Amira (yazılım)

Amira (telaffuz: Ah-meer-ah), 3B ve 4B veri görselleştirme, işleme ve analiz için bir yazılım platformudur. Thermo Fisher Scientific tarafından Zuse Institute Berlin (ZIB) ile işbirliği içinde aktif olarak geliştirilmekte ve Thermo Fisher Scientific tarafından ticari olarak dağıtılmaktadır.

Bu nedenle, tıbbi yönelimli, çok disiplinli işbirlikçi bir araştırma merkezindeki bir araştırma projesinde yeni bir yazılım sisteminin geliştirilmesine başlanmıştır. Tobias Höllerer'in 1993 sonlarında yeni grafik kitaplığı IRIS Inventor ile edindiği deneyimlere dayanarak, bu kitaplığın kullanılmasına karar verilmiştir. Tıbbi planlama sisteminin geliştirilmesi, daha sonra Amira'nın baş yazılım mimarı olacak olan Detlev Stalling tarafından gerçekleştirilmiştir. Yeni yazılıma "HyperPlan" adı verildi ve başlangıçtaki hedef uygulaması olan hipertermi kanseri tedavisi için bir planlama sistemi vurgulanmıştır. Sistem, o zamanlar üst düzey grafik hesaplama için kullanılan standart iş istasyonları olan Silicon Graphics (SGI) bilgisayarlarında geliştirilmiştir. Yazılım, OpenGL (başlangıçta IRIS GL), Open Inventor (başlangıçta IRIS Inventor) ve grafik kullanıcı arabirimi kitaplıkları X11, Motif (yazılım) ve ViewKit gibi kitaplıklara dayanıyordu. 1998'de X11/Motif/Viewkit, Qt araç seti ile değiştirilmiştir.

HyperPlan çerçevesi, ZIB'de giderek daha fazla projenin temeli olarak hizmet etmiştir. İşbirliği yapan kurumlarda giderek artan sayıda araştırmacı tarafından kullanılmıştır. Projeler tıbbi görüntü hesaplama, tıbbi görselleştirme, nörobiyoloji, konfokal mikroskopi, akış görselleştirme, moleküler analitik ve hesaplamalı astrofizik uygulamalarını içermektedir.

ZIB'nin birincil görevi algoritmik araştırma olduğundan, sistemin artan kullanıcı sayısı, ZIB'nin yazılım dağıtımı ve desteği için ayırabileceği kapasiteleri aşmaya başlamıştır. Bu nedenle, bir yan şirket olan Indeed – Visual Concepts GmbH, yazılımın kapsamlı yeteneklerini dünya çapındaki endüstri ve akademi araştırmacılarının kullanımına sunma ve ürünü sağlama vizyonuyla Hans-Christian Hege, Detlev Stalling ve Malte Westerhoff tarafından kurulmultur. Günümüzün hızlı ve rekabetçi dünyasında ihtiyaç duyulan destek ve sağlamlık getirilmiştir.

Şubat 1998'de HyperPlan yazılımına yeni, uygulamadan bağımsız “Amira” adı verilmiştir. Bu isim bir kısaltma olmayıp, farklı dillerde telaffuz edilebildiği ve uygun bir çağrışım sağladığı için seçilmiştir.

Detlev Stalling ve Malte Westerhoff, yazılımı ticari olarak desteklenebilir bir ürün haline getirmek ve SGI olmayan bilgisayarlarda da kullanılabilir hale getirmek için yazılımın büyük bir yeniden tasarımını üstlenmiştir. Mart 1999'da ticari Amira'nın ilk versiyonu Almanya'nın Hannover kentindeki CeBIT fuarında SGI IRIX ve Hewlett-Packard UniX (HP-UX) stantlarında sergilenmiştir. Bunu takip eden on iki ay içinde Linux ve Microsoft Windows sürümleri izlemiştir. Daha sonra Mac OS X desteği eklenmiştir. Gerçekten – Visual Concepts GmbH, Amira'nın dünya çapındaki distribütörü olarak Bordeaux, Fransa ve San Diego, Amerika Birleşik Devletleri merkezli TGS, Inc.'i seçilmiştir. Sonraki dört yıl içinde beş ana yayın (versiyon 3.1'e kadar) tamamlanmıştır.

2003 yılında hem Indeed – Visual Concepts GmbH hem de TGS, Inc. Massachusetts merkezli Mercury Computer Systems, Inc. (NASDAQ:MRCY) tarafından satın alınmıştır. Mercury'nin daha sonra Visage Imaging olarak adlandırılan yeni kurulan yaşam bilimleri iş biriminin bir parçası olmuştur. 2009 yılında, Mercury Computer Systems, Inc., Visage Imaging'i yeniden üretti ve radyoloji bilgi sistemleri ve tıbbi BT çözümlerinin önde gelen sağlayıcısı olan Melbourne, Avustralya merkezli Promedicus Ltd'ye (ASX:PME) satmıştır. Bu süre boyunca, Amira Berlin, Almanya'da ve hala Amira'nın orijinal yaratıcıları tarafından yönetilen ZIB ile yakın işbirliği içinde geliştirilmeye devam etmiştir. Fransa, Bordeaux'da bulunan TGS, Mercury Computer Systems tarafından bir Fransız yatırımcıya satılmıştır. Ayrıca adı Visualization Sciences Group (VSG) olarak değiştirilmiştir. VSG, aynı kaynak koduna dayanan ancak malzeme bilimleri için özelleştirilmiş Avizo adlı tamamlayıcı bir ürün üzerinde çalışmaya devam etmiştir.

Ağustos 2012'de, o tarihe kadar Amira'nın en büyük OEM satıcısı olan FEI, VSG'yi ve Amira işini Promedicus'tan satın almıştır. Bu, iki yazılım kardeş Amira ve Avizo'yu tekrar bir araya getirmiştir. Ağustos 2013'te Görselleştirme Bilimleri Grubu (VSG), FEI'nin bir iş birimi haline gelmiştir. 2016 yılında FEI, Thermo Fisher Scientific tarafından satın almıştır. Ayırca, 2017 başlarında Malzeme ve Yapısal Analiz bölümünün bir parçası olmuştur.

Amira ve Avizo halen iki farklı ürün olarak pazarlanmaktadır. Yaşam bilimleri için Amira ve malzeme bilimi için Avizo kullanılmaktadır. Ancak geliştirme çabaları şimdi bir kez daha birleştirilmiştir. Bu arada Amira/Avizo yazılımını kullanan bilimsel makale sayısı 10 bin mertebesindedir. Başlangıçta olduğu gibi, Amira yol haritası, dünyanın dört bir yanındaki Amira kullanıcılarının, genellikle alanlarında öncü olan, yanıtlamaya çalıştıkları zorlu bilimsel sorular tarafından yönlendirilmeye devam etmektedir.