"操作されたHAポリペプチドであって、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が、アルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンからなる群より選択される、配列番号1の137位に対応する位置のアミノ酸残基残基137;アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の193位に対応する位置のアミノ酸残基残基193;アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の226位に対応する位置のアミノ酸残基残基226;ならびにアルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニンおよびチロシンからなる群より選択される、配列番号1の228位に対応する位置のアミノ酸残基残基228を含むことを特徴とする、操作されたHAポリペプチド。前記残基137がアルギニン、リシン、グルタミンおよびメチオニンから選択される、請求項1に記載の操作されたHAポリペプチド。前記残基193がアラニン、グルタミン酸、スレオニン、システイン、メチオニン、バリンおよびセリンからなる群より選択される、請求項1に記載の操作されたHAポリペプチド。前記残基226がロイシン、イソロイシンおよびバリンからなる群より選択される、請求項1に記載の操作されたHAポリペプチド。前記残基228がアルギニン、アスパラギン、セリン、グリシンおよびスレオニンからなる群より選択される、請求項1に記載の操作されたHAポリペプチド。操作されたHAポリペプチドであって、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が、アルギニンであるアミノ酸残基137、スレオニンであるアミノ酸残基193、ロイシンであるアミノ酸残基226、およびセリンであるアミノ酸残基228を含むことを特徴とする、操作されたHAポリペプチド。H2ポリペプチドである、前述の請求項のいずれか一項に記載の操作されたHAポリペプチド。高親和性でアンブレラトポロジーグリカンに結合することを特徴とする、前述の請求項のいずれか一項に記載の操作されたHAポリペプチド。請求項8に記載の操作されたHAポリペプチドであって、ヒト伝染性の同じサブタイプの野生型HAの親和性と同等の親和性で、前記アンブレラトポロジーグリカンに結合する、操作されたHAポリペプチド。請求項8に記載の操作されたHAポリペプチドであって、ヒト伝染性の同じサブタイプの野生型HAの親和性の少なくとも50の親和性で、前記アンブレラトポロジーグリカンに結合する、操作されたHAポリペプチド。請求項8に記載の操作されたHAポリペプチドであって、ヒト伝染性の同じサブタイプの野生型HAの親和性の少なくとも70の親和性で、前記アンブレラトポロジーグリカンに結合する、操作されたHAポリペプチド。請求項8に記載の操作されたHAポリペプチドであって、ヒト伝染性の同じサブタイプの野生型HAの親和性の少なくとも90の親和性で、前記アンブレラトポロジーグリカンに結合する、操作されたHAポリペプチド。請求項8に記載の操作されたHAポリペプチドであって、ヒト伝染性の同じサブタイプの野生型HAの親和性の少なくとも100の親和性で、前記アンブレラトポロジーグリカンに結合する、操作されたHAポリペプチド。コーントポロジーグリカンと比較してアンブレラトポロジーグリカンに優先的に結合する、請求項1から13のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。コーントポロジーグリカンに対する少なくとも2の相対的親和性で、アンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項1から13のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。コーントポロジーグリカンに対する少なくとも4の相対的親和性で、アンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項1から13のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。コーントポロジーグリカンに対する少なくとも10の相対的親和性で、アンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項1から13のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。コーントポロジーグリカンに対する少なくとも20の相対的親和性で、アンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項1から13のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。低親和性でコーントポロジーグリカンに結合することを特徴とする、請求項1から18のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。約200pM以下のKd’でアンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項1から19のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。約100pM以下のKd’でアンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項19に記載の操作されたHAポリペプチド。約50pM以下のKd’でアンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項19に記載の操作されたHAポリペプチド。約20pM以下のKd’でアンブレラトポロジーグリカンに結合する、請求項19に記載の操作されたHAポリペプチド。約100pM以上のKd’でコーントポロジーグリカンに結合する、請求項1から23のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチド。約200pM以上のKd’でコーントポロジーグリカンに結合する、請求項23に記載の操作されたHAポリペプチド。約500pM以上のKd’でコーントポロジーグリカンに結合する、請求項23に記載の操作されたHAポリペプチド。約1nM以上のKd’でコーントポロジーグリカンに結合する、請求項23に記載の操作されたHAポリペプチド。高親和性でアンブレラトポロジーグリカンに結合し、低親和性でコーントポロジーグリカンに結合することを特徴とする、請求項1に記載の操作されたHAポリペプチド。約200pM以下のKd’でアンブレラトポロジーグリカンに結合し、約200pM以上のKd’でコーントポロジーグリカンに結合する、請求項28に記載の操作されたHAポリペプチド。請求項1から29のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチドを含む組成物を投与することによる、インフルエンザ感染を処置する方法。請求項1から29のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチドを含むワクチン組成物。弱毒化生ウイルスを含む、請求項31に記載のワクチン組成物。ウイルス様粒子を含む、請求項31に記載のワクチン組成物。サブユニットワクチンである、請求項31に記載のワクチン組成物。アジュバントをさらに含む、請求項1から34のいずれかに記載のワクチン組成物。請求項31から35のいずれかに記載のワクチン組成物を、インフルエンザウイルスに感染しているかまたは感染が疑われる個体に投与するステップを含む、方法。操作されたHAポリペプチドであって、改善は、アルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンからなる群より選択される、配列番号1の137位に対応する位置のアミノ酸残基残基137;アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の193位に対応する位置のアミノ酸残基残基193;アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の226位に対応する位置のアミノ酸残基残基226;ならびにアルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニンおよびチロシンからなる群より選択される、配列番号1の228位に対応する位置のアミノ酸残基残基228の存在を含む、操作されたHAポリペプチド。操作されたHAポリペプチドであって、改善は、残基137のアルギニン、残基193のスレオニン、残基226のロイシン、および残基228のセリンの存在を含む、操作されたHAポリペプチド。インフルエンザ感染を処置する方法であって、改善は、操作されたHAポリペプチドの含有、調製および/または使用を含み、該操作されたHAポリペプチドは、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が、アルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンからなる群より選択される、配列番号1の137位に対応する位置のアミノ酸残基残基137;アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の193位に対応する位置のアミノ酸残基残基193;アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の226位に対応する位置のアミノ酸残基残基226;ならびにアルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニンおよびチロシンからなる群より選択される、配列番号1の228位に対応する位置のアミノ酸残基残基228を含むことを特徴とする、方法。インフルエンザ感染を処置する方法であって、改善は、操作されたHAポリペプチドの含有、調製および/または使用を含み、該操作されたHAポリペプチドは、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が、残基137にアルギニン、残基193にスレオニン、残基226にロイシン、および残基228にセリンを含むことを特徴とする、方法。望ましい結合剤を同定する方法であって、改善は、操作されたHAポリペプチドの使用を含み、該操作されたHAポリペプチドは、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が、アルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンからなる群より選択される、配列番号1の137位に対応する位置のアミノ酸残基残基137;アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の193位に対応する位置のアミノ酸残基残基193;アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択される、配列番号1の226位に対応する位置のアミノ酸残基残基226;ならびにアルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニン、グリシンおよびチロシンからなる群より選択される、配列番号1の228位に対応する位置のアミノ酸残基残基228を含むことを特徴とする、方法。望ましい結合剤を同定する方法であって、請求項1から29のいずれかに記載の操作されたHAポリペプチドの使用を含む、方法。望ましい結合剤を同定する方法であって、改善は、操作されたHAポリペプチドの使用を含み、該操作されたHAポリペプチドは、該操作されたHAポリペプチドのアミノ酸配列が残基137にアルギニン、残基193にスレオニン、残基226にロイシン、および残基228にセリンを含むことを特徴とする、方法。本発明は、アンブレラトポロジーumbrella-topologyグリカンとコーントポロジーcone-topologyグリカンとを識別する高い能力を示す結合剤を提供する。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、操作されたHAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、操作されたH2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、本明細書に記載のRTLSHAポリペプチド例えばRTLSH2HAポリペプチドによって示されるものと少なくとも同様に有効な、アンブレラトポロジーグリカンとコーントポロジーグリカンとを識別する能力を示す。いくつかの実施形態では、本発明は、本明細書においてRTLSと称する配列エレメントを含む、操作された血球凝集素HAポリペプチドを特に提供する。本明細書において記載の通り、RTLSエレメントはHAポリペプチドの残基137、193、226および228に対応する位置での特定のアミノ酸の存在を表す。いくつかの実施形態では、本発明は、例えば改善された、操作されたHAポリペプチドが、137、193、226および228に対応する位置に、ある特定のアミノ酸残基を有する、操作されたHAポリペプチドに対する改善を提供する。本明細書に記載の通り、そのようなHAポリペプチドは、先行技術での操作されたHAポリペプチドを含む先行技術HAポリペプチドと比較して種々の予測されない、有用な特徴を有する。本発明は、例えば、提供される結合剤に関連する診断用および治療用の試薬および方法ワクチンを含むも提供する。提供される試薬および方法は、とりわけ医療活動において、例えばワクチンの送達において、および/または例えばインフルエンザウイルスでの感染の処置もしくは予防のために有用である。いくつかの実施形態では、提供される試薬および方法はヒトの処置において特に有用である。いくつかの実施形態では、本発明は、いくつかの診断および/または治療用の試薬および方法に対する改善であって、例えば本明細書に記載の操作されたHAポリペプチドおよび/または137、193、226および228に対応する位置に、ある特定のアミノ酸残基を有するHAポリペプチドの含有、調製および/または使用を含む、改善を提供する。本発明は、例えば、アンブレラトポロジーグリカンとコーントポロジーグリカンとを有効に識別する結合剤を同定するための系および試薬も提供する。いくつかの実施形態では、そのような結合剤は、本明細書に記載のRTLSHAポリペプチド例えばRTLSH2HAポリペプチドが行うのと少なくとも同様の強い識別能力を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、特定の基準と比較してアンブレラトポロジーグリカンへの増強された結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、特定の基準と比較してコーントポロジーグリカンへの低下した結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、特定の基準と比較してアンブレラトポロジーグリカンへの増強された結合およびコーントポロジーグリカンへの低下した能力の両方を示す。いくつかの実施形態では、特定の基準は、野生型HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、特定の基準は、野生型H2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、特定の基準は、RTLSHAポリペプチド例えばRTLSH2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、本発明は、望ましい結合剤を同定するための改善された系および/または方法であって、137、193、226および228に対応する位置に、ある特定のアミノ酸残基を有するHAポリペプチド例えば操作されたポリペプチドの使用例えば比較を含む、改善された系および/または方法を提供する。いくつかの実施形態では、提供される結合剤提供されるHAポリペプチド、例えば操作されたHAポリペプチドを含むは、アンブレラトポロジーグリカンに対して約1.5nMから約2pMの範囲内の親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンに対して約1.5nMから約200pMの範囲内の親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンに対して約200pMから約10pMの範囲内の親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンに対して約10pMから約2pMの範囲内の親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤はコーントポロジーグリカンに対して2nM以上である親和性Kd’を示し;いくつかの実施形態では、提供される結合剤はコーントポロジーグリカンに対して約200pMから約2nMの範囲内である親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラグリカン対コーングリカンについて、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約20、約30、約40、約50、約60、約70、約80、約90、約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000、約100,000までまたはそれ以上である相対的親和性を示す。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、コーントポロジーグリカンに対する親和性の約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000またはそれを超えるアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性を示す。いくつかの実施形態では、本発明は、アミノ酸配列が下に記載のエレメント:X137L1X193L2X226L3X228を含むHAポリペプチド例えば操作されたHAポリペプチドを提供し、X137はアルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンからなる群より選択されるアミノ酸であり、いくつかの実施形態ではX137はアルギニンおよびリシンからなる群より選択され;いくつかの実施形態ではX137はアルギニンであり、L1はおよそ40~70アミノ酸を含むリンカーであり、X193はアラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択されるアミノ酸であり、いくつかの実施形態ではX193はアラニン、グルタミン酸およびスレオニンからなる群より選択され;いくつかの実施形態ではX193はスレオニンであり、L2はおよそ20~50アミノ酸を含むリンカーであり、X226はアラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択されるアミノ酸であり、いくつかの実施形態ではX226はロイシン、イソロイシンおよびバリンからなる群より選択され;いくつかの実施形態ではX226はロイシンであり、L2はおよそ1~15アミノ酸を含むリンカーであり、X228はアルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニンおよびチロシンからなる群より選択されるアミノ酸であり、いくつかの実施形態ではX228はアルギニン、アスパラギン、セリンおよびスレオニンからなる群より選択され;いくつかの実施形態ではX228はセリンである。いくつかの実施形態では、L1、L2およびL3のそれぞれは、X137、X193、X226およびX228が、図17および/もしくは18において示されおり、かつ/または配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号6および配列番号7からなる群より選択されるHAポリペプチドにおけるような、残基137、193、226および228と実質的に同様に、三次元空間においてお互いに配置されるような長さおよびアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、L1はおよそ40~70アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL1は50~60アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL1は53~58アミノ酸を含む。いくつかの実施形態ではL1はおよそ56アミノ酸長であり、配列番号2の残基138から192と少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99または100の同一性を示すアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態ではL2は、およそ20~50アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL2は30~40アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL2は32~35アミノ酸を含む。いくつかの実施形態ではL2はおよそ33アミノ酸長であり、配列番号2の残基194から225と少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99または100の同一性を示すアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態ではL3はおよそ1~15アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL3は1~10アミノ酸を含み、いくつかの実施形態ではL3は1~5アミノ酸を含む。いくつかの実施形態ではL3はおよそ1アミノ酸長であり、配列番号2の残基227と100の同一性を示すアミノ酸配列を有する。一態様では、本発明は、アンブレラトポロジーグリカンへの高親和性結合だけではヒトへの有効な伝染性/感染力を付与するためには十分ではない可能性があるという特定の認識を提供する。むしろ本発明はコーントポロジーグリカンへの低下した結合も重要である場合があるという知見を提供する。HA配列エレメントの記載HA配列エレメント1HA配列エレメント1は、天然のインフルエンザ単離物において見出される多数のHAタンパク質の残基97~185残基位置はH3HAを基準として用いて割り当てられている付近に対応する配列エレメントである。この配列エレメントは基本構造:CY/FPX1CX2WX3WX4HHPを有し、式中:X1はおよそ30~45アミノ酸長であり、X2はおよそ5~20アミノ酸長であり、X3はおよそ25~30アミノ酸長であり、X4はおよそ2アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、X1は約35~45または約35~43または約35、36、37、38、38、40、41、42もしくは43アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、X2は約9~15または約9~14または約9、10、11、12、13もしくは14アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、X3は約26~28または約26、27もしくは28アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、X4は配列G/AI/Vを有する。いくつかの実施形態では、X4は配列GIを有し;いくつかの実施形態では、X4は配列GVを有し;いくつかの実施形態では、X4は配列AIを有し;いくつかの実施形態では、X4は配列AVを有する。いくつかの実施形態では、HA配列エレメント1は、ジスルフィド結合を含む。いくつかの実施形態では、このジスルフィド結合は97位と139位本明細書において利用される標準的なH3番号付けシステムに基づくとに対応する残基を架橋する。HA配列エレメント2HA配列エレメント2は、天然のインフルエンザ単離物において見出される多数のHAタンパク質の残基324~340H3HAに基づく番号付けシステムを再度用いる付近に対応する配列エレメントである。この配列エレメントは基本構造:GAIAGFIEを有する。いくつかの実施形態では、HA配列エレメント2は配列:PX1GAIAGFIEを有し、式中:X1はおよそ4~14アミノ酸長または約8~12アミノ酸長、または約12、11、10、9もしくは8アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、この配列エレメントはHA0切断部位を提供し、HA1およびHA2の産生を可能にする。定義親和性:当技術分野において公知である通り、親和性は、特定のリガンド例えばHAポリペプチドの、そのパートナー例えばHA受容体への結合の緊密さの尺度である。親和性は様々な方法で測定され得る。いくつかの実施形態では、親和性は、定量的アッセイ例えばグリカン結合アッセイによって測定される。そのようないくつかの実施形態では、結合パートナー濃度例えばHA受容体、グリカンなどは、生理学的条件例えば細胞表面グリカンに結合するウイルス性HAを模倣するために、リガンド例えばHAポリペプチド濃度過剰に設定され得る。代替的にまたは付加的にいくつかの実施形態では、結合パートナー例えばHA受容体、グリカンなど濃度および/またはリガンドHAポリペプチド濃度は変更され得る。いくつかのそのような実施形態では、親和性例えば結合親和性は、比較できる条件例えば濃度下で基準例えばヒトの感染を媒介する野生型HAと比較され得る。結合:本明細書において用いられる用語結合は、薬剤間または薬剤における非共有結合を典型的には意味する。本明細書の多数の実施形態では、結合は、特定のグリカン例えばアンブレラトポロジーグリカンまたはコーントポロジーグリカンに関連して述べられる。そのような結合が任意の種々の状況において評価され得ることは当業者に理解される。いくつかの実施形態では、結合は遊離グリカンに関して評価される。いくつかの実施形態では、結合は、キャリアに付着した例えば共有結合的に連結したグリカンに関して評価される。いくつかのそのような実施形態では、キャリアはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、結合はHA受容体に付着したグリカンに関して評価される。そのような実施形態では、基準は、受容体結合またはグリカン結合に対して作製され得る。結合剤:一般に用語結合剤は、本明細書に記載のグリカン例えばアンブレラトポロジーグリカンに結合する任意の実体を意味して本明細書において用いられる。結合剤は、任意の化学型であってよい。いくつかの実施形態では、結合剤はポリペプチド例えば抗体または抗体断片を含むであり、いくつかのそのような実施形態では、結合剤はHAポリペプチドであり、他の実施形態では、結合剤はアミノ酸配列がHAの特徴的配列を含まないポリペプチドすなわち非HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、結合剤は、小分子である。いくつかの実施形態では、結合剤は核酸である。いくつかの実施形態では、結合剤はアプタマーである。いくつかの実施形態では、結合剤はポリマーであり、いくつかの実施形態では、結合剤は非ポリマーである。いくつかの実施形態では、結合剤は炭水化物である。いくつかの実施形態では、結合剤はレクチンである。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の結合剤は、アンブレラ様トポロジーを有するシアリル化グリカンに結合する。いくつかの実施形態では、結合剤は高い親和性および/または特異性でアンブレラトポロジーグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、結合剤は、コーントポロジーグリカンと比較して、アンブレラトポロジーグリカンに対して結合優先性を示す。いくつかの実施形態では、結合剤は、血球凝集素受容体上のグリカンへの結合について血球凝集素と競合する。いくつかの実施形態では、結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンへの結合について血球凝集素と競合する。いくつかの実施形態では、本明細書において提供される結合剤は、アンブレラトポロジー遮断剤である。いくつかの実施形態では、本明細書において提供される結合剤は、アンブレラトポロジー特異的遮断剤である。いくつかの実施形態では、結合剤はアンブレラトポロジーグリカン模倣物に結合する。生物学的に活性:本明細書において用いられる語句生物学的に活性は、生物系、具体的には生物において活性を有する任意の薬剤の特徴を意味する。例えば生物に投与される場合に生物に生物学的効果を有する薬剤は、生物学的に活性であると考えられる。特定の実施形態では、タンパク質またはポリペプチドが生物学的に活性である場合、タンパク質またはポリペプチドの少なくとも1つの生物学的活性を共有する、そのタンパク質またはポリペプチドの部分は、典型的には生物学的に活性な部分と称される。特徴的部分:本明細書において用いられる語句、タンパク質またはポリペプチドの特徴的部分は、アミノ酸の連続するストレッチまたはアミノ酸の連続するストレッチの集合物一緒になってタンパク質またはポリペプチドの特徴を示すを含有するものである。そのようなそれぞれの連続するストレッチは、少なくとも2個のアミノ酸を一般に含有する。さらに当業者は、典型的には少なくとも5個、少なくとも10個、少なくとも15個、少なくとも20個またはそれ以上のアミノ酸がタンパク質の特徴を示すために必要であることを理解する。一般に特徴的部分は、上に明記した配列同一性に加えて、少なくとも1つの機能的特徴を、関連するインタクトなタンパク質と共有する部分である。特徴的配列:特徴的配列は、ポリペプチドまたは核酸のファミリーの全てのメンバーにおいて見出され、かつ/または免疫原性エピトープを含む配列であり、したがってファミリーのメンバーを定義するために当業者によって用いられ得る。コーントポロジー:語句コーントポロジーは、あるグリカンによって、詳細にはHA受容体上のグリカンによって採用される三次元配置を意味して本明細書において用いられる。図3に例示される通り、コーントポロジーは、α2-3シアリル化グリカンによって、またはα2-6シアリル化グリカンによって採用される場合があり、いくつかの長いオリゴヌクレオチドもこのコンフォメーションを採用する場合があるが、これは、短いオリゴヌクレオチド鎖の典型である。コーントポロジーはNeu5Acα2-3Gal結合のグリコシドのねじれ角によって特徴付けられ、これは、約-60、約60もしくは約180のΦC1-C2-O-C3/C6値、および-60から60を抽出sampleしているΨC2-O-C3/C6-H3/C5によって与えられる最小エネルギーコンフォメーションの3つの領域を抽出している図11。図3は、コーントポロジーをとるグリカンのある代表的なしかし網羅的ではない例を示す。に対応する:本明細書において用いられる用語に対応するは、HAポリペプチドにおけるアミノ酸残基の位置/同一性を指定するためにしばしば用いられる。当業者は、簡潔さのために標準的な番号付けシステム野生型H3HAに基づくが本明細書において利用される例えば図1~2において例示される通りことを理解し、例えば190位の残基に対応するアミノ酸は、特定のアミノ酸鎖において実際に190番目のアミノ酸である必要はなく、むしろ野生型H3HAにおいて190位に見出される残基に対応し;当業者は対応するアミノ酸をどのように同定するかを容易に理解する。分離距離の程度:本明細書で用いられる、ある分離距離の程度であるアミノ酸は、グリカン結合に間接的な効果を有するHAアミノ酸である。例えば、分離距離の程度1one-degree-of-separation-removedのアミノ酸は、1直接結合アミノ酸と相互作用する;および/または2そうでなければ、直接結合アミノ酸の宿主細胞HA受容体と関連しているグリカンと相互作用する能力に影響を与える、のいずれかであり得る;このような分離距離の程度1のアミノ酸は、それ自体がグリカンに直接的に結合してよく、またはしなくてもよい。分離距離の程度2のアミノ酸は、1分離距離の程度1のアミノ酸と相互作用する;および/または2そうでなければ、分離距離の程度1のアミノ酸の直接結合アミノ酸と相互作用する能力に影響を与える、のいずれかである、などである。直接結合アミノ酸:本明細書で用いられる語句直接結合アミノ酸は、宿主細胞HA受容体と関連している1つまたは複数のグリカンと直接的に相互作用するHAポリペプチドアミノ酸を意味する。操作された:本明細書において用いられる用語操作されたは、アミノ酸配列が人によって選択されているポリペプチドを説明する。例えば、操作されたHAポリペプチドは、天然のインフルエンザ単離物において見出されるHAポリペプチドのアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、操作されたHAポリペプチドは、NCBIデータベースに含まれるHAポリペプチドのアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を有する。H2ポリペプチド:本明細書において用いられる用語H2ポリペプチドは、アミノ酸配列が、H2の特徴を示し、H2を他のHA亜型から識別する少なくとも1つの配列エレメントを含むHAポリペプチドである。代表的なそのような配列エレメントは、例えば図1に例示されるものなどのアラインメントによって決定されることができ、例えばHA配列エレメントのH2特異的実施形態に関連して本明細書に記載されるものを含む。血球凝集素HAポリペプチド:本明細書において用いられる用語血球凝集素ポリペプチドまたはHAポリペプチドは、アミノ酸配列がHAの少なくとも1つの特徴的配列を含むポリペプチドを意味する。インフルエンザ単離物由来の多種多様なHA配列が当技術分野において公知であり、実際にNationalCenterforBiotechnologyInformationNCBIは、データベースwww.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/flu.htmlを維持しており、本出願の出願時点で9796個のHA配列を含んでいた。当業者はこのデータベースを参照することによって、一般的にHAポリペプチドに、および/または特定のHAポリペプチドに例えばH1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10、H11、H12、H13、H14、H15もしくはH16ポリペプチド特徴的である配列;または特定の宿主、例えばトリ、ラクダ、イヌ、ネコ、シベット、環境、ウマ、ヒト、ヒョウ、ミンク、マウス、アザラシ、ムナジロテンstonemartin、ブタ、トラ、クジラなどの感染を媒介するHAに特徴的である配列を容易に同定できる。例えばいくつかの実施形態では、HAポリペプチドは、天然のインフルエンザウイルス単離物において見出されたHAタンパク質の残基97付近から185付近、324付近から340付近、96付近から100付近および/または130付近から230付近に見出された1つまたは複数の特徴的配列エレメントを含む。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドは、本明細書において定義のHA配列エレメント1および2の少なくとも1つを含むアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドは、HA配列エレメント1および2を含むアミノ酸配列を有し、いくつかの実施形態では、互いに約100から約200、もしくは約125から約175、もしくは約125から約160、もしくは約125から約150、もしくは約129から約139、または約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138または約139アミノ酸離れている。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドは、グリカン結合に関与する残基を領域96~100および/または130~230内の位置に含むアミノ酸配列を有する。例えば多数のHAポリペプチドは、1つまたは複数の次の残基:Tyr98、Ser/Thr136、Trp153、His183およびLeu/Ile194を含む。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドはこれらの残基の少なくとも2個、3個、4個または5個全てを含む。高親和性結合:本明細書において用いられる用語高親和性結合は、特定のリガンド例えばHAポリペプチドのそのパートナー例えばHA受容体への結合の高い程度の緊密さを意味する。親和性は当技術分野において公知のものを含む任意の利用可能な方法によって測定され得る。いくつかの実施形態では、結合は、結合アッセイにおいてKd’が約500pM以下例えば約400pM、約300pM、約200pM、約100pM、約90pM、約80pM、約70pM、約60pM、約50pM、約40pM、約30pM、約20pM、約10pM、約5pM、約4pM、約3pM、約2pM未満などである場合に高親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、親和性が選択された基準ポリペプチドに対してよりも目的のポリペプチドに対して強い例えばKd’がより低い場合に高親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、目的のポリペプチドについてのKd’対選択された基準ポリペプチドについてのKd’の比が1:1以下例えば0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1、0.5:1、0.4:1、0.3:1、0.2:1、0.1:1、0.05:1、0.01:1以下である場合に高親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、目的のポリペプチドに対するKd’が選択された基準ポリペプチドに対するKd’の約100以下例えば約99、約98、約97、約96、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約15、約10、約5、約4、約3、約2、約1以下である場合に高親和性であると考えられる。単離された:本明細書において用いられる用語単離されたは、i最初に産生された際に天然においてであるかまたは実験的設定においてであるかにかかわらずそれが関連していた成分の少なくとも一部から分離されている;またはiiヒトの手によって産生された、のいずれかである薬剤または実体を意味する。単離された薬剤または実体は、最初にそれらが関連していた他の成分の少なくとも約10、少なくとも約20、少なくとも約30、少なくとも約40、少なくとも約50、少なくとも約60、少なくとも約70、少なくとも約80、少なくとも約90またはそれ以上から分離されている場合がある。いくつかの実施形態では、単離された薬剤は、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99超純粋である。連結特異的遮断剤LSBA:本明細書において用いられる用語連結特異的遮断剤は、α2-6シアリル化グリカンを有するHA受容体に結合する薬剤を意味する。いくつかの実施形態では、LSBAは、α2-3シアリル化グリカンを有するHA受容体に対する親和性の少なくとも約40、50または75の親和性でα2-6シアリル化グリカンを有するHA受容体に、選択的に結合する。いくつかの実施形態では、LSBAは、α2-3シアリル化グリカンを有するHA受容体に対する親和性よりも少なくとも約2、4、5または10倍大きな親和性でα2-6シアリル化グリカンを有するHA受容体に選択的に結合する。いくつかの実施形態では、LSBAは、α2-3シアリル化グリカンに対する親和性の少なくとも50、100、150または200のα2-6シアリル化グリカンに対する親和性を有する。いくつかの実施形態では、LSBAは、HA受容体への結合について血球凝集素と競合する場合がある。例えばLSBAは、インフルエンザウイルス粒子例えばヒトまたはトリインフルエンザウイルスのHA受容体への結合を、連結特徴例えばα2-6シアリル化グリカンまたはα2-3シアリル化グリカンに基づいて選択的に阻害できる。いくつかの実施形態では、LSBAはポリペプチドである。いくつかのそのような実施形態では、LSBAポリペプチドは、天然に存在するポリペプチドのアミノ酸配列と実質的に同一または実質的に相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、LSBAポリペプチドは、HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、LSBAポリペプチドは、天然に存在するHAポリペプチドまたはこれらの断片である。いくつかの実施形態では、LSBAポリペプチドは、HAポリペプチドのアミノ酸配列に関連しないアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、LSBAポリペプチドは、抗体またはこれらの断片である。いくつかの実施形態では、LSBAポリペプチドは、レクチン例えばSNA-1である。いくつかの実施形態では、LSBAは、ポリペプチドではない。いくつかの実施形態では、LSBAは小分子である。いくつかの実施形態では、LSBAは核酸である。長いオリゴ糖:本開示の目的のために、オリゴ糖は、少なくとも4つの糖残基を有する少なくとも1つの直鎖を含む場合に長いと典型的には考えられる。低親和性結合:本明細書において用いられる用語低親和性結合は、特定のリガンド例えばHAポリペプチドのそのパートナー例えばHA受容体への結合の低い程度の緊密さを意味する。本明細書に記載の通り、親和性は当技術分野において公知の方法を含む任意の利用可能な方法によって測定され得る。いくつかの実施形態では、結合は、Kd’が約100pM以上例えば約200pM、300pM、400pM、500pM、600pM、700pM、800pM、900pM、1nM、1.1nM、1.2nM、1.3nM、1.4nM、1.5nMを超えるなどである場合に低親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、親和性が選択された基準ポリペプチドと目的のポリペプチドとで同じか、または選択された基準ポリペプチドよりも目的のポリペプチドが低い例えばKd’がほとんど同じかまたは高い場合に低親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、目的のポリペプチドに対するKd’対選択された基準ポリペプチドに対するKd’の比が1:1以上例えば1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、3:1、4:1、5:1、10:1以上である場合に低親和性であると考えられる。いくつかの実施形態では、結合は、目的のポリペプチドに対するKd’が選択された基準ポリペプチドに対するKd’の100以上例えば100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、300、400、500、1000以上である場合に低親和性であると考えられる。非天然アミノ酸:語句非天然アミノ酸は、アミノ酸、すなわち:の化学構造を有し、したがって少なくとも2つのペプチド結合に関与できるが、天然において見出されるものとは異なるR基を有する実体を意味する。いくつかの実施形態では、非天然アミノ酸は水素ではなく第2のR基を有することもでき、および/または1つまたは複数の他の置換基をアミノ部分またはカルボン酸部分に有し得る。ポリペプチド:ポリペプチドは、一般的に言えば、ペプチド結合によってお互いに結びついた少なくとも2つのアミノ酸のストリングである。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、少なくとも3~5個のアミノ酸を含んでよく、そのそれぞれは少なくとも1つのペプチド結合によって他と結びついている。当業者はポリペプチドが、非天然アミノ酸または他の実体それにもかかわらず、ポリペプチド鎖に組み込まれ得るを任意選択で含む場合があることを理解する。顕著に存在predominantlypresent:本明細書において用いられる用語顕著に存在は、集団全体における特定の位置での実体例えばアミノ酸残基の存在を意味する。例えばアミノ酸は、ポリペプチドの集団全体において特定のアミノがポリペプチド集団の少なくとも約50、約55、約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95、約96、約97、約98、約99においてまたはそれを超えて統計的に存在する場合に、顕著に存在となり得る。予防:本明細書において用いられる用語予防は、特定の疾患、障害または状態例えばインフルエンザウイルスでの例えば感染の1つまたは複数の症状の発症の遅延、ならびに/または頻度および/もしくは重症度における低減を意味する。いくつかの実施形態では、予防は、集団に基づいて評価され、ここで、疾患、障害または状態に罹りやすい集団において、疾患、障害または状態の1つまたは複数の症状の発症、頻度および/または強度における統計的に有意な減少が観察される場合に、特定の疾患、障害または状態を薬剤が予防していると考えられる。純粋:本明細書において用いられる際に、実質的に他の成分を含有しない場合に、薬剤または実体は純粋である。例えば特定の薬剤または実体を約90を超えて含有する調製物は、純粋な調製物であると典型的には考えられる。いくつかの実施形態では、薬剤または実体は、少なくとも91、少なくとも92、少なくとも93、少なくとも94、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98または少なくとも99純粋である。短いオリゴ糖:本開示の目的のために、オリゴ糖は、任意の直鎖中に4より少ない、または確実には3より少ない残基を有する場合に短いと典型的には考えられる。特異性:当技術分野において公知である通り特異性は、特定のリガンド例えばHAポリペプチドがその結合パートナー例えばヒトHA受容体および具体的にはヒト上気道管HA受容体を他の潜在的結合パートナー例えばトリHA受容体から識別する能力の尺度である。実質的相同性:語句実質的相同性は、本明細書において、アミノ酸または核酸の配列間の比較を意味して用いられる。当業者に理解される通り、2つの配列は、対応する位置に相同残基を含有する場合に、一般に実質的に相同であると考えられる。相同残基は同一残基であってもよい。代替的に相同残基は、適切に類似した構造および/または機能的特徴を有する非同一残基であってもよい。例えば当業者に周知である通り、いくつかのアミノ酸は疎水性もしくは親水性アミノ酸に、および/または極性もしくは非極性側鎖を有するとして典型的には分類される。1つのアミノ酸の同じ種類の他のアミノ酸への置換は、しばしば相同置換と考えることができる。典型的アミノ酸分類は下に要約される:当技術分野において周知である通りアミノ酸または核酸の配列は、ヌクレオチド配列についてのBLASTNならびにアミノ酸配列についてのBLASTP、gappedBLASTおよびPSI-BLASTなどの商業的コンピュータープログラムにおいて利用可能なものを含む任意の種々のアルゴリズムを用いて比較され得る。例示的なそのようなプログラムは、Altschulら、Basiclocalalignmentsearchtool、J.Mol.Biol.、215巻3号:403~410頁、1990年;Altschulら、MethodsinEnzymology;Altschulら、GappedBLASTandPSI-BLAST:anewgenerationofproteindatabasesearchprograms、NucleicAcidsRes.25巻:3389~3402頁、1997年;Baxevanisら、Bioinformatics:APracticalGuidetotheAnalysisofGenesandProteins、Wiley、1998年;およびMisenerら、編、BioinformaticsMethodsandProtocolsMethodsinMolecularBiology、132巻、HumanaPress、1999年;において記載されており、前述の全ては参照により本明細書に組み込まれる。相同配列を同定することに加えて、上に述べたプログラムは、相同性の程度の指標を典型的には提供する。いくつかの実施形態では、2つの配列は、それらの対応する残基の少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも91、少なくとも92、少なくとも93、少なくとも94、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99またはそれ以上が、関連する残基のストレッチにわたって相同性である場合に、実質的に相同であると考えられる。いくつかの実施形態では、関連するストレッチは、完全配列である。いくつかの実施形態では、関連するストレッチは少なくとも10、少なくとも15、少なくとも20、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも35、少なくとも40、少なくとも45、少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも100、少なくとも125、少なくとも150、少なくとも175、少なくとも200、少なくとも225、少なくとも250、少なくとも275、少なくとも300、少なくとも325、少なくとも350、少なくとも375、少なくとも400、少なくとも425、少なくとも450、少なくとも475、少なくとも500またはそれ以上の残基である。実質的同一性;語句実質的同一性は、アミノ酸または核酸の配列間の比較を意味して本明細書において用いられる。当業者に理解される通り、2つの配列は、対応する位置に同一残基を含有する場合に一般に実質的に同一であると考えられる。当技術分野において周知である通り、アミノ酸または核酸の配列は、ヌクレオチド配列についてのBLASTNならびにアミノ酸配列についてのBLASTP、gappedBLASTおよびPSI-BLASTなどの商業的コンピュータープログラムにおいて利用可能なものを含む任意の種々のアルゴリズムを用いて比較され得る。例示的なそのようなプログラムは、Altschulら、Basiclocalalignmentsearchtool、J.Mol.Biol.、215巻3号:403~410頁、1990年;Altschulら、MethodsinEnzymology;Altschulら、GappedBLASTandPSI-BLAST:anewgenerationofproteindatabasesearchprograms、NucleicAcidsRes.25巻:3389~3402頁、1997年;Baxevanisら、Bioinformatics:APracticalGuidetotheAnalysisofGenesandProteins、Wiley、1998年;およびMisenerら、編、BioinformaticsMethodsandProtocolsMethodsinMolecularBiology、132巻、HumanaPress、1999年;において記載されており、前述の全ては参照により本明細書に組み込まれる。同一配列を同定することに加えて、上に述べたプログラムは、同一性の程度の指標を典型的には提供する。いくつかの実施形態では、2つの配列は、それらの対応する残基の少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも91、少なくとも92、少なくとも93、少なくとも94、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99またはそれ以上が、関連する残基のストレッチにわたって同一である場合に、実質的に同一であると考えられる。いくつかの実施形態では、関連するストレッチは完全配列である。いくつかの実施形態では、関連するストレッチは少なくとも10、少なくとも15、少なくとも20、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも35、少なくとも40、少なくとも45、少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも100、少なくとも125、少なくとも150、少なくとも175、少なくとも200、少なくとも225、少なくとも250、少なくとも275、少なくとも300、少なくとも325、少なくとも350、少なくとも375、少なくとも400、少なくとも425、少なくとも450、少なくとも475、少なくとも500またはそれ以上の残基である。治療剤:本明細書において用いられる語句治療剤は、所望の生物学的または薬理学的効果を引き出す任意の薬剤を意味する。処置:本明細書において用いられる用語処置は、疾患、障害または状態の1つまたは複数の症状または状況を緩和する、発症を遅延させる、重症度もしくは発生数を軽減する、または予防を得るために用いられる任意の方法を意味する。本発明の目的のために処置は、症状の発症の前、間および/または後に投与され得る。アンブレラトポロジー:語句アンブレラトポロジーは、いくつかのグリカン、具体的にはHA受容体上のグリカンによって採用される三次元配置を意味して本明細書において用いられる。本発明は、アンブレラトポロジーグリカンへの結合が、ヒト宿主への感染を媒介するHAタンパク質の特徴であるという認識を包含する。図12に例示される通り、アンブレラトポロジーは、典型的にはα2-6シアリル化グリカンによってのみ採用され、長い例えば四糖より大きいオリゴ糖の典型である。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは、図6右パネルに表す構造に実質的に類似する三次元構造を示すグリカンである。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは、図6右パネルに示すアミノ酸残基を介してHAポリペプチドに接触するグリカンである。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは、図6右パネルに示すアミノ酸結合ポケットに接触できる、および/または特異的に結合できるグリカンである。いくつかの実施形態では、グリカン構造のトポロジーは、SiaのC2、GalのC1およびGlcNAcのC1の間の角度として定義されるパラメータθに基づいて分類される。θ値<100°は、α2-3および短いα2-6グリカンとによって採用されるコーン様トポロジーを表す。θ値>110°は、長いα2-6グリカンによって採用されるトポロジーなどのアンブレラ様トポロジーを表す図6。アンブレラトポロジーの例は、およそ-60のNeu5Acα2-6Gal連結のΦ角によって与えられる例えば図11を参照されたい。図4は、アンブレラトポロジーをとり得るグリカンのある代表的なしかし網羅的ではない例を表す。図4に表される長いα2-6モチーフは、生物学的N連結グリカン、O連結グリカンおよび糖脂質の部分として見出される、長鎖例えば少なくとも三糖に非還元末端で連結しているNeu5Acα2-6を含む。囲み挿入図は、HAと高親和性で結合する生物学的グリカンの部分として見出される、アンブレラトポロジーの長いα2-6グリカン部分の例を示す。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは例えばある位置で、短いα2-6例えば単一のラクトサミン分枝よりも長い例えば複数のラクトサミン単位α2-6オリゴ糖分枝を高い割合で含む。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは例えばある位置で、短いα2-6例えば単一のラクトサミン分枝より約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約20倍、約50倍または約50倍を超えて、長いα2-6オリゴ糖分枝を含む。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンおよび/またはグリカンデコイとのHA相互作用の特有の特徴は、非還元末端にシアル酸SAおよび/またはSA類似物を含むグリカンと接触しているHAである。いくつかの実施形態では、オリゴ糖の鎖長は、少なくとも三糖であるSAまたはSA類似物を除く。いくつかの実施形態では、図12の右側パネルに示される番号付けられた残基の組合せは、アンブレラ様トポロジーとの接触に関与する。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンは、次の形態:Neu5Acα2-6Sug1-Sug2-Sug3のオリゴ糖である。式中:aNeu5Acα2-6は典型的にはしかし必要不可欠ではなく非還元末端にある;bSug1は:iαまたはβ立体配置NおよびO連結伸長についてはしばしばβ-、糖タンパク質にO連結しているGalNAcα-の場合はα-にあるヘキソースしばしばGalもしくはGlcまたはヘキソサミンGlcNAcもしくはGalNAcである;iiNeu5Acα2-6以外の糖は、Sug1のいずれの非還元位置にも結合しないSug1が糖タンパク質にO連結しているGalNAcα-である場合を除く;および/またはiiiサルフェート、ホスフェート、グアニジウム、アミン、N-アセチルなどの非糖部分はSug1の非還元位置典型的には6位に結合し得る例えばHAとの接触を改善するために;cSug2および/あるいはSug3は:iαまたはβ立体配置しばしばβにあるヘキソースしばしばGalもしくはGlcまたはヘキソサミンGlcNAcもしくはGalNAcである;および/あるいはii糖Fucなどまたは、サルフェート、ホスフェート、グアニジウム、アミン、N-アセチルなどの非糖部分はSug2、Sug3および/またはSug4の非還元位置に結合し得る;dNeu5Acα2-6連結とは別のオリゴ糖における任意の2つの糖の間の連結は、1-2、1-3、1-4および/または1-6典型的には1-3または1-4であってよく;ならびに/あるいはeNeu5Acα2-6が、糖タンパク質にO連結しているGalNAcαに連結しており、付加糖がGalNAcαの非還元末端に連結している構造は、例えばiNeu5Acα2-6Neu5Acα2-3Galβ1-3GalNAcα-iiNeu5Acα2-6Galβ1-3GalNAcα-である。アンブレラトポロジー遮断剤UTBA:本明細書において用いられる用語アンブレラトポロジー遮断剤は、アンブレラトポロジーグリカンを有するHA受容体に結合する薬剤を意味する。いくつかの実施形態では、UTBAは、ヒト上気道において見出されるアンブレラトポロジーグリカンを有するHA受容体に結合する。UBTAはアンブレラトポロジーグリカンおよび/またはコーントポロジーグリカンのいずれかに結合できる。いくつかの実施形態では、UTBAは、コーントポロジーグリカンに対する親和性の50、100、150または200でアンブレラトポロジーグリカンに選択的に結合する。いくつかの実施形態では、UTBAは、コーントポロジーグリカンに対する親和性の50~150でアンブレラトポロジーグリカンに選択的に結合する。いくつかの実施形態では、いくつかの実施形態ではUTBAは、コーントポロジーグリカンに対してとほぼ同じ親和性でアンブレラトポロジーグリカンに結合する。例えばいくつかの実施形態では、UTBAは、コーントポロジーグリカン例えば3’SLN-LNへの結合の親和性の約50~200、50~150で、またはほぼ同じ親和性でアンブレラトポロジーグリカン例えば6’SLN-LNに結合する。いくつかの実施形態では、UTBAは、インフルエンザウイルス粒子例えば、ヒトまたはトリインフルエンザウイルスのHA受容体への結合を、受容体のグリカントポロジー例えばアンブレラまたはコーンに基づいて選択的に阻害する。いくつかの実施形態では、UTBAは、ポリペプチドである。いくつかのそのような実施形態では、UTBAポリペプチドは、天然に存在するポリペプチドと実質的に同一、または実質的に相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、UTBAポリペプチドは、HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、UTBAポリペプチドは、天然に存在するHAポリペプチドまたはその断片である。いくつかの実施形態では、UTBAポリペプチドは、HAポリペプチドのアミノ酸配列に関係していないアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、UTBAポリペプチドは、抗体またはその断片である。いくつかの実施形態では、UTBAポリペプチドは、レクチン例えばSNA-1である。いくつかの実施形態では、UTBAはポリペプチドではない。いくつかの実施形態では、UTBAは小分子である。いくつかの実施形態では、UTBAは核酸である。アンブレラトポロジーグリカン模倣物:アンブレラトポロジーグリカン模倣物は、本明細書に記載の結合剤に結合するアンブレラトポロジーグリカン以外の薬剤である。いくつかの実施形態では、アンブレラトポロジーグリカン模倣物は、HAポリペプチドに結合する薬剤である。いくつかのそのような実施形態では、アンブレラトポロジーグリカン模倣物は、残基95、98、128、130、131、132、133、135、136、137、138、145、153、155、156、158、159、160、183、186、187、188、189、190、192、193、194、195、196、219、221、222、224、225、226、227、228およびこれらの組合せからなる群より選択されるHAポリペプチド残基と相互作用する薬剤である。いくつかのそのような実施形態では、アンブレラトポロジーグリカン模倣物は、残基130、131、132、133、135、137、155、188、192、193、221、226、227、228およびこれらの組合せからなる群より選択されるHAポリペプチド残基と相互作用する薬剤である。いくつかのそのような実施形態では、アンブレラトポロジーグリカン模倣物は、残基160、192、193およびこれらの組合せからなる群より選択されるHAポリペプチド残基と相互作用する薬剤である。上に述べたアミノ酸位置がH3HA番号付けに基づくことに注意されたい。いくつかの実施形態では、HAトポロジーグリカン模倣物は、HAポリペプチドとの相互作用についてアンブレラトポロジーグリカンと競合する薬剤である。アンブレラトポロジー特異的遮断剤UTSBA:本明細書において用いられる用語アンブレラトポロジー特異的遮断剤は、ヒト上気道において見出されるアンブレラトポロジーグリカンを有するHA受容体に結合する薬剤を意味する。UTSBAは、アンブレラトポロジーグリカンHAに選択的に結合する。例えばUTSBAは、コーントポロジーグリカン例えば3’SLN-LNへの結合の親和性より少なくとも約2、4、5または10倍大きな親和性でアンブレラトポロジーグリカン例えば6’SLN-LNに結合する。典型的にはUTSBAのアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性は、1nMより大きい。典型的にはコーントポロジーグリカンに対するUTSBAの親和性は、アンブレラトポロジーグリカンのSC18、Mos99、Tx91などのヒト適応HAおよびSNA-Iなどのα2-6結合植物レクチンへの結合親和性より少なくとも2から3桁以内で低い。用量依存的直接結合アッセイ図19および20によって測定されるUTSBAの結合親和性は、典型的には少なくとも1nMである。典型的にはコーントポロジーグリカンに対するUTSBAの親和性は、コーントポロジーグリカンのトリHAViet0405、Av18などへの結合親和性より最大で1から3桁低い。いくつかの実施形態では、UTSBAは、インフルエンザウイルス粒子例えばヒトまたはトリインフルエンザウイルスのHA受容体例えばH1、H2もしくはH3またはヒト適応H5、H7もしくはH9への結合を、グリカントポロジー例えばアンブレラまたはコーンに基づいて選択的に阻害する。いくつかの実施形態では、UTSBAは、ポリペプチドである。いくつかのそのような実施形態では、UTSBAポリペプチドは、天然に存在するポリペプチドのアミノ酸配列と実質的に同一または実質的に相同性であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、UTSBAポリペプチドは、HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、UTSBAポリペプチドは、天然に存在するHAポリペプチドまたはその断片である。いくつかの実施形態では、UTSBAポリペプチドは、HAポリペプチドのアミノ酸配列に関係しないアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、UTSBAポリペプチドは、抗体またはその断片である。いくつかの実施形態では、UTSBAポリペプチドは、レクチンである例えばSNA-1。いくつかの実施形態では、UTSBAは、ポリペプチドではない。いくつかの実施形態では、UTSBAは、小分子である。いくつかの実施形態では、UTSBAは核酸である。ワクチン接種:本明細書において用いられる用語ワクチン接種は、免疫応答例えば病原体disease-causingagentに対するを生じさせることを意図する組成物の投与を意味する。本発明の目的のために、ワクチン接種は、病原体への曝露、および/または1つまたは複数の症状の発症の前、間および/または後に、いくつかの実施形態では、病原体への曝露の前、間および/または直後に投与され得る。いくつかの実施形態では、ワクチン接種は、ワクチン組成物の、適切に時間を開けた複数回投与を含む。バリアント:本明細書において用いられる用語バリアントは、目的の特定のポリペプチド例えばHAポリペプチドとその配列が比較される親ポリペプチドとの間の関係を説明する相対的な用語である。目的のポリペプチドが、特定の位置でのわずかな数の配列変化がなければ親のアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有する場合に、目的のポリペプチドは、親ポリペプチドのバリアントであると考えられる。典型的にはバリアントにおける残基の20、15、10、9、8、7、6、5、4、3、2未満が親と比較して置換されている。いくつかの実施形態では、バリアントは、親と比較して10、9、8、7、6、5、4、3、2または1個の置換された残基を有する。しばしばバリアントは、非常に少ない例えば5、4、3、2または1個より少ない数の置換された機能性残基すなわち特定の生物活性に関与する残基を有する。さらにバリアントは典型的には親と比較して5、4、3、2または1個以下の付加または欠失を有し、しばしば付加または欠失を有さない。さらに任意の付加または欠失は典型的には約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約10、約9、約8、約7、約6より少なく、一般に約5、約4、約3または約2残基より少ない。いくつかの実施形態では、親ポリペプチドは天然に認められるものである。例えば親HAポリペプチドは、天然のインフルエンザウイルス例えば野生型単離物において見出されるものであってよい例えば野生型HA。ベクター:本明細書において用いられるベクターは、連結されている別の核酸を輸送できる核酸分子を意味する。いくつかの実施形態では、ベクターは、真核細胞または原核細胞などの宿主細胞における、連結されている核酸の染色体外複製および/または発現が可能である。作動可能に連結された遺伝子の発現を指示することが可能であるベクターは、本明細書において発現ベクターと称される。野生型:当技術分野において理解される通り、語句野生型は、一般にタンパク質または核酸の、天然において見出される通常形態を意味する。例えば野生型HAポリペプチドは、インフルエンザウイルスの天然単離物において見出される。様々な異なる野生型HA配列がNCBIインフルエンザウイルス配列データベースhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/FLU.htmlにおいて見出され得る。いくつかの例示的野生型H2HAポリペプチドは図1に示される。本発明のある特定の実施形態の詳細な記載本発明は、アンブレラトポロジーグリカンとコーントポロジーグリカンとを識別する強い能力を示す結合剤を提供する。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、操作されたHAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、操作されたH2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、本明細書に記載のRTLSHAポリペプチド例えばRTLSH2HAポリペプチドによって示されるものと少なくとも同様に有効である、アンブレラトポロジーグリカンとコーントポロジーグリカンとを識別するための能力を示す。本発明は、アンブレラトポロジーグリカンとコーントポロジーグリカンとを識別する強い能力を示す結合剤を同定するための系および試薬も提供する。本発明は、提供される結合剤に関連する種々の試薬および方法例えばこれらを同定するための系、これらを調製するための戦略、これらに結合する抗体、ならびにこれらに関係する種々の診断方法および治療方法を含むも提供する。本発明のこれらの態様のいくつかの実施形態のさらなる記載などは、下に示される。血球凝集素HAインフルエンザウイルスは、ウイルス粒子の膜に埋め込まれた2つの糖タンパク質、血球凝集素HAおよびノイラミニダーゼNAを含有する脂質膜エンベロープによって特徴付けられるRNAウイルスである。16個の公知のHA亜型および9個のNA亜型があり、異なるインフルエンザ株は、株のHAおよびNA亜型の数字に基づいて命名される。アミノ酸配列同一性および結晶構造の比較に基づいて、HA亜型は2つの主な群および4つの小さなクレードに分けられている。異なるHA亜型は強いアミノ酸配列同一性を共有する必要はないが、様々なHA亜型の全体的な三次元構造は、分類目的に用いられ得る数個のわずかな差異を伴って、互いに類似している。例えば中央αヘリックスとの関係での膜遠位サブドメインの特定の向きは、HA亜型を決定するために一般に用いられる1つの構造的特徴であるRussellら、2004年Virology、325巻:287頁、2004年;参照により本明細書に組み込まれる。HAは、H1~H16と称される16個の亜型の内の1個のホモ三量体として膜中に存在する。これらの亜型のうち3個H1、H2およびH3だけが、これまでのところヒト感染に適応するようになっている。ヒトに感染するように適応しているHA例えば、汎発流行H1N11918年およびH3N21967~68年インフルエンザ亜型由来のHAの報告された1つの特徴は、α2-3シアリル化グリカンに優先的に結合するそれらのトリ祖先と比較して、α2-6シアリル化グリカンに優先的に結合するそれらの能力である。SkehelWiley、2000年AnnuRevBiochem、69巻:531頁;Rogers,Paulson、1983年、Virology、127巻:361頁;Rogersら、1983年Nature、304巻:76頁;Sauterら、1992年Biochemistry、31巻:9609頁;Connorら、1994年Virology、205巻:17頁;Tumpeyら、2005年Science、310巻:77頁;これら全ては参照により本明細書に組み込まれる。しかし本発明は、ヒト宿主に感染する能力が特定の連結のグリカンへの結合とあまり相関せず、特定のトポロジーのグリカンへの結合とより相関するという認識を包含する。したがって本発明は、コーントポロジーグリカンがα2-6シアリル化グリカンである場合があるにもかかわらずしばしばコーントポロジーグリカンよりもアンブレラトポロジーグリカンについての優先性を示して、ヒトへの感染を媒介するHAがアンブレラトポロジーグリカンに結合することを実証する。シアリル化オリゴ糖α2-3およびα2-6連結の両方のに結合したH1ヒトおよびブタ、H3トリならびにH5トリ亜型由来のHAのいくつかの結晶構造は入手可能であり、これらのグリカンとHAとの別個の相互作用に関与する特定のアミノ酸についての分子的知見を提供するEisenら、1997年Virology、232巻:19頁;Haら、2001年ProcNatlAcadSciUSA、98巻:11181頁;Haら、2003年Virology、309巻:209頁;Gamblinら、2004年Science、303巻:1838頁;Stevensら、2004年Science、303巻:1866頁;Russellら、2006年GlycoconjJ23巻:85頁;Stevensら、2006年Science、312巻:404頁;これら全ては参照により本明細書に組み込まれる。例えば、単独またはα2-3もしくはα2-6シアリル化オリゴ糖に結合したH5A/duck/Singapore/3/97の結晶構造は、結合したグリカンと直接相互作用するいくつかのアミノ酸、さらに1または複数の分離距離の程度であるアミノ酸を同定するStevensら、2001年ProcNatlAcadSciUSA98巻:11181頁;参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの場合では、これらの残基のコンフォメーションは、非結合状態に対して結合状態において異なっている。例えばGlu190、Lys193およびGln226は、全て直接結合相互作用に関与し、非結合状態に対して結合状態において異なるコンフォメーションを有する。Glu190の近位にあるAsn186のコンフォメーションも、非結合状態に対して結合状態において顕著に異なっている。ヒトおよびトリHA受容体の類似物と複合体化した例示的H2HAヒトウイルスA/Singapore/1/57およびA/Japan/305/57、トリウイルスA/ck/Postdam/84、A/dk/Ontario/77およびA/ck/NewYork/91の結晶構造は、結合したグリカンと直接相互作用するいくつかのアミノ酸、さらにHAの受容体結合ポケットを変化させる変異も同定するXuRら、2010年JVirol84巻4号:1715頁;LiuJら、2009年ProcNatlAcadSciUSA106巻40号:17175頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれる。結合部位のいくつかの二次構造エレメント例えば130および220ループならびに/または190ヘリックスは、ヒトおよび/またはトリ受容体との相互作用に影響を与える場合がある。例えばヒトH2HA残基222Lysは、Gal-2の3’OHと水素結合を形成し:ヒトH2HA残基226ロイシンはトリHAにおいては妨げられるより疎水性の環境を導くことが報告されているLiuJら、2009年ProcNatlAcadSciUSA106巻40号:17175頁。受容体結合部位が、190ヘリックス残基190から198、220ループ残基221から228、130ループ残基134から138からの残基およびThr155によって取り囲まれる浅い空洞によって形成されることは報告されているXuRら、2010年JVirol84巻4号:1715頁。Tyr98、Trp153およびHis183を含む数個の保存された芳香族残基が、受容体結合部位のくぼみの底を形成する場合があることが観察されているXuRら、2010年JVirol84巻4号:1715頁。いくつかの実施形態では、配列モチーフV/IHHPは、H2HA受容体結合部位に存在し、ここでは、最初のHが残基183のヒスチジンに対応する。いくつかのそのような実施形態では、グリシンは残基134に存在する場合があり、トリプトファンは残基153に存在する場合があり、スレオニンは残基155に存在する場合があり、グルタミン酸は残基190に存在する場合があり、および/またはロイシンは残基194に存在する場合があり、これらの組合せである場合もある。いくつかの実施形態では、残基134、153、155、190および194は、シアル酸への結合に関わる。結合剤本明細書に記載の通り、アンブレラトポロジーグリカンへの結合は、例えばヒトを含む特定の宿主の感染を媒介する能力に相関する。したがって本発明は、アンブレラグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物に結合する結合剤例えばHAポリペプチド、具体的にはH2HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを提供する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、高親和性でアンブレラグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、複数の異なるアンブレラトポロジーグリカンに、しばしば高い親和性および/または特異性で結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、高親和性でアンブレラトポロジーグリカン例えばNeu5Acα2-6Galβ1-4GlcNAcβ1-3Galβ1-4GlcNAc-などの例えば長いα2-6シアリル化グリカンに結合する。例えばいくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒトの感染を媒介する野生型HAについて観察されたものと同等の親和性で、アンブレラトポロジーグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、ヒトにおける感染を媒介する例えばヒト伝染性である野生型HAは、H1N1HA、H2N2HAおよび/またはH3N2HAである。いくつかの実施形態では、ヒトにおける感染を媒介する例えばヒト伝染性である野生型HAは、A/SouthCarolina/1/1918由来のHAである。いくつかの実施形態では、ヒトにおける感染を媒介する例えばヒト伝染性である野生型HAは、A/Albany/6/58由来のHAである。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒトの感染を媒介する野生型HAについての親和性の10倍以下例えば9倍、8倍、7倍、6倍、5倍、4倍、3倍、2倍、1.5倍などの範囲内でアンブレラグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒトの感染を媒介する例えばヒト伝染性である野生型HAについて比較可能な条件下で観察されたものの少なくとも25、少なくとも30、少なくとも35、少なくとも40、少なくとも45、少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99または少なくとも100である親和性でアンブレラグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒトの感染を媒介する例えばヒト伝染性である野生型HAについて比較可能な条件下で観察されたものよりも大きい親和性で、アンブレラグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤の結合親和性は、ある範囲の濃度にわたって評価される。そのような戦略は、単一濃度分析よりも、特に多価結合アッセイにおいて顕著に多い情報を提供する。いくつかの実施形態において、例えば本発明の結合剤の結合親和性は、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、少なくとも10倍またはそれを超える範囲の濃度にわたって評価される。いくつかの実施形態では、結合パートナー濃度例えばHA受容体、グリカンなどは、生理学的条件例えば細胞表面グリカンへのウイルス性HA結合を模倣するためにリガンド例えばHAポリペプチド濃度過剰に設定され得る。代替的にまたは付加的にいくつかの実施形態では、結合パートナー例えばHA受容体、グリカンなど濃度および/またはリガンド例えばHAポリペプチド濃度は、変更され得る。いくつかのそのような実施形態では、親和性例えば結合親和性は基準例えばヒトの感染を媒介する野生型HAと比較可能な条件下例えば濃度で比較され得る。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤の結合親和性は、全ウイルスを用いて実施される。いくつかのそのような実施形態では、ウイルス力価はウイルス粒子の数に直接相関する単位で測定される。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、それらが本明細書に記載のものなどの多価グリカンアレイ結合アッセイにおいて飽和シグナルを示す場合に高親和性を示す。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、それらがそのような研究において約400000超例えば約500000、約600000、約700000、約800000超などのシグナルを示す場合に高親和性を示す。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の結合剤は、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、少なくとも100倍以上の濃度範囲にわたってアンブレラグリカンへの飽和結合を示し、いくつかの実施形態では、少なくとも200倍以上の広い濃度範囲にわたる。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物への高親和性結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、約1.5nMから約2pMの範囲内でアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、約1.5nMから約200pMの範囲内でアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、約200pMから約10pMの範囲内でアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、約10pMから約2pMの範囲内でアンブレラトポロジーグリカンに対する親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、それらが結合アッセイにおいて約500pM以下例えば約400pM、約300pM、約200pM、約100pM、約90pM、約80pM、約70pM、約60pM、約50pM、約40pM、約30pM、約20pM、約10pM、約5pM、約4pM、約3pM、約2pMより低いなどのKd’を示す場合にアンブレラトポロジーグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物への高親和性結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、コーントポロジーグリカンおよび/またはコーントポロジーグリカン模倣物への低親和性結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、それらが結合アッセイにおいて約100pM以上例えば約200pM、約300pM、約400pM、約500pM、約600pM、約700pM、約800pM、約900pM、約1nM、約1.1nM、約1.2nM、約1.3nM、約1.4nM、約1.5nMを超えるなどのKd’を示す場合にコーントポロジーグリカンおよび/またはコーントポロジーグリカン模倣物への低親和性結合を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、アンブレラトポロジーグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物への高親和性ならびにコーントポロジーグリカンおよび/またはコーントポロジーグリカン模倣物への低親和性の両方を示す。いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、結合アッセイにおいてアンブレラトポロジーグリカンに対して約500pM以下例えば約400pM、約300pM、約200pM、約100pM、約90pM、約80pM、約70pM、約60pM、約50pM、約40pM、約30pM、約20pM、約10pM、約5pM、約4pM、約3pM、約2pMより低いなどのKd’、およびコーントポロジーグリカンに対して約100pM以上例えば約200pM、約300pM、約400pM、約500pM、約600pM、約700pM、約800pM、約900pM、約1nM、約1.1nM、約1.2nM、約1.3nM、約1.4nM、約1.5nMを超えるなどのKd’を示す。一態様では、本発明は、アンブレラトポロジーグリカンに対する高い親和性だけではヒトへの伝染を効果的および/または効率的に媒介するためには十分でない可能性があるという驚くべき認識を提供する。むしろ本開示により、いくつかの実施形態では、提供される結合剤は、コーントポロジーグリカンへの低い結合、ならびに/またはアンブレラトポロジーグリカンに対する高親和性およびコーントポロジーグリカンへの低親和性の両方を示す。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤はα2-6シアリル化グリカンに結合し、いくつかの実施形態では、本発明の結合剤はα2-6シアリル化グリカンに優先的に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は複数の異なるα2-6シアリル化グリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤はα2-3シアリル化グリカンに結合できず、他の実施形態では、本発明の結合剤はα2-3シアリル化グリカンに結合できる。さらにいくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、コーントポロジーグリカンに結合するよりも優先的にアンブレラトポロジーグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物に結合する例えばそれらはより強く結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、アンブレラグリカン対コーングリカンについて約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約20、約30、約40、約50、約60、約70、約80、約90、約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000、約100,000までまたはそれ以上である相対的親和性を示す。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、コーントポロジーグリカンについてのそれらの親和性の約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000またはそれ以上である親和性をアンブレラトポロジーグリカンについて示す。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒト上気道上皮細胞上に見出される受容体に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、気管支および/または気管におけるHA受容体に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、肺深部における受容体には結合できず、他の実施形態では、本発明の結合剤は肺深部における受容体に結合できる。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、ヒト上気道管組織例えば上皮細胞におけるHA受容体で見出されるグリカンの少なくとも約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約55、約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95またはそれ以上に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、図4に例示される1つまたは複数のグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、図4に例示される複数のグリカンに結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、図4に例示されるグリカンに高い親和性および/または特異性で結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、図3に例示されるグリカンへのそれらの結合と比較して、図4に例示されるグリカンに優先的に結合する。いくつかの実施形態では、本発明の結合剤は、次の形態:Neu5Acα2-6Sug1-Sug2-Sug3のオリゴ糖に結合する。式中:1.Neu5Acα2-6は、常にまたはほとんど非還元末端にある;2.Sug1は:a.αまたはβ立体配置NおよびO連結伸長についてはしばしばβ-、糖タンパク質にO連結しているGalNAcα-の場合はα-にあるヘキソースしばしばGalもしくはGlcまたはヘキソサミンGlcNAcもしくはGalNAcである;b.Neu5Acα2-6以外の糖は、Sug1のいずれの非還元位置にも結合しないSug1が糖タンパク質にO連結しているGalNAcα-である場合を除く;および/またはc.サルフェート、ホスフェート、グアニジウム、アミン、N-アセチルなどの非糖部分はHAとの接触を改善するためにSug1の非還元位置典型的には6位に結合し得る;3.Sug2および/またはSug3は:a.αまたはβ立体配置しばしばβにあるヘキソースしばしばGalもしくはGlcまたはヘキソサミンGlcNAcもしくはGalNAcである;ならびに/あるいはb.糖Fucなどまたは、サルフェート、ホスフェート、グアニジウム、アミン、N-アセチルなどの非糖部分はSug2、Sug3および/またはSug4の非還元位置に結合し得る;4.Neu5Acα2-6連結とは別のオリゴ糖における任意の2つの糖の間の連結は、1-2、1-3、1-4および/または1-6典型的には1-3または1-4であってよく;ならびに/あるいは5.Neu5Acα2-6が、糖タンパク質にO連結しているGalNAcαに連結しており、付加的糖がGalNAcαの非還元末端に連結している構造は、例えばi.Neu5Acα2-6Neu5Acα2-3Galβ1-3GalNAcα-ii.Neu5Acα2-6Galβ1-3GalNAcα-である。本発明は、指定された結合特異性を有する結合剤を提供し、アンブレラグリカンに関して指定された結合特徴を有する結合剤も提供する。本発明によって提供されるある特定の結合剤は、下にさらに詳細に記載される。HAポリペプチドいくつかの実施形態では、本発明の結合剤はHAポリペプチドである。例えば本発明は、指定された結合特異性を有する単離されたHAポリペプチドを提供し、アンブレラグリカンに関して指定された結合特徴を有する操作されたHAポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する提供されるHAポリペプチドは、H1ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H2ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H3ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H4ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H5ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H6ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H7ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H8ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H9ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H10ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H11ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H12ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H13ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H14ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H15ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H16ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、指定された結合特徴を有する本発明によるHAポリペプチドは、H1ポリペプチドではなく、H2ポリペプチドではなく、および/またはH3ポリペプチドではない。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドは、株:のいずれかに由来するH1タンパク質を含まない。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドは、1957~58年のアジアでのインフルエンザ蔓延株のいずれかに由来するH2タンパク質ではない。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドは、株:A/Japan/305/1957;A/Singapore/1/1957;A/Taiwan/1/1964;A/Taiwan/1/1967のいずれかに由来するH2タンパク質を含まない。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドは、A/Chicken/Pennsylvania/2004由来のH2タンパク質を含まない。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドは、株:のいずれかに由来するH3タンパク質を含まない。操作されたおよび/またはバリアントHAポリペプチドいくつかの実施形態では、提供されるHAポリペプチドは、そのアミノ酸配列が、わずかな数の特定の配列変更を除いて、親HAのアミノ酸配列と同一である親HAポリペプチドのバリアントである。いくつかの実施形態では、親HAは、インフルエンザウイルスの天然単離物において見出されるHAポリペプチドである例えば野生型HAポリペプチド。いくつかの実施形態では、親HAは、H2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、親HAは、野生型H2HAポリペプチドである。いくつかの実施形態では、親HAは、図1に列挙される群から選択されるH2HAである。いくつかの実施形態では、親HAは、CkPA04である。いくつかの実施形態では、親HAは、Alb58である。いくつかの実施形態では、親HAは、A/Singapore/1/57またはA/Japan/305/57である。いくつかの実施形態では、親HAは、A/ck/NewYork/29878/91、A/dk/Ontario/77またはA/ck/postdam/4705/84である。いくつかの実施形態では、本発明のHAポリペプチドバリアントは、それらの対応する親HAポリペプチドとは異なるグリカン結合特徴を有する。いくつかの実施形態では、本発明のHAバリアントポリペプチドは、それらの同族の親HAポリペプチドよりも大きな親和性および/または特異性をアンブレラグリカンに対して例えばコーングリカンに対してと比較して有する。いくつかの実施形態では、そのようなHAポリペプチドバリアントは、操作されたバリアントである。いくつかの実施形態では、変更されたグリカン結合特徴を有するHAポリペプチドバリアントは、グリカン結合部位における、またはそれに影響を与える残基において配列変更を有する。いくつかの実施形態では、そのような置換は結合グリカンと直接相互作用するアミノ酸の置換であり、他の実施形態では、そのような置換は結合グリカンと相互作用するものから分離距離の程度1であるアミノ酸の置換であり、分離距離の程度1においてアミノ酸は1直接結合アミノ酸と相互作用する;2そうでなければ、直接結合アミノ酸がグリカンと相互作用する能力に影響するが、グリカンとは直接相互作用しない;または3そうでなければ、直接結合アミノ酸がグリカンと相互作用する能力に影響し、グリカンとも直接相互作用する、のいずれかである。本発明のHAポリペプチドバリアントは、1つもしくは複数の直接結合アミノ酸、1つもしくは複数の分離の程度1のアミノ酸、1つもしくは複数の分離の程度2のアミノ酸、またはこれらの任意の組合せの置換を含有する。いくつかの実施形態では、本発明のHAポリペプチドバリアントは、より高い分離の程度を有する1つまたは複数のアミノ酸の置換を含有する場合もある。いくつかの実施形態では、変更されたグリカン結合特徴を有するHAポリペプチドバリアントは、Neu5AcおよびGal以外の糖例えば図13を参照されたいと接触する残基に配列変更を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントは、野生型親HAと比較して少なくとも1つのアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、本発明のHAポリペプチドバリアントは、同族の野生型親HAと比較して少なくとも2個、3個、4個、5個またはそれ以上のアミノ酸置換を有し;いくつかの実施形態では、本発明のHAポリペプチドバリアントは、2個、3個または4個のアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、そのような全てのアミノ酸置換は、グリカン結合部位内に位置する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアント、具体的にはH2ポリペプチドバリアントは、野生型親HAと比較して、結合グリカンと相互作用するアミノ酸から分離距離の程度1であるアミノ酸から選択される残基に1つまたは複数のアミノ酸置換を有し、分離距離の程度1においてアミノ酸は1直接結合アミノ酸と相互作用する;2そうでなければ、直接結合アミノ酸がグリカンと相互作用する能力に影響するが、グリカンとは直接相互作用しない;または3そうでなければ、直接結合アミノ酸がグリカンと相互作用する能力に影響し、グリカンと直接相互作用もする、のいずれかであり、これだけに限らないが、残基137、145、156、159、186、187、189、190、192、193、196、222、225、226および228を含む。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアント、具体的にはH2ポリペプチドバリアントは、残基137、193、226および228の1つまたは複数に対応する位置に配列置換を有する。代替的にまたは付加的に、いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントは、残基145、156、159、186、187、189、190、192、196、222および225の1つまたは複数に対応する位置に配列置換を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、137に対応する位置残基137にアルギニン、リシン、グルタミン、メチオニンおよびヒスチジンから選択されるアミノ酸残基を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、137に対応する位置残基137にアルギニン、リシン、グルタミンおよびメチオニンから選択されるアミノ酸残基を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、137に対応する位置残基137にアルギニンおよびリシンから選択されるアミノ酸残基を有する。いくつかの実施形態では、提供されるHAポリペプチドおよび/またはポリペプチドバリアント例えばH2HAポリペプチドバリアントは、残基137としてアルギニン残基を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、193に対応する位置残基193にアラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、セリン、スレオニン、システインおよびバリンからなる群より選択されるアミノ酸残基を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、アラニン、グルタミン酸、スレオニン、システイン、メチオニン、バリンおよびセリンからなる群より選択される残基193を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、アラニン、グルタミン酸およびスレオニンからなる群より選択される残基193を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、スレオニンである残基193を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、残基226に対応する残基残基226として非極性アミノ酸であるアミノ酸を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、トリプトファンおよびバリンからなる群より選択される残基226を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、ロイシン、イソロイシンおよびバリンからなる群より選択される残基226を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、ロイシンである残基226を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、228に対応する位置残基228に極性アミノ酸であるアミノ酸残基を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、リシン、セリン、グリシン、スレオニンおよびチロシンからなる群より選択される残基228を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、アルギニン、アスパラギン、セリン、グリシンおよびスレオニンからなる群より選択される残基228を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、セリンである残基228を有する。いくつかの実施形態では、提供されるHAポリペプチドバリアントは、特定の基準HAポリペプチドと例えば例えば本明細書に記載の野生型H2HAポリペプチドなどの野生型HAポリペプチドと比較して、137、193、226および/または228以外の位置に少なくとも1つの置換を有する。いくつかのそのような実施形態では、アンブレラトポロジーグリカンに対するバリアントの親和性および/または特異性は増大している。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、対応するヒト適応HA例えば図1に示すものなどのヒト適応H2HAにおいて顕著に存在するアミノ酸を特定の残基例えば137、145、186、187、189、190、192、193、222、225、226、228に有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供されるHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、対応するヒト適応HA例えばヒト適応H2HAにおいて見出される少なくとも1つのアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、本発明のHAポリペプチドバリアントは、基準または親HAと、具体的には親野生型HAと比較して、開いた結合部位を有する。HAポリペプチドの部分または断片本発明は、本発明によるHAポリペプチドおよび/またはポリペプチドバリアントの特徴的部分結合剤であってもなくてもよいならびにそれらをコードする核酸をさらに提供する。一般に特徴的部分は、アミノ酸の連続するストレッチまたはアミノ酸の連続するストレッチの集合物一緒になってHAポリペプチドの特徴を示すを含有するものである。そのような連続するストレッチそれぞれは、一般に少なくとも2つのアミノ酸を含有する。さらに当業者は、典型的にはHAポリペプチド例えばH2HAポリペプチドの特徴となるために少なくとも5個、10個、15個、20個またはそれ以上のアミノ酸が必要であること理解する。一般に特徴的部分は、上に記載の配列同一性に加えて、少なくとも1つの機能的特徴を関連するインタクトなHAポリペプチドと共有するものである。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドの本発明の特徴的部分は、グリカン結合特徴を関連する全長HAポリペプチドと共有する。非HAポリペプチドいくつかの実施形態では、本発明により提供される結合剤は、アミノ酸配列が特徴的HA配列を含まないポリペプチドである。そのようなポリペプチドは、本明細書において非HAポリペプチドと称される。いくつかの実施形態では、非HAポリペプチドは予め選択されたアミノ酸配列を有する例えば、基準配列と比較した戦略的アミノ酸変更の導入[付加、欠失および/または置換]を例えば含む、合理的設計を介して。いくつかの実施形態では、非HAポリペプチドは、確率的に決定され、例えば本明細書において定義の望ましい結合特徴に基づいて同定されるアミノ酸配列を有する。抗体いくつかの実施形態では、本発明により提供される結合剤は、例えばアンブレラトポロジーグリカンにおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣物に結合する抗体である。本発明に適切である抗体は、任意のアンブレラトポロジーグリカンエピトープに免疫特異的に結合する抗体または抗体の断片を含む。本明細書において用いられる用語抗体は、指定されたタンパク質もしくはペプチドまたはこれらの断片に特異的に反応性である免疫グロブリンおよびこの断片を含むことを意図する。適切な抗体は、これだけに限らないがヒト抗体、霊長類化primatized抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、結合体化抗体すなわち他のタンパク質、放射標識、細胞毒に結合体化または融合した抗体、SmallModularImmunoPharmaceuticalsSMIPs商標、1本鎖抗体、ラクダ化cameloid抗体および抗体断片を含む。本明細書において用いられる用語抗体は、インタクトなモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、単一ドメイン抗体例えばサメ単一ドメイン抗体例えばIgNARまたはその断片、少なくとも2つのインタクトな抗体から形成される多重特異性抗体例えば二重特異性抗体および所望の生物学的活性を呈する限りでの抗体断片も含む。本明細書における使用のための抗体ポリペプチドは、任意の型例えばIgA、IgD、IgE、IgG、IgMであってよい。本明細書において用いられる抗体断片は、例えば抗体の抗原結合領域または可変領域などのインタクトな抗体の部分を含む。抗体断片の例は、Fab、Fab’、Fab’2およびFv断片;トリアボディー;テトラボディー;直鎖抗体;1本鎖抗体分子;および抗体断片から形成される多重特異性抗体を含む。用語抗体断片は、複合体を形成するように特定の抗原に結合することによって、抗体のように作用する任意の合成または遺伝的に操作されたタンパク質も含む。例えば抗体断片は、単離された断片、重鎖および軽鎖の可変領域からなるFv断片、軽鎖および重鎖可変領域がペプチドリンカーによって繋がれている組換え1本鎖ポリペプチド分子ScFvタンパク質、ならびに超可変領域を模倣するアミノ酸残基からなる最小認識単位を含む。抗体は、当技術分野において周知の方法を使用して生成され得る。例えば抗体産生のためのプロトコールは、参照により本明細書に組み込まれるHarlowandLane、1988年、Antibodies:ALaboratoryManualによって記載されている。典型的には抗体は、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、ラクダ、ラマ、サメまたは他の適切な宿主において生成され得る。代替的に抗体は、IgY分子を産生するニワトリにおいて作製され得るSchadeら、1996年ALTEX13巻5号:80頁;参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明に適する抗体は、ヒトに近い霊長類抗体である。例えば治療用に有用な抗体をヒヒにおいて生じさせる一般的技術は、それぞれが参照により本明細書に組み込まれる、例えばGoldenbergら、国際特許出願公開第WO91/11465号1991年およびLosmanら、1990年Int.J.Cancer46巻:310頁において見出され得る。いくつかの実施形態では、モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ法MilsteinandCuello、1983年Nature305巻5934号:537頁;参照により本明細書に組み込まれるを使用して調製され得る。いくつかの実施形態では、モノクローナル抗体は、組換え法によっても作製され得る米国特許第4,166,452号、1979年;参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明に適する抗体は、ヒト化またはヒト抗体を含み得る。非ヒト抗体のヒト化形態は、非ヒトIg由来の最小配列を含有するキメラIg、Ig鎖または断片Fv、Fab、Fab’、Fab’2またはAbの他の抗原結合サブ配列などである。一般にヒト化抗体は、非ヒト供給源から導入される1つまたは複数のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、しばしばインポート残基と称され、典型的にはインポート可変ドメインから得られる。ヒト化は、ヒト抗体の対応する配列をげっ歯類相補性決定領域CDRまたはCDR配列に置換することによって達成されるRiechmannら、1988年Nature332巻6162号:323頁;Verhoeyenら、1988年Science.239巻4847号:1534頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれる。そのようなヒト化抗体は、キメラAb米国特許第4,816,567号、1989年;参照により本明細書に組み込まれるであり、ここで、実質的にインタクトなヒト可変ドメイン未満のものが、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されている。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体は、典型的にはいくつかのCDR残基および場合によりいくつかのFR残基がげっ歯類Abの類似部位由来の残基によって置換されているヒト抗体である。ヒト化抗体は、レシピエントのCDR由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラット、ウサギ、などの非ヒト種ドナー抗体のCDR由来の残基によって置き換えられているヒトIgレシピエント抗体を含む。いくつかの場合では、対応する非ヒト残基がヒトIgのFvフレームワーク残基を置き換える。ヒト化抗体は、レシピエント抗体およびインポートされたCDRまたはフレームワーク配列のいずれにも見出されない残基を含んでもよい。一般にヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、ここで、非ヒトIgのCDR領域に対応する全てではなくともほとんどのCDR領域、および全てではなくともほとんどのFR領域がヒトIgコンセンサス配列のものである。最適にはヒト化抗体はまた、Ig定常領域Fc典型的にはヒトIgのの少なくとも部分を含むRiechmannら、1988年Nature332巻6162号:323頁;Verhoeyenら、1988年Science.239巻4847号:1534頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれる。ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリHoogenboomら、1991年MolImmunol.28巻9号:1027~37頁;Marksら、1991年JMolBiol.222巻3号:581~97頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれるおよびヒトモノクローナル抗体の調製ReisfeldandSell、1985年、CancerSurv.4巻1号:271~90頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれるを含む種々の技術を使用しても産生され得る。同様に、内在性Ig遺伝子が部分的または完全に不活性化されているトランスジェニック動物へのヒトIg遺伝子の導入は、ヒト抗体を合成するために利用され得る。挑戦において、遺伝子再配列、アッセンブリ、抗体レパートリーを含む全ての観点についてヒトにおいて見られるものと酷似しているヒト抗体産生が認められるFishwildら、High-avidityhumanIgGkappamonoclonalantibodiesfromanovelstrainofminilocustransgenicmice、NatBiotechnol.1996年7月;14巻7号:845~51頁;Lonbergら、Antigen-specifichumanantibodiesfrommicecomprisingfourdistinctgeneticmodifications、Nature1994年4月28日;368巻6474号:856~9頁;LonbergandHuszar、Humanantibodiesfromtransgenicmice、Int.Rev.Immunol.1995年;13巻1号:65~93頁;Marksら、By-passingimmunization:buildinghighaffinityhumanantibodiesbychainshuffling.BiotechnologyNY.1992年7月;10巻7号:779~83頁;それぞれ参照により本明細書に組み込まれる。レクチンいくつかの実施形態では、本発明に従って提供される結合剤はレクチンである。レクチンは、可溶性炭水化物、または複合糖質例えば、糖ペプチドもしくは糖脂質の一部分である炭水化物部分に結合することができる糖結合タンパク質である。レクチンは、典型的に、特定の糖部分を認識することによって、ある種の動物細胞を凝集させ、かつ/または複合糖質を沈澱させる。例えば、SNA-1は、α2-6シアル酸に対して高親和性を有するレクチンである。さらに別の一例として、PolyporussquamosusレクチンPSL1aおよびPSL1bは、アスパラギン連結糖タンパク質のNeu5Acα2,6Galβ1,4Glc/GlcNAcの三糖配列を含む、シアリル化した複合糖質の結合について高親和性を有する。結合剤として働くことができる非限定的な例示的なレクチンは、SNA-1、SNA-1’、PSL1a、PSL1b、およびこれらに由来するポリペプチドを含む。例示的なレクチンのアミノ酸配列を、以下の表1~4において提供する。アプタマーいくつかの実施形態では、本発明に従って提供する結合剤はアプタマーである。アプタマーは、特定の分子標的例えば、アンブレラトポロジーグリカンに対して緊密に結合する核酸例えば、RNA、DNAからなる巨大分子である。特定のアプタマーは、直鎖状ヌクレオチド配列によって記載することができ、典型的に長さ約15から約60ヌクレオチドである。いかなる理論によっても拘束しようとするものではないが、アプタマーにおけるヌクレオチド鎖は分子を複雑な三次元の形状にフォールディングする分子内相互作用を形成し、この三次元の形状により、アプタマーはその標的分子の表面に緊密に結合できるようになると考えられる。全ての可能なヌクレオチド配列の領域内に存在する、分子の形状の極めて高い多様性を考慮すると、アプタマーを、タンパク質および小分子を含めた広範囲の分子標的について得ることができる。アプタマーは特異性が高いことに加えて、その標的に対して非常に高い親和性を有する例えば、タンパク質に対してピコモルから低ナノモル範囲の親和性。アプタマーは化学的に安定であり、活性を失わずに煮沸または冷凍することができる。アプタマーは合成分子であるので、種々の修飾を受け入れることができ、種々の修飾はこれらの機能を特定の適用に対して最適化することができる。例えば、アプタマーを修飾して、invivoの適用における使用について、血液中の酵素による分解に対してこれらの感受性を劇的に低減することができる。さらに、アプタマーを、アプタマーの体内分布または血漿滞留時間を変更するように修飾することができる。アンブレラトポロジーグリカンおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン模倣体に結合することができるアプタマーの選択は、当技術分野において公知の方法によって実現することができる。例えば、アプタマーは、SELEX試験管内進化SystematicEvolutionofLigandsbyExponentialEnrichment法を用いて選択することができる参照により本明細書に組み込まれる、Tuerk,C.およびGold,L.、1990年、Science、249巻、505頁。SELEX法では、核酸分子の大型のライブラリ例えば、1015個の異なる分子が生成され、かつ/または標的分子例えば、アンブレラトポロジーグリカンエピトープのアンブレラトポロジーグリカンでスクリーニングされる。標的分子を、ある期間、ヌクレオチド配列のライブラリとインキュベートする。次いで、当技術分野において公知のいくつかの方法を用いて、混合物中の非結合の分子からアプタマー標的分子を物理的に単離することができ、非結合の分子は捨てることができる。次いで、標的分子に対して最高の親和性を有するアプタマーを、標的分子から精製し、酵素的に増幅して、標的分子に結合することができるアプタマーについて実質的に濃縮されている分子の新たなライブラリを生成することができる。次いで、濃縮されたライブラリを用いて、新たなサイクルの選択、分割、および増幅を開始することができる。この反復性の選択、分割、および増幅プロセス、5~15サイクルの後、ライブラリは、標的分子に対して緊密に結合する少数のアプタマーに低減する。混合物中の個々の分子を次いで単離し、これらのヌクレオチド配列を決定し、結合親和性および特異性に関してこれらの性質を測定し、比較することができる。単離したアプタマーを、次いでさらに洗練させ、標的の結合および/またはアプタマーの構造に寄与しないあらゆるヌクレオチドを排除し、それによって、これらのコア結合ドメインに切断されたアプタマーを生成することができる。アプタマー技術の再考には、その教示全体が参照により本明細書に組み込まれる、Jayasena,S.D.、1999年、Clin.Chem.、45巻、1628~1650頁を参照されたい。ポリペプチドの生成本発明のポリペプチド例えば、HAポリペプチドおよび/または非HAポリペプチド、ならびに/あるいはこれらの特徴的部分、あるいはこれらをコードする核酸は、あらゆる利用可能な手段によって生成することができる。本発明のポリペプチドまたは特徴的部分は、例えば、本発明のポリペプチドをコードする核酸を発現するように操作された宿主細胞系を利用することによって生成することができる。卵、バキュロウイルス、植物、イースト、メイディンダービーイヌ腎細胞MDCK、またはベロアフリカミドリザル腎細胞など、あらゆる系を用いて、ポリペプチドもしくは特徴的部分を生成することができる。あるいは、またはさらに、ポリペプチドもしくは特徴的部分を、発現ベクターの使用によるなど、組換え技術を用いて、細胞において発現させることができる参照により本明細書に組み込まれる、Sambrookら、1989年、MolecularCloning:ALaboratoryManual、CSHLPress。あるいは、またはさらに、本発明のポリペプチドまたはこれらの特徴的部分は、合成の手段によって生成することができる。あるいは、またはさらに、本発明のポリペプチドまたはこれらの特徴的部分、特にHAポリペプチドは、インタクトなウイルスの状況においてそうでなければ野生型、弱毒、死滅ウイルスなどでも生成することができる。本発明のポリペプチド例えば、HAポリペプチド、またはこれらの特徴的部分は、ウイルス様粒子の状況においても生成することができる。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドまたはこれらの特徴的部分は、インフルエンザウイルスから単離および/または精製することができる。例えば、ウイルスは、孵化鶏卵などの卵中で増殖させることができ、この場合、収集される材料は尿膜腔液であるのが典型的である。あるいは、またはさらに、インフルエンザウイルスは、ウイルスを増殖させるための組織培養物を用いるあらゆる方法に由来してよい。ウイルスを増殖させるのに適する細胞基材は、例えば、市販の供給源例えば、ATCC、Rockville、Md.から容易に入手できる、MDCKなどのイヌ腎細胞、またはMDCKのクローンからの細胞、MDCK様細胞、ベロ細胞を含めたAGMK細胞などのサル腎細胞、連続細胞系として培養された上皮細胞、293T細胞、BK-21細胞、CV-1細胞、またはワクチン目的のインフルエンザウイルスの生成に適するあらゆる他の哺乳動物細胞型を含む。適切な細胞基材は、MRC-5細胞などのヒト細胞も含む。適切な細胞基材は細胞系に限定されず、例えば、ニワトリ胚線維芽細胞などの初代細胞も含まれる。また、当業者であれば、ポリペプチド、特に本明細書に記載するバリアントHAポリペプチドは、アンブレラトポロジーグリカンに結合することができるポリペプチドを容易にスクリーニングおよび/または選択できる条件下で、ポリペプチド単独でも、またはウイルス粒子もしくはウイルスの部分を含めた複合体の部分としてを生成する細胞あるいは生物体を培養することによって、産生し、同定し、単離し、かつ/または生成することができることを理解されよう。例を1つだけ挙げると、いくつかの実施形態では、例えば、特定の特異性および/もしくは親和性でアンブレラトポロジーグリカンに結合するこれらのバリアントを明らかにし、かつ/またはこれらのバリアントに都合がよい条件下で、ポリペプチド例えば、HAバリアントポリペプチドの集合物を生成および/または研究することは有用であり得る。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのこのような集合物例えば、HAバリアントポリペプチドは、自然界における進化に起因する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのこのような集合物例えば、HAバリアントポリペプチドは、操作に起因する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのこのような集合物例えば、HAバリアントポリペプチドは、操作および自然界の進化の組合せに起因する。HA受容体HAは、糖タンパク質受容体に結合することによって細胞の表面と相互作用する。HAのHA受容体に対する結合は、HA受容体上のN連結グリカンによって主に媒介される。特に、インフルエンザウイルス粒子の表面上のHAは、細胞宿主の表面上のHA受容体と関連しているシアリル化グリカンを認識する。認識し、結合した後、宿主細胞はウイルス細胞を貪食し、ウイルスは隣接する細胞に分配するための多くのさらなるウイルス粒子を複製し、生成することができる。例示的なHA-グリカン相互作用のいくつかの結晶構造は同定されており、表5に示す:HA受容体は、受容体のHA結合部位付近でα2-3またはα2-6いずれかのシアリル化グリカンによって修飾されており、受容体結合グリカンの連結のタイプは受容体のHA結合部位のコンフォメーションに影響を及ぼすことがあり、このため、異なるHAに対する受容体の特異性に影響を及ぼすことがある。例えば、トリHAのグリカン結合ポケットは狭い。本発明によると、このポケットは、トランスコンフォメーションのα2-3シアリル化グリカンに、および/またはα2-3連結であれα2-6連結であれコーントポロジーグリカンに結合する。トリ組織、ならびにヒト肺深部、さらに胃腸GI管組織におけるHA受容体は、α2-3シアリル化グリカン連結を特徴とし、さらに本発明に従って、コーントポロジーを主に採用する、α2-3シアリル化および/またはα2-6シアリル化グリカンを含めたグリカンによって特徴付けられる。このようなコーントポロジーグリカンを有するHA受容体を、本明細書においてCTHArと呼ぶことができる。対照的に、上気道の気管支および気管におけるヒトHA受容体は、α2-6シアリル化グリカンによって修飾されている。α2-3モチーフと異なり、α2-6モチーフは、C6-C5結合によるコンフォメーションのさらなる自由度を有する参照により本明細書に組み込まれる、Russellら、2006年、GlycoconjJ、23巻、85頁。このようなα2-6シアリル化グリカンに結合するHAは、このコンフォメーションの自由度に起因する構造の多様性に適応する、より開かれた結合ポケットを有する。さらに、本発明によると、HAは、ヒト上気道組織の感染を効果的に媒介するために、アンブレラトポロジーにおけるグリカン例えば、α2-6シアリル化グリカンに結合する必要がある場合があり、特に強い親和性および/または特異性でこのようなアンブレラトポロジーグリカンに結合する必要がある場合がある。アンブレラトポロジーグリカンを有するHA受容体を、本明細書においてUTHArと呼ぶことができる。これらの空間的に制限されたグリコシル化プロファイルの結果、ヒトは、多くの野生型トリHA例えば、トリH2を含むウイルスに通常感染しない。特に、ウイルスに最も遭遇する可能性のあるヒト気道の部分すなわち、気管および気管支にはコーングリカン例えば、α2-3シアリル化グリカン、および/または短いグリカンとの受容体がなく、野生型トリHAは典型的にコーングリカン例えば、α2-3シアリル化グリカン、および/または短いグリカンに関連する受容体に、主にまたは独占的に結合するため、ヒトがトリのウイルスに感染することは滅多にない。アンブレラグリカン例えば、長いα2-6シアリル化グリカンを有する肺深部および/または胃腸管の受容体に接近することができるほどウイルスと十分密接して接触する場合にのみ、ヒトは感染する。グリカンアレイ公知の特異的なグリカン-グリカン結合タンパク質GBPの相互作用の現在の知識を速やかに広げるために、国際共同研究の主導であるConsortiumforFunctionalGlycomicsCFG;www.functionalglycomics.orgは、新規なグリカンリガンドの特異性についてのGBPのハイスループットスクリーニングを可能にした、いくつかのグリカン構造を含むグリカンアレイを開発した。グリカンアレイは、1価および多価両方のグリカンモチーフを含みすなわち、ポリアクリルアミド骨格に付着しており、各アレイは低濃度10μMおよび高濃度100μMの264のグリカン、ならびに各濃度に対して6個のスポットを含むhttp://www.functionalglycomics.org/static/consortium/resources/resourcecoreh5.shtmlを参照されたい。アレイは、N連結およびO連結グリカンの生理学的多様性を捉える合成のグリカンを主に含む。合成のグリカンの他に、様々な哺乳動物の糖タンパク質に由来するN連結グリカンの混合物も、アレイ上に提示される。本明細書で用いられる、グリカンのアレイは、任意選択で固体支持体上に固定されている一連の1つまたは複数のグリカンを意味する。いくつかの実施形態では、アレイは、空間において物理的に分離されている2つまたはそれを超える位置で、組織化された配置またはパターンとして存在するグリカンの集合物である。典型的に、グリカンアレイは、少なくとも4個、少なくとも8個、少なくとも16個、少なくとも24個、少なくとも48個、少なくとも96個、または数百もしくは数千の別々の位置を有する。一般的に、本発明のグリカンアレイは、あらゆる様々な型式を有することができる。生体分子に適用できる様々な異なるアレイの型式は当技術分野において公知である。例えば、多数のタンパク質および/または核酸のアレイが周知である。当業者であれば、本発明のグリカンアレイに好適な標準のアレイ型式を即座に理解されよう。いくつかの実施形態では、本発明のグリカンアレイは、マイクロアレイの型式において存在する。マイクロアレイは、典型的に、約50ミクロンから約200ミクロンまたはそれ未満の距離によって分離されている試料位置、およびナノからマイクロモル範囲またはナノからピコグラム範囲の固定された試料を有することができる。当技術分野において公知のアレイ型式は、例えば、別々の各試料の位置が、例えば10ミクロンの規模を有するものを含む。いくつかの実施形態では、本発明のグリカンアレイは、支持体上に空間的に固定されている複数のグリカンを含む。本発明は、支持体上に整列しているグリカン分子を提供する。本明細書で用いられる支持体は、グリカン分子を整列するのに用いるのに適するあらゆる材料を意味する。当業者であれば理解される通り、あらゆる広範囲の材料を用いることができる。例を少数だけ挙げると、本発明において用いることができる支持体材料は、疎水性メンブレン、例えば、ニトロセルロース、PVDF、またはナイロンのメンブレンを含む。このようなメンブレンは当技術分野において周知であり、例えば、Bio-Rad、HemelHempstead、UKから得ることができる。いくつかの実施形態では、その上にグリカンが整列している支持体は金属酸化物を含むことができる。適切な金属酸化物は、それだけには限定されないが、酸化チタン、酸化タンタル、および酸化アルミニウムを含む。このような材料の例は、Sigma-AldrichCompanyLtd、FancyRoad、Poole、Dorset、BH124QHUKから得ることができる。いくつかの実施形態では、このような支持体は、金属酸化物ゲルであり、または金属酸化物ゲルを含む。金属酸化物ゲルは、炭水化物含有分子の固定を助けるために、所与の巨視的領域内に大きな表面積を提供すると考えられている。本発明に従って用いることができるさらなるまたは代替の支持体材料は、シリカゲルまたは酸化アルミニウムゲルなどのゲルを含む。このような材料の例は、例えば、MerckKGaA、Darmstadt、ドイツから得ることができる。いくつかの実施形態では、グリカンアレイは、通常の使用の間、サイズまたは形状における変化に抵抗することができる支持体上に固定されている。例えば、支持体は、グリカンを整列させるのに用いるのに適する成分材料でコーティングされているスライドガラスであってよい。また、いくつかの複合性材料が支持体に望ましい堅固性をもたらすことがある。本明細書において実証する通り、本発明のアレイは、様々なHAポリペプチドおよびその結合特性を、同定および/または特徴付けするのに有用である。いくつかの実施形態では、本発明によるHAポリペプチドをこのようなアレイ上で試験して、アンブレラトポロジーグリカンに対して例えば、α2-6シアリル化グリカンに対して、特にアンブレラトポロジーにおいて配置される長いα2-6シアリル化グリカンに対して結合する能力を評価する。実際、本発明は、HAポリペプチド結合能力を特徴付けるために、かつ/またはヒト結合HAポリペプチドなどを検出するための診断薬として用いることができる、α2-6シアリル化グリカンのアレイ、および任意選択でα2-3シアリル化グリカンのアレイを提供する。いくつかの実施形態では、本発明のアレイは、アンブレラトポロジーにおけるグリカン例えば、α2-6シアリル化グリカン、特に、長いα2-6シアリル化グリカンを含む。当業者であれば明らかである通り、このようなアレイは、例えば、研究者がデザインおよび/または調製したものの他に、天然のインフルエンザ単離物において見出されるものを含めた、あらゆるHAポリペプチドを特徴付けまたは検出するのに有用である。いくつかの実施形態では、このようなアレイは、ヒトHA受容体上に、特にヒト上気道HA受容体上に見出されるグリカン例えば、しばしばα2-6シアリル化グリカン、特に長いα2-6シアリル化グリカンであるアンブレラグリカンの、約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約55、約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95以上を代表するグリカンを含む。いくつかの実施形態では、本発明のアレイは、図14に示すグリカン構造のいくつかまたは全てを含む。いくつかの実施形態では、アレイは、これら示すグリカンの、少なくとも約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約55、約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95以上を含む。本発明は、グリカンアレイを用いてHAポリペプチドを同定または特徴付けをする方法を提供する。いくつかの実施形態では、例えば、このような方法は、1HAポリペプチドを含む試料を提供するステップと、2グリカンを含むアレイと試料を接触させるステップと、3HAポリペプチドの、アレイ上の1つまたは複数のグリカンに対する結合を検出するステップとを含む。本発明によるグリカンアレイと接触させるHAポリペプチドを含む試料の適切な供給源は、それだけには限定されないが、病理学的試料、例えば、血液、血清/血漿、末梢血単核細胞/末梢血リンパ球PBMC/PBL、痰、尿、糞便、咽頭スワブ、皮膚病変スワブ、脳脊髄液、子宮頚部スミア、膿汁試料、食品マトリックス、ならびに脳、脾臓、および肝臓などの身体の様々な部分からの組織を含む。あるいは、またはさらに、HAポリペプチドを含む試料の他の適切な供給源は、それだけには限定されないが、環境試料、例えば、土壌、水、および微生物叢を含む。さらに他の試料は、試験室試料、例えば研究者らがデザインおよび/または調製した操作されたHAポリペプチドの試料を含む。列挙されていない他の試料も適用することができる。本発明のグリカンアレイに結合するHAポリペプチドをアッセイするのに適する、広範囲の検出系が当技術分野において公知である。例えば、HAポリペプチドを、アレイと接触させる前または後に検出可能に直接的もしくは間接的に標識することができ、次いで、結合を、局在化標識を検出することによって検出することができる。いくつかの実施形態では、スキャンデバイスを利用して、アレイ上の特定の位置を調べることができる。あるいは、またはさらに、整列したグリカンに対する結合を、例えば、熱量測定、蛍光、もしくは放射性の検出系、または他の標識化方法、または標識化を必要としない他の方法を用いて測定することができる。一般的に蛍光の検出は、蛍光分子でアレイを直接プローブし、蛍光シグナルをモニタリングすることを伴うのが典型的である。あるいは、またはさらに、アレイを、間接的な蛍光検出のために、例えば、ビオチンでタグ付けされている分子でプローブすることができるこの場合、蛍光標識されたストレプトアビジンの結合について試験することによる。あるいは、またはさらに、整列したグリカンを蛍光標識し、試験分子異なるフルオロフォアで標識されていてもよく、またはされていなくてもよいでプローブする蛍光クエンチング法を利用することができる。このような実施形態では、アレイに対する結合は、整列したグリカンから放出される蛍光を抑制squelchするように働き、したがって蛍光の放出の減少によって結合が検出される。あるいは、またはさらに、整列したグリカンを、放射性物質の存在下で増殖させた生の組織試料放射標識したプローブを産生でプローブすることができる。このような実施形態における結合は、放射性の放出を測定することによって検出することができる。このような方法は、HAポリペプチドの本発明のグリカンアレイに対する結合の事実および/または結合の程度を決定するのに有用である。本発明のいくつかの実施形態では、このような方法をさらに用いて、グリカン-HAポリペプチド相互作用に干渉し、またはそうでなければそれを変更する薬剤を同定および/または特徴付けすることができる。以下に記載する方法は、例えば、炭水化物と相互作用することができると考えられている分子が実際に相互作用することができるか否かを同定する上で、または分子が炭水化物と相互作用する能力を予想外に有するか否かを同定するのに、特に有用であり得る。本発明はまた、例えば、試験試料中の特定の薬剤を検出するための、本発明のアレイを用いる方法を提供する。例えば、このような方法は、1グリカンアレイを試験試料と例えば、HAポリペプチドを含むと思われる試料と接触させるステップと、2試験試料中の任意の薬剤のアレイに対する結合を検出するステップとを含むことができる。またさらに、本発明のアレイに対する結合を利用して、例えば、結合剤とグリカンとの間の相互作用の動態を決定することができる。例えば、相互作用の動態を決定するための本発明の方法は、1グリカンアレイを試験する分子と接触させるステップと、2結合剤と、整列したグリカン複数可との間の相互作用の動態を測定するステップとを含むことができる。結合剤の、本発明のアレイにおける任意のグリカンとの相互作用の動態は、例えば、上記に記載した通り、比色または蛍光のシグナルにおけるリアルタイムの変化によって測定することができる。このような方法は、例えば、特定の結合剤が特定の炭水化物と、同じ炭水化物と相互作用する異なる結合剤よりも高度の結合で相互作用することができるか否かを決定する上で、特に有用であり得る。もちろん、本発明によるHAポリペプチドによるグリカンの結合は、本質的にアレイ型式において存在しないグリカンの試料または供給源において評価することができることが理解されよう。例えば、本発明によるHAポリペプチドを、組織試料および/または細胞系に結合させてこれらのグリカン結合特性を評価することができる。好適な細胞系は、例えば、任意の様々な哺乳動物細胞系、特に、アンブレラトポロジーグリカン例えば、少なくともそのいくつかはα2-6シアリル化グリカン、特に長いα2-6シアリル化グリカンであってよいを含むHA受容体を発現する哺乳動物細胞系を含む。いくつかの実施形態では、利用する細胞系は、アンブレラトポロジーを有する個々のグリカンを発現する。いくつかの実施形態では、利用する細胞系は多様なグリカンを発現する。いくつかの実施形態では、細胞系は臨床分離株から得られ、いくつかの実施形態では、これらは所望のグリカンの分布および/または保有率を有するように維持され、または操作される。いくつかの実施形態では、組織試料および/または細胞系は、哺乳動物上気道上皮細胞に特徴的なグリカンを発現する。データマイニングプラットフォームここで論じる通り、本発明に従って、HAポリペプチドは、グリカン結合の研究、構造の情報例えば、HA結晶構造、および/またはタンパク質構造予測プログラムからのマイニングデータによって同定および/または特徴付けをすることができる。本発明者らが利用したそして本明細書に例示した特定のデータマイニングプロセスに関与する主なステップを図15に示す。これらのステップは、データオブジェクト、特徴、および分類指標の3つのエレメント上の操作を伴うものであった。データオブジェクトは、データベース中に蓄えられた生データであった。グリカンアレイデータの場合では、単糖および連結の点でのグリカン構造、ならびにスクリーニングした様々なGBPとの結合シグナルの化学的記載がデータオブジェクトを構成していた。データオブジェクトの性質は、特徴であった。特徴に基づいて得られたルールまたはパターンを選択して、データオブジェクトを記載した。分類指標は、データオブジェクトを特定のクラスにクラスタリングclusterするか、または特徴間もしくは特徴中の関係を決定する、のいずれかに用いられるルールまたはパターンであった。分類指標は、GBPに対して高親和性で結合するグリカンによって満たされる特定の特徴を提供した。これらのルールは、1結合を増強するとみなすことができる、一連の高親和性のグリカンリガンド上に存在する特徴、および2結合に都合がよくないとみなすことができる、高親和性のグリカンリガンド中に存在してはならない特徴の2種類であった。本明細書で利用するデータマイニングプラットフォームは、上記に記載した操作を行うためにお互いに相互作用するソフトウエアモジュール図15を含んでいた。特徴抽出装置extractorは、CFGデータベースに接続して特徴を抽出し、CFGによって用いられるオブジェクトベースのリレーショナルデータベースは、特徴の柔軟な定義definitionを促進する。特徴抽出およびデータ準備グリカンアレイ上のグリカンから抽出される代表的な特徴を表6に列挙する。示したこれらの特定の特徴を選択した背後にある根拠は、GBP上のグリカン結合部位は、典型的に二糖~四糖に適応するということであった。ツリーベースの表現を用いてグリカン構造における単糖および連結に対する情報を捉えた還元性末端のツリーの根。この表現により、接続したセットの単糖のトリプレットなど、より高次の特徴を含めた様々な特徴の抽出が促進された図16。データ準備は、各グリカンに対する抽出した特徴表6とともにグリカンアレイにおける全てのグリカンのカラム状のcolumn-wiseリストの生成を伴うものであった。グリカンおよびグリカンの特徴のこの基本表から、特定のGBPまたはセットのGBPに対する結合を支配する特定のパターンを決定するために、ルールベースの分類以下を参照されたいについてサブセットを選択する。分類指標様々なタイプの分類指標が開発されており、多くの適用において用いられる。これらは、数学的方法、間隔法、および論理法の3つの主なカテゴリーに主に分類される。これらの異なる方法ならびにこれらの利点および短所は、WeissおよびIndrukhyaPredictivedatamining-Apracticalguide、MorganKaufmann、SanFrancisco、1998年において詳しく論じられている。この特定の適用に対して、本発明者らは、論理法に該当する、規則帰納分析と呼ばれる方法を選択する。規則帰納分析の分類指標は、IF-THENルールの形態のパターンを生成する。論理法、特にIF-THENルールを生成する規則帰納分析法などの分類指標の主な利点の1つは、他の統計学的方法または数学的方法に比較した場合、分類指標の結果をより簡単に説明することができることである。これにより、発見されたルールまたはパターンの構造的および生物学的な重要性を探求できる。先表6に記載した特徴を用いて生成した一例のルールは:グリカンがGalb4GlcNAcb3Gal[B]を含み、かつFuca3GlcNAc[B]を含まなければ、グリカンはGalectin3に対してより高い親和性で結合するということである。この場合に用いた特定の規則帰納分析アルゴリズムは、WeissおよびIndurkyaPredictivedatamining-Apracticalguide、MorganKaufmann、SanFrancisco、1998年によって開発されたものである。結合レベル低親和性の結合と高親和性の結合とを区別する閾値を、グリカンアレイスクリーニングデータセットの各々に対して規定した。核酸いくつかの実施形態では、本発明は、HAポリペプチド、またはHAポリペプチドの特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードする核酸を提供する。他の実施形態では、本発明は、HAポリペプチド、またはHAポリペプチドの特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードする核酸に対して相補的である核酸を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、HAポリペプチド、またはHAポリペプチドの特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードする核酸に対してハイブリダイズする核酸分子を提供する。このような核酸は、例えば、プライマーとして、またはプローブとして用いることができる。例を少数だけ挙げると、このような核酸は、ポリメラーゼ連鎖反応PCRにおけるプライマーとして、ハイブリダイゼーションinsituチューハイブリダイゼーションを含むのためのプローブとして、および/または逆転写PCRRT-PCRのためのプライマーとして用いることができる。いくつかの実施形態では、核酸はDNAまたはRNAであってよく、1本鎖または2本鎖であってよい。いくつかの実施形態では、本発明の核酸は1つまたは複数の非天然のヌクレオチドを含むことができ、他の実施形態では、本発明による核酸は天然のヌクレオチドだけを含む。ポリペプチドに対する抗体本発明は、本発明による結合剤ポリペプチド例えば、HAポリペプチドに対する抗体を提供する。これらはモノクローナルまたはポリクローナルであってよく、当業者には公知の任意の様々な技術によって調製することができる例えば、参照により本明細書に組み込まれる、HarlowおよびLane、1988年、Antibodies:ALaboratoryManual、ColdSpringHarborLaboratoryを参照されたい。例えば、抗体は、組換え抗体を生成させるために、モノクローナル抗体の産生を含めた細胞培養技術によって、または抗体遺伝子を適切な細菌もしくは哺乳動物の細胞宿主中にトランスフェクトすることによって生成することができる。動物モデルにおける結合剤の試験本発明は、本発明による結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、USBA、UTSBAなどを、動物宿主において試験するための方法を提供する。本明細書で用いられる動物宿主は、インフルエンザの調査に適するあらゆる動物モデルを含む。例えば、本発明に適する動物宿主は、霊長類、フェレット、ネコ、イヌ、ウシ、ウマ、げっ歯動物例えば、マウス、ハムスター、ウサギ、およびラットを含めたあらゆる哺乳動物宿主であってよい。いくつかの実施形態では、本発明に用いる動物宿主はフェレットである。特に、いくつかの実施形態では、動物宿主は、本発明の結合剤任意選択で本発明の組成物中のの投与前のウイルスの曝露または感染に対してナイーブである。いくつかの実施形態では、動物宿主に、本発明の結合剤の投与前に、または投与と同時に、ウイルスを接種し、ウイルスを感染させ、またはそうでなければ、ウイルスに対して曝露する。本発明の実施において用いられる動物宿主に、当技術分野において公知のあらゆる方法によってウイルスを接種し、ウイルスを感染させ、またはそうでなければ、ウイルスに対して曝露することができる。いくつかの実施形態では、動物宿主に、経鼻的にウイルスを接種し、ウイルスを感染させ、またはウイルスに対して曝露してもよい。いくつかの実施形態では、適切な動物宿主は、ヒト気道において見出される分布に対して、アンブレラトポロジーグリカン対コーントポロジーグリカン、および/またはα2-6グリカン対α2-3グリカンの同様の分布を有することがある。例えば、動物宿主としてのフェレットは、ヒトにおけるインフルエンザウイルスによって引き起こされる疾患のモデルとして用いられる場合、マウスよりも代表的であることがある参照により本明細書に組み込まれる、Tumpeyら、2007年、Science、315巻、655~659頁ことが考慮される。いかなる理論にも拘束しようとするものではないが、本発明は、フェレットは、マウスよりも、ヒト気道におけるグリカンの分布により類似した気道におけるグリカンの分布を有することがあるという考えを包含するものである。ナイーブの動物および/または接種した動物を、あらゆる様々な試験に用いることができる。例えば、このような動物モデルは、当技術分野において公知のウイルス伝染試験に用いることができる。ウイルス伝染試験においてフェレットを使用すると、ヒトにおけるウイルス伝染に対する信頼できる予測因子として働き得ることが企図される。例えば、接種した動物例えば、フェレットからナイーブの動物へのウイルスのインフルエンザの空気伝染は当技術分野において公知である参照により本明細書に組み込まれる、Tumpeyら、2007年、Science、315巻、655~659頁。ウイルス伝染試験を、本発明の結合剤ポリペプチド例えば、HAポリペプチドを試験するのに用いることができる。例えば、ウイルスの結合を遮断する上での結合剤の効力、および/または動物宿主における感染力を決定するために、本発明の結合剤をウイルス伝染試験の前、間、または後に適切な動物宿主に投与することができる。動物宿主におけるウイルス伝染試験から集めた情報を用いて、ウイルスの結合を遮断する上での結合剤の効力、および/またはヒト宿主における感染力を予測することができる。処置本発明は、インフルエンザ感染を処置例えば、インフルエンザ感染の1つまたは複数の症状または特徴を、軽減し、寛解し、緩和し、発症を遅らせ、進行を阻害し、重症度を低減し、かつ/または発生率を低減する、および/または防止するための系、組成物、および方法を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するものなどの本発明の結合剤を、インフルエンザ感染の処置および/またはインフルエンザ感染に対して被験体を免疫化するためのワクチンの開発など、様々な治療目的に用いることができる。A.ワクチン接種いくつかの実施形態では、本発明による本発明の結合剤例えば、HAポリペプチド、および/またはこれらの断片、バリアント、および/または特徴的部分に結合する実体;アンブレラトポロジーグリカンに結合する実体を、予防的適用に利用することができる。いくつかの実施形態では、予防的適用は、インフルエンザ感染を防ぎ、進行を阻害し、かつ/または発症を遅らせるための系および方法を伴う。いくつかの実施形態では、インフルエンザワクチンは、インフルエンザによる感染を防ぎ、かつ/または発症を遅らせるのに用いられる。いくつかの実施形態では、ワクチン接種は、特定のHAポリペプチドに対して調整される。例えば、ワクチン組成物は、H2HAポリペプチドおよび/またはこれらのバリアント、断片、および/または特徴的部分を含むことができる。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、天然のコンフォメーションを有し、保護的応答例えば、補体活性化、ウイルス中和などを媒介し、かつ/または強い抗体応答を誘発することができる抗原を含むことが望ましい。いくつかの実施形態では、受動免疫すなわち、抗体が被験体に投与される免疫化に干渉剤を利用することができる。いくつかの実施形態では、受動免疫のためのインフルエンザワクチンは、本明細書に記載するものなどの抗体干渉剤を含むことができる。いくつかの実施形態では、妊娠の間に抗体が母親から胎児に伝達されるときに受動免疫が生じる。いくつかの実施形態では、抗体を直接個体に投与する例えば、注射による、経口的など。本発明は、能動免疫すなわち、微生物、タンパク質、ペプチド、エピトープ、ミモトープなどが被験体に投与される免疫化のためのインフルエンザワクチンを提供する。いくつかの実施形態では、インフルエンザワクチンは、本明細書に記載する、1つまたは複数の干渉剤および/または結合剤を含むことができる。いくつかの実施形態では、ワクチンは少なくとも1つのHAポリペプチドおよび/またはこれらのバリアント、断片、および/または特徴的部分、例えば、本明細書に記載する任意のHAポリペプチド、これらのバリアント、断片、特徴的部分、および/または組合せを含む。いくつかの実施形態では、ワクチンはH2HAポリペプチドおよび/またはこれらのバリアント、断片、および/または特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、ワクチンは以下:残基137位のアルギニン、残基193位のスレオニン、残基226位のロイシン、および/または残基228位のセリンの1つまたは複数を有するHAポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ワクチンは以下:残基137位のアルギニン、残基193位のスレオニン、残基226位のロイシン、および/または残基228位のセリンの各々を有するHAポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ワクチンは、本明細書に記載する1つもしくは複数の任意のHAポリペプチドを含む生の活動性のウイルス粒子、本明細書に記載する1つもしくは複数の任意のHAポリペプチドを含む弱毒化生ウイルス粒子、本明細書に記載する1つもしくは複数の任意のHAポリペプチドを含むウイルス様粒子VLP、本明細書に記載する1つもしくは複数の任意のHAポリペプチドを含むサブユニットワクチン、および/またはこれらの組合せを含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は少なくとも1つのアジュバントを含む。あらゆるアジュバントを本発明に従って用いることができる。多数のアジュバントが公知であり、多くのこのような化合物の有用な概論は、アメリカ国立衛生研究所によって準備されており、インターネット上に見出すことができるwww.niaid.nih.gov/daids/vaccine/pdf/compendium.pdf。Allison参照により本明細書に組み込まれる、1998年、Dev.Biol.Stand.、92巻、3~11頁、Unkelessら、参照により本明細書に組み込まれる、1998年、Annu.Rev.Immunol.、6巻、251~281頁、およびPhillipsら、参照により本明細書に組み込まれる、1992年、Vaccine、10巻、151~158頁も参照されたい。何百もの様々なアジュバントが当技術分野において公知であり、本発明の実施において用いられ得る。本発明に従って利用することができる例示的なアジュバントは、それだけには限定されないが、サイトカイン、アルミニウム塩例えば、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウムなど、参照により本明細書に組み込まれる、Baylorら、Vaccine、20巻、S18頁、2002年、ゲルタイプのアジュバント例えば、リン酸カルシウムなど;微生物のアジュバント例えば、CpGモチーフを含む免疫調節性DNA配列;モノホスホリル脂質Aなどの内毒素参照により本明細書に組み込まれる、Ribiら、1986年、ImmunologyandImmunopharmacologyofbacterialendotoxins、PlenumPubl.Corp.、NY、407頁、1986年;コレラ毒素、E.coli易熱性毒素、および百日咳毒素などの外毒素;ムラミルジペプチドなど;油-エマルジョンおよび乳化剤ベースのアジュバント例えば、フロイントのアジュバント、MF59[Novartis]、SAFなど;粒子性のアジュバント例えば、リポソーム、生物分解性のミクロスフェアなど;合成のアジュバント例えば、非イオン性ブロック共重合体、ムラミルペプチド類似体、ポリホスファゼン、合成のポリヌクレオチドなど;ならびに/またはこれらの組合せを含む。他の例示的なアジュバントは、いくつかのポリマー例えば、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第5,500,161号に記載されているポリホスファゼン、Q57、サポニン例えば、QS21、参照により本明細書に組み込まれる、Ghochikyanら、Vaccine、24巻、2275頁、2006年、スクアレン、テトラクロロデカオキシド、CPG7909参照により本明細書に組み込まれる、Cooperら、Vaccine、22巻、3136頁、2004年、ポリ[ジカルボキシラートフェノキシホスファゼン]PCCP、参照により本明細書に組み込まれる、Payneら、Vaccine、16巻、92頁、1998年、インターフェロン-γ参照により本明細書に組み込まれる、Caoら、Vaccine、10巻、238頁、1992年、ブロック共重合体P1205CRL1005、参照により本明細書に組み込まれる、Katzら、Vaccine、18巻、2177頁、2000年、インターロイキン-2IL-2、参照により本明細書に組み込まれるMbwuikeら、Vaccine、8巻、347頁、1990年、ポリメチルメタクリレートPMMA、参照により本明細書に組み込まれる、Kreuterら、J.Pharm.Sci.、70巻、367頁、1981年などを含む。B.治療法本発明は、インフルエンザに感染している、感染を生じることが多い、かつ/または症状を表す患者を処置するための系および方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、インフルエンザに感染している、感染を生じることが多い、かつ/または症状を表す患者を層別化するのに有用な系および方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明による本発明の結合剤を、治療的な適用に利用することができる。いくつかの実施形態では、治療的な適用は、本発明による少なくとも1つの結合剤の治療有効量を、それを必要とする被験体に投与することを含む。いくつかの実施形態では、結合剤の被験体への投与は、インフルエンザ感染の1つまたは複数の徴候、症状、および/または特徴を軽減し、寛解し、緩和し、発症を遅らせ、進行を阻害し、重症度を低減し、かつ/または発生率を低減することができる。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、被験体中を循環するインフルエンザビリオン例えば、新たな細胞に感染することができるインフルエンザビリオンのレベルを低減する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、被験体中を循環するインフルエンザビリオンのレベルを、無処置の対照に比べて、約10、約20、約30、約40、約50、約60、約70、約80、約90、約95、約99、または約100低減する。いくつかの実施形態では、結合剤をinvitroで用いて、被験体におけるウイルス負荷を低減することができる。身体成分、特にインフルエンザに感染している患者の身体成分のウイルス負荷を低減するために、患者の血液を、インフルエンザビリオンを捉えるための表面または固体支持体に結合している結合剤を含むデバイスを通過させる例えば、両方とも参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第5,698,390号および第4,692,411号を参照されたい。文献において見出される様々な他のデバイスを、対象の抗体と一緒に用いて同様の結果を達成することができる。身体成分は、生体液例えば、血液、血清など、組織、器官、例えば、肝臓などであってよい。いくつかの実施形態では、被験体中を循環するインフルエンザビリオンのレベルは、被験体中を循環するビリオンの絶対数を意味する。いくつかの実施形態では、被験体中を循環するインフルエンザビリオンのレベルは、被験体の血液の単位容積例えば、ミリリットル、リットルなどあたりのビリオンの数を意味する。いくつかの実施形態では、被験体中を循環するインフルエンザビリオンのレベルは、ウイルス負荷を意味する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、HA受容体に対するウイルスの結合を阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、無処置の対照に比べて、少なくとも1つのHA受容体に対するウイルスの結合を約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約50倍、約100倍、約500倍、約1000倍、約10,000倍、または約10,000倍を超えて阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、被験体におけるインフルエンザビリオンを死滅させ、かつ/または不活化する。いくつかの実施形態では、インフルエンザ抗体の投与は、無処置の被験体に比べて、被験体におけるインフルエンザビリオンの約10、約20、約30、約40、約50、約60、約70、約80、約90、約95、約99、または約100を死滅させ、かつ/または不活化する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、標的細胞とのウイルス媒介性の融合を阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、無処置の対照に比べて、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約50倍、約100倍、約500倍、約1000倍、約10,000倍、または約10,000倍を超えて標的細胞とのウイルス媒介性の融合を阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、ウイルス侵入に関連する1つまたは複数のタンパク質のコンフォメーションの変化を阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、無処置の対照に比べて、約2倍、約3倍、約4倍、約5倍、約10倍、約50倍、約100倍、約500倍、約1000倍、約10,000倍、または約10,000倍を超えて、ウイルス侵入に関連する1つまたは複数のタンパク質のコンフォメーションの変化を阻害する。いくつかの実施形態では、結合剤の投与は、HAポリペプチドおよび/またはHA受容体におけるコンフォメーションの変化をもたらす。例えば、投与した干渉剤および/または結合剤は、HAポリペプチドおよび/またはHA受容体に結合し、それによってHAポリペプチドおよび/またはHA受容体がお互いに認識および/または相互作用する能力を立体的に阻害することができる。いくつかの実施形態では、投与した結合剤は、HAポリペプチドおよび/またはHA受容体に結合し、それによってHAポリペプチドおよび/またはHA受容体がお互いに認識できなくするようなやり方で、HAポリペプチドおよび/またはHA受容体の三次元コンフォメーションを変化させることができる。いくつかの実施形態では、処置および/またはワクチン接種のレジメンは、処置および/またはワクチン接種される個体に対して特に調整される。本発明は、患者がH2HAインフルエンザに感染しているか、または非H2HAインフルエンザに感染しているかを決定するのに有用な系、組成物、および方法を提供する。このような方法を利用して、患者を処置および/またはワクチン接種のカテゴリーに層別化することができる。いくつかの実施形態では、このような方法は、処置および/またはワクチン接種が、処置および/またはワクチン接種される特定の個体に調整されるので有利であり得る。特定の一例だけを挙げると、患者がH2HAインフルエンザに感染していると分類された場合、H2HAインフルエンザの処置に有用である治療法を患者に施すことができ、H2HAインフルエンザの処置に有用ではない治療法は施されない。これにより、必要とされない治療薬の投与からの有害反応の危険性が回避または低減される。このような方法により、このような処置および/またはワクチン接種の恩恵を受けない患者を処置および/またはワクチン接種する出費が排除される。C.医薬組成物いくつかの実施形態では、本発明は、本発明の結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTBSAなどおよび/または関連する実体を含む医薬組成物を提供する。例えば、いくつかの実施形態では、結合剤のポリペプチド複数可例えば、HAポリペプチド、このようなポリペプチドをコードする核酸、このようなポリペプチドまたは核酸の特徴的な断片または生物学的に活性な断片、このようなポリペプチドまたは断片に結合および/または競合する抗体、このようなポリペプチドまたはこれらに結合するグリカンと相互作用または競合する小分子などが、本発明の医薬組成物中に含まれる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドではない例えば、小分子、アンブレラトポロジーグリカンおよびその模倣体、炭水化物、アプタマー、ポリマー、核酸など本発明の結合剤が、医薬組成物中に含まれる。本発明は、このような本発明の医薬組成物を投与することによるインフルエンザ感染の処置を包含する。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物を、インフルエンザに感染している、または感染を生じることが多い被験体に投与する。いくつかの実施形態では、被験体はインフルエンザに感染しているとみなされ、被験体はインフルエンザ感染に通常関連する1つもしくは複数の症状を表している。いくつかの実施形態では、被験体はインフルエンザウイルスに曝露されていたことが知られているか、または考えられている。いくつかの実施形態では、被験体がインフルエンザウイルスに曝露されていたことが知られているか、または考えられている場合、被験体はインフルエンザ感染を生じることが多いとみなされる。いくつかの実施形態では、被験体が、インフルエンザウイルスに感染していたことが知られているか、または感染が疑われる他の個体と接触していた場合、ならびに/あるいは被験体が、インフルエンザ感染が蔓延していることが知られているか、または考えられている場所に存在しているか、または存在していた場合、被験体はインフルエンザウイルスに曝露されていたことが知られているか、または考えられる。いくつかの実施形態では、インフルエンザに感染しているか、または感染を生じることが多い被験体を、本発明の医薬組成物の投与前、間、または後に、本発明の結合剤に対する抗体について試験する。いくつかの実施形態では、このような抗体を有する被験体に、本発明の結合剤を含む医薬組成物を投与しない。いくつかの実施形態では、医薬組成物および/または結合剤の好適な投与量は、このような抗体の検出またはその欠乏に基づいて選択される。いくつかの実施形態では、処置に対する特定の被験体の選択、投与に対する特定の結合剤もしくは組成物の選択、および/または投与に対する特定の投与量もしくはレジメンの選択は、書面の、印刷された、または電子の記憶形態などにおいて記憶される。本発明の組成物は、インフルエンザ感染の1つまたは複数の症状の発症の前または後に投与することができる。本発明は、本明細書に記載する薬剤および/または組成物の投与による、インフルエンザ感染の処置および/または防止例えば、ワクチン接種を包含する。いくつかの実施形態では、本発明によるインフルエンザ感染の処置は、ワクチンの投与によって達成される。現在まで、インフルエンザワクチンの開発において著しい業績が得られているが、さらなる改善の余地がある。本発明は、本発明の結合剤例えば、HAポリペプチド、特にH2HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTBSAなどを含む、特にアンブレラグリカン例えば、α2-6連結したアンブレラグリカン、例えば、長いα2-6シアリル化グリカンに結合する結合剤を含むワクチンを提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、非アンブレラトポロジーグリカンに優先的に結合する薬剤を実質的に含まない。このようないくつかの実施形態では、医薬組成物は、アンブレラトポロジーグリカン以外のHA受容体グリカンに結合する薬剤を、50、40、30、20、10、5、または1以下含む。例を1つだけ挙げると、H2N2インフルエンザサブタイプは1968年までにヒトにおける循環を停止したが、H2サブタイプウイルスはブタおよびトリの種から時折単離される。家畜のトリおよびブタにおけるトリH2系統の循環により、ヒトがこれらのウイルスに曝露され、ヒト集団にウイルスが再導入される危険性が高まっている。このような再導入により、1968年以後に生まれたヒト集団の巨大なサブセットに既存の免疫がないものとすると、重大な地球規模の健康上の脅威がもたらされ得る。本発明は、とりわけ、インフルエンザ感染を処置および/または防止するための、H2HAポリペプチドを含むワクチンを提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、ワクチン、およびこれらのワクチンのヒト被験体への例えば、インフルエンザに感染している、または感染を生じることが多い個体への投与を提供する。いくつかの実施形態では、ワクチンは、以下の1つまたは複数を含む組成物である:1不活化ウイルス、2弱毒化生インフルエンザウイルス、例えば、複製欠損ウイルス、3本発明の結合剤例えば、HAポリペプチドおよび/またはポリペプチドバリアント、LSBA、UTBA、UTBSAなど、4結合剤ポリペプチド例えば、HAポリペプチドまたはその特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードする核酸、5本発明の結合剤ポリペプチド例えば、HAポリペプチドまたはその特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードするDNAベクター、ならびに/あるいは6発現系、例えば、抗原として用いられる1つまたは複数のインフルエンザタンパク質を発現する細胞、および/またはウイルス様粒子。このように、いくつかの実施形態では、本発明は、不活化インフルエンザワクチンを提供する。いくつかの実施形態では、不活化インフルエンザワクチンは3タイプの抗原調製物:不活化ウイルス全体、精製されたウイルス粒子が洗剤もしくは脂質のエンベロープを可溶化するための他の試薬で破壊されているサブビリオンスプリットワクチン、または精製されたHAポリペプチドサブユニットワクチンのうちの1タイプを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ホルムアルデヒド、β-プロピオラクトン、エーテル、洗剤とエーテル例えば、TWEEN-80、セチルトリメチルアンモニウムブロミドCTABおよびTritonN101、デオキシコール酸ナトリウムおよびトリn-ブチルホスフェートとの処理によって不活化することができる。不活化は、尿膜腔液の清澄化の後または前に生じてよく卵において生成されたウイルスから、ビリオンは遠心分離によって単離および精製されるNicholsonら編集、TextbookofInfluenza、BlackwellScience、Malden、MA、1998年。ワクチンの効力を評価するために一元放射免疫拡散SRD試験を用いることができる参照により本明細書に組み込まれる、Schildら、Bull.WorldHealthOrgan.、52巻、43~50頁および223~31頁、1975年;Mostowら、J.Clin.Microbiol.、2巻、531頁、1975年。いくつかの実施形態では、本発明はワクチンに有用であるウイルス様粒子VLPを提供する。一般に、VLPは、一緒にアッセンブルした場合に天然のウイルスのコンフォメーションを模倣するタンパク質抗原の複数のコピーを含む。いくつかの実施形態では、VLPは、強いT細胞および/またはB細胞の免疫応答を誘発することができるコンフォメーションエピトープを提示する、インフルエンザウイルス表面タンパク質例えば、本発明によるHAポリペプチドの反復性の高密度ディスプレイを含む。VLPは任意のウイルス遺伝物質を含まないので、VLPはワクチン組成物において弱毒化ウイルスよりも安全であり得る。VLPは、哺乳動物細胞系、昆虫細胞系、イースト、植物細胞などを含めた様々な細胞培養系において生成することができる。VLPの一般的な考察には、例えば、これらの全てが参照により本明細書に組み込まれる、公開されているPCT出願である、WO02/000885、WO05/020889、WO06/108226、WO07/130327、WO07/130330、WO08/005777、WO08/040060、WO08/054535、WO08/061243、WO08/094197、WO08/094200、WO08/148104、WO09/009876、WO09/012489、WO10/006452、および米国特許出願公開第2005/0009008号を参照されたい。いくつかの実施形態では、本発明によるVLPは、脂質粒子と呼ばれる特殊化されたVLPである。一般的に、脂質粒子は、コンフォメーションがインタクトな対象の膜タンパク質を高濃度含むように操作されている、安定で、高度に精製された、均一なVLPである。いくつかの実施形態では、本発明による脂質粒子は、インフルエンザエンベロープタンパク質および/または他のインフルエンザ抗原を含んでいる。本発明は、生の、弱毒化インフルエンザワクチンも提供し、弱毒化のための方法は当技術分野において周知である。いくつかの実施形態では、弱毒化は、部位特異的変異誘発などの逆遺伝学の使用によって実現される。いくつかの実施形態では、ワクチンにおいて用いるためのインフルエンザウイルスは、孵化鶏卵などの卵中で増殖され、この場合、収集される材料は尿膜腔液である。あるいは、またはさらに、インフルエンザウイルスは、ウイルスを増殖させるための組織培養を用いたあらゆる方法に由来してよい。ウイルスを増殖させるのに適する細胞基材は、例えば、市販の供給源例えば、ATCC、Rockville、Mdから容易に入手できる、MDCKなどのイヌ腎細胞またはMDCKのクローンからの細胞、MDCK様細胞、ベロ細胞を含めたAGMK細胞などのサル腎細胞、連続細胞系としての培養上皮細胞、293T細胞、BK-21細胞、CV-1細胞、またはワクチン目的のインフルエンザウイルスの生成に適するあらゆる他の哺乳動物細胞型上気道上皮細胞を含むを含む。適切な細胞基材は、MRC-5細胞などのヒト細胞も含む。適切な細胞基材は細胞系に限定されず、例えば、ニワトリ胚線維芽細胞などの初代細胞も含まれる。いくつかの実施形態では、ワクチンは1つまたは複数のアジュバントをさらに含む。あらゆるアジュバントを本発明に従って用いることができる。多数のアジュバントが公知であり、このような多くの化合物の有用な概論は、アメリカ国立衛生研究所によって準備されており、インターネット上に見出すことができるwww.niaid.nih.gov/daids/vaccine/pdf/compendium.pdf。Allison1998年、Dev.Biol.Stand.、92巻、3~11頁;参照により本明細書に組み込まれる、Unkelessら、1998年、Annu.Rev.Immunol.、6巻、251~281頁;参照により本明細書に組み込まれる、およびPhillipsら、1992年、Vaccine、10巻、151~158頁;参照により本明細書に組み込まれるも参照されたい。何百もの様々なアジュバントが当技術分野において公知であり、本発明の実施において用いることができる。例えば、アルミニウム塩例えば、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウムなど、Baylorら、Vaccine、20巻、S18頁、2002年、およびモノホスホリル脂質AMPL、Ribiら、1986年、ImmunologyandImmunopharmacologyofbacterialendotoxins、PlenumPubl.Corp.、NY、407頁、1986年を、ヒトワクチンにおけるアジュバントとして用いることができる。あるいは、またはさらに、本発明に従って利用することができる例示的なアジュバントは、サイトカイン、リン酸カルシウム、微生物のアジュバント例えば、CpGモチーフを含む免疫調節性DNA配列;モノホスホリル脂質Aなどの内毒素参照により本明細書に組み込まれる、Ribiら、1986年、ImmunologyandImmunopharmacologyofbacterialendotoxins、PlenumPubl.Corp.、NY、407頁、1986年;コレラ毒素、E.coli易熱性毒素、および百日咳毒素などの外毒素;ムラミルジペプチドなど;油-エマルジョンおよび乳化剤ベースのアジュバント例えば、フロイントのアジュバント、SAFなど;粒子性のアジュバント例えば、リポソーム、生物分解性のミクロスフェアなど;合成のアジュバント例えば、非イオン性ブロック共重合体、ムラミルペプチド類似体、ポリホスファゼン、合成のポリヌクレオチドなど;ポリマー例えば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第5,500,161号に記載されている、ポリホスファゼン、Q57、スクアレン、および/またはテトラクロロデカオキシドを含む。あるいは、またはさらに、MF59ChironCorp.、http://www.chiron.com/investors/pressreleases/2005/051028.html、CPG7909参照により本明細書に組み込まれる、Cooperら、Vaccine、22巻、3136頁、2004年、およびQS21などのサポニン参照により本明細書に組み込まれる、Ghochikyanら、Vaccine、24巻、2275頁、2006年などの新たな化合物が、ヒトワクチンにおけるアジュバントとして現在試験中である。さらに、ポリ[ジカルボキシラートフェノキシホスファゼン]PCCP;参照により本明細書に組み込まれる、Payneら、Vaccine、16巻、92頁、1998年、インターフェロン-γ参照により本明細書に組み込まれる、Caoら、Vaccine、10巻、238頁、1992年、ブロック共重合体P1205CRL1005;参照により本明細書に組み込まれる、Katzら、Vaccine、18巻、2177頁、2000年、インターロイキン-2IL-2;参照により本明細書に組み込まれる、Mbwuikeら、Vaccine、8巻、347頁、1990年、およびポリメチルメタクリレートPMMA;参照により本明細書に組み込まれる、Kreuterら、J.Pharm.Sci.、70巻、367頁、1981年など、インフルエンザワクチンの免疫原性を増強するために、いくつかのアジュバントが当技術分野において公知である。いくつかの実施形態では、医薬組成物はアジュバントを含まない例えば、提供する組成物はアジュバントを本質的に含まない。いくつかの実施形態では、医薬組成物はアラムalumアジュバントを含まない例えば、提供する組成物はアラムを本質的に含まない。ワクチンの他に、本発明は、ウイルス感染の処置および/またはワクチン接種において有用な他の治療用組成物を提供する。いくつかの実施形態では、処置および/またはワクチン接種は、HAポリペプチドの発現または活性に干渉する薬剤の投与によって実現される。いくつかの実施形態では、本発明は、提供するポリペプチドに関連する抗体または他の薬剤を含む医薬組成物を提供する。例えば、本発明は、特定のHAポリペプチド例えば、アンブレラグリカンに結合するHAポリペプチドを含むウイルス粒子を認識する抗体、核酸RNAiに用いることができる、HA配列に相補的である核酸配列など、HA受容体に対する結合を競合するグリカン、グリカン-HAポリペプチド相互作用に競合する小分子もしくはグリコミメティックスglycomometics、またはこれらのあらゆる組合せを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、多様な構造を有する様々な薬剤の集合物が利用される。いくつかの実施形態では、治療用組成物は1つまたは複数の多価の薬剤を含む。いくつかの実施形態では、処置は曝露または曝露の疑いの直後に緊急投与することを含む。一般に、医薬組成物は、それだけには限定されないが無菌の水、食塩水、緩衝食塩水、またはデキストロース溶液を含めた無菌の、生体適合性のキャリアなどの1つまたは複数の不活性な薬剤に加えて、治療剤を含む。あるいは、またはさらに、組成物は、所望の特定の投薬形態に適する、本明細書で用いられる、あらゆる全ての溶媒、分散媒体、希釈液、または他の液体のビヒクル、分散補助剤もしくは懸濁補助剤、崩壊剤、界面活性剤、等張剤、増粘剤もしくは乳化剤、保存剤、緩衝化剤、固体の結合剤、顆粒化剤、潤滑剤、着色剤、甘味剤、矯味矯臭剤、芳香剤などを含む薬学的に許容される賦形剤を含むことができる。Remington’sTheScienceandPracticeofPharmacy、第21版、A.R.GennaroLippincott,WilliamsWilkins,Baltimore、MD、2006年;参照により本明細書に組み込まれるは、医薬組成物を処方する上で用いられる様々な賦形剤、およびこれらを調製するのに公知の技術を公開している。任意の従来の賦形剤媒体が、任意の望ましくない生物学的効果を生じさせるか、またはそうでなければ、医薬組成物の任意の他の成分と有害な方法で相互作用することなどにより、ある物質またはその誘導体と不適合性である場合以外は、賦形剤媒体の使用は本発明の範囲内であることが企図される。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物中に存在する治療剤は、本明細書に記載する1つまたは複数の結合剤からなる。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、アンブレラトポロジーグリカンにおよび/またはアンブレラトポロジーグリカン類似体に結合する結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを含んでいる。このようないくつかの実施形態では、本発明の組成物は、アンブレラトポロジーグリカンに結合しない関連の薬剤例えば、他のHAポリペプチドなどを実質的に含まない。このようないくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、アンブレラトポロジーグリカン以外のHA受容体グリカンに結合する薬剤を50、40、30、20、10、5、または1以下含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、脂質小胞、生物学的に利用可能な、および/または生体適合性の、および/または生物分解性のマトリックス、あるいは他の微粒子内に被包され、捕捉され、または結合されている治療剤を含む。いくつかの実施形態では、提供する医薬組成物は、凝集していない結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを含む。例えば、いくつかの実施形態では、乾燥重量または数で、1、2、5、10、20、または30未満の結合剤が、凝集物中に存在する。いくつかの実施形態では、提供する医薬組成物は、変性していない結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを含む。例えば、いくつかの実施形態では、投与するUTSBAの、乾燥重量または数で、1、2、5、10、20、または30未満が変性している。いくつかの実施形態では、提供する医薬組成物は、不活性ではない結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを含む。例えば、いくつかの実施形態では、投与するUTSBAの、乾燥重量または数で、1、2、5、10、20、または30未満が不活性である。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、提供する結合剤の免疫原性を低減するように処方される。例えば、いくつかの実施形態では、提供する結合剤は、その免疫原性をマスクする、ポリエチレングリコールおよび/またはカルボキシメチルセルロースなどの薬剤と関連例えば、結合させている。いくつかの実施形態では、提供する結合剤は、免疫原性を低減するさらなるグリコシル化を有する。本発明の医薬組成物は、単独で、あるいはそれだけには限定されないがワクチンおよび/または抗体を含めた1つまたは複数の他の治療剤と組み合わせてのいずれかで、投与することができる。と組み合わせては、薬剤を同時に投与しなければならないことも、一緒に送達するように処方しなければならないことも含意しないものとされるが、これらの送達方法は本発明の範囲内である。一般的に、各薬剤が、その薬剤に対して決定された投与量および時間スケジュールで投与される。さらに、本発明は、医薬組成物の生物学的利用能を改善し、その代謝を低減または修飾し、その排泄を阻害し、または身体内のその分布を修飾し得る薬剤と組み合わせた、本発明の医薬組成物の送達を包含する。本発明の医薬組成物を、それを必要とする任意の被験体例えば、任意の動物の処置に用いることができるが、ヒトの処置において用いるのが最も好ましい。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物および/または結合剤は、1つもしくは複数の抗ウイルス薬例えば、オセルタミビル[タミフル]、ザナミビル[リレンザ]などおよび/またはシアリダーゼと組み合わせて投与される。医薬組成物は、処置および/またはワクチン接種に効果的なあらゆる量およびあらゆる投与経路を用いて投与することができる。必要とされる正確な量は、被験体の種、年齢、および全身状態、感染の重症度、特定の組成、その投与様式、その活性の様式などに応じて、被験体ごとに変化する。医薬組成物は、投与を容易にし、投与量を均一にするための投与量単位形態において処方されるのが典型的である。しかし、本発明の組成物の合計の一日使用量は、担当の医師によって正常な医学的判断の範囲内で決定されることが理解されよう。あらゆる特定の被験体または生物体に対する特定の治療有効投与量レベルは、処置および/またはワクチン接種される障害、障害の重症度、使用される特定のワクチン組成物の活性、投与後の組成物の半減期、被験体の年齢、体重、全身の健康、性別、および食事、投与時間、投与経路、使用される特定の化合物の排泄速度、処置の期間、使用する特定の化合物と組み合わせてまたは同時に用いられる薬物、ならびに医学の技術分野において周知の同様の因子を含めた様々な因子に依存する。本発明の医薬組成物は、あらゆる経路によって投与することができる。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、経口PO、静脈内IV、筋肉内IM、動脈内、髄内、くも膜下腔内、皮下SQ、脳室内、経皮、皮中interdermal、皮内、直腸内PR、膣内、腹腔内IP、胃内IG、局所例えば、散剤、軟膏剤、クリーム剤、ゲル剤、ローション剤、および/または滴剤によって、粘膜、経鼻、頬側、経腸、硝子体、舌下を含めた様々な経路によって;気管内滴下、気管支滴下、および/または吸入によって;経口噴射、経鼻噴射、および/またはエアロゾルとして、ならびに/あるいは門脈カテーテルによって投与される。一般的に、最も好適な投与経路は、投与される薬剤の性質例えば、投与時の安定性、被験体の状態例えば、被験体が特定の投与様式に耐えることができるか否かなどを含めた様々な因子に依存する。特定の実施形態では、医薬組成物は経鼻投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は気管内滴下によって投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は気管支滴下によって投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は吸入によって投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は経鼻噴射として投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は粘膜投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は経口投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は静脈注射によって投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は筋肉内注射によって投与することができる。特定の実施形態では、医薬組成物は皮下注射によって投与することができる。現在、経口もしくは経鼻噴射、またはエアロゾルの経路例えば、吸入によるが、治療剤を肺および呼吸器系に直接送達するのに最も一般的に用いられている。しかし、本発明は、薬物送達の科学における可能性のある進歩を考慮に入れた、あらゆる好適な経路による本発明の組成物の送達を包含するものである。いくつかの実施形態では、吸入またはエアロゾルの送達のための調製物は複数の粒子を含む。いくつかの実施形態では、このような調製物は、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、または約13ミクロンの平均粒子サイズを有する。いくつかの実施形態では、吸入またはエアロゾルの送達のための調製物は、乾燥粉末として処方される。いくつかの実施形態では、吸入またはエアロゾルの送達のための調製物は、例えば、湿潤剤を含めることによって、湿潤粉末として処方される。いくつかの実施形態では、湿潤剤は、水、食塩水、または生理学的pHの他の液体からなる群より選択される。いくつかの実施形態では、本発明の組成物は、滴剤として鼻腔または頬側口腔に投与される。いくつかの実施形態では、投与量は複数の液滴例えば、1~100滴、1~50滴、1~20滴、1~10滴、1~5滴などを含むことができる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物を、定量の投与量の組成物例えば、結合剤を送達するデバイスを用いて投与する。本明細書に記載する皮内の医薬組成物の送達において用いるのに適するデバイスは、これら全てが参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第4,886,499号、米国特許第5,190,521号、米国特許第5,328,483号、米国特許第5,527,288号、米国特許第4,270,537号、米国特許第5,015,235号、米国特許第5,141,496号、米国特許第5,417,662号において記載されているものなどの短針デバイスを含む。皮内組成物は、参照により本明細書に組み込まれるWO99/34850において記載されているもの、およびこれらの機能上の等価物など、皮膚中への針の効果的な貫入の長さを制限するデバイスによっても投与することができる。液体のワクチンを液体ジェット式注射器によって、または角質層を貫通し、真皮に到達する噴出を生成する針によって、真皮に送達するジェット式注射デバイスも適切である。ジェット式注射デバイスは、例えば、これら全てが参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第5,480,381号、米国特許第5,599,302号、米国特許第5,334,144号、米国特許第5,993,412号、米国特許第5,649,912号、米国特許第5,569,189号、米国特許第5,704,911号、米国特許第5,383,851号、米国特許第5,893,397号、米国特許第5,466,220号、米国特許第5,339,163号、米国特許第5,312,335号、米国特許第5,503,627号、米国特許第5,064,413号、米国特許第5,520,639号、米国特許第4,596,556号、米国特許第4,790,824号、米国特許第4,941,880号、米国特許第4,940,460号、WO97/37705、およびWO97/13537に記載されている。圧縮ガスを用いて粉末形態のワクチンを皮膚の外側層を介して真皮へと加速する、弾道的な粉末/粒子の送達デバイスも適する。さらに、従来の注射器を、皮内投与の古典的なマントー法において用いることができる。医薬品の処方および製造における全般的な考察は、例えば、Remington’sPharmaceuticalSciences、第19版、MackPublishingCo.、Easton、PA、1995年において見出すことができる。本発明の医薬組成物を、所望の結果を達成するのに好適な任意の投与量において投与することができる。いくつかの実施形態では、所望の結果は、インフルエンザ感染の1つまたは複数の症状の強度、重症度、および/または頻度における低減、ならびに/あるいは発症の遅延である。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、アンブレラトポロジーグリカンに結合するためのインフルエンザHAと競合するのに効果的なある投与量の結合剤を投与するように処方される。いくつかの実施形態では、インフルエンザHAによるこのような結合は、このような投与が無いときのレベルと比較して、本発明の組成物の1つまたは複数の投与量を投与した後に低減する。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、組成物を投与する被験体において例えば、被験体の気道において存在する少なくとも10、少なくとも15、少なくとも20、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも35、少なくとも40、少なくとも45、少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも91、少なくとも92、少なくとも93、少なくとも94、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99、または99超、またはそれを超えるHA結合部位例えば、アンブレラトポロジーグリカンを含むHA結合部位を飽和するのに有効なある投与量の結合剤を投与するように処方される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、所望の治療効果を得るために、1日あたり被験体の体重あたり約0.001mg/kgから約100mg/kg、約0.01mg/kgから約50mg/kg、約0.1mg/kgから約40mg/kg、約0.5mg/kgから約30mg/kg、約0.01mg/kgから約10mg/kg、約0.1mg/kgから約10mg/kg、または約1mg/kgから約25mg/kgの治療剤を送達するのに十分な投与量レベルを投与することができる。所望の投与量を1回だけ被験体に送達してもよい。所望の投与量を、1日あたり3回を超えて、1日あたり3回、1日あたり2回、1日あたり1回、1日おき、2日おき、毎週、2週ごと、3週ごと、4週ごと、2ヶ月ごと、6ヶ月ごと、12ヶ月ごと、2年ごと、3年ごと、4年ごと、5年ごと、10年ごと、または20年ごとに送達してもよい。いくつかの実施形態では、所望の投与量を、複数の投与例えば、2回、3回、4回、5回、6回、7回、8回、9回、10回、11回、12回、13回、14回、15回、またはそれを超えた投与を用いて送達することができる。本発明による組成物を組み合わせ療法において用いることができることが理解されよう。組み合わせレジメンにおいて用いるための特定の組合せの治療法例えば、治療薬もしくは手順は、所望の治療薬および/または手順の適合性、ならびに達成すべき望ましい治療効果を考慮に入れる。使用する治療法は同じ目的について所望の効果を達成することがあり例えば、インフルエンザ感染を処置し、防止し、かつ/または発症を遅らせるのに有用な薬剤を、インフルエンザ感染を処置し、防止し、かつ/または発症を遅らせるのに有用な別の薬剤と同時に投与することがある、あるいは使用する治療法は異なる効果例えば、任意の有害効果のコントロールを達成することがあることが理解されよう。本発明は、医薬組成物の生物学的利用能を改善し、その代謝を低減および/もしくは修飾し、その排泄を阻害し、かつ/または身体内のその分布を修飾し得る薬剤と組み合わせた医薬組成物の送達を包含する。本発明による医薬組成物は、単独で、または1つもしくは複数の他の治療剤と組み合わせて投与することができる。と組み合わせては、薬剤を同時に投与しなければならないことも、かつ/または一緒に送達するように処方しなければならないことも含意しないものとされるが、これらの送達方法は本発明の範囲内である。組成物を、1つまたは複数の他の望ましい治療薬または医学的手順と同時に、その前に、またはそれに引き続き投与することができる。組み合わせて利用される治療的に有効な薬剤は、単一の組成物において一緒に投与してもよく、または異なる組成物において別々に投与してもよいことが理解されよう。一般的に、各薬剤は、その薬剤に対して決定された投与量および/または時間スケジュールで投与される。一般的に、組み合わせて利用される薬剤は、これらが個々に利用されるレベルを超えないレベルで利用されることが予期される。いくつかの実施形態では、組み合わせて利用されるレベルは、個々に利用されるレベルよりも低い。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、1つまたは複数の抗ウイルス薬例えば、オセルタミビル[タミフル]、ザナミビル[リレンザ]などおよび/またはシアリダーゼと組み合わせて投与される。診断/キット本発明は、それだけには限定されないが、血液、血清/血漿、末梢血単核細胞/末梢血リンパ球PBMC/PBL、痰、尿、糞便、咽頭スワブ、皮膚病変スワブ、脳脊髄液、子宮頚部スミア、膿汁試料、食品マトリックス、ならびに脳、脾臓、および肝臓などの身体の様々な部分からの組織を含めた病理学的試料における、結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを検出するための、特に特定のグリカン結合の特徴例えば、アンブレラグリカンに対する、α2-6シアリル化グリカンに対する、長いα2-6シアリル化グリカンに対する結合などを有する結合剤を検出するためのキットを提供する。本発明は、それだけには限定されないが、土壌、水、および微生物叢を含めた環境試料における、対象の結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを検出するためのキットも提供する。列挙していない他の試料も適用することができる。いくつかの実施形態では、本発明は、本明細書に記載するHAポリペプチドこのようなポリペプチドが結合剤であっても、またはなくてもを検出するためのキットを提供する。いくつかの実施形態では、本発明のキットは、特定のグリカン結合性の性質を有する結合剤例えば、HAポリペプチド、LSBA、UTBA、UTSBAなどを特異的に検出する1つまたは複数の薬剤を含むことができる。このような検出剤は、例えば、ある種の結合剤例えば、アンブレラグリカンに、および/またはα2-6シアリル化グリカンに、および/または長いα2-6シアリル化グリカンに結合する結合剤を特異的に認識する抗体を含むことができ、ELISA、免疫蛍光法、および/または免疫ブロット法によってこれらの結合剤を特異的に検出するのに用いることができる。HAポリペプチドに対して例えば、HAポリペプチドバリアントなどの、提供されるHAポリペプチドに対して結合する抗体もウイルス中和試験において用いることができ、ウイルス中和試験では、試料を対象のHAポリペプチドに特異的な抗体で処理し、無処理の試料と比べて、培養細胞に感染するその能力について試験する。その試料中のウイルスがこのようなHAポリペプチドを含んでいる場合、抗体はウイルスを中和し、ウイルスが培養細胞に感染するのを防ぐ。あるいは、またはさらに、このような抗体をHA阻害試験において用いることもでき、HA阻害試験ではHAタンパク質を所与の試料から単離し、特定のHAポリペプチドまたはHAポリペプチドのセットに特異的な抗体で処理し、無処理の試料と比べて、赤血球を凝集するその能力について試験する。試料中のウイルスがこのようなHAポリペプチドを含んでいる場合、抗体はHAポリペプチドの活性を中和し、HAポリペプチドが赤血球を凝集するのを防ぐ。他の実施形態では、このような薬剤は、特定のHAポリペプチドをコードし、RT-PCRまたはinsituハイブリダイゼーションによってこのようなHAポリペプチドを特異的に検出するのに用いることができるヌクレオチドに特異的に結合する核酸を含むことがある。いくつかの実施形態では、試料から単離した核酸を増幅した後、検出する。いくつかの実施形態では、診断試薬を検出可能に標識することができる。本発明は、インフルエンザウイルスおよびワクチンを産生するための、本発明による試薬を含むキットも提供する。キットの内容は、それだけには限定されないが、対象のHAポリペプチドまたは特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分をコードするHAヌクレオチドまたは特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分を含む発現プラスミドを含む。あるいは、またはさらに、キットは、対象のHAポリペプチドまたは特徴的部分もしくは生物学的に活性な部分を発現する発現プラスミドを含むことができる。使用者が、対象の任意のインフルエンザウイルスからのHAヌクレオチドを組み込むことができるように、ウイルス遺伝子を含まない発現プラスミドも含まれてよい。それだけには限定されないが、ベロおよびMDCK細胞系を含む哺乳動物細胞系もキットに含まれてよい。いくつかの実施形態では、診断試薬を検出可能に標識することができる。いくつかの実施形態では、本発明に従って用いるためのキットは、基準の試料、試料を処理加工し、試験を行うための指示書、結果を解釈するための指示書、試験を行うのに必要なバッファーおよび/または他の試薬を含むことができる。いくつかの実施形態では、キットは抗体のパネルを含むことができる。本発明のいくつかの実施形態では、上記で論じたグリカンアレイを、診断法および/またはキットとして利用してもよい。いくつかの実施形態では、本発明のグリカンアレイおよび/またはキットを用いて、複数の投与量例えば、本明細書で論じた通りにおいて、アンブレラグリカンに対するHAポリペプチドの結合を評価するための用量応答試験を行う。このような試験は、試験するHAポリペプチドの結合特性についての特に価値ある見識をもたらし、特異的な結合を評価するのに特に有用である。このタイプの用量応答結合試験は多くの有用な適用を見出す。例を1つだけ挙げると、これらの試験は、関連する一連のHAポリペプチドバリアントにおける結合特性の進化を追跡する上で、この一連のものが天然の進化によって産生されたものでも、意図的な操作によって産生されたものでも、2つの組合せによって産生されたものでも、役立つことがある。いくつかの実施形態では、本発明のグリカンアレイおよび/またはキットを用いて、所望の結合特性を有する結合剤例えば、HAポリペプチド、および/またはHAポリペプチドバリアントなどのHAポリペプチドを誘導し、同定し、かつ/または選択する。例えば、いくつかの実施形態では、本発明のグリカンアレイおよび/またはキットを用いて、ポリペプチド結合剤例えば、HAポリペプチドの集団に対して進化的な例えば、スクリーニングおよび/または選択の圧力をかける。本発明は、本発明の医薬組成物を投与するためのキットを提供する。例えば、いくつかの実施形態では、本発明は、少なくとも1投与量の結合剤を含むキットを提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、結合剤の開始の単位投与量およびその後の単位投与量を含むキットを提供する。このようないくつかの実施形態では、開始の単位投与量はその後の単位投与量よりも多く、または2つの投与量は等しい。いくつかの実施形態では、本発明のキット特に本発明の医薬組成物を投与するためのものは、吸入器など、送達デバイスの少なくとも1つの成分を含む。このようないくつかの実施形態では、本発明は、吸入器など、送達デバイスの少なくとも1つの成分、および1投与量の結合剤を含むキットを提供する。いくつかの実施形態では、提供するキットは使用のための指示書を含む。実施例1H2N2HAバリアント20世紀は、1918年のスペイン風邪H1N1、1957年~58年のアジア風邪H2N2、および1967年~68年の香港風邪H3N2という3つのインフルエンザの汎発流行を目撃した。これらのサブタイプのうち、H1N1およびH3N2はヒト集団において依然として循環し、毎年の流行、大発生をもたらし、H1N1サブタイプは2009年の豚インフルエンザ汎発流行2009年H1N1に関与した。H2N2サブタイプは1968年までにヒトにおける循環を停止したが、H2サブタイプウイルスは時折ブタおよびトリの種から単離されている。家畜のトリおよびブタにおけるトリH2系統の循環により、ヒトがこれらのウイルスに曝露され、ヒト集団にウイルスが再導入される危険性は高まっている。このような再導入により、1968年以後に生まれたヒト集団の巨大なサブセットに既存の免疫がないとすると、重大な地球規模の健康上の脅威がもたらされ得る。汎発流行インフルエンザウイルスの進化における主なステップの1つは、効率的に複製し、速やかに伝染するために、ウイルスがヒト宿主に適応することを可能にする遺伝子変化を獲得することであり、このことは、ヒトにおける広範で持続的な疾患をもたらす。ウイルスによる宿主の感染における重要な第1のステップは、ウイルス表面の糖タンパク質である血球凝集素HAの、宿主細胞の表面上に発現されたN-アセチルノイラミン酸Neu5Acを末端とする複雑なグリカンである、シアリル化グリカン受容体に対する結合である。末端から2番目の糖に対してα2→6連結しているNeu5Acを末端とするグリカンがヒト上気道上皮において優先的に発現され、ヒト適応インフルエンザAウイルスに対する受容体以後ヒト受容体と呼ぶとして働く。一方、末端から2番目の糖残基に対してα2→3連結しているNeu5Acを末端とするグリカンは、トリ適応インフルエンザウイルスに対する受容体以後トリ受容体と呼ぶとして働く。HAの、トリ受容体およびヒト受容体との分子相互作用は、グリカン受容体のトポロジーベースの定義を用いて捉えられている。代表的なトリ受容体およびヒト受容体から構成されるグリカンアレイプラットフォームが、HAおよびウイルス全体のグリカン受容体の結合を研究するのに広く用いられている。トリ適応ウイルス例えば、H1N1およびH5N1、ならびにヒト適応ウイルス例えば、H1N1およびH3N2から組換え発現されたHAの、トリおよびヒトの受容体に対する相対的な結合親和性は、これらのHAまたはウイルス全体を用量依存性の様式においてグリカンアレイプラットフォーム上で分析することによって定量化されている。さらに、HAのグリカンアレイ結合の性質は、ヒト呼吸器組織における生理学的なグリカン受容体に対する結合と相関することが示されている。ヒトにおけるウイルス伝染性を評価するための確立されたモデルであるフェレット動物モデルにおいて、H1N1HAのヒト受容体結合親和性は、空気伝搬性のウイルス伝染の効率と相関することが示されている。このような関係はH2N2サブタイプに対しては、未だ示されていない。構造および生化学に関する以前の研究により、1957~58年H2N2汎発流行系統に由来する野生型WTおよび変異型両方のHAについての、トリおよびヒトの受容体と、HAの受容体結合部位RBSとの相互作用についての見識がもたらされている。しかし、抗原ドリフトまたは再集合による置換に起因する、RBS内およびRBS近位のアミノ酸間の相互作用における変化は、HA-グリカン相互作用に対して深刻な効果を有し、この相互作用は次にHAのグリカン結合親和性に影響を及ぼすことが最近実証された。この知見は、汎発流行H2N2系統のHA配列と比べて配列がかなり異なっている最近のトリ-H2系統からのHAに特に関係がある。したがって、ヒト適応をもたらす可能性がある最近のトリH2サブタイプウイルスにおける変化をモニタリングするために、1957~58年のヒト適応H2N2汎発流行ウイルスからのHAの親和性と定量的に同じ範囲にあるヒト受容体結合親和性を付与する、トリH2サブタイプウイルスのHAにおける変異を理解することが重要である。本実施例において、本発明者らは、汎発流行および最近のトリH2N2のHAのグリカンRBSにおける変異の、それぞれのグリカン結合特異性に対する効果を系統的に分析した。代表的な1957~58年汎発流行のH2N2系統である、A/Albany/6/58Alb58からのHAを、基準のヒト適応HAとして選択した。代表的なトリH2N2ウイルスであり、トリから単離した最も新しい系統の1つであるA/Chicken/Pennsylvania/2004CkPA04からのHAも、この研究において評価した。本発明者らは最初に、これらのトリ適応およびヒト適応H2N2HAのグリカン受容体結合親和性およびヒト呼吸器組織結合性質を特徴付けた。HAのグリカン受容体結合親和性を、先に記載した通り、多価HA-グリカン相互作用における協同性および結合活性を考慮に入れる、見かけの結合定数Kd’を用いて定量的に定義する。次に、Alb58HA-ヒト受容体およびCkPA04HA-トリ受容体の複合体のホモロジーベースの構造モデルを用いて、本発明者らはこれらHAのRBSを分析し、ヒト受容体結合親和性をAlb58HAの結合親和性と同じ範囲にする、CkPA04HAにおける変異をデザインし、評価した。Alb58HAのグリカン受容体結合特異性の特徴付け本発明者らは、以前に、見かけの結合定数Kd’を計算することによって、HAのグリカン受容体結合親和性を定量的に特徴付けるための用量依存性グリカンアレイ結合アッセイを開発している。Alb58HAを組換え発現し、このアッセイを用いて分析した。Alb58HAは、代表的なヒト受容体である6’SLNKd’約35pMおよび6’SLN-LNKd’約5pMに高親和性で結合した図5A。とりわけ、Alb58HAの6’SLN-LNに対する結合親和性は、汎発流行H1N1A/SouthCarolina/1/1918またはSC18のHAの結合親和性と同じ範囲にある。しかしSC18HAとは異なり、驚くべきことに、Alb58HAは、代表的なトリ受容体である、グリカンアレイ上の3’SLN-LNKd’約1.5nMおよび3’SLN-LN-LNKd’約1nMに対しても実質的な結合を示した図5A。ヒト上気道気管組織切片上のAlb58HAの染色により、タンパク質の、頂端側に対する広範囲な結合図5Bが明らかになり、このように、ヒト受容体に対する高親和性の結合と相関していた。さらに、グリカンアレイアッセイにおいて観察されたAlb58の実質的なα2→3シアリル化グリカンへの結合は、これらのグリカンを優先的に発現するヒト肺深部肺胞組織に対するAlb58の結合にも反映されていた図5B。以前の研究は、グリカン受容体結合特異性を決定する上での、H2N2HAのRBSにおける226位および228位のアミノ酸が果たす役割を指摘していた。この知見は、ほとんどのヒトH2N2単離物からのHAはそのRBS内にLeu226およびSer228を有し、ほとんどのトリH2単離物からのHAはGln226およびGly228を有するという事実を含む。これらの残基の、Alb58HAの定量的なグリカン受容体結合親和性における役割を理解するために、Alb58の変異形態を3つデザインした。これら変異体の2つは、Leu226→GlnAlb58-QS変異体およびSer228→GlyAlb58-LGのアミノ酸変化を1つだけ有していた。第3の変異体は、Leu226→Gln/Ser228→GlyAlb58-QGの2つのアミノ酸変化を保有していた。Alb58-LG変異体は、WTAlb58HAのヒト受容体結合特異性を保持していたが、用量依存性の直接結合アッセイにおいてトリ受容体結合における完全な欠損を示した図6A。一方、Alb58-QG変異体は、ヒト受容体結合における完全な欠損を示したが、Alb58HAとは対照的にトリ受容体に対する実質的な結合を示した図6B。驚くべきことに、Alb58-QS変異体は、トリおよびヒトのグリカン受容体に対して結合をほとんどまたは全く示さなかった図6C。Alb58-QSの円偏光二色性分析により、Alb58-QSがミスフォールディングされている可能性は除外された。Alb58-QS変異体のホモロジーベースの構造モデルを構築して、観察された生化学的な結合性質の分子的基礎を調べた。この変異体のグリカン受容体結合部位をモデルにおいて分析すると、Ser228が、Gln226と水素結合を形成するように配置されていることが示された図6D。Gln226とSer228との間の相互作用が、Gln226の、トリ受容体と最適に接触するのに好ましい位置付けを潜在的に破壊している。この知見により、Alb58-QS変異体におけるトリ受容体結合の欠損に対する説明がもたらされる。さらに、Gln226とヒト受容体との間に接触が無いことが、ヒト受容体結合の欠損の説明となり得る。CkPA04のRBSにおける変異およびグリカン受容体結合特異性に対する変異の影響CkPA04HAの用量依存性のグリカンアレイ結合は、代表的なトリ受容体である3’SLN、3’SLN-LN、および3’SLN-LN-LNに対する高親和性の結合を示し、ヒト受容体に対しては最小の結合であった図7A。さらに、CkPA04のグリカンアレイ結合性質は、ヒト肺胞組織に対する広範囲な結合および気管組織の頂端側に対する最小の結合と相関した図7B。H2HA-グリカン受容体相互作用の分子的局面を理解するために、本発明者らは、CkPA04-トリ受容体複合体図8AおよびAlb58-ヒト受容体複合体図8Bのホモロジーベースの構造モデルを構築した。CkPA04HAおよびAlb58HAのこれらの構造モデルに基づいて、グリカン受容体と相互作用するように位置付けられたアミノ酸を比較した表7。226位および228位における違いの他に、137位および193位を含めた他の位置において違いが存在した。137位および193位のアミノ酸は、Neu5Acα2→6Galモチーフおよびヒト受容体の状況ではこのモチーフを超えて糖と相互作用するようにまた、H2ウイルスの現在の系統間での抗原性の変動において潜在的に役割を果たすように;考察を参照されたい配向される。これらの違いは、H2N2HAのヒト受容体結合に潜在的に影響を及ぼす。とりわけ、CkPA04HAは、初期のトリ適応H2N2HAと137位および193位において異なる。したがって、Gln226→LeuおよびGly228→Serの置換により、初期のトリ適応H2N2HAのRBSは汎発流行のAlb58HAのRBSとほとんど同一になっているが、CkPA04を含めたより最近のトリ適応HAにおいて、さらなるアミノ酸変化が必要とされる。上記の分析に基づいて、3セットの変異をCkPA04上で進行的に作製して、ヒト受容体との接触を改善した。第1の変異体はGln226→Leu/Gly228→Serの2つのアミノ酸変化を含むCkPA04-LS。第2の変異体であるCkPA04-TLSは、CkPA04-LSHAにおけるさらなるAla193→Thrアミノ酸変化を含んでいた。第3の変異体であるCkPA04-RTLSは、CkPA04-TLSHAにおいてさらなるGln137→Arg変異を導入することによって産生した。これらのHA変異体を組換え発現させ、これらの定量的なグリカン受容体結合親和性およびヒト組織結合性質の点で特徴付けた。CkPA04-LSは、CkPA04と比較して、トリ受容体に対する結合の低下およびヒト受容体に対する実質的な結合を示した図9A。CkPA04-TLSは、CkPA04-LSと比較した場合、ヒトおよびトリ両方の受容体に対して実質的に高い結合シグナルを示した図9C。一方、CkPA04-RTLSは、CkPA04-LSと比較して、ヒト受容体に対する結合シグナルの増大を示し、トリ受容体に対する同様の結合シグナルを示した図9E。ヒト呼吸器組織でのこれらの変異体H2HAの結合は、これらに観察されるグリカンアレイの結合と一致していた図9B、9D、9F。記載したHAの用量依存性のグリカン結合データを用いて、結合データをHillの等式に適合させる多価の結合に対してことによってKd’およびn値を計算し全てのHAに対してnは約1.3、次いでこれを用いて、理論上の結合曲線を生成して、代表的なトリおよびヒトの受容体に対するWTおよび変異体のH2HAの相対的な結合親和性を明確に区別した図10。CkPA04-LSのヒト受容体結合親和性Kd’約50pMは、Alb58HAの結合親和性Kd’約5pMの1/10であった。一方、CkPA04-TLSKd’約3pMおよびCkPA04-RTLSKd’約8pM両方のヒト受容体結合親和性は、CkPA04-LSの結合親和性より数倍高く、Alb58HAの結合親和性と同じ範囲にあった。CkPA04-TLSKd’約50pMのトリ受容体結合親和性は、WTCkPA04HAKd’約20pMの結合親和性と同じ範囲であり、CkPA04-LSKd’約220pMおよびCkPA04-RTLSKd’約220pMの結合親和性より数倍高かった。したがって、様々な変異体の中で、CkPA04-RTLSは、相対的なヒト対トリの受容体結合親和性の点で、Alb58HAに最も近かった。本発明者らの構造の理解に基づくと、この知見は、Neu5Ac連結を超えたグリカン受容体との広範囲の接触を含めて、CkPA04-RTLSおよびAlb58のRBSは互いに非常に似ているという事実と一致する。本発明者らの研究は、HA-グリカン分子の相互作用の配列および構造の系統的な分析、ならびに、これら相互作用の、HAの生化学的グリカン受容体結合親和性に対する影響を試験するための定量的結合アッセイを統合する価値を強調するものである。以前の研究は、汎発流行H2N2HAのRBSにおける226位および228位におけるアミノ酸置換に注目していた。最近、Alb58ウイルス、ならびにWTおよび変異型HAにおける226位および228位における置換を有するの関連の汎発流行H2N2ウイルスであるA/ElSalvador/2/57すなわちElSalv57のグリカン受容体結合の性質が、グリカンアレイプラットフォーム上で用量依存性の様式においてこれらウイルス全体を分析することによって特徴付けられた。現在の研究において報告された、組換えのAlb58HAのグリカン受容体結合の性質は、ウイルス全体を用いて得られた結合の性質と良好に一致する。本発明者らの結果は、226位および228位における置換の、Alb58HAの定量的なグリカン受容体結合親和性に対する影響を特徴付けることによって、これらの知見をさらに増強するものである。以前に留意した226位および228位の他に、本発明者らのH2HA-グリカン複合体の配列および構造の系統的な分析により、137位および193位などの他の位置におけるCkPA04HAとAlb58HAとの間の違いが明らかになった。CkPA04における変異を進行的にデザインすることによって、本発明者らは、137位および193位の置換は226位および228位における置換に加えて、グリカン受容体の結合親和性を相当変えることを実証している。実際、これらのさらなるアミノ酸変化を導入することでCkPA04-TLSおよびCkPA04-RTLS変異体、ヒト受容体結合親和性において、CkPA04-LS変異体の結合親和性に比べて、10倍の増大がもたらされ、親和性を汎発流行H2N2のHAAlb58について観察される親和性の範囲にしている。したがって、RBSにおけるこれらのさらなる位置における変異をモニタリングすることは、H2HAのグリカン受容体結合親和性における変化を理解するのに役立つ。さらに、これらのさらなる位置は、抗原ループの一部分でもあり、したがって、抗体の中和を回避するためのH2ウイルスにおける抗原ドリフトの結果として、一定の置換を受ける可能性がある。これらの変異をモニタリングすることはまた、ワクチン開発において重要な意味があり、最近のトリまたはブタのH2ウイルスがヒト集団において足がかりを得ることができるというシナリオが生じるだろう。本発明者らの研究において計算した見かけの結合定数Kd’を主に用いて、グリカンに対するHAの定義した空間的配置全てのHAについて固定されているを考慮に入れることによって、様々な組換えHAの相対的な結合親和性を比較する。ヒトにおける効果的なウイルスの伝染性に影響を及ぼす様々な因子の中で、本発明者らは1918年の汎発流行H1N1および最近公表された2009年の汎発流行H1N1の両方において、ヒト受容体に対する結合親和性Kd’を用いて定量化したは、フェレットにおける呼吸器の液滴によるウイルスの伝染性と相関することを示した。Alb58HAのヒト受容体結合親和性がSC18HAの結合親和性と同じ範囲にあることは、Alb58ウイルスの効果的な呼吸器の液滴による伝染と併せると、H2N2ウイルスに対し、この相関を拡大するものである。さらに、Alb58ウイルスはフェレットにおいて呼吸器の液滴によって効果的に伝染することを考えると、本発明者らの結果は、トリ受容体からヒト受容体の結合への完全な切換えは、インフルエンザAウイルスHAのヒト適応の決定的な決定要因ではないという事実を強調する。Alb58HAの定量的なグリカンアレイ結合およびヒト組織結合両方の結果は、実質的なトリ受容体結合を示す。そうではなく、ヒト受容体に対する高親和性の結合は、H2HAが他のヒト適応ウイルスのサブタイプH1およびH3と共有する共通因子であると思われ、したがって、この性質は効果的なヒト適応および伝染についての重要な決定要因であると思われる。要約すると、本発明者らの研究は、現在循環しているトリH2インフルエンザAウイルスのHAにおけるヒト適応変異の進化をモニタリングするための価値ある戦略を提供する。本開示は、本明細書で報告する絶対的および/または相対的な結合親和性を特徴とする、H2HAポリペプチドの最初の記載を報告する。本開示は、このようなH2HAポリペプチドを提供することが可能であることを確立しているので、当業者であれば、このような絶対的および/または相対的な結合親和性を同様に特徴とする他のH2HAポリペプチド例えば、本明細書において明確に試験されたH2HAポリペプチドの特異的な配列と比較して1つまたは複数の配列の変動を含むを調製することができることを理解されよう。本発明はしたがって、高親和性でアンブレラトポロジーグリカンに対する結合を示すことを特徴とするH2HAポリペプチドを提供する。例えば、いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドのアンブレラグリカンに対する結合は、ヒトの感染を媒介する野生型HAについての親和性の、10倍またはそれ未満の範囲内例えば、9倍、8倍、7倍、6倍、5倍、4倍、3倍、2倍、1.5倍などである。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドの、アンブレラグリカンに対する結合は、ヒトの感染を媒介する例えば、ヒト伝染性である野生型HAについて比較可能な条件下で観察されるものの、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも35、少なくとも40、少なくとも45、少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも96、少なくとも97、少なくとも98、少なくとも99、または少なくとも100の親和性を有する。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、多価グリカンアレイ結合アッセイにおいて、約400000超例えば、約500000、約600000、約700000、約800000などを超えるの、アンブレラトポロジーグリカンに対する結合についてのシグナルを示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、約1.5nMから約2pMの範囲内の、アンブレラトポロジーグリカンに対する親和性Kd’を示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、結合アッセイにおいて、約100pMまたはそれを超える例えば、約200pM、約300pM、約400pM、約500pM、約600pM、約700pM、約800pM、約900pM、約1nM、約1.1nM、約1.2nM、約1.3nM、約1.4nM、約1.5nMを超えるなど、コーントポロジーグリカンに対する結合についてのKd’を示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、結合アッセイにおいて、アンブレラトポロジーグリカンに対して、約500pMまたはそれ未満例えば、約400pM、約300pM、約200pM、約100pM、約90pM、約80pM、約70pM、約60pM、約50pM、約40pM、約30pM、約20pM、約10pM、約5pM、約4pM、約3pM、約2pM未満などのKd’を示し、コーントポロジーグリカンに対して約100pMまたはそれを超える例えば、約200pM、約300pM、約400pM、約500pM、約600pM、約700pM、約800pM、約900pM、約1nM、約1.1nM、約1.2nM、約1.3nM、約1.4nM、約1.5nMを超えるなどKd’を示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、アンブレラグリカン対コーングリカンについて、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約20、約30、約40、約50、約60、約70、約80、約90、約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000、約100,000まで、またはそれを超える、相対的親和性を示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、コーントポロジーグリカンに対するそれらの親和性の約100、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000、約2000、約3000、約4000、約5000、約6000、約7000、約8000、約9000、約10,000または約10,000超の、アンブレラトポロジーグリカンに対する親和性を示す。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、ヒト上気道組織例えば、上皮細胞におけるHA受容体上に見出されるグリカンの、少なくとも約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約55、約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95または約95超に対して結合する。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、対応するヒト適応HA例えば、ヒト適応H2HA、例えば、図1に示すものなどに顕著に存在する特定の残基例えば、137位、145位、186位、187位、189位、190位、192位、193位、222位、225位、226位、228位のアミノ酸を有する。いくつかの実施形態では、HAポリペプチドバリアントなどの提供するHAポリペプチド例えば、H2HAポリペプチドバリアントなどのH2HAポリペプチドは、対応するヒト適応HA例えば、ヒト適応H2HAにおいて見出される少なくとも1つのアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、H2HAポリペプチドは、野生型H2HA配列と異なる配列を有する。材料と方法CkPA04HA-およびAlb58HA-グリカン構造複合体のホモロジーベースのモデリング共結晶構造のA/Singapore/1/57H2N2HA-ヒト受容体PDBID:2WR7およびA/ck/NewYork/91-トリ受容体PDBID:2WR2を、それぞれAlb58-ヒト受容体およびCkPA04-トリ受容体の構造複合体をモデリングするためのテンプレートとして用いた。ホモロジーモデリングを、SWISS-MODELウェブベースのプログラムURL:http://swissmodel.expasy.org/SWISS-MODEL.htmlを用いて行った。HAのクローニング、変異誘発、および発現Alb58およびCkPA04のプラスミドは、それぞれTerrenceTumpey博士およびAdolfoGarcia-Sastre博士からもたらされた。ヒトおよびトリのWTのH2N2のHA遺伝子をpAcGP67Aベクター中にサブクローニングして、昆虫細胞におけるバキュロウイルス発現用に、それぞれpAcGp67-Alb58-HAおよびpAcGp67-CkPA04-HAを産生した。テンプレートとしてpAcGp67-CkPA04-HAを用いて、遺伝子を変異させて、pAcGp67-LS-HA[Gln226Leu、Gly228Ser]、pAcGp67-TLS-HA[Ala193Thr、Gln226Leu、Gly228Ser]、およびpAcGp67-RTLS-HA[Gln137Arg、Ala193Thr、Gln226Leu、Gly228Ser]を産生した。変異誘発用のプライマーを、PrimerXhttp://bioinformatics.org/primerx/を用いてデザインし、IDTDNAテクノロジーCoralville、IAによって合成した。変異誘発反応を、QuikChangeMultiSite-DirectedMutagenesisKitStratagene、CAを用いて行い、BaculogoldシステムBDBiosciences、CAを用いて製造元の指示に従って、Alb58、CkPA04、CkPA04-LS、CkPA04-TLS、およびCkPA04-RTLSバキュロウイルスをそれぞれのプラスミドから作り出した。バキュロウイルスを用いて、Sf-900IISFM培地Invitrogen、Carlsbad、CA中で培養したSf9細胞Invitrogen、Carlsbad、CAの300ml懸濁培養物に感染させた。感染させた培養物をモニタリングし、感染4~5日後に収集した。可溶性の三量体形態のHAを、先に記載したプロトコールの改変を用いて、感染させた細胞の上清から精製した。簡潔に述べると、上清を、CentriconPlus-70遠心フィルターMillipore、Billerica、MAを用いて濃縮し、三量体のHAを、Ni-NTAビーズQiagen、Valencia、CAを充填したカラムでのアフィニティークロマトグラフィーを用いて濃縮した細胞上清から収集した。HAを含む画分を一緒にプールし、AmiconUltra100KNMWLメンブレンフィルターMillipore、Billerica、MAを用いて限外ろ過にかけた。タンパク質をPBS中で再構成し、濃縮した。精製したタンパク質の濃度を、Bio-RadのプロテインアッセイBio-Rad、CAを用いて決定した。用量依存性の直接グリカンアレイ結合アッセイ多価HA-グリカン相互作用を調べるために、先に記載した通り、ストレプトアビジンプレートアレイは、代表的なビオチン化α2→3およびα2→6シアリル化グリカンを含んだ。グリカン、3’SLN、3’SLN-LN、3’SLN-LN-LNは代表的なトリ受容体である。6’SLNおよび6’SLN-LNは代表的なヒト受容体である。LNはラクトサミンGalβ1-4GlcNAcに相当し、3’SLNおよび6’SLNはそれぞれ、LNに連結しているNeu5Acα2-3およびNeu5Acα2-6に対応する。ビオチン化グリカンはConsortiumofFunctionalGlycomicsから、これらのリソースリクエストプログラムresourcerequestprogramによって入手した。ストレプトアビジンコーティングした高結合能力384ウエルプレートPierceを、2.4μMのビオチン化グリカン50μlを有するウエルを4°Cで一夜インキュベートすることによって、各ウエルの全容量までローディングした。過剰のグリカンを、PBSで広範囲に洗浄することによって除去した。三量体のHA単位は、HAモノマー3個したがって各モノマーに対して1個ずつの、RBS3個で構成される。ストレプトアビジンプレートアレイのウエルにおけるビオチン化したグリカンの空間的配置は、三量体HA単位における3個のHAモノマーのうちの1個だけに結合するのに都合がよい。したがって、HA-グリカン相互作用における多価性を特に増強するために、組換えHAタンパク質を4:2:1HA:1次:2次の比率で1次抗体および2次抗体と予め複合体を形成した。全てのHAについてのプレ複合体における三量体のHA単位4個の同一の配置により、これらのグリカン結合親和性間の比較が可能になる。好適な量の、4:2:1の比率における、ヒスチジンでタグ付けしたHAタンパク質、1次抗体マウス抗6XHisタグIgG、および2次抗体HRP結合体化ヤギ抗マウスIgGSantacruzBiotechnologyを含むストック溶液を、氷上で20分間インキュベートした。予め複合体を形成したストックHAの好適な量を、PBS中1BSAで250μlに希釈した。この予め複合体を形成したHA50μlをグリカンコーティングした各ウエルに加え、室温で2時間インキュベートし、その後上記の洗浄ステップを続けた。結合シグナルを、HRP活性に基づいて、AmplexRedPeroxidaseAssayInvitrogen、CAを用いて製造元の指示に従って決定した。実験を3回行った。グリカンなしのウエルに対する予め複合体を形成した単位の結合、およびグリカン有りのウエルに対する抗体単独の結合を含めた陰性対照において、最小の結合シグナルが観察された。H2HA-グリカン結合について、結合のパラメータである協同性nおよび見かけの結合定数Kd’を、直線化した形態のHillの等式:[式中、yは飽和度平均の結合シグナル/観察された最大の結合シグナルである]に対して、シグナル平均値3回の分析からのおよびHA濃度を適合させることによって計算した。Hillの等式:nおよびKd’のセットのパラメータに対してを用いて計算した理論上のy値を、HAの変化する濃度に対してプロットして、図10に示す、代表的なヒト6’SLN-LNおよびトリ3’SLN-LNの受容体に対する結合曲線を得た。ヒト呼吸器組織結合アッセイホルマリン固定し、パラフィン包埋した、正常ヒト気管および肺胞の組織切片を、それぞれUSBiologicalおよびUSBiomaxから購入した。組織切片を60°Cのハイブリダイゼーションオーブン中で30分間インキュベートしてパラフィンを溶かした。過剰のパラフィンを、キシレン中で複数回洗浄することによって除去した。切片を引き続き、一連のエタノール洗浄中で再水和した。非特異的な結合を防ぐために、切片を、室温RTで30分間、PBS中1BSAで予めブロックした。HA-抗体プレ複合体を産生するために、ヒスチジンタグ付けして精製した組換えHAAlb58、CkPA04、LS、およびTLSを、hisタグに対する1次抗体マウス抗6XHisタグ、Abcam、および2次AlexaFluor488ヤギ抗マウスIgG、Invitrogen抗体とそれぞれ4:2:1の比率、氷上で20分間インキュベートした。組織切片を、HA-抗体の予め複合体を形成した単位1BSA-PBSにおいて様々な最終濃度に希釈したとRTで3時間インキュベートした。次いで、切片をヨウ化プロピジウムとRTで20分間インキュベートして核を対比染色したInvitrogen;TBST中1:100。徹底的に洗浄した後、切片をマウントし、ZeissLSM510レーザー走査共焦点顕微鏡を用いて分析した。実施例2本発明の結合剤の動物宿主における試験本明細書に記載する通り、本発明は、ウイルス伝染試験のために動物宿主例えば、フェレットを用いることで、ヒトのウイルス伝染の信頼できる指標を提供することができるという認識を包含する。同様に、本発明は、ウイルスの伝染試験のために本発明の結合剤例えば、HAポリペプチドで処置した動物宿主例えば、フェレットを用いることで、ヒト宿主におけるウイルスの防止および処置のためのこのような本発明の結合剤の効力の信頼できる指標を提供することができるという認識を包含する。本実施例は、本発明の結合剤の存在下または非存在下で、適切な動物モデルにおけるウイルス伝染を決定するのに用いることができるウイルス伝染アッセイを記載する。フェレットなどの動物宿主は、動物間の直接的および間接的な接触を防ぐ、隣接するケージ中に収容することができる。しかし、これらの収容条件では、インフルエンザウイルスが空気を介して拡散される。第1の部分の動物に、有効量のウイルスを、鼻腔内などの当技術分野において公知の方法によって接種する接種動物。次いで、ナイーブの動物を、1、2、3日後またはそれ以降、接種動物に隣接するケージ内に導入することができる。本試験において用いる動物は、分析のために接種または伝染の1、2、3日後またはそれを超える日にちの任意の時間に屠殺することができる。ウイルス伝染試験に適する分析は、それだけには限定されないが、数ある中で、感染性ウイルスの力価の決定例えば、鼻洗浄液による、動物における身体的症状の観察例えば、嗜眠、食欲不振、鼻漏、くしゃみ、高熱、および/または死亡、呼吸器組織の免疫組織化学的分析を含むことができる。上記に記載したウイルス伝染アッセイは、ウイルスの接種または伝染の前、間、または後の、動物宿主の、本明細書に記載した本発明の結合剤での処置も組み込むことができる。次いで本明細書に記載する分析方法を用いて、動物宿主のウイルスによる伝染および/または感染の阻害における結合剤複数可の効力を決定する。等価物当業者は、本明細書に記載の本発明の具体的実施形態の多数の等価物を認識することも、日常的な実験だけを用いて確認することもできる。本発明の範囲が上の記載に限定されることは意図されず、次の特許請求の範囲において記載の通りである。"