"明細書中に記載の発明。本発明の目的は、グラム陽性細菌の疾患および/または感染に対する免疫を提供するためのさらなる、改良された組成物を提供することである。上記組成物は、連鎖球菌のゲノム内のアドヘシンアイランドの同定、および治療的組成物または予防的組成物におけるこれらのアイランドによってコードされるアミノ酸配列の使用に基づく。本発明は、治療的組成物または予防的組成物における他のグラム陽性細菌内の、免疫原性アドヘシンアイランドタンパク質を含有する組成物をさらに含む。発明の要旨本出願人らは、新規のアドヘシンアイランド数種のB群連鎖球菌の血清型および単離体isolateのゲノム内のGBSアドヘシンアイランド1、AI-1またはGBSAI-1を同定した。このアドヘシンアイランドは、細菌の毒性において重要である表面タンパク質をコードすると考えられる。さらに、本出願人らは、GBSアドヘシンアイランド内の表面タンパク質が、GBS細菌の表面上に、これまでに見られなかった線毛構造物を形成することを見出した。このようなGBSアドヘシンアイランドによってコードされるアミノ酸配列は、GBS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方され得るかまたは精製され得る、AI-1表面タンパク質例えば、GBS80を含有する。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。野生型GBS株におけるこの線毛構造物の最初の視覚化のいくつかを示す電子顕微鏡写真は、図16、17、49、および50に示される。さらに、本出願人らは、そのAI表面タンパク質の増加した産生を生じるAI表面タンパク質GBS80を含むプラスミドによって、GBS株を形質転換した。図13~15におけるこの変異GBS株の電子顕微鏡写真は、細菌の表面の部分を覆い、そして上清supernatantへと著しく伸びるようであるGBS80を含む長い、ハイパーオリゴマー構造物を示す。GBSAI表面タンパク質を含むこれらのハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために、精製され得るか、あるいは処方され得る。GBSAI-1は、表面タンパク質およびソルターゼsortaseAI-1タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約5個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、AI-1は、GBS80、GBS104、GBS52、SAG0647およびSAG0648の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。AI-1ポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、AI-1オープンリーディングフレームの1個以上は、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。代表的に、AI-1は、trmAについてのオープンリーディングフレーム中に頻繁に挿入される、約16.1kbのトランスポゾン様エレメント上に存在する。AI-1表面タンパク質配列の1つ以上は、代表的にはLPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のAI表面タンパク質は、上皮細胞に付着し、そして侵入するGBS細菌の能力に影響し得る。AI表面タンパク質はまた、上皮細胞層を通してトランスロケーションを行なうGBSの能力に影響し得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、もしくはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチン、もしくはコラーゲンと会合し得る。ソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関係していると考えられる。AI-1は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、AI-1は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、AI-1は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。上記組成物のGBSAI-1タンパク質は、GBS80、GBS104、GBS52、SAG0647およびSAG0648からなる群より選択され得る。GBSAI-1表面タンパク質GBS80およびGBSAI-1表面タンパク質GBS104は、本発明の免疫原性組成物において使用するのに好ましい。AI-1タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、AI-1はまた、araCのような多岐転写型divergentlytranscribed転写調節因子すなわち、その転写調節因子は、AIタンパク質のオープンリーディングフレームの近傍か、またはそれに隣接して配置されるが、その調節因子は、反対方向に転写されるを含み得る。araCは、GBSAIオペロンの発現を調節し得ると考えられる。E.coliにおける多岐転写型調節因子の考察については、Korbelら、NatureBiotechnology2004227:911-917を参照のこと。第二のアドヘシンアイランド、アドヘシンアイランド-2、AI-2またはGBSAI-2はまた、多くのGBS血清型において同定さている。AI-2のオープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列はまた、GBS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。GBSAI-2は、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約5個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、AI-2は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、SAG1406、01520、01521、01522、01523、01523、01524および01525の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含む。GBSAI-2配列は、2つのサブグループに分けられ得る。1つの実施形態において、AI-2は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、およびSAG1406の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含む。オープンリーディングフレームのこの集合体は、一般にGBSAI-2サブグループ1と称され得る。あるいは、AI-2は、01520、01521、01522、01523、01523、01524および01525の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。オープンリーディングフレームのこの集合体は、一般にGBSAI-2サブグループ2と称され得る。AI-2オープンリーディングフレームのポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、AI-2オープンリーディングフレームの1個以上は、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。AI-2表面タンパク質の1つ以上は、代表的にはLPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関係していると考えられる。AI-2は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、AI-2は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、AI-2は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフを含み得る。上記組成物のAI-2タンパク質は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、SAG1406、01520、01521、01522、01523、01523、01524および01525からなる群より選択され得る。AI-2表面タンパク質GBS67、GBS59、および01524は、本発明の免疫原性組成物に使用するのに好ましいAI-2タンパク質である。GBS67またはGBS59が、特に好ましい。GBSAI-2はまた、RofA様タンパク質のような多岐転写型転写調節因子例えば、rogBを含み得る。AI-1における場合、rogBは、AI-2オペロンの発現を調節すると考えられる。本発明のGBSAIタンパク質は、GBS感染に対する予防的な免疫または治療的な免疫のための免疫原性組成物において使用され得る。例えば、本発明は、1つ以上のGBSAI-1タンパク質および1つ以上のGBSAI-2タンパク質を含有する免疫原性組成物を含み得る。上記免疫原性組成物はまた、GBS血清型およびGBS株単離体の範囲の増加に対して保護を提供するように選択され得る。例えば、上記免疫原性組成物は、第1および第2のGBSAIタンパク質を含有し得、第1のGBSAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列は、第2のGBSAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列を含むゲノム中に存在しない。さらに、上記免疫原性組成物において使用するために選択される各抗原は、好ましくは複数のGBS血清型およびGBS株単離体のゲノム中に存在する。好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、またはそれより多くのGBS株単離体のゲノム中に存在する。より好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、少なくとも3種、4種、5種またはそれより多くのGBS血清型のゲノム中に存在する。GBSAI-1内において、本出願人らは、GBS104のB群連鎖球菌の表面露出が、GBS80の同時発現に依存することを見出した。GBS80は、細菌の表面へのGBS104の輸送または局在化に関係すると考えられる。これらの2つのタンパク質は、オリゴマー化され得るか、あるいは、化学的かまたは物理的に結合される。この結合は、GBS細菌の表面への転位を促進するGBS104の立体構造変化を含むと考えられる。さらに、1つ以上のAIソルターゼはまた、この表面への局在化および化学的結合または物理的結合に関係し得る。同様の関係が、GBSAI-2内に存在すると考えられる。従って、本発明の組成物は、少なくとも2つのAIタンパク質を含み得、これらの2つのAIタンパク質は、物理的かまたは化学的に結合される。好ましくは、上記2つのAIタンパク質は、オリゴマーを形成する。好ましくは、上記AIタンパク質の1つ以上は、ハイパーオリゴマー形態にある。1つの実施形態において、上記結合したAIタンパク質は、GBS細菌または組換え宿主細胞から精製されても単離されてもよい。本発明の目的はまた、グラム陽性細菌の疾患および/もしくは感染に対する予防的な保護または治療的な保護を提供するためのさらなる、改良された組成物を提供することである。上記組成物は、連鎖球菌のゲノム内のアドヘシンアイランドの同定および治療的組成物または予防的組成物中のこれらのアイランドによってコードされたアミノ酸配列の使用に基づく。本発明は、治療的組成物または予防的組成物中に他のグラム陽性細菌内の免疫原性アドヘシンアイランドタンパク質を含有する組成物をさらに含む。本発明において使用するための好ましいグラム陽性菌のアドヘシンアイランドタンパク質は、ブドウ球菌属例えば、S.aureus、連鎖球菌属例えば、S.agalactiaeGBS、S.pyogenesGAS、S.pneumonaie、S.mutans、エンテロコッカス属例えば、E.faecalisおよびE.faecium、クロストリジウム属例えば、C.difficile、リステリア属例えば、L.monocytogenesおよびコリネバクテリウム属例えば、C.diphtheriaに由来し得る。好ましくは、上記グラム陽性菌のアドヘシンアイランド表面タンパク質は、オリゴマー形態またはハイパーオリゴマー形態にある。例えば、本出願人らは、数種のA群連鎖球菌の血清型および単離体のゲノム内のアドヘシンアイランドを同定した。これらのアドヘシンアイランドは、細菌の毒性において重要である表面タンパク質をコードすると考えられ、そして本出願人らは、A群連鎖球菌の表面上のハイパーオリゴマー線毛構造物におけるこれらのアドヘシンアイランドタンパク質の存在を示す最初の電子顕微鏡写真を得た。A群連鎖球菌は、咽頭炎および膿痂疹から生命を危うくする侵襲性の疾患および壊死性筋膜炎の範囲の広範な種々の疾患を引き起こす、ヒトに特異的な病原体である。さらに、連鎖球菌感染後の自己免疫応答は、いまだ小児における心臓の病態の主要な原因である。ヒト宿主のA群連鎖球菌感染は、一般的に3つの段階において起こり得る。第1段階は、宿主組織中へ付着および/または侵入ならびに細胞外領域内での細菌の増殖を含む。一般に、この付着段階は、咽頭または皮膚において始まる。感染された組織のレベルが深刻より深くになるにつれて、引き起こされ得る損傷は、より重篤になる。感染の第2段階において、上記細菌は、周囲の組織、または脈管構造を経て全身にさえ拡散する可溶性毒素を分泌する。この毒素は、感受性の宿主細胞レセプターに結合し、そしてこれらの宿主細胞による不適切なinnappropropriate免疫応答を誘発し、病態を生じる。この毒素は、宿主全体に拡散し得るので、GAS毒素によって直接引き起こされる壊死は、細菌感染から物理的に離れた部位に位置し得る。GAS感染の最後の段階は、最初の細菌が宿主系から排除されたずっと後に起こり得る。この段階において、GAS細菌に対する宿主の先の免疫応答は、GAS表面タンパク質Mのエピトープと宿主組織例えば、心臓との間の交差反応性に起因する。GAS感染の概説は、PrinciplesofBacterialPathogeneis、Groisman編、第15章、2001に見出され得る。GAS感染の後期に付随する病原性の効果を予防するために、GASに対して有効なワクチンは、好ましくは、最初の付着および侵入の段階の間に、宿主による細菌の排除を容易にする。A群連鎖球菌の単離体は、伝統的に、上に記載されるようなM表面タンパク質に従って分類される。上記Mタンパク質は、αへリックス形態で複合体を形成する2つのポリペプチド鎖を含む、表面に露出したトリプシン感受性タンパク質である。そのカルボキシル末端は、菌の細胞膜に係留され、そして全てのA群連鎖球菌の間で高度に保存される。細胞壁を通して細胞表面へと伸びるアミノ末端は、Mタンパク質の80種以上の血清型の間で観察される抗原多様性に関与する。分類の第2の層は、一般的にT-抗原と称される、可変性の、トリプシン抵抗性の表面抗原に基づく。数十年間にわたるMおよびTの血清学的な分類に基づく疫学は、A群連鎖球菌の生物学的多様性および疾患を引き起こす潜在能力における研究について中心的であった。M-タンパク質成分およびその固有の可変性は、広範囲に特徴付けられてきたが、50年間にわたる研究の後でさえ、T-抗原の構造および可変性については、いまだほとんど知られていない。T型を規定する抗血清は、Sevapharmahttp://www.sevapharma.cz/enが挙げられる数種の供給源から市販されている。GASD741のM6株由来のT-抗原の1つの形態をコードする遺伝子T-型6は、クローニングされ、かつ特徴付けられ、そしてそれは、約11kbの高度に可変性である病原性アイランドpathogenicityislandに位置する。Schneewindら、JBacteriol.19901726:3310-3317。このアイランドは、それが、T6コード遺伝子tee6に加えて、細胞外マトリックスECM結合タンパク質をコードする遺伝子のファミリーの一員を含むので、フィブロネクチン結合性の、コラーゲン結合T-抗原FCT領域として公知である。Bessenら、InfectionImmunity2002703:1159-1167。この遺伝子ファミリーのタンパク質産物の数種は、フィブロネクチンおよび/またはコラーゲンのいずれかに直接結合することが示されている。Hanskiら、InfectionImmunity19926012:5119-5125;Talayら、InfectionImmunity1992609:3837-3844;Jaffeら、1996212:373-384;Rochaら、AdvExpMedBiol.1997418:737-739;Kreikemeyerら、JBiolChem200427916:15850-15859;Podbielskiら、Mol.Microbiol.1999314:1051-64;およびKreikemeyerら、Int.J.MedMicrobiol20042942-3:177-88を参照のこと。いくつかの場合において、付着および侵入におけるこれらのタンパク質の役割についての直接的な証拠が、得られている。本出願人らは、tee6遺伝子の組換え産物に対する抗血清を産生し、そしてM6株2724におけるT6の発現を探索するためにその抗血清を使用した。この株のムタノリシンmutanolysin抽出物の免疫ブロットにおいて、抗血清は、その産物の予想された分子量に対応するバンドに加えて、約100kDaから、使用した3~8の勾配ゲルの分解能を超えるまでの移動度の範囲にある非常に高い分子量のラダーを認識した。高分子量産物のこのパターンは、Streptococcusagalactiae上に記載されるにおいて同定された線毛および先にCorynebacteriumdiphtheriaeにおいて同定された線毛のタンパク質成分の免疫ブロットにおいて観察されたパターンと同様である。tee6の産物に特異的な抗血清を用いた株M6_2724の電子顕微鏡法は、十分な表面の染色、および細菌の表面から700ナノメートルまで伸びる長い線毛様構造物を示した。このことは、T6タンパク質従来のランスフィールド血清型検査システムにおいて認識される抗原の1つがGASアドヘシンアイランドGASAI-1内に位置し、そして長い共有結合した線毛構造物を形成することを示す。本出願人らは、少なくとも4つの異なるA群連鎖球菌のアドヘシンアイランドを同定した。これらのGASAI配列は、多くのM型において同定され得る一方で、本出願人らは、驚くべきことに、4つの異なるGASAI型由来の4つの主要な線毛サブユニットと、特定のT分類との間の相関を見出した。他のトリプシン抵抗性の表面露出タンパク質はまた、T分類の命名に関連するようであり、T分類およびGAS血清型の相違におけるGASアドヘシンアイランドおよび関連するハイパーオリゴマー線毛様構造物の役割の発見は、GAS感染の予防および処置に対して重要な意味を有する。本出願人らは、線毛の形成に関連する各々のGASアドヘシンアイランド内のタンパク質成分を同定した。これらのタンパク質は、細菌の最初の付着機構に関連していると考えられる。これらのタンパク質の免疫学的な認識は、宿主免疫応答がより病原性である感染の後期への細菌の移行を遅らせるか、または予防することを可能にし得る。さらに、本出願人らは、GBSの線毛構造物がバイオフィルム表面上の細胞増殖の集団、多くの場合にエキソポリサッカリドマトリックス中に封入されるの形成に関係するようであることを見出した。抗生物質による処置および宿主免疫応答は、頻繁に、バイオフィルムの細菌成分の全てが広がらないようにすることができないように、バイオフィルムは、一般的に、細菌の抵抗性に関連する。細菌の付着の第1の段階の間すなわち、完全なバイオフィルムの形成前の、露出した表面タンパク質に対する宿主免疫応答の方向が、好ましい。従って、本発明は、宿主の上皮細胞に対する最初の付着の試みの間にGAS細菌を標的化し得るGAS感染に対する改良された免疫原性組成物を提供し、そして広範なGAS血清型からの保護を提供し得る。本発明の免疫原性組成物は、オリゴマー形態、またはハイパーオリゴマー線毛形態で処方され得るGASAI表面タンパク質を含む。本発明の免疫原性組成物は、1つ以上のGASAI表面タンパク質を含み得る。本発明はまた、GASAI表面タンパク質の組み合わせを含む。GASAI表面タンパク質の組み合わせは、同じアドヘシンアイランドから選択され得るか、またはGASAI表面タンパク質の組み合わせは、異なるGASアドヘシンアイランドから選択され得る。このようなGASアドヘシンアイランドによってコードされるアミノ酸配列は、GAS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方されるかまたは精製された、GASAI表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。一般的に、GASアドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードするGASゲノム内に一連のオープンリーディングフレームを含む。GASアドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードし得る。従って、上記アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASアドヘシンアイランドは、少なくとも2つの表面タンパク質、および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASアドヘシンアイランドは、少なくとも3つの表面タンパク質、および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。1つ以上のGASAI表面タンパク質は、上記グラム陽性細菌の表面上の線毛構造物の形成に関与し得る。本発明のGASアドヘシンアイランドは、好ましくは、多岐転写型転写調節因子を含む。上記転写調節因子は、GASAIオペロンの発現を調節し得る。GASAI配列において見出される転写調節因子の例としては、RofAおよびNraが挙げられる。GASAI表面タンパク質は、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンに結合し得るか、あるいはフィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンに付着し得る。GASAI表面タンパク質の1つ以上は、線毛fimbrial構造物サブユニットを含み得る。GASAI表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。LPXTGモチーフの後に、膜局在性のソルターゼによる認識を容易にするために細胞膜中のタンパク質を遅らせるretardと考えられる、疎水性領域および荷電したC末端が続き得る。Barnettら、J.Bacteriology200418617:5865-5875を参照のこと。GASAI配列は、一般的に、上記アイランドの中のソルターゼ配列の数および型ならびに上記アイランドの中の他のタンパク質RofAおよびcpaを除くの同一性のに依存して、1型、2型、3型、または4型としてカテゴリー化され得る。GASアドヘシンアイランドの概略図は、図51Aおよび図162に示される。GASアドヘシンアイランド-1またはGASAI-1は、表面タンパク質およびソルターゼGASAI-1タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約5個のオープンリーディングフレームを含む。GASAI-1は、好ましくは、表面タンパク質、srtBソルターゼおよびrofA多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI-1表面タンパク質は、フィブロネクチン結合タンパク質、コラーゲン付着タンパク質および線毛fimbrial構造物サブユニットを含み得る。上記線毛fimbrial構造物サブユニットtee6としても公知であるは、線毛様構造物の軸部分を形成すると考えられるが、上記コラーゲン付着タンパク質Cpaは、細菌莢膜の表面上に露出される、線毛構造物の形成を容易にするアクセサリーaccessoryタンパク質として作用すると考えられる。具体的には、GASAI-1は、M6_Spy0157、M6_Spy0158、M6_Spy0159、M6_Spy0160、M6_Spy0161の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。GASAI-1はまた、CDCSS410_線毛fimbrial、ISS3650_線毛fimbrial、DSM2071_線毛fimbrialのいずれか1つをコードするポリヌクレオチド配列を含み得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方され得るか、または精製され得るGASAI-1表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。あるいは、本発明の免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態の単離されたGASAI-1表面タンパク質を含み得る。GASAI-1表面タンパク質を含むオリゴマー構造物またはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、あるいは処方され得る。GASAI-1ポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-1オープンリーディングフレームの1個以上は、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。GASAI-1表面タンパク質の1つ以上は、代表的にはLPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関係していると考えられる。GASAI-1は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-1は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-1は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフを含み得る。GASAI-1は、好ましくは、srtBソルターゼを含む。GASsrtBソルターゼは、好ましくは、LPSTGモチーフ配列番号166を有する表面タンパク質を係留し得る特に、このモチーフの後に、セリンが続く場合。上記組成物のGASAI-1タンパク質は、M6_Spy0157、M6_Spy0158、M6_Spy0159、M6_Spy0160M6_Spy0161、CDCSS410_線毛fimbrial、ISS3650_線毛fimbrial、およびDSM2071_線毛fimbrialからなる群より選択され得る。GASAI-1表面タンパク質M6_Spy0157フィブロネクチン結合タンパク質、M6_Spy0159コラーゲン付着タンパク質、Cpa、M6_Spy0160線毛fimbrial構造物サブユニット、tee6、CDCSS410_線毛fimbrial線毛fimbrial構造物サブユニット、ISS3650_線毛fimbrial線毛fimbrial構造物サブユニット、およびDSM2071_線毛fimbrial線毛fimbrial構造物サブユニットは、本発明の免疫原性組成物において使用するのに好ましいGASAI-1タンパク質である。線毛fimbrial構造物サブユニットtee6およびコラーゲン付着タンパク質Cpaは、好ましいGASAI-1表面タンパク質である。好ましくは、これらのGASAI-1表面タンパク質の各々は、LPXTGソルターゼ基質モチーフを含む例えば、LPXTG配列番号122またはLPXSG配列番号134トレオニンのセリンによる保存的置換。GASAI-1タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-1はまた、rofAのような多岐転写型転写調節因子すなわち、その転写調節因子は、GASAIタンパク質のオープンリーディングフレームの近傍か、またはそれに隣接して配置されるが、その調節因子は、反対方向に転写されるを含み得る。GASAI-1表面タンパク質は、単独か、他のGASAI-1表面タンパク質と組み合わせてか、または他のGASAI表面タンパク質と組み合わせて使用され得る。好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-1線毛fimbrial構造物サブユニットtee6およびGASAI-1コラーゲン結合タンパク質を含む。よりさらに好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-1線毛fimbrial構造物サブユニットtee6を含む。第二のGAS付着アイランドGASアドヘシンアイランド-2またはGASAI-2はまた、GAS血清型において同定されている。GASAI-2オープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列はまた、GAS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方され得るか、または精製され得るGASAI-2表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。あるいは、本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態の単離されたGASAI-2表面タンパク質を含む。GASAI-2表面タンパク質を含むオリゴマー構造物またはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、あるいは処方され得る。GASAI-2は、表面タンパク質およびソルターゼGASAI-2タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約8個のオープンリーディングフレームを含む。GASAI-2は、好ましくは、表面タンパク質、srtBソルターゼ、srtC1ソルターゼおよびrofA多岐転写型転写調節因子を含む。具体的には、GASAI-2は、GAS15、Spy0127、GAS16、GAS17、GAS18、Spy0131、Spy0133、およびGAS20の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。GASAI-2ポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-2オープンリーディングフレームの1個以上は、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。GASAI-2表面タンパク質の1つ以上は、代表的にはLPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関係すると考えられる。GASAI-2は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-2は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-2は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフを含み得る。GASAI-2は、好ましくはsrtBソルターゼおよびsrtC1ソルターゼを含む。上で考察される通り、GASsrtBソルターゼは、好ましくはLPSTGモチーフ配列番号166を有する表面タンパク質を係留し得る特に、このモチーフの後に、セリンが続く場合。GASsrtC1ソルターゼは、VP/VPTG配列番号167モチーフを有する表面タンパク質を優先的に係留し得る。GASsrtC1は、rofAによって差次的に調節され得る。上記組成物のGASAI-2タンパク質は、GAS15、Spy0127、GAS16、GAS17、GAS18、Spy0131、Spy0133、およびGAS20からなる群より選択され得る。GASAI-2表面タンパク質GAS15Cpa、GAS16線毛fimbrialタンパク質M1_128であると考えられる、GAS18M1_Spy0130、およびGAS20は、本発明の免疫原性組成物において使用するのに好ましい。GAS16は、線毛様構造物の軸部分を形成すると考えられる一方で、GAS15コラーゲン付着タンパク質CpaおよびGAS18は、細菌莢膜の表面上に露出される、線毛構造物の形成を容易にするアクセサリータンパク質として作用すると考えられる。好ましくは、これらのGASAI-2表面タンパク質の各々は、LPXTGソルターゼ基質モチーフ例えば、LPXTG配列番号122、VVXTG配列番号135、またはEVXTG配列番号136を含む。GASAI-2タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-2はまた、rofAのような多岐転写型転写調節因子すなわち、その転写調節因子は、GASAIタンパク質のオープンリーディングフレームの近傍か、またはそれに隣接して配置されるが、その調節因子は、反対方向に転写されるを含み得る。GASAI-2表面タンパク質は、単独か、他のGASAI-2表面タンパク質と組み合わせてか、または他のGASAI表面タンパク質と組み合わせて使用され得る。好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-2線毛fimbrialタンパク質GAS16、GASAI-2コラーゲン結合タンパク質GAS15およびGAS18M1_Spy0130を含む。より好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-2線毛fimbrialタンパク質GAS16を含む。第3のGAS付着アイランドGASアドヘシンアイランド-3またはGASAI-3はまた、多くのGAS血清型において同定されている。GASAI-3のオープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列はまた、GAS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方され得るか、または精製され得るGASAI-3表面タンパク質を含有する。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。あるいは、本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態の単離されたGASAI-3表面タンパク質を含有する。GASAI-3表面タンパク質を含むオリゴマー構造物またはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、あるいは処方され得る。GASAI-3は、表面タンパク質およびソルターゼGASAI-3タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約7個のオープンリーディングフレームを含む。GASAI-3は、好ましくは、表面タンパク質、srtC2ソルターゼ、および負の転写調節因子Nraである多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI-3表面タンパク質は、コラーゲン結合タンパク質、線毛fimbrialタンパク質、およびF2様フィブロネクチン結合タンパク質を含み得る。GASAI-3表面タンパク質はまた、仮説的な表面タンパク質を含み得る。線毛fimbrialタンパク質は、線毛様構造物の軸部分を形成すると考えられる一方で、コラーゲン付着タンパク質Cpaおよび仮説的な表面タンパク質は、細菌莢膜の表面上に露出される、線毛構造物の形成を容易にするアクセサリータンパク質として作用すると考えられる。好ましいAI-3表面タンパク質は、線毛fimbrialタンパク質、コラーゲン結合タンパク質および仮説的なタンパク質を含む。好ましくは、これらのGASAI-3表面タンパク質の各々は、LPXTGソルターゼ基質モチーフ例えば、LPXTG配列番号122、VPXTG配列番号137、QVXTG配列番号138またはLPXAG配列番号139を含む。具体的には、GASAI-3は、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、SpyM3_0104、Sps0100、Sps0101、Sps0102、Sps0103、Sps0104、Sps0105、Sps0106、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、orf84、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。1つの実施形態において、GASAI-3は、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、およびSpyM3_0104の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。あるいは、GASAI-3は、Sps0100、Sps0101、Sps0102、Sps0103、Sps0104、Sps0105、およびSps0106の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。あるいは、GASAI-3は、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、およびorf84の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。あるいは、GASAI-3は、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、およびspyM18_0132の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。あるいは、GASAI-3は、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、およびSpyoM01000149の2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。あるいは、GASAI-1はまた、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialのいずれか1つをコードするポリヌクレオチド配列を含み得る。GASAI-3ポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-3オープンリーディングフレームの1個以上は、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。GASAI-3表面タンパク質の1つ以上は、代表的にはLPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関係すると考えられる。GASAI-3は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-3は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-3は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフを含み得る。GASAI-3は、好ましくはsrtC2型ソルターゼを含む。GASsrtC2型ソルターゼは、好ましくは、QVPTG配列番号140モチーフを有する表面タンパク質を係留し得る特に、このモチーフの後に、疎水性領域および荷電したC末端尾部が続く場合。GASSrtC2は、Nraによって差次的に調節され得る。上記組成物のGASAI-3タンパク質は、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、SpyM3_0104、Sps0100、Sps0101、Sps0102、Sps0103、Sps0104、Sps0105、Sps0106、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、orf84、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialからなる群より選択され得る。GASAI-3表面タンパク質SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0102、SPs0104、SPs0106、orf78、orf80、orf82、orf84、spyM18_0126、spyM18_0128、spyM18_0130、spyM18_0132、SpyoM01000155、SpyoM01000153、SpyoM01000151、SpyoM01000149、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialは、本発明の免疫原性組成物において使用するのに好ましいGASAI-3タンパク質である。GASAI-3タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-3はまた、転写調節因子例えば、Nraを含み得る。GASAI-3はまた、LepA推定シグナルペプチダーゼIタンパク質を含み得る。GASAI-3表面タンパク質は、単独か、他のGASAI-3表面タンパク質と組み合わせてか、または他のGASAI表面タンパク質と組み合わせて使用され得る。好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-3線毛fimbrialタンパク質、GASAI-3コラーゲン結合タンパク質、GASAI-3表面タンパク質例えば、SpyM3_0102、M3_Sps0104、M5_orf82、またはspyM18_0130、およびフィブロネクチン結合タンパク質PrtF2を含む。より好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-3線毛fimbrialタンパク質、GASAI-3コラーゲン結合タンパク質、およびGASAI-3表面タンパク質を含む。よりさらに好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-3線毛fimbrialタンパク質を含む。GASAI-3線毛fimbrialタンパク質の代表的な例としては、SpyM3_0100、M3_Sps0102、M5_orf80、spyM18_128、SpyoM01000153、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、ISS4959_線毛fimbrialが挙げられる。GASAI-3コラーゲン結合タンパク質の代表的な例としては、SpyM3_0098、M3_Sps0100、M5_orf78、spyM18_0126、およびSpyoM01000155が挙げられる。GASAI-3フィブロネクチン結合タンパク質PrtF2の代表的な例としては、SpyM3_0104、M3_Sps0106、M5_orf84およびspyM18_0132、ならびにSpyoM01000149が挙げられる。第4のGAS付着アイランドGASアドヘシンアイランド-4またはGASAI-4はまた、GAS血清型において同定されている。GASAI-4のオープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列はまた、GAS感染の処置または予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方され得るか、または精製され得るGASAI-4表面タンパク質を含有する。好ましい実施形態において、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。あるいは、本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態の単離されたGASAI-4表面タンパク質を含有する。GASAI-3表面タンパク質を含むオリゴマー構造物またはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、あるいは処方され得る。GASAI-4表面タンパク質を含むオリゴマー線毛構造物またはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、あるいは処方され得る。GASAI-4は、表面タンパク質およびソルターゼGASAI-4タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約8個のオープンリーディングフレームを含む。このGASアドヘシンアイランド4GASAI-4は、表面タンパク質、srtC2ソルターゼ、およびRofA調節タンパク質を含む。GASAI-4表面タンパク質は、その中に、線毛fimbrialタンパク質、F1様フィブロネクチン結合タンパク質およびF2様フィブロネクチン結合タンパク質、ならびに莢膜多糖類付着タンパク質cpaを含み得る。GASAI-4表面タンパク質はまた、オープンリーディングフレームorf中に仮説的な表面タンパク質を含み得る。線毛fimbrialタンパク質EftLSLは、線毛様構造物の軸部分を形成すると考えられ、一方、コラーゲン付着タンパク質Cpaおよび上記仮説上のタンパク質は、細菌莢膜の表面上に露出して、線毛構造物の形成を促進するアクセサリータンパク質として作用すると考えられる。好ましくは、これらのGASAI-4表面タンパク質の各々は、LPXTGソルターゼ基質モチーフ例えば、LPXTG配列番号122、VPXTG配列番号137、QVXTG配列番号138もしくはLPXAG配列番号139を含む。具体的には、GASAI-4は、19224134、19224135、19224136、19224137、19224138、19224139、19224140、および19224141の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。GASAI-4ポリヌクレオチドはまた、20010296_fimbrial、20020069_fimbrial、CDCSS635_fimbrial、ISS4883_fimbrial、ISS4538_fimbrialのいずれか1つをコードするポリヌクレオチド配列を含む。1つ以上のGASAI-4ポリヌクレオチド配列は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、1つ以上のGASAI-4オープンリーディングフレームは、置換されたORFに対して配列相同性配列同一性を有する配列によって置換され得る。1つ以上のGASAI-4表面タンパク質は、代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTGを含む表面タンパク質の分泌および係留に関与すると考えられる。GASAI-4は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-4は、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-4は、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。1つ以上の表面タンパク質は、LPXTGモチーフを含み得る。GASAI-4は、SrtC2型ソルターゼを含む。GASSrtC2型ソルターゼは、好ましくはQVPTG配列番号140モチーフを有する表面タンパク質を係留し得る特に、このモチーフに、疎水性領域および荷電C末端尾部が続く場合。この組成物のGASAI-4タンパク質は、19224134、19224135、19224136、19224137、19224138、19224139、19224140、19224141、20010296_fimbrial、20020069_fimbrial、CDCSS635_fimbrial、ISS4883_fimbrial、およびISS4538_fimbrialからなる群から選択され得る。GASAI-4表面タンパク質である19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_fimbrial、20020069_fimbrial、CDCSS635_fimbrial、ISS4883_fimbrial、ISS4538_fimbrialは、本発明の免疫原性組成物における使用のために好ましいタンパク質である。GASAI-4タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-4はまた、RofAすなわち、AIタンパク質オープンリーディングフレームの近位に位置するかもしくはこれに隣接して位置する転写調節因子であるが、これは逆方向に転写するのような多岐転写型転写調節因子を含み得る。GASAI-4はまた、LepA推定シグナルペプチダーゼIタンパク質およびMsmRLタンパク質を含む。GASAI-4表面タンパク質は、単独で使用されてもよく、他のGASAI-4表面タンパク質と組み合わせて使用されてもよく、または他のGASAI表面タンパク質と組み合わせて使用されてもよい。好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-4線毛fimbrialタンパク質EftLSLまたは20010296_fimbrial、20020069_fimbrial、CDCSS635_fimbrial、ISS4883_fimbrial、もしくはISS4538_fimbrial、GASAI-4コラーゲン結合性タンパク質、GASAI-4表面タンパク質例えば、M12単離物A735orf2、およびフィブロネクチン結合性タンパク質PrtF1およびPrtF2を含む。より好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-4線毛fimbrialタンパク質、GASAI-4コラーゲン結合性タンパク質、およびGASAI-4表面タンパク質を含む。なおより好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、GASAI-4線毛fimbrialタンパク質を含む。本発明のGASAIタンパク質は、GAS感染に対する予防的免疫もしくは治療的免疫のための免疫原性組成物に使用され得る。例えば、本発明は、1種以上のGASAI-1タンパク質およびGASAI-2、GASAI-3、もしくはGASAI-4タンパク質のいずれかの1種以上を含有する免疫原性組成物を含み得る。例えば、本発明は、少なくとも2種のGASAIタンパク質であって、ここで各タンパク質は、異なるGASアドヘシンアイランドから選択される、GASAIタンパク質を含有する免疫原性組成物を含む。この2種のGASAIタンパク質は、以下のGASAI組み合わせの1種から選択され得る:GASAI-1およびGASAI-2;GASAI-1およびGASAI-3;GASAI-1およびGASAI-4;GASAI-2およびGASAI-3;GASAI-2およびGASAI-4;ならびにGASAI3およびGASAI-4。好ましくは、この組み合わせは、1つ以上のGASアドヘシンアイランドに由来する線毛fimbrialタンパク質を含む。この免疫原性組成物はまた、より広範な範囲のGAS血清型および単離株に対する保護を提供するように選択され得る。例えば、免疫原性組成物は、第1のGASAIタンパク質および第2のGASAIタンパク質を含有し得、ここで、第1のGASAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列は、第2のGASAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列を含むゲノム中に存在しない。さらに、免疫原性組成物における使用のために選択される各抗原は、好ましくは、複数のGAS血清型および単離株のゲノム中に存在する。好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、またはそれより多くのGAS単離株のゲノムにおいて存在する。より好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、少なくとも3種、4種、5種、またはそれより多くのGAS血清型のゲノムにおいて存在する。本出願人らはまた、Streptococcuspneumoniaeのゲノム内においてアドヘシンアイランドを同定している。これらのアドヘシンアイランドは、細菌のビルレンスにおいて重要である表面タンパク質をコードすると考えられる。このようなS.pneumoniaeアドヘシンアイランドによってコードされるアミノ酸配列は、S.pneumoniae感染の処置もしくは予防のための免疫原性組成物において使用され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方されるかまたは精製されている、S.pneumoniaeAI表面タンパク質を含有する。好ましい実施形態において、このオリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。または、本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で単離されたS.pneumoniae表面タンパク質を含有する。S.pneumoniae表面タンパク質を含むこのオリゴマーもしくはハイパーオリゴマーの線毛構造物は、精製され得るか、またはさもなければ免疫原性組成物における使用のために処方され得る。S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、一般に、表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードするS.pneumoniaeゲノム内部に、一連のオープンリーディングフレームを含む。S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードし得る。あるいは、S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。1つ以上の表面タンパク質は、LPTXGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。1種以上のS.pneumoniaeAI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌の表面上の線毛構造物の形成に関与し得る。本発明のS.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、好ましくは、多岐転写型転写調節因子を含む。この転写調節因子は、S.pneumoniaeAIオペロンの発現を調節し得る。S.pneumoniaeAI配列において見出された転写調節因子の例は、rlrAである。S.pneumoniaeAI遺伝子座の構成の図は、図137に提供される。この遺伝子座は、転写調節因子rlrA、細胞壁表面タンパク質rrgA、rrgB、rrgCおよびソルターゼsrtB、srtC、srtDをコードするオープンリーディングフレームを含む。S.pneumoniaeAI配列は、一般に、相同性の2つの群であるS.pneuamoniaeAI-aおよびS.pneuamoniaeAI-bに分類され得る。AI-aを含むS.pneumoniae株としては、14CSR10、19AHungary6、23FPoland15、670、6BFinland12、および6BSpain2が挙げられる。AI-bを含むS.pneumoniaeAI株としては、19FTaiwan14、9VSpain3、23FTaiwan15およびTIGR4が挙げられる。TIGR4由来のS.pneumoniaeAI株は、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIは、SP0462、SP0463、SP0464、SP0465、SP0466、SP0467、およびSP0468の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。TIGR4由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株670AIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株670AIは、orf1_670、orf3_670、orf4_670、orf5_670、orf6_670、orf7_670、およびorf8_670の2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。S.pneumoniae株670AIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、S.pneumoniae株670AIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。14CSR10由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、14CSR10由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_14CSR、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF6_14CSR、ORF7_14CSR、およびORF8_14CSRの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。14CSR10由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、14CSR10由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。19AHungary6由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、19AHungary6由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_19AH、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF6_19AH、ORF7_19AH、およびORF8_19AHの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。19AHungary6由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、19AHungary6由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。19FTaiwan14由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、19FTaiwan14由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_19FTW、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF6_19FTW、ORF7_19FTW、およびORF8_19FTWの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。19FTaiwan14由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、19FTaiwan14由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_23FP、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF6_23FP、ORF7_23FP、およびORF8_23FPの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。23FTaiwan15由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、23FTaiwan15由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_23FTW、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF6_23FTW、ORF7_23FTW、およびORF8_23FTWの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。23FTaiwan15由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、23FTaiwan15由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。6BFinland12由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、6BFinland12由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_6BF、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF6_6BF、ORF7_6BF、およびORF8_6BFの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。6BFinland12由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、6BFinland12由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。6BSpain2由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、6BSpain2由来のS.pneumoniaeAIは、ORF2_6BSP、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF6_6BSP、ORF7_6BSP、およびORF8_6BSPの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。6BSpain2由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、6BSpain2由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。9VSpain3由来のS.pneumoniaeAIは、表面タンパク質およびソルターゼS.pneumoniaeAIタンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連の約7つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、9VSpain3由来のS.pneumoniaeAIはORF2_9VSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、ORF6_9VSP、ORF7_9VSP、およびORF8_9VSPの2つ以上をコードするポリヌクレオチド配列を含む。9VSpain3由来のS.pneumoniaeAIポリヌクレオチド配列の1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。または、9VSpain3由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームの1つ以上は、置換されたORFに対する配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniaeAI表面タンパク質の1つ以上は、代表的に、LPXTGモチーフ例えばLPXTG配列番号122もしくは他のソルターゼ基質モチーフを含む。これらのソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると考えられる。S.pneumoniaeAIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。または、S.pneumoniaeAIは、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniaeAIは、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。1つ以上の表面タンパク質は、LPXTGモチーフを含む。この組成物のS.pneumoniaeAIタンパク質は、SP0462、SP0463、SP0464、SP0465、SP0466、SP0467、SP0468、orf1_670、orf3_670、orf4_670、orf5_670、orf6_670、orf7_670、orf8_670、ORF2_14CSR、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF6_14CSR、ORF7_14CSR、ORF8_14CSR、ORF2_19AH、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF6_19AH、ORF7_19AH、ORF8_19AH、ORF2_19FTW、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF6_19FTW、ORF7_19FTW、ORF8_19FTW、ORF2_23FP、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF6_23FP、ORF7_23FP、ORF8_23FP、ORF2_23FTW、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF6_23FTW、ORF7_23FTW、ORF8_23FTW、ORF2_6BF、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF6_6BF、ORF7_6BF、ORF8_6BF、ORF2_6BSP、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF6_6BSP、ORF7_6BSP、ORF8_6BSP、ORF2_9VSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、ORF6_9VSP、ORF7_9VSPおよびORF8_9VSPからなる群より選択され得る。S.pneumoniaeAI表面タンパク質は、本発明の免疫原性組成物における使用のために好ましいタンパク質である。1つの実施形態において、本発明の組成物は、2種以上のSpneumoniaeAI表面タンパク質の組み合わせを含有する。このましくは、このような組み合わせは、以下からなる群の2種以上より選択される:SP0462、SP0463、SP0464、orf3_670、orf4_670、orf5_670、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、およびORF5_9VSP。S.pneumoniaeAIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniaeAIはまた、転写調節因子を含み得る。本発明のS.pneumoniaeAIタンパク質は、S.pneumoniae感染に対する予防的免疫および治療的免疫のための免疫原性組成物において使用され得る。例えば、本発明は、1種以上のTIGR4由来のS.pneumoniaeAIタンパク質および1種以上のS.pneumoniae株670タンパク質を含有する免疫原性組成物を含み得る。この免疫原性組成物は、S.pneumoniae株TIGR4、S.pneumoniae株19AHungary6、S.pneumoniae株6BFinland12、S.pneumoniae株6BSpain2、S.pneumoniae株9VSpain3、S.pneumoniae株14CSR10、S.pneumoniae株19FTaiwan14、S.pneumoniae株23FTaiwan15、S.pneumoniae株23FPoland16、およびS.pneumoniae株670の任意の1種以上に由来する1種以上のAIタンパク質を含有し得る。この免疫原性組成物はまた、より広範な範囲のS.pneumoniaeの血清型および単離株に対する保護を提供するように選択され得る。例えば、免疫原性組成物は、第1のS.pneumoniaeAIタンパク質および第2のS.pneumoniaeAIタンパク質を含有し得、ここで、第1のS.pneumoniaeAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列は、第2のS.pneumoniaeAIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列を含むゲノム中に存在しない。さらに、免疫原性組成物における使用のために選択される各抗原は、好ましくは、複数のS.pneumoniae血清型および単離株のゲノム中に存在する。好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、またはそれより多くのS.pneumoniae単離株のゲノムにおいて存在する。より好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、少なくとも3種、4種、5種またはそれより多くのS.pneumoniae血清型のゲノム中に存在する。この免疫原性組成物はまた、より広範な範囲のグラム陽性細菌の血清型および単離株に対する保護を提供するように選択され得る。例えば、免疫原性組成物は、第1のグラム陽性細菌AIタンパク質および第2のグラム陽性細菌AIタンパク質を含有し得、ここで、第1のグラム陽性細菌AIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列は、第2のグラム陽性細菌AIタンパク質をコードする全長ポリヌクレオチド配列を含むゲノム中に存在しない。さらに、免疫原性組成物における使用のために選択される各抗原は、好ましくは、複数のグラム陽性細菌の血清型および単離株のゲノム中に存在する。好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、またはそれより多くのグラム陽性細菌単離株のゲノムにおいて存在する。より好ましくは、各抗原は、少なくとも2種すなわち、少なくとも3種、4種、5種またはそれより多くのグラム陽性細菌血清型のゲノム中に存在する。第1および第2のAIタンパク質の一方または両方は、好ましくは、オリゴマー形態またはハイパーオリゴマー形態であり得る。2つ以上のグラム陽性細菌の属もしくは種に由来するアドヘシンアイランド表面タンパク質は、組み合わされて、2種以上のグラム陽性細菌の属もしくは種の疾患または感染の予防的処置もしくは治療的処置のための免疫原性組成物を提供し得る。必要に応じて、このア物ドヘシンアイランド表面タンパク質は、オリゴマー構造物もしくはハイパーオリゴマー構造物に互いに結合させられてもよい。1つの実施形態において、本発明は、連鎖球菌属の2つ以上の種由来のアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む。例えば、本発明は、GBSAI表面タンパク質およびGASアドヘシンアイランド表面タンパク質を含有する組成物を含む。別の例として、本発明は、GASアドヘシンアイランド表面タンパク質およびS.pneumoniaeアドヘシンアイランド表面タンパク質を含有する組成物を含む。GASAI表面タンパク質およびS.pneumoniaeAI表面タンパク質の1つもしくは両方は、オリゴマー形態もしくはハイパーオリゴマー形態であり得る。さらなる例として、本発明は、GBSアドヘシンアイランド表面タンパク質およびS.pneumoniaeアドヘシンアイランド表面タンパク質を含有する組成物を含む。1つの実施形態において、本発明は、グラム陽性細菌の2つ以上の属由来のアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む。例えば、本発明は、連鎖球菌属アドヘシンアイランドタンパク質およびコリネバクテリウム属アドヘシンアイランドタンパク質を含有する組成物を含む。1種以上のグラム陽性細菌AI表面タンパク質は、オリゴマー形態もしくはハイパーオリゴマー形態であり得る。さらに、本発明のAIポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列はまた、生物学的サンプル中のGBSもしくはグラム陽性細菌の存在もしくは非存在を同定するための診断において使用され得る。これらは、生物学的サンプルにおけるAIタンパク質の存在もしくは非存在を同定するために使用され得、またはGBSもしくはグラム陽性細菌感染についての予防的処置もしくは治療的処置において使用され得る抗体を産生するために使用され得る。さらにまた、本発明のAIポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列は、AIのビルレンス関連活性を阻害するかもしくは低下させる、低分子化合物を同定するために使用され得る。本発明は例えば、以下の項目を提供する:項目1オリゴマー形態の、精製B群連鎖球菌GBSアドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。項目2前記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-1から選択される、項目1に記載の免疫原性組成物。項目3前記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-2から選択される、項目1に記載の免疫原性組成物。項目4前記GBSAIポリペプチドが、GBS80、GBS104、GBS52およびこれらのフラグメントからなる群より選択される、項目2に記載の免疫原性組成物。項目5前記GBSAIポリペプチドが、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524およびこれらのフラグメントからなる群より選択される、項目3に記載の免疫原性組成物。項目6前記GBSAIポリペプチドが、GBS80である、項目4に記載の免疫原性組成物。項目7前記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、項目1~6のいずれかに記載の免疫原性組成物。項目8オリゴマー形態の、精製グラム陽性細菌アドヘシンアイランドAIポリペプチドを含む、免疫原性組成物。項目9前記グラム陽性細菌が、連鎖球菌属、エンテロコッカス属、ブドウ球菌属、クロストリジウム属、コリネバクテリウム属またはリステリア属からなる群より選択される属の細菌である、項目8に記載の免疫原性組成物。項目10前記グラム陽性細菌が、連鎖球菌属の細菌である、項目9に記載の免疫原性組成物。項目11前記連鎖球菌属の細菌が、A群連鎖球菌GAS細菌であり、そして、前記グラム陽性細菌AIポリペプチドが、GASAIポリペプチドである、項目10に記載の免疫原性組成物。項目12前記GASAIポリペプチドが、GASAI-1から選択される、項目11に記載の免疫原性組成物。項目13前記GASAIポリペプチドが、GASAI-2から選択される、項目11に記載の免疫原性組成物。項目14前記GASAIポリペプチドが、GASAI-3から選択される、項目11に記載の免疫原性組成物。項目15前記GASAIポリペプチドが、GASAI-4から選択される、項目11に記載の免疫原性組成物。項目16前記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、項目8~15のいずれかに記載の免疫原性組成物。項目17第一および第二のB群連鎖球菌GBSアドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。項目18前記第一のGBSAIポリペプチドが、GBSAI-1によってコードされる、項目17に記載の免疫原性組成物。項目19前記第二のGBSAIポリペプチドが、GBSAI-2によってコードされる、項目18に記載の免疫原性組成物。項目20前記第一のGBSAIポリペプチドが、GBS80、GBS104、GBS52およびこれらのフラグメントからなる群より選択される、項目18に記載の免疫原性組成物。項目21前記第二のGBSAIポリペプチドが、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524およびこれらのフラグメントからなる群より選択され、そして、前記第一のGBSAIポリペプチドと前記第二のGBSAIポリペプチドとが、同じポリペプチドでない、項目19に記載の免疫原性組成物。項目22前記第一のGBSAIポリペプチドが、GBS80であり、そして、前記第二のGBSAIポリペプチドが、GBS67である、項目19に記載の免疫原性組成物。項目23第一および第二のグラム陽性細菌アドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。項目24前記グラム陽性細菌が、連鎖球菌属、エンテロコッカス属、ブドウ球菌属、クロストリジウム属、コリネバクテリウム属またはリステリア属である、項目23に記載の免疫原性組成物。項目25前記第一のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、第一のA群連鎖球菌GASAIポリペプチドである、項目23に記載の免疫原性組成物。項目26前記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-1ポリペプチドである、項目25に記載の免疫原性組成物。項目27前記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-2ポリペプチドである、項目25に記載の免疫原性組成物。項目28前記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-3ポリペプチドである、項目25に記載の免疫原性組成物。項目29前記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-4ポリペプチドである、項目25に記載の免疫原性組成物。項目30前記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、第二のGASAIポリペプチドである、項目25~29のいずれか1項に記載の免疫原性組成物。項目31前記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-1ポリペプチドである、項目30に記載の免疫原性組成物。項目32前記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-2ポリペプチドである、項目30に記載の免疫原性組成物。項目33前記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-3ポリペプチドである、項目30に記載の免疫原性組成物。項目34前記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-4ポリペプチドである、項目30に記載の免疫原性組成物。項目35上昇したレベルのAI表面タンパク質を生成するように適合された、改変グラム陽性細菌。項目36前記AI表面タンパク質が、オリゴマー形態である、項目35に記載の改変グラム陽性細菌。項目37前記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、項目36に記載の改変グラム陽性細菌。項目38非病原性グラム陽性細菌である、項目35~37のいずれか1項に記載の改変グラム陽性細菌。項目39前記非病原性グラム陽性細菌が、Lactococcuslactisである、項目38に記載の改変グラム陽性細菌。項目40オリゴマー性アドヘシンアイランドAI表面抗原を製造するための方法であって、該方法は、以下:オリゴマー性AI表面抗原を発現するグラム陽性細菌を培養する工程;および該発現されたオリゴマー性AI表面抗原を単離する工程を包含する、方法。表の簡単な説明表1:GBS80のフラグメントについての能動先天性免疫アッセイactivematernalimmunizationassay。表2:GBS80のフラグメントについての受動先天性免疫アッセイpassivematernalimmunizationassay。表3:GBS株単離体2603由来のAI-1変異体の50致死用量。表4:M6単離体MGAS10394由来のGASAI-1配列。表5:M1単離体SF370由来のGASAI-2配列。表6:M3単離体MGAS315由来のGASAI-3配列。表7:M3単離体SSI-1由来のGASAI-3配列。表8:M18単離体MGAS8232由来のGASAI-3配列。表9:TIGR4配列由来のS.pneumoniaeAI配列。表10:M5単離体Manfredo由来のGASAI-3配列。表11:M12単離体A735由来のGASAI-4配列。表12:GBS80およびGBS104のアミノ酸配列の保存。表13:GBS322およびGBS276のアミノ酸配列の保存。表14:GBS322、GBS80、GBS104、およびGBS67由来のフラグメントの組合せについての能動先天性免疫アッセイ。表15:GBS80、GBS322、GBS104、およびGBS67の抗原表面露出。表16:GBS80抗原およびGBS322抗原の各々についての能動先天性免疫アッセイ。表17:GBS59についての能動先天性免疫アッセイ。表18:spyM6_0159の表面発現についてのFACS値の概要。表19:spyM6_0160の表面発現についてのFACS値の概要。表20:GAS15の表面発現についてのFACS値の概要。表21:GAS16の表面発現についてのFACS値の概要。表22:第二の抗血清を用いたGAS16の表面発現についてのFACS値の概要。表23:GAS18の表面発現についてのFACS値の概要。表24:第二の抗血清を用いたGAS18の表面発現についてのFACS値の概要。表25:SpyM3_0098の表面発現についてのFACS値の概要。表26:SpyM3_0100の表面発現についてのFACS値の概要。表27:M3血清型におけるSpyM3_0102の表面発現についてのFACS値の概要。表28:M6血清型におけるSpyM3_0102の表面発現についてのFACS値の概要。表29:M3血清型におけるSpyM3_0104の表面発現についてのFACS値の概要。表30:M12血清型におけるSpyM3_0104の表面発現についてのFACS値の概要。表31:M3血清型におけるSPs_0106の表面発現についてのFACS値の概要。表32:M12血清型におけるSPs_0106の表面発現についてのFACS値の概要。表33:M12血清型における19224134の表面発現についてのFACS値の概要。表34:M6血清型における19224134の表面発現についてのFACS値の概要。表35:M12血清型における19224135の表面発現についてのFACS値の概要。表36:M12血清型における19224137の表面発現についてのFACS値の概要。表37:M12血清型における19224141の表面発現についてのFACS値の概要。表38:S.pneumoniae株670AI配列。表39:S.pneumoniae株AI配列のパーセント同一性比較。表40:GBSAI-1を発現するL.lactis株およびGBS細菌株のFACS分析。表41:AI遺伝子座を増幅するために使用したプライマーの配列。表42:S.pneumoniaeAI遺伝子座によりコードされるアミノ酸配列の保存。表43:GBSAI-1を発現するL.lactisで免疫したマウスの防御。表44:M49単離体591由来のGASAI-3配列。表45:4つのGASAI間の配列比較。表46:GBSAI-1を発現するL.lactisで免疫したマウスの血清におけるGBS80に対する抗体応答。表47:GBSAI-1を発現するL.lactisで免疫後のマウス組織において検出された抗GBS80IgA抗体。表48:免疫アッセイにおいて、GBS67はマウスを防御する。表49:GBS株におけるGBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59の露出レベル。表50:GBS血清型に関する高レベルの表面タンパク質発現。表51:GBSAI-1を発現するL.lactisで免疫したマウスのさらなる防御。発明の詳細な説明他に示さない限り、本発明の実施は、当該分野内の化学、生化学、分子生物学、免疫学および薬理学の従来の方法を用いる。このような技術は、文献に十分に説明される。例えば、Remington’sPharmaceuticalSciences、MackPublishingCompany、Easton,Pa.、第19版1995;MethodsInEnzymologyS.ColowickおよびN.Kaplan編、AcademicPress,Inc.;およびHandbookofExperimentalImmunology、第I-IV巻D.M.WeirおよびC.C.Blackwell編、1986、BlackwellScientificPublications;Sambrookら、MolecularCloning:ALaboratoryManual第2版、1989;HandbookofSurfaceandColloidalChemistryBirdi,K.S.編、CRCPress,1997;ShortProtocolsinMolecularBiology、第4版Ausubelら、1999、JohnWileySons;MolecularBiologyTechniques:AnIntensiveLaboratoryCourse、Reamら編、1998、AcademicPress;PCRIntroductiontoBiotechniquesSeries、第2版NewtonGraham編、1997、SpringerVerlag;PetersおよびDalrymple,FieldsVirology第2版、Fieldsら編、B.N.RavenPress,NewYork,NY.を参照のこと。本明細書中に引用される全ての刊行物、特許および特許出願は、その全体が本明細書中に参考として援用される。本明細書中で使用される場合、アドヘシンアイランドAdhesinIslandまたはAIとは、細菌ゲノム例えば、A群連鎖球菌またはB群連鎖球菌あるいは表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードする他のグラム陽性菌についてのゲノム内の一連のオープンリーディングフレームをいう。アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードし得る。アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、アドヘシンアイランドは、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、アドヘシンアイランドは、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも1つの2つのソルターゼをコードする。表面タンパク質の1つ以上は、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。1つ以上のAI表面タンパク質は、グラム陽性菌の表面上の線毛構造物の形成に関与し得る。本発明のアドヘシンアイランドは、好ましくは、多岐転写型調節因子を含むすなわち、転写調節因子は、AIタンパク質オープンリーディングフレーム付近またはAIタンパク質オープンリーディングフレームに隣接して位置するが、反対方向に転写される。転写調節因子は、AIオペロンの発現を調節し得る。GBSアドヘシンアイランド1上記に議論したように、出願人は、数種のB群連鎖球菌血清型および単離体のゲノム内に新規のアドヘシンアイランドアドヘシンアイランド1、AI-1またはGBSAI-1を同定した。AI-1は、表面タンパク質およびソルターゼAI-1タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ5個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、AI-1は、GBS80、GBS104、GBS52、SAG0647およびSAG0648のうちの2つ以上すなわち、2、3、4または5をコードするオープンリーディングフレームを含む。1つ以上のAI-1オープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列は、置き換えられたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置き換えられ得る。あるいは、1つ以上のAI-1オープンリーディングフレームは、置き換えられたORFと配列相同性を有する配列によって置き換えられ得る。AI-1の概略図を図1に示す。AI-1は、代表的に、trmAについてのオープンリーディングフレーム内に頻繁に挿入される約16.1kbのトランスポゾン様エレメントに存在する。AI-1表面タンパク質配列の1つ以上は、代表的に、LPXTG例えば、LPXTG配列番号122モチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のAI表面タンパク質は、GBS細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、GBSが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。AI-1ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予測される。AI-1は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、AI-1は、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、AI-1は、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI-1タンパク質は、好ましくは、GBS80またはそのフラグメントあるいはGBS80と配列同一性を有する配列を含む。本明細書中で使用される場合、LPXTGモチーフは、少なくとも5つのアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を表す。好ましくは、このモチーフは、第1のアミノ酸位置においてロイシンL、第2のアミノ酸位置においてプロリンP、第4のアミノ酸位置においてトレオニンTおよび第5のアミノ酸位置においてグリシンGを含む。Xによって表される第3の位置は、任意のアミノ酸残基によって占められ得る。好ましくは、Xは、リジンK、グルタミン酸E、アスパラギンN、グルタミンQまたはアラニンAによって占められる。好ましくは、X位は、リジンKによって占められる。いくつかの実施形態において、1つの指定したLPXTGアミノ酸位置は、別のアミノ酸と置換される。好ましくは、このような置換は、保存的アミノ酸置換を含み、置換されたアミノ酸残基は、除去されたアミノ酸残基と類似の生理学的特性を有することを意味する。遺伝的に、コードされるアミノ酸は、生理学的特性に基づいた4種のファミリー:1酸性アスパラギン酸およびグルタミン酸、2塩基性リジン、アルギニン、ヒスチジン、3非極性アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファンおよび4無電荷極性グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、トレオニンおよびチロシンに分けられ得る。フェニルアラニン、トリプトファンおよびチロシンは、時折、芳香族アミノ酸として両方に分類される。例えば、ロイシンのイソロイシンまたはバリンによる、アスパラギン酸のグルタミン酸による、トレオニンのセリンによる単独の置換、あるいは構造的に関連したアミノ酸による同様のアミノ酸の保存的置換は、生物学的活性に大きく影響しないことが合理的に予測可能である。LPXTGモチーフの第1のアミノ酸位置は、別のアミノ酸残基で置換され得る。好ましくは、第1のアミノ酸残基ロイシンは、アラニンA、バリンV、イソロイシンI、プロリンP、フェニルアラニンF、メチオニンM、グルタミン酸E、グルタミンQ、またはトリプトファンY残基で置換される。好ましい1つの実施形態において、第1のアミノ酸残基は、イソロイシンIで置換される。LPXTGモチーフの第2のアミノ酸残基は、別のアミノ酸残基と置換され得る。好ましくは、第2のアミノ酸残基プロリンPは、バリンV残基と置換される。LPXTGモチーフの第4のアミノ酸残基は、別のアミノ酸残基と置換され得る。好ましくは、第4のアミノ酸残基トレオニンは、セリンSまたはアラニンAと置換される。一般に、LPXTGモチーフは、アミノ酸配列XXXXGによって表され得、ここで、アミノ酸1位におけるXは、L、V、E、I、FまたはQであり;アミノ酸1位におけるXが、L、IまたはFである場合、アミノ酸2位におけるXは、Pであり;アミノ酸1位におけるXがEまたはQである場合、アミノ酸2位におけるXは、Vであり;アミノ酸1位におけるXがVである場合、アミノ酸2位におけるXは、VまたはPであり;アミノ酸3位におけるXは、任意のアミノ酸残基であり;アミノ酸1位におけるXがV、E、I、FまたはQである場合、アミノ酸4位におけるXは、Tであり;そしてアミノ酸1位におけるXがLである場合、アミノ酸4位におけるXは、T、SまたはAである。一般に、GBSAIタンパク質のLPXTGモチーフは、アミノ酸配列XPXTGによって表わされ得、ここで、アミノ酸1位におけるXは、L、IまたはFであり、そしてアミノ酸3位におけるXは、任意のアミノ酸残基である。GBSAIタンパク質におけるLPXTGモチーフのアミノ酸配列の具体的な例としては、LPXTG配列番号122またはIPXTG配列番号133が挙げられ得る。以下にさらに議論するように、LPXTGモチーフの第4のアミノ酸位置におけるトレオニンは、LPXTG含有タンパク質と細胞壁前駆物質との間の結合の形成において関与し得る。従って、好ましいLPXTGモチーフにおいて、第4のアミノ酸位置におけるトレオニンは、別のアミノ酸と置換されないか、またはトレオニンが置換される場合、置換アミノ酸は、好ましくは、保存的アミノ酸置換例えば、セリンである。LPXTGモチーフの代わりに、本発明のAI表面タンパク質は、代替のソルターゼ基質モチーフ例えば、NPQTN配列番号142、NPKTN配列番号168、NPQTG配列番号169、NPKTG配列番号170、XPXTGG配列番号143、LPXTAX配列番号144、またはLAXTGX配列番号145を含み得る類似の保存的アミノ酸置換はまた、これらの膜モチーフに対して作製され得る。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移反応およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンに組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。AI表面タンパク質は、ソルターゼが触媒するペプチド転移によって線毛に重合化され得る図44を参照のこと。LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間のソルターゼによるAI表面タンパク質の切断は、ソルターゼのチオエステル結合アシル中間体を生じる。多くのAI表面タンパク質は、ソルターゼとLPXTGアミノ酸配列とを相互作用するピリンモチーフアミノ酸配列を含む。ピリンモチーフにおける第1のリジン残基は、切断されたLPXTGモチーフのアミノ基アクセプターとして役立ち得、それによって、線毛を形成するためにAIサブユニット間の共有結合を提供する。例えば、ピリンモチーフは、線毛を形成させて、ソルターゼ酵素を再生するためにAIサブユニット間の共有結合を提供するアセチル酵素に対する求核攻撃を作製し得る。ピリンモチーフの例としては、YPKNX10K;配列番号146、YPKNX9K;配列番号147、YPKX7K;配列番号148、YPKX11K;配列番号149、PKNX9K;配列番号150が挙げられ得る。好ましくは、本発明のAI表面タンパク質は、ピリンモチーフアミノ酸配列を含む。代表的に、本発明のAI表面タンパク質は、細菌膜にわたる表面タンパク質の転位を促進するためにN末端リーダーまたは分泌シグナルを含む。B群連鎖球菌は、ヒトの尿路、下部の胃腸管路、および上部の気道においてコロニー形成することが公知である。頚部上皮細胞株ME180のGBS感染の電子顕微鏡写真は、図25に示される。これらの写真に示されるように、細菌は、細胞間のタイトジャンクションと密接に会合し、傍細胞経路によって単相を横切るように見える。ME180細胞の類似の傍細胞侵入もまた、図26の対照写真によって示される。本発明のAI表面タンパク質は、GBS細菌が上皮細胞層に付着して転位する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、GBSが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面と結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。出願人は、AI-1表面タンパク質GBS104が、上皮細胞例えば、ME180ヒト頚部細胞、A549ヒトの肺細胞およびCaco2ヒトの腸細胞と結合し得ることを発見した図29および210を参照のこと。さらに、GBS株におけるGBS104配列の欠失は、ME180頚部上皮細胞に付着するGBSの能力を減少させる図30および211を参照のこと。GBS104の欠失はまた、J774マクロファージ様細胞に侵入するGBSの能力を減少させる図32および205を参照のこと。GBS104の欠失によってまた、GBSが上皮細胞単層を通して転位することができなくなる。図206を参照のこと。従って、GBS104タンパク質は、ME180上皮細胞に結合するようであり、上皮細胞およびマクロファージ細胞株に対する付着において役割を有するように見える。GBS104、GBS80についての欠失変異体であるGBS菌と同様に、GBS80ノックアウト変異体株もまた、上皮単層を通して転位する能力を部分的に損失する。図207を参照のこと。COH1細胞におけるGBS80またはGBS104の欠失は、HUVEC上皮細胞への付着を減少させる。図208を参照のこと。しかしながら、COH1におけるGBS80またはGBS104の欠失は、ME180細胞を用いて、またはインキュベーション培地IMにおいてCOH1の増殖に影響しない。図209を参照のこと。従って、GBS80およびGBS104の両方は、上皮細胞を通るGBSの転位に関与するように見える。GBS80は、上皮細胞に結合しないように見える。GBS80タンパク質の存在下での上皮細胞のインキュベーションに続く抗GBS80ポリクローナル抗体を用いるFACS分析では、上皮細胞へのGBS80の結合を検出しなかった。図202を参照のこと。さらに、GBS80タンパク質の欠失は、GBSがME180頚部上皮細胞に付着および侵入する能力に影響しなかった。図203を参照のこと。好ましくは、表面タンパク質のうちの1つ以上は、1つ以上の細胞外マトリックスECM結合タンパク質例えば、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得る。図5および204ならびに実施例1に示すように、GBS80,AI-1表面タンパク質のうちの1つは、細胞外マトリックス結合タンパク質のフィブロネクチンおよびフィブリノーゲンに結合し得る。GBS80タンパク質は、特定の上皮細胞に明らかに結合しないか、または頚部上皮細胞に付着もしくは侵入するGBS菌の能力に影響を与えず図27および28を参照のこと、野生型株由来のGBS80の除去は、株が上皮細胞層を通して転位する能力を減少させる図31を参照のこと。GBS80はまた、バイオフィルムの形成に関与し得る。GBS80タンパク質を過剰発現するCOH1菌は、上皮単層を通して転位するのに十分に機能を果たさない能力を有する。図212を参照のこと。GBS80を過剰発現するこれらのCOH1菌は、上皮細胞に微小コロニーを形成する。図213および214を参照のこと。これらの微小コロニーは、バイオフィルム発達の始まりであり得る。AI表面タンパク質はまた、以前に同定された付着タンパク質または細胞外マトリックスECM結合タンパク質と機能的相同性を示し得る。例えば、GBS80、AI-1における表面タンパク質は、FimA、グラム陽性菌A.naeslundiiの主要な線毛サブユニットといくつかの機能的相同性を示す。FimAは、唾液タンパク質との結合において関与し、A.naeslundiiの表面上の線毛における成分であり得ると考えられる。Yeungら1997InfectionImmunity65:2629-2639;Yeungeら1998J.Bacteriol66:1482-1491;Yeungら1998J.Bacteriol170:3803-3809;およびLiら2001infectionImmunity69:7224-7233を参照のこと。類似の機能的相同性もまた、グラム陽性菌CorynebacteriumdiphtheriaeSpaA、SpaD、およびSpaHにおいて線毛形成に関与するGBS80とタンパク質との間で同定されている。Ton-Thatら2003MolecularMicrobioligy504:1429-1438およびTon-Thatら2004MolecularMicrobioligy531:252-261を参照のこと。C.diphtheriaeタンパク質全ては、WxxxVxVYPK配列番号151;ここで、xは、種々のアミノ酸残基を示すのピリンモチーフを含んだ。リジンK残基は特に、C.diphtheriae線毛タンパク質に保存されて、C.diphtheriae線毛構造物に関与するサブユニットのソルターゼが触媒するオリゴマー形成に関与すると考えられるC.diphtheriaeピリンサブユニットSpaAは、隣接するピリンサブユニットのソルターゼが触媒するアミド結合架橋によって生じると考えられる。チオエステル結合したソルターゼのアシル中間体は、放出のための求核攻撃を必要とするので、SpaAピリンモチーフ内の保存されたリジンは、切断された局在化シグナルのアミノ基アクセプターとして機能し得、それによって、C.diphtheriaピリンサブユニットの共有結合を提供する。Ton-Thatら、MolecularMicrobioligy2003504:1429-1438の図6dを参照のこと。さらに、保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスboxはまた、C.diphtheria線毛構築物において重要なものとして、C.diphtheria線毛関連タンパク質において同定されている。Eボックスモチーフは一般に、YxLxETxAPxGY配列番号152;ここで、xは、種々のアミノ酸残基を示すを含む。特に、Eボックス内の保存されたグルタミン酸残基は、C.diphtheria線毛形成において必要であると考えられる。好ましくは、免疫原性組成物のAI-1ポリペプチドは、Eボックスモチーフを含む。AI-1ポリペプチドにおけるEボックスモチーフのいくつかの例としては、アミノ酸配列YxLxExxxxxGY配列番号153、YxLxExxxPxGY配列番号154、またはYxLxETxAPxGY配列番号152が挙げられ得る。具体的には、ポリペプチドのEボックスモチーフは、アミノ酸配列YKLKETKAPEGY配列番号155、YVLKEIETQSGY配列番号156またはYKLYEISSPDGY配列番号157を含み得る。以下により詳細に記載するように、保存されたリジン残基を含有するピリンモチーフおよび保存されたグルタミン残基を含有するEボックスモチーフは、GBS80において同定されている。以前の刊行物は、線毛様構造物が、streptococciの表面に形成され得ると推測している例えば、Ton-Thatら、MolecularMicrobioligy2003504:1429-1438を参照のことが、これらの構造物は、疑いに対してそのような推測を投げかけるネガティブ染色非特異的電子顕微鏡写真において以前に可視化されていなかった。例えば、図34は、GBS血清型III、GBS80の過剰発現を促進する挿入されたプラスミドを有するCOH1単離株の電子顕微鏡写真を示す。このEM写真は、標準的なネガティブ染色線毛構造物が区別されないで作製された。さらに、グラム陽性菌に対する感染を処置または予防するための免疫原性組成物におけるこのようなAI表面タンパク質の使用は、以前に記載されていなかった。驚くべきことに、出願人は、現在、電子顕微鏡写真において可視化できる表面に露出した線毛形成物においてGBS80の存在を同定した。これらの構造物は、電子顕微鏡写真が、AI表面タンパク質例えば、GBS80に対して特異的に染色される場合にのみ可視化できる。これらの電子顕微鏡写真の例を図11、16および17に示し、これは、野生型COH1Streptococcusagalactiaeにおいて線毛構造物の存在を明らかにする。これらの電子顕微鏡写真の他の例を図49に示し、これは、GBS80が、S.agalactiae、JM9030013野生型の臨床単離体において線毛を伴うことを示す図49を参照のこと。本出願人はまた、変異体GBS株を構築した。この変異体は、この変異体中のGBS80の過剰発現を生じるGBS80を含むプラスミドを含む。図13~15の電子顕微鏡写真もまた、GBS80に対して染色される。これらは、上記細菌の表面の部分を覆ってその上清中へと遠く延びるようである、GBS80を含む長いオリゴマー構造物を示す。ある場合には、GBS上での線毛構造物の形成は、GBS80の表面発現に相関するようである。図61は、抗GBS80抗血清を使用する、細菌COH1株およびJM9130013株におけるGBS80表面レベルのFAC分析を提供する。抗GBS80抗血清を使用するCOH1細菌およびJM9130013細菌の免疫金電子顕微鏡法は、JM9130013細菌これは、GBS80表面発現に関して、より高い値を有するもまた、より長い線毛構造物を形成することを示した。GBSにおけるGBS80の表面露出は、一般的には、夾膜依存性ではない。図62は、抗GBS80抗体および抗GBS322抗体を用いて分析した、夾膜GBSおよび非夾膜GBSのFACS分析を提供する。GBS80の表面露出は、GBS322とは異なり、夾膜依存性ではない。アドヘシンアイランド表面タンパク質例えば、GBS80ならびにアドヘシンアイランドソルターゼは、線毛形成のために必要であるようである。線毛は、GBS80を過剰発現するがGBS104を欠くCoh1細菌クローン中、またはAI-1ソルターゼsag0647もしくはsag0648のうちの1つを過剰発現するCoh1細菌クローン中で、形成される。しかし、線毛は、GBS80を過剰発現し、かつsag0647およびsag0648の両方を欠如するCoh1細菌クローンにおいては、形成されない。従って、例えば、少なくともGBS80と、ソルターゼsag0647またはsag0648とが、線毛形成のために必要であり得るようである図48を参照のこと。GBS515株AI-1を欠如するにおけるGBS80の過剰発現はまた、GBS80を線毛へとアセンブルさせる。GBS515株は、AI-2を含み、従って、AI-2ソルターゼを含む。GBS515株におけるAI-2ソルターゼは、明らかに、GBS80を線毛へとポリマー化する図42を参照のこと。GBS67発現についてノックアウトされているGBS515株細胞におけるGBS80の過剰発現もまた、明らかに、GBS80を線毛へとポリマー化する図72を参照のこと。GBS80は、GBSAI-1線毛形成のために必要であるようであるが、GBS104およびソルターゼSAG0648は、効率的なAI-1線毛アセンブリのために重要であるようである。例えば、高分子構造物は、遺伝子破壊が原因でGBS80の発現を欠く同系遺伝子型COH1株においてはアセンブルされず、GBS104の発現を欠く同系遺伝子型COH1株においてそれほど効率的にはアセンブリされない図41を参照のこと。このGBS株は、共有結合されたGBS80サブユニットとGBS104サブユニットとから構成される、高分子量線毛構造物を含む。さらに、COH1細菌におけるSAG0648の欠失は、上記の高分子量線毛構造物のうちのいくつかのアセンブリを妨害する。従って、SAG0648が、これらの線毛種のアセンブリにおいて一定の役割を果たすことを示す図41を参照のこと。電子顕微鏡EM写真により、増加したGBS80発現について適合されたGBS株のハイパーオリゴマー構造物内にAI表面タンパク質GBS104が含まれることが確認される図34~41および実施例6を参照のこと。野生型の血清型VIIIGBS株であるJM9030013株において、IEMは、GBS104を、その細菌表面上でクラスターを形成するものとして同定する図50を参照のこと。GBS52はまた、GBS線毛の成分であるようである。Coh1の総細胞抽出物およびGBS52ヌル変異体Coh1の総細胞抽出物に対して抗GBS80抗血清を使用するイムノブロットは、GBS52ヌル変異体Coh1株に対するCoh1野生型株において検出されるタンパク質のシフトを示す。シフトしたタンパク質はまた、抗GBS52抗血清を用いて野生型Coh1細菌において検出された。これは、GBS52が、線毛において存在し得ることを示す図45を参照のこと。一実施形態において、本発明は、AI表面タンパク質例えば、GBS80を含むオリゴマー線毛様構造物を含む組成物を包含する。上記のオリゴマー線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数の単位を含み得る。好ましくは、上記のオリゴマー線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。なおより好ましくは、上記オリゴマー線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13、14個、15個、20個、25個、30個、35個、40個、45個、50個、60個、70個、80個、90個、100個、120個、140個、150個、200個、またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマー線毛様構造物を含み、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。上記オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合され得る。上記オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して好ましくは、そのスレオニンアミノ酸残基を介して共有結合され得る。本発明のオリゴマー線毛様構造物中に組み込まれるべきAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、保存されたリジン残基を含むピリンモチーフと、保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスモチーフとのうちの1つまたは両方を含む。1つよりも多いAI表面タンパク質が、本発明のオリゴマー線毛様構造物中に存在し得る。例えば、GBS80およびGBS104が、オリゴマー構造物中に組み込まれ得る。あるいは、GBS80およびGBS52が、オリゴマー構造物中に組み込まれ得るか、またはGBS80と、GBS104と、GBS52とが、オリゴマー構造物中に組み込まれ得る。別の実施形態において、本発明は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む組成物を包含する。上記組成物は、同じアドヘシンアイランドに由来する表面タンパク質を含み得る。例えば、上記組成物は、2つ以上のGBSAI-1表面タンパク質例えば、GBS80、GBS104、およびGBS52を含み得る。上記表面タンパク質は、グラム陽性細菌から単離され得るか、または組換え産生され得る。上記オリゴマー線毛様構造物は、単独で使用され得るか、または本発明の組み合わせの状態で使用され得る。一実施形態において、本発明は、オリゴマー形態好ましくは、ハイパーオリゴマー形態であるGBSアドヘシンアイランドタンパク質を含む。一実施形態において、本発明は、1つ以上のGBSアドヘシンアイランド1AI-1タンパク質と、1つ以上のGBSアドヘシンアイランド2AI-2タンパク質とを含む、組成物を包含し、そのアドヘシンアイランドタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態であり、好ましくはハイパーオリゴマー形態である。本発明のオリゴマー線毛様構造物は、1つ以上のさらなるGBSタンパク質と組み合わされ得る。一実施形態において、上記オリゴマー線毛様構造物は、1つ以上のAI表面タンパク質を、第二のGBSタンパク質と組み合わせて含む。上記第二のGBSタンパク質は、公知のGBS抗原例えば、GBS322一般的にはsipと呼ばれるまたはGBS276であり得る。血清型V単離株2603V/Rから配列決定されたGBS322のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列が、WO02/35771において配列番号8539および配列番号8540として示されており、本明細書において、配列番号38および配列番号39として示される。特に好ましいGBS322ポリペプチドは、N末端シグナルペプチドアミノ酸残基1~24を欠く。好ましいGBS322ポリペプチドの例は、407アミノ酸フラグメントであり、配列番号40に示される。好ましいGBS322ポリペプチドの例は、2004年9月15日に出願されWO2005/002619として公開されたPCT/US04/_代理人整理番号PP20665.002本明細書中に参考として援用されるにさらに記載される。本発明のGBSAI表面タンパク質と組み合わされ得るさらなるGBSタンパク質もまた、WO2005/002619に記載される。これらのGBSタンパク質としては、GBS91、GBS184、GBS305、GBS330、GBS338、GBS361、GBS404、GBS690、およびGBS691が挙げられる。本発明のGBSAI表面タンパク質と組み合わされ得るさらなるGBSタンパク質が、WO02/34771に記載されている。本発明のGBSAI表面タンパク質と組み合わされ得るGBS多糖が、WO2004/041157に記載されている。例えば、本発明のGBSAI表面タンパク質は、血清型Ia、血清型Ib、血清型Ia/c、血清型II、血清型III、血清型IV、血清型V、血清型VI、血清型VII、および血清型VIIIからなる群より選択されるGBS多糖と組み合わされ得る。上記オリゴマー線毛様構造物は、細菌培養物から単離または精製され得、その培養物において、その細菌は、AI表面タンパク質を発現する。従って、本発明は、オリゴマーAI表面抗原を製造するための方法を包含し、この方法は、上記のオリゴマーAIタンパク質を発現するGBS細菌を培養する工程;および当該GBS細菌から発現されたオリゴマーAIタンパク質を単離する工程;を包含する。上記AIタンパク質は、その上清中への分泌物から収集され得るか、またはその細菌の表面から精製され得る。上記方法は、上記の発現されたAIタンパク質の精製をさらに包含し得る。好ましくは、上記AIタンパク質は、ハイパーオリゴマー形態である。オリゴマー線毛と会合している高分子構造物が、培養されたGBS株Coh1の上清中で観察される図46を参照のこと。これらの線毛は、培養されたCoh1細菌のすべての増殖期において上清中で見出される図47を参照のこと。オリゴマーである、線毛様構造物は、AI表面タンパク質を過剰発現する細菌培養物から単離または精製され得る。従って、本発明は、オリゴマーアドヘシンアイランド表面抗原を製造するための方法を含み、この方法は、増加されたAIタンパク質発現およびGBS細菌由来の発現されたオリゴマーアドヘシンアイランドタンパク質の単離のために適合されたGBS細菌を培養する工程を包含する。AIタンパク質は、上清中への分泌物から収集され得るか、または細菌表面から精製され得る。この方法はさらに、発現されたアドヘシンアイランドの精製を含む。好ましくは、アドヘシンアイランドタンパク質は、ハイパーオリゴマー形態である。GBS細菌は、好ましくは、少なくとも2例えば、2、3、4、5、8、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、125、150または200倍の野生型発現レベルまでAIタンパク質発現を増加させるように適合される。GBS細菌は、遺伝子量を増加させる方法および遺伝子アップレギュレーションの方法を含む、当該分野に公知の任意の手段によってAIタンパク質発現を増加させるように適合され得る。このような方法としては、例えば、AIタンパク質をコードするプラスミドでのGBS細菌の形質転換が挙げられる。このプラスミドは、強力なプロモーターを含み得るか、またはAIタンパク質をコードする配列の複数のコピーを含み得る。必要に応じて、GBS細菌ゲノム内のAIタンパク質をコードする配列は、欠失され得る。あるいは、またはさらに、GBSアドヘシンアイランドを調節するプロモーターは、発現を増加させるように改変され得る。GBSAI-1を有するGBS細菌はまた、AraCとGBS80との間の遺伝子間領域の2つの部位に存在するアデノシンヌクレオチドの数を変化させることによってAIタンパク質発現を増加させるように適合され得る。図197Aこれは、GBSAI-1の構成を示す概略図であるおよび図197Bこれは、AIにおけるAraCとGBS80との間の遺伝子間領域の配列を提供するを参照のこと。GBS80表面発現に影響を与えるものとして出願人が同定したアデノシン経路は、図197Bに示される配列配列番号273のヌクレオチド187位および233位に存在する。出願人は、187位において4つのアデノシン、233位において6つのアデノシン、187位において5つのアデノシン、233位において6つのアデノシン、187位において5つのアデノシンおよび233位において7つのアデノシンを有するGBS細菌の株においてGBS80表面発現に対するこれらのアデノシン経路の影響を決定した。抗GBS80抗血清を用いるこれらの株のFACS分析によって、187位において5つのアデノシンおよび233位において6つのアデノシンを有する遺伝子間領域が、他の株よりそれらの表面においてGBS80のより高い発現レベルを有することが決定された。FACS分析から得られる結果について図197Cを参照のこと。従って、AraCおよびGBS80遺伝子間領域の187位および233位に存在するアデノシンの数を操作することはさらに、GBSがAIタンパク質発現を増加させるように適合させるために使用され得る。本発明はさらに、増加されたレベルのAI表面タンパク質を生成するために適合されたGBS細菌を含む。特に、本発明は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマーのAI表面タンパク質例えば、GBS80を生成するために適合されたGBS細菌を含む。1つの実施形態において、本発明のグラム陽性菌は、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌のインビボでの送達を可能にするために不活性化または弱毒化される。本発明はさらに、GBS細菌の表面の線毛に組み込まれた増加されたレベルの発現されたAIタンパク質を有するように適合されたGBS細菌を含む。GBS細菌は、シグナルペプチダーゼポリペプチドの発現レベルを増加させることによって、その表面にオリゴマーまたはハイパーオリゴマーのAIタンパク質の増加された露出を有するように適合され得る。グラム陽性菌における局所シグナルペプチダーゼ例えば、GASにおけるLepA発現の増加されたレベルは、グラム陽性菌の表面の線毛タンパク質の増加された露出の結果と予想される。GBSにおけるリーダーペプチダーゼの増加された発現は、当該分野における公知の任意の手段例えば、遺伝子量の増加および遺伝子アップレギュレーションの方法によって達成され得る。リーダーペプチダーゼの増加されたレベルを有するように適合されたGBS細菌はさらに、増加されたレベルの少なくとも1つの線毛タンパク質を発現するように適合され得る。あるいは、本発明のAIタンパク質は、非病原性グラム陽性菌例えば、Streptococusgordonii例えば、Byrdら、Biologicalconsequencesofantigenandcytokineco-expressionbyrecombinantStreptococcusgordoniivaccinevectors、Vaccine200220:2197-2205を参照のことまたはLactococcuslactis例えば、Mannamら、MucosalVaccineMadefromLive,RecombinantLactoccuslactisProtectsMiceagainstPharangealInfectionwithStreptococcuspyogenesInfectionandImmunity2004726:3444-3450を参照のことの表面に発現され得る。本明細書中で使用される場合、非病原性グラム陽性菌とは、ヒト宿主被験体と適合可能であり、ヒト病原性と関連しないグラム陽性菌をいう。好ましくは、非病原性菌は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態においてAI表面タンパク質を発現するように改変される。AI表面タンパク質および必要に応じて、AIソルターゼをコードする配列は、非病原性グラム陽性菌の細菌ゲノム内に組み込まれ得るか、またはプラスミド内に挿入され得る。非病原性グラム陽性菌は、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌のインビボでの送達を容易にするために不活性化され得るか、または弱毒化され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の細菌培養物から単離または精製され得る。例えば、AI表面タンパク質は、細胞抽出物または培養上清から単離され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の表面から単離または精製され得る。非病原性グラム陽性菌は、本明細書中に記載される任意のグラム陽性菌のアドヘシンアイランドタンパク質GBSアドヘシンアイランド、GASアドヘシンアイランド、またはSpneumoアドヘシンアイランド由来のタンパク質が挙げられるを発現するために使用され得る。非病原性グラム陽性菌は、アドヘシンアイランド表面タンパク質を発現するように形質転換される。好ましくは、非病原性グラム陽性菌はまた、少なくとも1つのアドヘシンアイランドソルターゼを発現する。本発明のAI形質転換された非病原性グラム陽性菌は、病原性グラム陽性菌例えば、GBS、GASまたはStreptococcuspneumoniaeの感染を予防または処置するために使用され得る。非病原性グラム陽性菌は、非病原性グラム陽性菌のゲノム内にコードされたアドヘシンアイランドタンパク質をさらに含むオリゴマー形態においてグラム陽性菌のアドヘシンアイランドタンパク質を発現し得る。出願人は、L.lactisを改変して、それが、GBSAIポリペプチドを発現し得ることを示した。L.lactisは、それ自身のプロモーターおよびターミネーター配列の下でGBS80をコードする構築物で形質転換された。形質転換されたL.lactisは、抗GBS80抗血清を用いるウエスタンブロット分析によって示されるように、GBS80を発現するように見える。図133Aおよび133Bに提供されるウエスタンブロットのレーン6および7を参照のこと133Aおよび133Bは、同じウエスタンブロットの2つの異なる露出である。実施例13もまた参照のこと。出願人はまた、L.lactisをGBS80プロモーターおよびターミネーター配列の下でGBSAI-1ポリペプチドGBS80、GBS52、SAG0647、SAG0648、およびGBS104をコードする構築物で形質転換した。これらのL.lactisは、免疫ブロット法において抗GBS80と免疫反応性である高分子量構造物を発現した。図134、レーン2を参照のことこれは、完全な形質転換されたL.lactis抽出物においてGBS80モノマーおよび高分子量ポリマーの検出を示す。従って、これは、L.lactisが、オリゴマー形態においてGBS80を発現し得るように見える。高分子量ポリマーは、L.lactis抽出物においてだけでなく、培養物上清においてもまた検出された。図135のレーン4を参照のこと。実施例14もまた参照のこと。従って、オリゴマー形態におけるGBSAIポリペプチドは、L.lactis細胞抽出物または培養上清のいずれかから単離および精製され得る。これらのオリゴマー形態は、例えば、超音波処理による遊離によって細胞抽出物または培養上清から単離され得る。図136AおよびBを参照のこと。図171これは、超音波処理およびSephacrylHR400カラムでのゲル濾過後のGBSAI-1を発現するL.lactisの全抽出物のGBS線毛の精製を示すもまた参照のこと。さらに、GBS80プロモーターおよびターミネーター配列の下でGBSAI-1ポリペプチドGBS80、GBS52、SAG0647、SAG0648、およびGBS104をコードする構築物で形質転換されたL.lactisは、その表面にGBSAI-1ポリペプチドを発現した。これらの形質転換されたL.lactisのFACS分析によって、GBS80およびGBS104の両方の細胞表面発現が検出された。形質転換されたL.lactisにおけるGBS80およびGBS104の表面発現レベルは、GBS株COH1およびJM9130013これは、自然にGBSAI-1を発現するにおけるGBS80およびGBS104の表面発現レベルと同様であった。抗GBS80およびGBS104抗血清を用いるGBSAI-1および野生型JM9130013菌での形質転換されたL.lactisに関するFACS分析データについて図169を参照のこと。表40は、抗GBS80および抗GBS104抗血清を用いて形質転換されたL.lactis、COH1およびJM9130013菌のFACS分析の結果を提供する。提供される数は、各細菌株について得られた免疫血清対免疫前血清について計算された平均蛍光値の相違を示す。抗GBS80一次抗体で行った免疫金-電子顕微鏡検査は、GBSAI-1を発現するL.lactis菌の表面に線毛構造物の存在を検出し、FACS分析の結果を確認した。図168BおよびCを参照のこと。興味深いことには、L.lactisの表面のGBS線毛のこの発現は、L.lactis凝集を誘発した。図170を参照のこと。従って、GBSAIポリペプチドはまた、L.lactisの表面から単離および精製され得る。L.lactisの表面にGBSAIポリペプチドを発現するL.lactisの能力はまた、GBSAI抗原を送達するための宿主として有用であり得ることを示す。実際、GBSAI-1で形質転換されたL.lactisでのマウスの免疫は、GBSでのその後のチャレンジに対して防御した。雌性マウスは、GBSAI-1で形質転換されたL.lactisで免疫された。免疫された雌性マウスは、仔を産み、それらの仔は、免疫されていない仔の90を殺傷するのに十分なGBSの用量でチャレンジされた。形質転換されたL.lactisでのマウスの鼻腔内および皮下免疫についての詳細なプロトコルは、それぞれ実施例18および19に見出され得る。表43は、GBSAI-1LL-AI1を発現するL.lactisでの雌性マウスの免疫を示すデータを提供し、ネガティブPBSコントロールPBSおよびネガティブL.lactisコントロールLL10E9これは、GBSAI-1を発現するように形質転換されていない野生型のL.lactisである両方と比較してチャレンジされた仔の生存率を非常に増加することを示すデータを提供した。表51は、GBSAI-1で形質転換されたL.lactisでのマウスの免疫がGBSに対して防御するさらなる証拠を提供する。GBSAI-1を発現するL.lactisで免疫されたマウスの防御は、新しく惹起された抗体反応に少なくとも部分的に起因する。表46は、抗GBS80抗体力価が、上記のようにGBSAI-1を発現するL.lactisで免疫されたマウスの血清に検出されることを提供する。GBAAI-1を発現するL.lactisで免疫されたマウスは、抗GBS80抗体力価を有し、これは、GBSAI-1を発現するように形質転換されていないL.lactisで免疫されたマウスにおいて観測されない。さらに、生存データから予測されるように、GBSAI-1を発現するように形質転換されたL.lactisで皮下免疫されたマウスは、GBSAI-1を発現するように形質転換されたL.lactisで鼻腔内免疫されたマウスより顕著に高い血清抗GBS80抗体力価を有する。IgAアイソタイプの抗GBS80抗体は、GBSAI-1を発現するL.lactisで皮下または鼻腔内免疫されたマウスの種々の体液において特異的に検出した。さらに、オプソニンファゴサイトーシスアッセイはまた、GBSAI1を発現するL.lactisに対して生成される抗血清のうちの少なくとも一部は、GBSに対するオプソニンであることを実証した。図161を参照のこと。多数の株および血清型にわたってGBSに対する防御を得るために、L.lactisを、GBSAI-1およびGBSAI-2の両方をコードする組換えGBSAIすなわち、ハイブリッドGBSAIで形質転換することが、可能である。例として、ハイブリッドGBSAIは、GBS104遺伝子がGBS67遺伝子で置換されているGBSAI-1であり得る。そのようなハイブリッドGBSAIの模式図が、図231Aに示される。ハイブリッドGBSAIは、あるいは、GBS52遺伝子がGBS59遺伝子で置換されているGBSAI-1であり得る。図231Bの模式図を参照のこと。あるいは、ハイブリッドGBSAIは、GBS52遺伝子がGBS59ポリペプチドで置換されており、かつGBS59をコードする遺伝子および2つのGBSAI-2ソルターゼをコードする遺伝子がGBS104遺伝子で置換されている、GBSAI-1であり得る。ハイブリッドGBSAIの別の例は、GBS52遺伝子がGBS59遺伝子で置換されておりかつGBS104遺伝子がGBS67で置換されている、GBSAI-1である。図232の模式図を参照のこと。ハイブリッドGBSAIのさらなる例は、GBS59遺伝子およびGBSAI-2ソルターゼをコードする遺伝子を、GBS52遺伝子の代わりに有する、GBSAI-1である。ハイブリッドGBSAIのなお別の例は、GBS52またはGBS104のいずれかが、GBS322と、GBS59、GBS67、またはGBS150のうちの1つとを含む融合タンパク質で置換されている、GBSAI-1である。これらのハイブリッドGBSAIのうちの一部は、図234A~234Fにおいて概略されているように調製され得る。本出願人は、図231Aに示されるGBS104遺伝子をGBS67コード配列で置換しているGBSAI-1配列を有するハイブリッドGBSAIを調製した。L.lactisをハイブリッドGBSAI-1で形質転換すると、GBS80タンパク質とGBS67タンパク質とを含む高分子量ポリマーのL.lactis発現を生じた。図233Aこれは、図231Aに示されるハイブリッドGBSAIで形質転換されたL.lactisのウェスタンブロット分析を提供するを参照のこと。ハイブリッドGBSAIで形質転換されたL.lactisを、GBS80に対する抗体またはGBS67に対する抗体でプロービングした場合、高分子量構造物が、検出された。α-80イムノブロットおよびα-67イムノブロットの両方における、LLaと標識されるレーンを参照のこと。GBS80タンパク質およびGBS67タンパク質は、FACS分析によりL.lactisの表面上に存在することが確認された。図233Bこれは、GBS80表面発現およびGBS67表面発現を検出するためにGBS80抗体およびGBS67抗体が使用される場合の蛍光のシフトを示すを参照のこと。同じ蛍光シフトは、L.lactisコントロール細胞ハイブリッドGBSAIで形質転換されていない細胞において観察されなかった。あるいは、上記のオリゴマー線毛様構造物は、組換え生成され得る。組換え宿主細胞系において生成される場合、AI表面タンパク質は、好ましくは、本発明のAIソルターゼのうちの1つ以上の発現と協調して発現される。そのようなAIソルターゼは、AI表面タンパク質サブユニットのオリゴマー形成またはハイパーオリゴマー形成を促進する。本発明のAIソルターゼは、代表的には、最初の70アミノ酸残基内にシグナルペプチド配列を有する。これらはまた、C末端の50アミノ酸残基内に膜貫通配列を含み得る。上記ソルターゼはまた、最後の8アミノ酸内に少なくとも1つの塩基性アミノ酸残基を含み得る。好ましくは、上記ソルターゼは、1つ以上の活性部位残基例えば、触媒性システインおよび触媒性ヒスチジンを有する。図1に示されるように、AI-1は、表面に露出したGBS80タンパク質、表面に露出したGBS52タンパク質、および表面に露出したGBS104タンパク質、ならびにソルターゼSAG0647およびソルターゼSAG0648を含む。AI-1は、代表的には、trmA遺伝子の3’末端中への挿入として存在する。AI-1タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、AI-1はまた、多岐転写型転写調節因子例えば、araCを含み得るすなわち、その転写因子は、AIタンパク質オープンリーディングフレームの近傍に位置するかまたはそれに隣接して位置するが、この転写調節因子は、反対方向に転写される。araCは、AIオペロンの発現を調節し得ることが、考えられる。E.coliにおいて多岐転写型調節因子の考察については、Korbelら、NatureBiotechnology2004227:911~917を参照のこと。AI-1はまた、rho独立転写ターミネーターをコードする配列を含み得る図1におけるヘアピン構造を参照のこと。アドヘシンアイランド内にこの構造物が存在すると、GBS80オープンリーディングフレームの後ろで転写を妨害して、この表面タンパク質の発現増加をもたらすと考えられる。いくつかのGBS血清型内にAI-1を同定する模式図が、図2に示される。AI-1配列は、GBS血清型V単離株2603;GBS血清型III単離株NEM316;GBS血清型II単離株18RS21;GBS血清型V単離株CJB111;GBS血清型III単離株COH1;およびGBS血清型1a単離株A909において同定された。示されるパーセンテージは、2603配列に対するアミノ酸同一性である。AI-1は、GBS血清型1b単離株H36AB、またはGBS血清型1a単離株515において同定されなかった。血清型V単離株2603に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列および血清型V単離株CJB111に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列;血清型II単離株18RS21に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列;血清型III単離株COH1に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列および血清型III単離株NEM316に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列;ならびに血清型1a単離株A909に由来するAI-1ポリヌクレオチド配列のアライメントが、図18に提示される。血清型V単離株2603に由来するAI-1表面タンパク質GBS80および血清型V単離株CJB111に由来するAI-1表面タンパク質GBS80;血清型1a単離株A909に由来するAI-1表面タンパク質GBS80;血清型III単離株COH1に由来するAI-1表面タンパク質GBS80、および血清型III単離株NEM316に由来するAI-1表面タンパク質GBS80のアミノ酸配列のアライメントが、図22において提示される。血清型V単離株2603に由来するAI-1表面タンパク質GBS104および血清型V単離株CJB111に由来するAI-1表面タンパク質GBS104;血清型III単離株COH1に由来するAI-1表面タンパク質GBS104、および血清型III単離株NEM316に由来するAI-1表面タンパク質GBS104のアライメント;ならびに血清型II単離株18RS21に由来するAI-1表面タンパク質GBS104のアミノ酸配列のアライメントが、図23において提示される。好ましいAI-1ポリヌクレオチドおよびAI-1アミノ酸配列が、2つ以上のGBS血清型またはGBS単離株の間で保存される。この図において示されるように、表面タンパク質GBS80の全長は、GBS血清型V単離株2603および単離株CJBIII、GBS血清型III単離株NEM316および単離株COH1、およびGBS血清型Ia単離株A909の間で特に保存される。上記GBS80表面タンパク質は、血清型II単離株18RS21、血清型Ib単離株H36B、および血清型Ia単離株515において欠失しているかまたはフラグメント化されている。AraCのポリヌクレオチド配列およびAraCのアミノ酸配列が、図30において示される。GBSアドヘシンアイランド2第二のアドヘシンアイランド、アドヘシンアイランド2またはAI-2またはGBSAI-2もまた、多数のGBS血清型において同定されている。GBS血清型V単離株2603内でのAI-1とAI-2との間の相関関係を示す模式図が、図3において示される。図3における相同性パーセントは、AI-1タンパク質に対するAI-2タンパク質のアミノ酸同一性を示す。AI-2ポリヌクレオチド配列のアライメントが、図20および図21において示される図20は、血清型V単離株2603に由来する配列、および血清型III単離株NEM316に由来する配列を含む。図21は、血清型III単離株COH1に由来する配列、および血清型Ia単離株A909に由来する配列を含む。血清型V単離株2603に由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列および血清型V単離株CJB111に由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列;血清型1a単離株515に由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列;血清型II単離株18RS21に由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列;血清型Ib単離株H36Bに由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列;ならびに血清型III単離株NEM316に由来するAI-2表面タンパク質GBS067のアミノ酸配列のアライメントが、図24に提示される。好ましいAI-2ポリヌクレオチドおよびAI-2アミノ酸配列が、2つ以上のGBS血清型またはGBS単離株の間で保存される。AI-2は、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする、一連のほぼ5つのオープンリーディングフレームを含む。具体的には、AI-2は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、SAG1406、01520、01521、01522、01523、01523、01524、および01525のうちの2つ以上すなわち、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれより多くをコードするオープンリーディングフレームを含む。一実施形態において、AI-2は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、およびSAG1406のうちの2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含む。あるいは、AI-2は、01520、01521、01522、01523、01523、01524、および01525のうちの2つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含み得る。上記表面タンパク質のうちの1つ以上は、代表的には、LPXTGモチーフ例えば、LPTXG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。上記GBSAI-2ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると考えられる。GBSAI-2は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、AI-2は、少なくとも2つの表面タンパク質と少なくとも1つのソルターゼとをコードし得る。好ましくは、GBSAI-2は、少なくとも3つの表面タンパク質と少なくとも2つのソルターゼとをコードする。上記AI-2表面タンパク質のうちの1つ以上は、LPXTGまたは他のソルターゼ基質モチーフを含み得る。上記表面タンパク質のうちの1つ以上はまた、代表的には、ピリンモチーフを含み得る。上記ピリンモチーフは、ピリ線毛形成に関与し得る。LPXTGモチーフのスレオニン残基とグリシン残基との間における、ソルターゼによるAI表面タンパク質の切断は、ソルターゼのチオエステル結合型アシル中間体を生じる。ピリンモチーフ中の最初のリジン残基は、切断されたLPXTGモチーフのアミノ基アクセプターとして作用し得、それにより、AIサブユニット間に共有結合を提供してピリ線毛を形成し得る。例えば、上記ピリンモチーフは、上記アシル酵素に対する求核性攻撃を行って、AIサブユニット間に共有結合を提供してピリ線毛を形成し得、そして上記ソルターゼ酵素を再生し得る。GBSAI-2タンパク質中に存在し得るピリンモチーフのいくつかの例としては、YPKNX8K;配列番号158、PKX8K;配列番号159、YPKX9K;配列番号160、PKNX8K;配列番号161、またはPKX10K;配列番号162が挙げられる。表面タンパク質のうちの1つ以上はまた、Eボックスモチーフを含み得る。Eボックスモチーフは、線毛形成のために必要であると考えられる保存されたグルタミン酸残基を含む。Eボックスモチーフのいくつかの例は、アミノ酸配列YxLxETxAPxG配列番号163、YxxxExxAxxGY配列番号164、YxLxExxxPxDY配列番号165、またはYxLxETxAPxGY配列番号152を含み得る。図3に示すように、GBSAI-2は、GBS67、GBS59およびGBS150の表面に露出したタンパク質ならびにSAG1406およびSAG1405のソルターゼを含み得る。あるいは、GBSAI-2は、タンパク質01521、01524および01525ならびにソルターゼ01520および01522を含み得る。GBS067および01524は、好ましいAI-2表面タンパク質である。AI-2はまた、多岐転写型転写調節因子例えば、RofA様タンパク質例えば、rogBを含み得る。AI-1の場合のように、rogBは、AI-2オペロンの発現を調節すると考えられる。数種のGBS血清型内のAI-2の概略図を図4に示す示される割合は、2603配列とのアミノ酸同一性である。AI-2表面タンパク質GBS59およびGBS67は、GBS血清型にわたって、相当するAI-1表面タンパク質より可変性であるが、AI-2表面タンパク質GBS67は、AI-1表面タンパク質が破壊または欠失するGBS血清型において保存されるように見える。例えば、上記および図2で議論したように、AI-1GBS80表面タンパク質は、GBS血清型II菌株単離体18RS21において断片化される。この同じ配列についてのAI-2内で、図4に示すように、GBS67表面タンパク質は、菌株単離体2603において対応する配列と99のアミノ酸配列相同性を有する。同様に、AI-1GBS80表面タンパク質は、GBS血清型Ib菌株単離体H36BおよびGBS血清型Ia菌株単離体515において欠失しているように見える。しかしながら、これらの配列についてのAI-2内で、GBS67表面タンパク質は、菌株単離体2603において対応する配列と97~99のアミノ酸配列相同性を有する。GBS67は、2つの対立遺伝子改変体を有するように見え、この対立遺伝子改変体は、菌株2603およびH36Bとの相同パーセントに従って分けられ得る。図237~239を参照のこと。GBS67とは異なり、GBS59のアミノ酸配列同一性は、異なるGBS株にわたって可変性である。図63および224に示すように、GBS株単離体2603のGBS59は、GBS株18RS21と100のアミノ酸残基相同性、GBS株H36Bと62のアミノ酸残基相同性、GBS株515およびGBS株CJB111と48のアミノ酸残基相同性、およびGBS株NEM316と47のアミノ酸残基相同性を共有する。異なるGBS株のアミノ酸配列相同性は、GBS59の2つのアイソフォームが存在することを示唆している。第1のアイソフォームは、GBS株CJB111、NEM316および515のGBS59タンパク質を含むように見える。第2のアイソフォームは、GBS株18RS21、2603およびH36BのGBS59タンパク質を含むように見える図63および224を参照のこと。GBS59アイソフォームにおける可変性から予想されるように、第1のGBS59アイソフォームに特異的な抗体は、第2ではなく第1のGBS59アイソフォームを検出し、そして第2のGBS59アイソフォームに特異的な抗体は、第1ではなく第2のGBS59アイソフォームを検出する。図226Aこれは、GBS59表面発現についてPCRを用いて検出されるGBS59遺伝子を有する28のGBS株のFACS分析を示すを参照のこと。この28のGBS株の各々について、FACS分析を、GBS59アイソフォーム1α-cjb111またはGBS59アイソフォーム2α-2603についての抗体のいずれかを用いて行った。2つの抗体のうちの1つのみが、各GBS株に対してGBS59表面発現を検出した。ネガティブコントロールの場合、GBS59遺伝子がPCRによって検出可能でないGBS株は、有意なGBS59表面発現レベルを有さなかった。図226B。また、GBS59は、相同性GBS59タンパク質を発現するGBS株に対してのみオプソニンである。図225を参照のこと。1つの実施形態において、本発明の免疫原性組成物は、GBS59タンパク質の第1および第2のアイソフォームを含み、GBSAI-2由来のポリペプチドを発現する広範囲のGBS血清型にわたって保護を提供する。第1のアイソフォームは、GBS株CJB111、NEM316または515のGBS59タンパク質であり得る。第2のアイソフォームは、GBS株18RS21、2603またはH36BのGBS59タンパク質であり得る。GBS59をコードする遺伝子は、多数のGBS単離体において同定されており;GBS59遺伝子は、試験された40のGBS単離体のうちの31において検出された77.5。GBS59タンパク質はまた、GBS株由来の全抽出物において線毛の一部として提示されるように見える。図64は、GBS株CJB111のGBS59に対して惹起される抗血清を用いる、GBS株のCJB111、7357B、COH31、D1363C、5408、1999、5364、5518および515の全抽出物における高分子量のGBS59ポリマーの検出を示す。図65はまた、GBS株のD136C、515、およびCJB111の全抽出物におけるこれらの高分子量のGBS59ポリマーの抗-GBS59抗血清を用いた検出を示す株515におけるGBS59高分子量ポリマーの検出についての図220Aもまた参照のこと。図65は、GBS59の異なるアイソフォームの存在を確認する。2つの異なるGBS59アイソフォームに対して惹起された抗血清は、全抽出物のGBS株起源に依存する異なる型の免疫反応性を生じる。図65はさらに、精製されたGBS59調製物におけるGBS59モノマーの検出を示す。GBS59はまた、GBS株の表面上に高度に発現される。GBS59は、GBSCJB111のGBS59に対して惹起されたマウス抗血清を用いるFACS分析によって、GBS株のCJB111、DK1、DK8、Davis、515、2986、5551、1169および7357Bの表面上に検出された。FACS分析は、GBS59遺伝子を含まないGBS株のSMU071、JM9130013、およびCOH1においてGBS59の表面発現を検出しなかった図66を参照のこと。GBS株515菌の表面上の免疫電子顕微鏡によるGBS59の検出により、GBSの表面上にGBS59が発現されることがさらに確認される。図215を参照のこと。GBS67およびGBS150もまた、高分子量構造物または線毛に含まれるように見える。図69は、全GBS株515抽出物における高分子量構造物と抗-GBS67および抗-GBS150との免疫反応を示す図220BおよびCもまた参照のこと。図69において、GBS株2603のGBS59での免疫後にマウスにおいて惹起された抗-GBS59抗血清が、GBS株515においてGBS59とクロスハイブリダイズcross-hybridizeしないこともまた、留意すべきである。GBS株515のGBS59は、GBS株2603のGBS59より異なるアイソタイプのものである。図63これらの2つのGBS59ポリペプチドの相同性は48であることを示す、および図65GBS株2603に対して惹起されるGBS59抗血清は、GBS株515のGBS59とクロスハイブリダイズしないことを確認するを参照のこと。線毛含有GBS150の形成は、GBS67発現を必要としないようである。図70は、GBS株515全抽出物におけるよりも高分子量の構造物と抗-GBS67および抗-GBS150抗血清との免疫反応を示すウエスタンブロットを提供する。GBS67発現を欠くGBS株515において、抗-GBS67抗血清はもはや、全抽出物においてポリペプチドと免疫反応しないが、抗-GBS150抗血清はまだ、高分子量構造物とクロスハイブリダイズし得る。同様に、線毛含有GBS59の形成は、GBS67発現を必要としないようである。予想されるように、FACSは、野生型GBS株515におけるGBS67細胞表面発現を検出するが、GBS67をノックアウトされたGBS株515細胞を検出しない。しかしながら、抗-GBS59抗血清を用いるFACS分析は、野生型GBS株515細胞およびGBS67をノックアウトされたGBS株515細胞の両方においてGBS59発現を検出する。従って、GBS59細胞表面発現は、GBS67発現に関わらずGBS株515細胞において検出される。GBS67は、線毛に存在するが、GBS株515細胞の表面付近に局在化しているように見える。図216に示した免疫電子顕微鏡写真を参照のこと。GBS67は、フィブロネクチンに結合する。図217を参照のこと。GBSAI-2によってコードされる線毛の形成は、GBS59の発現を必要する。株515菌由来のGBS59の欠失は、GBS59図221A、レーン3、GBS67図221B、レーン3、およびGBS150図221C、レーン3に結合する抗体による高分子量構造物の検出を排除する。対照的に、GBS67遺伝子を欠失させた515菌のウエスタンブロット分析により、GBS59図221A、レーン2およびGBS150図221C、レーン2の抗血清を用いて、高分子量構造物が検出される。同様に、GBS150遺伝子を欠失させた515菌のウエスタンブロット分析により、GBS59図221A、レーン4およびGBS67図221B、レーン4を用いて、高分子量構造物が検出される。図223これは、GBS59、GBS67およびGBS150についての抗体で検索interrogateされる515株の各々のウエスタンブロットを提供するもまた参照のこと。GBS59またはGBS67のいずれかを欠失した株515菌のFACS分析により、これらの結果が確認される。図222GBS59の欠失のみが、GBS59およびGBS67の両方の表面発現を破壊することを示すを参照のこと。GBSAI-2によってコードされる線毛の形成もまた、両方のGBSアドヘシンアイランド2によってコードされたソルターゼの発現を必要とする。図218Srt1、Srt2またはSrt1およびSrt2の両方を欠く株515菌のウエスタンブロット分析を提供するを参照のこと。Str1およびStr2の両方の欠失のみは、GBS59、GBS67およびGBS150の各々とクロスハイブリダイズする抗体によって検出されるように線毛構築物を破壊する。ウエスタンブロット分析の結果はFACSによって実証され、これは、同様の結果を提供した。図219を参照のこと。図4に示すように、GBS株単離体のうちの2つCOH1およびA909は、表面タンパク質GBS59およびGBS67との相同体を含まないように見える。これらの2つの株について、図4に示す割合は、COH1タンパク質とのアミノ酸同一性である。これらの2つの株についての表面タンパク質の長さの相違にもかかわらず、これらの配列内のAI-2はまだ、2つのソルターゼタンパク質および3つのLPXTG含有表面タンパク質、ならびに第1の表面タンパク質に誘導するシグナルペプチダーゼ配列を含む。AI-2、spb1のこの改変体における表面タンパク質のうちの1つは、潜在的付着タンパク質として以前に同定されているAddersonら、InfectionandImmunity20037112:6857-6863を参照のこと。あるいは、GBS59配列およびGBS67配列の欠失に起因して、AI-2のこの改変体は、第3の型のAIであり得るアドヘシンアイランド-3、AI-3またはGBSAI-3。1つより多いAI表面タンパク質は、本発明のオリゴマーである、線毛様構造物において存在し得る。例えば、GBS59およびGBS67は、オリゴマー構造物に組み込まれ得る。あるいは、GBS59およびGBS150は、オリゴマー構造物に組み込まれ得、またはGBS59、GBS150およびGBS67は、オリゴマー構造物に組み込まれ得る。別の実施形態において、本発明は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む組成物を含む。この組成物は、同じアドヘシンアイランド由来の表面タンパク質を含み得る。例えば、この組成物は、2つ以上のGBSAI-2表面タンパク質例えば、GBS59、GBS67およびGBS150を含み得る。この表面タンパク質は、グラム陽性菌から単離され得るか、またはそれらは、組換えて産生され得る。GASアドヘシンアイランド上記に議論したように、出願人は、少なくとも4種の異なるGASアドヘシンアイランドを同定した。これらのアドヘシンアイランドは、細菌の毒性において重要である表面タンパク質をコードすると考えられ、出願人は、A群連鎖球菌の表面上のハイパーオリゴマー線毛構造物においてこれらのアドヘシンアイランドタンパク質の存在を現す電子顕微鏡写真を得た。A群連鎖球菌は、咽頭炎および膿痂疹から生命を脅かす侵襲性疾患および壊死性筋膜炎に及ぶ広範囲の疾患を引き起こすヒト特異的病原体である。さらに、連鎖球菌自己免疫反応後もなお、小児における心臓病理の主要な要因である。ヒト宿主のA群連鎖球菌感染は一般に、3つの局面で発生する。第1の局面は、細菌の宿主組織への付着および/または侵入、ならびに細胞外間隙内の細菌の増殖に関する。一般に、この付着の局面は、咽頭または皮膚において開始する。より深い組織レベルへの感染は、より重篤な損傷を引き起こし得る。感染の第2の段階において、細菌は、周囲組織へ、またはさらに脈管構造を通って全身へと拡散する可溶性毒素を分泌する。この毒素は、感受性の宿主細胞レセプターに結合し、これらの宿主細胞によって不適切な免疫応答を誘発し、病状を生じる。毒素は、宿主全体にわたって拡散し得るので、GAS毒素によって直接引き起こされる壊死は、細菌感染から離れた部位の身体上に位置し得る。GAS感染の最終的な局面は、元の細菌が宿主系から除去されたずっと後に生じ得る。この段階で、GAS細菌に対する宿主の以前の免疫応答は、GAS表面タンパク質、Mのエピトープと宿主組織例えば、心臓との間の交差反応に起因する。GAS感染の一般的な概説は、PrinciplesofBacterialPathogenesis、Groisman編、第15章2001において見出され得る。GAS感染の後期段階に関連する病原性の影響を防ぐために、GASに対する効果的なワクチンは、好ましくは、初期の付着および侵入段階の間に細菌の宿主の除去を促進する。A群連鎖球菌の単離体は、歴史的に、上記のM表面タンパク質に従って分類されている。Mタンパク質は、α螺旋形成において2つのポリペプチド鎖複合型を一般に含む表面に露出したトリプシン感受性タンパク質である。カルボキシ末端は、細胞膜に係留され、全てのA群連鎖球菌の間で高度に保存される。細胞壁から細胞表面に伸長するアミノ末端は、Mタンパク質の80以上の血清型の間で観察される抗原の可変性を担う。第2層の分類は、可変性のトリプシン耐性表面抗原一般にT抗原と呼ばれるに基づく。MおよびT血清学分類に基づいた数10年間の疫学は、生物学的多様性および潜在的なA群連鎖球菌が原因である疾患に関する研究を中心としている。Mタンパク質成分およびその固有の可変性が、広範に特徴付けられているが、50年間の研究の後でさえ、依然として、T抗原の構造および可変性についてほとんど知られていない。T型を規定する抗血清は、Sevapharmahttp://www.sevapharma.cz/enを含む数種の供給源から市販されている。T抗原の1つの形態、T6型GASD741のM6株由来をコードする遺伝子は、クローニングされて、特徴付けられており、約11kbの非常に可変性の病原性アイランドまでマッピングしている。Schneewindら、J.Bacteriol.19901726:3310-3317。このアイランドは、T6コード遺伝子tee6に加えて、細胞外マトリックスECM結合タンパク質をコードする遺伝子のファミリーの一員を含むために、フィブロネクチン結合T抗原、コラーゲン結合T抗原FCT領域として公知である。Bessenら、InfectionImmunity2002703:1159-1167。この遺伝子ファミリーの数種のタンパク質生成物は、フィブロネクチンおよび/またはコラーゲンのいずれかと直接的に結合することが示されている。Hanskiら、InfectionImmunity19926012:5119-5125;Talayら、InfectionImmunity1992609:3837-3844;Jaffeら1996212:373-384;Rochaら、AdvExpMedBiol.1997418:737-739;Kreikemeyerら、J.BiolChem200427916:15850-15859;Podbielskiら、Mol.Microbiol.1999314:1051-64;およびKreikemeyerら、Int.J.MedMicrobiol20042942-3:177-88を参照のこと。いくつかの場合において、付着および侵入におけるこれらのタンパク質の役割についての直接的な証拠が得られている。出願人は、tee6遺伝子の組換え産物に対する抗血清を惹起させて、M6株2724においてT6の発現を調べるためにそれを使用した。この株のミュータノリシンmutanolysin抽出物の免疫ブロット法において、産物の予測される分子量に相当するバンドに加えて、その抗血清は、約100kDaから、使用される3~8の勾配ゲルの分解能を超える移動性の範囲に及ぶ非常に高分子量のラダーを認識した。高分子量産物のパターンは、Streptococcusagalactiae上記において同定された線毛およびCorynebacteriumdiphtheriaeにおいて以前に同定された線毛のタンパク質成分の免疫ブロット法において観測されるものと類似している。tee6の産物に特異的な抗血清を用いた株M6_2724の電子顕微鏡法は、十分な表面染色および細菌表面から700ナノメートルまで伸びる長い線毛様構造物を示し、T6タンパク質元のランスフィールドLancefield血清型分類系において認識される抗原のうちの1つは、GASアドヘシンアイランドGASAI-1内に位置し、長い共有結合された線毛構造物を形成することを明らかにした。出願人は、少なくとも4種の異なるA群連鎖球菌アドヘシンアイランドを同定した。これらのGASAI配列は、多数のM型において同定され得るが、出願人は、驚くべきことに、4種の異なるGASAI型由来の4種の主要な線毛サブユニットと特定のT分類との間の関係を発見した。他のトリプシン耐性の、表面に露出したタンパク質もまた、同様に、T分類指定に関係しているようであるが、T分類およびGAS血清型の相違におけるGASアドヘシンアイランドおよび関連するハイパーオリゴマー線毛様構造物の役割の発見は、GAS感染の予防および処置についての重要な意味を有する。出願人は、線毛形成に関連する各々のGASアドヘシンアイランド内のタンパク質成分を同定した。これらのタンパク質は、細菌の初期の付着機構に関連すると考えられている。これらのタンパク質の免疫学的認識は、宿主免疫応答に、より病原性の感染の後期段階への細菌の転位を遅くさせ得るか、または予防させ得る。さらに、出願人は、GBS線毛構造物が、バイオフィルムしばしば、エキソポリサッカライドマトリックス内に囲まれる表面上で増殖する細菌の集団の形成に関係しているように見えることを発見した。抗生物質処置および宿主免疫応答は、バイオフィルムの全ての細菌成分を頻繁に根絶できないので、バイオフィルムは一般に、細菌耐性と関連する。細菌付着の最初の段階すなわち、完全なバイオフィルム形成の前の間に露出する表面タンパク質に対する宿主免疫応答の方向付けが好まししい。従って、本発明は、宿主上皮細胞に対するそれらの初期の付着の試みの間にGAS細菌を標的とし得るGAS感染に対する改良された免疫原性組成物を提供し、広範囲のGAS血清型に対する防御を提供し得る。本発明の免疫原生組成物は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛の形態で処方され得るGASAI表面タンパク質を含む。本発明はまた、GASAI表面タンパク質の組み合わせを含む。GASAI表面タンパク質の組み合わせは、同じアドヘシンアイランドから選択され得るか、またはそれらは、異なるGASアドヘシンアイランドから選択され得る。単離体にわたって、GASAI成分の数および配列において驚くべき可変性が存在するが、GASAI配列は、一般に、アイランド内のソルターゼ配列の数および型ならびにアイランド内の他のタンパク質の同一性の割合に依存して、1型、2型、3型および4型として特徴付けられ得る。GASアドヘシンアイランドの概略図を、図51Aおよび図162に示す。今まで同定された全ての株において、アドヘシンアイランド領域は、高度に保存されたオープンリーディングフレームM1_123およびM1_136に隣接する。各々のGASアドヘシンアイランドにおける3と5との間の遺伝子は、LPXTGモチーフを含むECMに結合する付着タンパク質をコードする。GASアドヘシンアイランド1上記に議論したように、出願人は、A群連鎖球菌血清型および単離体ゲノム内にアドヘシンアイランドGASアドヘシンアイランド1またはGASAI-1を同定した。GASAI-1は、表面タンパク質およびソルターゼGASAI-1タンパク質を含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ5個のオープンリーディングフレームを含む。GASAI-1は、好ましくは、表面タンパク質、srtBソルターゼ、およびrofA多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI-1表面タンパク質は、フィブロネクチン結合タンパク質を、コラーゲン付着タンパク質および線毛構造物サブユニットを含み得る。好ましくは、これらのGASAI-1表面タンパク質の各々は、LPXTGソルターゼ基質モチーフ例えば、LPXTG配列番号122またはLPXSG配列番号134を含むトレオニンのセリンによる保存的置換。具体的には、GASAI-1は、2つ以上すなわち、2、3、4または5のM6_Spy0157、M6_Spy0158、M6_Spy0159、M6_Spy0160、M6_Spy0161をコードするオープンリーディングフレームを含む。出願人はまた、AI-1を有する他のGAS菌において線毛構造物サブユニットをコードするオープンリーディングフレームを同定した。これらのオープンリーディングフレームは、線毛構造物サブユニットCDCSS410_線毛fimbrial、ISS3650_線毛fimbrial、およびDSM2071_線毛fimbrialをコードする。GASAI-1は、CDCSS410_線毛fimbrial、ISS3650_線毛fimbrial、およびDSM2071_線毛fimbrialのうちの任意の1つをコードするポリヌクレオチドを含み得る。上記に議論したように、GASAI-1のハイパーオリゴマー線毛構造物は、T抗原6型分類を担っているようであり、そしてGASAI-1は、以前にtee6と同定されたFCT領域に相当するように見える。GASAI-1の場合、tee6FCT領域は、コラーゲン付着タンパク質cpa、莢膜多糖付着およびフィブロネクチン結合タンパク質prtF1をコードするオープンリーディングフレームを含む。tee6、M6_Spy160に相当するGASAI-1線毛構造物サブユニットの免疫ブロット法は、ハイパーオリゴマー線毛構造物を示す高分子量構造物を表す。Cpaに特異的な抗血清を用いる免疫ブロット法もまた、高分子量のラダー構造物を認識し、GASAI-1線毛構造物または形成においてCpaの関与を示す。GAS細菌のEM写真において、Cpa抗血清は、細菌の表面上に十分な染色および時折、細菌の表面から伸長する金の粒子を示す。対照的に、PrtF1に特異的な抗血清を用いる免疫ブロットは、その予想される分子量に相当する電気泳動度で単一分子種のみを認識し、PrtF1がオリゴマー線毛構造物と関連し得ないことを示す。好ましい本発明の免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方または精製され得るGASAI-1表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているGASAI-1表面タンパク質を含む。GASAI-1表面タンパク質を含むオリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物において使用するために精製され得るか、またはそうでなければ処方され得る。GASAI-1オープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列に置換され得る。あるいは、GASAI-1オープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列に置換され得る。GASAI-1表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。GASAI表面タンパク質のLPXTGソルターゼ基質モチーフは一般に、式XXXXG表され得、ここで、アミノ酸1位におけるXはL、V、EまたはQであり、アミノ酸1位におけるXがLである場合、アミノ酸2位におけるXはPであり、アミノ酸1位におけるXがEまたはQである場合、アミノ酸2位におけるXはVであり、アミノ酸1位におけるXがVである場合、アミノ酸2位におけるXは、VまたはPであり、アミノ酸3位におけるXは、任意のアミノ酸残基であり、アミノ酸1位におけるXがV、EまたはQである場合、アミノ酸4位におけるXは、Tであり、そしてアミノ酸1位におけるXがLである場合、アミノ酸4位におけるXがT、SまたはAである。GASAI表面タンパク質に存在するLPXTGモチーフのいくつかの例は、LPSXG配列番号134、VVXTG配列番号135、EVXTG配列番号136、VPXTG配列番号137、QVXTG配列番号138、LPXAG配列番号139、QVPTG配列番号140、およびFPXTG配列番号141を含む。本発明のGSAAI表面タンパク質は、GAS細菌の、上皮細胞に付着し、侵入する能力に影響し得る。AI表面タンパク質はまた、GASの、上皮細胞の層を通って転位する能力に影響し得る。好ましくは、1つ以上のGASAI表面タンパク質は、上皮細胞表面と結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。GASAI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、または会合し得る。上記GASAI-1ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与していると予測される。GASAI-1は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-1は、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-1は、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記AI表面タンパク質は、膜会合トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌の細胞壁に共有結合され得る。このソルターゼは、好ましくはLPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間で、表面タンパク質を切断するように機能し得る。このソルターゼは、次いで、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆体例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成を補助し得る。この前駆体は、次いで、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移によって、ペプチドグリカン内に組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。GASAI-1は、好ましくは、srtBソルターゼを含む。特にモチーフにセリンが続く場合に、GASsrtBソルターゼは、好ましくは、LPSTGモチーフ配列番号166を有する表面タンパク質を係留する。一実施形態において、本発明は、GASAI-1表面タンパク質例えば、M6_Spy0157、M6_Spy0159、M6_Spy0160、CDCSS410_fimbrial、ISS3650_fimbrial、またはDSM2071_fimbrialを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を包含する。このオリゴマーの線毛様構造物は、多数の単位のAI表面タンパク質を含み得る。好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。なおさらに好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150もしくは200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含む。ここで、各サブユニットが、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。このオリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合され得る。このオリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、それぞれトレオニンアミノ酸残基またはセリンアミノ酸残基を介して、共有結合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。上記オリゴマーの線毛様構造物は、単独で使用されてもよいし、本発明の組み合わせにおいて使用されてもよい。一実施形態において、本発明は、オリゴマー形態の好ましくは、ハイパーオリゴマー形態のGASアドヘシンアイランドタンパク質を含む。一実施形態において、本発明は、1つ以上のGASアドヘシンアイランド1GASAI-1タンパク質と、1つ以上のGASアドヘシンアイランド2GASAI-2タンパク質、GASアドヘシンアイランド3GASAI-3タンパク質またはGASアドヘシンアイランド4GASAI-4タンパク質とを含む組成物を包含し、ここで、このGASアドヘシンアイランドタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態であり、好ましくはハイパーオリゴマーの形態である。GASAI-1タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-1は、RofAのような多岐転写型転写調節因子もまた含み得るすなわち、転写調節因子が、AIタンパク質オープンリーディングフレームに近接または隣接して位置するが、逆向きに転写される。GASアドヘシンアイランド2第2のアドヘシンアイランドGASアドヘシンアイランド2またはGASAI-2もまた、A群連鎖球菌血清型および単離体において同定されている。GASAI-2は、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体GASAI-2タンパク質をコードする、一連の約8個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、GASAI-2は、GAS15、Spy0127、GAS16、GAS17、GAS18、Spy0131、Spy0133およびGAS20のうちの2つ以上すなわち、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つまたは8つをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方または精製され得るGASAI-2表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、このオリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているGASAI-2表面タンパク質を含む。GASAI-2表面タンパク質を含むオリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物における使用のために、精製され得るか、またはそうでなければ処方され得る。1つ以上のGASAI-2オープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列は、置換されるORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-2オープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されるORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。1つ以上のGASAI-2表面タンパク質配列は、代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のAI表面タンパク質は、GAS細菌の、上皮細胞に付着し、侵入する能力に影響し得る。AI表面タンパク質はまた、GASの、上皮細胞の層を通って転位する能力に影響し得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面と結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、または会合し得る。上記GASAI-2ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与していると予測される。GASAI-2は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-2は、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-2は、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記AI表面タンパク質は、膜会合トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌の細胞壁に共有結合され得る。このソルターゼは、好ましくはLPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間で、表面タンパク質を切断するように機能し得る。このソルターゼは、次いで、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆体例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成を補助し得る。この前駆体は、次いで、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移によって、ペプチドグリカン内に組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。一実施形態において、本発明は、AI表面タンパク質例えば、GAS15、GAS16またはGAS18を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を包含する。このオリゴマーの線毛様構造物は、多数の単位のAI表面タンパク質を含み得る。好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。なおさらに好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150もしくは200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含む。ここで、各サブユニットが、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。このオリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合され得る。このオリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニンアミノ酸残基を介して、共有結合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。上記オリゴマーの線毛様構造物は、単独で使用されてもよいし、本発明の組み合わせにおいて使用されてもよい。一実施形態において、本発明は、オリゴマー形態の好ましくは、ハイパーオリゴマー形態のGASアドヘシンアイランドタンパク質を含む。一実施形態において、本発明は、1つ以上のGASアドヘシンアイランド2GASAI-2タンパク質と、1つ以上のGASアドヘシンアイランド1GASAI-1タンパク質、GASアドヘシンアイランド3GASAI-3タンパク質またはGASアドヘシンアイランド4GASAI-4タンパク質とを含む組成物を包含し、ここで、このGASアドヘシンアイランドタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態であり、好ましくはハイパーオリゴマーの形態である。GASAI-2タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-2は、rofAのような多岐転写型転写調節因子もまた含み得るすなわち、転写調節因子が、AIタンパク質オープンリーディングフレームに近接または隣接して位置するが、逆向きに転写される。GASアドヘシンアイランド3第3のアドヘシンアイランドGASアドヘシンアイランド3またはGASAI-3もまた、いくつかのA群連鎖球菌血清型および単離体において同定されている。GASAI-3は、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体GASAI-3タンパク質をコードする、一連の約7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、GASAI-3は、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0101、SPs0102、SPs0103、SPs0104、SPs0105、SPs0106、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、orf84、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150およびSpyoM01000149の2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7をコードするオープンリーディングフレームを含む。1つの実施形態において、GASAI-3は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のSpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、およびSpyM3_0104をコードするオープンリーディングフレームを含む。別の実施形態において、GASAI-3は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のSPs0100、SPs0101、SPs0102、SPs0103、SPs0104、SPs0105、およびSPs0106をコードするオープンリーディングフレームを含む。さらなる実施形態において、GASAI-3は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のorf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、およびorf84をコードするオープンリーディングフレームを含む。さらに別の実施形態において、GASAI-3は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のspyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、およびspyM18_0132をコードするオープンリーディングフレームを含む。別のさらなる実施形態において、GASAI-3は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のSpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、およびSpyoM01000149をコードするオープンリーディングフレームを含む。出願人はまた、AI-3を有する他のGAS菌において線毛構造物サブユニットをコードするオープンリーディングフレームを同定した。これらのオープンリーディングフレームは、線毛構造物サブユニットISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialをコードする。GASAI-3は、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialのうちのいずれか1つをコードするポリヌクレオチドを含み得る。1つ以上のGASAI-3オープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列は、置換されるORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-3オープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されるORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方または精製され得るGASAI-3表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、このオリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているGASAI-3表面タンパク質を含む。GASAI-3表面タンパク質を含むオリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物における使用のために、精製され得るか、またはそうでなければ処方され得る。1つ以上のGASAI-3表面タンパク質配列は、代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のAI表面タンパク質は、GAS細菌の、上皮細胞に付着し、侵入する能力に影響し得る。AI表面タンパク質はまた、GASの、上皮細胞の層を通って転位する能力に影響し得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面と結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、または会合し得る。上記GASAI-3ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与していると予測される。GASAI-3は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-3は、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-3は、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記AI表面タンパク質は、膜会合トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌の細胞壁に共有結合され得る。このソルターゼは、好ましくはLPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間で、表面タンパク質を切断するように機能し得る。このソルターゼは、次いで、トレオニンまたはアラニンのカルボキシル基と細胞壁前駆体例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成を補助し得る。この前駆体は、次いで、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移によって、ペプチドグリカン内に組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。本発明は、SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0102、SPs0104、SPs0106、orf78、orf80、orf82、orf84、spyM18_0126、spyM18_0128、spyM18_0130、spyM18_0132、SpyoM01000155、SpyoM01000153、SpyoM01000151、SpyoM01000149、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrialおよびISS4959_線毛fimbrialのようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。1つの実施形態において、本発明は、SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102およびSpyM3_0104のようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。別の実施形態において、本発明は、SPs0100、SPs0102、SPs0104およびSPs0106のようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。別の実施形態において、本発明は、orf78、orf80、orf82およびorf84のようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。さらなる別の実施形態において、本発明は、spyM18_0126、spyM18_0128、spyM18_0130およびspyM18_0132のようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。さらなる実施形態において、本発明は、SpyoM01000155、SpyoM01000153、SpyoM01000151およびSpyoM01000149のようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。またさらなる実施形態において、本発明は、ISS3040_線毛fimbrial、ISS3776_線毛fimbrial、およびISS4959_線毛fimbrialのようなAI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含み得る。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーのサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニンアミノ酸残基を介して共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。上記オリゴマーの線毛様構造物は、単独で使用されてもよいし、本発明の組み合わせにおいて使用されてもよい。一実施形態において、本発明は、オリゴマー形態の好ましくは、ハイパーオリゴマー形態のGASアドヘシンアイランドタンパク質を含む。一実施形態において、本発明は、1つ以上のGASアドヘシンアイランド3GASAI-3タンパク質と、1つ以上のGASアドヘシンアイランド1GASAI-1タンパク質、GASアドヘシンアイランド2GASAI-2タンパク質またはGASアドヘシンアイランド4GASAI-4タンパク質とを含む組成物を包含し、ここで、このGASアドヘシンアイランドタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態であり、好ましくはハイパーオリゴマーの形態である。GASAI-3タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-3は、Nraのような多岐転写型転写調節因子もまた含み得る。GASアドヘシンアイランド4第4のアドヘシンアイランドGASアドヘシンアイランド4またはGASAI-4もまた、A群連鎖球菌血清型および単離体において同定されている。GASAI-4は、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体GASAI-4タンパク質をコードする、一連の約8個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、GASAI-4は、19224134、19224135、19223136、19223137、19224138、19224139、19224140、および19224141のうちの2つ以上すなわち、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つまたは8つをコードするオープンリーディングフレームを含む。出願人はまた、AI-4を有する他のGAS菌において線毛構造物サブユニットをコードするオープンリーディングフレームを同定した。これらのオープンリーディングフレームは、線毛構造物サブユニット20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、およびISS4538_線毛をコードする。GASAI-4は、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、およびISS4538_線毛のうちのいずれか1つをコードするポリヌクレオチドを含み得る。1つ以上のGASAI-4オープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列は、置換されるORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、GASAI-4オープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されるORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態で処方または精製され得るGASAI-4表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、このオリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているGASAI-4表面タンパク質を含む。GASAI-4表面タンパク質を含むオリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物における使用のために、精製され得るか、またはそうでなければ処方され得る。1つ以上のGASAI-4表面タンパク質配列は、代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のAI表面タンパク質は、GAS細菌の、上皮細胞に付着し、侵入する能力に影響し得る。AI表面タンパク質はまた、GASの、上皮細胞の層を通って転位する能力に影響し得る。好ましくは、1つ以上のAI表面タンパク質は、上皮細胞表面と結合し得るか、またはそうでなければ上皮細胞表面と会合し得る。AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、または会合し得る。上記GASAI-4ソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与していると予測される。GASAI-4は、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、GASAI-4は、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、GASAI-4は、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。上記AI表面タンパク質は、膜会合トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌の細胞壁に共有結合され得る。このソルターゼは、好ましくはLPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間で、表面タンパク質を切断するように機能し得る。このソルターゼは、次いで、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆体例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成を補助し得る。この前駆体は、次いで、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移によって、ペプチドグリカン内に組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。一実施形態において、本発明は、AI表面タンパク質例えば、19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛,ISS4883_線毛、およびISS4538_線毛を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を包含する。このオリゴマーの線毛様構造物は、多数の単位のAI表面タンパク質を含み得る。好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。なおさらに好ましくは、このオリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150もしくは200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含む。ここで、各サブユニットが、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。このオリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合され得る。このオリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニンアミノ酸残基を介して、共有結合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。上記オリゴマーの線毛様構造物は、単独で使用されてもよいし、本発明の組み合わせにおいて使用されてもよい。一実施形態において、本発明は、オリゴマー形態の好ましくは、ハイパーオリゴマー形態のGASアドヘシンアイランドタンパク質を含む。一実施形態において、本発明は、1つ以上のGASアドヘシンアイランド4GASAI-4タンパク質と、1つ以上のGASアドヘシンアイランド1GASAI-1タンパク質、GASアドヘシンアイランド2GASAI-2タンパク質またはGASアドヘシンアイランド3GASAI-3タンパク質とを含む組成物を包含し、ここで、このGASアドヘシンアイランドタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態であり、好ましくはハイパーオリゴマーの形態である。GASAI-4タンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、GASAI-4は、rofAのような多岐転写型転写調節因子もまた含み得るすなわち、転写調節因子が、AIタンパク質オープンリーディングフレームに近接または隣接して位置するが、逆向きに転写される。本発明のオリゴマーの線毛様構造物は、1つ以上のさらなるGASタンパク質と組み合わされ得る。1つの実施形態において、オリゴマーの線毛様構造物は、第2のGASタンパク質と組み合わせた1つ以上のAI表面タンパク質を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、細菌がAI表面タンパク質を発現する細菌培養物から単離または精製され得る。従って、本発明は、オリゴマーAI表面抗原を製造するための方法を包含し、この方法は、オリゴマーAIタンパク質を発現するGAS細菌を培養する工程およびGAS細菌由来の発現されたオリゴマーのAIタンパク質を単離する工程を包含する。AIタンパク質は、上清への分泌物から収集され得るか、または細菌表面から精製され得る。この方法はさらに、発現されたAIタンパク質の精製を含み得る。好ましくは、AIタンパク質は、ハイパーオリゴマー形態である。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質を過剰発現する細菌培養物から単離または精製され得る。従って、本発明は、オリゴマーアドヘシンアイランド表面タンパク質抗原を製造するための方法を包含し、この方法は、AIタンパク質発現およびGAS細菌由来の発現されたオリゴマーアドヘシンアイランドの単離を増加させるために適合されたGAS細菌を培養する工程を包含する。AIタンパク質は、上清中への分泌物から収集され得るか、または細菌表面から精製され得る。この方法はさらに、発現されたアドヘシンアイランドタンパク質の精製を含み得る。好ましくは、アドヘシンアイランドタンパク質は、ハイパーオリゴマーの形態である。GAS菌は、好ましくは、少なくとも2例えば、2、3、4、5、8、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、125、150または200倍の野生型発現レベルにAIタンパク質発現を増加させるために適合される。GAS菌は、遺伝子量を増加させる方法および遺伝子アップレギュレーションの方法を含む、当該分野に公知の任意の手段によってAIタンパク質発現を増加させるために適合され得る。このような手段としては、例えば、AIタンパク質をコードするプラスミドでのGAS細菌の形質転換が挙げられる。プラスミドはまた、強力なプロモーターを含み得るか、またはAIタンパク質をコードする配列の複数のコピーを含み得る。必要に応じて、GAS菌ゲノム内にAIタンパク質をコードする配列は、欠失され得る。あるいは、またはさらに、GASアドヘシンアイランドを調節するプロモーターは、発現を増加させるために改変され得る。本発明はさらに、増加させたレベルのAI表面タンパク質を生成するために適合させたGAS菌を含む。特に、本発明は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマーAI表面タンパク質を生成するために適合させたGAS菌を含む。1つの実施形態において、本発明のグラム陽性菌は、不活性化または弱毒化されて、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌の送達をインビボで可能にする。本発明はさらに、それらの表面上の線毛に組み込まれる発現されたAIタンパク質のレベルを増加させるために適合されたGAS菌を含む。GAS菌は、GAS菌において、LepAポリペプチド、または当量のシグナルペプチダーゼの発現レベルを増加させることによって、その表面上にオリゴマーまたはハイパーオリゴマーAIタンパク質の増加された露出を有するように適合され得る。出願人は、GASAI-2を有するSF370菌株におけるLepAの欠失は、GAS上のMおよび線毛タンパク質の表面露出を消滅させることを示した。GASにおけるLepA発現の増加されたレベルは、GASの表面上のMおよび線毛タンパク質の増加させた露出を生じると予想される。GASにおけるLepAの増加された発現は、当該分野に公知の任意の手段例えば、遺伝子量の増加および遺伝子アップレギュレーションの方法によって達成され得る。増加されたレベルのLepA発現を有するように適合されたGAS菌は、増加されたレベルの少なくとも1つの線毛タンパク質を発現するようにさらに適合され得る。あるいは、本発明のAIタンパク質は、非病原性グラム陽性菌例えば、Streptococusgordonii例えば、Byrdら、Biologicalconsequencesofantigenandcytokineco-expressionbyrecombinantStreptococcusgordoniivaccinevectors、Vaccine200220:2197-2205を参照のことまたはLactococcuslactis例えば、Mannamら、MucosalVaccineMadefromLive,RecombinantLactococcuslactisProtectsMiceagainstPharangealInfectionwithStreptococcuspyogenesInfectionandImmunity2004726:3444-3450を参照のことの表面上に発現され得る。本明細書中で使用される場合、非病原性グラム陽性菌とは、ヒト宿主被験体と適合可能であり、ヒト病原性と関連しないグラム陽性菌をいう。好ましくは、非病原性菌は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態においてAI表面タンパク質を発現するように改変される。AI表面タンパク質および必要に応じて、AIソルターゼをコードする配列は、非病原性グラム陽性菌の細菌ゲノム内に組み込まれ得るか、またはプラスミド内に挿入され得る。非病原性グラム陽性菌は、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌のインビボでの送達を容易にするために不活性化され得るか、または弱毒化され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の細菌培養物から単離または精製され得る。例えば、AI表面タンパク質は、細胞抽出物または培養上清から単離され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の表面から単離または精製され得る。非病原性グラム陽性菌は、本明細書中に記載される任意のGASアドヘシンアイランドタンパク質を発現するために使用され得る。非病原性グラム陽性菌は、アドヘシンアイランド表面タンパク質を発現するように形質転換される。好ましくは、非病原性グラム陽性菌はまた、少なくとも1つのアドヘシンアイランドソルターゼを発現する。本発明のAI形質転換された非病原性グラム陽性菌は、病原性GASの感染を予防または処置するために使用され得る。出願人は、L.lactisを改変して、GBSポリペプチドと同様に、それが、GASAIポリペプチドを発現し得ることを示した。L.lactisは、AI-1、AI-2、およびAI-4アドヘシンアイランドの完全な線毛遺伝子クラスターをコードするpAM401構築物で形質転換された。簡単に言うと、pAM401は、プロモーターのないハイコピープラスミドである。M6AI-1、M1AI-2およびM12AI-4菌の完全な線毛遺伝子クラスターは、pAM401構築物に挿入された。遺伝子クラスターは、上記のL.lactisにおいてGBSAI-1アドヘシンアイランドの発現を首尾よく開始するそれら独自M6、M1またはM12のプロモーターまたはGBSプロモーターの制御下で転写された。図172は、GASM6AI-1、M1AI-2、およびM12AI-4アドヘシンアイランドの概略図を提供し、pAM401構築物に挿入されるアドヘシンアイランド配列の部分示す。M6、M1またはM12アドヘシンアイランド遺伝子クラスターの1つで形質転換されたL.lactisの各々は、それらのそれぞれの線毛に存在するポリペプチドに結合する抗体との免疫反応である高分子量構造物を発現した。図173A~Cは、各クラスターによってコードされる線毛構造物サブユニットに結合する抗体を用いて、M6図173A、M1図173B、またはM12図173Cアドヘシンアイランド遺伝子クラスターで形質転換されたL.lactisの表面タンパク質-富化抽出物のウエスタンブロット分析の結果を提供する。図173Aのレーン3および4は、線毛構造物サブユニットSpy0128に結合する抗体を用いて、M1AI-2由来のアドヘシンアイランド線毛遺伝子クラスターで形質転換されたL.lactisにおける高分子量構造物の欠失を示す。図173Bのレーン3およびレーン4は、線毛構造物サブユニットEftLSL.A.に結合する抗体を用いて、M12AI-4由来のアドヘシンアイランド線毛遺伝子クラスターで形質転換されたL.lactisにおける高分子量構造物の検出を示す。図173Cのレーン3は、線毛構造物サブユニットM6_Spy0160に結合する抗体を用いて、M6AI-1由来のアドヘシンアイランド線毛遺伝子クラスターで形質転換されたL.lactisにおける高分子量構造物の検出を示す。図173A~Cにおいて、AIサブタイプの表記のすぐ後のp1は、アドヘシンアイランドに存在するプロモーターが、アドヘシンアイランド遺伝子クラスターの転写を駆動するために使用されることを示し、そしてp2は、プロモーターが、上記のGBSプロモーターであったことを示す。従って、L.lactisは、オリゴマー形態におけるGASアドヘシンアイランドによってコードされた線毛構造物サブユニットを発現し得るように見える。あるいは、オリゴマーの線毛様構造物は、組換えて生成され得る。組換え宿主細胞系において生成される場合、AI表面タンパク質は、好ましくは、本発明のAIソルターゼのうちの1つ以上発現と協調して発現される。このようなAIソルターゼは、AI表面タンパク質サブユニットのオリゴマーまたはハイパーオリゴマー形成を容易にする。TIGR4アドヘシンアイランド由来のS.pneumoniae上で議論したように、出願人は、TIGR4由来のS.pneumoniaeのゲノム内のアドヘシンアイランドを同定した。TIGR4由来のS.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のSP0462、SP0463、SP0464、SP0465、SP0466、SP0467およびSP0468をコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るTIGR4由来のS.pneumoniaeAI表面タンパク質を含む。好ましい実施形態において、オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているTIGR4由来のS.pneumoniaeAI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae表面タンパク質を含むオリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛構造物は、免疫原性組成物における使用のために精製され得るか、またはそうでなければ処方され得る。TIGR4由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。TIGR4由来のS.pneumoniaeAI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のTIGR4由来のS.pneumoniaeAI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のTIGR4由来のS.pneumoniaeAI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。TIGR4AI表面タンパク質由来のS.pneumoniaeはまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。TIGR4由来のS.pneumoniaeAIソルターゼタンパク質表面タンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。TIGR4由来のS.pneumoniaeAIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、TIGR4由来のS.pneumoniaeAI例えば、SP0462、SP0463、SP0464またはSP0465を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明と組み合わせて使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてTIGR4由来のS.pneumoniaeAIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のTIGR4由来のS.pneumoniaeAIタンパク質および1つ以上のS.pneumoniae株670AIタンパク質を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。TIGR4由来のS.pneumoniaeAIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、TIGR4由来のS.pneumoniaeAIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株670アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株670のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株670アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株670AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のorf1_670、orf3_670、orf4_670、orf5_670、orf6_670、orf7_670、orf8_670をコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株670AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株670AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株670AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株670AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株670AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株670AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株670AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株670AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株670AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株670AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株670AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株670AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株670AI表面タンパク質例えば、orf3_670、orf4_670、またはorf5_670を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株670AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株670AIタンパク質および1つ以上のTIGR4由来S.pneumoniaeAIタンパク質を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株670AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株670AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株14CSR10アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株14CSR10のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株14CSR10アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株14CSR10AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_14CSR、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF6_14CSR、ORF7_14CSR、ORF8_14CSRをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株14CSR10AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株14CSR10AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株14CSR10AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株14CSR10AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株14CSR10AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株14CSR10AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株14CSR10AI表面タンパク質例えば、orf3_CSR、orf4_CSR、またはorf5_CSRを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株14CSR10AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株14CSR10AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または23FPoland16由来のS.pneumoniaeの任意の1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株14CSR10AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株14CSR10AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株19AHungary6アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株19AHungary6のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株19AHungary6アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株19AHungary6AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_19AH、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF6_19AH、ORF7_19AH、ORF8_19AHをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株19AHungary6AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株19AHungary6AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株19AHungary6AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株19AHungary6AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株19AHungary6AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株19AHungary6AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株19AHungary6AI表面タンパク質例えば、orf3_19AH、orf4_19AH、またはorf5_19AHを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株19AHungary6AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株19AHungary6AIタンパク質およびTIGR4、670、14CSR10、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIGR4AIタンパク質の任意の1つのものからの1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株19AHungary6AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株19AHungary6AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株19FTaiwan14アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株19FTaiwan14のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株19FTaiwan14アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株19FTaiwan14AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_19FTW、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF6_19FTW、ORF7_19FTW、およびORF8_19FTWをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株19FTaiwan14AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株19FTaiwan14AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株19FTaiwan14AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株19FTaiwan14AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株19FTaiwan14AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株19FTaiwan14AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株19FTaiwan14AI表面タンパク質例えば、orf3_19FTW、orf4_19FTW、またはorf5_19FTWを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株19FTaiwan14AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株19FTaiwan14AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、14CSR10、23FTaiwan15、または23FPoland16由来のS.pmeumoniaeの任意の1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株19FTaiwan14AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株19FTaiwan14AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株23FPoland16アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株23FPoland16のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株23FPoland16アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株23FPoland16AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_23FP、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF6_23FP、ORF7_23FP、およびORF8_23FPをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株23FPoland16AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株23FPoland16AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株23FPoland16AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株23FPoland16AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株23FPoland16AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株23FPoland16AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株23FPoland16AI表面タンパク質例えば、orf3_23FP、orf4_23FP、またはorf5_23FPを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株23FPoland16AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株23FPoland16AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または14CSR10由来の任意の1つ以上のS.pneumoniae株からの1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株23FPoland16AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株23FPoland16AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株23FTaiwan15アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株23FTaiwan15のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株23FTaiwan15アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株23FTaiwan15AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_23FTW、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF6_23FTW、ORF7_23FTW、およびORF8_23FTWをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株23FTaiwan15AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株23FTaiwan15AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞層に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株23FTaiwan15AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株23FTaiwan15AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株23FTaiwan15AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株23FTaiwan15AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株23FTaiwan15AI表面タンパク質例えば、orf3_23FTW、orf4_23FTW、またはorf5_23FTWを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株23FTaiwan15AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株23FTaiwan15AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、19FTaiwan14、14CSR10、または23FPoland16AIに由来する任意の1つ以上のS.pneumoniaeの1つ以上のAIタンパク質を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株23FTaiwan15AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株23FTaiwan15AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株6BFinland12アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株6BFinland12のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株6BFinland12アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株6BFinland12AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_6BF、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF6_6BF、ORF7_6BF、およびORF8_6BFをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株6BFinland12AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株6BFinland12AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質は、S.pneumoniae菌が、上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが、上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンに結合し得るか、あるいはフィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株6BFinland12AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株6BFinland12AIはまた、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株6BFinland12AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株6BFinland12AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成に役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移反応およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンの中に組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株6BFinland12AI表面タンパク質例えば、orf3_6BF、orf4_6BF、またはorf5_6BFを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を包含する。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、好ましくは、トレオニンまたはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、LPXTGモチーフを介して共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態、好ましくはハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株6BFinland12AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株6BFinland12AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または23FPoland16AI由来の任意の1つ以上のS.pneumoniaeの1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、S.pneumoniaeAIタンパク質のうちの1つ以上は、オリゴマーの形態、好ましくはハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株6BFinland12AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株6BFinland12AIもまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株6BSpain2アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株6BSpain2のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株6BSpain2アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株6BSpain2AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_6BSP、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF6_6BSP、ORF7_6BSP、およびORF8_6BSPをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質を含む。S.pneumoniae株6BSpain2AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上は、置換されたORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、S.pneumoniae株6BSpain2AIオープンリーディングフレームのうちの1つ以上は、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。S.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質配列のうちの1つ以上は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通して転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合し得る。S.pneumoniae株6BSpain2AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予想される。S.pneumoniae株6BSpain2AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株6BSpain2AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株6BSpain2AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンへと組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株6BSpain2AI表面タンパク質例えば、orf3_6BSP、orf4_6BSP、またはorf5_6BSPを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株6BSpain2AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株6BSpain2AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、14CSR10、9VSpain3、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または23FPoland16由来のS.pneumoniaeAIの任意の1つ以上のうちの1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株6BSpain2AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株6BSpain2AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniae株9VSpain3アドヘシンアイランド上で議論したように、出願人は、S.pneumoniae株9VSpain3のゲノム内にアドヘシンアイランドを同定した。S.pneumoniae株9VSpain3アドヘシンアイランドは、表面タンパク質およびソルターゼを含むアミノ酸配列の集合体をコードする連続したおよそ7個のオープンリーディングフレームを含む。具体的には、S.pneumoniae株9VSpain3AIタンパク質は、2つ以上すなわち、2、3、4、5、6または7のORF2_9VSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、ORF6_9VSP、ORF7_9VSPおよびORF8_9VSPをコードするオープンリーディングフレームを含む。本発明の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において処方され得るか、または精製され得るS.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質を含む。本発明の別の好ましい免疫原性組成物は、オリゴマー線毛形態において単離されているS.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質を含む。1つ以上のS.pneumoniae株9VSpain3AIオープンリーディングフレームポリヌクレオチド配列は、置換ORFのフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列によって置換され得る。あるいは、1つ以上のS.pneumoniae株9VSpain3AIオープンリーディングフレームは、置換されたORFと配列相同性を有する配列によって置換され得る。1つ以上のS.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質配列は代表的に、LPXTGモチーフ例えば、LPXTG配列番号122または他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のS.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌が、上皮細胞に付着および侵入する能力に影響を与え得る。AI表面タンパク質はまた、S.pneumoniaeが、上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与え得る。好ましくは、1つ以上のS.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し得るか、またはそうでなければ、上皮細胞表面と会合し得る。S.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質はまた、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合され得るか、またはフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンと会合され得る。S.pneumoniae株9VSpain3AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関連すると予測される。S.pneumoniae株9VSpain3AIは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードし得る。あるいは、S.pneumoniae株9VSpain3AIは、少なくとも2つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードし得る。好ましくは、S.pneumoniae株9VSpain3AIは、少なくとも3つの、表面に露出したタンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。AI表面タンパク質は、膜関連トランスペプチダーゼ例えば、AIソルターゼによって細菌細胞壁に共有結合的に付着され得る。ソルターゼは、表面タンパク質、好ましくは、LPXTGモチーフのトレオニン残基とグリシン残基との間を切断するために機能し得る。次いで、ソルターゼは、トレオニンカルボキシル基と細胞壁前駆物質例えば、脂質IIとの間のアミド結合の形成において役立ち得る。次いで、前駆物質は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移を介してペプチドグリカンに組み込まれ得る。Comfortら、InfectionImmunity2004725:2710-2722を参照のこと。1つの実施形態において、本発明は、S.pneumoniae株9VSpain3AI表面タンパク質例えば、orf3_9VSP、orf4_9VSP、またはorf5_9VSPを含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含み得る。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、2つ以上のAI表面タンパク質を含む。さらにより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つ例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200またはそれより多くのオリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマーの線毛様構造物を含み、ここで、各サブユニットは、AI表面タンパク質またはそのフラグメントを含む。オリゴマーサブユニットは、ピリンモチーフ内の保存されたリジンを介して共有結合的に会合され得る。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、トレオニン残基またはセリンアミノ酸残基をそれぞれ介して、共有結合的に会合され得る。本発明のオリゴマーの線毛様構造物に組み込まれるAI表面タンパク質またはそのフラグメントは、好ましくは、ピリンモチーフを含む。オリゴマーの線毛様構造物は、単独または本発明の組み合わせで使用され得る。1つの実施形態において、本発明は、オリゴマー形態において、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態においてS.pneumoniae株9VSpain3AIタンパク質を含む。1つの実施形態において、本発明は、1つ以上のS.pneumoniae株9VSpain3AIタンパク質およびTIGR4、670、19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、14CSR10、19FTaiwan14、23FTaiwan15、または23FPoland16AI由来の任意の1つ以上のS.pneumoniaeの1つ以上のAIタンパク質を含む組成物を含み、ここで、1つ以上のS.pmeumoniaeAIタンパク質は、オリゴマーの形態、好ましくは、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae株9VSpain3AIタンパク質をコードするオープンリーディングフレームに加えて、S.pneumoniae株9VSpain3AIはまた、転写調節因子を含み得る。S.pneumoniaeオリゴマーの線毛様構造物は、細菌培養物から単離または精製され得、その細菌は、S.pneumoniaeAI表面タンパク質を発現する。従って、本発明は、オリゴマーAI表面抗原を製造するための方法を包含し、この方法は、オリゴマーAIタンパク質を発現するS.pneumoniae細菌を培養物する工程およびS.pneumoniae細菌由来の発現されたオリゴマーのAIタンパク質を単離する工程を包含する。AIタンパク質は、上清への分泌物から収集され得るか、または細菌表面から精製され得る。この方法はさらに、発現されたAIタンパク質の精製を含み得る。好ましくは、AIタンパク質は、ハイパーオリゴマー形態である。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質を過剰発現する細菌培養物から単離または精製され得る。従って、本発明は、S.pneumoniaeオリゴマーアドヘシンアイランド表面タンパク質抗原を製造するための方法を包含し、この方法は、AIタンパク質発現およびS.pneumoniae細菌由来の発現されたオリゴマーアドヘシンアイランドタンパク質の単離を増加させるために適合されたS.pneumoniae細菌を培養する工程を包含する。AIタンパク質は、上清中への分泌物から収集され得るか、または細菌表面から精製され得る。この方法はさらに、発現されたアドヘシンアイランドタンパク質の精製を含む。好ましくは、アドヘシンアイランドタンパク質は、ハイパーオリゴマーの形態である。S.pneumoniae細菌は、好ましくは、少なくとも2例えば、2、3、4、5、8、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、125、150または200倍の野生型発現レベルにAIタンパク質発現を増加させるために適合される。S.pneumoniae細菌は、遺伝子量を増加させる方法および遺伝子アップレギュレーションの方法を含む、当該分野に公知の任意の手段によってAIタンパク質発現を増加させるために適合され得る。このような手段としては、例えば、AIタンパク質をコードするプラスミドでのS.pneumoniae細菌の形質転換が挙げられる。プラスミドはまた、強力なプロモーターを含み得るか、またはAIタンパク質をコードする配列の複数のコピーを含み得る。必要に応じて、S.pneumoniae細菌ゲノム内にAIタンパク質をコードする配列は、欠失され得る。あるいは、またはさらに、S.pneumoniaeアドヘシンアイランドを調節するプロモーターは、発現を増加させるために改変され得る。本発明はさらに、増加させたレベルのAI表面タンパク質を生成するために適合させたS.pneumoniae細菌を含む。特に、本発明は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマーAI表面タンパク質を生成するために適合させたS.pneumoniae細菌を含む。1つの実施形態において、本発明のS.pneumoniaeは、不活性化または弱毒化されて、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌の送達をインビボで可能にする。本発明はさらに、それらの表面上の線毛に組み込まれる発現されたAIタンパク質のレベルを増加させるために適合されたS.pneumoniae細菌を含む。S.pneumoniae細菌は、シグナルペプチダーゼポリペプチドの発現レベルを増加させることによって、その表面上にオリゴマーまたはハイパーオリゴマーAIタンパク質の増加された露出を有するように適合され得る。グラム陽性菌例えば、GASにおけるLepAにおいて局所的なシグナルペプチダーゼ発現の増加させたレベルは、グラム陽性菌の表面上の線毛タンパク質の増加させた露出をもたらすと予想される。S.pneumoniaeにおけるリーダーペプチダーゼの増加させた発現は、当該分野に公知の任意の手段例えば、遺伝子量を増加させることおよび遺伝子アップレギュレーションの方法によって達成され得る。リーダーペプチダーゼの増加させたレベルを有するように適合されたS.pneumoniae菌はさらに、増加させたレベルの少なくとも1つの線毛タンパク質を発現するように適合され得る。あるいは、本発明のAIタンパク質は、非病原性グラム陽性菌例えば、Streptococusgordonii例えば、Byrdら、Biologicalconsequencesofantigenandcytokineco-expressionbyrecombinantStreptococcusgordoniivaccinevectors、Vaccine200220:2197-2205を参照のことまたはLactococcuslactis例えば、Mannamら、MucosalVaccineMadefromLive,RecombinantLactoccuslactisProtectsMiceagainstPharangealInfectionwithStreptococcuspyogenesInfectionandImmunity2004726:3444-3450を参照のことの表面上に発現され得る。本明細書中で使用される場合、非病原性グラム陽性菌とは、ヒト宿主被験体と適合可能であり、ヒト病原性と関連しないグラム陽性菌をいう。好ましくは、非病原性菌は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態においてAI表面タンパク質を発現するように改変される。AI表面タンパク質および必要に応じて、AIソルターゼをコードする配列は、非病原性グラム陽性菌の細菌ゲノム内に組み込まれ得るか、またはプラスミド内に挿入され得る。非病原性グラム陽性菌は、その表面に露出したAI表面タンパク質を有する完全な細菌のインビボでの送達を容易にするために不活性化され得るか、または弱毒化され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の細菌培養物から単離または精製され得る。例えば、AI表面タンパク質は、細胞抽出物または培養上清から単離され得る。あるいは、AI表面タンパク質は、非病原性グラム陽性菌の表面から単離または精製され得る。非病原性グラム陽性菌は、本明細書中に記載される任意のS.pneumoniaeアドヘシンアイランドタンパク質を発現するために使用され得る。非病原性グラム陽性菌は、アドヘシンアイランド表面タンパク質を発現するように形質転換される。好ましくは、非病原性グラム陽性菌はまた、少なくとも1つのアドヘシンアイランドソルターゼを発現する。本発明のAI形質転換された非病原性グラム陽性菌は、病原性S.pneumoniaeの感染を予防または処置するために使用され得る。図190AおよびB、ならびに193~195は、出願人によってS.pneumoniaeTIGR4から線毛を精製するために首尾よく実施された3つの方法の例を提供する。免疫原性組成物本明細書中で記載されたグラム陽性菌AIタンパク質は、グラム陽性菌の感染の予防または治療用の免疫原性組成物で有用である。例えば、本明細書中で記載されたGBSAI表面タンパク質は、GBS感染の予防または治療用の免疫原性組成物で有用である。もう1つの例として、本明細書中で記載するGASAI表面タンパク質は、GAS感染の予防または治療用の免疫原性組成物で有用であり得る。もう1つの例として、S.pneumoniaeAI表面タンパク質は、S.pneumoniae感染の予防または治療用の免疫原性組成物で有用であり得る。1を超える血清型または株単離体全体にわたっての保護を提供することができるグラム陽性菌AI表面タンパク質を用いて免疫原性有効性を増加させることができる。例えば、少なくとも2つすなわち、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10以上の他のGBS血清型または株単離体の特定のGBSAI表面タンパク質と少なくとも50すなわち、少なくとも55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100相同であるアミノ酸配列を有する特定のGBSAI表面タンパク質を用いて、そのような組成物の有効性を増加させることができる。もう1つの例として、1を超える血清型または株単離体全体にわたって保護を提供することができるグラム陽性菌AI表面タンパク質の断片を用いて、免疫原性有効性を増加させることができる。そのような断片は、グラム陽性菌AI表面タンパク質の全長アミノ酸配列のコンセンサス配列内で同定することができる。そのような断片は、複数のすなわち、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10以上のグラム陽性菌血清型または株単離体全体にわたるその高度な相同性または同一性によってコンセンサス配列において同定することができる。好ましくは、高度な相同性は、グラム陽性菌血清型または株単離体全体にわたっての少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100の相同性の程度である。好ましくは、高度な同一性は、グラム陽性菌血清型または株単離体全体にわたっての少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100の同一性の程度である。本発明の1つの実施形態において、グラム陽性菌AI表面タンパク質のそのような断片は、免疫原性組成物で有用であり得る。加えて、AI表面タンパク質オリゴマー線毛構造物を、免疫用に処方し、または精製することができる。単離されたAI表面タンパク質オリゴマー線毛構造物を免疫で用いることも可能である。本発明は、第1のグラム陽性菌AIタンパク質および第2のグラム陽性菌AIタンパク質を含む免疫原性組成物を含む。1以上のAIタンパク質は表面タンパク質であり得る。そのような表面タンパク質はLPXTGモチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含むことができる。第1および第2のAIタンパク質は、グラム陽性菌の同一または異なる属または種からのものであってよい。もし同一種内であれば、第1および第2のAIタンパク質は同一または異なるAIサブタイプのものであってよい。2つのAIが同一のサブタイプのものであれば、AIは同一の数字命名を有する。例えば、AI-1と命名される全てのAIは同一のAIサブタイプのものである。もし2つのAIが異なるサブタイプのものであれば、AIは異なる数字命名を有する。例えば、AI-1はAI-2、AI-3、AI-4等からの異なるAIサブタイプのものである。同様に、AI-2は、AI-1、AI-3、AI-4等からの異なるAIサブタイプのものである。例えば、本発明は、1以上のGBSAI-1タンパク質および1以上のGBSAI-2タンパク質を含む免疫原性組成物を含む。AIタンパク質の1以上は表面タンパク質であってよい。そのような表面タンパク質はLPXTG配列番号122のようなLPXTGモチーフを含有してよく、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合し得る。AIタンパク質の1以上はソルターゼであり得る。GBSAI-1タンパク質はGBS80、GBS104、GBS52、SAG0647およびSAG0648よりなる群から選択することができる。好ましくは、GBSAI-1タンパク質はGBS80またはGBS104を含む。GBSAI-2タンパク質は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、SAG1406、01520、01521、01522、01523、01523、01524および01525よりなる群から選択することができる。1つの実施形態において、GBSAI-2タンパク質は、GBS67、GBS59、GBS150、SAG1405、およびSAG1406よりなる群から選択される。もう1つの実施形態において、GBSAI-2タンパク質は、01520、01521、01522、01523、01523、01524および01525よりなる群から選択することができる。好ましくは、GBSAI-2タンパク質は、GBS59またはGBS67を含む。もう1つの例において、本発明はGASAI-1、GASAI-2、GASAI-3、またはGASAI-4タンパク質のいずれかの組合せの1以上を含む免疫原性組成物を含む。GASAIタンパク質の1以上はソルターゼであり得る。GASAI-1タンパク質はM6_Spy0156、M6_Spy0157、M6_Spy0158、M6_Spy0159、M6_Spy0160、M6_Spy0161、CDCSS410_線毛、ISS3650_線毛、およびDSM2071_線毛よりなる群から選択することができる。好ましくは、GASAI-1タンパク質はM6_Spy0157、M6_Spy0159、M6_Spy0160、CDCSS410_線毛、ISS3650_線毛、およびDSM2071_線毛よりなる群から選択される。該GASAI-2タンパク質は、Spy0124、GAS15、Spy0127、GAS16、GAS17、GAS18、Spy0131、Spy0133、およびGAS20よりなる群から選択することができる。好ましくは、該GASAI-2タンパク質は、GAS15、GAS16、およびGAS18よりなる群から選択される。該GASAI-3タンパク質は、SpyM3_0097、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、SpyM3_0104、SPs0099、SPs0100、SPs0101、SPs0102、SPs0103、SPs0104、SPs0105、SPs0106、orf77、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、orf84、spyM18_0125、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_線毛、ISS3776_線毛、およびISS4959_線毛よりなる群から選択することができる。1つの実施形態において、該GASAI-3タンパク質はSpyM3_0097、SpyM3_0098、SpyM3_0099、SpyM3_0100、SpyM3_0101、SpyM3_0102、SpyM3_0103、およびSpyM3_0104よりなる群から選択される。もう1つの実施形態において、該GASAI-3タンパク質は、SPs0099、SPs0100、SPs0101、SPs0102、SPs0103、SPs0104、SPs0105、およびSPs0106よりなる群から選択される。なお、もう1つの実施形態において、該GASAI-3タンパク質は、orf77、orf78、orf79、orf80、orf81、orf82、orf83、およびorf84よりなる群から選択される。さらなる実施形態において、該GASAI-3タンパク質は、spyM18_0125、spyM18_0126、spyM18_0127、spyM18_0128、spyM18_0129、spyM18_0130、spyM18_0131、およびspyM18_0132よりなる群から選択される。なおもう1つの実施形態において、該GASAI-3タンパク質は、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、およびSpyoM01000149よりなる群から選択される。該GASAI-4タンパク質は、19224133、19224134、19224135、19224136、19224137、19224138、19224139、19224140、19224141、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、およびISS4538_線毛よりなる群から選択することができる。好ましくは、該GASAI-4タンパク質は、19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、およびISS4538_線毛よりなる群から選択される。なおもう1つの例として、本発明はTIGR4からのS.pneumonaie、S.pneumonaie株670、19AHungary6からのS.pneumonaie、6BFinland12からのS.pneumonaie、6BSpain2からのS.pneumonaie、9VSpain3からのS.pneumonaie、14CSR10からのS.pneumonaie、19FTaiwan14からのS.pneumonaie、23FTaiwan15からのS.pneumonaie、または23FPoland16からのS.pneumonaieAIタンパク質のいずれかの組合せの1以上を含む免疫原性組成物を含む。該AIタンパク質の1以上は表面タンパク質であり得る。そのような表面タンパク質はLPXTG配列番号122のようなLPXTGモチーフを含有することができ、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合することができる。AIタンパク質の1以上はソルターゼであり得る。TIGR4由来のS.pneumonaieAIタンパク質はSP0462、SP0463、SP0464、SP0465、SP0466、SP0467、SP0468よりなる群から選択することができる。好ましくは、TIGR4由来のS.pneumonaieAIタンパク質はSP0462、SP0463、またはSP0464を含む。該S.pneumonaie株670AIタンパク質はOrf1_670、Orf3_670、Orf4_670、Orf5_670、Orf6_670、Orf7_670、およびOrf8_670よりなる群から選択することができる。好ましくは、該S.pneumonaie株670AIタンパク質はOrf3_670、Orf4_670、またはOrf5_670を含む。19AHungary6由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_19AH、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF6_19AH、ORF7_19AH、またはORF8_19AHよりなる群から選択することができる。6BFinland12由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_6BF、ORF3_6BF,ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF6_6BF、ORF7_6BF、またはORF8_6BFよりなる群から選択することができる。6BSpain2由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_6BSP、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF6_6BSP、ORF7_6BSP、またはORF8_6BSPよりなる群から選択することができる。9VSpain3由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_9VSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、ORF6_9VSP、ORF7_9VSP、またはORF8_9VSPよりなる群から選択することができる。14CSR10由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_14CSR、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF6_14CSR、ORF7_14CSR,またはORF8_14CSRよりなる群から選択することができる。19FTaiwan14由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_19FTW、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF6_19FTW、ORF7_19FTW、またはORF8_19FTWよりなる群から選択することができる。23FTaiwan15由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_23FTW、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF6_23FTW、ORF7_23FTW、またはORF8_23FTWよりなる群から選択することができる。23FPoland16由来のS.pneumonaieAIタンパク質は、ORF2_23FP、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF6_23FP、ORF7_23FP、またはORF8_23FPよりなる群から選択することができる。好ましくは、本発明の免疫原性組成物に含まれるグラム陽性菌AIタンパク質は、1を超える血清型または株単離体全体にわたっての保護を提供することができる。例えば、免疫原性組成物は、第1のAIタンパク質を含むことができ、ここに、該AIタンパク質のアミノ酸配列は第2のAIタンパク質のアミノ酸配列に対して少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100相同であり、ここに、該第1のAIタンパク質および該第2のAIタンパク質はグラム陽性菌の異なる血清型のゲノムに由来する。該第1のAIタンパク質は第3のAIタンパク質のアミノ酸配列に対しても相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該第3のAIタンパク質はグラム陽性菌の異なる血清型のゲノムに由来する。該第1のAIタンパク質は第4のAIタンパク質のアミノ酸配列に対しても相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該3のAIタンパク質はグラム陽性菌の異なる血清型のゲノムに由来する。例えば、好ましくは、本発明の免疫原性組成物に含まれるGBSAIタンパク質は、1を超えるGBS血清型または株単離体全体にわたっての保護を提供することができる。例えば、該免疫原性組成物は、第1のGBSAIタンパク質を含むことができ、ここに該AIタンパク質のアミノ酸配列は第2のGBSAIタンパク質のアミノ酸配列に対して少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100相同であり、ここに、該第1のAIタンパク質および該第2のAIタンパク質は異なるGBS血清型のゲノムに由来する。該第1のGBSAIタンパク質は第3のGBSAIタンパク質のアミノ酸配列に対しても相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該第3のAIタンパク質は異なるGBS血清型のゲノムに由来する。該第1のAIタンパク質は第4のGBSAIタンパク質のアミノ酸配列に対しても相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該第3のAIタンパク質は異なるGBS血清型のゲノムに由来する。該第1のAIタンパク質はAI-1タンパク質またはAI-2タンパク質から選択することができる。例えば、該第1のAIタンパク質はGBS80のようなGBSAI-1表面タンパク質であり得る。GBS血清型V株単離体2603からのGBS80のアミノ酸配列は、GBS血清型III、株単離体NEM316およびCOH1からのGBS80アミノ酸配列およびGBS血清型1a、株単離体A909からのGBS80アミノ酸配列に対して90を超えて相同である。もう1つの例として、該第1のAIタンパク質はGBS104であり得る。GBS血清型V、株単離体2603からのGBS104のアミノ酸配列は、GBS血清型III,株単離体NEM316およびCOH1からのGBS104アミノ酸配列、GBS血清型1a、株単離体A909からのGBS104アミノ酸配列、および血清型II、株単離体18RS21のGBS104アミノ酸配列に対して90を超えて相同である。表12はGBS血清型Ia、Ib、II、III、V、およびVIII全体にわたってのGBS80およびGBS104のアミノ酸配列同一性を提供する。GBS80およびGBS104をコードする遺伝子が同定されたGBS株は、平均して、各々、99.88および99.96アミノ酸配列同一性を共有する。この高度なアミノ酸同一性は、GBS80またはGBS104の第1のタンパク質を含む免疫原性組成物が、1を超えるGBS血清型または株単離体全体にわたっての保護を供することが可能であることを示す。もう1つの例として、第1のAIタンパク質はGBS67のようなAI-2タンパク質であり得る。GBS血清型V、株単離体2603からのGBS67のアミノ酸配列は、GBS血清型III、株単離体NEM316からのGBS67アミノ酸配列、GBS血清型1b、株単離体H36BからのGBS67アミノ酸配列、およびGBS血清型II、株単離体17RS21からのGBS67アミノ酸配列に対して90を超えて相同である。もう1つの例として、第1のAIタンパク質はspb1のようなAI-2タンパク質であり得る。GBS血清型III、株単離体COH1からのspb1のアミノ酸配列は、GBS血清型Ia、株単離体A909からのspb1アミノ酸配列に対して90を超えて相同である。なおもう1つの例として、第1のAIタンパク質はGBS59のようなAI-2タンパク質であり得る。GBS血清型II、株単離体18RS21からのGBS59のアミノ酸配列は、GBS血清型V、株単離体2603からのGBS59アミノ酸配列に対して100相同である。GBS血清型V、株単離体CJB111からのGBS59のアミノ酸配列は、GBS血清型III、株単離体NEM316からのGBS59アミノ酸配列に対して98相同である。本発明の組成物は、異なる血清型または株単離体からのグラム陽性AIタンパク質を含むように、すなわち、グラム陽性菌の血清型または株単離体の1つの集合体に存在する第1のAIタンパク質、および第1のAIタンパク質によって表されない血清型、または株単離体に存在する第2のAIタンパク質を含むように設計することもできる。例えば、本発明は、第1および第2のグラム陽性菌AIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、第1のAIタンパク質の全長配列をコードするポリヌクレオチド配列は、第2のAIタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む同様なグラム陽性菌ゲノムに存在しない。また、本発明の組成物は、異なるGBS血清型または株単離体からのAIタンパク質を含むように、すなわち、GBS血清型または株単離体の1つの集合体に存在する第1のAIタンパク質、および第1のAIタンパク質によって表されない血清型または株単離体に存在する第2のAIタンパク質を含むように設計することもできる。例えば、本発明は、第1および第2のGBSAIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、該第1のGBSAIタンパク質の全長配列をコードするポリヌクレオチド配列は該第2のGBSAIタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含むゲノムに存在しない。例えば、該第1のAIタンパク質はGBS血清型V、株単離体2603からのGBS80配列のようなGBS80となり得る。先に議論したかつ図2に示すように、GBS血清型II、株単離体18RS21におけるGBS80についての配列が破壊される。この場合には、該第2のAIタンパク質は、GBS104またはGBS67GBS血清型II、株単離体18RS21から選択される配列となり得る。さらに、本発明は、第1および第2のGBSAIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、該第1のGBSAIタンパク質は第1のGBS株または血清型では検出可能な表面露出を有するが、第2のGBS株または血清型では有さず、該第2のGBSAIタンパク質は第2のGBS株または血清型では検出可能な表面露出を有するが、第1のGBS株または血清型では有さない。例えば、該AIタンパク質はGBS80であり得、該第2のAIタンパク質はGBS67であり得る。表15で分かるように、表面露出GBS80を有するが、表面露出GBS67を有さず、およびその逆であるいくつかのGBS血清型および株がある。GBS80およびGBS67タンパク質を含む免疫原性組成物は、GBS株および血清型のより広い群全体にわたっての保護を提供することができる。あるいは、本発明は、第1および第2のグラム陽性菌AIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、該第1のAIタンパク質の配列をコードするポリヌクレオチド配列は、該第2のAIタンパク質のゲノム中の対応する配列よりも90未満すなわち、90、88、86、84、82、80、78、76、74、72、70、65、60、55、50、45、40、35または30パーセント未満相同である。本発明は、第1および第2のGBSAIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、該第1のGBSAIタンパク質の配列をコードするポリヌクレオチド配列は、該第2のGBSAIタンパク質のゲノム中の対応する配列よりも90未満すなわち、90,88、86、84、82、80、78、76、74、72、70、65、60、55、50、45、40、35または30パーセント未満相同である。例えば、該第1のGBSAIタンパク質はGBS血清型Ib、株単離体H36BからのGBS67配列のようなGBS67となり得る。図2および4に示すようにこの株についてのGBS67配列は、GBS血清型V、株単離体2603中の対応するGBS67配列に対して90未満相同である87。この例においては、第2のGBSAIタンパク質は、従って、GBS血清型V、株単離体2603からのGBS80配列となり得る。本発明の例としての免疫原性組成物はアドヘシンアイランドタンパク質GBS80、GBS104、GBS67、およびGBS59、および非-AIタンパク質GBS322を含むことができる。異なるGBS株のFACS分析は、これらの5つのタンパク質の少なくとも1つがGBS細菌の表面に発現されることが常に見出されることを示す。米国におけるCDC33株、イタリアにおけるISS17株およびヒューストン/ハーバード20株から得られた、GBS細菌の70株の最初のFACS分析は、GBS細菌の表面でのGBS80、GBS104、GBS322、GBS67、またはGBS59の少なくとも1つの表面露出を検出した。図227は、37のGBS株でのGBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59の表面露出で得られたFACSデータを提供する。図228は、CDCから得られた41のGBS株の各々でのGBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59の表面露出で得られたFACSデータを提供する。図227および228から分かるように、各GBS株は、GBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59の少なくとも1つの表面発現を有した。各細菌株でのこれらのタンパク質の少なくとも1つの表面露出は、これらのタンパク質を含む免疫原性組成物が、GBS株および血清型全体にわたっての広い保護を提供することを示す。表面露出GBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59タンパク質もまたFACSによって測定されるように高いレベルで存在する。表49は、GBS80、GBS104、GBS67、GBS322、およびGBS59表面発現について調べた最初の70のGBS株についてのFACS結果をまとめる。もし蛍光における5倍シフトが、プレ免疫コントロール血清と比べて、タンパク質に対する抗体を用いる場合に観察されたならば、そのタンパク質は、そのタンパク質の高レベルの表面発現を有するものとして明示された。表50は、表面タンパク質のいずれが異なるGBS血清型で高度に発現されるかを詳細に示す。あるいは、本発明の免疫原性組成物はGBS80、GBS104、GBS67、およびGBS322を含むことができる。抗体に対して高度に接近可能であるタンパク質抗原は適当なアジュバントとで100保護を付与すると仮定すると、GBS80、GBS104、GBS67、GBS59およびGBS322を含有する免疫原性組成物はGBS株および血清型の89に対して保護を提供し、これは、GBS80、GBS104、GBS67、およびGBS322タンパク質を含有する免疫原性組成物と同一のパーセンテージである。図229参照。しかしながら、組成物にGBS59を含めて、その免疫原性強度を増加させるのが好ましいことがある。表50から分かるように、GBS59は、調べたGBS細菌の半分未満で高度に発現される、GBS80、GBS104、およびGBS322とは異なり、FACS分析によって調べたGBS細菌の2/3で表面に高度に発現される。GBS59オプソノファゴサイトーシス活性は、GBS322、GBS104、GBS67、およびGBS80タンパク質の混合物のそれに匹敵する。図230参照。もう1つの例として、好ましくは、本発明の免疫原性組成物に含まれるGASAIタンパク質は、1を超えるGAS血清型または株単離体全体にわたっての保護を提供することができる。例えば、該免疫原性組成物は第1のGASAIタンパク質を含むことができ、ここに、該AIタンパク質のアミノ酸配列は第2のGASAIタンパク質のアミノ酸配列に対して少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100相同であり、およびここに、該第1のAIタンパク質および該第2のAIタンパク質は異なるGAS血清型のゲノムに由来する。また、該第1のGASAIタンパク質は第3のGASAIタンパク質のアミノ酸配列に対して相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該第3のAIタンパク質は異なるGAS血清型のゲノムに由来する。また、該第1のAIタンパク質は第4のGASAIタンパク質のアミノ酸配列に対して相同であり得、従って、該第1のAIタンパク質、該第2のAIタンパク質および該第3のAIタンパク質は異なるGAS血清型のゲノムに由来する。また、本発明の組成物は、異なる血清型または株単離体からのGASAIタンパク質を含むように、すなわち、GAS細菌の血清型または株単離体の1つの集合体に存在する第1のAIタンパク質、および該第1のAIタンパク質によって表されない血清型または株単離体に存在する第2のAIタンパク質を含むように設計することもできる。例えば、該第1のAIタンパク質はGAS血清型M12、株単離体A735からの19224141タンパク質のようなprtF2タンパク質であり得る。先に議論しかつ図164に示すように、prtF2タンパク質についての配列はGASAI型1または2に存在しない。この例においては、第2のAIタンパク質はAI-1を含む、M6単離体MGAS10394からのコラーゲン結合タンパク質M6_Spy0159またはAI-2を含む、M1単離体SF370からのGAS15であり得る。さらに、本発明は、第1および第2のGASAIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、該第1のGASAIタンパク質は第1のGAS株または血清型で検出可能な表面露出を有するが、第2のGAS株または血清型では有さず、該第2のGASAIタンパク質は第2のGAS株または血清型で検出可能な表面露出を有するが、第1のGAS株または血清型では有しない。本発明は第1および第2のGASAIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、該第1のGASAIタンパク質の配列をコードするポリヌクレオチド配列は、第2のGASAIタンパク質のゲノム中の対応する配列よりも90未満すなわち、90、88、86、84、82、80、78、76、74、72、70、65、60、55、50、45、40、35または30パーセント未満相同である。好ましくは、該第1および第2のGASAIタンパク質は線毛のサブユニットである。より好ましくは、該第1および第2のGASAIタンパク質は主な線毛形成タンパク質すなわち、M6株10394からのM6_Spy0160、M1株SF370からのSPy0128、M3株315からのSpyM3_0100、M3株SSIからのSPs0102、M5単離体Manfredoからのorf80、M18株8232からのspyM18_0128、M49株591からのSpyoM01000153、M12株A735からの19224137、M77株ISS4959からの線毛構造物サブユニット、M44株ISS3776からの線毛構造物サブユニット、M50株ISS3776ISS4538からの線毛構造物サブユニット、M12株CDCSS635からの線毛構造物サブユニット、M23株DSM2071からの線毛構造物サブユニット、M6株CDCSS410からの線毛構造物サブユニットから選択される。表45はGASAI-1、AI-2、AI-3、およびAI-4の代表的な株からの主な線毛形成サブユニットすなわち、M6株10394からのM6_Spy0160、M1株SF370からのSPy0128、M3株315からのSpyM3_0100、M3株SSIからのSPs0102、M5単離体Manfredoからのorf80、M18株8232からのspyM18_0128、M49株591からのSpyoM01000153、M12株A735からの19224137、M77株ISS4959からの線毛構造物サブユニット、M44株ISS3776からの線毛構造物サブユニット、M50株ISS3776ISS4538からの線毛構造物サブユニット、M12株CDCSS635からの線毛構造物サブユニット、M23株DSM2071からの線毛構造物サブユニット、M6株CDCSS410からの線毛構造物サブユニットの各々のアミノ酸配列の間のパーセント同一性を提供する。例えば、第1の主な線毛サブユニットはGAS血清型M6株10394の細菌から選択することができ、第2の主な線毛サブユニットはGAS血清型M1株370の細菌から選択することができる。表45から理解できるように、細菌のこれらの株によってコードされる主な線毛サブユニットは、23のヌクレオチド同一性を共有するに過ぎない。細菌のこれらの株の各々からの線毛の主なサブユニットを含む免疫原性組成物は、GAS株および血清型のより広い群全体にわたっての保護を供すると予測される。GAS株および血清型のより広い範囲全体にわたっての増大した保護を供するために組み合わせて用いることができる主な線毛サブユニットの他の例は、23配列同一性を共有するGAS血清型M5Manfredo単離体および血清型M6株10394、38配列同一性を共有するGAS血清型M18株8232および血清型M1株370、61配列同一性を共有するGAS血清型M3株315および血清型M12株A735および25配列同一性を共有するGAS血清型M3株315および血清型M6株10394を含む。表45からも理解できるように、GASに存在する主な線毛サブユニットの4つの型のアミノ酸配列は比較的異なっている。図198ないし201は、同一または異なるサブタイプGASAI-1、GASAI-2、GASAI-3、およびGASAI-4のアドヘシンアイランドを保有する他のGAS血清型に対して、異なるGAS血清型についてのアドヘシンアイランドがコードする表面露出タンパク質のパーセント同一性を比較するさらなる表を供する。また、後のさらなる議論参照。本発明のアドヘシンアイランドタンパク質での免疫は、実施例においてさらに議論する。GBSアドヘシンアイランドタンパク質の共発現および表面提示におけるGBSAIタンパク質の役割交差株および交差血清型保護のためのGBSアドヘシンアイランドタンパク質の使用に加えて、本出願人らは、細菌の表面での表面タンパク質の送達または提示に影響するように見えるアドヘシンアイランドタンパク質の間の相互作用を同定した。特に、本出願人らは、GBS104の表面露出は、GBS80の同時発現に依存することを発見した。実施例2でさらに議論するように、AI-1の逆転写酵素PCR分析は、AI遺伝子の全てがオペロンとして共転写されることを示す。本出願人らは、種々のAI-1遺伝子のインフレーム欠失を含む一連の変異体GBSを構築したGBS変異体の概略は図7に示す。抗GBS80-対-抗GBS104抗体を用いる平均シフト値を比較する種々の変異体のFACS分析を図8に示す。GBS80オペロンの除去はGBS104の表面露出を妨げる;GBS104の除去はGBS80の表面露出に影響しなかった。特定の理論に制限されるものではないが、GBS80はGBS104の細菌の表面への輸送または局所化に関与すると考えられる。2つのタンパク質はオリゴマーカー化、またはそうでなければ会合させることができる。この会合は、GBS細菌の表面へのその移動を容易とするGBS104における高次構造変化に関与する可能性がある。GBS104を含む線毛構造物は、GBS104を欠く線毛構造物よりも低い分子量のものであるように見える。図68は、ポリクローナル抗GBS104抗体α-104POLICとマークしたレーン参照は、ポリクローナル抗GBS80抗体α-GBS80POLICとマークしたレーン参照よりもより小さな構造物と交差-ハイブリダイズすることを示す。加えて、本出願人らは、GBS80が弱毒化を引き起こすことができることを示し、さらに、該タンパク質がビルレンスに寄与することを示唆する。実施例3においてより詳細に記載するように、Δ80変異体およびΔ80、Δ104二重変異体についてのLD50は、野生型およびΔ104変異体と比較して一桁だけ低下した。アドヘシンアイランド内のソルターゼもまた、表面タンパク質の局所化および提示において役割を演じるようである。実施例4でさらに議論するように、種々のソルターゼ欠失変異体のFACS分析は、ソルターゼSAG0648の除去がGBS104が表面に到達するのを妨げ、GBS80の表面露出を僅かに低下させたことを示した。ソルターゼSAG0647およびソルターゼSAG0648が共にノックアウトされた場合、GBS80もGBS104も表面に露出されなかった。いずれかのソルターゼ単独の発現は、GBS80が細菌の表面に到達するのに十分であった。しかしながら、SAG0648の発現が、GBS104表面局所化で必要であった。従って、本発明の組成物は2以上のAIタンパク質を含むことができ、ここに、AIタンパク質は物理的にまたは化学的に会合される。例えば、2つのAIタンパク質はオリゴマーを形成することができる。1つの実施形態において、会合されたタンパク質はGBS80およびGBS104のような2つのAI表面タンパク質である。会合されたタンパク質は、もしAI表面タンパク質が組換え系で発現されるならば、宿主細胞アドヘシンアイランドタンパク質を含めた、異なるアドヘシンアイランドからのAI表面タンパク質であり得る。例えば、会合したタンパク質はGBS80およびGBS67であり得る。他のグラム陽性菌からのアドヘシンアイランドタンパク質GBSアドヘシンアイランドの本出願人らの同定および分析、およびこれらのAIタンパク質およびそれらの線毛構造物の免疫学的および生物学的機能は、他のグラム陽性菌における同様な構造物への洞察を提供する。先に議論したように、アドヘシンアイランドまたはAIとは、表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードする細菌ゲノム内の一連のオープンリーディングフレームを言う。アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードすることができる。アドヘシンアイランドは、少なくとも一つの表面タンパク質をコードすることができる。あるいは、アドヘシンアイランドは少なくとも2つの表面タンパク質、少なくとも1つのソルターゼをコードすることができる。好ましくは、アドヘシンアイランドは少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。1以上の表面タンパク質はLPXTG配列番号122のようなLPXTGモチーフ、または他のソルターゼ基質モチーフを含むことができる。1以上のAI表面タンパク質は、グラム陽性菌の表面での線毛構造物の形成に参画することができる。本発明のグラム陽性アドヘシンアイランドは、好ましくは、多様に転写された転写調節因子を含む。転写調節因子はAIオペロンの発現を調節することができる。本発明は、1以上のグラム陽性菌AI表面タンパク質を含む組成物を含む。そのようなAI表面タンパク質は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー構造物にて会合することができる。本発明で用いられる好ましいグラム陽性アドヘシンアイランドタンパク質は、S.aureusのようなStaphylococcus、S.agalactiaeGBS、S.pyogenesGAS、S.pneumoniae、S.mutansのようなStreptococcus、E.faecalisおよびE.faeciumのようなEnterococcus、C.difficileのようなClostridium、L.monocytogenesのようなListeriaおよびC.diphtheriaのようなCorynebacteriumに由来し得る。グラム陽性AI表面タンパク質配列の1以上は典型的には、LPXTGモチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含む。本発明のグラム陽性AI表面タンパク質は、上皮細胞に接着し、それに侵入するグラム陽性菌の能力に影響し得る。AI表面タンパク質は、上皮細胞層を通って移動するグラム陽性菌の能力にやはり影響し得る。好ましくは、1以上のAI表面タンパク質は上皮細胞表面に結合するか、あるいはそうでなければ会合することができる。グラム陽性AI表面タンパク質は、フィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンに結合することができるか、会合することができる。グラム陽性AIソルターゼタンパク質は、LPXTG含有表面タンパク質の分泌および係留に関与すると予測される。グラム陽性菌AIは、少なくとも1つの表面露出タンパク質をコードすることができる。アドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質をコードすることができる。あるいは、グラム陽性菌AIは少なくとも2つの表面露出タンパク質および少なくとも一つのソルターゼをコードすることができる。好ましくは、グラム陽性AIは、少なくとも3つの表面露出タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。グラム陽性AI表面タンパク質は、AIソルターゼのような、膜結合トランスペプチダーゼによって細菌細胞壁に共有結合することができる。ソルターゼは、好ましくは、LPXTGモチーフのスレオニンおよびグリシン残基の間の表面タンパク質を切断するように機能することができる。従って、ソルターゼは、スレオニンカルボキシル基およびリピドIIのような細胞壁前駆体の間のアミド結合の形成を助けることができる。次いで、前駆体は、細菌壁合成のグリコシル転移およびペプチド転移反応を介してペプチドグリカンに取り込むことができる。Comfortetal.,InfectionImmunity2004725:2710-2722参照。典型的には、本発明のグラム陽性菌AI表面タンパク質は、細菌膜を横切っての表面タンパク質の移動を容易とするためにN-末端リーダーまたは分泌シグナルを含む。本発明のグラム陽性菌AI表面タンパク質は、上皮細胞のような、標的宿主細胞に接着し、それに侵入するグラム陽性菌の能力に影響し得る。グラム陽性菌AI表面タンパク質は、上皮細胞層を通じて移動するグラム陽性菌の能力にやはり影響し得る。好ましくは、1以上のグラム陽性AI表面タンパク質は、上皮細胞表面に結合し、またはそうでなければ会合することができる。さらに、1以上のグラム陽性AI表面タンパク質はフィブリノーゲン、フィブロネクチンまたはコラーゲンタンパク質に結合することができる。1つの実施形態において、本発明は、グラム陽性菌AI表面タンパク質を含むオリゴマーの線毛様構造物を含む組成物を含む。オリゴマーの線毛様構造物は、AI表面タンパク質の多数のユニットを含むことができる。好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は2以上のAI表面タンパク質を含む。なおより好ましくは、オリゴマーの線毛様構造物は、少なくとも2つの例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、120、140、150、200以上オリゴマーサブユニットを含むハイパーオリゴマー線毛様構造物を含み、ここに、各サブユニットはAI表面タンパク質またはその断片を含む。オリゴマーサブユニットはピリンモチーフ内の保存されたリシンと共有結合することができる。オリゴマーサブユニットは、LPXTGモチーフを介して、好ましくは、スレオニンアミノ酸残基を介して、共有結合することができる。本発明のオリゴマー線毛様構造物に取り込むべきグラム陽性菌AI表面タンパク質またはその断片は、好ましくは、保存されたリシン残基を含むピリンモチーフおよび保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスモチーフの一方または双方を含む。オリゴマー線毛様構造物は単独で、または本発明の組み合わせで用いることができる。1つの実施形態において、本発明はオリゴマー形態、好ましくは、ハイパーオリゴマー形態のグラム陽性菌アドヘシンアイランドを含む。本発明のオリゴマー線毛様構造物は、同一または異なるグラム陽性種または属からの1以上のさらなるグラム陽性AIタンパク質と組み合わせることができる。1つの実施形態において、オリゴマー線毛様構造物は、第2のグラム陽性菌タンパク質と組み合わせた1以上のグラム陽性菌AI表面タンパク質を含む。第2のグラム陽性菌タンパク質は公知の抗原であってよく、AIタンパク質と通常は会合させる必要がない。オリゴマー線毛様構造物は、グラム陽性菌AI表面タンパク質を過剰発現する細菌培養物から単離しまたは精製することができる。従って、本発明は、グラム陽性菌からの発現されたオリゴマーアドヘシンアイランドタンパク質の増大したAIタンパク質の発現および単離に適合したグラム陽性菌を培養することを含む、オリゴマーアドヘシンアイランド表面抗原を製造する方法を含む。AIタンパク質は上清への分泌物から収集することができ、あるいはそれは細菌表面から精製することができる。該方法は、さらに、発現されたアドヘシンアイランドタンパク質の精製を含むことができる。好ましくは、アドヘシンアイランドタンパク質はハイパーオリゴマー形態である。グラム陽性菌は、好ましくは、野生型発現レベルの少なくとも2倍例えば、2,3、4、5、8、10、15,20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、125、150また200倍だけAIタンパク質の発現を増加させるのに適合させる。グラム陽性菌は、遺伝子量を増加させる方法および遺伝子アップレギュレーションの方法を含めた、当該分野で公知の手段によってAIタンパク質の発現を増大させるように適合させることができる。そのような手段は、例えば、AIタンパク質をコードするプラスミドでのグラム陽性菌の形質転換を含む。プラスミドは強力なプロモーターを含むことができるかまたは、それは、AIタンパク質をコードする配列の複数コピーを含むことができる。所望により、グラム陽性菌ゲノム内のAIタンパク質コードする配列を欠失させることができる。あるいは、あるいは加えて、グラム陽性アドヘシンアイランドを調節するプロモーターを修飾して、発現を増加させることができる。本発明は、さらに、増大したレベルのAI表面タンパク質を生産するのに適合させたグラム陽性菌を含む。とくに、本発明は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマーAI表面タンパク質を生産するように適合させたグラム陽性菌を含む。1つの実施形態において、本発明のグラム陽性菌を不活化し、または減弱化させて、その表面に露出されたAIタンパク質を有する、全細菌のインビボ送達を可能にする。本発明は、さらに、その表面の線毛に組み込まれた増大したレベルの発現されたAIタンパク質を有するように適合させたグラム陽性菌を含む。グラム陽性菌は、シグナルペプチダーゼポリペプチドの発現レベルを増加させることによって、その表面でのオリゴマーまたはハイパーオリゴマーAIタンパク質の増大した露出を有するように適合させることができる。GASにおけるLepAのようなグラム陽性菌での増大したレベルの局所シグナルペプチダーゼ発現は、グラム陽性菌の表面での線毛タンパク質の増大した露出をもたらすと予測される。グラム陽性菌におけるリーダーペプチダーゼの増大した発現は、遺伝子量の増大および遺伝子アップレギュレーションの方法のような当該分野で知られたいずれかの手段で達成することができる。増大したレベルのリーダーペプチダーゼを有するように適合させたグラム陽性菌は、加えて、増大したレベルの少なくとも1つの線毛タンパク質を発現するよう適合させることができる。あるいは、本発明のAIタンパク質はStreptococcusgorddonii例えば、Byrdetal,Biologicalconsequencesofantigenandcytokineco-expressionbyrecombinantStreptococcusgordoniivaccinevectorsVaccine200220:2197-2205参照またはLactococcuslactis例えば、Mannametal.,MucosalVaccineMadefromLive,RecombinantLactococcuslactisProtectsMiceagainstPharangealInfectionwithStreptococcuspyogenesInfectionandImmunity2004726:3444-3450参照のような非病原性グラム陽性菌の表面で発現させることもできる。L.lactisがオリゴマーの形態で、かつその表面でGBSおよびGASAIポリペプチドを発現することは前記で既に示されている。あるいは、オリゴマー線毛様構造物は組換えにより生産することができる。もし組換え宿主細胞系で生産されればグラム陽性菌AI表面タンパク質は、好ましくは、本発明の1以上のAIソルターゼの発現と共調して発現される。そのようなAIソルターゼは、AI表面タンパク質サブユニットのオリゴマーまたはハイパーオリゴマー形成を容易とするであろう。本発明のグラム陽性AIソルターゼは、典型的には、最初の70アミノ酸残基内にシグナルペプチド配列を有する。それらは、C末端の50アミノ酸残基内に膜貫通配列も含むことができる。ソルターゼは、最後の8アミノ酸内で少なくとも1つの塩基性アミノ酸残基を含むこともできる。好ましくは、ソルターゼは、触媒システインおよびヒスチジンのような1以上の活性部位の残基を有する。2以上のグラム陽性菌の属または種からのアドヘシンアイランド表面タンパク質を組み合わせて、さらにもう2つのグラム陽性菌の属または種の疾患または感染の予防的または治療的処置のための免疫原性組成物を提供することができる。所望により、アドヘシンアイランド表面タンパク質は、一緒にオリゴマーまたはハイパーオリゴマー構造物に会合させることができる。1つの実施形態において、本発明は、2以上のStreptococcus種からのアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む。例えば、本発明は、GBSAI表面タンパク質およびGASアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む組成物を含む。もう1つの例として、本発明は、GASアドヘシンアイランド表面タンパク質およびS.pneumoniaeアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む組成物を含む。1つの実施形態において、本発明は、2以上のグラム陽性菌属からのアドヘシンアイランド表面タンパク質を含む。例えば、本発明は、Streptococcusアドヘシンアイランドタンパク質およびCorynebacteriumアドヘシンアイランドタンパク質を含む組成物を含む。いくつかのグラム陽性菌におけるAI配列の例を以下にさらに議論する。StreptococcuspyogenesGAS先に議論したように、本出願人らは少なくとも4つの異なるGASアドヘシンアイランドを同定した。これらのアドヘシンアイランドは、細菌のビルレンスにおいて重要である表面タンパク質をコードすると考えられ、本出願人らは、A群連鎖球菌の表面でのハイパーオリゴマー線毛構造物のこれらのアドヘシンアイランドタンパク質の存在を明らかとする最初の電子顕微鏡写真を得た。A群連鎖球菌は、咽頭炎およびインペチゴから生命を脅かす侵襲的疾患および壊死筋膜炎までの範囲の広く種々の疾患を引き起こすヒト特異的病原体である。加えて、ポスト-Streptococcus自己免疫応答は子供においては依然として心臓病変の主な原因である。そのヒト宿主のA群連鎖球菌感染は一般に3つの相で起こり得る。第一の相は、細菌の宿主組織への付着および/または侵入、細胞外空間内での細菌の増殖を含む。一般には、この付着相は、喉または皮膚で開始する。感染した組織レベルがより深くなると、引き起こされ得る損傷はより重症になる。感染の第2の段階においては、細菌は可溶性トキシンを分泌し、これは、血管系を介して周囲の組織または全身さえ拡散する。このトキシンは感受性宿主細胞の受容体に結合し、これらの宿主細胞による不適切な免疫応答をトリガーし、その結果、病変をもたらす。トキシンは宿主全体に拡散できるため、GASトキシンによって直接的に引き起こされた壊死は、身体上で、細菌感染から離れた部位に位置することができる。元の細菌が宿主系から一掃されてから長時間の後、GAS感染の最後の相が起こり得る。この段階においては、宿主の以前の免疫は、GAS表面タンパク質Mのエピトープ、および心臓のような宿主組織のエピトープの間の交差反応性のためGAS細菌に応答する。GAS感染の一般的なレビューはPrinciplesofBacterialPathogenesis,Groismaned.,Chapter152001に見出すことができる。GAS感染のより後の段階に関連する病原効果を妨げるために、GASに対する効果的なワクチンは、最初の付着および侵入段階の間に細菌の宿主排除を好ましくは容易とする。A群連鎖球菌の単離体は、歴史的には、前記したM表面タンパク質に従って分類される。Mタンパク質は、一般には、アルファラセン形成において複合体化された2つのポリペプチド鎖を含む表面露出トリプシン-感受性タンパク質である。カルボキシル末端は細胞質膜中に係留され、これは、全てのA群連鎖球菌の間で高度に保存されている。細胞壁を通って細胞表面まで延びるアミノ末端は、Mタンパク質の80以上の血清型の間で観察される抗原性の変動を担う。分類の第2の層は、通常はT-抗原と言われる可変トリプシン-耐性表面抗原に基づく。MおよびT血清学的型分けに基づく疫学の数十年は、A群連鎖球菌の生物学的多様性および疾患を引き起こす能力についての研究が中心であった。M-タンパク質成分およびその固有の差異は広く特徴付けられてきたが、50年間の研究の後でさえ、T-抗原の構造および変動については依然としてほとんど知られていない。T型を規定する抗血清は、Sevapharmahttp://www.sevapharma.cz/enを含めたいくつかの源から商業的に入手可能である。GASD741のM6株からのT-抗原の1つの形態、T-型6をコードする遺伝子はクローン化され、特徴付けられ、ほぼ11kbのコードに可変な病原性アイランドにマップされる。Schneewindetal.,JBacteriol.19901726:3310-3317。このアイランドはフィブロネクチン結合、コラーゲン結合T-抗原FCT領域として知られている。なぜならば、それは、T6コーディング遺伝子tee6に加えて、細胞外マトリックスECM結合タンパク質についてコードする遺伝子のファミリーのメンバーを含むからである。Bessenetal.,InfectionImmunity2002703:1159-1167。この遺伝子ファミリーのタンパク質産物のいくつかは、フィブロネクチンおよび/またはコラーゲンに直接的に結合することが示されている。Hanskietal.,InfectionImmunity19926012:5119-5125;Talayetal.,InfectionImmunity1992609:3837-3844;Jaffeetal.1996212:373-384;Rochaetal.,AdvExpMedBiol.1997418:737-739;Kreikemeyeretal.,JBiolChem200427916:15850-15859;Podbielskietal.,Mol.Microbiol.1999314:1051-64;およびKreikemeyeretal.,Int.J.MedMicrobiol20042942-3:177-88を参照のこと。いくつかの場合に、付着および侵入におけるこれらのタンパク質の役割に対する直接的な証拠が得られている。tee6遺伝子の組換え産物に対する抗血清を本出願人らは生起させ、それを用いてM6株ISS3650におけるT6の発現を調べた。この株のムタノリシン抽出物のイムノブロットにおいて、該抗血清は、tee6遺伝子産物の予測される分子質量に対応するバンドに加えて、約100kDaから、用いた3ないし8グラジエントゲルの分解能を超えるまでの移動度の範囲の非常に高い分子量のラダーを認識した。図163A、M6_Tee6とマークした最後のレーン参照。高分子量産物のこのパターンは、Streptococcusagalactiae前記において、および従前に、Corynebacteriumdiphtheriaeで同定された線毛のタンパク質成分のイムノブロットで観察されたのと同様である。tee6の産物に対して特異的な抗血清を用いる株M6ISS3650の電子顕微鏡観察は、豊富な表面染色、および細菌表面から700ナノメートルまで延びる長い線毛様構造物を明らかとし、これは、元のLancefield血清型分けシステムで認識された抗原の1つであるT6タンパク質はGASアドヘシンアイランドGASAI-1内に位置し、長い共有結合により連結された線毛構造物を形成することを明らかとした。図163I参照。tee6遺伝子に加えて、M6_ISS3650GASAI-1におけるFCT領域は、表面露出タンパク質をコードすると予測される2つの他の遺伝子prtF1およびcpaを含有し;これらのタンパク質は細胞壁付着モチーフLPXTGを含有するものとして特徴付けられる。PrtF1に特異的な抗血清を用いるウエスタンブロット分析は、タンパク質の予測された分子質量に対応する電気泳動移動度を持つ単一の分子種、および未知の起源の1つのより小さなバンドを検出した。Cpaに対して特異的な抗血清を用いるウエスタンブロット分析は、高分子量の共有結合により連結されたラダーを認識した図163A、第2のレーン。特異的抗血清でのCpaの免疫金標識、続いての透過型電子顕微鏡観察により、細胞表面におけるCpaの豊富性、および細胞表面から延びる偶然に過ぎない構造物が検出された図163J。FCT領域の4つのクラスは、該領域内に含まれる遺伝子のタイプおよび順序によって識別することができる。M3、M5、M18およびM49型の株のFCT領域は同様な組織化を有し、他方、M6、M1およびM12のそれは異なる。図164参照。後に議論するように、これらの4つのFCT領域は4つのGASアドヘシンアイランド型AI-1、AI-2、AI-3、およびAI-4に相関する。株M6_ISS3650のFCT領域における線毛をコードする遺伝子の本出願人らの発見は、他の3つのFCT変種を表す異なるM-型M1_SF370、M5_ISS4883およびM12_20010296を有する3つの他のGAS株の変種FCT領域における予測される表面露出タンパク質を調べることを促進した。各細菌のFCT領域に存在する各遺伝子をクローン化し、発現させた。次いで、各組換えタンパク質に特異的な抗血清を用いて、各株6のムタノリシン抽出物をプローブした。M1株SF370においては、3つの予測される表面タンパク質があるM1_126およびGAS15とも言われるCpa、M1_128Spy0128およびGAS16とも言われる線毛タンパク質、およびSpy0130およびGAS18とも言われるM1_130GASAI-2。各表面タンパク質に特異的な抗血清は、高分子量の物質のラダーと反応した図163B。M1_128に特異的な抗血清でのM1株SF370の免疫金染色は、M6株ISS3650をtee6に特異的な抗血清で免疫金染色した場合に観察されるのと同様な線毛構造物を明らかとした図1163K参照。表面タンパク質CpaおよびM1_130に特異的な抗血清は、豊富な表面染色、およびM1株SF370細菌の表面から延びる偶然の構造物を明らかとした図163S。M1_128タンパク質は、CpaおよびM1_130タンパク質の重合に必要なように見える。もしM1_SF370におけるM1_128遺伝子を欠失すれば、CpaおよびM1_130にハイブリダイズする抗体を用いるウエスタンブロット分析は、もはや、CpaおよびM1_130タンパク質を含む高分子量ラダーを検出しなかった図163E。また、抗M1_130抗血清図177A、抗M1_128抗血清図177B、および抗M1_126抗血清図177Cを用いるM1_128Δ128欠失細菌のウエスタンブロット分析の結果を供する図177AないしCも参照されたし。M1株SF370の表面での線毛形成を示す高分子量ラダーは、Δ128細菌における3つの抗血清のいずれによっても検出できなかった。もしΔ128細菌を、M1_128についての遺伝子を含有するプラスミドで形質転換すれば、CpaおよびM1_130に特異的な抗血清を用いるウエスタンブロット分析は、再度、高分子量ラダーを検出した図163H。ウエスタンブロット分析と合致して、免疫電子顕微鏡観察は、M1_128抗血清を用いてΔ128株SF370細菌で線毛アセンブリを検出しなかった図178B。Δ128SF370細菌は線毛を形成できなかったが、ソルターゼ基質モチーフを含むM1_126cpaおよびM1_130は細菌の表面に存在した。M1_128欠失Δ128株SF370細菌のFACS分析もまた、Δ128株SF370細菌の表面でM1_126およびM1_130を共に検出した。M1_126およびM1_130に対して免疫反応性である抗体をΔ128細菌で用いる場合に、蛍光におけるシフトを示す図179DおよびF参照。予測されたように、M1_128に対して免疫反応性である抗体をΔ128細菌で用いる場合に、蛍光におけるシフトは実質的に観察されない図179E。対照的に、M1_130遺伝子の欠失は、M1_128の重合に影響しなかった図163F。また、抗M1_130図177A、抗M1_128図177B、および抗M1_126抗血清図177Cを用いるM1_130欠失Δ130株SF370細菌のウエスタンブロット分析結果を供する図177AないしCも参照されたし。抗M1_128および抗M1_126抗血清は、共に、Δ130株SF370細菌における高分子量ラダーの存在を検出し、これは、Δ130細菌が、M1_130の非存在下でM1_126およびM1_128ポリペプチドを含む線毛を形成することを示す。予測されるように、M1_130と免疫反応性である抗血清でプローブしたウエスタンブロットは、Δ130細菌についてのいずれのタンパク質も検出しなかった図177A。よって、GASにおける線毛の組成は、各線毛が、EMにおける線毛を豊富に染色し、他の成分の取込みに必須である骨格成分によって形成される点で、C.diphtheria7,8、およびS.agalactiae前記9双方について従前に記載されたのと似ている。また、C.diphtheriaと同様にM1_SF370のFCT領域からのsrtC1遺伝子の排除は、全ての3つのタンパク質の重合および線毛の組立を無くした図163G。また、抗M1_130図177A、抗M1_128図177B、および抗M1_126抗血清図177Cを用いるSrtC1欠失ΔSrtC1株SF370細菌のウエスタンブロット分析を供する図177AないしCも参照されたし。3つの抗血清のいずれも、ΔSrtC1細菌における高分子量構造物線毛と免疫反応しなかった。SrtC1遺伝子の欠失が株SF370における線毛アセンブリを無くしたことを確認し、M1_128に対する抗血清を用いる免疫電子顕微鏡観察は、細菌表面での線毛の形成を検出しなかった。図178C参照。組み立てられた線毛はΔSrtC1SF370で検出されなかったが、M1_128タンパク質はSF370の表面で検出できた。かくして、SrtC1欠失はSF370細菌の表面での線毛アセンブリを妨げるように見えたが、細菌細胞壁への、線毛を含むタンパク質の係留を妨げなかったようである。ΔSrtC1株SF370のFACS分析は、SrtC1の欠失は、M1_126、M1_128またはM1_130の細胞表面発現を排除しないことを確認した。M1_126図179G、M1_128図179H、およびM1_130図179Iに対して免疫反応性である抗体を用いて、ΔSrtC1細菌での細胞表面タンパク質の発現を検出する場合に、蛍光のシフトを示す図179GないしI参照。かくして、SrtC1欠失は、線毛の形成を妨げたが、細菌の表面での線毛形成に関与するタンパク質の表面係留を妨げない。もう1つのソルターゼは、恐らく、タンパク質の細菌表面への係留に関与する。C.diphtheriaeにおける線毛重合もまた、その遺伝子は線毛成分と同一の遺伝子座に存在する特定のソルターゼ酵素にやはり依存する7,8。LepAシグナルペプチダーゼ、Spy0127もまた、株SF370における線毛アセンブリで必須であるように見える。株SF370のLepA欠失変異体ΔLepAは細胞表面で線毛を組み立てられない。ΔLepA変異体は線毛を組み立てられないのみならず、細胞表面M1発現が欠乏している。M1抗血清を用いる野生型AおよびΔLepA変異体BSF370細菌のFACS分析を供する図180参照。M1免疫血清の存在下で、ΔLepA変異体細菌で蛍光のシフトは観察されない。LepAのこれらの欠失変異体は、GAS、またはいずれかのグラム陽性菌の表面で非-M、非-線毛、表面露出抗原を検出するのに有用である。これらの抗原は免疫原性組成物でも有用であり得る。線毛はM5株ISS4882およびM12株20010296でも観察された。M5株ISS4882は、4つの予測される表面露出タンパク質GASAI-3についての遺伝子を含む。M5_ISS4883Cpa、M5_orf80、M5_orf82のFCT領域GASAI-3の4つの産物のうち3つに対する抗血清は、ウエスタンブロット分析において高分子量ラダーを染色した図163C。M5_orf80に対する抗血清を免疫金染色、続いての、電子顕微鏡観察で用いた場合、長い線毛が見えた図163L。M12株20010296は5つの予測される表面露出タンパク質についての遺伝子を含む。GASAI-4。M12_20010296Cpa、EftLSL.A、Orf2のFCT領域GASAI-4の5つの産物のうち3つに対する抗血清は、ウエスタンブロット分析において高分子量ラダーを染色した図163D。EftLSL.Aに対する抗血清を用いた場合に、長い線毛が見えた図163M。本出願人らによって研究された4つの株T6、M1_128、M5_orf80およびEftLSL.Aで同定された主な線毛形成タンパク質は、いずれの対様式の比較においても23および65の間のアミノ酸同一性を共有し、これは、各線毛が異なるLancefieldT抗原を表すことができることを示す。LancefieldT抗原で当てはまるように、各線毛はGAS細菌表面のトリプシン耐性構造物の一部である。トリプシンで処理された、または処理されていないFCT型の各々を保有する細菌のFACS分析を供する図165参照6。処理に続き、線毛タンパク質、細菌の各Mタンパク質または線毛に関連しない表面タンパク質に特異的な抗体を用いる間接的免疫蛍光およびフローサイトメトリーによって線毛タンパク質の表面発現をアッセイした図165。線毛に関連するタンパク質に特異的な血清での細胞の染色はトリプシン処理によって影響されず、他方、トリプシン処理は、M-タンパク質または線毛に関連しない表面タンパク質の検出を実質的に低下させた。GAS細菌の表面で同定された線毛構造物は、商業的に入手可能なT-セロタイピング血清が細菌の表面で線毛を検出した場合に、LancefieldT抗原であることが確認された。ウエスタンブロット分析を最初に行って、T、U、W、XおよびYと命名された多価血清プールが、前記した細菌の株で同定された主な線毛成分T6、M1_128、M5_orf80およびEftLSL.Aの各々で組換えタンパク質を検出できるかを決定した。T6血清を含有するプールUは、T6タンパク質を特異的に認識したGASAI-1からの表面露出線毛タンパク質図166B。プールTはM1_128を特異的に認識したGASAI-2からの表面露出線毛タンパク質図166A。プールWはM5_orf80およびEftLSL.Aを共に認識した図166C。各多価プールの成分の各々の一価血清代表を用い、本出願人らはGASAI-1からの表面露出線毛タンパク質に対応するT6抗原の特異性を確認し図166E、GASAI-2からの表面露出線毛タンパク質に対応する抗原T1としてのM1_128図166D、GASAI-4からの表面露出線毛タンパク質に対応する抗原T12としてのEftLSL.A図166GおよびGASAI-3からの表面露出線毛タンパク質に対応する関連血清T5、T27およびT44によって認識される共通抗原としてのM5_orf80を同定した。M1_SF370からのM1_128遺伝子の欠失が線毛形成を無くするという前記で議論した出願人の観察を確認し、プールT血清は全M1_SF370細菌を染色した図166Hが、M1_128遺伝子を欠くM1_SF370細菌を染色しなかった図166I。上で議論したように、本出願人らは、少なくとも4つの異なるA群連鎖球菌アドヘシンアイランドを同定した。これらのGASAI配列は多数のM型で同定できるが、本出願人らは、驚くべきことに、4つの異なるGASAI型からの4つの主な線毛サブユニット、および特異的T分類の間の相関を発見した。他のトリプシン-耐性表面露出タンパク質もまたT分類命名に関連するようであるが、T分類およびGAS血清型の相違におけるGASアドヘシンアイランドおよび関連する超-オリゴマー線毛様構造物の役割の発見は、GAS感染の予防および治療のための重要な意味を有する。本出願人らは、線毛形成に関連するGASアドヘシンアイランドの各々の内のタンパク質成分を同定した。これらのタンパク質は細菌の初期の付着メカニズムに関与すると考えられる。これらのタンパク質の免疫学的認識は、宿主免疫応答が、感染のより病原性後期段階への細菌の移動を遅くし、または妨げるのを可能とすることができる。加えて、GAS線毛はバイオフィルムの形成に関与し得る。本出願人らは、GBS線毛構造物がバイオフィルムしばしば、エキソ多糖マトリックスに包まれた表面で増殖する細菌の集団の形成に関係するように見えることを発見した。バイオフィルムは一般には細菌耐性に関連する。というのは、抗生物質処置および宿主免疫応答は、しばしば、バイオフィルムの細菌成分の全てを根絶できないからである。細菌付着の最初の工程の間にすなわち、完全なバイオフィルム形成の前に露出された表面タンパク質に対する宿主免疫応答の指令が好ましい。本発明は、従って、宿主上皮細胞へのそれらの初期の付着努力の間にGAS細菌を標的化することができるGAS感染に対する改良された免疫原性組成物を提供し、これは、広い範囲のGAS血清型に対する保護を提供することができる。本発明の免疫原性組成物は、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー線毛形態に処方することができるGASAI表面タンパク質を含む。本発明はGASAI表面タンパク質の組合せも含む。GASAI表面タンパク質の組合せは同一アドヘシンアイランドから選択することができるか、あるいは異なるGASアドヘシンアイランドから選択することができる。本発明は、第1のGASAIタンパク質および第2のGASAIタンパク質を含む組成物を含み、ここに、該第1および第2のGASAIタンパク質は異なるGASアドヘシンアイランドに由来する。例えば、本発明は、少なくとも2つのGASAIタンパク質を含む組成物を含み、ここに、GASAIタンパク質はGASAI-1およびAI-2;GASAI-1およびGASAI-3;GASAI-1およびGASAI-4;GASAI-2およびGASAI-3;GASAI-2およびGASAI-4;およびGASAI-3およびGASAI-4よりなる群から選択されるアドヘシンアイランドによってコードされる。好ましくは、2つのGASAIタンパク質は異なるT-型に由来する。GASアドヘシンアイランド配列の模式的配置を図162に記載する。全ての株において、AI領域には、高度に保存されたオープンリーディングフレームM1_123およびM1-136が近接する。各遺伝子座における3および5の間の遺伝子は、LPXTGモチーフを含む表面タンパク質をコードする。これらの表面タンパク質は、全て、ECM結合アドヘシンをコードする遺伝子のファミリーに属する。アドヘシンアイランド配列はA群連鎖球菌の多数のM型において同定することができる。M1、M6、M3、M5、M12、M18、およびM49血清型内のAI配列の例を以下に議論する。GASアドヘシンアイランドは、一般には、表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードするGASゲノム内の一連のオープンリーディングフレームを含む。GASアドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードすることができる。あるいは、GASアドヘシンアイランドは、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードすることができる。好ましくは、GASアドヘシンアイランドは、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。表面タンパク質の1以上はLPXTG配列番号122のようなLPXTGモチーフ、または他のソルターゼ基質モチーフを含むことができる。1以上のGASAI表面タンパク質は、グラム陽性菌の表面での線毛構造物の形成に参画することができる。本発明のGASアドヘシンアイランドは、好ましくは、多岐転写型転写調節因子を含む。転写調節因子はGASAIオペロンの発現を調節することができる。GASAI配列で見出された転写調節因子の例はRofAおよびNraを含む。GASAI表面タンパク質はフィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンに結合するか、またはそうでなければ、接着することができる。GASAI表面タンパク質の1以上は線毛構造物サブユニットを含むことができる。GASAI表面タンパク質の1以上は、LPXTGモチーフまたは他のソルターゼ基質モチーフを含むことができる。LPXTGモチーフに続いて、疎水性領域および荷電C末端とすることができ、これは、細胞膜中のタンパク質を遅くして、膜-局所化ソルターゼによる認識を容易とすると考えられる。Barnett,etal.,J.Bacteriology200418617:5865-5875参照。GASAI配列は、一般には、アイランド内のソルターゼ配列の数および型、およびアイランド内のRofAおよびcpaを例外として他のタンパク質のパーセンテージ同一性に応じて型1、型2、型3または型4にカテゴリー化することができる。図167は、GASの種々の株および血清型のアドヘシンアイランド内で同定されたソルターゼ配列の数および型を示すチャートを提供する。この図面において分かるように、全てのGAS株および血清型は、これまでは、AI-1がSrtB型ソルターゼを有するように特徴づけ、全てのGAS株および血清型は、これまでは、AI-2がSrtBおよびSrtC1型ソルターゼを有するように特徴付け、全てのGAS株および血清型は、これまでは、AI-3がSrtC2型ソルターゼを有するように特徴付けおよび全てのGAS株および血清型は、かくして、AI-4がSrtBおよびSrtC2型ソルターゼを有するように遠くを特徴付ける。アドヘシンアイランド内の配列のパーセンテージ同一性の比較は表45に掲げる。前記参照。1M6内のアドヘシンアイランド配列:GASアドヘシンアイランド1GASAI-1M6血清型MGAS10394内のGASアドヘシンアイランドを以下の表4において概略を示す。このGASアドヘシンアイランド1GASAI-1は表面タンパク質、srtBソルターゼおよびrofA多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI―1表面タンパク質はSpy0157フィブロネクチン結合タンパク質、Spy0159コラーゲン接着タンパク質およびSpy0160線毛構造物サブユニットを含む。好ましくは、これらのGASAI-1表面タンパク質の各々は、LPXTG配列番号122またはLPXSG配列番号134スレオニンのセリンでの保存的置換のようなLPXTGソルターゼ基質モチーフを含む。GASAI-1はsrtB型ソルターゼを含む。GASsrtBソルターゼは、好ましくは、LPSTGモチーフ配列番号166を持つ表面タンパク質を係留することができ、特に、ここに、該モチーフにはセリンが続く。M6_Spy0160は、オリゴマー線毛構造物の一部としてGASの表面に存在するように見える。図127ないし132は、抗M6_Spy0160抗血清を用いてM6_Spy0160について免疫金染色したGAS血清型M6株3650の電子顕微鏡写真を示す。金粒子で標識されたオリゴマーまたはハイパーオリゴマー構造物は、これらの図面の各々においてGASの表面から延びているのを見ることができ、これは、オリゴマーまたはハイパーオリゴマー構造物における複数のM6_Spy0160ポリペプチドの存在を示す。図176AないしFは、抗M6_Spy0160抗血清を用いてM6_Spy0160について免疫金染色された図176AないしE、あるいは抗M6_Spy0159抗血清を用いてM6_Spy0159について免疫金染色された図176FGASM6株2724の電子顕微鏡写真を表す。金粒子で標識されたオリゴマーまたはハイパーオリゴマー構造物は、再度、M6_Spy0160について免疫金染色されたM6株2724GAS細菌の表面から延びているのを見ることができる。M6_Spy0159もまたM6株2724GASの表面で検出される。FACS分析は、GASAI-1表面タンパク質spyM6_0159およびspyM6_0160が、事実、GASの表面で発現されることを確認した。図73は、GAS血清型M62724、M63650、およびM62894の各々でのspyM6_0159の表面発現についてのFACS分析の結果を提供する。蛍光におけるシフトは、抗spyM6_0159抗血清が存在する場合に各GAS血清型について観察され、細胞表面発現を示す。以下の表18は、免疫前抗血清、抗spyM6_0159抗血清の存在下における各GAS血清型について得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗spyM6_0159抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図74は、GAS血清型M62724、M63650、およびM62894の各々でのspyM6_0160の表面発現についてのFACS分析の結果を提供する。抗spyM6_0160抗血清の存在下で、蛍光におけるシフトが各GAS血清型について観察され、これはその細胞表面発現を示す。以下の表19は、免疫前抗血清、抗spyM6_0160抗血清の存在下における各GAS血清型で得られたFACS蛍光値および免疫前抗血清および抗spyM6_0160抗血清の間の蛍光値の変化を定量的にまとめる。M6血清型GASでのM6_spy0159およびM6_Spy0160の表面発現もまた、ウエスタンブロット分析によって確認された。図98は、免疫前血清Pα-0159はGAS血清型M6においてM6_Spy0159の発現を検出しないが、抗M6_Spy0159免疫血清Iα-0159が、合計GASM6抽出物M6totおよび細胞表面タンパク質が豊富となったGASM6画分M6surfprot双方においてM6_Spy0159タンパク質を検出できることを示す。合計GASM6抽出物または表面タンパク質が豊富となったGASM6抽出物で検出されたM6_Spy0159タンパク質もまた高分子量構造物として存在し、これは、M6_Spy0159がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。図112は、免疫前血清プレ免疫抗106はGAS血清型M6株2724においてM6_Spy0160の発現を検出しないが、抗M6_Spy0160免疫血清抗160は、合計GASM6株2724抽出物M62724totおよび表面タンパク質は豊富となったGASM6株2724画分双方で検出することを示す。合計GASM6株2724抽出物、または表面タンパク質は豊富となったGASM6株2724抽出物で検出されたM6_Spy0160タンパク質はやはり高い分子量構造物として存在し、これは、M6_Spy0160がオリゴマー線毛形態で存在できることを示す。図110および111は、共に、GASの表面での高分子量構造物におけるM6_Spy0159およびM6_Spy0160の存在をさらに証明する。図110は、表面タンパク質が豊富となったGASM6株2724抽出物におけるM6_Spy0159およびM6_Spy0160を検出するために行われるウエスタンブロットを供する。M6_Spy0159抗159またはM6_Spy0160抗160いずれかに対して生起された抗血清は、これらの抽出物において高分子量構造物線毛と交差-ハイブリダイズする。図111は、表面タンパク質が豊富となったGASM6株3650抽出物における高分子量構造物でのM6_Spy0159およびM6_Spy0160の存在を証明する同様なウエスタンブロットを供する。SpyM6_0157フィブロネクチン結合タンパク質もまたGAS血清型M6細菌の表面で発現され得る。図174は、M6株3650でのspyM6_0157の表面発現についてのFACS分析の結果を示す。蛍光における僅かなシフトが観察され、これは、いくらかのspyM6_0157がGAS細胞表面で発現できることを示す。M6内のアドヘシンアイランド配列:GASアドヘシンアイランド2GASAI―2M1血清型SF370内のGASアドヘシンアイランドを以下の表5において概説する。このGASアドヘシンアイランド2GASAI-2は表面タンパク質、SrtBソルターゼ、SrtC1ソルターゼおよびRofA多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI-2表面タンパク質は、GAS15Cpa、線毛タンパク質であると考えられるSpy0128、およびSpy0130仮想タンパク質を含む。好ましくは、これらのGASAI-2表面タンパク質の各々は、LPXTG配列番号122、VVXTG配列番号135またはEVXTG配列番号136のようなLPXTGソルターゼ基質モチーフを含む。GASAI-2はsrtB型ソルターゼおよびsrtC1ソルターゼを含む。前記したように、GASSrtBソルターゼは、好ましくは、LPSTG配列番号166モチーフを持つ表面タンパク質を係留することができ、特に、ここに、該モチーフに続いてセリンがある。GASSrtC1ソルターゼは、優先的に、VP/VPTG配列番号167モチーフを持つ表面タンパク質を係留することができる。GASSrtC1はRofAによって異なって調節することができる。GASAI-2はまた、LepA推定シグナルペプチターゼIタンパク質を含むことができる。GAS15、GAS16およびGAS18は、オリゴマー線毛構造物の一部としてGASの表面に存在するように見える。図113ないし115は、抗GAS15抗血清を用いてGAS15につき免疫金染色されたGAS血清型M1株SF370の電子顕微鏡写真を示す。図116ないし121は、抗GAS16抗血清を用いてGAS16につき免疫金染色されたGAS血清型M1株SF370の電子顕微鏡写真を供する。図122ないし125は、抗GAS18抗血清を用いてGAS18につき免疫金染色されたGAS血清型M1株SF370の電子顕微鏡写真を示す。これらのタンパク質のオリゴマーは、免疫-金染色された顕微鏡写真においてSF370細菌の表面で観察することができる。図126は、GAS18につき免疫金染色されたGAS血清型M1株SF370細菌の表面でのハイパーオリゴマーを明らかとする。GAS18を含むこの長いハイパーオリゴマー構造物は、細菌の表面から上清まで遠くに延びる。FACS分析は、GASAI-2表面タンパク質GAS15、GAS16、およびGAS18がGASの表面で発現されることを確認した。図75は、GAS血清型M12719、M12580、M13280、M1SF370、M12913、およびM13348の各々でのGAS15の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗GAS15抗血清が存在する場合に各GAS血清型で観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表20は、免疫前抗血清、抗GAS15抗血清の存在下にて各GAS血清型で得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗GAS15抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図76および79は、GAS血清型M12719、M12580、M13280、M1SF370、M12913、およびM13348の各々でのGAS16の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。図76におけるFACSデータは、全長GAS16に対して生起した抗血清を用いて得られた。抗GAS16抗血清の存在下では、蛍光におけるシフトが各GAS血清型で観察され、これは、その細胞表面発現を示す。以下の表21は、免疫前抗血清、抗GAS16抗血清の存在下での各GAS血清型について得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗GAS16抗血清の間の蛍光値の変化を定量的にまとめる。図79におけるFACSデータは、以下に示される配列番号179によってコードされた、切形GAS16に対して生起した抗血清を用いて得られた。この抗GAS16抗血清の存在下では、蛍光におけるシフトが各GAS血清型につき観察され、これは、その細胞表面発現を示す。以下の表22は、免疫前抗血清、抗GAS16抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗GAS16抗血清の間の蛍光値の変化を定量的にまとめる。図77および78は、GAS血清型M12719、M12580、M13280、M1SF370、M12913、およびM13348の各々でのGAS18の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。各々は全長GAS18に対して生起されたが、図77および78の各々においてFACSデータを得るのに用いた抗血清は異なった。抗GAS18抗血清の各々の存在下で、蛍光におけるシフトが各GAS血清型で観察され、これは、その細胞表面発現を示す。以下の表23および24は、免疫前抗血清、第1、または第2の抗GAS18抗血清の存在下での各GAS血清型について得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および第1または第2の抗GAS18抗血清の間の蛍光値の変化を定量的にまとめる。M1血清型GASでのGAS15、GAS16、およびGAS18の表面発現もまた、ウエスタンブロット分析によって確認された。図89は、免疫前血清はGAS15のGASM1発現を検出しないが、抗GAS15免疫血清は、合計GASM1抽出物、および細胞表面タンパク質が豊富となったGASM1タンパク質双方においてGAS15タンパク質を検出できることを示す。表面タンパク質が豊富となったM1抽出物で検出されたGAS15タンパク質は、高分子量構造物としてやはり存在し、これは、GAS15がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。また、図90は、抗GAS15抗血清を用いるM1血清型GASのウエスタンブロット分析の結果を示す。再度、表面タンパク質が豊富となったGASM1抽出物M1protsupを含有するレーンは、GAS15のオリゴマーであり得る高分子量構造物の存在を示す。図91は、免疫前血清でプローブした以外は、図90のそれと同一のさらなるウエスタンブロットを供する。予測されるように、この膜上でタンパク質は検出されなかった。図92は、GAS16タンパク質につきプローブしたウエスタンブロットを供する。免疫前血清はGAS16のGASM1発現を検出しなかったが、抗GAS16免疫血清は、細胞表面タンパク質が豊富となったGASM1抽出物においてGAS16タンパク質を検出できる。表面タンパク質が豊富となったM1抽出物で検出されたGAS16タンパク質は高分子量構造物として存在し、これは、GAS16がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。また、図93は、抗GAS16抗血清を用いるM1血清型GASのウエスタンブロットの分析の結果を示す。合計GASM1タンパク質M1tot新およびM1tot旧を含有するレーン、および表面タンパク質が豊富となったGASM1抽出物M1protsupを含有するレーンは、GAS16のオリゴマーであり得る高分子量構造物の存在を示す。図94は、免疫前血清でプローブした以外は図93のそれと同一のさらなるウエスタンブロットを供する。予測されるように、この膜上ではタンパク質は検出されなかった。図95は、GAS18タンパク質についてプローブしたウエスタンブロットを供する。免疫前血清はGAS18のGASM1発現を検出しないが、抗GAS18免疫血清は、細胞表面タンパク質が豊富となったGASM1抽出物においてGAS18タンパク質を検出することができる。表面タンパク質が豊富となったM1抽出物で検出されたGAS18タンパク質は高分子量構造物として存在し、これは、GAS18がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。また、図96は、抗GAS18抗血清を用いるM1血清型GASのウエスタンブロット分析の結果を示す。表面タンパク質が豊富となったGASM1抽出物M1protsupを含有するレーンは、GAS18のオリゴマーであり得る高分子量構造物の存在を示す。図97は、免疫前血清でプローブした以外は図96のそれと同一であるさらなるウエスタンブロットを供する。予測されるように、この膜上ではタンパク質は検出されなかった。図102ないし106は、GASにおける高分子量構造物のGAS15、GAS16、およびGAS18の存在を証明するためのさらなるウエスタンブロットを供する。各ウエスタンブロットは、異なるGASM1株、2580、2913、3280、3348、および2719からのタンパク質を用いて行った。各ウエスタンブロットは、GAS15、GAS16、およびGAS18の各々に対して生起された抗血清でプローブした。図102ないし106で理解できるように、ウエスタンブロットのいずれも、免疫前血清を用いるタンパク質の検出を示さずPα-158、Pα-15、Pα-16、またはPα-18、他方、各ウエスタンブロットは、GAS15Iα-15、GAS16Iα-16、およびGAS18Iα-18抗血清の、高分子量構造物への交差-ハイブリダイゼーションを示す。かくして、これらのウエスタンブロットは、GAS15、GAS16、およびGAS18がGASM1における線毛で存在できることを確認する。図107は、表面タンパク質が豊富となったGAS血清型M1株SF370タンパク質画分においてGAS15、GAS16、およびGAS18タンパク質を検出するために行った同様のウエスタンブロットを提供する。また、このウエスタンブロットは、高分子量構造物としてのGAS15抗15、GAS16抗16、およびGAS18抗18の検出を示す。3M3、M5、およびM18内のアドヘシンアイランド配列:GASアドヘシンアイランド3GASAI-3M3、M5、およびM18血清型内のGASアドヘシンアイランド配列は以下の表6ないし8および10において概説される。このGASアドヘシンアイランド3GASAI-3は、表面タンパク質、SrtC2ソルターゼ、および負の転写調節因子Nraの多岐転写型転写調節因子を含む。GASAI-3表面タンパク質は、コラーゲン結合タンパク質、線毛タンパク質、F2様フィブロネクチン結合タンパク質を含む。GASAI-3表面タンパク質は仮定表面タンパク質を含むこともできる。好ましくは、これらのGASAI-3表面タンパク質の各々は、LPXTG配列番号122,VPXTG配列番号137,QVXTG配列番号138またはLPXAG配列番号139のようなLPXTGソルターゼ基質モチーフを含む。GASAI-3はSrtC2型ソルターゼを含む。GASSrtC2型ソルターゼは、好ましくは、特に、該モチーフに続いて疎水性領域および荷電C末端テイルがある場合に、QVPTG配列番号140モチーフを持つ表面タンパク質を係留することができる。GASSrtC2はNraによって異なって調節され得る。GASAI-3はLepA推定シグナルペプチダーゼIタンパク質を含むこともできる。GASAI-3は推定多重糖代謝調節因子を含むこともできる。AI-3血清型M3、M5、M18、およびM49の模式図を図51Aに示す。各々は、ほとんど同一のアミノ酸配列のSrtC2-型ソルターゼをコードするオープンリーディングフレームを含む。SrtC2アミノ酸配列の各々についてのアミノ酸配列アラインメントについては図52B参照。各々のこれらの3型アドヘシンアイランドのプロテインF2-様フィブロネクチン結合タンパク質は、ピリンモチーフおよびE-ボックスを含む。図60は、GASAI-3血清型M3MGAS315SpyM3_0104/21909640、GASAI-3血清型M3SSISps0106/28895018、GASAI-3血清型M18SpyM18_0132/19745307、およびGASAI-3血清型M5orf84の各々のピリンモチーフおよびE-ボックスのアミノ酸配列を示す。FACS分析は、GASAI-3表面タンパク質SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、およびSpyM3_0104がGASの表面で発現されることを確認した。図80は、GAS血清型M32721およびM33135の各々でのSpyM3_0098の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトが抗SpyM3_0098抗血清が存在する場合に各GAS血清型で観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表25は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0098抗血清の存在下で各GAS血清型について得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0098抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図81は、GAS血清型M32721およびM33135の各々でのSpyM3_0100の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗SpyM3_0100抗血清が存在する場合に各GAS血清型で観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表26は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0100抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0100抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図82は、GAS血清型M32721およびM33135の各々でのSpyM3_0102の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトが、抗SpyM3_0102抗血清が存在する場合に各GAS血清型につき観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表27は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0102抗血清の存在下で各GAS血清型で得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0102抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。また、図82は、異なるGAS血清型、M6で同定されたSpyM3_0102に対して相同性を有するピリン抗原の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。SpyM3_0102抗血清で行われたFACS分析は、GAS血清型M62724、M63650、およびM62894の各々での相同SpyM3_0102抗原の表面発現を検出することができた。以下の表28は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0102抗血清の存在下にて各GAS血清型で得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0102抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。SpyM3_0102もまた、GAS血清型M12のピリン抗原19224139に対して相同である。SpyM3_0102に対して生起された抗血清は、19224139抗原を含む、表面タンパク質が豊富となったGAS血清型M12株2728タンパク質画分において高分子量構造物を検出することができる。M122728surfprotと標識されたレーンにおける図109参照。図83は、GAS血清型M32721およびM33135の各々でのSpyM3_0104の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗SpyM3_0104抗血清が存在する場合に各GAS血清型につき観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表29は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0104抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0104抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。また、図83は、異なるGAS血清型、M12で同定されたSpyM3_0104に対して相同性を有するピリン抗原の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。SpyM3_0104抗血清で行ったFACS分析は、GAS血清型M122728での相同SpyM3_0104抗原の表面発現を検出することができた。以下の表30は、免疫前抗血清、抗SpyM3_0104抗血清の存在下でこのGAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SpyM3_0104抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図84は、GAS血清型M32721およびM33135の各々でのSPs_0106の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗SPs_0106抗血清が存在する場合に各GAS血清型で観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表31は、免疫前抗血清、抗SPs_0106抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SPs_0106抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。また、図84は、異なるGAS血清型、M12で同定されたSPs_0106に対して相同性を有するピリン抗原の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。SPs_0106抗血清で行ったFACS分析は、GAS血清型M122728での相同SPs_0106抗原の表面発現を検出することができた。以下の表32は、免疫前抗血清、抗SPs_0106抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗SPs_0106抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。4M12内のアドヘシンアイランド配列:GASアドヘシンアイランド4GASAI-4M12血清型内のGASアドヘシンアイランド配列を以下の表11に概説する。このGASアドヘシンアイランド4GASAI-4は表面タンパク質、SrtC2ソルターゼ、およびRofA調節タンパク質を含む。GASAI-4表面タンパク質は線毛タンパク質、FまたはF2様フィブロネクチン結合タンパク質、および莢膜多糖アドヘシンタンパク質Cpaをその中に含むことができる。GASAI-4表面タンパク質はオープンリーディングフレームorfにおける仮想表面タンパク質を含むこともできる。好ましくは、これらのGASAI-4表面タンパク質の各々は、LPXTG配列番号122,VPXTG配列番号137,QVXTG配列番号138またはLPXAG配列番号139のようなLPXTGソルターゼ基質モチーフを含む。GASAI-4はSrtC2型ソルターゼを含む。GASSrtC2型ソルターゼは、好ましくは、特に、当該モチーフに続いて疎水性領域および荷電C末端テイルがある場合に、QVPTG配列番号140モチーフを持つ表面タンパク質を係留することができる。GASAI-4はLepA推定シグナルペプチダーゼIタンパク質およびMsmRLタンパク質を含むこともできる。AI-4血清型M12の模式図を図51Aに示す。該オープンリーディングフレームの1つは、前記したAI-3血清型のSrtC2-型ソルターゼのアミノ酸配列とほとんど同一であるアミノ酸配列を有するSrtC2-型ソルターゼをコードする。SrtC2アミノ酸配列の各々についてのアミノ酸配列アラインメントについては図52B参照。AI-4血清型M12のオープンリーディングフレームによってコードされた他のタンパク質は、S.pyogenesにおける他の公知のアドヘシンアイランド、ならびにGASAI-3血清型M5Manfredoによってコードされたタンパク質に対して相同である。図52は、AI-4血清型M1219224135、GASAI-3血清型M5ORF78、S.pyogenes株MGAS315血清型M321909634、S.pyogenesSSI-1血清型M328810257、S.pyogenesMGAS8232血清型M319745301、およびGASAI-2血清型M1GAS15の莢膜多糖アドヘシンタンパク質cpaのアミノ酸整列である。AI-4血清型M12cpaのアミノ酸配列は、他のcpaタンパク質に対して高度な相同性を共有する。図53は、AI-4血清型M12オープンリーディングフレーム19224134によってコードされたF-様フィブロネクチン結合タンパク質が、S.pyogenes株MGAS10394血清型M650913503で見出されたF-様フィブロネクチン結合タンパク質に対して相同性を有することを示す。図54は、AI-4血清型M1219224141のF2-様フィブロネクチン結合タンパク質が、S.pyogenes株MGAS8232血清型M319745307、GASAI-3血清型M5ORF84、S.pyogenes株SSI血清型M328810263、およびS.pyogenes株MGAS315血清型M321909640のF2-様フィブロネクチン結合タンパク質に対して相同性を有することを示すアミノ酸配列アラインメントである。図55は、AI-4血清型M1219224137の線毛タンパク質が、GASAI-3血清型M5ORF80の線毛タンパク質、およびS.pyogenes株MGAS315血清型M321909636、S.pyogenes株SSI血清型M328810259、S.pyogenes株MGAS8732血清型M319745303、およびS.pyogenes株M1GAS血清型M113621428の仮想タンパク質に対して相同性を有することを示すアミノ酸配列アラインメントである。図56は、GASAI-4血清型M1219224139の仮想タンパク質が、S.pyogenes株MGAS315血清型M321909638、S.pyogenes株SSI-1血清型M328810261、GASAI-3血清型M5ORF82、およびS.pyogenes株MGAS8232血清型M319745305の仮想タンパク質に対して相同性を有することを示すアミノ酸配列アラインメントである。4型アドヘシンアイランドのプロテインF2-様フィブロネクチン結合タンパク質もまた、高度に保存されたピリンモチーフおよびE-ボックスを含む。図60は、AI-4血清型M12におけるピリンモチーフおよびE-ボックスのアミノ酸配列を示す。FACS分析は、GASAI-4表面タンパク質19224134、19224135、19224137、および19224141がGASの表面で発現されることを確認した。図85は、GAS血清型M122728での19224134の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗19224134抗血清が存在する場合に観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表33は、免疫前抗血清、抗19224134抗血清の存在下でGAS血清型M122728につき得られたFACS蛍光値、および、免疫前抗血清、および抗19224134抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。また、図85は、異なるGAS血清型、M6で同定された19224134に対して相同性を有するピリン抗原の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。19224134抗血清で行ったFACS分析は、GAS血清型M62724、M63650、およびM62894の各々での相同な19224134抗原の表面発現を検出することができた。以下の表34は、免疫前抗血清、抗19224134抗血清の存在下で各GAS血清型につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗19224134抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図86は、GAS血清型M122728での19224135の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗19224135抗血清が存在する場合に観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表35は、免疫前抗血清、抗19224135抗血清の存在下でGAS血清型M122728につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗―19224135抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図87は、GAS血清型M122728での19224137の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗19224137抗血清が存在する場合に観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表36は、免疫前抗血清、抗19224137抗血清の存在下でGAS血清型M122728につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗19224137抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。図88は、GAS血清型M122728での19224141の表面発現についてのFACS分析の結果を供する。蛍光におけるシフトは、抗19224141抗血清が存在する場合に観察され、これは、細胞表面発現を示す。以下の表37は、免疫前抗血清、抗19224141抗血清の存在下でGAS血清型M122728につき得られたFACS蛍光値、および免疫前抗血清および抗19224141抗血清の間の蛍光値の差を定量的にまとめる。19224139orf2と命名されるは、GAS血清型M12細菌の表面で発現させることもできる。図175は、M12株2728での19224139の表面発現についてのFACS分析の結果を示す。蛍光におけるわずかなシフトが観察され、これは、いくらかの19224139がGAS細胞表面で発現され得ることを示す。M12血清型GASでの19224135の表面発現は、ウエスタンブロット分析によっても確認された。図99は、免疫前血清Pα-4135が19224135のGASM12発現を検出しないが、抗19224135免疫血清Iα-4135が、合計GASM12抽出物M12totおよび細胞表面タンパク質が豊富となったGASM12画分M12surfprot双方において19224135タンパク質を検出できることを示す。合計GASM12抽出物、または表面タンパク質が豊富となったGASM12抽出物で検出された19224135タンパク質は、高分子量構造物としても存在し、これは、19224135がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。また、抗19224135抗血清抗19224135が、表面タンパク質が豊富となったGASM12株2728タンパク質抽出物における高分子量構造物と免疫反応することを示すさらなるウエスタンブロットを供する図108も参照。M12血清型GASでの19224137の表面発現は、ウエスタンブロット分析によっても確認された。図100は、免疫前血清Pα-4137が19224137のGASM12発現を検出しないが、抗19224137免疫血清Iα-4137が、合計GASM12抽出物M12tot、および細胞表面タンパク質が豊富となったGASM12画分M12surfprot双方における19224137タンパク質を検出できることを示す。合計GASM12抽出物、または表面タンパク質が豊富となったGASM12抽出物で検出された19224137タンパク質は、高分子量構造物としても存在し、これは、19224137がオリゴマー線毛形態であり得ることを示す。また、抗19224137抗血清抗19224137が、表面タンパク質が豊富となったGASM12株2728タンパク質抽出物における高分子量構造物と免疫反応することを示すさらなるウエスタンブロットを供する図108も参照。Streptococcuspneumoniaeアドヘシンアイランド配列は、Streptococcuspneumoniaeゲノムにおいて同定することができる。これらのゲノムのいくつかは、公に入手可能なStreptococcuspneumoniaeTIGR4ゲノムまたはStreptococcuspneumoniae株670ゲノムを含む。これらの、S.pneumoniaeAI配列の例を以下に議論する。S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、一般には、表面タンパク質およびソルターゼの集合体をコードするS.pneumoniaeゲノム内の一連のオープンリーディングフレームを含む。S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも1つの表面タンパク質を含むアミノ酸配列をコードすることができる。あるいは、S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも2つの表面タンパク質および少なくとも1つのソルターゼをコードすることができる。好ましくは、S.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、少なくとも3つの表面タンパク質および少なくとも2つのソルターゼをコードする。表面タンパク質の1以上は、LPXTG配列番号122のようなLPXTGモチーフ、または他のソルターゼ基質モチーフを含むことができる。1以上のS.pneumoniaeAI表面タンパク質は、S.pneumoniae細菌の表面の線毛構造物の形成に参画することができる。本発明のS.pneumoniaeアドヘシンアイランドは、好ましくは、多岐転写型転写調節因子を含む。転写調節因子は、S.pneumoniaeAIオペロンの発現を調節することができる。S.pneumoniaeAI表面タンパク質はフィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはコラーゲンに結合するか、またはそうでなければ接着することができる。S.pneumoniaeAI遺伝子座の組織化の模式図を、図137に供する。該遺伝子座は、転写調節因子rlrA、細胞壁表面タンパク質rrgA、rrgB、rrgC、およびソルターゼsrtB、srtC、srtDをコードするオープンリーディングフレームを含む。また、図137は、これらのオープンリーディングフレームの各々に対応するS.pneumoniae株TIGR4遺伝子名称を示す。表9および38は、各々、S.pneumoniae株TIGR4および670におけるこれらのオープンリーディングフレームの各々のゲノム位置を同定する。S.pneumoniae株670AIの全長ヌクレオチド配列もまた、その転写されたアミノ酸配列と同様に、図101に示す。少なくとも8つの他のS.pneumoniae株は、図137に示された遺伝子座によって記載されるアドヘシンアイランド遺伝子座を含む。これらの株は、増幅分析によって同定された。異なるS.pneumoniae株のゲノムは、プライマーの11の別々のセットで増幅した。これらのプライマーの各々の配列を以下に表41において供する。これらのプライマーはAI遺伝子座の完全長に沿ってハイブリダイズして、遺伝子座を通じての配列を代表する増幅産物を生じた。S.pneumoniaeAI遺伝子座にこれらのプライマーの各々がハイブリダイズする位置の模式図である図138参照。図139Aは、S.pneumoniae株TIGR4におけるAI遺伝子座の増幅から得られたアンプリコンのセットを供する。図139Bは、S.pneumoniae株TIGR4における各アンプリコンの、塩基対における、長さを供する。S.pneumoniae株19AHungary6、6BFinland12、6BSpain2、9VSpain3、14CSR10、19FTaiwan14、23FTaiwan15、および23FPoland16のゲノムの増幅は、11のプライマー対についての11アンプリコンのセットを生じ、これは、これらの株の各々がやはりS.pneumoniaeAI遺伝子座を含んだことを示す。該S.pneumoniae株は、比較ゲノムハイブリダイゼーションCGH分析によってAI遺伝子座を含有するものとしても同定された。16のS.pneumoniae株のゲノムを、株TIGR4のユニークなオープンリーディングフレームに対する比較によってAI遺伝子座の存在について問い合わせした。AI遺伝子座は、この方法によって、株19AHungary619AHUN、6BFinland126BFIN12、6BSpain26BSP2、14CSR1014CSR10、9VSpain39VSP3、19FTaiwan1419FTW14、23FTaiwan1519FTW15、および23FPoland1623FP16において検出された。図140参照。AI遺伝子座を、これらの株の各々について配列決定し、各orfについてのヌクレオチドおよびコードされたアミノ酸配列を決定した。10の株の各々に存在するアドヘシンアイランドの完全なヌクレオチド配列の整列を、図196に供する。orfによってコードされるアミノ酸配列の整列は、AIポリペプチドのアミノ酸配列の多くの保存を明らかとする。例えば、表39は、S.pneumoniae株670およびTIGR4アドヘシンアイランド内のコードされたポリペプチドのパーセント同一性の比較を供する。図141ないし147は、各々、全ての10のAI-陽性S.pneumoniae株におけるオープンリーディングフレームの1つによってコードされるポリペプチドについての複数配列アラインメントを供する。配列アラインメントの各々において、明るい陰影はLPXTGモチーフを示し、暗い陰影は、太文字のE-ボックスモチーフの保存されたグルタミン酸残基を持つE-ボックスモチーフの存在を示す。配列アラインメントは、オープンリーディングフレームのほとんどによってコードされるポリペプチドを、相同性の2つの群、S.pneumoniaeAI-aおよびAI-bに分けることができることも明らかにした。AI-aを含むS.pneumoniae株は、14CSR10、19AHungary6、23FPoland15、670、6BFinland12、および6BSpain2を含む。AI-bを含むS.pneumoniaeは、19FTaiwan14、9VSpain3、23FTaiwan15、およびTIGR4を含む。本発明の免疫原性組成物は、S.pneumoniaeAI-aおよびAI-bの各々内からの1以上のポリペプチドを含むことができる。例えば、オープンリーディングフレーム4によってコードされたポリペプチドRrgBは、相同性の2つのそのような群内に分けることができる。1つの群は6つのS.pneumoniae株のRrgB配列を含み、第2の群は4つのS.pneumoniae株のRrgB配列を含む。各個々の群内の株のアミノ酸配列は99ないし100パーセント同一であるが、第2の群に対する第1の群における株のアミノ酸配列同一性は48にすぎない。表41は、10のS.pneumoniae株についての各オープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列の同一性比較を供する。S.pneumoniae株におけるRrgBポリペプチドとの間の相同性の不一致は、中央のアミノ酸残基におけるアミノ酸配列同一性の欠如による。アミノ酸残基1ないし30および617ないし665は、10のS.pneumoniae株の各々について同一である。しかしながら、アミノ酸残基31ないし616は株の間で42および100の間のパーセント同一性を共有する。図149参照。RrgBポリペプチドにおける同一性の共有されたN-およびC-末端領域は、免疫原性組成物で用いるRrgBポリペプチドの好ましい部分であり得る。同様に、S.pneumoniaeAI遺伝子座によってコードされるポリペプチドのいずれかにおける同一性の共有された領域は、免疫原性組成物で用いるのに好ましい場合がある。図141ないし147で供されるアミノ酸整列を用いる当業者であれば、同一性のこれらの領域を容易に決定できる。これらのAI遺伝子座を含むS.pneumoniaeは、事実、それらの表面で高分子量ポリマーを発現し、これは、線毛の存在を示す。図137で示されるアドヘシンアイランド遺伝子座を含むS.pneumoniae株によって発現される高分子量構造物の検出を示す図182参照。これらの株はrlrAとして示される。これらの知見を確認し、電子顕微鏡観察およびネガティブ染色は、S.pneumoniaeの表面から延びる線毛の存在を検出する。図185参照。アドヘシンアイランド遺伝子座が線毛を担うことを証明するために、TIGR4のrrgAないしsrtD領域を欠失した。アドヘシンアイランドのこの領域の欠失の結果、線毛発現が喪失した。図186参照。また、抗RrgBおよび抗RrgC抗体を用いて免疫金染色したrrgAないしsrtD領域を欠くS.pneumoniaeの電子顕微鏡写真を供する図235も参照。線毛は見ることができない。前記したのと同様に、アドヘシンアイランドにおける遺伝子の転写リプレッサーmgrAを欠くS.pneumoniae細菌は線毛を発現する。図187参照。しかしながら、予測されるように、rrgAないしsrtD領域においてmgrAおよびアドヘシンアイランド遺伝子を共に欠くS.pneumoniae細菌は線毛を発現しない。図188参照。これらの高分子量線毛構造物は、S.pneumoniaeの細胞への付着において役割を演じるように見える。線毛オペロンを欠くS.pneumoniaeTIGR4は、インビトロでA549肺胞細胞へ付着する能力を有意に減少させた。図184参照。Sp0463S.pneumoniaeTIGR4rrgBアドヘシンアイランドポリペプチドはオリゴマー形態で発現される。全細胞抽出物は、Sp0463抗血清を用いるウエスタンブロットによって分析した。該抗血清は、高分子量Sp0463ポリマーと交差-ハイブリダイズした。図156参照。該抗血清は、図137に示すAI遺伝子座を含まないS.pneumoniaeのD39またはR6株からのポリペプチドと交差―ハイブリダイズしなかた。RrgB抗血清を用いるS.pneumoniaeTIGR4の免疫金標識により、線毛におけるRrgBの存在が確認される。図189は、RrgB5nm金粒子およびRrgC10nm金粒子タンパク質についての免疫標識でのS.pneumoniaeTIGR4細菌の二重標識を示す。RrgBタンパク質は、線毛構造物に沿って一定間隔で存在するものとして検出される。RrgCタンパク質は線毛の先端で検出される。図234の矢印参照;図234は、によって示される位置における図189中の線毛のクローズアップである。RrgAタンパク質は、S.pneumoniaeTIGR4の表面での高分子量構造物に存在し、その形成に必要であるように見える。RrgAをコードする遺伝子を欠くTIGR4S.pneumoniaeのウエスタンブロット分析の結果を供する図181参照。RrgBに対して生起される抗血清を用いて、高分子量構造物は、RrgAを発現しないS.pneumoniaeでは検出されない。図183も参照。10のS.pneumoniae株におけるRrgAタンパク質のアミノ酸配列の比較の詳細なダイヤグラムを図148に示す。該ダイヤグラムは、個々のS.pneumoniae株が2つの異なる相同性群に分けられることを明らかにする。S.pneumoniaeTIGR4AIによってコードされる細胞表面ポリペプチド、Sp0462rrgA、Sp0463rrgB、およびSp0464rrgCをクローン化し、発現させた。実施例15ないし17参照。RrgAの成功した組換え発現を示すポリアクリルアミドゲルを図190Aに供する。ヒスチジンタグを持つpET21bにおいて発現されるRrgAタンパク質の検出もまた、抗ヒスチジンタグ抗体を用いる、図190Bにおけるウエスタンブロット分析によって示す。RrgBおよびRrgC抗体を検出する抗体はマウスで生産されている。生起した抗体を用いる、各々、RrgBおよびRrgCの検出を示す図191および192参照。これらのS.pneumoniaeアドヘシンアイランドの同定に加えて、SrtB型ソルターゼについてのコーディング配列はいくつかのS.pneumoniae臨床単離体で同定されており、これは、これらの単離体全体にわたってのSrtB型ソルターゼの保存を示す。組換えにより生産されたAIポリペプチドAIポリペプチドとして発現されるように非-AIポリペプチドを改変するのも本発明の態様である。非-AIポリペプチドは、加えて、非-AIポリペプチドのAIポリペプチドとしての発現を引き起こすことができる、AIポリペプチド配列、例えば、ソルターゼ基質、ピリン、またはE-ボックスモチーフを含むように遺伝子的に操作することができる。あるいは、非-AIポリペプチドは、非-AIポリペプチドのAIポリペプチドとしての発現を引き起こすことができるAIポリペプチド配列、例えば、ソルターゼ基質、ピリン、またはE-ボックスモチーフに代えて、非-AIポリペプチド内のアミノ酸配列で置き換えるように遺伝子的に操作することができる。いずれの数のアミノ酸残基も非―AIポリペプチドに加えることができ、あるいは非-AIポリペプチド内を置き換えて、AIポリペプチドとしてのその発現を引き起こすことができる。少なくとも5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、50、75、100、150、200、または250のアミノ酸残基を置き換え、あるいは非-AIポリペプチドアミノ酸配列に付加することができる。GBS322は、AIポリペプチドとして発現させることができる1つのそのような非-AIポリペプチドであり得る。GBSアドヘシンアイランド配列本発明のGBSAIポリペプチドは、勿論、種々の手段例えば、組換え発現、GBSからの精製、化学合成等によって、種々の形態で例えば、天然、融合、グリコシル化、非-グリコシル化等調製することができる。それらは、好ましくは、実質的に純粋な形態ですなわち、他の連鎖球菌性タンパク質または宿主細胞タンパク質を実質的に含まない、あるいは実質的に単離された形態で調製される。本発明のGBSAIタンパク質は、同定されたGBSタンパク質に対する配列相同性を有するポリペプチド配列を含むことができる。配列同一性の程度は問題とするアミノ酸配列aに依存して変化することができるが、好ましくは50よりも大きい例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。配列同一性を有するポリペプチドは、同定されたGBSタンパク質のホモログ、オルソログ、対立遺伝子変種および機能的変異体を含む。典型的には、2つのタンパク質の間の50以上の同一性は、機能的同等性を示すものと考えられる。タンパク質の間の同一性は、パラメーター、ギャップ開放ペナルティ=12、およびギャップ延長ペナルティ=1にてアフィニティギャップサーチを用いる、MPSRCHプログラムOxfordMolecularで実行されるSmith-Waterman相同性サーチアルゴリズムによって好ましくは決定される。GBSアドヘシンアイランドポリペプチド配列は、同定されたGBSアドヘシンアイランドポリペプチド配列に対して配列同一性を有するプリヌクレオチド配列を含む事ができる。配列同一性の程度は、問題とするポリヌクレオチド配列に従って変化させることができるが、好ましくは50よりも大きい例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。本発明のGBSアドヘシンアイランドポリヌクレオチド配列は、同定されたアドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド断片を含むことができる。該断片の長さは、特異的アドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド配列に応じて変化することができるが、該断片は、好ましくは、少なくとも10の連続ポリヌクレオチドである例えば、少なくとも10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。本発明のGBSアドヘシンアイランドアミノ酸配列は、同定されたGBSタンパク質のポリペプチド断片を含むことができる。該断片の長さは、特異的GBS抗原のアミノ酸配列に応じて変化させることができるが、該断片は、好ましくは、少なくとも7つの連続アミノ酸である例えば、8,10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。好ましくは、該断片は該配列からの1以上のエピトープを含む。他の好ましい断片は1各同定されたGBSタンパク質のN-末端シグナルペプチド、2それらのN-末端シグナルペプチドが無い同定されたGBSタンパク質、および310までのアミノ酸残基例えば、1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25以上がN-末端および/またはC-末端から欠失された、例えば、N-末端アミノ酸残基を欠失することができる各同定されたGBSタンパク質を含む。他の断片は該タンパク質の1以上のドメインを省く例えば、シグナルペプチドの、細胞質ドメインの、膜貫通ドメインの、または細胞外ドメインの省略。GBS80好ましいGBS80断片の例を以下に議論する。種々のGBS血清型および株単離体からのGBS80のポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を図18および22に記載する。GBS血清型V、株単離体2603からのGBS80についてのポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を以下に配列番号1および2として含める:前記したように、本発明の組成物はAIタンパク質の断片を含むことができる。いくつかの例において、リーダーまたはシグナル配列領域、膜貫通領域、細胞質領域または細胞壁アンカリングモチーフのような1以上のドメインの除去は、該タンパク質をコードする遺伝子のクローニング、および/またはGBSAIタンパク質の組換え発現を容易とすることができる。加えて、引用されたGBSAIタンパク質の免疫原性エピトープを含む断片を、本発明の組成物で用いることができる。例えば、GBS80は、前記配列番号2の始まりにおいて下線を施した配列によって示されるN-末端リーダーまたはシグナル配列領域を含む。1つの実施形態において、GBS80のリーダーまたはシグナル配列領域からの1以上のアミノ酸を除去する。そのようなGBS80断片の例を以下に配列番号3として記載する:GBS80は、前記配列番号2の最後の近くの下線を施した配列によって示されるC-末端膜貫通領域を含む。1つの実施形態において、膜貫通領域および/または細胞質領域からの1以上のアミノ酸を除去する。そのようなGBS80断片の例は以下に配列番号4として記載する:GBS80は、前記配列番号2においてイタリック体で示した細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:配列番号5IPNTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組み換えGBS80タンパク質の分泌を容易とするのが望ましい場合がある。従って、本発明で用いられるGBS80の1つの好ましい断片において、膜貫通および/または細胞質領域、および細胞壁アンカーモチーフをGBS80から除去する。そのようなGBS80断片の例を以下に配列番号6として記載する。あるいは、いくつかの組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインを精製の間に切断することができるか、あるいは組み換えタンパク質を最終組成物中に不活化宿主細胞または細胞膜に結合したままとすることができる。1つの実施形態において、リーダーまたはシグナル配列領域、膜貫通および細胞質領域、および細胞壁アンカーモチーフをGBS80配列から除去する。そのようなGBS80断片の例を以下に配列番号7として記載する。本出願人らは、GBS80タンパク質の特に免疫原性断片を同定した。この免疫原性断片はタンパク質のN-末端に向かって位置し、以下のGBS80配列番号2配列において下線を施す。下線を施した断片を以下に配列番号8として記載する。配列番号7によってコードされるタンパク質の免疫原性を、PBS、GBS全細胞、GBS80全長、およびペプチドのC-末端以下の配列番号9により近く位置したGBS80のもう1つの断片に対して比較した。能動先天性免疫アッセイおよび受動先天性免疫アッセイの両方を、タンパク質のこの集合体に対して行った。本明細書中で用いるように、能動先天性免疫アッセイとは、雌マウスがテスト抗原組成物で免疫されるインビボ保護アッセイを言う。次いで、該雌マウスを交配させ、その仔を致死量のGBSでチャレンジする。免疫スケジュールの間での雌マウスの血清力価、ならびにチャレンジ後の仔の生存時間を測定する。具体的には、ここで言及する能動先天性免疫アッセイは、4匹のCD-1雌マウスCharlesRiverLaboratories,CalcoItalyの群を用いた。これらのマウスを、交配に先立って、1、21および35日に、フロイントのアジュバント中の選択されたタンパク質で腹腔内免疫した。6ないし8週齢マウスに、単一抗原で免疫する場合には20μgタンパク質/用量を与え、抗原の組み合わせで免疫する場合には、30ないし45μgタンパク質/用量15μgの各抗原を与えた。雌親の免疫応答を、0日および49日に採取した血清試料を用いることによってモニターした。雌マウスを最後の免疫から2ないし7日後にほぼt=36-37において交配させ、典型的には、21日間の妊娠期間を有した。誕生から48時間以内に、PBSコントロール群から集めた平均的なデータによって決定されるように免疫していない仔の70ないし90を殺すのに十分であろう量とほぼ同等の用量のGBSで仔をI.P.を介してチャレンジした。GBSチャレンジ用量は、このましくは、50μLのTHB媒体中で投与する。好ましくは、仔チャレンジは、最初の免疫から56ないし61日後に行う。チャレンジ接種物は、使用前にTHBで適当な濃度まで希釈した凍結培養物から出発して調製した。仔の生存はチャレンジ後5日間モニターした。本明細書中で用いるように、受動先天性免疫アッセイとは、送達からほぼ2日前にウサギ免疫血清またはコントロール血清を注射することによって妊娠したマウスを受動的に免疫するインビボ保護アッセイを言う。次いで、仔を致死量のGBSでチャレンジする。具体的には、ここに言及する受動先天性免疫アッセイは、送達から2日前にI.P.を介して1mLのウサギ免疫血清またはコントロール血清を注射することによって受動的に免疫した妊娠CD1マウスの群を用いた。新生マウス誕生後24ないし48時間を、70ないし90致死量のGBS血清型IIICOH1でI.P.を介してチャレンジする。凍結した中期対数相培養物を希釈することによって得られたチャレンジ用量を、50μLのTHB培地中で投与した。双方のアッセイでは、GBS感染で生き残る仔の数を12時間毎に4日間評価した。統計学的有意性は、Fisherの直接確率検定によって見積もった。配列番号7、配列番号8、PBS、およびGBS全細胞での免疫のための各アッセイの結果を以下の表1および2に記載する。表1および2に示したように、配列番号7のGBS80断片での免疫は、比較配列番号8のGBS80断片よりもチャレンジされた仔についての実質的に改良された生存率を供した。これらの結果は、配列番号7のGBS80断片が、GBS80の重要な免疫原性エピトープを含み得ることを示す。前記したように、保存されたリシンK残基を含有するピリンモチーフはGBS80で同定されている。ピリンモチーフ配列は、以下の配列番号2においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基199および207において、およびアミノ酸残基368および375において太文字でマークされている。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、GBS80のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS80の好ましい断片は、少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスもまたGBS80で同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号2においては下線を施されている。アミノ酸残基392および471における保存されたグルタミン酸E残基は太文字でマークされている。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS80のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS80の好ましい断片は、少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。GBS104同様に、以下に好ましいGBS104断片の例を提供する。血清型V単離株2603から配列決定されたGBS104のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を以下に配列番号10および11として記載する:GBS104は、前記配列番号11の始まりにおいて下線を施した配列によって示されるN-末端リーダーまたはシグナル配列領域を含む。1つの実施形態において、GBS104のリーダーまたはシグナル配列領域からの1以上のアミノ酸配列を除去する。そのようなGBS104断片の例を以下に配列番号12として記載する。GBS104は、前記配列番号11の最後の近くの下線を施した領域によって示されるC-末端膜貫通および/または細胞質領域を含む。1つの実施形態において、膜貫通または細胞質領域からの1以上のアミノ酸を除去する。そのようなGBS104断片の例を以下に配列番号13として記載する。1つの実施形態において、リーダーまたはシグナル配列領域からの1以上のアミノ酸、および膜貫通または細胞質領域からの1以上のアミノ酸を除去する。そのようなGBS104断片の例を以下に配列番号14として記載する。GBS80のように、GBS104は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号11においてはイタリック体で示した配列番号123FPKTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGBS104タンパク質の分泌を促進するのが好ましい場合がある。従って、本発明で用いるGBS104の1つの好ましい断片において、膜貫通および/または細胞質領域および細胞壁アンカーモチーフのみをGBS104から除去する。あるいは、いくつかの組み換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断できるか、あるいは組換えタンパク質は最終組成物中で不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合されたままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する2つのピリンモチーフがGBS104で同定されている。ピリンモチーフ配列には以下の配列番号11では下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基141および149において、およびアミノ酸残基499および507において太文字でマークする。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、GBS104のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS104の好ましい断片は、少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。また、保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスがGBS104で同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号11においては下線を施す。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基94および798において、太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS104のオリゴマー線毛様の構造物の形成で重要であると考えられる。GBS104の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。GBS067以下に好ましいGBS067断片の例を提供する。血清型V単離株2603からのGBS067配列のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を以下に配列番号15および16として記載する。GBS067は、前記配列番号16のC-末端に最も近い下線を施した領域によって示されるC-末端膜貫通領域を含む。1つの実施形態において、膜貫通領域からの1以上のアミノ酸を除去し、および/または膜貫通領域前でアミノ酸を切形する。そのようなGBS067断片の例を以下に配列番号17として記載する。GBS067は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフLPXTG配列番号122モチーフ:前記配列番号16においてはイタリック体で示した配列番号18IPMTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGBS067タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。従って、本発明で用いられるGBS067の1つの好ましい断片において、膜貫通および細胞壁アンカーモチーフをGBS67から除去する。そのようなGBS067断片の例を以下に配列番号19として記載する。あるいは、いくつかの組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留させるのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組み換えタンパク質を、最終組成物中で不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合させたままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する3つのピリンモチーフがGBS67で同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号16においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基478および488において、アミノ酸残基340および342において、およびアミノ酸残基703および717において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、GBS67のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS67の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスもまたGBS67で同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号16においては下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基96および801においては、太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS67のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS67の好ましい断片は、少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。GBS067アミノ酸配列についての予測される二次構造を図33に記載する。この図面に示されるように、GBS067は、アルファラセン構造物を形成すること予測されるいくつかの領域を含む。そのようなアルファラセン領域はコイルド-コイル構造物を形成するようであり、GBS_067のオリゴマー化に関与することができる。GBS067についてのアミノ酸配列は、Staphylococcusaureusコラーゲン結合表面タンパク質pfam05738のCna_Bドメインに対して相同である領域も含む。Cna_B領域はコラーゲン結合を媒介すると考えられていないが、それは、ベータサンドイッチ構造物を形成すると予測される。Staphaureusタンパク質においては、このベータサンドイッチ構造物は、細菌細胞壁から離れるようにリガンド結合ドメインを示す幹を形成すると考えられる。この同一アミノ酸配列領域は、細胞エンベロープ生合成に関与する外膜タンパク質であるとも予測される。GBS067についてのアミノ酸配列は、vonWillebrand因子vWFA型ドメインに対して相同である領域を含む。vWFA型ドメインは、配列番号16に示すようにGBS067のアミノ酸残基229ないし402に存在する。このタイプの配列は、典型的には、インテグリンのような細胞外タンパク質で見出され、それは、前記したコラーゲン、フィブロネクチン、およびフィブリノーゲンへの接着を含めた接着を媒介すると考えられる。本出願人らはGBS上の表面露出タンパク質としてGBS67を同定した故に、かつGBS67はGBS付着に関与しうる故に、GBS67タンパク質の免疫原性をマウスで調べた。GBS67での免疫アッセイの結果を以下の表48に記載する。表48に示すように、GBS67での免疫は、ネガティブコントロール、PBS、免疫マウスに対してチャレンジされたマウスにつき、実質的に改良された生存率を供する。これらの結果は、GBS67が本発明の免疫原性組成物を含み得ることを示す。GBS59以下にGBS59断片の例を提供する。血清型V単離株2603から配列決定されたGBS59のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を以下に配列番号125および126として記載する。配列番号126のGBS59ポリペプチドをSAG1407という。血清型V単離株CJB111から配列決定されたGBS59のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を以下に配列番号127および128として記載する。配列番号128のGBS59ポリペプチドをBO1575という。GBS59ポリペプチドは細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号126および128においてはイタリック体で示した配列番号129IPQTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGBS59タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、いくつかの組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインを精製の間に切断することができるか、あるいは、組換えタンパク質を、最終組成物中に不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合させたままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有するピリンモチーフはGBS59ポリペプチドで同定されている。ピリンモチーフ配列は、以下の配列番号126および128の各々においては、下線を施す。保存されたリシンK残基は太文字でマークする。保存されたリシンK残基は、配列番号:126のアミノ酸残基202および212、およびアミノ酸残基489および495に、および配列番号128のアミノ酸残基188および198に位置する。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、GBS59のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS59の好ましい断片は、少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は、少なくとも1つのピリン配列を含む。また、保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスが、GBS59ポリペプチドの各々で同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号126および128の各々では下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは配列番号126においてはアミノ酸残基621において、および配列番号128ではアミノ酸残基588において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS59のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS59の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。能動先天性免疫アッセイにおいて、雌マウスをSAG1407配列番号126またはBO1575配列番号128いずれかで免疫した。免疫された雌マウスから生まれた仔は、コントロールPBS処置マウスよりもGBSチャレンジに対して良好に生存した。GBS59免疫原性組成物を用いる能動先天性免疫アッセイの結果を以下の表17に示す。オプソノファゴサイトーシスアッセイは、BO1575に対する抗体がGBS血清型V、株CJB111に対してオプソニン性であることを示した。図67参照。GBS52GBS52についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号20および21はGBS血清型V、株単離体2603からのGBS52配列を表す。GBS52は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号21ではイタリック体で示す配列番号124IPKTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGBS52タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留させるのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において、不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに付着されたままとすることができる。また、保存されたリシンK残基を含む前記したピリンモチーフがGBS52においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号21においては下線が施される。また、保存されたリシンK残基はアミノ酸残基148および160において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS52の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはGBS52で同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号21においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基226において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS52のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS52の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SAG0647SAG0647についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号22および23はGBS血清型V、株単離体2603からのSAG0647配列を表す。。SAG0648SAG0648についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号24および25はGBS血清型V、株単離体2603からのSAG0648配列を表す。。GBS150GBS150についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号26および27は、GBS血清型V、株単離体2603からのGBS150配列を表す。GBS150は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号27においてはイタリック体で示した配列番号130LPKTGを含む。いくつかの組み換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGBS150タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組み換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断できるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。前記したように、保存されたリシンK残基を含有するピリンモチーフはGBS150で同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号27においては下線が施されている。保存されたリシンK残基はアミノ酸残基139および148において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、GBS150のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS150の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはGBS150で同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号27においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基216において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、GBS150のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GBS150の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SAG1405SAG1405についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号28および29は、GBS血清型V、株単離体2603からのSAG1405配列を表す。SAG1406SAG1405についてのポリヌクレオチドおよびアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号30および31は、GBS血清型V、株単離体2603からのSAG1405配列を表す。。0152001520についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号32は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01520配列を表す。。0152101521についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号33は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01521配列を表す。01521は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号33においてはイタリック体で示した配列番号132LPFTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え01521タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する2つのピリンモチーフが01521において同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号33においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基154および165において、およびアミノ酸残基174および188において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、01521のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。01521の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスは01521においても同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号33においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基177において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、01521のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。01521の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。0152201522についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号34は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01522配列を表す。0152301523についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号35は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01523配列を表す。01523は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号35においてはイタリック体で示した配列番号131LPSTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え01523タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスは01523において同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号35においては下線を施す。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基423において、太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、01523のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。01523の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。。0152401524についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号36は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01524配列を表す。01524は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号36においてはイタリック体で示した配列番号131LPSTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え01524タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する3つのピリンモチーフが01524において同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号36においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基128および138、アミノ酸残基671および682、およびアミノ酸残基809および820において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、01524のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。01524の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスは01524においても同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号36においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基1344において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、01524のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。01524の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。0152501525についてのアミノ酸配列の例を以下に記載する。配列番号37は、GBS血清型III、株単離体COH1からの01525配列を表す。GBS322GBS322とは、sipともいう表面免疫原性タンパク質をいう。血清型V単離体2603V/Rから配列決定されたGBS322のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を配列番号8539および配列番号8540としてRef.3に記載する。これらの配列を以下に配列番号38および39として記載する:GBS322は、配列番号39の始まり近くの下線を施した配列によって示されるN-末端リーダーまたはシグナル配列領域を含む。1つの実施形態において、GBS322のリーダーまたはシグナル配列領域からの1以上のアミノ酸を除去する。そのようなGBS322断片の例を以下に配列番号40として記載する。GBS322のさらなる好ましい断片は、その各々を特にここに引用して援用するWO03/068813で確認される免疫原性エピトープを含む。本発明の組成物中に入れられるGBSタンパク質の数に対して上限が存在し得る。好ましくは、本発明の組成物におけるGBSタンパク質の数は20未満、19未満、18未満、17未満、16未満、15未満、14未満、13未満、12未満、11未満、10未満、9未満、8未満、7未満、6未満、5未満、4未満、または3未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物におけるGBS蛋白の数は6未満、5未満、または4未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物におけるGBS蛋白の数は3である。本発明で用いるGBSタンパク質およびポリヌクレオチドは、好ましくは、当該分子が天然ではそれと共に見出される、全生物から単離され、すなわち、それとは別々かつ区別され、あるいは、当該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが天然で見出されない場合、該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドをその意図した目的に用いることができるように、他の生物学的マクロ分子から十分に離されている。A群連鎖球菌アドヘシンアイランド配列本発明のGASAIポリペプチドは、もちろん、種々の手段によって例えば、組換え発現、GASからの精製、化学合成など、かつ種々の形態で例えば、天然、融合、グリコシル化、非-グリコシル化など調製することができる。それらは、好ましくは、実質的に純粋な形態ですなわち、他の連鎖球菌性タンパク質または宿主細胞タンパク質を実質的に含まない、または実質的に単離された形態で調製される。本発明のGASAIタンパク質は、同定されたGASタンパク質に対する配列同一性を有するポリペプチド配列を含むことができる。配列同一性の程度は問題とするアミノ酸配列aに応じて変化させることができるが、好ましくは、50を超える例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。配列同一性を有するポリペプチドは同定されたGBSタンパク質のホモログ、オルソログ、対立遺伝子変種、および機能的変異体を含む。典型的には、2つのタンパク質の間の50以上の同一性が機能的同等性を示すと考えられる。タンパク質の間の同一性は、好ましくは、パラメータギャップ開放ペナルティ=12およびギャップ延長ペナルティ=1でのアフィニティギャップサーチを用い、MPSRCHプログラムOxfordMolecularで実行されるSmith-Waterman相同性サーチアルゴリズムによって決定される。GASアドヘシンアイランドポリヌクレオチド配列は、同定されたGASアドヘシンアイランドポリヌクレオチド配列に対する配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含むことができる。配列同一性の程度は問題とするポリヌクレオチド配列に応じて変化し得るが、好ましくは50を超える例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。本発明のGASアドヘシンアイランドポリヌクレオチド配列は、同定されたアドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド断片を含むことができる。断片の長さは特異的なアドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド配列に応じて変化し得るか、断片は、好ましくは、少なくとも10の連続ポリヌクレオチドである例えば、少なくとも10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。本発明GASアドヘシンアイランドアミノ酸配列は、同定されたGASタンパク質のポリペプチド断片を含むことができる。断片の長さは特異的GAS抗原のアミノ酸配列に応じて変化し得るが、断片は好ましくは少なくとも7つの連続アミノ酸である例えば、8,10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。好ましくは、断片は当該配列からの1以上のエピトープを含む。他の好ましい断片は、1各同定されたGASタンパク質のN-末端シグナルペプチド、2それらのN-末端シグナルペプチドが無い同定されたGASタンパク質、および310までのアミノ酸残基例えば、1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25以上がN-末端および/またはC-末端から欠失された、例えば、N-末端アミノ酸残基を欠失することができる各同定されたGASタンパク質を含む。他の断片は当該タンパク質の1以上のドメインを省略する例えば、シグナルペプチドの、細胞質ドメインの、膜貫通ドメインの、または細胞外ドメインの省略。GASAI-1配列前記したように、GASAI-1配列はM6株単離体MGAS10394に存在する。M6株単離体MGAS10394からのGASAI-1配列の例を以下に記載する。M6_Spy0156:Spy0156はrofA転写調節因子である。M6_Spy0156についてのアミノ酸配列の例を配列番号41に記載する。M6_Spy0157:M6_Spy0157はフィブロネクチン結合タンパク質である。それは、アミノ酸配列の配列番号42においてイタリック体で示されたソルターゼ基質モチーフLPXTG配列番号122を含む。M6_Spy0157は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号42においてはイタリック体で示した配列番号180LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えM6_Spy0157タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはM6_Spy0157においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号42においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基277、287および301において、太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。M6_Spy0157の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有する4つのEボックスの反復シリーズがM6_Spy0157において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号42においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基415、452、489および526において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、M6_Spy0157のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。M6_Spy0157の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。M6_Spy0158:M6_Spy0158は逆転写酵素である。Spy0158の例は、アミノ酸配列の配列番号43に示される。M6_Spy0159:M6_Spy0159はコラーゲン接着タンパク質である。それは、アミノ酸配列の配列番号44において、イタリック体で示すソルターゼ基質モチーフLPXSGを含む。M6_Spy0159は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号44においてはイタリック体で示した配列番号181LPSSGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えM6_Spy0159タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはM6_Spy0159においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号44においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基265および276において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。M6_Spy0159の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはM6_Spy0159においても同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号44においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基950において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、M6_Spy0159のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。M6_Spy0159の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。M6_Spy0160:M6_Spy0160は線毛構造物サブユニットである。それは、アミノ酸配列の配列番号45においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフLPXTG配列番号122を含む。M6_Spy0160は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号45においてはイタリック体で示した配列番号131LPSTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えM6_Spy0160タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはM6_Spy0160で同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号45においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基412において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、M6_Spy0160のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。M6_Spy0160の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。M6_Spy0161はsrtB型ソルターゼである。M6_Spy-161のアミノ酸配列の例をアミノ酸配列番号46に示す。前記したように、本出願人らは、細菌のいくつかの他のGASAI-1株における線毛構造物サブユニットのヌクレオチドおよびコードされたアミノ酸配列も決定した。これらの線毛構造物サブユニットの配列の例を以下に記載する。M6株単離体CDCSS410は細菌のGASAI-1株である。CDCSS410_線毛は、M6株単離体CDCSS410の線毛構造物サブユニットであると考えられる。CDCSS410_線毛タンパク質配列番号267をコードするヌクレオチド配列およびCDCSS410_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号268の例を以下に記載する。M6株単離体ISS3650は細菌のGASAI-1株である。ISS3650_線毛は、M6株単離体ISS3650の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS3650_線毛タンパク質配列番号269をコードするヌクレオチド配列およびISS3650_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号270の例を以下に記載する。M23株単離体DSM2071は細菌のGASAI-1株である。DSM2071_線毛は、M23株DSM2071の線毛構造物サブユニットであると考えられる。DSM2071_線毛タンパク質配列番号251をコードするヌクレオチド配列およびDSM2071_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号252の例を以下に記載する。GASAI-2配列前記したように、GASAI-2配列はM1株単離体SF370に存在する。M1株単離体SF370からのGASAI-2配列の例を以下に記載する。Spy0124はrofA転写調節因子である。Spy0124についてのアミノ酸配列の例を配列番号47に記載する。GAS015はCpaともいう。それは、配列番号48においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフVVXTG配列番号135を含む。GAS015は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号48においてはイタリック体で示した配列番号182VVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えGAS015タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはGAS015においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号48においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基243においてやはり太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GAS015の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはGAS015において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号48においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基352において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、GAS015のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。GAS015の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。Spy0127はLepA推定シグナルペプチダーゼである。Spy0127においてのアミノ酸配列の例を配列番号49に記載する。Spy0128は線毛タンパク質であると考えられる。それは、配列番号50においてイタリック体で示されるソルターゼ基質モチーフEVXTG配列番号136を含む。Spy0128は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号50においてはイタリック体で示した配列番号183EVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpy0128タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスはSpy0128に同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号50においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基271および290において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Spy0128のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Spy0128の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。Spy0129はsrtC1型ソルターゼである。Spy0129についてのアミノ酸配列の例を配列番号51に記載する。Spy0130は仮想タンパク質という。それは、配列番号52においてイタリック体で示されたソルターゼ基質モチーフLPXTG配列番号122を含む。Spy0130は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号52においてはイタリック体で示した配列番号131LPSTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpy0130タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスはSpy0130に同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号52においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基118および148において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Spy0130のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Spy0130の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。Spy0131は保存された仮想タンパク質という。Spy0131のアミノ酸配列の例を配列番号53に記載する。Spy0133は保存された仮想タンパク質という。Spy0133のアミノ酸配列の例を配列番号54に記載する。Spy0135はSrtB型ソルターゼである。それは推定フィブリア関連タンパク質ともいう。Spy0135のアミノ酸配列の例を配列番号55に記載する。。GASAI-3配列前記したように、GASAI-3配列はM3、M18およびM5株単離体に存在する。M3株単離体MGAS315からのGASAI-3の例を以下に記載する。SpyM30097は負の転写調節因子Nraである。SpyM30097のアミノ酸配列の例を配列番号56に記載する。SpyM30098はコラーゲン結合タンパク質Cpbであると考えられる。それは、配列番号57においてイタリック体で示されたソルターゼ基質モチーフVPXTG配列番号137を含む。SpyM30098は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号57においてはイタリック体で示した配列番号184VPPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM30098タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはSpyM30098においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号57においては下線を施す。保存されたリシンK残基もまた、アミノ酸残基262および270において太文字でマークする。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30098の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはSpyM30098において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号57においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基330において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM30098のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30098の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SpyM30099はLepAという。SpyM30099のアミノ酸配列の例を配列番号58に記載する。SpyM30100は線毛タンパク質であると考えられる。SpyM30100のアミノ酸配列の例を配列番号59に記載する。SpyM30100は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号59においてはイタリック体で示した配列番号140QVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM30100タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、2つのピリンモチーフはSpyM30100においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号59においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基57および63において、およびアミノ酸残基161および166において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30100の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。各々が保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスはSpyM30100において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号59においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基232および264において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM30100のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30100の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。SpyM30101はSrtC2型ソルターゼである。Spy30101のアミノ酸配列の例を配列番号60に記載する。SpyM30102は仮想タンパク質という。SpyM30102のアミノ酸配列の例を配列番号61に記載する。SpyM30102は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号61においてはイタリック体で示した配列番号185LPLAGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM30102タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはSpyM30102においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号61においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基132において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30102の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有する2つのEボックスはSpyM30102で同定されている。Eボックスモチーフは以下の配列番号61においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基52および122において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM30102のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30102の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。SpyM30103は推定多重糖代謝調節因子という。SpyM3103についてのアミノ酸配列の例を配列番号62に記載する。SpyM30104はF2様フィブロネクチン結合タンパク質であると考えられる。SPYM30104についてのアミノ酸配列の例を配列番号63に記載する。SpyM30104は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号63においてはイタリック体で示した配列番号180LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM30104タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、2つのピリンモチーフはSpyM30104においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号63においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基156および227において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30104の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはSpyM30104において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号63においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基402において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM30104のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM30104の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。M3株単離体SSI-1からのGASAI-3配列の例を以下に記載する。Sps0099は負の転写調節因子Nraである。Sps0099についてのアミノ酸配列の例は配列番号64に記載する。Sps0100はコラーゲン結合タンパク質Cbpであると考えられる。それは、配列番号65においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフVPXTGを含む。Sps0101はLepAタンパク質という。Sps0101のアミノ酸配列の例を配列番号66に記載する。Sps0102は線毛タンパク質であると考えられる。それは、配列番号67においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフQVXTGを含む。Sps0103はSrtC2型ソルターゼである。Sps0103の例を配列番号68に記載する。Sps0104は仮想タンパク質という。それは、配列番号69においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフLPXAGを含む。Sps0105は推定多重糖代謝調節因子という。Sps0105の例を配列番号70に記載する。Sps0106はF2様フィブロネクチン結合タンパク質であると考えられる。それは、配列番号71においてイタリック体で示したソルターゼ基質LPXTG配列番号122を含む。M5単離体ManfredoからのGASAI-3配列の例を以下に記載する。Orf77は負の転写調節因子Nraをコードする。Nraをコードするヌクレオチド配列配列番号88およびNraアミノ酸配列配列番号89の例を以下に記載する。Orf78はコラーゲン結合タンパク質Cbpであると考えられる。Cbpをコードするヌクレオチド配列配列番号90およびCbpアミノ酸配列配列番号91の例を以下に記載する。Orf78は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号91においてはイタリック体で示した配列番号184VPPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えOrf78タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有する3つのEボックスはOrf78で同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号91においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基112、395および447において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Orf78のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf78の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。Orf79はLepAシグナルペプチダーゼIであると考えられる。LepAシグナルペプチダーゼIをコードするヌクレオチド配列配列番号92およびLepAシグナルペプチダーゼIアミノ酸配列配列番号93の例を以下に記載する。Orf80は線毛タンパク質であると考えられる。線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号94および線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号95の例を以下に記載する。Orf82は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号95においてはイタリック体で示した配列番号140QVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えOrf82タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはOrf80で同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号95においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基270において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Orf80のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf80の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。Orf81はSrtC2型ソルターゼであると考えられる。SrtC2ソルターゼをコードするヌクレオチド配列配列番号96およびSrtC2ソルターゼアミノ酸配列配列番号97を以下に記載する。Orf82は仮想タンパク質という。それは、配列番号99においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフLPXAGを含む。仮想タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号98および仮想タンパク質アミノ酸配列配列番号99の例を以下に記載する。Orf82は細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号99においてはイタリック体で示した配列番号185LPLAGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えOrf82タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む上記のピリンモチーフはOrf82で同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号99においては下線が施される。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基173および188において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf82の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはOrf82において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号99においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基163において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Orf82のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf82の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。Orf83は多重糖代謝調節因子タンパク質であると考えられる。該糖代謝調節因子タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号100および糖代謝調節因子タンパク質アミノ酸配列配列番号101の例を以下に記載する。Orf84はF2様フィブロネクチン結合タンパク質であると考えられる。F2様フィブロネクチン結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号102およびF2様フィブロネクチン結合タンパク質アミノ酸配列配列番号103の例を以下に記載する。Orf84は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号103においてはイタリック体で示した配列番号181LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えOrf84タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはOrf84においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号103においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基270において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf84の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはOrf84において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号103においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基516において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、Orf84のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。Orf84の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。M18株単離体MGAS8232からのGASAI-3配列の例を以下に記載する。SpyM18_0125は負の転写調節因子Nraである。SpyM18_0125の例を配列番号72に記載する。SpyM18_0126はコラーゲン結合タンパク質CBPであると考えられる。SpyM18_0126の例を配列番号73に記載する。SpyM18_0126は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号73においてはイタリック体で示した配列番号184VPPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM18_0126タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはSpyM18_0126においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号73においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基172および179において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0126の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有する3つのEボックスはSpyM18_0126において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号73においては下線が施される。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基112、257および415において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM18_0126のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0126の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。SpyM18_0127はLepAタンパク質である。SpyM18_0127の例を配列番号74に示す。SpyM18_0128は線毛タンパク質であると考えられる。SpyM18_0128の例を配列番号75に示す。SpyM18_0128は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号75においてはイタリック体で示した配列番号140QVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM18_0128タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含有する、前記した、ピリンモチーフはSpyM18_0128においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号75においては下線を施す。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基57において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基は、オリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0128の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含有するEボックスはSpyM18_0128において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号75においては下線が施される。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基266において太文字でマークされる。Eボックスモチーフは、特に保存されたグルタミン酸残基は、SpyM18_0128のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0128の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SpyM18_0129はSrtC2型ソルターゼである。SpyM18_0129の例を配列番号76に示す。SpyM18_0130は仮想タンパク質という。SpyM18_0130の例を配列番号77に示す。SpyM18_0130は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号77においてイタリック体で示した配列番号185LPLAGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM18_0130タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記したピリンモチーフはSpyM18_0130においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号77においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基144,159および169において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0130の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスはSpyM18_0130において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号77において下線が施されている。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基134において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyM18_0130のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0130の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SpyM18_0131は推定多重糖代謝調節因子という。SpyM18_0131の例を配列番号78に記載する。SpyM18_0132はF2様フィブロネクチン結合タンパク質である。SpyM18_0132の例を配列番号79に記載する。SpyM18_0132は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号79においてイタリック体で示した配列番号180LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyM18_0132タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記したピリンモチーフはSpyM18_0132においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号79においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基270において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0132の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスはSpyM18_0132において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号79において下線が施されている。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基516において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyM18_0132のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyM18_0132の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。M49株単離体591からのGASAI-3配列の例を以下に記載する。SpyoM01000156は負の転写調節因子Nraである。SpyoM01000156の例を配列番号243に記載する。SpyoM01000155はコラーゲン結合タンパク質CPAであると考えられる。SpyoM01000155の例を配列番号244に記載する。SpyoM01000155は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号244においてイタリック体で示した配列番号184VPPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyoM01000155タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、2つのピリンモチーフはSpyoM01000155においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号244においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基71および261において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000155の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスはSpyoM01000155において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号244において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基329および668において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyoM01000155のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000155の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。SpyoM01000154はLepAタンパク質である。SpyoM01000154の例は配列番号245において示す。SpyoM01000153は線毛タンパク質であると考えられる。SpyoM01000153の例を配列番号246において示す。SpyoM01000153は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号246においてイタリック体で示した配列番号140QVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyoM01000153タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフはSpyoM01000153においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号246においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基57において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000153の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスはSpyoM01000153において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号246において下線が施されている。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基265において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyoM01000153のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000153の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。SpyoM01000152はSrtC2型ソルターゼである。SpyoM01000152の例を配列番号247に示す。SpyoM01000151を仮想タンパク質という。SpyoM01000151の例を配列番号248に示す。SpyoM01000151は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号248においてイタリック体で示した配列番号185LPLAGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyoM01000151タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフはSpyoM01000151においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号248においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基138において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000151の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスはSpyoM01000151において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号248において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基58および128において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyoM01000151のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000151の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。SpyoM01000150を推定MsmRLという。SpyoM01000150の例を配列番号249に記載する。SpyoM01000149はF2様フィブロネクチン結合タンパク質である。SpyoM01000149の例を配列番号250に記載する。SpyoM01000149は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号250においてイタリック体で示した配列番号180LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換えSpyoM01000149タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、2つのピリンモチーフはSpyoM01000149においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号250においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基157および163、216および224において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000149の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスはSpyoM01000149において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号250において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基329および668において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基はSpyoM01000149のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。SpyoM01000149の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。前記したように、本出願人らは、細菌のいくつかの他のGASAI-3株における線毛構造物サブリミットのヌクレオチドおよびコードされたアミノ酸配列を決定した。これらの線毛構造物サブユニットの配列の例を以下に記載する。M3株単離体ISS3040は細菌のGASAI-3株である。ISS3040_線毛は、M3株単離体ISS3040の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS3040_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号263およびISS3040_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号264の例を以下に記載する。M44株単離体ISS3776は細菌のGASAI-3株である。ISS3776_線毛は、M44単離体ISS3776の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS3776_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号253およびISS3776_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号254の例を以下に記載する。M77株単離体ISS4959は細菌のGASAI-3株である。ISS4959_線毛は、M77株ISS4959の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS4959_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号271およびISS4959_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号272の例を以下に記載する。M12株単離体A735からのGASAI-4配列の例を以下に記載する。19224133はRofA調節タンパク質であると考えられる。RofA調節タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号104およびRofA調節タンパク質アミノ酸配列配列番号105の例を以下に記載する。19224134はプロテインFフィブロネクチン結合タンパク質であると考えられる。プロテインFフィブロネクチン結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号106およびプロテインFフィブロネクチン結合タンパク質アミノ酸配列配列番号107の例を以下に記載する。19224134は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号107においてイタリック体で示した配列番号181LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え19224134タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフは19224134においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号107においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基275、285、および299において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224134の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスは19224134において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号107において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基487および524において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は19224134のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224134の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。19224135は莢膜多糖アドヘシンCpaタンパク質であると考えられる。Cpaタンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号108およびCpaタンパク質アミノ酸配列配列番号109の例を以下に記載する。19224135は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号109においてイタリック体で示した配列番号184VPPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え19224135タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフは19224135においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号109においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基164および172において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224135の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスは19224135において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号109において下線が施されている。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基339において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は19224135のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224135の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。19224136はLepAタンパク質であると考えられる。LepAタンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号110およびLepAタンパク質アミノ酸配列配列番号111の例を以下に記載する。19224137は線毛タンパク質であると考えられる。線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号112および線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号113の例を以下に記載する。19224137は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号113においてイタリック体で示した配列番号140QVPTGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え19224137タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフは19224137においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号113においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基160において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224137の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含むEボックスは19224137において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号113において下線が施されている。保存されたグルタミン酸Eは、アミノ酸残基263において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は19224137のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224137の好ましい断片は保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片はEボックスモチーフを含む。19224138はSrtC2-型ソルターゼであると考えられる。SrtC2ソルターゼをコードするヌクレオチド配列配列番号114およびSrtC2ソルターゼアミノ酸配列配列番号115の例を以下に記載する。19224139は、配列番号117においてイタリック体で示したソルターゼ基質モチーフLPXAGをコードするオープンリーディングフレームである。該オープンリーディングフレームのヌクレオチド配列配列番号116および該オープンリーディングフレームによってコードされるアミノ酸配列配列番号117の例を以下に記載する。19224139は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号117においてイタリック体で示した配列番号185LPLAGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え19224139タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、ピリンモチーフは19224139においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号117においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基138において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224139の好ましい断片は保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片はピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスは19224139において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号117において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基58および128において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は19224139のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224139の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。19224140はMsmRLタンパク質であると考えられる。MsmRLタンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号118およびMsmRLタンパク質アミノ酸配列配列番号119の例を以下に記載する。19224141はプロテインF2フィブロネクチン結合タンパク質であると考えられる。プロテインF2フィブロネクチン結合タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号120およびプロテインF2フィブロネクチン結合タンパク質アミノ酸配列配列番号121の例を以下に記載する。19224141は、細胞壁アンカーを示すアミノ酸モチーフ:前記配列番号121においてイタリック体で示した配列番号181LPATGを含む。いくつかの組換え宿主細胞系においては、このモチーフを除去して、宿主細胞からの組換え19224141タンパク質の分泌を容易とするのが好ましい場合がある。あるいは、他の組換え宿主細胞系においては、細胞壁アンカーモチーフを用いて、組換えにより発現されたタンパク質を細胞壁に係留するのが好ましい場合がある。発現されたタンパク質の細胞外ドメインは精製の間に切断することができるか、あるいは組換えタンパク質は、最終組成物において不活化宿主細胞または細胞膜いずれかに結合したままとすることができる。保存されたリシンK残基を含む、前記した、2つのピリンモチーフは19224141においても同定されている。ピリンモチーフ配列は以下の配列番号121においては下線が施されている。保存されたリシンK残基は、アミノ酸残基157および163において、およびアミノ酸残基216、224および238において太文字でマークされる。ピリン配列、特に保存されたリシン残基はオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224141の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたリシン残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのピリン配列を含む。保存されたグルタミン酸残基を含む2つのEボックスは19224141において同定されている。E-ボックスモチーフは以下の配列番号121において下線が施されている。保存されたグルタミン酸E残基は、アミノ酸残基567および944において太文字でマークされる。Eボックスモチーフ、特に保存されたグルタミン酸残基は19224141のオリゴマー線毛様構造物の形成で重要であると考えられる。19224141の好ましい断片は少なくとも1つの保存されたグルタミン酸残基を含む。好ましくは、断片は少なくとも1つのEボックスモチーフを含む。前記したように、本出願人らは、細菌のいくつかの他のGASAI-4株においても線毛構造物サブリミットのヌクレオチドおよびコードされたアミノ酸配列を決定した。これらの線毛構造物サブユニットの配列の例を以下に記載する。M12株単離体20010296は細菌のGASAI-4株である。20010296_線毛は、M12株単離体20010296の線毛構造物サブユニットであると考えられる。20010296_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号257および20010296_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号258の例を以下に記載する。M12株単離体20020069は細菌のGASAI-4株である。20020069_線毛は、M12株単離体20020069の線毛構造物サブユニットであると考えられる。20020069_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号259および20020069_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号260の例を以下に記載する。M12株単離体CDCSS635は細菌のGASAI-4株である。CDCSS635_線毛は、M12株単離体CDCSS635の線毛構造物サブユニットであると考えられる。CDCSS635_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号261およびCDCSS635_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号262の例を以下に記載する。M5株単離体ISS4883は細菌のGASAI-4株である。ISS4883_線毛は、M5株単離体ISS4883の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS4883_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号265およびISS4883_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号266の例を以下に記載する。M50株単離体ISS4538は細菌のGASAI-4株である。ISS4538_線毛は、M50株単離体ISS4538の線毛構造物サブユニットであると考えられる。ISS4538_線毛タンパク質をコードするヌクレオチド配列配列番号255およびISS4538_線毛タンパク質アミノ酸配列配列番号256の例を以下に記載する。本発明の組成物に入れることができるGASタンパク質の数には上限があり得る。好ましくは、本発明の組成物におけるGASタンパク質の数は20未満、19未満、18未満、17未満、16未満、15未満、14未満、13未満、12未満、11未満、10未満、9未満、8未満、7未満、6未満、5未満、4未満、または3未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物におけるGASタンパク質の数は6未満、5未満、または4未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物におけるGASタンパク質の数は3である。本発明で用いるGASタンパク質およびポリヌクレオチドは好ましくは単離されており、すなわち、天然においては当該分子がそれの中に見出される全生物から別々のものであり、区別され、あるいは当該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが天然で見出されない場合、当該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドをその意図した目的で用いることができるように、他の生物学的マクロ分子から十分に離されている。例他のグラム陽性菌アドヘシンアイランド配列本発明のグラム陽性菌AIポリペプチドは、勿論、種々の手段によって、例えば、組換え発現、グラム陽性菌からの精製、化学合成等かつ種々の形態で例えば、天然、融合、グリコシル化、非-グリコシル化など調製することができる。それらは、好ましくは、実質的に純粋な形態ですなわち、他のstreptococcusまたは宿主細胞タンパク質を実質的に含まない、または実質的に単離された形態で調製される。本発明のグラム陽性菌AIタンパク質は、同定されたグラム陽性菌タンパク質に対して配列同一性を有するポリペプチド配列を含むことができる。配列同一性の程度は、問題とするアミノ酸配列aに応じて変化させることができるが、好ましくは、50よりも大きい例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。配列同一性を有するポリペプチドは同定されたグラム陽性菌タンパク質のホモログ、オルソログ、対立遺伝子変種および変異体を含む。典型的には、2つのタンパク質の間の50以上の同一性は、機能的な同等性を示すと考えられる。タンパク質の間の同一性は、好ましくは、パラメータギャップ開放ペナルティ=12およびギャップ延長ペナルティ=1でのアフィニティギャップサーチを用いて、MPSRCHプログラムOxfordMolecularで実行されるSmith-Waterman相同性サーチアルゴリズムによって決定される。グラム陽性菌アドヘシンアイランドポリヌクレオチド配列は、同定されたグラム陽性菌アドヘシンアイランドのポリヌクレオチド配列に対する配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含むことができる。配列同一性の程度は、問題とするポリヌクレオチド配列に応じて変化させることができるが、好ましくは50よりも大きい例えば、60,65,70,75,80,85,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,99.5以上。本発明のグラム陽性菌アドヘシンアイランドのポリヌクレオチド配列は、同定されたアドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド断片を含むことができる。該断片の長さは、特異的アドヘシンアイランド配列のポリヌクレオチド配列に応じて変化させることができるが、該断片は好ましくは少なくとも10連続ポリヌクレオチドである例えば、少なくとも10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。本発明のグラム陽性菌アドヘシンアイランドアミノ酸配列は、同定されたグラム陽性菌タンパク質のポリペプチドの断片を含むことができる。該断片の長さは特異的グラム陽性菌抗原のアミノ酸配列に応じて変化させることができるが、該断片は好ましくは少なくとも7つの連続アミノ酸である例えば、8,10,12,14,16,18,20,25,30,35,40,50,60,70,80,90,100,150,200以上。好ましくは、該断片は、配列からの1以上のエピトープを含む。該断片は該配列の少なくとも1つのT-細胞または、好ましくは、B-細胞エピトープを含むことができる。T-およびB-細胞エピトープは、例えば、PEPSCAN[Geysenetal.1984PNASUSA81:3998-4002;Carter1994MethedsMol.Biol.36:207-223]または同様な方法を用いて経験的に同定することができるか、あるいは例えば、Jameson-Wolf抗原性指標[Jameson,BAetal.1988,CABIOS41:1818-186]、マトリックス-ベースのアプローチ[RaddrizzaniandHammer2000BriefBioinform.12:179-189]、TEPITOPE[DeLallaetal.199J.Immunol.163:1725-1729]、神経ネットワーク[Brusicetal.1998Bioinformatics142:121-130]、OptiMerEpiMer[Meisteretal.1995Vaccine136:581-591;Robertsetal.1996AIDSRes.Hum.Retroviruses127:593-610]、ADEPT[MaksyutovZagrebelnaya1993Comput.Appl.Biosci.93:291-297]、Tsites[FellerdelaCruz1991Nature3496311:720-721]、親水性[Hopp1993PeptideResearch6;183-190]、抗原指標[Wellingetal.1985FEBSLett.188:215-218]、またはDavenportetal.1995Immunogenetics42:392-297に開示された方法等を用いそれらを予測することができる。他の好ましい断片は、1各同定されたグラム陽性菌タンパク質のN-末端シグナルペプチド、2それらのN-末端シグナルペプチドが無い同定されたグラム陽性菌タンパク質、310までのアミノ酸残基例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25またはそれより多くがN-末端および/またはC-末端から欠失された、例えば、N-末端アミノ酸残基を欠失することができる各同定されたグラム陽性菌タンパク質を含む。他の断片はタンパク質の1以上のドメインを省略し例えば、シグナルペプチドの、細胞質ドメインの、膜貫通ドメインの、または細胞外ドメインの省略、および4それらのN-末端アミノ酸残基が無い以外は該ポリペプチドが含まれる。前記テキストに示されるように、本発明の核酸およびポリペプチドは;a配列表に開示された配列に対して同一であるすなわち、100同一;b配列表に開示された配列に対して配列同一性を有する;caまたはbの配列と比較して、別々の位置であってもよく、あるいは連続していてもよい、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10の単一のヌクレオチドまたはアミノ酸改変欠失、挿入、置換を有する;d対様式の整列アルゴリズムで、pのモノマーここに、p>xまで延びる整列については、p-x1のウインドウがあるような、開始N-末端すなわち5’から末端C-末端すなわち3’まで動くxのモノマーアミノ酸またはヌクレオチドの移動するウインドウを用いて配列表からの特定の配列を整列させた場合、各ウインドウが少なくともxyの同一の整列されたモノマーを有し、ここに:xは20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、150、200から選択され;yは0.50、0.60、0.70.0.75、0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99から選択され;およびもしxyが整数でないならば、それは最も近い整数まで丸められる:配列を含むことができる。好ましい対様式整列アルゴリズムは、デフォルトパラメーター例えば、ギャップ開放ペナルティ=10.0およびギャップ延長ペナルティ=0.5にて、EBLOSUM62スコアリングマトリックスを用いるを用いる、Needleman-Wunschグローバル整列アルゴリズム[NeedlmanWunsch1970J.Mol.Biol.48,443-453]である。このアルゴリズムは、便宜には、EMBOSSパッケージ中のニードルツールで実行される[Riceetal.2000TrendsGenet.16:276-277]。本発明の核酸およびポリペプチドは、加えて、これらの配列aないしdのN-末端/5’/および/またはC-末端/3’に対するさらなる配列を有する。本明細書中で参照するグラム陽性菌配列の全てはGenBankのPubMedを通じて公に入手可能である。Streptococcuspneumoniaeアドヘシンアイランド配列前記したように、S.pneumoniaeAI配列はTIGR4S.pneumoniaeゲノムに存在する。S.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。SrtDSp0468はソルターゼである。SrtDのアミノ酸配列の例を配列番号80に記載する。SrtCSp0467はソルターゼである。SrtCのアミノ酸配列の例を配列番号81に記載する。SrtBSP0466はソルターゼである。SrtBのアミノ酸配列の例を配列番号82に記載する。Sp0465は仮想タンパク質である。Sp0465のアミノ酸配列の例を配列番号83に記載する。RrgCSP0464は細胞壁表面アンカーファミリータンパク質である。RrgCは、配列番号84においてイタリック体に示されるソルターゼ基質モチーフVPXTG配列番号137を含む。RrgBSp0463は細胞壁表面アンカータンパク質である。RrgBは、配列番号85においてイタリック体で示されるソルターゼ基質モチーフIPXTG配列番号133を含む。RrgASp0462は細胞壁表面アンカータンパク質である。RrgAは、配列番号86においてイタリック体で示されるソルターゼ基質モチーフYPXTG配列番号186を含む。RlrASp0461は転写調節因子である。RlrAについてのアミノ酸配列の例を配列番号87に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列はS.pneumoniae株670ゲノムに存在する。S.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。Orf1_670はトランスポザーゼである。orf1_670のアミノ酸配列の例を配列番号171に記載する。Orf2_670は転写調節因子である。Orf2_670のアミノ酸配列の例を配列番号172に記載する。Orf3_670は細胞壁表面アンカーファミリータンパク質である。Orf3_670のアミノ酸配列の例を配列番号173に記載する。Orf4_670は細胞壁表面アンカーファミリータンパク質である。orf4_670のアミノ酸配列の例を配列番号174に記載する。Orf5_670は細胞壁表面アンカーファミリータンパク質である。orf5_670のアミノ酸配列の例を配列番号175に記載する。Orf6_670はソルターゼである。orf6_670のアミノ酸配列の例を配列番号176に記載する。Orf7_670はソルターゼである。orf7_670のアミノ酸配列の例を配列番号177に記載する。Orf8_670はソルターゼである。orf8_670のアミノ酸配列の例を配列番号178に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は19AHungary6S.pneumoniaeゲノムに存在する。19AHungary6からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_19AHは転写調節因子である。ORF2_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号187に記載する。ORF3_19AHは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号188に記載する。ORF4_19AHは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号189に記載する。ORF5_19AHは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号190に記載する。ORF6_19AHは推定ソルターゼである。ORF6_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号191に記載する。ORF7_19AHは推定ソルターゼである。ORF7_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号192に記載する。ORF8_19AHは推定ソルターゼである。ORF8_19AHのアミノ酸配列の例を配列番号193に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は6BFinland12S.pneumoniaeゲノムに存在する。6BFinland12からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_6BFは転写調節因子である。ORF2_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号194に記載する。ORF3_6BFは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号195に記載する。ORF4_6BFは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号196に記載する。ORF5_6BFは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号197に記載する。ORF6_6BFは推定ソルターゼである。ORF6_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号198に記載する。ORF7_6BFは推定ソルターゼである。ORF7_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号199に記載する。ORF8_6BFは推定ソルターゼである。ORF8_6BFのアミノ酸配列の例を配列番号200に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は6BSpain2S.pneumoniaeゲノムに存在する。6BSpain2からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_6BSPは転写調節因子である。ORF2_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号201に記載する。ORF3_6BSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号202に記載する。ORF4_6BSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号203に記載する。ORF5_6BSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号204に記載する。ORF6_6BSPは推定ソルターゼである。ORF6_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号205に記載する。ORF7_6BSPは推定ソルターゼである。ORF7_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号206に記載する。ORF8_6BSPは推定ソルターゼである。ORF8_6BSPのアミノ酸配列の例を配列番号207に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は9VSpain3S.pneumoniaeゲノムに存在する。9VSpain3からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_9VSPは転写調節因子である。ORF2_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号208に記載する。ORF3_9VSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号209に記載する。ORF4_9VSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号210に記載する。ORF5_9VSPは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号211に記載する。ORF6_9VSPは推定ソルターゼである。ORF6_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号212に記載する。ORF7_9VSPは推定ソルターゼである。ORF7_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号213に記載する。ORF8_9VSPは推定ソルターゼである。ORF8_9VSPのアミノ酸配列の例を配列番号214に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は14CSR10S.pneumoniaeゲノムに存在する。14CSR10からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_14CSRは転写調節因子である。ORF2_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号215に記載する。ORF3_14CSRは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号216に記載する。ORF4_14CSRは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号217に記載する。ORF5_14CSRは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号218に記載する。ORF6_14CSRは推定ソルターゼである。ORF6_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号219に記載する。ORF7_14CSRは推定ソルターゼである。ORF7_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号220に記載する。ORF8_14CSRは推定ソルターゼである。ORF8_14CSRのアミノ酸配列の例を配列番号221に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は19FTaiwan14S.pneumoniaeゲノムに存在する。19FTaiwan14からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_19FTWは転写調節因子である。ORF2_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号222に記載する。ORF3_19FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号223に記載する。ORF4_19FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号224に記載する。ORF5_19FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号225に記載する。ORF6_19FTWは推定ソルターゼである。ORF6_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号226に記載する。ORF7_19FTWは推定ソルターゼである。ORF7_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号227に記載する。ORF8_19FTWは推定ソルターゼである。ORF8_19FTWのアミノ酸配列の例を配列番号228に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は23FTaiwan15S.pneumoniaeゲノムに存在する。23FTaiwan15からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_23FTWは転写調節因子である。ORF2_23_FTWのアミノ酸配列の例を配列番号229に記載する。ORF3_23FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号230に記載する。ORF4_23FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号231に記載する。ORF5_23FTWは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号232に記載する。ORF6_23FTWは推定ソルターゼである。ORF6_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号233に記載する。ORF7_23FTWは推定ソルターゼである。ORF7_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号234に記載する。ORF8_23FTWは推定ソルターゼである。ORF8_23FTWのアミノ酸配列の例を配列番号235に記載する。前記したように、S.pneumoniaeAI配列は23FPoland16S.pneumoniaeゲノムに存在する。23FPoland16からのS.pneumoniaeAI配列の例を以下に記載する。ORF2_23FPは転写調節因子である。ORF2_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号236に記載する。ORF3_23FPは細胞壁表面タンパク質である。ORF3_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号237に記載する。ORF4_23FPは細胞壁表面タンパク質である。ORF4_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号238に記載する。ORF5_23FPは細胞壁表面タンパク質である。ORF5_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号239に記載する。ORF6_23FPは推定ソルターゼである。ORF6_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号240に記載する。ORF7_23FPは推定ソルターゼである。ORF7_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号241に記載する。ORF8_23FPは推定ソルターゼである。ORF8_23FPのアミノ酸配列の例を配列番号242に記載する。AI抗原を含む本発明の免疫原性組成物は、さらに、1以上の抗原性因子を含むことができる。好ましい抗原は以下にリストするものを含む。加えて、本発明の組成物を用いて、以下にリストする微生物のいずれかによって引き起こされる感染を治療または予防することができる。免疫原性組成物で用いられる抗原は、限定されるものではないが、以下に記載するものの1以上、または以下に記載するものの1以上から由来する抗原を含む。細菌抗原N.meningitides:N.meningitides血清群A、C、W135、Yおよび/またはB1-7からのタンパク質抗原;N.meningitides血清群B.8、9、10、11からの外側膜小胞OMV調製物;血清群Cからのオリゴ糖のようなN.meningitides血清群A、B、C、W135および/またはYからのLPSを含めた糖類抗原PCT/US99/09346;PCTIB98/01665;およびPCTIB99/00103参照;Streptococcuspneumoniae:Streptococcuspneumoniaeからの糖類またはタンパク質抗原、特に糖類;Streptococcusagalactiae:特に、B群連鎖球菌抗原;Streptococcuspyogenes:特に、A群連鎖球菌抗原;EnterococcusfaecalisまたはEnterococcusfaecium:特に、米国特許第6,756,361号に提供される三糖反復または他のEnterococcus由来抗原;Helicobacterpylori:Cag、Vac、Nap、HopX、HopYおよび/またはウレアーゼ抗原を含む;Bordetellapertussis:例えば、B.pertussisからのペルツシスホロトキシンpetussisholotoxinPTおよびフィラメント状血球凝集素FHA、所望により、ペルタクチンおよび/またはアグルチノゲン2および3抗原との組合せ;Staphylococcusaureus:所望により非毒性組換えPseudomonasaeruginosaエキソトキシンAにコンジュゲートしたS.aureusタイプ5および8莢膜多糖、例えばStaphVAXTM、または表面タンパク質、インバシンロイコシジン、キナーゼ、ヒアルロニダーゼ、ファゴサイトーシス飲み込みを阻害する表面因子莢膜、プロテインA、カロテノイド、カタラーゼ生産、プロテインA、コアギュラーゼ、凝固因子および/または真核生物細胞膜を溶解する膜-損傷トキシン所望により解毒されているものヘモリシン、リューコトキシン、ロイコシジンに由来する抗原を含む;Staphylococcusepidermis:特に、S.epidermidisスライム関連抗原SAA;Staphylococcussaprophyticus:泌尿器系管感染を引き起こす、特に、S.saprophyticus抗原の160kDa血球凝集素;Pseudomonasaeruginosa:特に、エンドトキシンA、Wzzタンパク質、P.aeruginosaLPS、より特別には、PAO1O5血清型から単離されたLPS、および/または外側膜プロテインFOprFを含めた外側膜タンパク質InfectImmun.2001May;695:3510-3515;Bacillusanthracis炭疽;例えば、その双方が保護抗原PAとして知られた共通のB-成分を共有することができる、A-成分致死因子LFおよび浮腫因子EFからの所望により解毒されたB.anthracis抗原;Moraxellacatarrhalis:呼吸器系、外側膜タンパク質抗原HMW-OMP、C-抗原、および/またはLPSを含む;Yersiniapestisペスト:例えば、F1莢膜抗原InfectImmun.2003Jan;711:374-383、LPSInfectImmun.1999Oct;6710:5395,YersiniapestisV抗原InfectImmun.1997Nov;6511:4476-4482;Yersiniaenterocolitica胃腸病原体:特に、LPSInfectImmun.2002August;708:4414;Yersiniapseudotuberculosis:胃腸病原体抗原;Mycobacteriumtuberculosis:例えば、リポタンパク質、LPS、BCG抗原、カチオン性脂質小胞中に所望により処方された抗原85BAg85Bおよび/またはESAT-6の融合タンパク質InfectImmun.2004October;7210:6148;MycobacteriumtuberculosisMtbイソクエン酸デヒドロゲナーゼ関連抗原ProcNatlAcadSciUSA.2004Aug24;10134:12652,および/またはMPT51抗原InfectImmun.2004July;727:3829;Legionellapneumophilaレジオネール病:L.pneumophila抗原――所望により破壊されたasd遺伝子を持つ細胞系に由来するInfectImmun.1998May;665:1898;Rickettsia:外側膜プロテインAおよび/またはBOmpBを含めた外側膜タンパク質BiochimBiophysActa.2004Nov1;17022:145,LPS、および表面タンパク質抗原SPAJAutoimmun.1989Jun;2Suppl:81;を含む;E.coli:エンテロトキシン産生性E.coliETEC、腸凝集性E.coliEAggEC、拡散接着性E.coliDAEC、腸病原性E.coliEPEC、および/または腸出血性E.coliEHECからの抗原を含む;Vibriocholerae:プロテイナーゼ抗原、LPS、特にVibriocholeraeIIのリポ多糖、O1InabaO-特異的多糖、V.choleraO139、IEM108ワクチンの抗原InfectImmun.2003Oct;7110:5498-504,および/またはZonulaoccludensトキシンZotを含む;Salmonellatyphi腸チフス熱:莢膜多糖、好ましくは、コンジュゲートVi、すなわちvax-TyViを含む;Salmonellatyphimurium胃腸炎:それから由来する抗原は、脈管形成阻害およびflkの調節を含めた、微生物および癌療法で考えられる;Listeriamonocytogenes免疫無防備状態または老齢の人における全身感染、胎児の感染:L.monocytogenesに由来する抗原は、好ましくは、本発明のコンジュゲート/関連組成物の細胞質内送達のための担体/ベクターとして用いられる;Porphyromonasgingivalis:特に、P.gingivalis外側膜タンパク質OMP;Tetanus:例えば、好ましくは、本発明の組成物と組み合わされた/コンジュゲートされた担体タンパク質として用いられる破傷風トキソイドTT抗原;Diphtheria:例えば、ジフテリアトキソイド、好ましくは、CRM197、加えて、ADPリボシル化を調節する、阻害する、またはそれに関連することができる抗原は、本発明の組成物との組合せ/共投与/コンジュゲーションで考えられ、ジフテリアトキソイドは好ましくはキャリアータンパク質として用いられる;Borreliaburgdorferiライム病:例えば、P39およびP13関連抗原内在性膜タンパク質、InfectImmun.2001May;695:3323-3334、Vlse抗原変異タンパク質JClinMicrobiol.1999Dec;3712:3997;HaemophilusinfluenzaeB:例えば、それからの糖抗原;Klebsiella:例えば、OMPAを含めたOMP、または所望により破傷風トキソイドにコンジュゲートした多糖;Neiserriagonorrhoeae:PorBZhuetal.,Vaccine200422:660669参照のようなPorまたはポリンタンパク質、TbpAおよびTbpBPriceetal.,InfectionandImmunity2004711:277283参照のようなトランスフェリンtransferring結合タンパク質、Opaのような不透明タンパク質、還元-修飾可能タンパク質Rmp、および外側膜小胞OMV調製物を含むPlanteetal.,JInfectiousDisease2000182:848855参照、また、例えば、WO99/24578、WO99/36544、WO99/57280、WO02/079243参照;Chlamydiapneumoniae:特に、C.pneumoneaeタンパク質抗原;Chlamydiatrachomatis:血清型A、B、BaおよびCトラコーマの作用因子、失明を引き起こす、血清型L1、L2およびL3性病性リンパ肉芽腫に関連、および血清型DないしKに由来する抗原を含む;TreponemapallidumSyphilis:特に、TmpA抗原;およびHaemophilusducreyi軟性下疳を引き起こす:外側膜タンパク質DsrAを含む。具体的には引用しないが、本発明のさらなる細菌抗原は前記のいずれかの莢膜抗原、多糖抗原またはタンパク質抗原であり得る。さらなる細菌抗原は外側膜小胞OMV調製物も含み得る。加えて、抗原は前記した細菌のいずれかの生きた、弱毒化、分割および/または精製バージョンを含む。本発明の細菌または微生物由来抗原はグラム陰性またはグラム陽性であり得、好気性または嫌気性であり得る。加えて、前記細菌-由来糖類多糖、LPS、LOSまたはオリゴ糖のいずれかを、キャリアータンパク質例えば、CRM197のように、もう1つの剤または抗原にコンジュゲートすることができる。そのようなコンジュゲーションは、米国特許第5,360,897およびCanJBiochemCellBiol.1984May;625:270-5において供されているように、糖類上のカルボニル基の、タンパク質上のアミノ基への還元的アミノ化によって行われる直接的コンジュゲーションであり得る。あるいは、糖類は、スクシンアミドを有するようなリンカーまたはBioconjugateTechniques,1996andCRC,ChemistryofProteinConjugationandCross-Linking,1993に供される他の結合を介してコンジュゲートすることができる。ウイルス抗原インフルエンザInfluenza:血球凝集素HAおよび/またはノイラミニダーゼNA表面タンパク質を含む全ウイルス粒子減弱化、分割、またはサブユニットを含む;インフルエンザ抗原はニワトリ胚に由来することができるか、あるいは細胞培養で増殖させることができ、および/またはインフルエンザ抗原は、とりわけ、インフルエンザA、Bおよび/またはC型に由来する;呼吸器系シンシチウムウイルスRespiratorysincytialvirusRSV:RSVのA2株のFプロテインJGenVirol.2004Nov;85Pt11:3229および/またはG糖タンパク質を含む;パラインフルエンザウイルスParainfluenzavirusPIV:好ましくは、血球凝集素、ノイラミニダーゼおよび/または融合糖タンパク質を含有するPIV1、2および3型を含む;ポリオウイルスPoliovirus:ピコルナウイルス科からの抗原、好ましくは、OPVまたは好ましくはIPVのようなポリオウイルス抗原を含む;麻疹:所望により、プロトリンと組み合わせてもよい分割麻疹ウイルスMV抗原および/またはMMRワクチンに存在する抗原を含む;流行性耳下腺炎:MMRワクチンに存在する抗原を含む;風疹:MMRワクチンに存在する抗原、ならびにデングウイルスを含めた、トガウイルス科からの他の抗原を含む;狂犬病:例えば、凍結乾燥された不活化ウイルスRabAvertTM;フラビウイルス科ウイルスFlaviviridaeviruses:例えば、黄熱病ウイルス、日本脳炎ウイルス、デングウイルス1、2、3または4型、マダニ媒介脳炎ウイルス、およびウエストナイルウイルスおよびそれに由来する抗原;カリシウイルス科Caliciviridae;それからの抗原;HIV:gagp24gagおよびp55gag、envgp160およびgp41、pol、tat、nef、revvpu、ミニタンパク質好ましくはp55gagおよびgp140v欠失のようなHIV-1またはHIV-2株抗原、および単離体HIVIIIb、HIVSF2、HIVLAV、HIVLAI、HIVMN、HIV-1CM235、HIV-1US4、HIV-2からの抗原;とりわけ、シミアン免疫不全ウイルスSIVを含む;ロタウイルスRotavirus:VP4、VP5、VP6、VP7、VP8タンパク質ProteinExprPurif.2004Dec;382:205および/またはNSP4を含む;ペスチウイルスPestivirus:例えば、古典的なブタ発熱ウイルス、ウシウイルス性下痢ウイルス、および/またはボーダーborder病ウイルス由来の抗原;パルボウイルスParvovirus:例えば、パルボウイルスB19;コロナウイルスCoronavirus:SARSウイルス抗原、特に、それからのスパイクタンパク質またはプロテアーゼ、ならびにWO04/92360に含まれる抗原を含む;A型肝炎ウイルスHepatitisAvirus:例えば、不活化ウイルス;B型肝炎ウイルスHepatitisBvirus:例えば、表面および/またはコア抗原sAg、ならびにプレ表面配列、pre-S1およびpre-S2以前は、pre-Sと呼ばれる、ならびに前記の組合せ、例えば、sAg/pre-S1、sAg/pre-S2、sAg/pre-S1/pre-S2、およびpre-S1/pre-S2例えば、AHBVVaccines-HumanVaccinesandVaccination,pp.159-176;および米国特許4,722,840号、第5,098,704号、第5,324,513号;Beamesetal.,J.Virol.199569:6833-6838,Birnbaumetal.,J.Virol.199064:3319-3330;およびZhouetal.,J.Virol.199165:5457-5464参照;C型肝炎ウイルスHepatitisCvirus:例えば、E1、E2、E1/E2Houghtonetal.,Hepatology199114:381参照、NS345ポリプロテイン、NS345-コアポリプロテイン、コア、および/または非構造領域からのペプチド国際公開番号WO89/04669;WO90/11089;およびWO90/14436;デルタ肝炎ウイルスDeltaHepatitisvirusHDV:それに由来する抗原、特にHDVからのδ-抗原例えば、米国特許第5,378,814号参照;E型肝炎ウイルスHepatitisEvirusHEV:それに由来する抗原;G型肝炎ウイルスHepatitisGvirusHGV:それに由来する抗原;水痘帯状ウイルスVarcicellazostervirus:水痘帯状ウイルスVZVに由来する抗原J.Gen.Virol.198667:1759;エプスタイン-バールウイルスEpstein-Barrvirus:EBVに由来する抗原Baeretal.,Nature1984310:207;サイトメガロウイルスCytomegalovirus:gBおよびgHを含めたCMV抗原CytomegalovirusesJ.K.McDougall,ed.,Springer-Verlag1990pp.125-169;単純疱疹ウイルスHerpessimplexvirus:HSV-1またはHSV-2株からの抗原、および糖タンパク質gB、gDおよびgHを含むMcGeochetal.,J.Gen.Virol.198869:1531および米国特許第5,171,568号;ヒトヘルペスウイルスHumanHerpesVirus:HHV6およびHHV7のような他のヒトヘルペスウイルスに由来する抗原;およびHPV:ヒトパピロマウイルスHPVに関連しているか、またはそれに由来する抗原、例えば、E1ないしE7、L1、L2の1以上、およびその融合を含む;特に、本発明の組成物はL1主要キャプシドタンパク質を含むウイルス-様粒子VLPを含むことができ、なおより特別には、HPV抗原はHPV血清型6、11、16および/または18の1以上に対して保護的である。さらに、本発明の組成物との組合せが考えられる、Vaccines,4thEditionPlotkinandOrensteined.2004;MedicalMicrobiology4thEditionMurrayetal.ed.2002;Virology,3rdEditionW.K.Jokliked.1988;FundamentalVirology,2ndEditionB.N.FieldsandD.M.Knipe,eds.1991に含まれる抗原、組成物、方法および微生物が提供される。加えて、抗原は前記したウイルスのいずれかの生きた、弱毒化、分割および/または精製バージョンを含む。真菌抗原ワクチンに関連する、本発明中で用いるための真菌抗原は、Trichophytonmentagrophytesによって引き起こされるトリコパイトーシスtrichopytosiisの予防および治療用の米国特許第4,229,434号および第4,368,191号;モルモット、ネコ、ウサギ、ウマおよびヒツジのような動物における皮膚糸状菌感染の予防用の広スペクトル皮膚糸状菌ワクチンについての米国特許第5,277,904号および第5,284,652号;これらの抗原は所望によりアジュバントと組み合わせた有効量の殺したT.equinum、T.mentagrophytesvar.granulare、M.canisおよび/またはM.gypseumの懸濁液を含む;担体中のホモゲナイズしたホルモアルデヒドで殺傷した真菌、すなわち、Microsporumcanis培養物の有効量を含む白癬ワクチンについての米国特許第5,453,273号および第6,132,733号;ピチオシスpythiosisについての細胞外および細胞内タンパク質に関連する米国特許第5,948,413号に記載されたものを含む。抗真菌ワクチン内で同定されたさらなる抗原はRingvacbovisLTF-130およびBiovetaを含む。さらに、本明細書中で用いるための真菌抗原は:Epidermophytonfloccusum、Microsporumaudouini、Microsporumcanis、Microsporumdistortum、Microsporumequinum、Microsporumgypsum、Microsporumnanum、Trichophytonconcentricum、Trichophytonequinum、Trichophytongallinae、Trichophytongypseum、Trichophytonmegnini、Trichophytonmentagrophytes、Trichophytonquinckeanum、Trichophytonrubrum、Trichophytonschoenleini、Trichophytontonsurans、Trichophytonverrucosum、T.verrucosumvar.album、var.discoides、var.ochraceum、Trichophytonviolaceum、および/またはTrichophytonfaviformeを含めたDermatophytresに由来し得る。本発明の組成物と組み合わせた抗原として、または抗原の由来として用いられる真菌病原体はAspergillusfumigatus、Aspergillusflavus、Aspergillusniger、Aspergillusnidulans、Aspergillusterreus、Aspergillussydowi、Aspergillusflavatus、Aspergillusglaucus、Blastoschizomycescapitatus、Candidaalbicans、Candidaenolase、Candidatropicalis、Candidaglabrata、Candidakrusei、Candidaparapsilosis、Candidastellatoidea、Candidakusei、Candidaparakwsei、Candidalusitaniae、Candidapseudotropicalis、Candidaguilliermondi、Cladosporiumcarrionii、Coccidioidesimmitis、Blastomycesdermatidis、Cryptococcusneoformals、Geotrichumclavatum、Histoplasmacapsulatum、KlebsiellaPneumoniae、Paracoccidioidesbrasiliensis、Pneumocystiscarinii、Pythiumninsidiosum、Pityrosporumovale、Sacharomycescerevisae、Saccharomycesboulardii、Saccharomycespombe、Scedosporiumapiosperum、Sporothrixschenckii、Trichosporonbeigelii、Toxoplasmagondii、Penicilliummarneffei、Malasseziaspp.、Fonsecaeaspp.、Wangiellaspp.、Sporothrixspp.、Basidiobolusspp.、Conidiobolusspp.、Rhizopusspp、Mucorspp、Absidiaspp、Mortierellaspp、Cunninghamellaspp、およびSaksenaeasppを含む。抗原が由来する他の真菌はAlternariaspp、Curvilariaspp、Helminthosporiumspp、Fusariumspp、Aspergillusspp、Penicilliumspp、Monoliniaspp、Rhizoctoniaspp、Paecilomycesspp、Pithomycesspp、およびCladosporiumsppを含む。真菌抗原を生産するためのプロセスは当該分野でよく知られている米国特許第6,333,164号参照。好ましい方法において、可溶化画分を、その細胞壁が実質的に除去されるか、あるいは少なくとも部分的に除去された真菌細胞から得ることができる不溶性画分から抽出し、分離し、これは、該プロセスが:生きた真菌細胞を入手し;その細胞壁が実質的に除去されるか、あるいは少なくとも部分的に除去された真菌細胞を入手し;その細胞壁が実質的に除去されるか、あるいは少なくとも部分的に除去された真菌細胞を破裂させ;不溶性画分を得;次いで、不溶性画分から可溶性画分を抽出し、分離する工程を含むことを特徴とする。STD抗原特定の実施形態において、本発明の組成物および方法を実施することができる微生物細菌、ウイルスおよび/または真菌は、性的に伝播する障害STDを引き起こすもの、および/または本発明の標的または抗原組成物であり得る抗原をその表面に提示するものを含む。本発明の好ましい実施形態において、組成物はウイルスまたは細菌STDに由来する抗原と組み合わされる。細菌またはウイルスに由来する抗原は本発明の組成物と組み合わせて投与して、とりわけ、以下のSTD:クラミジア、生殖系ヘルペス、肝炎特にHCV、生殖系いぼ、淋病、梅毒および/または軟性下疳のうちの少なくとも1つに対する保護を供することができるWO00/15255参照。もう1つの実施形態において、本発明の組成物はSTDの予防または治療のために抗原と共投与される。前記でかなり詳細に記載されたSTDに関連する以下のウイルスに由来する抗原は、本発明の組成物との共投与で好ましい:肝炎特にHCV、HPV、HIVまたはHSV。加えて、前記にてかなり詳細に記載されたSTDに関連する以下の細菌に由来する抗原は本発明の組成物との共投与で好ましい:Neiserriagonorrhoeae、Chlamydiapneumoniae、Chlamydiatrachomatis、Treponemapallidum、またはHaemophilusducreyi。呼吸器系抗原抗原は呼吸器系抗原であってよく、特に、感染および/または呼吸器系ウイルス感染の1以上の症状を低減し、または予防することによって、呼吸器系シンチチウムウイルスRSV、PIV、SARSウイルス、インフルエンザ、Bacillusanthracisのようなウイルス、細菌または真菌を含めた呼吸器系病原体による感染を予防しおよび/または治療する方法のために免疫原性組成物でさらに用いることができよう。呼吸器系ウイルス、細菌または真菌に由来するもののような本明細書中に記載された抗原を含む組成物は、その特定の呼吸器系微生物に曝露される危険性がある、呼吸器系微生物に曝露された、または呼吸器系ウイルス、細菌または真菌に感染した個体に本発明の組成物と組み合わせて投与される。本発明の組成物は、好ましくは、呼吸器系病原体の抗原と同時に、または同一処方にて共投与される。組成物の投与の結果、呼吸器系感染の1以上の症状の低下した発生率および/または重症度がもたらされる。小児科/老人科学抗原1つの実施形態において、本発明の組成物は、小児科抗原において、小児科集団の治療用の抗原と組み合わせて用いられる。より特定の実施形態において、小児科集団は約3歳未満、または約2歳未満、または約1歳未満である。もう1つの実施形態において、本発明の組成物と組み合わされる小児科抗原は少なくとも1年、2年または3年にわたって複数回投与される。もう1つの実施形態において、本発明の組成物は、老人科学抗原において、老人集団の治療用の抗原と組み合わされて用いられる。他の抗原本発明の組成物と組み合わされて用いられる他の抗原は、病院で獲得された院内関連抗原を含む。もう1つの実施形態において、寄生虫抗原が、本発明の組成物との組合せで考えられる。寄生虫抗原の例はマラリアおよび/またはライム病を引き起こす生物に由来するものを含む。もう1つの実施形態において、本発明の組成物と組み合わせる抗原は蚊媒介障害に関連し、またはそれに対して有効である。もう1つの実施形態において、本発明の組成物と組み合わされる抗原は脳炎に関連するか、またはそれに対して効果的である。もう1つの実施形態において、本発明の組成物と組み合わされる抗原は神経系の感染に関連するか、またはそれに対して有効である。もう1つの実施形態において、本発明の組成物と組み合わされる抗原は血液または体液を介して伝播可能な抗原である。抗原処方物本発明の他の態様において、吸着された抗原を有するミクロ粒子を製造する方法が提供される。該方法はai水、ii洗剤、iii有機溶媒、およびivポリα-ヒドロキシ酸、ポリヒドロキシ酪酸、ポリカプロラクトン、ポリオルトエステル、ポリアンヒドライド、およびポリシアノアクリレートよりなる群から選択される生分解性ポリマーを含む混合物を分散させることによってエマルジョンを供し;該ポリマーは、典型的には、有機溶媒に対して約1ないし約30の濃度で混合物に存在させ、他方、洗剤は、典型的には、約0.00001:1ないし約0.1:1より典型的には約0.0001:1ないし0.1:1、約0.001:1ないし約0.1:1、または約0.005:1ないし約0.1:1の重量-対-重量の洗剤-対-ポリマー比率で混合物中に存在する;b有機溶媒をエマルジョンから除去し;次いで、c抗原をミクロ粒子の表面に吸着させることを含む。ある実施形態において、生分解性ポリマーは有機溶媒に対して約3ないし約10の濃度で存在させる。本明細書中で用いるミクロ粒子は滅菌可能な、非毒性であって生分解性である材料から形成されるであろう。そのような材料は、限定されるものではないが、ポリα-ヒドロキシ酸、ポリヒドロキシ酪酸、ポリカプロラクトン、ポリオルトエステル、ポリアンヒドライド、PACA、およびポリシアノアクリレートを含む。好ましくは、本発明で用いられるミクロ粒子はポリα-ヒドロキシ酸から、特に、ポリラクチドPLA、あるいはポリD,L-ラクチド-コ-グリコシドPLGまたはPLGAのようなD,L-ラクチドおよびグリコリドまたはグリコール酸のコポリマー、あるいはD,L-ラクチドおよびカプロラクトンのコポリマーから由来する。ミクロ粒子は、種々の分子量および、PLGのようなコポリマーの場合には、種々のラクチド:グリコリド比率を有する種々のポリマー出発材料のいずれかに由来することができ、その選択は、部分的には、共投与されるマクロ分子に依存して大いに選択的事項である。これらのパラメーターは以下により十分に議論する。さらなる抗原は外側膜小胞OMV調製物も含むことができる。さらなる処方方法および抗原特に腫瘍抗原は米国特許出願第09/581,772号に供される。抗原の文献以下の文献は本発明の組成物と組み合わせて有用な抗原を含む:前記引用の特許、特許出願および雑誌論文の全ての内容は、あたかも十分にここに記載されているように参考として援用される。本発明の組成物中にあるグラム陽性細菌タンパク質の数には上限があり得る。好ましくは、本発明の組成物中のグラム陽性細菌タンパク質の数は20未満、19未満、18未満、17未満、16未満、15未満、14未満、13未満、12未満、11未満、10未満、9未満、8未満、7未満、6未満、5未満、4未満、または3未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物中のグラム陽性細菌タンパク質の数は6未満、5未満、または4未満である。なおより好ましくは、本発明の組成物中のグラム陽性細菌タンパク質の数は3である。本発明で用いるグラム陽性細菌タンパク質およびポリヌクレオチドは、好ましくは、単離されている、すなわち、当該分子が天然において見出される生物全体から分離され、区別され、あるいは当該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが天然で見出されない場合、該ポリヌクレオチドまたはポリペプチドがその意図した目的で用いることができるように、他の生物学的マクロ分子から十分に離されている。融合タンパク質:GBSAI配列本発明で用いるGBSAIタンパク質は個々の別々のポリペプチドとして組成物に存在させることができるが、抗原の少なくとも2つすなわち、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17または18が単一ポリペプチド鎖ハイブリッドまたは融合ポリペプチドとして発現されるのが好ましい。そのような融合ポリペプチドは2つの主な利点を供する:まず、それ自身において不安定であるか、または貧弱にしか発現できない場合があるポリペプチドは、問題を克服する適当な融合パートナーを加えることによって援助することができ;第二に、商業的な製造は、共に抗原的に有用な2つのポリペプチドを生産するために、1つの発現および精製のみ使用することが必要とされるなど、単純化される。融合ポリペプチドは1以上のAIポリペプチド配列を含むことができる。好ましくは、融合物はAI表面タンパク質配列を含む。好ましくは、融合ポリペプチドはGBS80、GBS104、およびGBS67の1以上を含む。最も好ましくは、融合ペプチドはGBS80からのポリペプチド配列を含む。従って、本発明は、第一のアミノ酸配列および第二のアミノ酸配列を含む融合ペプチドを含み、ここに、該第一および第二のアミノ酸配列はGBSAI表面タンパク質またはそのフラグメントから選択される。好ましくは、融合ポリペプチド中の第一および第二のアミノ酸配列は異なるエピトープを含む。2、3、4、5、6、7、8、9または10のGBS抗原からのアミノ酸配列を含むハイブリッドまたは融合物が好ましい。特に、2、3、4または5のGBS抗原からのアミノ酸配列よりなるハイブリッドが好ましい。異なるハイブリッドポリペプチドは単一の処方において一緒に混合することができる。そのような組合せ内で、GBS抗原は1を超えるハイブリッドポリペプチド中に、および/または非-ハイブリッドポリペプチドとして存在させることができる。しかしながら、抗原はハイブリッドとして、または非-ハイブリッドとして存在させるのが好ましいが、双方としてではない。ハイブリッドポリペプチドは式NH2-A-{-X-L-}n-B-COOHによって表すことができ、ここに:XはGBSAIタンパク質またはそのフラグメントのアミノ酸配列であり;Lは任意のリンカーアミノ酸配列であり;Aは任意にN-末端アミノ酸配列であり;Bは任意のC-末端アミノ酸配列であり;およびnは2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15である。-X-基がその野生型形態においてリーダーペプチド配列を有すれば、これはハイブリッドタンパク質において含むことができるか、あるいは省略することができる。いくつかの実施形態において、ハイブリッドタンパク質のN-末端に位置する-X-基を除いてリーダーペプチドが欠失されており、すなわち、X1のリーダーペプチドは保持されているが、X2...Xnのリーダーペプチドは省略されるであろう。これは全てのリーダーペプチドを欠失させ、および基-A-としてX1のリーダーペプチドを用いるのと同等である。{-X-L-}の各nの場合では、リンカーアミノ酸配列-L-は存在してもまたは不存在でも良い。例えば、n=2である場合、ハイブリッドはNH2-X1-L1-X2-L2-COOH、NH2-X1-X2-COOH、NH2-X1-L1-X2-COOH、NH2-X1-X2-L2-COOHなどであり得る。リンカーアミノ酸配列-L-は典型的には、短い例えば、20以下のアミノ酸、すなわち19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、クローニングを容易とする短いペプチド配列、ポリ-グリシンリンカーすなわち、Glynを含む;ここに、n=2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多く、およびヒスチジンタグすなわち、Hisn;ここにn=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くを含む。他の適当なリンカーアミノ酸配列は当業者に明らかであろう。有用なリンカーはGSGGGGであり、Gly-SerジペプチドはBamHI制限部位から形成され、かくしてクローニングおよび操作を助け、Gly4テトラペプチドは典型的なポリ-グリシンリンカーである。-A-は任意のN-末端アミノ酸配列である。これは、典型的には短い例えば、40以下のアミノ酸、すなわち、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、タンパク質トラフィッキングを指令するためのリーダー配列、またはクローニングまたは精製を容易とする短いペプチド配列を含む例えば、ヒスチジンタグ、すなわち、Hisn、ここにn=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多く。他の適当なN-末端アミノ酸配列は当業者に明らかであろう。もしX1がそれ自体のN-末端メチオニンを欠くならば、-A-は、好ましくは、N-末端メチオニンを供する例えば、1、2、3、4、5、6、7または8のアミノ酸を持つオリゴペプチドである。-B-は任意のC-末端アミノ酸配列である。これは、典型的には短い例えば、40以下のアミノ酸、すなわち、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、タンパク質トラフィッキングを指令する配列、例えば、ヒスチジンタグ、すなわち、n=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多いHisnを含むクローニングまたは精製を容易とする短いペプチド配列、またはタンパク質安定性を増強させる配列を含む。他の適当なC-末端アミノ酸配列は当業者に明らかであろう。最も好ましくは、nは2または3である。融合タンパク質:グラム陽性細菌AI配列本発明で用いるグラム陽性細菌AIタンパク質は個々の別々のポリペプチドとして組成物中に存在させることができるが、抗原の少なくとも2つすなわち、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17または18は単一ポリペプチド鎖ハイブリッドまたは融合ポリペプチドとして発現されるのが好ましい。そのような融合ポリペプチドが2つの主な利点を供する:まず、それ自体において不安定であるか、または貧弱にしか発現できない場合があるポリペプチドは、問題を克服する適当な融合パートナーを加えることによって助けることができ;第二に商業的な製造は、共に抗原的に有用な2つのポリペプチドを生産するために、ただ1つの発現および精製のみ使用することが必要とされるなど、単純化される。融合ポリペプチドは1以上のAIポリペプチド配列を含むことができる。好ましくは、融合物はAI表面タンパク質配列を含む。従って、本発明は、第一のアミノ酸配列および第二のアミノ酸配列を含む融合ペプチドを含み、ここに、該第一および第二のアミノ酸配列はグラム陽性細菌AIタンパク質またはそのフラグメントから選択される。好ましくは、融合ポリペプチド中の第一および第二のアミノ酸配列は異なるエピトープを含む。2、3、4、5、6、7、8、9または10のグラム陽性細菌抗原からのアミノ酸配列よりなるハイブリッドまたは融合物が好ましい。特に2、3、4または5のグラム陽性細菌抗原からのアミノ酸配列よりなるハイブリッドが好ましい。異なるハイブリッドポリペプチドは単一の処方において一緒に混合することができる。そのような組合せ内では、グラム陽性細菌AI配列は、1を超えるハイブリッドポリペプチドにおいて、および/または非-ハイブリッドポリペプチドとして存在させることができる。しかしながら、抗原はハイブリッドとして、または非-ハイブリッドとして存在させ、双方としては存在させない。ハイブリッドポリペプチドは式NH2-A-{-X-L-}n-B-COOHによって表すことができ、ここに:Xはグラム陽性細菌AI配列またはそのフラグメントのアミノ酸配列であり;Lは任意のリンカーアミノ酸配列であり;Aは任意のN-末端アミノ酸配列であり;Bは任意のC-末端アミノ酸配列であり;およびnは2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15である。もし-X-基がその野生型形態においてリーダーペプチド配列を有するならば、これはハイブリッドタンパク質に含めてもよく、または省略してもよい。いくつかの実施形態において、リーダーペプチドは、ハイブリッドタンパク質のN-末端に位置する-X-基のそれを除いて欠失され、すなわち、X1のリーダーペプチドは保持されるが、X2...Xnのリーダーペプチドは省略されるであろう。これは、全てのリーダーペプチドを欠失し、基-A-としてX1のリーダーペプチドを用いることと同等である。{-X-L}の各nの場合では、リンカーアミノ酸配列-L-は存在してもまたは存在しなくてもよい。例えば、n=2の場合には、ハイブリッドはNH2-X1-L1-X2-L2-COOH、NH2-X1-X2-COOH、NH2-X1-L1-X2-COOH、NH2-X1-X2-L2-COOHなどであり得る。リンカーアミノ酸配列-L-は典型的には短いであろう例えば、20以下のアミノ酸、すなわち、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、クローニングを容易とする短いペプチド配列、ポリ-グリシンリンカーすなわち、Glynを含む;ここにn=2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多く、およびヒスチジンタグすなわち、Hisn;ここに、n=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くを含む。他の適当なリンカーアミノ酸配列は当業者に明らかであろう。有用なリンカーはGSGGGGであり、Gly-SerジペプチドはBamHI制限部位から形成され、かくして、クローニングおよび操作を助け、Gly4テトラペプチドは、典型的なポリーグリシンリンである。-A-は任意のN-末端アミノ酸配列である。これは典型的には短いであろう例えば、40以下のアミノ酸、すなわち、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、タンパク質トラフィッキングを指令するためのリーダー配列、またはクローニングまたは精製を容易とする短いペプチド配列例えば、ヒスチジンタグ、すなわち、Hisn;ここに、n=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くを含む。他の適当なN-末端アミノ酸配列は当業者に明らかであろう。もしX1がそれ自身のN-末端メチオニンを欠くならば、-A-は、好ましくは、N-末端メチオニンを供する例えば、1、2、3、4、5、6、7または8アミノ酸を持つオリゴペプチドである。-B-は任意のC-末端アミノ酸配列である。これは典型的には短いであろう例えば、40以下のアミノ酸、すなわち、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1。その例は、タンパク質トラフィッキングを指令する配列、例えば、ヒスチジンタグ、すなわち、Hisnを含む;n=3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くクローニングまたは精製を容易とする短いペプチド配列、またはタンパク質安定性を増強させる配列を含む。他の適当なC-末端アミノ酸配列は当業者に明らかであろう。最も好ましくは、nは2または3である。抗体:GBSAI配列本発明のGBSAIタンパク質を用いて、GBSAIタンパク質に特異的な抗体を調製することもできる。抗体は、好ましくは、AIタンパク質のオリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態に対して特異的である。本発明は、増大した範囲のGBS血清型および株単離体に対して保護を供するように選択されたGBSAIタンパク質に対して特異的な抗体の組合せも含む。例えば、組合せは第一および第二の抗体を含むことができ、ここに、該第一の抗体は第一のGBSAIタンパク質に対して特異的であって、該第二の抗体は第二のGBSAIタンパク質に対して特異的である。好ましくは、該第一のGBSAIタンパク質をコードする核酸配列は、該第二のGBSAIタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含むGBSゲノムには存在しない。好ましくは、該第一および第二のGBSAIタンパク質をコードする核酸配列は、複数のGBS血清型および株単離体のゲノムに存在する。本発明のGBS特異的抗体は、化学的または物理的手段を介して、GBSポリペプチドのエピトープに結合できるか、あるいは会合できる1以上の生物学的基を含む。本発明の抗体は、GBSAIタンパク質に特異的に結合する抗体を含む。本発明は、ポリクローナルおよびモノクローナル調製物双方から得られる抗体、ならびに以下の:ハイブリッドキメラ抗体分子例えば、Winteretal.1991Nature349:293-299;および米国特許第4,816,567号参照;Fab’2およびFabフラグメント;Fv分子非-共有結合ヘテロダイマー、例えば、Inbaretal.1972ProcNatlAcadSciUSA69:2659-2662;およびEhrlichetal.1980Biochem19:4091-4096参照;単一鎖Fv分子sFv例えば、Hustonetal.1988ProcNatlAcadSciUSA85:5897-5883参照;ダイマーおよびトリマー抗体フラグメント構築体;ミニボディー例えば、Packetal.1992Biochem31:1579-1584;Cumberetal.1992JImmunology149B:120-126参照;ヒト化抗体分子例えば、Riechmannetal.1988Nature332:323-327;Verhoeyanetal.1988Science239:1534-1536;および1994年9月21日に公開された英国特許公開番号GB2,276,169参照;およびそのような分子から得られるいずれかの機能的フラグメントを含み、ここに、そのようなフラグメントは親抗体分子の免疫学的結合特性を保有する。本発明は、さらに、ファージディスプレイのような非-慣用的プロセスを介して得られた抗体を含む。好ましくは、本発明のGBS特異的抗体は、モノクローナル抗体である。本発明のモノクローナル抗体は、均一な抗体集団を有する抗体組成物を含む。本発明のモノクローナル抗体はマウスハイブリドーマーから得ることができ、ならびにマウスハイブリドーマーではなくヒトを用いて得ることができるヒトモノクローナル抗体であり得る。例えば、Cote,etal.MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy,AlanR.Liss,1985,p77参照。本発明の抗体を診断適用で用いて、例えば、生物学的試料中でのGBSの存在または不存在を検出することができる。本発明の抗体は、GBS感染の予防的または治療的処置で用いることもできる。抗体:グラム陽性細菌AI配列本発明のグラム陽性細菌AIタンパク質を用いて、グラム陽性細菌AIタンパク質に対して特異的な抗体を調製することもできる。抗体は、好ましくは、AIタンパク質のオリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態に対して特異的である。本発明は、増大した範囲のグラム陽性細菌の属、種、血清型および株単離体に対して保護を供するように選択されたグラム陽性細菌AIタンパク質に対して特異的な抗体の組合せも含む。例えば、組合せは第一および第二の抗体を含むことができ、ここに、該第一の抗体は第一のグラム陽性細菌AIタンパク質に対して特異的であって、該第二の抗体は第二のグラム陽性細菌AIタンパク質に対して特異的である。好ましくは、該第一のグラム陽性細菌AIタンパク質をコードする核酸配列は、該第二のグラム陽性細菌AIタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含むグラム陽性細菌ゲノムに存在しない。好ましくは、該第一のおよび第二のグラム陽性細菌AIタンパク質をコードする核酸配列は、複数のグラム陽性細菌の属、種、血清型または株単離体のゲノムに存在する。抗体の該組合せが増大した範囲の細菌血清型に対する保護を供する場合の例として、第一の抗体は第一のGASAIタンパク質に対して特異的であってよく、第二の抗体は第二のGASAIタンパク質に対して特異的であってよい。第一のGASAIタンパク質はGASAI-1表面タンパク質を含むことができ、他方、第二のGASAIタンパク質はGASAI-2またはAI-3表面タンパク質を含むことができる。抗体の該組合せが増大した範囲の細菌種に対する保護を供する場合の例として、第一の抗体はGBSAIタンパク質に対して特異的であってよく、第二の抗体はGASAIタンパク質に対して特異的であってよい。あるいは、第一の抗体はGASAIタンパク質に対して特異的であってよく、第二の抗体はS.pneumoniaeAIタンパク質に対して特異的であってよい。本発明のグラム陽性特異的抗体は、化学的または物理的手段を介して、グラム陽性細菌AIポリペプチドのエピトープに結合することができるか、または会合することができる1以上の生物学的基を含む。本発明の抗体は、グラム陽性細菌AIタンパク質に特異的に結合する抗体を含む。本発明は、ポリクローナルおよびモノクローナル調製物双方から得られた抗体、ならびに以下の:ハイブリッドキメラ抗体分子例えば、Winteretal.1991Nature349:293-299;および米国特許第4,816,567号参照;Fab’2およびFabフラグメント;Fv分子非-共有結合ヘテロダイマー、例えば、Inbaretal.1972ProcNatlAcadSciUSA69:2659-2662;およびEhrlichetal.1980Biochem19:4091-4096参照;単一鎖Fv分子sFv例えば、Hustonetal.1988ProcNatlAcadSciUSA85:5897-5883参照;ダイマーおよびトリマー抗体フラグメント構築体;ミニボディー例えば、Packetal.1992Biochem31:1579-1584;Cumberetal.1992JImmunology149B:120-126参照;ヒト化抗体分子例えば、Riechmannetal.1988Nature332:323-327;Verhoeyanetal.1988Science239:1534-1536;および1994年9月21日に公開された英国特許公開番号GB2,276,169参照;およびそのような分子から得られるいずれかの機能的フラグメントを含み、ここに、そのようなフラグメントは親抗体分子の免疫学的結合特性を保有する。本発明は、さらに、ファージディスプレイのような非-慣用的プロセスを介して得られた抗体を含む。好ましくは、本発明のグラム陽性特異的抗体はモノクローナル抗体である。本発明のモノクローナル抗体は、均一な抗体集団を有する抗体組成物を含む。本発明のモノクローナル抗体はマウスハイブリドーマーから得ることができ、ならびにマウスハイブリドーマーではなくヒトを用いて得られたヒトモノクローナル抗体であり得る。例えば、Cote,etal.MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy,AlanR.Liss,1985,p77参照。本発明の抗体を診断適用で用いて、例えば、生物学的試料中のグラム陽性細菌の存在または不存在を検出することができる。本発明の抗体は、グラム陽性細菌感染の予防的または治療的処置で用いることもできる。核酸本発明は、本発明のグラム陽性細菌配列および/またはハイブリッド融合ポリペプチドをコードする核酸を提供する。本発明はまた、本発明のGBS抗原および/またはハイブリッド融合ポリペプチドをコードする核酸を提供する。さらに、本発明は、好ましくは、高ストリンジェンシー条件例えば、0.1×SSC、0.5SDS溶液中で65°C下でこれらの核酸にハイブリダイズすることができる核酸を提供する。本発明のポリペプチドは、種々の手段例えば、組換え発現、細胞培養からの精製、化学的合成などによって、かつ種々の形態例えば、天然、融合、非-グリコシル化、脂質化などで調製することができる。それらは、好ましくは、実質的に純粋な形態で調製されるすなわち、他のGASまたは宿主細胞タンパク質を実質的に有さない。本発明による核酸は、種々の方法で例えば、ゲノムまたはcDNAライブラリーから、生物それ自体から、化学合成によって調製することができ、種々の形態例えば、一本鎖、二本鎖、ベクター、プローブなどを取ることができる。それらは、好ましくは、実質的に純粋な形態で調製されるすなわち、他のGBSまたは宿主細胞核酸を実質的に有さない。用語核酸はDNAおよびRNA、また修飾された骨格例えば、ホスホロチオエートなどを含有するもののようなそれらのアナログ、また、ペプチド核酸PNAなどを含む。本発明は、例えば、アンチセンスまたはプロービング目的で前記したものに相補的な配列を含む核酸を含む。本発明は、ポリペプチド発現を誘導する条件下で、本発明の核酸で形質転換された宿主細胞を培養する工程を含む、本発明のポリペプチドの生産方法も提供する。本発明は、化学的手段によってポリペプチドの少なくとも一部を合成する工程を含む、本発明のポリペプチドを生産する方法を提供する。本発明は、プライマー-ベースの増幅方法例えば、PCRを用いて核酸を増幅する工程を含む、本発明の核酸を生産する方法を提供する。本発明は、化学的手段によって核酸の少なくとも一部を合成する工程を含む、本発明の核酸を生産する方法を提供する。精製および組換発現本発明のグラム陽性細菌AIタンパク質は天然グラム陽性細菌から単離することができるか、あるいは例えば、異種宿主において組換えにより生産することができる。例えば、本発明のGAS、GBS、およびS.pneumoniae抗原はStreptococcusagalactiae、S.pyogenes、S.pneumoniaeから単離することができるか、あるいはそれらは、例えば、異種宿主において組換えにより生産することができる。好ましくは、GBS抗原は異種宿主を用いて調製される。異種宿主は原核生物例えば、細菌または真核生物であってよい。それは好ましくはE.coliであるが、他の適当な宿主はBacillussubtilis、Vibriocholerae、Salmonellatyphi、Salmonellatyphimurium、Neisserialactamica、Neisseriacinerea、Mycobacteria例えば、M.tuberculosis、S.gordonii、L.lactis、酵母などを含む。ポリペプチドの組換生産は、タグタンパク質およびグラム陽性細菌抗原を含む融合タンパク質として発現させるようにグラム陽性細菌AI配列に該タグタンパク質を加えることによって促進される。例えば、ポリペプチドの組換生産は、タグタンパク質およびGBS抗原を含む融合タンパク質として発現させるようにGBS抗原に該タグタンパク質を加えることによって促進される。そのようなタグタンパク質は発現されたタンパク質の精製、検出および安定性を促進することができる。本発明で用いるのに適したタグタンパク質はポリアルギニンタグArg-タグ、ポリヒスチジンタグHis-タグ、FLAG-タグ、Strep-タグ、c-myc-タグ、S-タグ、カルモジュリン結合ペプチド、セルロース結合ドメイン、SBP-タグ、キチン結合ドメイン、グルタチオンS-トランスフェラーゼ-タグGST、マルトース結合タンパク質、転写終止抗終止因子NusA、E.coliチオレドキシンTrxAおよびタンパク質ジスルフィドイソメラーゼIDsbAを含む。好ましいタグタンパク質はHis-タグおよびGSTを含む。タグタンパク質の使用についての十分な議論がTerpeetal.,Overviewoftagproteinfusions:frommolecularandbiochemicalfundamentalstocommercialsystems,ApplMicrobiolBiotechnol200360:523-533に見出すことができる。精製の後、タグタンパク質は、所望により、すなわち、当該分野で公知の特別に仕立てられた酵素処理によって、発現された融合タンパク質から除去することができる。共通に使用されるプロテアーゼはエンテロキナーゼ、タバコエッチウイルスTEV、トロンビン、および第Xa因子を含む。GBS多糖本発明の組成物は、GBS多糖を含めることによってさらに改良することができる。好ましくは、GBS抗原および糖類は、各々受容者における免疫学的応答に寄与する。組合せは特に有利であり、ここに、糖類およびポリペプチドは異なるGBS血清型からの保護を供する。組み合わせられた抗原は、別々の糖類およびポリペプチド抗原を一緒に投与する単純な組合せとして供することができるか、あるいはそれらは、糖類およびポリペプチド抗原が相互に共有結合により連結されたコンジュゲーテッド組合せとして存在することができる。かくして、本発明は、i1以上のGBSAIタンパク質、およびii1以上のGBS糖類抗原を含む免疫原性組成物を提供する。ポリペプチドおよび多糖は有利には相互に共有結合連結させて、コンジュゲートを形成することができる。それらの間では、組み合わせられたポリペプチドおよび糖類抗原は、好ましくは、2以上のGBS血清型例えば、2、3、4、5、6、7、8以上の血清型を網羅するまたはそれからの保護を供する。ポリペプチドおよび糖類抗原の血清型は重複してもしなくてもよい。例えば、ポリペプチドは血清型IIまたはVに対して保護し得、他方、糖類は血清型Ia、IbまたはIIIいずれかに対して保護する。好ましい組合せは血清の以下の群に対して保護する:1血清型IaおよびIb、2血清型IaおよびII、3血清型IaおよびIII、4血清型IaおよびIV、5血清型IaおよびV、6血清型IaおよびVI、7血清型IaおよびVII、8血清型IaおよびVIII、9血清型IbおよびII、10血清型IbおよびIII、11血清型IbおよびIV、12血清型IbおよびV、13血清型IbおよびVI、14血清型IbおよびVII、15血清型IbおよびVIII、16血清型IIおよびIII、17血清型IIおよびIV、18血清型IIおよびV、19血清型IIおよびVI、20血清型IIおよびVII、21血清型IIおよびVII、22血清型IIIおよびIV、23血清型IIIおよびV、24血清型IIIおよびVI、25血清型IIIおよびVII、26血清型IIIおよびVIII、27血清型IVおよびV、28血清型IVおよびVI、29血清型IVおよびVII、30血清型IVおよびVIII、31血清型VおよびVI、32血清型VおよびVII、33血清型VおよびVIII、34血清型VIおよびVII、35血清型VIおよびVIII、および36血清型VIIおよびVIII。なおより好ましくは、該組合せは血清型の以下の群に対して保護する:1血清型IaおよびII、2血清型IaおよびV、3血清型IbおよびII、4血清型IbおよびV、5血清型IIIおよびII、および6血清型IIIおよびV。最も好ましくは、該組合せは血清型IIIおよびVに対して保護する。血清型IIおよびVに対する保護は、好ましくは、ポリペプチド抗原によって供される。血清型Ia、Ibおよび/またはIIIに対する保護はポリペプチドまたは糖類抗原であり得る。免疫原性組成物および医薬本発明の組成物は好ましくは免疫原性組成物であり、より好ましくはワクチン組成物である。組成物のpHは好ましくは6および8の間であり、好ましくは約7である。pHは緩衝液の使用によって維持することができる。組成物は滅菌することができ、および/またはパイロジェン-フリーとすることができる。組成物はヒトに対して等張とすることができる。本発明によるワクチンは予防的としてすなわち、感染を予防することができ、または治療的としてすなわち、感染を治療することができるが、典型的には予防的であろう。従って、本発明は、動物に、治療または予防量の本発明の免疫原性組成物を投与することを含む、グラム陽性細菌感染に対して感受性である動物においてそのようなグラム陽性細菌感染を治療的または予防的に処置する方法を含む。例えば、本発明は、動物に、治療または予防量の本発明の免疫原性組成物を投与することを含む。streptococcus感染に対して感受性である動物においてStreptococcusagalactiae、S.pyogenes、またはS.pneumoniae感染を治療的または予防的に処置する方法を含む。本発明は、医薬としての本明細書中に記載された組成物の使用のための本発明の組成物も提供する。該医薬は、好ましくは、哺乳動物において免疫応答を生起させることができすなわち、それは免疫原性組成物である、より好ましくは、ワクチンである。本発明は哺乳動物において免疫応答を生起させるための医薬の製造における本発明の組成物の使用も提供する。該医薬は、好ましくは、ワクチンである。本発明は、本発明の組成物の1以上の容器を含むキットも提供する。組成物は、個々の抗原が可能であるように、液体形態とすることができるか、あるいは凍結乾燥することができる。組成物のための適当な容器は、例えば、ビン、バイアル、シリンジおよび試験管を含む。容器は、ガラスまたはプラスチックを含めた種々の材料から形成することができる。容器は滅菌アクセスポートを有することができる例えば、容器は皮下注射針によって刺すことができるストッパー有する静脈内溶液のバックまたはバイアルとすることができる。組成物は、1以上のグラム陽性細菌AIタンパク質を含む第一の成分を含むことができる。好ましくは、AIタンパク質は表面AIタンパク質である。好ましくは、AI表面タンパク質はオリゴマーまたはハイパーオリゴマー形態である。例えば、第一の成分はGBS抗原またはGAS抗原、あるいはS.pneumoniae抗原の組合せを含む。好ましくは、該組合せはGBS80を含む。好ましくは、GBS80はオリゴマーまたはハイパーオリゴマーの形態である。該キットは、さらに、リン酸緩衝化生理食塩水、リンゲル液、またはデキストロース溶液のような医薬上許容される緩衝液を含む第二の容器を含むことができる。それは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針およびシリンジを含めた、最終ユーザーに有用な他の材料を含むこともできる。該キットはもう1つの活性な剤、例えば、抗生物質を持つ第二または第三の容器を含むこともできる。該キットは、S.agalactiaeおよび/またはS.pyogenesおよび/またはS.pneumoniaeに対する免疫を誘導する方法のための、またはS.agalactiaeおよび/またはS.pyogenesおよび/またはS.pneumoniae感染を治療するための書面による指示書を含む添付文書を含むこともできる。該添付文書は認可されていない添付文書案とすることかでき、あるいは食品医薬品局FDAまたは他の取り締まり当局によって認可された添付文書とすることができる。本発明は、本発明の免疫原性組成物を予め充填した送達デバイスも提供する。本発明は、有効量の本発明の組成物を投与する工程を含む、哺乳動物において免疫応答を生起させる方法も提供する。免疫応答は好ましくは保護的であり、好ましくは、抗体および/または細胞-媒介免疫を含む。この免疫応答は、好ましくは、1以上のGBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae抗原に対する露出に際して迅速に応答することができる長く続く例えば、中和抗体および細胞媒介免疫を誘導するであろう。該方法はブースター応答を生起させることができる。本発明は、哺乳動物に、有効量の本発明の免疫原性組成物、本発明のワクチン、または本発明の免疫原性組成物を認識する抗体を投与する工程を含む、哺乳動物においてGBS、GAS、またはS.pneumoniae感染を中和する方法を提供する。哺乳動物は好ましくはヒトである。ワクチンが予防的使用である場合、ヒトは好ましくは女性である子供を持つ年齢またはティーンエイジャーいずれか。あるいは、ヒトは高齢者であってよく例えば、50歳、55歳、60歳、65歳、70歳または75歳の年齢を超える、糖尿病または癌のような基本的な障害を有するものであってよい。ワクチンが治療的使用のためのものである場合、ヒトは好ましくは妊娠した女性または高齢の成人である。これらの使用および方法は、好ましくは、Streptococcusagalactiae、またはS.pyogenes、またはS.pneumoniaeによって引き起こされた障害の予防および/または治療用である。組成物は他のストレプトコッカス細菌に対しても効果的であり得る。組成物は他のグラム陽性細菌に対しても効果的であり得る。治療的処置の有効性をチェックする1つの方法は、本発明の組成物の投与後にグラム陽性細菌感染をモニターすることを含む。予防的処置の有効性をチェックする1つの方法は、本発明の組成物の投与後に該組成物におけるグラム陽性細菌抗原に対する免疫応答をモニターすることを含む。治療的処置の有効性をチェックする1つの方法は、本発明の組成物の投与後にGBS感染をモニターすることを含む。予防的処置の有効性をチェックする1つの方法は、本発明の組成物の投与後に該組成物におけるGBS抗原に対する免疫応答をモニターすることを含む。本発明の免疫原性組成物の成分タンパク質の免疫原性を評価する方法は、組換えによりタンパク質を発現させ、イムノブロッドによって患者の血清または粘膜分泌をスクリーニングすることである。タンパク質および患者血清の間の陽性反応は、患者が問題のタンパク質に対して免疫応答を従前に配置した、すなわち、タンパク質は免疫原であることを示す。この方法を用いて、免疫優性タンパク質および/またはエピトープを同定することもできる。治療的処置の有効性をチェックするもう1つの方法は、本発明の組成物の投与後にGBSまたはGASまたはS.pneumoniae感染をモニターすることを含む。予防的処置の有効性をチェックする1つの方法は、本発明の組成物の投与後に該組成物におけるGBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae抗原に対する免疫応答をIgG1およびIgG2a生産のレベルをモニターするように全身的に、およびIgA生産のレベルをモニターするように粘膜的にの双方でモニターすることを含む。典型的には、GBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae血清特異的抗体の応答は免疫後であるがチャレンジ前に測定され、他方、粘膜GBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae特異的抗体の体応答は免疫後であってチャレンジ後に測定される。本発明のワクチン組成物は、宿主、例えば、ヒトへの投与に先立って、インビトロおよびインビボ動物モデルにおいて評価することができる。本発明の免疫原性組成物の有効性は、GBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae感染の動物モデル、例えば、モルモットまたはマウスを免疫原性組成物でチャレンジすることによってインビボで測定することもできる。免疫原性組成物はチャレンジ血清型と同一の血清型に由来するものであってもなくてもよい。好ましくは、免疫原性組成物はチャレンジ血清型と同一の血清型から由来できる。より好ましくは、免疫原性組成物および/またはチャレンジ血清型は、GBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae血清型の群に由来できる。インビボ有効性モデルは、限定されるものではないが、iヒトGBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae血清型を用いるマウス感染モデル;iiマウスにおいて特にビルレントである前記で概説した株のような、マウスに適合されたGBSおよび/またはGASおよび/またはS.pneumoniae株を用いるマウスモデルであるマウス障害モデル、iiiヒトGBSまたはGASまたはS.pneumoniae単離体を用いる霊長類モデルを含む。免疫応答はTH1免疫応答およびTH2応答の一方または双方であり得る。免疫応答は改良された、または増強された、または改変された免疫応答であり得る。免疫応答は全身および粘膜免疫応答の一方または双方であり得る。好ましくは、免疫応答は増強された全身および粘膜応答である。増強された全身および/または粘膜免疫性は、増強されたTH1および/またはTH2免疫応答において反映される。好ましくは、増強された免疫応答はIgG1および/またはIgG2aおよび/またはIgAの生産の増加を含む。好ましくは、粘膜免疫応答はTH2免疫応答である。好ましくは、粘膜免疫応答はIgAの生産の増加を含む。活性化されたTH2細胞は抗体の生産を増強し、従って、細胞外感染に対して応答するのに価値がある。活性化されたTH2細胞はIL-4、IL-5、IL-6およびIL-10の1以上を分泌することができる。TH2免疫応答の結果、将来の保護のために、IgG1、IgE、IgAおよび記憶B細胞の生産をもたらし得る。TH2免疫応答は、IL-4、IL-5、IL-6およびIL-10のようなTH2免疫応答に関連するサイトカインの1以上の増加、またはIgG1、IgE、IgAおよび記憶B細胞生産の増加の1以上を含むことができる。好ましくは、増強されたTH2免疫応答はIgG1生産の増加を含むであろう。TH1免疫応答はCTLの増加、IL-2、IFNγおよびTNFベータのようなTH1免疫応答に関連するサイトカインの1以上の増加、活性化されたマクロファージの増加、NK活性の増加、またはIgG2aの生産の増加の1以上を含むことができる。好ましくは、増強されたTH1免疫応答はIgG2a生産の増加を含むであろう。本発明の免疫原性組成物、特に、本発明の1以上のGAS抗原を含む免疫原性組成物は、単独で、あるいは所望によりTh1および/またはTh2応答を誘導することができる免疫調節剤と共に他のGAS抗原と組み合わせて用いることができる。本発明の組成物は、一般には、患者に直接投与されるであろう。ある種の経路は、より効果的な免疫応答、好ましくは、CMI応答の発生をもたらすものとして、あるいは副作用を誘導することがあまりないように、または投与のために容易であるように、ある組成物で好都合であり得る。直接的送達は非経口注射例えば、皮下、腹腔内、皮内、静脈内、筋肉内、または組織の間質腔によって、あるいは直腸、経口例えば、錠剤、スプレー、膣、局所、経皮transdermal例えば、WO99/27961参照または経皮transcutaneous例えば、WO02/074244およびWO02/064162参照、鼻腔内例えば、WO03/028760参照、眼、耳、肺または他の粘膜投与によって達成することができる。本発明を用いて、全身および/または粘膜粘液性を誘導することができる。1つの特に好ましい実施形態において、免疫原性組成物は、中和抗体応答を誘導する1以上のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae抗原、および細胞媒介免疫応答を誘導する1以上のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae抗原を含む。このようにして、中和抗体応答は初期のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae感染を予防または阻害し、他方、増強されたTh1細胞応答を誘導することができる細胞-媒介免疫応答は、GBSまたはGASまたはS.pneumoniae感染のさらなる拡大を予防する。好ましくは、免疫原性組成物は1以上のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae表面抗原および1以上のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae細胞質抗原を含む。好ましくは、免疫原性組成物は、1以上のGBSまたはGASまたはS.pneumoniae表面抗原等、および、Th1細胞応答を誘導できる細胞質抗原のような1または他の抗原を含む。投与処置は単一用量スケジュールまたは複数用量スケジュールであり得る。複数用量は、一次免疫スケジュールにおいて、および/またはブースター免疫スケジュールにおいて用いることができる。複数用量スケジュールにおいて、種々の用量は同一または異なる経路、例えば、非経口で一次、および粘膜でブースト、粘膜で一次、および非経口でブーストなどによって与えることができる。本発明の組成物は種々の形態で調製することができる。例えば、組成物は液状溶液または懸濁液いずれかとしての注射剤として調製することができる。注射に先立っての、液体ビヒクルにおける溶液または懸濁液に適した固体形態を調製することもできる例えば、凍結乾燥した組成物。組成物は、例えば、軟膏、クリームまたは粉末として局所投与のために調製することができる。組成物は、例えば、錠剤またはカプセル剤として、スプレーとして、あるいは所望により香味を付したシロップとして経口投与用に調製することができる。組成物は、微粉末またはスプレーを用いて、例えば、吸入剤として、肺投与のために調製することができる。組成物は坐薬またはペッサリーとして調製することができる。組成物は、例えば、点剤として、鼻、耳、または眼投与のために調製することができる。組成物は、組み合わされた組成物が患者への投与直前に再構成されるように設計されたキット形態とすることができる。そのようなキットは液体形態の1以上の抗原、および1以上の凍結乾燥された抗原を含むことができる。ワクチンとして用いられる免疫原性組成物は、免疫的に有効な量の抗原、ならびに必要であれば抗生物質のようないずれかの他の成分を含む。免疫的に有効な量とは、単一用量または一連の一部としてのいずれかでの個体へのその量の投与が、治療または予防で効果的であり、あるいは測定可能な免疫応答を増加させ、または臨床的症状を予防または低下させることを意味する。この量は治療すべき個体の健康および身体的条件、治療すべき個体例えば、非-ヒト霊長類、霊長類などの年齢、分類学的群、抗体を合成する個体の免疫系の能力、所望の保護の程度、ワクチンの処方、医療状況の治療する医師の評価、および他の関連因子に依存して変化する。該量は、ルーチン的試験を通じて決定することができる比較的広い範囲に入ると予測される。組成物のさらなる成分本発明の組成物は、典型的には、前記した成分に加えて、組成物を受ける個体に有害な抗体の生産をそれ自体が誘導しないいずれの担体も含む1以上の医薬上許容される担体を含む。適当な担体は、典型的には、タンパク質、多糖、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、ポリマーアミノ酸、アミノ酸コポリマー、および油滴またはリポソームのような脂質凝集体のような大きくてゆっくりと代謝されるマクロ分子である。そのような担体は当業者によく知られている。ワクチンは水、生理食塩水、グリセロール等のような希釈剤を含むこともできる。加えて、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝性物質などのような補助的物質を存在させることができる。医薬上許容される賦形剤の徹底的な議論はGennaro2000Remington:TheScienceandPracticeofPharmacy.20thed.,ISBN:0683306472において入手可能である。アジュバント本発明のワクチンは他の免疫調節剤と組み合わせて投与することができる。特に、組成物は通常はアジュバントを含むであろう。本発明で用いるアジュバントは、限定されるものではないが、以下に記載された1以上を含む。A.ミネラル含有組成物本発明においてアジュバントとして用いるのに適したミネラル含有組成物は、アルミニウム塩およびカルシウム塩のようなミネラル塩を含む。本発明は水酸化物例えば、オキシ水酸化物、リン酸塩例えば、ヒドロキシリン酸塩、オルトリン酸塩、硫酸塩などのようなミネラル塩例えば、VaccineDesign...1995eds.PowellNewman.ISBN:030644867XPlenumの第8および9章参照、または異なるミネラル化合物の混合物例えば、必要に応じてリン酸塩が過剰の、リン酸塩および水酸化物アジュバントの混合物を含む化合物はいずれかの適当な形態例えば、ゲル、結晶、アモルファスなどを取り、および塩への吸着が好ましい。ミネラル含有組成物は金属塩の粒子として処方することもできるWO00/23105。アルミニウム塩は、Al3の量が用量当たり0.2および1.0mgの間であるように本発明のワクチンに含めることができる。B.油-エマルジョン本発明においてアジュバントとして用いるのに適した油-エマルジョン組成物はMF59のようなスクワレン-水エマルジョンを含むマイクロフルイダイザーを用いてサブミクロン粒子に処方された5スクワレン、0.5Tween80、および0.5Span85。WO90/14837参照。また、Podda,Theadjuvantedinfluenzavaccineswithnoveladjuvants:ExperiensewiththeMF59-adjuvantedvaccine,Vaccine200119:2673-2680;Freyetal.,Comparisonofthesafety,tolerability,andimmunogenicityofaMF59-adjuvantedinfluenzavaccineandanon-adjuvantedinfluenzavacciceinnon-elderlyadults,Vaccine200321:4234-4237参照。MF59はFLUADTMインフルエンザウイルス三価サブユニットワクチンにおいてアジュバントとして用いられる。組成物で用いられる特に好ましいアジュバントはサブミクロン水中油型エマルジョンである。ここに用いられる好ましいサブミクロン水中油型エマルジョンは、4ないし5w/vスクワレン、0.25ないし1.0w/vTween80TMポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、および/または0.25ないし1.0Span85TMソルビタントリオレエートおよび、所望により、N-アセチルムラミル-L-アラニル-D-イソグルタミニル-L-アラニン-2-1’-2’-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ヒドロキシホスホリルオキシhuydroxyphosphophoryloxy-エチルアミンMTP-PEを含有するサブミクロン水中油型エマルジョン、例えば、MF59ここに参考としてその全体を援用する国際公開番号WO90/14837;米国特許第6,299,884号および第6,451,325号;およびOttetal.,MF59--DesignandEvaluationofaSafeandPotentAdjuvantforHumanVaccinesinVaccineDesign:TheSubunitandAdjuvantApproachPowell,M.F.andNewman,M.J.eds.PlenumPress,NewYork,1995,pb.277-296として知られたサブミクロン水中油型エマルジョンのようなMTP-PEの種々の量を所望により含有するスクワレン/水エマルジョンである。MP59は、4ないし5w/vのスクワレン例えば、4.3、0.25ないし0.5w/vのTween80TM、および0.5w/vSpan85TMを含有し、所望により、種々の量のMTP-PEを含有し、モデル110YマイクロフルイダイザーMicrofluidics,Newton,MAのようなマイクロフルイダイザーを用いてサブミクロン粒子に処方されている。例えば、MTP-PEは約0ないし500μg/用量、より好ましくは0ないし250μg/用量、最も好ましくは0ないし100μg/用量の量で存在させることができる。本明細書中で用いるように、用語MF59-0とは、MTP-PEを欠く前記サブミクロン水中油型エマルジョンをいい、他方、用語MF59-MTPは、MTP-PEを含有する処方を示す。例えば、MF59-100は用量当たり100μgのMTP-PEを含有する、等。ここに用いられるMF69、もう1つのサブミクロン水中油型エマルジョンは4.3w/vスクワレン、0.25w/vTween80TM、および0.75w/vのSpan85TMおよび、所望により、MTP-PEを含有する。なおもう1つのサブミクロン水中油型エマルジョンは、サブミクロンエマルジョンにやはりマイクロフルイダイズされた、10スクワレン、0.4Tween80TM、5プルロニック-ブロックポリマーL121、およびthr-MDPを含有する、SAFとしても知られたMF75である。MF75-MTPは、用量当たり100ないし400μgのMTP-PEのようなMTPを含むMF75処方を示す。組成物で用いられる、サブミクロン水中油型エマルジョン、その製造方法、およびムラミルペプチドのような免疫刺激剤は、ここに参考としてその全体を援用する、国際公開番号WO90/14837および米国特許第6,299,884号および第6,451,325号に詳細に記載されている。フロイントの完全アジュバントCFAおよびフロイントの不完全アジュバントIFAも本発明でアジュバントとして用いることもできる。C.サポニン処方物サポニン処方物も本発明においてアジュバントとして用いることができる。サポニンは広い範囲の植物種の樹皮、葉、幹、根および花においてさえ見出されるステロールグリコシドおよびトリテルペノイドグリコシドの異種群である。QuillaiasaponaraMolina樹木の樹皮からのサポニンは広くアジュバントとして研究されてきた。サポニンは、商業的には、Smilaxornataサルサパリラ、Gypsophillapaniculataブライドベール、およびSaponariaofficianalisソープルートから得ることもできる。サポニンアジュバント処方物は、QS21のような精製された処方物、ならびにISCOMのような脂質処方物を含む。サポニン組成物は高速薄層クロマトグラフィーHP-LCおよび逆相高速液体クロマトグラフィーRP-HPLCを用いて精製されてきた。これらの技術を用いる特定の精製された画分が同定されており、QS7、QS17、QS18、QS21、QH-A、QH-BおよびQH-Cを含む。好ましくは、サポニンはQS21である。QS21の生産方法は米国特許第5,057,540号に開示されている。サポニン処方物はコレステロールのようなステロールを含むこともできるWO96/33739参照。サポニンおよびコレステロールの組み合わせを用いて、免疫刺激複合体ISCOMと呼ばれるユニークな粒子を形成することができる。ISCOMは、典型的には、ホスファチジルエタノールアミンまたはホスファチジルコリンのようなリン脂質も含む。いずれの公知のサポニンもISCOMで用いることができる。特に、ISCOMはQuilA、QHAおよびQHCの1以上を含む。ISCOMはさらにEP0109942、WO96/11711およびWO96/33739に記載されている。所望により、ISCOMSはさらなる洗剤を欠くことができる。WO00/07621参照。サポニンベースのアジュバントの開発のレビューはBarr,etal.,ISCOMsandothersaponinbasedadjuvants,AdvancedDrugDeliveryReviews199832:247-271で見出すことができる。また、Sjolander,etal.,UptakeandadjuvantactivityoforallydeliveredsaponinandISCOMvaccines,AdvancedDrugDeliveryReviews199832:321-338も参照。D.ビロソームおよびウイルス様粒子VLPビロソームおよびウイルス様粒子VLPは本発明においてアジュバントとして用いることもできる。これらの構造物は、一般には、所望により、リン脂質と組み合わせた、またはそれと共に処方されたウイルスからの1以上のタンパク質を含有する。それらは一般には非-病原性であり、非-複製性であって、一般には、天然ウイルスゲノムのいずれも含まない。ウイルスタンパク質は組換えにより生産することができ、あるいは全ウイルスから単離することができる。ビロソームまたはVLPで用いるのに適したこれらのウイルスタンパク質はHAまたはNAのようなインフルエンザウイルス、コアまたはキャプシドタンパク質のようなB型肝炎ウイルス、E型肝炎ウイルス、麻疹ウイルス、シンドビスウイルス、ロタウイルス、口蹄疫ウイルス、レトロウイルス、ノルワークウイルス、ヒトパピローマーウイルス、HIV、RNA-ファージ、コートタンパク質のようなQβ-ファージ、GA-ファージ、fr-ファージ、AP205ファージ、およびレトロトランスポゾンTyタンパク質p1のようなTyに由来するタンパク質を含む。VLPはさらにWO03/024480、WO03/024481、およびNiikuraetal.,ChimericRecombinantHepatitisEVirus-LikeParticlesasanOralVaccineVehiclePresentingForeignEpitopes,Virology2002293:273-280;Lenzetal.,Papillomarivurs-LikeParticlesInduceAccuteActivationofDendriticCells,JournalofImmunology20015246-5355;Pinto,etal.,CellularImmuneResponsestoHumanPapillomavirusHPV-16L1HealthyVolantieersImmunizedwillRecombinantHPV-16L1Virus-LikePartiucles,JournalofInfectiousDeseases2003188:327-338;およびGerberetal.,HumanPapillomavriusVirus-LikeParticlesAreEfficientOralImmunogenswhenCoadminsteredwithEscherichiacoliHeatLabileEntertoxinMutantR192GorCpG,JournalofVilology20017510:4752-4760に議論されている。ビロソームは、さらに、例えば、Glucketal.,NewTechnologyPlatformsintheDevelopmentofVaccinesfortheFuture,Vaccine200220:B10-B16に議論されている。免疫増強再構成インフルエンザビロソームIRIVは鼻腔内三価INFLEXALTM製品{MischlerMetcalfe2002Vaccine20Suppl5:B17-23}およびINFLUVACPLUSTM製品においてサブユニット抗原送達系として用いられる。E.細菌または微生物誘導体本発明で用いるのに適したアジュバントは以下のような細菌または微生物誘導体を含む:1腸内細菌リポ多糖LPSの非-毒性誘導体そのような誘導体はMonophosphoryl脂質AMPLおよび3-O-脱アシル化MPL3dMPLを含む。3dMPLは3脱-O-アシル化モノホスホリル脂質Aと4,5または6アシル化鎖との混合物である。3脱-O-アシル化モノホスホリル脂質Aの好ましい小粒子形態はEP0689454に開示されている。3dMPLのそのような小粒子は、0.22ミクロン膜を通って滅菌濾過されるのに十分小さいEP0689454参照。他の非-毒性LPS誘導体はアミノアルキルグルコサミニドリン酸誘導体、例えば、RC-529のようなモノホスホリル脂質Aミミックを含む。Johnsonetal.1999BioorgMedChemLett9:2273-2278参照。2脂質A誘導体脂質A誘導体はOM-174のようなEscherichiacoliからの脂質Aの誘導体を含む。OM-174は、例えば、Meraldietal.,OM-174,aNewAdjuvantwithaPotentialforHumanUse,InducesaProtectiveResponsewithAdministeredwiththeSyntheticC-TerminalFragment242-310fromthecircumsporozoiteproteinofPlasmodiumberghei,Vaccine200321:2485-2491;およびPajak,etal.,TheAdjuvantOM-174inducesboththemigrationandmaturationofmurinedendriticcellsinvivo,Vaccine200321:836-842に記載されている。3免疫刺激オリゴヌクレオチド本発明においてアジュバントとして用いられるのに適した免疫刺激オリゴヌクレオチドは、CpGモチーフ非メチル化シトシン、続いて、グアノシンを含有し、リン酸結合によって連結された配列を含有するヌクレオチド配列を含む。回文またはポリdG配列を含む細菌二本鎖RNAまたはオリゴヌクレオチドもまた免疫刺激性であることが示されている。CpGはホスホロチオエート修飾のようなヌクレオチド修飾/アナログを含むことができ、二本鎖または一本鎖であり得る。所望により、グアノシンは2’-デオキシ-7-デアザグアノシンのようなアナログで置き換えることができる。Kandimalla,etal.,Divergentsyntheticnucleotidemotifrecognitionpattern:designdevelopmentofpotentimmunomodulatoryoligodeoxyribonucleotideagentswithdistinctcytokineinductionprofiles,NucleicAcidsResearch2003319:2393-2400;例えば可能なアナログ置換のWO02/26757およびWO99/62923参照。CpGオリゴヌクレオチドのアジュバント効果は、さらに、Krieg,CpGmotifs:theactiveingredientinbacterialextracts,NatureMedicine200397:831-835;McCluskie,etal.,Parenteralandmucosalprime-boostimmunizationstrategiesinmicewithhepatitisBsurfaceantigenandCbGDNA,FEMSImmunologyandMedicalMicrobiology200232:179-185;WO98/40100;米国特許第6,207,646号;米国特許第6,239,116号および米国特許第6,429,199号に議論されている。CpG配列はモチーフGTCGTTまたはTTCGTTのようなTLR9に向けることができる。Kandimala,etal.,Toll-likereceptor9:ModulationofrecognitionandcytokineinductionbynovelsyntheticCpGDNAS,BiochemicalSocietyTransactions200331part3:654-658参照。CpG配列はCpG-AODNのようにTh1免疫応答を誘導するのに特異的であり得、あるいはそれはCpG-BODNのようにB細胞応答を誘導するのにより特異的であり得る。CpG-AおよびCpG-BODNはBlackwell,etal.,CpG-A-InducedMonocyteIFN-gamma-InducibleProtein-10ProductionisRegulatedbyPlasmacytoidDendriticcellDerivedIFN-alpha,J.Immunol.20031708:4061-4068;Krieg,FromAtoZonCpG,TRENDSinImmunology2002232:64-65およびWO01/95935に議論されている。好ましくは、CpGはCpG-AODNである。好ましくは、CpGオリゴヌクレオチドは、5’末端は受容体認識のためにアクセス可能であるように構築される。所望により、2つのCpGオリゴヌクレオチド配列はそれらの3’末端で結合させて、イミュノマーimmunomerを形成することができる。例えば、Kandimalla,etal.,SecondarystructuresinCpGoligonucleotidesaffectimmunostimulatoryactivity,BBRC2003306:948-953;Kandimalla,etal.,Toll-likereceptor9:modulationofrecognitionandcytokineinductionbynovelsyntheticGpGDNAs,BiochemicalSocietyTransactions200331part3:664-658;Bhagatetal.,CpGpenta-andhexadeoxyribonucleotidesaspotentimmunomodulatoryagentsBBRC2003300:853-861およびWO03/035836参照。4ADP-リボシル化トキシンおよびその解毒された誘導体細菌ADP-リボシル化トキシンおよびその解毒された誘導体は本発明においてアジュバントとして用いることができる。好ましくは、タンパク質はE.coliすなわち、E.coli加熱不安定エンテロトキシンLT、コレラCT、または百日咳PTに由来する。粘膜アジュバントとしての解毒されたADP-リボシル化トキシンの使用はWO95/17211に記載されており、非経口アジュバントとしての使用はWO98/42375に記載されている。好ましくは、アジュバントはLT-K63、LT-R72およびLTR192Gのような解毒されたLT変異体である。アジュバントとしてのADP-リボシル化トキシンおよびその解毒された誘導体、特に、LT-K63およびLT-R72の使用は、その各々が参考としてその全体が本明細書に明確に援用される以下の文献に見出すことができる:Beignon,etal.,TheLTR72MutantofHeart-LabileEnterotoxinofEscherichiacoliEnhancestheAbilityofPeptideAntigenstoElicitCD4TCellsandSecreteGammaInterferonafterCoapplicationontoBareSkin,InfectionandImmunity2002706:3012-3019;Pizza,etal.,Mucosalvaccines:nontoxicderivativesofLTandCTasmucosaladjuvants,Vaccine200119:2534-2541;Pizza,etal,LTK63andLTR72,twomucosaladjuvantsreadyforclinicaltrialsInt.J.Med.Microbiol20002904-5:455-461;Scharton-Kerstenetal.,TranscutaneousImmunizationwithBacterialADP-RibosylatingExotoxins,SubunitsandUnrelatedAdjuvants,InfectionandImmunity2000689:5306-5313;Ryanetal.,MutantsofEscherichiacoliHeart-LabileToxinActasEffectiveMucosalAdjuvantsforNasalDeliveryofanAcellularPertussisVaccine:DefferentialEffectsoftheNontoxicABComplexandEnzymeActivityonTh1andTh2CellsInfectionandImmunity19996712:6270-6280;Partidosetal.,Heart-labileenterotoxinofEscherichiacolianditssite-directedmutantLTK63-enhancetheproliferativeandcytotoxicT-cellresponsestointranasallyco-immunizedsyntheticpeptides,Immunol.Lett.1999673:209-216;Peppolonietal.,MutantsoftheEscherichiacoliheart-labileenterotoxinassafeandstrongadjuvantsforintranasalderiveryofvaccinesVaccines200322:285-293;およびPineetal.,2002IntranasalimmunizationwithinfluenzavaccineandadetoxifiedmutantofheatlabileenterotoxinfromEcsherichiacoliLTK63J.ControlRelease2002851-3:263-270。アミノ酸置換についての数字の言及は、好ましくは、本明細書に参考としてその全体が明確に援用される、Domenighinietal.,Mol.Micirobiol1995156:1165-1167に記載されたADP-リボシル化トキシンのAおよびBサブユニットの整列に基づく。F.バイオ接着剤およびムコ接着剤バイオ接着剤およびムコ接着剤を本発明においてアジュバントとして用いることもできる。適当なバイオ接着剤はエステル化されたヒアルロン酸マイクロスフィアーSinghetal.2001J.Cont.Rele.70:267-276、あるいはポリアクリル酸、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、多糖、およびカルボキシメチルセルロースの架橋された誘導体のような、ムコ接着剤を含む。キトサンおよびその誘導体を本発明のアジュバントとして用いることもできる。例えば、WO99/27960。G.ミクロ粒子ミクロ粒子を本発明においてアジュバントとして用いることもできる。ミクロ粒子すなわち、直径が約100nmないし約150μm、より好ましくは直径が約200nmないし約30μm、最も好ましくは直径が約500nmないし約10μmの粒子は、生分解性で非毒性である物質例えば、ポリα-ヒドロキシ酸、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリアンヒドリド、ポリカプロラクトンなどから形成され、ポリラクチド-コ-グリコリドが好ましく、所望により、例えば、SDSで負に荷電した表面、あるいは例えば、CTABのようなカチオン性洗剤で正に荷電した表面を有するように処理されている。H.リポソームアジュバントとして用いるのに適したリポソーム処方物の例は、米国特許第6,090,406号、米国特許第5,916,588号、およびEP0626169に記載されている。I.ポリオキシエチレンエーテルおよびポリオキシエチレンエステル処方物本発明で用いるのに適したアジュバンドは、ポリオキシエチレンエーテルおよびポリオキシエチレンエステルを含む。WO99/52549。そのような処方物はさらに、オクトキシノールと組み合わせたポリオキシエチレンソルビタンエステル界面活性剤WO01/21207、ならびにオクトキシノールのような少なくとも一つのさらなる非-イオン性界面活性剤と組み合わせたポリオキシエチレンアルキルエーテルまたはエステル界面活性剤WO01/21152を含む。好ましいポリオキシエチレンエーテルは以下の群:ポリオキシエチレン-9-ラウリルエーテルlaureth9、ポリオキシエチレン-9-ステオリルエーテル、ポリオキシエチレン-8-ステオリルエーテル、ポリオキシエチレン-4-ラウリルエーテル、ポリオキシエチレン-35-ラウリルエーテル、およびポリオキシエチレン-23-ラウリルエ-テルから選択される。J.ポリホスファゼンPCPPPCPP処方物は、例えば、Andrianovetal.,Preparationofhydrogelmicrospheresbycoacervationofaqueouspolyphophazenesolutions,Biomatherials1998191-3:109-115およびPayneetal.,ProteinReleasefromPolyphosphazeneMatrices,Adv.Drug.DeliveryReview1998313:185-196に記載されている。K.ムラミルペプチド本発明においてアジュバンドとして用いるのに適したムラミルペプチドの例はN-アセチル-ムラミル-L-スレオニル-D-イソグルタミンthr-MDP、N-アセチル-ノルムラミル-l-アラニル-d-イソグルタミンノル-MDP、およびN-アセチルムラミル-l-アラニル-d-イソグルタミニル-l-アラニン-2-1’-2’-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ヒドロキシホスホリルオキシ-エチルアミンMTP-PEを含む。L.イミダゾキノロン化合物本発明でアジュバントとして用いるのに適したイミダゾキノロン化合の例は、さらに、Stanley,Imiquimodandtheimidazoquinolones:mechanismofactionandtherapiuticpotentialClinExpDermatol2002277:571-577およびJones,Resiquimod3M,CurrOpinInvestigDrugs2003,42:214-218に記載されている、Imiquamodおよびそのホモログを含む。本発明は、前記で同定されたアジュバントの1以上の態様の組合せも含むことができる。例えば、以下のアジュバント組成物を本発明で用いることができる:1サポニンおよび水中油型エマルジョンWO99/11241;2サポニン例えば、QS21非-毒性LPS誘導体例えば、3dMPLWO94/00153参照;3サポニン例えば、QS21非-毒性LPS誘導体3dMPLコレステロール;4サポニン例えば、QS213dMPLIL-12所望によりステロールWO98/57659;5例えば、QS21および/または水中油型エマルジョンと3dMPLの組合せ欧州特許出願0835318、0735898および0761231参照;6サブミクロンエマルジョンにマイクロフルイダイズされたかまたはボルテックスしてvortexより大きな粒子サイズエマルジョンを生じさせた、10スクワレン、0.4Tween80、5プルロニック-ブロックポリマーL121およびthr-MDPを含有するSAF;72スクワレン、0.2Tween80、ならびにモノホスホリル脂質AMPL、トレハロースジミコレートTDM、および細胞壁骨格CWSからなる群からの1以上の細菌細胞壁成分、好ましくはMPLCWSDetoxTMを含有するRibiTMアジュバントシステムRASRibiImmunochem;8アルミニウム塩のような1以上のミネラル塩3dPMLのようなLPSの非毒性誘導体;9アルミニウム塩のような1以上のミネラル塩CpGモチーフを含めたヌクレオチド配列のような免疫刺激オリゴヌクレオチド。組合せ番号9が好ましいアジュバント組合せである。M.ヒト免疫モジュレーター本発明においてアジュバントと用いるのに適したヒト免疫モジュレーターは、インターロイキン例えば、IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12など、インターフェロン例えば、インターフェロン-γ、マクロファージコロニー刺激因子、および腫瘍壊死因子のようなサイトカインを含む。アルミニウム塩およびMF59は注射インフルエンザワクチンで用いる好ましいアジュバントである。細菌トキシンおよびバイオ接着剤は、鼻ワクチンのような粘膜送達ワクチンで用いるための好ましいアジュバントである。本発明の免疫原性組成物は、抗生物質治療養生法と組み合わせて投与することができる。1つの実施形態において、抗生物質は、本発明の抗原、または本発明の1以上の抗原を含む組成物の投与に先立って投与される。もう1つの実施形態において、抗生物質は、本発明の1以上の抗原、または本発明の1以上の抗原を含む組成物の投与に引き続いて投与される。本発明のSteptococcal感染の治療で用いるのに適した抗生物質の例は、限定されるものではないが、ペニシリンまたはその誘導体、あるいはクリンダマイシンなどを含む。さらなる抗原本発明の組成物は、さらに、AIと関連しない1以上のさらなるグラム陽性細菌抗原を含むことができる。好ましくは、AIに関連しないグラム陽性細菌抗原は、1を超える血清型または株単離体にわたる保護を提供することができる。例えば、第一の非-AI抗原は第二の非-AI抗原のアミノ酸配列に対して少なくとも90すなわち、少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100相同であり、第一および第二の非-AI抗原はグラム陽性細菌の異なる血清型のゲノムに由来する、第一の非-AI抗原をさらに組成物に含めることができる。第一の非-AI抗原は、第一の非-AI抗原、第二の非-AI抗原および第三の非-AI抗原がグラム陽性細菌の異なる血清型のゲノムに由来するように、第三の非-AI抗原のアミノ酸配列に対しても相同であり得る。第一の非-AI抗原は、第一の非-AI抗原、第二の非-AI抗原、第三の非-AI抗原、および第四の非-AI抗原がグラム陽性細菌の異なる血清型のゲノムに由来するように、第四の非-AI抗原のアミノ酸配列に対しても相同であり得る。第一の非-AI抗原はGBS322であり得る。血清型Ia、Ib、II、III、VおよびVIIIからのGBS株にわたるGBS322のアミノ酸配列は90を超える。あるいは、第一の非-AI抗原はGBS276であり得る。血清型Ia、Ib、II、III、VおよびVIIIからのGBS株にわたるGBS276のアミノ酸配列は90よりも大きい。表13は、異なるGBS株および血清型にわたるGBS322およびGBS276のパーセントアミノ酸配列同一性を供する。例として、AI抗原GBS67、GBS80、およびGBS104と組み合わせて、非-AIタンパク質GBS322を含めることは、能動先天性免疫アッセイにおける新生マウスに対する保護を提供した。事実、非-AIGBS322抗原は、それ自体、能動先天性免疫アッセイにおいて新生マウスに対する保護を供することができる。かくして、本発明の免疫原性組成物に非-AIタンパク質を含めると、増大した哺乳動物の保護を供することができる。S.pneumonaieAIポリペプチドを含む免疫原性組成物は、さらに、aWO02/077021または2005年4月20日に出願された米国仮出願代理人書類番号002441.00154に開示されたSPタンパク質抗原のいずれか、2少なくとも7つの連続アミノ酸を含む抗原の免疫原性部分、3免疫原性を保有し、かつこれらのSPタンパク質抗原に対して少なくとも95同一例えば、95、96、97、98、99または99.5同一であるアミノ酸配列を含むタンパク質、および41ないし3を含むハイブリッドSPタンパク質抗原を含む融合タンパク質、を含む二次的SPタンパク質抗原を含み得る。あるいは、本発明は、第一および第二のグラム陽性細菌非-AIタンパク質を含む免疫原性組成物を含むことができ、ここに、第一の非-AIタンパク質の配列をコードするポリヌクレオチド配列は、第二の非-AIタンパク質のゲノムにおける対応する配列に90未満すなわち、90、88、86、84、82、81、78、76、74、72、70、65、60、55、50、45、40、35または30パーセント未満相同である。本発明の組成物は、さらに、さらなる細菌、ウイルスまたは寄生虫抗原を含めた1以上のさらなる非-グラム陽性細菌抗原を含むことができる。本発明の組成物は、さらに、さらなる細菌、ウイルスまたは寄生虫抗原を含めた1以上のさらなる非-GBS抗原を含むことができる。もう1つの実施形態では、本発明のGBS抗原組合せは、高齢者または免疫無防備状態の個人を保護するように設計されたワクチンで用いるのに適した1以上のさらなる非-GBS抗原と組み合わされる。例えば、GBS抗原組合せは、Enterococcusfaecalis、Staphylococcusaureus、Staphylococcusepidermis、Pseudomonasaeruginosa、Legionellapneumophila、Listeriamonocytogenes、Neisseriameningitides、インフルエンザ、およびパラインフルエンザウイルスPIVよりなる群に由来する抗原と組み合わせることができる。糖類または炭水化物抗原を用いる場合、それは好ましくは担体タンパク質にコンジュゲートして、免疫原性を増強させる{例えば、Ramsayetal.2001Lancet3579251:195-196;Lindberg1999Vaccine17Suppl2:S28-36;ButteryMoxon2000JRCollPhysiciansLond34:163-168;AhmadChapnick1999InfectDisClinNorthAm13:113-133,vii.;Goldblatt1998J.Med.Microbiol.47:563-567;欧州特許0477508;米国特許第5,306,492号;国際特許出願WO98/42721;ConjugateVaccineseds.Cruseetal.ISBN3805549326、特にvol.10:48ないし114;およびHermanson1996BioconjugateTechniquesISBN:0123423368または012342335X}。好ましい担体タンパク質はジフテリアまたは破傷風トキソイドのような細菌トキシンまたはトキソイドである。CRM197ジフテリアトキソイドが特に好ましい{ResearchDisclosure,453077Jan2002}。他の担体ポリペプチドはN.meningitidis外側膜タンパク質EP-A-0372501、合成ペプチドEP-A-0378881;EP-A-0427347、熱ショックタンパク質WO93/17712;WO94/03208、百日咳タンパク質WO98/58668;EP-A-0471177、H.influenazeからのプロテインDWO00/56360、サイトカインWO91/01146、リンホカイン、ホルモン、成長因子、C.difficileからのトキシンAまたはBWO00/61761、鉄-取り込みタンパク質WO01/72337などを含む。混合物は血清型AおよびC双方からの莢膜糖類を含む場合、MenA糖類:MenC糖類の比率w/wは1よりも大きい例えば、2:1、3:1、4:1、5:1、10:1またはそれよりも高いのが好ましいであろう。異なる糖類を同一または異なるタイプの担体タンパク質にコンジュゲートすることができる。いずれかの適当なコンジュゲーション反応を、必要な場合、いずれかの適当なリンカーと共に用いることができる。毒性タンパク質抗原を必要であれば解毒することができる。例えば、化学的および/または遺伝子的手段による百日咳トキシンの解毒。ジフテリア抗原が組成物に含まれる場合、破傷風抗原および百日咳抗原を含めるのも好ましい。同様に、破傷風抗原を含める場合、ジフテリアおよび百日咳抗原を含めるのも好ましい。同様に、百日咳抗原を含める場合、ジフテリアおよび破傷風抗原を含めるのも好ましい。組成物における抗原は、典型的に、各々少なくとも、1μg/mLの濃度で存在させるであろう。一般には、いずれかの与えられた抗原の濃度は、その抗原に対する免疫応答を誘導するのに十分であろう。本発明の組成物において、タンパク質抗原を用いるのに対する代替法として、抗原をコードする核酸を用いることができる{例えば、refs.RobinsonTorres1997SeminarsinImmunology9:271-283;Donnellyetal.1997AnnuRevImmunol15:617-648;Scott-TaylorDalgleish2000ExpertOpinInvestigDrugs9:471-480;ApostolopoulosPlebanski2000CurrOpinMolTher2:441-447;Ilan1999CurrOpinMolTher1:116-120;Dubenskyetal.2000MolMed6:723-732;RobinsonPertmer2000AdvVirusRes55:1-74;Donnellyetal.2000AmJRespirCritCareMed1624Pt2:S190-193;およびDavis1999Mt.SinaiJ.Med.66:84-90}。本発明の組成物のタンパク質成分は、かくして、タンパク質をコードする核酸好ましくは、例えば、プラスミドの形態のDNAによって置き換えることができる。定義用語を含むcomprisingは、を含めたならびにより成るを意味し、例えば、Xをを含む組成物は専らXよりなることができ、あるいは何か追加のものを含むことができる例えば、XY。数値xに関して用語約は、例えば、x±10を意味する。2つのアミノ酸配列の間のパーセンテージ配列同一性に対する参照は、整列させた場合に、アミノ酸のそのパーセンテージがその2つの配列の比較において同一であることを意味する。この整列およびパーセント相同性または配列同一性は、当該分野で知られたソフトウェアプログラム、例えば、CurrentProtocolsinMolecularBiologyF.M.AusubelEtAl.,eds.,1987Supplement30のセクション7.7.18に記載されたものを用いて決定することができる。好ましい整列は、12のギャップオープンペナルティ、および2のギャップ延長ペナルティ、62のBLOSUMマトリックスでのアフィンaffineギャップサーチを用いるSmith-Waterman相同性サーチアルゴリズムによって決定される。Smith-Waterman相同性サーチアルゴリズムは、SmithWaterman1981Adv.Appl.Math.2:482-489に開示されている。以下の実施例によって、本発明をさらに説明するが、限定するものではない。実施例1:アドヘシンアイランド表面タンパク質、GBS80の、フィブリノーゲンおよびフィブロネクチンへの結合本実施例は、アドヘシンアイランド表面タンパク質、GBS80をフィブリノーゲンおよびフィブロネクチンに結合させることができることを示す。酵素結合免疫吸着検定法ELISAを用いて、ウシ血清アルブミンBSAに対してではなく、固定化された細胞外マトリックスECMタンパク質に対する組換えGBS80のインビトロ結合能力を分析した。マイクロタイタープレートをECMタンパク質フィブリノーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、コラーゲンIV型でコートし、E.coli図5Aから過剰発現され、精製されたGBS80の種々の濃度の組換え形態を加えることによって結合を評価した。次いで、プレートを、順次、aマウス抗GBS80一次抗体;bウサギ抗マウスAP-コンジュゲーテッド2次抗体;cpNPP比色基質と共にインキュベートした。相対的結合は、595nmを参照波長として用い、405nmにおいて吸光度をモニターすることによって測定した。図5bは、GBS80の濃度の関数として、固定化されたECMタンパク質1μgへの組換えGBS80の結合を示す。BSAをネガティブコントロールとして用いた。データ点は、3つのウェルについてのOD405値の平均±標準偏差を表す。テストされたECMタンパク質へのGBS80の結合は、濃度依存的であることが判明し、飽和キネティックスを呈した。図5からも明らかなように、フィブロネクチンおよびフィブリノーゲンへのGBS80の結合は、テストした全ての濃度において、ラミニンおよびコラーゲンIV型への結合よりも大きかった。実施例2:GBS80はGBS104の表面局在化で必要である。本実施例は、GBS80の共発現がGBS104の表面局在化に必要であることを示す。アドヘシンアイランドImRNAのポリシストロニック性質は、連続遺伝子から生起した転写体を検出するように設計されたプライマーを使用して逆転写酵素-PCRRT-PCR分析を介して調べた。全RNAは、製造業者の指示に従って、RNeasy全RNA単離方法Qiagenによって、THBTodd-Hewittブロス中の0.3の600nmにおける光学密度OD600まで増殖させたGBS培養物から単離した。汚染染色体DNAの不存在は、逆転写酵素の不存在下で、アガロースゲル電気泳動によって検出可能な生成物を生じさせるための遺伝子増幅反応の失敗によって確認した。RT-PCR分析は、アニーリングのための60°Cおよび伸長のための70°CのPCRサイクリング温度を使用し、製造業者の指示に従って、AccessRT-PCRシステムPromegaで行った。増幅産物は、臭化エチジウム染色後に、2アガロースゲルにおける100-bpのDNAマーカーと一緒に可視化した。図5は、全ての遺伝子がオペロンとして共転写されることを示す。AI-1オペロンの模式図を、RT-PCR産物のアガロースゲル分析上方に示す。大きな矩形矢印は、予測される転写方向を示す。1-4のようなプライマー対を選択し、それは連続遺伝子の3’終了-5’開始を横切り、少なくとも200bpで各遺伝子と重複する。加えて、1は推定rho-独立転写ターミネーターを横切る。5は内部GBS80コントロールであり、6は高度に発現された遺伝子からの無関係のコントロールである。レーンa:RNARTase酵素;b:RTase無しのRNA;c:ゲノムDNAコントロール。AI-1タンパク質の機能を解明するための努力において、オペロン内の全ての遺伝子のインフレーム欠失は構築されており、得られた変異体は、コードされた抗原の表面露出に関して特徴付けられている図8参照。各インフレーム欠失変異は、適当なプライマーを用い、Hortonetal.[HortonR.M.,Z.L.Cai,S.N.Ho,L.R.Pease1990Biotechniques8:528-35]によって実質的に記載されたスプライス重複伸長PCRSOE-PCRによって構築し、温度感受性シャトルベクターpJRS233にクローン化して、対立遺伝子交換によって野生型コピーを置き換えた[Perez-Casal,J.,J.A.Price,etal.1993MolMicrobiol85:809-19.]。全てのプラスミド構築体は標準分子生物学技術を利用し、PCRによって生じたDNAフラグメントの同一性は、配列決定によって確認した。SOE-PCRに続いて、得られた変異体DNAフラグメントをXhoIおよびEcoRIで消化し、同様に消化されたpJRS233に連結した。得られたベクターは、Framsonetal.[Framson,P.E.,A.Nittayajarn,J.Merry,P.Youngman,andC.E.Rubens.1997Appl.Environ.Microbiol.639:3539-47]に実質的に記載されたように、3-工程プロセスにおいて2603およびCOH1GBS株の染色体へエレクトロポレーションによって導入した。簡単に述べれば、ベクターpJRS233は、エリスロマイシン耐性をコードするerm遺伝子、および37°Cではなく30°Cにおいて活性な温度-感受性グラム陽性レプリコンを含有する。最初に、Framesonetal.によって記載されたように、調製されたGBSエレクトローコンピテント細胞へ構築体をエレクトロポレーションし、1μg/mLのエリスロマイシンを含有するTodd-HewittブロスTHB寒天プレート上で30°Cにおいて増殖するその能力によって、遊離プラスミドを含有する形質転換体を選択する。第二の工程は、プラスミドが、相同プラスミドインサートおよび染色体配列にわたっての単一組換え事象を介して染色体に組み込まれた株についての、1mg/mLのエリスロマイシンを含有するTHB寒天培地で37°Cにて増殖するその能力による選択工程を含む。第三の工程において、染色体内に組み込まれたプラスミドインテグラントを含有するGBS細胞を30°Cにて抗生物質の不存在下でブロス培養にて系列的に継代する。複製された標的遺伝子配列にわたる第二の組換え事象を介する染色体からのプラスミド切り出しは、対立遺伝子交換を完了させるか、あるいは野生型遺伝子型を再構築した。抗生物質選択圧の不存在下でのプラスミドの引き続いての喪失は、エリスロマイシン-感受性表現型をもたらした。遺伝子置換を評価するために、標的遺伝子PCRアンプリコンの分析によって、エリスロマイシン-感受性コロニーのスクリーニングを行った。図7は、アミノ酸配列内の欠失位置と共に、生じた各ノックアウト株についてのIS-1オペロンの模式図を報告する。ここに示したほとんどのデータはCOH1欠失株に関連し、ここに、抗原の各々の発現は、DNAマイクロアレイ分析によればより高くデータは示さず、ならびにFACS分析によって検出可能である図8参照。2603における二重変異体である、Δ80Δ104二重変異体は、示された対立遺伝子の順次の対立遺伝子交換によって構築した。免疫プロトコルFACS実験についての免疫血清は以下のようにして得られた。6ないし7週齢の4匹のCD-1非近交系雌マウスの群CharlesRiverLaboratories,CalcoItalyを、100μLのPBSに懸濁させた選択されたGBS抗原20μgの各組換えGBS抗原で免疫した。各群は0、21および35日に3つの用量を受けた。免疫は、等容量の第一の用量のためのフロイントの完全アジュバントCFAおよび続いての2つの用量のためのフロイントの不完全アジュバントIFAを用いてタンパク質の腹腔内注射を介して行った。各免疫スキームにおいて、陰性および陽性対象群を用いる。免疫応答は、0日および49日に採取された血清試料を用いることによってモニターした。FACS分析パラホルムアルデヒド処理GBS細胞の調製およびそれらのFACS分析は、以下のように行った。GBS血清型COH1株細胞を、ToddHewittブロスTHB;DifcoLaboratories,Detroit,Mich.中でOD600nm=0.5まで増殖させた。培養物を5000rpmにおいて20分間遠心分離し、細菌をPBSで1回洗浄し、0.05パラホルムアルデヒドを含有するPBSに再懸濁し、37°Cにおいて1時間、次いで4°Cにて一晩インキュベートした。50μLの固定された細菌OD6000.1をPBSで1回洗浄し、20ulの新生仔牛血清Sigmaに再懸濁させ、室温にて20分間インキュベートした。次いで、細胞を希釈緩衝液PBS、20新生仔牛血清、0.1BSA中に1:200希釈した100μLのプレ免疫または免疫血清中で4°Cにて1時間インキュベートした。遠心分離、および200μLの洗浄緩衝液PBS中の0.1BSAでの洗浄後に、試料を、緩衝液中に1:100希釈された50μLのR-PhicoeritrienコンジュゲーテッドFab2ヤギ抗マウスIgGJacksonImmunoResearchLaboratories;Inc.と共に4°Cにて1時間インキュベートした。細胞を200μLの洗浄緩衝液で洗浄し、200μLのPBSに再懸濁した。FACSCalibur装置BectonDickinson,MountainView,Calf.を用いて試料を分析し、CellQuestソフトウェアBectonDickinsonを用いてデータを分析した。同一マウスからのプレ免疫血清と比較した>75チャネルの平均蛍光強度におけるシフトは陽性であると考えられた。このカットオフは、空の発現ベクターを有するE.coliの培養物からのモック精製組換えタンパク質に対して生起されたコントロール血清で得られたシフトの平均2標準偏差から決定される。これを各実験に含めた。細菌溶解によるアーチファクトは、その全てが陰性である6つの異なる公知の細胞質タンパク質に対して生起された抗血清を用いて排除した。GBS104およびGBS80についてのCOH1単一KO変異体についてのFACSデータは、GBS80がGBS104の表面局在化で必要であることを示した。図8に示すように、Δ80株においてGBS104は表面露出されていないが第2カラム、下部、全タンパク質抽出物に存在する図10参照。平均シフト値は、GBS104がGBS80表面露出を部分的に担うことGBS80の平均シフトはΔ104において約60野生型レベルまで低下する、およびGBS80は補充された株において過剰発現される平均シフト値約200野生型レベルことを示唆する。Δ80/pGBS80株はシャトル-ベクターpAM401においてクローン化されたGBS80orfを含有するWirth,R.,F.Y.An,etal.1986.JBacteriol1653:831-6。ベクター単独はGBS104の分泌パターンを改変しない右カラム。FACSは、左に示されたマウスポリクローナル抗体にて中期-対数固定細菌で行った。黒色のピークは免疫前血清であり、着色したピークは免疫した動物からの血清である。実施例3:GBS80の欠失はインビボにて減弱化を引き起こす。本実施例中でGBS80の欠失がインビボにて減弱化を引き起こすことを示し、これは、このタンパク質が細菌ビルレンスに寄与することを示唆する。マウス動物モデルを用いることによって、発明者らは、S.agalactiaeのビルレンスにおけるGBS80およびGBS104の役割を研究した。10匹の5ないし6週齢の非近交系雌マウスの群CharlesRiverLaboratories、CalcoItalyに、変異体株を異なる希釈で腹腔内接種し、LD50致死用量50を、ReedおよびMuench[Reed,L.J.andH.Muench1938.TheAmericanJournalofHygiene273:493-7]の方法に従って計算した。以下の表に示すように、Δ80およびΔ80,Δ104二重変異体双方についてカウントしたコロニー形成単位cfuの数は、野生型株と比較した場合に、約10倍高く、これは、GBS104ではなくGBS80の不活化はビルレンスにおける減弱化を担うことを示唆する。この知見は、AI-1におけるGBS80遺伝子はビルレンスに寄与するであろうことを示す。表2603株バックグラウンドにおけるAI-1変異体の致死用量50分析。LD50は、5ないし6週齢における雌CD-1マウスのIP注射によって行った。LD50はReedおよびMuenchの方法によって計算した8。実施例4:表面抗原提示に対するアドヘシンアイランドソルターゼ欠失の効果本実施例は、表面抗原提示に対するアドヘシンアイランドソルターゼ欠失の効果を示す。図9に記載するFACS分析の結果は、ソルターゼSAG0648における欠失が、GBS104が表面に到達するのを妨ぎ、GBS80の表面露出をわずかに低下させたことを示す4番目のパネル;平均シフト値約60野生型COH1。二重ソルターゼノックアウト株において、いずれの抗原も表面露出されなかった最も右側のパネル。いずれのソルターゼ単独も、GBS80が細菌表面に到達するのに十分であった第3および第4のカラム、上部。ΔGBS52株における抗原GBS80またはGBS104の表面露出において効果は見られなかった。精製されたGBS52に由来する抗体はいずれも非-特異的であるか、あるいはGBS52についてFACS陰性であったデータは示さず。FACS分析は前記したように行った実施例2参照。図10に示すように、GBS80の不活化は、GBS104発現に対して効果を有さず、同様に、GBS104ノックアウトは発現されたGBS80の全量を変化させない。抗GBS80抗血清でプローブされた全タンパク質抽出物レーン上方に記載された株のウエスタンブロットはパネルAに示される。矢印はGBS80の予測されたサイズを示す60kDa。GBS80抗体はダブレットを認識し、下方バンドはΔGBS80株に存在しない。パネルBは抗GBS104抗血清でプローブした全タンパク質抽出物のウエスタンブロットを示す。矢印は、GBS104の予測されるサイズを示す99.4kDa。タンパク質抽出物はFACSで用いた同一の細菌培養物から調製した図8および9。結論において、GBS104はFACSによるとΔ80株において表面に到達しないが図8第2カラム、それは全タンパク質調製物においてほぼ野生型レベルで存在するB、第2のレーン。ほぼ20μgの各タンパク質抽出物をレーン当たりにロードした。ウエスタンブロット分析SDSローディング緩衝液1×:60mMTRIS-HClpH6.8、5w/vSDS、10v/vグリセリン、0.1ブロモフェノールブルー、100mMDTTと混合し、95°Cにて5分間沸騰した全タンパク質抽出物のアリコットを12.5SDS-PAGEプレキャストゲルBiorad上にロードした。250mMTRIS、2.5mMグリシンおよび0.1SDSを含有するSDS-PAGE泳動緩衝液を用いてゲルで実行する。ゲルをニトロセルロース膜上に200mAにて60分間電気ブロットする。膜をPBS/0.05Tween-20Sigma、10脱脂粉乳で60分間ブロックし、血清の適当な希釈を含む、PBS/0.05Tween20、1脱脂粉乳と共に4°CにてO/Nインキュベートした。PBS/0.05Tweenで2回洗浄した後、膜を、1:4000希釈したベルオキシダーゼ-コンジュゲーテッド2次抗マウス抗体Amershamと共に2時間インキュベートする。ニトロセルロースをPBS/0.05Tweenで10分間3回、およびPBSで1回洗浄し、その後Opti4-CN基質キットBioradによって発色させる。実施例5:アドヘシンアイランドタンパク質の上皮細胞への結合、および上皮細胞に付着するGBSの能力に対するアドヘシンアイランドタンパク質の効果本実施例は、上皮細胞へのAIタンパク質の結合、および上皮細胞に付着するGBSの能力に対するAIタンパク質の効果を示す。本出願人らは、組換えAI表面タンパク質GBS80またはGBS104が、FACS分析における種々の上皮細胞への結合を示すか否かを分析した。本出願人らは、AI表面タンパク質GBS80またはGBS104の欠失が、ME180頸部上皮細胞に付着し、そこに侵入するGBSの能力に影響するか否かも分析した。図28に示すように、GBS株単離体2603血清型VからのGBS80配列の欠失は、ME180頸部上皮細胞に付着し、それに侵入する変異GBSの能力に影響しなかった。ここに、ME180頸部癌上皮細胞を野生型GBS2603またはGBS2603Δ80同質遺伝子変異体で感染させた。感染から2時間後に非-付着性細菌を洗い流し、さらに2時間および4時間感染を延長させた。侵入実験において、各時点の後、続いて、2時間抗生物質処理を行った。次いで、細胞を1サポニンで溶解させ、溶解物をTSAプレートで平板培養した。図28に示すように、4時間の時点までの野生型および変異体株のパーセント侵入またはパーセント付着の間でほとんど差はなかった。図30は、異なる株単離体からのΔ104およびΔ80変異体双方で、この実験を反復する。ここに、ME180頸部癌上皮細胞をGBS株単離体COH血清型III野生型またはCOH1ΔGBS104またはCOH1Δ80同質遺伝子変異体で感染させた。感染から1時間後に、非-付着性細菌を洗い流し、細胞を1サポニンで溶解させた。溶解物をTSAプレート上で平板培養した。図30に示すように、パーセント侵入にほとんど差は無いが、野生型およびΔ80変異体双方と比較して、Δ104変異体のパーセント会合の有意な減少があった。上皮単層を介して転位するGBSの能力に対するAI表面タンパク質の効果も分析した。図31に示すように、GBS80ノックアウト変異体株は、上皮単層を通じて転位する能力を部分的に喪失する。ここに、上皮単層を、トランスウェルシステムの頂上apicalチャンバーにおいて野生型またはノックアウト変異体と共に2時間インキュベートし、次いで、非-付着性細菌を洗い流した。感染はさらに2時間および4時間の間延長させた。試料を、基底外側の媒質から採取し、コロニー形成単位の数を測定した。感染に先立って、および後に測定された経上皮電気抵抗は同等の値を与え、これは、単層の一体性の維持を示す。6時間の時点までにΔ80変異体は低下したパーセントトランスサイトーシスを示した。同様の実験をGBS104ノックアウト変異体で行った。ここに、図22に示されるようにΔ104変異体は低下したパーセントトランスサイトーシスも示し、これは、変異体株がその同質遺伝子野生型カウンターパートよりも低い効率で、上皮単層を通って転位することを示す。また、本出願人らは、J774マクロファージ-様細胞に侵入するGBS株の能力に対するAIタンパク質の効果を実験した。ここに、J774細胞をGBSCOH1野生型またはCOH1ΔGBS104またはCOH1ΔGBS80同質遺伝子変異体で感染させた。感染の1時間後に、非-付着性細菌を洗い流し、細胞内細菌を抗生物質処理から2時間、4時間および6時間後に回収した。各時点において、細胞を0.25トリトンX-100で溶解させ、溶解物をTSAプレート上で平板培養した。図32に示すように、Δ104変異体は、野生型およびΔ80変異体双方と比較して、有意に低下したパーセント侵入を示した。実施例6:AI表面タンパク質GBS80およびGBS104を含むハイパーオリゴマー構造物本実施例は、AI表面タンパク質GBS80およびGBS104を含むハイパーオリゴマー構造物を説明する。GBS単離体COH1血清型IIIを適合させて、GBS80の発現を増加させた。図34はこの変異体の標準的ネガティブ染色電子顕微鏡写真を示し;線毛またはハイパーオリゴマー構造物は細菌の表面で識別できなかった。EM染色が10または20nmの金粒子で標識された抗GBS80抗体に基づく場合、ハイパーオリゴマー構造物を通じてのGBS80の存在が明瞭に示される図36、37および38。GBS10410nm金粒子で標識された抗GBS104抗体に対するEM染色もまた、主として、細菌の表面に、またはその近くでのGBS104の存在、あるいは潜在的な、細菌ペプチドグリカンとの会合を明らかにする図39。20nm金粒子を用いる抗GBS80および10nm金粒子を用いる抗GBS104の組合せでのGBS80を過剰発現するこの同一株の分析は、表面での、およびハイパーオリゴマー構造物内でのGBS104の存在を明らかにする図40および41参照。実施例7:GBS80はポリマー形成に必要であり、GBS104およびソルターゼSAG0648は効果的な線毛構築で必要である。この実施例は、GBS80がポリマーの形成で必要であり、GBS104およびソルターゼSAG0648が効果的な線毛構築で必要であることを示す。GBS80およびGBS104ポリマー構築は、AI-1における関連コード遺伝子の各々のCoh1株単一ノックアウト変異体において系統的に分析したGBS80、GBS104、GBS52、sag0647およびsag0648。図41は、これらのCoh1、およびCoh1ノックアウト株の各々についての、抗GBS80左側パネル血清または抗GBS104血清右側パネルいずれかでプローブされた全タンパク質抽出物レーン上方に示された株のウエスタンブロットを供するCoh1、野生型Coh1;Δ80、GBS80がノックアウトされたCoh1;Δ104、GBS104がノックアウトされたCoh1;Δ52、GBS52がノックアウトされたCoh1;Δ647、SAG0647がノックアウトされたCoh1;Δ648、SAG0648がノックアウトされたCoh1;Δ647-8、SAG0647およびSAG0648がノックアウトされたCoh1;Δ80/pGBS80、GBS80がノックアウトされたが、GBS80を発現する高コピー数プラスミドを補ったCoh1。星印はGBS80およびGBS104のモノマーを確認する。Δ80およびΔ104変異体におけるその消失と共に、野生型株で観察された免疫反応性の物質のスミアは、そのような高分子量構造物が共有結合により連結されたSDS-耐性GBS80およびGBS104サブユニットから構成されるという考えと合致する。抗GBS80α-GBS80および抗GBS104α-GBS104の双方での免疫ブロッティングは、ソルターゼSAG0648の欠失が高分子量種の構築にやはり干渉し、他方、第二のソルターゼのノックアウト変異体SAG0647が、たとえ幾分低下しても、依然として、ポリマー構造物を形成する能力を維持することを明らかとした。全抽出物形態GBSは以下のようにして調製した。細菌を50mLのTodd-HetittブロスDifco中で0.5ないし0.6のOD600nmまで増殖させ、続いて、ペレット化した。PBS中での2回の洗浄の後、ペレットを再懸濁し、ムタノリシンと共に37°Cにて3時間インキュベートした。次いで、細胞を、ドライアイスおよび37°C浴中で少なくとも3回の凍結-解凍サイクルにて溶解させた。次いで、溶解物を遠心分離して、細胞デブリスを排除し、上清を定量した。ほぼ40μgの各タンパク質抽出物をSDS-PAGEで分離した。次いで、ゲルをマウス抗血清での免疫ブロッティングに付し、化学発光で検出した。実施例8:GBS80はAI-2ソルターゼによって重合する。本実施例は、GBS80がAI-1ソルターゼのみならず、AI-2ソルターゼによって重合することができることを示す。図42は、AI-1を欠くGBS515株の全細胞抽出物イムノブロットを示す。左側パネルは、抗GBS67血清を用いる場合に、AI-2からのGBS67が高分子量複合体に集合させられることを示し、これは、第二の型の線毛の形成を示唆する。GBS80がプラスミドpGBS80内に遺伝子を再導入することによって高度に発現される場合に、同一の高分子量構造物が観察される。同一抽出物上で抗GBS80右側パネル血清を用いることによって、再度、GBS80過剰発現515/pGBS80にて、高分子量構造物が構築されることが観察される。これは、AI-1ソルターゼの不存在下で、AI-2ソルターゼSAG1405およびSAG1406が機能欠如を補うことができ、依然として、線毛構造物に、GBS80を集合させることができることを示唆する。実施例9:Coh1は高分子量分子、GBS80ピリンを生じさせる。本実施例は、Coh1がGBS80ピリンである1000kDaよりも大きな高分子量分子を生じさせることを示す。図43は、Coh1が2つのマクロ分子を生じることを示す銀-染色電気泳動ゲルを供する。これらのマクロ分子の1つはCoh1GBS80ノックアウト細胞において消失するが、Coh1GBS52ノックアウト変異体細胞では消失しない。右側の最後の2つのレーンは、他のレーンでロードした量の15倍でロードした。これを行って、バンドをカウントすることができた。これを行うことによって、一番上のバンドの内輪のサイズ推定は、GBS80モノマーの連続的添加の結果として、240kDaで開始し、14のより高いバンドの各々を考慮することによって計算した。Coh1、野生型Coh1;Δ80、GBS80がノックアウトされたCoh1細胞;Δ52、GBS52がノックアウトされたCoh1細胞;Δ80/pGBS80、GBS80がノックアウトされ、GBS80を発現する高コピー数構築体を補ったCoh1細胞。実施例10:GBS52はGBS線毛の微量成分である。本実施例は、GBS52がGBS線毛に存在し、線毛の微量成分であることを説明する。図45は、GBSCoh1株、およびGBS52についてノックアウトされたGBSCoh1株Δ52からの全細胞抽出物の免疫ブロットを示す。全細胞抽出物は、抗GBS80抗血清左側および抗GBS52抗血清右側で免疫ブロットされた。免疫ブロッティングは、大きな分子量のタンパク質の優れた分離を供する3ないし8トリス-酢酸ポリアクリルアミドゲルInvitrogenを用いて行った図41参照。ゲルを抗GBS80血清と共にインキュベートした場合、Δ52変異体と比較した場合に、Coh1野生型株からのバンドはシフトして出現した。この観察は、2つの株における線毛ポリマー成分の異なるサイズを示した。同一ゲルをストリップし、抗GBS52血清と共にインキュベートした場合、Coh1野生型株における高分子量サブユニットは、左側パネルにおいて対応するレーンでのものと同様な分子サイズを示した。これらの知見は、GBS52が事実、GBS80マクロ-分子構造物に会合するが、GBS線毛の微量成分を表すことを確認した。実施例11:線毛構造物はGBS細菌培養の上清に存在する。本実施例は、Coh1GBSで構築された線毛構造物が細菌細胞培養の上清に存在することを示す。図46は、異なるGBS変異体株の培養からの上清のタンパク質抽出物の免疫ブロットを示す117=Coh1GBS80ノックアウト;159=Coh1GBS104ノックアウト;202=Coh1GBS52ノックアウト;206=Coh1GBSsag0647ノックアウト;208=Coh1GBSsag0648ノックアウト;197=Coh1GBSsag0647sag0648ノックアウト;179=GBS80を発現する高コピープラスミドを補充したCoh1GBS80ノックアウト。GBS80抗血清は、適当なCoh1株における線毛構造物の存在を検出する。タンパク質抽出物は以下のように調製した。細菌をTHB中で0.5ないし0.6のOD600nmまで増殖させ、上清を遠心分離によって細胞から分離した。次いで、上清を濾過しφ0.2μm、タンパク質沈殿のために1mLに60TCAを加えた。GBS線毛をまた、後に記載するように、Coh1株およびそのGBS80ノックアウト変異体における表面-露出タンパク質の画分から抽出した。細菌を50mLのTHBにおいて37°Cで0.6のOD600nmまで増殖させた。細胞をPBSで1回洗浄し、次いで、ペレットを0.1MKPO4pH6.2、40スクロース、10mMMgCl2、400U/mLムタノリシンに再懸濁させ、37°Cにて3時間インキュベートした。プロトプラストを遠心分離によって分離し、上清を取り、そのタンパク質含有量を測定した。異なる増殖相の間の線毛生産のダイナミクスを研究するために、異なるOD600nmにおける培養の1mL上清をTCA沈殿させ、前記したように、3ないし8SDS-PAGEにロードした。図47はGBS80抗血清での対応するウエスタンブロットを示す。レーンの最初の群左側の5つの試料レーンとはCoh1株増殖を言いOD600nmはレーンの上方に示す、他方、レーンの第二の群右側の5つの試料はGBS80を過剰発現するGBS80ノックアウト株からのものである。実験は、線毛マクロ分子構造物は、テストした全ての増殖相における上清で見出すことができることを示す。実施例12:GBS株Coh1において、GBS80およびソルターゼsag0647またはsag0648のみが重合で必要である。本実施例はCoh1における線毛形成の要件を記載する。図48はCoh1クローンでの、抗GBS80血清を用いる前記したように調製された全タンパク質抽出物のウエスタンブロットを示すCoh1、野生型Coh1;Δ104、GBS104についてノックアウトされたCoh1、Δ647、sag0647についてノックアウトされたCoh1、Δ648、sag0648についてノックアウトされたCoh1、Δ647-8、sag0647およびsag0648についてノックアウトされたCoh1;515、AI-1を欠く野生型細菌株515;p80、GBS80を発現する高コピー数プラスミド。データは、二重ソルターゼ変異体のみがGBS80を重合させることができないことを示し、これは、線毛重合についてのconditiosinequanon必要条件が、少なくとも一つのソルターゼとGBS80の共存在であることを示す。この結果は、SAG1405およびSAG1406がこの株において重合を担うという合理的な仮定に導く。実施例13:GBS80はそれ自身のプロモーターおよびターミネーター配列下でL.lactisにおいて発現されることができる。本実施例は、L.laztis、非-病原性細菌がGBS80のようなGBSAI-ポリペプチドを発現できることを示す。L.lactisM1363J.Bacteriol.1541893:1-9を、GBS80をコードする構築体で形質転換した。簡単に述べれば、それ自身のプロモーターおよびターミネーター配列下でGBS80についてコードする遺伝子を含有するDNAフラグメントをプラスミドpAM401にクローニングすることによって構築体を調製したE.coliおよび他のグラム陽性細菌についてのシャトルベクター;J.Bacteriol.1631986:831-836。対数相における形質転換された細菌の全抽出物をSDS-PAGEで分離し、膜に移し、GBS80に対する抗血清と共にインキュベートした。GBS80の分子量に対応するポリペプチドは、GBS80構築体で形質転換されたL.lactisの全抽出物を含有するレーンで検出された。図133Aおよび133B、レーン6および7参照。この同一のポリペプチドは、GBS80構築体で形質転換されなかったL.lactisの全抽出物を含有するレーンで検出されなかった。レーン9。本実施例は、L.lactisがそれ自身のプロモーターおよびターミネーター下でGBS80を発現できることを示す。実施例14:GBS80プロモーターおよびターミネーター配列下でGBSAI-1を発現するように改変されたL.lactisは、ポリマー構造物のGBS80を発現する。本実施例は、GBSAI-1ポリペプチドを発現し、ポリペプチドの少なくとも幾つかをオリゴマーに一体化させるL.lactisの能力を示す。L.lactisを、GBSAI-1ポリペプチドをコードする遺伝子を含有する構築体で形質転換した。簡単に述べると、構築体は、GBS80、GBS52、SAG0647、SAG0648、およびGBS104についての遺伝子を含有するDNAフラグメントを、GBS80プロモーターおよびターミネーター配列下で構築体pAM401にクローン化することによって調製した。構築体をL.lactisM1363に形質転換した。対数相形質転換細菌の全抽出物を還元SDS-PAGEで分離し、膜に移し、GBS80に対する抗血清と共にインキュベートした。GBS80の分子量に対応する分子量を持つポリペプチドは、GBSAI-1コード構築体で形質転換したL.lactisを含むレーンで検出された。図134、レーン2参照。加えて、同一レーンは、GBS80の分子量を有するポリペプチドよりも高い分子量を有するポリペプチドの免疫反応性も示した。これらのより高い分子量のポリペプチドはGBS80のオリゴマーのようである。同様な分子量のオリゴマーは、形質転換されたL.lactisの培養上清のウエスタンブロットでも観察された。図135のレーン4参照。かくして、本実施例は、GBSAI-1を発現するように形質転換されたL.lactisが、線毛の形態のGBS80を効果的に重合することができることを示す。この線毛構造物は、細胞培養上清または細胞抽出物いずれかから精製することができるようである。実施例15:S.pneumoniaeSp0462のクローニングおよび発現本実施例は、Sp0462ポリペプチドをコードするクローンの生産、および該クローンの発現を記載する。Sp0462をコードするクローンを生産するために、全長Sp0462オープンリーディングフレーム配列内でアニールしたプライマーを用い、Sp0462をコードするオープンリーディングフレームを増幅した。図150AはSp0462の893アミノ酸配列を供する。Sp0462ポリペプチドをコードするクローンを生産するのに用いるプライマーを図150Bに示す。これらのプライマーは、図150Aにおいて下線を施すことによって示されたアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列にアニールした。これらのプライマーを用いたSp0462をコードするオープンリーディングフレームの増幅は、図160に供されたアガロースゲルのレーン2に示されたアンプリコンを生じた。Sp0462クローンは893アミノ酸残基Sp0462タンパク質のアミノ酸残基38ないし862をコードする;図150A中のイタリック体の残基を排除した。図151Aは組換えSp0462ポリペプチドの模式図を供した。図151Bは、全長Sp0462ポリペプチドの模式図を示す。該クローンによってコードされる組換えSp0462および全長Sp0462タンパク質双方は、2つのコラーゲン結合タンパク質B型CnaBドメインおよびvonHillebrand因子AvWAドメインを有する。クローン化された組換えSp0462は全長Sp0462タンパク質に存在するLPXTGモチーフを欠く。Sp0462クローンの発現のためのウエスタンブロット分析の結果、S.pneumoniae-感染患者から得られた血清図152AまたはGBS80抗血清図152Bでのポリペプチドの検出をもたらさなかった。実施例16:S.pneumoniaeSp0463のクローニングおよび発現本実施例は、Sp0463ポリペプチドをコードするクローンの生産および該クローンから発現された組換えSp0463ポリペプチドの検出を記載する。Sp0463をコードするクローンを生産するために、全長Sp0463オープンリーディングフレーム配列内でアニールしたプライマーを用い、Sp0463をコードするオープンリーディングフレームを増幅した。図153Aは、Sp0463の665アミノ酸配列を供する。Sp0463ポリペプチドをコードするクローンを生産するのに用いるプライマーを図153Bに示す。これらのプライマーは、図153A中で下線を施すことによって示されるアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列にアニールした。これらのプライマーを用いるSp0463をコードするオープンリーディングフレームの増幅は、図160に供されたアガロースゲルのレーン3に示されたアンプリコンを生じさせた。Sp0463クローンは、665アミノ酸残基Sp0463タンパク質のアミノ酸残基23ないし627をコードし;図153Aにおいてイタリック体の残基を排除した。図154Aは、組換えSp0463ポリペプチドの模式図を供する。図154Bは、全長Sp0463ポリペプチドの模式図を示す。該クローンによってコードされる組換えSp0463、および全長Sp0463タンパク質は共にCnaBドメインおよびEボックスモチーフを有する。クローン化された組換えSp0463は、全長Sp0463タンパク質に存在するLPXTGモチーフを欠如する。Sp0463クローンの発現の結果、60kDポリペプチド、組換えSp0463ポリペプチドの予測される分子量の、ウエスタンブロット分析による検出がもたらされた。図155参照。実施例17:S.pneumoniaeSp0464のクローニングおよび発現本実施例は、Sp0464ポリペプチドをコードするクローンの生産、および該クローンから発現された組換えSp0464ポリペプチドの検出を記載する。Sp0464をコードするクローンを生産するために、全長Sp0464オープンリーディンクフレーム配列内にアニールしたプライマーを用い、Sp0464をコードするオープンリーディングフレームを増幅した。図157Aは、Sp0464の393アミノ酸配列を供する。Sp0464ポリペプチドをコードするクローンを生産するのに用いるプライマーを図157Bに示す。これらのプライマーは、図157A中で下線を施すことによって示されるアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列にアニールした。これらのプライマーを用いるSp0464をコードするオープンリーディングフレームの増幅は、図160に供されるアガロースゲルのレーン4において示されるアンプリコンを生じた。Sp0464クローンは393アミノ酸残基Sp0464タンパク質のアミノ酸残基19ないし356をコードし;図157Aにおけるイタリック体残基を排除した。図158Aは組換えSp0464ポリペプチドの模式図を供する。図158Bは、全長Sp0464ポリペプチドの模式図を示す。該クローンによってコードされる組換えSp0464および全長Sp0464タンパク質は共に2つのCnaBドメインを有する。クローン化された組換えSp0464は、全長Sp0464タンパク質に存在するLPXTGモチーフを欠如する。Sp0464クローンの発現の結果、ウエスタンブロット分析による、38kDポリペプチド、組換えSp0464ポリペプチドの予測される分子量の検出がもたらされた。図159参照。実施例18:GBS80を発現する組換えL.lactisでのマウスの鼻腔内免疫および引き続いてのチャレンジ本実施例は、GBS80を発現するL.lactisを用いてマウスを鼻腔内免疫する方法を記載する。鼻腔内免疫は0、14および28日目における3つの用量よりなるものであり、各用量は3連続日で投与した。各日において、3匹の6ないし7週齢のCD-1非近交系雌マウスの群CharlesRiverLaboratories,CalcoItalyを、20μLのPBSに懸濁させた109または1010CFUの組換えLactococcuslactisで鼻腔内免疫した。各免疫スキームにおいて、陰性野生型L.lactisおよび陽性組換えGBS80コントロール群を用いた。雌親の免疫応答は、0および49日目に採取した血清試料を用いることによってモニターした。雌マウスを最後の免疫の2ないし7日後に交配させほぼt=36ないし37、それは、典型的には、21日の妊娠期間を有した。誕生から48時間以内に、PBSコントロール群から集めた経験的なデータによって判断されるように免疫された仔マウスの90を殺すのに十分であろう量とほぼ同等な用量にてGBSで仔マウスをI.P.を介してチャレンジした。GBSチャレンジ用量は、好ましくは、50mLのTHB培地において投与される。好ましくは、仔マウスチャレンジは最初の免疫から56ないし61日後に行われる。チャレンジ接種物は、使用に先立って、THBで適当な濃度まで希釈された凍結培養物から出発して調整した。仔マウスの生存は、チャレンジから5日後にモニターした。実施例19:GBS80を発現する組換えL.lactisでのマウスの皮下免疫、および引き続いてのチャレンジ本実施例は、GBS80を発現するL.lactisを用いるマウスの皮下免疫の方法を記載する。皮下免疫は0、14および28日目における3用量よりなるものであった。3匹の6ないし7週齢のCD-1非近交系雌マウスの群CharlesRiverLaboratories,CalcoItalyに、100μLのPBSに懸濁させた109または1010CFUの組換えLactococcuslactisを皮下注射した。各免疫スキームにおいて、陰性野生型L.lactisおよび陽性組換えGBS80コントロール群を用いた。雌親の免疫応答は、0および49日目に採取された血清試料を用いることによってモニターした。雌マウスをほぼt=36ないし37において最後の免疫から2ないし7日後に交配させ、典型的には、21日の妊娠期間を有した。誕生から48時間以内に、PBSコントロール群から集めた経験的なデータによって判断して免疫仔マウスの90を殺すのに十分な量とほぼ同等の用量にて、仔マウスをGBSでI.P.を介してチャレンジした。GBSチャレンジ用量は好ましくは、50mLのTHB培地において投与する。好ましくは、仔マウスチャレンジは最初の免疫から56ないし61日後に行う。チャレンジ接種物は、使用に先立って、THBで適当な濃度に希釈された凍結培養物から出発して調製した。仔マウスの生存はチャレンジ後5日間モニターした。実施例20:GASAIポリペプチドでのマウスの免疫および引き続いての鼻腔内チャレンジ本実施例は、GASAIポリペプチドでマウスを免疫し、引き続いて、該マウスをGAS細菌で鼻腔内チャレンジする方法を記載する。6~7週齢の10匹のCD1雌マウスの群を、100μLの適当な溶液に懸濁させた、本発明GAS15、GAS16およびGAS18のGAS抗原の組合せ15μgの、M1株SF370に由来する各組換え抗原、またはM1株SF370アドへシンアイランドを発現するL.lactisで免疫した。各群は0、21および45日目に3用量を受ける。免疫は、GAS15、GAS16、GAS18タンパク質組合せについて皮下または腹腔内注射を介して行われる。タンパク質組合せは、等容量の最初の用量のためのフロイントの完全アジュバントCFA、および続く2つの用量のためのフロイントの不完全アジュバントIFAと共に投与する。免疫は、M1株SF370アドヘシンアイランドを発現するL.lactisについては鼻腔内で行う。各免疫スキームにおいて、ネガティブコントロール群およびポジティブコントロール群を用いる。GAS15、GAS16、GAS18タンパク質組合せで免疫されたマウスについてのネガティブコントロール群は、PBSで免疫されたマウスを含んだ。M1株SF370アドヘシンアイランドを発現するL.lactisで免疫されたマウスについてのネガティブコントロール群は、野生型L.lactis、あるいはいずれかのクローン化されたアドヘシンアイランド配列を欠如するpAM401発現ベクターで形質転換されたL.lactisいずれかで免疫されたマウスを含んだ。ポジティブコントロール群は、精製されたM1株SF370Mタンパク質で免疫されたマウスを含んだ。次いで、免疫されたマウスをゾレチルZoletilで麻酔し、THB中の1.2×106または1.2×108CFUのISS3348を含有する25μL懸濁液で鼻腔内チャレンジする。動物を毎日観察し、生存についてチェックする。実施例21:能動先天性免疫アッセイ本明細書中で用いるように、能動先天性免疫アッセイは、インビボ保護アッセイをいい、そこでは、雌マウスをテスト抗原組成物で免疫する。次いで、雌マウスを交配させ、その仔をGBSの致死用量でチャレンジする。免疫スケジュールの間の雌マウスの血清力価を測定し、ならびにチャレンジ後の仔の生存時間を測定する。マウス免疫具体的には、4匹の6ないし8週齢CD-1非近交系雌マウスの群CharlesRiverLaboratories,CalcoItalyを、100μLのPBSに懸濁させた、1以上のGBS抗原20μgの各組換えGBS抗原で免疫する。各群は0、21および35日目に3つの用量を受ける。免疫は、等容量の最初の用量のためのフロイントの完全アジュバントCFA、および続いての2つの用量のためのフロイントの不完全アジュバントIFAを用いて、タンパク質の腹腔内注射を介して行う。各免疫スケジュールにおいて、ネガティブコントロール群およびポジティブコントロール群が用いられる。免疫応答は0および49日目に採取された血清試料を用いることによってモニターする。血清はマウスの各群からのプールとして分析する。能動先天性免疫GBS感染の先天性免疫/新生仔チャレンジモデルを用いて、マウスにおける抗原の保護効率を確認した。マウス保護実験はRodewaldetal.Rodewaldetal.J.Infect.Diseases166:6351992から適合させた。簡単に述べれば、CD-1雌マウス6ないし8週齢を、前記したように、交配前に免疫した。マウスは単一抗原で免疫する場合に用量当たり20μgのタンパク質を受け、抗原の組合せで免疫する場合には用量当たり60μgのタンパク質15μgの各抗原を受けた。最後の免疫から2ないし7日後にマウスを交配させた。誕生から48時間以内に、仔マウスに50μLのGBS培養物を腹腔内注射した。チャレンジ接種物は、使用前にTHBで適当な濃度に希釈された凍結培養物から出発して調製した。予備的な実験示さずにおいては、テストした各株についての仔マウス当たりのチャレンジ用量は、90致死を引き起こすと判断された。仔マウスの生存は、チャレンジ後2日間モニターした。保護は、パーセンテージ死亡コントロールからパーセンテージ死亡ワクチンを差し引き、パーセンテージ死亡コントロールで割り、100を掛けて計算した。データは、フィッシャーの正確検定によって統計学的有意性について評価した。本発明の実施形態本発明は、以下に列挙される実施形態を包含するが、これらに限定はされない。1オリゴマー形態の精製B群連鎖球菌GBSアドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。2上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-1から選択される、実施形態1に記載の免疫原性組成物。3上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-2から選択される、実施形態1に記載の免疫原性組成物。1オリゴマー形態の精製B群連鎖球菌GBSアドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。2上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-1から選択される、実施形態1に記載の免疫原性組成物。3上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-2から選択される、実施形態1に記載の免疫原性組成物。4上記GBSAIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態1~3のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物。5上記ソルターゼ基質モチーフが、LPXTGモチーフである、実施形態4に記載の免疫原性組成物。6上記LPXTGモチーフが、アミノ酸配列XPXTGにより示され、アミノ酸1位にあるXが、L、I、またはFであり、アミノ酸3位にあるXが、任意のアミノ酸残基である、実施形態5に記載の免疫原性組成物。7実施形態1~3のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞に付着する能力に影響を与える、免疫原性組成物。8実施形態1~3のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞に侵入する能力に影響を与える、免疫原性組成物。9実施形態1~3のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与える、免疫原性組成物。10実施形態1~3のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、上皮細胞表面に会合可能である、免疫原性組成物。11実施形態10に記載の免疫原性組成物であって、上記上皮細胞表面との会合は、当該上皮細胞表面に対する結合である、免疫原性組成物。12実施形態1~3のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、全長GBSAIタンパク質である、免疫原性組成物。13実施形態1~3のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、全長GBSAIタンパク質のフラグメントである、免疫原性組成物。14実施形態13に記載の免疫原性組成物であって、上記フラグメントは、上記GBSAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、免疫原性組成物。15上記GBSAIポリペプチドが、GBS80、GBS104、GBS52およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態2に記載の免疫原性組成物。16上記GBSAIポリペプチドが、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態3に記載の免疫原性組成物。17上記GBSAIポリペプチドが、GBS80である、実施形態15に記載の免疫原性組成物。18上記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、実施形態1~3または15~17のうちのいずれかに記載の免疫原性組成物。19実施形態1~3または15~17のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、AIと会合していないグラム陽性細菌抗原をさらに含む、免疫原性組成物。20実施形態19に記載の免疫原性組成物であって、上記抗原は、GBS322およびGBS276からなる群より選択される、免疫原性組成物。21実施形態20に記載の免疫原性組成物であって、上記抗原は、GBS322である、免疫原性組成物。22オリゴマー形態の精製グラム陽性細菌アドヘシンアイランドAIポリペプチドを含む、免疫原性組成物。23上記グラム陽性細菌が、連鎖球菌属、エンテロコッカス属、ブドウ球菌属、またはリステリア属からなる群より選択される属の細菌である、実施形態22に記載の免疫原性組成物。24上記グラム陽性細菌が、連鎖球菌属の細菌である、実施形態23に記載の免疫原性組成物。25上記グラム陽性細菌AIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態22~24のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物。26上記ソルターゼ基質モチーフが、LPXTGモチーフである、実施形態25に記載の免疫原性組成物。27実施形態22~24のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、グラム陽性細菌が上皮細胞に付着する能力に影響を与える、免疫原性組成物。28実施形態22~24のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、グラム陽性細菌が上皮細胞に侵入する能力に影響を与える、免疫原性組成物。29実施形態22~24のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、グラム陽性細菌が上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与える、免疫原性組成物。30実施形態22~24のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、上皮細胞表面に会合可能である、免疫原性組成物。31実施形態30に記載の免疫原性組成物であって、上記上皮細胞表面との会合は、当該上皮細胞表面に対する結合である、免疫原性組成物。32実施形態22~24のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、全長グラム陽性細菌AIタンパク質である、免疫原性組成物。33実施形態22~24のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、全長グラム陽性細菌AIタンパク質のフラグメントである、免疫原性組成物。34実施形態33に記載の免疫原性組成物であって、上記フラグメントは、グラム陽性細菌AIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、免疫原性組成物。35実施形態24に記載の免疫原性組成物であって、上記連鎖球菌属細菌は、A群連鎖球菌GAS細菌であり、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、GASAIポリペプチドである、免疫原性組成物。36実施形態35に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、GASAI-Iから選択される、免疫原性組成物。37上記GASAIポリペプチドが、GASAI-2から選択される、実施形態35に記載の免疫原性組成物。38上記GASAIポリペプチドが、GASAI-3から選択される、実施形態35に記載の免疫原性組成物。39上記GASAIポリペプチドが、GASAI-4から選択される、実施形態35に記載の免疫原性組成物。40上記GBSAIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態35~39のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物。41上記ソルターゼ基質モチーフが、LPXTGモチーフである、実施形態40に記載の免疫原性組成物。42実施形態41に記載の免疫原性組成物であって、上記LPXTGモチーフは、XXXXGにより示され、1番目のアミノ酸位置にあるXは、L、V、E、またはQであり、2番目のアミノ酸位置にあるXは、1番目のアミノ酸位置にあるXがLの場合にPであり、2番目のアミノ酸位置にあるXは、1番目のアミノ酸位置にあるXがEまたはQの場合にVであり、あるいは2番目のアミノ酸位置にあるXは、1番目のアミノ酸位置にあるXがVの場合にVまたはPであり、3番目のアミノ酸位置にあるXは、任意のアミノ酸残基であり、4番目のアミノ酸位置にあるXは、1番目のアミノ酸位置にあるXがV、E、またはQの場合にTであり、あるいは4番目のアミノ酸位置にあるXは、1番目のアミノ酸位置にあるXがLの場合にT、S、またはAである、免疫原性組成物。43実施形態35~39のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、GAS細菌が上皮細胞に付着する能力に影響を与える、免疫原性組成物。44実施形態35~39のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、GAS細菌が上皮細胞に侵入する能力に影響を与える、免疫原性組成物。45実施形態35~39のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、GAS細菌が上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与える、免疫原性組成物。46実施形態35~39のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、上皮細胞表面に会合可能である、免疫原性組成物。47実施形態46に記載の免疫原性組成物であって、上記上皮細胞表面との会合は、当該上皮細胞表面に対する結合である、免疫原性組成物。48実施形態35~39のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、全長GASAIタンパク質である、免疫原性組成物。49実施形態35~39のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAIポリペプチドは、全長GASAIタンパク質のフラグメントである、免疫原性組成物。50実施形態49に記載の免疫原性組成物であって、上記フラグメントは、上記GASAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、免疫原性組成物。51実施形態36に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAI-1ポリペプチドは、M6_Spy0157、M6_Spy0159、M6_Spy0160、CDCSS410_fimbrial、ISS3650_fimbrial、DSM2071_fimbrial、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。52実施形態37に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAI-2ポリペプチドは、GAS15、GAS16、GAS18、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。53請求項38に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAI-3ポリペプチドは、SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0102、SPs0104、SPs0106、orf78、orf80、orf82、orf84、SpyM18_0126、SpyM18_0128、SpyM18_0130、SpyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_fimbrial、ISS3776_fimbrial、ISS4959_fimbrial、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。53実施形態39に記載の免疫原性組成物であって、上記GASAI-4ポリペプチドは、19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_fimbrial、20020069_fimbrial、CDCSS635_fimbrial、ISS4883_fimbrial、ISS4538_fimbrial、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。54実施形態24に記載の免疫原性組成物であって、上記連鎖球菌属細菌は、肺炎連鎖球菌Streptococcuspneumoniaeであり、上記グラム陽性細菌AIポリペプチドは、S.pneumoniaeAIポリペプチドである、免疫原性組成物。55実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、ソルターゼ基質モチーフを含む、免疫原性組成物。56実施形態55に記載の免疫原性組成物であって、上記ソルターゼ基質モチーフは、LPXTGモチーフである、免疫原性組成物。57実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、S.pneumoniaeが上皮細胞に付着する能力に影響を与える、免疫原性組成物。58実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、S.pneumoniaeが上皮細胞に侵入する能力に影響を与える、免疫原性組成物。59実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、S.pneumoniaeが上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与える、免疫原性組成物。60実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、上皮細胞表面と会合可能である、免疫原性組成物。61実施形態60に記載の免疫原性組成物であって、上記上皮細胞表面との会合は、当該上皮細胞表面に対する結合である、免疫原性組成物。62実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、全長S.pneumoniaeAIタンパク質である、免疫原性組成物。63実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、全長S.pneumoniaeAIタンパク質のフラグメントである、免疫原性組成物。64実施形態63に記載の免疫原性組成物であって、上記フラグメントは、上記S.pneumoniaeAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、免疫原性組成物。65実施形態54に記載の免疫原性組成物であって、上記S.pneumoniaeAIポリペプチドは、SP0462、SP0463、SP0464、orf3_670、orf4_670、orf5_670、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。66実施形態22~24、35~39、51~54、または65のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである、免疫原性組成物。67実施形態22~24、35~39、51~54、または65のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、AIと会合していないグラム陽性細菌抗原をさらに含む、免疫原性組成物。68実施形態67に記載の免疫原性組成物であって、上記抗原は、GBS322およびGBS276からなる群より選択される、免疫原性組成物。69第一および第二のB群連鎖球菌GBSアドヘシンアイランドAIポリペプチドを含有する、免疫原性組成物。70実施形態69に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドをコードする全長ポリヌクレオチド配列は、上記第二のGBSAIポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むGBS細菌ゲノム中には存在しない、免疫原性組成物。71実施形態69に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドをコードするポリヌクレオチドおよび第二のGBSAIポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、各々、1種よりも多い数のGBS血清型および単離株のゲノム中に存在する、免疫原性組成物。72実施形態69に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-1によりコードされる、免疫原性組成物。73実施形態69に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-2によりコードされる、免疫原性組成物。74実施形態72に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-2によりコードされる、免疫原性組成物。75実施形態73に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-2によりコードされる、免疫原性組成物。76実施形態72に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-1によりコードされる、免疫原性組成物。77実施形態73に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBSAI-1によりコードされる、免疫原性組成物。78実施形態72に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS80、GBS104、GBS52およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、免疫原性組成物。79上記第一のGBSAIポリペプチドが、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態73に記載の免疫原性組成物。80実施形態74または75に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524およびそれらのフラグメントからなる群より選択され、上記第一のGBSAIポリペプチドと上記第二のGBSAIポリペプチドとは、同じポリペプチドではない、免疫原性組成物。81実施形態76または77に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBS80、GBS104、GBS52およびそれらのフラグメントからなる群より選択され、上記第一のGBSAIポリペプチドと上記第二のGBSAIポリペプチドとは、同じポリペプチドではない、免疫原性組成物。82実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記GBSAIポリペプチドは、ソルターゼ基質モチーフを含む、免疫原性組成物。83上記ソルターゼ基質モチーフが、LPXTGモチーフである、実施形態82に記載の免疫原性組成物。84上記LPXTGモチーフが、配列XPXTGにより示され、アミノ酸1位にあるXが、L、I、またはFであり、アミノ酸3位にあるXが、任意のアミノ酸残基である、実施形態83に記載の免疫原性組成物。85実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞に付着する能力に影響を与える、免疫原性組成物。86実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞に侵入する能力に影響を与える、免疫原性組成物。87実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS細菌が上皮細胞層を通って転位する能力に影響を与える、免疫原性組成物。88実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、上皮細胞表面に会合可能である、免疫原性組成物。89実施形態88に記載の免疫原性組成物であって、上記上皮細胞表面との会合は、当該上皮細胞表面に対する結合である、免疫原性組成物。90実施形態69~77のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、全長GBSAIタンパク質である、免疫原性組成物。91実施形態69~77のうちのいずれかの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、全長GBSAIタンパク質のフラグメントである、免疫原性組成物。92実施形態91に記載の免疫原性組成物であって、上記フラグメントは、上記第一のGBSAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、免疫原性組成物。93実施形態69~79のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、オリゴマー形態である、免疫原性組成物。94実施形態69~77のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第二のGBSAIポリペプチドは、オリゴマー形態である、免疫原性組成物。95実施形態69~79のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドと上記第二のGBSAIポリペプチドとは、1つのオリゴマー形態で会合している、免疫原性組成物。96実施形態95に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドと上記第二のGBSAIポリペプチドとは、化学的に会合している、免疫原性組成物。97実施形態95に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドと上記第二のGBSAIポリペプチドとは、物理的に会合している、免疫原性組成物。98実施形態93に記載の免疫原性組成物であって、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである、免疫原性組成物。99実施形態94に記載の免疫原性組成物であって、上記オリゴマー形態は、ハイパーオリゴマーである、免疫原性組成物。100実施形態76に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS80であり、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBS104である、免疫原性組成物。101実施形態74に記載の免疫原性組成物であって、上記第一のGBSAIポリペプチドは、GBS80であり、上記第二のGBSAIポリペプチドは、GBS67である、免疫原性組成物。102実施形態69~79、100、または101のうちのいずれか1つの実施形態に記載の免疫原性組成物であって、AIと会合していないGBSポリペプチドをさらに含む、免疫原性組成物。103実施形態102に記載の免疫原性組成物であって、上記AIと会合していないGBSポリペプチドは、GBS322およびGBS276からなる群より選択される、免疫原性組成物。104実施形態103に記載の免疫原性組成物であって、上記AIと会合していないGBSポリペプチドは、GBS322である、免疫原性組成物。105第一および第二のグラム陽性細菌アドヘシンアイランドAIポリペプチドを含む、免疫原性組成物。106上記第一のグラム陽性細菌AIポリペプチドをコードする全長ポリヌクレオチド配列が、上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドをコードする全長ポリヌクレオチド配列を含むグラム陽性細菌のゲノムに存在しない、実施形態105に記載の免疫原性組成物。107上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが、それぞれ1つより多いグラム陽性細菌血清型および株単離体のゲノムに存在する、実施形態105に記載の免疫原性組成物。108上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、異なるグラム陽性細菌種のものである、実施形態105に記載の免疫原性組成物。109上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、同一のグラム陽性細菌種のものである、実施形態105に記載の免疫原性組成物。110上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、異なるAIサブタイプに由来する、実施形態105に記載の免疫原性組成物。111上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、同一のAIサブタイプに由来する、実施形態105に記載の免疫原性組成物。112上記第一のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、この第一のグラム陽性細菌株または血清型上に検出可能な表面露出を有するが、これは上記第二のグラム陽性細菌株上にも血清型上にも検出可能な表面露出を有さず、かつ上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、この第二のグラム陽性細菌株または血清型上に検出可能な表面露出を有するが、これは上記第一のグラム陽性細菌株上にも血清型上にも検出可能な表面露出を有さない、実施形態105に記載の免疫原性組成物。113上記グラム陽性細菌が、S.pneumonaie、S.mutans、E.faecalis、E.faecium、C.difficile、L.monocytogenesまたはC.diphtheriaeである、実施形態105に記載の免疫原性組成物。114上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態105~113のいずれかに記載の免疫原性組成物。115上記ソルターゼ基質モチーフがLPXTGモチーフである、実施形態114に記載の免疫原性組成物。116上記LPXTGモチーフがXXXXGにより表され、ここでアミノ酸位置1のXは、L、V、E、I、FまたはQであり、アミノ酸位置1のXがL、IまたはFである場合に、アミノ酸位置2のXはPであり、アミノ酸位置1のXがEまたはQである場合に、アミノ酸位置2のXはVであり、アミノ酸位置1のXがVである場合に、アミノ酸位置2のXはVまたはPであり、アミノ酸位置3のXは、任意のアミノ酸残基であり、ならびにアミノ酸位置1のXがV、E、I、FまたはQである場合に、アミノ酸位置4のXはTであり、アミノ酸位置1のXがLである場合に、アミノ酸位置4のXはT、SまたはAである、実施形態115に記載の免疫原性組成物。117上記第一のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、第一のA群連鎖球菌GASAIポリペプチドである、実施形態105に記載の免疫原性組成物。118上記第一のGASAIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態117に記載の免疫原性組成物。119上記ソルターゼ基質モチーフがLPXTGモチーフである、実施形態118に記載の免疫原性組成物。120上記LPXTGモチーフがXXXXGにより表され、ここで、一番目のアミノ酸位置のXがL、V、EまたはQであり、一番目のアミノ酸位置のXがLである場合に、二番目のアミノ酸位置のXはPであり、一番目のアミノ酸位置のXがEまたはQである場合に、二番目のアミノ酸位置のXはVであり、あるいは、一番目のアミノ酸位置のXがVである場合に、二番目のアミノ酸位置のXはVまたはPであり、三番目のアミノ酸位置のXは任意のアミノ酸残基であり、ならびに一番目のアミノ酸位置のXがV、EまたはQである場合に、四番目のアミノ酸位置のXはTであり、あるいは、一番目のアミノ酸位置のXがLである場合に、四番目のアミノ酸位置のXはT、SまたはAである、実施形態119に記載の免疫原性組成物。121上記第一のGASAIポリペプチドが、上皮細胞に付着するGAS細菌の能力に影響を与える、実施形態117に記載の免疫原性組成物。122上記第一のGASAIポリペプチドが、上皮細胞に侵入するGAS細菌の能力に影響を与える、実施形態117に記載の免疫原性組成物。123上記第一のGASAIポリペプチドが、上皮細胞層を通って転位するGAS細菌の能力に影響を与える、実施形態117に記載の免疫原性組成物。124上記第一のGASAIポリペプチドが上皮細胞表面に会合し得る、実施形態117に記載の免疫原性組成物。125上記の上皮細胞表面との会合が、この上皮細胞表面への結合である、実施形態117に記載の免疫原性組成物。126上記第一のGASAIポリペプチドが、全長GASAIタンパク質である、実施形態117に記載の免疫原性組成物。127上記第一のGASAIポリペプチドが、全長GASAIタンパク質のフラグメントである、実施形態117に記載の免疫原性組成物。128上記フラグメントが、上記GASAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、実施形態127に記載の免疫原性組成物。129上記第一のGASAIポリペプチドが第一のGASAI-1ポリペプチドである、実施形態117に記載の免疫原性組成物。130上記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-2ポリペプチドである、実施形態117に記載の免疫原性組成物。131上記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-3ポリペプチドである、実施形態117に記載の免疫原性組成物。132上記第一のGASAIポリペプチドが、第一のGASAI-4ポリペプチドである、実施形態117に記載の免疫原性組成物。133上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、第二のGASAIポリペプチドである、実施形態117または129~132のいずれか一つに記載の免疫原性組成物。134上記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-1ポリペプチドである、実施形態133に記載の免疫原性組成物。135上記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-2ポリペプチドである、実施形態133に記載の免疫原性組成物。136上記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-3ポリペプチドである、実施形態133に記載の免疫原性組成物。137上記第二のGASAIポリペプチドが、第二のGASAI-4ポリペプチドである、実施形態133に記載の免疫原性組成物。138上記第一のGASAI-1ポリペプチドが、M6_Spy0157、M6_Spy0159、M6_Spy0160、CDCSS410_線毛、ISS3650_線毛、DSM2071_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態129に記載の免疫原性組成物。139上記第一のGASAI-2ポリペプチドが、GAS15、GAS16、GAS18、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態130に記載の免疫原性組成物。140上記第一のGASAI-3ポリペプチドが、SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0102、SPs0104、SPs0106、orf78、orf80、orf82、orf84、spyM18_0126、spyM18_0128、spyM18_0130、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_線毛、ISS3776_線毛、ISS4959_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態131に記載の免疫原性組成物。141上記第一のGASAI-4ポリペプチドが、19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、ISS4538_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態132に記載の免疫原性組成物。142上記第二のGASAI-1ポリペプチドが、M6_Spy0157、M6_Spy0159、M6_Spy0160、CDCSS410_線毛、ISS3650_線毛、DSM2071_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態134に記載の免疫原性組成物。143上記第二のGASAI-2ポリペプチドが、GAS15、GAS16、GAS18、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態135に記載の免疫原性組成物。144上記第二のGASAI-3ポリペプチドが、SpyM3_0098、SpyM3_0100、SpyM3_0102、SpyM3_0104、SPs0100、SPs0102、SPs0104、SPs0106、orf78、orf80、orf82、orf84、spyM18_0126、spyM18_0128、spyM18_0130、spyM18_0132、SpyoM01000156、SpyoM01000155、SpyoM01000154、SpyoM01000153、SpyoM01000152、SpyoM01000151、SpyoM01000150、SpyoM01000149、ISS3040_線毛、ISS3776_線毛、ISS4959_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態136に記載の免疫原性組成物。145上記第二のGASAI-4ポリペプチドが、19224134、19224135、19224137、19224139、19224141、20010296_線毛、20020069_線毛、CDCSS635_線毛、ISS4883_線毛、ISS4538_線毛、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態137に記載の免疫原性組成物。146上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、B群連鎖球菌GBSAIポリペプチドである、実施形態117~132または138~141のいずれか一つに記載の免疫原性組成物。147上記GBSAIポリペプチドがソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態146に記載の免疫原性組成物。148上記ソルターゼ基質モチーフがLPXTGモチーフである、実施形態147に記載の免疫原性組成物。149上記LPXTGモチーフがアミノ酸配列XPXTGにより表され、ここで、アミノ酸位置1のXがL、IまたはFであり、アミノ酸位置3のXが任意のアミノ酸残基である、実施形態148に記載の免疫原性組成物。150上記GBSAIポリペプチドが、上皮細胞に付着するGBS細菌の能力に影響を与える、実施形態146に記載の免疫原性組成物。151上記GBSAIポリペプチドが、上皮細胞に侵入するGBS細菌の能力に影響を与える、実施形態146に記載の免疫原性組成物。152上記GBSAIポリペプチドが、上皮細胞層を通って転位するGBS細菌の能力に影響を与える、実施形態146に記載の免疫原性組成物。153上記GBSAIポリペプチドが上皮細胞表面に会合し得る、実施形態146に記載の免疫原性組成物。154上記の上皮細胞表面への会合が、この上皮細胞表面への結合である、実施形態146に記載の免疫原性組成物。155上記GBSAIポリペプチドが、全長GBSAIタンパク質である、実施形態146に記載の免疫原性組成物。156上記GBSAIポリペプチドが、全長GBSAIタンパク質のフラグメントである、実施形態146に記載の免疫原性組成物。157上記フラグメントが、GBSAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、実施形態156に記載の免疫原性組成物。158上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-1ポリペプチドである、実施形態146に記載の免疫原性組成物。159上記GBSAIポリペプチドが、GBSAI-2ポリペプチドである、実施形態146に記載の免疫原性組成物。160上記GBSAI-1ポリペプチドが、GBS80、GBS104、GBS52、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態158に記載の免疫原性組成物。161上記GBSAI-2ポリペプチドが、GBS59、GBS67、GBS150、01521、01523、01524、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態159に記載の免疫原性組成物。162上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが、StreptococcuspneumoniaeAIポリペプチドである、実施形態117~132または138~141のいずれか一つに記載の免疫原性組成物。163上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、ソルターゼ基質モチーフを含む、実施形態162に記載の免疫原性組成物。164上記ソルターゼ基質モチーフが、LPXTGモチーフである、実施形態163に記載の免疫原性組成物。165上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、上皮細胞に付着するS.pneumoniaeの能力に影響を与える、実施形態162に記載の免疫原性組成物。166上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、上皮細胞に侵入するS.pneumoniaeの能力に影響を与える、実施形態162に記載の免疫原性組成物。167上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、上皮細胞層を通って転位するS.pneumoniaeの能力に影響を与える、実施形態162に記載の免疫原性組成物。168上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが上皮細胞表面に会合し得る、実施形態162に記載の免疫原性組成物。169上記の上皮細胞表面との会合が、この上皮細胞表面への結合である、実施形態168に記載の免疫原性組成物。170上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、全長S.pneumoniaeAIタンパク質である、実施形態162に記載の免疫原性組成物。171上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、全長S.pneumoniaeAIタンパク質のフラグメントである、実施形態162に記載の免疫原性組成物。172上記フラグメントが、S.pneumoniaeAIタンパク質の少なくとも7個連続するアミノ酸残基を含む、実施形態162に記載の免疫原性組成物。173上記S.pneumoniaeAIポリペプチドが、SP0462、SP0463、SP0464、orf3_670、orf4_670、orf5_670、ORF3_14CSR、ORF4_14CSR、ORF5_14CSR、ORF3_19AH、ORF4_19AH、ORF5_19AH、ORF3_19FTW、ORF4_19FTW、ORF5_19FTW、ORF3_23FP、ORF4_23FP、ORF5_23FP、ORF3_23FTW、ORF4_23FTW、ORF5_23FTW、ORF3_6BF、ORF4_6BF、ORF5_6BF、ORF3_6BSP、ORF4_6BSP、ORF5_6BSP、ORF3_9VSP、ORF4_9VSP、ORF5_9VSP、およびそれらのフラグメントからなる群より選択される、実施形態162に記載の免疫原性組成物。174上記第一のグラム陽性細菌AIポリペプチドがオリゴマー形態である、実施形態105~117のいずれか1つに記載の免疫原性組成物。175上記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、実施形態174に記載の免疫原性組成物。176上記第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドがオリゴマー形態である、実施形態174に記載の免疫原性組成物。177上記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである、実施形態176に記載の免疫原性組成物。178上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが単一のオリゴマー形態で会合している、実施形態176に記載の免疫原性組成物。179上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが化学的に会合している、実施形態178に記載の免疫原性組成物。180上記第一および第二のグラム陽性細菌AIポリペプチドが物理的に会合している、実施形態178に記載の免疫原性組成物。181AIと会合していないグラム陽性細菌ポリペプチドをさらに含む、実施形態105~117のいずれか1つに記載の免疫原性組成物。182上記のAIと会合していないグラム陽性細菌ポリペプチドが、GBS322およびGBS276からなる群より選択される、実施形態181に記載の免疫原性組成物。183上記のAIと会合していないグラム陽性細菌ポリペプチドがGBS322である、実施形態182に記載の免疫原性組成物。184増大したレベルのAI表面タンパク質を産生するように適合された、改変グラム陽性細菌。185上記AI表面タンパク質がオリゴマー形態である、実施形態184に記載の改変グラム陽性細菌。186上記オリゴマー形態が、ハイパーオリゴマーである実施形態185に記載の改変グラム陽性細菌。187B群連鎖球菌細菌である、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌188A群連鎖球菌細菌である、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌。189非病原性グラム陽性細菌である、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌。190上記非病原性グラム陽性細菌がStreptococusgordoniiである、実施形態189に記載の改変グラム陽性細菌。191上記非病原性グラム陽性細菌がLactococcuslactisである、実施形態189に記載の改変グラム陽性細菌。192不活化された、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記グラム陽性細菌の表面に露出される、細菌。193弱毒化された、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記グラム陽性細菌の表面に露出される、細菌。194不活化された、実施形態187に記載の改変GBS細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記GBS細菌の表面に露出される、細菌。195弱毒化された、実施形態187に記載の改変GBS細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記GBS細菌の表面に露出される、細菌。196不活化された、実施形態188に記載の改変GAS細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記GAS細菌の表面に露出される、細菌。197弱毒化された、実施形態188に記載の改変GAS細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記GAS細菌の表面に露出される、細菌。198不活化された、実施形態189に記載の改変非病原性細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記非病原性グラム陽性細菌の表面に露出される、細菌。199弱毒化された、実施形態189に記載の改変非病原性細菌であって、上記AI表面タンパク質が上記非病原性グラム陽性細菌の表面に露出される、細菌。200オリゴマー性アドヘシンアイランドAI表面抗原を製造するための方法であって、該方法は、以下:オリゴマー性AI表面抗原を発現するグラム陽性細菌を培養する工程、およびこの発現されたオリゴマー性AI表面抗原を単離する工程を包含する、方法。201上記単離する工程が、上記グラム陽性細菌培養物中のグラム陽性細菌分泌物から上記オリゴマー性AI表面抗原を収集することによって実行される、実施形態200に記載の方法。202精製する工程をさらに包含する、実施形態200に記載の方法。203上記オリゴマー性AI表面抗原がグラム陽性細菌の細胞表面から精製される、実施形態202に記載の方法。204上記グラム陽性細菌が、増大したAIタンパク質発現に適合されている、実施形態200に記載の方法。205上記グラム陽性細菌が、A群連鎖球菌細菌である、実施形態200~204のいずれか1つに記載の方法。206上記グラム陽性細菌が、B群連鎖球菌細菌である、実施形態200~204のいずれか1つに記載の方法。207上記オリゴマー性AI表面抗原がハイパーオリゴマー形態である、実施形態200~204のいずれか1つに記載の方法。208上記グラム陽性細菌が、上記オリゴマー性AI表面抗原を組換え発現する、実施形態200に記載の方法。209さらに操作された上記グラム陽性細菌が、少なくとも1つのAIソルターゼを発現する、実施形態208に記載の方法。210S.pneumoniae細菌である、実施形態184~186のいずれか1つに記載の改変グラム陽性細菌。211上記グラム陽性細菌がS.pneumoniaeである、実施形態200~204のいずれか1つに記載の方法。"