アフラトキシン (aflatoxin , AFT) とは、カビ毒（マイコトキシン）の一種でB、B、G、Gを始めとする10数種の関連物質の総称。熱帯から亜熱帯地域にかけて生息するアスペルギルス・フラブス (Aspergillus flavus) やアスペルギルス・パラシチクス などのカビにより生成され、紫外線の照射により強い蛍光を発する。蛍光はB、Bで紫青色（B：blue）、G、Gで黄緑色（G：green）、M, Mで紫色を発する（M：metabolite、M, MはB、Bの代謝産物）。

1960年にイギリスで七面鳥が大量死した際の分析中に発見された。その際は「ターキーX（七面鳥X病）」と呼ばれていた。

人に対する急性中毒の例として、1974年にインドで肝炎のために106名が死亡した事件や、ケニアでの急性中毒事件などがある。

名前は、最初に発見された産生菌のAspergillus flavus と 毒 toxin の合成語。ビスフラン環とクマリン化合物が結合した構造。

構造決定と合成 
多くの化学者により行われたが、1963年 CheungらによりGの、1964年 van SoestらによりB の構造が確定し、1967年には Buechi らによって全合成が達成された。

アフラトキシンBの化学式は、CHO

産生菌 

下記が産生菌として知られている。

 非産生菌
Aspergillus 属では

 A. oryzae
 A. sojae
 A. tamarii
 A. caelatus

1960年代に麹菌のA. oryzae（ニホンコウジカビ）やA. sojae（ショウユコウジカビ）でアフラトキシン生成が疑われたが、アフラトキシンを生成する機能は失われている事が判明している。

毒性 
主に肝細胞癌を引き起こす原因物質として知られている。少なくとも13種類に分かれるが、毒性はBが最も強く、食品に含有され問題となるのは、B, B, G, G, M, Mの6種類である。国際がん研究機関(IARC)ではクラス1に分類され、急性毒性の動物実験ではアヒル雛で、半数致死量(LD) は B - 18.2 μg、B - 84.8 μg、G - 39.2 μg、G - 172.5 μg と算出されている。

作用機序 
発癌機構として、肝臓の代謝酵素シトクロムP450によって活性化され、それがDNAと結合して付加体を形成する。付加体はDNAの変異や複製阻害を引き起こし、癌化のイニシエーターとなることが報告されている。

動物実験 
動物実験では15 μg/kgのアフラトキシンBを含む飼料で飼育されたラットが全て肝臓癌の発生を示すなど、非常に発ガン性が強いことが分かっている。調理では分解せず食品中に残る。経口摂取量の20%は尿中に排出される。大量に摂取した場合の急性症状は、黄疸、急性腹水症など。慢性症状は肝臓癌、免疫毒性。

ラットによる動物実験で、グレープフルーツ果汁の摂取によりアフラトキシンB1による肝臓の損傷が抑制されたとの報告がある。

相互作用 
B型肝炎感染者がアフラトキシンを摂取すると肝臓癌リスクが上昇する。

分解 
純粋なアフラトキシンは、調理の加熱では分解されず、酸素存在下での紫外線照射、強酸条件下（pH 3以下）や強アルカリ条件下（pH 10以上）の条件下では分解される。特定条件下のメタン生成菌が分解する事が明らかとなっているが、実用化はされていない。

基準 
国家によっての評価や規制値はまちまちであるが、各国で厳しい基準が設けられている。しかし現実的な基準値は発癌リスクをゼロにすることではなく、リスクを抑え基準以上の含有で廃棄される穀物を抑制し、飢餓を発生させないための値を、各国の都合により定めている。

検疫所の検査や地方公共団体の衛生研究所によるモニタリング調査により監視が行われているが、食卓に上る料理の食材の多くを輸入に頼る日本では、アフラトキシンを始めとするカビ毒は、摂取を避けて通ることができない毒である。

なお、2010年までにアフラトキシンが検出されたものは全て輸入食品であったが、2011年に宮崎大学農学部が生産した食用米から、B型アフラトキシンが検出された。穀物・豆類だけでなく、生薬の原料となる乾燥された薬草からの検出も報告されている。

食品の含有基準 
 日本
 基準は10 μg/kg(0.01 ppm)。これを超えて検出する食品は、食品衛生法第6条第1項第2号に違反するものとして取り扱われる。
 なお、2011年10月よりアフラトキシンの指標が、アフラトキシンBから総アフラトキシン（アフラトキシンB、B、G及びGの総和）に変更された。
 国際基準（CODEX）
 落花生（加工原料用）：0.015 ppm
 アーモンド、ヘーゼルナッツ、ピスタチオ（加工原料用）：0.015 ppm
 アーモンド、ヘーゼルナッツ、ピスタチオ（直接消費用）：0.01 ppm
 アメリカ
 基準は20 ppb(0.02 ppm)
 欧州連合
 落花生・ナッツ類及びその加工食品等にアフラトキシンB1及び総アフラトキシンの基準値を設定。
 穀類：アフラトキシンB1 2.0 μg/kg、総アフラトキシン 4.0 μg/kg
 加工用落花生：アフラトキシンB 8.0 μg/kg(ppb)、総アフラトキシン 15.0 μg/kg

労働安全衛生 
厚生労働省より輸入貨物に係る港湾荷役作業に於いてのアフラトキシン暴露防止対策として、「防じんマスクの規格(昭和63年労働省告示第19号)に適合した防じんマスクの常時着用」「保護衣及び保護眼鏡の適切な着用」「保護衣の脱衣時の粉塵吸入防止」「暴露のリスクについての労働者への周知」などが指導されている。

基準超過検出事例 
 1997年から2000年 - イランから輸入されたピスタチオから検出
 2002年 - ペルーから輸入されたナッツから検出
 2004年 - ベトナムから輸入された米（政府保管米）から検出
 2005年 - 中国から輸入されたそば粉から検出
 2008年
 中国製品による食中毒が社会問題となった時期、主に中国から輸入されたピーナッツ類から2ヶ月間で8件検出
 事故米穀が大阪市の米販売業者・三笠フーズにより、少なくとも1998年以前から各地に食品用として転売されていた事が発覚（事故米不正転売事件）
 2011年 - 宮崎大学農学部が生産した食用米からB型アフラトキシンが検出された。厚生労働省によると、国産の食用米からアフラトキシンが検出されたのは初めて。健康被害については不明。
 2011年 - 中国国内において、蒙牛乳業産紙パック牛乳から中国国内基準の2.4倍に達するアフラトキシンが検出された。
 2012年
 中国から輸入されたホワイトペッパーから検出
 アメリカから輸入されたピーナッツバターから検出
 2015年 - オーストラリア産アーモンドから検出
 2017年 - 岐阜市の菓子製造販売会社が販売したピーナツ豆菓子(中国産)から検出
 2019年 - 大阪市の輸入卸売業者が販売したひまわりの種子（中国産）から検出

ピスタチオ、ピーナッツ等のナッツ類や干しイチジク、トウモロコシ、ナツメグなどの香辛料からは基準値以下のアフラトキシンがしばしば検出される。食品用もしくは食品加工を目的として輸入された穀類で、一定レベル以上のアフラトキシンが検出されたものは、食品用途用および家畜飼料として使用することはできず、工業用「糊」ほか用途への転換や廃棄処分が行われる。ただし日本では、米を原料として糊を製造する企業は存在せず、コーンスターチなどに限られる。

被害 
 2020年12月 - アメリカ国内で特定のドッグフードを食べた犬が死亡する事例が発生、70頭以上が死亡した。その後、販売されていたドッグフードの原料（トウモロコシ）からアフラトキシンが検出されリコールが行われた。