1での修飾は特に好ましく、単独でも、あるいは他の位置例えば、上記に同定された位置との併用でもよい。二本鎖領域のAS5’末端の上述の領域の1つに存在する少なくとも1個、より好ましくは2個、3個、4個又は5個の対は、独立に、以下の群から選ばれることが好ましい:A:UG:UI:Cミスマッチな対、例えば非標準的な対合、すなわち標準的な対合以外の対合、あるいは普遍的塩基を含む対合、及びP5~P1、より好ましくはP4~P1、さらに好ましくはP3~P1での修飾。P1での修飾は特に好ましく、単独でも、あるいは他の位置例えば、上記に同定された位置との併用でもよい。二本鎖領域のAS3’末端の上述の領域の1つに存在する少なくとも1個、より好ましくは2個、3個、4個又は5個の対は、独立に、以下の群:G:Cワトソン-クリックの対合A:T、A:U、G:Cを上回って安定性を増大させる類縁体を有する対2-アミノ-A:U2-チオU又は5Me-チオ-U:AG-クランプ4個の水素結合を有するCの類縁体:Gグアナジニウム-G-クランプ:Gプソイドウリジン:A一方又は両方のサブユニットが、結合を増強する糖修飾、例えば2’位修飾例えば、2’F、ENA又はLNAを有する対から選ばれることが好ましい。本発明はまた、DMTDSを有するiRNA剤を選択及び作製する方法を包含する。例えば、iRNA剤として使用するための候補配列に関して標的配列をスクリーニングする場合、本明細書中に記載するDMTDS特性を有する配列、及び、所望のレベルのDMTDSを付与するために好ましくはできる限り少ない変更で特にAS鎖に対して修飾を施すことができる配列を選択することができる。本発明はまた、iRNA剤候補配列を提供すること、ならびにDMTDSiRNA剤を提供するために、P-5~P-1における少なくとも1個のP及び/又はP5~P1における少なくとも1個のPを修飾することを包含する。DMTDSiRNA剤は、本明細書中に記載する任意の方法において、例えばSNCAのRNAをサイレンシングするために、本明細書中に記載する任意の障害例えば、神経変性障害を治療するために、本明細書中に記載する任意の製剤中で、ならびに通常は本明細書中の他の箇所に記載する方法及び組成物において、または本明細書中の他の箇所に記載する方法及び組成物とともに使用することができる。DMTDSiRNA剤は、本明細書中に記載する他の修飾、例えば標的化剤を結合すること又は安定性を増強する修飾を含めること、例えばヌクレアーゼ耐性モノマーを含めることもしくは自己会合して鎖内二本鎖構造を形成する一本鎖突出部例えば、3’AS突出部及び/又は3’S鎖突出部を含めること、を取り入れることができる。好ましくは、これらのiRNA剤は、本明細書中に記載する構成様式を有する。その他の実施形態RNA、例えばiRNA剤は、例えば細胞へ送達される外来DNAの鋳型から、invivoで細胞において産生され得る。例えば、該DNA鋳型をベクターに挿入して、遺伝子治療ベクターとして使用することができる。遺伝子治療ベクターは、例えば静脈内注射、局所投与米国特許第5,328,470号により、あるいは定位注射例えば、チェンらChenetal.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA第91巻:3054~3057ページ、1994年を参照により対象へ送達することができる。遺伝子治療ベクターの医薬調製物は、許容可能な希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含むこともできるし、あるいは遺伝子送達ビヒクルが包埋される徐放性マトリックスを含むこともできる。例えば、DNA鋳型は、2つの転写ユニットiRNA剤の鎖の上部を包含する転写物を産生するもの、及びiRNA剤の下部を包含する転写物を産生するものを包含することができる。鋳型が転写されると、iRNA剤が産生され、プロセシングを受けて遺伝子サイレンシングを仲介するsRNA剤断片となる。invivo送達iRNA剤は、対象例えば、ヒトのような哺乳類へiRNA剤を効率的に送達するためのポリマーに結合、例えば非共有結合させることができる。iRNA剤は、例えばシクロデキストリンと複合体形成させることができる。シクロデキストリンは、治療用化合物の送達ビヒクルとして使用されている。シクロデキストリンは、シクロデキストリンの疎水性キャビティ内へ収まることが可能な薬物と包接複合体を形成することができる。他の例では、シクロデキストリンは、オリゴヌクレオチド及びそれらの誘導体のような他の生物学的に活性な分子と非共有結合を形成する。シクロデキストリンの使用により、水溶性の薬物送達複合体が創出され、該複合体は標的指向性の基又は他の官能基で修飾することができる。米国特許第5,691,316号これは、参照により本明細書に援用されるに記載されるオリゴヌクレオチド用のシクロデキストリン細胞送達系は、本発明の方法における使用に適している。この系では、オリゴヌクレオチドはシクロデキストリンと非共有結合的に複合体形成されるか、あるいはオリゴヌクレオチドがアダマンチンに共有結合され、続いてアダマンチンがシクロデキストリンと非共有結合的に結合される。送達分子には、線状シクロデキストリンコポリマー又は線状酸化シクロデキストリンコポリマーであってシクロデキストリンコポリマーに少なくとも1つのリガンドが結合されたものを挙げることができる。米国特許第6,509,323号参照により本明細書に援用されるに記載されるような送達系は、本発明における使用に適している。iRNA剤は、線状シクロデキストリンコポリマー及び/又は線状酸化シクロデキストリンコポリマーに結合させることができる。シクロデキストリンコポリマー又は酸化シクロデキストリンコポリマーの一方又は両方を、別のポリマーに架橋させることもでき、かつ/又はリガンドに結合させることもできる。iRNA送達用組成物は、付加物の特徴的な構造を有する分子化合物である包接複合体を使用することができる。この構造では、ホスト分子が、送達ビヒクル中の別の化合物の少なくとも1部を空間的に封入する。封入される化合物ゲスト分子は、ホスト分子のフレームワーク構造に影響を及ぼすことなくホスト分子のキャビティに配置される。ホストは、好ましくはデキストリンであるが、米国特許公報第2003/0008818号参照により本明細書に援用されるで提唱される任意の分子であり得る。シクロデキストリンは、各種のイオン及び分子と相互作用することができ、生じた包接化合物は、ホスト-ゲスト複合体の種類に属する。ホスト-ゲストの関係内で、ホスト分子及びゲスト分子の結合部位は、立体電子的意味合いで相補的であるべきである。本発明の組成物は、少なくとも1つのポリマー及び少なくとも1つの治療薬を、通常はポリマー及び治療薬例えば、iRNA剤の粒子状複合物の形態で含有することができる。iRNA剤は、1つ又はそれ以上の複合化剤を含有することができる。粒子状複合物の少なくとも1つのポリマーは、ホスト-ゲスト又はゲスト-ホスト相互作用で複合化剤と相互作用して、ポリマーと複合化剤との間で包接複合体を形成することができる。より具体的には、ポリマー及び複合化剤は、組成物に機能性を導入するのに使用することができる。例えば、粒子状複合物の少なくとも1つのポリマーはホスト機能を有し、ゲスト機能を有する複合化剤と包接複合体を形成する。別例として、粒子状複合物の少なくとも1つのポリマーはゲスト機能を有し、ホスト機能を有する複合化剤と包接複合体を形成する。粒子状複合物のポリマーはまた、ホスト機能及びゲスト機能の両方を含有し、ゲストの複合化剤及びホストの複合化剤と包接複合体を形成することもできる。機能性を有するポリマーは、例えば細胞標的化及び/又は細胞との接触例えば、神経細胞に対する標的化又は神経細胞との接触、細胞間輸送、ならびに細胞への流入及び細胞からの放出のうち少なくともいずれかを促進することができる。粒子状複合物を形成する際、iRNA剤は、その生物学的又は治療的活性を維持してもよいし、あるいは維持しなくてもよい。治療用組成物から、具体的には粒子状複合物のポリマーから放出されると、iRNA剤の活性は回復する。したがって、粒子状複合物は好適には、例えば分解に起因する活性の損失からiRNA剤を保護し、生物学的利用性を増強する。したがって、組成物は、iRNA剤又は任意の活性な化学物質に安定性、特に貯蔵中又は溶液中の安定性を提供するのに使用することができる。iRNA剤は、粒子状複合物又は治療用組成物を形成する前又は後に、リガンドでさらに修飾されてもよい。リガンドは、さらなる機能性を提供することができる。例えば、リガンドは、標的化部分であり得る。生理学的影響本明細書中に記載するiRNA剤は、治療上の毒性の決定が、該iRNA剤と、ヒト配列および非ヒト動物配列の両方との相補性によってより容易になされるように設計することができる。これらの方法では、RNA剤は、ヒト由来の核酸配列及び少なくとも1種類の非ヒト動物、例えば非ヒト哺乳類例えば、げっ歯類、反すう類又は霊長類由来の核酸配列に完全に相補的である配列から構成され得る。例えば、非ヒト哺乳類は、マウス、ラット、イヌ、ブタ、ヤギ、ヒツジ、ウシ、サル、ピグミーチンパンジー、ナミチンパンジー、アカゲザル又はカニクイザルであり得る。iRNA剤の配列は、非ヒト哺乳類及びヒトの相同遺伝子、例えば発がん遺伝子又は腫瘍抑制遺伝子内の配列に相補的であり得る。非ヒト哺乳類におけるiRNA剤の毒性を決定することにより、ヒトにおけるiRNA剤の毒性を推定することができる。より厳しい毒性試験のためには、iRNA剤を、ヒト及び2種類以上例えば2種類又は3種類又はそれ以上の非ヒト動物に対して相補的とすることができる。本明細書中に記載する方法は、ヒトに対するiRNA剤の任意の生理学的作用、例えば毒性作用のような任意の望ましくない作用、又は任意の好ましい作用、すなわち所望の作用と相関させるのに使用することができる。送達モジュールRNA、例えば本明細書中に記載するiRNA剤は、例えば、本明細書中に記載する薬物送達複合体又はモジュールとともに使用することができる。さらに、本明細書中に記載のiRNA剤、例えば、パリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書中に記載する遺伝子例えば、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本発明に記載する化学修飾例えば、分解に対する耐性を増強する修飾を有するiRNA剤、本明細書中に記載する構成様式又は構造を有するiRNA剤、本明細書中に記載するように投与されるiRNA剤、又は本明細書中に記載するように製剤化されるiRNA剤は、そのような薬物送達複合体又はモジュールと組み合わされ、結合され、かつそのような薬物送達複合体又はモジュールにより送達されうる。iRNA剤は、モジュラー複合体を特徴とする送達剤に複合体形成させることができる。複合体は、a縮合剤例えば、核酸を例えばイオン相互作用又は静電相互作用により誘引例えば、結合することが可能な作用物質、b融合剤例えば、細胞膜例えば、エンドソーム膜と融合すること、及び/又は該膜を通過して輸送されることが可能な作用物質、及びc標的化基、例えば、細胞又は組織を標的とする物質例えば、脳内の神経細胞のような特定の細胞種に結合するレクチン、糖タンパク質、脂質又はタンパク質例えば抗体、のうち1つ又はそれ以上好ましくは2つ又はそれ以上、より好ましくは3つすべてに連結させた担体物質を包含することができる。iRNA剤、例えば本明細書中に記載するiRNA剤又はsRNA剤は、モジュラー複合体に連結例えばカップリング又は結合させることができる。iRNA剤は、複合体の縮合剤と相互作用することができ、複合体は、例えばinvitro又はinvivoで、iRNA剤を細胞へ送達するのに使用することができる。例えば、複合体は、iRNA剤の送達を必要とする対象へiRNA剤を送達するために、例えば障害例えば、神経変性疾患又は神経変性障害のような本明細書中に記載する障害を有する対象へiRNA剤を送達するために使用することができる。融合剤及び縮合剤は、異なる作用物質であってもよいし、又は1つの同じ作用物質であってもよい。例えば、ポリアミノ鎖、例えばポリエチレンイミンPEIは、融合剤及び/又は縮合剤であり得る。送達剤は、モジュラー複合体であり得る。例えば、複合体は、以下の:a縮合剤例えば、核酸を例えばイオン相互作用により誘引例えば、結合することが可能な作用物質、b融合剤例えば、細胞膜例えば、エンドソーム膜と融合すること及び/又は該膜を通過して輸送されることが可能な作用物質、及びc標的化基、例えば、細胞又は組織を標的とする物質例えば、脳内の神経細胞などの神経細胞のような特定の細胞種に結合するレクチン、糖タンパク質、脂質又はタンパク質例えば抗体のうち1つ又はそれ以上好ましくは2つ又はそれ以上の、より好ましくは3つすべてに連結させた担体物質を包含することができる。標的化基は、甲状腺刺激ホルモン、メラニン細胞刺激ホルモン、レクチン、糖タンパク質、サーファクタントプロテインA、ムチン糖質、多価ラクトース、多価ガラクトース、N-アセチルガラクトサミン、N-アセチルグルコサミン、多価マンノース、多価フコース、グリコシル化ポリアミノ酸、多価ガラクトース、トランスフェリン、ビスホスホネート、ポリグルタミン酸、ポリアスパラギン酸、脂質、コレステロール、ステロイド、胆汁酸、葉酸塩、ビタミンB12、ビオチン、ネプロキシンNeproxin、又はRGDペプチド若しくはRDGペプチド擬似体であり得る。担体物質本明細書中に記載するモジュラー複合体の担体物質は、縮合剤、融合剤及び標的化基のうち1つ又はそれ以上を結合するための基剤であり得る。担体物質は内因性の酵素活性を欠いていることが好ましい。担体物質は好ましくは、生体分子、好ましくは高分子である。高分子の生物学的担体が好ましい。担体分子は生分解性であることもまた好ましい。担体物質は、タンパク質例えば、ヒト血清アルブミンHSA、低密度リポタンパク質LDL又はグロブリン、糖質例えば、デキストラン、プルラン、キチン、キトサン、イヌリン、シクロデキストリン又はヒアルロン酸、又は脂質のような天然に存在する物質であり得る。担体分子はまた、合成ポリマー例えば、合成ポリアミノ酸のような組換え分子又は合成分子であり得る。ポリアミノ酸の例としては、ポリリシンPLL、ポリL-アスパラギン酸、ポリL-グルタミン酸、スチレン-マレイン酸無水物コポリマー、ポリL-ラクチド-コ-グリコリドコポリマー、ジビニルエーテル-マレイン酸無水物コポリマー、N-2-ヒドロキシプロピルメタクリルアミドコポリマーHMPA、ポリエチレングリコールPEG、ポリビニルアルコールPVA、ポリウレタン、ポリ2-エチルアクリル酸、N-イソプロピルアクリルアミドポリマー、又はポリホスファジンpolyphosphazineが挙げられる。他の有用な担体分子は、日常的な方法により同定することができる。担体物質は、aサイズが少なくとも1Daであること、b少なくとも5個の荷電基、好ましくは5~5,000個の荷電基を有すること、c少なくとも1:1の担体物質対融合剤の比で複合体中に存在すること、d少なくとも1:1の担体物質対縮合剤の比で複合体中に存在すること、e少なくとも1:1の担体物質対標的化剤の比で複合体中に存在すること、のうち1つ又はそれ以上を特徴とすることができる。融合剤本明細書中に記載するモジュラー複合体の融合剤は、pH環境に応答性である、例えばpH環境に応じて電荷を変化させる作用物質であり得る。エンドソームのpHに遭遇すると、融合剤は、物理的変化、例えばエンドソーム膜を崩壊するか、又はエンドソーム膜の浸透性を増大する浸透圧特性の変化を引き起こすことができる。好ましくは、融合剤は、生理学的範囲未満のpHで、電荷を変化させる例えば、プロトン化されるようになる。例えば、融合剤は、pH4.5~6.5でプロトン化されるようになり得る。融合剤は、複合体が例えばエンドサイトーシスによって細胞に取り込まれた後、細胞の細胞質へiRNA剤を放出するように作用することにより、細胞内のiRNA剤の細胞内濃度を増大させることができる。一実施形態では、融合剤は、特定のpH範囲に暴露されると、例えば電荷の変化例えばプロトン化を受ける構成部分例えば、アミノ基を有することができる。融合剤の電荷の変化は、小胞、例えば細胞内小胞例えば、エンドソームの変化例えば、浸透圧変化を誘発することができる。例えば、融合剤は、エンドソームのpH環境に暴露されると、エンドソーム膜の多孔性を増大するのに好ましくは、破裂させるのに実質的に十分な溶解性又は浸透圧変化を引き起こす。融合剤は、ポリマー、好ましくはポリアミノ鎖例えば、ポリエチレンイミンPEIであり得る。PEIは、直鎖状でも、分岐状でも、合成でも天然でもよい。PEIは、例えばアルキル置換されたPEIでもよいし脂質置換されたPEIでもよい。他の実施形態では、融合剤は、ポリヒスチジン、ポリイミダゾール、ポリピリジン、ポリプロピレンイミン、メリチン又はポリアセタール物質例えば、カチオン性ポリアセタールであり得る。幾つかの実施形態では、融合剤は、αらせん構造を有することができる。融合剤は、膜崩壊剤例えばメリチンであり得る。融合剤は、1つ又はそれ以上の以下の特徴を有することができる:aサイズが少なくとも1Daであること、b少なくとも10個の荷電基、好ましくは10~5,000個の荷電基、より好ましくは50~1,000個の荷電基を有すること、c少なくとも1:1の融合剤対担体物質の比で複合体中に存在すること、d少なくとも1:1の融合剤対縮合剤の比で複合体中に存在すること、e少なくとも1:1の融合剤対標的化剤の比で複合体中に存在すること。他の適切な融合剤は、専門家により試験及び同定され得る。化合物の、pH環境に応答する例えば、pH環境に応じて電荷を変化させる能力は、日常的な方法により、例えば細胞アッセイにおいて試験することができる。例えば、試験化合物を細胞と組み合わせるか、又は細胞と接触させて、例えばエンドサイトーシスにより細胞に試験化合物を取り込ませる。続いて、接触させた細胞からエンドソーム調製物を作製することができ、該エンドソーム調製物を対照細胞由来のエンドソーム調製物と比較することができる。接触処理した細胞由来のエンドソーム画分の対照細胞に対する変化例えば、減少は試験化合物が融合剤として機能することができることを示す。あるいは、接触処理した細胞及び対照細胞を、例えば顕微鏡法により例えば、光学顕微鏡法又は電子顕微鏡法により評価して、細胞におけるエンドソーム集団の差を決定することができる。試験化合物を標識してもよい。別のタイプのアッセイでは、本明細書中に記載するモジュラー複合体は、1つ又はそれ以上の試験融合剤又は推定融合剤を用いて構築される。モジュラー複合体は、iRNAの替わりに標識された核酸を用いて構築することもできる。2工程アッセイも実施することができ、該アッセイでは、第1のアッセイが試験化合物単独のpH環境に応答する例えば、pH環境に応じて電荷を変化させる能力を評価し、第2のアッセイが、試験化合物を含むモジュラー複合体のpH環境に応答する例えば、pH環境に応じて電荷を変化させる能力を評価する。縮合剤本明細書中に記載するモジュラー複合体の縮合剤は、iRNA剤と相互作用例えば、iRNA剤を誘引、保持又はiRNA剤に結合することができ、aiRNA剤を縮合例えば、iRNA剤のサイズ又は電荷を低減させ、かつ/又はbiRNA剤を保護例えば、分解に対してiRNA剤を保護するように作用することができる。縮合剤は、例えばイオン性相互作用により、核酸例えば、iRNA剤と相互作用することができる構成部分例えば、荷電基を包含することができる。縮合剤は好ましくは、荷電ポリマー例えば、ポリカチオン鎖である。縮合剤は、ポリリシンPLL、スペルミン、スペルミジン、ポリアミン、プソイドペプチド-ポリアミン、ペプチド模倣ポリアミン、デンドリマーポリアミン、アルギニン、アミジン、プロタミン、カチオン性脂質、カチオン性ポルフィリン、ポリアミンの第四級塩又はαらせん状ペプチドであり得る。縮合剤は、以下の特徴を有することができる:aサイズが少なくとも1Daであること、b少なくとも2個の荷電基、好ましくは2~100個の荷電基を有すること、c少なくとも1:1の縮合剤対担体物質の比で複合体中に存在すること、d少なくとも1:1の縮合剤対融合剤の比で複合体中に存在すること、e少なくとも1:1の縮合剤対標的化剤の比で複合体中に存在すること。その他の適切な縮合剤は、専門家により、例えば、核酸例えば、iRNA剤と相互作用する試験剤の能力を評価することにより、試験及び同定され得る。試験剤の、核酸例えば、iRNA剤と相互作用する例えば、iRNA剤を縮合又は保護する能力は、日常的な技法により評価することができる。1つのアッセイでは、試験剤を核酸と接触させて、接触させた核酸のサイズ及び/又は電荷を、分子の質量及び/又は電荷の変化を検出するのに適した技法により評価する。このような技法としては、非変性ゲル電気泳動、免疫学的方法例えば、免疫沈降、ゲル濾過、イオン相互作用クロマトグラフィ等が挙げられる。試験剤は、対照と比較して、接触させた核酸の質量及び/又は電荷好ましくは、両方を変化させる場合に、縮合剤として同定される。2工程アッセイもまた実施することができ、該2工程アッセイでは、第1のアッセイが試験化合物単独の核酸と相互作用する例えば、核酸に結合する例えば、核酸の電荷及び/又は質量を縮合する能力を評価し、第2のアッセイが、試験化合物を含むモジュラー複合体の、核酸と相互作用する例えば、核酸に結合する例えば、核酸の電荷及び/又は質量を縮合する能力を評価する。両親媒性送達剤RNA、例えば本明細書中に記載するiRNA剤は、本明細書中に記載する両親媒性送達複合体又はモジュールとともに使用することができる。さらに、iRNA剤、例えば、パリンドローム構造のiRNA剤、非標準的な対合を有するiRNA剤、本明細書中に記載する遺伝子例えば、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤、本明細書中に記載する化学修飾例えば、分解に対する耐性を増強する修飾を有するiRNA剤、本明細書中に記載する構成様式又は構造を有するiRNA剤、本明細書中に記載するように投与されるiRNA剤、又は本明細書中に記載するように製剤化されるiRNA剤は、このような両親媒性送達複合体と組み合わされ、結合され、かつこのような両親媒性送達複合体により送達されうる。両親媒性分子は、疎水性領域及び親水性領域を有する分子である。このような分子は、脂質例えば、細胞の脂質二重層と相互作用する例えば、浸透又は破壊することができる。したがって、両親媒性分子は、会合された例えば、結合されたiRNA例えば、本明細書中に記載するiRNA又はsRNAの送達剤として作用することができる。本明細書中に記載する組成物例えば、本明細書中に記載する両親媒性iRNA構築物で使用されるべき好ましい両親媒性分子は、ポリマーである。該ポリマーは、二次構造、例えば反復性の二次構造を有し得る。両親媒性ポリマーの一例は、両親媒性ポリペプチド、例えばポリペプチドが親水面及び疎水面を有するような二次構造を有するポリペプチドである。両親媒性ペプチド構造例えば、αらせん状ポリペプチドの設計は、当業者には日常的である。例えば、以下の参照文献にガイダンスが提供されている:グレルらGrelletal.2001年、JPeptSci第73巻:146~51ページ;チェンらChenetal.2002年、JPeptRes第591巻:18~33ページ;イワタらIwataetal.1994年、JBiolChem第2697巻:4928~33ページ;コーナットらCornutetal.1994年、FEBSLett第3491巻:29~33ページ;ネグレートらNegreteetal.1998年、ProteinSci第76巻:1368~79ページ。両親媒性ポリマーの別の例は、2つ又はそれ以上の両親媒性サブユニット、例えば環状部分例えば、1つ又はそれ以上の親水性基及び1つ又はそれ以上の疎水性基を有する環状部分を含有する2つ又はそれ以上のサブユニットから構成されるポリマーである。例えば、サブユニットは、ステロイド例えばコール酸又は芳香族部分を含有してもよい。このような構成部分は、それらがポリマー構造中にある場合、対向する親水面及び疎水面を形成することができるように、アトロプ異性を示すことができることが好ましい。推定上の両親媒性分子の、脂質膜例えば、細胞膜と相互作用する能力は、日常的な方法により、例えば無細胞アッセイ又は細胞アッセイにおいて試験することができる。例えば、試験化合物を、合成脂質二重層、細胞膜分画又は細胞と組み合わせるか、あるいは接触させて、試験化合物が、脂質二重層、細胞膜又は細胞と相互作用し、細胞膜又は細胞に浸透し、あるいは細胞膜又は細胞を破壊するその能力に関して評価する。試験化合物を、脂質二重層、細胞膜又は細胞との相互作用を検出するために標識することもできる。別のタイプのアッセイでは、試験化合物をレポーター分子又はiRNA剤例えば、本明細書中に記載するiRNA又はsRNAに連結させて、レポーター分子又はiRNA剤が脂質二重層、細胞膜又は細胞に浸透する能力を評価する。2工程アッセイもまた実施することができ、該2工程アッセイでは、第1のアッセイが、試験化合物単独の、脂質二重層、細胞膜又は細胞と相互作用する能力を評価し、第2のアッセイが、試験化合物及びレポーター又はiRNA剤を含む構築物例えば、本明細書中に記載する構築物の、脂質二重層、細胞膜又は細胞と相互作用する能力を評価する。本明細書中に記載する組成物において有用な両親媒性ポリマーは、少なくとも2個、好ましくは少なくとも5個、より好ましくは少なくとも10個、25個、50個、100個、200個、500個、1,000個、2,000個、50,000個又はそれ以上のサブユニット例えば、アミノ酸又は環状サブユニットを有する。1つの両親媒性ポリマーを、1つ又はそれ以上、例えば2個、3個、5個、10個又はそれ以上のiRNA剤例えば、本明細書中に記載するiRNA又はsRNA剤に連結させることができる。幾つかの実施形態では、両親媒性ポリマーは、アミノ酸及び環状サブユニット例えば、芳香族サブユニットの両方を含有することができる。本発明は、両親媒性分子と関係付けられたiRNA剤例えば、本明細書中に記載するiRNA又はsRNAを包含する組成物を特徴とする。このような組成物は、本明細書中では両親媒性iRNA構築物とも呼ばれる。このような組成物及び構築物は、iRNA剤の送達又は標的化、例えばiRNA剤を細胞へ送達又は標的化するのに有用である。理論により拘束されることを望まないが、このような組成物及び構築物は、例えばiRNA剤の細胞への進入が可能となるように、脂質例えば、細胞の脂質二重層の多孔性を増大させる例えば、浸透又は崩壊させることができる。一態様では、本発明は、両親媒性分子に連結されたiRNA剤例えば、本明細書中に記載するiRNA剤又はsRNA剤を含む組成物に関する。iRNA剤及び両親媒性分子は、共有結合又は非共有結合のいずれかにより、互いに持続的に接触した状態に保持されていてもよい。該組成物又は構築物の両親媒性分子は、リン脂質以外、例えばミセル、膜又は膜断片以外であることが好ましい。組成物又は構築物の両親媒性分子は、好ましくはポリマーである。該ポリマーは、2つ又はそれ以上の両親媒性サブユニットを含んでもよい。1つ又はそれ以上の親水性基及び1つ又はそれ以上の疎水性基がポリマー上に存在してもよい。ポリマーは、反復性の二次構造ならびに第1の面及び第2の面を有してもよい。反復性の二次構造に沿った親水性基及び疎水性基の分布は、ポリマーの一方の面が親水面であり、かつポリマーの他方の面が疎水面であるような分布であり得る。両親媒性分子は、ポリペプチド、例えばその二次構造としてα-らせん構造を含むポリペプチドであり得る。一実施形態では、両親媒性ポリマーは、1つ又はそれ以上の環状部分例えば、1つ又はそれ以上の親水性基及び/又は1つ又はそれ以上の疎水性基を有する環状部分を含有する1つ又はそれ以上のサブユニットを包含する。一実施形態では、ポリマーは、環状部分が交互に疎水性基及び親水性基を有するように環状部分を有するポリマーである。例えば、サブユニットは、ステロイド例えば、コール酸を含有してもよい。別の例では、サブユニットは、芳香族部分を含有してもよい。芳香族部分は、アトロプ異性を示すことができるもの、例えば2,2’-ビス置換-1,1’-ビナフチル又は2,2’-ビス置換ビフェニルであり得る。サブユニットは、式M:を有する芳香族部分を含んでもよい。本発明は、両親媒性分子と関連付けられたiRNA剤例えば、本明細書中に記載するiRNA又はsRNAを包含する組成物を特徴とする。このような組成物は、本明細書中では両親媒性iRNA構築物と称し得る。このような組成物及び構築物は、iRNA剤の送達又は標的化、例えば細胞へのiRNA剤の送達又は標的化において有用である。理論により拘束されることを望まないが、このような組成物及び構築物は、例えばiRNA剤の細胞への進入が可能となるように、脂質例えば、細胞の脂質二重層の多孔性を増大させる例えば浸透又は破壊することができる。式Mに関して、R1は、任意選択でアリール、アルケニル、アルキニル、アルコキシ又はハロで置換されるか、かつ/又は任意選択でO、S、アルケニル又はアルキニルが挿入されるC1~C100アルキル、C1~C100ペルフルオロアルキル、又はOR5である。R2は、ヒドロキシ、ニトロ、サルフェート、リン酸、リン酸エステル、スルホン酸、OR6、又は任意選択でヒドロキシ、ハロ、ニトロ、アリールスルフィニル若しくはアルキルスルフィニル、アリールスルホニル若しくはアルキルスルホニル、サルフェート、スルホン酸、リン酸、リン酸エステル、置換若しくは非置換アリール、カルボキシル、カルボン酸、アミノカルボニル又はアルコキシカルボニルで置換されるか、かつ/又は任意選択でO、NH、S、SO、SO2、アルケニル又はアルキニルが挿入されるC1~C100アルキルである。R3は、水素であるか、又はR4と一体となって融合フェニル環を形成する。R4は、水素であるか、又はR3と一体となって融合フェニル環を形成する。R5は、任意選択でアリール、アルケニル、アルキニル、アルコキシ又はハロで置換されるか、かつ/又は任意選択でO、S、アルケニル又はアルキニルが挿入されるC1~C100アルキル、あるいはC1~C100ペルフルオロアルキルであり、R6は、任意選択でヒドロキシ、ハロ、ニトロ、アリールスルフィニル若しくはアルキルスルフィニル、アリールスルホニル若しくはアルキルスルホニル、サルフェート、スルホン酸、リン酸、リン酸エステル、置換若しくは非置換アリール、カルボキシル、カルボン酸、アミノカルボニル又はアルコキシカルボニルで置換されるか、かつ/又は任意選択でO、NH、S、SO、SO2、アルケニル又はアルキニルが挿入されるC1~C100アルキルである。dsRNAの細胞取り込みの増大本発明の方法は、iRNA剤、ならびにiRNA剤の細胞への取り込みに影響を及ぼす薬物の投与を包含し得る。該薬物は、iRNA剤が投与される前に、iRNA剤が投与された後に、あるいはiRNA剤が投与されると同時に投与され得る。薬物はiRNA剤と共有結合され得る。薬物は、細胞に対する一過性の影響を有し得る。薬物は、例えば細胞の細胞骨格を崩壊させることにより、例えば細胞の微小管、ミクロフィラメント及び/又は中間フィラメントを崩壊させることにより、iRNA剤の細胞への取り込みを増大させることができる。薬物は、例えば、タキソン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、サイトカラシン、ノコダゾール、ジャプラキノライドjaplakinolide、ラトランクリンA、ファロイジン、スウィンホライドA、インダノシンindanocine又はミオセルビンmyoservinであり得る。iRNA複合体iRNA剤は、第2の作用物質にカップリング例えば、共有結合させることができる。例えば、特定の障害を治療するのに使用されるiRNA剤は、第2の治療薬、例えばiRNA剤以外の作用物質にカップリングさせることができる。第2の治療薬は、同じ障害の治療を対象とするものであり得る。例えば、α‐シヌクレインの蓄積を特徴とする障害例えば、PDを治療するのに使用されるiRNAの場合では、iRNA剤は、PDの治療に有用な第2の作用物質にカップリングさせることができる。iRNAの生産iRNAは、例えば大量に、各種方法により生産することができる。例示的な方法としては、有機合成及びRNA切断例えば、invitroでの切断が挙げられる。有機合成iRNAは、二本鎖のRNA分子の各々の鎖を別個に合成することにより作製することができる。次に、構成成分の鎖をアニーリングさせることができる。大きなバイオリアクター例えば、ファルマシアバイオテックABPharmaciaBiotecABスウェーデンウプサラUppsala所在のOligoPilot商標IIを用いて、所定のiRNA用の特定のRNA鎖を大量に生産することができる。OligoPilotIIリアクターは、1.5M過剰のホスホロアミダイトヌクレオチドのみを使用して、効率的にヌクレオチドをカップリングすることができる。RNA鎖を作製するためには、リボヌクレオチドアミダイトが使用される。標準的なモノマー添加サイクルを使用して、iRNA用の21~23ヌクレオチド鎖を合成することができる。通常、2つの相補的な鎖を別個に生産した後、例えば固体支持体からの放出及び脱保護の後にアニーリングさせる。アルナイラムへの関連はあるか。有機合成を使用して、別個のiRNA種を生産することができる。特定の標的遺伝子に対する該iRNA種の相補性を、正確に指定することができる。例えば、該iRNA種は、多型、例えば一塩基多型を含む領域に相補的であり得る。さらに、多型の位置は、正確に規定され得る。幾つかの実施形態では、多型は、内部領域、例えば末端の一方又は両方から少なくとも4、5、7又は9ヌクレオチドの位置にある。dsRNA切断iRNAはまた、より大きなdsiRNAを切断することにより作製することができる。切断は、invitro又はinvivoで実現され得る。例えば、invitroでの切断によりiRNAを生産するために、以下の方法を使用することができる:invitro転写。dsRNAは、両方向に核酸DNAセグメントを転写することにより生産される。例えば、HiScribe商標RNAi転写キットニューイングランドバイオラブズNewEnglandBiolabsは、ベクターと、両側にT7プロモーターが隣接する位置で該ベクターにクローニングされた核酸セグメントに関してdsRNAを生産する方法とを提供する。別個の鋳型が、dsRNA用の2つの相補鎖のT7転写用に生成される。該鋳型は、T7RNAポリメラーゼの添加によりinvitroで転写され、dsRNAが生産される。PCR及び/又は他のRNAポリメラーゼ例えば、T3ポリメラーゼ又はSP6ポリメラーゼを用いた同様の方法もまた使用することができる。一実施形態では、この方法により生成されるRNAは、組換え酵素の調製物に混入し得るエンドトキシンを除去するように慎重に精製される。invitro切断。dsRNAは、例えばDicer又は匹敵するRNAアーゼIIIベースの活性を用いて、invitroで切断されてiRNAとなる。例えば、dsRNAは、ショウジョウバエ由来のinvitro抽出物中で、あるいは精製された成分例えば、精製RNAアーゼ又はRISC複合体RNA誘導性サイレンシング複合体を用いてインキュベートすることができる。例えば、ケッテイングらKettingetal.GenesDev2001年10月15日、第1520巻:2654~9ページ及びハモンドHammondScience2001年8月10日;第2935532巻:1146~50ページを参照されたい。dsRNAの切断により、概して複数のiRNA種が生産され、それぞれがもとのdsRNA分子の特定の21~23ntフラグメントである。例えば、もとのdsRNA分子のオーバーラッピング領域及び隣接領域に相補的な配列を含むiRNAが存在し得る。合成方法にかかわらず、iRNA調製物は、製剤化に適した溶液例えば、水溶液及び/又は有機溶液中で調製することができる。例えば、iRNA調製物は、純粋な二重に蒸留した蒸留水中で沈殿及び再溶解され、凍結乾燥され得る。続いて、乾燥させたiRNAは、意図される製剤化プロセスに適した溶液中に再懸濁させることができる。修飾iRNA剤及びヌクレオチド代用物のiRNA剤の合成は後述する。製剤化本明細書中に記載するiRNA剤は、対象への投与用に製剤化することができる。説明を簡略化するために、本項での製剤、組成物及び方法は、主として非修飾iRNA剤に関して論述する。しかしながら、これらの製剤、組成物及び方法は、他のiRNA剤、例えば修飾iRNA剤で実施することができ、かつそのような実施は本発明の範囲内にあることが理解されるべきである。製剤化されたiRNA組成物は、様々な状態であると仮定することができる。幾つかの例では、組成物は、少なくとも部分的に結晶性、一様に結晶性、かつ/又は無水例えば、水分が80未満、50未満、30未満、20未満又は10未満である。別の例では、iRNAは、水相中に、例えば水を含む溶液中に存在する。水相組成物又は結晶性組成物は、例えば送達ビヒクル、例えばリポソーム特に水相に関して又は粒子例えば、結晶性組成物に関して適切であり得るような微粒子に組み込むことができる。概して、iRNA組成物は、意図される投与方法と適合性の様式で製剤化される。特定の実施形態では、組成物は、以下の方法:噴霧乾燥、凍結乾燥、真空乾燥、蒸発、流動床乾燥fluidbeddrying又はこれらの技法の組合せ、あるいは液体を用いた超音波処理、フリーズドライ、凝縮及び他の自己集合、の少なくとも1つにより調製される。iRNA調製物は、別の作用物質、例えば別の治療薬又はiRNAを安定化する作用物質例えば、iRNAと複合体形成してiRNPを形成するためのタンパク質と組み合わせて製剤化することができる。さらに別の作用物質としては、例えばEDTAなどのキレート化剤例えば、Mg2のような二価カチオンを除去するため、塩、RNAアーゼ阻害剤例えば、RNAsinのような広域特異性のRNAアーゼ阻害剤等が挙げられる。一実施形態では、iRNA調製物は、別のiRNA剤、例えば第2の遺伝子または同じ遺伝子に関してRNAiを仲介することができる第2のiRNAを包含する。さらに別の調製物は、少なくとも3個、5個、10個、20個、50個若しくは100個又はそれ以上の異なるiRNA種を包含することができる。このようなiRNAは、同様の数の異なる遺伝子に関してRNAiを仲介することができる。一実施形態では、iRNA調製物は、少なくとも第2の治療薬例えば、RNA又はDNA以外の作用物質を包含する。例えば、神経変性疾患例えば、PDの治療用のiRNA組成物は、既知のPD治療剤例えば、レバドーパlevadopa又はデプロニルdepronilを含んでもよい。標的化説明を簡略化するために、本項での製剤、組成物および方法は、主として非修飾iRNA剤に関して論述する。しかしながら、これらの製剤、組成物および方法は、他のiRNA剤、例えば修飾iRNA剤で実施することができ、かつかかる実施は本発明の範囲内にあることが理解されるべきである。幾つかの実施形態では、iRNA剤、例えば二本鎖のiRNA剤またはsRNA剤例えば、前駆体、例えばsRNA剤へプロセシングされ得るより大きなiRNA剤、あるいは、例えば二本鎖のiRNA剤もしくはsRNA剤などのiRNA剤またはそれらの前駆体をコードするDNAは、特定の細胞を標的とする。例えば、iRNAを包含するリポソームもしくは粒子または他の構造は、標的細胞上の特定の分子を認識する標的化部分を包含することもできる。標的化部分は、標的細胞に関して特異的な親和性を有する分子であり得る。標的化部分には、標的細胞の表面上に見られるタンパク質に対する抗体、あるいは標的細胞の表面上に見られる分子に関するリガンドまたはリガンドの受容体結合部分を挙げることができる。iRNAを脳内の神経細胞に対して標的化するために抗原を使用することも可能である。一実施形態では、標的化部分はリポソームに結合される。例えば、米国特許第6,245,427号は、タンパク質またはペプチドを用いてリポソームを標的化する方法について記載している。別の例では、リポソームのカチオン性脂質成分が、標的化部分で誘導体化される。例えば、国際公開公報第96/37194号は、N-グルタリルジオレオイルホスファチジルエタノールアミンをN-ヒドロキシスクシンイミド活性エステルに変換することについて記載している。該生成物は続いてRGDペプチドにカップリングされた。抗体本明細書に記載される組成物は、例えば、シヌクレインの活性を妨害するため、および/またはシヌクレインの凝集を阻害するために、シヌクレインポリペプチドを標的とする抗体を含み得る。抗体は、抗体またはそのフラグメント、例えば、抗体の抗原結合部分であってよい。本明細書において使用される場合、用語抗体とは、少なくとも1つ、および好ましくは2つの重鎖H鎖可変領域本明細書ではVHという略号を使用する、ならびに少なくとも1つ、および好ましくは2つの軽鎖L鎖可変領域本明細書ではVLという略号を使用するを含むタンパク質をいう。VH領域およびVL領域は、相補性決定領域CDRと呼ばれる超可変領域にさらに分割可能であり、超可変領域にはより保存性の高いフレームワーク領域FRと呼ばれる領域が散在している。フレームワーク領域およびCDRの範囲は正確に決定されているカバトらKabatetal.、SequencesofProteinsofImmunologicalInterest、第5版、米国保健社会福祉省U.S.DepartmentofHealthandHumanServices、NIH出版第91-3242号、1991年、およびショチアらChothiaetal.、J.Mol.Biol.第196巻、901~917ページ、1987年を参照のこと、これらは本願明細書に援用する。各VHおよびVLは3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって次の順番:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4に配列されている。抗体はさらに重鎖および軽鎖の定常領域を含んでいてもよく、それによってそれぞれ重鎖および軽鎖の免疫グロブリン鎖を形成し得る。1つの実施形態において、抗体は、2つの免疫グロブリン重鎖および2つの免疫グロブリン軽鎖のテトラマーであり、ここで、免疫グロブリン重鎖および免疫グロブリン軽鎖は、例えばジスルフィド結合によって、鎖間で結合されている。重鎖定常領域は、3つのドメイン、CH1、CH2、およびCH3から構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、CLから構成される。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、一般に宿主の組織または因子、例えば、免疫系の種々の細胞例えば、エフェクター細胞および古典的な補体系の最初の成分C1qなどに対する抗体の結合を仲介する。用語、抗体の抗原結合フラグメントまたは単に抗体部分またはフラグメントとは、本明細書で使用される場合、抗原例えば、SNCA核酸によってコードされるポリペプチドに特異的に結合する能力を保持している、抗体全長のうちの1つまたは複数のフラグメントをいう。用語、抗体の抗原結合フラグメントに含まれる結合フラグメントの例には:iVLドメイン、VHドメイン、CLドメイン、およびCH1ドメインからなる1価フラグメントであるFabフラグメント;iiヒンジ領域においてジスルフィド結合で連結された2つのFabフラグメントを含む2価フラグメントであるFab’2フラグメント;iiiVHドメインおよびCH1ドメインからなるFdフラグメント;iv抗体の単一アームのVLドメインおよびVHドメインからなるFvフラグメント;vVHドメインで構成されるdAbフラグメントワードらWardetal.、Nature第341巻、544~546ページ、1989年;ならびにvi単離された相補性決定領域CDRが含まれる。さらに、Fvフラグメントの2つのドメイン、VLおよびVHは、別々の核酸によってコードされているが、組換え技法を使用して、VL領域およびVH領域が対となり1価の分子を形成する単一のタンパク質鎖として作製されうるような合成リンカーによって連結されてもよい単鎖FvscFvとして知られる;例えば、バードらBirdetal.、Science第242巻、423~426ページ、1988年、およびヒューストンらHustonetal.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA第85巻、5879~5883ページ、1988年を参照のこと。このような単鎖抗体もまた、用語、抗体の抗原結合フラグメントの中に含まれることが意図される。これらの抗体フラグメントは、当業者に公知である従来の技術を使用して入手され、該フラグメントは、完全な抗体と同様にして有用性についてスクリーニングされる。用語モノクローナル抗体またはモノクローナル抗体組成物は、本明細書で使用される場合、特定のエピトープと免疫反応しうる抗原結合部位を1種類だけ含む抗体分子の集団をいう。したがって、モノクローナル抗体組成物は、一般には、免疫反応する相手の特定のタンパク質について単一の結合親和性を示す。抗-タンパク質/抗-ペプチド抗血清またはモノクローナル抗体は、標準的なプロトコールを使用して本明細書に記載されるように作製可能である例えばAntibodies:ALaboratoryManual、ハーローHarlowおよびレーンLane編、コールドスプリングハーバー出版ColdSpringHarborPress、1988年を参照のこと。本明細書に記載されるタンパク質、例えば、α-シヌクレインポリペプチドを免疫原として使用して、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の調製のための標準的な技術を使用して、該成分に結合する抗体を作製することが可能である。完全長の成分タンパク質を使用してもよいし、または代替として該成分の抗原性ペプチドフラグメントを免疫原として使用してもよい。典型的には、ペプチドを使用して、適切な対象例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、または他の哺乳動物を該免疫原で免疫することによって、抗体を調製する。適切な免疫原性調製物は、例えば、組換え型の本明細書に記載されるタンパク質、例えば、α-シヌクレインポリペプチドを含み得る。例えば、米国特許第5,460,959号;ならびに同時係属の米国特許出願第08/334,797号;同第08/231,439号;同第08/334,455号;および同第08/928,881号これらはその全体を明確に本明細書に援用するを参照のこと。α-シヌクレインのヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は公知である。この調製物はさらに、フロイントの完全アジュバントもしくは不完全アジュバントなどのアジュバント、または同様の免疫刺激剤をさらに含み得る。本明細書に記載の免疫原性タンパク質例えば、α-シヌクレインポリペプチドまたはフラグメントの調製物を用いて適切な対象を免疫することにより、ポリクローナル抗体応答が誘導される。さらに、遺伝子操作方法によって作製された抗体、例えば、標準的な組換えDNA技術を使用して作製可能な、ヒト部分と非ヒト部分の両方を含んでなるキメラモノクローナル抗体およびヒト化モノクローナル抗体などを使用可能である。このようなキメラモノクローナル抗体およびヒト化モノクローナル抗体は、当該分野において公知の標準的なDNA操作方法を用いる遺伝子操作により作製可能である。使用されうる方法は、例えば、ロビンソンらRobinsonetal.、国際出願番号第PCT/US86/02269号;アキラらAkiraetal.、欧州特許出願第184,187号;タニグチTaniguchi,M.、欧州特許出願第171,496号;モリソンらMorrisonetal.、欧州特許出願第173,494号;ノイバーガーらNeubergeretal.、国際公開公報第86/01533号;キャビリーらCabillyetal.、米国特許第4,816,567号;キャビリーらCabillyetal.、欧州特許出願第125,023号;ベターらBetteretal.、Science第240巻、1041~1043ページ、1988年;リューらLiuetal.、PNAS第84巻、3439~3443ページ、1987年;リューらLiuetal.、J.Immunol.第139巻、3521~3526ページ、1987年;サンらSunetal.、PNAS第84巻、214~218ページ、1987年;ニシムラらNishimuraetal.、Canc.Res.第47巻、999~1005ページ、1987年;ウッドらWoodetal.、Nature第314巻、446~449ページ、1985年;およびショーらShawetal.、J.Natl.CancerInst.第80巻、1553~1559ページ、1988年;モリソンMorrison,S.L.,Science第229巻、1202~1207ページ、1985年;オイらOietal.、BioTechniques第4巻、214ページ、1986年;ウィンターWinter米国特許第5,225,539号;ジョーンズらJonesetal.、Nature第321巻、552~525ページ、1986年;バーホーエンらVerhoeyanetal.、Science第239巻、1534ページ、1988年;およびバイドラーーらBeidleretal.、J.Immunol.第141巻、4053~4060ページ、1988年に記載されている。さらに、本明細書に記載のタンパク質、例えば、α-シヌクレインタンパク質に対するヒトモノクローナル抗体を、標準的な技術を使用して作製可能である。例えば、ヒトモノクローナル抗体は、トランスジェニックマウス、または抗体を産生するヒト細胞を移植した免疫不全マウスにおいて生産可能である。このようなマウスを生成する方法は、例えば、以下の文献に記載されている:ウッドらWoodetal.、国際公開公報第91/00906号;クチャラパチらKucherlapatietal.、国際公開公報第91/10741号;ロンバーグらLonbergetal.、国際公開公報第92/03918;ケイらKayetal.、国際公開公報第92/03917号;ケイらKayetal.、国際公開公報第93/12227号;ケイらKayetal.、国際公開公報第94/25585;ラジュースキーらRajewskyetal.、国際公開公報第94/04667号;ジチューリオらDitullioetal.、国際公開公報第95/17085号;ロンバーグらLonbergetal.、Nature第368巻、856~859ページ、1994年;グリーンらGreenetal.、NatureGenet.第7巻、13~21ページ、1994年;モリソンらMorrisonetal.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA第81巻、6851~6855ページ、1994年;ブラグマンらBruggemanetal.、YearImmunol第7巻、33~40ページ、1993年;チョイらChoietal.、NatureGenet.第4巻、117~123ページ、1993年;ツアリオンらTuaillonetal.、PNAS第90巻、3720~3724ページ、1993年;ブラグマンらBruggemanetal.、EurJImmunol第21巻、1323~1326ページ、1991年;ジュコサールらDuchosaletal.、国際公開公報第93/05796号;米国特許第5,411,749号;マックーンらMcCuneetal.、Science第241巻、1632~1639ページ、1988年;カメル-レイドらKamel-Reidetal.、Science第242巻、1706ページ、1988年;スパノポロウSpanopoulou、GenesDevelopment第8巻、1030~1042ページ、1994年;およびシンカイらShinkaietal.、Cell第68巻、855~868ページ、1992年。ヒト抗体トランスジェニックマウス、またはヒト抗体を産生する細胞もしくは組織を移植した免疫不全マウスを、本明細書に記載のタンパク質、例えば、α-シヌクレインタンパク質、またはその抗原性ペプチドで免疫し、次いで、これらの免疫マウス由来の脾細胞を、ハイブリドーマ作製のために使用することができる。ハイブリドーマの作製方法は周知である。本明細書に記載のタンパク質例えば、α-シヌクレインタンパク質に対するヒトモノクローナル抗体はまた、対象のリンパ球に由来するmRNAから調製された免疫グロブリンの軽鎖および重鎖のcDNAを使用して、免疫グロブリンのコンビナトリアルライブラリー、例えば、FabファージディスプレイライブラリーまたはscFvファージディスプレイライブラリーなどを構築することによって調製可能である。例えば、マッカファーティーらMcCaffertyetal.、国際公開公報第92/01047号;マークスらMarksetal.、J.Mol.Biol.第222巻、581~597ページ、1991年;およびグリフィスズらGriffithsetal.、EMBOJ第12巻、725~734ページ、1993年を参照のこと。さらに、既知のヒト抗体を変異させることによって抗体可変領域のコンビナトリアルライブラリーを作製可能である。例えば、本明細書に記載されるタンパク質に結合することが知られているヒト抗体の可変領域を、例えば、ランダムに変化するように変異誘発させたオリゴヌクレオチドを使用することによって変異させ、変異を有する可変領域のライブラリーを作製することが可能であり、次いで該ライブラリーを、本明細書に記載のタンパク質例えば、α-シヌクレインへの結合についてスクリーニングすることができる。免疫グロブリンの重鎖および/または軽鎖のCDR領域中でランダムな変異誘発を誘導する方法、ランダムに変異させた重鎖および軽鎖を相互に組み合わせて対を形成させる方法、ならびにスクリーニング方法は、例えば、バーバスらBarbasetal.、国際公開公報第96/07754号;およびバーバスらBarbasetal.、Proc.Nat’lAcad.Sci.USA第89巻、4457~4461ページ、1992年において見出され得る。免疫グロブリンライブラリーは、抗体ディスプレイライブラリーを形成するために、好ましくは繊維状ファージ由来のディスプレイパッケージの集団によって発現させることが可能である。抗体ディスプレイライブラリーを作製する際に特に使用しやすい方法および試薬の例は、例えば、ラドナーらLadneretal.の米国特許第5,223,409号;カンらKangetal.、国際公開公報第92/18619号;ダウアーらDoweretal.、国際公開公報第91/17271号;ウィンターらWinteretal.、国際公開公報第92/20791号;マークランドらMarklandetal.、国際公開公報第92/15679号;ブライトリングらBreitlingetal.、国際公開公報第93/01288号;マックファーティーらMcCaffertyetal.、国際公開公報第92/01047号;ギャラードらGarrardetal.、国際公開公報第92/09690号;ラドナーらLadneretal.、国際公開公報第90/02809号;フッチスらFuchsetal.、Bio/Technology第9巻、1370~1372ページ、1991年;ヘイらHayetal.、HumAntibodHybridomas第3巻、81~85ページ、1992年;フセらHuseetal.、Science第246巻、1275~1281ページ、1989年;グリフィスズらGriffithsetal.、1993年、前出;ホーキンスらHawkinsetal.、JMolBiol第226巻、889~896ページ、1992年;クラックソンらClacksonetal.、Nature第352巻、624~628ページ、1991年;グラムらGrametal.、PNAS第89巻、3576~3580ページ、1992年;ギャラードらGarradetal.、Bio/Technology第9巻、1373~1377ページ、1991年;フーゲンブームらHoogenboometal.、NucAcidRes第19巻、4133~4137ページ、1991年;およびバーバスらBarbasetal.、PNAS第88巻、7978~7982ページ、1991年において見出され得る。ディスプレイパッケージ例えば、繊維状ファージの表面に提示ディスプレイさせた上で、該抗体ライブラリーを、本明細書に記載のタンパク質、例えば、α-シヌクレインポリペプチドに結合する抗体を発現するパッケージを同定および単離するためにスクリーニングする。好ましい実施形態では、ライブラリーの一次スクリーニングでは、本明細書に記載の固定化タンパク質を用いるパニングが実施され、本明細書に記載の固定化タンパク質に結合する抗体を発現しているディスプレイパッケージが選択される。アンチセンス核酸配列本明細書に記載のタンパク質、例えば、α-シヌクレインポリペプチドをコードするヌクレオチドに対してアンチセンスである核酸分子は、該タンパク質の発現を阻害する薬剤として使用することも可能である。アンチセンス核酸は、該成分をコードするセンス核酸に対して相補的である、例えば、二本鎖cDNA分子のコード鎖に相補的であるか、またはmRNA配列に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む。したがって、アンチセンス核酸は、センス核酸と水素結合を形成可能である。アンチセンス核酸は、コード鎖または非コード鎖の一部分に対して相補的であってもよい。α-シヌクレインタンパク質をコードするコード鎖の配列は公知である。コード鎖の配列例えば、cDNA分子のセンス鎖の配列が与えられると、ワトソン-クリック塩基対合の規則に従ってアンチセンス核酸を設計することができる。アンチセンス核酸分子は、mRNAのコード領域または非コード領域の一部分に対して相補的であってもよい。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、mRNAの翻訳開始部位周辺の領域例えば、5’UTRに対して相補的であってもよい。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、長さが約10~25ヌクレオチド例えば、長さが11、12、13、14、15、16、18、19、20、または24ヌクレオチドであり得る。アンチセンス核酸は、当該分野において公知の手順を使用する、化学合成および酵素によるライゲーションを使用して構築可能である。例えば、アンチセンス核酸例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、天然に存在するヌクレオチド、または、該分子の生物学的安定性を高めるために、もしくはアンチセンス核酸とセンス核酸との間に形成される二本鎖の物理的安定性を高めるように設計された様々な修飾を有するヌクレオチドを使用して、化学的に合成可能であり、例えば、ホスホロチオエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチドを使用可能である。アンチセンス核酸を作製するために使用可能な修飾ヌクレオチドの例には:2’-O-メチル化ヌクレオチド、5-フルオロウラシル、5-ブロモウラシル、5-クロロウラシル、5-ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4-アセチルシトシン、5-カルボキシヒドロキシルメチルウラシル、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、β-D-ガラクトシルクエオシン、イノシン、N6-イソペンテニルアデニン、1-メチルグアニン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアニン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、N6-アデニン、7-メチルグアニン、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、β-D-マンノシルクエオシン、5’-メトキシカルボキシメチルウラシル、5-メトキシウラシル、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸v、ワイブトキソシン、プソイドウラシル、クエオシン、2-チオシトシン、5-メチル-2-チオウラシル、2-チオウラシル、4-チオウラシル、5-メチルウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル-5-オキシ酢酸v、5-メチル-2-チオウラシル、3-3-アミノ-3-N-2-カルボキシプロピルウラシル、acp3w、および2,6-ジアミノプリンが含まれる。代替的には、アンチセンス核酸は、核酸がアンチセンス方向にサブクローニングされている発現ベクターを使用して生物学的に生産可能であるすなわち、挿入された核酸から転写されるRNAは、対象とする標的核酸に対してアンチセンス方向となる。アンチセンス剤は、リボヌクレオチドのみ、デオキシリボヌクレオチドのみ例えば、オリゴデオキシヌクレオチド、またはデオキシリボヌクレオチド配列とリボヌクレオチド配列の両方を含み得る。例えば、リボヌクレオチドのみからなるアンチセンス剤は、相補的なRNA例えば、α-シヌクレインRNAにハイブリダイズし、この標的RNA転写物に対する翻訳装置の接近を妨害することによって、タンパク質合成を妨害することができる。デオキシリボヌクレオチドのみを含むアンチセンス分子、またはデオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドを含むアンチセンス分子例えば、5’末端および3’末端にRNA配列が隣接しているDNA配列のアンチセンス剤は、相補的RNAにハイブリダイズ可能であり、続いて該標的RNAは酵素例えば、RNAseHによって切断されうる。該標的RNAの分解により翻訳が阻止される。この隣接RNA配列は2’-O-メチル化ヌクレオチド、およびホスホロチオエート結合を含んでもよく、内側のDNAは、ヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含んでもよい。RNAseH活性の標的としたい場合、内側のDNA配列の長さは少なくとも約5ヌクレオチドであることが好ましい。ヌクレアーゼ耐性の向上のために、アンチセンス剤を、3’-3’結合で3’末端のヌクレオシドを反転させることにより、さらに修飾することができる。別の代替例において、3’末端をアミノアルキル基でブロックすることもできる。ジンクフィンガータンパク質ZFPジンクフィンガータンパク質技術を用いて、標的候補遺伝子、例えば、SNCA遺伝子の転写をダウンレギュレーションすることが可能である。例えば、SNCA遺伝子特異的なDNA結合ドメインを、SNCA遺伝子の発現をダウンレギュレーションするためにリプレッサードメインに融合させることができる。様々な特異性を有する様々な多数のジンクフィンガードメインを使用してジンクフィンガータンパク質を構築し、新規な配列を認識するのみならず、様々な長さの配列も認識するDNA結合タンパク質を提供することができる。遺伝子発現の調節のためのジンクフィンガー結合タンパク質については、例えば、米国特許第6,607,882号および同第6,534,261号に記載されている。ZFPによって認識される標的部位は、ZFP任意選択で調節ドメインに連結されているによる遺伝子発現の抑制が可能となるような、標的遺伝子例えば、SNCA遺伝子中の任意の適切な部位であってよい。好ましい標的部位には、転写開始部位の下流または上流に隣接する領域が含まれる。さらに、標的部位は、エンハンサー領域、リプレッサー部位、RNAポリメラーゼ休止部位、および特異的調節部位例えば、REP1部位に位置してもよく、cDNAコード領域内の部位、または発現配列タグESTコード領域内に位置してもよい。典型的には、各フィンガーは2~4塩基対を認識し、2フィンガーのZFPは4~7bpの標的部位に結合し、3フィンガーのZFPは6~10塩基対の部位に結合し、そして6フィンガーのZFPは各々約6~10塩基対の2つの隣接する標的部位に結合する。典型的には、ジンクフィンガーDNA結合ドメインは、調節ドメイン、例えば、Krueppel結合ボックスKRAB、ERFリプレッサードメインERD、またはmSIN3相互作用ドメインSIDなどの転写因子リプレッサードメインに連結される。遺伝子発現を抑制するためには、一般に、該遺伝子の発現を、約20低減しすなわち、ZFPの調節を受けていない発現の80とし、より好ましくは約50低減しすなわち、ZFPの調節を受けていない発現の50とし、より好ましくは約75~100低減するすなわち、ZFPの調節を受けていない発現の25~0とする。ジンクフィンガータンパク質を低分子に応答するように人為操作して、該低分子によりジンクフィンガータンパク質の活性を調節可能とすることができる。1つの実施形態において、細胞は2つのジンクフィンガータンパク質を含む。これらのジンクフィンガータンパク質は2つの異なる候補遺伝子を標的とし得る。例えば、1つのZFPがSNCA遺伝子を標的として発現を阻害し、第2のZFPがプロテアソーム機構の成分をコードする遺伝子を標的として、例えば発現を増強してもよい。別例として、第2のZFPが、α-シヌクレインの凝集表現型に寄与する第2の遺伝子の発現を標的とし、かつ阻害してもよい。別例として、ジンクフィンガータンパク質が、同じ候補遺伝子上の2つの異なる標的部位を標的としてもよい。各ジンクフィンガータンパク質の発現が低分子例えば、2つの異なる低分子の制御下にあり、遺伝子発現の抑制の程度を変動可能にすることもできる。低分子とは、本明細書で使用される場合、例えば、細胞中で特定のタンパク質または核酸、例えば、SNCAタンパク質または核酸の活性を調節することによって、細胞または生物の表現型に影響を与え得る化学化合物である。低分子は、タンパク質と直接的に相互作用することによって、またはタンパク質の発現もしくは活性をもたらす生化学カスケードの上流もしくは下流に作用する分子と相互作用することによって、細胞に影響を与え得る。典型的には、低分子の分子量は、約3000Da未満、好ましくは約2000Da未満、より好ましくは約1000Da未満、約900Da未満、約800Da未満、約700Da未満、または約600Da未満である。治療方法および送達経路以下の議論は、iRNA剤を用いる治療に関する。しかしながら、本発明は、本明細書に開示される他の阻害剤、例えば、SNCARNAを標的とするアンチセンス分子およびリボザイム、ジンクフィンガータンパク質、および抗体、ならびに、好ましい実施形態においてSNCAタンパク質に結合しかつこれを阻害する合成ポリペプチドおよび天然に存在するポリペプチドまたは低分子を使用または具体化する類似の方法および組成物を含むと理解されるものである。α-シヌクレインを標的とする組成物、例えば、リボザイム、アンチセンスオリゴヌクレオチド、iRNA剤、抗体、低分子、またはジンクフィンガータンパク質を含む組成物は、種々の経路によって対象に送達可能である。例示的な経路には、クモ膜下腔内、例えば、脳内の実質、静脈内、鼻、および眼への送達が含まれる。好ましい送達経路は、脳への直接送達である。抗SNCA剤は、投与に適した薬学的組成物に組み込まれ得る。例えば、組成物は、1種以上のiRNA剤および薬学的に許容可能な担体を含み得る。本明細書で使用される場合、用語薬学的に許容可能な担体とは、薬学的投与に適した任意のあらゆる溶媒、分散媒体、被覆剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含むことを意図する。薬学的に活性な物質のためにこのような媒体および薬剤を使用することは、当該分野において周知である。任意の従来の媒体または薬剤は、該活性化合物とは相容れない場合を除き、本発明の組成物中における使用が意図される。補助的な活性化合物もまた、組成物に組み込み可能である。本発明の薬学的組成物は、局所治療が所望されるか全身治療が所望されるかにより、また治療すべき領域により、多数の方法で投与可能である。投与は、局所点眼、鼻内投与、経皮投与などでも、経口または非経口であってもよい。非経口投与は、静脈内点滴、皮下、腹腔内、もしくは筋肉内の注射、またはクモ膜下腔内もしくは脳室内の投与を含む。送達の経路は、患者の障害によって変わりうる。例えば、PDと診断された対象に、抗SNCAiRNA剤を、脳に直接的に、例えば、脳の黒質に直接的に例えば、黒質内の線条体のドーパミン領域に投与可能である。多系統萎縮症と診断された対象には、脳に直接的に、例えば、脳の線条体および黒質の領域に、および脊髄にiRNA剤を投与可能である。レーヴィ小体痴呆と診断された対象には、脳に直接的に、例えば、脳の皮質に直接的にiRNA剤を投与可能であり、そして投与は拡散可能である。SNCA発現を阻害する薬剤、例えば、抗SNCAiRNA剤に加えて、患者に、第2の治療、例えば、緩和治療および/または疾患特異的な治療を施しても良い。緩和治療は、ドーパミン作動薬治療、例えば、メチルドーパまたはコエンザイムQ10などであり得る。ある実施形態において、例えば、パーキンソン病の治療のために、第2の治療は、例えば、対症的治療例えば、症状を緩和するため、神経を保護する治療例えば、疾患の進行を遅延または停止させるため、または回復治療例えば、疾患の過程を逆行させるためであり得る。対症的治療は、薬物カルビドーパ/レボドーパ、エンタカポン、トルカポン、プラミペキソール、ロピネロールropinerole、ペルゴリド、ブロモクリプチン、セレゲリン、アマンタジン、および数種の抗コリン作用剤を含む。脳深部刺激手術ならびに定位的脳手術もまた、対症的軽減をもたらす可能性がある。神経を保護する治療には、例えば、カルビドーパ/レボドーパ、セレゲリン、ビタミンE、アマンタジン、プラミペキソール、ロピネロール、コエンザイムQ10、およびGDNFが含まれる。回復治療には、例えば、幹細胞の外科的移植が含まれ得る。抗SNCAiRNA剤は、脳の神経細胞に送達可能である。組成物が血液脳関門を通過する必要のない送達方法が利用可能である。例えば、iRNA剤を含む薬学的組成物を、α-シヌクレイン凝集物を含む領域への直接的な注射によって患者に送達可能である。例えば、薬学的組成物を、脳への直接的注射によって送達可能である。この注射は、脳の特定の領域例えば、黒質、皮質、海馬、または淡蒼球への定位的な注射であり得る。iRNA剤は、中枢神経系の複数の領域に例えば、脳の複数の領域に、および/または脊髄に送達可能である。iRNA剤は、脳の広範な領域に送達可能である例えば、脳の皮質への拡散性送達。1つの実施形態において、iRNA剤は、組織、例えば、脳例えば、脳の黒質、海馬、または淡蒼球に一端が移植されたカニューレまたは他の送達デバイスによって送達可能である。カニューレはiRNA剤のリザーバーに接続可能である。フローまたは送達は、ポンプ、例えば、浸透圧ポンプまたはミニポンプによって調節可能である。1つの実施形態において、ポンプまたはリザーバーは組織から離れた領域に、例えば、腹部に移植され、送達は、ポンプまたはリザーバーから放出部位まで通じている導管によってもたらされる。脳への送達のためのデバイスは、例えば、米国特許第6,093,180号および同第5,814,014号に記載されている。iRNA剤は、血液脳関門を通過できるように修飾可能である。例えば、iRNA剤は、該薬剤が血液脳関門を通過できるようにする分子と複合体化されてもよい。このような修飾iRNA剤は、任意の所望の方法によって、例えば、脳室内もしくは筋肉内注射によって、または肺送達によって投与可能である。抗SNCAiRNA剤は、例えば、網膜の障害例えば、網膜症を治療するために眼に投与可能である。例えば、薬学的組成物は、眼の表面または周辺組織、例えば、瞼の内部に施用可能である。該組成物は、局所的に、例えば、噴霧することによって、点眼として、眼洗浄液として、または軟膏として施用可能である。軟膏および滴下可能な液体は、当該分野で既知の眼への送達系、例えば、アプリケーターまたは点眼器によって送達されてもよい。このような組成物は、ヒアルロン酸、コンドロイチン硫酸、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、もしくはポリビニルアルコールなどの粘膜模倣物、ソルビン酸、EDTA、またはベンジルクロミウムクロライドなどの保存剤、ならびに通常の量の希釈剤および/または担体を含み得る。薬学的組成物はまた、眼の内部に投与可能であり、かつ選択された領域または構造に組成物を導入することが可能な針または他の送達デバイスによって導入可能である。iRNA剤を含む組成物はまた、眼用パッチを介して施用可能である。投与は、投与対象者によって為されても良いし、または別のヒト、例えば、別の介護者によって為されても良い。介護者は、ヒトを介護することに関与する任意の存在であり得る:例えば、病院、ホスピス、医院、外来診察室;医師、看護師、もしくは他の実務者などの医療従事者;または配偶者もしくは保護者例えば、親などである。投薬は、測定された用量で、または測定された用量を送達するディスペンサーで供給可能である。対象を、浮腫または脳内出血などの治療に対する反応についてモニターすることが可能である。例えば、患者をMRIによって、例えば、注射後毎日または毎週、または注射後定期的な時間間隔でモニター可能である。対象を、疾患の症状の改善または安定化についてモニターすることも可能である。このようなモニタリングは、例えば、経時的な臨床評価例えば、統合パーキンソン病評価尺度を使用して、または機能的神経画像化によって達成可能である。モニタリングはまた、未治療の対象から収集した規準データに対して治療した対象を比較する、線条体ドーパミン作動性機能の経時的な定量測定値例えば、フルオロドーパおよびポジトロン放出断層撮影を含み得る。別の成果尺度には、生存ならびに緩和治療および診療所への入所なしでの生存を含み得る。治療した対象および未治療の対象についてのこれらの測定値および成果における統計学的に有意な違いは、治療効力の証拠である。抗SNCAiRNA剤を含む薬学的組成物は、シヌクレイン症などの神経変性障害を有するか、または発症するリスクがあると診断された任意の患者に投与可能である。1つの実施形態において、患者は神経変性障害を有すると診断され、その患者は他の点では一般的に良好な健康状態にある。例えば、この患者は末期症状にはなく、この患者は、診断後少なくとも2年、3年、5年、または10年またはそれ以上生存すると思われる。患者は診断後すぐに治療されてもよいし、またはより衰弱させる症状例えば、PD患者における動揺性動作障害および運動障害を患者が経験するまで治療を遅延してもよい。別の実施形態において、患者は疾患の重症な段階に達しておらず、例えば、患者は、ホーンHoehnおよびヤールYahrのPDの段階5に達していないホーンHoehnおよびヤールYahr、Neurology第17巻、427~442ページ、1967年。別の実施形態において、患者は末期症状ではない。一般的に、抗SNCAiRNA剤は、任意の適切な方法によって投与可能である。本明細書において使用される場合、局所送達とは、身体の任意の表面眼、粘膜、体腔の表面、または任意の内部表面へのiRNA剤の直接的施用を指すことが可能である。局所投与のための製剤には、経皮パッチ、軟膏、ローション、クリーム、ゲル、点眼剤、スプレー、およびリキッド剤が含まれうる。従来の薬学的担体、水性、粉末、または油性の基剤、増粘剤などが必要であるか、または望ましい場合がある。局所投与は、対象の表皮もしくは真皮、または表皮もしくは真皮の特定の層、または下層組織にiRNA剤を選択的に送達するための手段としても使用可能である。クモ膜下腔内投与または脳室内投与のための組成物は滅菌水性溶液を含んでもよく、該水性溶液はさらに緩衝剤、希釈剤、および他の適切な添加剤を含んでもよい。非経口投与のための製剤は滅菌水性溶液を含んでもよく、該水性溶液はさらに緩衝剤、希釈剤、および他の適切な添加物を含んでもよい。脳室内注射は、例えばリザーバーに連結された脳室内カテーテルによって容易に実施可能である。静脈内で使用するためには、溶質の全体の濃度を調節して、調製物を等張にするべきである。抗SNCAiRNA剤は、肺送達によって対象に投与されてもよい。肺送達組成物は、患者が分散物を吸入することによって、分散物中の組成物、好ましくはiRNAが肺に到達可能となり、肺において肺胞領域を介して血液循環中に直接容易に吸収されうるように送達することができる。肺送達は、全身への送達、および肺の疾患を治療するための局所送達のいずれにおいても有効であり得る。1つの実施形態において、肺送達によって投与される抗SNCAiRNA剤は、血液脳関門を通過可能であるように修飾されている。肺送達は、霧状、エアロゾル状、ミセル状、および乾燥粉末状の製剤の使用など、種々の手法によって達成可能である。送達は、液体噴霧器、エアロゾルベースの吸入器、および乾燥粉末分散物用デバイスを用いて達成可能である。計量式デバイスが好ましい。アトマイザーまたは吸入器を使用する利点の1つは、デバイスが内蔵型であるために夾雑物混入の可能性が最小化されることである。乾燥粉末分散物用デバイスは、例えば、乾燥粉末として容易に製剤化可能な薬物を送達する。iRNA組成物は、単独で凍結乾燥粉末もしくは噴霧乾燥粉末として、または適切な粉末担体と組み合わせて安定に保存可能である。吸入用組成物の送達は投薬調節要素を介して行うことも可能であり、該投薬調節要素には、デバイスに組み込まれたときに、エアロゾル医薬の投与時における用量の追跡、服薬の監視、および/または患者への投薬開始を可能にする、タイマー、用量計測器、時間測定デバイス、または時間表示器が含まれ得る。用語治療有効量は、治療される対象において期待の生理学的応答を生じさせる所望の薬物レベルを提供するために必要な、組成物中に存在する量である。用語生理学的有効量は、所望の緩和効果または治癒効果を与えるために対象に送達される量である。用語薬学的に許容可能な担体とは、その担体が、肺に対して有意な毒性副作用を伴わずに肺に取り込まれ得ることを意味する。担体として有用である医薬賦形剤の種類には、ヒト血清アルブミンHSAなどの安定剤、糖質、アミノ酸、およびポリペプチドなどの充填剤;pH調整剤または緩衝剤;塩化ナトリウムなどの塩;その他が含まれる。これらの担体は、結晶型でもアモルファス型でもよく、またはその2つの混合物であってもよい。特に有用な充填剤には、共用可能な糖質、ポリペプチド、アミノ酸、またはそれらの組み合わせが含まれる。適切な糖質には、ガラクトース、D-マンノース、ソルボースなどの単糖;ラクトース、トレハロースなどの二糖;2-ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリンなどのシクロデキストリン;およびラフィノース、マルトデキストリン、デキストランなどの多糖;マンニトール、キシリトールなどのアルジトールが含まれる。好ましい糖質の群には、ラクトース、トレハロース、ラフィノース、マルトデキストリン、およびマンニトールが含まれる。適切なポリペプチドにはアスパルテームが含まれる。アミノ酸には、アラニンおよびグリシンが含まれ、グリシンが好ましい。適切なpH調整剤または緩衝剤には、クエン酸ナトリウム、アスコルビン酸ナトリウムなどの有機酸および有機塩基から調製した有機塩が含まれ;クエン酸ナトリウムが好ましい。抗SNCAiRNA剤は、経口および経鼻送達によって投与可能である。例えば、これらの膜を通して投与される薬物は、作用開始が迅速であり、治療的な血漿レベルを提供し、肝代謝の初回通過効果を回避し、かつ敵対的な胃腸GI環境に対する薬物の曝露を回避する。さらなる利点には、薬物が容易に適用、局在化、および除去されうるように膜部位へ接近しやすいことが含まれる。1つの実施形態において、経口または経鼻送達によって投与される抗SNCAiRNA剤は、血液脳関門を通過可能であるように修飾されている。1つの実施形態において、iRNAを含む組成物の単位用量または測定された用量が、移植されたデバイスによって投薬される。このデバイスは、対象の体内のパラメータをモニターするセンサーを含み得る。例えば、このデバイスは、浸透圧ポンプなどのポンプ、および場合により、関連する電子部品を備え得る。iRNA剤は、ウイルスの天然のカプシドにパッケージングされてもよいし、化学的もしくは酵素的に作製された人工のカプシドまたはそこから誘導される構造物にパッケージングされてもよい。投薬量。抗SNCAiRNA剤は、体重1kg当たり約1.4mg未満の単位用量、または体重1kg当たり10、5、2、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001、0.0005、0.0001、0.00005、もしくは0.00001mg未満の単位用量で投与可能であり、体重1kg当たり200ナノモル例えば、約4.4×1016コピーのRNA剤、または体重1kg当たり1500、750、300、150、75、15、7.5、1.5、0.75、0.15、0.075、0.015、0.0075、0.0015、0.00075、0.00015ナノモルのRNA剤の単位用量で投与可能である。この単位用量を、例えば、注射例えば、静脈内注射もしくは筋肉内注射、クモ膜下腔内注射、または脳への直接的な注射、吸入投薬、または局所的施用によって投与可能である。特に好ましい投薬量は、体重1kgあたり2、1、または0.1mg未満である。器官への直接的な例えば、脳への直接的なiRNA剤の送達は、器官当たり約0.00001mg~約3mg、または好ましくは器官当たり約0.0001~0.001mg、器官当たり約0.03~3.0mg、眼当たり約0.1~3.0mg、または器官当たり約0.3~3.0mgのオーダーの投薬量であり得る。投薬量は、疾患または障害、例えば、シヌクレイン症と関連する疾患または障害を治療または予防するために有効な量であり得る。1つの実施形態において、単位用量は、1日に1回未満の頻度で、例えば、2日毎、4日毎、8日毎、または30日毎に1回未満の頻度で投与される。別の実施形態において、単位用量は、一定の頻度で投与されない例えば、不規則的な投与頻度。例えば、単位用量が単回投与されてもよい。1つの実施形態において、有効用量が他の伝統的な治療様式と一緒に投与される。1つの実施形態において、対象はPDを有し、該治療様式はiRNA剤以外、例えば、二本鎖iRNA剤またはsRNA剤以外の治療剤である。この治療様式は、例えば、レバドーパまたはデプロニルであり得る。1つの実施形態において、対象に、初回用量および1回以上の維持用量のiRNA剤、例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤例えば、前駆体、例えば、プロセシングされてsRNA剤になる大きなiRNA剤、またはiRNA剤例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤、またはそれらの前駆体をコードするDNAを投与する。維持用量は、一般的に初回用量よりも少なく、例えば、初回用量の半分である。維持投薬計画は、1日当たり体重1kg当たり0.01μg~1.4mgの範囲、例えば、1日当たり体重1kg当たり10、1、0.1、0.01、0.001、または0.00001mgの用量で対象を治療することを包含し得る。維持用量は、5日、10日、または30日毎に1回以下投与されることが好ましい。さらに、治療計画の継続期間は、特定の疾患の性質、その重症度、および患者の全身状態に依存して変化しうる。好ましい実施形態において、投薬量は、1日に1回以下、例えば、24時間、36時間、48時間、またはそれ以上の時間当たりで1回以下、例えば、5日毎または8日毎に1回以下送達してもよい。治療後、患者の状態の変化について、および疾患状態の症状の緩和について患者をモニターしてもよい。化合物の投薬量は、患者が現在の投薬量レベルに対して有意に応答しない場合には増加してもよいし、疾患状態の症状の緩和が観察される場合、疾患状態が除去された場合、もしくは望ましくない副作用が観察される場合には用量を減少してもよい。有効用量は特定の状況下で所望される、または適切と考えられるような、単回投与または2回以上の投与で投与可能である。反復または頻繁な注入を容易にすることが所望される場合、送達デバイス例えば、ポンプ、半透過性ステント例えば、静脈内、腹腔内、槽内、または嚢内、またはリザーバーの移植が推奨されることがある。1つの実施形態において、iRNA剤の薬学的組成物は、複数種のiRNA剤を含む。別の実施形態において、複数種の該iRNA剤の配列は、天然に存在する標的配列に関して別の種類のiRNA剤と重複せず、かつ隣接しない。別の実施形態において、複数種のiRNA剤は、天然に存在する異なる標的遺伝子に特異的である。別の実施形態において、iRNAは対立遺伝子特異的である。治療に成功した後、疾患状態の再発を予防するために、患者に維持治療を受けさせることが望ましいことがある。該維持治療において、本発明の化合物は、体重1kg当たり0.01μg~100gの範囲の維持用量で投与される米国特許第6,107,094号を参照のこと。iRNA剤組成物の濃度は、疾患の治療もしくは予防に有効であるために十分な量、またはヒトにおける生理学的状態を調節するために十分な量である。投与されるiRNA剤の濃度または量は、薬剤について決定されるパラメータ、および投与方法例えば、鼻、口腔、または肺に依存する。例えば、点鼻用製剤は、鼻腔の刺激および炎症を回避するために、一部の成分を非常に低濃度とする必要がある傾向を有する。適切な点鼻用製剤を提供するために、経口製剤を10~100倍まで希釈することが望ましいことがある。疾患または障害の重症度、以前の治療、対象の全体的な健康、および/または年齢、ならびに存在する他の疾患などこれらに限定されないの特定の要因は、対象を有効に治療するために必要な投薬量に影響を与える可能性がある。さらに、治療有効量のiRNA剤、例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤例えば、前駆体、例えば、プロセシングされてsRNA剤となりうる大きなiRNA剤、またはiRNA剤例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤、またはそれらの前駆体をコードするDNAを用いる対象の治療は、単一の治療も、好ましくは、一連の治療を含み得る。当然のことながら、治療のために使用されるiRNA剤例えば、sRNA剤の有効投薬量が特定の治療の過程にわたって増加または減少されてもよい。投薬量の変化は、本明細書に記載されるような診断アッセイの結果に起因することもあり、かつ該結果から明らかとなることもある。例えば、iRNA剤組成物の投与後に対象をモニター可能である。モニタリングからの情報に基づいて、付加的な量のiRNA剤組成物を投与することができる。投薬は、治療される疾患状態の重症度および応答性に依存し、治療の期間は数日から数カ月まで続くか、または治癒がもたらされるまで、もしくは疾患状態の減少が達成されるまでである。最適な投薬スケジュールは、患者の身体における薬物の蓄積の測定から計算可能である。当業者は、最適な投薬量、投薬方法論、および反復の程度を容易に決定可能である。最適投薬量は、個々の化合物の相対的効力に依存して変化する可能性があり、一般的には、invitroおよびinvivoの動物モデルにおいて有効であることが見出されたEC50に基づいて推定することができる。ある実施形態において、動物モデルは、ヒト遺伝子例えば、標的RNA例えば、SNCARNAを産生する遺伝子を発現するトランスジェニック動物を含む。トランスジェニック動物は、対応する内在性RNAが欠損していてもよい。別の実施形態において、試験のための組成物は、動物モデル中の標的RNAとヒト中の標的RNAとの間で保存されている配列に対して、少なくとも内部領域において相補的であるiRNA剤を含む。キット。特定の他の態様において、本発明は、iRNA剤、例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤例えば、前駆体、例えば、プロセシングされてsRNA剤になりうる大きなiRNA剤、またはiRNA剤例えば、二本鎖iRNA剤、またはsRNA剤、またはそれらの前駆体をコードするDNAの医薬製剤を含む適切な容器を含むキットを提供する。特定の実施形態において、医薬製剤の個々の成分は1つの容器中で提供され得る。別例として、医薬製剤の成分を2つ以上の容器中で別々に提供することが望ましい場合もある。例えば、前記2つ以上の容器のうち1つの容器はiRNA剤調製物のためであり、および少なくとももう1つの容器は担体化合物のためである。キットは、多数の異なる構成として例えば、単一の箱の中に1つまたは複数の容器などの構成としてパッケージすることが可能である。異なる成分を、例えば、キットとともに提供される指示書に従って組み合わせることが可能である。成分は、例えば、薬学的組成物を調製および投与するために、本明細書に記載の方法に従って組み合わせることが可能である。キットはまた、送達デバイスを含み得る。本発明を以下の実施例によってさらに例証するが、実施例はさらなる限定と解釈されるべきではない。[SNCAを標的とするiRNA剤の設計]表1に記載される配列を有する二本鎖RNAを合成した。図1Aは、完全長のSNCAmRNAの配列、およびdsRNASNCA1~9表1の標的部位を示す。SNCA6、7、8、および9の配列を、ホワイトヘッドインスチチュートWhiteheadInstitute[米国マサチューセッツ州ケンブリッジCambridge所在]で開発され、オンラインで自由に利用可能なdsRNA選択ツールを使用して設計した。該dsRNA選択ツールを使用することによって、a4つ以上連続するA、T、またはG残基を含む任意の配列、およびb1列に8つ以上の連続するGC対を有する任意の配列を除く、30から70の間のGC含量を有するすべての可能なsiRNAを選択した。全体で237種の候補siRNAがこの判断基準に合致した。次いで、この237種の候補siRNAを、ヒトα-シヌクレインにのみ合致した配列を有するsiRNAを同定するために、UniGeneデータベースポンチウスらPontiusetal.TheNCBIHandbook.のUniGene:aunifiedviewofthetranscriptome.、米国メリーランド州ベテスダ所在のNationalCenterforBiotechnologyInformation;2003年に対してスクリーニングした。このスクリーニングは、BLAST検索技術アルチュールらAltschuletal.NucleicAcidsRes.第25巻、3389~3402ページ、1997年を使用して実行した。同定されたsiRNAのサブセットを、マウスのα-シヌクレイン遺伝子にのみ合致する配列を有するsiRNAを同定するためにBLASTを使用してマウスUniGeneに対してスクリーニングした。13個の配列が同定され、重複部分を含まない4個の二本鎖SNCA6、7、8、および9を、以下に記載するアッセイにおける使用のために選択した。[SNCAdsRNAはinvitroにおいてタンパク質発現を減少させた]神経芽細胞腫細胞BE2-M17を、50nMdsRNA、およびEGFPまたはα-シヌクレイン-EGFPEGFP/NACP融合タンパク質のいずれかを発現するプラスミドで同時にトランスフェクションした本明細書において使用されるように、NACPはSNCAの遺伝子産物と同義である。EGFPおよびEGFP/NACP融合タンパク質の発現をウェスタンブロット分析によってアッセイした図2。invitroの細胞アッセイは、表1の試験用dsRNAがSNCARNAの発現をダウンレギュレーションする能力をモニターする。これらの実験におけるSNCA標的RNAはEGFPRNAに融合されている。EGFPに対する抗体は、RNAから翻訳されたEGFP/NACP融合タンパク質の検出を容易にする。このアッセイにおいて使用される対照実験には、ルシフェラーゼRNAを標的とするdsRNA図2のsiRNAMrと記されたレーンを参照のこと、およびsiRNAでトランスフェクションされていない細胞の使用を含めた。αチューブリンに対する抗体を、各レーンに装荷された全タンパク質の量をモニターするための対照として使用した。対照実験は、EGFPタンパク質およびEGFP/NACPタンパク質が、抗SNCAdsRNAの非存在下ではほぼ等量で発現されていることを示した。観察されたEGFP/NACP発現のダウンレギュレーション効果が最大であったのは、Mayo2、Mayo7、およびMayo8dsRNAであった本明細書において使用される場合、MayoXsiRNAは、SNCAXdsRNAと同義である。Mayo1、Mayo6、およびMayo9dsRNAでは、それより弱い効果が観察された。siRNAMrは、ベクター由来のEGFPおよびEGFP/NACP複合体の両方の発現に影響を与え、このアッセイの適合性を実証した。最も有効なdsRNAMayo2、Mayo7、およびMayo8の阻害効果を、様々なdsRNA濃度において24時間インキュベーションとして試験した図3。IC50値は1nM未満と決定された。最も有効なsiRNAの阻害効果を、低濃度の血清を用いる培養中のゆっくりと分裂している神経芽細胞腫細胞中で試験した。BE2-M17細胞を、EGFP/NACP融合タンパク質を発現するプラスミド単独でトランスフェクションするか対照、またはdsRNAMayo2、Mayo7、もしくはMayo8とともに同時トランスフェクションした。EGFP/NACPタンパク質の発現を、6日間にわたってモニターした。融合タンパク質の発現は、少なくとも3日間有効にサイレンシングされることが観察された図4。dsRNAはまた、少なくとも3日間、同様の細胞において内在性タンパク質の発現も阻害した図5。Mayo2、Mayo7、およびMayo8siRNAはまた、ゆっくりと分裂している細胞中の内在性α-シヌクレインRNAの発現も阻害した図6。6日後、Mayo2およびMayo8は、内在性SNCA発現を有効に阻害し続けていた。細胞中のα-シヌクレインmRNAのレベルは、定量的RT-PCRのTaqman登録商標法によって、18SrRNA発現レベルに対して標準化して測定した。SNCAの3’UTRを標的とするMayo9は、内在性α-シヌクレインRNAの発現を阻害しなかった。Mayo2、7、および8のdsRNAの効力を、マウスSNCAに対して試験した。細胞を、dsRNA、およびEGFPのみをコードするプラスミドベクターまたはヒトもしくはマウス由来のEGFP-NACPをコードするプラスミドを用いて同時トランスフェクションした。EGFPおよびEGFP-NACPの発現を、ウェスタンブロットによってアッセイした。3種すべてのdsRNAがヒトEGFP-NACPの発現を阻害したのに対して、Mayo2のみがマウスEGFP-NACPの発現を阻害した図7。ヒトおよびマウスのmRNA配列はMayo2遺伝子座においては同一であるが、Mayo7およびMayo8の各遺伝子座においては、2つのヌクレオチドが相違している。SNCBβ-シヌクレインは、Mayo2遺伝子座においてα-シヌクレインと配列類似性を共有しているが、配列中4つのヌクレオチドが異なっている。Mayo2の効力を、SNCBに対して試験した。BE2-M17細胞を、dsRNAMayo2またはMayo9を発現するプラスミドでトランスフェクションした。内在性のSNCAおよびSNCBのRNAの発現を、Taqman登録商標法による定量的RT-PCRでアッセイした。Mayo2はSNCAの発現を阻害したが、SNCBの発現を阻害しなかった図11。予測されたように、Mayo9はSNCBまたはSNCAの発現を阻害しなかった。[SNCAsiRNAの安定性]SNCAsiRNAのセンス鎖およびアンチセンス鎖の安定性を、90マウス血清または90ヒト血清中で、およびマウス脳組織中で試験した。安定性アッセイを実行するために、siRNAのセンス鎖またはアンチセンス鎖を放射活性標識した両方の鎖を、血清および脳組織中での安定性についてアッセイした。タンパク質抽出物をマウス脳から調製し、100nMのsiRNA二本鎖を、該抽出物とともに37°Cでインキュベートした。4~5時間にわたって経時的に、試料を取り出してポリアクリルアミド変性ゲルで分析した。Mayo2、7、および8の安定性を、マウスの血清および脳抽出物中で試験した。さらに、Mayo7およびMayo8の切断部位を、T1分析によってマッピングした図8Aおよび8B。RNAseT1はGヌクレオチドの3’を切断するので、既知の配列を有するRNAのT1消化により、RNAseT1以外の切断部位を検出するための方向および比較の基準が得られる。T1を、Mayo7SNCA7、またはAL-DUP-1477とも呼ばれるおよびMayo8SNCA8、またはAL-DUP-1478とも呼ばれるの各siRNAの切断部位をマッピングするために使用したそれぞれ図8Aおよび8B、ならびに表1。Mayo7および8のセンス鎖を32Pで5’末端標識し、そしてRNAseT1消化を4時間実行した。試料を電気泳動によって分析した。Mayo7は、U16およびU17の3’エンドヌクレアーゼ切断に対して感受性であることが見出された。Mayo8は、U16の3’エンドヌクレアーゼ切断に対して感受性であることが見出された。Mayo7およびMayo8siRNAの安定性を増大させるために、ヌクレオチドを2’-O-Me基またはホスホロチオエート連結で修飾し、Mayo7s、Mayo8s1、およびMayo8s2を作製した表1。該修飾siRNA50nMを、EGFP-NACPベクターとともに、上記のように細胞に同時トランスフェクションした。トランスフェクションしていない細胞は対照とした。遺伝子発現を、ウェスタンブロット分析によってモニターした。3種の修飾siRNAの各々が、EGFP-NACP構築物の発現を阻害した図9Aおよび9B。修飾および非修飾のMayo8siRNAを、Stains-All商品名、カタログ番号E9379、米国ミズーリ州セントルイス所在のシグマSigmaによって分析し、分析は以下のようにして実行した。すべての溶液を、ヌクレアーゼを含まない水カタログ番号9930、米国テキサス州オースチンAustin所在のアンビヨンAmbion中で、ヌクレアーゼを含まない試薬を使用して調製した。安定性アッセイにおいて使用するためのdsRNAの50μMストックを、1×PBS中で、50μMのセンス鎖RNAおよび50μMのアンチセンス鎖を混合することによって調製した。この混合物を90°Cで2分間インキュベートして核酸を変性させ、次いでアニーリングのために37°Cで1時間インキュベートした。安定性アッセイを実行するために、凝血させたAB型男性の全血由来のヒト血清カタログ番号H1513、米国ミズーリ州セントルイス所在のシグマを使用した。血清を氷上で融解し、dsRNAと混合して終濃度約4.5μMとしたすなわち、約4.2μg、または約300ピコモルのdsRNA。0の時点で、1つの対照試料をdsRNAの血清への添加直後にドライアイス上で凍結し、この試料を-80°Cで保存した。他の時点についてはヒト血清中、15分、30分、60分、120分、および240分、試料をサーモミキサーThermomixerエッペンドルフEppendorf[ドイツ、ハンブルク所在]中で37°Cにてインキュベートした。各々の終了時点において、試料をドライアイス上で凍結し、-80°Cで保存した。血清からRNAを抽出するために、試料を氷上で融解し、次いで0.5MNaClヌクレアーゼを含まないもの;カタログ番号9760、米国テキサス州オースチンAustin所在のアンビヨンAmbionを試料に加えて、終濃度を約0.45MNaClとした。この試料を短時間約5秒間渦流混合し、次いで、調製しかつ冷却したPhase-Lock-Gel-Eppis商品名、ドイツ国ハンブルク所在のエッペンドルフEppendorfに移した。500μlのフェノール:クロロホルム:イソアミルアルコール25:24:1および300μLのクロロホルムを加えて混合した。試料を30秒間手短に渦流混合し、次いで13,200rpmで15分間、4°Cにて遠心分離した。水相を清浄なエッペンドルフチューブに移し、3MNaOAc、pH5.2を、約0.1MNaOAcの最終濃度まで加えた。この溶液を約20秒間渦流混合し、次いで、1μLのGlycoBlue商品名、米国テキサス州オースチン所在のアンビヨンを加えた。溶液を手短にかつ穏やかに渦流混合し、次いで、1mLの氷冷100エタノールを加えた。この溶液を約20秒間渦流混合し、次いで、RNAを沈殿させるために-80°Cで1時間、または-20°Cで一晩保存した。沈殿後、この混合物を13,200rpmで30分間、4°Cにて遠心分離し、そしてRNAペレットを500μLの70エタノールで洗浄した。このペレットを風乾し、次いで30μLのゲルローディング緩衝液95ホルムアミド、50mMEDTA、キシレンシアノール、ブロモフェノールブルーを加えて混合し、そしてこの混合物を2分間渦流混合して再懸濁させた。RNA試料を、20cm×20cm×0.8mm高さ×幅×厚さの20ポリアクリルアミドゲルで分析した。このゲルを作製するために、24gの8M尿素、25mLの4019:1アクリルアミド、および8mLのホルムアミドを、1×TBE中で混合して50mLの溶液とした。重合は、50μLのTemedおよび200μLの10APS過硫酸アンモニウムによって活性化した。ゲルは1×TBE中で泳動した。ゲルを40mAで30分間予備泳動した。試料を100°Cで5分間加熱し、次いで、すぐに氷上で冷却した。対照実験のために、2μLのdsRNAを、8μLのゲルローディング緩衝液と混合した。試料を13,200rpmで20秒間、4°C遠心分離し、10μLをゲルに装荷した。このゲルを40mAで約1時間泳動した。RNAを可視化するために、ゲルをStains-All溶液カタログ番号E9379、米国ミズーリ州セントルイス所在のシグマ100mgのStains-Allを800mLのホルムアミド:水1:1v/vに溶解で30分間染色した。必要に応じて、ゲルを30~60分間、水中で脱色した。次いで、ゲルをスキャナー上で画像化して分析した。安定性アッセイの結果を図10A、10B、および10Cに示す。比較により、非修飾のSNCA8dsRNAが急速に分解され、部分的に修飾されたdsRNASNCA8s1が部分的に安定化され、そしてさらに修飾されたSNCA8s2がこれら3種の二本鎖中では最も安定であることが示されている。[siRNAの生体内分布のinvivo分析]siRNAがinvivoで神経細胞に送達され得るか否かを測定するために、ルシフェラーゼを標的とするsiRNAALN-DP-3000表1をフルオレセイン標識と複合体化し、定位的注射によってマウス脳の個別の領域に投与した表2。ALN-DP-3000を、脳の皮質、海馬、および淡蒼球の領域に注射した。注射後の異なる時点において、脳組織を採取し、その切片を作製し、蛍光標識されたsiRNAの局在を顕微鏡で調べた。試験したすべての脳組織皮質、海馬、および淡蒼球において、および注射後のすべての時点において、siRNAは細胞外空間ならびに細胞内に局在していることが見出された。[シヌクレイン症と診断された患者を治療する方法]シヌクレイン症と診断された患者には、SNCA遺伝子を標的とするiRNA剤を含む薬学的組成物を投与することができる。この組成物は、浸透圧ポンプおよび小型カニューレを備え、患者に左右対称に移植されたデバイスによって脳に直接送達することができる。このデバイスの移植の前に、定位固定用フレームを用いて患者にMRIを実施する。脳へのカニューレの送達のためにコンピュータ補助軌道を使用する。小型ポンプデバイスを腹部に移植し、次いで、出血についてモニターするために患者を2~3日入院させる。ポンプ移植の約2週間後、患者にMRIを実施して移植デバイスをチェックするとよい。このヒトが十分に治癒しており、かつデバイス移植の結果として合併症が起こっていなければ、抗SNCA組成物をポンプに、そしてカニューレに注入することができる。治療計画の開始の前に試験用量の抗SNCA剤を投与することができる。最初の治療の3カ月、6カ月、および1年後に得たMRIを使用して、デバイスの状態、ならびにデバイスに対する患者の反応およびiRNA剤を用いる治療をモニターすることができる。臨床医は、浮腫および炎症性応答の発生に注意すべきである。治療開始の1年後に、必要に応じてMRIを実施することができる。治療の過程を通して、疾患の症状の改善または安定化について患者をモニターすることができる。モニタリングには、連続的な臨床的評価および機能的神経画像化例えば、MRIによるが含まれうる。[その他の実施形態]本発明のいくつかの実施形態に関して説明してきた。しかしながら、本発明の思想および範囲を逸脱することなく種々の変更を施すことが可能であることは理解されよう。従って、その他の実施形態は添付の特許請求の範囲に包含される。"