日琉祖語（にちりゅうそご）とは日琉語族に属す諸言語の祖語である。日本祖語（にほんそご）とも呼ぶが、琉球語を除いた本土日本語諸方言の祖語を指して日本祖語と呼ぶ場合もある。

英語ではとよばれることもあり、かつては共通日本語、原始日本語、といった呼ばれ方をすることもあった。

日琉の分岐

奈良時代の上代日本語には琉球語と共有していない改新がいくつか見られるため、両者は7世紀以前に分岐したと考えなければならない。（先）琉球祖語は分岐以降もしばらく九州にとどまり、琉球列島への移住はおそらく10世紀から11世紀にかけての農耕文化の急激な拡大（グスク時代の開始）と一致すると考えられる。こう考えると、琉球祖語に存在する漢語を9世紀以降に中古日本語から借用されたものとして説明できる。琉球への移住が行われてから1609年に薩摩藩が琉球王国へ侵攻するまでは、日本本土からの影響は限られていた。

子音体系
日琉祖語の子音は下記のものが考えられており、このうちと以外は広く合意が得られている。

濁音の起源 
上代日本語の濁音, , , は語頭に来ることがほとんど無かった。濁音は鼻音＋無声子音という子音連続に由来することが合意されている。ほとんどの場合、この子音連続は間に挟まっていた母音の脱落により発生したものである（連声濁）。

 ゆづら「弓弦」<  < 「弓-弦」
 あび1き1「網引」<  < 「網-引き」
 ぬすび1と2「盗人」<  < 「盗み-人」
 むらじ「連」<  < 「村-主」

いくつかの語では母音脱落が起きた証拠がないが、それらのケースで多くの研究者は無声阻害音の前の音節末鼻音を再建している。例えば、 > （粒）、 > （膝）などである。この  は後代の日本語の撥音とは関係がない。撥音は語の縮約あるいは中国語のような他の言語からの借用に由来する。また、「櫓」を < 「矢の倉」のように、連濁に対しては属格の助詞「の」の祖形や、「に」の祖形を挟んだ形からの母音の脱落が想定されることが多い。但し、異説も有る。

*s の破擦音説 
日琉祖語の  を破擦音だとする説は、古代日本語のサ行子音の音価に直接かかわっている。

古代日本語（上代日本語と中古日本語の総称）の  が破擦音だったとする説は、悉曇学の音図に影響されて日本語の子音が並べられていると見られる平安時代の五十音図において、ちょうど破擦音である口蓋化音が置かれている位置にサ行が配置されていることに端を発する。ただ、この配列は口蓋化した歯擦音の  のような音であった可能性を排除するものではない。

有坂秀世などの国内の研究者やミラーなどの20世紀の上代日本語研究者は  にいくつかの環境での破擦音の異音を認めたが（「上代日本語」を参照）、アンガーは言語類型論的には殆ど全ての言語が通時的に  を持っており、ある言語が歯擦音を一つだけ持っている場合それは常に  であることを指摘し、破擦音説を否定している。また、ミヤケは上代日本語の万葉仮名を推古期の用字と比較分析すると、声母の書き分けが存在するという仮定のもとでは考えにくい破擦音の変化が起こらなければならないこと、またサ行に使われている万葉仮名はそれ以前の体系を継承していることを指摘し、日本書紀α群に基づいた破擦音の異音説を否定している。

*w/*j の破裂音説 
上代日本語のと（ヤ行子音）の起源を、半母音ととするか、南琉球語群での反映に基づき有声破裂音ととするかについては意見が分かれている。 韓国語や他の北東アジア言語との遺伝的関係を主張する者を含む多くの著者は、南琉球語群のと与那国語のは日琉祖語の有声破裂音とが残ったもので、他の言語では子音弱化してととなったと主張する。
 南琉球語群ではが上代日本語のに対応し、例えば「私」、「腹」は上代日本語の、に対応する。また、富山湾周辺の2つの方言には、他の日本語方言のに対応するがある。
 与那国語には、上代日本語のに対応するがある。例えば、「家」、「湯」、「山」は、上代日本語の、、に対応する。

しかし多くの言語学者は、日琉祖語のとが強化されて南琉球語群のと与那国語のになったとする説を支持している。 >  のような強化は珍しくなく、複合語にが現れないことから、のほうが新しいと考えられる。また、与那国語では | >  が起こっており、 >  という自然な変化を新たに認めるだけで十分である。また、「茶碗」、「野菜」のように、漢語でも や  という対応が存在する。15世紀末の韓国の年鑑『成宗実録』には、与那国島の地名を吏読で「」と記されており、中期朝鮮語の読みはで、本文ではは日本語の「島」であることが説明されている。これは強化  >  >  の中間段階の直接的な証拠であり、現代の「与那国」につながるものである。

母音体系
現在では多くの研究者は日琉祖語にを再建する6母音説を受け入れている。ジョン・ホイットマンとビャーケ・フレレスビッグはこれらにを加えた7母音説を唱えていたが、少なくともホイットマンは近年6母音説に転じている。上代特殊仮名遣いのオ甲乙が条件異音であるとする説は、最小対や意味の対立の存在からもはや説得力を持たないと考えられる。

中段母音 
上代日本語の, , , は、, , , に比べて出現頻度が非常に少なく、多くが語の途中または末尾において現れることから、これらが二次的なものなのではないかという発想があった。

また、以下のような内的再構から、下の音法則が記述された。
 「咲けり」< 「咲き-あり」
 「嘆く」< 「長-生く（長く息を吐く）」
 「数える」< 「数-合える」
 「集う」< 「粒-合う」
  ~ 「倭文」< 「しつ-織り」
  ~ 「現身」< 「現し-臣」
 「日置」< 「日-置き」

この種の内的再構から、先上代日本語に (>), , (>), の四母音が再構され、これを敷衍してこれ以外の上代日本語の母音も日琉祖語の母音連続に由来するとする説がかつてミラー、大野晋ら、ホイットマン、マーティン、スタロスティンなど多くの研究者によって提唱され、一般的であった。なお、 は歴史的には各研究者によって表記法が異なっていて、現在でも  に ⟨o⟩ を用いる研究者がいるらしいため、対照表を置く。

しかし、「水」「蒜」「肘」などの一部の単語で、上代日本語の  に琉球祖語  が対応している例があり、それらに対し日琉祖語 （「水」、「蒜」、「肘」）が再建できる。また「海」「薬」「過ごす」などの語において、上代日本語に琉球祖語が対応している例があり、それらに日琉祖語 （「海」、「薬」、「過ごす」）が再建できるといったことが指摘されるようになった。上代日本語に起きた  > ,  >  の音韻変化を「中高母音の上昇」と言う。これらは最初に服部四郎によって、続いてマナー・ソープ、レオン・セラフィムなどによって1970年代後半以降に再構された。四母音説の主唱者たちはこの琉球祖語の中段母音は一定の条件や散発的な低舌化によって説明できると考え（あるいは信じ）た。例えば、ホイットマンはその1985年の博士論文で、表のような同化を想定することによって琉球祖語の  が二次的なものであるとみなせると考えた。

日琉祖語  > 琉球祖語 , 上代中央語  ___C[+有声]V[+高母音]

しかし、これは20世紀の終わり前後にレオン・セラフィムやマーク・ミヤケによって具体的な例外が多数指摘された。※琉球祖語のあとにある学者の名前はその琉球祖語形の再構者を意味している；必ずしもこれらの形が最新のものであるとは限らない。

  > 琉球祖語（ソープ）, 上代中央語 「鳥」（予測されるのは✕）
  > 琉球祖語（ソープ）, 上代中央語 「海苔」（予測されるのは✕）
  > 琉球祖語（セラフィム）, 上代中央語 「犬」（予測できない）
  > 琉球祖語（セラフィム）, 上代中央語 「蒜」（予測できない）
  > 琉球祖語（セラフィム）, 上代中央語 「肉」（予測できない）
  > 琉球祖語（セラフィム）, 上代中央語  「舌」（予測できない）

うえにあげたようなさまざまな経緯から、日琉祖語には ,  という二つの原初的な中段母音を再構しなければならないことが2000年代前後から徐々に合意されていった。この  と  は、上代東国諸語にも痕跡が残されている。また、たとえば稲荷山古墳出土鉄剣の⟨獲加多支鹵⟩に対応する上代中央語「ワカ-タケ1ル」の「ケ1」が、上代中央語ではキ1相当の万葉仮名である⟨支⟩で書かれていることなども、これによって説明することができる。つまり、先上代日本語では「ケ1」と読まれる仮名であったものが、MVRによって「キ1」と読まれるようになった、と考えられる。

これまでに説明した琉球諸語などとの音韻対応から、上代日本語の / の一部は祖語からのものであると考えることができるが、これらがMVRを起こしていないことに対する説明が必要になった。そこで服部四郎とそれに続いた早田輝洋の二人は、上代日本語でMVRをしなかった両母音に日琉祖語の / という二つの長母音を再構することでこれを説明しようとした。なお、通言語的には長母音の方が高舌化する傾向があることが知られていることなどから、服部四郎と早田輝洋の説は現在ではあまり受け入れられていない。

代わって提案されたのが、韻律的に顕著な場合にのみ高舌化が起きた、より具体的に言えば、概ね / は語末にある場合には高舌化を起こさなかった、というものであった。上代日本語 / の多くは二音節以上の単語の最終音節か、一音節の単語の中で見つかることが明らかになっていることや、上代日本語の /「婿」という二重語がこれを典型的に支持する。一方で上代日本語で語末以外に見つかる / は、この音法則で説明できないことが指摘されている。

母音連結

*Vi (*Vy) 
アマ/アメ2(雨)、ウハ/ウヘ2(上)、サカ/サケ2(酒)、マ/メ2(目)というふうに、上代日本語には複合語中で現れる形（被覆形）と単独で現れる形（露出形）というふたつの形を持った単語が多数あることが明らかになっていた。この被覆形—露出形交替を起こすイ乙・エ乙の起源として、// という三つの母音連結を再構する立場はその当時から、また現在ではさらに  をも再構するのが一般的である。

これらは下降二重母音であったと解釈され、一部の研究者（はアレクサンダー・ヴォヴィンなど、 はジョン・ホイットマンなど）に /// あるいは /// と書かれることがあるが、これらの母音連結は以下の音韻変化を経験したと考えられる。

語例：

 サケ2(酒) ~ サカヅキ1(盃) < 
メ2(目) ~ マヘ1(前) < 
 ミ2(身) ~ ムカハリ(身代り) < 
ツキ2(月) ~ ツクヨ1(月夜) <  (Thorpe の琉球祖語によれば)
ツキ2(調「貢ぎ物」) ~ ツク-ナフ(償う) < 
ツキ2(槻) ~ ツク-ユミ(槻弓) < 
クキ2(茎) ~ ククタチ(アブラナなどの野菜［の薹］）< （Thorpe の琉球祖語によれば）
キ2(木) ~ コ2ノ2ハ(木の葉) < 
ヨミ2(黄泉) ~ ヨモ2- < 
ミ2ル ~ モ2ト2ホ(2)ル/EMJ モドル < ?
 ヒ2(火) ~ ホノ2ホ(炎) < 

これらの音法則は以下のような内的再構からも支持することができる。

 ワキ2ラツコ1 「菟道稚郎子」<  「若-郎子」
 タケ2チ「高市皇子」< 「高-市」
オヒ2シ「大石」< 「大-石」
 EMJ ヱヌ「仔犬」< pre-OWJ  < 「小-犬」
 ト2ネリ「舍人」< *tənə-iri「殿-入り」

, , , が再建される被覆形—露出形の対応の多くは接辞の添加によるとする説が一般的であったが、一方で、 が語末子音由来であるとの見解が服部四郎や村山七郎などのころからあり、被覆形の由来はその語の後に子音で始まる形態素が結合した場合に語末子音が脱落したものとする説がある。この語末子音は、周辺言語との借用の検討や内的再構からより古い段階の  に由来するとする説がある。また、一部の研究者は pJ  > WOJ 「身」のような変化を朝鮮語族との比較から再構する場合もある。

名詞における被覆形—露出形交替と同一の母音交替（こちらもしばしば被覆形—露出形とよばれる）は、二段活用動詞の連用形でも見られる。たとえば下二段活用動詞の連用形語尾はe2であるが、多くの語が

 アケ2/アカ(明・赤)
 アレ/アラ(荒)
 カレ/カラ(枯)
 アゲ2/アガル(上)
 アテ/アタル(当)

などのように、で終わる語根と密接な関係を持つ。従って下二段活用動詞の連用形語尾の古形はと再構することができる。また上二段活用動詞の連用形語尾はであるが

 オキ2/オコ2ル・オコ2ス(起)
 オチ2/オト2ル・オト2ス（落・劣）
オヒ2(育つ)/オホス(育てる)
ヨキ2(避)/ヨ2コ2ス(讒)
アミ2/アムス(浴)
 ツキ2/ツクス(尽)
ワビ2/ワブシ(侘)
ナギ2(凪ぐ)/ナグサム(心が静まる)/ナゴ1ヤカ(和)
コ1ヒ2/コ1ホシ(恋)

などのように、 またはで終わる語根と密接な関係を持つから、上二段活用動詞連用形語尾の古形は  または / と内的再構することも可能である。（ただし「尽」の場合、上代日本語からは内的にが再建されることになるが、では琉球祖語を考慮した比較によりに修正されている）

その他の母音連結 
 という被覆形でおわり、露出形を  とする単語に対して日琉祖語には  が再構される。また、Kupchik によれば上代駿河方言の「鴨」 <  などのように上代東国諸語から比較手法によって再構することもできる。

 シロ1/シラ-(白) < 
 クロ1/クラ-(黒/暗) <

母音連結対応 
日琉祖語の母音連続は、琉球祖語や上代東国諸語においては以下のように異なった現れ方をしている。例えば（7母音説では）を含む「木」「落ち(る)」は、それぞれ琉球祖語、/が再構できる。

※上代東国諸語の具体的な音価については、資料性の問題でよくわからない部分も多い。また、非常に多彩な写映形が観察され、ここにあげているものは一部に過ぎない。詳細はKupchik(2011)に詳しい。

アクセント体系 

日本語（本土方言）諸方言および中古日本語の声点資料の比較から、1音節名詞に3類、2音節名詞に5類の、主要なアクセント型の対立（類の対立）があったと考えられ、その音調は、中古日本語と同様に2音節名詞であれば第1類から第5類までそれぞれHH、HL、LL、LH、LFとする説が比較的有力である（Hは高い音調、Lは低い音調、Fは下降調）。一方で、琉球諸語ではこのうち2音節名詞の第3類・第4類・第5類がそれぞれ二つの類に分裂していることが明らかとなったため、日琉祖語にはより多くのアクセント型の対立があったと考えられる。

母音調和

*oi の存否
日琉祖語の音節構造や、属格の助詞などの一部の形態素の説明のために有坂＝池上法則のような母音調和があったと仮定すると、それは // の三つの母音と  が対立するという不均衡なものになってしまう。また、「火」は琉球祖語の対応からは  が再構されるはずであるが、上代日本語では「炎（ほのほ）」などからわかるようにオ段（ホ甲乙を認める場合はホ甲類）である。こういったことを説明するために、服部四郎は本土日本語で  ~  対応になると考えた単語を  と同じ母音調和のグループに属していたとみなし、 を含んだ形として再構した。

しかし、「指」の再構の根拠は薄弱であり、また「皆」「火」は円唇子音につづくものであった。そのため、ホイットマンの博士論文はこれが日琉祖語  > 先琉球祖語  /唇音の後 ではないかと提案し、ソープも琉球祖語の研究から、同様の結論を出した。ソープは琉球祖語では (=) > {, ?}__が発生したと考え、日琉祖語に  (現代の日琉祖語では  に相当する)「火」・ (現代の日琉祖語では  に相当する）「居る」などといった形を再構した。しかしトマ・ペラールは 「生ふ」 > 琉球祖語  がこの反例であり、日琉祖語に  (> PR)「藍」 ~ 「青」といった単語を再構するのは有坂池上法則に反することを指摘する。一方で、ホイットマンは依然として先琉球祖語での  > {, , }＿ を支持している。

舌根調和
早田輝洋はツングース諸語やニヴフ語のそれと一致する以下のような母音調和を指摘している。

他の再構体系

他の単母音の可能性

7母音説 
との交替に日琉祖語のを再構するのが普通であるが、との交替のある少数のに対しても、日琉祖語にが再建されることが音法則の無例外性に違反する。したがってこの母音交替に対し中舌の狭母音を再建し、 > ,  > とする研究（ビャーケ・フレレスヴィッグとジョン・ホイットマン、それに続いたマーティン・ロベーツなどによるもの）が存在した。これは朝鮮語族との比較からは支持されるが、琉球語や上代東国諸語にその区別に関する写映形がないことが問題になっている。また、提案者の一人であったホイットマンは、上代日本語においてとの交替は  の後、との交替は舌頂子音の後に限定されており、先行する子音の高調音性(acute)・低調音性(grave)の対立によっての二通りの変化を説明できると述べ、6母音説に転じた。

服部四郎
参考として、服部四郎の考えた母音体系を示しておく。 以外には長母音がさらに再構され、母音字を二つ重ねて表記される。

重母音を認めない再構

ソープの9母音説 
マナー・ソープは1983年の博士論文で琉球祖語をはじめて体系的に再構するとともに日琉祖語を再構したが、琉球祖語でも被覆形と露出形の交替が発生することから、少なくとも日琉祖語（ソープの用語は）の段階で ,  などといった母音連結を認めず、全てを単母音とみなして体系を構築した。

セラフィムの10母音説 
レオン・セラフィムは1977年に先上代日本語体系に  を二つ加える10母音体系を再構したが、これは日野資成によると  の存在を裏付ける証拠が少ないことが問題であるという。

その他の過去の再構

アンガーの5母音説 
ジェームズ・アンガーは1977年の博士論文で他の体系とは著しく異なったものを再構した。これによると、 > 上代日本語 {, , , , }__, 上代日本語 それ以外  という音法則が想定され、また、,  が散発的な低舌化によって上代日本語の ,  を生み出したとした。

音素配列論 
日琉祖語の単語は多くが二音節以上で、各音節は(子音+)母音の構造を持っていた。また、日琉祖語の特徴としては、同じ母音を含む音節が結合する単語がよく見つかり母音調和を行っていた根拠とも言われるが、真相は定かではない。同一結合単位内（語根内）においてはや、はや、はやと共存しない傾向が強い。

有坂=池上の法則 
有坂=池上の法則（有坂池上法則、有坂の法則ともいう）は、上代日本語、さらには日琉諸語全体に化石的に見られる音節結合の法則である。有坂秀世と池上禎造によって1930年代に独立して発表された。

オ列甲類とオ列乙類は、同一結合単位（語幹ないし語根の形態素）に共存することはない。
 ウ列とオ列乙類は同一結合単位に共存することは少ない。特にウ列とオ列からなる2音節の結合単位においては、そのオ列音は乙類ではない。
 ア列とオ列乙類は同一結合単位に共存することは少ない。
上代日本語の  の日琉祖語形はこれに基づいてしばしば決定される。

 「十」 > 上代日本語 
 「青」> 上代日本語

ホイットマンの法則

活用語形態論

主な再構される接辞

他動詞性飛ばし

四段動詞と形容詞の連体形

名詞形態論

格助詞 
格助詞「つ」は現在使われていないが、現代語の名詞に現れることがある。

（海つ神霊/わだつみ）こちらのは“”の「ミ」ではなく、「御霊/みたま」などの「ミ」であるため甲類である。神は当て字
（山つ神霊/やまつみ）
（厳つ霊/いかづち）雷
（水つ霊/みづち）蛟
（野つ霊/のづち）野槌
（目つ毛/まつげ）睫毛
（身つ柄/みづから）自ら
（遠つ日/をとつひ）一昨日
（家つ子/やつこ）奴
ただし、出づ水（泉/いづみ）は格助詞「つ」ではなく"出る水"という意味である。

格助詞「な」も同様に、以下の単語が挙げられる
　（水な戸/みなと）港
　（水な元/みなもと）源
　（水な月/みなづき）水の月＝水無月[6月]
　（神な月/かむなづき）神の月＝神無月[10月]
　（神な柄/かむながら）随神

後置修飾

語彙 
※OJは(上代日本語)

※PRは(琉球祖語)

※EMJは(中古日本語)

わ行音と青色や水の関連性も指摘される。*アイヌ語で「水」は「wakka」
awo（青）、awi（藍）

起源

日琉語族と他の語族との関連性は立証されていないが、文法など類型的には、朝鮮語およびアルタイ諸語との関連性が高いとする見方が比較的有力である。

故地
五十嵐陽介は、日琉語族の下位系統に拡大東日本語派と南日本語派を提案し、そのどちらにも属さない諸方言が分布する北陸・近畿から九州北東部のどこかに、日琉語族の源郷があったとみている。

一方、日琉語族が日本列島で話されるようになるより前の段階については、日琉語族の話者（弥生人）が紀元前700年～300年頃に朝鮮半島から日本列島に移住し、最終的に列島先住言語（縄文語）に取って代わったとする説が広く受け入れられている。

朝鮮半島における日琉語族話者の集団は無文土器文化の担い手であったという説が複数の学者から提唱されている。これらの説によれば、古代満州南部から朝鮮半島北部にかけての地域で確立された朝鮮語族に属する言語集団が北方から南方へ拡大し、当時朝鮮半島中部から南部に存在していた日琉語族の集団に置き換わっていったとしている。この過程で南方へ追いやられる形となった日琉語族話者の集団が弥生人の祖であるとされる。

この朝鮮語族話者の拡大及び日琉語族話者の置き換えが起きた時期については諸説ある。ジョン・ホイットマンや宮本一夫らは山東半島から朝鮮半島南部に移住した日琉語族話者が無文土器時代の末まで存続し、琵琶形銅剣の使用に代表される朝鮮半島青銅器時代に朝鮮語話者に置き換わったとしている。一方でヴォヴィンは朝鮮半島の三国時代において高句麗から朝鮮語族話者が南下し、百済・新羅・加耶などの国家を設立するまで朝鮮半島南部では日琉語族話者が存在していたとするまた、別の発表では、日琉語族とオーストロアジア語族またはタイ・カダイ語族の間に接触の痕跡があることから、日琉語族の（朝鮮半島よりさらに過去の）故地は中国南部であり、“Altaic”ではないと主張している。