Home ・産業経学＆応用経学・Mass Spectrometry ・液体クロマトグラフィ一質量分析（LC-MS） ・ LC-MSソフトウェア｜ペプチド・臨質分析など・マルチオミクスデータ解析» Prote rアお問い合わせ一覧人クイックオーダーサインインDiscovererソフトウェア包括的で拡張性のあるプラットフォームプロテオミクス研究には単純な同定以上のことが求められます。タンパク質およびペプチド同定からPTM解析、同重体質量タグおよびSILACとラベルフリー定量に至るまで、さまざまなプロテオミクスワークフローで行う複雑な生物学的サンプル中のタンパク質の同定および定量を単純化します。 Thermo Scientific Proteome Discovererソフトウェアは、さまざまな研究ワークフローに柔軟に対応できる分析ツールと使いやすいウィザード型インターフェースを備えています。複数のデータベース検東アルゴリズム（SEQUEST HT、Mascot、Byonic、MS AmandaおよびProSightPD）および複数の解離法（CID、HCD、ETDおよびEThcD）に対応し、より網羅的かつ完全な分析を実現します。お問い合わせ無料トライアルをダウンロードカタログをダウンロード
__な利点
対応範囲を最大限広げるためにデータ解析をカスタマイズ
相対定量を実施
ノードベースのワークフローエディタを使用してデータ解析をカスタマイズできます。 SEQUEST、Mascot、MSAmanda、Byonic、 Thermo Scientific ProSightPDなどの複数の検索エンジンによるデータベース検索結果を統合できます。以下の目的で同位体標識したペプチドの相対発現量を測定して報告します： ● TMT SPS MS1 •グリコペプチドの同定および定量•リン酸化ペプチドの同定および定量•トップダウンプロテオミクス•クロスリンクProteome Discovererソフトウェア独自の高性能の統計および視覚化ツールを用いて確信を持ってデータを解釈できます。ワークフローツールにアクセス複数の第三者によるアルゴリズムも当社の視覚化および統計ツールに組み込まれており、これを活用して分析のレベルを上げることができます。詳細を見る複数の解離法、定量技術およびデータベース検索アルゴリズムに対応し、網羅的なタンパク質同定、特性評価、定量を実現するProteome Discovererはプロテオミクス研究の包括的なツールです。研究を支える包括的なツールセットSEQUESTのさまざまな検索アルゴリズム（Mascot、MS Amanda、ByonicおよびProsightPD）を用いて、複数のアルゴリズムで得られた結果を統合できるため、結果のクロスバリデーションを実施でき、より確信を持って判断できます。衝突誘起解離（CID）、高エネルギー衝突解離（HCD）、電子移動解離（ETD）といった複数の解離法に対応しているため、十分な配列カバレッジで信頼性の高い翻訳後修節（PTM）の同定が行えます。さらに、TMTおよびITRAQを用いた同重体質量タグ、SILACによる同位体標識、ラベルフリー定量法に完全対応し、お客様のラポラトリーの分析で楽軟にご使用になれます。相対定量and peptide quantification to extract the maximum possible information from quantitative proteomics studies. Protein Metrics Proteinaceous/Northwestern Matrix Science public databases (active maintenance required) can be illustrated. Eflective location of low-level sample components using creative data interrogation strategies such as generating inclusion and exclusion lists and importing those lists dir comparison, exchange, and verfication with support for data standards developed by the HUPO Proteomics Standards Intiative (PSI) is additionally supported.サードパーティーのノードをダウンロードKEGGライセンスキーへのアクセス以前ご利用いただいたことのあるお客様には、2019年用の新しいKEGGライセンスキーをご用意しております。 KEGGライセンスを有効化するには、Administration > Manage Licensesページで「Add Activation Code」をクリックし、このライセンスキーを入力してくずさい： WUC2-1MNB-D2GX-1MZ4サポートが必要な場合はこちらからご連絡ください,関連するコンテンツアプリ分Proteome Discovererソフトウェアにおいて、PTMの特性1ション・クスを可能にする非常に高感lションカQ Exactiveシリーズにおける度の堅牢な150 μmカラムProteome Discoverer 2.1ソフトウェアにおける装置パラメーターの最適化およびデ夕解析（英語）注文ガイドお問い合わせProteome Discovererソフトウェアの無料トライアルを最大限活用できるようにお手伝いいたします。使用法についてのご質問がある場合や担当者からの連絡をご希望の場合は、当社にお問い合わせください。連絡のご依頼ベルースカタログ：Thermo Scientific Proteome Discoverer：タンパク質科学者のための質量インフォマティクスプラットフォーム（英語）タンパク質分析向け質量分析の概要Planet OrbitrapサポートUnity Lab Services Thermo Fisher Connect Orbitrap質量分析MSラーニングセンター LC-MS装置サポートセンター液体クロマトグラフィー質量分析ソフトウェアのサポートHPLCのTipsのe-learning製品一覧Mascot Scaffoldプ日グスレーお問合せMascot Server
Mascot Server
The leading software package for protein identification and characterisation using mass spectrometry data
製品情報
Mascot Serverは、質量分析計で測定されたタンバク質あるいはペプチドの質量スペクトルに一致するアミノ酸配列をタンバク質・ゲノムの配列データベースやスペクトルライプラリから検索し、試料に含まれるタンパク質を同定するためのソフトウェアです。以下の質量分析計ペンダーの質量ピークリストを使って検索する事ができます。
● Waters Mascot検索によって検出されたタンパク質またはペプチドは確率的なスコアリングアルゴリズムによって処理され、統計的に有意なタンバク質・ペプチドは期待値（または期待値に対応するスコア）と偽陽性率（FDR）によって明確に区別され、同定されたかどうかを直感的にわかりやすい形式で可視化します。無料でご利用いただけるMascot検索サーバをインターネット上に公開しています。お客様のWebプラウザからアクセスできますのでお試しください。なお、より多くの方に快適にお使いいただくため、投入できる質量データサイズ等に若干の制限があります。詳しくはFAQベージをご覧ください。
無料Mascot検索サーバー
Peptide Mass Fingerprintペプチドイオン質量スペクトルに一致するタンパク質を探しますMs/ms Ion Searchプロダクトイオン質量スペクトルに一致するペプチドを探しますSequence Query配列タグに一致するペプチドを探しますMascot検索サーバは、 1. Mascot Serverソフトウェア2. Webサーバーアプリケーション(IISあるいはApache) 3.ソフトウェアを走らせるPC (WindowsまたはLinux)で構成されています。Mascot Serverライセンスを購入することにより、お客様のイントラネットワーク環境の中に次のような特徴を持つMascot検索サーバサイトを導入する事ができます。 8 2 X 4 X 1 1 1 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ●質量データのサイズや量に制限のないMascot検索•検索データベース、修飾、消化酵素、定量メソッドを編集・新規構成可能●ロール形式のユーザ管理機能• Mascot検索を自動化するためのMascot Daemonソフトウェアを無料バンドル●質量分析計解析システム、実験データ管理システムとネットワーク接続可能● 1ライセンス当たり6コアプロセッサまで動作可能●マルチCPU、PCネットワーククラスタに対応したスケーラビリティまた、Mascot Serverライセンスにはオンサイトを含む充実した技術サポートと最新バージョン提供サービス（保守契約）が付属しています。購入から1年間は無償で保守契約が付属しており、その後も有償で保守を継続する事ができまti
バージョン情報
Version 2.8
X
0 2021年7月リリース○最新バージョン2.8.2 (パッチリリース日:2022年8月) ○新規サポート機能： Error Tolerant検索に対する新しいアルゴリズムの適用,検索速度向上, …きらに見る� Windows版○リリースノート新規インストール手順○新規インストール手順におけるクラスターシステム補足○アップグレード手順● Linux級ロリリースノート○新規インストール手順○新規インストール手順におけるクラスターシステム補足○アップグレード手順
▷オリジナルデータベースの作成・更新方法テキストエディタを使ってオリジナルのデータベースファイルをご自身で作成する方法について説明しています。 ▷検索対象の生物種を予め絞り込んだUniprotKBデータベースの作成手順NCBIprotの代わりにお勧めのUniprotKBをMascot Serverで使用可能にする方法について説明しています。 ▷ SwissProtの手動更新方法SwissProtデータベースを手動で更新する方法について説明しています。 ▷ Taxonomyリストの変更方法について検索条件設定画面の「Taxonomy」リストを変更する方法について説明しています。 ▷データベース管理マニュアルデータベースの登録、更新などを行う設定画面「Database manager」について説明しています。 ▷ Mascot Server取扱説明書Mascot Serverの使い方を説明しています。 ▷ユーザ管理とセキュリティ機能の使い方ユーザ管理とセキュリティ機能の使い方を説明しています。 ▷消化酵素の新規登録・変更方法消化酵素の新規登録、登録内容の変更方法を説明しています。 ▷修飾エディタの使い方Mascot Server 2.2からサポートしたプラウザベースの修飾エディタの使い方を説明しています。 ▷検索結果ログの構造検索結果ログの構造について説明しています。 ▷ robocopyプログラムを利用したMascot Server検索結果のバックアップマイクロソフトが提供する高機能バックアッププログラム「robocopy」を利用したMascot Server検索結果ファイルのバックアップ方法について説明しています。 ▷ Windows7からWindows10へのアップグレード手順Mascot Server PCにインストールされているWindows7をWindows10にアップグレードする手順について説明しています。 ▷消化酵素のデータフォーマット消化酵素のデータフォーマットついて説明しています。 ▷修節のデータフォーマット修飾のデータフォーマットについて説明しています。タンパク質同定結果検証・整理　ソフトウェア
MASCOTなど各種検索エンジンの検索結果を取り込み、結果をサンプル毎にまとめて表示したり、結果の検証に役立つアルゴリズムを適用したり、様々な生物学的情報の表示を行うソフトウェアです
[主な特徴・機能]
■ MASCOTなど各種検索エンジンの結果を取り込み、サンプル間比較の表を作成■内部搭載しているX!Tandemでデータ取り込み時に追加の検索が実施可能■データ取り込みのバッチ処理| new ! ■データ取り込み時に独自の同定結果検証アルゴリズムを適用■表示するタンパク質・ペプチドの基準をインタラクティブに変更可能■同定タンパク質-同定ペプチドの関係性の確認やスペクトルデータの検証が容易■ベン図を使ってサンプル間共通/サンプル独自のタンパク質・ペプチドをリストアップ■ Gene Ontology情報付与・表示■ Pathwayデータベースへのリンク■複数のSpectral Countingに対応。Precursor Intensityを利用した定量手法にも一部対応■論文のmethod記述サポートとrepositoryサイト投稿補助■ XLSフォーマットで結果内容を出力■無償Viewerソフトウェアを使って結果のシェアが容易に◾ Scaffold Q+S[オプション]により、定量解析結果の取り込みと表示が可能となります検索エンジンの結果取り込みとサンプル間の比較長作成 / Gene Ontology情報付与・表示マトリックスサイエンス株式会社・・・バク質のFDR,ベブチドリタ
アサインペプチPathwayデ
スペクトデータの詳細
インストールするコンピュータの推奨スペック
やの一トする人の
D MASCOT ) Proteome Discoverer MaxQuant PLGS-Identityその他mzIdentMLで出力した検索エンジンの結果(PEAKS,Protein Pilotなど) OS : Mac (OS 10.9以降,) Windows 10, Linux (Ubuntu 12以降,centOS5.6以降)メモリ : 32GB以上ディスク：SSD   (HDDと合わせて1TB以上)国内販売代理
マトリックスサイエンス株式会社
住所:  〒110-0015    東京都台東区東上野1-6-10 ARTビル 1F FAX    : 03-5807-7896 TEL ：03-5807-7895 URL：http://www.matrixscience.co.jp   Email：info-jp@matrixscience.com