ジャパンラグビートップリーグ2004-2005は、2004年9月18日から2005年1月10日までレギュラーシーズンが行われた。

参加チーム 
ジャパンラグビートップリーグ2004-2005の参加チームは下表の通りである（記載は前年シーズンの成績上位順）。

昨シーズンの結果、セコムラガッツ（トップイースト10）、福岡サニックスボムズ（トップキュウシュウ）が地域リーグに降格し、トヨタ自動車ヴェルブリッツ、日本IBMビッグブルーが地域リーグから昇格した。

順位表 
{| class="wikitable" style="text-align:center"
|-
!順位
!チーム
!試合
!勝
!分
!負
!得点
!失点
!得失
!BP
!勝点
!
|- style="background-color:#ccffcc"
|1
|style="text-align:left"|東芝府中ブレイブルーパス
||11||10||0||1||463||166||297||10||50
|rowspan="4"|マイクロソフトカップ、日本選手権へ
|- style="background-color:#ccffcc"
|2
|style="text-align:left"|ヤマハ発動機（ジュビロ）
||11||9||0||2||380||218||162||9||45
|- style="background-color:#ccffcc"
|3
|style="text-align:left"|NECグリーンロケッツ
||11||9||0||2||407||253||154||8||44
|- style="background-color:#ccffcc"
|4
|style="text-align:left"|トヨタ自動車ヴェルブリッツ
||11||8||0||3||427||224||203||11||43
|- style="background-color:#cffcff"
|5
|style="text-align:left"|神戸製鋼コベルコスティーラーズ
||11||6||0||5||326||356||-30||10||34
|rowspan="4"|マイクロソフトカップへ
|- style="background-color:#cffcff"
|6
|style="text-align:left"|クボタスピアーズ
||11||5||0||6||277||334||-57||7||27
|- style="background-color:#cffcff"
|7
|style="text-align:left"|三洋電機ワイルドナイツ
||11||4||0||7||346||296||50||8||24
|- style="background-color:#cffcff"
|8
|style="text-align:left"|サントリーサンゴリアス
||11||4||0||7||307||282||25||8||24
|- style="background-color:#ffffcc"
|9
|style="text-align:left"|ワールドファイティングブル
||11||4||0||7||230||366||-136||4||20
|rowspan="2"|入替戦へ
|- style="background-color:#ffffcc"
|10
|style="text-align:left"|リコーブラックラムズ
||11||4||0||7||207||370||-163||2||18
|- style="background-color:#ffcccc"
|11
|style="text-align:left"|近鉄ライナーズ
||11||2||0||9||261||514||-253||5||13
|rowspan="2"|自動降格
|- style="background-color:#ffcccc"
|12
|style="text-align:left"|日本IBMビッグブルー
||11||1||0||10||243||495||-252||6||10
|}

マイクロソフトカップ

入替制度

自動降格 
トップリーグの結果、11位近鉄ライナーズのトップウェスト、12位日本IBMビッグブルーのトップイースト10への自動降格が決定した。

トップリーグチャレンジシリーズ1 
{| class="wikitable" style="text-align:center"
|-
!順位
!チーム
!試合
!勝
!分
!負
!得点
!失点
!得失
!BP
!勝点
!
|- style="background-color:#ccffcc"
|1
|style="text-align:left"|福岡サニックスボムズ（トップキュウシュウ）
||2||2||0||0||75||36||39||2||10
|rowspan="2"|自動昇格
|- style="background-color:#ccffcc"
|2
|style="text-align:left"|セコムラガッツ（トップイースト10）
||2||1||0||1||24||51||-27||0||4
|- style="background-color:#ffffcc"
|3
|style="text-align:left"|豊田自動織機（トップウェスト）
||2||0||0||2||53||65||-12||3||3
|入替戦へ
|}

 1月16日 福岡サニックスボムズ 34–0 セコムラガッツ（駒沢陸上競技場）
 1月23日 福岡サニックスボムズ 41–36 豊田自動織機（レベルファイブスタジアム）
 1月29日 豊田自動織機 17–24 セコムラガッツ（名古屋市瑞穂公園ラグビー場）

以上の結果、1位福岡サニックスボムズ、2位セコムラガッツがトップリーグへ自動昇格、
3位の豊田自動織機がトップリーグ入替戦への進出が決定した。

トップリーグチャレンジシリーズ2 
{| class="wikitable" style="text-align:center"
|-
!順位
!チーム
!試合
!勝
!分
!負
!得点
!失点
!得失
!BP
!勝点
!
|- style="background-color:#ffffcc"
|1
|style="text-align:left"|ホンダヒート（トップウェスト）
||2||1||0||1||59||69||-10||2||6
|入替戦へ
|-
|2
|style="text-align:left"|コカ・コーラウエストジャパン（トップキュウシュウ）
||2||1||0||1||77||42||35||1||5
|rowspan="2"|
|-
|3
|style="text-align:left"|三菱重工相模原（トップイースト10代表）
||2||1||0||1||68||93||-25||1||5
|}

 1月16日 コカ・コーラウエストジャパン 62–14 三菱重工相模原（駒沢陸上競技場）
 1月23日 コカ・コーラウエストジャパン 15–28 ホンダヒート（レベルファイブスタジアム）
 1月29日 ホンダヒート 31–54 三菱重工相模原（名古屋市瑞穂公園ラグビー場）

以上の結果、1位ホンダヒートのトップリーグ入替戦への進出が決定した。

トップリーグ入替戦 
規定により、トップリーグ9位ワールドファイティングブルが、トップチャレンジ2・1位ホンダヒートと、トップリーグ10位リコーブラックラムズがトップチャレンジ1・3位の豊田自動織機と入替戦を行った。

 2月13日 ワールドファイティングブル 49–0 ホンダヒート（近鉄花園ラグビー場）
 2月13日 リコーブラックラムズ 42–7 豊田自動織機（秩父宮ラグビー場）

入替戦の結果、ワールドファイティングブルとリコーブラックラムズのトップリーグが残留した。

表彰 
2004-2005シーズンの年間表彰式は、2005年2月7日に東京プリンスホテル鳳凰の間で実施された。

チーム表彰

TOP LEAGUE 優勝チーム

フェアプレーチーム賞

ベストファンサービス賞

特別賞

マイクロソフトカップ優勝チーム

個人表彰

トップリーグMVP

新人賞

最多トライゲッター

得点王

ベストキッカー

特別賞

マイクロソフトカップMVP

ベストフィフティーン