燃料電池を有する燃料電池システムであって、前記燃料電池を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路と、前記冷却水経路に設けられた前記冷却水を貯える冷却水タンクと、前記冷却水経路に設けられた加熱器と、前記燃料電池システムで生じる排ガスから回収される水を貯える回収水タンクと、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で循環する水が流れる水循環経路と、前記水循環経路に設けられ、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で水を循環させる水循環器と、前記燃料電池システムの発電運転時に、前記加熱器及び前記水循環器を動作させ、前記回収水タンク内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行し、該殺菌処理において前記燃料電池に供給される冷却水の温度が前記殺菌処理の非実行時よりも低下しないよう前記加熱器の発熱量を制御するように構成されている制御器と、を備える、燃料電池システム。前記加熱器は、前記燃料電池システムの余剰電力を消費する電気ヒータである、請求項1記載の燃料電池システム。前記制御器は、前記余剰電力が発生しているときに、前記殺菌処理を実行するように構成されている、請求項2記載の燃料電池システム。前記加熱器は、電気ヒータであり、前記電気ヒータへの供給電力を燃料電池からの電力と系統電源からの電力との間で切替える切替器を備え、前記制御器は、前記燃料電池システムの発電運転時は、前記燃料電池からの電力を前記電気ヒータに供給して前記殺菌処理を実行し、前記燃料電池システムの発電停止時は、前記系統電源からの電力を前記電気ヒータに供給して前記殺菌処理を実行するよう構成されている、請求項1記載の燃料電池システム。前記制御器は、前記殺菌処理を実行しているときは、前記殺菌処理を実行していない場合に比べて前記燃料電池システムの発電量が大きくなるよう制御する、請求項1記載の燃料電池システム。燃料電池を有する燃料電池システムの運転方法であって、前記燃料電池システムは、前記燃料電池を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路と、前記冷却水経路に設けられた前記冷却水を貯える冷却水タンクと、前記冷却水経路に設けられた加熱器と、前記燃料電池システムで生じる排ガスから回収される水を貯える回収水タンクと、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で循環する水が流れる水循環経路と、前記水循環経路に設けられ、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で水を循環させる水循環器と、を備え、前記燃料電池システムの発電運転時に、前記加熱器及び前記水循環器を動作させ、前記回収水タンク内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行し、前記加熱器は、前記殺菌処理において、前記燃料電池に供給される冷却水の温度が前記殺菌処理の非実行時よりも低下しないように加熱する、燃料電池システムの運転方法。ところで、上記特許文献1記載の燃料電池システムにおいて、仮に、発電運転時に、加熱手段を用いた回収水の加熱殺菌動作を実行した場合、冷却水の温度よりも低い温度の回収水が冷却水タンク内に供給される。このため、冷却水温度が低下し、ひいては、燃料電池の運転温度が低下することになる。燃料電池の運転温度が低下すると、燃料電池内を流れる燃料ガス及び酸化剤ガスの少なくともいずれか一方からの水凝縮量が増加し、ガス流路閉塞以下、フラッディング等の問題を発生する可能性があった。しかしながら、この問題について、上記従来の燃料電池システムは考慮されていない。本発明は、上記従来の課題を解決するものであり、回収水の加熱殺菌処理時における燃料電池の温度低下を、従来の燃料電池システムよりも抑制することができる、燃料電池システム及び燃料電池システムの運転方法を提供することを目的とする。上記課題を解決するために、本発明に係る燃料電池システムは、燃料電池を有する燃料電池システムであって、前記燃料電池を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路と、前記冷却水経路に設けられた前記冷却水を貯える冷却水タンクと、前記冷却水経路に設けられた加熱器と、前記燃料電池システムで生じる排ガスから回収される水を貯える回収水タンクと、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で循環する水が流れる水循環経路と、前記水循環経路に設けられ、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で水を循環させる水循環器と、前記燃料電池システムの発電運転時に、前記加熱器及び前記水循環器を動作させ、前記回収水タンク内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行し、該殺菌処理において前記燃料電池に供給される冷却水の温度が前記殺菌処理の非実行時よりも低下しないよう前記加熱器の発熱量を制御するように構成されている制御器と、を備える。これにより、回収水の加熱殺菌処理時における燃料電池の温度低下が、従来の燃料電池システムよりも抑制される。また、本発明に係る燃料電池システムの運転方法は、前記燃料電池システムが、前記燃料電池を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路と、前記冷却水経路に設けられた前記冷却水を貯える冷却水タンクと、前記冷却水経路に設けられた加熱器と、前記燃料電池システムで生じる排ガスから回収される水を貯える回収水タンクと、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で循環する水が流れる水循環経路と、前記水循環経路に設けられ、前記回収水タンクと前記冷却水タンクとの間で水を循環させる水循環器と、を備え、前記燃料電池システムの発電運転時に、前記加熱器及び前記水循環器を動作させ、前記回収水タンク内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行する。これにより、回収水の加熱殺菌処理時における燃料電池の温度低下が、従来の燃料電池システムよりも抑制される。本発明の燃料電池システム及び燃料電池システムの運転方法によれば、回収水の加熱殺菌処理時における燃料電池の温度低下が、従来の燃料電池システムよりも抑制される。以下、本発明の実施の形態を具体的に例示する。なお、全ての図面において、同一または相当部分には同一符号を付し、重複する説明は省略する。また、全ての図面において、本発明を説明するために必要となる構成要素のみを抜粋して図示しており、その他の構成要素については図示を省略している。さらに、本発明は以下の実施の形態に限定されない。実施の形態1実施の形態1に係る燃料電池システムは、燃料電池と、燃料電池を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路と、冷却水経路に設けられ、冷却水を貯える冷却水タンクと、冷却水経路に設けられた加熱器と、燃料電池システムで生じる排ガスから回収される水を貯える回収水タンクと、回収水タンクと冷却水タンクとの間で循環する水が流れる水循環経路と、水循環経路に設けられ、回収水タンクと冷却水タンクとの間で水を循環させる水循環器と、燃料電池システムの発電運転時に、加熱器及び水循環器を動作させ、回収水タンク内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行し、該殺菌処理において燃料電池に供給される冷却水の温度が殺菌処理の非実行時よりも低下しないよう加熱器の発熱量を制御するように構成されている制御器と、を備える。ここで、燃料電池システムで生じる排ガスとしては、燃料電池で未使用の燃料ガス以下、オフ燃料ガスというや酸化剤ガス以下、オフ燃料ガスという、また、燃料電池システムに水素生成装置が設けられている場合、水素生成装置内を加熱するための燃焼器から排出される燃焼排ガスが挙げられる。また、燃料電池システムの発電運転時とは、燃料電池で発電が行われている状態をいう。さらに、菌とは、大腸菌や枯草菌等の細菌、及びカビ等の菌類のうち少なくともいずれか一つの菌を含む概念である。また、殺菌温度とは、回収水タンク内の水に存在する菌を殺菌することができる温度をいい、増殖抑制の対象となる菌の種類によって適宜設定される。上記構成により、回収水の加熱殺菌処理時における燃料電池の温度低下が、従来の燃料電池システムよりも抑制される。従って、従来の燃料電池システムに比べ、燃料電池内でのフラッディングの発生を抑制することができる。また、実施の形態1に係る燃料電池システムでは、制御器が、殺菌処理を実行しているときは、殺菌処理を実行していない場合に比べて、燃料電池システムの発電量が大きくなるよう制御してもよい。[燃料電池システムの構成]図1は、実施の形態1に係る燃料電池システムの概略構成の一例を模式的に示すブロック図である。図1に示すように、実施の形態1に係る燃料電池システム100は、燃料電池101、冷却水経路71、冷却水タンク102、加熱器103、回収水タンク104、水循環経路72、水循環器105、及び制御器110、を備えている。制御器110は、燃料電池システム100の発電運転時に、加熱器103及び水循環器105を動作させ、回収水タンク104内の水を該水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行し、該殺菌処理において燃料電池101に供給される冷却水の温度が殺菌処理の非実行時よりも低下しないよう加熱器103の発熱量を制御するように構成されている。燃料電池101は、アノード11Aとカソード11Bを有している。アノード11Aには、燃料ガス供給路73を介して、燃料ガス供給器106から燃料ガスが供給されるように構成されている。また、カソード11Bには、酸化剤ガス供給路74を介して、酸化剤ガス供給器107から酸化剤ガスが供給されるように構成されている。なお、燃料電池101としては、高分子電解質形燃料電池、リン酸形燃料電池等の各燃料電池を用いることができる。また、燃料電池101の構成については、一般的な燃料電池と同じであるため、その詳細な説明は省略する。燃料ガス供給器106は、燃料電池101のアノード11Aに燃料ガスを供給するように構成されていれば、どのような形態であってもよい。燃料ガス供給器106としては、例えば、燃料ガスを貯えるタンクと該タンクから燃料ガスを送出するポンプから構成されていてもよく、また、原料と水を用いて改質反応により燃料ガスを生成する水素生成装置で構成されていてもよい。また、酸化剤ガス供給器107は、燃料電池101のカソード11Bに酸化剤ガスを供給するように構成されていれば、どのような形態であってもよく、例えば、ブロワやシロッコファン等のファン類を用いることができる。なお、燃料ガス供給器106又は酸化剤ガス供給器107は、供給するガスを加湿する加湿器を備えていてもよい。そして、燃料電池101では、アノード11Aに供給された燃料ガスとカソード11Bに供給された酸化剤ガスが電気化学的に反応して、水が生成されるとともに、電気と熱が発生する。なお、発生した熱は、後述するように、冷却水経路71を通流する冷却水により回収されて、燃料電池101が冷却される。また、生成された水の一部は、気化して反応ガスを加湿する。そして、反応ガスを加湿した水蒸気と生成された水は、未利用の反応ガスとともに燃料電池101外に排出される。具体的には、燃料電池101で未利用の燃料ガスオフ燃料ガス、水蒸気、及び生成された水は、オフ燃料ガス経路75を介して燃料電池システム100外に排出される。また、燃料電池101で未利用の酸化剤ガスオフ酸化剤ガス、水蒸気、及び生成された水の一部は、オフ酸化剤ガス経路76を介して燃料電池システム100外に排出される。燃料ガスを加湿した水蒸気は、オフ燃料ガス経路75を通流する間に、水に凝縮する。オフ燃料ガス経路75で凝縮した水及びオフ燃料ガス経路75に排出された水は、回収水として、回収水タンク104に貯えられる。同様に、酸化剤ガスを加湿した水蒸気は、オフ酸化剤ガス経路76を通流する間に、水に凝縮する。オフ酸化剤ガス経路76で凝縮した水及びオフ酸化剤ガス経路76に排出された水は、回収水として、回収水タンク104に貯えられる。回収水タンク104内に貯えられた余剰の回収水は、排水経路104Aから燃料電池システム100外に排出される。なお、実施の形態1に係る燃料電池システム100においては、オフ燃料ガス経路75及びオフ酸化剤ガス経路76の両方から水を回収する形態を採用したが、これに限定されない。燃料電池システム100は、オフ燃料ガス経路75及びオフ酸化剤ガス経路76の少なくとも一方から水を回収すれば、どのような形態を採用してもよい。また、オフ燃料ガス経路75及びオフ酸化剤ガス経路76の少なくとも一方に、水蒸気の凝縮を促進する凝縮器を設ける形態を採用してもよい。凝縮器としては、例えば、熱交換器を使用することができる。また、燃料電池101には、燃料電池101を冷却するための冷却水が流れる冷却水経路71が設けられている。冷却水経路71の途中には、冷却水タンク102、加熱器103、及び送出器108が設けられている。加熱器103は、冷却水経路71内の冷却水を加熱するように構成されていればどのような形態を用いてもよく、例えば、電気ヒータを用いてもよい。また、加熱器103として、電気ヒータを用いた場合には、当該電気ヒータは、燃料電池101燃料電池システム100で発電された余剰電力を消費するように構成されていてもよい。さらに、送出器108としては、冷却水経路71内の水を送出することができればどのような態様であってもよく、例えば、ポンプを使用することができる。なお、実施の形態1においては、加熱器103を冷却水タンク102内に配置している。これは、冷却水タンク102は、冷却水経路71を通流する冷却水を貯え、貯えた冷却水を冷却水経路71に供給するように構成されているため、冷却水経路71の一部とみなすことができることによる。このため、加熱器103は、冷却水経路71内の冷却水を加熱することができれば、冷却水経路71冷却水タンク102を含む内に配置してもよく、また、冷却水経路71冷却水タンク102を含む外に配置してもよい。冷却水タンク102には、水循環経路72を介して、回収水タンク104が接続されている。水循環経路72には、水循環器105が設けられている。水循環器105は、回収水タンク104と冷却水タンク102との間で水を循環させるように構成されている。水循環器105としては、例えば、ポンプを用いてもよく、ポンプと水循環経路72内の水の通流を許可/遮断する開閉弁を用いてもよい。また、水循環経路72の回収水タンク104から冷却水タンク102へ向かう経路には、浄化器109が設けられている。浄化器109としては、水を浄化することができれば、どのような形態であってもよい。実施の形態1においては、イオン交換樹脂が充填された筐体で構成されていて、水に含まれる不純物主に、イオンをイオン交換樹脂に吸着させて、浄化する。なお、浄化器109としては、活性炭フィルタや逆浸透膜が設けられた筐体で構成されていてもよい。制御器110は、例えば、マイクロコンピュータによって構成されており、燃料電池システム100に関する各種の制御を行う。なお、制御器110は、単独の制御器で構成される形態だけでなく、複数の制御器が協働して燃料電池システム100の制御を実行する制御器群で構成される形態であっても構わない。[燃料電池システムの動作]次に、実施の形態1に係る燃料電池システム100の発電運転時の動作について、図1を参照しながら説明する。なお、以下の諸動作は、制御器110が燃料電池システム100の各機器を制御することにより行われる。まず、加熱器103が作動して、冷却水タンク102内の冷却水を加熱する。そして、送出器108が作動して、加熱された冷却水を冷却水経路71燃料電池101内に供給する。これにより、燃料電池101内が燃料ガスと酸化剤ガスが電気化学反応を行うのに適した温度にまで加熱される。なお、実施の形態1に係る燃料電池システム100では、加熱器103により、冷却水を加熱したが、燃料電池101自体の発電時の発熱を利用して、燃料電池101内を、電気化学反応を行うのに適した温度に加熱するようにしても構わない。次に、燃料ガス供給器106が作動して、燃料電池101のアノード11Aに燃料ガスを供給する。また、酸化剤ガス供給器107が作動して、燃料電池101のカソード11Bに酸化剤ガスを供給する。燃料電池101では、アノード11Aに供給された燃料ガスとカソード11Bに供給された酸化剤ガスが電気化学的に反応して、水が生成されるとともに、電気と熱が発生する。発生した電気は、図示されない電力調整器により、外部の電力負荷に供給される。また、発生した熱は、冷却水経路71を通流する冷却水により回収されて、燃料電池101が冷却される。さらに、未使用の反応ガス中の水蒸気や生成された水は、回収水タンク104に回収される。ところで、上述したように、オフ燃料ガス経路75又はオフ酸化剤ガス経路76の大気開放口や回収水タンク104の排水経路104Aの出口等から菌が侵入する場合がある。そして、侵入した菌が、回収水タンク104や水循環経路72等で増殖すると、水循環経路72が流路閉塞又は流路狭窄等が発生することで、水の供給機能や浄化機能に障害が生じるおそれがある。しかしながら、実施の形態1に係る燃料電池システム100では、制御器110が、燃料電池システム100の発電運転時に、加熱器103及び水循環器105を動作させ、回収水タンク104内の回収水を該回収水中に存在する菌の殺菌温度以上に加熱する殺菌処理を実行するように制御する。これにより、燃料電池101で発生する熱量に加えて、燃料電池101の発電による電気エネルギーも熱量として利用することができる。なお、制御器110は、燃料電池101に供給される冷却水の温度が、燃料電池101の温度を、殺菌処理を行っていないときの発電運転時の温度よりも低下しないよう加熱器103の発熱量加熱器103に供給される電力量を制御することが好ましい。具体的には、制御器110は、燃料電池101に供給される冷却水の温度が、殺菌処理の非実行時の冷却水の制御温度以上になるよう加熱器103の発熱量を制御する。ここで、実施の形態1に係る燃料電池システム100において、菌として、カビ例えば、ネオサルトリアシュードフィシェリNeosartoryapeudofischeriの殺菌を主目的とする場合、制御器110は、冷却水タンク102内の冷却水の温度が約80°C、回収水タンク104内の回収水の温度が45°C以上となるように、加熱器103及び水循環器105の操作量を制御する。具体的には、制御器110は、水循環器105を間欠的に動作させるように制御し、殺菌処理終了時に水循環器105を停止するように制御する。なお、実施の形態1においては、制御器110は、水循環器105を間欠的に動作するように制御する形態を採用したが、これに限定されず、水循環器105に供給する電圧値、電流値、周波数、又はduty比等を変化させて、水循環器105によって、水循環経路72を通流する水の流量を制御する形態を採用してもよい。また、加熱器103及び水循環器105を動作させることによる殺菌処理を行う時間の長さは、回収水を加熱殺菌することで、水循環経路72内での流路閉塞又は流路狭窄等により水の供給機能や浄化器109の浄化機能に障害が生じない程度の菌量に低減できる時間に適宜設定することができる。より詳しくは、回収水タンク104内の回収水の温度が高いほど殺菌効果は大きいということを考慮して、冷却水タンク102及び回収水タンク104内の温度加熱器103の操作量等の燃料電池システム100の構成や運転条件に基づき、殺菌処理を行う時間は設定され、実施の形態1においては、2時間に設定されている。また、加熱器103及び水循環器105を動作させることによる殺菌処理を行うタイミングは、燃料電池システム100の発電運転時であれば、いつでも行ってよい。また、殺菌処理を行う回数は、燃料電池システム100の発電運転時に1回だけ行ってもよく、複数回行ってもよい。さらに、制御器110は、上記殺菌処理を実行しているときは、殺菌処理を実行していない場合に比べて、燃料電池システム100燃料電池101の発電量が大きくなるように、燃料電池システム100の各機器を制御するように構成されていてもよい。このように構成された実施の形態1に係る燃料電池システム100では、加熱器103により加熱された冷却水を回収水タンク13に供給することで、回収水を昇温して、回収水を菌の殺菌温度以上に加熱することで、回収水中に含まれる菌の増殖を抑制することができる。また、実施の形態1に係る燃料電池システム100では、水循環器105を動作させることによって、回収水タンク104内の回収水が、冷却水タンク102内に供給されるが、加熱器103が動作しているため、冷却水タンク102内の冷却水回収水タンク104から供給された回収水を含むの温度を所定の範囲に保つことができる。このため、燃料電池101内の温度を所定の温度に保つことができ、燃料電池101内でのフラッディングの発生を抑制することができる。なお、浄化器109として、イオン交換樹脂を使用する場合には、イオン交換樹脂の耐熱温度が比較的低く、特に、陰イオン交換樹脂を使用する場合には、その傾向が顕著である。このため、浄化器109を通流する水の温度を考慮して、加熱器103及び浄化器109の操作量や殺菌処理の時間を設定することが好ましい。また、実施の形態1では、制御器110は、殺菌処理を実行しているときは、殺菌処理を実行していない場合に比べて燃料電池システム100の発電量が大きくなるよう制御する形態を採用したが、このような制御を行わない形態を採用してもよい。実施の形態2実施の形態2に係る燃料電池システムは、加熱器が、燃料電池システムの余剰電力を消費する電気ヒータである形態を例示する。また、本実施の形態2に係る燃料電池システムでは、制御器が、余剰電力が発生しているときに、殺菌処理を実行するように構成されていてもよい。[燃料電池システムの構成]図2は、実施の形態2に係る燃料電池システムの概略構成の一例を模式的に示すブロック図である。図2に示すように、実施の形態2に係る燃料電池システム100は、実施の形態1に係る燃料電池システム100と基本的構成は同じであるが、加熱器103が電気ヒータで構成されている点が異なる。また、実施の形態2に係る燃料電池システム100では、電力検知器112が設けられていて、制御器110は、電力検知器112が検知する電力量に基づき、燃料電池システム100で余剰電力が発生しているか否かを判断し、燃料電池システム100で余剰電力が発生しているときに、殺菌処理を行うように構成されている。具体的には、燃料電池101は、連系点114において、配線81を介して、系統電源111と接続されている。連系点114には、配線82を介して、電気ヒータ103が接続されている。また、連系点114には、配線83を介して、外部電力負荷113が接続されている。電力検知器112は、配線83の途中に設けられていて、外部電力負荷113に供給される電力量を検知するように構成されている。なお、外部電力負荷113としては、例えば、家庭で使用する電気機器が挙げられる。制御器110は、電力検知器112で検知された電力量を取得し、燃料電池101で発電された電力を検知する電力検知器図示せずで検知された電力量と電力検知器112から取得した電力量とを比較して、燃料電池システム100で余剰電力が発生しているか判断する。そして、制御器110は、燃料電池システム100で余剰電力が発生しているときには、殺菌処理を実行する。ここで、上記電力検知器図示せず、電力検知器112及び制御器110が余剰電力検知器として機能する。なお、余剰電力検知器は、上記形態に限定されるものではなく、いずれの形態であっても構わない。例えば、余剰電力検知器は、系統電源111から連系点114との間の電路を流れる電流を検知する電流検知器図示せずと制御器110で構成される形態であっても構わない。具体的には、電流検知器図示せずで連系点から系統電源の向きに電流が流れることを検知すると、余剰電力が発生していると判断する。なお、制御器110は、殺菌処理を実行するにあたって、適宜な手段を用いて、電気ヒータ103及び水循環器105の少なくとも一方に発生した余剰電力を供給することにより、電気ヒータ103及び/又は水循環器105作動させてもよい。このように構成された実施の形態2に係る燃料電池システム100であっても、実施の形態1に係る燃料電池システム100と同様の作用効果を奏する。また、実施の形態2に係る燃料電池システム100では、余剰電力が発生しているときに、殺菌処理を行うため、より省エネルギー化を図ることができる。なお、実施の形態2に係る燃料電池システム100では、余剰電力が発生している場合に、殺菌処理を実行する形態を採用したが、これに限定されない。例えば、制御器110が、電力検知器112で検知される外部電力負荷113の電力量を超える電力量を発電するよう電力制御器図示せずを制御してもよい。なお、電力制御器図示せずは、燃料電池101の発電量を制御する機器であり、例えば、インバータ等が例示される。また、本実施の形態2に係る燃料電池システムでは、制御器110が、余剰電力が発生しているときに、殺菌処理を実行するように構成されている形態を採用したが、これに限定されず、制御器110は、このような構成を採らない形態を採用してもよい。実施の形態3実施の形態3に係る燃料電池システムは、加熱器が電気ヒータであり、電気ヒータへの供給電力を燃料電池からの電力と系統電源からの電力との間で切替える切替器を備え、制御器は、燃料電池システムの発電運転時は、燃料電池からの電力を電気ヒータに供給して殺菌処理を実行し、燃料電池システムの発電停止時は、系統電源からの電力を電気ヒータに供給して殺菌処理を実行するよう構成されている形態を例示する。[燃料電池システムの構成]図3は、実施の形態3に係る燃料電池システムの概略構成の一例を模式的に示すブロック図である。図3に示すように、実施の形態3に係る燃料電池システム100は、実施の形態1に係る燃料電池システム100と基本的構成は同じであるが、加熱器103が電気ヒータで構成されている点が異なる。また、実施の形態3に係る燃料電池システム100では、切替器115が設けられている。具体的には、燃料電池101は、連系点114において、配線81を介して、系統電源111と接続されている。連系点114には、配線83を介して、外部電力負荷113が接続されている。また、燃料電池101及び系統電源111は、それぞれ、配線84及び配線85を介して、電気ヒータ103が接続されている。配線84及び配線85の途中には、電気ヒータ103への電力の供給先を燃料電池101又は系統電源111に切替える切替器115が設けられている。なお、切替器115は、電気ヒータ103の接続先を燃料電池101又は系統電源111に切替えることができれば、どのような形態であってもよく、例えば、切替スイッチで構成してもよく、また、配線84及び配線85のそれぞれに、継電器リレーを設けて、これらの継電器によって構成してもよい。制御器110は、燃料電池システム100の発電運転時には、燃料電池101が発電した電力を電気ヒータ103に供給するように切替器115を制御する。具体的には、制御器110は、燃料電池101と電気ヒータ103を接続するように、切替器115を制御する。そして、制御器110は、電気ヒータ103及び水循環器105を作動させて、殺菌処理を行う。また、制御器110は、燃料電池システム100の発電停止時には、系統電源111からの電力を電気ヒータ103に供給するように切替器115を制御する。具体的には、制御器110は、系統電源111と電気ヒータ103を接続するように、切替器115を制御する。そして、制御器110は、電気ヒータ103及び水循環器105を作動させて、殺菌処理を行う。ここで、燃料電池システム100の発電停止時とは、燃料電池システム100が発電を行っていない状態をいう。このように構成された実施の形態3に係る燃料電池システム100であっても、実施の形態1に係る燃料電池システム100と同様の作用効果を奏する。また、実施の形態3に係る燃料電池システム100では、発電停止時にも殺菌処理を行うことで、菌の増殖をより抑制することができる。なお、実施の形態3においては、制御器110は、燃料電池システム100に余剰電力が発生しているときに、殺菌処理を行うように構成されていてもよい。また、実施の形態1及び2においても、発電停止時にも殺菌処理を行ってもよいことはいうまでもない。