次のソフトウェアのパッケージとアプリケーションは、健康医療産業で利活用するためにオープンソースライセンスまたはパブリックドメインでライセンスされている。

無償で使用できるソフトウェアでオープンソース・ライセンスでないものは、無償健康ソフトウェアに位置づけられる。

カテゴリー

公衆衛生と生物学的監視 
Epi Info  アメリカ疾病予防管理センターが開発した、パブリックドメインの疫学用統計ソフトウェア。
 開発元 Centers for Disease Control and Prevention
 安定版 7.1.0.6 / August 9, 2012
 開発言語 Microsoft Visual C# 3.5
 稼働環境 Windows
 カテゴリ 統計ソフトウェア, 疫学
 ライセンス Public domain（著作権放棄）
Spatiotemporal Epidemiological Modeler  元々IBMリサーチが開発した、感染症の広がりをモデル化し、可視化のためのツール。
 開発元 IBM, BfR, Eclipse Foundation
 開発開始時期 2006
 開発言語 Java software
 稼働環境 Any (Java software)
 使用言語 English (with Java National Language Support)
 カテゴリ 科学ソフトウェア
 ライセンス EPL

歯科管理や患者の記録 
Open Dental  記録管理、患者のスケジュールおよび歯科医院管理に関する非常に幅広い機能を備えた歯科管理パッケージ。
 開発者 Dr. Jordan Sparks
 安定版 13.1 / June 25, 2013
 プレビュー版 13.2(Beta) / July 21, 2013
 開発言語 C#
 稼働環境 Microsoft Windows, Linux
 カテゴリ 業務管理ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License

電子医療やカルテ 
Bots open source edi translator  GPLライセンスでクロスプラットフォームのEDIソフトウェアフレームワークで、すべてのHIPAAトランザクションをサポートする。Djangoを使用している。MySQLおよびPostgreSQLのようなデータベースをサポートする。
 安定版 3.1.0 (released at 2013-09-03)
 開発言語 Python
 稼働環境 Windows, Linux, OSX and Unix
 カテゴリ 電子データ交換ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
 CottageMed  ファイルメーカーをベースにしたクロスプラットフォームの電子カルテシステム。
 開発元 Caring in Community 501(c)3 & Stefan Topolski
 安定版 2.7 / February 12, 2013
 稼働環境 Linux, Cross-platform
 カテゴリ 電子カルテ
 ライセンス GPL v2
FreeMED  業務管理、電子およびコンピュータ記録システム。診察だけではなく受診理由など保存するため詳細に医療データの追跡が可能である。
 開発元 FreeMED Software Foundation
 開発開始時期 1999
 活動状況 活動中
 開発言語 PHP
 稼働環境 Cross-platform
 使用言語 多言語
 カテゴリ 健康医療ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
GaiaEHR  PHPとExt JSを使用して開発された近代的な電子カルテ。
 安定版 v0.0.7 / March 2014
 稼働環境 Linux, Unix-like, OS X, Windows
 カテゴリ 医療業務管理ソフトウェア, 電子カルテ
 ライセンス GNU General Public License
GNUmed  PostgreSQLを使用したwxPythonアプリケーション。
 開発元 GNU Project
 安定版 Client 1.4.7, Server 19.7 / March 19, 2014
 開発言語 Python
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ 電子医療記録
 ライセンス GNU GPL
GNU Health  無料で一元化された拡張性の高い健康と病院情報システム。
 開発元 GNU Project
 安定版 Client 1.4.7, Server 19.7 / March 19, 2014
 開発言語 Python
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ 電子医療記録
 ライセンス GNU GPL
Hospital OS  タイにおける小規模病院向け病院情報システム。
 開発開始時期 2005
 安定版 3.9
 開発言語 Java
 稼働環境 Windows XP, 7, MacOS, Ubuntu
 使用言語 English, Thai
 カテゴリ 病院情報システム
 ライセンス GNU GPL
HOSxP  タイで70以上の病院で使用されている電子カルテ(EHR)を含む病院情報システム。
 開発元 Chaiyaporn Suratemekul
 開発開始時期 1999
 カテゴリ 病院情報システム
 ライセンス GNU General Public License
Mirth Connect  複数のトランスポート経由でシステムやアプリケーション間のHL7メッセージの送信双方向が可能なクロスプラットフォームであるHL7インタフェースエンジン。
 開発元 Mirth Corporation
 最初のリリース July 18, 2006
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ Integration engine
 ライセンス Mozilla Public License 1.1
NOSH ChartingSystem (source code)  Laravel(フレームワーク)・PHP・jQueryをベースにした電子カルテシステムおよび患者ポータルシステム。
 稼働環境 Ubuntu
openEHR  管理と保存、およびモデリング·パラダイムのレベル2準拠の電子カルテ(EHR)上の健康データの検索と交換を記述する医療情報におけるオープンな標準仕様。
OpenEMR  PHPベースの電子医療記録(EMR)システム。
 安定版 4.1.2 / August 17, 2013
 稼働環境 Linux, Unix-like, OS X, Windows
 カテゴリ 医療業務管理ソフトウェア, 電子医療記録
 ライセンス GNU General Public License
OpenMRS  コミュニティで開発された企業向け電子カルテのフレームワークで、Javaをベースにした拡張可能でスケーラブルなEMR。
 開発開始時期 February 2006
 安定版 2.0
 開発言語 Java
 稼働環境 Linux, Windows, Mac OS X
 ライセンス Mozilla Public License
OSCAR McMaster  電子カルテ(EMR)ソフトウェア。ソフトウェアの有償コンポーネントはカナダの医療従事者のニーズに特化している。
 開発元 McMaster University
 安定版 12_1 / 2012-07-31
 動作環境 Cross-platform
 カテゴリ 医療業務管理ソフトウェア
 ライセンス GPL v2
THIRRA (EHR)  主に狭帯域用に設計されたWebベースの電子カルテのアプリケーション。Mozilla Public Licenseの下でリリースされ、伝染病の生物学的監視機能を含む。
 開発元 PCDOM
 安定版 2012-02-29 (0.9.14) / February 2012
 活動状況 活動中
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ 医療ソフトウェア
 ライセンス Mozilla Public License
VistA – Veterans Administrations  OpenVistaまたはWorldVistAを使用する非政府向けに利用可能な統合電子カルテシステム。
 開発元 US Department of Veterans Affairs
 安定版 13.06
 稼働環境 Server：Linux, Client：Windows, Linux
 ライセンス パブリックドメイン
ZEPRS  Webブラウザを使用して患者の訪問先からのデータ入力できる臨床医電子患者記録システム。
 開発言語 Java
 ライセンス Apache Software License (Version 2.0)
SmartCare  ザンビア、エチオピア、南アフリカでインストールされて稼働しているC# WindowsベースのEHRアプリケーション。発展途上国の貧困層における接続性の悪さを念頭に置き、患者レベルの情報を格納するスマートカードを使用させるために設計。中核開発チームは、政府が国民のEHRとして採用しているザンビアがベースとなっている。
Rugged EHR  CDAおよびHL7 V3標準ベースのEHR。これは、国内および国際的な外来診療提供者のために設計されている。IHE XDR、XDS、およびXCA標準を使用してボックス医療情報交換(HIE)の互換性が不足している。直接のプロジェクト標準の安全な通信である。ICD-10、SNOMED、およびLOINCの用語規格である。

医療業務管理ソフトウェア 
ClearHealth  スケジューリング、請求、EMR、HIPAAのセキュリティおよび売掛金などの実践事業の5つの主要な分野をカバーしている。
 開発者 Open source community
 最初のリリース 2003
 活動状況 活動中
 開発言語 PHP
 稼働環境 Cross-platform
 使用言語 Multilingual
 カテゴリ 医療ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
FreeMED  業務管理、電子およびコンピュータ記録システム。診察だけではなく受診理由など保存するため詳細に医療データの追跡が可能である。HIPAA準拠のFOSSの請求を処理する業務管理システムである。
 開発元 FreeMED Software Foundation
 開発開始時期 1999
 活動状況 活動中
 開発言語 PHP
 稼働環境 Cross-platform
 使用言語 多言語
 カテゴリ 医療ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
GNU Health  無料かつ一元化された拡張性の高い健康と病院情報システム。
 開発元 GNU Project
 開発者 Luis Falcón
 最初のリリース October 12, 2008
 安定版 2.4.1 / February 18, 2014
 活動状況 活動中
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ 病院情報システム
 ライセンス GNU GPL
MedinTux  デスクトップのようなウェブインターフェイスを持つフランスの医療行為管理システムで、最初から病院の救急外来を管理できる。細かくモジュール化されており、多くの異なる業務を実行するように拡張している。
 開発者 Dr. Roland Sevin
 稼働環境 Linux, Mac OS X, Microsoft Windows
 使用言語 French
 カテゴリ 健康管理
 ライセンス CeCILL
Open Dental  歯科診療管理。
 開発者 Dr. Jordan Sparks
 安定版 13.1 / June 25, 2013
 プレビュー版 13.2(Beta) / July 21, 2013
 開発言語 C#
 稼働環境 Microsoft Windows, Linux
 カテゴリ 業務管理ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
OpenEMR  無料の医療業務管理、電子カルテ、処方箋の書き込み、および医療費請求アプリケーション。
 安定版 4.1.2 / August 17, 2013
 稼働環境 Linux, Unix-like, OS X, Windows
 カテゴリ 医療業務管理ソフトウェア, 電子医療記録
 ライセンス GNU General Public License
OpenHospital  電子カルテシステム。小さな地方病院で使うための特徴を持つ。
Practice Manager  CDAとはHL7 V3の規格に基づいた近代的な業務管理システム。アメリカ国内および国際的な外来診療提供者のために設計されている。IHE XDR、XDS、およびXCA標準を使用してボックス医療情報交換(HIE)の互換性が不足している。ダイレクト・プロジェクト標準の安全な通信である。ICD-10、SNOMED、およびLOINCの用語規格となっている。

保健システム管理 
DHIS  地域向け保健管理情報システムおよびデータウェアハウス。
 開発元 Health Information Systems Programme
 カテゴリ 保健医療情報システム
 ライセンス DHIS 1: proprietary, DHIS 2: BSD
HRHIS  国際協力機構(JICA)が出資し、ダルエスサラーム大学、保健社会福祉省(タンザニア)のコンピュータサイエンス部により開発された健康のための人的資源の管理のための健康情報システム。
 開発言語 PHP
 稼働環境 Linux
 カテゴリ 健康情報のための人的資源
 ライセンス GPLV 3

イメージング/可視化 

Drishti|Drishti (software)|Drishti  コンピュータ断層撮影データを閲覧するための容積可視化パッケージ。DICOM画像スタックのインポートが可能である。
 開発元 ANU Vizlab
 開発者 Ajay Limaye
 安定版 0.1.8
 稼働環境 Linux, Mac OS X, Microsoft Windows
 カテゴリ 科学的可視化, 対話型可視化
 ライセンス GNU General Public License Version 2
Endrov  画像やデータビューアとエディタ。
 開発者 Johan Henriksson (Karolinska Institute)
 安定版 2.15 / 17 June 2009 (official release)
 稼働環境 Any (Java-based)
 カテゴリ 画像処理, 画像分析
 ライセンス New BSD License

Horos  OsiriX を fork した DICOMビューア/PACS
 開発元 horosproject
 安定版 3.1.1
 開発言語 Objective-C
 稼働環境 Mac OS X
 使用開発言語 Objective-C
 カテゴリ 画像処理
 ライセンス GPL Ver3
ITK  セグメント化および登録用ツールキット。
 開発元 Insight Software Consortium
 安定版 4.5.0 / 15 December 2013; 6 months ago
 開発言語 C++
 稼働環境 Cross-platform
 使用開発言語 C++, Python, Java
 カテゴリ 開発用ライブラリ
 ライセンス Apache 2, Apache 2
InVesalius  3D医療イメージ復元ソフトウェア。
 開発元 CTI
 安定版 3.0 beta 4 / 2013
 開発言語 Python
 稼働環境 GNU Linux, Windows, Mac OS X
 使用言語 English, French, Portuguese, Spanish, Chinese, German, Greek
 カテゴリ 医療ソフトウェア
 ライセンス GNU GPL2
ITK-SNAP  3D画像ナビゲーション、注釈と自動セグメンテーションのための対話型ソフトウェア。
 開発元 Researchers at UPenn and UNC
 最初のリリース 2004
 開発言語 C++
 稼働環境 Cross-platform
 使用言語 English
 カテゴリ 保健ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License
Ginkgo CADx  クロスプラットフォームのオープンソースのDICOM画像ビューアと画像DICOM規格変換ツール。
 開発元 Researchers at UPenn and UNC
 最初のリリース 2004
 開発言語 C++
 稼働環境 Cross-platform
 使用言語 English
 カテゴリ 保健ソフトウェア
 ライセンス GNU General Public License

MITK  対話型の医用画像処理のための医療画像の相互作用ツールキット。
 開発元 Deutsches Krebsforschungszentrum
 安定版 2013.12(09.12.2013)
 稼働環境 Linux, Mac OS X, Windows
 開発言語 C++
 カテゴリ 医療可視化, プログラムライブラリ, フレームワーク, ツールキット, 医療
 ライセンス BSD-artige
Orthanc  軽量、分散型ハイパーメディアのためのアーキテクチャ(RESTful)な DICOMストア。
 開発元 C.H.U. of Liège
 開発者 Sébastien Jodogne
 最初のリリース 19 July 2012; 22 months ago
 安定版 0.7.6 / 11 June 2014
 開発言語 C++, HTML, JavaScript
 稼働環境 Cross-platform: Linux, Windows, OS X
 使用言語 English
 カテゴリ DICOMストア
 ライセンス GPLv3, with OpenSSL exception
OsiriX  Mac OS X向けの3D DICOM医療ビューア。DICOMネットワークをサポートした完全なDICOMビューアとなっている。
 安定版 5.8.1 / November, 2013
 稼働環境 Mac OS X (GNU Lesser General Public License), iOS (commercial software)
 カテゴリ 医療
 ライセンス GNU Lesser General Public License

ParaView  大規模な可視化ツール。
 開発元 Sandia National Laboratory, Kitware Inc, Los Alamos National Laboratory
 安定版 4.1 / 2014-01-11
 稼働環境 Unix/Linux, Mac OS X, Microsoft Windows
 カテゴリ Scientific visualization, Interactive visualization
 ライセンス BSD
3DSlicer  医用画像の可視化とアルゴリズム開発のためのプラットフォーム。DICOMサポート、セグメント化および登録、拡散MRIの処理、および手術支援をガイドする画像である。
 開発元 The Slicer Community
 安定版 4.3.0 / 5 September 2013
 開発言語 C++, Python, Java, Qt
 稼働環境 Linux, Mac OS X, Windows
 サイズ 200MB
 使用言語 English
 カテゴリ 科学的可視化, 画像処理
 ライセンス BSD-style

Voreen  ボリュームデータセットを視覚的に探索するのにライブラリのあるレンダリング・エンジン。DICOMをサポートし、医療視覚化ならびに電子顕微鏡データを視覚化するために使用している。
 安定版 4.3 / June 14, 2013
 開発言語 C++ (Qt), OpenGL, GLSL, OpenCL. Python
 稼働環境 Cross-platform
 カテゴリ 立体レンダリング, 対話型可視化
 ライセンス GNU General Public License Version 2
VTK  可視化ツールキット。
 開発元 Kitware Inc.
 安定版 6.0.0 / 24 June 2013
 稼働環境 Cross-platform
 使用可能言語 C++, Tcl, Perl, Python, Java
 カテゴリ 科学的可視化
 ライセンス 3-Clause BSD
Xebra (medical imaging software)  医療用画像ソフトウェア。
 開発元 Hx Technologies
 開発言語 Java
 ライセンス GNU GPL
GIMIAS  生物医学画像演算およびシミュレーションに焦点を当てた環境指向のワークフロー。
 開発元 Cistib
 安定版 1.5.r4 / October, 2012
 稼働環境 Windows, Linux
 開発言語 C++
 カテゴリ 科学的可視化, 画像処理
 ライセンス BSD-style

医療情報システム 
Caisis  診療と研究の間のギャップを埋めることを目的としたガン患者のデータの格納および分析のためのウェブベースの情報システム。
 開発元 Caisis Team
 安定版 5.0 / May 24, 2010
 開発言語 C#, XML, HTML, JavaScript
 稼働環境 Windows
 カテゴリ 患者データ管理, 調査データベース, ガン調査
 ライセンス GNU General Public License Version 2

研究関連 
LabKey Server  統合分析し、生物医学研究のすべてのタイプのデータを共有するための拡張可能なプラットフォーム。研究データおよびへの安全なWebベースのアクセスを提供し、パイプライン処理によりカスタマイズ可能なデータを含む。
 開発元 LabKey Software Foundation
 安定版 12.1 / May 3, 2012
 活動状況 活動中
 開発環境 Java
 稼働環境 Cross-platform
 ライセンス Apache License 2.0

モバイルデバイス 
Ushahidi  承認済みの人々が、携帯電話、電子メールまたはWebフォームを使用してテキストメッセージを通じて危機情報を送信する。地図上に情報を表示する。
 Type 501(c)(3)
 Tax ID No. 2652079
 出資年 2008
 出資者 Erik Hersman, Ory Okolloh, Juliana Rotich, David Kobia
 本社 Nairobi, Kenya
 原点 クラウドソース
 キーパーソン Erik Hersman, Juliana Rotich, David Kobia,
 対象地域 World
 フォーカス 積極行動主義, マッピング
 手段 マッピングおよび地理空間
 資本金 $300,000
 寄付 $1,800,000
 ボランティア 50
 従業員 29
 オーナー Ushahidi, Inc.
 モットー Crowdsourcing Crisis Information

すぐに使えるディストリビューション 
BioLinux  500以上の生物情報に関するプログラムと、ドキュメント、サンプルデータを収録したUbuntuベースのライブ版DVD。
 安定版 7.0.9
Debian-Med  臨床医学および生物医学研究向けに医用画像、生物情報学、診療所のIT基盤などを収録したDebianベースのシステム。
Ubuntu-Med  医療業務と研究のフリーソフトウェアを収集したKubuntuベースの医療用ディストリビューション。

相互運用性テスト 
Cypress  アメリカ保健福祉省国家医療IT調整室(ONC)は、EHRソフトウェアが使用段階2臨床品質措置に準拠していることをテストするこのオープンソースプログラムを開発することをMITREに課している。
Laika  ヘルスケア情報技術認定委員会(CCHIT)とMITREは、EHRソフトウェアが HITSP C32 XML and HL7 v2 Labメッセージを含むCCHIT相互運用性データ規格に準拠していることをテストするこれを開発した。

ライブラリと単位系 
PUMA Repository  測定の単位のためのコンバータとHL7のエンジンを含む医療情報学のためのパスカル単位のコレクション。
 開発言語 Pascal
 カテゴリ 生物学情報, データフォーマット, 医療/保健
 ライセンス BSD