2041 मंशीर 1–16 सम्म पाँचौं महाधिवेशन भयो । महाधिवेशनले मोहन बिक्रमको सारसंग्रहवादी कार्यदिशा पास ग¥यो । तर यौन काण्डका कारण महाधिवेशनमा व्यापक बहस भई उनलाई हलबाट कार्वाही गरी बाहिर निकालियो । महाधिवेशनमा क. प्रचण्डद्घारा मोहन विक्रममा सैद्धान्तिक विचलन रहेको प्रतिवेदन प्रस्तुत भयो । महाधिवेशनले मोहन वैद्य लाई महामन्त्रीमा निर्वाचित ग¥यो । 2042 सालमा पाँचौं महाधिवेशनबाट निर्वाचित 17 जना केन्द्रीय सदस्यमध्ये 4 जनलाई लिएर मोहन बिक्रमले ने.क.पा. गठन गरे 2043 सालमा यसको सम्मेलन गरे । 2043 सालमा ने.क.पा. को तर्फबाट काठमाण्डौंका प्रहरी विटमा आक्रमण र पोष्टर टाँस्ने काम भयो, जुन घटनामा पार्टीका धेरै कार्यकर्ता गिरफ्तार परे र पार्टीलाई गम्भीर क्षति पुग्यो । जुन घटनालाई सेक्टरकाण्ड भनिन्छ । सेक्टरकाण्डमा पार्टीको योजना असफल भएपछि मोहन वैद्यले महामन्त्रीबाट राजीनामा दिए । 2045 सालमा ने.क.पा. को सम्मेलनले प्रचण्डलाई महामन्त्रीमा निर्वाचित ग¥यो र माओवाद पास ग¥यो । साथै दीर्घकालीन जनयुद्धको कार्यदिशा समेत पास ग¥यो । 2046 सालको जनआन्दोलनमा ने.क.पा., ने.क.पा., सर्वहारा श्रमिक सङ्गठन, ने.क.पा. लगायत मिलेर संयुक्त जनआन्दोलन संयोजन समिति बन्यो ।