"微小流体用の基板であって、第1のPCR反応室と、第2のPCR反応室と、第1のPCR反応室との間で流体が移動可能な第1の入口と、第2のPCR反応室との間で流体が移動可能な第2の入口と、第1のPCR反応室との間で流体が移動可能な第1の出口と、第2のPCR反応室との間で流体が移動可能な第2の出口と、第1の入口及び出口と第1のPCR反応室とを分離するための微小流体用の第1の組のバルブと、第2の入口及び出口と第2のPCR反応室とを分離するための微小液滴用の第2の組のバルブとを備え、第1及び第2の組のバルブによる分離によって、第1及び第2のPCR反応室から及びこれらPCR反応室への液体の移動を阻止し、第1及び第2のPCR反応室、第1及び第2の入口、第1及び第2の出口、並びに、第1及び第2の組のバルブは、同一の1つの基板上に構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項1記載の微小流体用基板において、第1及び第2のPCR反応室は、1又は複数のポリヌクレオチドを相互に独立して増幅するよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項1又は2記載の微小流体用基板において、第1及び第2の出口はそれぞれ第1及び第2の孔によって構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項1-3いずれかに記載の微小流体用基板において、第1及び第2の入口はピペットチップからサンプルを受け取るよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項1-4いずれかに記載の微小流体用基板において、第1及び第2のPCR反応室の少なくとも一方において、リアルタイムPCRを実行することができるよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項1-5いずれかに記載の微小流体用基板において、第1及び第2の入口は、複数のピペットヘッドを有する分配器から同時にサンプルを受け取ることができるように、相互に離間して配置されていることを特徴とする微小液流体用基板。請求項1-6いずれかに記載の微小流体用基板において、第1及び第2の組のバルブは、加熱されると溶解し、第1及び第2のPCR反応室を封鎖する温度反応型の物質で構成されていることを特徴とする微小流体用基板。微小流体用のカートリッジであって、請求項1-7いずれかに記載の微小流体用基板を備えていることを特徴とする微小流体用カートリッジ。複数のサンプルレーンであって、相互に流体が移動可能なネットワークを構成している複数のサンプルレーンを備えた微小流体用基板であって、サンプルレーンのそれぞれが、入口と、抜け孔と、第1及び第2のバルブと、入口から第1のバルブを介してPCR反応室に延びる第1のチャネルと、PCR反応室から第2のバルブを介して出口孔に延びる第2のチャネルとを備え、第1及び第2のバルブは、反応室への流体の移動又は反応室からの流体の移動を阻止するように、入口及び抜け孔と反応室とを分離するよう構成され、PCR反応室、第1及び第2のバルブ、入口、抜け孔、第1及び第2のチャネルは、同一の1つの基板上に構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9記載の微小流体用基板において、該基板はさらに、入口からPCR反応室に延び、ゲートが配置されている第3のチャネルを備え、該ゲートは、PCR反応室から流体が入口を介して排出されるように第3のチャネルを解放するよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9又は10記載の微小液適用基板において、複数のサンプルレーンのそれぞれは、相互に1又は複数のポリヌクレオチドを独立して増幅するよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9-11いずれかに記載の微小流体用基板において、複数のサンプルレーンのそれぞれは、バブル抜け孔を備えていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9-12いずれかに記載の微小流体用基板において、入口は、ピペットチップからサンプルを受け取るよう構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9-13いずれかに記載の微小流体用基板において、該基板は、少なくとも1つのPCR反応室においてリアルタイムPCRを実行することが可能に構成されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9-14いずれかに記載の微小流体用基板において、複数のサンプルレーンのそれぞれの入口は、複数のピペットヘッドを有する分配器からサンプルを受け取ることができるように、離間して配置されていることを特徴とする微小流体用基板。請求項9-15いずれかに記載の微小流体用基板において、第1及び第2のバルブは、加熱されると溶解してPCR反応室を封鎖する物質で構成されていることを特徴とする微小流体用基板。微小流体用のカートリッジであって、請求項9-16いずれかに記載の微小流体用基板を備えていることを特徴とする微小流体用カートリッジ。請求項17記載の微小流体用カートリッジにおいて、該カートリッジはさらに、該カートリッジが補助的診断装置によって一方向に受け取られるようにするためのレジストレーション要素を備えていることを特徴とする微小流体用カートリッジ。請求項17又は18記載の微小流体用カートリッジにおいて、基板は、剛体で空気及び液体に耐性を有し、かつ、該微小流体用カートリッジの動作中の空気又は液体の進入又は排出が、入口及び抜け孔のみを介して行われることを特徴とする微小流体用カートリッジ。ポリヌクレオチド含有の複数のサンプルに独立してPCRを実行する方法であって、該複数のサンプルを、相互に独立して熱循環が可能である複数のPCR反応室を備えた微小流体用カートリッジに導入するステップと、複数のサンプルを複数のPCR反応室にそれぞれ移動するステップと、複数のPCR反応室を隔離する隔離ステップと、複数のサンプルに含まれるポリヌクレオチドを、PCR反応室に加熱及び冷却の複数のサイクルを連続して及ぼすことにより、増幅するステップとからなることを特徴とする方法。請求項20記載の方法において、隔離ステップは、微小流体用の複数のバルブを動作させることによって実行されることを特徴とする方法。請求項21記載の方法において、複数のバルブの動作は、感熱応答物質を加熱することにより、該物質がロードチャネルからフローチャネルに移動してフローチャネルを閉鎖することにより行われることを特徴とする方法。微小流体用のバルブであって、第1のロードチャネルに接続された第1の室と、第2のロードチャネルに接続された第2の室と、フローチャネルとを備え、第1及び第2のロードチャネルは、フローチャネルに接続されており、第1及び第2のロードチャネルはそれぞれ、感熱応答物質を含み、バルブが駆動されたとき、該感熱物質がフローチャネルに移動して該チャネルを閉鎖するよう構成されており、フローチャネルは、第1及び第2のロードチャネルの一方の側の長手方向に沿って圧縮されていることを特徴とする微小流体用バルブ。請求項23記載の微小流体用バルブにおいて、フローチャネルの圧縮された部分は、少なくとも1つの曲線部であることを特徴とする微小流体用バルブ。サンプルフローは、数個の主要なステップに別れることが分かっており、これらをできるだけ多く自動化し、望ましくはできるだけ多くを1つの機械で遂行し、オンデマンドで多くのユーザに利用可能にする方法を検討することが望ましいであろう。したがって、サンプル準備、PCR、及び生物サンプル上における検出を、実行する別個のステップをできるだけ少なくするような方法で実行する方法及び装置が求められている。この技術に対する背景の論述は、技術のコンテキストを説明するために含まれている。これは、特許請求の範囲のいずれの優先日においても、引用する素材のいずれもが公開されている、公知であり、又は共通の一般的知識の一部であることの承認とは受け取らないこととする。本明細書の説明及び特許請求の範囲全体を通じて、備えている並びにcomprising及びcomprisesのようなその変形は、他の追加の物、成分、完全体、又はステップを除外することは意図していない。本装置は、挿入可能な微小流体カートリッジを収容するように構成されている受容ベイと、カートリッジに熱的に結合されており、カートリッジ上に保持してあるポリヌクレオチド含有生物サンプルの微小液滴を形成し、微小液滴を微小流体カートリッジの1つ以上の位置間で移動させ、細胞が生物サンプル内に存在する場合、当該細胞を溶解することにより、細胞からポリヌクレオチドを放出し、増幅のためにポリヌクレオチドの1つ以上を準備し、ポリヌクレオチドの1つ以上を増幅するために、1つ以上の選択した時点に、カートリッジにおいて選択した1つ以上の領域に熱を加えるように構成されている少なくとも1つの熱源と、1つ以上の増幅したポリヌクレオチドの存在を検出するように構成されている検出器と、検出器と少なくとも1つの熱源とに結合されているプロセッサであって、1つ以上の選択した時点に微小流体カートリッジの1つ以上の選択した領域に対して行う加熱を制御するように構成されている、プロセッサとを備えている。本システムは、更に、装置と相補的カートリッジとを備えており、装置及びカートリッジが共にカートリッジに注入されているサンプルを処理し、このサンプルに関する診断結果を与える一体型システムも備えている。本装置の受容ベイは、この中で更に説明し添付図面において例示するように、微小流体カートリッジを選択的に収容するように構成されている。例えば、受容ベイ及び微小流体カートリッジは、形状を相補的とすることができ、微小流体カートリッジを、例えば、1つの向きで選択的に収容できるようになっている。微小流体カートリッジは、受容ベイの相補的機構にはまりこむ位置合わせ部材を有することができる。選択的にカートリッジを収容することにより、受容ベイは、装置がカートリッジに対して適正に動作することができるように、ユーザがカートリッジを配置するのを助けることができる。また、受容ベイは、微小流体カートリッジ上で動作する装置の種々の構成要素ヒートポンプ、ペルティエクーラ、排熱電子エレメント、検出器、動力部材などを、微小流体カートリッジ上で適正に動作するように位置付けることができるように、構成することもできる。例えば、接触熱源を受容ベイ内に配置し、選択的に受容ベイに収容することができる微小流体カートリッジの1つ以上の別個の位置にこの熱源を熱的に結合することができるようにする。ヒートポンプは、例えば、抵抗器、液体充填熱転移回路又は熱電エレメントのような可逆的ヒートポンプ、キセノンランプのような放射熱源等のような、熱源とすることができる。ヒートポンプは、微小流体エレメントに熱を供給するためだけでなく、ある種の試薬の活動を抑え、微小チャネル内の液体を凍結してその相を液体から固体に変化させ、空気室の圧力を低下させて部分的な真空を発生する等のために用いることができる。本装置の種々の実施形態では、本装置は、更に、微小流体カートリッジに対して相補的な位置合わせ部材を含むことができ、これによって、受容ベイは微流体カートリッジを1つの向きで収容する。本装置は、更に、プロセッサに結合されているセンサを備えており、このセンサは、微小流体カートリッジが収容されているか否か検知するように構成されている。プロセッサは、受容ベイ内に配置した微小流体カートリッジにおいてポリヌクレオチド又はそのプローブを検出するために、検出器を動作させるようにプログラム可能とすることができる。検出器は、例えば、光検出器とすることができる。例えば、検出器は、蛍光染料の吸収帯において光を放出する光源と、蛍光染料の発光帯において光を検出する光検出器とを含むことができ、蛍光染料は蛍光ポリヌクレオチドプローブ又はその断片に対応する。例えば、光検出器は、選択的に蛍光染料の吸収帯において光を放出するバンドパスフィルタダイオードと、選択的に蛍光染料の発光帯において光を検出するバンドパスフィルタフォトダイオードとを含むことができ、あるいは、例えば、光検出器は、異なる蛍光発光スペクトルを有する複数の蛍光染料を独立して検出するように構成することができ、各蛍光染料は、蛍光ポリヌクレオチドプローブ又はその断片に対応し、あるいは、例えば、光検出器は、カートリッジ内の複数の異なる場所において複数の蛍光染料を独立して検出するように構成することができ、各蛍光染料は、蛍光ポリヌクレオチドプローブ又はその断片に対応する。プロセッサは、例えば、少なくとも1つのヒートポンプを動作させるようにプログラム可能とすることができる。種々の実施形態において、少なくとも1つのヒートポンプは、抵抗性ヒータ、ラジエータ、流体熱交換機、及びペルティエデバイスから選択する接触熱源とすることができる。接触熱源は、前受容ベイにおいて、当該受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの別個の場所に熱的に結合するように構成することができ、これによって、別個の場所を選択的に加熱することができる。少なくとも1つの追加の接触熱源を含むことができ、この場合、接触熱源は、各々、受容ベイにおいて、当該受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの異なる別個の場所と独立して熱的に結合するように構成することができ、これによって別個の場所を独立して加熱することができる。接触熱源は、受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの別個の場所と直接物理的に接触するように構成することができる。種々の実施形態では、各接触熱源ヒータは、二次元における平均直径が約1ミリメートルmmから約15mm通例約1mmから約10mmである別個の場所、又は約1mm2ために選択的とする及び約225mm2の間通例、約1mm2及び約100mm2の間、又は実施形態によっては、約5mm2及び約50mm2の間の表面積を有する別個の場所を加熱するように構成することができる。種々の実施形態では、本装置は、接触熱源において伸展層を含むことができ、この伸展層は、接触熱源を、受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの少なくとも一部と熱的に結合するように構成されている。伸展層は、約0.05及び約2ミリメートルの間での厚さと、約25及び約100の間のショア硬度を有することができる。種々の実施形態では、少なくとも1つのヒートポンプは、受容ベイに収容されている微小流体の別個の場所を直接加熱するように構成されている抵抗性熱源とすることができる。種々の実施形態では、1つ以上の動力部材は、受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの少なくとも一部に力を加えるように構成されている。種々の実施形態では、1つ以上の動力部材は、少なくとも1つのヒートポンプを微小流体カートリッジの少なくとも一部に熱的に結合するために力を加えるように構成することができる。1つ以上の動力部材は、微小流体カートリッジにおいて機械的部材を動作させるように構成することができ、穿孔可能リザーバ、弁バルブ、又はポンプから成る一群から機械的部材を選択する。種々の実施形態では、1つ以上の動力部材は、微小流体カートリッジにおける複数の場所に力を加えるように構成することができる。1つ以上の動力部材によって力を加えることにより、受容ベイの一部と微小流体カートリッジの一部との間の界面に、平均で約5キロパスカル及び約50キロパスカルの間の圧力を発生することができ、例えば、平均圧力は、少なくとも、約14キロパスカルとすることができる。少なくとも1つの動力部材を手動で動作させることができる。少なくとも1つの動力部材を受容ベイの蓋に機械的に結合することができ、これによって、蓋の動作で動力部材が動作することになる。種々の実施形態では、本装置は、更に、受容ベイにおいて蓋を含むことができ、この蓋は、受容ベイから少なくとも部分的に周囲光を除外するように動作可能である。蓋は、例えば、滑動扉とすることができる。蓋は、光検出器を含むことができる。光検出器又は受容ベイにおける蓋の主面は、約100マイクロメートル未満だけ、例えば、約25マイクロメータ未満だけ、平坦からばらつきがあることが可能である。蓋は、装置から取り外し可能に構成することができる。蓋は、係留部材を含むことができる。種々の実施形態では、本装置は、更に、プロセッサに結合されている少なくとも1つの入力デバイスを含むことができる。種々の実施形態では、本装置は、更に、装置から取り外し可能に構成されている加熱ステージを含むことができ、ヒートポンプの少なくとも1つを加熱ステージに配置することができる。種々の実施形態では、カートリッジは、更に分析ポートを含むことができる。分析ポートは、外部サンプルシステムが、微小流体カートリッジにおいてサンプルを分析することができるように構成することができ、例えば、分析ポートは、装置内の孔又は窓とすることができ、微小流体カートリッジにおいて現場でサンプルを分析することができる光検出プローブを受け入れることができる。実施形態によっては、分析ポートは、微小流体カートリッジから外部サンプルシステムにサンプルを送出するように構成することができる。例えば、分析ポートは、微小流体カートリッジと流体連通する導管を含むことができ、液体サンプルをクロマトグラフ装置、光学分光計、質量分光計等に送出することができる。実施形態によっては、本装置は、微小流体カートリッジを1つの向きで収容するように構成されている受容ベイと、受容ベイに熱的に結合されている少なくとも1つの放射熱源と、別個の場所に熱的に結合されるように受容ベイにおいて構成され、これによって別個の場所を選択的に加熱することができる少なくとも2つの接触熱源と、受容ベイに収容されている微小流体カートリッジの少なくとも一部に力を加えるように構成されている1つ以上の動力部材であって、1つ以上の動力部材の内少なくとも1つは接触熱源を別個の場所に熱的に結合するために力を加えるように構成することができ、1つ以上の動力部材の内少なくとも1つは微小流体カートリッジにおいて機械的部材を動作させるように構成することができ、穿孔可能リザーバから成る一群から機械的部材を選択する、動力部材と、受容ベイにおける蓋であって、受容ベイから周囲光を少なくとも部分的に除外するように動作可能であり、1つ以上の蛍光染料を独立して検出するように構成されており、任意に異なる蛍光発光スペクトルを有する光検出器を備えており、各蛍光染料が蛍光ポリヌクレオチドプローブ又はその断片に対応する、蓋と、キーボード、接触感応面、マイクロフォン、及びマウスから成る一群から選択した少なくとも1つの入力デバイスと、ハードディスクドライブ、光ディスクドライブから成る一群から選択した少なくとも1つのデータ記憶媒体と、シリアル接続、パラレル接続、ワイヤレスネットワーク接続、及び有線ネットワーク接続から成る一群から選択した通信インターフェースと、光学式キャラクタリーダ、バーコードリーダ、及び無線周波数タグリーダから選択したサンプル識別器と、ディスプレイ、プリンタ、スピーカから選択した少なくとも1つの出力と、検出器、センサ、熱源、入力、及び出力と結合されているプロセッサとを含むことができる。微小流体カートリッジは、微小流体ネットワークと、この微小流体ネットワークと流体連通する保持部材とを含むことができ、保持部材は、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応インヒビタに対して少なくとも1つのポリヌクレオチドのために選択的とする。実施形態によっては、微小流体カートリッジは、位置合わせ部材も含む。微小流体カートリッジの種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、更に、微小流体ネットワークと流体連通するサンプル入口弁を含むことができる。サンプル入口弁は、周囲圧力と比較して約20キロパスカル及び200キロパスカルの間、例えば、約70キロパスカル及び110キロパスカルの間の圧力差でサンプルを受け入れるように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、サンプル入口弁と流体連通するフィルタを含むことができ、このフィルタは、サンプル入口において導入するサンプル混合物から少なくとも1つの成分を分離するように構成されている。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、微小流体ネットワークと流体連通する少なくとも1つの熱作動ポンプを含むことができる。熱作動ポンプは、気体、25°C及び100°Cの間の温度及び1気圧で気化することができる液体、及び膨張性ポリマから選択した熱膨張性材料を含むことができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、微小流体ネットワークと流体連通する少なくとも1つの熱作動弁を含むことができる。熱作動弁は、25°C及び100°Cの間の温度及び1気圧において固相-液相遷移を有する材料を含むことができる。種々の実施形態において、微小流体ネットワークは、試薬、緩衝液、又は溶剤を収容した少なくとも1つの封止リザーバを含むことができる。封止リザーバは、例えば、試薬、緩衝液、又は溶剤を微小流体ネットワークと流体連通させるように構成されている自己穿孔可能ブリスタパックとすることができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、少なくとも少なくとも1つの疎水ベント抜け孔を含むことができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、細胞ごみのような流体及び/又は粒子物のような廃棄物を受け取り貯蔵するように構成されている少なくとも1つのリザーバを含むことができる。種々の実施形態では、保持部材は、ポリアルキレンイミン又はポリカチオニックポリアミド、例えば、ポリエチレンイミン、ポリ-L-リシン、又はポリ-D-リシンを含むことができる。保持部材は1つ以上の粒子の形態とすることができる。保持部材は、微小流体カートリッジから取り出し可能とすることができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、溶解試薬を含むことができる。溶解試薬は、界面活性剤の1つ以上の凍結乾燥ペレットを含むことができ、微小流体ネットワークは、界面活性剤の凍結乾燥ペレットを、液体と接触させて、溶解試薬溶液を作成するように構成することができる。微小流体ネットワークは、サンプルを溶解試薬と接触させて、溶解サンプルを生成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、外部熱源からの熱をサンプルに結合して、溶解サンプルを生成するように構成することができる。例えば、微小流体ネットワークは、保持部材及び溶解サンプルを接触させて、ポリヌクレオチド装填保持部材を作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、更に、ポリヌクレオチド装填保持部材を液体から分離するように構成されているフィルタを含むことができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、更に、洗浄緩衝液を収容するリザーバを含むことができ、微小流体ネットワークは、ポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させるように構成することができ、例えば、洗浄緩衝液は、少なくとも約10のpHを有することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、放出緩衝液を収容するリザーバを含むことができ、微小流体カートリッジは、ポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させて、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、外部熱源からの熱をポリヌクレオチド装填保持部材に結合して、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、中和緩衝液を収容するリザーバを含むことができ、微小流体ネットワークは、放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、ポリメラーゼ酵素及び複数のヌクレオチドを含むPCR試薬混合物を含むことができる。PCR試薬混合物は、1つ以上の凍結乾燥ペレットの形態とすることができ、微小流体ネットワークは、PCRペレットを液体と接触させて、PCR試薬混合溶液を作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークは、外部熱源からの熱をPCR試薬混合物及び中和ポリヌクレオチドサンプルを、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で結合するように構成することができる。種々の実施形態では、PCR試薬混合物は、更に、陽性対照プラスミドと、プラスミドの少なくとも一部のために選択的とする蛍光原混成プローブとを含むことができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、陰性対照ポリヌクレオチドを含むことができ、微小流体ネットワークは、中和ポリヌクレオチドサンプルのPCRアンプリコン及び陰性対照ポリヌクレオチドのPCRアンプリコンを独立して作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプル及び陰性対照ポリヌクレオチドの各々をPCR試薬混合物と独立して接触させるように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブを含むことができ、微小流体カートリッジは、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンをプローブと接触させるように構成することができる。プローブは、蛍光原混成プローブとすることができる。蛍光原混成プローブは、蛍光リポータ染料及び蛍光消光染料に結合されているポリヌクレオチドシーケンスを含むことができる。PCR試薬混合物は、更に、陽性対照プラスミドと、プラスミドの少なくとも一部のために選択的なプラスミド蛍光原混成プローブとを含むことができ、微小流体カートリッジは、蛍光原混成プローブ及びプラスミド蛍光原混成プローブの独立した光学的検出を可能にするように構成することができる。種々の実施形態では、プローブは、有機体を特徴付けることができるポリヌクレオチドシーケンス、例えば、ディオキシリボ核酸又はリボ核酸ポリヌクレオチドを用いたあらゆる有機体のために選択的とすることができる。つまり、プローブは、いずれの有機体のためにも選択することができる。適した有機体は、ほ乳類ヒトを含む、鳥類、は虫類、両生類、魚類、家畜、飼育動物、野生動物、絶滅した有機体、バクテリア、菌類、ウィルス、植物等を含む。また、プローブは、それら自体のポリヌクレオチドを用いる有機体、例えば、ミトコンドリアの成分のために選択的とすることもできる。実施形態の中には、プローブは、微小有機体、例えば、食品生産に用いられる有機体発酵製品において用いられるイースト、チーズに用いられるカビ又はバクテリア等又は病原体例えば、ヒト、家畜又は野生動物、家禽又は野生鳥類等のに用いられる有機体のために選択的とすることができる場合もある。実施形態の中には、プローブが、グラム陽性バクテリア、グラム陰性バクテリア、イースト、菌類、原生動物、及びウィルスから成る一群から選択した有機体のために選択的とすることができる場合もある。種々の実施形態では、プローブは、グループBストレプトコッカスの特徴を示すポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、発光原混成プローブの光学的検出を可能にするように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、更に、コンピュータ読み取り可能なラベルも含むことができる。例えば、ラベルは、バーコード、無線周波数タグ、又は1つ以上のコンピュータ読み取り可能キャラクタを含むことができる。ラベルは、機械的に伸展可能な材料で形成することができる。例えば、ラベルの機械的に伸展可能な材料は、約0.05及び約2ミリメートルの間の厚さと、約25及び約100の間のショア硬度とを有することができる。種々の実施形態では、取扱及び保管中、並びに室に挿入する前に、微小流体カートリッジを更に封止パウチで包囲することができる。微小流体カートリッジは、パウチの中に不活性ガスと共に封止することができる。封止パウチは、一塊の乾燥剤も収容することもできる。微小流体カートリッジは使い捨て型とすることができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、1つ以上のサンプルレーンを内蔵することができる。例えば、サンプルレーンは、熱作動型ポンプ、熱作動型弁、サンプル入口弁、フィルタ、及び少なくとも1つのリザーバを含むことができる。レーンは互いに独立であることができ、又は部分的に依存することもでき、例えば、レーンが、溶解試薬のような、1つ以上の試薬を共有することができる。実施形態によっては、微小流体カートリッジが位置合わせ部材及び微小流体ネットワークを含むことができる。微小流体ネットワークは、流体連通した状態で、少なくとも1つの熱作動型ポンプ、少なくとも1つの熱作動型弁、周囲圧力と比較して約70キロパスカル及び110キロパスカルの間の圧力差でサンプルを受け入れるように構成されているサンプル入口弁、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応よりも少なくとも1つのポリヌクレオチドのために選択した保持部材であって、ポリアルキレンイミン又はポリカチオニックポリアミドで形成した複数の粒子の形態である、保持部材、ポリヌクレオチド装填保持部材を液体から分離するように構成されているフィルタ、複数のリザーバであって、少なくとも1つが封止されている自己穿孔可能ブリスタパックリザーバである、リザーバを含むことができる。複数のリザーバは、とりわけ、リーシス試薬であって、微小流体ネットワークは、サンプル入口に導入されるサンプルを、リーシス試薬及び保持部材と接触させて、ポリヌクレオチド装填保持部材を作成するように構成されている、リーシス試薬と、洗浄緩衝液を収容するリザーバであって、微小流体ネットワークがポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させるように構成されている、リザーバと、放出緩衝液を収容するリザーバであって、微小流体ネットワークがポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させて放出ポリヌクレオチドサンプルを作成するように構成されている、リザーバと、中和緩衝液であって、微小流体ネットワークが放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成する、中和緩衝液と、ポリメラーゼ酵素、陽性対照プラスミド、プラスミドの少なくとも一部及び複数のヌクレオチドのために選択した蛍光原混成プローブを備えているPCR試薬混合物と、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブであって、微小流体ネットワークが中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンをプローブと接触させるように構成することができる、プローブとを含むことができる。更に、微小流体ネットワークは、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で、外部熱源からの熱をPCR試薬混合物及び中和ポリヌクレオチドサンプルに結合するように構成することができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチド分析システムは、微小流体カートリッジ及び、更にこの中で説明する、装置の双方を含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、微小流体ネットワークと、この微小流体ネットワークと流体連通する保持部材とを備えている微小流体カートリッジであって、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応インヒビタに対して少なくとも1つのポリヌクレオチドのために保持部材を選択する、微小流体カートリッジと、サンプルコンテナと、シリンジのような液体転送部材とを含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、サンプルをサンプルコンテナから微小流体ネットワークに転送するために液体転送部材を用いる命令を含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、サンプルをサンプルコンテナから送出し、ある体積の空気を微小流体ネットワークに送出するために液体転送部材を用いる命令を含むことができ、空気の体積は、約0.5mL及び約5mLの間である。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、フィルタと、例えば、液体転送部材を用いてサンプルをサンプルコンテナからフィルタを通じて微小流体ネットワークに送出する命令を含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、サンプルコンテナ上に少なくとも1つのコンピュータ読み取り可能ラベルを含むことができる。このラベルは、例えば、バーコード、無線周波数タグ、又は1つ以上のコンピュータ読み取り可能キャラクタを含むことができる。微小流体カートリッジは、不活性ガスと共にパウチの中に封止することができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、採取部材、転送コンテナ、及び採取部材を生物サンプルに接触させ、採取部材を転送コンテナの中に置く命令を含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、サンプル緩衝液、及び、例えば、採取部材及びサンプル緩衝液を接触させる命令を含むことができる。種々の実施形態では、ポリヌクレオチドサンプルキットは、更に、ポリヌクレオチドシーケンス、例えば、グラム陽性バクテリア、グラム陰性バクテリア、イースト、菌類、原生動物、及びウィルスから成る一群から選択した病原体の特徴を示すポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブをふうむことができる。実施形態によっては、ポリヌクレオチドサンプルキットは、微小流体ネットワークと、この微小流体ネットワークと流体連通する保持部材とを備えている微小流体カートリッジと、蛍光原プローブとを備えている微小流体カートリッジであって、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応インヒビタに対して少なくとも1つのポリヌクレオチドのために保持部材を選択し、グラム陽性バクテリア、グラム陰性バクテリア、イースト、菌類、原生動物、及びウィルスから成る一群から選択した病原体の特徴を示すポリヌクレオチドシーケンスのために蛍光原プローブを選択する、微小流体カートリッジと、サンプルコンテナと、液体転送部材と、採取部材と、転送コンテナと、サンプル緩衝液と、命令とを含むことができる。命令は、サンプルをサンプルコンテナから微小流体ネットワークに転送するために液体転送部材を用い、サンプルをサンプルコンテナから送出し、ある体積の空気を微小流体ネットワークに送出するために液体転送部材を用い、空気の体積は、約0.5mL及び約5mLの間であり、サンプルをサンプルコンテナからフィルタを通じて微小流体ネットワークに送出ために液体転送部材を用い、採取部材を生物サンプルに接触させ、採取部材を転送コンテナの中に置く命令を含むことができる。ポリヌクレオチドの採取方法は、微小流体カートリッジにおける保持部材を生物サンプルと接触させるステップであって、生物サンプルが少なくとも1つのポリヌクレオチドを含み、これによって微小流体カートリッジにおいてポリヌクレオチド装填保持部材を生成するステップと、生物サンプルの少なくとも一部をポリヌクレオチド装填保持部材から分離するステップと、ポリヌクレオチド装填保持部材からポリヌクレオチドの少なくとも一部を放出することにより、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成するステップとを含むことができる。種々の実施形態では、本方法は、更に、以下のステップの内1つ以上を含むことができる。微小流体カートリッジを前述の装置の受容ベイに入れるステップ、装置において動力部材を動作させて、受容ベイの一部と微小流体カートリッジの一部との間の界面に圧力を加えるステップ例えば、約5キロパスカル及び約50キロパスカルの間の圧力、又は実施形態によっては少なくとも約14キロパスカルの圧力を発生させる、動力部材を用いて微小流体カートリッジの中にある機械部材に力を加えるステップであって、この機械部材を、穿孔可能リザーバ、弁又はポンプから選択し、少なくとも1つの試薬、緩衝液、又は溶剤を微小流体チップの中にあるリザーバから放出するステップ、及び/又は蓋を閉鎖して動力部材を動作させ、動力部材を機械的に受容ベイにおける蓋と結合することができるステップ。実施形態によっては、本方法は、更に、サンプル識別器を用いて、微小流体カートリッジ上のラベル、又は生物サンプル上のラベルを読み取るステップも含むことができる。実施形態によっては、本方法は、更に、生の生物サンプルを微小流体カートリッジに導入し、微小流体カートリッジの中で、例えば、カートリッジ内においてフィルタを用いて、生の生物サンプルから生物サンプルを分離するステップを含むことができ、あるいは生物サンプルを微小流体カートリッジに導入する前に、生物サンプルを生の生物サンプルから分離することもできる。実施形態によっては、本方法は、更に、例えば、熱、溶解試薬等を用いて、生物サンプルを溶解するステップを含むこともできる。実施形態によっては、微小流体カートリッジが1つ以上の溶解試薬の凍結乾燥ペレットを備えている場合、本方法は、更に、液体によって界面活性剤の凍結乾燥ペレットを復元し、溶解試薬溶液を作成するステップを含むこともできる。種々の実施形態では、本方法は、更に、以下のステップの内1つ以上を含むことができる。微小流体カートリッジにおいて生物サンプルを加熱するステップ、微小流体カートリッジにおいて、周囲圧力と比較して約20キロパスカル及び200キロパスカルの間の差圧、又は、実施形態によっては、約70キロパスカル及び110キロパスカルの間の差圧で生物サンプルを加圧するステップ。実施形態によっては、ポリヌクレオチド装填保持部材から分離した生物サンプルの一部は、ヘモグロビン、ペプチド、糞便複合体、フミン酸、粘性複合体、DNA結合蛋白質、又はサッカリドから成る一群から選択した、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応インヒビタを含む可能性がある。実施形態によっては、本方法は、更に、生物サンプルにおけるポリメラーゼ連鎖反応インヒビタの実質的に全てからポリヌクレオチド装填保持部材を分離するステップを含むことができる。種々の実施形態では、本方法は、更に、以下のステップの内1つ以上を含むことができる。熱作動型ポンプ又は熱作動型弁を動作させることによって、微小流体カートリッジにおいて流体を送出するステップ、ポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させるステップ、ポリヌクレオチド装填保持部材を少なくとも約50°C実施形態によっては、温度は100°C以下とすることができるに加熱するステップ、約10分未満の間ポリヌクレオチド装填保持部材を加熱するステップ、ポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させて、放出ポリヌクレオチドサンプル例えば、実施形態によっては、放出緩衝液は、約50マイクロリットル未満の体積を有することができ、放出緩衝液は洗剤を含むことができ、及び/又は放出緩衝液は少なくとも約10のpHを有することができるを作成するステップ、及び/又は放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成するステップ。種々の実施形態では、本方法は、更に、以下のステップの内1つ以上を含むことができる。中和ポリヌクレオチドサンプルを、ポリメラーゼ酵素及び複数のヌクレオチド実施形態によっては、PCR試薬混合物は、更に、陽性対照プラスミド、及びプラスミドの少なくとも一部のために選択した蛍光原混成プローブを含むことができるを含むPCR試薬と接触させるステップ。実施形態によっては、PCR試薬混合物は、1つ以上の凍結乾燥ペレットの形態とすることができ、本方法は、更に、PCRペレットを液体によって復元し、PCR試薬混合物溶液を作成するステップと、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で、PCR試薬混合物及び中和ポリヌクレオチドサンプルを加熱するステップと、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブと接触させるステップと、中和ポリヌクレオチドサンプルのPCRアンプリコン及び陰性対照ポリヌクレオチドのPCRアンプリコンを独立して作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプル及び陰性対照ポリヌクレオチドの各々をPCR試薬混合物と独立して接触させるステップと、及び/又は中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコン、及び陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択した少なくとも1つのプローブと接触させるステップ。種々の実施形態では、本方法は、更に、以下のステップの内1つ以上を含むことができる。生物サンプルにおけるポリヌクレオチドシーケンスの存在を判定するステップであって、プローブが中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、ポリヌクレオチドシーケンスがプローブに対応する、ステップ、プローブが陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、汚染結果を判定するステップ、及び/又は、実施形態によっては、PCR試薬混合物が更に陽性対照プラスミド及びプラスミドの少なくとも一部のために選択したプラスミドプローブを備えている場合、本方法は、更に、プラスミドプローブが検出された場合にPCR反応が発生したと判定するステップを含む。種々の実施形態では、本方法は、更に、ポリヌクレオチド装填保持部材の遠心分離を含まない。実施形態によっては、ポリヌクレオチド採取方法は、微小流体カートリッジを装置の受容ベイに入れるステップと、装置において動力部材を動作させて、受容ベイの一部と微小流体カートリッジの一部との間の界面に圧力を加えるステップであって、力は、少なくとも1つの試薬、緩衝液、又は溶剤を微小流体カートリッジの中にあるリザーバから放出するように動作する、ステップと、微小流体カートリッジにおいて生物サンプルを溶解して、溶解生物サンプルを作成するステップと、微小流体カートリッジにおいて保持部材を溶解生物サンプルと接触させるステップであって、生物サンプルが少なくとも1つのポリヌクレオチドを含み、これによって、微小流体カートリッジにおいてポリヌクレオチド装填保持部材を生成し、保持部材が、ポリアルキレンイミン又はポリカチオニックポリアミドで形成した複数の粒子の形態である、ステップと、ポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させるステップと、ポリヌクレオチド装填保持部材を少なくとも約50°Cの温度に約10分未満の間加熱するステップと、ポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させて、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成するステップと、放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成するステップと、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプルをPCR試薬混合物と接触させるステップであって、PCR試薬混合物が、ポリメラーゼ酵素、陽性対照プラスミド、プラスミドの少なくとも一部のために選択した蛍光原混成プローブ、及び複数のヌクレオチドを含む、ステップと、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つの蛍光原プローブと接触させるステップであって、プローブは、グラム陽性バクテリア、グラム陰性バクテリア、イースト、菌類、原生動物、及びウィルスから成る一群から選択した有機体の特徴を示すポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができ、1つの蛍光原プローブを選択することができる有機体の存在を判定するステップを含むことができる。種々の実施形態では、コンピュータプログラム生産物は、前述の装置を動作させるためのコンピュータ読み取り可能命令をその上に含む。実施形態によっては、コンピュータプログラム生産物は、システムに放出ポリヌクレオチドサンプルを生物サンプルから作成させるコンピュータ読み取り可能命令をその上に含む。コンピュータ読み取り可能命令は、ポリヌクレオチド装填保持部材を生成するのに適した条件の下で、保持部材を生物サンプルと接触させる命令と、生物サンプルの少なくとも一部をポリヌクレオチド装填保持部材から分離する命令と、ポリヌクレオチド装填保持部材からポリヌクレオチドの少なくとも一部を放出することによって、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成する命令とを含むことができる。種々の実施形態では、コンピュータプログラム生産物は、システムに、受容ベイに微小流体カートリッジを入れたことの指示を出力させ、サンプルラベル又は微小流体カートリッジラベルを読み取らせ、ユーザがサンプル識別子を入力する指令を出力させ、ユーザがサンプル転送部材に生物サンプルを装填する指令を出力させ、ユーザがフィルタをサンプル転送部材に適用する指令を出力させ、ユーザが生物サンプルを微小流体カートリッジに導入する指令を出力させ、ユーザに生物サンプルを微小流体カートリッジにおける溶解試薬と接触させる指令を出力させ、ユーザが微小流体カートリッジを受容ベイに入れる指令を出力させ、ユーザが装置において動力部材を動作させて、受容ベイの一部と微小流体カートリッジの一部との間の界面に圧力を加える指令を出力させ、ユーザが蓋を閉鎖して動力部材を動作させる指令を出力させ、及び/又はユーザが生物サンプルを約0.5mL及び約5mLの間の体積の空気と共に導入することによって、微小流体カートリッジの中で生物サンプルを加圧する指令を出力させる1つ以上の命令を含むことができる。種々の実施形態では、コンピュータプログラム生産物は、システムに、生物サンプルを溶解させ、生物サンプルを溶解試薬によって溶解させ、液体によって界面活性剤の凍結乾燥ペレットを復元させて、溶解試薬溶液を作成させ、生物サンプルを加熱させ、ポリヌクレオチド装填保持部材を生物サンプルの少なくとも一部から分離させ、生物サンプルにおけるポリメラーゼ連鎖反応インヒビタの実質的に全てからポリヌクレオチド装填保持部材を分離させ、熱作動型ポンプ又は熱作動型弁を動作させることによって、微小流体カートリッジにおいて流体を送出させ、ポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させ、ポリヌクレオチド装填保持部材を少なくとも約50°C実施形態によっては、温度は100°C以下とすることができるに加熱させ、約10分未満の間ポリヌクレオチド装填保持部材を加熱させ、ポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させて、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成させ、及び/又は放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成させる1つ以上の命令を含むことができる。種々の実施形態では、コンピュータプログラム生産物は、システムに、中和ポリヌクレオチドサンプルを、ポリメラーゼ酵素及び複数のヌクレオチドを含むPCR試薬混合物と接触させ、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で、PCR試薬混合物及び中和ポリヌクレオチドサンプルを加熱させ、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブと接触させ、中和ポリヌクレオチドサンプルのPCRアンプリコン及び陰性対照ポリヌクレオチドのPCRアンプリコンを独立して作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプル及び陰性対照ポリヌクレオチドの各々をPCR試薬混合物と独立して接触させ、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコン、及び陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択した少なくとも1つのプローブと接触させ、プローブが中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、生物サンプルにおけるポリヌクレオチドシーケンスの存在の判定を出力させ、ポリヌクレオチドシーケンスがプローブに対応し、及び/又はプローブが陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、汚染結果の判定を出力させる1つ以上の命令を含むことができる。種々の実施形態では、コンピュータプログラム生産物は、システムに前述の方法のステップの1つ以上を自動的に実行させる1つ以上の命令を含むことができる。種々の実施形態では、微小流体ネットワークが2つ以上のサンプルレーンを含み、その各々が、熱作動型ポンプ、熱作動型弁、サンプル入口弁、フィルタ、及び少なくとも1つのリザーバを含み、コンピュータ読み取り可能命令は、システムにおける各レーンを独立して動作させるように構成することができる。実施形態によっては、コンピュータプログラム生産物は、生物サンプルから放出ポリヌクレオチドサンプルをシステムに作成させるコンピュータ読み取り可能命令をその上に含む。このシステムは、微小流体ネットワークと、この微小流体ネットワークと流体連通する保持部材であって、少なくとも1つのポリメラーゼ連鎖反応インヒビタに対して少なくとも1つのポリヌクレオチドのために選択した保持部材とを備えている微小流体カートリッジと、微小流体カートリッジを選択的に収容するように構成されている受容ベイと、受容ベイにおける微小流体カートリッジに熱的に結合するように構成されている少なくとも1つのヒートポンプと、検出器と、検出器及びヒートポンプと結合されているプラグラマブルプロセッサとを備えている装置とを含むことができる。コンピュータ読み取り可能命令は、生物サンプルを溶解試薬と接触させることによって生物サンプルを溶解し、更に加熱して溶解サンプルを生成し、保持部材を生物サンプル及び/又は溶解サンプルと接触させて、ポリヌクレオチド装填保持部材を生成し、ポリヌクレオチド装填保持部材から生物サンプルの少なくとも一部を分離し、ポリヌクレオチド装填保持部材を洗浄緩衝液と接触させ、ポリヌクレオチド装填保持部材を放出緩衝液と接触させるか、又は加熱してポリヌクレオチドの少なくとも一部をポリヌクレオチド装填保持部材から放出することによって、放出ポリヌクレオチドサンプルを作成し、放出ポリヌクレオチドサンプルを中和緩衝液と接触させて、中和ポリヌクレオチドサンプルを作成し、PCRアンプリコンを独立して作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプル及び陰性対照ポリヌクレオチドの各々をPCR試薬混合物と独立して接触させ、PCR試薬混合物が、ポリメラーゼ酵素、複数のヌクレオチド、陽性対照プラスミド、プラスミドの少なくとも一部のために選択したプラスミドプローブを含み、プラスミドプローブが検出された場合、PCR反応が発生したと判定し、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコン、及び陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンを、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択した少なくとも1つのプローブと接触させ、プローブが中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、生物サンプルにおけるポリヌクレオチドシーケンスの存在を判定し、ポリヌクレオチドシーケンスがプローブに対応し、プローブが陰性対照ポリヌクレオチド又はそのPCRアンプリコンにおいて検出された場合、汚染結果の判定を出力させる1つ以上の命令を含むことができる。本技術の1つ以上の実施形態の詳細は、添付図面及び以下の説明に明記されている。本技術のその他の特徴、目的、及び利点は、説明及び図面、並びに特許請求の範囲から明白であろう。種々の図面における同様の参照記号は、同様の要素を示すこととする。これより、システム、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物について更に説明する。生物サンプルの分析は、多くの場合、1つ以上のポリヌクレオチド例えば、DNA、RNA、mRNA、又はrRNAがサンプルの中に存在する可能性があるか否か判断することを含む。例えば、サンプルを分析して、特定の病原体バクテリア又はビールスのようなを示すポリヌクレオチドが存在する可能性があるか否か判断する場合がある。ポリヌクレオチドは、ゲノムDNAのサンプルとすることができ、又はミトコンドリアDNAのサンプルとすることもできる。通例、生物サンプルは複合の混合物とすることができる。例えば、サンプルは、血液サンプル、組織サンプル例えば、鼻、口、肛門、膣組織のスワブバイオプシ吸引液、溶菌液、菌類、又はバクテリアとして供給することができる。判断すべきポリヌクレオチドは、粒子の中に含有されていてもよい例えば、細胞例えば、白血球細胞及び/又は赤血球細胞、組織断片、バクテリア例えば、グラム陽性バクテリア及び/又はグラム陰性バクテリア、菌類、胞子。1つ以上の液体例えば、水、緩衝液、血液、血液プラズマ、唾液、尿、髄液、又は有機溶剤が、通例、サンプルの一部となることができ、及び/又は処理ステップの間にサンプルに添加することができる。生物サンプルの分析方法は、生物サンプル例えば、スワブを用意し、サンプルの粒子例えば、バクテリアのような細胞からポリヌクレオチドを放出し、放出したポリヌクレオチドの1つ以上を増幅し例えば、ポリメラーゼ連鎖反応PCRによって、増幅ポリヌクレオチドの存在又は不在を判定する例えば、蛍光検出によって。しかしながら、生物サンプルは、通例、インヒビタ例えば、粘液複合物、ヘモグロビン、糞便複合物、及びDNA結合蛋白質を含み、これがサンプルにおけるポリヌクレオチドの存在を判定するのを妨げる可能性がある。例えば、このようなインヒビタは、PCR及びポリヌクレオチドの存在を判定するその他の酵素技法によるポリヌクレオチドの増幅効率を低下させる可能性がある。インヒビタの濃度が、判定すべきポリヌクレオチドに対して減少しない場合、分析が偽りの陰性結果を生成する可能性がある。ここでは、生物サンプル例えば、判定すべき1つ以上のポリヌクレオチドを有するサンプルを処理する本方法及び関係するシステムは、通例、インヒビタの濃度を判定すべきポリヌクレオチドの濃度に対して、ここで更に説明する方法によって低下させることができる。システム及び微小流体カートリッジの種々の態様について、ここで説明する。その種々の構成要素の追加の開示は、米国特許出願第11/580,267号、及び仮特許出願第60/859,284号において見出すことができ、その明細書はここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。システムの全体像ここに記載する分析を実行するシステム981の模式的な全体像を図1に示す。図1に示すシステム981の構成要素の幾何学的配置は、一例であり、限定することは意図していない。マイクロプロセッサのようなプロセッサ980は、図示のようなシステムの種々の構成要素の機能を制御するように構成されており、これによってこのような構成要素の各々と通信する。即ち、プロセッサ980は、分析すべきサンプルに関するデータを、例えば、サンプルリーダ990からうけとるように構成されている。サンプルリーダ990は、バーコードリーダ、光学式キャラクタリーダ、又はRFIDスキャナ無線周波数タグリーダとすればよい。例えば、サンプル識別器は、ハンドヘルドバーコードリーダとすることができる。プロセッサ980は、ユーザ命令や動作条件の選択を入力984から受け入れるように構成されており、このような命令は、サンプルの分析を開始する命令を含むことができる。また、プロセッサ980は、ディスプレイ982と通信するように構成されているので、例えば、分析の結果をディスプレイに送信する。加えて、プロセッサ980は、ディスプレイ982上に表示すべき1つ以上の質問を送信し、ユーザがそれに応答して入力を与えるように促すことができる。つまり、ある種の実施形態では、入力984及びディスプレイ982は、互いに一体化されている。任意に、プロセッサ986は更に分析の結果を、プリンタ、視覚ディスプレイ、又はスピーカ、あるいはその組み合わせのような出力デバイスに送信するように構成されている。任意に、プロセッサ980は更にネットワークインターフェースのような通信インターフェースを通じて、コンピュータネットワーク988に接続されている。通信インターフェースは、シリアル接続、パラレル接続、ワイヤレスネットワーク接続、及び有線ネットワーク接続から成る一群から選択した1つ以上のインターフェースとすることができる。これによって、システムが相応しくネットワーク上でアドレスされているとき、遠隔ユーザはプロセッサにアクセスし、命令を送信し、データを入力し、データを読み出し、プロセッサと関連のあるメモリ図示せず、又はプロセッサと通信するその他の何らかのコンピュータ読み取り可能媒体に格納することができる。図1には示していないが、種々の実施形態では、入力984は、キーボード、接触感応面、マイクロフォン、トラックパッド、網膜スキャナ、及びマウスから成る一群から選択した1つ以上の入力デバイスを含むことができる。加えて、種々の実施形態では、本装置は、更に、プロセッサ、入力デバイス、及び通信インターフェースの1つ以上からデータを受け取るように構成されているデータ記憶媒体も備えることができ、データ記憶媒体は、ハードディスクドライブ、光ディスクドライブ、フラッシュカード、及びDC-Romから成る一群から選択した1つ以上の媒体である。更に、プロセッサ980は、全体像において以下に続き、この中で更に詳しく説明する、サンプル診断の種々の態様を制御するように構成されている。本システムは、微小流体カートリッジのような、相補的カートリッジ994と合わせて動作するように構成されている。カートリッジ自体は、この中で更に説明するが、生物サンプル996を、ワークアップ及び診断分析に適した形態で受け取るように構成されている。カートリッジは、システムの中にある受容ベイ992に収容される。受容ベイは、ヒータ998と連通しており、ヒータ998自体はカートリッジの特定の領域をサンプルワークアップ及び分析中の特定の時点に加熱するようにプロセッサ980によって制御される。また、プロセッサは、カートリッジ994からの診断の指示を受け取る検出器999を制御するように構成されている。前述のように、診断は、出力デバイス986及び/又はディスプレイ982に送信することができる。適したプロセッサ980は、当技術分野では周知の設計原理及び半導体処理方法によって、それぞれ、設計及び製造することができる。図1に全体像を示したシステムは、ここに記載するその他の実施形態例と同様に、優位性がある。何故なら、これは試薬の蓄積に適した構成のシステム内部に場所を必要としないからである。本システムも、この中にあるその他の実施形態例も、例えば、ボトル、キャニスタ、又はリザーバのような外部蓄積容器から試薬を受け取るように構成されている入口や出口ポートを必要としない。したがって、図1におけるシステムは自己充足的であり、微小流体カートリッジと合わせて動作する。このカートリッジは、その内部に試薬蓄積専用の場所を有する。図1のシステムは、研究室のセッティングのような、1つの場所で動作を実行するように構成することができ、あるいは携行可能であってもよく、例えば、異なる場所の患者を訪問する場合がある、外科医又はその他の健康管理専門家に随伴することができる。本システムには、通例、電力コードが設けられているので、主電源又は発電機からAC電力を受け入れることができる。任意の変圧器図示せずをシステムに組み込むか、又は電力ソケットとシステムとの間で外部に配置すれば、AC入力電力をシステムが用いるためのDC出力に変圧する。また、本システムは、1つ以上のバッテリを用いることによって動作するように構成することもでき、したがって、通例、バッテリ再充電システムや、診断分析を信頼性高く開始又は完了するにはバッテリ電力が低くなり過ぎた場合にはユーザに警告する種々の警報デバイスも装備されている。図1のシステムは、更に、他の実施形態では、多重化サンプル分析に合わせて構成することもできる。このような構成の1つでは、図1に全体像を示したようなシステムの多数のインスタンス同士を一緒に動作させて、多数のカートリッジを受け入れて処理する。各カートリッジには、異なるサンプルが装填されている。図1に示す各構成要素は、したがって、サンプルの数だけあってもよいが、種々の構成要素は共通の筐体内に構成することができる。更に別の構成では、システムは、多数のカートリッジを受け入れて処理するように構成されているが、図1における1つ以上の構成要素は、多数のカートリッジに共通である。例えば、1つのデバイスに多数のカートリッジ受容ベイを構成することができるが、共通のプロセッサ及びユーザインターフェースを、種々のカートリッジの同時、連続、又は同時制御を可能にするのに適した構成とすることができる。更に、このような実施形態は、1つのサンプルリーダ及び1つの出力デバイスを利用することも可能である。更に別の構成では、図1に示すシステムは、1つのカートリッジを受け入れるように構成されているが、1つのカートリッジは、1つよりも多い、例えば、2、3、4、5、又は6つのサンプルを並列に、互いに独立して、処理するように構成されている。多数のサンプルを取り扱うことができるカートリッジを作成する技術の例は、別の文献、例えば、米国特許出願第60/859,284号に記載されている。その内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。更に、カートリッジに、タグを付ける、例えば、サンプルを示す分子バーコードを付けることができ、サンプルの追跡をし易くし、サンプルの混合の危険性を極力抑えるようにすることも、本技術と調和する。このようなタグ付け方法は、例えば、米国特許出願公開第10/360,854号に記載されている。その内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。システム例図2A~図2Eは、本明細書中で更に説明するシステム例の種々の構成の外部斜視図を示す。図2Aは、微小流体カートリッジ図示せずを収容し、カートリッジに導入されたサンプルに種々の処理動作を行わせ、それらの動作を制御するシステム2000の斜視図を示す。システム2000のエレメントは、明示的に示すものに限定されるのではない。例えば、図示しないが、システム2000は、この中で更に説明するように、ハンドヘルドバーコードリーダに接続することもできる。システム2000は、筐体2002を備えており、筐体2002は金属又は硬化プラスチックで作ることができる。図2Aに示す筐体の形態は、様式的及び機能的特徴を具体化している。本発明のその他の実施形態は、構成要素の配列において、そして線の平滑さ、外部仕上げ、及び模様に関するそれらの全体的外観において、多少異なって見える場合もある。更に、システム2000は、1つ以上の安定化部材2004を備えている。図2Aに示すのは、安定脚であり、通常数個設けられており、システム2000の下側の種々の領域に配置されて、バランスを取り支持している。例えば、3本、4本、5本、6本、又は8本のこのような安定脚があってもよい。脚は、成型され、筐体2002と同じ材料で作るとよく、あるいは1つ以上の別個の材料で作り、システム2000の下側に取り付けてもよい。例えば、脚は、ゴムを含み、システム2000が設置されている面上で滑り難くし、更に表面を傷から保護することもできる。部材の安定化部材は、脚以外の形態、例えば、レール、ランナ、又は1つ以上のパッドの形態をなすこともできる。更に、システム2000は、ディスプレイ2006を備えており、これはアクティブマトリクスのような液晶ディスプレイ、OLED、又はその他の何らかの適した形態とすればよい。これは、画像及びその他の情報をカラー又は白黒で呈示することができる。また、ディスプレイ2006は、接触感応ディスプレイとしてもよく、したがって、種々の表示プロンプトに応答してユーザからの入力を受け入れるように構成することもできる。ディスプレイ2006は、反射防止被膜をその上に有し、研究室設定において頭上光からのグレアや反射を低減するようにするとよい。また、ディスプレイ2006は、例えば、バックライトから照明し、暗い研究室において一層視認し易くするとよい。図2Aに示すように、システム200は、ハンドル2008を有する可動蓋201も備えている。蓋2010は、前後に摺動することができる。図2Aでは、蓋は前方位置にあり、これによって閉鎖されている。図2Bでは、蓋は後方位置にあり、この場合蓋は開放しており、微小流体カートリッジを収容するように構成されている受容ベイ2014を露見させる。勿論、当業者は認めようが、ここに記載する技術は、摺動する蓋や、前後に摺動する蓋には限定されない。蓋がデバイスの前方に位置するときに開放する構成のように、横の移動も可能である。また、蓋が蝶番式の蓋であることや、完全に取り外し可能な蓋であることも可能である。ハンドル2008は、ユーザが蓋2010を一方の位置から他方に移動させることを可能にする役割を果たし、更に、閉鎖位置にあるときに、蓋に対して下方に圧力を賭けさせ、圧力が受容ベイ2014の中にあるカートリッジに加えることができるようにする役割も果たす。図2Cでは、ハンドル2008は押下位置に示されており、これによって力が蓋2014に加えられ、このため、蓋の直下にある受容ベイに収容されているカートリッジに圧力が加えられる。一実施形態では、ハンドル及び蓋の構造体には運動センサがはめ込まれており、受容ベイの中にカートリッジがないときには、ハンドルを押下させないようにする。別の実施形態では、ハンドル及び蓋の構造体には、機械的ラッチがはめ込まれており、分析が進行中のときにはハンドルを引き上げられないようにする。システム2000の更に別の構成を図2Dに示す。この場合、扉2012が開放位置にある。扉2012は、図2A~図2Cでは閉鎖位置に示されている。扉は、任意の構成要素であり、ユーザがヒータモジュール2020、そしてコンピュータ読み取り可能媒体入力トレイ2022にも接近することができるようにする。システム2000は、ヒータモジュール2020及び媒体入力2022を覆う扉がなくても機能するが、このような扉が取り付けられていると便利なことがある。扉2012は底辺が蝶番式となって示されているが、その側辺、又はその上縁に蝶番が取り付けられていてもよい。あるいは、扉2012は、蝶番で取り付ける代わりに、取り外し可能なカバーであってもよい。例えば、ヒータモジュール及び/又はコンピュータ読み取り可能媒体入力への接近がシステムの異なる面上の方が望ましい場合、扉2012は、システム2000の背面又は側面に配置してもよい。また、ヒータモジュール、及びコンピュータ読み取り可能媒体入力には、デバイスの同じ又は異なる側面で別個の扉を介して到達することも、本システムと調和し、この場合、このような別個の扉は、独立して蝶番で取り付けられていても、取り外し可能でもよい。ヒータモジュール2020は、好ましくは取り外し可能であり、以下で更に説明する。コンピュータ読み取り可能媒体入力2022は、種々の媒体の1つ以上を受け入れることができる。図2Dに示すのは、入力2022の一形態例であり、共通に用いられる読み取り可能、読み取り-書き込み可能、及び書き込み可能フォーマットのCD、DVD、又はミニ-CD、あるいはミニ-DVDを受け入れるCD-Romトレイである。また、フロッピディスク、メモリスティックのようなフラッシュメモリ、コンパクトフラッシュ、スマートデータカード、又はセキュアデータカード、ペンドライブ、可搬型USBドライブ、ジップディスク、及びその他のような、他の形態の媒体も受け入れることができる入力も、この中の記載と調和する。また、このような入力は、様々な異なる形態の媒体も受け入れるように構成することができる。このような入力2022は、プロセッサと通信し図2A~図2Eには示さないが、図1に関連付けて説明した、適正に入力に挿入されたときに、コンピュータ読み取り可能媒体からデータを読み取ることができる。図2Eは、システム2000の背面の平面図を示す。図示するのは、分析の間余分な熱を逃がすためのエアベント2024である。通例、システム2000の内側には、エアベント2024を介してファンがあるが、図2Eには示されていない。図2Eに示すその他のポートは次の通りである。システム2000を電源に接続する電力コードを受け入れる電力ソケット2026、システム2000をローカルエリアネットワークのようなコンピュータネットワークにリンクするイーサネット登録商標接続2028、システム2000を電話ネットワークのような通信ネットワークにリンクするフォンジャック接続2032、システム2000を、プリンタ又はコンピュータハードドライブのような1つ以上の周辺デバイスに接続する1つ以上のUSBポート2030、例えば、リモートコントローラ図示せずと通信して、ユーザに、タッチスクリーンインターフェースを用いずに、システムを制御させる、赤外線ポート。例えば、ユーザは離れたところからスケジューリングコマンドをシステム2000に発行して、今後の特定の時刻に分析を開始させることもできる。システム2000の背面上に示す機構は、種々の構成要素の内部構成に応じて、いずれの異なる様式にでも配置することができる。加えて、システム2000の背面にあるように示す機構は、設計の好みに応じて、任意にシステム2000の別の面に設けてもよい。図2Eに示すのは、接続の例である。尚、入力、出力、ソケット、及び接続を含むその他の機構がシステム2000の背面上に設けても、図示しないが、システム2000の別の面上に設けてもよいことは言うまでもない。本装置の実施形態の一例の分解図を図3に示し、特に、装置2000の内部機構を示す。装置2000は、それと共に用いるカートリッジ上の動作を駆動し監視するために用いることができるハードウェア/ファームウェア、及びカートリッジ内で処理されるサンプルに対して実行される診断検査の結果を解釈し、伝達し、格納するソフトウェアが構成されているコンピュータ読み取り可能媒体を備えることができる。図3を参照すると、装置2000の典型的な構成要素が示されており、例えば、制御電子回路2005、着脱可能なヒータ/センサモジュール2020、携行検出モジュールのような検出器2009、表示画面又は任意に合体したディスプレイ及びユーザインターフェース2006例えば、医療級接触感応液晶ディスプレイLCDを含む。実施形態によっては、蓋2010、検出器2009、及びハンドル2008を纏めてスライダモジュール2007と呼ぶことができる場合もある。装置2000の更に別の構成要素には、種々のモジュール例えば、ヒータ/センサモジュール2020及び/又はスライダモジュール2007を位置合わせして保持し、構造的剛性を与えるためのフレーム2019のような、1つ以上の機械的固定具を含むことができる。検出器モジュール2009は、レールに配置すれば、装置2000におけるカートリッジ2060の開放及び配置がし易くなり、閉鎖するときに光学素子の位置合わせをし易くすることができる。ヒータ/センサモジュール2020は、容易に取り外し構造体に挿入するために、レール上に配置することもできる。また、装置2000の実施形態は、ソフトウェア例えば、ユーザとインターフェースし、分析を行い、及び/又は検査結果を分析するため、ファームウェア例えば、カートリッジ812上での検査の間ハードウェアを制御するため、及び周辺機器のための、2031で纏めて示す1つ以上の周辺通信インターフェース例えば、コンパクトディスク又はハードディスクのようなストレージに接続するため、バーコードリーダ及び/又はキーボードのような入力デバイスを接続するため、その他のコンピュータ又はストレージにネットワークを通じて接続するため等の、USB/シリアル/イーサネット登録商標のような通信ポートも含む。制御電子回路840は、図4では模式的にブロック図で示されており、種々の実施形態において、例えば、主制御900、多重化902、表示制御904、検出器制御906等のための1つ以上の機能を含むことができる。主制御機能は、装置2000における制御電子回路840のハブとしての役割を果たせばよく、種々の電子機能の通信及び制御を管理することができる。また、主制御機能は、ユーザ又はプリンタ920のような出力デバイス、並びに任意の診断及び安全機能との電気的及び通信インターフェース908をサポートすることができる。主制御機能900と合わせて、マルチプレクサ機能902は、センサデータ914及び出力電流916を制御し、ヒータ/センサモジュール2020を制御するのに役立つことができる。表示制御機能904は、タッチスクリーンLCD846への出力を制御し、そして該当するのであれば、これからの入力を解釈することができ、ある種の実施形態では、これによってグラフィカルインターフェースをユーザに提供する。検出器機能906は、制御電子回路840内に実施することができ、典型的な制御及び処理回路を用いて、1つ以上の蛍光検出モジュールのような検出器2009からのデータの収集、ディジタル化、フィルタ処理、及び/又は送信する。種々の実施形態では、蛍光検出モジュール2009は、微小化した、高感度蛍光検出システムとすることができ、例えば、図5に示すように、相応しく位置付けした微小流体カートリッジから発する蛍光信号のリアルタイム分析を可能とすることができる。検出モジュール2009は、1つ以上の光源2850例えば、発光ダイオードLED、1つ以上の検出器2852例えば、フォトダイオード、並びに1つ以上のフィルタ2851及び/又はレンズ2853を用いることができる。実施形態によっては、検出モジュール2009は多数例えば、6つの検出エレメントを内蔵することができる場合もあり、各エレメントが1つ以上の蛍光プローブを検出することができる。種々の実施形態では、装置2000のスライダモジュール2007は、検出モジュール2009例えば、光検出システム及びスライダモジュール2007のハンドル2008を押下したときに微小流体カートリッジ2020を押下する機械的構造体/光学素子ジグ856を収容することができる。図6A及び図6Bは、種々の実施形態における、装置2000への挿入後の微小流体カートリッジ2060の場所を示す。光学素子ジグ856は、1箇所以上例えば、4箇所の点でスライダモジュール2007のケースから吊り下げることができる。スライダモジュール2007を閉鎖し、装置2000のハンドル2008を下に回すと、1つ以上の機械的アクチュエータ858例えば、4つのカムがプレート860を1つ以上例えば、4つのばね862に対抗して押下することができる。圧縮時には、ばね862は力を検出器モジュール2009に伝達することができる。検出器モジュール2009の底面864は平坦に作ることができ例えば、250ミクロン以内、典型的には100ミクロン以内、更に典型的には25ミクロン以内、表面864はカートリッジ2060を押圧することができる。カートリッジ2060は、非圧縮時に厚さが0.1~2.5mm、典型的には非圧縮時の厚さが約1.5mmの共形層868例えば、ショア高度が約50から70を有することができる。したがって、カートリッジ2060の圧縮は、平坦面864との組み合わせで、圧力、つまり熱接触を、微小流体カートリッジ2060全域にほぼ均一に発生することができる。スライダモジュール2007における1つ以上のばね862は力例えば、5~500N、典型的には約200~250Nを伝達し、微小流体カートリッジ2060の底面全域に圧力例えば、2psiを発生することができる。また、図6Bは、スライダモジュール2007を閉鎖することができるときに、スライダモジュール2007の機械的機構863が微小流体カートリッジ2060の自己穿孔可能リザーバ866を押下して、リザーバの内容物例えば、DI水、PCR試薬を放出させることができる。着脱式ヒータモジュール着脱式ヒータモジュール2020の一例を図7に示す。このモジュールは、局在化した熱を、受容ベイ2014の中に収容されているカートリッジの種々の選択領域に伝達するように構成されている。図7に示すのは、凹陥面2044を有するヒータモジュールであり、これが、受容ベイ2014の中にあるときカートリッジを支持するプラットフォームを設ける。一実施形態では、カートリッジは直接表面2044上に載る。表面2044は、図7では、凹陥して示されているが、そうである必要はない。区域2044は、1つの向きで微小流体カートリッジを受け入れるように構成されている。したがって、区域2044には、ユーザがカートリッジを受容ベイ2014に間違った構成で挿入することを防止する機械的なキーのような、位置合わせ部材を装備することができる。図7において機械的なキー2045として示すのは、区域2044の対角線に沿って切り欠いた角であり、この中に微小流体カートリッジの相補的に切り欠いた角をはめ込む例えば、図9参照。その他の位置合わせ部材も、ここに記載する装置と調和し、例えば、2つ以上のような数個の切欠角、図9のカートリッジの1つ以上の縁に切り込んだ1つ以上のノッチ、又は図9のカートリッジの1つ以上の縁に製作した1つ以上の突起を含むがこれらには限定されない、カートリッジの1つ以上の縁に設計する機構である。代わりの位置合わせ部材には、カートリッジの下側に設計され、表面2044における1つ以上の凹陥ソケット又は孔と相補的な1つ以上のラグ又はバンプが含まれる。代わりの位置合わせ部材には、カートリッジの下側に設計され、表面2044における1つ以上の1つ以上のラグ又はバンプと相補的な1つ以上の凹陥ソケット又は孔が含まれる。一般に、機構のパターンは、カートリッジが少なくとも1つの非対称エレメントを所有し、1つの向きでしか受容ベイには挿入できないようになっている。また、図7には、ハンドグリップ2042も示されており、ユーザによるヒータモジュールの取り外し及び挿入をやり易くする。切欠2048によって、ユーザは、処理実行後カートリッジを受容ベイ2014から容易に取り外すことが可能になり、例えば、ユーザの親指は、カートリッジの上面を掴んでいるとき、切欠2048によって余裕のある空間が得られる。切欠2042及び2048の双方は、図7の実施形態では半円状の凹陥として示されているが、これらはその形状に限定されるのではないことは言うまでもない。つまり、矩形、正方形、三角形、楕円形、及びその他の形状の凹陥も、ここに記載するヒータモジュールと調和する。図7の実施形態は、図2A~図2Eのシステムと互換性を有するように設計されており、ヒータモジュールの前面が図の左側にある。ヒータモジュール2020の背後には、RS-232接続のような電気接続2050があり、これによって、この中で更に説明するサンプル処理及び分析の間、区域2044の特定の領域に配置されているヒータに電気信号を送出することができる。つまり、区域2044の直下は、図7には示されていないが、抵抗性ヒータのような熱源のアレイとすることができ、受容ベイに適正に挿入された微小流体カートリッジの指定箇所と整合するように構成されている。表面2044は、周期的に浄化して、サンプル取り扱いの間に発生する可能性があるいずれの液体の漏出も、短絡を全く起こさないことを確保することができる。ヒータモジュール2020には、他にも以下の必須でない機構がある。ヒータモジュール2020の1つ以上の側面前面、背面、又はフランキング等、又は表面上面又は下面等には、1つ以上のエアベント2052を設けることができ、受容ベイ2014の直下にあるヒータが動作しているときに、過剰の熱を逃がすことができる。図7におけるエアベントの構成は一例であり、他の数及び形状も、ヒータモジュールの慣例的な製作及び使用と調和することは言うまでもない。例えば、5つの正方形エアベントを示すが、1、2、3、4、6、8、又は10個というような他の数のエアベントを、ヒータモジュールの一方側に配列する、あるいは2つ以上の側面及び/又は面全体に分散させることもできる。更に別の実施形態では、エアベントは、円形、矩形、楕円形、三角形、多角形、とすることもでき、湾曲した又は直角の頂点、又は不規則な形状を含む、更に別の形状を有することもできる。更に、ヒータモジュール2020は、1つ以上の案内部材2047も備えることができ、これらはヒータモジュールを装置に挿入し易くする。これについては、ヒータモジュール2020がユーザによって取り外すことができる実施形態で更に説明する。ヒータモジュールが取り外せることが利点であるのは、異なる位置合わせ部材及び/又は微小流体ネットワークを有する異なるカートリッジを、同じ又は異なる処理動作のシーケンスと共に採用するというように、異なる種類の分析のためにシステム2000の構成を容易に変更できるからである。別の実施形態では、ヒータモジュール2020は、固定とし、例えば、浄化、交換、又は保守のために、製造業者又は公認保守代理人によってのみ取り外すことができ、ユーザによって日常的に取り外すことはできないように設計されている。案内部材は、ヒータモジュールが正しく装置内で位置合わせされていることを確保すること、そしてサンプルの処理及び分析の間、又は装置の輸送の間、ヒータモジュールが密着し大きく移動しないことを保証することという1つ以上の役割を果たすことができる。図7の実施形態に示す案内部材は、受容ベイ2044のいずれかの側にあり、モジュール2020の全長の相当な部分に沿って広がっている。別の案内部材もこの中の使用と調和し、限定ではないが、1、3、4、5、6、又は8つというような、別の数の案内部材、そしてモジュール2020の区域2051内に配置することを含む、別の位置が含まれる。案内部材2047は、その長さに沿って一定でない厚さを有するように示されている。他の案内部材はその長さに沿って本質的に一定の厚さを有してもよいことは、本発明と調和する。隣接する受容ベイ2014は、ランプのような、凹陥区域2053の中に設定した、非接触加熱エレメント2046である。凹陥区域2053には、反射板、又は反射被膜も設けて、非接触加熱エレメント2046からのできるだけ多くの熱及び光エネルギを受容ベイ2014に向けて外側に送出するように構成するとよい。エレメント2046は、ある種の実施形態では、熱ランプである。エレメント2046は、電気エネルギを受け、それによって電気抵抗の効果によって加熱するように構成されている。エレメント2046は、受容ベイ2014に収容されているカートリッジの隆起領域を加熱する方法を提供する。カートリッジの隆起領域例えば、図9参照は、溶解室を内蔵することができ、非接触加熱エレメント2046からの熱を加えることによって、溶解室内で細胞を溶解させる効果を有することができる。また、図7には、ヒータモジュール2020の区域2051上にある、光学蛍光材2049のような、蛍光材の任意領域も示されている。蛍光材の領域は、この中で更に説明する検出システムによって検出されるように構成されている。領域2049は、サンプル処理及び分析に先だって、検出システムにおいて光学素子の状態を検証するために用いられ、したがって制御又は標準として作用する。例えば、一実施形態では、装置の蓋例えば、図2A参照が開いているとき、周囲の光が領域2049に到達することができ、これによって蛍光材が特性周波数又は光のスペクトルを放出することができ、これを検出器が、例えば、標準化又は較正の目的で測定することができる。別の実施形態では、周囲光を拠り所として蛍光材料に発光させる代わりに、1つ以上のLEDのような、検出システム自体からの光源を用いる。したがって、領域2049は、検出器の位置と整合するように位置付けられる。領域2049は、矩形であるように示されているが、正方形、円形、楕円形、三角形、多角形のようなその他の形状で、湾曲した又は直角の頂点を有するように構成することもできる。また、領域2049は、都合に応じて、そして展開する検出システムに対して相補的となるために、ヒータモジュール2020上の他の場所に配置してもいいことは言うまでもない。また、ヒータモジュール2020は、区域2044の直下に配されているヒータのアレイも備えているが、図7には示されていない。更にここで説明するように、このようなヒータは、受信した電気信号にしたがって特定的にそして特定の時点に加熱するように構成されている、抵抗性ヒータとするとよい。即ち、図7には示されていないが、ヒータ/センサモジュール2020は、例えば、多重化機能902を離散多重化回路ボードMUXボードに、1つ以上のヒータ例えば、マイクロヒータ、1つ以上の温度センサ任意に、例えば、溶融シリカ基板上にフォトリソグラフィによって製作したような、1つ以上のそれぞれのマイクロヒータを有し、任意に合体して1つのヒータ/センサユニットとなる、及び非接触加熱エレメント2046を含むことができる。マイクロヒータ及び非接触加熱エレメントは、熱エネルギを供給することができ、この熱エネルギは、相応しく位置付けられている微小流体カートリッジ上にある種々の微小流体構成要素を作動させることができる。センサ例えば、抵抗性温度検出器RTDのようなは、例えば、フィードバックに基づくメカニズムを通じて、マイクロヒータ及び非接触ヒータ2046のリアルタイム監視を可能とし、温度制御に対処する。1つ以上のマクロヒータは、相応しく位置付けられた微小流体カートリッジ上で加熱する対応の微小流体構成要素例えば、弁、ポンプ、ゲート、反応室と位置合わせすることができる。マイクロヒータは、微小流体カートリッジ上の対応する微小流体構成要素よりも多少大きく設計することができるので、中心外れのように、カートリッジが多少ヒータからずれていても、個々の構成要素を効果的に加熱することができる。また、非接触ヒータ2046は、相応しく位置付けられている微小流体カートリッジの少なくとも一区分を加熱する放射熱源としての役割を果たすこともできる。例えば、20Wのキセノンランプを、非接触加熱エレメント2046として用いることができる。種々の実施形態では、ヒータ/センサモジュール2020は、個々のカートリッジ設計に特定的とすることができ、装置800の前面パネルを通じて容易に交換可能とすることができる。ヒータ/センサモジュール2020は、普通の洗剤例えば、10漂白溶液で加熱面2044を洗浄できるように構成することができる。図8A及び図8Bを参照すると、循環的にPCR反応ゾーン1001を加熱するように構成されているヒータ集合の一例が示されている。尚、図8A及び図8Bに示すヒータを統御する原理と同様の原理にしたがって、他のゲート、弁、及びアクチュエータのような微小流体カートリッジの他の領域を作動させるためのヒータ構成を設計し展開することもできることは言うまでもない。PRC反応ゾーン1001の一例、通例、~1.6μlの容積を有する室又はチャネルには、長辺と短辺とが設けられており、各々には、加熱エレメントが関連付けられている。PCR反応ゾーンは、ここでは、PCRリアクタとも呼ぶ場合もある。したがって、装置は、好ましくは、図8Aの実施形態例に示すように、所与のPCR反応ゾーンの辺に沿って配置されこれを加熱するように構成されている4つのヒータ、即ち、長い上側ヒータ1005、長い下側ヒータ1003、短い左側ヒータ1007、及び短い右側ヒータ1009を含む。長い上側ヒータ1005と長い下側ヒータ1003の間に小さい間隙があるため、無視し得る温度勾配PCR反応ゾーンの長さに沿ったいずれの地点においてもPCRチャネルの幅を横切って1°C未満が生じ、したがってPCR反応ゾーン全体に事実上均一な温度が得られる。PCRリアクタの短縁上のヒータは、2つの長ヒータによってリアクタの中心からリアクタの縁までに発生する勾配を相殺するための熱を供給する。尚、PCR反応ゾーンを中心に配置されている1つ以上のヒータの更に別の構成も、ここに記載する方法及び装置と調和することは、当業者には当然分かるはずである。例えば、反応ゾーンの長い辺は、2つ以上のヒータで加熱するように構成することができる。熱伝導性が低い基板上においても均一な加熱ゾーンを創作するために、特定的な方位及び構成のヒータを用いる。何故なら、ガラス又はクオーツ、あるいは溶融シリカ基板の低い熱伝導性は、弁のような種々の微小流体構成要素の独立した動作、及び種々のPCRレーンの独立した動作を促進するために利用されるからである。尚、PCR反応ゾーン周囲のヒータの構成の基礎となる原理は、アクチュエータ、弁、及びゲートのような、微小流体カートリッジのその他の構成要素に隣接するヒータの配列にも同様に適用可能であることも、当業者には当然分かるはずである。ある種の実施形態では、各ヒータには温度センサが関連付けられている。図8Aの実施形態では、双方の長ヒータに1つの温度センサ1011が用いられている。短い左側ヒータの温度センサ1013、及び短い右側ヒータの温度センサ1015も示されている。リアクタの中央にある温度センサは、フィードバックを与え、2つの長ヒータに供給する電力量を制御するために用いられ、一方短ヒータの各々は、それに隣接して配置されておりそれを制御するための専用の温度センサを有する。温度センサは、好ましくは、ヒータを加熱させる電流をヒータが受信していないようなときに、その近傍における温度に関する情報をプロセッサに送信するように構成されている。これは、電流サイクルのしかるべき制御によって達成することができる。PCRヒータを制御するために必要なセンサ又はヒータエレメントの数を削減するために、熱を検知するためにもヒータを用いることによって、ヒータ毎に別個の専用センサを有する必要性をなくすことができる。別の実施形態では、4つのヒータの各々は、しかるべきワット数を有し、4つのヒータを直列又は並列に接続して、電気的に制御可能なエレメントの数を4から1に削減することによって、付随する電子回路への負担を低減するように設計することができる。図8Bは、図8AのPCR反応ゾーンと共に用いるヒータ及び温度センサの拡大図を示す。温度センサ1001及び1013は、約200~300オームの常温抵抗を有するように設計されている。この抵抗値は、堆積する金属層の厚さ例えば、400ÅのTiW/3,000ÅのAu/400ÅのTiWの積層を制御し、金属巻線をエッチングして約10~25μmの幅及び20~40mmの長さを有するようにすることによって決定する。この層に金属を用いることによって、約0.5~20°C/Ω、好ましくは1.5~3°C/Ωの範囲の抵抗率の温度係数がそれに与えられる。もっと高い温度で抵抗を測定すると、これらのセンサの場所の正確な温度の判定が可能となる。図8Aに示す、1つのPCR反応ゾーンのための均一加熱構成は、多数の独立したPCR反応が起こるマルチレーンPCRカートリッジにも適用することができる。各ヒータは、ここに記載する装置と共に用いるプロセッサ及び/又は制御回路によって独立して制御することができる。図8Cは、図8A及び図8Bにおけるように構成したヒータによって加熱した場合の、微小流体カートリッジの上面からの熱像を示す。このとき、各ヒータを次のように順番に活性化した。図8Cにおいて、1は長い上側のみ、2は長い下側のみ、3は短い左側のみ、4は短い右側のみ、及び5は4つのヒータ全てがオン下状態を示している。パネル6は、図8Cにおけるその他の画像パネルと同じメモリで、反応ゾーン及びヒータの図を示す。また、図8Cには、温度軸も示されている。微小流体カートリッジ図9は、本明細書に記載するシステムと共に用いる微小流体カートリッジ2060の一例の外見の斜視図を示す。カートリッジ2060の中には、少なくとも1つの試薬パッケージ2062が含まれている。このような試薬カートリッジが4つ示されているが、限定ではなく、1、2、3、5、6、8、10、及び12個というような、その他の数のこのようなパッケージも、用途に応じて可能である。更に、カートリッジ2060は、試薬を収容し、ルアーのような入口2066にはめ込まれるタワー2064を備えている。入口2066を通じて、生物サンプルの一部を導入することができる。また、タワー2064は、バルク溶解室2065及び廃棄物室2067のような、1つ以上の室も備えることができる。廃棄物室2067は、空気のような気体を放出するためのベント2069を有するとよい。タワー2064以外では、カートリッジ2060は実質的に平坦であり、操作者が容易に取り扱うことができ、図1に示すような装置の相補的受容ベイに容易に沿わせることができるようになっている。更に、カートリッジ2060は、ポート2068を備えており、これを通じて検出器が、処理又は増幅中に、信号を直接又は間接的にサンプル内の1つ以上のポリヌクレオチドから受け取り、ユーザにサンプルに対する診断結果を供給することができる。更に、カートリッジ2060は、受信ベイにおける対応する位置合わせ部材に対して相補的な、機械的キーのような、位置合わせ部材も備えることができる。図9には、位置合わせ部材2071の一例として、カートリッジからの角切欠が示されている。ここに記載する一体化システムは、微小流体カートリッジを収容するように構成されている装置と、微小流体カートリッジとを備えている。微小流体カートリッジの多数の異なる構成、及びその目的が、相応しく構成された装置と互換性を有することは、ここに記載するシステムと調和する。つまり、例えば、1つのカートリッジが収集した生物サンプルを受け入れ、サンプルに一連の検査を行い、溶解細胞を含ませてその中に含有するポリヌクレオチドを解放及び収集し、予備増幅準備ステップをポリヌクレオチドに適用し、ポリヌクレオチドを増幅し、増幅したポリヌクレオチドを検出させることができる場合の便益について述べるが、他の微小流体カートリッジを用いることができることも、この中の記載と調和する。このようなその他のカートリッジは、前述のステップよりも少ない、1つ以上のようなステップを実行するように構成することができ、対応して、それと共に用いる装置は、このような少ないステップを実行させるように構成される。したがって、この中で微小流体カートリッジの種々の構成例を紹介するときは、その種々の構成要素は、修正せずにでも、適宜幾何学的形状又はサイズの適した調節又は修正を伴ってでも、相互交換可能に用いることができることは言うまでもない例えば、1つのカートリッジと関連付けて記載する弁の一例は、他のカートリッジと関連付けて記載するネットワークにおいて用いることもできる。微小流体カートリッジの態様したがって、本技術は、以下のような属性を有する微小流体カートリッジも備えている。つまり、本技術は、1つ以上のポリヌクレオチドを処理し、例えば、ポリヌクレオチドを終結させる及び/又はポリヌクレオチドの検出及び/又は増幅を妨げる虞れがあるインヒビタ複合体例えば、ヘモグロビン、ペプチド、糞便複合体、フミン酸、粘性複合体、DNA結合蛋白質、サッカリドからポリヌクレオチドを分離するように構成されている微小流体カートリッジを含む。微小流体カートリッジは、ポリヌクレオチドと、インヒビタとは対照的にポリヌクレオチドと優先的に連合する例えば、保持する、比較的固定化した複合体とを接触させるように構成することができる。複合体の一例には、ポリカチオニックポリアミド例えば、ポリ-L-リシン及び/又はポリ-D-リシン又はポリエチレンイミンPEIがあり、表面例えば、1つ以上の粒子の表面に結合することができる。複合体は、ポリヌクレオチドを保持し、複合体及び付随するポリヌクレオチドが結合される表面を洗浄する等によって、ポリヌクレオチド及びインヒビタを分離できるようにする。分離の再、ポリヌクレオチドと複合体との間の連合は破壊され、複合体及び表面からポリヌクレオチドを放出例えば、分離することができる。実施形態の中には、表面例えば、1つ以上の粒子の表面を、共有結合によって表面に結合することができる、ポリアミド又はPEIのようなポリカチオニック物質で改質することができる場合もある。ポリカチオニックポリアミドは、ポリ-L-リシン及びポリ-D-リシンの内少なくとも1つを含むとよい。実施形態に中には、ポリカチオンポリアミド例えば、ポリ-L-リシン及びポリ-D-リシンの内少なくとも1つは、少なくとも約7500Daの平均分子重量を有する。ポリカチオンポリアミド例えば、ポリ-L-リシン及びポリ-D-リシンの内少なくとも1つは、約35,000Da未満の平均分子重量を有するとよい例えば、約30,000Da未満の平均分子重量例えば、約25,000Daの平均分子重量。ポリカチオンポリアミド例えば、ポリ-L-リシン及びポリ-D-リシンの内少なくとも1つは、少なくとも約15,000Daの中央分子重量を有するとよい。ポリカチオンポリアミド例えば、ポリ-L-リシン及びポリ-D-リシンの内少なくとも1つは、約25,000Da未満の中央分子重量例えば、約20,000Da未満の中央分子重量例えば、約20,000Daの中央分子重量を有するとよい。ポリカチオン材料がPEIである場合、その分子重量は、600~800ダルトンの範囲であることが好ましい。他の実施形態では、微小流体カートリッジは、ポリカチオンポリアミド又はPEIが結合した表面と、表面を流体サンプルに接触させるための表面と連通するサンプル導入路とを含む。実施形態の中には、本装置が、表面と接触する水溶液を少なくとも約65°Cまで加熱するように構成されている熱源を含む場合もある。実施形態の中には、カートリッジが少なくとも約10例えば、約10.5以上のpHを有する液体のリザーバを含む場合もある。カートリッジは、表面を液体と接触させるように構成することができる例えば、圧力源を作動させて液体を移動させることによって。微小流体カートリッジの別の態様は、保持部材、例えば、結合PEI、又はポリリシン、例えば、ポリ-L-リシンを含むビーズのような複数の粒子、並びに関係する方法及びシステムに関する。サンプルを処理する方法の一例は、保持部材を、混合物と接触させることを含み、液体及びある量のポリヌクレオチドを含む混合物を供給することを含む。保持部材は、ポリメラーゼ連鎖反応インヒビタと比較して、ポリヌクレオチドを優先的に保持するように構成するとよい。混合物における液体の実質的に全てを、保持部材から除去することができる。ポリヌクレオチドは、保持部材から放出することができる。ポリヌクレオチドは、約7.5Mbp未満のサイズを有することが好ましい。液体は、第1液体であり、保持部材から液体の実質的に全てを除去する際、保持部材を第2液体と接触させることを含む。保持部材を第2液体と接触させる際、熱作動式圧力源を作動させて、圧力を台2液体に加えることを含むことができる。保持部材を第2液体と接触させる際、熱作動式弁を開放して、第2液体を保持部材と連通させることを含むことができる。第2液体は、約50マイクロリットル未満の体積を有し、洗剤例えば、SDSを含んでいる。保持部材は、ポリヌクレオチドを優先的にポリメラーゼ連鎖反応インヒビタに結合するように構成されている複合体を有する表面を含むとよいこのようなインヒビタは、例えば、ヘモグロビン、ペプチド、糞便複合体、フミン酸、粘性複合体、DNA結合蛋白質、サッカリドを含む。表面は、ポリリシン例えば、ポリ-L-リシン及び/又はポリ-D-リシン又はPEIを含むとよい。ポリヌクレオチドを保持部材から放出する際、保持部材を少なくとも約50°C例えば、約65°Cの温度に加熱することを含むとよい。温度は、加熱の間保持部材の存在下において液体を沸騰させるには不十分とするとよい。温度は、100°C以下とするとよい例えば、100°C未満、約97°C以下。温度は、約10分未満の間例えば、約5分未満、約3分未満維持するとよい。放出は、保持部材の遠心分離を伴わずに行うとよい。ある種の実施形態では、PCRインヒビタを臨床サンプルから迅速に除去して、PCRの準備ができたサンプルを作成することができる。したがって、本方法は、インヒビタを実質的に排除することができるポリヌクレオチド含有サンプルの調合を含むとよい。このようなサンプルは、例えば、熱、化学、超音波、機械、静電、及びその他の溶解技法から得られる、生のライセートから調合するとよい。サンプルは、遠心分離を伴わずに調合するとよい。サンプルは、他の微小流体デバイスを用いて、又は規模を大きくして調合してもよい。保持部材は、ポリメラーゼ連鎖反応による増幅のような、更に別の処理のためにポリヌクレオチドサンプルを調合するために用いてもよい。ある種の実施形態では、90よりも多いポリヌクレオチドがサンプル内に存在すると、保持部材に結合させ、放出し、回収することができる。ある種の実施形態では、約10分未満例えば、約7.5分未満、約5分未満、又は約3分未満でポリヌクレオチドを保持部材に結合し、放出し、回収することができる。ポリヌクレオチド、保持部材、及び/又はインヒビタを遠心分離にかけなくても、ポリヌクレオチドを保持部材に結合し、放出し、回収することもできる。ポリヌクレオチド及びインヒビタを分離するには、一般に、ポリヌクレオチド、インヒビタ、処理領域、及び/又は保持部材を沈殿例えば、遠心分離させることを除外する。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、ポリメラーゼ酵素と複数のヌクレオチドとを含むPCR試薬混合物を含むことができる。PCR試薬混合物は、1つ以上の凍結乾燥ペレットの形態をなすことができ、微小流体ネットワークは、PCRペレットを液体と接触させてPCR試薬混合物溶液を作成するように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、外部熱源からの熱をPCR試薬混合物及び中和したポリヌクレオチドサンプルと、中和ポリヌクレオチドサンプルからPCRアンプリコンを作成するのに適した熱サイクル条件の下で、結合するように構成することができる。種々の実施形態では、PCR試薬混合物は、更に、陽性制御プラスミド及びプラスミドの少なくとも一部のために選択した蛍光原混成プローブを含むことができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、陰性制御ポリヌクレオチドを含むことができ、微小流体ネットワークは、中和ポリヌクレオチドサンプルのPCRアンプリコン及び陰性制御ポリヌクレオチドのPCRアンプリコンを独立して作成するのに適した熱サイクル条件の下で、中和ポリヌクレオチドサンプル及び陰性制御ポリヌクレオチドの各々を独立してPCR試薬混合物と接触させるように構成することができる。種々の実施形態では、微小流体カートリッジは、ポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる少なくとも1つのプローブを含むことができ、微小流体カートリッジは、中和ポリヌクレオチドサンプル又はそのPCRアンプリコンをプローブと接触させるように構成することができる。プローブは、蛍光原混成プローブとすることができる。蛍光原混成プローブは、蛍光レポータ染料及び蛍光消光染料に結合されたポリヌクレオチドシーケンスを含むことができる。PCR試薬混合物は、更に、陽性制御プラスミドと、プラスミドの少なくとも一部のために選択したプラスミド蛍光原混成プローブとを含むことができ、微量流体カートリッジは、蛍光原混成プローブ及びプラスミド蛍光原混成プローブの独立した光学的検出を可能にするように構成することができる。種々の実施形態では、プローブは、有機体、例えば、ディオキシリボ核酸又はリボ核酸ポリヌクレオチドを用いるいずれの有機体の特徴をも示すことができるポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる。つまり、プローブはいずれの有機体にも選択することができる。適した有機体は、ほ乳類ヒトを含む、鳥類、は虫類、両生類、魚類、家畜、飼育動物、野生動物、絶滅した有機体、バクテリア、菌類、ウィルス、植物等を含む。また、プローブは、それら自体のポリヌクレオチドを用いる有機体、例えば、ミトコンドリアの成分のために選択的とすることもできる。実施形態の中には、プローブは、微小有機体、例えば、食品生産に用いられる有機体発酵製品において用いられるイースト、チーズに用いられるカビ又はバクテリア等又は病原体例えば、ヒト、家畜又は野生動物、家禽又は野生鳥類等のに用いられる有機体のために選択的とすることができる場合もある。実施形態の中には、プローブが、グラム陽性バクテリア、グラム陰性バクテリア、イースト、菌類、原生動物、及びウィルスから成る一群から選択した有機体のために選択的とすることができる場合もある。種々の実施形態では、プローブは、Staphylococcusspp、例えば、S.エピダーミディス、S.オーレウス、耐メチシリンスタフィロコッカスオーレウス、耐バンコミシンスタフィロコッカス;S.ピオジーンズ、S.アガラクティエのようなストレプトコッカス;E.フェーカリス、E.デュランズ及びE.フェーシウム以前のS.フェーカリス、S.デュランズ、S.フェーシウム;ノネンテロコッカルグループDストレプトコッチ、例えば、S.ボビス、及びS.エクインズ;ストレプトコッチヴィリダンス、例えば、S.ミュータンス、S.サンギス、S.サリバリアス、S.ミチア、A.ミレーリ、S.コンステラタス、S.インターミディウス、及びS.アンギノスス;S.イニエ;S.ニューモニエ;ネイセリア、例えば、N.メニンジタイズ、N.ゴノローエ、サプロフィックネイセリアsp;エリシペロスリクス、例えば、E.ルシオパティエ;リステリアspp、例えば、L.モノシトジェン、希にL.イヴァノヴィイ、及びL.シーリゲリ;バシラス、例えば、B.アンスラシス、B.セレウス、B.サブティリス、B.サブティラスニガー、B.サリンジーシス;ノカーディアアステロイズ;レジオネラ、例えば、L.ニューモノフィリア、ニューモシスティス、例えば、P.カリニイ;サルモネラ、シゲーラ、エシェリキアのようなエンテロバクテリアセエ例えば、E.コリ、E.コリO157:H7;クレブシーラ、エンテロバクター、セラティア、プロテウス、モルガネラ、プロビデンシア、エルシニア等、例えば、サルモネラ、例えば、S.ティフィ、S.パラティフィA、BS.ショットミューレリ、及びCS.ヒルシュフェルディ、S.ダブリンSコレレースイス、S.エンテリティディス、S.ティフィミュリアン、S.ハイデルベルグ、S.ニューポート、S.インファンティス、S.アゴナ、S.モンテビデオ、及びS.サンポール;シゲーラ、例えば、S.フレックスネリ、S.ソネイ、S.ボイディイ、S.ディセンテリエのような、サブグループ:A、B、C、及びD;プロテウスP.ミラビリス、P.ブルガリス、及びP.ミクソファシアンズ、モーガネラM.モーガニイMmorganii;プロビデンシアP.レットゲリ、P.アルカリファシエンス、及びP.スチュアーティ;イエルシニア、例えば、Y.ペスティス、Y.エンテロコリチカ;ヘモフィラス、例えば、H.インフルエンゼ、H.パラインフルエンゼ、H.アフロフィラス、H.デュクレイ;ブルセラ、例えば、B.アボータス、B.メリテンシス、B.スイス、B.カニス;フランシセラ、例えば、F.チュラレンシス;シュードモナス、例えば、P.エルギノサ、P.ポーシモビリス、P.ピュティダ、P.フルオレセンス、P.アシドボランス、バークホルデリアシュードモナスシュードマレイpseudomallei。バークホルデリアマレイ、バークホルデリアセパシア、及びステノトロフォマナスマルトフィリア;カンピロバクタ、例えば、C.フェツスフェツス、C.ジェジュニ、C.ピロリヘリコバクタピロリ;ビブリオ、例えば、V.コレラ、V.パラヘモリティカス、V.ミニカス、V.アルギノリティカス、V.ホリセ、V.ヴルニフィカス、及び凝着不可のビブリオ;クロストリディア、例えば、C.パーフリンゲンス、C.テタニ、C.ディフィシル、C.ボツリヌス;アンチノミセス、例えば、A.イスラエリ;バクテロイズ、例えば、B.フラジリス、B.テタイオタオミクロン、B.ディスタサニス、B.ブルガツス、B.オヴァテュス、B.カッケ、及びB.マーデ;プレボトラ、例えば、P.メラニノゲニカ;ジーナスフソバクテリウム;トレポネマ、例えば、T.パリダムサブスペシーズエンデミカム、T.パリダムサブスペシーズパーテニュー、T.カラテウム、及びT.パリダムサブスペシーズパリダム;ジーナスボレリア、例えば、B.バーグドーフェリ;ジーナスレプトスピラ;ストレプトバシラス、例えば、S.モニリフォーミス;スピリラム、例えば、S.ミヌス;ミコバクテリウム、例えば、M.ツベルクロシス、M.ボビス、M.アフリカヌム、M.アヴィウス、M.イントラセルレア、M.カンサシ、M.ゼノピ、M.マリヌム、M.ウルセランス、M.フォーテュイタムコンプレックスM.フォーテュイタム及びM.ケロネイ、M.レプラエ、M.アシアティクム、M.ケロネイスブスプアブセサス、M.ファラックス、M.フォーテュイタム、M.マルモエンセ、M.シモイデイ、M.シミエ、M.スズルガイ、M.ゼノピ;ミコプラズマ、例えば、M.ホミニス、M.オラレ、M.サリバリウム、M.ファーメンタンス、M.ニューモニエ、M.ボビス、M.ツベルクロシス、M.アヴィウム、M.レプレ;ミコプラスマ、例えば、M.ジェニタリウム;ユレアプラスマ、例えば、U.ユレアリティクム;トリコモナス、例えば、T.ヴァジナリス;クリプトコッカス、例えば、C.ネオフォーマンス;ヒストプラズマ、例えば、H.カプスラタム;カンディダ、例えば、C.アルビカンス;アスパージルスsp;コクシディオイデス、例えば、C.イミティス;ブラストミセス、例えば、B.ダーマティティディス;パラコクシディオイデス、例えば、P.ブラジリエンシス;ペニシリウム、例えば、P.マーネフェイ;スポロスリクス、例えば、S.シェンキー;リゾプス、リゾムコア、アブシディア、及びバシディオボルス;ビポラリス、クラドフィアロフォラ、クラドスポリウム、ドレシェラ、エクゾフィリア、フォンセカエ、フィアロフォラ、キシロヒファ、オクロコニス、リノクラディエラ、スコレコバシディウム、及びワンジーラによって生ずる病気;トリコスポロン、例えば、T.ベイジェリ;ブラストシゾミセス、例えば、B.カピタツス;プラスモディウム、例えば、P.ファルシパルム、P.ヴィヴァックス、P.オヴァレ、及びP.マラリエ;バベシアsp;ジーナストリパノソマアのプロトゾア、例えば、T.クルジ;レイシュマニア、例えば、L.ドノヴァニ、L.メイジャL.トロピカ、L.メキシカナ、L.ブラジリエンシス、L.ヴィアニアブラジリエンシス;トクソプラズマ、例えば、T.ゴンディイ;ジェネラネグリエラ又はアカンサモエバのアモエバス;エンタモエバヒストリティカ;ジアルディアランブリア;ジーナスクリプトスポリディウム、例えば、C.パーヴム;イソスポラベッリ;シクロスポラカイエタネシス;アスカリスランブリコイズ;トリチュリストリチウラ;アンシロストマデュオデナェ又はネケータアメリカヌス;ストロンジロイデスステルコラリストクソカラ、例えば、T.カニス、T.カティス;ベイリサスカリス、例えば、B.プロシオニス;トリチネラ、例えば、T.スピラリス;ドラクンクラス、例えば、D.メディネンシス;ジーナスフィラリオイデア;ウッチェレリアバンクロフティ;ブリンジア、例えば、B.マライ又はB.ティモリ;オンコセルカヴォルヴルス;ロアロア;ディロフィアリアインミティス;ジーナスシストソマ、例えば、S.ジャポニクム、S.マンソニ、S.メコンジ、S.インターカラツム、S.ヘモトビウム;パラゴニムス、例えば、P.ウェスターマニ、P.スキリアビニ;クロノーチスシネンシス;ファシオラヘパティカ;オピストホーチスsp;ファシオロプシスバスキ;ディフィロボツリウムラツム;テニア、例えば、T.サジナタ、T.ソリウム;エキノコッカス、例えば、E.グラヌロスス、E.ムルチロクラリス;ピコマヴィルセス、リノヴィルーセスエコヴィルセス、コックサキエヴィルセス、インフルエンザヴィルス;パラミクソヴィルセス、例えば、タイプ1、2、3、及び4;アドノヴィムセス;ヘルペスヴィルセス、例えば、HSV-1及びHSV-2;ヴァリセラ-ゾスタヴィルス;ヒトT-リンファトロフィックヴィルスタイプI及びタイプII;アーボヴァイラシス及びアレナヴィルセストガヴィリダエ、フラヴィヴィリダエ、ブニアヴィリダエ、レオヴィリダエ;フラヴィヴィルス;ハンタヴィルス;ウィルス性脳炎アルファヴィルセス、例えば、ヴェネズレランエクインエンセファリティス、イースタンエクインエンセファリティス、ウェスタンエクインエンセファリティス;ウィルス性出血熱フィロヴィルセス、例えば、エボラ、マーバーグ、及びアレナヴィルセス、例えば、ラッサ、マチュポ;天然痘ヴィリオラ;レトロウィルス、例えば、ヒト免疫不全ウィルス1及び2;ヒト乳頭腫ウィルスHPVタイプ6、11、16、18、31、33、及び35から成る一群から選択した有機体の特徴を示すことができるポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる。種々の実施形態では、プローブは、シュードモナアエルジノサ、プロテウスミラビリス、クレブシエラオキシトカ、クレブシエラニューモニエ、エシェリチアコリ、アシネトバクテルバウマンニ、セラティアマルセセンス、エンテロバクタアエロジェネス、エンテロコッカスファエシウム、耐ヴァコミシンエンテロコッカス、スタフィロコッカスアウレウス、耐メセシリンスタフィロコッカスアウレウス、ストレプトコッカスヴィリダンス、リステリアモノシトジェネス、エンテロコッカスspp.、ストレプトコッカスグループB、ストレプトコッカスグループC、ストレプトコッカスグループG、ストレプトコッカスグループF、エンテロコッカスファエカリス、ストレプトコッカスニューモニエ、スタフィロコッカスエピデルミディス、ガルデネララヴァジナリス、ミクロコッカスsps.、ハエモフィルスインフルエンゼ、ネイセリアゴノルホエエ、モラクセラカタラリス、サルモネラsps.、クラミディアトラコマティス、ペプトストレプトコッカス生成物、ペプトストレプトコッカスアナエロビウス、ラクトバシルスフェルメンツム、ユーバクテリウムレンテュム、カンディダグラブラタ、カンディダアルビカンス、クラミディアspp.、カンプロバクタspp.、サルモネラsp.、天然痘ヴィリオラマジョール、イエルシナペスティス、ヘルペスシンプレクスヴィルスI、及びヘルペスシンプレクスヴィルスIIから成る一群から選択した有機体を特徴付けるポリヌクレオチドシーケンスのために選択的とすることができる。種々の実施形態では、プローブを、グループBストレプトコッカスの特徴を示すポリヌクレオチドシーケンスのために選択することができる。また、本技術は、流体の運動を抑制する構成要素を有する微小流体カートリッジも備えている。この構成要素は、チャネルと、チャネルの第1側に配置した第1熱応答物質TRS質量体と、チャネルの第1側とは逆になるチャネルの第2側に配置した第2TRS質量体と、第1TRS質量体と関連付けられている気体圧力源とを備えている。気体圧力源を作動させることにより、第1TRS質量体を第2TRS質量体に送り込み、チャネルを遮断する。微小流体カートリッジは、第2TRS質量体と関連付けられている第2気体圧力源を含むことができる。第2気体圧力源を作動させることによって、第2TRS質量体を第1TRS質量体に送り込む。第1及び第2TRS質量体の少なくとも一方例えば、双方は、ワックスとすることができる。微小流体カートリッジの別の態様は、微小流体カートリッジのチャネルを遮断する構成要素を含む。TRSの質量体を加熱し、チャネルを横切って例えば、気体圧力によって第2TRS質量体に送り込むことができる。また、第2TRS質量体を第1TRS質量体に向けて送り込むことができる例えば、気体圧力によって。微小流体カートリッジの別の態様は、アクチュエータである。このアクチュエータは、チャネルと、チャネルに接続されている室と、室内に配される封入液体の少なくとも1つのリザーバと、室内部においてリザーバを包囲する気体とを含む。室を加熱することによって、封入液体のリザーバが膨張し、気体を加圧する。通例、この液体の沸点は約90°C以下である。この液体は、約10個以下の炭素原子を有する炭化水素とするとよい。液体は、ポリマによって封入するとよい。アクチュエータは、多数の封入液体のリザーバを含み、室内に配することができる。多数のリザーバは、固体例えば、ワックスの中に分散することができる。多数のリザーバは、可撓性エンクロージャ例えば、可撓性の袋の中に配することもできる。微小流体カートリッジの別の態様は、デバイスの室内部において気体を加圧して、微小流体デバイスのチャネル内において液体を移動させるのに十分な気体圧力を発生させることを含む。通例、気体を加圧すると、室内部に配置されている少なくとも1つの封入気体のリザーバが膨張する。少なくとも1つのリザーバを膨張させるには、室を加熱することを含むことができる。気体を加圧するには、多数の封入液体のリザーバを膨張させることを含むことができる。ここで用いるための微小流体カートリッジの別の態様は、第1及び第2液体体積を合体例えば、混合することを含む。本デバイスは、デバイスの第1及び第2チャネルを分離する、温度応答物質TRSの質量体を含む。デバイスは、第1チャネルに沿って第1液体を移動させて、第1液体の一部例えば、中央部分がTRSに隣接できるようにし、第2液体を第2チャネルに沿って移動させて、第2液体の一部例えば、中央部分がTRSに隣接できるように構成することができる。熱源を作動させてTRSを移動させる例えば、溶解、分散、崩壊によってことができる。第1及び第2液体の中央部分は、通例、合体しており、気体界面によって分離されていない。通例、第1液体の部分集合及び第2液体の部分集合を合体させることができる。液体は、混合チャネルに沿って移動するときに混合する。液体合体すると、少なくとも2液滴長だけ移動し、層間挿入及び横断方向核酸微小チャネルの長さに対して垂直によって、適正な混合が得られ、混合のために長手方向の拡散のみを拠り所とする必要はない例えば、Mathematicalmodelingofdropmixinginaslittypemicrochannelスリット型微小チャネルにおける滴下混合の数学的モデリング、KHandiqueetalJMicromechMicroeng11548554も参照のこと。この内容はここで引用したことにより本願にも含まれるものとする。混合液滴を一滴長ずつ移動させることによって、後端液滴の中央を先端液滴の先頭に移動させ、次いでチャネルの壁に向けて移動させる。液滴の後端では、液体が壁から液滴の中心に向かって移動する。この液滴の運動によって、2つの液体間に層間挿入が生ずる。本方法を余分な回数繰り返すことにより、更に多くの液滴長にわたってというように、より多くの層間挿入を達成することができる。更に、微小流体カートリッジは、凍結乾燥試薬粒子も含む。実施形態によっては、凍結乾燥粒子は、多数の更に小さい粒子を含み、各々が、PCRインヒビタと比較してポリヌクレオチドと優先的に連合する複数の受容体を有する。またあるいは、凍結乾燥粒子は、細胞を溶解してポリヌクレオチドを放出するように構成されている溶解試薬例えば、酵素も含むことができる。またあるいは、凍結乾燥粒子は、蛋白質を劣化させる酵素例えば、プロテーゼも含むことができる。細胞は、例えば、微小流体液滴において、細胞の溶液を合体することによって溶解することができ、凍結乾燥粒子はこれによって粒子を再構成する。再構成した溶解試薬は、細胞を溶解する。ポリヌクレオチドは、更に小さい粒子の受容体と連合する。溶解の間、溶液を加熱するとよい例えば、ヒートランプのようなランプを用いて放射的に、又は接触熱源によって。実施形態によっては、凍結乾燥粒子が、PCRを実行するために試薬例えば、プライマ、制御プラスミド、ポリメラーゼ酵素を含む場合もある。微小流体カートリッジの別の態様は、液体例えば、溶剤、緩衝液、試薬、又はその組み合わせを保持することができる液体リザーバを含む。一般に、リザーバは、国際出願公開第WO2006/079082号に更に記載されているような、以下の特徴の1つ以上を有することができる。リザーバは、当該リザーバ内部の容積を減少させるように操作例えば、押圧又は押下することができる壁を含むことができる。例えば、リザーバは、液体を放出するためにリザーバの別の部分例えば、壁の一部を裂く穿孔部材例えば、針状又はそれ以外の、先が尖った又は尖鋭な部材を含むことができる。穿孔部材は、リザーバの内部にあり、穿孔部材がリザーバの内面例えば、壁から外に向かって壁を裂くようにすることができる。一般に、壁は液体又は蒸気の通過に抵抗する。実施形態によっては、壁が伸縮性に欠ける場合もある。壁は可撓性があるとよい。壁は、例えば、金属層、例えば、箔層、ポリマ、又はその組み合わせを含み積層体であるとよい。壁は、真空成形によって形成するとよい例えば、真空及び熱を材料層に食わせて、成型面に対して層を引き延ばす。成型面は、壁に全体的に凸状面を設けることができるように、凹状であるとよい。リザーバが保持する液体の例には、水、及び1つ以上の塩例えば、塩化マグネシウム、塩化ナトリウム、トリス緩衝液、又はその組み合わせを含む水溶液が含まれる。リザーバは、液体例えば、実質的にその気化を生ずることなくをある時間期間例えば、少なくとも6カ月又は少なくとも1年保管することができる。実施形態によっては、1年で10重量未満例えば、約5未満の液体が気化する。穿孔部材は、リザーバの壁の一体部分であってもよい。例えば、リザーバは、内部突起を有する壁を含むことができ、この内部突起がリザーバ内の液体と接触することができる。また、リザーバは、穿孔部材と対向する第2壁も含む。作動中、穿孔部材を駆動して第2壁を貫通し例えば、内側から外側に向けて、液体を放出することができる。実施形態によっては、リザーバが保管する液体の最大量を約1ml未満とすることができる。例えば、リザーバは、約500マイクロリットル例えば、300マイクロリットル以下を保持することができる。一般に、リザーバは、少なくとも約25マイクロリットル例えば、少なくとも約50マイクロリットルを保持する。リザーバは、意図する液体量の約10以内例えば、50±5μlで導入することができる。リザーバは、実質的に空気がない例えば、実質的に気体がないことが可能な所定量の液体を配出することができる。液体を導入するとき、実質的に空気及び/又は気体がない液体は、微小流体デバイス内にある液体の移動を妨害するような大きな気泡を殆ど又は全く生成しない。リザーバ内部に穿孔部材を用いることによって、リザーバが実質的に空気及び/又は気体がない液体を配出する能力を高めることができる。実施形態によっては、押圧によって液体を開放するためにリザーバを作動させることができる場合がある例えば、ヒトの指又は親指で、あるいは機械的圧力作動によって。圧力はリザーバの壁に直接加えてもよく、又は穿孔部材を有するプランジャに加えてもよい。種々の実施形態では、リザーバを作動させるためには、最低限の圧力で済ますことができる。複数のリザーバを同時に又は順次作動させる又は押下するために、自動化したシステムを用いることができる。リザーバの作動には、穿孔部材を駆動してリザーバの壁を貫通させることを含むとよい。実施形態によっては、リザーバが穿孔部材を含まないこともある。代わりに、リザーバ内部で発生する内部圧力がリザーバの壁を裂いて、液体を微小流体デバイスに進入させる。リザーバを作動させて液体を微小流体デバイスに導入すると、液体は一般にはリザーバに引き返すことはない。例えば、作動時に、リザーバの容積がある最小値に減少する場合があるが、一般には液体をリザーバに引き戻すように増大することはない。例えば、リザーバは、作動時に、押しつぶされたままになっていると考えられる。このような実施形態では、可撓性がある壁は、可撓性があってもよいが、ヒステリシス、弾力性、又は伸展性はなくてもよい。あるいは又はそれと共に、リザーバは、液体を全く引き戻すことなく、ベントから空気を引き込んでもよい。リザーバは、その中にある試薬の反応性及び組成を保存する例えば、リザーバの中にある化学薬品は、6カ月又は1年にわたって反応性の変化を殆ど又は全く呈しないことも可能である。リザーバの可撓壁は、化学薬品の侵出を制限又は防止することができる。リザーバは、微小流体カートリッジとは独立して組み立て、次いで微小流体カートリッジに固着することができる。ポリヌクレオチドを処理するための微小流体カートリッジの例図10を参照すると、ここに記載するシステムと共に用いるのに適した微小流体カートリッジ200の一例の一部は、微小流体ネットワーク201を定める第1、第2、及び第3層205、207、及び209を含む。微小流体ネットワーク201は、検出すべき1つ以上のポリヌクレオチドを含むサンプルを処理するように構成されている種々の構成要素を有する。カートリッジ200は、通例、サンプルを処理する際、とりわけ、判定すべきポリヌクレオチドの濃度を高める、及び/又は判定すべきポリヌクレオチドの濃度に対して、インヒビタの濃度を低下させる。カートリッジ200の種々の特徴は、無差別に組み込むこと、又は適した修正を加えて、種々のその他の動作と合わせてポリヌクレオチドの処理を実行するカートリッジの代わりの構成に組み込むこともできる。カートリッジの製作微小流体カートリッジ200は、所望通りに製作することができる。通例、層205、207、及び209は、ポリマ材で形成することができる。ネットワーク201の構成要素は、通例、層207、209を成型する例えば、射出成型することによって形成することができる。層205は、通例、ネットワーク201の構成要素を封止するために層207に固着する例えば、接着及び/又は熱着ことができる可撓性ポリマ材例えば、積層体とすることができる。層207及び209は、接着剤を用いて互いに接着することができる。本願に適したカートリッジ製作の別の方法が、2006年11月14日に出願した米国仮特許出願第60/859,284号において見出すことができる。その内容全体が、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。微小流量ネットワークネットワーク201の構成要素の配列例は、米国特許出願公開第2006/0166233号に更に記載されているように、次の通りである。この出願の内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。ネットワーク201は、サンプル材料をネットワークに導入することができる入口202と、処理したサンプルをネットワーク201から取り出すことができる例えば、ネットワークから放出又は抽出する出口236とを含む。チャネル204が、入口202と合流点255との間を繋いでいる。弁206をチャネル204に沿って位置付けることができる。リザーバチャネル240が、合流点255とアクチュエータ244との間を繋いでいる。ゲート242及び246をチャネル240に沿って位置付けることができる。チャネル257が、合流点255と合流点259との間を繋いでいる。弁208をチャネル257に沿って位置付けることができる。リザーバチャネル246が、合流点259とアクチュエータ248との間を繋いでいる。ゲート250及び252をチャネル246に沿って位置付けることができる。チャネル261が、合流点259と合流点263との間を繋いでいる。弁210及び疎水性ベント212を、チャネル261に沿って位置付けることができる。チャネル256が、合流点263とアクチュエータ254との間を繋いでいる。ゲート258をチャネル256に沿って位置付けることができる。チャネル214が、合流点263と処理室220との間を繋いでおり、処理室220は入口265及び出口267を有する。チャネル228が、処理室の出口267と廃棄物リザーバ232との間を繋いでいる。弁234をチャネル228に沿って位置付けることができる。チャネル230が、処理室の出口267と出口236との間を繋いでいる。微小流体ネットワーク201の個々の構成要素について、以下のように更に説明する。処理室図11も参照すると、処理室220は、第1条件集合例えば、第1温度及び/又は第1pHの下ではサンプルのポリヌクレオチドを保持し、第2条件集合例えば、第2の高い温度、及び/又は第2のアルカリ側のpHの下ではポリヌクレオチドを放出するように構成されている複数の粒子例えば、ビーズ、微小球体218を含む。通例、サンプル内に存在するかもしれないインヒビタと比較して、ポリヌクレオチドを優先的に保持することができる。粒子218は、保持部材216例えば、カラムとして構成することができ、処理領域220の入口265及び出口267間で移動する場合、サンプル材料例えば、ポリヌクレオチドはここを通過しなければならない。フィルタ219が、粒子218が処理領域220の下流に流れることを防止する。チャネル287は、フィルタ219を出口267と接続する。フィルタ219は、入口265の断面積よりも大きくすることができる表面区域を処理領域220内部に有する。例えば、実施形態によっては、処理室220内部のフィルタ219の表面積の出口265の断面積この断面積は、通例、チャネル214の断面積とほぼ同一であるに対する比率は、少なくとも約5例えば、少なくとも約10、少なくとも約20、すくなくとも約30とすることができる。実施形態によっては、処理領域220内部のフィルタ219の表面積は、少なくとも約1mm2例えば、約2mm2、少なくとも約3mm2とすることができる。実施形態によっては、入口265及び/又はチャネル214の断面積は、約0.25mm2以下例えば、約0.2mm2以下、約0.15mm2以下、約0.1mm2以下とすることができる。処理室220を通過する材料に対して、フィルタ219が示す表面積が大きい程、処理領域の目詰まりを防止するのに役立ちつつ、処理領域の無効容積以下で説明するの著しい増大を回避する。粒子218は、ポリヌクレオチドを保持するインヒビタと比較して優先的に少なくとも1つの受容体によって改質することができる。通例、受容体は、約9.5以下のpH例えば、約9.0以下、約8.75以下、約8.5以下を有する液体からポリヌクレオチドを保持する。サンプル溶液が処理室220を通過すると、ポリヌクレオチドを保持することができつつ、液体及びその他の溶液成分例えば、インヒビタを殆ど保持せず例えば、全く保持せず処理領域から排出することができる。一般に、受容体は、pHが約10以上例えば、約10.5以上、約11.0以上になることができると、ポリヌクレオチドを放出する。その結果、受容体改質粒子からポリヌクレオチドを、周囲の液体に放出することができる。粒子218上の受容体の例には、例えば、ポリアミド例えば、ポリ-L-リシン、ポリ-D-リシン、ポリ-DL-オルニシンのようなポリカチオンポリアミド及びPEIが含まれる。他の受容体には、例えば、インターカレータ、ポリ-インターカレータ、マイナグルーブポリアミン例えば、スペルミジン、複数のアミノ酸を備えているホモポリマ及びコポリマ、並びにその組み合わせが含まれる。実施形態によっては、受容体の平均分子重量は、少なくとも約5,000Da例えば、少なくとも約7,500Da、少なくとも約15,000Daである。実施形態によっては、受容体は、アミド結合によって粒子表面に付着したポリリシン受容体とすることができる。ある実施形態では、粒子218上の受容体は、ペプチド結合を切断するプロテーゼ酵素例えば、プロナーゼのようなエンド-及びエクソ-プロテーゼの混合体による劣化のような、酵素劣化に対して抵抗力を有することができる。耐プロテーゼ受容体の例には、例えば、ポリ-D-リシン、及び酵素攻撃を受けやすい受容体の鏡像体となることができるその他の受容耐が含まれる。粒子218は、通例、受容体を連合させることができる材料で形成することができる。粒子218を形成することができる材料の例には、受容体を付着するように改質することができるポリマ材が含まれる。典型的なポリマ材は、受容体を付着するために利用可能なカルボキシル基及び/又はアミノ基を供給する、又は供給するように改質することができる。ポリマ材の例には、例えば、ポリスチレン、ラテックスポリマ例えば、ポリカルボキシレート被覆ラテックス、ポリアクリルアミド、酸化ポリエチレン、及びその派生物が含まれる。粒子218を形成するために用いることができるポリマ材は、Mathiowitzetalの米国特許第6,235,313号に記載されている。この特許の内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。他の材料には、ガラス、シリカ、アガローズ、及びアミノ-プロピル-トリ-エトキシ-シランAPES改質材料が含まれる。適した受容体で改質することができる粒子の例には、カルボキシル粒子例えば、カルボキシレート改質磁気ビーズセラ-マグ磁気カルボキシレート改質ビーズ、Part3008050250、セラダイン、及びPolyscienceカタログ番号09850から入手可能なポリビーズカルボキシレート改質微小球体が含まれる。実施形態によっては、受容体がポリ-D-リシンを含み、ビーズがポリマ例えば、ポリカルボキシレート被覆ラテックスを備えている場合もある。別の実施形態では、受容体はPEIを含む。一般に、粒子の質量の、当該粒子が保持するポリヌクレオチドの質量に対する比率は、約25以下又は以上例えば、約20以下、約10以下とすることができる。例えば、実施形態によっては、約1グラムの粒子が約100ミリグラムのポリヌクレオチドを保持する。通例、入口265とフィルタ219との間の処理室220粒子218を含むの全容積は、約15マイクロリットル以下例えば、約10マイクロリットル以下、約5マイクロリットル以下、約2.5マイクロリットル以下、約2マイクロリットル以下とすることができる。実施形態の一例では、処理領域220の全容積は、約2.3マイクロリットルとすることができる。実施形態によっては、粒子218が処理領域220の全容積の少なくとも約10パーセント例えば、少なくとも約15パーセントを占める場合がある。実施形態によっては、粒子218が処理室220の全容積の約75パーセット以下例えば、約50パーセント以下、約35パーセント以下を占める場合がある。実施形態によっては、液体が自由に占めることができる処理室220の容積例えば、粒子218間の隙間を含む処理室220の空隙容積は、全容積から粒子が占める容積を減算した値にほぼ等しくすることができる。通例、処理領域220の空隙容積は、約10マイクロリットル以下例えば、約7.5マイクロリットル以下、約5マイクロリットル以下、約2.5マイクロリットル以下、約2マイクロリットル以下とすることができる。実施形態によっては、空隙容積は、約50ナノリットル以上例えば、約100ナノリットル以上、約250ナノリットル以上とすることができる。例えば、実施形態の一例では、処理室220の全容積は約2.3マイクロリットルとすることができ、粒子が占める容積は約0.3マイクロリットルとすることができ、液体が自由に占める容積空隙容積は、約2マイクロリットルとすることができる。粒子218は、通例、平均直径が約20ミクロン以下例えば、約15ミクロン以下、約10ミクロン以下である。実施形態によっては、粒子218の平均直径が少なくとも約4ミクロン例えば、少なくとも約6ミクロン、少なくとも約8ミクロンである場合もある。実施形態によっては、フィルタ219と出口267との間にあるチャネル287の容積は、処理室220の空隙容積よりもかなり小さくすることができる。例えば、実施形態によっては、フィルタ219と出口267との間にあるチャネル287の容積は、空隙容積の約35以下例えば、約25以下、約20以下とすることができる。実施形態の一例では、フィルタ219と出口267との間にあるチャネル287の容積は、約500ナノリットルとすることができる。粒子密度は、通例、少なくともミリリットル当たり約108粒子例えば、ミリリットル当たり約109粒子とすることができる。例えば、全容積が約1マイクロリットルである処理領域では、約103個のビーズを含むことができる。フィルタ219は、通例、粒子218の直径よりも直径が小さい孔を有する。実施形態の一例では、フィルタ219の孔は、平均約8ミクロンの幅を有し、粒子218の平均直径は約10ミクロンである。実施形態によっては、粒子の少なくとも一部例えば、全部が磁性であることができる。代替実施形態では、粒子の殆ど例えば、全部が磁性でない。実施形態によっては、粒子の少なくとも一部例えば、全部が固体であることができる。実施形態によっては、粒子の少なくとも一部例えば全部が多孔性であることができる例えば、粒子は、その内部に少なくとも部分的に達するチャネルを有することができる。微小流体ネットワーク201において見出すことができるその他の構成要素は次の通りである。チャネル微小流体ネットワーク201のチャネルは、通例、少なくとも1つのミリメートル未満の断面寸法を有する。例えば、ネットワーク201のチャネルの幅及び/又は深さは、約1mm以下例えば、750ミクロン以下、約500ミクロン以下、約250ミクロン以下とすることができる。弁弁は、常時開放状態を有する構成要素であり、弁の一方側例えば、弁の上流側の位置から、弁の他方側例えば、弁の下流側の位置にチャネルに沿って材料が通過することを可能にする。作動時に、弁は閉鎖状態に遷移し、材料がチャネルに沿って弁の一方側から他方側に通過するのを妨げる。例えば、図10において、弁206は、熱応答物質TRSの質量体251を含み、TRSは、第1温度では比較的不動であり、第2温度では良く移動することができる例えば、パラフィンワックス、はんだなどのような、通例、約60°C、約75°C、又は約90°Cというように、融点が既知の、相遷移材料PTM。室253は、質量体251と気体連通することができる。室253内で気体例えば、空気を加熱し、TRSの質量体251を第2温度に加熱すると、室253内の気体圧力によって、質量体251がチャネル204の中に移動して、材料がそれに沿って通過するのを遮断する。ネットワーク201のその他の弁も、弁206と同様の構造を有し、同様に動作する。TRSの質量体は、本質的に、固体質量体、又は共同して通路を遮断する小さな粒子の集合体とすることができる。TRSの例には、共晶合金例えば、はんだ、ワックス例えば、オレフィン、ポリマ、プラスチック、及びその組み合わせが含まれる。第1及び第2温度は、カートリッジ200のポリマ層のような材料を損傷する程には高くない温度にすることができる。一般に、第2温度は約90°C未満とすることができ、第1温度は第2温度未満例えば、約70°C以下とすることができる。ゲートは、当該ゲートの一方側の位置からゲートの他方側にチャネルを沿って材料を通過させない閉鎖状態と、当該ゲートの一方側の位置からゲートの他方側にチャネルを沿って材料を通過させる開放状態とを有することができる構成要素とすることができる。開放ゲートを作動させると、閉鎖状態にゲートを遷移させることができ、閉鎖状態では、ゲートの一方側例えば、ゲートの上流側からゲートの他方側例えば、ゲートの下流側に材料を通過させない。作動時に、閉鎖ゲートは、開放状態に遷移することができ、開放状態では、ゲートの一方側例えば、ゲートの上流側からゲートの他方側例えば、ゲートの下流側に材料を通過させる。例えば、図10におけるゲート242は、合流点255とチャネル240との間における材料の通過を妨害するように位置付けられたTRSの質量体271を含む。質量体271を第2温度に加熱すると、質量体は状態が変化し例えば、溶融、分散、断片化、及び/又は溶解によって、合流点255とチャネル240との間の材料の通過を許容する。種々の実施形態では、微小流体ネットワーク201は、図12Aに示すような狭いゲート380を含むことができ、ワックス装填孔384からゲート合流点386までワックスを装填するために用いられるゲート装填チャネル382を狭くすることができる例えば、幅が約150μm、深さが約100ミクロン。ゲート合流部386の上流チャネル388及び下流チャネル390は、ワックスがゲート合流部386において確実に停止するのを補助するために、広く例えば、500μmまでそして深く例えば、500μmまで作ることができる。溶融しゲート合流部386から外部に移動するゲート材料の量は、ゲート380の最適な開口度を得るためには、最小限に抑えるとよい。カートリッジ外部のヒータを用いて、ゲート380において熱反応物質を溶融してもよいので、ヒータの位置がずれていると、ゲート装填チャネル382内にあるワックスも溶融する可能性がある。したがって、装填チャネルの寸法を狭くすることによって、ゲート開放の信頼性を高めることができる。ゲート合流部386及びゲート装填チャネル382において溶融するワックスの量が過剰な場合、ゲート合流部386に隣接する下流チャネル390の断面積を大きくすれば、ゲート380の開放の間、ワックスが下流チャネル390を未詰まりさせるのを防止することができる。ゲート合流部386における上流チャネル388の寸法は、ゲート製造中に正しいワックスの装填を確保するために、下流チャネル390と同様に作ることができる。種々の実施形態では、ゲートは、図12Bに示すようなベントゲート392のように、ネットワーク内部のゲートの有効面積即ちフットプリントを最小にするように構成することができる。ネットワーク内部のゲートの有効面積即ちフットプリントを最小にすることにより、所与の微小流体ネットワークの密度を高めることができ、これによって部品毎のコストを低減し、ネットワークの小型化を図り、ネットワークのチャネル長又は容積を最小に抑える等が可能となる。微小流体ネットワークの具体的なレイアウトに応じて、更に別の構成も可能であるが、図面には明示的には示さない。図10の微小流体カートリッジでは、ゲート242及び246間のチャネル240の一部が、液体例えば、水、有機液体、又はその組み合わせを保持するように構成されている流体リザーバ279を形成する。保存の間、ゲート242及び246は流体リザーバ内における液体の気化を抑制する例えば、防止する。カートリッジ200の動作中、リザーバ279の液体は、粒子218図11と連合するポリヌクレオチドを残しながら、処理領域220からインヒビタを除去する洗浄液として用いることができる。通例、洗浄液は、1つ以上の追加成分例えば、緩衝液、キレータ、界面活性剤、洗剤、塩基、酸、又はその組み合わせを有する溶液とすることができる。溶液の例には、例えば、pH8.0の10~50mMトリス、0.5~2mMのEDTA、及び0.5~2SDSの溶液、pH8.0の10~50mMのトリス、0.5~2mMのEDTA、及び0.5~2トリトンX-100の溶液が含まれる。流体リザーバ281からゲート250及び252の間にあるチャネル247の一部は、気化を抑制又は防止して液体例えば、溶液を保持するリザーバ279のように構成されている。カートリッジ200の動作中、リザーバ281の液体は、通例、放出液として用いることができ、この中に、粒子218が保持していたポリヌクレオチドを放出することができる。放出液の一例は、例えば、濃度が約2mM水酸化物例えば、約2mMのNaOH及び約500mM水酸化物例えば、約500mMのNaOH水酸化溶液例えば、HaOH溶液とすることができる。実施形態によっては、リザーバ281内の液体は、濃度が約25mM以下の水酸化物溶液例えば、濃度が約15mMの水酸化物とすることができる。通例、リザーバ279、281は、各々、少なくとも約0.375マイクロリットルの液体例えば、少なくとも約0.750マイクロリットル、少なくとも約1.25マイクロリットル、少なくとも約2.5マイクロリットルを独立して保持する。実施形態によっては、リザーバ279、281は、各々、約7.5マイクロリットル以下の液体例えば、約5マイクロリットル以下、約4マイクロリットル以下、約3マイクロリットル以下を独立して保持する。アクチュエータアクチュエータは、ネットワーク、例えば、ネットワーク201における1つの場所と他の場所との間で材料例えば、サンプル材料及び/又は試薬材料を移動させることができる気体圧力を供給する構成要素とすることができる。例えば、図13を参照すると、アクチュエータ244は、内部に熱膨張材料TEMの質量体273を有する室272を含む。加熱すると、TEMが膨張して、室272内部の自由容積が減少し、室272内部の質量体273を包囲する気体例えば、空気を加圧する。通例、ネットワーク201におけるゲート246及び242のようなゲートを、アクチュエータ244によって作動させることができる。その結果、加圧気体が流体リザーバ279内にある液体を合流部255に向けて送り出す。実施形態によっては、アクチュエータ244が約3psi例えば、少なくとも約4psi、少なくとも約5psiの圧力差を、アクチュエータと合流部255との間に発生することができる。図13に示す一実施形態では、TEMは、キャリア277内に分散した複数の封止液体リザーバ例えば、球体275を含む。通例、液体は、容器例えば、塩化ビニリデン、アクリロニトリル、及びメチルメタクリレートのようなモノマで形成したポリマ容器内に封止された高蒸気圧液体例えば、イソブタン及び/又はイソペンタンとすることができる。キャリア277は、リザーバをチャネル240に沿って通過させずに、リザーバ275の膨張を許容するプロパティ例えば、可撓性及び/又は高温における軟化例えば、溶融性を有する。実施形態によっては、キャリア277はワックスオレフィン又は適したガラス繊維温度を有するポリマとすることができる。通例、リザーバは、少なくとも約25重量パーセント例えば、少なくとも約35重量パーセント、少なくとも約50重量パーセントのTEMを構成する。実施形態によっては、リザーバが約75重量パーセント以下例えば、約65重量パーセント以下、約50重量パーセント以下のTEMを構成する場合もある。適した封止液体リザーバは、ExpancelAkzoNobel社から入手することができる。TEMを加熱することができる場合例えば、少なくとも約50°Cの温度まで例えば、少なくとも約75°C又は少なくとも約90°Cまで、液体は気化し、各封止リザーバ及び質量体273の体積を増大させる。キャリア277は軟化して、質量体273を膨張させる。通例、TEMは、作動中に、約150°C未満例えば、約125°C以下、約110°C以下、約100°C以下の温度まで加熱することができる。実施形態によっては、TEMの体積は、少なくとも約5倍例えば、少なくとも約10倍、少なくとも約20倍、少なくとも約30倍に膨張する。ベント疎水ベント例えば、ベント212は、気体がチャネルから出ていくことを可能にしつつ、液体がチャネルから出ていくのを制限する例えば、防止する構造とすることができる。通例、疎水ベントは、チャネルの壁を定める多孔性疎水材例えば、Osmonicsからの多孔性疎水メンブレーンのような、多孔性フィルタの層を含む。以下で説明するが、疎水ベントは、サンプルの微小液滴をネットワーク201内部の所望の場所に位置付けるために用いることができる。本技術の疎水ベントは、これらから逃げる空気の量を最大にしつつ、ベント面の下にあるチャネルの容積を最小にすることができるように構成することが好ましい。したがって、表面積が大きな疎水性メンブレーンと、ベント面の下に浅い断面の微小チャネルとを有するように、ベントを構成することができることが好ましい。疎水ベントは、通例、チャネルに沿って、少なくとも約2.5mm例えば、少なくとも約5mm、少なくとも約7.5mmの長さを有する。疎水ベントの長さは、通例、疎水ベント内部にあるチャネルの深さよりも少なくとも約5倍例えば、少なくとも約10倍、少なくとも約20倍大きくすることができる。例えば、実施形態によっては、疎水ベント内部のチャネルの深さは、約300ミクロン以下例えば、約250ミクロン以下、約200ミクロン以下、約150ミクロン以下とすることができる。疎水ベント内部にあるチャネルの深さは、通例、疎水ベントの上流及び下流側にあるチャネルの深さの約75以下例えば、約65以下、約60以下とすることができる。例えば、実施形態によっては、疎水ベント内部のチャネル深さは、約150ミクロンとすることができ、疎水ベントの上流及び下流側のチャネル深さは約250ミクロンとすることができる。疎水ベント内部にあるチャネルの幅は、通例、当該ベントの上流側及び当該ベントの下流側にあるチャネルの幅よりも少なくとも約25広く例えば、少なくとも約50広くすることができる。例えば、実施形態の一例では、疎水ベント内部にあるチャネルの幅は、約400ミクロンとすることができ、ベントから上流及び下流側の幅は、約250ミクロンとすることができる。使用中、カートリッジ200は、通例、カートリッジの種々の構成要素例えば、弁、ゲート、アクチュエータ、及び処理領域220を動作させるように構成されている熱源のアレイと熱的に連動させることができる。実施形態によっては、熱源を、以下で更に説明するようなシステム内のプロセッサによって制御することができ、使用中にカートリッジを収容し監視するように動作する。プロセッサ例えば、マイクロプロセッサは、所望のプロトコルに応じて、熱源を個々にそして異なる時点で作動させるように構成されている。ここで用いる又は修正するのに適した、微小流量カートリッジを動作させるように構成されているプロセッサは、2001年3月28日に出願した米国特許出願第09/819,105号現在では、米国特許第7,010,391号に記載されている。この特許の内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。別の実施形態では、熱源はカートリッジ自体と一体化することができる。カートリッジ200は、以下のように動作させるとよい。ネットワーク201の弁は、開放状態で製作することができる。ネットワーク201のゲートは閉鎖状態で製作することができる。ここで更に説明するような生物サンプルのような、ポリヌクレオチドを含む流体サンプルを、入口202を通じてネットワーク201に導入することができる。例えば、サンプルは、ルアー取付具を有するシリンジを用いて導入することができる。シリンジは、圧力を供給しサンプルをまずネットワーク201内部に移動させる。サンプルは、チャネル204、257、261、及び214に沿って、処理領域220の入口265まで進む。サンプルは、処理領域220を通過し、出口267から排出し、チャネル228に沿って廃棄物室232まで進む。サンプルの後端縁例えば、上流側液体-気体界面が疎水ベント212に達したときに、導入デバイス例えば、シリンジによって供給される圧力をネットワーク201から放出して、サンプルのそれ以上の運動を停止させることができる。通例、導入するサンプル量は、約500マイクロリットル以下例えば、約250マイクロリットル以下、約100マイクロリットル以下、約50マイクロリットル以下、約25マイクロリットル以下、約10マイクロリットル以下とすることができる。実施形態によっては、サンプルの量は約2マイクロリットル以下例えば、約0.5マイクロリットル以下とすることもできる。処理領域220に入ったポリヌクレオチドは、粒子218間の隙間を通り抜ける。サンプルのポリヌクレオチドは、保持部材216と接触し、サンプルの液体、及びある種のその他のサンプル成分例えば、インヒビタと比較して優先的に保持することができる。通例、保持部材220は、処理領域220に入ったサンプルの中にあるポリヌクレオチドの内、少なくとも約50のポリヌクレオチド例えば、少なくとも約75、少なくとも約85、少なくとも約90を保持する。サンプルの液体及びサンプルの中にあるインヒビタは、出口267を通って処理領域220から出て、廃棄物室232に入る。処理領域220は、通例、サンプルの導入中は約50°C以下例えば、約30°C以下の温度とすることができる。処理は継続して、保持部材216をリザーバ279の液体で洗浄して、残留するインヒビタを、保持部材216が保持するポリヌクレオチドから分離する。保持部材216を洗浄するには、弁206を閉鎖することができ、第1リザーバ240のゲート242、246を開放することができる。アクチュエータ244を作動させて、リザーバ279内にある洗浄液をチャネル257、261、及び214に沿って移動させ、処理領域220を通過させ、廃棄物リザーバ232に入れる。洗浄液は、チャネル204、257、261、及び214の中に残留している可能性があるサンプルを、処理領域を通って、廃棄物室232の中まで移動させる。一旦洗浄液の後端縁がベント212に達したなら、アクチュエータ244が発生する気体圧力を発散させることができ、液体のそれ以上の運動を停止させることができる。アクチュエータ244によって処理領域220を通過して移動する洗浄液の体積は、通例、処理領域220の空隙容積の少なくとも約2倍例えば、空隙容積の少なくとも約3倍とすることができ、空隙容積の約10倍以下例えば、空隙容積の約5倍以下とすることができる。処理領域は、通例、洗浄中約50°C以下の温度例えば、約30°C以下とすることができる。洗浄液の例には、この中のリザーバ279及び281に関して記載した液体が含まれる。処理は継続して、保持部材216からポリヌクレオチドを放出する。通例、ポリヌクレオチドを放出する前に、リザーバ279からの洗浄液をリザーバ281からの放出液例えば、水酸化物溶液と交換することができる。弁208を閉鎖することができ、ゲート250、252を開放することができる。アクチュエータ248を作動し、これによって、リザーバ281内部にある放出液をチャネル261、214に沿って処理領域220内にまで移動させ、保持部材216と接触させる。リザーバ281からの放出液の後端縁が疎水ベント212に達したときに、アクチュエータ248が発生する圧力を発散させて、液体のそれ以上の運動を停止させることができる。アクチュエータ248によって処理領域220を通過して移動させる液体の体積は、通例、少なくとも処理領域220の空隙容積とほぼ等しく例えば、空隙容積の少なくとも約2倍することができ、空隙容積の約10倍以下例えば、空隙容積の約5倍以下とすることができる。一旦ポリヌクレオチドを保持した保持部材216がリザーバ281からの液体と接触すると、放出ステップを通例実行することができる。通例、放出は、処理領域216内にある放出液を加熱することを含む。一般に、液体は、保持部材が存在する液体を沸騰させるには不十分な温度まで加熱することができる。実施形態によっては、温度は100°C以下例えば、100°C未満、約97°C以下とすることができる。実施形態によっては、温度は約65°C以上例えば、約75°C以上、約80°C以上、約90°C以上とすることができる。実施形態によっては、温度を約1分以上例えば、約2分以上、約5分以上、約10分以上維持する。実施形態によっては、温度は約30分例えば、約15分以下、約10分以下、約5分以下維持する可能性もある。実施形態の一例では、処理領域220を約65及び90°Cの間例えば、約70°Cまでまで、約1及び7分例えば、約2分間の間加熱することができる。このような温度及び時間は、サンプルに応じて変化し、したがって当業者が選択することができる。ポリヌクレオチドは、処理領域220内にある液体の中に放出することができる例えば、ポリヌクレオチドは、通例、処理領域220の空隙容積とほぼ同じ体積を有する量の放出液に放出することができる。通例、ポリヌクレオチドは、約10マイクロリットル以下例えば、約5マイクロリットル以下、約2.5マイクロリットル以下の液体に放出することができる。ある種の実施形態では、処理領域220を通して移動させた元のサンプルの体積の、ポリヌクレオチドを放出することができる液体の体積に対する比率は、少なくとも約10例えば、少なくとも約50、少なくとも約100、少なくとも約250、少なくとも約500、少なくとも約1000とすることができる。実施形態によっては、約2mlの体積を有するサンプルからのポリヌクレオチドを処理領域内に保持し、約4マイクロリットル以下例えば、約3マイクロリットル以下、約2マイクロリットル以下、約1マイクロリットル以下の液体に放出することができる。ポリヌクレオチドを放出することができる液体は、通例、処理領域220に入ったサンプルの中にあるポリヌクレオチドの少なくとも約50例えば、少なくとも約75、少なくとも約85、少なくとも約90を含む。放出液の中にあるポリヌクレオチドの濃度は、元のサンプルにおけるよりも高い場合がある。何故なら、放出液の体積は、通例、処理領域を通じて移動させて元の液体サンプルの体積よりも少なくなっている可能性があるからである。例えば、放出液におけるポリヌクレオチドの濃度は、カートリッジ200に導入したサンプルにおけるポリヌクレオチドの濃度よりも、少なくとも約10倍大きい例えば、少なくとも約25倍大きい、少なくとも約100倍大きい場合もある。ポリヌクレオチドを放出することができる液体の中にあるインヒビタの濃度は、一般に、元の流体サンプルにおけるインヒビタの濃度よりも、ポリヌクレオチドに対する増幅効率を増大させるのに十分な量だけ少なくすることができる。ポリヌクレオチド含有サンプルを処理領域220に導入してから、ポリヌクレオチドを放出液に放出するまでの時間間隔は、通例、約15分以下例えば、約10分以下、約5分以下とすることができる。放出したポリヌクレオチドを含む液体は、以下のように、処理領域220から除去するとよい。弁210及び234を閉鎖することができる。ゲート238及び258を開放することができる。アクチュエータ254を作動させて、圧力を発生することができる。この圧力が、液体及びポリヌクレオチドを処理領域220から、チャネル230の中へ、そして出口236に向けて移動させる。ポリヌクレオチドを含む液体は、例えば、シリンジ又は自動化したサンプリングデバイスを用いて、除去することができる。ポリヌクレオチド放出の間に保持部材216と接触する液体に応じて、放出したポリヌクレオチドを含む溶液を、ある量の緩衝液例えば、pH8.0の等しい体積の20~50mMトリス-HCl緩衝剤によって中和するとよい場合もある。ポリヌクレオチドの放出について、加熱ステップを含むように説明したが、ポリヌクレオチドは加熱しなくても放出することができる。例えば、実施形態によっては、リザーバ281の液体は、追加の加熱を必要とせずに、常温において保持部材からポリヌクレオチドを放出するイオン強度、pH、表面活性剤濃度、組成、又はその組み合わせを有する。ポリヌクレオチドについて、処理領域220の中にある1種類の液体の体積の中に放出するように説明したが、別の構成を用いることもできる。例えば、ポリヌクレオチドは、流体の処理領域220への導入及び/又は通過と同時に段階毎又は連続的放出することもできる。このような実施形態では、ポリヌクレオチドは、処理領域220の空隙容積の約10倍以下例えば、約7.5倍以下、約5倍以下、約2.5倍以下、約2倍以下の体積を有する液体に放出することもできる。リザーバ279、281について、第1及び第2ゲートの間で液体を保持するように説明したが、別の構成を用いることもできる。例えば、リザーバ毎の液体を、全体的に透湿性のないメンブレーンによってネットワーク201から分離したパウチ例えば、この中で更に説明するような、ブリスタパックの中に保持してもよい。パウチは、使用中にアクチュエータ244、248が液体を移動させることができるときに、ユーザがメンブレーンを裂いて、液体をリザーバ279、281の中に注入することができるように構成することができる。処理領域について、マイクロリットル目盛りの寸法を有するように説明したが、他の寸法を用いることもできる。例えば、インヒビタに対してポリヌクレオチドを優先的に保持するように構成した表面例えば、粒子を有する処理領域が、大きな容積例えば、数十マイクロリットル以上、少なくとも約1ミリリットル以上を有してもよい。実施形態によっては、処理領域がベンチトップ目盛りを有する場合もある。処理領域220について、多数の表面改質粒子で形成した保持部材を有するように説明したが、別の構成を用いることもできる。例えば、実施形態によっては、処理領域220が、多数の開口例えば、孔及び/又はチャネルを有し、それをポリヌクレオチドが通過する多孔性部材例えば、フィルタ、多孔性メンブレーン、又はゲルマトリクスとして構成した保持部材を含む場合もある。ポリヌクレオチドを優先的に保持するように、多孔性部材の表面を改質することができる。例えば、Osmonicsから入手可能なフィルタメンブレーンは、表面改質し、処理領域220内部にポリヌクレオチドを保持するために用いることができるポリマで形成することができる。実施形態によっては、処理領域220は、複数の表面壁又はバッフルを有し、これをサンプルが通過するように構成した保持部材を含む場合もある。壁又はバッフルは、ポリヌクレオチドを優先的に保持するように改質することができる。処理領域220について、微小流体ネットワークの構成要素として説明したが、別の構成を用いることもできる。例えば、実施形態によっては、保持部材を、処理のために、処理領域から別の場所に除去することができる。例えば、ある場所で保持部材を、ポリヌクレオチド及びインヒビタを含む混合物と接触させ、次いで別の場所に移動させて、ここでポリヌクレオチドを保持部材から除去することができる。リザーバ275は、キャリア内に分散するように示したが、別の構成を用いてもよい。例えば、リザーバ275を可撓性のあるエンクロージャ例えば、メンブレーン、例えば、袋のようなエンクロージャの中に密封することができる。実施形態によっては、リザーバは室272の中で固定されてないことも可能である。このような実施形態では、アクチュエータ244は、リザーバ275の通過を可能にするには小さすぎるが、気体が室272から出ていくことができる程に大きな孔を有する多孔性部材を含むとよい。溶解室を有する微小流体カートリッジの例種々の構成要素を有する更に別の微小流体カートリッジが、Parunaketalによって2004年3月17日に出願した米国仮特許出願第60/553,553号、及び米国特許出願公開第2005-0084424号に記載されている。これらの出願の内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。微小流体カートリッジについて、既に細胞から放出されたポリヌクレオチドを受け取るように構成されていると説明したが、ここで用いる微小流体カートリッジは、細胞からポリヌクレオチドを放出するように構成することもできる例えば、セルを溶解することによって。例えば、図14A、図14B、図15A、及び図15Bを参照すると、微小流体カートリッジ300は、サンプル溶解室302を含み、この中で細胞を溶解してポリヌクレオチドをその中で放出することができる。更に、微小流体カートリッジ300は、基板層L1~L3、微小流体ネットワーク304図14Aには、その一部のみが見られる、及び液体試薬リザーバR1~R4も含む。液体試薬リザーバR1~R4は、液体試薬を保持し例えば、サンプル材料を処理するために、試薬ポートPR1~PR4によってネットワーク304に接続することができる。したがって、微小流体カートリッジ300は、自己充足型環境とすることができ、軌道、細胞溶解、ポリヌクレオチド分離、増幅前処理、増幅、及びサンプル検出のステップを実行するために必要な試薬及び材料全てを備えている。実施形態によっては、1つ以上の必要な試薬が混合されているサンプルを導入する。その場合、残留する試薬をカートリッジ上に保管する。試薬及びその他の材料は、カートリッジ300上において、液体試薬リザーバR1~R4、微小流体ネットワークの中にある微小流体チャネル又は室、及び/又は溶解室302に保管してもよい。ネットワーク304は、実質的に層L2及びL3の間に定義することができるが、3つの層L1~L3の全ての間にある部分に広がっている。微小流体ネットワーク304は、この中で更に説明するような種々の微小流体構成要素を含み、チャネルCi、弁Vi、二重弁V’i、ゲートGi、混合ゲートMGi、ベントHi、気体アクチュエータ例えば、ポンプPi、第1処理領域B1、第2処理領域B2、検出ゾーンDi、空気ベントAVi、及び廃棄物ゾーンWiを含む。図15A、図15Bは、微小流体ネットワーク304の一例の2つの相補的な半分を示す。尚、ネットワークを2つの別個の半分に分割することは、任意であり、純粋に図示を容易にするために過ぎないことは、当業者には言外であろう。図15A、図15Bに示す構成要素の配列は一例であり、同じ構成要素の異なる幾何学的配列、又は異なる構成要素の異なる配列のような、別のこのような配列も、ここに説明するステップを遂行するために、当業者によって組み立てることができることは、当業者には言外であろう。通例、ネットワーク304の構成要素は熱的に作動させることができる。図16に見られるように、熱源ネットワーク312の一例は、微小流体ネットワーク304の種々の熱作動構成要素に対応する場所を有する熱源例えば、抵抗性熱源を含む。例えば、熱源HPiの場所は、アクチュエータPiの場所に対応し、熱源HGiの場所はゲートGi及び混合ゲートMGiの場所に対応し、熱源HViの場所は、弁Vi及び二重弁V’iの場所に対応し、熱源HDiの場所は処理室Di、ネットワーク304の全ての場所に対応する。使用中、カートリッジ300の構成要素は、ネットワーク312の対応する熱源に熱的に接触して配置することができ、カートリッジ200について先に説明したように、通例、プロセッサを用いて動作させることができる。熱源ネットワーク312は、カートリッジ200について説明したように、カートリッジ300と一体であっても、別個であっても可能である。例えば、熱源ネットワーク312を、受容ベイ2014の直下等に、内部に配置されているカートリッジのネットワークと位置が合うように、加熱モジュール2020に一体化することができる。微小流体カートリッジ300のその他の構成要素は、次の通りである。空気ベント空気ベントAViは、ネットワーク304内部における液体の移動によって変位した気体例えば、空気を発散させて、圧力の蓄積が液体の所望の移動を妨げないようにすることができる。例えば、空気ベントAV2は、ベントAV2を通過する液体の下流において気体を発散させることによって、液体をチャネルC14に沿ってチャネルC16の中まで移動させる。弁弁Viは、常時開放状態を有し、弁の一方側例えば、弁の上流側における位置から、弁の他方側例えば、弁の下流側における位置まで、チャネルに沿って材料を通過させることができる。弁Viは、微小流体カートリッジ200の弁と同様の構造を有することができ、この中において更に説明する。図17及び図18に見られるように、二重弁V’iも常時開放状態を有し、弁の一方側例えば、弁の上流側における位置から、弁の他方側例えば、弁の下流側における位置まで、チャネルに沿って材料を通過させることができる。図17及び図18の二重弁V11’を例にあげると、二重弁Vi’はTRSの第1及び第2質量体314、316例えば、共晶合金又はワックスを含み、これらはチャネル例えば、チャネルC14のいずれかの側において互いに離間されている。通例、TRS質量体314、316は、互いにずらすことができる例えば、TRS質量体の幅の約50以下の距離だけ。開放した弁を通って移動する材料は、第1及び第2TRS質量体314、316の間を通過する。各TRS質量体314、316は、それぞれの室318、320と関連付けることがで、室318、320は通例気体例えば、空気を含む。二重弁Vi’のTRS質量体314、316及び室318、320は、熱源ネットワーク312の対応する熱源HV11’と熱的に接触することができる。熱源HV11’を作動させると、TRS質量体314、316は更に移動可能な第2状態例えば、部分的溶融状態に遷移し、室318、320内における気体の圧力を高める。気体圧力は、チャネルC11を横切るようにTRS質量体314、316を進ませて、弁HV11’図18を閉鎖させる。通例、質量体314、316は少なくとも部分的に合体して質量体322を形成し、これがチャネルC11を遮断する。図15A、図15Bに戻って、ゲートGiは常時閉鎖状態を有することができ、ゲートの一方側における位置からゲートの他方側にチャネルに沿って材料を通過させない。ゲートGiは、前述したカートリッジ200のゲートと同様の構造を有することができる。微小流体ネットワークの一部の例について、図19Aから図19Dに見られるように、混合ゲートMGiは、液体の2つの体積をネットワーク304内部において合体例えば、混合させることができる。混合ゲートMGiについては、以下で更に説明する。アクチュエータアクチュエータPiは、ネットワーク304の1つの場所と別の場所との間で材料例えば、サンプル材料及び/又は試薬材料を移動させる気体圧力を供給することができる。アクチュエータPiは、カートリッジ200のアクチュエータと形態が同様であることができる。例えば、各アクチュエータPiは、TEMの質量体273を有する室を含み、TEMの質量体273を加熱して室内部で気体を加圧することができる。各アクチュエータPiは、液体がアクチュエータの室に入るのを防止する、対応するゲートGi例えば、アクチュエータP1のゲートG2を含む。ゲートを作動させる例えば、開放すると、通例、アクチュエータの室内で発生した圧力を微小流体ネットワークに進入させることができる。廃棄物室廃棄物室Wiは、ネットワーク304内部における液体の操作例えば、移動及び/又は混合の結果生ずる無駄な例えば、溢れた液体を収容することができる。通例、各廃棄物室Wiには、空気ベントが付随しており、液体によって変位され室に入った気体を発散させる。処理領域ネットワーク304の第1処理領域B1は、ポリヌクレオチドを集中させ、サンプルのインヒビタから分離させる構成要素とすることができる。処理領域B1は、カートリッジ200の処理領域220のように構成し動作させることができる。実施形態によっては、第1処理領域B1が保持部材例えば、多数の粒子例えば、微小球体又はビーズ、多孔性部材、多数の壁を含む場合もあり、保持部材は、処理領域220について説明したように、1つ以上の受容体によって少なくとも1つの表面が改質されている。例えば、受容体は、1つ以上のポリアミド例えば、ポリ-L-リシン、ポリ-D-リシン、ポリ-DL-オルニシンのようなポリカチオンポリアミド、又はポリエチレンイミンを含むことができる。実施形態によっては、保持部材の粒子を溶解室302内に配することができ、サンプル材料と共に処理領域B1に移動させることができる。第2処理領域B2は、1つ以上のポリヌクレオチドの存在を判定するために、材料例えば、サンプル材料を化合物例えば、試薬と合体させる構成要素とすることができる。実施形態によっては、化合物が1つ以上のPCR試薬例えば、プライマ、制御プラスミド、及びポリメラーゼ酵素を含む場合がある。凍結乾燥粒子実施形態によっては、1つ以上のポリヌクレオチドの存在を判定するために化合物は、1つ以上の凍結乾燥粒子例えば、ペレットとして、B2のような処理領域内に蓄積することができる。粒子は、一般に、室温例えば、約20°Cで少なくとも約6カ月例えば、少なくとも約12カ月の保管寿命を有する。第2処理領域B2に入った液体は、凍結乾燥化合物を溶解例えば、復元する。通例、処理領域B2の凍結乾燥粒子は、平均体積が約5マイクロリットル以下例えば、約4マイクロリットル以下、約3マイクロリットル以下、約2マイクロリットル以下である。実施形態によっては、処理領域B2の凍結乾燥粒子は、平均直径が約4mm以下例えば、約3mm以下、約2mm以下である。実施形態の一例では、凍結乾燥粒子の平均体積は、約2マイクロリットルであり、平均直径は約1.35mmである。別の実施形態では、凍結乾燥粒子の直径は約5mm以下例えば、約2.5mm以下、約1.75mm以下である。1つ以上のポリヌクレオチドの存在を判定する凍結乾燥粒子は、通例、多数の化合物を含む。実施形態によっては、凍結乾燥粒子は、ポリヌクレオチドの存在を判定するため及び/又はポリヌクレオチドの濃度を高めるために反応において用いられる1つ以上の化合物を含む。例えば、凍結乾燥粒子は、PCRによる等で、ポリヌクレオチドを増幅する1つ以上の酵素を含むことができる。凍結乾燥粒子の例には、グループBストレプトコッカスGBSバクテリアと関連のあるポリヌクレオチドの増幅のための試薬の例が含まれる。実施形態によっては、凍結乾燥粒子は、1つ以上のクリオプロテクタント、1つ以上の塩、1つ以上のプライマ例えば、GBSプライマF及び/又はGBSプライマR、1つ以上のプローブ例えば、GBSプローブ-FAM、1つ以上の内部制御プラスミド、1つ以上の特定性対照例えば、GBSのPCRに対する対照のようなストレプトコッカスニューモニエDNA又は充填剤例えば、非特定蛋白質例えば、ボビンセラムアルブミンBSA:bovineserumalbumin、RNAseA、又はゼラチン、及びポリメラーゼ例えば、グリセロールがないタクポリメラーゼが含まれる。勿論、その他の成分例えば、その他のプリマ及び/又は特定性対照も、その他のポリヌクレオチドの増幅のために用いることができる。クリオプロテクタントは、一般に、凍結乾燥粒子の安定性を高めるのに役立ち、粒子の他の化合物に対する損傷を防止するのに役立つ例えば、粒子の調合及び/又は保管中に酵素の変性を防止することによって。実施形態によっては、クリオプロテクタントが1つ以上の糖例えば、1つ以上のディサッカライド例えば、トレハローゼ、メリジトーゼ、ラフィノーゼ及び/又は1つ以上のポリアルコール例えば、マニトール、ソルビトールを含む場合がある。凍結乾燥粒子は、所望通りに調合することができる。凍結乾燥粒子を作る方法は、粒子及びクリオプロテクタント例えば、糖又はポリアルコールの試薬の溶液を形成することを含む。通例、凍結乾燥粒子の化合物を溶剤例えば、水と合体させて溶液を作ることができ、次いで、この溶液を冷却した疎水面例えば、ダイアモンド膜又はポリテトラフルオルエチレン面上に配することができる例えば、1滴ずつ、ピペットによる等での離散分取例えば、液滴。一般に、表面の温度は、極低温剤の冷却槽を直下で使用する等によって、液体窒素の温度例えば、約-150 ゚F以下、約-200 ゚F以下、約-275 ゚F以下付近まで低下させることができる。溶液は、極低温剤に接触せずに分与することができる。溶液は、離散粒子のように凍結する。凍結粒子を、通例凍結したままで、ペレットから溶液を除去する例えば、昇華によってのに十分な圧力及び時間だけ、真空状態に置くことができる。このような方法は、国際特許出願公開第WO2006/119280号に更に記載されている。その内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。一般に、粒子を作る元の溶液における化合物の濃度は、微小流体カートリッジにおいて復元するときよりも高くすることができる。通例、溶液の濃度の復元した濃度に対する比率は、少なくとも約3例えば、少なくとも約4.5とすることができる。実施形態によっては、この比率が約6である可能性もある。GBSの存在を示すポリヌクレオチドの増幅に使用するための凍結乾燥ペレットを調合するための溶液の一例は、クリオプロテクタント例えば、乾燥パウダのような120mgのトレハローゼ、緩衝溶液例えば、pH8.4の1Mトリス、2.5MKCl、及び200mGのMgCl2の溶液48マイクロリットル、第1プライマ例えば、1.92マイクロリットルの500マイクロモラーGBSプライマFインヴィトロゲン、第2プライマ例えば、1.92マイクロリットルの500マイクロモラーGBSプライマRインヴィトロゲン、プローブ例えば、1.92マイクロリットルの250マイクロモラーGBSプローブ-FAMIDT/BiosearchTechnologiesバイオサーチテクノロジ社、対照プローブ例えば、1.92マイクロリットルの250マイクロモラーカルオレンジ560BiosearchTechnologiesバイオサーチテクノロジ社、テンプレートプラスミド例えば、0.6マイクロリットルのマイクロリットル当たり105コピーのプラスミドの溶液、特定性対照例えば、1.2マイクロリットルのマイクロリットル当たり10ナノグラムのストレプトコッカスニューモニエDNAATCCの溶液例えば、マイクロリットル当たり約5,000,000コピー、PCR試薬例えば、4.8マイクロリットルのdNTP中心の100ミリモラー溶液及び4マイクロリットルのdUTP中心の20ミリモラー溶液、充填剤例えば、24マイクロリットルのBSAインヴィトロゲンのミリリットル当たり50ミリグラムの溶液、ポリメラーゼ例えば、60マイクロリットルのグリセロールがないタクポリメラーゼインヴィトロゲン/エッペンドルフのマイクロリットル当たり5Uの溶液、並びに約400マイクロリットルの溶液を作るための溶剤例えば、水を組み合わせることによって作ることができる。前述のように、この溶液の約2マイクロリットル毎の約200の標本を凍結し、脱溶媒して、200個のペレットを作ることができる。復元すると、200の粒子がPCR試薬溶液を作り、全体積は約2.4ミリリットルとなる。試薬リザーバ図14に見られるように、試薬リザーバRiは、使用する準備ができるまで、ネットワーク304から分離した液体試薬例えば、水、緩衝溶液、水酸化溶液を保持するように構成することができる。リザーバR1は、液体を保持するための封止空間330を規定するエンクロージャ329を含む。各空間330は、エンクロージャ329の下壁によって、試薬ポートRPi及びネットワーク304から分離することができる。キャッピング材341例えば、積層体、接着剤、又はポリマ層でエンクロージャの上壁を覆ってもよい。エンクロージャ329の一部は、各エンクロージャの下壁333に向かって方向付けられた作動メカニズム例えば、穿孔部材331として形成することができる。カートリッジ300を用いることができるとき、穿孔部材331を押下することによって試薬リザーバRiを作動させて、壁333を穿刺することができる。穿孔部材331は、ユーザによって例えば、親指で、又はカートリッジ300を動作させるために用いられるオペレーティングシステムによって押下することができる。壁333は、通例、切り裂く又は穿孔することができる低透湿率を有する材料例えば、アクラー、メタライズ例えば、アルミニウム積層体、プラスチック、又は箔積層体で形成することができる。例えば、リザーバは約200マイクロリットルまで保持することができる。穿孔部材331は、その体積の一部例えば、約25までを占めてもよい。塩基の水酸化ナトリウムのような腐食性試薬と接触する可能性があるブリスタ内部の積層体の材料は、6から12カ月の露出の後であっても、腐食してはならない。一般に、リザーバRiは、所望通りに形成し充填することができる。例えば、エンクロージャの上壁を下壁333に封止することができる例えば、接着及び/又は熱封止。例えば、穿孔部材331の下端にある開口によって、液体をリザーバに導入することができる。充填の後、例えば、局在的加熱による熱封止、又は封止材例えば、キャッピング材料341の被着によって開口を封止することができる。壁333を穿刺することができると、リザーバからの流体はネットワーク333に入る。例えば、図14及び図15に見られるように、リザーバR2からの液体は、ポートRP2を通ってネットワーク304に入り、チャネルC2に沿って進む。ゲートG3は、液体がチャネルC8に沿って通過するのを防止する。過剰な液体がチャネルC7に沿って通過して、廃棄物室W2に入る。リザーバR2からの液体の後端縁が疎水ベントH2を通過するときに、リザーバ内に発生した圧力を発散させて、液体のこれ以上の運動を停止させることができる。その結果、ネットワーク304は、合流点J1と合流点J2との間にあるチャネルC2の容積によって規定される体積を有する液体試薬の標本を受け取る。アクチュエータP1を作動させることができると、この試薬の標本をネットワーク304内部で更に移動させることができる。試薬リザーバR1、R3、及びR4を、対応するチャネル、疎水ベント、及びアクチュエータと関連付けることができる。図示の構成では、試薬リザーバR1は、通例、処理領域B1内部に保持されているポリヌクレオチドを放出するために放出液例えば、カートリッジ200について先に述べたような水酸化溶液を保持する。試薬リザーバR2は、通例、ポリヌクレオチドを放出する前に、処理領域B1から保持しない化合物例えば、インヒビタを除去するために洗浄液例えば、カートリッジ200について先に述べたような緩衝溶液を保持する。試薬リザーバR3は、通例、中和緩衝液例えば、pH8.0の25~50mMのトリス-HCl緩衝液を保持する。試薬リザーバR4は、通例、脱イオン水を保持する。リザーバは、当該リザーバの壁に穿孔部材が形成されているように示したが、別の構成も可能である。例えば、実施形態によっては、リザーバが針状の穿孔部材を含み、これがリザーバの上壁を貫通して、リザーバの下壁に向かって封止空間内に達することもある。リザーバの上壁は、針状穿孔部材において例えば、接着剤、エポキシによって封止することができる。使用中に、上壁を押下して、穿孔部材を押し進めて下壁を貫通させ、封止空間の中にある液体を微小流体ネットワークに進入させる。リザーバは、作動メカニズム例えば、穿孔部材を含むように説明したが、別の構成も可能である。例えば、実施形態によっては、リザーバの封止空間の下壁は、微小流体ネットワークへの開口の上に被さる弱化部分を含むこともある。開口に被さる下壁の材料例えば、積層体、ポリマ膜、又は箔は、封止空間内部にある液体の逸失を防止する程度に厚いが、内部の液体に圧力を加えたときに避ける程度に薄くすることができる。通例、開口を覆う材料は、隣接する材料よりも薄くすることができる。あるいは、又は加えて、下壁の周りの材料と比較して、弱化した材料を比較的支持しないでおくことにより、この材料を形成することもできる。リザーバは、封止空間の壁によって部分的に形成された封止空間を有するように説明したが、別の構成も可能である。例えば、図20Aを参照すると、リザーバは、プランジャ状の作動メカニズム例えば、穿孔部材342と、上層及び下層344、345をそれぞれ有する例えば、上下積層体層を有するガスケット状封止空間343を含む。液体は、上層と下層との間に封止することができる。封止空間は、支持構造346例えば、ドーナツ状ガスケットによって包囲することができ、支持構造は、その上下周面において封止空間を支持する。図20Bを参照すると、穿孔部材342が示されており、穿孔部材342が上下層双方を穿孔し、液体を微小流体ネットワークと連通させるまで押下している。プランジャに隣接するベント346が、穿孔部材と封止空間の上層との間に取り込まれた気体を、微小流体ネットワークの中に押し込むことなく、逃がすことができる。図20Cを参照すると、穿孔部材342を最大限作動させた場合が示されている。穿孔部材の一部が、液体の対応する体積を封止空間から変位させ、所定の体積の液体を微小流体カートリッジに導入する。リザーバは、穿孔部材に対して固定とすることができる封止空間を有するように説明したが、別の構成も可能である。例えば、図21Aは、封止空間347を有するリザーバを示す。封止空間347は、作動メカニズムに対して固着例えば、これと一体化することができる。作動メカニズムは、可動部材348例えば、プランジャと、封止空間に対して固定とすることができる穿孔部材支持部350によって支持されている穿孔部材349とを有する。通例、封止空間は、可動部材内部の空洞と、封止空間内に液体を封止する下壁351とによって規定することができる。穿孔部材は、可動部材を押下することができるときに、下壁を裂くように構成することができる。穿孔部材支持部は、可動部材の空洞に対して全体的に相補的な形状を有する。穿孔部材支持部は、微小流体ネットワークに接続されているチャネル352を含み、密閉空間から放出した流体を、微小流体ネットワークに進入させる。図21Bを参照すると、可動部材が押下されており、穿孔部材が丁度封止空間の下層を裂いたところとなっている。図21Cを参照すると、リザーバは穿孔部材及び穿孔部材支持部上に最大に押下されている。リザーバから変位させられる流体の体積は、一般に、密閉空間に入る穿孔部材支持部の体積に対応する。チャネル353によって、可動部材が変位させた空気を排出させる。リザーバは、当該リザーバの何らかの部分に対して固着することができる穿孔部材を有するように説明したが、別の構成も可能である。例えば、図22を参照すると、リザーバは、当該リザーバに対して固着しないことが可能な作動メカニズム354例えば、針状穿孔部材のような穿孔部材を含む。リザーバの封止空間355は、上壁356によって規定することができ、内部に微小流体ネットワークを規定することができる基板361の一部を貫通するチャネル357を含む。封止空間の下壁358が、封止空間を微小流体ネットワークのチャネル359から分離する。穿孔部材は、封止空間のチャネル357を占有し、穿孔部材の穿孔先端360が下壁358に対抗して留まるようになっている。リザーバの上壁356を押下すると、穿孔部材354が下壁を貫通し、封止空間内にある液体を微小流体ネットワークの中に押し込むことになる。別の例として、図23A及び図23Bは、作動メカニズム例えば、穿孔部材を含むリザーバを示す。この作動メカニズムは、初期状態ではリザーバの上壁の内部に固着することができるが、リザーバの作動時に上壁から少なくとも部分的に分離する。更に別の例として、図24A及び図24Bは、穿孔部材364を含むリザーバを示す。穿孔部材364は、初期状態ではリザーバの上壁366の内部365に固着することができるが、リザーバの作動時に実質的に上壁から分離する例えば、完全に分離する。リザーバについて、密閉空間を有し、これをリザーバの一部に固定又はそうでなければ一体化することができるように説明したが、別の構成も可能である。例えば、図25を参照すると、リザーバは、外壁368によって規定されたカプセル状密閉空間367を含む。外壁は、全体的に、低い透湿率を有する材料で形成することができる。また、リザーバは可動部材369を有する作動メカニズムも含む。可動部材369は穿孔部材370を有し、これが密閉空間を穿孔して中にある液体を放出する。液体はチャネル372に沿って通過し、微小流体ネットワークに至る。チャネル371は、他の場合では可動部材に取り込まれる気体例えば、空気を排出させる。リザーバについて、微小流体ネットワークへの入口を全体的に覆うように説明したが、別の構成も可能である。例えば、図26を参照すると、リザーバは、内部に液体を蓄積することができる密閉空間373と、微小流体ネットワークに入口376に接続されている接続部374とを含む。密閉空間373及び接続部374は、切り裂き可能なシール375例えば、弱いシールによって分離することができる。一般に、切り裂き可能なシール375は、液体又は蒸気が密閉空間から出るのを防止する。しかしながら、液体に圧力を加えるときに例えば、密閉空間の壁377を押下することによって、切り裂き可能シール375が裂けて、液体が弱いシールを通過して接続部に達し、更に微小流体ネットワーク378に入ることができる。穿孔部材を有するリザーバの更に別の実施形態を図27Aに示す。これは、外側シェル2703と、穿孔エレメント2704とを有するリザーバ2701を示し、双方とも同じ材料片で作ることができる。このような合体したシェル及び穿孔エレメントは、当業者には既知の多くのプロセスから形成することができる。特に好ましいプロセスは、真空熱形成及び射出成型とすることができる。穿孔エレメント2704は、全体的に円錐形状とすることができ、頂角がメンブレーン2702に隣接し、その頂角は0.040を超過しないことが好ましい。外側シェルを押下することができるときに、穿孔エレメントは、メンブレーン2702を穿刺してリザーバ2701から液体を放出する。代表的な寸法を図27Aに示す。リザーバは、上面を水平にすることができ、平坦な保護片2705が穿孔部材2704の円錐形の底面を覆うように組み立てるとよい。穿孔部材を有するリザーバの更に別の実施形態を図27Bに示す。これは、単体外側シェル2712及び穿孔エレメント2714を有するリザーバ2711を示す。このような合体したシェル及び穿孔エレメントは、当業者には既知の多くのプロセスから形成することができる。特に好ましいプロセスは、真空熱形成及び射出成型とすることができる。穿孔エレメント2714は、全体的に円錐台形状とすることができ、その狭い辺がメンブレーン2713に隣接する。あるいは、穿孔エレメント2714は、数個の別個の穿孔エレメントを備え、円錐状空間内に配置することもできる。このような穿孔エレメントが4つあることができ、多数のエレメントがあることができることが好ましい。尚、図27A及び図27Bにインチ単位の十進量で示すリザーバの寸法、穿孔エレメント、シェル、及び成型品は、一例であることは言うまでもない。特に、寸法は、シェルがそれ自体の重量で潰れることがなく、通例、カートリッジの動作中に必要となったときに、穿孔部材の押下を妨げる程強くはないようにすることができる。更に、種々の実施形態の材料も、カートリッジの保管寿命が約1年となるように選択することができる。これによって、種々の材料の厚さは、これらが、拡散のような手段によって、所望の保管寿命期間中にその内部に収容する液体体積の10の消失を阻止するようにすることができる。好ましくは、リザーバの容積は、シェルを押下する前において、約150μlとすることができる。シェルを押下したときでは、容積は、その元の容積の約半分に変形できることが好ましい。尚、ブリスタパックに液体試薬を完全に充填し、気泡のための空間が残っていないと、ブリスタには、好ましいよりもかなり大きな力を加えることが必要となる。したがって、ブリスタは、通例、その容積の約80~95まで充填し、空気のために約5~20、通例では、10~15の容積を確保しておく。つまり、一実施形態では、全容積が200μlのブリスタに170mlの液体を充填する。溶解室図14A及び図14Bに示したような溶解室302の一例は、タワー型の外形で示されており、微小流体カートリッジ300の面から突出している。溶解室302は、主要溶解室306と廃棄物室308とに分割することができる。一実施形態では、主要溶解室及び廃棄物室306、308は、互いに分離されているので、材料はこれらの室の一方から他方の室に通り抜け、ネットワーク304の少なくとも一部を通過することはできない。主要溶解室306は、サンプルを室306に導入するサンプル入力ポートSP1、室306をネットワーク304に接続するサンプル出力ポートSP2、及びここに記載するように室306内部でサンプル材料と相互作用する凍結乾燥試薬LPを含む。ポートSP2は、図14Aでは、室302の底面にあるように示されている。図15Bは、微小流体ネットワーク304の残りに対するSP2の位置を示す。入力ポートSP1は、材料例えば、サンプル材料及び気体を室306に進入させるが材料がポートSP1を通って室308から出ることは制限する例えば、防止する一方向弁を含む。通例、ポートSP1は、気密封止を形成するためにサンプル入力デバイス例えば、シリンジと嵌合するように構成されている取付具例えば、ルアー取付具を含む。主要室306は、通例、約5ミリリットル以下例えば、約4ミリリットル以下の容積を有する。使用前に、主要室306は、通例、気体例えば、空気で充填することができる。廃棄物室308は、液体が室308にネットワーク304から入ることができる廃棄物部W6と、室308に入る液体によって変位する気体が出ていくことができるベント310とを含む。溶解試薬粒子溶解室302の乾燥凍結試薬粒子LPは、細胞からポリヌクレオチドを放出する例えば、細胞を溶解することによってように構成されている1つ以上の化合物例えば、試薬を含む。例えば、粒子LPは、蛋白質例えば、プロテイナーゼ、プロテーゼ例えば、プロナーゼ、トリプシン、プロテイナーゼK、ファージリティック酵素例えば、PlyGBS、リゾジーム例えば、ReadyLyseのような改質リゾジーム、細胞特定酵素例えば、グループBストリプトコッチを溶解するためのミュタノリシンを減少させる例えば、変性させるように構成されている1つ以上の酵素を含むことができる。実施形態によっては、粒子LPは、代わりに又は加えて、インヒビタに比較してポリヌクレオチドを保持する成分を含むこともある。例えば、粒子LPは、カートリッジ200の処理室について先に述べたように、受容体で表面を改質した多数の粒子218を含むことができる。粒子LPは、表面改質粒子上の部位を結合するために、判定すべきポリヌクレオチドと競合する可能性があるポリヌクレオチドを減少させる酵素を含むことができる。例えば、判定すべきDNAと競合する可能性があるRNAを減少させるには、粒子LPはRNAase例えば、RNAseAISCBioExpressAmrescoのような酵素を含むとよい。実施形態の一例では、粒子LPは、クリオプロテカント、インヒビタと比較してポリヌクレオチドを保持するように受容体で改質した粒子、及び1つ以上の酵素を含む。通例、粒子LPの平均体積は、約35マイクロリットル以下例えば、約27.5マイクロリットル以下、約25マイクロリットル以下、約20マイクロリットル以下である。実施形態によっては、粒子LPの平均直径が、約8mm以下例えば、約5mm以下、約4mm以下である場合もある。実施形態の一例では、凍結乾燥粒子はの平均体積は約20マイクロリットルであり、平均直径は約3.5mmである。粒子LPは、所望通りに調合することができる。通例、他の試薬粒子について先に述べたように、クリオプロテクタント及び冷却した疎水面を用いて、粒子を調合する。例えば、粒子LPを調合するための溶液は、約20ミリリットル作るためには、クリオプロテクタント例えば、6グラムのトレハローゼ、受容体で改質した複数の粒子例えば、約2ミリリットルのポリ-D-リシン受容体を有するカルボキシル改質粒子の懸濁液、プロテーゼ例えば、約400ミリグラムのプロナーゼ、RNAase例えば、約30ミリグラムのRNAseAミリグラム当たり120Uの活量、ペプチドグリカンを消化する酵素例えば、ReadyLyse例えば、160マイクロリットルのReadyLyseのマイクロリットル当たり30,000Uの溶液、細胞特定酵素例えば、ミュタノリシン例えば、200マイクロリットルのミュタノリシンのマイクロリットル当たり50Uの溶液、及び溶剤例えば、水を組み合わせることによって調合することができる。この溶液の約20マイクロリットル毎の約1,000個の標本を、前述のように、凍結しそして脱溶剤して、1,000個のペレットを作る。復元したとき、ペレットは、通例、合計約200ミリリットルの溶液を作るために用いることができる。微小流体カートリッジの動作例使用中、カートリッジ300の種々の構成要素は、次のように動作することができる。ネットワーク304の弁Vi及び弁Vi’は、開放状態に構成することができる。ネットワーク304のゲートGi及び混合ゲートMGiは、閉鎖状態に構成することができる。試薬ポートR1~R4は、例えば、機械的な力を加えることによって押下して、先に説明したように、液体試薬をネットワーク304に導入することができる。サンプルは、ポートSP1を通じて溶解室302に導入し、主要溶解室306内において凍結乾燥粒子LPと合体することができる。通例、サンプルは、粒子例えば、細胞と緩衝溶液との組み合わせを含む。例えば、サンプルの一例は、約2部全血液から3約部緩衝溶液例えば、pH8.0の20mMトリス、1mMのEDTA、及び1SDSの溶液を含む。別のサンプル例は、グループBストレプトコッチ及び緩衝溶液例えば、pH8.0の20mMのトリス、1mMのEDTA、及び1トリトンX-100の溶液を含む。一般に、導入するサンプルの体積は、主要溶解室306の全容積よりも小さくすることができる。例えば、サンプルの体積は、室306の全容積の約50以下例えば、約35以下、約30以下とするとよい。典型的なサンプルは、体積が約3ミリリットル以下例えば、約1.5ミリリットル以下である。一般に、ある体積の気体例えば、空気が、サンプルと共に主要室306に導入される可能性がある。通例、導入される気体の体積は、室306の全容積の約50以下例えば、約35以下、約30以下とすることができる。サンプル及び気体の体積が合わさって、室306の中に既に入っている気体を加圧する。ポートSP1の弁307は、気体が室306から出るのを防止する。ゲートG3、G4、G8、及びG10は閉鎖状態にあるので、加圧サンプルがポートSP2を通ってネットワーク304に入るのを防止することができる。サンプルは室306において粒子LPを溶解する。復元された溶解試薬例えば、ReadyLyse、ミュタノリシンがサンプルの細胞を溶解し始め、ポリヌクレオチドを放出する。その他の試薬例えば、プロナーゼのようなプロテーゼ酵素がサンプルの中にあるインヒビタ例えば、蛋白質を減少又は変性させ始める。サンプルからのポリヌクレオチドが、粒子LPから放出された粒子218の受容体と連合例えば、結合し始める。通例、室306内では、溶解が行われている間、サンプルをある時間期間例えば、約15分以下、約10分以下、約7分以下加熱する例えば、少なくとも約50°Cまで、少なくとも約60°Cまでことができる。実施形態によっては、光エネルギを用いて、少なくとも部分的に、溶解室306の内容物を加熱することができる。例えば、カートリッジ300を動作させるために用いられる動作システムは、室306と熱的及び/又は光学的に接触するように配置した光源399例えば、主に赤外線領域の光を放出するランプを含むことができる。このような光源は、ヒータモジュール2020、図7、参照番号2046と共に示したものとすることができる。室306は、室306の内部におけるサンプルの温度を監視するために用いる温度センサTSを含む。ランプ出力は、センサTSによって決定した温度に基づいて、増減することができる。カートリッジ300の動作を続けると、G2を作動させて例えば、開放する、主要溶解室306のポートSP2と溶解廃棄物室308のポートW6との間に経路を設ける。経路は、チャネルC9、チャネルC8に沿って延び、処理領域B1を貫通し、チャネルC11に至る。室306内の圧力が、溶解サンプル材料ライセート、粒子218に結合したポリヌクレオチド、及びその他のサンプル成分を含有するを通路に沿って送り出す。粒子218ポリヌクレオチドを含むを処理領域B1内に保持する例えば、フィルタによってことができ、一方サンプルの液体及びその他の成分は廃棄物室308に流入する。ある時間期間の後例えば、約2分及び約5分の間、ゲートG1を開放することによって溶解室306内の圧力を発散させて、ポートSP2及びW6の間に第2経路を形成することができる。二重弁V1’及びV8’を閉鎖して、溶解室302をネットワーク304から分離することができる。カートリッジ300の動作は、続いて、ポンプP1を作動させ、ゲートG2、G3、及びG9を開放する。ポンプP1は、チャネルC2の中にある洗浄液を合流点J1の下流に処理領域B1を通って、廃棄物室W5まで送り込む。洗浄液は、インヒビタ、及び粒子218によって保持されないその他の化合物を、処理領域B1から除去する。洗浄液の後端縁例えば、上流側界面が疎水ベントH14を通過したときに、アクチュエータP1からの圧力がネットワーク304から発散し、液体のそれ以上の運動を停止させる。二重弁V2’及びV9’を閉鎖することができる。動作は続いて、ポンプP2を作動させ、ゲートG6、G4、及びG8を開放して、放出液を試薬リザーバR1から処理領域B1に移動させ、粒子218と接触させる。空気ベントAV1は、放出液の移動に先だって、圧力を発散させる。疎水ベントH6は、放出液の後端縁の後で圧力を発散させ、放出液のそれ以上の運動を停止させる。二重弁V6’及びV10’を閉鎖することができる。動作は続いて、処理領域B1を加熱して例えば、粒子218を加熱することによって、粒子218からポリヌクレオチドを放出する。粒子は、カートリッジ200について先に説明したように、加熱することができる。通例、放出液は、約15mMの水酸化物例えば、NaOH溶液を含み、粒子を約70°Cまで約2分加熱すると、粒子218からポリヌクレオチドを放出することができる。動作は続いて、ポンプP3を作動させ、ゲートG5及びG10を開放して、放出液を処理領域B1から下流に移動させる。空気ベントAV2が、放出液の下流側の気体圧力を発散し、液体がチャネルC16に流入できるようにする。疎水ベントH8は、放出液の上流から圧力を発散して、それ以上の移動を停止させる。二重弁V11’及び弁V14を閉鎖することができる。図19Aから図19Dを参照すると、粒子218から放出されたポリヌクレオチドを含む放出液の一部と、試薬リザーバR3からの中和緩衝液とを混合するために、混合ゲートMG11を用いることができる。図19Aは、試薬リザーバR3を押下して中和緩衝液をネットワーク304に導入する前における混合ゲートMG111領域を示す。図19Bは、中和緩衝液をチャネルC13及びC12に導入した後における混合ゲートMG11を示す。二重弁V13’を閉鎖すると、ネットワーク304を試薬リザーバR3から分離することができる。二重弁V12’を閉鎖すると、ネットワーク304を廃棄物室W3から分離することができる。中和緩衝液は、ゲートMG11のTRSの質量体324の一方側と接触する。図19Cは、放出液をチャネルC16内に移動させた後における混合ゲートMG11領域を示す。微小流体ネットワーク304の寸法例えば、チャネルの寸法、及び疎水ベントH8の位置は、チャネルC16及びC14の合流点J3及びJ4の間に位置する放出液の一部が、放出ステップの間粒子218と接触する液体の体積にほぼ対応するように構成することができる。実施形態によっては、合流点J3及びJ4の間に位置する液体の体積は、約5マイクロリットル未満例えば、約4マイクロリットル以下、約2.5マイクロリットル以下とすることができる。実施形態の一例では、合流点J3及びJ4の間にある放出液の体積は、約1.75マイクロリットルとすることができる。通例、合流点J3及びJ4の間にある液体は、処理領域B1に入ったサンプルの中にあるポリヌクレオチドの内、少なくとも約50少なくとも約75、少なくとも約85、少なくとも約90のポリヌクレオチドを含む。弁V14を閉鎖すると、ネットワーク304を空気ベントAV2から分離することができる。混合ゲートMG11を作動させる前に、合流点J4における放出液、及びチャネルC13及びC12の間にある合流点J6における中和緩衝液を、TRSの質量体324によって分離することができる例えば、液体は、通例、ある体積の気体によって離間されない。放出液及び中和緩衝液を合体させるには、ポンプP4並びにゲートG12、G13、及びMG11を作動させることができる。ポンプP4は、合流点J5及びJ6の間にある中和液の体積、及び合流点J4及びJ3の間にある放出液の体積を混合チャネルC15図19Dの中に送り込む。TRSの質量体324は、通例、散乱及び/又は溶融して、2つの液体が合体することが可能になる。合体した液体は、下流側界面335合流点J3によって形成されたと、上流側界面合流点J5によって形成されたとを含む。これらの界面があるために、界面がない場合よりも効率の高い混合が可能となる例えば、混合液の再循環。図19Dにおいて見られるように、混合は、通例、2つの液体の界面付近で開始する。混合チャネルC15は、通例、チャネル内部にある合体した液体の全長と少なくともほぼ同じ長さ例えば、少なくとも約2倍長いとすることができる。放出液と合体する中和緩衝液の体積は、合流点J5及びJ6の間におけるチャネルの寸法によって決定することができる。通例、合体させる中和液の体積は、合体させる放出液の体積とほぼ同じとすることができる。実施形態によっては、合流点J5及びJ6間に位置する液体の体積は、約5マイクロリットル未満例えば、約4マイクロリットル以下、約2.5マイクロリットル以下である。実施形態の一例では、合流点J5及びJ6の間にある放出液の体積は、約2.25マイクロリットルとすることができる例えば、放出液及び中和緩衝液の総体積は約4マイクロリットルとすることができる。図15A、15Bに戻り、合体した放出液及び中和緩衝液は、混合チャネルC15に沿って移動し、チャネルC32に流入する空気ベントAV8によって下流側で脱気させる。運動は、合体した液体の上流側界面が疎水ベントH11を通過するまで続く。疎水ベントH11は、アクチュエータP4からの圧力を発散させて、合体した液体のそれ以上の運動を停止させる。カートリッジ300の動作を続けると、試薬リザーバR4からの、水中で第2処理領域B2にある凍結乾燥PCR粒子を溶解するために、アクチュエータP5並びにゲートG14、G15、及びG17を作動させることができる。疎水ベントH10は、水の上流側にあるアクチュエータP5からの圧力を発散させて、それ以上の運動を停止させる。PCR-試薬ペレットの溶解は、通例、約2分以下で例えば、約1分以下で行われる。弁V17を閉鎖することができる。カートリッジ300の動作を続けると、凍結乾燥粒子の溶解化合物を処理領域B2からチャネルC31に送り込むために、アクチュエータP6及びゲートG16を作動させることができ、溶解した試薬が混合して、均質に溶解した乾燥凍結粒子溶液を形成する。アクチュエータP6は、溶液をチャネルC35及びC33の中に移動させる空気ベントAV5によって下流側で脱気させる。疎水ベントH9は、溶液の上流側でアクチュエータP6が発生した圧力を発散させて、それ以上の運動を停止させる。弁V18、V19、V20’、及びV22’を閉鎖することができる。カートリッジ300の動作を続けると、ゲートMG20とゲートG22との間にあるチャネル32内にある中和放出液の一部と、ゲートG18及びMG20の間にあるチャネルC35内にある溶解凍結乾燥粒子溶液の一部とを合体例えば、混合するために、アクチュエータP7並びにゲートG18、MG20、及びG22を作動させることができる。合体した液体は、混合チャネルC37に沿って進み、検出領域D2に入る。空気ベントAV3が、混合液の下流側で気体圧力を発散させる。合体した液体の上流側界面が疎水ベントH13を通過するとき、アクチュエータP7からの圧力を発散させることができ、合体した液体は検出領域D2の中に位置することができる。MG2とゲートG23との間にある試薬リザーバR4からの水の一部を、ゲートG19及びMG2の間にあるチャネルC33内にある溶解凍結乾燥粒子溶液の第2部分とを合体するために、アクチュエータP8並びにゲートMG2、G23、及びG19を作動させることができる。合体した液体は、混合チャネルC41に沿って進み、検出領域D1に入る。空気ベントAV4が、合体した液体の下流側で気体圧力を発散させる。合体した液体の上流側界面が疎水ベントH12を通過するとき、アクチュエータP8からの圧力を発散させることができ、合体した液体は検出領域D1の中に位置することができる。カートリッジ300の動作を続けると、検出領域D1をネットワーク304から分離するために、二重弁V26’及びV27’を閉鎖することができ、検出領域D2をネットワーク304から分離するために、二重弁V24’及びV25’を閉鎖することができる。各検出領域の内容物検出領域D2内にあるサンプルポリヌクレオチドを含む中和放出液、溶解凍結乾燥粒子溶液からのPCR試薬、及び検出領域D1における溶解凍結乾燥粒子溶液からのPCR試薬を含み脱イオン水に対して加熱及び冷却ステップを実施して、ポリヌクレオチド検出領域D2にある場合を増幅することができる。各検出領域の二重弁は、加熱の間、検出領域の内容物の気化を防止する。増幅したポリヌクレオチドは、通例、蛍光検出を用いて検出することができる。つまり、通例検出領域D1、D2の一方又は双方の上には、窓例えば、図9におけるようながあり、検出器が窓の上に配置されたときに、反応混合における蛍光物質からの蛍光の検出が可能となる。サンプルを処理する種々の段階を実行するカートリッジについて、ここでは全体的に平坦な外形を有するように示し説明したが、別の構成を用いることもでき、ここに記載する一体化システムと調和する。例えば、全体的に管状又は小瓶状の外形を有するカートリッジが、米国特許出願公開第2006-0166233号に記載されている。その内容は、ここで引用したことにより、本願にも含まれるものとする。実施例以下の実施例は、例示であり、限定することは意図していない。実施例1:ポリヌクレオチド処理装置この非限定的な実施例では、図28から図40に示すように、装置、システム、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態例について説明する。例えば、図28は、小型ベンチトップリアルタイム、ポリヌクレオチド分析システムとして動作することができる装置800の図である。このようなシステムは、ポリヌクレオチドに対して、例えば、1つ以上の感染症の徴候を見つけるために患者からの検査サンプルに対して種々の検査を実行することができる。本装置は、例えば、医療環境から離れる前に患者を検査し所持する際に臨床要員を補助するために、臨床診断市場において用いるための、リアルタイムポリヌクレオチド分析システムとして機能することができる。装置800は、例えば、表示出力802を有する筐体、ハンドル805を有する蓋804、及びバーコードリーダ806を含むことができる。図28及び図36を参照すると、装置800は、受容ベイ807も含むことができ、これを蓋804によって覆うことができる。種々の実施形態では、装置800は、可搬型とすることができ、例えば、装置800は、重量を約10kgとすることができ、幅約25cm、奥行き約40cm、高さ約33cmの寸法を有することができる。装置800は、図29に示すサンプルキット810と共に用いることができる。サンプルキット810は、例えば、任意のラベル813例えば、バーコードラベルを有する微小流体カートリッジ812、任意のラベル8159例えば、バーコードラベルを有するサンプルコンテナ814、任意のフィルタ818、任意のピペット先端820、及び任意のシリンジ82を含むことができる。図30を参照すると、サンプルキット810の1つ以上の構成要素例えば、微小流体カートリッジ812を、例えば、任意にアルゴン又は窒素のような不活性ガスを気密封止することができる、封止パウチ824の中に収めることができる。図31に示すように、微小流体カートリッジ812は、サンプル入口826、複数の自己穿孔可能なリザーバ828、リーシスリザーバ830、廃棄物リザーバ832、任意のラベル813例えば、バーコード、及び位置合わせ部材836例えば、面取りした角を含むことができる。図31及び図36を参照すると、位置合わせ部材836は、装置800における受容ベイ807の相補位置合わせ部材機構809と一致することができ、装置800に挿入するときに、カートリッジ812の向きを決めやすくするために用いることができる。実施例によっては、微小流体カートリッジ812は、ヒータ/センサモジュール842におけるウェル807よりも多少小さくして例えば、50~300ミクロン、通例、200~300ミクロン、微小流体カートリッジ812の取付及び取り外しをし易くするように設計することができる。図32及び図33を参照すると、微小流体カートリッジ812及び/又はサンプルコンテナ814上のラベル、例えば、バーコード813及び815を、通例検査を行う前に、例えば、手作業で又はバーコードリーダ806を用いることによってラベルコードを入力することによって、装置800によって記録することができる。サンプルを検査する準備において、キット810からのピペット先端820をシリンジ822に取り付けることができ、サンプルコンテナ814からシリンジ822の中にサンプルを引き込むことができる。図34を参照すると、次に、サンプル入口826を通じて微小流体カートリッジ812のリーシスリザーバ830にフィルタ818を取り付けることができ例えば、サンプル入口826においてダックビル弁を有するルアーロックを用いて、シリンジ822の内容物例えば、サンプル/空気混合物を、フィルタ818を通じて微小流体カートリッジ812に注入することができる。追加の空気例えば、1~3mLをシリンジ822に引き込むことができ図35に示すように、微小流体カートリッジ812を加圧できるようにする例えば、周囲圧力に対して平方インチpsi当たり5~50ポンド、典型的には、周囲圧力に対して5~25psiの間、更に典型的には10~15psiの間。微小流体カートリッジ812は、緩衝液、試薬などを、例えば、リーシスリザーバ830に、液体、固体、凍結乾燥試薬ペレット等の形態で収容することができる。微小流体カートリッジ812を揺り動かして、注入したサンプルを緩衝液、試薬等と混合することができる。図35を参照すると、微小流体カートリッジ812を加圧するには、シリンジ822及びフィルタ818を、追加の空気と共に用いることができる。微小流体カートリッジ812は、図36に示すように、装置800の受容ベイ807の中に配置することができ、微小流体カートリッジ812上の位置合わせ部材836と受容ベイ807の中にある相補的な位置合わせ部材809との間における相互作用のために、装置800の受容ベイ807には1つの向きでなければ据え付けることができない。図37及び図38に示すように、装置800の蓋804を閉鎖すると、周囲の光をサンプルベイから遮断する役割を果たすことができる。加えて、蓋804を閉鎖すると、蓋の中に収容されている光学検出器を微小流体カートリッジ812に対して正しく位置付けることができる。また、装置の蓋804を閉鎖すると、圧力を微小流体カートリッジ812に加え、ウェル807における加熱/センサモジュール842との熱的接触を確保することができる。図39及び図40を参照すると、装置800の加熱/センサモジュール842は、洗浄、保守、又は特定の微小流体カートリッジ812のための特別な加熱段階との交換のために、着脱可能とすることができる。実施例2:ポリヌクレオチド処理装置この非限定的な実施例では、装置、システム、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態例、特に、方法及びコンピュータプログラム生産物の態様例に関する、実施例1に記載した装置800を用いる種々の態様について説明する。図28から図40を参照すると、装置800は、制御ソフトウェアの形態としてコンピュータプログラム生産物を含む、又はこれと共に構成することができる。このソフトウェアは、分析に用いられておらず、装置800を差し込んでユーザの入力を待つことができるときに、レディモード例えば、スタンバイモードを装置に設けることができる。操作者は、ハンドル805を用いて蓋804を滑らせてその最大開放位置まで開くことができる。ソフトウェア及び装置800は、表示出力802上に、蓋804が開いており、装置800の準備ができていることを示すように構成することができる。ソフトウェア及び装置800は、ハードウェア及び/又はソフトウェア自己検査を実行するように構成するとよい。ソフトウェア及び装置800は、例えば、タッチスクリーンインターフェースを用いることによって例えば、表示出力802上の数字キーボードのキーに触れることによって、バーコードリーダ806によって、IDバッジ上に見られるような、ユーザを表すバーコードを走査入力すること等により、ユーザにログインさせるために、ユーザID及びパスワード画面の入力を要求するように構成するとよい。次いで、ユーザは微小流体カートリッジ812及びサンプルコンテナ814を封止パウチ824から取り出すことができる。ソフトウェア及び装置800は、いずれの検査を実行する前にも、図32及び図33におけるように、バーコードリーダ806を用いて、微小流体カートリッジ812上のバーコード813及び/又はサンプルコンテナ814上のバーコード815を走査入力することを要求するように構成するとよい。ソフトウェア及び装置800は、核酸検査を実行する前に、バーコードに基づいて、適格性検査を実行するように構成するとよい例えば、微小流体カートリッジ812及びサンプルコンテナ814が同じ封止パウチ824に入っていたか否か、キット810の有効期限が過ぎていないか、キット810を、ソフトウェア及び装置800等が行う特定の分析シーケンスと共に用いるように構成することができるか否か等を判定するため。次に、表示出力802は、患者識別子のような、入力を要求する画面に進むことができる。また、装置800は、バーコードリーダ806を用いて、バーコード例えば、患者に割り当てられて医療IDブレスレット上にあるを走査することによって、患者情報を入力させてもよい。表示出力802は、例えば、既に実施した検査の結果、実施する検査についての選択肢等に関する情報を、ユーザに提供することができる。提供するとよい情報の例には、限定ではないが、検査判定例えば、陽性/陰性結果、内部制御結果例えば、陽性及び/又は陰性、及び/又は患者の結果を含む。この実施例では、ユーザを促して、装置800に、検査データを用いて、データを記録しプリンタ、記憶装置、又はコンピュータ等に出力するというような、追加のタスクを実行させるようにしてもよい。ソフトウェア及び装置800の種々の実施形態は、ユーザに1つ以上の任意の機能を実行させるように構成することができる例えば、装置800又はソフトウェアに対する調節。任意の機能には、限定ではないが、ユーザ設定値の修正、ログアウト設定値の修正、システムクロックの設定、表示設定値の修正、QC要件の修正、報告の好みの設定、取り付けたプリンタの環境設定、ネットワーク接続の環境設定、ネットワーク接続を通じたデータ送出、データ分析プロトコルの選択又は適応化等が含まれる。種々の実施形態では、ソフトウェアは、ユーザインターフェース及びデバイスファームウェアを含むことができる。ユーザインターフェースソフトウェアは、ユーザとの相互作用の側面に対処することができ、限定ではないが、患者/サンプル情報の入力、検査進展の監視、エラー警告、検査結果の印刷、結果のデータベースへのアップロード、ソフトウェアの更新等が含まれる。デバイスファームウェアは、分析検査中装置800を動作させることができ、検査とは関係ない包括部分と、実行する検査に特定的な部分を有することができる。検査特定部分プロトコルは、検査を遂行するために、微小流体動作及びその順序を指定することができる。図41Aは、リアルタイム熱センサデータを表示するインターフェースの一例から取り込んだ画面を示す。図41Bは、リアルタイムの光学検出器のデータを表示するインターフェースの一例から取り込んだ画面を示す。実施例3:ポリヌクレオチド処理装置この非限定的な実施例では、特許請求する装置、システム、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態例について説明する。一実施形態では、図28に示す装置800は、病原菌例えば、出産前の女性におけるグループBストレプトコッカスGBSの迅速かつ正確な診断のための微小流体技術に基づく自己充足型、リアルタイムPCRデバイスとすることができる。実施形態の一例では、微小流体カートリッジ812図31を設置することができる場合、装置800はカートリッジ上の動作を作動させること、PCR増幅の生成物を検出及び分析すること、及び/又は結果をグラフィカルユーザインターフェースに表示することができる。微小流体カートリッジ812は、複数の室及び/又はサブユニットを含み、ユーザによる介入を抑えて又は介入なしに、種々のタスクを実行することができる。図42は、微小流体カートリッジ812の一例における種々の室及び/又はサブユニットの模式図である。微小流体カートリッジ812は、サンプル入口826を通じて未処理の臨床サンプル例えば、GBSの場合輸送緩衝液内に浸漬した膣/直腸スワブを受け入れることができる。サンプル入口826は、ルアー型注入ポートとするとよい。ヒト及びバクテリアの細胞及びごみを含有する臨床スワブサンプルは、定期的に2mlの輸送緩衝液の中に収集することができる。しかしながら、微小流体デバイス上では、小さい体積例えば、数マイクロリットル程度であると、容易に処理することができる。マクロ及びミクロ動作間にインターフェースを組み込むことにより、微小流体技術の臨床診断に適応させることが可能になる。サンプルを注入するとき、カートリッジを装置800内に配すればよく、更に別の動作、例えば、サンプルの準備、試薬の計測/混合、及びPCR増幅/検出は、自動的に手を使わずに行うことができる。図43は、微小流体カートリッジ812の一例において実行することができるPCR及び検出に関係するステップの模式図である。種々の実施形態では、PCRに基づく病原菌例えば、膣/直腸スワブからのGBSの検出及び診断のためにサンプルを処理するステップは、DNAを放出するための溶解例えば、ポリヌクレオチドを放出するためのGBSの溶解、DNAの捕獲及び濃縮、並びにPCR互換性のためにDNAを浄化するためのインヒビタ及びコンペティタの最小化を含むとよい。臨床サンプルの中にインヒビタがあると、サンプルの浄化によってそれらの影響を軽減することができなければ、PCRに基づく診断検査に対して誤った陰性結果を生ずる危険性が高まる可能性がある。細胞の溶解は、当技術分野では周知の方法、例えば、熱及び/又は化学的活性化によって行うことができる。実施形態によっては、1.0/-0.2mLのサンプルをサンプル入口826を通じてリーシスリザーバ830に注入することができた後に、装置800は、サンプルを湿性試薬貯蔵部838からの溶解試薬と混合させ、リーシスリザーバ830において加熱させることができる例えば、7分間。このプロトコルを用いると、90よりも高い溶解効率が、GBS及びその他のバクテリア細胞に達成されている。また、溶解試薬は、カチオニックポリアミド改質ポリヌクレオチド-ポリスチレンラテックスビーズ系DNA親和性マトリクス例えば、保持部材821も組み込み、溶解プロセスの間に放出されることもある、負に荷電されたDNAを捕獲することもできる。親和性ビーズは、非常に高い親和性で、負に荷電されたDNAに結合することができ、一方潜在的なPCRインヒビタは、結合できなくなるか、又は後続の洗浄ステップの間に除去することができる。実施形態の一例では、装置800は、PCR対応DNAを発生するために、生のサンプルライセート例えば、GBSサンプルライセートからのDNAの捕獲及び洗浄を自動化することもできる。リーシスリザーバ830の内容物例えば、1.0/-0.2mLのサンプル及び試薬をDNA処理室840に転送することができる。入力サンプルからのDNAが結合した親和性ビーズを、直列ビーズコラム例えば、特定の孔の大きさを有するフィルタを用いて取り込むことができ、カートリッジ上のポンプを用いて親和性ビーズを洗浄し、緩衝液の交換を行うことにより、特定的に結合されていない半分及び溶解可能なインヒビタを除去することができる。結合したDNAは、既知の方法で、例えば、親和性ビーズを加熱する例えば80°Cまでことにより、及び/又は放出緩衝液を用いることによって、放出することができる。この単一ステップの放出で、非常に小さい体積3~4μlにおいて無傷のDNAを復元することができ、これによって、元の目標DNAのかなりの濃縮を達成することができる。当技術分野では既知のその他の方法も、細胞溶解並びにDNA捕獲、洗浄、及び放出を遂行するために、本システムによって用いることができる。ここに記載している実施例では、用いられるリアルタイムPCR分析の基礎は、TaqMan商標分析であり、図44に模式的に動作を示す。しかしながら、当技術分野には既知の別の分析技法を用いてもよい例えば、SYBR-緑I蛍光。TaqMan商標PCR反応は、ある種のDNAポリメラーゼの5’ヌクアレーゼ活動を利用して、PCRの間にTaqMan商標プローブを割る。TaqMan商標プローブは、当該プローブの5’-端部にリポータ染料を、そして当該プローブの3’-端部に消光染料を含有する。反応の間、プローブの劈開がリポータ染料及び消光染料を分離することができ、その結果リポータの蛍光を増大させることができる。PCR生成物の蓄積は、リポータ染料の蛍光の増加を監視することによって、直接検出することができる。プローブが無傷の場合、レポータ染料が消光染料に近接すると、リポータが抑制される結果が得られる蛍光放出は、フェルスタ型エネルギ転移によって生ずることができる。PCRの間、対象のターゲットが存在することができれば、プローブは順及び逆プライマ部位間でアニールすることができる。プローブがターゲットに混成する場合、DNAポリメラーゼは、通例、プローブをリポータと消光剤との間で裂くことができる。次いで、プローブの断片をターゲットから変位させることができ、ストランドのポリマ化は継続することができる。プローブの3’-端部を遮断して、PCRの間プローブの拡張を防止することができる。このプロセスは、通例、例えば熱サイクル毎に行うことができ、生成物の指数的蓄積と干渉してはならない。蛍光信号の増大は、通例、ターゲットシーケンスがプローブに対して相補的になることができ、PCRの間増幅することができれば、検出することができる。TaqMan商標分析は、2倍の厳格さを提供することができプライマは通例結合し、プローブは通例ターゲットシーケンスに結合する、したがって、いずれの非特定的な増幅の検出も低減又は解消することができる。GBSストレプトコッカスアガラクティエに合わせたリアルタイムPCRプライマ及びプローブのセットを、臨床サンプルを用いて設計し検査した。PCR試薬は、CAMP係数をエンコードする位置328及び451の間にあるcfb遺伝子の部分に特定的な1対の混成プリマを含むことができるChristieAtkinsandMunchPetersen、例えば、BollIstSieroterMilan3444152を参照のこと。CAMP係数は、拡散可能な細胞外蛋白質であり、GBSの大多数によって生成される。CAMP係数をエンコードする遺伝子、即ち、cfb遺伝子GenBankアクセス番号:X72754は、GBS分離株に存在する可能性があり、GBSのPCRに基づく識別の発現に用いられているDanbingKetalClinicalChemistry46324331。更に、一例では、蛍光測定を用いることによってプライマ間で増幅されたシーケンスを認識し、リアルタイムの検出を可能にするために、特定的なTaqMan商標型蛍光プローブも設計及び検査されている。DNA浄化プロセスを評価し、実行時における本プリマの性能を監視するために、陽性内部対照プラスミド例えば、図45に示すを採用することができる。種々の実施形態では、以下のように内部対照プラスミドを組み立てるために特定のGBSプライマを採用した。特定のPCRプライマによって包囲した1片のランダムDNAシーケンスを、オリゴヌクレオチド合成によって発生した。このシーケンスと他のDNAシーケンス、特に、Genbankにおいて入手可能なStrepagalactiaeDNAストレプ.アガラクティエDNAとの間におけるいずれの可能な相同も慎重にチェックした。このシーケンスから発生するアンプリコンを認識するように蛍光原TaqMan商標型プローブを設計し、GBSターゲットシーケンスDNAFAM又は類似品に用いたものとは異なる蛍光体CalOrange560又は類似品を、同時二重色蛍光検出に用いた。ある種の実施形態では、GBS特定増幅に重大な悪影響を及ぼすことなく内部対照生成物の増幅を可能にするために、PCR反応に含まれる内部対照プラスミドの量を最適化した。実施例によっては、以前に指定した相互反応性検査リストに含まれる病原体及びGBSDNAから純化したDNAを用いて、内部対照に対するプローブの特定性も検査し、PCRによって最適化した。実施形態の一例では、微小流体体積を用いて迅速な熱サイクルを実行するロバストなシステムを設計し、開発し、微小流体形式で実現した。収容することができる微小流体体積は、約0.01μlから約10μlまでの範囲を取り、下限に対する主な制限は、検出感度である。体積の例は、0.5~4.5μlの範囲である。更に別の体積例は、2μlである。図41A及び図41Bは、装置800の出力例例えば、接触感応LCD846上において見られるの画面撮影を示す。図41Aは、迅速熱サイクルを受けている微小流体PCRモジュールを示し、図41Bは、リアルタイムPCR分析を示す。このデータは、装置800のユーザに入手可能にすることができ、あるいは隠すこともできる。この場合、GBSカートリッジも、2つのPCR室を収容するように設計されており、基板上の陰性対照を組み込み、結果の忠実度を改善するために、サンプルを流出させることを考慮している。実施例によっては、化学薬品を最適化し、互換性のある検出システムを開発して、二色多重PCRを可能にすることによって、サンプル準備の効率及び関連する計装の適正な性能をチェックするための内部陽性対照の使用を容易にした。熱質量が非常に小さく、効率的なフィードバック制御に基づくアルゴリズムのために、超高速熱サイクルを実行し、典型的な50サイクルPCRを約20分で完了できるようにすることを可能にすることができる。熱サイクルに必要な熱は、ヒータ/センサモジュール842によって供給することができ、リアルタイム多重化検出は、光学モジュール例えば、蛍光検出モジュール844によって実行することができる。種々の実施形態では、PCRを実行するために、いずれの数例えば、0、1、2、又は全ての試薬でも、凍結乾燥形式でカートリッジ上に組み込むことができる。使用時に、凍結乾燥PCR試薬を、例えば、脱イオン化水を用いて復元することができる。脱イオン化水は、ブリスタ形式で例えば、自己穿孔可能リザーバ828に微小流体カートリッジ812上に貯蔵することもできる。復元したPCR試薬は、例えば、2部分に分別することができる。種々の実施形態では、PCR対応DNAサンプル準備モジュールの出力を1つの標本に混合し、リアルタイムPCRサンプルPCRのために第1PCRチャネルに送ることができる。非ターゲットDNAを含有するDI水を、PCR試薬の第2標本と混合することができ、陰性対照としての機能を果たすために、別のPCR室陰性PCRに送ることができる。実施例4:ポリヌクレオチド処理装置種々の実施形態において、微小流体システム例えば、微小流体カートリッジ812は、液体液滴を移動/混合するための微小ポンプ、熱始動生物化学反応を行うための微小リアクタ、及び液体圧送動作の制御を可能とし、更に熱サイクルの間PCR室のようなカートリッジの領域を分離するための微小弁又は微小ゲートというような構成要素を含むことができる。実施形態によっては、液体落滴取扱システムを用いて、熱的に作動させるポンプ例えば、熱-空気圧送に基づく液体サンプルの注入及び運動を生成することができる。熱的に作動させるポンプは、機械的弁を用いずに、電子的に動作させてもよい。例えば、主要チャネルに接続することができる室の内側に取り込んだ空気を加熱することにより、熱-空気圧送のために大きな空気圧力を発生することができる。空気の温度を上昇させると、室内部の圧力を上昇させて、液滴を放出し標本を測定する、それを所望の場所まで移動させるのに十分に高い圧力までにすることができる。この技法は、カートリッジ上作動メカニズムとして実装することができ、例えば、成型室、チャネル、及びヒータを用いるとよい。通例、これは機械的移動部品を回避することができ、製作を容易にすることができる。図46は、前述の液滴取扱システムを用いて2つの流体A-青、及びB-オレンジ色の混合を示す実証の写真を示す。圧力ポンプP1及びP2を正確に制御して起動することができ、チャネルMに沿って交互回転離散液滴として、液体を移動させることができ、チャネルMにおいてこれらは混合し、最終的に室Cの中に入れることができ、ここでPCRを実施することができる。実施形態によっては、気体、容易に気化可能な液体例えば、1気圧では25°C及び100°Cの間で気化可能のような熱膨張材料、及び/又は熱膨張ポリマ例えば、エクスパンセルを熱作動ポンプ例えば、熱空気式空気室に導入することもでき、5psiよりも大きな差圧を圧制するためのポンプサイズを最小に抑えることができる。これらの材料は、閾値温度に達することができるときには、例えば、100以上に膨張することができ、部分的又は完全に熱空気室を充填し、更に空気の圧縮を生じさせる。例えば、図47A及び図47Bは、相遷移材料PTM510パラフィンワックス、はんだ、エクスパンセル等のような、融点が分かっているPTM例えば、60°C/75°C/90°Cに基づく熱作動ポンプ500を、閉鎖図47A及び開放図47B構成にした場合を示す。PTM510は、特定の場所に制約することができる。この特定の場所は、PTM510通例、約50~100μlを積層体上に配した封止室512とすることができる。ポンプを120°Cよりも高い温度に加熱すると、PTM510は非可逆的に膨張しその本来のサイズの40倍まで、室512内部の空気を圧縮し、空気を室から変位させ、隣接するゲート514を開放させる。図47C及び図47Dは、ゲート515を動作させるために作動させることができるポンプ501の別の例を、室513内にあるエクスパンセルポリマ511と共に示す。微小流体カートリッジ812に入力する臨床サンプルの一例は、約1ミリリットルの体積を有することができる。細胞の酵素/熱溶解の後、放出されたDNAを親和性マイクロビーズに結合することができる。これらのマイクロビームのサイズは、例えば、10ミクロン程度とすることができる。種々の実施形態では、全量が数百万個の範囲のビーズを、DNA濃縮のために、微小流体カートリッジ812毎に用いることができる。場合によっては、数分例えば、3分の内に数平方ミリメートル孔サイズは8ミクロンの直列フィルタ区域に対抗してビーズを濃縮するために、10psi例えば、10psi,11psi、又は15psiの最小圧力を用いてもよい。この圧力は、例えば、余分な空気例えば、1~3mLを微小流体カートリッジ812のバルクリーシス室に注入することによって発生することができる。実施形態によっては、一方向ダックビル弁を、ルアー入口に用いると、空気圧力が入口を通って逃げるのを最小に抑えるか又は防止することができる。計器の使用中に計器のスライダによって試薬ブリスタドームを押下することによって、サンプルの準備及びPCR反応に用いることができる試薬を、微小流体ネットワーク内に圧送することができる。実施形態例では、細胞溶解、DNA捕獲、及びリアルタイムPCRを実行するために通例用いられる酵素をペレットの中に凍結乾燥させ、カートリッジの異なる場所に貯蔵することができる。ペレットを微小流体カートリッジ812の中、例えば、窒素浄化室又は熱ゲートによって微小チャネルのいずれかの端部で封止したチャネル構造に格納することによって、空気の接触を最小に抑えることができる。サンプルの準備、試薬水和、及びPCRに通例用いられる干渉液は、密閉封止した試薬ブリスタ例えば、自己穿孔可能なリザーバ828に貯蔵することができる。試薬ブリスタを作るために用いられる材料は、高い水分蒸気障壁を有することができ、1年に及ぶカートリッジの保管の間に液体の逸失を最小に抑えることができる。燐送サンプル及び種々の洗浄緩衝液から生ずる廃棄物は、カートリッジ基板上の室及び微小チャネル通例、漏れを防止することができる廃棄物リザーバ832に貯蔵することができる。実施例5:リアルタイムPCRの態様高精度のリアルタイムPCRに基づく病原体例えば、出産前の女性におけるグループBストレプトコッカスGBS定着の診断に用いることができる複数のステップを、図48に示すような、単体の微小流体技術に基づく使い捨てカートリッジに統合した。このようなカートリッジにおいてサンプル入力;結果出力型動作で実行することができるステップの例には、一括溶解、DNA捕獲、洗浄、及び放出、並びにPCR準備及び実行が含まれる。このカートリッジの種々の実施形態では、サンプル及び試薬は、微小流体カートリッジ812図31に示すような自体に収容することができ、通例、例えば、サンプルをデバイスに注入する行為の間を除いて、手作業での動作との相互作用は不要である。処理の間に形成され取り込まれた空気を除去するために、最大限の効果が得られるように位置付けた疎水ベントを含ませることができ、分析に通例用いられる試薬は、カートリッジ内に凍結乾燥ビーズとして収めることができる。復元に必要な液体は、使用時に放出するブリスタパウチに貯蔵することができる。種々の実施形態では、シリンジを収容するためのルアー取付具を有することができるサンプル入口826を通って、サンプル例えば、GBSサンプルを導入することができる。サンプルからの生不純物の少なくとも一部を除去するために、プレフィルタ例えば、シリンジに取り付けるを用いることができ、実施形態によっては、加熱及び/又は溶解酵素を用いて、サンプル例えば、1mLを溶解室において溶解することができる。妨害蛋白質物及び競合RNA分子を除去するために、プロナーゼ、プロティナーゼK、及びRNAaseAのような酵素を例えば、溶解ステップの間に用いることができる。図49を参照すると、DNA捕獲ビーズも、マスタミックスに含めることができる。溶解液体サンプル例えば、親和性ビーズに結合したBGS及び/又はその他のDNAを含有するを、溶解室の出口から微小流体カートリッジに逆流させることができる。実施例によっては、望ましくないごみや過剰な液体を廃棄物室に送ることができる間、DNAを捕獲した親和性ビーズを直列フィルタによって保持することができる。このような実施形態では、用いるビーズは、非磁性体でも磁性体でもよく、フィルタは、粒子をサイズで判別するように選択する。別の実施形態では、ビーズは磁性体であり、磁力線を問題の場所に集中させるように構成した磁場を加えることによって、室又はチャネルのような、微小流体カートリッジの特定の場所に集中させる。用いる磁石は、サンプル分析の間の指定した時点にオン及びオフに切り換えるようにプロセッサによって制御するような、電磁石とするとよい。あるいは、磁石は、必要なときに適所に出入りさせるような、永久磁石としてもよい。実施形態によっては、廃棄物室にシメティコンのような発泡防止剤を装備する。液体は高速で廃棄物室に入り、廃棄物室内にある空気と混合すると発泡するので、廃棄物室では激しい気泡形成が生ずる可能性がある。泡が廃棄物室から溢れ出すと望ましくない。発泡防止剤があれば、この現象を軽減することができる。発泡防止剤は、パウダ、タブレット、ペレット、又は粒子形態で存在することができる。実施形態によっては、ビーズを洗浄して、非結合及び非特定的結合物を除去することができ、浄化したDNAを小容積~3μlの区分室内に放出し、濃縮する例えば、約300倍にことができる。種々の実施形態では、濃縮したDNAは、次に、しかるべきPCR試薬と混合すること、及び/又はリアルタイムPCRのためにPCRチャネルに送ることができる。内部対照プラスミドその同系プローブと共にも、第1PCRチャネルに含めてもよく、陽性対照として作用することができる。第2PCRチャネル存在する場合では、非ターゲットDNAを含有するDI水及び内部対照を、PCR試薬と共に混合し、陰性対照として作用することができる。ユーザは、サンプルを、一括溶解サンプルで、ルアーダックビル弁例えば、サンプル入口826を通じて導入し、軽く振ってリーシス試薬ペレットを溶解し、余分な量の空気例えば、0.25~0.75mlを溶解室に導入し、溶解室を過剰に加圧する。次の式のように、室容積Vchamberを有する溶解室内に発生する絶対圧力Pは、注入する液体サンプルの量Vsample、及び注入する余分な空気の量VextraAairと関係がある。PPatm/VchamberVsampleVextraAair次いで、微小流体カートリッジ812を装置800の中に入れて、スライダモジュール848を閉鎖することができる。閉鎖するとき、スライダモジュール848は試薬ブリスタ例えば、自己穿孔可能リザーバ828を押圧し、これらを破裂させて試薬例えば、洗浄緩衝液、放出緩衝液、中和緩衝液、及び水を、試薬を含むチャネルに放出させる。種々の実施形態では、装置800は、以下のステップのいずれか又は全てを実行することができる。次に、図50A~図50Jを参照すると、種々のエレメントは、図15A及び図15Bにおける同じ参照符号によって発見することができる。図50Aを参照すると、4つの試薬を保持するチャネルのいずれかの側にある弁V3、V4、V5、V7、V12、V13、V15、V16、V23を閉鎖し、一括溶解ランプを活性化して、一括溶解室を、例えば、60°Cに7分間例えば、フィードバックのために図50Bにおける温度センサLを用いて加熱することができる。図50Bを参照すると、ゲートG1を開放して、所定の時間量例えば、サンプルの種類に応じて2~5分の間液体ライセート、DNA親和性ビーズに結合したDNA等を含有するを、ビーズ捕獲フィルタを通じて、廃棄物室に排出することができる。DNAビーズは、直列フィルタで捕らえることができるが、他の液体は廃棄物室まで流れていく。ゲートG7を開放すると、溶解室内の過剰な液体及び/又は圧力を、廃棄物室に発散させることができる。弁V1及びV8を閉鎖すると、溶解室及び廃棄物室をそれぞれ閉塞することができる。図50Cを参照すると、実施例によっては、ポンプE1を用いて洗浄緩衝液をビーズコラムを通して圧送し、ゲートG2、G3、及びG9を開放して、洗浄緩衝剤を疎水ベントH2の下流側に移すことによって、捕らえたビーズを洗浄するとよい。洗浄緩衝チャネル例えば、V2、及び洗浄緩衝廃棄物例えば、V9を分離する弁を閉鎖することができる。図50Dを参照すると、ポンプE2を用いることによって放出緩衝液を圧送し、ゲートG6、G4、及びG8を開放してビーズコラムを充填し、放出緩衝液を空気ベントH1の下流に移すことができる。放出緩衝液チャネル例えば、V6及びビーズコラムの下流側のチャネル例えば、V10を閉塞する弁を閉鎖し、ビーズを例えば70Cに2分間加熱することができ、これによってDNA親和性ビーズからDNAを放出することができる。図50Eを参照すると、ポンプE3を用いて、放出したDNAを圧送し、ゲートG5及びG10を開放して、疎水ベントH4の下流側に移すことができる。このとき、弁V11及びV14を閉鎖することができる。図50Fを参照すると、ポンプE4を用いゲートG12、G11、及びG13を開放することによって、放出したDNAの一部合流点G11及びa1の間、及び中和緩衝液の一部G11及びa2の間を混合することができる。a1及びa2間における複合液体プラグの混合は、中和混合チャネルを通ってそれを圧送し、疎水ベントH4の下流側に移した後に行うとよい。G11は、ゼロデッドボリュームゲートとするとよく、2つの液体プラグの融合中気泡を取り込むことなく、2つの液体チャネルを互いに接近させる。中和サンプルの端部にある2つの弁V21及びV22を閉鎖することができ、ここで図50Gを参照すると、ポンプE5を用いてDI水を圧送し、ゲートG14、G15、及びG17を開放して、PCR-試薬ペレットを溶解する。この液体は、疎水ベントH12を用いて配置することができる。凍結乾燥PCR試薬ペレットの完全な溶解に十分な長い時間期間例えば、約1分の後、弁V17を閉鎖することができる。図50Hを参照すると、ポンプE6を用い、ゲートG16を開放することにより、溶解した酵素を、酵素混合チャネルを通して圧送することができ、更に疎水ベントH5を用いて、流体の配置をし易くすることができる。種々の実施形態では、混合した酵素を、多数の反応のために、サンプルPCR混合部及び陰性PCR混合部に例えば、等しい2部分に分配することができ、そのときに弁V18、V20、及びV19を閉鎖すればよい。種々の実施形態では、図50Iを参照すると、ポンプE7を用いゲートG18、G20、及びG22を開放することによって、中和したDNAの一部合流点G20及びb1の間、及び酵素の一部G20及びb2の間を混合することができる。a1及びa2間における複合液体プラグの混合は、中和混合チャネルを通って圧送し、疎水弁H6の下流側に移すことができた後に、行うことができる。ポンプE8を用いゲートG19、G21、及びG23を開放することによって、DI水の一部合流点G21及びc1の間及び酵素の一部G21及びc2の間を混合することができる。複合液体プラグの混合は、中和混合チャネルを通って圧送し、疎水弁H7の下流側に移すことができた後に、c1及びc3間において行うことができる。図50Jを参照すると、弁V24、25、26、27は、実施例によっては、サンプルPCR及び陰性対照PCRを実行するために、閉鎖することができる。種々の実施形態では、スライダにおいて光学系を用いて光例えば、蛍光を検出することができる。実施例によっては、蛍光データに基づいて、ソフトウェアがサンプル内におけるターゲット例えば、GBSの存在を判定することができ、結果を報告することもできる。実施例6:ポリヌクレオチド処理装置この非限定的な例は、前述の装置、システム、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態例のCAD図を示し、更に説明する。図51は、レバー1210、ギアユニット1212、及び動力部材1214を有するレバーアセンブリ1200の側面図を示す。アセンブリ1200は、装置の蓋を閉鎖するため、そして動力部材1214によって受容ベイ1217の中にある微小流体カートリッジ1216に力を加えるために用いることができる。この切欠図には1つの動力部材しか見えないが、いずれの数、例えば、4つでも用いることができる。動力部材は、例えば、図示のような手動ばね装荷アクチュエータ、自動機械式アクチュエータ、十分な機械的伸展性及び剛性を備えた材料例えば、硬質エラストマプラグ等とすることができる。微小流体カートリッジ1216に力を加えると、少なくとも約0.7psiから約7psi約5及び約50キロパスカルの間の圧力が、微小流体カートリッジ1216の表面に生ずる可能性がある。実施形態によっては、約2psi約14キロパスカルの場合もある。図52は、微小流体カートリッジ1216が受容ベイ1217に入っている、レバーアセンブリ1200の側面図を示す。ヒートポンプ1219例えば、図示のようなキセノンバルブが、サンプル入口リザーバ1218に向けた放射熱源として機能することができ、この熱がリザーバ1218において細胞を溶解することができる。熱伝導性で、機械的な伸展性がある層1222を、微小流体カートリッジ1216と熱ステージ1224との間の界面に配することができる。通例、微小流体カートリッジ1216及び熱ステージ1224は、それぞれの界面上において平面であり、例えば、約100ミクロン以内、あるいは更に典型的には約25ミクロン以内で平面とすることができる。層1222は、微小流体カートリッジ1216と熱ステージ1224との間における熱結合を改善することができる。光検出エレメント1220は、微小流体カートリッジ1216の上面に向けることができる。図53は、受容ベイ1217の至近図を示す。図54は、微小流体カートリッジ1216、熱伝導性、機械的伸展性層1222、及び熱ステージ1224間の界面の至近図を示す。図55は、アセンブリ1200の上面図を示す。機械的部材1214に加えて、案内部材1226も用いることができる。図56は、図55の至近図を示す。図57から図59は、作動時のレバー1210の一連の画像である。加えて、ギアアセンブリ1212の中に、カム1228も示すことができ、これは動力部材1214に結合されているプレート1230に、レバー1210が力を加えることを可能にする。図60及び図61は、自己穿孔可能リザーバ1228と、自己穿孔可能リザーバを作動させる機械的部材1230とを含む微小流体カートリッジ1216の図を示す。図62及び図63は、光検出エレメント1220のエレメントを示し、光源1232例えば、発光ダイオード、レンズ1234、光検出器1236例えば、フォトダイオード、及びフィルタ1238を含む。フィルタは、例えば、バンドパスフィルタ、1つ以上の蛍光原プローブの吸収帯に対応する光源におけるフィルタ、及び蛍光原プローブの発光帯に対応する検出器におけるフィルタとすることができる。実施例7:保持部材の準備濃度が約1011mL-1のカルボキシル表面磁気ビーズ改質セラ-マグ磁気カルボキシレート、部品番号3008050250、Seradynを、pH6.1の500mMの2-N-モルフォリニオ-エタネスルフォン酸MES:2ethanesulfonicacid緩衝溶液において、N-ヒドロキシルサクシニミドNHS:Nhydroxylsuccinimide及び1-エチル-3-3-ヂメチルアミノプロピルカルボジイミドEDACを用いて30分活性化した。活性化したビーズを、3,000Da又は300,000Da平均分子重量のポリ-L-リシンPLLによって培養した。未結合PLLを除去するための2回の洗浄の後、ビーズは使用する準備ができた。実施例8:微小流体カートリッジ図64及び図65を参照すると、ポリヌクレオチドのインヒビタからの分離を実証するために微小流体カートリッジ300を製作した。カートリッジ300は、第1及び第2基板部302’、304’を備えており、これらは、それぞれ、第1及び第2層302a’、302b’及び304a’、304b’を備えている。第1及び第2層302a’、302b’は、入口310’及び出口312’を備えているチャネル306’を規定する。第1及び第2層304a’、304b’は、入口314’及び出口316’を備えているチャネル308’を規定する。接着剤324’を用いて、第1及び第2基板部302’、304’を填め合わせて、出口312’が入口314’と連通し、それらの間にフィルタ318’を位置付けるようにする。出口312’の一部に、先に準備した活性化ビーズを充填にて、保持部材ビーズを備えた処理領域320’を設ける。接着剤326’によって固着したピペット322’図66によって、サンプルを導入し易くした。使用中、入口310’を通って導入したサンプルは、チャネルに沿って進み処理領域320’を通過した。過剰なサンプル材料は、チャネル308’に沿って通過し、出口316’を通ってデバイス300’から排出した。ポリヌクレオチドは、インヒビタと比較して、優先的にビーズによって保持された。一旦サンプルを導入したなら、追加の液体、例えば、洗浄液及び/又は保持したポリヌクレオチドを放出する際に用いる液体を、入口326’を通じて導入した。実施例9:DNAの保持約1000個のビーズを含む約1μLの容積を有する処理領域を備えている各デバイスを準備することによって、デバイス300’のポリ-L-リシン改質ビーズによるポリヌクレオチドの保持を実証した。約15,000及び30,000Daの間のポリ-L-リシンでビーズを改質した。各処理領域に、ニシン精子DNA濃度が約20mg/mLのサンプル役20uLで充填することによって、ビーズ及び液体を接触させた。10分間液体及びビーズが接触した後、液体を各処理領域から除去し、定量的リアルタイムPCRを実行して、液体内にあるニシン精子DNAの量を判定した。2種類の制御を実施した。第1に、別の同一処理領域に、非改質ビーズ、即ち、活性化及びポリ-L-リシン培養ステップを除いてポリ-L-リシンビーズと同一のビーズを充填した。ニシン精子DNAを含む液体をこれらのビーズと接触させ、10分間定在させ、除去し、定量的リアルタイムPCRにかけた。第2に、ニシン精子DNAを含む液体未処理の液体を定量的リアルタイムPCRにかけた。図66を参照すると、第1及び第2制御は、本質的に同一の応答を呈し、非改質ビーズと接触させた液体及び未処理の液体においてニシン精子DNAの存在を示した。3,000個のポリ-L-リシンビーズと接触した液体の方が低い応答を呈し、改質ビーズがニシン精子DNAの実質的に全てを保持していたことを示す。300,000Daのポリ-L-リシンビーズと接触した液体のPCR応答は、3,000Daのビーズよりも少なくとも約50大きい増幅応答を呈し、分子重量が小さい程、表面を改質すると、ニシン精子DNAを保持する効率が高いことを示した。実施例10:ポリ-L-リシン改質ビーズからのDNAの放出処理領域を有するデバイスに、3,000Daのポリ-L-リシン改質ビーズを充填した。グループBストレプトコッチGBSから得たポリヌクレオチドを含む液体をビーズと接触させ、ニシン精子DNAについて上述したように、10分間培養した。この液体は、10μlの20mMトリスpH8、1mMのEDTA、1トリトンX-100緩衝液において、10,000のGBSバクテリアを97°Cの熱溶解に3分間かけることによって得た。10分後、処理領域に約10μlの洗浄溶液1トリトンX100を含むpH8.0のトリス-EDTAを流すことによって、ビーズと接触した液体を除去した。その後、約1μlの5mMNaOH溶液を処理領域に追加した。このプロセスによって、処理領域には、ビーズと接触したNaOH溶液が充填した。ビーズと接触する溶液を95°Cに加熱した。95°Cの加熱の5分後、処理領域の空隙容積の3倍に等しい体積の溶液によって処理領域を溶離することによって、ビーズと接触する溶液を除去した。図67を参照すると、溶液の標本5つに対して、定量的リアルタイムPCR増幅を行った。標本E1、E2、及びE3は、各々、約1μlの液体を含有した。標本Lは、処理領域を通過した元のサンプルの液体に対応する。標本Wは、加熱しない洗浄溶液から得た液体であった。標本E1は、チャネル308の容積にほぼ等しい、デバイス300の死空間に対応する。つまり、標本E1の液体は、チャネル308の中にあり、加熱中ビーズと接触しなかった。この液体は、加熱前に処理領域を通過した。標本E2は、処理領域の中にあり、加熱中ビーズと接触した液体を含む。標本E3は、処理領域から標本E2を除去するために用いた液体を含む。図67に見られるように、初期サンプルにあったGBSDNAの65超が、ビーズによって保持され、これらから放出された標本E2。また、標本E2は、ビーズによって保持されていたDNAの80超の放出を実証した。GBSDNAの約18未満が、捕獲されずに、処理領域を通過した。加熱しない洗浄溶液は、5未満のGBSDNAを含んでいた標本W。実施例11:ポリヌクレオチド及びインヒビタの分離頬の裏層からの口腔細胞は、ヒトの遺伝子材料DNA源を提供し、単独ヌクレオチド多形性SNP:singlenucleotidepolymorphism検出に用いることができる。口腔細胞を含むサンプルに対して、熱溶解を行い、細胞内部からDNAを放出させた。デバイス300を用いて、前述のような随伴するインヒビタからDNAを分離した。図67の標本E2に対応する洗浄済みサンプルに対して、ポリメラーゼ連鎖反応を行った。熱溶解から得られた対照又は生サンプルも増幅した。図68を参照すると、洗浄したサンプルは、対照サンプルよりも少ないサイクルでかなり高いPCR応答を呈した。例えば、洗浄サンプルは、32サイクル以内で20の応答を超過したが、一方対象サンプルは同じ応答を得るには約45サイクルを要した。血液は、感染症因子、癌マーカ、及びその他の遺伝子マーカの検出を含む種々の診断検査において、サンプルマトリクスとして作用する。血液サンプルの中にあるヘモグロビンは、PCRの強力なインヒビタであり、文書に記載されている。2つの5ml血液サンプルを、20mMのpH8のトリス、1mMのEDTA、1SDS緩衝液において溶解し、それぞれのデバイス300に導入した。デバイス300は、前述のように動作して、2つの洗浄サンプルを準備した。第3の5ml血液サンプルを溶解し、GentraSystems社MNの市販のDNA抽出方法Puregeneを用いて準備した。それぞれの洗浄済みサンプル、及び市販の抽出方法を実施したサンプルを、対立遺伝子判別分析CYP2D64試薬、AppliedBiosystems社CAに用いた。各サンプルは、約1mlの血液に対応する量のDNAを含有した。図69を参照すると、洗浄済みで市販の方法で抽出したサンプルは、同様のPCR応答を呈し、デバイス300’の処理領域は効率的にインヒビタを血液サンプルから除去したことを実証した。実施例12:耐プロテーゼ保持部材更なる処理のためのポリヌクレオチドサンプルの準備には、多くの場合、サンプルに対してプロテーゼ処置を施すことがふくまれ、その場合、プロテーゼがサンプル内の蛋白質のペプチド結合を裂いてしまう。プロテーゼの一例に、生体内及び生体外プロテーゼの混合物である、プロナーゼがある。プロナーゼは、殆どのペプチド結合を裂いてしまう。ポリ-L-リシンのような、ある種の受容体は、プロナーゼ及びその他のプロテーゼによる破壊を受けやすい可能性がある。つまり、結合する受容体がプロテーゼの影響を受けやすい場合、サンプルは、一般に、保持部材が存在する状態でプロテーゼ処置を受けない。ポリ-D-リシン、ポリ-リシンの右旋性エナンチオ異性体は、プロナーゼ及びその他のプロテーゼによる劈開に対して抵抗力がある。プロテーゼ処置を受ける場合における結合ポリ-D-リシンを含む保持部材のDNAを保持する能力について、研究した。8つのサンプルを準備した。4つのサンプルから成る第1グループは、10μlの緩衝液の中に1000GBSの細胞を含有した。4つのサンプルから成る第2グループは、10μl緩衝液の中に100GBSの細胞を含有した。8つのサンプルの各々を97°Cで3分間加熱して、GBS細胞を溶解した。加熱したサンプルから、4つのサンプル集合を作成した。各サンプル集合は、第1及び第2グループの各々から1つのサンプルを含んだ。各サンプル集合のサンプルを以下のように処置した。図70Aを参照すると、サンプル集合1のサンプルに対してプロナーゼ培養を行い、それぞれの蛋白質劈開サンプルを準備し、次いでこれらを加熱してプロテーゼを不活性化した。蛋白質劈開、加熱サンプルをそれぞれの保持部材と接触させた。保持部材は、各々、ポリ-L-リシン改質ビーズの集合体を備えている。5分後、それぞれのビーズ集合体を、5マイクロリットルの5mMNaOH溶液で洗浄して、インヒビタ及び蛋白質劈開の生成物を結合DNAから分離した。それぞれのビーズ集合体を、各々、NaOH溶液の第2標本と接触させ、80°Cまで2分間加熱して、DNAを放出した。DNAが放出された溶液を、等しい体積の緩衝液で中和した。中和した溶液を分析して、DNA復元の効率を判定した。結果を平均化し、図70Bに示す。サンプル集合2のサンプルに対して、プロナーゼ培養を行い、それぞれの蛋白質劈開サンプルを準備し、次いでこれらを加熱してプロテーゼを不活性化した。蛋白質劈開、加熱サンプルを、それぞれの保持部材と接触させた。保持部材は、各々、ポリ-D-リシン改質ビーズの集合体を備えている。5分後、それぞれのビーズ集合体を、5マイクロリットルの5mMNaOH溶液で洗浄して、インヒビタ及び蛋白質劈開の生成物を結合DNAから分離した。それぞれのビーズ集合体を、各々、NaOH溶液の第2標本と接触させ、80°Cまで2分間加熱して、DNAを放出した。DNAが放出された溶液を、等しい体積の緩衝液で中和した。中和した溶液を分析して、DNA復元の効率を判定した。結果を平均化し、図70Bに示す。サンプル集合3のサンプルに対して、プロナーゼ培養を行い、それぞれの蛋白質劈開サンプルを準備した。プロテーゼは、熱的にも化学的にも不活性化しなかった。蛋白質劈開サンプルを、それぞれの保持部材と接触させた。保持部材は、各々、ポリ-L-リシン改質ビーズの集合体を備えている。5分後、それぞれのビーズ集合体を、5マイクロリットルの5mMNaOH溶液で洗浄して、インヒビタ及び蛋白質劈開の生成物を結合DNAから分離した。それぞれのビーズ集合体を、各々、NaOH溶液の第2標本と接触させ、80°Cまで2分間加熱して、DNAを放出した。ポリヌクレオチドが放出された溶液を、各々、等しい体積の緩衝液で中和した。中和した溶液を分析して、DNA復元の効率を判定した。結果を平均化し、図70Bに示す。サンプル集合4のサンプルに対して、プロナーゼ培養を行い、それぞれの蛋白質劈開サンプルを準備した。プロテーゼは、熱的にも化学的にも不活性化しなかった。蛋白質劈開サンプルを、それぞれの保持部材と接触させた。保持部材は、各々、ポリ-D-リシン改質ビーズの集合体を備えている。5分後、それぞれのビーズ集合体を、5マイクロリットルの5mMNaOH溶液で洗浄して、インヒビタ及び蛋白質劈開の生成物を結合DNAから分離した。それぞれのビーズ集合体を、各々、NaOH溶液の第2標本と接触させ、80°Cまで2分間加熱して、DNAを放出した。ポリヌクレオチドが放出された溶液を、各々、等しい体積の緩衝液で中和した。中和した溶液を分析して、DNA復元の効率を判定した。結果を平均化し、図70Bに示す。図70Bに見られるように、サンプル集合4を用いると、平均してGBS細胞からのDNAの80超が復元されており、これらのサンプルは、ポリ-D-リシン改質ビーズと接触し、プロテーゼ不活性化を行わなかったビーズが存在する状態で、プロナーゼ培養が行われた。サンプル集合4の復元効率は、他のサンプルのいずれに対しても、2倍よりも高くなる可能性がある。具体的には、サンプル集合1、2、3、及び4の復元効率は、それぞれ、29、32、14、及び81.5であった。これらの効率は、DNAを保持する保持部材が存在する状態においてプロテーゼ培養を行ったサンプルについて、高い復元効率を得ることができることを実証している。実施例13:ポリヌクレオチド処理装置の操作者取扱書この非限定的な実施例では、操作者の取扱書の形態で、特に、グループBストレプトコッカスGBSのような、微小有機体の定量的検出のための微小流体PCR分析を含む単体カートリッジシステムを対象とする、特許請求する装置、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態について説明する。GBS分析に関する更に詳しい説明は、実施例14において呈示する。以下のサンプル準備キットを含むことが好ましい。緩衝液及び防腐剤を含有するサンプル小瓶患者自身が収集するための指示書が付属する収集スワブ多数の例えば、25個フィルタ付きシリンジ緩衝液を収容した小瓶収集小瓶用患者IDラベル3ccシリンジこの中で更に説明する微小流体カートリッジ以下の外部制御サンプルキットを備えることが好ましい。例えば、脱水形態のGBSバクテリアの検出サンプルの限度を含有する陽性対照スワブ被検物小瓶上に陽性識別がある緩衝液を含有する小瓶小瓶上に陰性識別がある緩衝液を含有する小瓶シリンジ機器:バーコードリーダを備えたシステムに、例えば、115V又は220Vの電源コードを差し込む。双方については、ここで更に説明する。追加の任意選択機器USB接続を有するプリンタ病院ネットワーク接続使用例及び使用の指示この実施例における説明は、GBSの存在を調べるためのサンプル検査に適しており、その更に詳しい説明は、実施例14において提示する。検査アプリケーションの説明この中で更に説明するように、種々の病原体や微小有機体を検査するために、本装置及び材料を用いることができる。一例は、実施例14において更に説明するが、GBSを検査することである。検査は、実験室の手順にはさほど訓練されていない臨床家によって、患者の近くに設定して行うことができる。GBS検査のために継続して品質保証を行うためにシステムのユーザインターフェースにQCルーチンを組み込むことができる。また、検査を依頼した外科医が要求する時間枠以内にサンプル検査が行われるのであれば、検査は中央病院のstat実験室で行うこともできる。警告及び注意の例GBSに特定的なその他の警告及び注意を実施例14に呈示する。実施形態によっては、患者を現在抗生物質で処置している場合、検査は病状の信頼できる指標とはならない場合がある。通例、使用期限が切れたカートリッジ/サンプルキットの使用を避ける。通例、以前に開封したカートリッジの使用を避ける。空気及び水分に晒すと、試薬が劣化する可能性がある。サンプルを注入する準備ができる後まで、カートリッジを開封するのを回避する。通例、サンプルの準備には新しいシリンジ材料を用いる。通例、検査キットの中に用意されているスワブ及び緩衝液を用いる。実施形態によっては、他のブランドの収集スワブでは、検査性能を損なう場合もある。被検物を保管しなければならない場合、4°Cで24時間までの期間の冷蔵が指示されるのが通例である。通例、本システム及び被検物の成分を取り扱う間、保護服及び使い捨て手袋を用いる。通例、無菌技法を用いる。検査被検物又は検査材料の汚染を回避するために、新しい使い捨て手袋を用いることは、特に重要となる可能性がある。通例、サンプルを高圧で注入することを避ける。緩やかな注入が好ましい。通例、潜在的な感染被検物に対する安全病院手順にしたがって、統一予防策を用いて被検物を取り扱う。通例、システムを洗浄するときには、推奨された洗浄剤を用いる。通例、溢流が起きた場合、いずれの洗浄薬品で検査カートリッジを洗浄することも回避する。必要であれば、液体を除去するためには乾燥した実験室用ティッシュを用いる。被検物収集の一例注意:スワブのDacron商標端部に指で触るのを避ける。容器からスワブを取り出す。過剰な膣分泌物を拭い去る。スワブを2cm膣膣に挿入する。同じスワブを1cm肛門直腸に挿入する。乾燥させて保管する場合、スワブを輸送用パッケージに入れる。被検物準備の一例検査材料及び被検物を取り扱うときは、無菌技法を用いる。サンプル緩衝液が期限切れでないことを確認する。1ccの緩衝液を収容する小瓶の中にスワブを20回勢い良く浸す。スワブを取り出して破棄する。臨床標準手順で要求されている場合、患者ID及び収集時刻を小瓶に記す。注意:使用する準備ができるまで、カートリッジのパッケージを開封するのを避ける。内蔵試薬は、光及び水分に感応する可能性がある。システム動作命令の一例システムレディ画面を示すとよい。スクリーンセーバを停止させるために、画面に触る。ハンドルを上げ、システムの蓋を開いて、開始する。一旦蓋を完全に開いて、開放インディケータがある場合、これがオンになると、システムの自己検査を開始することができる。以前の検査から残留しているいずれかの使用済みカートリッジがないか、システムを調べる。ユーザID及びパスワードを用いて、ログインする。サンプル収集小瓶のバーコードを走査する。検査カートリッジを開く。カートリッジバーコードを走査する。材料が期限切れの場合、及び/又は被検物小瓶及び検査材料が相応に一致しない場合、システムはエラーメッセージを出すとよい。患者情報により、サンプルIDを確認する。必要であれば、患者ID及びその他の病院識別情報を入力する。サンプルをカートリッジに転送する命令の一例新品の1対の手袋を着用する。サンプル小瓶をカウンタ上に置く。先端をシリンジに取り付ける。サンプル全体をシリンジに引き込む。加えて、2ccの空気をシリンジに引き込む。先端を取り外し、フィルタを取り付ける。シリンジを用いて、1ccのサンプル及び追加の2ccの空気をカートリッジに注入する。注意:サンプルからの跳ね返りを回避するために、サンプルに注入する際には弱い圧力を用いる。検査実行指示の一例は、次の通りである。ペレットが溶解するまで、カートリッジを前後にゆっくりと揺する。カートリッジをシステム上に置く。システムのカバーを閉じる。検査は自動的に開始することができる。結果。検査が完了したとき、表示又は印刷のために結果を利用可能とするとよい。材料の廃棄。使用したカートリッジ及び収集キットは、生物学的有害物質として取り扱うことができる。出荷のための材料の準備通例、国際規格に記載されているように、カートリッジは生物学的有害物質保護材の中に包装しなければならない。システム洗浄手順の一例10漂白剤0.5次亜塩素酸ナトリウムの溶液、続いて洗浄水濯ぎ洗いを用いて、消毒し、潜在的なDNA汚染を低減することができる。DNA汚染は、通例、漂白剤又はDNA汚染を解消するのに適した材料で洗浄することによって、遂行することができる。Chemicon商標核酸リムーバも、通常の消毒剤での洗浄の後に用いることができる。通例、アルコール又は通常の衛生布では、計器のDNA汚染は低減しない。試薬ロット検証の一例目的-カートリッジ及びサンプルキットロットの評価、並びにシステム性能全体の検証。推奨:カートリッジ又はサンプルキットの新しいロットを受け取ったとき、品質管理を実施して、例えば、試薬セットが1外部対照及び1陰性外部対照を含むか否か確認することができる。品質管理ルーチンの一例外部陽性対照は、被検物準備ステップの感度及び分析を監視し較正する役割を果たし、偽りの陰性結果の危険性を最小限に抑えるために用いることができる。検査が失敗した場合、そのカートリッジ群からの結果を無効にすればよく、供給業者に報告すべきである。目的-サンプル取扱技法の評価を含むシステム性能全体の検証。検査は、ユーザが選択し予め設定した間隔で行うことができる。推奨:検査を行うとき、1陽性外部対照及び1陰性外部対照を含むQCセットを実施し、QC検査で予期した結果が得られなかった場合、製造業者に連絡する。品質管理ルーチン指令の例品質管理画面に移る。ユーザIDを入力する。画面上で指令される通りに、QC技法検証、新試薬ロット、規則的なQC実行サンプルを選択する。システムの自己検査本システムは、電源を投入するときに、システム起動検査を実行することができる。各患者検査サンプル又はQCサンプルの開始ルーチンとして、システムは、自己検査を実行して、例えば、電子回路、光学系、ヒータ及び温度センサが、意図したように機能しているか否か判断することができる。内部対照の例カートリッジ上分析に用いることができる試薬をカートリッジ上に含めれば、ユーザの取扱誤りや汚染の潜在的可能性を低減することができる。各微小流体カートリッジの中に、2種類のカートリッジ上陽性及び陰性対照方策を組み込んで、個々のPCR分析性能を監視することができる。以下に2つの例を示す。1陽性内部対照プラスミドICP:内部対照プラスミドは、PCR分析試薬の完全性に対する対照を規定し、被検物の中にPCR妨害物質があることの指標となることができる。即ち、これは偽りの陰性結果に対する対照となることができる。熱サイクルの間、この領域を増幅すると、双方のPCRレーンに別個の蛍光原信号が発生する場合がある。陽性サンプルがない状態で、内部対照シーケンスを増幅し損ねることは、試薬混合の失敗、又は被検物におけるPCRインヒビタの存在の指示となることができる。これは、計器上のエラーコードによって示されるように、検査結果を無効にすることができる。INDを表示して、中間結果を報告することができる。2陰性内部対照PCRレーン:サンプルが全くない同じ混合からの試薬を用いて第2PCRを実施するために、並列レーンを用いることができる。これは、試薬の汚染による偽りの陽性結果に対する対照を規定することができる。陰性対象レーンにおける失敗結果は、結果を無効化することができ、計器上のエラーコードによって示すことができる。INDを表示して、中間結果を報告することができる。GBSDNA検出のためのリアルタイムPCRの一例種々の実施形態では、検査は、臨床サンプルから復元したGBSのcfb遺伝子シーケンスの増幅、及び増幅したDNAの検出のための蛍光原ターゲット特定混成化に、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応PCRを用いることができる。cfb遺伝子は、CAMP係数、即ち、典型的にGBS隔離集団に存在する拡散可能な細胞外蛋白質をエンコードする。グループBストレプトコッカスGBS検出検査を一体化し、原料-サンプル-結果型の核酸増幅分析とすることができる。TaqMan蛍光原プローブを用いて、PCRアンプリコンを検出することもできる。分析に用いられる試薬は、カートリッジに含ませると、ユーザの取扱謝りや汚染の潜在的可能性を低減することができる。潜在的な注意の例実施形態によっては、膣及び/又は直腸被検物以外の被検物における、GBSDNAのようなターゲットを特定する適格性がない場合がある。尿及び血液の被検物は適していない場合がある。実施形態によっては、抗生物質の処置を受けている患者は、この診断検査又はその他の診断検査では正しい診断を得ることができない場合がある。実施形態によっては、微生物学者によるバクテリアの直接的な識別に適したGBS培養が、本検査から得られない場合もある。実施形態によっては、ペニシリンアレルギのヒトに対する処置を推奨するために必要な罹患性結果が、本検査からは得られない場合がある。潜在的な妨害物質の例実施形態によっては、尿及び膣分泌物が大量に存在すると、検査を妨害する可能性がある。通例、サンプルの血液、胎便、羊水汚染のような汚染物が検査を妨害する可能性はない。通例、抗生物質以外の薬剤の妨害膣及び直腸分泌物に存在するようなは、この時点では、PCRを妨害することは知られていない。性能特性及び解釈の例図71のフローチャートは、結果を解釈するために計器における判断アルゴリズムが用いることができる判断基準集合の一例である。PCR反応サンプル及び対照は、問題のターゲットに対して、陽性又は陰性と解釈することができる。サンプルが決定的に陽性又は陰性か、あるいは不確定か判断するために、論理アルゴリズムを用いることができる。相互反応物質の例以下の有機体から分離したゲノムDNAを用いて、リアルタイムPCRTaqman分析によって、プライマ及びプローブの特定性を検査することができる。9つのGBSセロタイプセロタイプ1a、1b、1c、II、III、IV、V、VI及びVII、AmericanTypeCultureCollectionandNationalCenterforStreptococcusCanada、10個の臨床GBS隔離集団、60個の臨床サンプル、多種多様のグラム-陽性及びグラム-陰性バクテリア菌種、並びに2つのイースト菌種及びRSVタイプ1及び2。微小有機体の例病原体タイプシュードモナアエルジノサグラム-バクテリアプロテウスミラビリスグラム-バクテリアキーブシエラオキシトカグラム-バクテリアキーブシエラニューモニエグラム-バクテリアエシェリチアコット臨床的隔離集団1グラム-バクテリアエシェリチアコリ臨床的隔離集団2グラム-バクテリアアシネトバクテルバウマンドグラム-バクテリアセラマルセセンスグラム-バクテリアエンテンバクタアエルジェネスグラムバクテリアエンテロコッカスマックリーングラム-バクテリアスタフィロコッカスアウレウス臨床的隔離集団1グラム-バクテリアスタフィロコッカスアウレウス臨床的隔離集団2グラム-バクテリアストレプトコッカスピオジーンズグラム-バクテリアストレプトコッカスヴィリダンスグラム-バクテリアリステナモノシトジェネスグラム-バクテリアエンテロコッカスsps.グラム-バクテリアセンディダグラブラタイーストカンディダアルビカンスイーストストレプトコッカスグループCグラムバクテリアストレプトコッカスグループGグラムバクテリアストレプトコッカスグループFグラムバクテリアエンテロコッカスフィーカリスグラムバクテリアストレプトコッカスニューモニエグラムバクテリアスタフィロコカスエピダーニディスC-グラムバクテリアガルデネレラヴァジナリスグラムバクテリアミクロコカスsps.グラムバクテリアハエモフィルスインフルエンザ ゚グラム-バクテリアネイセリアゴノルホエエグラム-バクテリアモラクセラカタラリスグラム-バクテリアサルモネラsps.グラム-バクテリアクラミサトレコマティスグラム-バクテリアペプトストレプトコッカス生成物グラムバクテリアペプトストレプトコッカスアナエローベグラムバクテリアラクトバシルスレンネンタムグラムバクテリアユーバクテリウムレンテュムグラムバクテリアヘルペスシンプレクスヴィルスIウィルスヘルペスシンプレクスヴィルスIIウィルス実施例14:ポリヌクレオチド処理装置の操作者説明書この非限定的実施例では、ユーザ指示の形式で、特に、グループBストレプトコッカスのような微小有機体の定性的検出を含む微小流体PCR分析において用いる微小流体カートリッジを対象として、特許請求する装置、微小流体カートリッジ、キット、方法、及びコンピュータプログラム生産物の種々の実施形態について説明する。グループBストレプトコッチGBSの存在は、1990年代以来敗血症、誕生後の赤ん坊を冒す肺炎、及び骨髄炎の防止が大きく進歩したにも拘わらず、重大な新生児感染の最大の原因であり続けている。GBS検査システムは、膣/直腸サンプルにおけるグループBストレプトコッカスGBSDNAの迅速な定性的検出に用いることができる。使用例及び使用のための指示種々の実施形態では、GBS検査システムは、膣/直腸サンプルにおけるグループBストレプトコッカスGBSDNAのような、臨床サンプルにおける微小有機体の迅速な定性的検出に用いることができる。GBS検査に用いるための典型的な指示には、CDC指針124に記載されているように陣痛中における抗生物質処置の必要性を判断するために、産科患者に対する出産前看護養生における迅速な選別検査が含まれる。この検査は、看護の時点、又は産科患者の分娩中及び分娩後段階における迅速なターンアラウンドサービスを備えた中央検査室において迅速な結果を出すことができる。また、この検査は、GBS感染が疑われるいずれの被験者の膣又は直腸サンプルにおいてGBSDNAを検出するためにも用いることができる。ABurnsBrianNJohnsonSundareshNBrahmasandraKalyanHandiqueJamesRWebsterMadhaviKrishnanTimothySSammarcoPiuMManDarrenJonesDylanHeldsingerCarlosHMastrangeloDavidTBurkeAnIntegratedNanoliterDNAAnalysisDevice一体化ナノリットルDNA分析装置ScienceVol28216October1998も参照のこと。検査アプリケーションの説明疾病管理及び防止センタは、陣痛及び分娩中における予防用抗生物質の必要性を判断するために、妊娠期間35~37週の全ての女性の膣/直腸GBS定着について全般的な出生前診査を推奨する。現在のCDC推奨は、培養に基づく検査方法標準的培養方法であり、通例、48~72時間で結果が得られるが、それと比較して、本検査では約30分で済む。本検査は、CAMP係数をエンコードする、確立した特定シーケンスであるGBSゲノムにおけるcfb遺伝子を特定するために、自動化したサンプル準備及びリアルタイムPCRを利用することができる。CAMP係数は、GBS分離菌内に通例存在する余分な細胞蛋白質である。CAMP係数は、培養方法による臨床サンプルにおけるGBSバクテリアの推定特定に用いることができる。この検査は、実験室の手順にはさほど訓練されていない臨床家によって、患者の近くに設定して行うことができる。GBS検査のために継続して品質保証を行うために、ユーザインターフェースにQCルーチンを組み込むことができる。また、産科が要求する時間枠以内にサンプル検査が行われるのであれば、検査は中央病院のstat実験室で行うこともできる。可能性のある禁忌GBS検査は、被検物収集スワブに含有するポリエステルに対してアレルギのあるヒトには、禁忌を示す場合がある。警告及び注意の例ここの警告は、実施例13に示した一般的な応用のそれらに追加するとよい。GBS検査は、ペニシリンにアレルギがある女性に推奨される罹患性結果を与えない場合がある。IV抗生物質は通例分娩の少なくとも4時間前に開始する必要があり、そして分娩前GBSデータがない状態では、患者が病院の陣痛及び分娩区域に入ったら直ちにサンプルを収集して、GBS検査を開始することが重要となることがある。実施形態によっては、患者が現在抗生物質で治療を受けている場合、検査は疾病状態の指標にしては信頼性が低くなる場合もある。緩衝液は、防腐剤としてアジ化ナトリウムを含有する場合がある。摂取すると、健康被害が出る。通例、サンプリング及び緩衝液内の蓄積から、例えば、8時間以内に被検物を検査する。被検物を保管しなければならない状況では、4Cにおいて24時間までの期間での冷蔵を用いるとよい。通例、有効期限が切れた検査材料の使用を回避する。通例、サンプルを注入する準備ができた後まで、カートリッジの開封を回避する。通例、保護用メタライズバッグを開封した場合、カートリッジの使用を回避する。実施形態によっては、光、空気、及び水分に晒すと、試薬が劣化する可能性がある。通例、検査キットに備えられているスワブ、シリンジ、及び緩衝液を用いる。実施形態によっては、GBS収集スワブの別のブランドでは、検査性能が阻害される可能性がある。通例、材料の使用は1回に限る。材料を再利用すると、誤った結果が得られる場合がある。検査の準備ができるまで、カートリッジのパッケージを開封するのを回避する。内蔵試薬は、光及び水分に感応する可能性がある。パッケージの封止が破れており、箔パウチがもはや伸びない膨れている場合、使用を回避する。サンプル収集キットの例A.スワブB.サンプル収集緩衝液を収容するチューブC.カニューレ先端D.シリンジ例えば、3ccE.シリンジフィルタF.GBS微小流体カートリッジ被検物収集及び緩衝液懸濁指令の例注意:通例、収集キットのみを用いる。スワブの端部に指で触れるのを避ける。容器からスワブを取り出す。過剰な膣分泌物を拭い去る。スワブを2cm膣膣に挿入する。同じスワブを1cm肛門直腸に挿入する。サンプル緩衝液Bの小瓶が期限切れでないことを確認する。スワブAを、緩衝液を収容した小瓶の中に浸漬して20回上下に激しく振る。スワブを取り出し破棄する。患者のID情報を小瓶に記す。検査用サンプル準備の例カニューレ先端CをシリンジDに取り付けることができる。サンプルの一部又は全部をシリンジの中に引き込む。加えて、空気例えば、2mlも引き込んでもよい。カニューレ先端CをフィルタEと交換してもよい。パッケージ上に印されている開封箇所から、カートリッジパッケージを開封することができる。サンプル小瓶B及びカートリッジFのバーコードを、システムスキャナによって走査することができる。材料が期限切れの場合、システムは警告するとよい。必要であれば、患者識別情報を入力することができる。カートリッジを平坦な表面に置くか、ルアーを用いて直立姿勢で平坦に保持する。通例、手順の間カートリッジのラベル側が上向きになっていることを確認する。シリンジ/フィルタアセンブリを用いてサンプル過剰な空気を含むをカートリッジに注入することができる。弱い注入圧力を用いると、サンプルからの跳ね返りを避けることができる。シリンジ/フィルタアセンブリをカートリッジから取り外すことができる。サンプル室内部にあるペレットが溶解し混合するまで、約10回カートリッジを横に軽く揺することができる。カートリッジをシステム上に置くことができる。システムのカバーを閉じ、ハンドルを下方位置で固定することができる検査が自動的に開始してもよい。結果検査が完了したとき、結果を明確に表示するとよい。結果は、実験手順で決定した通りに、印刷又は格納することができる。材料の処分例カートリッジ及び収集キットは、生物的有害物質として扱わなければならない。推奨する実験室品質管理ルーチンの例検査検証の例1週間毎に、1陽性外部対照及び1陰性外部対照を実行することができる。QCを、システムの総合システム性能を確認するように設定する。この手順は、新たなユーザを訓練する場合にも推奨する。品質管理ルーチン指令の例表示画面上で、指令通りに、サンプルを走らせることができる。QC検査で、予期した結果を得ることができなかった場合、製造業者に連絡することができる。外部陽性対照は、実行時にサンプル収集緩衝液によって復元したストレプトコッカスアガラクチエGBS細胞の凍結乾燥標本を含むことができる。外部陽性対照内にあるGBS細胞の数は、検査の最大検出可能限界MDLにほぼ等しくするとよい。また、品質管理検査の例には、実施例14において説明した、システム自己検査QCも含む。内部対照カートリッジ上の例分析用の典型的な試薬は、ユーザの取扱謝りや汚染の潜在性を低減するために、カートリッジに含めるとよい。2種類のカートリッジ上陽性及び陰性対照方策を、各微小流体カートリッジ内に組み込み、個々のPCR分析実施過程を監視することができる。GBS用陽性内部対照プラスミドの一例は、cfb遺伝子からの順方向及び逆方向シーケンスが側面に位置する一意の39bp人工DNAシーケンスから成る96bp領域を含有する二重鎖円形DNA分子であり、この一意のシーケンスに特定的な第2の別個の蛍光原プローブと共に、凍結乾燥マスタミックスに含めることができる。陽性GBSサンプルがない状態で、内部対照シーケンスを増幅できない場合、試薬混合の失敗又は被検物におけるPCRインヒビタの存在を示す可能性がある。GBSDNA検出のためのリアルタイムPCRの例この検査は、臨床サンプルから復元したBGSのcfb遺伝子シーケンスの増幅のために、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応PCRを利用することができる。増幅したDNAの検出には、蛍光原特定Tacman商標プローブを用いることができる。cfb遺伝子は、CAMP係数をエンコードし、GBS分離菌の中に通例存在する拡散可能な細胞外蛋白質を分離する。グループBストレプトコッカスGBS検出検査は、核酸増幅分析の一体型の、原料-サンプル-結果型とするとよい。この分析のための典型的な試薬をカートリッジに含めれば、ユーザの取扱謝りや相互汚染の潜在性を低減することができる。可能な検査制限の例実施形態によっては、検査システムは、膣及び/又は直腸被検物以外の被検物におけるGBSDNAを特定する適格性がない場合がある。例えば、実施形態によっては、尿及び血液の被検物は適していない場合がある。実施形態によっては、抗生物質の治療を受けている患者は、正しいGBS診断が得られない場合もある。実施形態によっては、微生物学者によるバクテリアの直接的な識別に適したGBS培養が、本検査から得られない場合もある。性能特性及び解釈の例妊娠中の女性の10~30に、GBSが定着している。GBS定着のカットオフは、cfb遺伝子シーケンスの増幅によって判定したDNA/サンプルの約1000コピーであると定めれらている。結果の解釈のための判断基準例の適用について、ユーザは図71のフローチャートを参照すること。この場合、問題のターゲットはGBS及びICプラスミドである。可能な妨害物質の例実施形態によっては、尿又は膣分泌物、あるいは粘液が大量に存在すると、検査を妨害する場合がある。ある実施形態では、サンプルの血液、胎便、羊水汚染は、通例、検査を妨害する可能性はない。ある実施形態では、抗生物質以外の薬剤の妨害膣及び直腸分泌物に存在するようなは、この時点では、通例PCRを妨害することは知られていない。結果の解釈及び期待値の例妊娠中の女性の10~30に、GBSが定着している。GBS定着のカットオフは、cfb遺伝子シーケンスの増幅によって判定したDNA/サンプルの約1000コピーであると定められている。PCR反応は、GBS及び内部対照に対して陽性又は陰性として解釈することができる。サンプルが陽性又は陰性か、あるいは不確定か決定するために、論理アルゴリズムを用いてもよい。この中で引用した各引例は、引用したことによりその全体が本願にも含まれることとし、米国特許第6,057,149号、第6,048,734号、第6,130,098号、第6,271,021号、第6,911,183号、第CA2,294,819号、第6,575,188号、第6,692,700号、第6,852,287号、及びカナダ特許出願第CA2,294,819号を含む。以上、本技術の多数の実施形態について説明した。しかしながら、本技術の主旨及び範囲から逸脱することなく、種々の修正が可能であることは言うまでもない。したがって、他の実施形態も、以下の特許請求の範囲に該当するものとする。"