自己タンパク質をコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して免疫抑制剤または免疫調節剤の治療的有効量を哺乳動物に投与する段階を含む、該哺乳動物における自己免疫疾患を処置するための方法。前記自己免疫疾患が1型糖尿病である、請求項1記載の方法。前記自己免疫疾患が多発性硬化症である、請求項1記載の方法。前記自己免疫疾患が関節リウマチである、請求項1記載の方法。前記自己免疫疾患が尋常性天疱瘡である、請求項1記載の方法。前記自己免疫疾患が重症筋無力症である、請求項1記載の方法。前記免疫抑制剤または前記免疫調節剤と前記DNA抗原特異的治療物質との投与が同時である、請求項1記載の方法。前記免疫抑制剤または前記免疫調節剤と前記DNA抗原特異的治療物質との投与が連続的である、請求項1記載の方法。前記自己タンパク質が前記自己免疫疾患に関連する、請求項1記載の方法。前記免疫調節剤がB細胞特異的作用物質である、請求項1記載の方法。前記B細胞特異的作用物質がCD20抗体である、請求項10記載の方法。前記CD20抗体が、リツキシマブ、オクレリズマブ、オファツムマブ、およびベルツズマブからなる群より選択される、請求項11記載の方法。前記DNA抗原特異的治療物質によってコードされる前記自己タンパク質が、インスリン、プロインスリン、グルタミン酸デカルボキシラーゼ65または島細胞抗原からなる群より選択される、請求項2記載の方法。前記DNA抗原特異的治療物質によってコードされる前記自己タンパク質がプロインスリンである、請求項13記載の方法。前記DNA抗原特異的治療物質によってコードされる前記自己タンパク質が、ミエリン塩基性タンパク質、プロテオリピドタンパク質、ミエリン関連糖タンパク質、環状ヌクレオチドホスホジエステラーゼ、ミエリン関連糖タンパク質、ミエリン関連オリゴデンドロサイト塩基性タンパク質、αBクリスタリン、またはミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質からなる群より選択される、請求項3記載の方法。プロインスリンをコードするDNAプラスミドと併用してCD20抗体の治療的有効量を哺乳動物に投与する段階を含む、該哺乳動物における1型糖尿病T1Dを処置するための方法。前記CD20抗体がリツキシマブであり、かつプロインスリンをコードする前記DNAプラスミドがプロインスリン寛容化プラスミドPTPである、請求項16記載の方法。前記CD20抗体とプロインスリンをコードする前記DNAプラスミドとの投与が同時または連続的である、請求項16記載の方法。前記併用投与が、いずれかの作用物質の単独投与と比較して相乗効果的である、請求項16記載の方法。前記併用投与により、前記CD20抗体の単独投与と比較した場合に該CD20抗体の投与回数が低減している、請求項16記載の方法。前記哺乳動物がヒトである、請求項16記載の方法。aCD20特異的作用物質と、bDNA抗原特異的治療物質と、c薬学的に許容される担体とを自己免疫疾患を処置するのに有効な量で含む、薬学的組成物。aCD20特異的作用物質と、bDNA抗原特異的治療物質と、c薬学的に許容される担体とを含む、キット。発明の詳細な説明自己免疫疾患自己免疫疾患関連自己抗原のいくつかの例は、表2に示されており、特定の例は、以下でさらに詳細に記述されている。表2例示的な自己免疫疾患および関連自己抗原1型糖尿病1型糖尿病といわれることもあるは、膵臓ランゲルハンス島におけるβ細胞の自己免疫性破壊により特徴付けられる。β細胞の枯渇は、結果として、血中のグルコースのレベルを制御する能力の喪失を生じる。顕性糖尿病は、血中のグルコースのレベルが特定レベル、通常には約250mgdlを超えて上昇する場合に起こる。ヒトにおいて、長い前駆症状期間が、糖尿病の発症に先行する。この期間中、膵臓のβ細胞機能の漸次消失がある。疾患の発生は、インスリン、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、およびチロシンホスファターゼIA2に対する自己抗体の存在により結びつけられる。前駆症状期中に評価されうるマーカーは、膵臓における膵島炎の存在、島細胞抗体、島細胞表面抗体のレベルおよび頻度、膵臓β細胞上のクラスIIMHCの異常発現、血中のグルコース濃度、ならびにインスリンの血漿濃度である。膵臓におけるTリンパ球、島細胞抗体、および血中グルコースの数の増加は、疾患を示し、インスリン濃度の減少も同様である。非肥満性糖尿病マウスは、ヒトT1Dと共通した、多くの臨床的、免疫学的および組織病理学的特徴をもつ動物モデルである。NODマウスは、島の炎症およびβ細胞の破壊を自然発症的に発生し、それが高血糖症および顕性糖尿病へ導く。CD4T細胞およびCD8T細胞の両方は、糖尿病が発症するのに必要とされるが、それぞれの役割ははっきりしないままである。寛容化条件下でタンパク質としてインスリンまたはGADのNODマウスへの投与は疾患を予防し、他の自己抗原に対する応答を下方制御することが示されている。血清におけるさまざまな特異性をもつ自己抗体の組み合わせの存在は、ヒトI型糖尿病に対して高い感度および特異性がある。例えば、GADおよびまたはIA2に対する自己抗体の存在は、I型糖尿病を対照血清から同定することに対して約98感度および99特異性である。I型糖尿病患者の非糖尿病の一等親血縁者において、GAD、インスリン、およびIA2を含む3つの自己抗原のうちの2つに特異的な自己抗原の存在は、5年以内のI型DMの発症について>90の陽性適中率を告げている。ヒトインスリン依存性糖尿病において標的とされる自己抗原には、例えば、チロシンホスファターゼIA2IA2βグルタミン酸デカルボキシラーゼ65kDaおよび67kDaの両方の型カルボキシペプチダーゼHインスリンプロインスリン熱ショックタンパク質グリマ38島細胞抗原69KDap522つのガングリオシド抗原島特異性グルコース6ホスファターゼ関連タンパク質および島細胞グルコース輸送体が挙げられうる。ヒトT1Dは、血中グルコースレベルをモニターして、組換えインスリンの注射またはポンプに基づいた送達を指導することにより現在、処置されている。食事療法および運動療法は、適切な血中グルコース調節を達成することに貢献する。多発性硬化症多発性硬化症は、CNSの最も一般的な脱髄障害であり、350000人のアメリカ人および百万人の世界中の人々が罹患している。症状の発生は、典型的には、年齢が20歳から40歳の間で起こり、一側性視力障害、筋衰弱、知覚障害、運動失調、目眩、尿失禁、構音障害、もしくは精神障害の急性または亜急性の発作として現れる。そのような症状は、軸索伝導の遅延による負の伝導異常および異所性刺激発生による正の伝導異常の両方を引き起こす脱髄の限局性病変に起因する。MSの診断は、時間的な隔たりがある、神経学的機能障害の客観的な臨床上の証拠を生じている、およびCNS白質の別々の領域に関係している、神経学的機能障害の少なくとも2つの別個の発作を含む病歴に基づいている。MSの診断を裏付ける追加の客観的証拠を提供する実験研究には、CNS白質の磁気共鳴映像法、IgGの脳脊髄液オリゴクローナルバンド形成、および異常誘発応答が挙げられる。たいていの患者は、徐々に進行する再発寛解型疾患経過を経験するが、MSの臨床経過は、個体間で大きく異なり、一生に渡って数回の軽度の発作に限られているものから劇症慢性進行性疾患までの範囲でありうる。IFNγを分泌する能力をもつミエリン自己反応性T細胞における量的増加は、MSおよびEAEの病因と関連している。多発性硬化症および実験的自己免疫性脳脊髄炎などの自己免疫性脱髄疾患における自己免疫応答の自己抗原標的は、プロテオリピドタンパク質ミエリン塩基性タンパク質ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質環状ヌクレオチドホスホジエステラーゼミエリン関連糖タンパク質およびミエリン関連オリゴデンドロサイト塩基性タンパク質αBクリスタリンウイルスおよび細菌の模倣ペプチド、例えば、インフルエンザウイルス、ヘルペスウイルス、B型肝炎ウイルスなどOSPシトルリン修飾MBPされているMBPのC8アイソフォームなど由来のエピトープを含みうる。内在性膜タンパク質PLPは、ミエリンの優性自己抗原である。PLP抗原性の決定基は、いくつかのマウス系統において同定されており、残基139~151位、103~116位、215~232位、43~64位、および178~191位を含む。少なくとも26個のMBPエピトープが報告されている。顕著なのは、残基1~11位、59~76位、および87~99位である。いくつかのマウス系統において同定されている免疫優性MOGエピトープには、1~22位、35~55位、64~96位が挙げられる。ヒトMS患者において、以下のミエリンタンパク質およびエピトープは、自己免疫性T細胞およびB細胞応答の標的として同定された。MS脳プラークから溶出した抗体は、ミエリン塩基性タンパク質ペプチド83~97位を認識した。別の研究は、MS患者の約50がミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質に対する末梢血リンパ球T細胞反応性を有し、20がMBPに対する反応性、8がPLPに対する反応性、0がMAGに対する反応性を有することを見出した。この研究において、10人のMOG反応性患者のうちの7人が、MOG1~22位、MOG34~56位、MOG64~96位を含む3つのペプチドエピトープのうちの1つに集中したT細胞増殖性応答を有した。T細胞およびB細胞応答はMBP87~99位に集中した。MBP87~99位において、アミノ酸モチーフHFFKは、T細胞およびB細胞応答の両方の優性標的である。別の研究は、残基MOBP21~39位およびMOBP37~60位を含むミエリン関連オリゴデンドロサイト塩基性タンパク質に対するリンパ球反応性を観察した。MSおよび対照の脳を染色するためにMOGおよびMBPペプチドの免疫金結合体を用いて、MBPならびにMOGペプチドの両方は、MSプラーク結合性抗体により認識された。関節リウマチ関節リウマチは、世界人口の08が罹患している慢性自己免疫性炎症性滑膜炎である。それは、びらん性関節破壊を引き起こす慢性炎症性滑膜炎によって特徴付けられる。RAは、T細胞、B細胞、およびマクロファージにより媒介される。T細胞がRAにおいて重大な役割を果たすという証拠には、滑膜に浸潤するCD4T細胞の優勢、シクロスポリンなどの薬物でのT細胞機能の抑制に関連した臨床的改善、およびRAの特定のHLADR対立遺伝子との関連が挙げられる。RAと関連したHLADR対立遺伝子は、ペプチド結合およびT細胞への提示に関与するβ鎖の第三の超可変領域における67~74位におけるアミノ酸の類似した配列を含む。RAは、滑膜関節に存在する自己タンパク質または改変自己タンパク質を認識する自己反応性T細胞により媒介される。RAにおいて標的とされる自己抗原は、例えば、II型コラーゲンhnRNPA2RA33Saフィラグリンケラチンシトルリンgp39を含む軟骨タンパク質コラーゲンI型、III型、IV型、V型、IX型、XI型HSP6560IgMRNAポリメラーゼhnRNPB1hnRNPDカルジオリピンアルドラーゼAシトルリン修飾フィラグリンおよびフィブリン由来のエピトープを含む。修飾アルギニン残基を含むフィラグリンペプチドを認識する自己抗体が、高い割合のRA患者の血清において同定されている。自己反応性T細胞およびB細胞応答は、両方とも、何人かの患者において同じ免疫優性II型コラーゲンペプチド257~270位に対して向けられる。自己免疫性ブドウ膜炎自己免疫性ブドウ膜炎は、米国において、400000人の人々が罹患し、1年あたり43000の新規症例の発生があると推定される眼の自己免疫性疾患である。自己免疫性ブドウ膜炎は、ステロイド、メトトレキセートおよびシクロスポリンなどの免疫抑制剤、静注用免疫グロブリン、およびTNFαアンタゴニストで現在、処置されている。実験的自己免疫性ブドウ膜炎は、眼における神経網膜、ブドウ膜、および関連組織を標的とするT細胞媒介性自己免疫性疾患である。EAUは、ヒト自己免疫性ブドウ膜炎と多くの臨床的および免疫学的特徴を共有し、完全フロイントアジュバントに乳化されたブドウ膜炎誘発性ペプチドの末梢投与により誘導される。ヒト自己免疫性ブドウ膜炎における自己免疫応答により標的とされる自己抗原には、S抗原、光受容体間レチノイド結合タンパク質、ロドプシン、およびリカバリンが挙げられうる。原発性胆汁性肝硬変原発性胆汁性肝硬変は、主に、年齢が40~60歳の間の女性が罹患している器官特異的自己免疫性疾患である。この群の中での報告された有病率は、1000人あたりほぼ1人に等しい。PBCは、小さな肝内胆管を裏打ちする肝内胆管上皮細胞の進行性破壊により特徴付けられる。これは、胆汁分泌の妨害および干渉につながり、最終的な肝硬変を引き起こす。シェーグレン症候群、CREST症候群、自己免疫性甲状腺疾患、および関節リウマチを含め、上皮裏打ち分泌系損傷により特徴付けられる他の自己免疫疾患との関連が報告されている。駆動抗原に関する注目は、50年以上に渡ってミトコンドリアに焦点を当て、抗ミトコンドリア抗体の発見につながった。臨床症状が現れるよりずっと前から90~95患者の血清に存在するAMAはまもなく、PBCの検査室診断についての土台になった。ミトコンドリアにおける自己抗原性反応性は、M1およびM2と名付けられた。M2反応性は、48~74kDaの構成要素のファミリーに対して向けられる。M2は、2オキソ酸デヒドロゲナーゼ複合体の酵素の複数の自己抗原性サブユニットを表し、本発明の自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドの別の例である。PBCの原因病理論においてピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体抗原の役割を同定する研究は、PDCが疾患の誘発に中心的な役割を果たすという概念を支持している。PBCの症例の95における最も頻度の高い反応性は、PDCE2に属するE274kDaサブユニットである。以下を含む、関連しているが別個の複合体が、存在する2オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ複合体および分枝鎖2OADC。3つの成分酵素は、NADのNADHへの還元と共に2オキソ酸基質をアシル補酵素Aへ変換することができる触媒機能に寄与する。哺乳動物のPDCは、プロテインXまたはE3結合タンパク質と名付けられた、追加の構成要素を含む。PBC患者において、主要な抗原性応答は、PDCE2およびE3BPに対して向けられる。E2ポリペプチドは、2つの縦列反復リポイルドメインを含み、一方、E3BPは単一のリポイルドメインを有する。リポイルドメインは、PBCのいくつかの自己抗原標的に見出され、本明細書においてPBCリポイルドメインといわれる。PBCは、グルココルチコイド、ならびにメトトレキセートおよびシクロスポリンAを含む免疫抑制剤で処置される。実験的自己免疫性胆管炎のマウスモデルは、非化膿性破壊性胆管炎およびAMAの産生を誘導する、雌SJLJマウスにおける哺乳動物PDCでの腹腔内感作を用いる。他の自己免疫疾患および関連した自己抗原重症筋無力症についての自己抗原は、アセチルコリン受容体内のエピトープを含みうる。尋常性天疱瘡において標的とされる自己抗原は、デスモグレイン3を含みうる。シェーグレン症候群抗原は、SSASSBおよびフォドリンを含みうる。尋常性天疱瘡についての優性自己抗原は、デスモグレイン3を含みうる。筋炎についてのパネルは、tRNAシンセターゼKuSclSSAU1Snリボ核タンパク質Mi1Mi1Jo1KuならびにSRPを含みうる。強皮症についてのパネルは、Scl70セントロメアU1リボ核タンパク質およびフィブリラリンを含みうる。悪性貧血についてのパネルは、内因子および胃HKATPアーゼの糖タンパク質βサブユニットを含みうる。全身性紅斑性狼瘡についてのエピトープ抗原は、DNAリン脂質核抗原RoLaU1リボ核タンパク質Ro60Ro52LaカルレティキュリンGrp78Scl70ヒストンSmタンパク質およびクロマチンなどを含みうる。グレーブス病について、エピトープは、NaI共輸送体;チロトロピン受容体;Tg;およびTPOを含みうる。移植片対宿主病ヒトにおける組織および器官移植の最大の制限の一つは、レシピエントの免疫系による組織移植の拒絶である。ドナーとレシピエントの間のMHCクラスIおよびII対立遺伝子の適合が高ければ高いほど、移植片生存は良くなる。移植片対宿主病は、同種異系造血細胞を含む移植片を受ける患者において重大な罹患率および死亡率を引き起こす。造血細胞は、骨髄移植片、幹細胞移植片、および他の移植片に存在する。HLA適合同胞由来の移植片を受ける患者の約50が、中等度から重度のGVHDを発症し、発生率は、非HLA適合移植片においてよりずっと高い。中等度から重度のGVHDを発症する患者の3分の1は結果として死亡する。ドナー移植片におけるTリンパ球および他の免疫細胞は、ポリペプチドのアミノ酸配列における変異、特に、ヒトの第6染色体上の主要組織適合複合体遺伝子複合体にコードされるタンパク質における変異を発現するレシピエントの細胞を攻撃する。同種異系造血細胞を含む移植におけるGVHDについて最も大きな影響を及ぼすタンパク質は、高度に多型性であるクラスIタンパク質およびクラスIIタンパク質である。MHCクラスI対立遺伝子がドナーとレシピエントの間で血清学的に適合している場合でさえも、DNA配列決定により、症例の30において対立遺伝子レベルのミスマッチがあることが明らかにされ、適合したドナーレシピエントのペアにおいてさえもクラスI指向性GVHDについての基礎を提供する。マイナー組織適合性自己抗原GVHDは、しばしば、皮膚、腸管、肝臓、肺、および膵臓への損傷を引き起こす。GVHDは、グルココルチコイド、シクロスポリン、メトトレキセート、フルダラビン、およびOKT3で処置される。組織移植拒絶肺、心臓、肝臓、腎臓、膵臓、ならびに他の器官および組織を含む組織移植片の免疫拒絶は、移植器官に対して向けられた移植レシピエントにおける免疫応答により媒介される。同種異系移植器官は、移植レシピエントのアミノ酸配列と比較した場合、アミノ酸配列に変異を有するタンパク質を含む。移植器官のアミノ酸配列は移植レシピエントのそれらと異なるため、それらは、しばしば、移植器官に対するレシピエントにおける免疫応答を誘発する。移植器官の拒絶は、主な合併症、および組織移植の制限であり、かつ、レシピエントにおいて移植器官の不全を引き起こしうる。拒絶に起因する慢性炎症は、しばしば、移植器官における機能障害へ導く。移植レシピエントは、現在、拒絶を予防し、抑制するさまざまな免疫抑制剤で処置される。これらの作用物質には、グルココルチコイド、シクロスポリンA、セルセプト、FK506、およびOKT3が挙げられる。免疫抑制剤または免疫調節剤本明細書において用いられる場合、免疫抑制剤または免疫調節剤は、哺乳動物の免疫応答を広くまたは特異的に抑制または調節する作用物質である。そのような作用物質は、例えば、小分子、または生物学的治療薬でありうる。例示的な免疫抑制剤にはグルココルチコイド、細胞毒性剤、コルチコステロイド、シクロホスファミド、シクロスポリン、タクロリムス、メトトレキセート、クラドリビン、ミコフェノール酸モフェチルなどが挙げられる。免疫調節剤には、リンパ球またはサイトカイン、例えばTNFαの作用に影響を及ぼす抗体または他のタンパク質が挙げられる。以下で説明される通り、典型的な態様において、免疫調節剤はB細胞特異的作用物質である。B細胞特異的作用物質B細胞は骨髄内で成熟するリンパ球であり、ナイーブB細胞、記憶B細胞、またはエフェクターB細胞を含む。本明細書におけるB細胞は正常または非悪性のB細胞である。本明細書におけるB細胞表面マーカーまたはB細胞表面抗原は、B細胞の表面上に発現される抗原であり、それに結合するアンタゴニストの標的となることができる。例示的なB細胞表面マーカーとしては、CD10、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD37、CD40、CD53、CD72、CD73、CD74、CDw75、CDw76、CD77、CDw78、CD79a、CD79b、CD80、CD81、CD82、CD83、CDw84、CD85およびCD86白血球表面マーカーが挙げられる。他のB細胞表面マーカーには、RP105、FcRH2、B細胞CR2、CCR6、P2X5、HLADOB、CXCR5、FCER2、BR3、BAFF、BLyS、Btig、NAG14、SLGC16270、FcRH1、IRTA2、ATWD578、FcRH3、IRTA1、FcRH6、BCMA、および239287が含まれる。特に関心対象のB細胞表面マーカーは、哺乳動物の他の非B細胞組織と比較してB細胞上に選択的に発現されており、前駆体B細胞にも成熟B細胞にもともに発現されてもよい。本明細書における好ましいB細胞表面マーカーはCD20、CD22、CD23、CD40、BR3、BLyS、およびBAFFである。CD20抗原またはCD20は、末梢血またはリンパ系器官に由来するB細胞の90超の表面にみられる約35kDaの非グルコシル化リンタンパク質である。CD20は正常B細胞上に存在し、幹細胞上には発現されない。文献中でのCD20の他の名称にはBリンパ球限定抗原およびBp35が含まれる。CD20抗原は、例えば、ClarketalProcNatlAcadSci821766に記述されている。BLCAMまたはLyb8としても公知のCD22抗原またはCD22は、約130kDから140kDの分子量を有する1型膜内在性糖タンパク質である。これはBリンパ球の細胞質にも細胞膜にもともに発現される。CD22抗原は、B細胞リンパ球分化の初期にCD19抗原とおよそ同じ段階で現れる。他のB細胞マーカーと異なり、CD22膜発現は成熟B細胞と形質細胞の間に含まれる後期分化段階に限定される。CD22抗原は、例えば、WilsonetalJExpMed173137およびWilsonetalJImmunol1505013に記述されている。本明細書において用いられる場合、B細胞特異的作用物質およびB細胞を標的とする作用物質という用語は、例えば、B細胞によって誘発される体液性反応を低減または防止することにより、B細胞の機能を修飾、改変、低減または阻害することでB細胞を特異的に標的とする免疫調節剤をいう。B細胞特異的作用物質は、好ましくは、それによって処置された哺乳動物におけるB細胞を枯渇させることができる。そのような枯渇は、ADCCおよびもしくはCDC、B細胞増殖の阻害およびもしくはB細胞死の誘導またはB細胞分化の阻害もしくは妨害などのさまざまな機構を介して達成されうる。したがって、本発明の作用物質はB細胞の成長を停止する作用物質、B細胞成長阻害剤、B細胞分化を停止する作用物質またはB細胞分化阻害剤と記述されることもある。使用される作用物質の性質は、本発明にとって重要ではなく、例えば、ポリペプチド、核酸または小分子であってよい。いくつかの態様において、本発明により標的とされるB細胞は、CD20を発現しているB細胞である。B細胞特異的作用物質は、アポトーシスならびに枯渇、およびB細胞の増殖および成長の遅延もしくは停止またはB細胞の生存に向けた他の測定で当技術分野において公知のさまざまな方法によりスクリーニングすることができる。例示的な抗体としては、リツキシマブ、オクレリズマブ、オファツムマブ、およびベルツズマブが挙げられ、これらの全てが先行技術において記述されている。例えば、迅速かつ特異的な分解を目的にcmycタンパク質を標的化することによりB細胞増殖の阻害について化合物がスクリーニングされたSundbergetalCancerResearch6617751782に記述されている通りにスクリーニングする方法を用いることができる。同様に、BAFF、APRIL、とB細胞の生存およびスクリーニングの指導に関してはMackayetalAnnualReviewofImmunology21231264、ならびにB細胞増殖とAPRILに関してはThangarajhetalScandinavianJImmunol6592を参照されたい。さらに、SakuraietalEuropeanJImmunol37110には、BAFFRおよびCD40によって共刺激された抗体産生をTACIが減弱することが開示されている。さらに、AcostaRodriguezetalEuropeanJImmunol37990には、BAFFおよびLPSが協調してB細胞を誘導し、CD95Fasを介した細胞死の影響を受けやすくなることが開示されている。さらなるスクリーニング方法は、MartinandChanBCellImmunobiologyinDiseaseEvolvingConceptsfromtheClinicAnnualReviewofImmunology24467496、PillaietalMarginalZoneBCellsAnnualReviewofImmunology23161196、およびHardyandHayakawaBCellDevelopmentPathwaysAnnualReviewofImmunology19595621のなかで見出すことができる。これらのおよび他の参考文献から、当業者は適切なアンタゴニストをスクリーニングすることができる。RNA干渉のほか、この目的のためにはマイクロアレイを用いることができる。本発明の範囲内に含まれるB細胞特異的作用物質には、抗体、合成または天然の配列のペプチド、イムノアドヘシン、および別の分子に任意で結合または融合されてもよい、B細胞表面マーカーまたはB細胞特異的な生存因子もしくは増殖因子に結合する小分子アンタゴニストが含まれる。好ましいB細胞特異的作用物質には抗体またはイムノアドヘシンが含まれる。それはイムノアドヘシンなどのBLySアンタゴニストを含み、好ましくは抗CD23抗体、抗CD20抗体、抗CD22抗体もしくは抗BR3抗体、APRILアンタゴニスト、およびまたはBLySイムノアドヘシンである。BLySイムノアドヘシンは、BR3の細胞外ドメインを含むBR3イムノアドヘシン、TACIの細胞外ドメインを含むTACIイムノアドヘシン、およびBCMAの細胞外ドメインを含むBCMAイムノアドヘシンからなる群より選択されることが好ましい。最も好ましいBR3イムノアドヘシンは、WO200500351および米国特許第20050095243号のSEQIDNO2のhBR3Fcである。同様に、米国特許第20050163775号およびWO2006068867を参照されたい。別の好ましいBLySB細胞特異的作用物質は、残基番号162275を含んだBLySの領域内でBLySを結合することがより好ましい、抗BLyS抗体であるか、またはヒトBR3の残基番号2338を含んだ領域中でBR3を結合することがより好ましい、抗BR3抗体である。本明細書において特に好ましいイムノアドヘシンはTACIIg、またはアタシセプト、およびBR3Igである。B細胞特異的作用物質の好ましいセットは、CD20、CD22、BAFF、またはAPRILに対するものである。B細胞特異的作用物質は、1つの局面において、抗体またはTACIIgでありうる。抗体という用語は、最も広い意味で用いられ、無傷のモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、少なくとも2つの無傷の抗体から形成された多重特異性抗体、および所望の生物学的活性を示す限り抗体断片を特に網羅する。単離された抗体は、その自然環境の成分から特定され、ならびに分離およびまたは回収されたものである。その自然環境の夾雑成分は、抗体の研究的、診断的または治療的使用を妨害しうる物質であり、酵素、ホルモン、および他のタンパク質様または非タンパク質様の溶質を含みうる。いくつかの態様において、抗体は、例えば、Lowry法で測定した場合に95重量超の抗体まで、およびいくつかの態様において、99重量超まで、例えば、スピニングカップ配列決定装置の使用によって少なくとも15残基のN末端もしくは内部アミノ酸配列を得るのに十分な程度まで、または例えば、クマシーブルーもしくは銀染色を用いた還元もしくは非還元条件下でのSDSPAGEによる均質にまで、精製される。単離された抗体には、抗体の自然環境の少なくとも1つの成分が存在しないため、組換え細胞内のインサイチューの抗体が含まれる。しかしながら、通常は、単離された抗体は少なくとも1つの精製段階により調製される。天然抗体および天然免疫グロブリンは、通常、2つの同一の軽鎖および2つの同一の重鎖から構成される約150000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。各軽鎖は1つの共有ジスルフィド結合により重鎖に結合され、一方でジスルフィド結合の数は異なる免疫グロブリンアイソタイプの重鎖によって変わる。各重鎖および軽鎖はまた、規則的に間隔を置かれた鎖間ジスルフィド結合を有する。各重鎖は、いくつかの定常ドメインが続く可変ドメインを一端に有する。各軽鎖は一端に可変ドメインを、およびその他端に定常ドメインを有し軽鎖の定常ドメインは重鎖の第一の定常ドメインと整列し、軽鎖可変ドメインは重鎖の可変ドメインと整列している。特定のアミノ酸残基が、軽鎖および重鎖可変ドメイン間の界面を形成すると考えられている。本明細書における抗体B細胞特異的作用物質または抗体アンタゴニストは、B細胞上のB細胞表面マーカーに結合することによって、哺乳動物におけるB細胞を破壊もしくは枯渇させる、およびまたは、例えば、B細胞によって誘発される体液性反応を低減もしくは防止することにより、1つもしくは複数のB細胞機能を妨害する抗体である。抗体アンタゴニストは、好ましくは、それによって処置された哺乳動物におけるB細胞を枯渇させることができる。そのような枯渇は、ADCCおよびもしくはCDC、B細胞増殖の阻害ならびにまたはB細胞死の誘導などのさまざまな機構を介して達成されうる。B細胞表面マーカーに結合する抗体またはB細胞表面マーカーに対する抗体は、B細胞表面マーカーに結合することによって、哺乳動物におけるB細胞を破壊もしくは枯渇させる、およびまたは、例えば、B細胞によって誘発される体液性反応を低減もしくは防止することにより、1つもしくは複数のB細胞機能を妨害する分子である。抗体は、好ましくは、それによって処置された哺乳動物におけるB細胞を枯渇させることができる。そのような枯渇は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害およびもしくは補体依存性細胞傷害、B細胞増殖の阻害、ならびにまたはB細胞死の誘導などのさまざまな機構を介して達成されうる。B細胞表面マーカーに結合する抗体は、以下の通りに指定することができCD20またはCD22に結合する抗体は、それぞれ抗CD20抗体または抗CD22抗体である。1つの態様において、抗体は抗CD20抗体、抗CD22抗体、抗CD23抗体、または抗BR3抗体である。典型的に用いられる別の態様は、抗CD20抗体、抗CD22抗体、または抗BR3抗体である抗体である。典型的に用いられる別の態様は抗CD20抗体または抗CD22抗体であり、より頻繁に用いられる態様は、抗CD20抗体である抗体である。抗CD20抗体の例には以下が挙げられる現在ではリツキシマブマブセラと呼ばれるC2B8BiogenIdecIncから市販されているY2B8またはイブリツモマブチウキセタンと名付けられたイットリウム90標識2B8マウス抗体131IB1またはCorixaから市販されているヨウ素I131トシツモマブ抗体を作製するために131Iで標識されてもよい、トシツモマブとも呼ばれるマウスIgG2aB1マウスモノクローナル抗体1F5584591およびフレームワークパッチまたはヒト化1F5を含むその変種マウス2H7およびキメラ2H7抗体2H7抗体および以下に掲げるものB細胞の細胞膜のCD20分子を標的としたHUMAXCD20完全ヒト、高親和性抗体およびCraggetalBlood10110451052を参照されたいWO2004035607およびWO2005103081に記載のヒトモノクローナル抗体米国特許第20040093621号に記述されているFc領域に結合された複雑なNグリコシド結合糖鎖を有する抗体WO2006106959に記述されているCD20抗原の細胞外エピトープに対して高い結合親和性を有するキメラ化またはヒト化モノクローナル抗体HB203、HB204、HB2025、およびMB2011などのCD20に結合するモノクローナル抗体および抗原結合断片TRU015を含むが、これに限定されない、CD20に結合する一本鎖タンパク質米国特許第20050202534号米国特許第20050202028号米国特許第2005136049号米国特許第20050202023号TrubionPharmInc例えば、WO2004103404米国特許第20050025764号および米国特許第20060251652号に記載のAME系列の抗体、例えば、AME133抗体などのCD20結合分子、ならびに、例えば、WO2005070963に記載のFc変異を有する抗CD20抗体WO2005016969および米国特許第20050069545号に記述されているものなどのCD20結合分子例えば、WO2005014618に記載の二重特異性抗体例えば、米国特許第7151164号に記述のヒト化LL2モノクローナル抗体および他の抗CD20抗体例えば、WO2006130458GazitetalAmgenAstraZenecaに記述のCD20に対する完全ヒト抗体例えば、WO2006126069に記述のCD20に対する抗体例えば、WO2005044859米国特許第20050123546号米国特許第20040072290号および米国特許第20030175884号に記述のCD20に対するキメラまたはヒト化BLy1抗体A20抗体またはその変種、例えばキメラまたはヒト化A20抗体およびIMMUN106ならびにInternationalLeukocyteTypingWorkshopから入手可能なモノクローナル抗体L27、G282、931B3、BC1またはNUB2。本明細書における好ましい抗CD20抗体は、キメラ、ヒト化またはヒト抗CD20抗体、より好ましくはリツキシマブ、2H7抗体、キメラまたはヒト化A20抗体、およびHUMAXCD20ヒト抗CD20抗体である。抗CD22抗体の例には、EP1476120、EP1485130およびEP1504035に記述されているもの、ならびに米国特許第20040258682号、米国特許第5484892号、米国特許第6183744号および米国特許第7074403号に記述されているものが挙げられる。B細胞表面マーカーに対する抗体の好ましい具体例には、リツキシマブ、2H7抗体および本明細書において定義されるその変種、2F2ヒト抗CD20抗体、ヒト化A20抗体ベルツズマブまたはhA20、マウス由来の相補性決定領域を有するかつエプラツズマブと同一のヒトフレームワーク領域の90を有するヒト化遺伝子操作抗体低分子モジュラー免疫薬剤、ならびに抗CD22抗体、例えばエプラツズマブ、ABIOGEN抗CD22抗体およびIMPHERON抗B細胞抗体が挙げられる。抗体の可変領域または可変ドメインは、抗体の重鎖または軽鎖のアミノ末端ドメインをいう。重鎖の可変ドメインはVHということができる。軽鎖の可変ドメインはVLということができる。これらのドメインは一般に抗体の最も可変的な部分であり、抗原結合部位を含む。可変という用語は、可変ドメインのある部位が、抗体の中で配列が広範囲に異なっており、その特定の抗原に対する各特定の抗体の結合性および特異性に使用されているという事実をいう。しかしながら、可変性は抗体の可変ドメインにわたって一様には分布していない。軽鎖および重鎖の可変ドメインの両方の相補性決定領域または超可変領域と呼ばれる3つのセグメントに濃縮される。可変ドメインのより高度に保持された部分はフレームワーク領域と呼ばれる。天然の重鎖および軽鎖の可変ドメインは、βシート構造を連結するループ結合、ある場合にはその一部を形成するループ結合を形成する、3つのCDRにより連結されたβシート配置を主にとる4つのFR領域をそれぞれ含んでいる。各鎖のCDRは、FRによって近接して結合され、他の鎖のCDRと共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している。定常ドメインは、抗体の抗原への結合に直接関わっているものではないが、さまざまなエフェクター機能、例えば抗体依存性細胞傷害への抗体の関与を示す。任意の脊椎動物種由来の抗体の軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパおよびラムダと呼ばれる2つの明確に区別されるタイプの1つに割り当てることができる。免疫グロブリンは、その重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に依って、異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンには5つの主なクラスIgA、IgD、IgE、IgGおよびIgMがあり、これらのうちのいくつかはサブクラス、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、およびIgA2にさらに分類することができる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γおよびμと呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット構造および三次元立体配位は周知である。エフェクター機能に関して、例えば、抗体の抗原依存性細胞媒介性細胞傷害およびまたは補体依存性細胞傷害を増強するため、本発明の抗体を修飾することが望ましい場合がある。これは、抗体のFc領域に1つまたは複数のアミノ酸置換を導入することによって達成されうる。代替としてまたはさらに、システイン残基をFc領域に導入し、それによって、この領域での鎖間ジスルフィド結合の形成を可能にすることができる。このようにして作製されたホモ二量体抗体は、改善された内部移行能ならびにまたは増大された補体媒介性細胞死滅および抗体依存性細胞傷害を持ちうる。CaronetalJExpMed17611911195およびShopesBJImmunol14829182922を参照されたい。また、増強された抗腫瘍活性を有するホモ二量体抗体を、WolffetalCancerResearch5325602565に記述されている通りにヘテロ二官能性架橋剤を用いて調製することができる。あるいは、抗体を遺伝子操作して二重のFc領域を持たせ、それによって補体による溶解およびADCC能を増強させてもよい。StevensonetalAntiCancerDrugDesign3219230を参照されたい。成長阻害抗体または分化阻害抗体などのCD20に対する本発明の関連の中の抗体を特定するために、CD20を発現するB細胞の分化を阻害する抗体をスクリーニングすることができる。好ましい態様において、CD20を発現している細胞の成長を停止させる作用物質、CD20を発現している細胞を破壊する作用物質、またはCD20を発現している細胞の枯渇を引き起こす作用物質は、抗体である。本発明によって用いられる好ましい抗体の産生のための例示的な技法に関する記述が続けられる。抗体の産生のために用いられるCD20抗原は、例えば、CD20の細胞外ドメインの可溶型または所望のエピトープを含有する、その一部分でありうる。あるいは、細胞表面にCD20を発現している細胞を用いて、抗体を作製してもよい。抗体を作製するのに有用な抗原の他の型は、当業者には明らかであろう。ポリクローナル抗体ポリクローナル抗体は、好ましくは、関連する抗原およびアジュバントの複数回の皮下または腹腔内注射により動物において産生される。免疫される種において免疫原性であるタンパク質、例えばキーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリンまたは大豆トリプシンインヒビターに関連抗原を、二官能性物質または誘導体化物質、例えばマレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル、Nヒドロキシスクシンイミド、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl2、またはRおよびR1が異なったアルキル基であるR1NCNRにより結合させることが有用でありうる。動物を、例えば、タンパク質または結合体100μgまたは5μgを完全フロイントアジュバント3容量と併せ、この溶液を複数部位に皮内注射することによって、抗原、免疫原性結合体、または誘導体に対して免疫する。1ヶ月後、この動物に、完全フロイントアジュバントに入れた初回量の15~110のペプチドまたは結合体を複数部位に皮下注射することによって追加免疫する。7~14日後に動物から採血し、抗体価について血清をアッセイする。力価がプラトーに達するまで動物に追加免疫する。好ましくは、同じ抗原の結合体であるが、異なるタンパク質におよびまたは異なる架橋試薬によって結合された、結合体を動物に追加免疫する。結合体はまた、タンパク質融合体として組換え細胞培養において作製することもできる。また、アラムなどの凝集化剤が、免疫応答を増強するために適切に用いられる。モノクローナル抗体本明細書において用いられるモノクローナル抗体という用語は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体をいい、すなわち、集団に含まれる個々の抗体は、少量で存在しうる可能性がある天然に存在する変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は、非常に特異的であり、単一の抗原部位に対して作製される。さらに、異なる決定基に対して作製された異なる抗体を典型的に含む従来の抗体調製物とは異なり、各モノクローナル抗体は抗原上の単一の決定基に対して作製される。モノクローナル抗体は、その特異性に加えて、ハイブリドーマ培養によって合成され、他の免疫グロブリンによる夾雑がないという点で有利である。モノクローナルという修飾語は、実質的に均一な抗体の集団から得られたものであるという抗体の特性を示し、いずれかの特定の方法による抗体の産生を要すると解釈されるものではない。例えば、本発明によって用いられるモノクローナル抗体は、KohleretalNature256495によって最初に記述されたハイブリドーマ法により作製することができ、または組換えDNA法により作製することができる。モノクローナル抗体は、例えば、ClacksonetalNature352624628およびMarksetalJMolBiol222581597に記述されている技法を用いて、ファージ抗体ライブラリーから単離することもできる。モノクローナルという修飾語は、実質的に均一な抗体の集団から得られたものであるという抗体の特性を示し、いずれかの特定の方法による抗体の産生を要すると解釈されるものではない。例えば、本発明によって用いられるモノクローナル抗体は、例えば、ハイブリドーマ法HongoetalHybridoma14253260、HarlowetalAntibodiesALaboratoryManualHammerlingetalMonoclonalAntibodiesandTCellHybridomas563681、組換えDNA法、ファージディスプレイ技術MarksetalJMolBiol222581597SidhuetalJMolBiol338299310LeeetalJMolBiol34010731093FellouseProcNatlAcadSciUSA1011246712472およびLeeetalJImmunolMethods284119132を参照されたい、ならびにヒト免疫グロブリン座位の一部もしくは全部、またはヒト免疫グロブリン配列をコードする遺伝子を有する動物においてヒトまたはヒト様抗体を産生するための技術JakobovitsetalNature362255258BruggemannetalYearinImmunol733米国特許第5545807号同第5545806号同第5569825号同第5625126号同第5633425号および同第5661016号MarksetalBioTechnology10779783LonbergetalNature368856859MorrisonNature368812813FishwildetalNatureBiotechnol14845851NeubergerNatureBiotechnol14826ならびにLonbergandHuszarInternRevImmunol136593を参照されたいを含む、種々の技法によって作製することができる。本明細書におけるモノクローナル抗体は、特にキメラ抗体を含み、これにおいては、重鎖およびまたは軽鎖の一部が、特定の種に由来するまたは特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体において対応する配列と同一または相同であり、その一方で鎖の残部は、別の種に由来するまたは別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体、および、所望の生物学的活性を示す限り、このような抗体の断片において対応する配列と同一または相同である。例えば、モノクローナル抗体は、KohleretalNature256495によって最初に記述されたハイブリドーマ法を用いて作製することができ、または組換えDNA法により作製することができる。ハイブリドーマ法においては、マウスまたは他の適切な宿主動物、例えばハムスターを上記の通りに免疫し、免疫に用いられるタンパク質に特異的に結合する抗体を産生するまたは産生できるリンパ球を導き出す。あるいは、リンパ球をインビトロで免疫することもできる。次に、リンパ球をポリエチレングリコールなどの、適切な融合剤を用い骨髄腫細胞と融合させて、ハイブリドーマ細胞を形成させる。このようにして調製されたハイブリドーマ細胞を、融合していない親の骨髄腫細胞の成長または生存を阻害する1種または複数種の物質を好ましくは含有する適した培地に蒔き、成長させる。例えば、親の骨髄腫細胞が酵素ヒポキサンチングアニジンホスホリボシルトランスフェラーゼを欠いているなら、ハイブリドーマのための培地には、典型的には、HGPRT欠損細胞の成長を妨げる物質であるヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンが含まれよう。好ましい骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定な高レベルの産生を支援し、HAT培地などの培地に対して感受性である細胞である。これらの中でも、好ましい骨髄腫細胞系はマウス骨髄腫系、例えば、SalkInstituteCellDistributionCenterSanDiegoCaliforniaUSAから入手可能なMOPC21およびMPC11マウス腫瘍、ならびにアメリカンタイプカルチャーコレクションRockvilleMarylandUSAから入手可能なSP2またはX63Ag8653細胞に由来するものである。ヒト骨髄腫およびマウスヒトヘテロ骨髄腫細胞系も、ヒトモノクローナル抗体の産生について記述されているおよびBrodeuretalMonoclonalAntibodyProductionTechniquesandApplicationspp5163。ハイブリドーマ細胞が成長している培地を、抗原に対するモノクローナル抗体の産生についてアッセイする。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性を、免疫沈降法により、またはインビトロ結合アッセイ法、例えば、ラジオイムノアッセイ法または酵素結合免疫吸着アッセイ法により測定する。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、MunsonetalAnalBiochem107220のスキャッチャード分析法によって測定することができる。所望の特異性、親和性、およびまたは活性の抗体を産生するハイブリドーマ細胞が特定された後に、このクローンを限界希釈法によってサブクローニングし、標準的な方法によって成長させることができる。この目的に適した培地には、例えば、DMEMまたはRPMI1640培地が含まれる。さらに、ハイブリドーマ細胞は、動物において腹水腫瘍としてインビボで成長させることができる。サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は、例えば、プロテインAセファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、または親和性クロマトグラフィーなどの従来の抗体精製手順により、培地、腹水、または血清から適切に分離される。モノクローナル抗体をコードしているDNAは、従来の手順を用いて容易に単離され配列決定される。ハイブリドーマ細胞はこのようなDNAの好ましい供給源となる。単離されたら、DNAを発現ベクター中に入れ、次いでこれを、トランスフェクトしなければ抗体タンパク質を産生しない大腸菌細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞または骨髄腫細胞などの宿主細胞にトランスフェクトして、組換え宿主細胞でのモノクローナル抗体の合成を達成することができる。抗体をコードするDNAの細菌中での組換え発現に関する概説論文には、SkerraetalCurrOpinioninImmunol5256262およびPluckthunImmunolRevs130151188が含まれる。さらなる態様において、モノクローナル抗体または抗体断片は、McCaffertyetalNature348552554に記述された技法を用いて作製される抗体ファージライブラリーから単離することができる。ClacksonetalNature352624628およびMarksetalJMolBiol222581597には、ファージライブラリーを用いた、それぞれ、マウスおよびヒト抗体の単離が記述されている。後続の刊行物には、鎖シャッフリングによる高親和性ヒト抗体の産生、ならびに非常に大きなファージライブラリーを構築するための方策としてコンビナトリアル感染およびインビボ組換えが記述されている。したがって、これらの技法はモノクローナル抗体の単離のための伝統的なモノクローナル抗体ハイブリドーマ法に対する実行可能な別法である。DNAはまた、例えば、ヒト重鎖および軽鎖定常ドメインのコード配列を、相同マウス配列に代えて置換することにより、または免疫グロブリンコード配列に非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部もしくは一部を共有結合させることにより修飾することができる。典型的には、このような非免疫グロブリンポリペプチドは、抗体の定常ドメインに置換されるか、または、抗体の1つの抗原結合部位の可変ドメインに置換されて、抗原に対する特異性を有する1つの抗原結合部位と異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原結合部位とを含むキメラ二価抗体を作製する。ヒト化抗体非ヒトの抗体のヒト化型は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含むキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片2もしくは抗体の他の抗原結合部分配列などである。大抵の場合、ヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギなどの非ヒト種のCDR由来の残基によって置換されたヒト免疫グロブリンである。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域残基は、対応する非ヒト残基によって置換される。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも、または移入されたCDRもしくはフレームワーク配列にも見出されない残基を含んでいてもよい。これらの修飾は抗体の性能をさらに洗練かつ最大化するために行われる。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つの、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、この場合、CDR領域の全てまたは実質的に全てが、非ヒト免疫グロブリンのものに相当し、FRの全てまたは実質的に全てが、ヒト免疫グロブリン配列のものである。ヒト化抗体は、最適には免疫グロブリン定常領域、典型的にはヒト免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部分も含む。さらなる詳細については、JonesetalNature321522525ReichmannetalNature332323329およびPrestaCurrOpStructBiol2593596を参照されたい。ヒト化抗体は、抗体の抗原結合領域が、マカクザルを関心対象の抗原で免疫することによって産生された抗体に由来するPRIMATIZED抗体を含む。非ヒト抗体をヒト化するための方法は当技術分野において記述されている。好ましくは、ヒト化抗体は、ヒト以外のものである供給源由来の抗体に1つまたは複数のアミノ酸残基が導入されている。これらの非ヒトアミノ酸残基は、典型的には移入可変ドメインから得られる移入残基と呼ばれることが多い。ヒト化は、超可変領域配列をヒト抗体の対応配列の代わりに用いることによって、Winterおよび共同研究者らの方法RiechmannetalNature332323327VerhoeyenetalScience23915341536にしたがって本質的には行うことができる。したがって、このようなヒト化抗体は、無傷のヒト可変ドメインより実質的に少ない分が非ヒト種由来の対応配列で置換されたキメラ抗体である。実際には、ヒト化抗体は、典型的には、いくらかの超可変領域残基がおよび場合によってはいくらかのFR残基が齧歯類抗体の類似部位由来の残基によって置換されているヒト抗体である。抗原性を低減するには、ヒト化抗体を作製する際に用いられるヒトの軽鎖および重鎖の両方の可変ドメインの選択が非常に重要である。いわゆるベストフィット法によれば、齧歯類抗体の可変ドメインの配列を公知のヒト可変ドメイン配列のライブラリー全体に対してスクリーニングする。次に齧歯類のものと最も近いヒト配列をヒト化抗体のヒトフレームワーク領域として受け入れるChothiaetalJMolBiol196901。別の方法では、軽鎖または重鎖の特定のサブグループのヒト抗体全てのコンセンサス配列から導出される特定のフレームワーク領域を用いる。同じフレームワークをいくつかの異なるヒト化抗体に用いることができるPrestaetalJImmunol1512623。抗原に対する高親和性および他の好ましい生物学的特性は保持したままで抗体をヒト化することがさらに重要である。この目標を達成するために、好ましい方法によれば、親配列およびヒト化配列の三次元モデルを用いた親配列およびさまざまな概念的ヒト化産物の分析工程によってヒト化抗体を調製する。三次元免疫グロブリンモデルは一般的に入手可能であり、当業者にはよく知られている。選択された候補免疫グロブリン配列の推測三次元立体配座構造を図解し、表示するコンピュータプログラムを用いることができる。これらの表示の検証によって、候補免疫グロブリン配列の機能性における残基の役割の可能性の分析、すなわち、候補免疫グロブリンの、その抗原との結合能に影響を及ぼす残基の分析が可能になる。このようにして、例えば標的抗原に対する親和性の増大などの、望ましい抗体特性が達成されるように、FR残基をレシピエントおよび移入配列から選択し、組み合わせることができる。一般的に、超可変領域残基は、抗原結合に影響を及ぼす際に関わる超可変領域残基である。ヒト化されたまたは親和性成熟化された抗体のさまざまな型が企図される。例えば、ヒト化されたまたは親和性成熟化された抗体は、免疫結合体を作製するために1つまたは複数の細胞毒性剤と任意で結合されてもよい、Fabなどの、抗体断片でありうる。あるいは、ヒト化されたまたは親和性成熟化された抗体は、無傷のIgG1抗体などの、無傷の抗体でありうる。ヒト抗体ヒト抗体は、ヒトによって産生される抗体のアミノ酸配列に対応するアミノ酸配列を有するもの、およびまたは本明細書において開示されるヒト抗体を作製するための任意の技術を用いて作製されたものである。ヒト抗体のこの定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を明確に除く。ヒト化のための別法として、ヒト抗体を作製することができる。例えば、内因性の免疫グロブリン産生がなくともヒト抗体の全レパートリーを、免疫によって、産生できるトランスジェニック動物を作製することが現在は可能である。例えば、キメラおよび生殖系列変異体マウスにおける抗体重鎖結合領域遺伝子のホモ接合性欠失が内因性抗体産生の完全な阻害をもたらすことが記述されている。このような生殖系列変異体マウスにおけるヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子列の転移は、抗原投与時にヒト抗体の産生をもたらす。例えばJakobovitsetalProcNatlAcadSciUSA902551JakobovitsetalNature362255258BruggermannetalYearinImmuno733ならびに米国特許第5591669号、同第5589369号および同第5545807号を参照されたい。あるいは、ファージディスプレイ技術を、非免疫ドナー由来の免疫グロブリン可変ドメイン遺伝子レパートリーから、インビトロでヒト抗体および抗体断片を産生するために用いることができる。この技法によれば、抗体Vドメイン遺伝子は、M13またはfdなどの、繊維状バクテリオファージの主または副外被タンパク質遺伝子のいずれかにインフレームでクローニングされ、ファージ粒子の表面上に機能的な抗体断片として提示される。繊維状粒子がファージゲノムの一本鎖のDNAコピーを含むので、抗体の機能特性に基づいた選択によってまた、これらの特性を示す抗体をコードする遺伝子の選択がなされる。したがって、ファージはB細胞の特性のいくつかを模倣している。ファージディスプレイは種々の形式で行うことができその概説としては、例えば、JohnsonKevinSandChiswellDavidJCurrentOpinioninStructuralBiology3564571を参照されたい。V遺伝子セグメントのいくつかの供給源をファージディスプレイに用いることができる。ClacksonetalNature352624628では、免疫マウスの脾臓に由来するV遺伝子の小ランダムコンビナトリアルライブラリーから多種多様な抗オキサゾロン抗体が単離されている。非免疫ヒトドナー由来のV遺伝子のレパートリーを構築することができ、多種多様な抗原に対する抗体をMarksetalJMolBiol222581597、またはGriffithetalEMBOJ12725734により記述されている技法に本質的にはしたがって単離することができる。また、米国特許第5565332号および同第5573905号を参照されたい。抗体断片抗体断片は、無傷の抗体の一部分、好ましくは無傷の抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。抗体断片の例には、Fab、Fab、F2、およびFv断片ダイアボディ線形抗体105710621995一本鎖抗体分子ならびに抗体断片から形成された多特異性抗体が挙げられる。抗体断片の産生のためにさまざまな技法が開発されている。伝統的には、これらの断片は、無傷の抗体のタンパク質分解消化を介して導出されたおよびBrennanetalScience22981を参照されたい。しかし、これらの断片は現在では組換え宿主細胞によって直接産生することができる。例えば、抗体断片は上記の抗体ファージライブラリーから単離することができる。あるいは、FabSH断片は大腸菌から直接回収することができ、化学的に結合させてF2断片を形成させることができる。別の取り組みによれば、F2断片を組換え宿主細胞培養から直接単離することができる。抗体断片の産生のための他の技法は当業者には明らかであろう。他の態様において、選択の抗体は一本鎖Fv断片である。WO9316185米国特許第5571894号および米国特許第5587458号を参照されたい。また、抗体断片は、例えば、米国特許第5641870号に記述されているような線形抗体であってもよい。このような線形抗体断片は単一特異性または二重特異性でもよい。抗体のパパイン消化により、それぞれが単一の抗原結合部位を有した、Fab断片と呼ばれる、2つの同一の抗原結合断片、および容易に結晶化する能力が名に反映されている、残りのFc断片が生じる。ペプシン処理により、2つの抗原結合部位を有するが、それでも抗原を架橋結合する能力を有する、F2断片が得られる。また、Fab断片も、軽鎖の定常ドメインおよび重鎖の第一の定常ドメインを含む。Fab断片は、抗体のヒンジ領域からの1つまたは複数のシステインを含めた、重鎖CH1ドメインのカルボキシ末端における数残基の付加によって、Fab断片と異なる。定常ドメインのシステイン残基が遊離チオール基を有するFabの本明細書における命名は、FabSHである。F2抗体断片は、最初、その間にヒンジシステインを有するFab断片の対として産生された。また、抗体断片の他の化学結合も公知である。Fvは、完全な抗原認識部位および結合部位を含む最小の抗体断片である。この領域は、1本の重鎖および1本の軽鎖の可変ドメインの、密な非共有結合の二量体からなる。それぞれの可変ドメインの3つのCDRが相互作用してVHVL二量体の表面上の抗原結合部位を規定するのは、この立体配置においてである。集合的に、6つのCDRが抗体に抗原結合の特異性を与える。しかしながら、単一の可変ドメインさえも、結合部位全体よりも低い親和性であるが、抗原を認識かつ結合する能力を有する。一本鎖FvまたはsFv抗体断片は、抗体のVHおよびVLドメインを含み、これらのドメインは単一のポリペプチド鎖に存在する。好ましくは、FvポリペプチドはVHおよびVLドメイン間にポリペプチドリンカーをさらに含み、これによってsFvが抗原結合に望ましい構造を形成することが可能になる。sFvの概説としては、PluckthuninThePharmacologyofMonoclonalAntibodiesvol113RosenburgandMooreedsSpringerVerlagNewYorkpp269315を参照されたい。ダイアボディという用語は、2つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片をいい、その断片は同一のポリペプチド鎖内で軽鎖可変ドメインに連結された重鎖可変ドメインを含む。短すぎて同一鎖上での2つのドメイン間で対形成できないリンカーを用いることにより、ドメインを別の鎖の相補ドメインと強制的に対形成させ、2つの抗原結合部位を作製する。ダイアボディは、例えば、EP404097WO9311161およびHollingeretalProcNatlAcadSciUSA9064446448にさらに十分に記述されている。二重特異性抗体二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なるエピトープに対して結合特異性を有する抗体である。例示的な二重特異性抗体は、CD40またはCD20の2つの異なるエピトープに結合することができる。他のそのような抗体では、CD20結合部位と、関心対象の自己免疫疾患に関連する自己抗原に結合する結合部位とを組み合わせることができる。あるいは、抗CD20アームまたは抗CD40アームは、細胞防御機構をCD20発現細胞に集中させるようにFcγRI、FcγRIIおよびFcγRIIIなどの、IgGに対するFc受容体、またはT細胞受容体分子などの白血球上のトリガリング分子に結合するアームと組み合わされてもよい。二価超の結合価を有する抗体が企図される。例えば、三重特異性抗体を調製することができる。TuttetalJImmunol14760。結合親和性は一般に、分子の単一結合部位とその結合パートナーとの間の非共有結合性相互作用の総体的な強度をいう。特に指定のない限り、本明細書において用いられる場合、結合親和性は、結合対の成員間の11の相互作用を反映する内因の結合親和性をいう。分子XのそのパートナーYに対する親和性は一般に、解離定数によって表すことができる。親和性は、本明細書において記述されるものを含め、当技術分野において公知の共通の方法によって測定することができる。低親和性抗体は一般に、抗原にゆっくり結合して素早く解離する傾向があるのに対し、高親和性抗体は一般に、抗原にもっと早く結合してもっと長く結合したままとなる傾向がある。結合親和性を測定する種々の方法が当技術分野において公知であり、それらのいずれかを本発明の目的に用いることができる。結合親和性を測定するための特定の例証的かつ例示的な態様を以下に記述する。1つの態様において、本発明によるKdまたはKd値は、以下のアッセイ法によって記述される通りに、関心対象の抗体のFab型とその抗原を用いて行われる放射性標識抗原結合アッセイ法によって測定される。一連の力価の非標識抗原の存在下において最小濃度の標識抗原にてFabを平衡化し、次に抗Fab抗体でコーティングされたプレートと結合した抗原を捕捉することにより、抗原に対するFabの溶液結合親和性を測定するを参照されたい。アッセイ法の条件を確立するために、マイクロタイタープレートを50mM炭酸ナトリウム中5μgmlの捕捉用抗Fab抗体で終夜コーティングし、その後、PBS中2のウシ血清アルブミンで室温にて2~5時間ブロッキングする。非吸着プレートにおいて、100pMまたは26pMの125I抗原を関心対象のFabの連続希釈液と混合するにおける、抗VEGF抗体Fab12の評価にしたがう。関心対象のFabを次いで終夜インキュベートするがしかしながら、インキュベーションは平衡状態に達したことを確認するまでにさらに長い時間続けられることもある。その後、室温でのインキュベーションのために混合物を捕捉プレートに移し入れる。次いで溶液を除去し、プレートをPBS中01のTWEEN20の界面活性剤で8回洗浄する。プレートが乾燥したら、150μlウェルの閃光物質Packardを加え、プレートをTOPCOUNT計測器にて10分間計測する。最大結合の20未満または20相当をもたらす各Fabの濃度を、競合結合アッセイ法で用いるために選択する。別の態様によれば、およそ10反応単位の固定された抗原CM5チップとともに25°CでBIACORE2000またはBIACORE3000装置を用いた表面プラズモン共鳴アッセイ法の使用によりKdまたはKd値を測定する。手短に言えば、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサチップを、供給元の使用説明書にしたがってNエチルNカルボジイミド塩酸塩およびNヒドロキシスクシンイミドで活性化する。抗原を10mM酢酸ナトリウムpH48で5μgmlに希釈した後に、結合タンパク質の反応単位がおよそ10となるように5μl分の流速で注入する。抗原の注入後、未反応群をブロッキングするために1Mのエタノールアミンを注入する。動力学的な測定のために、Fabの2倍連続希釈液を25°Cにて、およそ25μl分の流速で005TWEEN20界面活性剤を含むPBS中にて注入する。会合および解離のセンサグラムを同時にフィットさせることによる単純一対一ラングミュア結合モデル評価ソフトウェアバージョン32を用いて、会合速度および解離速度を算出する。平衡解離定数をkoffkon比として算出する。例えば、ChenetalJMolBiol293865881を参照されたい。上記の表面プラズモン共鳴アッセイ法による結合速度が106M1s1を上回るなら、分光計、例えば、流動停止を備えた分光光度計または撹拌キュベットを備えた8000シリーズSLMAMINCO分光光度計にて測定される、漸増濃度の抗原の存在下、PBSpH72中20nMの抗抗原抗体の25°Cでの蛍光放出強度の増加または減少を測定する蛍光消光技法を用いることによって結合速度を測定することができる。また、本発明による結合速度、会合の速度、会合速度またはkonは、BIACORE2000またはBIACORE3000システムを用いて上記の通りに測定することができる。本明細書において用いられる実質的に類似のまたは実質的に同じのという用語は、当業者によって二つの値の間の相違に、該値により測定される生物学的特性との関連のなかでわずかにまたは全く生物学的およびまたは統計学的有意差がないものと考えられるような、二つの数値間の十分に高い類似度を意味する。前記の二つの値の間の相違は、例えば、参照比較値に応じて約50未満、約40未満、約30未満、約20未満、およびまたは約10未満である。本明細書において用いられる実質的に低減されたまたは実質的に異なるという語句は、当業者によって二つの値の間の相違に、該値により測定される生物学的特性との関連のなかで統計学的に有意であるものと考えられるような、二つの数値間の十分に高い相違度を意味する。前記の二つの値の間の相違は、例えば、参照比較分子の値に応じて約10超、約20超、約30超、約40超、およびまたは約50超である。阻害核酸いくつかの態様において、免疫抑制剤または免疫調節剤は、B細胞または他のリンパ球における標的遺伝子の発現を阻害する阻害核酸であり、例えば、低分子干渉RNAまたは低分子ヘアピン型RNAおよび低分子干渉DNARNAまたはDNAおよびRNAの低分子ヘアピン型キメラを含む。本明細書において用いられる場合、siRNAという用語は、標的B細胞mRNAの翻訳を妨止する二本鎖RNA分子をいう。DNAがRNA転写の鋳型であるものを含め、siRNAを細胞へ導入する標準的な技法が用いられる。siRNAは、標的遺伝子のセンス核酸配列の一部、標的遺伝子のアンチセンス核酸配列の一部またはその両方を含む。単一の転写産物が標的遺伝子のセンス核酸配列および相補的なアンチセンス核酸配列の両方を有する、例えば、ヘアピンなどのsiRNAを構築することができる。siRNAはdsRNAまたはshRNAのいずれかでよい。本明細書において用いられる場合、dsRNAという用語は、互いに相補的な配列から構成され、かつ相補的配列を介してともにアニールし二本鎖RNA分子を形成した、2つのRNA分子の構築体をいう。2つの鎖のヌクレオチド配列は、標的遺伝子配列のタンパク質コード配列より選択されるセンスRNAまたはアンチセンスRNAだけでなく、標的遺伝子の非コード領域より選択されるヌクレオチド配列を有するRNA分子も含んでよい。shRNAという用語は、本明細書において用いられる場合、互いに相補的な第一の領域および第二の領域、すなわちセンス鎖およびアンチセンス鎖から構成される、ステムループ構造を有するsiRNAをいう。これらの領域の相補性の程度および向きは、塩基対合がそれらの領域の間で生じるのに十分であり、第一の領域および第二の領域はループ領域によって連結され、このループは、ループ領域内のヌクレオチドの間で塩基対合が無いことに起因する。shRNAのループ領域は、センス鎖とアンチセンス鎖の間に介在する一本鎖領域であり、介在性一本鎖といわれることもある。免疫抑制剤または免疫調節剤の投与当業者は、免疫抑制剤または免疫調節剤を、作用物質、処置されている特定の疾患、患者などに依って、種々の方法で投与できることを認識するであろう。本発明の作用物質または組成物を用いて、ヒト、ならびにマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシ、ウマ、サル、ヒヒおよびチンパンジー、特に商業的に重要な動物または家畜を含むが、これらに限定されない、任意の他の哺乳動物を含む対象または患者において自己免疫疾患を処置およびまたは予防することができる。免疫抑制剤または免疫調節剤は、他の治療用物質、特に、以下に記述されるDNA抗原特異的な治療物質を任意で含んでもよい薬学的組成物に好都合に製剤化される。この製剤は、抗炎症剤、鎮痛薬などのような他の剤を含んでもよい。本発明の免疫抑制剤または免疫調節剤およびDNA抗原特異的な治療物質は、1つまたは複数の他の薬理学的な作用物質と連続的にまたは同時に投与することができる。医薬および薬理学的な作用物質の量は、例えば、どのような種類の薬理学的な作用物質が用いられるか、処置されている疾患、ならびに投与のスケジュールおよび経路に依る。本明細書において特に言及される成分に加えて、本発明の薬学的な作用物質および組成物は、問題の製剤の種類を考慮して、当技術分野において慣例的な他の作用物質も含みうることが理解されるべきである。いくつかの態様において、免疫抑制剤もしくは免疫調節剤およびまたはDNA抗原特異的な治療物質は、自己免疫疾患を処置するのに有用な材料を含む製造物およびキットに含めることができる。該製造物は、ラベルを有する本薬学的組成物のいずれかの容器を含みうる。適した容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれる。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどの、種々の材料から形成されうる。容器上のラベルには、作用物質が、疾患の1つまたは複数の状態の処置または予防のために用いられることが示されるべきである。ラベルはまた、投与などに関する指示も示しうる。本発明の免疫抑制剤または免疫調節剤は、薬学的組成物として直接的に、または必要なら、慣例的な製剤化の方法により製剤化して、投与することができる。したがって、本発明の薬学的組成物は、特定の制限なしに必要に応じて含めることができる薬物に通常用いられる薬学的に許容される担体、賦形剤などを含む。そのような担体の例は滅菌水、生理食塩水、リン酸緩衝液、培養液などである。さらに、薬学的な作用物質または組成物は必要に応じて、安定剤、懸濁液、保存料、界面活性剤などを含みうる。本発明の薬学的な作用物質または組成物は抗がんの目的に用いることができる。医薬は、自己免疫疾患あるいは自己免疫疾患の兆候もしくは症候または副作用を処置するための活性な薬物である。薬学的製剤という用語は、医薬の生物学的活性が有効であることを可能にするような形態であり、かつ製剤が投与される対象に対して許容されない毒性がある追加成分を含まない無菌調製物をいう。無菌製剤は、無菌性であるか、または全ての生きている微生物およびそれらの胞子を含まない。添付文書は、適応症、用途、投与量、投与、禁忌、包装された製品と併用される他の治療用製品、およびまたはそのような治療用製品もしくは医薬の使用に関する警告などについての情報を含む、治療用製品または医薬の商業的包装に慣習的に含まれる指示書をいうように用いられる。キットは、少なくとも1つの試薬、例えば、自己免疫疾患の処置のための医薬、または本発明のバイオマーカー遺伝子もしくはタンパク質を特異的に検出するためのプローブを含む任意の製造品である。製造品は、本発明の方法を行うための構成単位として、宣伝、流通または市販されることが好ましい。標的視聴者は、とりわけ特定の使用、処置または適応症について、マーケティングまたは宣伝することにより、特定の医薬が販売促進されるかまたは販売促進されるよう意図される、人々の集団または施設であり、例えば、個々の患者、患者集団、新聞、医学文献および雑誌の読者、テレビまたはインターネットの視聴者、ラジオまたはインターネット聴視者、医師、製薬会社などである。試料という用語は、個人から得られる任意の生体試料、生体液、体組織、細胞系、組織培養物、または他の供給源を広く意味するものとする。生体液は、例えば、リンパ液、血清、新鮮な全血、末梢血液単核細胞、凍結した全血、血漿、尿、唾液、精液、滑液および髄液である。試料には、滑膜組織、皮膚、毛包、および骨髄も含まれる。哺乳動物から組織生検および生体液を得るための方法は、当技術分野において周知である。試料という用語が単独で用いられるなら、試料は生体試料であり、すなわち、これらの用語は互換的に用いられることを意味するものとする。血清試料という用語は、個人から得られる任意の血清試料を広く意味するものとする。哺乳動物から血清を得るための方法は、当技術分野において周知である。事前に投与された医薬の1つまたは複数に対する、対象または患者の反応に関して~に反応しないという表現は、このような医薬の投与時に、対象または患者が、処置されている障害の処置に関して何らのもしくは十分な兆候を示さなかったこと、または医薬に対して臨床的に許容されない高度の毒性を示したこと、またはこのような医薬の最初の投与後に、処置の兆候が維持されなかったことを記述し、処置という言い回しはこの文脈において本明細書に定義されるように用いられる。反応しないという語句には、事前に投与された医薬に対して抵抗性およびまたは不応性である対象に関する記述が含まれ、付与されている医薬の服薬中に対象または患者が進行させた状況、および、もはや反応しない医薬に関わる投与計画の完了後12ヶ月以内に対象または患者が進行させた状況を含む。したがって、1つまたは複数の医薬に対する無反応性には、以前または現在の処置をもって、その後も活動性疾患を持ち続けている対象が含まれる。例えば、患者は、それらが反応しない医薬による治療の約1~3ヶ月後も、活動性疾患の活動性を有している場合もある。そのような反応性は、問題の自己免疫疾患の処置に熟練している臨床医によって評価されうる。医薬に対する無反応のために、1つまたは複数の医薬による以前または現在の処置から臨床的に許容されない高い毒性レベルを経験する対象は、例えば、重篤感染症、うっ血性心不全、脱髄、著しい過敏症、神経病理事象、高い度合いの自己免疫、子宮内膜がん、非ホジキンリンパ腫、乳がん、前立腺がん、肺がん、卵巣がんまたは黒色腫などのがん、結核などのような、経験豊かな臨床医によって重要であるものと考えられる、それらの処置と関連する1つまたは複数の負の副作用または有害事象を経験する。負の副作用の危険性を低減するとは、以前に投与された医薬による同じ患者または別の患者の処置に起因して観察される危険性よりも低い程度にまで、本明細書におけるアンタゴニストによる処置に起因した副作用の危険性を低減することを意味する。このような副作用は、毒性に関して上に記載したものを含み、好ましくは感染症、がん、心不全、または脱髄である。相関するまたは相関することとは、任意の方法で、第一の分析またはプロトコルの成績およびまたは結果と、第二の分析またはプロトコルの成績およびまたは結果とを比較することを意味する。例えば、第一の分析またはプロトコルの結果を、第二のプロトコルの実行に用いてもよく、かつまたは第二の分析またはプロトコルを実施すべきかどうかを判定するために、第一の分析またはプロトコルの結果を用いてもよい。本明細書におけるさまざまな態様に関して、DNA抗原特異的な治療物質と組み合わせてB細胞特異的作用物質を用いる特定の治療投与計画を実施すべきかどうかを判定するために、分析アッセイ法の結果を用いてもよい。DNA抗原特異的な治療物質と組み合わせて免疫抑制剤または免疫調節剤の治療的有効量を患者に投与する的確な方法が、担当医の裁量によることは、医療分野の当業者には理解されるであろう。投与量、他の自己免疫剤との組み合せ、投与のタイミングおよび頻度などを含めて、投与の方法は、このような併用治療に対して患者に起こりうる反応性の診断の程度、ならびに患者の状態および病歴の影響を受けうる。併用治療を構成する各作用物質は、良好な医療行為と一致した様式で製剤化され、投薬され、かつ投与されるであろう。この文脈における考慮の因子には、処置される自己免疫疾患の特定の種類、処置される特定の哺乳動物、個々の患者の臨床症状、自己免疫疾患の原因、作用物質の送達部位、起こりうる副作用、作用物質、すなわち免疫抑制剤もしくは免疫調節剤またはDNA抗原特異的な治療物質の種類、投与方法、投与スケジュール、および医者に公知の他の因子が含まれる。投与される作用物質の有効量は、このような考慮による影響を受けるであろう。治療的有効量という用語は、成長停止効果、分化阻害効果を有するまたはB細胞の欠失を引き起こすB細胞特異的作用物質などの、活性な免疫抑制剤または免疫調節剤の量をいうように用いられる。特定の局面において、治療的有効量は、例えば、疾患進行の緩徐化において有効であることが示されている標的血清濃度をいう。有効性は、処置される状態に依り、慣例的な方法で測定することができる。当技術分野における通常の技術を有する医師は、特定の作用物質、すなわちB細胞特異的作用物質またはDNA抗原特異的治療物質、および安全性プロファイルのような因子に依り、必要とされる各作用物質の薬学的組成物の有効量を容易に判定かつ処方することができる。例えば、医師は、安全性を評価するため、望ましい治療効果を達成するのに必要とされるものよりも低いレベルで薬学的組成物において用いられる、抗CD20抗体もしくは抗CD22抗体またはイムノアドヘシンなどの、B細胞特異的作用物質の用量から始めて、望ましい効果が後続のDNA抗原特異的な治療物質の投与で達成されるまで投与量を徐々に増やすことができる。作用物質の所与の用量または処置計画の有効性は、例えば、特定の自己免疫疾患に対する効力の標準的手段を用いて患者での兆候および症候を評価することにより、判定することができる。一般的な提案として、1用量あたり非経口的に投与されるB細胞特異的作用物質の有効量は、1回または複数回の投与量により、約20mg~約5000mgの範囲内であろう。抗CD20抗体および抗CD22抗体、ならびにBAFFおよびAPRILアンタゴニストなどの無傷の抗体に対する例示的な投与量計画は、375mgm2毎週×4または500mg×2、もしくは1000mg×2または1グラム×3または200mg×1~4または300mg×1~4、もしくは400mg×1~4または500mg×3~4または1グラム×4を含む。好ましくは、B細胞特異的作用物質は約02~4グラム、より好ましくは約02~35グラム、より好ましくは約04~25グラム、より好ましくは約05~15グラム、およびさらにより好ましくは約07~11グラムの用量で投与される。より好ましくは、そのような用量は、抗体またはイムノアドヘシンであるアンタゴニストに当てはまる。あるいは、B細胞特異的作用物質は処置の開始時、1日目および15日目に約1000mg×2の用量で静脈内投与される抗CD20抗体である。別の代替的な好ましい態様において、抗CD20抗体は単回の用量としてまたは2回の輸液として、各用量が約200mg~12g、より好ましくは約200mg~11g、およびさらにより好ましくは約200mg~900mgで投与される。別の好ましい態様において、B細胞特異的作用物質は、処置の開始時、1日目および15日目に約1000mg×2の用量で静脈内投与される抗CD20抗体である。好ましくは、抗CD20抗体は、単回の用量としてまたは2回の輸液として、各用量が約200mg~600mgで投与される。好ましい局面において、B細胞特異的作用物質は、約1ヶ月の期間内に1~4回の用量の頻度で投与される。アンタゴニストは好ましくは、2~3回の用量で投与される。さらに、アンタゴニストは好ましくは、約2~3週の期間内に投与される。しかしながら、上記の通りに、提案したこれらのアンタゴニスト量および投薬の頻度はかなり多くの治療的裁量による。適切な用量およびスケジュールの選択における重要な因子は、上述の通りに、得られた結果である。例えば、比較的高い用量は、進行性および急性の自己免疫炎症の処置に当初必要とされる場合がある。最も効果的な結果を得るためには、併用治療が見込まれたら、併用治療計画は、最初の兆候、診断、外観、もしくは自己免疫炎症の発生のできるだけ近くで、または自己免疫疾患の寛解期に開始されるべきである。静脈内輸液という用語は、およそ15分超の期間にわたる、一般的にはおよそ30~90分の期間にわたる動物またはヒト患者の静脈への作用物質の導入をいう。静脈内ボーラスまたは静脈内プッシュという用語は、身体がおよそ15分またはそれ以下、一般的には5分またはそれ以下で薬物を受け入れるような動物またはヒトの静脈内への薬物の投与をいう。皮下投与という用語は、薬物容器から比較的ゆっくりとした、徐放により動物またはヒト患者の皮下、好ましくは皮膚と下層組織の間の窪みに作用物質の導入を行うことをいう。この窪みは、皮膚を上に摘むかまたは引っ張ることにより、下層組織から離すことで作ってもよい。処置目的のための哺乳動物は、ヒト、家畜および牧畜、ならびに動物園の動物、競技用の動物またはペット動物、例えば、ほんの数例を挙げればイヌ、ウマ、ネコおよびウシを含む、哺乳動物に分類される任意の動物をいう。添付文書という用語は、適応症、用途、投与量、投与、禁忌およびまたは当該の治療用製品の使用に関する警告についての情報を含む、治療用製品の商業的包装に慣習的に含まれる指示書をいうように用いられる。皮下輸液という用語は、30分もしくはそれ以下、または90分もしくはそれ以下を含むが、これらに限定されない期間にわたって薬物容器から比較的ゆっくりとした、徐放により動物またはヒト患者の皮下、好ましくは皮膚と下層組織の間の窪みに薬物の導入を行うことをいう。任意で、輸液は、動物またはヒト患者の皮下に埋め込まれる皮下埋め込み術により行われてもよく、この場合にはポンプによって所定量の薬物を所定の期間、例えば30分、90分、または処置計画の長さに及ぶ期間にわたり送達する。皮下ボーラスという用語は、動物またはヒト患者の皮下への薬物の投与をいい、ここでボーラス薬物投与は、好ましくはおよそ15分未満、より好ましくは5分未満、および最も好ましくは60秒未満である。投与は、好ましくは、皮膚と、窪みのある下層組織の間の窪みになされる。DNA抗原特異的な治療物質DNA抗原特異的な治療物質という用語は、免疫応答を調節する目的で対象に投与されるポリヌクレオチドをいう。本発明の意図に関して、DNA寛容化、DNAワクチン接種、DNA免疫化またはポリヌクレオチド治療は、疾患に関連する1つまたは複数の自己抗原性エピトープを含む1つまたは複数の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの投与をいう。DNA寛容化またはDNAワクチン接種は、自己免疫疾患の処置または予防のために自己免疫破壊を抑制するように進行中の免疫応答を調節する目的を果たす。DNAワクチン接種に応じた免疫応答の調節は、自己反応性リンパ球をTh1型応答からTh2型応答へシフトすることを含みうる。免疫応答の調節は、全身性に、または自己免疫攻撃下の標的器官に局所的のみに、起こりうる。ポリヌクレオチドおよび核酸という用語は、ホスホジエステル結合を介して連結された多数のヌクレオチド単位で構成される重合体をいう。ポリヌクレオチドまたは核酸は、実質的には任意の長さであり、典型的には約六ヌクレオチド~約109ヌクレオチド~約4000ヌクレオチドまたはそれ以上でありうる。ポリヌクレオチドおよび核酸は、RNA、DNA、合成型、および混合重合体、センス鎖およびアンチセンス鎖の両方、二本鎖または一本鎖を含み、また、当業者により容易に認識されている通り、化学的にもしくは生化学的に改変されうるか、または非天然ヌクレオチド塩基もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含みうる。そのような改変には、例えば、標識、メチル化、1つまたは複数の天然に存在するヌクレオチドの類似体との置換、非荷電性結合、荷電性結合、ペンダント部分、インターカレーター、キレーター、アルキレーター、および修飾結合のようなヌクレオチド間改変が挙げられる。水素結合および他の化学的相互作用を介して指定された配列に結合する能力においてポリヌクレオチドを模倣する、合成分子もまた挙げられる。そのような分子は当技術分野において公知であり、例えば、分子の骨格においてペプチド結合がリン酸結合と置き換わっているものを含む。プロモーターという用語は、RNA合成、すなわち転写の開始のためにRNAポリメラーゼにより認識されるポリヌクレオチド領域をいう。プロモーターは、転写の効率、およびそれに従って、自己ベクターによりコードされる自己ポリペプチドのタンパク質発現のレベルを制御する自己ベクターの機能的要素の1つである。プロモーターは、構成的であってもよく、関連した遺伝子の継続的な転写を可能にするか、または誘導性であってもよく、したがって、環境における異なる物質の存在もしくは非存在により制御されうる。加えて、プロモーターはまた、広範囲の異なる細胞型における発現として一般的でありうるか、または細胞型特異的で、およびそれに従って、筋肉細胞などの特定の細胞型においてのみ活性もしくは誘導性でありうるかのいずれかである。ベクターからの転写を制御するプロモーターは、さまざまな供給源、例えば、ポリオーマ、サルウイルス40、アデノウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルス、および好ましくは、サイトメガロウイルスなどのウイルスのゲノムから、または異種性哺乳動物プロモーター、例えば、bアクチンプロモーターから得られうる。SV40ウイルスの初期および後期プロモーターは都合よく得られ、ヒトサイトメガロウイルスの最初期プロモーターも同様である。エンハンサーは、プロモーターへ作用して、そのプロモーターからの転写を増強する約10~300塩基対のシス作用性ポリヌクレオチド領域をいう。エンハンサーは、比較的、配向非依存性および位置非依存性であり、転写単位の5側もしくは3側に、イントロン内に、またはコード配列自体の内部に配置されうる。本明細書において用いられるイントロンまたはイントロン配列という用語は、RNAプロセッシング中に保持されかつポリペプチドをコードすることが最も多いポリヌクレオチド配列である、エキソンの上流に、または該エキソンの間に位置している、自己ベクターに存在する遺伝子または遺伝子の部分の中の介在ポリヌクレオチド配列をいう。イントロンは、タンパク質合成のためのコードディングにおいて機能せず、ポリペプチドへ翻訳される前にRNAから外へスプライスされる。スプライシングは、単一の機能的RNA分子が、一次転写産物またはプレRNAのプロセッシング中にイントロンの除去およびエキソンの並置により生成される機構をいう。コンセンサス配列は、イントロンの5末端または供与部位および3末端または受容部位を画定するイントロンエキソン接合部に、ならびにイントロン配列内の受容部位の約20~50塩基対上流に位置する分岐部位に存在する。たいていのイントロンは、配列GUから始まり、配列AGで終わり、CUAに近似する分岐部位を有し、Aは全ての遺伝子において保存されている。これらの配列は、イントロンの外へのループ形成およびそれの引き続いて起こる除去の合図をする。本明細書において用いられる場合、ターミネーター配列とは、DNA転写の終わりをRNAポリメラーゼに合図するポリヌクレオチド配列を意味する。ターミネーター配列により生じたRNAの3末端は、しばしば、その後、ポリアデニル化によってかなり上流でプロセッシングされる。ポリアデニル化は、転写された伝令RNAの3末端への約50~約200ヌクレオチド鎖のポリアデニル酸の非鋳型性付加をいうように用いられる。ポリアデニル化シグナルは、mRNAの3非翻訳領域内に見出され、転写産物の切断およびポリA尾部の付加についての部位を特定する。転写終結およびポリアデニル化は、機能的に関連しており、効率的な切断ポリアデニル化に必要とされる配列もまた、終結配列の重要な要素を構成する。自己ベクター、自己ベクター特異的な作用物質は、まとめると、1つまたは複数の自己タンパク質、自己ポリペプチド、自己ペプチドをコードするDNAまたはRNAのいずれかのポリヌクレオチドを含む1つまたは複数のベクターを意味する。DNA寛容化ベクターまたはDNA寛容化プラスミドは、特定の自己免疫疾患の文脈において用いられる場合、その記述のなかに特定の自己抗原を含むことができ、例えば、T1Dの場合、DNA寛容化プラスミドは、プロインスリンが自己ベクターによってコードされる自己抗原である場合にはプロインスリン寛容化プラスミドということができる。多発性硬化症の場合、DNA寛容化プラスミドは、ミエリン塩基性タンパク質が自己ベクターによってコードされる自己抗原である場合にはミエリン塩基性タンパク質寛容化プラスミドということができる。ポリヌクレオチドは、本明細書において用いられる場合、本発明の自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードする、DNAを含むデオキシリボ核酸またはRNAを含むリボ核酸のいずれかの系列、およびそれらの誘導体である。自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードする配列は、適切なプラスミド発現自己カセットへ挿入される。自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするポリヌクレオチドが発現自己カセットへ挿入されたら、ベクターはその後、自己ベクターといわれる。複数の自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするポリヌクレオチドが投与される場合、単一の自己ベクターが複数の別個の自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードすることができる。1つの態様において、いくつかの自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするDNAは、内部リボソーム再侵入配列または単一のDNA分子から複数のタンパク質を発現するための他の方法を用いて単一の自己プラスミドに連続的にコードされる。自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするDNA発現自己ベクターは、QiagenCorporationから市販されているものなどのプラスミドDNAの単離のための市販の技法を用いて調製され単離される。DNAは、治療物質としてのヒトへの送達のために細菌内毒素を含まないように精製される。あるいは、各自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドは別個のDNA発現ベクター上にコードされる。高発現自己ベクターまたはHESVは、本明細書において、コードされる自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドの発現を、同じ自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドをコードする非改変自己ベクターと比較して増加させるように変化している改変自己ベクターをいう。HESVは、自己免疫疾患に関連する自己ポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、改変されていない同じ自己ベクターと比較して自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための改変とを含む。HESVはさらに、以下を機能的に組み合わせて含むプロモーター自己免疫疾患に関連する少なくとも1つの自己抗原性エピトープを含む自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド転写ターミネーターならびに、プロモーター、ポリヌクレオチド、および転写ターミネーターを含む非改変自己ベクターと比較して、宿主細胞における自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための少なくとも1つの改変。自己ポリペプチドの発現の増加を有するHESVを作製するための自己ベクターの改変は、以下を増加させる変化から選択される転写開始、転写終結、mRNA安定性、翻訳効率、およびタンパク質安定性。より具体的には、自己ポリペプチドの発現を増加させるための自己ベクターの改変は、以下からなる群より選択されるより強いプロモーター領域の使用、エンハンサー領域の付加、より効率的な転写ターミネーター配列の使用、ポリアデニル化シグナルの付加、より理想的なコンセンサスコザック配列の使用、コドン使用頻度の最適化、イントロンの包含、または前記の改変の組み合わせ。単一または複数の改変が、HESVを作製するために自己ベクターへ組み入れられうる。1つの好ましい態様において、改変は、プロモーター領域の下流かつ1つまたは複数の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの開始コドンの下流のイントロンの包含である。より具体的には、好ましいイントロンは、ヒトサイトメガロウイルスのイントロンAまたはβグロビンIgキメライントロンであり、かつ最も好ましくは、好ましいイントロンはβグロビンIgキメライントロンである。インスリン依存性糖尿病、多発性硬化症、全身性紅斑性狼瘡、または関節リウマチなどの自己免疫疾患に関連する自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドをコードする非改変自己ベクターと比較して、同じ自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドの増加した量を発現するHESVが作製される。T1Dの場合、非改変自己ベクターと比較して自己ポリペプチドであるプレプロインスリンの増加した量を発現するHESVが作製される。自己免疫疾患の多発性硬化症に関連する自己ポリペプチドをコードする非改変自己ベクターと比較して、同じ自己ポリペプチドの増加した量を発現するHESVが作製される。より具体的には、非改変自己ベクターと比較して自己ポリペプチドであるミエリン塩基性タンパク質の増加した量を発現するHESVが作製される。好ましい態様において、HESVは、自己ポリペプチドであるMBPの開始コドンの5側にβグロビンIgキメライントロンを含む。非分泌性自己ベクターまたはNSSVまたは非分泌性自己ベクター特異的な作用物質は本明細書において、自己免疫疾患に関連する細胞外もしくは分泌性の自己抗原の細胞内または非分泌性の自己ポリペプチド型をコードするポリヌクレオチドを含む改変自己ベクターをいう。NSSVは、自己免疫疾患に関連する分泌性自己ポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、非分泌性または非膜結合性の自己ポリペプチドを宿主細胞から発現するための改変とを含む。NSSVはさらに、以下を機能的に組み合わせて含むプロモーター自己免疫疾患に関連する少なくとも1つの自己抗原性エピトープを含む細胞外または分泌性の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド転写ターミネーターならびに、プロモーター、ポリヌクレオチド、および転写ターミネーターを含む非改変自己ベクターと比較して、宿主細胞からの自己ポリペプチドの分泌を防止するための少なくとも1つの改変。分泌性または膜結合性の自己ポリペプチドの非分泌性型または非膜結合性型をコードしかつ発現するNSSVを作製するための自己ベクターへの改変には、限定されるわけではないが、シグナル配列を除去すること、シグナル配列を突然変異させること、ならびに代替のタンパク質局在化シグナルおよびタンパク質分解シグナルを付加することまたは自己ポリペプチドの膜貫通ドメインもしくは疎水性領域を改変もしくは欠失させることが挙げられる。非分泌性高発現自己ベクターまたはNSHESVまたは非分泌性高発現自己ベクター特異的な作用物質は、細胞外もしくは分泌性の自己ポリペプチドのコードされた細胞内型もしくは非分泌性型、または膜結合性自己ポリペプチドの非膜結合性型の発現を増加させるように変化している改変自己ベクターをいい、発現および分泌は、非改変自己ベクターと比較した場合である。NSHESV特異的な作用物質は、自己免疫疾患に関連する分泌性または膜結合性の自己ポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、非改変自己ベクターと比較して非分泌性型または非膜結合型での自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための改変とを含む。NSHESVはさらに、以下を機能的に組み合わせて含むプロモーター自己免疫疾患に関連する少なくとも1つの自己抗原性エピトープを含む細胞外または分泌性の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド転写ターミネーター;ならびに、両改変が、プロモーター、ポリヌクレオチド、および転写ターミネーターを含む非改変自己ベクターと比較した場合である、自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための少なくとも1つの改変、および宿主細胞からの非分泌性または非膜結合性の自己ポリペプチドを発現させるための少なくとも1つの改変。分泌性自己ベクターまたはSSVまたは分泌性自己ベクター特異的な作用物質は本明細書において、自己免疫疾患に関連する膜結合性または細胞内の自己抗原についての分泌性自己ポリペプチド型をコードするポリヌクレオチドを含む改変自己ベクターをいう。SSVは、自己免疫疾患に関連する膜結合性または細胞内の自己ポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、自己ポリペプチドの宿主細胞からの分泌を可能にするための改変とを含む。SSVは、自己免疫疾患に関連する膜結合性または細胞内の自己ポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、自己ポリペプチドの宿主細胞からの分泌を可能にするための改変とを含む。SSVはさらに、以下を機能的に組み合わせて含むプロモーター自己免疫疾患に関連する少なくとも1つの自己抗原性エピトープを含む膜結合性または細胞内の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド転写ターミネーターならびに、プロモーター、ポリヌクレオチド、および転写ターミネーターを含む非改変自己ベクターと比較して、宿主細胞からの自己ポリペプチドの分泌を可能にするための少なくとも1つの改変。細胞内自己ポリペプチドの分泌性型をコードしかつ発現するSSVを作製するための自己ベクターへの改変には、限定されるわけではないが、シグナル配列の付加が挙げられる。加えて、改変はさらに、細胞内エピトープが細胞外へ提示されるように、例えば、膜貫通ドメインまたはGPIアンカーを含む膜結合についてのシグナルを含みうる。膜結合性自己ポリペプチドの分泌性型をコードしかつ発現するSSVを作製するための自己ベクターへの改変には、限定されるわけではないが、以下が挙げられる膜貫通ドメインの除去GPI連結の除去、シグナル配列の細胞内ドメインへの付加と共に細胞外および膜貫通ドメインの除去ならびに、膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインの除去。本明細書において用いられる分泌性高発現自己ベクターまたはSHESVまたは分泌性高発現自己ベクター特異的な作用物質は、膜結合性または細胞内の自己ポリペプチドの、コードされた分泌性型の発現を増加させるように変化している改変自己ベクターをいい、発現および分泌は、非改変自己ベクターと比較した場合である。SHESVは、自己免疫疾患に関連する膜結合性または細胞内自己のポリペプチドをコードしかつ発現する能力があるポリヌクレオチドと、改変されていない同じ自己ベクターと比較して分泌性型または細胞外膜結合型での自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための改変とを含む。SHESVはさらに、以下を機能的に組み合わせて含むプロモーター自己免疫疾患に関連する少なくとも1つの自己抗原性エピトープを含む膜結合性または細胞内の自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド転写ターミネーターならびに、両改変が、プロモーター、ポリヌクレオチド、および転写ターミネーターを含む非改変自己ベクターと比較した場合である、自己ポリペプチドの発現の増加を生じるための少なくとも1つの改変、および宿主細胞からの自己ポリペプチドの分泌を可能にするための少なくとも1つの改変。ベクター骨格という用語は、自己抗原、自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードする配列以外のプラスミドベクターの部分をいう。免疫抑制性ベクター骨格は、親ベクター骨格と比べて免疫応答の低減を引き起こすか、または免疫応答を防止もしくは阻害するかのいずれかのベクター骨格をいう。免疫応答は、当技術分野において公知のインビトロまたはインビボのアッセイ法を用いて測定することができる。例えば、免疫応答は、ベクター骨格に曝露されたリンパ球の増殖を測定することにより、または免疫刺激を示すサイトカインの産生を測定することにより判定することができる。いくつかの態様において、免疫抑制性ベクター骨格は親ベクター骨格と比べて、より少ない免疫刺激性配列を含む。いくつかの態様において、免疫抑制性ベクター骨格は、例えば、本明細書において記述のおよび当技術分野において公知の、1つまたは複数の免疫阻害性配列を含む。いくつかの態様において、免疫抑制性ベクター骨格は、Th2免疫応答を促進し、かつTh1免疫応答を阻害する。ある種の変形において、自己免疫疾患を処置するための方法はさらに、阻害性免疫調節配列または免疫阻害性配列を含んだポリヌクレオチドの投与を含む。本発明によって有用なIISは、以下のコア六量体を含む。5プリンピリミジンXYピリミジンピリミジン3または5プリンプリンXYピリミジンピリミジン3。式中、XおよびYは、XおよびYがシトシングアニンとはなりえないことを除いて、任意の天然に存在するヌクレオチドまたは合成ヌクレオチドである。IMSのコア六量体には、任意の組成もしくは数のヌクレオチドまたはヌクレオシドが5側およびまたは3側に隣接しうる。好ましくは、IMSは、長さが6塩基対から100塩基対の間、および最も好ましくは、長さが16~50塩基対の範囲である。IMSはまた、100塩基対から100000塩基対までの範囲である、より大きなDNA断片の一部として送達されうる。IMSは、DNAプラスミド、ウイルスベクター、およびゲノムDNAに組み入れられても、またはすでにそれらの中に存在していてもよい。最も好ましいIMSはまた、サイズが6塩基対から10000塩基対まで、またはそれ以上の範囲でありうる。六量体コアに隣接し存在する配列は、任意の公知の免疫阻害性配列に存在する隣接配列に実質的にマッチするように構築されうる。例えば、隣接配列は、が隣接配列である。別の好ましい隣接配列は、2回またはそれ以上反復される個々のピリミジンとしてか、または長さが2個もしくはそれ以上の異なるピリミジンの混合物としてかのいずれかでのひと続きのピリミジンを組み入れる。異なる隣接配列が、阻害性調節配列の試験において用いられている。阻害性オリゴヌクレオチドについての隣接配列のさらなる例は、以下の参照文献に含まれる米国特許第6225292号および同第6339068号ならびにZeuneretalArthritisandRheumatism46221924。IISは、配列AAGGTTを有するコア六量体領域を含む。その配列は本明細書において免疫調節配列またはIMSといわれる。IMS内に含まれる類似のモチーフを有する他の関連したIISは以下である。1GGジヌクレオチドのコアなどを含む、5プリンプリンXYピリミジンピリミジン3のIMS。2GCジヌクレオチドのコアなどを含む、5プリンプリンXYピリミジンピリミジン3のIMS。3アデニンからグアニンおよびイノシンへの置換、ならびにまたはシトシンもしくはチミンからウリジンへの置換は、上記の指針に基づき記載の通りに行うことができる。本発明のある種の態様において、IMSのコア六量体領域は、ポリG領域に、5末端かもしくは3末端のいずれかで、または5末端および3末端の両方で、隣接している。本明細書において用いられる場合、ポリG領域またはポリGモチーフとは、少なくとも二個の連続したグアニン残基、典型的には2個から30個まで、または2個から20個までの連続したグアニンからなる核酸領域を意味する。いくつかの態様において、ポリG領域は、2個から10個まで、4個から10個まで、または4個から8個までの連続したグアニン残基を有する。ある種の好ましい態様において、隣接ポリG領域はコア六量体に隣接している。さらに他の態様において、ポリG領域は、非ポリG領域によってコア六量体に連結されており典型的には、非ポリGリンカー領域は、わずか6ヌクレオチド、より典型的にはわずか4ヌクレオチド、および最も典型的にはわずか2ヌクレオチドを有する。免疫調節核酸はIMSを、単独で、または、例えば、組換え発現ベクターによって送達可能な任意の自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードしうる組換え自己ベクターになど他の核酸領域とシスでもしくはトランスで組み入れて、含むことができる。ある種の態様において、IMSは、例えば、当業者に公知の従来の技法を用いて達成されうる、例えば、発現ベクターなどの、ベクターに組み入れられる。例えば、組換え発現ベクターの構築では、標準的なライゲーション技法を用いる。構築されたベクターにおける正しい配列を確認する分析のため、ライゲーション混合物を用いて宿主細胞を形質転換することができ、成功している形質転換体を必要に応じて抗生物質耐性により選択することができる。形質転換体由来のベクターを調製し、制限消化によって分析し、およびまたは例えば、MessingetalNucleicAcidsRes93091981の方法、MaxametalMethodsinEnzymology654991980の方法、もしくは当業者に公知である他の適した方法によって配列決定する。例えば、ManiatisetalMolecularCloningpp1331341982によって記述されている通りに従来のゲル電気泳動を用いて、切断された断片のサイズ分離を行う。宿主細胞を本発明の発現ベクターで形質転換することができ、プロモーターの誘導、形質転換体の選択または遺伝子の増幅に適切であるように改変された従来の栄養培地中で培養することができる。温度、pHなどのような、培養条件は、発現用に選択された宿主細胞で以前に用いられたものであり、当業者には明らかであろう。組換えベクターが本発明のIMSONのための担体として用いられるなら、プラスミドおよびコスミドはその病原性の欠如のため特に好ましい。しかしながら、プラスミドおよびコスミドはウイルスよりも素早くインビボでの分解を受け、それゆえ、炎症性疾患または自己免疫疾患を予防または処置するのに十分なIMSONの投与量を送達することができない。関連する局面において、非CpGジヌクレオチドが式5プリンピリミジンCGピリミジンピリミジン3または5プリンプリンCGピリミジンピリミジン3の1つまたは複数のCpGジヌクレオチドの代わりに用いられ、それによりIISに関連する免疫刺激活性が低減されているベクターを生ずる、核酸ベクターが提供される。そのようなベクターは、例えば、免疫調節核酸を投与するための、およびまたは1つもしくは複数の自己タンパク質、自己ポリペプチドもしくは自己ペプチドをコードする自己ベクターを投与するための方法において有用である。例えば、CpGジヌクレオチドのシトシンがグアニンで置換され、それにより、式5プリンピリミジンGGピリミジンピリミジン3または5プリンプリンGGピリミジンピリミジン3のGpGモチーフを有するIMS領域を生じうる。シトシンはまた、任意の他の非シトシンのヌクレオチドで置換されうる。置換は、例えば、部位特異的突然変異誘発を用いて、達成されうる。典型的には、置換されたCpGモチーフは、ベクターの重要な調節領域に位置していないCpGである。加えて、CpGが発現ベクターのコード領域内に位置している場合、非シトシン置換は、典型的には、サイレント突然変異、またはコードされたアミノ酸の保存的置換に対応するコドンを生じるように選択される。例えば、ある種の態様において、式5プリンピリミジンCGピリミジンピリミジン3の1つまたは複数のCpGジヌクレオチドが、CpGジヌクレオチドのシトシンを非シトシンのヌクレオチドで置換することにより突然変異している、改変pVAX1ベクターが提供される。pVAX1ベクターは、当技術分野において公知であり、Invitrogenから市販されている。1つの例示的な態様において、改変pVAX1ベクターは、CpGモチーフ内において以下のシトシンの非シトシンへの置換を有する。ヌクレオチド784位、1161位、1218位、および1966位におけるシトシンからグアニンへの置換ヌクレオチド1264位、1337位、1829位、1874位、1940位、および1997位におけるシトシンからアデニンへの置換ならびにヌクレオチド1158位および1987位におけるシトシンからチミンへの置換。ヌクレオチド1831位、1876位、1942位、および1999位における追加のシトシンからグアニンへの突然変異を含む。このように構築されたベクターは、pBHT1と名付けられた。自己ベクターに用いるのに選択されたヌクレオチド配列は、例えば、標準技法を用いて所望の遺伝子またはヌクレオチド配列を含む細胞から核酸を単離することにより、公知の供給源から得ることができる。同様に、ヌクレオチド配列は、当技術分野において周知であるポリヌクレオチド合成の標準様式を用いて合成的に作製されうる。例えば、EdgeetalNature2927561981NambairetalScience22312991984JayetalJBiolChem25963111984を参照されたい。一般的に、合成オリゴヌクレオチドは、EdgeetalおよびDuckworthetalNucleicAcidsRes916911981により記述されているようなホスホトリエステル方法またはBeaucageetalTetLetts2218591981およびMatteuccietalJAmChemSoc10331851981により記述されているようなホスホロアミダイト方法のいずれかにより調製されうる。合成オリゴヌクレオチドはまた、市販されている自動オリゴヌクレオチド合成機を用いて調製されうる。ヌクレオチド配列は、このように、特定のアミノ酸配列についての適切なコドンを用いて設計されうる。一般的に、意図された宿主における発現にとって好ましいコドンを選択する。完全な配列は、標準方法により調製された重複オリゴヌクレオチドから構築し、集合させて完全なコード配列を構築する。例えば、EdgeetalNambairetalおよびJayetalを参照されたい。本発明に用いる核酸配列を得るための別の方法は、組換え手段による。したがって、所望のヌクレオチド配列は、標準制限酵素および手順を用いて核酸を有するプラスミドから切り出されうる。部位特異的DNA切断は、適した制限酵素および手順で処理することにより行われる。部位特異的DNA切断は、当技術分野において一般的に理解されている条件下で、および市販されている制限酵素の製造元により特定されているそれらの事項のもとで行われる。必要に応じて、切断された断片のサイズ分離が、標準技法を用いるポリアクリルアミドゲルまたはアガロースゲルにより行われうる。特定の核酸分子を単離するためのさらに別の都合のよい方法は、ポリメラーゼ連鎖反応または逆転写PCRによる。特定の核酸配列は、RTPCRによりRNAから単離されうる。RNAは、当業者に公知の技術により、例えば、細胞、組織、または生物全体から単離される。相補DNAは、その後、ポリdTまたはランダム六量体プライマー、デオキシヌクレオチド、および適した逆転写酵素を用いて生成される。所望のポリヌクレオチドは、その後、PCRより生成されたcDNAから増幅されうる。または、対象となるポリヌクレオチドは、適切なcDNAライブラリーから直接的に増幅されうる。対象となるポリヌクレオチド配列の5末端および3末端の両方とハイブリダイズするプライマーが合成され、PCRに用いられる。プライマーはまた、容易な消化、および同様に制限消化されたプラスミドベクターへの増幅配列のライゲーションのために、5末端に特定の制限酵素部位を含みうる。改変自己ベクターの発現カセットは、宿主細胞において機能しうるプロモーターを用いる。一般的に、宿主細胞と適合性の種由来であるプロモーターおよび調節配列を含むベクターが特定の宿主細胞と共に用いられる。原核生物宿主と共に用いるのに適したプロモーターは、例証として、βラクマターゼおよびラクトースプロモーターシステム、アルカリホスファターゼ、トリプトファンプロモーターシステム、およびtacプロモーターなどのハイブリッドプロモーターを含む。しかしながら、他の機能的な細菌プロモーターが適している。原核生物に加えて、酵母培養物などの真核微生物もまた用いられうる。サッカロマイセスセレビシエまたは一般的なパン酵母は、最も一般的に用いられる真核微生物であるが、いくつかの他の菌株もまた一般的に用いることができる。哺乳動物宿主細胞においてベクターからの転写を調節するプロモーターは、さまざまな供給源、例えば、ポリオーマ、サルウイルス40、アデノウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルス、および好ましくは、サイトメガロウイルスなどのウイルスのゲノムから、または異種性哺乳動物プロモーター、例えば、βアクチンプロモーターから得られうる。SV40ウイルスの初期および後期プロモーターは、SV40ウイルス複製起点も含むSV40制限断片として都合よく得られる。ヒトサイトメガロウイルスの最初期プロモーターは、HindIII制限断片として都合よく得られる。もちろん、宿主細胞または関連種由来のプロモーターもまた本発明において有用である。1つの態様において、2つまたはそれ以上の自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドをコードするDNAは、単一のDNA分子から複数のタンパク質の発現のために内部リボソーム再侵入配列または他の要素を用いる単一の自己ベクターにおいて連続的にコードされる。本発明において用いられるベクターは、選択マーカーとも呼ばれる選択遺伝子を含みうる。選択遺伝子は、ベクターで形質転換された宿主細胞の生存または成長に必要なタンパク質をコードする。哺乳動物細胞に適した選択マーカーの例には、ジヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子、オルニチンデカルボキシラーゼ遺伝子、多剤耐性遺伝子、アデノシンデアミナーゼ遺伝子、およびグルタミンシンターゼ遺伝子が挙げられる。そのような選択マーカーが哺乳動物宿主細胞へうまく移入された場合、形質転換された哺乳動物宿主細胞は、選択圧下に置かれたとしても生存できる。選択方式についての2つの広く用いられる別個のカテゴリーがある。第一のカテゴリーは、細胞の代謝、および補充された培地と無関係に成長する能力を欠く突然変異体細胞系の使用に基づいている。第二のカテゴリーは、任意の細胞型に用いられる選択スキームを指しかつ突然変異体細胞系の使用を必要としない、優性選択と呼ばれる。これらのスキームは典型的には、宿主細胞の成長を停止させるために薬物を用いる。新規の遺伝子を有するそれらの細胞は、薬物抵抗性を伝えるタンパク質を発現し、選択から生き残る。そのような優性選択の例は、薬物ネオマイシンJMolecApplGenet1327、ミコフェノール酸Science2091422、またはハイグロマイシンMolCellBio5410413を用いる。上記で示された3つの例は、それぞれ、適切な薬物であるネオマイシン、xgpt、またはハイグロマイシンに対する抵抗性を伝えるために真核生物制御下で細菌遺伝子を用いる。あるいは、本発明において用いられるベクターは、リプレッサーの力価測定に基づいた抗生物質を含まない選択を用いて、宿主細胞において増殖させる。ベクターは、lacプロモーターの一部としてか、またはpUCシリーズのプラスミドベクターに見出される最適な間隔をもつlacO1およびlacO3オペレーターと共にかのいずれかで、lacオペロンを含むように改変される。あるいは、lacO1オペレーターまたはlacOのパリンドローム型が、単一または複数のコピーとしての単離に用いられうる。lacオペロン配列は、ベクターの他の機能的構成要素に干渉しないようにベクター内のどこかの単一または複数の部位に組み入れられうる。好ましい態様において、合成大腸菌lacオペロン二量体オペレーターが用いられる。lacオペロンは、選択を提供するのに適した切な選択マーカーを欠くベクターに付加されうるか、別の選択マーカーに加えて付加されうるか、またはベクターを治療的適用により適切にさせるために、選択マーカー、特に抗生物質抵抗性マーカーを置換するために用いられうる。lacオペロンを含むベクターは、lacプロモーターの制御下にdapDを含む必須遺伝子を有する遺伝子改変の大腸菌において選択され、それに従って、lacOPからlac抑圧を力価測定し、dapDの発現を可能にすることにより、改変された宿主細胞が生存することを可能にする。適した大腸菌株には、DH1lacdapDおよびDH1lacP2dapDが挙げられる。本発明の自己ベクター特異的な作用物質は、薬剤として用いるポリヌクレオチド塩として製剤化されうる。ポリヌクレオチド塩は、無毒性無機または有機塩基を用いて調製されうる。無機塩基塩には、ナトリウム、カリウム、亜鉛、カルシウム、アルミニウム、マグネシウムなどが挙げられる。有機無毒性塩基には、1級、2級および3級アミンなどの塩が挙げられる。そのような自己DNAポリヌクレオチド塩は、滅菌水または食塩水などの送達前の再構成のための凍結乾燥された形態に、製剤化されうる。または、自己DNAポリヌクレオチド塩は、送達のための水性または油性の媒体を含む溶液、懸濁液、または乳濁液に製剤化されうる。1つの好ましい態様において、DNAは、生理学的レベルのカルシウムを含むリン酸緩衝食塩水において凍結乾燥され、その後、投与前に滅菌水で再構成される。または、DNAは、1mMから2Mの間のより高い量のCaを含む溶液中において製剤化される。DNAはまた、特定のイオン種の非存在下で製剤化されうる。DNA抗原特異的な治療物質の投与本明細書において定義される通り、ポリヌクレオチドを対象に送達するための多種多様の方法が存在する。例えば、自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、陽イオン性リポソームを含む陽イオン性ポリマーと共に製剤化されうる。他のリポソームもまた、自己ポリヌクレオチドを製剤化し、かつ送達するのに効果的な手段を示す。あるいは、自己DNAは、薬理学的送達のためのウイルスベクター、ウイルス粒子、または細菌へ組み入れられうる。ウイルスベクターは、感染能力があっても、弱毒化されていても、または複製欠損であってもよい。病原性自己タンパク質の沈着、蓄積、または活性を防止するために自己DNAを用いる方法は、コードされる自己タンパク質に対する体液性応答を増加させるウイルスベクターまたは他の送達システムの使用により強化されうる。他の態様において、DNAは、注入されても、吸入されても、または微粒子銃で送達されてもよい金粒子、多糖ベースの支持体、または他の粒子もしくはビーズを含む固体支持体に結合されうる。核酸調製物を送達するための方法は当技術分野において公知である。例えば、以下を参照されたい米国特許第5399346号、同第5580859号、および同第5589466号。いくつかのウイルスに基づいたシステムが、哺乳動物細胞への移入のために開発されている。例えば、レトロウイルスシステムが記述されている。いくつかのアデノウイルスベクターもまた記述されており、例えば、を参照されたい。アデノ随伴ウイルスベクターシステムもまた、核酸送達のために開発されている。AAVベクターは、当技術分野において周知の技術を用いて容易に構築されうる。例えば、米国特許第5173414号および同第5139941号国際公開番号WO9201070およびWO9303769LebkowskietalMolecCellBiol8398839961988VincentetalVaccines901990CarterCurrentOpinioninBiotechnology35335391992MuzyczkaCurrentTopicsinMicrobiolAndImmunol158971291992KotinHumanGeneTherapy57938011994ShellingetalGeneTherapy11651691994およびZhouetalJExpMed179186718751994を参照されたい。本発明のポリヌクレオチドはまた、ウイルスベクター無しで送達されうる。例えば、分子は、対象への送達の前にリポソームにパッケージングされうる。脂質カプセル化は、一般的に、核酸を安定に結合または捕捉し、かつ保持することができるリポソームを用いて達成される。核酸の送達のための担体としてのリポソームの使用の概説として、例えば、HugetalBiochimBiophysActa10971171991StraubingeretalMethodsofEnzymologyVol101pp5125271983を参照されたい。自己ベクターの治療的有効量は、約0001mg~約1gの範囲である。自己ベクターの好ましい治療的量は、約10ng~約10mgの範囲である。自己ベクターの最も好ましい治療的量は、約0025mg~6mgの範囲である。ある種の態様において、自己ベクターは、6~12ヶ月間は毎月、およびその後、維持用量として3~12ヶ月ごとに、投与される。代替の処置計画が開発されてもよく、疾患の重症度、患者の年齢、投与される自己ポリペプチド、および通常の処置を行う医師により考慮されるような他の因子に依存して、毎日の投与から、毎週、隔月、毎年、1回限りの投与までの範囲でありうる。1つの態様において、ポリヌクレオチドは、筋肉内注射により送達される。他の変形において、ポリヌクレオチドは、鼻腔内に、経口で、皮下に、皮内に、静脈内に、粘膜に、皮膚を通して圧入され、または真皮までもしくは真皮を通って送達される金粒子に付着させて、送達される。あるいは、核酸は、リポソームまたは荷電脂質の有無にかかわらず、局所的投与により皮膚細胞へ送達されうる。さらに別の代替法は、核酸を吸入物質として送達することである。ポリヌクレオチドは生理学的レベルのカルシウムを含むリン酸緩衝食塩水中において製剤化される。あるいは、ポリヌクレオチドは、1mMから2Mの間のCaのより高い量を含む溶液中において製剤化される。ポリヌクレオチドは、亜鉛、アルミニウムなどのような他の陽イオンと共に製剤化されうる。代替として、または加えて、ポリヌクレオチドは、陽イオン性ポリマー、陽イオン性リポソーム形成化合物と共に、または非陽イオン性リポソーム中においてのいずれかで製剤化されうる。DNA送達のための陽イオン性リポソームの例には、12ビス3プロパンおよび他のそのような分子を用いて作製されるリポソームが挙げられる。ポリヌクレオチドの送達の前に、送達部位は、ブピビカン、心臓毒、またはその後のポリヌクレオチドの送達を増強しうる別の作用物質での処置によりあらかじめ調整されうる。そのようなプレコンディショニング療法は、一般的に、治療用ポリヌクレオチドの送達の12~96時間前により頻繁には、治療用ポリヌクレオチドの送達の24~48時間前に送達される。あるいは、ポリヌクレオチド治療の前に、プレコンディショニング処置は与えられない。本明細書に用いられる抗原は、B細胞もしくはT細胞、または両方によるものである免疫系により認識されうる任意の分子をいう。本明細書において用いられる自己抗原は、病原性免疫応答を誘発する内因性分子、典型的にはタンパク質またはその断片をいう。自己抗原またはそのエピトープを自己免疫疾患と関連していると言及する場合、自己抗原またはエピトープは、病態生理を引き起こす、病態生理学的過程を媒介もしくは促進することによるおよびまたは病態生理学的過程の標的であることによるのいずれかで疾患の病態生理に関与することを意味することは理解されている。例えば、自己免疫疾患において、免疫系は、異常なことに、自己抗原を標的とし、自己抗原が発現しているおよびまたは存在する細胞および組織の損傷ならびに機能障害を引き起こす。正常な生理学的状態下において、自己抗原は、免疫寛容と名付けられた過程を通して、自己抗原を認識する能力をもつ免疫細胞の排除、不活性化、または活性化の欠如によって宿主免疫系に無視される。本明細書において用いられる場合、エピトープという用語は、動物の免疫系のB細胞かまたはT細胞かのいずれかにより認識される特定の形または構造を有するポリペプチドの部分を意味すると理解される。自己抗原性エピトープまたは病原性エピトープは、病原性免疫応答を誘発する自己抗原のエピトープをいう。ポリペプチド、ペプチド、およびタンパク質という用語は、アミノ酸残基の重合体をいうように本明細書において互換的に用いられる。それらの用語は、1つまたは複数のアミノ酸残基が、対応する天然に存在するアミノ酸の人工化学的模倣体であるアミノ酸重合体に、ならびに天然に存在するアミノ酸重合体および非天然のアミノ酸重合体に適用される。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、本明細書において互換的に用いられ、かつ、動物のゲノム内にコードされる動物において産生または生成される動物の生涯の間のいつかに翻訳後、修飾されうるおよび動物において非生理学的に存在する、任意のタンパク質、ポリペプチドもしくはペプチド、またはその断片もしくは誘導体をいう。本発明の自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドを記述するために用いられる場合の非生理学的または非生理学的にという用語は、その自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドについての動物における正常な役割または過程からの離脱または逸脱を意味する。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドを疾患に関連しているまたは疾患に関与していると言及する場合、自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドが、形態または構造において改変され、それに従って、その生理学的役割または過程を行うことができない可能性があることを意味すること、または、病態生理を誘導することによる病態生理学的過程を媒介もしくは促進することによるおよびまたは病態生理学的過程の標的であることによるのいずれかで状態または疾患の病態生理に関与している可能性があることを意味することは理解されている。例えば、自己免疫疾患において、免疫系は、異常なことに、自己タンパク質を攻撃して、その自己タンパク質が発現しているおよびまたは存在する細胞および組織の損傷ならびに機能障害を引き起こす。あるいは、自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、それ自体、非生理学的レベルで発現しうる、かつまたは非生理学的に機能しうる。例えば、神経変性疾患において、自己タンパク質は、異常に発現し、脳における病変に凝集し、それにより、神経機能障害を引き起こす。他の場合では、自己タンパク質が望ましくない状態または過程を悪化させる。例えば、変形性関節症において、コラゲナーゼおよびマトリックスメタロプロテイナーゼを含む自己タンパク質が異常に、関節部の関節面を覆う軟骨を分解する。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドの翻訳後修飾の例は、グリコシル化、脂質基の付加、可逆性リン酸化、ジメチルアルギニン残基の付加、シトルリン化、およびタンパク質分解、ならびにより具体的には、ペプチジルアルギニンデイミナーゼによるフィラグリンおよびフィブリンのシトルリン化、αβクリスタリンのリン酸化、MBPのシトルリン化、ならびにカスパーゼおよびグランザイムによるSLE自己抗原タンパク質分解である。免疫学的には、自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、すべて、宿主自己抗原とみなされ、正常な生理学的状態下では、免疫寛容と名付けられた過程を通して、自己抗原を認識する能力をもつ免疫細胞の排除、不活性化、または活性化の欠如によって宿主免疫系に無視される。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、免疫機能を制御する目的で独占的に免疫系の細胞によってのみ生理学的に発現する分子である免疫タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドを含まない。免疫系は、動物界に生息する無数の潜在的病原性の微生物に対して迅速で、高度に特異的な保護性応答を生じるための手段を提供する防御機構である。免疫タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドの例は、T細胞受容体、免疫グロブリン、I型インターロイキン、およびインターフェロンおよびIL10を含むII型サイトカイン、TNF、リンフォトキシン、およびマクロファージ炎症性タンパク質1αおよびβ、単球走化性タンパク質、およびRANTESなどのケモカインを含むサイトカイン、ならびにFasリガンドなどの免疫機能に直接的に関与した他の分子を含むタンパク質である。本発明の自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドに含まれる特定の免疫タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドがあり、それらは以下であるクラスIMHC膜糖タンパク質、クラスIIMHC糖タンパク質、およびオステオポンチン。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、代謝性または機能性の障害を引き起こす遺伝的または後天的欠損により完全にかまたは実質的にかのいずれかで対象に欠如しており、かつ該タンパク質、該ポリペプチド、もしくは該ペプチドの投与によるかまたは該タンパク質、該ポリペプチド、もしくは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドの投与によるかのいずれかで取って代わられる、タンパク質、ポリペプチド、およびペプチドを含まない。そのような障害の例には、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、嚢胞性線維症、フェニルケトン尿症、ガラクトース血症、メープルシロップ尿症、およびホモシスチン尿症が挙げられる。自己タンパク質、自己ポリペプチド、または自己ペプチドは、以下を含みそれらをそれらの正常な対応物と区別する特徴を有する細胞により、特異的かつ独占的に発現されるタンパク質、ポリペプチド、およびペプチドを含まない悪性細胞のクローンを形成しうる遺伝子変化を有する単一細胞の増殖を表すクローン性、成長が正しく制御されていないことを示す自律性、および退生、または正常な協調された細胞分化の欠如。前記の3つの基準のうちの1つまたは複数を有する細胞は、新生物細胞、がん細胞、または悪性細胞のいずれかで呼ばれる。本明細書において用いられる免疫応答の調節、免疫応答を調節すること、または免疫応答を変化させることは、自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの投与の結果として起こる、例えば、核酸、脂質、リン脂質、糖、自己ポリペプチド、タンパク質複合体、またはリボ核タンパク質複合体を含む自己分子に対する既存のまたは潜在的な免疫応答の任意の変化をいう。そのような調節は、免疫応答に関与するもしくは関与する能力がある任意の免疫細胞の存在、能力、または機能における任意の変化を含む。免疫細胞には、B細胞、T細胞、NK細胞、NKT細胞、プロフェッショナル抗原提示細胞、非プロフェッショナル抗原提示細胞、炎症細胞、または免疫応答に関与する能力もしくは影響を及ぼす能力がある任意の他の細胞が挙げられる。調節は、既存の免疫応答、発達中の免疫応答、潜在的な免疫応答に与えられる、または免疫応答を誘導する能力に、免疫応答を制御する能力に、免疫応答に影響を及ぼす能力に、もしくは免疫応答に応答する能力に与えられる、任意の変化を含む。調節は、免疫応答の一部としての免疫細胞における遺伝子、タンパク質、およびもしくは他の分子の発現ならびにまたは機能の任意の変化を含む。免疫応答の調節は、例えば、以下が挙げられる免疫細胞の排除、消失、または隔離自己反応性リンパ球、抗原提示細胞、または炎症細胞などの他の細胞の機能的能力を調節できる免疫細胞の誘導または生成免疫細胞における非応答性状態の誘導限定されるわけではないが、免疫細胞により発現したタンパク質のパターンを変化させることを含む、免疫細胞の活性もしくは機能、またはそのように行う能力を増加、減少、または変化させること。例には、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、転写因子、キナーゼ、副刺激分子、または他の細胞表面受容体などの分子の特定のクラスの産生およびまたは分泌の変化またはこれらの調節事象の任意の組み合わせが挙げられる。本発明の文脈において用いられる場合、疾患または障害の予防すること、予防、または防止は、疾患もしくは障害の出現もしくは発生、または疾患もしくは障害の症候の一部もしくは全部を予防するための、または疾患もしくは障害の発生の見込みを減少させるための、自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするポリヌクレオチドの単独かまたは本明細書において記述されているような別の化合物と組み合わせてかのいずれかでの投与をいう。本発明の文脈の範囲内で用いられる用語処置すること、処置および治療などは、1つまたは複数の症候の軽減、退縮、疾患または障害の進行の緩徐化または停止を含むが、これらに限定されない、いずれかの臨床的に望ましいまたは有益な効果をもたらす、疾患または障害に対する治療的処置だけでなく、予防的処置、または抑制的処置を含むよう意図される。したがって、例えば、処置という用語は、自己免疫の疾患または障害の症候の発症の前または後に本発明の一方または両方の作用物質を投与し、それによって自己免疫の疾患または障害の全ての徴候を予防または除去することを含む。別の例として、この用語は、自己免疫疾患の症候に抵抗しようとする、疾患の臨床的徴候後の一方または両方の作用物質の投与を含む。さらに、自己免疫の疾患または障害の臨床的パラメータ、例えば組織傷害の程度、処置が自己免疫疾患の改善をもたらすか否かなどに投与が影響を与える場合の、発症後および臨床症状の発現後の本発明の一方または両方の作用物質の投与は、本発明の文脈の範囲内で処置または治療を含む。1つまたは複数の自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己ベクターの治療的有効量は、本発明の教示にしたがって投与され、例えば、疾患の症候およびまたは原因を改善または排除することによってなど、疾患を処置または予防するのに十分であろう。例えば、治療的有効量は、広い範囲の中にあり、臨床試験を通して決定され、特定の患者については、疾患の重症度、患者の体重、年齢および他の因子を含む当業者に公知の因子に基づいて決定される。自己ベクターの治療的有効量は、約0001マイクログラム~約1グラムの範囲である。自己ベクターの好ましい治療的量は、約10マイクログラム~約5ミリグラムの範囲である。自己ベクターの最も好ましい治療的量は、約0025mg~5mgの範囲である。ポリヌクレオチド治療は、6~12ヶ月間は毎月、およびその後、維持用量として3~12ヶ月ごとに、遂行される。代替の処置計画が開発されてもよく、疾患の重症度、患者の年齢、投与される自己タンパク質、自己ポリペプチドまたは自己ペプチド、および通常の処置を行う医師により考慮されるような他の因子に依存して、毎日の投与から、毎週、隔月、毎年、1回限りの投与までの範囲でありうる。例えば、自己ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むDNA抗原特異的な治療物質と組み合わせてB細胞特異的作用物質を含む特異的作用物質の組み合わせを投与することにより自己免疫疾患を処置する方法は、望ましくない免疫応答を媒介するもしくは媒介する能力がある免疫細胞を排除、隔離、または不活性化すること保護性免疫応答を媒介するもしくは媒介する能力がある免疫細胞を誘導する、産生する、または作動させること免疫細胞の物理的または機能的な性質を変化させることまたはこれらの効果の組み合わせにより免疫応答を調節できる。免疫応答の調節の測定の例には、限定されるわけではないが、免疫細胞集団の存在または非存在の試験を用いるシグナルに応答して増殖もしくは分裂する能力または抵抗性を含む免疫細胞の機能的能力の測定他の細胞を殺傷するまたは溶解する能力の測定サイトカイン、ケモカイン、細胞表面分子、抗体、および細胞の他の産物の測定免疫細胞の活性化の生化学的マーカーまたは免疫細胞内のシグナル伝達経路の測定アポトーシス、壊死、または他の機構による細胞死の測定免疫細胞により産生された遺伝子、タンパク質、および他の分子の測定ならびに、例えば、多発性硬化症の症例において再発率もしくは疾患重症度を測定する、I型糖尿病の症例において血中グルコースを測定する、または関節リウマチの症例において関節の炎症を測定することによる、自己タンパク質または自己ポリペプチドに関連する自己免疫疾患、神経変性疾患、および他の疾患の改善などの臨床症状または転帰の測定が挙げられる。実施例1NODマウスにおけるT1DのB細胞特異的作用物質処置これらの試験を行うために、前糖尿病の8~10週齢の雌性非肥満糖尿病マウスNODマウスおよび最近発症した1型糖尿病T1D雌性NODマウスを1群あたり20匹用いた。ONETOUCHULTRA登録商標グルコースモニターLifespanIncを用いて1週間に2回血糖値を測定した。血糖>250mgdLを超える読みが2回連続して得られた場合、マウスは糖尿病であると見なされた。ネズミCD20に結合する5D2と呼ばれるネズミモノクローナル抗体Genentechの半減期を測定するために、抗体200μgを前糖尿病NODマウスに静脈内iv投与した。血液50μLを毎日採取して、血清中の抗CD20の量を、既に記述された通りにPJAdamsonHZolaICNicholsonGPilkingtonAHohmannLeukRes251047、140番目のアミノ酸でビオチンに融合した140番目から184番目のアミノ酸のその細胞外配列を含有する合成CD20ペプチドを用いてELISAによって定量した。マウスにB細胞特異的作用物質、すなわち抗CD20mAbの異なる用量5、10、25、50、または100μgを、1日目のみ1回または1、4、7および10日目4回に静脈内投与した。または、抗体による処置を行わないマウス、またはアイソタイプをマッチさせた対照抗体によって処置したマウスを対照として用いた。抗CD20mAb処置によって提供される保護を判定するために、処置および無処置のマウスにおいて1週間に2回、10週間の間血糖をモニターした。血糖値が<200μgdLであればマウスは保護されたと見なされた。処置後5週間目での膵臓におけるインスリンの発現を、記述される通りにDBressonetalJClinInvest1161371UChristenetalClinInvest1141290、モルモット抗ブタインスリン1:300抗体による6μMの凍結膵臓切片の免疫組織化学IHC染色によって判定した。インスリン炎を測定するために、凍結膵臓切片を、抗CD4RM45および抗CD8aIHCBDBiosciences1:50倍希釈DBressonetalJClinInvest1161371UChristenetalJClinInvest1141290によって染色した。観察された保護の機序を決定するために、末梢血中の様々な細胞タイプの頻度および総数を、抗CD4、抗CD8、および抗IgMIgDBDpharmingenによる染色およびFACSによる分析によって、処置後1、3、8、および15日目に測定した。さらに脾細胞またはPLN細胞を、抗CD4、抗CD8、抗CD25、抗CD127、抗CTLA41:20倍希釈、BDBiosciencesによって表面染色後に、抗Foxp3ebioscienceまたは抗GITRRDsystemsDBressonetalJClinInvest1161371による細胞内染色を行った。nTreg細胞の頻度を、CD4CD127lowCD25またはCD4CD25細胞における、および対照としてのCD8細胞におけるFoxp3、CTLA4、またはGITRの発現を分析することによって測定した。さらにサイトカインの産生を、ELISA、ELISPOT、またはICSによって評価した。脾細胞またはPLN細胞を、抗CD3CD28またはアイソタイプマッチ対照抗体各1μgmLを用いてインビトロで3日間刺激した。培養上清を回収して、IFNγ、TNFα、IL10、IL4BDpharmingen、TGFβ1Quantikineキット、RDsystemsELISAキットを用いて、または多重サイトカインアッセイ法BeadlyteMouseMultiCytokineDetectionSystemUpstateUSAIncを用いて、製造元の説明書に従ってサイトカインを定量した。細胞内サイトカイン染色および分析を記述した通りに行ったDBressonetalJClinInvest1161371。適応性のインスリン特異的Tregを計数するために、インスリン923およびプロインスリンペプチドIAg7拘束による刺激後にサイトカインアッセイ法上記を行った。加えて、自己攻撃性CD8T細胞の効果を判定するために、末梢血中の抗原特異的T細胞の頻度をFACS分析によって判定したか、またはその存在を凍結膵臓切片においてNRPV7四量体PereSantamariaUniversityofCalgaryCanadaから得たを用いるIHCによって検出したDBressonetalJClinInvest1161371。これらの抗原特異的T細胞の機能的状態は、それらをインビトロで抗CD3/抗CD28各1μgmLによって刺激して、ELISAおよびICSによってIFNγおよびTNFαの産生を測定することによって判定した。かつ最後に、最近発症したT1Dの部分的寛解を誘導する抗CD20抗体の最小有効量を判定するために、最近発症したT1Dマウスにおける様々な処置抗体10、50、および100μgのivによる1d/4d処置後の長期保護を判定した。血糖値を先に記述した通りに判定して、血糖値<200μgdLを有するマウスは治癒したと見なされた。部分寛解最近発症したT1DNODマウスにおける糖尿病の10~20減少を誘導する抗体の用量をこれらの分析から計算した。結果抗CD20の1回投与は、より高濃度の抗体を用いた場合に限って保護的であった図1A。抗CD20の5または10μgの投与は、保護的ではなかったが、抗CD20の50および250μgはそれぞれ、糖尿病の発生率を40および50低減させた。抗CD20の用量をさらに増加させても保護は認められなかった。次に、抗CD20を1、2、3および4日目に4回投与した。対照マウスの少なくとも70が糖尿病になる20週目に、抗CD20処置マウスのほとんどが糖尿病に罹っていないままであった図1B。調べた各用量、すなわち抗CD20の5、10、50、および100μgにおいて、糖尿病の発生率は75低減される。このように、抗CD20抗体の4回処置レジメンは、抗CD20のみを用いて観察される最善の保護を提供した。実施例2NODマウスにおけるT1Dを処置するためにDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質これらの試験を行うために、最近発症した1型糖尿病T1D雌性NODマウス20~40匹、または前糖尿病1群20匹の8~10週齢雌性NODマウスの群を用いた。ONETOUCHULTRA登録商標グルコースモニターLifespanIncを用いて、血糖値を1週間に2回測定した。2回連続した読みが血糖値>250mgdLであれば、マウスは糖尿病であると見なされた。マウスに、B細胞特異的作用物質、すなわちネズミ抗CD20抗体5D2の10、50、および100μg用量を1回投与した。プロインスリンSEQIDNO20をコードするDNAプラスミドベクターを調製してWO2007044394を参照されたい、>95の純度で用いた。抗CD20の投与後、マウスに、プロインスリンをコードするDNAプラスミドベクターを1、8、15、および22日目に投与した。抗CD20単独、インスリン単独によって処置した最近発症したT1DNODマウス、または無処置マウスを対照として含めた。併用治療後、これらのマウスにおける糖尿病の発生率を、血糖値を測定することによってモニターして、血糖値が<200μgdLであれば、マウスは保護されたと見なされた。抗CD20またはインスリンペプチド投与と比較した併用治療後の効力の増加を、×100として決定して、データを、糖尿病になったマウスの週齢ならびにマウスの試験登録時の血糖値に関して評価したBG>400mgdlを有するマウスは、残っているβ細胞塊が少なすぎることから、最近発症した糖尿病からほとんど復帰できないことが観察されている。保護の効力が増加したマウスにおいて、膵臓のインスリン発現、インスリン炎、および抗原特異的CD8T細胞に及ぼす効果を判定した。寛容誘導の原因となる細胞を同定するために、脾細胞または末梢リンパ節PLN細胞またはCD4またはCD8またはB220細胞MiltenyiBiotecUSAのそれぞれの自動MACS精製キットによって精製を上記の通りに用いた。FACSによる様々な細胞タイプの計数およびこれらの細胞のELISAまたはICSによるサイトカイン分泌プロファイルを上記の通りに行った。共培養試験において、CFSE標識BDC25CD8T細胞を応答細胞として用いて、DNAプラスミドまたは対照によって6時間パルスしたDCを、応答細胞を刺激するための抗原提示細胞APCとして用いた。応答細胞CD8T細胞1×105個を同数のまたは連続希釈した精製CD4またはCD8またはB220細胞と混合した。2日間共培養した後、上清中の調節性サイトカインの産生をELISAによって定量化して、抗原特異的T細胞の増殖阻害を、FACSによってCFSE希釈率を測定することによって判定した。nTregおよび適応性Tregを計数して、上記の通りにサイトカイン分泌に関して試験した。これらの調節細胞集団が、レシピエントに優性寛容を移入することができるか否かを判定するために、全脾細胞、またはPLN細胞、または精製CD4またはCD8またはB220細胞のいずれかを、ポリクローナル刺激T細胞に関して1μgmL抗CD3CD28、またはB細胞に関して1μgmL抗B220CD40などの、またはDNAプラスミド1μgmLを用いてインビトロで3日間拡張させた。そのように拡張させた細胞細胞5×106個を最近発症したT1Dまたは前糖尿病NODマウスに養子移入して、血糖値をモニターする。同時に、そのように拡張させた細胞そのものをCFSEによって標識して、レシピエントマウスに養子移入した。移入後2日目に、脾臓またはPLNからプールした細胞を抗CD4、抗CD8、または抗B220BDpharmingenによって染色して、CFSE希釈率を測定することによって、これらの位置での移入細胞の拡張を判定した。より厳格な最近発症したT1Dモデルにおける寛容の移入を判定するために、インビトロで拡張させた調節細胞集団細胞5×106個を、記述される通りに、LCMVarmstrong株感染による糖尿病の発症後5日目にRIPLCMVNPマウスに養子移入した。移入した細胞によって与えられた糖尿病からの保護を、血糖値を測定することによって、インスリン炎を決定することによって、または記述される通りにDBressonetalJClinInvest1161371NP118四量体を用いるIHCによって、膵臓のAg特異的CD8T細胞浸潤の程度を判定することによって判定した。結果抗CD20によるT1D処置の効力を改善するために、本発明者らは、抗CD20の投与を、プロインスリンをコードするDNAプラスミドの投与と併用した。抗CD20の1回1日目静脈内投与を、プロインスリンをコードするDNAプラスミドの1回1日目または4回1、8、15、21日目筋肉内注射のいずれかと併用して与えた。これらの試験に用いた抗CD20の最低用量である10μgは、単独でもプロインスリンプラスミドとの併用でもいかなる保護も提供しなかった図2A。抗CD20の高用量、すなわち50図2Bおよび100μg図2Cはいずれも、単独でT1Dに対して何らかの保護を提供した。プロインスリンをコードするDNA自己ベクターを抗CD20と同時投与すると、保護の効力を増加させた。50μgの抗CD20単独は、T1Dの発生率を40低減させたが、プロインスリンをコードするDNAプラスミドを4回同時投与すると、発生率をさらに75低減させた。抗CD20の1回投与とプロインスリンペプチドの1回投与との併用は、抗CD20単独より良好な応答を達成しなかった。興味深いことに、抗CD20100μgを、プロインスリンプラスミドをコードするDNAプラスミドと併用して用いると、プロインスリンをコードするDNAプラスミドの1回投与およびDNA自己ベクターの4回投与は共に、糖尿病の発生率を75低減させることができ、単剤投与と比較して相乗効果を示した。このように、抗CD20と、プロインスリンプラスミドをコードするDNA自己ベクターとの併用治療は、これらの試薬単独のいずれかを用いる場合より有効である。抗CD20によるT1D予防の効力を改善するためにさらなる実験を行った。この組の実験に関して、プロインスリンプラスミドの濃度は常に同じで、50μg動物注射であった。投与頻度は、プロインスリンプラスミドの持続的投与と併用せずに図3Aまたは併用した図3B、抗CD20の1回1日目、または4回1、2、3および4日目静脈内注射であった。前糖尿病NODマウスに抗CD20のみを与えると、調べた最高用量で最善の保護が認められ、抗CD20100μgを与えるとマウスの25が保護された。意外なことに、抗CD20単独を1回のみまたは4回投与しても、これらのマウスにおいて類似の保護を達成した図3A、右のパネル。調べた低用量は、T1Dの発症に対して有意な保護を提供しなかった。本発明者らのNODコロニーにおいて、T1Dの発生率は、30週齢までに90またはそれ以上に達する。興味深いことに、プロインスリンプラスミドを抗CD20と同時投与すると、保護の効力を増加させた。調べた低用量である抗CD20の10および50μgと、プロインスリンとを同時投与すると、抗CD20単独より多くのマウスにおいてT1Dの発症を予防するために役立つことができた図3B、左および中央のパネル。抗CD2050μgを単独で投与しても、保護は観察されなかった図3A、中央のパネル。しかし、プロインスリンプラスミドと同時投与すると、マウスの約50を糖尿病の発症から保護した図3B、中央のパネル。抗CD20の用量をさらに増加させても、保護のいかなる増加も起こらなかった図3B、右のパネル。抗CD20の頻回投与は併用治療に好都合ではない。この組の実験において、最高の相乗効果を達成するための抗CD20およびプロインスリンの最適な用量を発見するために、本発明者らは、抗CD20およびプロインスリンプラスミドの双方の投与回数を変化させた。抗CD20投与を、1回限り1日目、図4A、Cまたは4回図4B行った。同様に、プロインスリンプラスミドを1回限り図4A、Bまたは4回図4C投与した。抗CD20の頻回投与をプロインスリンの1回投与と併用しても、この投与回数ではT1D発症に対していかなる保護も示さなかったことから有益ではなかった図4B。意外なことに、抗CD20の1回投与をプロインスリンプラスミドの1回図4Aまたは4回図4C投与のいずれかと併用すると、T1Dの発症に対するNODマウスの保護において相乗効果を示した。さらに、プロインスリンプラスミドの4回投与は、プロインスリンプラスミドの1回投与より大きい相乗効果を示した。抗CD20100μgの1回投与をプロインスリンプラスミドの1回投与と併用すると相乗効果を示すことができるという観察は、有意な知見である。このため、抗CD20とプロインスリンプラスミドの併用治療は、これらの試薬単独のいずれかを用いるよりも有効である。実施例3尋常性天疱瘡PVを処置するためのDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質尋常性天疱瘡PVは、自己タンパク質であるデスモグレインIIIDMGIIIに対する標的とされる自己抗体免疫応答によって引き起こされる皮膚水疱形成疾患であるPerezandPattonDrugsAging26833462009。現在の第一選択治療は、高用量全身性コルチコステロイドたとえば、プレドニゾン1mgkg日を含む。アザチオプリン、シクロホスファミド、ミコフェノール酸モフェチルなどのステロイドを用いない免疫抑制剤も同様に広く用いられている。リツキシマブ抗CD20は、従来の治療に対して不応性である尋常性天疱瘡を処置するために用いられているFernandoandBroadfootGItalDermatolVenereol144363772009。静脈内免疫グロブリンIVIGは、ステロイドに応答しない患者またはリツキシマブが禁忌である患者において単剤治療として有用でありうる。ヒトデスモグレインIIIDMGIIIは、分子量10753のタンパク質であり、そのヌクレオチド配列はSEQIDNO3に記載される。免疫したDMGIIIノックアウトマウスから得られた抗DMGIII抗体を用いて、PVを処置するための可能性がある治療薬をスクリーニングするために用いられるPVの動物モデルが開発されているKochetalJCellBiol137109111021997AmagaietalJClinInvest1056256312000。抗DMGIII抗体を野生型マウスに養子移入すると、マウスは、PV患者における病変と病理生理学的に類似の皮膚病変をその後発症する。DNA抗原特異的治療物質と併用した抗CD20などの抗B細胞特異的作用物質の連続治療または同時治療の効力を証明する実験に関して、適切な制御および調節要素たとえばWO2007044394を参照されたいを含む、自己抗原ペプチドであるデスモグレインIIISEQIDNO1をコードするpDNA自己ベクターを構築する。非分泌性DMGIIISEQIDNO2をコードする第二のpDNA自己ベクターを構築して、同様に以下の通りに試験する。DMGIIIに対する抗体が誘導されてELISAによって検出可能となった後に、DMGIIIノックアウト動物において処置を開始する。この疾患モデルにおいて抗CD20の応答の動態および疾患改変の程度を明確にする、抗CD20単独の5~250μgマウスの用量範囲を試験する。抗CD20の最適以下のおよび最適な用量レベルを、DMGIIIをコードするpDNA自己ベクターと併用して試験する。効力を維持しながら抗CD20mAbの安全性プロファイルを改善するために、DMGIIIをコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して投与するための抗CD20mAbのより低用量を同定するために、抗CD20mAbの最適以下の用量を評価する。抗CD20mAbいずれも最適以下のおよび最適な用量レベルおよびDMGIIIをコードするpDNA自己ベクターを、抗体レベルに基づいて7つの処置群に無作為割付したDMGIIIノックアウトマウスに投与する。処置レジメンを表3に示す。表31群は無処置のままである。本発明の併用治療を行う2つの群を含む3つの群を最適以下の抗CD20mAbによって処置し、本発明の併用治療を行う2つの群を含む3つの群を最適な抗CD20mAb用量によって処置する。抗CD20mAb単独の効果は2群および5群に認められる。自己抗原をコードするpDNA自己ベクターと抗CD20mAbとを併用することによる併用治療の効果は、3、4、6および7群に認められる。効力に及ぼす投与タイミング同時治療対連続治療の効果は、3群を4群とおよび6群を7群と比較することによって証明される。pDNA自己ベクターを、IM注射50μgマウス、25μg大腿方形筋によって毎週投与する。4群および7群に関して、抗CD20mAbを投与後2、4または6週目にpDNA治療を開始する。開始後、養子移入のための血清を採取するまでpDNA治療を毎週継続する。抗DMGIII抗体レベルに及ぼす効果を、DMGIIIノックアウト動物から採取した血清において評価する。DMGIIIに対する自己抗体レベルを、抗原としてDMGIIIタンパク質またはペプチドを用いるELISAによってモニターする。処置したマウスから採取した血清の野生型マウスへの養子移入を行う。体重および皮膚病変の組織病理学的スコアリングをモニターすることにより、効力をレシピエントマウスにおいて証明するTakaeetalExpDermat18252602009。実施例4多発性硬化症MSを処置するためにDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質実験的に誘導された自己免疫性脳脊髄炎EAEマウスモデルを用いて、多発性硬化症を処置するための化合物を評価する。アジュバントと共にミエリンタンパク質またはペプチドによってマウスを免疫した後に、異なるバックグラウンドの動物においてEAEを誘導する。疾患は、免疫後2週間以内に起こる。脚の麻痺の程度を測定するスコアリング尺度は確立されており、組織学的評価により、EAEを有するマウスの脳にリンパ球が浸潤することが証明されている。EAEマウスは、CopaxoneWebbetalImmunochemistry1333371976およびTysabriYednocketalNature3566361992などのあるMS薬物を検証および開発するために前臨床試験において用いられており、薬物の開発におけるこのモデルの有用性を確認する。抗原特異的治療は、EAEの症状を減少させることが既に証明されている。EAEにおける自己免疫応答の際に標的とされるミエリンタンパク質の1つは、タンパク質、プロテオリピドタンパク質、またはPLPである。pDNA自己ベクターアプローチを用いて、PLPをコードするpDNA自己ベクターは、マウスにおける前臨床EAE試験において再発率を低下させる能力があることを証明しているがGarrenetalImmunity1515222001、動物は疾患の症状を有し続けることから、B細胞特異的作用物質などの別の免疫調節化合物と併用したDNA抗原特異的治療物質の併用治療により恩典を得ることができるであろう。ネズミPLPは、分子量3008のポリペプチドである。pDNA抗原特異的治療物質と併用した抗B細胞抗体などのB細胞特異的作用物質を用いる併用治療の効力を証明する実験に関して、CFA中で乳化したPLPペプチドを用いてSJLマウスモデルにおいてEAEを誘導する。適切な制御および調節要素WO2007044394を参照されたいを含む、自己抗原ポリペプチド、プロテオリピドタンパク質、PLPSEQIDNO5をコードするDNA自己ベクターを構築する。抗CD20モノクローナル抗体を、このモデルにおける抗CD20の応答の動態および疾患改変の程度を明確にする抗CD20単独の5~250μgマウスの用量範囲で試験する。抗CD20mAbの最適以下のおよび最適な用量レベルを、単独でおよびPLPをコードするpDNA自己ベクターと併用して試験する。効力を維持しながら抗CD20mAbの安全性プロファイルを改善するために、PLPをコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して投与するための抗CD20mAbのより低用量を同定するために、抗CD20mAbの最適以下の用量を評価する。抗CD20最適以下のおよび最適な用量レベルの双方およびPLPをコードするpDNA自己ベクターを、疾患の重症度に基づいて7つの処置群に無作為割付したEAEマウスに投与する。処置レジメンを上記の表3に示す。1群は無処置のままである。3つの群を最適以下の抗CD20mAbによって処置し、2つの群を最適な抗CD20mAn用量によって処置する。抗CD20mAb単独の効果は2群および5群に認められる。自己抗原をコードするpDNA自己ベクターと抗CD20mAbとを併用することによる併用治療の効果は、3、4、6および7群に認められる。効力に及ぼす投与タイミング同時治療対連続治療の効果は、3群を4群とおよび6群を7群と比較することによって証明される。開始後、pDNA抗原特異的治療を試験期間の間毎週継続する。pDNA自己ベクターを、用量50μgマウス25μg大腿方形筋のIM注射によって毎週投与する。4群および7群に関して、抗CD20を投与後2、4または6週目にpDNA抗原特異的治療を開始する。開始後、試験期間の間pDNA治療を毎週継続する。抗CD20抗体のみを投与したマウスからの疾患スコアおよび脳組織学を、抗CD20mAbとPLPをコードするpDNA自己ベクターとの併用治療を受けた動物と比較することにより、併用アプローチの有効性を判定する。実施例5関節リウマチRAを処置するためにDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質シトルリン化フィブリノーゲンを特異的に標的とする実験的に誘導されたマウス関節炎モデルFIAが最近確立されているHoetalJImmunol184379902010。シトルリン化タンパク質に対する抗体は、関節リウマチ炎患者において容易に検出可能であり、このマウスモデルの開発は、この消耗性の疾患に関する抗原特異的寛容化アプローチの開発に役立つであろう。FIAを発症するように誘導されたマウスは、前炎症性サイトカインを産生するフィブリノーゲン反応性T細胞を保有するが、血漿のみによって疾患をナイーブ動物に養子移入できることから、疾患は抗体媒介性であると考えられる。フィブリノーゲンは、分子量6976のポリペプチドである。FIAマウスにおける抗CD20と自己抗原をコードするpDNA自己ベクターとの同時併用治療または連続的併用治療の効力を証明する実験に関する。適切な制御および調節要素WO2007044394を参照されたいを含む、自己抗原ポリペプチドであるフィブリノーゲンSEQIDNO6をコードするDNA自己ベクターを構築する。抗CD20モノクローナル抗体を、このモデルにおける抗CD20の応答の動態および疾患改変の程度を明確にする抗CD20単独の5~250μgマウスの用量範囲で試験する。抗CD20mAbの最適以下のおよび最適な用量レベルを、単独およびフィブリノーゲンをコードするpDNA自己ベクターとの併用で試験する。効力を維持しながら抗CD20mAbの安全性プロファイルを改善するために、フィブリノーゲンをコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して投与するための抗CD20mAbのより低用量を同定するために、抗CD20mAbの最適以下の用量を評価する。抗CD20最適以下のおよび最適な用量レベルおよびフィブリノーゲンをコードするpDNA自己ベクターを、疾患の重症度に基づいて7つの処置群に無作為割付したEAEマウスに投与する。処置レジメンを上記の表3に示す。1群は、無処置のままである。3つの群を最適以下の抗CD20mAbによって処置し、2つの群を最適な抗CD20mAb用量によって処置する。抗CD20mAb単独の効果は2群および5群に認められる。自己抗原をコードするpDNA自己ベクターと抗CD20mAbとを併用することによる併用治療の効果は、3、4、6および7群に認められる。効力に及ぼす投与タイミング同時治療対連続治療の効果は、3群を4群とおよび6群を7群と比較することによって証明される。開始後、pDNA抗原特異的治療を、試験期間の間毎週継続する。pDNA自己ベクターを、用量50μgマウス25μg大腿方形筋のIM注射によって毎週投与する。4群および7群に関して、抗CD20の投与後2、4または6週目に、pDNA抗原特異的治療を開始する。開始後、試験期間の間pDNA治療を毎週継続する。抗CD20抗体のみを投与したマウスからの疾患スコアおよび関節の組織学を、抗CD20mAbとフィブリノーゲンをコードするpDNA自己ベクターとの併用治療を受けた動物と比較することによって、併用アプローチの有効性を判定する。実施例6特発性肺線維症IPFに対するDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質特発性肺線維症IPFは、原因不明の最終的に致死性の肺疾患である慢性の進行性自己免疫疾患である。その予後は不良であり、その転帰は多くの悪性疾患の中でもさらに悪い。IPFのブレオマイシンマウスモデルbIPFは、臨床試験において評価するための治療薬を評価するためのモデルシステムとして、何十年もの間用いられているMoelleretalIntJBiochemCellBiol200840362382。肺に投与すると、ブレオマイシンは、短期間の間に炎症性の線維症性の反応を引き起こす。前炎症性サイトカインが上昇した後、約14日をピークとする前線維症マーカーの発現の増加が起こる。炎症と線維症の間のスイッチは約9日目で起こる。誘導される炎症の一部は、損傷に曝露後の肺組織のリモデリングの際に露出するV型コラーゲンに対する自己免疫応答の結果であると考えられるWilkesDSArchImmunolTherExp20035122730。V型コラーゲンは、分子量18356のポリペプチドである。ブレオマイシン誘導IPFマウスbIPFにおける、抗CD20と自己抗原をコードするpDNA自己ベクターとの同時併用治療または連続的併用治療の効力を証明する実験に関して、適切な制御および調節要素WO2007044394を参照されたいを含む、自己抗原ポリペプチドであるV型コラーゲンSEQIDNO10をコードするDNA自己ベクターを構築する。非分泌性V型コラーゲンをコードする第二のpDNA自己ベクターを構築して、同様に以下の通りに試験する。抗CD20モノクローナル抗体を、このモデルにおける抗CD20の応答の動態および疾患改変の程度を明確にする抗CD20単独の5~250μgマウスの用量範囲で試験する。抗CD20mAbの最適以下のおよび最適な用量レベルを、単独およびV型コラーゲンをコードするpDNA自己ベクターとの併用で試験する。効力を維持しながら抗CD20mAbの安全性プロファイルを改善するために、V型コラーゲンをコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して投与するための抗CD20mAbのより低用量を同定するために、抗CD20mAbの最適以下の用量を評価する。抗CD20最適以下のおよび最適な用量レベルおよびコラーゲンをコードするpDNA自己ベクターを、疾患の重症度に基づいて7つの処置群に無作為割付したEAEマウスに投与する。処置レジメンを上記の表3に示す。1群は、無処置のままである。3つの群を最適以下の抗CD20mAbによって処置し、2つの群を最適な抗CD20mAb用量によって処置する。抗CD20mAb単独の効果は2群および5群に認められる。自己抗原をコードするpDNA自己ベクターと抗CD20mAbとを併用することによる併用治療の効果は、3、4、6および7群に認められる。効力に及ぼす投与タイミング同時治療対連続治療の効果は、3群を4群とおよび6群を7群と比較することによって証明される。開始後、pDNA抗原特異的治療を、試験期間の間毎週継続する。pDNA自己ベクターを、用量50μgマウス25μg大腿方形筋のIM注射によって毎週投与する。4群および7群に関して、抗CD20の投与後2、4または6週目に、pDNA抗原特異的治療を開始する。開始後、試験期間の間pDNA治療を毎週継続する。抗CD20抗体のみを投与されたマウスの疾患スコアおよび肺組織の組織病理学的評価を、抗CD20mAbとV型コラーゲンをコードするpDNA自己ベクターとの併用治療を受けた動物と比較することによって、併用アプローチの有効性を判定する。実施例7アセチルコリン受容体AChRに対するDNA抗原特異的治療物質と併用したB細胞特異的作用物質重症筋無力症MGは、変動する筋衰弱および疲労性に至るニコチン作動性アセチルコリン受容体AChRのα鎖に対する自己抗体応答を特徴とする慢性の進行性自己免疫疾患であるGrobetalMuscleNerve20083714149。疾患は、神経伝達物質であるアセチルコリンの刺激効果を阻害するシナプス後神経筋接合部でアセチルコリン受容体を遮断する血液中の自己抗体によって媒介される。筋無力症は、内科的にはコリンエステラーゼ阻害剤または免疫抑制剤によって処置されるが、選択された症例では、胸腺切除によって処置される。最近、抗CD20が何人かのMG患者において用いられているChanetalJNeurol2007254160406。重症筋無力症の治療薬の開発は、ラットにおいて実験的に誘導された自己免疫性重症筋無力症EAMGと呼ばれる誘導MGモデルの確立によって促進されている。EAMGは、CFA中で乳化した精製アセチルコリン受容体通常、シビレエイから精製されるによってラットを免疫することによって誘導される。動物は、運動後の筋疲労性の徴候を示し、疾患の重症度をモニターするために臨床疾患スコアリングシステムが確立されている。AChRは、分子量5184のポリペプチドである。抗CD20mAbおよび自己抗原をコードするpDNA自己ベクターの同時併用治療または連続併用治療の効力を証明する実験に関して、適切な制御および調節要素WO2007044394を参照されたいを含む、自己抗原ポリペプチドであるアセチルコリン受容体SEQIDNO14をコードするDNA自己ベクターを構築する。抗CD20モノクローナル抗体を、EAMGモデルにおける抗CD20mAbの応答の動態および疾患改変の程度を明確にする抗CD20単独の5~250μgラットの用量範囲で試験する。抗CD20mAbの最適以下のおよび最適な用量レベルを、単独でおよびAChRをコードするpDNA自己ベクターと併用して試験する。効力を維持しながら抗CD20mAbの安全性プロファイルを改善するために、AChRをコードするDNA抗原特異的治療物質と併用して投与するための抗CD20mAbのより低用量を同定するために、抗CD20mAbの最適以下の用量を評価する。抗CD20最適以下のおよび最適な用量レベルの双方およびAChRをコードするpDNA自己ベクターを、疾患の重症度に基づいて7つの処置群に無作為割付したEAMGラットに投与する。処置レジメンを上記の表3に示す。1群は、無処置のままである。3つの群を最適以下の抗CD20mAbによって処置し、2つの群を最適な抗CD20mAb用量によって処置する。抗CD20mAb単独の効果は2群および5群に認められる。自己抗原をコードするpDNA自己ベクターと抗CD20mAbとを併用することによる併用治療の効果は、3、4、6および7群に認められる。効力に及ぼす投与タイミング同時治療対連続治療の効果は、3群を4群とおよび6群を7群と比較することによって証明される。開始後、pDNA抗原特異的治療を、試験期間の間毎週継続する。pDNA自己ベクターを、用量50μgラット25μg大腿方形筋のIM注射によって毎週投与する。4群および7群に関して、抗CD20の投与後2、4または6週目に、pDNA抗原特異的治療を開始する。開始後、試験期間の間pDNA治療を毎週継続する。抗CD20抗体のみを投与されたラットの疾患スコア、筋疲労性、および筋組織の組織病理学的評価を、抗CD20mAbとAChRをコードするpDNA自己ベクターとの併用治療を投与された動物と比較することによって、併用アプローチの有効性を判定する。実施例8アセチルコリン受容体AChRに対するDNA抗原特異的治療物質と併用した免疫抑制剤本実施例は、DNAワクチンrBHT3034およびコルチコステロイドSoluメドロールの併用治療が、ラットEAMGモデルにおける疾患スコアの抑制に関していずれかの単剤治療より有効であることを示すデータを提供する。これまでの試験から、ラットアセチルコリン受容体サブユニットαタンパク質の非分泌性型をコードするDNAワクチンの毎週投与が、ラット実験的自己免疫性重症筋無力症EAMGモデルにおける疾患スコアの低減において有効であることが証明されている。同様に、公表された試験から、ラットEAMGにおけるコルチコステロイド治療の用量依存的恩典が示されている。本研究において、本発明者らは、ラットEAMGモデルにおけるDNAワクチン/コルチコステロイド併用治療の効力を評価した。図5に示される通り、rBHT3034Soluメドロール併用治療を与えたラットは、PBS処置対照群ならびにrBHT3034およびSoluメドロール単剤治療群と比較して疾患スコアの統計学的に有意な低減を示す。EAMGを、既に記述されている通りにLewisラットにおいて誘導した。疾患の発症前、動物を処置群に無作為割付して、Soluメドロールの投与を免疫後7日目に開始した。rBHT3034の毎週のIM注射を28日目に開始した。疾患に関するスコアを動物から毎週得て、疾患スコアをプロットして、その上に±SEMを示す。クラスカルウォリス検定を用いて、SoluメドロールrBHT3034をPBS対照群と比較したところ、76日目から105日までのP値<005を得た。本明細書において記述された実施例および態様は、説明目的に限られること、ならびに本発明に照らして様々な改変または変化が当業者に示唆されるであろうが、それらも本出願および添付の特許請求の範囲の精神および範囲に含まれると理解される。本明細書において引用された刊行物、特許、および特許出願は全て、その全内容が全ての目的に関して参照により本明細書に組み入れられる。配列表SEQIDNO1マウスデスモグレイン3のヌクレオチド配列SEQIDNO2マウス非分泌性デスモグレイン3のヌクレオチド配列SEQIDNO3ヒトデスモグレイン3のヌクレオチド配列SEQIDNO4ヒト非分泌性デスモグレイン3のヌクレオチド配列SEQIDNO5マウスPLPのヌクレオチド配列SEQIDNO6マウス非分泌性フィブリノーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO7マウスフィブリノーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO8ヒトフィブリノーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO9マウスV型コラーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO10マウス非分泌性V型コラーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO11ヒトV型コラーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO12ヒト非分泌性V型コラーゲンのヌクレオチド配列SEQIDNO13マウスアセチルコリン受容体のヌクレオチド配列SEQIDNO14マウス非分泌性アセチルコリン受容体のヌクレオチド配列SEQIDNO15ヒトアセチルコリン受容体のヌクレオチド配列SEQIDNO16ヒト非分泌性アセチルコリン受容体のヌクレオチド配列SEQIDNO17ヒトプレプロインスリンのヌクレオチド配列SEQIDNO18ヒトプレプロインスリンのヌクレオチド配列SEQIDNO19マウスプレプロインスリンのヌクレオチド配列SEQIDNO20マウスプレプロインスリンのヌクレオチド配列