燃料ガスと酸化剤ガスにより発電を行う燃料電池システムにおいて、燃料ガスと酸化剤ガスを電気化学的に反応させる燃料電池セルと、燃料ガスを水素リッチなガスに改質する改質器と、上記改質器で改質された燃料ガスを上記燃料電池セルに供給する改質ガス供給手段と、上記改質ガス供給手段を制御し、上記燃料電池システムの運転状態の制御を行う制御手段と、を有し、上記改質ガス供給手段は、改質された燃料ガスを流す第一流路と、上記第一流路内の燃料ガスと熱交換可能なように熱媒体を流す第二流路とを有し、上記制御手段は、上記燃料電池セルを加熱して発電可能な状態まで昇温させる起動工程の実行時は上記第二流路の熱媒体を比較的高温とする一方で、上記燃料電池セルを冷却する停止工程の実行時は上記第二流路の熱媒体を比較的低温とすることを特徴する燃料電池システム。上記第二流路は上記第一流路の周囲を覆うように形成されるとともに、上記制御手段は、上記停止工程の実行時は上記第二流路に熱媒体として水を供給する一方で、上記起動工程の実行時は上記第二流路への水の供給を禁止することを特徴とする請求項1記載の燃料電池システム。上記制御手段は、上記起動工程の実行時に上記第二流路内の水が気化した後に上記第二流路を遮断してその内部を閉空間とすることを特徴とする請求項2に記載の燃料電池システム。上記制御手段は、上記停止工程の実行時は上記第一流路を流れる燃料ガス中の水蒸気分圧が飽和水蒸気圧未満となるよう、上記第二流路に供給する水の流量を調整することを特徴とする請求項2または3に記載の燃料電池システム。上記第一流路に、下方に向けて突設され、且つ水を貯留する結露水貯留部が設けられていることを特徴する請求項2または3に記載の燃料電池システム。しかし、ガス流路を切り替えるためのバルブは高温のガスにさらされるため、バルブの気密性や開閉トルクなどの機能を維持することが難しい。また、バルブの開閉の駆動部は室温に近い環境にする必要があるためバルブの回転軸は断熱材の外にまで取りだされ、放熱や強制冷却により温度を下げて駆動部に接続されるので、放熱ロスが増加し燃料電池システムの性能を低下させる。本発明は、上記従来技術の課題に鑑みて、還元ガスの流路を変更することなく、起動工程では還元ガスを高温に保ち、停止工程では還元ガスを低温化させて、起動工程と停止工程の両方を効率よく実行することを目的とする。上記課題を解決するために、本発明によれば、燃料ガスと酸化剤ガスにより発電を行う燃料電池システムにおいて、燃料ガスと酸化剤ガスを電気化学的に反応させる燃料電池セルと、燃料ガスを水素リッチなガスに改質する改質器と、上記改質器で改質された燃料ガスを上記燃料電池セルに供給する改質ガス供給手段と、上記改質ガス供給手段を制御し、上記燃料電池システムの運転状態の制御を行う制御手段と、を有し、上記改質ガス供給手段は、改質された燃料ガスを流す第一流路と、上記第一流路内の燃料ガスと熱交換可能なように熱媒体を流す第二流路とを有し、上記制御手段は、上記燃料電池セルを加熱して発電可能な状態まで昇温させる起動工程の実行時は上記第二流路の熱媒体を比較的高温とする一方で、上記燃料電池セルを冷却する停止工程の実行時は上記第二流路の熱媒体を比較的低温とする。本発明によれば、改質器により水素リッチなガスに改質された燃料ガスを、起動工程、停止行程のいずれの実行時も、第一流路によって適切な温度にて燃料電池セルに供給することができる。すなわち、起動工程の実行時においては、第二流路の熱媒体は比較的高温のため、第一流路を流れる燃料ガスは熱媒体に熱を奪われることなく高温のまま燃料電池セルまで供給され、燃料電池セルを加熱して迅速に発電可能な状態まで昇温させることができる。一方、停止工程の実行時においては、第二流路の熱媒体は比較的低温のため、第一流路を流れる燃料ガスは熱媒体に熱を奪われて低温となり燃料電池セルを迅速に冷却することが可能となる。本発明において、好ましくは、上記第二流路は上記第一流路の周囲を覆うように形成されるとともに、上記制御手段は、上記停止工程の実行時は上記第二流路に熱媒体として水を供給する一方で、上記起動工程の実行時は上記第二流路への水の供給を禁止する。停止工程の実行時は、第二流路に供給される水によって第一流路内の燃料ガスから熱を奪い、燃料ガスを低温にして迅速に燃料電池セルを冷却する。一方、起動工程の実行時は、第二流路への水の供給を禁止することで、第二流路に留まっている水が加熱されて気化することで水蒸気が発生する。水より熱伝導率が小さい水蒸気が第二流路に存在することによって、第一流路内の燃料ガスからの熱の放散が抑制され、高温の燃料ガスを燃料電池セルに供給することで、燃料電池セルを加熱して迅速に発電可能な状態まで昇温させることができる。尚、水とは、必ずしも純水に限られるものではなく、所謂クーラント液等、純水に不凍剤や防錆剤等の様々な物質が添加された液体をも含む概念である。さらに好ましくは、上記制御手段は、上記起動工程の実行時に上記第二流路内の水が気化した後に上記第二流路を遮断してその内部を閉空間とする。起動工程の実行時において第二流路が開放されている場合、第二流路内で高温となった水蒸気が対流作用により第二流路外に排出され、効率的に燃料電池セルを加熱することができない。起動工程の実行時は第二流路を遮断してその内部を閉空間とすることによって、第二流路内の高温となった水蒸気の外部への排出を抑制し、伝熱によるロスを最小限にとどめることができる。さらに好ましくは、上記制御手段は、上記停止工程の実行時は上記第一流路を流れる燃料ガス中の水蒸気分圧が飽和水蒸気圧未満となるよう、上記第二流路に供給する水の流量を調整する。第二流路に供給する水によって燃料ガスを冷却することで、燃料ガスに含まれる水蒸気が結露するおそれがある。その結露水が第一流路内に残留し、第一流路を塞ぐなどすると、燃料電池セルへ安定的に燃料ガスを供給できなくなるといった不具合が生じる。本発明では、燃料ガス中の水蒸気が飽和水蒸気圧未満となるよう、第二流路に供給される水が調整されているため、結露発生を抑制し、このような不具合を防止することができる。さらに好ましくは、上記第一流路に、下方に向けて突設され、且つ水を貯留する結露水貯留部が設けられている。本発明では、燃料ガス中の水蒸気が結露した場合であっても結露水貯留部に貯留される。この結露水貯留部は下方に向けて突設されたものであるため、その上方に燃料ガスの通路が確保される。したがって、結露水が第一流路に残留し、第一流路を塞ぐなどの不具合を防止することができる。本発明によれば、還元ガスの流路を変更することなく、起動工程では還元ガスを高温に保ち、停止工程では還元ガスを低温化させて、起動工程と停止工程の両方を効率よく実行することができる。以下、添付図面を参照しながら本発明の実施の形態について説明する。説明の理解を容易にするため、各図面において同一の構成要素に対しては可能な限り同一の符号を付して、重複する説明は省略する。はじめに、図1を参照しながら、本発明の一実施形態である燃料電池システムについて説明する。図1は、一実施形態としての燃料電池システムFCSの全体構成を示す概略構成図である。図1に示すように、燃料電池システムFCSは、燃料電池モジュールFCMと、補器ユニットADUと、貯水タンクWP2と、温水製造装置HWとを備えている。まず、燃料電池モジュールFCMについて説明する。燃料電池モジュールFCMは、燃料電池FCと、改質器RFと、制御ボックスCBと、一酸化炭素検知器CODと、可燃ガス検知器GD1とを備えている。燃料電池FCは、固体酸化物形の燃料電池SOFC:SolidOxideFuelCellであって、発電室FC1と燃焼室FC2とを備えている。発電室FC1には複数本の燃料電池セルCEが配置されている。燃料電池セルCEは、電解質を挟んで燃料極アノードと空気極カソードとが設けられているものであって、燃料極側に燃料ガスを通し、空気極側に酸化ガスとしての空気を通すことで発電反応を起こすことができるように構成されている。本実施形態の燃料電池FCは固体酸化物形燃料電池SOFCであるので、電解質を構成する材料としては、例えば、Y、Sc等の希土類元素から選ばれる少なくとも一種をドープしたジルコニア、希土類元素から選ばれる少なくとも一種をドープしたセリア、Sr、Mgから選ばれる少なくとも一種をドープしたランタンガレートといった酸素イオン導電性酸化物を用いている。燃料極を構成する材料は、NiOやCoO等の金属酸化物を含み、例えば、NiOと、CaやY、Sc等の希土類元素から選ばれる少なくとも一種をドープしたジルコニアとの混合体、NiOと、希土類元素から選ばれる少なくとも一種をドープしたセリアとの混合体、NiOと、Sr、Mg、Co、Fe、Cuから選ばれる少なくとも一種をドープしたランタンガレートとの混合体といった材料が用いられる。詳細は後述するように、NiO等の金属酸化物は、燃料電池システムの初回の起動工程中にNi等に還元される。空気極を構成する材料としては、例えば、Sr、Caから選ばれる少なくとも一種をドープしたランタンマンガナイト、Sr、Co、Ni、Cuから選ばれる少なくとも一種をドープしたランタンフェライト、Sr、Fe、Ni、Cuから選ばれる少なくとも一種をドープしたランタンコバルタイト、銀といった材料が用いられる。もっとも、電解質や燃料極及び空気極を構成する材料はこれらに限られるものではない。発電室FC1において発電された電気は電力取出ラインEP1によって発電電力として取り出されて利用される。燃焼室FC2は、発電室FC1に配置された燃料電池セルCEによって発電反応に利用された残余の燃料ガスを燃焼させる部分である。燃焼室FC2において燃料ガスが燃焼した結果生じる排気ガスは、改質器RFと熱交換をした後に温水製造装置HWへと供給される。温水製造装置HWへと供給された排気ガスは更に熱交換を行い、水道水を昇温して温水とした後に外部へと排出される。改質器RFは、被改質ガスを改質して燃料ガスとし、燃料電池FCの発電室FC1へと供給する部分である。被改質ガスの改質態様としては、部分酸化改質反応POX:PartialOxidationReforming、オートサーマル改質反応ATR:AutoThermalReforming、水蒸気改質反応SR:SteamReformingがあり、運転状況に応じて選択的に実行される。改質器RFは、改質部RF1と、蒸発部RF2とを備えている。蒸発部RF2は、補器ユニットADU側から供給される純水を蒸発させて水蒸気とし、その水蒸気を改質部RF1に供給する部分である。改質部RF1は、補器ユニットADU側から供給される被改質ガス、空気及び蒸発部RF2から供給される水蒸気を用いて被改質ガスを改質して燃料ガスとする部分である。改質部RF1には、改質触媒が封入されている。改質触媒としては、アルミナの球体表面にニッケルを付与したもの、アルミナの球体表面にルテニウムを付与したもの、が適宜用いられる。本実施形態の場合、これらの改質触媒は球体である。制御ボックスCBは、燃料電池システム制御部制御手段をその内部に収納し、操作装置や表示装置、報知装置が設けられているものである。燃料電池システム制御部、操作装置、表示装置、報知装置については後述する。一酸化炭素検知器CODは、燃料電池モジュールFCMの燃焼室FC2において残余の燃料ガスの不完全燃焼が起きてしまい、一酸化炭素が燃料電池モジュールFCM内に発生していないか検知するためのセンサである。可燃ガス検知器GD1は、燃料電池モジュールFCMの燃焼室FC2において残余の燃料ガスが燃え残ってしまい、いわゆる生ガスが燃料電池モジュールFCM内に発生していないか検知するためのセンサである。続いて、補器ユニットADUについて説明する。補器ユニットADUは、燃料電池モジュールFCMに水、被改質ガス、及び空気を供給するための補器を備えるユニットである。補器ユニットADUは、空気供給部として空気ブロワや流量調整弁等を含む流量調整ユニットAP1a、AP1b、及び電磁弁AP2と、燃料供給部として燃料ポンプや流量調整弁等を含む流量調整ユニットFP1、脱硫器FP2、ガス遮断弁FP4、及びガス遮断弁FP5と、水供給部として水ポンプや流量調整弁等を含む流量調整ユニットWP1と、可燃ガス検知器GD2と、を備えている。外部の空気供給源から供給される空気は、電磁弁AP2が閉じていれば流量調整ユニットAP1a、AP1bに供給されず、電磁弁AP2が開いていれば流量調整ユニットAP1a、AP1bに供給される。流量調整ユニットAP1aによって流量調整された空気は改質用空気として、ヒーターAH1によって昇温され、被改質ガスとの混合部MVに供給される。流量調整ユニットAP1bによって流量調整された空気は発電用空気として、ヒーターAH2によって昇温され、空気供給路を通って燃料電池モジュールFCMの発電室FC1に供給される。発電室FC1に供給された発電用空気は、燃料電池セルCEの空気極に供給される。外部の燃料供給源から供給される都市ガスは、2連電磁弁であるガス遮断弁FP4及びガス遮断弁FP5によってその流入が制御される。ガス遮断弁FP4、FP5のいずれもが開いていれば、都市ガスは脱硫器FP2に供給され、ガス遮断弁FP4、FP5のいずれかが閉じていれば、都市ガスは遮断される。脱硫器FP2に供給された都市ガスは、硫黄成分を除去されて被改質ガスとなり、流量調整ユニットFP1に供給される。流量調整ユニットFP1によって流量調整された被改質ガスは、改質用空気との混合部MVに供給される。混合部MVにおいて混合された被改質ガスと改質用空気とは、燃料電池モジュールFCMの改質器RFに供給される。外部の水供給源から供給される水道水は、純水とされてから貯水タンクWP2に貯水される。貯水タンクWP2に貯水されている純水は、流量調整ユニットWP1によって流量が調整されて燃料電池モジュールFCMの改質器RFへと供給される。可燃ガス検知器GD2は、燃料供給部としての系統であるガス遮断弁FP5、ガス遮断弁FP4、脱硫器FP2、流量調整ユニットFP1において、ガス漏れが発生していわゆる生ガスが外部に放出されないか検知するためのセンサである。続いて、図2を参照しながら本実施形態の燃料電池システムFCSの制御的な構成について説明する。図2は、燃料電池システムFCSの制御的な構成を示すブロック図である。図2に示すように、燃料電池システムFCSは、燃料電池モジュールFCMと、燃料電池モジュールFCMに空気を供給する空気供給部APと、燃料電池モジュールFCMに燃料ガスとなる被改質ガスを供給する燃料供給部FPと、燃料電池モジュールFCMに水を供給する水供給部WPと、燃料電池モジュールFCMから電力を取り出す電力取出部EPとを備えている。空気供給部AP、燃料供給部FP、水供給部WP、及び電力取出部EPは補器ユニットADUに収められている。燃料電池モジュールFCM、空気供給部AP、燃料供給部FP、水供給部WP及び電力取出部EPは、燃料電池システム制御部CSから出力される制御信号に基づいて制御される。燃料電池システム制御部CSは、CPU、ROM及びRAMといったメモリ、及び制御信号やセンサ信号を授受するためのインターフェイスによって構成されている。燃料電池システム制御部CSには、操作装置CS1、表示装置CS2、及び報知装置CS3が取り付けられている。操作装置CS1から入力される操作指示信号は燃料電池システム制御部CSに出力され、燃料電池システム制御部CSは、その操作指示信号に基づいて、燃料電池モジュールFCM等を制御する。燃料電池システム制御部CSが制御した情報や、所定の警告情報は、表示装置CS2及び報知装置CS3に出力される。操作装置CS1、表示装置CS2、及び報知装置CS3の具体的なハードウェア構成は特に限定されるものではなく、必要となる機能に応じて最適なハードウェア構成が選択される。一例としては、操作装置CS1として、キーボード、マウス、タッチパネルといったハードウェアが用いられる。表示装置CS2としては、CRTディスプレイ、液晶ディスプレイといった表示系のハードウェアが用いられる。報知装置CS3としては、スピーカー、点灯器といったハードウェアが用いられる。燃料電池システム制御部CSは制御ボックスCBに収められている。また操作装置CS1、表示装置CS2、報知装置CS3は、図示しないボックスに収められ屋内に配置されている。燃料電池システム制御部CSには、燃料電池システムFCSの各所に設けられたセンサからセンサ信号が出力される。燃料電池システム制御部CSに信号を出力するセンサとしては、改質器温度センサDS1、スタック温度センサDS2、排気温度センサDS3、改質器内圧力センサDS4、水位センサDS5、水流量センサDS6、燃料流量センサDS7、改質用空気流量センサDS8、発電用空気流量センサDS9、電力状態検出部DS10、貯湯状態検出センサDS11、一酸化炭素検出センサDS12、可燃ガス検出センサDS13が設けられている。改質器温度センサDS1は、改質器RFの温度を測定するためのセンサであって、本実施形態の場合は2つ設けられている。スタック温度センサDS2は、発電室FC1に配置されている燃料電池セルCEの温度を測定するためのセンサであって、複数の燃料電池セルCEからなる燃料電池セルスタック近傍に配置されている。排気温度センサDS3は、燃焼室FC2から排出される排気ガスの温度を測定するためのセンサであって、燃焼室FC2から改質器RF近傍を通って温水製造装置HWに至る経路に配置されている。改質器内圧力センサDS4は、改質器RF内の圧力を測定するためのセンサである。なお、ここでは改質器RF内の圧力をセンサで測定するようにしているが、改質器RFの前段で燃料と水が混合される部分の圧力を検出するものであっても良い。水位センサDS5は、貯水タンクWP2の水位を測定するためのセンサであって、本実施形態の場合は4つ設けられている。水流量センサDS6は、補器ユニットADUから燃料電池モジュールFCMへと供給される純水の流量を測定するためのセンサである。燃料流量センサDS7は、補器ユニットADUから燃料電池モジュールFCMへと供給される被改質ガスの流量を測定するためのセンサである。改質用空気流量センサDS8は、補器ユニットADUから燃料電池モジュールFCMの改質器RFへと供給される改質用空気の流量を測定するためのセンサである。発電用空気流量センサDS9は、補器ユニットADUから燃料電池モジュールFCMへと供給される発電用空気の流量を測定するためのセンサである。電力状態検出部DS10は、センシング手段の集合体であって、燃料電池モジュールFCMから取り出す発電電力の状態を検出する部分である。貯湯状態検出センサDS11は、センシング手段の集合体であって、温水製造装置HWの貯湯状態を検出する部分である。一酸化炭素検出センサDS12は、一酸化炭素検知器CODに備えられているセンサであって、燃料電池モジュールFCM内における一酸化炭素のハウジング内への漏れを検出するセンサである。可燃ガス検出センサDS13は、可燃ガス検知器GD1、GD2に備えられているセンサであって、燃料電池モジュールFCM及び補器ユニットADU内における可燃ガスの漏洩を検出するセンサである。続いて、図3および図4を参照しながら本実施形態の燃料電池システムFCSを構成する燃料電池モジュールFCMの詳細な構成について説明する。図3は本発明の一実施形態である燃料電池システムの起動工程の実行時における概略断面図であり、図4は本発明の一実施形態である燃料電池システムの停止工程の実行時における概略断面図である。燃料電池モジュールFCMは、発電室FC1と、分散室FDBと、燃焼室FC2と、水蒸気改質器RFSと、部分酸化改質器RFPとを備えている。発電室FC1、分散室FDB及び燃焼室FC2は、耐熱性金属の壁体で構成されたモジュール容器MC内に収容されており、水蒸気改質器RFSはモジュール容器MCに連結され、部分酸化改質器RFPは、モジュール容器MCの外部に配設されている。燃料電池セルCEはモジュール容器MCの内部に収容されており、複数の燃料電池セルCEは集電部材EFで連結されている。連結された複数の燃料電池セルCEの1本目と最終番目には、電極ロッドRDが接続されており、電極ロッドRDはモジュール容器MCを貫通して外部に発電された電力を取り出せるようにしている。貫通部はモジュール容器MCの壁体に開設された入口部から外方に突出形成されて内部に空間を有するハウジング部CRの先端付近で電極ロッドRDとの絶縁かつ気密が保たれている。集電部材EFおよび電極ロッドRDは耐熱性および耐酸化性に優れる耐熱合金が使われる。集電部材EFおよび電極ロッドRDがアノード側に設置されているのであればニッケルを使ってもいい。分散室FDBは、発電室FC1の下部に配設されている。この分散室FDBは、水蒸気改質器RFS又は部分酸化改質器RFPで改質された燃料ガスを分散させ、発電室FC1内に燃料ガスを均一に供給するためのものであり、その上壁には、燃料ガスを発電室FC1内に供給する複数の穴が貫通形成されている。また、分散室FDBの底面には、水蒸気改質器RFS又は部分酸化改質器RFPから供給される改質ガスを導入するための燃料配管FPが接続されている。分散室FDBの底面側下側から導入された改質ガスは、ここで分散され、発電室FC1の底面側下側から発電室FC1内に導入され、発電室FC1内に立設された燃料電池セルCEの燃料極に供給される。改質器RFは、水蒸気改質器RFSと部分酸化改質器RFPとに分けて設けられている。まず、水蒸気改質器RFSの構成について説明する。水蒸気改質器RFSは、蒸発部RFS1、予熱部RFS2、及び改質部RFS3を備えている。改質部RFS3は、燃焼室FC2の上部に配設されている。改質部RFS3の上部には、予熱部RFS2が配設され、更にその上方には蒸発部RFS1が配設されている。蒸発部RFS1は、補器ユニットADU側から純水が供給され、その純水を蒸発させて水蒸気となし、その水蒸気を予熱部RFS2に送り込む。予熱部RFS2は、蒸発部RFS1から水蒸気が供給されると共に、補器ユニットADU側から被改質ガスとしての都市ガスが供給される。予熱部RFS2においては水蒸気と被改質ガスである都市ガスとが混合され、その混合されたガスは改質部RFS3に送り込まれる。改質部RFS3では、予熱部RFS2から供給された水蒸気及び被改質ガスが、改質触媒の作用によって改質されて改質ガスとなし、燃料配管FPを通って分散室FDBへと送り込まれている。水蒸気改質器RFS改質部RFS3は、モジュール容器MCに連通もしくはモジュール容器MC内に配設されており、且つ同じモジュール容器MC内に配設された燃焼室FC2の上方に配設されているため、燃焼室FC2で生じる燃焼排ガスは改質部RFS3、予熱部RFS2、蒸発部RFS1の加熱ガス流路側を流れて熱交換を行うことができる。このように燃焼室FC2で生じる燃焼排熱を用いて吸熱反応である水蒸気改質反応を効率よく行うことができる。部分酸化改質器RFPは、モジュール容器MCの外側に断熱材図示せずを介して配設されている。部分酸化改質器RFPは、被改質ガス、空気、純水が供給されるように構成されている。ここでは、部分酸化改質器RFPは触媒反応を利用したものを反応管の例として記載しているが部分酸化バーナーに置き換えることもできる。部分酸化改質器RFPで改質された改質ガスは、水蒸気改質器RFSからの改質ガスを供給する燃料配管FPと合流して分散室FDBに供給される。燃料配管FPは断熱材図示せずで包まれている。部分酸化改質器RFPは、燃料電池システムの起動工程の実行時と、発電を停止する停止行程の実行に、被改質ガスに部分酸化改質又は水を用いた改質を行い、燃料電池セルCEに還元ガスである改質ガスを供給する。起動工程の実行時に、各燃料電池セルCEに高温の酸化ガスを供給するために、触媒燃焼器CC及び空気ヘッダADBが設けられている。触媒燃焼器CCには、触媒が充填されており、空気と燃料ガスとが供給され、所定のSV空間速度値と温度の着火条件を満たした場合に着火して燃焼するように構成されている。触媒燃焼器CCには、流量調整ユニットAP1bから送出され、ヒーターAH2によって昇温された空気が供給されるように構成されている。また、触媒燃焼器CCには、都市ガスが直接供給されるように構成されている。触媒燃焼器CCによって更に昇温された空気は空気ヘッダADBに供給される。空気ヘッダADBは、複数の燃料電池セルCEそれぞれに空気を分配供給するように構成されている。部分酸化改質器RFPの下流には、燃料配管FPの周囲を覆うように水流路部CLが形成されており、水流路部CLには水供給管CPinと水排出管CPoutが接続されている。図3および図4では水流路部CLは燃料配管FPの周囲を取り囲む二重管状にした例を記載しているが、燃料配管FPの周囲を螺旋管状に巻きつけることもできる。停止工程の実行時は、空気側ではヒーターAH2は停止しており、触媒燃焼器CCに燃料も供給されないので、低温の空気が燃料電池セルCEに供給される。水入口バルブCiVが開き、水流路部CLに水供給管CPinから水が供給される図4参照、斜線部は水を示す。燃料側では、所定量の燃料および必要に応じて水と空気が水蒸気改質器RFSもしくは部分酸化改質器RFPに供給され、高温の改質ガスが生成される。この高温の改質ガスは燃料配管FPを流れ、水流路部CL内で水供給管CPinから流れてきた水と熱交換されて、低温の改質ガスとなって分散室FDBから燃料電池セルCEに供給される。このように燃料電池セルCEに対して空気側と燃料側の両方から低温のガスを供給することで燃料電池セルCEを室温程度に冷却する時間を短縮することができる。水流路部CLで熱交換された水は、その後水蒸気もしくは温水となって水排出管CPoutから排出される。冷却流路部CLから排出された水蒸気もしくは温水は、燃料電池システムの後段に設けられた給湯用温水タンクに送られ、給湯用の温水として利用することができる。起動工程の実行時は、空気側ではヒーターAH2を作動させて、燃料を混合させて触媒燃焼器CCで燃焼させ高温の空気として空気ヘッダADBから燃料電池セルCEに供給し加熱する。燃料側では、ヒーターAH1で加熱された空気と燃料および水を部分酸化改質器RFPに供給し、部分酸化改質器RFP内の触媒反応により高温の改質ガスを生成する。この高温の改質ガスは燃料配管FPを通って分散室FDBから燃料電池セルCEに供給され、燃料電池セルCEの燃料極を酸化させることなく加熱することができる。この時、水入口バルブCiVは閉じ水流路部CLへの水の供給を停止している図3参照、斜線部は水を示す。停止工程の実行時に供給された水は水流路部CL内に残っているが、高温の改質ガスに加熱されて気化される。水は1気圧化では沸点が100°Cであり97°Cの液体時の熱伝導率と気化した100°Cでの熱伝導率を比較すると、気化することで熱伝導率は約1/30となる。よって起動工程で水流路部CL内の水が気化した後は、水流路部CLは断熱として作用し高温の改質ガスから放熱を抑制し、燃料電池セルCEを効率よく加熱することができる。起動工程で水流路部CL内の水が気化した後は、水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVの両方を閉止することが望ましい。水流路部CL内を閉空間とすることで対流による熱の放散を抑制することができ、起動工程における水流路部CLの断熱性を高めることができる。水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVの両方を閉止し、水流路部CLを閉空間とするタイミングは、起動工程が開始したら水入口バルブCiVを閉止し、水流路部CL内または水排出管CPout内の水の温度、水流路部CLの壁面温度、水流路部CL内または水流路部CLより下流の改質ガス温度のいずれかが所定の温度に達した時に水出口バルブCoVを閉止する。ここで言う所定の温度とは、気化した水の熱伝導率が許容値以下となり水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVの耐圧以下であることが事前に設計確認がなされている温度である。また水排出管CPoutにはバルブの代わりに所定の圧力以上で開放される安全弁を設けることもできる。ここで言う所定の圧力とは、気化した水の熱伝導率が許容値以下となり水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVの耐圧以下であることが事前に設計確認がなされている圧力である。あるいは、起動工程が常に同じ条件化で行われる場合は、水流路部CLを閉空間とするタイミングは、起動工程開始後一定時間が経過したあとに行われるものでもいい。個々で言う一定時間とは、気化した水の熱伝導率が許容値以下となり水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVの耐圧以下であることが事前に設計確認がなされている時間である。このような水入口バルブCiVおよび水出口バルブCoVで閉止する制御手段を持つことで起動工程における断熱作用を効果的かつ継続的に発揮することができる。水蒸気改質器RFSまたは部分酸化改質器RFPから供給される改質ガスには水蒸気が含まれている。よって停止工程において、水流路部CLで冷却された改質ガス内の水蒸気分圧が飽和水蒸気圧以上となり燃料配管FP内で結露しないよう水流路部CLに供給される水の流量は調整される。この水の流量は、水流路部CL内または水流路部CLより下流の改質ガス温度、もしくは水排出管CPout内の水温度から判断される。図5の例では、水流路部CL内に位置する燃料配管FPの一部に結露水貯留部DTが設けられている。停止工程において、水蒸気改質器RFSまたは部分酸化改質器RFPから供給される改質ガスは水流路部CLで水と熱交換することで冷却され、改質ガス内の水蒸気分圧が飽和水蒸気圧以上となることで結露するが、結露水は結露水貯留部DTに貯められる。停止工程において水流路部CLで燃料配管FP内に発生する結露水の量は予め設計確認ができるので、結露水貯留部DTは発生した結露水を十分に貯水できる容量を持たせており、燃料配管FPを閉塞させることはない。結露水貯留部DTに溜まった結露水は、起動工程において高温の改質ガスに加熱されて全て気化され、改質ガスと共に分散室FDBに流れていく。よって、何度起動工程と停止工程を繰り返しても結露水貯留部DTが飽和して燃料配管FPを閉塞させることはない。