対象においてガンを診断する方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドが該試料中に存在するか否かを検出する工程を含み、該Ciz1b変異体ポリペプチドの存在が、該対象がガンを有することを示す、方法。ガンが、肺ガン、リンパ腫、腎臓ガン、乳ガン、肝臓ガン、膀胱ガン、および甲状腺ガンより選択される、請求項1記載の方法。対象における肺ガンの早期検出のための方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドが該試料中に存在するか否かを検出する工程を含み、該試料中の該Ciz1b変異体ポリペプチドの存在が、対象がガンを有することを示す、方法。肺ガンに関して以前に処置された対象における肺ガン再発の検出のための方法であって、以下:i該対象由来の、試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドが該試料中に存在するか否かを検出する工程を含み、該試料中の該Ciz1b変異体ポリペプチドの存在が、該対象における肺ガンの再発を示す、方法。肺結節を伴う対象においてガンを診断する方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドが該試料中に存在するか否かを検出する工程を含み、該試料中の該Ciz1b変異体ポリペプチドの存在が、対象がガンを有することを示す、方法。肺炎または肺ガンのいずれかを有することが疑われる対象において肺ガンを肺炎から鑑別診断する方法であって:i該対象由来の、試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドが該試料中に存在するか否かを検出する工程を含み、該試料中の該Ciz1b変異体ポリペプチドの存在が、対象がガンを有することを示す、方法。ガンが、非小細胞肺ガンNSCLCである、請求項1~6のいずれか一項記載の方法。肺ガンが、小細胞肺ガンSCLCである、請求項1~6のいずれか一項記載の方法。肺ガンが、ステージ0のNSCLCである、請求項7記載の方法。肺ガンが、ステージIAのNSCLCである、請求項7記載の方法。肺ガンが、ステージIBのNSCLCである、請求項7記載の方法。肺ガンが、限定されたステージのSCLCである、請求項8記載の方法。肺結節が、直径約20mm未満である、請求項5記載の方法。肺結節が、約15mm未満である、請求項13記載の方法。肺結節が、10mm未満または約10mmである、請求項14記載の方法。肺結節が、約75mm未満である、請求項15記載の方法。肺結節が、約5mm~約10mmの間である、請求項16記載の方法。対象の肺を撮像する工程を含む、請求項1~17のいずれか一項記載の方法。撮像が、胸部X線、コンピューター断層撮影CTスキャン、磁気共鳴イメージングMRIスキャン、または陽電子放射断層撮影PETスキャンを実施する工程をさらに含み、該撮像が、単独ではガンの該診断のためには不十分である、請求項18記載の方法。撮像が、胸部X線を実施する工程を含む、請求項19記載の方法。撮像が、コンピューター断層撮影CTスキャンを実施する工程を含む、請求項19記載の方法。CTスキャンが、低線量ヘリカルコンピュータ断層撮影CTスキャンである、請求項21記載の方法。撮像が、MRIスキャンを実施する工程を含む、請求項19記載の方法。撮像が、PETスキャンを実施する工程を含む、請求項19記載の方法。肺ガンに関して処置された対象においてガン細胞死を示す方法であって、以下:i該処置の前後に、該対象由来の、試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii該処置の前後に、該生物学的試料中に存在する該Ciz1b変異体ポリペプチドの量を測定する工程を含み、処置後の該Ciz1b変異体ポリペプチドの量の増加が、腫瘍細胞死を示す、方法。Ciz1b変異体ポリペプチドが、アミノ酸配列を含む、請求項1~25のいずれか一項記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチドが、SEQIDNO22のアミノ酸配列を含む、請求項26記載の方法。生物学的試料が、組織、血液、血漿、喀痰、気管支肺胞洗浄液、気管支肺胞擦過物または尿である、請求項1~27のいずれか一項記載の方法。生物学的試料が、組織である、請求項28記載の方法。組織が、肺組織である、請求項29記載の方法。生物学的試料が、血液である、請求項28記載の方法。生物学的試料が、単離されたCTCである、請求項31記載の方法。生物学的試料が、血漿である、請求項28記載の方法。生物学的試料が、喀痰である、請求項28記載の方法。生物学的試料が、気管支肺胞洗浄液である、請求項28記載の方法。生物学的試料が、尿である、請求項28記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチドが、細胞外にある、請求項1~29および33~36のいずれか一項記載の方法。生物学的試料100μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項33記載の方法。生物学的試料50μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項38記載の方法。生物学的試料25μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項39記載の方法。生物学的試料10μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項40記載の方法。生物学的試料5μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項40記載の方法。生物学的試料1μL未満を、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料05~5μLを、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料025~5μLを、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料025~2μLを、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料05~15μLを、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料約1μLを、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在について試験する、請求項41記載の方法。生物学的試料をCiz1b変異体ポリペプチド結合剤と接触させる工程をさらに含む、請求項1~48のいずれか一項記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、抗体またはその抗原結合フラグメントである、請求項49記載の方法。抗体が、ポリクローナルである、請求項50記載の方法。抗体が、モノクローナルである、請求項50記載の方法。抗原結合フラグメントが、Fab、Fab、F2、scFv、またはsdAbより選択される、請求項50記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、核酸アプタマーである、請求項49記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチドアプタマーである、請求項49記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチド模倣体である、請求項49記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、アミノ酸配列SEQIDNO22を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項49~56のいずれか一項記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、SEQIDNO8のアミノ酸配列を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項57記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、エクソン14bおよび15にまたがるエピトープに特異的に結合する、請求項57記載の方法。結合剤が、少なくとも100倍上回る親和性で、SEQIDNO23のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドよりも、SEQIDNO8のアミノ酸配列を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項58記載の方法。結合剤が、少なくとも1000倍上回る親和性で、Ciz1ポリペプチドよりも、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項60記載の方法。結合剤が、少なくとも10000倍上回る親和性で、Ciz1ポリペプチドよりも、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項60記載の方法。結合剤が、SEQIDNO23のアミノ酸配列に特異的に結合しない、請求項49~62のいずれか一項記載の方法。生物学的試料を第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤と接触させる工程をさらに含み、該第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、エクソン14bおよび15にまたがるエピトープ以外のエピトープを認識する、請求項49~63のいずれか一項記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、抗体またはその抗原結合フラグメントである、請求項64記載の方法。抗体が、ポリクローナルである、請求項65記載の方法。抗体が、モノクローナルである、請求項65記載の方法。抗原結合フラグメントが、Fab、Fab、F2、scFv、またはsdAbより選択される、請求項65記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、核酸アプタマーである、請求項64記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチドアプタマーである、請求項64記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチド模倣体である、請求項64記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチドを固体支持体上に固定化する工程をさらに含む、請求項1~71のいずれか一項記載の方法。固体支持体が、ビーズである、請求項72記載の方法。固体支持体が、マイクロタイタープレートである、請求項72記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤を固体支持体上に固定化する工程をさらに含む、請求項64~74のいずれか一項記載の方法。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤の結合によって、それに結合する場合にCiz1b変異体ポリペプチドを固体支持体上に固定化する、請求項75記載の方法。サンドイッチアッセイである、請求項1~76のいずれか一項記載の方法。サンドイッチイムノアッセイである、請求項77記載の方法。ELISAである、請求項1~78のいずれか一項記載の方法。Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、単離されたCiz1b変異体ポリペプチド結合剤。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、アミノ酸配列SEQIDNO22を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項80記載の結合剤。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、SEQIDNO8のアミノ酸配列を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項81記載の結合剤。Ciz1b変異体ポリペプチド結合剤が、エクソン14bおよび15にまたがるエピトープに特異的に結合する、請求項80記載の結合剤。少なくとも100倍上回る親和性で、SEQIDNO23のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドよりも、SEQIDNO8のアミノ酸配列を含むCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項82記載の結合剤。少なくとも1000倍上回る親和性で、Ciz1ポリペプチドよりも、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項84記載の結合剤。少なくとも10000倍上回る親和性で、Ciz1ポリペプチドよりも、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、請求項84記載の結合剤。SEQIDNO23のアミノ酸配列に特異的に結合しない、請求項80~86のいずれか一項記載の結合剤。結合剤が、単離された抗体またはその抗原結合フラグメントである、請求項80~87のいずれか一項記載のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤。ポリクローナルである、請求項88記載の抗体。モノクローナルである、請求項88記載の抗体。Fab、Fab、F2、scFv、またはsdAbより選択される、請求項88記載の抗原結合フラグメント。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、核酸アプタマーである、請求項80~87のいずれか一項記載のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチドアプタマーである、請求項80~87のいずれか一項記載のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤。第2のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤が、ペプチド模倣体である、請求項80~87のいずれか一項記載のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤。請求項80~91のいずれか一項記載のCiz1b変異体ポリペプチド結合剤を発現する、単離された細胞。Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する、単離されたヒト自己抗体。対象においてガンを診断する方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体転写物が該生物学的試料中に存在するか否かを決定する工程を含み、該Ciz1b変異体転写物の存在が、該生物学的試料中でのガン細胞の存在を示す、方法。Ciz1複製ドメインとCiz1固定化ドメインの発現を比較することによって、対象においてガンを診断する方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAを検出する工程;iiiCiz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAを検出する工程;iv該Ciz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含む該mRNAに対する該Ciz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含む該mRNAの相対的な発現レベルを比較する工程を含み、相対的な発現における少なくとも2倍の差が、ガン細胞の存在を示す、方法。Ciz1複製ドメインを含むポリペプチドと、Ciz1固定化ドメインを含むポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断する方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii該Ciz1複製ドメインおよび該Ciz1固定化ドメインを検出する工程;iii該試料中に存在する該Ciz1固定化ドメインに対する該Ciz1複製ドメインの相対的レベルを比較する工程を含み、Ciz1複製ドメインと該Ciz1固定化ドメインの相対的レベルにおける2倍超の差が、ガンの存在を示す、方法。Ciz1複製ドメインとCiz1固定化ドメインの発現を比較することによって、ガン患者の予後を示すための方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的固形組織試料を提供する工程であって、該組織が固形腫瘍に隣接している、工程;iiCiz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAを検出する工程;iiiCiz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAを検出する工程;iv該Ciz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含む該mRNAと、該Ciz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含む該mRNAの相対的な発現レベルを比較する工程を含み、相対的レベルにおける少なくとも2倍の差が、より不良な予後を示す、方法。Ciz1複製ドメインを含むポリペプチドと、Ciz1固定化ドメインを含むポリペプチドの発現を比較することによって、ガン患者の予後を示すための方法であって、以下:i試験に供する単離された生物学的固形組織試料を提供する工程であって、該組織が固形腫瘍に隣接している、工程;ii該組織試料中の該Ciz1複製ドメインおよび該Ciz1固定化ドメインを検出する工程;iii該試料中に存在する該Ciz1複製ドメインと該Ciz1固定化ドメインの相対的レベルを比較する工程を含み、該Ciz1固定化ドメインに対するCiz1複製ドメインの相対的レベルにおける2倍超の差が、より不良な予後を示す、方法。対象におけるガンの診断または予後判定のための方法であって、以下:a対象に由来する生物学的試料中のCiz1タンパク質を定量的に検出する工程;およびb対象の試料中で検出された該Ciz1タンパク質のレベルと、対照試料中で検出されたタンパク質のレベルを比較する工程を含み、対照試料と比較した、対象の試料中で検出されたCiz1タンパク質のレベルの増加が、ガンを伴う対象の指標である、方法。生物学的試料中の抗Ciz1抗体を検出するための方法であって、以下:a抗Ciz1抗体を含む試料を、Ciz1タンパク質抗原を含む試料と、免疫特異的な抗原抗体結合反応が生じうるような条件下で接触させる工程;およびb試料中でのCiz1タンパク質への抗Ciz1抗体の免疫特異的な結合を検出する工程を含む、方法。試料中の抗Ciz1抗体を検出する工程が、試料中の抗Ciz1抗体に対して特異的である抗体に結合しているシグナル生成成分を使用することを含む、請求項103記載の方法。試料中の抗Ciz1抗体の存在が、イムノアッセイによって測定され、以下:a固体基質上に1つまたは複数のCiz1タンパク質を固定化する工程;b固体基質と試料を接触させる工程;およびc試料中の、Ciz1タンパク質に対して特異的な抗Ciz1抗体の存在を検出する工程を含む、請求項103記載の方法。生物学的試料中のCiz1ポリペプチドの存在を検出するための成分を含む、対象におけるガンの診断および予後判定のためのキット。Ciz1ポリペプチドの存在を検出するための成分が、Ciz1結合剤である、請求項106記載のキット。Ciz1ポリペプチドが、Ciz1b変異体ポリペプチドである、請求項106記載のキット。Ciz1ポリペプチドを検出するための成分が、抗Ciz1抗体である、請求項106~108のいずれか一項記載のキット。抗Ciz1抗体が標識された、請求項109記載のキット。標識が、放射性、蛍光、比色、または酵素標識である、請求項110記載のキット。抗Ciz1抗体に免疫特異的に結合する標識二次抗体をさらに含む、請求項109記載のキット。生物学的試料中の抗Ciz1抗体の存在を検出するための成分を含む、生物学的試料中の該抗Ciz1自己抗体の存在を検出するためのキット。成分が、Ciz1抗原である、請求項113記載のキット。Ciz1抗原が標識された、請求項114記載のキット。Ciz1抗原が固相に連結された、請求項113または114記載のキット。Ciz1b変異体mRNAを標的とする、単離されたアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNA。請求項117記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNAまたはshRNA、および薬学的に許容される賦形剤を含む、薬学的組成物。アンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAが、エクソン14b及び15の接合部にまたがるCiz1のヌクレオチド配列を介してCiz1b変異体mRNAを標的とする、請求項118記載の薬学的組成物。細胞においてCiz1b変異体mRNAの発現を低下させる方法であって、b変異体mRNAを発現する細胞を、b変異体mRNAを低下させる量の請求項117記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAと接触させる工程を含む、方法。哺乳動物においてb変異体mRNAの発現を低下させる方法であって、哺乳動物に、b変異体mRNAを低下させる量の請求項117記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAを含む組成物を投与する工程を含む、方法。詳細な説明本発明は、化合物および組成物ならびに前記化合物および組成物を作製する方法およびこれらを使用する方法に関する。本発明の化合物および組成物は、例えば、肺、乳房、結腸、腎臓、肝臓、およびリンパ腫のガンを含む、ガンの処置および診断において有用である。一局面において、本発明は、Ciz1のb変異体転写物のみを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAに関する。別の局面において、本発明は、Ciz1のb変異体転写物のみを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAを含む組成物に関する。別の局面において、本発明は、本発明によるアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAおよび薬学的に許容される賦形剤を含む薬学的組成物に関する。別の局面において、本発明は、Ciz1b変異体転写物の発現レベルを低下させるためにsiRNAまたはshRNAを使用する方法に関する。本明細書において使用される通り、用語サイレンスおよびノックダウンは、遺伝子発現に言及する場合、遺伝子発現における低下を意味する。用語転写物は、転写のRNA産物を指す。一態様において、転写物はmRNAである。本発明はさらに、化学合成によって、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAを作製するためのプロセスに関する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、Ciz1b変異体転写物の発現を検出するために適している。一局面において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、哺乳動物細胞においてCiz1b変異体転写物のレベルを低下させるために適している。本発明によるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、mRNAレベルで遺伝子発現を減少させることによって、Ciz1b変異体mRNAによりコードされるCiz1b変異体タンパク質の発現を減少させるためにさらに適している。本発明のsiRNAまたはshRNAは、Ciz1b変異体転写物のレベルを低下させるために適している。本発明によるsiRNAまたはshRNAは、mRNAレベルで遺伝子発現を減少させることによって、Ciz1b変異体mRNAによりコードされるタンパク質の発現を減少させるためにさらに適している。アンチセンスデザイン:Ciz1b変異体転写物のレベルを低下させるために適したアンチセンスオリゴヌクレオチドは、SEQIDNO7の25~26位のヌクレオチドを含むSEQIDNO7と相補的な少なくとも8つの連続ヌクレオチドを含む12~50ヌクレオチド長の一本鎖オリゴヌクレオチドである。一態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドとSEQIDNO7の間の相補性は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが、SEQIDNO7の25~26位のヌクレオチドを含むSEQIDNO7の配列に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることができるようになるものであり、このストリンジェントなハイブリダイゼーションは、本明細書において、以下のハイブリダイゼーション条件として定義される:400mMNaCl、40mMPIPESpH64、1mMEDTA、70°C。アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾リボヌクレオチド、またはそれらの組み合わせでありうる。アンチセンスオリゴヌクレオチドがRNaseHを介してmRNAを分解するために使用される場合、通常、ヌクレオチドの少なくとも一部はデオキシリボヌクレオチドである。siRNAデザイン:本発明のsiRNAは、1つはアンチセンス鎖でありもう1つはセンス鎖である、核酸の2つの鎖を含む。核酸は、通常、リボヌクレオチドまたは修飾リボヌクレオチドからなるが、核酸はデオキシリボヌクレオチドDNAを含みうる。siRNAは、アンチセンス鎖の全てまたは一部およびセンス鎖の全てまたは一部により形成される二本鎖核酸部分またはデュプレックス領域をさらに含む。センス鎖とデュプレックス領域を形成するアンチセンス鎖の部分は、アンチセンス鎖デュプレックス領域、または単純にアンチセンスデュプレックス領域であり、アンチセンス鎖とデュプレックス領域を形成するセンス鎖の部分は、センス鎖デュプレックス領域、または単純にセンスデュプレックス領域である。デュプレックス領域は、アンチセンス鎖とセンス鎖の間に形成される最初の塩基対で開始し、アンチセンス鎖とセンス鎖の間に形成される最後の塩基対までで終わると定義される。デュプレックス領域のいずれかの側のsiRNAの部分は、隣接領域である。アンチセンスデュプレックス領域のいずれかの側のアンチセンス鎖の部分は、アンチセンス隣接領域である。アンチセンスデュプレックス領域の5のアンチセンス鎖の部分は、アンチセンス5隣接領域である。アンチセンスデュプレックス領域の3のアンチセンス鎖の部分は、アンチセンス3隣接領域である。センスデュプレックス領域のいずれかの側のセンス鎖の部分は、センス隣接領域である。センスデュプレックス領域の5のセンス鎖の部分は、センス5隣接領域である。センスデュプレックス領域の3のセンス鎖の部分は、センス3隣接領域である。相補性:一局面において、アンチセンスデュプレックス領域およびセンスデュプレックス領域は、互いに完全に相補的でありうるが、少なくとも部分的には相補的である。そのような相補性は、ワトソンクリック塩基対合即ち、A:UおよびG:C塩基対合に基づく。siRNAの長さに依存して、アンチセンスデュプレックス領域とセンスデュプレックス領域の間の塩基相補性に関する完全一致は必ずしも要求されないが、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、生理学的条件下でハイブリダイズできなければならない。一態様において、アンチセンス鎖とセンス鎖の間の相補性は完全であるいずれの鎖においてもヌクレオチドミスマッチまたは追加欠失ヌクレオチドがない。一態様において、アンチセンスデュプレックス領域とセンスデュプレックス領域の間の相補性は完全であるいずれの鎖のデュプレックス領域においてもヌクレオチドミスマッチまたは追加欠失ヌクレオチドがない。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域とセンスデュプレックス領域の間の相補性は、完全ではない。本発明のsiRNAまたはshRNAまたは他の関連デザインを使用したRNAiは、アンチセンス鎖の全てまたは一部と、25~26位のヌクレオチド標的核酸または標的配列を含むSEQIDNO7のヌクレオチド配列の一部の間のデュプレックス領域の形成を含む。より具体的には、標的配列は、アンチセンス鎖とデュプレックス領域を形成する、25~26位のヌクレオチドを含むSEQIDNO7の一部であり、アンチセンス鎖とSEQIDNO7の間に形成される最初の塩基対で開始し、アンチセンス鎖とSEQIDNO7の間に形成される最後の塩基対で終わると定義される。アンチセンス鎖とセンス鎖の間に形成されるデュプレックス領域は、アンチセンス鎖と標的配列の間に形成されるデュプレックス領域と同じでありうるが、その必要はない。すなわち、センス鎖は、標的核酸とは異なる配列を有しうるが、アンチセンス鎖は、生理学的条件下で、センス鎖および標的核酸の両方とデュプレックス構造を形成することができなければならない。一態様において、アンチセンス鎖と標的核酸の間の相補性は、完全であるいずれの核酸においてもヌクレオチドミスマッチまたは追加欠失ヌクレオチドはない。一態様において、アンチセンスデュプレックス領域センス鎖とデュプレックス領域を形成するアンチセンス鎖の部分と標的核酸の間の相補性は、完全であるいずれの核酸においてもヌクレオチドミスマッチまたは追加/欠失ヌクレオチドがない。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域と標的核酸の間の相補性は、完全ではない。別の態様において、本発明のsiRNAはデュプレックス領域を含み、ここでアンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域においてヌクレオチドに塩基対合していない1、2、または3ヌクレオチドを有し、ここでsiRNAは、b変異体転写物の発現を低下させるために適している。別の態様において、アンチセンス鎖は、センス鎖と塩基対合しない1、2、または3ヌクレオチドを有し、ここでアンチセンス鎖を含むsiRNAは、b変異体転写物の発現を低下させるために適している。塩基対合の欠如は、塩基間の相補性の欠如即ち、ワトソンクリック塩基対合なしに起因するか、または、バルジもしくはオーバーハングが形成されるように、対応するヌクレオチドがないから、のいずれかであることが理由である。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域およびセンスデュプレックス領域は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズし、ここで、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、400mMNaCl、40mMPIPESpH64、1mMEDTA、70°Cとして定義される。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域および標的核酸は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域ならびにセンスデュプレックス領域および標的核酸の両方は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする。本発明のsiRNAのように、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸と完全に相補的でありうるが、少なくとも部分的に相補的である。アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸の間の塩基相補性に関する完全一致は必ずしも要求されないが、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび標的核酸は、生理学的条件下でハイブリダイズできなければならない。一態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸の間の相補性は、完全であるいずれの鎖においてもヌクレオチドミスマッチまたは追加欠失ヌクレオチドがない。別の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸の間の相補性は、完全ではない。別の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび標的核酸配列は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする。長さ:本発明の局面は、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAを構成する核酸および特定の領域の長さに関する。特定の態様において、本発明は、SEQIDNO7と相補的な少なくとも8つの連続ヌクレオチドを含む、アンチセンスオリゴヌクレオチド12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50ヌクレオチド長に関し、ヌクレオチド25~26を含む。特定の態様において、本発明は、SEQIDNO7と相補的な、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50連続ヌクレオチドを含む、単離アンチセンスオリゴヌクレオチドに関し、ヌクレオチド25~26を含む。特定の態様において、本発明は、SEQIDNO7と相補的な、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50連続ヌクレオチドからなるアンチセンスオリゴヌクレオチドに関し、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、30ヌクレオチド長未満または30ヌクレオチド長に等しく;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも16連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、30ヌクレオチド長未満または30ヌクレオチド長に等しく;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも18連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;このアンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;かつこのアンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、25ヌクレオチド長未満または25ヌクレオチド長に等しく;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも16連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、25ヌクレオチド長未満または25ヌクレオチド長に等しく;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも18連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、18~25ヌクレオチド長であり;このセンス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも16連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、18~25ヌクレオチド長であり;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも18連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々独立して、19~23ヌクレオチド長であり;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも18連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、各々、19~25ヌクレオチド長であり;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも19連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明は、アンチセンス鎖およびセンス鎖を含むsiRNAに関し;ここで、アンチセンス鎖および前記センス鎖は、各々、19~23ヌクレオチド長であり;ここで、センス鎖はセンスデュプレックス領域を含み;ここで、センスデュプレックス領域は、SEQIDNO7のうち少なくとも19連続ヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を含み、ここで、連続ヌクレオチドは、SEQIDNO7のヌクレオチド25~26を含み;ここで、アンチセンス鎖は、アンチセンスデュプレックス領域を含み;ここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と等しいヌクレオチド長を有し;およびここで、アンチセンスデュプレックス領域は、センスデュプレックス領域と相補的なヌクレオチド配列を含む。一態様において、本発明のsiRNAまたはshRNAのアンチセンス鎖は、以下より選択されるヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列を含む:。末端オーバーハングおよび平滑末端:別の局面は、siRNAの末端デザインに関する。本発明のsiRNAは、オーバーハングを含みうるか、または平滑末端でありうる。オーバーハングは、本明細書において使用されるように、当技術分野におけるその通常の慣習的な意味、即ち二本鎖核酸中の相補鎖の末端ヌクレオチドを越えて伸長する核酸の一本鎖部分、を有する。用語平滑末端は二本鎖核酸を含み、両方の鎖は、末端ヌクレオチドが塩基対合しているか否かにかかわらず、同じ位置で終結する。一態様において、平滑末端の末端ヌクレオチドは塩基対合している。別の態様において、平滑末端の末端ヌクレオチドは対合していない。一態様において、本発明のsiRNAは、1つの末端に1、2、3、4、または5ヌクレオチドのオーバーハングおよび他の末端に平滑末端を有する。別の態様において、siRNAは、両方の末端に1、2、3、4、または5ヌクレオチドのオーバーハングを有する。一態様において、siRNAは、両方の末端で平滑末端になっている。別の態様において、siRNAは、センス鎖の5末端およびアンチセンス鎖の3末端によって定義される末端で平滑末端になっている。別の態様において、siRNAは、センス鎖の3末端およびアンチセンス鎖の5末端によって定義される末端で平滑末端になっている。別の態様において、siRNAは、センス鎖およびアンチセンス鎖のいずれかまたは両方の3もしくは5末端での、1、2、3、4、または5ヌクレオチドのオーバーハングを含む。一態様において、siRNAは、アンチセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの3オーバーハングを有し、他の末端で平滑末端になっている。一態様において、siRNAは、センス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの3オーバーハングを有し、他の末端で平滑末端になっている。一態様において、siRNAは、アンチセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの5オーバーハングを有し、他の末端で平滑末端になっている。一態様において、siRNAは、センス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの5オーバーハングを有し、他の末端で平滑末端になっている。一態様において、siRNAは、アンチセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの3オーバーハングおよびセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの3オーバーハングを有する。一態様において、siRNAは、アンチセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの5オーバーハングおよびセンス鎖上に1、2、3、4、または5ヌクレオチドの5オーバーハングを有する。塩基部分への修飾:別の局面は、塩基部分への修飾に関する。本発明の核酸の1つまたは複数のヌクレオチドは、修飾塩基を含みうる。修飾塩基は、1位置でのアデニン、グアニン、シトシン、またはウラシル以外のヌクレオチド塩基を意味する。一態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAは、修飾塩基を含む、少なくとも1つのヌクレオチドを含む。別の態様において、本発明の核酸は修飾ヌクレオチドを含み、ここで、修飾ヌクレオチドは修飾塩基を含み、ここで、修飾塩基は、2アミノアデノシン、26ジアミノプリン、イノシン、ピリジン4オン、ピリジン2オン、フェニル、プソイドウラシル、246トリメトキシベンゼン、3メチルウラシル、ジヒドロウリジン、ナフチル、アミノフェニル、5アルキルシチジン例えば、5メチルシチジン、5アルキルウリジン例えば、リボチミジン、5ハロウリジン例えば、5ブロモウリジン、6アザピリミジン、6アルキルピリミジン例えば、6メチルウリジン、プロピン、クエオシン、2チオウリジン、4チオウリジン、ワイブトシン、ワイブトキソシン、4アセチルシチジン、5カルボキシヒドロキシメチルウリジン、5カルボキシメチルアミノメチル2チオウリジン、5カルボキシメチルアミノメチルウリジン、ベータDガラクトシルクエオシン、1メチルアデノシン、1メチルイノシン、22ジメチルグアノシン、3メチルシチジン、2メチルアデノシン、2メチルグアノシン、N6メチルアデノシン、7メチルグアノシン、5メトキシアミノメチル2チオウリジン、5メチルアミノメチルウリジン、5メチルカルボニルメチルウリジン、5メチルオキシウリジン、5メチル2チオウリジン、2メチルチオN6イソペンテニルアデノシン、ベータDマンノシルクエオシン、ウリジン5オキシ酢酸、2チオシチジンN4エタノシトシン、8ヒドロキシN6メチルアデニン、4アセチルシトシン、5フルオロウラシル;5ブロモウラシル、5カルボキシメチルアミノメチル2チオウラシル、5カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、N6イソペンチルアデニン、1メチルプソイドウラシル、1メチルグアニン、22ジメチルグアニン、2メチルグアニン、3メチルシトシン、N6メチルアデニン、5メトキシアミノメチル2チオウラシル、βDマンノシルクエオシン、5メトキシカルボニルメチルウラシル、2メチルチオN6イソペンテニルアデニン、ウラシル5オキシ酢酸メチルエステル、プソイドウラシル、2チオシトシン、5メチル2チオウラシル、2チオウラシル、4チオウラシル、5メチルウラシル、Nウラシル5オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル5オキシ酢酸、クエオシン、2チオシトシン、5プロピルウラシル、5プロピルシトシン、5エチルウラシル、5エチルシトシン、5ブチルウラシル、5ペンチルウラシル、5ペンチルシトシン、および26ジアミノプリン、メチルプソイドウラシル、1メチルグアニン、1メチルシトシンより選択される。別の局面において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAは、脱塩基ヌクレオチドを含む。用語脱塩基は、本明細書において使用される通り、例えば、33結合または55結合デオキシ脱塩基リボース誘導体のような、1位置の塩基の場所において塩基を欠くまたは他の化学基を有する部分を指す。本明細書において使用されるように、修飾塩基を伴うヌクレオチドは、脱塩基ヌクレオチドを含まない。糖部分への修飾:別の第2の局面は、糖部分への修飾に関する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、またはshRNAの1つまたは複数のヌクレオチドは、修飾リボース部分を含みうる。2OHが置換される2位置の修飾は、アルキル、置換アルキル、アルカリル、アラルキル、F、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、OCN、Oアルキル、Sアルキル、Oアリル、Sアリル、HSアルキルO、Oアルケニル、Sアルケニル、Nアルケニル、SOアルキル、アルキルOSH、アルキルOH、OアルキルOH、OアルキルSH、SアルキルOH、SアルキルSH、アルキルSアルキル、アルキルOアルキル、ONO2、NO2、N3、NH2、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アミノアルキル、アミノアルコキシ、アミノ酸、アミノアシル、ONH2、Oアミノアルキル、Oアミノ酸、Oアミノアシル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキリルアミノ、置換シリル、メトキシエチル、アルケニルおよびアルキニルより選択される非限定的な例を含む。2ヒドロキシルが、例えば、メチレン架橋により、同じリボース糖の4炭素に連結されるロックド核酸LNAは、本発明の2修飾としてさらに含まれる。好ましい置換基は、2メトキシエチル、2OCH3、2Oアリル、2Cアリル、および2フルオロである。一態様において、本発明のsiRNAは、アンチセンス鎖上のヌクレオチド3、5、7、9、11、13、15、および17ならびにセンス鎖上のヌクレオチド4、6、8、10、12、14、および16で2OCH3修飾を含み、ここで、前記アンチセンス鎖は5から3へ番号を付けられ、前記センス鎖は3から5へ番号を付けられる。一態様において、本発明のsiRNAは、アンチセンス鎖上のヌクレオチド7、9、11、および13ならびにセンス鎖上のヌクレオチド8、10、および12で2OCH3修飾を含み、ここで、前記アンチセンス鎖は5から3へ番号を付けられ、前記センス鎖は3から5へ番号を付けられる。一態様において、本発明のsiRNAは、アンチセンス鎖上のヌクレオチド7、9、および11ならびにセンス鎖上のヌクレオチド8、10、および12で2OCH3修飾を含み、ここで、前記アンチセンス鎖は5から3へ番号を付けられ、前記センス鎖は3から5へ番号を付けられる。別の態様において、アンチセンス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25の2デオキシヌクレオチドを含む。別の態様において、センス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25の2デオキシヌクレオチドを含む。別の態様において、アンチセンス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25の2フルオロヌクレオチドを含む。別の態様において、センス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25の2フルオロヌクレオチドを含む。別の態様において、アンチセンス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンス鎖中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンス鎖中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンス鎖中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センス鎖中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス領域中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、アンチセンスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2Oメチルピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2Oメチルプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2デオキシピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2デオキシプリンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のピリミジンヌクレオチドは、2フルオロピリミジンヌクレオチドである。別の態様において、センスデュプレックス隣接領域中のプリンヌクレオチドは、2フルオロプリンヌクレオチドである。リン酸骨格への修飾:別の第2の局面は、リン酸骨格への修飾に関する。本発明の核酸のヌクレオチドの全てまたは一部を、非修飾核酸において見出される通り、ホスホジエステル結合を介して連結してもよい。しかし、本発明の核酸は、修飾ホスホジエステル結合を含みうる。アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAのアンチセンス鎖もしくはセンス鎖のいずれかのホスホジエステル結合を修飾し、独立して、窒素および硫黄からなる群より選択される少なくとも1つのヘテロ原子を含みうる。一態様において、リボヌクレオチドを隣接リボヌクレオチドに連結するホスホエステル基を、修飾基により置換する。一態様において、リボヌクレオチドを隣接リボヌクレオチドに連結する1つまたは複数のホスホエステル基を、ホスホロチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、リン酸エステル、アルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、カルバメート、リン酸トリエステル、アセトアミデート、ペプチド、またはカルボキシメチルエステルにより置換する。一態様において、ホスホエステル基を置換する修飾基は、ホスホチオエート、メチルホスホネート、またはホスホラミデート基より選択される。一態様において、ホスホエステル基を置換する修飾基は、ホスホチオエート、メチルホスホネート、またはホスホラミデート基より選択される。一態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAのアンチセンス鎖のヌクレオチドの全てを、ホスホジエステル結合を介して連結する。別の態様において、siRNAのアンチセンスデュプレックス領域のヌクレオチドの全てを、ホスホジエステル結合を介して連結する。別の態様において、siRNAのセンス鎖のヌクレオチドの全てを、ホスホジエステル結合を介して連結する。別の態様において、siRNAのセンスデュプレックス領域のヌクレオチドの全てを、ホスホジエステル結合を介して連結する。別の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAのアンチセンス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の修飾ホスホエステル基を含む。別の態様において、siRNAのアンチセンスデュプレックス領域は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の修飾ホスホエステル基を含む。別の態様において、siRNAのセンス鎖は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の修飾ホスホエステル基を含む。別の態様において、siRNAのセンスデュプレックス領域は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の修飾ホスホエステル基を含む。5および3末端の修飾:別の第2の局面は、5および3修飾に関する。本発明の核酸は、1つまたは複数の修飾ヌクレオチド、脱塩基ヌクレオチド、非環式またはデオキシリボヌクレオチドを、アンチセンスオリゴヌクレオチドの5または3末端あるいはsiRNAのセンス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかまたは両方に含む核酸分子を含みうる。一態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドの5および3末端ヌクレオチドまたはsiRNAのセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方は非修飾である。別の態様において、siRNAのセンス鎖の5末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の3末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、siRNAのセンス鎖の3末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の3末端ヌクレオチドおよびsiRNAのセンス鎖の3末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の3末端ヌクレオチドおよびsiRNAのセンス鎖の5末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の3末端ヌクレオチドならびにsiRNAのセンス鎖の5および3の両方の末端ヌクレオチドを修飾する。別の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAのアンチセンス鎖の5末端ヌクレオチドをリン酸化する。別の態様において、siRNAのセンス鎖の5末端ヌクレオチドをリン酸化する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖およびセンス鎖の両方の5末端ヌクレオチドをリン酸化する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の5末端ヌクレオチドをリン酸化し、センス鎖の5末端ヌクレオチドは遊離ヒドロキシ基5OHを有する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の5末端ヌクレオチドをリン酸化し、センス鎖の5末端ヌクレオチドを修飾する。5および3末端ヌクレオチドへの修飾は、これらの末端ヌクレオチド上の5および3位置に限定されない。末端ヌクレオチドへの修飾の例は、非限定的に、ビオチン、逆向きのデオキシ脱塩基、アミノ、フルオロ、クロロ、ブロモ、CN、CF、メトキシ、イミダゾール、カルボキシレート、チオエート、C1C10低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリルまたはアラルキル、OCF3、OCN、O、S、またはNアルキル;O、S、またはNアルケニル;SOCH3;SO2CH3;ONO2;NO2、N3;ヘテロシクロアルキル;ヘテロシクロアルカリル;アミノアルキルアミノ;ポリアルキルアミノまたは置換シリルを含み、とりわけ、例えば、PCT特許出願WO9954459、欧州特許EP0586520B1またはEP0618925B1に記載される通りであり、それらの全体が参照により組み入れられる。本明細書において使用される通り、アルキルはC1C12アルキルを意味し、低級アルキルはC1、C2、C3、C4、C5、およびC6アルキルを含むC1C6アルキルを意味する。別の局面において、アンチセンスオリゴヌクレオチドの5末端、アンチセンス鎖の5末端、センス鎖の5末端、アンチセンスオリゴヌクレオチドの3末端、アンチセンス鎖の3末端、またはセンス鎖の3末端を、プロドラッグ部分に共有結合的に連結する。一態様において、その部分をエンドソーム中で切断する。別において、その部分を細胞質中で切断する。別の態様において、アンチセンス鎖もしくはセンス鎖のいずれかもしくは両方の上のその末端3ヌクレオチドまたは2つの末端3ヌクレオチドは、2デオキシヌクレオチドである。別の態様において、2デオキシヌクレオチドは2デオキシピリミジンである。別の態様において、2デオキシヌクレオチドは2デオキシチミジンである。別の態様において、アンチセンス鎖もしくはセンス鎖のいずれかもしくは両方の上のその末端3ヌクレオチドまたは2つの末端3ヌクレオチドは、塩基対合しておらず、即ち、それらは、1つまたは2つのヌクレオチドオーバーハングである。一態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖の両方の3末端は、TTジヌクレオチドオーバーハングを有する。本発明の一局面は、ギャップマーを形成するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドの修飾に関する。ギャップマーは、非デオキシオリゴヌクレオチドセグメントが隣接した2デオキシオリゴヌクレオチド領域を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドとして定義される。中央領域をギャップと称す。隣接セグメントをウィングと称す。各々のウィングは、1つまたは複数の非デオキシオリゴヌクレオチドモノマーでありうる。一態様において、ギャップマーは、5つの非デオキシヌクレオチドウィングが隣接した10のデオキシヌクレオチドギャップである。これを5105ギャップマーと称す。他の配置は、当業者により容易に認識される。一態様において、ウィングは、2O2MOE修飾ヌクレオチドを含む。別の態様において、ギャップマーはホスホロチオエート骨格を有する。別の態様において、ギャップマーは2MOEウィングおよびホスホロチオエート骨格を有する。他の適した修飾は、当業者により容易に認識可能である。shRNAおよび連結siRNA:別の局面は、shRNAおよび連結siRNAに関する。二本鎖構造が、2つの別々の鎖、即ち、アンチセンス鎖およびセンス鎖によって形成されることは本発明の範囲内である。しかし、アンチセンス鎖およびセンス鎖が、互いに共有結合的に連結されていることも本発明の範囲内である。そのような連結は、それぞれアンチセンス鎖およびセンス鎖を形成するヌクレオチドのいずれかの間に生じうる。そのような連結は、共有結合的または非共有結合的な連結から形成することができる。共有結合的な連結は、好ましくはメチレンブルーおよび二官能基を含む群より選択される化合物により、両方の鎖を、1回または数回、1つまたはいくつかの位置でそれぞれ連結することによって形成されうる。そのような二官能基は、好ましくは、ビスアミン、NアセチルNシスタミン、4チオウラシル、およびソラレンを含む群より選択される。一局面において、本発明のsiRNAのアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ループ構造により連結される。一態様において、ループ構造は非核酸ポリマーで構成される。別の態様において、非核酸ポリマーはポリエチレングリコールである。別の態様において、アンチセンス鎖の5末端は、センス鎖の3末端に連結される。別の態様において、アンチセンス鎖の3末端は、センス鎖の5末端に連結される。別の態様において、本発明のsiRNAのアンチセンス鎖およびセンス鎖は、核酸からなるループにより連結される。本明細書において使用される通り、ロックド核酸LNAElayadiandCoreyCurrOpinInvestigDrugs255861およびペプチド核酸PNAFasebJ1410411060に概説されるは、核酸として見なされ、ループ形成ポリマーとしても使用されうる。一態様において、核酸はリボ核酸である。一態様において、核酸はデオキシリボ核酸である。一態様において、siRNAのアンチセンス鎖の5末端は、siRNAのセンス鎖の3末端に連結され、shRNAを形成する。別の態様において、siRNAのアンチセンス鎖の3末端は、siRNAのセンス鎖の5末端に連結され、shRNAを形成する。ループは、4つのヌクレオチドまたはヌクレオチドアナログの最小長からなる。特定の態様において、ループは、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15のヌクレオチドまたはヌクレオチドアナログからなる。一態様において、ループヌクレオチド配列は、アンチセンス鎖の一部である。別の態様において、ループヌクレオチド配列は、センス鎖の一部である。別の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖の両方の部分が、ループヌクレオチド配列を形成する。別の態様において、ループヌクレオチド配列は異種配列であり、即ち、標的配列と同じまたは相補的ではない。リボ核酸コンストラクトを、適した発現ベクターシステム中に組み入れてもよい。好ましくは、ベクターは、RNAiの発現のためのプロモーターを含む。GoodetalGeneTher44554に記載される通り、好ましくは、各々のプロモーターはpolIIIであり、より好ましくは、プロモーターはU6、H1、7SKプロモーターである。作製のプロセス:本発明の核酸は、化学合成、または核酸をインビトロ例えば、ランオフ転写またはインビボのいずれかで発現させることを含む当技術分野における通常の方法を使用して産生することができる。一態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAは、固相化学合成を使用して産生する。別の態様において、核酸は、発現ベクターを使用して産生される。一態様において、発現ベクターは、本発明の核酸を、標的細胞において産生した。したがって、そのようなベクターは、医薬の製造のために使用することができる。本明細書に記載される核酸分子の合成のための方法は、当業者に公知である。一態様において、前記のsiRNAまたはshRNAは、真核生物発現のために適応された発現ベクターの一部である。好ましくは、前記のsiRNAまたはshRNAは、少なくとも1つのプロモーター配列に機能しうる態様で連結される。本発明の別の態様において、前記核酸分子のセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方を転写する少なくとも2つのプロモーターを伴う、前記カセットを提供する。本発明の別の態様において、カセットは核酸分子を含み、ここで、この分子は、第2の部分に連結された第1の部分を含み、ここで、第1および第2の部分は、それらの配列の少なくとも一部にわたって相補的であり、さらにここで、核酸分子の転写はRNA分子を産生し、それは、第1および第2の部分の相補的な塩基対合によって二本鎖領域を形成し、それによってshRNAを形成する。プロモーターは、当技術分野で認識された用語であり、明瞭さのために、例示のみによって提供される以下の特徴を含む。エンハンサーエレメントは、遺伝子の転写開始部位の5でしばしば見出されるシス作用性核酸配列であるエンハンサーは、遺伝子配列の3でも見出される、または、イントロン配列中にさえ位置付けられる。エンハンサーは、エンハンサーが連結される遺伝子の転写速度を増加させるように機能する。エンハンサー活性は、エンハンサーエレメントに特異的に結合することが示されているトランス作用性転写因子に応答性である。転写因子の結合/活性EukaryoticTranscriptionFactorsbyDavidSLatchmanAcademicPressLtdSanDiegoを参照のことは、多数の生理学的/環境的な合図に対し応答する。プロモーターエレメントはまた、いわゆるTATAボックスおよびRNAポリメラーゼ開始選択配列を含み、それらは、転写開始部位を選択するように機能する。これらの配列は、とりわけ、RNAポリメラーゼによる転写開始選択を促進するように機能するポリペプチドにも結合する。適応はまた、選択可能マーカーおよび自律複製配列の提供を含み、それらは、真核細胞または原核宿主のいずれかにおける前記ベクターの維持を促進する。自律的に維持されるベクターを、エピソームベクターと称す。ベクターにコードされる遺伝子の発現を促進する適応には、転写終結ポリアデニル化配列の提供が含まれる。発現制御配列は、いわゆる、遺伝子座制御領域LCRも含む。これらは、トランスジェニックコンストラクトとしてアッセイした場合、連結された遺伝子に、位置非依存的、コピー数依存的な発現を与える調節エレメントである。LCRは、隣接ヘテロクロマチンのサイレンシング効果からトランスジーンを隔離する調節エレメントを含むGrosveldetalCell51975985。一般的な発現ベクター構築および組換えDNA技術に関して、数多くの文献が発表されている。SambrooketalMolecularCloningALaboratoryManualColdSpringHarbourLaboratoryColdSpringHarbourNYおよびその中の参考文献;MarstonFDNACloningTechniquesAPracticalApproachVolIIIIRLPressOxfordUKDNACloningFMAusubeletalCurrentProtocolsinMolecularBiologyJohnWileySonsIncを参照。治療剤としてのウイルスまたはウイルスベクターの使用は、当技術分野において周知である。加えて、多数のウイルスが、外因性遺伝子の送達のためのベクターとして一般に使用される。一般に用いられるベクターは、好ましくは、レトロウイルス科retroviridae、バキュロウイルス科baculoviridiae、パルボウイルス科parvoviridiae、ピコルナウイルス科picornoviridiae、ヘルペスウイルス科herpesveridiae、ポックスウイルス科、アデノウイルス科adenoviridiae、またはピコルナウイルス科picornnaviridiaeより選択される、組換え改変されたエンベロープまたは非エンベロープDNAおよびRNAウイルスを含む。キメラベクターも用いてもよく、それは親ベクターの特性の各々の有利な要素を利用する例えば、FengetalNatureBiotechnology15866870を参照のこと。そのようなウイルスベクターは、野生型でありうるが、または、組換えDNA技術によって改変され、複製欠損、条件的複製、または複製能力がありうる。好ましいベクターは、レトロウイルスゲノム例えば、レンチウイルスおよびアデノ随伴ウイルスに由来するものを含む。ウイルスベクターは、条件的複製または複製能力がありうる。条件的複製ウイルスベクターを使用し、有害な広範囲の感染を回避しながら、特定の細胞型において選択的な発現を達成する。条件的複製ウイルスベクターの例は、PennisiEScience274342343;RussellandSJEurJofCancer30A11651171に記載されている。選択的に複製するベクターのさらなる例は、ウイルスの複製のために必須、つまりそのような遺伝子の発現がない場合にはウイルスが複製しないような遺伝子が、特定の細胞型、または、細胞状態においてのみ活性であるプロモーターの制御下にあるようなベクターを含む。そのようなベクターの例は、Hendersonら、米国特許第5698443号1997年12月16日取得およびHendersonら、米国特許第5871726号1999年2月16日取得に記載されており、それらの全教示が、参照により本明細書に組み入れられる。加えて、ウイルスゲノムは、特定の条件下でのみ複製または発現を達成する誘導性プロモーターを含むように改変してもよい。誘導性プロモーターの例は、科学文献において公知である例えば、YoshidaandHamadaBiochemBiophysResComm230426430;lidaetalJVirol7060546059HwangetalJVirol7171287131LeeetalMolCellBiol1750975105;およびDreheretalJBiolChem2722936429371を参照のこと。一態様において、前記ベクターは、実質的に肺またはガンに特異的であるプロモーターを含む。好ましくは、前記プロモーターは肺ガン細胞において優先的に活性である。送達/製剤:アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびsiRNAを、インビトロおよびインビボの両方で、細胞との直接接触ネイキッド送達を含む当業者に公知の種々の方法により、または、細胞中への標的化または送達を促進する1つまたは複数の薬剤との組み合わせにより、細胞に送達することができる。そのような薬剤および方法は、リポプレックス、リポソーム、イオントフォレーシス、ヒドロゲル、シクロデキストリン、ナノカプセル、マイクロおよびナノスフィア、ならびにタンパク質性ベクターを含む例えば、BioconjugateChem1010681074およびWO0053722。核酸組成物は、インビボで、局所的または全身的のいずれかで、静脈内、皮下、筋肉内、もしくは皮内注射または吸入を含む種々の手段により送達されうる。本発明の分子は、薬学的な剤として使用することができる。好ましくは、薬学的な剤は、対象における疾患状態の発生を予防、調節、または処置するある程度まで症状を、好ましくは症状の全てを軽減する。ガンを処置する場合において、処置は、対象において腫瘍量または腫瘍体積を低下させる。また、ポリ脂質PEG修飾、または長期循環リポソームもしくはステルスリポソームを含む表面修飾リポソームを含む組成物の使用を提供する。これらの製剤は、それらの凝集および融合を防止することによって、リポソームまたはリポプレックス溶液の安定性を増加させるための方法を与える。製剤はまた、インビボにおいて、単核食細胞系MPSまたはRESによるオプソニン化および除去に抵抗するさらなる利点を有し、それによって、カプセル化薬物について、より長い血液循環時間および増強された組織への曝露を可能にする。そのようなリポソームは、恐らくは新血管形成標的組織における血管外漏出および捕捉によって、腫瘍中に選択的に蓄積することが示されているLasicetalScience199526712751276;Okuetal1995BiochimBiophysActa12388690。長期循環リポソームは、特にMPSの組織中に蓄積することが公知である従来のカチオン性リポソームと比較して、DNAおよびRNAの薬物動態および薬力学を増強するLiuら、JBiolChem1995422486424780;Choiら、国際PCT公開WO9610391;Ansellら、国際PCT公開WO9610390;Hollandら、国際PCT公開WO9610392。長期循環リポソームはまた、ヌクレアーゼ分解からsiRNAを保護する。本発明の核酸は、薬学的組成物として製剤化してもよい。薬学的組成物は、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、医薬としてまたは診断用薬剤として使用してもよい。例えば、本発明の1つまたは複数の核酸を、送達媒体例えば、リポソームおよび/または担体、希釈剤などの賦形剤と組み合わせることができる。用語賦形剤は、薬学的に活性な成分のための担体として使用される、薬学的に許容される、薬学的に不活性な物質を指す。核酸分子の送達のための方法は、当技術分野において公知であり、例えば、Akhtaretal1992TrendsCellBio2139DeliveryStrategiesforAntisenseOligonucleotideTherapeuticsedAkhtar1995Maureretal1999MolMembBiol16129140HoflandandHuang1999HandbExpPharmacol137165192;およびLeeetal2000ACSSympSer752184192、米国特許第6395713号、およびPCTWO9402595に記載されるそれらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる。本発明の核酸はまた、他の治療用化合物と組み合わせて投与することができ、例えば、組み合わせた単位用量として、別々にまたは同時に投与される。一態様において、本発明は、生理学的/薬学的に許容される安定剤、保存剤、希釈剤、緩衝剤などの賦形剤中に、本発明の1つまたは複数の核酸を含む薬学的組成物を含む。本発明の核酸を送達するために適した送達製剤の例は、WO28137758US28317839A1およびWO29046220A2に開示されるものを含み、各々はその全体が参照により組み入れられる。適した送達システムは、TraversaTherapeuticsSanDiegoCaliforniaのPTDDRBDを含み、それは、二本鎖RNA結合ドメインDRBDに融合したペプチド導入ドメインPTDを含む。PTD細胞透過性ペプチドまたはCPPとも呼ばれるは、細胞表面上のプロテオグリカンに結合するペプチドである。結合PTDは、全ての細胞が行う液相取り込みの特殊な形態であるマクロピノサイトーシスによって細胞中に取り込まれる。マクロピノサイトーシスの利点は、それがリソソーム経路を含まないことであり、それによって、エンドソームから逃れるためのsiRNAペイロードの必要性を回避する。DRBDは、自明であり、即ち、二本鎖RNAに結合するタンパク質の結合ドメインである。PTDDRBDは、WO2007095152US20090093026A1TheRegentsOfTheUniversityOfCaliforniaに帰属するに開示されており、NatureBiotechnology27567571に公開されている各々の特許出願および刊行物は、その全体が参照により組み入れられる。一態様において、PTDは、3回反復するHIV1tatタンパク質RKKRRQRRRの一部分である。一態様において、DRBDは、プロテインキナーゼRNA活性化、つまりPKRタンパク質真核生物翻訳開始因子2アルファキナーゼ2EIF2AK2およびPRKRとしても公知であるの65アミノ酸部分を含む。他の態様において、PTDは、ヘルペスウイルスVP22タンパク質;ヒト免疫不全ウイルスHIVTATタンパク質を含むポリペプチド;アンテナペディアタンパク質のホメオドメインAntpHDを含むポリペプチド、およびそれらの機能的フラグメントである。他の態様において、DRBDは、ヒストン、RDE4タンパク質、プロタミンからなる群より選択される配列を含み、dsRNA結合タンパク質カッコ中はアクセッション番号は、PKRAAA36409、AAA61926、Q03963、TRBPP97473、AAA36765、PACTAAC25672、AAA49947、NP609646、StaufenAAD17531、AAF98119、AAD17529、P25159、NFAR1AF167569、NFAR2AF167570、AAF31446、AAC71052、AAA19960、AAA19961、AAG22859、SPNRAAK20832、AAF59924、A57284、RHACAA71668、AAC05725、AAF57297、NREBPAAK07692、AAF23120、AAF54409、T33856、kanadaptinAAK29177、AAB88191、AAF55582、NP499172、NP198700、BAB19354、HYLLNP563850、hyponasticleavesCAC05659、BAB00641、ADAR1AAB97118、P55266、AAK16102、AAB51687、AF051275、ADAR2P78563、P51400、AAK17102、AAF63702、ADAR3AAF78094、AAB41862、AAF76894、TENRXP059592、CAA59168、RNaselllAAF80558、AAF59169、Z81070Q02555S55784、P05797、およびDicerBAA78691、AF408401、AAF56056、S44849、AAF03534、Q9884、RDE4AY071926、FLJ20399NP060273、BAB26260、CG1434AAF48360、EAA12065、CAA21662、CG13139XP059208、XP143416、XP110450、AAF52926、EEA14824、DGCRK6BAB83032、XP110167、CG1800AAF57175、EAA08039、FLJ20036AAH22270、XP134159、MRPL45BAB14234、XP129893、CG2109AAF52025、CG12493NP647927、CG10630AAF50777、CG17686AAD50502、T22A35CAB03384およびアクセッション番号EAA14308のものを含む。別の適した送達システムは、CalandoPharmaceuticals以前はInsertTherapeuticsおよび持株会社ArrowheadResearchCorporationの子会社のClycodextrinBasedDeliveryであり、RNAiOligonucleotideNanoparticleDeliveryRONDEL技術として言及される。RONDELの直線状シクロデキストリンは、環状オリゴ糖とカチオン含有化学連結基を連結することにより形成されたコポリマーである。連結基および末端基において見出されるアミンおよびイミダゾールは、エンドソーム放出において役立つ。シクロデキストリン含有ポリカチオンCDPと呼ばれるポリマーは、siRNAペイロードと凝縮する。シクロデキストリン分子の内部の環または核は疎水性であり、疎水性化合物を取り込むために使用することができる。形成された複合体は、包接複合体と呼ばれる。RONDEL製剤中では、シクロデキストリンサブユニットの疎水性核は、アダマンチンPEGコンジュゲートの分子を固定するために使用される。PEGはアダマンタンにコンジュゲートされ、次に、PEGアダマンチンコンジュゲートは直線状シクロデキストリンCDPと組み合わされる。特定の細胞型にナノ粒子を標的化するために、リガンドをPEGアダマンタン分子のPEG部分にコンジュゲートし、アダマンチンPEGリガンド複合体を形成する。RONDELの場合において、ヒトトランスフェリンタンパク質Tfは、使用することができるリガンドの1つの例である。その理由は、大半のガン細胞が、細胞表面上にヒトトランスフェリン受容体を過剰発現するからである。RONDEL製剤の例が、DavidetalNature46410671070およびHeideletalPNAS10457175721に開示されている各々は、その全体が参照により組み入れられる。直線状シクロデキストリン技術が、WO0001734US20070025952A1、US20020151523A1、US7091192、US6884789、およびUS6509323に開示および特許請求されている各々は、その全体が参照により組み入れられる。アダマンタンPEGおよびアダマンタンPEGTFとの包接複合体を含む直線状シクロデキストリン包接複合体が、WO0249676US20070128167A1、US20060182795A1、US20030017972A1、US20030008818A1、US7166302、およびUS7018609に開示されている各々は、その全体が参照により組み入れられる。他の製剤はSNALPを含み、NatureBiotechnology2310021007に開示されており、その全体が参照により組み入れられる。SNALP製剤が、WO05120152US20060083780A1US20060008910A1、WO05026372A1US20050175682A1、WO06007712US20060051405A1US20060025366A1に開示されており、各々は、その全体が参照により組み入れられる。SNALP製剤の例は、12ジステアロイルsnグリセロ3ホスホコリンDSPCMW387、コレステロールMW790、12ジリノレイルオキシNNジメチル3アミノプロパンDLinDMAMW616および3Nωメトキシポリ平均MW2000カルバモイル12ジミリスチルオキシプロピルアミンPEGCDMAMW2524である。別の有用な態様において、上のDLinDMA成分は、22ジリノレイル413ジオキソランDLinKC2DMAを用いて置換される。これおよび他の有用な製剤が、WO2009086558およびWO2009132131に開示されており、各々は、その全体が参照により組み入れられる。他の有用な製剤はリピドイドに基づき、NatureBiotechnology26561569およびLoveetalPNAS10718641869およびWO28042973A2USUS20090023673A1およびWO28042973A2USUS20090023673A1に開示されている通りであり、各々は、その全体が参照により組み入れられる。他の有用な製剤は、WO2010021865およびWO2007086881A2およびWO2007086883US20100063308A1US20090048197A1US20080188675A1US20080020058A1US20060240554A1US7691405、US7641915、US7514099およびUS7404969WO2008147438A2US20100048888A1、US20090048197A1、US20080020058A1およびUS7691405、US7404969に開示されるものであり、各々は、その全体が参照により組み入れられる。他の有用な製剤は、WO2007095152US20090093026A1およびNatureBiotechnology27567571のものを含み、各々は、その全体が参照により組み入れられる。他の有用な製剤は、RozemaetalPNAS1041298212987、HeideletalPNAS10457175721、WakefieldetalBioconjugateChem1612041208およびWO0001734US20070025952A1、US20020151523A1、US7091192、US6884789、およびUS6509323、WO0249676US20070128167A1、US20060182795A1、US20030017972A1、US20030008818A1、US7166302、およびUS7018609、WO04090107US20070105804A1、US20070036865A1、およびUS20040198687A1、WO2008022309US20090048410A1、US20090023890A1、US20080287630A1、US20080287628A1、US20080281074A1、US20080281044A1、US20080281041A1、US20080269450A1、US20080152661A1からのものを含み、各々は、その全体が参照により組み入れられる。本発明の組成物は、有効量で投与される。有効量は、単独で、またはさらなる用量と一緒に、所望の応答を産生する組成物の量である。例えば、ガンなどの特定の疾患を処置する場合において、所望の応答とは、疾患の進行を阻害することである。これは、疾患の進行を一時的に遅らせることのみを含みうるが、より好ましくは、疾患の進行を恒久的に停止させることを含む。これは、日常的な方法によってモニターすることができる。そのような量は、当然、処置される特定の状態、状態の重症度、個々の患者パラメーター年齢、健康状態、サイズおよび体重、処置の持続期間、併用治療の性質ある場合、特定の投与経路、および医療従事者の知識および専門知識内の同様の因子を含むに依存する。これらの因子は当業者に周知であり、単に日常的な実験法を用いて対処することができる。一般的に、個々の成分またはそれらの組み合わせの最大用量、即ち、妥当な医学的判断に従った最も高い安全用量を使用することが好ましい。しかし、患者が、医学的な理由、心理学的な理由のために、または、実質的に任意の他の理由のために、より低い用量または耐容量を主張しうることが、当業者により理解されるであろう。先の方法において使用される薬学的組成物は、好ましくは、無菌であり、患者への投与のために適した重量または容積単位で所望の応答を産生するために本発明による薬剤の有効量を含む。対象に投与される本発明によるsiRNAshRNAの用量は、様々なパラメーターに従って、特に、使用される投与様式および対象の状態に従って選ぶことができる。他の因子は、所望の処置期間を含む。対象における応答が、適用された初回用量で不十分である事象において、より高い用量または、異なる、より局所的な送達経路による有効でより高い用量を、患者の耐容性が許す範囲で用いてもよい。本発明の医薬および薬学的組成物のための投与量レベルは、日常的な実験法によって、当業者により決定することができる。一態様において、単位用量は、約001mgkg~約100mgkg体重の核酸を含む。一態様において、核酸の用量は、約10mgkg~約25mgkg体重である。一態様において、核酸の用量は、約1mgkg~約10mgkg体重である。一態様において、核酸の用量は、約005mgkg~約5mgkg体重である。別の態様において、核酸の用量は、約01mgkg~約5mgkg体重である。別の態様において、核酸の用量は、約01mgkg~約1mgkg体重である。別の態様において、核酸の用量は、約01mgkg~約05mgkg体重である。別の態様において、核酸の用量は、約05mgkg~約1mgkg体重である。別の態様において、siRNAshRNAの用量は、1nM~1μMの間である。特定の態様において、用量は、1nM~500nM、5nM~200nM、および10nM~100nMの範囲でありうる。組成物の投与のための他のプロトコールが、当業者に公知であり、ここで、投与量、注射スケジュール、注射部位、投与様式などは前述とは異なる。ヒト以外の哺乳動物への組成物の投与は例えば、試験目的または獣医治療目的のため、上記と実質的に同じ条件下で行われる。対象は、本明細書において使用される通り、哺乳動物、好ましくはヒトであり、非ヒト霊長類、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ、または齧歯類を含む。投与される場合、本発明の薬学的調製物は、薬学的に許容される量でおよび薬学的に許容される組成物中で適用される。用語薬学的に許容されるは、活性成分の生物学的活性の有効性に干渉しない非毒性物質を意味する。そのような製剤は、通常使用する、塩、緩衝剤、保存剤、適合する担体、および、場合によっては、他の治療剤を含んでもよい。薬学的組成物は、好都合に、単位投与形態で提示してもよく、薬学の分野において周知の方法のいずれかによって調製されうる。一態様において、薬学的組成物は、無菌の水性懸濁液または溶液である。別の態様において、薬学的組成物は、無菌の注射可能な水性懸濁液または溶液である。一態様において、薬学的組成物は凍結乾燥形態である。一態様において、薬学的組成物は凍結乾燥リポプレックスを含み、このリポプレックスは本発明の核酸を含む。別の態様において、薬学的組成物はリポプレックスの水性懸濁液を含み、このリポプレックスは本発明の核酸を含む。本発明の薬学的組成物および医薬は、哺乳動物に投与してもよい。一態様において、哺乳動物は、ヒト、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ブタ、ヤギ、ヒツジ、マウス、ラット、ハムスター、およびモルモットからなる群より選択される。一態様において、哺乳動物はヒトである。別の態様において、哺乳動物は非ヒトの哺乳動物である。本明細書において使用される通り、用語ガンまたはガン性は、自律増殖のための能力、即ち、急速に増殖する細胞増殖によって特徴付けられる異常な状態または条件を有する細胞を指す。この用語は、病理組織型および侵襲性のステージにかかわらず、ガン性増殖または発ガンプロセス、転移性組織、または悪性形質転換細胞、組織、もしくは臓器の全ての型を含むことを意味する。用語ガンは、種々の臓器系の悪性腫瘍、例えば、肺、乳房、甲状腺、リンパ系、胃腸、および尿生殖路に罹患するものなど、ならびに悪性腫瘍、例えば、大半の結腸ガン、腎細胞ガン、前立腺ガンおよび/または精巣腫瘍、肺の非小細胞ガン、小腸のガン、および食道のガンなどを含む腺ガンを含む。用語ガン再発は、本明細書において使用される通り、ガン細胞が身体において検出できなかった期間の後でのガンが検出されること、またはガンが再び現れることを指す。用語ガンは、当技術分野で認識されており、呼吸器系ガン、胃腸系ガン、泌尿生殖器系ガン、精巣ガン、乳ガン、前立腺ガン、内分泌系ガン、および黒色腫を含む、上皮または内分泌組織の悪性腫瘍を指す。例示的なガンは、子宮頸部、肺、前立腺、乳房、頭頸部、結腸、および卵巣の組織から形成されるものを含む。用語ガンはまた、例えばガン組織および肉腫組織で構成される、悪性腫瘍を含むガン肉腫を含む。腺ガンは、腺組織に由来する、または、腫瘍細胞が認識可能な腺構造を形成するガンを指す。用語肉腫は、当技術分野で認識され、間葉系由来の悪性腫瘍を指す。さらなる例は、肺ガン、例えば、小細胞肺ガンまたは非小細胞肺ガンを含む。肺ガンの他のクラスは、神経内分泌ガン、肉腫、および異なる組織由来の転移性ガンを含む。本発明の別の局面によれば、対象においてガンを診断する方法において:この方法は、i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体転写物が生物学的試料中に存在するか否かを決定する工程を含み、ここで、Ciz1b変異体転写物の存在が対象におけるガンの存在を示す、方法が提供される。一態様において、対象はヒトである。一態様において、ガンはガンの再発である。Ciz1b変異体は、いくつかのガンNSCLCおよびSCLCの両方である肺ガン、乳ガン、甲状腺ガン、膀胱ガン、肝臓ガン、腎臓ガン、リンパ腫、および白血病を含むにおいて検出されている。一態様において、ガンは肺ガンである。さらなる態様において、肺ガンはNSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンはSCLCである。別の態様において、ガンは乳ガンである。別の態様において、ガンは甲状腺ガンである。さらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺髄様ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンはヒュルトレ細胞ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺乳頭ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺濾胞ガンである。別の態様において、ガンはリンパ腫である。さらなる態様において、リンパ腫はB細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はホジキンリンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は濾胞性リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は未分化大細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は節外周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は脾臓周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はマントル細胞リンパ腫である。別の態様において、ガンは白血病である。別のさらなる態様において、白血病は慢性リンパ性白血病である。別のさらなる態様において、白血病はヘアリー細胞白血病である。一態様において、生物学的試料は、固形組織試料、血液、血漿、血清、喀痰、尿、または気管支肺胞洗浄液より選択される。さらなる態様において、試料は固形組織試料である。別のさらなる態様において、試料は血液である。別のさらなる態様において、試料は血漿である。別のさらなる態様において、試料は血清である。別のさらなる態様において、試料は喀痰である。別のさらなる態様において、試料は尿である。別のさらなる態様において、試料は気管支肺胞洗浄液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は循環腫瘍細胞CTCである。さらなる態様において、生物学的試料中のCiz1b変異体転写物は、細胞外にある、即ち、細胞の外に存在する。一態様において、方法は、ポリメラーゼ連鎖反応PCRを使用し、Ciz1b変異体転写物の存在を検出する。別の態様において、ヌクレオチドプライマーをPCRにおいて使用し、エクソン14bとエクソン15の間の接合部にまたがる核酸の部分を増幅する。別の態様において、PCRを使用して増幅された核酸産物は、ヌクレオチド配列を含む。別の態様において、PCRを使用して増幅された核酸は、ヌクレオチド配列を含む。別の態様において、増幅された核酸産物は、通常の対応する対照を伴う。一態様において、ガンは、リンパ腫、肺ガン、乳ガン、腎臓ガン、甲状腺ガン、または結腸ガンである。一態様において、ガンは小細胞肺ガンSCLCである。別の態様において、ガンは非小細胞肺ガンである。別の態様において、ガンは乳ガンである。別の態様において、ガンは腎臓ガンである。別の態様において、ガンはリンパ腫である。別の態様において、ガンは結腸ガンである。一態様において、前記の増幅産物を、核酸配列を切断しない制限エンドヌクレアーゼで消化する。別の態様において、前記の制限エンドヌクレアーゼはCAC81である。別の態様において、前記オリゴヌクレオチドプライマー対を適応し、核酸配列を含む核酸分子を特異的に増幅する。別の態様において、前記プライマー対中の前記オリゴヌクレオチドプライマーの1つは、核酸配列を含むか、またはそれからなる。別の態様において、前記オリゴヌクレオチドプライマー対は、核酸配列を含むか、またはそれからなる。別の態様において、配列を含む増幅産物は、ヌクレオチド配列を含むか、またはそれからなるオリゴヌクレオチドプローブを用いて検出する。本発明の好ましい方法において、生物学的試料は肺細胞を含む。別の態様において、診断を、診断されるガンについて適した処置計画と組み合わせる。別の態様において、処置計画は、抗ガン剤の投与を含む。別の態様において、化学療法剤は、シスプラチン、カルボプラチン、イリノテカン、トポテカン、カンプトテシン、エトポシド、ドキソルビシン、パクリタキセル、ドセタキセル、ゲムシタビン、およびビノレルビンからなる群より選択される。別の態様において、抗ガン剤は、本発明によるsiRNAまたはshRNAである。別の態様において、処置計画は、少なくとも1つのsiRNAまたはshRNAの投与を含み、化学療法剤は、別々に、同時に、または連続的に投与される。一態様において、ガンは肺ガンである。別の態様において、肺ガンは小細胞肺ガンである。別の態様において、肺ガンは非小細胞肺ガンである。本発明の一局面において、ガンを有するヒトにおいてCiz1b変異体mRNAから翻訳されたCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出する方法を提供し、この方法は以下の工程:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出する工程、を含む。一態様において、生物学的試料は血漿である。一態様において、ガンは肺ガンである。本発明の一局面において、Ciz1b変異体mRNAから翻訳されたCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:iii試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ivCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出する工程を含み、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在は、ガンの存在を示す。一態様において、対象はヒトである。一態様において、生物学的試料は血漿である。一態様において、ガンはガン再発である。一態様において、ガンは肺ガンである。本発明の一態様において、Ciz1b変異体mRNAから翻訳されたCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii生物学的試料を、前記Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと接触させる工程;iiiCiz1b変異体ポリペプチドに結合した前記の抗体または抗原結合フラグメントの存在を検出する工程を含み、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在は、ガンの存在を示す。一態様において、ガンはガン再発である。一態様において、対象はヒトである。一態様において、抗体は、前記Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合するが、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドには特異的に結合しない。一態様において、生物学的試料は、固形組織試料、血液、血漿、血清、喀痰、尿、または気管支肺胞洗浄液より選択される。さらなる態様において、生物学的試料は固形組織試料である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血漿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血清である。別のさらなる態様において、生物学的試料は喀痰である。別のさらなる態様において、試料は尿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は気管支肺胞洗浄液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は循環腫瘍細胞CTCである。さらなる態様において、前記の生物学的試料中のCiz1b変異体転写物は、細胞外にある、即ち、細胞の外に存在する。一態様において、ガンは肺ガンである。さらなる態様において、肺ガンはNSCLCである。さらなる態様において、肺ガンはステージ0のNSCLCである。さらなる態様において、肺ガンはステージIのNSCLCである。さらなる態様において、肺ガンはステージIIのNSCLCである。さらなる態様において、肺ガンはステージIIIのNSCLCである。さらなる態様において、肺ガンはステージIVのNSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンはSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンは限定されたステージのSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンは広範なステージのSCLCである。別の態様において、ガンは乳ガンである。別の態様において、ガンは甲状腺ガンである。さらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺髄様ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンはヒュルトレ細胞ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺乳頭ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺濾胞ガンである。別の態様において、ガンはリンパ腫である。さらなる態様において、リンパ腫はB細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はホジキンリンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は濾胞性リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は未分化大細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は節外周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は脾臓周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はマントル細胞リンパ腫である。別の態様において、ガンは白血病である。別のさらなる態様において、白血病は慢性リンパ性白血病である。別のさらなる態様において、白血病はヘアリー細胞白血病である。別のさらなる態様において、ガンは腎臓ガンである。別のさらなる態様において、ガンは肝臓ガンである。別のさらなる態様において、ガンは膀胱ガンである。一態様において、前記のb変異体ポリペプチドは、タンパク質分解的に切断されたCiz1b変異体ポリペプチドフラグメントである。さらなる態様において、ポリペプチドフラグメントは、エクソン14bおよび15によってコードされるポリペプチド配列を含む。さらなる態様において、ポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列DEEEIEVRSRDISを含む。別の態様において、フラグメントは、分解の程度に依存して、8SDSPAGE上で、約50~60kDaの間の見掛けの分子量を伴って移動する。さらなる態様において、フラグメントは、8SDSPAGE上で、約50kDaの見掛けの分子量を伴って移動する。一態様において、抗体は、エクソン14bおよびエクソン15の両方によってコードされるアミノ酸残基を含む連続エピトープに特異的に結合する。別の態様において、抗体は、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合するが、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドには特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、少なくとも10倍上回る親和性で、Ciz1b変異体ポリペプチドよりもエクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドに特異的に結合する。一態様において、抗体は、少なくとも100倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、前記の抗体は、少なくとも1000倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、抗体は、少なくとも10000倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、抗体は、少なくとも100000倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合する。一態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列のいずれにも特異的に結合しない。一態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の局面において、本発明は、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメントを提供する。一態様において、抗体はモノクローナル抗体である。別の態様において、前記の抗体はポリクローナル抗体である。別の態様において、抗体は、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合するが、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドには特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、少なくとも10倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドよりもCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する。一態様において、抗体は、少なくとも100倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、抗体は、少なくとも1000倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、抗体は、エクソン14bおよびエクソン15によってコードされるアミノ酸残基を含む連続エピトープに特異的に結合する。一態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。本発明の別の局面において、本発明によるモノクローナル抗体またはその抗原結合フラグメントを産生するハイブリドーマ細胞株を提供する。本発明の別の局面は、肺結節が、胸部X線、コンピューター断層撮影CTスキャン低線量ヘリカルスパイラルCTスキャンを含む、磁気共鳴画像法MRI、陽電子放射断層撮影PETスキャン、または他の撮影方法によって観察される通り、ガン性であるか否かを予測または決定する方法である。肺における組織の小さな腫瘤である肺結節は、非常に一般的である。大半の肺結節が非ガン性良性であるが、一部は早期肺ガンを表す。肺結節は、通常、胸部X線またはCTスキャン上で、丸く白い影として現れる。肺結節は、通常、約15インチから1インチ、または5ミリメートルmmから25mmのサイズである。一局面において、本発明は、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在を検出することによって、肺結節がガン性である否かを予測または決定する方法を提供し、この方法は以下:i肺結節を伴うヒト由来の、試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii生物学的試料を、例えば、前記Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントなどのCiz1b変異体ポリペプチド結合剤と接触させる工程;iiiCiz1b変異体ポリペプチドに結合したCiz1b変異体ポリペプチド結合剤抗体または抗原結合フラグメントの存在を検出する工程を含み、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在は、肺ガンの存在を示す。一態様において、生物学的試料は血漿である。本発明の別の局面は、対象における肺ガンの早期検出のための方法であり、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出する工程、iiiCiz1b変異体ポリペプチドの存在は、ガンの存在を示す、ことを含む。一態様において、肺ガンはステージ0、IA、またはIBのNSCLCである。NSCLCはステージ0からステージIVでありうる。ステージ0はインサイチュのガンとして定義される。ステージIAにおいて、ガンは肺内だけであり、3cmまたはそれより小さい。ステージIBにおいて、ガンは、a3cmより大きく、しかし、5cmより大きくない、b主気管支まで広がっている、および/またはc肺裏層の最も内側の層まで広がっている。SCLCについて2つのステージ、つまり限定されたステージおよび広範なステージの疾患がある。限定されたステージのSCLC対象は、半胸郭由来、縦隔、または鎖骨上リンパ節に限局した腫瘍を有し、当技術分野において周知であり、NationalCancerInstituteNCIBethesdaMDUSAにより公開されたPhysicianDataQueryPDQによって定義され、その全体が参照により組み入れられる。しばしば、放射線単独を使用して肺炎とガン性病変とを鑑別診断することは困難である。本発明の別の局面は、本発明のCiz1b変異体ポリペプチドの存在を検出することによって、患者が肺炎または肺ガンに苦しんでいるか否かを鑑別診断する手段を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii生物学的試料を、前記Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと接触させる工程;iiiCiz1b変異体ポリペプチドに結合した抗体または抗原結合フラグメントの存在を検出する工程を含み、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在は、ガンの存在を示す。一態様において、生物学的試料は、固形組織試料、血液、血漿、血清、喀痰、尿、または気管支肺胞洗浄液より選択される。さらなる態様において、生物学的試料は固形組織試料である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血漿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血清である。別のさらなる態様において、生物学的試料は喀痰である。別のさらなる態様において、試料は尿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は気管支肺胞洗浄液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は循環腫瘍細胞CTCである。一態様において、ガンは肺ガンである。さらなる態様において、肺ガンはNSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンはSCLCである。本明細書において開示される、ガンを検出するための方法は、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、または少なくとも94の1標準偏差SDでの感度を有する。本明細書において開示される、ガンを検出するための方法は、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、または少なくとも90の1標準偏差での特異度を有する。感度は、ガンを有すると正確に診断された対象の数/ガンを伴う対象の総数×1001SDでのとして定義される。特異度は、ガンを有するおよびガンを有さないと正確に診断された対象の数/対象の総数×1001SDでのとして定義される。ROC受信者動作特性曲線は、全ての可能な間隔での1-特異度に対する感度を使用してプロットされ、ROC曲線下面積AUCを生成する。例えば、httpwwwjrocfitorgで入手可能な、ウェブに基づく計算機連続分散データ用のフォーマット5を便宜上使用してもよい。大半のガン治療放射線、小分子、または生物製剤を問わずは細胞傷害性であり、アポトーシスを誘発することによって、ネクローシスを介して、または2つの組み合わせのいずれかによって細胞を殺傷する。さらに、これらの治療は、通常、ガン細胞に完全に特異的であるわけではなく、特定の治療および患者に依存して、多かれ少なかれ正常細胞を殺す。正常細胞の非特異的な殺傷は、用量依存的な副作用に導く。正常細胞が殺される範囲は患者間で変動し、患者が用量制限毒性を経験する用量を予測することを困難にする。患者がいつ治療的な制限用量を有するかまたはそれに達しうるかを決定または予測することができると、より良好な患者のケアを導きうる。非特異的な細胞傷害性または用量依存的な細胞傷害性の程度は、ガン細胞により、それが死ぬ時に放出されるバイオマーカーの量を、ガン細胞または正常細胞のいずれかが死ぬ時に放出されるバイオマーカーの量と比較することによって直接的に決定することができる。一局面において、本発明は、腫瘍細胞から、それが死ぬ時に放出されるCiz1b変異体ポリペプチドの量を、腫瘍細胞または正常細胞の両方から、それが死ぬ時に放出される細胞死バイオマーカーの量と比較することにより、Ciz1b変異体ポリペプチドを発現するガンを処置するために施されたガン治療の結果としての非特異的な細胞傷害性を測定する方法を提供する。Ciz1b変異体ポリペプチドと細胞死バイオマーカーの比率が低いほど、非特異的な細胞傷害性は大きくなる。一局面において、方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii生物学的試料中に存在する前記Ciz1b変異体ポリペプチドの量を測定する工程であって、Ciz1b変異体ポリペプチドの存在がガン細胞の細胞傷害性を示す、工程;iii細胞死バイオマーカーの量を測定する工程であって、細胞死バイオマーカーが、ガン細胞および正常細胞の両方の細胞傷害性を示す、工程;ivCiz1b変異体ポリペプチドの量を、細胞死バイオマーカーの量と比較する工程を含む。一態様において、生物学的試料は、固形組織試料、血液、血漿、血清、喀痰、尿、または気管支肺胞洗浄液より選択される。さらなる態様において、生物学的試料は固形組織試料である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血液である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血漿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は血清である。別のさらなる態様において、生物学的試料は喀痰である。別のさらなる態様において、試料は尿である。別のさらなる態様において、生物学的試料は気管支肺胞洗浄液である。一態様において、細胞死バイオマーカーは、アポトーシスについてのバイオマーカーである。別の態様において、細胞死バイオマーカーは、ネクローシスについてのバイオマーカーである。別の態様において、細胞死バイオマーカーは、アポトーシスおよびネクローシスの両方についてのバイオマーカーである。一態様において、細胞死バイオマーカーは、サイトケラチン18CK18である。さらなる態様において、方法は、完全長CK18の量を測定する。別の態様において、方法は、カスパーゼ切断CK18の量を測定する。完全長CK18およびカスパーゼ切断CK18の両方を測定するための抗体およびキットは、市販されている。例えば、カスパーゼ切断CK18を検出するためのM30APOPTOSENSEおよび完全長CK18を検出するためのM65ELISAが、PevivaABBrommaSwedenから市販されている。別の態様において、細胞死バイオマーカーは、ヌクレオソームDNAnDNAであるヒストン関連DNAとしても言及される。nDNAを測定するための抗体およびキットは、市販されている。例えば、CellDeathDetectionELISAは、RocheDiagnosticsから市販されている。別の態様において、細胞死マーカーはシクロフィリンAである。本発明の別の局面は、前記のCiz1b変異体転写物またはポリペプチドの相対量を、処置の過程の前、ならびにその間および後のいずれかまたは両方に測定することによって、対象においてガン治療の効力を決定する方法である。本明細書において使用される通り、処置の過程は、特定の期間にわたり追跡される処方された計画を指す。一態様において、方法は以下:iガン治療を用いた処置の前に、対象由来の、試験に供する第1の単離された生物学的試料を提供する工程;iiガン治療を用いた処置の過程の間に、対象由来の、試験に供する第2の単離された生物学的試料を提供する工程;iii各々の生物学的試料を、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと別々に接触させる工程;iv各々の生物学的試料中に存在するCiz1b変異体ポリペプチドの量を測定する工程を含み、第1の試料と比較した、第2の試料中のCiz1b変異体ポリペプチドの量における増加は、ガン治療の効力を示している。別の態様において、方法は以下:iガン治療を用いた処置の前に、対象由来の、試験に供する第1の単離された生物学的試料を提供する工程;iiガン治療を用いた処置の過程の後に、対象由来の、試験に供する第2の単離された生物学的試料を提供する工程;iii各々の生物学的試料を、前記Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと別々に接触させる工程;iv各々の生物学的試料中に存在する前記Ciz1b変異体ポリペプチドの量を測定する工程を含み、第1の試料と比較した、第2の試料中のCiz1b変異体ポリペプチドの量における減少は、ガン治療の効力を示している。他の態様においては、上記の方法を改変し、Ciz1b変異体ポリペプチドよりはむしろ、Ciz1b変異体転写物を検出する。本発明のさらなる局面によれば、核酸配列を含むmRNA分子を検出するためのオリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブを含むキットを提供する。本発明の一態様において、前記キットは、核酸配列を含むか、またはそれからなるオリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブを含む。本発明の好ましい態様において、前記キットは、さらに、熱安定性DNAポリメラーゼおよびデオキシヌクレオチド三リン酸を含む。別の態様において、前記キットは、前記の核酸分子を選択的に増幅するために必要な説明書を含む。本発明のさらなる局面によれば、Ciz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAと、Ciz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;iiiCiz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;ivCiz1複製ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAと、Ciz1固定化ドメインをコードするヌクレオチド配列を含むmRNAの相対的な発現レベルを比較する工程を含み、少なくとも2倍の相対的な発現における差は、ガンを示している。本発明の一態様において、SEQIDNO12のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO18のヌクレオチド配列を含むmRNAの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO12のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;iiiSEQIDNO18のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;ivSEQIDNO12のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO18のヌクレオチド配列を含むmRNAの相対的な発現を比較する工程を含み、相対における少なくとも2倍の差は、ガンを示している。本発明の別の態様において、SEQIDNO13のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO19のヌクレオチド配列を含むmRNAの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO13のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;iiiSEQIDNO19のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;ivSEQIDNO13のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO19のヌクレオチド配列を含むmRNAの相対的な発現を比較する工程を含み、相対における少なくとも2倍の差は、ガンを示している。本発明の別の態様において、SEQIDNO14のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO20のヌクレオチド配列を含むmRNAの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO14のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;iiiSEQIDNO20のヌクレオチド配列を含むmRNAの存在を検出する工程;ivSEQIDNO14のヌクレオチド配列を含むmRNAと、SEQIDNO20のヌクレオチド配列を含むmRNAの相対的な発現を比較する工程を含み、相対における少なくとも2倍の差は、ガンを示している。一態様において、本方法はポリメラーゼ連鎖反応PCRを使用し、前記のCiz1複製および固定化ドメインの存在を検出する。別の態様において、本方法は、さらに、前記試料ならびに前記Ciz1複製の全てまたは一部を増幅するために適するオリゴヌクレオチドプライマー対およびCiz1固定化ドメインの全てまたは一部を増幅するために適するオリゴヌクレオチドプライマー対を含む調製物を形成する工程、および試料でポリメラーゼ連鎖反応を実施する工程を含む。一態様において、ガンは、肺ガン、乳ガン、腎臓ガン、甲状腺ガン、黒色腫、肝臓ガン、膀胱ガン、または結腸ガンである。一態様において、ガンは非小細胞肺ガンNSCLCである。別の態様において、ガンは乳ガンである。別の態様において、ガンは腎臓ガンである。別の態様において、ガンは結腸ガンである。一態様において、Ciz1複製ドメインを増幅する前記オリゴヌクレオチドプライマー対は、からなる群より選択される。別の態様において、前記の増幅された複製ドメインは、配列を含むオリゴヌクレオチドを用いて検出される。別の態様において、Ciz1固定化ドメインを増幅する前記オリゴヌクレオチドプライマー対は、からなる群より選択される。別の態様において、増幅された固定化ドメインは、配列を含むオリゴヌクレオチドを用いて検出される。別において方法は、本発明のCiz1b変異体転写物の発現の分析と組み合わせる。本発明の好ましい方法において、診断方法は、本発明の処置の方法と組み合わせる。本発明の一局面において、Ciz1複製ドメインを含むポリペプチドとCiz1固定化ドメインを含むポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiCiz1複製ドメインおよびCiz1固定化ドメインの存在を検出する工程;iii試料中に存在するCiz1複製ドメインとCiz1固定化ドメインの相対量を比較する工程を含み、ここで、Ciz1複製ドメインとCiz1固定化ドメインの相対量における2倍超の差は、ガンの存在を示している。本発明の態様において、SEQIDNO9のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO15のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO9のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドおよびSEQIDNO15のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの存在を検出する工程;iii試料中に存在するSEQIDNO9のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO15のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドの相対量を比較する工程を含み、SEQIDNO9のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO15のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの相対量における2倍超の差は、ガンの存在を示している。本発明の別の態様において、SEQIDNO10のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO16のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO10のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドおよびSEQIDNO16のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの存在を検出する工程;iii試料中に存在するSEQIDNO10のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドとSEQIDNO16のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの相対量を比較する工程を含み、ここで、SEQIDNO10のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドとSEQIDNO16のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの相対量における2倍超の差は、ガンの存在を示している。本発明の別の態様において、SEQIDNO11のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO17のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;iiSEQIDNO11のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドおよびSEQIDNO17のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの存在を検出する工程;iii前記試料中に存在するSEQIDNO11のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドとSEQIDNO17のアミノ酸配列を含む前記Ciz1ポリペプチドの相対量を比較する工程を含み、SEQIDNO11のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドとSEQIDNO17のアミノ酸配列を含むCiz1ポリペプチドの相対量における2倍超の差は、ガンの存在を示している。本発明の別の態様において、Ciz1複製ドメインを含むポリペプチドとCiz1固定化ドメインを含むポリペプチドの発現を比較することによって、対象においてガンを診断するための方法を提供し、この方法は以下:i試験に供する単離された生物学的試料を提供する工程;ii前記の生物学的試料を、Ciz1ポリペプチド複製ドメインに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと接触させる工程;iii生物学的試料を、前記Ciz1ポリペプチド固定化ドメインに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと接触させる工程;ivCiz1bポリペプチド複製ドメインに結合したおよびCiz1bポリペプチド固定化ドメインに結合した抗体または抗原結合フラグメントの存在を検出する工程;v試料中に存在する前記Ciz1bポリペプチド複製ドメインと前記Ciz1bポリペプチド固定化ドメインの相対量を比較する工程を含み、Ciz1bポリペプチド複製ドメインと前記Ciz1bポリペプチド固定化ドメインの相対量における2倍超の差は、ガンの存在を示している。一態様において、固定化ドメインより少なくとも2倍より多い複製ドメインの存在は、転移性ガンを示している。本発明のさらなる局面によれば、Ciz1の複製ドメインおよびCiz1の固定化ドメインを含む核酸分子を特異的に増幅するように適応されたオリゴヌクレオチドプライマーを含むキットを提供する。本発明の一態様において、複製ドメインを増幅するオリゴヌクレオチドプライマーは、である。本発明の好ましい方法において、固定化ドメインを増幅するオリゴヌクレオチドプライマーは、である。本発明の好ましい態様において、前記キットは、増幅されたCiz1複製ドメインを検出する、より選択されるオリゴヌクレオチドプローブを含む。本発明の好ましい態様において、キットは、増幅されたCiz1固定化ドメインを検出する、より選択されるオリゴヌクレオチドプローブを含む。本発明のさらなる局面によれば、Ciz1タンパク質の複製ドメインに特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合フラグメント、およびCiz1タンパク質の固定化ドメインに特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合フラグメントを含むキットを提供する。本発明の別の局面は、ガン患者の予後を示すためのCiz1複製ドメインおよび固定化ドメインまたはこれをコードするmRNAの検出を含む上記の方法の使用に関する。一部の態様において、上記の方法は、腫瘍自体よりむしろ、腫瘍に隣接する組織における相対的レベルを測定し、ここで固定化ドメインより少なくとも2倍より多い複製ドメインを伴う患者は、2倍未満の差を伴う患者と比較して、より不良な予後を有する。一部の態様において、隣接組織は、腫瘍境界の20mm、15mm、10mm、または5mm内である。本発明の好ましい態様において、抗体はモノクローナル抗体である。本発明のCiz1ポリペプチドに結合する抗体は、好ましくは、例えば、モノクローナル抗体、またはその抗原結合フラグメントのように単一特異的である。用語単一特異的抗体は、エピトープ等の特定の標的について単一の結合特異性および親和性を示す抗体を指す。この用語はモノクローナル抗体を含み、それは、単一分子種として、例えば、均一な単離細胞の集団から産生される抗体を指す。モノクローナル抗体組成物は、抗体の単一分子種を含む組成物中の抗体またはそのフラグメントの調製物を指す。一態様において、モノクローナル抗体は、哺乳動物細胞によって産生される。1つまたは複数のモノクローナル抗体種を組み合わせてもよい。本発明の抗体は、組換えであってもよく、または、ハイブリドーマ技術を使用して産生されてもよい。Ciz1ポリペプチド結合抗体は、完全長例えば、IgG例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA例えば、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEであるか、または、抗原結合フラグメント例えば、Fab、Fab、F2、またはscFvフラグメントだけを含んでもよく、例えば、それは、FcドメインまたはCH2、CH3、もしくはCH4配列を含まない。抗体は、2つの重鎖免疫グロブリンおよび2つの軽鎖免疫グロブリンを含みうるか、または、一本鎖抗体でありうる。抗体は、場合によっては、カッパ、ラムダ、アルファ、ガンマ、デルタ、エプシロン、またはミュー定常領域遺伝子より選ばれる定常領域を含む。本発明のCiz1ポリペプチド結合抗体は、ヒトIgG1定常領域またはその一部などの実質的にヒト抗体由来の、またはマウス、ラット、イヌ、ネコ、ヤギ、ヒツジ、ウシ、ウマ、ニワトリ、またはモルモットを含むがこれに限定されない別の種由来の重鎖および軽鎖定常領域を含む。一態様において、抗体またはそのフラグメントは、例えば、キメラ、ヒト化、脱免疫化、またはインビトロ生成抗体のような組換えまたは改変抗体である。用語組換えまたは改変抗体は、本明細書において使用される通り、組換え手段によって調製、発現、作製、または単離された全ての抗体、例えば宿主細胞中にトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現された抗体、組換えコンビナトリアル抗体ライブラリーから単離された抗体、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックである動物例えば、マウスから単離された抗体、または他のDNA配列への免疫グロブリン遺伝子配列のスプライシングを含む任意の他の手段によって調製、発現、作製、または単離された抗体などを含むことが意図される。そのような組換え抗体は、ヒト化、CDRグラフト、キメラ、脱免疫、インビトロで生成された抗体を含み、場合によっては、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する定常領域を含みうる。本明細書において使用される通り、用語抗体は、少なくとも1つの免疫グロブリン可変ドメインまたは免疫グロブリン可変ドメイン配列を含むタンパク質を指す。例えば、抗体は、重H鎖可変領域本明細書においてVHとして省略されるおよび軽L鎖可変領域本明細書においてVLとして省略されるを含みうる。別の例において、抗体は、2つの重H鎖可変領域および2つの軽L鎖可変領域を含む。別の例において、抗体はラクダ単一ドメインVH抗体である。用語抗体は、抗体の抗原結合フラグメント例えば、単鎖抗体、Fabフラグメント、F2、Fdフラグメント、Fvフラグメント、およびdAbフラグメントならびに完全抗体を包含する。VHおよびVL領域は、さらに、相補性決定領域CDRと呼ばれる超可変領域に細分化することができ、フレームワーク領域FRと呼ばれるより保存された領域が散在する。フレームワーク領域およびCDRの範囲が、正確に定義されているKabatEAetalSequencesofProteinsofImmunologicalInterestFifthEditionUSDepartmentofHealthandHumanServicesNIHPublicationNo913242、およびChothiaCetalJMolBiol196901917を参照のこと。Kabatの定義を本明細書において使用する。各々のVHおよびVLは、典型的には、3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ末端からカルボキシ末端に以下の順番で配置される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリン分子の可変または定常ドメイン由来のドメインを指す。免疫グロブリンドメインは、典型的には、約7つのベータ鎖で形成される2つのベータシート、および保存されたジスルフィド結合を含む例えば、AFWilliamsandANBarclay1988AnnRevImmunol6381405を参照のこと。免疫グロブリン可変の超可変ループの正準構造は、その配列から推測することができ、ChothiaetalJMolBiol227799817;TomlinsonetalJMolBiol227776798;およびTomlinsonetalEMBOJ14462838に記載される通りである。本明細書において使用されるように、免疫グロブリン可変ドメイン配列は、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成することができるアミノ酸配列を指す。例えば、配列は、天然の可変ドメインのアミノ酸配列の全てまたは一部を含みうる。例えば、配列は、1つ、2つまたはそれ以上のNまたはC末端アミノ酸を省略してもよく、内部のアミノ酸は、1つまたは複数の挿入または追加末端アミノ酸を含んでもよく、あるいは他の変化を含んでいてもよい。一態様において、免疫グロブリン可変ドメイン配列を含むポリペプチドは、別の免疫グロブリン可変ドメイン配列に結合し、標的結合構造または抗原結合部位、例えば、本発明のCiz1ポリペプチドと相互作用する、例えば、本発明のCiz1ポリペプチド例えば、b変異体に結合するか、またはそれを阻害する構造を形成することができる。抗体のVHまたはVL鎖は、さらに、重鎖または軽鎖の定常領域の全てまたは一部を含むことができ、それにより、免疫グロブリン重鎖または軽鎖をそれぞれ形成する。一態様において、抗体は、2つの免疫グロブリン重鎖および2つの免疫グロブリン軽鎖のテトラマーであって、この免疫グロブリン重鎖および軽鎖は、例えば、ジスルフィド結合によって相互連結されている。重鎖定常領域は3つのドメイン、CH1、CH2、およびCH3を含む。軽鎖定常領域はCLドメインを含む。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、典型的には、免疫系の種々の細胞例えば、エフェクター細胞および古典的補体系の第1成分C1qを含む宿主組織または因子への抗体の結合を媒介する。用語抗体は、IgA、IgG、IgE、IgD、IgM型ならびにそれらのサブタイプを含むのインタクトな免疫グロブリンを含む。一態様において、抗体はIgAである。別の態様において、抗体はIgGである。別の態様において、抗体はIgEである。別の態様において、抗体はIgDである。別の態様において、抗体はIgMである。免疫グロブリンの軽鎖は、カッパまたはラムダ型でありうる。一態様において、抗体をグリコシル化する。抗体は、抗体依存的な細胞傷害性および/または補体媒介性の細胞傷害性について機能的でありうる。抗体の1つまたは複数の領域は、ヒトでありうるか、または事実上ヒトでありうる。例えば、可変領域の1つまたは複数は、ヒトでありうるか、または事実上ヒトでありうる。例えば、CDRの1つまたは複数は、ヒトでありえ、例えば、HCCDR1、HCCDR2、HCCDR3、LCCDR1、LCCDR2、およびLCCDR3である。軽鎖CDRの各々はヒトでありうる。HCCDR3はヒトでありうる。フレームワーク領域の1つまたは複数は、ヒトでありえ、例えば、HCまたはLCのFR1、FR2、FR3、およびFR4である。一態様において、全てのフレームワーク領域は、ヒトであり、例えば、ヒト体細胞に由来し、例えば、免疫グロブリンを産生する造血細胞または非造血細胞である。一態様において、ヒト配列は生殖系列配列であり、例えば、生殖系列核酸によってコードされる。定常領域の1つまたは複数は、ヒトでありうる、または、事実上ヒトでありうる。別の態様において、例えば、FR1、FR2、およびFR3をまとめた、またはFR1、FR2、FR3、およびFR4をまとめたフレームワーク領域の少なくとも70、75、80、85、90、92、95、もしくは98または抗体全体は、ヒトまたは事実上ヒトであり得る。例えば、FR1、FR2、およびFR3をまとめたものは、軽鎖または重鎖配列をコードする遺伝子座のヒト生殖系列Vセグメントによってコードされるヒト配列と少なくとも70、75、80、85、90、92、95、98、または99同一でありうる。抗体の全てまたは一部は、免疫グロブリン遺伝子またはそのセグメントによってコードされうる。例示的な免疫グロブリン遺伝子は、カッパ、ラムダ、アルファIgA1およびIgA2、ガンマIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、デルタ、イプシロン、およびミュー定常領域遺伝子、ならびに無数の免疫グロブリン可変領域遺伝子を含む。完全長の免疫グロブリン軽鎖約25Kdまたは214のアミノ酸が、NH2末端の可変領域遺伝子約110アミノ酸およびCOOH末端のカッパまたはラムダ定常領域遺伝子によってコードされる。完全長の免疫グロブリン重鎖約50Kdまたは446のアミノ酸は、同様に、可変領域遺伝子約116アミノ酸および他の前述の定常領域遺伝子の1つ、例えば、ガンマ約330アミノ酸をコードするによってコードされる。軽鎖は、軽鎖可変ドメインを含む任意のポリペプチドを指す。重鎖は、重鎖可変ドメインを含む任意のポリペプチドを指す。完全長抗体の用語抗原結合フラグメントまたは、単に抗体部分またはフラグメントは、本明細書において使用される通り、目的の標的に特異的に結合するための能力を保持する完全長抗体の1つまたは複数のフラグメントを指す。完全長抗体の用語抗原結合フラグメント内に包含される結合フラグメントの例は、iFabフラグメント、VL、VH、CL、およびCH1ドメインからなる一価フラグメント;iiF2フラグメント、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された2つのFabフラグメントを含む二価フラグメント;iiiVHおよびCH1ドメインからなるFdフラグメント;iv抗体の単一アームのVLおよびVHドメインからなるFvフラグメント;vdAbフラグメントWardetalNature341544546、VHドメインからなる;およびvi機能性を保持する、単離された相補性決定領域CDRを含む。さらに、Fvフラグメントの2つのドメイン、VLおよびVHは、別々の遺伝子によってコードされるが、それらは、組換え方法を使用して、それらを単一タンパク質鎖として作ることを可能にする合成リンカーによって結合することができ、ここでVLおよびVH領域が対合し、単鎖Fvとして公知である一価の分子を形成する。例えば、BirdetalScience242423426;およびHustonetalProcNatlAcadSciUSA8558795883を参照のこと。ヒト化免疫グロブリン可変領域は、十分な数のヒトフレームワークのアミノ酸位置を含む免疫グロブリン可変領域であり、免疫グロブリン可変領域が、正常なヒトにおいて免疫原性応答を誘発しないようになる。ヒト化免疫グロブリンの記載は、例えば、米国特許第6407213号および米国特許第5693762号を含む。事実上ヒトの免疫グロブリン可変領域は、十分な数のヒトフレームワークのアミノ酸位置を含む免疫グロブリン可変領域であり、免疫グロブリン可変領域が、正常なヒトにおいて免疫原性応答を誘発しないようになる。事実上ヒトの抗体は、十分な数のヒトのアミノ酸位置を含む抗体であり、抗体が、正常なヒトにおいて免疫原性応答を誘発しないようになる。本明細書において使用される通り、結合親和性は、見掛けの会合定数またはKaを指す。結合親和性は解離定数Kdとして表現してもよく、それはKaの逆数である。抗体などの標的結合剤は、例えば、特定の標的分子について105、106、107、または108M未満のKdを有しうる。結合親和性における差例えば、特異性または他の比較については、例えば、少なくとも15、2、5、10、50、100、または1000倍でありうる。例えば、Ciz1ポリペプチド結合タンパク質は、エクソン14bの代わりにエクソン14aによってコードされるアミノ酸配列を含む別のCiz1ポリペプチドよりも、少なくとも15、2、5、10、50、100、または1000倍良くCiz1b変異体に優先的に結合しうる。Ciz1ポリペプチド結合タンパク質はまた、種特異的または種一般的でありうる例えば、1を上回る種由来の本発明のCiz1ポリペプチドに結合することができる、または、例えば、ヒトCiz1b変異体などのヒトCiz1ポリペプチドに特異的でありうる。結合親和性は、平衡透析、平衡結合、ゲルろ過法、ELISA、表面プラズモン共鳴、または分光法例えば、蛍光アッセイを使用してを含む種々の方法によって決定することができる。これらの技術を使用し、リガンドまたは標的濃度の関数として結合リガンドおよび遊離リガンドの濃度を測定することができる。結合リガンド[結合]の濃度は、遊離リガンド[遊離]の濃度および標的上のリガンドについての結合部位の濃度と関係し、ここで、Nは、以下の等式による標的分子当たりの結合部位の数である:[結合]=N[遊離]/[遊離]。Kaの定量的測定は通常行われるが、Kaの正確な決定を行うことが常に必要というわけではない。場合によっては、例えば、ELISAまたはFACS分析などの方法を使用して決定される、Kaに比例する、定性的な親和性の測定値を得ることで十分であるため、従って、例えば、参照よりも高い親和性であるか、例えば、2、5、10、20、または50倍高いか否かの決定などの比較のために使用することができる。結合親和性は、典型的には、001MHEPESpH74、015MNaCl、3mMEDTA、および0005vv界面活性剤P20中で評価する。タンパク質産生。標準的な組換え核酸方法を使用し、本発明のCiz1ポリペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現させることができる。例えば、SambrookRussellMolecularCloningALaboratoryManual3rdEditionColdSpringHarborLaboratoryNYおよびAusubeletalCurrentProtocolsinMolecularBiologyに記載される技術を参照のこと。一般的に、結合タンパク質をコードする核酸配列を、核酸発現ベクター中にクローン化する。タンパク質が複数のポリペプチド鎖を含む場合、各々の鎖は、例えば、同じまたは異なるベクターのような発現ベクター中にクローン化することができ、それは、同じまたは異なる細胞中で発現される。抗体を産生するための方法も、以下に提供される。Fabなどの一部の抗体は、大腸菌Ecoli細胞などの細菌細胞中で産生することができる。抗体はまた、真核生物細胞中で産生することができる。一態様において、抗体例えば、scFvなどを、ピキア例えば、PowersetalJImmunolMethods25112335を参照のこと、ハンゼヌラ、またはサッカロミセスなどのような酵母細胞において発現させる。一態様において、抗体は哺乳動物細胞中で産生される。クローン抗体またはその抗原結合フラグメントを発現させるための好ましい哺乳動物宿主細胞は、チャイニーズハムスター卵巣CHO細胞dhfrCHO細胞を含む。UrlaubandChasinProcNatlAcadSciUSA7742164220に記載。DHFR選択可能なマーカーと使用。例えば、KaufmanandSharpMolBiol159601621に記載される通り、リンパ球細胞株、例えば、NSO骨髄腫細胞、SP2細胞、COS細胞、HEK293T細胞、およびトランスジェニック動物、例えば、トランスジェニック哺乳動物由来の細胞を含む。例えば、細胞は乳房上皮細胞である。免疫グロブリンドメインをコードする核酸配列に加えて、組換え発現ベクターは、追加の配列、例えば宿主細胞においてベクターの複製を調節する配列例えば、複製起点および選択可能なマーカー遺伝子などを保有しうる。選択可能なマーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞の選択を促進する例えば、米国特許第4399216号、第4634665号、および第5179017号を参照のこと。例えば、典型的には、選択可能なマーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞に、薬物、例えばG418、ハイグロマイシン、またはメトトレキサートなどに対する耐性を付与する。好ましい選択可能なマーカー遺伝子は、ジヒドロ葉酸還元酵素DHFR遺伝子メトトレキサート選択/増幅を伴うdhfr宿主細胞中での使用およびneo遺伝子G418選択のためを含む。別の例示的な発現システムは、LonzaGroupLtdCHから入手可能なグルタミンシンターゼGSベクターシステムである例えば、ClarketalBioProcessInternational24852;BarnesetalBiotechBioeng81631639を参照のこと。抗体またはその抗原結合部分の組換え発現のための例示的なシステムにおいて、抗体重鎖および抗体軽鎖の両方をコードする組換え発現ベクターを、例えば、リン酸カルシウム媒介トランスフェクションによってdhfrCHO細胞中に導入する。組換え発現ベクター内に、抗体重鎖および軽鎖遺伝子を、エンハンサー/プロモーター調節エレメント例えば、SV40、CMV、アデノウイルスなどに由来する。例えばCMVエンハンサー/AdMLPプロモーター調節エレメントまたはSV40エンハンサー/AdMLPプロモーター調節エレメントなどに、各々、機能しうる態様で連結し、高レベルの遺伝子の転写をおこす。組換え発現ベクターはまたDHFR遺伝子を保有し、それは、メトトレキサート選択/増幅を使用して、ベクターを用いてトランスフェクトされたCHO細胞の選択を可能にする。選択された形質転換宿主細胞を培養し、抗体の重鎖および軽鎖の発現を可能にする。インタクトな抗体が、培養培地から回収される。標準的な分子生物学的技術を使用し、組換え発現ベクターを調製し、宿主細胞をトランスフェクトし、形質転換体について選択し、宿主細胞を培養し、培養培地から抗体を回収する。例えば、一部の抗体を、プロテインAまたはプロテインGを用いた親和性クロマトグラフィーによって単離することができる。コドン使用頻度は、宿主細胞のコドンバイアスに適応させることができる。例えば、CHO細胞について、それは、モンゴルキヌゲネズミCricetulusgriseus遺伝子のコドンバイアスに適応させることができる。また、非常に高い80または非常に低い30GC含量の領域は、可能な場合、回避することができる。最適化プロセスの間、以下のシス作用性配列モチーフを回避する:内部TATAボックス;カイ部位およびリボソーム進入部位;ATリッチまたはGCリッチ配列ストレッチ;ARE、INS、CRS配列エレメント;リピート配列およびRNA二次構造;ならびに暗号化スプライスドナーおよびアクセプター部位、分岐点。2つのストップコドンを使用して、効率的な終結を確実にすることができる。配列のコドン最適化を、SharpPMLiWHNucleicAcidsRes151987に従って評価することができる。標準コドン適応指数CAIを使用することができる。稀なコドンは、0~40のクオリティクラスを伴うものを含む。アプタマー。一態様において、本発明はまた、標的タンパク質結合剤、例えば、アプタマーなどを特徴とする。アプタマーは、核酸アプタマーまたはペプチドアプタマーでありうる。用語核酸アプタマーは、本明細書において使用される通り、少なくとも5つのヌクレオチドの内部非デュプレックス核酸構造を含む立体構造を有する核酸分子を指す。アプタマーは、自己相補性の領域を有する一本鎖核酸分子でありうる。ペプチドアプタマーは、頑強な不活性タンパク質スキャフォールドにおいて提示され、立体構造的に制約される短いペプチド配列であるEvansetalJournalofBiology200873、その全体において組み入れられる。タンパク質スキャフォールドによって適用される挿入ペプチドの三次元構造的な制約は、現実に、非制約ペプチド配列のそれを上回り、標的についてアプタマーの親和性を向上させる。例示的なアプタマーは、本発明のCiz1ポリペプチド例えば、b変異体に結合する核酸分子およびペプチドを含む。特定のアプタマーを、多くの場合において、抗体の代わりに使用してもよい。本発明のCiz1ポリペプチドに結合する他のペプチドも含まれる。ペプチド様分子、例えば、ペプトイドなどが、さらに、本発明に含まれる。ペプトイドまたはポリN置換グリシンは、側鎖が、α炭素それらがアミノ酸である場合よりむしろ、ペプチド骨格の窒素原子に付加されるペプチド模倣物のクラスである。T細胞受容体はまた、標的結合剤として使用することができる。用語結合剤は、実験条件下で本発明のCiz1ポリペプチド例えば、Ciz1b変異体に結合することが可能な薬剤を指し、非限定的に、Fab、Fab、F2、scFv、または単一ドメイン抗体sdAbナノボディともいうを含むがこれに限定されない抗体およびその抗原抗体結合フラグメント、核酸アプタマー、およびペプチドアプタマーを含む。Ciz1ポリペプチド結合剤は、インビトロおよびインビボでの診断的有用性を有する。例えば、対象に由来する試料中のCiz1ポリペプチドのレベルの測定を、疾患、例えばガンなどの診断のために使用することができる。さらに、Ciz1ポリペプチドレベルのモニタリングおよび定量化を予後判定に使用し、病気の進行を病期分類し、ガン対象を処置するために使用される薬剤の効力を評価することができる。一局面において、Ciz1ポリペプチドを含みうる生物学的試料、例えば、肺組織または他の生物学的組織などを、特定のガンまたはガンのリスクを有することが疑われる対象から得る。全組織または細胞の一定分量を、当業者に公知の種々の可溶化カクテルのいずれか1つを使用して可溶化する。例えば、組織を、8M尿素、20mlのNonidetP40界面活性剤、20mlの両性電解質液pH35~10、20mlの2メルカプトエタノール、および02mMフッ化フェニルメチルスルホニルPMSFを蒸留脱イオン水1リットル当たり中に含む溶解バッファーの添加によって可溶化することができる。一局面において、本発明は、本発明のCiz1ポリペプチドの存在を、インビトロ例えば、組織のような生物学的試料、生検、例えば、ガン性組織またはインビボ例えば、対象におけるインビボ撮像で検出するための診断方法を提供する。本方法は以下:i試料を、本発明の結合剤のCiz1ポリペプチド例えば、抗体、抗原結合フラグメントまたはアプタマーと接触させること;およびiiCiz1ポリペプチド結合剤と試料の間の複合体の形成を検出すること、を含む。本方法はまた、参照試料例えば、対照試料を結合剤と接触させ、参照試料についてのそれと比べて、結合剤と試料の間での複合体形成の範囲を決定することを含むことができる。対照試料または対象と比べた、試料または対象における複合体の形成における変化、例えば、統計的に有意な変化は、試料中の本発明のCiz1ポリペプチド例えば、b変異体の存在を示しうる。本発明の結合剤のCiz1ポリペプチドを、検出可能な物質を用いて直接的にまたは間接的に標識し、結合または非結合抗体の検出を促進することができる。適した検出可能な物質は、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、および放射性物質を含む。本明細書に記載される局面の一部の態様において、Ciz1ポリペプチドに対して特異的な薬剤、例えば抗体またはその抗原結合フラグメント、天然または組換えリガンド、小分子、あるいは修飾部分などを、タグを用いて直接的に標識し、修飾の検出を促進する。用語標識またはタグは、本明細書において使用される通り、標的の存在を示している検出可能なシグナル、例えば、生物学的試料中での特定の修飾の存在などを産生することが可能な組成物を指す。適した標識は、蛍光分子、放射性同位体、ヌクレオチド発色団、酵素、基質、化学発光部分、磁性粒子、生物発光部分、ペプチドタグcMyc、HA、VSVG、HSV、FLAG、V5、またはHISなどを含む。そのようなものとして、標識は、Ciz1ポリペプチドを同定するための方法のために必要とされる分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、電気的、光学的、または化学的手段によって検出可能な任意の組成物である。本明細書に記載される局面の一部の態様において、修飾部分自体を直接的に標識してもよい。例えば、放射性標識または蛍光標識を使用することができ、タンパク質修飾を、抗体を使用することなく、直接的にまたは他の修飾と組み合わせて読むことができるようになる。また、当然、抗体を標識し、それらの直接的な検出を補助することもできる。用語標識抗体またはタグ付き抗体は、本明細書において使用される通り、検出可能な手段によって標識された抗体を含み、非限定的に、蛍光、酵素、放射性、および化学発光標識された抗体を含む。抗体はまた、検出可能なタグ、例えばcMyc、HA、VSVG、HSV、FLAG、V5、またはHISなどを用いて標識することができ、それらは、タグに特異的な抗体、例えば、抗cMyc抗体を使用して検出することができる。抗体はまた、酵素例えば、アルカリホスファターゼ、酸性ホスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、ベータガラクトシダーゼ、およびリボヌクレアーゼを用いて標識することもできる。結合剤を標識する種々の方法が、当技術分野において公知であり、使用されうる。本発明の方法における使用のための抗体を標識するための蛍光標識またはタグの非限定的な例は、ヒドロキシクマリン、スクシンイミジルエステル、アミノクマリン、スクシンイミジルエステル、メトキシクマリン、スクシンイミジルエステル、カスケードブルー、ヒドラジド、パシフィックブルー、マレイミド、パシフィックオレンジ、ルシファーイエロー、NBD、NBDX、RフィコエリトリンPE、PECy5コンジュゲートCychrome、R670、TriColor、QuantumRed、PECy7コンジュゲート、レッド613、PEテキサスレッド、PerCP、ペリジニンクロロフィルタンパク質、TruRedPerCPCy55コンジュゲート、FluorX、フルオレセインイソチオシアネートFITC、BODIPYFL、TRITC、XローダミンXRITC、LissamineローダミンB、テキサスレッド、アロフィコシアニンAPC、APCCy7コンジュゲート、AlexaFluor350、AlexaFluor405、AlexaFluor430、AlexaFluor488、AlexaFluor500、AlexaFluor514、AlexaFluor532、AlexaFluor546、AlexaFluor555、AlexaFluor568、AlexaFluor594、AlexaFluor610、AlexaFluor633、AlexaFluor647、AlexaFluor660、AlexaFluor680、AlexaFluor700、AlexaFluor750、AlexaFluor790、Cy2、Cy3、Cy3B、Cy35、Cy5、Cy55、またはCy7を含む。種々の適した蛍光剤と発色剤が、StryerScience162526およびBrandLetalAnnualReviewofBiochemistry41843868により記載されている。結合タンパク質を、例えば米国特許第3940475号、第4289747号、および第4376110号に開示されるものなどの従来の手順によって、蛍光発色基を用いて標識することができる。一態様において、蛍光剤はフルオレセインおよびローダミンを含むキサンテン色素である。別の態様において、蛍光化合物はナフチルアミンである。一度、フルオロフォアまたは発色団を用いて標識されれば、結合タンパク質を使用し、例えば、蛍光顕微鏡を使用して、試料中の本発明のCiz1ポリペプチドの存在または局在を検出することができる。一態様において、蛍光顕微鏡は共焦点またはデコンボリューション顕微鏡である。同様に、生物発光化合物を使用し、Ciz1抗体を標識してもよい。生物発光タンパク質の存在は、発光の存在を検出することによって決定される。標識の目的のための重要な生物発光化合物は、ルシフェリン、ルシフェラーゼ、およびエクオリンである。本発明の特定の態様において、生物学的試料中のCiz1ポリペプチドのレベルを、二次元ゲル電気泳動によって分析することができる。二次元電気泳動の方法は、当業者に公知である。生物学的試料、例えば組織試料などを、電荷に基づいてタンパク質を分離する一次元での等電点電気泳動分離のために、電気泳動ゲル上に添加する。多数の一次元ゲル調製物を利用することができ、担体両性電解質ベースの分離用チューブゲルまたは固定化勾配ベースの分離用ゲルストリップを含む。一次元分離後、タンパク質を、平衡化手順に続き、二次元ゲル上にトランスファーし、分子量に基づいてタンパク質を分離するSDSPAGEを使用して分離する。異なる対象に由来する生物学的試料を比較する場合、複数のゲルを、個々の生物学的試料正常対照由来の試料を含むから調製する。分離に続き、タンパク質を、二次元ゲルから、ウエスタンブロッティングのために一般に使用されるメンブレン上にトランスファーする。タンパク質のウエスタンブロッティングおよびその後の可視化の技術はまた、当技術分野において周知であるSambrooketalMolecularCloningALaboratoryManual2supndEditionVolume31989ColdSpringHarbor。標準的な手順を使用してもよく、または、手順を、特定の型、例えば高度に塩基性もしくは酸性、または脂質可溶性などのタンパク質の同定のために、当技術分野において公知の通りに改変してもよい例えば、Ausubeletal1999CurrentProtocolsinMolecularBiologyWileySonsIncNYを参照のこと。Ciz1ポリペプチドに結合する抗体を、インキュベーション工程において利用する。これはウエスタンブロット分析の手順と同様である。一次抗体に対して特異的な二次抗体を、ウエスタンブロット分析の手順において利用し、一次抗体と反応したタンパク質を可視化する。生物学的試料中のCiz1ポリペプチドレベルの検出はまた、処置の間の潜在的な抗ガン剤の効力をモニターするために使用することができる。例えば、Ciz1ポリペプチド産生のレベルを、処置の前およびその間に決定することができる。薬剤の効力は、処置を通してCiz1発現を比較することによって、追跡することができる。効力を示す薬剤は、薬剤を用いた処置が進行するにつれて、Ciz1ポリペプチド産生のレベルを減少させるものである。Ciz1ポリペプチド結合剤と本発明のCiz1ポリペプチド例えば、b変異体の間の複合体形成を、Ciz1ポリペプチドに結合した結合剤または非結合剤のいずれかを測定または可視化することによって検出することができる。本発明のアッセイ、例えば、イムノアッセイは、競合的および非競合的サンドイッチアッセイを含む。本発明のイムノアッセイは、非限定的に、例えば、ウエスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ELISA酵素結合免疫吸着アッセイ、サンドイッチイムノアッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降反応、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体固定アッセイ、免疫放射線アッセイ、蛍光イムノアッセイ、プロテインAイムノアッセイ、フローサイトメトリー、または組織の免疫組織化学など、少数の技術を使用したアッセイ系を含む。さらに、Ciz1ポリペプチド結合剤の標識に、本発明のCiz1ポリペプチドの存在を、検出可能な物質を用いて標識したスタンダードおよび非標識Ciz1ポリペプチド結合剤を利用した競合イムノアッセイによって、試料中でアッセイすることができる。このアッセイの1つの例において、生物学的試料、標識スタンダード、およびCiz1ポリペプチド結合剤を混合し、非標識結合剤に結合した標識スタンダードの量を決定する。試料中の本発明のCiz1ポリペプチドの量は、Ciz1ポリペプチド結合剤に結合した標識スタンダードの量に反比例する。組織学的分析。免疫組織化学は、Ciz1ポリペプチド結合剤例えば、抗体、その抗原結合フラグメント、またはアプタマーを使用して実施することができる。例えば、抗体の場合において、抗体を、標識例えば、精製またはエピトープタグなどを用いて合成することができる、または、例えば、標識または標識結合基をコンジュゲートさせることによって、検出可能に標識することができる。例えば、キレーターを抗体に付着させることができる。抗体を、次に、組織学的調製物、例えば、顕微鏡スライド上にある固定化した組織切片と接触させる。結合のためのインキュベーション後、調製物を洗浄し、非結合抗体を除去する。調製物を、次に、例えば、顕微鏡法を使用して分析し、抗体が調製物に結合したかどうかを特定する。この方法を使用し、細胞または組織例えば、ガン細胞または固体腫瘍組織試料を評価することができる。抗体または他のポリペプチドもしくはペプチドは、結合時に非標識でありうる。結合および洗浄後、抗体を、それを検出可能にするために、標識する。タンパク質アレイ。Ciz1ポリペプチド結合剤はまた、アレイ例えば、タンパク質アレイまたはマイクロアレイ上に固定化することができる。アレイを診断ツールとして使用し、例えば、医学的試料例えば、単離細胞、血液、血漿、血清、尿、喀痰、生検などをスクリーニングすることができる。当然、アレイはまた、例えば、本発明のCiz1ポリペプチドまたは他の標的分子に結合する他の結合タンパク質を含みうる。ポリペプチドアレイを産生するための方法は、例えば、DeWildtetalNatBiotechnol18989994LuekingetalAnalBiochem270103111GeNucleicAcidsRes28e3lVIIMacBeathandSchreiberScience28917601763WO0140803およびWO9951773A1に記載されている。アレイ用のポリペプチドは、例えば市販のロボット装置を使用して、高速でスポットすることができる。アレイ基板は、例えば、ニトロセルロース、プラスチック、ガラス、例えば、表面修飾ガラスでありうる。アレイはまた、多孔性マトリクス、例えば、アクリルアミド、アガロース、または他のポリマーを含むことができる。例えば、アレイは、抗体のアレイでありえ、例えば、DeWildt上記に記載される通りである。結合タンパク質を産生する細胞を、アレイ化フォーマットにおいてフィルター上で増殖させることができる。ポリペプチド産生が誘導され、発現されたポリペプチドは、細胞の位置でフィルターに固定化される。タンパク質アレイを、標識された標的と接触させて、各々の固定化ポリペプチドへの標的の結合の範囲を決定することができる。標的が非標識である場合、サンドイッチ方法を使用して、例えば、非標識プローブを使用して、非標識標的の結合を検出することができる。アレイの各アドレスでの結合の範囲についての情報は、例えば、コンピュータデータベース中に、プロファイルとして保存することができる。タンパク質アレイを反復で産生し、例えば、標的および非標的の結合プロファイルを比較するために使用することができる。FACS蛍光活性化細胞選別。Ciz1ポリペプチド結合剤を使用し、細胞またはタンパク質、例えば、患者試料などの生物学的試料中の細胞またはタンパク質を標識することができる。結合タンパク質をまた、蛍光化合物に付着させることもできるまたは付着可能である。細胞を、次に、蛍光活性化細胞選別を使用して選別することができる例えば、BectonDickinsonImmunocytometrySystemsSanJoseCalifから入手可能な選別機を使用する;米国特許第5627037号;第5030002号;および第5137809号も参照のこと。細胞が選別機を通過する際、レーザービームが蛍光化合物を励起し、検出器は、通過する細胞をカウントし、蛍光化合物が細胞に付着しているか否かを、蛍光を検出することによって決定する。各々の細胞に結合した標識の量を、定量化し、分析し、試料を特徴付けることができる。選別機はまた、細胞を偏向させ、結合タンパク質によって結合した細胞を、結合していない細胞から分離することができる。分離された細胞を培養および/または特徴付けることができる。インビボ撮像。さらに別の態様において、本発明は、インビボのCiz1ポリペプチド例えば、b変異体発現ガン性組織またはその残遺物の存在を検出するための方法を提供する。本方法は、Ciz1ポリペプチド結合剤を対象に投与する工程;および、Ciz1ポリペプチド結合剤を対象において検出する工程を含む。検出する工程は、複合体の形成の位置または時間を決定することを含みうる。本方法は、対象、例えば、対象の身体の部位をスキャニングまたは、他の方法では、撮像することを含むことができる。別の方法は、i対象例えば、ガンまたは腫瘍性疾患を有する患者に、検出可能なマーカーにコンジュゲートされたCiz1ペプチド結合抗体を投与する工程;ii対象を、Ciz1ポリペプチド発現組織または細胞に対する前記の検出可能なマーカーを検出するための手段に曝露する工程を含む。例えば、本方法を使用して、患者において、死んだかまたは死にかけているガン細胞から放出されたCiz1b変異体を可視化することができる。対象を、例えば、NMRまたは他の断層撮影手段によって撮像することができる。診断撮像のために有用な標識の例は、放射性標識、例えば131I、111In、123I、99mTc、32P、125I、3H、14C、および188Rhなど、蛍光標識、例えばフルオレセインおよびローダミンなど、核磁気共鳴活性標識、陽電子放射断層撮影PETスキャナによって検出可能な陽電子放出同位体、化学発光体、例えばルシフェリンなど、および酵素マーカー、例えば、ペルオキシダーゼまたはホスファターゼなどを含む。短距離放射エミッタ、例えば、短距離検出器プローブによって検出可能な同位体なども用いてもよい。結合剤を、そのような試薬を用いて、公知の技術を使用して標識することができる。例えば、WenselandMearesRadioimmunoimagingandRadioimmunotherapyElsevierNY抗体の放射標識に関する技術用およびDColcheretalMethEnzymol121802816を参照のこと。放射性標識された結合剤を、またインビトロ診断試験のために使用することができる。同位体標識タンパク質の特異的活性は、半減期、放射性標識の同位体純度、および標識がどのようにタンパク質中に組み込まれているかに依存する。また、本発明に含まれるのは、本発明のCiz1ポリペプチドに結合する結合剤を含むキットおよび診断的使用、例えば、インビトロで、例えば、試料、例えば、ガンまたは腫瘍性障害を有する患者由来の生検または細胞中で、またはインビボで、例えば、対象を撮像することによって、本発明のCiz1ポリペプチドを検出するための標的結合剤例えば、抗体またはその抗原結合フラグメント、あるいは他のポリペプチドまたはペプチドまたはアプタマーの使用のための説明書を含む。キットは、少なくとも1つの追加試薬、例えば、標識または追加の診断用薬剤などをさらに含むことができる。インビボでの使用のために、結合タンパク質を、薬学的組成物として製剤化することができる。一態様において、本発明は、本発明のヒトCiz1ポリペプチドまたは抗原に、1×108M未満の親和性KDで結合する、単離抗体またはその抗原結合フラグメントを提供する。別の態様において、本発明は、本発明のヒトCiz1ポリペプチドまたは抗原に、5×109未満の親和性KDで結合する、単離抗体またはその抗原結合フラグメントを提供する。別の態様において、本発明は、本発明のヒトCiz1ポリペプチドまたは抗原に、1×109M未満の親和性KDで結合する、単離抗体またはその抗原結合フラグメントを提供する。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ヒト抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、マウス抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ラット抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ウサギ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、モルモット抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ヤギ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ヒツジ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ウシ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ウマ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ニワトリ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ブタ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ネコ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、イヌ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、ラクダ抗体またはその抗原結合フラグメントである。一態様において、単離抗体またはその抗原結合フラグメントは、組換えであるヒト抗体またはその抗原結合フラグメントである。本発明の一局面は、ガンの検出および予後評価のため、ガンの素因を持つ対象の同定のため、および薬物効力のサロゲートマーカーとしてガンの処置を受けている患者をモニターするため、および再発を検出するための、対象の生物学的試料中のCiz1自己抗体または循環免疫複合体CICの上昇レベルの検出に基づく、スクリーニング方法を提供することである。用語自己抗体または複数の自己抗体は、対象自身のタンパク質の1つまたは複数に対して向けられる、対象の免疫系によって産生された抗体である。用語抗Ciz1自己抗体またはCiz1自己抗体は、Ciz1に対して特異的な自己抗体を指す。本発明はまた、ガンの診断または予後指標として、Ciz1自己抗体遊離またはCiz1抗原との複合体かを問わずを検出するための方法を提供する。一態様において、Ciz1ポリペプチドは、Ciz1b変異体ポリペプチドである。本発明は、ガンを伴うまたはガンについての高リスクな対象例えば、喫煙者、COPD、ガンについての遺伝的素因を伴う患者由来の生物学的試料中のCiz1ポリペプチドまたはCiz1ポリペプチド抗原に対する自己抗体を検出することによる、ガンの診断的評価および/または予後判定に関する。一態様において、抗Ciz1自己抗体についてアッセイされる前記の生物学的試料は、血液、血漿、血清、喀痰、尿、または気管支肺胞洗浄液より選択される。別のさらなる態様において、試料は血液である。別のさらなる態様において、試料は血漿である。別のさらなる態様において、試料は血清である。別のさらなる態様において、試料は喀痰である。別のさらなる態様において、試料は尿である。別のさらなる態様において、試料は気管支肺胞洗浄液である。一態様において、ガンは、肺ガン、乳ガン、甲状腺ガン、膀胱ガン、肝臓ガン、腎臓ガン、リンパ腫、および白血病である。一態様において、ガンは肺ガンである。さらなる態様において、肺ガンはNSCLCである。別のさらなる態様において、肺ガンはSCLCである。別の態様において、ガンは乳ガンである。別の態様において、ガンは甲状腺ガンである。さらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺髄様ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンはヒュルトレ細胞ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺乳頭ガンである。別のさらなる態様において、甲状腺ガンは甲状腺濾胞ガンである。別の態様において、ガンはリンパ腫である。さらなる態様において、リンパ腫はB細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はホジキンリンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は濾胞性リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は未分化大細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は節外周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫は脾臓周辺帯B細胞リンパ腫である。別のさらなる態様において、リンパ腫はマントル細胞リンパ腫である。別の態様において、ガンは白血病である。別のさらなる態様において、白血病は慢性リンパ性白血病である。別のさらなる態様において、白血病はヘアリー細胞白血病である。生物学的試料中でのCiz1ポリペプチドまたはCiz1ポリペプチドに対する自己抗体の増加レベルの検出は、ガンのスクリーニング、診断、および予後判定についての新規戦略を構成する。一態様において、Ciz1ポリペプチドはCiz1b変異体ポリペプチドである。一態様において、Ciz1ポリペプチドに対する自己抗体は、Ciz1b変異体ポリペプチドに対する。一態様において、自己抗体は、エクソン14bおよびエクソン15の両方によってコードされるアミノ酸残基を含む連続エピトープに特異的に結合する。別の態様において、自己抗体は、Ciz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合するが、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドには特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、少なくとも10倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドよりもCiz1b変異体ポリペプチドに特異的に結合する。一態様において、自己抗体は、少なくとも102倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、自己抗体は、少なくとも103倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、自己抗体は、少なくとも104倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、自己抗体は、少なくとも105倍上回る親和性で、エクソン14aを含むmRNAから翻訳されたCiz1ポリペプチドと比較して、Ciz1b変異体ポリペプチドに結合する。一態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合する。一態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列のいずれにも特異的に結合しない。一態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、前記の自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。別の態様において、自己抗体は、アミノ酸配列に特異的に結合するが、アミノ酸配列には特異的に結合しない。本発明は、Ciz1ポリペプチドに対する自己抗体の存在を検出するようにデザインされたイムノアッセイにおける抗原としてのCiz1ポリペプチドまたはそのペプチドの使用を提供する。そのようなイムノアッセイを、ガンの診断および予後判定のために利用することができる。本発明に従って、対象の尿、血液、血漿、または血清などにおけるCiz1自己抗体レベルの測定を、ガンの早期診断のために使用することができる。さらに、自己抗体レベルのモニタリングを予後判定に使用し、疾患の進行および再発を病期分類することができる。本発明はさらに、対象の生物学的試料中でCiz1自己抗体を検出するための方法に関する。そのようなアッセイは、本明細書に記載されるイムノアッセイを含み、ここでCiz1自己抗体は、Ciz1抗原を含むポリペプチドまたはペプチドとのそれらの相互作用によって検出される。Ciz1抗原を使用し、対象の生物学的試料中のCiz1自己抗体の存在および量を定量的に検出してもよい。本発明はまた、Ciz1ポリペプチドの発現レベルの増加によって特徴付けられる疾患に苦しむ患者に免疫を与えるための、Ciz1抗原を含むポリペプチドまたはペプチドの使用に関する。そのような抗原への免疫学的応答の刺激は、腫瘍細胞に対するより有効な攻撃を誘発することを意図する;例えば、とりわけ、腫瘍細胞増殖を阻害することまたは腫瘍細胞の殺傷を促進すること、である。本発明はさらに、ガンまたはガンを発症する素因を有する患者を診断するために臨床現場で便利に使用することができる、事前にパッケージ化された診断キットを提供する。キットをまた、使用し、ガンの処置のために使用される薬剤の効力をモニターすることができる。本発明の一態様において、キットは、試料中のCiz1ポリペプチド抗原に向けられた自己抗体のレベルを検出および/または測定するための成分を含む。第2の態様において、本発明のキットは、生物学的試料中のCiz1ポリペプチド抗原を検出および/または測定する成分を含む。一局面において、本発明は、対象におけるガンの診断のための方法を提供し、以下:a対象に由来する生物学的試料中のCiz1ポリペプチドのレベルを定量的に検出する工程;b対照試料中のCiz1ポリペプチドのレベルを検出する工程;およびc対象の試料中で検出されるCiz1ポリペプチドのレベルを、対照試料中で検出されるCiz1ポリペプチドのレベルと比較する工程、および、対象の試料中のCiz1ポリペプチドのレベルにおける増加を同定することによって、ガンを伴う対象を診断する工程を含み、対照試料と比較した、対象の試料中で検出されるCiz1ポリペプチドのレベルにおける増加は、ガンを伴う対象の指標である。一態様において、ガンは肺ガンである。別の態様において、ガンはSCLCである。一態様において、Ciz1ポリペプチドを、イムノアッセイを使用して検出する。一態様において、イムノアッセイは免疫沈降アッセイである。一態様において、生物学的試料は肺組織試料である。一態様において、Ciz1ポリペプチドはCiz1b変異体ポリペプチドである。一局面において、本発明は、対象におけるガンの診断のための方法を提供し、以下を含む:a対象に由来する生物学的試料中のCiz1自己抗体のレベルを定量的に検出する工程;b対照試料中のCiz1自己抗体のレベルを検出する工程;およびc対象の試料中で検出されるCiz1自己抗体のレベルを、対照試料中で検出されるCiz1自己抗体のレベルと比較する工程、ここで対照試料と比較した、対象の試料中で検出されるCiz1自己抗体のレベルにおける増加は、ガンを伴う対象の指標である。一態様において、ガンは肺ガンである。別の態様において、ガンはSCLCである。一態様において、Ciz1自己抗体を、イムノアッセイを使用して検出する。一態様において、イムノアッセイは免疫沈降アッセイである。一態様において、試料は肺組織試料である。一態様において、Ciz1自己抗体はCiz1b変異体に対する自己抗体である。本発明は、対象におけるCiz1自己抗体の検出に基づく、疾患、例えば、ガンなどについての診断および予後判定方法を提供する。本方法は、例えば、ガンを伴う対象から、ならびに、ガンを伴わない年齢および性別を一致させた対照由来の生物学的試料の使用によって検証してもよい。自己抗体を含みうる生物学的試料、例えば、尿、血液、血清、または血漿などは、特定のガンを有するまたは有することが疑われる、あるいは、ガンを発症する素因があると疑われる対象から得られる。対応する体液は、例えば、対照として、ガンを有さない対象から得てもよい。本発明に従い、Ciz1ポリペプチド抗原に対して反応性の自己抗体の測定は、疾患、例えば、ガンなどの診断のために使用することができる。さらに、自己抗体レベルのモニタリングを予後判定に使用し、疾患の進行を病期分類し、再発を検出することができる。対象由来の尿、血液、血清もしくは血漿、または他の生物学的液体試料中での自己抗体の検出は、多数の方法のいずれかによって達成することができる。そのような方法は、非限定的に、例えば、ウエスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ELISA酵素結合免疫吸着アッセイ、サンドイッチイムノアッセイ、競合イムノアッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降反応、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体固定アッセイ、免疫放射線アッセイ、蛍光イムノアッセイ、プロテインAイムノアッセイ、およびフローサイトメトリーなどの技術を使用したアッセイ系を含むが、少数および本明細書で他に開示するその他を含む、イムノアッセイも含む。そのようなイムノアッセイは、対象に由来する尿、血液、血清、または血漿試料を、免疫特異的な抗原抗体結合を生じることができるような条件下でCiz1ポリペプチド抗原を含む試料と接触させる工程、および自己抗体による任意の免疫特異的な結合の量を検出または測定する工程を含む方法によって行う。尿、血液、血清、または血漿試料中の自己抗体のレベルを、障害を有さない対象由来の類似の生物学的試料中、抗原が存在しないまたは異なる抗原が存在する試料中に存在するレベルと比較してもよい。イムノアッセイは、種々の方法で行うことができる。例えば、1つの方法は、固体支持体上にCiz1ポリペプチド/ペプチドを固定化する工程、および、それに特異的に結合した抗Ciz1抗体を検出する工程を含む。代替アプローチは、例えば、抗ヒト抗体またはプロテインAもしくはGを使用し、生物学的試料由来の自己抗体を固定化する工程、および、例えば、Ciz1ポリペプチド/ペプチドを標識することによって、または抗体もしくは他の適切な手段を使用してCiz1ポリペプチド/ペプチドを検出することによってそれに結合したCiz1ポリペプチド/ペプチドを検出する工程を含む。本発明のアッセイにおいて利用されるCiz1ポリペプチド/ペプチド抗原は、例えば、当技術分野において周知である組換えDNA技術を介して調製することができる、または、化学的に合成することができる。例えば、Ciz1ポリペプチドまたはその抗原フラグメントをコードするDNA分子は、Ciz1ポリペプチドの大規模調製のために、適切な発現ベクター中に遺伝的に操作することができる。他の態様において、Ciz1抗原は、Ciz1自己抗体の標識、固定化、または検出を促進することができる融合タンパク質として操作される。例えば、Sambrooketal1989MolecularCloningAlaboratoryManualColdSpringHarborPressColdSpringHarborNYに記載される技術を参照のこと。あるいは、Ciz1ポリペプチドは、当技術分野において周知のタンパク質分離技術を使用して、天然の供給源から精製してもよく、例えば、細胞から精製してもよい。そのような精製技術は、非限定的に、分子ふるいクロマトグラフィーおよび/またはイオン交換クロマトグラフィーを含みうる。実際には、マイクロタイタープレート、ビーズ、またはメンブレンは、便利に、Ciz1抗原のための固体支持体として利用される。表面を前もって調製し、保存してもよい。一態様において、Ciz1抗原は、別のビーズ中、および、別のメンブレン中、マイクロタイタープレートに結合される。別の態様において、Ciz1抗原の結合は、固体支持体に結合されず、自己抗体へのCiz1抗原の結合が液相中で起こるようになる。一態様において、Ciz1抗原自己抗体複合体は、標識された抗原結合分子、例えば、抗体またはアプタマーなどを使用して検出される。好ましくは、抗原結合剤は抗体である。標識された抗原結合剤は、Ciz1抗原、例えば、液相の場合において、または自己抗体のいずれかに対して特異的でありうる。一態様において、標識された抗原結合剤は、抗ヒト抗体抗体、即ち、ヒト抗体に対して特異的な抗体である。低親和性Ciz1自己抗体の結合を促進するために、Ciz1抗原を、ダイマー、トリマー、テトラマーなどに多量体化してもよい。一態様において、Ciz1抗原を、ストレプトアビジンを使用して、テトラマーに多量体化するMcLaughlinKetalProtocolExchange、2007年1月29日オンライン公開。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるCiz1抗原は、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列IEVRSを含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するために使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列EVRSを含む。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するための方法において対照として使用されるポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。一態様において、ポリペプチドまたはペプチド対照は、アミノ酸配列を含む。Ciz1ポリペプチドまたはペプチドはまた、Ciz1自己抗体を検出するためのアッセイにおいて遮断剤として使用することができる。一態様において、Ciz1自己抗体を検出するための方法において対照として使用されるCiz1ポリペプチドまたはペプチドは、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。別の態様において、ポリペプチドまたはペプチド遮断剤は、アミノ酸配列を含む。本明細書の記載および特許請求の範囲を通して、文脈が他の意味を要求しない限り、単数形は複数を包含する。特に、不定冠詞が使用される場合、文脈が他を要求しない限り、本明細書は、複数ならびに単数を企図するものとして理解すべきである。本発明の特定の局面、態様、または実施例と併せて記載される特徴、整数、特性、化合物、化学部分、または化学基は、それと不適合ではない限り本明細書に記載される他の任意の局面、態様、または実施例に適用可能であると理解すべきである。表1オリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブの概要cDNAアレイ48の異なる肺試料HLRT101、ならびに、同じ患者由来の肺ガンと隣接組織の24のマッチドペアHLRT504、または、異なるガン由来の10セットの組織試料CSRT504から得た、2~3ngのcDNAを含むTissueScanqPCRアレイは、OriGeneTechnologiesIncRockvilleMDからのものであった。肺/正常マッチドペア組織アレイについての腫瘍分類および要約された病理報告書が、httpwwworigenecomgeneexpressiondiseasepanelsproductsHLRT504aspxに与えられる。図3B中のデータについての多重の反応、および全ての他のアレイについての単一の反応において、供給業者によるbアクチン発現およびCiz1発現についての結果を標準化するために、bアクチンの増幅に関して各ウェル中のcDNAのレベルが標準化された。閾値を設定し、全ての分析をABI700ソフトウェアを使用して実施した。ヒト組織由来RNAIRBの承認プロトコール下で採取された組織由来の肺腫瘍/正常RNAの3ペアは、Cytomyxhttpwwwcytomyxcomcytomyxcytomyxbiorepositoryaspからのものであった。ドナーのインフォームドコンセントを得て採取したヒト肺組織の追加試料が、ILSbiohttpwwwilsbiocomから得られた。製造業者の指示に従って、TRIzolを使用して組織からRNAを単離した。組織の均質化をRNaseフリーの15mLPelletPestleAnachemを使用して行った。以下のように、ランダムプライマー、またはオリゴdTおよびランダムプライマーの混合物を用いてRNA試料を逆転写した。約16mgの全RNAを、1μLの10mMdNTP、05μLの05μgμLランダムプライマーPromega、および05μLの05μgμLオリゴdT1218プライマーInvitrogenを用いて、DEPC水中、全体積12μLでインキュベートした。あるいは全RNAを、1μLの500μgmLランダムプライマー、1μLの10mMdNTPを用いて、DEPC水中、全体積13μLでインキュベートした。試料を、65°Cで10分間、PTC200PeltierThermalCyclerMJResearchにおいてインキュベートし、氷上で5分間インキュベーションを続けた。ランダムプライム反応物に、以下を加え体積20μLとする:1×FirstStrandバッファー、5mMDTT、200USuperScriptIII、および40URNaseOUT全てInvitrogen。反応物を、46°Cで3時間、その後70°Cで15分間インキュベートした。ランダムプライマー/オリゴdT反応物に、以下を加え最終体積20μLとした:1×MMLV反応バッファー、10mMDTT、200UMMLV逆転写酵素全てがPromega、および40URNaseOUTInvitrogen。反応物を、42°Cで52分間、その後70°Cで15分間インキュベートした。PCRおよびQPCRフラグメント増幅のために使用されたプライマー対の組み合わせは、p8p2TaqポリメラーゼNEBHertsUKを使用し、94°C/5分、次に94°C/15秒、55°C/30秒および68°Cで1分間の33サイクル、68°Cで7分間の最終工程、p1p2phusionポリメラーゼFinnzymesEspooFinlandを使用し、98°C/30秒、次に98°C/10秒、62°C/30秒、および72°Cで40秒の33サイクル、および72°Cで7分間、ならびにp4p3TaqポリメラーゼNEBHertsUK、94°C/5分、次に94°C/30秒、62°C/30秒、および72°C/40秒の33サイクル、72°Cで7分間の最終工程が続くを含む。PCR反応は、MJサーマルサイクラーPTC200で行った。定量的PCR反応は、光学接着フィルム付きのMicroAmp商標光学96ウェル反応プレート中AppliedBiosystemsで、全体積25μL中で行った。各反応について、cDNAを、1×TaqMan登録商標PCRミックスAppliedBiosystems、04μMフォワードプライマー、04μMリバースプライマー、および04μMプローブとインキュベートした。試料を、ABIPrism7000または7300配列検出システムで、相対定量化アッセイおよび以下のプログラムを使用して実行した;50°C[2分間]、95°C[10分間]、それに続く、40サイクルの95°C変性[15秒間]、60°Cアニーリングおよび伸長[1分間]。試料が閾値レベルを通過したサイクル数は、Ct値である。1つの試料を、キャリブレーター試料として選択し、全ての他の発現値を、それと比べて表現したRQ。他に明記しない限り、プライマーはSigmaAldrichから、プローブはMWGから入手し、クローンおよびPCR産物の配列検証はMWGによって行った。細胞培養およびトランスフェクション細胞株は、EuropeanCellCultureCollectionhttpwwwecaccorgukまたはJapaneseCollectionofResearchBioresourcehttpcellbanknibiogojpから得るか、または、JSouthgateの好意によって得た。全ての細胞株を、推奨に従って培養した。NIH3T3細胞を、以前に記載された通りに増殖させ、Mirus3T3を使用し、GFPCiz1またはGFPC275を用いてトランスフェクトした。核分画核分画は、基本的には記載された通りである。示したように、典型的には、カバースリップ上の細胞を、冷PBS、次に冷CSKバッファー10mMPipesKOHPh68、100mMNaCl、1mMEGTA、300mMスクロース、加えて、1mMDTT、およびプロテアーゼ阻害剤カクテルRocheを用い、界面活性剤01TX100を使用してまたは使用せずにリンスした。DNase処理のために、細胞をさらに、CSK示したように、01または05MNaCl、続いてPBS中でリンスし、消化バッファー10mMTris[pH76]、25mMMgCl2、05mMCaCl2中のDNase1と、25°Cで20分間、推奨にしたがってRocheインキュベートした。示したように、DNAse処理細胞を、固定の前に05MNaClを用いて1分間リンスした。全ての調製物を、新鮮な4パラホルムアルデヒドを用いて室温で20分間固定した。免疫蛍光カバースリップ上の固定細胞をPBSを用いて洗浄し、次に抗体バッファーPBS中の10プロテアーゼ不含有BSA、002SDS、01TritonX100を用いてブロックした。Ciz1RDを、抗Ciz1ポリクローナル抗体1793を用いて、Ciz1ADを、Ciz1アンカードメインペプチドを使用して、アフィニティー精製したポリクローナル抗体2Cを用いて検出した。DNAを、Hoechst33258Sigmaを用いて対比染色した。画像を、ZeissAxiovert200MおよびOpenlab画像取得ソフトウェアを使用し、実験内で同一のパラメーター、典型的にはTRITC標識Ciz1については300ms、GFPについては400ms、Hoeschtについては15msを使用して収集した。画像をデジタル的に増強し、バックグラウンド蛍光を除去する、または、AdobePhotoshopを使用して明るさを増加させる場合、同一の操作を1つの実験内で画像に適用した。そのため、例えば抽出前後のCiz1染色の強度は、処理の効果を反映する。蛍光強度を、OpenlabProfileツールを使用して同一の撮像パラメーター下で取得した生画像から定量化した。実施例1DNA複製ドメインおよびアンカードメインの非共役発現Ciz1の2つのよく特徴付けられた機能DNA複製のサイクリン依存的刺激および核マトリクスとの結合は、別々のタンパク質ドメインによってコードされる。これらは、RD複製ドメインおよびADアンカードメインと呼ばれる。インビトロでは、DNA複製を促すためには、Ciz1の核マトリクスアンカーは不要である。実際に、ADを欠くCiz1フラグメントは、核マトリクス3に付着しうるものよりも活性であるように見え、固定化が、機能固有であるものよりむしろ、制約的な特徴であることを意味する。本明細書では、RDおよびADの発現が、大半のガン細胞において一致していないという証拠、即ち、非共役発現を示す。ドメインの一方または他方の発現が、肺ガンの大部分、ならびに広範な他の一般の固形腫瘍において変化しており、不均衡である。RDまたはADの発現を検出する定量的PCR試薬図1aを使用し、46の肺由来cDNAを含むcDNAアレイを調べた図1b。アレイにわたり、両方のRDプローブによって、一致した発現パターンが明らかになった。同様に、両方のADプローブによって、一致した発現パターンが明らかになった。しかし、RDおよびADの発現は、互いに決して同一ではなかった。これは、2つのドメインがいつも一緒に発現しているわけではないこと、および、それらは恐らく、Ciz1タンパク質中にいつも両方が存在するわけではないことを実証する。肺腫瘍における非共役発現隣接対照試料とは対照的に、腫瘍自体は、はるかに説得力のない傾向を示す。Ciz1発現は明らかに非共役および不均衡であるが、一部の患者についてはこれはRD減少として、他についてはRD増加としてステージIA試料と比べて顕在化し、不良な適合を伴う水平に近い傾向線を生じる。一方のドメインの発現増加および他方の発現減少の組み合わせ効果も明らかにされている。RDおよびAD発現についての組み合わせ結果を、各々の個々の隣接対照と比べて提示する場合図1E、データから、それらの均衡比の崩壊が腫瘍ステージと相関することがわかる。ステージ1の疾患を伴う患者由来の腫瘍について、1258人中1人が、周囲組織と比較して、ADとRDの間の均衡における2倍超の変化を有し、ステージII腫瘍について、これは90910であり、ステージIII腫瘍について6035である。この傾向は、Ciz1発現が腫瘍形成の期間中、非共役および不均衡であるという結論を支持する。腫瘍の他の型における非共役発現Ciz1転写物発現の概要をつかむために、RDおよびADを、多数の一般の固形腫瘍においてサンプリングした図2。ADは、大半の腫瘍型の非マッチド対照試料と比べて、ほぼ全てのステージI、II、およびIII腫瘍において過剰に提示される。これは、乳ガン、肺ガン、および甲状腺ガンについて最も明白である図2Bに示す比率曲線における下落から、明白。ステージIV疾患における非共役発現注目すべきことに、全ての組織型のステージIV腫瘍の半数以上において、逆のことがあてはまる図2Aにおいて星印で示す。これらの試料中では、RD転写物が過剰に提示され、転移した、または転移するであろう腫瘍のサブセットにおいて、RDで優先して発現が崩壊することを示唆する。同様の分析を、ステージIV疾患を伴う患者由来の19試料を含む40の悪性黒色腫の試料に適用した図3A。全てのグレードの腫瘍の大部分において、AD発現はRDを超えるが、3つ全ての対照試料について、これは当てはまらない。従って、悪性黒色腫は上記の傾向に従わず、この型の腫瘍についてはRDの優性発現へ切り替わっても、転移能力は伴わないことを示す。タンパク質レベルで、かつ既に公知のCiz1機能に照らして考える場合、細胞DNA複製に対する過剰なRDまたは過剰なADの影響は非常に類似し、重症度に差をもたらしうる。具体的には、Ciz1の複製ドメインは、核マトリクスアンカー3が存在しない場合にDNA複製の開始を刺激するように機能することが可能であること、しかし、核マトリクスへの付着が、NIH3T3細胞1および出願人が試験してきた非腫瘍由来の大半の他の確立された細胞株示さず中でのCiz1の多くにとって普通のことであることが、出願人により公知であった。出願人は、核マトリクスアンカー非存在下での複製ドメインの発現が、非アンカー活性をもたらしうること、および、これが、DNA複製の空間-時間組織化についての結果を有しうることを示唆する。同様に、触媒機能を持たないタンパク質の状況におけるC末端固定化ドメインの発現は、核マトリクス上の固定化部位について完全長タンパク質と競合することにより、ドミナントネガティブな効果を有しうる図4A。実施例2タンパク質検出ツール出願人は、RDおよびADに対するモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体のセットを開発し図5A、それらを用いて、タンパク質レベルでCiz1発現を検出した。これらは、分子診断ツールとしての潜在的能力を有し、現在、ガン細胞株中でのCiz1タンパク質の機能および挙動についての問いに答えるために使用されている。今までに、出願人は、Ciz1RDおよびADの両方がタンパク質レベルでは独立して存在すること図5B、C、RDは付着しないがADが一部のガン細胞中で核マトリクスに付着すること図5C、および、ADの過剰発現が内在性RDの正常な細胞内局在化および固定化を崩壊させること図5D、Eを実証してきた。これらの観察の全てが、Ciz1RDとADの間の比率の崩壊が核の構築を変えるとの考えと一致している。実施例3b型変異体出願人は、Ciz1コード配列中の選択的スプライシングを証明するために、Ciz1UnigeneクラスターHs212395httpwwwncbinlmnihgovsitesentrezdbunigeneにマップされる発現配列タグESTを調査した。これは、神経内分泌肺ガン主に肺小細胞ガン、SCLCが、非ガン組織よりもはるかに高頻繁に選択的スプライシングされたCiz1の形態で発現するb型転写物を産出することを示唆した図4Bに示す。b型転写物において選択的スプライシングされている領域にまたがるCiz1転写物は、合計23の異なるライブラリーである10のガンおよび13の非ガンにおいて検出された。非ガンライブラリー由来のわずか3と比較して、ガン由来転写物について、その40はb型転写物であった。選択的検出ツール出願人は、b型転写物を検出する分子ツールを開発した。これらは、エクソン接合部のいずれかの側に位置付けられるプライマーであり、エクソン接合部にわたってb型転写物由来の産物のみを与えるプライマーであり、かつエクソン接合部にもわたるがb型転写物のみを認識するQPCRプローブである。最初に、これらを、肺ガン細胞株のパネルに適用し、aツールを検証し、bb型転写物の発現に関する確認データを生成した。SCLCにおける発現選択的転写物検出ツールの適用によって、SCLC患者に由来する細胞株が、b型変異体を、対照細胞株よりも高頻度で発現することを示した図6、7A。神経内分泌肺ガン患者由来の腫瘍の少量のサンプリング、および、同様に同じ患者由来の正常な隣接肺組織に由来するRNA試料への適用によって、b型転写物が、3人のSCLC患者全てにおいて優先的に発現していることが確認される図7B。非小細胞肺ガンにおけるb変異体発現b型転写物について選択的であるQPCR試薬を、図1において使用したマッチド肺腫瘍/正常組織cDNAアレイに適用した。試料セットの6つが、正常な隣接対照組織と比較して、腫瘍中で2倍超のb型転写物を発現した図8A。これは、アレイ上に単一の神経内分泌腫瘍を含むセット910。同様に、NSCLC試料の別々のセット内で、b変異体は、非マッチド対照と比較して、症例の小サブセットにおいて上昇した図8B。このように、b型転写物の発現は、神経内分泌腫瘍においてよく見られるが、肺ガンのこの型に限定されない。他の型のガンにおけるb変異体発現出願人は、異なるグレードの腫瘍および見掛け上は正常な組織由来の非マッチド試料のセットを含む、同様のcDNAアレイOrigeneを使用して、広範な他の一般のガンを調査した。対照と比較した場合、b変異体の増加が、肝臓腫瘍図8Cおよび腎臓腫瘍図8Dのサブセットにおいて検出された。対照的に、甲状腺腫瘍およびリンパ腫の両方が、症例の高い割合において、高レベルのb変異体を発現する図9。従って、これら2つの腫瘍型は、Ciz1b変異体選択的な診断および治療ツールの適用のための、有力な代替指標である。Ciz1変異体タンパク質高親和性の変異体特異的ポリクローナル抗体が生成されており、SCLC細胞株における組換えタンパク質図10A、10B、および10Cおよび内在性b変異体タンパク質図10Dを使用して検証されている。これは、変異体転写物が実際に肺ガン細胞において変異体タンパク質に翻訳されること、および、細胞の状況においても、本発明者らのツールが有効で選択的な検出を可能にすることを示す。Cizzleがまた、同様の高程度の特異性を有するモノクローナル抗体の産生および検証に関与する。実施例4マウス培養細胞由来Ciz1のRNA干渉を使用した枯渇によって、細胞周期の進行が阻害され、細胞増殖3が制限される。従って、Ciz1を阻害する薬剤は、ガン細胞の増殖を制限する治療的分子としての潜在力を有する。出願人は、概してCiz1を標的とすることによって、または、肺ガン関連b型転写物を選択的に標的とすることによって、Ciz1発現を阻害するヒト特異的RNA干渉分子を生成し、かつ試験してきた。両方とも、神経内分泌肺ガン細胞の増殖を抑制する。b型転写物抑制本発明者らの主な戦略は、b型転写物を発現する肺ガン細胞の増殖を選択的に抑制することを目的とした選択的な方法でb型転写物を抑制することである。b型転写物に特異的なRNA干渉分子候補の、Ciz1の他の形態に影響を与えずb型転写物発現を抑制する能力について比較した。最も有効で選択的なsiRNA配列を、Ciz1タンパク質の選択的抑制についてさらに試験した図11。誘導性shRNA送達ベクターへのトランスファー後、内在性b型転写物を発現するSCLC細胞の増殖に対する顕著な効果図12Aが、b変異体転写物図12Bおよびタンパク質図12Cの選択的抑制とともに、記録された。4日間の時間経過後、同様に処置された対照細胞の約35にまで増殖が抑制された図12D。b変異体抑制を伴う長期培養の間に、細胞形態における著しい変化が観察された図12E。インビボでの標的抑制誘導性shRNA送達ベクターを有する同じSCLC細胞を使用し、皮下注射によりマウスに腫瘍を作成した。細胞注射の日から活性化されたか、または、腫瘍が形成された後に開始されたかを問わず、b型転写物に選択的なRNAiは、インビボでの腫瘍増殖を有効に阻害した図13A、B。これらのデータから、SCLC関連Ciz1スプライス変異体b型転写物を標的とすることは、それを発現する腫瘍型における細胞増殖の選択的な抑制のための潜在的に実行可能な戦略であることが示される。追加の検証が、リンパ腫ベースのモデルおよび安定化siRNAの全身送達を包含するように計画される。循環腫瘍細胞の検出皮下腫瘍を有するマウスの一部の全末梢血から単離したRNAを使用し、b型転写物検出ツールの感度を試験した図13C。b変異体は、腫瘍を伴う両方のマウスにおいて簡単に検出されたが、対照群の両方のマウスにおいては検出されず、b変異体がSCLCについての血液試験の基礎を形成する可能性を高めている。参考文献上記明細書に記載の文献は全て参照により本明細書に組み入れられる。本発明に記載した方法およびシステムの様々な変更および変形が、本発明の範囲および主旨の範囲から逸脱しないことは当業者にとって自明であろう。本発明を具体的な好ましい態様との関連で記載したが、本発明の特許請求の範囲がそのような具体的な態様によって必要以上に制限されないことが理解されるべきである。実際に、本発明を実施するために記載した様式の、分子生物学や関連する分野の当業者に自明である種々の変更が、以下の特許請求の範囲内であることが意図される。配列表