以下の1~5のいずれかの領域に存在する一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて前立腺癌を検査することを特徴とする、前立腺癌の発症および/または罹患リスクの判定方法。1第5染色体短腕15領域またはIRX4遺伝子2GPRC6A/RFX6遺伝子3第13染色体長腕22領域4C2orf43遺伝子5FOXP4遺伝子前記一塩基多型が、配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列の塩基番号61番目の塩基に相当する塩基、または該塩基と連鎖不平衡の関係にある塩基における一塩基多型である、請求項1に記載の方法。配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列において、塩基番号61番目の塩基を含む10塩基以上の配列、又はその相補配列を有する前立腺癌検査用プローブ。配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列において、塩基番号61番目の塩基を含む領域を増幅することのできる前立腺癌検査用プライマー。本発明は、前立腺癌の発症リスクや発症を正確に検査する方法、及び該方法に用いられる検査試薬を提供することを課題とする。本発明者らは上記課題の解決のために鋭意検討した結果、第5染色体短腕15領域もしくはIRX4遺伝子、GPRC6A/RFX6遺伝子、第13染色体長腕22領域、C2orf43遺伝子、またはFOXP4遺伝子に存在する一塩基多型SNPが前立腺癌と相関することを同定した。そして、これらの多型を調べることにより前立腺癌の発症リスクや発症の推定を正確に実施できることを見出し、本発明を完成するに至った。すなわち、本発明は以下の通りである。1以下の1~5のいずれかの領域に存在する一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて前立腺癌を検査することを特徴とする、前立腺癌の発症および/または罹患リスクの判定方法。1第5染色体短腕15領域またはIRX4遺伝子2GPRC6A/RFX6遺伝子3第13染色体長腕22領域4C2orf43遺伝子5FOXP4遺伝子2前記一塩基多型が、配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列の塩基番号61番目の塩基に相当する塩基、または該塩基と連鎖不平衡の関係にある塩基における一塩基多型である、1に記載の方法。3配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列において、塩基番号61番目の塩基を含む10塩基以上の配列、又はその相補配列を有する前立腺癌検査用プローブ。4配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列において、塩基番号61番目の塩基を含む領域を増幅することのできる前立腺癌検査用プライマー。本発明によれば、これまで予測が困難であった前立腺癌の発症リスク罹患リスクを正確かつ簡便に予測することができる。また、前立腺癌の発症を正確かつ簡便に判定することができる。したがって、本発明は前立腺癌の予防や早期治療に貢献するものである。<1>本発明の方法本発明の方法は、ヒトの第5染色体短腕15領域もしくはIRX4遺伝子、GPRC6A/RFX6遺伝子、第13染色体長腕22領域、C2orf43遺伝子、またはFOXP4遺伝子に含まれるSNPを分析し、該分析結果に基づいて前立腺癌を検査することを特徴とする、前立腺癌の発症および/または罹患リスクの判定方法である。なお、本発明において、検査とは前立腺癌の発症リスクの検査及び前立腺癌の発症の有無の検査を含む。本発明の方法においては、SNPの分析結果を、前立腺癌の発症リスクおよび/または発症の有無と関連付ける。C2orf43遺伝子は、第2染色体のオープンリーディングフレーム43を意味する機能未知の遺伝子であり、ヒト第2染色体短腕24領域2p24領域に存在する。C2orf43遺伝子としては、具体的には、GenBankAccessionNoNC00000211の20884818~21022827の領域が挙げられる。C2orf43遺伝子に存在する具体的なSNPとしては、ヒトrs13385191を挙げることができる。ここで、rs番号はNationalCenterforBiotechnologyInformationのdbSNPデータベースhttpwwwncbinlmnihgovprojectsSNPの登録番号を示す。rs13385191はGenBankAccessionNoNT01592614の20751746番目の塩基におけるグアニンG/アデニンAの多型を意味し、この塩基がGである場合は前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。また、アレルを考慮して解析した場合は、rs13385191がGG>GA>AAの順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。ヒト第5染色体短腕15領域5p15領域とは、より具体的には、第5染色体の190~199Mbの領域を意味する。この領域に関わる遺伝子多型は、近傍のIRX4遺伝子の発現に関わるものである。したがって、IRX4遺伝子に存在するSNPを解析することによっても前立腺癌を検査することができる。IRX4遺伝子としては、具体的には、GenBankAccessionNoNC0000059の1877541~1882880の領域が挙げられる。5p15領域に存在する具体的なSNPとしては、ヒトrs12653946を挙げることができる。rs12653946はGenBankAccessionNoNT00657615の1948829番目の塩基におけるシトシンC/チミンTの多型を意味し、この塩基がTである場合は前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。また、アレルを考慮して解析した場合は、rs12653946がTT>TC>CCの順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。FOXP4遺伝子は、FOXファミリーのサブファミリーPに属する転写因子をコードし、ヒト第6染色体短腕21領域6p21領域に存在する。FOXP4遺伝子としては、具体的には、GenBankAccessionNoNC00000611の41514164~41570122の領域が挙げられる。FOXP4遺伝子に存在する具体的なSNPとしては、ヒトrs1983891を挙げることができる。rs1983891はGenBankAccessionNoNT00759214の41644405番目の塩基におけるシトシンC/チミンTの多型を意味し、この塩基がTである場合は前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。また、アレルを考慮して解析した場合は、rs1983891がTT>TC>CCの順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。GPRC6A/RFX6遺伝子は、ヒト第6染色体長腕22領域6q22領域に存在する。GPRC6A遺伝子は、Gタンパク質共役受容体GproteincoupledreceptorGPCRをコードし、性ホルモンの産生やメタボリック症候群に関連する。RFX6遺伝子は、RFXファミリーに属する転写因子をコードする。GPRC6A/RFX6遺伝子としては、具体的には、GenBankAccessionNoNC00000611の117113248~117253314の領域が挙げられる。より具体的には、GPRC6A遺伝子としては117113248~117150198の領域が挙げられ、RFX6遺伝子としては117198376~117253314の領域が挙げられる。GPRC6A/RFX6遺伝子に存在する具体的なSNPとしては、ヒトrs339331を挙げることができる。rs339331はGenBankAccessionNoNT02574114の117316745番目の塩基におけるチミンT/シトシンCの多型を意味し、この塩基がTである場合は前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。また、アレルを考慮して解析した場合は、rs339331がTT>TC>CCの順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。ヒト第13染色体長腕22領域13q22領域とは、より具体的には、第13染色体の7257~7268Mbの領域を意味する。13q22領域に存在する具体的なSNPとしては、ヒトrs9600079を挙げることができる。rs9600079はGenBankAccessionNoNT02452413の72626140番目の塩基におけるグアニンG/チミンTの多型を意味し、この塩基がTである場合は前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。また、アレルを考慮して解析した場合は、rs9600079がTT>TG>GGの順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。なお、rs13385191、rs12653946、rs1983891、rs339331、およびrs9600079について、SNP塩基及びその前後60bpの領域を含む合計121bpの長さの配列を、それぞれ配列番号1、2、3、4、および5に示した。61番目の塩基が多型を有する。本発明においては、上記塩基に相当する塩基を解析する。上記塩基に相当する塩基とは、上記領域における該当塩基を意味する。すなわち、上記塩基に相当する塩基を解析することには、仮に人種の違いなどによって上記配列がSNP以外の位置で若干変化したとしても、上記領域における該当塩基を解析することが含まれる。また、本発明において解析する塩基は上記のものに限定されず、上記の塩基と連鎖不平衡にある塩基の多型を分析してもよい。ここで上記の塩基と連鎖不平衡にある塩基とは、上記の塩基とr2>0.5、好ましくはr2>0.8、さらに好ましくはr2>0.9の関係を満たす塩基をいう。いずれも、リスクアレルのホモ接合体>リスクアレルと非リスクアレルのへテロ接合体>非リスクアレルのホモ接合体の順で前立腺癌の可能性または発症リスクが高い。上記SNPの塩基の種類を調べ、得られた結果を上記のような基準に基づいて前立腺癌と関連付けることにより、前立腺癌を検査することができる。上記SNPは単独で解析されてもよいし、上記SNPの少なくとも1つを含む複数のSNPsをまとめて解析ハプロタイプ解析してもよい。例えば、上記SNPの複数をまとめて解析してもよいし、上記SNPの少なくとも1つと、前立腺癌と相関する既知のSNPとを組み合わせて解析してもよい。前立腺癌と相関する既知のSNPとしては、欧米人被検者で見出された31個のSNPsが挙げられる表3後述。日本人の前立腺癌を検査する場合には、前立腺癌と相関する既知のSNPとして、日本人の前立腺癌と相関する19個のSNPsを用いることができる表3後述。これらのSNPsの多型の種類や、前後の領域を含む塩基配列は、上記dbSNPデータベースで参照できる。また、前立腺癌と相関する既知のSNPとしては、これら既知のSNPsと連鎖不平衡にある塩基を解析してもよい。前立腺癌と相関する複数のSNPsをまとめて解析すれば、前立腺癌の検査の精度が向上する。なお、いずれのSNPも、二本鎖DNAのどちらの鎖を解析してもよい。例えば、IRX4遺伝子、C2orf43遺伝子、GPRC6A/RFX6遺伝子、またはFOXP4遺伝子の配列はセンス鎖を解析してもよいし、アンチセンス鎖を解析してもよい。SNPの解析に用いる試料としては、染色体DNAを含む試料であれば特に制限されないが、例えば、血液、尿等の体液サンプル、口腔粘膜などの細胞、毛髪等の体毛などが挙げられる。SNPの解析にはこれらの試料を直接使用することもできるが、これらの試料から染色体DNAを常法により単離し、これを用いて解析することが好ましい。SNPの解析は、通常の遺伝子多型解析方法によって行うことができる。例えば、シークエンス解析、PCR、ハイブリダイゼーション、インベーダー法などが挙げられるが、これらに限定されない。シークエンス解析は通常の方法により行うことができる。具体的には、多型を示す塩基の5’側数十塩基の位置に設定したプライマーを使用してシークエンス反応を行い、その解析結果から、該当する位置がどの種類の塩基であるかを決定することができる。なお、シークエンス反応の前に、あらかじめSNP部位を含む断片をPCRなどによって増幅しておくことが好ましい。また、SNPの解析は、PCRによる増幅の有無を調べることによって行うことができる。例えば、多型を示す塩基を含む領域に対応する配列を有し、かつ、3’末端が各多型に対応するプライマーをそれぞれ用意する。それぞれのプライマーを使用してPCRを行い、増幅産物の有無によってどのタイプの多型であるかを決定することができる。また、LAMP法特許第3313358号明細書、NASBA法NucleicAcidSequenceBasedAmplification;特許2843586号明細書、ICAN法特開2002-233379号公報などによって増幅の有無を調べることもできる。その他、単鎖増幅法を用いてもよい。また、SNP部位を含むDNA断片を増幅し、増幅産物の電気泳動における移動度の違いによってどのタイプの多型であるかを決定することもできる。このような方法としては、例えば、PCR-SSCPsinglestrandconformationpolymorphism法Genomics1992Jan112139146が挙げられる。具体的には、まず、目的のSNPを含むDNAを増幅し、増幅したDNAを一本鎖DNAに解離させる。次いで、解離させた一本鎖DNAを非変性ゲル上で分離し、分離した一本鎖DNAのゲル上での移動度の違いによってどのタイプの多型であるかを決定することができる。さらに、多型を示す塩基が制限酵素認識配列に含まれる場合は、制限酵素による切断の有無によって解析することもできるRFLP法。この場合、まず、DNA試料を制限酵素により切断する。次いで、DNA断片を分離し、検出されたDNA断片の大きさによってどのタイプの多型であるかを決定することができる。また、ハイブリダイゼーションの有無を調べることによって多型の種類を解析することも可能である。すなわち、各塩基に対応するプローブを用意し、いずれのプローブにハイブリダイズするかを調べることによってSNPがいずれの塩基であるかを調べることもできる。このようにしてSNPがいずれの塩基であるかを決定することで、前立腺癌を検査するためのデータを得ることができる。<2>本発明の検査用試薬本発明はまた、前立腺癌を検査するためのプライマーやプローブなどの検査試薬を提供する。このようなプローブとしては、上記SNP部位を含み、ハイブリダイズの有無によってSNP部位の塩基の種類を判定できるプローブが挙げられる。具体的には、配列番号1、2、3、4、または5において塩基配列の61番目の塩基を含む配列、又はその相補配列を有する10塩基以上の長さのプローブが挙げられる。プローブの長さは好ましくは、15~35塩基であり、より好ましくは20~35塩基である。また、プライマーとしては、上記SNP部位を増幅するためのPCRに用いることのできるプライマー、又は上記SNP部位を配列解析シークエンシングするために用いることのできるプライマーが挙げられる。具体的には、配列番号1、2、3、4、または5の塩基配列の61番目の塩基を含む領域を増幅したりシークエンシングしたりすることのできるプライマーが挙げられる。このようなプライマーの長さは10~50塩基が好ましく、15~35塩基がより好ましく、20~35塩基がさらに好ましい。上記SNP部位をシークエンシングするためのプライマーとしては、上記塩基の5’側領域、好ましくは30~100塩基上流の配列を有するプライマーや、上記塩基の3’側領域、好ましくは30~100塩基下流の領域に相補的な配列を有するプライマーが例示される。PCRによる増幅の有無で多型を判定するために用いるプライマーとしては、上記塩基を含む配列を有し、上記塩基を3’側に含むプライマーや、上記塩基を含む配列の相補配列を有し、上記塩基の相補塩基を3’側に含むプライマーなどが例示される。なお、本発明の検査用試薬はこれらのプライマーやプローブに加えて、PCR用のポリメラーゼやバッファー、ハイブリダイゼーション用試薬などを含むものであってもよい。以下、本発明を実施例によりさらに具体的に説明する。但し、本発明はこれらの実施例に限定されない。1前立腺癌と相関するSNPsの同定前立腺癌感受性を決定する遺伝的変異を同定するために、日本人被検者を用いてゲノムワイド相関解析GWASおよび追試replicationstudyを行った。GWASとは、疾患等の表現型に関わる遺伝的変異を探索する遺伝統計学的手法である。例えば、ヒトゲノム全体を網羅するような数十万~100万箇所のSNPsを用いて、ある疾患の患者ケースとその疾患にかかっていない被験者コントロールとの間で、多型の頻度に差があるかどうかを統計的に検定することで、疾患と関連する遺伝的変異を見出すことができる。<被検者>GWASおよび追試に用いた被検者の特徴を表1に示す。GWASおよび追試に用いる前立腺癌の被検者ケースCaseとしては、東京大学医科学研究所のBioBankJapanに登録された前立腺癌患者群から、前立腺生検による病理学的評価に基づき、前立腺癌に罹患していると臨床的に診断された患者を選択して用いた。なお、GWASに用いた前立腺癌の被検者1583名の内、250名は前立腺癌の家族歴を有し、744名はグリーソンスコアGleasonscoreが8以上である。GWASに用いる対照被検者コントロールcontrolとしては、BBJに登録された2480名の前立腺癌以外の疾患の患者、および大阪御堂筋ロータリークラブで募集した906名の健康なボランティアを用いた。追試に用いる対照被検者としては、これまでに前立腺癌以外の疾患のGWASに患者として用いた男性被検者を用いた。いずれの被検者も、アジア人集団に分類され、かつ、分集団が存在しないことは、主成分分析PCAにより確認された。本研究は東京大学医科学研究所および理化学研究所横浜研究所の倫理委員会によって承認され、全ての参加者からインフォームドコンセントを得た。<統計解析>GWASおよび追試において、常染色体上の各SNPと前立腺癌との相関は、遺伝モデルとしてadditivemodelを用いて解析し、dominantmodelおよびrecessivemodelも参照した。X染色体上の各SNPと前立腺癌との相関は、2×2のカイ2乗検定により解析した。GWASと追試を組み合わせた統計解析は、同じ遺伝モデルに基づきMantel-Haenszel法により行った。<GWAS>前立腺癌の被検者1594名の遺伝型は、Human610QuadBeadChipIllumina社を用いて解析した。対照被検者3386名の遺伝型は、HumanHap550v3GenotypingBeadChipIllumina社を用いて解析した。両チップで共通に利用できる510687個のSNPsについて相関解析を行った。GWASにより、染色体上の独立した8つの領域に、P<1.0×107で前立腺癌と有意に相関する37個のSNPsを同定した。この内、6つの領域にはすでに前立腺癌に関連するSNPsが報告されていたが、それに加えて、第5染色体短腕15領域5p15領域にrs12653946P=8.3×1010が、第6染色体長腕22領域6q22領域にrs339331P=6.0×108が、前立腺癌に感受性のSNPsとして新たに見出された表2。P値は、いずれも、genomicinflationfactorλに基づき補正したPGC値を意味する。a:NCBIのヒトゲノムBuild36の座標情報NCBIHumanGenomeBuild36coordinatesに基づく染色体上の位置。b:SNPが位置する領域。なお、任意の遺伝子の転写開始点から20kb以内、あるいは最後のエクソンから10kb以内にSNPsが位置する場合には、SNPsは当該遺伝子に含まれるものとした。c:GWASで用いた対照被検者での頻度に基づくメジャーアレル/マイナーアレル。d:前立腺癌感受性をもたらすSNPアレル。e:信頼区間ConfidenceInterval;CI95でのアレルのオッズ比OddsRatio;OR。<追試>前立腺癌に感受性の箇所をさらに探索するため、前立腺癌の被検者3001名と対照被検者5415名を用いて追試を行った。前立腺癌の被検者の遺伝型は、multiplexPCRinvaderassayThirdWaveTechnologiesOhnishiYetalJHumGenet464717により解析した。対照被検者の遺伝型は、Human610QuadBeadChipIllumina社を用いて解析した。なお、被検者はいずれもGWASに用いた被検者とは独立である。追試に用いるSNPsとしては、GWASにおいて、3つの遺伝モデルadditivemodel、dominantmodel、およびrecessivemodelの少なくとも1つで最小P<1.0×104となった263個のSNPsを選択した。これらP<1.0×104で前立腺癌と有意に相関する263個のSNPsの内、既知の80個を除いた183個のSNPsについて、これらSNPs間での連鎖不平衡係数linkagedisequilibiumLDcoefficientr2を算出した。それぞれr2≧0.8の範囲で、P値の低い上位91個のSNPsを選択し、追試に供した。91個の内、3個のSNPsが、ボンフェローニ補正後のP<5.5×104を満たし、前立腺癌との有意な相関が再度確認された。当該3個のSNPsは、前記rs12653946およびrs339331、並びに第13染色体長腕22領域13q22領域のrs9600079であった。また、これら3個のSNPsは、GWASと追試を組み合わせると、PGC=3.9×1018~2.8×109で前立腺癌と有意に相関することが再度確認された。さらに、第2染色体短腕24領域2p24領域のrs13385191、および第6染色体短腕21領域6p21領域のrs1983891は、P<5.5×104を満たさなかったものの、P<0.05を満たした。GWASと追試を組み合わせると、rs13385191はPGC=7.5×108、rs1983891はPGC=7.6×108で、いずれもゲノムワイドな有意性genomewidesignificanceの閾値として設定されたP<1.0×107を満たしており前立腺癌と有意に相関することが確認された。以上より、前立腺癌に感受性の5個のSNPsが新規に見出された表2。また、これら5個のSNPsは、前立腺癌の家族歴を有さない被験者と比較して、前立腺癌の家族歴を有する被験者においてオッズ比OddsRatio;ORが高くなる傾向が見られた。2前立腺癌感受性遺伝子の同定前立腺癌の感受性遺伝子を探索するため、これら5個のSNPsが位置する領域のマッピング解析連鎖不平衡LDパターンの解析を行った。HapMapプロジェクトのフェーズ2の日本人のデータベースJPTに基づき、HaploviewBarrettJetalBioinformatics21263265を用いて、これらSNPsの周辺領域に存在するマイナーアレル頻度MAFs≧0.05である全SNPsがr2>0.9で含まれるようタグSNPsを選択した。結果を図1~5に示す。最も前立腺癌との相関が強いrs12653946PGC=3.9×1018は、染色体の5p15領域に位置していた。36個のタグSNPsを用いて候補領域第5染色体の190~199Mbのマッピング解析を行ったところ、rs12653946の位置する20kbにわたる相関領域associatedregionが前立腺癌感受性領域として同定された図2。当該領域には既知の遺伝子は存在しないが、当該領域は近傍に存在するIRX4遺伝子の発現に関わっている。2番目に前立腺癌との相関が強いrs339331PGC=1.6×1012は、染色体の6q22領域に位置し、具体的には、RFX6遺伝子のイントロン4に位置していた。59個のタグSNPsを用いて580kbの候補領域第6染色体の1170~1176Mbのマッピング解析を行ったところ、rs339331は、RFX6遺伝子とGPRC6A遺伝子の2遺伝子を含む200kbにわたる相関領域に位置することが明らかとなった図4。RFX6遺伝子は、RFXファミリーに属する転写因子をコードし、ほぼ膵臓のランゲルハンス島でのみ発現するAftabSetalBMCEvolBiol8226。GPRC6A遺伝子は、Gタンパク質共役受容体GproteincoupledreceptorGPCRをコードし、精巣のライディッヒ細胞で強く発現する。GPRC6A遺伝子の雄ノックアウトマウスは、雌化が認められ、また、エストラジオールの血中濃度上昇とテストステロンの血中濃度低下を含むメタボリック症候群の症状を呈することが知られているPiMetalPLoSOne3e3858。これらの性ホルモンは前立腺癌の発生initiation過程や進行progression過程と密接に関わっており、GPRC6A/RFX6遺伝子領域の遺伝的変異は、GPRC6Aを介した性ホルモン産生を変化させることにより前立腺癌感受性に影響している可能性がある。なお、GPRC6A遺伝子とRFX6遺伝子では、GPRC6A遺伝子の方が、前立腺癌感受性に影響している可能性が高いと考えられる。3番目に前立腺癌との相関が強いrs9600079PGC=2.8×109は、染色体の13q22領域に位置していた。36個のタグSNPsを用いて候補領域第13染色体の7257~7268Mbのマッピング解析を行ったところ、rs9600079は、35kbにわたる相関領域に位置することが明らかとなった図5。当該領域には、既知の遺伝子は存在しない。4番目に前立腺癌との相関が強いrs13385191PGC=7.5×108は、染色体の2p24領域に位置し、具体的には、C2orf43遺伝子のイントロン6に位置していた。C2orf43遺伝子とは、第2染色体のオープンリーディングフレーム43を意味し、機能未知の遺伝子である。45個のタグSNPsを用いて候補領域第2染色体の2072~2093Mbのマッピング解析を行ったところ、rs13385191の位置するC2orf43遺伝子の3’側の12.3kbにわたる相関領域が前立腺癌感受性領域として同定された図1。5番目に前立腺癌との相関が強いrs1983891PGC=7.6×108は、染色体の6p21領域に位置し、具体的には、FOXP4遺伝子のイントロン2に位置していた。候補領域第6染色体の4158~4174Mbのマッピング解析を行ったところ、rs1983891の位置する72kbにわたる相関領域が前立腺癌感受性領域として同定された図3。当該領域に含まれる遺伝子はFOXP4遺伝子のみであった。FOXP4遺伝子は、FOXファミリーのサブファミリーPに属する転写因子をコードし、胚発生、細胞周期制御、および腫瘍形成において重大な役割を担っているTeufelAetalBiochimBiophysActa1627147152。なお、欧米人被検者を用いた研究により前立腺癌と相関することが報告されている31個のSNPs非特許文献1~11の内、19個のSNPsは日本人被検者を用いたGWASでも前立腺癌との相関が確認された表3。一方、残りの12個のSNPsは、日本人では前立腺癌との相関は確認されなかった。また、本実施例で見出された5個のSNPsは、欧米人被検者を用いた大規模な相関解析では見出されていなかったものであるが、それらのマイナーアレル頻度MAFsは日本人と欧米人とで顕著な差は認められなかった。これらのことから、日本人と欧米人とでは、前立腺癌感受性を決定する遺伝的変異と、マーカーとなるSNPsとの連鎖不平衡LDのパターンが異なっている可能性がある。よって、本実施例で見出された5個のSNPsおよびそれらと連鎖不平衡の関係にあるSNPsは、これらSNPsが前立腺癌と相関するいずれの人種においても有用であるが、特に、日本人の前立腺癌の検査に有用であると期待される。GWASinJapanesepopulationは、日本人被検者を用いた本実施例のGWASおよび追試の結果を示す。濃く色付けしたSNPsは日本人においてP<1.6×10‐3で前立腺癌と有意な相関を示すもの、薄く色付けしたSNPsは日本人において1.6×10‐3<P<0.05で前立腺癌と有意な相関を示すものである。a:データは既報非特許文献1~11のものである。b:各試験でのリスクアレル頻度。c:HapMapデータベースから取得したリスクアレル頻度。d:統計的検出力statisticalpowerは、HapMapプロジェクトのJPTデータベースのマイナーアレル頻度に基づき、CaTS‐powercalculatorにより算出した。e:リスクアレル頻度およびオッズ比は、ステージ1とステージ2の試験結果を組み合わせたものである。f:各SNPは、あらかじめ選択されたHapMapプロジェクトのフェーズ2のCEUデータベースのSNPsと強い連鎖不平衡r2≧0.8を示した。3前立腺癌と相関するSNPsを用いた前立腺癌の罹患リスク予測本願により新たに見出された上記5個と、既報の前立腺癌と相関する11個の計16個のSNPs表4を用いて、前立腺癌の罹患リスクの予測を行った。<方法>前立腺癌と相関する16個のSNPs表4について、ロジスティック回帰モデルLogisticregressionmodelによって、前立腺癌の罹患リスク診断モデルとして下記のような式を導きだした。式中で用いるパラメータについては表5に示す。このリスク診断モデルの精度を、モデルを構築した集団追試で用いた前立腺癌の被検者3001名と対照被検者5415名からなる集団の遺伝子多型情報と、該集団とは別の独立した集団の遺伝子多型情報を用いて評価をおこなった。<結果と考察>上記の式を用いて、追試で用いた前立腺癌の被検者3001名と対照被検者5415名でのROCカーブを描くと、図6Aのようになり、AUCAreaUndertheCurveで0665であった。つぎに、別の独立した732例の前立腺癌被検者および957例の男性対照被検者からなる集団について、16個の遺伝子多型の型判定を行い、上記の式を用いてロジスティック回帰分析を行い、各個人での前立腺癌リスクを検討した。ROCカーブを描くと図6Bのようになり、AUCで0672であり、前立腺癌のリスク評価の再現性が得られた。また、前立腺癌の確定診断が比較的難しい約80が前立腺癌の診断が得られないPSA値10ngmL未満の症例について、同様の解析を行うと、AUCは0659であり、同様の精度で前立腺癌のリスク評価が行えた図6C。血清PSA値の測定は、現在広く前立腺癌の検診に使われており、癌の診断マーカーとしては唯一信頼性が高いマーカーとされる。しかし、最近、PSA検診が最も普及し、前立腺癌の罹患者数が最も多いアメリカを中心にPSAの評価の見直しが唱えられている。まず、一般的に増殖が遅くて予後がよく、また、高齢での発生が多い前立腺癌においては、PSAスクリーニング導入による前立腺癌の生存率の延長が必ずしも確認されていない。また、一般的にPSAのカットオフ値は40ngmLであるが、40ngmL以下でも約20に前立腺癌が発見されるとの報告があり、2ngml以下でも10数が前立腺癌を罹患しているとの報告もあり、PSAのカットオフ値がゆらいでいる。なお、10ngmL以上だと40に前立腺癌が発見されるが、4~10ngmLだと20となる。このような特異性が低い診断方法で陽性になった人には、前立腺生検という侵襲的で入院を要するような精密検査が行われるのが現状である。前立腺癌と相関するSNPsを用いた前立腺癌のリスク診断モデルは、前立腺癌の検査に特に制限されず利用することができるが、特に、以下のような目的において有用である。1PSA4~10ngmLのいわゆるグレーゾーンの症例に対して、遺伝子多型によるリスク診断を行い、侵襲的な前立腺生検を行うか否かの判断に用いる。また、前立腺生検陰性であった症例においても、遺伝子多型によるリスク診断を行い、以後のサーベイランスの頻度の決定の材料に用いる。2Dutasterideなどの前立腺癌の予防プログラムがいくつか行われているが、遺伝子多型によるリスク診断によって、高リスク群を絞り込んで前立腺癌の予防プログラムを行い、効率的な前立腺癌予防を試みる。