大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)小野浩刊自己紹介小野浩雅Hiromasa Ono hono@dbcls.rois.ac.jp https://twitter.com/h_ono編集・管理者＠TogoTV生命科学分野の有用なデータベース(DB)やウェブツールの活用法を動画で紹介https://togotv.dbcls.jp/開発者＠RefEx正常組織や細胞株の遺伝子発現データを簡単に検索できるDB https://refex.dbcls.jp/講師＠統合データベース講習会(AJACS)生命科学分野のDB統合を担う人材育成(主に遺伝子発現解析を担当) https://github.com/AJACS-training/ (cc)  Licensed under CC-BY 4.0 © 2022 Hiromasa Ono (DBCLS)

https://dbcls.rois.ac.jp/aboutより
Licensed under CC-BY 4.0 © 2022 Hiromasa Ono (DBCLS)
(CC)
.生命科学分野では、DBやバイオインフォマティクスツールの種類や対象が日々増加しているo初学者にとっては、何を選ぶべきか、どう使えるのか、組み合わせて使うことができるのかが分からないため利用を躊躇してしまうo DBやウェブツールを利活用するためのまとまった教材はほとんどない
対応
o生命科学分野における有用なデータベースやツールの動画マニュアル、講演や講習会動画、資料、イラストを独自に制作し、紹介するウェブサイトを開発実験系研究者の初学者が主要な想定利用考. .技術習得の障壁を下げる自主学習、新人・後輩指導、講義・勉強会の教材として誰でも自由に使えるTOGOOTY統合TVウェブサイトのトップページ統合TV (TogoTV) https://togotv.dbcls.jp/ or "TogoTV"で検索!動画数スキル別コース数2,039* 9本TOGOOTV統合TVウェブサイトのトップページ総再生数チャンネル登録数257万(月間3万+) 8,000+イラスト数のべ製作者数1,509* 130+名
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.コミュニティの公共財として利活用されやすくするための取組み.動画はYouTubeに、イラストはWikimedia Commonsでも公開.クリエイティブ・コモンズ(CC)・ライセンスの付与.出典の明記のみで自由に利用できるe-learning教材として、日本で初めてDOIを付与.信頼性を担保する恒久的なURL .個別の動画、講習、イラストに付与学会との連携体制の構築.日本人類遺伝学会(JSHG)との連携. JSHGのホームページから教育的コンテンツを配信する「JSHG-WebCast(JWC)」に掲載.学会の推薦を受けた専門家のレビューや、分野の専門家自身の講義・講習、イラストをコンテンツ化d under CC-BY 4.0 c 2022 Hiromasa Ono (DBCLS) 2020統合TV資格販売企概 広ファイル編集ある挿入表示形式データツール絵語地組ヘルプ 反地編集:数分目3
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ubuntu@ip-172-30-2-194: ~/togotv2020-api/jalcxml (ssh)み# -*- coding: utf-8 -*- from google.oauth2.service_account_import Credentials import json import yaml import xml.etree.ElementTree as ET import gspread import re from xml dom import minidom scopes = ['https://spreadsheets.google.com/feeds','https://www.googleapis.com/auth/drive'] sheet_conf = { "sheet": "2020統合TV番組展簿", "credentials": Credentials.from_service_account_file("/home/ubuntu/togotv2020-apt/togotvupdate/conf/togotv2020-service-account_json", scopes-scopes), "wks_name": ["Movies", "AJACS-training", "Pictures"] output_f = "togotv2020_jalc_{}.xml" class CreateXML: def update(self): xmlString = '<body><site_id>SI/DBCLS</site_id></body>' for n in sheet_conf["wks_name"]: els = ET.fromstring(xmlString)  #文字列からElementを作成jalc_el_dbcls = ET.parse("jalc_el_dbcls_template.xml")  #最終的にappendするxmlの共通要素をElementにしておくjalc_root = jalc_el_dbcls.getroot() getcontents = GetContents() if n == "Movies": n = n.lower() #スプレッドシート"Movies"のデータを取得contentinfos_ss = getcontents.contentsinfo(sheet_conf['sheet'], "Movies") #i = 0 #テスト用5コンテンツのみ書き出す設定for info in contentinfos_ss: # sortableな数字で構成されるidが必要？ex. 00932 sequence = "00" + str(info['TogoTV_Video_ID']) togotvuri = info['url'] #注引数のdateのformattingと出力する日付データのformatting getetelement = GetETElement("movies", info['TogoTV_Video_ID'], info['id'], togotvuri, info['name'], None, info['uploadDate'], info['embedUrl'], info['contentUrl'], sequence) element = getetelement.dumps() els.append(element) elif n == "AJACS-training":
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教材コンテンツの利用者論文等での利用時に、URL以外に信頼性が担保された恒久的リンク情報として引用できる(DOI Citation Formatter https://citation.crosscite.org/などの活用も)教材コンテンツの作成、提供者プロフィール・業績管理サイトへ容易に追加できる(ORCIDを経由してresearchmapなどへのインポートが可能)
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https://orcid.org/ 000-0001-8675-963X公開記録をプレビュー名前
� Hiromasa Ono  ◇日本語>技奈. @ &印刷可能バージョンo ● ● ● 6
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ソース: Hiromasa OnoからJaLC   BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science ■ data and services 2019-09 |その他のアウトブットDOI: 10.12688/f1000research.18238.1 OTHER-ID: PPR93390 6 in詳細を表示