"c-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性がある癌患者を同定するための方法であって、患者の癌が多量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含み、c-metバイオマーカーの発現が、患者がc-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性があることを示す方法。癌患者の予後を決定するための方法であって、患者の癌が、多量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含み、患者がc-metアンタゴニストで治療されたとき、c-metバイオマーカーの発現が、患者が全生存期間OS及び/又は無増悪生存期間PFSが増加している可能性が高いことを示している方法。c-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性が少ない癌患者を同定するための方法であって、患者の癌が少量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含み、c-metバイオマーカーの発現が、患者がc-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性が少ないことを示す方法。c-metバイオマーカータンパク質の発現が免疫組織化学IHCを用いて、患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項1又は2に記載の方法。IHCのスコアが2又は3である、請求項4に記載の方法。高いc-metバイオマーカーの発現が、中程度のc-met染色強度、中程度/高の混合性のc-met染色強度又は高c-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である、請求項4に記載の方法。c-met発現の染色強度が、コントロール細胞ペレットのc-met染色強度と比較して決定される、請求項10に記載の方法。細胞株A549が中程度のc-met染色強度を有する、請求項7に記載の方法。細胞株H441が強いc-met染色強度を有する、請求項7に記載の方法。c-metバイオマーカーの発現が、核酸の発現であり、rtPCR、RNN-seq、マイクロアレイ解析、SAGE、MassARRAY技術、又はFISHを用いて患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項1又は2に記載の方法。患者が、高c-metバイオマーカーを有さない患者と比較して大きなPFS及び/又はOSを有する、請求項1、2、及び請求項4から10の何れかに記載の方法。c-metバイオマーカーの発現がタンパク質の発現であり、免疫組織化学IHCを用いて患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項3に記載の方法。IHCのスコアが1又は0である、請求項12に記載の方法。IHCのスコアが0である、請求項13に記載の方法。低いc-metバイオマーカーの発現が陰性c-met染色であり、50未満の腫瘍細胞が弱又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度を持つか、又は50以上の腫瘍細胞が弱又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度を持つが、50未満の腫瘍細胞が中程度又は中程度と強の混合性のc-met染色強度を持つ、請求項12に記載の方法。c-met発現の染色強度が、コントロール細胞ペレットのc-met染色強度と比較して決定される、請求項15に記載の方法。細胞株H1155が陰性c-met染色強度を有する、請求項16に記載の方法。細胞株HEK293が低c-met染色強度を有する、請求項16に記載の方法。患者のサンプルが患者の癌のものである、請求項1から18の何れかに記載の方法。サンプルがc-metアンタゴニストによる治療の前に得られる、請求項19に記載の方法。サンプルが癌医薬による治療の前に得られる、請求項20に記載の方法。サンプルが癌が転移した後で得られる、請求項20に記載の方法。サンプルがホルマリン固定及びパラフィン包埋される、請求項1から22の何れかに記載の方法。c-metIHC1が抗c-met抗体SP44を使用して実施される、請求項1から23の何れかに記載の方法。癌が、非小細胞肺癌、腎細胞癌、膵臓癌、胃癌、膀胱癌、食道癌、中皮腫、黒色腫、乳癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、頭頸部癌、骨肉腫、前立腺癌又は神経膠芽腫である、請求項1から24の何れかに記載の方法。癌が非小細胞肺癌NSCLCである、請求項25に記載の方法。NSCLCが第二ライン又は第三ラインの局所進行性又は転移性非小細胞肺癌である、請求項26に記載の方法。NSCLCが腺癌である、請求項26又は27に記載の方法。NSCLCが扁平上皮癌である、請求項26又は27に記載の方法。c-metアンタゴニストがアンタゴニスト抗c-met抗体である、請求項1から29の何れかに記載の抗体。抗c-met抗体が、a配列GYTFTSYWLH配列番号1を含むHVR1;b配列GMIDPSNSDTRFNPNFKD配列番号2を含むHVR2;c配列ATYRSYVTPLDY配列番号3を含むHVR3-HC;d配列KSSQSLLYTSSQKNYLA配列番号4を含むHVR1-LC;e配列WASTRES配列番号5を含むHVR2-LC;及びf配列QQYYAYPWT配列番号6を含むHVR3-LCを含む、請求項30に記載の方法。抗c-met抗体が一価であり、a重鎖を含む第一のポリペプチドであって、配列:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTFTSYWLHWVRQAPGKGLEWVGMIDPSNSDTRFNPNFKDRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCATYRSYVTPLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号11を含む該ポリペプチド;b軽鎖を含む第二のポリペプチドであって、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYTSSQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYAYPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC配列番号12を含むポリペプチド;及びFc配列を含む第三のポリペプチドであって、配列DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号13を含むポリペプチドを含み、重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメインが複合体として存在し、単一の抗原結合の腕を形成し、第一及び第二のFcポリペプチドが複合体中に存在し、前記抗原結合の腕を含むFab分子と比較して前記抗体断片の安定性を増加させるFc領域を形成する、請求項31に記載の方法。c-metアンタゴニストが、クリゾチニブ、チバンチニブ、カボザンチニブ、MGCD-265、フィクラツズマブ、ヒト化TAK-701、リロツムマブ、フォレチニブ、h224G11、DN-30、MK-2461、E7050、MK-8033、PF-4217903、AMG208、JNJ-38877605、EMD1204831、INC-280、LY-2801653、SGX-126、RP1040、LY2801653、BAY-853474、及び/又はLA480である、請求項1から32の何れかに記載の方法。治療がEGFRアンタゴニストによる治療との併用である、請求項33の何れかに記載の方法。EGFRアンタゴニストがエルロチニブである、請求項34に記載の方法。c-metアンタゴニストがオナルツズマブであり、治療がエルロチニブによる治療を更に含む、請求項1から32の何れかに記載の方法。c-metアンタゴニストがクリゾチニブ、チバンチニブ、カボザンチニブ、MGCD-265、フィクラツズマブ、ヒト化TAK-701、又はフォレチニブであり、治療がエルロチニブによる治療を更に含む、請求項33に記載の方法。c-metバイオマーカーの発現を決定するための方法であって、患者の癌がc-metバイオマーカーの高レベルを有するかどうかを決定する工程を含み、c-metバイオマーカーの発現がタンパク質の発現であって、患者からのサンプルにおいてIHCを用いて決定され、高いc-metバイオマーカーの発現が、中程度のc-met染色強度、中程度/強の混合性のc-met染色強度又は強いc-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞であり、c-metの発現がc-met抗体を用いて検出され、c-metバイオマーカーの発現が、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるときに、患者が増加したOS及び/又はPFSを有する可能性があることを示す方法。患者の癌が多量のc-metバイオマーカーを有することが見出された場合、c-metアンタゴニストの治療的有効量を患者に投与することを含む、癌の患者を治療するための方法。c-metアンタゴニストがc-met抗体である、請求項39に記載の方法。抗c-met抗体がオナルツズマブである、請求項39に記載の方法。c-metバイオマーカータンパク質の発現が免疫組織化学IHCを用いて、患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項39から41の何れかに記載の方法。IHCスコアが少なくとも2である、請求項42に記載の方法。高いc-metバイオマーカーの発現が、中程度のc-met染色強度、中程度/高の混合性のc-met染色強度又は高c-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である、請求項42に記載の方法。c-met発現の染色強度が、コントロール細胞ペレットのc-met染色強度と比較して決定される、請求項44に記載の方法。細胞株A549が中程度のc-met染色強度を有する、請求項45に記載の方法。細胞株H441が強いc-met染色強度を有する、請求項45に記載の方法。c-metバイオマーカーの発現が、核酸の発現であり、rtPCR、RNN-seq、マイクロアレイ解析、SAGE、MassARRAY技術、又はFISHを用いて患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項42に記載の方法。患者が、高いc-metバイオマーカーを有さない患者と比較して大きなPFS及び/又はOSを有する、請求項39から48の何れかに記載の方法。患者の癌が少量のc-metバイオマーカーを有することが見出された場合、c-metアンタゴニスト以外の医薬の治療的有効量を患者に投与することを含む、癌の患者を治療するための方法。c-metバイオマーカータンパク質の発現が免疫組織化学IHCを用いて、患者由来のサンプルにおいて決定される、請求項50に記載の方法。IHCスコアが1以下である、請求項51に記載の方法。低いc-metバイオマーカーの発現が陰性c-met染色の存在により決定され、50未満の腫瘍細胞が弱又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度を持つか、又は50以上の腫瘍細胞が弱又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度を持つが、50未満の腫瘍細胞が中程度又は中程度と強の混合性のc-met染色強度を持つ、請求項51に記載の方法。c-met発現の染色強度が、コントロール細胞ペレットのc-met染色強度と比較して決定される、請求項53に記載の方法。細胞株H1155が陰性c-met染色強度を有する、請求項54に記載の方法。細胞株293が低いc-met染色強度を有する、請求項54に記載の方法。癌が、非小細胞肺癌、腎細胞癌、膵臓癌、胃癌、膀胱癌、食道癌、中皮腫、黒色腫、乳癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、頭頸部癌、骨肉腫、前立腺癌か又は神経膠芽腫である、請求項50から56の何れかに記載の方法。癌が非小細胞肺癌NSCLCである、請求項57に記載の方法。NSCLCが第二ライン又は第三ラインの局所進行性又は転移性非小細胞肺癌である、請求項58に記載の方法。NSCLCが腺癌である、請求項58又は59に記載の方法。NSCLCが扁平上皮癌である、請求項58又は59に記載の方法。患者がNSCLSCを有し、抗c-met抗体とEGFRアンタゴニストの併用により治療される、請求項2に記載の方法。EGFRアンタゴニストがエルロチニブである、請求項62に記載の方法。患者がNSCLCを有し、a3週間ごとに約15mg/kgの投与量でオナルツズマブ;及びb3週間のサイクルの毎日150mgの投与量でエルロチニブN-3-エチニルフェニル-6,7-ビス2-メトキシエトキシ-4-キナゾリンアミンにより治療される、請求項6に記載の方法。患者の癌においてc-metバイオマーカーの発現を決定し、バイオマーカーの発現のレベルに基づいて癌医薬を選択することを含む、癌患者の治療を選択するための方法。癌サンプルがバイオマーカーを高レベルで発現する場合、患者がc-metアンタゴニストによる治療に対して選択される、請求項65に記載の方法。癌サンプルがバイオマーカーを低い又は実質的に検出不可能なレベルで発現する場合、患者がc-metアンタゴニスト以外の癌医薬による治療に対して選択される、請求項65に記載の方法。ターゲット層に対して、c-metバイオマーカーの発現に基づいて癌患者を治療するためのc-met抗体の使用を宣伝することを含む、c-met抗体を広告するための方法。宣伝が、抗c-met抗体の市販製剤に伴うパッケージ挿入物による、請求項68に記載の方法。宣伝が、第二医薬の市販製剤に伴うパッケージ挿入物による、請求項68に記載の方法。第二医薬がEGFRアンタゴニストである、請求項70に記載の方法。c-met抗体がMetMAbであり、EGFRアンタゴニストがエルロチニブである請求項71に記載の方法。癌サンプルがバイオマーカーを高レベルで発現する場合、患者がc-metアンタゴニストによる治療のために選択される、請求項68に記載の方法。宣伝が、パッケージ挿入物がEGFRアンタゴニストとの併用による抗c-met抗体による治療を受けるための使用説明を提供する、パッケージ挿入物による請求項68に記載の方法。宣伝の後に、第二医薬を含むか又は含まない抗c-met抗体による患者の治療が続く、請求項74に記載の方法。NSCLC患者からのサンプルにおけるc-metバイオマーカーの発現を決定するための一以上の試薬を含む診断キットであって、患者がc-metアンタゴニストにより治療されたとき、多量のc-metバイオマーカーの検出が増加したPFS又はOSを意味し、患者がc-metアンタゴニストによる治療を受けたとき、少量又は実質的に検出不可能な量のc-metバイオマーカーの検出が減少したPFSを意味するキット。多量のc-metバイオマーカーが決定される場合に、NSCLC患者を治療するためにc-met医薬を選択するためのキットを使用するための使用説明を更に含む、請求項76に記載の診断キット。癌医薬を含む薬学的組成物と、薬学的組成物がc-metバイオマーカーの発現に基づいて癌患者を治療するためのものであることを示すパッケージ挿入物をパッケージ中に組み合わせることを含む、請求項76に記載の診断キットを作製する方法。本発明の実施態様の詳細な記述I.定義ここでは、患者はヒトの患者である。患者は癌患者、すなわち、癌の一以上の症状に罹患しているか又は罹患するリスクにある者であり得る更に、患者は以前に治療された癌患者であり得る。患者はNSCLC癌患者、すなわち、NSCLCの一以上の症状に罹患しているか又は罹患するリスクにある者であり得る。更に、患者は以前に治療されたNSCLC患者であって良い。用語c-met又はMetは本明細書で使用される場合、特に明記しないない限り、任意の天然又は変異体天然又は合成であろうとなかろうとc-metポリペプチドを指す。用語野生型c-metは一般に、天然に生じるc-metタンパク質のアミノ酸配列を含むポリペプチドを指す。用語野生型c-met配列は一般に天然に生じるc-metに見いだされるアミノ酸配列を指す。抗c-met抗体は、十分な親和性及び特異性でc-metに結合する抗体である。選択される抗体は通常c-metに十分に強い結合親和性を有し、例えば、抗体はヒトc-metにKd値が100nMから1pMの間で結合し得る。抗体の親和性は、表面プラズモン共鳴に基づくアッセイ例えばPCT出願公開番号第2005/012359号に記載されてビアコアアッセイなど;酵素結合免疫吸着検定法ELISA;及び競合アッセイ例えばRIAにより決定することができる。ある実施態様において、抗c-met抗体は、c-metの活性が関与している疾患又は症状を標的とすること及び妨げることにおける治療剤として使用することができる。また、抗体は、例えば治療としての有効性を評価するために、他の生物学的活性アッセイを施してもよい。このようなアッセイは、当技術分野で公知であり、標的抗原に依存し、抗体としての使用を意図している。c-metアンタゴニスト同じ意味でc-met阻害剤と称すはc-metの活性化又は機能を妨げる薬剤である。c-met阻害剤の例は、c-met抗体;HGF抗体;小分子のc-metアンタゴニスト;c-metチロシンキナーゼ阻害剤、アンチセンス及び阻害性RNA例えば、shRNA分子例えば、国際公開第2004/87207号を参照を含む。好ましくは、c-met阻害剤は、c-metと特異的に結合する抗体または小分子である。特定の実施態様では、c-met阻害剤は、約1,000nM以下のc-metに対する結合親和性解離定数を有する。別の実施態様では、c-met阻害剤は、約100nM以下のc-metに対する結合親和性を有する。その他の実施態様では、c-met阻害剤は、約50nM以下のc-metに対する結合親和性を有する。特定の実施態様では、c-met阻害剤は、共有結合でc-metに結合している。特定の実施態様では、c-met阻害剤は、IC50が1,000nM以下でc-metシグナル伝達を阻害する。別の実施態様では、c-met阻害剤は、IC50が500nM以下でc-metシグナル伝達を阻害する。別の実施態様では、c-met阻害剤は、IC50が50nM以下でc-metシグナル伝達を阻害する。c-metの活性化とはc-met受容体の、活性化、又はリン酸化を指す。一般に、c-metの活性化はシグナル伝達例えば、c-met受容体の細胞内キナーゼドメインにより、c-met又は基質ポリペプチドのチロシン残基のリン酸化を引き起こされるを結果的に生じる。c-metの活性化は、c-metリガンドHGFの、目的のc-met受容体への結合により媒介されうる。HGFのc-metへの結合は、c-metのキナーゼドメインを活性化する場合があり、それによって、c-metのチロシン残基のリン酸化及び/又は付加的な基質ポリペプチドのチロシン残基のリン酸化を生じる。被験体の集団は、臨床試験における場合、又は乳癌治療などの特定の効能に対するFDAの承認後に腫瘍学者によって見られる場合、癌を有する被験体の群を指す。本明細書で使用される場合、バイオマーカーに関して、実質的なバイオマーカーの発現を保有していない又は実質的にバイオマーカーの発現は無いという語句は、バイオマーカーが、統計的有意性のあるバックグラウンドレベルを超えた発現レベルを示していないことを意味する。本明細書で使用される場合、バイオマーカーに関して、バイオマーカー発現が皆無かそれに近いという語句は、バイオマーカーが生物学的に意味のある量の発現を示さないことを意味する。当技術分野で理解されるように、発現量は、バイオマーカーのサンプルと基準の対応物との間の比較を行うことが可能な限り、定量的又は定性的に決定することができる。発現は、例えば本明細書に記載のもの例えば、IHCなどを含み、当該分野で公知の任意のアッセイまたは技術に従って測定または検出することができる。遺伝子増幅なる語句は、遺伝子又は遺伝子断片の複数のコピーが特定の細胞又は細胞株において形成されるプロセスを意味する。本発明の方法のために、患者を指導するなる用語は、適用可能な治療、薬物、治療、治療レジメンなどを、任意の方法により、しかし好ましくは、パッケージ挿入物又は他の書面による宣伝資料の形態による等の文書で提供することを意味する。本発明の方法では、用語宣伝するとは、特定の薬物、薬物の併用、又は治療法を、パッケージ挿入物の形態にあるような文書を含む任意の手段によって、提供し、広告し、販売し又は説明することを意味する。本明細書における宣伝とは、NSCLCの治療などの適応症のために、例えば抗c-met抗体及び/又はエルロチニブなどの治療薬の宣伝を言い、ここでその宣伝は、被験者の集団において統計的に有意な治療効果と許容される安全性に関連することが実証されたとして、食品医薬品局FDAによって承認されている。用語マーケティングは、製品例えば、薬物の宣伝、販売又は配布を記述するために本明細書で使用される。マーケティングは、製品の商品化を目的とした梱包、広告、および任意の事業活動を含む。本明細書における目的のために、以前に治療された癌患者は以前に癌治療を受けている。難治性癌は、化学療法剤などの抗腫瘍剤によってさえも進行するが、癌患者に投与されている。癌医薬は癌の治療に有効な薬剤である。癌の医薬の例は、下記の化学療法剤および化学療法レジメン;MetMAbなどの抗c-Metの抗体を含むc-metアンタゴニストを含む。本明細書で用いられるバイオマーカー又はマーカーなる用語は一般的に、遺伝子、mRNA、タンパク質、糖質構造又は糖脂質を含む分子を指し、組織内又は組織上、又は細胞内又は細胞上、又は分泌内又は分泌上でのその発現は既知の方法又はここで開示される方法で検出することができ、かつ細胞、組織又は治療レジメンに対する患者の応答性に対して予測的であるか又は予測する又は予測を補助することに用いることができる。本明細書中で特に関心があるバイオマーカーは、c-metである。幾つかの実施態様において、c-metバイオマーカーはc-met遺伝子の増幅例えば、細胞の集団の平均は3以上、4以上、又は5以上のc-met遺伝子のコピーか、又はそれ以上、例えば8以上、又は10以上のc-met遺伝子のコピーを含まない。患者のサンプルにより、癌患者から得た類似細胞の収集物を意味する。組織又は細胞サンプルの起源は、新鮮な、冷凍された、及び/又は保存された臓器又は組織サンプル、又は生検又は吸引からの固形組織、血液又は任意の血液成分、脳脊髄液、羊水、腹水、または間質液などの体液、被検体の妊娠期間又は発育の任意の時期に由来する細胞であり得る。組織サンプルは、本質的に組織と自然に混在しない化合物、例えば、防腐剤、抗凝血剤、緩衝剤、定着剤、栄養剤、抗生物質などが含まれる場合がある。腫瘍サンプルの例は、限定されないが、腫瘍生検、循環性腫瘍細胞、血清又は血漿、循環性血漿タンパク質、腹水、腫瘍に由来するか又は腫瘍のような特性を呈する細胞株又は初代細胞培養物、並びに、ホルマリン固定腫瘍サンプル、パラフィン包埋腫瘍サンプル又は凍結腫瘍サンプルなどの保存された腫瘍サンプルを含む。一実施態様において、サンプルでは、NSCLC例えば、扁平上皮サブタイプまたは非扁平上皮サブタイプの腫瘍サンプルを含む。医薬による処置に対する患者の効果的な応答又は患者の応答性及び類似した表現は、医薬の投与によって癌例えばNSCLCに罹患しているか又は癌のリスクにある患者に与えられる臨床的又は治療的利益を指す。このような利点は、生存全生存および無増悪生存を含むを延長すること;客観的奏効完全寛解又は部分寛解を含むをもたらすこと;又は癌の徴候又は症状を改善するなどのいずれか1つ以上を含む。一実施態様において、バイオマーカー例えば、IHCを用いて決定されるc-metの発現は、同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者と比較して、医薬例えば抗c-met抗体で治療されたときに大きな無増悪生存PFSを有することが期待されている患者を特定するのに使用される。一実施態様において、医薬で治療されて同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者に対して、又は医薬で治療されておらず同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者に対して、バイオマーカーは医薬で治療をうけたときにPFSが減少することが期待される患者を同定するために使用される。一実施態様において、バイオマーカーは、同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者に対して、医薬で治療したときに、大きい全生存期間OSを有することが期待されている患者を同定するために使用される。一実施態様において、医薬で治療されて同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者に対して、又は医薬で治療されておらず同じレベルでバイオマーカーを発現しない患者に対して、バイオマーカーは全生存期間OSが減少することが期待される患者を同定するために使用される。本明細書においてバイオマーカーの発現率は、そのような効果的な応答を効果的に予測したり、又は高感度に予測する。生存は、生存している患者を指し、全生存並びに無増悪生存を含む。全生存期間は、診断又は治療の時から例えば1年、5年などの定められた期間において生存している患者を指す。無増悪生存期間とは、癌の進行又は悪化することなく、患者が生き残っていることを言う。生存の延長とは、未治療の患者と比較してすなわち、医薬で治療されていない患者と比較して、又は指定レベルでバイオマーカーを発現しない患者と比較して、及び/又は承認された抗腫瘍薬エルロチニブの化学療法レジメンなどで治療された患者と比較して、治療された患者における全生存期間又は無増悪生存期間の増加を意味する。客観的反応とは、完全寛解CR又は部分寛解PRを含めて、測定可能な反応を意味する。完全寛解又はCRは、治療に反応して癌の全ての徴候の消失を対象としている。これは、常に癌が治癒されたという意味ではない。部分寛解又はPRは、治療に応答して、1つ以上の腫瘍又は病変の大きさの減少、又は体内での癌の範囲の減少を指す。癌例えば、NSCLC患者に対する臨床的利点の増加に関連したバイオマーカーの量又はレベルは、バイオマーカーのレベルが患者の臨床的利点の増加に関連付けられており、生物学的試料中において検出可能なレベルを指す。これらは、当業者に知られており、また、本発明によって開示された方法により測定することができる。評価するのバイオマーカーの発現レベル又は量は、治療に対する反応を決定するために使用することができる。幾つかの実施態様において、バイオマーカーの量又はレベルは、例えば、患者の腫瘍サンプルのIHCを用いて決定される。幾つかの実施態様において、癌患者における臨床的利点の増加に関連付けられているc-metバイオマーカーの量又はレベルは、IHCスコアが2、IHCスコアが3、又はIHCスコアが2又は3である。幾つかの実施態様において、癌患者における臨床的利点の増加に関連付けられているc-metバイオマーカーの量又はレベルは、中程度のc-met染色強度、中程度/強の混合性のc-met染色強度又は強いc-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である。幾つかの実施態様において、癌患者における臨床的利点の増加に関連付けられているc-metバイオマーカーの量又はレベルは、中程度又は強いc-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である。癌例えば、NSCLC患者に対する臨床的利点の減少に関連したバイオマーカーの量又はレベルは、バイオマーカーのレベルが患者の臨床的利点の減少に関連付けられており、生物学的試料中において検出可能なバイオマーカーの欠損又は低い検出可能なレベルを指す。これらは、当業者に知られており、また、本発明によって開示された方法により測定することができる。評価するのバイオマーカーの発現レベル又は量は、治療に対する反応を決定するために使用することができる。幾つかの実施態様において、バイオマーカーの量又はレベルは、例えば、患者の腫瘍サンプルのIHCを用いて決定される。幾つかの実施態様において、癌患者における臨床的利点の減少に関連付けられているc-metバイオマーカーの量又はレベルは、IHCスコアが0、IHCスコアが1、又はIHCスコアが0又は1である。幾つかの実施態様において、癌患者における臨床的利点の減少に関連したバイオマーカーの量又はレベルは陰性c-met染色であり、50未満の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度、又は50以上の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度であるが、50未満の腫瘍細胞が中程度のc-met染色強度又は中程度と強の混合性のc-met染色強度である。発現のレベル又は発現レベルなる用語は、交換可能に使用され、一般に、生物学的試料中のポリヌクレオチド、mRNA、又はアミノ酸生成物又はタンパク質の量を指す。発現は、一般に、遺伝子コード情報が、細胞中に存在し操作する構造に変換されるプロセスを意味する。従って、本発明によれば、遺伝子の発現は、ポリヌクレオチドへの転写、タンパク質への翻訳、又はタンパク質の翻訳後修飾を意味しうる。転写されたポリヌクレオチド、翻訳されたタンパク質、又は翻訳後修飾されたタンパク質の断片はまた、選択的スプライシングにより生成された転写物、又は分解された転写物に由来するか、又は例えばタンパク質分解によるタンパク質の翻訳後プロセシングに由来しようが、発現したとみなされる。幾つかの実施態様において、表現のレベルは、IHCを用いて決定されるような生物学的サンプル中のタンパク質の量を指す。本明細書中で使用されるときの発現に基づいてという言い回しは、本明細書における一以上のバイオマーカー発現レベルに関する情報は、治療法の決定、パッケージ挿入物に提供された情報、又はマーケティング/宣伝指針などを通知するために使用されることを意味する。バイオマーカーが高発現の場合には、患者は、例えばc-metアンタゴニストMetMAbなどの抗c-met抗体などなどの癌例えばNSCLC医薬で治療され得る。バイオマーカーの発現レベルの減少の場合には、患者は、c-metアンタゴニスト以外の癌の医薬例えば、MetMAbなどの抗c-met抗体で治療することができる。治療は、治療的処置及び予防手段又は防止手段の両方を指す。治療が必要なものは、良性、前癌性又は非転移性腫瘍を既に有するもの、並びに癌の発生又は再発が防止されるべきものを含む。治療的有効量という用語は、哺乳動物の疾患又は疾病を治療又は予防するための薬剤の量を指す。癌の場合、治療的に有効量の薬剤は、癌細胞の数を減じ;原発腫瘍の大きさを減じ;末梢器官への癌細胞の浸潤を阻害すなわち、ある程度まで減速、好ましくは停止し;腫瘍転移を阻害すなわち、ある程度まで減速及び好ましくは停止し;腫瘍増殖をある程度まで阻害し;及び/又は疾病に関連する一又は複数の症状をある程度まで緩和する。既存の癌細胞の増殖を妨げ及び/又は死滅させる程度まで、薬剤は、細胞分裂停止及び/又は細胞障害性であり得る。癌治療の場合、インビボでの有効性は、生存期間、細胞増殖停止時間TTP、奏功率RR、奏功期間、及び/又は生活の質を評価することにより測定することができる。癌及び癌性なる用語は、一般的に調節されない細胞増殖を特徴とする哺乳動物の生理学的状態を指す又は表わす。この定義には、良性及び悪性の癌が含まれる。初期癌又は初期腫瘍とは、侵襲性又は転移性でない癌を意味するか、或いはステージ0、I、又はIIの癌を意味する。癌の例には、限定するものではないが、細胞腫、リンパ腫、芽細胞腫髄芽腫及び網膜芽細胞腫を含む、肉腫脂肪肉腫及び滑膜細胞肉腫を含む、神経内分泌腫瘍カルチノイド腫瘍、ガストリン産生腫瘍、及び島細胞癌を含む、中皮腫、シュワン腫聴神経腫瘍を含む、髄膜腫、腺癌、メラノーマ、及び白血病又はリンパ性悪性腫瘍が含まれる。このような癌のより具体的な例には、扁平上皮癌例えば上皮の扁平細胞癌、小細胞肺癌SCLCを含む肺癌、非小細胞肺癌NSCLC、肺の腺癌及び肺の扁平上皮癌、腹膜の癌、肝細胞性癌、胃腸癌を含む胃gastric、stomach癌、膵癌、神経膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌転移性乳癌を含む、大腸癌、直腸癌、大腸直腸癌、子宮内膜ないし子宮細胞腫、唾液腺細胞腫、腎臓癌又は腎癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝細胞腫、食道細胞腫、肝細胞腫、肛門部の細胞腫、陰茎細胞腫、精巣癌、食道癌、胆道癌、並びに頭部及び頚部の癌が含まれる。幾つかの実施態様において、局所的な再発又は転移性疾患局所再発疾患が治癒目的で切除を受けられない場合を有する、任意の組織学的に確認されたトリプルネガティブER、PR、HER2な乳房の腺癌を含む、癌は、トリプルネガティブ転移性乳癌である。c-metの発現を示す癌又は生物学的サンプルは、診断検査において、c-metの受容体を発現する過剰発現を含むものである。c-metの増幅を示す癌又は生物学的サンプルは、診断検査において、増幅したc-metの遺伝子を有するものである。幾つかの実施態様において、増幅されたc-met遺伝子は細胞の集団において平均で5以上のc-met遺伝子の複製を上回るか、又は平均で8以上のc-met遺伝子の複製かそれ以上である。c-metの増幅を示さない癌又は生物学的サンプルは、診断検査において、増幅したc-metの遺伝子を有しないものである。幾つかの実施態様において、c-met遺伝子の増幅を示さないサンプルは、平均で4コピー未満のc-met遺伝子を有するサンプルである。EGFRは、UllrichetalNature309418425に記述されるレセプターチロシンキナーゼポリペプチド上皮増殖因子受容体を意味し、あるいはHer-1及びc-erbB遺伝子産物、並びにEGFRvIIIなどその変異体を言う。EGFRの変異体はまた、例えばLynchetalPaezetalPaoetalに記述されるものなど欠失、置換、及び挿入変異体をも含む。EGFRアンタゴニスト同じ意味でEGFR阻害剤と称すはEGFRの活性化又は機能を妨げる薬剤である。EGFR阻害剤の例は、EGFR抗体;EGFRリガンド抗体;小分子のEGFRアンタゴニスト;EGFRチロシンキナーゼ阻害剤、アンチセンス及び阻害性RNA例えば、shRNA分子例えば、国際公開第2004/87207号を参照を含む。好ましくは、EGFR阻害剤は、EGFRと特異的に結合する抗体または小分子である。幾つかの実施態様において、EGFR阻害剤はEGFR標的薬である。特定の実施態様では、EGFR阻害剤は、約1,000nM以下のEGFRに対する結合親和性解離定数を有する。その他の実施態様では、EGFR阻害剤は、約100nM以下のEGFRに対する結合親和性を有する。その他の実施態様では、EGFR阻害剤は、約50nM以下のEGFRに対する結合親和性を有する。特定の実施態様では、EGFR阻害剤は、共有結合でEGFRに結合している。特定の実施態様では、EGFR阻害剤は、IC50が1,000nM以下でEGFRのシグナル伝達を阻害する。別の実施態様では、EGFR阻害剤は、IC50が500nM以下でEGFRのシグナル伝達を阻害する。別の実施態様では、EGFR阻害剤は、IC50が50nM以下でEGFRのシグナル伝達を阻害する。ある実施態様では、EGFRアンタゴニストは、EGFRの発現レベル又は生物学的活性を少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90又はそれ以上低減又は阻害する。EGFRの活性化とはEGFR受容体の、活性化、又はリン酸化を指す。一般に、EGFRの活性化はシグナル伝達例えば、EGFR受容体の細胞内キナーゼドメインにより、EGFR又は基質ポリペプチドのチロシン残基のリン酸化を引き起こされるを結果的に生じる。EGFR活性化は、EGFRを含むEGFR二量体へのEGFRリガンドの結合によって媒介され得る。EGFR二量体へのEGFRリガンドの結合は二量体におけるEGFRの一つ以上のキナーゼドメインを活性化することができ、それによって一以上のEGFRのチロシン残基のリン酸化及び/又は付加的な基質ポリペプチドのチロシン残基のリン酸化をもたらす。本明細書で使用される場合、用語EGFR標的薬は、EGFRに結合し、EGFRの活性化を阻害する治療薬を指す。このような薬剤の例は、EGFRに結合する抗体及び小分子を含む。EGFRに結合する抗体の例は、MAb579ATCCCRLHB8506、MAb455ATCCCRLHB8507、MAb225ATCCCRL8508、MAb528ATCCCRL8509米国特許第4943533号,Mendelsohn等を参照及びその変異体、例えばキメラ化225C225又はセツキシマブ;ERBITUX登録商標及び再形成ヒト225H225国際公開第96/40210号,ImcloneSystemsInc.を参照;IMC-11F8,完全ヒトEGFR標的抗体Imclone;タイプII変異体EGFRに結合する抗体米国特許第5212290号;米国特許第5891996号に記載されているようなEGFRに結合するヒト化及びキメラ化抗体;及びEGFRに結合するヒト抗体、例えばABX-EGF国際公開第98/50433,Abgenixを参照;EMD55900Stragliotto等EurJCancer32A636640;EMD7200マツズマブ,EGFR結合についてEGF及びTGF-α双方と競合するEGFRに対するヒト化EGFR及びmAb806又はヒト化mAb806Johns等,JBiolChem2793037530384ErlichedPCRTechnology3542;及びMaetalCancerCell5607616参照;CDP323、経口アルファ-4インテグリン阻害剤;ジネマイシンAを含むジネマイシン;エスペラマイシン;並びに、ネオカルチノスタチン発色団及び関連色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アウトラマイシンauthramycin、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシンcarabicin、カルミノマイシン、カルチノフィリン、クロモマイシンchromocycinis、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシンADRIAMYCIN登録商標、モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシン、ドキソルビシンHClリポソーム注射液DOXIL登録商標、リポソームドキソルビシンTLCD-99MYOCET登録商標、PEG化リポソームドキソルビシンCAELYX登録商標、及びデオキシドキソルビシンを含む、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシンCなどのマイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシンpotfiromycin、ピューロマイシン、クエラマイシンquelamycin、ロドルビシンrodorubicin、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;メトトレキサート、ゲムシタビンGEMZAR登録商標、テガフールUFTORAL登録商標、カペシタビンXELODA登録商標、エピチロン、及び5-フルオロウラシル5-FUなどの代謝拮抗物質;フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニンなどのプリンアナログ;アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロキシウリジンなどのピリミジンアナログ;アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンなどの抗副腎剤;フロリニン酸frolinicacidなどの葉酸補給剤;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキサートedatraxate;デホファミンdefofamine;デメコルシン;ジアジクオン;エルホルニチンelfornithine;酢酸エリプチニウム;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダイニン;メイタンシン及びアンサミトシンなどのメイタンシノイド;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモールmopidanmol;ニトラエリンnitraerine;ペントスタチン;フェナメットphenamet;ピラルビシン;ロソキサントロン;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK登録商標多糖複合体JHSNaturalProducts,Eugene,OR;ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2’’-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン特にT-2毒素、ベラクリンverracurinA、ロリジンA及びアングイジン;ウレタン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシンgacytosine;アラビノシドAra-C;チオテパ;タキソイド、例えば、パクリタキセルTAXOL登録商標、パクリタキセルのアルブミン加工ナノ粒子製剤ABRAXANE登録商標、及びドセタキセルTAXOTERE登録商標;クロランブシル;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;シスプラチン、オキサリプラチン、及びカルボプラチンなどのプラチナ剤;ビンブラスチンVELBAN登録商標、ビンクリスチンONCOVIN登録商標、ビンデシンELDISINE登録商標、FILDESIN登録商標、及びビノレルビンNAVELBINE登録商標を含む、微小管形成からチューブリン重合を阻止するビンカ;エトポシドVP-16;イホスファミド;ミトキサントロン;ロイコボビンleucovovin;ノバントロン;エダトレキサート;ダウノマイシン;アミノプテリン;イバンドロネート;トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000;ジフルオロメチルオルニチンDMFO;ベキサロテンTARGRETIN登録商標を含めたレチノイン酸などのレチノイド;クロドロネート例えば、BONEFOS登録商標又はOSTAC登録商標、エチドロネートDIDROCAL登録商標、NE-58095、ゾレドロン酸/ゾレドロネートZOMETA登録商標、アレンドロネートFOSAMAX登録商標、パミドロネートAREDIA登録商標、チルドロネートSKELID登録商標、又はリセドロネートACTONEL登録商標などのビスホスフォネート;トロキサシタビン1,3-ジオキソランヌクレオシドシトシンアナログ;アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に異常な細胞増殖に関係づけられているシグナル伝達経路における遺伝子発現、例えばPKC-アルファ、Raf、H-Ras、及び上皮成長因子受容体EGF-Rを阻害するもの;THERATOPE登録商標ワクチン並びに遺伝子治療用ワクチン、例えばALLOVECTIN登録商標ワクチン、LEUVECTIN登録商標ワクチン、及びVAXID登録商標ワクチンなどのワクチン;トポイソメラーゼ1阻害剤例えばLURTOTECAN登録商標;rmRH例えば、ABARELIX登録商標;BAY439006ソラフェニブ;Bayer;SU-11248Pfizer;ペリホシン、COX-2阻害剤例えば、セレコキシブ又はエトリコキシブ、プロテオソーム阻害剤例えば、PS341;ボルテゾミブVELCADE登録商標;CCI-779;チピファルニブR11577;オラフェニブorafenib、ABT510;オブリマーセンoblimersenナトリウムGENASENSE登録商標などのBcl-2阻害剤;ピクサントロン;EGFR阻害剤下記定義参照;チロシンキナーゼ阻害剤下記定義参照;並びに上記いずれかの薬学的に許容できる塩、酸若しくは誘導体;並びにCHOP、シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、及びプレドニゾロンの併用療法についての略語、及びFOLFOX、5-FU及びロイコボリンと組み合わせたオキサリプラチンELOXATIN商標を用いた治療方式についての略語、などの、上記のうち2つ以上の組み合わせがある。ここで、化学療法剤は、癌の増殖を促進しうるホルモンの作用を調節、低減、遮断、又は阻害するように働く抗ホルモン剤又は内分泌治療剤が含まれる。それらはそれ自体がホルモンであってもよく、限定するものではないが、混合アゴニスト/アンタゴニストプロファイルを持つ抗エストロゲン、例えばタモキシフェンNOLVADEX登録商標、4-ヒドロキシタモキシフェン、トレミフェンFARESTON登録商標、イドキシフェン、ドロロキシフェン、ラロキシフェンraloxifeneEVISTA登録商標、トリオキシフェンtrioxifene、ケオキシフェンkeoxifene、及びSERM3などの選択的なエストロゲン受容体調節因子SERM;アゴニスト特性を有さない純粋な抗エストロゲン類、例えばフルベストラントFASLODEX登録商標、及びEM800このような薬剤はエストロゲン受容体ER二量体化をブロックし、DNA結合を阻害し、ER代謝回転を増加させ、及び/又はERレベルを抑制しうる;アロマターゼインヒビター、例えば、ホルメスタン及びエキセメスタンAROMASIN登録商標などのステロイド系アロマターゼインヒビター、及びアナストロゾールARIMIDEX登録商標、レトロゾールFEMARA登録商標及びアミノグルテチミドなどの非ステロイド性アロマターゼインヒビター、及びボロゾールRIVISOR登録商標、メゲストロールアセテートMEGASE登録商標、ファドロゾール及び45-イミダゾールを含む他のアロマターゼインヒビター;黄体形成ホルモン放出ホルモンアゴニスト、例えばロイプロリドLUPRON登録商標及びELIGARD登録商標、ゴセレリン、ブセレリン、及びトリプトレリン;性ステロイド、例えばプロゲスチン、例えばメゲストロールアセテート及びメドロキシプロゲステロンアセテート、エストロゲン、例えばジエチルスチルベストロール及びプレマリン、及びアンドロゲン/レチノイド、例えばフルオキシメステロン、全てのトランスレチオニン酸及びフェンレチニド;オナプリストン;抗プロゲステロン;エストロゲン受容体下方制御因子ERD;抗アンドロゲン類、例えばフルタミド、ニルタミド及びビカルタミド;及び上記の何れかの薬学的に許容可能な塩、酸又は誘導体;並びに、上記のうちの2以上の組合せを含む。本明細書における化学療法剤または化学療法レジメンの具体例としては:アルキル化剤例えば、クロラムブシル、ベンダムスチン、又はシクロホスファミド;ヌクレオシド類似体又は代謝拮抗薬例えばフルダラビン、フルダラビンとシクロホスファミドFC;プレドニゾン又はプレドニゾロン;ビンクリスチン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、プレドニゾロンCHOP、又はシクロホスファミド、プレドニゾロンCVPなどを含むアルキル化剤含有併用療法を含む。ターゲット層targetaudienceは、個々の患者、患者集団;新聞、医学文献、雑誌の読者;テレビやインターネットの視聴者;ラジオやインターネットのリスナー:医師、製薬会社など、とりわけ特定の使用、治療、又は適応症について、マーケティング又は広告により、特定の医薬が宣伝されるか又は宣伝されることが意図される人々のグループ又は機関である。パッケージ挿入物は、効能、用法、用量、投与、禁忌、パッケージ製品と併用される他の治療用製品、及び/又はそのような治療用製品の使用に関する警告を含む、治療用製品の商用パッケージに慣習的に含まれている説明書を指すために使用される。用語抗体は最も広い意味で用いられ、様々な抗体構造を包含し、限定されないが、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体例えば二重特異性抗体、及び、所望の抗原結合活性を示す限り、抗体断片を含む。抗体断片は、インタクトな抗体が結合する抗原を結合するインタクトな抗体の一部を含むインタクトな抗体以外の分子を指す。抗体断片の例としては、限定されないが、Fv、Fab、Fab’、Fab’-SHは、Fab’2、ダイアボディ、直鎖状抗体、単鎖抗体分子例えばscFv、及び抗体断片から形成された多重特異性抗体を含む。親和性成熟抗体とは、その改変を有していない親抗体と比較して、抗原に対する抗体の親和性に改良を生じせしめる、その一又は複数の超可変領域HVRにおいて一又は複数の改変を持つものである。参照抗体として同一のエピトープに結合する抗体とは、競合アッセイにおいて50以上、参照抗体のその抗原への結合をブロックする抗体、逆に競合アッセイにおいて50以上、その抗体のその抗原への結合をブロックするその参照抗体を指す。用語キメラ抗体は、重鎖及び/又は軽鎖の一部分が特定の起源又は種から由来し、一方重鎖及び/又は軽鎖の残りが異なる起源又は種から由来する抗体を指す。抗体のクラスは、その重鎖が保有する定常ドメイン又は定常領域のタイプを指す。抗体の5つの主要なクラスがあり:IgA、IgD、IgE、IgG及びIgM、及びこれらのいくつかは、さらにサブクラスアイソタイプ、例えば、IgG1、IgG2に、IgG3、IgG4、IGA1、及びIgA2に分けることができる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。本明細書で用いられる細胞傷害性薬物という用語は、細胞の機能を阻害又は阻止し及び/又は細胞死又は破壊を生ずる物質を指す。細胞傷害性薬物は、限定されないが、放射性同位体例えば、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212及びLuの放射性同位体:化学療法剤又は薬物例えば、メトトレキセート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイドビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、ダウノルビシンまたは他の挿入剤、成長阻害剤、酵素及びその断片、例えば核酸分解酵素など、抗生物質、小分子毒素などの毒素、又は細菌、真菌、植物又は動物由来の酵素活性毒素それらの断片及び/又はその変異体を含む、及び以下に開示される様々な抗腫瘍剤又は抗癌剤を包含する。エフェクター機能とは、抗体のアイソタイプにより変わる、抗体のFc領域に起因する生物学的活性を指す。抗体エフェクター機能の例としては、C1q結合及び補体依存性細胞傷害CDC、Fc受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞障害ADCC、貪食、細胞表面受容体例えば、B細胞受容体のダウンレギュレーション、及びB細胞の活性化を含む。用語Fc領域は、定常領域の少なくとも一部を含む、免疫グロブリン重鎖のC末端領域を定義するために使用される。その用語は、天然配列Fc領域と変異体Fc領域を含む。一実施態様において、ヒトIgG重鎖Fc領域はCys226又はPro230から重鎖のカルボキシル末端まで伸長する。しかし、Fc領域のC末端リジンLys447は存在しているか、又は存在していない場合がある。本明細書に明記されていない限り、Fc領域又は定常領域内のアミノ酸残基の番号付けは、KabatetalSequencesofProteinsofImmunologicalInterest5thEdPublicHealthServiceNationalInstitutesofHealthBethesdaMD1991に記載されるように、EUインデックスとも呼ばれるEU番号付けシステムに従う。フレームワーク又はFRは、超可変領域HVR残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、一般的に4つのFRのドメイン、FR1、FR2、FR3、及びFR4で構成される。従っ従って、HVR及びFR配列は一般にVH又はVLの以下の配列に現れる:FR1-H1L1-FR2-H2L2-FR3-H3L3-FR4。用語完全長抗体、インタクトな抗体及び全抗体は、本明細書中で互換的に使用され、天然型抗体構造と実質的に類似の構造を有するか、又は本明細書で定義されるFc領域を含む重鎖を有する抗体を指す。ヒト抗体は、ヒト又はヒト細胞により産生されるか、又はヒト抗体のレパートリー又は他のヒト抗体をコードする配列を利用した非ヒト起源に由来する抗体のそれに対応するアミノ酸配列を有するものである。ヒト抗体のこの定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を特に除外する。ヒト化抗体は、非ヒトHVR由来のアミノ酸残基、及びヒトFR由来アミノ酸残基を含むキメラ抗体を指す。所定の実施態様において、ヒト化抗体は、少なくとも一つ、典型的には2つの可変ドメインの全てを実質的に含み、HVR例えば、CDRの全て又は実質的に全てが、非ヒト抗体のものに対応し、全てまたは実質的にFRの全てが、ヒト抗体のものに対応する。ヒト化抗体は、任意で、ヒト抗体由来の抗体定常領域の少なくとも一部を含んでもよい。抗体のヒト化型、例えば、非ヒト抗体は、ヒト化を遂げた抗体を指す。本明細書で使用される用語超可変領域又はHVRは、配列が超可変であるか、及び/又は構造的に定義されたループ超可変ループを形成する抗体可変ドメインの各領域を指す。一般的に、天然型4鎖抗体は、VHH1、H2、H3に3つ、及びVLL1、L2、L3に3つの6つのHVRを含む。HVRは、一般的に超可変ループ由来及び/又は相補性決定領域CDR由来のアミノ酸残基を含み、後者は、最高の配列可変性であり、及び/又は抗原認識に関与している。典型的な超可変ループはアミノ酸残基26-32L1、50-52L2、91-96L3、26-32H1、53-55H2、及び96-101H3で生じる。ChothiaandLeskJMolBiol196901917典型的なCDRCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3は、アミノ酸残基L1の24-34、L2の50-56、L3の89-97、H1の31-35B、H2の50-65、及びH3の95-102に生じる。KabatetalSequencesofProteinsofImmunologicalInterest5thEdPublicHealthServiceNationalInstitutesofHealthBethesdaMDVHのCDR1の例外とともに、CDRは一般に超可変ループを形成するアミノ酸残基を含む。CDRは、抗原に接触する残基である特異性決定残基又はSDRを含む。SDRは、略称abbreviated-CDR、又はa-CDRと呼ばれる、CDRの領域内に含まれている。典型的なa-CDRa-CDR-L1、a-CDR-L2、a-CDR-L3、a-CDR-H1、a-CDR-H2、及びa-CDR-H3は、アミノ酸残基L1の31-34、L2の50-55、L3の89-96、H1の31-35B、H2の50-58、及びH3の95-102に生じる。AlmagroandFranssonFrontBiosci1316191633684360に開示される。別の実施態様において、抗c-met抗体はa配列GYTFTSYWLH配列番号1を含むHVR1;b配列GMIDPSNSDTRFNPNFKD配列番号2を含むHVR2;及び/又は配列ATYRSYVTPLDY配列番号3を含むHVR3-HCの一以上を含む重鎖可変ドメインを含む。幾つかの実施態様において、抗体はa配列KSSQSLLYTSSQKNYLA配列番号4を含むHVR1-L1;b配列WASTRES配列番号5を含むHVR2-LC;及び/又は配列QQYYAYPWT配列番号6を含むHVR3-LCの一以上を含む軽鎖可変ドメインを含む。一実施態様において、抗c-met抗体は、a配列GYTFTSYWLH配列番号1を含むHVR1;b配列GMIDPSNSDTRFNPNFKD配列番号2を含むHVR2;及びc配列ATYRSYVTPLDY配列番号3を含むHVR3-HCを含む重鎖可変ドメイン;及びa配列KSSQSLLYTSSQKNYLA配列番号4を含むHVR1-LC;b配列WASTRES配列番号5を含むHVR2-LC;及びc配列QQYYAYPWT配列番号6を含むHVR3-LCを含む軽鎖可変ドメインを含む。上記実施態様の何れかにおいて、抗c-met抗体はヒト化されている。一実施態様において、抗c-met抗体は、上記実施態様の何れかにおけるHVRを含み、更に、アクセプターヒトフレームワーク、例えばヒト免疫グロブリンのフレームワーク又はヒトコンセンサスフレームワークを含む。その他の態様において、抗c-met抗体は、配列番号7のアミノ酸配列に対して、少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98,99、又は100の配列同一性を有する重鎖可変ドメインVH配列を含む。ある実施態様において、少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98、又は99の同一性を有するVH配列は、参照配列に対して置換例えば保存的置換、挿入、又は欠失を含むが、その配列を含む抗c-met抗体は、ヒトc-metへ結合する能力を保持する。ある実施態様において、配列番号7において、合計1から10のアミノ酸が、置換、変更、挿入及び/又は欠失している。ある実施態様において、置換、挿入、又は欠失は、HVR外のすなわちFR内の領域で生じる。任意で、抗c-met抗体は、配列番号7のVH配列を、その配列の翻訳後修飾を含み、含む。その他の態様において、配列番号8のアミノ酸配列に対して、少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98,99、又は100の配列同一性を有する軽鎖可変ドメインVLを含む、抗c-met抗体が提供される。ある実施態様において、少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98、又は99の同一性を有するVL配列は、参照配列に対して置換例えば保存的置換、挿入、又は欠失を含むが、その配列を含む抗c-met抗体は、c-metへ結合する能力を保持する。ある実施態様において、配列番号8において、合計1から10のアミノ酸が、置換、挿入及び/又は欠失している。ある実施態様において、置換、挿入、又は欠失は、HVR外のすなわちFR内の領域で生じる。任意で、抗c-met抗体は、配列番号8のVL配列を、その配列の翻訳後修飾を含み、含む。更に別の実施態様において、抗c-met抗体は、配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,又は100の配列同一性を有するVL領域、及び配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,又は100の配列同一性を有するVH領域を含む。更なる実施態様において、抗c-met抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR-L1;配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR-L2;配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR-L3;配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR-H1;配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H2;及び配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。その他の態様において、抗c-met抗体が提供され、その抗体は、上記に与えられた実施態様の何れかにあるVH、及び上記に与えられた実施態様の何れかにあるVLを含む。更なる態様において、本発明は、本明細書に与えられた抗c-met抗体と同じエピトープに結合する抗体を提供する。例えば、ある実施態様において、配列番号7のVH配列及び配列番号8のVL配列を含む抗c-met抗体と同じエピトープに結合するか、又は該抗体により競合的に阻害されうる抗体が提供される。本発明の更なる態様では、上記実施態様のいずれかに記載の抗c-met抗体は、一価、キメラ、ヒト化又はヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施態様において、抗c-met抗体は、抗体断片、例えば、片腕型、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、又はFab’2断片である。その他の態様において、抗体は、全長抗体、例えば、インタクトなIgG1又はIgG4抗体、又は本明細書において定義された他の抗体クラス又はアイソタイプである。その他の実施態様において、抗体は二重特異性抗体である。一実施態様において、二重特異性抗体は、上述されたVH領域及びVL領域を含むか又はHVRを含む。幾つかの実施態様において、抗c-met抗体は一価であり、a配列:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTFTSYWLHWVRQAPGKGLEWVGMIDPSNSDTRFNPNFKDRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCATYRSYVTPLDYWGQGTLVTVSS配列番号7を有する重鎖可変ドメイン、CH1配列、及び第一のFcポリペプチドを含む第一のポリペプチド;b配列:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYTSSQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYAYPWTFGQGTKVEIKR配列番号8を有する軽鎖可変ドメイン、及びCL1配列を含む第二のポリペプチド;及びc第二のFcポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、重鎖可変ドメインと軽鎖可変ドメインは複合体として存在して単一の抗原結合の腕を形成し、第一及び第二のFcポリペプチドは複合体として存在し、前記抗原結合の腕を含むFab分子と比較して、前記抗体断片の安定性を増加させたFc領域を形成する。幾つかの実施態様において、第一のポリペプチドは、Fc配列CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号9を含み、第二のポリペプチドは、Fc配列CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号10を含む。その他の実施態様において、抗c-met抗体が一価であり、a重鎖を含む第一のポリペプチドであって、配列:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTFTSYWLHWVRQAPGKGLEWVGMIDPSNSDTRFNPNFKDRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCATYRSYVTPLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号11を含む該ポリペプチド;b軽鎖を含む第二のポリペプチドであって、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLYTSSQKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYAYPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC配列番号12を含むポリペプチド;及びFc配列を含む第三のポリペプチドであって、配列DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK配列番号13を含むポリペプチドを含み、重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメインが複合体として存在し、単一の抗原結合の腕を形成し、第一及び第二のFcポリペプチドが複合体中に存在し、前記抗原結合の腕を含むFab分子と比較して前記抗体断片の安定性を増加させたFc領域を形成する。本発明の方法における使用に適した別の抗c-met抗体が本明細書に記載され、当技術分野で知られている。例えば、国際公開第05/016382号に開示された抗c-met抗体限定されないが抗体13.3.2,9.1.2,8.70.2,8.90.3を含む;ジェノアのCBAでICLC番号PD03001により寄託されたハイブリドーマ細胞株により産生される抗c-met抗体、又はHGFレセプターのβ鎖の細胞外ドメイン上のエピトープを認識し、前記エピトープがモノクローナル抗体により認識されるものと同じである抗c-met抗体;国際公開第2007/126799号に開示された抗c-met抗体限定されないが04536,05087,05088,05091,05092,04687,05097,05098,05100,05101,04541,05093,05094,04537,05102,05105,04696,04682を含む;国際公開第2009/007427号に開示された抗c-met抗体限定されないが、CNCM、パスツール研究所フランス、パリに2007年3月14日に番号I-3731で、2007年3月14日に番号I-3732で、2007年7月6日に番号I-3786で、2007年3月14日に番号I-3724で寄託された抗c-met抗体;20110129481に開示された抗c-met抗体;米国特許出願公開第20110104176号に開示された抗c-met抗体;国際公開第2009/134776号に開示された抗c-met抗体;国際公開第2010/059654号に開示された抗c-met抗体;国際公開第2011020925号に開示された抗c-met抗体限定されないが、CNCM、パスツール研究所フランス、パリに2008年3月12日に番号I-3949で寄託されたハイブリドーマから分泌される抗体、及び2010年1月14日に番号I-4273で寄託されたハイブリドーマからから分泌される抗体。一態様において、抗c-met抗体は、抗体断片内のFc配列のホモ2量体化を最小にしつ、ヘテロ2量体化を促進する少なくとも一つの特性を含む。そうした特徴は免疫グロブリン集団の収率及び/又は純度及び/又は均一性を改良する。一実施態様では、国際公開第2005/063816号に記述されるように、抗体は、ノブknob及びホールholeを構成するFc突然変異を含む。例えば、ホールhole突然変異は、Fcポリペプチド内のT366A、L368A及び/又はY407Vの一又は複数でありえ、キャビティcavity突然変異はT366Wでありうる。幾つかの実施態様において、c-metアンタゴニストは抗肝細胞増殖因子HGF抗体、例えば、ヒト化抗HGF抗体TAK701、リロツムマブrilotumumab、フィクラツズマブficlatuzumab、及び/又は国際公開第2007/143090号に記載されるヒト化抗体2B8である。幾つかの実施態様において、抗HGF抗体は米国特許第7718174B2号に記載された抗HGF抗体である。幾つかの実施態様において、c-metアンタゴニストは、c-met小分子阻害剤である。幾つかの実施態様において、c-met小分子阻害剤は、選択的c-met小分子阻害剤である。一実施態様において、c-metアンタゴニストはc-met細胞外ドメインに結合する。幾つかの実施態様において、c-metアンタゴニストはc-metのキナーゼドメインに結合する。幾つかの実施態様において、c-metアンタゴニストは肝細胞増殖因子HGFとc-me結合について競合する。幾つかの実施態様において、c-metアンタゴニストはHGFに結合する。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、細胞増殖、例えば、細胞株EBC-1、H441および/またはKP4のHGF誘導性細胞増殖を阻害する。幾つかの実施態様において、細胞増殖はKiが600nM以下より強力、500nM以下、400nM以下、300nM以下又はより強力に阻害される。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、EBC-1細胞が10ウシ胎児血清の存在下においてc-metアンタゴニストで処置されたときに、c-metシグナル伝達例えば、ホスホc-met、ホスホAKT、ホスホMAPKを阻害する。幾つかの実施態様において、c-metシグナル伝達はKiが600nM以下より強力、500nM以下、400nM以下、300nM以下より強力に阻害される。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは扁平上皮癌を治療する治療が可能である。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは野生型k-rasを発現するNSCLCを治療する治療が可能である。ある実施態様において、c-met阻害剤は、非ATP競合性小分子ではない。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、細胞増殖、例えば、細胞株EBC-1、H441および/またはKP4のHGF誘導性細胞増殖を阻害する。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、EBC-1細胞が10ウシ胎児血清の存在下においてc-metアンタゴニストで処置されたときに、c-metシグナル伝達例えば、ホスホc-met、及び下流のc-metシグナル伝達経路、例えばホスホAKT、ホスホMAPKを阻害する。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは外因性HGFの存在下または非存在下で細胞株MDA-MB-231及びHT29の細胞増殖を阻害しない。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、10ウシ胎児血清の存在下で、細胞株MDA-MB-231及びHT29の細胞増殖を阻害しない。細胞増殖をアッセイするための方法は当技術分野でよく知られており、幾つかの方法が、国際公開第2009/111691号;国際公開第2006/015371号;及びJinetalCancerRes684360に記載されている。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは扁平上皮癌を治療する治療が可能である。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは野生型k-rasを発現するNSCLCを治療する治療が可能である。ある実施態様において、c-metアンタゴニストはチバンチニブARQ-197でない。特定の実施態様では、c-metアンタゴニストは、c-metシグナル伝達を、IC50が1,000nM以下すなわちより強力で阻害する。その他の実施態様において、c-metアンタゴニストは、c-metシグナル伝達を、IC50が400nM以下、500nM以下、600nM以下、700nM以下で阻害する。別の実施態様では、c-metアンタゴニストは、c-metシグナル伝達を、IC50が50nM以下で阻害する。ある実施態様において、c-metアンタゴニストはクリゾチニブcrizotinibでない。ある実施態様において、c-metアンタゴニストはフォレチニブforetinibでない。ある実施態様において、c-metアンタゴニストはフィクラツズマブficlatuzumabでない。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、SGX-523、クリゾチニブPF-02341066;3-[1R-1-2,6-ジクロロ-3-フルオロフェニルエトキシ]-5-1-ピペリジン-4-イルピラゾール-4-イルピリジン-2-アミン;CAS番号877399-52-5;JNJ-38877605CAS番号943540-75-8,BMS-698769、PHA-665752ファイザー、SU5416、INC-280Incyte、SU11274Sugen;[3Z-N-3-クロロフェニル-3-{3,5-ジメチル-4-[4-メチルピペラジン-1-イルカルボニル]-1H-ピロール-2-イル}メチレン-N-メチル-2-オキソインドリン-5-スルホンアミド;CAS番号658084-23-2]ForetinibGSK1363089、XL880CAS番号849217-64-7;XL880はmetとVEGFR2とKDRの阻害剤である;MGCD-265MethylGene;MGCD-265はc-met、VEGFR1、VEGFR2、VEGFR3、Ron及びTie-2レセプターを標的にする;CAS番号875337-44-3、チバンチニブARQ197;--3R,4R-3-5,6-ジヒドロ-4H-ピロロ[3,2,1-ij]キノリン-1-イル-4-1H-インドール-3-ylピロリジン-2,5-ジオン;MunchietalMolCancerTherJune201091544を参照;CAS番号905854-02-6,LY-2801653Lilly,LY2875358Lilly,MP-470,リロツムマブAMG102,抗HGFモノクローナル抗体,抗体223C4又はヒト化抗体223C4国際公開第2009/007427号,ヒト化L2G7ヒト化TAK701;ヒト化抗HGFモノクローナル抗体;EMD1214063MerckSorono,EMD1204831MerckSerono,NK4,カボザンチニブCabozantinibXL-184,CAS番号849217-68-1;カボザンチニブcarbozantinibはmetとVEGF2の二重阻害剤である,MP-470SuperGen;c-KIT,MET,PDGFR,Flt3,及びAXLの新規阻害剤,Comp-1,フィクラツズマブFiclatuzumabAV-299;抗HGFモノクローナル抗体,E7050Cas番号1196681-49-8;E7050は二重のc-metとVEGFR2阻害剤であるEsai;MK-2461Merck;N-2R-1,4-ジオキサン-2-イルメチル-N-メチル-N’-[3-1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル-5-オキソ-5H-ベンゾ[4,5]シクロヘプタ[1,2-b]ピリジン-7-イル]スルファミド;CAS番号917879-39-1;MK8066Merck,PF4217903Pfizer,AMG208Amgen,SGX-126,RP1040,LY2801653,AMG458,EMD637830,BAY-853474,DP-3590の何れか一である。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、クリゾチニブcrizotinib、チバンチニブtivantinib、カボザンチニブcarbozantinib、MGCD-265、フィクラツズマブficlatuzumab、ヒト化TAK-701、リロツムマブrilotumumab、フォレチニブforetinib、h224G11、DN-30、MK-2461、E7050、MK-8033、PF-4217903、AMG208、JNJ-38877605、EMD1204831、INC-280、LY-2801653、SGX-126、RP1040、LY2801653、BAY-853474、及び/又はLA480である。ある実施態様において、c-metアンタゴニストは、クリゾチニブcrizotinib、チバンチニブtivantinib、カボザンチニブcarbozantinib、MGCD-265、フィクラツズマブficlatuzumab、ヒト化TAK-701、リロツムマブrilotumumab、及び/又はフォレチニブforetinibの何れか一か又は複数である。EGFRアンタゴニストには、例えばニモツズマブYMBiosciencesとして知られているヒト化モノクローナル抗体、全長ヒトABX-EGFパニツムマブ、AbgenixInc.、並びにE1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3及びE7.6.3として知られており、米国特許第6,235,883号に記載の全長ヒト抗体;MDX-447MedarexIncが含まれる。ペルツズマブ2C4はHER2に直接結合するが、HER2-EGFR二量体化に干渉し、よってEGFRシグナル伝達を阻害するヒト化抗体である。EGFRに結合する抗体の他の例は、MAb579ATCCCRLHB8506、MAb455ATCCCRLHB8507、MAb225ATCCCRL8508、MAb528ATCCCRL8509米国特許第4943533号,Mendelsohn等を参照及びその変異体、例えばキメラ化225C225又はセツキシマブ;ERBITUX登録商標及び再形成ヒト225H225国際公開第96/40210号,ImcloneSystemsInc.を参照;IMC-11F8,完全ヒトEGFR標的抗体Imclone;タイプII変異体EGFRに結合する抗体米国特許第5212290号;米国特許第5891996号に記載されているようなEGFRに結合するヒト化及びキメラ化抗体;及びEGFRに結合するヒト抗体、例えばABX-EGF国際公開第98/50433,Abgenixを参照;EMD55900Stragliotto等EurJCancer32A636640;EMD7200マツズマブ,EGFR結合についてEGF及びTGF-α双方と競合するEGFRに対するヒト化EGFR及びmAb806又はヒト化mAb806Johns等,JBiolChem2793037530384を含む。抗EGFR抗体は細胞傷害剤とコンジュゲートされ得、よってイムノコンジュゲートを生じる例えば、欧州特許出願公開第659439A2号,MerckPatentGmbHを参照。本発明の方法において有用な抗EGFR抗体は、EGFRに十分な親和性と特異性で結合し、EGFR活性を減少又は阻害することができる任意の抗体が含まれている。選択される抗体は通常EGFRに十分に強い結合親和性を有し、例えば、抗体はヒトc-metにKd値が100nMから1pMの間で結合し得る。抗体の親和性は、表面プラズモン共鳴に基づくアッセイ例えばPCT出願公開番号第2005/012359号に記載されてビアコアアッセイなど;酵素結合免疫吸着検定法ELISA;及び競合アッセイ例えばRIAにより決定することができる。好ましくは、本発明の抗EGFR抗体は、EGFR/EGFRリガンドの活性が関与している疾患又は症状を標的とすること及び妨げることにおける治療剤として使用することができる。また、抗体は、例えば治療としての有効性を評価するために、他の生物学的活性アッセイを施してもよい。このようなアッセイは、当技術分野で公知であり、標的抗原に依存し、抗体としての使用を意図している。二重特異性抗体は、少なくとも二つの異なるエピトープに対して結合特異性を有する抗体である。例示的な二重特異性抗体は、EGFR及びc-metに結合しうる。他の例において、二重特異性抗体は、同じタンパク質、例えばc-metタンパク質の2つの異なるエピトープに結合しうる。また、c-met又はEGFRは、c-met又はEGFR発現細胞に対する細胞防御メカニズムを集中させるように、FcγRICD64、FcγRIICD32及びFcγRIIICD16等のIgGFcγRに対するFcレセプター、又はT細胞レセプター分子例えばCD2又はCD3等の白血球上のトリガー分子に結合するアームと結合しうる。また、二重特異性抗体は、c-met又はEGFRを発現する細胞に細胞傷害剤を局在化するためにも使用されうる。これらの抗体は、EGFR又はc-met結合アーム、及び細胞傷害剤例えば、サポリンsaporin、抗インターフェロン-α、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキセート又は放射性同位体ハプテンと結合するアームを有する。二重特異性抗体は全長抗体又は抗体断片例えばFab’2二重特異性抗体として調製することができる。一実施態様において、2重特異性抗体は、米国特許出願公開第20100254989A号に開示された2重特異性MET-EGFR抗体の何れかである。また、EGFRアンタゴニストには、小分子、例えば米国特許第5616582号、米国特許第5457105号、米国特許第5475001号、米国特許第5654307号、米国特許第5679683号、米国特許第6084095号、米国特許第6265410号、米国特許第6455534号、米国特許第6521620号、米国特許第6596726号、米国特許第6713484号、米国特許第5770599号、米国特許第6140332号、米国特許第5866572号、米国特許第6399602号、米国特許第6344459号、米国特許第6602863号、米国特許第6391874号、国際公開第9814451号、国際公開第9850038号、国際公開第9909016号、国際公開第9924037号、国際公開第9935146号、国際公開第0132651号、米国特許第6344455号、米国特許第5760041号、米国特許第6002008号、米国特許第5747498号に記載されている化合物が含まれる。特定の小分子EGFRアンタゴニストには、OSI-774CP-358774、エルロチニブ,OSIPharmaceuticals;PD183805CI1033、2-プロペンアミド、N-[4-[3-クロロ-4-フルオロフェニルアミノ]-7-[3-4-モルホリニルプロポキシ]-6-キナゾリニル]-,二塩酸塩,PfizerInc.;Iressa登録商標ZD1839、ゲフィチニブ、AstraZeneca;ZM1051806-アミノ-4-3-メチルフェニル-アミノ-キナゾリン、Zeneca;BIBX-1382N8-3-クロロ-4-フルオロ-フェニル-N2-1-メチル-ピペリジン-4-イル-ピリミド[5,4-d]ピリミジン-2,8-ジアミン,BoehringerIngelheim;PKI-166R-4-[4-[1-フェニルエチルアミノ]-1H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-6-イル]-フェノール;R-6-4-ヒドロキシフェニル-4-[1-フェニルエチルアミノ]-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン;CL-387785N-[4-[3-ブロモフェニルアミノ]-6-キナゾリニル]-2-ブチナミド;EKB-569N-[4-[3-クロロ-4-フルオロフェニルアミノ]-3-シアノ-7-エトキシ-6-キノリニル]-4-ジメチルアミノ-2-ブテナミド;ラパチニブTykerb,GlaxoSmithKline;ZD6474Zactima,AstraZeneca;CUDC-101Curis;カネルチニブCI-1033;AEE7886-[4-[4-エチル-1-ピペラジニルメチル]フェニル]-N-[1R-1-フェニルエチル]-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン、国際公開第2003013541号、Novartis及びPKI1664-[4-[[1R-1-フェニルエチル]アミノ]-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-6-イル]-フェノール、国際公開第9702266号、Novartisが含まれる。一実施態様において、抗体、例えば、本明細書の方法で使用される抗体は、以下のセクション1-6で説明されるように、単独または組み合わせで任意の特徴を組み込むことができる:1.抗体断片ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片は、限定されないが、Fab,Fab’,Fab’-SH,Fab’2,Fv,及びscFv断片、片腕型抗体及び下記の他の断片を含む。所定の抗体断片の総説については、HudsonetalNatMed9129134を参照。scFv断片の総説については、例えば、PluckthueninThePharmacologyofMonoclonalAntibodiesvol113RosenburgandMooreedspp269315を参照;また、国際公開第93/16185号;及び米国特許第5,571,894号及び第5,587,458号も参照。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、かつインビボ半減期を増加させたFab及びFab’2断片の議論については、米国特許第5869046号を参照のこと。ダイアボディは2価または二重特異性であり得る2つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、欧州特許第404,097号;国際公開第1993/01161号;HudsonetalNatMed9129134;及びHollingeretalProcNatlAcadSciUSA9064446448を参照。トリアボディ及びテトラボディもまたHudsonetalNatMed9129134に記載されている。単一ドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインの全て又は一部、又は軽鎖可変ドメインの全て又は一部を含む抗体断片である。ある実施態様において、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体であるDomantis,Inc.,Waltham,MA;例えば、米国特許第6,248,516B1号を参照。片腕型抗体すなわち重鎖可変領域および軽鎖可変ドメインは単一の抗原結合の腕を形成するは例えば国際公開第2005/063816号;MartensetalClinCancerRes126144に開示される。拮抗的機能を必要とする病的状態の治療のために、抗体の2価性が望まれないアゴニスト作用をもたらす場合、片腕型抗体すなわち単一の抗原結合の腕を含む抗体の一価の特性が、ターゲット分子に対する抗体の結合に際し拮抗的機能をもたらすか及び/又は確実にする。更に、Fc領域を含む片腕型抗体は、類似した/実質的に同一の抗原結合特性を有するFab形態と比較して、優れた薬物動態学的性質例えばインビボでの拡張された半減期および/またはクリアランス速度の減少などによって特徴付けられ、従って従来の一価Fab抗体の使用における主要な欠点を克服している。片腕型抗体を作成する技術は、限定されないが、knob-in-holeエンジニアリング米国特許第5,731,168号を含む。MetMAbは片腕型抗体の例である。[別の片腕型の一価形態を追加Genmab]抗体断片は様々な技術で作成することができ、限定されないが、本明細書に記載するように、インタクトな抗体の分解、並びに組換え宿主細胞例えば、大腸菌又はファージによる生産を含む。2.キメラ及びヒト化抗体ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体が、例えば、米国特許第4,816,567号、及びMorrisonetalProcNatlAcadSciUSA8168516855に記載されている。一例において、キメラ抗体は、非ヒト可変領域例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、又はサル等の非ヒト霊長類由来の可変領域及びヒト定常領域を含む。更なる例において、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のものから変更されたクラススイッチ抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片を含む。ある実施態様において、キメラ抗体は、ヒト化抗体である。典型的には、非ヒト抗体は、ヒトに対する免疫原性を低減するために、親の非ヒト抗体の特異性と親和性を保持したまま、ヒト化されている。一般に、ヒト化抗体は、HVR、例えば、CDRまたはその一部が、非ヒト抗体から由来し、FRまたはその一部がヒト抗体配列に由来する、一以上の可変ドメインを含む。ヒト化抗体はまた、任意で、ヒト定常領域の少なくとも一部をも含む。幾つかの実施態様において、ヒト化抗体の幾つかのFR残基は、抗体特異性又は親和性を回復もしくは改善するめに、非ヒト抗体例えば、HVR残基が由来する抗体由来の対応する残基で置換されている。ヒト化抗体およびそれらの製造方法は、例えば、AlmagroandFranssonFrontBiosci1316191633に総説され、更に、RiechmannetalNature332323329QueenetalProcNatlAcadSciUSA861002910033;米国特許第5,821,337,7,527,791,6,982,321,及び7,087,409;KashmirietalMethods362534SDRa-CDRグラフティングを記述;PadlanMolImmunol28489498リサーフェシングを記述;DallAcquaetalMethods364360FRシャッフリングを記述;及びOsbournetalMethods366168及びKlimkaetalBrJCancer83252260FRのシャッフリングへの誘導選択アプローチを記述に記載されている。ヒト化に用いられ得るヒトフレームワーク領域は、限定されないが、ベストフィット法を用いて選択されるフレームワーク領域例えば、SimsetalJImmunol1512296;軽鎖または重鎖の可変領域の特定のサブグループのヒト抗体のコンセンサス配列由来のフレームワーク領域例えば、CarteretalProcNatlAcadSciUSA894285;及びPrestaetalJImmunol1512623を参照;ヒト成熟体細胞変異フレームワーク領域またはヒト生殖細胞系フレームワーク領域例えば、AlmagroandFranssonFrontBiosci1316191633を参照;及びFRライブラリスクリーニング由来のフレームワーク領域例えば、BacaetalJBiolChem2721067810684及びRosoketalJBiolChem2712261122618を参照を含む。3.ヒト抗体ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当技術分野で公知の様々な技術を用いて生産することができる。ヒト抗体は一般的にvanDijkandvandeWinkelCurrOpinPharmacol536874及びLonbergCurrOpinImmunol20450459に記載されている。ヒト抗体は、抗原チャレンジに応答して、インタクトなヒト抗体又はヒト可変領域を持つ又はインタクトな抗体を産生するように改変されたトランスジェニック動物に、免疫原を投与することにより調製することができる。このような動物は、典型的には、内因性免疫グロブリン遺伝子座を置換するか、又は染色体外に存在するかもしくは動物の染色体にランダムに組み込まれている、ヒト免疫グロブリン遺伝子座の全てまたは一部を含む。このようなトランスジェニックマウスでは、内因性免疫グロブリン遺伝子座は、一般的に不活性化される。トランスジェニック動物からヒト抗体を得るための方法の総説については、LonbergNatBiotech2311171125を参照。また、例えば、XENOMOUSETM技術を記載している、米国特許第6,075,181号及び6,150,584号;HuMab登録商標技術を記載している米国特許第5,770,429号;K-MMOUSE登録商標技術を記載している米国特許第7,041,870号及び、VelociMouse登録商標技術を記載している米国特許出願公開第2007/0061900号を参照。このような動物で生成されたインタクトな抗体由来のヒト可変領域は、例えば、異なるヒト定常領域と組み合わせることにより、更に改変される可能性がある。ヒト抗体は、ハイブリドーマベース法によって作成することができる。ヒトモノクローナル抗体の産生のためのヒト骨髄腫及びマウス-ヒトヘテロ細胞株が記載されている。例えば、KozborJImmunol1333001BrodeuretalMonoclonalAntibodyProductionTechniquesandApplicationspp5163及びBoerneretalJImmunol14786を参照ヒトB細胞ハイブリドーマ技術を介して生成されたヒト抗体はまた、LietalProcNatlAcadSciUSA10335573562に記載されている。更なる方法は、例えば、米国特許第7,189,826号ハイブリドーマ細胞株からのモノクローナルヒトIgM抗体の産生を記載している及びNiXiandaiMianyixue26265268ヒト-ヒトハイブリドーマを記載しているに記載されたものを含む。ヒトハイブリドーマ技術トリオーマ技術もまた、VollmersandBrandleinHistologyandHistopathology20927937及びVollmersandBrandleinMethodsandFindingsinExperimentalandClinicalPharmacology2718591に記載される。ヒト抗体はまた、ヒト由来のファージディスプレイライブラリーから選択されたFvクローン可変ドメイン配列を単離することによって生成され得る。このような可変ドメイン配列は、次に所望のヒト定常ドメインと組み合わせてもよい。抗体ライブラリーからヒト抗体を選択するための技術が、以下に説明される。4.ライブラリー由来の抗体本発明の抗体は、所望の活性または活性複数を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって単離することができる。例えば、様々な方法が、ファージディスプレイライブラリーを生成し、所望の結合特性を有する抗体についてのライブラリーをスクリーニングするために、当該技術分野で知られている。そのような方法は、例えば、HoogenboometalinMethodsinMolecularBiology178137に総説され、更に、例えば、McCaffertyetalNature348552554ClacksonetalNature352624628MarksetalJMolBiol222581597MarksandBradburyinMethodsinMolecularBiology248161175SidhuetalJMolBiol338299310LeeetalJMolBiol34010731093FellouseProcNatlAcadSciUSA1011246712472及びLeeetalJImmunolMethods284119132に記載されている。特定のファージディスプレイ法において、VH及びVL遺伝子のレパートリーがポリメラーゼ連鎖反応PCRにより個別にクローニングされ、ファージライブラリーにランダムに再結合され、その後、WinteretalAnnRevImmunol12433455に記載されるように、ナイーブなレパートリーが、任意の免疫感作無しで、広範囲の非自己抗原及び自己抗原に対して、抗体の単一起源を提供するために、例えば、ヒトからクローン化することができる。最後に、ナイーブなライブラリはまた、HoogenboomandWinterJMolBiol227381388に記載されるように、非常に可変なCDR3領域をコードし、インビトロで再構成を達成するために、幹細胞由来の未転位V遺伝子セグメントをクローニングし、ランダム配列を含むPCRプライマーを使用することにより合成することができる。ヒト抗体ファージライブラリーを記述する特許公報は、例えば、米国特許第5,750,373号、及び米国特許出願公開第2005/0079574号、2005/0119455号、2005/0266000号、2007/0117126号、2007/0160598号、2007/0237764号、2007/0292936号及び2009/0002360を含む。ヒト抗体ライブラリーから単離された抗体または抗体断片は、本明細書でヒト抗体またはヒト抗体の断片とみなされる。5.多重特異性抗体ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも二つの異なる部位に対して結合特異性を有するモノクローナル抗体である。ある実施態様において、結合特異性の一つはc-metに対してであり、他は、任意の他の抗原に対してである。ある実施態様において、二重特異性抗体は、c-metの2つの異なるエピトープに結合することができる。二重特異性抗体はまたc-metを発現する細胞に対して細胞傷害性薬物を局在化させるために用いることができる。二重特異性抗体は、全長抗体又は抗体断片として調製することができる。多重特異性抗体を作製するための技術は、限定されないが、異なる特異性を有する2つの免疫グロブリン重鎖-軽鎖対の組換え共発現MilsteinandCuelloNature305537、国際公開第93/08829号、及びTrauneckeretalEMBOJ103655を参照及びknob-in-holeエンジニアリング例えば、米国特許第5,731,168号を参照を含む。多重特異抗体はまた、抗体のFc-ヘテロ2量体分子を作成するための静電ステアリング効果を操作すること国際公開第2009/089004A1号、2つ以上の抗体又は断片を架橋すること例えば米国特許第4,676,980号、及びBrennanetalScience22981を参照、2重特異性抗体を生成するためにロイシンジッパーを使用すること例えば、KostelnyetalJImmunol14815471553を参照、二重特異性抗体フラグメントを作製するため、ダイアボディ技術を使用すること例えば、HollingeretalProcNatlAcadSciUSA9064446448を参照、単鎖FvsFvダイマーを使用すること例えば、GruberetalJImmunol1525368を参照、及び、例えばTuttetalJImmunol14760に記載されているように、三重特異性抗体を調製することによって作成することができる。オクトパス抗体を含む、3つ以上の機能性抗原結合部位を持つ改変抗体もまた本明細書に含まれる例えば、米国特許出願公開第2006/0025576A1号を参照。本明細書中の抗体又は断片はまた、c-met並びにその他の異なる抗原、例えばEGFR例えば米国特許出願公開第2008/0069820号を参照に結合する抗原結合部位を含む、2重作用DualActingFAb又はDAFを含む。6.抗体変異体ある実施態様において、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列変異体が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/又は他の生物学的特性を改善することが望まれ得る。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な改変を導入することにより、またはペプチド合成によって調製することができる。このような改変は、例えば、抗体のアミノ酸配列内における、残基の欠失、及び/又は挿入及び/又は置換を含む。最終コンストラクトが所望の特性、例えば、抗原結合を有していることを条件として、欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせが、最終コンストラクトに到達させるために作成され得る。ある実施態様において、一つ以上のアミノ酸置換を有する抗体変異体が提供される。置換突然変異の対象となる部位は、HVRとFRを含む。アミノ酸置換は、目的の抗体に導入することができ、その産物は、所望の活性、例えば、抗原結合の保持/改善、免疫原性の減少、又はADCC又はCDCの改善についてスクリーニングされた。置換変異体の一つのタイプは、親抗体例えば、ヒト化又はヒト抗体などの一以上の高頻度可変領域残基の置換を含む。一般的には、更なる研究のために選択され得られた変異体は、親抗体と比較して、特定の生物学的特性の改変例えば、改善例えば、親和性の増加、免疫原性を減少を有し、及び/又は親抗体の特定の生物学的特性を実質的に保持しているであろう。典型的な置換変異体は、親和性成熟抗体であり、例えば、本明細書に記載されるファージディスプレイベースの親和性成熟技術を用いて、簡便に生成され得る。簡潔に言えば、一つ以上のHVR残基が変異し、変異体抗体は、ファージ上に表示され、特定の生物学的活性例えば、結合親和性についてスクリーニングされる。アミノ酸配列挿入は、一残基から百以上の残基を含有するポリペプチド長にわたるアミノ及び/又はカルボキシル末端融合、並びに単一または複数のアミノ酸残基の配列内挿入を含む。末端挿入の例としては、N末端メチオニン残基を有する抗体が含まれる。抗体分子の他の挿入変異体は、酵素に対する抗体のN末端またはC末端への融合例えばADEPTの場合、または抗体の血清半減期を増加させるポリペプチドへの融合を含む。ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は抗体がグリコシル化される程度を増加または減少するように改変される。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、一以上のグリコシル化部位が作成または削除されるようにアミノ酸配列を変えることによって簡便に達成することができる。抗体がFc領域を含む場合には、それに付着する糖を変えることができる。哺乳動物細胞によって生成された天然型抗体は、典型的には、Fc領域のCH2ドメインのAsn297にN-結合により一般的に付着した分岐鎖、二分岐オリゴ糖を含んでいる。例えばWrightetalTIBTECH152632を参照。オリゴ糖は、様々な炭水化物、例えば、二分岐糖鎖構造の幹のGlcNAcに結合した、マンノース、N-アセチルグルコサミンGlcNAc、ガラクトース、シアル酸、並びにフコースを含み得る。幾つかの実施態様において、本発明の抗体におけるオリゴ糖の改変は一定の改善された特性を有する抗体変異型を作成するために行われ得る。一実施態様において、抗体変異体は、Fc領域に直接または間接的に付着されたフコースを欠いた糖鎖構造を有して提供される。例えば、このような抗体のフコース量は、1から80、1から65、5から65、または20から40であり得る。フコースの量は、例えば、国際公開第2008/077546号に記載されているように、MALDI-TOF質量分析法によって測定されるAsn297に付着しているすべての糖構造の合計例えば、コンプレックス、ハイブリッド及び高マンノース構造に対して、Asn297の糖鎖中のフコースの平均量を計算することによって決定される。Asn297は、Fc領域Fc領域残基のEU番号付けでおよそ297の位置に位置するアスパラギン残基を指し、しかし、Asn297もまた位置297の上流または下流のおよそ±3アミノ酸に、すなわち抗体の軽微な配列変異に起因して、位置294と300の間に配置され得る。このようなフコシル化変異体はADCC機能を改善させた可能性がある。例えば、米国特許出願公開第2003/0157108号Presta,L.;米国特許出願公開第2004/0093621号協和発酵工業株式会社を参照。フコース非修飾又はフコース欠損抗体変異体に関連する出版物の例としては、米国特許出願公開第2003/0157108号、国際公開第2000/61739号、国際公開第2001/29246号、米国特許出願公開第2003/0115614号、米国特許出願公開第2002/0164328号、米国特許出願公開第2004/0093621号、米国特許出願公開第2004/0132140号、米国特許出願公開第2004/0110704号、米国特許出願公開第2004/0110282号、米国特許出願公開第2004/0109865号、国際公開第2003/085119号、国際公開第2003/084570号、国際公開第2005/035586号、国際公開第2005/035778号、国際公開第2005/053742号、国際公開第2002/031140号、OkazakietalJMolBiol33612391249YamaneOhnukietalBiotechBioeng87614が含まれる。非フコシル化抗体を産生する能力を有する細胞株の例としては、タンパク質フコシル化を欠損しているLec13CHO細胞RipkaetalArchBiochemBiophys249533545;米国特許出願公開第2003/0157108A1号,Presta,L;及び国際公開第2004/056312A1号,Adamsら,特に実施例11、及びノックアウト細胞株、アルファ-1、6-フコシルトランスフェラーゼ遺伝子、FUT8、ノックアウトCHO細胞例えば、YamaneOhnukietalBiotechBioeng87614KandaYetalBiotechnolBioeng94680688;及び国際公開第2003/085107号を参照を含む。抗体変異体が、例えば、抗体のFc領域に結合した二分岐オリゴ糖がGlcNAcによって二分されている二分オリゴ糖とともに更に与えられる。このような抗体変異体はフコシル化を減少させ、及び/又はADCC機能を改善している可能性がある。そのような抗体変異体の例は、例えば、国際公開第2003/011878号Jean-Mairettら;米国特許第6,602,684号Umanaら;及び米国特許出願公開第2005/0123546号Umanaらに記載されている。Fc領域に結合したオリゴ糖内に少なくとも1つのガラクトース残基を持つ抗体変異体も提供される。このような抗体変異体はCDC機能を改善させた可能性がある。このような抗体変異体は、例えば、国際公開第1997/30087号Patelら;国際公開第1998/58964号Raju,S.;及び国際公開第1999/22764号Raju,S.に記載されている。ある実施態様において、1つまたは複数のアミノ酸改変を、本明細書で提供される抗体のFc領域に導入することができ、それによってFc領域変異体を生成する。Fc領域の変異体は、1つまたは複数のアミノ酸位置においてアミノ酸修飾例えば置換を含むヒトFc領域の配列例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のFc領域を含んでもよい。ある実施態様において、本発明は、インビボにおける抗体の半減期が重要であるが、ある種のエフェクター機能例えば補体およびADCCなどが不要または有害である用途のための望ましい候補とならしめる、全てではないが一部のエフェクター機能を有する抗体変異体を意図している。エフェクター機能が減少した抗体は、Fc領域の残基238、265、269、270、297、327、329の一つ以上の置換を有するものが含まれる米国特許第6737056号。そのようなFc変異体は、残基265及び297のアラニンへの置換を有する、いわゆるDANAFc変異体を含む、アミノ酸位置265、269、270、297及び327の2以上での置換を有するFc変異体を含む米国特許第7,332,581号。FcRへの改善又は減少させた結合を持つ特定の抗体変異体が記載されている。例えば、米国特許第6,737,056号;国際公開第2004/056312号、及びShieldsetalJBiolChem965916604を参照。ある実施態様において、抗体変異体はADCCを改善する1つまたは複数のアミノ酸置換、例えば、Fc領域の位置298、333、及び/又は334における置換EUの残基番号付けを含む。幾つかの実施態様において、改変されたすなわち改善されたか減少したC1q結合及び/又は補体依存性細胞傷害CDCを生じる、Fc領域における改変がなされ、例えば、米国特許第6,194,551号、国際公開第99/51642号、及びIdusogieetalJImmunol16441784184に説明される。増加した半減期を持ち、胎仔への母性IgGの移送を担う、新生児Fc受容体FcRnへの結合が改善された抗体GuyeretalJImmunol117587及びKimetalJImmunol24249が、米国特許出願公開第2005/0014934A1号Hintonらに記載されている。これらの抗体は、FcRnへのFc領域の結合を改善する一つまたは複数の置換を有するFc領域を含む。このようなFc変異体は、Fc領域の残基:238,256,265,272,286,303,305,307,311,312,317,340,356,360,362,376,378,380,382,413,424又は434の1以上の置換、例えば、Fc領域の残基434の置換を有するものが含まれる米国特許第7,371,826号。DuncanWinterNature32273840;米国特許第5,648,260号;米国特許第5,624,821号;及び、Fc領域の変異体の他の例に関しては国際公開第94/29351号も参照のこと。ある実施態様において、抗体の1つ以上の残基がシステイン残基で置換されている、システイン改変抗体、例えば、thioMAbsを作成することが望まれ得る。特定の実施態様において、置換された残基は、抗体のアクセス可能な部位で起きる。それらの残基をシステインで置換することにより、反応性チオール基は、それによって抗体のアクセス可能な部位に配置され、本明細書中でさらに記載されるように、イムノコンジュゲーを作成するために、例えば薬物部分またはリンカー-薬剤部分などの他の部分に抗体をコンジュゲートするために使用することができる。ある実施態様において、一以上の以下の残基がシステインで置換され得る:軽鎖のV205Kabatの番号付け;重鎖のA118EU番号付け;及び重鎖Fc領域のS400EU番号付け。システイン改変抗体は、例えば、米国特許第7521541号に記載のように生成され得る。ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、当技術分野で知られ、容易に入手されている追加の非タンパク質部分を含むように更に改変することができる。抗体の誘導体化に適した部分としては、限定されないが、水溶性ポリマーを含む。水溶性ポリマーの非限定的な例は、限定されないが、ポリエチレングリコールPEG、エチレングリコール/プロピレングリコールの共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキソラン、エチレン/無水マレイン酸共重合体、ポリアミノ酸単独重合体又はランダム共重合体の何れか及びデキストラン又はポリn-ビニルピロリドンポリエチレングリコール、プロピレングリコール単独重合体、プロピレンオキシド/エチレンオキシド共重合体、ポリオキシエチル化ポリオール例えばグリセロール、ポリビニルアルコール及びこれらの混合物を包含する。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドはその水中での安定性のために製造上の利点を有し得る。ポリマーは何れかの分子量のものであってよく、そして分枝鎖又は未分枝鎖であってよい。抗体に結合するポリマーの数は変動してよく、そして、一以上の重合体が結合する場合は、それらは同じか又は異なる分子であることができる。一般的に、誘導体化に使用するポリマーの数及び/又は種類は、限定されないが、向上させるべき抗体の特定の特性又は機能、抗体誘導体が特定の条件下で治療に使用されるのか等を考慮しながら決定することができる。その他の実施態様において、放射線への曝露によって選択的に加熱されてもよい抗体と非タンパク質部分とのコンジュゲートが、提供される。一実施態様において、非タンパク質部分はカーボンナノチューブであるKametalProcNatlAcadSciUSA1021160011605;及びLodeetalCancerRes5829252928;ダウノマイシン又はドキソルビシンなどのアントラサイクリンJeffreyetalBioorganicMedChemLetters16358362TorgovetalBioconjChem16717721NagyetalProcNatlAcadSciUSA97829834DubowchiketalBioorgMedChemLetters1215291532KingetalJMedChem4543364343;及び米国特許第6,630,579号を参照;メトトレキサート、ビンデシン、ドセタキセル、パクリタキセル、ラロタキセル、テセタキセル、及びオルタタキセルなどのタキサン、トリコテセン、及びCC1065を含む一つ以上の薬物とコンジュゲートしている。その他の実施態様において、イムノコンジュゲートは、酵素的に活性な毒素又はその断片にコンジュゲートした、本明細書に記載の抗体を含み、限定されないが、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性断片、緑膿菌からの外毒素A鎖、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデクシンmodeccinA鎖、アルファ-サルシン、アレウリテスフォーディAleuritesfordiiタンパク質、ジアンチンdianthinタンパク質、フィトラカアメリカーナPhytolacaamericanaタンパク質PAPI、PAPII、及びPAP-S、モモルディカチャランチアmomordicacharantiaインヒビター、クルシンcurcin、クロチンcrotin、サパオナリアオフィシナリスsapaonariaoficinalisインヒビター、ゲロニンgelonin、ミトゲリンmitogellin、レストリクトシンrestrictocin、フェノマイシンphenomycin、エノマイシンenomycin及びトリコテセンtricotheceneが含まれる。その他の実施態様では、イムノコンジュゲートは、放射性コンジュゲートを形成するために放射性原子にコンジュゲートした本明細書に記載されるような抗体を含む。様々な放射性同位体が放射性コンジュゲートの生産のために入手可能である。例としては、At211,I131,I125,Y90,Re186,Re188,Sm153,Bi212,P32,Pb212及びLuの放射性同位体を含む。検出のために放射性コンジュゲートを使用するとき、それはシンチグラフィー試験のための放射性原子、例えばtc99m又はI123、又は核磁気共鳴NMR画像化磁気共鳴画像化mriとしても知られているのためのスピン標識、例えば再び、ヨウ素-123、ヨウ素-131、インジウム-111、フッ素-19、炭素-13、窒素-15、酸素-17、ガドリニウム、マンガン又は鉄を含んでよい。抗体と細胞傷害性薬物のコンジュゲートは、様々な二官能性タンパク質カップリング剤、例えば、N-スクシンイミジル3-2-ピリジルチオプロピオネートSPDP、スクシンイミジル4-N-マレイミドメチルシクロヘキサン-1-カルボキシレートSMCC、イミノチオランIT、イミドエステルの2官能性誘導体例えばジメチルアジピミデートHCl、活性エステル例えばジスクシンイミジルズベレート、アルデヒド例えばグルタルアルデヒド、ビス-アジド化合物例えばビスp-アジドベンゾイルヘキサンジアミン、ビスジアゾニウム誘導体例えばビスp-ジアゾニウムベンゾイルエチレンジアミン、ジイソシアネート例えばトルエン2,6-ジイソシアネート及びビス活性フッ素化合物例えば1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼンなど、を使って作成され得る。VitettaetalScience2381098に記載されるように、例えば、リシンイムノトキシンを調製することができる。カーボン-14-標識1-イソチオシアナトベンジル-3-メチルジエチレントリアミン五酢酸MX-DTPAは、放射性ヌクレオチドの抗体へのコンジュゲーションのためのキレート剤の例である国際公開第94/11026号を参照。リンカーは、細胞中に細胞毒性薬物の放出を容易にする切断可能なリンカーであり得る。例えば、酸に不安定なリンカー、ペプチダーゼ過敏性リンカー、光解離性リンカー、ジメチルリンカー又はジスルフィド含有リンカーCharietalCancerRes52127131;米国特許第5,208,020号が使用され得る。本明細書において、イムノコンジュゲート又はADCは、限定されないが、市販の例えばPierceBiotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.Aからの、BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBSMPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、スルホ-EMCS、スルホ-GMBS、スルホ-KMUS、スルホ-MBS、スルホ-SIAB、スルホ-SMPB、及びスルホ-SMPB、SVSBスクシンイミジル4-ビニルスルホンベンゾエートを含むクロスリンカー試薬を用いて調製されるコンジュゲートを特に熟考する。III.診断方法一態様において、本発明は、患者の癌が大量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含む、c-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性がある癌患者を同定するための方法を提供し、ここで、c-metバイオマーカーの発現は、患者がc-metアンタゴニストによる治療に応答する可能性があることを示す。別の態様において、本発明は、患者の癌が、大量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含む、癌患者の予後を決定するための方法を提供し、ここで患者がc-metアンタゴニストで治療されたときの、c-metバイオマーカーの発現は、患者が全生存期間OS及び/又は無増悪生存期間PFSが増加している可能性が高いことを示している。別の態様において、本発明は、患者の癌が多量のc-metバイオマーカーを有するかどうかを決定する工程を含むc-metバイオマーカーの発現を決定するための方法であって、c-metバイオマーカーの発現がタンパク質の発現であって、患者からのサンプルにおいてIHCを用いて決定され、高いc-metバイオマーカーの発現が、中程度のc-met染色強度、中程度/強の混合性のc-met染色強度又は強いc-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞であり、c-metの発現がc-met抗体を用いて決定され、c-metバイオマーカーの発現が、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるときに、増加したOS及び/又はPFSを有する可能性があることを示す方法を提供する。一態様において、本発明は、患者からのサンプルにおいてc-metバイオマーカーの発現を決定し、バイオマーカーの発現のレベルに基づいて癌の医薬を選択することを含む、癌例えばNSCLC患者の治療を選択するための方法に関する。一実施態様において、高レベルのバイオマーカー複数は、患者の治療に使用するためのc-met抗体などc-metアンタゴニストの選択を結果としてもたらす。その他の実施態様において、バイオマーカーが低レベル低いレベルか又は実質的に検出不可能なレベルで存在している場合、患者はc-metアンタゴニスト以外の癌医薬による治療のために選択される。幾つかの実施態様において、サンプルは患者の癌例えばNSCLCのものである。一態様において、本発明は、患者の癌サンプル中のc-metバイオマーカーの発現を決定することを含み、治療効果を最適化する方法を提供する。幾つかの実施態様において、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるとき、高c-metバイオマーカーの検出は、増加したPFS及び/又はOSを意味する。幾つかの実施態様において、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるとき、低c-metバイオマーカーの検出は、減少したPFS及び/又はOSを意味する。幾つかの実施態様において、癌はNSCLCである。一態様において、本発明は、患者の癌サンプル中のc-metバイオマーカーのレベルを決定することを含み、患者の予後を決定する方法を提供する。幾つかの実施態様において、高c-metバイオマーカーは、癌が低c-metバイオマーカーを有する患者に比較して、PSF及び/又はOSが減少した可能性を意味する。幾つかの実施態様において、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるとき、高c-metバイオマーカーの発現は、増加したPFS及び/又はOSを意味する。幾つかの実施態様において、患者がc-metアンタゴニストにより治療されるとき、低c-metバイオマーカーの発現は、減少したPFS及び/又はOSを意味する。幾つかの実施態様において、癌はNSCLCであり、患者がEGFRアンタゴニストと併用してc-metアンタゴニストにより治療されるとき、高c-metバイオマーカーの発現は、増加したPFS及び/又はOSを意味する。幾つかの実施態様において、癌はNSCLCであり、患者がEGFRアンタゴニストと併用してc-metアンタゴニストにより治療されるとき、低c-metバイオマーカーの発現は、減少したPFS及び/又はOSを意味する。一態様において、c-metバイオマーカーの量は、aサンプル例えば患者の癌サンプルの抗c-met抗体によるIHC解析の実施;及びbサンプル中のc-metバイオマーカーの発現の決定を含む方法を用いて決定される。幾つかの実施態様において、c-metのIHC染色強度は基準値に比較して決定される。幾つかの実施態様において、c-metバイオマーカーの発現は、本明細書に開示される、例えば。下のセクションIII.7の表Aにあるc-met染色強度のスコアリング方式を用いて決定される。幾つかの実施態様において、本方法はIHCスコアに基づいく患者の層別化を更に含む。一態様において、c-metバイオマーカー発現の量は、サンプル例えば患者の癌サンプルのc-metバイオマーカーの発現を決定する工程を含む方法を用いて決定され、ここで患者のサンプルは抗c-met抗体を用いたIHC分析に供されている。幾つかの実施態様において、c-metのIHC染色強度は基準値に比較して決定される。幾つかの実施態様において、c-metバイオマーカーの発現は、本明細書に開示される、例えば。下のセクションIII.7の表Aにあるc-met染色強度のスコアリング方式を用いて決定される。幾つかの実施態様において、IHC分析は、その前後のどちらかで形態学的な染色を含む。一態様において、ヘマトキシリンはスライドの細胞核を染色するための用途である。ヘマトキシリンは広く利用可能である。適切なヘマトキシリンの例は、ヘマトキシリンIIベンタナである。明るい青色の核が望まれる場合、ヘマトキシリン染色後にブルーイング試薬が使用され得る。IHCを用いるc-metバイオマーカーの検出は本明細書に開示され、c-met染色強度のスコアリング方式は、本明細書中例えば下のセクションIII.7の表Aに開示される。本明細書に記載されるように、他のバイオマーカーを検出することができる。典型的な他のバイオマーカーが本明細書に開示される。本明細書に開示される発明の何れかの幾つかの実施態様において、本明細書の表Aに従って定められるように、高いc-metバイオマーカーの発現はmet診断陽性臨床状態である。本明細書に開示される発明の何れかの幾つかの実施態様において、本明細書の表Aに従って定められるように、低いc-metバイオマーカーの発現はmet診断陰性臨床状態である。一態様において、c-metバイオマーカーの量は、aサンプル癌患者のサンプルなど上での遺伝子発現プロファイリング、PCR例えばrtPCR、RNN-seq、マイクロアレイ解析、SAGE、MassARRAY技術又はFISHの実施;及びbサンプル中のc-metバイオマーカーの発現の決定を含む方法を用いて決定される。本明細書に記載されるように、他のバイオマーカーを検出することができる。典型的な他のバイオマーカーが本明細書に開示される。患者からのサンプルは、本明細書中のバイオマーカーの1以上の発現について検査される。組織又は細胞サンプルの起源は、新鮮な、冷凍された、及び/又は保存された臓器又は組織サンプル、又は生検又は吸引からの固形組織、血液又は任意の血液成分、脳脊髄液、羊水、腹水、または間質液などの体液、被検体の妊娠期間又は発育の任意の時期に由来する細胞であり得る。組織サンプルは、本質的に組織と自然に混在しない化合物、例えば、防腐剤、抗凝血剤、緩衝剤、定着剤、栄養剤、抗生物質などが含まれる場合がある。腫瘍サンプルの例は、限定されないが、腫瘍生検、腫瘍細胞、血清又は血漿、循環性血漿タンパク質、腹水、腫瘍に由来するか又は腫瘍のような特性を呈する細胞株又は初代細胞培養物、並びに、ホルマリン固定腫瘍サンプル、パラフィン包埋腫瘍サンプル又は凍結腫瘍サンプルなどの保存された腫瘍サンプルを含む。一実施態様において、患者のサンプルはホルマリン固定されたパラフィン包埋FFPE腫瘍サンプル例えば、NSCLC腫瘍サンプル又は乳癌腫瘍サンプルである。サンプルは、癌医薬例えば、抗c-metアンタゴニストなどによる患者の治療に先立って得ることができる。サンプルは原発腫瘍からか又は転移性腫瘍から得ることができる。サンプルは、癌が最初に診断されるか、又は、例えば、腫瘍が転移した後で得ることができる。幾つかの実施態様において、腫瘍サンプルは、肺、リンパ節、肝臓又は脳である。mRNA、タンパク質の発現、又は遺伝子増幅を決定するための様々方法としては、限定されないが、遺伝子発現プロファイリング、定量的リアルタイムPCRqRT-PCRを含むポリメラーゼ連鎖反応PCR、RNA-Seq、FISH、マイクロアレイ解析、遺伝子発現の連続分析SAGE、MassARRAY、プロテオミクス、免疫組織化学IHCなどを含む。好ましくmRNAが定量化される。幾つかの実施態様において、タンパク質の発現が定量化される。そうしたタンパク質分析は、IHCを用いて、例えば患者の腫瘍サンプルについて行うことができる。バイオマーカー発現を決定するための様々な例示的な方法を詳細に説明する。1.遺伝子発現プロファイリング一般に、遺伝子発現プロファイリングの方法は、二つの大きなグループに分けることができる:ポリヌクレオチドのハイブリダイゼーション解析に基づく方法と、生化学的検出又はポリヌクレオチドの配列決定に基づく他の方法である。試料中のmRNA発現を定量化するために当該分野で最も広く用いられている方法には、ノーザンブロット及びインサイツハイブリダイゼーションParker及びBarnesMethodsinMolecularBiology106247283;RNAse保護アッセイHodBiotechniques13852854が含まれる。あるいは、DNA二重鎖、RNA二重鎖、及びDNA-RNAハイブリッド二重鎖又はDNA-タンパク質二重鎖を含む特定の二重鎖を認識できる抗体を用いてもよい。配列ベースの遺伝子発現解析の代表的な方法には、連続遺伝子発現解析SAGE、及びMassivelyParallelSignatureSequencingMPSSによる遺伝子発現解析を含む。2.ポリメラーゼ連鎖反応PCR上に列挙した技術のうち、最も感度が良く最も柔軟性がある定量法はPCRであり、これは、正常組織及び腫瘍組織中の異なった試料集団におけるmRNAレベルを、薬剤処置を含むか又は含まずに、比較し、遺伝子発現のパターンを特徴付けし、密接に関連したmRNA間を識別し、RNA構造を解析するために使用することができる。第一工程は標的試料からのmRNAの単離である。出発材料は典型的には、ヒト腫瘍または腫瘍細胞株、および対応する正常組織または細胞株から単離された全RNAである。従って、RNAは、乳房、肺、大腸、前立腺、脳、肝臓、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、精巣、卵巣、子宮、等を含む様々な原発腫瘍、腫瘍又は腫瘍細胞株から、健常者ドナー由来のプールされたDNAとともに単離することができる。mRNAの供給源が原発腫瘍の場合、mRNAは凍結又はパラフィン包埋されて保存され及び固定された例えば、ホルマリン固定組織試料から、例えば、抽出することができる。mRNA抽出に関する一般的方法は当該分野で良く知られており、Ausubel等,CurrentProtocolsofMolecularBiologyJohnWileyandSonsを含む分子生物学の標準的教科書に開示されている。パラフィン包埋組織からのRNA抽出の方法は、例えば、RuppandLockerLabInvest56A67andDeAndresetalBioTechniques1842044に開示されている。特に、RNAの単離は、Qiagen等の商業的製造者の精製キット、バッファーセット及びプロテアーゼを、製造者の説明書に従って使用することで実施することができる。例えば、培養液中の細胞からの全RNAは、QiagenRNeasyミニカラムを使用して単離できる。他の市販のRNA分離キットには、MASTERPURE登録商標完全DNA及びRNA精製キットCompleteDNAandRNAPurificationKitEPICENTRE登録商標,Madison,Wis.,及びパラフィンブロックRNA単離キットParaffinBlockRNAIsolationKitAmbion,Inc.を含む。組織試料からの全RNAは、RNAStat-60Tel-Testを使用して単離できる。腫瘍から調製したRNAは、例えば、塩化セシウム密度勾配遠心分離によって単離できる。RNAはPCRのテンプレートとならないので、RT-PCRによる遺伝子発現プロファイリングの最初のステップはRNAテンプレートのcDNAへの逆転写と、それに続くPCR反応でのそれの指数関数的な増幅である。2つの最も広く用いられている逆転写酵素はトリ骨髄芽球症ウイルス逆転写酵素AMV-RT及びモロニーマウス白血球ウイルス逆転写酵素MMLV-RTである。逆転写段階は、典型的には、発現プロファイリングの環境及び目的に依存し、特異的プライマー、ランダムヘキサマー、又はオリゴ-dTプライマーを使用してプライムされる。例えば、製造者説明書に従い、GENEAMPTMRNAPCRキットPerkinElmer,Calif.,USAを使用して抽出RNAを逆転写することができる。誘導したcDNAは、ついで、後のPCR反応のテンプレートとして使用できる。PCR工程では、様々な熱安定性DNA依存性DNAポリメラーゼを使用することができるが、典型的には、5’-3’ヌクレアーゼ活性を有するが3’-5’プルーフリーディングエンドヌクレアーゼ活性を欠くTaqDNAポリメラーゼを用いる。よって、TAQMAN登録商標PCRでは、典型的には、Taq又はTthポリメラーゼの5’-ヌクレアーゼ活性を用いて、その標的アンプリコンに結合したハイブリダイゼーションプローブを加水分解するが、5’ヌクレアーゼ活性と同等の任意の酵素を用いることができる。PCR反応にとって典型的なアンプリコンを生成するために2つのオリゴヌクレオチドプライマーを使用する。三番目のオリゴヌクレオチド、又はプローブを、2つのPCRプライマーの間に位置するヌクレオチド配列を検出するために設計する。該プローブは、TaqDNAポリメラーゼ酵素によって伸長せず、レポーター蛍光色素及び消光蛍光色素で標識される。このレポーター色素のどんなレーザー誘導放射も、プローブ上でこの2つの色素が近接して位置している場合には、消光色素によって消光する。増幅反応の間、TaqDNAポリメラーゼ酵素は、テンプレートに依存する形でプローブを切断する。生じたプローブ断片は溶液中で解離し、放出されたレポーター色素からのシグナルは、二番目のフルオロフォアの消光効果とは無関係である。新しい分子が合成される度にレポーター色素の1分子が遊離させられ、消光しないレポーター色素の検出がデータの定量的な解釈の基礎を提供する。TAQMAN登録商標PCRは、例えば、ABIPRIZM7700商品名SequenceDetectionSystem登録商標Perkin-Elmer-AppliedBiosystems,FosterCity,CA,USA、又はLightcyclerRocheMolecularBiochemicals,Mannheim,Germany等の商業的に入手可能な装置を使用しておこなうことができる。好ましい実施態様では、5’ヌクレアーゼ手法は、ABIPRIZM7700登録商標SequenceDetectionSystem等のリアルタイム定量PCR装置ですすめられる。該システムは、サーモサイクラー、レーザー、電荷結合素子CCD、カメラ及びコンピューターからなる。該システムでは、サーモサイクラー上の96-ウェルフォーマットで試料を増幅する。増幅の間、96ウェル全てに関する光ファイバーケーブルを通してレーザー励起した蛍光シグナルがリアルタイムで収集され、CCDカメラで検出される。該システムは、装置を作動し、データを分析するソフトウェアを含む。5’-ヌクレアーゼアッセイのデータは、Ct又は閾値サイクルとして最初に表される。上で検討したように、蛍光値は毎サイクルの間に記録され、増幅反応においてそのポイントまでに増幅した産物の量を表す。蛍光シグナルが統計的に有意であるとして最初に記録されたポイントが閾値サイクルCtである。エラー及び試料と試料間の変化による効果を最小限にするために、通常は内部標準を使用してPCRを実施する。理想的な内部標準は、異なる組織間では一定のレベルで発現し、実験上の処理によって影響を受けない。遺伝子発現のパターンを正規化するために最も頻繁に使用されているRNAは、ハウスキーピング遺伝子であるグリセルアルデヒド-3-リン酸-デヒドロゲナーゼGAPDH及びP-アクチンのmRNAである。PCR技術のより最近の変形例は、二重標識蛍光発生プローブつまり、TAQMAN登録商標プローブによってPCR産物の蓄積を測定する定量的リアルタイムPCRqRT-PCRである。リアルタイムPCRは、各標的配列に対する内部競合体が正規化のために使用される定量的競合PCRと、試料内に含まれる正規化遺伝子、又はPCRのためのハウスキーピング遺伝子を使用する定量的比較PCRの双方に匹敵する。更なる詳細については、例えばHeld等GenomeResearch6986994を参照のこと。RNAの供給源として固定された、パラフィン包埋組織を用い、mRNAの単離、精製、プライマー伸長及び増幅を含む、遺伝子発現のプロファイリングのための代表的なプロトコル工程が、様々な出版された雑誌の記事に記載されている例えば:GodfreyetalJMolecDiagnostics28491SpechtetalAmJPathol15841929。簡単に言えば、代表的なプロセスは、パラフィン包埋腫瘍組織サンプルの10マイクログラム厚切片の切断から始まる。RNAを抽出し、タンパク質やDNAが除去される。RNA濃度を分析した後、RNAの修復および/または増幅ステップが必要に応じて含まれ得、RNAは遺伝子特異的プロモーターを用いて転写され、PCRが続く。本発明の一態様によれば、増幅される遺伝子中に存在するイントロン配列に基づいてPCRプライマー及びプローブが設計される。この実施態様では、プライマー/プローブ設計の第一工程は遺伝子内のイントロン配列の描写である。これは、公に入手可能なソフトウェア、例えばKentWJGenomeRes1265664によって開発されたDNABLATソフトウェア、あるいはその変形形を含むBLASTソフトウェアによって行うことができる。PCRプライマー及びプローブ設計の十分に確立された方法が次の工程として続く。非特異的シグナルを避けるために、プライマーとプローブを設計する場合、イントロン内において反復配列をマスクすることが重要である。これは、反復エレメントのライブラリに対してDNA配列をスクリーニングし、反復エレメントがマスクされる問い合わせ配列を返すベイラー医科大学からオンラインで入手可能なRepeatMaskerプログラムを使用して容易に達成することができる。ついで、マスクされたイントロン配列を使用し、例えばPrimerExpressAppliedBiosystems;MGBアッセイ-バイ-デザインAppliedBiosystems;プライマー3Rozen及びSkaletskyPrimer3ontheWWWforgeneralusersandforbiologistprogrammersInKrawetzSMisenerS編BioinformaticsMethodsandProtocolsMethodsinMolecularBiologyHumanaPressTotowaNJpp365386のような任意の商業的に又は他の好適に入手できるプライマー/プローブ設計パッケージを使用して、プライマー及びプローブ配列を設計することができる。PCRプライマー設計で考慮される因子は、プライマー長、融解温度Tm、及びG/C含有量、特異性、相補的プライマー配列、及び3’末端配列を含む。一般に、最適なPCRプライマーは、一般に17-30塩基長であり、約20-80、例えば約50-60のGC塩基を含む。50°Cから80°Cの間、例えば約50°Cから70°CのTmが典型的には好ましい。PCRプライマー及びプローブ設計のための更なる指針については、その開示全体が出典明示によりここに明示的に援用される例えばDieffenbach等,GeneralConceptsforPCRPrimerDesigninPCRPrimerALaboratoryManualColdSpringHarborLaboratoryPressNewYork1995pp133155Innis及びGelfandOptimizationofPCRsinPCRProtocolsAGuidetoMethodsandApplicationsCRCPressLondon1994pp511;及びPlastererTNPrimerselectPrimerandprobedesignMethodsMolBiol70520527を参照のこと。3.RNN-Seq全トランスクリプトーショットガンシーケンシングWTSSとも呼ばれるRNA-SEQは、サンプルのRNA含有量に関する情報を取得するために、cDNAの配列に対してハイスループットシークエンシング技術を使用することを指す。RNA-Seqを記述している出版物は、WangetalRNASeqarevolutionarytoolfortranscriptomicsNatureReviewsGenetics105763RyanetalBioTechniques458194;及びMaheretalTranscriptomesequencingtodetectgenefusionsincancerNature45897101を含む。4.マイクロアレイ差次的遺伝子発現も、マイクロアレイ技術を用いて同定し、又は確かめることができる。よって、乳癌関連遺伝子の発現プロファイルを、マイクロアレイ技術を使用して新鮮組織又はパラフィン包埋組織の何れかで測定することができる。この方法では、興味あるポリヌクレオチド配列cDNA及びオリゴヌクレオチドを含むをマイクロチップ基板上にプレートし、整列させる。ついで、この整列させた配列を、興味ある細胞又は組織からの特異的DNAプローブでハイブリダイズする。丁度PCR法のように、mRNAのソースは、典型的にはヒト腫瘍又は腫瘍細胞株及び対応する正常な組織又は細胞株からの全RNAである。したがってRNAは様々な原発腫瘍または腫瘍細胞株から単離することができる。mRNAの供給源が原発腫瘍の場合、mRNAは、毎日の臨床の現場で日常的に調製され保持される凍結又はパラフィン包埋されて保存され及び固定された例えば、ホルマリン固定組織試料から、例えば、抽出することができる。マイクロアレイ技術の特定の実施態様では、cDNAクローンのPCR増幅挿入部分を高密度アレイの基板へ塗布する。好ましくは、少なくとも10000のヌクレオチド配列を基板へ塗布する。それぞれ10000エレメントがマイクロチップ上に固定化された、マイクロアレイ遺伝子は、ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーションに適している。蛍光標識cDNAプローブは、興味ある組織から抽出したRNAの逆転写によって蛍光ヌクレオチドを取り込むことで作製できる。チップへ塗布した標識cDNAプローブは、アレイ上の各スポットのDNAと特異性をもってハイブリダイズする。非特異的に結合したプローブを除くためにストリンジェントに洗浄した後、チップを共焦点レーザー顕微鏡によって又はCCDカメラのような他の検出法によってスキャンする。各整列したエレメントのハイブリダイゼーションの定量化によって、対応するmRNA発生量の評価が可能となる。二色蛍光によって、2つのソースのRNAから作製した別々の標識cDNAプローブを2つ1組でアレイへハイブリダイズする。従って、各特定の遺伝子に対応する2つのソースからの転写物の相対発生量が、同時に決定される。小型化したハイブリダイゼーションのスケールによって、非常に多くの遺伝子に関する発現パターンの簡便で迅速な評価が可能となる。このような方法が、細胞当たり少数のコピーが発現する希な転写物を検出するため、また発現レベルにおける少なくともおよそ2倍の違いを再現可能に検出するために必要とされる感度を有していることが示されているSchena等,ProcNatlAcadSciUSA9310649。マイクロアレイ解析は、製造者のプロトコルに従って、例えばAffymetrixGENCHIPTM技術、又はIncyteのマイクロアレイ技術を使用することによって、市販の装置によって実施することができる。遺伝子発現の大規模解析のためのマイクロアレイ法の開発により、様々な腫瘍のタイプにおいて、癌の分類と予後予測の分子マーカーについて体系的に探索することが可能となる。5.遺伝子発現連続解析SAGE遺伝子発現連続解析SAGEは、各転写物に対して個々のハイブリダイゼーションプローブを提供することを要せず、多数の遺伝子転写物の同時の定量解析を可能にせしめる方法である。先ず、タグが各転写物内の独特の位置から得られるとの前提で、転写物をユニークに同定するのに十分な情報を含む短い配列タグ約10-14bpが生成される。ついで、多くの転写物を互いに結合させて長い連続の分子を形成し、これを配列決定して、複数タグの同一性を同時に明らかにすることができる。転写物の任意の集団の発現パターンは、個々のタグの存在量を決定し、各タグに対応する遺伝子を同定することによって定量的に評価することができる。更なる詳細については、例えばVelculescu等Science270484487及びVelculescu等Cell8824351を参照のこと。6.MassARRAY技術MassARRAYSequenom,SanDiego,Calif.の技術は、検出用質量分析MSを用いた遺伝子発現解析の自動化したハイスループットな方法である。この方法によれば、RNAの単離、逆転写およびPCR増幅の後に、cDNAがプライマー伸長に供される。cDNA由来のプライマー伸長産物を精製し、MALTI-TOFMSのサンプル調製に必要な成分があらかじめロードされているチップアレイ上に分配される。反応物に存在する様々なcDNAが、得られた質量スペクトルのピーク面積を分析することによって定量される。7.免疫組織化学法免疫組織化学法IHCはまた本発明のマーカーの発現レベルを検出するのに適している。組織切片の免疫組織化学的染色は、サンプル中のタンパク質の存在を評価又は検出するの信頼性の高い方法であることが示されている。免疫組織化学技術は、一般的に発色法又は蛍光法により、インサイツで細胞の抗原を探索し、可視化する抗体を利用する。よって、抗体又は抗血清、好ましくはポリクローナル抗血清、最も好ましくは各マーカーに特異的なモノクローナル抗体が発現の検出に使用される。下に更に詳細に議論されるように、抗体は、例えば、放射標識、蛍光標識、例えばビオチン等のハプテン標識、又は西洋ワサビペルオキシダーゼ又はアルカリホスファターゼのような酵素によって、検出することができる。あるいは、未標識一次抗体が、抗血清、ポリクローナル抗血清又は一次抗体に特異的なモノクローナル抗体を含む、標識二次抗体との関連で使用される。免疫組織化学プロトコル及びキットは当該分野でよく知られており、商業的に入手可能である。IHCの2つの一般的な方法が利用可能である;直接アッセイ及び間接アッセイ。第一ののアッセイによれば、標的抗原への抗体の結合が直接的に決定される。この直接的なアッセイは、更なる抗体相互作用無しに可視化することができる標識試薬、例えば蛍光タグ、酵素標識一次抗体などを使用する。典型的な間接的なアッセイでは、非結合型一次抗体が抗原に結合し、その後、標識二次抗体が一次抗体に結合する。二次抗体が酵素標識に結合されると、発色性又は蛍光基質が抗原の可視化を提供するために添加される。複数の二次抗体が一次抗体上の異なるエピトープと反応する可能性があるため、シグナル増幅が発生する。免疫組織化学のために使用される一次及び/又は二次抗体は、典型的には、検出可能な部分で標識される。以下の種類に通常分類できる多くの標識が利用可能である:aラジオアイソトープ、例えば35S、14C、125I、3H及び131I。抗体は例えばImmunologyVolumes1and2Coligenら編WileyInterscienceNewYorkNewYorkPubsのCurrentProtocolsに記載される技術を用いて放射性同位体にて標識することができ、放射能はシンチレーション計測器を用いて測定することができる。bコロイド金粒子c希有土類キレートユウロピウムキレート、テキサスレッド、ローダミン、フルオレセイン、ダンシル、リサミン、ウンベリフェロン、フィコクリセリンphycocrytherin、フィコシアニン又はSPECTRUMORANGE登録商標及びSPECTRUMGREEN登録商標などの市販のフルオロフォア及び/又は上記の何れか一ないしは複数の誘導体を含むが、これらに限定されるものではない蛍光標識。蛍光標識は、例えば、上記のImmunologyのCurrentProtocolsに開示される技術を用いて抗体にコンジュゲートすることができる。蛍光は、蛍光計を用いて定量化することができる。d様々な酵素基質標識が利用可能であり、米国特許第4,275,149号はこれらの幾つかの概説を提供する。一般に、酵素は、様々な技術を用いて測定することができる発色性基質の化学変化を触媒する。例えば、酵素は、分光測光法で測定することができる基質の変色を触媒するかもしれない。あるいは、酵素は、基質の蛍光又は化学発光を変えうる。蛍光の変化を定量化する技術は上記の通りである。化学発光基質は、化学反応によって電子的に励起され、測定することができる例えば化学発光計測器を用いてか、又はエネルギーを蛍光アクセプターに与える光を発しうる。酵素標識の例には、ルシフェラーゼ例えば、ホタルルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ;米国特許第4,737,456号、ルシフェリン、2,3-ジヒドロフタルアジネジオンdihydrophthalazinediones、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ウレアーゼ、西洋わさびペルオキシダーゼHRPOなどのペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、サッカライドオキシダーゼ例えばグルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ及びグルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ、複素環のオキシダーゼ例えばウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼ、ラクトペルオキシダーゼ、ミクロペルオキシダーゼなどが含まれる。抗体に酵素をコンジュゲートする技術は、OSullivanらMethodsforthePreparationofEnzymeAntibodyConjugatesforuseinEnzymeImmunoassayinMethodsinEnzymAcademicpressNewYork73147166201を参照。任意のブロック工程の後に、一次抗体が組織試料中の標的タンパク質抗原と結合するような好適な条件下と十分な時間、組織切片を一次抗体に曝露させる。これを達成するための好適な条件は慣例的な実験によって決定できる。試料に対する抗体の結合の範囲は、上で議論された検出可能な標識の何れか一つを用いて決定される。好ましくは、標識は、3,3’-ジアミノベンジジンクロモゲンなどの色素生産性基質の化学変化を触媒する酵素標識例えばHRPOである。好ましくは、酵素標識は、一次抗体例えば、一次抗体はウサギポリクローナル抗体であり、二次抗体はヤギ抗ウサギ抗体であるに特異的に結合する抗体にコンジュゲートさせる。こうして調製される検体はマウントしてカバーグラスをかけてもよい。その後、例えば顕微鏡を使用してスライドの評価が決定される。その前か又はその後のいずれかで、IHCが形態学的染色と組み合わされても良い。脱パラフィン後、スライドにマウントされた切片が、評価のために形態学的染色により染色され得る。使用される形態学的染色は、組織切片の正確な形態学的評価を提供する。切片は、異なる細胞成分を明瞭に染色する一以上の色素の各々で染色され得る。一態様において、ヘマトキシリンはスライドの細胞核を染色するための使用である。ヘマトキシリンは広く利用可能である。適切なヘマトキシリンの例は、ヘマトキシリンIIベンタナである。明るい青色の核が望まれる場合、ヘマトキシリン染色後にブルーイング試薬が使用され得る。当業者は、染色は、スライドが色素中にとどまる時間の長さを増加又は減少させることによって、与えられた組織に対して最適化され得ることを理解するであろう。スライドの調整とIHC処理用の自動化システムは市販されている。Ventana登録商標BenchMarkXTシステムはそうした自動化システムの例である。染色後、組織切片を顕微鏡の標準的な技術により分析することができる。一般的に、病理学者らが異常細胞または正常細胞または特定の細胞型の存在について組織を評価し、目的の細胞型の遺伝子座を提供する。従って、例えば、病理学者らはスライドを精査し、正常細胞例えば、正常肺細胞などと異常細胞例えば、異常又は腫瘍性の肺細胞などを識別する。目的の細胞の遺伝子座を定義するする任意の手段が用いられ得る例えば、XY軸上の座標。IHCで使用するのに適した抗c-met抗体は当該技術分野において良く知られており、SP-44Ventana,DL-21Upstate,ab27492Abcam,PA1-37483PierceAntibodiesを含む。当業者は、追加の適切な抗c-met抗体が、例えば、本明細書に開示されるIHCプロトコルを使用してc-met抗体と比較することにより識別されて特徴付けられ得ることを理解している。種々の染色強度を持つコントロール細胞ペレットが、IHC分析並びにスコアリングのコントロールとして利用することができる。例えば、H441強c-met染色強度;A549中程度のc-met染色強度;H1703弱いc-met染色強度,HEK-293293弱いc-met染色強度;およびTOV-112D陰性c-met染色強度又はH1155陰性c-met染色強度。幾つかの実施態様において、本明細書の図1及び/又は2が典型的なc-metのIHCスコアリング強度のために参照される。幾つかの実施態様において、図1は、例えば、下の表Aのスコアリング方式に従った、典型的な0、1、2及び3c-metIHCのスコアリング強度を示す。幾つかの実施態様において、図2は、例えば、下の表Aのスコアリング方式に従った、典型的なc-metIHCのスコアの0、1、2、及び3を示す。c-met免疫組織化学プロトコル及びスコアリング方式は本明細書に例示される。c-met染色強度の判定基準は表Aに従って評価することができる。幾つかの実施態様において、臨床的Met診断陽性とMet診断陰性の区分は以下のように定義される。Met診断陽性:IHCスコアが2又は3表Aに定義される、及びMet診断陰性:IHCスコアが0又は1表Aに定義される。幾つかの実施態様において、関連した高c-metバイオマーカーは、IHCスコアが2、IHCスコアが3、又はIHCスコアが2又は3である。幾つかの実施態様において、高いc-metバイオマーカーは、中程度のc-met染色強度、中程度/高c-met染色強度の混合性又は高c-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である。幾つかの実施態様において、高c-metバイオマーカーは中程度又は高c-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である。幾つかの実施態様において、サンプル中で少なくとも50の腫瘍細胞が分析される。幾つかの実施態様において、サンプル中で少なくとも10、20、30、40、50、60、または70又はそれ以上の腫瘍細胞が分析される。幾つかの実施態様において、本明細書の表Aに従って定められるように、高いc-metバイオマーカーの発現はmet診断陽性met診断陽性臨床状態である。幾つかの実施態様において、低c-metバイオマーカーは、IHCスコアが0、IHCスコアが1、又はIHCスコアが0又は1である。幾つかの実施態様において、低いc-metバイオマーカーは陰性c-met染色であり、50未満の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度、又は50以上の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度であるが、50未満の腫瘍細胞が中程度のc-met染色強度又は中程度と強の混合性のc-met染色強度である。幾つかの実施態様において、サンプル中で少なくとも10、20、30、40、50、60、または70又はそれ以上の腫瘍細胞が分析される。幾つかの実施態様において、本明細書の表Aに従って定められるように、低いc-metバイオマーカーの発現はmet診断陰性met診断陰性臨床状態である。8.プロテオミクスプロテオームなる用語は、ある時点でのサンプル例えば組織、生物、又は細胞培養物中に存在するタンパク質の全体として定義される。プロテオミクスは、とりわけ、サンプル中のタンパク質発現の網羅的変化の研究を含む発現プロテオミクスとも称される。プロテオミクスは典型的には次の工程を含む:12-Dゲル電気泳動2-DPAGEによるサンプル中の個々のタンパク質の分離;2例えば質量スペクトル又はN末端配列決定によるゲルから回収された個々のタンパク質の同定、及び3バイオインフォマティクスを使用するデータ解析。プロテオミクス法は、遺伝子発現プロファイリングの他の方法に対する貴重な補充手段であり、単独で又は他の方法と組み合わせて、本発明のマーカーの産物を検出するために使用することができる。9.遺伝子増幅c-met遺伝子の増幅の検出は、当業者に知られているある種の技術を使用して達成される。例えば、比較ゲノムハイブリダイゼーションが、染色体位置の関数としてDNA配列コピー数のマップを作成するために使用され得る。例えば。KallioniemietalScience258818821を参照。c-met遺伝子の増幅は、例えば、c-met遺伝子に特異的なプローブを用いるサザンハイブリダイゼーションにより又はリアルタイム定量PCRによって、検出することもできる。ある実施態様において、c-met遺伝子の増幅の検出は、c-met遺伝子のコピー数を直接評価することにより、例えば、c-met遺伝子にハイブリダイズするプローブを用いることにより達成される。例えば、FISHアッセイが行われ得る。ある実施態様において、c-met遺伝子の増幅の検出は、c-met遺伝子のコピー数を間接的に評価することにより、例えば、c-met遺伝子の外側にあるが、c-met遺伝子と共増幅される染色体領域のコピー数を評価することにより達成される。バイオマーカーの発現はまた、インビボでの診断アッセイを使用して、例えば、検出されるべき分子に結合し検出可能なラベル例えば、放射性同位元素などでタグ付けされた分子例えば抗体を投与し、そのラベルの局在化について患者を外部からスキャンすることにより評価することができる。IV.治療方法一態様において、本発明は、患者が多増加した量のc-metバイオマーカーを有することを見出されている場合、c-metアンタゴニストの治療的有効量を患者に投与することを含む、癌の患者を治療するための方法を提供する。本発明はまた、患者が多量のc-metバイオマーカーを有することが見いだされた場合例えば、患者の癌が、例えばIHCを用いて決定される、高いc-metバイオマーカーを発現する場合、c-metアンタゴニスト例えばMetMAbなどの抗c-met抗体の治療的有効量を患者に投与することを含む、NSCLC患者を治療するための方法に関する。幾つかの実施態様において、NSCLCは扁平上皮癌である。幾つかの実施態様において、NSCLCは腺癌である。幾つかの実施態様において、NSCLCが第二ライン又は第3ラインの局所進行性又は転移性のNSCLCである。幾つかの実施態様において、NSCLCは、少なくとも1回の前の化学療法が奏効しなかった後の局所進行性又は転移性NSCLCである。IHCを用いたc-met発現を決定するための方法が議論され、本明細書に例示される。幾つかの実施態様において、患者の癌はIHCスコアが2、IHCスコアが3、又はIHCスコアが少なくとも22又は3で高c-metを発現することが示されている。幾つかの実施態様において、患者の癌患者の癌からのサンプルは、中程度のc-met染色強度、中程度/強の混合性のc-met染色強度又は強いc-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞を含有することが示されている。幾つかの実施態様において、高c-metバイオマーカーは中程度又は高c-met染色強度を持つ50以上の腫瘍細胞である。幾つかの実施態様において、本明細書に開示された基準はc-metバイオマーカーの状態を高い又は低いとしてスコアリングするために用いられる。更に、本発明は、患者が多量のc-metバイオマーカーを有することが見いだされた場合、c-metアンタゴニスト例えば、MetMAbなどの抗c-met抗体などとEGRFアンタゴニストエルロチニブなどの組み合わせの治療的有効量を患者に投与することを含む、NSCLCを有する患者を治療する方法を提供する。本明細書において治療される患者は望ましくは、c-metバイオマーカーの量が減少した患者に比較して、より大きい無増悪生存期間PFS及び全生存期間OSから恩恵を受ける又は示す可能性があるであろう。典型的なEGFRアンタゴニストが本明細書に記載される。幾つかの実施態様において、NSCLCは、少なくとも1回の前の化学療法が奏効しなかった後の局所進行性又は転移性NSCLCである。本発明は、患者が減少した量のc-metバイオマーカーを有することが見いだされた場合例えば、患者の癌が、例えばIHCを用いて決定される、減少したc-metバイオマーカーを発現する場合、c-metアンタゴニスト以外の癌の治療的有効量を患者に投与することを含む、癌例えばNSCLC患者を治療するための方法に更に関する。幾つかの実施態様において、患者の癌は、c-metを検出可能に発現しないか又はIHCスコアが0、IHCスコアが1、又はIHCスコアが0又は1でc-metを発現する。幾つかの実施態様において、本明細書に開示された基準はc-metバイオマーカーの状態を陰性としてスコアリングするために用いられる。幾つかの実施態様において、患者の癌患者の癌からのサンプルは、陰性c-met染色を含むことが示され、50未満の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度、又は50以上の腫瘍細胞が弱いc-met染色強度又は弱と中程度の混合性のc-met染色強度であるが、50未満の腫瘍細胞が中程度のc-met染色強度又は中程度と強の混合性のc-met染色強度である。本発明の癌医薬は、単独で、または他の癌医薬と組み合わせて使用することができる。例えば、抗c-met抗体例えばMetMAbは、約15mg/kgを3週間毎の投与量で、又は約10mg/kgを隔週の投与量で投与される。例えば、c-met抗体は、少なくとも一の付加的治療薬とともに、例えば、化学療法薬とともに、他のc-metアンタゴニスト他のc-met抗体などとともに、EGFRアンタゴニストエルロチニブなどとともに、又は抗VEGF抗体ベバシズマブなどとともに共投与することができる。c-met抗体は、付加的なc-metアンタゴニストとともに共投与することができる。上記のこうした併用療法は、併用投与2つ以上の治療剤が、同一または別々の製剤に含まれている及び分離投与を包含し、その場合、第一の医薬の投与が、第二の医薬の投与投与の前、同時、及び/又はその後に起きうる。一実施態様において、3週間ごとに約15mg/kgの用量で抗c-met抗体例えばMetMAbが、3週間のサイクルの毎日に150mgの用量でのエルロチニブN-3-エチニルフェニル-6,7-ビス2-メトキシエトキシ-4-キナゾリンアミンと併用で使用される。他の実施態様において、c-metアンタゴニスト例えば、抗c-met抗体は、抗VEGF抗体と化学療法例えば、タキサンと組み合わせて使用される。典型的なプロトコルは、トリプルネガティブ転移性乳癌患者に対して、28日周期の1日目と15日目に10mg/kgの用量で投与される抗c-met抗体例えばMetMAb、28日周期の1日目と15日目に10mg/kgの用量で投与される抗VEGF抗体例えば、ベバシズマブ、及び28日周期の1日目、8日目及び15日目に静脈注射により90mg/m2の用量で投与されるパクリタキセルを投与することである。典型的なプロトコルは、トリプルネガティブ転移性乳癌患者に対して、28日周期の1日目と15日目に10mg/kgの用量で投与される抗c-met抗体例えばMetMAb、及び28日周期の1日目、8日目及び15日目に静脈注射により90mg/m2の用量で投与されるパクリタキセルを投与することである。癌医薬はまた放射線治療と併用して用いることができる。本発明の医薬は、任意の適切な手段によって投与することができ、経口、肺内、および鼻腔内、及び局所治療が所望される場合、病巣内投与が含まれる。非経口注入には、筋肉内、静脈内、動脈内、腹腔内、又は皮下投与が含まれる。投薬は、その投与が短期間か又は長期であるかどうかに部分的に依存し、任意の適切な経路、例えば、静脈内または皮下注射などの注射により行うことができる。限定されないが、様々な時間点にわたる、単一または複数回投与、ボーラス投与、パルス注入を含む様々な投与スケジュールが本明細書で考えられている。疾患の予防又は治療のためには、本発明の抗体の適切な用量単独で使用されるか、又は、一以上の更なる治療的薬剤との組み合わされる場合は治療すべき疾患の種類、抗体の種類、疾患の重症度及び経過、抗体を予防又は治療目的のいずれにおいて投与するか、以前の治療、患者の臨床的履歴及び抗体に対する応答性、及び担当医の判断に依存する。抗体は、患者に対して、単回、又は一連の治療にわたって適切に投与される。1つの典型的な一日当たり用量は上記した要因に応じて約1μg/kgから100mg/kg又はそれ以上の範囲である。数日間以上に渡る反復投与の場合には、状態に応じて、治療は疾患症状の望まれる抑制が起こるまで持続するであろう。しかしながら、他の投与計画は有効でありうる。この治療の進行は、従来技術及びアッセイにより容易にモニターされる。上記の製剤または治療方法のいずれかが、医薬としての抗体の代わりか又は抗体に加えて、本発明のイムノコンジュゲートを用いて行うことができることが理解される。幾つかの実施態様において、患者はIIIB/IV期に2つを上回る前治療を受けなかった。幾つかの実施態様において、患者は、EGFR阻害又は用量の変更を生じる既知のEGFRに関連した毒性により作用することができる治験薬又は市販薬に30日を超えた曝露を受けなかった。EGFR阻害は、限定されないがゲフィチニブ、エルロチニブ、及びセツキシマブを含む。幾つかの実施態様において、患者は、無作為化の前28日以内に化学療法、生物学的療法、放射線療法または治験薬を受けなかった場合によっては、薬剤関連毒性が適切に解決されたとする条件で、キナーゼ阻害剤が無作為化の前2週間以内に用いられる場合がある。幾つかの実施態様において、患者は未治療及び/又は活動性進行しているか又は症候性制御のための抗けいれん薬やコルチコステロイドを必要とするCNS転移を持つ患者ではない。他の患者除外基準は、実施例に記載されており、本発明では、そこに記載されている一以上の除外の使用を意図している。幾つかの実施態様において、患者の癌のサンプルは野生型EGFRを有することが示されている。幾つかの実施態様において、患者の癌のサンプルは野生型EGFRを有することが示されていない。V.製造品本発明の別の実施態様において、癌例えばNSCLC又は乳癌の治療で使用のための製造品が提供される。製造品は、容器とラベルまたは容器上にあるまたは容器に付属するパッケージ挿入物を含む。好適な容器は、例としてボトル、バイアル、シリンジ等を含む。容器はガラス又はプラスチックなどの様々な物質から形成されうる。容器は、活性剤として癌医薬を含む組成物を保持しているか又は含み、かつ無菌のアクセスポートを有し得る例えば、容器は皮下注射針による穴あきストッパーを有する静脈内溶液バッグ又はバイアルであってよい。製造品は、薬学的に許容される希釈バッファー、例えば注射用静菌水BWFI、リン酸緩衝化塩水、リンガー溶液およびデキストロース溶液を含む第二の容器をさらに含んでもよい。製造品には、他のバッファー、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジを含む、商業的およびユーザーの立場から望まれる他の物質のさらに含んでもよい。本発明の製造品はまた、例えばパッケージ挿入物の形で、本組成物が、本明細書におけるバイオマーカーに基づいて癌の治療のために使用されることを示す情報を含む。挿入物またはラベルは、紙媒体又は磁気記録媒体例えば、フロッピーディスクやCD-ROMなどの電子媒体上など任意の形態をとることができる。ラベル又は挿入物はまた、キット又は製造品のキットにおける薬学的組成物及び剤形に関する他の情報を含んでもよい。本発明の一実施態様によれば、薬学的に許容される担体中のc-metアンタゴニスト例えば抗c-met抗体及びc-metアンタゴニストがc-metバイオマーカーの発現にもとづく癌例えばNSCLC患者の治療用であることを示したパッケージ挿入物を一緒にパッケージされて含有する製造品が提供される。本発明はまた、c-metアンタゴニスト例えば抗c-met抗体を含む薬学的組成物と、薬学的組成物がc-metバイオマーカーの発現に基づき癌例えばNSCLC患者を治療するためのものであることを示すパッケージ挿入物をパッケージ中に組み合わせることを含む製造品を製造するための方法に関する。製造品は、薬学的に許容される希釈バッファー、例えば注射用静菌水BWFI、リン酸緩衝化塩水、リンガー溶液及び/又はデキストロース溶液を含む付加的な容器をさらに含んでもよい。製造品には、他のバッファー、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジを含む、商業的およびユーザーの立場から望まれる他の物質のさらに含んでもよい。VI.診断キット本発明はまた、本明細書中で同定するバイオマーカーの任意の1つまたは複数のを検出するのに有用な診断キットに関する。従って、診断キットは、癌患者由来のサンプルにおいて、c-met,k-ras,ALK及びEGFRバイオマーカーの一以上の発現を決定するための一以上の試薬を含み提供される。任意で、キットは、患者がc-metバイオマーカーを高レベルで発現する場合、癌患者を治療するための癌医薬例えば抗c-met抗体などのc-metアンタゴニストを選択するためのキットを使用するための説明書を更に含む。別の実施態様において、説明書は、患者がバイオマーカーを低下したレベルで発現する場合、c-metアンタゴニスト以外又は抗c-met抗体以外の癌医薬を選択するためのキットを使用するためである。VII.広告の方法本明細書の発明はまた、ターゲット層に対して、c-metバイオマーカーの発現に基づいて癌患者を治療するための癌医薬例えば抗c-met抗体の使用を宣伝することを含む、癌医薬を広告するための方法に関する。広告は一般的にはスポンサーが識別され、メッセージが制御された非個人的な媒体を介する有料の通信である。本明細書における目的のための広告は、広報、広報活動、製品の配置、スポンサーシップ、引受業務、及び販売宣伝を含む。該用語はまた、本明細書の発明を購入し、支援し、又は承認する良好なパターンに向かって、大衆を、説得し、情報提供し、宣伝し、動機付けし、あるいは行動を変更するようにアピールするように計画された、印刷通信媒体の何れかに現れるスポンサー提供の情報公告を含む。本明細書中の診断方法の広告や宣伝は、任意の手段によって達成することができる。これらのメッセージを配信するために使用する広告媒体の例としては、放送メディアに現れるメッセージであるコマーシャルを含む、テレビ、ラジオ、映画、雑誌、新聞、インターネット、及び看板を含む。広告はまた、食料品のカートの座席上、空港の通路の壁、バスの側面にあるもの、または電話保留メッセージ、または店舗内のPAシステムで聞くもの、または視覚的にも又は聴覚的にも通信が配置されうる任意の場所を含む。宣伝や広告手段のより具体的な例は、テレビ、ラジオ、映画、ウェブキャスト及びウェビナーなどのインターネット、同時にユーザに届くこように意図されたインタラクティブなコンピュータネットワーク、固定または電光掲示板、およびその他の公共看板、ポスター、雑誌や新聞などの伝統的または電子的な文献、他の報道発信地、プレゼンテーション、又は、例えば、電子メール、電話、インスタントメッセージ、郵便、宅配便、大量一斉メール又はキャリアメール、対面での訪問などによる個別の接触を含む。使用される広告の種類は、到達されるべきターゲト層、例えば、病院、保険会社、クリニック、医師、看護師、及び患者、並びに、コストの考慮、及び医薬と診断の広告を規制する関連法律及び規制など、多くの要因に依存する。広告は、サービスの相互作用及び/又はユーザーの人口統計及び地理的な場所など他のデータによって定義されたユーザの特性評価に基づいて、個別化又はカスタマイズされ得る。材料と方法サンプル:治療前の患者のサンプルが、NSCLCにおけるMetMAbエルロチニブに対するエルロチニブプラセボによる治療の安全性及び予備的活性を評価するために計画された、盲検、第II相無作為化、多施設試験から分析された下記に更に記述。代表的な腫瘍のホルマリン固定パラフィン包埋腫瘍標本又は未染色のパラフィンスライド15スライドの提出が、試験に登録された全患者において必要とされた。免疫組織化学IHC:抗原回復、ブロッキング、及び一次抗c-Met抗体とインキュベーションの前に、ホルマリン固定化されたパラフィン包埋組織切片が脱パラフィン処理された。二次抗体とのインキュベーション及び酵素発色に続いて、カバーガラス装着前に、封入前に対比染色されてアルコールとキシレンのシリーズで脱水した。以下のプロトコールがIHCについて用いられた。VentanaBenchmarkXTシステムが以下の試薬と材料を用いてc-metIHC染色を実施するために用いられた。一次抗体:ベンタナ抗トータルTotalcMETSP44ウサギモノクローナル一次抗体カタログ番号M3444.R検体型:ホルマリン固定パラフィン包埋FFPEサンプル及び様々な染色強度のコントロール細胞ペレット治療される種:ヒト機器:BenchMarkXTエピトープの回復条件:細胞の前処置1CC1、ベンタナ、カタログ番号950-124一次抗体の条件:37°Cで10u/ml/16分希釈剤:ベンタナ抗体希釈バッファーTrisHClバッファー、カタログ番号95119陰性コントロール用のナイーブ抗体:ナイーブウサギIgGを3u/mlベンタナ確認用陰性コントロールのウサギIgG、カタログ番号760-1029検出:ウルトラビューユニバーサルDAB検出キットベンチマーク試薬、ポリマー系、ベンタナカタログ番号760-500を製造業者の説明に従って使用対比染色:ベンタナヘマトキシリンIIカタログ番号790-2208/ブルーイング試薬カタログ番号760-2037ベンチマークXTプロトコールは以下であった:1.パラフィン選択2.脱パラフィン選択3.細胞の前処置選択4.コンディショナ1選択5.穏やかなCC1選択6.標準のCC1選択7.抗体Abインキュベーション温度選択8.37°Cでの抗体インキュベーションAbInc.選択9.滴定選択10.ハンドアプライHandApply、0時間16分のインキュベート11.対比染色Countstain選択12.一ドロップのヘマトシアニンII対比染色Countstainを加え、カバーガラスを装着し、4分間インキュベート。13.対比染色Countstain後選択14.一ドロップのブルーイング試薬対比染色Countstain後を加え、カバーガラスを装着し、4分間インキュベート。15.油を除去するために石鹸水でスライドを洗浄16.水でスライドをすすぐ17.95エタノール、100エタノールとキシレンライカの自動染色プログラム918.カバーガラスを装着IHCによるc-metの発現のスコアリング:腫瘍標本におけるc-met発現の有無は、IHCを用いて評価した。NSCLCにおいてc-met染色強度に広いダイナミックレンジがあり、腫瘍細胞は陰性、弱、中程度、又は強い強度を持っていた。加えて、NSCLC腫瘍組織内におけるc-metの発現はしばしば不均一であり、つまり、腫瘍細胞はサンプル中で異なるレベルのc-metの発現を示した。IHC染色の強度陰性、弱、中程度、又は強と異なるレベルの強度で染色された腫瘍細胞の割合の両方がIHCによるc-metの発現を評価するときに考慮された。met診断陽性腫瘍とmet診断陰性腫瘍を定義するための基準は、非盲検試験前に下記のスコアリングシステムによるIHCにより定義されるように定められた。腫瘍細胞を、c-Metの染色のためにスコア化した。多くの場合、染色はいくつかの細胞質のシグナルM、cを持ち主に膜性であったが、しかしながら、優勢な細胞質染色C、mはまた5-10のサンプルで観察された。染色は、強3、中程度2、弱1、曖昧/-又は陰性-に分類された。強い染色強度は、暗褐色から黒い細胞質、及び/又は類似の強度の肥厚性の暗い膜により特徴付けられた。中程度の染色強度は、褐色の細胞質及び/又は膜によって特徴付けられた。中程度の染色は強いシグナル強度で見られる黒さを欠いており、膜はより薄かった。弱いシグナル強度が淡褐色の細胞質によって特徴付けられた。弱いシグナルは中程度の染色強度で見られる濃い茶色を欠いており、膜はより薄かった。陰性又は曖昧なシグナル強度は、茶色よりも、任意の検出可能なシグナルまたは薄灰色または黄褐色のシグナルよって特徴付けられ、膜染色が増強した証拠は無かった。染色強度の評価に加えて、様々な染色強度/パターンの割合が、不均一なシグナルを持つサンプルで視覚的に評価された。種々の染色強度を持つ以下のコントロール細胞ペレットが、IHC分析並びにスコアリングのコントロールとして含められた。H441強い染色、A549中程度の染色、H1703弱い染色と、TOV-112D-陰性染色又はH1155-陰性染色。肺サンプル用に、気管支上皮が、中程度2の膜染色を示したため、内部コントロールとしても用いられた。アイソタイプコントロール抗体はまた、試験サンプルの基底バックグラウンド染色を決定するためにも使用した。例えばKi-67のような陽性コントロール抗体が、組織の品質を評価するために用いられた。図2は、上記IHCプロトコルに従って調製され、IHCのスコアが、0、1、2、又は3を有するNSCLCの組織サンプルの一例を示す図である。図2に示すように、c-met染色強度は腫瘍の腫瘍部分全体で均一なレベルの強度を有して均質に分布し得るか又は一以上の強度レベルを有して不均一に分布し得る。染色は不均一であって良く、例えば、サンプルは複数の強度レベルを有し得る。図1は、上記のIHCプロトコールに従って調製された典型的なコントロール細胞ペレットを示す。IHC染色を評価した後、IHCスコアは、以下のスコアリングカットオフを持つ少なくとも50の腫瘍細胞の分析に基づいて報告された。血管染色が文書化されたが、しかし、幾つかの生検サンプルにおいて十分な血管系が欠如していることに一部起因し、IHCスコアのためには使用されなかった。臨床的Met診断陽性とMet診断陰性の区分は以下のように定義される。Met診断陰性:IHCスコアが0又は1Met診断陽性:IHCスコアが2又は3明確にするために、本出願は、以下の用語を使用することが留意される。加えて、本出願に関連した特許出願である、2010年8月31日に出願された米国特許出願第61/378,911において、met陽性及びmet陰性なる用語は、それぞれIHCのスコアが2又は3、IHCのスコアが0又は1を言及するために用いられた。臨床試験肺癌は世界的に癌による死亡の第一の原因である:それは、乳癌、大腸癌、腎臓癌、肝臓癌、黒色腫、及び前立腺癌を合わせたものより多くの人々を殺に至らす。毎年、118万の人々が病気の結果として死亡するParkinDMCACancerJClin5574108。肺癌患者の大半は、疾患が進行した段階にあり、体の他の部分に拡散したときに診断される。非小細胞肺癌NSCLCは、全症例のおよそ85を占める、疾患の最も一般的な病態である。進行型ステージIVNSCLCと診断された人々のわずか7.5が5年後に生存していると予測される。NSCLCは、腺癌、扁平上皮癌又は大細胞癌であるとして分類することができる。腺癌はNSCLCのの最も一般的な形態である。二つの主なNSCLCの組織学的サブタイプである、腺癌肺癌の約40を占めるとSCC肺癌の約25を占めるは、類似した治療に対して差次的応答をもたらす固有の生物学的特性を示すという証拠が増えている。ペメトレキセドPemtrexedは、腺癌で活性であるが、SCCにおいては比較的低い有効性を示しているScagliottietal2008JClinOncol26354351Epub2008May27。中心部に位置するSCCを持つNSCLC患者におけるベバシズマブによる治療は、出血リスクの増大をもたらしたSandleretal2006NEnglJMed355254250。最後に、転移性疾患を有するSCC患者は、歴史的にみて腺癌と比較して一層悪い全生存期間を有する。従って、この組織学的サブセットための効果的なレジメンを同定する必要性が残っている。この研究のための元々のプロトコールは、例えば国際公開第2010/045345号に記載されているが、しかし、その研究は後に修正されて以下のように扁平上皮組織構造を持つ50人の患者の登録が追加された。患者は、2つの治療群の何れかに1:1の比率で無作為に割り付けられた:MetMAbエルロチニブに対するエルロチニブプラセボ。全体集団を含む120人の患者が登録されると、合計約80人のSCC患者が本研究に登録されたことを確実にするため、適格性は扁平上皮癌SCC組織構造を持つ患者に制限された。全体集団を含む第一の120人の患者についての無作為化が、喫煙状況、全身状態、及び組織構造で層別化され、次の50人のSCC患者についての無作為化は喫煙状態と全身状態により層別化されるようになった。本研究の間に、研究者を含む、患者と治療する個体は、治験薬MetMAbまたはプラセボによる治療の割り当てに対して盲検化された。2010年6月8日又はそれ以前に得られたこの研究のデータのプロトコール特異的解析n=128患者は、腫瘍がc-metを低レベルで発現する患者はMetMAbからの利益を引き出さないことを示唆した。これらのデータに基づいて、スクリーニング及び研究への新規患者の登録は停止され、試験は以下のように変更された。MetMAbは、治験責任医師の判断で、患者が治験薬から利益を導き出している場合、特定の患者を除いて、c-met診断陰性の腫瘍を有する患者において中止された。疾患の進行以外の理由でMetMAbを中止した、c-metによる診断の腫瘍を持つ患者は、エルロチニブ単剤療法を受け続けることが許容された。プラセボエルロチニブの群に無作為化されたc-metによる診断が陰性である腫瘍を持つ患者は、新鮮な組織生検が疾患の進行で得られ、IHCの結果は腫瘍がc-met診断陽性であることを示した場合、エルロチニブを続けることに加えMetMAbを受けるためにクロスオーバーすることを許容されるだけであった。他の全患者は、プロトコルに従って治療を受け続けた。改訂された研究の主な目的は、Met陽性腫瘍免疫組織化学によって決定されるを持つ患者において、扁平上皮組織構造を持つ患者並びに全患者すなわち、Met陰性腫瘍を持つ患者を含むにおいてエルロチニブプラセボに対するMetMAbエルロチニブの無増悪生存期間PFSを評価することであった。この研究の二次目的は、a扁平上皮組織構造を持つ患者の無増悪生存期間PFSを評価すること;bc-met陽性腫瘍、扁平上皮組織構造を持つ患者、並びに全患者集団において、全RECIST1.0奏効率と反応持続期間を決定すること;bNSCLC患者におけるMetMAbエルロチニブの安全性と耐容性の特性を明らかにすること;cNSCLC患者におけるMetMAbとエルロチニブの両方の最小濃度Cminと最大濃度Cmaxを評価することである。本研究での更なる目的は、a扁平上皮組織構造、c-met陽性腫瘍を持つ患者において並びに全集団において全生存期間を評価すること;b治療群による及びc-met陽性腫瘍を持つ患者、並びに全体においてFDG-PETの奏効率を評価すること;c治療群による及びMet陽性腫瘍、扁平上皮組織構造における、並びに全集団におけるFDG-PET応答者対非応答者における無増悪生存期間PFSを評価すること;d最初の腫瘍評価での固形がんの治療効果判定のためのガイドラインRECISTの1.0応答とPFSとの間の関係を評価すること;eHGF/Met及び/又はEFGRシグナル伝達経路限定されないがIL8と血清HGFを含むに関連する、バイオマーカー又は発現ベースラインにおける変化と応答との間の関係を評価すること;f研究で進行する患者における潜在的な耐性機構を評価すること;及びgc-met陽性腫瘍を持つ患者と全体において病勢進行までの時間を評価することであった。研究計画:この研究は、第二及び第三ラインのNSCLCにおけるMetMAbエルロチニブ対エルロチニブプラセボによる治療の予備的な活性と安全性を評価するために設計されたフェーズII、二重盲検、無作為化、多施設試験であった。およそ40の多国籍な場所からの約120人の組織学的に特定されていない患者が2つの治療群:MetMAbエルロチニブ対エルロチニブプラセボの一つに1:1の比率で無作為化された。全体集団を含む120人の患者が登録されると、合計約80人のSCC患者が本研究に登録されたことを確実にするため、適格性は扁平上皮癌SCC組織像を持つ患者に制限された。全体集団を含む第一の120人の患者に対する無作為化は、喫煙状態非喫煙者と10年以上前に止めた喫煙者対現喫煙者と止めて10年未満の喫煙者、全身状態及び組織構造により層別化され、次の50人のSCC患者は喫煙状況及び全身状態によって層別化されるであろう。各群の治療は、疾患の進行、許容できぬ毒性、又は任意の他の中断基準に至るまで継続した。疾患の進行の際、エルロチニブプラセボ治療群に無作為化された患者は、彼らが適格基準を満たし続けるならば、MetMAbをエルロチニブの継続に加えて受ける選択肢を与えられた。このクロスオーバーから収集された安全性のデータは、仮説作成を目的としてま要約された。上述したように、2010年6月8日またはそれ以前に得られたこの研究からのデータのプロトコル特有な分析n=128人の患者では、腫瘍がc-metの低レベルを発現する患者はMetMAbから利益を得ないことを示唆した。これらのデータに基づいて、スクリーニングと研究への新規患者の登録が停止され、上述のように試験が変更された。研究の期間中、腫瘍の測定、生存状態に関するデータを、PFS、全生存期間OS及び全奏効率ORRの評価のために収集した。CTスキャンは、ベースライン時、及び、最初の4サイクルの間、およそ6週間の間隔ですなわち、MetMAb/プラセボの2回の3週間のサイクルごとで得られた。4サイクル後、ルーチン的なCTスキャンがおよそ9週間ごとMetMAb/プラセボの3サイクルごとに実施された。FDG-PETイメージングは、ベースライン時及びサイクル1の10日~14日で得られる。この研究の経過の最中、画像読取施設IRFでFDG-PETの結果を評価し、FDG-PETイメージングを全参加サイトにて継続すべきかどうか、又はFDG-PETイメージングを受け取ったデータに基づいて少数のサイトに限定されるべきであるかどうかを決定した。幾つかの患者において、探索血清サンプルおよび血漿サンプルを、限定されないがIL-8およびHGFを含む活性の潜在的なマーカーの循環レベルにおける、MetMAbエルロチニブの作用を決定するために収集した。これらおよび他のマーカーを臨床転帰と関連付けることは、予測バイオマーカー、例えば、薬物活性又は治療に対する応答を反映し得る循環マーカーを同定する上で有用である。同意した患者から、血清および血漿用の血液を既定の時刻で集めて、これらの探索マーカーのレベルを評価した。c-met及び/又はEGFRの発現は、腫瘍の治療前のサンプルで決定された。c-met及び/又はEGFRの発現は、IHC及び/又はFISH分析により決定された。EGFRによる療法で治療されるとき東アジアでの生存利益が確立しているため、この研究では、評価可能な試験集団の20以上が東アジアとなることを許容しなかった。評価項目:この試験の主要評価項目は、固形がんの治療効果判定のためのガイドラインRECIST1.0によって定義された無増悪生存期間PFSまたは最後の治療の30日以内のあらゆる原因による死亡であった。この試験の二次的評価項目は以下の通りであった:aMet陽性腫瘍及び全対においてRECIST1.0を用いて決定される奏効率OR部分応答プラス完全応答;およびbORの持続時間。典型的な評価項目は以下を包含した:a癌研究のための欧州機関EORTCの定義に基づいたFDG-PET奏効率;b発生率、:有害事象および重篤な有害事象の性質と重症度:および治験薬投与の最中と後の、生命兆候、身体所見、及び臨床検査結果の変化が監視され;及びc全生存期間無作為化から最後の試験治療の30日以内のあらゆる原因による死亡まで時間。一次および二次の評価項目は、c-met陽性腫瘍、SCC患者、及び全集団において評価される。血清サンプルをMetMAbとエルロチニブの薬物動態および薬物動力学の分析のために収集する。患者の選択基準。成人患者は、彼らが手術不能な局所進行性または転移性ステージIIIb/IVのNSCLC例えば、組織学的検査によって決定を有し、ステージIIIb/IVのNSCLC疾患について少なくとも一の前投薬計画を受けたが二以上の前投薬計画は受けていない場合、この研究に参加する資格があった。組織ブロック推奨又は15の未染色連続スライドで十分生存可能な腫瘍細胞を持つNSCLCの確定診断を可能にし、関連する病理学報告が付随した代表的なホルマリン固定パラフィン包埋腫瘍試料の部位で利用できるものが、無作為化の前に必要であった。細胞学的サンプルまたは細針吸引サンプルは許容可能ではなかった。患者が少なくとも5以上の未染色の連続スライドを提供したか又は腫瘍のコア生検または切除生検の前処置に同意し受ける意志がある場合、患者はまだ適格である可能性がある。細胞学的または細針吸引サンプルは許容可能ではなかった。この研究において、癌の病期分類は、癌のAJCC癌病期分類に関する米国合同委員会マニュアルAmericanJointCommitteeonCancer’sAJCCCancerStagingManualに従った。第一ラインのレジメンステージIIIb/IVについての前に、ステージI-IIIaの疾患のネオアジュバント及び/又はアジュバント療法を受けた患者は、彼らが、ステージIIIb/IVの疾患の第一ラインの治療も受けていた場合、研究への参加に適格であった。幾つかの実施態様において、少なくとも一の化学療法レジメン任意のステージは白金に基づくものであった。RECISTによって決定された患者は、測定可能な疾患を有していなければならない。幾つかの実施態様において、患者は、RESISTによるCTにおける標的病変でもある、治療前のFDG-PETスキャンにおいて、少なくとも一つの測定可能な病変を有していた。幾つかの実施態様において、患者は、治療前の腫瘍サンプルを提供し、RESISTによるCTにおける標的病変でもある、治療前のFDG-PETスキャンにおいて少なくとも一つの測定可能な病変を有していた。幾つかの実施態様において、除外された被験体はステージIIIB/IVに2つを上回る前治療を受けた被験体であった。幾つかの実施態様において、除外された被験体は、EGFR阻害又は用量の変更を生じる既知のEGFRに関連した毒性により作用することができる治験薬又は市販薬に30日を超えた曝露を受けた被験体を含んでいた。EGFR阻害は、限定されないがゲフィチニブ、エルロチニブ、及びセツキシマブを含む。幾つかの実施態様において、除外された被験体は、化学療法、放射線療法又は治験薬を無作為化前の28日以内に受けた被験体任意の薬物関連毒性が十分に消散されている場合、キナーゼ阻害剤を無作為化前の2週間以内に使用することができることを除き、又は未治療及び/又は活動性進行中か又は症状の制御のための抗けいれん薬やコルチコステロイドを必要としているCNS転移を有する被験体を含んでいた。幾つかの実施態様において、脳転移の既往歴のある被験体は、彼らが以下の基準を満たしている限り、研究への参加に適格であった:aRECISTによって定義されたCNSの外部の測定可能な疾患;bCNS指向性治療の完了とスクリーニングの放射線検査の間に暫定的な悪化のX線撮影上の証拠が無いこと;c脳外科手術や定位放射線手術を含むCNS指向性治療;dCNSのX線撮影検査のスクリーニングは放射線治療の終了から4週間以上、及びコルチコステロイドおよび抗けいれん薬の中止から2週間以上であった;e放射線治療と定位放射線手術は、第一日の4週間以上前に完了し、及びf脳外科手術は第一日目の24週間以上前に完了し、脳生検は第一日の12週間以上前に完了した。幾つかの実施態様において、除外された被験体は、無作為化前の最後の6ヶ月以内の心筋梗塞、制御不能な高血圧症抗高血圧の持続血圧が150/100mmHg以上、不安定狭心症、ニューヨーク心臓協会NYHAグレードII以上のうっ血性心不全、薬物治療を要する不安定な症状を伴う不整脈慢性心房性不整脈、すなわち、心房細動または発作性上室性頻拍の患者が適格である:またはグレードII以上の末梢血管疾患;空腹時血清血糖値>200mg/dLによって証明される制御不能の糖尿病;無作為化前に28日以内の大きな外科手術または著しい外傷;試験の過程での大きな外科的処置の必要性の予想;無作為化またはグレードIIまたは無作為にあまり前に解決されていない放射線治療から永続的な悪影響から7または14日以内の局所緩和放射線療法;無作為化前の7又は14日以内の局所緩和放射線療法又は無作為化前にグレードII未満に対して解決されていない放射線治療法からの永続的な有害作用;経口薬の服用不能又は静脈栄養補給または脂質による完全非経口栄養の必要性、又は消化管吸収に影響を与える外科的処置を含む重篤な全身性疾患の既往歴を有する被験体が含まれていた。幾つかの実施態様において、除外された被験体は以下の校正不要の異常な血液学的値の何れかを無作為化前の2週間以内に有する被験体を含んでいた。赤血球輸血後にANC<1,500細胞/L,血小板数<100,000細胞/L,ヘモグロビン<9.0g/dL、その他のベースラインの臨床検査値無作為化前2週間以内に,血清ビリルビン>1.5xULN,血清中クレアチニン>1.5xULN,コントロール不良の高カルシウム血症>11.5mg/dL又は>1.5イオン化カルシウム.幾つかの実施態様において、除外された被験体は、制御不能な糖尿病を有する被験体、及びビスフォスフォネート療法の継続使用を必要とする症候性高カルシウム血症を持つ被験体を含んでいた。幾つかの実施態様において、除外された被験体は、妊娠中または授乳女性;無作為化の前の5年以内に手術又は放射線治療を受けたと推定される他の悪性腫瘍を有する被験体例えば、子宮の上皮内癌、前立腺切除術後の限局性前立腺癌、又は皮膚の基底/扁平上皮細胞癌が医療モニタ-で議論され得る;又は錯乱見当識障害の証拠、又は主要な精神疾患の病歴をを含んでいる。エルロチニブのラベルにおける更なる除外を参照。統計的方法と有効性の解析。一次及び二次の有効性解析は、無作為化された治療群に割り当てられた患者とともに全ての無作為化患者を含んでいた。安全性の解析は、実際に受けたレジメンに関連した治療群に割り当てられた患者とともに、試験治療の少なくとも一投与を受けた全無作為化患者が含まれていた。個体群統計学及びベースラインの特性年齢と性別などが、平均値、標準偏差、中央値、及び連続変数の範囲そして必要に応じてカテゴリ変数に対する割合を使用して要約された。要約は全患者集団によって、及び治療群によって発表された。任意の変数のベースライン値は、試験治療の最初の投与の前の最後の利用可能な値として定義された。カプランマイヤーの方法論が、各治療群についてのPSF中央値の推定に用いられた。層別因子は、CRFのデータが欠損していない限り、無作為化時の対話型音声読みよりシステムによって収集されたデータによってでなく、コンピュータ可読形式CRFによるデータにより決定した。ハザード比すなわち、治療効果の大きさと95信頼区間の推定は、MetMAb治療に対る標識変数を層別化Cox回帰モデルを用いて決定した。全集団の患者におけるPFSについて説明したものと同じ分析方法が、met陽性腫瘍を持つ患者とSCC組織構造を持つ患者に適用された。最後の治療から30日以内に何らかの原因による全ての死亡がPFSの事象として含まれた。客観的反応は、4週間以上離れた連続する2回にて決定された完全又は部分的な応答として定義された。ポストベースラインの腫瘍の評価の無い患者は、非応答者とみなした。客観的反応率および95信頼区間Blyth-Still-Casellaの推定値を、各治療群について計算した。腫瘍の応答速度の差の信頼区間SatnesandSnell1980BergerandBoos1994を計算した。客観的反応を持つ患者について、客観的反応の持続期間とは、最初の反応から、最後の治療の30日以内における任意の原因による死亡又は疾患の進行までの時間として定義された。打ち切りcensoringを扱う方法と分析の方法はPFSについて記載されたのと同じであった。すべての二次有効性エンドポイントを、met陽性腫瘍を持つ患者、SCC組織構造を持つ患者に対して、及び全患者集団によって評価した。試験薬:MetMAbは、c-metに対して指向された公知の組換え、ヒト化、一価モノクローナル抗体である。MetMAbは、単回使用15ccのバイアル中で無菌の液体として供給される。各バイアルは、10mMのヒスチジン酢酸、120nMのトレハロース、0.02ポリソルベート20、pH5.4で、60mg/mlの濃度で10ミリリットル中にMetMAbの600mgを含んでいる。MetMAbのバイアルは2C-8Cで冷蔵され、使用する直前まで冷蔵されたままである。MetMAbは、生理食塩水0.9で希釈の後に、静脈内投与される。エルロチニブTARCEVA登録商標は塩酸塩としてエルロチニブを含有する通常の即時放出錠としてとして提供される。加えて、活性成分、エルロチニブ、錠剤は、ラクトース含水、微結晶性セルロース、デンプングリコール酸ナトリウム、ラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムを含んでいる。25mg、100mg、及び150mgのとエルロチニブを含有する錠剤が入手可能である。プラセボは、250ccの0.9NSS生理食塩水静脈注射IV溶液、0.9を含有していた。研究治療MetMAbの投与量は、3週間のサイクルの第1日目に静脈内注射で15mg/kgであった。スクリーニング時の体重がMetMAbの実際の投与量を決定するために使用された。エルロチニブの投与量は、3週間のサイクルの各日に経口によって150mgであった。エルロチニブについての投与量レベルは、エルロチニブに起因する可能性のある毒性例えば、発疹、下痢のため、100mg最初の削減または50mg2回目の削減へと減少されても良い。METとEGFRのコピー数:METとEGFR遺伝子コピー数は、インサイツハイブリダイゼーションFISHにおける蛍光により評価した。5コピー以上のMET/細胞がFISH陽性として選定されたCappuzzoetalJClinOncol2716679を参照。真のMETの増幅は、10以上の腫瘍細胞におけるMETの15コピー以上の緊密な遺伝子クラスターとして、又は2以上のMET/CEP7比として定義された。METのとEGFRのコピー数の両方が評価される実験では、複数の臨床試験で使用されるスコアリング基準をもとにして腫瘍はMET及びEGFRFISH陽性であった例えば、VarellaGarciaetalJClinPathol629707CapuzzoetalJNCI97643-55を参照:FISH陽性:遺伝子増幅又は高多染色体性、FISH陰性:低多染色体性、三染色体性又は二染色体性、遺伝子増幅:緊密な遺伝子クラスター又は腫瘍細胞中における15コピー以上のMET又はCEP7に対するMetの比が2以上、高多染色体性:腫瘍細胞の40以上において4コピー以上のMET。EGFR、KRAS及びMETの遺伝子型:DNAは、マクロ解剖腫瘍組織スライドから単離した。EGFRおよびKRASの変異をDXS遺伝子型決定キットを用いて評価し、METエクソン14の変異体をDHPLCTransgenomicsInc,OmahaNEにより評価し、METN275Sの多型性をピロシーケンスにより評価した。mRNAプロファイリング:MET、HGF、EGFR、AREG、及びEREGのmRNA発現はFluidigmのプラットフォームを使用して、顕微解剖マクロ解剖腫瘍組織スライドから抽出されたRNAに関して評価した。転写レベルは、■安定して肺組織で発現される2つの基準遺伝子の平均値に対して規格化し、結果は正規化された発現値2-ΔCtとして表される。血漿HGF;治療前に収集された血漿中のHGFレベルが捕捉ELISAによって評価された。2010年6月8日以前のデータカットオフに基づいた分析の結果2009年3月から2010年3月まで第二又は第三ラインのNSCLCに罹患した128人の患者が登録され25のグローバルサイトで無作為化された:aMetMAb15mg/kgIVq3wksとエルロチニブ治療互換的にMEと称するn=64又はbプラセボとエルロチニブ治療互換的にPEと称するn=64。この分析で使用されるデータカットオフの日は2010年6月8日以前であった。患者の性質を表1に示す。患者の個体群統計学を表2に示す。ベースラインの特性は、Metの高い腫瘍51/56.5;PE/ME、突然変異23/23およびEGFR変異11/12.5を持つ患者の有病率を含み、全体ITT集団でよくバランスが取れていた。組織は、121人の患者患者の95におけるMetIHC分析及び112人の患者におけるEGFRおよびKRAS突然変異について評価可能であった。Metの状態によるベースライオン特性を表3に示す。本研究では、組織は患者の100から得られた。95の患者はIDCによるMetの評価において十分な組織を有していた。54の患者はMetが高いNSCLCを有していた。MetMAb及びエルロチニブによる治療は、Metが高いNSCLC患者に対して臨床的に有意義な利益を提供した図3。PFSの利益ハザード比HRが0.56;95CIが0.31、1.02、P=0.05とOSの利益HRが0.55;95CIが0.25、1.16、P=0.11の両方が、MetMAbとエルロチニブで治療されたMetが高い患者において観察された。曲線の早期の持続的な分離が観察された。エルロチニブに対するMetMAbの追加は、エルロチニブプラセボによる治療に比べ、metが高いNSCLC患者において無増悪生存期間及び全生存期間をほぼ倍増させたMEにおけるPFSが12.4週に対してPEにおいて6.4週;MEにおいてOSが7.7週に対してPEにおいて7.4週。エルロチニブプラセボの治療群からの23人の患者はMetMAbにクロスオーバーしており、MEにクロスオーバーした23人の患者のうち12人がMetの高いバイオマーカー発現を持っていた。Metが低いNSCLC患者はMetMAbエルロチニブによる治療から利益を得なかった図4。MetMAbはMetが低いNSCLC患者における進行と死亡のリスクをエルロチニブとプラセボによる治療に対して、増加させた。PFSHR2.01;95CI1.04,3.91;p=0.04およびOSHR3.26;95CI1.20,8.80;p=0.01の両方ともMEコホートにおいていっそう悪かった。MetMAbとエルロチニブで治療されたおよそ70のMetの低い患者が最初の評価によって進行していた第6週でのCATスキャン。全集団におけるPFSとOS図5。PFSとOSは全集団において、MetMAbエルロチニブ治療群及びプラセボエルロチニブ治療群において有意に違いは無かった。MetMAbエルロチニブの治療は、プラセボエルロチニブの治療に比べて全集団において利益を示さなかった。全体同じ意味で治療する意図又はITTと称す集団におけるPFSおよびOSに対するHRは、1.0995CI0.71,1.67;p=0.70および1.0995CI0.62,1.91;p=0.76であった。PFS中央値とOS中央値は、類似疾患の設定で以前に報告されたと一致していた。エルロチニブプラセボの治療群からの23人の患者はMetMAbエルロチニブの治療に対してクロスオーバーしていた。奏効率は、エルロチニブプラセボn=34.7、エルロチニブMetMAbn=46.3。PFSはサブグループで調べた図6。MetIHCの状態が3と2の患者は、MetMAbエルロチニブ治療の利益を示し、状態3の患者はより大きな利益を示した。MetIHCの状態が0と1の患者は、MetMAbエルロチニブ治療から利益を得なかった。状態0の患者は状態0の患者よりもMetMAbエルロチニブにおいて悪かった。MetMAbエルロチニブ治療の選択的な利益は、組織構造区分非扁平上皮対扁平上皮、喫煙経歴、ECOGCC、EGFR変異またはKras変異を含む他のサブグループにおいて観察されなかった。図9は、Metが高い患者におけるPFSのサブグループ分析を示す。OSはサブグループでも調べた図7。PFSの結果に類似して、Metが高いIHCの状態が3と2の患者は、MetMAbエルロチニブ治療の利益を示し、状態3の患者はより大きな利益を示した。Metが低いIHCの状態が0と1の患者は、MetMAbエルロチニブ治療から利益を得なかった。状態0の患者は状態0の患者よりもMetMAbエルロチニブにおいて悪かった。MetMAbエルロチニブ治療の選択的な利益は、組織構造区分非扁平上皮対扁平上皮、喫煙経歴、ECOGCC、EGFR変異またはKras変異を含む他のサブグループにおいて観察されなかった。図10は、Metが高い患者におけるOSのサブグループ分析を示す。図11と12は、Metが低い患者におけるPFSとOSのサブグループ解析をそれぞれ示す。既知のEGFR変異を持つ患者を除き、全生存期間もまたMetが高い集団で分析された。MetMAbエルロチニブ治療の利益の程度プラセボエルロチニブに対してOSHR=0.55、95CI0.26、1.20、P=0.13は、既知のEGFR変異を有する患者を含むMetが高い集団における全生存期間とほぼ同等であった。従って、Metが高い患者におけるMetMAbエルロチニブからの利益はEGFR変異の状態によって駆動されなかった。Metの状態による主な予後変数を表4に示す。Metの発現は悪い転帰の予後であった図8。エルロチニブのプラセボによる治療を受けた患者の分析では、Metが高い患者は進行のリスクが増加しておりHR=1.73、PFS中央値は6.4週間、Metが低い患者PFS中央値が11.4週、OS中央値が9.2週に比べて、ほぼ倍増した死のリスクHR=2.52、7.4週間のOS中央値を抱えていた。従って、Metの発現は、エルロチニブで治療された第二または第三ラインのNSCLC患者において、進行と生存についての予後因子である。Metが高い患者はエルロチニブで治療されたときに悪化したが、一方Metが低い患者はエルロチニブで治療されると良好であった。進行のパターン標的の増殖対新たな病変は治療群間で、およびmetの状態によって同等であった表5。進行のパターン標的の増殖対新たな病変は治療群間で、およびMetの状態により同等であった。ORRの有効性解析が表6に示されている。Metの状態による治療に対する曝露を表7に示す。安全性:エルロチニブMetMAbによる治療は十分に容認された。表8は、本研究で観察され、10を超える頻度で報告された、全有害事象を関連に関わらず示す。エデマ主にグレード1~2の例外を除いて、エルロチニブMetMAbについての全毒性はエルロチニブプラセボに匹敵した。表9は、本研究で観察されたグレード3~5の全ての有害事象頻度>5を示す。グレード5の事象は無かった。Metが高い亜集団とMetが低い亜集団の両方の治療群間で、発疹、下痢、疲労は同等であった。グレード3の有害事象の発生率は、Metが高い治療群においてME対PEで似ていた54対53;しかしながら、グレード3の有害事象の発生率は、Metが低い群においてME治療群で高かったPE治療群で52対35。安全性の要約が表10に示される。結論抗c-met抗体のMetMAbは、Met受容体の選択的かつ強力な阻害剤であった。Metの高発現はプラセボで処置された患者において悪い転帰と関連していた。エルロチニブMetMAbの併用による治療は、Metが高いNSCLC患者に利益をあたえた。エルロチニブMetMAbで治療されたMetが低いNSCLC患者に対する悪い転帰は、有害事象により説明することができない。エルロチニブMetMAbは十分に容認さされ、新たな有意な安全上の知見はなかった。全集団に対するMetが高いNSCLC患者についての結果は、診断を用いるすることの重要性を強調している。2010年11月15日以前のデータカットオフに基づいた最終分析2009年3月から2010年3月まで第二又は第三ラインのNSCLCに罹患した128人の患者が登録され25のグローバルサイトで無作為化された:aMetMAb15mg/kgIVq3wksとエルロチニブ治療互換的にMEと称するn=64又はbプラセボとエルロチニブ治療互換的にPEと称するn=64。この分析で使用されるデータカットオフの日は2010年11月15日であった。患者の性質を表11に示す。患者の個体群統計学を表12に示す。ベースラインの特性は、Met診断陽性腫瘍51/56.5;PE/ME、突然変異23/23およびEGFR変異11/12.5を有する患者の有病率を含み、全体ITT集団でよくバランスが取れていた。組織は、121人の患者患者の95におけるMetIHC分析及び112人の患者におけるEGFRおよびKRAS突然変異について評価可能であった。Metの状態によるベースライオン特性を表13に示す。本研究では、組織は患者の100から得られた。95の患者はIDCによるMetの評価において十分な組織を有していた。54の患者はMetが高いNSCLCを有していた。MetMAb及びエルロチニブによる治療は、Met診断陽性NSCLC患者に対して統計学的に有意で臨床的に有意義な利益を提供した図13。PFSの利益ハザード比HRが0.53;95CIが0.28-0.99、P=0.04とOSの利益HRが37;95CIが0.19-0.72、-0.72、P=0.002の両方が、MetMAbとエルロチニブで治療されたMet診断陽性患者において観察された。曲線の早期の持続的な分離が観察された。エルロチニブに対するMetMAbの追加は、死亡のリスクがほぼ3倍減少する結果となった。MetMAbエルロチニブMEで治療された患者におけるPFS中央値は2.9月であるのに対し、プラセボエルロチニブPEで治療された患者では1.5月であった;MetMAbエルロチニブで治療された患者のOSは12.6月であるのに対し、プラセボエルロチニブで治療された患者では3.8月であった。Met診断陰性NSCLC患者はMetMAbエルロチニブによる治療から利益を得なかった図14。MetMAbはMetが低いNSCLC患者における進行と死亡のリスクをエルロチニブとプラセボによる治療に対して、増加させた。PFSの中央値HR1.82;95CI0.99-3.32;p=0.05およびOSの中央値HR1.78;95CI0.79-3.99;p=0.16の両方ともMetMAbエルロチニブのコホートにおいていっそう悪かった。MetMAbとエルロチニブで治療されたおよそ70のMetの低い患者は最初の評価によって進行していた第6週でのCATスキャン。全集団におけるPFSとOSを図15に示す。PFSとOSは全集団において、MetMAbエルロチニブ治療群及びプラセボエルロチニブ治療群において有意に違いは無かった。MetMAbエルロチニブの治療は、プラセボエルロチニブの治療に比べて全集団において利益を示さなかった。全体同じ意味で治療する意図又はITTと称す集団におけるPFSおよびOSに対するハザード比は、1.0995CI0.73,-1.62;p=0.69および0.895CI0.5,-1.3;p=0.76であった。PFS中央値とOS中央値は、類似疾患の設定で以前に報告された知見と一致していた。OSはサブグループでも調べた図16。Met診断陽性IHCの状態が3と2の患者は、MetMAbエルロチニブ治療の利益を示し、状態3の患者はより大きな利益を示した。Met診断陰性IHCの状態が0と1の患者は、MetMAbエルロチニブ治療の利益を受けず、状態0の患者は状態1の患者よりもMetMAbエルロチニブで悪化した。MetMAbエルロチニブ治療の選択的な利益は、組織構造区分非扁平上皮対扁平上皮、喫煙経歴、ECOGCC、EGFR変異またはKras変異を含む他のサブグループにおいて観察されなかった。図17は、Met診断陰性患者におけるOSのサブグループの分析を示す。全生存はまた患者の主な亜集団にて分析された:METFISH陽性患者5コピー以上のMETとして定義される、Met診断陽性/METFISH陰性、Met診断陽性/EGFR野生型、およびMET診断陽性/METFISH陰性/EGFR野生型図18。MetMAbをエルロチニブに追加する利点はMETFISH陽性患者に排他的でなく、METFISH陰性/Met診断陽性患者でも観察され、IHCはMetMAbからの利益のより敏感な予測子であることを示唆している。Met診断陽性患者におけるMetMAbエルロチニブからの利益はEGFR変異の状態によって駆動されなかった。Metの状態による主な予後変数を表14に示す。Metの発現は悪い転帰の予後であった図19。エルロチニブのプラセボによる治療を受けた患者の分析では、Met診断陽性患者は進行のリスクが増加しておりHR=1.7、PFS中央値は1.5月、Met診断陰性患者PFS中央値が2.7月、OS中央値が15.3月に比べて、死亡のリスクの増大HR=3.8;OSが3.8月を抱えていた。従って、Metの発現は、エルロチニブで治療された第二または第三ラインのNSCLC患者において、進行と生存についての予後因子である。Met診断陽性患者はエルロチニブで治療されたときに悪化したが、一方Met診断陰性患者はエルロチニブで治療されると良好であった。安全性:エルロチニブMetMAbによる治療は十分に容認さされた。安全性のデータが表15に要約される。MetMAbの添加は、末梢性浮腫を除いて、診断される集団の両方において任意の特定の有害事象の頻度を10以上実質的に増加させず、このことはMet診断陽性及び診断陰性の集団におけるMetMAb治療群において高かった。MetMAb治療は、MetMAbエルロチニブにおけるMet診断陽性患者の多くの割合が有害事象のために中止となり、MetMAbエルロチニブにおけるMet診断陰性患者がグレード3以上の有意な有害事象を有していたが、Metの診断状態に関わらず、実質的に新たな毒性を加えたり、既知のエルロチニブの毒性を悪化させなかった。腫瘍の増殖及び疾患の進行:腫瘍増殖率は、サイクル2におけるMetの状態による治療群間で有意な違いは無く、その時点までに大半のPFSの事象が生じていた。MetMAbエルロチニブ治療の全生存治療効果はまた、met陽性としてスコア化された患者を定義するため、患者において異なるIHCスコアリング方式を用いて評価された。IHC染色強度が中程度2又は高い310以上の腫瘍細胞のそれほど厳密でないカットオフ10Met診断陽性IHC染色強度が中程度2又は高い390以上の腫瘍細胞のより厳密なカットオフ90Met診断陽性患者のサブセットにおける治療効果の推定は、95信頼区間を含む無成層のコックスモデルを用いてハザード比として表した。この解析の結果を図21に示す。カットオフとして10を使用するとき、10Met診断陽性として選択された患者におけるHRn=87は0.52で95CIが0.30,0.92であった。50をカットオフとして用いるときすなわち、50以上の腫瘍細胞が中程度2又は高い3IHC染色強度を持ち、Met診断陽性として選択された患者におけるHRn=66は0.38で95CIが0.20、0.71であった。カットオフとして90を使用するとき、90Met診断陽性として選択された患者n=47におけるHRは0.30で95CIが0.14,0.64であった。a10Met診断陽性として、かつb50カットオフを用いてMet診断陽性でないとして選択された患者においてn=21、HRは0.28で、95CIは0.53、15.2であった。a50カットオフを用いて10Met診断陽性として、かつb90Met診断陽性でないとして選択された患者においてn=19、HRは0.75で、95CIは0.24、2.42であった。異なるIHCのスコアリング方式の本詳細解析は、IHCによるMetの中程度2又は高3強度での50以上の腫瘍細胞の染色として、Met診断陽性の定義の使用を支持している。結論抗c-met抗体のMetMAbは、Met受容体の選択的かつ強力な阻害剤であった。Metの高発現はプラセボで処置された患者におけるより悪い転帰と関連していた。エルロチニブMetMAbの併用による治療は、Met診断陽性NSCLC患者に利益をあたえた。エルロチニブMetMAbで治療されたMet診断陽性NSCLC患者に対する悪い転帰は、有害事象により説明することができない。エルロチニブMetMAbは十分に容認さされ、新たな有意な安全上の知見はなかった。全集団に対するMet診断陽性NSCLC患者についての結果は、診断を用いるすることの重要性を強調する。OAM4558gからの例示的なバイオマーカー解析:進行した非小細胞肺癌NSCLC患者におけるエルロチニブ±MetMAbのプラセボで制御されたフェーズII試験c-Met及び/又はEGFRシグナル伝達に関連する探索腫瘍バイオマーカーは、アーカイブ腫瘍組織標本からFISH、qRT-PCRまたは種々の変異検出法により測定された。血漿HGFレベルは、ELISAによって測定した。転帰による分析は、Metの臨床診断状態に依存しないで行った。結果:評価可能な腫瘍または血漿検体による患者のベースライン特性は、一般的に同等であった。EGFRおよびKRAS変異:EGFRとKRASのデータはn=11293の患者から得られ、METエキソン14変異体がn=8772の患者から、およびMETN375Ssnpがn=11393の患者から得られた。EGFR変異は、研究上の6/7の客観的応答を予測し、治療群間で同等であった。KRAS変異評価可能な標本の2326/112で検出されたは、EGFR変異評価可能な標本の1213/112で検出されたと互いに排他的であり、ITTまたはMet診断陽性/陰性集団において、MetMAbによる転帰に大きな影響を与えなかった。MET変異体のデータ:METエキソン14欠失変異が評価可能な標本のうち1n=1で同定された。METN375Ssnpが評価可能な標本のうち11n=12で同定された。治療群間の不均衡により、転帰分析は行うことができなかった。METFISH:FISHデータは、n=9675の患者から得た。METFISH陽性であるEGFR-野生型患者では、低い閾値例えば4コピー以上HR=0.89、P=0.82でなく、5コピー以上のMET/細胞により定義されるように、改善された転帰に向けて有意な傾向は無かった。全体的に、FISH陽性患者の74がMet診断が陽性であった。真の遺伝子増幅は、患者の8で検出された。しかしながら、Met診断陽性およびMETFISH陰性であるEGFR-野生型患者は、改善された転帰への傾向を示しOSHR=0.45、P=0.07、FISHを使用してmet遺伝子の増幅を評価することは、MetMAb治療法の恩恵を受ける可能性のある患者の大きなサブグループが潜在的に欠けていることを示している。METとEGFRFISH陽性患者におけるOSにおいて有意な違いは無かった。qRT-PCRによるMETとEGFR経路遺伝子解析、および血漿HGFレベル分析:mRNAのデータは、n=67の患者49から得た図20。腫瘍のMETmRNAレベルとMETIHC臨床スコアとの統計的に有意な関連は観察されなかった;しかし、METmRNA遺伝子又は他の遺伝子の発現は、mRNAデータを持つ患者のサブセットにおいてPFS又はOSを独立に予測しなかった表16。ベースライン血漿HGFデータは、n=96の患者70から得た。治療の前に採取された血漿中で低いHGFタンパク質レベルを有する患者において、改善された転帰が有意ではない傾向が明らかであった。結論:本明細書に示されたデータは、MetMAb治療からのOSの利益の最も強い、敏感な、独立した予測因子としてMetIHCを支持している。この研究が小規模であることを考慮すると、これらのバイオマーカーの更なる探求が必要とされる。前述の発明は、理解を明確にする目的のために例示および実施例によってある程度詳細に説明してきたが、説明や例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。"