El Colegio de la Compañía de Villagarcía fue fundado, bajo el amparo de San Francisco de Borja, por doña Magdalena de Ulloa hacia 1571, viuda de don Luis Méndez Quijada, mayordomo de Carlos V y ayo de don Juan de Austria que se crió en el castillo del lugar. La iglesia es de estilo escurialense, construida en piedra durante el último tercio del siglo XVI, fue iniciada en 1571 con planos de Rodrigo Gil de Hontañón y comenzada por Juan de la Vega, aunque en 1575 Pedro de Tolosa cambió el proyecto abandonando el estilo tardogótico inicial por el clasicista. También intervino en el Colegio el hermano italiano Giuseppe Valeriani. Se convirtió en uno de los prototipos españoles jesuíticos.
Tiene planta de una nave dividida en cinco tramos por arcos peraltados encasetonados de medio punto y pilastras corintias, con capillas-hornacinas entre contrafuertes comunicadas entre sí e iluminación por huecos termales. Se cubre con bóveda de cañón con lunetos decorada con yeserías placadas y con puntas de diamante y con cúpula vaída sobre pechinas en el crucero. La reja y el púlpito son obra de Juan Tomás Celma y Diego de Roa. El presbiterio se levanta sobre la cripta de los fundadores cuyos relieves funerarios se disponen en sendos nichos laterales del mismo, obra de Cristóbal Ruiz de Andino (1672). El retablo mayor, clasicista, con traza, esculturas y relieves de alabastro, es obra de Juan Sáenz de Torrecilla (1579). Capillas con retablos barrocos del siglo XVII, la mayoría de Juan de Medina Argüelles. A los pies se eleva el coro-tribuna en alto, sobre triple arquería con pilastras corintias. El acceso se produce por la fachada principal, desornamentada como lo escurialense, de tres calles, con puerta adintelada rematada por frontón curvo como la ventana superior y decoración de bolas. Detrás del presbiterio se sitúa la sacristía, de cuatro tramos y con yeserías clasicistas. A los pies del templo se abre la capilla del relicario, fundada por doña Inés de Salazar y Mendoza y obra de Francisco Naveda (h. 1660) con un importante conjunto de retablos, esculturas y bustos barrocos, de maestros como C. Ruiz de Andino, Tomás de Sierra y Antonio de la Peña.
Subsisten otras dependencias barrocas de los siglos XVII y XVIII, como la capilla y sacristía de Novicios, estancias, etc., en las que se ha instalado un museo con objetos y sobre temas jesuíticos y de los mecenas fundadores, como de la antigua imprenta y las banderas de la batalla de Lepanto. Se conservan una fuente y acueducto, el estanque y una capilla.
Bibliografía: J.J. MARTIN GONZALEZ, "La Colegiata de Villagarcía de Campos y la arquitectura herreriana", B.S.A.A., Universidad de Valladolid, 1957; E. GARCIA CHICO, Catálogo monumental de la provincia de Valladolid. Partido judicial de Medina de Rioseco, Valladolid, 1959; P. Pirri, Giusseppe Valeriano S.I. Architetto Pittore, 1542- 1596, Roma, 1970; A. BUSTAMANTE GARCIA, La arquitectura clasicista del foco vallisoletano (1561-1640), Valladolid, 1983.