"微生物によって引き起こされる病原性感染を処置し、軽減し、又は予防する化合物を特定する方法であって、その方法が、apqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体を提供する工程、bpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体を試験化合物と接触させる工程、c試験化合物のpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体への結合を決定する工程を含んでなり、上記において、試験化合物がpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体に結合するときに、試験化合物を、病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防するために有用な可能性のある化合物として特定することを特徴とする、前記方法。試験化合物のpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体への結合を決定することが、PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の活性を決定することを含んでなり、PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の活性の低下が前記試験システムにおいてコントロールと比較して検出されるときに、試験化合物を、病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防するために有用な可能性のある化合物として特定することを特徴とする、請求項1に記載の方法。pqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体が、シュードモナス種、特にシュードモナスエルジノーサに由来する、請求項1又は2に記載の方法。PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の活性を、PqsDタンパク質の基質の生成物への変換を測定することによって決定する、請求項2又は3に記載の方法。前記基質がアントラニロイル-CoA及び/又は3-オキソ-C4-C23アルカン酸であり、そして生成物が4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリンである、請求項4に記載の方法。3-オキソ-C4-C23アルカン酸が、3-オキソデカン酸であり、生成物がHHQ4-ヒドロキシ-2-ヘプチルキノリンである、請求項5に記載の方法。アントラニロイル-CoAが、2-アミノ安息香酸-CoAリガーゼ又はその機能的断片若しくは変異体の使用によってアントラニル酸から合成される、請求項5又は6に記載の方法。前記方法がインビトロでの方法である、請求項1~7のいずれか1項に記載の方法。前記方法が自動化フォーマット、特にハイスループットフォーマットにおいて行われる、請求項1~8のいずれか1項に記載の方法。微生物によって引き起こされる病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するために有用な化合物を特定するための、pqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の使用。微生物がバイオフィルムを形成する、請求項1~9のいずれか1項に記載の方法、又は請求項10に記載の使用。バイオフィルムが、カテーテル、薬剤、薬物ポンプ、又はプロステーシスの上、又はそれらの中に形成される、請求項11に記載の方法又は使用。微生物が、シュードモナス、特にシュードモナスエルジノーサである、請求項1~9、11若しくは12のいずれか1項に記載の方法、又は請求項10~12のいずれか1項に記載の使用。薬剤を製造する方法であって、その方法が、a請求項1~9、又は11~13のいずれか1項に記載の方法を行って、試験化合物を特定する工程、b十分な量の試験化合物を提供する工程、c試験化合物を製薬学的に許容される担体又は補助物質と製剤化する工程を含んでなる、前記方法。請求項1又は請求項11~13のいずれか1項に定義されている、微生物によって引き起こされる病原性感染の処置において使用するための2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸。従って、この発明は、第一の局面では、微生物によって引き起こされる病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防する化合物を特定する方法であって、その方法が、apqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片functionalfragment若しくは変異体を提供する工程、bpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体を試験化合物と接触させる工程、c試験化合物のpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体への結合を決定する工程を含んでなり、上記において、試験化合物がpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体に結合するときに、試験化合物を、病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防するために有用な可能性のある化合物として特定することを特徴とする、前記方法を提供する。この発明は、本発明の第二の局面では、試験化合物のpqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体への結合を決定することが、PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の活性を決定することを含んでなり、試験化合物がこの試験システムにおいて、コントロールと比較して、PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体の活性の低下が検出されるときに、試験化合物を、病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防するために有用な可能性のある化合物として特定する方法を提供する。この発明の第一及び第二の局面の試験システムは、HAQsの生合成、特にHHQの生合成、又はPQSの生合成に関与するメカニズムを解明するために使用することができる。具体的には、この試験システムは、HAQの生合成、特にHHQの生合成、又はPQSの生合成の阻害に関与している、あるいは病原性感染に関連している、あるいは病原性感染を処置し、軽減させ、又は予防するために有用である化合物を開発し、特定し、及び/又は特徴付けるために使用することができる。こうした化合物は、PqsD核酸又はPqsDタンパク質、又はその断片若しくは変異体と相互作用し、特にそれらを不活性化する。特定された化合物は、病原性感染の処置に使用することができる注意を引き付ける治療薬でありうる。用語微生物によって引き起こされる病原性感染pathogenicinfectioncausedbyamicroorganismは、その宿主において疾患を引き起こす感染性微生物による感染を含む。感染は、外来種による宿主微生物の有害なコロニー形成である。感染では、感染微生物infectingorganismは、通例、宿主を犠牲にして増殖するために宿主の資源を活用しようとする。感染微生物は、宿主の正常な機能を妨害し、そして慢性的な傷、壊疽、感染した手足の喪失、及び死さえもたらしうる。感染に対する宿主の反応は炎症である。この発明では、感染する微生物は、クオラムセンシング分子によって制御される病原性因子の産生によって感染を媒介するクオラムセンシングを含み、かつ利用する。クオラムセンシングを利用する微生物は、シュードモナス属、バークホルデリア属、アルテロモナス属、ストレプトミセス属、ビブリオ属などの種に属する。クオラムセンシング分子は、ペプチド及びN-アシルホモセリンラクトンAHLからフラノン及びHAQsに至り、化学的に多様である。従って、この発明の実施態様では、この発明の方法に従って特定される化合物によって処置され、軽減され、又は予防される病原性感染は、クオラムセンシング分子であるHAQsを含む微生物によって引き起こされる。好ましい実施態様では、この微生物は、クオラムセンシング分子である、4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリン[ここで、アルキル鎖は、例えば、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル又はウンデシル基である]、好ましくは、HHQを産生する。更なる好ましい実施態様では、このHHQ分子は、PqsDタンパク質によって産生される。更なる好ましい実施態様では、この微生物は、シュードモナス属、又はバークホルデリア属又はアルテロモナス属の種であり、更に好ましくは、シュードモナス属の種であり、特に緑膿菌である。緑膿菌は、細菌のガンマプロテオバクテリア綱のメンバーである。これは、細菌科bacterialfamily、シュードモナス科シュードモナダセエ:Pseudomonadaceaeに属するグラム陰性好気性桿菌である。保存的マクロ分子例えば、16SリボソームRNAに基づく修正主義者の分類学以後、この科には、単に8つのグループに分かれるシュードモナス属genusPseudomonasのメンバーが含まれる。緑膿菌は、他に12のメンバーを含むそのグループのタイプ種である。属の他のメンバーのように、緑膿菌は土壌及び水中で通例見出される自由生活性細菌freelivingbacteriumである。緑膿菌は、臨床的関連で拡大している日和見性病原体としてますます認識されるようになっている。緑膿菌は日和見性病原体であり、これは宿主側の防御の休止を利用して感染を開始することを意味する。実際に、緑膿菌はヒトの日和見性病原体の典型である。細菌は、非易感染性組織uncompromisedtissuesに感染することはほとんどないが、それにもかかわらず、組織側防御がある種の形で易感染性である場合には、それが感染しえない組織はほとんどない。これは、特に重篤な熱傷に罹患している患者、及び免疫不全である癌及びAIDS患者において、尿路感染症、呼吸系感染症、皮膚炎、軟組織感染症、菌血症、骨及び関節感染症、消化器系感染症及び種々の全身感染症を引き起こす。緑膿菌感染は一般に、長期間の抗生物質治療の使用にもかかわらず、長く持続する。このことは、一つには、緑膿菌がエキソポリサッカライドマトリクスに埋め込まれた細菌集団から成る抗生物質抵抗性のバイオフィルムを形成するという事実によるものである。緑膿菌によって引き起こされるもう一つの問題は、ヒトの体の中で留置メディカルデバイス上にバイオフィルムが形成されることに関連していると理解されていることである。従って、好ましい実施態様では、緑膿菌によって引き起こされるあらゆる疾患は、この発明の意味で、処置され、軽減され、又は予防される。一実施態様では、上記に定義した感染微生物は、感染個体内で微生物バイオフィルムを形成する。バイオフィルムは、肺などの、微生物によってコロニーが作成される器官内に発生する場合がありうる。バイオフィルムはまた、カテーテル、埋め込み型薬物送達システム、又は、コンタクトレンズ、中心静脈カテーテル及びニードルレスコネクターneedlelessconnectors、気管内チューブ、子宮内避妊器具、人工心臓弁mechanicalheartvalves、ペースメーカー、腹膜透析カテーテル、人工関節prostheticjoints、中耳腔換気用チューブ、尿道カテーテル、及びボイスプロステーシスvoiceprosthesesを含むプロステーシスprothesis又はインプラントなどの留置するメディカルデバイスの上、又はそれらの中にも生じる場合もありうる。バイオフィルムは、細胞が互いに、及び/又は表面に付着する微生物の集合体である。こうした付着した細胞は、細胞外高分子物質extracellularpolymericsubstanceEPSが自己生産したマトリクス内に頻繁に埋め込まれる。スライムslimeとも呼ばれる、バイオフィルムEPSは一般に、細胞外DNA、タンパク質、及びポリサッカライドから構成される種々の形状の高分子集塊である。バイオフィルムは、生きているか、又は生きていない表面上に形成されえ、そして自然的な、工業的な、及び病院のセッティング中、微生物生命の通常よく見られる状態である。留置されているメディカルデバイスに接しているバイオフィルムは、グラム陽性菌、又はグラム陰性菌でも、あるいは酵母から構成されうる。こうしたデバイスから一般的に単離された細菌には、グラム陽性菌である、エンテロコッカスフェカリスEnterococcusfaecalis、スタフィロコッカスアウレウスStaphylococcusaureus、スタフィロコッカスエピデルミディスStaphylococcusepidermidis、及びストレプトコッカスビリダンスStreptococcusviridans;及びグラム陰性菌である、エッシェリキアコリEscherichiacoli、クレブシエラニューモニエKlebsiellapneumoniae、プロテウスミラビリスProteusmirabilis、及びシュードモナスエルジノーサ緑膿菌:Pseudomonasaeruginosaが含まれる。こうした微生物は、患者又は医療従事者の皮膚、入口が曝されている水道水、又は他の環境における起源に由来しうる。バイオフィルムは、デバイス及び患者のその使用継続期間に応じて単一種又は多数の種から構成されうる。カテーテルは、体腔、導管、又は管に挿入することができるチューブである。それによって、カテーテルは、排液、液体注入、又は外科器具によるアクセスを可能にする。大部分の使用の場合、カテーテルは、薄い、しなやかなチューブ軟性softカテーテルであるが、但しある種の使用では、カテーテルはより大きく、硬質solidハードhardカテーテルである。一時的に、あるいは恒久的に体内に残しておくカテーテルは、留置するカテーテルと呼ばれうる。恒久的に挿入されたカテーテルは、パームキャスpermcathと呼ぶ場合もある。体の特定の部分中へのカテーテルの配置によって、膀胱からの排尿;腎臓からの排尿;液貯留の排出などが可能になる。埋め込み型薬物送達システムは、薬物を送達するために使用するデバイスである。実例としては、慢性疼痛又は重篤な痙攣の処置のための薬物又は薬物ポンプがある。薬物送達システムは当技術分野で知られている。プロステーシスprosthesisは、欠落した体の部分に取って代わる人工補充部分artificialextensionである。プロステーシスは通例、損傷によって失われた部分、又は生まれたときから欠落している部分に取って代わるために、あるいは欠陥のある体の部分を補充するために使用される。体外のプロステーシスは、体外プロステーシスexoprosthesesと呼ばれ、一方、体の内部のプロステーシスは、体内プロステーシスendoprostheses又はインプラント埋め込み物と呼ばれる。人工股関節又は膝プロステーシスkneeprosthesesは、古典的な体内プロステーシスであり、これはインプラントとも呼ばれる場合もある。体から突き出ているオープンインプラントopenimplantとは対照的に、完全に体によって囲まれているクローズドインプラントclosedimplantが知られている。最も有名なインプラントは、歯科インプラントである。体組織の内部では、人工心臓弁が人工心臓及び人口肺と共に通例使用されており、そして活発な技術進歩のもとにある。プロステーシスと見なされうる他のメディカルデバイス及び補助器具には、人工眼球、口蓋塞栓子、胃バンドgastricbands及び義歯が含まれる。現在まで、プロステーシス及びインプラントなどの留置メディカルデバイス上のバイオフィルムは、体からデバイスを除去すること、デバイスから汚れを取り除くこと例えば、熱滅菌、及び体の中にデバイスを再び導入することによって除去することのみを行なうことが可能である。従って、本発明の実施態様では、化合物は、器官内、あるいは上記に言及したような留置するデバイス上又は留置するデバイス内にバイオフィルムを形成し、PqsDタンパク質を含む感染性微生物によって引き起こされる病原性感染を、処置し、軽減し、又は予防するために特定される。好ましくは、バイオフィルムは、唯一の、又は更なる成分として、シュードモナス種、特に緑膿菌を含む。用語病原性感染を処置し、軽減し又は予防することtreatingreducingorpreventingapathogenicinfectionは、最も広い意味で使用され、治療処置と、予防又は防止手段の双方を意味し、上記においてその目的は、標的とする病的な状態又は障害を防止し、又は緩和させることである。より詳細には、処置し、軽減し又は予防することは、病原性感染の病状の進行を防止し、あるいは病原性感染の病状を変化させる意図をもってなされる介入である。この発明の第一及び第二の局面の方法の第一工程では、PqsDタンパク質、又はその機能的断片若しくは変異体が提供される。シュードモナス菌Pseudomonasでは、PqsDはキノロンシグナル生合成酵素として機能する。シュードモナスキノロンシグナルPQSである2-ヘプチル-3-ヒドロキシ-4-キノロンは、日和見性病原体である緑膿菌によって産生される細胞内アルキルキノロンシグナル伝達分子である。PQSは、トリプトファン経路の中間体である、アントラニラートanthranilateから合成される。アントラニラートは、4-ヒドロキシ-2-ヘプチルキノリンを含む多くのHAQsを作り出すのに関与しており、あるいは、そうでない場合には、中間のPQS前駆体、2-ヘプチル-4-キノロンHHQと呼ばれている、pqsABCDEオペロンによってコードされる酵素及びPqsHによってPQSに変換される。エキスポートされたHHQExportedHHQは、隣接する細菌細胞によって取り込まれ、そしてPqsHによってPQSに変換されるモノオキシゲナーゼが想定される。これに加えて、PQSは、PqsRMvfRとの直接的相互作用を介してpqsABCDEの発現を推進することによってそれ自身の産生を調節する。唯一の生化学的に特徴付けられる反応では、PqsAは、それがPqsDのCys112に転送される、アントラニラートをPqsD活性部位に往復して輸送するshuttle活性化されたアントラニロイル-CoAチオエステルを形成する。次いで、アントラニロイル-PqsDとマロニル-CoA又はマロニル-ACP第二のPqsD基質間で縮合が起こり、2,4-ジヒドロキシキノリンDHQを形成する。しかしながら、PqsDがPQSなどの他のアルキルキノロンの生合成において果たしている役割は、依然として不明のままである。PqsD-アントラニラート共有結合中間体、及びアントラニラートと複合した、不活性な、Cys112Ala活性部位の変異体のキャラクタリゼーションを含めて、酵素のいくつかの結晶構造を含むPqsDの構造的及び生物物理学キャラクタリゼーションが報告されてきた。このキャラクタリゼーションによって、PqsDは、FabH及び脂肪酸のカルコンシンターゼファミリー及びポリケチドシンターゼに構造的に似ていることが示された。この結晶学的に非対称ユニットは、PqsDダイマーを含む。PqsDモノマーは、2つのほとんど同一な、およそ170残基のアルファベータアルファベータアルファαβαβαドメインalphabetaalphabetaalphadomainsから構成されている。この構造は、アントラニラートによってリガンドされたanthranilateligandedCys112が、およそ15Åの長さのチャネルの下部にタンパク質インテリアproteininterior中深く位置し、一方、第二のアントラニロイル-CoA分子は、タンパク質表面に繋がっている裂け目にウェイティングwaitingしていることを示している。Cys112、His257及びAsn287は、PqsDのFabH様触媒三残基を形成する。C112A変異体は、アントラニロイル-CoAに依然として可逆的に結合するが、不活性である。更に、PqsD活性部位空洞が、HHQの形成に必要であるであろう3-オキソデカノイル-ACPなどの基質を処理するには不十分であるようであることが報告されている。それ故、彼らは、PqsDは、HHQの生合成に関与していない可能性があることと結論付けているBeraAKetalBiochemistry20094886448655。PqsD配列は、アクセッション番号ABJ10163.1配列番号:1SEQIDNO1のもとで、NCBINationalCentreforBiotechnologyInformationNationalLibraryofMedicine38ABethesdaMD20894USAwwwncbinihgovから入手可能である。このタンパク質は、337アミノ酸から成る最初のメチオニン残基を含む。緑膿菌UCBPP-PA14のコンプリートゲノムが、シーケンシングされた。この配列は、アクセッション番号NC_008463のもとでNCBIから入手可能である:このpqsd遺伝子は、アイデンティフィケーション識別番号GeneID:4379983のもとで特定される。緑膿菌UCBPP-PA14は、熱傷患者から得られた、様々な遺伝的に扱いやすいモデル宿主及びマウスにおいて病原性を示す臨床分離株である。驚くべきことに、PqsDタンパク質が、アントラニロイル-CoAと3-オキソデカン酸が反応してHHQになる反応を触媒するのに、PqsB又はPqsCなどの更なる酵素を必要とせずに、唯一の酵素として適しており、十分であることが現在見出された。この発明の意味では、PqsDタンパク質は、それが自然的条件下にて、好ましくは、アントラニロイル-CoAと3-オキソアルカン酸が反応して4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリンへ変換すること、より好ましくは、アントラニロイル-CoAと3-オキソC4-C23アルカン酸が反応して4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリンへ変換すること及び最も好ましくは、アントラニロイル-CoAと3-オキソデカン酸が反応してHHQへ変換することを触媒するあらゆる反応を触媒する。HAQsとして文献中に明示されている、少なくとも5つの異なったクラスすなわち、クラスA~Eの構造的に関連する分子が存在する。これらの生合成は、とりわけ、pqsABCDEオペロンの発現によって調節されている。この発明の方法によって生成される最も好ましい分子であるHHQ分子は、HAQ分子のA系列に属する。HAQ分子は、4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリンである。HHQは、キノリン環構造の2の位置にヘプチル基を持っていることによって特徴付けられる。A系列の他の知られているHAQsは、キノリン環構造の2の位置でのペンチル、ヘキシル、オクチル、ノニル又はウンデシル基によって、HHQと異なっている。A系列のHAQsの提案されている生化学的経路は、図2に提示されている。それによって、アントラニロイル-CoAと3-オキソアルカン酸が、異なる長さのアルキル鎖がキノリン環構造の2の位置にあるHAQに変換されることが提案されている。これは、アントラニロイル-CoA及び3-オキソデカン酸の変換によってキノリン環構造の2の位置にC7のアルキル鎖をもつHHQとなることが例示的に示されている。すなわち、この発明の文脈では、環構造の2の位置でのアルキル鎖の長さだけがHHQと異なっているHAQ分子が含まれている。従って、HAQ分子のアルキル鎖は、1~20の炭素原子から成り、より好ましくは5~11の炭素原子、そして最も好ましくは5、6、7、8、9又は11の炭素原子から成る。このアルキル鎖は、飽和していても、それとも不飽和であってもよく、好ましくは、それらは飽和している。このアルキル鎖は、直鎖状のアルキル鎖であっても、それとも分岐鎖状のアルキル鎖であってもよい。それらには、メチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシル、ウンデシル、ドデシルデュオデシル:duodecyl、トリデシルトレデシル:tredecyl、テトラデシルクアトルデシル:quattordecyl、ペンタデシルクインデシル:quindecyl、ヘキサデシルセスデシル:sesdecyl、ヘプタデシルセプトデシル:septdecyl、オクタデシルオクトデシル:octdecyl、ノナデシルノンデシル:nondecyl又はエイコシルがありえ、それらには立体異性コンホメーションはすべて属しうる。それらは、エチレン、プロピレン、ブチレン、ペンチレン、ヘキシレン、ヘプチレン、オクチレン、ノニレン、デシレン、ウンデシレン、ドデシレンデュオデシレン:duodecylen、トリデシレントレデシレン:tredecylen、テトラデシレンクアトルデシレン:quattordecylen、ペンタデシレンクインデシレン:quindecylen、ヘキサデシレンセスデシレン:sesdecylen、ヘプタデシレンセプトデシレン:septdecylen、オクタデシレンオクトデシレン:octdecylen、ノナデシレンノンデシレン:nondecylen又はエイコシレンがありえ、それらには、立体異性コンホメーションはすべて属しうる。アントラニロイル-CoA及び3-オキソC4-C23アルカン酸の変換によって、キノリン環構造の2の位置でアルキル鎖の長さが、基質3-オキソC4-C23アルカン酸の長さに対して3個の炭素原子だけ減少するHAQ分子になるということは注目すべきである。その結果、3-オキソC4-C23アルカン酸を用いる場合には、その生成物は、4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリンである。アントラニロイル-CoAを、3-オキソデカン酸と反応させると生成物HHQが生じる。好ましくは、この発明により含まれるPqsDタンパク質は、シュードモナス種に、より好ましくは緑膿菌、そして最も好ましくは緑膿菌UCBPP-PA14に由来する。用語PqsDタンパク質PqsDproteinはまた、それらが配列番号:1の配列が誘導される同じシュードモナス種緑膿菌UCBPP-PA14に発生するとき、自然的に発生するPqsDタンパク質を包含し、そしてそれらが他のシュードモナス種及び菌株及びバークホルデリアBurkholderia又はアルテロモナスAlteromonas種などの非シュードモナス種に発生するときでも、自然的に発生するPqsDタンパク質を包含し、この場合、クオラムセンシングメカニズムが存在し、そしてPqsDタンパク質又はそのオルソログ若しくはホモログこのオルソログ又はホモログは、緑膿菌内のPqsDタンパク質と同じ機能を有するの存在を必要とするHAQsが生成される。好ましくは、自然的に発生するPqsDタンパク質又はそのオルソログ若しくはホモログは、配列番号:1の配列と、例えば、アミノ酸の付加、欠失、置換、及び/又は挿入によって異なっており、そして、50を超える、60を超える、好ましくは、80を超える、より好ましくは、85を超える、更により好ましくは、90を超える、更により好ましくは、95を超える、最も好ましくは、97を超える配列番号:1との配列同一性を有し、及び/又は配列番号:1のPqsDタンパク質の酵素活性の5を超える、10を超える、20を超える、30を超える、40を超える、50を超える、60を超える、70を超える、80を超える、90を超える、95を超える、97を超える、又は100を超える酵素活性を有する。この発明の文脈では、上記の定義と同様なPqsDタンパク質、あるいはこの発明によって包含される自然的に、又は非自然的に発生するその変異体は、PqsDタンパク質又は変異体は、その生物学的な機能、すなわち、それが、自然的条件下にて触媒する任意の反応にそれが関与すること非自然的変異体の場合には、参照タンパク質の生物学的機能、好ましくは、キノロンシグナルの生合成に関与すること、具体的には、HAQの生合成に関与すること、そしてより具体的には、HHQの合成に関与することが維持されているという点において、機能的に活性なタンパク質である。更により好ましくは、このPqsDタンパク質又はその変異体は、アントラニロイル-CoA及び3-オキソアルカン酸の、4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリンへの変換を触媒する、更により好ましくは、アントラニロイル-CoA及び3-オキソC4-C23アルカン酸の4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリンへの変換、そして最も好ましくは、アントラニロイル-CoA及び3-オキソデカン酸のHHQへの変換を触媒する。更に、自然的に発生するPqsDタンパク質の変異体はまた、用語PqsDタンパク質PqsDproteinによって包含される。こうした変異体は、例えば、配列番号:1の配列とは異なり例えば、アミノ酸の付加、欠失、置換及び/又は挿入による、そして自然的に発生するPqsDタンパク質に関して、上記に示した配列同一性、及びタンパク質活性を有する。用語PqsDタンパク質PqsDproteinによって包含される非自然的に発生する変異体は、それによって、それぞれの野生型タンパク質例えば、上記に言及した配列番号:1に関しての配列同一性、又は活性を含んでいる、限定された数のアミノ酸の欠失、挿入及び/又は置換、特に多くても、10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個又は1個のアミノ酸の欠失、挿入及び/又は置換によって得ることができる。この変異体は、更なるコンポーネントを含む、修飾されたPqsDタンパク質又は修飾されたPqsDタンパク質変異体でありうる。従って、この変異体は、本明細書中で詳述されているような自然的に発生するPqsDタンパク質又はその変異体から成るドメイン及び少なくとも1つの更なるコンポーネントcomponentを有する分子でありうる。1つの好ましい実施態様では、この変異体は、iPqsDタンパク質又は機能的に活性な変異体、及びii更なるタンパク質コンポーネントを含んでなる融合タンパク質でありうる。例えば、このタンパク質は、精製目的のために使用されるタグ例えば、6His又はHexaHisタグ、Strepタグ、HAタグ、c-mycタグ又はグルタチオンS-トランスフェラーゼGSTタグなどのマーカーと結合することができる。例えば、高度に精製されたPqsDタンパク質又は変異体が必要である場合には、二重又は多重マーカーdoubleormultiplemarkers例えば、上記のマーカー又はタグの組み合わせを使用することができる。この場合には、タンパク質は、2回又はそれより多い分離クロマトグラフィー工程で精製され、各場合において第一と次いで第二のタグの親和性を利用する。こうしたダブル又はタンデムタグtandemtagsの例には、GST-Hisタググルタチオン-S-トランスフェラーゼをポリヒスチジンタグに融合させた、6×His-Strepタグ6個のヒスチジン残基をStrepタグに融合させた、6×His-タグ100-タグ6個のヒスチジン残基を哺乳類MAPキナーゼ2の12個のアミノ酸タンパク質に融合させた、8×His-HA-タグ8個のヒスチジン残基をヘムアグルチニンエピトープタグhemagglutininpitopetagに融合させた、His-MBPHisタグをマルトース結合タンパク質に融合させた、FLAG-HAタグFLAGタグをヘムアグルチニンエピトープタグに融合させた、及びFLAG-Strepタグがある。マーカーはタグタンパク質を検出するために使用することができ、そこでは特異抗体が使用されうる。適切な抗体には、抗HA抗体例えば、12CA5又は3F10、抗6-His抗体、抗c-myc抗体及び抗GST抗体が挙げられる。更に、このPqsDタンパク質は、緑色蛍光タンパク質などの蛍光マーカー、ストレプトアビジンsteptavidinなどの結合タンパク質、1つ又は複数の小分子色素例えば、Cy色素、又は放射性マーカーなどの異なったカテゴリーのマーカーに連結することができ、これによってPqsDの検出が可能になる。更なる実施態様では、PqsDは、融合タンパク質の一部分であることができ、その場合、酵素活性を有するタンパク質コンポーネントなどの第二部分は検出のために使用することができる。この発明の別の実施態様では、PqsD変異体は、その断片が依然として機能的に活性であるPqsD断片でありうる。これには、短い内部領域及び/又はC及び/又はN末端領域の欠失例えば、最大で、20個、19個、18個、17個、16個、15個、14個、13個、12個、11個、10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個、又は1個のアミノ酸の欠失したPqsDタンパク質が含まれうる。これに加えて、PqsD断片はPqsDタンパク質の場合に上記に詳述したように更に修飾することができる。これに代えて、あるいはこれに加えて、上記に述べたようなPqsDタンパク質又はその変異体は、1つ又は複数のアミノ酸置換を含むことができる。しかしながら、アミノ酸が化学的に関連のあるアミノ酸と置換される半保存的及び特に保存的アミノ酸置換が好ましい。典型的な置換は、脂肪族アミノ酸の間で、脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸の間で、酸性残基を有するアミノ酸の間で、アミド誘導体の間で、塩基性残基を有するアミノ酸の間で、又は芳香族残基を有するアミノ酸の間でなされる。典型的な半保存的及び保存的置換は以下である:アミノ酸保存的置換半保存的置換AG;S;TN;V;CCA;V;LM;I;F;GDE;N;QA;S;T;K;R;HED;Q;NA;S;T;K;R;HFW;Y;L;M;HI;V;AGAS;N;T;D;E;N;QHY;F;K;RL;M;AIV;L;M;AF;Y;W;GKR;HD;E;N;Q;S;T;ALM;I;V;AF;Y;W;H;CML;I;V;AF;Y;W;C;NQD;E;S;T;A;G;K;RPV;IL;A;M;W;Y;S;T;C;FQND;E;A;S;T;L;M;K;RRK;HN;Q;S;T;D;E;ASA;T;G;ND;E;R;KTA;S;G;N;VD;E;R;K;IVA;L;IM;T;C;NWF;Y;HL;M;I;V;CYF;W;HL;M;I;V;CA、F、H、I、L、M、P、V、W又はYからCへの変更は、新規なシステインが遊離のチオールのままである場合には、半保存的である。更に、当業者であれば、立体的要求がなされる位置ではグリシンは置換されるべきではないこと、そしてPは、αヘリックス又はβシート構造を有するタンパク質の部分に導入されるべきではないことを理解するであろう。置換を有しているPqsDタンパク質又はその断片若しくは変異体は、PqsDタンパク質又は断片若しくは変異体の場合に上記に詳述されているように修飾することができる。このPqsDタンパク質の上記の修飾を組み合わせることができることが注目される。この発明の変異体は、例えば、それと融合するマーカーを有するPqsDの断片でも、あるいは1つ又は複数のアミノ酸置換を含んでなるPqsDタンパク質断片であってもよい。最も好ましくは、このPqsDタンパク質は、上記に詳述したごとく自然的に発生するPqsDタンパク質であり、更により好ましくは、自然的に発生するシュードモナスPqsDタンパク質例えば、配列番号:1である。本発明の下記の説明では、PqsDタンパク質に関して述べられているすべての詳細はまた、特段記載しない限り、その機能的に活性な変異体に関連する。このPqsDタンパク質の必要な量は、任意の手段、例えば、自然的源に起源するPqsDタンパク質を得ることによって、当技術分野で周知の生物工学的方法によって、及び/又は合成方法によって提供されうる。本明細書中では、用語提供することprovidingは、最も広い意味で理解されえ、PqsDタンパク質を得るために使用しうる当技術分野で知られている任意の生化学的又は生物工学的方法を含みうるが、これに限定されることはありえない。それ故、このPqsDタンパク質は、シュードモナス、バークホルデリア又はアルテロモナス、好ましくは、シュードモナス種、より好ましくは緑膿菌、そして最も好ましくは緑膿菌UCBPP-PA14のようなPqsDタンパク質を含む微生物などの自然的起源から抽出することによって得ることができる。当業者は、このタンパク質をいかにして単離し、そして精製するかについての方法を知っている。PqsDタンパク質を自然的に担持している細胞を当技術分野で知られている任意の手段によって破壊することができるが、その手段は以下を含むがそれらに限定されない:音波破砕、低張緩衝液、洗剤、ウルトラタラックスUltraTurrax、フレンチプレスFrenchpress、凍結-解凍サイクル、機械的ホモジナイゼーション及びスクラッチングmechanicalhomogenizationandscratching。次いで、関心のあるタンパク質を公知の方法によって単離することができる。あるいは、この発明で使用されるPqsDタンパク質は、組み換え方法、例えば、PqsDタンパク質又はその機能的断片若しくは変異体をコードするpqsD核酸をクローニングし、そのタンパク質を単離することによって生成できるPqsDタンパク質でありうる。遺伝子をレシピエント細胞に導入する手順は、トランスフェクションと呼ばれている。DNAを用いるトランスフェクションでは、安定及び不安定一過性細胞株が生じる。一過性細胞株は、染色体外形態でのトランスフェクションされたDNAの生存を反映し;安定細胞株は、ゲノム中への組込みから生じる。遺伝子は、当技術分野で知られている種々の手段で細胞内に導入され、各細胞型に適合され得る。用語細胞cellとは、それがバクテリア細胞、それとも真核細胞であるかどうかとは無関係に、そして細胞が自然的にpqsD遺伝子を発現するか否かとは無関係に、遺伝子が発現される細胞を意味する。核酸分子を導入し、そして発現する当技術分野において周知である組み換えDNAクローニング手法は、異種遺伝子を導入し、そして発現させるのに使用することができる。細胞は、ウイルスベクター、化学トランスフェクタント、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム共沈殿法又はDNA直接拡散を含む任意の適切な手段を用いてトランスフェクションすることができる。ベクターは、異種遺伝子を細胞中に輸送する媒介物agentsであり、プロモーターなどの適切な転写及び翻訳制御シグナルを含みうる。ベクターは、プラスミド、ウイルス又は当技術分野において知られている他のものでありうる。プロモーターは、誘導性又は構成的、一般的又は細胞特異的、核又は細胞質特異的でありうる。プロモーター、ベクター、及び他のエレメントの選択は、ルーチン的な設計事項である。多くのこうしたエレメントは、文献に記載されており、商業上の供給者を通して入手可能である。通例、トランスファー方法は、細胞への選択可能なマーカーのトランスファーを含む。一般に、細胞株は、上記に言及されている、導入遺伝子が、選択可能なマーカーに作動可能なように連結されている手段のいずれによってもトランスフェクションされる。トランスフェクションの後、細胞は適応期間にわたって増殖する。トランスフェクションされた細胞は、その選択に対して耐性を示し、増殖することができるが、一方、トランスフェクションされていない細胞は一般的に死滅する。選択マーカーの場合の例としては、それぞれ、ピューロマイシン、ゼオシン、アミノグリコシドG-418及びヒグロマイシンに対する耐性を与える、ピューロマイシン、ゼオシン、ネオマイシン及びヒグロマイシンBが挙げられる。この発明の関連で適切な細胞の例は、エッシェリキアコリ株Ecolistrains、サッカロミセスセレビシエSaccharomycescerevisiaeなどの酵母株、例えば、ポドプテラフルギペルダSpodopterafrugiperdaなどからの昆虫細胞株レピドプテラ、植物細胞、又はL6細胞、3T3アジポサイト、HEK293、745-A、A-431、心房筋細胞atrialmyocytes、BxPC3、C5N、Caco-2、Capan-1、CC531、CFPAC、CHO、CHOK1、COS-1、COS-7、CV-1、EAHY、EAHY926などの哺乳類細胞の細胞が含まれるが、これらに限定されない。樹立又は不死化細胞株は、テロメラーゼ遺伝子の人工発現などのランダム変異又は計画的修飾deliberatemodificationによって無制限に増殖する能力を取得してきた。特定の細胞型の数多くの十分に確立した細胞株代表例があり、適切な細胞株を選択することは当業者の知識内にある。細胞株は、誘導される培養液中で増殖する細胞の集団であり、それ故、遺伝的には、1つの共通の祖先細胞ancestorcellに同一である。好ましい細胞株には、HEK293細胞初代ヒト胎児腎臓primaryhumanembryonickidney、3T3細胞マウス胎児線維芽細胞murineembryonicfibroblasts、CHO細胞チャイニーズハムスター卵巣Chinesehamsterovary、COS-7細胞アフリカミドリザル細胞株Africangreenmonkeycellline、ヒーラ細胞HeLacellsヒト子宮頸部類上皮腫humanepithelioidcervicalcarcinoma、JURKAT細胞ヒトT細胞白血病humanTcellleukemia、BHK21細胞ハムスター正常腎臓,線維芽細胞hamsternormalkidneyfibroblast、及びMCF-7細胞ヒト乳癌humanbreastcancerがある。用語pqsD核酸pqsDnucleicacidは、上記のPqsDタンパク質、並びに自然的に発生する、及び非自然的に発生するその変異体本明細書中に定義されているを目的としてコーディングされている核酸を包含する。好ましくは、この用語は、pqsD遺伝子のコード領域又は非コード領域に関連し、その場合、こうしたセクションはその遺伝子に特異的であるために適切なサイズである。そうした領域の例には、コード領域又はpqsDプロモーターなどの調節エレメントがある。最も好ましくは、用語pqsD核酸pqsDnucleicacidは、pqsD遺伝子、プロモーター、DNA、cDNA又はmRNAに関連する。最も好ましいpqsD核酸は、上記に詳述したように自然的に発生するPqsDタンパク質、更により好ましくは、自然的に発生するシュードモナスPqsDタンパク質例えば、配列番号:1をコードする。この核酸は、細胞内で遺伝子情報又は形態構造を持っている、モノマーであるヌクレオチドの鎖から構成される任意のマクロ分子でありうる。最も一般的なそしてそれ故、好ましい核酸は、デオキシリボ核酸DNA及びリボ核酸RNAである。所望の遺伝子情報をコードしている核酸、好ましくは、DNAは、関心のある遺伝子、プロモーター領域、開始コドン及び終止コドン及び遺伝子の発現を調節するために使用されうるありうる更なる領域を含む。調節領域は、pqsD遺伝子に対して相同的homologousであっても、あるいは非相同的heterologousであってもよい。この遺伝子情報は、持続的に発現されてもよいし、又はレプレッサー及び/又はプロモーター領域の調節下で発現されてもよい。得られた細胞は、直接使用してもよいし、又は組織培養のために使用してもよく、あるいは細胞を回収し、そしてPqsDタンパク質を含む試料を、細胞を破壊することによって得ることができる。あるいは、DNA又はRNAは、細胞内で使用してもよいし、無細胞発現系で使用してもよく、これには、例えば、DNA又はRNAを固定化し、そして翻訳し、及び/又は、転写及び/又は翻訳に必要な因子酵素、リボソーム、tRNA、アミノ酸、ヌクレオチド、ATPなどを含んでいる官能性細胞溶解物functionalcelllysateを添加することによって転写するマイクロアレイシステムがある。あるいは、このPqsDタンパク質はまた、組織培養で発現させることができる。用語組織培養tissuecultureとは、三次元ネットワークを形成する細胞群が培養される方法を意味する。この組織は、細胞自体によって培養物中に形成されてもよいし、あるいは細胞によって作成される細胞外マトリクスによって形成されてもよく、この培養物は自然的、又は人工的な細胞外マトリクス例えば、コラーゲン、エラスチン、ポリスチレン、ナイロン、ポリリシンを用いて培養することができ、あるいはこの組織は、ヒトを含む動物から得ることができる。この組織培養は、培地で適切な温度で培養することができる。培地は、栄養素例えば、シュガー、塩、アミノ酸及び脂質、バッファー系しばしば、1つ又は複数の化学バッファー物質例えば、毒性が低いか、または毒性のない、リン酸類phosphates、リン酸水素類hydrogenphosphates、及び/又はトリスTris及び/又は炭酸ガスcarbondioxidegassingを含む、及び/又は所望により1つ又は複数の抗生物質を含むことができる。十分な量の栄養素を提供するために、及び/又は代謝産物を除去するために、必要な場合には、培地を交換することができる。所望により、この組織培養は、培地で灌流することができる。この灌流は、持続的でも、又はパルス灌流permanentorpulsedperfusionでもよい。人工核酸には、ペプチド核酸PNA、モルホリノ核酸及びロックド核酸LNA、並びにグリコール核酸GNA及びトレオース核酸TNAが含まれる。こうしたものはそれぞれ、分子の骨格の変化によって自然的に発生するDNA又はRNAと区別される。この方法を行なうときには、提供されたPqsD核酸又はPqsDタンパク質を、この発明の第一及び第二局面の第二工程部分を構成している化合物に接触させる。この発明の文脈では、用語接触させることcontactingは、PqsDタンパク質を、試験されうる1つ又は複数の化合物と相互作用することを可能にする任意の手段として最も広い意味で理解されうる。好ましくは、これは、PqsDタンパク質を含む1つ又は複数の溶液を、PqsDタンパク質の酵素活性に適しているバッファー溶液中の1つ又は複数の化合物と混和することによって達成される。混和するには、好ましくは、そのうちの一方がPqsDタンパク質を含み、他方が化合物を含んでいる2つ又はそれより多い溶液をピペッティングすること、より好ましくは、混和することによって達成しうる。好ましい実施態様では、接触させることは自動ピペッティングすることによって達成されうる。本発明を通して、用語試験化合物testcompound又は化合物compoundとは、あらゆる化学特質をもつ任意の試験物質を意味しうる。これは、サイズが500ダルトン未満の分子量を有する小分子又はその塩、タンパク質、ポリペプチド、デオキシリボ核酸DNA、リボ核酸RNA、合成ポリマー、抗体及び/又は抗体誘導体例えば、Fabフラグメント、一本鎖抗体、ダイアボディdiabodies、トリアボディtriabodies、フレキシボディflexibodies、タンダブtandabs:タンデムダイアボディなどの高分子量化合物を意味しうる。この化合物は、荷電されていて、荷電されていなくてもよい。更に、この化合物は、親水性であっても、疎水性であっても、あるいは両親媒性であってもよい。この化合物は、1つ又は複数の無機塩、1つ又は複数の塩イオンsaltions、1つ又は複数の金属、1つ又は複数の無機塩又はイオンの1つ又は複数の複合体complexes及び/又は1つ又は複数の金属の複合体好ましくは、1つ又は複数の有機分子と複合体化しているでありうる。あるいは、この化合物はガスであってもよい。好ましくは、この化合物は、水溶性バッファー又は水溶性溶媒に可溶性でありうる。この化合物は、既に薬物又は薬剤として使用されていてもよい。あるいは、この化合物はまた、治療的使用が知られていない化学物質であっても、それともアッセイでは使用されている知られていない化学特性を有する物質でもよい。更に、用語試験化合物testcompound又は化合物compoundはまた、この方法中で使用されている分子の前駆体として機能しうる物質を含んでいてもよい。具体的には、これは測定の直前に合成することが必要である不安定な物質の場合に当てはまる場合がある。これに加えて、これは、それらの作用を示す前に代謝される必要がある分子である、薬理学においてしばしば使用されるようなプロドラッグに当てはまる場合がありうる例えば、活性化合物のアセチル化された、脂質付加されたlapidated又は酸化された前駆体。これに代えて、又はこれに加えて、この化合物は、小分子、ペプチド、タンパク質、ポリサッカライド又は合成ポリマーなどの1つ又は複数の他の分子とコンジュゲート又は結合することができる。好ましくは、これは、1つ又は複数の小分子色素例えば、Cy色素例えば、Cy3、Cy5、Cy5、Alexa色素例えば、Alexa488、Alexa546、Alexa647、S色素例えば、S0387、フルオレセインfluorescein及びその官能性誘導体例えば、FITC、ローダミン、HOECHST色素などのような蛍光色素、又はUV/Vis色素、1つ又は複数の量子ドットquantumdots、1つ又は複数の結合モイエティ例えば、ビオチン、グリココルチコイド、又は例えば、1つ又は複数の活性エステル、イソチオシアネート、マレイミドmaleimids又はその組み合わせを含むモイエティ、1つ又は複数の可溶性及び/又は不溶性ポリマー例えば、ポリエチレングリコールPEG、ヒドロキシプロピルメタクリレートHPMA、1つ又は複数のスピン標識spinlabels、1つ又は複数の、及び/又はマイクロビーズ又はナノビーズ例えば、官能性を付与したシリカビーズfunctionalizedsilicabeads、シュガーベースビーズsugarbasedbeads、ポリマーソームpolymersomesにコンジュゲートすることができる。更に、この化合物は、シンチレーションアッセイ、又はコンピューター断層撮影法CTに適している、例えば、3H、32P、35S、14C又はランタノイド系元素lanthonoidsで、又は陽電子放出型断層撮影法PETに適している標識で、放射性標識することができる。本明細書中で使用される際には、用語方法method又はアッセイassayとは、実験活性又は手順として最も広い意味で理解されうる。これは、いくつかの特性を有する化合物を特定するのに、又はある種の化合物を特徴付けるのに使用することができるすべての手段として理解されるであろう。これは1つ又は複数の試料を試験すること、並びに数多くの試料を含むライブラリーをスクリーニングすることを含みうる。用語化合物を特定することidentifyingacompoundは、最も広い意味で、PqsDタンパク質と接触させたときに、PqsDタンパク質の酵素活性に対する作用を示す化合物、特に、PqsDタンパク質と接触させたときに、PqsDタンパク質の酵素活性に対する阻害作用を示す化合物を見出すことを意味する。こうした阻害作用を示す化合物は、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防する作用を有することが判明している。用語阻害剤inhibitorとは、アンタゴニストantagonist、不活性化因子inactivator、不活性化剤inactivatingagent、相互作用薬interactingdrug、阻害作用を有する化合物compoundwithinhibitoryeffect及び不活性化化合物inactivatingcompound及び酵素活性を不活性化する物質の他の呼称と互換性があるものと理解されうる。阻害剤は、酵素に結合し、そしてそれらの活性を低下させる分子である。酵素活性を遮断すると代謝不均衡を修正することができるので、薬は酵素阻害剤であることが多い。酵素に結合する分子がすべて阻害剤であるわけではない;酵素活性剤は、酵素に結合してそれらの酵素活性を上昇させる。阻害剤の結合は、結合パートナーが生体分子と相互作用することを阻止することができ、及び/又は生体分子が活性になるか、あるいは活性化することを妨げることができる。阻害剤結合は、可逆的か、あるいは不可逆的である。不可逆的阻害剤は通例、生体分子と反応し、それを化学的に変化させる。こうした阻害剤は、例えば、活性に必要なキーとなるアミノ酸残基を修飾することができる。対照的に、可逆的阻害剤は、非共有結合で結合し、そしてこうした阻害剤が生体分子に結合するか否かに応じて、異なる種類の阻害が引き起こされる。化合物が、PqsDタンパク質に対して特異的、かつ有意な減少作用を有する場合には、その化合物は、PqsDタンパク質の阻害剤として、それ故、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防する作用を有する化合物として特定される。この発明の文脈においてPqsDタンパク質の阻害剤は、コントロールと比較してPqsD酵素活性を低下させる化合物を意味する。当技術分野における当業者であれば、2つの値が互いに有意に異なっているかどうかを評価する統計的手順例えば、スチューデントのt検定又はカイ二乗検定を知っている。この発明の第一及び第二の局面の第三工程では、試験化合物のPqsDタンパク質に対する作用が検出される。この作用は、上記に定義されているように試験化合物のpqsD核酸又はPqsDタンパク質への結合として決定される。好ましい実施態様では、PqsDタンパク質の活性は、試験化合物のPqsDタンパク質への結合の結果として決定される。下記では、一連の異なった検出システムがより詳細に述べられている。しかしながら、こうしたものは例示的なものであり、他の試験システム及び方法である場合がありうることが理解されるべきである。試験化合物がPqsDタンパク質に対して特異的、かつ有意な作用を有している場合には、試験化合物は、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するために有用な化合物として特定される。この場合、試験化合物の作用はコントロール、特にネガティブコントロールと比較される。コントロールは、それらが意図されたものでない影響例えば、バックグラウンドシグナルを除去し、又は最小にすることができるので、試験方法の一部分である。コントロール実験は、可変部分の特定の系に対する作用を検討するために使用される。コントロール実験では、一方の群の試料が変化され又は変化されると考えられる、そして他方の群の試料が、変化を示さないと想定されるかネガティブコントロール、あるいは明確な変化を示すものと想定されるポジティブコントロール。コントロールは、試験物質と共に行なう1つの試験で決定することができる。これは、試験化合物の作用を決定する前または後に決定してもよいし、あるいはこれが知られている値であってもよい。この発明の関連では、試験化合物は、試験化合物と接触させたPqsDタンパク質は、コントロール例えば、試験化合物と接触していない試験システムのPqsD活性と比較して有意により低いPqsD活性を生み出す場合に、コントロールと比較して作用を有している。これに加えて、バックグラウンドPqsD活性と無関係である基質の変換は、酵素を欠如しているそれぞれのバッファー中の基質を含む試料によって測定することができる。このバックグラウンド試料では、基質の変換は全くないか、あるいはほとんどないであろう。当技術分野における当業者であれば、2つの値が互いに有意に異なっているかどうかを評価する統計的手順例えば、スチューデントのt検定又はカイ二乗検定を知っている。更に、当業者は、いかに適切なコントロールを選択するかについて知っている。好ましい実施態様では、PqsD活性は、試験化合物によって、コントロールの、少なくとも10、好ましくは、少なくとも25、より好ましくは、少なくとも50、更により好ましくは、少なくとも75、そして最も好ましくは、少なくとも90分変化する。本発明の方法の場合、検出するあらゆる適切な方法を使用することができる。適切な方法は、試験システム及び試験される化合物の特性に応じて選択することができる。この方法は、ヘテロジニアスアッセイであっても、あるいはホモジニアスアッセイであってもよい。本明細書中で使用される際には、ヘテロジニアスアッセイは、1つ又は複数のの洗浄工程を含むアッセイであり、一方ホモジニアスアッセイは、こうした洗浄工程は必要ない。試薬及び化合物を、単に混和し、測定するだけある。この試験方法は、連続的アッセイであってもよいし、又は非連続的アッセイであってもよい。連続的アッセイでは、反応速度が得られるが更なる作業は必要ない。連続的アッセイには多くの異なる種類がある。分光光度計によるアッセイspectrophotometerassaysでは、反応過程は吸光度の変化を測定することによって追跡する。蛍光発光は分子が異なる波長の光を吸収した後、1つの波長の光を放出するときに存在する。蛍光測定アッセイは、生成物からの基質の蛍光の差異を使用して酵素反応を測定する。こうしたアッセイは、一般的に、分光光度計によるアッセイと比較してはるかに高感度であるが、しかしながら、不純物によって引き起こされる干渉、及び光に曝露されるとき多くの蛍光化合物の不安定性を被る可能性がありうる。熱量法は、化学反応によって放出され、又は吸収された熱の測定である。こうしたアッセイは、熱のある程度の変化が必要である反応が多く、そして微量熱量計を用いると酵素又は基質があまり多く必要でないので極めて一般的である。こうしたアッセイは、他のいずれかの方法ではアッセイが不可能である反応を測定するのに使用することができる。化学発光は化学反応による光の放出である。いくつかの酵素反応では光が発生し、そしてこれを測定し生成物形成を検出することができる。こうした種類のアッセイは、発生する光が数日から数週間にわたって写真フィルムによって捕捉することができるので極度に感受性を示しうるが、しかしながら、反応によって放出される光のすべてが検出されるわけではないので定量化することが困難でありうる。静的光散乱は、溶液中のマクロ分子の重量平均モル質量及び濃度の生成物を測定する。測定時間にわたって1つ又は複数の種の一定の総濃度を考慮すると、散乱シグナルは、溶液の重量平均モル質量の直接測定であり、これは、複合体形態又は解離によって変化するであろう。それ故、この測定によって複合体並びに反応速度の化学量論比が定量化される。タンパク質動態の光散乱アッセイは、酵素を必要としない極めて一般的な手法である。非連続的アッセイは、試料が間隔をおいて酵素反応から取り出され、そして生成物産生又は基質消費の量がこうした試料中で測定されるときに使用される。放射アッセイは放射能の基質への取り込み、又は基質からのその放出を測定する。こうしたアッセイにおいて最も頻繁に使用される放射性同位体は、14C、32P、35S及び125Iである。放射性同位体は基質の単一原子を特異的に標識することを可能にしうるので、こうしたアッセイは極めて感受性があり、かつ特異的である。これらは生化学において頻繁に使用され、そして粗抽出物における特異的反応を測定する唯一の方法であることがしばしばある。クロマトグラフィーアッセイはクロマトグラフィーによって反応混合物をそのコンポーネントに分離することによって生成物の生成を測定する。これは通例、高性能液体クロマトグラフィーHPLCによってなされるが、薄層クロマトグラフィーのより簡単な手法を使用することもできる。このアプローチには多くの材料が必要でありうるが、その感受性は、基質/生成物を放射性又は蛍光タグを用いて標識することによって増大させることができる。この酵素活性が、酵素の量、酵素の活性状態、コアクティベーター又はコレプレッサーなどのコファクターの存在、アクティベーター及びインヒビター阻害剤の存在、並びに塩濃度、温度、pHなどの周囲条件を含む一連のファクターによって影響されることは明白である。通例、この酵素活性は、標準的な実験室条件で測定され、そして当該試験システムの最適条件に適合させることができる。従って、有用な治療薬でありうるアクティベーター及びインヒビターなどの酵素の活性状態を変化させる分子を検出又は特定するために、この試験システムを使用することができる。試験化合物の作用例えば、結合及びPqsDタンパク質に対する作用は、間接的に検出することができる。特に好ましい実施態様では、試験化合物の結合は、PqsDの活性の変化によって測定される。所望の酵素活性を得るために、この測定は、PqsDタンパク質の活性に適した分子環境で行うことができる。好ましくは、この方法は、中性から弱塩基性のpHの水溶性バッファー中で、より好ましくは、約pH8のpHのバッファー中で、更により好ましくは、Tris-HCl、ヘペスHEPES、ビシンBICINE、MES、トリエタノールアミン又はリン酸バッファーphosphatebufferを含むpH8のバッファー中で行なわれる。好ましくは、このPqsDタンパク質は、使用するバッファー中でその活性を維持し、そして好ましくは、化合物又は酵素の沈殿をさせないようにする。所望により、試料を酵素活性に適する温度で、好ましくは、0~50°Cの温度で、より好ましくは10~40°Cの温度で、更により好ましくは20~40°Cの温度で、最も好ましくは37°Cでインキュベートすることができる。適用される方法は、実施例セクション中により詳細に述べられている。しかしながら、こうしたものは例示的なものであり、そして他の方法もまた適切である場合のありうることが理解されるべきである。この酵素を、所望の濃度に希釈することが必要であり、そしてこの濃度は、酵素の量によって酵素活性が変化するため、様々なバッチによって異なりうることは、当技術分野における当業者にとって自明でありうる。好ましい実施態様では、このPqsDタンパク質の活性は、PqsDタンパク質の基質の生成物への変換を測定することによって決定される。基質の変換は、酵素作用enzymaticに関連し、すなわち、PqsDタンパク質によって触媒される変化、あるいは化学化合物の代謝に関連する。本発明を通して、用語基質substrateは、PqsDタンパク質によって生成物に代謝されうる任意の化学物質に関連する。この方法では、それらが上記に定義されているようにPqsDタンパク質を担持している有機体に存在するので、PqsDタンパク質の検出可能な自然的な基質は、PqsDタンパク質の酵素活性の検出を可能にするために使用することができる。更に、こうした自然的な基質の検出可能なサロゲートsurrogatesは、PqsDタンパク質又はその変異体の酵素活性の検出を可能にするために使用することができる。好ましくは、こうした自然的な基質又はサロゲート及びそれから生じる生成物は、物理化学的な手段によって、より好ましくは、下記に述べられているHPLC方法によって検出可能である。用語サロゲートsurrogateは、自然的な基質複数を含むの代わりに、代謝され、及び/又は酵素的に変換されうる分子として、最も広い意味で理解されうる。HAQの生合成の場合には、2つの基質はPqsDによって変換される。それ故、好ましい実施態様では、第一の基質は、アントラニル酸、好ましくは、アントラニロイル-CoAなどのアントラニル酸誘導体である。第二の基質は、好ましくは3-オキソアルカン酸、より好ましくは3-オキソC4-C23アルカン酸、そして最も好ましくは3-オキソデカン酸である。最も好ましい実施態様では、第一の基質は、アントラニロイル-CoAであり、そして第二の基質は、3-オキソデカン酸である。基質である3-オキソアルカン酸、好ましくは、3-オキソC4-C23アルカン酸、そしてより好ましくは、3-オキソデカン酸が、物質を活性化する物質に連結し、それによって、基質の生成物への変換が維持される実施態様もまた含まれる。この連結は共有結合的連結でありうる。好ましい物質は、補酵素A又はACPアシルキャリアタンパク質であり、その結合によって、3-オキソアルカン酸、好ましくは3-オキソC4-C23アルカン酸、そしてより好ましくは3-オキソデカン酸の対応するチオエステルが生じる。この発明の関連では、3-オキソアルカン酸、好ましくは3-オキソC4-C23アルカン酸、そしてより好ましくは3-オキソデカン酸は、上記に示されているように、アントラニロイル-CoAと変換反応しHAQになるのに有用であるために誘導体化される必要がないが、アントラニル酸が、活性化された形、すなわち、アントラニロイル-CoAとして反応混合物中に存在するときに限って反応は進行する。逆に、補酵素A又はACPによって誘導体化された3-オキソアルカン酸、好ましくは、3-オキソC4-C23アルカン酸、そしてより好ましくは3-オキソデカン酸は、アントラニロイル-CoAと組み合わせるか、又は補酵素Aがない状態で、アントラニル酸と組み合わせて酵素アッセイで使用することができる。2つの基質のうち少なくとも1つは、すなわち、アントラニル酸の活性化された形で、アントラニロイル-CoAとして、あるいは、HAQ分子の活性化された形で、HAQ-CoA又はHAQ-ACPとして存在すべきである。アントラニロイル-CoAは、3-オキソアルカン酸、好ましくは3-オキソC4-C23アルカン酸、そして最も好ましくは3-オキソデカン酸と共に、それぞれ、4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリンに、好ましくは4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリンに、そしてより好ましくはHHQに変換させるPqsDの基質の1つである。アントラニロイル-CoAは、PsqB、PsqC及びPsqDを必要とする一連の工程において、頭-頭縮合headtoheadcondensationを介してβ-ケト脂肪酸と反応して、HAQ又は好ましくは、HHQを形成すると予測される。シュードモナス菌では、アントラニロイル-CoAが、アントラニロイル-CoAシンターゼであるPqsAによってアントラニル酸から生成される。この発明の関連では、アントラニロイル-CoAを生成するあらゆる方法を使用することができる。当業者であれば、アントラニロイル-CoAを生成する方法を承知しているであろう。この発明の方法の一実施態様では、アントラニロイル-CoAは、アントラニル酸から生成される。アントラニル酸は、例えば、商業上の供給源から入手可能である。アントラニロイル-CoAの生成は、アントラニル酸をアントラニロイル-CoAに変換する任意の酵素によって酵素的触媒反応によって起こりうる。例えば、PqsAは、アントラニル酸をアントラニロイル-CoAに変換するために使用することができる。PqsAは、公知のアントラニラート-補酵素AリガーゼanthranilatecoenzymeAligaseである。PqsAタンパク質は、種々のアシル補酵素Aアシル-CoAリガーゼに相同的homologousであり、そしてPqsAの明らかな役割は、アントラニラートをCoAチオエステルに変換することである。この生成物は、最終的な4-キノロンを生じさせる縮合の前駆体である。この酵素は、アクセッション番号ABJ10160.1配列番号:2のもとでNCBIから入手可能である。緑膿菌UCBPP-PA14のコンプリートゲノムは、シークエンシングされている。この配列は、アクセッション番号NC_008463のもとでNCBIから入手可能である:pqsA遺伝子は、アイデンティフィケーション番号GeneID:4379980のもとで特定されている。この発明によって含まれる用語PqsA又はPqsAタンパク質PqsAproteinは、このPqsAタンパク質が、配列番号:2のタンパク質と同じ活性、すなわち、それはアントラニル酸のアントラニロイル-CoAへの変換を触媒することを条件として、それらがそれらから配列番号:2の配列が誘導されるのと同じ種緑膿菌PseudomonasaeruginosaUCBPPPA14中に発生したときの自然的に発生するPqsAタンパク質を包含し、あるいは、それらが他のシュードモナス種及び株、及び非シュードモナス種中に発生したときの自然的に発生するPqsAタンパク質を包含する。また、PqsDタンパク質に関して上記に言及されている如く定義される自然的に、又は非自然的に発生する変異体を含む。より好ましい実施態様では、アントラニル酸をアントラニロイル-CoAに変換する2-アミノ安息香酸-CoAリガーゼにおいて、PQS、HHQ及び関連する2-アルキル-4-キノロン分子を決定するための、HAQsが特異的に構築されたレポーター株の生物発光を介して検出されるバイオセンサーベースアッセイが記載されている。こうしたアッセイは、時間がかかり、かつ多大の労力が必要であり、自動化automatisationの可能性は極めて低く、潜在的に病原体との接触が必要である。アントラニロイル-CoA及び3-オキソアルカン酸[好ましくは3-オキソC4-C23アルカン酸、又はより好ましくは3-オキソデカン酸など]の基質の、4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリン、好ましくは4-ヒドロキシ-2-C1-C20アルキルキノリン、又はより好ましくはHHQなどの生成物へのインビトロ変換に関連してHPLC-MSによる化合物基質及び生成物の検出は、自動化及び安全な取り扱いのための迅速な作業及び見込みの可能性を提示している。これは、既に存在している物質ライブラリー中の阻害剤をスクリーニングするための可能性を広げている。HPLC-MSシステムの利点を考慮すると、このシステムは、基質及び/又は生成物、及び好ましくは、この発明における生成物の定量化の好ましいシステムである。この発明の最も好ましい実施態様は、アントラニロイル-CoA及び3-オキソデカン酸が、試験化合物の存在下で、配列番号:1のPqsDによって変換され、そしてHPLC-MSによるHHQの量を測定することによって、試験化合物を含まないコントロール反応と比べて酵素活性を測定する方法である。この反応は、適切な無細胞反応溶液中、インビトロで行なわれる。これに代えて、PqsD活性は、HAQの抗菌活性を測定することによって測定することができる。この発明の別の局面では、試験化合物のPqsDタンパク質に対する結合及び作用は、PqsDタンパク質との相互作用、あるいはPqsDタンパク質への結合を決定することによって直接的に決定することができる。従って、試験化合物のPqsDタンパク質との相互作用/結合は、PqsDタンパク質及び試験化合物の複合体を検出することによって決定することができる。こうした相互作用は、PqsDタンパク質の活性を高めるか、あるいは低下させうる。一実施態様では、試験化合物がPqsDタンパク質に結合するか、あるいはPqsDタンパク質と相互作用する能力を決定することは、上記に説明した如く、PqsDタンパク質の活性を決定することによって達成することができる。この発明の文脈では、試験化合物は、それがPqsDタンパク質の活性を低下させる場合には、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するために適している。2つ又はそれより多いコンポーネントの複合体を検出する適切な方法は、下記に詳述されている。特定のタンパク質又は他の核酸の存在又は量を測定するために設計されている多くの公知の検出方法は、タグ、マーカー又は標識の使用に左右される。試験システム又は試験化合物のコンポーネントは、十分な検出又は精製が可能なように、種々の方法で標識することができる。1つの好ましい実施態様では、検出可能なマーカーは、試験システムに対する作用を検出するために使用される。この場合には、PqsDタンパク質、試験化合物及び/又は試験システムの更なるコンポーネントを少なくとも1つの検出可能なマーカーを用いて標識することができる。通常の標識方法は、コンポーネントの1つ又は複数の官能基を標識するために使用することができる。タンパク質の場合には、これらは、例えば、各ポリペプチド鎖のN末端及びリシン残基の側鎖に存在する第1級アミノ基;ジスルフィド結合を還元剤で処理するか、又はリシン残基をスクシンイミジル-S-アセチルチオアセテートSATAなどの試薬で修飾することによって利用可能にしたシステイン残基上に存在するスルフヒドリル基;又は、通例、抗体のFc領域中に存在する炭水化物基[該炭水化物基は、酸化されて、カップリングのための活性なアルデヒドを創成することができる]でありうる。このコンポーネント又は化合物は、ビオチンアビジン-ビオチン化学のため、酵素、アミン、スルフヒドリル又は他の官能基標識のための活性化蛍光色素[例えば、FITC、フルオレセイン、ローダミン、Cy色素又はアレクサフルオロAlexafluosを加える]などの一連の種々の作用物質を用いて標識することができる。3H、32P、35S、125I又は14Cなどの放射性標識、並びにペニシリナーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ及びアルカリホスファターゼを含む一般的な酵素標識もまた用いることができる。そうした化学タグ、マーカー又は標識を介して検出可能である標的特異的プローブの使用がこの発明によって想定される。抗体は最も一般的な種類のプローブである;特定の抗原に対するそれらの結合親和性はそうした標的が複合体試料complexsample中に見出されfound、そして検出されることを可能にする。しかしながら、抗体はそれ自身タンパク質であり、それらが可視化のために標識されていないか、あるいは二次的に標識されている別の分子でプローブされていない場合には、それらはアッセイ系中で特異的に検出可能ではない。マーカー又はタグ又は標識は、別の物質又は物質の複合体の存在を指摘することができるあらゆる種類の物質である。このマーカーは、検出される物質に連結するか、あるいは検出される物質中に取り込まれている物質でありうる。検出可能なマーカーは、例えば、タンパク質、酵素反応の生成物、第二メッセンジャーsecondmessenger、DNA、分子の相互作用などを検出するために分子生物学及び生物工学で使用される。適切なマーカー又は標識の例には、フルオロフォアfluorophore、発色団、放射標識、金属コロイド、酵素、又は化学発光若しくは生物発光分子が含まれる。フルオロフォアの例には、フルオレセイン、ローダミン、及びスルホインドシアニン色素Cy5が含まれる。放射標識の例には、3H、14C、32P、33P、35S、99mTc又は125Iが含まれる。酵素の例には、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコースオキシダーゼ、及びウレアーゼが含まれる。異なるタイプの化学標識又はタグは二次抗体又は一次抗体及び他の分子にコンジュゲートでき、様々な方法によるそれらの可視化すなわち、検出及び測定を容易にすることができる。放射性同位体は過去には広範囲に使用されていたが、こうしたものは高価であり、シェルフライフが短く、シグナルの改善がなく:ノイズ比率、そして特別な取り扱い及び処理が必要である。酵素及びフルオロフォアが、アッセイのための検出可能なタグとして、放射性同位体に大幅に取って代わってきている。試薬及び機器のいくつかの進歩によって、こうしたより新しい技術を、より汎用性があり、かつ有力にさせている。西洋ワサビペルオキシダーゼHRPなどの酵素タグは、ブロッティング、免疫学的アッセイ、及び免疫組織化学方法の場合に最も一般的に使用される。蛍光タグは細胞イメージング、核酸増幅及びシークエンシング及びマイクロアレイの場合に主に使用されている;しかしながら、蛍光技術はあらゆるタイプのアッセイにおける応用のために急速に発展している。タンパク質を検出するには、特異抗体の使用がしばしば必要となる。従って、PqsDタンパク質又はその機能的変異体の検出は、特異的なPqsD抗体を含みうる。抗体は、調製された抗原の形態を用いる、免疫化動物のために十分に確立された手法を使用して調達することができる。種々の試薬が利用可能であり、抗体産生及び精製に役立ち、そして種々の会社が抗体作成サービスを専門にしている。果たすべき適用次第であるが、異なったレベルの純度及び特異性の種類が一次抗体の供給に必要である。ほんの一部のパラメーターをあげると、抗体はモノクローナルであってもよいし、それともポリクローナルであってもよく、抗血清、又はアフィニティー精製溶液として供給され、そして天然タンパク質検出、あるいは変性タンパク質検出の妥当性が検証される。標的抗原、本件ではPqsD又はその機能的変異体を認識する抗体は、一次抗体primaryantibodyと呼ばれる。この抗体を、タグを用いて標識する場合には、この抗原の直接検出が可能である。しかしながら、通例、直接検出の場合にはこの一次抗体は標識されない。その代わり、検出可能なタグで標識された二次抗体secondaryantibodyを、標的抗原に結合している一次抗体プローブに第二工程中で加える。すなわち、この抗原は間接的に検出される。間接的検出の別の形態では、ビオチンのようなアフィニティータグで標識されている一次又は二次抗体を用いることが必要である。次いで検出可能な酵素又はフルオロフォアタグで標識したストレプトアビジンのような二次又は三次プローブを、ビオチンタグプローブするために使用し、検出可能なシグナルを生じさせることができる。こうしたプロービングのいくつかの変異体及び検出ストラティジーが存在する。しかしながら、1つ1つは特異的プローブ例えば、一次抗体に左右され、その存在は直接又は間接的に、ある種の測定可能なタグたとえば、その活性が、その基質と反応して着色生成物をもたらすことができる酵素に連結する。通例、検出可能な標識のない一次抗体及びある種の二次間接的検出法が、アッセイ方法の中で必要である。それにもかかわらず、ほとんどすべての抗体は、必要に応じて、ビオチン、HRP酵素又はいくつかのフルオロフォアの1つで標識することができる。大抵の一次抗体はマウス、ウサギ又は他のいくつかの種の1つで作成される。ほとんどすべてのこうしたものはIgGクラスの抗体である。それ故、製造業者が、大部分の利用及び検出システムのためにすぐに使用できる標識二次抗体を作成し、供給することは比較的簡単であり、かつ経済的である。然れども、純度レベル、IgG及び種特異性、並びに検出標識レベルの点で異なる、数百のオプションが利用可能である。二次抗体の選択は、一次抗体が調達される動物種宿主種に左右される。例えば、一次抗体がマウスモノクローナル抗体である場合には、二次抗体はマウス以外の宿主から得られた抗マウス抗体である必要がある。プローブとしてのビオチン結合タンパク質である場合には、ビオチンと、アビジン若しくはストレプトアビジンタンパク質の間の高度に特異的なアフィニティー相互作用が、多くの種類の検出及びアフィニティー精製方法のベースである。酵素標識は、ブロッティング及び免疫アッセイで検出のための二次抗体又はストレプトアビジンタグとして最も一般的に使用されている。酵素はそれらの活性を介して検出可能なシグナルを提供する;特異的基質との化学反応が、着色した光放出、又は蛍光生成物を生ぜしめる。実例としては、β-ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼAP及び西洋ワサビペルオキシダーゼHRPがある。検出のための蛍光標識は、フローサイトメトリーFC、蛍光活性化セルソーティングfluorescenceactivatedcellsortingFACS及び蛍光顕微鏡を用いる免疫組織化学IHCなどの少数の細胞生物学的応用において歴史的に使用されてきた。標識プローブのための通常のフルオロフォアの例としては、フルオレセインフルオレセインイソチオシアネート,FITC及びローダミンテトラメチルローダミンイソチオシアネート,TRITC、緑色蛍光タンパク質GFP及びフィコビリタンパク質アロフィコシアニン、フィコシアニン、フィコエリスリン及びフィコエリスロシアニンがある。これに代えて、あるいはこれに加えて、2つの物質[例えば、試験化合物及びPqsDタンパク質]の近接性を検出するために、2つのマーカーを使用することができる。これらのマーカーは、例えば、1つの放射性又は蛍光性マーカーと、1つのシンチレータでもよく例えば、シンチレーション近接アッセイの場合、あるいは2つの蛍光マーカーを使用することもできる例えば、FRETの場合。一実施例では、PqsDタンパク質及び試験物質は、第一及び第二マーカーで標識することができる。試験物質がタンパク質に結合し、それ故、標識が非常に近接している場合には、エネルギーは第一から第二の標識に移動することができ、従って、PqsDタンパク質と試験物質の相互作用を検出することができる。この試験は、公知のPqsDリガンドが標識の1つを担持している競合結合試験として設計することができる。適切なマーカーの組み合わせの例には、イットリウム珪酸塩又はポリビニルトルエンなどのシンチレータと組み合わせた放射標識、3H、33P、35S又は14C、125I[例えば、微粒子に分けられる]、あるいは、LC-Red610、LC-Red640、LC-Red670、LC-Red705、Cy5、Cy5.5、リサミンローダミンBスルホニルクロリド、テトラメチルローダミンイソチオシアネート、ローダミンxイソチオシアネート、エリスロシンイソチオシアネート、フルオレセイン、ジエチレントリアミンペンタアセテート又はランタニドイオンの他のキレート例えば、ユーロピウム、テルビウムなどのアクセプター蛍光マーカーと組み合わせた、フルオレセイン、ルシファーイエロー、B-フィコエリスリン、9-アクリジンイソチオシアネート、ルシファーイエローVS、4-アセトアミド-4’-イソチオシアナトスチルベン-2,2’-ジスルホン酸、7-ジエチルアミノ-3-4’-イソチオシアナトフェニル-4-メチルクマリン、スクシンイミジル1-ピレンブチレートsuccinimdyl1pyrenebutyrate、及び4-アセトアミド-4’-イソチオシアナトスチルベン-2,2’-ジスルホン酸誘導体などのドナー蛍光マーカーが含まれる。競合結合試験の場合には、公知のリガンド又は結合分子PqsDを少なくとも1つの検出可能なマーカーで標識し、そしてbのインキュベーション工程に加える。工程bの後、結合した標識リガンドを非結合リガンドから分離する。この分離は、ろ過、遠心分離、固定化、相分離及び液体の除去などの一般的な分離工程によってなされうる。標識によって提供されたシグナルの量は、結合したリガンドの量を示しており、それ故、また、リガンドと試験化合物は生体分子への結合を得るために争うので、生体分子に結合した試験化合物の量をも示している。一実施態様では、試験化合物とPqsDタンパク質の相互作用を検出のためのアッセイは、SPAシンチレーション近接アッセイ、FRET蛍光共鳴エネルギー移動アッセイ、TR-FRET時間分解蛍光共鳴エネルギー移動アッセイ、又はFP蛍光偏光アッセイである。SPAシンチレーション近接アッセイは、生化学スクリーニングのために使用されるホモジニアス系において広範囲のプロセスの迅速であり、かつ感受性を有する測定を生物学的に可能にする技術の一種である。SPAにかかわるビーズのタイプは、寸法、及びビーズ自身の内部は微視的であり、それが刺激されたときに光を放出するシンチラントが存在する。刺激は、放射標識分子がビーズと相互作用するときに生じる。この相互作用は、ビーズが光を放出するのを誘発することになり、それはシンチレーションカウンターを用いて検出することができる。蛍光共鳴エネルギー移動FRETでは、2つの発色団間の放射のないエネルギー移動が述べられている。励起状態でのドナーの発色団は、非放射長距離の双極子-双極子カップリングメカニズムによってエネルギーを近接している通例、<10nmアクセプターフルオロフォアに移動させることができる。タンパク質が作用物質に結合することをモニタリングする場合には、一方の分子をドナーで標識し、他方をアクセプターで標識し、そしてこうしたフルオロフォア標識分子を混和する。これらが非結合状態で存在するときには、ドナー放出がドナー励起して検出される。分子が結合すると、このドナー及びアクセプターは近接状態になり、そしてドナーからアクセプターへの分子間FRETのため、アクセプター放出が主に観察される。FRET技術における種々のアクセプター蛍光モイエティと共に使用することができる代表的なドナー蛍光モイエティには、フルオレセイン、ルシファーイエロー、B-フィコエリスリンなどが含まれる。代表的なアクセプター蛍光モイエティには、使用されるドナー蛍光モイエティに左右されるが、LC-Red610、LC-Red640、LC-Red670、LC-Red705、Cy5、Cy5.5、リサミンローダミンBスルホニルクロリド、テトラメチルローダミンイソチオシアネート又はランタニドイオンの他のキレート例えば、ユーロピウム、又はテルビウムが含まれる。ドナー及びアクセプター蛍光モイエティは、例えば、MolecularProbes又はSigmaChemicalCoStLouisMOから得ることができる。また、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動TR-FRETは、この発明の試験システムのために使用することができる。TR-FRETは、TRF時間分解蛍光とFRETの原理を統合したものである。この組み合わせによって、TRFの低いバックグラウンドの利点とFRETのホモジニアスアッセイフォーマットが合体される。FRETについては既に上記に述べられているところであるが、TRFは長い半減期を有する、ランタニド類lanthanides又は他の任意のドナーのユニークな特性を利用している。TR-FRETの場合の好適なドナーには、とりわけ、ランタニドキレートクリプタート及び他のいくつかの金属リガンド複合体が挙げられ、これらは、マイクロからミリ秒時間範囲内の蛍光半減期を持つことができ、従って、また、これらによってエネルギー移動がマイクロからミリ秒測定値で生じさせることが可能となる。蛍光偏光FPに基づくアッセイは、溶液中の蛍光性基質を励起するために偏光を使用するアッセイである。こうした蛍光性基質は、溶液中において遊離型であり、そして回転tumbleし、その結果放出光が脱分極する。基質がより大きな分子、すなわち、アシル基に結合すると、その回転速度は大幅に減少し、放出光は高度に分極されたままとなる。これに代えて、マススペクトロメトリーを使用することができる。この発明の更なる局面では、この方法はインビトロで行なわれる。インビトロラテン語:ガラス器内でで行なわれる手順が、生体内ではなく、試験管又はペトリ皿中など制御された環境内で行なわれる。基質であるアントラニロイル-CoAと3-オキソデカン酸をインキュベーションして、タンパク質PqsDを用いることによって、HHQの生成がなされることになるという本発明者らの知見によって、インビトロアッセイシステムでのこの反応の遂行が可能になる。このことはHHQ及び他のHAQsの生合成を更に詳細に研究する可能性を広げるのみならず、PqsDタンパク質の阻害剤をスクリーニングするシステムを開発する新規なアプローチを付与することになる。インビトロアッセイは、インビボ方法において発生しうる不利な点を回避し、その一例を挙げれば、例えば、HAQs、特に、HHQ又はPQSの合成に関与しているコンポーネントが存在する場合にありうる不明瞭な点、可能性のある病原性作用物質に関する検討、自動化の可能性の制限、及び時間及び労働の消費の増大がある。インビトロアッセイでは、反応に参加しているコンポーネントは、試験管中で結合しており、その反応が進行し、そして、コンポーネントの結合、又は基質の生成物への変換が決定される。それ故、この発明の好ましい実施態様はインビトロアッセイである。これによって、この発明のアッセイは、好ましくは、無細胞アッセイであり、PqsDタンパク質又はその変異体を試験化合物に接触させ、そしてPqsDタンパク質又はその変異体に結合する試験化合物の能力を決定することを含んでなる。試験化合物のPqsDタンパク質又はその変異体への結合は、上記に説明した如く、直接的あるいは間接的に決定することができる。あるいは、当業者であれば、PqsDタンパク質を用いて酵素反応を行なう細胞ベースの方法を使用することができる。当業者は、それによって、先行技術及び提供される教示に基づいて、そうした方法を開発する状態にある。すなわち、この発明の実施態様では、この試験システムは、動物細胞、細菌細胞又は真菌細胞などの細胞内である。好ましくは、この細胞は、クオラムセンシングシステムを含まず、より好ましくは、この細胞はHAQsを生成せず、そして更により好ましくは、この細胞はHHQを生成しない。この細胞は、上記に述べられている、少なくともpqsD遺伝子又はその機能的に活性な変異体が導入される、遺伝子操作されている細胞でありうる。この細胞がもっぱらpqsD遺伝子でトランスフェクションされている場合には、アントラニロイル-CoAを試験する方法のために加えることが必要でありうる。これに代えて、これに加えて、アントラニロイル-CoAを生成する遺伝子を、必要ならば加えることができる。こうした遺伝子は、当技術分野における当業者に知られている。例えば、こうした遺伝子は、上記に言及した2-アミノ安息香酸-CoAリガーゼ例えば、アゾアルカスエバンシイ由来配列番号:3、あるいは、上記に言及したPqsA遺伝子例えば、緑膿菌由来配列番号:2を有するタンパク質などのでありうる。この場合、アントラニロイル-CoAの代わりにアントラニラートanthranilateを試験反応に加える。pqsD遺伝子、及び場合により、PqsA遺伝子ような生成物の形成を可能にする更なる遺伝子、又は2-アミノ安息香酸-CoAリガーゼ遺伝子でトランスフェクションされた細胞及び細胞株の調製は当技術分野で知られており、そして遺伝子操作によるPqsDタンパク質の調製に関しては本明細書中に記載されている。あるいは、細胞溶解物粗製の、分画された、又は精製されたが使用されうる。こうしたものを生成する例示的な方法は当業者に知られており、フラグメンテーション、遠心分離及び再懸濁を含みうる。別の実施態様では、この方法は、上記に定義されている通り、PqsDタンパク質をコードするpqsD核酸を提供し、そしてpqsDの発現の阻害剤を特定することを含んでなる。pqsDの発現の阻害剤は、細胞を試験化合物と接触させ、そして細胞内でのpqsDmRNA又はタンパク質の発現を決定する方法で特定される。試験化合物の存在下で、pqsDmRNA又はタンパク質の発現レベルを、試験化合物の不存在下でのpqsDmRNA又はタンパク質の発現レベルと比較する。次いでこの試験化合物を、pqsDmRNA又はタンパク質の発現が、試験化合物の不存在下の場合と比較してより低い場合に、こうした比較に基づいてpqsD発現の阻害剤として特定することができる。pqsDmRNA又はタンパク質を決定する方法は、当技術分野で知られているか、または本明細書中に記載されている。試験化合物の核酸に対する作用は、種々の発現、又はシグナル伝達レベルsignaltransductionlevelsによって決定することができる。試験化合物は、pqsD遺伝子の調節配列regulatorysequence、又はpqsD遺伝子自体に結合するように設計しうる。それによって、試験化合物は、遺伝子発現に対する作用を持つことができうる。従って、試験化合物の調節配列への結合は、調節配列又は遺伝子と、試験化合物の複合体を検出することによって決定しうる。2つ又はそれより多いコンポーネントの複合体を検出する適切な方法は、本明細書中に詳述されている。調節配列は、転写因子などの調節タンパク質が優先的に結合するDNAの断片である。こうした調節タンパク質は、ゲノム中で適切に位置している通例、調節されている遺伝子の短い距離の‘上流upstream’調節領域と呼ばれるDNAの短いストレッチに結合する。そうすることによって、こうした調節タンパク質は、RNAポリメラーゼとよばれる、別のタンパク質複合体を動員することができる。このように、それらは遺伝子発現を制御する。調節配列は、通例、他の調節領域と共同して働いて、所与の遺伝子の転写のレベルを方向づけるプロモーター領域を含む。あるいは、試験化合物の作用例えば、結合及び遺伝子転写に対する作用は、間接的に検出することができる。この場合には、pqsD遺伝子の下流の作用が、検出することができる。例えば、pqsDに関連する転写及び翻訳に対する作用を決定することができる。一実施態様では、pqsDmRNA又はPqsDタンパク質の量が検出される。mRNAを検出する適切な方法には、当技術分野において知られている方法、例えば、ノーザンブロット解析、ヌクレアーゼプロテクションアッセイNPA、insituインサイチュハイブリダイゼーション、及び逆転写ポリメラーゼ連鎖反応RT-PCRが含まれる。ノーザンブロッティング手順の場合には、膜結合性pqsD核酸にハイブリダイゼーションさせるために、ランダムプライミングされたDNAプローブ、ニック翻訳を行なったDNAプローブ、又はPCRによって作製されたDNAプローブ、インビトロ転写RNAプローブ、及びオリゴヌクレオチドを含めて、非同位体放射標識プローブ又は高比活性放射標識プローブを使用することができる。これに加えて、部分的にのみ相同性を有する配列例えば、異なる種由来のcDNAをプローブとして使用することができる。ヌクレアーゼプロテクションアッセイNPAは、特異的なmRNAを検出及び定量のための極めて高感度な方法である。NPAの原理は、アンチセンスプローブ放射性標識又は非同位体をRNA試料に溶液ハイブリダイゼーションすることである。RT-PCRでは、RNAテンプレートが、レトロウイルス逆転写酵素を用いて相補的DNAcDNAにコピーされる。次いでこのcDNAを、PCRによって指数的に増幅させる。上記の方法は、核酸標識を含みうる。DNA、RNA又はオリゴヌクレオチドの標識を可能にする一連の手法は当業者に知られている。こうしたものには、例えば、DNAプローブのニックトランスレーション標識、DNAプローブのランダムプライミングDNA標識、DNAプローブのPCR標識及びオリゴヌクレオチド3’/5’末端標識、RNAプローブの転写標識、オリゴヌクレオチド3’/5’末端標識及びオリゴヌクレオチドテイリングが挙げられる。上記の標識方法に使用することができる種々の標識が知られている。それらの検出を含めてそうしたものの一部を以下に例示的に記載する:ビオチン標識化合物は、例えば、抗ビオチン抗体によって、又はアビジン又はストレプトアビジンコンジュゲートによって検出することができる。抗ビオチン抗体[例えば、モノクローナル抗ビオチン抗体又はFab-断片アルカリホスファターゼAPでコンジュゲートされている]を、ナイロンメンブレンでの発光を伴う酵素免疫アッセイによってビオチン標識核酸を検出する際に使用することができる。アビジン又はストレプトアビジンコンジュゲートは、いくつかの免疫学的検出系の場合に使用できるビオチン標識物質例えば、ビオチン化抗体を検出する場合に使用される。この場合には、例えば、ストレプトミセスアビジニイStreptomycesavidiniiに起源するアビジン又はストレプトアビジンは、アルカリホスファターゼ又はβ-ペルオキシダーゼとカップリングすることができる。プローブ-標的ハイブリッドは、酵素結合免疫アッセイを用いて検出することができる。この免疫化学検出工程は通例、放射性検出手順と比較してより高感度である。このアッセイでは、メンブレンをブロッキングし、抗体とフィルターとの非特異的相互作用を妨ぐことができる。ジゴキシゲニンに特異的なアルカリホスファターゼコンジュゲート抗体は、標識ハイブリッド上のジゴキシゲニンdigoxigenin分子を認識する。アルカリホスファターゼ基質を添加すると、このハイブリッドの可視化が可能になる。化学発光検出の場合には、アルカリホスファターゼの適切な基質は、3-4-メトキシスピロ{1,2-ジオキセタン-3,2-5-クロロトリシクロ[3.3.1.137]デカン}-4-イルフェニルホスフェート二ナトリウム、又は4-クロロ-3-メトキシスピロ{1,2-ジオキセタン-3,2-5-クロロトリシクロ[3.3.1.137]デカン}-4-イルフェニルホスフェート二ナトリウムなどのジオキセタンフェニルホスフェートである。アルカリホスファターゼによって脱リン酸化すると中間体が形成され、その分解によって、例えば、X線フィルムに記録することができる光放出がもたらされる。DIG標識プローブ比色検出は通例、レドックス系を形成する無色基質と共に行なわれる。例としては、5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリル-ホスフェート及び4-ニトロ-ブルー-テトラゾリウム-クロリドなどがある。5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリル-ホスフェートは、アルカリホスファターゼによって酸化され、ホスフェート基の放出によってインジゴになる。並列して、4-ニトロ-ブルー-テトラゾリウム-クロリドは、還元されてジホルマザンになる。この反応生成物は、メンブレンの種類によるが、水不溶性の暗青色から帯褐色沈殿を形成する。種々のレポーター分子は、検出抗体とカップリングして、特定のプローブターゲットハイブリダイゼーション[これには、酵素結合抗体enzymecoupledantibodies、蛍光色素標識抗体蛍光色素によって放出される、波長の可視化を可能にする蛍光顕微鏡及び特定のフィルターによって検出、及び金コロイドに結合する抗体冷却した切片cryostaticsectionsを電子顕微鏡によって検出などが含まれるが、それらには限定されない]を可視化することができる。複数同時ハイブリダイゼーションMultiplesimultaneoushybridizationsは、ジゴキシゲニン標識プローブ、ビオチン標識プローブ、及び蛍光色素標識プローブの組み合わせを用いて、1つの調製物中で異なる染色体領域又は異なるRNA配列を局在化させることによって行うことができる。こうしたマルチプローブmultiprobe試験は、抗体にカップリングした異なる蛍光色素の可用性によって可能になる。こうしたものには、フルオレセイン又はFITCフルオレセインイソチオシアネート;黄色、ローダミン又はTRITCテトラメチルローダミンイソチオシアネート;赤、及びAMCAアミノ-メチルクマリン酢酸;青が挙げられる。調節配列に対する作用はまた、レギュレーターregulator配列をレポーター遺伝子に結合させ、そしてその結果生じたDNAコンストラクトを細胞又は有機体organismに導入することよって検出することができる。培養液中の細菌又は真核細胞の場合には、これは通例、プラスミドと呼ばれる環状DNA分子の形態である。レポーターの発現は、目的遺伝子を成功裡に取り込むためのマーカーとして使用しているので、研究中の細胞又は有機体中、天然では発現しないレポーター遺伝子を使用することが重要である。可視的に識別可能な特性を誘導する一般的に使用されるレポーター遺伝子には通例、蛍光及び発光タンパク質が必要である;例としては、クラゲjellyfishの緑色蛍光タンパク質GFP、ルシフェラーゼ酵素、及びdsRed遺伝子由来の赤色蛍光タンパク質をコードする遺伝子が挙げられる。別の細菌中の一般的なレポーターには、lacZ遺伝子がある。細菌中の選択可能なマーカーレポーターの例には、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼCAT遺伝子がある。試験化合物の影響は、コントロールと比較して上記のシグナルの量を決定することによって検出することができる。この発明の好ましい実施形態では、方法はハイスループットスクリーニング方法である。ハイスループットスクリーニングHTSは、特に薬物発見において使用され、生物学及び化学の分野に関連する科学実験のための方法である。ハイスループットスクリーニングHTSは、例えば、ロボット工学、データ処理及び制御ソフトウェア、液体ハンドリング装置、及び高感度検出器を用いて、研究者が何千、又はそれどころか何百万個の生化学的、遺伝的又は薬理学的試験を迅速に行なうことを可能にする。このプロセスによって、特定の生体分子経路をモジュレートする活性化合物、抗体又は遺伝子を迅速に同定することができる。通例、HTSは、候補化合物のライブラリーに対するアッセイのスクリーニングを行なうのに自動化を用いる。典型的なHTSスクリーニングライブラリー又はデックスdecksは、100,000乃至2,000,000を超える化合物を含むことができる。ほとんどの場合、HTSの重要な試験容器は、マルチウェルプレート又はマイクロプレートである。HTSのための現代のマイクロプレートは通例、96、384、1536、又は3456ウェルを有している。こうしたものは、すべて96の倍数単位であり、8×129mm間隔ウェルを有しているオリジナルの96ウェルマイクロプレートを反映している。大部分のウェルは、実験的に有用な物質、しばしば、ジメチルスルホキシドDMSO及び他の何らかの化学化合物の水溶液を含み、後者はプレート全体のそれぞれのウェルごとに異なる。他のウェルは、空である場合もあり、所望の実験コントロールとして使用することが意図されている。アッセイを準備するには、研究者はプレートの各ウェルに彼らが実験を行ないたい何らかの生物学的実体を充填させる。この場合には、pqsD核酸又はタンパク質を含む実験系をその中に充填させることになる。一定のインキュベーション時間が経過して、生物学的物質を、ウェル中の化合物に吸収させ、それに結合させ、さもなければそれと反応させ又は反応させずにた後、すべてのプレートのウェル全部を、手動、又は機器によって測定する。特殊化された自動式の分析機器によって、ウェル上でいくつかの実験例えば、それらに偏光を照らし、そして反射率を測定するこれによってタンパク質結合が示されうるが行なわれうる。この場合、該機器はそれぞれの数を1つのウェルから得られた値にマッピングして、グリッド数値として各実験の結果をアウトプットすることができる。高容量分析機器は、何千という実験データポイントを非常に迅速に作成して、このように数分間隔で数十のプレートを測定することができる。この発明の方法は、例えば、ロボットプレーティングroboticplating及びロボット液体輸送例えば、微小液体を用いて、すなわち、チャネル構造を含めてロボットシステムで行なうのが好都合である。更なる局面では、この発明は微生物によって引き起こされる病原性感染を処置し、軽減し、又は予防する化合物を特定する場合に、pqsD核酸又はタンパク質の使用を提供する。用語pqsD核酸pqsDnucleicacid又はPqsDタンパク質pqsDprotein及び微生物によって引き起こされる病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するための化合物を特定することidentifyingacompoundfortreatingreducingorpreventingapathogenicinfectioncausedbyamicroorganismに関しては、それはこの発明の方法の文脈で提供されている定義を指している。上記に述べられている方法が特定のために使用することができるということが注目される。この発明の更なる局面では、本明細書中で説明されている方法によって特定される化合物によって、処置、軽減、又は予防される感染は、微生物を形成するバイオフィルムによって引き起こされ、該微生物は、例えば、カテーテル、薬剤、又は薬物ポンプ、又はプロステーシスなどの薬物送達デバイスの上又はそれらの中にバイオフィルムを形成し、該微生物は、好ましくは、シュードモナスであり、特に緑膿菌である。この発明の方法では、試験化合物は、PqsD活性の低下が検出された場合に、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するために有用である。その結果、この試験化合物は阻害剤として機能する。PqsD活性の阻害剤として機能する化合物は、この発明によって特定化され、病原性感染を処置し、軽減し、又は予防するために有用である薬剤に導かれうる。薬剤を製造する場合には、特定化された目的物又はその製薬学的に許容される塩は一般的に、所望の特性を提供するように組み合わせた製薬学的に許容される担体又は補助剤などの成分の混合物から成る医薬投与剤形の形態でなければならない。こうして特定された阻害剤の例は、2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸である。この製剤は、少なくとも1つの適切な製薬学的に許容される担体又は補助剤を含んでなる。こうした物質の例には、脱塩水、等張生理食塩水、リンゲル液、緩衝剤、有機又は無機酸及び塩基並びにその塩、塩化ナトリウム、炭酸水素ナトリウム、クエン酸ナトリウム又はリン酸二カルシウム、プロピレングリコールなどのグリコール類、オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル類、グルコース、スクロース及びラクトースなどの糖類、とうもろこしデンプン及びジャガイモデンプンなどのデンプン類、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3-ブチレングリコール、ジメチルホルムアミドなどの可溶化剤及び乳化剤、落花生油、綿実油、トウモロコシ油、大豆油、ひまし油などの油類、オレイン酸エチル、ミリスチン酸イソプロピルなどの合成脂肪酸エステル、ゼラチン、デキストラン、セルロース及びその誘導体、アルブミンなどの高分子アジュバント、有機溶媒、シトレートcitrates及び尿素などの錯化剤、安定化剤、例えば、プロテアーゼ又はヌクレアーゼインヒビター、好ましくは、アプロチニン、ε-アミノカプロン酸又はペプスタチンA、ベンジルアルコールなどの保存剤、亜硫酸ナトリウムなどの酸化防止剤、ワックス及びEDTAなどの安定化剤がある。着色剤、放出剤releasingagents、コーティング剤、甘味料、矯味矯臭剤及び芳香剤、保存剤及び抗酸化剤もまた、この組成物中に存在することができる。生理学的バッファー溶液は、およそ6.0~8.0のpH、殊におよそ6.8~7.8のpH、特におよそ7.4のpH、及び/又はおよそ200~400ミリオスモル/リットル、好ましくはおよそ290~310ミリオスモル/リットルの浸透圧モル濃度を有することが好ましい。薬剤のpHは、一般に、例えば、好ましくは、リン酸塩バッファー、トリスバッファートリスヒドロキシメチルアミノメタン、ヘペスバッファー[4-2-ヒドロキシエチルピペラジノ]エタンスルホン酸、又はMOPSバッファー3-モルホリノ-1-プロパンスルホン酸などの適切な有機又は無機バッファーを用いて調整される。それぞれのバッファーの選択は、一般的に、所望のバッファーのモル濃度に左右される。リン酸塩バッファーは、例えば、注射及び点滴溶液に適切である。薬剤を製剤化する方法並びに適切な製薬学的に許容される担体または補助剤は、当技術分野の当業者に周知である。製薬学的に許容される担体及び補助剤は、広く使用されている投与剤形及び識別された化合物に応じて、数ある中で選択される。医薬組成物は、経口、経鼻、直腸、非経口、膣内、局所的又は膣内投与用に製造することができる。非経口投与には、皮下、皮内、筋肉内、静脈内又は腹腔内投与が含まれる。薬剤はカプセル剤、錠剤、丸剤、粉末剤及び顆粒剤などの経口投与のための固体投与剤形、製薬学的に許容されるエマルション、ミクロエマルション、溶液、懸濁液、シロップ及びエリキシルなどの経口投与のための液体投与剤形、注入可能な製剤、たとえば、滅菌した注入可能な水性又は油性の懸濁液、好ましくは、坐剤である、直腸又は膣内投与のための組成物、並びに軟膏、ペースト、クリーム、ローション、ゲル、粉末、溶液、スプレー、吸入剤又はパッチなどの局所又は経皮投与のための投与剤形を含む、様々な投与形態として製剤化することができる。任意の具体的な患者のための具体的な治療的に有効な投与量レベルは、特定された化合物の活性、投与剤形、患者の年齢、体重及び性別、処置期間、及び医療分野においてよく知られている同種類のファクターを含めて種々のファクターに左右されるであろう。ヒト又は他の哺乳類に1回又は分割投与で投与されるこの発明の化合物の1日当たりの総投与量は、例えば、約0.01~約50mg/kg体重の量でありえ、あるいは、より好ましくは約0.1~約25mg/kg体重でありうる。単回投与の組成物はこうした量又はその約数を含み、1日投与量を作製することができる。一般に、この発明による処置レジメンは、こうした処置を必要とする患者に、1日あたり約10mg~約1000mgのこの発明の化合物の化合物複数を含むを単回又は複数回投与量で投与することを含んでなる。本発明を更に、以下の図面及び実施例によって説明するが、該図面及び実施例は、この発明の範囲を説明するためであり、この発明の範囲を限定する意図ではない。実施例1:PqsDタンパク質によるHHQの生成実験プロトコル:HHQの構造は、その生成はアントラニル酸又はそのCoA誘導体を3-オキソデカン酸と縮合することによって行なわれることが示唆されている図2。この理論は、キノリン環系のヘテロ環部分が更に、アセタートユニットacetateunitsから合成される必要があるということを明確に示している標識アセタートでの検討が供給されたことによって裏付けられたBredenbruchFetalJBacteriol200518736303635。キノリン環の3と4の炭素間の炭素-炭素結合の形成は、β-ケトアシル-アシルキャリアタンパク質シンターゼIIIファミリーにすべて相同性を示す、タンパク質PqsB、PqsC又はPqsDの1つによって触媒される可能性がある。PqsDがHHQ生成に必要であるかどうかを試験するために、我々は組み換えPqsDタンパク質を精製し、そしてインビトロでHHQ生成を再調整することを試みた。非相同的タンパク質を、アントラニロイル-CoA及び3-オキソデカン酸と共にインキュベートし、そしてこの反応をHPLC-MSによって解析した。結果:このアッセイにおけるHHQの生成を、同じ保持時間14.4分で溶出し、そして同一のマススペクトル及びフラグメンテーションパターンを示した、HHQ参照物質と比較することによって確認した図3A及び3B。HPLC-MS2によるHHQの定量化方法を、159Daで最も豊富なabundantHHQのフラグメントイオンに基づいて展開した。これによって、インビトロアッセイにおいて生成されたHHQの量が決定されうる。アントラニロイル-CoAの濃度を200μMに固定し、3-オキソデカン酸の濃度を変化させて、PqsDの反応速度論パラメーターが付与された。3-オキソデカン酸の場合のPqsDのKm値はこの条件下で、562±91μMであった図4。実施例2:インビトロでのPqsD阻害剤の決定実験プロトコル:今まで確立してきたPqsDアッセイを用いて、インビトロにおけるPqsDによるHHQ生成の阻害剤である可能性をスクリーニングすることが可能である。この目的のために、アントラニロイル-CoA、3-オキソデカン酸及びPqsDタンパク質の濃度に一定値を付与する。初めにPqsD、アントラニロイル-CoA及び試験化合物を一定期間プレインキュベートした。想定される阻害剤を、濃度を増加させながらアッセイに加えた。この反応を3-オキソデカン酸を添加することによって開始し、そして一定期間インキュベートした。次いでこの反応を、メタノールを添加することによってクエンチし、50パーセントの最終濃度にした。それぞれの反応の場合、HHQ生成をHPLC/MS2によって定量化した。異なる濃度の阻害剤の存在下で、生成したHHQの量を、阻害剤を加えないコントロール反応の濃度と比較することによって、HHQ生成がコントロール反応の50パーセントである阻害剤の濃度IC50を算出することができる。細菌FabHの公知の阻害剤である2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸NieZetalJMedChem20054815961609を、PqsDを用いて濃度5、10、20、50、100及び200μM試験した。結果:PqsDによるHHQ生成の場合、2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸のIC50は、約35μMの範囲であると決定された図5。この知見は、PqsDの可能性のある阻害剤のスクリーニングにおいて、このアッセイを用いる原理の実験的証拠として役立つ。これは、インビボ実験の起こりうる不明瞭な点がなく、インビトロでの阻害剤スクリーニングを可能にした。インビボで阻害剤を試験することは、病原菌株を用いて検討することを意味する。優れた阻害剤候補のインビボでの試験は不可欠であるけれども、そうしたことは、インビボで物質ライブラリーの全体をスクリーニングする必要がある場合には、望ましくない。このことは、インビトロアッセイで提示される非常に大きい利点である。こうしたことによって、細菌における他の相互連続したクオラムセンシングシステムによって影響されない迅速な結果が届けられる。実験プロトコル材料:アントラニル酸は、SigmaAldrichから購入した。補酵素ACoAトリリチウム塩は、AppliChemから購入した。4-ヒドロキシ-2-ヘプチルキノリンは、SusanneHaeuslertheDepartmentofChronicalPseudomonasInfectionsattheHelmholtzCentreforInfectionResearchBraunschweigから供給された。エチル3-オキソデカノアートは、PharmtenChemicalCoChinaから購入した。3-オキソ-デカン酸の合成:NaOHの2.05M水溶液2.5mmol1.22mlのH2O中を、室温でエチル3-オキソ-デカノアート215mg,1.00mmolに加え、そしてこの混合物を終夜撹拌した。水で希釈した後、アルカリ溶液pH12~13を、エチルエーテルで抽出したこのエチルエーテルは捨てた。水層を1MHCl水溶液で酸性にし、pHを1とし、そして遊離の酸をジクロロメタンで3回dichloromethane3抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、そして蒸発させるとβ-ケト酸が白色固体として生じた163mg,0.875mmol,88。1HNMRケトδ086121132152164254349エノールδ2215011180。2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸の合成:合成はNieZetalδ122786884Hz1H80815及び79Hz1H78817及び81Hz1H77780Hz1H73876972678Hz1H71779Hz1H705。図6は、2-[2-フェノキシビフェニル-4-カルボニルアミノ]安息香酸の化学構造を示す。アントラニロイル-CoAの合成:アントラニロイル-CoAは、下記に述べられている通り、アントラニル酸及びCoAから、アゾアルカスエバンシイに起源する2-アミノ安息香酸-CoAリガーゼによってインビトロで創成された。細菌菌株、プラスミド及び培地:緑膿菌PseudomonasaeruginosaUCBPP-PA14RahmeLGetalScience199526818991902に起源するゲノムDNAを、SusanneHaeuslertheDepartmentofChronicalPseudomonasInfectionsattheHelmholtzCentreforInfectionResearchBraunschweigら得た。エッシェリキアコリDH10BInvitrogen及びプラスミドpET28bNovagenを、DNA操作のために使用した。Stratageneに起源するエッシェリキアコリEcoliBL21DE3を、N末端Hisタグタンパク質の発現のために使用した。培地及び増殖条件は、SambrooketalLesicBetalPLoSPathog2007312291239NiNetalMedResRev20092965124NieZetalJMedChem20054815961609RahmeLGetalScience199526818991902SambrooketalMolecularcloningAlaboratorymanualColdSpringHarborNYColdSpringHarborLaboratoryPress2001。"