彦根藩（ひこねはん）は、近江国犬上郡など近江国の北部を領有した藩。藩庁は彦根城（滋賀県彦根市）に置かれた（入封当初は佐和山城）。藩主は譜代大名筆頭の井伊家。支藩として一時、彦根新田藩があった。

略史 
慶長5年（1600年）、上野高崎城主で12万石を領していた徳川四天王の1人・井伊直政が関ヶ原の戦いの戦功により18万石に加増され、石田三成の居城であった佐和山城に入封して佐和山藩を立藩した。直政は賊将・石田三成の居城を嫌い、琵琶湖の湖岸の磯山に新城建設を計画したが、建設に着手する前に戦傷が元で慶長7年（1602年）に死去した。嫡男直継（直勝）が相続すると現在彦根城が存在する彦根山に新城の建設が開始され、慶長11年（1606年）完成し彦根城に入城した。

元和元年（1615年）、直継は病弱で大坂の陣に参陣出来なかったことを理由に、直勝と名を改め上野安中藩に3万石を分知され移封となった。代わって参陣し活躍した弟の直孝が藩主となった。この時点で直継の2代藩主としての履歴は抹消され、直孝を2代とした（後述）。

井伊氏は元々遠江の没落した国人の家で、直政は徳川家康の信任を受けて新参ながら徳川家の重臣の一人に列した。その過程で滅亡した武田氏の旧臣を付けられたり「（御）付人」と称される家康の命で徳川家の旗本から直政の寄騎を経て井伊家の家臣に編入された家臣を付けられたりと、家康の意向を反映する形で家臣団の充実が図られた（付人の成立過程は徳川御三家などに置かれた附家老と似た側面がある）。反面、初期の藩の人事は家康の許可を必要とし、付人の中には同じ徳川家臣のはずの直政の陪臣扱いをされることに不満を抱いて出奔する者もいた（例えば、家康から最初に直政に付けられた井伊谷三人衆の子孫はいずれも彦根藩には残らなかった）。直政が死去すると、跡を継いだ直継（直勝）と付人の対立や付人同士の対立などで藩政は混乱し、家康は家臣を統制しきれない直継を当主としての器量がないと判断して、病弱を名目に藩主の差替を図ったと考えられている。直孝の下で藩政の混乱は収拾され、井伊家中に残った付人は彦根藩の重臣層を形成することになる。

直孝は幕閣の中枢としての活躍を認められ、元和元年・元和3年（1617年）・寛永10年（1633年）の3度にわたりそれぞれ5万石の加増がなされた。よって30万石の大封を得る大大名となった。さらに幕府領の城付米預かりとして5万俵（知行高換算5万石）を付与され、35万石の格式を得るに至った。

彦根藩井伊家は幕閣の中枢を成し、酒井雅楽頭家・本多家など譜代有力大名が転封を繰り返す中、一度の転封もなく石高も譜代大名中最高であった。江戸城内の伺候席は会津松平家・高松松平家と共に将軍の執務空間である「奥」に最も近く、臣下に与えられた最高の席であった「溜間」である。また、直興・直幸・直亮・直弼と4代5度（直興が2度就任。直孝・直澄が大老になったかどうかは諸説ある。詳細は大政参与の項を参照）の大老職に就いた。文字通り譜代筆頭と言えよう。

歴代藩主の中で最も有名なのが、幕末に藩主となった直弼である。嘉永3年（1850年）、兄直亮の死去により藩主となった。13代将軍徳川家定の将軍継嗣問題で南紀派に属し、一橋慶喜ら一橋派と対立し徳川家茂の14代将軍就任に貢献する。安政5年（1858年）に大老に就き、勅許を得ず日米修好通商条約に調印、これを口実として詰問に出た旧一橋派要人を隠居させ、併せて言論人への死罪等を含む安政の大獄といわれる強権の発動を行った。結果、反発を招き、万延元年（1860年）に桜田門外の変で水戸藩浪士らに暗殺された。同年、藩主に就いた次男の直憲は、文久2年（1862年）に直弼の罪を問われ10万石を減封され、さらに預かり地5万石も没収された。

元治元年（1864年）、禁門の変での功により旧領のうち3万石を回復する。また天誅組の変・天狗党の乱・長州征討にも参戦し、幕府の軍事活動に協力した。しかし長州との戦いでは旧式の軍制・装備などが災いし大敗した。この時点では幕府内では旧一橋派が主導権を持っており、桜田門外の変以降の彦根藩への報われない扱いを彼らの報復と意識したことが、大政奉還以降の薩長新政府支持へ繋がったともいわれている。

慶応3年（1867年）、大政奉還後は譜代筆頭にもかかわらず新政府側に藩論を転向させた。翌慶応4年（1868年）の鳥羽・伏見の戦いでは、家老岡本半介は旧幕府軍と共に大坂城に詰めたが、藩兵の主力は東寺近くにある四塚や大津で薩長の後方支援にあたり、大垣藩への出兵に際しては先鋒となった。戊辰戦争では明治政府に加わって小山や本宮など各地を転戦、近藤勇の捕縛にもあたった。戦功により賞典禄2万石を朝廷から拝領している。

明治4年（1871年）、廃藩置県により彦根県となった。後、長浜県・犬上県を経て滋賀県に編入された。

明治17年（1884年）、井伊家は伯爵となり華族に列した。

藩邸および江戸での菩提寺 
慶応年間の江戸藩邸の所在は桜田門外に上屋敷、赤坂喰違に中屋敷、八丁堀と千駄ヶ谷の2か所に下屋敷があった。また京都河原町三条下がるに京都藩邸、大坂過書町に大坂藩邸蔵屋敷があった。

なお、江戸で藩主や藩士が死去した際に使用する菩提寺は世田谷の豪徳寺である。

歴代藩主井伊家 
譜代 18万石→15万石→20万石→25万石→30万石（35万石格）→20万石→23万石（1600年 - 1871年）
直政 18万石
直継 →安中藩へ （歴代に数えない場合も多い）。
直孝 15万石→20万石→25万石→30万石（35万石格）
直澄
直興
直通
直恒
直治のち直該 5代・直興が再封
直惟
直定
直禔
直定
直幸
直中
直亮
直弼
直憲 30万石→20万石→23万石

諸説ある歴代の数え方 
『新修彦根市史2巻 通史編近世』（2008年）66頁では、井伊直継を2代藩主としている。しかし、直継は安中藩初代であることから、それまで慣習的に彦根藩主には数えてこなかった。そのため、彦根城博物館では、「当主」という表現を使い、直継を数えない代数を使っている（例；井伊直弼 13代当主）。

彦根新田藩 
彦根新田藩（ひこねしんでんはん）は、江戸時代中期の正徳4年（1714年）より享保19年（1734年）まで存した彦根藩の支藩である。直興の十四男・直定が1万石を分与され立藩した。享保17年（1732年）、直定は奏者番に就任している。直定が兄で9代藩主の直惟の養嗣子となったため廃藩となった。直定はその後、彦根藩の10代・12代（再封）藩主となっている。

家臣 
実線は実子、点線は養子、太字は当主。
 家老
 木俣宗家（筆頭家老・1万石）維新後男爵

庵原助右衛門家（次席家老・5,000石）

長野十郎左衛門家（3席・4,000石）

西郷藤左衛門家（3,500石）

中野助太夫家（3,500石、藩主一門）※井伊直氏の弟・中野直房を祖とする家

小野田小一郎家（3,000石）

三浦与右衛門家（国家老・2,500石）

松下源太郎家（200石、藩主一門）※松下之綱室の兄で井伊直政の継父・松下清景を祖とする家。

宇津木治部右衛門家（2,500石）

岡本半介家（1,950石）

横地修理家（2,600石）

貫名筑後家（2,300石、井伊家庶流・藩主一門）※井伊良直の弟貫名政直を祖とする家。幕末に名跡を再興する。

新野左馬助家（2,000石、藩主一門）※井伊直政の恩人である新野親矩の名跡を再興する。

河手主水家（4,000石、藩主縁戚）※初代・良則の正室に藩主・直政の姉春光院を迎えた。

脇五右衛門家（2,000石）

 藩士（500石以上）
 戸塚左太夫家（1,600石、藩主一門）※幕末に藩主家より養子が入る。

内藤五郎左衛門家（1,500石）
内藤信矩（内藤昌月の子）

木俣多宮家（650石）※木俣清佐衛門家分家

2,000石
沢村角右衛門家
増田次右衛門家
1,500石
印具徳右衛門家（井伊直孝の母の生家）
1,300石
西山内蔵丞家
1,200石
犬塚求之介家
椋原治右衛門家
松平倉之介家 
1,000石
勝平次右衛門家
広瀬郷左衛門家 
吉用隼之丞家
900石
三浦五郎右衛門家 
800石
藤田衛門次家
今村源右衛門家
西尾治部之介家 

700石
朝比奈藤右衛門家 
奥山六左衛門家 
650石
青木平左衛門家
西堀才助家
600石
小林仁左衛門家 
荻原与惣次家 
550石
日下部三郎右衛門家（日下部鳴鶴）
500石
宇津木武兵衛家
鈴木平兵衛家 
藤田勝右衛門家 
三浦九右衛門家
 藩士（500石以下）
 相馬彦右衛門家（200石）※下総相馬氏傍流  

相馬宇平次家（130石）※相馬彦右衛門家分家  

450石
勝野五太夫家  
酒居三郎兵衛家 
今村忠右衛門家
430石
河北勝兵衛家 
400石
藤田四郎左衛門家 
大塚与一左衛門家  
杉原三平家 
吉川軍左衛門家 
中野平馬家 
杉原惣左衛門家 
庵原奥左衛門家  
荒居治太夫家  
石原甚五左衛門家  
犬塚十左衛門家 
高橋新五左衛門家  
向坂縫殿介家 
380石
大久保孫左衛門家 
360石
加藤彦兵衛家  
350石
西郷五郎右衛門家  
細江次郎右衛門家  
佐乙女八郎左衛門家  
吉用十郎右衛門家  
大久保与左衛門家  
浅居勝太夫家 
中居十次兵衛家  
330石
山田甚五右衛門家  
沢村左平太家  
320石
大野清兵衛家 
柏原与兵衛家  
300石
富田権兵衛家 
安中半右衛門家  
河手文左衛門家  
武笠魚兵衛家 
渥美平八郎家  
三浦半蔵家  
増田次郎左衛門家  
石居三郎左衛門家  
夏目外記家  
三浦左膳家  
青木角次家  
内田源太夫家  
杉原重太夫家 
舟橋六左衛門家  
本多七左衛門家   
小幡与五兵衛家  
中村三右衛門家 
前嶋弥次右衛門家  
村山宮内家 
渡辺弥五左衛門家
今村十郎右衛門家  
河西源五左衛門家  
鈴木権兵衛家
小泉弥一右衛門家  
今村源之進家 
270石
武藤源助家  
260石
脇十次右衛門家  
250石
中村太郎右衛門家  
本城善右衛門家 
稲垣弥五右衛門家  
閑野源左衛門家  
中村加助家  
石原善兵衛家  
堀部源蔵家  
宍戸四郎兵衛家（宍戸景好の直系子孫）  
田中三郎左衛門家  
横内頼母家  
只木次郎右衛門家  
黒柳孫左衛門家  
大久保藤助家  
神尾太左衛門家  
西郷与次兵衛家  
西堀太郎左衛門家（作事奉行/西村又次郎－西村捨三） 
230石 
鶴見治部左衛門家 
西村半太夫家  
八木原太郎右衛門家  
増嶋百介家（弓術師範/増島六一郎）  
中川治部太夫家  
成嶋彦左衛門家  
三浦十左衛門家  
永田権右衛門家（永田正備－海軍大尉/永田廉平） 

220石
丸山一太夫家  
土田甚五郎家  
210石
百々久弥家  
200石
藤堂次郎太夫家  
荻原丹下家 
山本運平家  
久保田又市家  
石居次郎兵衛家  
功刀千右衛門家  
大久保平介家  
越石何右衛門家  
加田孫兵衛家  
大川権右衛門家  
横田与左衛門家  
佐成源五兵衛家  
長浜文蔵家  
匂坂市右衛門家  
長野宇右衛門家 
今村八郎右衛門家  
林六右衛門家  
竹花小右衛門家  
脇源太兵衛家  
沢村与一郎家 
湯本弥五助家  
河手藤兵衛家  
広瀬助之進家  
羽田六兵衛家  
曽根惣三郎家  
今村小兵衛家  
宮崎甚太夫家  
奈越江忠蔵家 
西堀源蔵家  
西尾隆治家  
後閑新兵衛家 
180石 
広瀬清兵衛家  
林与兵衛家  
中村彦左衛門家  
岡嶋丹蔵家  
池田太右衛門家  
薬袋藤市家  
桃居杉右衛門家  
杉原三右衛門家  
安藤長三良家  
小野源太右衛門家  
八木三太夫家 
山下又右衛門家  
石尾太右衛門家 
170石
真野善次家  
湯本戸右衛門家  
小野半左衛門家  
奥山伝右衛門家 
山下弥惣兵衛家  
佐藤与左衛門家  
160石
神谷茂右衛門家  
武川源左衛門家  
平石弥右衛門家（奉行/平石時光）  
荒木儀太夫家  
佐成左太右衛門家  
沢村新介家  
高野瀬喜介家  
150石
久保田惣九郎家 
庵原三郎左衛門家  
辻平内家  
宮崎惣右衛門家 
毛利十兵衛家  
本上源之丞家  
木村半八家  
桜居彦太夫家  
所藤内家  
後藤弥惣右衛門家  
河手藤十郎家 
上田彦四郎家  
朝比奈清右衛門家  
田中与左衛門家 
津田叶家  
一瀬九左衛門家  
大鳥居彦右衛門家  
三居孫太夫家  
寺嶋長太夫家  
伊丹助内家  
花木伝蔵家 
土田仁右衛門家 
礒嶋新七家  

150石
真野善次家  
西村藤右衛門家  
山上弥次右衛門家  
安東七郎右衛門家  
山下藤太夫家  
岡本半右衛門家 
金田勘解由家  
細居広太家  
五十嵐半次家  
喜多山十蔵家  
宇津木小左衛門家  
高杉喜左衛門家  
塩野左近右衛門家  
竹中清太夫家  
石原善太右衛門家  
朽見助六家  
石原伝左衛門家 
江坂清次郎家  
三田村新左衛門家  
高橋四郎兵衛家  
河手四方左衛門家  
渡辺九郎左衛門家  
溝江彦之右衛門家 
勝五兵衛家  
大家長兵衛家  
薬袋貞右衛門家  
武笠七郎左衛門家  
山中宗十郎家  
松本伝兵衛家  
小山門左衛門家  
藤田貞蔵家  
君田十助家  
松居武太夫家 
140石
都筑弥次右衛門家 
青木津右衛門家  
小塙喜兵衛家  
大鳥居彦三郎家  
佐原善右衛門家  
海老江勝右衛門家
130石 
高橋建五郎家  
宇津木舎人家 
今村彦十郎家  
大嶋五太夫家 
木俣十蔵家  
吉川藤之丞家  
田中喜兵衛家  
大久保弥七郎家  
内藤喜右衛門家 
高野久兵衛家  
大堀小右衛門家  
岡武左衛門家 
120石
秋山忠兵衛家
上田八右衛門家 
上松助左衛門家 
内山次右衛門家 
宇津木三四郎家
舟越安左衛門家 
木村勝左衛門家 
木代利右衛門家 
中村惣左衛門家 
仙波久右衛門家 
箕形惣左衛門家 
一色七郎兵衛家 
本間九左衛門家 
戸次治部家 
孕石又七郎家 
浦上孫左衛門家
竹岡彦左衛門家 
草刈次郎右衛門家 
奥山又市家 
110石 
三宅庄左衛門家  
安藤孫左衛門家  
横山彦右衛門家  
山本岡右衛門家
90石
大西与九郎家  
小幡平太夫家

幕末の領地 
 近江国
 愛知郡のうち - 53村
 犬上郡のうち - 122村（残部は寺社領でありほぼ全域）
 坂田郡のうち - 130村（大部分）
 浅井郡のうち - 18村（うち10村を朝日山藩に編入）
 伊香郡のうち - 26村
 下野国
 安蘇郡のうち - 15村
 武蔵国
 荏原郡のうち - 10村 
 多摩郡のうち - 9村

上記のほか、明治維新後に千島国択捉郡および日高国沙流郡の一部を管轄した。また、蒲生郡7村、神崎郡1村（以上は大津県に編入）、愛知郡21村（うち11村を大津県に編入）、坂田郡5村、浅井郡24村（うち19村を朝日山藩に編入）、伊香郡13村（大津県に編入）の幕府領を預かり、他の藩・県に編入された村以外は本藩に編入された。