以下の段階を含む標的核酸を検出する方法:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズして、該プローブと標的核酸との間に二本鎖ハイブリッドを形成する段階であり、捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズすることができ、かつ相互にハイブリダイズしない段階;bハイブリダイゼーション反応にブロッカープローブを加える段階であり、該ブロッカープローブはハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする段階;cハイブリッドを固相に結合して、結合ハイブリッドを形成する段階;およびd結合ハイブリッドを検出する段階。以下の段階を含む標的核酸を検出する方法:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を固定化捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズして、該プローブと標的核酸との間に二本鎖ハイブリッドを形成する段階であり、捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズし、かつ相互にハイブリダイズしない段階;bハイブリダイゼーション反応にブロッカープローブを加える段階であり、該ブロッカープローブはハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする段階;c結合ハイブリッドを検出する段階。シグナル配列プローブが一本鎖である、請求項1または請求項2記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも1つのリガンドで修飾されている、請求項1または請求項2記載の方法。リガンドがビオチンである、請求項4記載の方法。捕捉配列プローブが5末端および3末端を有する線状であり、その5末端および3末端の両方がビオチン化されている、請求項5記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが3キロベース未満である、請求項1または請求項2記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが500ベース未満である、請求項1または請求項2記載の方法。捕捉配列プローブが、標的核酸の異なる領域または異なる標的分子に相補的な2つまたはそれ以上の配列の融合体である、請求項1または請求項2記載の方法。形成される二本鎖ハイブリッドがDNARNAハイブリッドである、請求項1または請求項2記載の方法。ハイブリダイゼーション段階の前に一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を形成する段階をさらに含む、請求項1または請求項2記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブの標的核酸へのハイブリダイゼーションが連続的に行われる、請求項1または請求項2記載の方法。段階aおよび段階bが同時に行われる、請求項1記載の方法。段階aおよび段階cが同時に行われる、請求項1記載の方法。段階a、段階bおよび段階cが同時に行われる、請求項1記載の方法。段階aおよび段階bが同時に行われる、請求項2記載の方法。ブロッカープローブが捕捉配列プローブの融解温度より低い融解温度を有する、請求項1または請求項2記載の方法。ハイブリッドが固相上へ捕捉される、請求項1記載の方法。固相がストレプトアビジンでコーティングされている、請求項17記載の方法。固相がマイクロプレートである、請求項17記載の方法。段階cが室温で実行される、請求項1記載の方法。結合ハイブリッドがそのハイブリッドを認識する抗体を使用して検出される、請求項1または請求項2記載の方法。ハイブリッドがDNARNAハイブリッドである、請求項22記載の方法。DNARNAハイブリッドを認識する抗体がアルカリホスファターゼで標識されている、請求項22記載の方法。以下の段階を含む標的核酸を検出する方法:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズする段階であり、捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズし、かつ相互にハイブリダイズせず、該ハイブリダイゼーションにより該シグナル配列プローブと標的核酸との間にRNADNAハイブリッドが形成される段階;およびbRNADNAハイブリッドが、そのRNADNAハイブリッドを認識する抗体を該ハイブリッドに結合することにより検出される段階であり、該抗体は検出可能に標識されている段階。段階aにおいて形成されるハイブリッドを固相に結合して、結合ハイブリッドを形成する段階をさらに含む、請求項25記載の方法。シグナル配列プローブが一本鎖である、請求項25記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも1つのリガンドで修飾されている、請求項25記載の方法。捕捉配列プローブがビオチン化されている、請求項28記載の方法。捕捉配列プローブが5末端および3末端を有する線状であり、その5末端および3末端の両方がビオチン化されている、請求項29記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが3キロベース未満である、請求項25記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが500ベース未満である、請求項25記載の方法。ハイブリダイゼーション段階の前に一本鎖の標的核酸を形成する段階をさらに含む、請求項25記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブの標的核酸へのハイブリダイゼーションが連続的に行われる、請求項25記載の方法。段階aにおいて形成されるハイブリッドを固相上へ結合して、結合ハイブリッドを形成する、請求項25記載の方法。結合ハイブリッドが室温で形成される、請求項35記載の方法。固相がストレプトアビジンでコーティングされている、請求項35記載の方法。固相がマイクロプレートである、請求項35記載の方法。抗体がアルカリホスファターゼで標識されている、請求項25記載の方法。ブロッカープローブをハイブリダイゼーション段階に加える段階をさらに含み、該ブロッカープローブがハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする、請求項25記載の方法。ブロッカープローブが、捕捉配列プローブの標的核酸へのハイブリダイゼーションに続いてハイブリダイゼーション反応に加えられる、請求項40記載の方法。ブロッカープローブが捕捉配列プローブの融解温度より低い融解温度を有する、請求項40記載の方法。以下の段階を含む標的核酸を検出する方法:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズする段階であり、捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズし、かつ相互にハイブリダイズせず、シグナル配列プローブはDNARNAハイブリッド領域を含み、該ハイブリダイゼーションにより複合体が形成される段階;およびb該複合体を検出する段階。シグナル配列プローブが少なくとも40塩基対の長さを含む、請求項43記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも6塩基対の長さを含む、請求項43記載の方法。捕捉配列プローブが固相上に固定化されている、請求項45記載の方法。複合体が、DNARNAハイブリッド領域を認識する抗体を該領域に結合することにより検出され、その抗体が検出可能に標識されている、請求項43記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも1つのリガンドで修飾されている、請求項43記載の方法。リガンドがビオチンである、請求項48記載の方法。捕捉配列プローブが5末端および3末端を有する線状であり、その5末端および3末端の両方がビオチン化されている、請求項49記載の方法。ブロッカープローブをハイブリダイゼーション段階後に加える段階をさらに含み、該ブロッカープローブがハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする、請求項43記載の方法。ブロッカープローブが捕捉配列プローブの長さより4塩基対~10塩基対短い長さを含む、請求項51記載の方法。配列番号:1から配列番号:160までからなる群より選択される配列からなる核酸プローブ。シグナル配列プローブがDNARNA二重鎖構造を有する第一の領域と一本鎖の核酸配列を有する第二の領域とを含む、請求項1記載の方法。DNARNA二重鎖がM13DNAM13RNA二重鎖である、請求項54記載の方法。以下の段階を含む標的核酸を検出する方法:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を捕捉配列プローブ、架橋プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズして、二本鎖ハイブリッドを形成する段階であり、捕捉配列プローブおよび架橋プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズし、かつ相互にハイブリダイズせず、ならびにシグナル配列プローブは架橋プローブにハイブリダイズし、かつ標的核酸および捕捉配列プローブにハイブリダイズしない段階;bブロッカープローブをハイブリダイゼーション反応に加える段階であり、該ブロッカープローブはハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする段階;cハイブリッドを固相に結合して、結合ハイブリッドを形成する段階;およびd結合ハイブリッドを検出する段階。シグナル配列プローブがDNARNA二重鎖構造を有する第一の領域および一本鎖の核酸を有する第二の領域を含む、請求項56記載の方法。DNARNA二重鎖がM13DNAM13RNA二重鎖である、請求項57記載の方法。DNARNA二重鎖がシグナル配列プローブ内の反復配列とその反復配列に相補的な配列を有する核酸分子との間に形成されるハイブリッドである、請求項57記載の方法。架橋プローブがポリテールをさらに含む、請求項56記載の方法。シグナル配列プローブが、架橋プローブのポリテールにハイブリダイズする一本鎖ポリDNA配列、およびシグナル配列プローブのポリ配列とポリ配列を有する核酸分子との間に形成されるDNARNA二重鎖を含む、請求項60記載の方法。以下の段階:a一本鎖または部分的一本鎖の標的核酸を捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブにハイブリダイズして、該プローブと標的核酸との間に二本鎖ハイブリッドを形成する段階;bハイブリッドを固相に結合して、結合ハイブリッドを形成する段階;およびc結合ハイブリッドを検出する段階、を含む標的核酸を検出する方法であり、捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブは標的核酸内の重複しない領域にハイブリダイズし、かつ相互にハイブリダイズしない方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブの標的核酸へのハイブリダイゼーションが連続的に行われる、請求項62記載の方法。段階aおよび段階bが同時に行われる、請求項62記載の方法。ブロッカープローブを加える段階をさらに含み、該ブロッカープローブはハイブリダイズされていない過剰の捕捉配列プローブにハイブリダイズする、請求項62記載の方法。ブロッカープローブの添加およびハイブリダイゼーション段階が同時に行われる、請求項65記載の方法。ブロッカープローブの添加および結合段階が同時に行われる、請求項65記載の方法。シグナル配列プローブが一本鎖である、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも1つのリガンドで修飾されている、請求項62記載の方法。リガンドがビオチンである、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブが5末端および3末端を有する線状であり、その5末端および3末端の両方がビオチン化されている、請求項70記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが3キロベース未満である、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブが標的核酸の領域にハイブリダイズし、その領域の隔たりが500ベース未満である、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブが、標的核酸の異なる領域または異なる標的分子に相補的な2つまたはそれ以上の配列の融合体である、請求項62記載の方法。形成される二本鎖ハイブリッドがDNARNAハイブリッドである、請求項62記載の方法。ハイブリダイゼーション段階の前に一本鎖DNAを形成する段階をさらに含む、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブの標的核酸へのハイブリダイゼーションが連続的に行われる、請求項62記載の方法。段階aおよび段階bが同時に行われる、請求項62記載の方法。ブロッカープローブが捕捉配列プローブの融解温度より低い融解温度を有する、請求項63記載の方法。固相がストレプトアビジンでコーティングされている、請求項63記載の方法。固相がマイクロプレートである、請求項73記載の方法。段階bが約20°C~90°Cで実行される、請求項62記載の方法。捕捉配列プローブが少なくとも6ベースの長さを含む、請求項82記載の方法。段階bが室温で実行される、請求項62記載の方法。結合ハイブリッドが、ハイブリッドを認識する抗体を使用して検出される、請求項62記載の方法。ハイブリッドがDNARNAハイブリッドである、請求項85記載の方法。DNARNAハイブリッドを認識する抗体がアルカリホスファターゼで標識されている、請求項85記載の方法。シグナル配列プローブが欠失した捕捉配列プローブ領域を含み、かつ標的核酸に相補的である、請求項62記載の方法。標的核酸が一塩基多型である、請求項62記載の方法。ハイブリッドの固相への結合の特異性が、室温より高い温度によって調節される、請求項89記載の方法。ハイブリッドの固相への結合の特異性が、ブロッカープローブの添加によって調節される、請求項89記載の方法。ハイブリッドの固相への結合の特異性が、室温より高い温度およびブロッカープローブの添加によって調節される、請求項89記載の方法。発明の詳細な説明本発明は、試験試料において核酸の存在を検出するための方法を提供する。より詳しくは、本発明は、高い相同性をもつ核酸配列を識別および検出できる高特異性および高感度の方法を提供する。本発明についての好ましい使用は、当業者によく知られており、限定されるものではないが、挿入、欠失、逆位、反復配列、および一塩基多型と同様に複数のものも含む様々な突然変異の検出および識別に適用されうる。さらに、本発明は、類似の配列エレメントを共有する核酸標的の検出のための群特異的でもありうる。精製または未精製の形での任意の核酸の供給源を試験試料として利用することができる。例えば、試験試料は、食物もしくは農業生産物、またはヒトもしくは獣医学臨床検体であってもよい。典型的には、試験試料は、尿、血液、血漿、血清、唾液などのような生物学的液体である。または、試験試料は、対象の核酸を所有することが疑われる組織検体であってもよい。試験試料における標的核酸は、検出されうる配列が核酸全体を構成しているような分離した分子として最初に存在していてもよいし、またはより大きな分子の成分にすぎなくてもよい。検出されうる核酸配列は純粋な形で最初に存在する必要はない。試験試料は、核酸の複合混合物を含み、それらのうちの標的核酸が、全ヒトゲノムDNAもしくはRNAに含まれる対象の遺伝子、または生物体が臨床試料の微量成分である病原性生物体の核酸配列の部分に相当してもよい。試験試料における標的核酸は、細菌、酵母、ウイルス、および植物もしくは動物のような高等生物体の細胞もしくは組織を含む任意の源由来のDNAまたはメッセンジャーRNAのようなRNAであることができる。そのような核酸の抽出およびまたは精製のための方法は、当技術分野においてよく知られている。標的核酸は、二本鎖であっても一本鎖であってもよい。本方法において、標的核酸は一本鎖、またはその方法のハイブリダイゼーション段階の前に通常の変性技術により一本鎖にさせられることが好ましい。好ましい態様において、二本鎖標的DNAを変性させるために塩基変性技術が用いられる。本明細書において用いられる場合のオリゴヌクレオチドという用語は、2個またはそれ以上のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドを含む核酸分子を指す。所望のオリゴヌクレオチドは、天然に存在する核酸からの精製のような任意の適する方法、分子生物学的方法、または新規合成により、調製されうる。オリゴヌクレオチドの例は、本明細書に記載されている核酸プローブである。核酸プローブは、試験試料において相補的RNAまたはDNA配列にハイブリダイズする検出可能な核酸配列である。プローブの検出は、試験試料において特定の核酸配列の存在を示す。一つの態様において、標的特異的ハイブリッド捕捉法は2つの型の核酸プローブ:捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブを使用する。捕捉配列プローブは、標的核酸内の固有の配列にハイブリダイズすることおよび固相上へ捕捉されることができる核酸配列を含む。シグナル配列プローブは、CSPにより認識される固有の領域に隣接している標的核酸内の領域にハイブリダイズすることができる核酸配列を含む。CSPおよびSSPの配列は、それらが標的核酸の同じ領域に、または相互にハイブリダイズしないように選択される。さらに、CSPおよびSSPは、互いの50000塩基内で標的の領域にハイブリダイズするように選択される。CSPが標的核酸内でハイブリダイズする配列とSSPがハイブリダイズする配列との間の距離は、好ましくは、1~50000塩基の間、より好ましくは、距離は3000塩基未満である。最も好ましくは、距離は1000塩基未満である。検出方法に使用されるCSPは、DNA、RNA、ペプチド核酸、ロック化核酸、または他の核酸類似体であることができる。本明細書において定義される場合のロック化核酸とは、高い熱安定性および選択性を有する相補DNAおよびRNAで二重鎖を形成する新規なクラスのオリゴヌクレオチド類似体である。標準ヌクレオシドでのフラノース環の通常の立体配置的自由は、2O位を4C位へ結合するメチレンリンカーのためにLNAにおいて制限される。PNAは、糖リン酸骨格がポリアミドまたは偽ペプチド骨格に置換されているオリゴヌクレオチドである。好ましい態様において、CSPはDNAである。CSPは最小限6塩基の長さをもち、好ましくは15~100塩基長、およびより好ましくは20~40塩基長である。CSPは、それがハイブリダイズする標的核酸内の配列に実質的に相補的である。CSPの配列は、標的ハイブリダイゼーション領域に、好ましくは少なくとも75相補的であり、より好ましくはこの配列に100相補的である。CSPは、試験試料に存在するものと考えられている所望しない配列に、75未満または同等の配列同一性、より好ましくは50未満の配列同一性を含むことがまた好ましい。CSPが結合する標的核酸内の配列は、好ましくは6塩基長、より好ましくは20~40塩基長である。CSPがハイブリダイズする配列は、固有の配列または群特異的配列であることがまた好ましいかもしれない。群特異的配列は、別々の群を形成する複数関連性配列である。一つの態様において、検出方法に使用されるCSPは、固相上へのプローブの特異的捕捉を可能にする、核酸における1つまたは複数の修飾を含んでもよい。例えば、CSPは、例えば、ニックトランスレーション、化学的または光化学的取り込みを含む、当業者によく知られた方法により、少なくとも1つのリガンドでそれをタグ付けすることにより修飾されてもよい。さらに、CSPは、複数の位置に1つまたは複数の型の標識でタグ付けされてもよい。例えば、CSPは、ストレプトアビジンに結合するビオチン;または抗ジゴキシゲニンに結合するジゴキシゲニン;または抗DNPに結合する24ジニトロフェノールで、タグ付けされてもよい。発蛍光団もまたプローブを修飾するために使用することができる。発蛍光団の例は、フルオレセインおよび誘導体、フィコエリトリン、アロフィコシアニン、フィコシアニン、ローダミン、テキサスレッドまたは他の有標発蛍光団を含む。発蛍光団は、一般的に化学的修飾により付着し、かつ抗フルオレセインのような発蛍光団特異的抗体に結合する。CSPがまた、特異的抗体により認識可能な任意の化学基を含む修飾化塩基の取り込みによりタグ付けされることもできることは、当業者により理解されるであろう。他のタグおよびヌクレオチド配列を基質でコーティングした固相上への捕捉のためにタグ付けする方法は、当業者によく知られている。核酸標識の概説は、ランデグレンら、DNA診断学分子技術と自動化、Science242229~237の論文に見出されうり、参照として本明細書に組み入れられている。一つの好ましい態様において、CSPは、ヌクレオチド配列の5末端および3末端の両方にビオチンでタグ付けされる。もう一つの態様において、CSPは修飾されずに、固体マトリックスへハイブリダイゼーションの可能なCSPに含まれる配列によって、そのマトリックス上へ捕捉される。検出方法に使用されるSSPはDNAまたはRNAであってもよい。本発明の一つの特定の態様において、SSPおよび標的核酸はDNARNAハイブリッドを形成する。それゆえ、この態様において、標的核酸がDNAである場合には、好ましいSSPはRNAである。同様に、標的核酸がRNAである場合には、好ましいSSPはDNAである。SSPは一般的に、少なくとも15塩基長である。しかしながら、SSPは1000塩基長に達するまたはそれ以上であってもよい。より長いSSPが好ましい。SSPは、単一の核酸断片、または各断片が好ましくは長さが15~100塩基の間である複数のより小さな核酸断片を含んでもよい。もう一つの態様において、検出方法に使用されるSSPは、DNARNA二重鎖および標的核酸にハイブリダイズすることができる一本鎖核酸配列を含む。SSPは、最初、標的核酸内の配列に相補的な一本鎖DNA配列を一本鎖DNAベクターへクローニングし、その後、DNAベクター配列に相補的なRNAをハイブリダイズしてDNARNA二重鎖を生成することにより、調製されてもよい。例えば、M13をDNAベクターとして使用する場合には、M13RNAをベクター中のM13DNA配列にハイブリダイズさせ、DNARNA二重鎖を生成させる。その結果生じるSSPは、標的核酸内の配列にハイブリダイズすることができる一本鎖部分と同様に、DNARNA二重鎖部分も含む。一本鎖DNAは、少なくとも10塩基長であるべきであり、1000塩基長に達するまたはそれ以上であってもよい。または、SSPのDNARNA二重鎖部分は、SSPの一本鎖部分が標的核酸にハイブリダイズされる反応の間または後に、形成されてもよい。SSPは、線状、環状、または2つまたはそれ以上の形の組み合わせであることができる。SSPのDNARNA二重鎖部分は、本明細書に記載されているように、抗DNARNA抗体を用いる捕捉されたハイブリッドの検出のための増幅されたシグナルを提供する。さらにもう一つの態様において、検出方法に使用されるSSPは、標的核酸にハイブリダイズすることができる配列を含まない分子である。この態様において、SSPにハイブリダイズすることができる配列と同様に標的核酸にハイブリダイズすることができる配列も含む架橋プローブが使用される。架橋プローブは、DNA、RNA、ペプチド核酸、ロック化核酸、または他の核酸類似体であることができる。一つの態様において、SSPは、DNARNA二重鎖部分および架橋プローブ内の配列に相補的な配列を含む一本鎖部分を含む。標的核酸およびSSPの両方にハイブリダイズすることができる架橋プローブは、それゆえに、SSPを標的核酸および標的核酸にハイブリダイズされているCSPに結合するための中間体としての役目を果たす。もう一つの態様において、検出方法に使用されるSSPは、架橋プローブにハイブリダイズすることができる一本鎖RNA配列と同様に複数組の反復配列も含む。反復配列に相補的な配列を含むDNAオリゴヌクレオチドプローブは、SSPにハイブリダイズしてシグナル増幅のために必要とされるRNADNA二重鎖を生成するために使用されてもよい。さらにもう一つの態様において、架橋プローブは、標的核酸にハイブリダイズすることができる配列に加えて、ポリテールを含む。この例に使用されるSSPはポリDNA配列を含む。架橋プローブは、それゆえ、そのポリテールを介してSSPにハイブリダイズすることができる。ポリ配列を含むRNAプローブは、SSP内に残っているポリDNA配列にハイブリダイズしてRNADNA二重鎖を形成するために使用されてもよい。ポリ配列を含むSSPおよびポリ配列を含むRNAプローブは、好ましくは、100~5000塩基長である。本発明の検出方法に使用されるSSPは、修飾されない、またはCSPについてのように、上記およびまたは当技術分野において公知の方法を用いて修飾されることができる。好ましい態様において、SSPは共有結合的に修飾されていないプローブである。複数のCSPおよびまたはSSPを本発明の検出方法において使用することができることは理解される。もう一つの態様において、標的核酸の2つまたはそれ以上の別個の領域の相補的配列を含むオリゴヌクレオチドプローブは、いっしょに融合されて、本発明の方法において捕捉配列プローブとして使用される。または、単一または複数の標的核酸に相補的な配列を含む単一のプローブを設計かつ作製することができる。この型のプローブはまた、本明細書において、融合化CSPとも呼ばれる。実施例5において示されるように、融合化捕捉配列プローブは、同じ濃度で使用される場合、2つの非融合化CSPの組合わせと同じくらい効率的に働く。本発明のさらなる態様において、欠失核酸プローブをTSHCにおいて使用してもよい。構築する必要のある転写鋳型の数を最小限にするために、欠失核酸プローブ、例えばRNAを1使用されるプローブの長さを最長化する;および2プローブがCSPにより標的される領域で重複するのを妨げるように、設計する。これらの欠失プローブは、そのプローブを作製するために使用される核酸鋳型において内部欠失を含む。さらに、これらの欠失プローブは核酸標的にハイブリダイズして、CSPハイブリダイゼーションにとって接近しやすいハイブリダイズされていない核酸のバブルを形成する。この方法はまた、標的全体としての核酸を転写ベクターへクローニングし、その後、配列を、一度配列がCSPハイブリダイゼーションに有用な領域として同定されれば、配列は取り除かれてもよいので、プローブを作製するためのとても便利な手段も提供する。さらに、この方法は、CSPと重複しない、ほぼ完全長の全ゲノムのプローブの使用を可能にする。転写鋳型内に標的される欠失を設計するために、いかなる市販の突然変異誘発キットが使用されうる。典型的には、SSP合成に用いられる核酸鋳型の欠失は、転写ベクターにクローニングされる鋳型に直接的に行われる。鋳型における欠失は、CSPによりハイブリダイズされる領域に重複する配列を除去するように、作成される。欠失は、CSP領域自体と同じくらい小さくてもよいが、一般的かつより好ましくは、CSPによりハイブリダイズされる領域の5末端および3末端における約100~300個のヌクレオチドが欠失される。本発明の核酸プローブは、例えば、化学的合成、天然に存在する源からの単離、組換え体生産および非対称的PCR、サンディエゴ、CA、アカデミックプレス、76~83を含む、当技術分野において公知の任意の適する方法により作製されてもよい。1つまたは複数のセグメントとしてプローブを化学的に合成し、かつ続いてそのセグメントを連結することが好ましいかもしれない。いくつかの化学的合成法は、ナラングら、、ブラウンら、およびカルターズら、により記載されており、参照として本明細書に組み入れられている。または、クローニング法により、プロモータープライマーとして使用するために単離されるうる便利な核酸断片を供給してもよい。二本鎖DNAプローブは、例えば、標的核酸へのハイブリダイゼーションの前に通常の変性方法を用いて、まず第一に、一本鎖にさせられる。ハイブリダイゼーションは、当業者によく知られている標準的ハイブリダイゼーション条件下で行われる。プローブの核酸配列へのハイブリダイゼーションについての反応条件は、プローブによって変化し、プローブの長さ、配列におけるGおよびCのヌクレオチドの数、およびハイブリダイゼーション反応に使用される緩衝液の成分のような要素に依存している。適度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、完全塩基対二本鎖DNAの融解温度以下である約25°Cに調節することのように、当業者により一般的に理解されている。より高い特異性は、一般的に、より高い温度をもつインキュベーション条件、換言すれば、よりストリンジェントな条件を用いることにより達成される。よく知られているサムブルックらの実験マニュアル、分子クローニング:実験マニュアル、第2版、コールドスプリングハーバーラボラトリープレス、ニューヨークの11章には、特異性のあるハイブリダイゼーションを保証するために必要な、関係する因子およびストリンジェンシーのレベルの記載を含め、極めて詳細にオリゴヌクレオチドプローブについてのハイブリダイゼーション条件を記載している。ハイブリダイゼーションは典型的には、緩衝水溶液中で行われ、温度、塩濃度、およびpHのようなそれのための条件は、プローブがいかなる他の配列でもなく、それらそれぞれの標的核酸配列に特異的にハイブリダイズするように十分なストリンジェンシーを与えるように選択される。一般的に、プローブおよび標的の間でのハイブリダイゼーションの効率は、添加されるプローブの量が鋳型に対してモル過剰であり、好ましくは2~106モル過剰量、より好ましくは103~106モル過剰量である条件下で向上する。効率的な捕捉のために供給される各CSPの濃度は、最終ハイブリダイゼーション溶液において少なくとも25fモルml、好ましくは25fモルml~104fモルmlの間である。各SSPの濃度は、最終ハイブリダイゼーション溶液において少なくとも15ngml、好ましくは150ngmlである。表Aはngmlで表示されるSSP濃度のモル基準への換算を示す。表ASSP濃度のngmlからfモルmlへの換算標的核酸へのCSPおよびSSPのハイブリダイゼーションは、同時に、または連続してどちらかの順で、行われてもよい。一つの態様において、標的核酸へのCSPのハイブリダイゼーションおよびSSPのハイブリダイゼーションは同時に行われる。形成されたハイブリッドはその後、CSPに付着しているリガンドが特異性をもって結合する基質によりコーティングされている固相上に捕捉される。もう一つの態様において、SSPの標的核酸へのハイブリダイゼーションは、CSPの標的核酸へのハイブリダイゼーションの後に行われる。この場合、CSPは、ハイブリダイゼーションの前または後に、固相に固定化されてもよい。この態様において、CSPおよび標的の両方がSSPハイブリダイゼーション反応の間に固相へ結合されてもよい。最も好ましくは、CSPおよびSSPは標的核酸にハイブリダイズされて、ハイブリダイズされた複合体を形成し、該複合体がその後、CSPに付着しているリガンドが特異性をもって結合する基質によりコーティングされている固相上へ捕捉される。付加された特異性および感度をもって特異的ポリヌクレオチド配列を同定および検出するために、条件が、シグナル検出を増強しかつバックグラウンド干渉を低下するのに最適であるように、アッセイ法を設計することができる。ストリンジェンシーの加算を達成するための好ましい方法は、TSHC加熱化捕捉段階およびまたはブロッカープローブの使用による段階を含む。CSP、SSP、および標的核酸を含むハイブリダイズされた複合体の捕捉効率はいくつかのアッセイ条件により影響されるため、加熱化捕捉は偽反応性を低下させ、かつ少なくとも1つのヌクレオチドの突然変異を検出するのに有用でありうる。好ましくは、加熱化捕捉法は一塩基多型の検出のために用いられる。簡単には、ハイブリダイズされた複合体を捕捉するまたは固相へ結合するための加熱化捕捉法では、温度の範囲を上昇させて利用している。ハイブリダイゼーションに続いてCSPハイブリダイズ化標的を固定するために、ハイブリダイゼーション溶液を例えば、96ウェルのプレートのウェルの中へ置き、そして1100rpmsの振盪で、20°Cから90°Cの範囲の温度で15分間~2時間、プレートを振盪する。選択的に、1100rpmsでの振盪で1時間、室温でハイブリダイゼーションを行うのが好ましいかもしれない。室温より上の捕捉温度は、ハイブリダイゼーションハイブリダイゼーションがプレート捕捉段階の間に起こってしまうようなストリンジェンシーのレベルを上げるために好ましいかもしれない。より高度の特異性および感度を得るためのもう一つの方法は、ブロッカープローブの使用による。本発明の一つの態様において、ハイブリダイズされたSSPおよび標的核酸の複合体を同時にかまたは連続してのいずれかで、固相に固定化されたCSPに捕捉するために温度を上昇させて用いる加熱化捕捉法が提供され、その上昇した温度により、CSPの非特異的ハイブリダイゼーションがプレート捕捉段階の間に起こるのを防ぐ。上昇した温度はまた、SSPハイブリダイゼーション特異性にも影響を及ぼす。TSHCに使用されるCSPは、核酸または修飾化核酸であってもよく、好ましくは固相上へ捕捉させるよう修飾を含むDNAである。そのような修飾の一つの例は、ビオチン標識であり、より好ましくは複数のビオチン標識である。CSPは最小限6塩基対を含み、好ましくは65°Cより上の好ましい融解温度をもつ16~50塩基を含む。好ましいCSPは試料に存在する核酸の標的分子内の固有の配列に相補的な配列を含んでいてもよいが、これは複数の核酸種を標的するのに必要ない。例えば、遺伝子ファミリーが標的の場合には、CSPは、好ましくは、遺伝子ファミリーの1つまたは複数のメンバーに共通の配列エレメントを含んでもよい。ほとんどの適用について、CSPは好ましくは、試料に存在することが疑われる所望しない標的に対して、多くとも75、より好ましくは50未満の配列同一性を含む。アッセイ法は、たった1個のヌクレオチドにおいて異なり、かつたった1個のヌクレオチドにおいて異なる標的を選択的に検出するCSPを利用することができる。この識別の程度を加熱化プレート捕捉段階を用いることにより促進することができる。CSPハイブリダイゼーションが溶液中で行われる場合、試料を続いて捕捉のために固相と反応させる。例えば、ビオチン標識化CSPが使用される場合には、アビジンまたは何か他のビオチン結合性タンパク質が捕捉のために固相をコーティングするのに使用されてもよい。本発明のもう一つの態様は、同時に起こるハイブリダイゼーションおよび捕捉を含み、ハイブリダイゼーションは捕捉固相上、例えば、捕捉プレート上で直接的に行われる。本発明のさらにもう一つの態様において、TSHC法はSNPを有する核酸標的を識別および検出するために用いられることができる。このハイブリッド捕捉一塩基多型検出方法は、高感度および高特異性でSNPを検出することができる。SNPを有する核酸標的を識別および検出するためのTSHCの拡張された能力を説明する実施例は本明細書に記載されているが、シグナル配列プローブ、および標的核酸分子に加えて、標識化において、捕捉オリゴヌクレオチドが使用される。CSPは核酸標的をハイブリダイズしかつ固相または表面に捕捉しうる。標識方法は当技術分野においてよく知られており、標的核酸の固定化を促進するためにもまた用いられうる。一つの態様において、標的核酸の捕捉は、CSP上のビオチンと固体表面上のストレプトアビジンとの間での高親和性相互作用によって達成される。同時に、DNA標的に相補的でかつ捕捉領域について重複しないRNAシグナル配列プローブはDNA標的にハイブリダイズされる。RNADNAハイブリッドは、アルカリホスファターゼで標識されたRNADNAハイブリッドに対して指向性のある抗体により認識される。この例において、化学発光のリン酸化基質がその後添加され、引き続き、活性化基質が照度計により検出および測定されうる。シグナルノイズ比は既知の陰性対照を用いて測定される。さらに、標的の濃度を、標準物質として既知の濃度の標的分子を使用することにより測定することができる。ハイブリッドを固相へ結合および捕捉することの特異性は、室温より高い温度、ブロッカープローブの添加、または室温より高い温度とブロッカープローブの添加とにより、調節、制御、または調整される。ストリンジェンシーを加算するために、ブロッカープローブを加熱化捕捉法と共にかまたは伴わずにのいずれかで、使用してもよい。または、捕捉段階は室温で行われてもよく、選択的にブロッカープローブを利用してもよい。本発明のもう一つの態様はさらに、多くの場合、加熱化捕捉段階の必要性を取り除く、ブロッカーオリゴヌクレオチド法を提供する。これは、室温でオリゴヌクレオチドを捕捉するためにブロッカーオリゴヌクレオチドをハイブリダイズし、それにより捕捉段階の間にCSPの所望しない標的へのさらなるハイブリダイゼーションを防ぐことにより達成されうる。捕捉プローブは、好ましくは、捕捉プローブに相補的なブロッカープローブの存在を必要としてもよい。ブロッカープローブの長さは、完全長CSPに相補的なブロッカーからCSPの小さな部分のみに相補的なとても短いブロッカーまで変化することができる。例えば、ブロッカープローブはCSPの長さより4~10塩基対短くありえる。ブロッカープローブの存在によりバックグラウンドが低下し、より高い感度が可能になる。加熱化捕捉段階およびブロッカープローブは、別々にまたは共にのいずれで使用されてもよく、ハイブリッドを固相へ結合および捕捉することの特異性は、室温より高い温度およびブロッカープローブの添加により、調節、制御、または調整される。固相またはマトリックスには、例えば、プレート、スライド、皿、ビーズ、粒子、微粒子、コップ、ストランド、チップおよびストリップの形状で、ポリスチレン、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリカーボネートまたは任意の固いプラスチック材が含まれることは、当業者により理解されるものと思われる。固相はまた、ガラスビーズ、ガラス試験管および任意の他の適当なガラス製品を含む。表面がカルボキシル基、アミノ基、ヒドラジド基、アルデヒド基、核酸またはヌクレオチド誘導体を含むように修飾されたプラスチックまたはガラスのような機能的にされた固相もまた使用することができる。プラスチックもしくはガラスの微粒子、ビーズ、ストリップ、試験管、スライド、ストランド、チップまたはマイクロタイタープレートのような任意の固相を使用することができる。一つの好ましい態様において、CSPはビオチンで標識され、かつハイブリッドを捕捉するためにストレプトアビジンコーティング化またはアビジンコーティング化固相が使用される。さらに好ましくは、ストレプトアビジンコーティング化マイクロタイタープレートが使用される。これらのプレートは受動的にまたは共有結合的にコーティングされてもよい。捕捉されたハイブリッドは、ハイブリッドに特異的な標識化ポリクローナルもしくはモノクローナル抗体、SSPに付着した1つもしくは複数のリガンドに特異的な抗体、標識化抗体、またはSSP自体の検出可能な修飾を用いる等の、当技術分野においてよく知られた通常の手段により検出されうる。一つの好ましい検出方法は、RNADNAハイブリッドに結合することができる抗体を使用することにより捕捉されたハイブリッドを検出する。この態様において、抗RNADNA抗体は、好ましくは、酵素、蛍光分子またはビオチンアビジン接合体で標識され、かつ非放射性である。標識は、比色計、照度計、または蛍光検出器のような当技術分野において公知の通常の手段により直接的または間接的に検出することができる。一つの好ましい標識は、例えば、アルカリホスファターゼである。当業者に公知の他の標識もまた、結合した二本鎖ハイブリッドを検出する手段として使用されうる。捕捉されたハイブリッドの検出は、好ましくは、接合型抗体をインキュベーション段階の間にハイブリッドに結合することにより達成される。その後、いかなる過剰な接合体を除去するために表面を洗浄する。これらの技術は当技術分野において公知である。例えば、手作業での洗浄は、50mlのCombitipを有するEppendorfリピートピペッター、ハンブルグ、ドイツ、コーニングリピート洗浄器、コーニング、NY、バリオスタットまたは付属チューブを有するリザーバからの重力流により制御される単式ポンプのいずれかを用いて行ってもよい。ソースサイエンティフィックシステムズから入手できる商業的に入手可能なチューブ洗浄システムもまた使用できる。結合された接合体は、続いて、当技術分野において通常に使用される方法、例えば、比色またはカウトリーら、JClinMicrobiol271002~1007に記載されているような化学発光により検出される。好ましくは、結合されたアルカリホスファターゼ接合体は、アルカリホスファターゼにより活性化されうる基質を添加することにより、化学発光により検出される。アルカリホスファターゼにより活性化される化学発光性基質は、当技術分野においてよく知られている。もう一つの態様において、本発明の標的特異的ハイブリッド捕捉法は、CSPおよびSSPに加えて、ブロッカープローブを使用する。ブロッカープローブは、CSPの配列に相補的である配列を含む。ブロッカープローブの配列は、好ましくはCSPの配列に少なくとも75相補的、より好ましくは、CSPに100相補的である。ブロッカープローブをハイブリダイゼーション反応混合物へ添加することにより、ハイブリダイズされていないCSPが標的に存在する交差反応性核酸配列にハイブリダイズすることを防ぎ、そのために検出の特異性が増大する。ブロッカープローブは、一般的に少なくとも5塩基長、好ましくは12塩基長である。ハイブリダイゼーション反応におけるブロッカープローブの濃度は、好ましくは、CSPおよびSSPのそれを超過する。好ましくは、ブロッカープローブは2倍のモル超過量で存在するが、10000倍モル超過量まで存在してもよい。ブロッカープローブはDNA、RNA、ペプチド核酸または他の核酸類似体であることができる。一つの態様において、完全長または完全長に近いCSPに相補的なブロッカープローブを使用する。CSP、SSPおよび標的核酸の間にハイブリッドが形成される反応に続いて、一つまたは複数のブロッカープローブをその反応に添加してもよく、ハイブリダイゼーションを望ましい時間、続ける。ハイブリダイゼーション生成物は、その後、上記のように検出される。もう一つの態様において、CSPの部分のみに相補的でかつCSPより短いブロッカープローブを使用する。これらのブロッカープローブはCSPより低い融解温度をもつ。好ましくは、ブロッカープローブの融解温度は、CSPのそれより10度低い。この場合、ブロッカープローブは、好ましくは、標的核酸にCSPおよびSSPとともに同時に添加される。ブロッカープローブはCSPより低い融解温度をもつため、ブロッカープローブがCSPのその標的配列へのハイブリダイゼーションを干渉しないようにハイブリダイゼーションの初期温度を選択する。しかしながら、ハイブリダイゼーション混合物の温度が標的ハイブリダイゼーションについて用いられる温度より低く調整される場合、ブロッカープローブはCSPにハイブリダイズして、CSPが交差反応性核酸配列にハイブリダイズするのを効率的にブロックする。例えば、ハイブリダイゼーション生成物をハイブリッド捕捉の間、ストレプトアビジンコーティング化マイクロタイタープレート上で、室温でインキュベートする時に、ブロッカープローブを添加してもよい。以下の実施例は、本増幅方法および本検出アッセイ法および本キットの使用を説明する。これらの実施例は例証として提供され、いずれの様式においても本発明の範囲を限定するものではない。本明細書に記載されているすべての引用文献は、参照として全部、明白に組み入れられている。実施例1標的特異的ハイブリッド捕捉アッセイ法プロトコール既知の濃度の単純ヘルペスウイルス1および単純ヘルペスウイルス2ウイルス粒子、コロンビア、MDまたは臨床試料を陰性対照培養液、ゲーサーズバーグ、MDまたは陰性子宮頸検体のいずれかを用いて、希釈した。様々な希釈溶液を作製し、個々のミクロチューブへ等分した。変性試薬51000431の半量を添加した。試験試料を試料中の核酸の変性のために65°Cで45分間インキュベートした。変性に続いて、シグナル配列プローブおよび捕捉配列プローブを含むハイブリダイゼーション溶液を試料へ添加し、74°Cで1時間インキュベートした。4xプローブ希釈液の1容量を含む溶液中のブロッカープローブ、1容量の変性試薬、および2容量の陰性対照培養液をその後、ハイブリダイゼーション混合物へ添加し、74°Cで15分間インキュベートした。実験の第二シリーズにおいて、核酸の変性に続いて、SSP、CSP、およびブロッカープローブを含むハイブリダイゼーション混合液を試料へ添加し、74°Cで1時間インキュベートした。反応混合物を含むチューブを室温で5分間冷却し、各チューブから一定分量を取り、96ウェルのストレプトアビジン捕捉プレートの個々のウェルへ移した。プレートを1100rpmsで1時間、室温で振盪した。その後、上清をデカントし、プレートをハイブリッド捕捉2洗浄緩衝液で2回洗浄し、残留洗浄緩衝液を除去するために一時的に逆さにした。アルカリホスファターゼ抗RNADNA抗体検出試薬1をその後、各ウェルに添加し、30分間、室温で、インキュベートした。その後、ウェルを以下の段階を含む多数の洗浄段階にさらした:1室温でシャープ洗浄緩衝液で3回洗浄;2加温ブロック上で60°Cで10分間、シャープ洗浄緩衝液でプレートのインキュベーション;3室温でシャープ洗浄緩衝液で2回洗浄;および4室温でSNM洗浄緩衝液で1回洗浄。残留液体の除去に続いて、発光基質51000350を各ウェルへ添加し、室温で15分間インキュベートした。個々のウェルをその後、プレート照度計で読み取って相対光ユニットのシグナルを得た。陰性対照培養液または既知のHSV陰性子宮頸検体を含む溶液を試験試料についての陰性対照として使用した。シグナルノイズ比は、陰性対照の平均RLUに対する試験試料から得られる平均RLUの比として計算された。シグナルノイズ比を捕捉効率の測定および標的核酸の検出のための基準として使用した。2またはそれ以上のSN値を自由裁量によって、陽性シグナルとして割り当て、一方、2未満のSN値を陰性とみなした。1試料組内の実験の変動性の測定である変動係数は、反復試験の標準偏差を取り、それらを平均値で割り、そしてパーセント値を得るためにその値に100を掛けることにより計算された。実施例2~実施例13に記載されている実験において使用される捕捉配列プローブおよびブロッカープローブは、コックらにより記載されている方法を用いて合成された。そうでないことを示さないかぎり、本明細書に記載されている実験において使用される捕捉配列プローブは、それらの5末端および3末端がビオチンで標識されている。実施例2~実施例13に記載されている実験において使用されるシグナル配列プローブはRNAプローブであるが、本発明は、RNAを含むSSPに限定されない。これらのプローブはイスラエリらにより記載されている方法を用いて調製される。実施例2以下の表は、実施例3~実施例13に記載されている実験において使用される様々なプローブを記載する。表1HSV1プローブの由来するHSV1クローン表2HSV2プローブの由来するHSV2クローン表3HSV1についての捕捉配列プローブ括弧内の配列はHSVへの指向性はないテール配列である。表4HSV1についてのブロッカープローブ表5HSV2についての捕捉配列プローブ表6HSV2についてのブロッカープローブ表7HPVについての捕捉配列プローブ括弧内の配列はHPVへの指向性はないテール配列である。表8HPVについてのブロッカープローブ実施例3捕捉効率へのビオチン標識の大きさの影響試験は、TSHC検出にとって捕捉配列プローブあたりのビオチン標識の最適な数を決定するために行われた。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。シグナルノイズ比により測定される、1個、2個、または3個のビオチンで標識された捕捉配列プローブF15Rの捕捉効率を試験した。使用されるシグナル配列プローブはH19であった。表9に示されるように、捕捉配列プローブあたり2個のビオチンが最適の捕捉効率として十分であった。2個のビオチン標識を有する捕捉配列プローブを使用する場合、単一のビオチン標識された捕捉配列プローブと比較して、SNにおいて50以上の増加が観察された。捕捉配列プローブに3個目のビオチン標識を付加することにより、2個のビオチン標識捕捉配列プローブと比較してSNにおいて減少が生じた。表9捕捉効率へのビオチン標識の程度の影響実施例4捕捉効率へのCSPおよびSSPの標的部位間の距離の影響捕捉効率への、HSV1標的核酸上の捕捉配列プローブおよびシグナル配列プローブのハイブリダイゼーション部位間の距離の影響を評価した。SSPハイブリダイゼーション部位から02kb、3kb、18kb、36kb、および46kbの位置にあるHSV1標的核酸配列にハイブリダイズするCSPを試験した。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。捕捉効率は、それぞれ、100、50、30、19および7であった。02kbから46kbへ距離が増加するにつれて、相対的捕捉効率において一定の低下が観察された。表10捕捉効率への標的部位間の距離の影響実施例5HSV1のTSHC検出への融合化捕捉配列プローブの効果ストレプトアビジンプレートの結合能力は、ウェルにつき二倍ビオチン化CSPで約2pモルであることが測定された。CSPは二倍にビオチン標識されているので、ウェルの結合能力を超えないためには最大限8つのCSPが好ましい。提示された能力を上回るビオチン標識化捕捉配列プローブにおける少しの増加でも、いわゆるフック効果と呼ばれる、シグナルにおける減少を引き起こした。このフック効果を避けて、かつ4つ以上のSSPCSPの組合わせの使用をなお可能にするために、いっしょに融合した2つのCSPの配列を含む合成オリゴヌクレオチドの効果を試験した。融合化捕捉配列プローブは、独立的に機能して、固有の標的部位へのハイブリダイゼーションを行いうる。もう一つの態様において、融合化プローブは、いったんプローブが第一の部位にハイブリダイズすれば、本質的にゼロ次速度論での単分子反応であるため、恵まれた第二のハイブリダイゼーションでもって2つの標的部位へ結合しうる。ハイブリダイゼーションは1つまたは両方の機構により決定されてもよい。以前の実験では、2つのCSPである、VH3およびNC1が、いっしょに使用される場合、個々のCSPの約2倍のSNを与えることが示された。非融合化捕捉配列プローブVH3およびNC1は、5pモルmlの全濃度に対して各25pモルmlで使用され、融合化プローブVH4は25pモルmlで使用された。表11に示されるように、融合化プローブは2つの非融合化プローブの組合わせと同じくらいに効果的であった。それゆえ、融合化捕捉配列プローブを使用するTSHC検出は、プレートのビオチン結合能力を超えることなく、シグナル配列プローブにより標的される核酸配列の数を少なくとも2倍にすることを可能にする。実験はまた、20未満のSN値により示されているように、107ゲノムでHSV2の交差反応性はないことを証明している。表11HSV1のTSHC検出における融合化捕捉配列プローブ対非融合化の捕捉配列プローブの比較実施例6HSV1のTSHC検出における様々なCSPおよびSSPの捕捉効率TSHCによるHSV1の検出において、4つのHSV1特異的シグナル配列プローブである、H19、RH5B、RH3およびR10のそれぞれについて捕捉配列プローブの捕捉効率を評価した。捕捉配列プローブを設計するために用いられる基準は以下のとおりである:1CSPハイブリダイゼーション部位は、HSV1核酸配列上においてSSPハイブリダイゼーション部位の5または3のいずれかの1kb以内、好ましくは05kb以内である;および2CSPは、10塩基以上のHSV2に相同的な配列のひと続きをもたず、HSV1に固有の配列を含む。CSPは、SSPハイブリダイゼーション部位に隣接する5領域および3領域を、好ましくは各SSPに対して5CSPおよび3CSPで標的するように設計された。オミガソフトウェア、キャンベル、CAをそのような部位の同定における手段とした。CSPの融解温度は、HSVについてのハイブリッド捕捉IIアッセイ法において用いられる70°C~75°Cのハイブリダイゼーション温度と同じになるように、70°C~85°Cの間であるように設計された。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。H19について11個のCSP、RH5Bについて6個のCSP、RH3について6個のCSP、およびR10について2個のCSPを試験した。表12に示されるように、シグナル配列プローブH19、RH5BおよびR10について、効率的な捕捉配列プローブが見出された。表12HSV1のTSHC検出のためのCSPおよびSSP実施例7HSV2のTSHC検出における様々なCSPおよびSSPの捕捉効率TSHCによるHSV2の検出において、4つのHSV2特異的シグナル配列プローブ、E4A、E4B、Ei8およびi8のそれぞれについて捕捉配列プローブの捕捉効率を評価した。HSV2特異的捕捉配列プローブは、それらがHSV2特異的であるという必要条件を除いては、HSV1のCSPと同じ基準に基づいて設計された。E4Aについては4個のCSP、E4Bについては3個のCSP、ならびにEi8およびi8については各2個のCSPを試験した。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。表13に示されるように、i8およびEi8について、効率的な捕捉配列プローブが見出された。表13HSV2のTSHC検出のためのCSPおよびSSP実施例8HSV1およびHSV2の検出へのブロッカープローブの効果捕捉段階を室温で起こるようにさせておきながら、TSHCの交差反応性を低下させる試みにおいて、ブロッカープローブを使用する方法を開発した。ブロッカープローブは、検出のために使用される捕捉配列プローブに相補的である配列を含む。これらの実験は、より低いストリンジェンシー条件、室温捕捉段階の間にしばしば遭遇する状況下において、CSPの試料中に存在する非標的核酸への非特異的ハイブリダイゼーションを防ぐために設計された。一つの方法において、完全長または完全長に近い捕捉配列プローブに相補的なブロッカープローブを使用した。ブロッカープローブは、CSPおよびSSPの標的DNA分子へのハイブリダイゼーションが起こった後、CSPの割合に対して10倍の超過量で反応混合物へ添加された。ブロッカープローブはCSPと類似した融解温度をもつため、CSPを最初に標的核酸にハイブリダイズさせて、CSPの標的核酸へのハイブリダイゼーションが起こる前にブロッカープローブのCSPへのハイブリダイゼーションが起こることを防ぐ。表14に示されるように、ブロッカープローブの添加により、これらのプローブがHSV1検出の感度に影響を及ぼすことなく、交差反応性における劇的な低下を生じた。ブロッカープローブを使用した場合、交差反応性のHSV2の検出についてのSNは50から08へ減少した。もう一つの方法において、CSPの部分のみに相補的でかつCSPより短いブロッカープローブを使用した。ブロッカープローブは、室温より高いが、CSPの標的核酸へのハイブリダイゼーション温度より少なくとも10°C低い融解温度をもつように設計された。これらのブロッカープローブはCSPの標的核酸へのハイブリダイゼーション温度より低い温度でCSPにハイブリダイズするため、CSPの標的核酸へのハイブリダイゼーション効率に影響を及ぼすことなく、CSPおよびSSPと同時に反応へ添加されうる。これらの短い方のブロッカープローブは、室温捕捉段階の間に起こるより低い温度でCSPにハイブリダイズすることにより、室温捕捉段階の間に機能する。表15に示されるように、単一かまたは対のいずれか短い方のブロッカープローブを、CSPの割合に対して100倍の超過量で添加することにより、HSV1検出の感度には影響を及ぼさず、交差反応性における劇的な低下が生じた。ブロッカープローブ無しで交差反応性のHSV2を検出することについてのSNは、106であったが、ブロッカープローブの添加により15未満または同等にまで低下した。それゆえに、ブロッカープローブを利用する両方の方法は、交差反応性に実質的な低下をもたらす。低い方の融解温度をもつブロッカープローブを利用する第二の方法は、捕捉配列プローブと同時にブロッカープローブを添加することで検出方法についての余分な段階が必要とされなくなるため、好ましいかもしれない。表14捕捉プローブハイブリダイゼーション後に添加されるブロッカープローブのTSHCへの効果表15捕捉プローブと同時に添加されるブロッカープローブのHSV1のTSHC検出への効果実施例9TSHC検出がベクターバックグラウンドを低下させるTSHCアッセイ法は、ハイブリッド捕捉II検出アッセイ法に関連することが多いベクター混入問題を排除する。HCIIに使用されるRNAシグナル配列プローブは線状化ベクター鋳型から作成されるので、いくらか残存している非線状化プラスミドDNAによりベクター配列に特異的な追加的RNAプローブ配列の産生が生じる。HCIIアッセイ法において、これらの読み過ごし転写の結果として形成するRNADNAハイブリッドが抗体コーティング化プレート上に捕捉されて、シグナルを生じる。対照的に、TSHC法において、捕捉配列プローブにもまたハイブリダイズするそれらのRNADNAのみが検出される。したがって、ベクター関連配列のどの検出も排除される。HSVHCII試験において検出可能であることが知られているプラスミドSK、pBR322、DgZ、および1066を2つのRNAシグナル配列プローブおよび2つの捕捉配列プローブを使用するTSHCアッセイ法において試験した。その後、RNAプローブの同一の組をHSV1の検出についてのHCII法およびTSHC法に使用した。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。表16に示されるように、標準HCIIにおけるシグナルノイズ比は14~48の範囲であったが、TSHC法についてのシグナルノイズ比は試験されたすべてのプラスミドについて2未満であった。表16TSHC対HCIIの検出におけるベクターバックグラウンド実施例10TSHCによりHSV1およびHSV2を検出することの感度および特異性HSV1およびHSV2のTSHC検出についての感度および分類識別力を実施例1に記載されているTSHCを用いて評価した。HSV1のTSHCアッセイ法において、シグナル配列プローブH19およびRH5B、捕捉配列プローブHZ1、VH2およびVH4、ならびにブロッカープローブNG7、NG8、GP3、GP4およびGP1を使用した。HSV2のTSHCアッセイ法において、シグナル配列プローブi8およびEi8、捕捉配列プローブNF1およびNF2、ならびにブロッカープローブHX4、HX5およびGP8を使用した。HSV1およびHSV2のウイルス粒子は、陰性対照溶液を用いて様々な濃度に希釈された。図4および図5に示されるように、104のコピーのHSV1またはHSV2のどちらも、それぞれのアッセイにおいて検出されたが、108コピーmlまでの濃度で、交差反応性型のHSVの検出は事実上なかった。このように、HSV1およびHSV2のTSHCアッセイ法は、優れた感度ウェルを維持しながら、10000倍以上の識別範囲で2つのHSV型を区別することができる。HSV1のTSHCアッセイ法は、少なくとも2x103VPmlから5x103VPmlの範囲にかけて検出の直線区域を示す。アッセイ法の特異性は、2x107ウイルス粒子ml~5x107ウイルス粒子mlほどの高い濃度のHSV2を含む試料において交差反応性が検出されなかったくらいに優れている。同様に、HSV2のTSHCアッセイ法もまた優れた特異性を示し、5x107ウイルス粒子mlほどの高い濃度のHSV1を含む試料において交差反応性が検出されなかった。同様の結果は、HSV2およびHSV1のウイルスの希釈シリーズを用いるHSV2のTSHC検出から得られた。表17HSV1のTSHCアッセイ法の分析的感度および特異性表18HSV2のTSHCアッセイ法の分析的感度および特異性表19異なる希釈度のHSV1およびHSV2を用いるHSV2プローブでの検出実施例11臨床検体試験TSHC法およびHCII法の両方を用いて、64人の臨床検体パネルをHSV1およびHSV2について検査した。パネルは、既知量のHSV1またはHSV2を含む15試料、およびPCR試験によりHSV1およびHSV2について陰性であることがわかっている49試料を含んだ。したがって、15個の陽性試料はHCIIおよびTSHCのアッセイ法の両方において、陽性の試験結果となることが予想され、かつ49個の陰性試料はHCIIおよびTSHCの試験の両方において陰性の試験結果となることが予想された。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。HCII法およびTSHC法を用いての結果は、それぞれ、表20および表21に示されている。陰性結果が生じることを予想されている49試料のうち、HCII法を用いた場合、5試料が陽性の試験結果となり、かつ44試料が陰性の試験結果となった。対照的に、TSHC法を用いた場合、すべての49試料が陰性の試験結果となった。それゆえ、TSHC法は、HSV1およびHSV2の検出において、HCII法よりも特異性について優れている。表20HSV1およびHSV2のHCII検出についての観察結果対予想結果表21HSV1およびHSV2のTSHC検出についての観察結果対予想結果実施例12HSVのTSHC検出におけるプローブを組み合わせることの効果HSV1検出におけるHSV1特異的シグナル配列プローブおよび捕捉配列プローブの組を組み合わせることの効果を評価した。HSV1およびHSV2交差反応性のTSHC検出をRNAシグナル配列プローブビオチン化捕捉配列プローブの組合わせの2つの異なる組で別々に行った。TSHCはまた、両方のRNAシグナル配列プローブビオチン化捕捉配列プローブの組を組み合わせて、2つのプローブ組を組み合わせることの感度および交差反応性への効果を評価するために行われた。実施例1に記載されている一般的なTSHC法を用いた。表22に示される結果より、HSV2交差反応性に明らかな増加もなく、HSV1検出についての2つのプローブ組を組み合わせることの相加作用が明らかに示されている。表22HSV1特異的CSPおよびSSPを組み合わせることにより感度が上昇する実施例13HPV18およびHPV45のTSHC検出ヒトパピローマウイルス18およびヒトパピローマウイルス45のTSHCおよびHCII検出の相対的感度および特異性を比較した。以前の研究より、HPV18に対する最も交差反応性が高いHPV型としてHPV45が、かつ逆に、HPV45に対する最も交差反応性が高いHPV型としてHPV18が確立されている。この研究において、HPV18およびHPV45を検出する2つの方法の能力をHPV18およびHPV45のプラスミドDNAを使用して評価した。4つのヒトパピローマウイルス型:HPV16、HPV18、HPV31およびHPV45のそれぞれについて捕捉配列プローブを設計した。捕捉配列プローブを設計するために用いられる基準は以下のとおりであった:1CSPハイブリダイゼーション部位はSSP部位と重複しない;2CSPは、12塩基以上の他のHPV型に相同的な配列のひと続きをもたない、1つのHPV型に固有の配列を含む;および3CSPは、70°Cで効率的にハイブリダイズすることができるのに十分な長さである。各CSPについてのブロッカープローブは、標的核酸へのハイブリダイゼーションの間に、CSPと同時に添加されることができるように設計された。ブロッカープローブは、オリゴ50プログラム、プリマス、MNにより計算される場合、少なくとも37°Cだが60°Cより高くない融解温度を有する。2つのブロッカープローブが、室温プレート捕捉段階の間にブロッカー効果を最大化するように、各捕捉オリゴヌクレオチドに対して使用された。各CSPに対するブロッカープローブが類似した融解温度を有することもまた望ましかった。各HPV型についてのCSPは、相対的捕捉効率および他のHPV型への交差反応性について試験された。感度および低交差反応性の最高の組合わせを与えるCSPをTSHCを用いるHPVの検出に使用した。HPV18のTSHCおよびHCIIの検出において、HPV18DNAは、10pgmlの濃度で使用された。交差反応性試験に使用されるHPV45は4ngmlで使用された。実施例1に記載される一般的なTSHC法を用いた。表23に示されるように、HPV18のHCII検出について得られた76という比と比較して、HPV18のTSHC検出について169というシグナルノイズ比が得られた。他方、HPV45との交差反応性は、TSHC法を用いる場合、有意的に低下した。その結果より、HCII法と比較して、HPV18の検出についてのTSHC法は、感度および特異性の両方において優れていたことが明らかに示されている。HPV45のTSHCおよびHCIIの検出を比較する実験において得られた結果より、HPV45の検出についてTSHC法が感度および特異性の両方において優れていることが証明されている。表23HPV18のTSHC検出表24HPV45のTSHC検出実施例14標的特異的ハイブリッド捕捉プラスアッセイ法プロトコールB型肝炎ウイルスは、標的核酸の検出についての標的特異的ハイブリッド捕捉プラスアッセイ法の開発のためのモデル系として使用された。TSHCプラス法におけるハイブリダイゼーションは、単一段階として行われてもよい。1段階法において、CSP、プレハイブリダイズされたDNARNA二重鎖を含むSSP、架橋プローブ、およびブロッカープローブは、標的核酸へ同時に添加される。ハイブリダイゼーションが2段階で行われる場合には、CSP、プレハイブリダイズされたDNARNA二重鎖非含有SSP、架橋プローブおよびブロッカープローブが最初に、標的核酸にハイブリダイズされる。SSPにおける一本鎖核酸配列に相補的なオリゴヌクレオチドプローブが、その後、DNARNA二重鎖を形成するために、その反応に添加される。ハイブリッドは、その後、実施例1に記載されているように、抗RNADNA抗体を用いて検出される。実験は、TSHCプラスを用いてHBVを検出するために行われた。図6Aに示される方法を用いた。既知の濃度のヒトB型肝炎ウイルスプラスミドDNAをHBV陰性試料希釈液を用いて希釈した。様々な希釈溶液を作成し、個々のチューブへ等分した。陰性試料希釈液は、陰性対照として使用された。変性試薬51000431の半量を試験試料へ添加した。試験試料を試料中の核酸を変性させるために65°Cで45分間インキュベートした。HBV試料の変性に続いて、捕捉配列プローブ、ブロッカープローブ、M13DNAM13RNA二重鎖を含むシグナル配列プローブ、およびSSPおよびHBV配列の両方にハイブリダイズすることができる一本鎖または部分的一本鎖のDNA配列の架橋プローブを含むハイブリダイゼーション溶液を試料に添加し、65°Cで1~2時間、インキュベートした。または、変性された試料を捕捉配列プローブ、ブロッカープローブおよびHBV相補的配列を含むM13DNAプラスミドを含むハイブリダイゼーション溶液とともに、1時間インキュベートした。インキュベーションに続いて、M13RNAをその反応に添加し、65°Cでさらに1時間、インキュベーションを続けた。反応混合物を含むチューブを室温で5分間冷却し、各チューブから一定分量を取り、96ウェルのストレプトアビジンプレートの個々のウェルへ移した。プレートを1100rpmsで1時間、室温で振盪した。その後、溶液をデカントして、プレートをSNM洗浄緩衝液で4回洗浄した。アルカリホスファターゼ抗RNADNA抗体DRIを各ウェルへ添加し、室温で30分間インキュベートした。その後、DRIをデカントして、プレートをSNM洗浄緩衝液で4回洗浄した。残留洗浄緩衝液の除去に続いて、発光性物質、トロピックス社を各ウェルへ添加し、室温で15分間インキュベートした。個々のウェルは、相対光ユニットシグナルを得るために、プレート照度計で読み取られた。実施例15以下の表は、実施例16~実施例18に記載した実験において試験される様々なプローブを記載する。表25HBVについての捕捉配列プローブ表26SSPの調製されるHBVM13クローン表27HBVブロッカープローブ実施例16HBVのTSHCプラス検出へのブロッカープローブの効果室温捕捉段階の間、CSPへ非特異的にハイブリダイズする過剰SSPは、プレート上へ固定化され、その結果として高バックグラウンドシグナルを生じる。バックグラウンドシグナルを低下させる試みにおいて、ブロッカープローブをHBVのTSHCプラス検出に使用した。ブロッカープローブは、アッセイ法で用いられるハイブリダイゼーション温度より十分に低い温度で捕捉プローブにハイブリダイズすることしかできないように、CSPよりかなり短く設計された。CSPに相補的である2つの別々のオリゴヌクレオチドから成るブロッカープローブの組を使用した。ブロッカープローブをCSPの割合に対して10倍の超過量でハイブリダイゼーション混合物に添加した。ブロッカープローブはCSPよりかなり短いため、標的ハイブリダイゼーション温度ではCSPにハイブリダイズせず、それゆえ、CSPの標的核酸へのハイブリダイゼーションを干渉しない。CSPおよび標的核酸のハイブリダイゼーションに続いて、試料を室温捕捉段階にさらし、その間にブロッカープローブが過剰CSPにハイブリダイズして、それらがSSPにハイブリダイズするのを防いだ。表28に示されるように、ハイブリダイゼーション反応でのブロッカープローブの使用により、アッセイ法のバックグラウンドシグナルが大幅に低下した。表28HBV検出へのブロッカープローブの効果実施例17HBVのTSHCプラス検出へのSSPの長さの影響SSPを産生するためのM13ベクターへ挿入されるDNA配列の長さのHBVのTSCHプラス検出への影響を研究した。20pgmlのHBVプラスミドDNAを含む陽性対照を使用した。表29に示されるように、SSPにおいて長い方のHBV相補的配列の使用が、検出のシグナルに実質的な増加を生じた。短い方のプローブのTmはハイブリダイゼーション温度より15度上であるため、最適状態に及ばないハイブリダイゼーション温度条件のせいである可能性は低い。SSPに形成されるM13RNADNA二重鎖は、そのプローブにおける相補的DNA配列が標的核酸中のHBV配列にハイブリダイズすることを部分的に妨害するように作用するため、SSPにおいて相補的配列の長い方がこの妨害に打ち勝つのかもしれない。表29HBVのTSHCプラス検出へのSSPにおける相補的配列の長さの影響実施例18HBVのTSHCプラスおよびHCII検出HBVのTSHCプラスおよびHCII検出の相対的感度を比較した。3つの異なる濃度のHBV陽性標準を実験において試験した。表30に示されるように、TSHCプラス検出方法を用いて得られたシグナルは、HCII検出方法を用いて得られたものより約2倍高かった。表30HBVのTSHCプラスおよびHCII検出相対光ユニットとして測定されるシグナル実施例19SNPの標的特異的ハイブリッド捕捉検出のための試料調製SNPを検出するためのTSHC法の態様として、標的分子としてp53DNAを用い、かつp53コード領域のコドン72での多型またはSNPを識別することを本明細書において実証されているハイブリッド捕捉SNP法を提供する。アンチセンス鎖上のコドン72での2つのp53多型は、アルギニンをコードするgCg、およびプロリンをコードするアンチセンス鎖上のp53コドン72、gGgである。2つの多型をp53Argおよびp53Proと呼ぶ。これはHCSNP法がヌクレオチドの特異的検出として用いられるSNPである。HCSNP法がプローブ、プローブ標識、および標的のこれらの特定の型に限定されるのではなく、TSHC法として記載される変形の全範囲をも含むことができることは理解される。PCR単位複製配列またはゲノムDNAのいずれかを含む試料をHCSNP態様における多型検出についての標的として使用した。ゲノムDNAを使用することは、診断的適用にとって特に有用でありえる。PCR単位複製配列の調製について、2つのプライマー、例えば、上流プライマーおよび下流プライマーを使用したら、JMolMed77299~3021999により記載。これらのプライマーは、以下を含むプログラムを利用して、p53エキソン4領域の増幅のために特に選択された:a95°Cで4分間;b94°Cで40秒間;c62°Cで40秒間;d72°Cで40秒間;e72°Cで6分間;およびf保管のためまたは使用前は4°Cであり、段階b~dはDNA鋳型の質しだいで25~45サイクル繰り返される。その後、PCR単位複製配列は、試験前に、TE、pH74中で11000または1100に希釈された。ゲノムDNAの調製のためのゲノムDNA試料の無制限な例には、限定されるものではないが、ヒト体液、細胞、組織、およびパラフィンブロック中の保管用組織を含む。ゲノムDNAの単離は、適切なキットを使用して行われた。標的の増幅段階を迂回して直接的に多型を検出するためには、およそ、試験一組につき10μg~20μgの単離されたゲノムDNAが必要とされた。各DNA標的は、p53Arg特異的およびp53Pro特異的捕捉オリゴで別々に試験された。シグナルノイズ比は計算され、p53Pro特異的SNに対するp53Arg特異的SNの比は試料の遺伝子型を同定するために用いられた。ホモ接合体対ヘテロ接合体を決定するためのSNP試験結果の例は表31に示されている。これらの試験の結果はウェーブ分析;サンタクララ、CAおよびDNA配列分析により確認された。実施例20SNPを検出するための標的特異的ハイブリッド捕捉法プラスミドDNAをキアプレップスピンミニプレップキット;バレンシア、CAを使用して細菌培養から調製した。ゲノムDNAをDNイージー組織キットを使用して細胞系から調製した。プラスミドDNAおよび臨床試料DNAを前に記載されているPCR法を用いて増幅した。使用前に、PCR増幅されたDNAをTE、pH74中で11000に希釈し、プラスミドDNA試料をTE、pH74中で100pgmlに希釈した。試験につき、希釈されたPCR増幅DNAまたはプラスミドDNAの5マイクロリットルを使用した。試験につきHeLa、ジャーカット、およびSiHaのゲノムDNAそれぞれについて、5μg、7μg、および10μgを含む50マイクロリットルの抽出されたゲノムDNA試料をを使用した。各試料は各アッセイ法について独立して2回試験された。第一試験はp53ArgCSPおよびp53SSPを使用して行われた。第二試験はp53ProCSPおよびp53SSPを使用して行われた。ウェルあたり50μlの最終容量で水およびDNA標的の混合物をハイブリダイゼーションマイクロプレートへ添加した。ウェルあたり変性試薬51000431を添加した。プレートをプレートシーラーでカバーし、プレート振盪機上で1100rpm、10~30秒間撹拌した。反応物をマイクロプレートヒーターI;サニーバレー、CAで65°C、25分間変性させた。変性段階の間、プローブ混合物を調製した。p53Arg特異的プローブ混合物は、15pモルmlの16塩基長Arg特異的CSP、600ngmlのp53SSP、および4Xプローブ希釈液から構成された。p53Pro特異的プローブ混合物は、15pモルmlの16塩基長Pro特異的CSP、600ngmlのp53SSP、および4Xプローブ希釈液から構成された。各プローブ混合物を変性された試料に添加した。プレートをプレートシーラーでカバーし、プレート振盪機を用いて、1100rpmで、10~30秒間撹拌した。試料をマイクロプレートヒーターで65°C、1時間、ハイブリダイズさせた。ハイブリダイズされた試料を室温で5~10分間、インキュベートした。ハイブリダイゼーション反応物を96ウェルのストレプトアビジンプレートへ移し、プレートシーラーでカバーした。ハイブリッドを45°Cで45分間、900rpmで撹拌しながら、SAプレート上へ捕捉させた。CSPハイブリダイズ化標的の固定化は、例えば、96ウェルプレートのウェルの中へ置かれているハイブリダイゼーション溶液中で行わせることができ、そしてプレートを15分~2時間、20°C~90°Cの範囲の温度で振盪し、好ましくは室温で1時間、1100rpmsで振盪する。室温より上の捕捉温度は、プレート捕捉段階の間にハイブリダイゼーションが起こってしまう場合には、ストリンジェンシーレベルを上げることとして好ましいかもしれない。上清をデカントし、ウェルにつき100μlのDR1を捕捉RNADNAハイブリッドの検出のために添加した。プレートを室温で30分間、撹拌せずにインキュベートした。上清を捨て、プレートを室温シャープ洗浄緩衝液で2回洗浄した。その後、ウェルをシャープ洗浄緩衝液で再び満たし、プレートを60°Cで10分間、インキュベートした。その後、プレートを室温シャープ洗浄緩衝液で2回、室温ハイブリッド捕捉2洗浄緩衝液で1回、洗浄した。プレートから残留洗浄緩衝液を吸い取った。化学発光性リン酸化基質、DR2を添加し、反応物を室温で15分間、撹拌せずにインキュベートした。活性化された基質を測定し、プレート照度計を用いて分析した。表31HCSNPからの遺伝子型データ様々な好ましい態様の前記述は、実例および説明の目的のために提供され、開示された精密な形態に網羅させるものでも限定するものでもない。上記開示に照らして、明らかな変更または変形は可能である。考察された態様は、実例およびそれの実践的適用を提供して、それらにより当業者が様々な態様および企図される特定の使用に適応するように様々な変更をもって利用することを可能にするために、選択かつ記載された。特許請求の範囲の公正に、法律的におよび衡平法的に権利を与えられる外延に従って解釈される場合、すべてのそのような変更および変形は添付の特許請求の範囲により決定される体系内である。