Se encuentra en tierras orientales de la provincia de Burgos, en el vallejo que hace el río Mataviejas en estribaciones de la Sierra de las Mamblas.
Zona de eremitismo, hubo un cenobio ya en época prerrománica, cuyos restos arqueológicos se conocen. Era el monasterio de San Sebastián de Silos, que recibió en el año 954 gran ayuda del conde Fernán González, siguiendo pronto la regla benedictina. No florecía demasiado el monasterio pues hacia el año 1040, según Berceo, "era tan caído que se quería ermar…". Encontró pronto su prestigio teniendo al frente durante el siglo XI un hombre notable, el abad Domingo, procedente de Cañas y antiguo prior de San Millán de la Cogolla. Habiendo prestigiado al monasterio, en el año 1073 murió con fama de virtuoso el abad Domingo, cuyo sepulcro fue visitado devotamente hasta el punto de ser cambiado el nombre del santuario por el de Santo Domingo de Silos.
Su sucesor, el abad Fortunio, acometió la construcción de un templo románico más grande, consagrado el año 1088, que hay que suponer semejante al vecino y coetáneo de Arlanza, con tres naves y sus correspondientes capillas. Después se construiría el claustro, progresivamente. Reformas posteriores han modificado algunas estancias y, sobre todo, reemplazado la iglesia. Así, en 1596 se hizo una nueva sacristía; en los años 1732-3 fue erigida una Capilla de Santo Domingo, para la veneración de su sepulcro. Por fin, en los años 1751-92 se sustituyó el templo románico por una obra sobria realizada por Antonio Machuca siguiendo planos de Ventura Rodríguez.
Con la guerra de la Independencia y la Desamortización sufrió incomodidades y serias pérdidas en el patrimonio. Pero reincorporada una comunidad benedictina en el año 1880 ha reverdecido el desarrollo cultural y patrimonial.
Más que las dependencias, interesa el famoso claustro románico, con capiteles de fina labra en motivos geométricos, vegetales y figurativos, así como con relieves en los machones angulares cuyo estilo románico concluye en los más tardíos ejemplos de la Anunciación y el Árbol de Jessé en animaciones protogóticas tempranas.
Conserva en sus dependencias y en el Museo piezas prerrománicas, códices, miniaturas, piezas de platería, cuadros, el famoso frontal con esmaltes, cerámicas de farmacopea, etc. de gran interés. En la barroca capilla del Santo, sobre su urna, hay tres coronas de plata enviadas desde Perú por voluntad del benedictino siliense fray Juan Vítores de Velasco, obispo de Trujillo, fallecido en 1713.
AUTOR: S. ANDRÉS ORDAX.
BIBLIOGRAFÍA: PALACIOS, Mariano, YARZA LUACES, Joaquín, y TORRES, Rafael: El Monasterio de Santo Domingo de Silos. León, 1973; CRUZ, Fr. Valentín, IBÁÑEZ, Alberto Cayetano, y SAN VALENTÍN, Luis: BURGOS-3. Viaje por la Provincia de Burgos tras el conocimiento y disfrute de su paisaje, historia, arte y gastronomía. Burgos, 1989, p. 84; ANDRÉS ORDAX, Salvador: La provincia de Burgos. Ediciones Lancia. Madrid, 1991, pp. 104-6; ANDRÉS ORDAX, Salvador; ZALAMA RODRÍGUEZ, Miguel Ángel; y ANDRÉS GONZÁLEZ, Patricia: Monasterios de Castilla y León. Edilesa y Junta de Castilla y León. León, 2002; Silos. Un Milenio. Studia Silensia. Burgos, 2003; Enciclopedia del Románico en Castilla $y$ León. Burgos. Tomo IV, pp. 2539-2600.