"a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、bDNA量が2nである貪食細胞2n貪食細胞集団または非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が、対象における前記疾患もしくは症状の存在、または対象における前記疾患もしくは症状が発症するリスク、または対象における前記疾患もしくは症状の予後を示す、対象における疾患もしくは症状を診断もしくは診断を補助する方法、または対象における疾患もしくは症状が発症するリスクを評価する方法、または対象における疾患もしくは症状を予後予測もしくは予後予測を補助する方法。a第1時点における対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、第1時点における前記対象の2n貪食細胞集団または非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b第2時点における前記対象の無細胞体液試料から、それぞれ、第2時点もしくは化合物を投与した後における、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、第2時点における前記対象の2n貪食細胞集団または非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、対象における前記疾患もしくは症状に対する治療の有効性、または対象における前記疾患もしくは症状の進行もしくは軽減を示すか、または対象において前記化合物が前記疾患もしくは症状を改善もしくは治療することができることを示す、対象における疾患もしくは症状に対する治療の有効性を評価する方法、対象における疾患もしくは症状の進行もしくは軽減をモニターする方法、または対象における疾患もしくは症状を改善もしくは治療することができる化合物を同定する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状の存在を示す、対象における疾患または症状を診断または診断を補助する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状が発症するリスクを示す、対象における疾患または症状が発症するリスクを評価する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記同定された差異が対象における前記疾患または症状の予後を示す、対象における疾患または症状を予後予測または予後予測を補助する方法。a治療前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、前記治療前の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b治療後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、前記治療後の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、前記対象における前記疾患または症状に対する治療の有効性を示す、対象における疾患または症状に対する治療の有効性を評価する方法。a第1時点における対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、第1時点における前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b第2時点における前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、第2時点における前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状の進行または軽減を示す、対象における疾患または症状の進行または軽減をモニターする方法。a化合物を投与する前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、前記化合物を投与する前の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b前記化合物を投与した後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、前記化合物を投与した後の前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、前記化合物が前記対象における前記疾患または症状を改善または治療することができることを示す、対象における疾患または症状を改善または治療することができる化合物を同定する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、bDNA量が2nである貪食細胞2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が前記対象における前記疾患または症状の存在を示す、対象における疾患または症状を診断または診断を補助する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状が発症するリスクを示す、対象における疾患または症状が発症するリスクを評価する方法。a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状の予後を示す、対象における疾患または症状の予後予測または予後予測を補助する方法。a治療前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、前記治療前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b治療後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、前記治療後の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状に対する治療の有効性を示す、対象における疾患または症状に対する治療の有効性を評価する方法。a第1時点における対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、第1時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b第2時点における前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、第2時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状の進行または軽減を示す、対象における疾患または症状の進行または軽減をモニターする方法。a化合物を投与する前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、前記化合物を投与する前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b前記化合物を投与した後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、前記化合物を投与した後の前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、c第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、前記化合物が前記対象における前記疾患または症状を改善または治療することができることを示す、対象における疾患または症状を改善または治療することができる化合物を同定する方法。前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記非貪食細胞と比較して前記無細胞体液試料において上方制御または活性化されている、請求項3~8のいずれか1項に記載の方法。前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記非貪食細胞と比較して前記無細胞体液試料において下方制御または抑制されている、請求項3~8のいずれか1項に記載の方法。前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記2n貪食細胞と比較して前記無細胞体液試料において上方制御または活性化されている、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記2n貪食細胞と比較して前記無細胞体液試料において下方制御または抑制されている、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。第1プロファイルまたは第2プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。第3プロファイルまたは第4プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つ欠如を含む、請求項6~8および請求項12~14のいずれか1項に記載の方法。前記無細胞体液試料から前記1つまたは複数のマーカーを抽出することをさらに含む、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記aの前に前記非貪食細胞を溶解することをさらに含む、請求項3~8のいずれか1項に記載の方法。前記aの前に前記非貪食細胞から細胞内容物を抽出することをさらに含む、請求項3~8および請求項21のいずれか1項に記載の方法。前記無細胞体液試料が、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片を含む、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記無細胞体液試料中に、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが存在する、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記非貪食細胞の細胞内容物中に、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーが存在しない、請求項23に記載の方法。前記aの前に前記2n貪食細胞を溶解することをさらに含む、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。前記aの前に前記2n貪食細胞から細胞内容物を抽出することをさらに含む、請求項9~14および請求項27のいずれか1項に記載の方法。前記2n貪食細胞の細胞内容物中に、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーが存在しない、請求項28に記載の方法。前記cの同定された差異と前記疾患または症状の1つまたは複数の既知のマーカーについてのリポジトリとを比較することをさらに含む、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記リポジトリがデータマイニングにより得られる、請求項30に記載の方法。前記貪食細胞が、専門貪食細胞、非専門貪食細胞、またはこれらの混合物である、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。前記専門貪食細胞が、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、好酸球、またはこれらの混合物である、請求項32に記載の方法。前記非専門貪食細胞が、上皮細胞、内皮細胞、線維芽細胞、間葉細胞、またはこれらの混合物である請求項32に記載の方法。前記非貪食細胞が、T細胞、B細胞、ヌル細胞、好塩基球、またはこれらの混合物である、請求項3~8のいずれか1項に記載の方法。前記無細胞体液試料が体液試料から分離される、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記体液試料が、血液、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血液、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液である、請求項36に記載の方法。前記無細胞体液試料が、濾過、遠心分離法、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより分離される、請求項36に記載の方法。前記無細胞体液試料が、前記試料中に存在する物質を用いて分離される、請求項36に記載の方法。前記物質が前記疾患または症状のマーカーの産物である、請求項39に記載の方法。前記無細胞体液試料が血漿または血清である、請求項36に記載の方法。前記非貪食細胞が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項3~8のいずれか1項に記載の方法。前記体液試料が、血液、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液である、請求項42に記載の方法。前記細胞が白血球である、請求項42に記載の方法。前記非貪食細胞が抗体を用いて単離される、請求項42~44のいずれか1項に記載の方法。前記非貪食細胞が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより単離される、請求項42~44のいずれか1項に記載の方法。前記2n貪食細胞が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。前記2n貪食細胞が貪食細胞集団から単離される、請求項9~14のいずれか1項に記載の方法。前記2n貪食細胞が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより貪食細胞集団から単離される、請求項48に記載の方法。前記食細胞集団が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項48に記載の方法。前記体液試料が、血液、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血液、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液である、請求項47または請求項50に記載の方法。前記細胞が白血球である、請求項47または請求項50に記載の方法。前記食細胞集団が抗体を用いて単離される、請求項48および請求項50~52のいずれか1項に記載の方法。前記貪食細胞集団が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより単離される、請求項48および請求項50~52のいずれか1項に記載の方法。前記1つまたは複数のマーカーが、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの組合せである、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記核酸が、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、DNA、RNA、またはDNA-RNAハイブリッドである、請求項54に記載の方法。前記DNAが、二本鎖DNA、一本鎖DNA、多重鎖DNA、相補DNA、ゲノムDNA、または非コードDNAである、請求項56に記載の方法。前記RNAが、メッセンジャーRNAmRNA、マイクロRNAmiRNA、核小体低分子RNAsnoRNA、リボソーマルRNArRNA、トランスファーRNAtRNA、低分子干渉RNAsiRNA、ヘテロ核RNAhnRNA、または低分子ヘアピン型RNAshRNAである、請求項56に記載の方法。前記タンパク質が、アミノ酸、ペプチド、酵素、抗原、抗体、サイトカイン、リポタンパク質、糖タンパク質、またはホルモンである、請求項54に記載の方法。前記脂質が、脂肪酸、中性脂肪、リン脂質、コレステロール、コレステロールエステル、トリグリセリド、糖脂質、グリセロ脂質、グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、ステロール脂質、プレノール脂質、サッカロ脂質、ポリケチド、コリングリセロリン脂質、エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルセリン、リゾ-コリングリセロリン脂質、リゾ-エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジン酸、リゾ-ホスファチジン酸、スフィンゴミエリン、ガラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、遊離脂肪酸、プロスタグランジン、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、モノアシルグリセロール、アシル-CoA、アシルカルニチン、オキシステロール、セラミド、カルジオリピン、スフィンゴイド塩基-1-リン酸、スフィンゴシン、リゾ-スフィンゴミエリン、ガングリオシド、プラスマローゲン、スルファチド、低密度リポタンパク質LDL、超低密度リポタンパク質VLDL、高密度リポタンパク質HDL、スフィンゴイド塩基-1-リン酸、またはこれらの誘導体である、請求項54に記載の方法。前記炭水化物が、単糖類、二糖類、多糖類、オリゴ糖類、またはこれらの誘導体である、請求項54に記載の方法。前記代謝物が、一次代謝物、二次代謝物、有機代謝物、無機代謝物、プロスタグランジン、ヒドロキシエイコサテトラエン酸、ヒドロキシオクタデカジエン酸、ステロイド類、胆汁酸、ビタミン、またはこれらの誘導体である、請求項54に記載の方法。前記プロファイルが、核酸プロファイル、タンパク質プロファイル、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記プロファイルが、定性的アッセイ、定量的アッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項63に記載の方法。前記定量的アッセイが、シークエンシング、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガージデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシングduplexsequencing、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアタームnear-termシークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシングsequencing-by-synthesis、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、SolexaGenomeAnalyzerを用いたシークエンシング、SOLiD登録商標を用いたシークエンシング、MS-PETシークエンシング、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ポリメラーゼ連鎖反応PCR解析、定量的PCR法、リアルタイムPCR法、蛍光アッセイ、比色アッセイ、化学発光アッセイ、またはこれらの組合せを用いる、請求項64に記載の方法。前記核酸プロファイルが、遺伝子型プロファイル、一塩基多型プロファイル、遺伝子変異プロファイル、遺伝子コピー数プロファイル、DNAメチル化プロファイル、DNAアセチル化プロファイル、染色体遺伝子量プロファイル、遺伝子発現プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項63に記載の方法。前記核酸プロファイルが、ポリメラーゼ連鎖反応PCR解析、シークエンシング解析、電気泳動解析、制限断片長多型RFLP解析、ノーザンブロット解析、定量的PCR法、逆転写PCR解析RT-PCR、アレル特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション解析、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、ヘテロ二重鎖移動度アッセイHMA、一本鎖高次構造多型SSCP法、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動DGGE法、RNAaseミスマッチ解析、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、表面プラズモン共鳴法、サザンブロット解析、insituハイブリダイゼーション法、蛍光insituハイブリダイゼーションFISH法、発色性insituハイブリダイゼーションCISH法、免疫組織化学IHC法、マイクロアレイ法、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、核型分析、多重ライゲーション依存性プローブ増幅MLPA法、短蛍光フラグメントの定量的多重PCRQMPSF法、顕微鏡法、メチル化特異的PCRMSPアッセイ、ライゲーション仲介PCRによるHpaII小断片濃縮HpaIITinyFragmentEnrichmentbyLigation-MediatedPCRHELPアッセイ、放射性酢酸塩標識アッセイ、比色によるDNAアセチル化アッセイ、マイクロアレイと組み合わせたクロマチン免疫沈降ChIP-on-chipアッセイ、制限酵素ランドマークゲノムスキャニング法、メチル化DNA免疫沈降MeDIP法、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ活性の分子切断光アッセイ、クロマトグラフィーによる分離、メチル化感受性制限酵素解析、バイサルファイトによる非メチル化シトシンのウラシルへの変換、メチル結合PCR解析、またはこれらの組合せにより決定される、請求項66に記載の方法。前記核酸プロファイルが、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガージデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシングduplexsequencing、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアタームnear-termシークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシングsequencing-by-synthesis、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、SolexaGenomeAnalyzerを用いたシークエンシング、SOLiD登録商標を用いたシークエンシング、MS-PETシークエンシング、質量分析法、およびこれらの組合せからなる群より選択されるシークエンシング技術により決定される、請求項66に記載の方法。前記タンパク質プロファイルが、タンパク質発現プロファイル、タンパク質活性化プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項63に記載の方法。前記タンパク質プロファイルが、免疫組織化学アッセイ、酵素結合免疫吸着検定法ELISA、insituハイブリダイゼーション法、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオイムノアッセイ、顕微鏡法、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、表面プラズモン共鳴法、シークエンシング、ウェスタンブロットアッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項69に記載の方法。前記タンパク質活性化プロファイルが、前記1つまたは複数のマーカーのリン酸化状態、ユビキチン化状態、ミリストイル化状態、立体構造状態、またはこれらの組合せを決定することを含む、請求項69に記載の方法。前記脂質プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項63に記載の方法。前記炭水化物プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、パルスドアンペロメトリー検出器を用いた高速陰イオン交換クロマトグラフィーHPAEC-PAD法、液体クロマトグラフィー法、ガスクロマトグラフィ法ー、蛍光アッセイ、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項63に記載の方法。前記対象が、少なくとも2つの疾患または症状を有する、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記対象が、少なくとも1つの胎児期または妊娠関連の疾患または症状を有する、請求項74に記載の方法。前記対象が、疾患または症状ではない少なくとも1つの疾患または症状を有する、請求項74に記載の方法。前記対象が哺乳類動物である、請求項3~14のいずれか1項に記載の方法。前記対象がヒトである、請求項77に記載の方法。前記疾患または症状が、心血管系の疾患または症状、腎臓関連の疾患または症状、胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状、神経性もしくは精神神経性の疾患または症状、自本発明の1つの目的は、無細胞体液および血液細胞を用いることにより、疾患または症状に特異的なマーカー、例えば、核酸、タンパク質、炭水化物、および/または脂質などの検出を容易にすることができる診断方法を提供することである。本発明の別の目的は、疾患または症状に特異的なマーカーを同定する方法を提供し、さらに、該マーカーを単独で、または任意の既知のマーカーと組み合わせて、疾患または症状を診断するために使用することである。本発明の概要発明者らは、無細胞体液を、非貪食細胞またはDNA量が2nである貪食細胞2n貪食細胞と併用することにより疾患または症状を検出/診断する新規で有用な方法を発明した。ある実施形態では、無細胞体液は、DNAおよび/またはタンパク質など、病気の細胞の成分を含有し、病気の細胞の代用物として働くが、非貪食細胞または。他の実施形態では、無細胞体液が病気の細胞の代用物として働き、2n貪食細胞がコントロール細胞として働くことがある。ある態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状の存在を示す、対象における疾患または症状を診断または診断補助する方法を提供する。別の態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状が発症するリスクを示す、対象における疾患または症状が発症するリスクを評価する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状の予後を示す、対象における疾患または症状を予後予測または予後予測を補助する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a治療前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;前記治療前の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b治療後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;前記治療後の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状に対する治療の有効性を示す、対象における疾患または症状に対する治療の有効性を評価する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a第1時点における対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;第1時点における前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b第2時点における前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;第2時点における前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状の進行または軽減を示す、対象における疾患または症状の進行または軽減をモニターする方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a化合物を投与する前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;前記化合物を投与する前の対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b前記化合物を投与した後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;前記化合物を投与した後の前記対象の非貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、前記化合物が前記対象における前記疾患または症状を改善または治療することができることを示す、対象における疾患または症状を改善または治療することができる化合物を同定する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が前記対象における前記疾患または症状の存在を示す、対象における疾患または症状を診断または診断を補助する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状が発症するリスクを示す、対象における疾患または症状が発症するリスクを評価する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、b2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、およびc前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、前記差異が対象における前記疾患または症状の予後を示す、対象における疾患または症状を予後予測または予後予測を補助する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a治療前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;前記治療前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b治療後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;前記治療後の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状に対する治療の有効性を示す、対象における疾患または症状に対する治療の有効性を評価する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a第1時点における対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;第1時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b第2時点における前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;第2時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、およびc第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が前記対象における疾患または症状の進行または軽減を示す、対象における疾患または症状の進行または軽減をモニターする方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a化合物を投与する前の対象の無細胞体液試料から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること;前記化合物を投与する前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、b前記化合物を投与した後の前記対象の無細胞体液試料から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること;前記化合物を投与した後の前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること;前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、c第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、前記同定された差異が、前記化合物が前記対象における疾患または症状を改善または治療することができることを示す、対象における疾患または症状を改善または治療することができる化合物を同定する方法を提供する。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状に対する1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、この方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第2プロファイルをデータマイニングにより得ること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルをデータマイニングにより得ること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、およびc第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルをデータマイニングにより得ること;前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルをデータマイニングにより得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第1差異セットと第2差異セットの両方に存在する1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第5プロファイルを決定すること;第5プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第5プロファイルとの第3差異セットを同定すること、e第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、およびc第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。ある実施形態では、マーカーまたは被分析物は、核酸例えば、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、DNA、RNA、またはDNA-RNAハイブリッド、タンパク質例えば、アミノ酸、ペプチド、酵素、抗原、抗体、サイトカイン、リポタンパク質、糖タンパク質、またはホルモン、脂質例えば、脂肪酸、リン脂質、コレステロール、炭水化物例えば、単糖類、二糖類、多糖類、代謝物例えば、ビタミン、一次代謝物、二次代謝物、またはこれらの組合せである。ある実施形態では、プロファイルは、核酸プロファイル例えば、遺伝子型プロファイル、一塩基多型プロファイル、遺伝子変異プロファイル、遺伝子コピー数プロファイル、DNAメチル化プロファイル、DNAアセチル化プロファイル、染色体遺伝子量プロファイル、遺伝子発現プロファイル、タンパク質プロファイル例えば、タンパク質発現、タンパク質活性化、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せである。ある実施形態では、プロファイルは、定性的アッセイ、定量的アッセイ、またはこれらの組合せにより決定される。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つは、非貪食細胞と比較して無細胞体液において上方制御または活性化されている。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つは、非貪食細胞と比較して無細胞体液試料において下方制御または抑制されている。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つは、2n貪食細胞と比較して無細胞体液において上方制御または活性化されている。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つは、2n貪食細胞と比較して無細胞体液において下方制御または抑制されている。ある実施形態では、第1プロファイル、第2プロファイル、第3プロファイル、第4プロファイル、第5プロファイル、または第6プロファイルには、1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが欠如している。ある実施形態では、差異は、少なくとも1.05倍、1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の差異である。ある実施形態において、本発明の方法はまた、2n貪食細胞および非貪食細胞を溶解すること、およびこれらの細胞から細胞内容物を抽出することを含む。ある実施形態において、本発明の方法は、無細胞体液から細胞内容物を抽出することを含む。ある実施形態では、無細胞体液は、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片を含む。ある実施形態では、無細胞体液の細胞内容物中に、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーうちの少なくとも1つが存在する。ある実施形態では、非貪食細胞または2n貪食細胞の細胞内容物中に、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーは存在しない。ある実施形態では、本発明の方法はまた、前記cの同定された差異と、疾患または症状の1つまたは複数の既知のマーカーについてのリポジトリ例えば、データマイニングにより得られたデータとを比較することを含む。ある実施形態では、貪食細胞は、専門貪食細胞例えば、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、好酸球、非専門貪食細胞例えば、上皮細胞、内皮細胞、線維芽細胞、間葉細胞、またはこれらの混合物である。ある実施形態では、非貪食細胞は、T細胞、B細胞、ヌル細胞、好塩基球、またはこれらの混合物である。ある実施形態では、貪食細胞例えば、2n貪食細胞および非貪食細胞が、対象の体液試料例えば、血液、尿、組織、または細胞例えば、白血球、胎生細胞から単離される。ある実施形態では、抗体、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せなどの標準的な/既知の細胞分離/単離/精製技術を用いて、体液、組織、または細胞から貪食細胞例えば、2n貪食細胞および非貪食細胞が単離、あるいは2n貪食細胞から>2n貪食細胞が分離される。本発明はまた、本発明の方法で使用することができるマーカー、および本発明の方法により同定され得るマーカーを提供する。本特許または出願ファイルは、カラーで作製された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面を含む本特許または特許出願公開のコピーは、庁へ申請し、必要な料金を支払うことで提供されるであろう。本発明の、前述した特徴およびその他の特徴ならびに利点は、添付の図面とともに、具体的実施形態についての以下の詳細な説明により十分に理解されるであろう。本明細書中で特に定義しない限り、本願において使用される科学用語および技術用語は、当業者によって一般に理解されている意味を有するものとする。一般に、本明細書に記載の細胞培養および組織培養、分子生物学、細胞生物学および癌生物学、神経生物学、神経化学、ウイルス学、免疫学、微生物学、薬理学、遺伝学、ならびにタンパク質化学および核酸化学に関して用いられる用語、およびこれらの技術は、当技術分野において周知であり、一般に用いられるものである。上記の全て、および本出願において引用されたすべての参考文献、特許、および特許出願公開は、具体的に参照により本明細書に組み込まれる。矛盾が生じる場合は、定義を含めて本明細書に従うものとする。本明細書を通して、単語含むcomprise、または含むcomprisesもしくは含んでいるcomprisingなどの変形は、明示的な整数もしくは成分または整数群もしくは成分群を包含することを意図するが、その他の整数もしくは成分または整数群もしくは成分群を排除することを意図するのではないことが理解されるであろう。a、anおよびtheの単数形は、文脈で明確に指示されない限り、複数形を含むものである。用語含むは、含むが限定されないという意味で使用される。含んでいるおよび含んでいるが限定されないが、互換的に使用される。患者、対象、または個体は、互換的に使用され、ヒトまたは非ヒト動物のいずれかを指す。これらの用語には、ヒト、霊長類、家畜動物例えば、ウシ、ブタ、愛玩動物例えば、イヌ、ネコ、およびげっ歯類例えば、マウスおよびラットなどの哺乳類が含まれる。本明細書において、コントロール対象は、アッセイされる疾患または症状を有すると診断されていない任意の個体を指す。同様に、用語正常コントロール、健常コントロール、および病気でない細胞は、アッセイされる症状または疾患を有せず、したがって測定される症状または障害のベースラインを決定するために使用することができる供給源例えば、対象、コントロール対象、株化細胞から採取された試料例えば、細胞、血清、組織を意味する。コントロール対象、正常コントロール、および健常コントロールは、標準として獲得および使用されるデータ、すなわち、複数の異なる対象に対して繰返し使用することができるデータを含むことも理解されよう。言い換えれば、例えば、対象試料をコントロール試料と比較した場合、コントロール試料のデータが異なる実験から得られたものであってもよく、例えば、対象のデータが取得されたときに実際に得られたものではない、多数の健康な対象から得られた平均値であってもよい。本明細書における用語診断は、患者が所与の疾患または症状を患っているかどうかを、当業者が評価および/または判断できる方法を指す。多くの場合、当業者は、1つまたは複数の診断指標、例えば、マーカーに基づいて診断を行い、その存在、欠如、量、または量の変化により、症状の存在、重症度、または欠如が示される。本明細書における用語予後は、疾患または症状の再発を含む、疾患または症状の進行の可能性を指す。国際出願第PCT/US2009/031395号の開示は、全ての目的のため参照により本明細書に組み込まれる。本発明の方法の説明本発明は、同一個体から採取された無細胞体液と非貪食細胞との間で、または、同一個体から採取された無細胞体液と、血液由来の細胞もしくは細胞成分をまだ貪食していない貪食細胞、すなわち、DNA量が2nである貪食細胞との間で、疾患または症状に関連するマーカー例えば、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物のプロファイル例えば、遺伝子/タンパク質/脂質/炭水化物発現プロファイル、遺伝子型、遺伝子コピー数、遺伝子量、DNAメチル化などを比較することによって、疾患または症状を診断または診断補助する方法を提供する。本発明はまた、疾患または症状を発症するリスクを評価する方法、疾患を予後予測する方法、疾患の進行または軽減をモニターする方法、治療の有効性を評価する方法、あるいは疾患または症状を改善もしくは治療することができる化合物を同定する方法を提供する。このような対象特異的プロファイルの比較により、対象における特定の疾患または症状の検出または診断に誤りをもたらす可能性がある、特定の疾患または症状についての集団由来の平均プロファイルへの依存が排除される。本発明の方法により、個体に個別化された、検出、診断、および治療が可能となる。本発明の方法により、i高い特異性、感受性、および精度を有し、体液試料、細胞、または組織内に存在する疾患または症状に特異的なマーカーの検出が可能となり、ii内在的例えば、年齢、性別、民族的背景、健康状態などおよび時間的なマーカー発現の変動の結果として個体間で発生することが知られているベースラインの不等性が排除される。したがって、ある態様では、本発明により、疾患または症状を早期にすなわち、疾患が、従来の診断技術、例えば、画像化技術により診断可能になる前に検出するための非侵襲的アッセイが提供され、その結果、このような疾患または症状を有する個体の介入治療、予防、および治療を行う必要性および方策に関連する意思決定を改善するための基礎が提供される。本発明の方法は、身体検査、目視検査、生検、スキャニング、組織学検査、放射線検査、画像検査、超音波検査、市販のキットの使用、遺伝子検査、免疫学的検査、体液の分析、または神経活動のモニタリングなどの任意の既知の診断方法と共に用いることができる。ある実施形態では、貪食細胞は、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、または好酸球などの専門貪食細胞である。ある実施形態では、貪食細胞は、上皮細胞、内皮細胞、線維芽細胞、または間葉細胞などの非専門貪食細胞である。他の実施形態では、貪食細胞は、様々な種類の貪食細胞の混合物であってもよい。本発明で使用され得る非貪食細胞としては、T細胞、B細胞、ヌル細胞、好塩基球、またはこれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書における2n貪食細胞は、DNA量が2nである貪食細胞を指す。本発明によれば、体液中に存在する、生存している/死につつある/死んだ病気の細胞もしくは断片、および/または疾患特異的な無細胞性の核酸、タンパク質、脂質、および/または炭水化物を貪食していない貪食細胞もある。この貪食細胞群のDNA量は、2nのままである。本明細書において、疾患または症状のマーカーのプロファイルは、マーカーに関する任意の情報を広く指すことがある。この情報は、定性的情報例えば、存在または欠如、または定量的情報例えば、レベル、コピー数、または量のいずれであってもよい。ある実施形態では、マーカーのプロファイルによりこのマーカーの欠如が示されることがある。プロファイルは、核酸例えば、DNAまたはRNAプロファイル、タンパク質プロファイル、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せであってもよい。本明細書におけるマーカーは、一般に、貪食細胞で差次的に検出可能であり、疾患または症状の存在の指標となる被分析物を指す。貪食細胞において定量的または定性的に被分析物を区別することができる場合、この被分析物は、差次的に検出可能である。本発明の方法は、様々な疾患または症状に適用可能である。本発明の方法は、様々な疾患または症状に適用可能である。例示的な疾患または症状は、心血管系の疾患または症状、腎臓関連の疾患または症状、胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状、神経性もしくは精神神経性の疾患または症状、自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状、癌、感染性の疾患または症状、ミトコンドリア病、呼吸器胃腸管系の疾患または症状、生殖器系の疾患または症状、眼部の疾患または症状、筋骨格系の疾患または症状、あるいは皮膚の疾患または症状である。本明細書における用語心血管系の疾患または症状は、心臓または血管系動脈および静脈を冒す任意の症状を指す。心血管系の疾患の例には、これらに限定されないが、心筋梗塞、冠動脈疾患、経皮的冠動脈形成術PTCA、冠動脈バイパス手術CABG、再狭窄、末梢動脈疾患、脳卒中、腹部大動脈瘤、頭蓋内動脈瘤、大動脈アテローム硬化性脳卒中、心原性脳卒中、早発性心筋梗塞、心不全、肺塞栓症、急性冠症候群ACS、狭心症、心肥大、動脈硬化症、心筋炎、汎心炎、心内膜炎、高血圧、鬱血性心不全、アテローム性硬化症、脳血管疾患、心臓の健康状態の低下、虚血性心疾患、心膜炎、心原性ショック、アルコール性心筋症、先天性心疾患、虚血性心筋症、高血圧性心筋症、弁膜性心筋症、炎症性心筋症、全身性代謝疾患に伴う二次性心筋症、拡張型心筋症、肥大型心筋症、不整脈原性右室心筋症、拘束性心筋症、非圧縮型心筋症、心臓弁膜症、高血圧性心疾患、心筋虚血性発作、不安定狭心症、心筋破裂、心原性ショック、塞栓症、深部静脈血栓症、不整脈、不整脈原性右室心筋症、糖尿病性心筋症、僧房弁逆流症、僧房弁逸脱症、末梢血管疾患、動脈疾患、頸動脈疾患、深部静脈血栓症、静脈疾患、脳血管性疾患、動脈瘤、左室肥大、高血圧性腎疾患、高血圧性網膜疾患、脈管炎、左主部病変、動脈血管疾患、静脈血管疾患、微小循環血栓症、一過性脳血管障害、虚血肢、動脈瘤、血栓症、表在性静脈血栓症、および深部静脈血栓症が含まれる。本明細書における用語腎臓関連の疾患または症状は、腎臓または腎臓系を冒す任意の疾患または症状を指す。腎臓関連の疾患の例には、これらに限定されないが、慢性腎臓疾患、原発性腎臓疾患、非糖尿病性腎臓疾患、糸球体腎炎、間質性腎炎、糖尿病性腎臓疾患、糖尿病性腎症、糸球体硬化症、急速進行性糸球体腎炎、腎線維症、アルポート症候群、インスリン依存型糖尿病性IDDM腎炎、メサンギウム増殖性糸球体腎炎、膜性増殖性糸球体腎炎、半月体形成性糸球体腎炎、間質性腎線維症、巣状分節性糸球体硬化症、膜性腎症、微小変化型ネフローゼ症候群、pauci-immune型急速進行性糸球体腎炎、IgA腎症、多発性嚢胞腎、デント病、腎シスチン蓄積症nephrocytinosis、ヘイマン腎炎、常染色体優性成人性多発性嚢胞腎、常染色体劣性小児性多発性嚢胞腎、急性腎障害、ネフローゼ症候群、腎虚血、ポドサイト疾患または障害、タンパク尿症、糸球体疾患、膜性糸球体腎炎、巣状分節性糸球体腎炎、子癇前症、子癇症、腎臓病変、膠原血管病、良性起立性体位性タンパク尿症、IgM腎症、膜性腎症、サルコイドーシス、糖尿病、薬剤が原因の腎臓損傷、ファブリー病、アミノ酸尿、ファンコーニ症候群、高血圧性腎硬化症、間質性腎炎、鎌状赤血球症、ヘモグロビン尿症、ミオグロビン尿症、ウェゲナー肉芽腫症、1型糖原貯蔵障害、慢性腎臓疾患、慢性腎不全、低糸球体濾過率GFR、腎血管硬化症、ループス腎炎、ANCA陽性pauci-immune型半月体形成性糸球体腎炎、慢性移植腎症、腎毒性、腎臓毒性、腎臓壊死、腎臓損傷、糸球体および尿細管の傷害、腎臓機能不全、腎炎症候群、急性腎不全、慢性腎不全、近位尿細管機能不全、急性腎移植拒絶反応、慢性腎臓移植拒絶反応、非IgAメサンギウム増殖性糸球体腎炎、感染後糸球体腎炎、任意の種類の腎障害を伴う血管炎、任意の遺伝性腎臓疾患、任意の間質性腎炎、腎臓移植不全、腎臓癌、その他の症状例えば、高血圧、糖尿病、および自己免疫疾患を伴う腎臓疾患、デント病、腎シスチン蓄積症nephrocytinosis、ヘイマン腎炎、原発性腎臓疾患、虚脱性糸球体症、デンスデポジット病、クリオグロブリン血症関連糸球体腎炎、ヘノッホシェーンライン病、感染後糸球体腎炎、細菌性心内膜炎、顕微鏡的多発血管炎、チャーグシュトラウス症候群、抗GBM抗体介在性の糸球体腎炎、アミロイドーシス、単クローン性免疫グロブリン沈着症、細線維性糸球体腎炎、イムノタクトイド糸球体症、虚血性尿細管傷害、薬剤誘発性尿細管間質性腎炎、中毒性尿細管間質性腎炎、感染性尿細管間質性腎炎、細菌性腎盂腎炎、ポリオーマウイルスまたはHIVの感染に起因するウイルス感染性尿細管間質性腎炎、代謝誘導性尿細管間質性疾患、混合性結合組織病、円柱腎症、尿酸結晶もしくはシュウ酸結晶または薬剤誘発性結晶の沈着に起因しうる結晶性腎障害、急性細胞性尿細管間質性同種移植片拒絶反応、リンパ腫または移植後リンパ増殖性疾患に起因する腫瘍性浸潤性疾患、閉塞性腎臓疾患、血管疾患、血栓性微小血管症、腎血管硬化症、アテローム塞栓性疾患、混合性結合組織病、結節性多発動脈炎、カルシニューリン阻害剤誘導性血管疾患、急性細胞性血管同種移植片拒絶反応、急性液性同種移植片拒絶反応、早期腎機能低下症ERFD、末期腎疾患ESRD、腎静脈血栓症、急性尿細管壊死、急性間質性腎炎、既存の慢性腎臓病、腎動脈狭窄症、虚血性腎症、尿毒症、薬剤誘導性および毒物誘導性の慢性尿細管間質性腎炎、逆流腎症、腎結石、グッドパスチャー症候群、および水腎症が含まれる。本明細書における用語胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状は、妊婦、胚、または胎児が罹患する、任意の疾患、障害、または症状を指す。胎児期または妊娠関連の症状はまた、妊娠に関連して、または妊娠の結果として、直接的または間接的に生じる、任意の疾患、障害、または症状を指す場合もある。これらの疾患または症状には、任意の全ての先天性欠損、先天性の症状、または遺伝性の疾患もしくは症状が含まれることがある。胎児期または妊娠関連の疾患の例には、これらに限定されないが、Rh血液型不適合、新生児の溶血性疾患、ベータサラセミア、性別判定、妊娠判定、遺伝性メンデル遺伝疾患、染色体異常、胎児染色体異数性、胎児染色体トリソミー、胎児染色体モノソミー、8番染色体トリソミー、13番染色体トリソミーパトー症候群、16番染色体トリソミー、18番染色体トリソミーエドワーズ症候群、21番染色体トリソミーダウン症、X染色体連鎖疾患、X染色体トリソミーXXX症候群、X染色体モノソミーターナー症候群、XXY症候群、XYY症候群、XYY症候群、XXXY症候群、XXYY症候群、XYYY症候群、XXXXX症候群、XXXXY症候群、XXXYY症候群、XXYYY症候群、脆弱X症候群、胎児発育遅延、嚢胞性線維症、ヘモグロビン症、胎児死亡、胎児アルコール症候群、鎌状赤血球貧血、血友病、クラインフェルター症候群、17番染色体p11.2p1.2重複症候群、子宮内膜症、ペリツェウスメルツバッハー病、22番染色体q11.2q11.2重複症候群、猫の目症候群、猫鳴き症候群、ウォルフハーシュホーン症候群、ウィリアムズビューレン症候群、シャルコーマリートゥース病、圧迫性麻痺傾向を伴うニューロパチー、スミスマゲニス症候群、神経線維腫症、アラジール症候群、口蓋心顔面症候群、ディジョージ症候群、ステロイドスルファターゼ欠損症、プラダーヴィリ症候群、カルマン症候群、線状皮膚欠損を伴う小眼球症、副腎低形成、グリセロールキナーゼ欠損症、ペリツェウスメルツバッハー病、Y染色体の精巣決定因子、無精子症a因子、無精子症b因子、無精子症c因子、1p36欠失、フェニルケトン尿症、テイサックス疾患、副腎過形成、ファンコーニ貧血、脊髄性筋委縮症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ハンチントン病、筋緊張性ジストロフィー、ロバートソン転座、エンジェルマン症候群、結節性硬化症、毛細血管拡張性運動失調症、開放性二分脊椎、神経管欠損、腹壁欠損、胎内発育遅延、先天性サイトメガロウイルス感染症、軟骨無形性症、マルファン症候群、先天性甲状腺機能低下症、先天性トキソプラズマ症、ビオチナーゼ欠損症、ガラクトース血症、メープルシロップ尿症、ホモシスチン尿症、中位鎖アシルCoA脱水素酵素欠損症、構造的先天性欠損、心臓欠損、四肢異常、内反足、無脳症、無嗅脳症/全前脳胞症、水頭症、無眼球症/小眼球症、無耳症/小耳症、大血管転位症、ファロー四徴症、左心低形成症候群、大動脈縮窄、口唇裂を伴わない口蓋裂、口蓋裂を伴うまたは伴わない口唇裂、瘻孔を伴うまたは伴わない食道の閉鎖/狭窄、小腸の閉鎖/狭窄、肛門直腸の閉鎖/狭窄、尿道下裂、半陰陽、腎無形性、嚢胞性腎、軸前側多指症、肢欠損、横隔膜ヘルニア、盲目症、白内障、視覚障害、聴力損失、難聴、X連鎖副腎白質ジストロフィー、レット症候群、リソソーム病、脳性麻痺、自閉症、無舌症、白子症、眼白子症、眼皮膚白皮症、妊娠糖尿病、アーノルドキアリ奇形、チャージ症候群、先天性横隔膜ヘルニア、短指症、無虹彩症、裂手裂足症、異色症、ドワーニアン耳症Dwarnianear、エーラスダンロス症候群、表皮水疱症、ゴーラム病、橋本症候群、胎児水腫、緊張低下症、クリッペルファイル症候群、筋ジストロフィー、骨形成不全症、早老症、スミスレムリオピッツ症候群、色視症chromatelopsia、X連鎖リンパ増殖性疾患、臍帯ヘルニア、腹壁破裂、子癇前症、子癇症、早期産、早産、流産、子宮内胎児発育遅延、子宮外妊娠、妊娠亜阻、つわり、または誘発分娩の成功尤度が含まれる。本明細書における用語神経性もしくは精神神経性の疾患または症状は、神経系を冒す任意の疾患または症状を指す。神経性もしくは精神神経性の疾患または症状の例には、これらに限定されないが、頭部外傷、脳卒中、脳卒中、虚血性脳卒中、出血性卒中、くも膜下出血、頭蓋内出血、一過性虚血性発作、血管性認知症、大脳皮質基底核神経節変性症、脳炎、てんかん、ランドークレフナー症候群、水頭症、偽性脳腫瘍、視床疾患、髄膜炎、脊髄炎、運動障害、本態性振戦、脊髄疾患、脊髄空洞症、アルツハイマー病早発性、アルツハイマー病遅発性、多発梗塞性認知症、ピック病、ハンチントン病、パーキンソン病、パーキンソン症候群、認知症、前頭側頭型認知症、大脳皮質基底核変性症、多系統委縮症、進行性核上性麻痺、レビー小体病、クロイツフェルトヤコブ病、ダンディーウォーカー症候群、フリードライヒ運動失調症、マシャドジョセフ病、偏頭痛、統合失調症、気分障害および鬱病、レビー小体型認知症DLB、前頭側頭型認知症FTD、様々な形態の血管性認知症VD、皮質下血管性認知症ビンスワンガー病、自閉症、発達遅延、運動ニューロン病、筋委縮性側索硬化症ALS、神経もしくは脳の損傷、脳低酸素症、脳性麻痺CP、記憶障害、運動障害、大脳皮質基底核神経節変性症、様々な形態の多系統委縮症、脳卒中関連疾患、脳血管障害、痙攣を伴う放射線照射後脳症、血管性パーキンソニズム、視床脳血管障害、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパチー、アルコール関連認知症、意味性認知症、運動失調症、非定型パーキンソニズム、ジストニア、進行性核上性麻痺、本態性振戦、軽度認知障害、筋委縮性側索硬化症、多発性硬化症、ニューロパチー、ピック病、コンゴーレッド親和性血管障害、クロイツフェルトヤコブ病、エイズ認知症複合症、鬱病、不安障害、恐怖症、ベル麻痺、てんかん、脳炎、神経筋障害、神経腫瘍学的疾患、脳腫瘍、神経血管性障害、神経免疫学的障害、神経耳科疾患、脊椎損傷を含む神経外傷、神経因性疼痛を含む疼痛、小児性神経障害および精神神経障害、睡眠障害、トゥレット症候群、大脳皮質基底核神経節変性症、アルコール関連認知症、意味性認知症、多発梗塞性認知症を合併したアルツハイマー病、レビー小体認知症を合併したアルツハイマー病、レビー小体認知症を合併したパーキンソン病、レビー小体認知症を合併したアルツハイマー病およびパーキンソン病、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパチーを合併した前頭側頭型認知症、注意欠陥多動性障害、統合失調症、強迫性障害、精神遅滞、自閉症スペクトラム障害、オプソクローヌスミオクローヌス症候群OMS痙攣、構音障害、学習障害すなわち、読みまたは計算、言語能力または言語運用能力の欠陥、注意欠陥障害、アミロイド病、プリオン病、タウオパチー、αシヌクレイン病、コカイン、ニコチン、アルコール、食物、エクスタシー、チャット、カフェイン、アヘン、ヘロイン、マリファナ、アンフェタミン、メタンフェタミンまたはギャンブルのうちの少なくとも1つに起因する中毒症状、およびファブリー病が含まれる。本明細書における用語自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状は、免疫系の機能に悪影響を及ぼす任意の疾患または症状を指す。自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状の例には、これらに限定されないが、抗リン脂質抗体症候群、全身性エリテマトーデス、リウマチ性関節炎、自己免疫性血管炎、セリアック病、自己免疫性甲状腺炎、輸血後免疫付与、母体胎児間不適合、輸血反応、IgA欠損症などの免疫不全症、分類不能型免疫不全症、薬剤誘発性ループス、糖尿病、I型糖尿病、II型糖尿病、若年発症糖尿病、若年性リウマチ性関節炎、乾癬性関節炎、多発性硬化症、免疫不全、アレルギー、喘息、乾癬、アトピー性皮膚炎、アレルギー性接触性皮膚炎、慢性皮膚疾患、筋委縮性側索硬化症、化学療法誘発性損傷、移植片対宿主病、骨髄移植拒絶反応、強直性脊椎炎、アトピー性湿疹、天疱瘡、ベーチェット病、慢性疲労症候群線維筋痛症、化学療法誘発性損傷、重症筋無力症、糸球体腎炎、アレルギー性網膜炎、全身性硬化症、亜急性皮膚エリテマトーデス、凍瘡状エリテマトーデスを含む皮膚エリテマトーデス、シェーグレン症候群、自己免疫性腎炎、自己免疫性血管炎、自己免疫性肝炎、自己免疫性心臓炎、自己免疫性脳炎、自己免疫介在性の血液疾患、lc-SSc限局皮膚硬化型強皮症、dc-SScびまん皮膚硬化型強皮症、自己免疫性甲状腺炎AT、グレーブス病GD、重症筋無力症、多発性硬化症MS、強直性脊椎炎、移植拒絶反応、免疫老化、リウマチ性/自己免疫性疾患、混合性結合組織病、脊椎関節症、乾癬、乾癬性関節炎、筋炎、強皮症、皮膚筋炎、自己免疫性血管炎、混合性結合組織病、特発性血小板減少性紫斑病、クローン病、ヒトアジュバント病、変形性関節炎、若年性慢性関節炎、脊椎関節症、特発性炎症性ミオパチー、全身性血管炎、サルコイドーシス、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性血小板減少症、甲状腺炎、免疫介在性の腎臓疾患、中枢神経系または末梢神経系の脱髄疾患、特発性脱髄性多発ニューロパチー、ギランバレー症候群、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパチー、肝胆道系疾患、感染性または自己免疫性の慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎、硬化性胆管炎、炎症性腸疾患、グルテン過敏性腸疾患、ウィップル病、自己免疫介在または免疫介在性の皮膚疾患、水疱性皮膚症、多形紅斑、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症、じん麻疹、肺の免疫疾患、好酸球性肺炎、特発性肺線維症、過敏性肺臓炎、移植関連疾患、移植片拒絶反応または移植片対宿主病、乾癬性関節炎、乾癬、皮膚炎、多発性筋炎/皮膚筋炎、中毒性表皮壊死症、全身性強皮症および硬化症、炎症性腸疾患関連反応、クローン病、潰瘍性大腸炎、呼吸窮迫症候群、成人性呼吸窮迫症候群ARDS、髄膜炎、脳炎、ぶどう膜炎、大腸炎、糸球体腎炎、アレルギー性病態、湿疹、喘息、T細胞浸潤および慢性炎症性反応を伴う症状、アテローム性硬化症、自己免疫性心筋炎、白血球接着異常症、アレルギー性脳脊髄炎、サイトカイン介在性およびTリンパ球介在性の急性過敏および遅延性過敏を伴う免疫反応、結核、サルコイドーシス、ウェゲナー肉芽腫症を含む肉芽腫症、無顆粒球症、血管炎ANCAを含む、再生不良性貧血、ダイアモンドブラックファン貧血、自己免疫性溶血性貧血AIHAを含む免疫性溶血性貧血、悪性貧血、赤芽球癆PRCA、第VIII因子欠損、A型血友病、自己免疫性好中球減少症、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出を伴う疾患、中枢神経系CNS炎症性疾患、多臓器損傷症候群、重症筋無力症、抗原抗体複合体介在性の疾患、抗糸球体基底膜抗体疾患、抗リン脂質抗体症候群、アレルギー性神経炎、ベーチェット病、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、ランバートイートン筋無力症症候群、レイノー症候群、シェーングレン症候群、スティーブンスジョンソン症候群、水疱性類天疱瘡、天疱瘡、自己免疫性多発性内分泌腺症、ライター病、スティッフマン症候群、巨細胞性動脈炎、免疫複合体腎炎、IgA腎症、IgM多発ニューロパチーまたはIgM介在性のニューロパチー、特発性血小板減少性紫斑病ITP、血栓性血小板減少性紫斑病TTP、自己免疫性血小板減少症、自己免疫性精巣炎および自己免疫性卵巣炎を含む精巣および卵巣の自己免疫性疾患、原発性甲状腺機能低下症、自己免疫性甲状腺炎を含む自己免疫性内分泌疾患、慢性甲状腺炎橋本病甲状腺炎、亜急性甲状腺炎、特発性甲状腺機能低下症、アジソン病、グレーヴス病、自己免疫性多腺性症候群または、多腺性内分泌障害症候群、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、リンパ性間質性肺炎HIV性、閉塞性細気管支炎非移植性対NSIP、ギランバレー症候群、大血管炎リウマチ性多発筋痛および巨細胞性高安動脈炎を含む、中血管炎川崎病および結節性多発動脈炎を含む、強直性脊椎炎、ベルジェ病IgA腎症、急速進行性糸球体腎炎、原発性胆汁性肝硬変、セリアック病グルテン性腸疾患、クリオグロブリン血症、および筋委縮性側索硬化症ALSが含まれる。本明細書における用語癌は、様々な種類の悪性新生物を指し、そのほとんどは、周囲の組織に浸潤することができ、様々な部位へ転移することがある例えば、その全体が全ての目的のため参照により本明細書に組み込まれる、PDRMedicalDictionary、1stedition1995を参照のこと。用語新生物および腫瘍は、細胞増殖によって正常よりも速く成長し、増殖を開始させた刺激が除去された後も成長を続ける異常組織を指す同文献。このような異常組織は、構造的な組織化および正常組織との機能的な協調が、部分的にまたは完全に失われており、これは良性すなわち、良性腫瘍であっても、悪性すなわち、悪性腫瘍であってもよい。癌の一般的な分類の例としては、これらに限定されないが、癌腫すなわち、例えば、一般的な乳癌、前立腺癌、肺癌、および結腸癌などの上皮細胞由来の悪性腫瘍、肉腫すなわち、結合組織または間葉細胞由来の悪性腫瘍、リンパ腫すなわち、造血細胞由来の悪性病変、白血病すなわち、造血細胞由来の悪性病変、胚細胞性腫瘍すなわち、全能性細胞由来の腫瘍。成人では、精巣または卵巣で最も多く見られ、胎児、乳児、および幼児では、身体正中で、特に尾骨の先端で最も多く見られる、および芽細胞性腫瘍すなわち、未成熟組織または胚性組織に類似する、通常は悪性である腫瘍などが挙げられる。本発明に包含されることが意図される新生物の種類の例としては、これらに限定されないが、神経組織癌、造血性組織癌、乳腺癌、皮膚癌、骨癌、前立腺癌、卵巣癌、子宮癌、子宮頸癌、肝臓癌、肺癌、脳癌、喉頭癌、胆嚢癌、膵臓癌、直腸癌、副甲状腺癌、甲状腺癌、副腎癌、免疫系の癌、頭頸部癌、結腸癌、胃癌、気管支癌、および/または腎臓癌と関連する新生物が挙げられる。本明細書における用語感染性因子には、これらに限定されないが、ウイルス、細菌、真菌、寄生生物、感染性タンパク質などの病原性生物が含まれる。ウイルスとしては、DNA動物ウイルスまたはRNA動物ウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書におけるRNAウイルスとしては、これらに限定されないが、ピコルナウイルス例えば、ポリオイルス、レオウイルス例えば、ロタウイルス、トガウイルス例えば、脳炎ウイルス、黄熱病ウイルス、風疹ウイルス、オルトミクソウイルス例えば、インフルエンザウイルス、パラミクソウイルス例えば、呼吸器多核体ウイルスウイルス、麻疹ウイルス、ムンプスウイルス、パラインフルエンザウイルス、ラブドウイルス例えば、狂犬病ウイルス、コロナウイルス、ブニヤウイルス、フラビウイルス、フィロウイルス、アレナウイルス、ブニヤウイルス、およびレトロウイルス例えば、ヒトT細胞リンパ球向性ウイルスHTLV、ヒト免疫不全ウイルスHIVなどのウイルスファミリーが挙げられる。本明細書におけるDNAウイルスとしては、これらに限定されないが、パポバウイルス例えば、パピローマウイルス、アデノウイルス例えば、アデノウイルス、ヘルペスウイルス例えば、単純ヘルペスウイルス、およびポックスウイルス例えば、痘瘡ウイルスなどのウイルスファミリーが挙げられる。細菌としては、グラム陽性細菌、グラム陰性細菌、および好酸菌などが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書におけるグラム陽性細菌としては、これらに限定されないが、アクチノマヅラ、アクチノミセスイスラエリー、バチルスアントラシス、バチルスセレウス、クロストリジウムボツリヌス、クロストリジウムディフィシル、クロストリジウムパーフリンジェンス、クロストリジウムテタニ、コリネバクテリウム、エンテロコッカスフェカリス、リステリアモノサイトゲネス、ノカルジア、プロピオニバクテリウムアクネス、スタフィロコッカスアウレウス、スタフィロコッカスエピデルミデス、ストレプトコッカスミュータンス、およびストレプトコッカスニューモニエなどが挙げられる。本明細書におけるグラム陰性細菌としては、これらに限定されないが、アフピアフェリス、バクテロイデス、バルトネラバシリホルミス、ボルタデラパーツシス、ボレリアブルグドルフェリ、ボレリアレカレンチス、ブルセラ、カリマトバクテリウムグラヌロマティス、カンピロバクター、エシェリキアコリ、フランシセラツラレンシス、ガードネレラバギナリス、ヘモフィルスエジプチウス、ヘモフィルスデュクレイ、ヘモフィルスインフルエンザエ、ヘリコバクターピロリ、レジオネラニューモフィラ、レプトスピラインターロガンス、ナイセリアメニンギティディア、ポルフィロモナスジンジバリス、プロビデンシアスチュアーティイ、シュードモナスエルジノーサ、サルモネラエンテリティディス、サルモネラチフィ、セラチアマルセセンス、シゲラボイディ、ストレプトバチルスモニリフォルミス、ストレプトコッカスピオゲネス、トレポネーマパリダム、ビブリオコレラエ、エルシニアエンテロコリチカ、およびエルシニアペスチスなどが挙げられる。本明細書における好酸菌としては、これらに限定されないが、マイオバクテリウムアビウム、マイオバクテリウムレプレ、およびマイオバクテリウムツベルクローシスなどが挙げられる。本明細書における他の3つの分類に含まれないその他の細菌としては、これらに限定されないが、バルトネラヘンセラ、クラミジアシタッシ、クラミジアトラコマチス、コクシエラブルネッティ、マイコプラズマニューモニエ、リケッチアアカリ、リケッチアプロワツェキイ、リケッチアリケッチイ、リケッチアツツガムシ、リケッチアチフィ、ウレアプラズマウレアリチカム、ディプロコッカスニューモニエ、エーリキアシャフェンシス、およびエンテロコッカスフェシウム、髄膜炎菌などが挙げられる。本明細書における真菌としては、これらに限定されないが、コウジカビ、カンジダ、カンジダアルビカンス、コクシジオイデスイミチス、クリプトコッカス、およびこれらの組合せが挙げられる。本明細書における寄生性微生物としては、これらに限定されないが、バランチジウムコリ、クリプトスポリジウムパルバム、シクロスポラカイエタネンシス、エンセファリトゾア、エントアメーバヒストリチカ、エンテロシトゾーンビエヌーシ、ジアルジアランブリア、リーシュマニア、プラスモディPlasmodii、トキソプラズマゴンディ、トリパノソーマ、および台形状アメーバなどが挙げられる。本明細書における寄生生物としては、虫類例えば、蠕虫類、特に、線形動物門回虫、例えば、鞭虫類、鉤虫類、蟯虫類、回虫類、糸状虫類など、条虫類例えば、サナダムシ類などの寄生性虫類が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書における疾患または症状の治療は、臨床的結果を含む、有益な結果または所望のを得るための手段を講じることを指す。有益な結果または所望の臨床的結果としては、疾患または症状と関連する1つまたは複数の症状の緩和または改善が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書において、対象に化合物または薬剤を投与することまたはその投与は、当業者に周知の様々な方法のうちの1つを用いて実行してもよい。例えば、化合物または薬剤を、静脈内投与、動脈投与、皮内投与、筋肉内投与、腹腔内投与、静脈内投与、皮下投与、眼投与、舌下投与、経口投与摂取により、鼻腔内投与吸入により、髄腔内投与、脳内投与、および経皮投与例えば、皮膚導管を介した吸収によりしてもよい。化合物または薬剤を、再充填可能または生分解性の高分子製デバイスもしくはその他のデバイス、例えばパッチおよびポンプにより適切に導入してもよく、化合物または薬剤を持続放出、放出遅延、または制御放出させる製剤により適切に導入してもよい。例えば、1回の投与、複数回の投与、および/または1回または複数回の長期間にわたる投与を実行してもよい。ある態様では、投与には、自己投与を含む直接投与、および薬品を処方する行為を含む間接投与の両方が含まれる。例えば、本明細書において、薬品を自己投与するように指導する医師、または他人に薬品を投与してもらうよう患者に指導する医師、および/または薬品の処方箋を患者に与える医師は、患者に薬品を投与している。ある実施形態では、例えば摂食により経口的に、または、例えば注射により静脈内に、化合物または薬剤が患者に投与される。ある実施形態では、経口投与された化合物または薬剤は、徐放性製剤または放出遅延製剤であるか、または、このような持続放出または放出遅延をもたらすデバイスを使用して投与される。ある実施形態では、本発明の方法で使用されるマーカーは、非貪食細胞と比較して無細胞体液で上方制御または活性化されている。ある実施形態では、本発明の方法で使用されるマーカーは、非貪食細胞と比較して無細胞体液で下方制御または抑制されている。ある実施形態では、本発明の方法で使用されるマーカーは、2n貪食細胞と比べて無細胞体液で上方制御または活性化されている。ある実施形態では、本発明の方法で使用されるマーカーは、2n貪食細胞と比べて無細胞体液で下方制御または抑制されている。種々の疾患または症状が、種々のマーカーの上方制御もしくは、活性化、または下方制御もしくは、抑制と関連していることがある。本明細書における上方制御または上方制御されたは、マーカーの発現レベル例えば、遺伝子発現またはタンパク質発現、遺伝子コピー数、遺伝子量、およびその他の定性的または定量的に検出可能な状態の増大を指すことがある。同様に、下方制御または下方制御されたは、マーカーの発現レベル、遺伝子コピー数、遺伝子量、およびその他の定性的または定量的に検出可能な状態の増大を指すことがある。本明細書における活性化または活性化されたは、マーカーの活性状態、例えば、リン酸化状態、DNAメチル化状態、またはDNAアセチル化状態を指すことがある。同様に、抑制または抑制されたは、マーカーの抑制状態または不活性化状態、例えば、脱リン酸化状態、ユビキチン化状態、DNA脱メチル化状態を指すことがある。ある実施形態では、本発明の方法はまた、無細胞体液からマーカーを抽出または濃縮することを含むことがある。本明細書では、任意の既知の抽出方法および濃縮方法を用いることができる。ある実施形態では、本発明の方法はまた、様々なプロファイルを判定する前に、i非貪食細胞または2n貪食細胞を溶解するステップ、ii溶解した非貪食細胞または溶解した2n貪食細胞から細胞内容物を抽出するステップ、のうちの少なくとも1つを含む。本明細書では、任意の既知の細胞溶解方法および抽出方法を用いることができる。ある実施形態では、無細胞体液は、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片など、貪食細胞に貪食された様々な種類の物質を含む。ある実施形態では、疾患または症状の少なくとも1つまたは複数のマーカーが無細胞体液中に存在する。ある実施形態では、非貪食細胞または2n貪食細胞の細胞内容物中にはマーカーが存在しない。ある実施形態では、本発明の方法は、疾患または症状に特異的なマーカーについて同定された差異を、当技術分野において周知の少なくとも1つのマーカーのリポジトリと比較することをさらに含む。このような比較により、疾患または症状の存在をさらに確認することができる。ある実施形態では、既知マーカーのリポジトリをデータマイニングによって得ることがある。本明細書における用語データマイニングは、データベースの既知データから導かれる新規なデータのパターン、関係、または相関を見い出し、将来的に利用可能な情報を抽出するプロセスを指す。一般に、データについてデータマイニングを実行するように例えば、入力されたデータを分類するようにコンピュータベースのシステムをトレーニングし、その後、このシステムを新規に入力されたデータとともに用いて、トレーニングデータに基づく決定を行うことができる。このようなシステムとしては、これらに限定されないが、エキスパートシステム、ファジー論理、非線形回帰分析、多変量解析、決定木分類器、およびベイズの信念ネットワークが挙げられる。ある実施形態では、無細胞体液は、体液試料に由来する。例示的な体液試料は、全血、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血液、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液であってもよい。ある実施形態では、無細胞体液は、抽出、遠心分離、および濾過などの当技術分野において周知の方法によって体液試料から細胞を分離することにより得られる。ある実施形態では、2n貪食細胞または非貪食細胞は、白血球から単離される。ある実施形態では、2n貪食細胞は、貪食細胞集団から分離される。ある実施形態では、DNA量が2nである細胞を含む組織試料または体液試料は、静脈または動脈の穿刺とそれに続く血液の採取、組織生検、気管支肺胞洗浄、鼻洗浄、眼洗浄、腹腔洗浄、膣洗浄、膀胱洗浄、直腸洗浄、脊髄液の細針吸引、および滑液の吸引などにより得られた体液の非細胞画分を例えば、遠心分離により分離した後に得られる。無細胞体液は、静脈または動脈の穿刺とそれに続く血液の採取、組織生検、気管支肺胞洗浄、鼻洗浄、眼洗浄、腹腔洗浄、膣洗浄、膀胱洗浄、直腸洗浄、脊髄液の細針吸引、および滑液の吸引などにより得られた体液の細胞画分を例えば、遠心分離により分離した後に得られる。本発明の方法では、細胞分離/単離/精製の方法を使用して、対象の体液試料、細胞、または組織から細胞集団が単離される。当業者は、任意の既知の細胞分離/単離/精製技術を用いて、体液から2n貪食細胞または非貪食細胞を単離することができる。例示的な細胞抽出/分離/単離技術としては、これらに限定されないが、抗体の使用、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せが挙げられる。本明細書に記載の方法のある態様では、プロファイルされる被分析物としては、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの任意の組合せが挙げられる。本明細書に記載の方法のある態様では、マーカーとしては、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの任意の組合せが挙げられる。本明細書における用語核酸には、DNA分子例えば、cDNAまたはゲノムDNA、RNA分子例えば、mRNA、DNA-RNAハイブリッド、およびヌクレオチド類似体を用いて生成されたDNAまたはRNAの類似体が含まれることが意図される。核酸分子は、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、二本鎖DNA、一本鎖DNA、多重鎖DNA、相補DNA、ゲノムDNA、非コードDNA、メッセンジャーRNAmRNA、マイクロRNAmiRNA、核小体低分子RNAsnoRNA、リボソーマルRNArRNA、トランスファーRNAtRNA、低分子干渉RNAsiRNA、ヘテロ核RNAhnRNA、または低分子ヘアピン型RNAshRNAであってもよい。本明細書における用語アミノ酸には、塩基性アミノ基および酸性カルボキシル基の両方を含有する有機化合物が含まれる。天然アミノ酸例えば、L-アミノ酸、修飾アミノ酸および異常アミノ酸例えば、D-アミノ酸およびβ-アミノ酸、ならびに生物学的には遊離型または結合型で存在することが知られているが、タンパク質中には通常存在しないアミノ酸がこの用語の範囲に含まれる。天然タンパク質中に存在するアミノ酸としては、アラニン、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グルタミン酸、グルタミン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、トレオニン、チロシン、トリプトファン、プロリン、およびバリンが挙げられる。非天然タンパク質のアミノ酸としては、アルギノコハク酸、シトルリン、システイン硫酸、3,4-ジヒドロキシフェニルアラニン、ホモシステイン、ホモセリン、オルニチン、3-モノヨードチロシン、3,5-ジヨードチロシン、3,5,5-トリヨードチロシ、および3,3’,5,5’-テトラヨードチロシンが挙げられる。修飾アミノ酸または異常アミノ酸としては、D-アミノ酸、ヒドロキシリシン、4-ヒドロキシプロリン、N-Cbz-保護アミノ酸、2,4-ジアミノ酪酸、ホモアルギニン、ノルロイシン、N-メチルアミノ酪酸、ナフチルアラニン、フェニルグリシン、α-フェニルプロリン、tert-ロイシン、4-アミノシクロヘキシルアラニン、N-メチル-ノルロイシン、3,4-デヒドロプロリン、Ν,Ν-ジメチルアミノグリシン、N-メチルアミノグリシン、4-アミノピペリジン-4-カルボン酸、6-アミノカプロン酸、trans-4-アミノメチル-シクロヘキサンカルボン酸、2-,3-,4-アミノメチル-安息香酸、1-アミノシクロペンタンカルボン酸、1-アミノシクロプロパンカルボン酸、および2-ベンジル-5-アミノペンタン酸が挙げられる。本明細書における用語ペプチドには、ペプチド結合によって連結される2つまたは複数のアミノ酸からなる化合物が含まれる。ペプチドの分子量は、10,000ダルトン未満、5,000ダルトン未満、または2,500ダルトン未満であってもよい。用語ペプチドにはまた、ペプチド成分と、擬似ペプチド残基もしくはペプチド模倣残基またはその他の非アミノ酸成分などの非ペプチド成分との両方を含有する化合物が含まれる。ペプチド成分と非ペプチド成分の両方を含有するこのような化合物はまた、ペプチド類似体と呼ばれることがある。本明細書における用語タンパク質には、直鎖状に配列され、隣接するアミノ酸残基のカルボキシル基とアミノ基との間のペプチド結合により連結されるアミノ酸からなる化合物が含まれる。本発明の方法で用いられるタンパク質としては、これらに限定されないが、アミノ酸、ペプチド、抗体、抗体断片、サイトカイン、リポタンパク質、または糖タンパク質が挙げられる。本明細書における用語抗体には、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体免疫グロブリンFc領域を有する全長抗体を含む、多重エピトープ特異性を有する抗体組成物、多重特異性抗体例えば、二重特異性抗体、二特異性抗体、および一本鎖分子、および抗体断片例えば、FabまたはFab’2、およびFvが含まれる。様々な種類の抗体の構造と特性については、例えば、BasicandClinicalImmunology,8thEdition,DanielP.Sties,AbbaI.TerrandTristramG.Parsolweds,AppletonLange,Norwalk,Conn.,1994,71ページおよび第6章を参照のこと。本明細書における用語サイトカインは、免疫系細胞の活性を調節する分泌タンパク質またはその活性断片もしくは変異体を指す。サイトカインの例としては、これらに限定されないが、インターロイキン、インターフェロン、ケモカイン、腫瘍壊死因子、および免疫細胞前駆体のコロニー刺激因子などが挙げられる。本明細書における用語リポタンパク質には、遊離コレステロールおよびアポリポタンパク質が結合した両親媒性リン脂質の表面層で取り囲まれた、疎水性コレステリルエステルとトリグリセリドとのコアを含む負に帯電した組成物が含まれる。リポタンパク質は、そのサイズにより決定される、脂質とタンパク質との相対量である密度例えば、超低密度リポタンパク質VLDL、低密度リポタンパク質LDL、および高密度リポタンパク質HDLによって特徴づけられてもよい。リポタンパク質はまた、特定の修飾例えば、酸化、アセチル化、または糖化の有無によって特徴づけられてもよい。本明細書における用語糖タンパク質には、ペプチドまたはタンパク質に共有結合した1つまたは複数のオリゴ糖または多糖を有する配糖体が含まれる。例示的な糖タンパク質としては、これらに限定されないが、免疫グロブリン、主要組織適合複合体のメンバー、コラーゲン、ムチン、糖タンパク質IIb/IIIa、糖タンパク質-41gp41および糖タンパク質-120gp12、濾胞刺激ホルモン、α-フェトプロテイン、エリスロポエチン、トランスフェリン、アルカリホスファターゼ、およびレクチンを挙げることができる。本明細書における用語脂質には、一般に両親媒性で生体適合性の、合成化合物または天然化合物が含まれる。脂質は、通常、親水性成分および疎水性成分を含む。例示的な脂質としては、これらに限定されないが、脂肪酸、中性脂肪、リン脂質、コレステロール、コレステロールエステル、トリグリセリド、糖脂質、グリセロ脂質、グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、ステロール脂質、プレノール脂質、サッカロ脂質、ポリケチド、コリングリセロリン脂質、エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルセリン、リゾ-コリングリセロリン脂質、リゾ-エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジン酸、リゾ-ホスファチジン酸、スフィンゴミエリン、ガラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、スルファチド、遊離脂肪酸、プロスタグランジン、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、モノアシルグリセロール、アシル-CoA、アシルカルニチン、オキシステロール、セラミド、カルジオリピン、スフィンゴイド塩基-1-リン酸、スフィンゴシン、リゾ-スフィンゴミエリン、ガングリオシド、プラスマローゲン、スルファチド、セラミド、低密度リポタンパク質LDL、超低密度リポタンパク質VLDL、高密度リポタンパク質HDL、スフィンゴイド塩基-1-リン酸、またはこれらの誘導体が挙げられる。本明細書における用語炭水化物には、これらに限定されないが、酸素原子、水素原子、および炭素原子を含有する化合物、通常はCH2Onnは整数が含まれる。例示的な炭水化物としては、これらに限定されないが、単糖類、二糖類、多糖類、またはオリゴ糖類が挙げられる。本明細書における用語代謝物には、代謝において使用される任意の分子が含まれる。代謝物は、代謝プロセスにおける産物、基質、または中間産物であってもよい。一次代謝物、二次代謝物、有機代謝物、または無機代謝物がこの用語の範囲に含まれる。代謝物としては、これらに限定されないが、アミノ酸、ペプチド、アシルカルニチン、単糖類、脂質およびリン脂質、プロスタグランジン、ヒドロキシエイコサテトラエン酸、ヒドロキシオクタデカジエン酸、ステロイド類、胆汁酸、ならびに糖脂質およびリン脂質が挙げられる。例示的な代謝物は、スフィンゴ脂質、グリコスフィンゴ脂質、スフィンゴシン、セラミド、スフィンゴミエリン、スフィンゴシルホスフォリルコリン、ジヒドロスフィンゴシン、ホスファチジルコリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルセリン、リゾホスファチジルコリン、リゾホスファチジルイノシトール、リゾホスファチジルセリン、プラスメニルホスファチジルコリン、プラスマニルホスファチジルコリン、タンパク質を構成するアミノ酸、アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、フェニルアラニン、グリシン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、リシン、メチオニン、プロリン、アルギニン、セリン、トレオニン、バリン、トリプトファン、チロシン、非対称性ジメチルアルギニン、対称性ジメチルアルギニン、グルタミン、アスパラギン、ニトロチロシン、ヒドロキシプロリン、キヌレニン、3-ヒドロキシキヌレニン、タンパク質を構成しないアミノ酸、オルニチン、シトルリン、アシルカルニチン、カルニチン、遊離カルニチン、アシルカルニチン、ヒドロキシルアシルカルニチン、ジカルボキシルアシルカルニチン、還元単糖類、ヘキソース、ペントース、デオキシヘキソース、クレアチニン、クレアチン、スペルミジンスペルミン、プトレシン、ドーパミン、セロトニン、プロスタグランジン、ヒドロキシエイコサテトラエン酸、ヒドロキシオクタデカジエン酸、ロイコトリエン、トロンボキサン、胆汁酸、ステロール、コレステロール、ビタミンおよび補因子、薬物、ならびに薬物代謝物であってもよい。本発明のある実施形態では、疾患または症状の少なくとも1つまたは複数のマーカーのプロファイルが比較される。この比較は、定量的であっても定性的であってもよい。定量的な測定は、本明細書に記載の任意のアッセイを用いて行うことができる。例えば、シークエンシング、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガージデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシングduplexsequencing、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアタームnear-termシークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシングsequencing-by-synthesis、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、SolexaGenomeAnalyzerを用いたシークエンシング、SOLiD登録商標を用いたシークエンシング、MS-PETシークエンシング、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析法、二次イオン質量分析SIMS法、ポリメラーゼ連鎖反応PCR解析、定量的PCR法、リアルタイムPCR法、蛍光アッセイ、比色アッセイ、化学発光アッセイ、またはこれらの組合せである。定量的比較としては、t検定、分散分析ANOVA、クラスカルウォリス検定、ウィルコクソン検定、マンホイットニー検定、およびオッズ比などの統計解析を挙げることができる。定量的な差異としては、プロファイル間のマーカーレベルの差異、またはプロファイル間のマーカー存在数の差異、およびこれらの組合せを挙げることができる。マーカーレベルの例は、これらに限定されないが、遺伝子発現レベル、核酸レベル、タンパク質レベル、および脂質レベルなどであってもよい。定性的な差異としては、これらに限定されないが、活性化および不活化、タンパク質分解、核酸分解、ならびに共有結合修飾を挙げることができる。本発明のある実施形態では、プロファイルは、核酸プロファイル、タンパク質プロファイル、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せである。プロファイルは、定性的または定量的に決定され得る。核酸プロファイルは、これらに限定されないが、遺伝子型プロファイル、一塩基多型プロファイル、遺伝子変異プロファイル、遺伝子コピー数プロファイル、DNAメチル化プロファイル、DNAアセチル化プロファイル、染色体遺伝子量プロファイル、遺伝子発現プロファイル、またはこれらの組合せであってもよい。核酸プロファイルは、遺伝子型、一塩基多型、遺伝子変異、遺伝子コピー数、DNAメチル化状態、DNAアセチル化状態、染色体遺伝子量を検出するための当技術分野において周知の任意の方法によって決定することができる。例示的な方法には、これらに限定されないが、ポリメラーゼ連鎖反応PCR解析、シークエンシング解析、電気泳動解析、制限断片長多型RFLP解析、ノーザンブロット解析、定量的PCR法、逆転写PCR解析RT-PCR、アレル特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション解析、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、ヘテロ二重鎖移動度アッセイHMA、一本鎖高次構造多型SSCP法、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動DGGE法、RNAaseミスマッチ解析、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、表面プラズモン共鳴法、サザンブロット解析、insituハイブリダイゼーション法、蛍光insituハイブリダイゼーションFISH法、発色性insituハイブリダイゼーションCISH法、免疫組織化学IHC法、マイクロアレイ法、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、核型分析、多重ライゲーション依存性プローブ増幅MLPA法、短蛍光フラグメントの定量的多重PCRQMPSF法、顕微鏡法、メチル化特異的PCRMSPアッセイ、ライゲーション仲介PCRによるHpaII小断片濃縮HpaIITinyFragmentEnrichmentbyLigation-MediatedPCRHELPアッセイ、放射性酢酸塩標識アッセイ、比色によるDNAアセチル化アッセイ、マイクロアレイと組み合わせたクロマチン免疫沈降ChIP-on-chipアッセイ、制限酵素ランドマークゲノムスキャニング法、メチル化DNA免疫沈降MeDIP法、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ活性の分子切断光アッセイ、クロマトグラフィーによる分離、メチル化感受性制限酵素解析、バイサルファイトによる非メチル化シトシンのウラシルへの変換、メチル結合PCR解析、またはこれらの組合せが含まれる。本明細書における用語シークエンシングは、広い意味で使用され、核酸の少なくとも一部これらに限定されないが、伸長産物またはベクターインサートの少なくとも一部を含むにおいて少なくともいくつかの連続するヌクレオチドの順序を同定することを可能にする、当技術分野において周知の任意の技術を指す。例示的なシークエンシング技術としては、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガージデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシングduplexsequencing、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアタームnear-termシークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシングsequencing-by-synthesis、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、SolexaGenomeAnalyzerを用いたシークエンシング、SOLiD登録商標を用いたシークエンシング、MS-PETシークエンシング、質量分析法、およびこれらの組合せが挙げられる。ある実施形態では、シークエンシングには、例えば、これらに限定されないが、ABIPRISM登録商標377DNAシークエンサー、ABIPRISM登録商標310、3100、3100-Avant、3730、または3730xIジェネティックアナライザー、ABIPRISM登録商標3700DNAアナライザー、またはアプライドバイオシステムズソSOLiD商標システム全てAppliedBiosystems社製、ゲノムシークエンサー20システムRocheAppliedScience社、または質量分析計などの機器を使用してシークエンシング産物を検出することが含まれる。ある実施形態では、シークエンシングには、エマルジョンPCRが含まれる。ある実施形態では、シークエンシングには、ハイスループットシークエンシング技術、例えば、これに限定されないが、大規模並列処理シグネチャシークエンシングMPSSが含まれる。本発明のさらなる実施形態では、タンパク質プロファイルは、タンパク質発現プロファイル、タンパク質活性化プロファイル、またはこれらの組合せであってもよい。ある実施形態では、タンパク質活性化プロファイルには、リン酸化状態、ユビキチン化状態、ミリストイル化状態、またはタンパク質の立体構造状態を決定することが含まれていてもよい。タンパク質プロファイルは、タンパク質発現レベル、タンパク質リン酸化状態、タンパク質ユビキチン化状態、タンパク質ミリストイル化状態、またはタンパク質立体構造状態を検出するための当技術分野において周知の任意の方法により検出することができる。ある実施形態では、タンパク質プロファイルを、免疫組織化学分アッセイ、酵素結合免疫吸着検定法ELISA、insituハイブリダイゼーション法、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオイムノアッセイ、顕微鏡法、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、表面プラズモン共鳴法、シークエンシング、ウェスタンブロットアッセイ、またはこれらの組合せによって決定することができる。本発明のある実施形態では、脂質プロファイルを、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオミムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せによって決定することができる。生体試料中の脂質含量を分析するための別の方法は、当技術分野において周知である例えば、Kangetal.1992Biochim.Biophys.Acta.1128:267;Weylandtetal.1996Lipids31:977;J.Schilleretal.1999Anal.Biochem.267:46;Kangetal.2001Proc.Natl.Acad.Sci.USA98:4050;Schilleretal.2004Prog.LipidRes.43:499を参照のこと。脂質分析の1つの例示的な方法としては、例えば、0.005のブチル化ヒドロキシトルエンBHT、抗酸化剤としてを含有するクロロホルムメタノール2:1、体積/体積を用いて生体試料から脂質を抽出し、例えば、14BF3メタノール試薬を用いて脂肪酸メチルエステルを調製し、例えば、HPLC、TLCにより、市販のガスクロマトグラフ、質量分析計、および/またはガスクロマトグラフ/質量分析計の組み合わせを用いたガスクロマトグラフィー質量分光法によって脂肪酸メチルエステルの定量化を行うことが挙げられる。脂肪酸の質量は、種々の分析された脂肪酸の領域を、一定濃度の内部標準の領域と比較することにより決定される。本発明のある実施形態では、炭水化物プロファイルを、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析法FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析法MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析法SIMS法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せによって決定することができる。本発明のある実施形態では、代謝物プロファイルを、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィーHPLC法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間MALDI-TOF型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化ESI質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間SELDI-TOF型質量分析法、四重極飛行時間Q-TOF型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析APPI-MS法、フーリエ変換質量分析FTMS法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析MALDI-FT-ICR法、二次イオン質量分析SIMS法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せによって決定することができる。本明細書において、本発明の方法により検出される種々のプロファイル間の差異とは、異なった遺伝子コピー数、DNA、RNA、タンパク質、脂質、または炭水化物の異なった発現レベル、異なったDNAメチル化状態、異なったDNAアセチル化状態、および異なったタンパク質修飾状態を指すことがある。差異は、1倍よりも大きい差異であってもよい。ある実施形態では、差異は、1.05倍、1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の差異である。ある実施形態では、差異は、1~10倍の間、2~10倍の間、5~10倍の間、10~20倍の間、または10~100倍の間の任意の差異である。マーカーを検出するためのアッセイの一般的な原理としては、マーカー例えば、1つまたは複数のDNA、RNA、タンパク質、ポリペプチド、炭水化物、脂質、および代謝物など、およびプローブを含有していてもよい試料または反応混合物を、適切な条件下にて、該マーカーおよびプローブが相互作用して結合するのに十分な時間で調製して、反応混合物中に取出しおよび/または検出が可能である複合体を形成することが挙げられる。このようなアッセイは、様々な方法で実施することができる。例えば、このようなアッセイを実施する1つの方法としては、マーカーまたはプローブを、基材とも呼ばれる固相支持体上に固定して、固相上に固定された標的マーカー/プローブ複合体を反応終了時に検出することが挙げられる。このような方法のある実施形態では、担体または固相支持体上に、マーカーの存在および/または濃度についてのアッセイが行われる対象からの試料を固定してもよい。別の実施形態では、逆の状態も可能であり、その場合、プローブを固相に固定し、対象からの試料をこのアッセイの未固定成分として反応させてもよい。アッセイ成分を固相へ固定するための多くの方法が確立されている。これらには、ビオチンおよびストレプトアビジンの結合によって固定化されるマーカーまたはプローブ分子が含まれるが、これらに限定されない。このようなビオチン化アッセイ成分は、ビオチン-NHSN-ヒドロキシスクシンイミドから当技術分野において周知の技術例えば、ビオチン化キット、PierceChemical社、ロックフォード、イリノイ州を用いて調製し、ストレプトアビジンでコートした96ウェルプレートPierceChemical社のウェル中に固定化することができる。ある実施形態では、固定化アッセイ成分を有する表面を予め作製し、保存しておくことができる。このようなアッセイに適切なその他の担体または固相支持体としては、マーカーまたはプローブが属する種類の分子を結合することができる任意の材質が挙げられる。周知の支持体または担体としては、これらに限定されないが、ガラス、ポリスチレン、ナイロン、ポリプロピレン、ナイロン、ポリエチレン、デキストラン、アミラーゼ、天然セルロースおよび修飾セルロース、ポリアクリルアミド、斑れい岩、ならびにマグネタイトが挙げられる。上記手法を用いたアッセイを実施するために、第二の成分が固定された固相に非固定化成分が添加される。反応完了後、形成された複合体がいずれも固相上に固定化されたままとなる条件下で、複合体を形成していない成分を例えば、洗浄することにより除去してもよい。固相に固定化されたマーカー/プローブ複合体の検出は、本明細書で概説する多数の方法によって行うことができる。ある例示的な実施形態では、プローブが固定化されていないアッセイ成分である場合、プローブは、アッセイの検出および読み取りの目的で、本明細書で検討され当業者に周知である標識により、直接的または間接的に標識されることがある。任意の成分マーカーまたはプローブをさらに処置または標識することなく、例えば、蛍光エネルギー転移技術例えば、米国特許第5,631,169号および同第4,868,103号を参照のことを利用することにより、マーカー/プローブ複合体の形成を直接的に検出することも可能である。第一のドナー分子上のフルオロフォア標識は、適切な波長の入射光で励起された場合に、放出された蛍光エネルギーが第二のアクセプター分子上の蛍光標識によって吸収され、吸収されたエネルギーによって該分子が次に蛍光を発することができるように選択される。あるいは、ドナータンパク質分子は、単にトリプトファン残基の天然の蛍光エネルギーを利用してもよい。標識は、アクセプター分子の標識をドナーの標識と区別することができるように、異なる波長の光を発するものが選択される。標識間のエネルギー転移の効率が分子を隔てる距離と関連していることから、分子間の空間的な関係を評価することができる。分子間で結合が生じる状況では、このアッセイにおけるアクセプター分子標識の蛍光発光が最大となるはずである。FET結合事象は、当技術分野において周知の標準的な蛍光定量的検出手段により例えば、蛍光光度計を用いて、簡便に測定することができる。別の実施形態では、プローブがマーカーを認識する能力の測定は、リアルタイム生体分子相互作用解析BIA例えば、Sjolander,S.andUrbaniczky,C,1991,Anal.Chem.63:23382345、およびSzaboetal,1995,Curr.Opin.Struct.Biol.5:699705を参照のことなどの技術を利用することにより、いずれのアッセイ成分プローブまたはマーカーも標識することなく行うことができる。本明細書におけるBIAまたは表面プラズモン共鳴とは、相互作用物のいずれをも標識せずに、リアルタイムで生体分子特異的相互作用の研究を行うための技術である例えば、BIAcore。結合表面における質量の変化結合事象の指標によって表面付近での光の屈折率が変化し表面プラズモン共鳴SPRの光学現象、生体分子間のリアルタイム反応の指標として用いることができる検出可能なシグナルが生じる。あるいは、別の実施形態では、類似の診断アッセイおよび予後アッセイを、液相中の溶質としてマーカーおよびプローブを用いて実施することができる。このようなアッセイでは、数多くの標準的な技術のうちの任意の技術によって、複合体を形成したマーカーとプローブが、複合体を形成していない成分から分離される。前記技術としては、これらに限定されないが、分画遠心分離法、クロマトグラフィー法、電気泳動法、および免疫沈降法が挙げられる。分画遠心分離法では、サイズおよび密度の違いに基づいた複合体の沈降係数の相違により、一連の遠心分離により、マーカー/プローブ複合体を複合体を形成していないアッセイ成分から分離することができる例えば、RivasandMinton1993TrendsBiochem.Sci.18:284を参照のこと。標準的なクロマトグラフィー技術も、複合体を形成していない分子から複合体を形成した分子を分離するために用いることができる。例えば、ゲル濾過クロマトグラフィーは、サイズに基づいて分子を分離するものであり、適切なゲル濾過樹脂をカラムの形態で用いることにより、例えば、複合体を形成していない相対的に小さな成分から相対的に大きな複合体を分離することが可能である。同様に、複合体を形成していない成分と比較したマーカー/プローブ複合体の荷電特性の相対的差異を利用して、例えばイオン交換クロマトグラフィー樹脂を用いて、複合体を形成していない成分から複合体を分離することができる。このような樹脂およびクロマトグラフィー技術は、当業者に周知である例えば、Heegaard1998J.MoI.Recognit.11:141;HageandTweed1997J.Chromatogr.B.Biomed.Sci.Appl.12:499を参照のこと。ゲル電気泳動も、未結合成分から複合体を形成したアッセイ成分を分離するために利用することができる例えば、Ausubeletal,ed.,CurrentProtocolsinMolecularBiology,JohnWileySons,NewYork,19871999を参照のこと。この技術では、タンパク質または核酸の複合体が、例えば、サイズまたは電荷に基づいて分離される。電気泳動プロセスの間、結合相互作用を維持するために、通常は非変性ゲルマトリックス材料が好ましく、還元剤が存在しない条件が好ましい。特定のアッセイに対する適切な条件およびその成分は、当業者に周知であるだろう。ある例示的な実施形態では、マーカーに対応するmRNAのレベルを、当技術分野において周知の方法を用いて、生体試料中でinsitu方式および/またはinvitro方式のいずれかにより決定することができる。発現検出方法の多くが単離されたRNAを用いる。invitroの方法では、mRNAの単離に対しては選択されない任意のRNA単離技術を、血液細胞からのRNAの精製に利用することができる例えば、Ausubeletal,ed.,CurrentProtocolsinMolecularBiology,JohnWileySons,NewYork19871999を参照のこと。さらに、例えば、ChomczynskiのシングルステップRNA単離プロセス1989年、米国特許第4,843,155号などの当業者に周知の技術を用いて、大量の細胞および/または試料を容易に処理することができる。単離されたmRNAは、これらに限定されないが、サザン解析またはノーザン解析、ポリメラーゼ連鎖反応解析、およびプローブアレイを含む、ハイブリダイゼーションアッセイまたは増幅アッセイに用いることができる。ある例示的な実施形態では、mRNAレベルを検出するための診断方法としては、単離されたmRNAを、被検出遺伝子によってコードされたmRNAとハイブリダイズすることができる核酸分子プローブに接触させることが挙げられる。核酸プローブは、例えば、完全長cDNA、あるいは少なくとも7、15、30、50、100、250、または500ヌクレオチド長であり、本発明のマーカーをコードするmRNAまたはゲノムDNAとストリンジェントな条件下で特異的にハイブリダイズするのに十分であるオリゴヌクレオチドなど、完全長cDNAの一部であってもよい。本発明の診断アッセイに用いるその他の適切なプローブについては、本明細書に記載される。mRNAとプローブとのハイブリダイゼーションは、対象とするマーカーが発現していることを示すものである。ある方式では、例えば、単離されたmRNAをアガロースゲル上で泳動し、このmRNAをゲルからニトロセルロースなどの膜に転写することによって、mRNAを固相表面上に固定化してプローブと接触させる。別の方式では、例えば遺伝子チップアレイにおいて、プローブを固相表面上に固定化して、mRNAをこのプローブと接触させる。当業者は、既知のmRNA検出方法を適合させて、本発明のマーカーによってコードされるmRNAのレベルの検出に用いることができる。試料中の本発明のマーカーに対応するmRNAのレベルを測定するための別の方法としては、例えば、RT-PCR米国特許第4,683,195号および同第4,683,202号に記載の実施例、COLD-PCRLietal.2008Nat.Med.14:579、リガーゼ連鎖反応Barany,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:189、自家持続配列複製法Guatellietal.,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA87:1874、転写増幅システムKwohetal.1989Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:1173、Qβレプリカーゼ法Lizardietal.1988Bio/Technology6:1197、ローリングサークル複製法米国特許第5,854,033号による核酸増幅プロセス、またはその他の任意の核酸増幅方法が挙げられ、続いて、当業者に周知の技術を用いて増幅分子が検出される。これらの検出方法は、核酸分子の検出において、このような分子の存在数が非常に少ない場合に特に有用である。本明細書において、増幅プライマーは、遺伝子の5’領域または3’領域それぞれ、プラス鎖およびマイナス鎖、または逆も同様にアニールすることができ、中間に短い領域を含む一対の核酸分子と定義される。一般に、増幅プライマーは、約10~30ヌクレオチド長であり、約50~200ヌクレオチド長の領域に隣接する。適切な条件下で適切な試薬を用いて、このようなプライマーにより、プライマーに隣接するヌクレオチド配列を含む核酸分子が増幅される。insitu法では、検出の前に試料例えば、体液例えば、血液細胞からmRNAを単離する必要がない。このような方法では、細胞試料または組織試料は、既知の組織学的方法を用いて調製/処理される。次に、この試料を、支持体通常はスライドグラス上に固定化して、マーカーをコードするmRNAとハイブリダイズ可能なプローブと接触させる。マーカーの絶対的発現レベルに基づいて決定する変法として、標準化されたマーカー発現レベルに基づいて判定してもよい。発現レベルの標準化は、マーカーの発現を、例えば、恒常的に発現しているハウスキーピング遺伝子など、マーカーではない遺伝子の発現と比較することにより、マーカーの絶対的発現レベルを補正することによって行われる。標準化に適した遺伝子としては、アクチン遺伝子などのハウスキーピング遺伝子、または上皮細胞特異的遺伝子が挙げられる。この標準化により、ある供給源由来の患者試料中の発現レベルを別の供給源由来の患者試料と比較することが可能となり、例えば、個体の貪食血液細胞をその個体の非貪食血液細胞と比較することができる。本発明のある実施形態では、マーカーに対応するタンパク質またはポリペプチドが検出される。ある実施形態では、タンパク質またはポリペプチドを検出するための薬剤は、ポリペプチドに結合することができる抗体、例えば、検出可能な標識を有する抗体などであってもよい。本明細書における用語標識されたは、プローブまたは抗体に関して、検出可能な物質をプローブまたは抗体にカップリングすなわち、物理的に連結させることによりプローブまたは抗体を直接的に標識すること、および直接的に標識された別の試薬との反応性によってプローブまたは抗体を間接的に標識することを包含することを意図している。間接的な標識の例には、蛍光標識された二次抗体を用いて一次抗体を検出すること、および蛍光標識されたストレプトアビジンで検出できるよう、ビオチンによりDNAプローブを末端標識することが含まれる。抗体は、ポリクローナルであってもモノクローナルであってもよい。完全長の抗体またはその断片例えば、FabまたはFab’2を用いてもよい。ある方式では、発現タンパク質を検出するためのウェスタンブロットまたは免疫蛍光法などの方法において、抗体または抗体断片を用いることができる。このような使用では、抗体またはタンパク質のいずれかを固形支持体上に固定化することが一般に好ましい。適切な固相支持体または担体としては、抗原または抗体に結合することができる任意の支持体が挙げられる。既知の支持体または担体としては、ガラス、ポリスチレン、ポリプロピレン、ポリエチレン、デキストラン、ナイロン、アミラーゼ、天然セルロースおよび修飾セルロース、ポリアクリルアミド、斑れい岩、およびマグネタイトなどが挙げられる。種々の方式を用いて、試料が所与の抗体と結合するタンパク質を含有するかどうかを判定することができる。このような方式の例としては、これらに限定されないが、競合的イムノアッセイおよび非競合的イムノアッセイ、エンザイムイムノアッセイEIA、ラジオイムノアッセイRIA、抗原捕捉アッセイ、二抗体サンドイッチアッセイ、ウェスタンブロット解析、酵素結合免疫吸着検定法ELISA、平面アレイ、比色アッセイ、化学発光アッセイ、および蛍光アッセイなどが挙げられる。ラジオイムノアッセイおよび酵素結合イムノアッセイを含むイムノアッセイは、本発明の方法において有用である。当業者は、既知のタンパク質/抗体検出方法を容易に適合させて、細胞例えば、血液細胞などの体液細胞が本発明のマーカーを発現するかの判定に用いることができる。当業者であれば、抗体または抗原を結合させるためのその他の多くの適切な担体を理解しており、そのような支持体を本発明での使用に適合させることができるであろう。例えば、細胞例えば、血液細胞などの体液細胞から単離されたタンパク質をポリアクリルアミドゲルで電気泳動して、ニトロセルロースなどの固相支持体上へ固定してもよい。次に、この支持体を適切なバッファーで洗浄し、続いて検出可能なように標識された抗体を用いて処理することができる。次に、この固相支持体をバッファーで再度洗浄し、未結合の抗体を除去することができる。次に、固相支持体上に結合した標識の量を、従来の手段で検出することができる。ある例示的な実施形態では、診断、予後予測、疾患を発症するリスクの評価、治療の有効性の評価、疾患の進行または軽減のモニタリング、および疾患の改善または治療が可能な化合物の同定のためにアッセイが提供される。これらの方法の例示的な方法としては、試験対象から体液試料を得ること、および体液試料を、疾患または症状の1つまたは複数のマーカー、例えば、マーカー核酸例えば、mRNA、ゲノムDNA、マーカーペプチド例えば、ポリペプチドまたはタンパク質、マーカー脂質例えば、コレステロール、またはマーカー代謝物例えば、クレアチニンを検出することができる化合物または薬剤と接触させてマーカーの存在を生体試料中で検出することが挙げられる。ある実施形態では、マーカーmRNAまたはゲノムDNAを検出するための薬剤は、マーカーmRNAまたはゲノムDNAとハイブリダイズすることができる標識核酸プローブである。核酸プローブは、例えば、完全長マーカー核酸、またはその一部であってもよい。本発明の診断アッセイに用いられるその他の適切なプローブは、本明細書に記載される。本明細書において、疾患または症状を改善または治療することが可能な化合物としては、これらに限定されないが、症状または予後を改善、疾患または症状の進行を防止、疾患または症状の軽減を促進、あるいは疾患または症状を除去することができる任意の物質を挙げることができる。本発明の方法はまた、マーカー遺伝子における遺伝的な変化を検出するために用いることもでき、それによって変化した遺伝子を有する対象が、癌および/または感染性因子に関連する疾患および/または障害、および/または癌などのマーカータンパク質活性もしくは核酸発現の誤制御を特徴とする本明細書に記載の1つまたは複数のその他の疾患を発症するリスクを有するかどうかを判定することができる。ある実施形態では、前記方法には、対象からの無細胞体液試料において、マーカーペプチドをコードする遺伝子および/またはマーカー遺伝子の完全性に影響を与える変化を特徴とする遺伝的変化の有無を検出することが含まれる。例えば、このような遺伝的変化は、11つまたは複数のマーカー遺伝子からの1つまたは複数のヌクレオチドの欠失、21つまたは複数のマーカー遺伝子への1つまたは複数のヌクレオチドの付加、31つまたは複数のマーカー遺伝子の1つまたは複数のヌクレオチドの置換、41つまたは複数のマーカー遺伝子の染色体再構築、51つまたは複数のマーカー遺伝子のメッセンジャーRNA転写物のレベルの変化、6ゲノムDNAのメチル化パターンの異常修飾など、1つまたは複数のマーカー遺伝子の異常修飾、71つまたは複数のマーカー遺伝子のメッセンジャーRNA転写物の非野生型スプライシングパターンの存在、8非野生型レベルの1つまたは複数のマーカータンパク質、91つまたは複数のマーカー遺伝子のアレル喪失、および101つまたは複数のマーカータンパク質の不適切な翻訳後修飾、の少なくとも1つの存在を確認することによって検出することができる。本明細書に記載のように、1つまたは複数のマーカー遺伝子の変化の検出に用いることができる当技術分野において周知のアッセイが数多く存在する。ある実施形態では、変化の検出としては、例えば、リアルタイムPCR、COLD-PCRLietal.2008Nat.Med.14:579、アンカーPCR、反復PCR、またはRACEPCRなどのポリメラーゼ連鎖反応PCR例えば、米国特許第4,683,195号、同第4,683,202号、および同第5,854,033号を参照のことにおいて、あるいは、ライゲーション連鎖反応LCR例えば、Landegranetal.1988Science241:1077;ProdromouandPearl1992ProteinEng.5:827;およびNakazawaetal.1994Proc.Natl.Acad.Sci.USA91:360を参照のことにおいて、プローブ/プライマーを用いることが挙げられる。後者は、マーカー遺伝子における点変異の検出に特に有用である場合があるAbravayaetal.1995NucleicAcidsRes.23:675を参照のこと。この方法は、対象から無細胞体液試料を採取するステップ、試料から核酸例えば、ゲノムDNA、mRNA、または両方を単離するステップ、核酸試料を、マーカー遺伝子と特異的にハイブリダイズする1つまたは複数のプライマーと、マーカー遺伝子存在する場合のハイブリダイゼーションおよび増幅が起こるような条件下で接触させるステップ、ならびに増幅産物の有無を検出するステップまたは増幅産物のサイズを検出してその長さをコントロール試料と比較するステップを含んでいてもよい。PCRおよび/またはLCRは、本明細書に記載の変異検出に用いられる任意の技術と組み合わせて、予備的増幅ステップとして用いることが望ましいことがあることが予想される。別の増幅方法としては、自家持続配列複製法Guatellietal.,1990Proc.Natl.Acad.Sci.USA87:1874、転写増幅システムKwohetal.,1989Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:1173、Qβレプリカーゼ法Lizardietal.1988Bio-Technology6:1197、またはその他の任意の核酸増幅方法が挙げられ、続いて当業者に周知の技術を用いて増幅分子が検出される。これらの検出方式は、核酸分子の検出において、このような分子の存在数が非常に少ない場合に特に有用である。別の実施形態では、試料の1つまたは複数のマーカー遺伝子における変異を、制限酵素切断パターンの変化によって同定することができる。例えば、試料DNAおよびコントロールDNAを単離し、所望により増幅し、1つまたは複数の制限酵素で消化して、断片長さのサイズをゲル電気泳動で測定して比較する。試料およびコントロールDNAの断片長さサイズの違いが、試料DNAにおける変異を示す。さらに、配列特異的リボザイムを使用することで例えば、米国特許第5,498,531号を参照のこと、リボザイム切断部位の発生または喪失によって特定の変異の存在をスコア化することができる。他の実施形態では、本明細書に記載のマーカーの1つまたは複数における遺伝子変異は、DNAまたはRNAなどの試料およびコントロール核酸を、数百または数千のオリゴヌクレオチドプローブを含む高密度アレイとハイブリダイズすることによって同定することができるCroninetal.1996HumanMutation7:244;Kozaletal.1996NatureMedicine2:753。例えば、マーカー核酸における遺伝子変異は、CroninM.T.etal.上記文献に記載のように、光発生DNAプローブlight-generatedDNAprobesを含む二次元アレイで同定することができる。簡潔に述べると、プローブの第一のハイブリダイゼーションアレイを用いて、試料およびコントロール中のDNAの長い範囲をスキャンし、連続的な重複プローブの直線配列を作成することにより配列間の塩基の変化を同定することができる。このステップにより、点変異の同定が可能となる。第二のハイブリダイゼーションアレイがこの工程に続き、これにより、検出された全ての異型または変異に相補的な低分子の特異的プローブアレイを用いて特定の変異の特性決定が可能となる。各々の変異アレイは、一方は野生型遺伝子に対して相補的であり、他方は変異遺伝子に対して相補的である並列プローブセットからなる。さらに別の実施形態では、当技術分野において周知の種々のシークエンシング反応の任意の方法を用いて、マーカー遺伝子の配列を直接的に決定し、試料マーカー遺伝子の配列を対応する野生型コントロール配列と比較することにより変異を検出することができる。シークエンシング反応の例としては、MaxamandGilbert1977Proc.Natl.Acad.Sci.USA74:560、またはSanger1977Proc.Natl.Acad.Sci.USA74:5463により開発された技術に基づく反応が挙げられる。また、診断アッセイを実施する際に、質量分析法によるシークエンシング例えば、PCT国際公開第94/16101号、Cohenetal.1996Adv.Chromatogr.36:127-162;およびGriffinetal.1993Appl.Biochem.Biotechnol.38:147を参照を含む、種々の自動化シークエンシング方法のいずれをも用いることが出来ることも意図される1995Biotechniques19:448。マーカー遺伝子の変異を検出するその他の方法としては、切断薬剤からの保護を用いてRNA/RNAまたはRNA/DNAヘテロ二重鎖のミスマッチ塩基を検出する方法が挙げられるMyersetal.1985Science230:1242。一般的に、ミスマッチ切断という技術では、最初に、野生型マーカー配列を含む標識されたRNAまたはDNAを、組織試料から得られた、変異の可能性のあるRNAまたはDNAとハイブリダイズさせることにより形成されたヘテロ二重鎖を準備する。例えば、コントロール鎖と試料鎖との塩基対ミスマッチが原因で存在することがある二重鎖の一本鎖領域を切断する薬剤で、二本鎖の二重鎖を処理する。例えば、RNA/DNA二重鎖をRNaseで処理し、DNA/DNAハイブリッドをS1ヌクレアーゼで処理することにより、ミスマッチ領域を酵素切断することができる。他の実施形態では、ミスマッチ領域を消化するために、DNA/DNA二重鎖またはRNA/DNA二重鎖のいずれかを、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウムで処理して、ピペリジンで処理することができる。ミスマッチ領域の消化後、次に、得られた物質を変性ポリアクリルアミドゲル上でサイズによって分離し、変異部位を決定する。例えば、Cottonetal.1988Proc.Natl.Acad.Sci.USA85:4397;Saleebaetal.1992MethodsEnzymol.217:286を参照のこと。ある実施形態では、コントロールDNAまたはRNAを検出のために標識してもよい。さらに別の実施形態では、ミスマッチ切断反応は、細胞試料から得られたマーカーcDNAの点変異の検出およびマッピングを行うための限定された系において、二本鎖DNA中のミスマッチ塩基対を認識する1つまたは複数のタンパク質いわゆるDNAミスマッチ修復酵素を利用する。例えば、大腸菌のmutY酵素は、G/AミスマッチにおいてAを切断し、HeLa細胞からのチミジンDNAグリコシラーゼは、G/TミスマッチにおいてTを切断するHsuetal.1994Carcinogenesis15:1657。例示的な実施形態では、例えば、野生型マーカー配列などのマーカー配列に基づくプローブを、試験細胞からのcDNAまたはその他のDNA産物とハイブリダイズさせる。この二重鎖をDNAミスマッチ修復酵素で処理し、切断産物が存在する場合は、これを電気泳動法などで検出することができる。例えば、米国特許第5,459,039号を参照のこと。他の実施形態では、電気泳動移動度の変化を用いて、マーカー遺伝子の変異が同定される。例えば、一本鎖高次構造多型分析SSCPを用いて、変異型核酸と野生型核酸との電気泳動移動度の違いを検出することができるOritaetal.1989Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:2766。Cotton1993Mutat.Res.285:125;およびHayashi1992Genet.Anal.Tech.Appl.9:73も参照のこと。試料およびコントロールのマーカー核酸の一本鎖DNA断片を変性し、復元させる。一本鎖核酸の二次構造は配列に応じて異なり、その結果生じる電気泳動移動度の変化により、単一塩基の変化でさえ検出することができる。DNA断片を標識してもよく、標識したプローブで検出してもよい。アッセイの感度は、二次構造が配列の変化に対してより高感度であるRNAを用いることでDNAを用いるよりも向上させることができる。ある実施形態では、本方法は、ヘテロ二重鎖分析を利用して、電気泳動移動度の変化に基づいて二本鎖ヘテロ二重鎖分子が分離されるKeenetal.1991TrendsGenet.7:5。さらに別の実施形態では、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動DGGEMyersetal.1985Nature313:495を用い、変性剤の濃度勾配を含むポリアクリルアミドゲル中での変異型断片または野生型断片の移動がアッセイされる。解析方法としてDGGEを用いる場合、例えば、およそ40塩基対の高融点GCリッチDNAであるGCクランプをPCRにより付加することによって、完全に変性されないことを確実にするようDNAが修飾される。さらなる実施形態では、変性剤濃度勾配の代わりに温度勾配を用いて、コントロールDNAおよび試料DNAの移動度の違いが同定されるRosenbaumandReissner1987Biophys.Chem.265:12753。点変異を検出するためのその他の技術の例には、これらに限定されないが、選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増幅、または選択的プライマー伸長が含まれる。例えば、既知の変異を中央部に配置したオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、次に、完全にマッチする場合にのみハイブリダイゼーションが可能である条件下にて標的DNAとハイブリダイズしてもよいSaikietal.1986Nature324:163;Saikietal.1989Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:6230。このようなアレル特異的オリゴヌクレオチドは、このオリゴヌクレオチドがハイブリダイゼーションメンブレンと結合し、標識された標的DNAとハイブリダイズする場合に、PCRで増幅された標的DNAまたは多数の異なった変異とハイブリダイズする。あるいは、選択的PCR増幅に依存したアレル特異的増幅技術を、本発明と組み合わせて用いることが可能である。特異的増幅のためのプライマーとして用いられるオリゴヌクレオチドは、分子の中央部にそれによって増幅が差次的ハイブリダイゼーションに依存するようにGibbsetal.1989Nucl.AcidsRes.17:2437対象となる変異を有していてもよく、適切な条件下にてミスマッチがポリメラーゼ伸長を阻止または低減することができる一方のプライマーの3’最末端にProssner1993Tibtech11:238対象となる変異を有していてもよい。さらに、変異領域中に新規な制限部位を導入して切断に基づく検出を行うことが望ましい場合もあるGasparinietal.1992Mol.CellProbes6:1。ある実施形態では、増幅用Taqリガーゼを用いて増幅を実行することも可能であると想定されるBarany1991Proc.Natl.Acad.Sci.USA88:189。このような場合、5’配列の3’末端にて完全一致する場合にのみライゲーションが起こり、それにより、増幅の有無を調べることで特定部位における既知の変異の存在を検出することが可能となる。ある態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状に対する1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、この方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第2プロファイルをデータマイニングにより得ること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルをデータマイニングにより得ること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、およびc第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルをデータマイニングにより得ること;前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルをデータマイニングにより得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること:前記疾患または症状を有する対象の非貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、c第1差異セットと第2差異セットの両方に存在する1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第5プロファイルを決定すること;第5プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第5プロファイルとの第3差異セットを同定すること、e第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。さらに別の態様では、本発明は、a疾患または症状を有する対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有する対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること;第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、b前記疾患または症状を有しないコントロール対象の無細胞体液試料から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること;前記疾患または症状を有しないコントロール対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること;第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、およびc第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法を提供する。所望により、前記方法は、d前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること;前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること;第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、およびe第3差異セット中に存在する、cの1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む。本発明のマーカーに対応する被分析物例えば、DNA、RNA、タンパク質、ポリペプチド、炭水化物、または脂質などの有無を、生体試料において検出するための例示的な方法としては、試験対象から体液試料例えば、血液を採取すること、および該体液試料を1つまたは複数のマーカーを検出することができる化合物または薬剤と接触させることが挙げられる。本明細書に記載の検出方法を用いて、生体試料中の1つまたは複数のマーカーを、invitroおよびinvivoで検出することができる。例えば、mRNAの検出のためのinvitro技術としては、ノーザンハイブリダイゼーションおよびinsituハイブリダイゼーションが挙げられる。本発明のマーカーに対応するポリペプチドの検出のためのinvitro技術としては、酵素結合免疫吸着検定法ELISA、ウェスタンブロット法、免疫沈降法、および免疫蛍光法が挙げられる。ゲノムDNAの検出のためのinvitro技術としては、サザンハイブリダイゼーションが挙げられる。さらに、本発明のマーカーに対応するポリペプチドの検出のためのinvivo技術としては、該ポリペプチドに対する標識抗体を対象に導入することが挙げられる。例えば、標準的なイメージング技術によって対象内での存在および局在を検出することができる放射性マーカーで、抗体を標識することができる。各々のマーカーもまた被分析物であるので、マーカーの有無を検出するための本明細書に記載の任意の方法を用いて被分析物の有無を検出することも可能である。本発明の方法において有用なマーカーとしては、上記マーカーのいずれか1つにおける任意の変異を挙げることができる。変異部位および配列は、例えば、HumanGeneMutationDatabasewww.hgmd.cf.ac.uk、SingleNucleotidePolymorphismDatabasedbSNP、www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP、およびOnlineMendelianInheritanceinManOMIMウェブサイトwww.ncbi.nlm.nih.gov/omimなど、変異部位および配列の情報のデータベースおよびリポジトリにより同定することができる。本発明の方法において有用なマーカーとしては、疾患または症状と関連があることが知られている任意のマーカーを挙げることができる。ある実施形態では、非貪食白血球、生存している/死につつある/死んだ原核細胞および真核細胞ならびにその断片をまだ貪食していない/内部に取り込んでいない貪食白血球、およびDNA量が2nすなわち、DNA指数が1である白血球などの例えば、血液、尿、および唾液から単離された白血球WBC亜集団は、評価を受ける個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、メタボロームプロファイル、グリコームプロファイル、グリコプロテオームプロファイル、リピドームプロファイルおよび/またはリポプロテオームプロファイルを報告および排除するのに有用である。診断を受ける疾患、病状および/または症状に関係のない患者特異的シグネチャをこのように同定することにより、癌またはその他の疾患または障害または症状を有している疑いがある個体の無細胞体液内全血、血漿、血清、尿、唾液、脳脊髄液、羊水、眼液、鼻汁、肺洗浄液、腹水、大便、およびリンパ液などの腫瘍/その他の疾患/症状に特異的なシグネチャを同定および検出することが可能となる。したがって、無細胞体液例えば、全血、血清、血漿、尿、唾液、脳脊髄液、羊水、眼液、鼻汁、肺洗浄液、腹水、大便、リンパ液に存在する疾患または症状に特異的なマーカーのプロファイルを、任意の非貪食白血球または非侵襲的に例えば、頬袋から擦り取ることにより得ることができる細胞におけるプロファイルと比較することにより、あるいはDNA指数が1である任意の貪食白血球および/または非貪食白血球または非侵襲的に例えば、頬袋から擦り取ることにより得ることができる細胞におけるプロファイルと比較することにより、非貪食細胞において、あるいはDNA量が2であるすなわち、DNA指数が1である任意の白血球および/またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞内で発現するすなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する、患者特異的、且つ腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的なシグネチャが同定されることになる。同様に、無細胞体液、およびDNA量が2nである非貪食白血球、DNA量が2であるすなわち、DN指数が1である任意の白血球、または非侵襲的に得ることができるDNA量が2nであるその他の任意の哺乳類細胞のタンパク質発現プロファイルにより、非貪食細胞、あるいはDNA量が2であるすなわち、DNA指数が1である任意の白血球および/またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞において発現するすなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する、体液内の腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的なタンパク質シグネチャが同定および検出されることになる。さらに、無細胞体液、およびDNA量が2nである非貪食白血球、DNA量が2であるすなわち、DNA指数が1である任意の白血球、または非侵襲的に得ることができるDNA量が2nであるその他の任意の哺乳類細胞の脂質プロファイルにより、非貪食細胞、あるいはDNA量が2であるすなわち、DNA指数が1である任意の白血球および/またはその他の体細胞において、発現していない、発現低下している、または診断もしくは検出される疾患もしくは症状の結果としてではなくこれらの細胞において発現するすなわち、個体の内在的なゲノムプロファイル、プロテオームプロファイル、およびエピジェネティックプロファイルに関連する、体液内の腫瘍特異的、疾患特異的、または症状特異的な脂質シグネチャが同定および検出されることになる。本発明の方法において有用なマーカーとしては、疾患または症状と関連があることが知られている任意のマーカーを挙げることができる。本発明において使用することができるマーカーは、特定の疾患または症状と関連があるものとして特徴が明らかである任意のマーカー、または本発明の方法により同定された任意のマーカーであってもよい。ある実施形態では、マーカーは、AKT2、BAK1、EGFR、ERBB2、ETS2、FOS、JUN、MAP2K1、MMP2、PDGFB、RB1、SERPINB2、SNCG、およびSPP1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーは、AKT1、AKT2、BAK2、CDC25A、E2F1、EGFR、ERBB2、FOS、JUN、MAP2K1、MMP2、NFKB1、PDGFB、PIK3R1、PNN、RB1、SERPINB2、SERPINB5、SNCG、SPP1、TERT、TIMP3、およびTP53からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーは、CASP8、CASP9、COL18A1、ETS2、HTATIP2、MMP9、SRC、およびTWIST1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、1つまたは複数のマーカーは、AKT1、APAF1、ATM、CDC25A、CDKN1A、ETS2、FOS、IL8、ITGA4、ITGA6、ITGAV、JUN、MAP2K1、NFKBIA、PLAU、PLAUR、RAF1、SERPINB2、SYK、TIMP1、TNF、TNFRSF10B、およびTNFRSF1Aからなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、マーカーは、ACP2、AK2、AKT3、ARL5B、ATP2B3、BGN、BRAF、BTG2、CAMKK2、CAPG、CAPN12、CPLX2、DENND5A、DNA2、FAM104A、FNIP1、GFRA4、GLUD1、GNAQ、GP1BB、HNRPLL、HOXA2、HPS3、IΝΡΡ4Α、ITGAV、KLHL23、LANCL2、LYPD6、MAPKAPK3、MEF2AEG:4205を含む、MEF2C、NVL、PCYT1A、PGLYRP4、PLOD1、PPP1CB、PRKAB2、PROS1、PTPRE、RASA4EG:10156を含む、RBMS2、RBPJ、STAT5B、THBS1、TRIB1、TRIM2、TSPAN6、およびZDHHC21からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、マーカーは、B4GALT5、BOP1、CCL2、CCL3、CCL3L1、CCRL2、CD83、CLEC4G、CLIC4、CTSC、CTSO、CXCL10、FCGR3A、FPR3、HBA1、HBB、LRMP、MAP1LC3B2、MS4A4A、MSR1、MYADML、NID1、PF4、PION、RNF217、SAMD9L、SERPING1、およびSPARCからなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、マーカーは、ACOT9、AMPD2、ARHGAP15、BATF2、C3AR1、C5orf41、CCL3、CCL3L1、CD63、CHST11、CHSY1、CLEC4G、CTSZ、CXorf21、CYTH4、CYTIP、DLEU2、DNAJA1、DOCK8、DTX3L、DUSP6、EPSTI1、ERF、F2RL1、FYB、GABRB2、GBP5、GLRX、GNB4、ICAM1、IFI35、IFIH1、IFNAR2、IL1R1、IRF1、ITGA5、LAP3、LAPTM5、LCP2、MAP1LC3B、MAP1LC3B2、MICAL2、MT1DP、MT1JP、MT1M、MT2A、MYADML、NEK6、NINJ2、NNMT、NT5C3L、NUB1、PDE4B、PLOD1、PML、PRKCB、PSMB9、RCN3、RGS4、RNASE6、RTP4、SAMD9L、SEL1L、SERPING1、SETX、SIGLEC10、SKIL、SLC7A7、SNORA21、SP100、SP110、SP140、SSFA2、STAT2、STK17B、STK3、TDRD7、TMCC1、TMPRSS11E2、TNFRSF1B、TPM1、TRIM21、TXNDC4、UBE2L6、UBE2W、USP18、VAV1、WARS、WIPF1、およびWIPI1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、マーカーは、ADAR、ADM、ALAS1、ANKRD22、ARHGAP27、B3GNT5、BCL10、C12orf35、C15orf29、C2orf59、CD177、CEACAM1、CPEB2、DDX58、F2RL1、GDPD3、GNAI3、HIST2H3A、HIST2H3D、HIST2H4A、HMGCR、HSPA6、HSPC159、IL4R、IMPA2、KPNB1、KREMEN1、KRT23、LDLR、LOC100130904、LTB4R、MAEA、MARK2、MBOAT2、MPZL3、N4BP1、NBEAL2、NMI、NPEPPS、PARP14、PGM2、PPIF、PXN、RALBP1、ROD1、RPS6KA1、S100P、SERTAD2、SLC9A1、SLPI、SP110、SPINT1、ST14、TBC1D3、TNFRSF9、TRIM21、UPP1、VPS24、ZBTB34、およびZNF256からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む。ある実施形態では、本発明の方法において有用である胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状のマーカーとしては、例えば、米国特許第7,655,399号、同第7,651,838号、同第6,660,477号、同第6,172,198号、同第5,594,637号、同第5,514,598号、同第6,258,540号、同第6,664,056号、同第7,235,359号、および同第7,645,576号、米国特許出願公開第20090162842号、同第20090155776号、同第20070207466号、同第20060019278号、同第20040086864号、同第20020045176号、同第20010051341号、同第20020192642号、同第20040009518号、同第20040203037号、同第20050282185号、同第20060252071号、同第20070275402号、同第20080153090号、同第20090170102号、同第20090061425号、同第20020045176号、同第20040137452号、同第20050164241号、同第20060019278号、同第20060252068号、同第20060252071号、同第20060257901号、同第20070141625号、同第20070218469号、同第20070275402号、同第20090155776号、同第20090162842号、同第20090170102号、同第20090317797号、同第20100120056号、同第20100120076号、および同第20100137263号、および国際特許出願公開第2006/026020号、同第2002/068685号、同第2005/111626号、同第2009/055487号、同第2009/001392号、および同第2008/014516号において開示されるマーカーが挙げられる。ある実施形態では、本発明の方法において有用である神経性もしくは精神神経性の疾患または症状のマーカーとしては、例えば、米国特許第7,723,117号、同第6,867,236号、米国特許出願公開第20060115854号、同第20060115855号、同第20060166283号、同第20060234301号、同第20060259990号、同第20060259991号、同第20070162983号、同第20070264197号、同第20080026405号、同第20080038730号、同第20080051334号、同第20080152589号、同第20080220013号、同第20080261226号、同第20080269103号、同第20080286263号、同第20090041862号、同第20090239241号、同第20090275046号、同第20090318354号、同第20090324611号、同第20100009352号、同第20100021929号、同第20100028356号、同第20100055722号、同第20100062463号、同第20100075891号、同第20100105623号、同第20100124756号、同第20100159486号、同第20100167937号、同第20100169988号、同第20100167320号、同第20100112587号、同第20100098705号、同第20100068705号、同第20100009356号、同第20090305265号、同第20100124746号、同第20100092983号、同第20070148661号、同第20070141625号、同第20100120050号、同第20090155230号、同第20090274709号、国際特許出願公開第2004/040016号、同第2004/071269号、同第2005/033341号、同第2005/052592号、同第2005/103712号、同第2005/114222号、同第2006/020269号、同第2006/048778号、同第2006/050475号、同第2006/061609号、同第2006/105907号、同第2006/133423号、同第2006/134390号、同第2007/098585号、同第2007/119179号、同第2008/010660号、同第2008/014314号、同第2008/028257号、同第2008/046509号、同第2008/046510号、同第2008/046511号、同第2008/046512号、同第2008/063369号、同第2008/085035号、同第2008/095261号、同第2008/100596号、同第2008/120684号、同第2008/125651号、同第2008/127317号、同第2008/132464号、同第2009/000520号、同第2009/001392号、同第2009/068591号、同第2009/074331号、同第2009/100131号、同第2010/005750号、同第2010/011506号、同第2010/019553号、同第2010/059242号、同第2010/061283号、同第2010/063009号、同第2010/066000号、同第2009/121152号、同第2009/121951号、同第2009/097450号、同第2009/092382号、同第2009/075579号、同第2009/058168号、同第2009/053523号、同第2009/034470号、同第2009/032722号、同第2009/014639号、同第2009/003142号、同第2010/041046号、同第2007/131345号、同第2008/003826号、および同第2009/07556号において開示されるマーカーが挙げられる。ある実施形態では、本発明の方法において有用である心血管系の疾患または症状のマーカーとしては、例えば、米国特許第7,670,769号、同第7,445,886号、同第7,432,107号、同第7,157,235号、および同第7,009,038号、米国特許出願公開第20100167320号、同第20100112587号、同第20100098705号、同第20100068705号、同第20100009356号、同第20090305265号同、第20100124746号、同第20100092983号、同第20070148661号、同第20070141625号、同第20100120050号、同第20090155230号、および同第20090274709号、および国際特許出願公開第2009/121152号、同第2009/121951号、同第2009/097450号、同第2009/092382号、同第2009/075579号、同第2009/058168号、同第2009/053523号、同第2009/034470号、同第2009/032722号、同第2009/014639号、同第2009/003142号、同第2010/041046号、同第2007/131345号、同第2008/003826号、および同第2009/075566号において開示されるマーカーが挙げられる。ある実施形態では、本発明の方法において有用である腎臓関連の疾患または症状のマーカーとしては、例えば、米国特許第7,488,584号、同第7,459,280号、同第7,294,465号、および同第7,662,578号、米国特許出願公開第20100143951号、同第20100124746号、同第20100120056号、同第20100120041号、同第20100081142号、同第20090155230号、および同第20090239242号、国際特許出願公開第2010/059996号、同第2010/054389号、同第2010/048347号、同第2010/048497号、同第2010/054167号、同第2010/048346号、同第2010/046137号、同第2010/025434号、同第2010/018185号、同第2010/012306号、同第2009/122387号、同第2009/083950号、同第2009/080780号、同第2009/060035号、同第2009/059259号、同第2008/154238号、同第2008/089936号、同第2008/084331号、同第2008/042012号、同第2007/131345号、同第2005/012907号、同第2004/024098号、同第2003/019193号、同第2007/112999号、同第2007/082733号、同第2006/073941号、同第2010/068686号、同第2010/022210号、および同第2009/127644号において開示されるマーカーが挙げられる。ある実施形態では、本発明の方法において有用である自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状のマーカーとしては、例えば、第7,604,948号、第7,670,764号、第6,986,995号、および第6,631,330号、米国特許出願公開第20070141625号、同第20090263474号、同第20100075891号、同第20100104579号、同第20100105086号、同第20100131286号、同第20090176217号、同第20090202469号、同第20020119118号、同第20090258025号、同第20100137393号、同第20100120629号、同第20090318392号、同第20090196927号、同第20090023166号、同第20080227709号、同第20080039402号、同第20080026378号、同第20070224638号、同第20070218519号、同第20060210562号、同第20050266432号、同第20050164233号、同第20050130245号、同第20090130683号、同第20090110667号、同第20090054321号、同第20090023166号、および同第20080274118号、および国際特許出願公開第2009/043848号、同第2010/053587号、同第2010/046503号、同第2010/039714号、同第2009/100342号、同第2009/053537号、同第2009/017444号、同第2008/156867号、同第2008/147938号、同第2008/129296号、同第2008/137835号、同第2008/082519号、同第2008/064336号、同第2008/043782号、同第2008/043725号、同第2007/047907号、同第2006/125117号、同第2006/114661号、同第2006/020899号、同第2005/114222号、同第2005/007836号、同第2004/076639号、同第2004/050704号、および同第2001/014881号において開示されるマーカーが挙げられる。本発明はまた、本発明の方法によって同定される少なくとも1つまたは複数のマーカーを検出するマーカー検出剤を含むキットを提供する。本発明はまた、本発明の方法により同定される少なくとも1つまたは複数のマーカーの活性または発現を調節する薬剤を対象に投与することを含む、対象において疾患または症状を治療または予防する方法を提供する。記載される本発明の実施形態は、単に本発明の原理のいくつかの応用を説明する例にすぎないこと理解されたい。当業者であれば、本明細書の教示に基づいて、本発明の真の趣旨および範囲から逸脱することなく、数多くの変更を行うことが可能である。以下の実施例は、本発明を代表するものとして示すものである。これらの実施形態およびその他の対応する実施形態が、本発明の開示、図面、および添付の請求項に照らして明らかであることから、これらの実施例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。実施例1非貪食細胞からDNA量が2nである貪食細胞を分離し、発現プロファイルを解析するための代表的な方法I1.血液試料を、血漿と白血球試料を含むバフィーコートとに分離する。白血球試料を入れるプレートをアビジンでコーティングする。2.非貪食血液細胞例えば、T細胞に対するビオチン化抗体をウェルに添加し、室温で30分間インキュベートし、ウェルを洗浄する。3.磁性ビーズを添加する。4.白血球血液試料を添加する。5.37°Cでインキュベートする30分~1時間。6.貪食細胞によるビーズの貪食、およびアビジン-ビオチン抗体の非貪食細胞への結合の後、プレートを磁石上に置き、洗浄する磁性ビーズを内部へ取り込んだ貪食細胞および抗体と結合した非貪食細胞が残留し、その他の全ての細胞は洗い流される。7.磁石を取り除き、貪食細胞を回収して、DNA量が2nである貪食細胞とDNA量が2n超である貪食細胞とに分離する。DNA量が2nである非貪食細胞および貪食細胞を、DNA量が2nである細胞という。8.血漿からRNAを単離し、DNA量が2nの貪食細胞からのRNAおよび非貪食細胞のRNAを単離し、cDNA、cRNAを調製し、これらを用いて血漿の遺伝子プロファイル例えば、全遺伝子アレイ、および/または癌遺伝子アレイを、貪食細胞および/または非貪食細胞の遺伝子プロファイルと区別する。9.血漿およびDNA量が2nである細胞からDNAを単離し、血漿に選択的に存在するすなわち、非貪食細胞などのDNA量が2nである細胞には存在しない腫瘍DNAシグネチャを同定し、プロファイル例えば、貪食細胞および非貪食細胞で得られた、全遺伝子アレイ、DNA変異、および/またはSNPを比較する。10.血漿およびDNA量が2nである細胞からタンパク質を単離し、ヒト腫瘍で過剰発現される既知のタンパク質例えば、前立腺癌におけるPSAおよびPSMA、結腸癌におけるCEA、ならびに卵巣癌におけるCA125に対する抗体を用いてウェスタンブロットを行い、血漿およびDNA量が2nである細胞で得られたプロファイルを比較する。あるいは、質量分析法を用いて、タンパク質を同定する。11.血漿およびDNA量が2nである細胞から脂質を単離し、例えばHPLCを用いて、その量および質を比較する。実施例2非貪食細胞から貪食細胞を分離し、発現プロファイルを解析するための代表的な方法II1.血液試料を血漿と白血球試料を含むバフィーコートとに分離する。2.スライドグラス上で白血球をサイトスピンにかける。3.アセトン/メタノール中で細胞を固定する-20°Cで5分間。4.ヘマトキシリンエオシン染色液、および抗T細胞抗体で染色する。5.レーザーキャプチャー顕微鏡法LCMを用いて、T細胞非貪食性およびマクロファージ貪食性を単離する。DNA量が2nである貪食細胞とDNA量が2n超である貪食細胞とに分離する。DNA量が2nである非貪食細胞および貪食細胞を、DNA量が2nである細胞という。6.血漿からRNAを単離し、DNA量が2nである貪食細胞からのRNAおよび非貪食細胞のRNAを単離し、cDNA、cRNAを調製し、これらを用いて血漿の遺伝子プロファイル例えば、全遺伝子アレイ、および/または癌遺伝子アレイを、貪食細胞および/または非貪食細胞の遺伝子プロファイルと区別する。7.血漿およびDNA量が2nである細胞からDNAを単離し、血漿に選択的に存在するすなわち、非貪食細胞などのDNA量が2nである細胞には存在しない腫瘍DNAシグネチャを同定し、プロファイル例えば、貪食細胞および非貪食細胞で得られた、全遺伝子アレイ、DNA変異、および/またはSNPを比較する。8.血漿およびDNA量が2nである細胞からタンパク質を単離し、ヒト腫瘍で過剰発現される既知のタンパク質例えば、前立腺癌におけるPSAおよびPSMA、結腸癌におけるCEA、ならびに卵巣癌におけるCA125に対する抗体を用いてウェスタンブロットを行い、血漿およびDNA量が2nである細胞で得られたプロファイルを比較する。あるいは、質量分析法を用いて、タンパク質を同定する。9.血漿およびDNA量が2nである細胞から脂質を単離し、例えばHPLCを用いて、その量および質を比較する。実施例3非貪食細胞から貪食細胞を分離し、発現プロファイルを解析するための代表的な方法III1.全血から血漿を分離する。2.磁性抗体結合ビーズを用いて、全血から非貪食細胞例えば、T細胞とおよび貪食細胞例えば、好中球、および/またはマクロファージ、および/または単球を単離する。DNA量が2nである貪食細胞とDNA量が2n超である貪食細胞とに分離する。DNA量が2nである非貪食細胞および貪食細胞を、DNA量が2nである細胞という。3.血漿からRNAを単離し、DNA量が2nである貪食細胞からのRNAおよび非貪食細胞のRNAを単離し、cDNA、cRNAを調製し、これらを用いて血漿の遺伝子プロファイル例えば、全遺伝子アレイ、および/または癌遺伝子アレイを、貪食細胞および/または非貪食細胞の遺伝子プロファイルと区別する。4.血漿およびDNA量が2nである細胞からDNAを単離し、血漿に選択的に存在するすなわち、非貪食細胞などのDNA量が2nである細胞には存在しない腫瘍DNAシグネチャを同定し、プロファイル例えば、貪食細胞および非貪食細胞で得られた、全遺伝子アレイ、DNA変異、および/またはSNPを比較する。5.血漿およびDNA量が2nである細胞からタンパク質を単離し、ヒト腫瘍で過剰発現される既知のタンパク質例えば、前立腺癌におけるPSAおよびPSMA、結腸癌におけるCEA、ならびに卵巣癌におけるCA125に対する抗体を用いてウェスタンブロットを行い、血漿およびDNA量が2nである細胞で得られたプロファイルを比較する。あるいは、質量分析法を用いて、タンパク質を同定する。6.血漿およびDNA量が2nである細胞から脂質を単離し、例えばHPLCを用いて、その量および質を比較する。実施例4非貪食細胞から貪食細胞を分離し、発現プロファイルを解析するための代表的な方法IV1.血液試料を血漿と白血球試料を含むバフィーコートとに分離する。特定の細胞亜集団例えば、好中球、マクロファージ、単球、およびT細胞などに対して特異的な蛍光抗体およびDNA染色液例えば、ヘキスト33342、ヨウ化プロピジウムで白血球を染色する。2.例えば、FACSにより細胞を選別する。3.血漿からRNAを単離し、DNA量が2nである貪食細胞からのRNAおよび非貪食細胞のRNAを単離し、cDNA、cRNAを調製し、これらを用いて血漿の遺伝子プロファイル例えば、全遺伝子アレイ、および/または癌遺伝子アレイを、貪食細胞および/または非貪食細胞の遺伝子プロファイルと区別する。4.血漿およびDNA量が2nである細胞からDNAを単離し、血漿に選択的に存在するすなわち、非貪食細胞などのDNA量が2nである細胞には存在しない腫瘍DNAシグネチャを同定し、プロファイル例えば、貪食細胞および非貪食細胞で得られた、全遺伝子アレイ、DNA変異、および/またはSNPを比較する。5.血漿およびDNA量が2nである細胞からタンパク質を単離し、ヒト腫瘍で過剰発現される既知のタンパク質例えば、前立腺癌におけるPSAおよびPSMA、結腸癌におけるCEA、ならびに卵巣癌におけるCA125に対する抗体を用いてウェスタンブロットを行い、血漿およびDNA量が2nである細胞で得られたプロファイルを比較する。あるいは、質量分析法を用いて、タンパク質を同定する。6.血漿およびDNA量が2nである細胞から脂質を単離し、例えばHPLCを用いて、その量および質を比較する。実施例5腫瘍を有するマウスから得られた無細胞体液中の腫瘍特異的遺伝子シグネチャの検出本発明の実施形態によれば、無細胞体液中の正常な非特異的ノイズと腫瘍特異的シグネチャおよび/または疾患特異的シグネチャおよび/または症状特異的シグネチャとを区別する方法が提供される。腫瘍を有するマウスの無細胞体液の遺伝子発現プロファイルを同じドナーマウスの非貪食T細胞の遺伝子発現プロファイルと比較して、同様の腫瘍を有するマウスおよび腫瘍を有しない動物の非貪食細胞中では発現されないかまたは著しく異なって発現される、無細胞体液内の腫瘍特異的シグネチャが同定される。ヒト前立腺LNCaP癌細胞胸腺欠損ヌードマウスn=5に、ヒト前立腺LNCaP癌細胞を皮下s.c.注射する。27日後腫瘍サイズ=約0.4cm、このマウスから心臓穿刺によりEDTA含有チューブへ採血約1mL/マウスを行った後、これを遠心分離する。血漿が単離される。バフィーコートを単離して洗浄し、好中球、マクロファージ、およびT細胞を、それぞれ、抗マウス好中球-免疫磁性ダイナビーズDynaBeads、抗マウスマクロファージ-免疫磁性ダイナビーズ、および抗マウスT細胞-免疫磁性ダイナビーズを用いて分離する。T細胞からRNAを単離するTriazol登録商標。RNAの品質を決定する。cDNAおよびビオチン化cRNAcRNA-Bを調製する。血漿からビオチン化cRNAcRNA-Bを調製する。血漿からのcRNA-B試料およびT細胞からのcRNA-B試料を、別々に癌遺伝子ヒトマイクロアレイOligoGEArray登録商標HumanCancerPathwayFinderMicroarray、OHS-033、SuperArrayBioscience社とインキュベートする。ハイブリダイゼーションの後、膜を洗浄し、アビジン結合アルカリホスファターゼで染色して、化学発光法X線フィルムを用いて遺伝子を検出する。T細胞から得られた遺伝子シグネチャと血漿から得られた遺伝子シグネチャとを比較する。血漿の遺伝子シグネチャからT細胞の遺伝子シグネチャを差し引くことにより、前立腺癌に関連する1つまたは複数のマーカーが患者特異的シグネチャに提供される。ヒトLS174T結腸腺癌腫瘍、LLC1癌細胞、B16F10マウスメラノーマ細胞ヒトLS174T結腸腺癌腫瘍腫瘍サイズ=約0.3cmを皮下注射した胸腺欠損ヌードマウスn=5、マウスルイス肺癌腫細胞LLC1腫瘍サイズ=約0.6cmを皮下注射したC57Blマウスn=5、および106個のB16F10マウスメラノーマ細胞を皮下注射したC57B1マウスn=5から単離された血漿および細胞を用いて同様の実験を行う腫瘍細胞がマウス由来の場合、血漿およびT細胞のcRNA-B試料は、OligoGEArray登録商標MouseCancerPathwayFinderMicroarray、OMM-033、SuperArrayBioscienceとハイブリダイズする。RNAは、指数関数的に増殖するLS174T培養細胞、LLC1培養細胞、B16F10培養細胞、およびLNCaP培養細胞、ならびに腫瘍を有しないC57Blマウスおよびヌードマウスから単離した血漿およびT細胞からも単離し、これらの癌関連遺伝子プロファイルを決定する。本発明の態様によれば、ヒト前立腺腫瘍細胞または結腸腫瘍細胞を注射したマウスから得られた血漿、およびマウス肺癌またはメラノーマを有するマウスから得られた血漿は、種々の癌関連遺伝子シグネチャを有しており、該シグネチャは、これらに対応する腫瘍細胞でも見出される。別の態様によれば、癌関連遺伝子は、i腫瘍を有するマウスから単離された非貪食T細胞、およびii腫瘍を有しないマウスから得られた貪食好中球およびマクロファージによって発現されないか、またはその発現は最小限である。実施例8癌患者から得られた無細胞体液における腫瘍特異的遺伝子シグネチャの検出本発明のある実施形態によれば、癌患者からの無細胞体液の遺伝子発現プロファイルを同じドナー個体からの非貪食T細胞の遺伝子発現プロファイルと比較し、非貪食細胞中では発現されないかまたは著しく異なって発現される、無細胞体液内の腫瘍特異的シグネチャが同定された。頭頸部腫瘍を有する患者頸部扁平上皮癌を有することが分かっている患者から、10ミリリットルの静脈血をEDTA含有チューブへ採取する。室温、2,000rpmにて5分間の遠心分離を行った後、血漿を残してバフィーコートをチューブへ移し、PBSで洗浄する。この細胞を、T細胞-ラット抗ヒト免疫磁性ダイナビーズ登録商標、好中球-ラット抗ヒト免疫磁性ダイナビーズ登録商標、およびマクロファージ/単球-ラット抗ヒト免疫磁性ダイナビーズ登録商標Invitrogen商標社、カールスバッド、カリフォルニア州を用いて分離する。基本的には、ビーズを白血球試料に連続的に添加し、個別に4°Cにて30分間インキュベーションした後、磁石を用いてT細胞-結合ビーズ、好中球-結合ビーズ、およびマクロファージ/単球-結合ビーズを単離し、PBSで3回洗浄する。次に、TRIZOL登録商標、Invitrogen商標社、カールスバッド、カリフォルニア州、を用いてT細胞からRNAを単離する。RNAの量および品質を測定し、cDNAおよびビオチン化cRNAcRNA-Bを調製する。血漿からビオチン化cRNAcRNA-Bを調製する。血漿からのcRNA-B試料およびT細胞からのcRNA-B試料を、別々に癌遺伝子ヒトマイクロアレイOligoGEArray登録商標HumanCancerPathwayFinderMicroarray、OHS-033、SuperArrayBioscience社、フレデリック、メリーランド州とインキュベートする60°C、一晩。ハイブリダイゼーションの後、膜を洗浄し、アビジン複合体化アルカリホスファターゼで染色して、化学発光法X線フィルムを用いて遺伝子を検出する。T細胞から得られた遺伝子シグネチャと血漿から得られた遺伝子シグネチャとを比較する。血漿の遺伝子シグネチャからT細胞の遺伝子シグネチャを差し引くことにより、頭頸部癌に関連する1つまたは複数のマーカーが患者特異的シグネチャに提供される。本発明の態様によれば、頭頸部癌の患者から得られた血漿は、種々の癌関連遺伝子シグネチャを有しており、該シグネチャは、これらに対応する腫瘍細胞でも見出される。以下の遺伝子、すなわち、E26ウイルス癌遺伝子相同体ETS2、HIV-1Tat相互作用タンパク質HTAT1P2、IL8好中球活性化および走化性、Jun発癌遺伝子JUN、およびマトリックスメタロプロテアーゼ9MMP9を同定することができる。別の態様によれば、これらの癌関連遺伝子は、非貪食T細胞によって発現されないか、またはその発現は最小限である。卵巣癌患者卵巣癌を有する患者から単離された血漿および細胞を用いて同様の実験を行う。血漿は、非貪食T細胞によって発現されないかまたはその発現が最小限である、多くの癌関連遺伝子を含む可能性がある。このような癌遺伝子としては、AKT1、APAF1、ATM、CDC25A、CDKN1A、ETS2、FOS、IL8、ITGA4、ITGA6、ITGAV、JUN、MAP2K1、NFKBIA、PLAU、PLAUR、RAF1、SERPINB2、SYK、TIMP1、TNF、TNFRSF10B、またはTNFRSF1Aのうちの1つまたは複数を挙げることができる。実施例9ヒト前立腺LNCaP腫瘍およびヒト結腸LS174T腫瘍を有するマウスから得られた無細胞体液における腫瘍特異的タンパク質シグネチャの検出タンパク質精製キットNorgen社、製品番号23500を用いて、マウス白血球、T細胞、およびマクロファージからタンパク質を単離し、精製する。このアッセイは非常に簡便で所要時間が短くおよそ30分、単離されたタンパク質は、SDS-PAGE解析およびウェスタンブロットなどの多くの下流用途に用いることができる。タンパク質試料は、LNCaP腫瘍およびLS174T腫瘍を有するマウスから得られた血漿および非貪食細胞T-リンパ球より単離する。前者の細胞株はPSAを発現しDenmeadeetal.2001Prostate48:1;Linetal.2001J.Urol.166:1943、後者は高分子量ムチンである腫瘍特異的糖タンパク質TAG-72を提示するColcheretal.1981Proc.Natl.Acad.Sci.USA78:3199;Colcheretal.1984CancerRes.44:5744;Kassisetal.1996J.Nucl.Med.37:343からである。血漿からの精製タンパク質試料およびT細胞からの精製タンパク質試料16μgを各々用いてウェスタンブロット解析を行う。基本的には、各試料を2倍容量のSDSローディングバッファーと混合し、未染色のプレシジョンplusプロテインスタンダードprecisionplusproteinstandardsBiorad社と共に、トリス-グリシン-SDSバッファーpH8.4中で10のSDS-PAGEで200ボルトにて泳動する。ミニトランスブロットMiniTrans-BlotBiorad社装置、ならびに25mMトリス、pH8.4、192mMグリシン、および20メタノールを含有する転写バッファーを用いて、タンパク質をニトロセルロース膜へ転写する4°Cにて一晩。5の脱脂粉乳を用いて膜をブロッキングし室温RTで60分、抗ヒトTAG-72マウスモノクローナル抗体であるB72.3、または抗ヒトPSAマウスモノクローナル抗体であるER-PR8のいずれかとインキュベートするRTで1時間。ブロットを洗浄し、次に、マウスIgGに特異的な二次抗体であるImmun-Starヤギ抗マウス-HRP複合体Biorad社とインキュベートし、ルミノール溶液と過酸化物バッファーBiorad社との1:1混合液とRTにて5分間インキュベートして現像し、続いてオートラジオグラフィーを行う。本発明のある態様によれば、LNCaP腫瘍を有するマウスからの血漿は、PSAに対して陽性である可能性があり、一方、このタンパク質は、同じ動物からの非貪食T細胞において検出されない。同様に、TAG-72は、LS174T腫瘍を有するマウスから得られた単球/マクロファージによって発現され、同じ動物からのT細胞において検出されない。実施例10プロファイリング実験血中貪食細胞の単離患者から血液試料を採取する。血液約5mLを、50μLの0.5MEDTAを含有する50mLチューブへ移すEDTAの最終濃度=約4.8mM。チューブを穏やかにボルテックス攪拌し、25mLのRBC溶解バッファーNorgen社を添加する。チューブを再度穏やかにボルテックス攪拌し、溶液の色が明赤色に変わるまで室温にてインキュベートし3~5分間、2,000rpmにて3分間遠心分離する。上清を注意深く吸引した後、40mLのCa/Mgフリー0.1MPBS2FBS、2mMEDTA、および20mMグルコースを含有で白血球を洗浄し、次に、細胞106個/mLを、i生細胞透過性DNA染色液ヘキスト333424μg/mL、Em=483nm、ii循環単球/マクロファージによって発現されるヒトF4/80抗原を認識する抗ヒト単球/マクロファージモノクローナル抗体AlexaFluor登録商標647複合体、Em=668nm、およびiiiヒト循環好中球を認識する抗ヒト好中球モノクローナル抗体RPE標識複合体、Em=578nmを含有する細胞染色溶液と共にインキュベートする暗所で4°C、30分間。次に、細胞を洗浄し、好中球Nn=2、好中球Nn>2、単球/マクロファージM/Mn=2、および単球/マクロファージM/Mn>2に選別するBDFACSAria。本発明の態様によれば、DNA量が2nである細胞の内容物が、同じ個体から得られた血漿の内容物と比較される。遺伝子プロファイリングヒト全ゲノム遺伝子プロファイリングを実施する。血漿、またはヒト腫瘍細胞、あるいは好中球Nn=2、Nn>2および単球/マクロファージM/Mn=2、M/Mn>2から得られたRNA試料に対して、GeneChip登録商標ヒトゲノムU133プラス2.0アレイAffymetrix社を使用する。このアレイでは、38,500の十分に特徴づけられたヒト遺伝子を含む、47,000を超える転写産物およびバリアントの発現レベルが解析される。一般的には、上述のアレイを用いてヒト遺伝子の発現プロファイルを決定するために、抽出したRNAが使用される。アレイの再現性を確実にするために、各試料を3連triplicateでプロファイル化し、繰り返し実験を1回行う。マイクロアレイデータは、以下に記載するように、癌誘導関連遺伝子についてフィルタリングし、定量的リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応RT-PCRを用いて確認する。癌誘導関連遺伝子の上方制御/下方制御TriazolInvitrogen社を用いてRNAを単離し、このキットに付属のカートリッジを用いて精製する。RNAの質および量は、Bioanalyzer2100AgilentTechnologies社、パロアルト、カリフォルニア州およびDegradometerソフトウェアバージョン1.41ワールドワイドウェブ:dnaarrays.orgを用いて評価する。これらの実験結果は、腫瘍の存在により乱された分子経路を見分ける際の手助けとなる。マイクロアレイ実験の解析得られた大規模/ハイスループット分子発現データの解析は、i血漿において異なって発現する遺伝子を同定する能力、ii同定された遺伝子をアノテートする能力、およびiiiアノテートされた遺伝子を特定の腫瘍によって特異的に発現される遺伝子へ割り当てる能力に大いに依存する。マイクロアレイデータの統計的解析は、例えば、試料解析/比較メニュー中のこの種の遺伝子リスト構築に容易に対応するdChipパッケージを用いて行うことができる。AffymetrixGeneChipsを用いる場合、1つまたは複数のGeneChipsおよび関連する方法を適用して、マイクロアレイ生データの質を確認するGautieretal.2004Bioinformatics20:307。さらに、種々のバックグランド補正および標準化の手順を利用して、発現値を得るためのプローブセットの標準化および集計のために最適なプロトコルを得るHuberetal.2002Bioinformatics18Suppl.1:S96、Wuetal.2004JournaloftheAmericanStatisticalAssociation99:909、SeoandHoffman2006BioMedCentralBioinformatics7:395。二段階フィルトレーションtwo-stepfiltrationアプローチにおいて、発明者らは、Pn=2の遺伝子プロファイルをPn>2の遺伝子プロファイルと比較して、発現された遺伝子のリストを構築し、次にPn=2遺伝子プロファイルをフィルタリングした後に、これらの遺伝子と各腫瘍細胞株に対して同定された腫瘍特異的遺伝子とを比較する。例えば、i乳癌患者から血液を採取し、これを血漿とT細胞が単離されるバフィーコートとに分離し、ii血漿とT細胞のそれぞれについて、3連triplicateで遺伝子プロファイルを測定し、iii同定された各遺伝子の3個の試料の平均値および対応する標準誤差SEを各グループNn>2、およびNn=2に対して計算し、iv次に、この2つのグループの遺伝子発現プロファイルを比較し、ウェルチの改良2標本t検定に準じて、絶対値で2倍以上の対数の変化absolute≧2-foldlogchangeNn>2/Nn=2に基づいて発現遺伝子のリストL-1を同定し、vNn=2の遺伝子発現プロファイルおよび腫瘍および正常乳腺組織生検から得られる乳癌の遺伝子発現プロファイルを比較し、発現遺伝子のリストL-2を同定し、viL-1およびL-2の遺伝子を比較しdChipの試料解析/比較/比較の統合、共通の遺伝子をフィルタリングすることにより、Nn>2によって獲得/発現された乳癌特異的遺伝子シグネチャを同定する。タンパク質プロファイリング血漿およびT細胞のそれぞれからの総タンパク質50~100マイクログラムを変性し、トリス-2-カルボキシエチルホスフィントリプシン1mMおよび0.02ドデシル硫酸ナトリウムを用いて、60°Cにて1時間還元する。続いてシステインをブロックし、総タンパク質をトリプシンで37°Cにて12~16時間消化する。得られたペプチドを、1時間、113~119および121にタグを有するiTRAQで標識する比較する細胞型の数に応じて、4種類または8種類。標識後、別々にタグ付けされた試料を1つにまとめ、強カチオンイオン交換カラムAppliedBiosystems社、4.6×100多孔性を備えたAgilent1200シリーズHPLCシステムへ注入する。次に、96個の回収した画分を14個の画分へプールし、各画分を、逆相条件下にてLCPackingsUltimateHPLCシステムLCPackings社、15cm×75μm分析カラムへ注入し、2回目の分画を行う。LCPackingsProbotを使用して逆相画分を標的プレート上に直接スポットし、質量分析AppliedBiosystems4800PlusProteomicsAnalyzerによって分析する。データの取得後にProteinPilotソフトウェアパッケージAppliedBiosystems/MDSSciex社を用いてスペクトルを処理し、ProteinPilot商標ソフトウェアを用いて血漿試料およびT細胞試料のそれぞれにおける個々のタンパク質をその相対的発現レベルと共に同定して、癌関連プロテオームシグネチャの解析および同定を実施する。"