『ドラえもん のび太の恐竜2006 DS』（ドラえもん のびたのきょうりゅう2006ディーエス）は2006年3月2日に初のニンテンドーDS用ソフトとして、5年ぶりにセガから発売されたカードバトルRPG。テレビアニメ第2作第2期のドラえもんゲームシリーズとしては初の作品。

『ドラえもん のび太の恐竜2006』のゲーム作品であるが、ドラえもんたちがピー助を助けに白亜紀に到着して以降は、ドラえもんとのび太以外のメンバーは行方不明となった上で本作オリジナルのストーリーが展開され、オリジナルキャラクター、原作漫画や映画には出てこない恐竜・古生物も多数登場する。

恐竜がカード化され、属性がつけられている。大まかには「赤属性＝大型獣脚類」、「青属性＝翼竜、飛行恐竜、三畳紀恐竜」「紫属性＝小型中型獣脚類」「緑属性＝竜脚類、鎧竜類」「黄属性＝海棲爬虫類」という傾向があるが絶対ではなく、例外も多々あり剣竜などは複数属性にまたがっており、実際の属性はカード個別といえる。

登場人物 
※声優はドラえもん、のび太、しずか、ジャイアン、スネ夫以外は映画版とは異なる。
ドラえもん
声 - 水田わさび
カードバトルに参加できる。スペシャル技は、もしもボックス。そのスペシャル技を使ったターンはひみつ道具カードのコストを0にする。
のび太
声 - 大原めぐみ
カードバトルに参加できる。スペシャル技はどこでもドア。山札から好きな恐竜カードを一枚選びポケットに出す。
しずか
声 - かかずゆみ
ジュラ紀でラプトルライダーに捕獲される。
ジャイアン
声 - 木村昴
白亜紀前期でティラノライダーに捕獲される。
スネ夫
声 - 関智一
三畳紀でスカイライダーに捕獲される。
 ピー助
 声 - 福島おりね
 ドルマンスタイン
 声 - 飯塚昭三
 レプリカ恐竜達の合成体・ドルマンザウルスを使役する。特製レプリガンで他のレプリカ恐竜を吸収するが、強すぎて制御が難しいため、さらにピー助が持つ忠誠心を加えようとしている。ゲーム内には、グレートザウルスというカード（背に翼をもつ獣脚類。こちらもキメラ、幻獣の類）があり、ザウルスは本作オリジナル恐竜であることを表している。
 黒マントの男
 声 - 峯暢也
 レプリカ恐竜として、ギガノトサウルスを使役する。

オリジナルキャラクター 
 ルル
 声 - たちばなみかみ
 タイムパトロール女性隊員。24世紀の未来の出身ゆえに、ドラえもんですら知らないひみつ道具・レプリガンを持つ。ホバーボードで空を飛ぶが、タケコプターのことは知らなかった。
 特命を帯びて活動しているために、ドラえもん一行の事情を知ってもタイムパトロールに連絡することを拒否している。
 実際は特命は嘘であり、生き別れの兄・レックスを探し出すために命令もなく動いている独断行動である。タイムパトロールに連絡しなかったのは、自分の位置を知られるのを避けるため。
 最終的には、レックスと再会し、兄を改心させる。事件後、本隊から、独断を咎められるが、ドラえもん一行のフォローや恐竜ハンター逮捕の功績で罰則無しとなった。
 ティラノライダー
 1億2000万年前、白亜紀前期で戦う。カラーは赤、顔の左側に傷があるサングラスの青年。
 レプリカ恐竜として、ティラノサウルスや、2頭のカルノタウルスを使役する。
 その正体は、ルルの生き別れの兄「レックス」。幼い頃、のび太と同じように恐竜の卵の化石から、ティラノサウルスを復活させ、レグルスと名付けて可愛がっていたが、航時法により引き離されてしまう。取り戻そうと家出した後、恐竜ハンターの一員となるが、最終的には改心。恐竜の知識を買われ、妹と共にタイムパトロールで活動。
 スカイライダー
 2億2000万年前、三畳紀で戦う。カラーは青、語尾に「ショ」を付けて喋るトリ顔の男ハンター。
 レプリカの翼竜に載って空を飛び、プテラノドンやランフォリンクスの群れを使役する。
 ラプトルライダー
 1億6000万年前、ジュラ紀で戦う。カラーは紫、冷酷な女性ハンター。
 レプリカ恐竜として、小型中型獣脚類（羽毛恐竜を含む）の群れを使役する。本人はディロフォサウルスに騎乗する。
 グランドライダー
 9000万年前、白亜紀後期Aで戦う。カラーは緑、巨体の男ハンター。
 レプリカ恐竜として、アラモサウルスなどを使役する。漫画では戦闘描写を省かれて倒された。
 エラスモライダー
 7000万年前、白亜紀後期Bで戦う。カラーは黄色、サーファー風の小柄な少年でティラノライダーの弟分。しずかのことを気に入り、自分の嫁にしようとする。
 レプリカ恐竜として、エラスモサウルスなどを使役する。漫画では戦闘描写を省かれて倒された。

ゲスト声優 
水木竜司
山崎たくみ
吉田裕秋
吉沢キヨ
河相智哉
にしやまけん
金谷ヒデユキ
加藤ヒトミ
森和也
おくかずま

登場するカード一覧
 キャラクターカード・パワーアップカード
 キャラクターカード･･･ドラえもんやのび太などのキャラクターの名前がカード名になっている。後述するパワーアップカードで強化できる。基本どの属性の恐竜カードとチームを組んでもスキルを発動できる。
 パワーアップカード･･･キャラクターカードを強化するカード。同じキャラクターのキャラクターカードにのみ強化することが可能である。スキルを発動させるには特定の属性のカードとチームを組まないといけないことが多い。
(スキル発動条件に書いてあるAllは、どの属性のカードでも組めることを示す)

恐竜カード
中生代の古生物が描かれている。キャラクターカードよりパワー・HPは高い。また、特殊なスキルを持つカードも多い。
赤・青・紫・緑・黄の5属性に分かれており、これらは恐竜カードのスキルやパワーアップカードのスキルに関与してくる。
尚、EVカードは元のカードから進化したという意味、SPカードはライダーの持ち札であると言うことを表す。
また、本作における『〜ザウルス』という名前の恐竜は、本作独自の恐竜であることを意味する(実際には存在しない)

各カードのスキル一覧

白亜紀前期のカード

三畳紀のカード

ジュラ紀のカード

白亜紀後期Aのカード

白亜紀後期Bのカード

特殊な恐竜カード

これらのカードは、上記のさまざまな恐竜カードを掛け合わせて作られた。

コミック版 
2006年4月25日、本作のコミカライズと攻略本を兼ねた『ドラえもん のび太の恐竜2006DS オリジナルコミック』が小学館のてんとう虫コミックススペシャルから刊行された。シナリオはセガ、漫画の作画は岡田康則が担当。

原作や映画版同様に冒頭でドラえもんのタイムマシンが壊れてしまい、各時代の恐竜ハンターを倒して仲間を助けてタイムマシンを奪い、次の時代へと移動するということをくり返すことで進んでいく。

映画版同様に、恐竜の描写が新研究に基づくリファインがなされているが、子供のティラノサウルスに羽毛があるなど、DSコミック版ではより顕著になっている。さらにレプリカードによって、時代や生息地の異なる恐竜・古生物でもレプリカとして出すことができるようになっている。

映画版ではスピノサウルスがドルマンスタインの最終兵器として登場しドラえもん側のティラノサウルスと対決したが、コミック版ではスコミムスが味方レプリカとして敵のティラノサウルスレプリカと戦うというシーンがあり、状況が逆転している。※コミック版ではスコミムスの名前でスピノサウルスが出ている。

 レプリガン、レプリカード
 被写体を撮影すると、複製を作ってカードに保存することができる。24世紀の道具。ルルとハンター達の両方が使用する。
 本作では、この道具を用いて、レプリカ恐竜で戦う。