対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかを予測し、かつまたは対象由来の試料中の癌性細胞の存在を決定するための方法であって、対象由来の浮遊液中の子宮頸部細胞の標識液体試料からデータを得るステップであって、データが、形態計測データならびにバイオマーカーデータ、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含むステップと、対象がCIN病変を有するかどうかを前記データから予測し、かつまたは癌性細胞が試料中に存在するかどうかを前記データから決定するステップとを含む方法。前記CINがCIN2病変である、請求項1に記載の方法。前記予測が、85以上の感度およびまたは85以上の特異性によって特徴付けられる、請求項1または2に記載の方法。前記データが、フローサイトメトリーデバイスを用いて液体試料を分析することによって得られる、請求項1から3のいずれかに記載の方法。前記形態計測データが、前方光散乱データ、側方光散乱データ、画像データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含む、請求項1から4のいずれかに記載の方法。前記標識液体試料がバイオマーカー標識液体試料であり、前記データがバイオマーカーデータを含み、前記バイオマーカーデータが、細胞当たりのバイオマーカー定量化データを含む、請求項1から5のいずれかに記載の方法。子宮頸部細胞のバイオマーカー標識液体試料を調製するステップをさらに含む、請求項1から6のいずれかに記載の方法。前記調製するステップが、細胞を固定し、透過処理するために、最初の子宮頸部細胞試料を固定試薬および透過処理試薬と組み合わせるステップと、固定および透過処理した細胞を、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する蛍光標識バイオマーカープローブと接触させるステップとを含む、請求項7に記載の方法。前記子宮頸癌バイオマーカーが核酸またはタンパク質である、請求項1から8のいずれかに記載の方法。異なる子宮頸癌バイオマーカーにそれぞれ特異的に結合する2つ以上の異なる蛍光標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させるステップを含む、請求項1から9のいずれかに記載の方法。異常細胞が試料中に存在することが決定した場合に、子宮頸部生検を推奨するステップをさらに含む、請求項1から10のいずれかに記載の方法。前記標識液体試料がDNA標識液体試料であり、前記データが、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、またはその両方を含む、請求項1から11のいずれかに記載の方法。フローチャネル、前記フローチャネルのアッセイ領域に対して光を当てるように構成された光源、前記フローチャネルのアッセイ領域から光を受け取り、形態計測データを生成するように構成された第1の検出器、前記フローチャネルのアッセイ領域から光を受け取り、追加データを生成するように構成された第2の検出器、ならびに前記第1および前記第2の検出器から前記形態計測データおよび前記追加データを受け取り、前記形態計測データおよび前記追加データの両方に基づく、対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかの予測の結果を出力するように構成されたシグナル処理モジュールを含むシステム。請求項1から12のいずれかに記載の方法を実行するように構成される、請求項13に記載のシステム。対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかを予測するための方法が提供される。方法の態様は、浮遊液中の試料をアッセイすることによって、液体子宮頸部細胞性試料から形態計測データならびにバイオマーカーデータおよびまたは非特異的細胞データを得るステップと、次いで異なるタイプのデータを使用して対象がCIN病変を有するかどうかを予測するステップとを含む。方法を実施する際に使用を見出すシステムもまた提供される。方法およびシステムは、子宮頸癌スクリーニングへの適用を含む、様々な適用において使用を見出す。本発明の態様は、対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかを予測するための方法を含む。いくつかの場合には、方法は、対象由来の浮遊液中の子宮頸部細胞の標識液体試料からデータを得るステップであって、データが、形態計測データならびにバイオマーカーデータ、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含むステップと、対象がCIN病変、たとえばCIN2病変を有するかどうかをデータから予測するステップとを含む。予測は、85以上の感度およびまたは85以上の特異性によって特徴付けることができる。データは、たとえば、試料を流し、照明源および1つまたは複数の光検出器を通過させるステップを含む方法において、フローサイトメトリーデバイスを用いて液体試料を分析することによって得ることができる。形態計測データは、前方光散乱データ、側方光散乱データ、画像データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含んでいてもよい。いくつかの場合には、標識液体試料はバイオマーカー標識液体試料であり、データはバイオマーカーデータを含み、バイオマーカーデータは、細胞当たりのバイオマーカー定量化データを含み、細胞当たりのバイオマーカー定量化データは、蛍光標識検出データを含んでいてもよい。いくつかの場合には、方法は、子宮頸部細胞のバイオマーカー標識液体試料を調製するステップをさらに含む。子宮頸部細胞のバイオマーカー標識液体試料は、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する蛍光標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させることによって調製することができる。子宮頸癌バイオマーカーは、核酸、たとえばHPV核酸またはタンパク質であってもよい。方法は、異なる子宮頸癌バイオマーカーにそれぞれ特異的に結合する2つ以上の異なる蛍光標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させるステップを含んでいてもよい。いくつかの場合には、最初の子宮頸部細胞試料中の細胞は、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する蛍光標識バイオマーカープローブと接触させる前に、固定および透過処理される。いくつかの場合には、方法は、異常細胞が試料中に存在することが決定した場合に、子宮頸部生検を推奨するステップをさらに含む。いくつかの場合には、標識液体試料はDNA標識液体試料であり、データは、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、またはその両方を含む。本発明の態様は、フローチャネル、フローチャネルのアッセイ領域に対して光を当てるように構成された光源、フローチャネルのアッセイ領域から光を受け取り、形態計測データを生成するように構成された第1の検出器、フローチャネルのアッセイ領域から光を受け取り、追加データを生成するように構成された第2の検出器、ならびに第1および第2の検出器から形態計測データおよび追加データを受け取り、形態計測データおよび追加データの両方に基づく、対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかの予測の結果を出力するように構成されたシグナル処理モジュールを含むシステムもまた含む。システムは、上記に概説されるものを含めて、本発明の方法を実行するように構成することができる。本発明の態様は、対象由来の試料中の癌性細胞の存在を決定するための方法であって、対象由来の浮遊液中の子宮頸部細胞の標識液体試料からデータを得るステップであって、データは、形態計測データならびにバイオマーカーデータ、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含むステップと、癌性細胞が試料中に存在するかどうかをデータから決定するステップとを含む方法をさらに含む。データは、たとえば、試料を流し、照明源および1つまたは複数の光検出器を通過させるステップを含む方法において、フローサイトメトリーデバイスを用いて液体試料を分析することによって得ることができる。形態計測データは、前方光散乱データ、側方光散乱データ、画像データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含んでいてもよい。いくつかの場合には、標識液体試料はバイオマーカー標識液体試料であり、データはバイオマーカーデータを含み、バイオマーカーデータは、細胞当たりのバイオマーカー定量化データを含み、細胞当たりのバイオマーカー定量化データは、蛍光標識検出データを含んでいてもよい。いくつかの場合には、方法は、子宮頸部細胞のバイオマーカー標識液体試料を調製するステップをさらに含む。子宮頸部細胞のバイオマーカー標識液体試料は、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する蛍光標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させることによって調製することができる。子宮頸癌バイオマーカーは、核酸、たとえばHPV核酸またはタンパク質であってもよい。方法は、異なる子宮頸癌バイオマーカーにそれぞれ特異的に結合する2つ以上の異なる蛍光標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させるステップを含んでいてもよい。いくつかの場合には、最初の子宮頸部細胞試料中の細胞は、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する蛍光標識バイオマーカープローブと接触させる前に、固定および透過処理される。いくつかの場合には、方法は、異常細胞が試料中に存在することが決定した場合に、子宮頸部生検を推奨するステップをさらに含む。いくつかの場合には、標識液体試料はDNA標識液体試料であり、データは、DNA含有量データ、パーセント核形成データ、またはその両方を含む。対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかを予測するための方法が提供される。方法の態様は、浮遊液中の試料をアッセイすることによって、液体子宮頸部細胞性試料から形態計測データならびにバイオマーカーデータおよびまたは非特異的細胞データを得るステップと、次いで異なるタイプのデータを使用して対象がCIN病変を有するかどうかを予測するステップとを含む。方法を実施する際に使用を見出すシステムもまた提供される。方法およびシステムは、子宮頸癌スクリーニングへの適用を含む、様々な適用において使用を見出す。すでに、本発明は、非常に詳細に記載されているが、本発明が、記載されている特定の実施形態に限定されず、そのため、もちろん、様々でよいことを理解されたい。本発明の範囲が添付の請求項によってのみ限定されるので、本明細書において使用される用語は、特定の実施形態を説明する目的のみのものであり、限定するようには意図されないこともまた理解されたい。値の範囲が提供される場合、文脈が明確に指示しない限り、その範囲の上限値および下限値の間の、下限値の単位の10分の1までのそれぞれの介在値ならびに任意の他の明示される値またはその明示される範囲における介在値が本発明の範囲内に包含されることを理解されたい。これらのより小さな範囲の上限値および下限値は、そのより小さな範囲の中に独立して含まれてもよく、これらもまた、明示される範囲においてあらゆる明確に除かれる限界値に従って、本発明の範囲内に包含される。明示される範囲が、一方または両方の限界値を含む場合、それらの含まれる限界値のいずれかまたは両方を除く範囲もまた、本発明に含まれる。ある範囲は、用語約が前につけられた数値により本明細書において示される。用語約は、それが前につく、まさにその数およびその用語が前につく数に近い数またはおよそその数である数について、文字どおりの補足を提供するために本明細書において使用される。数が明確に記載される数に近いまたはおよそその数であるかどうかを決定する際に、近いまたは近似する、記載されていない数は、それが示される文脈において、明確に記載される数の実質的な等価物を提供する数であってもよい。その他に定義されない限り、本明細書において使用される技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する当技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書において記載されるものに類似するまたはそれと等価であるいかなる方法および材料も、本発明の実施または試験において使用することができるが、ここでは、代表的な例証となる方法および物質が記載されている。本明細書において引用される刊行物および特許はすべて、それぞれの個々の刊行物または特許が、参照により組み込まれるように明確にかつ個々に示されるかのように、参照により本明細書に組み込まれ、刊行物を引用する方法およびまたは物質を開示し、記載するために参照により本明細書に組み込まれる。あらゆる刊行物の引用は、出願日前のその開示についてのものであり、本発明が、先の発明によって、そのような刊行物に先立つ権利を与えられないということを許可するものとして解釈されない。さらに、提供される刊行物の日付は、実際の刊行の日付とは異なることがあり、これは、独立して確認される必要がありうる。本明細書および添付の請求項において使用されるように、単数形1つの、1つの、およびそのは、文脈が明確に指示しない限り、複数の指示物を含むことに注意されたい。請求項は、いかなる任意選択の要素を除くために採用されてもよいことにさらに注意されたい。そのため、この表現は、請求項の要素の記載に関する単独で、のみなどのような排他的な術語の使用または否定的な限定の使用のための先行詞として働くように意図される。明確にするために別々の実施形態の文脈において記載される本発明のある特徴はまた、単一の実施形態において組み合わせて提供できることを十分に理解されたい。逆に、簡潔にするために単一の実施形態の文脈において記載される本発明の様々な特徴はまた、別々にまたは任意の適した下位の組み合わせで提供することができる。実施形態の組み合わせはすべて、本発明によって明確に包含され、それぞれおよびすべての組み合わせが、そのような組み合わせが使用可能な方法およびまたはデバイスシステムキットを包含する程度まで、個々にかつ明白に開示されるかのように、本明細書において開示される。さらに、そのような変化するものを記載する実施形態において列挙される下位の組み合わせのすべてもまた、本発明によって明確に包含され、化学基のそれぞれのおよびすべてのそのような下位の組み合わせが個々にかつ明白に本明細書において開示されるかのように、本明細書において開示される。本開示を読む際に当業者らに明らかになるように、本明細書において記載され、例証される個々の実施形態のそれぞれは、本発明の範囲または精神から逸脱することなく他のいくつかの実施形態のいずれかの特徴から容易に分けてもよくまたはそれと組み合わせてもよい別個の成分および特徴を有する。任意の記載される方法は、記載される事象の順序でまたは論理的に可能な任意の他の順序で実行することができる。本発明の実施形態をさらに記載する際に、方法の実施形態の態様を、より詳細に、最初に記載する。次に、本発明の方法を実施する際に使用することができるシステムの実施形態を、概説する。方法上記に概説されるように、本発明の実施形態は、対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変または子宮頸癌を有するかどうかを予測するための方法に関する。用語CIN病変は、子宮頸部の表面上の扁平上皮細胞の異常成長を指すためにその通常の意味で使用される。当技術分野において知られているように、CIN病変は、CIN1、CIN23、CIN2、およびCIN3として組織学的に類別することができる。CIN1病変は、上皮の基底の13に限られる病変であり、他のカテゴリーの病変に比べて、癌性の病変へ進展する最小の危険性を有する。CIN2病変は、上皮の基底の23に限られる中程度の異形成によって特徴付けられる。CIN3病変は、上皮の23以上を横断する重症の異形成の存在によって分類される。CIN23カテゴリーは、まとめて、CIN2およびCIN3病変の両方を指す。本発明の実施形態は、高度の感度および特異性により、対象のCIN病変の存在を予測することによって特徴付けられる。予測は、対象の子宮頸部の生検材料を実際に採取することなく、対象のCIN病変の存在を予知するまたは予見することを意味する。感度および特異性という用語は、それらの通常の意味で使用される。そのため、感度は、正確に同定される実際の陽性の割合の程度であり、特異性は、正確に同定される陰性の程度である。本発明の実施形態は、任意のタイプのCIN病変の存在または不在を予測することができる。本発明の実施形態はまた、CIN病変のタイプ、たとえばCIN病変がCIN1、CIN2、CIN2、またはCIN3病変であるかどうかを予測することができる。方法の実施形態は、高度の感度および特異性により、この予測、たとえば、病変が存在するかどうか、どのタイプの病変が存在するかを行う。いくつかの場合には、感度は、95以上を含み、90以上など、85以上である。いくつかの場合には、特異性は、90以上を含み、87以上など、85以上である。方法の態様は、対象由来の浮遊液中の子宮頸部細胞の標識液体試料、たとえばバイオマーカー標識および非特異的細胞標識の一方または両方により標識された液体試料から、形態計測データならびにバイオマーカーデータおよびまたは非特異的細胞データの両方を得るステップを含む。言いかえれば、子宮頸部細胞の液体試料は、対象から収集され、子宮頸部細胞は、液状培地中に浮遊しており、形態計測データおよびバイオマーカー非特異的細胞データの両方を得るためにアッセイされる。したがって、方法の態様による標識液体試料は、バイオマーカー標識液体試料、非特異的細胞標識液体試料、またはバイオマーカー標識液体試料および非特異的細胞標識液体試料であってもよい。アッセイされる子宮頸部細胞の標識液体試料は、任意の好都合なプロトコールに従って提供することができる。一実施形態では、最初の液状子宮頸部細胞性試料は、子宮頸部から細胞性試料を採取し、適した液状培地とそれを組み合わせることによって調製される。子宮頸部細胞を収集するための任意の好都合なプロトコールを用いることができる。対象とするプロトコールの例は、子宮頸部および子宮頸内膜の表面から細胞を収集するために子宮頸部ブラシまたはほうきデバイスを用いるプロトコールを含む。本発明の方法における使用を見出すことができる子宮頸部細胞収集デバイスの例の記載は、米国特許第2955591号第3626470号第3815580号第3877464号第3881464号第3945372号第4127113号第4175008号第4700713号第4754764号第4762133号第4754764号第4873992号第4862899号第4953560号第5445164号第5787891号第5795309号第6387058号、および第6740049号において提供される。収集の後に、細胞性試料は、所望されるように適した液体培地と組み合わせてもよい。対象とする液体培地は、生理食塩水または平衡塩類、溶液組織培養培地、POLYSAL溶液、および通常生理食塩溶液など細胞診培地、たとえばUniversalCollectionMedium米国特許第7371518号において記載されるuniversalcollectionmediumStandardTransportMedium、PRESERVCYT液状培地CytoPtich液状培地などを含むが、これらに限定されない。所望される場合、収集された最初の試料を、方法においてさらに進める前に妥当性について評価することができる。たとえば、試料のアリコートは、たとえば本開示が参照により本明細書に組み込まれている米国特許第6329167号において記載されるように、適切な標的細胞が試料中に存在するかどうかを決定するために光散乱分析にかけることができる。調製の後に、結果として生じた最初の液状子宮頸部細胞性試料は、所望されるように、固定およびまたは透過処理することができる。そのため、本発明の方法は、適した固定試薬と試料を接触させることによって細胞性試料を固定するステップを含む。対象とする固定試薬は、所望の時点で細胞を固定するものである。任意の好都合な固定試薬を用いることができ、適した固定試薬は、ホルムアルデヒド、パラホルムアルデヒド、ホルムアルデヒドアセトン、メタノールアセトン、IncellFPなどを含むが、これらに限定されない。たとえば、約1~2の最終濃度で使用されるパラホルムアルデヒドは、好適な架橋固定液であることが分かっている。いくつかの場合には、試料中の細胞は、細胞を透過処理試薬と接触させることによって透過処理される。対象とする透過処理試薬は、標識バイオマーカープローブが、たとえば、下記により詳細に記載されるように、細胞内環境に到達するのを可能にする試薬である。任意の好都合な透過処理試薬を用いることができ、適した試薬は、TritonX100、NP40、サポニンなどのような緩やかな界面活性剤メタノールなどを含むが、これらに限定されない。陽性重金属対照、たとえば、重金属、たとえばイリジウムなどにより標識されたDNA干渉物質により細胞を標識することが望ましいこともある。細胞はまた、所望されるように、固定前に、バイアビリティー色素、たとえば臭化エチジウム、ヨウ化プロピジウム、DAPI、RhCI3などにより染色することができる。ある実施形態では、また、上記に概説されるように、形態計測データおよびバイオマーカーデータを得るためにアッセイされる試料は、バイオマーカー標識試料である。したがって、試料は、対象とする1つまたは複数のバイオマーカーについて標識されている試料である。バイオマーカー標識試料によって、バイオマーカーが細胞性試料中に存在する場合、対象とするバイオマーカーに特異的に結合する標識バイオマーカープローブと接触させた試料を意味する。対象とするバイオマーカーは、子宮頸癌バイオマーカーを含むが、これらに限定されない。子宮頸癌バイオマーカーは、特有の生物学的または生物学的に誘導されるインジケータ、たとえば核酸またはタンパク質であり、この存在は、対象が子宮頸部癌を発症する傾向または対象における子宮頸癌の存在と関連づけられる。したがって、対象とするバイオマーカーは、核酸およびタンパク質分析物を含み、細胞におけるこの存在およびまたは量は、少なくとも、対象が子宮頸癌に罹患する傾向の予測を行うために使用することができる。対象とするバイオマーカーは、HPV遺伝子L1、L2、E2、E4、E5、E6、またはE7などのようなHPV遺伝子のHPV発現産物サイクリン依存性キナーゼ阻害剤、たとえばp14、p15INK4b、p16704~7頁において記載されるp16INK4a、p18INK4c、p19INK4d、p21WAFCIP1、およびp27KIP1細胞周期調節タンパク質、たとえばp14ARF特異的マイクロRNA、または米国特許公開第20100234445号において記載されるものなどのような染色体変化3q子宮頸癌と関連、などを含むが、これらに限定されない。本発明の方法においてアッセイされるバイオマーカー標識液体子宮頸部細胞性試料は、任意の好都合な標識プロトコールを使用して調製することができる。いくつかの実施形態では、バイオマーカー標識液体試料の調製は、子宮頸癌バイオマーカーに特異的に結合する標識バイオマーカープローブと最初の子宮頸部細胞試料を接触させるステップを含む。実行されることとなる特定のアッセイに依存して、最初の試料は、単一の標識バイオマーカープローブまたは異なる分子組成の異なるバイオマーカーに結合する、2つ以上の別個の標識バイオマーカープローブと組み合わせてもよく、そのような別個の標識バイオマーカープローブの数は、たとえばアッセイが2つ以上のバイオマーカーについての多重アッセイである場合、2以上、たとえば3以上、4以上、5以上などであってもよい。標識バイオマーカープローブと最初の試料を接触させる際に、試料を1つまたは複数の標識バイオマーカープローブと組み合わせて反応混合物を生成する。対象とする標識バイオマーカープローブは、特異的結合ドメインおよび標識ドメインを含む。特異的結合ドメインは、対象とするバイオマーカーに特異的に結合する捕捉リガンドを含む。特定のアッセイに依存して、対象とするバイオマーカーは、タンパク質、ポリペプチド、プロテオグリカン、糖タンパク質、およびこれらの分子のそれぞれの断片核酸、たとえばDNAおよびmRNAなどのようなRNAなどを含むが、これらに限定されない、様々な異なるタイプの分子であってもよい。そのため、捕捉リガンドは、対象とするバイオマーカー分子に結合するリガンドであり、この捕捉リガンドは、もちろん、検出されることとなる特異的なタイプのバイオマーカー分子に依存して様々でよく、たとえばタンパク質バイオマーカーに対する抗体、mRNAバイオマーカーに対するオリゴヌクレオチドであってもよい。ある実施形態では、それらが結合複合体で互いに特異的に結合する場合に、捕捉リガンドおよびそれが特異的に結合するバイオマーカー分子の間の親和性は、1015M以下を含めて、106M以下、107M以下、108M以下、109M以下、1010M以下、1011M以下、1012M以下、1013M以下、1014M以下のKDによって特徴付けられる。上記に示されるように、様々な異なるタイプの特異的結合剤を、捕捉リガンドとして用いることができ、特定のタイプの結合剤は、対象とするバイオマーカーの分子の特定のタイプに少なくとも部分的に基づいて選択される。対象とする特異的結合剤は、抗体結合剤、タンパク質、ペプチド、ハプテン、核酸などを含む。本明細書において使用される用語抗体結合剤は、対象とする分析物に結合するのに十分な、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体または断片を含む。抗体断片は、たとえば単量体Fab断片、単量体Fab断片、または二量体F2断片とすることができる。単鎖抗体分子またはキメラ抗体を産生するための重鎖および軽鎖の定常領域の置き換えもしくはヒト化抗体を産生するための定常領域および可変領域のフレームワーク部分の両方の置き換えによってモノクローナル抗体から産生されるヒト化もしくはキメラ抗体などのような、抗体工学によって産生される分子もまた、用語抗体結合剤の範囲内にある。対象とする核酸結合剤は、細胞中のバイオマーカー核酸に特異的に結合する核酸である。これらの核酸の長さは、オリゴヌクレオチドが特異的結合剤として働くのに十分である限り様々でよく、いくつかの場合には、14~50nt、たとえば15~25ntなどのように、13~100ntに及ぶ。これらの核酸結合剤を構成するオリゴヌクレオチドは、所望されるように、DNAもしくはRNAまたはその合成類似体であってもよい。特異的結合ドメインに加えて、標識バイオマーカープローブは、検出可能な標識をさらに含む。検出可能な標識として対象とするのは、蛍光色素である。蛍光色素は、画像化の適用において使用するのに適した多くの色素のいずれかから選択することができる。多くの色素は、たとえばMolecularProbesおよびExcitonなどのような様々な供給源から市販で入手可能である。対象とする蛍光団の例は、4アセトアミド4イソチオシアン酸スチルベン22ジスルホン酸アクリジンならびにアクリジン、アクリジンオレンジ、アクリジンイエロー、アクリジンレッド、およびアクリジンイソチオシアネートなどのような誘導体5アミノナフタレン1スルホン酸4アミノN3フェニルナフタルイミド35ジスルホネートNマレイミドアントラニルアミドブリリアントイエロークマリンおよびクマリン、7アミノ4メチルクマリン、7アミノ4トリフルオロメチルクマリンなどのような誘導体シアニンならびにシアノシン、Cy3、Cy5、Cy55、およびCy7などのような誘導体46ジアミジノ2フェニルインドール55ジブロモピロガロールスルホンフタレイン7ジエチルアミノ34メチルクマリンジエチルアミノクマリンジエチレントリアミンペンタアセテート44ジイソチオシアナトジヒドロスチルベン22ジスルホン酸44ジイソチオシアナトスチルベン22ジスルホン酸5ジメチルアミノナフタレン1塩化スルホニル4安息香酸4ジメチルアミノフェニルアゾフェニル4イソチオシアネートエオシンならびにエオシンおよびエオシンイソチオシアネートなどのような誘導体エリトロシンならびにエリトロシンBおよびエリトロシンイソチオシアネートなどのような誘導体エチジウムフルオレセインならびに5カルボキシフルオレスセイン、5アミノフルオレセイン、27ジメトキシ45ジクロロ6カルボキシフルオレスセイン、フルオレセインイソチオシアネート、フルオレセインクロロトリアジニル、ナフトフルオレセイン、およびQFITCなどのような誘導体フルオレサミンIR144IR1446緑色蛍光タンパク質サンゴ由来蛍光タンパク質Lissamineリサミンローダミン、ルシファーイエローマラカイトグリーンイソチオシアネート4メチルウンベリフェロンオルトクレゾールフタレインニトロチロシンパラローザニリンナイルレッドオレゴングリーンフェノールレッドBフィコエリトリンoフタルジアルデヒドピレンならびにピレン、ピレンブチレート、およびスクシンイミジル1ピレンブチレートなどのような誘導体リアクティブレッド4ブリリアントレッド3BAローダミンならびに6カルボキシXローダミン、6カルボキシローダミン、47ジクロロローダミンリサミン、ローダミンB塩化スルホニル、ローダミン、ローダミンB、ローダミン123、ローダミンXイソチオシアネート、スルホローダミンB、スルホローダミン101、スルホローダミン101の塩化スルホニル誘導体、NNNNテトラメチル6カルボキシローダミン、テトラメチルローダミン、ならびにテトラメチルローダミンイソチオシアネートなどのような誘導体リボフラビンロゾール酸およびテルビウムキレート誘導体キサンテンまたはその組み合わせを含むが、これらに限定されない。当業者らに知られている他の蛍光団またはその組み合わせ、たとえばMolecularProbesおよびExcitonから入手可能なものもまた使用することができる。多数の別個の標識バイオマーカープローブが用いられる場合、それぞれの別個のプローブの標識は、識別可能なシグナルをもたらすように選択することができる。たとえば、第1および第2の別個の標識バイオマーカープローブが用いられる実施形態では、第2のプローブ中の標識は、第1のプローブの標識の第1の蛍光シグナルと識別可能である蛍光シグナルを産生する蛍光標識である。したがって、第1および第2の蛍光標識の励起に際して産生される第1および第2の蛍光シグナルは、互いに識別可能であり、両方を同時に検出することができ、一方のシグナルが他方のシグナルを改変しないまたは変化させないことを意味する。それぞれの別個の標識は、任意の他の標識と識別可能なシグナルを産生することができる。たとえば、細胞は、第1および第2の蛍光シグナルと識別可能な第3の蛍光シグナルを産生する第3の蛍光標識により染色することができる。いくつかの場合には、用いられる標識バイオマーカープローブは、HPVE6、E7オリゴヌクレオチド蛍光標識プローブである。そのようなプローブは、長さが様々でよく、いくつかの場合には、14~50nt、たとえば15~25ntなどのように、13~100ntに及ぶ。そのようなプローブの特定の配列は様々でよい。対象とする特異的配列は、HPVOncoTectE6E7mRNADetectionKitのプローブカクテルにおいて見出されるものを含むが、これらに限定されない。HPVE6E7遺伝子に対して特異的で例示的なプローブ配列は、FaulknerJonesらにおいて記載されるものを含む。そのような例示的なHPVE6E7特異的プローブ配列を示すFaulknerJonesらのTable1の配列は、下記に提供される。HPVE6E7についての追加の例示的なプローブ配列は、Plummerらにおいて記載されるものを含む。そのような例示的なHPVE6E7プローブ配列を示すPlummerらにおけるTable1の配列は、下記に提供される。本明細書において記載される方法およびシステムにおいて使用を見出す追加のHPV特異的プローブ配列は、任意の好都合なプローブ設計方法を用いて、設計および試験することができる。反応混合物を調製する際に、試料は、任意の好都合なプロトコールを使用して、標識バイオマーカープローブと組み合わせてもよい。組み合わせは、所望されるように、混合により実行することができる。標識バイオマーカープローブとの試料の接触は、存在する場合、試料中のそれらのそれぞれのバイオマーカーへのプローブの結合をもたらすインキュベーション条件下で実行される。いくつかの場合には、プローブおよび試料を、20~約40°Cなどのような15~50に及ぶ温度で接触させ、組み合わせる。接触は、反応成分および試料の十分な組み合わせをもたらすために、混合または撹拌により、たとえばボルテックスなどにより、実行することができる。次いで、結果として生じた反応混合物は、形態計測データおよびバイオマーカーデータについての、たとえば、フローサイトメトリー分析を介してのアッセイ前に、一定期間、維持またはインキュベートしてもよい。いくつかの場合には、反応混合物は、1時間~3時間を含む、1時間~24時間などのような、約30分~72時間に及ぶ一定期間、20~約40°Cなどのような15~50に及ぶ温度でインキュベートする。上記のインキュベーションステップの後に、試料を直ちにアッセイしてもよくまたは後のアッセイのために保存してもよい。保存される場合、いくつかの実施形態では、試料は、低温で、たとえば氷上で保存される。所望のところで、結果として生じた反応混合物は、たとえば、あらゆる非結合プローブおよび他の試料成分を除去するために洗浄してもよい。洗浄は、たとえば、適した洗浄バッファーと反応混合物を組み合わせ、液体から細胞を分離することによって、任意の好都合なプロトコールを使用して実行することができる。所与の洗浄プロトコールは、所望されるように、1つまたは複数の別個の洗浄工程を含んでいてもよい。任意の洗浄プロトコールの後に、標識細胞は、たとえばフローサイトメトリー分析を介しての続く分析のために、適した液体、たとえば洗浄バッファーまたは他のバッファー中に再懸濁させてもよい。いくつかの実施形態では、上記に記載されるように、標識液体細胞試料は、バイオマーカー標識に加えてまたはその不在下において、非特異的な細胞染色により標識される。細胞は、任意の好都合なプロトコールを使用して、非特異的な染色により染色することができる。非特異的な細胞染色として対象とするのは、DNA特異的染色である。DNAに対して特異的であり、そのため、非特異的な染料として用いることができる色素および染料は、Hoechst33342およびHoechst33258およびHoechstシリーズの他のものSYTO40、SYTO11、12、13、14、15、16、20、21、22、23、24、25SYTO17、59、DAPI、DRAQ5、YOYO1、ヨウ化プロピジウム、YOPRO3、TOPRO3、YOYO3およびTOTO3、SYTOXグリーン、SYTOX、メチルグリーン、アクリジンホモ二量体、7アミノアクチノマイシンD、9アミノ6クロロ2メトキシアクリジンを含むが、これらに限定されない。特定の染料およびアッセイに依存して、染料は、細胞周期の指標などとして、バイオマーカーの定量化において働くことができる。標識試料の調製の後に、たとえば上記に記載されるように、試料は、形態計測データならびにバイオマーカーデータおよびまたは非特異的細胞データの両方を得るためにアッセイされる。いくつかの場合には、試料の同じアリコート、つまり同じ物理量の試料が、形態計測データおよびバイオマーカー非特異的細胞データの両方を得るためにアッセイされる。したがって、これらの実施形態は、試料の第1のアリコートが、形態計測データのために、一方のプロトコール、たとえばスライドベースのプロトコールを使用してアッセイされ、試料の第2のアリコートが、他のプロトコール、たとえばフローサイトメトリープロトコールを使用してアッセイされるプロトコールと区別される。形態計測データは、細胞形態学の情報、つまり、細胞のサイズ、形状、およびまたは構造に関する情報を得ることができる任意のタイプのデータを指す。対象とする形態計測データは、前方光散乱データ、側方光散乱データ、画像データ、およびその組み合わせからなる群から選択されるデータを含むが、これらに限定されない。対象とする形態的パラメーターは、核面積、周囲長、テクスチャーまたは空間周波数量、重心位置、形状、体積、およびこれらのパラメーターのいずれかの比を含むが、これらに限定されない。得られた形態計測データは、全体としての細胞についてのものまたはその下位部分、たとえば、細胞の細胞質についてのものであってもよい。いくつかの場合には、形態計測データは、異常細胞のタイプを含めて、細胞が正常であるか異常であるかどうかの実際の指定を含んでいてもよい。たとえば、形態計測データは、いくつかの場合には、所与の細胞が異常であるという指定、たとえば、細胞が、異型扁平上皮細胞、たとえば意義不明異型扁平上皮細胞、HSILを除外できない異型扁平上皮細胞低悪性度扁平上皮内病変高悪性度扁平上皮内病変扁平上皮癌特定不能な異型腺細胞AISまたは癌が疑われる異型腺細胞および上皮内腺癌であるという指定を含んでいてもよい。バイオマーカーデータは、細胞についてのバイオマーカー情報を得ることができる任意のタイプのデータを指す。いくつかの場合には、バイオマーカーデータは、アッセイにおいて用いられる標識バイオマーカープローブの標識によって放出されるシグナルを含むデータである。バイオマーカーデータは、放出された光の存在および振幅、それから光シグナルが生じる細胞または他の物体における別個の位置の数、シグナル源の相対的な配置、ならびに細胞におけるそれぞれの位置で放出される光の色の形態をしていてもよい。バイオマーカーデータは、定性的データ、半定量的データ、または定量的データの形態を取ってもよい。定性的データは、単に、バイオマーカーの存在または不在である。半定量的または定量的データは、細胞におけるバイオマーカーの、量、たとえばコピー数、濃度などのいくつかの指標を提供するデータである。たとえば、半定量的データは、対象とするバイオマーカーのコピー数が一定の閾値数を上回るという指標の形態を取ってもよい。定量的データは、細胞におけるバイオマーカーの絶対値、たとえばコピー数、量などの指標を提供する。半定量的および定量的データは、まとめて、バイオマーカー定量化データと呼ぶことができる。いくつかの場合には、対象とするバイオマーカーは、対象が危険性が高いHPV株に感染している場合に存在するmRNAである。対象とするmRNAはHPVE6、E7mRNAを含む。これらの実施形態では、対象とするmRNA種の定量化データが得られるように、対象とするmRNA種の絶対的なコピー数が決定されてもよい。バイオマーカーがHPVE6、E7であるいくつかの場合には、細胞当たりのE6、E7mRNA種の合計量が決定される。これらの場合には、対象とするのは、これらの細胞が宿主においてCIN病変の存在と関連し得るので、細胞当たり、10以上、50以上、100以上、200以上、500以上を含む5以上などのような2つ以上のHPVE6、E7mRNAのコピーの細胞の同定である。いくつかの場合には、本発明の方法において得られるバイオマーカーデータは、細胞当たり、2~1000コピーのHPVE6、E7mRNA、たとえば、細胞当たり、10~500コピーのHPVE6、E7mRNAを含む、細胞当たり、5~750コピーのHPVE6、E7mRNAがあるという情報を提供する。いくつかの場合には、得られるバイオマーカーデータは、本開示が参照により本明細書において組み込まれている米国特許第7524631号において記載されるように、細胞当たりのHPVE6、E7mRNAのコピー数のデータである。コピー数の決定は、たとえば、非特異的なDNA染料によって、基準値によってなどによって提供されるように、1つを適した対照と比較することを含んでいてもよい。いくつかの場合には、光度測定もまた得られる。光度測定は、核光学濃度、細胞質光学濃度、バックグラウンド光学濃度、およびこれらの値のいずれかの比の決定を可能にする。非特異的細胞データは、試料中の細胞についての非特異的細胞情報を得ることができる任意のタイプのデータである。いくつかの場合には、非特異的細胞データは、アッセイにおいて用いられる非特異的細胞染料によって放出されるシグナルを含むデータである。非特異的細胞データは、放出された光の存在および振幅、それから光シグナルが生じる細胞または他の物体における別個の位置の数、シグナル源の相対的な配置、ならびに細胞におけるそれぞれの位置で放出される光の色の形態をしていてもよい。非特異的細胞データは、定性的データ、半定量的データ、または定量的データの形態を取ってもよい。たとえば、定量的または半定量的非特異的細胞データは、DNA染料を使用して得られる、細胞のDNA含有量についてのデータを含んでいてもよい。他の定量的データは、電気的体積を含む。したがって、非特異的細胞データは、細胞における非特異的細胞成分の絶対値または相対値、たとえばコピー数、量などの指標を提供することができる。半定量的および定量的データは、まとめて、非特異的細胞定量化データと呼ぶことができる。定性的非特異的細胞データは、細胞の特定の特徴の存在または不在に関しての情報を提供することができる。たとえば、DNA染料により染色された細胞では、細胞核の存在または不在を決定することができる。多数の別個の標識、たとえば、単一の試料において使用されるバイオマーカープローブ標識および非特異的細胞染料が、単一の標識液体細胞試料において検出されることになっている場合、用いられる標識および染料は、識別可能なシグナルをもたらすように選ぶことができることに注意されたい。たとえば、標識バイオマーカープローブおよびDNA染料が用いられる実施形態では、バイオマーカープローブについての標識は、DNA染料の蛍光シグナルから識別可能な蛍光シグナルを産生する蛍光標識である。したがって、バイオマーカープローブ標識およびDNA染料の励起に際して産生される蛍光シグナルは、互いに識別可能であり、両方を同時に検出することができ、一方のシグナルが他方のシグナルを改変しないまたは変化させないことを意味する。それぞれの別個の標識は、任意の他の標識と識別可能なシグナルを産生することができる。たとえば、細胞は、励起に際して互いに識別可能な、3つの別個の蛍光シグナルを生成する3つの蛍光標識により染色することができる。上記のタイプのデータ、たとえば形態計測データ、バイオマーカーデータ、および非特異的細胞データは、任意の好都合なプロトコールを使用して、試料の同じアリコートから得ることができる。いくつかの場合には、それぞれのタイプのデータを収集するフローサイトメトリープロトコールが用いられる。フローサイトメトリーは、液状培地中の異なる粒子タイプ、つまり、標識、サイズなどに関して互いに異なる粒子を同定し、区別するために多重パラメーターデータを使用する、よく知られている方法である。上記に記載されるように調製される試料をフローサイトメトリーにより分析する際に、試料のアリコートは、フローサイトメーターの流路に最初に導入される。流路において、細胞のそれぞれが単一波長の光源に別々に個々に暴露される1つまたは複数の感知領域を、試料中の細胞が実質的に1度に1つずつ通過すると、形態計測パラメーター、たとえば光散乱パラメーターおよびまたはバイオマーカーパラメーター、たとえば、所望されるように蛍光放射の測定値がそれぞれの細胞について別々に記録される。それぞれの細胞について記録されるデータは、所望されるように、リアルタイムで分析され、または後の分析のためにコンピューターなどのようなデータ記憶装置および分析手段中に保存される。より具体的には、フローサイトメーターにおいて、細胞は、それぞれの領域においてそれぞれの細胞がエネルギー源によって照明される1つまたは複数の感知領域を、流路において浮遊して、実質的に1度に1つずつ通過する。エネルギー源は、レーザーによって提供されるものなどのような単一の波長の光を放出する照明器または適切なフィルターを有する水銀灯を含んでいてもよい。たとえば、488nmの光は、単一の感知領域を有するフローサイトメーターにおいて放射の波長として使用することができる。2つの別個の波長の光を放出するフローサイトメーターについては、放射光の追加の波長を用いることができ、対象とする特異的な波長は、535nm、635nmなどを含むが、これらに限定されない。感知領域と連続して、検出器、たとえば、光電子増倍管などのような光収集器、画像収集器の形態をしたなどは、細胞が感知領域を通過し、エネルギー源によって照明されると、それぞれの細胞を通過する光、感知領域を通る細胞のフローの方向に対して直角に反射される光、およびそれが蛍光マーカーにより標識されている場合に細胞から放出される蛍光を記録するために使用される。得られるそれぞれのタイプのデータは、たとえば前方光散乱、直角光散乱、および蛍光放射、ならびに画像などは、それぞれの細胞についての別々のパラメーターを含む。フローサイトメーターは、コンピューターなどのようなデータ獲得、分析、および記録手段をさらに含み、多数のデータチャネルは、それが感知領域を通過すると、それぞれの細胞によって放出される形態計測データおよびバイオマーカーデータについてのそれぞれの検出器からのデータを記録する。分析システムの目的は、細胞を分類し、数えることであり、細胞はそれぞれ、デジタル化されたパラメーター値のセットとして示される。本発明の方法において細胞をフローサイトメトリーによりアッセイする際に、フローサイトメーターは、バックグラウンドおよびノイズから対象とする細胞を区別するために選択されたパラメーターに対してトリガーを設定してもよい。トリガーは、パラメーターの検出のためにプレセットされた閾値を指す。それは、細胞がレーザー光線を通過するのを検出するための手段として典型的に使用される。選択されたパラメーターについての閾値を超える事象の検出は、細胞についての光散乱および蛍光データの獲得を引き起こす。データは、閾値より下の応答を引き起こす、アッセイされている培地中の細胞または他の成分については獲得されない。トリガーパラメーターは、細胞が光線を通過することによって引き起こされる前方光散乱の検出であってもよい。次いで、フローサイトメーターは、細胞についての光散乱および蛍光データを検出し、収集する。次いで、対象とする特定の亜集団は、全集団について収集されたデータに基づいてゲートをかけることによってさらに分析される。適切なゲートを選択するために、データは、可能性のある亜集団の最善の分離を得るようにプロットされる。この処置は、2次元ドットプロット上に前方光散乱対側方光散乱をプロットすることによって典型的に行われる。次いで、フローサイトメーターオペレーターは、細胞の所望の亜集団を選択し、ゲート内にない細胞を除く。所望される場合、オペレーターは、コンピュータースクリーン上でカーソルを使用して、所望の亜集団のまわりに線を引くことによってゲートを選択してもよい。次いで、ゲート内のそれらの細胞のみが、蛍光などのようなこれらの細胞についての他のパラメーターをプロットすることによってさらに分析される。液体試料の同じアリコートから、たとえば上記に記載されるように、形態計測データおよびバイオマーカー非特異的細胞データの両方を得ることができる任意のフローサイトメーターを用いることができる。対象とするのは、米国特許第6211955号、第6249341号、第6256096号、第6473176号、第6507391号、第6532061号、第6563583号、第6580504号、第6583865号、第6608680号、第6608682号、第6618140号、第6671044号、第6707551号、第6763149号、第6778263号、第6875973号、第6906792号、第6934408号、第6947128号、第6947136号、第6975400号、第7006710号、第7009651号、第7057732号、第7079708号、第7087877号、第7190832号、第7221457号、第7286719号、第7315357号、第7450229号、第7522758号、第7567695号、第7610942号、第7634125号、第7634126号、第7719598号において記載されているフローサイトメーターシステムであり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。たとえば上記に記載されるように、子宮頸部細胞性試料の同じアリコートから得られる形態計測データおよびバイオマーカー非特異的細胞データは、上記に記載されるように、対象がCIN病変を有するかどうかについて用いられる。形態計測データ、バイオマーカーデータ、および非特異的細胞データの様々な組み合わせは、対象がCIN病変を有するかどうかの予測を行うのに用いることができる。対象とする組み合わせは、以下を含むが、これらに限定されないaE6、E7mRNAの定量と結び付けられた核対細胞質比分析bDAPI染色によって決定される細胞周期分析およびE6、E7mRNAハイブリダイゼーションシグナルの緑色蛍光と結び付けられたNC比分析cp16染色によって決定される細胞周期分析およびE6、E7mRNAハイブリダイゼーションシグナルの緑色蛍光と結び付けられたNC比分析dDAPI染色によって決定される細胞周期分析と結び付けられたNC比分析など。増加したまたは高NC比は、025以上、030以上、04以上、05以上、06以上、07以上、08以上、09以上、095以上などのNC比を含む。NC比に加えて、核面積アセスメントを、形態計測データとして使用することができる。たとえば正常な中層型扁平上皮細胞における核と比較して、核面積が増加した子宮頸部細胞試料中の細胞は、異常細胞として同定される細胞とすることができる。異常細胞は、125以上、175以上、20以上、225以上、275以上、30以上、325以上、35以上などの核面積対核面積比を有しうる。標準的な顕微鏡検査法による観察を使用すると、核面積を評価する精度が低いことにここで注意されたい287~93頁を参照されたい。本発明の態様は、核面積のより正確でより再現可能なアセスメントを提供する。側方光散乱、前方散乱、および電気的体積を含む、追加のデータパラメーターもまた、子宮頸部細胞試料中の細胞を分析するのに用いることができる。そのようなパラメーターは、異常細胞の存在について分析されることとなる試料中の細胞の集団または亜集団を同定する際に使用を見出す。たとえば、EVおよびDNA含有量の分析は、有核扁平上皮細胞からの除核細胞の区別を可能にする。いくつかの場合には、方法は、アッセイされる細胞性試料が癌性細胞を含むことを決定するステップを含む。これらの実施形態では、方法は、試料中の1つまたは複数の癌性細胞の存在を同定するステップを含み、同定は、たとえば上記に記載されるように、形態計測データおよびバイオマーカーデータに基づいて行われる。そのような実施形態は、これらの実施形態の方法が試料中の実際の癌性細胞の存在を同定するので、対象におけるCINの存在を予測するステップを含んでいてもよくまたは含んでいなくてもよい。いくつかの場合には、CIN病変の存在の予測は、サイトメーターへの試料の導入の後の短期間内に行われる。したがって、結果は、1時間以下を含めて、3時間以下、たとえば2時間以下などのような6時間以下の期間でユーザに提供することができる。所望される場合、対象からの試料の獲得から対象への結果の配達に及ぶ全アッセイ時間は、3時間以下、たとえば2時間以下含む、5時間以下、たとえば4時間以下などのような6時間以下である。いくつかの場合には、方法は、方法が対象におけるCIN病変の予測をもたらす場合に、対象のさらなる分析を実行するステップをさらに含む。たとえば、本発明の方法が対象におけるCIN2病変の予測をもたらす場合、次いで、方法は、たとえば生検などのようなさらなる診断法の形態でさらなる処置を取るという推奨を対象に提供するステップをさらに含んでいてもよい。いくつかの場合には、方法は、診断上の処置をさらに取るステップを含む。さらなる診断上の処置は、コルポスコピーを含んでいてもよく、子宮頸部の拡大目視検査は、異常細胞を同定するために子宮頸部の表面上で実行される。癌または前癌病変が存在し得ることを生検が示す場合、ループ式電気外科円錐切除法および円錐切除術などのようなさらなる診断および治療処置を取ることができ、子宮頸部の内膜は、病理学的に検査するために取り出される。方法が、様々な異なる雌哺乳動物の対象での使用に適しているが、対象とするのは、10歳以上の、たとえば、20歳以上を含む、15年歳以上のヒト女性対象などのようなヒト女性対象での方法の使用である。デバイスおよびシステム本発明の態様は、本発明の方法の実施において使用されるシステムをさらに含む。対象とするシステムは、たとえば上記に記載されるように、形態計測データおよびバイオマーカーデータの両方について液体試料をアッセイするように構成されたフローサイトメーターを含む。対象とするフローサイトメーターは、必要であれば、上記に記載されるような画像データを得るための能力を含むように改変される、米国特許第4704891号第4727029号第4745285号第4867908号第5342790号第5620842号第5627037号第5701、012号第5895922号および第6287791号において記載されているデバイスならびに米国特許第6211955号、第6249341号、第6256096号、第6473176号、第6507391号、第6532061号、第6563583号、第6580504号、第6583865号、第6608680号、第6608682号、第6618140号、第6671044号、第6707551号、第6763149号、第6778263号、第6875973号、第6906792号、第6934408号、第6947128号、第6947136号、第6975400号、第7006710号、第7009651号、第7057732号、第7079708号、第7087877号、第7190832号、第7221457号、第7286719号、第7315357号、第7450229号、第7522758号、第7567695号、第7610942号、第7634125号、第7634126号、第7719598号において記載されているサイトメーターを含むが、これらに限定されず、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの場合には、フローサイトメーターは、フローチャネルフローチャネルのアッセイ領域に対して光を当てるように構成された少なくとも1つの第1の光源フローチャネルのアッセイ領域から第1の波長の光を受け取るように構成された第1の検出器およびフローチャネルのアッセイ領域から第2の波長の光を受け取るように構成された第2の検出器ならびに細胞の画像データを得るように構成された画像検出器を含む。そのようなサイトメーターは、画像検出器に加えて少なくとも2本の検出チャネルを有するであろう。いくつかの場合には、デバイスは、2つを超える検出チャネル、たとえば3以上、4以上、5以上、10以上などの検出チャネルを含んでいてもよい。本発明の態様は、第1および第2の検出器から形態計測データおよびバイオマーカーデータを受け取り、形態計測データおよびバイオマーカーデータの両方に基づく、対象が子宮頸部上皮内腫瘍病変を有するかどうかの予測の結果を出力するように構成されたシグナル処理モジュールを含むシステムをさらに含む。シグナル処理モジュールは、単一のデバイスとしてサイトメーターに統合されてもよくまたはサイトメーターから分散していてもよく、シグナル処理モジュールおよびサイトメーターは、たとえば、有線または無線通信プロトコールを介して互いに通信し合う。したがって、本発明の態様は、システム、たとえばコンピューターベースのシステムをさらに含み、これらは、たとえば上記に記載されるように、対象におけるCIN病変の存在を予測するように構成される。コンピューターベースのシステムは、本発明の情報を分析するために使用されるハードウェア手段、ソフトウェア手段、およびデータ保存手段を指す。本発明のコンピューターベースのシステムの最小のハードウェアは、中央処理装置、入力手段、出力手段、およびデータ保存手段を含む。当業者は、現在入手可能なコンピューターベースのシステムのいずれか1つが本発明において使用するのに適していることを容易に、十分に理解することができる。データ保存手段は、上記に記載されるように、本発明の情報の記録を含む任意の製品またはそのような製品にアクセスすることができるメモリアクセス手段を含んでいてもよい。記録データについて、コンピューター読み取り可能なメディア上のプログラミングまたは他の情報は、当技術分野において知られている任意のそのような方法を使用して情報を保存するための方法を指す。任意の好都合なデータ保存構造が、保存された情報にアクセスするために使用される手段に基づいて選ぶことができる。様々なデータプロセッサープログラムおよび形式、たとえば文書処理テキストファイル、データベース形式などは、保存のために使用することができる。プロセッサーは、それに必要とされる機能を実行するであろう任意のハードウェアおよびまたはソフトウェアの組み合わせを参照する。たとえば、本明細書における任意のプロセッサーは、電子制御器、メインフレーム、サーバー、またはパーソナルコンピューターの形態で入手可能なような、プログラム可能なデジタルマイクロプロセッサーであってもよい。プロセッサーがプログラム可能である場合、適したプログラミングは、リモート位置からプロセッサーに通信することができ、またはあらかじめ、コンピュータープログラム製品中に保存することができる。たとえば、磁気メディアまたは光ディスクは、プログラミングを保持してもよく、その対応するステーションでそれぞれのプロセッサーと通信する適したリーダーによって読み取ることができる。本発明のシステムの実施形態は、以下の成分を含む下記に記載される、たとえばユーザコンピューターを介して、システムおよび1つまたは複数のユーザの間の情報転送を促進するための通信モジュールならびに本発明の定量分析方法において含まれる1つまたは複数のタスクを実行するための処理モジュール。ある実施形態では、その中に保存される制御論理を有するコンピューター利用可能なメディアを含むコンピュータープログラム製品が、記載される。制御論理は、コンピューターのプロセッサーによって実行される場合、本明細書において記載される機能をプロセッサーに実行させる。他の実施形態では、いくつかの機能は、たとえば、ハードウェアステートマシンを使用して、主としてハードウェア中に構築される。本明細書において記載される機能を実行するためのハードウェアステートマシンの実装は、任意の好都合な方法および技術を使用して達成することができる。たとえば、上記に記載されるセンサーデバイスおよびシグナル処理モジュールに加えて、本発明のシステムは、データ出力デバイス、たとえばモニターおよびまたはスピーカー、データインプットデバイス、たとえばインタフェースポート、キーボードなど、流体操作成分、電源などのような多くの追加の成分を含んでいてもよい。いくつかの場合には、システムは、その反応混合物誘導体をさらに含んでいてもよく、反応混合物は、たとえば、試料を、1つまたは複数の標識バイオマーカープローブおよび任意選択の非特異的な染料と組み合わせることによって、上記に記載されるように調製される。有用性本発明の方法およびシステムは、対象におけるCIN病変の検出予測が、所望される、様々な異なる適用において使用を見出す。そのような適用は、研究および診断上の適用、たとえば、対象が、たとえば上記に記載されるように、子宮頸癌の存在またはそれを発症する傾向に関して診断される適用の両方を含む。本明細書において記載される方法およびシステムの臨床的有用性は、初期および末期の両方において、HPV関連性の病変形成および子宮頸癌の進行を検出し、スクリーニングするための強力なツールを提供し、したがって、疾患進行を予防するための治療的介入および早期治療を提供するための機会を可能にする。さらに、本発明の方法およびシステムは、HPV関連性の疾患または症状の進展をモニターするためのおよびたとえば抗HPVワクチンまたは抗HPVワクチン候補などのような抗HPV薬剤または治療の効率をモニターするためのHPV関連性の疾患または症状の予後またはリスクアセスメントにおいて使用を見出す。コンピューター関連の実施形態本発明の態様は、様々なコンピューター関連の実施形態をさらに含む。具体的には、前の部において記載されるデータ分析方法は、コンピューターを使用して実行することができる。したがって、本発明は、CIN病変を検出するまたは予測するために上記の方法を使用して産生されるデータを分析するためのコンピューターベースのシステムを提供する。ある実施形態では、方法は、プログラミングの形態をした物理的なコンピューター読み取り可能なメディア上にコードされ、本明細書において使用される用語コンピューター読み取り可能なメディアは、実行およびまたは処理のためにコンピューターに命令およびまたはデータを提供するのに参加する任意の保存または伝送メディアを指す。保存メディアの例は、そのようなデバイスがコンピューターの内部にあるか外部にあるかにかかわらず、フロッピー登録商標ディスク、磁気テープ、CDROM、ハードディスクドライブ、ROMもしくは集積回路、光磁気ディスク、またはPCMCIAカードなどのようなコンピューター読み取り可能なカードなどを含む。情報を含有しているファイルは、コンピューター読み取り可能なメディア上に保存されてもよく、保存は、それが、コンピューターによって後の日にアクセス可能であり、検索可能となるように、情報を記録することを意味する。メディアとして対象とするのは、非一時的メディア、つまり物理的メディアであり、プログラミングは、物理的構造物上に記録されるなどのように、物理的構造物と関連する。非一時的メディアは、無線プロトコールを介して移行中の電子信号を含まない。コンピューター読み取り可能なメディアに関して、固定記憶は、永久の記憶を指す。固定記憶は、コンピューターまたはプロセッサーへの給電の停止によって削除されない。コンピューターハードドライブ、CDROM、フロッピー登録商標ディスク、およびDVDはすべて、固定記憶の例である。ランダムアクセスメモリは、非永久記憶の例である。固定記憶中のファイルは、編集可能で、再書き込み可能であってもよい。キット他の態様では、本発明は、たとえば上記に記載されるように、本発明の方法を実施するためのキットを提供する。本発明のキットは、たとえば上記に記載されるように、標識バイオマーカープローブを含んでいてもよい。さらに、キットは、上記に記載されるように、非特異的染料を含んでいてもよい。さらに、キットは、所与のアッセイにおいて用いることができるバッファー、希釈剤、固定試薬、透過処理試薬などを含むが、これらに限定されない、用いられる1つまたは複数の追加の組成物を含んでいてもよい。キットは、上記に記載されるように、試料獲得デバイス、たとえば子宮頸部ほうきをさらに含んでいてもよい。上記の成分は、別々の容器中に存在してもよく、または1つもしくは複数の成分は、単一の容器、たとえばガラス製もしくはプラスチックバイアルの中に組み合わせてもよい。上記の成分に加えて、本発明のキットは、本発明の方法を実施するための説明書をさらに含むであろう。これらの説明書は、様々な形態で本発明のキット中に存在してもよく、これらの1つまたは複数は、キット中に存在してもよい。これらの説明書が存在してもよいある形態は、適したメディアまたは基板上の印刷情報、たとえば、キットの包装、添付文書などに情報が印刷されている1枚または複数枚の紙としてのものである。他の手段は、情報が記録されているコンピューター読み取り可能なメディア、たとえばディスケット、CDなどであろう。存在してもよい他の手段は、遠く離れたサイトで情報にアクセスするためにインターネットを介して使用することができるウェブサイトアドレスである。任意の好都合な手段が、キット中に存在してもよい。以下の実施例は、限定としてではなく、例証として提供される。実験液体ベースの子宮頸部細胞診検体の1ml試料アリコートを得、室温で、5分間、1000xgで遠心分離した。結果として生じた細胞ペレットは、リン酸緩衝生理食塩水、pH74中で2回洗浄し、細胞は、IncellFPを使用して、室温で、1時間、固定および透過処理した。結果として生じた、固定および透過処理した細胞は、2つの異なるプレハイブリダイゼーションバッファーを使用して2回洗浄し、ハイブリダイゼーションカクテルは、ハイブリダイゼーションバッファーを、すべての既知の危険性が高いHPVタイプについての蛍光標識HPVE6、E7mRNAプローブカクテルと混合することによって調製したE6E7mRNADetectionKitのプローブカクテルにおいて見出されるものからのものとした。ハイブリダイゼーション反応は、30分間、予熱した43±1°Cのウォーターバス中で実行し、非結合プローブを除去するために2つのポストハイブリダイゼーションバッファーにより細胞のストリンジェンシー洗浄を続けた。細胞は、2ウシ胎仔血清を含有する1mlPBS中で洗浄し、60μlのPBS、005TritonX100、および1μgmlDAPI中に再懸濁した。機器に流す前に、PBS中の200μlの10μΜEDTAを追加した。試料は、シリンジによりホモジナイズし、ImageStream機器に流した。機器は、たとえば図1において示されるように、縦横比対面積ドットプロットを使用して、完全な単一の細胞を区別するために設定した。この設定は、NC比分析による異常細胞の同定ならびにDAPI染色およびE6、E7mRNAハイブリダイゼーションシグナルの緑色蛍光によって決定されるE6、E7mRNAの定量を可能にした。その代わりに、DNA染色試薬によって決定される細胞周期分析およびE6、E7mRNAハイブリダイゼーションシグナルの緑色蛍光は、異常細胞を検出するために使用することができる。たとえば、図4におけるヒストグラムにおいて知ることができるように、E6E7mRNAの過剰発現は、DNA含有量が増加した細胞において見出される。すべて浮遊している細胞に対して実行される、Table1における容認されたスライドベースの基準と一致する形態計測測定および細胞ごとのE6、E7mRNAの過剰発現の使用の組み合わせは、それぞれ95および90までCIN2の検出のための感度および特異性を増加させた。単一のアッセイにおけるこの性能は、CIN2病変の検出のために組み合わせたPAPスミアおよびHPVDNAの試験性能を大幅に上回る。このアプローチは、E6、E7mRNAの検出の代わりにp16抗体を用いて、E6、E7mRNAプローブを、子宮頸癌と関連する特異的マイクロRNAもしくは染色体変化3q‐に対するプローブと置き換えて、またはE6、E7mRNAプローブの代わりにE6、E7特異的抗体を用いて使用することができる。追加のもう1つの方法として、形態計測測定、たとえば細胞の核細胞質比と結び付けた、DNA染色試薬によって決定される細胞周期分析は、異常細胞を検出するために使用することができる。たとえば、図5Aおよび5Bは、正常な子宮頸部細胞、LSIL子宮頸部細胞、およびHSIL子宮頸部細胞のNC比対DNA含有量のヒストグラムを示す。このもう1つの方法は、1つのみの染色試薬、つまり非特異的DNA染色試薬を使用する。さらに、下記のTable2において示されるように、発明者らは、DNA染色試薬の使用によって決定される、試料中の扁平上皮細胞の核形成の程度が、細胞学的異常の重症度と一致することを見出した。具体的には、試料中の扁平上皮細胞のパーセント核形成の増加は、細胞学的異常の重症度の増加と一致する。Table2では、正常な扁平上皮細胞は、約50の核形成を有し、LSIL扁平上皮細胞は、約80の核形成を有し、HSIL扁平上皮細胞は、90以上の核形成を有した。そのため、約80以上の対象由来の試料中の扁平上皮細胞についてのパーセント核形成は、対象が、子宮頸部上皮内腫瘍病変を有することを示し、試料における約90以上のパーセント核形成は、対象が、高悪性度扁平上皮病変を有することを示す。子宮頸部細胞試料は、本明細書において記載されるスクリーニングアッセイに適切でない細胞型を含み得、そのため、分析からそれらを除くことは好都合であろう。図6は、子宮頸部細胞診試料中の細胞の側方光散乱および電気的体積の組み合わせのドットプロットを示す。このプロットは、これらの形態計測パラメーターを使用して、試料中の異なる細胞を定めることができることを示す。4つの異なるゲートは、デブリ、子宮膣部の細胞、子宮頸管内の細胞、および多形核白血球を同定する。そのようなゲーティングを用いて、本発明の態様によってスクリーニングする対象とする細胞を同定することができる。前述の発明は、理解の明瞭さのために例証および実施例として詳細に記載されたが、添付の請求項の精神または範囲から逸脱することなく、ある変化および改変が成されてもよいことは、本発明の教示を考慮して当業者らに容易に明らかである。したがって、前述のものは、単に本発明の原理を例証するものである。本明細書において明白に記載されていないまたは示されていないが、本発明の原理を具体化し、その精神および範囲内に含まれる様々な構成を当業者らが考案することができるであろうということが十分に理解されるであろう。さらに、本明細書において記載される実施例および条件付きの用語はすべて、主として、本発明の原理および技術を進展させるために発明者によって提供された概念を理解する際に、読者を支援することを意図し、そのような具体的に記載される実施例および条件に対する限定を伴わないものとして解釈されたい。本発明の原理、態様、および実施形態ならびにその特定の実施例を記載する本明細書におけるすべての表現は、その構造的および機能的等価物を包含するように意図される。さらに、そのような等価物は、現在知られている等価物および今後開発される等価物、つまり、構造に関係なく、同じ機能を実行する、開発されるあらゆる要素の両方を含むことが意図される。本発明の範囲は、そのため、本明細書において示され、記載される例示的な実施形態に限定されるようには意図されない。むしろ、本発明の範囲および精神は、添付の請求項によって具体化される。