ヒメヒコ制とは、古代に日本各地で成立したとされる、ヒメとヒコによる共立的統治形態をさす仮説。

概説
高群逸枝が自著『母系制の研究』（1938年）において提唱した仮説によれば、ヤマト王権が成立する前後の古代日本では、祭祀的・農耕従事的・女性集団の長のヒメ（あるいはミコ、トベを称号とした）と軍事的・戦闘従事的・男性集団の長のヒコ（あるいはタケル、ワケあるいはネを称号とした）が共立的あるいは分業的に一定地域を統治していたとされている。また、高群によれば、『古事記』、『日本書紀』、『風土記』などの文献には宇佐地方にウサツヒコとウサツヒメ、阿蘇地方にアソツヒコとアソツヒメ、加佐地方（丹後国）にカサヒコとカサヒメ、伊賀国にイガツヒメとイガツヒコ、芸都（きつ）地方（常陸国）にキツビコとキツビメがいたとしている。ならびに『播磨国風土記』では各地でヒメ神とヒコ神が一対で統治したとしている。　そのようなヒメ・ヒコの首長はその地の神社の由来となっている例もあり、ヒメやヒコを神社名や祭神名にしている地域は、かつてヒメヒコ制の統治があったことの傍証とも言えるとしている。

しかし、ペアによる統治制度を誇大解釈して「ヒメヒコ制」と捉えるのは危険であり、後述の兄弟統治や夫婦統治と明確に区別しなければならない。

地方のヒメ・ヒコ 
ヤマト王権が成立する以前、地方に見られるエ・オト（兄・弟）制がヒメヒコ制の先駆的制度であったとする研究者もいる。神武天皇紀には奈良県宇陀地方に兄猾（兄宇迦斯）と弟猾（弟宇迦斯）、奈良県磯城地方に兄磯城・弟磯城およ兄倉下・弟倉下というようにエオト（兄弟）による統治制が伝えられており、ヒメヒコ制を支持する者たちは、弟猾ならびに弟磯城は祭祀的女性首長を意味し、それぞれ菟田県主と磯城県主になり、エウカシならびにエシキは軍事的男性首長を意味するという解釈を試み、美濃国では兄遠子と弟遠子、九州では兄夷守と弟夷守、兄熊と弟熊の伝承もヒメヒコ制と同一視出来ると主張している。

しかし、弟猾や弟磯城は男性と見られているし、兄多毛比命（武蔵国造）と弟武彦命（新治国造）や、兄武彦命（洲羽国造）と弟武彦命（木蘇国造）のように、「武」を冠する男弟も存在する。また男兄弟によるエオト制を異性ペアのヒメヒコ制の先駆的制度であると断言するのは強引であるという意見が多い。傍証として、景行天皇紀においては行幸先の美濃国の妹遠子・弟姫を妃にしようと泳宮に滞在しており、拒まれたため姉の姉遠子・八坂入媛命を妃としたとあり、エオトは姉妹にも適用され、エオト制＝ヒメヒコ制とはできないという指摘がある。

兄・弟という語頭名称の他に、「ネ・ベ」「オ・メ」「キ・ミ」という語尾が男女の共通名に付く場合は「ヒメヒコ制」のパターンと解釈することができる。代表的な例としてはイザナギとイザナミの夫婦神である。他にも、尾張地方の「オツナネ」(尾綱根)と「オツナマワカトベ」（尾綱真若刀俾）、シリツキトベ（志里都岐刀邊、志理都紀斗賣）とシリツキネ（志里都岐根、尻調根）そしてイナダネ（伊那陀禰、建稲種命）とイナダヒメ（伊那陀、奇稲田姫命）の場合、トベが女性名詞であるため「ヒメヒコ制」の１パターンと捉えることが出来る。また、物部氏族の祖先として登場する、欝色謎命・欝色雄命と伊香色謎命・伊香色雄命はヤマト政権以前の大和国山辺郡にも「ヒメヒコ制」に類似した１パターンが存在していたと言える。くわえて、開化天皇の后であるイカガシコメは大臣であるイカガシコオと共に石上神宮に仕えたと伝えられている。

邪馬台国におけるヒメヒコ制 
魏志倭人伝における邪馬台国では女性のヒミコ（卑弥呼）が王に共立されて呪術的（祭祀的）支配を行い、男弟が卑弥呼を補佐して政治を執行していた。また、邪馬台国に属する対馬国や壱岐国では大官にヒコ（卑狗）、副官にヒナモリ（卑奴母離）という主副のペア制による統治の記録がある。これらをひとまとめにして「ヒメヒコ制」だとする研究者もいるが、卑弥呼の名を「ヒメ・ミコ」と解釈したとしても、男弟の名を魏志倭人伝が書き留めていない（重要視していない）ため、「ヒコ」とは断定できない。

卑弥呼が閉じこもって祭祀のみ行い、実際の政治を男弟に委ねていたとする説に対しては、『日本書紀』の記述ではワカタケル（雄略天皇）も呉からの使者に面会しておらず、また稲荷山古墳出土鉄剣にも、豪族ヲワケがワカタケルを（男弟が卑弥呼に対したように）「左治」したとあることから、卑弥呼はワカタケルと同質の王であったとの反論がある。

また、近年では姉弟であるから「エオト制」であるとの指摘もされている。ヒコ・ヒナモリは前述の兄夷守と弟夷守の例があるように「エオト制」である可能性が高い。また呪術（祭祀）的首長を意味する「ミミ（彌彌）」は投馬国の「タマ（多模）」は不弥国それぞれの大官であり、副官はそれぞれヒナモリとミミナリ（彌彌那利）であり、これをヒメヒコ制だと唱えることも不可能ではないが、やはり性別不明である以上は一般的なペア制と捉えるべきである。しかしながら、こういった邪馬台国にペア統治体制が数多く見られることから、ヒメヒコ制の起源を卑弥呼と男弟のペア統治に求めようとする研究者は少なくはない。

記紀伝承のヒメ・ヒコ 
ヒメ・ヒコの一対的命名は、ヤマト王権の確立当初の崇神天皇期前後の諸文献の上に最も著しく見える。孝元天皇期の赤波迩兄彦命・埴安媛（凡河内国造族）、開化天皇期の日子国意祁都命・意祁都比売命（和珥氏族）、崇神天皇期の豊城入彦命・豊鍬入姫命、八坂入彦命・八坂入媛命、垂仁天皇期の狭穂彦命・狭穂姫命（日下部氏族）、景行天皇期の五百城入彦皇子・五百城入姫皇女などが挙げられる。これらの伝承はこの頃がヒメヒコ制の最盛期ではなく、すでにその実質を失い、命名上の遺習としてのみ残され、守られているものと考えられる。ただし多数の兄弟姉妹の中から、特に一対の人物を選んで命名するという習慣は、かつて臨時的あるいは世襲的にヒメヒコを選びだし統治者と仰いだことの反映であるという説もある。

ヤマトヒメ・ヒコ 
記紀伝承にはヤマトヒメとヤマトヒコすなわち日本の女性統治者と男性統治者を意味する名前も崇神天皇期前後に見つけることができる。ヤマトヒメでは、ヤマトトトヒモモソヒメ（倭迹迹日百襲姫）を始め、その母、ヤマトカグアレヒメ（意富夜麻登久邇阿礼比売）や叔母のヤマトトトワカヤヒメ（倭飛羽矢若屋比売）、崇神天皇の子でチチツクヤマトヒメ（千千衝倭姫命）、垂仁天皇の子でヤマトヒメ（倭姫命）などの例がある。ヤマトヒコでは、崇神天皇の子にヤマトヒコ（倭日子）、景行天皇の子にヤマトネコ（倭根子）やヤマトタケル（倭武）といった例がある。このヤマトヒメ・ヤマトヒコの伝承はこの時期の日本で男女の共立的統治の志向があったことを示唆すると言える。しかし、記紀伝承は男子の天皇の単立的統治を正当として、女王やヒメヒコの共立的統治を記していない。垂仁天皇が皇女のヤマトヒメを伊勢神宮に斎宮として送ったとの伝承は、日本におけるヒメヒコ制の終わりを意味している。

ただし男女の共同統治の伝統はその後も消えず、直系の天皇後継者が絶えた継体天皇期には再びヤマトヒメ（倭比売）やヤマトヒコオウ（倭彦王）をその傍証だとする説もある。推古天皇期においても推古天皇がヒメ（兄）を聖徳太子がヒコ（弟）を担い共同統治をしたと見ることが可能である 。

ヒメヒコ神社 
9世紀に完成した『延喜式神名帳』にはヒメヒコ制の名残と考えられる、ヒメとヒコ（ワケ）が対になって祭られている神社が35地域に知られている(表参照)。

その他、地域名を負ったヒコあるいはヒメが単独祭られている神社は片方のヒメあるいはヒコが何かの理由で欠落した可能性が考えられる。

延喜式神名帳には記載されない神社でも風土記や文書に残されているものに多賀八幡社の祭神となっている伊勢都比古と伊勢都比賣、英賀神社の祭神となっている阿賀比古と阿賀比売などのヒメヒコ神社が点在している。

このようにヒメとヒコを対として祭る神社は北陸、近畿、出雲、播磨、そして伊豆から武蔵地方を中心に点在している。この内、国名をもつ伊予ヒメ・ヒコと越ヒメ・ヒコに関しては、魏志倭人伝における女王国に属する伊邪（イヤ）国および躬臣（コシ）国の統治者の可能性があるとする説もある。