커졌다. 수의사단체 등이 의료 봉사로 중성화 수술을 때때로 시행하긴 했지만, 자체 번식을 막을 수는 없었다. 버려진 동물뿐 아니라 보호소 내에서 태어난 개들까지 더해져 보호소 내 동물의 수는 기하급수적으로 늘어났다. 개체 수의 급증은 보호소 내부의 위생, 질병 등의 문제로 이어졌다. 과거 애린원의 유기견·유기묘 수는 2천~3천 마리 수준으로 파악되기도 했다. 동물단체 비글구조네트워크(이하 비구협) 관계자는 현재 애린원 내 유기동물의 수를 1천~1천200여 마리로 추정했다. 2015년에는 애린원이 위치한 땅