オプソニンの糖鎖認識ドメイン;基質結合ドメイン;および該認識ドメインを基質結合ドメインに連結させるペプチドドメインを含む、組換えオプソニン。前記糖鎖認識ドメインがコレクチンもしくはフィコリンficollinである、またはコレクチンもしくはフィコリンに由来する、請求項1記載の組換えオプソニン。前記糖鎖認識ドメインがレクチン、またはレクチンの一部分もしくはフラグメントである、請求項1記載の組換えオプソニン。前記レクチンがマンノース結合レクチンMBLである、請求項3記載の組換えオプソニン。レクチンがMBLのアミノ酸残基81プロリン~228イソロイシンSEQIDNO2からなる、請求項4記載の組換えオプソニン。前記基質結合ドメインが、固体基質への化学的架橋を可能にする少なくとも1つのシステイン残基を含む、前記請求項のいずれか一項記載の組換えオプソニン。フレキシブルペプチドがグリシンセリンセグメントまたはプロリンアラニンセリンセグメントを含む、前記請求項のいずれか一項記載の組換えオプソニン。フレキシブルペプチドが免疫グロブリンのFcの部分を含む、前記請求項のいずれか一項記載の組換えオプソニン。Fc部分がIgGFcドメインのCH2CH3境界面を含む、請求項8記載の組換えオプソニン。前記基質が磁性マイクロビーズ、常磁性マイクロビーズ、微多孔膜、中空糸リアクター、または他の任意の流体濾過膜もしくはフローデバイスである、前記請求項のいずれか一項記載の組換えオプソニン。前記基質が生物学的組織または器官の生きた細胞または細胞外マトリックスである、前記請求項のいずれか一項記載の組換えオプソニン。前記基質が食細胞である、請求項11記載の組換えオプソニン。固体表面にコンジュゲートさせた組換えオプソニンと流体を接触させる工程であって、組換えオプソニンが、オプソニンの糖鎖認識ドメイン、固体基質結合ドメイン、および該認識ドメインを固体表面結合ドメインに連結させるフレキシブルペプチドドメインからなる、工程;オプソニン結合微生物を該組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートに結合させる工程;ならびに該微生物が結合した組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートから該流体を分離する工程を含む、流体からオプソニン結合微生物を回収する方法。固体表面が磁性粒子であり、かつオプソニン結合微生物が組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートに結合した後に流体に磁力をかけることによって分離が達成される、請求項13記載の方法。微生物を同定する工程をさらに含む、請求項13記載の方法。流体が生物学的流体である、請求項13記載の方法。生物学的流体が、血液、脳脊髄液、滑液、尿、精液、唾液、涙液、および注射針、生検、または吸引の手順によって回収される流体からなる群より選択される、請求項16記載の方法。生物学的流体が血液である、請求項17記載の方法。血液をその供給源に戻す工程をさらに含む、請求項18記載の方法。供給源が対象である、請求項19記載の方法。対象が感染症または敗血症に罹患している、請求項20記載の方法。流体が水または食物サンプルに由来する、請求項13記載の方法。病原体の同定における、請求項1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。疾患の診断における、請求項1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。水または食物のコンタミネーションの同定における、請求項1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。疾患の治療における、請求項1~12のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。追加の治療または療法とさらに組み合わせた、請求項26記載の組換えオプソニンの使用。対象の血液に組換えオプソニンを投与する工程であって、組換えオプソニンが、オプソニンの糖鎖認識ドメイン、基質結合ドメイン、および認識ドメインを基質結合ドメインに連結させるフレキシブルペプチドドメインからなり、糖鎖認識ドメインがオプソニン結合微生物に結合し、かつ基質結合ドメインが免疫系の細胞、組織、または器官に結合する、工程;組換えオプソニンをオプソニン結合微生物に結合させる工程;ならびに微生物が結合した組換えオプソニンを、微生物を殺傷する免疫系の細胞、組織、または器官に結合させる工程を含む、対象における血液感染症を治療する方法。対象が動物である、請求項28記載の方法。対象がヒトである、請求項28記載の方法。詳細な説明本発明は、本明細書に記載される特定の方法論、プロトコール、および試薬などに限定されるものではなく、そのため変化し得ることが理解されるべきである。本明細書で用いられる用語は、特定の態様を記載することのみを目的とするものであって、特許請求の範囲によってだけ規定される本発明の範囲を限定することを意図するものではない。本明細書においておよび特許請求の範囲において使用するとき、単数形には、別様に文脈ではっきりと指示されていない限り、複数形の指示対象が含まれ、逆もまた同様である。実施例を行う際以外でまたは別様に指示されていない場合、本明細書において用いられる成分または反応条件の量を表現するすべての数は、約という用語によって、すべての場合において修飾されると理解されるべきである。特定されるすべての特許および他の刊行物は、例えば本発明に関連して用いられ得るそのような刊行物に記載される方法論を記載および開示することを目的として、参照により本明細書に明確に組み入れられる。これらの刊行物は、本出願の提出日より前のそれらの開示のためだけに提供される。この点において、先行発明という理由でまたは他の任意の理由で、本発明者らがそのような開示に先行する権利を付与されないことを承認するものとしていかなるものも見なされるべきでない。これらの文献の日時に関するすべての記述または内容に関する表示は、本出願人らが入手可能な情報に基づくものであり、これらの文献の日時または内容の正確性に関していかなる承認を成すものではない。別様に定義されていない限り、本明細書において用いられるすべての技術的および科学的用語は、本発明が関連する技術分野における当業者に一般に理解されるものと同じ意味を有する。任意の公知の方法、デバイス、および材料を本発明の実践または試験に用いてよいが、この点においてこれらの方法、デバイス、および材料は本明細書において記載される。最も広い意味において、オプソニンは、粒子の表面に結合するタンパク質である。本来、オプソニンは、例えば標的病原体の膜上に負に帯電した分子をコートすることによって、貪食作用の過程の結合エンハンサーとして働く。本発明が提供するマンノース結合レクチンMBL等の改変分子オプソニンは、生物学的病原体に結合させるのに用いられ得るか、または感染性疾患、血液媒介性感染症、もしくは敗血症を有する患者の治療および診断のためのデバイスおよびシステムにおける使用のためのサブクラスもしくは特定病原体種を同定するのに用いられ得る。治療は、インビボまたはエクスビボで実行されてよい。MBLは、マンノース、NアセチルグルコサミンNAG含有糖鎖、および多くの微生物病原体の表面上に存在する他の種々の糖鎖に結合する血清レクチンオプソニンである。MBLマンノースまたはマンナン結合タンパク質MBPとも呼ばれるは、3つまたはそれ以上の32kDa単量体を会合させた重合体タンパク質である。それぞれの単量体は、N末端のシステインリッチ領域、コラーゲン様glyXY領域、ネック領域、および糖鎖認識ドメインを有する。より高い分子量MWの重合体の会合は、32kDa単量体の三量体の形成から始まり、これらの三量体は、その後三量体の3~6セットのより高いMWの重合体へ自己会合する。図1を参照されたい。MBLは、微生物病原体のオプソニン化において、ならびに補体レクチン経路を介したおよび凝集の活性化において主要な構成要素である。オプソニン化とは、標的細胞へのタンパク質の結合、ならびにマクロファージおよび好中球等の食細胞による取り込みおよび破壊のためのこれらの細胞の標的化である。このオプソニン化は、MBLの小さいシステインリッチなN末端ドメイン、ならびにMBLを介したレクチン補体経路の活性化により標的細胞表面上に堆積したC3bによって仲介されると見られる。レクチン経路を介した補体の活性化において、微生物および特殊化タンパク質、すなわちMASP1マンナン結合レクチン関連セリンプロテアーゼMatsushitaFujita176JExpMed1497およびMASP2Thieletal386Nat506は、結合したMBLと相互作用し、抗体の非存在下で補体を活性化する。より高い分子量のMBL複合体5~6リピートの機能的MBL三量体は、このレクチン経路を介した補体の強力な活性化因子であり、この経路では、MASP2が補体を活性化すると見られ、かつMASP1が凝集を活性化する。より小さな複合体3~4リピートのMBL三量体ユニットは、凝集の最も強力な活性化因子である。Krarupetal2PLoSOnee623。あるヒト集団では、MBLにおけるコラーゲンヘリックス中のコドン52、54、および57に高い対立遺伝子頻度の変異が存在する。Garredetal7GenesImmun85。これらの変異は、より高い分子量型のMBLの形成を妨げ、補体の活性化を抑制する。これらの場合、MBLはまだオプソニンとして機能し、凝集を促すが、補体を活性化することはない。ヘテロ接合体が最高の生存率を有し、ホモ接合性の野生型が2番目によく、そしてホモ接合性の変異体が最低の生存率を有するという点で、敗血症に対するヘテロ接合体の利点に関するいくつかの証拠もある。Sprongetal49ClinInfectDis1380を参照されたい。さらに、ホモ接合性変異体の新生児は、獲得免疫系が機能し始める前に感染症に特にかかりやすい。感染性疾患の治療のための治療用組換えタンパク質としてのMBLの有用性に関しては多くの論争がある。第1相および第2相臨床試験では、組換えタンパク質としてのおよびヒトの献血から精製された場合のどちらにおいても、完全なままのMBLが用いられている。実際に、化学療法誘発性好中球減少症を有するMBL欠損の小児患者の第1相および第2相試験では、治療法として血漿由来のMBLが用いられている。Frakkingetal45EurJCancer50。MBLを開発するための商業的努力は、組換えタンパク質を産生することおよび有効性を確立することの両方における困難のために失敗している。本明細書において使用するとき、対象の治療または治療することとは、その疾患、病気、または症状を管理、改善、または軽減するために提供される医学的ケアを表し得る。本発明は、病原体の検出および除去のためのデバイスおよびシステムにおける使用のための改変オプソニン、例えば改変MBLまたはMBL重合体を提供する。図5は、MBLをコンジュゲートさせた磁性マイクロビーズの酵母C.アルビカンスへのカルシウム依存的結合を示す。図6および7は、グラム陽性菌の黄色ブドウ球菌、グラム陰性菌のクレブシエラKlebsiellaおよび大腸菌Ecoli、ならびに酵母のC.アルビカンスを含む、数種の異なる病原体間でのMBL磁性ビーズの結合を比較している。最近の研究では、血液等の生物学的流体等の流動流体から生きた病原体を除去するために、マイクロ磁気技術およびマイクロ流体技術の組み合わせを用いることの実現可能性が実証されている。Xiaetal8BiomedDevBiomedMicrodev299YungetalLabonaChipDOI101039b816986a。これらのマイクロデバイス病原体細胞上の表面マーカーに特異的に結合する分子でコートされた磁性マイクロビーズでは、ヒトの全血中のこれらの細胞に結合させることが可能であり、その後適用した磁場勾配を用いることによってマイクロ流体チャネル中を流れる血液から引き抜いて除かれる。WO2008130618WO2007044642を参照されたい。他の用途の中でも、これらのデバイスは、毒素を産生する病原体を敗血症患者の血液から迅速に除去し、それゆえ従来の抗生物質療法に対する応答を大幅に増大させることが大いに見込まれる。潜在的に安価でかつ簡便なマイクロデバイスを用いて、血中を循環するまたは他の生物学的流体中に存在する生きた病原体を迅速に数分以内に結合、検出、および単離することができることにより、病院または商業的研究所において微生物培養に何日も要する現在の病原体の検出および感受性試験アッセイの大きな制限も回避される。本発明において用いられ得る生物学的流体には、例えば血液、脳脊髄液、滑液、尿、精液、唾液、涙液、および注射針の挿入によって回収される流体が含まれる。さらに、本発明に従った迅速で一般的なコンタミネーションアッセイのために、食物または水のサンプルから流体を回収してもよく、そのような流体を回収し、天然の微生物コンタミネーションについてまたは可能性のある生物テロによるコンタミネーションについて分析することができる。さらには、血液浄化デバイスを用いる前にその病原体に対する特異的リガンド例えば、特異的抗体を磁性マイクロビーズ上に置くため、これらの方法の現在の有効性は、血液からの除去が望まれる特定病原体についての事前の知識を利用するものである。したがって本発明は、適用に必要とされるのに応じて、生物学的オプソニンのように機能しかつ特定の多くのまたはすべての種類の微生物病原体に結合する改変した包括的結合分子を提供することによって、現在の手法を強化する。この点において、本発明は治療上の応用性を有する。本明細書で取り組んだ別の必要性は、例えばすべての種類の真菌またはすべてのグラム陰性菌またはすべてのもしくは特定のグラム陽性菌またはすべてのウイルスまたはすべての原生動物に結合する特殊化した病原体のクラス特異的オプソニンの開発であり、なぜなら、それを知ることで、しばしば完了するのに多くの日数がかかる従来の方法を用いて抗生物質感受性について種のタイプの完全な特徴が同定される前に、医師が抗微生物療法を選択する際にすぐに助言できるからである。さらに、遺伝子工学、ならびに指向進化および選択ストラテジーを使用して、種特異的様式で病原体に結合する、MBL等の天然オプソニンの修飾版を改変することができる。最終的に、異なる抗生物質または抗微生物療法に対する病原体感受性に特異的である結合は、適切な選択ストラテジーを用いることによって達成され得る。それゆえ、本発明は、これらの高価値の特性を提供する改変オプソニンの開発を提供する。MBLは、本明細書に記載する目的のための包括的オプソニンとしての使用にとって優れた選択であるが、しかしながら、完全なままの分子は、それが診断および治療用マイクロデバイスの機能を妨害し得る血液凝集を促進する複数の機能的ドメインを有するため、全血の存在下では典型的には用いられない。このMBLの特徴は、本明細書において提供されるその病原体結合機能から切り離すことができる。より具体的には、MBLは、N末端からC末端に4つの部分:マクロファージ結合および/またはMASP結合に関与し得る本質的に未知の機能の小さなN末ドメイン;MASP結合およびより高次のオリゴマー化にも関与し得るコラーゲンセグメント;三量化に十分であるαヘリックスのネックセグメント;ならびに直接的な病原体結合を仲介するC末端におけるCRDレクチンドメインを含有する。レクチンドメインは目前の適用に有用であり、その他のドメインは使用者の必要に応じて存在してもまたは欠失してもよく、ルーチン試験によって決定することができる。さらに、レクチン活性はカルシウム依存的であり、そのため結合した微生物を診断目的のためにキレート剤によって放出することができる。診断および治療上の応用のための包括的オプソニンとして有用な改変した形態のMBLの一態様は、MBLのレクチンドメインを含む。例えば、グリシン111構造バイオインフォマティクス研究共同体RCSB、タンパク質データバンクの構造ファイル1HUPにおいて定義されているは、改変オプソニンのレクチン部分を開始する好都合なN末端のポイントである。既定の単量体の糖へのMBLの結合は弱いため、表面上のタンパク質が移動できかつ微生物の形状に適合できるように、フレキシブルな様式で固体マトリックスへMBLを接着させてよい。例えば、1つもしくは複数のグリシンセリンセグメント、または1つもしくは複数のプロリンアラニンセリンセグメント、あるいは当技術分野において公知の他のペプチドリンカー等のフレキシブルペプチドを、これらのセグメントは折り畳まれた構造を形成しない傾向があるため、図2AにあるようにMBLのN末端に置いてよい。診断および治療上の応用のための包括的オプソニンとして有用な改変した形態のMBLの別の態様は、MBLのネックおよびレクチンドメインを含む。プロリン81例えば、構造バイオインフォマティクス研究共同体、タンパク質データバンクRCSBPDB構造ファイル1HUPにおいて定義されているは、この改変オプソニン構築物のレクチン配列を開始する好都合なN末のポイントである。MBLのこの部分を、ヒトIgGのFc部分Fcγの下流C末端に融合させる。Fc部分には、ブドウ球菌プロテインAを含む多数のFc受容体に対する結合部位を含有するIgGFcドメインのCH2CH3境界面が含まれてよい。使用の際、Fc部分は二量体化し、MBLレクチンによる単量体の糖への結合の親和性アフィニティーを増強する。さらに、診断用試薬として用いた場合、組換えオプソニンのN結合型グリコシル化を取り除くことができる。例えばFcMBL81では、抗体中のアミノ酸を番号付けするKabatシステムにおいて、残基297におけるアミノ酸をアスパラギンからアスパラギン酸N297Dに変えることによってグリコシル化を取り除くことができ、これはこの特定のFc構築物におけるアミノ酸82に相当する。グリコシル化されたFcは、Fcを介した抗体依存性細胞介在性細胞障害作用ADCCおよび補体介在性細胞障害作用CDCの正しい方向性を維持する。マンノース受容体を介したヒト型結核菌Mycobacteriumtuberculosisの取り込みを避けて、Fc受容体を介したFcMBLオプソニン化ヒト型結核菌の取り込みの活性化に、改変FcMBLオプソニンを用いることができる。最近の刊行物Kangetal202JExpMed987によれば、ヒト型結核菌の細胞表面上にあるリポアラビノマンナンManLaMが、貪食作用の過程の間にマクロファージマンノース受容体MMRに関わることが示唆されている。これにより、ヒト型結核菌はその初期ファゴソーム間隙へ導かれ、ファゴソーム-リソソームPL融合が阻害され、それによってヒトマクロファージの生存率が高まる。興味深いことに、PL融合の阻害は、Fcγ受容体を介した侵入では起こらなかった。一態様では、例えばヒト型結核菌等の細菌は、Fc受容体エンドサイトーシスによる取り込みにより、異なる細胞内小胞へ送られる。本発明の改変オプソニンの形態は、N末端におけるアミノ基に特異的である化学架橋剤を用いることにより、融合タンパク質の、磁性マイクロビーズもしくは微多孔膜の固体表面等の基質への、または図2Bにあるように該タンパク質のN末端に近接するように改変されている遊離システイン残基への接着も助ける。、PerSeptiveDiagnosticsInc、InvitrogenCorp、CortexBiochemInc、およびBangsLaboratories等から商業的に入手可能である。特定の態様では、磁性粒子は、MyOne商標Dynabeads登録商標磁性ビーズDynalIncである。固体基質を、生体適合性材料から作製することもまたは生体適合性材料でコートすることもできる。本明細書において使用するとき、生体適合性材料という用語は、対象の生物学的組織内に移植したもしくは隣接して置かれた場合に、経時的に、目に見えるほど悪化させず、かつ重大な免疫応答もしくは有害な組織反応、例えば中毒反応もしくは重大な炎症を誘発しないか、またはそれが血液と接触した場合に血液凝固もしくは凝集を誘発しない、任意の材料を表す。適した生体適合性材料には、例えばポリイミド、ポリエチレングリコール、ポリビニルアルコール、ポリエチレンイミン、およびポリビニルアミン、ポリアクリレート、ポリアミド、ポリエステル、ポリカーボネート、およびポリスチレンの誘導体および共重合体が含まれる。いくつかの態様では、固体基質は、ポリジメチルシロキサン、ポリイミド、ポリエチレンテレフタレート、ポリメチルメタクリレート、ポリウレタン、ポリ塩化ビニル、ポリスチレンポリスルホン、ポリカーボネート、ポリメチルペンテン、ポリプロピレン、ポリフッ化ビニリデン、ポリシリコン、ポリテトラフルオロエチレン、ポリスルホン、アクリロニトリルブタジエンスチレン、ポリアクリロニトリル、ポリブタジエン、ポリブチレンテレフタレート、ポリエーテルスルホン、ポリエーテルエーテルケトン、ポリエチレングリコール、スチレン-アクリロニトリル樹脂、ポリトリメチレンテレフタレート、ポリビニルブチラール、ポリ二フッ化ビニリデン、ポリビニルピロリドン、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される材料から作られているかまたは該材料でコートされている。本発明の局面において、ペプチドを他の分子とコンジュゲートさせるための当技術分野において周知の方法によって、本明細書において記載される組換えオプソニンを、固体基質とコンジュゲートさせることができる。例えば、HermansonBIOCONJUGATETECHNIQUESおよびNiemeyrBioconjugationProtocolsStrategiesMethodsinMETHODSINMOLECULARBIOLOGYには、ペプチドを他の分子にコンジュゲートさせるための多数の方法および技術が提供されている。deGraafetal20BiocojugateChem1281には、コンジュゲートのためのペプチド内への非天然アミノ酸の部位特異的導入についての概説が提供されている。あるいは、固体基質の表面を、組換えオプソニンと選択的に結合する結合分子を含むように官能化することができる。これらの結合分子は、本明細書においてアフィニティー分子とも称される。結合分子は、固体基質の表面上で共有結合または非共有結合することができる。本明細書において使用するとき、結合分子またはアフィニティー分子という用語は、本明細書において記載される組換えオプソニンに特異的に結合することができる任意の分子を表す。アフィニティー分子の代表例には、抗体、抗原、レクチン、タンパク質、ペプチド、核酸DNA、RNA、PNA、およびそれらの混合物である核酸またはヌクレオチド誘導体もしくは類似体を含む核酸;インシュリン受容体等の受容体分子;受容体に対するリガンド例えば、インシュリン受容体に対するインシュリン;ならびにビオチンおよびアビジン等の別の分子に対するアフィニティーを有する生物学的、化学的、または他の分子が含まれるが、これらに限定されない。結合分子は、天然に存在する分子全体を含む必要はないが、例えば抗体のFabフラグメントのように、天然に存在するまたは天然に存在しない分子の一部分、フラグメント、またはサブユニットのみからなってもよい。結合分子は、検出することができるマーカーをさらに含んでいてよい。結合分子を、当業者に公知の様々な方法のいずれかを用いることによって、固体基質の表面にコンジュゲートさせることができる。結合分子を、固体基質の表面に共有結合または非共有結合でカップリングまたはコンジュゲートさせることができる。共有結合による固定化は、例えばシランカップリングを介して達成され得る。例えば、Weetall15AdvMolCellBio161Weetall44MethsEnzymol134を参照されたい。結合分子と表面との間の共有結合による連結は、リンカーによっても仲介され得る。アフィニティー分子と表面との間の非共有結合による連結は、イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、双極子-双極子相互作用、水素結合、静電相互作用、および/または形状認識相互作用に基づくものであり得る。本明細書において使用するとき、リンカーという用語は、組成物の2つの部分を結び付ける分子構成成分を意味する。ペプチドリンカーは、既定の融合タンパク質の折り畳みに影響を及ぼす場合があり、かつ他のタンパク質と反応/結合する場合もあり、これらの特性について公知の技術によってスクリーニングすることができる。本明細書において記載されるものに加えて、例示的なリンカーには、例えばHis6などの連続したヒスチジン残基;AlaProペアの数を変化させてリンカーの柔軟性を調節する、AlaおよびProから構成される配列;ならびに、例えばGluおよびLysを混合させた、荷電アミノ酸残基から構成される配列が含まれる。リンカー内の残基の種類および数によって、柔軟性を制御することができる。例えば、Perham30Biochem8501Wriggersetal80Biopolymers736を参照されたい。化学的リンカーは、直接結合、または酸素もしくは硫黄等の原子、NH、C、CNH、SO、S02、S02NH等のユニット、または1個もしくは複数のメチレンがO、S、S、S02、NH、もしくはCによって中断もしくは終結してよい、置換されているもしくは置換されていないC1C6アルキル、置換されているもしくは置換されていないC2C6アルケニル、置換されているもしくは置換されていないC2C6アルキニル、置換されているもしくは置換されていないC6C12アリール、置換されているもしくは置換されていないC5C12ヘテロアリール、置換されているもしくは置換されていないC5C12ヘテロシクリル、置換されているもしくは置換されていないC3C12シクロアルキル等の原子の鎖を含んでいてよい。核酸ベースの結合分子には、アプタマーが含まれる。本明細書において使用するとき、アプタマーという用語は、ワトソン-クリック塩基対合または三重鎖形成以外のメカニズムによって、選択された非オリゴヌクレオチド分子または分子の群を特異的に認識することができる一本鎖、部分的に一本鎖、部分的に二本鎖、または二本鎖のヌクレオチド配列を意味する。アプタマーには、規定された配列セグメント、ならびにヌクレオチドと、リボヌクレオチドと、デオキシリボヌクレオチドと、ヌクレオチド類似体と、修飾されたヌクレオチドと、骨格修飾、分岐点、および非ヌクレオチドの残基、基、またはブリッジを含むヌクレオチドとを含む配列が含まれてよいが、これらに限定されるわけではない。分子に結合させるためのアプタマーを選択するための方法は、当技術分野において広く公知であり、当業者にとって容易に利用可能である。組換えオプソニンを、アフィニティー結合ペアによって固体基質の表面とコンジュゲートさせることができる。アフィニティー結合ペアまたは結合ペアという用語は、互いに特異的に結合する第一および第二の分子を表す。結合ペアの一方のメンバーを固体基質とコンジュゲートさせ、一方で第二のメンバーを組換えオプソニンとコンジュゲートさせる。本明細書において使用するとき、特異的結合という用語は、他の分子に対するものより高いアフィニティーおよび特異性を有する、結合ペアの第一のメンバーと結合ペアの第二のメンバーとの結合を表す。例示的な結合ペアには、対応する抗体と組み合わせた任意のハプテン性もしくは抗原性の化合物、またはそれらの結合部分もしくはフラグメント例えば、ジゴキシゲニンと抗ジゴキシゲニン;マウス免疫グロブリンとヤギ抗マウス免疫グロブリン;ならびに非免疫学的結合ペア例えば、ビオチン-アビジン、ビオチン-ストレプトアビジン、ホルモン例えば、サイロキシンおよびコルチゾールホルモン結合タンパク質、受容体-受容体アゴニスト、受容体-受容体アンタゴニスト例えば、アセチルコリン受容体-アセチルコリンもしくはそのアナログ、IgG-プロテインA、レクチン-糖鎖、酵素-酵素補因子、酵素-酵素阻害剤、および核酸二重鎖を形成することができる相補的オリゴヌクレオチドペアなどが含まれる。結合ペアには、負に帯電している第一の分子および正に帯電している第二の分子も含まれてよい。結合ペアによるコンジュゲートを用いる一例は、ビオチンサンドイッチ法である。例えば、Davisetal103PNAS8155を参照されたい。一緒にコンジュゲートさせるべき2つの分子をビオチン化し、その後リンカーとして四価のストレプトアビジンを用いることによって一緒にコンジュゲートさせる。ビオチン化に対するアクセプターペプチドAPと称される;Chenetal2NatMethods99の15アミノ酸配列に、ペプチドをカップリングさせることができる。アクセプターペプチド配列は、大腸菌酵素のビオチンリガーゼBirA;Idによる部位特異的なビオチン化を可能にする。固体基質とのコンジュゲートのために、組換えオプソニンを同様にビオチン化することができる。タンパク質をビオチン化するために、多くの商業的キットも利用可能である。固体表面へのコンジュゲートのための別の例は、PLPを介したバイオコンジュゲーションを用いることであろう。例えば、Witusetal132JACS16812を参照されたい。この例では、FcのN末上のAKT配列により、固体表面へのコンジュゲート、および固体表面から離れたところを指し示す最適な方向にあるレクチン結合ドメインの方向付けが可能となる。糖に対する1個のレクチンドメインのアフィニティーは低く、通常、結合は親和性および多価性によって推進されることに留意すべきである。本発明のデバイスの場合、多量体化ドメインをタンパク質から欠失させ、かつ高密度での固体基質例えば、ビーズへの接着によって、タンパク質の多価性を効果的に作り出すものであって、最適な機能性を提供するためにその密度を変化させることができる。さらにMBLに関して、その結合の特徴を、結合特異性の変更に対する指向進化によって操作することができる。MBLを、それがより限定されたセットの糖または他の分子属性molecularfeatureに結合するように修飾してよく、その結果、修飾されたMBLはより限定されたセットの微生物に結合して、病原体クラスの同定例えば、ウイルス、細菌、真菌、もしくは原生動物のもの、サブクラスの分類例えば、グラム陰性菌もしくはグラム陽性菌、または特定種の判定のための能力を提供すると考えられる。当技術分野において数々のストラテジーが利用可能である。例えば、直進的指向進化のストラテジーは、糖と複合したMBLの原子構造を視覚的に調べ、その後、特有の接触が失われるかまたは特定の種類の立体障害が創出されるように、糖特異的様式で接触する適切なアミノ酸を変異させる。高マンノース型オリゴ糖と、およびNアセチルグルコサミン、メチル化フコースなどと複合した状態のラットMBLの三次元構造が解かれている。His189ValおよびIle207Valは、修飾によって特異性が変更される置換の例である。指向進化の別のストラテジーでは、タンパク質をランダム変異導入に供し、結果として生じたタンパク質を所望の品質についてスクリーニングする。これは、ファージディスプレイ抗体のアフィニティー成熟のための特に有用な技術であって、抗体の相補性決定領域CDRを飽和変異誘発によって変異させ、6つのCDRの成功したバリアントを一緒に混ぜ合わせて、最高アフィニティーの抗体を形成する。酵母、グラム陽性菌、グラム陰性菌、コアグラーゼ陰性菌、好気性細菌などへの特異的結合性を有するMBLバリアントを選択するために、指向進化パラダイムをMBLに適用することができる。しかしながら、これを機能させるために、標的の糖のパターンおよび性質、またはこれらの標的生物上の関係する表面属性は、クラスまたは種の間で異なる必要がある場合がある。MBLは、真菌、グラム陽性菌、およびグラム陰性菌上のマンノースおよびNアセチルグルコサミンの糖に強く結合することが知られている。例えば、MBLは、カンジダ属Candidaspp、アスペルギルスフミガーツスAspergillusfumigatus、黄色ブドウ球菌、およびβ溶血性A群連鎖球菌streptococciに強く結合する。MBLは、大腸菌、クレブシエラ属、およびヘモフィルスインフルエンザ菌Haemophilusinfluenzaeb型に中間のアフィニティーを有する。MBLは、β溶血性B群連鎖球菌、肺炎連鎖球菌Streptococcuspneumoniae、および表皮ブドウ球菌Staphylococcusepidermidisに弱く結合する。Nethetal68InfectImmun688。血清型B髄膜炎菌Neisseriameningitides、ヘモフィルスインフルエンザ菌b型、およびクリプトコッカスネオフォルマンスCryptococcusneoformansの莢膜多糖は、細菌内毒素がするように、MBL結合を低下させると考えられる。IdVanEmmeriketal97ClinExpImmunol411Schelenzetal63InfectImmun3360。他の研究では、補体のMBLレクチン経路は酵母のオプソニン化貪食作用に重要であったが、古典的な補体経路は細菌のオプソニン化貪食作用に重要であったという、MBLは、MBL結合にもかかわらず、細菌ではなく酵母のオプソニン化貪食作用を容易にすることが報告されている。Brouweretal180JImmunol4124。MBLが試験した細菌種に結合したことは報告されず、しかしながら、MBL結合が補体の活性化およびオプソニン化貪食作用を有意には促進しなかったことのみ報告された。特定の特異性を有するMBLの誘導体を、標準的なファージディスプレイのストラテジーである以下の手法によって単離することができる:まず、ファージミドベクターからMBLバリアントのセットを発現させ、その後、このライブラリーを対象となる標的例えば、大腸菌に結合させ、1または2ラウンドの選択を実施する;その後、関係する標的例えば、カンジダに対するネガティブ選択のラウンドを実施し、結合しないファージミドを選ぶ。その後、標的に概して結合しかつ標的でないものに結合しないファージ集団が出るまで、これらのポジティブおよびネガティブ選択のサイクルを繰り返す。この方法を、既定の抗生物質に対して耐性がある細菌および感受性がある細菌等、示差的結合が望まれる任意の微生物株のペアに適用することができる。このポジティブ/ネガティブ濃縮ストラテジーを、そのような特異的に結合するものを単離するためのさらに標準的な手段である抗体-ファージディスプレイライブラリーとともに用いてもよい。MBLは、C型カルシウム依存性レクチンスーパーファミリー中のコレクチンのクラスに属し、サーファクタントタンパク質A、サーファクタントタンパク質D、CLL1、およびCLP1等、その他のメンバーは本発明において有用であり得る。他の可能性のあるオプソニンには、フィコリンThieletal1997が含まれ、これも補体のレクチン経路を活性化し、かつMASPタンパク質に結合する。これらのタンパク質はMBLに関係するが、異なるより限定された特異性を有する。本明細書において記載される診断用デバイスとの関連において、一つの選択肢は、上記のMBLのレクチンドメインに相当するフィコリンのレクチンドメインを単純に用いることである。別の手法は、MBLと1種または複数種のフィコリンとの間のセグメントまたは個々のアミノ酸のシャフリングを用いて、ハイブリッド特異性を有し得るハイブリッド分子を創出することである。上記の指向進化および選択手法を潜在的に用いて、上記のクラス、サブクラス、および種特異性を提供するヒト抗体フラグメントまたはペプチドを生成することもできるであろう。本発明は、以下の番号付けされた項目のいずれかにおいて規定され得る。1.オプソニンの糖鎖認識ドメイン;基質結合ドメイン;および該認識ドメインを基質結合ドメインに連結させるペプチドドメインを含む、組換えオプソニン。2.前記糖鎖認識ドメインがコレクチンもしくはフィコリンficollinである、またはコレクチンもしくはフィコリンに由来する、項目1記載の組換えオプソニン。3.前記糖鎖認識ドメインがレクチン、またはレクチンの一部分もしくはフラグメントである、項目1記載の組換えオプソニン。4.前記レクチンがマンノース結合レクチンMBLである、項目3記載の組換えオプソニン。5.レクチンがMBLのアミノ酸残基81プロリン~228イソロイシンSEQIDNO2からなる、項目4記載の組換えオプソニン。6.前記基質結合ドメインが、固体基質への化学的架橋を可能にする少なくとも1つのシステイン残基を含む、前記項目のいずれか一項記載の組換えオプソニン。7.フレキシブルペプチドがグリシンセリンセグメントまたはプロリンアラニンセリンセグメントを含む、前記項目のいずれか一項記載の組換えオプソニン。8.フレキシブルペプチドが免疫グロブリンのFcの部分を含む、前記項目のいずれか一項記載の組換えオプソニン。9.Fc部分がIgGFcドメインのCH2CH3境界面を含む、項目8記載の組換えオプソニン。10.前記基質が磁性マイクロビーズ、常磁性マイクロビーズ、微多孔膜、中空糸リアクター、または他の任意の流体濾過膜もしくはフローデバイスである、前記項目のいずれか一項記載の組換えオプソニン。11.前記基質が生物学的組織または器官の生きた細胞または細胞外マトリックスである、前記項目のいずれか一項記載の組換えオプソニン。12.前記基質が食細胞である、項目11記載の組換えオプソニン。13.固体表面にコンジュゲートさせた組換えオプソニンと流体を接触させる工程であって、組換えオプソニンが、オプソニンの糖鎖認識ドメイン、固体基質結合ドメイン、および該認識ドメインを固体表面結合ドメインに連結させるフレキシブルペプチドドメインからなる、工程;オプソニン結合微生物を該組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートに結合させる工程;ならびに該微生物が結合した組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートから該流体を分離する工程を含む、流体からオプソニン結合微生物を回収する方法。14.固体表面が磁性粒子であり、かつオプソニン結合微生物が組換えオプソニン-固体表面コンジュゲートに結合した後に流体に磁力をかけることによって分離が達成される、項目13記載の方法。15.微生物を同定する工程をさらに含む、項目13記載の方法。16.流体が生物学的流体である、項目13記載の方法。17.生物学的流体が、血液、脳脊髄液、滑液、尿、精液、唾液、涙液、および注射針、生検、または吸引の手順によって回収される流体からなる群より選択される、項目16記載の方法。18.生物学的流体が血液である、項目17記載の方法。19.血液をその供給源に戻す工程をさらに含む、項目18記載の方法。20.供給源が対象である、項目19記載の方法。21.対象が感染症または敗血症に罹患している、項目20記載の方法。22.流体が水または食物サンプルに由来する、項目13記載の方法。23.病原体の同定における、項目1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。24.疾患の診断における、項目1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。25.水または食物のコンタミネーションの同定における、項目1~10のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。26.疾患の治療における、項目1~12のいずれか一項記載の組換えオプソニンの使用。27.追加の治療または療法とさらに組み合わせた、項目26記載の組換えオプソニンの使用。28.対象の血液に組換えオプソニンを投与する工程であって、組換えオプソニンが、オプソニンの糖鎖認識ドメイン、基質結合ドメイン、および該認識ドメインを基質結合ドメインに連結させるフレキシブルペプチドドメインからなり、糖鎖認識ドメインがオプソニン結合微生物に結合し、かつ基質結合ドメインが免疫系の細胞、組織、または器官に結合する、工程;組換えオプソニンをオプソニン結合微生物に結合させる工程;ならびに微生物が結合した組換えオプソニンを、微生物を殺傷する免疫系の細胞、組織、または器官に結合させる工程を含む、対象における血液感染症を治療する方法。29.対象が動物である、項目28記載の方法。30.対象がヒトである、項目28記載の方法。実施例1.FcMBL81の構築および発現診断および治療上の応用のための包括的オプソニンとして有用な改変した形態のMBLの態様を、MBLのネックおよびレクチンドメインを用いて構築した。プロリン81構造バイオインフォマティクス研究共同体、タンパク質データバンクの構造ファイル1HUPにおいて定義されているを、レクチン配列を開始するN末端のポイントとして選択した。レクチン分子のこの部分を、ヒトγ1のFc部分Fcγの下流C末端に融合させた。改変オプソニン構築物の略図を図3に示す。クローンのFc部分の図式を図4に示す。この構築物のアミノ酸には、以下の残基が含まれる:Fcタンパク質配列:MBL81タンパク質配列これには、ヒトMBLのコイルドコイルのネック領域および糖鎖認識ドメインCRDが含まれる:FcMBL81配列:したがって、FcMBL81構築物は、Fcγの部分を融合した、MBLのアミノ酸残基81プロリン~228イソロイシンを有するレクチンからなる。使用の際、Fc部分は二量体化し、MBLレクチンによる単量体の糖への結合の弱いアフィニティーに親和性を加える。FcMBL81を診断用試薬としての使用のために設計する場合、297におけるアミノ酸をアスパラギンからアスパラギン酸N297Dに、またはFc構築物におけるアミノ酸82を変えることによって、N結合型グリコシル化を取り除くことができる。グリコシル化されたFcは、Fcを介したADCCおよびCDCの正しい方向性を維持する。さらに、化学的コンジュゲートを介した固体基質への結合を可能にするために、改変オプソニン上へシステイン残基をクローニングすることができる。FcMBL等の改変オプソニンの構築および発現は、当技術分野において公知の様々な技術によって成し遂げられ得、例えば米国特許第5541087号を参照されたい。一過性にトランスフェクションした細胞内での構築物の発現は、図8Aおよび8Bにおいて実証されている。FcMBL81は、約35mgL発現した。実施例2.酵母に結合することにおける、FcMBL81構築物と全長MBLとの比較およそ550万個のカンジダアルビカンス酵母細胞に、野生型、全長MBL三量体の六量体、またはFcMBL81のいずれかをコートした種々の数のMBLビーズを接種した。図9に図で表現されているように、1800万個の野生型、全長MBL、またはFcMBL81のビーズは、550万個のすべての真菌細胞に結合した。この実施例は、C.アルビカンスへの結合において、FcMBL81のビーズが、野生型、全長MBLのビーズと同程度に活性があることを実証している。