"本明細書中に記載の発明。本発明の組成物および方法は、可溶性形態で天然に存在するポリペプチドを検出するために、メソセリン/MPFおよび/またはメソセリン/MPF関連抗原に特異的な抗体を使用して、悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供することによって、先行技術のこれらの制限を克服し、そして他の関連する利点を提供する。発明の要旨本発明は、被験体における悪性状態の存在のスクリーニングにおいて有用な組成物および方法に関する。特に、本発明は、可溶性メソセリンポリペプチド、またはメソセリンポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体と反応性の抗原決定基を有し、可溶性形態で天然に存在する分子が、被験体からの生物学的サンプル中で検出され得るという、予想外の知見に関する。被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供することが、本発明の1つの局面であって、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、この少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基へのこの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在しかつこの抗原決定基を有する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。いくつかの実施形態において、この生物学的サンプルは血液、血清、漿液serosalfluid、血漿、リンパ、尿、脳脊髄液、唾液、粘膜分泌物、膣分泌物、腹水ascitesfluid、胸膜液、囲心腔液pericardialfluid、腹膜液peritonealfluid、腹部液abdominalfluid、培養培地、馴化培養培地または洗浄液である。他の特定の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドは、配列番号1もしくは配列番号2に記載のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントもしくは誘導体を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチド改変体は、スプライス改変体である。本発明の特定の実施形態において、この抗体はポリクローナル抗体を含み、そして他の実施形態において、抗体はアフィニティー精製された抗体を含む。特定の好ましい実施形態において、抗体はモノクローナル抗体を含む。別の実施形態において、抗体は組換え抗体を含み、そして別の実施形態において、抗体はキメラ抗体を含む。別の実施形態において、抗体はヒト化抗体を含む。別の実施形態において、抗体は単鎖抗体を含む。本発明のいくつかの実施形態において、抗体の抗原決定基への結合の検出は、放射性核種の検出を含む。他の実施形態において、抗体の抗原決定基への結合の検出は、発蛍光団の検出を含む。別の実施形態において、抗体の抗原決定基への結合の検出は、アビジン分子とビオチン分子との間の結合事象の検出を含み、そして別の実施形態において、抗体の抗原決定基への結合の検出は、ストレプトアビジン分子とビオチン分子との間の結合事象の検出を含む。特定の実施形態において、抗体の抗原決定基への結合の検出は、酵素反応産物の分光光度的検出を含む。本発明のいくつかの実施形態において、少なくとも1つの抗体は検出可能に標識され、一方、他の特定の実施形態においては、少なくとも1つの抗体は、検出可能に標識されず、そして抗体の抗原決定基への結合の検出は間接的である。本発明の特定の実施形態に従って、悪性状態は、腺癌、中皮腫、卵巣癌、膵臓癌または非小細胞肺癌であり得る。本発明の別の局面は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供することであって、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルと少なくとも1つの抗体とを、この少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基へのこの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつこの抗原決定基を有する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この抗体の抗原結合部位がOV569、MAbK-1、4H3、3G3または1A6であるモノクローナル抗体の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。本発明の別の局面は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルと少なくとも1つの抗体とを、この抗体と反応性である抗原決定基へのこの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつこの抗原決定基を有する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この抗体の抗原結合部位がモノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。本発明のさらに別の局面は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、この抗体と反応性である抗原決定基へのこの少なくとも1つの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつこの抗原決定基を有する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この少なくとも1つの抗体は、メソセリン関連抗原に免疫特異的に結合する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。特定の実施形態において、メソセリン関連抗原はまた、モノクローナル抗体MAbK-1と免疫特異的に反応性である。別の局面について、本発明は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、この少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基へのこの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつこの抗原決定基を有する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この抗体の抗原結合部位がOV569、MAbK-1、4H3、3G3または1A6であるモノクローナル抗体の免疫特異的結合を競合的に阻害する工程であって、この少なくとも1つの抗体は、メソセリン関連抗原に免疫特異的に結合する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。特定の実施形態において、メソセリン関連抗原はまた、モノクローナル抗体MAbK-1に免疫特異的に反応性である。別の局面について、本発明は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、この固定された少なくとも1つの第1抗体をこのメソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程;この固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、このサンプル中の成分を除去する工程;およびこの免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、このメソセリン関連抗原ポリペプチドへのこの少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、この少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、この固定された少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。さらに別の局面において、本発明は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、この固定された少なくとも1つの第1抗体をこのメソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程;この固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、このサンプル中の成分を除去する工程;およびこの免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、このメソセリン関連抗原ポリペプチドへのこの少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、この少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。別の局面において、本発明は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、この固定された少なくとも1つの第1抗体をこのメソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、この生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、この少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体MAbK-1の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程;この固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、このサンプル中の成分を除去する工程;およびこの免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、このメソセリン関連抗原ポリペプチドへのこの少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、この少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体MAbK-1の免疫特異的結合を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。特定の実施形態において、本発明の方法は、悪性状態の少なくとも1つの可溶性マーカーの、サンプル中における存在を決定する工程ここで、このマーカーは、癌胎児抗原、CA125、シアリルTN、扁平上皮癌抗原、組織ペプチド抗原または胎盤アルカリホスファターゼであるをさらに包含する。本発明のさらなる別の局面は、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供することであって、この方法は、i悪性状態を有すると疑われる第1被験体由来の第1生物学的サンプル、およびii悪性状態を有さないことが既知の第2被験体由来の第2生物学的サンプルの各々とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、この少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基へのこの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、このサンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつこの抗原決定基を有する分子の、この第1生物学的サンプルおよびこの第2生物学的サンプルの各々における存在を決定する工程、ならびにこの第2生物学的サンプル中のこの抗原決定基へのこの抗体の検出可能な結合のレベルに対して、この第1生物学的サンプル中のこの抗原決定基へのこの抗体の検出可能な結合のレベルを比較する工程、ならびにそれから悪性状態の存在を検出する工程を包含する。別の局面において、本発明は、メソセリン関連抗原ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体の存在を、被験体からの生物学的サンプル中で検出する工程を包含する、被験体の悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供する。特定の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドは、配列番号1または配列番号2あるいは配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態について、本発明は、モノクローナル抗体MAbK-1の、メソセリンポリペプチドへの免疫特異的結合を競合的に阻害せず、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチド配列番号1または配列番号2あるいは配列番号13に記載のアミノ酸配列を含むに特異的結合するモノクローナル免疫グロブリン可変領域を含む、ヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な抗体を提供する。特定の実施形態において、抗体は融合タンパク質であり、他の特定の実施形態において、抗体は単鎖抗体である。他の特定の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドは、グリコシル化メソセリンポリペプチドをさらに含む。別の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドは、約42~45キロダルトンの見かけ上の分子量を有する。特定の実施形態において、抗体は、モノクローナル抗体OV569、4H3、3G3または1A6である。さらに別の局面において、本発明は、サンプル中に可溶性形態で天然に存在する抗体のメソセリン関連抗原ポリペプチドへの結合を検出するのに十分な条件および時間で、検出可能に標識されたメソセリン関連抗原ポリペプチドを、被験体からの生物学的サンプルに接触させる工程、ならびに、それから悪性状態の存在を検出する工程を包含する、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法を提供する。別の局面について、本発明は、メソセリン関連抗原ポリペプチドこのポリペプチドは、配列番号1または配列番号2または配列番号13に記載のアミノ酸配列を含むをコードする核酸分子、あるいは中程度にストリンジェントな条件下でメソセリン関連抗原をコードするこのような核酸分子にハイブリダイズし得、メソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸分子である、単離された核酸分子を提供し、ここで、この単離された核酸分子は、配列番号15に記載のヌクレオチド配列、配列番号16に記載のヌクレオチド配列、配列番号17に記載のヌクレオチド配列、または配列番号18に記載のヌクレオチド配列からなる核酸分子ではない。特定の実施形態において、本発明は、メソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸分子に相補的な、少なくとも15個の連続したヌクレオチドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。他の実施形態において、本発明は、メソセリン関連抗原ポリペプチドに融合したポリペプチド配列を含む、融合タンパク質を提供する。さらなる特定の実施形態において、ポリペプチドは、酵素またはその改変体もしくはフラグメントである。さらなる特定の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに融合したポリペプチド配列は、プロテアーゼによって切断可能である。別の実施形態において、このポリペプチド配列は、リガンドに対して親和性を有するアフィニティータグポリペプチドである。別の実施形態において、本発明は、上記のようなメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸分子に作動可能に連結された、少なくとも1つのプロモーターを含む組換え発現構築物を提供する。特定の実施形態において、このプロモーターは、調節プロモーターregulatedpromoterであり、そして特定の他の実施形態において、このメソセリン関連抗原ポリペプチドは、第2核酸配列のポリペプチド産物と融合タンパク質として発現される。さらなる実施形態において、第2核酸配列のポリペプチド産物は、酵素である。別の実施形態において、この発現構築物は、組換えウイルス性発現構築物である。他の実施形態に従って、本発明は、本明細書中に提供されるような組換え発現構築物を含む宿主細胞を提供する。1つの実施形態において、この宿主細胞は、原核生物細胞であり、そして別の実施形態において、この宿主細胞は、真核生物細胞である。別の局面において、本発明は、組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドを生成する方法を提供し、この方法は、本明細書中に提供されるようなメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸分子に作動可能に連結された、少なくとも1つのプロモーターを含む組換え発現構築物を含む宿主細胞を培養することによる。特定の実施形態において、このプロモーターは、調節プロモーターである。別の実施形態において、本発明は、組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドを生成する方法を提供し、この方法は、組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドの発現のために本明細書中に提供されたような、組換えウイルス性発現構築物で感染された宿主細胞を培養することによる。別の実施形態において本発明はまた、サンプル中のメソセリン関連抗原の発現を検出する方法を提供し、この方法は、上記のようなアンチセンスオリゴヌクレオチドを、配列番号13に示されるアミノ酸配列を有するメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸配列、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むサンプルと接触させる工程;および、サンプル中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズする、メソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の量を検出し、そしてこれからサンプル中のメソセリン関連抗原の発現を検出する工程による。別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズする、メソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の量は、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて測定される。別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズするメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の量は、ハイブリダイゼーションアッセイを用いて測定される。別の実施形態において、このサンプルは、RNA調製物またはcDNA調製物を含む。本発明はまた、以下の項目を提供する。項目1被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、該少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基への該抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在しかつ該抗原決定基を有する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目2前記生物学的サンプルが、血液、血清、漿液、血漿、リンパ、尿、脳脊髄液、唾液、粘膜分泌物、膣分泌物、腹水、胸膜液、囲心腔液、腹膜液、腹部液、培養培地、馴化培養培地、および洗浄液からなる群から選択される、項目1に記載の方法。項目3前記生物学的サンプルが血清である、項目1に記載の方法。項目4前記生物学的サンプルが血漿である、項目1に記載の方法。項目5前記生物学的サンプルが腹水である、項目1に記載の方法。項目6前記生物学的サンプルが膣分泌物である、項目1に記載の方法。項目7前記生物学的サンプルが胸膜液である、項目1に記載の方法。項目8前記メソセリン関連抗原が、配列番号1に示される配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは誘導体を含む、項目1に記載の方法。項目9前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、スプライス改変体である、項目8に記載の方法。項目10前記メソセリン関連抗原が、配列番号2に示される配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは誘導体を含む、項目1に記載の方法。項目11前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、スプライス改変体である、項目10に記載の方法。項目12前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、メソセリン関連抗原改変体またはそのフラグメントもしくは誘導体である、項目1に記載の方法。項目13前記抗体がポリクローナル抗体を含む、項目1に記載の方法。項目14前記抗体がアフィニティー精製された抗体を含む、項目1に記載の方法。項目15前記抗体がモノクローナル抗体を含む、項目1に記載の方法。項目16前記抗体が組換え抗体を含む、項目1に記載の方法。項目17前記抗体がキメラ抗体を含む、項目1に記載の方法。項目18前記抗体がヒト化抗体を含む、項目1に記載の方法。項目19前記抗体が単鎖抗体を含む、項目1に記載の方法。項目20抗原決定基への前記抗体の結合の検出が、放射性核種の検出を包含する、項目1に記載の方法。項目21抗原決定基への前記抗体の結合の検出が、発蛍光団の検出を包含する、項目1に記載の方法。項目22抗原決定基への前記抗体の結合の検出が、アビジン分子とビオチン分子との間の結合事象の検出を包含する、項目1に記載の方法。項目23抗原決定基への前記抗体の結合の検出が、ストレプトアビジン分子とビオチン分子との間の結合事象の検出を包含する、項目1に記載の方法。項目24抗原決定基への前記抗体の結合の検出が、酵素反応の産物の分光光度的検出を包含する、項目1に記載の方法。項目25前記少なくとも1つの抗体が検出可能に標識されている、項目1に記載の方法。項目26前記少なくとも1つの抗体は検出可能に標識されておらず、そしてここで抗原決定基への該抗体の結合の検出は間接的である、項目1に記載の方法。項目27前記悪性状態が、腺癌、中皮腫、卵巣癌、膵臓癌、および非小細胞肺癌からなる群から選択される、項目1に記載の方法。項目28被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルと少なくとも1つの抗体とを、該少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基への該抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつ該抗原決定基を有する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、該抗体の抗原結合部位がOV569、MAbK-1、4H3、3G3および1A6からなる群から選択されるモノクローナル抗体の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目29被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルと少なくとも1つの抗体とを、該抗体と反応性である抗原決定基への該抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつ該抗原決定基を有する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、該抗体の抗原結合部位がモノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目30被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、該抗体と反応性である抗原決定基への該少なくとも1つの抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつ該抗原決定基を有する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、ここで、該少なくとも1つの抗体は、メソセリン関連抗原に免疫特異的に結合する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目31前記メソセリン関連抗原がまた、モノクローナル抗体MAbK-1と免疫特異的に反応性である、項目30に記載の方法。項目32被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、該少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基への該抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつ該抗原決定基を有する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、該抗体の抗原結合部位がOV569、MAbK-1、4H3、3G3および1A6からなる群から選択されるモノクローナル抗体の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程であってここで、該少なくとも1つの抗体は、メソセリン関連抗原に免疫特異的に結合する、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目33前記メソセリン関連抗原がまた、モノクローナル抗体MAbK-1と免疫特異的に反応性である、項目32に記載の方法。項目34被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、該固定された少なくとも1つの第1抗体を該メソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程;該固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、該サンプル中の成分を除去する工程;および該免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、該メソセリン関連抗原ポリペプチドへの該少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、ここで該少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、該固定された少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目35被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、該固定された少なくとも1つの第1抗体を該メソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、ここで該少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程、該固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、該サンプル中の成分を除去する工程;および該免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、該メソセリン関連抗原ポリペプチドへの該少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、ここで該少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体OV569の免疫特異的結合を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目36被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルとメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な固定された少なくとも1つの第1抗体とを、該固定された少なくとも1つの第1抗体を該メソセリン関連抗原ポリペプチドへと特異的に結合させるに十分な条件および時間の下で接触させ、それにより免疫複合体を形成して、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在する分子の、該生物学的サンプル中における存在を決定する工程であって、ここで該少なくとも1つの第1抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体MAbK-1の免疫特異的結合を競合的に阻害する、工程、該固定された少なくとも1つの第1抗体に特異的に結合しない、該サンプル中の成分を除去する工程;および該免疫複合体とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの第2抗体とを、該メソセリン関連抗原ポリペプチドへの該少なくとも1つの第2抗体の特異的結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程であって、ここで該少なくとも1つの第2抗体の抗原結合部位は、モノクローナル抗体MAbK-1の免疫特異的結合を競合的に阻害しない、工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目37項目1~36のいずれか一項に記載の方法であって、癌胎児抗原、CA125、シアリルTN、扁平上皮癌抗原、組織ポリペプチド抗原、および胎盤アルカリホスファターゼからなる群から選択される悪性状態の少なくとも1つの可溶性マーカーの、前記サンプル中における存在を決定する工程をさらに包含する、方法。項目38被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:i悪性状態を有すると疑われる第1被験体由来の第1生物学的サンプル、およびii悪性状態を有さないことが既知の第2被験体由来の第2生物学的サンプルの各々とメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体とを、該少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基への該抗体の結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させて、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在し、かつ該抗原決定基を有する分子の、該第1生物学的サンプルおよび該第2生物学的サンプルの各々における存在を決定する工程、ならびに該第2生物学的サンプル中の該抗原決定基への該抗体の検出可能な結合のレベルに対して、該第1生物学的サンプル中の該抗原決定基への該抗体の検出可能な結合のレベルを比較する工程、ならびにそれから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目39被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:メソセリン関連抗原ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体の存在を該被験体由来の生物学的サンプル中において検出する工程、を包含する、方法。項目40項目39に記載の方法であって、前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、配列番号1、配列番号2、および配列番号13からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む、方法。項目41メソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な抗体であって、以下:メソセリンポリペプチドへのモノクローナル抗体MAbK-1の免疫特異的結合を競合的に阻害せず、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル免疫グロブリン可変領域であって、ここで該メソセリン関連抗原ポリペプチドが、配列番号1、配列番号2、および配列番号13からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む、モノクローナル免疫グロブリン可変領域、を含む、抗体。項目42融合タンパク質である、項目41に記載の抗体。項目43単鎖抗体である、項目41に記載の抗体。項目44前記メソセリン関連抗原ポリペプチドがグリコシル化されている、項目41に記載の抗体。項目45前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、約42~45キロダルトンの見かけ上の分子量を有する、項目41に記載の抗体。項目46モノクローナル抗体OV569、4H3、3G3、および1A6からなる群から選択される、項目41に記載の抗体。項目47被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法であって、以下:被験体由来の生物学的サンプルと検出可能に標識されたメソセリン関連抗原ポリペプチドとを、該サンプル中において可溶性形態で天然に存在する抗体の該メソセリン関連抗原ポリペプチドへの結合を検出するに十分な条件および時間の下で接触させる工程、および、それから悪性状態の存在を検出する工程、を包含する、方法。項目48単離された核酸分子であって、該核酸分子は、以下:aメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸分子であって、該ポリペプチドは、配列番号1に示されるアミノ酸配列、配列番号2に示されるアミノ酸配列、および配列番号13に示されるアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、核酸分子;ならびにb中程度にストリンジェントな条件下でaの核酸分子に対してハイブリダイズし得、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードし得る核酸分子からなる群から選択され、ここで、該単離された核酸分子は、配列番号15に示されるヌクレオチド配列、配列番号16に示されるヌクレオチド配列、配列番号17に示されるヌクレオチド配列、および配列番号18に示されるヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列からなる核酸分子ではない、単離された核酸分子。項目49項目48に記載の核酸分子に対して相補的な、少なくとも15個連続したヌクレオチドを含む、アンチセンスオリゴヌクレオチド。項目50メソセリン関連抗原ポリペプチドに融合したポリペプチド配列を含む、融合タンパク質。項目51前記ポリペプチドが、酵素またはその改変体もしくはフラグメントである、項目50に記載の融合タンパク質。項目52前記メソセリン関連抗原ポリペプチドに融合したポリペプチド配列が、プロテアーゼによって切断可能である、項目51に記載の融合タンパク質。項目53前記ポリペプチド配列が、リガンドに対する親和性を有するアフィニティータグポリペプチドである、項目50に記載の融合タンパク質。項目54項目48に記載の核酸に作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含む、組換え発現構築物。項目55前記プロモーターが調節プロモーターである、項目54に記載の発現構築物。項目56前記メソセリン関連抗原ポリペプチドが、第2核酸配列のポリペプチド産物を有する融合タンパク質として発現される、項目54に記載の発現構築物。項目57前記第2核酸配列のポリペプチド産物が酵素である、項目56に記載の発現構築物。項目58前記発現構築物が組換えウイルス性発現構築物である、項目54に記載の組換え発現構築物。項目59項目54~58のいずれか一項に記載の組換え発現構築物を含む、宿主細胞。項目60前記宿主細胞が原核生物細胞である、項目59に記載の宿主細胞。項目61前記宿主細胞が真核生物細胞である、項目59に記載の宿主細胞。項目62組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドを生成する方法であって、以下:項目48に記載の核酸配列に作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含む組換え発現構築物を含む宿主細胞を培養する工程、を包含する、方法。項目63前記プロモーターが調節プロモーターである、項目62に記載の方法。項目64組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドを生成する方法であって、以下:項目58に記載の組換えウイルス性発現構築物に感染させた宿主細胞を培養する工程、を包含する、方法。項目65サンプル中のメソセリン関連抗原の発現を検出する方法であって、以下:a項目49に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、配列番号13に示されるアミノ酸配列を有するメソセリン関連抗原ポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体をコードする核酸配列を含むサンプルとを接触させる工程;およびb該アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズするメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の、該サンプル中における量を検出する工程、および、それから該サンプル中のメソセリン関連抗原の発現を検出する工程、を包含する、方法。項目66前記アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズするメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の量が、ポリメラーゼ連鎖反応を使用して決定される、項目65に記載の方法。項目67前記アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズするメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸の量が、ハイブリダイゼーションアッセイを使用して決定される、項目65に記載の方法。項目68前記サンプルがRNA調製物またはcDNA調製物を含む、項目65に記載の方法。本発明のこれらの局面および他の局面は、以下の詳細な説明および添付される図面の参照することによって、明らかになる。さらに、種々の参考文献が本明細書中に示され、これは、本発明の特定の局面をより詳細に記載し、従ってその全体が参考として援用される。発明の詳細な説明本発明は、メソセリンポリペプチドとして本明細書中に参照される特定の遺伝子産物の可溶性形態が被験体中に天然に生じるという予期しない発見に一部関連し、これには、特定の癌を有する被験体中の増大したレベルのそのような可溶性メソセリンポリペプチドを含む。従って本発明は、そのような可溶性メソセリンポリペプチドの特異的な検出によって、被験体における悪性状態を検出および診断するための有用な組成物および方法を提供する。以下に詳述するように、本発明の特定の実施形態は、ヒトメソセリンポリペプチドに関し、ヒトメソセリンポリペプチドは、本明細書中に記載の新規可溶性メソセリン関連抗原mesothelinrelatedantigenMRAポリペプチドのようなポリペプチドを含み、そしてまた、メソセリンの細胞表面関連タンパク質Changら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136および巨核球増殖因子megakaryocytepotentiatingfactorMPF前駆体の膜結合タンパク質Kojimaら、1995J.Biol.Chem.270:21984を含む。特定の他の実施形態において、本発明は、MRAポリペプチドのフラグメント、誘導体および/またはアナログに関する。簡単に言うと、本発明の特定の実施形態に従って、被験体由来の生物学的サンプルをヒトメソセリンポリペプチドに特異的な抗体と接触させることによって、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法が提供される。MRAの完全アミノ酸配列および完全核酸コード配列が、本明細書中に開示され、これには、ポリARNAから誘導される核酸分子でありかつMRAをコードする核酸分子が終止コドンを欠くという驚くべき知見が含まれる。メソセリンChangら、1996およびMPFKojimaら、1995の完全アミノ酸配列および完全核酸コード配列は、公知であり、これには、MRAを含む本明細書中に使用されるようなメソセリンポリペプチドに対応するこれらの配列の部分が含まれる。種々のヒト腫瘍細胞株の細胞質ならびに表面上におけるメソセリンポリペプチドの発現は、公知である例えば、Changら、1996;Kojimaら、1995;およびその中に引用される参考文献を参照のこと。このことは、本明細書中に記載されるように、メソセリンポリペプチドに対して特異的な抗体を生成するための免疫原としてのそのような細胞の使用を可能にする。ヒトメソセリンポリペプチドを特異的に認識するモノクローナル抗体が報告され、そして入手可能であるChangら、1996;Changら、1992Int.J.Cancer50:373。あるいは、当業者は、当該分野で周知の方法論を伴う本発明の技術を使用して、慣用的そして過度の実験を伴わずに、メソセリンポリペプチド特異的抗体生成のために宿主を免疫し得、そしてスクリーニングし得る。例えば、免疫原として使用され得る特定の腫瘍細胞は、メソセリンポリペプチドを発現することが公知であり例えば、Changら、1996;Kojimaら、1995;およびその中に引用される参考文献を参照のこと、そして候補免疫原性細胞株におけるメソセリンポリペプチドの発現の測定は、本明細書中に提供されるメソセリンポリペプチドの特徴付けおよび/または報告されるような例えば、Changら1996およびKojimaら1995メソセリンポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の検出可能な発現に基づいて達成され得る。本明細書中に開示される可溶性メソセリンポリペプチドの物理化学的特性および免疫化学的特性から、そしてメソセリン関連抗原MRAであるメソセリンポリペプチドファミリーのメンバーをコードする本明細書中に開示される核酸配列を用いて、または必要に応じて他のメソセリンポリペプチド例えば、メソセリンまたはMPFをコードするヌクレオチド配列の報告された特性を使用して、当業者はまた、周知の方法論に従って、特異的抗体を生成かつ特徴付けるために使用され得る組換えメソセリンポリペプチドを調製し得る。メソセリンポリペプチドは、適切なプロモーターの制御下で、哺乳動物細胞、酵母、細菌または他の細胞において発現し得る。無細胞翻訳系はまた、引用される参考文献のメソセリンポリペプチドDNAコード領域Changら、1996;Kojimaら、1995からか、または本明細書中に開示されるMRAコード化核酸配列から誘導されるRNAを用いて、そのようなタンパク質を生成するために使用され得るか、あるいは本明細書中に提供されるMRAアミノ酸配列から推定され得るようなタンパク質を生成するために使用され得る。原核生物宿主および真核生物宿主を用いる使用のための適切なクローニングベクターおよび発現ベクターは、Sambrookら、MolecularCloning:ALaboratoryManual,第2版,ColdSpringHarbor,NY1989によって記載される。本発明の好ましい実施形態において、メソセリンポリペプチドは、哺乳動物細胞で発現される。本発明の核酸は、RNAの形態であり得るかまたはDNAの形態であり得、このDNAは、cDNA、ゲノムDNAおよび合成DNAを含む。DNAは、二本鎖または一本鎖であり得、そして一本鎖の場合、このDNAはコード鎖または非コードアンチセンス鎖であり得る。本発明に従う使用のためのMRAポリペプチドをコードするコード配列は、配列番号3または配列番号4に提供されるコード配列に同一であり得るか、あるいは異なるコード配列これは遺伝子暗号の重複性または縮重の結果として、例えばcDNA配列番号3および4と同じMRAポリペプチドをコードするであり得る。従って、本発明は、配列番号1または2のアミノ酸配列を有するメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする単離された核酸分子、またはそのようなMRAポリペプチドをコードする核酸にハイブリダイズし得る核酸分子もしくはそれに相補的な配列を有する核酸配列。改変体は、天然のメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列もしくはその部分例えば、配列番号3および4に示される核酸配列などに対して、好ましくは少なくとも約70同一性、より好ましくは少なくとも約80同一性、そして最も好ましくは少なくとも約90同一性を示す。パーセント同一性は、当業者に周知のコンピューターアルゴリズム例えば、AlignまたはBLASTアルゴリズムAltschul,J.Mol.Biol.219:555-565,1991;HenikoffおよびHenikoff、Proc.Nat.Acad.Sci.USA89:10915-10919、1992;これは、NCBIウェブサイトhttp://www/ncbi.nlm.nih.gov/cgi-bin/BLASTで入手可能であるを使用して配列を比較することによって、容易に決定され得る。デフォルトパラメーターを使用し得る。特定の改変体は、天然の遺伝子に実質的に相同性である。そのようなポリヌクレオチド改変体は、中程度にストリンジェントな条件下で、天然のメソセリン関連抗原をコードする天然に存在するDNAまたはRNA配列またはその相補配列にハイブリダイズし得る。適切な中程度にストリンジェントな条件としては、例えば、以下の工程またはそれらの等価な工程が挙げられる;5×SSC0.5SDS、1.0mMEDTApH8.0溶液中での前洗浄;50~65°Cで一晩5×SSCでハイブリダイゼーション;続いて65°Cにおいて、2×、0.5×および0.2×SSC0.1SDSを含むの各々で、20分間2回ずつの洗浄。さらなるストリンジェンシーのために、条件としては、例えば60°Cで15分間、0.1×SSCおよび0.1SDSで洗浄するか、またはその等価な条件が挙げられ得る。当業者は、適切にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件これは、目的の特定の核酸に対していくらか選択的であるを生成するための慣用的な事項として変更され得るパラメーターを容易に理解し、そしてさらに、そのような条件が、特に、例えば配列番号3および4これらは、それぞれ、メソセリン関連抗原ポリペプチドMRA-1およびMRA-2をコードするとして本明細書中に開示される核酸配列のような、ハイブリダイゼーションに関与する特定の核酸配列の機能であり得ることを理解する。例えば、Ausubelら、CurrentProtocolsinMolecularBiology,GreenePublishing,1995核酸ハイブリダイゼーション条件の選択に関してもまた参照のこと。MRAポリペプチド例えば、配列番号1~2のアミノ酸配列を有するヒトMRAポリペプチドまたは本発明に従う用途のための任意の他のMRAポリペプチドをコードする核酸としては、以下が挙げられ得るが、これらに限定されない:MRAポリペプチドのコード配列のみ;MRAポリペプチドのコード配列およびさらなるコード配列;MRAポリペプチドのコード配列および必要に応じてさらなるコード配列ならびに非コード配列例えば、MRAポリペプチドのコード配列のイントロンまたは非コード配列5’および/もしくは3’これは、例えば、調節されるかまたは調節され得るプロモーター、エンハンサー、他の転写調節配列、リプレッサー結合配列、翻訳調節配列または任意の他の調節核酸配列であり得る、1つ以上の調節核酸配列をさらに含むが、これらに限定されない。従って、用語MRAポリペプチドをコードする核酸とは、ポリペプチドのコード配列のみを含む核酸ならびにさらなるコード配列および/または非コード配列を含む核酸を含む。本発明はさらに、本明細書中に記載される核酸の改変体に関し、この核酸は、MRAポリペプチド例えば、配列番号1および2の推定アミノ酸配列を有するヒトMRAポリペプチドのフラグメント、アナログおよび誘導体をコードする。MRAをコードする核酸の改変体は、核酸の天然に存在する対立遺伝子改変体または天然に存在しない改変体であり得る。当該分野において公知のように、改変体は、1つ以上のヌクレオチドの置換、欠失または付加これらのいずれも、コードされたMRAポリペプチドの機能を実質的に変化させないを少なくとも1つ有し得る核酸配列の代替形態alternatformである。従って、例えば、本発明は、配列番号1および2に示されるMRAポリペプチドと同じMRAポリペプチドをコードする核酸、ならびにそのような核酸の改変体この改変体は、配列番号1または2の任意のポリペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログをコードし得るを含む。MRAの改変体および誘導体は、MRAポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の変異によって得られ得る。天然アミノ酸配列の改変は、任意の多数の従来法によって達成され得る。変異は、変異配列を含むオリゴヌクレオチドを合成することによって特定の座位に導入され得、天然配列のフラグメントに対する連結を可能にする制限部位が隣接する。連結の後、生じた再構成された配列は、所望のアミノ酸挿入、置換または欠失を有するアナログをコードする。あるいは、オリゴヌクレオチド指向性部位特異的突然変異手順が使用され、改変された遺伝子が得られ得、ここで、予め決定されたコドンは、置換、欠失または挿入によって改変され得る。そのような改変を作製する例示的な方法は、以下によって開示される:WalderらGene42:133、1986;BauerらGene37:73、1985;CraikBioTechniques,1985年1月,12-19;SmithらGeneticEngineering:PrinciplesandMethods,PlenumPress、1981;KunkelProc.Natl.Acad.Sci.USA82:488、1985;KunkelらMethodsinEnzymol.154:367、1987;ならびに米国特許第4,518,584号および同第4,737,462号。MRAポリペプチドまたはその改変体もしくはフラグメントをコードする核酸配列に特異的な、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびリボザイムを含むアンチセンス因子としての使用のための核酸分子の同定;ならびに遺伝子治療のための標的化された送達のためのMRA遺伝子をコードするDNAオリゴヌクレオチドの同定は、当該分野において周知の方法を含む。例えば、そのようなオリゴヌクレオチドの所望の特性、長さおよび他の特徴が周知である。特定の好ましい実施形態において、そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチドは、本明細書中に提供されるようなMRAポリペプチドをコードする単離された核酸分子に相補的な、少なくとも15個連続したヌクレオチドを含む。アンセンスオリゴヌクレオチドは、代表的に、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、スルホン、サルフェート、ケチル、ホスホロジチオエート、ホスホロアミデート、ホスフェートエステル、および他のそのような連結のような連結を用いることによって、内因性ヌクレオチド分解性nucleolytic酵素による分解に耐性であるように設計される例えば、Agrwalら、TetrehedronLett.28:3539-35421987;Millerら、J.Am.Chem.Soc.93:6657-66651971;Stecら、TetrehedronLett.26:2191-21941985;Moodyら、Nucl.AcidsRes.12:4769-47821989;Uznanskiら、Nucl.AcidsRes.1989;Letsingerら、Tetrahedron40:137-1431984;Eckstein,Annu.Rev.Biochem.54:367-4021985;Eckstein,TrendsBiol.Sci.14:97-1001989;Stein:Oligodeoxynucleotides.AntisenseInhibitorsofGeneExpression,Cohen編、MacmillanPress,London、97-117頁1989;Jagerら、Biochemistry27:7237-72461988を参照のこと。アンチセンスヌクレオチドは、mRNAまたはDNAのような核酸に配列特異的な様式で結合するオリゴヌクレオチドである。相補配列を有するmRNAに結合する場合、アンチセンスは、mRNAの翻訳を阻害する例えば、米国特許第5,168,053号Altmanら;米国特許第5,190,931号Inouye、米国特許第5,135,917号Burch;米国特許第5,087,617号SmithおよびCluselら1993Nucl.AcidsRes.21:3405-3411これは、亜鈴状アンチセンスオリゴヌクレオチドを記載するを参照のこと。三重鎖分子は、二本鎖DNAに結合する一本鎖DNA鎖が、共直線性の三重鎖分子を形成することをいい、これによって転写が阻害される例えば、米国特許第5,176,996号Hoganらを参照し、これは、二重鎖DNA上の標的部位に結合する合成オリゴヌクレオチドを作製するための方法を記載する。本発明のこの実施形態によって、特に有用なアンチセンスヌクレオチドおよび三重鎖分子は、MRAポリペプチドをコードするmRNAの翻訳阻害が効果的であるように、MRAポリペプチドをコードするDNAまたはmRNAのセンス鎖に相補的であるか、またはこれらに結合する分子である。リボザイムは、mRNAのようなRNA基質を特異的に切断するRNA分子であり、細胞性遺伝子発現の特定の阻害または妨害を生じる。RNA鎖の切断および/または連結に関与する、少なくとも5つの公知のリボザイムクラスが存在する。リボザイムは、任意のRNA転写物へ標的にされ得、そしてその転写物を触媒的に切断し得る例えば、米国特許第5,272,262号;米国特許第5,144,019号;および米国特許第5,168,053号、同第5,180,818号、同第5,116,742号、同第5,093,246号Cechらを参照のこと。本発明の特定の実施形態によって、任意のそのようなMRAmRNA特異的リボザイム、またはそのようなリボザイムをコードする核酸が、宿主細胞に送達され、MRA遺伝子発現の阻害に影響を与え得る。従って、リボザイムなどは、真核生物プロモーター例えば、真核性ウイルスプロモーターに連結されたリボザイムをコードするDNAによって宿主細胞に送達され得、その結果、核への導入の際にリボザイムは直接転写される。アミノ酸残基もしくは配列の種々の付加または置換、あるいは生物学的活性に必要でない、末端残基もしくは内部残基または末端配列もしくは内部配列の欠失をコードする等価なDNA構築物がまた、本発明によって含まれる。例えば、生物学的活性に重要でないCys残基をコードする配列は、変更され得、欠失されるかまたは他のアミノ酸と置換されるCys残基を生じ、これによって再生における不正確な分子内ジスルフィド架橋の形成を回避する。他の等価体は、隣接の二塩基性アミノ酸残基の改変によって調製され得、KEX2プロテアーゼ活性が存在する酵母系において発現を増強する。EP212,914は、タンパク質におけるKEX2プロテアーゼプロセシング部位を不活性化するための、部位特異的突然変異の使用を開示する。KEX2プロテアーゼプロセシング部位は、隣接の塩基性残基の出現を排除するために、Arg-Arg、Arg-LysおよびLys-Arg対を変化するための残基の欠失、付加または置換によって不活性化する。Lys-Lys対は、KEX2切断に対してかなり感受性ではなく、そしてArg-LysまたはLys-ArgのLys-Lysへの変換は、KEX2部位における不活性化に対する、保存的かつ好ましいアプローチを表す。適切なDNA配列は、種々の手順によって、選択された宿主細胞に対して適切な任意の多数の周知のベクターへ、挿入され得る。一般的に、このDNA配列は、当該分野において公知の手順によって適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。酵素学的反応DNAリガーゼ、DNAポリメラーゼ、制限エンドヌクレアーゼなどを含むのための、クローニング、DNA単離、増幅および精製に関する標準的な技術ならびに種々の分離技術は、当業者によって公知かつ通常使用される技術である。多くの標準的な技術は、例えばAusubelら1993CurrentProtocolsinMolecularBiology,GreenePubl.Assoc.Inc.JohnWileySons,Inc.,Boston,MA;Sambrookら1989MolecularCloning,第2版、ColdSpringHarborLaboratory,Plainview,NY;および他の箇所に記載される。哺乳動物発現系の例としては、Gluzman、Cell23:1751981によって記載されるサル腎臓線維芽細胞のCOS-7株、および適合性のベクターを発現し得る他の細胞株例えば、C127、3T3、CHO、HeLaおよびBHK細胞株が挙げられる。哺乳動物発現ベクターは、複製起点、適切なプロモーターおよびエンハンサー、ならびに任意の必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナーおよびアクセプター部位、転写終止配列、および5’隣接非転写領域も含む。例えば、S40スプライス部位およびポリアデニル化部位から誘導されるDNA配列が使用され、必要とされる非転写遺伝子エレメントが得られ得る。宿主細胞ヘの構築物の導入は、当業者に精通される種々の方法によって効果的にされ得、この方法としては、例えば、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE-Dextran媒介トランスフェクションまたはエレクトロポレーションが挙げられるが、これらに限定されないDavisら、1986BasicMethodsinMolecularBiology。本発明はさらに、MRA、メソセリン関連抗原ポリペプチドおよび特に悪性状態を検出するための方法に関する。好ましい実施形態において、悪性腫瘍は、ヒトメソセリンポリペプチドに特異的な少なくとも1つの抗体と反応性の抗原決定基を有する天然に存在する可溶性分子の、生物学的サンプル中における存在を測定することによって検出される。別の好ましい実施形態において、悪性腫瘍は、少なくとも1つの天然に存在するMRAポリペプチドの、生物学的サンプル中における存在を測定することによって検出される。本明細書中に提供されるように、メソセリン関連抗原ポリペプチドまたはMRAポリペプチドとしては、以下が挙げられる:配列番号1または2のアミノ酸配列を有する任意のポリペプチドその任意のフラグメント、誘導体またはアナログを含むを含み、そしてまた、配列番号3もしくは4を含む核酸分子または配列番号3もしくは4の核酸分子にハイブリダイズし得る核酸分子によってコードされる任意のポリペプチドまたはそのフラグメント、誘導体またはアナログを含む。従って、選択された、現在開示されたMRAアミノ酸または核酸配列の部分に依存して、MRAポリペプチドは、そうである必要はないがメソセリンポリペプチドであり得る。本明細書中に提供されるように、メソセリンポリペプチドは、以下のペプチド:EVEKTACPSGKKAREIDES配列番号5を含むアミノ酸配列、およびMAbK-1Changら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136;MAbK-1は、例えば、SignetLaboratories,Inc.,Dedham,MAから入手可能であるまたは本明細書中に提供されるようなモノクローナル抗体OV569、4H3、3G3、もしくは1A6の免疫特異的結合を競合的に阻害する、抗原結合部位antigencombiningsiteを有する少なくとも1つの抗体と反応する、少なくとも1つの抗原決定基をさらに有する可溶性ポリペプチドである。メソセリンポリペプチドは、例えば、本明細書中に提供されるようなメソセリン関連抗原MRAポリペプチドを含み得るか、またはメソセリンそれ自身の細胞表面関連部分Changら、1996、MPF前駆体タンパク質の膜結合部分Kojimaら、1995J.Biol.Chem.270:21984またはそのようなポリペプチドの任意のフラグメント、アナログおよび誘導体から誘導され得る。本発明のMRAポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドは、未改変ポリペプチドであってもよいし、または例えば、グリコシル化、リン酸化、脂肪アシル化グリコシルホスファチジルイノシトールアンカー改変などを含む、ホスファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼc媒介加水分解などのようなホスホリパーゼ切断、プロテアーゼ切断、脱リン酸または共有化学結合の形成または切断を含む改変のようなタンパク質翻訳後改変の任意の他の型により翻訳後改変されたポリペプチドであってもよい。用語フラグメント、誘導体、およびアナログは、メソセリン関連抗原ポリペプチドまたは融合タンパク質をいう場合、このようなポリペプチドと本質的に同じ生物学的機能および/または活性を保持する任意のメソセリン関連抗原ポリペプチドをいう。従って、アナログは、メソセリン関連抗原ポリペプチドアイソフォーム例えば、差示的に翻訳後に改変されたメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはスプライス改変体のような改変体を含み得る。当該分野で周知のように、スプライス改変体は、RNA転写物の差示的細胞内プロセシングから生じるポリペプチドの改変体または代替形態を含む。例えば、2つの異なるmRNA種は、それらが一方のmRNA種における特定のエキソンに対応する配列のすべてまたは1部分の封入および他方の種からのその非存在によってのみ異なる場合、互いのスプライス改変体であり得る。当業者は、他の構造的関係が、一般にスプライス改変体とみなされるmRNA種との間に存在し得ることを理解する。メソセリンポリペプチドは、さらに、活性化メソセリンポリペプチドを生成するために、プロタンパク質部分の切断によって活性化され得るプロタンパク質を含む。MRAポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドの、フラグメント、誘導体およびアナログの、生物学的機能および/または活性としては、本明細書中に開示されるように、被験体における悪性状態の存在をスクリーニングする方法におけるマーカーとして、このようなポリペプチドの使用が挙げられるが、これに限定される必要はない。例えば、被験体由来のサンプルにおいて、可溶性形態で天然に存在し、そしてメソセリンポリペプチドに対して特異的な、少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基を有する分子を検出することによって、当業者は、MRAポリペプチドおよび/またはメソセリンポリペプチドの、生物学的機能および/または活性をモニターし得る。さらに、特定の実施形態において、スクリーニングの本発明方法は、i悪性状態を有すると疑われる第1被験体由来の第1生物学的サンプル、およびii悪性状態でないことが既知の第2被験体由来の第2生物学的サンプルの各々において、可溶性形態で天然に存在し、そしてメソセリンポリペプチドに対して特異的な、少なくとも1つの抗体と反応性である抗原決定基を有する検出可能分子の相対量、レベルおよび/または量を比較することに関することに注目すべきである。従って、生物学的サンプルにおけるメソセリンポリペプチドの相対量的存在は、メソセリンポリペプチドの生物学的機能および/または活性であり得るが、このような機能および/または活性は、そのように限定されるべきではない。MRAポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログは、i1つ以上のアミノ酸残基が、保存的アミノ酸残基または非保存的アミノ酸残基好ましくは、保存的アミノ酸に置換されるもの;ii付加的なアミノ酸が、メソセリンポリペプチドと融合されもので、この付加的なアミノ酸はメソセリンポリペプチドの精製またはプロタンパク質配列に使用され得るアミノ酸を含む;またはiii短縮メソセリンポリペプチドであり得る。このようなフラグメント、誘導体およびアナログは、本明細書中の教示から当業者の範囲内であると考えられる。短縮メソセリンポリペプチドは、全長バージョンに満たないメソセリンポリペプチドを含む任意のメソセリンポリペプチド分子であり得る。本発明によって提供される短縮分子は、短縮された生物学的ポリマーを含み得、そして好ましい本発明の実施形態において、このような短縮分子は、短縮核酸分子または短縮ポリペプチドであり得る。短縮核酸分子は、既知または記載された核酸分子の全長に満たない核酸配列を有し、ここでこのような既知または記載の核酸分子は、当業者がそれを全長分子とみなす限り、天然に存在する核酸分子、合成核酸分子または組換え核酸分子であり得る。従って、例えば、遺伝子配列に対応する短縮核酸分子は、全長に満たない遺伝子を含み、ここでこの遺伝子は、コード配列および非コード配列、プロモーター、エンハンサーおよび他の調節配列、フランキング配列など、ならびに遺伝子の1部として認識される、他の機能的配列および非機能的配列を含む。別の実施形態において、mRNA配列に対応する短縮核酸分子は、全長に満たないmRNA転写物を含み、この転写物は、種々の翻訳領域および非翻訳領域ならびに他の機能的配列および非機能的配列を含み得る。他の好ましい実施形態において、短縮分子は、特定のタンパク質の全長に満たないアミノ酸配列を含むポリペプチドである。本明細書中で使用される場合、欠失は、当業者によって理解されるようなその一般的な意味を有し、そして、例えば、本明細書中で提供される短縮分子の場合のような対応する全長分子に関連して、1つ以上の、末端領域または非末端領域のいずれかからの配列の一部を欠く分子をいい得る。核酸分子またはポリペプチドのように直線状生物学的ポリマーである短縮分子は、1つ以上の、分子の末端からの欠失または分子の非末端領域からの欠失のいずれかを有し得、ここでこのような欠失は、1~1500個連続したヌクレオチドまたはアミノ酸残基、好ましくは1~500個連続したヌクレオチドまたはアミノ酸残基およびより好ましくは1~300個連続したヌクレオチドまたはアミノ酸残基の欠失であり得る。当該分野で公知のように、2つのポリペプチド間の類似性は、ポリペプチドのアミノ酸配列およびそれらに対する保存的アミノ酸置換基を、第2ポリペプチドの配列と比較することによって決定される。2つの、ポリペプチドまたはヌクレオチド配列間の類似性、または百分率の同一性でさえ、当業者に周知のコンピューターアルゴリズム例えば、BLASTアルゴリズムAltschul,J.Mol.Biol.219:555-565,1991;HenikoffおよびHenikoff,Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:10915-10919,1992これはNCBIウェブサイトhttp://www/ncbi.nlm.nih.gov/cgi-bin/BLASTにおいて利用可能であるを用いて配列を比較することによって容易に決定され得る。デフォルトdefaultパラメータが使用され得る。他の有用なコンピューターアルゴリズムの例は、AlignおよびFASTAのようなプログラムにおいて使用されるコンピューターアルゴリズムであり、これは、例えば、InstitutdeGenetiqueHumaine,Montpellier,FranceのGenestreamインターネットウェブサイトwww2.igh.cnrs.fr/home.eng.htmlでアクセスされ得、そしてデフォルトパラメータを用いて使用され得る。本発明のポリペプチドのフラグメントまたは一部は、ペプチド合成によって対応する全長ポリペプチドを生成するために使用され得;従って、このフラグメントは、全長ポリペプチドを生成するための中間体として使用され得る。用語単離されるたは、材料がその元々の環境例えば、それが天然に存在する場合の自然環境から取り出されることを意味する。例えば、天然に存在していて、生きている動物において存在する、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは単離されないが、自然系に共存する材料のいくつかまたは全てから分離される、同じポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、単離される。このようなポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、組成物の一部であり得、そしてなお、このような組成物はその天然の環境の一部ではないという点で単離されている。アフィニティー技術は、本発明の使用の方法に従った使用のために、MRAポリペプチドおよび/またはメソセリンポリペプチドを単離する範囲で特に有用であり、そして分離を行うためにMRAポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドとの特異的な結合相互作用を排除する任意の方法を含み得る。例えば、メソセリンポリペプチドは、共有結合したオリゴ糖部分を含み得ることから例えば、Changら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136;Changら、1992CancerRes.52:181;Kojimaら、1995J.BiolChem.270:21984;Yamaguchiら、1994J.Biol.Chem.269:805を参照のこと、レクチンによる炭水化物結合carbohydratebindingを可能にする条件下で、適切に固定されたレクチンに対する、メソセリンポリペプチドの結合のようなアフィニティー技術は、アフィニティー技術において特に有用であり得る。他の有用なアフィニティー技術としては、メソセリンポリペプチドを単離するための免疫学的技術が挙げられ、この技術は、抗原に対する抗体の結合部位と複合体に存在する抗原決定基との間の特異的結合の相互作用に頼る。免疫学的技術としては、免疫アフィニティークロマトグラフィー、免疫沈降、固相免疫吸着または他の免疫アフィニティーの方法が挙げられるが、これらに限定される必要はない。これらの有用なアフィニティー技術および他の有用なアフィニティー技術について、例えば、以下を参照せよ:Scopes,R.K.,ProteinPurification:PrinciplesandPractice,1987,Springer-Verlag,NY;Weir,D.M.,HandbookofExperimentalImmunology,1986,BlackwellScientific,Boston;およびHermanson,G.T.ら,ImmobilizedAffinityLigandTechniques,1992,AcademicPress,Inc.,California;これらは、アフィニティー技術を含む、複合体を単離して、そして特徴付けるための技術に関する詳細について、本明細書によってそれらの全体が参考として援用される。本明細書中に記載されるように、本発明は、MRAと融合されたポリペプチドを含む融合タンパク質を提供する。このようなMRA融合タンパク質は、例えば、MRA融合タンパク質の検出、単離および/または精製例示の目的であり、そして限定ではないを可能にする、付加的な、機能的ポリペプチド配列または非機能的ポリペプチド配列に融合されたMRAポリペプチド配列の発現を提供するために、付加的なコード配列とインフレームで融合されたMRAコード配列を有する核酸によってコードされる。このようなMRA融合タンパク質は、タンパク質-タンパク質アフィニティー、金属アフィニティーまたは荷電アフィニティーベースaffinity-basedポリペプチド精製によって、またはプロテアーゼによって切断可能な融合配列を含む融合タンパク質の特異的なプロテアーゼ切断によって、MRA融合タンパク質の検出、単離および/または精製を可能にし、その結果、MRAポリペプチドは、融合タンパク質と分離可能であり得る。従って、MRA融合タンパク質は、アフィニティータグポリペプチド配列を含み得、このMRA融合タンパク質は、リガンドとの特異的アフィニティー相互作用を介して、MRAの検出および単離を容易にするためにMRAに添加されるポリペプチドまたはペプチドをいう。このリガンドは、アフィニティータグが本明細書中で提供されるような特異的な結合相互作用を介して相互作用し得る、任意の、分子、レセプター、カウンターレセプターcounterreceptor、抗体などであり得る。このようなペプチドとしては、例えば、ポリ-Hisまたは米国特許番号第5,011,912号およびHoppら1988Bio/Technology6:1204に記載される抗原同定ペプチド、もしくはXPRESSTMエピトープタグInvitrogen、Carlsbad、CAが挙げられる。このアフィニティー配列は、細菌宿主の場合に、マーカーと融合された成熟ポリペプチドの精製を提供するために、例えば、pBAD/HisInvitrogenまたはpQE-9ベクターによって供給されるようなヘキサヒスチジンタグであってもよいし、または、例えば、哺乳動物宿主例えば、COS-7細胞が使用される場合、アフィニティー配列は、赤血球凝集素HAタグであってもよい。HAタグは、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープを規定された抗体に対応するWilsonら、1984Cell37:767。MRA融合タンパク質は、MRAの検出、単離および/または局在を容易にするためにMRAに付加された免疫グロビン定常領域ポリペプチドをさらに含み得る。免疫グロブリン定常領域ポリペプチドは、好ましくは、MRAポリペプチドのC末端と融合される。抗体由来ポリペプチドの種々の部分Fcドメインを含むと融合された異種ポリペプチドを含む融合タンパク質の一般的な調製が、例えば、AshkenaziらPNASUSA88:10535,1991およびByrnらNature344:677,1990によって記載されている。MRA:Fc融合タンパク質をコードする融合遺伝子が、適切な発現ベクターに挿入される。本発明の特定の実施形態において、MRA:Fc融合タンパク質は、よく似た抗体分子を集合させることを可能にし得、それから分子間鎖ジスルフィド結合が、Fcポリペプチド間に形成し、二量体のMRA融合タンパク質を生成する。MRAをコードする配列に、インフレームで結合されたDNA配列によって、コードされる免疫グロビンV領域ドメインを含む融合ポリペプチドのために、予め選択された抗原に対する特異的結合アフィニティーを有するMRA融合タンパク質もまた、本発明の範囲内であり、このタンパク質は、本明細書中で提供されるような、この改変体およびフラグメントを含む。免疫グロビンV領域融合ポリペプチドを有する融合タンパク質の構築についての一般的なストラテジーが、例えば、EP0318554;米国特許第5,132,405号;同第5,091,513号;および同第5,476,786号において開示される。本発明の核酸はまた、所望されるアフィニティー特性を有する他のポリペプチド例えば、グルタチオン-S-トランスフェラーゼのような酵素と融合されたMRAポリペプチドを含む融合タンパク質をコードし得る。別の実施例のように、MRA融合タンパク質はまた、StaphylococcusaureusプロテインAポリペプチドと融合されたMRAポリペプチドを含み得;プロテインAをコードする核酸および免疫グロブリン定常領域に対してアフィニティーを有する融合タンパク質を構築することにおけるそれらの使用は、一般に、例えば、米国特許第5,100,788号において開示される。MRA融合タンパク質の構築のための他の有用なアフィニティーポリペプチドとしては、例えば、WO89/03422;米国特許第5,489,528号;同第5,672,691号;WO93/24631;米国特許第5,168,049号;同第5,272,254号および他で開示されるような、ストレプトアビジン融合タンパク質、ならびにアビジン融合タンパク質例えば、EP511,747を参照のことが挙げられる。本明細書中および引用された参考文献において提供されるように、トラッピングtrapping変異体MRAを含むMRAポリペプチド配列は、全長融合ポリペプチドでもよく、そして、あるいは、その改変体またはフラグメントであってもよい融合ポリペプチド配列と融合され得る。本発明はまた、小胞体ERの内腔に存在するようにか、古典的なERGolgi分泌経路を介して細胞から分泌されるようにか例えば、vonHeijne,J.MembraneBiol.115:195-201,1990を参照のこと、形質膜に取り込まれるようにか、膜貫通細胞表面レセプターの細胞質ドメインを含む特定の細胞質成分と関係するようにか、または、当業者が精通する種々の、既知の細胞内タンパク質選別機構例えば、Rothman,Nature372:55-63,1994,Adraniら、1998J.Biol.Chem.273:10317,および本明細書中に引用される参考文献を参照のことのいずれかによって特定の非細胞位置に指向させるように、細胞核にMRA融合タンパク質を指向するポリペプチド配列を含むそのMRA融合タンパク質を意図する。従って、これらの実施形態および関連する実施形態は、本組成物および目的のポリペプチドを、予め規定された細胞内局在、膜局在または細胞外局在に対して標的化することに関する方法によって包含される。本発明はまた、本発明の核酸を含むベクターおよび構築物、ならびに特に、上記に提供されるような本発明に従って、MRAポリペプチドをコードする任意の核酸を含む組換え発現構築物;本発明のベクターおよび/または構築物を用いて遺伝的に操作される宿主細胞ならびに本発明のMRAポリペプチドおよび融合タンパク質、またはそれらのフラグメントもしくは改変体の、組換え技術による生成に関する。MRAタンパク質は、適切なプロモーターの制御下で、哺乳動物細胞、酵母、細菌、または他の細胞において発現され得る。無細胞翻訳系はまた、本発明のDNA構築物に由来するRNAを用いて、このようなタンパク質を生成するために使用され得る。原核生物宿主および真核生物宿主を用いた使用のための適切なクローニングおよび発現ベクターは、例えば、Sambrookら、MolecularCloning:ALaboratoryManual,第2版,ColdSpringHarbor,NewYork,1989によって記載される。一般に、組換え発現ベクターは、複製起点および宿主細胞の形質転換を可能にする選択マーカー例えば、E.coliのアンピシリン耐性遺伝子およびS.cerevisiaeTRP1遺伝子、ならびに下流構造配列の転写を指向する高度に発現される遺伝子由来のプロモーターを含む。このようなプロモーターは、解糖酵素例えば、とりわけ、3-ホスホグリセレートキナーゼPGK、α-因子、酸性ホスファターゼ、またはヒートショックタンパク質をコードするオペロン由来であり得る。異種構造配列は、翻訳開始配列および終結配列と共に、適切な相に集められる。必要に応じて、異種配列は、所望の特性例えば、発現された組換え産物の安定化または単純化された精製を与えるN末端同定ペプチドを含む融合タンパク質をコードし得る。細菌の使用のための有用な発現構築物は、機能的なプロモーターを伴って作動可能なリーディング相において、適切な翻訳開始シグナルおよび終結シグナルと共に、所望のタンパク質をコードする構造的なDNA配列を、発現ベクターに挿入することによって構築される。この構築物は、1つ以上の表現型選択マーカーおよび複製起点を含み、ベクター構築物の維持を保証し得、そして、所望される場合、宿主内で、増幅を提供し得る。形質転換のための適切な原核生物宿主は、Pseudomonas属、Streptomyces属、およびStaphylococcus属内の、E.coli、Bacillussubtilis、Salmonellatyphimuriumおよび種々の種を含むが、他もまた、選択の問題として使用され得る。任意の他のプラスミドまたは他のベクターは、これらが宿主において複製可能であり、そして生存可能である限り、使用され得る。代表的であるが非限定的な例として、細菌の使用のための有用な発現ベクターは、周知のクローニングベクターpBR322ATCC37017の遺伝的要素を含む市販のプラスミド由来の選択マーカーおよび細菌性複製起点を含み得る。このような市販のベクターとしては、例えば、pKK223-3PharmaciaFineChemicals,Uppsala,SwedenおよびGEM1PromegaBiotec,Madison,Wisconsin,USAが挙げられる。これらのpBR322骨格部分は、発現されるために、適切なプロモーターおよび構造的な配列と組み合わせられる。適切な株の形質転換および適切な細胞密度までの宿主細胞の増殖の後、選択されたプロモーターは、本明細書中で提供されるような調節プロモーターの場合、適切な手段例えば、温度変化または化学誘導によって誘導され、そして細胞は、付加的な期間培養される。細胞は、代表的に、遠心分離によって回収され、物理的または化学的手段により破壊され、そして得られた粗抽出物がさらなる精製のために保持される。タンパク質の発現に使用される微生物細胞は、任意の従来の方法凍結融解サイクリング、音波破砕、機械的破壊、または細胞溶解剤の使用を含むによって破壊され得;このような方法は、当業者に周知である。従って、例えば、本明細書中で提供されるような本発明の核酸は、MRAポリペプチドを発現するために、組換え発現構築物として種々の発現ベクター構築物のいずれか1つの中に含まれ得る。このようなベクターおよび構築物としては、染色体DNA配列、非染色体DNA配列および合成DNA配列例えば、SV40の誘導体;細菌性プラスミド;ファージDNA;バキュロウイルス;酵母プラスミド;プラスミドおよびファージDNAの組み合わせに由来するベクター、ウイルスDNA例えば、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、鶏痘ウイルス、および仮性狂犬病ウイルスが挙げられる。しかし、任意の他のベクターは、宿主において複製可能であり、そして生存可能である限り、組換え発現構築物の調製のために使用され得る。適切なDNA配列は、種々の手順によってベクターに挿入され得る。一般に、DNA配列は、当該分野で公知の手順によって、適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。クローニング、DNA単離、増幅および精製のための標準的技術、DNAリガーゼ、DNAポリメラーゼ、制限エンドヌクレアーゼなどを含む酵素反応のための標準的な技術、および種々の分離技術は、公知のものであり、そして当業者によって一般に使用される。多くの標準的技術は、例えば、以下に記載される:Ausubelら1993CurrentProtocolsinMolecularBiology、GreenePubl.Assoc.Inc.JohnWileySons,Inc.,Boston,MA;Sambrookら1989MolecularCloning,第2版,ColdSpringHarborLaboratory,Plainview,NY;Maniatisら1982MolecularCloning,ColdSpringHarborLaboratory,Plainview,NY;およびその他。発現ベクターにおけるDNA配列は、少なくとも1つの適切な発現制御配列例えば、プロモーターまたは調節プロモーターに作動可能に連結され、mRNA合成を指向する。このような制御配列の代表的な例としては、LTRプロモーターまたはSV40プロモーター、E.colilacプロモーターまたはtrpプロモーター、ファージλPLプロモーターおよび原核生物細胞または真核生物細胞あるいはそれらのウイルスにおいて遺伝子の発現を制御するために公知の他のプロモーターが挙げられる。プロモーター領域は、CATクロラムフェニコールトランスフェラーゼベクターまたは選択マーカーを有する他のベクターを用いて任意の所望される遺伝子から選択され得る。2つの適切なベクターは、pKK232-8およびpCM7である。特定の指定された細菌性プロモーターとしては、lacIプロモーター、lacZプロモーター、T3プロモーター、T7プロモーター、gptプロモーター、λPRプロモーター、PLプロモーターおよびtrpプロモーターが挙げられる。真核生物プロモーターとしては、CMV極初期immediateearlyプロモーター、HSVチミジンキナーゼプロモーター、初期SV40プロモーターおよび後期SV40プロモーター、レトロウイルス由来のLTRプロモーター、およびマウスメタロチオネイン-Iプロモーターが挙げられる。適切なベクターおよびプロモーターの選択は、当業者のレベル内で十分であり、そしてMRAポリペプチドをコードする核酸に作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターまたは調節プロモーターを含む特定の特に好ましい組換え発現構築物の調製が、本明細書中に記載される。上記のように、特定の実施形態において、ベクターは、レトロウイルスベクターのようなウイルスベクターであり得る。例えば、レトロウイルスプラスミドベクターの由来とされ得るベクターとしては、MoloneyMurineLeukemiaVirus、脾臓壊死ウイルス、レトロウイルス例えば、ラウス肉腫ウイルス、HarveySarcomavirus、鳥類白血病ウイルス、テナガザルサルgibbonape白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、アデノウイルス、MyeloproliferativeSarcomaVirus、およびマウス乳腺癌ウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。ウイルスベクターは、1つ以上のプロモーターを含む。使用され得る適切なプロモーターとしては、レトロウイルスLTR;SV40プロモーター;およびヒトサイトメガロウイルスCMVプロモーターMillerら、Biotechniques7:980-9901989に記載される、または任意の他のプロモーター例えば、ヒストンプロモーター、polIIIプロモーター、およびβアクチンプロモーターを含むがこれらに限定されない真核生物細胞性プロモーターのような細胞性プロモーターが挙げられるがこれらに限定されない。使用され得る他のウイルスプロモーターとしては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:アデノウイルスプロモーター、チミジンキナーゼTKプロモーター、およびB19パルボウイルスプロモーター。適切なプロモーターの選択は、本明細書中に含まれる教示から当業者に明らかであり、そして調節プロモーターまたは上記のプロモーターの中のいずれか由来であり得る。レトロウイルスプラスミドベクターは、パッケージング細胞株を形質導入して、プロデューサー細胞株を形成するために使用される。トランスフェクトされ得るパッケージング細胞の例としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:およびMiller、HumanGeneTherapy、1:5-141990において記載されるようなDAN細胞株これは、その全体が参考として本明細書中に援用される。このベクターは、当該分野で公知の任意の手段を通じてパッケージング細胞を形質導入し得る。このような手段としては、エレクトロポレーション、リポソームの使用、およびリン酸カルシウム沈殿が挙げられるがこれらに限定されない。1つの代替において、レトロウイルスプラスミドベクターは、リポソームにカプセル化され得るか、または脂質に連結され得、次いで宿主に投与され得る。プロデューサー細胞株は、MRAポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸配列を含む感染性レトロウイルスベクター粒子を生成する。次いで、このようなレトロベクター粒子は、インビトロまたはインビボのいずれかで真核生物細胞生物に形質導入するために使用され得る。この形質導入された真核生物細胞は、MRAポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸配列を発現する。形質導入され得る真核生物細胞としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:胚性幹細胞、胚性癌細胞ならびに造血幹細胞、肝細胞、線維芽細胞、筋芽細胞、ケラチノサイト、内皮細胞、気管上皮細胞および種々の他の培養適応細胞株。ウイルスベクターが組換えMRA発現構築物を調製するために使用される本発明の実施形態の別の例は、1つの好ましい実施形態において、MRAポリペプチドまたは融合タンパク質の発現を指向する組換えウイルス性構築物により形質導入された宿主細胞が、ウイルスの出芽の間にウイルス粒子により取り込まれる宿主細胞膜の部分に由来する、発現されるMRAポリペプチドまたは融合タンパク質を含むウイルス粒子を生成し得る。別の好ましい実施形態において、MRAをコードする核酸配列が、バキュロウイルスシャトルベクター中にクローニングされ、次いでこれが、組換えバキュロウイルス性発現構築物を生成するようにバキュロウイルスと組換えられ、この構築物は、例えば、BaculovirusExpressionProtocols,MethodsinMolecularBiologyVol.39,C.D.Richardson編,HumanPress,Totowa,NJ,1995;Piwnica-Worms,ExpressionofProteinsinInsectCellsUsingBaculoviralVectors,第16章第II章:ShortProtocolsinMolecularBiology,第2版、Ausbelら編、JohnWileySons,NewYork,NewYork,1992、16-32~16-48頁に記載されるように、Sf9宿主細胞を感染させるために使用される。別の局面において、本発明は、上記の組換えMRA発現構築物を含む宿主細胞に関する。宿主細胞は、本発明のベクターおよび/または発現構築物で遺伝子操作形質導入、形質転換またはトランスフェクトされ、この本発明のベクターおよび/または発現構築物は、例えば、クローニングベクター、シャトルベクターまたは発現構築物であり得る。このベクターまたは構築物は、例えば、プラスミド、ウイルス粒子、ファージなどの形態であり得る。この操作された宿主細胞は、プロモーターを活性するため、形質転換体を選択するため、あるいはMRAポリペプチドまたはMRA融合タンパク質をコードする遺伝子のような特定の遺伝子を増幅するために、適切なように改変された従来の栄養培地にて培養され得る。発現のために選択された特定の宿主細胞についての培養条件例えば、温度、pHなどは、当業者に容易に明らかである。この宿主細胞は、高等真核生物細胞例えば、哺乳動物細胞または下等真核生物例えば、酵母細胞であってもよいし、またはこの宿主細胞は、原核生物例えば、細菌細胞であってもよい。本発明による適切な宿主細胞の代表的例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:細菌細胞E.coli、Streptomyces、Salmonellatyphimurium;真菌細胞例えば、酵母;昆虫細胞例えば、DrosophilaS2およびSpodopteraSf9;動物細胞例えば、CHO細胞、COS細胞または293細胞;アデノウイルス;植物細胞、またはインビトロでの増殖にすでに適合されたかまたは新規にそのように樹立された適切な任意の細胞。適切な宿主の選択は、本明細書中の教示から当業者の範囲内にあると見なされる。種々の哺乳動物細胞培養系もまた、組換えタンパク質を発現するために使用され得る。従って、本発明は、組換えMRAポリペプチドを生成する方法に部分的に関し、この方法は、MRAをコードする核酸配列に作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含む組換え発現構築物を含む宿主細胞を培養することによる。特定の実施形態において、このプロモーターは、本明細書中に提供されるような、調節プロモーター例えば、テトラサイクリン抑制repressibleプロモーターであり得る。特定の実施形態において、この組換え発現構築物は、本明細書中で提供されるような組換えウイルス性発現構築物である。哺乳動物発現系の例としては、Gluzman、Cell23:1751981により記載される、サル腎臓線維芽細胞のCOS-7株、および適合可能なベクターを発現し得る他の細胞株例えば、C127細胞株、3T3細胞株、CHO細胞株、HeLa細胞株およびBHK細胞株が、挙げられる。哺乳動物発現ベクターは、複製起点、適切なプロモーターおよびエンハンサーを含み、また必要な任意のリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライス供給部位およびスプライス受容部位、転写終結配列、および5’隣接非転写配列例えば、MRA発現構築物の調製に関して本明細書中に記載されるようなを含み、また必要な任意のリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライス供与部位およびスプライス受容部位、転写終結配列、および5’隣接非転写配列例えば、MRA発現構築物の調製に関して本明細書中に記載されるようなを含む。SV40スプライスに由来するDNA配列、およびポリアデニル化部位は、必要な非転写遺伝子エレメントを提供するために使用され得る。宿主細胞へのこの構築物の導入は、当業者が精通する種々の方法により行われ得、その方法としては、例えば以下が挙げられるがこれらに限定されない:リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE-Dextran媒介トランスフェクション、またはエレクトロポレーションDavisら、1986BasicMethodsinMolecularBiology。発現される組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチド、またはそれに由来する融合タンパク質は、インタクトな宿主細胞の形態;インタクトなオルガネラ例えば、細胞膜、細胞内小胞または他の細胞内オルガネラの形態;または破壊された細胞調製物細胞ホモジネートまたは細胞溶解物、単膜リポソームおよび多重膜リポソームまたは他の調製物を含むが、これらに限定されないの形態で、免疫原として有用であり得る。あるいは、発現された組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドまたは融合タンパク質は、硫安沈殿またはエタノール沈殿、酸抽出、アニオン交換クロマトグラフィーまたはカチオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーイムノアフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含むを含む方法によって、組換え細胞培養物から回収および精製され得る。タンパク質リフォールディング工程が、成熟タンパク質の立体構造を完成させる際に、必要な場合は使用され得る。最後に、高速液体クロマトグラフィーHPLCが、最終精製工程のために使用され得る。発現される組換えメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドまたは融合タンパク質はまた、慣用的な抗体スクリーニングのために、多数のアッセイ構成のいずれかにおいて標的抗原として有用であり得、この慣用的な抗体スクリーニングは、当業者に容易に実施され得る。従って、本発明の方法において使用される特定の抗体の生成のための免疫原であるメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドは、天然に精製された産物、または化学合成手順の産物であり得るか、あるいは原核生物宿主もしくは好ましくは真核生物宿主から、組換え技術により生成され得る。組換え生成手順において使用される宿主に依存して、本発明のポリペプチドは、当該分野で公知であるように、そして本明細書中に提供されるように、グリコシル化され得るか、さもなければ翻訳後修飾され得る。本発明によると、可溶性ヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドは、被験体または生物学的供給原由来の生物学的サンプル中で検出され得る。生物学的サンプルは、血液サンプル、生検標本、組織移植片、器官培養物、生物学的流体、あるいは被験体または生物学的供給原由来の他の任意の組織調製物もしくは細胞調製物を得ることにより、提供され得る。この被験体または生物学的供原は、ヒトまたは非ヒト動物の、一次細胞培養物または培養適合された細胞株染色体に組み込まれた組換え核酸配列またはエピソーム性の組換え核酸配列を含み得る、遺伝子操作された細胞株;不朽化細胞株または非不朽化細胞株;体細胞ハイブリッド細胞株;分化した細胞株または分化し得る細胞株;形質転換された細胞株などを含むが、これらに限定されないであり得る。本発明の特定の好ましい実施形態において、その被験体または生物学的供給原は、悪性状態を有する疑いがあり得るかまたは悪性状態を有する危険を有する疑いがあり得、そして本発明の特定の好ましい実施形態において、その被験体または生物学的供給原は、このような疾患の危険がないかまたはこのような疾患の存在がないことが、既知であり得る。好ましい実施形態において、その生物学的サンプルは、可溶性ヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドを含む、生物学的流体である。生物学的流体は、代表的には、生理学的温度で液体であり、そして被験体または生物学的供給原中に存在するか、それらから取り出されているか、それらから発現されているか、さもなければそれらから抽出されている、天然に存在する流体を含み得る。特定の組織、器官または局在領域に由来する特定の生物学的流体、および特定の他の生物学的流体は、被験体または生物学的供給原にて、より全体的または全身的に位置し得る。生物学的流体の例としては、血液、血清、および漿液、血漿、リンパ、尿、脳脊髄液、唾液、分泌組織および分泌器官の粘膜分泌物、膣分泌物、非固形腫瘍と関係があるもののような腹水、胸膜液、囲心腔液、腹膜液、腹部液、および他の体腔の流体などが挙げられる。生物学的流体としてはまた、被験体または生物学的供給原と接触した液体溶液例えば、細胞および器官培養培地細胞または器官馴化培地を含む、洗浄液などが、挙げられ得る。特定の非常に好ましい実施形態において、この生物学的サンプルは血清であり、そして他の特定の非常に好ましい実施形態において、この生物学的サンプルは血漿である。他の好ましい実施形態において、この生物学的サンプルは、無血清液体溶液である。他の特定の好ましい実施形態において、この生物学的サンプルはインタクトな細胞を含み、そして他の好ましい実施形態において、この生物学的サンプルは、配列番号1または2に示されるアミノ酸配列を有するメソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸配列あるいはそのフラグメントあるいはその改変体を含む、細胞抽出物を含む。サンプル中で可溶性形態で天然に存在する分子は、可溶性タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、アミノ酸、またはそれらの誘導体;脂質、脂肪酸など、またはそれらの誘導体;炭化水素、糖質などまたはそれらの誘導体;核酸、ヌクレオチド、ヌクレオシド、プリン、ピリミジンもしくは関連分子またはそれらの誘導体など;あるいはそれらの任意の組み合わせ例えば、糖タンパク質、糖脂質、リポタンパク質、プロテオリピド、あるいは本明細書中に提供されるような生物学的サンプルの可溶性成分もしくは無細胞成分である、他の任意の生物学的分子であり得る。可溶性形態で天然に存在する分子はさらに、溶液の状態であるかまたは生物学的サンプル本明細書中に提供されるような生物学的流体を含む中に存在し、そしてインタクトな細胞の表面に結合していない分子をいう。例えば、可溶性形態で天然に存在する分子とは、以下を含み得るがこれらに限定されない:溶解物;高分子複合体の成分;細胞から発せられるか、分泌されるかまたは運び出される物質;コロイド;ミクロ粒子またはナノ粒子または他の微細懸濁粒子;など。被験体における悪性状態の存在とは、その被験体における形成異常細胞、癌性細胞および/または形質転換細胞の存在をいい、このような細胞は、例えば、新形成細胞、腫瘍細胞、非接触阻止細胞または腫瘍形成形質転換細胞などを含む。限定でなく例示のために、本発明の文脈において、悪性状態はさらに、メソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドを、このようなポリペプチドのレベルの上昇がその被験体由来の生物学的サンプルにて検出可能であるような様式で、分泌し得るか、発し得るか、運び出し得るか、または放出し得る、癌細胞の被験体中での存在をいい得る。好ましい実施形態において、例えば、このような癌細胞は、癌細胞のような悪性上皮細胞であり、そして特に好ましい実施形態において、このような癌細胞は、悪性中皮腫細胞であり、これは、例えば、胸膜腔、心膜腔、腹膜腔、腹腔および他の体腔の内側で見出される、扁平上皮細胞の上皮細胞または中皮細胞の形質転換された改変体である。本発明の最も好ましい実施形態において、腫瘍細胞その存在は悪性状態の存在を示すは、卵巣癌細胞原発性卵巣癌細胞および転移性卵巣癌細胞を含むである。卵巣癌を悪性として分類するための基準は、当該分野で周知であり例えば、Bellら、1998、Br.J.Obstet.Gynaecol.105:1136;Meierら、1997、AnticancerRes.174B:3019;Meierら、1997、AnticancerRes.174B:2949;Cioffiら、1997、Tumori83:594;およびそれらに引用される参考文献を参照のこと、原発性腫瘍および転移性腫瘍からのヒト卵巣癌細胞株の樹立および特徴づけも同様に周知である例えば、OVCAR-3、Amer.TyprCultureCollection、Manassas,VA;Yuanら、1997、Gynecol.Oncol.66:378。他の実施形態において、この悪性状態は、中皮腫、膵臓癌、非小細胞肺癌または別の形態の癌扁平上皮細胞癌および腺癌のような種々の任意の癌を含み、そしてまた、肉腫および血液学的悪性疾患例えば、白血病、リンパ腫、骨髄腫などを含むであり得る。これらの悪性状態および他の悪性状態の分類は、当業者に公知であり、そして本開示により、MRAポリペプチドの存在の決定を含むメソセリンポリペプチドの存在の決定が、このような悪性状態において過度の実験を伴わずに提供される。本明細書中に提供されるように、被験体における悪性状態の存在についてスクリーニングする方法は、ヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な抗体の使用、またはヒトメソセリンポリペプチドに特異的な抗体の使用を、特徴とし得る。メソセリン関連抗原ポリペプチドまたはメソセリンポリペプチドに特異的な抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体として容易に生成されるか、または当該分野で周知の方法を使用して望ましい特性を有するように設計された、遺伝子操作された免疫グロブリンIgとして生成され得る。例えば、限定ではなく例示として、抗体としては、組換えIgG、免疫グロブリン由来配列を有するキメラ融合タンパク質またはヒト化抗体が挙げられ得例えば、米国特許第5,693,762号;同第5,585,089号;同第4,816,567号;同第5,225,539号;同第5,530,101号;およびそれらに引用される参考文献を参照のこと、これらはすべて、本発明によるヒトメソセリンポリペプチドの検出に使用され得る。このような多くの抗体が開示されており、そして特定の供給原から入手可能であるか、または本明細書中に提供されるように下記のようなメソセリンポリペプチドでの免疫によるものを含む調製され得る。例えば、本明細書中に提供されるように、メソセリンポリペプチドをコードする核酸配列は、メソセリン自体の細胞表面結合部分Changら、1996について、そして巨核球増殖因子MPF前駆体タンパク質の膜結合部分Kojimaら、1995について、知られており、そして本開示はさらに、メソセリン関連抗原MRAポリペプチドをコードする核酸配列を提供し、その結果、当業者は、免疫原としての使用のためにこれらのポリペプチドを慣用的に調製し得る。例えば、4H3、3G3および1A6のようなモノクローナル抗体これらは、以下により詳細に記載されるは、本発明による特定の方法を実施するために使用され得る。また、上記のように、別の有用な抗体は、MAbK-1であり、これは、メソセリンポリペプチドと反応性があるモノクローナル抗体であるChangら、1996、Proc.Natl.Acad.Sci.USA93:136;Changら、1992、Int.J.Cancer50:373;MAbK-1は、例えば、SignetLaboratories,Inc.、Dedham、MAから入手可能である。用語抗体とは、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、それらのフラグメント例えば、Fab’2フラグメントおよびFabフラグメント、ならびに任意の、天然に存在する結合パートナーまたは組換え生成された結合パートナーこれらは、メソセリンポリペプチド例えば、メソセリン、メソセリン関連抗原MRAまたはMPFに特異的に結合する分子であるが、挙げられる。抗体は、メソセリンポリペプチドと、約104M1以上、好ましくは約105M1以上、より好ましくは約106M1以上、そしてなおより好ましくは約107M1以上のKaで結合する場合に、免疫特異的に結合するかまたは特異的に結合すると、規定される。結合パートナーまたは抗体の親和性は、従来技術例えば、Scatchardら、Ann.N.Y.Acad.Sci.51:6601949により記載される技術を使用して、容易に決定され得る。他のタンパク質をメソセリンポリペプチドの結合パートナーとして決定することは、他のタンパク質またはポリペプチドと特異的に相互作用するタンパク質を同定および入手するための多数の公知の方法のいずれかを使用して実施され得、このような方法は、たとえば、米国特許第5,283,173号および米国特許第5,468,614号に記載されるような、酵母ツーハイブリッド系、または等価物である。本発明はまた、メソセリンポリペプチドに特異的に結合する結合パートナーおよび抗体を調製するための、メソセリンポリペプチドの使用、およびメソセリンポリペプチドのアミノ酸配列に基づくペプチドの使用を含む。抗体は、一般的に、当業者に公知の種々の任意の技術によって調製され得る例えば、HarlowおよびLane,Antibodies:ALaboratoryManual,ColdSpringHarborLaboratory,1998を参照のこと。1つのこのような技術において、メソセリンポリペプチドを含む免疫原例えば、メソセリンポリペプチドをその表面上に有する細胞または単離されたメソセリンポリペプチド例えば、メソセリン、MRAまたはMPFが、最初に適切な動物例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジおよびヤギに、好ましくは1回以上のブースター免疫を組み込んだ所定のスケジュールに従って注射され、そしてその動物から周期的に採血する。このメソセリンポリペプチドに特異的なポリクローナル抗体は、次いで、例えば、適切な固体支持体に結合したポリペプチドを使用するアフィニティークロマトグラフィーによって、このような血清から精製され得る。メソセリンポリペプチドまたはその改変体に特異的なモノクローナル抗体は、例えば、KohlerおよびMilstein1976、Eur.J.Immunol.6:511~519の技術およびそれへの改良を使用して、調製され得る。手短かには、これらの方法は、所望の特異性すなわち、目的のメソセリンポリペプチドとの反応性を有する抗体を生成し得る、不朽化細胞株の調製を包含する。このような細胞株は、例えば、上記のように免疫された動物から得られた脾細胞から生成され得る。次いでこの脾細胞は、例えば、骨髄腫細胞融合パートナーとの融合、好ましくはその免疫された動物と相乗作用するものとの融合によって、不朽化される。例えば、この脾細胞および骨髄腫細胞は、膜融合促進剤例えば、ポリエチレングリコールまたは非イオン性界面活性剤と数分間混合され得、次いでハイブリッド細胞の増殖を支持するが骨髄腫細胞の増殖は支持しない選択培地上に、低密度にプレーティングされ得る。好ましい選択技術では、HATヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン選択が使用される。十分な時間の後、通常は約1~2週間後、ハイブリッドのコロニーが観察される。単コロニーが選択され、そしてそのポリペプチドに対する結合活性について試験される。高い反応性および特異性を有するハイブリドーマが、好ましい。メソセリンポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体を生成するハイブリドーマが、本発明により意図される。モノクローナル抗体が、増殖するハイブリドーマコロニーの上清から単離され得る。さらに、種々の技術例えば、適切な脊椎動物宿主例えば、マウスの腹腔へのハイブリドーマ細胞株の注射が、収量を増大させるために使用され得る。次いで、モノクローナル抗体が、腹水または血液から収集され得る。混入物は、従来技術例えば、クロマトグラフィー、ゲル濾過、沈殿、および抽出により、その抗体から除去され得る。例えば、抗体は、標準的技術を使用して、固定プロテインGまたは固定プロテインAにおけるクロマトグラフィーによって、精製され得る。特定の実施形態において、抗体の抗原結合フラグメントの使用が、好ましくあり得る。このようなフラグメントとしては、Fabフラグメントが挙げられ、これは、標準的技術を使用して調製され得る例えば、FabフラグメントおよびFcフラグメントを生じるようなパパインでの切断による。このFabフラグメントおよびFcフラグメントは、アフィニティークロマトグラフィー例えば、固定プロテインAカラムにおいてによって、標準的技術を使用して分離され得る。例えば、Weir,D.M.、HandbookofExperimentalImmunology、1986、BlackwellScientific,Bostonを参照のこと。種々のエフェクタータンパク質をコードする配列にインフレームで連結されたDNA配列によりコードされる免疫グロブリンV領域ドメインによって調製された抗原に特異的な結合親和性を有する多機能性融合タンパク質が、例えば、EP-B1-0318554、米国特許第5,132,405号、米国特許第5,091,513号および米国特許第5,476,786号に開示されるように、当該分野で公知である。このようなエフェクタータンパク質は、当業者が精通する種々の任意の技術により融合タンパク質の結合を検出するために使用され得る、ポリペプチドドメインを含み、そのような技術は、ビオチン模倣mimetic配列例えば、Luoら、1998、J.Biotechnol.65:225およびその中に引用される参考文献を参照のこと、検出可能な標識部分による直接の共有結合的改変、特定の標識レポーター分子への非共有結合、検出可能な基質の酵素的改変、又は固相支持体上での固定共有結合的または非共有結合的を含むが、これらに限定されない。本発明における使用のための単鎖抗体はまた、ファージディスプレイ例えば、米国特許第5,223,409号;Schlebuschら、1997、Hybridoma16:47;およびその中で引用された参考文献を参照のことのような方法によって、生成および選択され得る。手短かには、この方法において、DNA配列が、糸状ファージ例えば、M13の遺伝子IIIまたは遺伝子VIIIに挿入され得る。挿入のためにマルチクローニング部位を有するいくつかのベクターが、開発されているMcLaffertyら、Gene128:29~36、1993;ScottおよびSmith、Scinece249:386~390、1990;SmithおよびScott、MethodsEnzymol.217:228~257、1993。その挿入されたDNA配列は、ランダムに生成され得るか、またはメソセリンポリペプチドへの結合のための既知の結合ドメインの改変体であり得る。単鎖抗体は、この方法を使用して容易に生成され得る。一般的に、そのインサートは、6~20アミノ酸をコードする。その挿入された配列によりコードされるペプチドは、そのバクテリオファージの表面上に提示され得る。メソセリンポリペプチドの結合ドメインを発現するバクテリオファージは、例えば、当該分野で周知の方法およびChangら1996、Proc.Natl.Acad.Sci.USA93:136によってかまたはKojimaら1995、J.Biol.Chem.270:21984により開示されたような核酸コード配列を使用して調製された組換えポリペプチドを、固定メソセリンポリペプチドに結合することによって、選択される。非結合ファージは、代表的には、10mMTris、1mMEDTAを含みそして塩を含まないかまたは低塩濃度の洗浄により、除去される。結合ファージは、例えば、塩含有緩衝液で溶出される。このNaCl濃度は、そのファージすべてが溶出されるまで、段階式に増加される。代表的には、ファージ結合の親和性が高いほど、より高い塩濃度によって放出される。溶出されるファージは、細菌宿主において増殖される。さらなる回の選択が、高い親和性を有する少数のファージ結合について選択するために実施され得る。次いで、その結合ファージ中のインサートのDNA配列が、決定される。一旦この結合ペプチドの推定アミノ酸配列が既知になると、ヒトメソセリンポリペプチドに特異的な抗体としての本明細書における使用に十分なペプチドが、組換え手段によってか、または合成によってかのいずれかで、作製され得る。組換え手段は、その抗体が融合タンパク質として生成される場合に、使用される。そのペプチドはまた、親和性または結合を最大にするために、2つ以上の類似のペプチドまたは異なるペプチドの直列型のアレイとして作製され得る。ヒトメソセリンポリペプチドに特異的な抗体と反応性である抗原決定基を検出するために、この検出試薬は、代表的には抗体であり、これは、本明細書中に記載されるように調製され得る。サンプル中のポリペプチドを検出するために抗体を使用するための、当業者に公知の種々のアッセイ形態が存在し、そのアッセイは、以下を含むがこれらに限定されない:酵素免疫測定法ELISA、ラジオイムノアッセイRIA、免疫蛍光定量法、免疫沈降、平衡透析、免疫拡散法、および他の技術。例えば、HarlowおよびLane、Antibodies:ALaboratoryManual,COldSpringHarborLaboratory,1988;Weir,D.M.、HandbookofExperimentalImmunology,1986、BalckwellScientific,Bostonを参照のこと。例えば、このアッセイは、ウェスタンブロットの形態にて実施され得、そこで生物学的サンプル由来のタンパク質調製物が、ゲル電気泳動に供され、適切な膜にトランスファーされ、そして抗体と反応させられる。次いで、膜上の抗体の存在が、当該分野で周知でありそして下記に記載されるように、適切な検出試薬を使用して検出され得る。別の実施形態において、このアッセイは、標的メソセリンポリペプチドに結合しそしてそのメソセリンポリペプチドをサンプルの残りから取り出すための、固体支持体上に固定された抗体の使用を包含する。次いで、結合したメソセリンポリペプチドが、別個のメソセリンポリペプチド抗原決定基と反応性である第2抗体例えば、検出可能なレポーター部分を含む試薬を使用して、検出され得る。非限定的例として、この実施形態によると、別個の抗原決定基を認識する固定された抗体および第2抗体は、モノクローナル抗体OV569、4H3、3G3および1A6から選択される本明細書中に記載されるモノクローナル抗体のうちの任意の2つであり得る。あるいは、競合アッセイが利用され得、そのアッセイにおいて、メソセリンポリペプチドが、検出可能なレポーター部分で標識され、そしてサンプルとの固定された抗体のインキュベーションの後に、固定されたメソセリンポリペプチド特異的抗体に結合させられる。サンプルの成分が抗体への標識ポリペプチドの結合を阻害する程度は、その固定された抗体とのそのサンプルの反応性の指標であり、結果として、そのサンプル中のメソセリンのレベルの指標である。固体支持体は当業者に公知の任意の材料であり得、これに抗体が結合され得、これらの支持体としては、マイクロプレートウェル中の試験ウェル、ニトロセルロースフィルターまたは別の適切な膜が挙げられる。あるいは、この支持体は、ビーズまたはディスクであり得、例えば、ガラス、ファイバーグラス、ラテックスまたはポリスチレンもしくはポリ塩化ビニルようなプラスチックが挙げられる。抗体は、当該分野で公知の種々の技術を用いて固体支持体に固定され得、この技術は特許および科学文献中に詳細に記載されている。特定の好ましい実施形態において、サンプル中のメソセリン関連抗原ポリペプチドの検出のためのアッセイは、2抗体サンドイッチアッセイである。このアッセイは、最初に固体支持体通常は、マイクロタイタープレートのウェルに固定化されたメソセリン関連抗原ポリペプチドに特異的な抗体例えば、OV569、1A6、3G3または4H3のようなモノクローナル抗体を生物学的サンプルと接触させ、その結果、サンプル中に天然に存在し、かつ抗体と反応性である抗原決定基を有する可溶性分子を固定化された抗体に結合させて室温で30分間のインキュベーション時間は一般に十分である、抗原-抗体複合体または免疫複合体を形成させることにより行い得る。次いで、サンプルの非結合成分は、固定化された免疫複合体から除去される。次いで、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体を添加し、ここで、第2抗体の抗原結合部位は、固定化された第1抗体の抗原結合部位がメソセリン関連抗原ポリペプチド例えば、固体支持体に固定化されたモノクローナル抗体と同じではない、OV569、1A6、3G3または4H3のようなモノクローナル抗体に結合することを競合的に阻害しない。第2抗体は、本明細書中に提供されるように検出可能に標識され得、その結果、この抗体は、直接検出され得る。あるいは、第2抗体は、検出可能に標識された二次または第2段階抗抗体の使用により、または本明細書中に提供されるように特異的検出試薬を用いて間接的に検出され得る。本発明の方法は、イムノアッセイの当業者が、2抗体サンドイッチイムノアッセイにおいて特定の抗原例えば、メソセリンポリペプチドを免疫学的に検出するために多くの試薬および構成が存在することを理解するように、特定の検出手順に限定されない。上記の2抗体サンドイッチアッセイを用いる、本発明の特定の好ましい実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な固定化された第1抗体は、ポリクローナル抗体であり、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体はポリクローナル抗体である。本発明の特定の他の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な固定化された第1抗体はモノクローナル抗体であり、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体はポリクローナル抗体である。本発明の特定の他の実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な固定化された第1抗体はポリクローナル抗体であり、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体はモノクローナル抗体である。本発明の特定の他の非常に好ましい実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な固定化された第1抗体は、モノクローナル抗体であり、そしてメソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体は、モノクローナル抗体である。例えば、これらの実施形態において、本明細書中で提供されるように、モノクローナル抗体4H3、3G3、1A6およびOV569は、メソセリンポリペプチド例えば、MRAポリペプチド上の異なりかつ非競合性の抗原決定基例えば、エピトープを認識し、その結果、これらのモノクローナル抗体の任意の対形式の組み合わせが使用され得る。本発明の他の好ましい実施形態において、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な固定化された第1抗体および/またはメソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な第2抗体は、当該分野で公知および本明細書中で言われる任意の種の抗体であり得、例えば、Fabフラグメント、Fab’2フラグメント、免疫グロブリンV領域融合タンパク質または単鎖抗体が挙げられるが、これらに限定されない。当業者は、本発明が、開示された方法および本願方法において他の抗体形態、フラグメント、誘導体などの使用を含むことを理解する。特定の特に好ましい実施形態において、第2抗体が検出可能なレポーター部分または標識例えば、酵素、色素、放射性核種、発光基、蛍光基またはビオチンなどを含み得る。固体支持体に結合している第2抗体の量は、特異的な検出可能なレポーター部分または標識について適切な方法を用いて決定される。放射活性基については、シンチレーションカウンティングまたはオートラジオグラフィーが一般に適切である。抗体-酵素結合体は、種々のカップリング技術を用いて調製され得る概説に関しては、例えば、Scouten,W.H.,MethodsinEnzymology135:30-65,1987を参照のこと。分光法を使用して、色素例えば、酵素反応の比色生成物を含む、発光基および蛍光基を検出し得る。ビオチンは、アビジンまたはストレプトアビジンを用いて検出され得、ビオチンは、異なるレポーター基通常は、放射活性基または蛍光基または酵素に連結され得る。酵素レポーター基は、一般に、基質の添加一般に特定の期間の間、次いで分光的、分光光度的、または他の反応生成物の分析により検出され得る。標準物質および標準的添加物を用い、周知の技術を使用して、サンプル中のメソセリンポリペプチドのレベルを決定し得る。別の実施形態において、本発明は、本明細書中に提供されるように、生物学的供給源または被験体由来の生物学的サンプルにおける免疫特異的に反応性の抗体の検出によって悪性状態の存在についてスクリーニングするためにメソセリン関連抗原ポリペプチドの使用を企図する。この実施形態に従って、メソセリン関連抗原ポリペプチド本明細書中に記載のような短縮型のメソセリン関連抗原ポリペプチドを含むフラグメントまたはその改変体を検出可能に標識し、そして生物学的サンプルと接触させて、サンプル中に可溶性形態で天然に存在する抗体のメソセリン関連抗原ポリペプチドに対する結合を検出する。例えば、メソセリン関連抗原ポリペプチドは、容易に検出可能な例えば、放射活性に標識されるアミノ酸のインビトロ翻訳の間の組み込みのような周知の技術と合わせて、本明細書中に開示される配列をを使用することにより、または上記の技術のような検出可能な他のレポーター部分を使用することにより生合成的に標識される。理論に拘束されることは望まないが、本発明のこの実施形態により、特定のメソセリンポリペプチド例えば、本明細書中に開示されるMRAポリペプチドは特に免疫原性であるペプチドを提供し得、そのためにこのポリペプチドが特異的かつ検出可能な抗体を生じることを企図し、このポリペプチドは、核酸レベルでコード配列のインフレーム挿入から生じたフレームシフト配列を特徴とする。例えば、この理論に従って、特定のMRAポリペプチドは、強いavid免疫応答を誘発する非自己抗原を示し得る一方、インフレーム挿入がないメソセリンポリペプチド例えば、MPFまたはメソセリンは、体液性または細胞性免疫を容易に誘発しない自己抗原として免疫系に認められ得る。上記のように、本発明は、一部、ヒトメソセリン関連抗原ポリペプチドの可溶性形態が被験体に天然に存在する特定の癌を有する被験体におけるこのような可溶性メソセリンポリペプチドのレベルの上昇を含むという驚くべき知見に関する。本発明に従う、悪性状態の存在についてスクリーニングする方法は、被験体由来の生物学的サンプル中の1つより多くの腫瘍関連マーカーの検出によりさらに増強され得る。従って、特定の実施形態において、本発明は、メソセリン関連抗原ポリペプチドに対して特異的な抗体を用いて天然に存在する可溶性サンプル成分の反応性を検出することに加えて、当該分野で公知のように、そして本明細書中に提供されるように確立された方法を用いて、悪性状態の少なくとも1つのさらなる可溶性マーカーの検出を含むスクリーニングの方法を提供する。上記のように、現在、容易に得られた生物学的液体のサンプル中で検出可能な多くの可溶性腫瘍関連抗原が存在する。これらとしては、CEA、CA125、シアリルTN、SCC、TPSおよびPLAP例えば、Bastら,1983N.Eng.J.Med.309:883;Lloydら,1997Int.J.Canc.71:842;Sarandakouら,1997ActaOncol.36:755;Sarandakouら,1998Eur.J.Gynaecol.Oncol.19:73;Meierら,1997Anticanc.Res.174B:2945;Kudohら,1999Gynecol.Obstet.Invest.47:52;Indら,1997Br.J.Obstet.Gynaecol.104:1024;Bellら、1998Br.J.Obstet.Gynaecol.105:1136;Cioffiら,1997Tumori83:594;Meierら,1997Anticanc.Res.174B:2949;Meierら,1997Anticanc.Res.174B:3019が挙げられるが、これらに限定する必要はなく、そして本明細書中で提供されるように、任意の公知のマーカーをさらに含み得、その存在は、生物学的サンプル中で少なくとも1つの悪性状態の存在と相関し得る。あるいは、メソセリン関連抗原ポリペプチドをコードする核酸配列は、標準的なハイブリダイゼーション技術および/またはポリメラーゼ連鎖反応PCR技術を用いて検出され得る。適切なプローブおよびプライマーは、本明細書中に提供されるメソセリン関連抗原のcDNA配列に基づいて当業者により設計され得る。一般に、生物学的供給源例えば、真核生物細胞、細菌、ウイルス、そのような生物から調製された抽出物および生体内で見出される液体から得られた任意の種々のサンプルを用いてアッセイが行われ得る。以下の実施例は例示のためであって、限定するために提供されるものではない。実施例実施例1:メソセリンポリペプチドの対して特異的なモノクローナル抗体OV569本実施例は、卵巣癌由来のヒト悪性腹水細胞で免疫した後のマウスモノクローナル抗体MabOV569の生成を記載する。免疫原として使用するための細胞は、悪性卵巣癌を有する患者の腹膜腹水から遠心分離により回収し、洗浄し、そして液体窒素中で使用時まで保存した非分画細胞であった。BALB/cマウス約3ヶ月齢を合計7回、14日間隔で1回の免疫あたり1×107の融解した卵巣癌細胞を免疫した;アジュバントは用いなかった。初回免疫については、マウスに腹腔内i.p.および皮下s.c.の両方に注射したが、残りの6回の免疫については、融解細胞の注射をi.p.のみで投与した。最終免疫の4日後、脾臓を1匹のマウスから取り出し、IMDM培養培地GibcoBRL,GrandIsland,NY中に単一細胞懸濁物を形成するように細かく切り離し、そして引き続いて、以前に記載のように融合剤として40ポリエチレングリコールPEGを用いてYehら,1979Proc.Nat.Acad.Sci.USA76:2927、脾細胞を骨髄腫細胞P3x63Ag8.653CRL1580、ATCC,Rockville,MDと融合した。ハイブリダイゼーション後に、融合細胞懸濁物を希釈して、好ましくは一細胞から生じる低密度培養物を形成し、そして10ハイブリドーマ増殖因子IgenInc,Gaithersburg,MO、10ウシ胎仔血清、2HATおよび0.25ジェネティシンを含有する選択培地Yehら,1979にて96ウェルプレートFalcon,LindenPark,NYに播種した。各ウェルからの上清を、免疫に用いた卵巣癌腹水、他の患者由来の培養卵巣癌細胞、および培養ヒト線維芽細胞に結合し得る抗体の存在について、Douillardら1983Meth.Enzymol.92:168に記載のように酵素結合イムノソルベントアッセイELISAを用いてスクリーニングした。ヒト卵巣細胞に結合するが、培養ヒト線維芽細胞に結合しない抗体を生成するハイブリドーマを限界希釈により2回クローニングし、上清抗体の卵巣癌細胞との特異的反応性についておよび種々の正常ヒト組織由来の細胞との非反応性について再試験し、そしてインビトロで拡大した。抗体をハイブリドーマ上清から、固定化したプロテインAに対してアフィニティークロマトグラフィーRepliGen,Cambridge,MAにより、緩衝液および低pH溶出、次いで供給元により推奨されるように中和としてリン酸緩衝化生理食塩水PBSを用いて精製し、その後、これらを濾過滅菌し、そして-70度で使用時まで保存した。卵巣癌細胞に結合するが、正常な線維芽細胞には結合しない1つのこのようなモノクローナルハイブリドーマ抗体を、OV569と名付けた。モノクローナル抗体MabOV569を、ELISAによりマウスIgG1アイソタイプであることを決定した。簡潔には、Immunolon96ウェルプレートDynatech,Chantilly,VAのウェルを、異なるマウスIgGサブクラスに対して特異的なヤギ抗体SouthernBiotech,Birmingham,ALPBS中1μg/mlを用いて4°Cで一晩コーティングし、ブロッキングし、そして記載の手順に従ってOV569ハイブリドーマ上清の種々の希釈を試験するために使用したYehら,1979Proc.Nat.elcad.Sci.USA76:2927。実施例2:OV569により認識される卵巣癌抗原に対して特異的な第2モノクローナル抗体の生成ハイブリドーマの第2セットを作製し、MabOV569により認識される抗原分子に結合するが、OV569により使用される抗原性エピトープとは異なるエピトープの認識を介して結合する抗体の生成について選択した。第2Mab生成を誘発するための免疫原として使用するために、OV569結合抗原を、外科手術で除去した腫瘍から確立したヒト卵巣癌および肺癌の細胞培養物例えば、Hellstromら,1990CancerRes.50:2183に記載されるようにの上清から、または固定化したMAbOV569のカラムを使用した腹水もしくは胸膜液の採取物からアフィニティー精製した。簡潔には、1.5gの臭化シアンで活性化したセファロース4BSigma,St.Louis,MOに、9.2mgのOV569を添加し、そしてカラムを洗浄し、そして供給元のプロトコルに従って使用するために平衡化した。抗原が精製される出発物質例えば、遠心分離により清澄にされた培養上清をカラムに通過させ、その後にカラムを280nmの吸光度を有する物質がカラム溶出液に検出されなくなるまでPBSpH7.2中の0.01M0.02NaN3で洗浄した。次いで、MAbOV569カラムに特異的に結合した可溶性抗原を、pH2.6溶出緩衝液0.1Mグリシン-HCl-pH2.6、0.15MNaClを用いて溶出した。溶出液を2mlの容量で採取し、2.5MTris-HCl緩衝液pH8.8で中和し、そして280nmおよび260nmの吸光度の分光光度的測定により定量した。アフィニティー精製したOV569抗原0.1ml中に30μgのタンパク質を、0.1mlのRibiアジュバントRibiImmunochem.Research,Inc.,Hamilton,MTと混合し、そしてこの混合物を、3ヶ月齢のBALB/cマウスにs.c.部位で注射し、14日後に最初のブースター免疫を行ったこのブースター免疫は、i.p.で投与した。ブースター免疫については、Ribiアジュバントを、培養したH4013肺癌細胞例えば、Hellstromら,1990CancerRes.50:2183により記載されるような方法を用いて確立された癌細胞株の上清からOV569アフィニティークロマトグラフィーにより精製した抗原と混合した。一連の3回のブースター免疫各14日の間隔を与えるにおいて3回目の投与の14日後に、マウスをアジュバントなしで静脈内i.v.で抗原を注射することにより最終ブーストを与えた。最終ブーストの3日後に脾臓を取り出し、そして細胞融合をMAbOV569について実施例1で上記のように行った。得られたハイブリドーマ細胞の上清を、従来のELISA方法CurrentProtocolsinImmunology,J.E.Coliganら編1998JohnWileySons,NYを用いて、プラスチック96ウェルプレート上に固定化した標的抗原に結合し得る抗体の存在について試験した。標的抗原は、i上記のように調製したアフィニティー精製したOV569抗原免疫抗原;またはiiヒトIg配列をコードする記載されたベクターHollenbaughら、1995J.Immunol.Meth.188:1-7を使用して免疫グロブリン定常領域に融合し、そしてプロテインA/GアフィニティークロマトグラフィーImmunoPureA/G,PierceChemicals,Rockford,ILにより供給元の説明書に従って精製したメソセリン膜結合タンパク質のアミノ酸294~628からなる免疫グロブリン融合タンパク質であるD2hIgChangら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136であった。陽性の上清をELISAにより再試験して反応性を確認し、そして改変したELISA結合競合イムノアッセイにおいて引き続きスクリーニングした。簡潔には、このアッセイにおいて、OV569結合抗原上記のようにアフィニティー精製したを96ウェルプレートのウェルに固定化した。ウェルに、結合競合インキュベーション工程室温で1時間の間に各陽性ハイブリドーマおよびWeir,D.M.,HandbookofExperimentalImmunology1986,BlackwellScientific,Bostonに従ってビオチン化することにより調製した50μl400ngのビオチン化MAbOV569上清を与え、次いでPBSで洗浄し、そして今出工程を供給元の推奨に従って希釈した50μlのHRP-ストレプトアビジンPharMingen,SanDiego,CAを用いて行った。このアッセイにより、ビオチン化MAbOV569結合を阻害することができないことによってOV569により認識されるエピトープとは異なるエピトープを認識するMAbについて選択した。この競合アッセイにおいて試験した上清を、また、アフィニティー精製したOV569結合抗原でコーティングしたコントロールプレートの並行セットを用いて試験して、OV569抗原に結合するハイブリドーマ抗体を確認した。3つのハイブリドーマ4H3、3G3、および1A6と名付けたを同定した。これらのハイブリドーマは、D2hIgおよび培養したOV569陽性癌培養上清由来のOV569アフィニティー精製した抗原に結合し得る抗体を生成し、そしてOV569MAbと競合しなかった。これら3つのハイブリドーマをクローニングし、拡大し、そして同系マウスに移植して、抗体生成腹水腫瘍を確立した。4H3といわれるIgG1MAbを、以下に記載の二重決定基サンドイッチELISAアッセイにおいてOV569とともに使用した。実施例3:ヒト腫瘍細胞表面でのOV569卵巣癌抗原の発現本実施例は、MAbOV569により規定される抗原の発現の免疫組織学的特徴付けを記載する。イムノペルオキシダーゼ技術Sternberger,Immunocytochemistry,104-169頁,JohnWileySons,Inc.,NewYork,1979の改変法を、VectastainABC免疫染色試薬システムVectorLaboratories,Burlingame,CAを用いて製造業者の説明書に従って使用した。簡潔には、種々の正常ヒト組織またはヒト腫瘍サンプルを標準的外科的切除または生検手順により得、そして直ぐに凍結した。この凍結したサンプルを、冷却したミクロトームを用いて切片にし、顕微鏡用ガラススライドの上で風乾し、冷アセトンで固定し-20°Cで5分間、そしてPBSで2回洗浄し、通常マウス血清でブロッキングし室温で20分間、次いでアビジン/ビオチンブロッキング試薬で処理した。次いで、このスライドを、Vectastainブロッキング溶液VectorLaboratoriesで希釈した一次抗体とともに室温で90分間インキュベートし、そしてPBSで洗浄した。次いで、スライドを、Vectastainブロッキング溶液で1:150に希釈したビオチン化ヤギ抗マウスIgGSouthernBiotechnologyAssoc.,Birmingham,ALとともに室温で30分間インキュベートし、そして再びPBSで洗浄した。VectastainABCVectorElite西洋ワサビペルオキシダーゼHRP作業溶液を調製し、そして室温で保持した。スライドをこのHRP溶液と共に室温で30分間インキュベートし、PBSで3回洗浄し、そしてTris緩衝液0.05MTris-HCl-pH7.5、150mMNaCl中でリンスした。ジアミノベンザミジンdiaminobenzamidineDAB、Bio-TekInstruments,Inc.,Winooski,VT色素原試薬溶液をVectastainABCの説明書に従って毎日調製し、そしてスライドをこの試薬と共に柔らかな光の中で室温で7分間インキュベートした。PBSを添加することにより反応を停止させ、そして二回蒸留した水で2回洗浄した。スライドをヘマトキシリン蒸留水で1:10に希釈したBio-Tekヘマトキシリン溶液で10~45秒対比染色し、水で3回リンスし、そして顕微鏡にセットする前に勾配を付けた一連のエタノールを通して脱水した。このスライドを冷却し、そして独立した研究者が試験し、ディファレンシャル干渉コントラストNomarskiオプティクスを用いて、Zeissアップライト顕微鏡CarlZeiss,Inc.,Thornwood,NYで明視野照明下で代表的な顕微鏡視野を写真撮影した。ここで示されるように、サンプルを、試験した細胞の少なくとも1/3がDAB染色を示した場合に陽性とスコア付けした;陰性といわれるサンプルは、同じMAb希釈物を用いても有意な染色を示さなかった細胞の5未満。表1は、試験した癌標本の数に対する陽性に染色された癌Ca標本の比を示す。染色は、腫瘍細胞の細胞質において見られ、いくらかの場合には細胞表面にもまた染色が見られた。正常すなわち、非癌性細胞は、MAbOV569に対して染色が認められなかった。新生物細胞および間質細胞の両方が腫瘍サンプルにおいて観察され、そして前者のみがMAbOV569により染色された。正常ヒト組織サンプルを使用した結果を表2に示す。実施例4:培養したヒト癌細胞表面上のOV569卵巣癌抗原の発現本実施例において、癌細胞表面に結合するMAbOV569を、CoulterEpicsCFACS細胞蛍光測定器CoulterCorp.,Miami,FLを用いて、基本的には以前に記載されたとおりHellstromら,1986Canc.Res.46:3917免疫細胞蛍光フローサイトメトリーにより評価した。上記のように生成した培養接着ヒト癌細胞例えば、Hellstromら,1990CancerRes.50:2183を、培養フラスコからトリプシン/EDTAを用いて取り出し、、遠心分離200×g、10分により2回洗浄し、そして15FBSを含有するIMDM培地GibcoBRL,GrandIsland,NY中の再懸濁物を、室温で少なくとも1時間、同じ培地中で平衡化した。次いで、細胞のアリコート各群について0.5~1.0×106細胞/0.1mlを、氷上に15分間保持し、そして100μlのOV569ハイブリドーマ細胞培養上清中に4°Cで1時間再懸濁した。細胞を染色緩衝液5ウシ胎仔血清を含有するIMDM培地で3回洗浄し、そして1群あたり0.1mlのフルオレセイン結合体化ヤギ抗マウス免疫グロブリンFITC-GaMIg、BioSourceInternational,Inc.,Camarillo,CA供給元の推奨に従って染色緩衝液で希釈した中で4°Cで30分間再懸濁した。細胞を再び3回洗浄し、0.5mlの冷却染色緩衝液に再懸濁し、そして分析するまで4°Cで暗所に保存した。フロー免疫細胞蛍光検出を、CoulterEpicsCFACS細胞蛍光検出器CoulterCorp.,Miami,FLを用いて製造業者の説明書に従って行い、順方向および側方の散乱パラメーターscatterparameterをゲート制御gateして、単一細胞の事象を記録した。平均蛍光強度を各サンプルについて決定し、そして線形蛍光当量LFEを、CoulterEpicsCFACSに装備されたソフトウェアを用いて計算した。陰性コントロールサンプル第1抗体インキュベーション工程の間に無関係の特異性のMAbでインキュベートしたのLEFで除算した各試験サンプルのLEFにより、特異的に免疫蛍光染色した細胞の相対的明るさと陰性抗体で染色した細胞の相対的明るさとを比較するための比が与えられた。結果を表3に示す。実施例5:OV569卵巣癌抗原を内在化しないヒト癌細胞MAbOV569によって規定される抗原が抗原陽性癌細胞によって内在化され得るか否かを決定するために、免疫蛍光抗体局在化アッセイを、レーザー走査共焦点顕微鏡を使用して行った。上記例えば、Hellstromら、1990CancerRes.50:2183のように、外科手術切除に続いて培養するために適合されたヒト肺癌細胞H4013、または卵巣癌細胞H4007を、10胎仔ウシ血清を含むIMDM培養培地GibcoBRL、GrandIsland、NYで培養し、加湿された大気中、5CO2、37°Cで48時間、ガラススライドNUNCチャンバカバースリップ、NUNC、Rochester、NYに接着させた。免疫蛍光抗体標識化のために、細胞を15分間4°C細胞表面抗原の内在化には非許容性の温度で平衡化させた。FITC結合OV569を、製造業者の勧めに従って、固定化プロテインARepliGen、Cambridge、MA上にアフィニティー精製されたMAbOV569を用いて記載された条件下Weir,D.M.、HandbookofExperimentalImmunology、1986、BlackwellScientific、Bostonで、フルオレセインイソチオシアネートSigma、St.Louis、MOのインキュベーションによって調製した。FITC-OV569またはネガティブコントロールとしてFITC結合ヤギ抗マウスIgGTago、Burlingame、CAのいずれかを、各カバースリップをカバーするのに十分な容積で、4°Cで1時間、10μm/mlの濃度で細胞に加えた。結合していない抗体を、冷たい培養培地を用いてカバースリップを広範囲にリンスすることによって除いた。次いで、細胞を37°C特定の細胞表面抗原の内在化を許容する温度で、種々の時間インキュベートしたHellstromら、1990Canc.Res.50:2183。37°Cのインキュベーション期間を、冷PBSを培養物に添加し、そして細胞をPBS中の2ホルムアルデヒドで15分間室温で後固定するpost-fixngことによって終結した。次いで、各カバースリップを、供給業者の指示に従って抗退色剤ジチオエリスリトールSigma、St.Louis、MO、またはVectaStain抗退色試薬VectorLaboratories、Burlingame、CAを用いて処理した。レーザー走査共焦点顕微鏡イメージを、製造業者の指示に従って、フルオレセイン検出フィルターを備えたLeica共焦点顕微鏡Leica、Inc.、Deerfied、ILを用いて得た。共焦点イメージは、4°Cで抗体に対して曝され、洗浄され、そしてすぐに固定した、ヒト卵巣癌細胞およびヒト肺癌細胞の表面に対してFITC-MAbOV569の排他的局在化を示した。FITC-MAbOV569を用いて4°Cで染色された細胞を8時間以上37°Cに移した場合、検出可能なFITC-MAbOV569は、細胞表面に排他的に局在化したままであり、そして細胞質蛍光染色は観測されなかった。実施例6:OV569卵巣癌抗原のイムノブロット特徴付けこの実施例は、ウエスタンイムノブロット分析を使用して、MAbOV569によって認識されたヒト癌細胞表面抗原の特徴付けを記載する。溶解物を含むイムノブロット分析用サンプルを、以下のヒト細胞株から調製した:H4013肺癌細胞溶解物図1、レーン5、OVCAR-3卵巣癌細胞溶解物Amer.TypeCultureCollection、Manassas、VA図1、レーン7、および6K腎臓癌細胞溶解物図1、レーン8を、標準的な手順CurrentProtocolsinImmunology、J.E.Coliganら編、1998JohnWileySons、NYに従って調製した。タンパク質を、製造業者の指示に従って、BradfordCommassieタンパク質アッセイ試薬PierceChemicals、Inc.、Rockford、ILを使用して定量化した。イムノブロット分析のための他のサンプルは、ヒト患者から誘導され、そして上の実施例2に記載されたような固定化されたMAbOV569のカラムでアフィニティー精製された物質を含んだ。これらのサンプルは、卵巣癌を有する患者からの卵巣癌腹水流体のOV569アフィニティー精製された画分図1、レーン2、および肺癌を有すると診断された患者の流体で満たされた胸膜間腔interpleuralmembranecavityから収集された胸膜液のOV569アフィニティー精製された画分図1、レーン3を含んだ。流体サンプル調製およびアフィニティークロマトグラフィーは、それぞれ以下の実施例7および上の実施例2に記載された通りであった。イムノブロット分析のための他のサンプルは、ヒト癌細胞株から誘導され、そして上の実施例2に記載される固定化されたMAbOV569のカラム上にアフィニティー精製された物質を含んだ。これらのサンプルは、H4013肺癌図1、レーン4、OVCAR-3卵巣癌ATCC、Manassas、VA図1、レーン6のOV569アフィニティー精製された画分を含んだ。実施例2に記載されたD2hIg融合タンパク質もまた分析された図1、レーン1。タンパク質内容物によって標準化された各サンプルを、SDSサンプル緩衝液Novex、SanDiego、CAを用いて1:1に希釈し、20μl300ng/レーンを14Tris-グリシンゲルNovex、SanDiego、CA上にロードし、そしてゲルを製造業者の指示に従って、約1.5時間、125VでSDS電気泳動緩衝液を使用する電気泳動に供した。ゲル電気泳動に続いて、分離されたタンパク質を、Tris-グリシンSDS移動緩衝液および製造業者によって勧められた電気泳動移動条件を使用して、PVDF膜Novex、SanDiego、CA上にエレクトロブロットした。抗体調査の前に、PVDF膜を、室温で1時間、洗浄緩衝液0.2Tween20-PBS中の5脱脂乳でブロックし、続いて洗浄緩衝液で、10分間1回、および5分間2回洗浄した。次に、この膜を、1時間室温で、1脱脂乳を含む洗浄緩衝液中に3μg/mLまで希釈されたプロテインAアフィニティー精製MAbOV569の溶液4.6mg/mlに浸し、続いて上記のように一連の3回の洗浄を行った。特異的に結合されたMAbOV569の検出は、西洋ワサビペルオキシダーゼHRP結合二次抗体の化学発光検出を使用して達成された。手短には、膜を、1脱脂乳を含む洗浄緩衝液中のHRP標識ヤギ抗マウスIgG抗体ZymedLaboratories、SouthSanFrancisco、Californiaの1:5000希釈物中で1時間室温でインキュベートし、次いで洗浄緩衝液中にブロットを10分間1回、次いで5分間4回それぞれ浸すことによって、非結合抗体を除いた。ECL化学発光基質ECL-Amersham、Buckinghamshire、Englandを、供給業者の指示に従って暗い部屋内で1分間この膜に適用し、続いてX-omat放射線フィルムKodak、Rochester、NYに手短に曝露した。図1は、MAbOV569を結合することによって検出された、電気泳動的に分割された種のパターンを示し、これは、種々のヒト癌から誘導されるサンプル中の42~45kDaの見かけの相対分子量を有する成分を同定する。実施例7:モノクローナル抗体OV569によって認識されるメソセリン関連抗原MRA、癌抗原は、メソセリンポリペプチドであるこの実施例は、癌患者からの生物学的サンプル中に可溶性形態で天然に存在し、MAbOV569によってメソセリンポリペプチドとして認識される分子の同定を記載する。この天然に可溶性のメソセリンポリペプチドは、本明細書中で、メソセリン関連抗原MRAと呼ばれる。肺癌を有するとして診断された患者から単回引出しsingledrawingによってヘパリン処理されたチューブに収集された胸膜液2リットルを、細胞を除くために遠心分離によって清澄化し、PBSを用いて1:1v/vに希釈し、そして、イムノアフィニティークロマトグラフィーの前に、3MMフィルターペーパーWhatman、Clifton、NJを通して濾過した。希釈された胸膜液を、固定化されたMAbOV569のカラムに適用し、カラムを非結合成分を除去するために洗浄し、そして特異的に結合された物質を、実施例2に記載されたように溶出し、そして回収した。結合され、そして溶出された画分を、3mMグリシン-0.2NNaOH中和緩衝液の添加によって中和した。プールされ、溶出されたOV569結合物質を、可能性として存在するシステイン残基による人為的なジスルフィド結合の形成を妨げるために、数グレインの結晶性ヨードアセトアミドSigma、St.Louis、MOの添加によってアルキル化し、この物質をSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分割し、そしてブロットを、分割ゲルが7.5ポリアクリルアミドを含んだ以外、実施例6に記載された通りに、PVDF膜に移した。PVDF膜のレーンを、N末端配列分析のために約40kDaの拡散したバンドを局在化するために、実施例6にまた記載されるとおりにMAbOV569を用いて、免疫染色した。約40kDaのバンドのアミノ酸配列を、ABIModel473固相シークエンサーAppliedBiosystemsInc.、FosterCity、CA上での逐次的エドマン分解によって分析した。部分配列分析は、OV569アフィニティー単離された40kDaポリペプチドについて、以下のN末端アミノ酸配列を明らかにした:EVEKTACPSGKKAREIDES配列番号5このアミノ酸配列は、メソセリンポリペプチドファミリーの新規な天然に可溶性のメンバーの部分アミノ酸配列を示す。配列番号5のアミノ酸配列はまた、メソセリン本明細書中に提供されるように天然に可溶性の分子として検出可能でない中皮、中皮腫および卵巣癌上に発現される細胞表面差示的抗原Changら、1992Int.J.Canc.50:373;Changら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136の294~312の位置に存在し、本明細書に記載される可溶性OV569結合ポリペプチドは、メソセリン関連抗原MRAと呼ばれている。上記のように、配列番号5のアミノ酸配列はまた、MPF前駆体タンパク質の細胞表面膜結合すなわち、本明細書中に提供されるように可溶性ではない部分に存在するKojimaら、1995J.Biol.Chem.270:21984。上記のように、メソセリンおよびMPFは、可溶性で、かつ細胞表面に結合された生成物にタンパク質分解的にプロセスされる約70kDaの前駆体として合成されるChangら、1996Proc.Nat.Acad.Sci.USA93:136;Chowdhuryら、1998Proc.Nat.Acad.Sci.USA95:669;Kojimaら、1995J.Biol.Chem.270:21984;Yamaguchiら、1994J.Biol.Chem.269:805。OV569エピトープが存在するドメイン可溶性かまたは膜に会合を同定するために、2人のヒト免疫グロブリン定常領域融合タンパク質を構築した。D1hIgは、33kDaのMPF可溶性ドメインを含んだがChangら、1996;Kojimaら、1995、一方、D2hIgは、MPFの44kDa膜結合ドメインを含んだChangら、1996;実施例2を参照のこと。OV569の特異性は、上記のように従来のELISA法によって試験された。図2に示されるように、OV569は、D2hIgに結合したが、D1hIgを認識しなかった。実施例8:患者の悪性滲出液および血清におけるモノクローナル抗体OV569によって規定される卵巣癌の検出のためのアッセイこの実施例は、MRA、メソセリンポリペプチドファミリーの新規で天然に可溶性のメンバーの検出のためのサンドイッチELISAイムノアッセイを記載する。このアッセイは、MAbOV569およびMAb4H3を使用し、これは、MRA上に存在する別のエピトープに結合する。MaxisorpImmunoTMプレートNalgeNuncInternational、Napeville、ILのウェルを、炭酸-重炭酸緩衝液C-3041、Sigmaの50μl/ウェル中の、プロテインAイムノアフィニティーImmunoPureA/GIgGPurificationKit、PierceChemicals、Rockford、Illinois精製されたMAb4H3免疫グロブリンの50ngを用いて4°Cで一晩コーティングした。次の日に、ウェルをドレインし、200μl/ウェルのGSCブロック緩衝液GeneticSystemsCorp.、Redmond、WAを用いて室温で2時間ブロックした。次いで、ウェルを4回、0.1Tween20FischerChemicals、Fairlawn、NewJerseyを含む200μl/ウェルのPBSを用いて洗浄した。アッセイを開始するために、ブロック緩衝液中に希釈された患者血清の一連の倍加希釈物1:40~1:1280のウェル当たり100μlを加え、そしてプレートを1時間室温に保持した。ウェルをPBS-0.1Tween-20を用いて4回洗浄し、その後、50μl/ウェルのビオチン化MAbOV569実施例2に記載されるように調製される、結合体希釈物GeneticSystems中の200ng/mlを加え、そして1時間室温でインキュベートさせた。ウェルを再びPBS-Tweenで4回洗浄した。次に、結合体希釈物中に1:1000に希釈された50μl/ウェルのHRP-ストレプトアビジンPharMingen、SanDiego、CAを加え、そしてプレートを室温で45分間維持した。ウェルを4回PBS-Tweenで洗浄し、そして緩衝化された3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジンTMB、GeneticSystemsおよび1v/vのHRP-ストレプトアビジン結合体を15分間加えることによって、発展させた。この反応を2MH2SO4の添加によって停止させ、そしてプレートを、Spectracountマイクロプレート分光光度計PackardInstrumentCo.、Meriden、CTを使用して460nmで読んだ。2人の患者由来の陽性コントロール血清サンプルおよび陰性コントロール血清サンプルを全てのアッセイの中に含んだ。陰性コントロール血清は、健康なボランティア由来であり、1:40の希釈物で存在する場合、検出可能なシグナルを与えなかった。陽性コントロールcは、卵巣癌を有すると診断された患者由来であり、そして1:1280以下の希釈物で存在する場合、記載されたアッセイ条件下で容易に検出可能なシグナルを提供した。図3は、MRAの検出のためのサンドイッチELISAイムノアッセイを使用する代表的な結果を示す。2つのMAb、4H3およびOV569によって認識される可溶性分子は、2人の卵巣癌患者由来の血清2896および2897および肺癌患者由来の血清3Lにおいて容易に検出され、そして滴定可能な反応性として相対的に定量化され得た。陽性コントロール血清cはまた、MRA結合MAbとの反応性を示し、これは希釈因子が増加するにつれて減少した。卵巣癌を有するとして診断されたさらなる患者由来の血清、および種々の他の腫瘍を有する患者由来の血清は、MRAの検出のためのサンドイッチELISAイムノアッセイを使用してアッセイされた。非新生物性疾患を有するさらなる患者の血清および健康な患者由来の血清もまたこのアッセイを使用して比較された。結果の要旨は、図4に図式で示される。1:160の血清希釈物において、第3段階または第4段階の卵巣癌を有した患者由来の30の血清のうちの23は、健康なボランティア由来の60の血清のうちの0と比較して、有意に上昇した循環MRAレベルを示した。同じ判断基準を使用して、卵巣癌以外の腫瘍を有する患者由来の75の血清のうちの25が、MRAサンドイッチELISA中で検出可能な反応性を示し、陽性血清のうち最高の頻度66は、肺癌を有する患者において観測された表4。非新生物性疾患を有する3人の患者由来の血清は、MRAサンドイッチELISAにおいてネガティブであった。実施例9:メソセリン関連抗原MRA-1をコードする核酸配列の分子クローニングおよび配列決定モノクローナル抗体OV569が、MPFの膜結合ドメインD2hIgを認識するが、可溶性ドメインD1hIgを認識せず、しかし胸膜液由来の可溶性ポリペプチドを親和性単離するために使用され得た実施例7ので、新規メソセリン関連抗原MRAの正体を決定した。この実施例は、モノクローナル抗体OV569によって規定される抗原からの配列情報を使用する、ヒト前立腺癌株由来の、MRA、MRA-1をコードするcDNA分子のクローニングおよび配列決定を記載する。プラスミド単離、コンピテント細胞の生成、形質転換およびM13操作を、公開された手順に従って行ったSambrookら、MolecularCloning、aLaboratoryManual、ColdSpringHarborLaboratoryPress、ColdSpringHarbor、NY、1989。全RNAを、RNAgentTMキットPromega,Inc.、Madison、WIを使用してヒト前立腺癌細胞株から単離し上記のように生成されたHE1P、例えば、Hellstromら、1990CancerRes.50:2183を参照のこと、そして、ポリAおよびRNAを、mRNASeparatorTMClontech,Inc.、PaloAlto、CAを用いて全RNAから精製した共に製造業者の勧めに従った。MarathonTMcDNA増幅キットClontech、PaloAlto、CAを使用してRNAを逆転写し、二重鎖cDNAを作製した。この二重鎖cDNAを、供給業者の指示に従って、MarathonTMキットを備えるアダプターにライゲーションし、そしてEXPANDTM高忠実度PCRシステムRocheMolecularBiochemicals、Indianapolis、INを使用して増幅した。この増幅のために、第1オリゴヌクレオチドプライマーは、MarathonTMアダプター配列に特異的であり、そして第2プライマーは、OV569抗原のN末端配列についてのコード領域[配列番号5]に対応し、そしてMPFcDNA配列Kojimaら、1995から誘導される以下の配列を有した:GSP1:5’--GGAAGTGGAGAAGACAGCCTGTCCTTC--3’配列番号6PCR産物を、pGEM-TベクターPromega、Madison、WIにライゲートし、そしてライゲーション混合物を、DH5αコンピテント細胞LifeTechnologies、Gathersburg、MD中に形質転換した共に、製造業者の指示に従った。プラスミドを、QIAprepTMスピンミニプレップspinminiprepキットQiagen、Valencia、CAを使用して形質転換されたDH5α細胞の個々のコロニーから単離し、そしてBigDyeTMターミネーターサイクルterminatorcycle配列決定キットPEAppliedBiosystems、FosterCity、CAを使用して配列決定した。10個のクローンを単離し、これは、MPFcDNA配列Kojimaら、1995と同一の核酸配列を保有する8個、メソセリンChangら、1996と同一の配列を有する1個、および配列決定する際に、核酸配列を明らかにした1個図5A~Bおよび配列番号3を含み、この核酸配列図5A~Bおよび配列番号3は、MPFおよびメソセリン配列に関連するが、またMPFコード配列のヌクレオチド1874Kojimaら、1995に対応するヌクレオチド位置に82bpの挿入物を含み、これは212bpのフレームシフトを誘導した。配列分析は、このフレームシフトが、本明細書中においてメソセリン関連抗原-1MRA-1と呼ばれる新規なポリペプチドに対するコード配列において生じたことを示し、メソセリン関連抗原-1MRA-1は、MPFとメソセリンの両方とは異なり、親水性C末端テイルを含み、従って、水性の生理学的環境に可溶性であるようである。MRA-1のC末端98アミノ酸は、MPFまたはメソセリンのいずれかのC末端領域に見出されるいずれかのアミノ酸配列とは異なった。驚くことに、この新規タンパク質をコードする核酸配列配列番号3は、停止コドンを含まないが、代わりにポリAテイルに対するポリアデニル化部位に直接続いた。この停止コドンの欠失は、新生物細胞におけるこの配列の起源に関連し得る。MRA-1配列は、メソセリンDNA配列に存在するが、MPF配列には存在しない24bpの挿入物を欠いた点、および単一の塩基の差がMPFとメソセリンとの間に見出される二つのヌクレオチド位置においてMPFと同一であった点で、メソセリンよりもMPFにより密接に関連した。MRA-1ポリペプチド配列配列番号1は、図5A~Bに示される。実施例10:メソセリン関連抗原MRA-2の逆PCRinversePCRクローニングこの実施例は、MRA改変体MRA-2、ヒト結腸癌細胞株由来をコードするcDNA分子のクローニングおよび配列決定を記載する。MRA-2は、N末端において3つのさらなるアミノ酸FRRの存在配列番号2によってMRA-1とは異なり、そして以下に記載される様式と同一に様式によって、MRA-1の完全C末端領域を欠き、その代わりに、MRA-1の残基325に対応するアミノ酸位置で終結する。プラスミド単離、コンピテント細胞の生成、形質転換、および関連操作を、出版された手順Sambrookら、MolecularCloning、aLaboratoryManual、ColdSpringHarborLaboratoryPress、ColdSpringHarbor、NY、1989に従って行った。逆PCRZeinerら、1994Biotechniques17:1051を使用して、上記例えば、Hellstromら、1990CancerRes.50:2183を参照のことのように生成された細胞株である、3719の結腸癌由来のMRAをコードする核酸分子をクローニングした。手短には、全RNA5mgを、TrizolTM試薬GIBCO-BRL、GrandIsland、NYを使用して、3719の細胞のバルク培養物から抽出し、供給業者によって指示されるとおりに、ポリAmRNAをPolyATtractTMオリゴ-dTコーティング磁性ビーズPromega,Inc.,Madison、WIを使用して精製した。第1鎖のcDNA合成を、実施例9のMRAヌクレオチド配列において同定された82bp挿入物の56~80の位置にてヌクレオチドを含む部分に特異的なオリゴヌクレオチドプライマーを使用して逆転写により開始された:op56~80:5’-GCGCTCTGAGTCACCCCTCTCTCTG-3’配列番号7cDNA第2鎖を、実施例9に記載されるとおりにMarathonTMアダプタープライマーを使用して生成したClontech、PaloAlto、CA。cDNAを200μlの反応容積中のMarathonTMキットプロトコルClontechを使用して、15°Cで24時間それ自身に再ライゲーションすることによって環状にし得た。このライゲーション混合物から、5μlのアリコートを、以下のプライマーを用いるPCR反応のテンプレートとして、使用した:mpff735:AGAAACTTCTGGGACCCCAC配列番号8mpfr290:GGGACGTCACATTCCACTTG配列番号9および以下の入れ子nestedプライマー:GSP-25’-GAAGGACAGGCTGTCTTCTCCACTTCCC-3’配列番号10r80-545’-CAGAGAGAGGGGTGACTCAGAGC-3’配列番号11。PCR産物を、BigDyeTMターミネーターサイクル配列決定キットPEAppliedBiosystems、FosterCity、CAを使用して配列決定した。得られたDNA配列配列番号4、図6A~Bは、配列番号3の1位のヌクレオチドに対して9のさらなるbpを配置された5’の存在を除いて、実施例9に記載されたMRA-1DNA配列配列番号3の1~978位におけるヌクレオチドと同一であった。これらの9個のヌクレオチドは、N末端トリペプチドFRPをコードし、これは、本明細書中においてMRA-2として呼ばれる、配列番号2のアミノ酸1~3を含む。これらの3つのヌクレオチドコドンは、メソセリンとその前駆体との間Changら、1996、およびMPFとその前駆体との間Kojimaら、1995の切断部位のコード配列上流に見出される3つのコドンと同一である。従って、推論された可溶性メソセリン関連SMR抗原ポリペプチド配列配列番号13は、図7A~Bに示され、これは、このようなSMRポリペプチドをコードする核酸配列配列番号14である。SMRは、MRA-2において同定されたFRRN末端トリペプチドおよび上記のように、MRA-1配列番号1の全ポリペプチド配列配列番号1を含み、このC末端は、ポリアデニル化部位に伸長するが、停止コドンを欠くヌクレオチド配列によってコードされる。実施例11:卵巣癌細胞株におけるMRAの発現この実施例において、ヒト卵巣癌細胞株由来のcDNAライブラリー中のMRAコード核酸配列の検出が記載される。RNAは、培養された3997個の卵巣癌細胞上記のように生成され、例えばHellstromら、1990CancerRes.50:2183を参照のことから抽出され、そして製造業者の指示に従って、MarathonTMcDNA増幅キットClontech、PaloAlto、CAを使用して逆転写によってcDNAライブラリーを作製するために使用した。ライブラリーを、pCDNA3-ZeoInVitrogen,Inc.,Sandiego,CAにおいてクローニングし、そしてノーザンブロットへのオリゴヌクレオチドプローブのハイブリダイゼーションによってスクリーニングした。以下のオリゴヌクレオチドは、実施例9に記載されたMRA82ヌクレオチド挿入物の領域に対応して合成される:i35:5’-CCAGGGCTGGGGGCAGAGCTGGGGGGGCGTGGAGGTG-3’配列番号12。[32P]用いたi35の末端標識を、供給業者の指示に従って、PrimerExtensionSystemPromega、Madison、WIを使用して行い、標識オリゴヌクレオチドを使用して、周知の手順に従って、種々のヒト組織MTNTMMutitpleTissueNorthernBlot、Cat.No.7760-1、Clontech、PaloAlto、CAからの電気泳動的に分離されたRNAサンプルを含むノーザンブロットを調査した。スクリーニングアッセイによって同定された個々のクローンを選択し、増幅し、そして実施例10に記載されるように配列決定し、卵巣癌細胞株からのMRA配列を決定する。上記から、本発明の特定の実施形態が本明細書中に例示の目的のために記載されたが、種々の改変が本発明の精神および範囲から逸脱することなしになされ得ることが理解される。従って、本発明は、添付の特許請求の範囲による以外制限されない。"