"ポリペプチドに特異的に結合して該ポリペプチドの副腎皮質毛細管内皮細胞成長を刺激する能力を阻害する抗体を含む、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤であって、前記ポリペプチドは、図266配列番号:371に示されるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、ATCC受託番号203091で寄託された核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、のいずれかである、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤。PRO1186ベノムプロテインAと配列同一性を有し、本出願においてPRO1186と命名された新規なポリペプチドをコードするcDNAクローンDNA60621-1516が同定された。一実施態様では、PRO1186ポリペプチドをコードするDNAを含んでなる単離された核酸分子を提供する。一態様では、単離された核酸は、a図266のアミノ酸残基約20から約105の配列を有するPRO1186ポリペプチドコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有するDNAを含んでなる。他の態様では、図265の残基約148から約405の核酸の相補鎖にハイブリッド形成するDNAを含んでなるPRO1186ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。さらなる態様では、aATCC寄託番号203091のヒトタンパク質cDNAによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有するDNAを含んでなる単離された核酸分子に関する。好適な実施態様では、核酸はATCC寄託番号203091のヒトタンパク質cDNAにコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするDNAを含んでなる。またさらなる態様では、a図266のアミノ酸残基約20から約105の配列と少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有するポリペプチドをコードするDNA、又はaのDNAの相補鎖を含んでなる単離された核酸分子に関する。さらなる態様では、少なくとも約50のヌクレオチド、好ましくは少なくとも約100のヌクレオチドを有し、かつa図266のアミノ酸残基約20から約105の配列を有するPRO1186ポリペプチドをコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖と緊縮性条件下で被験DNA分子をハイブリッド形成させ、DNA分子がa又はbに対して少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有する場合に、被験DNA分子を単離することにより生産される単離された核酸分子に関する。他の態様では、a図266の残基20から約105のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約80ポジティブ、好ましくは少なくとも約85ポジティブ、より好ましくは少なくとも約90ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約95ポジティブのスコアのポリペプチドをコードするDNA、又はbaのDNAの相補鎖を含んでなる単離された核酸分子に関する。他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるPRO1186ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、約20から約80ヌクレオチド長、好ましくは約20から約60ヌクレオチド長、より好ましくは約20から約50ヌクレオチド長、最も好ましくは約20から約40ヌクレオチド長である。他の実施態様では、上記した単離された核酸配列の任意のものによりコードされる単離されたPRO1186ポリペプチドを提供する。特定の態様では、単離された天然配列PRO1186ポリペプチドを提供し、それは一実施態様では、図266の残基20から105を含むアミノ酸配列を含んでいる。他の態様では、図266のアミノ酸残基20から約105の配列に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、単離されたPRO1186ポリペプチドに関する。さらなる態様では、図266の残基20から105のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約80ポジティブ、好ましくは少なくとも約85ポジティブ、より好ましくは少なくとも約90ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約95ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含んでなる、単離されたPRO1186ポリペプチドに関する。さらに他の態様では、図266のアミノ酸残基20から約105の配列、又は抗PRO1186抗体に対する結合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたPRO1186ポリペプチドに関する。好ましくは、PRO1186断片は天然PRO1186ポリペプチドの定性的生物活性を保持する。また更なる態様では、ia図266の約20から約105のアミノ酸残基の配列を有するPRO1186ポリペプチドをコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖と、緊縮性条件下で被験DNA分子をハイブリッド形成し、被験DNA分子がa又はbに対して少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約85の配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約95の配列同一性を有する場合、iiポリペプチドの発現に適した条件下で被験DNA分子を含んでなる宿主細胞を培養し、iii細胞培養物からポリペプチドを回収することにより、生産されるポリペプチドを提供する。さらに他の実施態様では、天然PRO1186ポリペプチドのアゴニスト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタゴニストは抗PRO1186抗体である。さらなる実施態様では、天然PRO1186ポリペプチドを候補分子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性をモニターすることによる、天然PRO1186ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの同定方法に関する。またさらなる実施態様では、PRO1186ポリペプチド、又は上述したアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んでなる組成物に関する。他の実施態様では、上述の又は下記のポリペプチドの任意のものをコードするDNAを含んでなるベクターを提供する。そのようなベクターを含んでなる宿主細胞もまた提供される。例を挙げると、宿主細胞はCHO細胞、大腸菌、又は酵母でありうる。上述の又は下記のポリペプチドの任意のものを生産するための方法が更に提供され、これは、所望のポリペプチドの発現に適した条件下で宿主細胞を培養し、細胞培養から所望のポリペプチドを回収することを含んでなる。他の実施態様では、異種性ポリぺプチド又はアミノ酸配列に融合した上述の又は下記のポリペプチドの任意のものを含んでなるキメラ分子を提供する。そのようなキメラ分子の例は、免疫グロブリンのFc領域又はエピトープタグ配列に融合した上述の又は下記のポリペプチドの任意のものが含まれる。他の実施態様では、上述の又は下記のポリペプチドの任意のものに特異的に結合する抗体を提供する。場合によっては、抗体はモノクローナル抗体、ヒト化抗体、抗体断片又は1本鎖抗体である。さらに他の実施態様では、ゲノム及びcDNAヌクレオチド配列を単離するために有用なオリゴヌクレオチドプローブを提供し、ここでこれらプローブは上述の又は下記のヌクレオチド配列の任意のものから取り出されうる。他の実施態様では、PROポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子を提供する。一態様では、単離された核酸分子は、aここに開示された全長アミノ酸配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長アミノ酸配列又はここに開示した膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するPROポリペプチドをコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約81の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約82の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約83の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約84の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約85の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約86の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約87の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約88の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約89の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約90の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約91の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約92の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約93の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約94の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約95の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約96の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約97の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約98の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約99の配列同一性を有しているヌクレオチド配列を含んでなる。他の態様では、単離された核酸分子は、aここに開示された全長PROポリペプチドcDNAのコード配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長PROポリペプチドcDNAのコード配列又はここに開示した膜貫通PROポリペプチドの細胞外ドメインのコード配列、又はbaのDNA分子の相補鎖に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約81の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約82の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約83の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約84の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約85の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約86の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約87の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約88の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約89の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約90の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約91の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約92の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約93の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約94の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約95の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約96の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約97の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約98の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約99の配列同一性を有しているヌクレオチド配列を含んでなる。さらなる態様では、aここに開示されたATTCに寄託されたヒトタンパク質cDNAの任意のものによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするDNA分子、又はbaのDNA分子の相補鎖に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約81の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約82の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約83の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約84の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約85の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約86の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約87の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約88の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約89の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約90の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約91の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約92の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約93の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約94の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約95の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約96の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約97の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約98の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約99の配列同一性を有しているヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子に関する。他の態様は、膜貫通ドメインが欠失されているか膜貫通ドメインが不活性化されているPROポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子を提供し、またはそのようなコードヌクレオチド配列に相補的であり、ここでそのようなポリペプチドの膜貫通ドメインがここに開示される。従って、ここに記載されたPROポリペプチドの可溶性細胞外ドメインが考慮される。他の実施態様は、例えばハイブリッド形成プローブとしての又は抗PRO抗体に対する結合部位を含んでなるポリペプチドを場合によってはコードするPROポリペプチドの断片をコードするための用途が見出されるPROポリペプチドコード配列の断片に関する。そのような核酸断片は通常少なくとも約20のヌクレオチド長さ、好ましくは少なくとも約30のヌクレオチド長さ、より好ましくは少なくとも約40のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約50のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約60のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約70のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約80のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約90のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約100のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約110のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約120のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約130のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約140のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約150のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約160のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約170のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約180のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約190のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約200のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約250のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約300のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約350のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約400のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約450のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約500のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約600のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約700のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約800のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約900のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約1000のヌクレオチド長さであり、ここで、約という用語は、その参照長さのプラス又はマイナス10の参照ヌクレオチド配列長さを意味する。PROポリペプチドコードヌクレオチド配列の新規な断片は、多くのよく知られた配列アラインメントプログラムの任意のものを使用してPROポリペプチドコードヌクレオチド配列を他の既知のヌクレオチド配列にアラインメントさせ、どのPROポリペプチドコードヌクレオチド配列断片が新規であるかを決定することにより常套的に決定することができることに留意される。そのようなPROポリペプチドコードヌクレオチド配列の全てがここで考慮される。また考慮されるものは、これらのヌクレオチド分子断片によりコードされるPROポリペプチド断片、好ましくは抗PRO抗体に対する結合部位を含んでなるPROポリペプチド断片である。他の実施態様では、上記において特定した単離核酸配列の任意のものによりコードされる単離されたPROポリペプチドを提供する。ある態様では、ここに開示された全長アミノ酸配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長アミノ酸配列又はここに開示した膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するPROポリペプチドに対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約81の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約82の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約83の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約84の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約85の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約86の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約87の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約88の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約89の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約90の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約91の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約92の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約93の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約94の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約95の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約96の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約97の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約98の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約99の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、単離されたPROポリペプチドに関する。さらなる態様では、ここに開示されたATTCに寄託されたヒトタンパク質cDNAの任意のものによりコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも約80の配列同一性、好ましくは少なくとも約81の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約82の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約83の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約84の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約85の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約86の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約87の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約88の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約89の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約90の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約91の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約92の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約93の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約94の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約95の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約96の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約97の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約98の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約99の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離されたPROポリペプチドに関する。さらなる態様では、ここに開示された全長アミノ酸配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長アミノ酸配列又はここに開示された膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するPROポリペプチドのアミノ酸配列と比較したとき、少なくとも約80のポジティブ、好ましくは少なくとも約81のポジティブ、より好ましくは少なくとも約82のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約83のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約84のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約85のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約86のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約87のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約88のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約89のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約90のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約91のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約92のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約93のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約94のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約95のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約96のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約97のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約98のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約99のポジティブのスコアを示すアミノ酸配列を含んでなる単離されたPROポリペプチドに関する。特定の態様では、N末端シグナル配列及び/又は開始メチオニンを持たない単離されたPROポリペプチドを提供し、それは上述したそのようなアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列によりコードされる。これを生産する方法もまたここに記載され、ここで、これらの方法はPROポリペプチドの発現に適した条件下で適当なコード化核酸分子を含むベクターを含んでなる宿主細胞を培養し、細胞培養からPROポリペプチドを回収することを含んでなる。他の態様は、膜貫通ドメインが欠失されたか膜貫通ドメインが不活性化された単離されたPROポリペプチドを提供する。これを生産する方法もまたここに記載され、ここで、これらの方法はPROポリペプチドの発現に適した条件下で適当なコード化核酸分子を含むベクターを含んでなる宿主細胞を培養し、細胞培養からPROポリペプチドを回収することを含んでなる。さらに他の実施態様では、ここで同定される天然PROポリペプチドのアゴニスト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタゴニストは抗PRO抗体又は小分子である。さらなる実施態様では、PROポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストを同定する方法に関し、それは、PROポリペプチドを候補分子と接触させ、前記PROポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視することを含む。好ましくは、PROポリペプチドは天然PROポリペプチドである。またさらなる実施態様では、PROポリペプチド、又はここに記載するPROポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニスト、又は抗PRO抗体を、担体と組み合わせて含有する物質の組成物に関する。場合によっては、担体は製薬的に許容される担体である。他の実施態様は、上述のPROポリペプチド、そのアゴニスト又はアンタゴニスト又は抗PRO抗体に応答性である症状の治療に有用な医薬の調製のための、PROポリペプチド、またはそのアゴニスト又はアンタゴニスト又は抗PRO抗体の使用に関する。I.定義ここで使用される際のPROポリペプチド及びPROという用語は、直後に数値符号がある場合に種々のポリペプチドを指し、完全な符号例えば、PRO/数字は、ここに記載する特定のポリペプチド配列を意味する。ここで使用されるPRO/数字ポリペプチド及びPRO/数字は、天然配列ポリペプチド及び変異体ここで更に詳細に定義するを含む。ここの記載されるPROポリペプチドは、ヒト組織型又は他の供給源といった種々の供給源から単離してもよく、組換え又は合成方法によって調製してもよい。天然配列PROポリペプチドは、天然由来の対応するPROポリペプチドと同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含んでいる。このような天然配列PROポリペプチドは、自然から単離することもできるし、組換え又は合成手段により生産することもできる。天然配列PROポリペプチドという用語には、特に、特定のPROポリペプチドの自然に生じる切断又は分泌形態、自然に生じる変異形態及びそのポリペプチドの自然に生じる対立遺伝子変異体が含まれる。本発明の種々の実施態様において、ここに開示されている天然配列PROポリペプチドは、関連する図に示されている全長アミノ酸配列を含有する成熟又は全長天然配列ポリペプチドである。開始及び終止コドンは、太い書体及び下線で図中に示さている。しかし、関連する図に開示されているPROポリペプチドがメチオニン残基で開始すると図のアミノ酸位置1において示されている一方で、図のアミノ酸位置1より上流又は下流のいずれかに位置する他のメチオニン残基が、PROポリペプチドの開始アミノ酸残基として用いられることが考えられるし可能である。PROポリペプチド細胞外ドメイン又はECDは、膜貫通及び細胞質ドメインを実質的に有しないPROポリペプチドの形態を意味する。通常、PROポリペプチドECDは、それらの膜貫通及び/又は細胞質ドメインを1未満、好ましくはそのようなドメインを0.5未満しか持たない。本発明のPROポリペプチドについて同定された任意の膜貫通ドメインは、疎水性ドメインのその型を同定するために当該分野において日常的に使用される基準に従い同定されることが理解されるであろう。膜貫通ドメインの厳密な境界は変わり得るが、最初に同定されたドメインのいずれかの末端から約5アミノ酸を越えない可能性が高い。従って、PROポリペプチド細胞外ドメインは、場合によっては、実施例又明細書おいてに同定された膜貫通ドメインのいずれかの末端から約5を越えないアミノ酸を含みうるし、付着のシグナルペプチドを有する又は有しないそのようなポリペプチド及びそれらをコードする核酸は、本発明において考慮される。ここに開示する種々のPROポリペプチドのシグナルペプチドの適切な位置は、本明細書と添付の図面に示される。しかし、注記するように、シグナルペプチドのC末端境界は変化しうるが、ここで最初に定義したようにシグナルペプチドC末端境界のいずれかの側で約5アミノ酸未満である可能性が最も高く、シグナルペプチドのC末端境界は、そのような型のアミノ酸配列成分を同定するのに日常的に使用される基準に従って同定しうる例えば、Nielsen等ProtEng1016及びvonHeinje等NuclAcidsRes1446834690。さらに、幾つかの場合には、分泌ポリペプチドからのシグナルペプチドの切断は完全に均一ではなく、一以上の分泌種をもたらすことも認められる。シグナルペプチドがここに定義されるシグナルペプチドのC末端境界の何れかの側の約5アミノ酸未満内で切断されるこれらの成熟ポリペプチド、及びそれらをコードするポリヌクレオチドは、本発明で考慮される。PROポリペプチド変異体とは、上記又は下記に定義されるように、ここに開示される全長天然配列PROポリペプチド、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長天然配列PROポリペプチド配列、シグナルペプチド有無のここに開示されたPROの細胞外ドメイン又はここに開示された全長PROポリペプチドの他の断片と、少なくとも約80のアミノ酸配列同一性を有する活性PROポリペプチドを意味する。このようなPROポリペプチド変異体には、例えば、全長天然アミノ酸配列のN又はC末端において一又は複数のアミノ酸残基が付加、もしくは欠失されたPROポリペプチドが含まれる。通常、PROポリペプチド変異体は、ここに開示される全長天然アミノ酸配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く全長天然配列PROポリペプチド配列、シグナルペプチド有無のここに開示されたPROの細胞外ドメイン又はここに開示された全長PROポリペプチドの他の断片と、少なくとも約80のアミノ酸配列同一性、好ましくは少なくとも約81のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約82のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約83のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約84のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約85のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約86のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約87のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約88のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約89のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約90のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約91のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約92のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約93のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約94のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約95のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約96のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約97のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約98のアミノ酸配列同一性、そして、より好ましくは少なくとも約99のアミノ酸配列同一性を有している。通常は、PRO変異体ポリペプチドは、少なくとも約10アミノ酸長、より多くは少なくとも約20アミノ酸長、より多くは少なくとも約30アミノ酸長、より多くは少なくとも約40アミノ酸長、より多くは少なくとも約50アミノ酸長、より多くは少なくとも約60アミノ酸長、より多くは少なくとも約70アミノ酸長、より多くは少なくとも約80アミノ酸長、より多くは少なくとも約90アミノ酸長、より多くは少なくとも約100アミノ酸長、より多くは少なくとも約150アミノ酸長、より多くは少なくとも約200アミノ酸長、より多くは少なくとも約300アミノ酸長、又はそれ以上である。ここに定義されるPROポリペプチドに対してここで同定されているパーセントアミノ酸配列同一性は、配列を整列させ、最大のパーセント配列同一性を得るために必要ならば間隙を導入し、如何なる保存的置換も配列同一性の一部と考えないとした、PROポリペプチドのアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセントとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の技量の範囲にある種々の方法、例えばBLAST、BLAST2、ALIGN又はMegalignソフトウエアのような公に入手可能なコンピュータソフトウエアを使用することにより達成可能である。当業者であれば、比較される配列の全長に対して最大のアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。しかし、ここでの目的のためには、アミノ酸配列同一性値は、ALIGN2プログラム用の完全なソースコードが下記の表1に提供されている配列比較プログラムALIGN2を使用することによって得られ、ALIGN2配列比較コンピュータプログラムはジェネンテク社によって作成され、下記の表1に示したソースコードは米国著作権事務所WashingtonDC20559に使用者用書類とともに提出され、米国著作権登録番号TXU510087の下で登録されている。ALIGN2はジェネンテク社、SouthSanFranciscoCaliforniaから好適に入手可能であり、下記の表1に提供されたソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN2プログラムは、UNIX登録商標オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX登録商標V40Dでの使用のためにコンパイルされる。全ての配列比較パラメータは、ALIGN2プログラムによって設定され変動しない。アミノ酸配列比較にALIGN2が用いれれる状況では、与えられたアミノ酸配列Aの、与えられたアミノ酸配列Bとの、又はそれに対するアミノ酸配列同一性あるいは、与えられたアミノ酸配列Bと、又はそれに対して或る程度のアミノ酸配列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Aと言うこともできるは次のように計算される:分率X/Yの100倍ここで、Xは配列アラインメントプログラムALIGN2のA及びBのアラインメントによって同一であると一致したスコアのアミノ酸残基の数であり、YはBの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと異なる場合、AのBに対するアミノ酸配列同一性は、BのAに対するアミノ酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。この方法を用いたアミノ酸配列同一性の計算の例として、PROが対象となる仮説的PROポリペプチドのアミノ酸配列を表し、比較タンパク質が対象となる比較タンパク質が比較されているアミノ酸配列を表し、そしてX、Y及びZの各々が異なった仮説的アミノ酸残基を表し、表2及び3は、比較タンパク質と称されるアミノ酸配列のPROと称されるアミノ酸配列に対するアミノ酸配列同一性の計算方法を示す。特に断らない限りは、ここでの全てのアミノ酸配列同一性値は上記のようにALIGN2配列比較コンピュータプログラムを用いて得られる。しかしながら、アミノ酸配列同一性値は、WUBLAST2コンピュータプログラムAltschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて決定してもよい。さらに、殆どのWUBLAST2検索パラメータは初期値に設定される。初期値に設定されない、即ち調節可能なパラメータは以下の値に設定する:オーバーラップスパン=1、オーバーラップフラクション=0.125、ワード閾値T=11、及びスコアリングマトリクス=BLOSUM62。ここでの目的のために、アミノ酸配列同一性値は、a天然PROポリペプチドから誘導された配列を有する対象とするPROポリペプチドのアミノ酸配列と、対象とする比較アミノ酸配列即ち、対象とするPROポリペプチドが比較されるPROポリペプチド変異体であってもよい配列との間の、WUBLAST2によって決定した一致する同一アミノ酸残基の数を、b対象とするPROポリペプチドの残基の総数で除した商によって決定される。例えば、アミノ酸配列Bに対して少なくとも80のアミノ酸配列同一性を持つ又は持っているアミノ酸配列Aを含んでなるポリペプチドという表現では、アミノ酸配列Aが対象とする比較アミノ酸配列であり、アミノ酸配列Bが対象とするPROポリペプチドのアミノ酸配列である。また、アミノ酸配列同一性は、配列比較プログラムNCBIBLAST2Altschul等NucleicAcidsRes2533893402を用いて決定してもよい。NCBIBLAST2配列比較プログラムは、httpwwncbinlmnihgovからダウンロードできる。NCBIBLAST2は幾つかの検索パラメータを使用し、それら検索パラメータの全ては初期値に設定され、例えば、unmask=可、鎖=全て、予測される発生=10、最小低複合長=15/5、マルチパスe値=0.01、マルチパスの定数=25、最終ギャップアラインメントのドロップオフ=25、及びスコアリングマトリクス=BLOSUM62を含む。アミノ酸配列比較にNCBIBLAST2が用いれれる状況では、与えられたアミノ酸配列Aの、与えられたアミノ酸配列Bとの、又はそれに対するアミノ酸配列同一性あるいは、与えられたアミノ酸配列Bと、又はそれに対して或る程度のアミノ酸配列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Aと言うこともできるは次のように計算される:分率X/Yの100倍ここで、Xは配列アラインメントプログラムNCBIBLAST2のA及びBのアラインメントによって同一であると一致したスコアのアミノ酸残基の数であり、YはBの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと異なる場合、AのBに対するアミノ酸配列同一性は、BのAに対するアミノ酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。PRO変異体ポリヌクレオチド又はPRO変異体核酸配列とは、下記に定義されるように、活性PROポリペプチドをコードする核酸分子であり、ここに開示する全長天然配列PROポリペプチド配列、ここに開示するシグナルペプチドを欠いた全長天然配列PROポリペプチド配列、シグナルペプチド有無のここに開示するPROポリペプチドの細胞外ドメイン、又はここに開示する全長PROポリペプチド配列の他の任意の断片をコードする核酸配列と少なくとも80の配列同一性を有する。通常は、PRO変異体ポリペプチドヌクレオチドは、ここに開示する全長天然配列PROポリペプチド配列、ここに開示するシグナルペプチドを欠いた全長天然配列PROポリペプチド配列、シグナルペプチド有無のここに開示するPROポリペプチドの細胞外ドメイン、又はここに開示する全長PROポリペプチドの他の任意の断片をコードする核酸配列と、少なくとも約80の核酸配列同一性、好ましくは少なくとも約81の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約82の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約83の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約84の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約85の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約86の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約87の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約88の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約89の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約90の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約91の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約92の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約93の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約94の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約95の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約96の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約97の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約98の核酸配列同一性、そして、より好ましくは少なくとも約99の核酸配列同一性を有している。変異体は、天然ヌクレオチド配列を含まない。通常は、PRO変異体ポリヌクレオチドは、少なくとも約30ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約60ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約90ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約120ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約150ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約180ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約210ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約240ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約270ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約300ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約450ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約600ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約900ヌクレオチド長、又はそれ以上である。ここで同定されるPROコード化核酸配列に対するパーセント核酸配列同一性は、配列を整列させ、最大のパーセント配列同一性を得るために必要ならば間隙を導入し、PRO配列のヌクレオチドと同一である候補配列中のヌクレオチドのパーセントとして定義される。パーセント核酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の知る範囲にある種々の方法、例えばBLAST、BLAST2、ALIGN又はMegalignソフトウエアのような公に入手可能なコンピュータソフトウエアを使用することにより達成可能である。ここでの目的のためには、アミノ酸配列同一性値は、ALIGN2プログラム用の完全なソースコードが下記の表1に提供されている配列比較プログラALIGN2を使用することによって得られ。ALIGN2配列比較コンピュータプログラムはジェネンテク社によって作成され、下記の表1に示したソースコードは米国著作権事務所WashingtonDC20559に使用者用書類とともに提出され、米国著作権登録番号TXU510087の下で登録されている。ALIGN2はジェネンテク社、SouthSanFranciscoCaliforniaから好適に入手可能であり、下記の表1に提供されたソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN2プログラムは、UNIX登録商標オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX登録商標V40Dでの使用のためにコンパイルされる。全ての配列比較パラメータは、ALIGN2プログラムによって設定され変動しない。核酸配列比較にALIGN2が用いれれる状況では、与えられた核酸配列Cの、与えられた核酸配列Dとの、又はそれに対する核酸配列同一性あるいは、与えられたアミノ酸配列Dと、又はそれに対して或る程度の核酸配列同一性を持つ又は含む与えられた核酸配列Cと言うこともできるは次のように計算される:分率W/Zの100倍ここで、Wは配列アラインメントプログラムALIGN2のC及びDのアラインメントによって同一であると一致したスコアの核酸残基の数であり、ZはDの全核酸残基数である。核酸配列Cの長さがアミノ酸配列Dの長さと異なる場合、CのDに対する核酸配列同一性は、DのCに対する核酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。この方法を用いた核酸配列同一性の計算の例として、PRO-DNAが対象となる仮説的PROコード化核酸配列を表し、比較DNAが対象となるPRO-DNA核酸分子が比較されている核酸配列を表し、そしてN、L及びVの各々が異なった仮説的アミノ酸残基を表し、表4及び5が比較DNAと称される核酸配列のPRO-DNAと称される核酸配列に対する核酸配列同一性の計算方法を示す。特に断らない限りは、ここでの全ての核酸配列同一性値は、直上のパラグラフに示したようにALIGN2配列比較コンピュータプログラムを用いて得られる。しかしながら、核酸配列同一性値は、WUBLAST2コンピュータプログラムAltschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて決定してもよい。さらに、殆どのWUBLAST2検索パラメータは初期値に設定される。初期値に設定されない、即ち調節可能なパラメータは以下の値に設定する:オーバーラップスパン=1、オーバーラップフラクション=0.125、ワード閾値T=11、及びスコアリングマトリクス=BLOSUM62。WUBLAST2が用いられた場合、核酸配列同一性値は、a天然配列PROポリペプチドコード化核酸から誘導された配列を有する対象とするPROポリペプチドコード化核酸分子の核酸配列と、対象とする比較核酸配列即ち、対象とするPROポリペプチドコード化核酸分子が比較されるPROポリペプチド変異体であってもよい配列との間の、WUBLAST2によって決定した一致する同一核酸残基の数を、b対象とするPROポリペプチドコード化核酸分子のヌクレオチドの総数で除した商によって決定される。例えば、核酸配列Bに対して少なくとも80の核酸配列同一性を持つ又は持っている核酸配列Aを含んでなるポリペプチドという表現では、核酸配列Aが対象とする比較核酸配列であり、核酸配列Bが対象とするPROポリペプチドコード化核酸分子の核酸配列である。また、核酸配列同一性は、配列比較プログラムNCBIBLAST2Altschul等NucleicAcidsRes2533893402を用いて決定してもよい。NCBIBLAST2配列比較プログラムは、httpwwwncbinlmnihgovからダウンロードできる。NCBIBLAST2は幾つかの検索パラメータを使用し、それら検索パラメータの全ては初期値に設定され、例えば、unmask=可、鎖=全て、予測される発生=10、最小低複合長=15/5、マルチパスe値=0.01、マルチパスの定数=25、最終ギャップアラインメントのドロップオフ=25、及びスコアリングマトリクス=BLOSUM62を含む。核酸配列比較にNCBIBLAST2が用いれれる状況では、与えられた核酸配列Cの、与えられた核酸配列Dとの、又はそれに対する核酸配列同一性あるいは、与えられた核酸配列Dと、又はそれに対して或る程度の核酸配列同一性を持つ又は含む与えられた核酸配列Cと言うこともできるは次のように計算される:分率W/Zの100倍ここで、Wは配列アラインメントプログラムNCBIBLAST2のC及びDのアラインメントによって同一であると一致したスコアの核酸残基の数であり、ZはDの全核酸残基数である。核酸配列Cの長さが核酸配列Dの長さと異なる場合、CのDに対する核酸配列同一性は、DのCに対する核酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。他の実施態様では、PRO変異体ポリペプチドヌクレオチドは、活性PROポリペプチドをコードし、好ましくは緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で、ここに開示する全長PROポリペプチドをコードするヌクレオチド配列にハイブリッド形成する核酸分子である。PRO変異体ポリペプチドは、PRO変異体ポリヌクレオチドにコードされるものであってもよい。陽性ポジティブという用語は、上記のように実施された配列比較の中で、比較された配列において同一ではないが類似の特性を有している残基例えば、保存的置換の結果として、下記の表6参照を含む。ここでの目的のために、陽性の値は、a天然PROポリペプチドから誘導された配列を有する対象とするPROポリペプチドのアミノ酸配列と、対象とする比較アミノ酸配列即ち、PROポリペプチド配列が比較されるアミノ酸配列との間の、WUBLAST2のBLOSUM62マトリクス内でポジティブな値を記録したアミノ酸残基の数を、b対象とするPROポリペプチドのアミノ酸残基の総数で除した商によって決定される。特に断らない限り、陽性の値は、直上のパラグラフに記載したようにして計算される。WUBLAST2コンピュータプログラムを用いて得られる。しかしながら、ALIGN2及びNCBIBLAST2について上記したように実施されるアミノ酸配列同一性には、同一のみならず類似した特性をもつ配列におけるアミノ酸残基を含む。対象とするアミノ酸残基に対して陽性とされたアミノ酸残基は、対象とするアミノ酸残基と同一であるか、又は対象とするアミノ酸残基の好ましい置換下記の表6に定義であるものである。ALIGN2又はNCBIBLAST2を用いたアミノ酸配列比較では、与えられたアミノ酸配列Aの、与えられたアミノ酸配列Bとの、又はそれに対する陽性の値あるいは、与えられたアミノ酸配列Bと、又はそれに対して或る程度のアミノ酸配列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Aと言うこともできるは次のように計算される:分率X/Yの100倍ここで、Xは配列アラインメントプログラムALIGN2又はNCBIBLAST2のA及びBのアラインメントによって陽性であるとされたスコアのアミノ酸残基の数であり、YはBの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、AのBに対する陽性は、BのAに対する陽性とは異なることが理解されるであろう。単離されたとは、ここで開示された種々のポリペプチドを記述するために使用するときは、その自然環境の成分から同定され分離され及び/又は回収されたポリペプチドを意味する。その自然環境の汚染成分とは、そのポリペプチドの診断又は治療への使用を典型的には妨害する物質であり、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質様又は非タンパク質様溶質が含まれる。好ましい実施態様において、ポリペプチドは、スピニングカップシークエネーターを使用することにより、少なくとも15残基のN末端あるいは内部アミノ酸配列を得るのに充分なほど、あるいは、クーマシーブルーあるいは好ましくは銀染色を用いた非還元あるいは還元条件下でのSDSPAGEによる均一性まで精製される。単離されたポリペプチドには、PROポリペプチドの自然環境の少なくとも1つの成分が存在しないため、組換え細胞内のインサイツのタンパク質が含まれる。しかしながら、通常は、単離されたポリペプチドは少なくとも1つの精製工程により調製される。単離されたPROポリペプチドコード化核酸は、同定され、PROポリペプチドをコードする核酸の天然源に通常付随している少なくとも1つの汚染核酸分子から分離された核酸分子である。単離されたPROポリペプチドコード化核酸分子は、天然に見出される形態あるいは設定以外のものである。ゆえに、単離されたPROポリペプチドコード化核酸分子は、天然の細胞中に存在するPROポリペプチドコード化核酸分子とは区別される。しかし、単離されたPROポリペプチドコード化核酸分子は、例えば、核酸分子が天然細胞のものとは異なった染色体位置にあるPROポリペプチドを通常発現する細胞に含まれるPROポリペプチド核酸分子を含む。コントロール配列という表現は、特定の宿主生物において作用可能に結合したコード配列を発現するために必要なDNA配列を指す。例えば原核生物に好適なコントロール配列は、プロモーター、場合によってはオペレータ配列、及びリボソーム結合部位を含む。真核生物の細胞は、プロモーター、ポリアデニル化シグナル及びエンハンサーを利用することが知られている。核酸は、他の核酸配列と機能的な関係にあるときに作用可能に結合している。例えば、プレ配列あるいは分泌リーダーのDNAは、ポリペプチドの分泌に参画するプレタンパク質として発現されているなら、そのポリペプチドのDNAに作用可能に結合している;プロモーター又はエンハンサーは、配列の転写に影響を及ぼすならば、コード配列に作用可能に結合している;又はリボソーム結合部位は、もしそれが翻訳を容易にするような位置にあるなら、コード配列と作用可能に結合している。一般的に、作用可能に結合しているとは、結合したDNA配列が近接しており、分泌リーダーの場合には近接していて読みフェーズにあることを意味する。しかし、エンハンサーは必ずしも近接している必要はない。結合は簡便な制限部位でのライゲーションにより達成される。そのような部位が存在しない場合は、従来の手法に従って、合成オリゴヌクレオチドアダプターあるいはリンカーが使用される。抗体という用語は最も広い意味において使用され、例えば、単一の抗PROポリペプチドモノクローナル抗体、多エピトープ特異性を持つ抗PRO抗体組成物、一本鎖抗PRO抗体、及び抗PRO抗体の断片を包含している下記参照。ここで使用されるモノクローナル抗体という用語は、実質的に均一な抗体の集団、すなわち、構成する個々の抗体が、少量存在しうる自然に生じる可能性のある突然変異を除いて同一である集団から得られる抗体を称する。ハイブリッド形成反応の緊縮性は、当業者によって容易に決定され、一般的にプローブ長、洗浄温度、及び塩濃度に依存する経験的な計算である。一般に、プローブが長くなると適切なアニーリングのための温度が高くなり、プローブが短くなると温度は低くなる。ハイブリッド形成は、一般的に、相補的鎖がその融点に近いがそれより低い環境に存在する場合における変性DNAの再アニールする能力に依存する。プローブとハイブリッド形成可能な配列との間の所望の相同性の程度が高くなると、使用できる相対温度が高くなる。その結果、より高い相対温度は、反応条件をより緊縮性にするが、低い温度は緊縮性を低下させる。さらに、緊縮性は塩濃度に逆比例する。ハイブリッド形成反応の緊縮性の更なる詳細及び説明は、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyWileyIntersciencePublishersを参照のこと。ここで定義される緊縮性条件又は高度の緊縮性条件は、1洗浄のために低イオン強度及び高温度、例えば、50°Cにおいて0015Mの塩化ナトリウム/00015Mのクエン酸ナトリウム/01のドデシル硫酸ナトリウムを用いるもの;2ハイブリッド形成中にホルムアミド等の変性剤、例えば、42°Cにおいて50vvホルムアミドと01ウシ血清アルブミン/01フィコール/01のポリビニルピロリドン/50mMのpH6.5のリン酸ナトリウムバッファー、及び750mMの塩化ナトリウム、75mMクエン酸ナトリウムを用いるもの;342°Cにおける50ホルムアミド、5xSSC075MのNaCl、0075Mのクエン酸ナトリウム、50mMのリン酸ナトリウムpH68、01のピロリン酸ナトリウム、5xデンハード液、超音波処理サケ精子DNA50μgml、01SDS、及び10のデキストラン硫酸と、42°Cにおける02xSSC塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム中の洗浄及び55°Cでの50ホルムアミド、次いで55°CにおけるEDTAを含む01xSSCからなる高緊縮性洗浄を用いるものによって同定される。中程度の緊縮性条件は、Sambrook等MolecularCloningALaboratoryManualを有する。ここで用いられるイムノアドヘシンなる用語は、異種タンパク質アドヘシンの結合特異性と免疫グロブリン定常ドメインとを結合した抗体様分子を指す。構造的には、イムノアドヘシンは、所望の結合特異性を持ち、抗体の抗原認識及び結合部位以外である即ち異種のアミノ酸配列と、免疫グロブリン定常ドメイン配列との融合物を含む。イムノアドヘシン分子のアドへシン部分は、典型的には少なくともレセプター又はリガンドの結合部位を含む隣接アミノ酸配列である。イムノアドヘシンの免疫グロブリン定常ドメイン配列は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4サブタイプ、IgAIgA1及びIgA2を含む、IgE、IgD又はIgMなどの任意の免疫グロブリンから得ることができる。ここで意図している活性な及び活性とは、天然又は天然発生PROポリペプチドの生物学的及び/又は免疫学的活性を保持するPROの形態を意味し、生物学的活性とは、天然又は天然発生PROによって生ずる阻害性又は刺激性の生物学的機能であって、天然又は天然発生PROが有する抗原性エピトープに対して抗体を生成する能力を除くものを意味し、免疫学的活性とは、天然又は天然発生PROが有する抗原性エピトープに対して抗体を生成する能力を意味する。アンタゴニストなる用語は最も広い意味で用いられ、ここに開示した天然PROポリペプチドの生物学的活性を阻止、阻害、又は中和する任意の分子を指す。同様にアゴニストなる用語は最も広い意味で用いられ、ここに開示した天然PROポリペプチドの生物学的活性を模倣する任意の分子を指す。好適なアゴニスト又はアンタゴニスト分子は特に、アゴニスト又はアンタゴニスト抗体又は抗体断片、天然PROポリペプチドの断片又はアミノ酸配列変異体、ペプチド、有機小分子、などを含む。PROポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの同定方法は、PROポリペプチドを候補アンタゴニスト又はアゴニストと接触させ、PROポリペプチドに通常付随する一又は複数の生物学的活性の変化を測定することを含みうる。ここで使用される治療とは、治癒的処置、予防的療法及び防止的療法の両方を意味し、患者は標的とする病理学的状態又はしっかんを防止又は低下減少させられる。治療が必要なものとは、既に疾患に罹っているもの、並びに疾患に罹りやすいもの又は疾患が防止されているものを含む。慢性投与とは、急性様式とは異なり連続的な様式での薬剤を投与し、初期の治療効果活性を長時間に渡って維持することを意味する。間欠投与とは、中断無く連続的になされるのではなく、むしろ本質的に周期的になされる処理である。治療の対象のための哺乳動物は、ヒト、家庭及び農業用動物、動物園、スポーツ、又はペット動物、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ウサギなどを含む哺乳類に分類される任意の動物を意味する。好ましくは、哺乳動物はヒトである。一又は複数の治療薬と組み合わせた投与とは、同時同時期及び任意の順序での連続した投与を含む。ここで用いられる担体は、製薬的に許容されうる担体、賦形剤、又は安定化剤を含み、用いられる用量及び濃度でそれらに暴露される細胞又は哺乳動物に対して非毒性である。生理学的に許容されうる担体は、水性pH緩衝溶液であることが多い。生理学的に許容されうる担体の例は、リン酸塩、クエン酸塩、及び他の有機酸塩のバッファー;アスコルビン酸を含む酸化防止剤;低分子量約10残基未満ポリペプチド;タンパク質、例えば血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリン;疎水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン又はリシン;グルコース、マンノース又はデキストランを含む単糖類、二糖類、及び他の炭水化物;EDTA等のキレート剤;マンニトール又は祖ルビトール等の糖アルコール;ナトリウム等の塩形成対イオン;及び/又は非イオン性界面活性剤、例えば、TWEEN商品名、ポリエチレングリコールPEG、及びPLURONICSを含む。抗体断片は、無傷の抗体の一部、好ましくは無傷の抗体の抗原結合又は可変領域を含む。抗体断片の例は、Fab、Fab、F2、及びFv断片;ダイアボディ;直鎖状抗体Zapata等ProteinEng8105710621995;一本鎖抗体分子;及び抗体断片から形成された多重特異性抗体を含む。抗体のパパイン消化は、Fab断片と呼ばれる2つの同一の抗体結合断片を生成し、その各々は単一の抗原結合部位を持ち、残りは容易に結晶化する能力を反映してFc断片と命名される。ペプシン処理はF2断片を生じ、それは2つの抗原結合部位を持ち、抗原を交差結合することができる。Fvは、完全な抗原認識及び結合部位を含む最小の抗体断片である。この領域は、密接に非共有結合した1本の重鎖と1本の軽鎖の可変領域の二量体からなる。この配置において各ドメインの3つのCDRが相互作用してVH-VLに量体の表面に抗原結合部位を決定する。正しくは、6つのCDRsが抗体にたいする抗原結合特異性を持つ。しかしながら、単一の可変ドメイン又は抗原に特異的な3つのCDRのみを含んでなるFvの半分でさえ、結合部位全体よりは低い親和性であるが、抗原を認識し結合する能力を持つ。またFab断片は、軽鎖の定常ドメイン及び重鎖の第1の定常ドメインCH1も含む。Fab断片は、抗体ヒンジ領域からの一又は複数のシステインを含む重鎖CH1ドメインのカルボキシ末端に幾つかの残基が付加されていることによりFab断片と相違する。ここで、FabSHは、定常ドメインのシステイン残基が遊離のチオール基を持つFabを表す。F2抗体断片は、最初はFab断片の対として生成され、それらの間にヒンジシステインを有する。抗体断片の他の化学的結合も知られている。任意の脊椎動物種からの抗体免疫グロブリンの軽鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる二つの明らかに異なる型の一方に分類される。それらの重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に依存して、免疫グロブリンは異なるクラスに分類できる。免疫グロブリンの五つの主要なクラス:IgA、IgD、IgE、IgG及びIgMがあり、それらの幾つかは更にサブクラスアイソタイプ、例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA及びIgA2に分類される。一本鎖Fv又はsFv抗体断片は、抗体のVH及びVLドメインを含む抗体断片を含み、これらのドメインは単一のポリペプチド鎖に存在する。好ましくは、FvポリペプチドはVH及びVLドメイン間にポリペプチドリンカーを更に含み、それはsFVが抗原結合に望まれる構造を形成するのを可能にする。scFvの概説については、ThePharmacologyofMonoclonalAntibodiesvol113Rosenburg及びMoore編SpringerVerlagNewYorkpp269315のPluckthunを参照のこと。用語ダイアボディは、二つの抗原結合部位を持つ小型の抗体断片を指し、その断片は同じポリペプチド鎖VH-VL内で軽鎖可変ドメインVLに結合した重鎖可変ドメインVHを含む。同じ鎖の二つのドメイン間に対形成するには短すぎるリンカーを用いることにより、ドメインは強制的に他の鎖の相補的ドメインと対形成して二つの抗原結合部位を生成する。ダイアボディは、例えば、EP404097WO9311161及びHollinger等ProcNatlAcadSciUSA9064446448により十分に記載されている。単離された抗体は、その自然環境の成分から同定され分離及び/又は回収されたものである。その自然環境の汚染成分とは、その抗体の診断又は治療への使用を妨害する物質であり、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質様又は非タンパク質様溶質が含まれる。好ましい実施態様において、抗体は、1ローリ法で測定した場合95を越える抗体、最も好ましくは99重量を越えるまで、スピニングカップシークエネーターを使用することにより、少なくとも15残基のN末端あるいは内部アミノ酸配列を得るのに充分なほど、あるいは、クーマシーブルーあるいは好ましくは銀染色を用いた非還元あるいは還元条件下でのSDSPAGEによる均一性まで精製される。単離された抗体には、抗体の自然環境の少なくとも1つの成分が存在しないため、組換え細胞内のインサイツの抗体が含まれる。しかしながら、通常は、単離された抗体は少なくとも1つの精製工程により調製される。標識なる語は、ここで用いられる場合、抗体に直接又は間接的に抱合して標識抗体を生成する検出可能な化合物又は組成物を意味する。標識は、それ自身検出可能でもよく例えば、放射性標識又は蛍光標識、又は酵素標識の場合、検出可能な基質化合物又は組成物の化学変換を触媒してもよい。固相とは、本発明の抗体がそれに付着することのできる非水性マトリクスを意味する。ここに意図する固相の例は、部分的又は全体的に、ガラス例えば、孔制御ガラス、多糖類例えばアガロース、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、ポリビニルアルコール及びシリコーンから形成されたものを含む。或る種の実施態様では、内容に応じて、固相はアッセイプレートのウェルを構成することができ;その他では精製カラム例えばアフィニティクロマトグラフィーカラムとすることもできる。また、この用語は、米国特許第4275149号に記載されたような、別個の粒子の不連続な固相も包含する。リポソームは、種々の型の脂質、リン脂質及び/又は界面活性剤からなる小型の小胞であり、哺乳動物への薬物PROポリペプチド又はその抗体などの輸送に有用である。リポソームの成分は、通常は生体膜の脂質配列に類似する二層形式に配列させる。小分子とは、ここで、約500ダルトン未満の分子量を持つと定義される。II本発明の組成物と方法A.全長PROポリペプチド本発明は、本出願でPROポリペプチドと呼ばれるポリペプチドをコードする新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に下記の実施例でさらに詳細に説明するように、種々のPROポリペプチドをコードするcDNAが同定され単離された。別々の発現ラウンドで生成されたタンパク質には異なるPRO番号が与えられるが、UNQ番号は全ての与えられたDNA及びコード化タンパク質に独特であり、変わることはないことを記しておく。しかしながら、単純化のために、本明細書において、ここに開示した全長天然核酸分子にコードされるタンパク質並びに上記のPROの定義に含まれるさらなる天然相同体及び変異体は、それらの起源又は調製形式に関わらず、PRO/番号で呼称する。下記の実施例に開示するように、種々のcDNAクローンがATCCに寄託されている。これらのクローンの正確なヌクレオチド配列は、この分野で日常的な方法を用いて寄託されたクローンを配列決定することにより容易に決定することができる。予測されるアミノ酸配列は、ヌクレオチド配列から常套的技量を用いて決定できる。ここに記載したPROポリペプチド及びコード化核酸について、本出願人は、現時点で入手可能な配列情報と最も良く一致するリーディングフレームであると考えられるものを同定した。1.全長PRO281ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO281UNQ244と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO281ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列PRO281図2及び配列番号:2に示すがラットTEGTタンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO281が新規に同定されたTEGT相同体であり、そのタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。2.全長PRO276ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO276UNQ243と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO276ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA16435-1208配列はここでPRO276と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して配列同一性を持たないことが明らかとなった。見出された配列同一性の同定は下記の実施例に列挙する。3.全長PRO189ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO189と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO189ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の知識では、DNA21624-1391ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して配列同一性を持たないことが明らかとなった。4.全長PRO190ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO190と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO190ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO190コード化クローンは、ヒト網膜ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA23334-1392ヌクレオチド配列は新規な多重膜貫通スパンニングタンパク質をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントプログラムを用いて、CMP-シアル酸及びUDP-ガラクトーストランスポーターと或る程度の配列同一性があり、PRO190がトランスポーターに関連すること及びPRO190が新規なトランスポーターでありうることを示している。5.全長PRO341ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO341UNQ300と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO341ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA26288-1239クローンはヒト胎盤ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA26288-1239配列はここでPRO341と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性を持たないことが明らかとなった。6.全長PRO180ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO180UNQ154と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO180ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA26843-1389クローンはヒト胎盤ライブラリから、アミラーゼスクリーンから単離したDNA12922から形成したオリゴを用いて単離した。知りうる限り、DNA26843-1389配列は、ここでPRO180と命名される新規な因子をコードする。7.全長PRO194ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO194と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO194ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO194コード化クローンは、ヒト胎児肺ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA26844-1394ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性を持たないことが明らかとなった。8.全長PRO203ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO203と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO203ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントプログラムを用いて、本出願人は、PRO203がGSTATPaseと配列同一性を有していることを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO203ポリペプチドがATPaseファミリーの新たに同定されたメンバーであり、GSTATPaseに典型的な活性を有すると考えられている。9.全長PRO290ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO290と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO290ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。図23配列番号:33に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いた、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO290アミノ酸配列と以下のDayhoff配列との間の配列同一性が明らかになった:PR99800CC4HHUMANYCS2YEASTCEF35G1213HSFAN1MMU524611MMU700151HSU676151CET01H108及びCELT28F26。現在では、PRO290は上記のタンパク質の一又は複数に関連する細胞内タンパク質であると考えられている。10.全長PRO874ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO874と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO874ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO874コード化クローンは、ヒト胎児肺ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA40621-1440ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。しかし、BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性が明らかとなった。11.全長PRO710ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO710と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO710ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO710がCDC45タンパク質と有意な類似性を有していることを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO710ポリペプチドが新たに同定されたCDC45相同体であると考えられている。12.全長PRO1151ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1151と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1151ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、天然配列PRO1151図30及び配列番号:47に示すがヒト30kD脂肪細胞補体関連前駆体タンパク質ACR3HUMANと或るアミノ酸配列同一性を有していることが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1151が補体タンパク質ファミリーの新たに同定されたメンバーであり、そのファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。13.全長PRO1282ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1282と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1282ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA45495-1550配列は、ここでPRO1282と命名される新規な因子をコードする。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、下記の実施例で議論するように、PRO1282と他のロイシンリッチ反復タンパク質との間に或る程度の配列同一性が明らかとなり、ロイシンリッチ反復スーパーファミリーの新規なメンバーが同定されたことを示している。14.全長PRO358ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO358と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、新規なヒトTollポリペプチドPRO358をコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメント分析を用いて、本出願人は、PRO358のコード化配列が、GenBankのDNA配列HSU885401HSU888781HSU888791HSU888801HS888811及びHSU792601と有意な相同性を示すことを見出した。但し、HSU792601を除き、記載したタンパク質はヒトtoll様レセプターとして同定されている。従って現在では、本出願で開示されたPRO358タンパク質は、ショウジョウバエタンパク質Tollの新規に同定されたヒト相同体であり、適応免疫において重要な役割を担うであろうと考えられている。より詳細には、PRO358は、炎症、敗血性ショック、及び病原に対する反応に含まれており、免疫反応によって悪化する多様な医学的状態、例えば、糖尿病、ALS、癌、慢性関節リウマチ、及び潰瘍などにおいて役割を果たしうる。病原パターン認識レセプター、微生物上の保存された分子構造の存在の検知としてのPRO385の役割は、本出願で開示されるデータによって更に支持され、公知のヒトToll様レセプター、TLR2はLPSシグナル伝達の直接メディエータであることを示している。15.全長PRO1310ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1310と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1310ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1310図36及び配列番号:62に示すは、カルボキシペプチダーゼX2と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1310が新規に同定されたカルボキシペプチダーゼファミリーのメンバーであり、カルボキシル末端アミノ酸除去活性を有すると考えられている。16.全長PRO698ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO698と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO698ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO698ポリペプチドがオルファクトメジンタンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO698が新規に同定されたオルファクトメジン相同体であると考えられている。17.全長PRO732ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO732と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO732ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO732ポリペプチドがヒト胎盤Diff33タンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO732ポリペプチドが新規に同定されたDiff33相同体であると考えられている。18.全長PRO1120ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1120と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1120ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1120図47及び配列番号:84に示すは、Dayhoffバージョン3545SwissProt35データベースで各々CELK09C41及びGL6SHUMANと称される公知のスルファターゼと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1120が新規に同定されたスルファターゼファミリーのメンバーであり、スルファターゼの典型的な活性を有すると考えられている。19.全長PRO537ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO537と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO537ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA49141-1431クローンはヒト胎盤ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列のために選択する捕捉技術を用いて単離した。知りうる限り、DNA49141-1431配列は、ここでPRO537と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。20.全長PRO536ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO536と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO536ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA49142-1430クローンはヒト乳児脳ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列のために選択する捕捉技術を用いて単離した。知りうる限り、DNA49142-1430配列は、ここでPRO536と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。21.全長PRO535ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO535と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO535ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO535図53及び配列番号:99に示すは、推定ペプチジル-プロリルイソメラーゼタンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO535が新規に同定されたイソメラーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、これらのタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。22.全長PRO718ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO718と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO718ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO718-コード化クローンはヒト胎児肺ライブラリから単離した。本出願人の知識では、DNA49647-1398ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。23.全長PRO872ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO872と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO872ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO872ポリペプチドがデヒドロゲナーゼと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO872ポリペプチドが新規に同定されたデヒドロゲナーゼファミリーのメンバーであり、デヒドロゲナーゼ活性を有すると考えられている。24.全長PRO1063ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1063と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1063ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1063ポリペプチドがヒトIV型コラゲナーゼタンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1063ポリペプチドが新規に同定されたコラゲナーゼ相同体であると考えられている。25.全長PRO619ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO619と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO619ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO619図68及び配列番号:117に示すは、VpreB3と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO619が新規に同定されたIgGスーパーファミリーのメンバーであり、発達中のB細胞に関連する代理の軽鎖の組立及び/又は成分に関連する活性を有すると考えられている。26.全長PRO943ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO943と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO943ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO943図70及び配列番号:119に示すは、繊維芽成長因子レセプター4タンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO943が新規に同定された繊維芽成長因子レセプターファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。27.全長PRO1188ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1188と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1188ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。下記の実施例1で議論されるように、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1188図72;配列番号:124に示すは、ヌクレオチドピロホスホヒドロラーゼSSU831141と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1188が新規に同定されたヌクレオチドホスホヒドロラーゼファミリーのメンバーであり、このタンパク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。28.全長PRO1133ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1133と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1133ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1133図74及び配列番号:129に示すは、ネトリン1a、Dayhoff登録AF0027171と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1133がネトリンと少なくとも1つの関連するメカニズムを共有すると考えられている。29.全長PRO784ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO784と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO784ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO784図76;配列番号:135に示すは、sec22相同体と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO784が新規に同定されたsec22ファミリーのメンバーであり、sec22ファミリーに典型的な小胞輸送活性を有すると考えられている。30.全長PRO783ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO783と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO783ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO783-コード化クローンはヒト胎児腎臓ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA53996-1442ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が見られた。31.全長PRO820ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO820と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO820ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO820の種々の部分が低親和性免疫グロブリンガンマFcレセプター、IgE高親和性Fcレセプター及び高親和性免疫グロブリンイプシロンレセプターと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO820ポリペプチドがFcレセプターファミリーの新規に同定されたメンバーであると考えられている。32.全長PRO1080ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1080と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1080ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラム、Dayhoffデータベースバージョン3545swissProt35を用いて、本出願人は、PRO1080ポリペプチドがYRY1CAEELと称される39.9kdタンパク質、AF01271495と称されるDnaJ相同体、RNU957271と称されるDnaJ相同体2、及びAF0117931と称されるDna3Cpr3と配列同一性を有することを見出した。従って、これらの結果は、本出願で開示されたPRO1080ポリペプチドがDnaJ様タンパク質ファミリーの新規に同定されたメンバーであり、よってタンパク質生合成に含まれることを示している。33.全長PRO1079ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1079と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1079ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA56050-1455配列はここでPRO1079と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性を持つことが明らかとなった。34.全長PRO793ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO793と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO793ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA56110-1437クローンはヒト皮膚腫瘍ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA56110-1437配列はここでPRO793と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して配列同一性を持たないことが明らかとなった。35.全長PRO1016ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1016と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1016ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1016ポリペプチドがアシルトランスフェラーゼと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1016ポリペプチドがアシルトランスフェラーゼファミリーの新規に同定されたメンバーであり、このファミリーに典型的なアシル化能を有すると考えられている。36.全長PRO1013ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1013と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1013ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1013-コード化クローンはヒト乳腫瘍組織ライブラリからのものである。よって、PRO1013コード化クローンは癌に関連する分泌因子をコードしうる。本出願人の現在の知識では、DNA56410-1414ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、KIAA0157及びP120と或る程度の配列同一性が見られたPRO1013は成長因子及びサイトカインレセプターと共通の少なくとも1つの領域を有する。37.全長PRO937ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO937と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO937ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO937ポリペプチドがグリピカンファミリーのタンパク質と有意な配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO937ポリペプチドがグリピカンファミリーの新規に同定されたメンバーであり、グリピカンファミリーに典型的な特性を有すると考えられている。38.全長PRO842ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO842と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO842ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA56855-1447配列はここでPRO842と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性を持つことが明らかとなった。39.全長PRO839ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO839と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO839ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA56859-1445配列はここでPRO839と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性を持つことが明らかとなった。40.全長PRO1180ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1180と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1180ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1180ポリペプチドがメチルトランスフェラーゼと有意な配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1180ポリペプチドがメチルトランスフェラーゼファミリーの新規に同定されたメンバーであり、このファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。41.全長PRO1134ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1134と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1134ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA56865-1491クローンはヒト胎児肝臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA56865-1491クローンは分泌された因子をコードする。知りうる限り、DNA56865-1491配列はここでPRO1134と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して配列同一性を持たないことが明らかとなった。42.全長PRO830ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO830と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO830ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA56866-1342クローンはヒト胎児肝臓/脾臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA56866-1342クローンは分泌された因子をコードする。知りうる限り、DNA56866-1342配列はここでPRO830と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して配列同一性を持たないことが明らかとなった。43.全長PRO1115ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1115と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1115ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA56868-1478配列はここでPRO1115と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性を持つことが明らかとなった。44.全長PRO1277ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1277と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1277ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1277図113及び配列番号:179に示すは、Coch5B2タンパク質DayhoffデータベースでAF0122521と称すると或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1277が新規に同定されたCoch5B2タンパク質ファミリーのメンバーであり、Coch5B2と同様の活性及び特性を有すると考えられている。45.全長PRO1135ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1135と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1135ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1135ポリペプチドがアルファ1,2マンノシダーゼタンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1135ポリペプチドがマンノシダーゼ酵素ファミリーの新規に同定されたメンバーであり、このファミリーのタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。46.全長PRO1114ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1114インターフェロンレセプターと称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1114インターフェロンレセプターポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1114図117及び配列番号:183に示すは、他の公知のインターフェロンレセプターと配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、PRO1114インターフェロンレセプターがインターフェロンレセプターに典型的な活性を有すると考えられている。47.全長PRO828ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO828と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO828ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO828ポリペプチドがグルタチオンペルオキシダーゼと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO828ポリペプチドがグルタチオンペルオキシダーゼファミリーの新規に同定されたメンバーであり、ペルオキシダーゼ活性及びグルタチオンペルオキシダーゼに典型的な他の活性を有すると考えられている。48.全長PRO1009ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1009と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1009ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1009図122及び配列番号:194に示すは、F69893と称される長鎖アシルCoAシンセターゼ相同体と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1009が長鎖アシルCoAシンセターゼファミリーの新規に同定されたメンバーであり、このファミリーに関連する活性を有すると考えられている。49.全長PRO1007ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1007と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1007ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1007ポリペプチドがMAGPIAPと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されたPRO1007ポリペプチドがMAGPIAPファミリーの新規に同定されたメンバーであり、転移及び/又は細胞シグナル伝達及び/又は細胞複製に関連すると考えられている。50.全長PRO1056ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1056と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1056ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1056図127及び配列番号:199に示すは、塩素イオンチャンネルタンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1056が新規に同定された塩素イオンチャンネルタンパク質相同体であると考えられている。51.全長PRO826ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO826と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO826ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA57694-1341クローンはヒト胎児心臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA57694-1341クローンは分泌された因子をコードする。知りうる限り、DNA57694-1341配列はここでPRO826と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性を持たないことが明らかとなった。52.全長PRO819ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO819と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO819ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA57695-1340クローンはヒト胎児肝臓脾臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA57695-1340クローンは分泌された因子をコードする。知りうる限り、DNA57695-1340配列はここでPRO819と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性を持たないことが明らかとなった。53.全長PRO1006ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1006と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1006ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1006-コード化クローンはヒト子宮ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA57699-1412ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、推定チロシンタンパク質キナーゼとの或る程度の配列同一性が明らかになった。54.全長PRO1112ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1112と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1112ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。出願人の現在の知識では、DNA57702-1476ヌクレオチド配列は新規な因子をコードするが、BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、他の公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性が見出された。55.全長PRO1074ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1074と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1074ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1074ポリペプチドがグリコシルトランスフェラーゼと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1074ポリペプチドが新規に同定されたグリコシルトランスフェラーゼファミリーのメンバーであり、グリコシルトランスフェラーゼ活性を有すると考えられている。56.全長PRO1005ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1005と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1005ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA57708-1411配列はここでPRO1005と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性が明らかとなった。57.全長PRO1073ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1073と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1073ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA57710配列はここでPRO1073と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性が明らかとなった。58.全長PRO1152ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1152と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1152ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA57711-1501クローンはヒト乳児脳ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA57711-1501配列はここでPRO1152と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性を持たないことが明らかとなった。59.全長PRO1136ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1136と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1136ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1136図147及び配列番号:219に示すは、PDZドメイン含有タンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1136が新規に同定されたPDZドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。60.全長PRO813ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO813と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO813ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO813ポリペプチドが肺胞界面活性物質関連プロテインCと有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO813ポリペプチドが新規に同定された肺胞界面活性物質関連プロテインC相同体であると考えられている。61.全長PRO809ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO809と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO809ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。出願人の現在の知識では、DNA57836-1338ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。62.全長PRO791ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO791と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO791ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。出願人の現在の知識では、DNA57838-1337ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;しかし、BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、MHC1抗原との或る程度の配列同一性が明らかとなり、PRO791が構造及び機能においてそれに関連しうることを示している。63.全長PRO1004ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1004と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1004ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA57844-1410配列はここでPRO1004と命名される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質に対して或る程度の配列同一性が明らかとなった。64.全長PRO1111ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1111と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1111ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1111図157及び配列番号:229に示すは、LIGと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1111が新規に同定されたこの糖タンパク質ファミリーのメンバーであると考えられている。65.全長PRO1344ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1344と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1344ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1344図159及び配列番号:231に示すは、カルシノスコルピオスロツンジカウダの因子Cタンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1344が新規に同定された因子Cタンパク質であり、そのタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。66.全長PRO1109ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1109と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1109ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1109図161及び配列番号:236に示すは、ヒトUPDGal:GlcNAcガラクトシルトランスフェラーゼタンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1109が新規に同定されたβガラクトシルトランスフェラーゼ酵素であり、それらの酵素に典型的な活性を有すると考えられている。67.全長PRO1383ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1383と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1383ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1383図163及び配列番号:241に示すは、推定ヒト膜貫通タンパク質nmb前駆体NMBHUMANと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1383が新規に同定されたnmb相同体であると考えられている。68.全長PRO1003ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1003と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1003ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1003-コード化クローンはヒト乳腫瘍組織ライブラリから単離した。PRO1003-コード化クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。よって、PRO1003コード化クローンは分泌因子をコードしうる。本出願人の現在の知識では、UNQ487DNA58846-1409ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかになった。69.全長PRO1108ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1108と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1108ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1108ポリペプチドがLPAATタンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1108が新規に同定されたLPAAT相同体であると考えられている。70.全長PRO1137ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1137と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1137ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1137ポリペプチドがリボシルトランスフェラーゼと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1137ポリペプチドが新規に同定されたリボシルトランスフェラーゼファミリーのメンバーであり、リボシルトランスフェラーゼ活性を有すると考えられている。71.全長PRO1138ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1138と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1138ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1138ポリペプチドがCD84白血球抗原と配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1138ポリペプチドが新規に同定されたIgスーパーファミリーのメンバーであり、Igスーパーファミリーの他のメンバーに典型的な活性を有すると考えられている。72.全長PRO1054ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1054と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1054ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1054図174及び配列番号:256に示すは、一又は複数の主要な尿タンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1054が新規に同定されたMUPファミリーのメンバーであり、そのファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。73.全長PRO994ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO994と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO994ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO994図176及び配列番号:258に示すは、腫瘍関連抗原L6とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO994が新規に同定されたL6抗原相同体であると考えられている。74.全長PRO812ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO812と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO812ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO812図178及び配列番号:260に示すは、前立腺ステロイド-結合c1タンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO812が新規に同定された前立腺ステロイド-結合c1タンパク質相同体であると考えられている。75.全長PRO1069ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1069と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1069ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1069ポリペプチドがCHIFと配列同一性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1069ポリペプチドが新規に同定されたCHIFポリペプチドであり、イオン伝導又はイオン伝導の調節に含まれると考えられている。76.全長PRO1129ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1129と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1129ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1129ポリペプチドがチトクロムP450ファミリーのタンパク質と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1129が新規に同定されたチトクロムP450ファミリーのメンバーであり、そのファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。77.全長PRO1068ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1068と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1068ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1068は、ウロテンシンとアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1068が新規に同定されたウロテンシンファミリーのメンバーであり、ウロテンシンファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。78.全長PRO1066ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1066と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1066ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1066-コード化クローンはヒト膵臓腫瘍組織ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、PRO1066-コード化クローンは分泌因子をコードする。本出願人の現在の知識では、DNA59215-1425ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかになった。79.全長PRO1184ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1184と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1184ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59220-1514ヌクレオチド配列は新規な分泌因子をコードする。80.全長PRO1360ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1360と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1360ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA59488-1603配列はここでPRO1360と命名される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質に対して有意な配列同一性が無いことが明らかとなった。以下の実施例に示すように、幾分の配列同一性は見られた。81.全長PRO1029ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1029と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1029ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59493-1420クローンはヒト胎児肝臓脾臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA59493-1420クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA59493-1420配列はここでPRO1029と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかになった。82.全長PRO1139ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1139と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1139ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、最初に同定されたPRO1139ポリペプチドが、Bailleul等NucleicAcidsRes2527522758に記載されたOBレセプター関連タンパク質HSOBRGRP1と有意な配列相同性を示すことを見出した。83.全長PRO1309ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1309と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1309ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1309図196及び配列番号:278に示すは、Dayhoff表記AB0078761で与えられる、KIAA0416と称されるタンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。さらに、PRO1309はロイシンリッチ反復を有し、従って、現在では、本出願で開示されるPRO1309が新規に同定されたロイシンリッチ反復ファミリーのメンバーであり、タンパク質タンパク質相互作用に含まれると考えられている。84.全長PRO1028ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1028と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1028ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59603-1419ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムは、A53050と称するもののようなタンパク質との或る程度の配列同一性を示した。85.全長PRO1027ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1027と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1027ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1027-コード化クローンはヒト子宮頸部組織ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59605-1418ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。86.全長PRO1107ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1107と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1107ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1107ポリペプチドがPC1タンパク質、ヒトインシュリンレセプターチロシンキナーゼインヒビター、アルカリホシホジエステラーゼ、及び自己毒素と或る程度の類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1107ポリペプチドが新規に同定されたホスホジエステラーゼファミリーのメンバーであると考えられている。87.全長PRO1140ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1140と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1140ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との或る程度の配列同一性が見いだされた。88.全長PRO1106ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1106と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1106ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO1106ポリペプチドがペルオキシソーマルカルシウム依存性溶質担体と有意な類似性を有することを見出した。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1106ポリペプチドが新規に同定されたミトコンドリア担体スーパーファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。89.全長PRO1291ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1291と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1291ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1291図208及び配列番号:291に示すは、ブチロフィリンタンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1291が新規に同定されたブチロフィリン相同体であり、そのタンパク質に典型的な活性を有していると考えられている。90.全長PRO1105ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1105と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1105ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59612-1466ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。しかし、DayhoffデータベースでATTS16231と称されるペルオキシダーゼ前駆対と或る程度の配列同一性がある。91.全長PRO511ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO511と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO511ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO511コード化クローンはヒト結腸組織ライブラリから単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59613-1417ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、RoBo1、ホスホリパーゼインヒビター及びSSC20F101と称するタンパク質との配列同一性が示され、PRO511がこれらのタンパク質の一又は複数と関連していることを示している。92.全長PRO1104ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1104と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1104ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59616-1465ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、AB0021071、AF0229911及びSP96DICDIと称するタンパク質との或る程度の配列同一性が示された。93.全長PRO1100ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1100と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1100ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59619-1464ヌクレオチド配列は新規な因子をコードし;BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との或る程度の配列同一性が明らかとなった。YSCT4YEASTと称される、TSM1ARE1遺伝子内領域にある酵母仮説的42.5KDタンパク質登録番号140496との或る程度の配列同一性がある。94.全長PRO836ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO836と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO836ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59620-1463ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、SLS1との或る程度の配列同一性が示された。95.全長PRO1141ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1141と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1141ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59625-1498クローンはヒト回腸組織ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA59625-1498配列はここでPRO1141と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかになった。96.全長PRO1132ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1132と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1132ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1132図226及び配列番号:309に示すは、エナメルマトリクスセリンプロテイナーゼ1及びニューロプシンと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1132が新規に同定されたセリンプロテアーゼファミリーのメンバーであり、そのファミリーに典型的な活性を有していると考えられている。97.全長PRO1346ポリペプチド本発明は、本出願においてNL7UNQ701と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、NL7ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。下記の実施例に開示するように、クローンDNA59776-1600がATCCに寄託されている。このクローンの正確なヌクレオチド配列は、この分野で日常的な方法を用いて寄託されたクローンを配列決定することにより容易に決定することができる。予測されるアミノ酸配列は、ヌクレオチド配列から常套的技量を用いて決定できる。ここのNL7PRO1346について、本出願人は、出願時点で入手可能な配列情報と最も良く一致するリーディングフレームであると考えられるものを同定した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列NL7図228及び配列番号:314に示すは、微生物関連糖タンパク質4MFA4HUMAN;フィコリンAマウスAB0078131;ヒトレクチンP35D63155S61;フィコリンBマウスAF00632171;ヒトテナシンR制限HS518E131;ラットジャヌシン前駆体A45445;フィブリノーゲン関連タンパク質HFREP1前駆体JNO596;ヒトテナシン前駆体TENAHUMAN;ヒトCDT6HSY161321;及びアンギオポエチン1マウスMMU835091と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるNL7が新規なTIEリガンド相同体であり、血管形成及び/又は血管維持及び/又は創傷治癒及び/又は炎症及び/又は腫瘍発達及び/又は成長において役割を果たすと考えられている。98.全長PRO1131ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1131と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1131ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1131図230及び配列番号:319に示すは、レクチン様酸化LDLレセプターと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1131が少なくとも1つのLDLレセプターと類似のメカニズムを有すると考えられている。99.全長PRO1281ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1281と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1281ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59820-1549クローンはヒト胎児肝臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。知りうる限り、DNA59820-1549配列はここでPRO1281と称される新規な因子をコードする。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が見られたが、有意ではないと決定された。100.全長PRO1064ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1064と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1064ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59827-1426クローンはヒト胎児肝臓ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA59827-1426配列はここでPRO1064と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかになった。101.全長PRO1379ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1379と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1379ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59828クローンはヒト胎児肝臓ライブラリから単離した。知りうる限り、それによりコードされたPRO1379ポリペプチドは新規な分泌因子である。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、PRO1379と酵母タンパク質YHY8YEASTDayhoffデータベース;バージョン3545SwissProt35、特にC末端との間に配列同一性が見出された。他のタンパク質との配列相同性が見られたが、有意ではないと決定された。102.全長PRO844ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO844と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO844ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO844ポリペプチドがセリンプロテアーゼインヒビターと配列同一性を有することを見出した。従って現在では、本出願で開示されたPRO844ポリペプチドは、新規に同定されたセリンプロテアーゼインヒビターであり、セリンプロテアーゼを阻害できると考えられている。103.全長PRO848ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO848と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO848ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、本出願人は、PRO848ポリペプチドがシアリルトランスフェラーゼと配列同一性を有することを見出した。従って現在では、本出願で開示されたPRO848ポリペプチドは、新規に同定されたシアリルトランスフェラーゼファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的なようにシアル化能を持つと考えられている。104.全長PRO1097ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1097と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1097ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。本出願人の現在の知識では、DNA59841-1460ヌクレオチド配列は新規な因子をコードする。BLAST及びFastA配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、CELK05G33、CRU263441、SPBC16C68、PW13844及びAF013403と称されるタンパク質との或る程度の配列同一性が明らかになった。105.全長PRO1153ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1153と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1153ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1153図246及び配列番号:351に示すは、EMBLデータライブラリに1992年6月に提出されたHPBRII7タンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1153がHPBRII7と関連すると考えられている。106.全長PRO1154ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1154と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1154ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1154図248及び配列番号:353に示すは、AB011097と称されるKIAA0525タンパク質と整合することが見出された。PRO1154は73アミノ酸の新規なN末端を有する。従って、PRO1154は新規であると考えられる。またPRO1154は、アミノペプチダーゼN、インシュリン調節膜アミノペプチダーゼ、スロトロピン放出ホルモン分解酵素及び胎盤ロイシンアミノペプチダーゼと有意な配列同一性を有する。従って、PRO1154が新規なアミノペプチダーゼ、又はペプチドを分解するペプチドであると考えられている。107.全長PRO1181ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1181と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1181ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59847-1511クローンはヒト前立腺組織から、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。よって、DNA59847-1511クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA59847-1511クローンは分泌因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。108.全長PRO1182ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1182と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1182ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1182図252及び配列番号:357に示すは、コングルチニンタンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1182が新規に同定されたコングルチニン相同体であると考えられている。109.全長PRO1155ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1155と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1155ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1155図254及び配列番号:359に示すは、ニューロキニンBと或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1155が新規に同定されたニューロキニンファミリーのメンバーであると考えられている。110.全長PRO1156ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1156と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1156ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA59853-1505クローンは成人ヒト心臓ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。知りうる限り、DNA59853-1505クローンはここでPRO1156と称される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が明らかとなった。111.全長PRO1098ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1098と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1098ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。PRO1098-コード化クローンはヒト肺組織ライブラリから単離し;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。Envポリプロテイン及びメチルトランスフェラーゼ等のタンパク質と或る程度の配列同一性が明らかになった。112.全長PRO1127ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1127と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1127ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA60283-1484クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA60283-1484配列はここでPRO1127と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と最小の配列同一性が明らかとなった。113.全長PRO1126ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1126と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1126ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1126図262及び配列番号:367に示すは、オルファクトメジンタンパク質と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1126が新規に同定されたオルファクトメジン相同体であり、そのタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。114.全長PRO1125ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1125と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1125ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1125図264及び配列番号:369に示すは、転写リプレッサーrco1と或るアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1125が新規に同定されたWDスーパーファミリーのメンバーであると考えられている。115.全長PRO1186ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1186と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1186ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1186図266及び配列番号:371に示すは、デンドロアスピスポリレプシス毒液からの毒液プロテインAとアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1186が新規に同定された毒液プロテインAのメンバーであり、関連するメカニズムを共有すると考えられている。116.全長PRO1198ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1198と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1198ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA60622-1525配列はここでPRO1198と称される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が明らかとなった。117.全長PRO1158ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1158と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1158ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA60625-1507クローンはヒト肺腫瘍組織ライブラリから単離した。知りうる限り、DNA60625-1507配列はここでPRO1158と称される新規な因子をコードする。しかし、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が示された。118.全長PRO1159ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1159と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1159ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA60627-1508クローンはヒト末梢血液顆粒球組織ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA60627-1508クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA60627-1508配列はここでPRO1159と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。119.全長PRO1124ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1124と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1124ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1124図274及び配列番号:377に示すは、ボスタウルスbostaurusからの上皮塩素イオンチャンネルタンパク質とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。またPRO1124はECAM1とも配列同一性を有する。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1124がイオンチャンネル又は細胞接着分子のいずれかを介する細胞伝達に含まれる新規に同定された細胞膜タンパク質であると考えられている。120.全長PRO1287ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1287と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1287ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1287図276及び配列番号:381に示すは、ガルスからのラジカルフリンジタンパク質GGU820881ととアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1287が新規に同定されたフリンジタンパク質相同体であり、フリンジタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。121.全長PRO1312ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1312と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1312ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が明らかとなったが、有意ではないと決定された。従って、知りうる限り、DNA61873-1574配列はここでPRO1312と称される新規な膜貫通タンパク質をコードする。122.全長PRO1192ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1192と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1192ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1192図280及び配列番号:389に示すは、マスP0様糖タンパク質GEN12838IP1とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1192が新規に同定されたミエリンP0糖タンパク質ファミリーのメンバーであると考えられている。123.全長PRO1160ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1160と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1160ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA62872-1509クローンはヒト乳組織ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA62872-1509クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA62872-1509配列はここでPRO1160と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。124.全長PRO1187ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1187と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1187ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA62876-1517配列はここでPRO1187と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。125.全長PRO1185ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1185と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1185ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA62881-1515配列はここでPRO1185と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。126.全長PRO1345ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1345と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1345ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1345図288及び配列番号:403に示すは、ボスタウルスのC型レクチン相同体タンパク質BTU222981とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1345が新規に同定されたC型レクチンタンパク質ファミリーのメンバーであり、特にテトラネクチンタンパク質のファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。127.全長PRO1245ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1245と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1245ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA64884-1527クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する方法を用いて同定した。知りうる限り、DNA64884-1527配列はここでPRO1245と称される新規な因子をコードする。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と或る程度の配列同一性が明らかとなった;しかしそれは有意ではないと決定された。128.全長PRO1358ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1358と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1358ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1358図292及び配列番号:410に示すは、RASP1とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1358が新規に同定されたセリンプロテアーゼインヒビターのセルピンファミリーのメンバーであり、セルピンプロテアーゼ阻害活性、タンパク質異化作用阻害活性を有し及び/又は組織の再生に関連すると考えられている。129.全長PRO1195ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1195と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1195ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1195図294及び配列番号:412に示すは、マウスからのプロリンリンリッチ酸性タンパク質、遺伝子座MMU28486、JohnWKasikによ1995年6月6日に提出された、データベースGBTRANSの登録:U28486、と称されるMMU284861とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1195がこのタンパク質ファミリーの新規に同定されたメンバーであると考えられている。130.全長PRO1270ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1270と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1270ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1270図296及び配列番号:414に示すは、アフリカツメガエルのレクチンタンパク質XLU866991とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1270がレクチンタンパク質ファミリーの新規に同定されたメンバーであり、このファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。131.全長PRO1271ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1271と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1271ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。知りうる限り、DNA66309-1538配列はここでPRO1271と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなったその結果は下記の実施例に記載する。132.全長PRO1375ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1375と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1375ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1375図300及び配列番号:418に示すは、PUT2とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1375がPUT2の少なくとも1つの関連するメカニズムを有すると考えられている。133.全長PRO1385ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1385と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に本出願人は、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1385ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。DNA68869-1610クローンはヒト組織ライブラリから、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を選択する捕捉技術を用いて単離した。即ち、DNA68869-1610クローンは分泌因子をコードする。知りうる限り、DNA68869-1610配列はここでPRO1385と称される新規な因子をコードし;WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかとなった。134.全長PRO1387ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1387と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1387ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1387図304及び配列番号:422に示すは、ミエリンp0タンパク質前駆体MYP0HETFRとアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1387が新規に同定されたミエリンタンパク質ファミリーのメンバーであり、そのファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。135.全長PRO1384ポリペプチド本発明は、本出願においてPRO1384と称されるポリペプチドをコードする、新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に、以下の実施例で更に詳細に開示するような、PRO1384ポリペプチドをコードするcDNAを同定し単離した。WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配列PRO1384図306及び配列番号:424に示すは、NKG2DAF0548191;Dayhoffデータベース、バージョン3545SwissProt35とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるPRO1384が新規に同定されたNKG2ファミリーのメンバーであり、NKGファミリーに典型的なMHC活性化/不活性化活性を有すると考えられている。B.PRO変異体ここに記載した全長天然配列PROポリペプチドに加えて、PRO変異体も調製できると考えられる。PRO変異体は、PROポリペプチドDNAに適当なヌクレオチド変化を導入することにより、あるいは所望のPROポリペプチドを合成することにより調製できる。当業者は、グリコシル化部位の数又は位置の変化あるいは膜固着特性の変化などのアミノ酸変化がPROポリペプチドの翻訳後プロセスを変えうることを理解するであろう。天然全長配列PRO又はここに記載したPROポリペプチドの種々のドメインにおける変異は、例えば、米国特許第5364934号に記載されている保存的及び非保存的変異についての任意の技術及び指針を用いてなすことができる。変異は、結果として天然配列PROと比較してPROポリペプチドのアミノ酸配列が変化するPROポリペプチドをコードする一又は複数のコドンの置換、欠失又は挿入であってよい。場合によっては、変異は少なくとも1つのアミノ酸のPROポリペプチドの一又は複数のドメインの任意の他のアミノ酸による置換である。いずれのアミノ酸残基が所望の活性に悪影響を与えることなく挿入、置換又は欠失されるかの指針は、PROポリペプチドの配列を相同性の知られたタンパク質分子の配列と比較し、相同性の高い領域内でなされるアミノ酸配列変化を最小にすることによって見出される。アミノ酸置換は、一のアミノ酸の類似した構造及び/又は化学特性を持つ他のアミノ酸での置換、例えばロイシンのセリンでの置換、即ち保存的アミノ酸置換の結果とすることができる。挿入及び欠失は、場合によっては1から5のアミノ酸の範囲内とすることができる。許容される変異は、配列においてアミノ酸の挿入、欠失又は置換を系統的に作成し、得られた変異体を下記の実施例に記載するインビトロアッセイの任意のもので活性について試験することにより決定される。PROポリペプチド断片がここに提供される。このような断片は、例えば、全長天然タンパク質と比較した際に、N末端又はC末端で切断されてもよく、又は内部残基を欠いていてもよい。或る種の断片は、PROポリペプチドの所望の生物学的活性に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。PRO断片は、多くの従来技術の任意のものによって調製してよい。所望のペプチド断片は化学合成してもよい。代替的方法は、酵素的消化、例えば特定のアミノ酸残基によって決定される部位のタンパク質を切断することが知られた酵素でタンパク質を処理することにより、あるいは適当な制限酵素でDNAを消化して所望の断片を単離することによるPRO断片の生成を含む。さらに他の好適な技術は、ポリメラーゼ連鎖反応PCRにより、所望のポリペプチド断片をコードするDNA断片を単離し増幅することを含む。DNA断片の所望の末端を決定するオリゴヌクレオチドは、PCRの5’及び3’プライマーで用いられる。好ましくは、PROポリペプチド断片は、ここに開示した天然PROポリペプチドと少なくとも1つの生物学的及び/又は免疫学的活性を共有する。特別の実施態様では、対象とする保存的置換を、好ましい置換を先頭にして表1に示す。このような置換が生物学的活性の変化をもたらす場合、表1に例示的置換と名前を付けた又は以下にアミノ酸分類でさらに記載するように、より置換的な変化が導入され生成物がスクリーニングされる。表1元の残基例示的置換好ましい置換AlavalLeuilevalArglysglnasnlysAsnglnhislysargglnAspglugluCysserserGlnasnansGluaspaspGlyproalaalaHisasnglnlysargargIleleuvalmetalapheノルロイシンleuLeuノルロイシンilevalmetalapheileLysargglnasnargMetleupheileleuPheleuvalilealatyrleuProalaalaSerthrthrThrserserTrptyrphetyrTyrtrpphethrserpheValileleumetphealaノルロイシンleuPROポリペプチドの機能及び免疫学的同一性の置換的修飾は、a置換領域のポリペプチド骨格の構造、例えばシート又は螺旋配置、b標的部位の電荷又は疎水性、又はc側鎖の嵩を維持しながら、それらの効果において実質的に異なる置換基を選択することにより達成される。天然発生残基は共通の側鎖特性に基づいてグループに分けることができる:1疎水性:ノルロイシンmetalavalleuile2中性の親水性:cysserthr3酸性:aspglu4塩基性:asnglnhislysarg5鎖配向に影響する残基:glypro及び6芳香族:trptyrphe。非保存的置換は、これらの分類の一つのメンバーを他の分類に交換することを必要とするであろう。また、そのように置換された残基は、保存的置換部位、好ましくは残された非保存部位に導入されうる。変異は、オリゴヌクレオチド媒介部位特異的突然変異誘発、アラニンスキャンニング、及びPCR突然変異誘発[Carter等NuclAcidsRes134331Zoller等NuclAcidsRes106487]、カセット突然変異誘発[Wells等Gene34315]、制限的選択突然変異誘発[Wells等PhilosTransRSocLondonSerA317415]等のこの分野で知られた方法を用いてなすことができ、又は他の知られた技術をクローニングしたDNAに実施してPRO変異体DNAを作成することもできる。また、隣接配列に沿って一又は複数のアミノ酸を同定するのにスキャンニングアミノ酸分析を用いることができる。好ましいスキャンニングアミノ酸は比較的小さく、中性のアミノ酸である。そのようなアミノ酸は、アラニン、グリシン、セリン、及びシステインを含む。アラニンは、ベータ炭素を越える側鎖を排除し変異体の主鎖構造を変化させにくいので、この群の中で典型的に好ましいスキャンニングアミノ酸である。また、アラニンは最もありふれたアミノ酸であるため典型的には好ましい。さらに、それは埋もれた及び露出した位置の両方に見られることが多い[CreightonTheProteinsChothiaJMolBiol1501]。アラニン置換が十分な量の変異体を生じない場合は、アイソテリックアミノ酸を用いることができる。C.PROの修飾PROポリペプチドの共有結合的修飾は本発明の範囲内に含まれる。共有結合的修飾の一型は、PROポリペプチドの標的とするアミノ酸残基を、PROポリペプチドの選択された側鎖又はN又はC末端残基と反応できる有機誘導体化試薬と反応させることである。二官能性試薬での誘導体化が、例えばPROを水不溶性支持体マトリクスあるいは抗PRO抗体の精製方法又はその逆で用いるための表面に架橋させるのに有用である。通常用いられる架橋剤は、例えば、1,1ビスジアゾアセチル2フェニルエタン、グルタルアルデヒド、Nヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば4アジドサリチル酸、3,3’ジチオビススクシンイミジルプロピオネート等のジスクシンイミジルエステルを含むホモ二官能性イミドエステル、ビスNマレイミド1,8オクタン等の二官能性マレイミド、及びメチル3ジチオ]プロピオイミダート等の試薬を含む。他の修飾は、グルタミニル及びアスパラギニル残基の各々対応するグルタミル及びアスパルチルへの脱アミノ化、プロリン及びリシンのヒドロキシル化、セリル又はトレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニン、及びヒスチジン側鎖のαアミノ基のメチル化TECreightonProteinsStructureandMolecularPropertiesWHFreemanampampCoSanFranciscopp7986、N末端アミンのアセチル化、及び任意のC末端カルボキシル基のアミド化を含む。本発明の範囲内に含まれるPROポリペプチドの共有結合的修飾の他の型は、ポリペプチドの天然グリコシル化パターンの変更を含む。天然グリコシル化パターンの変更とは、ここで意図されるのは、天然配列PROに見られる1又は複数の炭水化物部分の欠失存在するグリコシル化部位の除去又は化学的及び/又は酵素的手段によるグリコシル化の削除のいずれかによる、及び/又は天然配列PROに存在しない1又は複数のグリコシル化部位の付加を意味する。さらに、この文節は、存在する種々の炭水化物部分の性質及び特性の変化を含む、天然タンパク質のグリコシル化における定性的変化を含む。PROポリペプチドへのグリコシル化部位の付加はアミノ酸配列の変更を伴ってもよい。この変更は、例えば、1又は複数のセリン又はトレオニン残基の天然配列PROO結合グリコシル化部位への付加、又は置換によってなされてもよい。PROアミノ酸配列は、場合によっては、DNAレベルでの変化、特に、PROポリペプチドをコードするDNAを予め選択された塩基において変異させ、所望のアミノ酸に翻訳されるコドンを生成させることを通して変更されてもよい。PROポリペプチド上に炭水化物部分の数を増加させる他の手段は、グリコシドのポリペプチドへの化学的又は酵素的結合による。このような方法は、この技術分野において、例えば、1987年9月11日に発行されたWO8705330、及びAplin及びWristonCRCCritRevBiochempp259306に記載されている。PROポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的又は酵素的に、あるいはグルコシル化の標的として提示されたアミノ酸残基をコードするコドンの変異的置換によってなすことができる。化学的脱グリコシル化技術は、この分野で知られており、例えば、Hakimuddin等ArchBiochemBiophys25952により、及びEdge等AnalBiochem118131により記載されている。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Thotakura等MethEnzymol138350に記載されているように、種々のエンド及びエキソグリコシダーゼを用いることにより達成される。本発明のPROの共有結合的修飾の他の型は、PROポリぺプチドの、種々の非タンパク質様ポリマー、例えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、又はポリオキシアルキレンの一つへの、米国特許第4640835号;第4496689号;第4301144号;第4670417号;第4791192号又は第4179337号に記載された方法での結合を含む。また、本発明のPROポリペプチドは、他の異種ポリペプチド又はアミノ酸配列に融合したPROポリペプチドを含むキメラ分子を形成する方法で修飾してもよい。一実施態様では、このようなキメラ分子は、抗タグ抗体が選択的に結合できるエピトープを提供するタグポリペプチドとPROポリペプチドとの融合を含む。エピトープタグは、一般的にはPROポリペプチドのアミノ又はカルボキシル末端に位置する。このようなPROポリペプチドのエピトープタグ形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出することができる。また、エピトープタグの提供は、抗タグ抗体又はエピトープタグに結合する他の型の親和性マトリクスを用いたアフィニティ精製によってPROポリペプチドを容易に精製できるようにする。種々のタグポリペプチド及びそれら各々の抗体はこの分野で良く知られている。例としては、ポリ-ヒスチジンpolyhis又はポリ-ヒスチジン-グリシンpolyhisglyタグ;fluHAタグポリペプチド及びその抗体12CA5[Field等MolCellBiol821592165];cmycタグ及びそれに対する8F9、3C7、6E10、G4、B7及び9E10抗体[Evan等MolecularandCellularBiology536103616];及び単純ヘルペスウイルス糖タンパク質DgDタグ及びその抗体[Paborsky等ProteinEngineering3547553]を含む。他のタグポリペプチドは、フラッグペプチド[Hopp等BioTechnology612041210];KT3エピトープペプチド[Martin等Science255192194];αチューブリンエピトープペプチド[Skinner等JBiolChem2661516315166];及びT7遺伝子10タンパク質ペプチドタグ[LutzFreyermuth等ProcNatlAcadSciUSA8763936397]を含む。それに換わる実施態様では、キメラ分子はPROの免疫グロブリン又は免疫グロブリンの特定領域との融合体を含んでもよい。キメラ分子の二価形態イムノアドヘシンとも呼ばれるについては、そのような融合体はIgG分子のFc領域であり得る。Ig融合体は、好ましくはIg分子内の少なくとも1つの可変領域に換えてPROポリペプチドの可溶化膜貫通ドメイン欠失又は不活性化形態を含む。特に好ましい実施態様では、免疫グロブリン融合体は、IgG分子のヒンジ、CH2及びCH3、又はヒンジ、CH1、CH2及びCH3領域を含む。免疫グロブリン融合体の製造については、1995年6月27日発行の米国特許第5428130号を参照のこと。D.PROの調製以下の説明は、主として、PRO核酸を含むベクターで形質転換又は形質移入された細胞を培養することによりPROを生産する方法に関する。もちろん、当該分野においてよく知られている他の方法を用いてPROを調製することができると考えられる。例えば、PRO配列、又はその一部は、固相技術を用いた直接ペプチド合成によって生産してもよい[例えば、Stewart等SolidPhasePeptideSynthesisWHFreemanCoSanFranciscoCA;MerrifieldJAmChemSoc8521492154参照]。手動技術又は自動によるインビトロタンパク質合成を行ってもよい。自動合成は、例えば、アプライドバイオシステムズペプチド合成機FosterCityCAを用いて、製造者の指示により実施してもよい。PROの種々の部分は、別々に化学的に合成され、化学的又は酵素的方法を用いて結合させて全長PROを生産してもよい。1.PROをコードするDNAの単離PROをコードするDNAは、PROmRNAを保有していてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製されたcDNAライブラリから得ることができる。従って、ヒトPRODNAは、実施例に記載されるように、ヒトの組織から調製されたcDNAライブラリから簡便に得ることができる。またPROコード化遺伝子は、ゲノムライブラリから又は公知の合成方法例えば、自動化核酸合成により得ることもできる。ライブラリは、対象となる遺伝子あるいはその遺伝子によりコードされるタンパク質を同定するために設計されたプローブによってスクリーニングできる。選択されたプローブによるcDNA又はゲノムライブラリのスクリーニングは、例えばSambrook等MolecularCloningALaboratoryManualに記載されている標準的な手順を使用して実施することができる。所望のPROポリペプチドをコードする遺伝子を単離する他の方法はPCR法を使用するものである[Sambrook等上掲;Dieffenbach等PCRPrimer:ALaboratoryManual]。下記の実施例には、cDNAライブラリのスクリーニング技術を記載している。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は、充分な長さで、疑陽性が最小化されるよう充分に明瞭でなければならない。オリゴヌクレオチドは、スクリーニングされるライブラリ内のDNAとのハイブリッド形成時に検出可能であるように標識されていることが好ましい。標識化の方法は当該分野において良く知られており、32P標識されたATPのような放射線標識、ビオチン化あるいは酵素標識の使用が含まれる。中程度の厳密性及び高度の厳密性を含むハイブリッド形成条件は、上掲のSambrook等に与えられている。このようなライブラリースクリーニング法において同定された配列は、Genbank等の公共データベース又は個人の配列データベースに寄託され公衆に利用可能とされている周知の配列と比較及びアラインメントすることができる。分子の決定された領域内又は全長に渡ってのアミノ酸又は核酸レベルのいずれかでの配列同一性は、この分野で知られた、そしてここに記載した方法を用いて決定することができる。タンパク質コード化配列を有する核酸は、初めてここで開示された推定アミノ酸配列を使用し、また必要ならば、cDNAに逆転写されなかったmRNAの生成中間体及び先駆物質を検出する上掲のSambrook等に記述されているような従来のプライマー伸展法を使用し、選択されたcDNA又はゲノムライブラリをスクリーニングすることにより得られる。2.宿主細胞の選択及び形質転換宿主細胞を、ここに記載したPRO生産のための発現又はクローニングベクターで形質移入又は形質転換し、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択し、又は所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために適当に変性された常套的栄養培地で培養する。培養条件、例えば培地、温度、pH等々は、過度の実験をすることなく当業者が選ぶことができる。一般に、細胞培養の生産性を最大にするための原理、プロトコール、及び実用技術は、MammalianCellBiotechnologyaPracticalApproachMButler編及びSambrook等上掲に見出すことができる。原核生物細胞形質移入及び真核生物細胞形質移入の方法、例えば、CaCl2、CaPO4、リポソーム媒介及びエレクトロポレーションは当業者に知られている。用いられる宿主細胞に応じて、その細胞に対して適した標準的な方法を用いて形質転換はなされる。前掲のSambrook等に記載された塩化カルシウムを用いるカルシウム処理又はエレクトロポレーションが、一般的に原核生物に対して用いられる。アグロバクテリウムトゥメファシエンスによる感染が、Shaw等Gene23315及び1989年6月29日公開のWO8905859に記載されているように、或る種の植物細胞の形質転換に用いられる。このような細胞壁のない哺乳動物の細胞に対しては、Graham及びvanderEbVirology52456457のリン酸カルシウム沈降法が好ましい。哺乳動物細胞の宿主系形質転換の一般的な態様は米国特許第4399216号に記載されている。酵母菌中への形質転換は、典型的には、Vansolingen等JBact130946及びHsiao等ProcNatlAcadSciUSA763829の方法に従って実施される。しかしながら、DNAを細胞中に導入する他の方法、例えば、核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、無傷の細胞、又はポリカチオン、例えばポリブレン、ポリオルニチン等を用いる細菌プロトプラスト融合もまた用いることもできる。哺乳動物細胞を形質転換するための種々の技術については、Keown等MethodsinEnzymology185527537及びMansour等Nature336348352を参照のこと。ここに記載のベクターにDNAをクローニングあるいは発現するために適切な宿主細胞は、原核生物、酵母菌、又は高等真核生物細胞である。適切な原核生物は、限定するものではないが、真正細菌、例えばグラム陰性又はグラム陽性生物体、例えば大腸菌のような腸内細菌科を含む。種々の大腸菌株が公衆に利用可能であり、例えば、大腸菌K12株MM294ATCC31446;大腸菌X1776ATCC31537;大腸菌株W3110ATCC27325及びK5772ATCC53635である。他の好ましい原核動物宿主細胞は、大腸菌、例えば、Ecoli、エンテロバクター、エルビニア、クレブシエラ、プロテウス、サルモネラ、例えば、ネズミチフス菌、セラチア、例えば、セラチアマルセサンス、及び赤痢菌、並びに桿菌、例えばバシリスブチリス及びバシリリチェニフォルミス例えば、1989年4月12日発行のDD266710に記載されたバシリリチェニフォルミス41P、シュードモナス、例えば緑膿筋及びストレプトマイセスなどの腸内細菌科を含む。これらの例は限定ではなく例示である。株W3110は、組換えDNA生産発行のための共通の宿主株であるので一つの特に好ましい宿主又は親宿主である。好ましくは、宿主細胞は最小量のタンパク質分解酵素を分泌する。例えば、株W3110は、細胞に外来のタンパク質をコードする遺伝子における遺伝子変異をするように修飾してもよく、そのような宿主の例としては、完全な遺伝子型tonAを有する大腸菌W3110株1A2;完全な遺伝子型tonAptr3を有する大腸菌W3110株9E4;完全な遺伝子型tonAprt3phoAE15169degPompTkanを有する大腸菌W3110株27C7ATCC55244;完全な遺伝子型tonAptr3phoAE15169degPompTrbs7ilvGkanを有する大腸菌W3110株37D6;非カナマイシン耐性degP欠失変異を持つ37D6株である大腸菌W3110株40B4;及び1990年8月7日発行の米国特許第4946783号に開示された変異周辺質プロテアーゼを有する大腸菌株を含む。あるいは、クローニングのインビトロ法、例えばPCR又は他の核酸ポリメラーゼポリメラーゼ反応が好ましい。原核生物に加えて、糸状菌又は酵母菌のような真核微生物は、PROポリペプチドコード化ベクターのための適切なクローニング又は発現宿主である。サッカロミセスセレヴィシアは、通常用いられる下等真核生物宿主微生物である。他に、シゾサッカロミセスプロンブBeach及びNurseNature29014019811985年5月2日発行のEP139383;クルベロミセスホスツ米国特許第4943529号Fleer等BioTechnology9968975、例えばケーラクチスMW988CCBS683CBS4574Louvencourt等JBacteriol7371983、ケーフラギリスATCC12424、ケーブルガリクスATCC16045、ケーウィケラミイATCC24178、ケーワルチイATCC56500、ケードロソフィラルムATCC36906VandenBerg等BioTechnology8135、ケーテモトレランス及びケーマルキシアナス;ヤロウィアEP402226;ピッチャパストリスEP183070Sheekrishna等JBasicMicrobiol282652781988;カンジダ;トリコデルマレーシアEP244234;アカパンカビCase等ProcNatlAcadSciUSA76525952631979;シュワニオマイセス、例えばシュワニオマイセスオクシデンタリス1990年10月31日発行のEP394538;及び糸状真菌、例えば、ニューロスポラ、ペニシリウム、トリポクラジウム1991年1月10日発行のWO9100357;及びコウジ菌、例えば偽巣性コウジ菌Ballance等BiochemBiophysResCommun1122842891983Tilburn等Gene262052211983Yelton等ProcNatlAcadSciUSA81147014741984及びクロカビKelly及びHynesEMBOJ44754791985が含まれる。ここで好ましいメチロトロピック酵母は、これらに限られないが、ハンセヌラ、カンジダ、クロエケラ、ピチア、サッカロミセス、トルロプシス、及びロドトルラからなる属から選択されるメタノールで成長可能な酵母を含む。この酵母の分類の例示である特定の種のリストは、CAnthonyTheBiochemistryofMethylotrophs269に記載されている。グリコシル化PROの発現に適切な宿主細胞は、多細胞生物から誘導される。無脊椎動物細胞の例としては、ショウジョウバエS2及びスポドスペラSf9等の昆虫細胞並びに植物細胞が含まれる。有用な哺乳動物宿主株化細胞の例は、チャイニーズハムスター卵巣CHO及びCOS細胞を含む。より詳細な例は、SV40によって形質転換されたサル腎臓CV1株ヒト胚腎臓株293又は懸濁培養での増殖のためにサブクローン化された293細胞、Graham等JGenVirol3659チャイニーズハムスター卵巣細胞/DHFRマウスのセルトリ細胞TM4MatherBiolReprod23243251ヒト肺細胞ヒト肝細胞及びマウス乳房腫瘍細胞を含む。適切な宿主細胞の選択は、この分野の技術常識内にある。3.複製可能なベクターの選択及び使用PROをコードする核酸は、クローニング又は発現のために複製可能なベクター内に挿入される。様々なベクターが公的に入手可能である。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルス粒子、又はファージの形態とすることができる。適切な核酸配列が、種々の手法によってベクターに挿入される。一般に、DNAはこの分野で周知の技術を用いて適当な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。ベクター成分としては、一般に、これらに制限されるものではないが、一又は複数のシグナル配列、複製開始点、一又は複数のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター、及び転写終結配列を含む。これらの成分の一又は複数を含む適当なベクターの作成には、当業者に知られた標準的なライゲーション技術を用いる。PROは直接的に組換え手法によって生産されるだけではなく、シグナル配列あるいは成熟タンパク質あるいはポリペプチドのN末端に特異的切断部位を有する他のポリペプチドである異種性ポリペプチドとの融合ペプチドとしても生産される。一般に、シグナル配列はベクターの成分であるか、ベクターに挿入されるPROコード化DNAの一部である。シグナル配列は、例えばアルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、lppあるいは熱安定性エンテロトキシンIIリーダーの群から選択される原核生物シグナル配列であってよい。酵母の分泌に関しては、シグナル配列は、酵母インベルターゼリーダー、アルファ因子リーダー及びクルイベロマイシスα因子リーダーを含み、後者は米国特許第5010182号に記載されている、又は酸ホスフォターゼリーダー、白体グルコアミラーゼリーダー、又は1990年11月15日に公開されたWO9013646に記載されているシグナルであり得る。哺乳動物細胞の発現においては、哺乳動物シグナル配列は、同一あるいは関連ある種の分泌ポリペプチド由来のシグナル配列並びにウイルス分泌リーダーのようなタンパク質の直接分泌に使用してもよい。発現及びクローニングベクターは共に一又は複数の選択された宿主細胞においてベクターの複製を可能にする核酸配列を含む。そのような配列は多くの細菌、酵母及びウイルスに対してよく知られている。プラスミドpBR322に由来する複製開始点は大部分のグラム陰性細菌に好適であり、2μプラスミド開始点は酵母に適しており、様々なウイルス開始点は哺乳動物細胞におけるクローニングベクターに有用である。発現及びクローニングベクターは、典型的には、選べるマーカーとも称される選択遺伝子を含む。典型的な選択遺伝子は、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキセートあるいはテトラサイクリンのような抗生物質あるいは他の毒素に耐性を与え、栄養要求性欠陥を補い、又は例えばバシリに対する遺伝子コードDアラニンラセマーゼのような、複合培地から得られない重要な栄養素を供給するタンパク質をコードする。哺乳動物細胞に適切な選べるマーカーの例は、DHFRあるいはチミジンキナーゼのように、PROコード化核酸を取り込むことのできる細胞成分を同定することのできるものである。野生型DHFRを用いた場合の好適な宿主細胞は、Urlaub等によりProcNatlAcadSciUSA774216に記載されているようにして調製され増殖されたDHFR活性に欠陥のあるCHO株化細胞である。酵母菌中での使用に好適な選択遺伝子は酵母プラスミドYRp7に存在するtrp1遺伝子である[Stinchcomb等Nature282:39;Kingman等Gene7:141;Tschemper等Gene10:157]。trp1遺伝子は、例えば、ATCC番号44076あるいはPEP41のようなトリプトファン内で成長する能力を欠く酵母菌の突然変異株に対する選択マーカーを提供する[JonesGenetics8512]。発現及びクローニングベクターは、通常、PROコード化核酸配列に作用可能に結合し、mRNA合成を制御するプロモーターを含む。種々の可能な宿主細胞により認識される好適なプロモーターが知られている。原核生物宿主での使用に好適なプロモーターはβラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系[Cahng等Nature275615;Goeddel等Nature281544]、アルカリホスファターゼ、トリプトファンプロモーター系[GoeddelNucleicAcidsRes84057EP36776]、及びハイブリッドプロモーター、例えばtacプロモーター[deBoer等ProcNatlAcadSciUSA802125]を含む。細菌系で使用するプロモータもまたPROをコードするDNAと作用可能に結合したシャインダルガーノ配列を有する。酵母宿主と共に用いて好適なプロモーター配列の例としては、3ホスホグリセラートキナーゼ[Hitzeman等JBiolChem2552073]又は他の糖分解酵素[Hess等JAdvEnzymeReg7149;HollandBiochemistry17:4900]、例えばエノラーゼ、グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、グルコース6リン酸イソメラーゼ、3ホスホグリセレートムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオセリン酸イソメラーゼ、ホスホグルコースイソメラーゼ、及びグルコキナーゼが含まれる。他の酵母プロモーターとしては、成長条件によって転写が制御される付加的効果を有する誘発的プロモーターであり、アルコールデヒドロゲナーゼ2、イソチトクロムC、酸ホスファターゼ、窒素代謝と関連する分解性酵素、メタロチオネイン、グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲナーゼ、及びマルトース及びガラクトースの利用を支配する酵素のプロモーター領域がある。酵母菌での発現に好適に用いられるベクターとプロモータはEP73657に更に記載されている。哺乳動物の宿主細胞におけるベクターからのPRO転写は、例えば、ポリオーマウィルス、伝染性上皮腫ウィルス、アデノウィルス、ウシ乳頭腫ウィルス、トリ肉腫ウィルス、サイトメガロウィルス、レトロウィルス、B型肝炎ウィルス及びサルウィルス40のようなウィルスのゲノムから得られるプロモーター、異種性哺乳動物プロモーター、例えばアクチンプロモーター又は免疫グロブリンプロモーター、及び熱衝撃プロモーターから得られるプロモーターによって、このようなプロモーターが宿主細胞系に適合し得る限り制御される。より高等の真核生物による所望のPROをコードするDNAの転写は、ベクター中にエンハンサー配列を挿入することによって増強され得る。エンハンサーは、通常は約10から300塩基対で、プロモーターに作用してその転写を増強するDNAのシス作動要素である。哺乳動物遺伝子由来の多くのエンハンサー配列が現在知られている。しかしながら、典型的には、真核細胞ウィルス由来のエンハンサーが用いられるであろう。例としては、複製起点の後期側のSV40エンハンサー、サイトメガロウィルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側のポリオーマエンハンサー及びアデノウィルスエンハンサーが含まれる。エンハンサーは、PROコード化配列の5’又は3’位でベクター中にスプライシングされ得るが、好ましくはプロモーターから5’位に位置している。また真核生物宿主細胞に用いられる発現ベクターは、転写の終結及びmRNAの安定化に必要な配列も含む。このような配列は、真核生物又はウィルスのDNA又はcDNAの通常は5’、時には3’の非翻訳領域から取得できる。これらの領域は、PROをコードするmRNAの非翻訳部分にポリアデニル化断片として転写されるヌクレオチドセグメントを含む。組換え脊椎動物細胞培養でのPROの合成に適応化するのに適切な他の方法、ベクター及び宿主細胞は、Gething等Nature293620625Mantei等Nature2814046EP117060及びEP117058に記載されている。4.遺伝子増幅/発現の検出遺伝子の増幅及び/又は発現は、ここで提供された配列に基づき、適切に標識されたプローブを用い、例えば、従来よりのサザンブロット法、mRNAの転写を定量化するノーザンブロット法[ThomasProcNatlAcadSciUSA7752015205]、ドットブロット法、又はインサイツハイブリッド形成法によって、直接的に試料中で測定することができる。あるいは、DNA二本鎖、RNA二本鎖及びDNA-RNAハイブリッド二本鎖又はDNAタンパク二本鎖を含む、特異的二本鎖を認識することができる抗体を用いることもできる。次いで、抗体を標識し、アッセイを実施することができ、ここで二本鎖は表面に結合しており、その結果二本鎖の表面での形成の時点でその二本鎖に結合した抗体の存在を検出することができる。あるいは、遺伝子の発現は、遺伝子産物の発現を直接的に定量する免疫学的な方法、例えば細胞又は組織切片の免疫組織化学的染色及び細胞培養又は体液のアッセイによって、測定することもできる。試料液の免疫組織化学的染色及び/又はアッセイに有用な抗体は、モノクローナルでもポリクローナルでもよく、任意の哺乳動物で調製することができる。簡便には、抗体は、天然配列PROポリペプチドに対して、又はここで提供されるDNA配列をベースとした合成ペプチドに対して、又はPRODNAに融合し特異的抗体エピトープをコードする外因性配列に対して調製され得る。5.ポリペプチドの精製PROの形態は、培地又は宿主細胞の溶菌液から回収することができる。膜結合性であるならば、適切な洗浄液又は酵素的切断を用いて膜から引き離すことができる。PROの発現に用いられる細胞は、凍結融解サイクル、超音波処理、機械的破壊、又は細胞溶解剤などの種々の化学的又は物理的手段によって破壊することができる。PROを、組換え細胞タンパク又はポリペプチドから精製することが望ましい。適切な精製手順の例である次の手順により精製される:すなわち、イオン交換カラムでの分画;エタノール沈殿;逆相HPLC;シリカ又はカチオン交換樹脂、例えばDEAEによるクロマトグラフィー;クロマトフォーカシング;SDSPAGE;硫酸アンモニウム沈殿;例えばセファデックスG75を用いるゲル濾過IgGのような汚染物を除くプロテインAセファロースカラム;及びPROポリペプチドのエピトープタグ形態を結合させる金属キレート化カラムである。この分野で知られ、例えば、DeutcherMethodesinEnzymology182;ScopesProteinPurificationPrinciplesandPracticeSpringerVerlagNewYorkに記載された多くのタンパク質精製方法を用いることができる。選ばれる精製過程は、例えば、用いられる生産方法及び特に生産される特定のPROの性質に依存する。E.PROの用途PROをコードする核酸配列又はそれらの相補鎖は、ハイブリッド形成プローブとしての使用を含む分子生物学の分野において、染色体及び遺伝子マッピングにおいて、及びアンチセンスRNA及びDNAの生成において種々の用途を有している。また、PRO核酸も、ここに記載される組換え技術によるPROポリペプチドの調製に有用であろう。全長天然配列PRO遺伝子又はその一部は、全長PROcDNAの単離又はここに開示したPRO配列に対して所望の配列同一性を持つ更に他の遺伝子例えば、PROの天然発生変異体又は他の種からのPROをコードするものの単離のためのcDNAライブラリ用のハイブリッド形成プローブとして使用できる。場合によっては、プローブの長さは約20~約50塩基である。ハイブリッド形成プローブは、少なくとも部分的に全長天然ヌクレオチド配列の新規な領域から誘導してもよく、それらの領域は、過度の実験をすることなく、天然配列PROのプロモーター、エンハンサー成分及びイントロンを含むゲノム配列から誘導され得る。例えば、スクリーニング法は、PROポリペプチド遺伝子のコード化領域を周知のDNA配列を用いて単離して約40塩基の選択されたプローブを合成することを含む。ハイブリッド形成プローブは、32P又は35S等の放射性ヌクレオチド、又はアビディン/ビオチン結合系を介してプローブに結合したアルカリホスファターゼ等の酵素標識を含む種々の標識で標識されうる。本発明のPROポリペプチド遺伝子に相補的な配列を有する標識されたプローブは、ヒトcDNA、ゲノムDNA又はmRNAのライブラリーをスクリーニングし、そのライブラリーの何れのメンバーがプローブにハイブッド形成するかを決定するのに使用できる。ハイブリッド形成技術は、以下の実施例において更に詳細に記載する。本出願で開示する任意のESTはプローブと同様に、ここに記載した方法で用いることができる。PRO核酸の他の有用な断片は、標的PROmRNAセンス又はPRODNAアンチセンス配列に結合できる一本鎖核酸配列RNA又はDNAのいずれかを含むアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを含む、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、本発明によると、PRODNAのコード化領域の断片を含む。このような断片は、一般的には少なくとも約14ヌクレオチド、好ましくは約14から30ヌクレオチドを含む。与えられたタンパク質をコードするcDNA配列に基づく、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを制御する可能性は、例えば、Stein及びCohenCancerRes4826591988及びvanderKrol等BioTechniques69581988に記載されている。アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドの標的核酸配列への結合は二重鎖の形成をもたらし、それは、二重鎖の分解の促進、転写又は翻訳の期外停止を含む幾つかの方法の一つ、又は他の方法により、標的配列の転写又は翻訳を阻止する。よって、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、PROタンパク質の発現を阻止するのに用いられる。アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、修飾糖-ホスホジエステル骨格又は他の糖結合、WO9106629に記載のもの等を有するオリゴヌクレオチドをさらに含み、そのような糖結合は内因性ヌクレアーゼ耐性である。そのような耐性糖結合を持つオリゴヌクレオチドは、インビボで安定であるが即ち、酵素分解に耐えうるが、標的ヌクレオチド配列に結合できる配列特異性は保持している。センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の例は、WO9010048に記載されているもののような、有機部分、及びオリゴヌクレオチドの標的核酸配列への親和性を向上させる他の部分、例えばポリに共有結合したオリゴヌクレオチドを含む。さらにまた、エリプチシン等の挿入剤、アルキル化剤又は金属作体をセンス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させ、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドの標的ヌクレオチド配列への結合特異性を改変してもよい。アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、CaPO4媒介DNA形質移入、エレクトロポレーションを含む任意の遺伝子転換方法により、又はエプスタインバーウイルスなどの遺伝子転換ベクターを用いることにより、標的核酸配列を含む細胞に導入される。好ましい方法では、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、適切なレトロウイルスベクターに挿入される。標的核酸配列を含む細胞は、インビボ又はエキソビボで組換えレトロウイルスベクターに接触させる。好適なレトロウイルスベクターは、これらに限られないが、マウスレトロウイルスMMuLVから誘導されるもの、N2MMuLVから誘導されたレトロウイルス、又はDCT5A、DCT5B及びDCT5Cと命名されたダブルコピーベクターWO9013641参照を含む。また、センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドは、WO9104753に記載されているように、リガンド結合分子との複合体の形成により標的配列を含む細胞に導入してもよい。適切なリガンド結合分子は、これらに限られないが、細胞表面レセプター、成長因子、他のサイトカイン、又は細胞表面レセプターに結合する他のリガンドを含む。好ましくは、リガンド結合分子の複合体形成は、リガンド結合分子がその対応する分子又はレセプターに結合する、あるいはセンス又はアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその複合体の細胞への侵入を阻止する能力を実質的に阻害しない。あるいは、センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドは、WO9010448に記載されたように、オリゴヌクレオチド-脂質複合体の形成により標的核酸配列を含む細胞に導入してもよい。センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチド-脂質複合体は、好ましくは内因性リパーゼにより細胞内で分解される。また、プローブは、PCR技術に用いて、密接に関連したPROコード化配列の同定のための配列のプールを作成することができる。また、PROをコードする核酸配列は、そのPROをコードする遺伝子のマッピングのため、及び遺伝子疾患を持つ個体の遺伝子分析のためのハイブリッド形成プローブの作成にも用いることができる。ここに提供される核酸配列は、インサイツハイブリッド形成、既知の染色体マーカーに対する結合分析、及びライブラリーでのハイブリッド形成スクリーニング等の周知の技術を用いて、染色体及び染色体の特定領域にマッピングすることができる。PROのコード化配列が他のタンパク質に結合するタンパク質をコードする場合例えば、PROがレセプターである場合、PROは、そのリガンドを同定するアッセイに用いることができる。このような方法により、レセプター/リガンド結合性相互作用の阻害剤を同定することができる。このような結合性相互作用に含まれるタンパク質も、ペプチド又は小分子阻害剤又は結合性相互作用のアゴニストのスクリーニングに用いることができる。また、レセプターPROは関連するリガンドの単離にも使用できる。スクリーニングアッセイは、天然PRO又はPROのレセプターの生物学的活性に似たリード化合物の発見のために設計される。このようなスクリーニングアッセイは、化学的ライブラリーの高スループットスクリーニングにも用いられ、小分子候補薬剤の同定に特に適したものとする。考慮される小分子は、合成有機又は無機化合物を含む。アッセイは、この分野で良く知られ特徴付けられているタンパク質-タンパク質結合アッセイ、生物学的スクリーニングアッセイ、免疫検定及び細胞ベースのアッセイを含む種々の型式で実施される。また、PRO又はその任意の修飾型をコードする核酸は、トランスジェニック動物又はノックアウト動物を産生するのにも使用でき、これらは治療的に有用な試薬の開発やスクリーニングに有用である。トランスジェニック動物とは、出生前、例えば胚段階で、その動物又はその動物の祖先に導入された導入遺伝子を含む細胞を有する動物である。導入遺伝子とは、トランスジェニック動物が発生する細胞のゲノムに組み込まれたDNAである。一実施形態では、PROをコードするcDNAは、確立された技術によりPROをコードするゲノムDNAをクローン化するために使用することができ、ゲノム配列を、PROをコードするDNAを発現する細胞を有するトランスジェニック動物を産生するために使用することができる。トランスジェニック動物、特にマウス又はラット等の特定の動物を産生する方法は当該分野において常套的になっており、例えば米国特許第4736866号や第4870009号に記述されている。典型的には、特定の細胞を組織特異的エンハンサーでのPRO導入遺伝子の導入の標的にする。胚段階で動物の生殖系列に導入されたPROコード化導入遺伝子のコピーを含むトランスジェニック動物はPROをコードするDNAの増大した発現の影響を調べるために使用できる。このような動物は、例えばその過剰発現を伴う病理学的状態に対して保護をもたらすと思われる試薬のテスター動物として使用できる。本発明のこの態様においては、動物を試薬で治療し、導入遺伝子を有する未治療の動物に比べ病理学的状態の発症率が低ければ、病理学的状態に対する治療的処置の可能性が示される。あるいは、PROの非ヒト相同体は、動物の胚性細胞に導入されたPROをコードする変更ゲノムDNAと、PROをコードする内在性遺伝子との間の相同的組換えによって、PROをコードする欠陥又は変更遺伝子を有するPROノックアウト動物を作成するために使用できる。例えば、PROをコードするcDNAは、確立された技術に従い、PROをコードするゲノムDNAのクローニングに使用できる。PROをコードするゲノムDNAの一部を欠失したり、組み込みを監視するために使用する選択可能なマーカーをコードする遺伝子等の他の遺伝子で置換することができる。典型的には、ベクターは無変化のフランキングDNAを数キロベース含む[例えば、相同的組換えベクターについてはThomas及びCapecchiCell51503を参照のこと]。ベクターは胚性幹細胞に導入し、導入されたDNAが内在性DNAと相同的に組換えられた細胞が選択される[例えば、Li等Cell69915参照]。選択された細胞は次に動物の胚盤胞内に注入されて集合キメラを形成する[例えば、BradleyTeratocarcinomasandEmbryonicStemCellsAPracticalApproachEJRobertsonedpp113152参照]。その後、キメラ性胚を適切な偽妊娠の雌性乳母に移植し、期間をおいてノックアウト動物をつくり出す。胚細胞に相同的に組換えられたDNAを有する子孫は標準的な技術により同定され、それらを利用して動物の全細胞が相同的に組換えられたDNAを含む動物を繁殖させることができる。ノックアウト動物は、PROポリペプチドが不在であることによるある種の病理的状態及びその病理的状態の進行に対する防御能力によって特徴付けられる。また、PROポリペプチドをコードする核酸は遺伝子治療にも使用できる。遺伝子治療用途においては、例えば欠陥遺伝子を置換するため、治療的有効量の遺伝子産物のインビボ合成を達成するために遺伝子が導入される。遺伝子治療とは、1回の処理により継続的効果が達成される従来の遺伝子治療と、治療的に有効なDNA又はmRNAの1回又は繰り返し投与を含む遺伝子治療薬の投与の両方を含む。アンチセンスRNA及びDNAは、ある種の遺伝子のインビボ発現を阻止する治療薬として用いることができる。短いアンチセンスオリゴヌクレオチドを、細胞膜による制限された取り込みに起因する低い細胞内濃度にもかかわらず、それが阻害剤として作用する細胞中に移入できることは既に示されているZamecnik等ProcNatlAcadSciUSA83414341461986。オリゴヌクレオチドは、それらの負に荷電したリン酸ジエステル基を非荷電基で置換することによって取り込みを促進するように修飾してもよい。生存可能な細胞に核酸を導入するための種々の技術が存在する。これらの技術は、核酸が培養細胞にインビトロで、あるいは意図する宿主の細胞においてインビボで移入されるかに応じて変わる。核酸を哺乳動物細胞にインビトロで移入するのに適した方法は、リポソーム、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシウム沈殿法などを含む。現在好ましいインビボ遺伝子移入技術は、ウイルス典型的にはレトロウイルスベクターでの形質移入及びウイルス被覆タンパク質リポソーム媒介形質移入であるDzau等TrendsinBiotechnology11205219。幾つかの状況では、核酸供給源を、細胞表面膜タンパク質又は標的細胞に特異的な抗体、標的細胞上のレセプターに対するリガンド等の標的細胞を標的化する薬剤とともに提供するのが望ましい。リポソームを用いる場合、エンドサイトーシスを伴って細胞表面膜タンパク質に結合するタンパク質、例えば、特定の細胞型向性のカプシドタンパク質又はその断片、サイクルにおいて内部移行を受けるタンパク質に対する抗体、細胞内局在化を標的とし細胞内半減期を向上させるタンパク質が、標的化及び/又は取り込みの促進のために用いられる。レセプター媒介エンドサイトーシスは、例えば、Wu等JBiolChem26244292232及びWagner等ProcNatlAcadSciUSA8734103414によって記述されている。遺伝子作成及び遺伝子治療のプロトコールの概説については、Anderson等Science256808813を参照のこと。ここに記載したPROポリペプチドは、タンパク質電気泳動目的の分子量マーカーとして用いてもよい。ここに記載したPROポリペプチド又はその断片をコードする核酸分子は染色体同定に有用である。この点において、実際の配列に基づく染色体マーキング試薬は殆ど利用可能ではないため、新規な染色体マーカーの同定の必要性が存在している。本発明の各PRO核酸分子は染色体マーカーとして使用できる。また本発明のPROポリペプチド及び核酸分子は組織タイピングに使用でき、本発明のPROポリペプチドは一方の組織で他方に比較して異なる発現をする。PRO核酸分子は、PCR、ノーザン分析、サザン分析及びウェスタン分析のプローブ生成のための用途が見出されるであろう。ここに記載したPROポリペプチドは治療薬として用いてもよい。本発明のPROポリペプチドは、製薬的に有用な組成物を調製するのに知られた方法に従って製剤され、それにより、このPRO生成物は製薬的に許容される担体媒体と混合される。治療用製剤は、凍結乾燥された製剤又は水性溶液の形態で、任意的な製薬上許容可能なキャリア、賦形剤又は安定剤と、所望の精製度を有する活性成分とを混合することにより、調製され保管される。許容される担体、賦形剤又は安定剤は、用いる投与量及び濃度ではレシピエントに対して無毒性であり、リン酸、クエン酸及び他の有機酸等の緩衝液;アスコルビン酸を含む抗酸化剤;低分子量ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン等のタンパク質;ポリビニルピロリドン等の親水性重合体;グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン又はリシン等のアミノ酸;グルコース、マンノース又はデキストリン等の単糖類、二糖類又は他の炭水化物、EDTA等のキレート剤、マンニトール又はソルビトール等の糖類、ナトリウム等の塩形成対イオン;及び/又はTWEEN、PLURONICS又はポリエチレングリコール等の非イオン性界面活性剤を含む。インビボ投与に使用される製剤は滅菌されていなくてはならない。これは、凍結乾燥及び再構成の前又は後に、滅菌フィルター膜を通す濾過により容易に達成される。ここで、本発明の製薬組成物は一般に、無菌のアクセスポートを具備する容器、例えば、皮下注射針で貫通可能なストッパーを持つ静脈内バッグ又はバイアル内に配される。投与経路は周知の方法、例えば、静脈内、腹膜内、脳内、筋肉内、眼内、動脈内又は病巣内経路での注射又は注入、局所投与、又は徐放系による。本発明の製薬組成物の用量及び望ましい薬物濃度は、意図する特定の用途に応じて変化する。適切な用量又は投与経路の決定は、通常の内科医の技量の範囲内である。動物実験は、ヒト治療のための有効量の決定についての信頼できるガイダンスを提供する。有効量の種間スケーリングは、ToxicokineticsandNewDrugDevelopmentYacobi等編PergamonPressNewYork1989pp4296のMordentiJ及びchappellWTheuseofinterspeciesscalingintoxicokineticsに記載された原理に従って実施できる。PROポリペプチド又はそのアゴニスト又はアンタゴニストのインビボ投与が用いられる場合、正常な投与量は、投与経路に応じて、哺乳動物の体重当たり1日に約10ng/kgから100mg/kgまで、好ましくは約1μg/kg/日から10mg/kg/日である。特定の用量及び輸送方法の指針は文献に与えられている;例えば、米国特許第4657760号、第5206344号、又は第5225212号参照。異なる製剤が異なる治療用化合物及び異なる疾患に有効であること、例えば一つの器官又な組織を標的とする投与には他の器官又は組織とは異なる方式で輸送することは必要であることが予想される。PROポリペプチドの投与を必要とする任意の疾患又は疾病の治療に適した放出特性を持つ製剤でPROポリペプチドの持続放出が望まれる場合、PROポリペプチドのマイクロカプセル化が考えられる。持続放出のための組換えタンパク質のマイクロカプセル化は、ヒト成長ホルモンrhGH、インターフェロンrhIFN、インターロイキン2、及びMNrgp120で成功裏に実施されている。Johnson等NatMed2795799YasudaBiomedTher2712211223Hora等BioTechnology8755758ClelandDesignandProductionofSingleImmunizationVaccinesUsingPolyactidePolyglycolideMicrosphereSystemsVaccineDesignTheSubunitandAdjuvantApproachPowell及びNewman編p439462WO9703692WO9640072WO9607399及び米国特許第5564010号。これらのタンパク質の持続放出製剤は、ポリ乳酸コグリコール酸PLGAポリマーを用い、その生体適合性及び広範囲の生分解特性に基づいて開発された。PLGAの分解生成物である乳酸及びグリコール酸は、ヒト身体内で即座にクリアされる。さらに、このポリマーの分解性は、分子量及び組成に依存して数ヶ月から数年まで調節できる。LewisControlledreleaseofbioactiveagentsfromlactideglycolidepolymerMChasin及びRLangerBiodegradablePolymersasDrugDeliverySystemspp141。本発明は、PROポリペプチドに類似するアゴニスト又はPROポリペプチドの効果を阻害するアンタゴニストものを同定するための化合物のスクリーニング方法も包含する。アンタゴニスト候補薬のスクリーニングアッセイは、ここに同定した遺伝子にコードされるPROポリペプチドと結合又は複合体形成する化合物、又は他にコード化ポリペプチドお他の細胞性タンパク質との相互作用を阻害する化合物を同定するために設計される。このようなスクリーニングアッセイは、それを特に小分子候補薬の同定に適したものにする、化学的ライブラリの高スループットスクリーニングに適用可能なアッセイを含む。このアッセイは、タンパク質-タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイ、及び細胞ベースのアッセイで、この分野で知られたものを含む種々の方式で実施される。アンタゴニストについての全てのアッセイは、それらが候補薬をここで同定された核酸にコードされるPROポリペプチドと、これら2つの成分が相互作用するのに十分な条件下及び時間で接触させることを必要とすることにおいて共通する。結合アッセイにおいて、相互作用は結合であり、形成された複合体は単離されるか、又は反応混合物中で検出される。特別な実施態様では、ここに同定された遺伝子にコードされるPROポリペプチド又は候補薬が、共有又は非共有結合により固相、例えばミクロタイタープレートに固定化される。非共有結合は、一般的に固体表面をポリペプチドの溶液で被覆し乾燥させることにより達成される。あるいは、固定化されるPROポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えばモノクローナル抗体を、それを固体表面に固着させるために用いることができる。アッセイは、固定化成分、例えば固着成分を含む被覆表面に、検出可能な標識で標識されていてもよい非固定化成分を添加することにより実施される。反応が完了したとき、未反応成分を例えば洗浄により除去し、固体表面に固着した複合体を検出する。最初の非固定化成分が検出可能な標識を有している場合、表面に固定化された標識の検出は複合体形成が起こったことを示す。最初の非固定化成分が標識を持たない場合は、複合体形成は、例えば、固定化された複合体に特異的に結合する標識抗体によって検出できる。候補化合物が相互作用するがここに同定した遺伝子にコードされる特定のPROポリペプチに結合しない場合、そのポリペプチドとの相互作用は、タンパク質-タンパク質相互作用を検出するために良く知られた方法によってアッセイすることができる。そのようなアッセイは、架橋、同時免疫沈降、及び勾配又はクロマトグラフィカラムを通す同時精製などの伝統的な手法を含む。さらに、タンパク質-タンパク質相互作用は、Fields及び共同研究者等[Fiels及びSongNature340245246Chien等ProcNatlAcadSciUSA8895789582]に記載された酵母菌ベースの遺伝子系を用いることにより、Chevray及びNathans[ProcNatlAcadSciUSA8957895793]に開示されている酵母菌ベースの系を用いて監視することができる。酵母菌GAL4などの多くの転写活性化剤は、2つの物理的に別個のモジュラードメインからなり、一方はDNA結合ドメインとして作用し、他方は転写活性化ドメインとして機能する。以前の文献に記載された酵母菌発現系一般に2ハイブリッド系と呼ばれるは、この特性の長所を利用して、2つのハイブリッドタンパク質を用い、一方では標的タンパク質がGAL4のDNA結合ドメインに融合し、他方では、候補となる活性化タンパク質が活性化ドメインに融合している。GAL1lacZリポーター遺伝子のGAL4活性化プロモーターの制御下での発現は、タンパク質タンパク質相互作用を介したGAL4活性の再構成に依存する。相互作用するポリペプチドを含むコロニーは、βガラクトシダーゼに対する色素生産性物質で検出される。2ハイブリッド技術を用いた2つの特定なタンパク質間のタンパク質タンパク質相互作用を同定するための完全なキットMATCHMAKERは、Clontechから商業的に入手可能である。この系は、特定のタンパク質相互作用に含まれるタンパク質ドメインのマッピング、並びにこの相互作用にとって重要なアミノ酸残基の特定にも拡張することができる。ここで同定されたPROポリペプチドをコードする遺伝子と細胞内又は細胞外成分との相互作用を阻害する化合物は、次のように試験できる:通常は反応混合物は、遺伝子産物と細胞外又は細胞内成分を、それら2つの生成物が相互作用及び結合する条件下及び時間で含むように調製される。候補化合物が結合を阻害する能力を試験するために、反応は試験化合物の不存在及び存在下で実施される。さらに、プラシーボを第3の反応混合物に添加してポジティブ対照を提供してもよい。混合物中に存在する試験化合物と細胞内又は細胞外成分との結合複合体形成は上記のように監視される。試験化合物を含有する反応混合物ではなく対照反応における複合体の形成は、試験化合物が試験化合物とその結合パートナーとの相互作用を阻害することを示す。アンタゴニストを検定するために、PROポリペプチドを特定の活性についてスクリーニングする化合物とともに添加してよく、PROポリペプチド存在下での対象とする活性を阻害する化合物の能力が化合物がPROポリペプチドのアンタゴニストであることを示す。あるいは、アンタゴニストは、PROポリペプチド及び膜結合PROポリペプチドレセプター又は組換えレセプターを持つ潜在的アンタゴニストを、競合的阻害アッセイに適した条件下で結合させることにより検出してもよい。PROポリペプチドは、放射活性等で標識でき、レセプターに結合したPROポリペプチドの数を潜在的アンタゴニストの有効性を決定するのに使用できる。レセプターをコードする遺伝子は、当業者に知られた多くの方法、例えばリガンドパンニング及びFACSソートにより同定できる。Coligan等CurrentProtocolsinImmun1Chapter5。好ましくは、発現クローニングが用いられ、ポリアデニル化RNAがPROポリペプチドに反応性の細胞から調製され、このRNAから生成されたcDNAライブラリがプールに分配され、COS細胞又はPROポリペプチド反応性でない他の細胞の形質移入に使用される。スライドガラスで成長させた形質移入細胞を標識したPROポリペプチドに暴露する。PROポリペプチドは、ヨウ素化又は部位特異的タンパク質キナーゼの認識部位の包含を含む種々の手段で標識できる。固定及びインキュベーションの後、スライドにオートラジオグラフィ分析を施す。ポジティブプールを同定し、相互作用サブプール化及び再スクリーニング工程を用いてサブプールを調製して再形質移入し、結果的に推定レセプターをコードする単一のクローンを生成する。レセプター同定の代替的方法として、標識下PROポリペプチドをレセプター分子を発現する細胞膜又は抽出調製物に光親和性結合させることができる。架橋材料はPAGEに溶解させ、X線フィルムに暴露する。レセプターを含む標識複合体を励起し、ペプチド断片に分離し、タンパク質マイクロ配列決定を施すことができる。マイクロ配列決定から得たアミノ酸配列は、推定レセプターをコードする遺伝子を同定するcDNAライブラリをスクリーニングする分解性オリゴヌクレオチドプローブの組の設計に用いられる。アンタゴニストの他の検定では、レセプターを発現する哺乳動物細胞又は膜調製物を、候補化合物の存在下で標識PROポリペプチドとともにインキュベートする。次いで、この相互作用を促進又は阻止する化合物の能力を測定する。潜在的なアンタゴニストのより特別な例は、免疫グロブリンとPROポリペプチドとの融合体に結合するオリゴヌクレオチド、特に、限られないが、ポリペプチド及びモノクローナル抗体及び抗体断片、一本鎖抗体、抗イディオタイプ抗体、及びこれらの抗体又は断片のキメラ又はヒト化形態、並びにヒト抗体及び抗体断片を含む抗体を含んでいる。あるいは、潜在的アンタゴニストは、密接に関連したタンパク質、例えば、レセプターを認識するが効果を与えず、従ってPROポリペプチドの作用を競合的に阻害するPROポリペプチドの変異形態であってもよい。他の潜在的なPROポリペプチドアンタゴニストは、アンチセンス技術を用いて調製されたアンチセンスRNA又はDNA作成物であり、例えば、アンチセンスRNA又はDNAは、標的mRNAにハイブリッド形成してタンパク質翻訳を妨害することによりmRNAの翻訳を直接阻止するように作用する。アンチセンス技術は、トリプルへリックス形成又はアンチセンスDNA又はRNAを通して遺伝子発現を制御するのに使用でき、それらの方法はともに、ポリペプチドヌクレオチドのDNA又はRNAへの結合に基づく。例えば、ここでの成熟PROポリペプチドをコードするポリペプチドヌクレオチド配列の5’コード化部分は、約10から40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドの設計に使用される。DNAオリゴヌクレオチドは、転写に含まれる遺伝子の領域に相補的であるように設計されトリプルへリックス-Lee等NuclAcidRes63073Cooney等Science241456Dervan等Science2511360参照、それによりPROポリペプチドの転写及び生成を防止する。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドはインビボでmRNAにハイブリッド形成してmRNA分子のPROポリペプチドへの翻訳を阻止するアンチセンス-OkanoNeurochem56560OligodeoxynucleotidesasAntisenseInhibitorsofGeneExpression。上記のオリゴヌクレオチドは、細胞に輸送され、アンチセンスRNA又はDNAをインビボで発現させて、PROポリペプチドの生産を阻害することもできる。アンチセンスDNAが用いられる場合、翻訳開始部位、例えば標的遺伝子ヌクレオチド配列の-10から10位置の間から誘導されるオリゴデオキシリボヌクレオチドが好ましい。潜在的アンタゴニストは、PROポリペプチドの活性部位、レセプター結合部位、又は成長因子又は他の関連結合部位に結合し、それによりPROポリペプチドの正常な生物学的活性を阻止する小分子を含む。小分子の例は、これらに限られないが、小型ペプチド又はペプチド様分子、好ましくは可溶性ペプチド、及び合成非ペプチド有機又は無機化合物を含む。リボザイムは、RNAの特異的切断を触媒できる酵素的RNA分子である。リボザイムは、相補的標的RNAへの配列特異的ハイブリッド形成、次いでヌクレオチド鎖切断的切断により作用する。潜在的RNA標的内の特異的リボザイム切断部位は、既知の技術で同定できる。更なる詳細は、例えば、RossiCurrentProtocolsinBiology4469471及びPCT公報、番号WO97335511997年9月18日発行を参照。転写阻害に用いられるトリプルヘリックス形成における核酸分子は一本鎖でデオキシヌクレオチドからなる。これらのオリゴヌクレオチドの基本組成は、フーグスチン塩基対則を介するトリプルヘリックス形成を促進するように設計され、それは一般に二重鎖の一方の鎖上のプリン又はピリミジンのサイズ変更可能な伸展を必要とする。さらなる詳細は、例えば、PCT公報、番号WO9733551上掲を参照。これらの小分子は、上記で議論したスクリーニングアッセイの一又は複数の任意のものにより及び/又は当業者に良く知られた他の任意のスクリーニング技術により同定できる。PRO189は、線虫のW01A61、ホスホジエステラーゼ、トランスポーター及び脂肪酸に結合するタンパク質での検定において、これらのタンパク質に対するPRO189の相対的活性を決定するのに使用できる。結果は適宜用いることができる。F.抗PRO抗体本発明は、さらに抗PRO抗体を提供するものである。抗体の例としては、ポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性及びヘテロ抱合体抗体が含まれる。1.ポリクローナル抗体抗PRO抗体はポリクローナル抗体を含む。ポリクローナル抗体の調製方法は当業者に知られている。哺乳動物においてポリクローナル抗体は、例えば免疫化剤、及び所望するのであればアジュバントを、一又は複数回注射することで発生させることができる。典型的には、免疫化剤及び/又はアジュバントを複数回皮下又は腹腔内注射により、哺乳動物に注射する。免疫化剤は、PROポリペプチド又はその融合タンパク質を含みうる。免疫化剤を免疫化された哺乳動物において免疫原性が知られているタンパク質に抱合させるのが有用である。このような免疫原タンパク質の例は、これらに限られないが、キーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン及び大豆トリプシンインヒビターが含まれる。使用され得るアジュバントの例には、フロイント完全アジュバント及びMPLTDMアジュバントが含まれる。免疫化プロトコールは、過度の実験なく当業者により選択されるであろう。2.モノクローナル抗体あるいは、抗PRO抗体はモノクローナル抗体であってもよい。モノクローナル抗体は、Kohler及びMilsteinNature256495に記載されているようなハイブリドーマ法を使用することで調製することができる。ハイブリドーマ法では、マウス、ハムスター又は他の適切な宿主動物を典型的には免疫化剤により免疫化することで、免疫化剤に特異的に結合する抗体を生成するかあるいは生成可能なリンパ球を誘発する。また、リンパ球をインビトロで免疫化することもできる。免疫化剤は、典型的には対象とするPROポリペプチド又はその融合タンパク質を含む。一般にヒト由来の細胞が望まれる場合には末梢血リンパ球が使用され、あるいは非ヒト哺乳動物源が望まれている場合は、脾臓細胞又はリンパ節細胞が使用される。次いで、ポリエチレングリコール等の適当な融合剤を用いてリンパ球を不死化株化細胞と融合させ、ハイブリドーマ細胞を形成する[GodingMonoclonalAntibodiesPrinciplesandPracticeAcademicPresspp59103]。不死化株化細胞は、通常は、形質転換した哺乳動物細胞、特に齧歯動物、ウシ、及びヒト由来の骨髄腫細胞である。通常、ラット又はマウスの骨髄腫株化細胞が使用される。ハイブリドーマ細胞は、好ましくは、未融合の不死化細胞の生存又は成長を阻害する一又は複数の物質を含有する適切な培地で培養される。例えば、親細胞が、酵素のヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼを欠いていると、ハイブリドーマの培地は、典型的には、ヒポキサチン、アミノプチリン及びチミジンを含み、この物質がHGPRT欠乏性細胞の増殖を阻止する。好ましい不死化株化細胞は、効率的に融合し、選択された抗体生成細胞による安定した高レベルの抗体発現を支援し、HAT培地のような培地に対して感受性である。より好ましい不死化株化細胞はマウス骨髄腫株であり、これは例えばカリフォルニア州サンディエゴのSalkInstituteCellDistributionCenterやメリーランド州ロックビルのアメリカンタイプカルチャーコレクションより入手可能である。ヒトモノクローナル抗体を生成するためのヒト骨髄腫及びマウスヒト異種骨髄腫株化細胞も開示されている[KozborJImmunol1333001、Brodeur等MonoclonalAntibodyProductionTechniquesandApplicationsMarcelDekkerIncNewYorkpp5163]。次いでハイブリドーマ細胞が培養される培養培地を、PROに対するモノクローナル抗体の存在について検定する。好ましくは、ハイブリドーマ細胞によって生成されたモノクローナル抗体の結合特異性は免疫沈降又はラジオイムノアッセイや酵素結合免疫測定法等のインビトロ結合検定法によって測定する。このような技術及びアッセイは、当該分野において公知である。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えばMunson及びPollardAnalBiochem107220によるスキャッチャード分析法によって測定することができる。所望のハイブリドーマ細胞が同定された後、クローンを制限希釈工程によりサブクローニングし、標準的な方法で成長させることができる[Goding上掲]。この目的のための適当な培地には、例えば、ダルベッコの改変イーグル培地及びRPMI1640倍地が含まれる。あるいは、ハイブリドーマ細胞は哺乳動物においてインビボで腹水として成長させることもできる。サブクローンによって分泌されたモノクローナル抗体は、例えばプロテインA-セファロース法、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー法、ゲル電気泳動法、透析法又はアフィニティークロマトグラフィー等の従来の免疫グロブリン精製方法によって培養培地又は腹水液から単離又は精製される。また、モノクローナル抗体は、組換えDNA法、例えば米国特許第4816567号に記載された方法により作成することができる。本発明のモノクローナル抗体をコードするDNAは、常套的な方法を用いて、容易に単離し配列決定することができる。本発明のハイブリドーマ細胞はそのようなDNAの好ましい供給源となる。ひとたび単離されたら、DNAは発現ベクター内に配することができ、これが宿主細胞、例えばサルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞、あるいは免疫グロブリンタンパク質を生成等しない骨髄腫細胞内に形質移入され、組換え宿主細胞内でモノクローナル抗体の合成をすることができる。また、DNAは、例えば相同マウス配列に換えてヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインのコード配列を置換することにより[米国特許第4816567号;Morrison等上掲]、又は免疫グロブリンコード配列に非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の一部又は全部を共有結合することにより修飾することができる。このような非免疫グロブリンポリペプチドは、本発明の抗体の定常ドメインに置換でき、あるいは本発明の抗体の1つの抗原結合部位の可変ドメインに置換でき、キメラ性二価抗体を生成する。抗体は一価抗体であってもよい。一価抗体の調製方法は当該分野においてよく知られてる。例えば、一つの方法は免疫グロブリン軽鎖と修飾重鎖の組換え発現を含む。重鎖は一般的に、重鎖の架橋を防止するようにFc領域の任意の点で切断される。あるいは、関連するシステイン残基を他のアミノ酸残基で置換するか欠失させて架橋を防止する。一価抗体の調製にはインビトロ法がまた適している。抗体の消化による、その断片、特にFab断片の生成は、当該分野において知られている慣用的技術を使用して達成できる。3.ヒト及びヒト化抗体本発明の抗PRO抗体は、さらにヒト化抗体又はヒト抗体を含む。非ヒト抗体のヒト化形とは、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖あるいはその断片2あるいは抗体の他の抗原結合サブ配列であって、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含むものである。ヒト化抗体はレシピエントの相補性決定領域の残基が、マウス、ラット又はウサギのような所望の特異性、親和性及び能力を有する非ヒト種のCDRの残基によって置換されたヒト免疫グロブリンを含む。幾つかの例では、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基によって置換されている。また、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも、移入されたCDRもしくはフレームワーク配列にも見出されない残基を含んでいてもよい。一般に、ヒト化抗体は、全てあるいはほとんど全てのCDR領域が非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、全てあるいはほとんど全てのFR領域がヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含む。ヒト化抗体は、最適には免疫グロブリン定常領域、典型的にはヒトの免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部を含んでなる[Jones等Nature321522525Riechmann等Nature332323329及びPrestaCurrOpStructBiol2593596]。非ヒト抗体をヒト化する方法はこの分野でよく知られている。一般的に、ヒト化抗体には非ヒト由来の一又は複数のアミノ酸残基が導入される。これら非ヒトアミノ酸残基は、しばしば、典型的には移入可変ドメインから得られる移入残基と称される。ヒト化は基本的に齧歯動物のCDR又はCDR配列でヒト抗体の該当する配列を置換することによりウィンター及び共同研究者[Jones等Nature321522525;Riechmann等Nature332323327;Verhoeyen等Science23915341536]の方法に従って、齧歯類CDR又はCDR配列をヒト抗体の対応する配列に置換することにより実施される。よって、このようなヒト化抗体は、無傷のヒト可変ドメインより実質的に少ない分が非ヒト種由来の対応する配列で置換されたキメラ抗体である。実際には、ヒト化抗体は典型的には幾つかのCDR残基及び場合によっては幾つかのFR残基が齧歯類抗体の類似する部位からの残基によって置換されたヒト抗体である。また、ヒト抗体は、ファージ表示ライブラリ[Hoogenboom及びWinterJMolBiol227381;Marks等JMolBiol222581]を含むこの分野で知られた種々の方法を用いて作成することもできる。また、Cole等及びBoerner等の方法も、ヒトモノクローナル抗体の調製に利用することができる[Cole等MonoclonalAntibodiesandCancerTherapyAlanRLissp77及びBoerner等JImmunol147:8695]。同様に、ヒト抗体はヒト免疫グロブリン座位をトランスジェニック動物、例えば内在性免疫グロブリン遺伝子は部分的又は完全に不活性化されたマウスに導入することにより産生することができる。投与の際に、遺伝子再配列、組立、及び抗体レパートリーを含むあらゆる観点においてヒトに見られるものに非常に類似しているヒト抗体の生産が観察される。このアプローチは、例えば米国特許第5545807号;同第5545806号;同第5569825号;同第5625126号;同第5633425号;同第5661016号、及び次の科学文献:Marks等BioTechnology10779783Lonberg等Nature368856859MorrisonNature36881213Fishwild等NatureBiotechnology1484551NeubergerNatureBiotechnology14826Lonberg及びHuszarInternRevImmunol136593に記載されている。4.二重特異性抗体二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる抗原に対して結合特異性を有するモノクローナル抗体、好ましくはヒトもしくはヒト化抗体である。本発明の場合において、結合特異性の一方はPROに対してであり、他方は任意の他の抗原、好ましくは細胞表面タンパク質又はレセプター又はレセプターサブユニットに対してである。二重特異性抗体を作成する方法は当該技術分野において周知である。伝統的には、二重特異性抗体の組換え生産は、二つの重鎖が異なる特異性を持つ二つの免疫グロブリン重鎖/軽鎖対の同時発現に基づく[Milstein及びCuelloNature305537539]。免疫グロブリンの重鎖と軽鎖を無作為に取り揃えるため、これらハイブリドーマは10種の異なる抗体分子の潜在的混合物を生成し、その内一種のみが正しい二重特異性構造を有する。正しい分子の精製は、アフィニティークロマトグラフィー工程によって通常達成される。同様の手順が1993年5月13日公開のWO9308829、及びTraunecker等EMBOJ1036553656に開示されている。所望の結合特異性を有する抗体可変ドメインを免疫グロブリン定常ドメイン配列に融合できる。融合は、好ましくは少なくともヒンジ部、CH2及びCH3領域の一部を含む免疫グロブリン重鎖定常ドメインとのものである。少なくとも一つの融合には軽鎖結合に必要な部位を含む第一の重鎖定常領域が存在することが望ましい。免疫グロブリン重鎖融合をコードするDNA、及び望むのであれば免疫グロブリン軽鎖を、別々の発現ベクターに挿入し、適当な宿主生物に同時形質移入する。二重特異性抗体を作成するための更なる詳細については、例えばSuresh等MethodsinEnzymology121210を参照されたい。WO9627011に記載された他の方法によれば、一対の抗体分子間の界面を操作して組換え細胞培養から回収される異種二量体の割合を最大にすることができる。好適な界面は抗体定常ドメインのCH3領域の少なくとも一部を含む。この方法では、第1抗体分子の界面からの一又は複数の小さいアミノ酸側鎖がより大きな側鎖と置き換えられる。大きな側鎖と同じ又は類似のサイズの相補的キャビティを、大きなアミノ酸側鎖を小さいものと置き換えることにより第2の抗体分子の界面に作り出す。これにより、ホモダイマーのような不要の他の最終産物に対してヘテロダイマーの収量を増大させるメカニズムが提供される。二重特異性抗体は、全長抗体又は抗体断片例えば、F2二重特異性抗体として調製できる。抗体断片から二重特異性抗体を産生する技術もまた文献に記載されている。例えば、化学結合を使用して二重特異性抗体を調製することができる。Brennan等Science22981は無傷の抗体をタンパク分解性に切断してF2断片を産生する手順を記述している。これらの断片は、ジチオール錯体形成剤亜砒酸ナトリウムの存在下で還元して近接ジチオールを安定化させ、分子間ジスルフィド形成を防止する。産生されたFab断片はついでチオニトロベンゾアート誘導体に転換される。FabTNB誘導体の一つをついでメルカプトエチルアミンでの還元によりFabチオールに再転換し、他のFabTNB誘導体の等モル量と混合して二重特異性抗体を形成する。作られた二重特異性抗体は酵素の選択的固定化用の薬剤として使用することができる。大腸菌からFabフラグメントを直接回収でき、これは化学的に結合して二重特異性抗体を形成することができる。Shalaby等JExpMed175217225は完全にヒト化された二重特異性抗体F2分子の製造を記述している。各Fabフラグメントは大腸菌から別個に分泌され、インビトロで定方向化学共役を受けて二重特異性抗体を形成する。このようにして形成された二重特異性抗体は、正常なヒトT細胞及びErbB2レセプターを過剰発現する細胞に結合可能で、ヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞障害性リンパ球の細胞溶解活性の誘因となる。組換え細胞培養から直接的に二重特異性抗体断片を作成し分離する様々な方法もまた記述されている。例えば、二重特異性抗体はロイシンジッパーを使用して生産されている。KostelnyらJImmunol14815471553。Fos及びJunタンパク質からのロイシンジッパーペプチドを遺伝子融合により二つの異なった抗体のFab部分に結合させる。抗体ホモダイマーをヒンジ領域で還元してモノマーを形成し、ついで再酸化して抗体ヘテロダイマーを形成する。この方法はまた抗体ホモダイマーの生産に対して使用することができる。HollingerらProcNatlAcadSciUSA9064446448により記述されたダイアボディ技術は二重特異性抗体断片を作成する別のメカニズムを提供した。断片は、同一鎖上の2つのドメイン間の対形成を可能にするには十分に短いリンカーにより軽鎖可変ドメインに重鎖可変ドメインを結合してなる。従って、一つの断片のVH及びVLドメインは他の断片の相補的VL及びVHドメインと強制的に対形成させられ、2つの抗原結合部位を形成する。単鎖Fvダイマーの使用により二重特異性抗体断片を製造する他の方策もまた報告されている。GruberらJImmunol1525368を参照されたい。二価より多い抗体も考えられる。例えば、三重特異性抗体を調製することができる。TuttらJImmunol14760。例示的な二重特異性抗体は、ここに与えられたPROポリペプチドの2つの異なるエピトープに結合しうる。あるいは、抗PROポリペプチドのアームは、特定のPROポリペプチド発現細胞に細胞防御メカニズムを集中させるように、T細胞レセプター分子等の白血球上のトリガー分子又はFcγRI、FcγRII及びFcγRIII等のIgGに対するFcレセプターに結合するアームと結合しうる。また、二重特異性抗体は特定のPROポリペプチドを発現する細胞に細胞毒性薬を局在化させるためにも使用されうる。これらの抗体はPRO結合アーム及び細胞毒性薬又は放射性キレート化剤、例えばEOTUBE、DPTA、DOTA、又はTETAと結合するアームを有する。興味の対象となる他の二重特異性抗体はPROポリペプチドに結合し、そしてさらに組織因子TFに結合する。5.ヘテロ抱合体抗体ヘテロ抱合抗体もまた本発明の範囲に入る。ヘテロ抱合抗体は、2つの共有結合した抗体からなる。このような抗体は、例えば、免疫系細胞を不要な細胞に対してターゲティングさせるため[米国特許第4676980号]及びHIV感染の治療のために[WO9100360WO92200373EP03089]提案されている。この抗体は、架橋剤に関連したものを含む合成タンパク化学における既知の方法を使用して、インビトロで調製することができると考えられる。例えば、ジスルフィド交換反応を使用するか又はチオエーテル結合を形成することにより、免疫毒素を作成することができる。この目的に対して好適な試薬の例には、イミノチオレート及びメチル4メルカプトブチリミデート、及び例えば米国特許第46767980号に開示されているものが含まれる。6.エフェクター機能の加工本発明の抗体をエフェクター機能について改変し、例えば癌治療における抗体の有効性を向上させるのが望ましい。例えば、システイン残基をFc領域に導入し、それにより、この領域に鎖間ジスルフィド結合を形成させるようにしてもよい。そのようにして生成された同種二量体抗体は、向上した内部移行能力及び/又は増加した補体媒介細胞殺傷及び抗体依存性細胞性細胞毒性ADCCを有しうる。Caron等JExpMed17611911195及びShopesBJImmunol14829182922参照。向上した抗腫瘍活性を持つ同種二量体抗体はまた、Wolff等Cancerresearch5325602565に記載されたような異種二官能性架橋を用いても調製しうる。あるいは、抗体は、2つのFc領域を有するように加工して、それにより補体溶解及びADCC能力を向上させることもできる。Stevenson等AntiCancerDrugDesign3219230参照。7.免疫複合体本発明はまた、化学治療薬、毒素例えば、細菌、真菌、植物又は動物由来の酵素活性毒素、又はその断片などの細胞毒性薬、あるいは放射性同位体即ち、放射性抱合に抱合された抗体を含む免疫複合体にも関する。このような免疫複合体の生成に有用な化学治療薬は上記した。用いることのできる酵素活性毒素及びその断片は、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性断片、緑膿菌からの外毒素A鎖、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデクシンA鎖、アルファサルシン、アレウリテスフォーディタンパク質、ジアンチンタンパク質、フィトラカアメリカーナタンパク質PAPI、PAPII、及びPAPS、モモルディカチャランチアインヒビター、クルシン、クロチン、サパオナリアオフィシナリスインヒビター、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコテセンを含む。様々な放射性ヌクレオチドが放射性抱合抗体の生成に利用可能である。例として、212Bi、131I、131In、90Y及び186Reを含む。抗体及び細胞毒性薬の複合体は、種々の二官能性タンパク質カップリング剤、例えば、Nスクシンイミジル3プロピオネートSPDP、イミノチオランIT、イミドエステルの二官能性誘導体ジメチルアジピミデートHCL等、活性エステルジスクシンイミジルスベレート等、アルデヒドグルタルアルデヒド等、ビスアジド化合物ビスヘキサンジアミン等、ビスジアゾニウム誘導体ビスエチレンジアミン等、ジイソシアネートトリエン2,6ジイソシアネート等、及びビス活性フッ素化合物1,5ジフルオロ2,4ジニトロベンゼン等を用いて作成できる。例えば、リシン免疫毒素は、Vitetta等Science2381098に記載されたように調製することができる。カーボン14標識1イソチオシアナトベンジル3メチルジエチレントリアミン五酢酸MXDTPAは、放射性ヌクレオチドの抗体への抱合のためのキレート剤の例である。WO9411026参照。他の実施態様では、腫瘍の予備標的化で使用するために、抗体はレセプターストレプトアビジン等に抱合されてもよく、抗体レセプター複合体は患者に投与され、次いで清澄化剤を用いて未結合複合体を循環から除去し、次に細胞毒性薬例えば、放射性ヌクレオチド等に抱合されたリガンドアビジン等を投与する。8.免疫リポソームまた、ここに開示する抗体は、免疫リポソームとして調製してもよい。抗体を含むリポソームは、Epstein等ProcNatlacadSciUSA823688Hwang等ProcnatlAcadSciUSA774030及び米国特許第4485045号及び第4544545号に記載されたような、この分野で知られた方法で調製される。向上した循環時間を持つリポソームは、米国特許第5013556号に開示されている。特に有用なリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロール及びPEG誘導ホスファチジルエタノールアミンPEGPEを含む脂質組成物での逆相蒸発法によって生成される。リポソームは、所定サイズのフィルターを通して押し出され、所望の径を有するリポソームが生成される。本発明の抗体のFab’断片は、Martin等JBiolChem257286288に記載されているように、ジスルフィド交換反応を介してリポソームに抱合され得る。化学治療薬ドキソルビシン等は、場合によってはリポソーム内に包含される。Gabizon等JNationalCancerInst811484参照。9.抗体の製薬組成物ここで同定されるPROポリペプチドに特異的に結合する抗体、並びに上記に開示したスクリーニングアッセイで同定された他の分子は、種々の疾患の治療のために、製薬組成物の形態で投与することができる。PROポリペプチドが細胞内であり、全抗体が阻害剤として用いられる場合、内在化抗体が好ましい。しかし、リポフェクション又はリポソームも抗体、又は抗体断片を細胞に導入するのに使用できる。抗体断片が用いられる場合、標的タンパク質の結合ドメインに特異的に結合する最小阻害断片が好ましい。例えば、抗体の可変領域配列に基づいて、標的タンパク質配列に結合する能力を保持したペプチド分子が設計できる。このようなペプチドは、化学的に合成でき、又は組換えDNA技術によって生成できる。例えば、Marasco等ProcNatlAcadSciUSA9078897893参照。ここでの製剤は、治療すべき特定の徴候に必要な場合に1以上の活性化合物、好ましくは互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を持つものも含んでよい。あるいは、又はそれに加えて、組成物は、細胞毒性薬、サイトカイン又は成長阻害剤を含んでもよい。これらの分子は、適切には、意図する目的に有効な量の組み合わせで存在する。また、活性成分は、例えばコアセルベーション技術により又は界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えば、各々ヒドロキシメチルセルロース又はゼラチンマイクロカプセル及びポリメタクリル酸メチルマイクロカプセル中、コロイド状薬物送達系例えば、リポソーム、アルブミン小球、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル中、又はマイクロエマルション中に包括されていてもよい。これらの技術は、RemingtonsPharmaceuticalScience上掲に開示されている。インビボ投与に使用される製剤は無菌でなけらばならない。これは、滅菌濾過膜を通した濾過により容易に達成される。徐放性製剤を調製してもよい。徐放性製剤の好適な例は、抗体を含有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリクスを含み、このマトリクスは成形された物品、例えばフィルム、又はマイクロカプセルの形状である。除放性マトリクスの例は、ポリエステルヒドロゲル例えば、ポリ又はポリ乳酸グリコール酸コポリマーと酢酸リュープロリドの注射可能な小球などの分解性乳酸グリコール酸コポリマー、ポリ3ヒドロキシブチル酸を含む。エチレン酢酸ビニル及び乳酸グリコール酸などのポリマーは分子を100日に渡って放出することができるが、ある種のヒドロゲルはより短時間でタンパク質を放出してしまう。カプセル化された抗体が身体内に長時間残ると、それらは37°Cの水分に露出されることにより変性又は凝集し、その結果、生物学的活性の低下及び起こりうる免疫原性の変化をもたらす。合理的な方法は、含まれる機構に依存する安定化について工夫することができる。例えば、凝集機構がチオ-ジスルフィド交換を通した分子間S-S結合形成であると発見された場合、安定化はスルフヒドリル残基の修飾、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含有量の制御、適切な添加剤の付加、及び特異的ポリマーマトリクス組成物の開発によって達成されうる。G.抗PRO抗体の用途本発明の抗PRO抗体は様々な有用性を有している。例えば、抗PRO抗体は、PROの診断アッセイ、例えばその特定細胞、組織、又は血清での発現の検出に用いられる。競合的結合アッセイ、直接又は間接サンドウィッチアッセイ及び不均一又は均一相で行われる免疫沈降アッセイ[ZolaMonoclonalAntibodiesAManualofTechniquesCRCPressIncpp147158]等のこの分野で知られた種々の診断アッセイ技術が使用される。診断アッセイで用いられる抗体は、検出可能な部位で標識される。検出可能な部位は、直接又は間接に、検出可能なシグナルを発生しなければならない。例えば、検出可能な部位は、3H、14C、32P、35S又は125I等の放射性同位体、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン又はルシフェリン等の蛍光又は化学発光化合物、あるいはアルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼ又はセイヨウワサビペルオキシダーゼ等の酵素であってよい。抗体に検出可能な部位を抱合させるためにこの分野で知られた任意の方法が用いられ、それにはHunter等Nature144945;David等Biochemistry131014;Pain等JImmunolMeth40219及びNygrenJHistochemandCytochem30407に記載された方法が含まれる。また、抗PRO抗体は組換え細胞培養又は天然供給源からのPROのアフィニティー精製にも有用である。この方法においては、PROに対する抗体を、当該分野でよく知られている方法を使用して、セファデックス樹脂や濾紙のような適当な支持体に固定化する。次に、固定化された抗体を、精製するPROを含む試料と接触させた後、固定化された抗体に結合したPRO以外の試料中の物質を実質的に全て除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に、PROを抗体から脱離させる他の適当な溶媒で支持体を洗浄する。以下に、PRO1186ポリペプチドの好ましい実施態様について記載する。1.ポリペプチドに特異的に結合して該ポリペプチドの副腎皮質毛細管内皮細胞成長を刺激する能力を阻害する抗体を含む、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤であって、前記ポリペプチドは、図266配列番号:371に示されるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、ATCC受託番号203091で寄託された核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、のいずれかである、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤。2.上記2に記載の成長阻害剤において、前記抗体はモノクローナル抗体である、成長阻害剤。3.上記1又は2記載の成長阻害剤において、前記抗体はヒト化抗体である、成長阻害剤。4.ポリペプチドに特異的に結合して該ポリペプチドの副腎皮質毛細管内皮細胞成長を刺激する能力を阻害する抗体フラグメントを含む、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤であって、前記ポリペプチドは、図266配列番号:371に示されるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、ATCC受託番号203091で寄託された核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、のいずれかである、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤。5.上記4記載の成長阻害剤において、前記抗体フラグメントは、モノクローナル抗体フラグメントである、成長阻害剤。6.上記4または5記載の成長阻害剤において、前記抗体フラグメントは、ヒト化抗体フラグメントである、成長阻害剤。7.ポリペプチドに特異的に結合して該ポリペプチドの副腎皮質毛細管内皮細胞成長を刺激する能力を阻害するアンタゴニストを含む、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤であって、前記ポリペプチドは、図266配列番号:371に示されるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、ATCC受託番号203091で寄託された核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を備え、さらにシグナルペプチドを伴う、または伴わないか、のいずれかである、副腎皮質毛細管内皮細胞の成長阻害剤。以下の実施例は例示するためにのみ提供されるものであって、本発明の範囲を決して限定することを意図するものではない。本明細書で引用した全ての特許及び参考文献の全体を、出典明示によりここに取り込む。実施例で言及されている全ての市販試薬は、特に示さない限りは製造者の使用説明に従い使用した。ATCC登録番号により以下の実施例及び明細書全体を通して特定されている細胞の供給源はアメリカンタイプカルチャーコレクション、マナッサス、VAである。実施例1:新規なポリペプチド及びそれをコードするcDNAを同定するための細胞外ドメイン相同性スクリーニングSwissProt公的データベースからの約950の公知の分泌タンパク質からの細胞外ドメインECD配列必要ならば、分泌シグナル配列を含むを、ESTデータベースの検索に使用した。ESTデータベースは、公的データベース例えば、Dayhoff、GenBank及び独自に開発したデータベース例えば、LIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて、ECDタンパク質配列のEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。公知のタンパク質をコードせず、Blastスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWAで集団化してコンセンサスDNA配列に構築した。この細胞外ドメイン相同性スクリーニングを用いて、phrapを用いて他の同定されたEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。さらに、得られたコンセンサスDNA配列を、しばしば全てではないBLAST又はBLAST2及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長し、コンセンサス配列を上で議論したEST配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。上記のように得られたコンセンサス配列に基づいて、次いでオリゴヌクレオチドを合成し、PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及びPROポリペプチドの全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして用いるために使用した。正方向及び逆方向PCRプライマーは一般的に20から30ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約100-1000bp長のPCR産物を与えるために設計される。プローブ配列は、典型的に40-55bp長である。或る場合には、コンセンサス配列が約1-1.5kbpより大きいときに付加的なオリゴヌクレオチドが合成される。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCRによりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAクローンの単離に用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法によって作成した。cDNAは、NotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、そして適切なクローニングベクターpRKB又はpRK5D等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRKDの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXhoI及びNotI部位において、所定の方向でクローニングした。実施例2:アミラーゼスクリーニングによるcDNAクローンの単離1.オリゴdTプライムcDNAライブラリの調製mRNAを対象とするヒト組織からInvitrogenSanDiegoCAからの試薬及びプロトコールを用いて単離したFastTrack2。このRNAを、LifeTechnologiesGaithersburgMDからの試薬及びプロトコールを用いるベクターpRK5DにおけるオリゴdTプライムしたcDNAの生成に使用した。この方法において、二本鎖cDNAは1000bpを越えるサイズ分類し、SalI/NotI結合cDNAをXhoI/NotI切断ベクターにクローニングした。pRK5Dを、sp6転写開始部位、それに続くSfiI制限酵素部位、さらにXhiI/NotIcDNAクローニング部位を持つベクターにクローニングした。2.ランダムプライムcDNAライブラリの調製一次cDNAクローンの5’末端を好ましく表現するために二次cDNAライブラリを作成した。Sp6RNAを上記の一次ライブラリから生成し、このRNAを、ベクターpSSTAMY.0におけるLifeTechnologiesからの試薬及びプロトコールを用いたランダムプライムしたcDNAライブラリの生成に使用した。この方法において、二本鎖cDNAを500-1000bpにサイズ分類し、平滑末端でNotIアダプターに結合させ、SfiI部位で切断し、そしてSfiI/NotI切断ベクターにクローニングした。pSSTAMY.0は、cDNAクローニング部位の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモータ、及びクローニング部位の後にマウスアミラーゼ配列分泌シグナルを持たない成熟配列に次いでアルコールデヒドロゲナーゼ転写終結区を有するクローニングベクターである。即ち、アミラーゼ配列でフレームに融合するこのベクターにクローニングされたcDNAは、適当に形質移入された酵母コロニーからのアミラーゼの分泌を導くであろう。3.形質転換及び検出上記2パラグラフに記載したライブラリからのDNAを氷上で冷却し、それにエレクトロコンピテントDH10B細菌LifeTechnoligies、20mlを添加した。細菌及びベクターの混合物は、次いで製造者に推奨されているように電気穿孔た。次いで、SOC培地LifeTechnplogies、1mlを添加し、この混合物を37°Cで30分間インキュベートした。形質転換体は、次いでアンピシリンを含む20標準150mmLBプレートに蒔き、16時間インキュベートした37°C。ポジティブコロニーをプレートから廃棄し、細菌ペレットから標準的な方法、例えばCsCl勾配を用いてDNAを単離した。精製DNAは、次いで以下の酵母プロトコールにのせた。酵母方法は3つの範疇に分けられる:1酵母のプラスミド/cDNA結合ベクターでの形質転換;2アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出及び単離;及び3酵母コロニーから直接的な挿入物のPCR増幅及び配列決定及びさらなる分析のためのDNAの精製。用いた酵母菌株はHD565AATCC90785であった。この株は以下の遺伝子型:MATアルファ、ura352、leu23、leu2112、his311、his315、MAL、SUC、GALを有する。好ましくは、不完全な翻訳後経路を持つ酵母変異体を用いることができるが、。このような変異体は、sec71、sec72、sec62に転位不全対立遺伝子を持つが、切断されたsec71が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な操作を阻害するアンタゴニストアンチセンスヌクレオチド及び/又はリガンドを含む、この翻訳後経路に含まれる他のタンパク質例えば、SEC61p、SEC72p、SEC62p、SEC63p、TDJ1p、SSA1p4p又はこれらのタンパク質の複合体形成も、アミラーゼ発現酵母と組み合わせて好ましく用いられる。形質転換は、Gietz等NuclAcidRes201425に概略が記されたプロトコールに基づいて実施された。形質転換細胞は、次いで寒天からYEPD複合培地ブロス100mlに播種し、30°Cで終夜成長させた。YEPDブロスは、Kaiser等MethodsinYeastGeneticsColdSpringHarborPressColdSpringHarborNYp207に記載されているように調製した。終夜培地は、次いで新鮮なYEPDブロス500ml中におよそ2x106細胞/ml約OD600=0.1に希釈し、1x107細胞/ml約OD600=0.4-0.5まで再成長させた。次いで細胞を収穫し、5000rpmで5分間のSorvalGS3ローターのGS3ローターボトルに移し、上清を捨て、次いで無菌水に再懸濁することにより形質転換のために調製し、そして50mlのファルコン管内で、BeckmanGS6KR遠心機において3500rpmで再度遠心分離した。上清を捨て、細胞をLiAc/TE10ml10mMのトリスHCl1mMのEDTApH75100mMのLi2OOCCH3で続けて洗浄し、LiAc/TE25ml中に再懸濁させた。形質転換は、マイクロチューブ内で、調製した細胞100μlを新鮮な変性一本鎖サケ精子DNALofstrandLabsGaitherburgMD及び形質転換DNA1μgvol<10μlと混合することにより起こした。混合物はボルテックスにより簡単に混合し、次いで40PEG/TE600μl40のポリエチレングリコール400010mMのトリスHCl1mMのEDTA100mMのLiOOCCH3pH75を添加した。この混合物を緩く撹拌し、30°Cで撹拌しながら30分間インキュベートした。次いで細胞に42°Cで15分間熱衝撃を与え、反応容器をミクロチューブ内で12000rpmで510秒間遠心分離し、デカント及びTE500μl10mMのトリスHCl1mMのEDTApH75への再懸濁に次いで遠心分離した。次いで、細胞をTE1ml中に希釈し、アリコート200μlを150mm成長プレートVWRに予め調製した選択培地に拡げた。あるいは、複数の少量反応ではなく、形質転換を1回の大規模反応で実施したが、試薬の量はしかるべくスケールアップした。用いた選択培地は、Kaiser等MethodsinYeastGeneticsColdSpringHarborpressColdSpringHarborNYp208210に記載されているように調製したウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天SCDUraであった。形質転換体は30°Cで2-3日成長させた。アミラーゼを分泌するコロニーの検出は、選択成長培地における赤色デンプンの包含により実施した。Biely等AnalBiochem172176179に記載された方法に従って、デンプンを赤色染料反応性Red120Sigmaに結合させた。結合したデンプンをSCDUra寒天プレートに最終濃度015wvで導入し、リン酸カリウムでpH7.0に緩衝した最終濃度50100mM。ポジティブコロニーを拾って新鮮な選択培地150mmプレートに画線し、良好に単離され同定可能な単一コロニーを得た。アミラーゼ分泌についてポジティブな良好に単離されたコロニーは、緩衝SCDUra寒天への赤色団分の直接導入により検出した。ポジティブコロニーは、デンプンを分解して、ポジティブコロニーの周囲に直接目視できる暈を形成する能力により決定した。4.PCR増幅によるDNAの単離ポジティブコロニーが単離された場合、その一部を楊枝で拾い、96ウェルプレートにおいて無菌水30μlに希釈した。この時点で、ポジティブコロニーは凍結して次の分析のために保存するか、即座に増幅するかのいずれかである。細胞のアリコート5μlを、05μlのKlentaqClontechPaloAltoCA40μlの10mMdNTPPerkinElmerCetus25μlのKentaqバッファー025μlの正方向オリゴ1;025μlの逆方向オリゴ2;125μlの蒸留水を含有する25μl容量におけるPCR反応のテンプレートとして使用した。正方向オリゴヌクレオチド1の配列は:5TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT3配列番号:3であった。逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:5CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT3配列番号:4であった。次いで、PCRは以下の通り実施した:a.変性92°C、5分間b.次の3サイクル変性92°C、30秒間アニール59°C、30秒間伸長72°C、60秒間c.次の3サイクル変性92°C、30秒間アニール57°C、30秒間伸長72°C、60秒間d.次の25サイクル変性92°C、30秒間アニール55°C、30秒間伸長72°C、60秒間e.保持4°C下線を施した領域は、各々ADHプロモーター領域及びアミラーゼ領域にアニーリングされ、挿入物が存在しない場合はベクターpSSTAMY.0からの307bp領域を増幅する。典型的には、これらのオリゴヌクレオチドの5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列プライマーのアニーリング部位を含んでいた。即ち、空のベクターからのPCR反応の全生成物は343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列をもたらした。PCRに続いて、反応のアリコート5μlを、上掲のSambrook等に記載されたように1アガロースゲル中でトリスボレーとEDTATBE緩衝系を用いたアガローススゲル電気泳動により試験した。400bpより大きな単一で強いPCR産物をもたらすクローンを、96QiaquickPCR清浄化カラムQuagenIncCharsworthCAでの精製の後にDNA配列によりさらに分析した。実施例3:シグナルアルゴリズム分析を用いたcDNAクローンの単離種々のポリペプチドコード化核酸配列は、ジェネンテク,インクSouthSanFranciscoCAによって開発された独自の配列発見アルゴリズムを、公的例えば、GenBank及び/又は個人的LIFESEQIncytePharmaceuticalsIncPaloAltoCAデータベースからのESTs並びに集団化及び組み立てられたEST断片に適用することにより同定した。シグナル配列アルゴリズムは、考慮している配列又は配列断片の5末端の第1の、場合によっては第2のメチオニンコドンATGを取り囲むDNAヌクレオチドの文字に基づく分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGに続くヌクレオチドは、停止コドンを持たない少なくとも35の不明瞭でないアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが必要なアミノ酸を有する場合、第2のものは試験しない。何れも要件を満たさない場合、候補配列にスコアをつけなかった。EST配列が真正のシグナル配列を含むか否かを決定するために、ATGコドンを取り囲むDNA及び対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られた7つのセンサー評価パラメータの組を用いてスコアをつけた。このアルゴリズムの使用により、多くのポリペプチドコード化核酸配列の同定がなされた。実施例4:ヒトPRO281をコードするcDNAクローンの単離PRO281をコードするcDNAクローンを得るために、Klein等ProcNatlAcadSci9371087113に記載された方法に以下の修正を加えて用いた。酵母形質転換は、多重形質転換された酵母細胞の数を減少させるために制限された量の形質転換DNAで実施した。上掲のKlein等に記載されたような酵母からのプラスミドの単離に続く大腸菌の形質転換ではなく、PCR分析を単一の酵母菌コロニーに実施した。用いたPCRプライマーは、挿入物及びインベルターゼ遺伝子の小部分を増幅挿入物がインベルターゼを持つ枠内であることを決定するため、そして全配列プライマー部位を付加するために二連とした。インベルターゼライブラリを酵母に形質転換し、スクロースプレート上でポジティブを選択した。ポジティブクローンを再試験し、PCR産物を配列決定した。一つのクローン、PRO281が単一のシグナルペプチドコード化配列を含むと同定した。PRO281のヌクレオチド配列を用いてオリゴヌクレオチドプライマー及びプローブを設計した。ヒト臍静脈上皮組織からのcDNAの全長プラスミドライブラリを滴定し、約100000cfuを96ウェルの丸底プレートに、500cfuプールの192プール中で蒔いた。プレートを密閉し、プールを振盪200rpmさせながら37°Cで終夜成長させた。アガロースゲル電気泳動を実施し、ポジティブウェルを予測されるサイズのバンドを可視化することにより同定した。個々のポジティブクローンは、コロニーリフトに続く32P標識オリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成により得た。これらのクローンを、PCR、制限消化、及びサザンブロット分析で特徴付けした。全長クローンは、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置80-82に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1115-1117に停止シグナルを持つと同定された図1;配列番号:1。予測されるポリペプチド前駆体は345アミノ酸長であり、約37,205の計算された分子量及び約10.15の見積もられたpIを有する。図2配列番号:2に示した全長PRO281の分析は、以下のものの存在を明らかにした:アミノ酸約1~アミノ酸約14のシグナルペプチド、アミノ酸位置約83~アミノ酸位置約105、アミノ酸位置約126~アミノ酸位置約146、アミノ酸位置約158~アミノ酸位置約177、アミノ酸位置約197~アミノ酸位置約216、アミノ酸位置約218~アミノ酸位置約238、アミノ酸位置約245~アミノ酸位置約265、及びアミノ酸位置約271~アミノ酸位置約290の多重膜貫通ドメイン、及びアミノ酸約115~アミノ酸約155のGタンパク質結合レセプタータンパク質に相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンUNQ224DNA16422-1209は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209929が付与されている。図2配列番号:2に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO281アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、H64634AF0330951B64815YBHLECOLIEMEQUTR1AF0647633S53708A69253AF03541312及びS63281との間の有意な相同性が明らかになった。実施例5:ヒトPRO276をコードするcDNAクローンの単離PRO276をコードするcDNAクローンを得るために、Klein等PNAS9371087113に記載された方法に以下の修正を加えて用いた。酵母形質転換は、多重形質転換された酵母細胞の数を減少させるために制限された量の形質転換DNAで実施した。上掲のKlein等に記載されたような酵母からのプラスミドの単離に続く大腸菌の形質転換ではなく、PCR分析を単一の酵母菌コロニーに実施した。用いたPCRプライマーは、挿入物及びインベルターゼ遺伝子の小部分を増幅挿入物がインベルターゼを持つ枠内であることを決定するため、そして全配列プライマー部位を付加するために二連とした。インベルターゼライブラリを酵母に形質転換し、スクロースプレート上でポジティブを選択した。ポジティブクローンを再試験し、PCR産物を配列決定した。一つのクローン、PRO276が単一のシグナルペプチドコード化配列を含むと同定した。PRO276のヌクレオチド配列を用いてオリゴヌクレオチドプライマー及びプローブを設計した。ヒト臍静脈上皮組織からのcDNAの全長プラスミドライブラリを滴定し、約100000cfuを96ウェルの丸底プレートに、500cfuプールの192プール中で蒔いた。プレートを密閉し、プールを振盪200rpmさせながら37°Cで終夜成長させた。アガロースゲル電気泳動を実施し、ポジティブウェルを予測されるサイズのバンドを可視化することにより同定した。個々のポジティブクローンは、コロニーリフトに続く32P標識オリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成により得た。これらのクローンを、PCR、制限消化、及びサザンブロット分析で特徴付けした。全長クローンは、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置180-182に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置933-935に停止シグナルを持つと同定された図3;配列番号:5。予測されるポリペプチド前駆体は251アミノ酸長であり、約28,801の計算された分子量及び約9.58の見積もられたpIを有する。膜貫通ドメインは、およそ図4配列番号:6に示したアミノ酸98~116及び152~172にある。クローンDNA16435-1208UNQ243はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209930が付与されている。図4配列番号:6に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO276アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、CEG25D72ATT8O52S69696GRHRRATNPCBAABCD3AB0131491PR85942及びAP0000065との間の或る程度の配列同一性が明らかになった。実施例6:ヒトPRO189をコードするcDNAクローンの単離上記実施例2に記載したように、ヒト網膜組織ライブラリからここでDNA14187と命名されるクローンを単離した。DNA14187配列を図7配列番号:9に示す。図7配列番号:9に示したDNA14187配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO189の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。正方向及び逆方向PCRプライマーは一般的に20から30ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約100-1000bp長のPCR産物を与えるために設計される。プローブ配列は、典型的に40-55bp長である。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5TTGACCTATACAGAGATTCATC3配列番号:10逆方向PCRプライマー5CTAAGAACTTCCCTCAGGATTTT3配列番号:11さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA14187配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5ATGAAGATCAATTTCAAGAAGCATGCACTTCTCCTCTTGC3配列番号:12全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO189遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト網膜組織LIB94から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCaからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO189の全長DNA配列及びPRO189の誘導タンパク質配列を与えた。DNA21624-1391の全核酸配列を図5配列番号:7に示す。クローンDNA21624-1391は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置200-202に見かけの翻訳開始部位そしてヌクレオチド位置1301-1303の停止コドンで終端する図5。予測されるポリペプチド前駆体は367アミノ酸長である図6。図6に示した全長PRO189タンパク質は約41,871ダルトンの見積もられた分子量及び約5.06のpIを有する。クローンDNA21624-1391はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:8のアミノ酸配列の分析により、推定Nグリコシル化部位は約アミノ酸224-227、246-249及び285-288である。サイトソル脂肪酸結合タンパク質は配列番号:8のアミノ酸78-107である。対応するヌクレオチドは、ここに提供される配列が与えられれば日常的に決定できる。Dayhoffデータベースにおいて各々CEW01A610及びCELF35D1111と称される線虫タンパク質、W01A61およびF35D1111に対して或る程度の配列同一性が見られた。また、Dayhoffデータベースで各々PR05766及びAF014121と称されるマラリア及びレスチンの抗原に対しても或る程度の配列同一性が見られた。また、Dayhoffデータベースで各々AF0413821及びS07537と称される微小管結合タンパク質及びミオシンに対しても或る程度の配列同一性が見られた。また、PIP1RATと称される1ホスファチジリノシトール4,5ビスホスフェートに対しても或る程度の配列同一性がある。実施例7:ヒトPRO190をコードするcDNAクローンの単離上記実施例2に記載したように、ヒト網膜組織ライブラリからここでDNA14232と命名されるクローンを単離した。DNA14232配列を図10配列番号:15に示す。DNA14232配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO190の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。正方向及び逆方向PCRプライマーは一般的に20から30ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約100-1000bp長のPCR産物を与えるために設計される。プローブ配列は、典型的に40-55bp長である。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5CTATACCTACTGTAGCTTCT3配列番号:16逆方向PCRプライマー5TCAGAGAATTCCTTCCAGGA3配列番号:17さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA14232配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5ACAGTGCTGTAGTCATCCTGTAATATGCTCCTTGTCAACA3配列番号:18全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO190遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト網膜組織LIB94から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCaからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO190の全長DNA配列[ここでDNA23334-1392と命名する]配列番号:13及びPRO190の誘導タンパク質配列を与えた。DNA23334-1392の全核酸配列を図8配列番号:13に示す。クローンDNA23334-1392は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置193-195に見かけの翻訳開始部位そしてヌクレオチド位置1465-1467の停止コドンで終端する図8。予測されるポリペプチド前駆体は424アミノ酸長である図9。図9に示した全長PRO190タンパク質は約48,500ダルトンの見積もられた分子量及び約8.65のpIを有する。クローンDNA23334-1392はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:14のアミノ酸配列の分析により、推定膜貫通ドメインは配列番号:14のおよそアミノ酸16-36、50-74、147-168、229-250、271-293、298-318及び328-368である。Nグリコシル化部位は、配列番号:14のおよそアミノ酸128-131、204-207、218-221及び274-377である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。PRO190は、少なくとも以下のように称されるDayhoff配列:CEZK8962JC5023GMS1SCHPO及びS44668と配列同一性を有する。実施例8:ヒトPRO341をコードするcDNAクローンの単離上記実施例2に記載したように、ヒト網膜組織ライブラリからここでDNA12920と命名されるクローンを単離した。DNA12920配列を図13配列番号:21に示す。DNA12920配列は、次いで、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々のESTデータベースと比較し、相同性EST配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2[Altschul等MethodsinEnzymology266460480]を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA25314と命名する。次いでDNA25314配列に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを合成し、ヒト胎盤cDNAライブラリのスクリーニングに使用し、図11に示すDNA26288-1239クローンを同定した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280、cDNAサイズ切断は2800bp未満であった。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置380-382に見かけの翻訳開始部位、そしてヌクレオチド位置1754-1756に停止シグナルを持つ図11;配列番号:19。予測されるポリペプチド前駆体は458アミノ酸長であり、約50,264の計算された分子量及び約8.17の見積もられたpIを有する。図12配列番号:20に示した全長PRO341配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸17のシグナルペプチド、約アミノ酸171~約アミノ酸190、約アミノ酸220~約アミノ酸239、約アミノ酸259~約アミノ酸275、約アミノ酸286~約アミノ酸305、約アミノ酸316~約アミノ酸335、約アミノ酸353~約アミノ酸378、及び約アミノ酸396~約アミノ酸417の膜貫通ドメイン、及び約アミノ酸145~約アミノ酸147及び約アミノ酸155~約アミノ酸158の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA26288-1239は1998年4月21日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209792が付与されている。図12配列番号:20に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO341アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、S75696H69788D69852A69888B64918F64752LPU892761G64962S52977及びS44253との間の相同性が明らかになった。実施例9:ヒトPRO180をコードするcDNAクローンの単離上記実施例2に記載したように、ヒト網膜組織ライブラリからここでDNA12922と命名されるクローンを単離した。DNA12922配列を図16配列番号:24に示す。DNA12922配列は、次いで、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々のESTデータベースと比較し、相同性EST配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2[Altschul等MethodsinEnzymology266460480]を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。上記で得られたコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを合成した。このプローブは次の配列を有していた:5ACCTGTTAGAAATGTGGTGGTTTCAGCAAGGCCTCAGTTT配列番号:25このプローブを、実施例2のパラグラフ1に記載したように調製したヒト胎盤cDNAライブラリのスクリーニングに使用した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280、cDNAサイズ切断は2800bp未満であった。ここでDNA26843-1389と命名されるクローンを得た。DNA26843-1389の全ヌクレオチド配列を図14配列番号:22に示す。クローンDNA26843-1389は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置121-123に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置919-921の停止コドンで終端する図14。予測されるポリペプチド前駆体は266アミノ酸長である図15。図15に示す全長PRO180タンパク質は、約29,766の見積もられた分子量及び約8.39のpIを有する。クローンDNA26843-1389はATCCに寄託された。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:23のアミノ酸配列の分析により、膜貫通ドメインは配列番号:23のおよそアミノ酸13-33II型、54-73、94-113、160-180、及び122-141である。Nミリストイル化部位は、配列番号:23のおよそアミノ酸57-62、95-100、99-104、124-129及び183-188である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。図15配列番号:23に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO180アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、CEC33A112CEG11E65CELW03A51及びPEU838612との間の相同性が明らかになった。実施例10:ヒトPRO194をコードするcDNAクローンの単離上記実施例1に記載したように、phrapを用いて他のESTに対してコンセンサスDNA配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでDNA19464とする。DNA19464配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO194の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。DNA19464配列に基づいてPCRプライマー正及び逆を合成した。さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブをコンセンサスDNA19464配列から作成した。全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO194遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肺組織LIB25から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO194の全長DNA配列[ここでDNA26844-1394と命名する]配列番号:27及びPRO194の誘導タンパク質配列を与えた。DNA26844-1394の全核酸配列を図17配列番号:27に示す。クローンDNA26844-1394は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置81-83に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置873-875の停止コドンで終端する図17。予測されるポリペプチド前駆体は264アミノ酸長である図18。図18に示した全長PRO194タンパク質は約29,665ダルトンの見積もられた分子量及び約9.34のpIを有する。図18配列番号:28に示す全長PRO194配列の分析により、図18に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになった。クローンDNA26844-1394は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209926が付与された。全長PRO194ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、任意の公知のヒトタンパク質と有意な相同性を示さないことが示唆された。しかし、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO194アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、HUMORFT1CET07F105ATFCA912F64934YDJXECOLIATAF00065719F29G2019H70002S76980H64934及びS76385との間の相同性が明らかになった。実施例11:ヒトPRO203をコードするcDNAクローンの単離上記実施例2に記載したように、ヒト胎児肺組織ライブラリからここでDNA15618と命名されるクローンを単離した。DNA15618配列を図21配列番号:31に示す。DNA15618分子の配列からオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記実施例2のパラグラフ1に記載したように調製したヒト胎児肺ライブラリLIB26のスクリーニングに使用した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280、cDNAサイズ切断は2800bp未満であった。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置159-161に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1200-1202の停止コドンで終端する図19;配列番号:29。予測されるポリペプチド前駆体は347アミノ酸長であり、約39,870の計算された分子量及び約6.76の見積もられたpIを有する。図20配列番号:30に示した全長PRO203配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸64~約アミノ酸87のII型膜貫通ドメイン;約アミノ酸147~約アミノ酸150、約アミノ酸155~約アミノ酸158、及び約アミノ酸237~約アミノ酸240の可能なNグリコシル化部位;約アミノ酸23~約アミノ酸45の重金属結合ドメインタンパク質との配列同一性;及び約アミノ酸24~約アミノ酸34のD異性体特異的2ヒドロキシ酸デヒドロゲナーゼとの配列同一性。クローンDNA30862-1396は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209920が付与されている。全長PRO203ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、GSTATPaseとの配列相同性を有することが示唆され、PRO203が新規なGCTATPaseであることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO203アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、AF0081241CFRCD1GEN1及びPR82566との間の相同性が明らかになった。実施例12:ヒトPRO290をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを検索してベージュ及びFANと相同性を持つESTを同定した。次いで同定したEST配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを合成し、全長cDNAクローンの同定を目的とするヒト胎児腎臓cDNAライブラリのスクリーニングに使用した。オリゴヌクレオチドプローブは、以下の配列を有していた:5TGACTGCACTACCCCGTGGCAAGCTGTTGAGCCAGCTCAGCTG3配列番号:34cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。cDNAクローン全体を同定し配列決定した。DNA35680-1212の全ヌクレオチド配列を図22配列番号:32に示す。クローンDNA35680-1212は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置293-295に見かけの翻訳開始部位、そしてヌクレオチド位置3302-3304にの停止コドンを持つ図22;配列番号:32。予測されるポリペプチド前駆体は1003アミノ酸長である現在では、PRO290ポリペプチドはFAN及び/又はベージュに関連すると考えられている。クローンDNA35680-1212はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209790が付与された。寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。図23に示した全長PRO290タンパク質は、約112,013ダルトンの見積もり分子量及び約6.4のpIを有する。実施例13:ヒトPRO874をコードするcDNAクローンの単離ここでDNA36459と命名されるコンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したようにphrapを用いて同定した。DNA36459コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO874のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5TCGTGCCCAGGGGCTGATGTGC3配列番号:37逆方向PCRプライマー5GTCTTTACCCAGCCCCGGGATGCG3配列番号:38さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA36459配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5GGCCTAATCCAACGTTCTGTCTTCAATCTGCAAATCTATGGGGTCCTGGG3配列番号:39全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO874遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肺組織LIB25から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO874の全長DNA配列[ここでDNA40621-1440と命名する]配列番号:35及びPRO874の誘導タンパク質配列を与えた。DNA40621-1440の全ヌクレオチド配列を図24配列番号:35に示す。クローンDNA40621-1440は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置964-966の停止コドンで終端する図24。DNA40621-1440にコードされる予測されるポリペプチドは321アミノ酸長である図25。図25に示したPRO874タンパク質は約36,194ダルトンの見積もられた分子量及び約9.85のpIを有する。図25配列番号:36に示した全長PRO874配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸57~約アミノ酸80のII型膜貫通ドメイン;約アミノ酸110~126、215-231、及び254-274の付加的膜貫通ドメイン;約アミノ酸16-19、27-30、及び289-292の潜在的Nグリコシル化部位;約アミノ酸276~287の仮定的YBR002cファミリータンパク質との配列同一性;及び約アミノ酸204~230のアンモニウムトランスポータータンパク質との配列同一性。クローンDNA40621-1440は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209922が付与されている。全長PRO874ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、新規の多重スパン膜貫通タンパク質であることが示唆された。しかし、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO874アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、S67049AF0548391S73437S52460及びHIVU805701との間の相同性が明らかになった。実施例14:ヒトPRO710をコードするcDNAクローンの単離潜在的な分泌タンパク質をコードするcDNAの同定に酵母スクリーニングアッセイを用いた。この酵母スクリーニングアッセイの使用により、その配列ここでDNA38190と命名するが図28配列番号:42に示される単一のcDNAの同定が可能になった。図28に示すDNA38190配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO710の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5TTCCGCAAAGAGTTCTACGAGGTGG3配列番号:43逆方向PCRプライマー5ATTGACAACATTGACTGGCCTATGGG3配列番号:44さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA38190配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5GTGGATGCTCTGTGTGCGTGCAAGATCCTTCAGGCCTTGTTCCAGTGTGA3配列番号:45全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO710遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織LIB227から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置67-69に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1765-1767に見られる停止コドンで終端する図26;配列番号:40。予測されるポリペプチド前駆体は566アミノ酸長であり、約65,555の計算された分子量及び約5.44の見積もられたpIを有する。図27配列番号:41に示した全長PRO710配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸32のシグナルペプチド、約アミノ酸454~約アミノ酸476の膜貫通ドメイン、約アミノ酸6~約アミノ酸26のアミノアシルトランスファーRNAシンセターゼクラスIIシグネーチャー配列、約アミノ酸111~約アミノ酸114、約アミノ酸146~約アミノ酸149の及び約アミノ酸292~約アミノ酸295の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA44161-1434は1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209907が付与されている。全長PRO710ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、CDC45タンパク質との有意な配列相同性を有することが示唆され、PRO710が新規なCDC45相同体であることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO710アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、HSAJ37281CEF34D101S64939UMU502761TRHYSHEEPCELT14E81RNA1YEASTLVU893401HSU807361及びCEZK3372との間の相同性が明らかになった。実施例15:ヒトPRO1151をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。DNA40665コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1151のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー5CCAGACGCTGCTCTTCGAAAGGGTC3配列番号:48逆方向PCRプライマー5GGTCCCCGTAGGCCAGGTCCAGC3配列番号:49さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA40665配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5CTACTTCTTCAGCCTCAATGTGCACAGCTGGAATTACAAGGAGACGTACG3配列番号:50全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1151遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1151の全長DNA配列ここでDNA44694-1500と命名する[図29;配列番号:46]及びPRO1151の誘導タンパク質配列を与えた。DNA44694-1500の全ヌクレオチド配列を図29配列番号:46に示す。クローンDNA44694-1500は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置272-274に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置1049-1051の停止コドンで終端する図29。予測されるポリペプチドは259アミノ酸長である図30。図30に示したPRO1151タンパク質は約28,770ダルトンの見積もられた分子量及び約6.12のpIを有する。図30配列番号:47に示した全長PRO1151配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸20のシグナルペプチド、約アミノ酸72~約アミノ酸75の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸144~約アミノ酸178、約アミノ酸78~約アミノ酸111及び約アミノ酸84~約アミノ酸117のC1qドメイン含有タンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンUNQ581DNA44694-1500は1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203114が付与されている。図30配列番号:47に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1151アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、ACR3HUMANHP25TAMASHUMC1QB21PR99306CA1FHUMANJX0369CA24HUMANS32436PR28916及びCA54HUMANとの間の相同性が明らかになった。実施例16:ヒトPRO1282をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。DNA33778コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1282のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー5TCTTCAGCCGCTTGCGCAACCTC3配列番号:53逆方向PCRプライマー5TTGCTCACATCCAGCTCCTGCAGG3配列番号:54さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA33778配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5TGGATGTTGTCCAGACAACCAGCTGGAGCTGTATCCGAGGC3配列番号:55全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1282遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肝臓から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1282の全長DNA配列ここでDNA45495-1550と命名する[図31;配列番号:51]及びPRO1282の誘導タンパク質配列を与えた。PRO1282の全コード化配列を図31配列番号:51に示す。クローンDNA45495-1550は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置120-122に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置2139-2141の停止コドンで終端する図51。予測されるポリペプチドは673アミノ酸長である。シグナルペプチドは、配列番号:52の約アミノ酸1~23であり;膜貫通ドメインは約アミノ酸579-599であり;EGF様ドメインシステインパターンシグネーチャーは約アミノ酸430で開始し;そしてロイシンジッパーパターンは約アミノ酸197及び269で開始する、図32参照。クローンDNA45495-1550はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203156が付与されている。図32に示した全長PRO1282タンパク質は約71,655ダルトンの見積もられた分子量及び約7.8のpIを有する。図32配列番号:52に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1282アミノ酸配列と以下のDayhoff配列データベースからのデータは参考として取り入れる、AB0078761RNPLGPV1MUSLRRP1ALSPAPPAAC0041421ALSHUMANAB0144621DMTARTAN1HSCHON31及びS46224との間の相同性が明らかになった。実施例17:ヒトPRO358をコードするcDNAクローンの単離上記実施例1に記載した方法を用いて、Incyteデータベースにおいて、ここでINC3115949と命名される単一のEST配列を同定した。INC3115949EST配列に基づいて、PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定し、PRO358の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー5TCCCACCAGGTATCATAAACTGAA3配列番号:58逆方向PCRプライマー5TTATAGACAATCTGTTCTCATCAGAGA3配列番号:59プローブも合成した:5AAAAAGCATACTTGGAATGGCCCAAGGATAGGTGTAAATG3配列番号:60全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及び対の一方を用いてPRO1282遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト骨髄LIB256から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO358の全長DNA配列図33;配列番号:56及びPRO358の誘導タンパク質配列図34,配列番号:57を与えた。同定されたクローンDNA47361-1154の全ヌクレオチド配列を図33配列番号:56に示す。クローンDNA47361-1154は、単一のオープンリーディングフレームを含み、図33に下線を付したヌクレオチド位置に見かけの翻訳開始部位ATG開始シグナルを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は811アミノ酸長であり、推定シグナル配列アミノ酸1~19、細胞外ドメインアミノ酸20~575、位置55~位置575の領域にロイシンリッチ反復を含む、推定膜貫通ドメインアミノ酸576~595を含む。クローンDNA47361-1249はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209431が付与されている。実施例18:ヒトPRO1310をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列をここでDNA37164と命名する。DNA37164コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1310のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー5GTTCTCAATGAGCTACCCGTCCCC3配列番号:63及び逆方向PCRプライマー5CGCGATGTAGTGGAACTCGGGCTC3配列番号:64さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA47394配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5ATCCGCATAAACCCTCAGTCCTGGTTTGATAATGGGAGCATCTGCATGAG3配列番号:65全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1310遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肝臓から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1310の全長DNA配列及びPRO1310の誘導タンパク質配列を与えた。PRO1310の全コード化配列を図35配列番号:61に示す。クローンDNA47394-1572は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置326-328に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置2594-2596に見かけの停止コドンを持つ図61。予測されるポリペプチドは765アミノ酸長である。シグナルペプチドは、配列番号:62の約アミノ酸1~25である。クローンDNA47394-1572はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203109が付与されている。図36に示した全長PRO1310タンパク質は約85,898ダルトンの見積もられた分子量及び約6.87のpIを有する。図36配列番号:62に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1310アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0176391PW36817JC5256CBPHHUMANMMU231841CBPNHUMANHSU834111CEF01D47RNU628971及びPW11851との間の配列同一性が明らかになった。実施例19:ヒトPRO698をコードするcDNAクローンの単離潜在的な分泌タンパク質をコードするcDNAの同定に酵母スクリーニングアッセイを用いた。この酵母スクリーニングアッセイの使用により、その配列ここでDNA39906と命名するが図39配列番号:68に示される単一のcDNAの同定が可能になった。図39に示すDNA39906配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO698の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5AGCTGTGGTCATGGTGGTGTGGTG3配列番号:69逆方向PCRプライマー5CTACCTTGGCCATAGGTGATCCGC3配列番号:70さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA39906配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5CATCAGCAAACCGTCTGTGGTTCAGCTCAACTGGAGAGGGTT3配列番号:71全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO698遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト骨髄組織LIB255から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置14-16に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1544-1546に見られる停止コドンで終端する図37;配列番号:66。予測されるポリペプチド前駆体は510アミノ酸長であり、約57,280の計算された分子量及び約5.61の見積もられたpIを有する。図38配列番号:67に示した全長PRO698配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸20のシグナルペプチド、約アミノ酸72~約アミノ酸75、約アミノ酸136~約アミノ酸139、約アミノ酸193~約アミノ酸196、約アミノ酸253~約アミノ酸256、約アミノ酸352~約アミノ酸355、及び約アミノ酸411~約アミノ酸414の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸20~約アミノ酸39のマメ科レクチンベータ鎖タンパク質に相同性を持つアミノ酸ブロック、及び約アミノ酸338~約アミノ酸365のHBGF/FEFファミリーのタンパク質に相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA48320-1433は1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209904が付与されている。全長PRO698ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、オルファクトメジンタンパク質との有意な配列相同性を有することが示唆され、PRO698が新規なオルファクトメジン相同体であることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO698アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、OLFMRANCAI73637AB006686S31RNU781051RNU724871PR98225CELC48E74CEF11C33XLU859701およびS42257との間の有意な相同性が明らかになった。実施例20:ヒトPRO732をコードするcDNAクローンの単離潜在的な分泌タンパク質をコードするcDNAの同定に酵母スクリーニングアッセイを用いた。この酵母スクリーニングアッセイの使用により、その配列ここでDNA42580と命名するが図45配列番号:77に示される単一のcDNAの同定が可能になった。DNA42580配列は、次いで、種々の公知のEST配列と比較して相同性を同定した。用いたESTデータベースは、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いてEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。上記の分析を用いて、コンセンサスDNA配列をphrapを用いて他のEST配列に対して組み立てた。独自に開発したジェネンテクEST配列をコンセンサス組立に用い、それらをここでDNA20239図42;配列番号:74、DNA38050図43;配列番号:75およびDNA40683図44;配列番号:76と命名した。consen01配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO732の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。正方向及び逆方向PCRプライマーは一般的に20から30ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約100-1000bp長のPCR産物を与えるために設計される。プローブ配列は、典型的に40-55bp長である。或る場合には、コンセンサス配列が1-1.5kbpより大きい場合に付加的オリゴヌクレオチドが合成される。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5ATGTTTGTGTGGAAGTGCCCCG3配列番号:78正方向PCRプライマー5GTCAACATGCTCCTCTGC3配列番号:79逆方向PCRプライマー5AATCCATTGTGCACTGCAGCTCTAGG3配列番号:80逆方向PCRプライマー5GAGCATGCCACCACTGGACTGAC3配列番号:81さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA44143配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5GCCGATGCTGTCCTAGTGGAAACAACTCCACTGTAACTAGATTGATCTATGCAC3配列番号:82全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO732遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肺組織LIB26から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置88-90に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1447-1449に見られる停止コドンで終端する図40;配列番号:72。予測されるポリペプチド前駆体は453アミノ酸長であり、約50,419の計算された分子量及び約5.78の見積もられたpIを有する。図41配列番号:73に示した全長PRO732配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸28のシグナルペプチド、約アミノ酸37~約アミノ酸57、約アミノ酸93~約アミノ酸109、約アミノ酸126~約アミノ酸148、約アミノ酸151~約アミノ酸172、約アミノ酸197~約アミノ酸215、約アミノ酸231~約アミノ酸245、約アミノ酸260~約アミノ酸279、約アミノ酸315~約アミノ酸333、約アミノ酸384~約アミノ酸403及び約アミノ酸422~約アミノ酸447の膜貫通ドメイン、約アミノ酸33~約アミノ酸36、約アミノ酸34~約アミノ酸37、約アミノ酸179~約アミノ酸183、約アミノ酸298~約アミノ酸301、約アミノ酸337~約アミノ酸340及び約アミノ酸406~約アミノ酸409の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸119~約アミノ酸149のMIPファミリーのタンパク質に相同性を持つアミノ酸ブロック、及び約アミノ酸279~約アミノ酸286のDNA/RNA非特異的エンドヌクレアーゼタンパク質に相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA48334-1435は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209924が付与されている。全長PRO732ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、Diff33タンパク質との有意な配列相同性を有することが示唆され、PRO732が新規なDiff33相同体であることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO732アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、HS179M202MUSTETU1CER11H62RATDRP1S51256E69226AE0008691JC4120CYBPARTE及びPR50619との間の有意な相同性が明らかになった。実施例21:ヒトPRO1120をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列をここでconsen0352と命名する。次いでconsen0352をBLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長させ、上記のEST配列の供給源を用いてコンセンサス配列をできるだけ伸長させた。伸長させたコンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1120のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5GAAGCCGGCTGTCTGAATC3配列番号:85、5GGCCAGCTATCTCCGCAG3配列番号:86、5AAGGGCCTGCAAGAGAAG3配列番号:87、5CACTGGGACAACTGTGGG3配列番号:88、5CAGAGGCAACGTGGAGAG3配列番号:89、及び5AAGTATTGTCATACAGTGTTC3配列番号:90;逆方向PCRプライマー:5TAGTACTTGGGCACGAGGTTGGAG3配列番号:91、及び5TCATACCAACTGCTGGTCATTGGC3配列番号:92;さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA34365配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5CTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCCGGTGAATCGGTTTCACTTG3配列番号:93全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1120遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1120の全長DNA配列ここでDNA48606-1479と命名される[図46、配列番号:83]及びPRO1120の誘導タンパク質配列を与えた。PRO1120の全コード化配列を図46配列番号:83に示す。クローンDNA48606-1479は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置608-610に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置3209-3211に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポリペプチドは867アミノ酸長である。図47に示した全長PRO1120タンパク質は約100,156ダルトンの見積もられた分子量及び約9.44のpIを有する。PRO1120ポリペプチドのさらなる特徴は、約アミノ酸1-17のシグナルペプチド;約アミノ酸86-98のスルファターゼシグネーチャー;約アミノ酸87-106、133-146、216-229、291-320、及び365-375のスルファターゼに相同な領域;及び約アミノ酸65-68、112-115、132-135、149-152、171-174、198-201、241-245、561-564、608-611、717-720,754-757及び764-767の潜在的Nグリコシル部位を含む。図47配列番号:84に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1120アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CELK09C41GL6SHUMANG65169NCU894921BCU448521E64903PR51355STSHUMANGA6SHUMAN及びIDSMOUSEとの間の配列同一性が明らかになった。クローンDNA48606-1479は1998年7月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203040が付与されている。実施例22:ヒトPRO537をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのIncyteESTクラスター番号29605と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQR、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA48350と命名する。DNA48350コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号R63443に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号R63443を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図48に示し、ここでDNA49141-1431と命名する。クローンDNA49141-1431は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置97-99に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置442-444の停止コドンで終端する図48。予測されるポリペプチド前駆体は115アミノ酸長である図49。図49に示す全長PRO537タンパク質は、約13,183の見積もられた分子量及び約12.13のpIを有する。図49配列番号:95に示した全長PRO537配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸31のシグナルペプチド、約アミノ酸44~約アミノ酸47の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸3~約アミノ酸8及び約アミノ酸16~約アミノ酸21の潜在的Nミリストリル化部位、及び約アミノ酸97~約アミノ酸105のマルチカッパーオキシダーゼタンパク質と相同性を有するアミノ酸ブロック。クローンDNA49141-1431は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203003が付与されている。図49配列番号:95に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO537アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:A54523CELF22H102FKH2MOUSEOTX1HUMANURB1USTMAKNOBPLAFNA328951AF0363321HRGHUMAN及びHRP3PLAFSとの間の配列同一性が明らかになった。実施例23:ヒトPRO536をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここでss.clu2437.initと命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA48351と命名する。DNA48351コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H11129に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH11129を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図50に示し、ここでDNA49142-1430と命名する。クローンDNA49142-1430は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置48-50に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置987-989の停止コドンで終端する図50。予測されるポリペプチド前駆体は313アミノ酸長である図51。図51に示す全長PRO536タンパク質は、約34,189の見積もられた分子量及び約4.8のpIを有する。図51配列番号:97に示した全長PRO536配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸25のシグナルペプチド、約アミノ酸45~約アミノ酸48の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸16~約アミノ酸26のスルファターゼタンパク質と相同性を有するアミノ酸ブロック。クローンDNA49142-1430は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203002が付与されている。図51配列番号:97に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO536アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:APU468571PK2DICDIH64743F511418CEAMECOLIGEN14267H64965TCU398151PSBJODOSI及びPR06980との間の配列同一性が明らかになった。実施例24:ヒトPRO535をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここでss.clu12694.initと命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA48352と命名する。2つの独自に開発したジェネンテクEST配列を組立に用い、図54及び55に示した。DNA48352コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H886994に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH86994を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図52に示し、ここでDNA49143-1429と命名する。クローンDNA49143-1429は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置78-80に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置681-683の停止コドンで終端する図52。予測されるポリペプチド前駆体は201アミノ酸長である図53。図53に示す全長PRO535タンパク質は、約22,180の見積もられた分子量及び約9.68のpIを有する。図53配列番号:99に示した全長PRO535配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸25のシグナルペプチド、約アミノ酸155~約アミノ酸174の膜貫通ドメイン、約アミノ酸196~約アミノ酸199の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸62~約アミノ酸77、約アミノ酸87~約アミノ酸123及び約アミノ酸128~約アミノ酸141のFKBR型ペプチジルプロリルシストランス異性体シグネーチャー配列。クローンDNA49143-1429は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203013が付与されている。図53配列番号:99に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO535アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S71237PR93551PR28980S71238FKB2HUMANCELC05C81S55383S72485CELC50F26及びS75144との間の配列同一性が明らかになった。実施例25:ヒトPRO718をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例2ヒト胎児肺ライブラリに記載したアミラーゼスクリーニングで単離したcDNA配列を、ここでDNA43512と命名する図62;配列番号:108参照。次いでDNA43512配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA45625と命名する。独自に開発したジェネンテクEST配列を組立に用い、図58-61に示した。DNA45626配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記実施例2のパラグラフ1に記載したように調製したヒト胎児肺ライブラリLIB25のスクリーニングに使用した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280、cDNAサイズ切断は2800bp未満であった。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5GGGTGGATGGTACTGCTGCATCC3配列番号:109逆方向PCRプライマー:5TGTTGTGCTGTGGGAAATCAGATGTG3配列番号:110さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA45625配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5GTGTCTGGAGGCTGTGGCCGTTTTGTTTTCTTGGGCTAAAATCGGG3配列番号:111全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO718遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置36-38に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位置607-609に見られる停止コドンで終端する図56;配列番号:102。予測されるポリペプチドは157アミノ酸長であり、約17,400ダルトンの計算された分子量及び約5.78の見積もられたpIを有する。図57配列番号:103に示すPRO718配列の分析により以下の存在が明らかとなった:約アミノ酸21-約アミノ酸40のII型膜貫通ドメイン、及び約アミノ酸58-約アミノ酸78、約アミノ酸95-約アミノ酸114及び約アミノ酸127-約アミノ酸147の他の膜貫通ドメイン;約アミノ酸79-約アミノ酸81の細胞接着配列;約アミノ酸53-約アミノ酸56の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA49647-1398は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209919が付与されている。全長PRO718ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、それが任意の公知のタンパク質と有意な相同性を持たないことを示唆している。しかし、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO718アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0456061AF0399061SPBC8D22S63441F64728COX1TRYBBF64375E64173RPYGJT3MTCY26123との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例26:ヒトPRO872をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここでss.clu120709.initと命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでclu120709.init配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA48254と命名する。DNA48254コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3438068に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3438068を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図63に示し、これはPRO872の全長DNA配列である。クローンDNA49819-1439は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209931が付与されている。DNA49819-1439の全ヌクレオチド配列を図63配列番号:112に示す。クローンDNA49819-1439は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置14-16に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1844-1846の停止コドンで終端する図63。予測されるポリペプチド前駆体は610アミノ酸長である図64。図64に示す全長PRO872タンパク質は、約66,820の見積もられた分子量及び約8.65のpIを有する。図64配列番号:113に示した全長PRO872配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸18のシグナルペプチド、約アミノ酸70-87、200-222及び568-588の推定膜貫通ドメイン;約アミノ酸71-105の細菌型フィトエンデヒドロゲナーゼタンパク質との配列同一性;約アミノ酸201-211の染色体縮合レギュレータRCC1シグネーチャー2との配列同一性;約アミノ酸214-235、221-242、228-249及び364-385のロイシンジッパーパターン;約アミノ酸271-274の潜在的Nグリコシル化部位;及び約アミノ酸75-78のグリコサミノグリカン結合部位。全長PRO872ポリペプチドのアミノ酸配列のDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた分析により、PRO872アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PRCRTI1S5951S74689CELF37C43CRTIRHOCAS76617YNI2METTLMTV01414APFBHUMAN及びMMU704291との間の相同性が明らかになった。実施例27:ヒトPRO1063をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここでss.clul19743.initと命名される単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのIncyteESTクラスター配列ss.clul19743.init配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA48288と命名する。DNA48288コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2783726に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン2793726を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図65に示し、ここでDNA49820-1427と命名する。図65に示した全長クローンはクローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置90-92に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置993-995の停止コドンで終端する図65;配列番号:114。予測されるポリペプチド前駆体は301アミノ酸長であり、約33,530の計算された分子量及び約4.80の見積もられたpIを有する。図66配列番号:115に示した全長PRO1063配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸21のシグナルペプチド、約アミノ酸195~約アミノ酸198、約アミノ酸217~約アミノ酸220及び約アミノ酸272~約アミノ酸275の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸267~約アミノ酸270のグリコサミノグリカン結合部位、約アミノ酸299~約アミノ酸301の微小体C末端標的化部位、約アミノ酸127~約アミノ酸168のII型フィブロネクチンコラーゲン結合ドメイン相同配列、及び約アミノ酸101~約アミノ酸118のフルクトースビスホスフェート或る度ラーゼクラスIIタンパク質相同配列。クローンDNA49820-1427は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号2099332が付与されている。全長PRO1063ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、ヒトIV型コラゲナーゼタンパク質との配列相同性を有することが示唆された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1063アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、S68303CFU685331PP91139RNU656561PA2RRABITMMU567341FINCXENLAA48925PR92778及びFA12HUMANとの間の相同性が明らかになった。実施例28:ヒトPRO619をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここで88434と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号16656694に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン16656694を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図67に示し、ここでDNA49821-1562と命名する。図67に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置81-83に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置450-452の停止コドンで終端する図67;配列番号:116。予測されるポリペプチド前駆体図68;配列番号:117は123アミノ酸長であり、約アミノ酸1-20に予測されるシグナルペプチドを含む。PRO619タンパク質は、約13,710の計算された分子量及び約5.19の見積もられたpIを有する。クローンDNA49821-1562は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209981が付与されている。図68配列番号:117に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO619アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S35302D870091HSU934941HUMIGLAM51D869992HUMIGLYM11HUMIGLYMKE1A294911A294981及びVPR2MOUSEとの間の有意な相同性が明らかになった。実施例29:ヒトPRO943をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。次いでこのコンセンサス配列をBLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長させ、上記のEST配列の供給源を用いてコンセンサス配列をできるだけ伸長させた。伸長させたコンセンサス配列をここでDNA36360と命名する。DNA36360コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO943のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5CGAGATGACGCCGAGCCCCC3配列番号:120逆方向PCRプライマー:5CGGTTCGACACGCGGCAGGTG3配列番号:121さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA36360配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5TGCTGCTCCTGCTGCCGCCGCTGCTGCTGGGGGCCTTCCCGCCGG3配列番号:122全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO943遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児脳組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO943の全長DNA配列ここでDNA52192-1369と命名される[図69、配列番号:118]及びPRO943の誘導タンパク質配列を与えた。PRO943の全コード化配列を図69配列番号:118に示す。クローンDNA52192-1369は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置150-152に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置1662-1664の停止コドンで終端する図69。予測されるポリペプチドは504アミノ酸長である図70。図70に示した全長PRO943タンパク質は約54,537ダルトンの見積もられた分子量及び約10.04のpIを有する。図70配列番号:119に示した全長PRO943配列の分析により、以下のものの存在が明らかとなった:約アミノ酸1~約アミノ酸17のシグナルペプチド;約アミノ酸376~約アミノ酸396の膜貫通ドメイン、約アミノ酸212~約アミノ酸219及び約アミノ酸329~約アミノ酸336のチロシンキナーゼリン酸化部位、約アミノ酸111~約アミノ酸114、約アミノ酸231~約アミノ酸234、約アミノ酸255~約アミノ酸258及び約アミノ酸293~約アミノ酸296の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸219~約アミノ酸236の免疫グロブリン及びMHCタンパク質配列相同ブロック。クローンDNA52192-1369は1998年7月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203042が付与されている。図70配列番号:119に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO943アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:B49151A39752FGR1XENLAS38579RATHBFGFRB1TVHU2FFRGquotMOUSECEK3CHICKPR21080及びA271711との間の有意な相同性が明らかになった。実施例30:ヒトPRO1188をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列をここでDNA45679と命名する。DNA45679コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1188のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5CTGGTGCCTCAACAGGGAGCAG3配列番号:125逆方向PCRプライマー:5CCATTGTGCAGGTCAGGTCACAG3配列番号:126さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA45679配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5CTGGAGCAAGTGCTCAGCTGCCTGTGGTCAGACTGGGGTC3配列番号:127全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1188遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1188の全長DNA配列ここでDNA52598-1518と命名される[図71、配列番号:123]及びPRO1188の誘導タンパク質配列を与えた。PRO1188の全コード化配列を図71配列番号:123に示す。クローンDNA52598-1518は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置136-138に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置3688-3690の停止コドンで終端する。予測されるポリペプチドは1184アミノ酸長である。図72に示した全長PRO1188タンパク質は約132,582ダルトンの見積もられた分子量及び約8.80のpIを有する。さらなる特徴は、約アミノ酸1-31のシグナルペプチド;約アミノ酸266-273のATP/GTP結合部位モチーフAPループ;約アミノ酸188-199のアルデヒドデヒドロゲナーゼシステイン活性部位;約アミノ酸153-159の成長因子及びサイトカインレセプターファミリーシグネーチャー2;及び約アミノ酸129-132、132-135、346-349、420-423、550-553、631-634、1000-1003,及び1056-1059の潜在的Nグリコシル化部位を含む。図72配列番号:124に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1188アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:SSU831141S56015CET21B64CELT19Dquot1及びTSP1MOUSEとの間の有意な相同性が明らかになった。クローンDNA52598-1518はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203107が付与されている。実施例31:ヒトPRO1133をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。この配列をphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長させた。伸長させたコンセンサス配列をここでDNA38102と命名する。DNA38102コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1133のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5TCGATTATGGACGAACATGGCAGC3配列番号:130;正方向PCRプライマー:5TTCTGAGATCCCTCATCCTC3配列番号:131;及び逆方向PCRプライマー:5AGGTTCAGGGACAGCAAGTTTGGG3配列番号:132さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA38102配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5TTTGCTGGACCTCGGCTACGGAATTGGCTTCCCTCTACGGACAGCTGGAT3配列番号:133全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1133遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1133の全長DNA配列及びPRO1133の誘導タンパク質配列を与えた。PRO1133の全コード化配列を図73配列番号:128に示す。クローンDNA53913-1490は、単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:128のヌクレオチド位置266-268に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置1580-1582に見かけの停止コドンを有する。予測されるポリペプチドは438アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:129のアミノ酸1-18である。EGF様ドメインシステインパターンシグネーチャーは図74に示した配列番号:129の315及び385で開始する。クローンDNA53913-1490はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203162が付与されている。図74に示す全長PRO1133タンパク質は約49,260ダルトンの見積もられた分子量及び約6.15のpIを有する。図74配列番号:129に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1133アミノ酸配列と以下のDayhoff配列データベースからのデータはここに取り込む:AF0027171LMG1HUMANB54665UNC6CAEELLML1CAEELLMA5MOUSEMMU883531LMA1HUMANHSLN2C641及びAF0052581との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例32:ヒトPRO784をコードするcDNAクローンの単離ここでDNA44661と命名され図77に示す初期DNA配列配列番号:136を、一次cDNAクローンの5’末端を優勢に示すヒト胎児cDNAライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した。DNA44661配列は、次いで、種々の公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAと、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2[Altschul等MethodsinEnzymology266460480]を用いて比較した。次いでESTをコンピュータプログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列を、ここでDNA45463と命名する。DNA45463コンセンサス配列に基づいて、ヒト胎児肺cDNAライブラリからPRO784の全長コード化配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。図75に示した全長DNA53978-1433クロンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置37-39に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置821-823に見られる停止コドンで終端する図75;配列番号:134。予測されるポリペプチド前駆体図76;配列番号:135は228アミノ酸長である。PRO78は、約25,735の計算された分子量及び約5.45の見積もられたpIを有する。PRO784は以下特徴を有する:約アミノ酸1~約15のシグナルペプチド;約アミノ酸68~約87、約183~約204の膜貫通ドメイン;約アミノ酸15-20、51-56、66-60、163-16、及び206-211のNミリストイル化部位;約アミノ酸108~約117のRNP1タンパク質RNA結合領域。クローンDNA53978-1443は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209983が付与されている。全長配列のALIGNコンピュータプログラムを用いたBLAST及びFastA配列アラインメント分析に基づき、PRO784は、以下のタンパク質:RNU422091MMU915381CGU917421CELF55A46SC22YEAST及びF48188とのアミノ酸配列同一性を示した。実施例33:ヒトPRO783をコードするcDNAクローンの単離潜在的な分泌タンパク質をコードするcDNAの同定に酵母スクリーニングアッセイを用いた。この酵母スクリーニングアッセイの使用により、ここでDNA45201図80;配列番号:139と命名される単一のcDNAの同定が可能になった。DNA45201配列は、次いで、EST配列と比較して相同性を同定するのに使用した。ESTデータベースは、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列を、ここでconsen01と銘々する。独自に開発したジェネンテクEST配列をコンセンサス組立に用い、それをここでDNA14575図81;配列番号:140と命名した。consen01配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO783の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。全長クローンについて幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiologyのように、PCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子をコードするクローンの単離するのに使用した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5GACTGTATCTGAGCCCCAGACTGC3配列番号:141、正方向PCRプライマー5TCAGCAATGAGGTGCTGCTC3配列番号:142、及び逆方向PCRプライマー5TGAGGAAGATGAGGGACAGGTTGG3配列番号:143さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNAconsen01配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5TATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCC3配列番号:144全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO783遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織LIB228から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO783の全長DNA配列ここでDNA53996-1442と命名される[配列番号:137]及びPRO783の誘導タンパク質配列を与えた。PRO783の全コード化配列を図78配列番号:137に示す。クローンDNA53996-1442は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置310-312に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置1777-1779の停止コドンで終端する図78。予測されるポリペプチドは489アミノ酸長である図79。図79に示した全長PRO783タンパク質は約55,219ダルトンの見積もられた分子量及び約8.47のpIを有する。図79配列番号:138に示した全長PRO783配列の分析により、以下のものの存在が明らかとなった:約アミノ酸23-42、67-89、111-135、154-176、194-218、296-319、348-370、387-410及び427-452の膜貫通ドメイン;約アミノ酸263-283及び399-420に局在化したロイシンジッパーパターン;約アミノ酸180-187の潜在的チロシンキナーゼリン酸化部位;約アミノ酸105-108及び121-124の潜在的Nグリコシル化部位;約アミノ酸288-291のcAMP及びcGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;及び約アミノ酸190-218の細菌ロドプシン網膜結合部位タンパク質と相同性を持つ領域。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO783アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:YNC2CAEELD64048ATAC0023323F4P93NY2RSHEEP及びVSHMUMPAとの間の或る程度の配列同一性が明らかになった。クローンDNA53996-1442は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209921が付与されている。実施例34:ヒトPRO820をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTデータベースMerckwshUを検索してEST番号AA504080,Merckクローン番号825136と称されるESTを同定したライブラリ312、ヒトB細胞扁桃腺。相同性検索により、このESTが低親和性免疫グロブリンガンマFcレセプターIIと配列同一性を示すことが明らかになった。DNA配列分析は、PRO820の全長DNA配列とPRO820の誘導タンパク質配列を与えた。DNA56041-1416の全ヌクレオチド配列を図82配列番号:145に示す。クローンDNA56041-1416は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置115-117に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位置487-489の停止コドンで終端する図82。予測されるポリペプチドは124アミノ酸長である図83。図83に示した全長PRO820タンパク質は約14,080ダルトンの見積もられた分子量及び約7.48のpIを有する。クローンDNA56041-1416はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:146のアミノ酸配列のさらなる分析により、推定シグナルペプチドは配列番号:146の約アミノ酸1-15である。タンパク質キナーゼCリン酸化部位は配列番号:146のおよそアミノ酸20-22及び43-45である。Nミリストイル化部位は、配列番号:146のおよそアミノ酸89-94である。免疫グロブリン及び主要組織適合性複合体ドメインは配列番号:146のおよそアミノ酸83-90である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。実施例35:ヒトPRO1080をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を他のEST配列に対してphrapを用いて作成し、BLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長させて上記実施例1に記載したようなEST配列の供給源を用いてコンセンサス配列をできるだけ伸長させた。このコンセンサス配列をここでDNA52640と命名する。ジェネンテクが独自に開発したESTをコンセンサス組立に用い、ここでDNA36527図86;配列番号:149と命名する。DNA36527コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号526423に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン526423を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図84に示し、ここでDNA56047-1456の全ヌクレオチド配列を図84配列番号:147に示す。クローンDNA56047-1456は、単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:147図84のヌクレオチド位置159-161に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置1233-1235の停止コドンで終端する。予測されるポリペプチド前駆体は358アミノ酸長である図85。図85に示す全長PRO1080タンパク質は約40,514ダルトンの見積もられた分子量及び約6.08のpIを有する。クローンDNA56047-1456は1998年6月9日にATCCに寄託されている。寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。また図85には、シグナルペプチド、細胞接着部位、NtDnajドメインシグネーチャー、NtDnajドメインタンパク質と配列同一性を持つ領域、及びNグリコシル化部位のおよその位置も示した。ここに提供されたこれらのアミノ酸配列に対応する核酸及びその他は、ここに与えられた情報により日常的に決定できる。実施例36:ヒトPRO1079をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成し、ここでDNA52714と命名する。組立によって提供された情報に基づき、MerckのEST番号HO6898のクローンを得て配列決定し、それにより、ここでDNA56050-1455と命名するクローンのヌクレオチド配列を与えた。DNA56050-1455の全ヌクレオチド配列を図87配列番号:150に示す。クローンDNA56050-1455は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置183-185に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置861-863の停止コドンで終端する図87。予測されるポリペプチドは226アミノ酸長である図88。図88に示した全長PRO1079タンパク質は約24,611ダルトンの見積もられた分子量及び約4.85のpIを有する。図88配列番号:3に示した全長PRO1079配列の分析により、以下の特徴の存在が明らかとなった:約アミノ酸1-29のシグナルペプチド;約アミノ酸10-15及び51-56のNミリストイル化部位;約アミノ酸2-20の光化学系IpsaG及びpsaKタンパク質に対する相同性;及び約アミノ酸150-163のプロリルエンドペプチダーゼタンパク質に対する相同性。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた全長PRO1079ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、PRO1079アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CEK10C34MMU507341D69503AF511491及びVSMPCVMSとの間の有意な相同性が明らかになった。クローンUNQ536DNA56050-1455は1998年6月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203011が付与されている。実施例37:ヒトPRO793をコードするcDNAクローンの単離天然ヒトPRO793ポリペプチドをコードするcDNAクローンDNA56110-1437を、一次cDNAクローンの5’末端を優勢に示すヒト皮膚腫瘍cDNAライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した。用いた酵母スクリーニングは、ここでDNA50177図91;配列番号:154と命名される単一のESTクローンを同定した。次いでDNA50177配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA50972と命名する。DNA50972コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号N33874に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンN33874を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図89に示し、ここでDNA56110-1437と命名する。図89に示した全長DNA56110-1437クロンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置77-79に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置491-493の停止コドンで終端する図89。予測されるポリペプチド前駆体は138アミノ酸長である図90。図90に示したPRO793タンパク質は、約15,426の見積もられた分子量及び約10.67のpIを有する。図90配列番号:153に示した全長PRO1180配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸12~約アミノ酸30、約アミノ酸33~約アミノ酸52、約アミノ酸69~約アミノ酸89及び約アミノ酸93~約アミノ酸109の膜貫通ドメイン、約アミノ酸11~約アミノ酸16、約アミノ酸51~約アミノ酸56及び約アミノ酸116~約アミノ酸121の潜在的Nミリストイル化部位、及び約アミノ酸49~約アミノ酸59のアミノアシル転移RNA合成酵素クラスIIタンパク質との相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンDNA56110-1437は1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203113が付与されている。図90配列番号:153に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO793アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S47453AF01519312MTEHGN92E64030H69784D64995CD53MOUSEGEN8006AE0011387及びCOX2STRPUとの間の或る相同性が明らかになった。実施例38:ヒトPRO1016をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対して作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA53502と命名する。DNA53502コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号38680に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン38680を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図92に示す。DNA56113-1378の全長ヌクレオチド配列を図92配列番号:155に示す。クローンDNA56113-1378は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置168-170に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1302-1304の停止コドンで終端する図92。予測されるポリペプチド前駆体は378アミノ酸長である図93。図93に示した全長PRO1016タンパク質は、約44,021ダルトンの見積もられた分子量及び約9.07のpIを有する。クローンDNA56113-1378はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO1016ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、その一部がアシルトランスフェラーゼと配列同一性を有することを示唆し、それによりPRO1016が新規なアシルトランスフェラーゼであることを示している。配列番号:156のアミノ酸配列をさらに分析すると、推定シグナルペプチドは配列番号:156の約アミノ酸1-18である。膜貫通ドメインは配列番号:156の約アミノ酸332-352及び305-330である。フルクトースビスホスフェートアルドラーゼクラスIIタンパク質は配列番号:156の約アミノ酸73-90である。エクストラジオール環切断ジオキシゲナーゼタンパク質は配列番号:156の約アミノ酸252-275である。対応するヌクレオチドは、ここに与えられた配列により日常的に決定できる。PRO1016が配列同一性を持つ配列の特定のDayhoffデータベース表記名は以下を含む:S52645PR59712PR99249PR59713BNAGPATRF1CELT05415及びCELZK401。実施例39:ヒトPRO1013をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対して作成した。次いでこのコンセンサスDNA配列をBLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長させてEST配列の供給源を用いてコンセンサス配列をできるだけ伸長させた。コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3107695に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3107695を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図94に示し、ここでDNA56410-1414と命名する。DNA56410-1414の全長ヌクレオチド配列を図94配列番号:157に示す。クローンDNA56410-1414は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置17-19に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1244-1246の停止コドンで終端する図94。予測されるポリペプチド前駆体は409アミノ酸長である図95。図95に示した全長PRO1013タンパク質は、約46,662ダルトンの見積もられた分子量及び約7.18のpIを有する。クローンDNA56410-1414はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:158のアミノ酸配列をさらに分析すると、推定シグナルペプチドは配列番号:158の約アミノ酸1-19である。Nグリコシル化部位は配列番号:158の約アミノ酸75-78及び322-325である。Nミリストイル化部位は配列番号:158の約アミノ酸184-189である。成長因子及びサイトカインレセプターファミリードメインは配列番号:158の約アミノ酸134-149である。対応するヌクレオチドは、ここに与えられた配列により日常的に決定できる。Blast分析は他のタンパク質との幾分の配列同一性を示した。特にPRO1013は少なくともD638771MHU220191AE00073010及びAF0190791と称されるDayhoff配列と或る程度の配列同一性を有する。実施例40:ヒトPRO937をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA49651と命名する。DNA49651コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO937のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー5CTCCGTGGTAAACCCCACAGCCC3配列番号:161逆方向PCRプライマー5TCACATCGATGGGATCCATGACCG3配列番号:162さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA49651配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5GGTCTCGTGACTGTGAAGCCATGTTACAACTACTGCTCAAACATCATGAG3配列番号:163全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO937遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織LB227から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO937の全長DNA配列[ここでDNA56436-1448と命名する図29;配列番号:159]及びPRO937の誘導タンパク質配列を与えた。DNA56436-1448の全ヌクレオチド配列を図96配列番号:159に示す。クローンDNA56436-1448は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置499-501に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置2167-2169に見られる停止コドンで終端する図96、配列番号:159。予測されるポリペプチド前駆体は556アミノ酸長であり、約62,412ダルトンの計算された分子量及び約6.62の見積もられたpIを有する。図97配列番号:160に示した全長PRO937配列の分析は、以下の特徴の存在を明らかにした:約アミノ酸1-22のシグナルペプチド;約アミノ酸515-523のATP/GTP結合部位モチーフAPループ;約アミノ酸514-517の潜在的Nグリコシル化部位;及び約アミノ酸54-74、106-156、238-279、309-345、423-459及び468-505のグリピカン相同性の部位。クローンDNA56436-1448は1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209902が付与されている。全長PRO937のアミノ酸配列の分析は、グリピカンタンパク質と有意な配列類似性をもつことを示唆し、それによりPRO937が新規なグリピカンタンパク質であることを示したいる。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO937アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、GPCKMOUSEGPS2RATGPC5HUMANGPC3HUMANPR30168CEC03H122GEN13820HS119E231HDACDROME及びAF0176371との間の有意な相同性が明らかになった。実施例41:ヒトPRO842をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのIncyteESTクラスター番号69572と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA54230と命名する。DNA54230コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA477092に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号AA477092を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図98に示し、ここでDNA56855-1447と命名する。図98に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置153-155に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置510-512の停止コドンで終端する図98;配列番号:164。予測されるポリペプチド前駆体は119アミノ酸長である図99;配列番号:165。PRO842は、約13,819ダルトンの計算された分子量及び約11.16の見積もられたpIを有する。PRO842の他の特徴は、約アミノ酸1-22シグナルペプチド、約アミノ酸39-41のタンパク質キナーゼCリン酸化部位、及び約アミノ酸27-32及び約アミノ酸46-51の潜在的Nグリコシル化部位を含む。図99配列番号:164に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO842アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CEZK13111PR80843RAT5HT2X1S818821A60912MCU60315137MC137LU934221pP91996U934621及びZN18HUMANとの間の或る程度の相同性が明らかになった。クローンDNA56855-1447は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203004が付与されている。実施例42:ヒトPRO839をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteのLIFESEQデータベースからのIncyteESTクラスター番号24479と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55709と命名する。DNA55709コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号754525に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン754525を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図100に示し、ここでDNA56859-1445と命名する。図100に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置2-4に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置263-265の停止コドンで終端する図100;配列番号:166。予測されるポリペプチド前駆体は87アミノ酸長である図101;配列番号:167。PRO839は、約9,719ダルトンの計算された分子量及び約4.67の見積もられたpIを有する。PRO839の他の特徴は、約アミノ酸1-23のシグナルペプチド、約アミノ酸37-40及び約アミノ酸85-87のタンパク質キナーゼCリン酸化部位、約アミノ酸37-40の潜在的カゼインキナーゼIIリン酸化部位、約アミノ酸50-60のリボヌクレオチドレダクターゼ大サブユニットタンパク質との配列同一性、及び約アミノ酸70-79の真核生物RNA結合領域RNP1タンパク質との配列同一性。図101配列番号:167に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO839アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CD14MOUSEXPR6YARLIHS7143851S49783BB19RABITGVPHHALMEAB0031351PR85453LUU270812及びTP2BMOUSEとの間の或る程度の相同性が明らかになった。クローンDNA56859-1445は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209019が付与されている。実施例43:ヒトPRO1180をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列Incyteクラスター配列番号14732の同定が可能となった。次いでこのIncyteクラスター配列番号14732配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55711と命名する。DNA55711コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号T60981に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンT60981を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図102に示し、ここでDNA56860-1510と命名した。図102に示す全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置78-80に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置909-911の停止コドンで終端する図102;配列番号:168。予測されるポリペプチド前駆体は277アミノ酸長であり、約31,416の計算された分子量及び約8.88の見積もられたpIを有する。図103配列番号:169に示した全長PRO1180配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸23のシグナルペプチド、約アミノ酸10~約アミノ酸31のロイシンジッパーパターン配列、及び約アミノ酸64~約アミノ酸69、約アミノ酸78~約アミノ酸83、約アミノ酸80~約アミノ酸85、約アミノ酸91~約アミノ酸96及び約アミノ酸201~約アミノ酸206のNミリストイル化部位。クローンDNA56860-1510は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209952が付与されている。全長PRO1180ポリペプチドのアミノ酸分析により、メチルトランスフェラーゼファミリーのタンパク質と配列類似性を有することが示唆された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた分析により、PRO1180アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MTC16514D69267YH09TEASTBIOCSERMAATAC00448415T1D1616SHGCPIR18SPBC3B94AB00950414PW1797及びA69952との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例44:ヒトPRO1134をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの7511と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55725と命名する。2つの独自に開発したEST配列を組立に用い、図106配列番号:172及び図107配列番号:173に示す。DNA55725コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H94897に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH94897を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図106に示し、ここでDNA56865-1491と命名する。クローンDNA56865-1491は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置153-155に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1266-1268の停止コドンで終端する図104。予測されるポリペプチド前駆体は371アミノ酸長である図105。図105に示した全長PRO1134は、約41,935ダルトンの見積もられた分子量及び約9.58のpIを有する。全長PRO1134の分析により以下のものの存在が明らかとなった:約アミノ酸1~約アミノ酸23のシグナルペプチド、約アミノ酸103~約アミノ酸106、約アミノ酸249~約アミノ酸252、及び約アミノ酸257~約アミノ酸260のNグリコシル化部位、及び約アミノ酸280~約アミノ酸306のチロシナーゼCuA結合領域タンパク質と相同性を有するアミノ酸ブロック。クローンDNA56865-1491は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203022が付与されている。図105配列番号:171に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1134アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:F20P518AC00239610S47847C64146GSPABACSUPW10564RFAIECOLIY258HAEINRFAJSALTY及びPR32985との間の有意な相同性が明らかになった。実施例45:ヒトPRO830をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの20251と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55733と命名する。DNA55733コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H78534に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH78534を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図108に示し、ここでDNA56866-1342と命名する。クローンDNA56866-1342は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置154-156に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置415-417の停止コドンで終端する図108。予測されるポリペプチド前駆体は87アミノ酸長である図109。図109に示した全長PRO830は、約9,272ダルトンの見積もられた分子量及び約9.19のpIを有する。図109配列番号:175に示す全長PRO830の分析により以下のものの存在が明らかとなった:約アミノ酸1~約アミノ酸33のシグナルペプチド、約アミノ酸2~約アミノ酸7及び約アミノ酸8~約アミノ酸13の潜在的Nミリストイル化部位、及び約アミノ酸23~約アミノ酸39のチオレドキシンファミリーのタンパク質相同性ブロック。クローンUNQ470DNA56866-1342は1998年6月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203023が付与されている。図109配列番号:175に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO830アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU881541HSU881531SAPKSGENE1HPU317915GGCNOT21CPU914211CHKESTPC091PQ0769U9755379及びB60095との間の有意な相同性が明らかになった。実施例46:ヒトPRO1115をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteのLIFESEQデータベースからのIncyteESTクラスター番号165008と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55726と命名する。DNA55726コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号R75784に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンR75784を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図111に示し、ここでDNA56868-1478と命名する。図110に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置189-191に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1524-1526の停止コドンで終端する図110;配列番号:176。予測されるポリペプチド前駆体は445アミノ酸長である図111;配列番号:177。PRO1115は、約50,533ダルトンの計算された分子量及び約8.26の見積もられたpIを有する。他の特徴は、約アミノ酸1-20のシグナルペプチド、約アミノ酸204-207、295-298及び313-316の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸35-54、75-97、126-146、185-204、333-350及び353-371の推定膜貫通ドメインを含む。図111配列番号:177に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1115アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF05394779S73698CEC47A104CCOMTNDS5G1HS4LMP2AC1LMP2EBVPA24MOUSEHCU333317PW05508及びAF0022731との間の或る程度の配列同一性が明らかになった。クローンDNA56868-1478は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203024が付与されている。実施例47:ヒトPRO1277をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、実施例1に記載したように、BLAST及びプログラムphrapの繰り返しサイクルを用いて他のEST配列に対して作成した。組立からの一又は複数のESTは疾患冠状動脈組織から誘導した。得られたコンセンサス配列を、ここでDNA49434と命名する。DNA49434コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3042605に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3042605を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図112配列番号:178に示した。クローンDNA56869-1545は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置188-190に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置2222-2224の停止コドンで終端する図112。予測されるポリペプチド前駆体は678アミノ酸長である図113。図113に示した全長PRO1277タンパク質は、約73,930ダルトンの見積もられた分子量及び約9.48のpIを有する。さらなる特徴は、約アミノ酸1-26のシグナルペプチド;約アミノ酸181-200の膜貫通ドメイン;及び約アミノ酸390-393及び520-523の潜在的Nグリコシル化部位を含む。図113配列番号:179に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1277アミノ酸配列と以下のDayhoff配列番号AF0122521との間の有意な相同性が明らかになった。相同性は、PRO1277アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0067401CA36HUMANHSU11HUMCOL7A1X1CA17HUMANMMZ781631CAMACHICKHSU692631YNX3CAEEL及びMMRNAM31との間にも見られた。クローンDNA56869-1545はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203161が付与されている。実施例48:ヒトPRO1135をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA52767と命名する。DNA52767コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1135のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAをDNA52767配列に基づいて調製したPCRプライマー対でPCR増幅することによりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及び対の一方を用いてPRO1135遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト冠状動脈平滑筋組織LIB309から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1135の全長DNA配列[ここでDNA56870-1492と命名する配列番号:180]及びPRO1135の誘導タンパク質配列を与えた。DNA56870-1492の全ヌクレオチド配列を図114配列番号:180に示す。クローンDNA56870-1492は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置62-64に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置1685-1687に見られる停止コドンで終端する図114。予測されるポリペプチド前駆体は541アミノ酸長である図115。図115に示した全長PRO1135配列は、約60,335ダルトンの見積もられた分子量及び約5.26のpIを有する。図115配列番号:181に示した全長PRO1135配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸21のシグナルペプチド;約アミノ酸53~約アミノ酸56、約アミノ酸75~約アミノ酸78、約アミノ酸252~約アミノ酸255及び約アミノ酸413~約アミノ酸416の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸399~約アミノ酸414のグリコシルヒドロラーゼファミリー35タンパク質と相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA56870-1492は1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209925が付与されている。全長PRO1135のアミノ酸配列の分析は、アルファ1,2マンノシダーゼタンパク質と有意な配列類似性をもつことを示唆し、それによりPRO1135が新規なグリピカンタンパク質であることを示したいる。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1135アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、DMC86E45D869671SPAC23A14YH04YEASTB54408SSMAN9MAN1CEZC4104S61631及びMSU141901との間の有意な相同性が明らかになった。実施例49:ヒトPRO1114をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例2ヒト胎児肺ライブラリに記載したアミラーゼスクリーニングで単離したcDNA配列を、WU-BLAST-2配列アラインメントコンピュータプログラムにより、他の公知のインターフェロンレセプターと或る配列同一性を持つことを見出した。このcDNA配列を、ここでDNA48466と命名して図118配列番号:184に示す。DNA48466分子から配列同一性に基づいてプローブを作成し、上記実施例2のパラグラフ1に記載したように調製したヒト乳癌LIB135ライブラリのスクリーニングに使用した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280、cDNAサイズ切断は2800bp未満であった。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5AGGCTTCGCTGCGACTAGACCTC3配列番号:185逆方向PCRプライマー:5CCAGGTCGGGTAAGGATGGTTGAG3配列番号:186ハイブリッド形成プローブ:5TTTCTACGCATTGATTCCATGTTTGCTCACAGATGAAGTGGCCATTCTGC3配列番号:187全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置250-252に見かけの翻訳開始部位、及びヌクレオチド位置1183-1185の停止シグナルを持つ図116;配列番号:182。予測されるポリペプチド前駆体は311アミノ酸長であり、約35,076ダルトンの計算された分子量及び約5.04の見積もられたpIを有する。図117配列番号:183に示すPRO1114配列の分析により以下の存在が明らかとなった:約アミノ酸1~約アミノ酸29のシグナルペプチド、約アミノ酸230~約アミノ酸255の膜貫通ドメイン、約アミノ酸40~約アミノ酸43及び約アミノ酸134~約アミノ酸137の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸92~約アミノ酸119の組織因子タンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック、及び約アミノ酸232~約アミノ酸262のインテグリンアルファ鎖タンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンDNA57033-1403は1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209905が付与されている。図117配列番号:183に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1114アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:G01418INR1MOUR71035INGSHUMANA265951A265931I56215及びTFHUMANとの間の有意な相同性が明らかになった。実施例50:ヒトPRO828をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を上記実施例1に記載した方法を用いて作成した。このコンセンサス配列をここでDNA35717と命名する。DNA35717コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO828のコード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した:正方向PCRプライマー:5GCAGGACTTCTACGACTTCAAGGC3配列番号:190逆方向PCRプライマー:5AGTCTGGGCCAGGTACTTGAAGGC3配列番号:191さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA35717配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ:5CAACATCCGGGGCAAACTGGTGTCGCTGGAGAAGTACCGCGGATCGGTGT3配列番号:192全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO828遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児肺組織LIB25から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO828の全長DNA配列[ここでDNA57037-1444と命名される]図188及びPRO828の誘導タンパク質配列を与えた。PRO828の全コード化配列を図119配列番号:188に示す。クローンDNA57037-1444は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置34-36に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置595-597の停止コドンで終端する図119。予測されるポリペプチド前駆体は187アミノ酸長である図120。図120に示した全長PRO828タンパク質は約20,996ダルトンの見積もられた分子量及び約8.62のpIを有する。図120配列番号:189に示した全長PRO828配列の分析により、以下のものの存在が明らかとなった:約アミノ酸1-21のシグナルペプチド;約アミノ酸82-89のグルタチオンペルオキシダーゼシグネーチャー2との配列同一性;約アミノ酸35-60、63-100、107-134及び138-159のグルタチオンペルオキシダーゼセレノシステインタンパク質との配列同一性。クローンDNA57037-1444は1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209903が付与されている。全長PRO828ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、グルタチオンペルオキシダーゼと有意な配列類似性を持つことを示唆し、それによりPRO828は新規なペルオキシダーゼ酵素であることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO828アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0533111CELT09A122AC0041513BTUEECOLICER05H103PP80918PWU889071及びPW22308との間の配列同一性が明らかになった。実施例51:ヒトPRO1009をコードするcDNAクローンの単離天然ヒトPRO1009をコードするcDNAクローンDNA57129-1413を、好ましくは一次cDNAクローンの5’末端を代表するSKLu1腺癌細胞系cDNAライブラリにおいて、酵母スクリーニングを用いて同定した。最初に配列番号:195図123を同定し、それを他のEST配列に対するアラインメントにより伸長してコンセンサス配列を形成した、コンセンサス配列に基づくオリゴヌクレオチドプローブを合成し、全長DNA57129-1413クローンをもたらすcDNAライブラリのスクリーニングに使用した。図121に示す全長DNA57129-1413クローンは、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置41-43に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置1886-1888の停止コドンで終端する図121;配列番号:193。予測されるポリペプチド前駆体は615アミノ酸長である図122、配列番号:194。図122は、シグナル配列、膜貫通ドメイン、ミリストイル化部位、グリコシル化部位及びAMP結合ドメインのおよその位置も示している。PRO1009は約68,125ダルトンの計算された分子量及び約7.82の見積もられたpIを有する。クローンDNA57129-1413はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209977が付与されている。寄託されたクローンは、実際の正しい配列を有し、ここでの提示は微量の通常の配列誤差を含みうると理解される。全長配列のALIGNコンピュータプログラムを用いたWUBLAST2配列アラインメント分析に基づき、PRO1009は、少なくともDayhoffデータベーで以下のように称される以下のタンパク質と配列同一性を有することが示された:F69893CEF28F82BSY139177BSY139177D69187D69649XCRPEB1E649928YDIDECOLIBNACSF81及びRPU753632。実施例52:ヒトPRO1007をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を実施例1に記載したように他のEST配列に対してphrapを用いて作成した。このコンセンサス配列をここでDNA40671と命名する。DNA40671コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号T70513に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンT70513を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図124に示す。DNA57690-1374の全ヌクレオチド配列を図124配列番号:196に示す。クローンDNA57690-1374は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置16-18に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置1054-1056の停止コドンで終端する図124。予測されるポリペプチド前駆体は346アミノ酸長である図125。図125に示す全長PRO1007タンパク質は約35,917ダルトンの見積もられた分子量及び約8.17のpIを有する。クローンDNA57690-1374は1998年6月9日にATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。ここでの代表的な図面は代表的な番号付けを示す。全長PRO1007ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、その一部がMAGPIAPと配列同一性を有することが示唆され、それによりPRO1007がMAGPIAPが属するファミリーの新規なメンバーであることを示している。配列番号:197のアミノ酸配列のさらなる分析により、推定シグナルペプチドは配列番号:197の約アミノ酸1-30である。膜貫通ドメインは配列番号:197のおよそアミノ酸325-346である。Nグリコシル化部位は、配列番号:197のおよそアミノ酸118-121、129-132、136-166、176-179、183-186及び227-130である。Ly6/uParドメインタンパク質相同性は配列番号:197のおよそアミノ酸17-36及び209-222である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。実施例53:ヒトPRO1056をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここで6425と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55736と命名する。DNA55736コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号R88049に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号R88049を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図126に示し、ここでDNA57693-1424と命名する。クローンDNA57693-1424は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置56-58に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置416-418の停止コドンで終端する図126。予測されるポリペプチド前駆体は120アミノ酸長である図127。図127に示す全長PRO1056タンパク質は、約13,345の見積もられた分子量及び約5.18のpIを有する。図127配列番号:199に示した全長PRO1056配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸18のシグナルペプチド、約アミノ酸39~約アミノ酸58の膜貫通ドメイン、約アミノ酸86~約アミノ酸89の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸36~約アミノ酸38及び約アミノ酸58~約アミノ酸60のタンパク質キナーゼCリン酸化部位、約アミノ酸25~約アミノ酸32のチロシンキナーゼリン酸化部位、及び約アミノ酸24~約アミノ酸56のチャンネル形成コリシンタンパク質に対して相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA57693-1424は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203008が付与されている。図127配列番号:199に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1056アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PLMHUMANA4053ATNGHUMANA55571ATNGSHEEPS31524GEN13025RICMOUSEA48678及びA108711との間の有意な相同性が明らかになった。実施例54:ヒトPRO826をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、47283と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56000と命名する。DNA56000コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号W69233に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号W69233を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図128に示し、ここでDNA57694-1341と命名する。クローンDNA57694-1341は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置13-15に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置310-312の停止コドンで終端する図128。予測されるポリペプチド前駆体は99アミノ酸長である図129。図129に示す全長PRO826タンパク質は、約11,050の見積もられた分子量及び約7.47のpIを有する。図129配列番号:201に示した全長PRO826配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸22のシグナルペプチド、約アミノ酸22~約アミノ酸27及び約アミノ酸90~約アミノ酸95の潜在的Nミリストイル化部位、約アミノ酸16~約アミノ酸48のペルオキシダーゼに相同性を有するアミノ酸ブロック。クローンDNA57694-1341は1998年6月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203017が付与されている。図129配列番号:201に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO826アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CCU123151SCU961086CELF39F104及びHELTHELHOとの間の有意な相同性が明らかになった。実施例55:ヒトPRO819をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、49605と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56015と命名する。DNA56015コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H65785に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号H65785を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図130に示し、ここでDNA57695-1340と命名する。クローンDNA57695-1340は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置46-48に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置202-204の停止コドンで終端する図130。予測されるポリペプチド前駆体は52アミノ酸長である図131。図131に示す全長PRO819タンパク質は、約5,216の見積もられた分子量及び約4.67のpIを有する。図131配列番号:203に示した全長PRO819配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸24のシグナルペプチド、約アミノ酸2~約アミノ酸7の潜在的Nミリストイル化部位、及び約アミノ酸5~約アミノ酸33の免疫グロブリン軽鎖に相同性を有する領域。クローンDNA15695-1340は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203006が付与されている。図131配列番号:203に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO819アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU038991HUMIGLITEB1VG28HSVSAAF315221PAD1YEAST及びAF0454841との間の有意な相同性が明らかになった。実施例56:ヒトPRO1006をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用して、Incyteクラスター配列番号45748から最初の候補配列を同定した。次いでこの配列を、種々の公的データベース及びIncyteEST配列と比較して、ここでDNA56036と称されるコンセンサス配列を同定した。DNA56036コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号489737に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号489737を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図132に示す。DNA57699-1412の全ヌクレオチド配列を図132配列番号:204に示す。クローンDNA57699-1412は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置28-30に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1204-1206の停止コドンで終端する図132。予測されるポリペプチド前駆体は392アミノ酸長である図133。図133に示す全長PRO1006タンパク質は、約46,189の見積もられた分子量及び約9.04のpIを有する。クローンDNA57699-1412はATCCに寄託されている。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:205のアミノ酸配列のさらなる分析により、推定シグナルペプチドは配列番号:205の約アミノ酸1-23であるNグリコシル化部位は配列番号:205のおよそアミノ酸40-43、53-56、204-207及び373-376である。Nミリストイル化部位は、配列番号:205のおよそアミノ酸273-278である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。実施例57:ヒトPRO1112をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により特定のEStクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56018と命名する。DNA56018コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA223546に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号AA223546を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図134に示し、ここでDNA57702-1476と命名する。DNA57702-1476の全ヌクレオチド配列を図134配列番号:206に示す。クローンDNA57702-1476は単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:206のヌクレオチド位置20-22に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置806-808の停止コドンで終端する図134。予測されるポリペプチド前駆体は262アミノ酸長である図135。図135に示す全長PRO1112タンパク質は、約29,379の見積もられた分子量及び約8.93のpIを有する。また図135はシグナルペプチド及び膜貫通ドメインのおよその位置も示す。クローンDNA57702-1476は1998年6月9日にATCCに寄託されている。寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO1112ポリペプチドのアミノ酸分析により、他のタンパク質との或る程度の相同性が示唆された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1112アミノ酸配列と少なくとも以下のDayhoff配列:MTY20B1113F64471AE0006906XLU163641E43259及びPIGSLADRXE1との間の或る程度の配列同一性が明らかになった。実施例58:ヒトPRO1074をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列Incyteクラスター配列番号42586の同定が可能となった。次いでこのクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56251と命名する。DNA56251コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA081912に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号AA081912を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図136に示し、PRO1074に対する全長DNA配列である。クローンDNA57704-1452は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209953が付与されている。DNA57704-1452の全長ヌクレオチド配列を図136配列番号:208に示す。クローンDNA57704-1452は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置322-324に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1315-1317の停止コドンで終端する図136。予測されるポリペプチド前駆体は331アミノ酸長である図137。図137に示す全長PRO1074タンパク質は、約39,512の見積もられた分子量及び約8.03のpIを有する。図137配列番号:209に示した全長PRO1074配列の分析は、以下の特徴の存在を明らかにした:約アミノ酸20-39の膜貫通ドメイン;約アミノ72-75、154-157、198-201、212-215及び326-329の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸239-242のグリコサミノグリカン結合部位、及び約アミノ酸23-36のLy6/uPARドメイン。全長PRO1074ポリペプチドのアミノ酸分析により、ベータ1,3ガラクトシルトランスフェラーゼとの有意な配列類似性が示唆され、PRO1074がガラクトシルトランスフェラーゼファミリーのタンパク質の新規なメンバーであることが示された。他のタンパク質との或る程度の相同性が示唆された。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた全長PRO1074ポリペプチドの分析により、PRO1074アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0297921PR57433DMU414491AC00034814PR47479CET09F52CEF14B64CET15D65CEC54C84及びCEE03H410との間の相同性が明らかになった。クローンDNA57704-1452は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209953が付与されている。実施例59:ヒトPRO1005をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、LIFESEQデータベースからのESTクラスター配列、Incyteクラスター配列番号49243の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56380と命名する。DNA56380コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA256657に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号AA256657を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図138に示し、ここでDNA57708-1411と命名する。図138に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置30-32に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置585-587の停止コドンで終端する図138;配列番号:210。予測されるポリペプチド前駆体は185アミノ酸長である図139;配列番号:211。PRO1005タンパク質は、約20,331の計算された分子量及び約5.85の見積もられたpIを有する。クローンDNA57708-1411は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203021が付与されている。図139配列番号:211に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1005アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:DDU071871DDU879121CELD100714A42239DDU425971CYAGDICDIS50452MRKCKLEPNPR41998及びXYNARUMFLとの間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例60:ヒトPRO1073をコードするcDNAクローンの単離ここでDNA55938と命名され図142配列番号:214に示す最初のDNA配列を、一次cDNAクローンの5’末端を優勢に示すヒトSKLu1肉芽腫細胞系cDNAライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した。次いでDNA55938を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAからのESTsと、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて比較した。ESTsは、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56411と命名する。DNA56411コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H86027に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH86027を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図140に示た。図140に示した全長DNA57710-1451クロンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置345-347に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1214-1244に見られる停止コドンで終端する図140;配列番号:212。予測されるポリペプチド前駆体は299アミノ酸長である図141;配列番号:213。PRO1073は、約34,689の計算された分子量及び約11.49の見積もられたpIを有する。PRO1173配列は以下のさらなる特徴を持つ:約アミノ酸1031のシグナルペプチド、約アミノ酸のbZIP転写因子塩基性ドメインシグネーチャーに対する配列同一性、約アミノ酸2-5の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸158-183のプロタミンP1タンパク質に対する配列同一性。図141配列番号:213に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1073アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MMU373511ATAC00250510T9J2210S59043ENXNUPR1B4328SR55DROMES26650SONHUMANVIT2CHICK及びXLC4SRPRT1との間の或る程度の配列同一性が明らかになった。クローンDNA57710-1451は1998年6月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203048が付与されている。実施例61:ヒトPRO1152をコードするcDNAクローンの単離天然ヒトPRO1152ポリペプチドをコードするcDNAクローンDNA57711-1501を、一次cDNAクローンの5’末端を優勢に示すヒト乳児脳cDNAライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した。特に、酵母スクリーニングは、ここでDNA55807配列番号:217;図145参照と命名されるcDNAを同定するのに用いた。DNA55807配列とMerckのESTクローン番号R56756に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンR56756を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図143に示す。図143に示した全長DNA57711-1501クロンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置58-60に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1495-1497の停止コドンで終端する図143。予測されるポリペプチド前駆体は479アミノ酸長である図144。図144に示したPRO1152タンパク質は、約53,602の見積もられた分子量及び約8.82のpIを有する。図144配列番号:216に示した全長PRO1152配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸28のシグナル配列、約アミノ酸133~約アミノ酸155、約アミノ酸168~約アミノ酸187、約アミノ酸229~約アミノ酸247、約アミノ酸264~約アミノ酸285、約アミノ酸309~約アミノ酸330、約アミノ酸371~約アミノ酸390及び約アミノ酸441~約アミノ酸464の膜貫通ドメイン、約アミノ酸34~約アミノ酸37及び約アミノ酸387~約アミノ酸390の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸243~約アミノ酸287の呼吸鎖NADHデヒドロゲナーゼサブユニットと相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンDNA57711-1501は1998年6月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203047が付与されている。図144配列番号:216に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1152アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0522391SYNN9CGA1SFCYTB1GEN12507PR11769MTV025109C61168S43171PP61689及びPP61696との間の有意な相同性が明らかになった。実施例62:ヒトPRO1136をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの、ここで109142と命名されるESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56039と命名する。DNA56039コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号HSC1NF011に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンHSC1NF011を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図146に示し、ここでDNA57827-1493と命名する。クローンDNA57827-1493は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置216-218に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置2112-2114の停止コドンで終端する図146。予測されるポリペプチド前駆体は632アミノ酸長である図147。図147に示す全長PRO1136タンパク質は、約69,643の見積もられた分子量及び約8.5のpIを有する。図147配列番号:219に示した全長PRO1136配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸15のシグナルペプチド、約アミノ酸108~約アミノ酸11、約アミノ酸157~約アミノ酸160、289~約アミノ酸292及び約アミノ酸384~約アミノ酸387の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA57827-1493は1998年6月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203045が付与されている。図147配列番号:219に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1136アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0347451MMAF00016819HSMUPP11AF0605391SP97RATI38757ltMMU933091CEK01A64及びHSA2247471との間の有意な相同性が明らかになった。実施例63:ヒトPRO813をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列IncyteESTクラスター配列番号45501の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列番号45501を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56400と命名する。DNA56400コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号T90592に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号T90592を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図148に示し、ここでDNA57834-1339と命名する。図148に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置109-111に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置637-639の停止コドンで終端する図149;配列番号:221。予測されるポリペプチド前駆体は176アミノ酸長であり、約19,616の計算された分子量及び約7.11の見積もられたpIを有する。図149配列番号:221に示した全長PRO813配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸26のシグナルペプチド、約アミノ酸48~約アミノ酸53、約アミノ酸153~約アミノ酸158、156~約アミノ酸161及び約アミノ酸167~約アミノ酸172の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA57834-1339は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209954が付与されている。全長PRO813ポリペプチドのアミノ酸分析により、複数の表面関連プロテインCと配列同一性を有することが示唆された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO813アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PSPCMUSVIPP92071G02964PR65489ltPP82977PR84555S55542MUSIGHAJ1及びPH1158との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例64:ヒトPRO809をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56418と命名する。DNA56418コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H74302に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号H74302を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図150に示し、ここでDNA57836-1338と命名する。DNA57836-1338の全長ヌクレオチド配列を図150配列番号:222に示す。クローンDNA57836-1338は単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:222のヌクレオチド位置63-65に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置858-860の停止コドンで終端する図150。予測されるポリペプチド前駆体は265アミノ酸長である図151。図151に示す全長PRO809タンパク質は約29,061の見積もられた分子量及び約9.18のpIを有する。図151はシグナルペプチド及びNグリコシル化部位のおよその位置も示す。対応するヌクレオチドは、図150を参照して容易に決定できる。クローンDNA57836-1338は1998年6月23日にATCCに寄託された。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO809ポリペプチドのアミノ酸配列分析により、ヘパリン表面プロテオグリカン及び内皮細胞接着因子1と或る程度の配列相同性を有することが示唆された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO809アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PGBMMOUSED820821及びPW14158との間の配列同一性が明らかになった。実施例65:ヒトPRO791をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56429と命名する。DNA56429コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号36367に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローン番号36367を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図152に示し、ここでDNA57838-1337と命名する。DNA57838-1337の全長ヌクレオチド配列を図152配列番号:224に示す。クローンDNA57838-1337は単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:224のヌクレオチド位置9-11に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置747-749の停止コドンで終端する図152。予測されるポリペプチド前駆体は246アミノ酸長である図153。図153に示す全長PRO791タンパク質は約27,368の見積もられた分子量及び約7.45のpIを有する。図153はシグナルペプチド、膜貫通ドメイン及びNグリコシル化部位及び細胞外タンパク質に保存される領域のおよその位置も示す。対応するヌクレオチドは、図152を参照してここに提供する一実施態様である。クローンDNA57838-1337は1998年6月23日にATCCに寄託された。配列について、寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO791ポリペプチドのアミノ酸配列分析により、MHCI抗原と配列類似性を有することが示唆され、PROがMHCI抗原に関連することが示された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO791アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0343461MMQ1K51及びHFEHUMANとの間の或る程度の配列同一性が明らかになった。実施例66:ヒトPRO1004をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteESTクラスター配列、Incyteクラスター配列番号73681の同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56516と命名する。DNA56516コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号H43837に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンH43837を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図154に示す。図154に示す全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置119-121に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置464-466の停止コドンで終端する図154;配列番号:226。予測されるポリペプチド前駆体は115アミノ酸長である図155;配列番号:227。図155に示す全長PRO1004タンパク質は、約13,649の見積もられた分子量及び約9.58のpIを有する。図155配列番号:227に示した全長PRO1004配列の分析は、以下の特徴の存在を明らかにした:約アミノ酸113-115の微小体C末端標的化シグナル、約アミノ酸71-74の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸22-48のジヒドロフォレートレダクターゼタンパク質と配列同一性を持つドメイン。全長PRO1004ポリペプチドのアミノ酸配列の、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた分析により、PRO1004アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CELR02D37LECIMOUSEAF06691SSZ97390SSZ973951及びSSZ974001との間の相同性が明らかになった。クローンDNA57844-1410は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203010が付与されている。実施例67:ヒトPRO1111をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを検索し、インシュリン様成長因子結合タンパク質と相同性を持つESTを同定した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児脳から単離した。PRO1111をコードするcDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。上記のように調製したヒト胎児脳cDNAライブラリを、上記のIncyteEST配列に基づく合成オリゴヌクレオチドプローブ:5CCACCACCTGGAGGTCCTGCAGTTGGGCAGGAACTCCATCCGGCAGATTG3でのハイブリッド形成によりスクリーニングした。同定したcDNAクローンは全体を配列決定した。PRO1111の全ヌクレオチド配列を図156配列番号:228に示す。クローンDNA58721-1475は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置57-59に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置2016-2018の停止コドンを持つ図156;配列番号:228。予測されるポリペプチド前駆体は653アミノ酸長である図157。膜貫通ドメインは位置21-40II型及び528-548である。クローンDNA58721-1475はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203110が付与されている。図157に示した全長PRO1111タンパク質は約72,717ダルトンの見積もられた分子量及び約6.99のpIを有する。図157配列番号:229に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1111アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:A58532D869831RNPLGPVVPGS2HUMANAF0381271ALSMOUSEGPVHUMANPGS2BOVINALSPAPPA及びI147020との間の或る程度の配列同一性が明らかになった。実施例68:ヒトPRO1344をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、上記実施例1に記載したようにphrapを用いて他のEST配列に対して作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA33790と命名する。DNA33790配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1344の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5AGGTTCGTGATGGAGACAACCGCG3配列番号:232逆方向PCRプライマー5TGTCAAGGACGCACTGCCGTCATG3配列番号:233さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA33790配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5TGGCCAGATCATCAAGCGTGTCTGTGGCAACGAGCGGCCAGCTCCTATCC3配列番号:234全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1344遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1344の全長DNA配列ここでDNA58723-1588と命名する[図158、配列番号:230]及びPRO1344の誘導タンパク質配列を与えた。DNA58723-1588の全核酸配列を図158配列番号:230に示す。クローンDNA58723-1588は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置26-28に見かけの翻訳開始部位そしてヌクレオチド位置2186-2188の停止コドンで終端する図158。予測されるポリペプチド前駆体は720アミノ酸長である図159。図159に示した全長PRO1344タンパク質は約80,199ダルトンの見積もられた分子量及び約7.77のpIを有する。図159配列番号:231に示した全長PRO1344配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸23のシグナルペプチド、約アミノ酸260~約アミノ酸271のEGF様ドメインシステインタンパク質シグネーチャー配列、約アミノ酸96~約アミノ酸99、約アミノ酸279~約アミノ酸282、約アミノ酸316~約アミノ酸319、約アミノ酸451~約アミノ酸454及び約アミノ酸614~約アミノ酸617の潜在的Nグリコシル化部位、約アミノ酸489~約アミノ酸505のセリンプロテアーゼ、トリプシンファミリーと相同性を持つアミノ酸配列ブロック、及び約アミノ酸150~約アミノ酸166のCUBドメインタンパク質プロフィール配列。クローンDNA58723-1588は1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203133が付与されている。図159配列番号:231に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1344アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S770631CRARMOUR74775PP90070PR09217PP70475HSBMP161及びU503301との間の有意な相同性が明らかになった。実施例69:ヒトPRO1109をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、上記実施例1に記載したようにphrapを用いて他のEST配列に対して作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA52642と命名する。できる限り上記のようなEST配列の供給源を用いて前もって得たコンセンサス配列のBLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いた伸長によりコンセンサスDNA配列を得た。DNA52642配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1109の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5CCTTACCTCAGAGGCCAGAGCAAGC3配列番号:237逆方向PCRプライマー5GAGCTTCATCCGTTCTGCGTTCACC3配列番号:238さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA52642配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5CAGGAATGTAAAGCTTTACAGAGGGTCGCCATCCTCGTTCCCCACC3配列番号:239全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1109遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒトSKLu1肉芽腫細胞組織LIB247から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1109の全長DNA配列ここでDNA58737-1473と命名する[図160、配列番号:235]及びPRO1109の誘導タンパク質配列を与えた。DNA58737-1473の全核酸配列を図160配列番号:235に示す。クローンDNA58737-1473は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置119-120に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1151-1153の停止コドンで終端する図160。予測されるポリペプチド前駆体は344アミノ酸長である図161。図161に示した全長PRO1109タンパク質は約40,041ダルトンの見積もられた分子量及び約9.34のpIを有する。図161配列番号:236に示した全長PRO1109配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸27のシグナルペプチド、約アミノ酸4~約アミノ酸7、約アミノ酸220~約アミノ酸223及び約アミノ酸335~約アミノ酸338の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸191~約アミノ酸201のキシロースイソメラーゼタンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンDNA58737-1473は1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203136が付与されている。図161配列番号:236に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1109アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSUDPGAL1HSUDPB141NALSBOVINHSU104731CEW02B1211YNJ4CAEELAE00073811CET24D11S48121及びCEGLY91との間の有意な相同性が明らかになった。実施例70:ヒトPRO1383をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、上記実施例1に記載したようにphrapを用いて他のEST配列に対して作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA53961と命名する。DNA53961配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO1383の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正及び逆を合成した::正方向PCRプライマー5CATTTCCTTACCCTGGACCCAGCTCC3配列番号:242逆方向PCRプライマー5GAAAGGCCCACAGCACATCTGGCAG3配列番号:243さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つDNA53961配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5CCACGACCCGAGCAACTTCCTCAAGACCGACTTGTTTCTCTACAGC3配列番号:244全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO1383遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児脳組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO1383の全長DNA配列ここでDNA58743-1609と命名する[図162、配列番号:240]及びPRO1383の誘導タンパク質配列を与えた。DNA58743-1609の全核酸配列を図162配列番号:240に示す。クローンDNA58743-1609は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置122-124に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1391-1393の停止コドンで終端する図162。予測されるポリペプチド前駆体は423アミノ酸長である図163。図163に示した全長PRO1383タンパク質は約46,989ダルトンの見積もられた分子量及び約6.77のpIを有する。図163配列番号:241に示した全長PRO1383配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸24のシグナルペプチド、約アミノ酸339~約アミノ酸362の膜貫通ドメイン、及び約アミノ酸34~約アミノ酸37、約アミノ酸58~約アミノ酸61、約アミノ酸142~約アミノ酸145、約アミノ酸197~約アミノ酸200、約アミノ酸300~約アミノ酸303及び約アミノ酸364~約アミノ酸367のNグリコシル化部位。クローンDNA58743-1609は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203154が付与されている。図163配列番号:241に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1383アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:NMBHUMANQNRCOTJAPW38335P115CHICKPW38164A459931MMU702091D837041及びPW39176との間の有意な相同性が明らかになった。実施例71:ヒトPRO1003をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで43055と命名される単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこの配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでconsen01と命名する。コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2849382に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン2849382を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図164に示た。DNA58846-1409の全ヌクレオチド配列を図164配列番号:245に示す。クローンDNA58846-1409は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置41-43に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置293-295の停止コドンで終端する図164。予測されるポリペプチド前駆体は84アミノ酸長である図165。図165に示す全長PRO1003は、約9,408の見積もられた分子量及び約9.28のpIを有する。図165配列番号:246に示した全長PRO1003配列の分析は、約アミノ酸1~約アミノ酸24のシグナルペプチド、約アミノ酸58~約61のcAMP及びcGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位の存在を明らかにした。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた全長PRO1003ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、PRO1003アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AOPCZA3633SRTXATRENA48298MHVJHMS1VGL2CVMJHDHDHTC22CORTRATTAL6HUMANPW14123及びDVUFI2との間の相同性が明らかになった。実施例72:ヒトPRO1108をコードするcDNAクローンの単離コンセンサスDNA配列を、上記の実施例1に記載したようにphrapを用いて他のEST配列に対して作成した。このコンセンサス配列を、ここでDNA53237と命名する。DNA53237コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2379881に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン2379881を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図166に示し、ここでDNA58848-1472と命名する。DNA58848-1472の全ヌクレオチド配列を図166配列番号:247に示す。クローンDNA58848-1472は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置77-79に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1445-1447の停止コドンで終端する図166。予測されるポリペプチド前駆体は456アミノ酸長である図167。図167に示す全長PRO1108タンパク質は、約52,071の見積もられた分子量及び約9.46のpIを有する。図167配列番号:248に示した全長PRO1108配列の分析は、以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸22~約アミノ酸42、約アミノ酸156~約アミノ酸176、約アミノ酸180~約アミノ酸199及び約アミノ酸369~約アミノ酸388のII型膜貫通ドメイン、約アミノ酸247~約アミノ酸250、約アミノ酸327~約アミノ酸330、約アミノ酸328~約アミノ酸331及び約アミノ酸362~約アミノ酸365の潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸153~約アミノ酸190のERルーメンタンパク質保持レセプタータンパク質と相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA58848-1472は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209955が付与されている。全長PRO1108ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、LPAATタンパク質と有意な配列類似性を有することが示唆され、それによりPRO1108が新規なLPAAT相同体であることが示された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1108アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF015111CER07E32YL35CAEELS73863CEF59F44PW06422MMU417361MTV00839PR99248及びY67BPT7との間の相同性が明らかになった。実施例72:ヒトPRO1137をコードするcDNAクローンの単離SwissProt公的タンパク質データベースからの約950の公知の分泌タンパク質からの細胞外ドメインECD配列必要ならば、分泌シグナルを含むを、発現配列タグESTデータベースの検索に使用した。ESTデータベースは、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いてEST配列の6フレーム翻訳に対するECDタンパク質配列の比較として実施した。この手法を用いて、ここでDNA7108とも称されるIncyteEST番号3459449を、公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア70以上を持つEStとして同定した。コンセンサスDNA配列を、BLAST及びプログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonの繰り返しサイクルを用いてDNA7108配列及び他のESTに対して構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA53952と命名する。DNA53952コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3663102に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3663102を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図168に示す。DNA58849-1494の全ヌクレオチド配列を図168配列番号:249に示す。クローンDNA58849-1494は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置77-79に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置797-799の停止コドンで終端する図168。予測されるポリペプチド前駆体は240アミノ酸長である図169。図169に示す全長PRO1137タンパク質は、約26,064の見積もられた分子量及び約8.65のpIを有する。図169配列番号:250に示した全長PRO1137配列の分析は、約アミノ酸1~14のシグナルペプチド及び約アミノ酸101~105の潜在的Nグリコシル化部位の存在を明らかにした。全長PRO1137ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、リボシルトランスフェラーゼと有意な配列類似性を有することが示唆され、それによりPRO1137がリボシルトランスファラーゼファミリーのタンパク質の新規なメンバーであることが示された。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1137アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MMART51NARGMOUSEGEN1909GEN13794GEN14406MMRNART621及びPR41876との間の相同性が明らかになった。実施例74:ヒトPRO1138をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで165212と命名される単一のIncyteEST配列の同定が可能となった。次いでこのクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA54224と命名する。この組立物は、ここでDNA49140図172;配列番号:254と命名される独自に開発したジェネンテクESTを含んでいた。DNA54224コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3836613に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3836613を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図170に示し、PRO1138の全長DNA配列である。クローンDNA58850-1495は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209956が付与されている。DNA58850-1495の全ヌクレオチド配列を図170配列番号:252に示す。クローンDNA58850-1495は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置38-40に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1043-1045の停止コドンで終端する図170。予測されるポリペプチド前駆体は335アミノ酸長である図171。図171に示す全長PRO1138は、約37,421ダルトンの見積もられた分子量及び約6.36のpIを有する。図171配列番号:253に示した全長PRO1138配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸22のシグナルペプチド、約アミノ酸224~約250の膜貫通ドメイン;約アミノ酸229~約アミノ酸250のロイシンジッパーパターン;約アミノ酸98-101、142-145、148-151、172-175、176-179、204-207及び291-295の潜在的グリコシル化部位。全長PRO1138のアミノ酸配列の分析は、CD84との有意な配列類似性を示唆し、それによりPRO1138がIgスーパーファミリーのポリペプチドの新規なメンバーであることを示している。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた全長PRO1138ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、PRO1138アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU829881HUMLY91PR97631PR97628PR97629PR97630CD48RATCD2HUMANPP93996及びHUMBGP1との間の相同性が明らかになった。クローンDNA58850-1495は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209956が付与されている。実施例75:ヒトPRO1054をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで66212と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55722と命名する。DNA55722コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号319751に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン319751を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図173に示し、ここでDNA58853-1423と命名する。クローンDNA58853-1423は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置46-48に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置586-588の停止コドンで終端する図173。予測されるポリペプチド前駆体は180アミノ酸長である図174。図174に示す全長PRO1054タンパク質は、約20,638ダルトンの見積もられた分子量及び約5.0のpIを有する。図174配列番号:256に示した全長PRO1054配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸18のシグナルペプチド、約アミノ酸155~約アミノ酸176のロイシンジッパーパターン;約アミノ酸27~約アミノ酸38及び約アミノ酸110~約アミノ酸120のリポカリンタンパク質と相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA58853-1423は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203016付与されている。図174配列番号:256に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1136アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MUP1MOUSEMUP6MOUSEMUP2MOUSEMUP2MOUSEMUP8MOUSEMUP5MOUSEMUP4MOUSES10124MUPMMOUSEMUPRAT及びECU708231との間の有意な相同性が明らかになった。実施例76:ヒトPRO994をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで157555と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55728と命名する。DNA55728コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2860366に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン2860366を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図175に示し、ここでDNA58855-1422と命名する。クローンDNA58855-1422は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置31-33に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置718-720の停止コドンで終端する図175。予測されるポリペプチド前駆体は229アミノ酸長である図176。図176に示す全長PRO994タンパク質は、約25,109ダルトンの見積もられた分子量及び約6.83のpIを有する。図176配列番号:258に示した全長PRO994配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸10~約アミノ酸31、約アミノ酸50~約アミノ酸72、約アミノ酸87~約アミノ酸110及び約アミノ酸191~約アミノ酸213の膜貫通ドメイン、約アミノ酸80~約アミノ酸83、約アミノ酸132~約アミノ酸135、約アミノ酸148~約アミノ酸151及び約アミノ酸163~約アミノ酸166の213潜在的Nグリコシル化部位、及び約アミノ酸4~約アミノ酸11のTNFR/NGFR脂捨て印リッチ領域タンパク質と相同性を持つアミノ酸ブロック。クローンDNA58855-1422は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203018付与されている。図176配列番号:258に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO994アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0272041TAL6HUMANILT4HUMANJC6205MMU575701S40363ETU560931S42858PR66849及びPR74751との間の有意な相同性が明らかになった。実施例77:ヒトPRO812をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで170079と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA55721と命名する。DNA55721コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号388964に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン388964を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図177に示し、ここでDNA59205-1421と命名する。クローンDNA59205-1421は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置55-57に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置304-306の停止コドンで終端する図177。予測されるポリペプチド前駆体は83アミノ酸長である図178。図178に示す全長PRO812タンパク質は、約9,201ダルトンの見積もられた分子量及び約9.3のpIを有する。図178配列番号:260に示した全長PRO812配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸15のシグナルペプチド、約アミノ酸73~約アミノ酸76のcAMP及びcGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、及び約アミノ酸70~約アミノ酸72及び約アミノ酸76~約アミノ酸78のタンパク質キナーゼCリン酸化部位。クローンDNA59205-1421は1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203009付与されている。図178配列番号:260に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO812アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PW35802PW35803PSC1RATS68231GEN13917PSC2RATCC10HUMANUTERRABITAF0085951及びA56413との間の有意な相同性が明らかになった。実施例78:ヒトPRO1069をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで100727と命名される単一のIncyteEST配列の同定が可能となった。次いでこの配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56001と命名する。DNA56001コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3533881に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3533881を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図179に示し、これはPRO1069の全長DNA配列である。クローンDNA59211-1450は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209960が付与されている。図179配列番号:261にDNA59211-1450の全ヌクレオチド配列を示す。クローンDNA59211-1450は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置197-199に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置464-466の停止コドンで終端する。予測されるポリペプチド前駆体は89アミノ酸長である図180。図180に示す全長PRO1069タンパク質は、約9,433ダルトンの見積もられた分子量及び約8.21のpIを有する。図180配列番号:262に示した全長PRO1069配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約16のシグナルペプチド;約アミノ酸36~約59の膜貫通ドメイン;約アミノ酸41-46、45-50及び84-89の潜在的Nミリストイル化部位;及び約アミノ酸54~約66の細胞外タンパク質SCP/Tpx1/Ag5/PR1/Sc7との相同性。全長PRO1069のアミノ酸配列の分析は、CHIFとの有意な配列類似性を示唆し、それによりPRO1069がCHIFファミリーのポリペプチドの新規なメンバーであることを示している。Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた全長PRO1069ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、PRO1069アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CHIFRATA55571PLMHUMANA40533ATNGBOVINRICMOUETDSYNY3VTB1XENLAA059009及びS75086との間の相同性が明らかになった。クローンDNA59211-1450は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209960が付与されている。実施例79:ヒトPRO1129をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで98833と命名される単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのIncyteESTクラスター配列番号98833配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56038と命名する。DNA56038コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1335241に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン1335241を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図181に示し、ここでDNA59213-1487と命名する。図181に示す全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置42-44に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1614-1616の停止コドンで終端する図181;配列番号:263。予測されるポリペプチド前駆体は524アミノ酸長であり、約60,310ダルトンの計算された分子量及び約7.46の見積もられたpIを有する。図182配列番号:264に示した全長PRO1129配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸13~約アミノ酸32及び約アミノ酸77~約アミノ酸102のII型膜貫通ドメイン、約アミノ酸461~約アミノ酸470のチトクロムP450システインヘム鉄リガンド脂具ネーチャー配列、及び約アミノ酸112~約アミノ酸115及び約アミノ酸168~約アミノ酸171の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA59213-1487は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209959が付与されている。全長PRO1129のアミノ酸配列の分析は、チトクロムP450ファミリーのタンパク質との配列類似性を示唆した。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1129アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AC0045231S45702AF0548211及びI53015との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例80:ヒトPRO1068をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここでIncyteクラスター番号14736と命名されるESTクラスター配列のLIFESEQデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56094と命名する。DNA56094コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号004974に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン004974を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図183に示し、ここでDNA59214-1449配列番号:265と命名する。図183に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置42-44に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置414-416の停止コドンで終端する図183;配列番号:265。予測されるポリペプチド前駆体は124アミノ酸長である。PRO1068は、約14,284ダルトンの計算された分子量及び約8.14の見積もられたpIを有する。図184に示すように、PRO1068ポリペプチドは以下のさらなる特徴を持つ:約アミノ酸1-20のシグナル配列、約アミノ酸118-123のウロテシンIIシグネーチャー配列、約アミノ酸64-66の細胞接着配列、約アミノ酸112-115の潜在的cAMP及びcGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位。図184配列番号:266に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1068アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HALBOP1MTV04336I50498及びPR78445との間の相同性が明らかになった。クローンDNA59214-1449は1998年7月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203046付与されている。実施例81:ヒトPRO1066をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで79066と命名される単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのIncyteESTクラスター配列番号79066配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56121と命名する。DNA56121コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1515315に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン1515315を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図185に示し、ここでDNA59215-1425と命名する。図185に示す全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置176-178に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置527-529の停止コドンで終端する図185;配列番号:267。予測されるポリペプチド前駆体は117アミノ酸長であり、約12,911ダルトンの計算された分子量及び約5.46の見積もられたpIを有する。図186配列番号:268に示した全長PRO1066配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸23のシグナルペプチド、約アミノ酸38~約アミノ酸41のcAMP及びcGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、及び約アミノ酸5~約アミノ酸10、約アミノ酸63~約アミノ酸68及び約アミノ酸83~約アミノ酸88の潜在的Nミリストイル化部位。クローンUNQ524DNA59215-1425は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209961が付与されている。全長PRO1066のアミノ酸配列の分析は、公知のタンパク質と有意な配列同一性を持たないことを示唆した。しかし、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1066アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MOTIHUMANAF0256671MTCY19H98及びRABIGKCH1との間の或る程度の相同性が明らかになった。実施例82:ヒトPRO1184をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムのIncyteデータベースからのESTsに対する使用により、ここでDNA56375と命名される候補配列の同定が可能となった。次いでこの配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56375と命名する。DNA56375コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1428374に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン1428374を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図187に示す。図187に示す全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置106-108に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置532-534に見られる停止コドンで終端する図187;配列番号:269。予測されるポリペプチド前駆体は142アミノ酸長であり、約15,690ダルトンの計算された分子量及び約9.64の見積もられたpIを有する。図188配列番号:270に示した全長PRO1184配列の分析は、約アミノ酸1-38のシグナルペプチドの存在を明らかにした。クローンDNA59220-1514は1998年6月9日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際のヌクレオチド配列を含み、ここに代表が提供されたと理解される。全長PRO1184ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35でDVTIMS021と称される、ショウジョウバエからのTIMと呼ばれるタンパク質と幾分の配列同一性を有することを示唆した。PRO1184と或る程度の配列同一性を持つ他のDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35配列は、WISISCHPOF0021861ATAC00239124及びMSAIPRP1を含む。実施例83:ヒトPRO1360をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、DNA10572と命名されるESTのIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのEST配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA57314と命名する。DNA57314コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA406443に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンAA406443を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図189に示し、ここでDNA59488-1603と命名する。図189に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置54-56に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置909-911の停止コドンで終端する図189;配列番号:271。予測されるポリペプチド前駆体は285アミノ酸長である図190;配列番号:272。PRO1360は、約31,433ダルトンの計算された分子量及び約7.32の見積もられたpIを有する。クローンDNA59488-1603は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203157が付与されている。図190配列番号:272に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1360アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:UN51CAFELYD4BSCHPOAF0006341GFOZYMMOYE1JSCHPOD865661ZMGFO1S76976PPSASYNY3及びCEF28B14との間の配列同一性が明らかになった。実施例84:ヒトPRO1029をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、18763と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA57854と命名する。DNA57854コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号T98880に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckESTクローンT98880を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図191に示し、ここでDNA59493-1420と命名する。クローンDNA59493-1420は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置39-41に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置297-299の停止コドンで終端する図191。予測されるポリペプチド前駆体は86アミノ酸長である図192。全長PRO1029タンパク質は、約9,548ダルトンの見積もられた分子量及び約8.52のpIを有する。図192配列番号:274に示す全長PRO1029配列の分析により、以下のものの存在があきらかとなった:約アミノ酸1~約アミノ酸19のシグナル配列、約アミノ酸50~約アミノ酸61の細菌ロドプシン網膜結合部位タンパク質と相同性を持つアミノ酸ブロック、約アミノ酸83~約アミノ酸86のプレニル基結合部位、及び約アミノ酸45~約アミノ酸48の潜在的Nグリコシル化部位。クローンDNA59493-1420は1998年7月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203050が付与されている。図192配列番号:274に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1029アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0318151MM4A6L1PSEIS2a1S17699及びPR63635との間の有意な相同性が明らかになった。実施例85:ヒトPRO1139をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、4461と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA57312と命名する。DNA57312コンセンサス配列は、172ヌクレオチド長の公的ESTT62095、Merck/ワシントン大学公的データベースを含んでいた。ここで推定タンパク質コード化配列と称されるこのESTクローンをMerckから購入し、配列決定してPRO1139のコード化配列を提供した図193。既に記したように、DNA59497-1496の推定アミノ酸配列はHSOBRGRP1の推定アミノ酸配列と有意な配列同一性を示す。全長タンパク質図194はアミノ酸残基1と28の間に推定シグナルペプチド、そして3つの推定膜貫通ドメイン約アミノ酸残基33-52、71-89、98-120を含む。実施例86:ヒトPRO1309をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを検索してSLITと相同性を示すESTを同定した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児脳組織から単離した。cDNAクローンを単離するのに用いたcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法により作成した。cDNAをNotI部位を含むオリゴdTでプライムし、平滑末端でSalIヘミキナーゼアダプターに結合させ、NotIで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し、所定の方向で適当なクローニングベクターpRKB又はpRKD等;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280参照に、独特のXol及びNotI部位でクローニングした。cDNAライブラリ上記のように調製を、上記のIncyteEST配列から誘導した合成オリゴヌクレオチドプローブ:5TCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGAAC3配列番号:279でのハイブリッド形成によりスクリーニングした。cDNAクローンを単離して配列決定した。DNA59588-1571の全ヌクレオチド配列を図195配列番号:277に示す。クローンDNA5958-1571は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置720-722に見かけの翻訳開始部位を持ちヌクレオチド位置2286-2288の停止コドンで終端する図195;配列番号:277。予測されるポリペプチド前駆体は522アミノ酸長である。シグナルペプチドは、配列番号:278のおよそ1-34、膜貫通ドメインはおよそ428-450である。クローンDNA59588-1571はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203106が付与されている。図196に示した全長PRO1309タンパク質は約58,614ダルトンの見積もられた分子量及び約7.42のpIを有する。図196配列番号:278に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1309アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AB0078761GPVMOUSEALSRATPR85889LUMCHICKAB0144621PGS1CANFACEM887A58532及びGEN11209との間の配列同一性が明らかになった。実施例87:ヒトPRO1028をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、或る種のESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA59603と命名する。DNA59603コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1497725に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン番号1497725を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図197に示し、ここでDNA59603-1419と命名する。DNA59603-1419の全長ヌクレオチド配列を図197配列番号:280に示す。クローンDNA59603-1419は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置21-23に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置612-614の停止コドンで終端する図197。予測されるポリペプチド前駆体は197アミノ酸長である図198。図198に示した全長PRO1028タンパク質は、約20,832ダルトンの見積もられた分子量及び約8.74のpIを有する。クローンDNA59603-1419はATCCに寄託された。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:281のアミノ酸配列を分析すると、推定シグナルペプチドは配列番号:281の約アミノ酸1-19である。Nグリコシル化部位は配列番号:281の約アミノ酸35-38である。C型レクチンドメインは配列番号:281の約アミノ酸108-117であり、PRO1028がレクチンに関連又はレクチンであることを示している。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。実施例88:ヒトPRO1027をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、或る種のESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56399と命名する。DNA56399コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号937605に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン番号937605を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図199に示し、ここでDNA59605-1418と命名する。DNA59605-1418の全長ヌクレオチド配列を図199配列番号:280に示す。クローンDNA59605-1418は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置31-33に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置262-264の停止コドンで終端する図199。予測されるポリペプチド前駆体は77アミノ酸長である図200。図200に示した全長PRO1027タンパク質は、約8,772ダルトンの見積もられた分子量及び約9.62のpIを有する。クローンDNA59605-1418はATCCに寄託された。配列について、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。配列番号:283のアミノ酸配列を分析すると、推定シグナルペプチドは配列番号:283の約アミノ酸1-33である。II型膜貫通ドメインは配列番号:283の約アミノ酸30である。対応するヌクレオチドは、ここに提供された配列が与えられれば日常的に決定できる。PRO1027は組織形成又は修復に含まれうる。以下のDayhoff表記はPRO1027と幾分の配列同一性をもつことが明らかとなった:SFT2YEASTATM3E92A69826YM16MARPOE64896U601932MTLRAJ2051MCU6031570SPASSHIFL及びS54213。実施例89:ヒトPRO1107をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、或る種のESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56402と命名する。DNA56402コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3203694に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3203694を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図201に示し、ここでDNA59606-1471と命名する。DNA59606-1471の全長ヌクレオチド配列を図201配列番号:284に示す。クローンDNA59606-1471は単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:284のヌクレオチド位置244-246に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1675-1677の停止コドンで終端する図201。予測されるポリペプチド前駆体は477アミノ酸長である図202。図202に示したPRO1107タンパク質は、約54,668ダルトンの見積もられた分子量及び約6.33のpIを有する。クローンDNA59606-1471は1998年6月9日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO1107ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、ホスホジエステラーゼI/ヌクレオチドピロホスファターゼ、ヒトインシュリンレセプターチロシンキナーゼイン非ビター、アルカリホスホジエステラーゼ、及び自己毒素との有意な配列類似性を示唆し、それによりPRO1107がこれらのタンパク質の少なくとも1つ又は全部の活性を有することを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1107アミノ酸配列と少なくとも1つの以下のDayhoff配列:AF0056321PR79148RNU787871AF602184A57080及びHUMATXT1との間の配列同一性が明らかになった。実施例90:ヒトPRO1140をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで135917と命名される単一のIncyteESTクラスター配列の同定が可能となった。次いでこの配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56416と命名する。DNA56416コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3345705に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン3345705を得て、そのcDNA挿入物を配列決定した。図203に示し、ここでDNA59607-1497と命名する配列は、PRO1140の全長DNA配列である。クローンDNA59607-1497は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209946が付与されている。DNA59607-1497の全ヌクレオチド配列を図203配列番号:286に示す。クローンDNA59607-1497は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置210-212に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置975-977の停止コドンで終端する図203。予測されるポリペプチド前駆体は255アミノ酸長である図204。図204に示した全長PRO1140は、約29,405ダルトンの見積もられた分子量及び約7.64のpIを有する。図204配列番号:287に示した全長PRO1140配列の分析は、約アミノ酸101-118、141-161及び172-191の3つの膜貫通ドメインの存在を明らかにした。全長PRO1140のアミノ酸配列のDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35を用いた分析により、PRO1140アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF0236021AF0003681CIN3RATAF0033731GEN13279及びAF0033721との間の相同性が明らかになった。クローンDNA59607-1497は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209946が付与されている。実施例91:ヒトPRO1106をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、単一のIncyteEST配列の同定が可能となった。次いでこの配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56423と命名する。DNA56423コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1711247に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン番号1711247を得て、そのcDNA挿入物を配列決定した。図205に示し、ここでDNA59609-1470と命名する配列は、PRO1106の全長DNA配列である。クローンDNA59609-1470は1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209963が付与されている。DNA59609-1470の全ヌクレオチド配列を図205配列番号:288に示す。クローンDNA59609-1470は単一のオープンリーディングフレームを含み、配列番号:288のヌクレオチド位置61-63に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1468-1470の停止コドンで終端する図205。予測されるポリペプチド前駆体は469アミノ酸長である図206。図206に示した全長PRO1106は、約52,689ダルトンの見積もられた分子量及び約8.68のpIを有する。当業者は、ポリペプチド又はそれをコードする核酸を、これら全てのドメインの一又は複数を排除するように構築できると理解される。例えば、膜貫通ドメイン及び/又はアミノ末端又はカルボキシル末端のいずれかを排除することができる。クローンDNA59609-1470は1998年6月9日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を含み、ここに提供された配列は公知の配列技術に基づくと理解される。全長PRO1106ポリペプチドのアミノ酸配列の分析は、ペルオキシソームCa依存性溶質キャリアとの有意な配列類似性を示唆し、それによりPRO1106が新規なトランスポーターであることを示した。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1106アミノ酸配列と少なくとも1つの以下のDayhoff配列:AF0041611IG002N0125GDCBOVIN及びBTMAIZEとの間の配列同一性が明らかになった。実施例92:ヒトPRO1291をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで120480と命名されるESTクラスター配列のIncyteデータベースからの同定が可能となった。次いでこのESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQ、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altschul等MethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA56425と命名する。DNA56425コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2798803に含まれるEST配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteESTクローン2798803を購入し、cDNA挿入物を得て配列決定した。この挿入物は全長タンパク質をコードすることがわかった。このcDNA挿入物の配列を図207に示し、ここでDNA59610-1556と命名する。クローンDNA59610-1556は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置61-63に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置907-909の停止コドンで終端する図207。予測されるポリペプチド前駆体は282アミノ酸長である図208。図208に示す全長PRO1291タンパク質は、約30,878ダルトンの見積もられた分子量及び約5.27のpIを有する。図208配列番号:291に示した全長PRO1291配列の分析は以下のものの存在を明らかにした:約アミノ酸1~約アミノ酸28のシグナルペプチド、約アミノ酸258~約アミノ酸281の膜貫通ドメイン、約アミノ酸112~約アミノ酸115、約アミノ酸160~約アミノ酸163、約アミノ酸190~約アミノ酸193、約アミノ酸196~約アミノ酸199、約アミノ酸205~約アミノ酸208、約アミノ酸216~約アミノ酸219及び約アミノ酸220~約アミノ酸223のNグリコシル化部位。クローンDNA59610-1556は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209990が付与されている。図208配列番号:291に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析を用いたDayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析により、PRO1291アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU905521HSU901441AF331071HSB731HSU901421GGCD801PW34452MOGMOUSEB39371及びPR71360との間の有意な相同性が明らかになった。実施例93:ヒトPRO1105をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLifeseqRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56430と命名する。DNA56430配列とIncyteのESTクローン番号1853047内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン番号1853047を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図209に示し、ここでDNA59612-1466と命名する。DNA59612-1466の全ヌクレオチド配列を図209配列番号:292に示す。DNA59612-1466は、配列番号:292図209のヌクレオチド位置28-30に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置568-570の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図209。予測されたポリペプチド前駆体は180アミノ酸長である図210。図210に示した全長PRO1105タンパク質は約20,040ダルトンの見積もり分子量と約8.35のpIを有する。クローンDNA59612-1466は1998年6月9日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。図210を分析すると、シグナル配列は配列番号:293のアミノ酸約1-19にあり、膜貫通ドメインは配列番号:293のアミノ酸約80-99及び145-162に示されている。当業者であればこれらの領域の全て又は任意の組み合わせ又は個々に選択したものを持つポリペプチドを生成するであろうと理解される。対応する核酸は常套的に同定することができ、ここに提供した情報に基づいて調製することができることもまた理解される。実施例94:ヒトPRO511をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLifeseqRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56434と命名する。DNA56434配列とIncyteのESTクローン番号1227491内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン番号1227491を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図211に示し、ここでDNA59613-1417と命名する。DNA59613-1417の全ヌクレオチド配列を図211配列番号:294に示す。DNA59613-1417は、ヌクレオチド位置233-235に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置944-946の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図211。予測されたポリペプチド前駆体は237アミノ酸長である図212。図212に示した全長PRO511タンパク質は約25,284ダルトンの見積もり分子量と約5.74のpIを有する。クローンDNA59613-1417はATCCに寄託された。配列に関しては、寄託されたクローンは正しい配列を含み、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。配列番号:295のアミノ酸配列を分析すると、推定上シグナル配列は配列番号:295のアミノ酸約1-25にある。Nグリコシル化部位は、配列番号:295のアミノ酸約45-48、73-76、107-110、118-121、132-135、172-175、175-178及び185-188にある。節足動物デフェンシン保存領域は配列番号:295のアミノ酸約176-182にある。クリングルドメインは配列番号:295のアミノ酸約128に始まり、ly6/uPARドメインは配列番号:295のアミノ酸約6に始まる。これらのアミノ酸配列及び他のものの対応するヌクレオチドはここに提供される配列が与えられると常套的に決定することができる。PRO511がある配列同一性を有しているDayhoffデータベースに現れる記号表示は次の通りである:SSC20F101SF041083PW26579S44208JC2394PSTADICDIA27020S59310RAG1RABIT及びMUSBALBC11。実施例95:ヒトPRO1104をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLifeseqRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56446と命名する。DNA56446配列とIncyteのESTクローン番号2837496内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン番号2837496を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図213に示し、ここでDNA59616-1465と命名する。DNA59616-1465の全ヌクレオチド配列を図213配列番号:296に示す。DNA59616-1465は、配列番号:296図213のヌクレオチド位置109-111に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1132-1134の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図213。予測されたポリペプチド前駆体は341アミノ酸長である図214。図214に示した全長PRO1104タンパク質は約36,769ダルトンの見積もり分子量と約9.03のpIを有する。クローンDNA59616-1465は1998年6月16日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。図214を分析すると、シグナル配列は配列番号:297のアミノ酸約1-22にある。Nミリストイル化部位は配列番号:297のアミノ酸約41-46、110-115、133-138、167-172及び179-184にある。実施例96:ヒトPRO1100をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLifeseqRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2305379内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2305379を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図215に示し、ここでDNA59619-1464と命名する。DNA59619-1464の全ヌクレオチド配列を図215配列番号:298に示す。DNA59619-1464は、配列番号:298図215のヌクレオチド位置33-35に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置993-995の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図216。予測されたポリペプチド前駆体は320アミノ酸長である図216。図216に示した全長PRO1100タンパク質は約36,475ダルトンの見積もり分子量と約7.29のpIを有する。クローンDNA59619-1464は1998年7月1日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。配列番号:299を分析すると、シグナルペプチド、膜貫通ドメイン、Nグリコシル化部位、Nピリストイル化部位、CUBドメイン及びアミロライド感受性ナトリウムチャンネルドメインのおよその位置が存在する。PRO1100はチャンネルとして機能しうると考えられる。これらのアミノ酸及び他のものに対する対応核酸は配列番号:299が与えられれば、常套的に決定することができる。実施例97:ヒトPRO836をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLifeseqRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56453と命名する。DNA56453コンセンサス配列とIncyteのESTクローン2610075内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2610075を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図217に示し、ここでDNA59620-1463と命名する。DNA59620-1463の全ヌクレオチド配列を図217配列番号:300に示す。DNA59620-1463は、配列番号:300図217のヌクレオチド位置65-67に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1448-1450の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図217。予測されたポリペプチド前駆体は461アミノ酸長である図218。図218に示した全長PRO836タンパク質は約52,085ダルトンの見積もり分子量と約5.36のpIを有する。図218配列番号:301に示した全長PRO836配列の分析により、次のもの:シグナルペプチド、Nグリコシル化部位、Nミリストイル化部位、タンパク質のYJL126w/YLR351c/yhcXファミリーに保存されているドメイン、及びSLS1と配列同一性を有する領域、の存在が証明される。クローンDNA59620-1463は1998年6月16日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。全長PRO839ポリペプチドのアミノ酸配列を分析すると、SLS1とある配列同一性を有することが示唆され、よってPRO836はERのタンパク質トランスロケーションに関与していることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析によりPRO836アミノ酸配列と少なくとも次のDayhoff配列、S58132SPBC3B91S66714CRU400571及びIMACAEELの間のある相同性が証明された。実施例98:ヒトPRO1141をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、11873と命名されるIncyteデータベースからのESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56518と命名する。DNA56518コンセンサス配列とIncyteのESTクローン2679995内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2679995を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図219に示し、ここでDNA59625-1498と命名する。クローンDNA59625-1498は、ヌクレオチド位置204-206に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置945-947の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図219。予測されたポリペプチド前駆体は247アミノ酸長である図220。図220に示した全長PRO1141タンパク質は約26,840ダルトンの見積もり分子量と約8.19のpIを有する。図220配列番号:303に示した全長PRO1141配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約19のシグナルペプチド及びアミノ酸約38からアミノ酸約57、アミノ酸約67からアミノ酸約83、アミノ酸約117からアミノ酸約139及びアミノ酸約153からアミノ酸約170の膜貫通ドメイン、の存在が証明される。クローンDNA59625-1498は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209992が付されている。図220配列番号:303に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1141アミノ酸配列と次のDayhoff配列、CEVF36H2L2PCRB7PRJ1AB0005061LEU950081MRU8798015YIGMECOLISTU657001GHU627781CYSTSYNY3及びAF0095671の間の有意な相同性が証明された。実施例99:ヒトPRO1132をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA35934と命名する。DNA35934コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1132に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5TCCTGTGACCACCCCTCTAACACC3配列番号:310及び逆方向PCRプライマー:5CTGGAACATCTGCTGCCCAGATTC3配列番号:311。さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:5GTCGGATGACAGCAGCAGCCGCATCATCAATGGATCCGACTGCGATATGC3配列番号:312を持つコンセンサス配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1132遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児腎臓から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1132に対する全長DNA配列とPRO1132に対する誘導タンパク質配列が得られた。PRO1132の全ヌクレオチド配列を図225配列番号:308に示す。クローンDNA59767-1489は、ヌクレオチド位置354-356に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1233-1235の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図225;配列番号:308。予測されたポリペプチド前駆体は293アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:309のアミノ酸約1-22にあり、ヒスチジン活性部位はアミノ酸約104-109にある。クローンDNA59767-1489ここに提供した配列決定法に基づく表示よりもむしろ実際の配列を有するはATCCに寄託され、ATCC寄託番号203108が付されている。図226に示した全長PRO1132タンパク質は約32,020ダルトンの見積もり分子量と約8.7のpIを有する。図226配列番号:309に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1132アミノ酸配列と次のDayhoff配列:SSU762561PW10694MMAE0006636AF0139881U660618MMAE0006652MMAE00066415MMAE00066414MMAE0006654及びMMAE00066412の間の配列同一性が証明された。実施例100:ヒトNL7をコードするcDNAクローンの単離単一のEST配列1398422が上述の実施例1に記載したようなLIFESEQRデータベースに見出された。このEST配列をDNA45668と改めて名付けた。DNA45668配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2NL7に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5CACACGTCCAACCTCAATGGGCAG3配列番号:315及び逆方向PCRプライマー:5GACCAGCAGGGCCAAGGACAAGG3配列番号:316さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ:5GTTCTCTGAGATGAAGATCCGGCCGGTCCGGGAGTACCGCTTAG3配列番号:317を持つコンセンサスDNA45668配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてNL7遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児腎臓ライブラリLIB227から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA59776-1600図227、配列番号:313と命名したNL7に対する全長DNA配列とNL7に対する誘導タンパク質配列が得られた。NL7の全ヌクレオチド配列を図227配列番号:313に示す。クローンDNA59776-1600は、ヌクレオチド位置1-3に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1384-1386に見かけの停止コドンを有する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は461アミノ酸長である。タンパク質は、約31から約50のアミノ酸位置に見かけのII型膜貫通ドメインを;アミノ酸位置約409から始まって、フィブリノーゲンβ及びγ鎖C末端ドメインサイン、及びアミノ酸位置約140、147、154及び161からそれぞれ始まってロイシンジッパーパターンを含んでいる。クローンDNA59776-1600はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203128が付されている。図228に示した全長NL7タンパク質は約50,744ダルトンの見積もり分子量と約6.38のpIを有する。全長配列のWUBLAST2コンピュータプログラムを使用してのWUBLAST2配列アラインメント分析に基づき、NL7は、ヒトミクロフィブリル関連糖タンパク質1MFA4HUMANに対して;既知のTIE2リガンド及びリガンド相同体、フィコリン、血清レクチン及びTGF1結合タンパク質に対して、有意なアミノ酸配列同一性を示している。実施例101:ヒトPRO1131をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列をここでDNA43546と命名する図231;配列番号:320を参照されたい。ついで、該DNA43546配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQTMIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA45627と命名する。DNA45627配列に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを産生し、上述の実施例2の第1段落に記載したヒトライブラリをスクリーニングするために使用した。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280を参照されたい、切断されたcDNAサイズは2800bp未満であった。PCRプライマー正方向及び2つの逆方向を合成した:正方向PCRプライマー5ATGCAGGCCAAGTACAGCAGCAC3配列番号:321;逆方向PCRプライマー15CATGCTGACGACTTCCTGCAAGC3配列番号:322;及び逆方向PCRプライマー25CCACACAGTCTCTGCTTCTTGGG3配列番号:323さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ:5ATGCTGGATGATGATGGGGACACCACCATGAGCCTGCATT3配列番号:234を持つDNA45627配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1131遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。ヌクレオチド位置144-146に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置984-986に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む全長クローンが同定された図229;配列番号:318。予測されたポリペプチド前駆体は280アミノ酸長であり、約31,966ダルトンの算定分子量と約6.26の推定pIを有する。膜貫通ドメインは配列番号:319の約49-74にあり、LDLレセプターと配列同一性を有する領域は配列番号:319の約50-265にある。PRO1131は配列番号:319のアミノ酸位置95-98及び169-172に潜在的なN結合グリコシル化部位を含む。クローンDNA59777-1480はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203111が付されている。図230配列番号:319に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1131アミノ酸配列と次のDayhoff配列、AB0107101I49053I49115RNU568631LY4AMOUSEI55686MMU564041I49361AF0303131及びMMU097391の間のある配列同一性が証明された。実施例102:ヒトPRO1281をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA35720と命名する。DNA35720配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1281に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5TGGAAGGCTGCCGCAACGACAATC3配列番号:327;5CTGATGTGGCCGATGTTCTG3配列番号:328;及び5ATGGCTCAGTGTGCAGACAG3配列番号:329。逆方向PCRプライマー:5GCATGCTGCTCCGTGAAGTAGTCC3配列番号:330;及び5ATGCATGGGAAAGAAGGCCTGCCC3配列番号:331。さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ:5TGCACTGGTGACCACGAGGGGGTGCACTATAGCCATCTGGAGCTGAG3配列番号:332を持つDNA35720配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1281遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児腎臓から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1281に対する全長DNA配列ここでDNA59820-1549と命名図232,配列番号:325とPRO1281に対する誘導タンパク質配列が得られた。PRO1281の全コード配列を図232配列番号:325に示す。クローンDNA59820-1549は、ヌクレオチド位置228-230に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置2553-2555に見かけの停止コドンを有する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は775アミノ酸長である。図233に示した全長PRO1281タンパク質は約85,481ダルトンの見積もり分子量と約6.92のpIを有する。さらなる特徴は、アミノ酸約1-15のシグナルペプチド;及びアミノ酸約138-141及び361-364の潜在的なNグリコシル化部位を含む。図233配列番号:326に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1281アミノ酸配列と次のDayhoff配列:S44860CET24D11CEC38H23CAC2HAECOB3A2HUMANS22373CEF38A32CEC34F62CEC34F63及びCELT22B113の間のある配列同一性が明らかになった。クローンDNA59820-1549はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203129が付されている。実施例103:ヒトPRO1064をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列は、WUBLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムにより、既知のヒトタンパク質とは有意な配列同一性を持たないことが分かった。このcDNA配列をここでDNA45288と命名する。ついで、該DNA45288配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々なESTデータベースと比較して、相同性EST配列を同定した。比較はコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をここでDNA48609と命名する。ついで、DNA48609配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを合成し、ヒト胎児腎臓cDNAライブラリをスクリーニングするために使用し、図234に示したDNA59827-1426クローンが同定された。クローニングベクターはpRK5BでありpRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280を参照されたい、切断されたcDNAサイズは2800bp未満であった。用いたオリゴヌクレオチドプローブは次の通りである:正方向PCRプライマー5CTGAGACCCTGCAGCACCATCTG3配列番号:336逆方向PCRプライマー5GGTGCTTCTTGAGCCCCACTTAGC3配列番号:337さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列ハイブリッド形成プローブ5AATCTAGCTTCTCCAGGACTGTGGTCGCCCCGTCCGCTGT3配列番号:338を持つコンセンサスDNA48609配列から作成した。ヌクレオチド位置532-534に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置991-993に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む全長クローンを同定した図234、配列番号:333。予測されたポリペプチド前駆体は153アミノ酸長で、約17,317ダルトンの算定分子量と約5.17の推定pIを有する。図235配列番号:334に示した全長PRO1064配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約24のシグナルペプチド、アミノ酸約89からアミノ酸約110の膜貫通ドメイン、アミノ酸約114からアミノ酸約137のMybDNA結合ドメインタンパク質反復タンパク質相同ブロック、の存在が証明される。クローンDNA59827-1426は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203089が付されている。図235配列番号:334に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1064アミノ酸配列と次のDayhoff配列:MMNP15PRO1BP187PLYH1CELF42G84MMU588881GEN14270TUB8SOLTURCNMOUSEHUMRBSY791SESENODA1及びA214671の間の相同性が証明された。実施例104:ヒトPRO1379をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA45232と命名する。DNA45232コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1379に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5TGGACACCGTACCCTGGTATCTGC3配列番号:341逆方向PCRプライマー:5CCAACTCTGAGGAGAGCAAGTGGC3配列番号:342さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5TGTATGTGCACACCCTCACCATCACCTCCAAGGGCAAGGAGAAC3配列番号:343を持つDNA45232配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1379遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児腎臓組織から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA59828-1608と命名され図237配列番号:339に示されるPRO1379に対する全長DNA配列とPRO1379に対する誘導タンパク質配列配列番号:340が得られた。PRO1379の全ヌクレオチド配列を図237配列番号:339に示す。クローンDNA59828-1608は、ヌクレオチド位置10-12に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1732-1734に見かけの停止コドンを有する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は574アミノ酸長である。図238に示した全長PRO1379タンパク質は約65,355ダルトンの見積もり分子量と約8.73のpIを有する。さらなる特徴は、アミノ酸約1-17のシグナルペプチド及びアミノ酸約160-163、287-290、及び323-326の潜在的なNグリコシル化部位を含む。図238配列番号:340に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1379アミノ酸配列と次のDayhoff配列:YHY8YEASTAF0406251HP7143941及びHIV18U456301の間のある相同性が明らかになった。クローンDNA59828-1608はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203158が付されている。実施例105:ヒトPRO844をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTDNAデータベースLIFESEQTMIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAをサーチして、LPと配列同一性を示したESTを同定した。ここに提供された情報と発見に基づいて、このESTに対するクローン、ガン性肺ライブラリからのIncyteクローン番号2657496をさらに調べた。このクローンに対する挿入断片のDNA配列決定により、PRO844に対する全長DNA配列を含む配列ここでDNA59838-1462と命名;配列番号:344とPRO844に対する誘導タンパク質配列が得られた。DNA59838-1462の全ヌクレオチド配列は図239配列番号:344に示す。クローンDNA59838-1462は、配列番号:344図239のヌクレオチド位置5-7に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置338-340の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は111アミノ酸長である図240。図240に示した全長PRO844タンパク質は約12,050ダルトンの見積もり分子量と約5.45のpIを有する。クローンUNQ544DNA59838-1462は1998年6月16日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。全長PRO844のアミノ酸配列を分析すると、セリンプロテアーゼ阻害剤に対して有意な配列類似性を有していることが示唆され、PRO844は新規なプロテイナーゼ阻害剤となりうることを示している。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO844アミノ酸配列と少なくとも次のDayhoff配列、ALK1HUMANPP82403PP82402ELAFHUMAN及びPP60950の間の有意な相同性が証明された。実施例106:ヒトPRO848をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA55999と命名する。DNA55999コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2768571内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2768571を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図241に示し、ここでDNA59839-1461と命名する。DNA59839-1461の全ヌクレオチド配列を図241配列番号:346に示す。クローンDNA59839-1461は、配列番号:346図241のヌクレオチド位置146-148に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1946-1948の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は600アミノ酸長である図242。図242に示した全長PRO848タンパク質は約68,536ダルトンの見積もり分子量を有する。クローンDNA59839-1461は1998年6月16日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。全長PRO848ポリペプチドのアミノ酸配列を分析すると、新規なシアリルトランスフェラーゼでありうることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO848アミノ酸配列と少なくとも次のDayhoff配列、PR78619CAAG5CHICKHSU145501CAG6HUMAN及びPR63217の間の配列同一性が証明された。実施例107:ヒトPRO1097をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56006と命名する。DNA56006コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2408105内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2408105を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図243に示し、ここでDNA59841-1460と命名する。DNA59841-1460の全ヌクレオチド配列を図243配列番号:348に示す。クローンDNA59841-1460は、配列番号:348図243のヌクレオチド位置3-5に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置276-278の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は91アミノ酸長である図244。図244に示した全長PRO1097タンパク質は約10,542ダルトンの見積もり分子量と約10.04のpIを有する。クローンDNA59841-1460は1998年7月1日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。図244を分析すると、シグナルペプチドは配列番号:349のアミノ酸約1-20にある。グリコプレテアーゼファミリーのタンパク質ドメインは配列番号:349のアミノ酸約56で始まり、アシルトランスフェラーゼChoActase/COT/CPTファミリーペプチドはアミノ酸約49で始まる。実施例108:ヒトPRO1153をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56008と命名する。DNA56008コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2472409内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2472409を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図245に示し、ここでDNA59842-1502と命名する。図245に示す全長クローンは、ヌクレオチド位置92-94に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置683-685に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図245;配列番号:350。予測されたポリペプチド前駆体図246、配列番号:351は197アミノ酸長である。PRO1153は約21,540ダルトンの算定分子量と約8.31の推定pIを有する。クローンDNA59842-1502はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209982が付された。正しい実際の配列は寄託されたクローンにあり、ここには少しの誤差がありうる現在の配列決定法に基づくものが提供されていることが理解される。全長配列のALIGNコンピュタープログラムを使用するWUBLAST2配列アラインメント分析に基づいて、PRO1153は、次のDayhoff標記:S57447SOYHRGPC1S46965PP82971VCPHEROPH1EXTNTOBACMLCB25489ANXARABITJC5437及びSSGPVOLCAに対してある程度のアミノ酸配列同一性を示している。実施例109:ヒトPRO1154をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56025と命名する。DNA56025コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2169375内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2169375を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図247に示し、ここでDNA59846-1503と命名する。図247に示す全長クローンは、ヌクレオチド位置86-88に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置2909-2911に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図247;配列番号:352。予測されたポリペプチド前駆体図248、配列番号:353は941アミノ酸長である。PRO1154は約107,144ダルトンの算定分子量と約6.26の推定pIを有する。クローンDNA59846-1503はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209978が付された。全長配列のALIGNコンピュタープログラムを使用するWUBLAST2配列アラインメント分析に基づいて、PRO1154は、少なくとも次のDayhoff標記:AB0110971AMPNHUMANRNU769971159331GEN14047HSU627681PR51281CET07F101SSU663711及びAMPREHUMANに対して配列同一性を示している。実施例110:ヒトPRO1181をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで82468と命名した、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56029と命名する。DNA56029コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2186536内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2186536を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図249に示し、ここでDNA59847-1511と命名する。クローンDNA59847-1511は、ヌクレオチド位置17-19に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1328-1330の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図249。予測されたポリペプチド前駆体は437アミノ酸長である図250。図250に示した全長PRO1181タンパク質は約46,363ダルトンの見積もり分子量と約6.22のpIを有する。図250配列番号:355に示した全長PRO1181配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約15のシグナルペプチド、アミノ酸約46からアミノ酸約49、アミノ酸約189からアミノ酸約192及びアミノ酸約192からアミノ酸約382の潜在的なNグリコシル化部位及びアミノ酸約287からアミノ酸約300及びアミノ酸約98からアミノ酸約111のLy6/uPARドメインタンパク質と相同性を有するアミノ酸配列ブロック、の存在が証明される。クローンDNA59847-1511は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203098が付されている。図250配列番号:355に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1181アミノ酸配列と次のDayhoff配列:AF0410831PW26579RNMAGPIAN1CELT13C22LMSAP2GN1S61882CEF35C512DP87DICDIGIU476311及びPR07092の間の相同性が証明された。実施例111:ヒトPRO1182をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで146647と命名した、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56033と命名する。DNA56033コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2595195内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2595195を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図251に示し、ここでDNA59848-1512と命名する。クローンDNA59848-1512は、ヌクレオチド位置67-69に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置880-882の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図251。予測されたポリペプチド前駆体は271アミノ酸長である図252。図252に示した全長PRO1182タンパク質は約28,665ダルトンの見積もり分子量と約5.33のpIを有する。図252配列番号:357に示した全長PRO1182配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約25のシグナルペプチド、アミノ酸約247からアミノ酸約256のC型レクチンドメインタンパク質と相同性を有するアミノ酸ブロック及びアミノ酸約44からアミノ酸約77のC1qドメインタンパク質と相同性を有するアミノ酸配列ブロック、の存在が証明される。クローンDNA59848-1512は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203088が付されている。図252配列番号:357に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1182アミノ酸配列と次のDayhoff配列:PSPDBOVINCL43BOVINCONGBOVINPW18780PR45005PR53257及びCELEGAP71の間の有意な相同性が証明された。実施例112:ヒトPRO1155をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56102と命名する。DNA56102コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2858870内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2858870を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図253に示し、ここでDNA59849-1504と命名する。図253に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置158-160に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置563-565の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図253;配列番号:358。予測されたポリペプチド前駆体図254、配列番号:359は135アミノ酸長である。PRO1155タンパク質は約14,833ダルトンの算定分子量と約9.78のpIを有する。クローンDNA59849-1504はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209986が付されている。実際のクローンは正しい配列を有する一方、ここに記載したものは些細な配列決定誤差のおそれがある表示にすぎないことが理解される。全長配列のALIGNコンピュータプログラムを使用するWUBLAST2配列アラインメント分析に基づいて、PRO1155は次のDayhoff表示:TKNKBOVINPVB19X5871AF0190491PW00948S72864PW00949I62742AF0385011TKNGHUMAN及びYAT1RHOBLとある程度のアミノ酸配列同一性を示している。ここに提供された情報に基づいて、PRO1155は神経保護と向知性化の提供にある役割を果たしうる。実施例113:ヒトPRO1156をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで138851と命名した、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56261と命名する。DNA56261コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3675191内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3675191を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図255に示し、ここでDNA59853-1505と命名する。図255に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置212-214に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置689-691に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図255;配列番号:360。予測されたポリペプチド前駆体図256;配列番号:361は159アミノ酸長である。PRO1156は約17,476ダルトンの算定分子量、約9.15の推定pI、アミノ酸約1から約22のシグナルペプチド配列、及びアミノ酸約27-30及び41-44の潜在的なNグリコシル化部位を有する。クローンDNA59853-1505は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209985が付されている。図256配列番号:361に示した全長配列のALIGNコンピュータプログラムを使用するWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1156アミノ酸配列と次のDayhoff配列:D450271PR79914JC5309KBF2HUMANAF0101441GEN14351S68681PR79915ZMTAC3及びHUMCPGO1の間のある程度の相同性が明らかになった。実施例114:ヒトPRO1098をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56377と命名する。DNA56377コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3050917内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3050917を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図257に示し、ここでDNA59854-1459と命名する。DNA59854-1459の全ヌクレオチド配列を図257配列番号:362に示す。クローンDNA59854-1459は、配列番号:362図257のヌクレオチド位置58-60に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置292-294の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は78アミノ酸長である図258。図258に示した全長PRO1098タンパク質は約8,396ダルトンの見積もり分子量と約7.66のpIを有する。クローンDNA59854-1459は1998年6月16日にATCCに寄託された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は既知の配列決定法に基づいていることが理解される。図258を分析すると、シグナル配列は配列番号:363のアミノ酸約1-19にあり、Nグリコシル化部位は配列番号:363のアミノ酸約37-40にあるように思われ、Nミリストイル化部位は配列番号:363のアミノ酸約15-20、19-24及び60-65にあるように思われる。実施例115:ヒトPRO1127をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57959と命名する。DNA57959コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号685126内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckのESTクローン685126を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図259に示し、ここでDNA60283-1484と命名する。図259に示す全長クローンは、ヌクレオチド位置126-128に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置327-329に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図259;配列番号:364。予測されたポリペプチド前駆体図260、配列番号:365は配列番号:365の約1-29のシグナルペプチドを含む67アミノ酸長である。PRO1127は約7,528ダルトンの算定分子量と約4.95の推定pIを有する。クローンDNA60283-1484は1998年7月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203043が付された。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有する一方、些細な配列決定誤差を有しうる表示がここに提供されていることが理解される。図260配列番号:365に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1127アミノ酸配列と次のDayhoff配列:AF03721848PW09638HBAHETPOS39821KR2EBVCET20D38HCU376301HS193B1210S40012及びTRITUBC1の間のある程度の相同性が明らかになった。実施例116:ヒトPRO1126をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56250と命名する。DNA56250コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1437250内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン1437250を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図261に示し、ここでDNA60615-1483と命名する。クローンDNA60615-1483は、ヌクレオチド位置110-112に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1316-1318の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図261。予測されたポリペプチド前駆体は402アミノ酸長である図262。図262に示される全長PRO1126タンパク質は約45,921ダルトンの見積もり分子量と約8.60のpIを有する。図262配列番号:367に示した全長PRO1126配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約25のシグナルペプチド及びアミノ酸約66からアミノ酸約69、アミノ酸約138からアミノ酸約141及びアミノ酸約183からアミノ酸約186の潜在的なNグリコシル化部位の存在が証明される。クローンDNA60615-1483は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209980が付されている。図262配列番号:367に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1126アミノ酸配列と次のDayhoff配列:I73636NOMRHUMANMMUSMYOC31HS454G61PR98225RNU781051RNU724871AF0353011CEELC48E74及びCEF11C33の間の有意な相同性が証明された。実施例117:ヒトPRO1125をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56540と命名する。DNA56540コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1486114内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン1486114を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図263に示し、ここでDNA60615-1482と命名する。図263に示される全長クローンは、ヌクレオチド位置47-49に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1388-1390に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図263,配列番号:368。予測されたポリペプチド前駆体図264,配列番号:369は447アミノ酸長である。PRO1125は約49,798ダルトンの算定分子量と約9.78の推定pIを有する。クローンDNA60619-1482はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209993が付された。クローンは実際の核酸配列を有し、ここに提供された配列は些細な誤差を含みうる現在の方法に基づく表示であることが理解される。全長配列のALIGNコンピュータプログラムを使用するWUBLAST2配列アラインメント分析法に基づいて、PRO1125は次のDayhoff表記:RCO1NEUCRS58306PKWATHECUS76086PR85881HET1PODANSPU927921APAFHUMANS76414及びS59317とある程度の配列同一性を示す。実施例118:ヒトPRO1186をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTデータベースと比較して、現存の相同体を同定した。相同性サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56748と命名する。DNA56748配列とIncyteのESTクローン番号3476792内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3476792を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図265に示し、ここでDNA60621-1516と命名する。図265に示す全長クローンは、ヌクレオチド位置91-93に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置406-408に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図265;配列番号:370。予測されたポリペプチド前駆体図266;配列番号:371は105アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:371のアミノ酸1-19にある。PRO1186は約11,715ダルトンの算定分子量と約9.05の推定pIを有する。クローンDNA60621-1516は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203091が付された。図266配列番号:371に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1186アミノ酸配列と次のDayhoff配列:VPRADENPOLFE4CHICKAF0342081AF0304331A55035COLRABITCELB05079S678261S34665及びCRU738171の間のある程度の配列同一性が明らかにされた。実施例119:ヒトPRO1198をコードするcDNAクローンの単離DNA52083とここで呼ばれる最初のDNA配列は、一次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すヒト臍静脈内皮細胞cDNAライブラリにおいて酵母スクリーニングを使用して同定された。DNA52083を、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して、公のデータベース例えばGenBankと企業のESTデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAからのESTと比較した。ESTを集合化し、コンピュータプログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonを用いてコンセンサスDNA配列を構築した。一または複数のESTがヒト乳房皮膚組織バイオプシーから得られた。このコンセンサス配列をここでDNA52780と命名する。DNA52780コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3852910内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3852910を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図267に示し、ここでDNA60622-1525と命名する。図267配列番号:372に示す全長DNA60622-1525クローンは、ヌクレオチド位置54から56に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置741から743に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。図268配列番号:373に示す、予測されたポリペプチド前駆体は229アミノ酸長である。PRO1198は約25,764ダルトンの算定分子量と約9.17の推定pIを有する。アミノ酸約1から34にシグナルペプチドがある。アミノ酸約142から約175にグリコシルヒドラーゼファミリー31タンパク質と配列同一性がある。図268配列番号:373に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1198アミノ酸配列と次のDayhoff配列:ATF6H116UCRIRATTOBSUP2NT1RCUERF31AMU881861PW22485S56579AF0407111DPP4PIGの間のある程度の相同性が明らかにされた。クローンDNA60622-1525は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203090が付された。実施例120:ヒトPRO1158をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57248と命名する。DNA57248コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2640776内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2640776を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図269に示し、ここでDNA60625-1507と命名する。図269に示す全長クローンは、ヌクレオチド位置163から165に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置532から534に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図269;配列番号:374。予測されたポリペプチド前駆体図270;配列番号:375は123アミノ酸長である。PRO1158は約13,113ダルトンの算定分子量と約8.53の推定pIを有する。さらなる特徴は、アミノ酸約1-19のシグナルペプチド配列、アミノ酸約56-80の膜貫通ドメイン及びアミノ酸約36-39の潜在的なNグリコシル化部位を含む。クローンDNA60625-1507は1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209975が付された。図270配列番号:375に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1158アミノ酸配列と次のDayhoff配列:ATAC00310510F18A810PR85151PHS2SOLTURNMHCIBAC1RNA1FMHC1I68771RNRT1A10G1PTPAHUMANHUMGACA1及びCHKPTPA1の間のある程度の相同性が明らかにされた。実施例121:ヒトPRO1159をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57221と命名する。DNA57221コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号376776内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン376776を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図271に示し、ここでDNA60627-1508と命名する。クローンDNA60627-1508は、ヌクレオチド位置92-94に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置362-364の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図271。予測されたポリペプチド前駆体は90アミノ酸長である図272。図272に示された全長PRO1159タンパク質は約9,840ダルトンの見積もり分子量と約10.13の推定pIを有する。図272配列番号:377に示した全長PRO1159配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約15のシグナルペプチド及びアミノ酸約38からアミノ酸約41の潜在的なNグリコシル化部位の存在が証明される。クローンDNA60627-1508は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203092が付されている。図272配列番号:377に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1159アミノ酸配列と次のDayhoff配列:AF0164946AF03670820DSSCUTE1D891001S28060MEFAXENLAAF02079812G70065E64423JQ2005の間の有意な相同性が明らかにされた。実施例122:ヒトPRO1124をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56035と命名する。DNA56035コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号2767646内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン2767646を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図273に示し、ここでDNA60629-1481と命名する。図273に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置25-27に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置2782-2784に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図273;配列番号:378。予測されたポリペプチド前駆体図274、配列番号:379は919アミノ酸長である。PRO1124は約101,282ダルトンの算定分子量と約5.37の推定pIを有する。クローンDNA60629-1481はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209979が付されている。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有する一方、通常の些細な誤差を含みうる現在の配列決定法に基づく表示のみがここに提供されることが理解される。全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析に基づくと、PRO1124は塩素イオンチャンネルタンパク質とECAM1に対して有意なアミノ酸配列同一性を示している。特に、次のDayhoff表示は、PRO1124と配列同一性を有すると同定された:ECLCBOVINAF0012611PW06548SSC6A101AF0043551S76691AF017642BYU068662CSADICDI及びSAU471392。実施例123:ヒトPRO1287をコードするcDNAクローンの単離発現配列タグESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAをサーチして、フリンジタンパク質と相同性を示したESTを同定した。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々なESTデータベースと比較して、相同性EST配列を同定した。比較はコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をここでDNA40568と命名する。DNA40568コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1287に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。正方向及び逆方向PCRプライマーは一般に20から30ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約100-1000bp長のPCR生成物を生じるように設計される。プローブ配列は典型的には40-55bp長である。ある場合には、コンセンサス配列が約1-1.5kbpよりも大きい場合に、さらなるオリゴヌクレオチドが合成される。全長クローンについて数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、PCRプライマー対での、Ausubel等CurrentProtocolsinMolecularBiology上掲のようなPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー5CTCGGGGAAAGGGACTTGATGTTGG3配列番号:382逆方向PCRプライマー15GCGAAGGTGAGCCTCTATCTCGTGCC3配列番号:383逆方向PCRプライマー25CAGCCTACACGTATTGAGG3配列番号:384さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5CAGTCAGTACAATCCTGGCATAATATACGGCCACCATGATGCAGTCCC3配列番号:385を持つコンセンサスDNA40568配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1287遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト骨髄組織から単離された。cDNAクローンを単離するために使用されるcDNAライブラリは、InvitrogenSanDiegoCAからのもののような商業的に入手可能な試薬を使用する標準的な方法により作成した。cDNAはNotI部位を含むオリゴdTで初回刺激され、SalIヘミキナーゼ化アダプターに平滑末端化されて結合され、NotIで切断され、ゲル電気泳動により適切なサイズにされ、独特のXhoI及びNotI部位において適当なクローニングベクター例えばpRKB又はpRKD;pRK5BはSfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes等Science25312781280を参照のことに決まった配向でクローニングされた。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1287に対する全長DNA配列DNA61755-1554図275、配列番号:380と命名とPRO1287に対する誘導タンパク質配列が得られた。DNA61755-1554の全ヌクレオチド配列を図275配列番号:380に示す。全長クローンは、ヌクレオチド位置655-657に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置2251-2253に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む図275;配列番号:380。予測されたポリペプチド前駆体は532アミノ酸長であり、約61,351ダルトンの算定分子量と約8.77の推定pIを有する。図276配列番号:381に示した全長PRO1287配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約27のシグナルペプチド及びアミノ酸約315からアミノ酸約318およびアミノ酸約324からアミノ酸約327の潜在的なNグリコシル化部位の存在が証明される。クローンDNA61755-1554は1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203112が付されている。図276配列番号:381に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1287アミノ酸配列と次のDayhoff配列:CET24D11EZRIBOVINGGU198891CC3YEASTS74244NALSMOUSEMOESPIGS28660S44860及びYNA4CAEELの間の有意な相同性が証明された。実施例124:ヒトPRO1312をコードするcDNAクローンの単離DNA55773は、一次cDNAクローンの5’末端を優先的に表す酵母スクリーニングを使用してヒト胎児腎臓cDNAライブラリにおいて同定された。DNA55773配列に基づいて、PRO1312に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のためにオリゴヌクレオチドを合成した。図277配列番号:386に示す全長DNA61873-1574クローンは、ヌクレオチド位置7-9に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置643-645に見出される停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は212アミノ酸長である図278、配列番号:387。PRO1312は約24,024ダルトンの算定分子量と約6.26の推定pIを有する。他の特徴は、アミノ酸約1-14のシグナルペプチド、アミノ酸約141-160の膜貫通ドメイン、及びアミノ酸約76-79及び93-96の潜在的なNグリコシル化部位を含む。図278配列番号:387に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1312アミノ酸配列と次のDayhoff配列:GCINTALPH1GIBMUC1A1PR96298AF0014061PVU888741PR85151AF0414091CELC50F27C45875及びAB00951021の間のある程度の相同性が明らかにされた。クローンDNA61873-1574はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203132が付された。実施例125:ヒトPRO1192をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA35924と命名する。DNA35924コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1192に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5CCGAGGCCATCTAGAGGCCAGAGC3配列番号:390逆方向PCRプライマー:5ACAGGCAGAGCCAATGGCCAGAGC3配列番号:391さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5GAGAGGACTGCGGGAGTTTGGGACCTTTGTGCAGACGTGCTCATG3配列番号:392を持つコンセンサスDNA35924配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1192遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児肝臓および脾臓組織から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA62814-1521と命名され図279配列番号:388に示されるPRO1192に対する全長DNA配列と図280に示されるPRO1192に対する誘導タンパク質配列配列番号:389が得られた。PRO1192の全コード配列を図279配列番号:388に示す。クローンDNA62814-1521は、ヌクレオチド位置121-123に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置766-768に見かけの停止コドンを有する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は215アミノ酸長である。予想されたポリペプチド前駆体は、次の特徴:図280のアミノ酸約1-21のシグナルペプチド;アミノ酸約153-176の膜貫通ドメイン;アミノ酸約39-42及び118-121の潜在的なNグリコシル化部位;及びアミノ酸約27-68及び99-128のミエリンP0タンパク質との相同性を有する。図280に示した全長PRO1192タンパク質は約24,484ダルトンの見積もり分子量と約6.98のpIを有する。図280配列番号:389に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1192アミノ酸配列と次のDayhoff配列:GEN12838MYP0HUMANAF0494981GEN14531PW14146HS46KDA1CINBRATOX2GRATD870181及びD869962の間の相同性が明らかになった。クローンDNA62814-1521は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203093が付されている。実施例126:ヒトPRO1160をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA40650と命名する。DNA40650コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1160に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5GCTCCCTGATCTTCATGTCACCACC3配列番号:395逆方向PCRプライマー:5CAGGGACACACTCTACCATTCGGGAG3配列番号:396さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5CCATCTTTCTGGTCTCTGCCCAGAATCCGACAACAGCTGCTC3配列番号:397を持つコンセンサスDNA40650配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1160遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト乳房組織から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA62872-1509図281,配列番号:393と命名されたPRO1160に対する全長DNA配列とPRO1160に対する誘導タンパク質配列が得られた。DNA62872-1509の全ヌクレオチド配列を図281配列番号:393に示す。クローンDNA62872-1509は、ヌクレオチド位置40-42に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置310-312の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図281。予測されたポリペプチド前駆体は90アミノ酸長である図282。図282に示した全長PRO1160タンパク質は約9,039ダルトンの見積もり分子量と約4.37のpIを有する。図282配列番号:394に示した全長PRO1160配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約19のシグナルペプチド及びアミノ酸約68からアミノ酸約70のプロテインキナーゼCリン酸化部位の存在が証明される。クローンDNA62872-1509は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203100が付されている。図282配列番号:394に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1160アミノ酸配列と次のDayhoff配列:B30305GEN13490I53641S53363HA34BRELCSP96DICDIS36326SSU5119710MUC1XENLATCU324481及びAF0004091の間の有意な相同性が証明された。実施例127:ヒトPRO1187をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57726と命名する。DNA57726コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号358563内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン358563を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図283に示し、ここでDNA62876-1517と命名する。図283に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置121-123に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置481-483に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図283;配列番号:398。予測されたポリペプチド前駆体図284、配列番号:399は120アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:399のアミノ酸約1-17にある。PRO1187は約12,925ダルトンの算定分子量と約9.46の推定pIを有する。クローンDNA62876-1517は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203095が付されている。寄託されたクローンは実際の核酸配列を有する一方、ここに記載の表示は些細な配列決定誤差を含みうることが理解される。図284配列番号:399に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1187アミノ酸配列と次のDayhoff配列:MGNENDOBX1CELF41G39AMPGSTRLIHSBBOVHERL2LEEXTEN101AF0299581及びPW04957の間のある程度の配列同一性従って、ある程度の関係が明らかにされた。実施例128:ヒトPRO1185をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56426と命名する。DNA57726コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3284411内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3284411を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図285に示し、ここでDNA62881-1515と命名する。図285に示した全長DNA62881-1515クローンは、ヌクレオチド位置4-6に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置598-600に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図285;配列番号:400。予測されたポリペプチド前駆体図286、配列番号:401は198アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:401のアミノ酸約1-21にある。PRO1185は約22,105ダルトンの算定分子量と約7.73の推定pIを有する。クローンDNA62881-1515はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203096が付されている。図286配列番号:401に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1185アミノ酸配列と次のDayhoff配列:TUP1YEASTAF0413821MAOMSOLTUSPPBPHU91I41024EPCPLCFAIL1HSPLEC1YKL4CAEELA44643TGU659221の間のある程度の配列同一性が明らかにされた。実施例129:ヒトPRO1345をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA47364と命名する。DNA47364コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1345に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー:5CCTGGTTATCCCCAGGAACTCCGAC3配列番号:404逆方向PCRプライマー:5CTCTTGCTGCTGCGACAGGCCTC3配列番号:405さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5CGCCCTCCAAGACTATGGTAAAAGGAGCCTGCCAGGTGTCAATGAC3配列番号:406を持つコンセンサスDNA47364配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1345遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト乳ガン組織から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA64852-1589図287、配列番号:402と命名されたPRO1345に対する全長DNA配列とPRO1345に対する誘導タンパク質配列が得られた。DNA64852-1589の全ヌクレオチド配列を図287配列番号:402に示す。クローンDNA64852-1589は、ヌクレオチド位置7-9または34-36に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置625-627の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図287。予測されたポリペプチド前駆体は206アミノ酸長である図288。図288に示した全長PRO1345タンパク質は約23,190ダルトンの見積もり分子量と約9.40のpIを有する。図288配列番号:403に示した全長PRO1345配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約31またはアミノ酸約10からアミノ酸約31のシグナルペプチド及びアミノ酸約176からアミノ酸約190のC型レクチンドメインシグネーチャー配列の存在が証明される。クローンDNA64852-1589は1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203127が付されている。図288配列番号:403に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1345アミノ酸配列と次のDayhoff配列:BTU222981TETNCARSPTETNHUMANMABARATS34198PW13144MACMBPA1A46274PSPDRAT及びPR32188の間の有意な相同性が証明された。実施例130:ヒトPRO1245をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56019と命名する。DNA56019コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号1327836内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン1327836を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図289に示し、ここでDNA64884-1527と命名する。図289に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置79-81に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置391-393に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図289;配列番号:407。予測されたポリペプチド前駆体図290、配列番号:408は104アミノ酸長であり、シグナルペプチド配列はアミノ酸約1からアミノ酸約18にある。PRO1245は約10,100ダルトンの算定分子量と約8.76の推定pIを有する。図290配列番号:408に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1245アミノ酸配列と次のDayhoff配列:SYATHETHGEN11167MTV0444AB0111511RLAJ27503SNELIPTRA1S63624C28391A37907及びS14064の間のある程度の相同性が明らかにされた。クローンDNA64884-1245は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203115が付されている。実施例131:ヒトPRO1358をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号88718内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン88718を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図291に示し、ここでDNA64890-1612と命名する。図291に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置86から88に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1418から1420に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図291;配列番号:409。予測されたポリペプチド前駆体図292、配列番号:410は444アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:410のアミノ酸約1-18にある。PRO1358は約50,719ダルトンの算定分子量と約8.82の推定pIを有する。クローンDNA64890-1612は1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203131が付されている。図292配列番号:410に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1358アミノ酸配列と次のDayhoff配列:PW07607AB0005451AB0005461A1ATRATAB0151641PP50021COTRCAVPO及びHAMHPP1の間の配列同一性が明らかにされた。この出願の請求の範囲に記載した変異体はこれらの配列を除くものである。実施例132:ヒトPRO1195をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA55716と命名する。DNA55716コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3252980内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3252980を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図293に示し、ここでDNA65412-1523と命名する。図293に示した全長クローンは、ヌクレオチド位置58-60に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置511-513に見いだされる停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図293;配列番号:411。予測されたポリペプチド前駆体図294、配列番号:412は151アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号:412のアミノ酸約1-22にある。PRO1195は約17,277ダルトンの算定分子量と約5.33の推定pIを有する。クローンDNA65412-1523は1998年8月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203094が付されている。図294配列番号:412に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1195アミノ酸配列と次のDayhoff配列:MMU284861AF0442051PW31186CELK03C71F69034EF1AMETVAAF0245401SSU903531MRSPSTAAU及びPR97680の間のある程度の配列同一性が明らかにされた。実施例133:ヒトPRO1270をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57951と命名する。DNA57951コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号124878内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckのESTクローン124878を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図295に示し、ここでDNA66308-1537と命名する。クローンDNA66308-1537は、ヌクレオチド位置103-105に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1042-1044の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図295。予測されたポリペプチド前駆体は313アミノ酸長である図296。図296に示した全長PRO1270タンパク質は約34,978ダルトンの見積もり分子量と約5.71のpIを有する。図296配列番号:414に示した全長PRO1270配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約16のシグナルペプチド、アミノ酸約163からアミノ酸約166の潜在的なNグリコシル化部位及びアミノ酸約74からアミノ酸約77及びアミノ酸約289からアミノ酸約292のグリコサミノグリカン付着部位の存在が証明される。クローンDNA66308-1537は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203159が付されている。図296配列番号:414に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1270アミノ酸配列と次のDayhoff配列:XLU866991S49589FIBAPARPAFIBBHUMANPR47189AF0043261DRTENASCN1AF0043271PW01411及びFIBGBOVINの間の有意な相同性が証明された。実施例134:ヒトPRO1271をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57955と命名する。DNA57955コンセンサス配列とMerckのESTクローン番号AA625350内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、MerckのESTクローンAA625350を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図297に示し、ここでDNA66309-1538と命名する。クローンDNA66309-1538は、ヌクレオチド位置94-96に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置718-720の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図297。予測されたポリペプチド前駆体は208アミノ酸長である図298。図298に示した全長PRO1271タンパク質は約21,531ダルトンの見積もり分子量と約8.99のpIを有する。図298配列番号:416に示した全長PRO1271配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約31のシグナルペプチドおよびアミノ酸約166からアミノ酸約187の膜貫通ドメインの存在が証明される。クローンDNA66309-1538は1998年9月15日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203235が付されている。図298配列番号:416に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1271アミノ酸配列と次のDayhoff配列:S57180S63257AGA1YEASTBPU435991YS8ACAEELS67570LSU545562S70305VGLXHSVEB及びD887331の間の有意な相同性が証明された。実施例135:ヒトPRO1375をコードするcDNAクローンの単離Merck/Wash.U.データベースをサーチしてMerkESTを同定した。ついで、この配列をSwissProt公的データベース、公のESTデータベース例えばGenBank、MerckWashUと企業のESTデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAからの他の配列とそれを整列化させるプログラムに入力した。サーチは、EST配列の6フレーム翻訳との細胞外ドメインECDタンパク質配列の比較としてコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。phrapを使用して他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列が構築された。このコンセンサス配列はここでDNA67003と命名する。DNA67003コンセンサス配列に基づいて、ヒト膵臓ライブラリにおいて核酸配列番号:417を同定した。クローンのDNA配列決定により、PRO1375に対する全長DNA配列とPRO1375に対する誘導タンパク質配列が得られた。PRO1375の全コード配列は図299配列番号:417に示される。クローンDNA67004-1614は、配列番号:417のヌクレオチド位置104-106に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置698-700に見かけの停止コドンを有する単一の読み取り枠を含む。予測されたポリペプチド前駆体は198アミノ酸長である。膜貫通ドメインは配列番号:418のアミノ酸約11-28II型と103-125にある。クローンDNA67004-1614はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203115が付されている。図300に示した全長PRO1375タンパク質は約22,531ダルトンの見積もり分子量と約8.47のpIを有する。図300配列番号:418に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1375アミノ酸配列と次のDayhoff配列:AF0261985CELR12C125S73465Y011MYCPNS645381PP8150MUVSHPO101VSHMUMPL及びCVU597515の間の配列同一性が明らかにされた。実施例136:ヒトPRO1385をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA57952と命名する。DNA57952コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3129630内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3129630を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図301に示し、ここでDNA68869-1610と命名する。クローンDNA68869-1610は、ヌクレオチド位置26-28に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置410-412の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図301。予測されたポリペプチド前駆体は128アミノ酸長である図302。図302に示した全長PRO1385タンパク質は約13,663ダルトンの見積もり分子量と約10.97のpIを有する。図302配列番号:420に示した全長PRO1385配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約28のシグナルペプチド、およびアミノ酸約82からアミノ酸約85およびアミノ酸約91からアミノ酸約94のグリコシルアミノグリカン付着部位の存在が証明される。クローンDNA68869-1610は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203164が付されている。図302配列番号:420に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1385アミノ酸配列と次のDayhoff配列:CELT14A81LMNACHRA11HXD9HUMANCHKCMLF1HS5PP342DMDRING1A371071MMLUNGENE1PUMDROME及びDMU251171の間の低い相同性が証明された。実施例137:ヒトPRO1387をコードするcDNAクローンの単離上記の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデータベースからの単一のESTクラスター配列の同定が可能になった。ついで、このESTクラスター配列を、公のESTデータベース例えばGenBankと企業のESTDNAデータベースLIFESEQRIncytePharmaceuticalsPaloAltoCAを含む様々な発現配列タグESTと比較して、現存の相同体を同定した。相同体サーチはコンピュータプログラムBLAST又はBLAST2Altshul等MethodsinEnzymology266460480を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった70又はある場合には90以上のBLASTスコアになったその比較物を集合化し、phrapプログラムPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonでコンセンサスDNA配列を構築した。得られたコンセンサス配列をここでDNA56259と命名する。DNA56259コンセンサス配列とIncyteのESTクローン番号3507924内に含まれていたEST配列の間の観察された配列相同性に鑑みて、IncyteのESTクローン3507924を購入し、cDNA挿入断片を得て配列決定した。この挿入断片は全長タンパク質をコードしていたことが分かった。このcDNA挿入断片の配列を図303に示し、ここでDNA68872-1620と命名する。クローンDNA68872-1620は、ヌクレオチド位置85-87に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置1267-1269の停止コドンで終端する単一の読み取り枠を含む図303。予測されたポリペプチド前駆体は394アミノ酸長である図304。図304に示した全長PRO1387タンパク質は約44,339ダルトンの見積もり分子量と約7.10のpIを有する。図304配列番号:422に示した全長PRO1387配列の分析により、次のもの:アミノ酸約1からアミノ酸約19のシグナルペプチド、アミノ酸約275からアミノ酸約296の膜貫通ドメイン、アミノ酸約76からアミノ酸約79、アミノ酸約231からアミノ酸約234、アミノ酸約302からアミノ酸約305、アミノ酸約307からアミノ酸約310およびアミノ酸約376からアミノ酸約379の潜在的なNグリコシル化部位、およびアミノ酸約210からアミノ酸約239およびアミノ酸約92からアミノ酸約121のミエリンp0タンパク質と相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が証明される。クローンDNA68872-1620は1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203160が付されている。図304配列番号:422に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1387アミノ酸配列と次のDayhoff配列:PW36955MYP0HETFRHS46KDA1AF0494981MYO0HUMANAF0304541A53268SHPTCRA1PW14146及びGEN12838の間の有意な相同性が証明された。実施例138:ヒトPRO1384をコードするcDNAクローンの単離上述の実施例1に記載したように、phrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列をDNA54192と命名する。DNA54192コンセンサス配列に基づき、1対象とする配列を含むcDNAライブラリをPCRにより同定するために、また2PRO1384に対する全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとしての使用のために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマー正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー5TGCAGCCCCTGTGACACAAACTGG3配列番号:425逆方向PCRプライマー5CTGAGATAACCGAGCCATCCTCCCAC3配列番号:426さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチド配列:ハイブリッド形成プローブ5GGAGATAGCTGCTATGGGTTCTTCAGGCACAACTTAACATGGGAAG3配列番号:27を持つDNA54192配列から作成した。全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを、上で同定したPCRプライマー対でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマーの一方を用いてPRO1384遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリの作成のためのRNAはヒト胎児肝臓から単離した。上述のようにして単離したクローンのDNA配列決定により、ここでDNA71159-1617図305、配列番号:423と命名されるPRO1384に対する全長DNA配列とPRO1384に対する誘導タンパク質配列が得られた。PRO1384の全コード配列を図305配列番号:423に示す。クローンDNA71159-1617は、ヌクレオチド位置182-184に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位置869-871に見かけの停止コドンを有する単一のリーディングフレームを含む。予測されたポリペプチド前駆体は229アミノ酸長である。図306に示した全長PRO1384タンパク質は約26,650ダルトンの見積もり分子量と約8.76のpIを有する。さらなる特徴は、アミノ酸約32-57のII型膜貫通ドメイン、およびアミノ酸約68-71、120-123、および134-137の潜在的なNグリコシル化部位を含む。図306配列番号:424に示した全長配列のWUBLAST2配列アラインメント分析法を使用してのDayhoffデータベースバージョン35.45SwissProt35の解析により、PRO1384アミノ酸配列と次のDayhoff配列:AF0548191HSAJ16871AF0095111AB0107101GEN13595HSAJ6731GEN13961AB0059001LECHCHICKAF0213491及びNK13RATの間の相同性が明らかになった。クローンDNA71159-1617はATCCに寄託され、ATCC寄託番号203135が付されている。実施例139:ハイブリッド形成プローブとしてのPROの使用以下の方法は、PROをコードする核酸配列のハイブリッド形成プローブとしての使用を記載する。ここに開示する全長又は成熟PROのコード化配列を含むDNAは、ヒト組織cDNAライブラリ又はヒト組織ゲノムライブラリにおける同種DNA類PROポリペプチドの天然発生変異体をコードするものなどのスクリーニングのためのプローブとして用いられる。いずれかのライブラリDNAを含むフィルターのハイブリッド形成及び洗浄は、以下の高い緊縮条件で実施した。放射性標識PRO誘導プローブのフィルターへのハイブリッド形成は、50ホルムアミド、5xSSC、01SDS、01ピロリン酸ナトリウム、50mMリン酸ナトリウム、pH68、2xデンハード液、及び10デキストラン硫酸の溶液中で、42°Cにおいて20時間行った。フィルターの洗浄は、01xSSC及び01SDSの水溶液中、42°Cで行った。次いで、全長天然配列PROをコードするDNAと所望の配列同一性を有するDNAは、この分野で知られた標準的な方法を用いて同定できる。実施例140:大腸菌におけるPROの発現この実施例は、大腸菌における組み換え発現による所望のPROの非グリコシル化形態の調製を例示する。PROをコードするDNA配列は、選択されたPCRプライマーを用いて最初に増幅した。プライマーは、選択された発現ベクターの制限酵素部位に対応する制限酵素部位を持たなければならない。種々の発現ベクターが用いられる。好適なベクターの例は、pBR322大腸菌から誘導されたもの;Bolivar等Gene295参照であり、アンピシリン及びテトラサイクリン耐性についての遺伝子を含む。ベクターは、制限酵素で消化され、脱リン酸される。PCR増幅した配列は、次いで、ベクターに結合させる。ベクターは、好ましくは抗生物質耐性遺伝子、trpプロモーター、polyhisリーダー最初の6つのSTIIコドン、polyhis配列、及びエンテロキナーゼ切断部位を含む、特定のPROコード化領域、ラムダ転写終結区、及びargU遺伝子を含む。ライゲーション混合物は、次いで、上掲のSambrook等に記載された方法を用いた選択した大腸菌の形質転換に使用される。形質転換体は、それらのLBプレートで成長する能力により同定され、次いで抗生物質耐性クローンが選択される。プラスミドDNAが単離され、制限分析及びDNA配列分析で確認される。選択されたクローンは、抗生物質を添加したLBブロスなどの液体培地で終夜成長させることができる。終夜培地は、続いて大規模培地の播種に用いられる。次に細胞を最適光学密度まで成長させ、その間に発現プロモーターが作動する。更に数時間の培養の後、細胞を採集して遠心分離できる。遠心分離で得られた細胞ペレットは、この分野で知られた種々の試薬を用いて可溶化され、次いで可溶化PROタンパク質を金属キレート化カラムを用いてタンパク質を緊密に結合させる条件下で精製した。以下の手法を用いて、大腸菌においてポリHisタグ形態でPROを発現させてもよい。PROをコードするDNAを選択したPCRプライマーを用いて最初に増幅した。プライマーは、選択された発現ベクターの制限酵素部位に対応する制限酵素部位、及び効率的で信頼性のある翻訳開始、金属キレートカラムでの迅速な精製、及びエンテロキナーゼでのタンパク質分解的除去を与える他の有用な配列を含む。次いでPCR増幅された、ポリHisタグ配列を発現ベクターに結合させ、それを株52W3110fuhAlongalErpoHtscllpPに基づく大腸菌宿主の形質転換に使用した。形質転換体は、最初に50mgmlのカルベニシリンを含有するLB中、30°Cで振盪しながら35のO.D.600に達するまで成長させた。ついで培地をCRAP培地357gのNH42SO4、071gのクエン酸ナトリウム2H2O、107gのKCl、536gのDifco酵母抽出物、500mL水中の536gのShefieldhycaseSF、並びに110mMのMPOS、pH73、055wvのグルコース及び7mMのMgSO4の混合で調製中に50100倍希釈し、30°Cで振盪させながら約2030時間成長させた。試料を取り出してSDSPAGEにより発現を確認し、バルク培地を遠心分離して細胞のペレットとした。細胞ペレットを精製及び再折りたたみまで凍結させた。05から1Lの発酵610gペレットからの大腸菌ペーストを、7Mのグアニジン、20mMのトリス、pH8バッファー中で10容量wvで再懸濁させた。固体硫酸ナトリウム及びテトラチオン酸ナトリウムを添加して最終濃度を各々01M及び002Mとし、溶液を4°Cで終夜撹拌した。この工程により、亜硫酸によりブロックされたシステイン残基を持つ変性タンパク質がもたらされた。溶液をBeckmanUltracentrifuge中で40000rpmで30分間濃縮した。上清を金属キレートカラムバッファー6Mのグアニジン、20mMのトリス、pH74の35容量で希釈し、022ミクロンフィルターを通して濾過して透明化した。透明化抽出物を、金属キレートカラムバッファーで平衡化させた5mlのQiagenNiNTA金属キレートカラムに負荷した。カラムを50mMのイミダゾールCalbiochemUtrolgradeを含む添加バッファー、pH74で洗浄した。タンパク質を250mMのイミダゾールを含有するバッファーで溶離した。所望のタンパク質を含有する画分をプールし、4°Cで保存した。タンパク質濃度は、そのアミノ酸配列に基づいて計算した吸光係数を用いて280nmにおけるその吸収により見積もった。試料を、20mMのトリス、pH86、03MのNaCl、25Mの尿素、5mMのシステイン、20mMのグリシン及び1mMのEDTAからなる新たに調製した再折りたたみバッファー中に徐々に希釈することによりタンパク質を再折りたたみさせた。リフォールディング容量は、最終的なタンパク質濃度が50~100マイクログラムmlとなるように選択した。リフォールディング溶液を4°Cで1236時間ゆっくり撹拌した。リフォールディング反応はTFAを採取濃度04約3のpHで添加することにより停止させた。タンパク質をさらに精製する前に、溶液を022ミクロンフィルターを通して濾過し、アセトニトリルを最終濃度210で添加した。再折りたたみされたタンパク質を、PorosR1H逆相カラムで、01TFAの移動バッファーと10~80のアセトニトリル勾配での溶離を用いてクロマトグラフにかけた。A280吸収を持つ画分のアリコートをSDSポリアクリルアミドゲルで分析し、相同な再折りたたみされたタンパク質を含有する画分をプールした。一般的に、殆どのタンパク質の正しく再折りたたみされた種は、これらの種が最もコンパクトであり、その疎水性内面が逆相樹脂との相互作用から遮蔽されているので、アセトニトリルの最低濃度で溶離される。凝集した種は通常、より高いアセトニトリル濃度で溶離される。タンパク質の誤って折りたたまれた形態を所望の形態から除くのに加えて、逆相工程は試料からエンドトキシンも除去する。所望の折りたたまれたPROポリペプチドを含有する画分をプールし、溶液に向けた窒素の弱い気流を用いてアセトニトリルを除去した。タンパク質を、透析又は調製バッファーで平衡化したG25SuperfinePharmacia樹脂でのゲル濾過及び滅菌濾過により、014Mの塩化ナトリウム及び4のマンニトールを含む20mMのHepes、pH68に調製した。ここに開示した多くのPROポリペプチドが上記のようにして成功裏に発現された。実施例141:哺乳動物細胞におけるPROポリペプチドの発現この実施例は、哺乳動物細胞における組み換え発現によるPROのグリコシル化形態の調製を例示する。発現ベクターとしてpRK51989年3月15日発行のEP307247参照を用いた。場合によっては、PRODNAを選択した制限酵素を持つpRK5に結合させ、Sambrook等上掲に記載されたようなライゲーション方法を用いてPRODNAを挿入させる。得られたベクターは、pRK5-PROと呼ばれる。一実施態様では、選択された宿主細胞は293細胞とすることができる。ヒト293細胞ATCCCCL1573は、ウシ胎児血清及び場合によっては滋養成分及び/又は抗生物質を添加したDMEMなどの媒質中で組織培養プレートにおいて成長させて集密化した。約10μgのpRK5-PROポリペプチドDNAを約1μgのVARNA遺伝子コード化DNA[Thimmappaya等Cell31543]と混合し、500μlの1mMトリスHCl、01mMEDTA、0227MCaCl2に溶解させた。この混合物に、滴状の、500μlの50mMHEPESpH735、280mMのNaCl、15mMのNaPO4を添加し、25°Cで10分間析出物を形成させた。析出物を懸濁し、293細胞に加えて37°Cで約4時間定着させた。培養培地を吸引し、2mlのPBS中20グリセロールを30秒間添加した。293細胞は、次いで無血清培地で洗浄し、新鮮な培地を添加し、細胞を約5日間インキュベートした。形質移入の約24時間後、培養培地を除去し、培養培地のみ又は200μCiml35S-システイン及び200μCiml35S-メチオニンを含む培養培地で置換した。12時間のインキュベーションの後、条件培地を回収し、スピンフィルターで濃縮し、15SDSゲルに添加した。処理したゲルを乾燥させ、PROポリペプチドの存在を現す選択された時間にわたってフィルムにさらした。形質転換した細胞を含む培地は、更なるインキュベーションを施し無血清培地で、培地を選択されたバイオアッセイで試験した。これに換わる技術において、PROは、Somparyac等ProcNatlAcadSci127575に記載されたデキストラン硫酸法を用いて293細胞に一過的に導入される。293細胞は、スピナーフラスコ内で最大密度まで成長させ、700μgのpRK5-PRODNAを添加する。細胞は、まずスピナーフラスコから遠心分離によって濃縮し、PBSで洗浄した。DNA-デキストラン沈殿物を細胞ペレット上で4時間インキュベートした。細胞を20グリセロールで90秒間処理し、組織培養培地で洗浄し、組織培養培地、5μgmlウシインシュリン及び01μgmlウシトランスフェリンを含むスピナーフラスコに再度導入した。約4日後に、条件培地を遠心分離して濾過し、細胞及び細胞片を除去した。次いで発現されたPROを含む試料を濃縮し、透析及び/又はカラムクロマトグラフィー等の選択した方法によって精製した。他の実施態様では、PROをCHO細胞で発現させることができる。pRK5-PROは、CaPO4又はDEAE-デキストランなどの公知の試薬を用いてCHO細胞に形質移入することができる。上記したように、細胞培地をインキュベートし、培地を培養培地のみ又は35Sメチオニン等の放射性標識を含む培地に置換することができる。PROポリペプチドの存在を同定した後、培養培地を無血清培地に置換してもよい。好ましくは、培地を約6日間インキュベートし、次いで条件培地を収集する。次いで、発現されたPROを含む培地を濃縮して、選択した方法にとって精製することができる。また、エピトープタグPROは、宿主CHO細胞において発現させてもよい。PROはpRK5ベクターからサブクローニングした。サブクローン挿入物は、次いで、PCRを施してバキュロウイルス発現ベクター中のポリhisタグ等の選択されたエピトープタグを持つ枠に融合できる。ポリhisタグPRO挿入物は、次いで、安定なクローンの選択のためのDHFR等の選択マーカーを含むSV40誘導ベクターにサブクローニングできる。最後に、CHO細胞をSV40誘導ベクターで上記のように形質移入した。発現を確認するために、上記のように標識化を行ってもよい。発現されたポリhisタグPROを含む培養培地は、次いで濃縮し、Ni2-キレートアフィニティクロマトグラフィー等の選択された方法により精製できる。またPROは、一過性発現法によりCHO及び/又はCOS細胞で、他の安定な発現方法によりCHO細胞で発現させてもよい。CHO細胞における安定な発現は以下の方法を用いて実施された。タンパク質は、それは対応するタンパク質の可溶化形態及び/又はポリHisタグ形態のコード化配列例えば、細胞外ドメインがIgG1のヒンジ、CH2及びCH2ドメインを含む定常領域配列に融合したIgG作成物イムノアドヘシン、又はポリHisタグ形態として発現された。PCR増幅に続いて、対応するDNAを、Ausubel等CurrentProtocolsofMolecularBiologyUnit326JohnWileyandSonsに記載されたような標準的技術を用いてCHO発現ベクターにサブクローニングした。CHO発現ベクターは、対象とするDNAの5’及び3’に適合する制限部位を有し、cDNAの便利なシャトル化ができるように作成される。ベクターは、Lucas等NuclAcidsres24917741779に記載されたようにCHO細胞での発現を用い、対象とするcDNA及びジヒドロフォレートレダクターゼDHFRの発現の制御にSV40初期プロモーター/エンハンサーを用いる。DHFR発現は、形質移入に続くプラスミドの安定な維持のための選択を可能にする。所望のプラスミドDNAの12マイクログラムを、市販の形質移入試薬SuperfectDosper及びFugeneBoehringerMannheim約一千万のCHO細胞に導入した。細胞は、上掲のLucas等に記載されているように成長させた。約3x10-7細胞を、下記のような更なる成長及び生産のためにアンプル中で凍結させた。プラスミドDNAを含むアンプルを水槽に配して解凍し、ボルテックスにより混合した。内容物を10mLの媒質を含む遠心管にピペットして、1000rpmで5分間遠心分離した。上清を吸引して細胞を10mLの選択培地02μm濾過PS20、5の02μm透析濾過ウシ胎児血清を添加中に懸濁させた。次いで細胞を90mLの選択培地を含む100mlスピナーに分けた12日後、細胞を150mLの選択培地を満たした250mLスピナーに移し、37°Cでインキュベートした。さらに23日後、250mL、500mL及び2000mLのスピナーを3x105細胞mLで播種した。細胞培地を遠心分離により新鮮培地に交換し、生産培地に再懸濁させた。任意の適切なCHO培地を用いてもよいが、実際には1992年6月16日に発行された米国特許第5122469号に記載された生産培地を使用した。3Lの生産スピナーを12x106細胞mLで播種した。0日目に、細胞数とpHを測定した。1日目に、スピナーをサンプルし、濾過空気での散布を実施した。2日目に、スピナーをサンプルし、温度を33°Cに変え、500gLのグルコース及び06mLの10消泡剤例えば35ポリジメチルシロキサンエマルション、DowCorning365MedicalGradeEmulsionの30mLとした。生産を通して、pHは72近傍に調節し維持した。10日後、又は生存率が70を下回るまで、細胞培地を遠心分離で回収して022μmフィルターを通して濾過した。濾過物は、4°Cで貯蔵するか、即座に精製用カラムに負荷した。ポリHisタグ作成物について、タンパク質はNiNTAカラムを用いて精製した。精製の前に、イミダゾールを条件培地に5mMの濃度まで添加した。条件培地を、03MのNaCl及び5mMイミダゾールを含む20mMのHepespH74バッファーで平衡化した6mlのNiNTAカラムに45ml分の流速で4°Cにおいてポンプ供給した。負荷後、カラムをさらに平衡バッファーで洗浄し、タンパク質を025Mイミダゾールを含む平衡バッファーで溶離した。高度に精製されたタンパク質は、続いて10mMのHepes、014MのNaCl及び4のマンニトールを含む貯蔵バッファー中で25mlのG25SuperfinePharmaciaを用いて脱塩し、80°Cで貯蔵した。イムノアドヘシンFc含有作成物を以下のようにして条件培地から精製した。条件培地を、20mMのリン酸ナトリウムバッファーpH68で平衡化した5mlのプロテインAカラムPharmaciaに負荷した。負荷後、カラムを平衡バッファーで強く洗浄した後、100mMのクエン酸pH35で溶離した。溶離したタンパク質は、1mlの画分を275μlの1MトリスバッファーpH9を含む管に回収することにより即座に中性化した。高度に精製されたタンパク質は、続いてポリHisタグタンパク質について上記した貯蔵バッファー中で脱塩した。均一性はSDSポリアクリルアミドゲルで試験し、エドマン分解によりN末端アミノ酸配列決定した。ここに開示したPROポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現された。実施例142:酵母菌でのPROの発現以下の方法は、酵母菌中でのPROの組換え発現を記載する。第1に、ADH2/GAPDHプロモーターからのPROの細胞内生産又は分泌のための酵母菌発現ベクターを作成する。PROをコードするDNA及びプロモーターを選択したプラスミドの適当な制限酵素部位に挿入してPROの細胞内発現を指示する。分泌のために、PROをコードするDNAを選択したプラスミドに、ADH2/GAPDHプロモーターをコードするDNA、天然PROシグナルペプチド又は他の哺乳動物シグナルペプチド、又は、例えば酵母菌アルファ因子分泌シグナル/リーダー配列、及び必要ならばPROの発現のためのリンカー配列とともにクローニングすることができる。酵母菌株AB110等の酵母菌は、次いで上記の発現プラスミドで形質転換し、選択された発酵培地中で培養できる。形質転換した酵母菌上清は、10トリクロロ酢酸での沈降及びSDS-PAGEによる分離で分析し、次いでクマシーブルー染色でゲルの染色をすることができる。続いて組換えPROは、発酵培地から遠心分離により酵母菌細胞を除去し、次いで選択されたカートリッジフィルターを用いて培地を濃縮することによって単離及び精製できる。PROを含む濃縮物は、選択されたカラムクロマトグラフィー樹脂を用いてさらに精製してもよい。ここに開示したPROポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現された。実施例143:バキュロウイルス感染昆虫細胞でのPROの発現以下の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞中におけるPROの組換え発現を記載する。PROコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクターに含まれるエピトープタグの上流に融合させた。このようなエピトープタグは、ポリhisタグ及び免疫グロブリンタグIgGのFc領域などを含む。pVL1393Navogenなどの市販されているプラスミドから誘導されるプラスミドを含む種々のプラスミドを用いることができる。簡単には、PRO又はPROコード化配列の所定部分、例えば膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列又はタンパク質が細胞外である場合の成熟タンパク質をコードする配列などが、5’及び3’領域に相補的なプライマーでのPCRにより増幅される。5’プライマーは、隣接する選択された制限酵素部位を包含していてもよい。生産物は、次いで、選択された制限酵素で消化され、発現ベクターにサブクローニングされる。組換えバキュロウイルスは、上記のプラスミド及びBaculoGoldウイルスDNAPharmingenを、SpodopterafrugiperdaSf9細胞ATCCCRL1711中にリポフェクチンGIBCOBRLから市販を用いて同時形質移入することにより作成される。28°Cで45日インキュベートした後、放出されたウイルスを回収し、更なる増幅に用いた。ウイルス感染及びタンパク質発現は、OReilley等BaculovirusexpressionvectorsAlaboratoryManualOxfordOxfordUniversityPressに記載されているように実施した。次に、発現されたポリhisタグPROは、例えばNi2-キレートアフィニティクロマトグラフィーにより次のように精製される。抽出は、Rupert等Nature362175179に記載されているように、ウイルス感染した組み換えSf9細胞から調製した。簡単には、Sf9細胞を洗浄し、超音波処理用バッファー25mMのHepes、pH79;125mMのMgCl2;01mMEDTA;10グリセロール;01のNP-40;04MのKCl中に再懸濁し、氷上で2回20秒間超音波処理した。超音波処理物を遠心分離で透明化し、上清を負荷バッファー50mMリン酸塩、300mMのNaCl、10グリセロール、pH78で50倍希釈し、045μmフィルターで濾過した。Ni2-NTAアガロースカラムQiagenから市販を5mLの総容積で調製し、25mLの水で洗浄し、25mLの負荷バッファーで平衡させた。濾過した細胞抽出物は、毎分05mLでカラムに負荷した。カラムを、分画回収が始まる点であるA280のベースラインまで負荷バッファーで洗浄した。次に、カラムを、結合タンパク質を非特異的に溶離する二次洗浄バッファー50mMリン酸塩;300mMのNaCl、10グリセロール、pH60で洗浄した。A280のベースラインに再度到達した後、カラムを二次洗浄バッファー中で0から500mMイミダゾール勾配で展開した。1mLの分画を回収し、SDS-PAGE及び銀染色又はアルカリホスファターゼQiagenに複合したNi2-NTAでのウェスタンブロットで分析した。溶離したHis10-タグPROを含む画分をプールして負荷バッファーで透析した。あるいは、IgGタグ又はFcタグPROの精製は、例えば、プロテインA又はプロテインGカラムクロマトグラフィーを含む公知のクロマトグラフィー技術を用いて実施できる。ここに開示したPROポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現された。実施例144:PROに結合する抗体の調製この実施例は、PROに特異的に結合できるモノクローナル抗体の調製を例示する。モノクローナル抗体の生産のための技術は、この分野で知られており、例えば、Goding上掲に記載されている。用いられ得る免疫原は、精製PRO、PROを含む融合タンパク質、細胞表面に組換えPROを発現する細胞を含む。免疫原の選択は、当業者が過度の実験をすることなくなすことができる。Balb/c等のマウスを、完全フロイントアジュバントに乳化して皮下又は腹腔内に1100マイクログラムで注入したPRO免疫原で免疫化する。あるいは、免疫原をMPL-TDMアジュバントRibiImmunochemicalResearhHamiltonMTに乳化し、動物の後足蹠に注入してもよい。免疫化したマウスは、次いで10から12日後に、選択したアジュバント中に乳化した付加的免疫源で追加免疫する。その後、数週間、マウスをさらなる免疫化注射で追加免疫する。抗PRO抗体の検出のためのELISAアッセイで試験するために、レトロオービタル出血からの血清試料をマウスから周期的に採取してもよい。適当な抗体力価が検出された後、抗体にポジティブ陽性な動物に、PRO静脈内注射の最後の注入をすることができる。3から4日後、マウスを屠殺し、脾臓を取り出した。次いで脾臓細胞を35ポリエチレングリコールを用いて、ACTTから番号CRL1597で入手可能なP3X63AgU.1等の選択されたマウス骨髄腫株化細胞に融合させた。融合によりハイブリドーマ細胞が生成され、次いで、HATヒポキサンチン、アミノプテリン、及びチミジン培地を含む96ウェル組織培養プレートに蒔き、非融合細胞、骨髄腫ハイブリッド、及び脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害した。ハイブリドーマ細胞は、PROに対する反応性についてのELISAでスクリーニングされる。PROに対するモノクローナル抗体を分泌するポジティブ陽性ハイブリドーマ細胞の決定は、技術常識の範囲内である。陽性ハイブリドーマ細胞を同系のBalb/cマウスに腹腔内注入し、抗PROモノクローナル抗体を含む腹水を生成させる。あるいは、ハイブリドーマ細胞を、組織培養フラスコ又はローラーボトルで成長させることもできる。腹水中に生成されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈降、それに続くゲル排除クロマトグラフィ-を用いて行うことができる。あるいは、抗体のプロテインA又はプロテインGへの親和性に基づくアフィニティクロマトグラフィーを用いることもできる。実施例145:特異的抗体を用いたPROポリペプチドの精製天然又は組換えPROポリペプチドは、この分野の種々の標準的なタンパク質精製方法によって精製できる。例えば、プロPROポリペプチド、成熟ポリペプチド、又はプレPROポリペプチドは、対象とするPROポリペプチドに特異的な抗体を用いた免疫親和性クロマトグラフィーによって精製される。一般に、免疫親和性カラムは抗PROポリペプチド抗体を活性化クロマトグラフィー樹脂に共有結合させて作成される。ポリクローナル免疫グロブリンは、硫酸アンモニウムでの沈殿又は固定化プロテインAPharmaciaLKBBiotechnologyPiscatawayNJでの精製のいずれかにより免疫血清から調製される。同様に、モノクローナル抗体は、硫酸アンモニウム沈殿又は固定化プロテインAでのクロマトグラフィーによりマウス腹水液から調製される。部分的に精製された免疫グロブリンは、CnBr活性化セファロースPharmaciaLKBBiotechnology等のクロマトグラフィー樹脂に共有結合される。抗体が樹脂に結合され、樹脂がブロックされ、誘導体樹脂は製造者の指示に従って洗浄される。このような免疫親和性カラムは、可溶化形態のPROポリペプチドを含有する細胞からの画分を調製することによるPROポリペプチドの精製において利用される。この調製物は、洗浄剤の添加又はこの分野で公知の方法により微分遠心分離を介して得られる全細胞又は細胞成分画分の可溶化により誘導される。あるいは、シグナル配列を含む可溶化PROポリペプチドは、細胞が成長する培地中に油様な量で分泌される。可溶化PROポリペプチド含有調製物は、免疫親和性カラムを通され、カラムはPROポリペプチドの好ましい吸着をさせる条件下例えば、洗浄剤存在下の高イオン強度バッファーで洗浄される。次いで、カラムは、抗体/PROポリペプチド結合を分解する条件下例えば、約23といった低pH、高濃度の尿素又はチオシアン酸イオン等のカオトロープで溶離され、PROポリペプチドが回収される。実施例146:薬剤スクリーニング本発明は、PROポリペプチド又はその結合断片を種々の薬剤スクリーニング技術において使用することによる化合物のスクリーニングに特に有用である。そのような試験に用いられるPROポリペプチド又は断片は、溶液中の自由状態でも、固体支持体に固定されても、細胞表面に位置しても、細胞内に局在化していてもよい。薬剤スクリーニングの1つの方法は、PROポリペプチド又は断片を発現する組換え核酸で安定に形質移入される真核生物又は原核生物宿主細胞を利用する。薬剤は、そのような形質移入細胞に対して、競合的結合アッセイにおいてスクリーニングされる。そのような細胞は、生存可能又は固定化形態のいずれかにおいて、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、PROポリペプチド又は断片と試験される試薬の間での複合体形成を測定してよい。あるいは、試験する試薬によって生ずるPROポリペプチドとその標的細胞との間の複合体形成における減少を試験することもできる。即ち本発明は、PROポリペプチド関連疾患又は障害に影響を与えうる薬剤又は任意の他の試薬のスクリーニング方法を提供する。これらの方法は、その試薬をPROポリペプチド又は断片に接触させ、試薬とPROポリペプチド又は断片との間の複合体の存在について、又はPROポリペプチド又は断片と細胞との間の複合体の存在について検定することを含む。これらの競合結合アッセイでは、PROポリペプチド又は断片が典型的には標識される。適切なインキュベーションの後、自由なPROポリペプチド又は断片を結合形態のものから分離し、自由又は未複合の標識の量が、特定の試薬がPROポリペプチドに結合する又はPROポリペプチド/細胞複合体を阻害する能力の尺度となる。薬剤スクリーニングのための他の技術は、ポリペプチドに対して適当な結合親和性を持つ化合物についての高スループットスクリーニングを提供し、1984年9月13日に発行されたWO8403564に詳細に記載されている。簡単に述べれば、多数の異なる小型ペプチド試験化合物が、プラスチックピン等の固体支持体又は幾つかの他の表面上で合成される。PROポリペプチドに適用すると、ペプチド試験化合物はPROポリペプチドと反応して洗浄される。結合したPROポリペプチドはこの分野で良く知られた方法により検出される。精製したPROポリペプチドは、上記の薬剤スクリーニング技術に使用するためにプレート上に直接被覆することもできる。さらに、非中和抗体は、ペプチドを捕捉し、それを固体支持体上に固定化するのに使用できる。また、本発明は、PROポリペプチドに結合可能な中和抗体がPROポリペプチド又はその断片について試験化合物と特異的に競合する競合薬剤スクリーニングアッセイも考慮する。この方法において、抗体は、PROポリペプチドで、一又は複数の抗原決定基を持つ任意のペプチドの存在を検出するのに使用できる。実施例147:合理的薬剤設計合理的薬剤設計の目的は、対象とする生物学的活性ポリペプチド例えば、PROポリペプチド又はそれらが相互作用する小分子、例えばアゴニスト、アンタゴニスト、又はインヒビターの構造的類似物を製造することである。これらの例は、PROポリペプチドのより活性で安定な形態又はインビボでPROポリペプチドに機能を促進又は阻害する薬剤の創作に使用できる参考、HodgsonBioTechnology91921。1つの方法において、PROポリペプチド、又はPROポリペプチドインヒビター複合体の三次元構造が、x線結晶学により、コンピュータモデル化により、最も典型的には2つの方法の組み合わせにより決定する。分子の構造を解明し活性部位を決定するためには、PROポリペプチドの形状及び電荷の両方が確認されなければならない。数は少ないが、PROポリペプチドの構造に関する有用な情報が相同タンパク質の構造に基づいたモデル化によって得られることもある。両方の場合において、関連する構造情報は、類似PROポリペプチド様分子の設計又は行こうなインヒビターの同定に使用される。合理的な薬剤設計の有用な例は、Braxton及びWellsBiochemistry3177967801に示されているような向上した活性又は安定性を持つ分子、又はAthauda等JBiochem113742746に示されているような天然ペプチドのインヒビター、アゴニスト、又はアンタゴニストとして作用する分子を含む。また、上記のような機能アッセイによって選択された標的特異的な抗体を単離しその結晶構造を解明することもできる。この方法は、原理的には、それに続く薬剤設計が基礎をおくことのできるファーマコアを生成する。機能的な薬理学的に活性な抗体に対する抗イディオタイプ抗体抗idsを生成することにより、タンパク質結晶学をバイパスすることができる。鏡像の鏡像として、抗idsの結合部位は最初のレセプターの類似物であると予測できる。抗idは、次いで、化学的又は生物学的に製造したペプチドのバンクからペプチドを同定及び単離するのに使用できる。単離されたペプチドは、ファーマコアとして機能するであろう。本発明により、十分な量のPROポリペプチドがX線結晶学などの分析実験を実施するために入手可能である。さらに、ここに提供したPROポリペプチドアミノ酸配列の知識は、x線結晶学に換える、又はそれに加えるコンピュータモデル化技術で用いられる知識を提供する。実施例148:心臓新生児肥大の刺激アッセイ1このアッセイは新生児心臓の肥大を刺激するPROポリペプチドの能力を測定するように設計されている。このアッセイで陽性と試験されるPROポリペプチドは様々な心不全疾患の治療上の処置に利用できることが期待される。1日齢のHarlanSpragueDawleyラットから筋細胞を得た。細胞75x104mlで180μl、血清<01、新たに単離をDMEMF124FCSで予めコートした96ウェルプレートに1日目に添加した。試験PROポリペプチド又は成長培地のみを含有する試験試料を1日目にウェルに直接添加した。次いで2日目に最終濃度が10-6MとなるようにPGFが加えられる。次いで4日目に細胞が染色され、5日目に視覚によりスコアをつけ、ここでサイズの増加しない細胞は0.0とスコアされ、サイズの小から中規模の増加を示した細胞は1.0とスコアされさらにサイズの大きな増大を示した細胞は2.0とスコアされる。このアッセイで陽性の結果としたのは、1.0又はそれ以上のスコアである。次のポリペプチドはこのアッセイで陽性と試験された:PRO1312実施例149:内皮細胞増殖の刺激アッセイ8このアッセイは、本発明のPROポリペプチドが副腎皮質毛細管内皮細胞ACE成長を刺激する能力を示すか否かを測定するように設計されている。このアッセイにおいて陽性と試験されたポリペプチドは、例えば創傷治癒、及びこれに類似のものを含み、血管新生が有益である症状や疾患の治療的処置において有用であると期待されるこれらPROポリペプチドのアゴニストがそうあろうように。このアッセイにおいて陽性と試験されたPROポリペプチドのアンタゴニストは、癌性腫瘍の治療的処置に対して有用であると期待される。ウシ副腎皮質毛細管内皮ACE細胞初代培養からのもの、最大12-14継代を96ウェルのプレートにおいて100マイクロリットル当たり500細胞/ウェルでプレーティングした。アッセイ媒体は、低グルコースDMEM、10子ウシ血清、2mMグルタミン、及び1xペニシリン/ストレプトマイシン/ファンギゾンを含む。対照ウェルは以下を含む:1ACE細胞無添加;2ACE細胞のみ;3ACE細胞VEGF;及び4ACE細胞FGF。次いで、対照及び試験試料100マイクロリットル容量をウェルに添加した各々、1、01及び001希釈。細胞培地を37°C/5CO2で6-7日間インキュベートした。インキュべーションの後、ウェル中の培地を吸引して細胞をPBSで1x洗浄した。次いで、酸ホスファターゼ反応混合物100マイクロリットル、01M酢酸ナトリウムpH55,01トリトンX100、10mMのリン酸pニトロフェニルを各ウェルに添加した。37°Cで2時間のインキュベーション後に、10マイクロリットルの1NのNaOHの添加により反応を停止させた。光学密度ODを405nmでマイクロタイタープレートで測定した。PROポリペプチドの活性は、1細胞のみのバックグラウンドに対する、及び2VEGFによる最大刺激に対する酸ホスファターゼ活性、OD405nmで測定した増殖の増加倍数として計算した。最大刺激に対する活性の規準としてVEGF3-10ngml及びFGF1-5ngmlを使用した。アッセイの結果は、観察された刺激がバックグラウンドに対して≧50増加している場合に陽性と考えた。VEGF5ngml対照は1希釈において1.24倍の刺激を与え;FGB5ngml対照は1希釈において146倍の刺激を与えた。以下の試験ポリペプチドがこのアッセイでポジティブであった:PRO1154及びPRO1186。実施例150:血管内皮成長因子VEGF刺激の内皮細胞成長の増殖を阻害するPROポリペプチドの能力ACE細胞を添加しないもの;ACE細胞単独;ACE細胞プラス5ngmlのFGF;ACE細胞プラス3ngmlのVEGF;ACE細胞プラス3ngmlのVEGFプラス1ngmlのTGFベータ;及びACE細胞プラス3ngmlのVEGFプラス5ngmlのLIF。ついで、試験用試料であるポリhisタグPROポリペプチドをウェルの添加した。細胞を37°C/5のCO2で6-7日インキュベートした。インキュベート後、ウェルの培地を吸引し、細胞を1xPBSで洗浄した。酸ホスファターゼ反応混合物100マイクロタイター、01Mの酢酸ナトリウム、pH55、01のトリトンX100、10mMのpニトロフェニルホスフェートを各ウェルに添加した。37°Cで2時間インキュベートした後、10マイクロタイターの1NのNaOHの添加で反応を停止した。光学密度をマイクロプレートリーダーで405nmにおいて測定した。PROポリペプチドの活性を、刺激無しの細胞に対するVEGF3ngml刺激増殖のパーセント阻害として算出した。TGFβはVEGF刺激ACE細胞増殖を70-90阻止するので、1ngmlで活性参照として使用した。結果は、PROポリペプチドの癌治療、特に腫瘍新脈管形成の阻害における有用性を示している。数値は刺激なし細胞に対するPROポリペプチドによるVEGF刺激増殖のパーセント阻害を算出し、ついで1ngml濃度でのTGFβが、VEGF刺激細胞増殖を70-90阻止することが知られていることで得られたパーセント阻害をパーセンテージに除することで決定される。結果は、PROポリペプチドが内皮細胞成長のVEGF刺激を30又はそれ以上を阻害したときにポジティブと考える。以下の試験ポリペプチドがこのアッセイにおいてポジティブであった:PRO812。実施例151:混合リンパ球反応を個々の哺乳類、例えばヒトのボランティアからロイコフェレーシスにより単離する。所望するならば、単離後に、細胞をウシ胎児血清及びDMSO中で凍結する。凍結細胞をアッセイ用培地で一晩解凍し、ついで洗浄し、アッセイ用培地に3x106細胞mlに再懸濁させる。刺激物PBMCは細胞を光にさらすことにより調製される。このアッセイは混合物:1001の1又は01に希釈された試験料試料、501の光にさらされた刺激物細胞、及び501のレスポンダーPBMC細胞、を三重ウェルに蒔くことにより調製される。100マイクロタイターの細胞培養培地又は100マイクロタイターのCD4IgGを対照体として使用する。ついで、ウェルを37°C、5CO2で4日間インキュベートする。5日目、各ウェルにトリチウム化チミジン10mCウェル;Amershamを適用する。6時間後、細胞を3回洗浄し、ついで標識の取込を評価する。このアッセイの他の変形例では、PBMCをBalbcマウス及びC57B6マウスの脾臓から単離する。細胞を、アッセイ用培地RPMI;10ウシ胎児血清、1ペニシリン/ストレプトマイシン、1グルタミン、1HEPES、1非必須アミノ酸、1ピルバートにおいて新たに回収された脾臓から顕微鏡検査用に細かく切断し、リンパライトMこのアッセイは、本発明の所定のポリペプチドが杆状体光受容体細胞の生存/増殖を高めるように作用し、よって、例えば色素性網膜炎、AMD等による哺乳類の視力喪失の治療を含む網膜疾患又は損傷の治療的処置に有用であることを示す。妊娠7日のSpragueDawleyラット胎児混合集団:グリア及び網膜ニューロン細胞型をCO2麻酔に続いて断頭により屠殺し、無菌条件下で眼を取り出した。神経網膜を色素上皮及び他の眼組織から切除し、ついでCa2、Mg2無しのPBS中の025トリプシンを用いて単細胞懸濁物中に解離させた。網膜を37°Cで7-10分間インキュベートし、その後1mlのダイズトリプシンインヒビターを添加することによりトリプシンを不活性化した。細胞を、N2を添加したDMEMF12中、96ウェルプレートにウェル当たり100000細胞で蒔いた。全ての実験について、細胞は5CO2の水飽和雰囲気下、37°Cで成長させた。培地中で2-3日後に細胞を4のパラホルムアルデヒドで固定し、次いでセルトラッカーグリーンCMFDA染色した。Rho4D2腹水又はIgG1100、可視色素ロドプシンに対するモノクローナル抗体を、間接的免疫蛍光法による杆状体光受容体の検出に使用した。結果は生存:培地中2-3日のカルセイン-ロドプシンポジティブ細胞の全数を、培地中2-3日でのカルセイン-ロドプシンポジティブ細胞の全数で除するものとして計算する。全細胞蛍光は、CCDカメラ及びMacIntosh用NIH画像ソフトウェアを用いて20X対物倍率で定量化した。ウェルの視野は無作為に選択した。以下の試験ポリペプチドがこのアッセイでポジティブであった:PRO536、PRO943、PRO828、PRO826、PRO1068及びPRO1132。実施例154:内皮細胞におけるcfosの誘導アッセイ34このアッセイはPROポリペプチドが内皮細胞においてcfosを誘導する能力を示すか否かを決定するために設計されている。このアッセイで陽性と試験されたPROポリペプチドは、症状や疾患の治療上の処置に役立ち、その脈管形成は例えば創傷治癒、及びその様なものを含むものに有用である。このアッセイで陽性と試験されたPROポリペプチドは癌性腫瘍の治療上の処置に役立つことが期待される。成長培地50のハムのF12w/oGHT:低グルコース、及びグリシンなしの50DMEM:NaHCO3、1グルタミン、10mMのHEPES、10のFBS、10ngmlのbFGF中のヒト静脈臍静脈内皮細胞HUVECCellSystemsを1x104細胞/ウェルの細胞密度で96ウェルマクロタイタープレートにプレーティングした。プレーティングの次の日、成長培地を除き、細胞を100μl/ウェルの試験試料とコントロールポジティブコントロール:成長培地;ネガティブコントロール:10mMのHEPES、140mMのNaCl、4wvマンニトール、pH68で処理することにより、細胞を飢餓させた。細胞を5CO2中で37°Cにおいて30分間インキュベートした。試料を取り除いて、bDNAキットプロトコールChironDiagnosticscat6005037の最初の部分に従った。ここで、下記の各大文字の試薬/バッファーはキットから利用可能であった。簡単には、試験に必要なTM溶菌バッファー及びプローブの量を製造者により提供された情報に基づいて計算した。適当な量の解凍プローブをTM溶菌バッファーに添加した。捕獲ハイブリッド形成バッファーを室温まで温めた。bDNA条片を金属条片ホルダーにセットアップし、100μlの捕獲ハイブリッド形成バッファーを必要な各bDNAウェルに添加し、少なくとも30分インキュベートした。細胞内の試験プレートをインキュベータから取り除き、真空マニフォールドを使用して培地を穏やかに除いた。マイクロタイタープレートの各ウェルに100μlのプローブを伴う溶菌ハイブリッド形成バッファーを各bDNAウェルにピペットで素早く添加した。ついで、プレートを15分間55°Cでインキュベートした。インキュベーターからの取り出し、マイクロタイターアダプターヘッドを備えたボルテックスミキサーにプレートを配し、1分の間、2の設定でボルテックスした。80μlの溶菌液を取り除き、捕獲ハイブリッド形成バッファーを含むbDNAウェルに添加し、ピペットで上下して混合した。プレートを少なくとも16時間の間53°Cでインキュベートした。次の日に、bDNAキットプロトコールの第2の部分に従った。すなわち、プレートをインキュベーターから取り除き、ベンチに配置して10分間冷却した。必要な添加の容積は製造者により適用された情報に基づいて計算した。ALハイブリッド形成バッファー中に1100の希釈のアンプリファイアー濃縮物AmplifierConcentrate20fmμlを作成することによりアンプリファイアー作用液を調製した。ハイブリダイゼーション混合物はウォシュAで2回洗浄された。50μlのアンプリファイアー作用液がそれぞれのウェルに加えられ、該ウェルは53°Cで30分でインキュベートされた。ついで、プレートをインキュベーターから取り除いて10分間冷却した。標識プローブ作用液を、ALハイブリッド形成バッファー中に1100の希釈で標識濃縮物40pmolesμlを作成することにより調製した。10分の冷却期間後、アンプリファイアーハイブリッド形成混合物を除去し、プレートを洗浄剤Aで2回洗浄した。50μlの標識プローブ作用液を各ウェルに添加し、ウェルを53°Cで15分間インキュベートした。10分間の冷却後、基質を室温まで温めた。アッセイに必要な各モルの基質に3μlの基質エンハンサーを添加して、プレートを10分間冷却し、標識ハイブリッド形成混合物を取り除き、プレートを洗浄剤Aで2回、洗浄剤Dで3回洗浄した。50μlのエンハンサーを伴う基質溶液を各ウェルに添加した。プレートを37°Cで30分間インキュベートし、RLUを適当な照度計で読みとった。複製を平均化し変動係数を決定した。ネガティブコントロール上述のHEPESバッファー値に対する増加倍数の活性の測定は化学発光単位RLUによって示された。結果を下記の表9に示し、ネガティブコントロール値に対して少なくとも2倍の値を示す試料は陽性と考えた。ネガティブコントロール=100希釈で100RLU。ポジティブコントロール=100希釈で839RLU。次のポリペプチドはこのアッセイで陽性と試験された:PRO535、PRO826、PRO819、PRO1126、PRO1160及びPRO1387。実施例155:混合リンパ球反応における阻害活性アッセイこの実施例は、本発明の一又は複数のポリペプチドが刺激されたTリンパ球の増殖阻害剤として活性であることを示す。リンパ球の増殖を阻害する化合物は、免疫反応の抑制が好ましい治療において有用である。このアッセイの基本的プロトコールは、Immunologyunit312;JEColiganAMKruisbeekDHMargliesEMShevachWStrober編国立衛生研究所JohnWileySonsIncから出版のCurrentProtocolsに記載されている。さらに、このアッセイの一変形例では、末梢血液単核細胞PBMCを個々の哺乳類、例えばヒトのボランティアからロイコフェレーシスにより単離する一人のドナーには刺激物PBMCを供給し、他のドナーにはレスポンダーPBMCを供給する。所望するならば、単離後に、細胞をウシ胎児血清及びDMSO中で凍結する。凍結細胞をアッセイ用培地37°C、5CO2で一晩解凍し、ついで洗浄し、アッセイ用培地RPMI;10ウシ胎児血清、1ペニシリン/ストレプトマイシン、1グルタミン、1HEPES、1非必須アミノ酸、1ピルビン酸塩に3x106細胞mlに再懸濁させる。刺激物PBMCは細胞を光にさらす約3000ラドことにより調製される。このアッセイは混合物:1001の1又は01に希釈された試験料試料、501の光にさらされた刺激物細胞、及び501のレスポンダーPBMC細胞、を三重ウェルに蒔くことにより調製される。100マイクロタイターの細胞培養培地又は100マイクロタイターのCD4IgGを対照体として使用する。ついで、ウェルを37°C、5CO2で4日間インキュベートする。5日目、各ウェルにトリチウム化チミジン10mCウェル;Amershamを適用する。6時間後、細胞を3回洗浄し、ついで標識の取込を評価する。このアッセイの他の変形例では、PBMCをBalbcマウス及びC57B6マウスの脾臓から単離する。細胞を、アッセイ用培地RPMI;10ウシ胎児血清、1ペニシリン/ストレプトマイシン、1グルタミン、1HEPES、1非必須アミノ酸、1ピルビン酸塩において新たに回収された脾臓から顕微鏡検査用に細かく切断し、リンパライトMLympholyteMOrganonTeknika上にこれらの細胞をオーバーレイすることによりPMBCを単離し、2000rpmで20分間遠心分離し、集め、アッセイ用培地における単核細胞層を洗浄し、アッセイ用培地に1x107細胞mlになるように細胞を再懸濁させる。ついで、このアッセイは上記のように行われる。任意に以下の対照体が減少することは、阻害用化合物についてのポジティブな結果であると考えられ、80未満の減少が好ましい。しかしながら、任意の値が対照体未満であるなら、試験用タンパク質について阻害効果を示す。以下の試験ポリペプチドがこのアッセイでポジティブであった:PRO1114、PRO836、PRO1159、PRO1312、PRO1192、PRO1195及びPRO1387。実施例156:マウス腎メサンギウム細胞増殖アッセイを各々のウェルへ添加し、比光分析反応を2時間に渡り継続させる。そして、吸光度を490nmで測定した。このアッセイにおける陽性は、少なくとも対照試料の示度よりも15上の吸光度示度を与える全てのものである。以下の試験ポリペプチドが、このアッセイでポジティブであった:PRO819、PRO813及びPRO1066。実施例157:周皮細胞cfos誘導を各ウェルへ添加し、プレートをさらに3時間、37°Cでインキュベートした。そして、各ウェルの蛍光を測定したこのアッセイは、成人のヘモグロビンから赤芽球細胞系における胎児ヘモグロビンへの切替を誘発する、PROポリペプチドの能力をスクリーニングするのに有用である。このアッセイにおいて試験する分子がポジティブであると、種々のサラセミア等の、多様な哺乳類ヘモグロビン関連疾患を治療的に処置するのに有用であることが期待される。このアッセイは以下のようにして行われる。赤芽球細胞を標準的成長培地において、96ウェルフォーマットに1000細胞/ウェルで蒔く。02又は2の濃度でPROポリペプチドを成長培地に添加し、細胞を37°Cで5日間インキュベートする。正の対照体として、細胞を100μMのヘミンで処理し、負の対照体として、細胞を処理しない。5日後、細胞溶解物を調製し、ガンマグロブリンの発現について分析する胎児用マーカー。このアッセイにおいてポジティブとは、ガンマグロブリンレベルが負の対照体の少なくとも2倍であることである。以下の試験ポリペプチドがこのアッセイでポジティブであった:PRO1114、PRO826、PRO1066、PRO844、PRO1192及びPRO1358。実施例164:膵臓β細胞前駆体分化の誘導アッセイ89このアッセイは、本発明のあるペプチドが膵臓β細胞前駆体の分化を誘導し、それ故に糖尿病を含む哺乳類における種々のインシュリン欠乏状態の治療に有用であると期待されることを示す。このアッセイは、以下のようにおこなわれた。このアッセイは、マウス胎児膵臓細胞の一次培養を使用し、一次計測は、β細胞前駆体又は成熟β細胞のいずれかを示すマーカーの発現の変化である。マーカー発現は、実時間数量化PCRを各々のウェルへ添加し、比光分析反応を2時間に渡り継続させた。そして、吸光度を490nmで測定した。このアッセイにおける陽性は、少なくとも対照試料の示度よりも10上の吸光度示度を与える全てのものである。以下の試験ポリペプチドが、このアッセイでポジティブであった:PRO1192、PRO1195。実施例169:インビトロ抗増殖性アッセイ種々のPROポリペプチドの抗増殖活性を、本質的にSkehan等JNatlCancerInst8211071112に記載されたスルホローダミンBSRB染料結合アッセイを用いる国立癌研究所NCIの実験的、疾患指向的インビトロ抗癌薬発見アッセイにおいて測定した。このアッセイで用いた60の腫瘍細胞系NCIパネル、並びにそれらの維持およびインビトロ培養の条件は、Monks等JNatlCancerInst83757766に記載されている。このスクリーニングの目的は、異なる型の腫瘍に対する試験化合物の細胞毒性及び/又は細胞分裂停止活性を最初に評価することであるMonks等上掲BoydCancerPrincPractOncolUpdate31121989。約60のヒト腫瘍細胞系からの細胞をトリプシン/EDTAGibcoで回収し、1回洗浄し、IMEM中に再懸濁し、それらの生存を測定した。細胞懸濁物をピペット100μL容量で別の96ウェルマイクロタイタープレートに添加した。6日インキュベーションの細胞密度は2日インキュベーションより小さく過剰成長は防止された。播種後、安定化のために37°Cで24時間プレインキュベーションした。目的とする試験濃度の2倍希釈をゼロ時に100μlのアリコートにマイクロタイタープレートウェルに添加した12希釈。試験化合物を2分の5log希釈1000~100000倍で評価した。インキュベーションは5CO2雰囲気および100湿度で2日および6日実施した。インキュベーション後、培地を除去し、細胞を10トリクロロ酢酸の01mlで40°Cにおいて固定した。プレートを脱イオン水で5回洗浄し、乾燥させ、1酢酸に溶解した04スルホローダミンB染料Sigmaの01mlで30分間染色し、1酢酸で4回洗浄して非結合染料を除去し、乾燥させ、染色物を10mMトリス塩基[トリスアミノメタン]pH105の01mlで5分間抽出した。スルホローダミンBの492nmにおける吸収ODを、コンピュータ接続96ウェルマイクロタイタープレートリーダーを使用して測定した。試験試料は、一又は複数の濃度で少なくとも50の成長阻害を示すときにポジティブと考える。このアッセイにおいてポジティブを示したPROポリペプチドは、表7に示されており、略語は以下の通りである:NSCL=非小細胞肺癌腫CNS=中枢神経系これらのアッセイの結果は、ポジティブと試験されるRPOポリペプチドが、多くの異なる腫瘍細胞型の腫瘍性成長を抑制するのに役立ち、その治療に役立ちうることを示している。これらのPROポリペプチドに対する抗体は、これらの有用なポリペプチドの親和性精製に役立つ。これらのPROポリペプチドをコードする核酸は、これらのポリペプチドの組換え生産に役立つ。実施例170:腫瘍の遺伝子増幅この実施例は、種々のPROポリペプチドをコードする遺伝子が或る種のヒト癌のゲノムで増幅されることを示す。増幅は遺伝子産物の過剰発現を伴い、PROポリペプチドが結腸、肺及び他の癌等の或る種の癌において治療的介入の有用な標的であることを示している。治療薬はPROポリペプチドコード化遺伝子のアンタゴニスト、例えばマウスヒトキメラ、PROポリペプチドに対するヒト化又はヒト抗体の形態をとりうる。スクリーニングの出発物質は種々の癌から単離したゲノムDNAである。DNAは、定量的、例えば蛍光定量的に正確である。ネガティブ対照として、DNAを10の正常健常個体からDNAを単離し、それをプールして健常個体における遺伝子コピーのアッセイ対照として使用した示さず。5ヌクレアーゼアッセイ例えばTaqManを、或る種の癌で潜在的に増幅される遺伝子の発見に使用した。結果は、PROポリペプチドがスクリーニングした肺及び結腸癌において過剰発現されたか否かの決定に用いた。原発性肺癌は、表8に示してあるように、個々の腫瘍の型及び段階から得た。表8の原発性腫瘍の命名に用いた省略形の説明及び本実施例を通して言及されている原発性腫瘍と細胞株は、下記に示されている。TaqMan商品名の結果はデルタΔCT単位で報告した。1単位は1PCRサイクル又は正常に対して約2倍の増幅に相当し、2単位は4倍、3単位は8倍等々に相当する。定量化はプライマー及びPROポリペプチドコード化遺伝子から誘導したTaqMan35680tmp5CCACCAATGGCAGCCCCACCT3配列番号:42835680tmf5GACTGCCCTCCCTGCCA3配列番号:42935680tmr5CAAAAAGCCTGGAAGTCTTCAAAG3配列番号:430PRO341:26288tmf15CAGCTGGACTGCAGGTGCTA3配列番号:43126288tmr15CAGTGAGCACAGCAAGTGTCCT3配列番号:43226288tmp15GGCCACCTCCTTGAGTCTTCAGTTCCCT3配列番号:433PRO53556866tmf15TCTAGCCAGCTTGGCTCCAATA3配列番号:44356866tmr15CCTGGCTCTAGCACCAACTCATA3配列番号:44456866tmp15TCAGTGGCCCTAAGGAGATGGGCCT3配列番号:445PRO84859839tmf15CAGGATACAGTGGGAATCTTGAGA3配列番号:44659839tmr15CCTGAAGGGCTTGGAGCTTAGT3配列番号:44759839tmp15TCTTTGGCCATTTCCCATGGCTCA3配列番号:448PRO94352192tmf15CCCATGGCGAGGAGGAAT3配列番号:44952192tmr15TGCGTACGTGTGCCTTCAG3配列番号:45052192tmp15CAGCACCCCAGGCAGTCTGTGTGT3配列番号:451PRO100557708tmf15AACGTGCTACACGACCAGTGTACT3配列番号:45257708tmr15CACAGCATATTCAGATGACTAAATCCA3配列番号:45357708tmp15TTGTTTAGTTCTCCACCGTGTCTCCACAGAA3配列番号:454PRO100957129tmf15TGTCAGAATGCAACCTGGCTT3配列番号:45557129tmr15TGATGTGCCTGGCTCAGAAC3配列番号:45657129tmp15TGCACCTAGATGTCCCCAGCACCC3配列番号:457PRO109759841tmf15AAGATGCGCCAGGCTTCTTA3配列番号:45859841tmr15CTCCTGTACGGTCTGCTCACTTAT3配列番号:45959841tmp15TGGCTGTCAGTCCAGTGTGCATGG3配列番号:460PRO110759606tmf15GCATAGGGATAGATAAGATCCTGCTTTAT3配列番号:46159606tmr15CAAATTAAAGTACCCATCAGGAGAGAA3配列番号:46259606tmp15AAGTTGCTAAATATATACATTATCTGCGCCAAGTCCA3配列番号:463PRO111158721tmf25GTGCTGCCCACAATTCATGA3配列番号:46458721tmp25GTCCTTGGTATGGGTCTGAATTATAT3配列番号:46558721tmr25ACTCTCTGCACCCCACAGTCACCACTATCTC3配列番号:466PRO115359842tmf15CTGAGGAACCAGCCATGTCTCT3配列番号:46759842tmr15GACCAGATGCAGGTACAGGATGA3配列番号:46859842tmp15CTGCCCCTTCAGTGATGCCAACCTT3配列番号:469PRO118259848tmf15GGGTGGAGGCTCACTGAGTAGA3配列番号:47059848tmr15CAATACAGGTAATGAAACTCTGCTTCTT3配列番号:47159848tmp15TCCTCTTAAGCATAGGCCATTTTCTCAGTTTAGACA3配列番号:472PRO118459220tmf15GGTGGTCTTGCTTGGTCTCAC3配列番号:47359220tmr15CCGTCGTTCAGCAACATGAC3配列番号:47459220tmp15ACCGCCTACCGCTGTGCCCA3配列番号:475PRO118762876tmf15CAGTAAAACCACAGGCTGGATTT3配列番号:47662876tmr15CCTGAGAGCAAGAAGGTTGAGAAT3配列番号:47762876tmp15TAGACAGGGACCATGGCCCGCA3配列番号:478PRO128159820tmf15TGGGCTGTAGAAGAGTTGTTG3配列番号:47959820tmr15TCCACACTTGGCCAGTTTAT3配列番号:48059820tmp15CCCAACTTCTCCCTTTTGGACCCT3配列番号:481PRO111257702tmf15GTCCCTTCACTGTTTAGAGCATGA3配列番号:48257702tmr15ACTCTCCCCCTCAACAGCCTCCTGAG3配列番号:48357702tmp15GTGGTCAGGGCAGACCTTT3配列番号:484PRO118562881tmf15ACAGATCCAGGAGAGACTCCACA3配列番号:48562881tmr15AGCGGCGCTCCCAGCCTGAAT3配列番号:48662881tmp15CATGATTGGTCCTCAGTTCCATC364884tmf15ATAGAGGGCTCCCAGAAGTG3配列番号:48864884tmp15CAGGGCCTTCAGGGCCTTCAC3配列番号:48964884tmr15GCTCAGCCAAACACTGTCA3配列番号:49064884tmf25GGGGCCCTGACAGTGTT3配列番号:49164884tmp25CTGAGCCGAGACTGGAGCATCTACAC3配列番号:49264884tmr25GTGGGCAGCGTCTTGTC3配列番号:4935ヌクレアーゼアッセイ反応は蛍光PCRベースの技術であり、実時間での増幅監視のためのTaqDNAポリメラーゼ酵素の5エキソヌクレアーゼ活性を使用する。PCR反応に典型的な単位複製配列の生成に2つのオリゴヌクレオチドプライマー2μl、ロット360851026を2mlの蛍光計溶液に添加して200単位で校正した。次いで、さらに2μlのpGEM3ZfDNAを試験し、40010単位で読みを確認した。次いで各試料を少なくとも3回読んだ。3試料が互いに10以内であることが見られたとき、それらの平均をとり、この値を定量化値として用いた。次いで、蛍光測定で決定した濃度を、各試料をddH2O中に10ngμlまで希釈するのに用いた。これは、1回のTaqManプレートアッセイについて全てのテンプレート試料について同時に行い、500-1000アッセイを実施するのに十分な材料で行った。試料は、Taqmanプライマー及びプローブで3回試験し、Bアクチン及びGAPDHともに正常なヒトDNAを持ちテンプレート対照を持たない単一のプレート上にある。希釈した試料を用いたが、試験DNAから減算した正常ヒトDNAのCT値は1CTであった。希釈した、ロット定性化したゲノムDNAを、10mlアリコートで-80°Cにおいて保存した。続いて遺伝し増幅アッセイに使用するアリコートは、4°Cで保存した。各1mlのアリコートは、8-9プレート又は64試験に十分である。遺伝子増幅アッセイ:本発明のPROポリペプチド化合物を以下の原発腫瘍でスクリーニングし、1.0以上の得られたΔCt値を表9に報告する。上記に記載した種々のDNAの増幅が種々の腫瘍において生じるため、種々DNAの増幅は腫瘍の形成及び/又は成長と関連しているようである。結果として、これらポリペプチドを標的としたアンタゴニストと命名される]配列番号:215及びPRO846の誘導タンパク質配列を与えた。UNQ422の全核酸配列を図329配列番号:516に示す。クローンUNQ422は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置25-27に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1021-1023の停止コドンで終端する図329。予測されるポリペプチド前駆体は332アミノ酸長である図330。図330に示した全長PRO846タンパク質は、約36,143ダルトンの見積もり分子量及び約5.89のpIを有する。PRO846のアミノ酸配列の重要な領域は、図330に示したように、シグナルペプチド、膜貫通ドメイン、Nグリコシル化部位、フィフ ゙リノーケ ゙ンベータ及びガンマ鎖C末端ドメインに典型的な配列、及びIg様V型ドメインに典型的な配列を含む。クローンUNQ422はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209847が付与されている。実施例174:ヒトPRO363をコードするcDNAクローンの単離上記実施例1に記載したように種々のEST配列に対してコンセンサス配列が得られ、得られたコンセンサス配列は、ここにDNA42828と命名される。DNA42828コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO363の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。PCRプライマーの対正方向及び逆方向を合成した:正方向PCRプライマー5CCAGTGCACAGCAGGCAACGAAGC3配列番号:521逆方向PCRプライマー5ACTAGGCTGTATGCCTGGGTGGGC3配列番号:522さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下の核酸配列を持つコンセンサスDNA42828配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ42828p15GTATGTACAAAGCATCGGCATGGTTGCAGGAGCAGTGACAGGC3配列番号:523全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対でPCR増幅した。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びPCRプライマー対の一方を用いてPRO363遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織LIB227から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列は、PRO363の全長DNA配列[ここで、UNQ318参照に、独特のXhoI及びNotI部位において、所定の方向でクローニングした。上述のようにして単離されたクローンのDNA配列決定により、全長PRO9828ポリペプチドの全長DNA配列ここでDNA142238-2768と命名[図323、配列番号:510]と、PRO9828ポリぺプチドの誘導タンパク質配列が得られた。上で同定された全長クローンは、ヌクレオチド位置232-234に見かけの転写開始部位、ヌクレオチド位置985-987の停止シグナルを含む図323、配列番号:510。予想されたポリペプチド前駆体は251アミノ酸長、約27954ダルトンの推定分子量及び約9.22の推定PIを有する。図324配列番号:511に示された全長PRO9828配列の分析により、図324に示されるような様々な重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになり、ここで、これらの重要なポリペプチドドメインを与える位置は上述されるようにおおよそである。染色体地図は、PRO9828コード化核酸がヒトにおいて染色体12p13に位置づけられることを示す。クローンDNA142238-2768は1999年10月5日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号819-PTAを付与されている。図324配列番号:511に示された全長配列のALIGN-2配列アラインメント分析を使用した、Dayhoffデータベースversion3545SwissProt35の解析により、PRO9828アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PY08581、AB0181221、FGF3HUMAN、PR70824、S54407、PR80780、PY23761、PW92312、OMFGF61及びPR80871との間の配列同一性が証明された。実施例176:ヒトPRO7170をコードするcDNAクローンの単離DNA108722-2743は、ジェネンテク,インクSouthSanFranciscoCAによって開発された独自の配列発見アルゴリズムを、公的例えば、GenBank及び/又は私的LIFESEQRIncytePharmaceuticalsIncPaloAltoCAデータベースからのESTs並びに集団化及び構築されたEST断片に適用することにより同定した。シグナル配列アルゴリズムは、考慮している配列又は配列断片の5末端の第1の、場合によっては第2のメチオニンコドンATGを取り囲むDNAヌクレオチドの性質に基づく分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGに続くヌクレオチドは、停止コドンを持たない少なくとも35の不明瞭でないアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが必要なアミノ酸を有する場合、第2のものは試験しない。何れも要件を満たさない場合、候補配列にスコアをつけなかった。EST配列が真正のシグナル配列を含むか否かを決定するために、ATGコドンを取り囲むDNA及び対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られた7つのセンサー評価パラメータの組を用いてスコアをつけた。このアルゴリズムの使用により、多くのポリペプチドコード化核酸配列の同定がなされた。上述したシグナル配列アルゴリズムの使用は、LIFESEQRデータベースIncytePharmaceuticals、PaloAltoからの、ここにおいてCLU57836と命名された、ESTクラスター配列の同定を可能にした。このESTクラスター配列を、公的データベース例えば、GenBank及び独自に開発したESTDNAデータベースLIFESEQR、IncytePharmaceuticals、PaloAltoCAを含む種々の発現配列タグESTデータベースと比較し、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2AltschulらMethodsinEnzymology266460480を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア7090の場合もある又はそれ以上を持つこれらの比較物は、プログラムphrapPhilGreenUniversityofWashingtonSeattleWashingtonで集団化してコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでDNA58756と命名する。DNA58756配列とIncyteIncytePharmaceuticals、PaloAltoCAIncyteデーターベースからのno2251462に包含されるEST配列に認められる配列相同性に鑑み、クローンno2251462は購入され、そのcDNA挿入部は得られて配列を決められた。ここにおいて、cDNA挿入部が全長タンパク質をコードすることが見出された。ここにおいて、cDNA挿入部が全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入部の配列は、図325に示され、ここにおいてDNA108722-2743と命名された。クローンDNA108722-2743は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置60-62に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置1506-1508の停止コドンで終端する図325。予測されるポリペプチド前駆体は、482アミノ酸長である図326。図326に示されている全長PRO7170タンパク質は、約49060の見積もり分子量及び約4.74のpIを有する。図326配列番号:513に示された全長PRO7170配列の分析は、図326に示されているような種々の重要なポリペプチドドメインの存在を証明し、これら重要なポリペプチドドメインへ与えられている位置は、上記に記載のようにおおよそである。クローンDNA108722-2743は、1999年8月17日にATCCへ寄託され、ATCC寄託番号552-PTAが付与された。図326配列番号:513に示した全長配列のALIGN-2配列アラインメント分析法を使用しての、Dayhoffデータベースバージョン3545SwissProt35の分析は、PRO7170アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PY12291、I47141、D887331、DMC56G71、PY11606、HWP1CANAL、HSMUC5BEX1、HSU785501、HSU701361、及びSGS3DROMEとの間の配列同一性を明らかにした。実施例177:ヒトPRO361をコードするcDNAクローンの単離上記実施例1に記載したようにphrapを用いて他のEST配列に対してコンセンサスDNA配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでDNA40654と命名する。DNA40654コンセンサス配列に基づいて、1PCRにより対象とする配列を含むcDNAライブラリを同定するため、及び2PRO361の全長コード配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。次のように正方向及び逆方向PCRプライマーを合成した:正方向PCRプライマー5AGGGAGGATTATCCTTGACCTTTGAAGACC3配列番号:528正方向PCRプライマー5GAAGCAAGTGCCCAGCTC3配列番号:529正方向PCRプライマー5CGGGTCCCTGCTCTTTGG3配列番号:530逆方向PCRプライマー5CACCGTAGCTGGGAGCGCACTCAC3配列番号:531逆方向PCRプライマー5AGTGTAAGTCAAGCTCCC3配列番号:532さらに、以下のヌクレオチド配列を持つ合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブをコンセンサスDNA40654配列から作成した。ハイブリッド形成プローブ5GCTTCCTGACACTAAGGCTGTCTGCTAGTCAGAATTGCCTCAAAAAGAG3配列番号:427全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのDNAを上で同定したPCRプライマー対の一方でのPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドを用いてPRO361遺伝子をコードするクローンを単離するのに使用した。cDNAライブラリー作成のためのRNAは、ヒト胎児腎臓組織から単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO361の全長DNA配列[ここではDNA45410-1250と命名]配列番号:514及びPRO361の誘導タンパク質配列が得られた。DNA45410-1250の全ヌクレオチド配列を図327配列番号:514に示す。クローンDNA45410-1250は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置226-228に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位置1519-1521の停止コドンで終端する図327。予測されるポリペプチド前駆体は431アミノ酸長である図328。図328に示した全長PRO361タンパク質は約46,810ダルトンの推定分子量及び約6.45のpIを有する。また、膜貫通ドメインアミノ酸380-409及びアルギナーゼタンパク質ファミリーに典型的な配列アミノ酸3-14及び39-57を含む興味ある領域が図328に示されている。クローンDNA45410-1250はATCCに寄託され、ATCC寄託番号209621が付与された。全長PRO361ポリペプチドのアミノ酸配列の分析により、その部分がムチン及び/又はキチナーゼタンパク質と有意な相同性を有していることが示唆され、PRO361が新規なムチン及び/又はキチナーゼタンパク質でありうることを示している。実施例178:ヒトPRO183、PRO184、PRO185、PRO5723、PRO3301又はPRO9940をコードするcDNAクローンの単離付随される図面に示されるヒトPRO183、PRO184、PRO185、PRO5723、PRO3301又はPRO9940ポリペプチドをコードするDNA分子はGenBankを通じて得られた。材料の寄託次の材料をアメリカンタイプカルチャーコレクション10801ユニバーシティブルバード,マナッサス,ヴァージニア201102209,米国に寄託した:表10材料ATCC寄託番号寄託日DNA454101250ATCC2096121998年2月5日DNA1087222743ATCC522PTA1999年8月17日DNA1422382768ATCC819PTA1999年10月5日DNA409811234ATCC2094391997年11月7日DNA454191252ATCC2096161998年2月5日DNA441961353ATCC2098471998年5月6日DNA164221209ATCC2099291998年6月2日DNA164351208ATCC2099301998年6月2日DNA216241391ATCC2099171998年6月2日DNA233341392ATCC2099181998年6月2日DNA262881239ATCC2097921998年4月21日DNA268431389ATCC2030991998年8月4日DNA268441394ATCC2099261998年6月2日DNA308621396ATCC2099201998年6月2日DNA356801212ATCC2097901998年4月21日DNA406211440ATCC2099221998年6月2日DNA441611434ATCC2099071998年5月27日DNA446941500ATCC2031141998年8月11日DNA454951550ATCC2031561998年8月25日DNA473611154ATCC2094311997年11月7日DNA473941572ATCC2031091998年8月11日DNA483201433ATCC2099041998年5月27日DNA483341435ATCC2099241998年6月2日DNA486061479ATCC2030401998年7月1日DNA491411431ATCC2030031998年6月23日DNA491421430ATCC2030021998年6月23日DNA491431429ATCC2030131998年6月23日DNA496471398ATCC2099191998年6月2日DNA498191439ATCC2099311998年6月2日DNA498201427ATCC2099321998年6月2日DNA498211562ATCC2099811998年6月16日DNA521921369ATCC2030421998年7月1日DNA525981518ATCC2031071998年8月11日DNA539131490ATCC2031621998年8月25日DNA539781443ATCC2099831998年6月16日DNA539961442ATCC2099211998年6月2日DNA560411416ATCC2030121998年6月23日DNA560471456ATCC2099481998年6月9日DNA560501455ATCC2030111998年6月23日DNA561101437ATCC2031131998年8月11日DNA561131378ATCC2030491998年7月1日DNA564101414ATCC2099231998年6月2日DNA564361448ATCC2099021998年5月27日DNA568551447ATCC2030041998年6月23日DNA568591445ATCC2030191998年6月23日DNA568601510ATCC2099521998年6月9日DNA568651491ATCC2030221998年6月23日DNA568661342ATCC2030231998年6月23日DNA568681209ATCC2030241998年6月23日DNA568691545ATCC2031611998年8月25日DNA568701492ATCC2099251998年6月2日DNA570331403ATCC2099051998年5月27日DNA570371444ATCC2099031998年5月27日DNA571291413ATCC2099771998年6月16日DNA576901374ATCC2099501998年6月9日DNA576931424ATCC2030081998年6月23日DNA576941341ATCC2030171998年6月23日DNA576951340ATCC2030061998年6月23日DNA576991412ATCC2030201998年6月23日DNA577021476ATCC2099511998年6月9日DNA577041452ATCC2099531998年6月9日DNA577081411ATCC2030211998年6月23日DNA577101451ATCC2030481998年7月1日DNA577111501ATCC2030471998年7月1日DNA578271493ATCC2030451998年7月1日DNA578341339ATCC2099541998年6月9日DNA578361338ATCC2030251998年6月23日DNA578381337ATCC2030141998年6月23日DNA578441410ATCC2030101998年6月23日DNA587211475ATCC2031101998年8月11日DNA587231588ATCC2031331998年8月18日DNA587371473ATCC2031361998年8月18日DNA587431609ATCC2031541998年8月25日DNA588461409ATCC2099571998年6月9日DNA588481472ATCC2099551998年6月9日DNA588491494ATCC2099581998年6月9日DNA588501495ATCC2099561998年6月9日DNA588531423ATCC2030161998年6月23日DNA588551422ATCC2030181998年6月23日DNA592051421ATCC2030091998年6月23日DNA592111450ATCC2099601998年6月9日DNA592131487ATCC2099591998年6月9日DNA592141449ATCC2030461998年7月1日DNA592151425ATCC2099611998年6月9日DNA592201514ATCC2099621998年6月9日DNA594881603ATCC2031571998年8月25日DNA594931420ATCC2030501998年7月1日DNA594971496ATCC2099411998年6月4日DNA595881571ATCC2031061998年8月11日DNA596031419ATCC2099441998年6月9日DNA596051418ATCC2030051998年6月23日DNA596061471ATCC2099451998年6月9日DNA596071497ATCC2099571998年6月9日DNA596091470ATCC2099631998年6月9日DNA596101559ATCC2099901998年6月16日DNA596121466ATCC2099471998年6月9日DNA596131417ATCC2030071998年6月23日DNA596161465ATCC2099911998年6月16日DNA596191464ATCC2030411998年7月1日DNA596201463ATCC2099891998年6月16日DNA596251498ATCC2099921998年6月17日DNA597671489ATCC2031081998年8月11日DNA597761600ATCC2031281998年8月18日DNA597771480ATCC2031111998年8月11日DNA598201549ATCC2031291998年8月18日DNA598271426ATCC2030891998年8月4日DNA598281608ATCC2031581998年8月25日DNA598381462ATCC2099761998年6月16日DNA598391461ATCC2099881998年6月16日DNA598411460ATCC2030441998年7月1日DNA598421502ATCC2099821998年6月16日DNA598461503ATCC2099781998年6月16日DNA598471511ATCC2030981998年8月4日DNA598481512ATCC2030881998年8月4日DNA598491504ATCC2099861998年6月16日DNA598531505ATCC2099851998年6月16日DNA598541459ATCC2099741998年6月16日DNA602831484ATCC2030431998年7月1日DNA606151483ATCC2099801998年6月16日DNA606191482ATCC2099931998年6月16日DNA606211516ATCC2030911998年8月4日DNA606221525ATCC2030901998年8月4日DNA606251507ATCC2099751998年6月16日DNA606271508ATCC2030921998年8月4日DNA606291481ATCC2099791998年6月16日DNA617551554ATCC2031121998年8月11日DNA618731574ATCC2031321998年8月18日DNA628141521ATCC2030931998年8月4日DNA628721509ATCC2031001998年8月4日DNA628761517ATCC2030951998年8月4日DNA628811515ATCC2030961998年8月4日DNA648521589ATCC2031271998年8月18日DNA648841527ATCC2031551998年8月25日DNA648901612ATCC2031311998年8月18日DNA654121523ATCC2030941998年8月4日DNA663081537ATCC2031591998年8月25日DNA663091538ATCC2032351998年9月15日DNA670041614ATCC2031151998年8月11日DNA688691610ATCC2031641998年8月25日DNA688721620ATCC2031601998年8月25日DNA711591617ATCC2031351998年8月18日この寄託は、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約及びその規則の規定に従って行われた。これは、寄託の日付から30年間、寄託の生存可能な培養が維持されることを保証するものである。寄託物はブダペスト条約の条項に従い、またジェネンテク社とATCCとの間の合意に従い、ATCCから入手することができ、これは、どれが最初であろうとも、関連した米国特許の発行時又は任意の米国又は外国特許出願の公開時に、寄託培養物の後代を永久かつ非制限的に入手可能とすることを保証し、米国特許法第122条及びそれに従う特許庁長官規則に従って権利を有すると米国特許庁長官が決定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。本出願の譲受人は、寄託した培養物が、適切な条件下で培養されていた場合に死亡もしくは損失又は破壊されたならば、材料は通知時に同一の他のものと即座に取り替えることに同意する。寄託物質の入手可能性は、特許法に従いあらゆる政府の権限下で認められた権利に違反して、本発明を実施するライセンスであるとみなされるものではない。上記の文書による明細書は、当業者に本発明を実施できるようにするために十分であると考えられる。寄託した態様は、本発明のある側面の一つの説明として意図されており、機能的に等価なあらゆる作成物がこの発明の範囲内にあるため、寄託された作成物により、本発明の範囲が限定されるものではない。ここでの物質の寄託は、ここに含まれる文書による説明が、そのベストモードを含む、本発明の任意の側面の実施を可能にするために不十分であることを認めるものではないし、それが表す特定の例証に対して請求の範囲を制限するものと解釈されるものでもない。実際、ここに示し記載したものに加えて、本発明を様々に改変することは、前記の記載から当業者にとっては明らかなものであり、添付の請求の範囲内に入るものである。"