門司機関区（もじきかんく）は、福岡県北九州市門司区にある日本貨物鉄道（JR貨物）の車両基地（機関区）である。

北九州貨物ターミナル駅及び門司駅に隣接しており、両駅への入出区が行われる。九州島内の貨物列車牽引用機関車及び各ターミナルに配置する入換動車が全て所属しており、それらの機関車および貨車（JR九州所有のチキ5500・チキ6000の委託含む）の検査（交番検査・仕業検査・臨時検査）修繕を行っている。所属電気機関車の車輪の削正作業については福岡貨物ターミナル内車輪旋盤機にて行い、内燃機関車については小倉車両所へ入場する。また、JR貨物九州支社内最大の運転区所でもある。

鹿児島県鹿児島市に門司機関区鹿児島派出がある。

所在地 
福岡県北九州市門司区大里新町11番1号：北九州貨物ターミナル駅（門司駅）構内

配置車両に表示される略号 
「門」…門司を意味する「門」から構成される。
機関車に配される区名札は黒地に白文字だが、EF81形300番台のみ白地に黒文字の区名札が用いられている。

所属車両
2022年3月現在の配置車両である。

電気機関車
ED76形
0番台2両、1000番台8両の計10両（81・83・1015 - 1022号機）が所属している。

運用区間は、北九州貨物ターミナル駅以南の貨物列車運行区間の全線。
全般検査・台車検査は九州旅客鉄道 小倉総合車両センター内 日本貨物鉄道小倉車両所が実施する。
81・83号機は、九州旅客鉄道（JR九州）からの購入車である。

EF81形
300番台1両、400番台3両、450番台5両、500番台3両、600番台2両の計14両（303・403・404・406・451 - 455・501 - 503・716・717号機）が所属している。

716・717号機が三菱電機/三菱重工製、その他が日立製作所製である。
運用区間は、北九州貨物ターミナル駅 - 鹿児島貨物ターミナル駅・鍋島駅・南延岡駅間。
全般検査・台車検査は九州旅客鉄道 小倉総合車両センター内 JR貨物小倉車両所が実施し、出場時の試運転では直流機器の走行テストも兼ねて山陽本線幡生操車場まで乗り入れる。
2010年12月15日に初めて鹿児島貨物ターミナル駅までの運用に就いた
2012年3月17日のダイヤ改正より幡生操車場への乗り入れ運用が消滅した。
2013年3月16日のダイヤ改正より初めて南延岡駅までの運用に就いた。

EH500形
3次形の15両（45 - 50・65 - 73）が所属している。
全車が東芝府中事業所にて製造された。
全般検査時は北陸経由で無動力回送され、東日本旅客鉄道 大宮総合車両センター内JR貨物大宮車両所にて行う。
運用区間は、幡生操車場 - 福岡貨物ターミナル駅-鳥栖貨物ターミナル間。従来、EF81形重連牽引であった幡生操車場-福岡貨物ターミナル間の運用を置き換えた。
2018年に福岡貨物ターミナル以南の熊本操車場まで試験的に入線しており、線路の負荷などを検証した後、今後の運用拡大が予想される。
線路規格が3～4級線と低い日豊本線大分以南、長崎本線、鹿児島本線八代以南には設計上入線できない。

EF510形300番台
九州地区専用機として2021年12月より300番台の1両（301号機）が所属している。製造は川崎車両が行っており、合計17両が投入され、既存のED76形及びEF81形を置き換える予定。

ディーゼル機関車
DE10形
1500番台2両（1745・1746号機）が所属している。

運用区間は、北九州貨物ターミナル駅  - 西小倉駅間。
新型車両や廃車車両の甲種輸送で運用区間外の本線上を運転することがある。
2021年現在、愛知機関区より貸し出されているDD200形がDE10形の受け持つ運用に入ることがある。

DB500形
0番台1両（下関駅1号機）、2021年より50番台3両（西大分駅51・52号機、延岡駅53号機）が所属している。

運転士乗務範囲 
山陽本線：幡生操車場 - 北九州貨物ターミナル駅間
鹿児島本線：門司駅 - 鳥栖駅間、千早操車場 - 福岡貨物ターミナル駅間
日豊本線：小倉駅 - 西大分駅
長崎本線: 鳥栖駅 - 鍋島駅

歴史 
1898年（明治31年）4月1日：九州鉄道大里機関庫として創設
1907年（明治40年）7月1日： 九州鉄道の国有化により官設鉄道に移管
1911年（明治44年）10月1日：関門航路貨客分離に併せて門司駅構内に大里機関庫門司分庫を開設
1936年（昭和17年）9月1日：大里機関区に改称、大里機関庫門司分庫は同区門司支区に改称
1942年（昭和17年）4月1日：門司機関区に改称、大里機関区門司支区は門司港支区に改称し敗戦前後に門司港機関区に分離独立
11月15日：関門トンネル開通
1962年（昭和37年）3月1日：ディーゼル機関車投入
10月1日：鹿児島本線電化（門司港駅 - 久留米駅）
1967年（昭和42年）10月1日：日豊本線電化（小倉駅 - 新田原駅）
1973年（昭和48年）9月30日：日田彦山線無煙化により蒸気機関車の運用廃止
1984年（昭和59年）4月1日：門司港、若松、行橋の各機関区を門司機関区に吸収統合
1987年（昭和62年）3月1日：門司客貨車区を統合
1987年（昭和62年）4月1日：国鉄分割民営化に伴い日本貨物鉄道門司機関区として発足
1993年（平成5年）3月18日：東小倉、浜小倉、熊本の各派出所を駅に統合
1993年（平成5年）12月1日 日豊本線貨物支線である細島線全線廃止。細島駅を廃止。
1994年（平成6年）12月3日：小波瀬西工大前駅 - 苅田港駅間推進運転開始（プッシュプル解消）
1995年（平成7年）4月20日：直方機関区を統合、関門間全面受託
1997年（平成9年）3月22日：日豊本線受委託全面解消
2016年（平成28年）10月1日 - 日豊本線貨物支線である苅田港線の廃止。

その他 
下関駅 - 門司駅間を走行する客車列車の牽引を九州旅客鉄道（JR九州）から受託しており、同社所属のEF81形400番台の2両も門司機関区に常駐していた。同区間を走行するブルートレインやムーンライト九州などの客車列車には、門司機関区の運転士が乗務していた。

過去に九州旅客鉄道(JR九州)が運行していた12系客車/24系客車を使用した夜行急行 かいもん・日南については分割民営化後も運行を委託され門司機関区所属のED76形を使用し、全区間門司機関区の運転士が乗務していた。

2009年（平成21年）3月14日ダイヤ改正でのはやぶさ・富士廃止による九州ブルトレ全廃、また同年8月にはムーンライト九州に使用されていた14系客車が廃車となり、同列車が事実上の運転終了となったため、この受託業務は解消されている。

現在、団体列車としてJR西日本の客車列車が下関駅 - 門司駅間を走行して九州入りすることがあるが、JR九州が電気機関車を淘汰・全廃したため、その場合は下関駅においてJR九州のDE10による重連で牽引され、九州上陸後もそのまま牽引する。2001年（平成13年）10月までは筑豊本線の客車列車の牽引も受託しており、当機関区に所属していたDD51形が担当していた。

その他、客車列車が大幅に遅延した場合や機関車運用が乱れた際などは、本来のJR九州所属のEF81形に代わって当機関区の機関車がピンチランナーとして牽引することもあった。

鹿児島派出 
鹿児島派出（かごしまはしゅつ）は、鹿児島県鹿児島市にある日本貨物鉄道（JR貨物）の乗務員区所である。

所在地 
鹿児島県鹿児島市浜町2-6（鹿児島貨物ターミナル駅構内）

歴史 
2004年（平成16年）3月13日 : 発足。
当駅までの貨物列車は肥薩おれんじ鉄道線を経由する。