BioResource Now ! Vol.7 No.5

BioResource Now !
Issue Number 7

May 2011

国内外のバイオリソースを巡る様々な問題や取り組みについて、毎月ホットな話題をこのニュースレターで紹介していきます。
情報センター
便り
じょうほう通信No.57

菅原秀明 ( 国立遺伝学研究所 )2012 年から GBIF（地球規模生物多様性情報機構）は第３期へ
パソコンの節電対策

P1 - 2
P2

情報センター便り2012 年から GBIF（地球規模生物多様性情報機構）は第３期へ＜前編＞

なぜ GBIF なのか
GBIF（Global Biodiversity InformationFacility）は、何時でも、どこでも、誰でもが、世界中の生物多様性情報を利用できる情報環境を実現することを目指して発足し、2001年以来、各国からの拠出金と、各国や生物多様性分野の国際機関・プロジェクトの自助努力によって運営されている（菅原 2006※1）。
2001 年 か ら 2006 年 ま で の 第 １ 期 は“Proving the concept” を旗印とし、2007 年から 2011 年までの第２期は “Towards fulloperation” を旗印として、着実に歩みを進めている。2010 年末の時点で、55 カ国と 46の国際組織・プロジェクトが参加し、300 のデータ提供機関が有する 10,000 のデータセットから 2 億 7 千万件の生物多様性情報を一括検索し、分布情報を閲覧することが可能になった。
2010 年 10 月に、生物多様性への取り組みにおいて重要な国際会議が名古屋で開催された。生物多様性条約第 10 回締約国会議(Convention on Biological Diversity 10th
Conference of the Parties (CBD COP10)) で ある。こ の 会 議 の 重 要 な 成 果 の 一 つ は、ABS（Access and Beneﬁt Sharing、 遺 伝 資 源 の 利用から生じた利益の公平な配分）の新議定書「名 古 屋 議 定 書」策 定 で あ る（鈴 木2010-2011※2）。この ABS を具体化するには、「いつどこにどのような遺伝資源が存在していたのか／存在しているのか」のデータが必要であり、また、商品化された遺伝資源を原産国まで辿れる情報管理の仕組みも必要である。
CBD COP10 会議のもう一つの重要な成果は、「愛知ターゲット」が設定されたことである。
2002 年の第６回会議（CBD COP 6）で設定された 2010 年ターゲット「締約国は現在の生物多様性の損失速度を 2010 年までに顕著に減少させる」が未達であることを認め、2020 年までの、より具体的な達成目標「愛知ターゲット」20 項目が設定された（環境省 2010※3）。
このターゲットの一つが「2020 年までに、生物多様性、その価値や機能、その現状や傾向、その損失の結果に関連する知識、科学的基礎及び技術が改善され、広く共有され、適用される」である。すなわち、生物多様性の現況を反映するデータを共有すること自体も、2020 年までの達成目標として挙げられている。

国立遺伝学研究所 特任教授 菅原秀明
GBIF は、これら COP10 で策定された名古屋議定書と愛知ターゲットが必要とする情報基盤を提供する立場にあることを自他共に認め、第３期（2012 〜 2016 年）の旗印を“Seizing the future to beneﬁt science andsociety” と設定した。事実、表１に例示する
生物多様性、生態、生物分類等に関する多くの国際組織やプロジェクトが、GBIF をその情報基盤として期待し、GBIF との連携を深めている。第 3 期はまた、2011 年から 2020 年までの “United Nations Decade on Biodiversity”においても重要な役割を果たすことになろう。

日本 GBIF ノードは何をしているのか
１）国内データの GBIF 公開
GBIF における生物多様性情報は、分散統合システムによって、網羅的検索が可能になっている。すなわち、各国や国際組織等のノードが、各地域や特定分野のデータを GBIF の標準に則って公開作業を行うと、続いてコペンハーゲンにある GBIF 本部のシステムが global indexing を行い、その結果、誰でもが、他国あるいは他組織由来のデータを検索・閲覧可能となるという仕組みである。したがって、GBIF 日本ノードの役割は第一に国内データを GBIF 標準で公開することである。GBIF 日本ノードでは、国立遺伝学研究所 ( 以下、遺伝研 ) と東京大学（以下、東大）が協力して、主として観測データを、国立科学博物館（以下、科博）が主として標本データの GBIF 公開に努めてきた。
表１

その結果、2011 年５月時点で動物、植物ならびに微生物の観測または標本データを235 万件余り公開した。これは、GBIF 公開データ総数 2 億 7 千万件に対してはごく一部ではあるが、加盟国の中で 15 位、アジア諸国の中で１位にあたる公開件数である。
国内データの公開のためには、公開のためのツールを用意する必要がある。遺伝研では、2010 年度にデータ公開プロトコルを 最 新 の Integrated Publishing Toolkit(IPT) へ更新した。その結果、より多様なデー
タ項目が公開可能となり、また、データを提供している機関やデータの由来を 図１ のように可視化することができた。科博においても GBIF 公開のためのツールに加えて自然地名の辞書を整備し、東大では学名辞書を整備している。

図１ GBIF の Integrated Publishing
Toolkit で容易になったデータ源の可視化：
遺伝研から公開したデータの提供機関（by Hosting Body）、由来国（by Region）、分布（by Coordinates）の例
次ページへ続く

Global Earth Observation System of Systems
http://www.earthobservations.org/geoss.shtml
The Group on Earth Observations Biodiversity Observation Network
GEO BON
http://www.earthobservations.org/geobon.shtml
Asia - Pacific Biodiversity Observation NetworkAP-BON
http://sites.google.com/site/asiapacificbon/
East and Southeast Asia Biodiversity Information Initiative
EABII
http://www.esabii.org/
Global Environmental Facility
GEF
http://www.thegef.org/
Biodiversity Indicators Partnership
BIP
http://www.bipindicators.net/
DIVERSITAS - An International Programme of Biodiversity Science
DIVESRSITAS
http://www.diversitas-international.org/
DIVERSITAS in the Western Pacific and Asia
DIPWA
http://diwpa.ecology.kyoto-u.ac.jp/
Intergovernmental Science - Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services
IPBES
http://ipbes.net/
International - the global network for taxonomy
BioNET International BioNET
http://www.bionet-intl.org
Convention on Biological Diversity, Global Taxonomy Initiative
CBD GTI
http://www.cbd.int/gti/
European Distributed Institute of Taxonomy
EDIT
http://www.e-taxonomy.eu/
EuropeanDistributed
International
Barcode Instituteof Life of Taxonomy
iBoL
http://www.e-taxonomy.eu/
http://ibol.org/
GEOSS

BioResource Now ! Vol.7 No.5

遺伝研は 2010 年に DiGIR に替えてIPT を採用したが、GBIF にはその他にも複数のデータ標準が共存している。それぞれの 利 用 状 況 を 表 ２ に ま と め た。簡 便 な
DarwinCore と DiGIR の方がよく使われているように見えるのは、米国由来のデータが大部分を占めていることに因る。

データ型式標準

データ型式
DarwinCore
ABCD Schema

採用機関数 データセット件数
234
8,716611,496

データ公開標準

データ公開方式 採用機関数 データセット件数
DiGIR protocol
178
8,456
TAPIR protocol
60262
BioCASE protocol
591,494
IPT23

遺伝研はまた 2010 年に、観測や研究の現場ではデータが Excel に書き込まれている
こ と が 多 い こ と に 着 目 し て、DarwinCoreへの適合性を判定できるマクロを組み込んだ、エクセルブックを開発した。これは、手元のパソコンで手軽に使えるツールであり、今後GBIF データ公開促進のための GBIF 日本ポータルサイトの「GBIF 公開支援 」のページ（http://www.gbif.nig.ac.jp/gbif̲regist.html）
から公開する。
（後編へ続く）■参考資料※1 菅原秀明（2006）「Global Biodiversity Information Facility (GBIF)
2011 年 GBIF は 180 万種 10 億件の生物多様性情報を提供する」*Bioresource Now! Vol.2, No.2

※2 鈴木睦昭（2010-2011）「生物多様性条約と遺伝資源をめぐる状況（３回連載）」*BioResource Now! Vol 6. No.12、Vol 7. No. 1 〜 No.2

※3 環境省（2010）「条約新戦略計画（ポスト 2010 年目標該当箇所）」[ 環境省仮訳 ]表２ GBIF データ公開プロトコルの使用状況
DarwinCore と DiGIR protocol は米国グループが開発した標準で、ABCD Schema,TAPIR protocol, BioCASE protocol は、TDWG(http://www.tdwg.org/) が開発した標準。
IPT は GBIF で統合化を進め 2010 年から公開されたツールキットで、データ公開プロトコルとして TAPIR を選択することもできる。

パソコンの節電対策

スリープ 電源 OFF

明るさ↓

じょうほう通信使用しない機器 OFF

310 分[ 第 57 回 ]ディスプレイの明るさ調節

東日本大震災の影響により、電力の最大供給が低下したため、電力不足が叫ばれています。電力は貯める事ができないため、電力会社は最大供給量以上の電力を供給することができません。毎日の消費電力のピーク時間※1 を知り、その時間だけでも消費電力を小さくする事が効果的な対策となります。
電力需要が拡大する夏に向けて大停電を発生させないよう、一人ひとりができる、パソコンの節電方法を紹介します。（表 1）

普段使用しているディスプレイですが、明るさ ( 輝度 ) を落とすことで節電をすることができます。
デスクトップの場合は、ディスプレイのボタンを操作し、メニューから輝度の調整を行うことができます。また、ノートパソコンの場合は[Fn] ボタンと [Fxx] などのキーボードから行います。

*1 東京電力が公開している電力使用状況グラフ
http://www.tepco.co.jp/forecast/index-j.html

パソコンに接続しているスピーカや外付け HDD などは待機状態でも電力を消費しています。また、パソコンで起動しているサービスも CPUの負荷を高め、消費電力を大きくします。使用しない機器や使っていない機能は、できるだけ OFF にする事で節電を行うことができます。
( ただし、PC 本体やプリンタなど起動に時間が掛かる製品は、起動時に消費電力が大きくなるため、約 2 時間以内に再使用する場合は電源を消さない方が消費電力が少ない場合もあります。)

節電方法

通常時 (W) 節電実行時 (W) 節電効果 *2

１ 離席時のスリープモード

52W

1W

98％

２ 離席時のディスプレイ設定

52W

21W

60％

３ ディスプレイの明るさ調節

52W

33W

37％

4 使用していない機能を切る

53W

52W

( 例 : IE の場合 )4（起動せず・閲覧せず）（起動・閲覧せず）

節電設定を自動で行うプログラム

2％

また、Windows 限定になりますが、Windows 節電設定を自動で行うプログ
ラムも配布されており、このプログラムを適用した場合の節電効率は、初期設定時に比べ消費電力が平均 70% になります。（表２）

表 1：パソコンの節電対策と節電効果

URL：http://support.microsoft.com/kb/2545427/ja?sd=gn*2 Desktop ( 一体型 ) 2010 年モデル（Windows 7）のデータを基に計算しています。
参考 URL：http://technet.microsoft.com/ja-jp/windows/gg715287

1

設定項目

設定値

省電力
PC 電源プラン40%
ディスプレイ輝度
2分
ディスプレイを暗くする時間
5分
ディスプレイの電源を切る時間（生物遺伝資源情報総合センター 系統情報研究室
10 分
ハードディスクの電源を切る時間
15 分
スリープ状態にする時間
一時停止
デスクトップの背景設定
省電力 ( 高 )ワイヤレスアダプターの設定
表 2：Windows 自動節電設定

離席時のスリープモード「スリープモード」とは、作業内容をメモリに保存し、節電状態で待機させる機能です。また復帰時は、電源を切った状態よりも、高速に作業への復帰が行えます。ただし、スリープモードは電源を切った状態よりもわずかに消費電力が大きいため、就寝時や半日以上使用しない時は電源を切りましょう。

2

使用していない機能を切る

離席時のディスプレイ設定

Windows7

デスクトップ ノートブック○○○○○○）

○○
○
○
○
○
○
○

上記「スリープモード」ではパソコンを一時停止してしまいますので、ファイルのダウンロードやウイルススキャンなどの処理中には使えません。処理の途中で離席する場合には、ディスプレイの電源を OFF にすることで、節電することができます。

このように、ほんの些細な事で、消費電力をわずかですが抑える事ができます。一人ひとりが少しずつ節電を行う事で、生活に大きな影響がでないようにしましょう。

NewsLetter に掲載されているあらゆる内容の無断転載・複製を禁じます。
すべての内容は日本の著作権法、及び国際条約により保護されています。

Contact Address（生物遺伝資源情報総合センター 系統情報研究室 渡辺拓貴）

連絡先 〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
TEL055-981-6885 ( 山崎 )E-mail brnews@chanko.lab.nig.ac.jp

ニュースレターのダウンロード先
www.shigen.nig.ac.jp/shigen/news/

international.org/

Editor's Note

バ イ オリソ ー ス 情 報

来年度から第 3 期に入る GBIF の、現状と今後の計画について 2 回に分けてお届けします。日本 GBIF ノードの活動はナショナルバイオリソースプロ
ジェクト（NBRP) の課題でもあり、これまでに NBRP マウス、シロイヌナズナ、藻類のリソースも参加しています。後編では公開情報を使った解析例などもご紹介しますのでお楽しみに。パソコンの節電対策も是非参考になさってください。
（Y.Y.)(NBRP) www.nbrp.jp/(SHIGEN) www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm(WGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/(JGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp

BioResource Now !
Issue Number 7 May 20112