"工程:aリガンドライブラリーを抗-標的に接触させることによりリガンドが抗-標的に結合することを可能にし;b未結合のリガンドを分離し;c未結合のリガンドを選択された標的に接触させることにより未結合のリガンドが標的に結合することを可能にして標的-結合リガンド複合体を形成させ;d標的-結合リガンド複合体を、標的に結合しないリガンドから分離し;そしてe標的-結合リガンド複合体上の標的-結合リガンドを同定することを含む、リガンドライブラリーをスクリーニングする方法。A.他に定義しない場合、本明細書において使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する分野の当業者の一人により通常理解されるのと同じ意味を有する。本発明の目的のため、以下の用語を用いて本明細書において発明を記載する。用語リガンドは、特定の標的又は抗-標的により認識される分子又は化合物を意味する。当該用語は分子サイズ又はその組成とは無関係である。リガンドは、酵素-触媒反応のための基質として、アゴニストとして、アンタゴニストとして、機能するか、シグナルメッセンジャーとして作用するか、又は代謝経路を刺激するか又は阻害してよい。リガンドは、核酸、ペプチド、ペプチド誘導体、ペプチド模倣物、ポリペプチド、小有機分子、糖質及び所望の様式にて標的上に作用する候補混合物から単離された他の分子であってよい。好ましくは、所望の様式は標的を結合することであるが、例えば、標的を修飾又は変化させるように標的を触媒で変化させること又は標的と反応させることを含み得る。一つの好ましい態様において、上記リガンドは選択された受容体に関する抗体結合親和性の範囲で標的に関する結合親和性を有する。用語ライブラリーは、単一の貯蔵書内で創製でき、そして同時に所望の特性に関してスクリーニングできる化学又は生物学上の完全性のコレクションを意味する。本明細書にて使用されるとおり、ライブラリーは、少なくとも2つのメンバーの最少のサイズを有することができ、そして1015メンバーほどを含んでよい。一つの側面において、ライブラリーは少なくとも102のメンバーを有する。別の側面において、ライブラリーは少なくとも103のメンバーを有する。また別の側面において、ライブラリーは少なくとも106のメンバーを有する。さらなる側面において、ライブラリーは109のメンバーを有する。ライブラリーのサイズは、メンバーが同じか又は異なる場合のライブラリーを含む実在物の全数を意味する。ペプチドライブラリーは、モノマーユニットがアミド結合で結合したアミノ酸典型的には、限定ではないがL-アミノ酸である、オリゴマーを意味する。ペプチドは2つ又はそれ以上のアミノ酸の長さであってよい。発明に従い同定されたペプチドは、好ましくは50アミノ酸より短い長さであり、より好ましくは30アミノ酸より短い長さであり、また好ましくは25アミノ酸より短い長さであり、そして好ましくは20アミノ酸より短い長さである。一つの好ましい態様において、発明の方法により同定されたペプチドは4から15アミノ酸の長さである。しかしながら、通常、ペプチドは100アミノ酸までの長さである。100アミノ酸より長いペプチドは通常ポリペプチドと呼ばれる。アミノ酸の標準的な略語を本明細書にて用いる。Singletonetal.,1987DictionaryofMicrobiologyandMolecularBiology,SecondEd.,page35,引用により本明細書に編入される。ペプチド又はポリペプチドは融合ペプチド又は蛋白質として提供してよい。ペプチドは、アミノ酸配列が公知の合成ペプチド類似体を含む。用語ペプチドは、ペプチドに構造上関連する分子、例えばその構造が標準の配列決定方法論では決定できないがより複雑な方法論、例えば質量分光分析法を用いて決定されるに違いないペプチド誘導体又はペプチド模倣物を含まない。ペプチド模倣物peptidomimeticsペプチド模倣物peptidemimeticsとしても知られるは、ペプチド類似体であるが、非ペプチド化合物である。通常、一つ又は複数のペプチド結合が任意に置換されている。Evansetal.,1987J.Med.Chem.30:1229。用語蛋白質はよく知られており、大きなポリペプチドを意味する。用語核酸は、DNA、RNA、一本鎖又は二本鎖及びそれらの化学修飾物を意味する。修飾は限定ではないが、修飾された塩基、バックボーンの修飾、メチル化、非通常の塩基対修飾、及びキャッピング修飾を含んでよい。核酸ライブラリーを発明の選択性標的化方法に用いる場合、核酸リガンドは通常4から250ヌクレオチドの長さであり、そして好ましくは4から60ヌクレオチドの長さである。発明は、さらに、リガンド、好ましくは核酸、ペプチド又はポリペプチドリガンド、そしてもっとも好ましくは核酸と実質上同じ能力で標的に結合するペプチドリガンド、本明細書に記載される選択性標的化により同定されたペプチド又は蛋白質を含む。実質上、標的に結合する同じ能力とは、親和性及び選択性が本明細書に請求された方法により選択されたリガンドの親和性と選択性とほぼ同じであることを意味する。さらに、標的を結合する実質上同じ能力を有するリガンドは、開示された選択性標的化方法により同定されるリガンドに実質上相同であることになる。核酸配列に関して、同定されたリガンドに実質上相同とは、一次配列の相同の程度が80を超え、好ましくは85を超え、より好ましくは90を超え、そしてさらに好ましくは95を超え、さらにより好ましくは97を超え、そしてもっとも好ましくは99を超えることを意味する。当業者は、遺伝子コードの縮重の結果として、ヌクレオチド配列をコードする多数のペプチドが生じてよいことを認識することになる。ペプチド又はポリペプチドが、最大に整列化した場合に、少なくとも85同一性を有するか、好ましくは少なくとも90から95同一性を有するか、より好ましくは少なくとも97同一性を有するか、そしてもっとも好ましくは99同一性を有するか又は参照配列と均等であるなら、参照配列と実質上相同である。配列の最大の整列化は、公知の様々な方法及び公知の計算法のコンピューター化手段により実施してよい例えば、TFASTA,BESTFIT、ウイスコンシンジェネティックスソフトウエアパッケージ、リリース7.0、ジェネティックスコンピューターグループ、マジソン、WI。均等なアミノ酸の一般的な分類は、1グルタミン酸とアスパラギン酸;2リジン、アルギニンとヒスチジン;3アラニン、バリン、ロイシンとイソロイシン;4アスパラギンとグルタミン;5スレオニンとセリン;6フェニルアラニン、チロシンとトリプトファン;7グリシンとアラニンである。当業者であれば、本明細書において同定された配列と実質上相同な提供された配列が、標的を、実質上同じ能力をもって結合するか否かをうまく決定する。本明細書で定義された小有機分子は、約1000ドルトン又はそれ未満であって好ましくは500ドルトン未満の分子量を有する分子、好ましくは非ポリマー分子である。ペプトイドは本明細書では酵素耐性ペプチド類似体として定義される。用語標的又は抗-標的は、所定のリガンドに関して本明細書で定義された結合親和性を有する分子又は異種分子を意味する。標的及び抗-標の両者は天然分子又は合成分子又は異種分子であってよい。その標的又は抗-標的に関するリガンドの結合親和性は、解離定数KD、50有効結合に必要な濃度EC50、又は標的に結合する別の化合物の結合の50阻害IC50により記述されてよい。KDはkoff/konにより規定される。koffは標的-リガンド複合体が別個に壊れるか又は分離する率を規定する。この用語はときどき当業界において、標的-リガンド複合体の動力学上の安定性又は結合親和性の率を反映する他の測定可能な量の率、例えば酵素結合免疫吸着アッセイELISAシグナル又は放射活性標識シグナルを意味する。選択性は、結合親和性の率又はリガンド-複合体の解離に関するkoff標的KD/抗-標的KDにより規定される。kon値は、標的とリガンドが結合して標的-リガンド複合体を形成する率を記述する。用語接触するは、リガンドライブラリーと標的又は抗-標的をすぐ近くにおくか又は対合させることを意味し、そしてインビトロ及びインビボの接触を含むように広く定義される。当該用語は、タッチする、アソシエートさせる、ジョインさせる、コンバインさせる、静脈内注射、経口投与、腹膜内、局所適用、筋肉内、吸入、皮下適用等を含む。本明細書で使用される用語分離するは、選択するselect、隔離するsegregate、仕切るpartition、単離するisolate、回収するcollect、別々にするkeepapart、及び分離するdisuniteを意味する。増幅するは、分子又は分子のクラスの量又はコピー数を増加させるプロセス又はプロセスの工程の組み合わせを意味する。一つの側面において、増幅は、当業界でよく知られたポリメラーゼ鎖反応PCR技術を用いて実施する核酸配列の追加のコピーの生産を意味する。別の側面において、増幅は、宿主の感染によるファージウイルス粒子濃度生産を意味する。本明細書及び特許請求の範囲において使用される、単独のa、an及びtheは、他に明確に事情を指図しない限り、複数の参照を含む。例えば、用語aproteaseは、複数のプロテアーゼを含んでよい。以下の文献は、本明細書で採用された一般的技術を記載する:Sambrooketal.,1989MolecularCloning:ALaboratoryManualHarborLaboratoryPress,ColdSpringHarbor,NY;Innisetal.,PCRProtocols-AGuidetoMethodsandApplications1990,AcademicPress,Inc.;Kayetal.,1996PhageDisplayofPeptidesandProteins,AcademicPress;Ausubeletal.,1987CurrentProtocolinMolecularBiology,Greene-PublishingWileyInterscienceNY1999から増補;BergerandKimmel,1987MethodsinEnzymology,Vol.152.AcademicPressInc.,SanDiego,CAである。この出願を通して引用された全ての文献、特許及び公表された特許出願のコンテクストは、それの全体を引用することにより本明細書に編入する。B.一般的方法本明細書に記載されるのは、選択された標的に関して結合親和性及び選択性を有するリガンドのライブラリーをスクリーニングする選択性標的化方法である。そのもっとも基本的な形態において、上記選択性標的化方法は以下のとおりに定義してよい:リガンド、好ましくは異なる配列の複数のペプチドのライブラリー、そしてより好ましくはランダムなペプチドライブラリーを作成するか又は得る。上記ライブラリーのリガンドと抗-標的の間の結合に関して好ましい条件下でリガンドライブラリーを抗-標的と接触させることにより抗-標的と結合するリガンドを選択から除外するdeselecting;抗-標的がリガンドと結合することを可能にする;そして抗-標的リガンド結合した分子又はあらゆる遊離のリガンドから抗-標的非バインダー未結合リガンドを分離する。当該抗-標的非バインダーを選択された標的に適切な条件下で接触させ、そしてそれらを結合させることを許容する。標的に親和性を有するリガンドは結合して標的結合リガンド複合体を形成することになる。抗-標的に結合したリガンドの除去及び弱く標的結合したリガンドの除去は、一般にライブラリー枯渇depletionと呼ぶ。標的結合リガンド複合体を次に未結合のリガンドを含む残りの混合物から分離する。標的結合リガンド複合体又は標的結合リガンドは、次に、任意に増幅、配列決定又はさらなるラウンドの選択に供してよい図1。発明は、さらに、発明の選択性標的化方法により同定されたリガンドを含む。発明の実施に際して、試験される化合物のライブラリーが通常提供されることになる。リガンドのライブラリーは、限定ではないが、ランダムペプチドライブラリー、合成ペプチド又はペプチド模倣物のコンビナトリアルライブラリー、ペプチドループライブラリー、コンビナトリアルケミカルライブラリー、及びオリゴヌクレオチドライブラリーを含んでよい。これらのライブラリーは、当業界においてよく知られており、上記ライブラリーを作成する方法も知られている。Barbas,C.F.1993CurrentOpinioninBiotech.,4:526;Cwirlaetal.,1990前記;ScottandSmith,1990Science,249:386;Culletal.,1992前記;Pinillaetal.,1994Biochem.J.301:847;Sambrooketal.,1989前記;Ausubeletal.,1987前記;及びGublerandHoffman,1983Gene25:263を参照されたく、各々は引用により本明細書に編入される。ライブラリーの一つの好ましい種類は、ランダムペプチドライブラリーである当業界においては時々エピトープライブラリーとも呼ばれる。これらのライブラリーは、細胞表面ライブラリー、例えば酵母ライブラリーBoderandWittrup1997Nat.Biotechnol.,15:553;蛋白質に挿入されたペプチドライブラリーLenstraetal.,1992J.Immunol.Methods,152:149及び米国特許第5,837,500号;ポリソ-ム上のペプチドの直接スクリーニングTuerketal.,1990Science249:505及びファージディスプレイライブラリーDelvinetal.,1990Science249:404;WO91/18980;Doweetal.WO91/19818;及びParmleyetal.,1988Gene73:305を含んでよい。ファージディスプレイライブラリーが特に好ましい。ファージディスプレイライブラリーは多数のライブラリーをバクテリオファージ、例えば繊維状ファージの上でディスプレイするライブラリーである。ペプチド又は蛋白質をバクテリオファージのコート蛋白質との融合物として発現して、ウイルス粒子の表面上に融合蛋白質をディスプレイし、当該融合物をコードするDNAはウイルス粒子中に存在する。ファージライブラリーの構築のためのベクターの適切な非限定例は、fAFF1;fUSEシリーズ、例えばfUSE5;ラムダファージベクター;及びT7セレクト非繊維状ファージベクターを含む。SmithandScott1993MethodsinEnzymol.217:228;及びCwirlaetal.,1990Proc.Natl.Acad.Sci.USA87:6378。ファージペプチドライブラリーキットが利用可能であり、ChironCorp.Emeryville,CA,NewEnglandBioLabsInc.,カタログ番号8100Beverly,MA及びNovagenカタログ番号70550-3Madison,WIを参照されたい。ファージ上の抗体ディスプレイライブラリーdeBruinetal.,1999Nat.Biotechnol.,17:397を含む様々な抗体ライブラリーが公知であるが、本発明の一つの好ましい側面において、発明による選択性標的化方法に使用されるリガンドのライブラリーは抗体を含まない。核酸によりコードされる別の種のペプチドライブラリーは、ペプチドが別の蛋白質、例えば細胞表面例えば又は宿主の内部蛋白質との融合物として発現されるライブラリーを含む。ペプチドをコードするヌクレオチドを内部蛋白質コード遺伝子に挿入する。この種のライブラリーの様々な例が、ペプチドの、lacリプレッサー、GAL4、チオレドキシン、及び様々な抗体への融合を含む米国特許第5,283,173号;5,270,181;及び5,292,646。Culletal.1992Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:1865は、ペプチドライブラリーメンバーとLaclの融合蛋白質をコードする融合遺伝子の構築を教示する。ペプチドのライブラリーをコードする核酸をLaclコーディング遺伝子に挿入する。当該融合蛋白質と当該融合蛋白質をコードする融合プラスミドを、プラスミド中でlacオペレーター配列に上記ペプチドを結合することにより物理的に連結する。宿主細胞はライブラリープラスミドにより形質転換してよい。上記融合蛋白質を発現する細胞を溶解することにより、融合蛋白質及び結合したDNAを放出する例えば、米国特許第5,733,731号を参照。上記ライブラリーを次にスクリーニングするか又は選択することができる。DNAシャッフルされたライブラリーも公知であり、DNA組換え法の間か又は合成法によりDNA断片の相同交換により構築される例えば、米国特許第5,605,793号及びStemmer1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA91:10747を参照。いわゆるアンカーライブラリーは、PCTUS96/09383及びWO97/22617に記載された。これは、ペプチドが特にデザインされたアミノ酸により分離されたランダムアミノ酸の非連続領域を有するペプチドランダムである。これらのライブラリーは遺伝学手段又は化学手段により作成される。コンビナトリアルケミカルライブラリー及び特にペプチドライブラリーは、当業界公知の方法により直接合成してもよく、限定ではないが、アレイによる合成Foderetal.,1991Science251:767;固相指示体上の合成WO97/35198;及び別の化学方法、例えばLametal.,1993Bioorg.Med.Chem.Lett.,3:419,Tjoengetal.,1990Int.J.Pept.ProteinRes.35:141、及びWO96/33010に記載された方法を含む。コンビナトリアルケミカルライブラリーを創製する方法も当業界公知である。コンビナトリアルライブラリーは、ペプチド、オリゴヌクレオチド、ペプトイド、糖質、小有機分子及び固体状態の物質にさえも関する、多数の化学変更物variantsを含むSchultzetal.,1995Science,268:1738。コアの構造は、置換体を付加すること又は異なる分子構築ブロックを連結することにより変更されることになる。ライブラリーは、固相粒子又はビーズに結合させるか又は修飾された生物の表面上にアレイ化させた、溶液中で固定しない分子を含んでよい。理想的には、コア分子の回りの置換基を変更することにより、如何なるクラスの化合物も修飾してよい。コンビナトリアルライブラリーのための化合物のクラスの様々な非限定例は、ベンゾジアゼピン類;メルカプトアシルプロリン類;カルバメート類;カルコンライブラリー;ケトアミドコンジュゲート類;ポリケトン類;パクリタキセルライブラリー;アニリド類;アリルオキシフェノキシプロピオネート類;オキサゾリジノン類;糖質;及び多数の他のクラスを含む。コンジュゲートライブラリーを作成するための方法は刊行物に十分に記載されているが、これらの方法は極めて時間を浪費するかもしれない。様々な会社が、今、溶液及び固相合成の両方からコンジュゲートライブラリーを生成する装置を作成しているCombiChemInc.sanDiego,CA;AdvancedChemTechLouisville;ZymarkCorp.MA;及びHewlettePackardCA。ライブラリーを作成したら、例えば高速液体クロマトグラフィーHPLCにより任意に精製することができる。発明の選択性標的化方法に従い小有機分子がスクリーニングされて同定されたなら、当業界公知の有機合成手段により大規模に生産してよい。本明細書に教示されるのは、よく知られたリガンドライブラリーを生成する標準法のみならず、リガンドライブラリーを例えばSigmaSt.Louis,Mo.又は様々な公的な源、例えばアメリカンタイプカルチャーコレクションATCC及びナショナルインスティチュートオブヘルスNIHから商業上得てよいことである。発明の選択性標的化方法において使用される適切な標的及び抗-標的は、限定ではないが、蛋白質、ペプチド、核酸、糖質、脂質、ポリサッカライド、糖蛋白質、ホルモン、受容体、抗原、抗体、ウイルス、病原体、毒性物質、代謝産物、阻害剤、薬剤、染料、栄養物、成長因子、細胞又は組織を含む。細胞又は組織の源は、ヒト、動物、細菌、真菌、ウイルス及び植物を含む。組織は複雑な標的であり、単細胞タイプ、細胞タイプのコレクション又は特定の種類の一般的な細胞の集合物を意味する。組織は完全であるか又は修飾されてよい。ヒトの一般的なクラスの組織は、限定ではないが、上皮、結合組織、神経組織、及び筋肉組織を含む。好ましいヒト細胞標的又は抗-標的は、造血細胞、癌細胞及びレトロウイルス媒介形質導入細胞を含む。造血細胞は、造血幹細胞、赤血球、好中球、単球、血小板、乳房細胞、好酸球、好塩基球、B及びT細胞、マクロファージ及びナチュラルキラー細胞を包含する。発明により包含される蛋白質及びケミカル標的の非限定例は、ケモカイン類及びサイトカイン類及びそれらの受容体を包含する。ここで使用されるサイトカイン類は、細胞に対する様々な作用、例えば成長又は増殖を誘導する多くの因子のいずれか一つを意味する。非限定例は、インターロイキンIL、IL-2,IL-3,IL-4,IL-6,IL-10,IL-12,IL-13,IL-14及びIL-16;可溶性IL-2受容体;可溶性IL-6受容体;エリスロポエチンEPO;トロンボポエチンTPO;顆粒球マクロファージコロニー刺激因子GM-CSF;幹細胞因子SCF;白血病阻害因子LIF;インターフェロン;オンコスタチンMOM;イムノグロブリンスーパーファミリー;腫瘍壊死因子TNFファミリー;特にTNF-α;TGF-β;及びIL-1α;及び血管内皮成長因子VEGFファミリー;特にVEGF当業界ではVEGF-Aとも呼ばれる,VEGF-B,VEGF-C,VEGF-D及び胎盤成長因子PLGFを含む。ケモカイン類は、細胞輸送及び炎症において重要な役割を担う小蛋白質のファミリーである。ケモカインファミリーのメンバーは、限定ではないが、IL-8,ストロマ由来の因子-1SDF-1、血小板因子4、好中球活性化蛋白質-2NAP-2及び単球化学誘因蛋白質-1MCP-1を含む。他の蛋白質及びケミカル標的は、免疫制御変調蛋白質、例えば可溶性ヒト白血球抗原HLA,クラスI及び/又はクラスII,及び非古典クラスIHLAE,F及びG;表面蛋白質、例えば可溶性T又はB表面蛋白質;ヒト血清アルブミン;アラキドン酸代謝産物、例えばプロスタグランジン類、ロイコトリエン類、トロンボキサン及びプロスタサイクリン;自己免疫又はアロ免疫又は異物免疫に関するIgE、自己抗体又はアロ抗体,IgFc受容体又はFc受容体結合因子;Gプロテイン共役された受容体;細胞表面糖質;脈管形成因子;接着分子;イオン、例えば、カルシウム、カリウム、マグネシウム、アルミニウム、及び鉄;原繊維蛋白質、例えばプリオン及びチューブリン;酵素、例えばプロテアーゼ類、アミノペプチダーゼ類、キナーゼ類、ホスファターゼ類、DNAse類、RNAse類、リパーゼ類、エステラーゼ類、デヒドロゲナーゼ類、オキシダーゼ類、ヒドロラーゼ類、スルファターゼ類、サイクラーゼ類、トランセフェラーゼ類、トランスアミナーゼ類、カルボキシラーゼ類、デカルボキシラーゼ類、スーパーオキシドジスムターゼ類、及びそれらの天然基質又は類似体;ホルモン類及びそれらの対応する受容体、例えば絨毛刺激ホルモンFSH、黄体ホルモンLH、チロキシンT4及びT3、アポリポ蛋白質類、低密度リポ蛋白質類LDL、極低密度リポ蛋白質類VLDL、コルチゾール、アルドステロン、エストリオール、エストラジオール、プロゲステロン、テストステロン、デヒドロエピアンドロステロンDHBA及びその硫酸塩DHBA-S;ペプチドホルモン、例えばレニン、インスリン、カルシトニン、パラチロイドホルモンPTH、ヒト成長ホルモンhGH、バソプレシン及び抗利尿ホルモンAD、プロラクチン、副腎皮質刺激ホルモンACTH、LHRH,甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンTHRH、血管作動性腸ペプチドVIP、ブラジキニン及び対応するプロホルモン;カテコールアミン、例えばアドレナリン及び代謝物;アトリオナトリウティック因子AdF、ビタミンA,B,C,D,E及びK及びセロトニンを含む共因子;凝固因子、例えばプロトロンビン、トロンビン、フィブリン、フィブリノーゲン、ファクターVIII、ファクターIX,ファクターXI及びフォンウイルブラント因子、プラスミノーゲン因子、例えばプラスミン、補体活性化因子、LDL及びそれらのリガンド、及び尿酸;凝固を制御する化合物、例えばヒルジン、ヒルログ、ヘメンチン、ヘプリン、及び組織プラスミノーゲン活性化因子TPA;遺伝子治療用核酸;酵素のアンタゴニストの化合物;及びリガンドを結合する化合物、例えば炎症因子を含む。非ヒト由来の標的及び抗-標的は、限定ではないが、薬剤、特に乱用になりやすい薬剤、例えばカンナビス、ヘロイン及び他のアヘン剤、フェンシクリジンPCP、バルビツール酸塩、コカイン及びその誘導体、及びベンザジアゼピン;毒素、例えば重金属様水銀及び鉛、ヒ素及び放射性の化合物;化学治療剤、例えばパラセタモール、ジゴキシン及び遊離ラジカル;細菌の毒素、例えばリポポリサッカライド類LPS及び他のグラム陰性毒素、スタフィロコッカスの毒素、トキシンA,破傷風毒素、ジフテリア毒素及び百日咳毒素;植物及び海洋性の毒素;ヘビ及び他の毒液、有毒因子、例えばエアロバクチン類、又は病原性微生物;感染性ウイルス、例えば肝炎ウイルス、サイトメガロウイルスCMV、単純ヘルペスウイルスHSVタイプ1、2及び6、エプスタイン-バールウイルスEBV、水痘帯状疱疹ウイルスVZV、ヒト免疫不全ウイルスHIV-1、-2及び他のレトロウイルス、アデノウイルス、ロタウイルス、インフルエンザ、ライノウイルス、パーボウイルス、風疹、麻疹、ポリオ、パラリクソウイルス、パポバウイルス、ポックスウイルス及びピコルナウイルス、プリオン、プラスモディウム組織因子、プロトゾアン、例えばエンタモエバヒストリチカ、フィラリア、ジアルディア、黒熱病、及びトキソプラズマ;細菌、敗血症及び院内感染の原因であるグラム陰性細菌、例えばエシェリヒアコリ、アシネトバクター、シュードモナス、プロテウス及びクレブシエラ、またグラム陽性細菌、例えばスタフィロコッカス、ストレプトコッカス、メニンゴコッカス及びリーコバクテリア、クラミジアレジオネラ及びアネアローブ;真菌、例えばカンジダ、ニューモシスティス、アスペルギルス及びマイコプラズマを含む。一つの側面において、標的は、酵素、例えば、プロテアーゼ類、アミノペプチダーゼ類、キナーゼ類、ホスファターゼ類、DNアーゼ類、RNアーゼ類、リパーゼ類、エステラーゼ類、デヒドロゲナーゼ類、オキシダーゼ類、ヒドロラーゼ類、スルファターゼ類、セルラーゼ類、サイクラーゼ類、トランスフェラーゼ類、トランスアミナーゼ類、カルボキシラーゼ類、デカルボキシラーゼ類、スーパーオキシドジスムターゼ類、及びそれらの天然基質又は類似体を含む。特に好ましい酵素は、ヒドロラーゼ類、特にアルファ/ベータヒドロラーゼ類;セリンプロテアーゼ類、例えばズブチリシン類、及びキモトリプシンセリンプロテアーゼ類;セルラーゼ類;及びリパーゼ類である。別の側面において、標的は、汚れ又は織物又は他の表面材料、例えばセラミックス、ガラス、シリカ、木、紙、金属及びアロイ、及び生物組織、例えば皮膚である。汚れは、以下の非限定の汚れ群から選択してよい:ポルフィリン由来の汚れ、タンニン由来の汚れ、カルテノイド色素由来の汚れ、アントシアニン色素由来の汚れ、しみに基づく汚れ、オイルに基づく汚れ、及びヒトの身体由来の汚れ。特に、汚れは血液由来の汚れ又はクロロフィル由来の汚れであってよい。より特定すれば、汚れは、ガラス;パプリカ;茶由来の汚れ;又は果実又は野菜由来の汚れ、例えばワイン、トマト及びベリー類であってよい。特に好ましい汚れは、ヒトの身体のオイル、そしてより特別な汚れは襟のしみと呼ばれる。また別の側面において、標的は、造血幹細胞HSCsを含む。HSCsの特に好ましい表面抗原発現プロフィールは、CD34Thy-1であり、そして好ましくはCD34Thy-1Lin-である。Lin-は、少なくとも一つの系列の特定のマーカーの発現の欠如を基に選択された細胞集団を意味する。HSCsを単離して選択する方法は当業界公知であり、米国特許第5,061,620号;第5,677,136号;及び第5,750,397号を参照されたい。さらなる側面において、好ましい標的は、サイトカイン類、特にIL-2,IL-3,IL-6,IL-10,IL-12,IL-13,IL-14及びIL-16;EPO;GM-CSF;TNFファミリー;VEGFファミリー、GFβ;及びIL-1αを含む。サイトカイン類はいくつかの売り主から市販されており、アムジェンサウザンドオークス、CA、イミュネックスシアトル、WA及びジェネンテックサウスサンフランシスコ、CAを含む。特に好ましいのは、VEGFとTNF-αである。TNF-αに対する抗体は、TNF-αとその受容体とのブロッキング相互作用が、敗血症性ショック、慢性関節リウマチ、又は他の炎症の進行のようないくつかの疾患状態においてTNF-αの過剰発現を変調するのに有用である。VEGFは、血管形成誘発物質であり、血管透過性の媒介因子であり、そして内皮細胞特異的有糸分裂促進物質である。VEGFは腫瘍においても関わった。VEGFファミリーの標的化メンバー及びそれらの受容体は有意な治療上の応用性を有するかもしれず、例えば、VEGFをブロッキングすることは、卵巣高刺激症候群OHSSにおいて治療上の価値を有するかもしれない。N.Ferraraetal.,1999Nat.Med.5:1359及びGerberetal.,1999Nat.Med.5:623を参照されたい。他の好ましい標的は、細胞表面受容体、例えばT細胞受容体を含む。標的と抗-標的は、構造レベル、化学レベル又は遺伝子レベル上のいくつかの詳細において特性決定されることにより、精製度、安定性及び標的濃度にわたりいくつかの制御を可能にさせることが好ましい。しかしながら、よく特性決定されていない標的と抗-標的を使用してよい。可能性としてのよく特性決定されていない標的の非限定例は、襟のしみ、腫瘍細胞、ヒトの皮膚及び毛髪を含む。好ましい抗-標的は、コットン、ウール、シルク、ポリエステル、レーヨン、リネン、ナイロン及びそれらのブレンドからなる群から選択される織物を含む。別の側面において、標的が損傷した細胞、組織又は器官の場合、抗-標的は健常な非損傷細胞、組織、器官又はその組み合わせである。特定の非限定抗-標的例は、健常な全血、皮膚、毛髪、歯、そして爪を含む。いくつかの応用において、標的と抗-標的は興味のある特定の応用に依存して逆転できる。例えば、ヒトの毛髪ではなく皮膚を標的とすることが望ましい場合、複数の応用が存在するかもしれない。よって、抗-標的は毛髪である。類似の応用において、ヒトの毛髪が標的であって対応する抗-標的、皮膚が標的ではないことを望んでよい。同じ応用において使用される標的/抗-標的の以下の一般例は、例示の目的のみに提供されて、本明細書に開示された選択性標的化方法に限定することを意図しない:腫瘍細胞/正常細胞;受容体細胞/受容体を発現しない細胞;新生物neoplastic細胞/正常細胞:しみ汚れ/コットン織物;食物汚れ/セラミック;特定のプロテアーゼ/他のプロテアーゼ;セリンプロテアーゼ/全血;造血幹細胞/全血;特定の酵素変異体/当該酵素の他の形態;細胞中のウイルス/細胞;TNF-アルファ/血液成分;特定の昆虫の酵素/動物中の相同な酵素;造血幹細胞/他の造血細胞;毛髪/皮膚;核/ミトコンドリア;細胞質/核;アルファ/ベータヒドロラーゼ/他のヒドロラーゼ;及び光合成に関与する特定の酵素/葉の組織。選択性標的化方法に使用される標的と抗-標的の両者の濃度は、使用されるリガンドライブラリー、抗-標的及び標的の種類に依存して変わる。本明細書にて考察されるとおり、開示された方法は多くの異なる標的及び抗-標的に広い応用性を有するので、上記方法に使用される濃度は約1.0Mから10-15Mの範囲で変更してよく、好ましくは上記濃度は10-9Mの範囲内である。通常、標的の量に対して過剰量の抗-標的が必要である。発明を限定するわけではないが、この過剰量は少なくとも10倍から1000倍を超える範囲であってよい。初期標的濃度は10-3Mから10-15Mの範囲で提供されるのが好ましいかもしれない。一つの好ましい態様において、標的が酵素の場合、標的濃度は約10-3Mから10-12Mの範囲にて提供してよい。別の好ましい態様において、標的がサイトカインの場合、標的は約10-3Mから10-12Mの範囲の濃度にて提供してよい。また別の態様においては、標的が造血細胞の場合に、標的濃度を約10から109細胞の範囲に提供してよい。一つの好ましい態様において、抗-標的が血液蛋白質であるか又は酵素である場合、抗-標的濃度は約1.0Mから10-12Mの濃度範囲で提供してよい。ある好ましい態様において、抗-標的又は標的は物質又は表面、例えば織物、セラミック又はマイクロ流体チップであってよい。この例において、標的又は抗-標的の面積は重要になる。如何なる様式にも発明を限定する意図はないが、通常、抗-標的又は標的物質のサイズは約1.0mmから1.5cm;より好ましくは約25.0mmから0.5cmである;しかしながら、直径又は面積はこの値より低いか又は高くてよい。一つの側面において、発明は選択された標的に結合するリガンドのスクリーニングと同定に向けられることにより、抗原に関する抗体の親和性の範囲で結合親和性をもって非共有標的-リガンド複合体を形成させる。KDに関する本発明によるリガンド結合親和性、EC50又はIC50は、約10-7Mから10-15Mの範囲であるが、より高いか又はより低い親和性を達成してよい。一つの側面において、上記親和性は少なくとも約10-7Mの範囲、また少なくとも約10-8M、好ましくは少なくとも約10-9M、そしてまた好ましくは少なくとも約10-12Mの範囲である。別の態様において、親和性は約10-7M未満である。別の側面において、リガンド-標的複合体に関するkoff値は、約10-3秒-1未満、約10-4秒-1未満、そして約10-5秒-1未満でもある。発明の選択性標的化方法により同定されたリガンドは、如何なる優位性をもっても、抗-標的には結合しない。発明を限定するわけではないが、本明細書に記載された選択性標的化方法により同定された好ましいリガンドは、抗-標的に関するKDが約10-4Mより大きく、そして好ましくは約10-1Mより大きい。発明による選択性標的化方法は、リガンドの標的に対する結合親和性により特徴付けされるのみならず、リガンド-標的複合体の選択性により特徴付されてよい。抗-標的に対するリガンド結合に比較した、標的に関するリガンド結合の選択性は、約3:1から500:1の範囲のKD,EC50又はIC50の比率により定義することができる。一つの側面において、選択性は少なくとも5:1、好ましくは少なくとも10:1、より好ましくは少なくとも約20:1、さらにより好ましくは少なくとも約30:1、さらにより好ましくは少なくとも約50:1、そしてさらにより好ましくは少なくとも約100:1である。別の側面において、選択性標的化方法は、標的に関して低い親和性であるが標的に関して高い選択性を伴ってリガンドを選択するのに使用してよい。この側面において、抗-標的に結合する上記リガンドに比較した、標的に関するリガンド結合親和性の選択性は、少なくとも約5:1、好ましくは少なくとも約10:1、また好ましくは少なくとも約20:1、より好ましくは少なくとも約50:1、そしてさらに好ましくは少なくとも100:1である。しかしながら、標的結合親和性は約10-3Mから10-7Mの範囲である。結合親和性及び選択性を測定する方法は当業界においてよく知られており、そしてこれらの方法は限定ではないが放射性標識放出及び競合アッセイによる測定を含み;恒温力価熱量測定;バイオセンサー結合アッセイMortonMyszka,1998MethodsEnzymol.295:268-294;蛍光及び化学発光分光分析;及び質量分光分析によるGaoetal.,1996,J.Med,Chem.,39:1949。一つの側面においては、抗-標的をリガンドのライブラリーと化合し、そしてリガンドのライブラリーの標的への暴露の前にインキュベートすることを許容する。別の側面において、抗-標的及び標的は本質的には同時にリガンドのライブラリーと化合する。本質的に同時にとは、リガンドライブラリーを抗-標的及び標的とあらゆる分離工程前に暴露する場合の、同時か又は極めて近い時間を意味する。本明細書に記載された選択性標的化方法はインビトロ又はインビボで実施してよい。インビトロで実施する場合、リガンドのライブラリーと抗-標的及び任意に標的を容器中又は上で化合する。当該容器は適切な材料又は貯蔵所、例えば、プレート、培養管、マイクロタイタープレート、マイクロ流体チップ、ペトリ皿等であってよい。好ましくは、抗-標的と標的は、非特異的結合事象が最少になる環境において利用可能である。これは様々な手段により達成してよく、限定ではないが、1リガンドライブラリー及び標的/抗-標的を含む容器をBSA,スキムミルク又は他の吸着蛋白質でコートすることにより非特異的結合をブロックするか、2標的分子を捕捉剤captureagent、例えばビオチン化化合物、例えばビオチン、アビジン又はのちにストレプトアビジン又はストレプトアビジン誘導体、例えばニトロストレプトアビジンによりトラップできるそれらの変異形態で標識するか、3ライブラリーから物理的に分離できる磁気ビーズ上に標的/抗-標的をディスプレイするか、又は4低いバックグラウンド吸着特性でライブラリーディスプレイベクターを使用すること、を含む。これらの方法は当業界公知であり、Parmleyetal.1988前記;及びBayeretal.,1990MethodsEnzymol.184:138を参照されたい。リガンドのライブラリー及び抗―標的を含む組成物は、追加の化合物、例えばバッファー及び任意には界面活性剤及び有機溶剤と共に、リガンドの抗-標的との結合を可能にさせる条件下で化合してよい。当業者は、有用なバッファーをよく知っている。非限定例は、トリスヒドロキシメチルアミノメタンTrisバッファー;N-2-ヒドロキシエチルピペラジン-N’-2-エタンスルフォン酸HEPESバッファー;モルホリノ-エタンスルフォン酸MESバッファー;緩衝塩溶液、例えばN,N-ビス[2-ヒドロキシエチル]2-アミノエタンスルフォン酸BES、トリス、及びリン酸緩衝塩PBS、好ましくは緩衝塩溶液を含むSambrooketal.,1989前記。市販のバッファーは例えばSuperBlock商標名ピアス、ロックフォード、ILから入手できる。他の成分、例えば界面活性剤、例えばツイーン及びトライトンを溶液中で使用することができる。標的に依存して、リガンドライブラリーと抗-標的を含む組成物を約1分から約96時間の間インキュベートして、リガンドを抗-標的に結合させる。しかしながら、標的又は抗-標的の安定性に依存して、より長い時間を使用してよい。未結合の抗-標的リガンドを含む成分を、インキュベーション後に、抗-標的結合リガンドから分離する。本質的ではないが、未結合の抗-標的リガンドを含む分離された成分は、任意に、抗-標的を含む新たな容器に移し、インキュベートし、そして次に未結合の抗-標的リガンドを含む成分を再び結合した抗-標的リガンドから分離することができる。この移すプロセスは多数回繰返してよく、例えば、2から10回もしくはそれ以上繰返してよい。繰返された移す工程はさらに、抗-標的に結合するリガンドの数を減少させる。しかしながら、リガンドのライブラリーの抗-標的との接触、及び抗-標的結合リガンドの未結合リガンドからの分離は、1ラウンドにて達成してよい。インキュベーションを含む接触、及び分離工程は、1ラウンドで完了するか複数ラウンドで完了するか否かに拘わらず、一般に排除deselectionと呼んでよい。一般に、除外の間の温度条件は2から30°Cの間であってよい。上記温度は成分の安定性に依存し、そして決定する当業者の範囲内である。未結合の抗-標的リガンドは、当業界公知の方法により抗-標的結合リガンドから分離してよい。これらの方法のいくつかは、移し替え、洗浄、遠心分離、濾過、クロマトグラフィー、マイクロ-解剖及び蛍光活性化細胞分類FACSを含む。抗-標的結合リガンドを枯渇されて未結合リガンドを含むリガンドライブラリーは、リガンドライブラリーの一つ又は複数のメンバーが標的に結合して、それにより標的-結合リガンド複合体を形成する適切な条件下で、標的を含む容器に移し替える。一つの側面において、リガンドを同じ標的に接触させてよい。別の側面において、リン酸を同時に標的のアレイに接触させてよい。標的のアレイの非限定例の一つは、リガンドの、表面上の複数の汚れへの接触を含む。標的に結合することを可能にする条件下で、通常約1分から約96時間の範囲の間、リガンドをインキュベートする。インキュベーション時間は標的の安定性に依存する。標的が汚れの場合、インキュベーション期間は通常約5分から約90分間になる。容器はさらに上記のとおりにバッファーを含んでよい。温度の範囲は通常約2から30°C、そして好ましくは約18から25°Cである。当業者は、細胞、器官、及び組織培養を記載する文献をよく知っており、そしてAtlasandParks編纂1993,TheHandbookofMicrobiologicalMedia,CRCPress,BocaRatonFL;GamborgandPhillips編纂1995PlantCellTissueandOrganCulture,FundamentalMethods,SpringerLabManualSpringer-Verlagを参照されたい。標的-結合リガンド複合体を1又は複数の洗浄工程に供してよい。洗浄化合物は、培養例えばTBS及びPBS、界面活性剤、酸グリシン、有機溶媒、塩基、酵素、音波処理、又はそれらの組み合わせを含んでよく、その際、未結合リガンドを洗浄する。標的-結合リガンド複合体を酸溶出に供する場合、酸溶出のpHは約1.5から4.5の範囲、好ましくは約2.0から3.5の範囲であってよい。酸溶出は2から20分の間で起こり、通常は約10分より長くかからない。洗浄工程は複数回繰返してよく、通常は特定の標的及びリガンドライブラリーに依存して2から6回繰返すことができる。特に、洗浄工程に酸を用いる場合、様々な公知の化合物及びバッファー、例えばTRIS-HCLを用いて中和した後に、洗浄するのが一般的になる。洗浄工程は、本明細書に定義されたKD,koff及び選択性の値を有する強く結合するリガンドを含む標的結合リガンド複合体をもたらす。リガンドライブラリーを抗-標的及び標的と連続的にではなく本質的には同時に接触させる場合、リガンドライブラリー、抗-標的及び標的組成物は、抗-標的及び標的の連続暴露のために、上記全ての物質をさらに含んでよい。さらに、リガンドライブラリーを抗-標的及び標的と本質的に同時に接触させる場合、上記方法はインビボにおいて実施してもよい。この側面において、リガンドのライブラリーは当業界でよく知られた手段により投与して良いが、好ましくは宿主への注射による。ライブラリーがファージペプチドライブラリーなら、変換ユニットの数は104-1010の範囲であってよい。宿主は動物、例えばヒト、マウス、チキン又はブタであってよく、好ましくはマウスである。標的は、例えば、全器官又は損傷した組織又は腫瘍組織、より特定すれば腫瘍血管であってよい。標的が血液中の組織又は細胞なら、リガンドのライブラリーは、約1分から約10分の間、血液を循環させてよく、標的との結合を可能にさせる。標的-結合リガンド複合体は、潅流して組織を切開した後に回収してよいKoivunenetal.,1999NatureBiotech.17:768及びArapetal.,1998Science279:377。標的-結合リガンドの、混合物中の抗-標的未結合リガンド又は遊離リガンドからの分離も、当業界でよく知られた手段により達成してよく、これらの方法は、親和性クロマトグラフィー;遠心分離;高速液体クロマトグラフィーHPLC;濾過、例えばゲル濾過;酵素結合免疫吸着アッセイELISA;及び蛍光活性化細胞分類FACSを含む。分離方法の選択は、様々な因子、例えば標的、抗-標的及びリガンド分子に依存することになる。分離方法の選択は、当業者にはよく知られており、これらの分離方法のために使用される様々な装置は市販されている。KennyandFowell編纂1992PracticalProteinChromatographyMethodsinMolecularBiology,vol.11,HumanaPress,TotowaNJを参照標的-結合複合体上の標的-結合リガンドは様々な技術により同定してよく、ポリメラーゼ鎖反応PCR、質量分光光度分析MS、表面プラズモン共鳴、免疫沈殿及び核磁気共鳴NMR分光分析を含む米国特許第4,683,202号;Szaboetal.,1995Curr.Opin.Struct.Bio.5:699:Harlowetal.,1999UsingAntibodies,ALaboratoryManual,ColdSpringHarborPress;及びHajduketal.,1999J.MedChem.,42:2315。非対称PCRも標的-結合リガンドの同定に用いてよく、その際、異なる濃度の単一プライマー種又は複数プライマーを用いてよい。当業者にはよく知られているとおり、ライブラリーのメンバーを遺伝学上ペプチド又は蛋白質に連結する場合、DNA又はmRNAをPCRにより増幅することができ、そして対応する配列を配列決定及び同定用のベクターにサブクローン化することができる。同定工程のプロセスの間、標的-結合リガンドを標的-結合リガンド複合体から分離してよいが、同定工程は分離を必要とせず、そして好ましくはリガンドの同定前に、標的-結合リガンドを標的-結合リガンド複合体から分離しない。例えば、質量分光光度分析MSの場合、標的-結合リガンド複合体を質量分光光度計に注入したら、標的-結合リガンドを標的複合体から分離してよい。さらに、PCRは直接標的-結合リガンド複合体上で実施してよい。発明による選択性標的化法は、好ましくはPCRを含むことにより、標的-結合ペプチドを同定する。発明によれば、PCRの使用が、酸溶出を利用した慣用のバイオパニング法により回収されなかったペプチドの回収をもたらす。通常、リガンドをコードするDNAは適切なプライマーを用いてPCRにより増幅される。特定のPCR産物の存在は、標的結合リガンドをコードするDNAが存在することを示す。標的結合リガンドの量は定量性PCRにより測定される。洗浄ストリンジェンシーの程度は、所望のレベルまで、及び極めて低い検出レベル、例えばアトモルレベルまで監視することができる。非特異的リガンドバインダーは、例えば野生型ファージを加え、そして上記リガンドライブラリーを増幅するのみのプライマーをデザインすることにより、競合させてよい。シグナル対ノイズ比の低下を阻止するため、リガンドをコードするDNAの周囲の配列を選択ラウンドの間にしばしば変更してよい。標的-結合リガンドの分析の感度は、標的濃度、PCR増幅サイクルの数、PCRプライマーの特異性、及びPCR産物の検出法を変更することにより制御してよい。一つの態様において、標的が腫瘍抗原の場合、標的-結合ファージライブラリーを含む腫瘍組織は腫瘍から切り出してよく、そして適切なPCRプライマー、ヌクレオチド及びポリメラーゼの添加が、増幅されたPCR産物を生じさせてよい。PCRの様々な阻害反応は、ウシ血清アルブミン、カチオン性アミン、及び有機溶剤を含む賦形剤の添加により軽減されてよく、Roux,1995OptimizationandTroubleshootinginPCRinPCRPrimer:ALaboratoryManual,ColdSpringHarborPressを参照されたい。DMSO及びグリセロールはPCRの増幅効率及び特異性を改善するために使用してよい。標的-結合リガンドのDNAは、標準の技術を使用して、抽出及び精製しても良い。所望のクローンの配列決定又は不所望の非特異的ファージからの分離を促進するためには、PCRにより生成されたポリヌクレオチド産物を、例えばビオチン標識モイエティ又は蛍光標識モイエティを用いてポリメラーゼ媒介触媒の間に導入することにより標識してよい。所望のPCR産物が発明の方法に従い選択性標的化の追加のラウンドについてベクターにクローン化される場合、変異原性PCR法により多様性を導入することを望んでよいStemmer,inKayetal.,前記を参照。これらは、カセット変異導入、エラー傾向のPCR、DNAシフト化、ITCHY-SCRATCY等を含む、当業者にはよく知られているとおりである。TillettandNeilan,1999Enzyme-freeClining:ARapidMethodstoClonePCRProductsIndependentofVectorRestrictionEnzymeSitesNucl.Acids.Res.,27:26eも参照されたい。上記及び当業界でよく知られているとおり、PCR断片は配列決定のために様々なベクターにクローン化されてよく、それらはペプチド蛋白質融合の形成において使用されるか又は追加のディスプレイベクターにクローン化されてよい。標的結合ライブラリーのメンバーは質量分光分析法により好ましくは同定されてもよい。これは、化合物の質量及び質量分光測光により生じた化合物の断片に基づいた、化合物の構造の同定である。化合物の構造を特定するための質量分光測定の使用は、Caoetal.,1997TechniquesinProteinChemistryVIII,AcademicPresspages177-184;及びYoungquistetal.,1995J.AmChem.Soc.117:3900に報告されている。また、Chengetal.,1995J.Am.Chem.Soc.,117:8859及びWalketal.,1999Angrew.Che.Int.Ed.,38:1763も参照されたい。一つの質量分光測定技術はタンデム質量分光測定MS/MSであり、液体クロマトグラフィーにおいて質量分光測定をタンデムに実施する。興味のあるリガンドを精製及び分離するために、この種のMSは、質量分光測定にリガンドを注入する前に生物系から標的-結合リガンドを分離及び精製する要求のために、ファージ-タイプのペプチド以外の標的-結合リガンドをスクリーニングするのに使用することが好ましい。様々な最近開発されたMS技術が標的-結合リガンドの同定に利用可能であるWuetal.,1997inChemistryandBiology,vol.149:653,Marshalletal.,1998,MassSpectrometryReviews17:1,及びNelsonetal.,1999J.Mol,Recognition,12:77を参照されたい。一つ又は複数のリガンドメンバー、特にペプチドリガンドのスクリーニング後に、アミノ酸配列を当業界で公知の標準技術により決定してよく、例えば、ペプチド配列決定機、MS/MS又はマニュアルを用いて選択されたペプチドの直接のアミノ酸配列決定又は上記ペプチドをコードするヌクレオチド配列を決定することによる。発明は、さらに、上記選択性標的化法により同定された、標的-結合リガンド、特に標的-結合ペプチドを含む。上記選択性標的化法により同定された標的-結合ペプチドは、配列番号:3-17;配列番号:18-26;配列番号:29-49;配列番号:50-63;配列番号:64-77及び配列番号:79-102のアミノ酸配列を有するペプチドを含む。複数のリガンドを初期リガンドライブラリーから選択する場合、そしてライブラリーがペプチドライブラリーである場合、整列化させたときのリガンドのアミノ酸配列は保存された領域またはペプチドモチーフを呈する必然性はなく、本明細書では、選択されたペプチドの全てにおいて好ましいアミノ酸配列を示すアミノ酸コンセンサス配列として定義される。特定の態様において、上記方法は、約10-7Mから約10-10Mの間の標的への結合親和性を有するペプチドライブラリーからペプチドを選択することに関し、ライブラリー中のペプチドが抗-標的に結合するのを可能にさせるようにペプチドライブラリーを抗-標的に接触させ;抗-標的結合ペプチドから未結合のペプチドを分離し;分離した未結合のペプチドを標的に接触させるが、当該未結合のペプチドが標的と結合することを可能にして標的-結合ペプチド複合体を形成する条件下で行い;標的-結合ペプチド複合体を、標的に結合しないペプチドから分離し;そして標的-結合ペプチド複合体を上の結合ペプチドを同定するが、その際、ペプチドは約50アミノ酸より短い長さであり、約10:1から約50:1の範囲の選択性を有する。好ましくは、標的-結合ペプチド複合体上で同定されたペプチドは25アミノ酸より短く、約20:1の範囲の選択性を有する。標的-結合リガンドが同定されたら、リガンドを選択性標的化法の繰返しラウンドに暴露してよく、図1を参照されたい。標的-結合リガンドは多様化に供されてよい。多様化は化学多様性を含み、多数の変異導入技術を含んでよい。Saikietal.,1988Science239:487;Zolleretal.,1982Nucl.Acids.Res.10:6487;及びSmith1985AnnRev.Genetics.19:423を参照。結合したリガンドの正体を確認するために、標的-結合リガンドを配列決定してよく、そして次に、当該配列を基にしてオリゴヌクレオチドを作成してよいが、小さなバリエーションを含んでよい。PCRは、リガンドのヌクレオチドコーディング配列ないに小さな変化を起こさせるのに使用してよい。このPCR変異導入はコーディング配列内のあらゆる位置に変異をもたらすことができる。多様化は、同定されたリガンドの小さいサブセットの変異導入により生じさせてもよい。通常、多様化されたリガンドはヌクレオチドレベルにおいて標的-結合リガンドに対して少なくとも80、85、90、95、97又は99アミノ酸配列同一性を有することになる。多様化されたリガンドは本発明の選択性標的化方法の1又は複数のラウンドに暴露してよい。多様化されたリガンドは、それらが由来する他の同定された標的-結合リガンドを用いてスクリーニングしてよく、リガンドが最初にスクリーニングされた適切な応用においてアッセイしてよい。標的に結合するリガンドのライブラリーをスクリーニングするための本発明の選択性標的化方法は、多くの応用に関して広い利用性を有する。一つの特定の応用において、本明細書に記載される選択性標的化方法は、苛酷な条件下で標的に結合するリガンドを同定するのに使用してよい。苛酷な条件は、限定ではないが、酸性pH、高温、及び界面活性剤への暴露を含んでよく、例えば、家庭の洗濯場の活性剤において見いだされるような条件である。この関係において、発明による一つの例示の応用は、洗浄の応用に有用な、リガンド、特にペプチドのスクリーニングと同定である。洗浄の応用とは、限定ではないが、洗浄剤組成物、汚れ除去組成物、及び織物処理組成物を含む。特定の汚れ標的は、胴体のしみ汚れ、ポルフィリン由来の汚れ、タンニン由来の汚れ、又カルテノイド色素由来の汚れ、アントシアニン色素由来の汚れ、しみに基づく汚れ、又はオイルに基づく汚れを含む。様々な洗浄組成物及び特定の界面活性剤の成分は、当業界においてよく知られており、本明細書においては、たいして詳細には繰返さない。上記組成物は、限定ではないが、以下の成分:界面活性剤、例えばアニオン性、非イオン性、カチオン性、両性、石鹸性、及びそれらの混合物;結合剤、例えば;リン酸結合剤、例えば3リン酸、アルミノ珪酸ナトリウム結合剤、例えば、ゼオライト;有機結合剤、例えばポリカルボキシル酸ポリマー;酵素、例えば、プロテアーゼ類、セルラーゼ類、リパーゼ類及びその他;酵素-安定剤;漂白剤;染料;マスキング剤;柔軟剤;及びその他を含んでよい。以下の文献、米国特許第3,929,678号;第4,760,025号;第4,800,197号;第5,011,681号;及びMcCutheon’sDetergentsandEmulsifiers,NorthAmericanEdition1986AlluredPublishingCoを参照されたい。別の特定の応用において、発明による選択性標的化方法は、治療上の介入のために有用なリガンドをスクリーニング及び同定するために使用してよい。この関係において、リガンドのライブラリーをスクリーニングすることにより、腫瘍-結合リガンドを同定してよい。腫瘍は、カルシノーマ、サルコーマ又はメラノーマであってよい。当業者は如何なる数の抗-標的も予見することができるが、一つの好ましい抗-標的は正常な細胞である。腫瘍-結合リガンドが同定されたなら、リガンドを使用して、腫瘍細胞の転移、腫瘍細胞の馴化及び/又は腫瘍細胞のインビボ成長を阻止してよい。さらに別の特定の治療上の介入の応用においては、リガンドのライブラリーを発明に従いスクリーニングすることにより、サイトカイン、そして特にはTNF又はVEGFを同定してよい。サイトカイン結合リガンドは、サイトカインがその対応する受容体へ結合することを阻止してよい。この阻害は、サイトカインを不活性化して、様々な疾患状態を制御する下流のシグナルトランスダクションを阻害する。当業者は如何なる数の抗-標的も予見できるが、一つの好ましい抗-標的は血液である。別の好ましい抗-標的は対応する受容体又はアイソフォームである。さらなる応用において、発明による選択性標的化方法は、個人的なケアの応用、例えばスキンケア又はヘアケアに有用なリガンド、特にペプチドを同定するために使用してよい。別の応用においては、発明による選択性標的化方法は、細胞種特異的表面分子を同定するのに使用してよい。好ましい抗-標的は、一つ又は複数の異なる細胞種、異なる状態の細胞、又は表面分子を提示しない細胞を含む。上記選択性標的化方法及び当該方法により同定されたリガンドは、広い応用において使用してよい。本明細書において前に議論された応用に加えて、特にペプチドリガンドに関しての他の非限定の応用は:1抗体のエピトープをマッピングするための応用;2重要な結合分子、例えば酵素及びホルモン受容体の新規なリガンドを提供する応用;3農薬特性を有する有力な農芸用化合物を提供する応用;4新規な薬剤リードを開発して現在のリードを開拓する応用;5工業触媒を同定する応用;6感度の高いインビボ及びインビトロの診断剤を同定する応用;7金属及び他の共因子を結合させることにより酵素触媒の効率を増大させる応用;8インビボにおいてプロテアーゼの作用を制御する応用;9標的化された蛋白質の阻害特性を変化させるための応用;10標的化酵素を開発する使用;11遺伝子治療ベクターを特定の組織又は細胞種に選択的に送達する使用;及び12薬剤送達又は標的化活性における使用を含む。従って、以下の実施例は、例示のために提供され、如何なる様式においても発明を限定することを意味しない。当業者は、日常の実験以上のものを使用せずに、本明細書に記載された特定の態様に対して多くの均等物を認識又は確かめることになる。制限消化、ライゲーション、塩化カルシウムを使用したコンピテント細胞の調製、20mg/mlイソプロピルIPTGの調製、20mg/ml5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリル-β-D-ガラクトシドX-galの調製、及びリン酸緩衝塩溶液PBSの調製は、当業界公知の方法に従い、そしてSambrooketal.1989前記に見いだすことができる。ファージディスプレイライブラリー環状7マー、直鎖7マー及び直鎖12マーはニューイングランドバイオラブズNEB;ビバリー、MAにより供給された。制限エンドヌクレアーゼEagI及びAcc561,10XNEBバッファー、T4DNAライゲース、アルカリ子ウシ腸ホスファターゼ、E.coliER2537宿主細胞、及びM13KEgIIIクローニングベクターはNEBにより供給され、そして他に記述しない限りは製造者の指示に従い使用した。Taqポリメラーゼ、10XPCRバッファー、及びdNTPミックスは、ロッシュモリキュラーバイオケミカルズインディアナポリス、INにより供給された。PCRは、EKサイエンティフィックプロダクツキャンベル、CAからのHYBRIDOmn-E温度循環器を用いて実施した。キアゲンゲル抽出キット及びキアクイックPCR精製キットはキアゲンQIAGENバレンシア、CAから得た。アンプリワックス商標名PCRジェムはパーキンエルマーから得た。フェノール/クロロホルム抽出は、5プライム3プライム社ボウルダー、COからのフェーズロックゲル商標名Iライトを用いて実施した。非変性ポリアクリルアミドゲル8及びD-15DNAマーカーはノベックスサンディエゴ、CAから得た。実施例1腫瘍ネクローシス因子αTNF-αに結合するファージ-ペプチドの高親和性ファージ-ペプチドクローン同定用PCRを用いた選択:薄壁PCR管を標的ヒトhTNF-αバイオソースインターナショナル;カマリロ、CAでコートしたが、PBS中の0.5mg/ml精製TNF-α100μlを4°CにおいてPCR管の中でインキュベートすることによりコートした。過剰の未結合のTNF-αを除去し、そして管を一晩4°Cにおいて、Tris緩衝塩溶液TBS中の100μlのスーパーブロック商標名ブロッキングバッファーピアス:ロックフォード、IL中でコートした。抗-標的スーパーブロック商標名ブロッキングバッファーは、100μlのスーパーブロック商標名で一晩4°Cにおいてコートされた別のPCR管の中で調製した。ファージディスプレイされた7マーのランダムペプチドライブラリー10μlの2x1013プラーク形成ユニットpfu/mlを50μlのPBS中で希釈して、抗-標的PBS管の中で30分間振盪しながら4°Cにおいてインキュベートした。上清を別の抗-標的PCR管に移して、この手続を3回繰返すことにより、抗-標的に結合するファージ-ディスプレイされたペプチドの数を大きく減少させた。ファージ-ペプチドライブラリーを含む上清抗-標的バインダーを含まないを、TNF-αでコートした標的PCRに移して、4時間4°Cにおいて振盪しながらインキュベートすることにより、ファージディスプレイされたペプチドが標的に結合することを可能にさせた。0.1のツイーン-20を含むPBS150μlを用いて室温において管を5回洗浄することにより、未結合ファージを除去した。60μlの0.2MグリシンpH2.2と共に6分間インキュベートし、次に9μlの1MTris-ClpH9.1で中和することにより、低親和性バインダーを洗い流した。管を次に再び3回150μlのPBSで洗浄した。TNF-αに結合した残りのファージ-ペプチドに、54μlの溶解バッファーA10mMTris-Cl,pH8.4,0.1Triton-X100及びアンプリワックス商標名PCRジェムパーキンエルマー、ノーウオーク、アメリカ合衆国を加えた。管を95°Cにおいて15分間加熱して、次に冷やした。以下のPCR試薬:10mMdNTPs2.5μl50μMCMM13-01プライマー10μl50μMCMM13-02プライマー10μl10XPCRバッファー7.5μlTaqポリメラーゼ5U/ml1μlを次に加えた。PCR増幅は、94°C15秒間の変性、55°C20秒間のアニーリング、及び72°C30秒間の伸長合成の20サイクルを用いて実施した。プライマーギブコBRLにより合成されたの配列は:CMM13-015’CCTCGAAAGCAAGCTGATAAC3’配列番号:1CMM13-025’CATTCCACAGACAACCCTCATAG3’配列番号:2であった。PCR産物267塩基対bpを8ポリアクリルアミドゲル上で、単一ファージペプチドクローンからのPCR産物陽性クローン及び分子量マーカーと共に分析した図2。拡散するバンドとして出現した移動の遅い産物が約500-700bp付近に観察された。これは、PCR反応中に鋳型即ち、ファージが多すぎたためであり、そしてファージ濃度を低下させることによるか、又はPCRサイクルの数を減らすことにより、緩和することができる図3。500-700bpの拡散バンドの量を減らすため、この出発物質から次のPCR反応のためにPCR産物をおおまかに希釈することにより、サブクローン化の目的でより多くの産物を生成させた。所望の産物267bpが増幅されたら、それをEagI及びAcc651制限エンドヌクレアーゼにより消化して、ランダムペプチドをコードするDNAを含む45bpの断片を生成した。当該45bp断片を次にM13KEベクターニューイングランドバイオラブズ;ビバリー、MA中にEagI及びAcc651制限部位において標準技術SAmbrook,etal.,1989前記を用いてサブクローン化した。当該45bp断片をM13KEベクターに連結した後、ライゲーション反応物で、化学的にコンピテントにしたER2537E.coli細胞を形質転換した。当該細胞は、標準プロトコルを用いてSambrook,etal.,1989前記塩化カルシウムによりコンピテントにした。ニューイングランドバイオラブズのM13DNA調製用プロトコルから修飾したプロトコルを用いて、様々な形質転換体からM13のDNAを単離し、そして配列決定した。修飾は、管とは反対に、96ウエルのプレートの使用を含む。対応するペプチドを表1に示す。実施例2:TNF-αに結合するファージ-ペプチドの結合親和性及び選択性の特性決定:ファージクローンA1、アミノ酸配列:RYWQDIP;表1、TNF-αに対する配列番号:3の結合及び解離を、IAsysAutoPlusBiosensorを用いて、次にLabsystemsAffinitySensorsIAsysProtocol2.4蛋白質層への固定化:アビジンにカップリングしたチオールThermoBioAnalysisCorp.フランクリン、MAを用いて監視した。2つのキュベットを最初にアビジンでコートして、一方対照を次にビオチンでブロックした。これを次にリジン基で活性化した。15μlのアリコートの1mg/mlhTNF-α溶液を各キュベットに加えた。表面への蛋白質の結合は対照キュベットにおいて観察されなかったが、hTNF-αは明らかに未ブロックアビジンコートキュベットに固定化された示さず。この複合体は安定であり、そして10分にわたって解離しなかった。ブロッキング及び洗浄の後に、ファージクローA1,RYWQDIP配列番号:3を加えて、最終力価を5x1011pfu/mlとした。図4に示すとおり、サンプルキュベットにおいてはファージのTNF-αへの有意な結合があるが、対照キュベットへ結合したファージは極めてわずかであった。TNF-αからのファージの解離は極めて遅く、koff<10-4秒-110mMHEPES/0.05ツイーンと見積もられる解離定数であった。10Xバッファー濃度による洗浄により70分時間点において、除去されたのはファージのほんの小さな一部のみであった。10mMHClによる追加の洗浄は、標的からファージペプチドを完全に除去しそこなった。ファージ-ディスプレイされたペプチド配列RYWQDIP配列番号:3の結合は特異的であるが、挿入物を欠く野生型のファージが固定化TNFに結合しなかったからである。実施例3:IL-6及びIL-8に結合するファージ-ペプチドの選択:実施例1に記載されたのと同じ方法を用いて、ヒトIL-6とIL-8標的として用い、そしてスーパーブロック商標名ブロッキングバッファーを抗-標的として用いた。PCR管を組換えヒトIL-60.1mg/ml及びIL-80.25mg/mlバイオソースインターナショナルでコートした。選択は、標的からのファージの酸溶出においてさえ、予測されたサイズ267bpのPCRバンドを生じた図2B。実施例4VEGFに結合するファージ-ペプチドの選択:滅菌マイクロタイタープレート5ウエル/サンプルを200μlの1PBS/BSAPBS1ウシ血清アルブミンでコートし、次に、200μlの0.25PBSTで洗浄した。ウエルを満たしたままにした。100μlの新鮮な全血を10μlのファージライブラリーと混合して、最初にコートされた細胞を添加し、そして30分間室温においてRTインキュベートすることにより、ファージペプチドのライブラリーを、抗-標的としてのヒト全血に対して排除したdeselected。30分後、上記溶液を吸引し、次にコートされたウエルに送達したdelivered。この手法を4回繰返すことにより、抗-標的非結合ファージのライブラリーを生じさせた。標的に関しては、5mgの200μmポリスチレンビーズをヒトVEGFでコートしたが、100μlの100μg/ml組換えヒトVEGFバイオソースインターナショナル;カマリロ、CAと共に一晩4°Cにおいてゆるやかに振盪しながらインキュベートすることによった。PBST1xPBS中の0.25ツイーン-20により3回洗浄することにより、過剰の未結合のVEGFを除去した。次に、ビーズを2ツイーン-20axPBSTと共に2時間室温RTにおいてブロックした。ファージ-ディスプレイされた環状の7マーのランダムペプチドライブラリーを使用した。選択手法は本質的に実施例1に記載されたのと同じであった。最初のラウンドの選択の後に、標的-結合リジンからのPCR断片を精製し、EagI及びAcc651により消化し、そして上記制限酵素を加熱変性した。断片を直接M13KE切断ベクターへTakaraライゲーションキットプロメガコープを用いてライゲーションした。ライゲーションミックスで形質転換し、そして標準手法Sambrooketal.1989前記に従い増幅した。第2ラウンドの選択を実施することにより、VEGFに結合するファージ-ペプチドをさらに富裕化した。対応するペプチド配列を以下の表に示す:本発明の選択性標的化方法を慣用のバイオパンニング方法と比較するため、慣用の酸-溶出方法を用いた平行実験を実施した。SmithandScott1990Science249:386により記載された方法による3ラウンドのバイオパンニングは、表3に要約された配列プロフィールを生じた。これらの配列は本発明による選択性標的化方法により同定された配列とオーバーラップしない表2。実施例5:襟のしみに結合するファージ-ペプチドの選択:コットン又は標的襟のしみを含む65ポリエステル:35コットン及び抗―標的EMPA213ポリエステルコットン織物試験織物、フリーホールド、NJ上のしみ化シャツの襟を、ダイスを用いて直径7/32に切り、NAEFパンチプレスに適合させる排除を伴ったMSインスツルメントカンパニー、ストニークリーク、NY。96ウエルの平底マイクロタイタープレートコスター、カタログ番号3598をスーパーブロック商標名ブロッキングバッファーで一晩コートして、次に200-250μlのTBST0.1ツイーン-20でEL403オートプレート洗浄機バイオテックインスツルメンツ、ウイノスキー、VTを用いて洗浄した。織物片をウエルの中にいれ、M13繊維状ファージ上にディスプレイされたファージ-ペプチド12マーライブラリーの10μlストック溶液を、100μlの界面活性剤3.4g/Lヨーロピアン界面活性剤に、抗-標的としてポリエステル-コットンを含むウエル中で加えた。20分間のインキュベーション後に、未結合ファージ抗-標的非バインダーを含む上清を、ポリエステル-コットン織物を含む第2のウエルに移した。これをもう一度繰返した。上清を次に、しみ化シャツの襟の織物を含むウエルに移し、そして汚れと10-60分間インキュベーションすることにより、残りのファージペプチド集団を汚れバインダーに関して選択した。0.1-2のツイーン-20又は3.4g/Lの界面活性剤の何れかによる一連の洗浄工程に汚れを供した。洗浄工程は所望のストリンジェンシーに対して操作することができる。汚れを含む最初のウエルの中での初期の洗浄後に、あらゆる残りの結合ファージを含む汚された織物片を、第2洗浄工程のために次のウエルに移した。結合ファージを含む汚された織物の一部を、60μlの溶解バッファーB10mMTris-Cl,pH8.4,1Triton-X100;10mMEDTA及びアンプリワックス商標名パーキンエルマー、ノーウオーク、アメリカ合衆国を含むPCR管に移した。管を次に95°Cにおいて20分間加熱して、次に、冷やした。標的-結合ファージのPCR増幅は、マイナーな修飾を伴って実施例1に記載された通りに実施した。図3は、20サイクル未満のPCRをホモ二重鎖DNAの単一バンドの増幅が要求することを示すレーン4。長いサイクル時間レーン3はヘテロ二重鎖DNA形成の実質上の画分を生じるのに対し、短いサイクル時間レーン5は測定可能なPCR産物を生じない。正確なサイズのPCR産物を8ポリアクリルアミドゲル上で精製して、M13KEにサブクローン化し戻して、実施例1に記載されたとおりに配列決定した。界面活性剤中で襟のしみに結合してポリエステルコットン織物に結合しないファージペプチドクローンに相当するアミノ酸配列を表4に要約する。実施例6:織物上の標的の襟のしみへの放射線標識ペプチドの選択性結合:標的襟のしみ及び抗―標的EMPA213ポリエステルコットン織物試験織物、フリーホールド、NJを含むしみ化シャツの襟コットン又は65ポリエステル:35コットンを、直径1/2に切り、コスター24ウエルプレートに入れた。本発明により同定されたしみ標的化ペプチドSISSTPRSYHWT配列番号:20を14CグリシンでN末端標識した。10μlの[1-14C-G]SISSTPRSYHWTシンペップ、ダブリン、CA配列番号:114400μM溶液を4mlの0.002ツイーン-20含有50mMCAPSバッファー、pH10.4に加えた。放射性標識ペプチドの950μLアリコートを各ウエルに加え、そしてサンプル回転振盪機上で30°Cにおいて30分間振盪した。サンプルを取り出し、そして4mLのバッファーで洗浄して、次に、4mLのミリQ水で20分間洗浄した。サンプルをワットマンフィルターペーパー上で空気乾燥、そしてヒューレットパッカードスキャナーパロアルト、CA上でデジタルスキャンした。放射性標識したスワッチを次にリン蛍光体スクリーンモリキュラーダイナミックス;サニーベール、CAに30時間-70°Cにおいて暴露した。結果のリンイメージをモリキュラーダイナミックスストーム登録商標を用いてスキャンした。図5は、汚された織物及び対照の織物の対応するリンイメージと共に、標的汚れ及び抗-標的の可視イメージを示す。リンイメージの相対強度をイメージクアントImageQuant登録商標イメージ分析ソフトウエアモリキュラーダイナミックス;サニーベール、CAを用いて定量し、そして織物の結合に対する汚れの結合の比は>15:1であることを示す。実施例7:汚れ標的化ペプチドの放出に関する遅いkoff速度定数の証明:標的襟のしみ及び抗―標的を対照抗-標的同じシャツからの汚されていないポリエステル:コットンと共に含むしみ化シャツの襟65ポリエステル:35コットンを、直径7/32に切り、96ウエルマイクロタイタープレートミリポアコーポ、0.22μMデュラポア膜;カタログ番号MAGVN2250に入れた。14Cグリシンで末端標識された、しみ標的化ペプチドSISSTPRSYHWT配列番号:20及びペプチド対照NFFPTWILPEHT配列番号:78の400μMストック溶液の連続希釈を、1g/Lのタイド界面活性剤溶液プロクターアンドギャンブル、シンシナチ、OHに加え、そして60μLのアリコートをマイクロタイタープレートのウエルに入れた。プレートを振盪しながら30分間32°Cにおいてインキュベートし、次に過剰の未結合の放射線標識ペプチドバキュームマイフォールド;ミリポアコープ、カタログ番号MAVM096ORの吸引濾過を行った。サンプルは3回200μLの蒸留水で洗浄し、洗浄と洗浄の間は振盪し、約40分かけた。サンプルに結合した残りの放射活性を液体シンチレーションカウンティングによりウオーラックマイクロベータカウンター内で定量した。図6Aは、全放射線標識の50より多くが、40分間の洗浄後でさえ、汚れ標的化ペプチドに関して汚された織物に結合したままである。これは、しみ標的化ペプチドの放出に関する速度定数koff≦2x10-4秒-1に相当する。対照的に、対照ペプチドは同じアッセイにおいて親和性又は選択性を何も示さない、図6B。実施例8:発明の選択性標的化方法に比較した酸溶出に関するペプチドの選択性と親和性:コットン上の襟のしみに結合するファージペプチド配列HTFQHQWTHQTR配列番号:27は、ScottandSmith1990Science249:386に記載された方法を用いて各ラウンドの後にファージペプチドを酸溶出した以外は、実施例5に記載されたとおりに、バイオパンニング5ラウンド後に同定した。選択性汚れ対コットン結合及び親和性koffは、以下のとおりに襟のしみに結合する対応のペプチドに関して測定した:NiキレートしたGGHTFQHQWTHQTR配列番号:28の1mM溶液をコットン上の襟のしみ又はコットンのみと90分間室温において撹拌しながらマイクロタイタープレート中でインキュベートした。対照ペプチドキレートNiGGHも同じ条件下で試験した。ウエルからインキュベーション溶液をピペットオフした後に、織物の布きれを200μLの水で撹拌しながら3分間撹拌した。200μLのo-フェニレンジアミンOPD及び50μLの100mMH2O2を加え、そして420nmにおいて酸化されたOPDの吸収を測定することにより、残りの結合ペプチドをアッセイした。表5及び図7において要約されるとおり、織物に対する汚れの結合の比は、≦3:1より低いか又は同等であり、そして親和性はkoff=1x10-3秒-1と測定された。これらのデータは、特異的且つ選択的に強固に結合するペプチドは、本発明による選択性標的化方法を用いて同定されるのが好ましいことを証明する。実施例9:界面活性剤マトリックス内のファージディスプレイされたライブラリーの安定性:ファージペプチドライブラリーの安定性に対する家庭内の洗濯場の界面活性剤の作用を試験するため、1013pfu/mLを含むM13繊維状ファージニューイングランドバイオラブズ、ビバリーMA,アメリカ合衆国上にディスプレイされたペプチド12マーのライブラリーのストック溶液を、a100mMTrisHCl,pH7.5,0.1ツイーン-20TBST対照、bガロンあたり3グラムgpgの硬化剤を含む0.7g/LのArielFuturプロクターアンドギャンブル。シンシナチ、OH、及びc15gpgの硬化剤を含む3.4g/LのArielFuturの中で、1012pfu/mLに希釈した。TBS中のスーパーブロッキングバッファーピアス、カタログ番号37535でブロックされた96ウエル平底マイクロタイタープレートコスター、カタログ番号3598のウエルに、アリコート100μLを加えた。サンプルを25°Cにおいてゆるやかに振盪しながら90分間インキュベートした。10μLのアリコートを取り出して、標準手法Kayetal.,1996前記に従ってファージ力価測定するためにルリアブロスに連続希釈した。TBST中の対照ファージライブラリーに比して、界面活性剤溶液においてはファージ力価の損失は観察されなかった。実施例10:ポリウレタンに結合してコットン、ポリエステル、又はポリエステル-コットン織物には結合しないファージ-ペプチドの選択:1.5mLのマイクロ遠心分離管を一晩ブロッキングバッファー-PBSによりブロックし、1mLの3.4g/L界面活性剤により洗浄し、そして水分を切った。500μLの3.4g/L界面活性剤を4つの管に加え、一片のコットン、ポリコットン、及びポリエステル織物をそれぞれ共にした。ファージペプチドライブラリーは以下の通りであった:管110μLのPh.D.-C7Cライブラリー管210μLのPh.D.-12ライブラリー管310μLの野生型ファージ対照管4ファージ対照なし。管を室温において20分間1000rpmにてエッペンドルフサーモミクサー中でインキュベートし、そして織物片を取り出した。この取り出し工程は全部で3回繰返し、次に、きれいなピペットチップで30分間搾ることsqueezingにより湿潤させたポリウレタンプラグと上記ファージライブラリーをインキュベーションした。バキュームラインに接続したきれいなピペットチップを用いて上清をプラグから吸引し、そして1mLの3.4g/L界面活性剤溶液を管に加えた。きれいな接種用ループを用いて搾ることによりプラグを再度湿潤させ、そして管をエッペンドルフサーモミクサー中に入れて全部で10回洗浄した。プラグを100mLディスポーザブルフィルターシステムコーニングに移し、そして洗浄溶液をフィルターシステムに送達することにより、3x40mLPBST0.25v/vツイーン-20洗浄を実施した。プラグは、きれいなピペットチップを用いて搾ることにより再度湿潤させ、PBSTと共に瞬インキュベートし、次に吸引により乾燥させた。上記フィルターシステムを真空下にしている間、洗浄溶液を直接プラグにピペッティングすることにより、10回の1mLのPBSによる洗浄を実施した。プラグをきれいな0.5mLマイクロ遠心分離管に移した。100μLの溶解バッファー0.1TritonX-100m10mMTrispH8.4を加え、そして管を95°Cにおいて20分間インキュベートすることにより、ファージを溶解した。溶解したファージは同じ管において以下のとおりにPCRを行った:50μLHotStarTaq登録商標マスターミックスキアゲン25μL溶解バッファー5μLBSA10μg/μL1.25μpLCMM13-01プライマー50μM1.25μLCMM13-02プライマー50μM17.5μLH2OPCR増幅は、95°Cにおいて15秒間の変性、58°Cにおいて30秒間のアニーリング、そして72°Cにおいて30秒間の伸長合成を30サイクル、そして次に72°Cにおいて5分間を1サイクル使用することにより、実施した。PCR産物は、製造者の指示に従い、ゼロブラントクローニングにより、TOPO登録商標-10ベクターインビトロジェン、サンディエゴ、CAへクローン化した。クローンは標準配列決定法を用いて配列決定し、表6に要約した。ペプチド配列を合成して、当該ペプチドがポリウレタン酸化に対して防御する能力を測定した。実施例11ステンレス鋼又はガラス上にて標的のベークドオンされた卵のしみに対して選択されたペプチドの選択性結合:卵のしみは、新鮮な卵からの黄身を使用して調製した。黄身を冷たい水で洗って、次にストレーナーを通してビーカーに押し出した。ビーカーを140°F水浴に入れて、卵の黄身を30分間一定の撹拌を伴って調理した。30分後に、ビーカーを氷の浴槽に入れて、一定撹拌を伴って黄身を室温まで冷やした。316ステンレス鋼フォイルディスクを、ダイスを用いて7/32の直径に切って、NAEFパンチプレスに適合させる排除を伴ったMSインスツルメントカンパニー、ストニークリーク、NY。これらは、標的、ベークドオンされた卵のしみ、及び抗-標的、未だしみ化していないディスクの両方の基質として使用した。使用の前に、当該ディスクをマイルドな界面活性剤の中で洗浄し、そして脱イオン水中で徹底的に洗い流した。卵のしみ化316ステンレス鋼ディスク及び卵のしみ化ガラスビーズをコスター96ウエル平底プレートに入れた。各ペプチドライブラリーに関して、3つのきれいなステンレス鋼SSディスク又はガラスビーズ抗-標的を隣のウエルに入れた。きれいなディスク又はビーズを含む最初のウエルAには、150μLの界面活性剤及び10μLのファージライブラリー-C7C、直鎖7マー、又は野生型ファージを加えた。当該サンプルを室温において20分間ゆるやかな振盪と共にインキュベートし、そして未結合ファージを含む上清を次にウエルに移し、そして上記プロセスを全部で3回繰返した。上清を次に卵のしみ化クーポン又はビーズに移し、そして30分間ゆるやかに混合しながらインキュベートした。当該サンプルを次に新たなウエルに移して、以下のとおり全部で38回洗浄した:200μL界面活性剤溶液、3.5g/lの粉末のオートマチック皿洗い用界面活性剤中で3x、250μLのPBST中で30x、そして200μLのPBS中で5x。洗浄した皿又はガラスビーズを0.5mLのPCR管に移した。PCR反応は、200μLの反応混合物を用いてキアゲンホットスポット登録商標キット及び50μLのミネラルオイルを用いて、直接に卵のしみ化ディスク又はビーズ上で稼働させた。PCR増幅は、反応開始のための95°Cにおいて15分間を1サイクル、次に、変性の94°C30分間、アニーリングの58°C30秒間、そして伸長合成の72°C30秒間を30サイクル行い、そしてエロンゲーションの72°C10分間を1サイクルで終わらせた。278bpの産物が、分子量マーカーと共に2アガロースゲル上で分析された。抗-標的に関するステンレス鋼に関する図8に示すとおり、PCR産物は直鎖7マーライブラリーに関して可視化され、そして野生型WTファージ対照に関しては可視シグナルはなかった。第2のPCR増幅を実施して、PCR産物をTOPO登録商標TAベクターインビトロジェンにクローン化して、表7に要約されたとおりに配列決定した。上記配列をズブチリシンプロテアーゼ遺伝子にクローン化して、卵のしみに関する親和性を蛋白質分解アッセイにおいて測定した。実施例12セラミック上の標的の茶の汚れに対する選択されたペプチドの特異的且つ選択的結合:実施例1に記載された方法を用いて、オートマチック皿洗い用界面活性剤の存在下でセラミック上のお茶に結合するペプチドを2ラウンドの選択性標的化の後に同定した。標的結合ペプチド配列を表8に要約する。実施例13ヒトの皮膚を標的化するが毛髪を標的化しないように選択されたペプチドのスクリーニング:濃いdarkヒトの毛髪3インチ片2つインターナショナルヘアインポーターアンドプロダクツ、ホワイトプレインズ、NYを、DI水中の2ニュートロジーナ登録商標ボディーウオッシュニュートロジーナコーポ溶液10mlを含む、BSAブロックされた50mlのコニカル管に入れた。10μLの環状7マー又は直鎖12マーペプチドライブラリー1010pfu/ml、又は野生型ファージ109pfu/mlを加え、そしてサンプルを15分間室温において回転撹拌しながら30rpm混合した。未結合の上清を、さらに2つの濃い毛髪の3インチ片を含む新たな管に移し、そして室温において15分間回転撹拌しながらインキュベートした。この第2の毛髪のインキュベーションの後に、500μlの上記溶液を、0.9mL組織培養培地MatTekCorpを含む6ウエルの培養プレート中のヒト皮膚組織EpiDerm登録商標,MatTekCorp.アシュランド、MAの表面上に30分間室温においてゆるやかに撹拌しながら移した。皮膚組織を取り出して、ブロックされたコニカル管の中で、50mlsの2ボディーウオッシュ中で2回各5分間洗浄し、そして50mlsのPBSで3回各5分間洗浄した。最後のPBS洗浄後に、皮膚組織を-20°Cに凍結して、次に標的結合リガンドファージのPCRを行った。実施例14ヒトの毛髪を標的化するが皮膚を標的化しないように選択されたペプチドのスクリーニング:予め平衡化した皮膚組織を新しい0.9mLの組織培養培地を含む6ウエルの培養プレートに入れ、そして10μLの環状7マー又は直鎖12マーペプチドライブラリー1010pfu/ml、又は野生型ファージ109pfu/mlを含む、300μlの2ニュートロジーナ登録商標ボディーウオッシュ溶液を皮膚表面に加えた。サンプルを15分間室温において回転撹拌しながら混合した。未結合の上清を、さらに皮膚組織を含む新たなウエルに移し、そして上記手法を繰返した。インキュベーション溶液を、2ボディーウオッシュ10mlを含む50ml管内の、9つの3インチの濃い毛髪インターナショナルヘアインポーターアンドプロダクツ、ホワイトプレインズ、NY片に、30分間ゆるやかに撹拌しながら30rpm室温において移した。毛髪サンプルを次に1X50mls,2X50mls,又は4X50mlsの2ボディーウオッシュで洗浄した;PBSの洗浄サイクルを続けた1X25mls5分間、1X25mls2分間、2X50mls各5分間、全部で150mls。最後のPBS洗浄後に、結合したファージペプチドを含む毛髪サンプルを-20°Cに保存した。標的-結合ファージのPCR増幅は実施例1に記載されたとおりに実施したが、マイナーな修飾を伴った。PCR反応物は50μgのBSAを含むことにより、毛髪又は皮膚によりPCR反応の阻害を予防した。実施例15ヒトの毛髪を標的化するが皮膚を標的化しないペプチド又はヒトの皮膚を標的化するが毛髪を標的化しないペプチドの選択性結合に関するELISAアッセイ:実施例13及び14において同定されたペプチド配列並びにランダムな対照ペプチドは、配列GGGKビオチンでC末端標識した。配列LESTPKMK配列番号:115はコンセンサス配列LESTを含み、そして毛髪上で単離された。FTQSLPR配列番号:116はコンセンサス配列TQSLを含み、そして皮膚上で単離された。YGGFMTSE配列番号:117は対照ペプチドである。濃いブラウンの毛髪3の長さ、各4を2ボディーウオッシュ及び予め平衡化したヒト皮膚組織で湿潤し、24ウエルプレートのウエルに入れた。2ニュートロジーナボディー中のビオチン化ペプチドの200μM溶液1mlを毛髪サンプル及び皮膚サンプルに加え、そしてゆるやかに撹拌しながら室温において30分間インキュベートした。当該溶液を次にピペットオフして、毛髪サンプル及び皮膚サンプルをきれいな毛抜きを用いて50mlコニカル管に移し、50mlの2ボディーウオッシュで1回洗浄し、水50mlで2回洗浄し、そして50mlのPBSで1回洗浄した;各洗浄工程は5分かけて、回転シェーカー上で20rpmにて実施した。毛髪サンプル及び皮膚サンプルは次にきれいな毛抜きを用いて24ウエルのプレートに移したが、その際、1mlのストレプトアビジン配合ホースラディッシュパーオキシダーゼPBS中で1/1000に希釈を1時間室温においてゆるやかに振盪しながら加えた。50mLコニカル管の中で、50mlのPBSで2回洗浄することにより5分間、各20rpm、過剰なストレプトアビジンHRPを除去した。毛髪及び皮膚のサンプルを新たなウエルに移し、そして1mlのH2O2/OPD溶液を加え、そして発色するまで室温に放置した。図9は、対照ペプチドに比較して、ペプチド結合が各々の標的に関して選択性であることを示す。"