"マイクロ流体デバイスのマイクロ流路の内部の反応の画像を生成するように構成されたイメージングシステムであって、マイクロ流路の少なくとも一部分の記憶可能な画像を生成するように構成されたセンサー素子と、前記センサー素子に対して配置され、前記センサー素子によって画像化されるマイクロ流体チップの一部分を照光するように構成された複数の照明素子とを備え、前記照明素子の少なくとも1つが照明アセンブリを備え、該照明アセンブリが、LEDと、前記LEDの前に配置され、前記照明アセンブリによって照光される領域を制御するように開口が形成されているマスクと、前記照明アセンブリによって発せられた光のスペクトル成分を制御するための、前記照明アセンブリの光路に沿ったフィルタと、前記照明アセンブリによって発せられた光を有する領域を画像化するためのレンズとを備え、前記LED、前記マスク、前記フィルタ、および前記レンズが、前記照明アセンブリの光学軸に沿って整列しているイメージングシステム。前記照明素子のうち少なくとも2つが、前記マイクロ流体チップの別々の部分を照光するように構成されている請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサー素子がデジタル一眼レフカメラを備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記照明素子のそれぞれがLEDを備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサー素子のまわりに90度の角度増分で配置された4つの照明素子を備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサー素子がCMOSセンサーを備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記CMOSセンサーが、5616×3744ピクセル以上までのピクセル配列を有する請求項6に記載のイメージングシステム。前記センサー素子がピクセル配列を含み、前記システムが、前記ピクセル配列の前記ピクセルの一部分のみの画像を検出するように構成された論理素子をさらに備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサー素子が複数の画像を生成するように構成されている請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサー素子が、JPEGフォーマットを有する画像を生成するように構成されている請求項1に記載のイメージングシステム。マイクロ流路の少なくとも一部分とともに前記センサー素子によって画像化されるように配置された基準蛍光物質をさらに備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサーと前記マイクロ流路の間に少なくとも1つの延長チューブをさらに備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記センサーと前記マイクロ流路の間に配置され、選択された波長の光信号しか前記センサーに到達させないように構成された放射フィルタをさらに備える請求項1に記載のイメージングシステム。前記マイクロ流路が第1のゾーンおよび第2のゾーンを備え、前記LEDのうち第1のLEDが、第2のゾーンを照光するように配置して配向されており、前記LEDのうち第2のLEDと第3のLEDが、互いから180度離隔して前記センサーの反対側に配置され、前記第1のゾーンを照光するように配置して配向されており、前記LEDのうち第4のLEDが、前記第1のゾーンと前記第2のゾーンの両方を照光するように配置して配向されている請求項5に記載のイメージングシステム。前記複数の照明素子のそれぞれが、前記マイクロ流体チップの一部分を、定められた波長で照光するように構成されている請求項1に記載のイメージングシステム。サンプル物質に対して核酸の診断分析を遂行するシステムであって、サンプル物質を運んで、マイクロ流路の1つまたは複数の部分の内部のサンプル物質に対して、PCR増幅および熱融解解析のうち少なくとも1つを含む分析プロセスを遂行することを可能にする、前記マイクロ流路を含むマイクロ流体手段と、前記マイクロ流体手段の前記マイクロ流路にサンプル物質を導入するための、前記マイクロ流体手段と動作協調する手段と、前記マイクロ流体手段の各マイクロ流路を通してサンプル物質を移動させるための、前記マイクロ流体手段と動作協調する手段と、前記マイクロ流体手段の1つまたは複数の部分を、1つまたは複数の選択された温度へと加熱および/または冷却する熱的手段と、イメージング手段によって生成された画像に関連するデータを記憶する手段を含む、それぞれの前記マイクロ流路の1つまたは複数の部分の内部のサンプル物質を画像化するイメージング手段とを備えるシステム。前記イメージング手段によって生成された画像に関連するデータを処理して、前記PCR増幅および前記熱融解解析のうち少なくとも1つの結果に関連するデータを生成する処理手段をさらに備える請求項16に記載のシステム。サンプル物質を導入する前記手段、サンプル物質を移動する前記手段、前記熱的手段、前記イメージング手段、および前記処理手段の動作を制御する制御手段をさらに備える請求項17に記載のシステム。前記イメージング手段が、前記マイクロ流路の内部のサンプル物質からの定められた波長の蛍光放射を検出するように構成され、定められた励起波長の励起信号を前記マイクロ流路の一部分に導く手段と、前記マイクロ流路の一部分の内部の前記サンプル物質から、定められた放射波長の蛍光放射の画像を取得する手段とを備える請求項16に記載のシステム。マイクロ流体デバイスのマイクロ流路の内部の反応の画像から熱融解データを解析するための、コンピュータで実施される方法であって、前記マイクロ流路の少なくとも一部分を照光すること、ピクセル配列のセンサーを用いて、前記マイクロ流路の前記照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を生成することであって、前記画像の各ピクセルがJPEG値を有すること、前記ピクセル配列の前記ピクセルの一部分を含む対象領域ROIを定義すること、および前記ROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、前記マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の強度を計算することを含む方法。各ピクセルが、第1の色の2つのサブピクセルおよび第2の色の1つのサブピクセルを有し、各ピクセルの前記JPEG値が2×第1の色のサブピクセル1×第2の色のサブピクセル/3として計算される請求項20に記載の方法。前記ROIの少なくとも一部分を1つまたは複数のサブROIに分割して、前記サブROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、各サブROIの内部の蛍光強度を計算することをさらに含む請求項20に記載の方法。前記生成するステップが、CMOSセンサーを用いて遂行される請求項20に記載の方法。前記CMOSセンサーがデジタル一眼レフカメラを備える請求項20に記載の方法。前記生成するステップおよび前記計算するステップを、ある期間にわたって1回または複数回繰り返して、計算された蛍光強度の変化を、ある期間にわたって監視することをさらに含む請求項20に記載の方法。前記マイクロ流路の前記照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を2つの別々の時間に生成し、前記画像のフィーチャが、1つの画像と次の画像の間で変位するのを検出して、1つの画像から次の画像への時間の経過を計算することにより、前記マイクロ流路の内部の流体流れを監視することを含む請求項20に記載の方法。前記マイクロ流路に隣接して配置された基準蛍光物質を照光し、ピクセル配列のセンサーを用いて、前記基準蛍光物質が発する蛍光の画像を生成して、1つのROIが前記マイクロ流路の一部分を包含し、第2のROIが前記基準蛍光物質の一部分を包含する、少なくとも2つのROIを定義することをさらに含む請求項20に記載の方法。前記基準蛍光物質を包含する前記ROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、前記基準蛍光物質が発する蛍光の前記強度を計算して、前記基準蛍光物質が発する蛍光の前記強度に基づいて、前記マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の前記強度を調節することをさらに含む請求項27に記載の方法。マイクロ流路の内部のサンプル物質からの熱融解データを解析するためのコンピュータで実施される方法であって、イメージングシステムを用いて、前記イメージングシステムによって生成されたJPEG画像をタイムスタンプとともに保存することにより、熱融解の画像データを時間の関数として記録すること、温度制御システムを用いて、温度データを時間の関数として記録すること、および静的記録信号を前記イメージングシステムへ送って、前記イメージングシステムに、熱融解が始まる前に静止画像データを記録させ、前記静止画像データの時間を記録し、そして、前記温度データを前記静止画像データの時間と同期させることにより、前記温度データを前記熱融解データと同期させることを含む方法。前記熱融解の画像データと、前記温度制御システムによって制御される加熱器とが同時にスタートするように、初期の加熱器信号が前記温度制御システムに送られるのと同時に前記イメージングシステムに前記静止画像信号を送り、次いで、前記静止画像データの前記時間と、前記熱融解の画像データの前記JPEG画像の前記タイムスタンプおよび前記温度データを記録した時間との関係に基づいて、前記温度データと前記熱融解画像データを同期させることを含む請求項29に記載の方法。熱画像データを記録することが、前記マイクロ流路の少なくとも一部分を照光すること、ピクセル配列のセンサーを用いて、前記マイクロ流路の前記照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を生成することであって、前記画像の各ピクセルがJPEG値を有すること、前記ピクセル配列の前記ピクセルの一部分を含む対象領域ROIを定義すること、および前記ROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、前記マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の強度を計算することを含む請求項29に記載の方法。各ピクセルが、第1の色の2つのサブピクセルおよび第2の色の1つのサブピクセルを有し、各ピクセルの前記JPEG値が2×第1の色のサブピクセル1×第2の色のサブピクセル/3として計算される請求項31に記載の方法。前記ROIの少なくとも一部分を1つまたは複数のサブROIに分割して、前記サブROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、各サブROIの内部の蛍光強度を計算することをさらに含む請求項31に記載の方法。前記生成するステップが、CMOSセンサーを用いて遂行される請求項31に記載の方法。前記CMOSセンサーがデジタル一眼レフカメラを備える請求項31に記載の方法。前記生成するステップおよび前記計算するステップを、ある期間にわたって1回または複数回繰り返して、計算された蛍光強度の変化をある期間にわたって監視することをさらに含む請求項31に記載の方法。前記マイクロ流路の前記照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を2つの別々の時間に生成し、画像のフィーチャが1つの画像と次の画像の間で変位するのを検出して、1つの画像から次の画像への時間の経過を計算することにより、前記マイクロ流路の内部の流体流れを監視することを含む請求項31に記載の方法。前記マイクロ流路に隣接して配置された基準蛍光物質を照光し、ピクセル配列のセンサーを用いて、前記基準蛍光物質が発する蛍光の画像を生成して、1つのROIが前記マイクロ流路の一部分を包含し、第2のROIが前記基準蛍光物質の一部分を包含する、少なくとも2つのROIを定義することをさらに含む請求項31に記載の方法。前記基準蛍光物質を包含する前記ROIの前記ピクセルのすべてのJPEG値の平均をとることにより、前記基準蛍光物質が発する蛍光の前記強度を計算すること、および前記基準蛍光物質が発する蛍光の前記強度に基づいて、前記マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の前記強度を調節することをさらに含む請求項38に記載の方法。前記センサー素子が、30Hz以下の周波数で複数の画像を生成するように構成される請求項9に記載のイメージングシステム。したがって、核酸の診断分析および他の生物学的プロセスを監視するイメージングシステムの精度、正確さ、および費用対効果の改善が、絶えず必要とされている。蛍光源を画像化するのに2次元のCMOSセンサーまたはCCDセンサーを使用することは、生物学的研究において既知である。通常、蛍光源を科学技術のCMOS/CCDセンサーに画像化するのに顕微鏡レンズが使用される。本発明の態様によれば、イメージングデバイスとしてデジタル一眼レフDSLRカメラを使用し、規定された構成のLED励起源および本明細書に説明された機構と組み合わせて、改善された画像化および/または低コストのイメージングシステムが実現される。このようなイメージングシステムには、以下を含む多くの利点がある。1DSLRカメラの大きなCMOSセンサーにより、同一のカメラを使用して流れ追跡および熱融解測定の両方が可能になる。2DSLRカメラの8ビットJPEGフォーマットにより、14ビットのRAWデータと比較して、データ転送の帯域幅およびハードディスクのスペースが節約される。ビット深度は、多くのピクセルの平均をとることにより回復することができる。3このようなDSLRカメラの大きなピクセル密度を有するセンサーにより、マイクロ流体流路における反応を観測することができる。PCRおよび熱融解プロセスのより優れた制御を得るために、気泡形成などの情報が取得され得る。4DSLRカメラのCMOSセンサーサイズが大きいので、光源および加熱器からの変動を補正して除去するために、基準蛍光物質を使用してよい。したがって、本発明の態様は、マイクロ流体デバイスのマイクロ流路の内部の反応の画像を生成するように構成されたイメージングシステムで実施される。一実施形態では、イメージングシステムは、マイクロ流路の少なくとも一部分の記憶可能な画像を生成するように構成されたセンサー素子と、センサー素子に対して配置され、センサー素子によって画像化されるマイクロ流体チップの一部分を照光するように構成された複数の照明素子とを備える。照明素子のうち少なくとも1つが、照明アセンブリを備え、該照明アセンブリが、LEDと、LEDの前に配置され、照明アセンブリによって照光される領域を制御するように開口が形成されているマスクと、照明アセンブリによって発せられた光のスペクトル成分を制御するための、照明アセンブリの光路に沿ったフィルタと、照明アセンブリによって発せられた光を有する領域を画像化するためのレンズとを備える。LED、マスク、フィルタ、およびレンズは、照明アセンブリの光学軸に沿って整列している。一実施形態では、照明素子のうち少なくとも2つが、マイクロ流体チップの別々の部分を照光するように構成されている。別の実施形態では、センサー素子がデジタル一眼レフカメラを備える。別の実施形態では、照明素子のそれぞれがLEDを備える。別の実施形態では、イメージングシステムは、センサー素子のまわりに90度の角度の増分で配置された4つの照明素子を備える。別の実施形態では、マイクロ流路は第1のゾーンおよび第2のゾーンを備え、第1のLEDが第2のゾーンを照光するように配置して配向され、第2のLEDと第3のLEDが、互いから180度離隔してセンサーの反対側に配置され、第1のゾーンを照光するように配置して配向されており、第4のLEDが、第1のゾーンと第2のゾーンの両方を照光するように配置して配向されている。別の実施形態では、センサー素子がCMOSセンサーを備える。別の実施形態では、CMOSセンサーは、5616×3744ピクセル以上までのピクセル配列を有する。別の実施形態では、センサー素子がピクセル配列を含み、このシステムは、ピクセル配列のピクセルの一部分のみの画像を検出するように構成された論理素子をさらに備える。別の実施形態では、センサー素子は、30Hz以上までの周波数で複数の画像を生成するように構成される。別の実施形態では、センサー素子は、8ビットのJPEGフォーマットを有する画像を生成するように構成される。別の実施形態では、このイメージングシステムは、マイクロ流路の少なくとも一部分とともにセンサー素子によって画像化されるように配置された基準蛍光物質をさらに備える。別の実施形態では、このイメージングシステムは、センサーとマイクロ流路の間に、少なくとも1つの延長チューブをさらに備える。他の実施形態では、延長チューブの代わりにレンズの組合せが使用されてもよい。別の実施形態では、このイメージングシステムには、センサーとマイクロ流路の間に配置され、選択された波長の光信号しかセンサーに到達させないように構成された放射フィルタがさらに備わっている。別の実施形態では、複数の照明素子のそれぞれが、マイクロ流体チップの一部分を、定められた波長で照光するように構成される。本発明のさらなる態様は、サンプル物質に対して核酸の診断分析を遂行するシステムで実施される。一実施形態では、このシステムには、サンプル物質を運んで、マイクロ流路の1つまたは複数の部分の内部のサンプル物質に対する分析プロセスの遂行を可能にする、マイクロ流路を含むマイクロ流体手段が備わっている。分析プロセスは、PCR増幅および/または熱融解解析のうち少なくとも1つを含む。このシステムは、マイクロ流体手段のマイクロ流路にサンプル物質を導入するための、マイクロ流体手段と動作協調する手段と、マイクロ流体手段の各マイクロ流路を通してサンプル物質を移動させるための、マイクロ流体手段と動作協調する手段と、マイクロ流体手段の1つまたは複数の部分を、1つまたは複数の選択された温度へと加熱および/または冷却する熱的手段と、イメージング手段によって生成された画像に関連するデータを記憶する手段を含む、各マイクロ流路の1つまたは複数の部分の内部のサンプル物質を画像化するイメージング手段とをさらに含む。別の実施形態では、このシステムは、イメージング手段によって生成された画像に関連するデータを処理して、PCR増幅および熱融解解析のうち少なくとも1つの結果に関連するデータを生成する処理手段をさらに備える。別の実施形態では、このシステムは、サンプル物質を導入する手段、サンプル物質を移動する手段、熱的手段、イメージング手段、及び処理手段の動作を制御する制御手段をさらに備える。別の実施形態では、イメージング手段は、マイクロ流路の内部のサンプル物質からの定められた波長の蛍光放射を検出するように構成されており、定められた励起波長の励起信号をマイクロ流路の一部分に導く手段と、マイクロ流路の一部分の内部のサンプル物質から、定められた放射波長の蛍光放射の画像を取得する手段とを備える。本発明のさらなる態様は、マイクロ流体デバイスのマイクロ流路の内部の反応の画像から熱融解データを解析するための、コンピュータで実施される方法で実施される。一実施形態では、この方法は、マイクロ流路の少なくとも一部分を照光するステップと、ピクセル配列のセンサーを用いて、マイクロ流路の照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を生成するステップであって、画像の各ピクセルがJPEG値を有するステップと、ピクセル配列のピクセルの一部分を含む対象領域ROIを定義するステップと、ROIのすべてのピクセルのJPEG値の平均をとることにより、マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の強度を計算するステップとを含む。別の実施形態では、各ピクセルは、第1の色の2つのサブピクセルおよび第2の色の1つのサブピクセルを有し、各ピクセルのJPEG値は2×第1の色のサブピクセル1×第2の色のサブピクセル/3として計算される。別の実施形態では、この方法は、ROIの少なくとも一部分を1つまたは複数のサブROIに分割すること、サブROIのすべてのピクセルのJPEG値の平均をとることにより、各サブROIの内部の蛍光強度を計算することをさらに含む。別の実施形態では、生成するステップは、CMOSセンサーを用いて遂行される。別の実施形態では、CMOSセンサーはデジタル一眼レフカメラを備える。別の実施形態では、この方法は、生成するステップと計算するステップとを、ある期間にわたって1回または複数回繰り返して、計算された蛍光強度の変化を、ある期間にわたって監視するステップをさらに含む。別の実施形態では、この方法は、マイクロ流路の照光された部分の内部の物質が発する蛍光の画像を2つの別々の時間に生成することにより、マイクロ流路の内部の流体流れを監視するステップと、画像のフィーチャが、1つの画像と次の画像の間で変位するのを検出するステップと、1つの画像から次の画像への時間の経過を計算するステップとをさらに含む。別の実施形態では、この方法は、マイクロ流路に隣接して配置された基準蛍光物質を照光するステップと、ピクセル配列のセンサーを用いて基準蛍光物質が発する蛍光の画像を生成するステップと、1つのROIがマイクロ流路の一部分を包含し、第2のROIが基準蛍光物質の一部分を包含する、少なくとも2つのROIを定義するステップとをさらに含む。別の実施形態では、この方法は、基準蛍光物質を包含するROIのすべてのピクセルのJPEG値の平均をとることにより、基準蛍光物質が発する蛍光の強度を計算すること、基準蛍光物質が発する蛍光の強度に基づいて、マイクロ流路の内部の物質が発する蛍光の強度を調節することをさらに含む。本発明のさらなる態様は、コンピュータで実施される、熱融解データを解析する方法で実施される。一実施形態では、この方法は、イメージングシステムを用いて、イメージングシステムによって生成されたJPEG画像をタイムスタンプとともに保存することにより、熱融解の画像データを時間の関数として記録すること、温度制御システムを用いて、温度データを時間の関数として記録すること、および静的記録信号をイメージングシステムへ送って、イメージングシステムに、熱融解が始まる前に静止画像データを記録させ、静止画像データの時間を記録し、そして、温度データを静止画像データの時間と同期させることにより、温度データを熱融解データと同期させることを含む。別の実施形態では、この方法は、熱融解の画像データと温度制御システムによって制御される加熱器とが同時にスタートするように、初期の加熱器信号が温度制御システムに送られるのと同時にイメージングシステムに静止画像信号を送ること、次いで、静止画像データの時間と、熱融解の画像データのJPEG画像のタイムスタンプおよび温度データを記録した時間との関係に基づいて、温度データと熱融解画像データを同期させることを含む。当業者には、本発明のこれらおよび他の特徴、態様および利点が、以下の詳細な説明、添付の特許請求の範囲および添付図面を考慮に入れた後に明らかになるであろう。添付図面は、本明細書に組み込まれて本明細書の一部分を形成するものであり、本発明の様々な実施形態を示す。これらの図面では、同じ参考番号は、同一の要素または機能的に類似した要素を示す。前述の‘230号公開、‘560号特許で説明されているシステム、および前述の‘124号特許で説明されているリアルタイムPCR構成など、1つまたは複数のマイクロ流路を有するマイクロ流体チップを使用する核酸解析用システムは、試験液の増幅産物および流速など、マイクロ流路を流れるサンプルの光学的に検出可能な特性を検出するためのイメージセンサーまたは光イメージングシステムを含む。各マイクロ流路を通って流れる試験液は、‘124号特許で説明されているように、分散媒によって分離された試料液の個々のボーラスの形態であってよい。図1は、本発明の様々な態様を具現するように構成することができる、複数の核酸分析を迅速に順次処理するためのシステム100を示すブロック図である。システム100は、マイクロ流体デバイス102を含んでよい。マイクロ流体デバイス102は、1つまたは複数のマイクロ流体流路104を含んでよい。示された実例では、デバイス102は、流路104aおよび流路104bの、2つのマイクロ流体流路を含む。例示的実施形態では2つの流路だけが示されているが、デバイス102は、2つ未満の流路または2つより多くの流路を有してよいように企図されている。例えば、いくつかの実施形態では、デバイス102は8つの流路104を含む。一実施形態では、デバイス102は、2つのDNA加工ゾーン、DNA増幅ゾーン131別称PCRゾーン131およびDNA熱融解ゾーン132を含んでよい。PCRゾーン131を通って進むDNAサンプルはPCRを受けてよく、熱融解ゾーン132を通過するDNAサンプルは高分解能熱融解を受けてよい。図1に示されるように、PCRゾーン131は流路104の第1の部分を含み、熱融解ゾーン132は、流路104の第1の部分から下流にある第2の部分を含む。デバイス102は、ストロー108も含んでよい。ストロー108は、中空チューブの形でよい。ストロー108は、注入口109に接続される近位端を有し、この注入口は、ストロー108の近位端を流路104に結合する。このシステムは、ストロー108の代わりに、またはストロー108に加えて、試薬および/またはサンプル混合物を、マイクロ流体カートリッジ102へと吸引し、混合し、かつ分配するための少なくとも1つのロボットのピペットを備える液体取扱いシステムを含んでよい。デバイス102は、注入口109に接続された共通の試薬ウェル106も含んでよい。デバイス102は、各流路104向けの遺伝子座特異の試薬ウェル105も含んでよい。例えば、示された実施形態では、デバイス102は、流路104aに接続された遺伝子座特異の試薬ウェル105aを含み、流路104bに接続された遺伝子座特異の試薬ウェル105bを含んでよい。デバイス102は、各流路104向けの廃棄物ウェル110も含んでよい。共通の試薬ウェル106に保管される溶液は、dNTP、ポリメラーゼ酵素、塩類、緩衝剤、表面安定剤、分子を検出する1つまたは複数の非特異性の蛍光DNA、流体マーカーなどを含んでよい。遺伝子座特異の試薬ウェル105に保管される溶液は、PCRプライマー、配列特異的蛍光DNAプローブまたはマーカー、塩類、緩衝剤、表面安定剤などを含んでよい。流路104へサンプル溶液を導入するために、システム100は、複数のウェル198を含むウェルプレート196を含んでよく、それらのうち少なくともいくつかはサンプル溶液例えば核酸サンプルを含む溶液を含む。示された実施形態では、ウェルプレート196は、主コントローラ130に接続されている位置決めシステム194に接続される。限定的でない一実施形態では、主コントローラ130は、テキサス州オースティンのNationalInstrumentsCorporationから入手可能な、PXI-8105コントローラを使用して実施することができる。限定的でない一実施形態では、位置決めシステム194は、ステッピング駆動の制御のためにウェルプレート196を位置決めするための位置決め装置例えばペンシルバニア州のParkerHannifinCorporationParkerから入手可能なMX80位置決め装置、位置決め装置を駆動するためのステップ駆動装置例えばParkerから入手可能なE-ACMicrosteppingDrive、およびコントローラ例えばParkerから入手可能な6K4コントローラを含んでよい。一実施形態では、流路104へサンプル溶液を導入するために、位置決めシステム194は、ウェル198のうちの1つに保管されたサンプル溶液にストロー108の遠位端が沈められるようにウェルプレート196を移動するように制御される。図1は、ウェル198nに保管されたサンプル溶液中に沈められている108の遠位端を示す。サンプル溶液を、ストローの上方へ、そして流路104内へ強制的に移動させるために、真空マニホールド112およびポンプ114が利用されてよい。真空マニホールド112は、デバイス102の一部分に動作可能に接続されてよく、ポンプ114は、マニホールド112に動作可能に接続されてよい。ポンプ114が起動されると、ポンプ114は圧力差を生成し例えばポンプ114は廃棄物ウェル110から空気を抜き取ることができる、ウェル198n内に保管されたサンプル溶液は、この圧力差によって、ストロー108を上方へ流れ、注入流路109を通って流路104の中へ流れる。そのうえ、この圧力差によって、ウェル106および105内の試薬が流路の中へ流れる。したがって、ポンプ114は、流路104を通してサンプル溶液およびリアルタイムPCR試薬を強制的に流すように機能する。図1に示されるように、融解ゾーン132はPCRゾーン131から下流に配置される。したがって、サンプル溶液は、まずPCRゾーンを通って流れ、次いで融解ゾーンを流れる。戻ってウェルプレート196を参照すると、ウェルプレート196は緩衝液ウェル198aを含んでよい。一実施形態では、緩衝液ウェル198aは緩衝液197を収容する。緩衝液197は、従来のリアルタイムRTPCR緩衝剤など、従来のPCR緩衝剤を含んでよい。従来のPCR緩衝剤は、例えばBio-RadLaboratories,Inc.、AppliedBiosystems、RocheDiagnostics他を含む複数の製造業者から入手可能である。緩衝液ウェル198aに緩衝液197を補充するために、システム100は、緩衝液保管容器190と、容器190からウェル198aへ緩衝液197を送るためのポンプ192とを含んでよい。そのうえ、ポンプ192は、ウェル198aに溶液197を追加するだけでなくウェル198aから溶液197を除去し、それによって溶液197を再循環させるように構成されてよい。‘124号特許で説明されている構成の1つでは、このシステムは試験液貯蔵器を含み、これは、前述のように、複数のウェル、各ウェルが例えば試験サンプルといった別々の試験液を含んでいるマイクロプレート196など、複数の試験液を含む貯蔵器でよい。このシステムは、分散媒貯蔵器をさらに含む。一実施形態では、この試験液は、必要なリアルタイムPCR試薬をすべて含んでいることを除けば、実質的に分散媒と同一である。リアルタイムPCR混合物は、PCRプライマー、dNTP、ポリメラーゼ酵素、塩分、緩衝剤、表面安定剤などを含んでよい。さらに、リアルタイムPCR試薬の混合物は、非特異性の蛍光DNAを検出する分子、配列特異的蛍光DNAプローブまたはマーカーを含んでよい。さらなる実施形態では、分散媒は、オイル、フッ素化された液体、またはその他の非水性もしくは疎水性の溶剤など、混合しない流体である。分散媒の目的は、物質が1つの試験ボーラスから別のボーラスへと移転するのを防止することである。分散媒の別の目的は、流路の中の流体流れを追跡するために用いられ得るボーラス間の識別可能な遷移をもたらすことである。一実施形態では、分散媒はマーカーを含んでよい。一実施形態では、試験液および分散媒は、主コントローラ130に制御されているスイッチ図示せずにより、分散媒および試験液が、マイクロ流路104a、104bの中に順次に交番して導入され、分散媒によって互いから分離された試験液の個々のボーラスを形成するように、マイクロ流路104a、104bの中に導入される。マイクロ流路104a、104bの中に導入される試験液および分散媒の体積は、マイクロ流路104a、104bによる試験液と分散媒の間の移動中の混合が最小限になるように選択される。したがって、それぞれが分散媒によって分離された別々の試験液のボーラスの、マイクロ流路104a、104bを通る連続的な移動の結果として、連続した多数の反応すなわち順次の反応が、マイクロ流路104a、104bのそれぞれの中で実行され得る。マイクロ流路104a、104bを通る分散媒および試験液ボーラスの流速は、マイクロ流路104a、104bの中の試験液ボーラスおよび分散媒の流速を調節するために、主コントローラ130の制御下のポンプ114によって制御される。流速は、試験液ボーラスがマイクロ流路104a、104bのPCRゾーン131を通るとき、所望数のPCRサイクルが遂行されるように調節されてよい。PCRゾーン131を流れるDNAサンプル向けのPCRを実現するためにサンプルの温度を循環させる必要があるが、これは当技術で周知のことである。したがって、いくつかの実施形態では、システム100は温度制御システム120を含む。温度制御システム120は、温度センサー、加熱器/冷却器および温度コントローラを含んでよい。いくつかの実施形態では、主コントローラ130がPCRゾーンおよび融解ゾーンを流れるサンプルの温度を制御することができるように、温度制御システム120が主コントローラ130とインターフェースされる。全体のマイクロチップ102に対して1つの温度制御システム120しか示されていないが、温度制御システム120は、例えば温度センサー、加熱器/冷却器および温度コントローラをそれぞれが備えている個別の温度制御サブシステムを、PCRゾーン131および融解ゾーン132向けに備えてよい。主コントローラ130は、グラフィカルユーザインターフェースを表示するための表示デバイスに接続されてよい。主コントローラ130はユーザ入力デバイス134に接続されてもよく、このデバイスによって、ユーザは、主コントローラ130へデータおよび命令を入力することができる。PCRゾーン131で生じるPCR処理および融解ゾーン132で生じる融解処理を監視するために、システム100はイメージングシステム118を含んでよい。イメージングシステム118は、励起源、画像取込みデバイス、コントローラおよび画像記憶装置を含んでよい。本発明の一実施形態によれば、イメージングシステム118は、一実施形態において既製のデジタル一眼レフDSLRカメラの一部分を備え得る大型CMOSセンサー例えば24mm×36mmなどを有するCMOSセンサーを備える。視界は、顕微鏡レンズを利用する従来システムよりはるかに大きく、マイクロ流体チップの全体の画像化を可能にする。イメージングシステム118は、マイクロ流体システムの流れ追跡および熱融解信号検出の両方に対して使用されてよい。流れ追跡の方法、すなわちマイクロ流路104a、104bを通る流速を測定する方法は、‘124号特許に説明されている。例えば、一実施形態では、平均流速は、流路からの反応依存性蛍光信号の順次画像を比較することによって測定される。第2の実施形態では、平均流速は、流路からの反応非依存性流れマーカーの順次画像を比較することによって測定される。より具体的には、このシステムは、流路の内容の1つまたは複数の画像を取得する。これらの画像データおよび取得時間は、後の解析のためにデータベースに記憶される。流体が、1つの画像から後続の画像へと流路に沿ってどれくらい遠くまで移動したのか求めるために、例えば流路からの反応依存性蛍光信号の順次画像または流路からの反応非依存性流れマーカーの順次画像といった、2つ以上の順次画像の特徴が比較されてよい。平均変位を経過時間で割ると、平均流速が得られる。別の実施形態では、反応非依存性流れマーカーからの散乱光は、波長スペクトルによって反応依存性蛍光から分解可能である。代替実施形態では、反応非依存性流れマーカーからの散乱光は、蛍光寿命に基づいて反応依存性蛍光から分解可能である。別の実施形態では、反応非依存性流れマーカーは、試験ボーラスの流れ分散を求めるのにさらに用いられる。さらなる実施形態では、反応依存性蛍光の画像が、PCRサイクルごとに少なくとも1回取得される。一実施形態では、反応依存性蛍光の画像は、1つのPCRサイクルの持続時間より短い時間スケールで流路の全長を走査することにより、順次に取得される。代替実施形態では、反応依存性蛍光の画像は、流路に沿った複数の点からの信号を同時に取得することによって取得される。別の実施形態では、流速測定は、流速を調節するためのフィードバックループの一部分である。さらなる実施形態では、流速は、サンプルのボーラスが、流路の定義された区間に入ってから出て来るのを検出することによって測定される。いくつかの実施形態では、求められた流速は、ポンプ114を制御するためのフィードバック流量制御ループにおいて、主コントローラ130によって入力として用いられてよい。より具体的には、本発明の一実施形態では、マイクロ流体チップの高分解能熱融解および流れ追跡に、デジタル一眼レフDSLRカメラが利用される。限定的でない実例では、DSLRカメラは、CanonEOS5DMarkIIであり得る。DSLRカメラは、適用可能であれば、例えば‘124号特許で説明されたようにリアルタイムPCR情報を取得するのにも適切である。通常、デジタルカメラは、RAWフォーマットまたはJPEGフォーマットで画像を保存する。高速のフレームレートを実現するために、通常はJPEGフォーマットが採用される。限定的でない一実施形態では、DSLRカメラは、ベイヤーパターンBayerpattern各ピクセルにつき2つの緑色サブピクセル、1つの青色サブピクセル、1つの赤色サブピクセルに配置された5616×3744以上のピクセル配列を有する24mm×36mmのCMOSセンサーを有する。DNA熱融解の間中、長時間にわたって蛍光変化を記録するのに、高フレームレートが好ましい。一実施形態では、検出器は、例えば20~30フレーム/秒などのビデオフレームレートでデータを記録することができるデジタルカラーカメラであり得る。例えばCanonEOS5DMarkIIなどの適切なDSLRカメラのライブビュー機能は、30fpsのフレームレートを提供する。もちろん、特定の実施形態では、より高いフレームレートまたはより低いフレームレートを有する適切なDSLRカメラも同様に使用されてよい。限定的でない実例では、ライブビュー機能からのファイルが、次の2つの解像度の選択肢を伴ってJPEGフォーマットで保存される。a.サブサンプリングされたピクセルを有するフルセンサー画像。画像サイズ1024×6801倍ズーム。b.フルピクセル解像度を有するセンサー群。画像サイズ1120×7525倍ズーム。一実施形態では、1倍ズームは、PCRおよび熱融解が生じるマイクロ流体チップの各部分と、液体処理のためのマイクロ流体チップに結合されるインターフェースチップの一部分とを含み得る比較的大きな領域を低下されたピクセル密度で画像化するので、流れ追跡用には1倍ズームが用いられる。一実施形態では、マイクロ流体チップの小部分の解像度の向上詳細が必要とされる熱融解検出用には、5倍ズームが用いられる。好ましい実施形態では、画像化された領域のピクセルがすべて保存されるので、より優れた信号対雑音比SNRを実現することができる。他の実施形態では、流れ追跡または熱融解検出のいずれかに対して様々なズーム値を用いてよい。JPEG画像フォーマットは、8ビットの解像度、すなわち各ピクセルにつき256のデジタルレベルを提供する。いくつかの実施形態では、8ビットを上回る解像度を実現するために、対象領域ROIの多くのピクセルの平均をとることにより、より大きなビット深度が実現され得る。‘560号特許で説明されているように、センサーのピクセル配列は、特定のROIに対応する対象ゾーンへと分割されてよい。すなわち、イメージセンサーは、ピクセル配列の所定の部分を読み出す能力または窓を付けるwindow能力これはウィンドウイングwindowingとして知られているを有する。熱融解の画像化のために、マイクロ流路104a、104bの融解ゾーン132は、高出力LEDで均一に照光されて約1:1の比でCMOSセンサーの中に画像化される。熱融解が測定される融解ゾーン132では、蛍光強度が、ROIのすべてのピクセルのJPEG値の平均をとることによって計算される。一実施形態では、蛍光強度は、2000個を上回る数のピクセルのJPEG値の平均をとることによって計算される。多数のピクセルを有するROIのピクセルのJPEG値8ビットの平均をとることにより、11ビットより優れた解像度が実現され得る。ROIのピクセルの平均をとることからの別の利益には、信号対雑音比SNRの改善がある。LCGreen高分解能融解のために用いられるDNA結合染料からの蛍光は、CMOSセンサーの緑色ピクセルと青色ピクセルによってほぼ等しく感知される。したがって、センサーの特定のピクセル上の蛍光強度を表すのに、緑色ピクセルと青色ピクセルの平均が用いられる。一実施形態によるセンサーの前のベイヤーフィルタBayerfilterは、各ピクセルに2つの緑色ピクセルおよび1つの青色ピクセルがある。したがって次式となる。ピクセルの蛍光強度=2×Green1×Blue/3。実際には、GreenとBlueのウェイトは、別のカメラ設定によって2:1の比から外れてもよい。GreenとBlueの比に対して影響を及ぼすことができるこのような設定の1つには、ホワイトバランスがある。ホワイトバランスは、画像を様々な照明状態に適応させるように、緑色、青色、および赤色のピクセルのJPEG値を操作する。SNRを測定基準として用いて、ホワイトバランス設定および緑色と青色の比の最適化された状態を計算する、または測定することが可能になり得る。本発明の一実施形態によるイメージングシステム10が、図2および図3に示されている。イメージングシステム10は、一実施形態では例えばCanonEOS5DMarkIIなどのDSLRカメラといったカメラ12の本体14の中に収容されたCMOSセンサー36と、1つまたは複数のレンズ32を含んでいる鏡筒16とを含む。本発明の実施形態では、イメージングシステム10は、熱融解測定および流れ追跡用に使用され得る。一実施形態では、イメージングシステム10は、流れ追跡および熱融解解析のために、毎秒複数の画像を生成して記録するように構成される。例えば、CanonEOS5DMarkIIは、ボーラスがマイクロ流体流路の中を流れている間に流れを追跡するために、約1HzでJPEG画像を生成して記録するのに用いられるライブビューモードを含む。ライブビューモードは、リアルタイムPCRのためにも用いられ得る。特定の実施形態では、熱融解のデータを記録するために、JPEGファイルなどの画像は、約30Hzのレートにて約33ミリ秒の積分時間すなわち積分時間間隔は周波数の逆数として計算されるで記録される。動作環境およびハードウェアの能力次第で、他のフレームレートおよび対応する積分時間間隔を用いてもよいが、フレームレートは、好ましくは10Hz以上である。一実施形態では、より優れた光子収集のために、市販のF/1.2レンズを使用してよい。F/がより小さいレンズは、より高度な光収集能力を有する。レンズ16と画像化されるマイクロ流体チップの間の距離をできるだけ近くするために、延長チューブ15、13が使用されてよい。光収集は、レンズと蛍光源の間の距離の2乗に比例する。一実施形態では、延長チューブは、25mmおよび12mmの長さを有し、延長部の合計の長さが37mmになり、これは、レンズ16と画像化されるマイクロ流体チップの間の距離を約6cm程度に近づけることができる。例えば25mmおよび25mmなどの、他の延長チューブ長さが使用されてもよい。さらに、2つ未満または2つより多くの延長チューブを使用することができる。例えば、他の実施形態は、25mm、25mmおよび12mmの3本の延長チューブまたは25mm、25mmおよび25mmの3本の延長チューブを含んでよい。延長チューブがより長ければ、レンズとマイクロ流体チップの間の距離がより短くなり、より多くの光をレンズに入れることができ、センサー上の画像もより大きくなり得る。延長チューブの選択は、具体的な機械的設計および視野の配慮に依拠してよい。延長チューブを使用することの代案として、マイクロ流体チップ内のサンプル物質のより近くへレンズを移動して、より大きな画像をもたらすという同じ目標を達成するのに、レンズの組合せを使用してもよい。センサーは、デュアルバンド放射フィルタ34を含んでよく、同フィルタは、選択された波長だけがセンサーに到達し得るように、延長チューブ15、13のうちの1つに取り付けられてよい。一実施形態では、フィルタは、LCGreenおよびAlexa647またはTexasRedの追跡染料からの蛍光だけがセンサーに到達し得るように構成される。例示の一実施形態では、放射フィルタは、IdahoTechnologyのDNA結合染料LCGreenPlus向けの通過帯域と、LifeTechnologiesのAlcxaFluor647などの赤色流れ追跡染料向けの通過帯域とを有するデュアルバンドパスフィルタである。しかし、蛍光染料の適切な代替の組合せ向けに代替フィルタが置換されてよい。LCGreenからの蛍光は、CMOSセンサーの青色ピクセルと緑色ピクセルの両方で感知される青緑色を有する。しかし、カメラの緑色フィルタが青色光子を遮断し、カメラの青色フィルタが緑色光子を遮断するので、光子の少なくとも半分がいずれのフィルタによって除去される。一実施形態では、フィルタが、例えば青緑色の波長へとシフトされたスペクトルを有し、したがって、すべての光子がフィルタを通ってセンサーのピクセルに到達する。カメラの赤色フィルタは不変に保つことができるので、デュアルカラーセンサーは、2つの別々の染料を用いて、引き続き流れ追跡と熱融解検出の両方を行なうことができる。一実施形態では、イメージングシステム10は、マイクロ流体チップの照明用にLED1、LED2、LED3、LED4の4つを含む。これらのLEDは、リアルタイムPCR中の増幅産物と、熱融解解析中の解離挙動とを検出するため、ならびに/あるいはマイクロ流路104aおよび/または104bの中の試験液の流速を監視するように存在し得るマーカーを検出するために用いられるラベルを励起するために、所望の波長で光を生成する励起源である。上記で説明されたように、チップのPCRゾーン131はPCR用であり、融解ゾーン132は熱融解用である。イメージングデバイス10の、センサー12およびLED1、LED2、LED3、LED4のレイアウトの実施形態が、図2および図3に示されている。図2は、センサー例えばカメラ12およびLEDレイアウトを含むイメージングデバイス10の説明である。図示された実施形態に示されるように、LED1、LED2、LED3、LED4は、レンズ16のまわりに、90°の角度間隔で、1つまたは複数のレンズ16鏡筒に隣接して配置されている。LED2とLED3は、レンズ16に関して相対して配置されており、LED1とLED4は、レンズ16に関して相対して配置されている。例示的実施形態では、LED1は、スロット開口およびイメージングレンズを有するアセンブリを備え、融解ゾーン132熱融解の照明用に配置され、かつ配向されている。LED2およびLED3は、PCRゾーン131PCRの加熱器の較正のために配置され、かつ配向されており、また、必要に応じてゾーン131のPCRプロセスおよび融解を監視するのに使用することができる。LED4は、全体のチップ102の流れ追跡染料を励起するように配置され、かつ配向されている。一実施形態では、目標は、LED4の照明をPCRゾーン132に限定して、熱融解を行なうとき融解ゾーン131の光退色を防止することである。図4は、一実施形態による、融解ゾーン132のLEDLED1アセンブリの概略図である。図4に示されるように、LED1は、実際には、LED30と、マスク28と、フィルタ26と、光学軸22に沿って整列したレンズ24とを含むアセンブリである。マスク28は、LED30からの照明を、マイクロ流体チップ102の熱融解ゾーン132に限定するためのスロットを含んでいる。フィルタ26は、チップ102に導かれる励起光のスペクトル成分を制御し、レンズ24は、融解ゾーン132上への光の帯域を画像化する。融解ゾーン132は、LEDアセンブリ1のマスク28からの帯状光で照光される。このLED青色LEDは、PCRゾーン131の染料の光退色を防止するように、帯状光を用いて融解ゾーン132のみを照光する。このアセンブリは、ヒートシンクおよびファンも含んでよい。一実施形態では、ゾーン131における加熱器較正用のLCGreenを励起するために、2つの高性能の青色LED2、3がPCRゾーン131の両側に設置される。1つまたは複数のマイクロ流路を有するマイクロ流体チップを使用する核酸解析用システムの一実施形態では、加熱素子は、例えば米国特許出願公開第2009-0248349号のMicrofluidicDeviceswithIntegratedResistiveHeaterElectrodesIncludingSystemsandMethodsforControllingandMeasuringtheTemperatureofSuchHeaterElectrodesおよび米国特許出願公開第2011-0048547号のMicrofluidicsystemsandmethodsforthermalcontrolに開示されているような、マイクロ流路に隣接して配置された金属ワイヤまたはフィラメントを備えてよく、これらの開示の全体が、参照によってここで組み込まれる。一実施形態では、PCRゾーン131における加熱要素によって影が生じるのを防止するために、LED2とLED3が、マイクロ流体チップ102の両側に配置される。さらに、LED2およびLED3のこの配置により、すべての流路にわたってより均一な照明が生じる。加熱器の較正は、マイクロ流路104a、104bに、既知の核酸濃度を有する物質を通し、LED1を用いて融解ゾーン132を照光して、既知の核酸濃度に対して予期された熱融解曲線と比較する熱融解曲線とを生成することによって遂行され得る。いくつかの実施形態では、LED2およびLED3は、ゾーン131におけるPCRおよび熱融解を監視するのにも使用されてよい。一実施形態では、LED4赤色LEDは、流れ追跡に使用され得る全体のチップ102を照光する。好ましい実施形態では、LED1、LED2、LED3、LED4のすべておよびセンサー12は上向きであり、マイクロ流体チップ102の透明な側は下向きである。この配置により、液体取扱いシステム例えばロボットのピペットがチップ102の上の空間を利用することに対する障害を、最小限にすることができる。好ましい実施形態では、LED1、LED2、LED3、LED4は、イメージングシステム118のコントローラおよび/または限定的でない実例ではNationalInstrumentsのLabviewで書かれた制御アルゴリズムを実行する主コントローラ130によって制御される。当業者に既知の他の制御アルゴリズムも用いられ得る。イメージングシステム10のCMOSセンサーは、DSLRカメラでなくてもよいことが理解される。本発明の実施形態では、イメージングシステム10のCMOSセンサーは、本明細書に説明された特性を有する別の適切なセンサーであり得る。特定の実施形態では、加熱器が均一でないとき、融解ゾーン132の小部分のみをROI熱的に均一な部分として用いてよい。一般に、融解ゾーン132の均一な部分は、較正された加熱素子で加熱された融解ゾーン132の部分に相当し、融解ゾーン132の不均一な周辺部分は、較正されていない加熱素子を含んでいる。不均一な加熱条件下では、融解ゾーン132の不均一なROI部分を、それぞれが均一な温度を有することができるほど十分に小さいいくつかのより小さなサブROIに分割することにより、より大きく効果的なROIを生成することができる。いくつかの実施形態では、それぞれの小さなサブROIに対して融解曲線がプロットされ、次いで、較正されていないサブROIの融解曲線を、融解ゾーン132の較正された部分のROIの融解曲線と関連づけるために、ROIの温度較正された領域へと数学的にシフトする。より大きく効果的なROIを用いて、SNRを改善することができる。あるいは、加熱器が較正される一実施形態では、加熱器の均一に加熱された区間にわたるROIが用いられるので、この特定のROIの温度は、較正されて正確なものであると想定することができる。加熱器の縁端部は、通常、較正されたROIとは異なる温度を有する。加熱器の縁端部の領域と較正されたROIの間の温度差は、計算することができる。例えば、較正されたROIの中の物質が70°Cで融解し、縁端部における物質が80°CROIを用いて較正された加熱器温度の読取り値で融解するとき、縁端部は、較正されたROIより、温度が10°C低いことが分かる。加熱器の縁端部は後に融解することになるが、温度差データを用いて温度軸を調節することができる。したがって、加熱器の縁端部は、較正されたROIと同一の温度軸を有し得る。加熱器に沿ったより多くのROIの融解曲線が、較正されたROIへとシフトされ得て、より優れたSNRを有する融解曲線を生成するために積算される。光源からの変動を識別して除去することができるように、基準蛍光物質は、サンプルの近くにサンプルからの蛍光と干渉しないように設置されてよい。すなわち、サンプル物質から測定された蛍光信号を補正することができるように、基準蛍光物質の予期された蛍光信号からの変動が識別され得る。さらに、システムをデバッグするときに、歪みが光源に由来するのかそれとも加熱器に由来するのか識別するために、基準蛍光物質が用いられてよい。すなわち、基準蛍光物質とサンプル物質の両方が示す歪みは、恐らく励起光源の歪みによるものであるが、基準蛍光物質ではなくサンプル物質が示す歪みは、恐らく加熱器の歪みによるものである。このような基準物質は、イメージングシステム10によって励起して検出することができる任意の蛍光物質であり得る。適切な、限定的でない実例には、Sytoxblue、CFP、Alexa647、Cy5、BODIPY650/665、または様々な量子ドットが含まれる。さらに、蛍光基準としてマイクロ流体器具のプラスチックも用いられてよい。一実施形態では、マイクロ流体チップとヒートシンクを結合するのに用いられる接着剤例えばペンシルバニア州ハットフィールドのSummersOpticalから入手可能なLensBondTypeSK-9を基準として用いることができる。基準蛍光物質は、温度に依拠するように選択することができる。このような基準蛍光物質を用いて、加熱器の変動を識別して除去することができる。例えば、温度に左右される蛍光強度を有する適切な物質AlexaFluor647、フルオレセインなどのほとんどの染料の蛍光強度は温度に左右されるが選択されたとき、基準染料の蛍光を用いて、加熱器の温度変動を監視することができる。加熱器の温度が変化するとき、基準染料の蛍光強度が温度変化に追従することになる。基準物質が十分な強度および面積を有するとき、基準物質測定からの蛍光信号は十分なSNRを有することになるため、加熱器の温度変動が蛍光強度の変化に反映され得る。このために、特定の実施形態では、基準物質は加熱器に十分近く配置されてよい。温度依存性は、測定下のサンプルと同一でなくてもよい。いくつかの実施形態では、サンプルの蛍光と基準蛍光の両方を測定するのに必要な検出器は1つだけである。一実施形態では、熱融解データは、イメージングシステム118によって時間の関数として記録されるそれらの時間スタンプをファイル名としてJPEGが保存される。温度も、温度制御システム120により、時間の関数として記録される。これによって、画像対時間データの組および温度対時間データの組といった2つのデータの組が生成される。好ましくは、これら2組のデータは、正確な融解温度を与えるために正確に同期される。2つの独立したデータの組を同期させるのに、多くのやり方がある。DSLRを用いる一実施形態では、静止画像を得るために、熱融解が始まる直前に、PCからカメラの遠隔撮影の制御ポートに信号を送ることができる。例えば、初期の加熱器信号が送られるのと同時に静止画像信号を送ることができる。したがって、画像と加熱器の両方が同一の開始時刻を有することになる。静止画像が取得される時間は、PC時間温度時間およびカメラのライブビュー画像のタイムスタンプの両方と既知の関係があるので、温度と画像は、場合によっては30ミリ秒未満の分解能で同期させることができる。均一な対象を画像化するとき、通常、画像は理想的に均一なものではない。中心は縁端部より高い強度を有するはずである。融解データをより優れたものにするために、マイクロ流体チップは、融解ゾーン132ここで熱融解が起こるが画像の中心にできるだけ接近するように移動され得る。本発明の態様は、制御および計算のハードウェア構成要素、ユーザが作成したソフトウェア、データ入力構成要素、およびデータ出力構成要素によって実現される。ハードウェア構成要素は、1つまたは複数の入力値を受け取り、入力値を操作して、または入力値に作用して、1つまたは複数の出力値を出力するための命令を与える、固定機械可読媒体に記憶された1つまたは複数のアルゴリズム例えばソフトウェアを実行することによって計算および/または制御のステップを遂げるように構成された主コントローラ130など、マイクロプロセッサおよびコンピュータなど、計算および制御のモジュールを含む。このような出力は、例えば表示デバイス132に表示されてよく、そうでなければ、ユーザに対して、例えば機器の状態またはそれによって遂行されているプロセスに関する情報といった情報を提供するために、ユーザに示されてよく、あるいは、このような出力は、他のプロセスおよび/または制御アルゴリズムに対する入力を含んでよい。データ入力構成要素が備える要素により、制御および計算のハードウェア構成要素が用いるデータが入力される。このようなデータ入力は、位置センサーおよび電動機エンコーダと、キーボード、タッチスクリーン、マイクロホン、スイッチ、手動操作スキャナなどといったユーザ入力デバイス134による手動入力要素とを含んでよい。データ出力構成要素は、ハードドライブまたは他の記憶媒体、モニタ、プリンタ、表示灯、または可聴信号要素例えばブザー、警笛、ベルなどを備えてよい。ソフトウェアは、固定コンピュータ可読媒体に記憶された命令を含み、制御および計算のハードウェアは、これらの命令を実行することにより、1つまたは複数の自動プロセスまたは半自動プロセスを遂行する。本発明の実施形態が、上記で図面を参照しながら十分に説明されてきた。本発明が、特徴の様々な組合せおよび副次的組合せを含む特定の例示的実施形態を参照しながら、かなり詳細に説明され、示されてきたが、当業者なら、他の実施形態および変形形態および変更形態が本発明の範囲内に包含されるものと容易に理解するであろう。そのうえ、このような実施形態、組合せ、および副次的組合せの説明は、本発明が、特許請求の範囲で明白に列挙されたもの以外の特徴または特徴の組合せを必要とすると示唆するようには意図されていない。したがって、本発明は、以下の添付の特許請求の範囲の趣旨および範囲内に包含されるすべての変更形態および変形形態を含むものと認められる。"