電解質90の両側に一対の電極92、94が設けられる電解質電極構造体22aと平面が矩形状のセパレータ20とが積層され、前記セパレータ20の互いに対向する一方の2辺には、積層方向に貫通するとともに、電極面に沿って反応ガスを流すための反応ガス流路に連通して反応ガス入口連通孔及び反応ガス出口連通孔が設けられ、前記セパレータ20の互いに対向する他方の2辺には、少なくとも前記反応ガス入口連通孔又は前記反応ガス出口連通孔に近接し、且つそれぞれ各辺に振り分けられて冷却媒体を流すための一対の冷却媒体入口連通孔34a及び一対の冷却媒体出口連通孔34bが設けられる燃料電池の運転方法であって、前記反応ガスである燃料ガスを流通させる前記反応ガス流路である燃料ガス流路36の少なくとも一部が、水により閉塞されたか否かを検出する工程と、前記燃料ガス流路36の少なくとも一部が、前記水により閉塞されたと判断された際、前記反応ガス出口連通孔に隣接する前記冷却媒体出口連通孔34bへの前記冷却媒体の流通を規制する工程と、を有することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項1記載の運転方法において、前記反応ガス出口連通孔は、燃料ガス出口連通孔32bであることを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項2記載の運転方法において、前記燃料ガス流路36の少なくとも一部が、前記水により閉塞されたと判断された際、前記燃料ガス出口連通孔32bに隣接する前記冷却媒体出口連通孔34bと同一の辺に設けられた前記冷却媒体入口連通孔34aからの前記冷却媒体の流通を規制することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項2記載の運転方法において、前記燃料電池は、前記電解質電極構造体22aと前記セパレータ20とが交互に2回以上積層された発電ユニット18を有し、前記発電ユニット18間に冷却媒体流路44が形成されることを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項1記載の運転方法において、前記セパレータ20の前記一方の2辺には、燃料ガス入口連通孔32a及び酸化剤ガス入口連通孔30aと、燃料ガス出口連通孔32b及び酸化剤ガス出口連通孔30bとが、それぞれ積層方向に貫通して各辺に設けられており、前記燃料ガス流路36の少なくとも下流側の一部が、前記水により閉塞されたと判断された際、前記酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bへの前記冷却媒体の流通を規制する工程を有することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項5記載の運転方法において、前記燃料ガス流路36の下流側で且つ前記燃料ガス出口連通孔32bよりも前記酸化剤ガス出口連通孔30bに近接する部分が、前記水により閉塞されたと判断された際、前記酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する前記冷却媒体出口連通孔34bへの前記冷却媒体の流通を規制することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項5記載の運転方法において、前記燃料電池は、前記電解質電極構造体22aと前記セパレータ20とが交互に2回以上積層された発電ユニット18を有し、前記発電ユニット18間には、前記電極面の面方向に沿って前記冷却媒体を流通させる冷却媒体流路44が形成されることを特徴とする燃料電池の運転方法。電解質90の両側に一対の電極92、94が設けられる電解質電極構造体22aと平面が矩形状のセパレータ20とが積層され、前記セパレータ20の互いに対向する一方の2辺には、積層方向に貫通するとともに、電極面に沿って反応ガスを流すための反応ガス流路に連通して反応ガス入口連通孔及び反応ガス出口連通孔が設けられ、前記セパレータ20の互いに対向する他方の2辺には、少なくとも前記反応ガス入口連通孔又は前記反応ガス出口連通孔に近接し、且つそれぞれ各辺に振り分けられて冷却媒体を流すための少なくとも一対の冷却媒体入口連通孔34a及び少なくとも一対の冷却媒体出口連通孔34bが、前記積層方向に貫通して設けられる燃料電池の運転方法であって、前記反応ガス流路の少なくとも一部が、水により閉塞されたか否かを検出する工程と、前記反応ガス流路の少なくとも一部が、前記水により閉塞されたと判断された際、少なくとも各冷却媒体入口連通孔34aへの前記冷却媒体のそれぞれの供給量又は各冷却媒体出口連通孔34bからの前記冷却媒体のそれぞれの排出量のいずれかを、異なる量に制御する工程と、を有することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項8記載の運転方法において、前記反応ガス流路の少なくとも一部が、前記水により閉塞されたと判断された際、前記反応ガス出口連通孔である燃料ガス出口連通孔32b又は酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する前記冷却媒体出口連通孔34bへの前記冷却媒体の流通を規制するとともに、前記冷却媒体の流通を規制された前記冷却媒体出口連通孔34bと同一の辺に設けられた前記冷却媒体入口連通孔34aからの前記冷却媒体の流通を規制することを特徴とする燃料電池の運転方法。請求項8記載の運転方法において、前記燃料電池は、前記電解質電極構造体22aと前記セパレータ20とが交互に2回以上積層された発電ユニット18を有し、前記発電ユニット18間には、冷却媒体流路44が形成されることを特徴とする燃料電池の運転方法。電解質90の両側に一対の電極92、94が設けられる電解質電極構造体22aと平面が矩形状のセパレータ20とが積層され、前記セパレータ20の互いに対向する一方の2辺には、積層方向に貫通するとともに、電極面に沿って反応ガスを流すための反応ガス流路に連通する反応ガス入口連通孔及び反応ガス出口連通孔が設けられ、前記セパレータ20の互いに対向する他方の2辺には、少なくとも前記反応ガス入口連通孔又は前記反応ガス出口連通孔に近接し、且つそれぞれ各辺に振り分けられて冷却媒体を流すための少なくとも一対の冷却媒体入口連通孔34a及び少なくとも一対の冷却媒体出口連通孔34bが、前記積層方向に貫通して設けられる燃料電池を備える燃料電池システムであって、前記セパレータ20の他方の2辺の中、第1の辺側に設けられる前記冷却媒体入口連通孔34a及び前記冷却媒体出口連通孔34bに、それぞれ接続される第1供給路106a及び第1排出路108aと、前記セパレータ20の他方の2辺の中、第2の辺側に設けられる前記冷却媒体入口連通孔34a及び前記冷却媒体出口連通孔34bに、それぞれ接続される第2供給路106b及び第2排出路108bと、前記第1供給路106aの途上と前記第1排出路108aの途上とに接続される第1分岐路134aと、前記第2供給路106bの途上と前記第2排出路108bの途上とに接続される第2分岐路134bと、少なくとも前記第1分岐路134a及び前記第2分岐路134bに、それぞれ配設される弁機構132e、132fと、前記反応ガス流路の少なくとも一部が、水により閉塞されたか否かを判断するコントローラ16と、を備えることを特徴とする燃料電池システム。請求項11記載の燃料電池システムにおいて、少なくとも前記第1供給路106a及び前記第2供給路106b、又は前記第1排出路108a及び前記第2排出路108bのいずれかに、弁機構が配設されることを特徴とする燃料電池システム。請求項11記載の燃料電池システムにおいて、前記弁機構は、可変絞り弁132a~132dを備えることを特徴とする燃料電池システム。請求項11記載の燃料電池システムにおいて、前記弁機構は、三方弁110a、110b、112a、112bを備えることを特徴とする燃料電池システム。請求項11記載の運転システムにおいて、前記燃料電池は、前記電解質電極構造体22aと前記セパレータ20とが交互に2回以上積層された発電ユニット18を備えるとともに、前記発電ユニット18間には、冷却媒体流路44が形成されることを特徴とする燃料電池システム。図1に示すように、本発明の第1の実施形態に係る運転方法が適用される燃料電池スタック燃料電池10は、燃料電池システム12に組み込まれる。この燃料電池システム12は、例えば、車両図示せずに搭載される車載用燃料電池システムを構成する。燃料電池システム12は、燃料電池スタック10に酸化剤ガスを供給する酸化剤ガス供給装置図示せずと、前記燃料電池スタック10に燃料ガスを供給する燃料ガス供給装置図示せずと、前記燃料電池スタック10に冷却媒体を供給する冷却媒体供給装置14と、前記燃料電池システム12全体を制御するコントローラ16とを備える。図2及び図3に示すように、燃料電池スタック10は、縦長形状の発電ユニット18を備え、複数の前記発電ユニット18が、水平方向矢印A方向に沿って互いに積層される。発電ユニット18は、第1セパレータ20、第1電解質膜電極構造体電解質電極構造体MEA22a、第2セパレータ24、第2電解質膜電極構造体電解質電極構造体MEA22b及び第3セパレータ26を設ける。第1セパレータ20、第2セパレータ24及び第3セパレータ26は、例えば、金属セパレータで構成されているが、カーボンセパレータ等により構成されてもよい。なお、発電ユニット18は、3枚のセパレータと2枚の電解質膜電極構造体とで構成されているが、これに限定されるものではない。例えば、4枚のセパレータと3枚の電解質膜電極構造体とで構成してもよい。図2に示すように、発電ユニット18の長辺方向矢印C方向の上端縁部には、矢印A方向に互いに連通して、酸化剤ガス、例えば、酸素含有ガスを供給するための酸化剤ガス入口連通孔30a、及び燃料ガス、例えば、水素含有ガスを供給するための燃料ガス入口連通孔32aが設けられる。発電ユニット18の長辺方向矢印C方向の下端縁部には、矢印A方向に互いに連通して、燃料ガスを排出するための燃料ガス出口連通孔32b、及び酸化剤ガスを排出するための酸化剤ガス出口連通孔30bが設けられる。発電ユニット18の短辺方向矢印B方向の両端縁部上方には、矢印A方向に互いに連通して、冷却媒体を供給するための少なくとも一対の冷却媒体入口連通孔34a、34aが設けられるとともに、前記発電ユニット18の短辺方向の両端縁部下方には、前記冷却媒体を排出するための少なくとも一対の冷却媒体出口連通孔34b、34bが設けられる。各冷却媒体入口連通孔34a、34aは、酸化剤ガス入口連通孔30a及び燃料ガス入口連通孔32aに近接し、且つそれぞれ矢印B方向両側の各辺に振り分けられる。各冷却媒体出口連通孔34b、34bは、酸化剤ガス出口連通孔30b及び燃料ガス出口連通孔32bにそれぞれ近接し、且つそれぞれ矢印B方向両側の各辺に振り分けられる。冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bは、それぞれ3つ以上設けてもよい。第1セパレータ20の第1電解質膜電極構造体22aに向かう面20aには、燃料ガス入口連通孔32aと燃料ガス出口連通孔32bとを連通する第1燃料ガス流路36が形成される。第1燃料ガス流路36は、矢印C方向に延在する複数の流路溝部36aを有するとともに、前記第1燃料ガス流路36の入口近傍及び出口近傍には、それぞれ複数のエンボスを有する入口バッファ部38及び出口バッファ部40が設けられる。図4に示すように、第1セパレータ20の面20bには、冷却媒体入口連通孔34aと冷却媒体出口連通孔34bとを連通する冷却媒体流路44の一部である複数の流路溝部44aが形成される。流路溝部44aの入口近傍及び出口近傍には、それぞれ複数のエンボスを有する入口バッファ部46a及び出口バッファ部48aが設けられる。図2に示すように、第2セパレータ24の第1電解質膜電極構造体22aに向かう面24aには、酸化剤ガス入口連通孔30aと酸化剤ガス出口連通孔30bとを連通する第1酸化剤ガス流路50が形成される。第1酸化剤ガス流路50は、矢印C方向に延在する複数の流路溝部50aを有する。第1酸化剤ガス流路50の入口近傍及び出口近傍には、入口バッファ部52及び出口バッファ部54が設けられる。第2セパレータ24の第2電解質膜電極構造体22bに向かう面24bには、燃料ガス入口連通孔32aと燃料ガス出口連通孔32bとを連通する第2燃料ガス流路58が形成される。第2燃料ガス流路58は、矢印C方向に延在する複数の流路溝部58aを有するとともに、前記第2燃料ガス流路58の入口近傍及び出口近傍には、入口バッファ部60及び出口バッファ部62が設けられる。第1及び第2燃料ガス流路36、58は、燃料ガスを重力方向に沿って流通させる。第3セパレータ26の第2電解質膜電極構造体22bに向かう面26aには、酸化剤ガス入口連通孔30aと酸化剤ガス出口連通孔30bとを連通する第2酸化剤ガス流路66が形成される。第2酸化剤ガス流路66は、矢印C方向に延在する複数の流路溝部66aを有する。第2酸化剤ガス流路66の入口近傍及び出口近傍には、入口バッファ部68及び出口バッファ部70が設けられる。第1及び第2酸化剤ガス流路50、66は、酸化剤ガスを重力方向に沿って流通させる。第3セパレータ26の面26bには、冷却媒体流路44の一部である複数の流路溝部44bが形成される。流路溝部44bの入口近傍及び出口近傍には、それぞれ複数のエンボスを有する入口バッファ部46b及び出口バッファ部48bが設けられる。第1セパレータ20の面20a、20bには、この第1セパレータ20の外周端縁部を周回して第1シール部材74が、個別に又は一体に設けられる。第2セパレータ24の面24a、24bには、この第2セパレータ24の外周端縁部を周回して第2シール部材76が、個別に又は一体に設けられるとともに、第3セパレータ26の面26a、26bには、この第3セパレータ26の外周端縁部を周回して第3シール部材78が、個別に又は一体に設けられる。第1セパレータ20は、燃料ガス入口連通孔32aと第1燃料ガス流路36とを連通する複数の外側供給孔部80a及び内側供給孔部80bと、燃料ガス出口連通孔32bと前記第1燃料ガス流路36とを連通する複数の外側排出孔部82a及び内側排出孔部82bとを有する。第2セパレータ24は、燃料ガス入口連通孔32aと第2燃料ガス流路58とを連通する複数の供給孔部84と、燃料ガス出口連通孔32bと前記第2燃料ガス流路58とを連通する複数の排出孔部86とを有する。発電ユニット18同士が互いに積層されることにより、一方の発電ユニット18を構成する第1セパレータ20と、他方の発電ユニット18を構成する第3セパレータ26との間には、矢印B方向に延在する冷却媒体流路44が形成される。図2に示すように、第1電解質膜電極構造体22aは、第2電解質膜電極構造体22bよりも小さな表面積に設定される。第1及び第2電解質膜電極構造体22a、22bは、例えば、パーフルオロスルホン酸の薄膜に水が含浸された固体高分子電解質膜電解質90と、前記固体高分子電解質膜90を挟持するアノード側電極92及びカソード側電極94とを備える。アノード側電極92は、カソード側電極94よりも小さな表面積を有する段差型MEAを構成している。アノード側電極92及びカソード側電極94は、カーボンペーパ等からなるガス拡散層図示せずと、白金合金が表面に担持された多孔質カーボン粒子が前記ガス拡散層の表面に一様に塗布されて形成される電極触媒層図示せずとを有する。電極触媒層は、固体高分子電解質膜90の両面に形成される。図1に示すように、冷却媒体供給装置14は、冷却媒体循環路100を備えるとともに、前記冷却媒体循環路100には、循環ポンプ102及びラジエータタンク機能を有する104が配設される。冷却媒体循環路100は、供給路100a側に分岐供給路106が設けられる一方、排出路100b側に分岐排出路108が設けられる。供給路100a及び排出路100bは、それぞれ三方弁110a、110bを介して一方の長辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに接続される。分岐供給路106及び分岐排出路108は、それぞれ三方弁112a、112bを介して他方の長辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに接続される。三方弁110a、110b間には、分岐経路114aが接続されるとともに、三方弁112a、112b間には、分岐経路114bが接続される。なお、三方弁110a、110b、112a及び112bに代えて、開度調整可能な、すなわち、冷却媒体流量調整可能な可変弁図示せずを使用することができる。また、可変弁は、それぞれ一対の冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bの中、任意の1つに設けてもよい。コントローラ16は、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部例えば、燃料ガス出口連通孔32b又は酸化剤ガス出口連通孔30bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたか否かを検出する機能を有する。水により閉塞されたか否かは、例えば、発電面のCDDcurrentdensitydistribution電流密度分布測定を行って、前記発電面に又は該発電面の上部に電流が集中した際には、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部に水が滞留していると判断することができる。また、燃料電池スタック10内のセル電圧を検出し、前記セル電圧の低下が検知された際に、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部に水が滞留していると判断してもよい。さらに、発電面内に複数の電位センサを配設し、アノード側の電位を測定することが可能である。その際、アノード側の電位が上昇する部位には、水素不足が発生していると、すなわち、水による閉塞が惹起していると判断することができる。さらにまた、燃料ガスの圧損等を検出することにより、水による閉塞の有無を判断してもよい。あるいは、各負荷毎に最適流配を記憶しておき、マッピングにより水の滞留の有無を判断してもよい。このように構成される燃料電池スタック10の動作について、第1の実施形態に係る運転方法との関連で以下に説明する。先ず、図2に示すように、酸化剤ガス入口連通孔30aには、酸素含有ガス等の酸化剤ガスが供給されるとともに、燃料ガス入口連通孔32aには、水素含有ガス等の燃料ガスが供給される。さらに、一対の冷却媒体入口連通孔34a、34aには、純水やエチレングリコール、オイル等の冷却媒体が供給される。このため、酸化剤ガスは、酸化剤ガス入口連通孔30aから第2セパレータ24の第1酸化剤ガス流路50及び第3セパレータ26の第2酸化剤ガス流路66に導入される。この酸化剤ガスは、第1酸化剤ガス流路50に沿って矢印C方向重力方向に移動し、第1電解質膜電極構造体22aのカソード側電極94に供給されるとともに、第2酸化剤ガス流路66に沿って矢印C方向に移動し、第2電解質膜電極構造体22bのカソード側電極94に供給される。一方、燃料ガスは、燃料ガス入口連通孔32aから外側供給孔部80aを通って第1セパレータ20の面20b側に移動する。さらに、燃料ガスは、内側供給孔部80bから面20a側に導入された後、第1燃料ガス流路36に沿って重力方向矢印C方向に移動し、第1電解質膜電極構造体22aのアノード側電極92に供給される。また、燃料ガスは、供給孔部84を通って第2セパレータ24の面24b側に移動する。このため、燃料ガスは、面24b側で第2燃料ガス流路58に沿って矢印C方向に移動し、第2電解質膜電極構造体22bのアノード側電極92に供給される。従って、第1及び第2電解質膜電極構造体22a、22bでは、カソード側電極94に供給される酸化剤ガスと、アノード側電極92に供給される燃料ガスとが、電極触媒層内で電気化学反応により消費されて発電が行われる。次いで、第1及び第2電解質膜電極構造体22a、22bの各カソード側電極94に供給されて消費された酸化剤ガスは、酸化剤ガス出口連通孔30bに沿って矢印A方向に排出される。第1電解質膜電極構造体22aのアノード側電極92に供給されて消費された燃料ガスは、内側排出孔部82bを通って第1セパレータ20の面20b側に導出される。面20b側に導出された燃料ガスは、外側排出孔部82aを通って、再度、面20a側に移動し、燃料ガス出口連通孔32bに排出される。また、第2電解質膜電極構造体22bのアノード側電極92に供給されて消費された燃料ガスは、排出孔部86を通って面24a側に移動する。この燃料ガスは、燃料ガス出口連通孔32bに排出される。さらに、図1に示すように、冷却媒体供給装置14では、三方弁110a、110b、112a及び112bが操作される。このため、供給路100a及び排出路100bは、一方の長辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに連通するとともに、分岐供給路106及び分岐排出路108は、他方の長辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに連通する。従って、燃料電池スタック10に供給された冷却媒体は、左右一対の冷却媒体入口連通孔34a、34aに供給される図1及び図2参照。冷却媒体は、一方の発電ユニット18を構成する第1セパレータ20と、他方の発電ユニット18を構成する第3セパレータ26との間に形成された冷却媒体流路44に導入される。図4に示すように、一対の冷却媒体入口連通孔34a、34aは、発電ユニット18の上部側左右両端に酸化剤ガス入口連通孔30a及び燃料ガス入口連通孔32aに近接する位置に振り分けて設けられている。このため、各冷却媒体入口連通孔34a、34aから冷却媒体流路44に供給される冷却媒体は、矢印B方向に且つ互いに近接する方向に供給される。そして、互いに近接する冷却媒体は、冷却媒体流路44の矢印B方向中央部側で衝突して重力方向矢印C方向下方に移動した後、発電ユニット18の下部側両側部に振り分けて設けられている各冷却媒体出口連通孔34b、34bに排出される。この場合、第1の実施形態では、コントローラ16は、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部特に、燃料ガス出口連通孔32bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたか否かを検出している。第1燃料ガス流路36では、第1酸化剤ガス流路50側に発生した生成水が、薄膜状の固体高分子電解質膜90を透過して逆拡散し易いからである。しかも、第1燃料ガス流路36は、図3に示すように、冷却媒体流路44に隣接しており、特に低負荷発電時に温度低下が著しく、凝縮水が滞留し易いからである。従って、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部が、水により閉塞されたと判断された際には、コントローラ16は、三方弁110bを操作して排出路100bと冷却媒体出口連通孔34bとを遮断している図5参照。これにより、燃料ガス出口連通孔32bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bでは、冷却媒体が流通することを規制することが可能になる。このため、発電面において、燃料ガス出口連通孔32bの近傍を流通する冷却媒体の流量が削減され、前記燃料ガス出口連通孔32bの近傍の温度を上昇させることができる。従って、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に滞留する凝縮水は、簡単且つ良好に排出され、滞留水を排除することが可能になる。これにより、特に低負荷発電時に、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができる。このため、良好な発電状態を確保することが可能になるという効果が得られる。また、第1の実施形態では、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部が、水により閉塞されたと判断された際、図6に示すように、三方弁110a及び110bを操作することもできる。すなわち、三方弁110aを介して供給路100aと冷却媒体入口連通孔34aとが遮断されるとともに、三方弁110bを介して排出路100bと冷却媒体出口連通孔34bとが遮断される。従って、供給路100aと排出路100bとは、冷却媒体流路44をバイパスして分岐経路114aに連通する。これにより、冷却媒体は、供給路100aから分岐経路114aを通って排出路100bに排出される。このため、発電面において、冷却媒体は、酸化剤ガス入口連通孔30a及び燃料ガス出口連通孔32bが設けられている一方の長辺側に流通することを規制されている。これにより、発電面では、燃料ガス入口連通孔32a及び酸化剤ガス出口連通孔30bが設けられている他方の長辺側に沿って冷却媒体が流通し、燃料ガス出口連通孔32bの近傍の温度を上昇させることができる。このため、特に低負荷発電時に、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができ、良好な発電状態を確保することが可能になる等、上記と同様の効果が得られる。次いで、本発明の第2の実施形態に係る運転方法について、燃料電池スタック10を用いて説明する。この第2の実施形態では、コントローラ16は、第1燃料ガス流路36の少なくとも下流側の一部特に、酸化剤ガス出口連通孔30bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたか否かを検出している。図7に示すように、第1燃料ガス流路36では、燃料ガス入口連通孔32aに加湿された燃料ガスが供給されており、加湿量等に起因して前記第1燃料ガス流路36に結露水が導入され易い。この結露水は、重力下方向に流動して第1燃料ガス流路36の下流側の一部、具体的には、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍上方近傍に滞留し易い。しかも、第1燃料ガス流路36は、図3に示すように、冷却媒体流路44に隣接しており、特に低負荷発電時に温度低下が著しく、凝縮水が滞留し易い。従って、第1燃料ガス流路36の少なくとも下流側の一部が、水により閉塞されたと判断された際には、コントローラ16は、三方弁112bを操作して冷却媒体出口連通孔34bと分岐排出路108とを遮断している図8参照。これにより、酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bでは、冷却媒体が流通することを規制することが可能になる。このため、発電面において、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍を流通する冷却媒体の流量が削減され、前記酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍の温度を上昇させることができる。従って、第1燃料ガス流路36では、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍に隣接する部位に滞留する凝縮水が、簡単且つ良好に排出され、滞留水を排除することが可能になる。これにより、特に低負荷発電時に、第1燃料ガス流路36では、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができる。このため、良好な発電状態を確保するとともに、第1酸化剤ガス流路50の下流側に滞留水が発生することを有効に抑制することが可能になるという効果が得られる。なお、第2燃料ガス流路58においても同様に、燃料ガスの加湿量等に起因して酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍に滞留水が発生し易い。従って、第2の実施形態では、上記のように、酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bに冷却媒体が流通することを規制されるため、第2燃料ガス流路58の下流側に滞留する凝縮水が、簡単且つ良好に排出され、滞留水を排除することが可能になる。また、第2の実施形態では、第1燃料ガス流路36の少なくとも下流側の一部が、水により閉塞されたと判断された際、図9に示すように、三方弁112a及び112bを操作することもできる。すなわち、三方弁112aを介して分岐供給路106と冷却媒体入口連通孔34aとが遮断されるとともに、三方弁112bを介して分岐排出路108と冷却媒体出口連通孔34bとが遮断される。従って、分岐供給路106と分岐排出路108とは、冷却媒体流路44をバイパスして分岐経路114bに連通する。これにより、冷却媒体は、分岐供給路106から分岐経路114bを通って分岐排出路108に排出される。このため、発電面において、冷却媒体は、燃料ガス入口連通孔32a及び酸化剤ガス出口連通孔30bが設けられている他方の長辺側に流通することを確実に規制されている。これにより、発電面では、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍の温度を一層迅速に上昇させることができ、前記酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍に隣接する第1燃料ガス流路36の下流側の温度を上昇させることができる。このため、特に低負荷発電時に、第1燃料ガス流路36の下流側に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができ、良好な発電状態を確保することが可能になる等、上記と同様の効果が得られる。図10は、本発明の第1及び第2の実施形態に係る運転方法が適用される燃料電池スタック燃料電池120を組み込む燃料電池システム122の概略説明図である。なお、第1の実施形態に係る燃料電池システム12と同一の構成要素には、同一の参照符号を付して、その詳細な説明は省略する。また、以下に説明する第3の実施形態においても同様に、その詳細な説明は省略する。燃料電池120は、横長形状を有するとともに、燃料ガス及び酸化剤ガスが、鉛直方向に直交する方向水平方向に流通される。この場合、燃料電池120が低負荷状態で長時間にわたって発電されると、MEA上部側に水が溜まり易くなる。このため、三方弁110a及び110bが操作されることにより、流路の上部側に流通する冷却媒体を絞って、MEA上部側の排水性を向上させることができる。一方、発電の過渡期には、水の飛び込み等によりMEA下部側の流路に水が溜まり易い。従って、過度発電後には、三方弁112a及び112bを操作することにより、MEA下部側の排水性を向上させることが可能になる。図11は、本発明の第3の実施形態に係る運転方法が適用される燃料電池システム130の概略説明図である。なお、燃料電池システム130は、燃料電池10を用いているが、これに限定されるものではなく、例えば、燃料電池120を使用してもよい。燃料電池システム130を構成する冷却媒体循環路100には、第1供給路106a側に第2供給路106bが分岐して設けられる一方、第1排出路108a側に第2排出路108bが分岐して設けられる。第1供給路106a及び第1排出路108aは、それぞれ可変絞り弁弁機構132a、132bを介して一方の長辺第1の辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに接続される。第2供給路106b及び第2排出路108bは、それぞれ可変絞り弁弁機構132c、132dを介して他方の長辺第2の辺側に設けられた冷却媒体入口連通孔34a及び冷却媒体出口連通孔34bに接続される。第1供給路106aの途上と第1排出路108aの途上とには、第1分岐路134aが接続される一方、第2供給路106bの途上と第2排出路108bの途上とには、第2分岐路134bが接続される。第1分岐路134aには、可変絞り弁弁機構132eが接続されるとともに、第2分岐路134bには、可変絞り弁弁機構132fが接続される。なお、第3の実施形態では、可変絞り弁132a~132fを用いているが、必要に応じて弁数の増減が可能である。例えば、可変絞り弁132a、132bのみを用いてもよい。コントローラ16は、第1燃料ガス流路36の少なくとも一部例えば、燃料ガス出口連通孔32bに近接する下流側端部や第1酸化剤ガス流路50の少なくとも一部例えば、酸化剤ガス出口連通孔30bに近接する下流側端部等が、水により閉塞されたか否かを検出する機能を有する。このように構成される燃料電池システム130の動作について、本発明の第3の実施形態に係る運転方法との関連で以下に説明する。コントローラ16は、例えば、第1燃料ガス流路36図2等参照の少なくとも一部燃料ガス出口連通孔32bに近接する下流側端部及び/又は酸化剤ガス出口連通孔30bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたか否かを検出している。そして、第1燃料ガス流路36の燃料ガス出口連通孔32bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたと判断された際には、コントローラ16は、先ず、可変絞り弁132eを閉塞する一方、可変絞り弁132bの開度を絞っている。このため、燃料ガス出口連通孔32bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bへの冷却媒体の排出が規制され、前記燃料ガス出口連通孔32bの近傍の温度を上昇させることができる。上記の処理でも、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に滞留する凝縮水が除去されない際には、コントローラ16は、図12に示すように、可変絞り弁132eを開放させて第1供給路106aと第1排出路108aとを第1分岐路134aにより連通させる。一方、可変絞り弁132bは、開度が絞られている。これにより、冷却媒体は、燃料電池スタック10内よりも圧損の小さな第1分岐路134aに沿って流通し易く、燃料ガス出口連通孔32bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bでは、前記冷却媒体が流通することを規制することが可能になる。このため、発電面において、燃料ガス出口連通孔32bの近傍を流通する冷却媒体の流量が削減され、前記燃料ガス出口連通孔32bの近傍の温度を上昇させることができる。従って、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に滞留する凝縮水は、簡単且つ良好に排出され、滞留水を排除することが可能になる。これにより、特に低負荷発電時に、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができる。このため、良好な発電状態を確保することが可能になるという効果が得られる。なお、第2燃料ガス流路58においても、上記の第1燃料ガス流路36と同様の効果が得られる。また、第3の実施形態では、第1燃料ガス流路36の燃料ガス出口連通孔32bに近接する下流側端部が、水により閉塞されたと判断された際、図13に示すように、可変絞り弁132a、132bを閉塞することもできる。従って、冷却媒体は、第1供給路106aから第1分岐路134aを通って第1排出路108aに排出され、前記冷却媒体は、酸化剤ガス入口連通孔30a及び燃料ガス出口連通孔32bが設けられている一方の長辺側に流通することを規制されている。これにより、発電面では、燃料ガス入口連通孔32a及び酸化剤ガス出口連通孔30bが設けられている他方の長辺側に沿って冷却媒体が流通し、燃料ガス出口連通孔32bの近傍の温度を上昇させることができる。このため、特に低負荷発電時に、燃料ガス出口連通孔32bの近傍に凝縮水が滞留することを確実に阻止することができ、良好な発電状態を確保することが可能になる等、上記と同様の効果が得られる。さらにまた、第1燃料ガス流路36では、燃料ガス入口連通孔32aに加湿された燃料ガスが供給されており、加湿量等に起因して前記第1燃料ガス流路36に結露水が導入され易い。この結露水は、重力下方向に流動して第1燃料ガス流路36の下流側の一部、具体的には、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍上方近傍に滞留し易い。従って、第1燃料ガス流路36の酸化剤ガス出口連通孔30bに対応する下流側端部が、水により閉塞されたと判断された際には、コントローラ16は、図14に示すように、可変絞り弁132fを開放させて第2供給路106bと第2排出路108bとを第2分岐路134bにより連通させる。なお、可変絞り弁132dは、開度を絞っている。これにより、冷却媒体は、比較的圧損の小さな第2分岐路134bに沿って流通し易く、酸化剤ガス出口連通孔30bに隣接する冷却媒体出口連通孔34bでは、前記冷却媒体が流通することを規制することが可能になる。このため、発電面において、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍を流通する冷却媒体の流量が削減され、前記酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍の温度を上昇させることができる。従って、第1燃料ガス流路36及び第2燃料ガス流路58では、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍に隣接する部位に滞留する凝縮水が、簡単且つ良好に排出され、滞留水を排除することが可能になる。なお、必要に応じて、可変絞り弁132c、132dを閉塞してもよい。さらに、第3の実施形態では、可変絞り弁132a~132fの開度を適宜制御することができる。これにより、例えば、低負荷発電時に電圧が不安定になる際、可変絞り弁132e、132fを開放させることによって、燃料電池スタック10の温度を変化させ、結露やフラッディングを抑制することが可能になる。さらにまた、第3の実施形態では、冷却媒体供給装置14は、燃料電池スタック10の積層方向一端側に設けられている。このため、燃料電池スタック10の積層方向他端側の発電ユニット18には、冷却媒体が十分に供給されない場合がある。そこで、第3の実施形態では、コントローラ16により可変絞り弁132e、132fを閉塞させるとともに、可変絞り弁132b、132dの開度を絞る処理が行われる。従って、各冷却媒体流路44では、一対の冷却媒体出口連通孔34bにおける圧力損失が高くなり、燃料電池スタック10の積層方向他端側に設けられている前記冷却媒体流路44にも、冷却媒体を十分に供給することができる。これにより、例えば、高負荷発電時に、燃料電池スタック10の積層方向他端側の発電ユニット18は、冷却不足による発電性能の低下を惹起することがない。しかも、酸化剤ガス出口連通孔30bの近傍での温度上昇を、有効に抑制することが可能になる。