Rikunarita-ORG/Wikinium huggingface dataset:
# 史蒂芬·古爾德[编辑]

| 史蒂芬·杰伊·古尔德 Stephen Jay Gould |
| --- |
| 出生 | (1941-09-10)1941年9月10日  美国紐約州紐約市皇后區 |
| 逝世 | 2002年5月20日(2002-05-20)（60歲）  美国紐約州紐約市曼哈頓 |
| 母校 | 安提亚克学院、哥伦比亚大学 |
| 奖项 | 倫敦林奈學會的达尔文-华莱士奖章 (2008) 古生物学会奖章 (2002) 舒克特奖章 (1975) |
| **科学生涯** |
| 研究领域 | 古生物学、进化生物学、科学史 |
| 机构 | 哈佛大学、美國自然歷史博物館、纽约大学 |
|  |
| 签名 |
|  |

**史蒂芬·杰伊·古爾德**（英語：Stephen Jay Gould，1941年9月10日—2002年5月20日）是一名美國古生物學家、演化生物學家，科學史學家與科普作家，職業生涯中大多在哈佛大學擔任教職，並曾在紐約的美國自然史博物館工作。

## 生平

古爾德出生於紐約市皇后區，父親倫納德為法庭速記員，母親埃利諾是個藝術家。古爾德五歲時，他父親帶他到美國自然史博物館的恐龍廳參觀，這是他最早接觸到暴龍的時刻。

## 科學研究

古尔德早期研究的对象是百慕大地区的蜗牛。1972年，他和纽约美国自然史博物馆的尼爾斯·艾崔奇（Niles Eldredge）共同提出“间断平衡”（英語：Punctuated Equilibrium）进化理论，由此享誉全球。“间断平衡”理论认为，生物的进化并不像达尔文所认为的那样，是一个缓慢的渐变积累的过程；而是长期的稳定甚至不变与短暂的剧变交替的过程，从而解释了化石在地层中为什么会有许多空缺之处。

古尔德是一位忠实的达尔文主义者，他认为达尔文理论的核心是自然选择，而不是生存竞争或生物渐变论。从他的作品中可以看出，他非常推崇自然选择在生物进化中的作用，尤其难能可贵的是，他也承认，自然选择不是唯一答案，而是最重要的答案。

## 科普寫作

古尔德的另一杰出贡献并不是提出什么理论，而是他写出了大量的科普作品，令世人对古生物学产生兴趣。没有人关注的科学是没有生命力的科学，古尔德的科普文章给予了古生物学持续的生命动力。古尔德文笔流畅、学识渊博，不仅向读者解释自然现象，而且讲述自然现象所引出的思考及其对人类社会的影响，他对科学的反思相当深刻，对社会曲解科学理论进行了尖锐的批判。他的主要科普作品有《千禧年》、《自达尔文以来》（臺譯：《達爾文大震撼》）、《熊猫的拇指》、《奇妙的生命》（臺譯：《壮丽的生命》）等。

## 延伸閱讀

* 米爾斯基（Steve Mirsky）. 古爾德與世長辭（Stephen Jay Gould, 1941–2002）. 科學人中文版. 2002年10月, **8**. ISSN 1682-2811.  內容節錄（页面存档备份，存于互联网档案馆）

* The Unofficial Stephen Jay Gould Archive（页面存档备份，存于互联网档案馆）
* Excerpts from Gould Lectures at Stanford University（页面存档备份，存于互联网档案馆）
* Richard C. Lewontin sums up Gould's career in an obituary（页面存档备份，存于互联网档案馆）
* "Darwinian Fundamentalism"（页面存档备份，存于互联网档案馆） - Gould's response to Daniel Dennett and other critics
* "The Median Isn't the Message" - Gould confronts the statistics of cancer and finds hope
* Online audio interview with Gould - Ann Online
* McLean v. Arkansas Creationism Trial（页面存档备份，存于互联网档案馆） - Plaintiff's transcript of Gould's testimony
* *World of Genetics* on Stephen Jay Gould（页面存档备份，存于互联网档案馆） - biographical information
# 奇妙的生命[编辑]

| 奇妙的生命 |
| --- |
| 作者 | 史蒂芬·古爾德  |
| 語言 | 英语  |
| 主题 | 生命史  |
| 类型 | 随笔  |
| 出版資訊 |
| 出版机构 | w·W·诺顿公司  |
| 出版時間 | 1989年  |
| 出版地點 | 美國  |
| 頁數 | 347、524  |
| 系列作品 |
| 前作 | An Urchin in the Storm  |
| 續作 | Bully for Brontosaurus  |
| 權威控制 |
| OCLC | 18983518 |

《**奇妙的生命：布尔吉斯页岩中的生命故事**》（英語：Wonderful Life: The Burgess Shale and the Nature of History）是一本史蒂芬·古爾德创作的科普图书，1989年由W·W·诺顿公司出版，介绍了生命史和伯吉斯頁岩，获得1991年的英国皇家学会科学图书奖和1990年的普立茲非小說獎提名。

* *Wonderful Life* （页面存档备份，存于互联网档案馆） - by Stephen Jay Gould
* The Cambrian "Explosion": Slow-fuse or Megatonnage? （页面存档备份，存于互联网档案馆） - by Simon Conway Morris
* The disparity of the Burgess Shale arthropod fauna and the limits of cladistic analysis - by Stephen Jay Gould
# 休厄尔·赖特[编辑]

| Sewall Wright |
| --- |
| 出生 | (1889-12-21)1889年12月21日 美国马萨诸塞州梅尔罗斯 |
| 逝世 | 1988年3月3日(1988-03-03)（98歲） 美国威斯康星州麦迪逊市 |
| 母校 | Lombard College 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校 哈佛大学 (Sc.D., 1915) |
| 知名于 | 决定系数 群体遗传学 Causal graph F-statistics Fixation index Fitness landscape Genetic rescue 遗传漂变 Inbreeding coefficient Path analysis Shifting balance theory Threshold model |
| 奖项 | 丹尼尔·吉罗·艾略特奖章（1945年） Weldon Memorial Prize（1947年） 金伯遗传学奖（1956年） 美国国家科学奖章（1966年） 達爾文獎章（1980年） 托马斯·亨特·摩根奖章（1982年） 巴尔赞奖（1984年） 皇家学会外籍院士（1963年） |
| **科学生涯** |
| 研究领域 | 遗传学 |
| 机构 | 芝加哥大学 (1926–1954) 威斯康星大学 (1955–1960) |
| 博士導師 | 威廉·欧内斯特·卡斯尔 |
|  |

**休厄尔·格林·赖特**（英語：Sewall Green Wright，1889年12月21日—1988年3月3日），美国遗传学家，在遗传理论的发展中做出了重要的贡献，与罗纳德·费希尔和约翰·伯顿·桑德森·霍尔丹并列为群体遗传学的奠基者。
# 北美锄足蟾科

| 北美锄足蟾科 |
| --- |
|  |
| 哈蒙旱掘蟾
 |
| 科学分类  |
| 界： | 动物界 Animalia |
| 门： | 脊索动物门 Chordata |
| 纲： | 两栖纲 Amphibia |
| 目： | 无尾目 Anura |
| 亚目： | 中蛙亞目 Mesobatrachia |
| 科： | **北美锄足蟾科 Scaphiopodidae** Cope, 1865 |
| 属
 |
|
见正文

 |
|  |
| 北美锄足蟾科分布
 |

**北美锄足蟾科**（学名：*Scaphiopodidae*），又称**掘足蟾科**，是两栖纲无尾目的一科，分布于加拿大南部、美国、墨西哥等地，共包含7个物种。这一科属锄足蟾科，现已从中分出。

北美锄足蟾与大多掘地蛙类的形态类似，体型圆润、四肢短小、眼睛突出。足部有坚硬的角蛋白凸出物，用来帮助它们掘地。

当北美锄足蟾不在地底时则是陆栖的。它们身上的颜色暗淡，通常呈灰色、暗绿或棕色，这使得它们能够在栖息地中隐藏自己。

北美锄足蟾為了避免水分散失，平時都躲在地底，下雨的季節才會出來繁殖。

## 下级分类

本科包括以下属：

* †*Prospea* Chen et al., 2016

	+ *Prospea holoserisca* Chen, Bever, Yi & Norell, 2016
* 掘足蟾属 *Scaphiopus* Holbrook, 1836
* 旱掘蟾属 *Spea* Cope, 1866

## 参考资料
# 无肺螈科[编辑]

| 无肺螈科 |
| --- |
|  |
| 细蜥尾螈 *Batrachoseps attenuatus* |
| 科学分类  |
| 界： | 动物界 Animalia |
| 门： | 脊索动物门 Chordata |
| 纲： | 两栖纲 Amphibia |
| 目： | 有尾目 Urodela |
| 亚目： | 蠑螈亞目 Salamandroidea |
| 科： | **无肺螈科 Plethodontidae** Gray, 1850 |
| 亞科
 |
|
脊口螈亚科 Desmognathinae
无肺螈亚科 Plethodontinae

 |
|  |

**无肺螈科**是蠑螈中最大、多樣性最豐富的一科，約有400種。分布於溫帶、亞熱帶和熱帶地區，是唯一分布於熱帶的蠑螈。除了5種*Speleomantes*屬分布於義大利和一種*Karsenia*屬分布於韓國以外，所有種類的无肺螈都分布於西半球。

肋骨間溝明顯。無肺部構造，完全使用皮膚進行氣體交換。身體纖細，四肢短小。通常有背部條紋。

成年無肺蝾螈有四肢，前肢有四個腳趾，後肢通常有五個腳趾。在許多物種中，交配和繁殖只發生在陸地上。因此，許多物種也缺乏水生蝌蚪階段，這種現象被稱為直接發育，其中後代孵化為完全成型的微型成體。水生幼體階段的進化喪失與繁殖對水生生境的依賴性降低有關。這種限制的解除允許在廣泛的陸地棲息地內進行廣泛的殖民化和多樣化，這使無肺螈高度成功擴散。

許多物種都有長舌頭和舌骨，它們可以高速發射與身體長度幾乎一樣的舌頭來捕獲獵物。

## 分類

### 脊口螈亚科 Desmognathinae Gray, 1850

* 脊口螈属 *Desmognathus* Baird, 1850
* 深口螈属 *Phaeognathus* Highton, 1961

### 无肺螈亚科 Plethodontinae Gray, 1850

* 攀螈属 *Aneides* Baird, 1851
* 蜥尾螈属 *Batrachoseps* Bonaparte, 1839
* 游舌螈属 *Bolitoglossa* Duméril, Bibron and Duméril, 1854
* 缓螈属 *Bradytriton* Wake and Elias, 1983
* 膜螈属 *Chiropterotriton* Taylor, 1944
* 克利普托螈屬 *Cryptotriton* García-París and Wake, 2000
* 丛螈属 *Dendrotriton* Wake and Elias, 1983
* 剑螈属 *Ensatina* Gray, 1850
* 河溪螈属 *Eurycea* Rafinesque, 1822
* 泉螈属 *Gyrinophilus* Cope, 1869
* 瞎螈属 *Haideotriton* Carr, 1939
* 半趾螈属 *Hemidactylium* Tschudi, 1838
* 穴螈属 *Hydromantes* Gistel, 1848
* *Isthmura* Dubois & Raffaelli, 2012

	+ *Isthmura bellii* (Gray, 1850)
	+ *Isthmura boneti* (Alvarez & Martín, 1967)
	+ *Isthmura corrugata* Sandoval-Comte, Pineda-Arredondo, Rovito & Luría-Manzano, 2017
	+ *Isthmura gigantea* (Taylor, 1939)
	+ *Isthmura maxima* (Parra-Olea, García-París, Papenfuss & Wake, 2005)
	+ *Isthmura naucampatepetl* (Parra-Olea, Papenfuss & Wake, 2001)
	+ *Isthmura sierraoccidentalis* (Lowe, Jones & Wright, 1968)
* *Ixalotriton* Wake and Johnson, 1989
* 韓國螈屬 *Karsenia* Min, Yang, Bonett, Vieites, Brandon and Wake, 2005
* 条螈属 *Lineatriton* Tanner, 1950
* 南螈属 *Nototriton* Wake and Elias, 1983
* 夜色螈属 *Nyctanolis* Elias and Wake, 1983
* 板足螈属 *Oedipina* Keferstein, 1868
* 儒螈属 *Parvimolge* Taylor, 1944
* 无肺螈属 *Plethodon* Tschudi, 1838
* 涓螈属 *Pseudoeurycea* Taylor, 1944
* 土螈属 *Pseudotriton* Tschudi, 1838
* 擬穴螈屬 *Speleomantes* Dubois, 1984
* 合颌螈属 *Stereochilus* Cope, 1869
* 索里螈属 *Thorius* Cope, 1869

## 參考

* Plethodontidae. *ITIS*.
# 核苷酸[编辑]

核苷酸單體的結構。該核苷酸包含：(一)一個五碳醣為脫氧核糖，(二)一個含氮鹼基為腺嘌呤，(三)一個磷酸基。具體來說，脫氧核糖和腺嘌呤組成一個脫氧核糖核苷，再與一個磷酸基團結合成一種去氧核糖核苷酸（DNA的核苷酸成分），或名去氧腺苷單磷酸。
**核苷酸**（英語：nucleotide）为一种**核苷磷酸**（nucleoside phosphate），是核苷中戊糖分子的碳原子上的羟基与一分子磷酸缩合脱水形成的磷酸酯，若无特别指明，一般指**5′-核苷酸**。

核苷酸是核酸的基本组成单位，化学结构属于一种磷酸酯。核苷酸由核碱基（嘌呤或嘧啶）、戊糖（核糖或脱氧核糖）及磷酸三种物质构成，即以一個含氮鹼基為核心，加上一個五碳醣和一個或者多个磷酸基團組成。

核苷酸根据“连接的磷酸基团数目”可分为：**核苷一磷酸**（nucleoside monophosphate，NMP）、**核苷二磷酸**（nucleoside diphosphate，NDP）和**核苷三磷酸**（nucleoside triphosphate，NTP）；或是根据“磷酯键的连接部位（C-2′、C-3′或C-5′羟基氧原子）”可以分为：2′-核苷酸、3′-核苷酸和5′-核苷酸。机体内常见的是5′-核苷酸。

核碱基（含氮碱基）有五种，分别是腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）和尿嘧啶（U）。戊糖（五碳糖）为去氧核糖者称为去氧核糖核苷酸（DNA的單體），五碳糖为核糖者称为核糖核苷酸（RNA的單體）。

核苷酸的結構。常見的核酸成分的結構元素。因為它們包含至少一個磷酸基團，該化合物標記為單磷酸核苷，二磷酸核苷和三磷酸核苷全都是核苷酸(不是簡單磷酸鹽缺乏核苷)。
依核苷酸数量，又分为寡核苷酸（少于或等于15个核苷酸）和多核苷酸（15个核苷酸以上）。许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能，如与能量代谢有关的腺苷三磷酸（ATP）、脱氢辅酶等。

## 合成

核苷酸可以通過多種體外（In vitro）和體內（In vivo）方法來合成。

在體內，核苷酸可以從頭合成（De novo synthesis）或补救途径（Salvage pathway）合成。在從頭合成中使用碳水化合物和胺基酸的代謝产物作为合成前體。肝臟是從頭合成核苷酸的主要器官。嘧啶和嘌呤的从头合成遵循两个不同的途径。嘧啶首先从细胞质中的天冬氨酸和胺基甲酰-磷酸合成到共同的前体环结构乳清酸，其上磷酸化的核糖基单元共价连接，而嘌呤首先从发生环合成的糖模板合成。作为参考，嘌呤和嘧啶核苷酸的合成由细胞的细胞质中的几种酶进行，而不在特定的细胞器内。核苷酸经历分解，使得有用的部分可以在合成反应中重复使用以产生新的核苷酸。

## 作用

几乎所有的食品都含有微量的核苷酸以及其结合物聚核苷酸、DNA、RNA等核酸。

### 核糖核苷酸

|  |  |  |
| --- | --- | --- |
|  單磷酸腺苷 AMP
 |  二磷酸腺苷 ADP
 |  三磷酸腺苷 ATP
 |
|  單磷酸鳥苷 GMP
 |  二磷酸鳥苷 GDP
 |  三磷酸鳥苷 GTP
 |
|  單磷酸胸苷 TMP
 |  二磷酸胸苷 TDP
 |  三磷酸胸苷 TTP
 |
|  单磷酸尿苷 UMP
 |  二磷酸尿苷 UDP
 |  三磷酸尿苷 UTP
 |
|  單磷酸胞苷 CMP
 |  二磷酸胞苷 CDP
 |  三磷酸胞苷 CTP
 |

### 脫氧核糖核苷酸

|  |  |  |
| --- | --- | --- |
|  單磷酸脫氧腺苷 dAMP
 |  二磷酸脫氧腺苷 dADP
 |  三磷酸脫氧腺苷 dATP
 |
|  單磷酸脫氧鳥苷 dGMP
 |  二磷酸脫氧鳥苷 dGDP
 |  三磷酸脫氧鳥苷 dGTP
 |
|  單磷酸脱氧胸苷 dTMP
 |  二磷酸脱氧胸苷 dTDP
 |  三磷酸脱氧胸苷 dTTP
 |
|  單磷酸脫氧尿苷 dUMP
 |  二磷酸脫氧尿苷 dUDP
 |  三磷酸脫氧尿苷 dUTP
 |
|  單磷酸脫氧胞苷 dCMP
 |  二磷酸脫氧胞苷 dCDP
 |  三磷酸脫氧胞苷 dCTP
 |

## 利用

### 调味料

鸟苷酸（GMP）、肌苷酸（IMP）等核苷酸属于呈味性核苷酸，除了本身具有鲜味之外，还有和左旋穀氨酸（味精）组合时，有提高鲜味的作用，作为调料、汤料的原料使用。

### 食品添加剂

母乳中含有尿苷酸（UMP）、胞苷酸（CMP）、腺苷酸（AMP）、鸟苷酸（GMP）、肌苷酸（IMP）等多种核苷酸，为提高婴儿的免疫调节功能和记忆力发挥着作用，部分婴儿奶粉按照母乳中的含量有添加微量核苷酸，也有添加RNA的例子。

### 医疗

核苷酸作为医药，可抑制尿道發炎，也有作为免疫调节剂给手术后的患者使用的例子。

## 註釋

* 譯名：國家教育研究院雙語詞彙、學術名詞暨辭書資訊網[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆）。

## 延伸閱讀

* Sigel, Astrid; Operschall, Bert P.; Sigel, Helmut. Chapter 11. Complex Formation of Lead(II) with Nucleotides and Their Constituents. Astrid, S.; Helmut, S.; Sigel, R. K. O. (编). Lead: Its Effects on Environment and Health. Metal Ions in Life Sciences **17**. de Gruyter. 2017: 319–402. doi:10.1515/9783110434330-011.

* Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and their Constituents （页面存档备份，存于互联网档案馆） (IUPAC)
* Provisional Recommendations 2004 (IUPAC)
* Chemistry explanation of nucleotide structure
# 转录组[编辑]

**转录组**（transcriptome）又称**转录物组**，广义上，指在相同环境（或生理条件）下的一套基因组（一个细胞、一群细胞、组织或生物体中）所能转录出的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA。

转录组，狭义上，则特指细胞所能转录出的所有信使RNA（mRNA）。

## 范围

這個術語可用於記錄總集在給定的有機體，或對特定子集的成績單呈現在特定的細胞類型。與基因組不同的是：不考虑突變，在固定給定細胞株的基因組數量基本上是不變的；然而，轉錄物組可以隨外部環境條件而有所轉變。由於轉錄物組包括了所有在細胞裡的mRNA的轉錄 ，除卻異常的mRNA降解現象（例如轉錄衰減）以外，轉錄組反映了在任何給定時間內活躍表達的基因。轉錄物組學的研究，也被稱為“基因表達譜”，檢測了在一個特定的細胞群內的mRNA表達水平，通常採用基於DNA微阵列技術的高通量技術。透過使用新一代測序技術來研究在核苷酸水平的轉錄物組，被稱为“RNA测序（RNA-Seq）”。

## 转录组学

轉錄组學（或“转录物组学”）是分子生物學的分支，負責研究在單個细胞，或特定类型的細胞，组织，器官或发育阶段的细胞群內所生產的各类RNA（通常是mRNA）分子的类型和数量。

转录组测定的是在某个特定样品里表达的基因的丰度及其类型（例如可变剪接）。每个细胞里每一种mRNA分子的平均数称为该种mRNA的丰度。根据丰度可把mRNA群体分为两大类：

1. 高丰度mRNA组分。通常由每个细胞里不到100种的mRNA而每种mRNA分子由1000-10,000份拷贝所组成，通常占总mRNA的50%左右。
2. 除高丰度mRNA组分外，另一半mRNA由长度不等的种类繁多的序列所组成，每种序列在mRNA中只有少量备份。称为“稀有mRNA”或“复杂mRNA”。

大量表达的基因之间是有很大区别的。例如，卵清蛋白只在输卵管细胞里合成而不在肝脏内合成。它占输卵管内mRNA总量的一半。但是高丰度的mRNA只占表达基因数的很小一部分。根据生物体的基因数目以及不同类型细胞出现转录变化的基因数，人们需要了解不同表型细胞稀有mRNA基因相同的程度。

稀有mRNA是普遍共有的。一个细胞中的mRNA序列只有10%左右是该细胞独有的，大部分序列是许多（甚至是所有）类型的细胞所共有的。这提示哺乳动物中共有的基因数也许达10,000个，包括了各种类型细胞所需的功能。编码这种类型的功能的基因，有时被称为“持家基因”或“组成型基因”。这类功能不同于特定细胞表现型所需的特定功能（例如卵清蛋白或珠蛋白的功能）。编码特殊功能的基因称为“奢侈基因”。

## 分析

许多生物特异性转录组数据库已经被构建并被注释了，以帮助鉴定在不同细胞群中差异表达的基因。

RNA测序(RNA-seq)正在出现（2013年）作为测量生物体转录组的首选方法，尽管仍在使用旧的DNA微阵列技术。

## 应用

干细胞和癌细胞的转录是那些寻求了解细胞分化和癌变的过程的研究人员特别感兴趣。

分析人类卵母细胞和胚胎的转录组用于了解控制早期胚胎发育的分子机制和信号通路，理论上可以成为在体外人工受精中进行适当胚胎选择的有力工具[1]。

转录物组学是一个新兴的和不断增长的领域，把生物标记发现用于评估药物的或化学品的安全性风险评估。

转录组也可用于个体之间的使用转录组学数据进行推断系统发育关系。

## 与蛋白质组的关系

转录组可以被视为蛋白质组的前体，即由基因组表达的整组蛋白质。

然而，相对mRNA表达水平的分析可能因以下事实而变得复杂：mRNA表达的相对小的变化可以在细胞中存在的相应蛋白质的总量中产生大的变化。 一种分析方法，称为基因集富集分析，识别协同调节的基因网络(coregulated gene networks)，而不是在不同细胞群中被上调或下调的单个基因[2]。

## 參见

* 基因表达谱
* 生物信息学
* DNA微阵列（比较常用的名字是基因芯片）
* 基因表达
* RNA-Seq
* 转录组学
* 代谢物组学
* 蛋白质组
* 功能基因组学

## 參考文献

1. **^** Subramanian A, Tamayo P, Mootha VK, Mukherjee S, Ebert BL, Gillette MA, Paulovich A, Pomeroy SL, Golub TR, Lander ES, Mesirov JP. Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles.. *Proc Natl Acad Sci USA*. 2005, **102** (43): 15545–15550 （英语）.
2. **^** RIKEN Genome Exploration Research Group and Genome Science Group (Genome Network Project Core Group) and the FANTOM Consortium: S. Katayama; et al. Antisense Transcription in the Mammalian Transcriptome. *Science. Sep 2, 2005, **309** (5740): 1564–1566 （英语）.*
3. **^** Velculescu VE, Zhang L, Zhou W, Vogelstein J, Basrai MA, Bassett DE Jr, Hieter P, Vogelstein B, Kinzler KW. Characterization of the yeast transcriptome.. Cell. Jan 24, 1997, **88** (2): 243–251 （英语）.
4. **^** Laule O, Hirsch-Hoffmann M, Hruz T, Gruissem W, and P Zimmermann. Web-based analysis of the mouse transcriptome using Genevestigator.. BMC Bioinformatics. 2006, **7**: 311 （英语）.
# 定向選擇[编辑]

**定向選擇**(Directional selection)是天擇的一種形式。

對於一種特徵(性狀)的不同狀態而言，因為不同狀態帶給生物體的適應度(適存度, fitness)有差異，其中一種狀態的適應度較高，具有此狀態的有利個體就能產生較多的子代，造成此狀態的等位基因(allele)便傾向於在族群中增加，並漸漸取代其他等位基因，此過程即稱為定向選擇。

假設，影響一特徵/性狀的等位基因有A1與A2兩種，如果同型合子A1A1的適應度最高，而異型合子A1A2適應度中等，A2A2適應度最低（ω11>ω12>ω22, ω代表適應度），在天擇的影響下，保留A1、並淘汰A2的過程就是定向選擇。若環境維持穩定，A1基因所代表的性狀持續帶給此物種較高的適應度，「有利的」A1基因隨著時間而漸漸散佈到整個族群，基因頻率提高，最後達到穩固(fixation)。

接續上例，適應度較低的A2基因可能會完全消失於族群中，此過程可稱為淨化選擇(purifying selection)。對於一個突變的新基因型，而受到定向選擇而被保留，可稱為正向選擇；反之，有害的基因受到淘汰稱為負向選擇。依照討論的例子，有時負向選擇與淨化選擇意義相同。

定向選擇與平衡選擇(balancing selection)相反，前者只保留有利的基因型，後者會傾向於保留多種基因型。值得考慮的是，不同的環境可能偏好不同的基因型，因此一個等位基因有利或有害，需要參考生物族群的生活環境才能決定。

定向選擇造成的基因頻率變化，由相對的適應度決定，並不會因為此基因是顯性或隱性而受影響。雖然說，被保留的基因達到穩固的時間，會因為此基因是顯性或隱性而有差異：若有利的基因是隱性，則在起始基因頻率很低的狀況下，只有很少的個體是隱性同型合子、很少個體表現出較高的適應度，因此需要累積很多世代才能增加基因頻率。

以族群遺傳學的方法，比較兩世代之間的基因頻率是否有變化，可以推知此基因所影響的性狀是否正在受到天擇的作用。

* Futuyma, D. J. (2009). Evolution (Sunderland, MA USA: Sinauer Associates, Inc.).

* 動物學名詞譯名
# 蛋白酶[编辑]

蛋白酶的所催化的反应
TEV蛋白酶的结构，其中红色的为催化三联体
**蛋白酶**（protease，proteinase）又称**肽酶**（peptidase）、**蛋白水解酶**（proteolytic enzyme）或**蛋白質分解酶**，是生物體內一類催化蛋白質或肽类中肽键水解的酶（酵素），可以將蛋白質分解成較小的多肽或單一氨基酸，並促進新蛋白質產物的形成。

尽管国际生物化学和分子生物学联盟命名委员会认为蛋白酶与肽酶为同义词，仍有些学者定义两者不同，例如：蛋白酶是内肽酶，或是认为“蛋白酶”为能够水解蛋白质分子内部的肽键，而“肽酶”只能从肽类末端的水解，每次水解释放一个氨基酸，其又分为：氨肽酶，羧肽酶。

蛋白酶參與多種生物途徑，包括消化攝取的蛋白質、蛋白質分解（舊蛋白質的分解）和细胞信号传送。

如果沒有功能性加速劑，蛋白水解過程將非常緩慢，需要數百年的時間。蛋白酶存在於所有形式的生命和病毒中。它們已經獨立進化了多次，不同種類的蛋白酶可以透過完全不同的催化機製完成相同的反應。

## 分類

目前已知的蛋白酶可以分成以下7大類：

* 絲氨酸蛋白酶（Serine proteases） - 使用丝氨酸醇
* 苏氨酸蛋白酶（Threonine proteases）- 使用蘇胺酸仲醇
* 半胱氨酸蛋白酶（Cysteine proteases） - 使用半胱氨酸硫醇
* 天冬氨酸蛋白酶（Aspartic acid proteases）- 使用天冬氨酸羧酸
* 金屬蛋白酶（Metalloproteases） - 使用金属，通常是锌
* 谷氨酸蛋白酶（Glutamic acid proteases）- 使用谷氨酸羧酸
* 天门冬酰胺肽裂解酶（Asparagine peptide lyase） - 使用天门冬酰胺進行消除反應（不需要水）

1993年，蛋白酶首次依其演化關係分為84個家族，並分為四種催化類型：絲氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶、天冬氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶。苏氨酸蛋白酶和谷氨酸蛋白酶分別直到 1995 年和 2004 年才被描述。用於裂解肽鍵的機制涉及使具有半胱氨酸和蘇氨酸（蛋白酶）或水分子（天冬氨酸、谷氨酸和金屬蛋白酶）的氨基酸殘基具有親核性，以便它可以攻擊肽羰基。 製備亲核体的一種方法是透過催化三聯體，其中組胺酸殘基用於活化絲胺酸、半胱氨酸或蘇胺酸作為亲核体。然而，這不是一個進化分組，因為亲核体類型在不同的蛋白质超家族中趨同進化，並且一些蛋白质超家族表現出向多種不同亲核体的發散進化。金屬蛋白酶、天門冬胺酸蛋白酶和谷氨酸蛋白酶利用其活性位點殘基活化水分子，然後攻擊易裂鍵。

## 酶的功能和機制

用於蛋白酶解的兩種水解機制的比較。酶顯示為黑色，底物蛋白顯示為紅色，水顯示為藍色。上圖顯示了一步水解，其中酶使用酸使水極化，然後水解底物。底部面板顯示了兩步驟水解，其中酶內的殘基被激活以充當亲核体 (Nu) 並攻擊底物。 這就形成了一個中間體，其中酵素與底物的 N 端半部共價連接。在第二步驟中，水被活化以水解該中間產物並完成催化。其他酵素殘基（圖中未標示）在反應機制中提供和接受氫，並在靜電上穩定電荷的累積。
蛋白酶透過分裂連接胺基酸殘基的肽鍵，將長蛋白質鏈消化成較短的片段。有些將末端胺基酸從蛋白鏈上分離（外肽酶，例如氨肽酶、羧肽酶A）；其他攻擊蛋白質的內部肽鍵（內肽酶，例如胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶、木瓜蛋白酶、彈性蛋白酶）。

### 催化

催化是透過以下兩種機制之一來實現的：

* 天門冬胺酸、谷氨酸和金屬蛋白酶激活水分子，對肽鍵進行親核攻擊以將其水解。
* 絲胺酸、蘇胺酸和半胱氨酸蛋白酶使用親核殘基（通常在催化三聯體中）。此殘基進行親核攻擊，將蛋白酶與底物蛋白共價連接，並釋放產物的前半部。然後，這種共價酰基酶中間體被活化水水解，透過釋放產物的後半部並再生遊離酶來完成催化作用。

### 特異性

蛋白質水解可以是高度混雜的的，使得多種蛋白質底物被水解。消化酶例如胰蛋白酶等就是這種情況，它必須能夠將攝取的一系列蛋白質裂解成更小的肽片段。混雜的蛋白酶通常與底物上的單一氨基酸結合，因此僅對該殘基具有特異性。例如，胰蛋白酶對序列 ...K\... 或 ...R\... 具有特異性（“\”=切割位點）。

相反，一些蛋白酶具有高度特異性，僅切割具有特定序列的底物。血液凝固（例如凝血酶）和病毒多蛋白加工（例如TEV蛋白酶）需要這種程度的特異性才能實現精確的切割事件。這是透過具有長結合裂縫或隧道的蛋白酶來實現的，該裂縫或隧道具有多個結合特定殘基的口袋。例如，TEV蛋白酶對序列...ENLYFQ\S...（“\”=切割位點）具有特異性。

### 降解和自溶

蛋白酶本身就是蛋白質，可以被其他蛋白酶分子（有時是同一種類的）切割。這是調節蛋白酶活性的一種方法。有些蛋白酶在自溶後活性較低（例如TEV蛋白酶），而有些則活性較高（例如胰蛋白酶原）。

## 蛋白酶的生物多樣性

蛋白酶存在於所有生物體中，從原核生物到真核生物到病毒。這些酶參與多種生理反應，從食物蛋白質的簡單消化到高度調節的級聯反應（例如凝血級聯反應、補體系統、細胞凋亡途徑和無脊椎動物酚氧化酶原激活級聯反應）。蛋白酶可以破壞特定的肽鍵（有限的蛋白質分解），這取決於蛋白質的氨基酸序列，也可以將肽完全分解為氨基酸（無限的蛋白質分解）。此活性可以是破壞性變化（消除蛋白質的功能或將其消化為其主要成分），可以是功能的激活，也可以是訊號傳導途徑中的訊號。

## 用途

蛋白酶研究領域十分龐大。自 2004 年以來，每年約有 8,000 篇與該領域相關的論文發表。蛋白酶被用於工業的、醫學的和基礎生物學的研究工具。

消化蛋白酶是許多洗衣粉的一部分，也廣泛用於麵包工業的麵包改良劑。 蛋白酶是重要的工業酶，佔全球總酶銷售量約六成，其中七成用於工業用途的蛋白酶用於食品發酵等方面，例如酸性蛋白酶用於傳統發酵食品和調味品的生產及催化酪蛋白沈澱；中性蛋白酶因能夠去除水解產物的苦味而令醬油脫苦；鹼性蛋白酶應用於食品烘烤等方面，因為能夠有效提高生麵團的延性和韌性，並且增強麵包的起泡性。

## 抑制劑

蛋白酶的活性受到蛋白酶抑制劑的抑制。蛋白酶抑制劑的一個例子是丝氨酸蛋白酶抑制剂蛋白质超家族。它包括α1-抗胰蛋白酶（可保護身體免受自身發炎蛋白酶的過度影響）、α1-抗胰凝乳蛋白酶（具有相同的作用）、C1 抑制劑（可保護身體免受蛋白酶觸發的自身補體系統過度活化 ）、抗凝血酶（保護身體免於過度凝血）、纖溶酶原激活劑抑制劑-1（透過阻斷蛋白酶觸發的纖溶作用，保護身體免於凝血不足）和神經絲氨酸蛋白酶抑制劑。

天然蛋白酶抑制劑包括脂質運載蛋白家族，在細胞調節和分化中發揮作用。已發現與脂質運載蛋白相連的親脂性配體具有腫瘤蛋白酶抑制特性。天然蛋白酶抑制劑不應與抗逆轉錄病毒治療中使用的蛋白酶抑制劑混淆。一些病毒，其中包括愛滋病，在其繁殖週期中依賴蛋白酶。因此，蛋白酶抑制劑被開發為抗病毒治療劑。

其他天然蛋白酶抑制劑被用作防禦機制。常見的例子是在一些植物的種子中發現的胰蛋白酶抑制劑，對人類來說最引人注目的是大豆，一種主要的糧食作物，它們的作用是阻止掠食者。生大豆對包括人類在內的許多動物有毒的，直到它們所含的蛋白酶抑制劑變性為止。

* 連接酶
* 趋同演化
* 蛋白酶解
* 催化三联体
* 蛋白酶抑制剂
* MEROPS

## 外部鏈接

* （英文）國際蛋白水解學會 (International Proteolysis Society) （页面存档备份，存于互联网档案馆）
# 錯義突變[编辑]

在遺傳學，**錯義突變**是一種點突變，其中單個核苷酸變化導致編碼不同氨基酸的密碼子。 是一種非同義替換。

## DNA突變替代蛋白質

此圖像顯示錯義突變的示例。DNA序列的一個核苷酸（腺嘌呤）被另一個核苷酸（胞嘧啶）取代。這導致錯誤的氨基酸（脯氨酸）被整合到蛋白質序列中。
錯義突變是指由單個核苷酸點突變引起蛋白質一個氨基酸異化。是DNA序列一種非同義替換。

錯義突變可以使生成的蛋白質失去功能，導致疾病，如大皰性表皮鬆解症、鐮狀細胞病、超氧化物歧化酶介導的肌萎縮側索硬化以及癌症

在最常見的鐮狀細胞病變體，血紅蛋白β鏈基因第20個核苷酸從GAG密碼子變為GTG密碼子。因此，第6個氨基酸谷氨酸被纈氨酸取代，標記為E6V突變，並且蛋白質發生充分改變以引起鐮狀細胞病。

並非所有的錯義突變都會導致明顯蛋白質變化。一種氨基酸可能被化學性質非常相似的氨基酸取代，這種情況，蛋白質可能仍能正常發揮作用；這被稱為保守突變。或者，氨基酸取代可以發生在不顯著影響蛋白質二級結構或功能的蛋白質區域，這或也可被稱為保守突變。

## 示例

```
    DNA: 5' - AAC AGC CTG CGT ACG GCT CTC - 3'
         3' - TTG TCG GAC GCA TGC CGA GAG - 5'
   mRNA: 5' - AAC AGC CUG CGU ACG GCU CUC - 3'

```

蛋白質：Asn Ser Leu Arg Thr Ala Leu

LMNAc.1580G>T錯義突變引入LMNA基因–DNA序列CGT位置1580nt導致鳥嘌呤被胸腺嘧啶取代，產生DNA序列中的CTT。這導致在蛋白質第527位的精氨酸被亮氨酸取代。這會導致鹽橋破壞和結構不穩定。在表型水平表現為重疊的下頜骨發育不良和早衰綜合症。

得到的轉錄物和蛋白質產物是：

```
    DNA: 5' - AAC AGC CTG CTT ACG GCT CTC - 3'
         3' - TTG TCG GAC GAA TGC CGA GAG - 5'
   mRNA: 5' - AAC AGC CUG CUU ACG GCU CUC - 3'

```

蛋白質：Asn Ser Leu Leu Thr Ala Leu

## 實驗分析

癌症相關的錯義突變可導致所得蛋白質的劇烈不穩定。

2012年提出了一種篩選此類變化的方法，即快速平行蛋白水解。

## 另見

* Ka/Ks
* Missense mRNA

## 參考

## 外部鏈接
# 冈瓦纳大陆[编辑]

5.5亿年前形成后的冈瓦纳大陆
4.2億年前的冈瓦纳大陸，此視角下中心對準地理南極
在地質學中，**冈瓦纳大陆**（英語：Gondwana，/ɡɒndˈwɑːnə/，或Gondwanaland），也稱**岡瓦那大陸**、**岡瓦納古陸**、**冈瓦纳古大陆**、**岡瓦那古大陸**、**岡瓦那超大陸**、**南方大陸**，是存在於新元古代至侏羅紀前期（約5.73億至1.8億年前）的超大陸，從羅迪尼亞大陸分裂出來的兩塊超大陸之一（另一個超大陸為勞亞大陸），位於南半球。

從最早的定義來看，岡瓦納沒有被認為是超大陸，因為波羅的大陸、勞倫大陸和西伯利亞大陸與之分離。它是由數個克拉通的增生所形成，最終成為古生代以來最大的超大陸，覆蓋面積約1億平方公里，約佔地球表面的五分之一。在石炭紀時期，它與歐美大陸合併成一個更大的超大陸 - 盤古大陸。在中生代，岡瓦納（和盤古大陸）逐漸破裂。岡瓦納的殘餘物約佔當今大陸面積的三分之二，包括南美大陸、非洲大陸、南極大陸、澳大利亞大陸、印度次大陸、西蘭大陸和阿拉伯半島。

岡瓦納的形成始於8億至6.5億年前東非造山運動（印度和馬達加斯加與東非的碰撞），並完成於6億至5.3億年前Brasiliano和Kuunga造山帶重合。

## 名字的由来

岡瓦納名稱源於印度中部的岡瓦納地區，該地名取自梵語，意為「贡德人的森林」（Gonda “贡德人” + vana「森林」）。在這個地方發現了岩石與南半球...等其他大陸的共通性，愛德華·休斯於是以此來取名岡瓦納大陸。此名稱曾在1872年被H.B. Medlicott第一次用於地質學，來描述岡瓦納二疊紀到三疊紀的沉積層序。
一些科學家更喜歡使用「岡瓦納蘭（Gondwanaland）」一詞，以便在該地區和超大陸之間做出明確區分。

## 大陸漂移過程

由羅迪尼亞大陸的南部分裂而成。進一步分裂成：紐西蘭島嶼、澳洲大陸、南美大陸、南極大陸、馬達加斯加及非洲大陸，以及已經漂流到北半球的印度古陸、阿拉伯半島。

## 走向分裂

### 中生代

位於超大陸中心的南極洲與岡瓦納的其他板塊都相鄰，岡瓦納的破碎陸塊圍繞其順時針傳播。超大陸的分裂是Karoo-Ferrar火成岩區域噴發的結果，該區域形成了地球上最廣的大型火成岩區域之一。但是南美、非洲與南極洲之間最古老的磁異常發現於160 to 180 Ma的侏羅紀的威德爾海南部。

##### 西印度洋的初始

非洲与马达加斯加之间的洋底形成150 Ma (左)，以及印度与马达加斯加之间洋底形成c. 70 Ma (右).
在c. 184 Ma.Karoo-Ferrar洪流玄武岩快速大範圍的侵入之後，岡瓦納在侏羅紀早期開始分裂。在Karoo plume開創非洲和南極洲之間裂谷之前，它把一些較小的陸塊與岡瓦納南部及原始太平洋邊緣（沿著現在的跨南極山脈）隔開了。

#### 東印度洋的序幕

印度和南極之間形成的第一個海床 c. 120 Ma (左). Kerguelen LIP開始形成90東脊 c. 80 Ma (中央). 印度和澳大利亞板塊合併 c. 40 Ma (右).
由南極洲，馬達加斯加，印度和澳大利亞組成的東岡瓦納開始與非洲分離。

#### 南大西洋的生成

在 c. 126 Ma (左) 福克蘭高地開始滑過南部非洲以及拍力那-厄星茶卡LIP（Paraná-EtendekaLIP）開啟了中大西洋海脊。在c. 83 Ma (右）完全開放，Romanche 斷裂帶在赤道附近形成。
南大西洋的開放使西岡瓦納（南美和非洲）分裂，但是對於此分裂的確切時間點，仍存在很多爭議。

#### 早期安第斯造山運動

侏羅紀和白堊紀初期是安第斯造山運動的第一階段，特徵是發展出伸展構造、裂谷、弧後盆地和形成大型岩磐。

### 新生代

#### 澳大利亞大陸–南極大陸分離

## 证据

* 古生物证据

中龙类化石在非洲和南美都有发现，而它们是淡水動物不可能跨越海洋游到对岸。只能说明大陆本相连。

* 岩石证据
* 其他证据

## 对动物地理的影响

很多动物起源于冈瓦纳大陆，如长鼻类（大象）、古腭类（鸵鸟等），解释了南亚和非洲，非洲和南美之间动物区系的类似性。解释了新西兰没有土生哺乳动物（蝙蝠除外）的原因等。

* 盤古大陸
* 勞亞大陸
* 地质
# 旧大陆[编辑]

**旧大陆**（拉丁語：Mundus vetus）是指在克里斯托弗·哥伦布发现新大陆之前，欧洲所认识的世界，包括欧洲、亚洲和非洲（全体被称为亚欧非大陆或世界岛）。这个词语是用来與新大陆（包括北美洲，南美洲和大洋洲）相對應。

旧大陆（亚欧非大陆上的国家）

## 词源

在考古学和世界历史的範疇裡，“旧大陆”这个词包括世界上從青铜器时代開始有文化接触(間接接觸也算)，造成早期文明并行發展的地區（大多位于北緯25度至45度中間的溫帶地區)。这里的地点包括：地中海、美索不达米亚、波斯高原、印度和中国。这些地点都是被丝绸之路连起来，直到新海上航線的出現才改變。青铜器时代之后，这些地方都有很明显的铁器时代。铁器时代以后就有了轴心时代。在轴心时代的过程当中发生了文化，哲学和宗教的发育，从而引起文化领域的出现，比如：西方（古希臘宗教，“经典”），东方（琐罗亚斯德教和亚伯拉罕）和远东（印度教，佛教，儒教，道教）。

## 历史

三洲（亚洲，欧洲和非洲）的概念可以追溯到古典时代。这三个洲的边界被托勒密下定为尼罗河和顿河。这个边界在中古时代和早现代对欧洲看世界有很大的影响。（参见“TO地圖”）

## 其他名字

亚欧非大陆（不包括英伦三岛、日本、马达加斯加和马来群岛）的昵称是世界岛。

## 參考
# 南北美洲生物大遷徙

從南美洲遷徙至北美洲的動物（棕色）及從北美洲遷徙至南美洲的動物（藍色）。
**南北美洲生物大遷徙**是動物地理學上的一次重要事件，北美洲及南美洲陸地及淡水的動物群因巴拿馬地峽的形成，而經中美洲互相遷徙交換。這次遷徙的最高峰是於約3百萬年前的上新世中期皮亞琴察階。

這是事件在新熱帶界及新北界的結合，最後形成美洲時發生。這次遷徙可以從地層學及新生物學中觀察得知。其最明顯的影響是哺乳動物的動物地理學，且給予了不懂飛行的鳥類、節肢動物、爬行動物、兩棲動物及甚至淡水魚類機會遷徙。

## 南美洲特有物種

大部份新生代時期的南美洲都由其他地方所沒有的哺乳動物特有種所支配，這些特有種包含了有袋类、貧齒類（如犰狳科、食蟻獸及樹懶等）及不同的南蹄目（如南方有蹄目、滑距骨目、閃獸目及焦獸目）。有袋类可能於上白堊紀或第三紀初經南極洲往來南美洲及澳洲。於南美洲的有袋目包括了負鼠目，而其他較大的形態如古鬣狗科及袋劍虎屬亦都存在。這些有袋目與巨大的駭鳥共同分享生態位。南方有蹄目及滑距骨目都有一些奇怪的形態，如後弓獸屬。這兩類可能是由踝節目開始，於下古新世遷徙前開始演化，並於更新世滅絕。閃獸目及焦獸目亦有奇怪的形態，不過形態較小及較早消失。部分南美洲的水生鱷魚如鉤鼻鱷、莫拉氏鱷及普魯斯鱷具有可比擬中生代鱷魚的巨大體型，體長可達 12米（39英尺）。生存在相同地區的還包括體型最大的烏龜駭龜，背甲長度達 3.3米（11英尺）。

## 跳島戰術

水豚
皇檉柳猴
入侵南美洲是在3150萬年前當豚鼠小目到達當地開始，很有可能是來自非洲。這時開始出現了水豚、毛絲鼠、兔鼠及美洲豪豬科。從西非前往巴西西北因大陸漂移而變得更為短程，另外跳島戰術亦幫助了一把。橫渡海洋亦可以因最少一頭懷孕的雌性透過浮木或紅樹林筏而達成。牠們後來在西印度群島至巴哈馬繁殖起來。

後來約於2500萬年前，靈長目亦跟隨而來，但能夠遷徙的則較為少數。南美洲猴的祖先相信亦像豚鼠小目般從非洲來到，形成了新世界猴。南美洲豚鼠小目及猴兩者都相信是一個單系群分支。

最早從北美洲到達的是肉食性浣熊科，牠們約於7百萬年前從中美洲跳島而來。一些南美洲浣熊科亦分化成現已滅絕的形態。但是所有現存的浣熊科似乎都是源自北美洲。同樣地，地懶亦於9百萬年前跳島至北美洲，在較早的中新世早期在安的列斯群島繁殖。

## 南北美洲生物大搬風

約於3百萬年前巴拿馬地峽的形成造成最後及最大型的大遷徙。當中包括大羊駝、乳齒象、貘、貓科、犬科、熊及馬等遷徙至南美洲。

最初的淨遷徙是對稱的，後來證實新熱帶界物種沒有新北界物種般成功。向北遷徙的動物未能成功挑戰已經佔有當地同一生態位的新北界物種。很多新熱帶界物種都習慣熱帶雨林環境，限制了牠們遠離中美洲的能力。向南遷徙的北方真兽类（Boreoeutheria）相信是造成一些南美洲哺乳動物滅絕的元兇。所有新熱帶界大型的有袋目及飛行獵食者最終消失。南美洲的南蹄目亦很難過活，只有後弓獸屬及一些箭齒獸屬能承受這種來自北方的突擊。細小的美洲有袋類則好些，當中較為原始的貧齒目很奇特的具競爭性。牠們演化很有效的保護甲殼（犰狳及雕齒獸科）或長爪（樹懶及食蟻獸）。非洲的豚鼠小目及新世界猴則在這次遷徙中保持原狀。而北美豪豬及幾種已滅絕的豪豬及水豚並沒有穿過中美洲。

在美國出現犰狳、負鼠目及豪豬都是因這次大搬風而致。負鼠目及豪豬是向北遷徙得最成功的，最遠達至加拿大。現時只有少數的貧齒目、有袋目或豚鼠小目仍然生存在北美洲，更多的只在中美洲生活。在第四紀滅絕事件前，大部份主要的貧齒目都進入了中北美洲。大型動物中的地懶是最成功的入侵者，巨爪地懶屬近擴展至阿拉斯加。一般來說，嚙齒目的擴散及後來的輻射適應在南美洲不論在空間及物種數量上都最為成功。

### 南美洲物種

#### 遷往北美洲的南美洲物種

雕齒獸科
地懶
過往1千萬年前從南美洲遷往北美洲現存或已滅絕物種的祖先：

* 北美負鼠
* 九帶犰狳
* 其他犰狳科（如†*Dasypus bellus*、†*Pachyarmatherium leiseyi*）
* 潘帕獸科：†荷氏獸屬
* 雕齒獸科（†*Glyptotherium texanum*）
* 地懶
* 北美豪豬
* 其他美洲豪豬科（如†*Erethizon poyeri*、†*Erethizon kleini*）
* 水豚（如†*Neochoerus pinckneyi*、†*Hydrochaeris holmesi*）
* 吸血蝠亞科（如†*Desmodus stocki*、†*D. archaeodaptes*）
* 美洲獅（在北美洲獅在更新世物種滅絕中消失後回歸）
* 駭鳥（†泰坦巨鳥於上新世晚期滅絕）
* 王鷲（†*Sarcoramphus kernensis*於上新世晚期滅絕）
* 蜂鳥
* 裸鼻雀科
* 霸鶲

#### 只遷往中美洲的南美洲物種

草莓毒刺蛙
箭齒獸屬
過往1千萬年前從南美洲遷往中美洲現存或已滅絕物種的祖先：

* 箭毒蛙科
* 蟒蛇科下的蚺亞科
* 其他負鼠目及12個現存物種
* 北方裸尾犰狳
* 二趾樹懶及三趾樹懶共4個現存物種
* 侏食蟻獸、大食蟻獸及中美小食蟻獸
* 箭齒獸屬（†*Mixotoxodon*）
* *Coendou prehensilis*、*Coendou rothschildi*及墨西哥樹豪豬
* 其他豚鼠小目及最少9個現存物種
* 新世界猴共10個現存物種
* 其他吸血蝠亞科
* 巨嘴鳥

### 北美洲物種

#### 遷往南美洲的北美洲物種

美洲乳齒象
南浣熊
過往1千萬年前從北美洲或中美洲遷往南美洲現存或已滅絕物種的祖先：

* 響尾蛇
* 鼩鼱科，只有在南美洲西北部的哥倫比亞、委內瑞拉、厄瓜多爾及秘魯出現
* 鼠總科
* 松鼠
* 兔科
* 貘
* 馬科（†*Plesippus*、†波拿馬）
* 野豬
* 鹿科
* 駱駝科
* 乳齒象（†美洲乳齒象）
* 嵌齒象（†居維象）
* 鼬科如水獺
* 臭鼬科
* 浣熊科
* 短臉熊（眼鏡熊、†細齒巨熊）
* 狼（如†恐狼、†*Canis ambrusteri*）……for a time
* 其他犬科
* 美洲獅
* 美洲豹
* 斯劍虎（†一般劍齒虎、†致命劍齒虎）
* 美洲擬獅（†*Panthera leo atrox*）
* 其他貓科
* 擬鱷龜

* History of the Fauna of Latin America by George Gaylord Simpson (1950) （页面存档备份，存于互联网档案馆）
# 袋劍虎[编辑]

| 袋劍虎 化石时期：晚中新世 - 上新世 ~
 |
| --- |
|  |
| 科学分类  |
| 界： | 动物界 Animalia |
| 门： | 脊索动物门 Chordata |
| 纲： | 哺乳纲 Mammalia |
| 目： | †袋犬目 Sparassodonta |
| 科： | †袋剑虎科 Thylacosmilidae |
| 属： | †袋剑虎属 *Thylacosmilus* Riggs, 1933 |
| 种：
 | †**袋劍虎 *T. atrox |
| 二名法
 |
| **†*Thylacosmilus atrox Riggs, 1933
 |
| 異名
 |
| * *Thylacosmilus lentis* Riggs, 1933
 |

**袋劍虎**（学名：*Thylacosmilus atrox*）是拥有劍齒的肉食有袋類，生存於晚中新世至上新世，屬袋犬目袋剑虎科，是**袋劍虎屬**的唯一已知物種。牠們的遺骸在南美洲發現，主要都是在阿根廷卡塔馬卡省、恩特雷里奧斯省與拉潘帕省。牠並非斯劍虎的近親，只是因趨同演化的關係而有類似的外形。

袋劍虎的模擬圖。

## 描述

袋劍虎復原圖
袋劍虎具有一對如軍刀的上犬齒，在一生中會不停生長，牙根的位置位於眼窩上方。劍齒的特化進而影響了袋劍虎門齒的退化，不過其他劍齒虎如斯劍虎與巴博劍齒虎依然保有完整的門牙齒式。牠的下顎亦有一對突出的邊，平時可以保護其劍齒。

雖然袋劍虎身體部份的化石並不完整，但足以發現許多與其他劍齒虎類似或相同的特徵。袋劍虎的頸椎十分粗壯，類似劍齒虎亞科。前肢肱骨與股骨十分粗壯，肱骨有發達的胸肌與三角肌附著，可用來捕捉獵物並吸收獵物造成的碰撞。 後腳肱骨也很粗壯，短脛骨與蹠行足顯示袋劍虎並不擅長奔跑，可能採伏擊策略。和巴博劍齒虎科與獵貓科不一樣的是，袋劍虎的爪子並無法收縮。

袋劍虎（橘色）與其他掠食者和人類的體型比較
## 滅絕

袋劍虎復原圖
一些較早的文獻會寫道：袋劍虎的滅絕是在南北美洲生物大遷徙贏不過更為強勢的斯劍虎而絕種。然而更新的研究顯示，袋劍虎大約於上新世（3.6–2.58 百萬年前）就已滅絕，而斯劍虎最早則是在中更新世（781,000-126,000 年前）才抵達南美洲。因此兩種袋劍虎與斯劍虎的消長之間其實存在 150 萬年的空窗期。

## 參考文獻

* Thylacosmilus (marsupial sabre-tooth)
* Art by Maximo Salas （页面存档备份，存于互联网档案馆）
* Skull of Thylacosmilus（页面存档备份，存于互联网档案馆）
* Comparison of Thylacosmilus (upper) and Smilodon (below)（页面存档备份，存于互联网档案馆）
# 袋鼹属

| 袋鼴屬 化石时期：
 |
| --- |
|  |
| 南方袋鼴
 |
| 科学分类  |
| 界： | 动物界 Animalia |
| 门： | 脊索动物门 Chordata |
| 纲： | 哺乳纲 Mammalia |
| 演化支： | 有袋類 Marsupialia |
| 目： | 袋鼴目 Notoryctemorphia |
| 科： | 袋鼴科 Notoryctidae |
| 属： | **袋鼴屬 *Notoryctes Stirling, 1891 |
| 模式種
 |
| 南方袋鼴 *Psammoryctes typhlops* Stirling, 1889
 |
| 種
 |
| * 南方袋鼴 *Notoryctes typhlops* Stirling, 1891
* 托氏袋鼴 *Notoryctes caurinus* Thomas, 1920
 |
|  |
| 分布地區
 |

**袋鼴屬**（學名：Notoryctes），屬於哺乳綱，**袋鼴目**下只有**袋鼴科**一科，**袋鼴科**只有**袋鼴屬**一屬。只有兩個種，但目前對其所知仍然甚少。

## 分布

分佈於澳大利亞西北部和中部的荒漠地帶。

## 下層物種

本屬包括以下物種：

* 托氏袋鼴 *Notoryctes caurinus* Thomas, 1920
* 南方袋鼴 *Notoryctes typhlops* (Stirling, 1889)

## 型態

體形如鼴，成體長12至16釐米，尾長2～3厘米，體重約40至60克。高度適應地下生活，眼隱於皮下，無晶體，直徑僅1毫米，因此缺乏視力；耳無耳殼。前肢強而有力，三、四趾的爪特長，有如鏟子的功能，其它趾縮小；後足中間有三趾有長爪；第一趾小而有甲，第五趾留有痕迹。雌獸在生殖季節有很發達的育幼袋，分隔為二，且出口向下，以免育兒袋內裝滿沙，每邊各有一乳頭。

## 習性

棲息於灌叢荒漠地帶和沙質窪地，主食甲蟲幼蟲和卵。掘土方式於鼩形目鼴鼠有明顯區別，在地下遊走，身後不會留下永久性洞道。

## 保育狀況

為瀕危動物。

## 參考文獻