生物学的試料における生物の複数の血清型の存在または非存在を検出するマルチプレックスアッセイであって、前記アッセイは、存在する検出のためのチャネルより多くの血清型を検出し、前記マルチプレックスアッセイが、生物学的試料を用意するステップと;前記生物学的試料を少なくとも3つのオリゴヌクレオチドプライマー/プローブのセットと接触させるステップであって、そのセットの各々が、検出可能な形で標識されており、ヌクレオチド配列の長さが約10から約50である少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプローブと、それらの各々のヌクレオチド配列の長さが約10から約150である少なくとも2つのオリゴヌクレオチドプライマーとを備え、前記接触が、プローブおよびプライマーが標的配列にアニーリングするような条件下で行われ、各プライマー/プローブのセットは、生物の特定の血清型に対して少なくとも優先的であり、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび第2のプライマー/プローブのセットは、互いに対して縮重しており、前記縮重プローブは各々、同じチャネルにおいて検出可能なシグナルを発するシグナル部分を有し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記他の2つのプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記縮重プライマー/プローブのセットが優先的にアニーリングする血清型ではない第3の血清型を識別し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記縮重プローブのシグナル部分により発せられる波長と同じまたは異なる波長のシグナルを発するシグナル部分を有する、ステップと;存在する場合は、前記標的配列を増幅するステップと;前記プローブセットの前記標的配列に対するハイブリダイゼーションの指標としての標識を検出のためにモニタリングし、これにより、HPVの血清型のうちの少なくとも1つの存在または非存在を示すステップと、を含むことを特徴とするマルチプレックスアッセイ。前記生物はヒトパピローマウイルスHPVであることを特徴とする請求項1に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの前記標的は、配列番号36~38からなる群から選択されることを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項2に記載のアッセイ。ヒトパピローマウイルスHPVの複数の血清型を検出するためのプローブセットであって、該プローブセットが、少なくとも3つのオリゴヌクレオチドプライマー/プローブのセットを備え、そのセットの各々が、検出可能な形で標識されており、ヌクレオチド配列の長さが約10から約50である少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプローブと、各々のヌクレオチド配列の長さが約10から約150である少なくとも2つのオリゴヌクレオチドプライマーとを備え、各プライマー/プローブのセットは、前記HPV生物の特定の血清型に対して少なくとも優先的であり、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび第2のプライマー/プローブのセットは、互いに対して縮重しており、前記縮重プローブは各々、同じチャネルにおいて検出可能なシグナルを発するシグナル部分を有し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記縮重プライマー/プローブのセットが優先的にアニーリングする血清型ではない第3の血清型を識別し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび第2のプライマー/プローブのセットにおけるプローブの波長と同じかまたは異なる波長のシグナルを発するシグナル部分を有する、ことを特徴とするプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36~38からなる群から選択されることを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも70相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも80相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号24~29、および配列番号24~29と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型39を選択し、HPV血清型68に対してHPV血清型39を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5、ならびに配列番号1、3および5と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型68を選択し、HPV血清型39に対してHPV血清型68を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6、ならびに配列番号2、4および6と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型33を選択し、HPV血清型58に対してHPV血清型33を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号7、9、11、13、および15、ならびに配列番号7、9、11、13、および15と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型58を選択し、HPV血清型33に対してHPV血清型58を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号8、10、12、14、および16、ならびに配列番号8、10、12、14、および16と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別するように構成され、前記第1のプライマー/プローブのセットまたは第2のプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記プライマー/プローブのセットは、配列番号30~35、および配列番号30~35と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第1のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型56を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第1のプライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21、ならびに配列番号17、19および21と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択され;前記第2のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型66を選択し、HPV血清型56に対してHPV血清型66を識別せず、前記第2のプライマー/プローブのセットは、配列番号18、20、22、および23、ならびに配列番号18、20、22、および23と少なくとも90相同である配列からなる群から選択される配列のうちの少なくとも1つから選択される、ことを特徴とする請求項13に記載のプローブセット。ヒトパピローマウイルスHPVの複数の血清型を検出するためのキットであって、該キットが、少なくとも3つのオリゴヌクレオチドプライマー/プローブのセットを備え、そのセットの各々が、前記HPV生物の特定の血清型のための、検出可能な形で標識された、ヌクレオチド配列の長さが約10から約50である少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプローブと、各々のヌクレオチド配列の長さが約10から約150である少なくとも2つのオリゴヌクレオチドプライマーとを備え、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび第2のプライマー/プローブのセットは、互いに対して縮重しており、前記縮重プローブは各々、同じチャネルにおいて検出可能なシグナルを発するシグナル部分を有し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記他の2つのプライマー/プローブのセットに対して縮重しておらず、前記縮重プライマー/プローブのセットが優先的にアニーリングする血清型ではない第3の血清型を識別し、前記第3のプライマー/プローブのセットは、前記縮重プライマー/プローブにおけるプローブのシグナル部分により発せられる波長と同じかまたは異なる波長のシグナルを発するシグナル部分を有する、ことを特徴とするキット。前記第1の縮重プライマー/プローブのセットおよび第2の縮重プライマー/プローブのセットについての、前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36~38からなる群から選択されることを特徴とする請求項24に記載のキット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36であり、前記第1の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号1、3および5を含み、前記第2の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6を含むことを特徴とする請求項24に記載のキット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37であり、前記第1の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号7、配列番号15、ならびに配列番号9、11、および13のうちの1つを含み、前記第2の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号8、配列番号15、ならびに配列番号10、12、および14のうちの1つを含む、ことを特徴とする請求項24に記載のキット。前記縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38であり、前記第1の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号17、19および21を含み、前記第2の縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号18、配列番号20、ならびに配列番号22および23のうちの1つを含む、ことを特徴とする請求項24に記載のキット。前記第3のプライマー/プローブのセットは、配列番号24~26、配列番号27~29、配列番号30~32、および配列番号33~35からなる群から選択されることを特徴とする請求項24に記載のキット。前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型51を識別し、配列番号24~26および配列番号27~29からなる群から選択されることを特徴とする請求項29に記載のキット。前記第3のプライマー/プローブのセットは、HPV血清型59を識別し、配列番号30~32および配列番号33~35からなる群から選択されることを特徴とする請求項29に記載のキット。前記第3のプライマー/プローブのセットの検出プローブの前記シグナル部分は、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび前記第2のプライマー/プローブのセットの検出プローブにより発せられる波長と同じ波長を発することを特徴とする請求項29に記載のキット。前記第3のプライマー/プローブのセットの検出プローブの前記シグナル部分は、前記第1のプライマー/プローブのセットおよび前記第2のプライマー/プローブのセットの検出プローブにより発せられる波長と異なる波長を発することを特徴とする請求項29に記載のキット。本発明は、Taq-Man化学反応を活用して、存在する検出のためのチャネルより多くのHPV型を同時に検出する、リアルタイムのPCR増幅を対象とする。言い換えれば、N個のチャネルを伴うアッセイにおいて、検出されるHPV型の数は、少なくともN1個である。本アッセイは、アッセイが検出するように構成されている各HPV型を検出するためのプライマー/プローブのセットを活用する。本アッセイによる検出に対して感受性である多様な血清型には、例えば、HPVの33型、39型、51型、56型、58型、59型、66型、および68型が含まれる。当業者は、本明細書で説明されるプライマー/プローブのセットを、他のHPV型例えば、16型、18型、および45型に対する他のプライマー/プローブのセットと組み合わせうることを理解するであろう。単一のプライマー/プローブセットを用いて、少なくとも1つの型を検出する。Taq-Manアッセイを用いるPCR増幅の状況では、プライマー/プローブのセットは、少なくとも、フォワードプライマー、リバースプライマー、およびプローブである。互いに対して縮重しているオリゴヌクレオチド配列を伴うプライマー/プローブ対のセットにより、少なくとも2つの型を選択する。本明細書で用いられる縮重配列とは、近縁の異なる型の同じ遺伝子の同じ遺伝子座と相補的であり、それらを2つの型に識別させるような、互いに対するわずかな配列のばらつきを有する、2つのオリゴヌクレオチドプライマーまたはオリゴヌクレオチドプローブである。本発明の一実施形態では、縮重プライマー/プローブのセットが、HPVの39型および68型を検出するためのセットである。このプライマー/プローブのセットは、両方の型のE6遺伝子における同じ遺伝子座を標的とする。この標的の長さは91ヌクレオチドであり、これを図1に示す。この標的は、E6遺伝子全体のうちの一セグメントであるに過ぎない。HPVの39型および68型の縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号36である。好ましい実施形態では、両方のプローブのシグナル部分が、CY5として市販されているシアニン色素標識である。この実施形態では、縮重していないプライマー/プローブのセットが、HPVの51型を識別する。51型に対するプライマー/プローブのセットもまた、異なる遺伝子座においてであるが、E6遺伝子を標的とする。好ましい実施形態では、このプライマー/プローブのセットにおけるこのプローブのシグナル部分がFAMであり、これについては以下で具体的に確認する。本発明の第2の実施形態では、縮重プライマー/プローブのセットが、HPVの33型および58型を検出するためのセットである。このプライマー/プローブのセットは、両方の型のE6遺伝子における同じ遺伝子座を標的とする。この標的の長さは138ヌクレオチドであり、これを図2に示す。この標的は、E6遺伝子全体のうちの一セグメントであるに過ぎない。HPVの33型および58型の縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号37である。好ましい実施形態では、両方のプローブのシグナル部分が、FAMである。この実施形態では、縮重していないプライマー/プローブのセットが、HPVの59型を識別する。59型に対するプライマー/プローブのセットもまた、E6遺伝子を標的とするが、必ずしも同じ遺伝子座ではない。好ましい実施形態では、このプライマー/プローブのセットにおけるこのプローブのシグナル部分がCY5であり、これについては以下で具体的に確認する。本発明の第3の実施形態では、縮重プライマー/プローブのセットが、HPVの56型および66型を検出するためのセットである。このプライマー/プローブのセットは、両方の型のE6遺伝子における同じ遺伝子座を標的とする。この標的の長さは79ヌクレオチドであり、これを図3に示す。この標的は、E6遺伝子全体のうちの一セグメントであるに過ぎない。HPVの56型および66型の縮重プライマー/プローブのセットの標的は、配列番号38である。好ましい実施形態では、両方のプローブのシグナル部分が、CY5である。この実施形態では、縮重していないプライマー/プローブのセットが、HPVの59型を識別する。59型に対するプライマー/プローブのセットは、E6遺伝子を標的とする。好ましい実施形態では、このプライマー/プローブのセットにおけるこのプローブのシグナル部分がCY5であり、これについては以下で具体的に確認する。この実施形態では、HPVの59型に用いられるシグナル部分と同じシグナル部分を、HPVの56型_66型にもまた用いる。この実施形態では、同じ色素を同じチャネルに割り当てるので、HPVの59型と、56型_66型とは光学的に識別されることがない。この実施形態は、さらに別のHPV血清型に対するさらに別のプライマー/プローブのセット縮重の場合もあり、識別性の場合もある例えば、HPVの33血清型および58血清型に対する縮重プライマー/プローブのセットを活用するマルチプレックスアッセイを意図する。このHPVの他の血清型に対するシグナル部分は、CY5ではなく、Cy5の発光波長とは検出可能な形で異なる波長で発光する例えば、FAM。他の実施形態では、HPVの59型に対するシグナル部分がFAMであり、これは、HPVの56血清型および66血清型に対する縮重プライマー/プローブのセットに対するCY5によるシグナル部分と光学的に識別されうる。代替的実施形態は、本明細書で説明されるプライマー/プローブのセットおよび縮重プライマー/プローブのセットによる任意の組合せおよびすべての組合せを伴うアッセイまたはプローブセットまたはキットを意図する。具体的に述べると、HPV血清型であるHPV51またはHPV59に対するプライマー/プローブのセットのうちの任意のセットを、HPV血清型であるHPV39_68、HPV33_58、およびHPV56_66に対する縮重プライマー/プローブのセットのうちの任意のセットと組み合わせることができる。具体的に述べると、HPV51に対するプライマー/プローブのセットを、HPV39_68、HPV33_58、およびHPV56_66のうちの1または複数による縮重プライマー/プローブのセットと組み合わせるアッセイまたはプローブセットまたはキットを意図する。HPV59に対するプライマー/プローブのセットを、HPV39_68、HPV33_58、およびHPV56_66のうちの1または複数による縮重プライマー/プローブのセットと組み合わせるアッセイまたはプローブセットまたはキットである。プローブのシグナル部分が同じ色素かまたは異なる色素である実施形態を意図する。マルチプレックスアッセイを意図するので、プライマー/プローブのセットを、HPVの他の血清型の存在または非存在を検出するように構成された他のプライマー/プローブのセットと組み合わせることができる。縮重プライマー/プローブのセットにおける検出プローブのシグナル部分が、HPVの51血清型または59血清型に対するプライマー/プローブのセットのシグナル部分と同じである実施形態では、マルチプレックスアッセイが、HPVの第4の血清型例えば、HPV31、HPV52、HPV45などに対する第4のプライマー/プローブのセットを包含し、この第4のプライマー/プローブのセットが、縮重プライマー/プローブのセットおよびHPV51またはHPV59のプライマー/プローブのセットの検出プローブのシグナル部分と異なるシグナル部分を有することを意図する。本明細書ではまた、1つのアッセイにおいて2つの縮重プライマー/プローブのセットを組み合わせるマルチプレックスアッセイも意図する。例えば、1つのマイクロウェルにおいて、HPVの33血清型および58血清型の存在を検出するための、第1の縮重プライマー/プローブのセットを、HPVの56血清型および66血清型の存在または非存在を検出するための、第2の縮重プライマー/プローブのセットと組み合わせることができる。これらの実施形態では、第1の縮重プライマー/プローブのセットのプローブが、第2の縮重プライマー/プローブのセットのシグナル部分の発光波長とは検出可能な形で異なる波長で発光するシグナル部分を有する。この例では、HPVの33血清型および58血清型に対するプローブのシグナル部分がFAMであり、HPVの56血清型および66血清型に対するプローブのシグナル部分がCY5となる。上記で説明したシグナル発生部分に加えて、プローブはまた、非蛍光性のダーククエンチャーも有する。適切なダーククエンチャーの一例は、BHQ商標1BiosearchTechnologiesであり、これは、FAMフルオロフォアと共に用いるのに適する。適切なクエンチャーの別の例は、BHQ商標2BiosearchTechnologiesであり、これは、CY5フルオロフォアと共に用いるのに適する。シグナル発生部分の他の例は当業者によく知られており、本明細書では詳述しない。本明細書で用いられるプライマーという用語は、核酸鎖に相補的であるプライマーの伸長産物の合成が触媒される条件下に置かれたとき、相補鎖に沿った合成の始点として作用することが可能なオリゴヌクレオチドを指す。このような条件は、適切な緩衝液緩衝液は、補因子であるか、またはイオン強度、pHなどに影響を及ぼす成分を包含する中で、適切な温度における、4つの異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸およびDNAポリメラーゼまたは逆転写酵素などの重合化誘導剤の存在を包含する。本明細書で用いられるオリゴヌクレオチドプライマーは、精製された制限消化産物の場合のように、天然の場合もあり、または合成により作製される場合もある。増幅における効率を最大とするには、プライマーが一本鎖であることが好ましい。本明細書で用いられるプライマー対とは、PCRによるアンプリコンを生成させる核酸ポリメラーゼの存在下において、核酸のセグメントのPCR増幅に関与することが可能な、フォワードプライマーおよびリバースプライマーの2つのプライマーを指す。プライマー対を含むプライマーは、同じHPV遺伝子に特異的であり、その結果として、単一のHPV遺伝子に由来するヌクレオチド配列からなるアンプリコンを生成させることが可能である。代替的に、プライマー対を含むプライマーは、HPVゲノム内で互いに対して近接する範囲内に位置する、異なるHPV遺伝子に特異的であり、これにより、複数の遺伝子に由来するヌクレオチド配列からなるアンプリコンを生成させることも可能である。本発明のフルオロフォアについて本明細書で用いられる異なるイメージングスペクトルとは、各フルオロフォアが、特定のアッセイで用いられる他のすべてのフルオロフォアと比べて異なる発光極大値においてエネルギーを発することを意味する。固有の発光極大値を伴うフルオロフォアを用いることにより、特定のアッセイにおいて用いられる複数のフルオロフォアの各々により発せられる蛍光エネルギーを同時に検出することが可能となる。本明細書で用いられる、本発明のオリゴヌクレオチドプライマーおよびオリゴヌクレオチドプローブについて使用される識別性という用語は、前記プライマーおよびプローブが、単一のHPV型に特異的であることを意味する。これは、単一のHPV型に特異的であるが、他のHPV型とある程度の相同性も共有するHPVプライマーおよびHPVプローブを包含する。本発明の識別性のプライマーおよびプローブは、少なくとも1ヌクレオチド以上において、他のHPV型との3’側における相同性を欠くオリゴヌクレオチドを包含する。特定の位置において特定のHPV型に固有であり、アライメントにおいてこのHPV型を他のHPV型から識別するように作用するこのような残基を、識別性塩基と称する。オリゴヌクレオチドについての識別性という用語は、複数のHPV型に特異的であるプライマーおよびプローブ、すなわち、複数のHPV型との完全な相同性を共有するプライマーおよびプローブを包含しない。この点において、本明細書で開示される縮重プライマー/プローブのセットは、それに対してこれらの縮重プライマー/プローブのセットが構成されるHPV型を識別しない。例えば、HPVの39型および68型を標的とする縮重プライマー/プローブのセットについて述べると、HPVの39型に対するプライマー/プローブのセットは、HPVの39型をHPVの68型よりも優先するが、HPVの39型をHPVの68型に対して識別するわけではない。縮重プライマー/プローブのセットは、HPV型を識別するわけではないため、プローブは、同じシグナル部分を有することが好ましい。アッセイは、凝集物におけるこれらのHPV型の存在または非存在を決定するように構成されているので、この目的で2つの光学的チャネルを用いる必要はない。さらに、マルチプレックスアッセイのための単一のマイクロウェルにおいて、縮重プライマー/プローブのセットを、他のプライマー/プローブのセットと混合する場合、他のプライマー/プローブのセット識別性の場合もあり識別性でない場合もあるに対するシグナル部分は、同じ場合もあり、異なる場合もある。アッセイのシグナル部分は、大部分、設計の選択の問題である。当業者は、特定のHPV型が存在するかどうかを知る必要がある場合、同じマイクロウェルにおいて、プライマー/プローブのセットにおいて同じシグナル部分を用いるであろう。これらの型のうちの1つだけが存在するかどうかを知れば十分である場合は、異なるHPV血清型に対するプライマー/プローブのセットにおいて同じシグナル部分を用いることができる。本明細書で用いられるアンプリコンとは、核酸ポリメラーゼおよび特定のプライマー対の存在下において、核酸を含む試料をPCR増幅することにより生成させる、特定のPCR反応産物を指す。アンプリコンは、単一のHPV型の単一の遺伝子に由来するヌクレオチド配列からなる場合もあり、アンプリコンは、単一のHPV型の複数の遺伝子に由来するヌクレオチド配列からなる場合もある。本明細書で用いられるプライマー/プローブのセットとは、単一のHPV型の特定のヌクレオチド配列とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプライマーの対およびオリゴヌクレオチドプローブの組み分けを指す。前記オリゴヌクレオチドのセットは、aHPV型の核酸配列の第1の位置とハイブリダイズする識別性のフォワードプライマー;b第1の位置の下流にある、HPV型の核酸配列の第2の位置とハイブリダイズする識別性のリバースプライマー;およびcこれらのプライマー間に位置するHPV型の核酸配列とハイブリダイズする、フルオロフォアおよびクエンチャーで標識された蛍光プローブからなる。言い換えれば、オリゴヌクレオチドのセットは、単一のHPV型に特異的なアンプリコンの合成を開始させることが可能な、特定のPCRプライマーのセットと、このアンプリコンとハイブリダイズする蛍光プローブとからなる。本明細書で用いられる複数とは、2つ以上を意味する。オリゴヌクレオチドのセット、オリゴヌクレオチドプライマー、またはオリゴヌクレオチドプローブについて本明細書で用いられる特異的にハイブリダイズするとは、前記オリゴヌクレオチドのセット、オリゴヌクレオチドプライマー、またはオリゴヌクレオチドプローブが、単一のHPV型の核酸配列とハイブリダイズすることを意味する。本明細書で用いられる遺伝子とは、ポリペプチド鎖の生成に関与する核酸のセグメントを意味する。遺伝子は、翻訳配列コード領域、ならびに5’側の非翻訳配列および3’側の非翻訳配列非コード領域のほか、個別のコードセグメントエクソン間の介在配列イントロンも包含する。本発明の実施形態を説明する目的では、HPVゲノムが、複数の遺伝子:例えば、L1遺伝子、L2遺伝子、およびE1遺伝子、E2遺伝子、E4~E7遺伝子を有する。本明細書で用いられる遺伝子座とは、形質に対応する遺伝子が存在する染色体上の位置を指す。遺伝子座という用語は、特定の遺伝子の対立遺伝子のうちのいずれか1つを包含する。遺伝子座はまた、異なるHPV型に由来する相同遺伝子も包含する。例えば、HPV16およびHPV6におけるL1遺伝子を検出するPCRアッセイは、異なるHPV型に由来する配列を検出するにも関わらず、単一の遺伝子座についてのアッセイである。これに対し、例えば、単一のHPV型のL1遺伝子およびE1遺伝子を検出するアッセイは、単一のHPV型を検出するアッセイではあるが、多重遺伝子座アッセイである。本明細書で用いられるHPVとは、ヒトパピローマウイルスを意味する。HPVとは、現在知られているものであれ、以下で説明されるものであれ、任意の種類のHPVを指すのに用いられる一般的な用語である。本明細書で用いられるフルオロフォアとは、レーザー、タングステン灯、水銀灯、もしくはキセノン灯、または発光ダイオードで励起されると、確定したスペクトルを有する光の形態でエネルギーを放出する蛍光レポーター分子を指す。蛍光共鳴エネルギー移動FRET過程において、フルオロフォアから発せられる光は、その励起スペクトルが、このフルオロフォアの発光スペクトルと重複する第2の分子を励起させうる。フルオロフォアの発光エネルギーが別の分子へと移動することにより、フルオロフォアの発光を消光させる。この第2の分子は、クエンチャー分子として知られている。本明細書では、フルオロフォアという用語が、蛍光レポーターという用語と互換的に用いられる。本明細書で用いられるクエンチャーまたはクエンチャー分子とは、フルオロフォアを含む蛍光プローブと連結されると、フルオロフォアにより発せられるエネルギーを受け取り、これにより、フルオロフォアの発光を消光させることが可能な分子を指す。クエンチャーは、蛍光性で、受け取ったエネルギーを光として放出する場合もあり、非蛍光性で、受け取ったエネルギーを熱として放出する場合もあり、プローブの長さに沿った任意の位置に結合させることができる。本明細書で用いられるダーククエンチャーとは、非蛍光性クエンチャーを指す。本明細書で用いられるプローブとは、該プローブのうちの少なくとも1つの配列による、標的領域内の配列または検出される領域内の配列との相補性のために、標的核酸内の配列と共に二重鎖構造を形成することが可能なオリゴヌクレオチドを指す。プローブという用語は、フルオロフォアおよび結合させたクエンチャー分子を伴うかまたは伴わない、上記で説明したオリゴヌクレオチドを包含する。蛍光プローブという用語は、フルオロフォアおよびクエンチャー分子を含むプローブを指す。本明細書で用いられるFAMとは、フルオロフォアである、6-カルボキシフルオレセインを指す。本発明の他の実施形態は、HPVのE6/E7遺伝子領域に結合する、異なるオリゴヌクレオチド配列を用いる。本明細書で説明されるオリゴヌクレオチドは、標的核酸配列およびその相補鎖に結合することが可能な配列を有する。本明細書で説明されるオリゴヌクレオチドはまた、HPVのE6/E7遺伝子の核酸配列を増幅することによる検出を容易とするように、単独で用いることもでき、組み合わせて用いることもできる。一実施形態では、遺伝子の標的部分において、Taq-Man登録商標リアルタイムPCRアッセイを実施するようにプローブを設計する。Taq-Man登録商標リアルタイムPCRアッセイに用いられる3つの縮重プローブのセットそれらのオリゴヌクレオチド配列との関係で説明されるの例については、以下で説明する。具体的に述べると、第1の縮重プライマー/プローブのセットがHPVの39型および68型に対するセットである第1の実施形態では、HPVの39型を優先するプライマー/プローブのセットが、配列番号1、3および5である。HPVの68型を優先するプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6である。配列番号1および2はいずれも、Taq-Manのフォワードプライマーであり、互いに対して縮重している。配列番号3および4はいずれも、Taq-Manのリバースプライマーであり、互いに対して縮重している。配列番号5および6はいずれも、Taq-Manのプローブであり、互いに対して縮重している。HPVの33型および58型に対する縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号7~16であり、これには、2つの代替的なリバースプライマーの配列が含まれるが、配列番号13および14が好ましい。HPVの56型および66型に対する縮重プライマー/プローブのセットは、配列番号17~23である。HPVの51血清型を選択するかまたは識別するプライマー/プローブの配列は、配列番号24~29である。HPVの59型を選択するかまたは識別するプライマー/プローブの配列は、配列番号30~35である。上記で言及したすべての配列を、以下の表1に列挙する。以下の表では、Dを検出物質とし、FPをフォワードプライマーとし、RPをリバースプライマーとする。上記の表に記載したプライマー/プローブのセットの標的領域の位置を、以下の表1Aに記載する。縮重プライマー/プローブのセットの標的領域間には配列の相同性が存在するが、これらの領域の座標は、遺伝子型に依存する。さらなる実施形態では、本方法は、異なるが近縁の2つのHPV型を選択するための少なくとも1つの縮重プライマー/プローブのセットと、第3のHPV型を識別するプライマー/プローブのセットとを用いて試料を処理する工程を含む。この場合、縮重プローブのシグナル部分は同じ波長のシグナルを発し、好ましくは、2つの縮重プローブでシグナル発生部分は同じである。第3のHPV型を識別するプライマー/プローブのセットのシグナル発生部分は、縮重プローブのシグナル発生部分により発せられる波長とは異なり、したがって、個別に検出可能である波長のシグナルを発する。これらのプライマー/プローブのセットは、増幅された核酸産物の存在または非存在を検出するための核酸増幅反応において用いられる。別の実施形態では、HPVを検出するためのキットが提供される。該キットは、異なるが近縁の2つのHPV型を選択する少なくとも1つの縮重プライマー/プローブのセットと、第3のHPV型を識別するプライマー/プローブのセットとを包含する。この場合、縮重プローブのシグナル部分は、同じ波長のシグナルを発し、好ましくは、2つの縮重プローブでシグナル発生部分は同じである。第3のHPV型を識別するプライマー/プローブのセットのシグナル発生部分は、縮重プローブのシグナル発生部分により発せられる波長とは異なり、したがって、個別に検出可能である波長のシグナルを発する。プライマー/プローブのセットは、その生物を検出するのに用いることができる標的配列を増幅することが可能である。キットには、増幅アッセイを実施するためのオリゴヌクレオチドのうちの1または複数、および緩衝剤試薬が備えられている。キットのさらに別の態様では、Taq-ManPCRを目的とするオリゴヌクレオチドおよび試薬を提供することができる。この態様では、3つのオリゴヌクレオチドが提供される。3つのオリゴヌクレオチドのうちの2つは、増幅プライマーであり、第3のオリゴヌクレオチドは、検出物質として構成されている。本明細書で説明されるオリゴヌクレオチドプローブおよびオリゴヌクレオチドプローブのセットは、とりわけ、HPV型を選択または識別する目的で設計される。具体的に述べると、近縁の2つのHPV型のうちの1つを何らかの形で選択する縮重プライマー/プローブのセットを、前記近縁のHPV型とは異なる、第3のさらなるHPV型を識別する、少なくとも1つの他のプライマー/プローブのセットと組み合わせる。試料中に特定のHPV型が存在する場合は、プライマー/プローブのセットが、検出可能なシグナルをもたらす。好ましい実施形態では、他の方法例えば、TMA法およびLCR法もまた意図されるが、PCR例えば、Taq-ManPCRである検出法が用いられる。さらに、存在する検出のためのチャネルより多くのHPV型を検出するためのキットも開示される。図1に言及すると、HPV型に特異的な縮重プライマー/プローブのセットが、図示されるE6遺伝子の標的領域とのアライメントとの関連で記載されている。図1は、フォワードプライマー領域10、Taq-Man検出領域20、およびリバースプライマー領域30を示す。図1はまた、縮重フォワードプライマー11、12、縮重リバースプライマー31、32、ならびに縮重プローブ21および22も、標的配列40におけるそれらの対応する領域との関連で示す。ボックス60、70、および80には、標的配列40における、フォワードプライマー領域、リバースプライマー領域、および検出プローブ領域に対する変化だけを示す。これらの領域間における配列の縮重に注目すると、このことから、これらの領域では配列の変化が増大するために、これらの領域はそれほど望ましくないことを観察することができる。例えば、ボックス60では、ボックス60により枠囲いされた標的配列40の部分と、HPVの39型標的の同じE6部分との間に一塩基多型T、Cが見られることに注目されたい。ボックス60、70、および80は、HPVの68型および39型の異なる株の標的に対する塩基多型を示す。これらの異なる株、ならびに塩基多型標的に対するの数および位置を、表2で報告する。HPV39のフォワードプライマー11は、HPV68のフォワードプライマー12に対して一塩基多型を有し、したがってこれに対して縮重している。フォワードプライマー11を配列番号1とし、フォワードプライマー12を配列番号2とする。2つの配列間における縮重が容易に観察される。CCACTAGCTGCATGCCAATCCCATTAGCTGCATGCCAATC下線を付すことにより各縮重を示す。縮重は、フォワードプライマーには、HPVの39型に結合することを優先させ、フォワードプライマー12には、HPVの68型に結合することを優先させる。縮重プライマー/プローブのセットは、1つのHPV型の標的に結合することを、他の型の標的に結合することより優先するが、識別するわけではない。図について述べると、プライマー/プローブのセットは、標的との関連で記載されている。ボックス60、70、および80は、ボックス60、70、および80により枠囲いされる標的領域40との関連で、HPVの39型および68型における縮重についての情報を含有する。これは、位置の指示であり、ハイブリダイゼーションの指示ではない。具体的に述べると、リバースプライマー31および32配列番号3および4は、標的40のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である配列を有する。同様に、検出プローブ21および22配列番号5および6は、標的40のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である。フォワードプライマー11および12配列番号1および2は、標的40のそれらの対応する位置における配列に対して相同である。図2A~Bは、図1と同様であるが、HPVの33型および58型を選択する縮重プライマー/プローブのセットについての図である。ボックス160、170、および180は、HPVの33型および58型の異なる株の標的に対する塩基多型を示す。これらの異なる株、ならびに塩基多型標的に対するの数および位置を、表3で報告する。多型の位置は、図2に示す。図2A~Bは、フォワードプライマー領域110、Taq-Man検出領域120、およびリバースプライマー領域130を示す。図2A~Bはまた、縮重フォワードプライマー111、112、縮重リバースプライマー131、132、ならびに縮重プローブ121および122も、標的配列140におけるそれらの対応する領域との関連で示す。ボックス160図2A、ボックス170および180図2Bには、標的配列140における、フォワードプライマー領域、リバースプライマー領域、および検出プローブ領域に対する変化だけを示す。例えば、ボックス160では、ボックス60により枠囲いされた標的配列140の部分と、HPVの33型標的の同じE6部分との間に一塩基多型T、G、Gが見られることに注目されたい。しかし、HPV58のフォワードプライマー112は、HPV33のフォワードプライマー111に対して3つの一塩基多型を有し、したがってこれに対して縮重している。フォワードプライマー111を配列番号7とし、フォワードプライマー112を配列番号8とする。2つの配列間における縮重が容易に観察される。TGTGCCAAGCATTGGAGACATGTGTCAGGCGTTGGAGACA下線を付すことにより各縮重を示す。縮重は、フォワードプライマー111には、HPVの33型に結合することを優先させ、フォワードプライマー112には、HPVの58型に結合することを優先させる。縮重プライマー/プローブのセットは、1つのHPV型の標的に結合することを、他の型の標的に結合することより優先するが、識別するわけではない。図について述べると、プライマー/プローブのセットは、標的との関連で記載されている。ボックス160、170、および180は、ボックス160、170、および180により枠囲いされる標的領域140との関連で、HPVの33型および58型間における縮重についての情報を含有する。これは、位置の指示であり、ハイブリダイゼーションの指示ではない。具体的に述べると、リバースプライマー131および132配列番号13および14は、標的140のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である配列を有する。同様に、検出プローブ121および122配列番号15および16は、標的140のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である。フォワードプライマー111および112配列番号7および8は、標的140のそれらの対応する位置における配列に対して相同である。図3は、図1および2と同様であるが、HPVの56型および66型を選択する縮重プライマー/プローブのセットについての図である。図3は、フォワードプライマー領域210、Taq-Man検出領域220、およびリバースプライマー領域230を示す。ボックス260、270、および280は、HPVの66型および56型の異なる株の標的に対する塩基多型を示す。これらの異なる株、ならびに塩基多型標的に対するの数および位置を、表2で報告する。図3はまた、縮重フォワードプライマー211、212、縮重リバースプライマー231、232、ならびに縮重プローブ221および222も、標的配列240におけるそれらの対応する領域との関連で示す。ボックス260、270、および280には、標的配列240における、フォワードプライマー領域、リバースプライマー領域、および検出プローブ領域に対する変化だけを示す。例えば、ボックス260では、ボックス260により枠囲いされた標的配列240の部分と、HPV66標的およびHPV56標的との間に2つの一塩基多型T、Cが見られることに注目されたい。しかし、HPV56のフォワードプライマー2112は、HPV66のフォワードプライマー211に対して一塩基多型を有し、したがってこれに対して縮重している。フォワードプライマー211を配列番号17とし、フォワードプライマー212を配列番号18とする。2つの配列間における縮重が容易に観察される。ACCTAATACACGTACCTTGTTACCTAATTCACGTACCTTGTT下線を付すことにより各縮重を示す。縮重は、フォワードプライマー211には、HPVの56型に結合することを優先させ、フォワードプライマー212には、HPVの66型に結合することを優先させる。縮重プライマー/プローブのセットは、1つのHPV型の標的に結合することを、他の型の標的に結合することより優先するが、識別するわけではない。図について述べると、プライマー/プローブのセットは、標的との関連で記載されている。ボックス260、270、および280は、ボックス260、270、および280により枠囲いされる標的領域240との関連で、HPVの56型および66型における縮重についての情報を含有する。これは、位置の指示であり、ハイブリダイゼーションの指示ではない。具体的に述べると、リバースプライマー231および232配列番号19および20は、標的240のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である配列を有する。同様に、検出プローブ221および222配列番号22および23は、標的240のそれらの対応する位置において、これらの配列の逆相補体である。フォワードプライマー211および212配列番号17および18は、標的240のそれらの対応する位置における配列に対して相同である。具体的には論じないが、縮重プライマー/プローブのセットにおけるリバースプライマー間の縮重およびプローブ間の縮重も容易に観察される。本明細書で説明される縮重プライマー/プローブのセットの例に加えて、当業者は、本明細書における説明および添付図に基づいて、縮重プライマー/プローブのセットを設計しうる、近縁の血清型の他の標的領域も同定することができるであろう。図により容易に観察される通り、所望の標的領域は、個別の血清型の間に数個の多型を有するであろう。存在する多型には、本明細書で説明される形と一致する縮重プライマー/プローブのセットを設計する中で対処することができる。以下で説明される通り、プライマーおよびプローブは、標的配列の領域との相補性が100未満であるが、これらの領域に結合しうる。必須の相補性の程度は、結合条件の厳密性を含めた多様な因子に依存する。用いられる厳密性の条件に応じて、プライマーおよびプローブを、それらの配列内に異なる塩基を包含し、なおも標的の核酸領域に結合するのに十分な程度に相補的であるように改変することができる。本明細書で用いられる十分な程度の相補性には、70以上の相補性が含まれる。好ましい実施形態では、プライマー/プローブの標的配列に対する相補性は、これらのプライマー/プローブの結合部分の全長の少なくとも80である。プライマーおよびプローブの標的配列に対する相補性は、90以上であることがより好ましい。言い換えれば、本発明は、本明細書において配列番号により具体的に同定されるプライマーおよびプローブと少なくとも70の相同性を有するプライマーおよびプローブを意図する。好ましい実施形態では、本明細書において配列番号により具体的に同定されるプライマーおよびプローブと少なくとも80の相同性を有するプライマー/プローブが意図される。より好ましくは、本明細書において配列番号により具体的に同定されるプライマーおよびプローブと少なくとも90の相同性を有するプライマーおよびプローブが意図される。本明細書で説明されるオリゴヌクレオチドは、それらが識別するHPV標的のそれぞれの部分に結合するのに十分な程度に相補的でなければならないが、ある時点において、オリゴヌクレオチドの配列の標的に対する相補性が低下し、他の核酸配列に結合する可能性もあることが認識される。したがって、オリゴヌクレオチドプローブが、標的遺伝子のそれぞれの部分との十分な相補性を維持し、それぞれの標的結合部位に対する選択性を失わないことが望ましい。オリゴヌクレオチドによる増幅プライマー内の標的結合配列は一般に、その3’端に位置する。標的結合配列は、約10~25ヌクレオチドの長さであることが可能であり、増幅プライマーとのハイブリダイゼーションの特異性を有することが可能である。したがって、当業者は、標的結合配列を変化させて、増幅プライマーのハイブリダイゼーションの特異性を効果的に変化させ、代替的な配列とハイブリダイゼーションさせることができることが理解される。当業者には、増幅アッセイにおいて用いられるオリゴヌクレオチドが、有用性または標的配列への特異性を失わずに、ある程度改変しうることが理解される。例えば、当技術分野で知られている通り、ハイブリダイゼーションの条件を、厳密性を増大または減少させるように調整することによりすなわち、ハイブリダイゼーションの温度または緩衝液の塩含量を調整することにより、相補的な核酸配列および部分的に相補的な核酸配列のハイブリダイゼーションを得ることができる。開示される配列に対するこのようなわずかな改変、およびハイブリダイゼーションの条件に対する任意の必要な調整により標的特異性を維持するのに要求されるのは、常法に従う実験だけであり、当技術分野の範囲内にある。プライマーとして有用なオリゴヌクレオチドを設計するときの一般的な指針として述べると、配列の相同性を1低下させるごとに、Tmを約1°C~1.5°C低下させる。温度範囲は、約60°Cと約70°Cとの間で変化させうるが、プライマーは、60°C±4°Cで最適であるように設計する場合があり、プローブは、70°C±4°Cで最適であるように設計するのが場合がある。増幅プライマーを設計する場合のさらなる考慮点は、グアニンおよびシトシンの含量でありうる。一般に、プライマーのGC含量は、約60~70でありうるが、またこれ未満とすることも可能であり、当業者により適切に調整されうる。アニーリングの条件を、厳密性を増大または減少させるように調整することによりすなわち、アニーリングの温度または緩衝液の塩含量を調整することにより、相補的な核酸配列および部分的に相補的な核酸配列のアニーリングを得ることができる。開示される配列に対するこのような改変、およびアニーリングの条件に対する任意の必要な調整により標的特異性を維持するのに要求されるのは、常法に従う実験だけであり、当技術分野の範囲内にある。Walkerら、上記により教示されている通り、本明細書で説明されるプライマーを用いる増幅反応は、チミンを組み込むことも可能であり、例えば、特許文献2において教示されている通り、後続の増幅反応による交差汚染を低減するのに、反応において、TTPを、2’-デオキシウリジン5’-三リン酸で完全にまたは部分的に置換することも可能である。dUウリジンを増幅産物に組み込み、ウラシルDNAグリコシラーゼUDGで処理することによりこれを切除することができる。これらの無塩基部位により、この増幅産物は、後続の増幅反応において増幅不可能となる。後続の増幅を実施する前に、UDGを、ウラシルDNAグリコシラーゼ阻害剤Ugiにより不活化して、新たに形成された増幅産物におけるdUの切除を防止することができる。本発明で用いるのに意図されるPCRDNAポリメラーゼは、5’-3’エキソヌクレアーゼ活性を有する例えば、Promega製のSequencingGradeTag、またはNewEnglandBioLabs製のDeepVentR商標エクソDNAが用いられる。プローブは、PCR増幅プライマーの下流において、標的とハイブリダイズする。下流におけるエンドヌクレアーゼによる合成がプライマーから進行するにつれて、プライマー間に配置されるプローブが置換される。熱サイクリングが、PCRによる増幅の特徴であるので、増幅のエンドポイントにおいて検出するには、プライマーのアニーリングおよび伸長の最終サイクルの後の低温において、制限エンドヌクレアーゼを添加することが好ましい。しかし、PCR反応の高温のフェーズを経ても活性を維持する、好熱性の制限エンドヌクレアーゼを増幅において存在させ、リアルタイムアッセイをもたらすことも可能であろう。二次構造が直鎖化され、色素対が分離されれば、蛍光の消光が低減されるので、強度などの蛍光パラメータの変化が、標的増幅の指標として用いられる。検出プローブのオリゴヌクレオチドの変性または直鎖化から生じる蛍光の変化は、反応内の選択されるエンドポイントにおいて検出することができる。しかし、二次構造の直鎖化は、ハイブリダイゼーションまたはプライマーの伸長と同時にもたらされるため、蛍光の変化もまた、反応が生じるのにつれて、すなわち、リアルタイムでモニタリングすることができる。この均一でリアルタイムのアッセイフォーマットを用いて、存在する標的の初期量について、半定量的情報または定量的情報をもたらすことができる。標的配列の初期コピーがより多く存在すれば、ドナーの蛍光は、選択した閾値に、より迅速に到達するすなわち、陽性までの時間が短縮される。アクセプターの蛍光が低減される場合も同様に、選択した最小値に到達するのに必要とされる時間として検出される、陽性までの時間が短縮される。加えて、反応経過における蛍光パラメータの変化速度も、含有する標的の初期量が低量である試料におけるより、含有する標的の初期量が多量である試料においてより迅速となるすなわち、蛍光曲線の傾きが増大する。当技術分野において知られるこれらの測定または他の測定は、標的の存在の指標として、または標的の増幅の指標として行うことができる。標的の初期量は、実験結果を、標的の既知量についての結果と比較することにより決定することが典型的である。本発明の方法による、選択された標的配列の存在についてのアッセイは、溶液中で実施することもでき、固相上で実施することもできる。検出プローブのオリゴヌクレオチドがプライマーとして機能するリアルタイムの均一アッセイまたはエンドポイントにおける均一アッセイは、溶液中で実施することが典型的である。本発明の検出プローブオリゴヌクレオチドを用いるハイブリダイゼーションアッセイはまた、溶液中でも実施しうる例えば、均一なリアルタイムアッセイとしてが、また、リアルタイムで標的を検出するかまたはエンドポイントで標的を検出するための固相アッセイにも特に好適である。固相アッセイでは、当技術分野で知られる方法を用いる内部標識または末端標識を介して、検出プローブのオリゴヌクレオチドを、固相例えば、ビーズ、膜、または反応容器上に固定化することができる。例えば、ビオチンで標識化した検出プローブのオリゴヌクレオチドを、アビジンで修飾した固相上に固定化することができ、この固相において、適切なハイブリダイゼーション条件下で標的に曝露すると、この検出プローブのオリゴヌクレオチドは、蛍光の変化をもたらす。このようにして標的を捕捉することにより、試料から標的を分離することが容易となり、シグナルの検出またはアッセイの他の側面に干渉しうる、試料中の物質の除去が可能となる。製品化の便宜のため、HPVの核酸を特異的に検出および同定するのに有用なオリゴヌクレオチドを、キットの形態でパッケージ化することができる。このようなキットは、本明細書で説明される少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを含有することが典型的である。また、核酸増幅反応を実施するための試薬も、HPV特異的なオリゴヌクレオチドと共に含めることができる。例えば、緩衝液、他のオリゴヌクレオチド、ヌクレオチド三リン酸、酵素なども含めることができる。キットの構成要素は、共通の容器内に併せてパッケージ化することができる。場合によって、本発明の方法の具体的な実施形態を実施するための1つの実施形態の記載を例示する指示書も含めることができる。また、他の任意選択の構成要素、例えば、アッセイプローブとして用いるのに適する標識をタグ付したオリゴヌクレオチド、および/またはこの標識を検出するための試薬もしくは手段も、キット内に含めることができる。さらに、キットは、オリゴヌクレオチドおよび試薬を、乾燥形式で包含する場合もあり、液体形式で包含する場合もある。乾燥形式とすれば、キットの構成要素を、より安定的なものとすることができ、容易に操作することができる。キットの乾燥させた構成要素を、マイクロ滴定プレート、マイクロアレイ、または他の適切な容器などの固相に対して添加または前処理することもでき、この場合、試料および緩衝液を添加しさえすればよい。この形式は、複数の試料を同時にアッセイすることを容易とし、ハイスループット法において有用である。BDによるProbeTec商標装置およびViper商標XTR装置を用いることができる。以下の実施例は、本明細書で説明される本発明の具体的な実施形態を例示する。当業者には明らかである通り、各種の変化および改変が可能であり、これらは、説明される本発明の範囲内にあることが意図されている。表1のプライマー/プローブのセットを用いる、HPVを検出するためのTaq-ManPCRシステムを、以下で実施例としてさらに説明する。上記の表1に記載したプライマー/プローブのセットは、HPVの39型、および68型、および51型に対して、Taq-ManPCRを実施するために設計した。具体的に述べると、第1の縮重プライマー/プローブのセットがHPVの39型および68型に対するセットである第1の実施形態では、HPVの39型を優先するプライマー/プローブのセットが、配列番号1、3および5である。HPVの68型を優先するプライマー/プローブのセットは、配列番号2、4および6である。Taq-ManリアルタイムPCRは、定量的PCRの一種である。Taq-Manでは、20~26ヌクレオチドの一本鎖のオリゴヌクレオチドであり、2つのPCRプライマーの間にあるDNA配列だけに結合するように設計されている、蛍光性プローブを用いる。Taq-Manでは、レポーター色素およびクエンチャー色素を、プローブに結合させている。温度を交互に変化させてDNAを変性させ、再アニーリングさせることにより、プローブをDNAにアニーリングさせる。Taqポリメラーゼにより、ヌクレオチドが標的DNAに付加され、これにより、鋳型のDNAからTaq-Manプローブが除去される。レポーター色素が、クエンチャー色素から分離されると、レポーター色素は、検出可能であるエネルギーを発する。このエネルギーは、コンピュータにより定量化され、これにより、標的が検出されたことを示すシグナルがもたらされる。Taq-ManPCRにおいて蛍光シグナルを発生させうるのは、特異的なPCR産物だけである。本明細書の例では、熱サイクリングが意図される。95°Cで15分間にわたる最初の変性ステップの後、標的の存在または非存在を検出するための、プライマー/プローブのセットと試料とのPCR混合物を、40サイクルにわたり、55°Cで1分間の後、95°Cで30秒間の熱サイクルにかける。Taq-ManPCRを実施するには、好ましい産物サイズを50~150塩基対とする2つのPCRプライマーと、蛍光レポーターまたはフルオロフォア例えば、6-カルボキシフルオレセインFAMおよびテトラクロロフルオレセインTET、ならびにその5’端および3’端に共有結合により結合させた、テトラメチルロダミンTAMRAなどのクエンチャー、または既に説明したようなダーククエンチャーを伴うプローブとを用いる。適切な蛍光レポーターおよびフルオロフォアはよく知られており、本明細書では詳述しない。プローブは、表に記載されるHPVのE6/E7遺伝子内のORF位置にアニーリングするように設計する。これについて、HPV59に対するプライマープローブ/セットのORF位置を、E6遺伝子およびE7遺伝子の両方について、以下の表に列挙する。プライマーおよびプローブに加えて、Taq-ManPCRは、データを解析するためのリアルタイムPCR装置のみならず、通常のPCRに用いられる試薬例えば、ポリメラーゼ、遊離ヌクレオチドも必要とする。これらの試薬および装置は、当業者によく知られており、本明細書では詳述しない。本明細書では、特定の実施形態との関係で本発明を説明してきたが、これらの実施形態は、本明細書で説明される本発明の原理および適用を例示するだけのものであることを理解されたい。したがって、これらの実施形態には、多くの改変を行うことができ、添付の特許請求の範囲により規定される、本明細書で説明される本発明の精神および範囲から逸脱しない限りにおいて、他の配置も考案しうることを理解されたい。