東京箱根間往復大学駅伝競走（とうきょうはこねかんおうふくだいがくえきでんきょうそう）は、1920年に開始された、毎年1月2日と1月3日の2日間で開催する関東地方の大学駅伝競技会（地方大会）である。関東学生陸上競技連盟（以下「関東学連」という。）が主催し読売新聞社が共催する。箱根駅伝（はこねえきでん）とも俗称されて広く知られる。実施は関東学連が定める「東京箱根間往復大学駅伝競走に関する内規」（以下「内規」という。）に定める。

現在開催されている駅伝の中で4番目に長い 距離を持ち、1987年からテレビ中継を開始した。

「箱根駅伝」は読売新聞東京本社の登録商標（登録番号 : 第5565518号）である。

概要 
出場校は20校で、これとは別に出場校以外の競技者による関東学生連合チーム（オープン参加）が参加する（2015年の第91回大会以降の編成）。2019年の第95回記念大会では「関東インカレ」成績枠が設けられた が、同回のみで廃止された。

コースは国道1号線、東京都千代田区大手町・読売新聞東京本社ビル前 から、鶴見、戸塚、平塚、小田原の各中継所を経て神奈川県足柄下郡箱根町・芦ノ湖までの往復で、往路107.5 km、復路109.6 km、計217.1 km。1月2日に東京から箱根への往路を、1月3日に箱根から東京への復路を走る。主に通過する路線名称は日比谷通り、国道15号、国道1号、国道134号などである。

第1回大会は、アメリカ大陸の継走での横断を実施するための予選会という位置付けで、1920年2月14日に行われた。これは、1912年のストックホルムオリンピックに出場した日本人五輪選手第1号の金栗四三が、「五輪で日本を強くするには、長距離、マラソン選手を育成すること」と発案したことがきっかけである。別の説として、駅伝の由来である宿駅伝馬制の飛脚をもとに、手紙に見立てた襷を、東京から東海道の宿駅があった鶴見（川崎宿）、戸塚（戸塚宿）、平塚（平塚宿）、小田原（小田原宿）で引継ぎ、箱根町郵便局（箱根関所）まで、どの大学が一番早く届けるかというイベントとして開催されたという説もある。第1回から第12回のゴール地点は箱根関所跡であり、第22回（箱根神社）を除く第13回から第44回までは箱根町郵便局がゴール地点であった。第二次世界大戦中の1941年から一時中断されたが、1943年に一度だけ戦時下で開催された（靖国神社・箱根神社間往復関東学徒鍛錬継走大会）。その後、再び中止となり、戦後の1947年に復活。第32回（1956年）から現在の1月2・3日の開催となった（内規第1条）。

箱根駅伝は、関東地方では従前から人気があったが、警察から駅伝自体の中止を含めた内容変更を迫られるなど、存続の危機に立たされていた。しかし、1987年に日本テレビが全国放送で全区間の生中継（電波を途切れさせない完全中継実施は1989年から）を開始して以降、正月の風物詩（国民的スポーツ大会）として関東地方以外でも知名度・注目度が格段に向上した（詳細は#中継番組を参照）。箱根駅伝出場者からオリンピックや世界陸上などに出場を果たした選手も少なくない（詳細は箱根駅伝の人物一覧を参照）。

箱根駅伝は、関東学連が主催する地方大会であり、10位以内に入ると、同じ年の全国大会で駅伝シーズンの開幕を告げる出雲全日本大学選抜駅伝競走（同年スポーツの日開催。以下「出雲駅伝」という）に関東代表として出場できる。一般に、出雲駅伝、全日本大学駅伝、そして本大会を併せて「大学三大駅伝」と呼ばれており、同じ年度の全大会に優勝すると「三冠」と称され、大東文化大学（1990年度）、順天堂大学（2000年度）、早稲田大学（2010年度）、青山学院大学（2016年度）、駒澤大学（2022年度）の5校が達成している。ただし、箱根駅伝は全国大会ではないため、関東学連加盟校以外の大学は三冠を達成することはない。大東文化大学は復路優勝を、順天堂大学と早稲田大学は往路優勝を逃しており、箱根駅伝を完全優勝しての三冠を達成した大学は2016年度の青山学院大学と2022年度の駒澤大学の2校である。

出場チームと出場選手 
関東学連加盟校のうち、前年大会でシード権（後述）を獲得した大学10校と予選会を通過した大学10校の計20校と、このほかに関東学生連合チームを加えた21チームが出場する（2015年の第91回大会以降の編成）。第95回（2019年）記念大会では、関東インカレ5年間の総合得点の累計が最も多い大学に出場権を与える関東インカレ成績枠が設けられる とともに予選会からの出場校が11校となり、計23チームが出場した。

競技者の参加資格

現行 
競技者は次の参加資格を満たしている必要がある。
 競技者の所属校が関東学連加盟校で競技者は当該年度の登録を完了していること（内規第4条）。
 所属する加盟校が関東学連から処分を受けていないこと（内規第5条）。
 本人が関東学連の資格審査委員会によって処分を受けていないこと（内規第6条）。
 出場申込回数が4回（予選会のみ出場の場合も回数に含む）を越えないこと（内規第7条）

「実質5年生」のランナー 
上記の参加資格の例外として、怪我によるエントリー漏れや年度途中での休学などに伴って留年し、「実質5年生」になった4年生ランナーが4回までとなっている参加資格の上限に到達していないことを理由に出場するケースも散見される。この場合には2通りのパターンがある。
怪我による欠場 - 竹石尚人（青山学院大学）、島崎慎愛（國學院大學）
年度途中での休学（による留年） - 嶋津雄大（創価大学）

年齢制限（撤廃） 
第68回（1992年）までは28歳以下という年齢制限があったが、第69回（1993年）から撤廃されている。

沿革 

 第1回 - 第31回（1920年 - 1955年）
参加希望校の内、関東学連が承認したすべてのチーム
 1920年のアントワープオリンピック代表選考予選から日本の陸上界でもアマチュア規定が採用となった。マラソンでは17歳以上でかつ「脚力ヲ用ウルヲ業トセサルモノ」と規定され、車夫（人力車）、牛乳、郵便配達夫、魚屋のひき子は締め出されることとなった。これにより多くの車夫が夜学に通い始めたが、後に農林大臣・建設大臣を歴任した早稲田大学主将の河野一郎が夜学生の締め出しを提案、第4回以降夜学生は出場できなくなった。
 1928年の第9回大会・1931年の第12回大会・1932年の第13回大会には、関西大学が出場した。
 開催30周年を迎えた第31回（1955年開催分）は本来開催予定だった予選会が後述の通り、降雨による予選会開催地のコンディション不良で開催を急遽中止した。
 第32回（1956年）
出場校を15チームに限定し、出場全チームを当該同年度秋季の予選会にて選考
 第33回 - 第46回（1957年 - 1970年）
以下の2種類の方法で選んだ合計15チーム
 前年度の総合順位「10位」までをシード校とし、その中で参加希望校は予選会免除の上で本大会に参加
 他の出場校については当該同年度秋季に行われる予選会に参加し、その予選会上位5チーム
※第35回（1959年）は予選会終了後に計算ミスで5位と6位が入れ替わったため、この年のみ予選会通過枠を1枠増やした16校で本大会を実施
※第40回（1964年）の記念大会時は、例年の15校のほかに特例として関西と九州から各1校の計2チームを招待
 第47回 - 第78回（1971年 - 2002年）
以下の2種類の方法で選んだ合計15チーム
 前年度の総合順位「9位」までをシード校とし、その中で参加希望校は予選会免除の上で本大会に参加
 他の出場校については当該同年度秋季（第68回（1992年）から10月下旬）に行われる予選会に参加し、その予選会上位6チーム
※第50、60、70回（1974、1984、1994年）の記念大会時は、特例として20チームで実施。増加分の決定方法は年度により異なるので、後述の歴史の年表を参照のこと。
 第79回 - 第89回（2003年 - 2013年）
箱根駅伝に出場できるのは、以下の4種類の方法で選んだ合計20チームとなった。
 前年度の総合順位「10位」までをシード校とし、その中で参加希望校は予選会免除の上で本大会に参加
 予選会タイムの上位6チーム
 予選7位〜予選9位の3チーム
 予選7位以降については予選会タイムに関東学生陸上競技対校選手権大会（関東インカレ）のポイント（順位・エントリー数をタイムに換算）を減算した上での上位3チーム（インカレポイントの詳細計算については外部リンクなどを参照。また後述の駅伝偏重とインカレポイントも参照）
 本大会出場校以外のチームから選ばれた関東学連選抜1チーム（各校最大2名まで選出）
 第80回（2004年）の記念大会では関東学連選抜に代わり、日本学連選抜が参加した。
 関東学連選抜チームは第79回（2003年）から第82回（2006年）まではオープン参加扱いだったため、記録の公認は個人記録に限られ総合順位は付けられなかったが、第83回（2007年）からは総合順位も公認されることになった。関東学連選抜チームがシード権を獲得できる総合順位10位以内に入った場合、翌年のシード枠が1つ減り予選会からの出場枠が1つ増える（第84回で総合4位、第85回で総合9位となっている）。
 第89回（2013年）では関東学連選抜は各校1名ずつ16校からの選出に変更された。
※第85回（2009年）は出場校を3校増やす。これは第85回記念大会に伴う措置で、シード校9校（第84回（2008年）で関東学連選抜が第4位に入ったことにより、前項の規定に基づき第85回（2009年）のシード枠が1つ減ったため）と予選会から選考した13校に、関東学連選抜チームを加えた23チームで争われる。予選会選考方式は成績上位10校に自動的に出場権を与え、残り3校についてはインカレポイントを加味して選考する。

※第86回（2010年）は関東学連選抜が第9位に入ったことに加え、第3位に入った日本体育大学が跳躍選手の不祥事でシード権を剥奪されたことから、予選会枠が11校に拡大された。
 第90回（2014年）以後
箱根駅伝に出場できるのは、以下の3種類の方法で選んだ合計21チームとなった（ただし第90回の記念大会では2枠増の23チーム）。
 前年度の総合順位「10位」までをシード校とし、その中で参加希望校は予選会免除の上で本大会に参加
 予選会タイムの上位10チーム（ただし第90回の記念大会では3枠増の上位13チーム）
 予選会タイムに関東インカレポイントを減算した成績順とする制度は廃止となった。
 本大会出場校以外のチームから選ばれた関東学生連合1チーム（ただし第90回の記念大会では編成しない）
※第95回（2019年）以降の5年ごとの記念大会では、予選会の枠とは別個に予選会が免除される「インカレポイント枠」を創設する方向で検討され、第95回大会では関東インカレ5年間の総合成績の累計が最も多い大学に出場権を与える関東インカレ成績枠が設けられたが、同大会のみで廃止された。
 第100回（2024年）
この年に限り予選会の参加資格が関東学連登録者から日本学生陸上競技連合男子登録者に変更。同時に関東学生連合チームは編成しない。

チームエントリーと区間エントリー 
申込み（チームエントリー、区間エントリー）は関東連盟が提示する日時と場所で所定の様式によって行われ、資格審査委員会の審査によって参加資格ありと認められた大学・競技者のみ正式出場が認められる（内規第8条）。

チームエントリーは16名以内で、区間エントリーのチーム編成は正選手10名と補欠選手6名以内である（内規第9条）。ただし、留学生については、エントリー2名以内、出走1名以内に制限されている（内規第9条）。現行の16人エントリーになったのは第79回（2003年）からで、体調不良によるブレーキや怪我による途中棄権などが相次いだため、主役である選手の健康を最優先した主催者側の配慮と言える。第82回（2006年）までは区間エントリーの際にメンバーを16人から14人に減らす必要があったが、第83回（2007年）より区間エントリーでも16人のまま登録することができるようになった。したがって、補欠選手はそれまでの4人から6人に増えた。

区間エントリーは1区から10区までにエントリーされた正選手とその他の補欠選手とに大別される。そして、正選手には主催者側が用意したナンバーカードが配布される。ナンバーは1区から順に1、2…となり、補欠選手は11番から16番までとなる。ナンバーカードの記載は「（前年の順位・予選会の順位に従い大学に割り振られた番号）-（1番 - 16番）」となり、例えば前年3位の大学の6区にエントリーされた選手は「3-6」となる（第80回より。それ以前は大学ごとの番号は付されなかった）。

変更は正選手と補欠選手との入れ替えのみで、1日に変更できる選手は4名までとされている。区間変更は認められていない（内規第10条2項）。つまり、補欠選手は当日のエントリー変更で正選手と入れ替えとしてどの区間にも入ることができるが、既に区間ごとに配置されている正選手はその区間しか走ることができない（例えば2区に補欠から選手を入れることはできるが、2区と4区の走者を変えることはできない）。通常の駅伝では補欠選手との交代には医師による診断書の提出が義務付けられているが、この大会は長時間の移動への配慮からその必要がないため、戦略的に補欠との選手交代が行われるケースが数多くあり、補欠選手は言わばジョーカー的な意味合いを持つ。逆に区間エントリーで補欠選手と交替した選手は走ることができないため、当て馬的な要素もある。2区にチームで最も力のある選手を置くのが通常であるが、選手層の厚い大学では「つなぎの区間」にエースを配置し、他大学の虚を突くこともある。

傾向としては往路での変更は比較的少なく、復路で何人かを変えてくることが多い。また、各校のエースが集う2区の変更が最も少ないようである。逆に言えば、補欠選手になるのはエースとまでは行かないものの、それに準じる選手や力がありながら調子が上がらない選手、全くの無名選手…などが考えられる。近年ではいずれかの区間を走るべき確実な力のある（かつ調子のよい）選手、またエースすらもあえて補欠登録して、他校のエントリー状況や往路の結果を見ながらいずれかの区間に投入する作戦を取る大学も見られるようになった。優勝をねらうチームは、ライバル視するチームの配置を読んだ上で自チームのそれを考える必要がある。逆に予選会を勝ち上がってきたチームや苦戦が予想されるチームの中は、往路重視の布陣を敷いてくることが多い。選手層が薄く、後半区間での巻き返しが難しいため、エースクラスを序盤に配置することで落ち込みを避けるのがねらいである。どのチームも特殊区間である5区、6区については候補を複数用意していることが多い。これは他の区間とは違い、コースの特殊性ゆえに突発的なアクシデントなどによる急な抜擢が難しい（起用しても適性がない選手が走ることになるため、結果は芳しくないことが多い）ためである。

全区間が20km超の長距離を考慮し、体調不良など万が一の状況に備えて選手の交替が認められている点が他の主要駅伝とは大きく違う点である。調子が上がらない選手の様子をぎりぎりまで見るという点でも、補欠温存ができるのは非常に大きい。

出場チーム 
先述したように箱根駅伝には関東学連加盟校のうち、前年大会でシード権を獲得した大学10校と予選会を通過した大学10校の計20校と、このほかに関東学生連合チームを加えた21チームが出場する（2015年の第91回大会以降の編成）。
 シード校（10校） - 前回大会で総合順位10位以内
 予選会通過校（10校） - 予選会での成績上位10校
 関東学生連合チーム（1チーム） - 第100回記念大会では編成されない

シード校 
本競技会で10位までに入った大学は「シード校」として次回の本競技会出場権を取得する（内規第13条1項）。つまり、前回の本競技会で総合10位以内に入賞していれば本競技会出場権を取得し予選会出場義務は免除される（シード権、予選免除権）。ただしシード権を確保した大学に重大不祥事が発覚した場合、シード権が剥奪される場合がある。実際に、日本体育大学は2009年4月に大麻で陸上競技部員が退学処分となったため、2010年大会のシード権が取り消されている。

前回大会でシード権を逃した大学と次の大会の予選会で本選出場権を獲得した大学がすべて一致することもあるが、過去に予選枠が6校だった第56回-第57回、第61回-第62回と、予選枠が9校だった第82回-第83回と、予選枠が10校になった第94回-第95回の計4回しか起きていない。

シード校の参加は希望制（日本国内での各学連主催の駅伝大会共通）であるが、不参加チームはいまだ発生していない（出雲駅伝では発生例があった）。

第95回記念大会において関東インカレ成績枠の該当校がシード権を獲得しており出場権を確保している場合には繰り上げは行われないこととされていた。

第83回から第90回までは関東学連選抜チームが10位以内に入った場合は、シード校は9校となり次回の予選会では10校を選抜するとされていたが（この場合は次年度の出雲全日本大学選抜駅伝競走への推薦校も9校となる）、2014年2月の関東学連代表委員総会において「関東学連選抜チーム」から「関東学生連合チーム」に名称変更されるとともにオープン参加となっている。

予選会

現行 

箱根駅伝の予選会は本競技会の2か月以上前に行われ、別に開催要項が定められている（内規第14条1項）。予選会は陸上自衛隊立川駐屯地内の滑走路を周回し、立川市の市街地を通過して、昭和記念公園内をゴールとするハーフマラソン（21.0975 km） のコースを各校10名以上12名以下の走者が走って行われる。

前年の1月1日から予選会申込期日前日までの公認記録で、10000m34分00秒00以内の記録（トラック記録に限る）を有する選手のみに出場資格があるため、この出場資格を有する者を補欠も含めて10人以上揃えなければならない。以前はこのような出場資格はなかったが、参加校の増加で予選会の段階である程度出場校を絞り込む必要が出てきたことから、このような資格が設けられた。

予選会では各校上位10名の合計タイムにより10校を選出する。

予選会での順位を決定する際の記録の扱いは、下記の通りとなっている。
 競技成績での「10名の合計タイム」が少ない大学を上位とする。
 1で同タイムの場合には「上位10名の合計順位」が少ない大学を上位とする。
 2によって順位が決定しない場合には、各校「最上位競技者の順位」が上位の大学を上位とする。

沿革 
箱根駅伝では第23回（1947年）から予選会が実施されている。

当初は関東学生10マイル（約16.1kmコース）の成績を選考材料にしていたが、予選会のコース・距離及び選考方法は、次第に変遷を重ね、第81回からは陸上自衛隊立川駐屯地→立川市街地→国営昭和記念公園のコースで開催されている。第97回および第98回の予選会は、新型コロナウイルス感染症対策として立川駐屯地内の滑走路を周回するコースに変更された。第95回からは、距離が従来の20㎞からハーフマラソン（21.0975km）に延長されている。

当初は参加校全校が予選会に参加し上位15校が本戦出場する規定となっていたが、第32回（1956年）まではいずれも参加校が15校以下であり予選参加の全校が本戦出場していた。第33回（1957年）からは規定が変更となり、前回大会の総合成績上位10校にシード権を与え、予選会からの本戦出場は予選上位5校のみとなり、これ以降は予選会で敗退校が出るようになった。第48回（1972年）からは予選会からの出場枠が6校となり、第79回（2003年）以降は予選会上位9校が出場となっている。

第79回から第89回まではインカレポイント制が導入されていた。これは予選会上位6校を合計タイムにより選出し、残る3校はその年の関東インカレの成績に基づくポイント制との併用により選出するものである。7位以下の順位は関東学生陸上競技対校選手権大会の成績に基づくポイント（インカレポイント）による減算タイムを併用して最終順位を決定していた。インカレポイントは、大学の陸上部全体の成績が反映されるため、駅伝だけではなく陸上競技部全体としての取組が成績に影響する。本戦がテレビメディアに大きく扱われるようになって以後は予選会の突破に僅差のタイムが頻発し、特に第83回予選会では、本戦出場を果たした9位の国士舘大学と、予選落ちとなった10位の拓殖大学のタイム差は、インカレポイントを含めて1秒だった。

関東学生連合チーム

現行 
前年大会でシード権を獲得した大学10校と予選会を通過した大学10校の計20校のほかに関東学生連合チームが出場する（2015年の第91回大会以降の編成）。2014年2月の関東学連代表委員総会において「関東学連選抜チーム」から「関東学生連合チーム」に名称が変更された。

 関東学生連合チームは1校から1名が選出される。
 選出選手は10月に行われた予選会に出走し、かつ本大会出場回数が2回を超えないことが要件となっている（第91回大会から適用）。
 関東学生連合チームはオープン参加である。個人記録そのものは有効な記録であるが順位は付かず、チーム・個人ともに参考記録となる。

沿革 
第79回（2003年）から関東学連選抜チームの参加が認められることとなり、第82回（2006年）までオープン参加として個人記録のみが認められていた。

5年ごとの記念大会は日本学連選抜チームが関東学連選抜チームに代わって参加することが認められている（内規第12条）。最近では第80回（2004年）で特別に日本学連選抜チーム がオープン参加で出場した。

第79回（2003年）から参加が認められるようになった関東学連選抜チームのメンバーは、予選会で落選したチームに所属する選手のうち個人成績で上位に位置する選手から、各校最大2名までの枠内で選抜される。第80回（2004年）では日本学連選抜としての参加だったこともあり、6位相当の成績を収めたが、通常の関東学連選抜の場合には下位に低迷することが多かった。もっとも、日本学連選抜チームとしての出場の機会しかない関東以外の各地区の学生が最初から選抜チームのメンバー入りを目指し練習してきたのに対し、関東学連選抜チームの場合、所属大学の一員として箱根駅伝に出たいと言う気持ちがあるのは普通のことであり、予選会で落選したショックからわずか2か月後の本番に選抜チームとして招集されたとしてもモチベーションが上げにくいことも事実である。大学ごとの真剣勝負の場に趣の異なるチームが混じることへの違和感も根強い。このような意見もある一方、選抜チームの経験をチームに持って帰り次回へのモチベーションとすることは大いに意義のあることであり、参加選手からは「この経験を母校に持ち帰り来年に生かす」との声も聞かれ、後年予選会を勝ち抜き本選出場を果たした大学も多い。

第83回（2007年）からはチームとして正式にタイムおよび順位が記録されることになり、関東学連選抜チームが10位以内に入った場合は、シード校は9校となり次回の予選会では10校を選出することとなり、この場合は次年度の出雲駅伝への推薦校も9校とされた。これにより全体のレベル拮抗が予選会参加校のレベル向上へと結びつき、第84回（2008年）では関東学連選抜が総合4位という好成績を収め、続く第85回（2009年）も総合9位となり、2大会連続してシード圏内入りを果たした。予選会出場枠が1枠増えることにより自身の所属大学の翌年の箱根出場の可能性がわずかながらも広がることから、関東学連選抜の存在価値が増し、そのレース順位が大きな意味を持つようになった。第80回（2004年）に出場した日本学連選抜については、東京箱根間往復大学駅伝競走に関する内規第12条において、5年ごとの記念大会での参加が認められてはいるが、第85回（2009年）記念大会では関東学連選抜が選抜チームとして出場している。

関東学連選抜チームについては、第86回（2010年）終了時から廃止・継続または新制度の導入などの議論を重ねた結果、2012年6月6日に行われた関東学連代表委員総会において、第89回（2013年）は現行どおり実施（ただし、各校から1名とし、16校から選出）、第90回（2014年）は不採用。第91回（2015年）以降は、廃止・継続のいずれの可能性も残し検討を重ねた 結果、2013年6月10日に行われた委員総会で当初案の5年ごとの記念大会の編成ではなく、第91回以降も継続して実施することが決定した。

2014年2月の関東学連代表委員総会において「関東学連選抜チーム」からオープン参加の「関東学生連合チーム」に変更された。

第100回（2024年）大会では、予選会に全国の大学が参加可能となる代わりに、本選での「関東学生連合チーム」の編成は行わない。

コースの特徴 

コース（競走路）は東京・読売新聞社前から箱根・箱根町芦ノ湖駐車場入口間の往復217.1 km。東京大手町読売新聞社前、日比谷、西新橋、三田、品川、六郷橋、鶴見、横浜駅、保土ケ谷、戸塚、藤沢、平塚、大磯、二宮、小田原、箱根町芦ノ湖駐車場入口の各点がコース上の通過点として設定されている（内規11条1項）。日本橋は復路のみ通過点とされている（内規11条1項）。

以下、各区の主な特徴について述べる。コース途中の括弧書きは主な経由地、および固定テレビカメラ設置地点。通過道路名は国道・主要道以外は割愛する。

往路（1月2日） 
 東京・大手町→箱根・芦ノ湖 5区間／107.5km

1区（21.3km） 

東京・大手町 読売新聞ビル 前（往路スタート）→（東京都道409号日比谷芝浦線）→（国道15号）→（田町）→（品川駅前）→（新八ツ山橋）→（大井）→（大森）→（蒲田（京浜急行電鉄・京急蒲田駅））→（六郷橋）→鶴見中継所
 大手町・読売新聞ビル前から神奈川県の鶴見中継所までを走る区間（当区と裏返しの10区だけ東京都がある）。距離は21.3kmである（第90回までは21.4kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 午前8時00分に一斉スタート。スタート前からあらかじめ指定された場所で出場大学の応援団やチアリーディングが母校の幟と共に応援合戦を繰り広げる。
 この区間で重要なのは「次につなげること」（先頭の見える位置でタスキを渡すこと）である。スピードランナーや準エースクラスの投入が多い区間だが、集団になれば牽制などでスローペースになったり、それほど大きくばらけなかったりする傾向にある。そのため、鶴見中継所に多数の選手が僅差で殺到することが多い。一方で、各校を代表するエースクラスが集い、他校よりとにかく1秒でも先に出るべく、超ハイペースで進行することもある。また、スタート直後に飛び出して逃げ切りを狙う（俗に言う「大逃げ」）学校もあり、各校の戦術が現れる区間の1つである。コース上の大きなアップダウンは新八ツ山橋と六郷橋のみ。この付近における選手同士の駆け引きも見もの。特に六郷橋から川崎市街にかけての区間では、橋からの下りを利用してスパートをかける選手も多い。
 運営管理車は、新八ツ山橋付近から入る。
 六郷橋は東京都と神奈川県の境界に位置しており、六郷橋までの交通規制・先導等は警視庁、六郷橋から神奈川県警察が担当している。
第88回まではコース中に京急蒲田第一踏切が存在したが、立体交差化に伴い、現在は撤去されている（変遷などについては#概要と走行方法の鉄道踏切におけるルールを参照）。

2区（23.1km） 

鶴見中継所→（横浜駅前）→（国道1号）→（権太坂）→戸塚中継所
 鶴見中継所から戸塚中継所までの23.1kmである（当区と裏返しの9区は横浜市内だけ）（第90回までは23.2kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 第37回（1961年）以降は最長区間となっている（ただし第82回（2006年）から第92回（2016年）は小田原中継所の位置が変更となっていて5区が最長区間だった）。各校がエース級の選手を揃えて争い「花の2区」と呼ばれ続けている区間。区間内に東海道五十三次で江戸を出て最初の難所として知られる権太坂 がある事など、地形的にも走りづらい区間といえる。
 留学生を擁する大学は、この区間に留学生をエントリーさせることが多い。
 箱根に限らず2区はその後の流れを決める重要な区間に挙げられることが多いが、各校のエース級の選手はほぼ均等な力を持っているため、ペース配分のミスやアクシデント発生以外の理由では差が広がりにくく、この区間の結果が総合優勝争いに直結することはほとんどない。 
 鶴見中継所から横浜駅前を経由して保土ケ谷駅までは標高差がほぼゼロの平坦なコースであるが、そこから東海道五十三次で箱根越えに次ぐ難所といわれた「権太坂」（ただ国道1号の権太坂は東海道のそれと比べて勾配が緩い）と、戸塚中継所手前3km地点から続く坂（通称「戸塚の壁」）がある。これら後半の難所をいかに攻略するかが最大のポイントとなる。
 鶴見中継所までは差が付かないことが多く、激しい順位変動が起こる区間でもある。エースの結果いかんで後の流れが決まってくるともいわれる。
 コースの特徴から分かる通り、地形的にも走りづらい区間といえ、平坦なコース前半にペースを上げ過ぎると権太坂と中継所手前の後半の上りで力尽き、失速することがある。好タイムを出すためにはこの上りにいかに余力を残して臨むかがポイントとなり、第75回（1999年）に当時の区間新記録を樹立した三代直樹は残り3kmの上りを快走した。

3区（21.4km） 

戸塚中継所→（遊行寺坂）→湘南新道→(藤沢)→国道134号→（茅ヶ崎）→（湘南大橋）→平塚中継所
 戸塚中継所から平塚中継所までの21.4kmである（第90回までは21.5kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 遊行寺坂を下って浜須賀交差点を右折すると湘南海岸に出るフラットなコースではあるが、海風の影響を受けやすい区間である。かつては「つなぎの区間」とされてきたが、2000年代以降、2区の流れを持続する、あるいは躓きを取り返すために力のある選手を起用するチームが増え、この区間でもごぼう抜きが見られる様になった。
 東京から小田原までのコースは東海道線と接近しているため、ファンはもちろん、出場校の走り終えた選手やコーチ、監督、付き添いなどが電車を使って移動することが多い。従って、大会開催中は移動の車中で選手や監督などに遭遇することもある（学校毎に揃いのグラウンドコートを着ている）。
 晴れた日には選手の前方に富士山の雄大な姿を望むことができる。

4区（20.9km） 

平塚中継所→（国道1号）→（大磯）→（二宮）→（酒匂橋）→（小田原市民会館前）→旧小田原中継所→新小田原中継所
 平塚中継所から小田原中継所までの20.9kmである。
 2006年の区間距離短縮以前は、4区がエース区間の一つとされており、4連覇時の駒澤大学のように、チームの絶対的エースを4区に置くケースも多く見られた。
 第82回（2006年）から第92回（2016年）までは18.5kmとされ、区間距離が大会唯一20kmを切る最も短い区間となっていた。第82回にて、往路の小田原中継所が2.5km東京寄りに変更となった（風祭鈴廣前→メガネスーパー本社前）。4区短縮の背景には「中距離で活躍する選手にも箱根に出場する機会を与えたい」という関東学連の意向があり、短縮1年目の第82回は目論み通り1500mの日本インカレ王者である村上康則（順天堂大学）が区間賞を取った。しかし、平塚中継所から11.8kmの国府津駅前交差点まで細かいアップダウンが続き、距離のわりにスピードが出にくいため、4区よりも3区にスピードランナーを置く学校も多く、この区間はチームで10番手の選手や1年生を起用する傾向が強まっている。これらのことから、他の区間よりも区間距離が短い割に1kmに平均3分以上かけて走る選手がほとんどである。1km平均3分（55分30秒）を切って走った選手は計225名中21名（約9.3%）しかいない。
 第93回（2017年）からは中継所が再び鈴廣前となり区間距離も20.9kmで、第81回までのコースと同じになる。4区については第82回大会以降の距離短縮がマラソンに順応できる選手の芽を摘み取っているという懸念が出され距離が再び延長された。この区間距離の変更に伴い第93回大会以前の記録は参考記録となった。
上位のチームは3区までの勢いを保って後続との差を広げて5区へ繋げたいのに対し、下位のチームはこの区間で前のチームとの差を縮めたいため、第93回のコース延長後は再びチームのエースが起用される区間となっている。
 晴れた日には選手の前方に富士山の雄大な姿を望むことができる。

5区（20.8km） 

小田原中継所→（箱根登山鉄道箱根湯本駅前）→（函嶺洞門バイパス）→（大平台ヘアピンカーブ）→（宮ノ下富士屋ホテル前）→（小涌園ユネッサン前）→（恵明学園前）→（芦の湯）→（国道1号最高点）→（元箱根）→箱根・芦ノ湖（往路ゴール）
 小田原中継所から芦ノ湖までの20.8kmである。
 第82回（2006年）からは距離が延長され、全区間で最長の23.4kmとなっていた。
 第91回（2015年）で区間距離は23.2kmに変更された。これは2014年2月7日をもって従来の通過点となっていた函嶺洞門を迂回する「函嶺洞門バイパス」の開通に伴いコースが変更されたためであり、約20m延長された。これに伴い第90回大会以前の記録は参考記録となった。コース変更と合わせて行った距離の再計測により、距離表示ではそれまでより200m短くなっている。
 第93回（2017年）からは中継所が再び鈴廣前となり区間距離も20.8kmとなる。5区については第82回大会以降の区間距離延長により、走行後半に低体温症や低血糖症の症状に陥る例が多数発生するなど選手に対する負担が問題視され、また5区の総合成績に対する貢献度が大きくなりすぎているという指摘があったことから距離が再び短縮されることとなった。この区間変更に伴い第92回大会以前の記録は参考記録となった。
 小涌園手前には箱根登山鉄道鉄道線の踏切（小涌谷踏切）があるが、箱根登山鉄道の協力を得て選手が通過する際には列車を踏切の直前で一旦停止させる措置がとられている（#概要と走行方法の鉄道踏切におけるルールを参照）。
 俗に「山上り」と呼ばれ、標高差864mを駆け上がる非常に特異な区間である。小田原中継所から箱根湯本駅前までの約3kmは若干の上り勾配はあるものの、比較的平坦ではあるがゆえに、序盤の平坦な区間では力を温存し、箱根湯本駅前から始まる本格的な上り坂でいかに力を発揮できるかがポイントとなる。相当な脚力とスタミナが要求され、コース適性が最も必要とされる。その為スペシャリストが担当することが多く、「4年連続同一区間走行選手数」が全区間中最多（37人）となっている。特殊な区間ゆえに個人成績で大差が付きやすく、4区終了までについた数分の大差を5区のみで挽回する大逆転も頻繁に発生する。シード制が導入された第33回以降、5区で区間賞を取った大学がシード権を逃したのは、参考記録扱いで個人記録のみ有効であった第80回（2004年）の日本学連選抜を除けば、第39回、第41回、第60回、第77回、第92回のわずか5例しかない。ことに第82回（2006年）の距離延長後は5区での成績如何により往路優勝が決しており、第82回から第92回（2016年）までのうち、5区で区間賞を取った大学が往路優勝できなかったことは第92回の日本大学のみであった（この年の往路優勝・青山学院大学の神野大地は区間2位）。山上りが注目される区間ではあるが、反対に最高点を過ぎた残り4kmの下りが勝負という言われ方もされる。事実、上りと下りでは使用する筋肉が異なるので向き不向きがあり、いきなり筋肉にかかる負荷が極端に変わることから、寒さも災いして中には下りで痙攣を起こして立ち止まる選手もいる。
 5区および6区は非常に気温の低い山中を走る。平地とは温度差があるため5・6区を走る選手の中にはタンクトップではなく、袖のあるユニフォームやアームウォーマーを着用することが少なからずある。
 第80回（2004年）の金栗四三杯創設以来、5区で区間賞を取った選手が同賞を9回（第80～83回、第85～86回、第88～89回、第91回）受賞している。この区間で圧倒的な実力を示した選手（今井正人、柏原竜二、神野大地など）に対しては「山の神」という異名が付けられることがある。

復路（1月3日） 
 箱根・芦ノ湖→東京・大手町 5区間／109.6 km

6区（20.8km） 

箱根・芦ノ湖（復路スタート）→国道1号→（芦之湯）→（恵明学園前）→（小涌園前）→（宮ノ下温泉郷）→（大平台）→（塔ノ沢温泉郷）→（函嶺洞門バイパス）→（箱根湯本駅前）→小田原中継所
 芦ノ湖から小田原中継所までの20.8kmである。
 2014年2月7日をもって従来の通過点となっていた函嶺洞門が通行禁止となり、第91回（2015年）から函嶺洞門バイパスへとコースが変更となり、約20m延長された。これに伴い第90回大会以前の6区の記録は参考記録となった。
 復路は、往路のゴール地点である芦ノ湖から出発する（復路のスタート方法については#復路のスタートを参照）。
 「山下り」区間と呼ばれ、下りでの平均速度は時速25kmに達し、この高速で半径の小さなカーブを多く回るため、ひざに大きな負担がかかる。箱根湯本駅前過ぎからの残り3kmのほぼ平坦な道（若干の下り勾配はある）は選手にとって上り坂に感じると言われ、ここから1分以上の差をつけられることもある。このような事情から、5区の距離延長と同時に6区の距離短縮も検討されたが、中継所の問題等から見送られた。
 「4年連続同一区間走行選手数」が5区に次いで多く（36人）、復路中最多。3番目である2区はこの半数以下となっており、山の上り下りという特殊性が現れている。
 朝8時台に高地からスタートする事もあって気温が低く、山中では降雪することも珍しくない。体温低下を防ぐために長袖シャツのユニフォームを着用、またはTシャツにアームウォーマーを併用して体温調節をする選手がほとんどである。
 前日の夜の気象状況によっては路面が凍結して滑りやすくなることもある。その影響により、下り坂の途中で選手が転倒するケースも見られる。
 箱根登山鉄道の小涌谷踏切では、往路と同様に選手が通過する際、職員が列車を踏切の直前で一旦停止させる措置がとられている（#概要と走行方法の鉄道踏切におけるルールを参照）。
 この区間は片側1車線しかなく運営管理車の伴走が困難な事から、箱根町役場駐車場に設けられた基地に待機し、箱根湯本駅付近でコースに合流する。

7区（21.3km） 

小田原中継所→（小田原市民会館前）→（二宮）→（大磯）→（国道134号）→平塚中継所
 小田原中継所から平塚中継所までの21.3kmである。
 往路（4区）では序盤、平塚中継所通過後直進し、海沿いのコースを通るのに対し、復路（7区）は終盤、大磯駅入口交差点通過後に陸寄りのコースを通るため、4区よりも若干距離が長い。
 10区間中最も走りやすい区間といわれるが、9km以降は小刻みなアップダウンがある。当初は山から吹き降ろす冷気で冷え込むが、太陽が高くなるにつれて気温も上がるため、最も気温差が激しい区間となっている。かつては、いわゆる「つなぎ区間」として、10人の中でもさほど走力が高くない選手を置くケースが多かったが、2010年代以降は「復路の2区」として位置付けられるようになり、優勝争いをする大学にとって、7区にいかに力のある選手を置けるかが鍵となっている。

8区（21.4km） 

平塚中継所→（湘南大橋）→（茅ヶ崎）→（浜須賀交差点）→湘南新道→（藤沢）→（遊行寺坂）→戸塚中継所
 平塚中継所から戸塚中継所までの21.4kmである（第90回までは21.5kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 前半はフラットで走りやすいが、藤沢を越えると通称「遊行寺の坂」が待ち構えるタフなコース。ここでどれだけ力のあるランナーを置けるかが逆転・シード権獲得への鍵となる。
 この区間では、日差しが強いと遊行寺の坂付近で脱水症状を起こしやすい。後半のアクシデントに泣いて優勝を逃す、最悪棄権で涙を飲んだチームもある。ここでブレーキを起こすと後の2区間に大きな影響を及ぼすこともあるため、体調管理も重要な区間といえる。
 この区間は当日のエントリー変更が多く、3分の2近くが入れ替わることもある。第98回で区間賞を獲得した順天堂大学・津田将希など5区の経験者が配置 されたり、法政大学・青木涼真のように8区を走った選手が翌年以降5区に配置される事もある。

9区（23.1km） 

戸塚中継所→（権太坂）→（横浜駅前）→国道15号→鶴見中継所
 戸塚中継所から鶴見中継所までの23.1kmである（第90回までは23.2kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 「復路のエース区間」、往路2区の「花の2区」に対して「松の9区」とも言われる。各校のキャプテンないし準エースクラスが集うことが多い。前半は権太坂等の下り主体、後半の保土ヶ谷駅以降はほぼ平坦なレイアウトだが、長い区間なのできっちりとしたペース配分が必要。
 交通の便の良さが手伝ってか、例年横浜駅前には大勢の駅伝ファンが押し寄せる。
 復路の鶴見中継所は全中継所中最も繰り上げスタートが発生しやすく、さらに中継所への側道入口からリレーゾーンまで約160mの直線区間となっている。このため、9区のランナーの目の前で10区のランナーが繰り上げスタートしてしまい、タスキをつなぐことができず涙する光景が幾度も見られる。
 この区間での成績が総合成績に大きく影響する。事実、この区間は逆転が非常に多く、近年では第75回（1999年）の順天堂大学、第79回（2003年）と第84回（2008年）の駒澤大学、第82回（2006年）の亜細亜大学が、いずれも9区での逆転に成功し、総合優勝を成し遂げている。

10区（23.0km） 

鶴見中継所→（六郷橋）→（蒲田（京急蒲田駅））→（大森）→（大井）→（新八ツ山橋）→（品川駅前）→（田町）→（日比谷通り（都道409号））→（鍛冶橋通り）→（中央通り）→（日本橋北詰交差点）→東京・大手町 読売新聞ビル 前（復路ゴール）
 鶴見中継所から東京大手町までの23.0kmである（第90回までは23.1kmとされていたが2014年の再計測で距離表示を変更）。
 1区とは異なり馬場先門から日本橋を経由するルートとなっている。日本橋経由のコースになったのは第75回（1999年）からで、その際に距離が1.7km延びている。六郷橋と新八ツ山橋付近のアップダウンを除きコース全体はほとんどフラットだが、時折ビル風が選手を襲うこともある。
 最終区間である上に沿道の観衆も増える事からプレッシャーが一層掛かる区間。第75回（1999年）以降、距離の延長に伴って各チームとも準エースクラスを配するようになり、選手層の厚さが問われる区間になりつつある。近年では鎧坂哲哉（明治大学）、出岐雄大（青山学院大学）など、チームの絶対的エースながらコンディションが万全ではない選手がエース区間を回避して起用されるケースもある。
 六郷橋は神奈川県と東京都の境界に位置しており、六郷橋までの交通規制・先導等は神奈川県警察が担当し、六郷橋で警視庁に交代する。
 第88回まではコース中に京急蒲田第一踏切が存在していたが、現在は京急線の高架化に伴い、撤去されている（変遷等については#概要と走行方法の鉄道踏切におけるルールを参照）。
 第87回で寺田夏生（國學院大學）がラストスパートをかけ、テレビ中継車を追って誤って右折してしまった都道402号（大名小路）の交差点は、駅伝ファンに「寺田交差点」の俗称で知られている。この交差点では第98回（2022年）でも川上有生（法政大学）が誤って中継車を追ってしまうハプニングがあった。「寺田交差点」は駅伝マニア集団「EKIDEN News」の西本武司が命名したとされ、Google マップにおいても「寺田交差点」と表示される。

競技方法 
東京箱根間往復大学駅伝競走競技実施要項並びに東京箱根間往復大学駅伝に関する内規第5章「競技細則」第15条〜第21条に基づいて行われる。

概要と走行方法 
 各競技者とも走行は1区間に限られる（内規第15条第2項）。競技者は競技中に理由の如何を問わずいかなる人の手助けを受けても失格となるとされているが、大会医務員が触診のために競技者の身体にふれても手助けとはならない（内規第15条第4項）。当然ながら禁止薬物の使用は厳禁とされており（内規第15条第5項）、大会の要項にはドーピング検査等に関する規定がある。
 1区と6区を除く往路と復路の各区間において給水が実施されるが、給水場所の選定や実施方法については駅伝対策委員会で設定される（内規第15条第6項）。各区間の給水場所（給水ポイント）は、近年チーム間で給水の必要性が議論されて設けられたものである。ただしマラソンなどで行われる給水とは異なり、テーブルに置かれたボトルなどを取るのではなく、各チームの部員あるいは各チームが許可した大学関係者が伴走しながら渡す。必ずしも長距離部門の部員に限られておらず、2013年の往路では早稲田大学のやり投げ選手であるディーン元気が、2020年には東洋大学の競歩選手である川野将虎が給水スタッフを務めたほか、駒澤大学OBの芸人・M高史も給水スタッフを務めたことがある。給水要領 によると主催者が用意する水・スポーツドリンクを使用することとしており、競技者はいずれかもしくは両方を飲むことができる。ボトルは協賛しているポッカサッポロフード&ビバレッジのものが使用されている（ヴィッテル→ヴァットヴィレール→富士山麓のきれいな水）。以前は監督による直接の給水が2回まで認められていたが、給水方法が道路交通法に抵触するおそれがあるため2015年の第91回大会から禁止された。
 鉄道踏切における遮断閉鎖は不可抗力ではあるが、審判員が計時を行い、その間のロスタイムは競技者の所要時間に含まれないこととなる（内規第15条第7項）。実際には近年は鉄道会社の配慮によって電車の一旦停止やダイヤ調整が行われている。京急蒲田第一踏切の高架化（2011年からは臨時ダイヤで上下線共に高架上り線を列車が走行している。正式開業は2013年、詳細は後述）によって、第87回（2011年）以降に競走路上に存在している踏切は箱根登山鉄道の小涌谷踏切のみとなった。
 東海道踏切（JR東海道線・横須賀線。通称・戸塚大踏切。現在は廃止） - かつては戸塚中継所の近くにある東海道線・横須賀線の東海道踏切（戸塚大踏切）を通るコースが設定されたが、開かずの踏切だったため、状況によっては長時間の立ち往生を余儀なくされた。当時は踏切での足止めによるタイムロスが計算されず、業を煮やした選手が踏切上で立往生した貨物列車のすき間をかいくぐったり、列車が来ない合間を見計らって踏切を突破したりすることもあった。第20回（1939年）では、先行する専修大学を猛追していた日本大学が、ここでの足止めが元で優勝を逃したというケースもあり、このタイムロスを味わった選手は「あの時以来横須賀線には乗らない」と振り返っている。しかし、1953年、当時首相の座にあった吉田茂が大磯の私邸から上京する際にこの区間が渋滞することに激怒し、バイパスが造られ、これによって箱根駅伝のコースもバイパス側に再設定されたため結果として踏切遮断による足止めが解消されることとなった（バイパスは戸塚道路も参照）。戸塚大踏切は2015年3月25日にアンダーパスが開通して廃止された。
 蒲田第一踏切（京浜急行電鉄空港線。現在は廃止） - 第86回（2010年）までは（詳細後述）コース上（往路1区・復路10区）には京急空港線の京急蒲田駅に隣接する京急蒲田（空）第一踏切があり、ランナーの通過が予想される時刻を対象に京急本線・空港線と、同路線に直通運転する都営地下鉄浅草線・京成電鉄押上線・成田スカイアクセス線・北総鉄道北総線で臨時ダイヤを組むなどして電車の行き先を変更していた。2007年の第83回から、列車の発車は京急社員の代用手信号によって許可されるなどの措置が取られていた。第84回（2008年）では東海大学の選手が踏切内の線路につまづいて足を痛め、その後20km過ぎで棄権に至るというアクシデントが発生した。2010年5月16日に上り線が先行して高架化された為、第87回（2011年）以降は臨時ダイヤで上下線共に高架上り線を走行するようになり、選手通過中は踏切を使用停止にする事が可能となったため当該ポイントでの踏切通過はなくなった。その後、2012年10月20日に下り線も立体交差化事業が完成したことによって蒲田第一踏切は完全に廃止された。
 小涌谷踏切（箱根登山鉄道鉄道線） - 小涌谷駅横のコース上（往路5区・復路6区）にあり、現在では選手が通過する時間帯に箱根登山鉄道の係員が待機し、選手通過時には電車を踏切手前で停止させ、発車は代用手信号によって許可されるなどの措置がとられている。第63回（1987年）では踏切に駅伝の隊列が引っかかり、やむを得ず選手を先に行かせて関係車両が後から追い掛けるハプニングもあった。最近ではバイクカメラによる中継で選手を後ろから追うことも多くなっているが、このハプニングの際には通常は選手の正面から撮影している大型の中継車が選手の後姿を放映するという、当時としては珍しい映像が放送される事態となった。第87回（2011年）以降は小涌谷踏切がコース上唯一の踏切となった。
 特殊事情によって審判員に走行を制止された場合のロスタイムも原則として競技者の所要時間に含まれないが、この場合の計時も審判員が行う（内規第15条第8項）。
 第77回（2001年）では、復路のスタートで2位以下のチームについてもスタート時にピストルを鳴らすように変更された。しかし、ピストルに弾を詰め直す作業が間に合わなかったためか、3位の法政大学が本来の時間から25秒遅れてスタートするハプニングがあり、この年の法政大学の記録はこの25秒を含まない時間となる。これを教訓として、翌年の箱根駅伝からは再び2位以下は手旗によるスタートに戻っている。

服装・ナンバーカード・タスキ 
 出場各競技者の服装（ランニング用シャツ、ランニング用パンツ、トレーニング用シャツ等）は、各チーム統一のものを使用した上で胸部と背部に大会本部指定のナンバーカードを取り付けるが、学連選抜チームは各選手の所属校のものの着用が認められる（内規第16条第1項）。テレビ中継が始まったころからPRの目的でユニフォームを変更する大学も見られた。戦前から出場している伝統校は、胸にアルファベット1文字のユニフォームが多く（早稲田大学の「W」、中央大学の「C」など）、新興校は校名を漢字で記載するケースが多い。テレビの生放送開始後に初出場した大学は、色合いなどが目立つユニフォームの採用も見られる。
 タスキは事前に連盟に提出された各チーム独自のタスキ3本のうちの1本を中継し、残りの2本は大会本部が保管する（内規第16条第2項）。繰り上げ出発のチームは、大会本部で用意する黄色と白色のストライプのタスキを使用することになるが、5区と10区については各校とも事前に本連盟に提出された各チーム独自のタスキを使用する（内規第16条第3項）。繰り上げタスキの色は長年茶色が採用されていたが、テレビ放送開始後は早稲田大学の臙脂色のタスキと間違えやすいことから、黄色と白のストライプのものに変更された。

走行不可能

途中棄権 
競技者が競技中にケガや疾病などによって走行困難となり歩行、立ち止まり、横臥などの行動に移った場合で、本人が競技続行の意思をもっている場合にも、運営管理車に同乗の競技運営委員、走路管理員、監督またはコーチの三者の合意によって競技を中止させることができる（内規第17条第1項）。競技中止の通告は、大会の競技運営委員が当該走者に対して赤旗を挙げて示す、という手順で行われる。

競技者が走行困難となり競技中止・途中棄権となった場合、その区間の前区間までの記録は公式に認められるが、次区間からはオープン参加として繰り上げ出発し以後走行そのものは許されるが記録は公式に認められない（内規第17条第2項）。

大会史上、計11大会で延べ15チームが途中棄権している。

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 途中棄権は1970年代までの50回以上行われた大会の中で3件しか発生していなかった。しかし第71回（1995年）に順天堂大学が19年ぶりの途中棄権となって以降、第90回までの20年間で延べ12件の途中棄権が発生している。この20年の間には同一大会での複数校による途中棄権も3度発生している。しかし第91回（2015年） 以降は途中棄権は1度も発生していない。
 同一大会で途中棄権校が最も多かったのは3校が棄権した第84回（順天堂大学、大東文化大学、東海大学）である。第72回（神奈川大学、山梨学院大学）、第89回（城西大学、中央大学）では2校が棄権している。
 同一大会の同一区間での複数校による途中棄権は、これまでに第72回（4区、神奈川大学と山梨学院大学）、第89回（5区、城西大学と中央大学）の2度生じている。
 複数回途中棄権となったことがある大学は、順天堂大学（第71回、第84回）、東海大学（第77回、第84回）、城西大学（第85回、第89回）、山梨学院大学（第72回、第90回）の4校である。
 これまでの計11大会で発生している途中棄権のうち、第71回以降では2年続けて途中棄権が発生するケースが4度生じている（第71回と第72回（2校）、第77回と第78回、第84回（3校）と第85回、第89回（2校）と第90回）。
 早い段階での途中棄権は、第77回では東海大学が、翌年の第78回では法政大学が、第90回大会では山梨学院大学が、それぞれ2区で途中棄権している。最も短い距離での棄権は2区7.3km過ぎ地点での棄権となった第78回の法政大学である。
 ゴール間近での途中棄権は、往路では第84回の順天堂大学が5区の芦ノ湖ゴールまで残り500mの地点で棄権している。復路では第52回の青山学院大学が10区のゴールまで残り150mの地点で棄権している。
 前年優勝校による途中棄権は、これまで2度生じている。第72回の山梨学院大学、第84回の順天堂大学である。
 これまで途中棄権が最も多い区間は、過去3チームが棄権している2区、5区及び10区である。途中棄権が発生していないのは1区、6区及び7区である。
 途中棄権した大学は以降の区間でオープン参加の扱いとなるが、棄権した以降の区間で参考記録ではあるが区間1位の公式記録を上回るタイムを記録したケースが2度生じている。第85回9区での城西大学（復路8区で棄権）、第89回8区の中央大学（往路5区で棄権）であるが、いずれの場合も参考記録扱いのため区間賞とはならなかった。ただし、かつては個人記録および一部のチーム記録（往路で途中棄権した場合は復路のチーム記録のみ）が公認されたことがある。第72回では7区と9区で神奈川大学（往路4区で棄権）が、10区で山梨学院大学（往路4区で棄権）が途中棄権した以降の区間で区間賞を獲得している。
 5区、10区以外で途中棄権した場合、次の区間のスタート時間は大会規定により繰り上げスタートと同様の扱いとなっているが、交通事情を考慮し、審判主任の裁定によりそのスタート時間を早める場合もある。第72回の4区で神奈川大学と山梨学院大学が途中棄権した際は、本来は先頭通過から20分後に小田原中継所をスタートするところ、交通渋滞を考慮し、最後尾（13番手）の東洋大学がタスキリレーを行った1分後に両校が一斉スタートとなった。第78回の2区で法政大学が途中棄権した際は、本来は先頭通過から10分後に戸塚中継所をスタートするところ、最下位（14位）の東海大学がタスキリレーを行ったと同時にスタートとなった。
 棄権には至らないものの故障や体調不良によるブレーキの事例が例年生じている。チーム競技である駅伝の特性上、体調を崩したり故障箇所を抱えている場合であっても、選手は「タスキをつなぎたい」と思うがゆえに無理を押して走行を続けようとし、監督も棄権は良しとしない傾向が見られる。この場合、指揮官としても止めがたい側面もあるが、場合によっては選手生命にも影響を及ぼしかねないため、途中棄権についての判断の是非は重要課題となっている。
 途中棄権を回避するには、コンディションの悪い選手のエントリーからの除外、区間エントリー時に補欠選手と交代などがある。エントリー数が20チームに増加した第79回（2003年）から、本番までのチームマネジメントに時間的猶予を配している。しかし本番直前の時期に調整不足や体調不良であった場合でも、その選手がそれまで良い成績を記録していたりチームのまとめ役だったりすると、本人が強い責任を感じている傾向にある上、監督としてもチーム事情を考慮した上で強行出場させてしまうケースがまま散見され、途中棄権の解消には至っていない。2012年（第88回）には東京農業大学の5区の選手がエントリー締切後に不調を訴える事案も発生した。この選手は中盤以降はジョギングほどのペースまで速度が落ちながらも、1位のフィニッシュから約40分後に無事に完走した。

代走（再走） 
現行ルールでは存在しないが過去の記録の上では、正規の選手が走行不能となった時に補欠選手が改めて走り直す「代走（再走）」が行われているケースが確認できる。これは当時のルールが「走行不能になった場合、途中棄権とはならず、代走にて再度該当区間初めから走り直し記録は残る」 となっていた事による。このケースでは同一区間について複数名の選手名の記載が確認できる資料がある。このような「代走（再走）」で過去の記録の上では5件確認されている。

{| class="wikitable" style="text-align:center;font-size:small;white-space:nowrap;"
|+ 記録上確認できる「代走（再走）」
!大会||大学名||区間||「代走（再走）」理由
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!第11回 (1930年)
|日本大学||9区||style="text-align:left;"|正規選手の転倒による走行不能
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!rowspan="2"|第13回 (1932年)
|東京文理科大学||1区||style="text-align:left;"|正規選手のアキレス腱痛による走行不能
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|明治大学||4区||style="text-align:left;"|正規選手の心拍異常による走行不能
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!rowspan="2"|第29回 (1953年)
|日本体育大学||3区||style="text-align:left;"|正規選手の右大腿骨骨折による走行不能
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|法政大学||8区||style="text-align:left;"|正規選手の転倒による走行不能
|}

タスキの中継方法 
タスキの受け渡しは、前走者が完全に所定の中継線を通過した上で、中継線の進行方向20m以内で次走者に渡して行うこととなっている（内規第18条第2項）。

繰り上げ出発（繰り上げスタート） 
往路の鶴見・戸塚中継所については先頭走者から10分遅れたチーム、往路の平塚・小田原中継所については先頭走者から15分遅れたチーム、復路すべての中継所については先頭走者から20分遅れたチームは、交通規制の時間を長引かせないため、各中継所審判主任の裁定で、前走者が到着しなくても次の走者を出発させる（内規第19条）。これを「繰り上げ出発」という（報道などでは「繰り上げスタート」と言われる）。

繰り上げ出発を採用する他の駅伝と同様に、チームが繰り上げスタートとなった場合、走者は「繰り上げタスキ」と呼ばれるタスキをかける。箱根駅伝の場合、内規第16条第3項により、繰り上げ出発のチームは、2区から4区・7区から9区では、大会本部で用意する黄色と白色のストライプのタスキを使用することになる。そのため、それまで走っていた選手らにとっては、自らの学校のタスキが全区間つながらなかったという悔しさがにじみ出る瞬間であるといわれ、実際に日本テレビの放送では「無念の繰り上げ」という表現も使われる。同時に出場校はすべての中継所で繰り上げを回避するべく高い競技レベルを維持することが要求される。

繰り上げ出発が行われた場合、各チームが走行している順位（見かけ上の順位）と実際の順位が異なる場合を生じるため、チームの総合順位は見た目のタイムに繰り上げ分の時間差を加算して算出される。テレビ中継における順位は、繰り上げ出発による時間差が換算された上で表示される。

繰り上げ出発となったチームの場合、走行順で最初にゴールした場合でも繰り上げ分の時間差を加算すると総合優勝とならないケースがある。

2012年（第88回）では、神奈川大学の9区走者が鶴見中継所まで残り100m地点で脱水症状のため転倒し、ふらふらになりながら繰り上げスタート直前に10区走者にタスキを渡した。このシーンでは日本テレビが独自に計測した時間と公式記録に差があったため、日本テレビではあたかも繰り上げスタートになったかのように実況され、大きな話題を呼んだ（公式記録では1位からちょうど20分差）。

復路のスタート 
復路のスタートは、1位から10分以内の大学は時差出発を行い、その他の大学は1位校のスタートから10分後に全員揃って同時出発する（内規第20条）。つまり、往路のゴールにおいて1位から10分を超えて到達した大学は、3日の復路では午前8時10分（JST）に同時出発となる（報道では「復路一斉スタート」「繰り上げ一斉スタート」などと呼ばれる）。

同時出発が行われた場合も繰り上げ出発と同様に、見た目のタイムに繰り上げ分の時間差が加算される。しかし、一斉出発の場合は往路からつないできたタスキが途切れるわけではないため、「無念の」などの表現が用いられることは少ない。

復路の一斉スタートも10分ではなく20分にすべきという主張もあるが、交通規制などの関係から難しいとされる。

同タイムの順位 
走行結果が同タイムの場合はゴールの着順に基づき成績順位とする。ただし、繰り上げ出発などによりゴールの着順が成績順位を示さない場合の同タイム校の順位決定は、区間上位者数の多少によるものとされる。まず区間1位の数で比較し、同数ならば区間2位の数と順位を一つずつ下げながら数を比較していき、多い方が上位となる（内規第21条）。

この方法でも同タイム校が複数になった場合は、すべて同順位として扱われ、10位同タイム校が複数になった場合は、すべて10位校として翌年へのシード権が与えられる（内規第21条）。

歴史 
箱根駅伝は、宿駅間を継走し文書や情報を伝達していた宿駅伝馬制の飛脚（現在の郵便配達制度）をもとに、手紙に見立てた襷を、東京から東海道の宿駅があった鶴見（川崎宿）、戸塚（戸塚宿）、平塚（平塚宿）、小田原（小田原宿）で引継ぎ、箱根町郵便局（箱根関所）に届けて、東京に戻るまでの速さを競う大学対抗戦のイベントとして開催された。第1回から第12回までの往路ゴール地点は箱根関所跡であり、第22回(箱根神社)を除く第13回から第44回までは箱根町郵便局がゴール地点だった。その開催目的は、寒さや雪で観光客が少なくなる冬に観光客を呼び込むためで、宿泊客を増やすために２日間に渡って開催されたという説がある。しかし第1回大会・5区箱根の山中で、慶應義塾大学の二木選手（山岳部主将）が遭難して消息が全く不明になり、箱根町の青年団は松明を持って捜索し、木にしがみつき泣きじゃくる選手を発見した。小雪が降る寒さの中、最悪の事態にならずに済んだが、この遭難により観光客を呼ぶという目的を公にすることが出来なくなり、「長距離選手を育成する」という目的になったといわれている。現在では「長距離選手を育成する」という目的が定説になっている。当初はイベントだったためルールが曖昧で、人力車夫や陸上以外の他競技の選手が走ったこともあったが、「長距離選手を育成する」という目的になることで回数を重ねるごとに陸上競技性が強くなり、1958年NHKによるラジオ放送、1987年日本テレビが中継を開始するなど放送技術の進化もあり、細かいタイムを競い合う大会になった。ルールが厳格化し競技性が強くなる過程で、駅伝という言葉の意味が「宿駅伝馬制」から「陸上競技」に変化した。

別の説もある。箱根駅伝を着想したきっかけは1919年10月、金栗四三が埼玉県の鴻巣で行われた小学校の運動会に審判として招かれたことであった。帰路の車中、金栗は（同じく審判として招かれていた）2人の陸上選手、東京高師の後輩である野口源三郎および明治大学の学生だった沢田英一と語り合った。沢田英一がその年の6月に同窓の出口林次郎と二人で札幌・東京間の走破を成し遂げていたことを踏まえ、3人は世界の耳目を集め、日本の長距離選手を育成するような外地での長距離走はできないものかと考えた。このときの結論が「アメリカ大陸横断駅伝」であった。その「予選会」という位置づけで国内での駅伝大会の実施が企図された。アメリカ大陸横断コースで最も大きな障壁となるであろうロッキー山脈の走破を見据え、この「予選会」のコースとして選ばれたのが山越えをコースに含む東京-箱根間であった。金栗らは大学や新聞社を回って参加と協力を訴え、金策に苦労しながら1920年2月14日に第1回箱根駅伝を実施した。

箱根駅伝は始まるが、肝心の「アメリカ大陸横断駅伝」は実現しなかった。明治大学の出口林次郎と早稲田大学の生田喜代治らは箱根駅伝の実施に協力を惜しまなかった報知新聞社を訪ねて再び計画への協力を願ったが、実現は難しいという答えしか得られなかった。二人はあきらめず毎日新聞社の資金を得て調査のため1922年にアメリカに渡った。結局「アメリカ大陸横断駅伝」の話はそのまま頓挫した。その後、出口はコーネル大学からベルリン体育大学に学び、母校明治大学で教鞭をとることになった。しかし生田は渡米5年目の1927年メキシコのカンセンシコで事業をめぐるトラブルに巻き込まれて横死している。資料によっては「アメリカに渡った学生が殺害されたため、アメリカ横断駅伝の計画はついえた」という書き方がされていることがあるが、実際には計画は早々に頓挫しており、生田の死によって駅伝計画が中止されたわけではない。

黎明期は現在のように開催期日が固定されていたわけではなかった。「学生の本分は勉強」という理由で、午前中に授業をした後で午後からスタートすることもあった。このためにレース途中で日没となり、中でも5区の選手が暗闇の中を走らなければならなかったが、実際には地元の青年団の団員が松明を持って伴走したために事なきを得た。

山登りの5区は当初はスタートとゴールしか決まっておらず、出場校は箱根山中をできるだけ近道をしようと思っていた。選手を心配した地元住民たちが松明を持って伴走するなど協力を得て近道をするチームはなく、全チームが無事に走り終える。しかし山登りのあまりの苦しさに、道端の木にしがみつき泣きじゃくる選手もいた。

1925年の第6回大会で、日本大学は選手の代わりにタスキをもらった人力車夫が走ったこともあり4人抜きを見せたが、翌年の出場を辞退した（人力車夫事件）。

勤労学生の出場で二重登録による失格処分になったり、ゴール直前で失神した選手を関係者がラインまで引きずり込んだにもかかわらず失格にならなかったりと失格に関する基準も曖昧だった。箱根駅伝関係の書籍に出場校の歴代全成績が掲載されているが、公式順位がついているものの実際には失格扱いになっている大学がいくつかある。かつての成績については資料によって若干の相違点が見受けられる。

第二次世界大戦前は学制の違いもあり、大学予科から大学本科まで入れると5回以上の出場が可能だった。大学専門部から予科を経て本科まで通い、最高で8回出場を果たした選手がいる。

第二次世界大戦前から終戦直後に掛けては学生数の絶対的な不足もあって、1チーム10人のメンバーを組むこと自体が困難だった。そのため、戦後すぐのころまでは他の種目の選手が起用されることは決して珍しいことではなかった。同じ陸上競技である短距離や跳躍、投擲選手が起用されたことはまだいい方で、ラグビーやスキーの選手が登場した例も多かったという。現在でも高校から陸上を始めた選手は多く見受けられ、第82回（2006年）・第83回（2007年）大会に出場した亜細亜大の岡田晃や第84回（2008年）・第85回（2009年）・第86回（2010年）に出場した大東文化大の清野篤のように大学から陸上競技を始めた選手もいる。1970年代ごろまでは実業団経由で入った選手も多かった。

モータリゼーション化で交通渋滞が増えてきたのが高度経済成長のころ。全国的な知名度はまだ低かったがコース沿線地域での人気は高かったため、コース周辺の交通渋滞に警察からも開催中止要請が出たこともあった。主催者側と警察側との折衝で15校制や繰り上げスタートなどのルール改正がなされたことにより、中止要請は出なくなり15校制は第78回（2002年）まで続いた。

1960年代から1970年代に体育系学部を擁する大学が台頭したが、この頃は学生運動の時期と重なり好成績にも影響しているとする説もある。

歴代大会 
注：出場校数に学連選抜チームは含まない。

成績・表彰・式典

成績 
 歴代出場校順位成績

 歴代本戦出場校一覧

表彰 
以下のような表彰がある。
 総合優勝校には、賞状、優勝カップ、金メダル、優勝旗などを授与（内規第24条第1項）。優勝校監督には記念品を授与（内規第24条第6項）。
 準優勝校、3位校には、賞状、カップ、メダルを授与。
 総合1位から10位までのチームを入賞として賞状とトロフィーを授与（内規第24条第2項）。第78回（2002年）までは入賞は8位までとされていた。
 往路優勝校、復路優勝校には賞状とトロフィーと副賞を授与（内規第24条第3項）。往路優勝校に関しては往路ゴール後に箱根町から提供される地元の名産寄木細工のトロフィー（箱根町長杯）が第73回（1997年）より授与されている。
 区間賞者（各区間1位の者）には賞状とトロフィーを授与（内規第24条第4項）。
 最優秀選手には金栗四三杯が授与される（内規第24条第5項）。「日本マラソンの父」と評された金栗四三の功績を讃えるため、第80回（2004年）に新設された最優秀選手賞。最も優秀な記録を出した選手に授与される。金栗四三杯の名称は富士登山駅伝でも用いられておりこちらの方が先に命名されている。山登りの5区を中心に往路から選出されることが多い一方、復路からは第84回（2008年）の篠藤淳（中央学院大学）、第90回（2014年）の大津顕杜（東洋大学）、第93回（2017年）の秋山清仁（日本体育大学）、第94回（2018年）の林奎介（青山学院大学）、第95回（2019年）の小松陽平（東海大学）、第98回の中村唯翔（青山学院大学）の6名しかいない。現在のところ3区（戸塚 ⇒ 平塚間）からの選出はない。

式典 
表彰（優勝校・入賞校・区間賞・金栗四三杯等）は「閉会式」の会場で行われるが、往路優勝の表彰については芦ノ湖の特設会場の「往路表彰式」で行われる。閉会式は1月3日の大会終了後によみうり大手町ホールで行われている。

大会運営

本大会

現在 
 主催 - 関東学生陸上競技連盟
 共催 - 読売新聞社
 特別後援 - 日本テレビ放送網
 後援 - 報知新聞社
 特別協賛 - サッポロホールディングス
 第63回（1987年） - 第79回（2003年）：サッポロビール（旧法人、現・サッポロホールディングス）。
 第80回（2004年） - 第93回（2017年）：サッポロビール（新法人）

 協賛 - トヨタ自動車、ミズノ、セコム、（第93回以降）敷島製パン（Pasco）

 運営協力 - 東京陸上競技協会、神奈川陸上競技協会、名橋日本橋保存会、箱根町、陸上競技社
 その他協力
 警視庁・神奈川県警察 - 選手の先導及び安全確保任務のため選抜された白バイ隊員は、このために事前に特別訓練を行なって本番に臨んでいる。
 大手町 - 六郷橋：警視庁第一方面交通機動隊（先導担当は各方面隊から特に選抜された隊員が担当）
 六郷橋 - 平塚中継所付近：神奈川県警第一交通機動隊
 平塚中継所付近 - 芦ノ湖：神奈川県警第二交通機動隊
 第88回（2012年）の10区では、かつて箱根を走った日大陸上部OB（第9方面隊所属、1年次に7区で区間賞、4年次に主将を務め総合4位に貢献）が先導を担当するというエピソードが生まれた。
 ウェザーニューズ - 気象面で運営をバックアップしている。具体的には、各中継地点で、気象情報を収集し、主催者や日本テレビに報告、大会運営や実況中継コメントなどで活用されている。第86回（2010年）からはテレビ中継の各中継地点の気象情報表示時に「気象情報 ウェザーニューズ」のクレジットが表示されている。
 医師 - 順天堂大学OB

過去 
 アシックス（第39回（1963年） - 第70回（1994年））
 日産自動車（第63回（1987年） - 第68回（1992年））
 マツダ（第69回（1993年））
 三菱自動車工業（第70回（1994年） - 第79回（2003年））
 本田技研工業（第80回（2004年） - 第86回（2010年））

運営車両の変遷 

運営車両は以下の編成
 大会会長車：審判長が乗車
 大会本部車：審判員が乗車
 技術総務車：走路の安全確認
 広報車：選手の接近を告知
 運営管理車：各大学の監督が乗車し、選手に指示を送る。監督・アシスタント・大会運営側委員が乗車。乗車人数が多い為、ミニバンが選ばれる。
 緊急対応車：3台投入。走路の最後尾を走り、選手のトラブルなどに対応
 医務車
その他、報道関係車両（日本テレビ所有のテレビ中継車とバイク中継車、NHK（日本放送協会）所有のラジオ中継車、共同カメラ車（小型トラック）、新聞社の報道車）や、警視庁・神奈川県警察の警察車両が隊列を組む。

第78回までは陸上自衛隊が担当。陸自撤退後の第76回からは三菱自動車が運営車両を提供していたが、リコール隠し騒動の影響で第79回（2003年）をもって撤退。第80回（2004年）から第86回（2010年）まではホンダが運営車両を提供した。この間は大会本部車に、ホンダで開発していた燃料電池自動車を冬季公道走行試験を兼ねて投入していた。

第89回（2013年）まではホンダが車両提供契約を締結していたが、第87回（2011年）以降はトヨタが運営車両全て（医務車と一部の車両を除いてハイブリッドカー）を提供。また第90回（2014年）以降の運営管理車には、各チームのたすきと同じ色のラインテープによる装飾（ボンネット・リアハッチ・左側面）が行われている。

予選会 
 主催 - 関東学生陸上競技連盟
 共催 - 読売新聞社
 特別後援 - 日本テレビ放送網
 後援 - 報知新聞社、国営昭和記念公園、立川市、立川商工会議所
 特別協賛 - サッポロホールディングス
 第63回（1987年） - 第79回（2003年）：サッポロビール（旧法人、現・サッポロホールディングス）。
 第80回（2004年） - 第93回（2017年）：サッポロビール（新法人）
 協賛 - トヨタ自動車、ミズノ、セコム、 （第93回以降）敷島製パン（Pasco）

 運営協力 - 東京陸上競技協会、陸上自衛隊立川駐屯地

学生スタッフ 
大会を支えているのは関東学連に加盟している加盟校である。創設以来の学生主体を現在も守り、沿道の走路員スタッフとして学生が起用されている。

箱根駅伝に出場するチームで選手や付き添い以外の部員、予選会で落選したチームの選手のほかにも1年生を多数スタッフとして送り込んでくる大学、トラック&フィールドも抱える大所帯の大学からも多数のスタッフが派遣されており、過去には末續慎吾、為末大なども走路員としてスタッフに加わった。

医療スタッフ 
駅伝に出走する選手のアクシデント等への対応のため、走者に車で伴走する医者のほか、各中継所に数人程度の医者が待機している。1992年より、順天堂大学医学部同窓会「順神会」の有志がメディカルボランティアを行っている。

かつてはスタートとゴールのみに医師がいる状態で、大手町側は読売新聞社の産業医が担当していたが、読売新聞本社ビルの建て替えのため対応できなくなった。昭和年代にも、途中棄権者が出た際に医師が不在であることが問題になったこともあり、関東学連と順天堂大学医学部OBの宮川政久（2022年現在は川崎市の宮川病院院長）が医学部を持つ大学への協力を求めたが、無報酬であることなどがネックとなり協力を得られなかった。やむなく宮川が順大同窓会に助けを求め、1992年から同窓会が医師の派遣を行うようになった。

出場チームの取り組み 〜1年間の流れ〜 
 3月頃まではハーフマラソンなどのに出て刺激を受ける選手も多い。そのうちに少しずつスピード練習を取り入れていくが、急激な練習の変化で肉離れなどが起きやすいともいわれる。近年は、この時期に合宿を組む大学も現れている。
 4月に新1年生部員が入部。春の目標は5月中旬の関東学生陸上競技対校選手権大会（関東インカレ）である。参加標準記録があり、種目ごとのエントリー人数も限りがあるので、それまでは各大学などで行われる記録会で標準記録を突破する必要がある。日本体育大学、東海大学、順天堂大学などが主催して大学内で行う長距離記録会が有名で、箱根出場大学や一部の実業団選手、高校生も出場する（この標準記録も有効期限内のものでなければいけない。大体至近2年ぐらいであることが多いようである）。関東インカレ男子は1部校と2部校（ならびに大学院生の3部校）に分かれ、毎年1部校下位2校と2部校上位2校が入れ替わる仕組みとなっているが、長距離部員のみの大学も多く、総合的なポイント獲得が難しいため、必ずしも強豪校が1部校というわけではない。
 6月中旬には全日本大学駅伝関東地区選考会が開催され、シード校を除く多くの大学が顔を合わせる。
 一部のトップ選手の場合には日本選手権など世界陸上やオリンピックへの出場を目指して実業団選手と走ることもある。近年は関東学連による海外遠征に参加する選手もいる。
 大学によって時期のずれはあるが、試験の終わる7月下旬からが夏合宿となる。長期間の合宿を組むところや、何回かに分けて練習場所を変えるところもある。選手の状態に合わせてAグループとBグループに分け、全く別の場所で行うところもあり、練習のスタイルも異なる。しかし月間で1000kmを超えることは珍しくなく、徹底した走りこみを行うことが特徴である。合宿の場所は北海道や東北地方、長野県などの高地や避暑地などが多い。前出の世界大会などに出場する選手は、チームを離れて別メニューとなることが多い。4年生は就職活動や卒業論文などと並行しながら行っている。教員免許をとる選手の場合には、夏又は秋以降に教育実習もあるためにチームを離れることも多くコンディションづくりも容易ではない。
 9月上旬には日本学生陸上競技対校選手権大会（日本インカレ）が開催される。出場のハードルは関東インカレよりも更に高い。しかし、箱根駅伝を最大の目標とする関東の大学は夏合宿での走りこみを重視し、この大会にピークを合わせることはしない。結果的に関東インカレよりもレベルの低いメンバーしか集まらないこともあり、後述される駅伝偏重につながる批判の矢面に挙げられている。
 下半期になると各大学のスタイルは、記録会にほとんど出ないところ、予選会突破を目指すところ、出雲駅伝や全日本大学駅伝を目指すところ、というように分かれてくる。特に駅伝では未経験者を試しに使ったり、様々なオーダーを試したりする使い方をする。9月ごろからは再び頻繁に記録会がある。
 予選会に出る大学にとっては、10月中旬の本番までに最高の状態にピークを持っていかなければならない。予選会を突破することが最優先のため、本番の準備（特に5区、6区の山の区間）が遅れがちになる傾向にある。
 全日本大学駅伝の後から短期の合宿を組むところもある。候補としては伊豆大島や房総半島など温暖な場所が挙げられる。
 11月下旬に各地で開催されるハーフマラソンや記録会が、事実上メンバー選考の舞台となることが多い。エースクラスはともかく、当落線上の選手達にとってはここが正念場である。多くの大学が一堂に会するので、次第に大学間の力関係も浮き上がってくる。ここでの選手記録上位校がスポーツ新聞などの「下馬評」で上位校として取り上げられることが多い。
 12月10日（第82回は2005年12月9日）までに出場校（チーム）は計16名以内のエントリーを関東学連に提出する。この最大16人がすなわち箱根駅伝本番への出場権を得た選手と言える。これ以外の選手は付き添いなど、裏方として本番までを過ごす。当日午後から出場校の監督・コーチとマネージャーがマスコミ向けに記者会見を行う。
 12月29日にエントリーした最大16人の区間エントリーを行う。16人のうち10人を1区から10区までの区間ごとに、残る6人を補欠選手として登録する。
 1月2日午前6時50分に往路のエントリー変更を締め切る。
 1月3日午前6時50分に復路のエントリー変更を締め切る。

トピックとエピソード

紫紺対決 
ユニフォームが白地に紫（藤色）のラインが入った駒澤大学と、紺色（茄子紺）の順天堂大学が激しい優勝争いを繰り広げていた2000年前後に使われていた言葉。第75回（1999年）から第84回（2008年）までは、亜細亜大学が優勝した第82回（2006年）を除き、駒澤大学、順天堂大学のいずれかが制している。

山の神 
「山の神」は、全10区の中でも箱根の山登り区間を含む5区を担当し、特に優秀な成績を修めかつ人々の記憶に強い印象を与えた選手を讃える称号である。現在は3人の選手が「山の神」と呼ばれている。
 今井正人（順天堂大学、2005年 - 2007年）
 2年生で出場した第81回大会（2005年）にて5区を担当した今井は、山上りで11人抜きを達成するとともに区間新記録を樹立。この激走を前に、実況アナウンサーが「山の神、ここに降臨」と実況したことが「山の神」の由来であり、当時同じ5区を担当した日本体育大学の北村聡が「今井さんは神様のような存在です」と言ったことに端を発する。今井はその後も5区を担当。「山の神・今井」という言葉で常に紹介された上で3年連続で区間賞を獲得し、3年時には往路優勝、4年時には総合優勝に貢献した。
 柏原竜二（東洋大学、2009年 - 2012年）
 1年生で出場した第85回大会（2009年）で5区を担当した柏原は、今井の記録を破る区間新記録を達成。その際に実況アナウンサーが「山の神を越える山の神童がここに誕生」と実況した。さらに第86回（2010年）では7位でタスキを受けた後、自己記録を10秒縮めた上で2位に3分38秒差を付けるという快走を見せ「新・山の神」と称された。紙面などではその名前と箱根芦ノ湖から「竜神」とも言われた。その後も第87回大会（2011年）、第88回大会（2012年）と4年間全てで5区を担当し、特に第88回大会では自身が持つ区間記録の更新とともに、東洋大学の総合優勝にも貢献した。今井と柏原は共に福島県の浜通り地方（今井は南相馬市、柏原はいわき市）の出身である。
 神野大地（青山学院大学、2015年 - 2016年）
 3年生で出場した第91回大会（2015年）で5区を担当した神野は、先述の通りコース変更に伴って20m延長された新コースを走った上で、参考記録扱いとなっていた柏原の記録を24秒更新する区間新記録を樹立。3代目「山の神」と称され、青山学院大学初の総合優勝（完全優勝）の立役者となった。この時ラジオ中継で解説を務めた柏原も「これで御役御免です」と発言した。翌年の第92回大会（2016年）でも5区を担当し区間2位を記録。1区〜10区までの全てで1位通過する総合完全優勝に貢献した。

スポーツライターの生島淳は『元祖・山の神』を1974年から4年連続で5区の区間賞を獲得した大久保初男（大東文化大学）であるとし、今井以前の「山の神」に上田誠仁（順天堂大）や木下哲彦（金哲彦、早稲田大学）を挙げている。奈良修（大東文化大）も今井以前の「山の神」とみなす記事もある。

なお、4代目の「山の神」の条件として、5区の距離延長前の第81回で今井が樹立した1時間09分12秒に近い記録を出すことが挙げられている。その後第93回で元の距離に戻され、ほぼ同じコースになったためである（ただしその間に函嶺洞門バイパスへコース切り替えがあったため、完全に同じコースではない）。

コースへ礼 
タスキを次走者へ渡したあとにコースへ礼をする選手も散見される。これは箱根駅伝へ出場でき、無事に走れたことへの感謝を示す行為で戦前から見受けられる。従来は個人的な行為であり、チーム全体としては行われてこなかったが、第85回（2009年）に東洋大学が優勝した際、前年に元部員による不祥事があったにもかかわらず関係者の配慮などで出場できたこと、沿道で暖かい声援を送ってくれた全ての観衆へのお礼として自粛した胴上げのかわりに行われた。東洋大学は第86回（2010年）、第88回（2012年）に総合優勝した際も胴上げの前にまずコースに向かって監督・コーチ・選手全員で礼をした後に胴上げをしている。

超高速化 
第87回（2011年）で優勝した早稲田大学の優勝タイムは、従来の総合記録を3分以上更新し、復路が日本橋を経由するルートに変更された第75回（1999年）以降では初めて11時間を切った。そして早稲田大学とはわずか21秒差で2位の東洋大学（11時間00分）、3位の駒澤大学（11時間03分）も、従来であれば十分に優勝出来るタイムであった（従来の総合2位の最高記録は11時間07分台であり、11時間06分以内のタイムで総合優勝を逃したケースはなかった）。

以降の大会では高速化はさらに進化し、第88回（2012年）では優勝した東洋大学の総合タイムは、前年の早稲田大学の記録を8分以上更新する10時間51分台であった。5区の山登りを（柏原が走ったことを）加味しても全区間の1kmラップが3分を切るという、驚異的なタイムであった。4位早稲田大学でも11時間3分台前半でフィニッシュしており、優勝争いするには11時間を切る実力が求められるようになった。第91回（2015年）で優勝した青山学院大学は、初めて10時間50分を切る10時間49分台でゴールした。

第96回（2020年）では、1区・8区・9区を除く7区間で区間新記録が生まれ、往路では全チームが5時間40分を切るタイムでゴール。復路でも全チームが5時間40分を切るタイムでゴールした。総合タイムでは青山学院大学と東海大学が10時間50分を切ったほか、シード権を得られる上位10校が全て11時間を切るタイムを記録した。さらに、第98回（2022年）では東海大学が、第99回（2023年）では東京国際大学が総合タイムで11時間を切ったにも関わらず、シード権を獲得できなかった。

2010年度以降、総合優勝タイムが11時間を超えたのは、強風に見舞われた第89回と、4区・5区の距離の再改正が行われた第93回のみである。往路優勝および復路優勝のタイムが5時間30分を超えたのもその2大会のみである。

2010年代以降の高速化の要因として、各大学ともに選手のスカウティングやトレーニングに力を入れた結果、選手層が厚くなり優勝争いのレベルが非常に高くなったこと、ナイキの厚底シューズに代表される高性能ランニングシューズが普及し、記録が更新しやすくなったことが挙げられる。

優勝を目指す大学にとっては、「つなぎ区間」という概念は無くなりつつあり、全ての区間が「重要区間」「エース区間」と位置づけられるようになってきており、いかに力のある選手が万全の体勢で走れるかが鍵となっている。

一方、ハイペースに付いて来られない下位の大学にとっては、繰り上げスタートのリスクが非常に高くなっており、如何にタイム差を抑えて母校のタスキを繋ぎきれるかが焦点となっている。事実、高速化が顕著になった第88回と第90回から第95回までの計7大会は、復路の鶴見中継所（10区スタート地点）で4チーム以上が繰り上げスタートになっており、戸塚中継所（9区スタート地点）でも繰り上げスタートが発生。さらに、第92回から第94回までの3大会は復路の平塚中継所（8区スタート地点）で繰り上げスタートが発生していた。

ただ、下位校の記録も年々向上し、第96回以降、復路の鶴見中継所での繰り上げスタートは3チーム以下にとどまっており、各校の戦力も徐々に均衡するようになってきている。

練習（試走）中の事故で死亡 
第32回大会が開催された1956年の12月11日、箱根町の国道1号線・宮ノ下界隈に於いて駅伝練習（試走）を行っていた専修大学の学生、小山国夫が交通事故に遭い、死亡した。事故当時、小山は前記国道1号線を駆け下りていたところだったという。小山は、前記第32回大会に専修大学の第7区走者としてエントリー、1時間13分35秒のタイムで区間9位という成績を残していた。

事故から2年余り経過した1959年3月5日、宮ノ下観光協会の手により、小山に対する鎮魂の意を込めた当駅伝35回記念碑が建立された。その記念碑は宮ノ下交差点から元箱根方向に約300m上ったところの右手、箱根神社宮ノ下別院付近に存在し、裏面には小山の母親による鎮魂の句が刻み込まれている。

コースに於ける事前試走は、現在、安全上の理由から当駅伝の主催者・関東学連により禁止されている。しかし実際には、箱根山中を試走する箱根駅伝出場ランナーとおぼしき姿が散見されている。

箱根駅伝ミュージアム 
2005年3月に芦ノ湖畔に箱根駅伝を題材にした箱根駅伝ミュージアムがオープンした。スポーツを題材にした博物館は多いが、1つの行事として博物館化されることは極めて珍しい。運営は富士屋ホテルが行っている。

ゴミ拾い駅伝 
箱根駅伝復路の翌日から2日間、出場した大学の学生たちなどがゴミ拾いして同じコースをもう一度歩く。1998年に神奈川大学のウォーキング活動を復活させる動きがきっかけとなり、2006年に「大学対抗・ゴミ拾い」の形式でリニューアルされた。「もう一つの箱根駅伝」と呼ばれた。

日程は往路の5区間を2日に分けて行い、1日目が東京・大手町から神奈川・平塚までの3区間。2日目は平塚 - 箱根の2区間をゴミ拾いしながら歩く。順位は1袋10Pで半分だと5P。到着時間は最後のチームを基準とし、1分早いごとに1Pが加算される。

チーム人数は原則5人だが、5人集まらない限り3人1チームで参加が認められる。

当初は大学のみだったが現在は一般の参加も可能となり箱根駅伝に出場できない女性や社会人、海外からのチームも参加している。

2011年に「もう一つの東海道駅伝」と名称を改め、京都・三条大橋までのゴミ拾い駅伝を実施。東京 - 神奈川間以外に活動を広げた。

エピソード 
箱根駅伝は日本のスポーツの中でも長い歴史を持つイベントである。そのために様々なエピソードが生まれた。
 箱根駅伝の開催目的に「アメリカ大陸横断駅伝」を開催するための「予選会」を行うためとあるが、この開催目的は1980年代に放送されていたテレビ番組「アメリカ横断ウルトラクイズ」の人気とともに言われ始めたという説がある。実際そのクイズ番組では「予選会」が行われており、箱根駅伝と同じ日本テレビが放送局であった。
 正式な資料は無いが、箱根駅伝は1917年に行われた「東海道駅伝徒歩競走」に影響を受けた当時の箱根町郵便局長・石内九吉郎と、その父親で箱根町長・石内為次郎が企画したものを、神奈川県の有力者だった県会議員・河野治平に開催の相談を持ち掛け、実施されたという話がある。箱根側の目的は冬に観光客を呼ぶというものであった。河野治平は、政治家を目指す息子・河野一郎を駅伝で走らせれば知名度を上げることができると考え、金栗四三に実施運営させたといわれる。河野一郎は選挙区がある小田原を第1回から4年間走った。街道の市民に手を振りながら走ったといわれる。なお、河野治平が関東地方に顔の利く政治家であったことが、関東地域の大学のみ出場するという流れになったといわれている。
第1回大会・5区箱根の山中で遭難した慶應義塾大学の選手を、松明を持った青年団が発見した時、選手は木にしがみつき「もう嫌だ！走りたくない！何で走らなきゃいけないんだ！」と泣きじゃくったという話がある。青年団は選手をなんとか説得しゴールまで伴走した。なお当時の箱根町は現在と違い、箱根・元箱根・芦ノ湯の３地区であり、選手は国道１号ではなく箱根旧街道を登った。
 遭難者を出したことで箱根駅伝を企画した石内九吉郎は地元から強いバッシングを受けた。息子・石内直太郎はその様子を見て箱根町と父親に嫌悪感を抱くようになり、彼は成長した後、長男だったが家を出て、人から感謝される教育の道に進み、沼津市立沼津高等学校を創立した。その理念は、戦後は箱根駅伝に出場するような有名大学に入るためのエリート教育ではなく、もっと名のない雑草のような子供たちが自由に学べる場所を創るべきというものだった。その石内直太郎の教育哲学に影響を受けた甥の宮下盛（石内九吉郎の孫）は、箱根町で生まれ育ったが、箱根駅伝に出場するような関東の有名大学ではなく、当時全くの無名だった関西の近畿大学に進学し、後にクロマグロの完全養殖（近大マグロ）を成功させた。(上記の箱根駅伝初期のエピソードは、宮下盛氏が語っていたことをまとめています)
 箱根駅伝に関する書籍が第１回開催（1920年）から３０年以上出版されなかったのは、第１回で遭難者が出てしまったため、という説がある。
 政治家と箱根駅伝の話。河野一郎と吉田茂は仲が悪かった。毎年正月に大磯町の別荘に行っていた吉田茂は、憎き河野一郎が箱根駅伝と関係が深かったため、箱根駅伝まで憎くなり、別荘の前を通過する選手への応援がうるさい、なんとかしろと難癖をつけたといわれる。（実際にコースが変更になったという説もある）
 伴走車には各校の応援団が大挙して乗り込み選手に声援を送っていたが、危険であるため河野洋平（日本陸上競技連盟会長・衆議院議長・外務大臣を歴任）が廃止させた。
 表彰式では総合優勝校に優勝旗が授与されるが、前年優勝校が大学に置いたままにしていたためにあわてて取りに帰り、表彰式の開始時刻が遅れたことがあった。
 第63回（1987年）には、最終10区で順天堂大学の選手が、興奮して突然飛び出してきたファンとの接触により転倒した。
 これまで、ごくまれに悪天候（多くは降雪）下で開催されたことがあるが、このために交通手段が影響を受け、選手や関係者が到着できずに失格の危機に瀕した事例もある。
 沿道で配られる読売新聞社と報知新聞社の紙製応援小旗には、近年懸賞応募券が付いていた。これは使い終わった小旗を観客が沿道に捨てるのを防ぐための工夫であった。2007年の懸賞は1等から8等まであり、1等は「箱根ホテル小涌園 宿泊招待券」だった。2010年の応援小旗は布製で、読売新聞社の小旗は読売新聞の社旗デザインが染め抜かれ、上部に「第86回箱根駅伝」と記されている。
 下述のように箱根駅伝を目標にする選手が多く、一度大学を卒業、実業団に入ったものの「箱根を走りたい」という思いだけで有力校に再入学し箱根を走った選手も多い。
 第79回（2003年）では、大学近くで万引き犯を見つけた専修大学の選手が「俺は絶対に箱根駅伝を走るんだ。どこまでも追い掛けてやる」と犯人を取り押さえ逮捕に貢献。この選手は実際に本番で走ったが腹痛で区間最下位に終わったものの、一連の善行で知名度が上がり、その本番では「沿道から名前で呼んで応援してもらえて、とても嬉しかった」と喜んだ。

箱根駅伝が抱える問題 

箱根駅伝は、1987年以後の全国完全生中継（日本テレビ）による人気沸騰により、多くの問題が浮き彫りにされてきた。以下に主要な議論をまとめる。これらを解決すべく、関東学連に設けられた「駅伝対策委員会」の存在に期待が集まる。

留学生 
テレビの全国生中継開始と同じ、第63回（1987年）に初出場を果たした山梨学院大学は、出場3年目からアフリカ人留学生の選手を呼び入れた。主催者側の判断により箱根駅伝を外国人選手が走ることができるようになり、その圧倒的な走りで新風を巻き起こした。特に、彼らは往路のエース区間とされる「花の2区」で、「ごぼう抜き」を演じるケースが非常に多かった。その後、山梨学院大学が彼らの快走によって3回の総合優勝を果たしたことと、初出場からの連続出場を30年以上も続けたことも、アフリカ系留学生の増加に拍車を掛ける大きな要因となっている。

1980年代後半からレース全体のスピードアップが進んだことにも、留学生の登場が大きく影響している。既に全国高校駅伝やニューイヤー駅伝では、外国人選手の起用制限事項（1チームあたりのエントリー数、起用区間の制限など）があり、箱根駅伝においても第82回（2006年）からは、前述の内規第9条を変更し、16名のエントリー時点では2人まで登録可能だが、実際に本番で走ることができるのは1人に限ると決められ、2005年秋に実施された予選会より適用されている。2006年以降本番で留学生を2名エントリーしたのは山梨学院大学（第85回・第92回・第99回）、日本大学（第86回・第89回・第92回）、拓殖大学（第87-88回）、国士舘大学（第95回）、創価大学（第96回・第99回）、東京国際大学（第96-99回）の例があり、いずれの例も、実際に本番で走ったのは1名のみで、もう1名は補欠選手となっている。大学三大駅伝のうち、全日本大学駅伝では2011年より箱根駅伝と同様の人数規制が行われることになったが、出雲駅伝においては規制がない。

留学生の起用が好成績に結びつくとは限らない。実際に留学生を擁して総合優勝を果たしたのは前述の山梨学院大学のみで、最後に優勝したのも第71回（1995年）と25年以上にわたって新たに留学生を擁して総合優勝を成し遂げた大学は出ていない。シード権においても例外ではなく、第99回（2023年）では7校が留学生を起用したが、シード権を獲得できたのは創価大学（8位）と城西大学（9位）の2校のみであった。しかしレースの高速化が顕著となった2010年代以降、留学生を受け入れる学校が増加しており、第99回大会予選会では参加43校中15校から留学生が出場し、そのうち5校が予選を通過している。

箱根駅伝本大会でアフリカ系留学生が走った大学は、第65回（1989年）の山梨学院大学を筆頭に、亜細亜大学（第69回）、平成国際大学（第77回）、日本大学（第81回）、拓殖大学（第87回）、東京国際大学（第92回）、創価大学（第93回）、国士舘大学（第95回）、専修大学（第98回）、駿河台大学（第98回）、大東文化大学（第99回）、城西大学（第99回）の12校である。

予選会でアフリカ系留学生が走った大学は、山梨学院大学（第65回）、亜細亜大学（第69回）、流通経済大学（第72回）、平成国際大学（第75回）、日本大学（第87回）、拓殖大学（第87回）、東京国際大学（第89回）、桜美林大学（第91回）、日本薬科大学（第92回）、創価大学（第93回）、武蔵野学院大学（第93回）、国士舘大学（第94回）、駿河台大学（第95回）、専修大学（第98回）、大東文化大学（第98回）、城西大学（第99回）、麗澤大学（第99回）、上武大学（第99回）、立正大学（第99回）の19校である。

白人やアジア系留学生が出場した例としては、戦前の草創期に権泰夏・金恩培・南昇竜ら朝鮮出身選手の活躍が見られたものの、戦後はほとんど例が無い。

駅伝偏重とインカレポイント 
大学経営策の一環として、箱根駅伝にPR効果を期待する大学が増えている。そのため「陸上競技部」と称しながら実際には長距離部門を中心に運営している大学や、「駅伝部」を称する大学、「陸上部監督」とは別に、駅伝に特化した「駅伝監督」なるポジションが存在する大学も見られる。予選会に出場する大学の中には予選会に全力を傾けるため、インカレへの出場に消極的になりがちな大学もある。

予選会の成績に関東インカレのポイントを導入した背景には、上記の「駅伝偏重」対策が大きく影響している。主催者側も箱根駅伝を「世界に通じる陸上競技者の育成」としており、その原点に立ち返る意味で導入した。このシステムは導入時から物議を醸しており、関東学連も導入後5年を経過した2007年を機にシステムの再構築も考える可能性を残した。一方で廃止論などに対し沢木啓祐は「たまたま同じ大学が悲劇の対象になっているだけ」という見方を示し、既に導入から5年経過しており各大学とも対策を練っていると廃止論を一蹴。青葉昌幸も「出場枠増にも様々な経緯があるだけに、そのような事情を知らないで（落選したチームが）かわいそうだと言われても困る」とコメントしている。総じて関東学連側は、見直し論については当初の予定どおり検討。第84回（2008年）の予選会よりポイント方式が変更されたものの廃止には否定的な見方を示していた。

インカレポイントについて、第86回（2010年）終了時から廃止・継続又は新制度の導入などの議論を重ねた結果、2012年6月6日に行われた関東学連代表委員総会において、第89回（2013年）は現行どおり実施、第90回（2014年）は不採用とすることが決定された。第91回（2015年）以降については、廃止・継続のいずれの可能性も残し、継続して検討を重ねたところ、2013年6月10日の関東学連代表委員総会で「インカレポイントは5年に1回の記念大会にのみ採用する」と決定された。具体的な運用については今後決定するとしている。現在検討されている方式は予選会の枠とは別個に予選会が免除される「インカレポイント枠」の創設である。この方式では、直近5年間の関東学生対校選手権の総合順位とエントリー人数をポイント換算して上位1位の大学が本戦の出場権を獲得することになる（時事通信社の報道による）。

2014年3月31日の関東学連代表委員総会において、従来の関東インカレポイントにかわって、第95回大会からの5年ごとの記念大会において5年間の総合成績の累計が最も多い大学に出場権を与える関東インカレ成績枠が創設されることが正式に決定された。しかし、第95回大会後、この関東インカレ成績枠は1回限りで廃止されることが決定。今後インカレポイントがどのように活用されていくのかは不明である。

門戸開放 
箱根駅伝を出雲駅伝・全日本大学駅伝とともに「大学三大駅伝」と並び称する人やメディアも少なくないが、出雲駅伝と全日本大学駅伝が全国大会（主催：日本学連）なのに対し、箱根駅伝は日本学連傘下の一組織である関東学連が主催する地方大会にすぎないため、大会としての格は明らかに下で、出雲駅伝の関東地区選考会でもある。しかし、近年では関東の各大学が、年間の最大の目標を箱根駅伝に置く傾向が強く、更に、箱根駅伝は全日本大学駅伝や出雲駅伝に比べ、区間数や、1区間あたりの距離の平均が非常に大きい上、他の学生駅伝には無い「山登り」「山下り」の区間も存在する（学生駅伝の中では最も過酷である）ため、全国大会で本来最も権威の高いはずの出雲駅伝と全日本大学駅伝を、単なる箱根駅伝の前哨戦又は調整試合という意味合いで戦い、必ずしもベストメンバーを送り込まない大学も少なくない。地方大会であるはずの箱根駅伝が事実上の学生駅伝No.1決定戦且つ国内陸上競技最大のイベントになったことで、他の大学スポーツと同様、男子陸上長距離の人材の東京一極集中が起こっている。

このほか、関東地区の地方大会がゆえに当大会の出場は原則として関東学連の加盟校に限られる一方、テレビ報道の影響により全国的に知名度が高いスポーツイベントになったことで、他地域の大学への門戸開放を求める声がしばしば発生する。

関東学連では1960年代に予選会への出場を他地域のチームへの門戸開放を検討したこともあるが、予選会への参加を全国に開放した場合には全国大会となるため、大会の主管を日本学連へ移す必要が生じる。開催の主導権が変わることを避けたかった関東学連有力校のOBらが中心になって反対したため、結局この時の門戸開放は実現しなかった。

この動きを受けた他の学連は、関西学連・東海学連が中心になり、箱根より高い権威を持つ全国大会を創設する目的で全日本大学駅伝の創設に導いた。こうした事情から、関東学連は全日本大学駅伝の創設に最後まで反対。これ以降は箱根駅伝を関東以外の大学に開放しようという意見は消滅することになる。第90回（2014年）では記念大会による増枠分3枠を関東以外のチームに与えるとの報道がされていたが、学連選抜としてなのか単独チームとしてなのかは明らかにされていなかった。結局、上記の学連選抜チームの記載のとおり、関東のチームのみとなった。

しかし近年、全日本大学駅伝の出場校が関東の大学と他地域の大学で実力差が如実に反映されるようになった。これは男子学生駅伝の特有の現象であるとされる。上位をほぼすべて関東の大学が占める一方で、地方から出場している大学が半分も行かない地点で既に繰り上げスタートになってしまう事態が発生するに至って、全日本大学駅伝の権威が著しく低下している。

文部科学省では現在でも全国大会は実力本位の選手権大会と、選抜大会の2つしか開催しないよう学生競技団体へ指導を行っており、箱根駅伝が国内の全大学に門戸開放されると、全国大会として運営されている出雲（選抜）駅伝および全日本大学駅伝（選手権）との関係が問題となる。しかし現実には箱根駅伝が、現存する日本の駅伝では最も長い歴史を持つ大会であり、知名度も高いことを勘案すると、長年にわたり主催してきた関東学連が当大会を手放すことは考えにくい。

2010年1月に行われた監督会議では、関東学連選抜枠を「廃止」もしくは「『全国』にも門戸を開く」案を含めて見直しの方向に入るとマスメディアによって報じられ、第89回（2013年）までは存続した。それ以降については学連選抜チームの記載を参照。

2017年11月6日、関東学連は、第100回を迎える2024年の記念大会より全国化を検討していることを明らかにした。現時点での試案として、前年秋の予選会において一定のタイムの基準を満たせば、関東地区以外の大学も出場できる案、本戦もオープン参加としてではなく、正式な記録として認め、同記念大会以降も同様の形式とする可能性が挙げられている。

2022年6月30日、関東学連は2023年10月に開催される予定の第100回箱根駅伝予選会の参加資格を現行の関東学連から日本学連に広げることを発表。これにより参加できる大学が全国に広がった。

日刊サイゾーによると上述の通り関東学連の有力校OBによる全国化への反対論は今も根強いものの、独占的に生中継する日本テレビおよびスポンサー企業から全国に拡大するよう迫られた結果、関東学連が折れる形で出場資格が「日本学連に加盟する大学」に変更されたと報じている。

かねてから箱根駅伝の全国化を求めてきた青山学院大学監督の原晋は2017年の第93回大会後に行われた自民党の会合にゲスト出演した際、「全国大会化は必要不可欠である」と述べたほか、「（100回大会限定の門戸開放は）厳しい言葉で言うならば、『茶番』」と切り捨て、「101回大会（2025年開催予定）以降も継続することで地方の大学が箱根を戦えるようになる」と指摘している。さらに日本陸上競技連盟副会長で箱根駅伝のテレビ実況番組にゲスト出演している瀬古利彦は「1回だけで茶を濁すのではなく、続けることこそが真の全国大会化である」、元マラソン選手の有森裕子も「1回限りでは地方の大学のモチベーションが下がる」といった、持続的な全国大会化を求む意見が相次いでいるが、関東陸連は「現段階は100回記念大会の限定処置であり、2025年の第101回以後は検討する」としたうえで、100回大会においても「予選参加校は各々12人が出場登録し、そのうちの10人がハーフマラソンを走っての合計タイムで出場校を決め、10位以内に入ること」としており、「地方の大学に門戸を開放すると発表したのは2022年6月。ハーフマラソンを強化するだけの時間もない。全国大会化を求める声は数年前からあったが、せめて2年ぐらい前に発表してほしかった。直前に中途半端な形で参加資格を拡大することを表明したのは、地方の大学に出場権を与えなければ批判されるので、門戸を開放したフリをしている」（ある関西の大学関係者）とする疑念がある一方、福岡大学は2023年1月3日に参加を表明した。陸上部男子長距離ブロック長の堤晃太朗（3年）は「ずっと夢に見た舞台。けがや家の都合で諦めた選手の希望になる」と意欲的な大学・選手もある。

なお、2025年・第101回以降の参加は決まっていないが、日本テレビ系で放送した「続報!箱根駅伝」（駅伝の後番組）内では「100回より全国の大学が出場できる」という意図で放送されており、後援する読売新聞と日本テレビの主張が全面的に反映されていた。

箱根駅伝不要論 
従来はテレビ東京がゴールのみ放送していたが、1987年から日本テレビが全国にネットして生放送を始めると、出場大学にとって宣伝効果も現れて下記のような弊害を挙げる者も散見する。

トラックの軽視 
持久力向上のために長い距離を走る練習ばかり行い、速度を付けさせるトラック競技を軽視することで、選手に速度が身に付かず、世界大会で勝てなくなるという指摘がある。高校時代のトップ選手であった遠藤日向や、外国人留学生のジュリアス・ギタヒ、サムエル・ワンジル、ビタン・カロキのように、敢えて関東の大学に進学せず、直接実業団に入る例も見られる。

箱根駅伝燃え尽き症候群 
箱根駅伝で大活躍した選手が大学卒業後に実業団に入ったものの、期待された程の活躍ができずに故障や不調に悩まされて引退した選手も少なくない。出場できても卒業せずに中退した者まで現れている。
早稲田大学時代に箱根駅伝で4年連続区間賞（区間新3回）を記録した武井隆次は、トラック、駅伝と季節を問わずフルに走り続けた影響からか卒業後は長い故障にさいなまれ、ヱスビー食品時代の日本代表歴は、29歳の時のアジア大会・マラソン代表のみにとどまった。
同じく早稲田大学出身の渡辺康幸は、箱根駅伝では2年次に1区区間新、3年次に2区区間新など華々しく活躍し、トラックでも4年次に世界陸上競技選手権イェーテボリ大会10000m12位、ユニバーシアード福岡大会10000m金メダルと輝かしい成績を残した。しかし過密スケジュールによる慢性疲労が徐々に体を蝕み、卒業前に予定していた東京国際マラソンは欠場に追い込まれ、急遽出場したびわ湖毎日マラソンも7位に終わった。ヱスビー食品入社後1996年アトランタオリンピック10000m代表に選ばれるが、左アキレス腱の故障で欠場。以降度重なるアキレス腱の故障に苦しみ、2002年に29歳の若さで引退した。
近年では「新・山の神」と称された柏原竜二が、卒業後相次ぐ怪我に悩まされ富士通入社からわずか5年で引退した 他、青山学院大学の過渡期のエースとして活躍した出岐雄大はモチベーション低下により中国電力入社からわずか3年で引退した。
外国人留学生ではメクボ・ジョブ・モグス、ギタウ・ダニエル等が実業団入り後、大学時代ほどの活躍が出来ていない。

対照的に、箱根駅伝を走らずに実業団や世界に通用した選手も存在する。
龍谷大学出身の高岡寿成は洛南高校時代、3年連続で全国高校駅伝に出場し、3年次に4区で当時の区間新記録を樹立する等ロードでの実績はあったことから、関東の大学からもスカウトを受けていたが全て断った。しかしトラック中心の練習の成果により、大学4年次には5000mの日本記録を樹立した。カネボウに入社後も、3000m、5000m、10000mで日本記録を次々に樹立し、2002年のシカゴマラソンでは日本記録を樹立。世界大会でのメダルこそ獲得できなかったものの、30代後半まで第一線で活躍を続けた。
1988年ソウルオリンピック、1992年バルセロナオリンピックで4位入賞した中山竹通、そのバルセロナオリンピックで銀メダルに輝いた森下広一はともに高校から実業団に進んでいる。
青山学院大学出身の橋本崚は、大学在籍時は全日本大学駅伝には2回出場したが、箱根駅伝は一度も走っていない。卒業後、GMOアスリーツに入ってからは頭角を現し、2016年の防府読売マラソンで初優勝。2019年のMGCでは5位に入っている。

箱根駅伝創設の目的は「世界に通用する長距離選手の育成」であるが、実際には多くの選手が箱根駅伝を最終目標としており、卒業後は実業団に進まず競技の第一線から退くのが現状であり区間賞・区間新記録を樹立した選手も例外ではない（中澤晃、鐘ヶ江幸治、高橋宗司）。一方で、箱根駅伝という大きな目標があるからこそ、モチベーションを保って陸上競技を続けている選手が多い、という一面もあり、日本の男子陸上長距離界の裾野の拡大に箱根駅伝は貢献していると主張する者も多い。
山梨学院大学出身の尾方剛は、箱根駅伝は2年次の第70回箱根駅伝10区で区間賞を獲得し山梨学院大学の優勝に貢献したものの、度重なる故障に苦しみその1回しか出場できなかった。中国電力入社後、30歳ごろからフルマラソンで結果を表して、2004年12月の福岡国際マラソンでフルマラソン初優勝を果たす。2005年8月の世界陸上ヘルシンキ大会本大会では、2時間11分16秒の好成績で日本人トップの3位入賞、銅メダルを獲得した。尾方を最後に現在まで世界陸上、およびオリンピックでメダルを獲得した日本人選手は現れていない。
学習院大学で学連選抜ランナーとして出場した川内優輝も卒業後実業団に所属しなかったが、公務員と市民ランナーを両立しながら実業団の選手に引けをとらない活躍を見せている。
青山学院大学出身の吉田祐也は、3年次までは箱根駅伝に出場経験が無く、大学卒業後は競技の第一線から退く事を表明していた。しかし、最終学年に初めての箱根駅伝（第96回箱根駅伝）で4区を走ると区間新記録を樹立し、青山学院大学の2年ぶりの優勝に貢献。その1ヶ月後の別府大分毎日マラソンで初マラソンを走り、学生歴代2位・初マラソン歴代2位となる2時間8分30秒を記録したことから、原晋監督をはじめ、陸上関係者から競技継続を薦められる。結果、引退を撤回して内定先の企業を辞退。GMOアスリーツで競技を継続した。卒業後、2020年12月の福岡国際マラソンに出場、2時間7分05秒の自己記録で2回目のマラソンにして初優勝を飾った。
北京オリンピック以降の男子マラソン代表は、全て箱根駅伝経験者で占められている（北京…尾方、佐藤敦之、大崎悟史。ロンドン…中本健太郎、山本亮、藤原新。リオデジャネイロ…佐々木悟、北島寿典、石川末廣、東京…中村匠吾、服部勇馬、大迫傑）。
2019年のMGCでエントリーした31人中、箱根駅伝経験者が25人も占めており、「元祖山の神」こと今井正人や「三代目山の神」こと神野大地も、この25人の中に含まれている。箱根駅伝未経験なのは前述の橋本崚の他、木滑良、宮脇千博、岩田勇治、上門大祐、河合代二のわずか6人であった。
2017年後半以降、箱根駅伝経験者である大迫、設楽悠太、井上大仁等がマラソンで相次いで好記録を出しており、2019年のMGCで1位の中村、2位の服部も箱根駅伝経験者である。
そもそも、箱根駅伝に出場するために練習している選手も多くないという。そのため、箱根駅伝で好記録を出したとしても実業団など、陸上を続けずに就職したり(引退)する選手もいる。

大学陸上部関係者による不祥事とその対応 
大学陸上部関係者が事件や不祥事を起こした場合、各大学で相応の処分がなされるほかに、箱根駅伝参加大学に対しては競技団体である関東学連が同連盟の規約に基づき審査を行い、当事者又は所属大学に対して罰則を与えることがある（規約第62条）。
 近年発覚した事件・不祥事の概要と処分
 2008年12月1日、第85回（2009年）のシード校である東洋大学経済学部2年の陸上部員（駅伝選手）が、通学途中の東武東上線電車内での強制わいせつ行為で現行犯逮捕されるという事件を起こした。本大会出場大学所属の陸上部員による不祥事が発覚したのは、これが初めてのことであった。箱根駅伝本大会まで1カ月を切った時期ではあったが、東洋大学はこの問題に対する処分として、当該学生の退部処分と監督と部長の引責辞任、陸上部長距離部門のチーム練習を無期限自粛する決定をした。この対応を受けた関東学連は特別審査委員会を開き、12月5日に、東洋大学への補助金の支給停止、本大会での集団応援の禁止といった条件を付けた上で、東洋大学の出場を認める決定をした。この決定について関東学連は、集団ではなく個人での犯罪であった点、加害者が個人的に責任を問える成人である点、合宿などチームの活動中ではない時に起きた点を挙げた上で「一部員の不祥事によって真摯に勉学とトレーニングに励んだ部員諸君がその成果を発表する機会まで失うことは誠に不憫」との見解を表明した。無期限の活動自粛は12月6日に解除された（自粛期間5日間）。
 2009年3月、日本体育大学陸上部の跳躍種目選手が同部合宿所内で大麻を栽培し、大麻取締法違反容疑で書類送検されたことなどを理由に関東学連の特別審査委員会は4月17日、日本体育大学陸上部全体に対して箱根駅伝の次大会シード権の剥奪、出雲全日本大学選抜駅伝と全日本大学駅伝への推薦取消を含めた処分を決定した。日本体育大学側は当初、陸上競技部の学生約400人に連帯責任を負わせるのは筋違いなどと反発し、関東学連に対して質問状を出した が、最終的には処分を受け入れた。次大会のシード権剥奪は箱根駅伝史上初めてである。

中継番組

テレビ放送

テレビ東京制作 

第55回（1979年〈昭和54年〉）から東京12チャンネル（1981年〈昭和56年〉にテレビ東京へ改称）が初めてのテレビ放送を開始した（1979年から1982年まではサンテレビへもネット、1983年からはネット局がテレビ大阪に変更）。しかし完全中継ではなく、1月3日 12:00 - 13:54の録画ダイジェスト放送（ゴールは生放送、放送を開始した1979年は13:25 - 14:10の放送）であった。その後、日本テレビが中継することに伴い第62回（1986年〈昭和61年〉）でテレビ東京での放送は終了した。

テレビ東京制作版の映像は長らく日の目を見る機会が非常に少なかったためお蔵入りしたが、2014年（平成26年）に放送された『テレビ東京開局50周年特別企画 50年のモヤモヤ映像大放出! この手の番組初めてやりますSP』の中で第59回（1983年〈昭和58年〉）の映像を蔵出しで放送された。テレビ東京で中継されていた時代の最高視聴率は13.4%（ビデオリサーチ調べ、関東地区・世帯・リアルタイム）と同番組の中で紹介されている。

日本テレビ制作 

第63回（1987年）から日本テレビが特別後援に入り、全国ネットの本格的なテレビ中継が開始された。第73回 - 第76回（1997年 - 2000年）はCS★日テレでも同時放送された。

第81回（2005年）からハイビジョン制作となった。

沖縄県など系列局がない地域への配慮としての衛星放送の中継はBS日テレで当日に、日テレジータスでも大会終了数日後に、それぞれ2時間程度にまとめたダイジェスト版を放送している。なお、鹿児島読売テレビのスピルオーバー電波を区域外再放送する形で2020年から沖縄ケーブルネットワークの「テレビにらい」、2023年から宮古テレビにて、本番組のリアルタイム放送を行っている。これにより、一部エリアには限定されるが、沖縄県でも箱根駅伝の視聴が可能になった。

第90回（2014年）からは予選会についても地上波で生中継されている。

ラジオ中継 
ラジオでの中継はテレビでの中継よりも古くから行われ、複数の放送局が中継を行っている（テレビ中継も行っている局は新春スポーツスペシャル箱根駅伝参照）。以下に制作局の体制や概要について記述する。ラジオ中継の実況用の映像は日本テレビが制作、テレビ放送用とは別に各局に送っている。

NHK制作 

NHK第1放送で放送。ただし、毎正時の前後にはNHKニュース放送のため数分程度中継が中断し、特に正午のニュースを優先するため春夏の高校野球中継と同様に正午前から20分ほど中継を中断する。基本はラジオセンター132スタジオ内のブースに置かれているモニターに映し出される日本テレビの映像を見ながら実況を行うが、中継車を出しており、3位走行中の選手前後に付く。各拠点にアナウンサーを配置し、電話リポートで臨場感のある実況中継を行う。コースにラジオ中継車がテレビ取材用報道カメラ車、日本テレビのテレビ中継車などに混じり、選手の動向を追っている。テレビ取材用報道カメラ車は日本テレビの移動1号車の後に付く。

NHKワールド・ラジオ日本は第88回（2012年）までは放送権上の制約および電波運用面の都合上、12時台の中断ニュースを除いて同時放送せず、当該時間帯はFM放送の邦楽関連の年始特集番組や定時番組および地上デジタルラジオ実用化試験放送の音楽番組を中心に別番組へ差し替えていたが、第89回（2013年）から全編同時放送している。

鹿児島県や福島県などでは、長らくNHK版しか放送しなかった。

日本テレビでのテレビ独占生中継が決まる前に関東学連は、NHKにもラジオに加えてテレビも生中継を要請するも、全国参加ではないことや山間部における中継が困難であることを理由として断られている。

文化放送制作 

文化放送では、『文化放送新春スポーツスペシャル 第○回箱根駅伝実況中継』として中継。第70回大会（1994年）から完全実況生中継を実施している。箱根駅伝と並んで「大学3大駅伝」に数えられている『出雲駅伝』『全日本大学駅伝』も中継しているため、「大学駅伝ラジオ独り占め -FIGHT THE FUTURE-」をキャッチフレーズに掲げている。

2022年からチーフディレクターを担当する黒川麻希（文化放送）によれば、アナウンサー、ディレクター、技術スタッフ、インターネットへの速報・情報発信に専念するスタッフ、アルバイトスタッフを含めて70名前後で中継を制作。同局の放送対象地域である関東地区では、他のスポーツ中継やレギュラー番組を凌ぐほどの聴取率を例年記録しているという。

第79回大会（2003年）からは原則としてNRN加盟局でも放送。後述するネット局（2020年以降は32局）では、『新春スポーツスペシャル 第○回箱根駅伝実況中継』というタイトルで、基本として8:00、8:30、9:00のいずれかの時間から14:00まで中継の同時ネットを実施する。文化放送（関東ローカル）のみで放送される時間帯（7:30 - 8:00および14:00以降）には「文化放送新春スポーツスペシャル」というタイトルを使用しているが、ネット局でも放送する時間帯には、CM明けのジングルもネット局向けに文化放送からの裏送り方式で差し替えている。

自前の中継車を出していないため、メイン実況のアナウンサー（公式サイト上の呼称は「センター実況」、2023年は往路：斉藤一美、復路：寺島啓太）は、スタジオ（放送上の呼称は「放送センター」）で日本テレビの映像を見ながら実況（いわゆる「オフチューブ」方式）。同局の中継とは別に、大学生時代に箱根駅伝で目覚ましい活躍を見せた人物を、「メイン解説者」（2023年は柏原竜二が復路のみ担当）や「ゲスト解説者」（2023年は往路：飯田貴之・青木涼真、復路：土方英和）に迎えている。

「放送センター」とは別のスタジオを「情報センター」という名称で使用。記録・タイムを伝えるアナウンサー1名（2023年は往路：寺島、復路：斉藤）、中継所通過時点での順位速報や（1区・6区を除く）区間の走者の氏名・大学名を伝える女性アナウンサー1名（2023年はフリーアナウンサーの小川真由美）、「ネットスタジオ担当」（提供クレジットの読み上げや途中飛び乗り・飛び降りネット局向けの案内を担当するアナウンサー）1名（2022年以降は往・復路とも松井佐祐里）を入れている。順位速報担当の女性アナウンサー は、2018年まで、Twitter上の公式アカウントに寄せられた大会・中継関連のツイートの一部も読み上げていた。2019年からは、ツイートに代わって、「応援一口メモ」（本選出場全校への事前取材に基づく注目選手の情報）を紹介している。

番組の途中では、ニュース、天気予報、交通情報、首都圏の鉄道情報を随時挿入。11時台後半に放送する文化放送発のニュース、天気予報、交通情報はネット局でもそのまま流れるため、同局のみで関東ローカル向けに放送する場合のタイトル（「文化放送ニュース」「文化放送交通情報」「文化放送天気予報」）やジングルを使用せず、「全国のニュース」「首都圏の交通情報・天気予報」と改題したうえでジングルを「箱根八里」に変更している。ネット局は9:58、10:58、12:58から5分間ずつ中継を中断したうえで、ローカル向けのニュース、天気予報、交通情報を放送する。さらに、「情報センター」からの記録の読み上げや、中継所・拠点からのリポート、「応援一口メモ」の直前にはジングルを鳴らし分けている。

実況については、放送事業局報道スポーツセンター所属のスポーツアナウンサーを総動員。往路・復路とも、すべての中継所と区間内の一部拠点にアナウンサーやリポーターを配置している ため、「センター実況」と「情報センター」を担当しないスポーツアナウンサー、「情報センター」を担当しない制作部所属のアナウンサー（2023年は砂山圭大郎）、文化放送の元アナウンサー（鈴木光裕）、フリーアナウンサー（2023年は鬼頭里枝）で分担している。文化放送アナウンサー時代の2020年からメイン実況を担当している寺島は、2021年4月の退社を経て、2022年以降の中継でもフリーアナウンサー（放送上の名義は「寺島啓太アナウンサー」）として担当を継続。過去には、朝日放送（2018年4月以降は朝日放送テレビ）のスポーツアナウンサーにも、中継所の一部で実況を任せた時期があった。

ネット局
以下は2023年のネット局で、○印の局では往路・復路とも8:00、△印の局では往路・復路とも8:30、▲印の局では9:00からの飛び乗り方式で放送（いずれも14:00でネットを終了）。

※印の局はラジオ・テレビ兼営局で、テレビ放送部門が日本テレビ系列に属しているため、テレビ・ラジオとも中継の同時ネットを実施。※印に相当する民放局が存在せず、テレビとラジオでネット局が異なる地域もある。

 文化放送（キー局） 放送時間は7:30 - 14:30（以前は2日は14:00・3日は14:15まで）
 北海道放送▲（テレビ中継のネット局は札幌テレビ）
 青森放送※▲
 IBC岩手放送△（テレビ中継のネット局はテレビ岩手）
 東北放送 ▲（テレビ中継のネット局はミヤギテレビ）
 秋田放送※△
 山形放送※△
 ラジオ福島○ 2017年よりネット開始（テレビ中継のネット局は福島中央テレビ）
 山梨放送※△
 信越放送△ 2018年までは2日に限って10:00から飛び乗り（テレビ中継のネット局はテレビ信州）
 新潟放送▲（テレビ中継のネット局はテレビ新潟）
 静岡放送△（テレビ中継のネット局は静岡第一テレビ）
 CBCラジオ○ NRN非加盟局で唯一放送（テレビ中継のネット局は中京テレビが放送）
 北日本放送※△
 北陸放送▲（テレビ中継のネット局はテレビ金沢）
 福井放送※●
 朝日放送ラジオ○（テレビ中継のネット局は読売テレビ） - 2007年から2018年までは、関東地方出身のスポーツアナウンサー 1名を、中継所の実況要員 として派遣していた。
 和歌山放送▲（同上）
 四国放送※▲
 山陰放送△ （テレビ中継のネット局は日本海テレビ）
 RSK山陽放送△（放送免許上の対象エリアは岡高地区内の岡山県域） - テレビ中継のネット局は、地区内の香川県域を含めて西日本放送。
 西日本放送※○（放送免許上の対象エリアは岡高地区内の香川県域）
 中国放送△（テレビ中継のネット局は広島テレビ）
 山口放送※○
 南海放送※▲
 高知放送※△
 九州朝日放送○（テレビ中継のネット局は福岡放送）
 長崎放送△（テレビ中継のネット局は長崎県域のみ長崎国際テレビ）
 NBCラジオ佐賀△ - テレビ中継については、佐賀県域内唯一の民放テレビ局（サガテレビ）で放送しないものの、県域内の一部で福岡放送・長崎国際テレビ・くまもと県民テレビなどを通じての視聴が可能。
 熊本放送▲（テレビ中継のネット局はくまもと県民テレビ）
 大分放送▲ 2008年よりネット開始（テレビ中継のネット局はクロスネット局のテレビ大分）
 宮崎放送▲ 2008年よりネット開始（テレビ中継のネット局はクロスネット局のテレビ宮崎）
 南日本放送▲ 2020年よりネット開始（テレビ中継のネット局は鹿児島読売テレビ）
 ラジオ沖縄▲ - テレビ中継については、沖縄県域に日本テレビ系列局が存在しないものの、沖縄ケーブルネットワークと宮古テレビ（ケーブルテレビ）の加入者のみ鹿児島読売テレビの放送の再送信による視聴が可能。また、沖縄本島北部の一部では、鹿児島読売テレビの直接受信が可能な地域もある。

文化放送を除く上記ネット局のうち、青森放送（RAB）・朝日放送ラジオ（ABC）・九州朝日放送・ラジオ沖縄 以外の27局では、2021年4月から毎週日曜日の8:00 - 10:00に『地方創生プログラム ONE-J』（RAB・ABCを除くJRN32局の共同制作による生放送番組）のフルネットを実施している。2022年には本大会の往路競走が1月2日（日曜日）に組まれたため、『ONE-J』のネット局では、中継のネット開始時刻によって同番組への対応が分かれた（当該項で詳述）。

アール・エフ・ラジオ日本は日本テレビグループで、コースに当たる神奈川県を放送対象地域とするラジオ局。いわゆる独立局であるが、文化放送と放送対象地域が重複する北関東のNRN加盟局、ラジオ日本とは提携関係がある兵庫県のラジオ関西や一部のコミュニティFM局でも放送している。

文化放送の制作版と同様に、自前で中継車を走らせていないため、アナウンサーは基本として日本テレビの映像を見ながら実況。ただし、スタート・ゴール地点と各中継所には、リポーターを独自に配置している。2008年から2020年まで文化放送の契約アナウンサーとして同局制作分の中継でセンター実況などを担当してきた槇嶋範彦は、契約期間の満了（2020年3月）を経て、2021年からラジオ日本制作分の中継でリポーターやセンター実況を任されている。

ラジオ日本の放送対象地域内にコースが設けられている関係で、地域内の道路交通情報をこまめに流すことが特徴。日本テレビ・文化放送の中継と同様にサッポロビールがスポンサーに名を連ねているが、文化放送制作分中継の実況音源を活用したサッポロビールの箱根駅伝限定ラジオCMは、ラジオ日本制作分の中継でもそのまま放送されている。

ネット局は以下のとおり。
 アール・エフ・ラジオ日本（キー局）放送時間は7:30 - 14:25
 栃木放送
 茨城放送（2022年まで）
 ラジオ関西（2007年より）
 FM世田谷（2004年から2009年まで、2013年から2015年まで） - 出場校が比較的多く立地している東京都世田谷区のコミュニティFM局。
 FM甲府（2009年から2018年?まで、2021年 -） - 山梨学院大学の構内に演奏所・送信所を持ち、山梨学院が資本参加している、山梨県甲府市のコミュニティFM局。
 FMみしま・かんなみ（2010年から2019年?まで） - 日本大学の国際関係学部がある静岡県三島市のコミュニティFM局。
関連番組として、毎年12月1日から25日まで「タスキでつなぐ青春の200キロ　―箱根駅伝への道―」を、20時45分から21時まで（土曜・日曜は19時45分から20時まで）放送する（これにより短縮される番組がある。60TRY部、タブレット純 音楽の黄金時代、THE BEATLES 10など。収録放送である「THE BEATLES 10」以外はネット受け局も同様に短縮となる）。

インターネット配信 
3局ともインターネットラジオを通じて、配信している。
 NHKネットラジオ らじる★らじる - NHK制作分
 radiko - 民放ラジオ制作分（実施地域により、主に文化放送制作分が聴取可能）・2018年大会以降のNHK制作分
 BBQR（2009年まで）→番組公式ホームページ内で配信 - 文化放送制作分
 Ustream - ラジオ日本（2011〜2013年）、文化放送（2015〜2017年）制作分
BBQRおよびUstreamは国内はもとより、海外でも聴取可能であった。これとは別に2014年大会ではニコニコ生放送でも配信されている。但しこちらは大会の映像を配信するものではなく、「年末年始ぶっ通し78時間全局テレビ実況」の一環として配信された。コメンテーターに徳本一善（法政大学OB、2000年1区区間賞、現・駿河台大学監督）。

雑誌 
現在陸上競技を取り扱う専門雑誌はベースボール・マガジン社の『陸上競技マガジン』と、陸上競技社の『月刊陸上競技』（発行は講談社と共同）の2種類がある。

このうち前者が上記の問題を比較的多く取り上げるのに対して、後者は、箱根駅伝そのものは予想なども専門的であるが、一連の問題は取り扱うものの、余り深いところまでは書かない傾向にある。これは後者が箱根駅伝を主催する関東学連とも繋がりが深く、大会協力として当大会に参加しているためでもある。

ただ、『月刊陸上競技』の編集長はたびたび留学生制度に対して苦言を呈していることもある。

箱根駅伝の観戦ガイドブックは上記2誌の増刊号として発売されているほか、共催社である読売新聞社、後援社である報知新聞社からも発売されている。