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本プロジェクトは、単一種を対象としたヒト・ゲノム・プロジェクトやイネ・ゲノム・プロジェクトとは異なり、高等植物の1/10を占め、かつ双子■ リソース関連イベント情報

葉植物で最も進化したキクを対象としているため、 扱う種が広範囲にわ■ 海外ホット情報 No.14
・キク・ゲノム・プロジェクトȊǷȧȊȫȐǤǪȪǽȸǹȗȭǸǧǯȈ࠼፯ǭǯ‫ޓ‬࠼޽‫ܖٻܖٻ‬ᨈྸ‫ܖ‬ᄂᆮᅹ᧽‫ޓ‬ౡཋᢡˡ‫̬܇‬ሥ᬴ܱ଀ᚨᡈᕲѨࢠたる。特に、キクの中には食料、野菜、油（食用ならびにバイオ・ディーゼル）、医薬品、試薬、嗜好品、穀物、花卉など高い経済有用性の中心となるべき40以上の種が存在し、さらにはシンテニーからそれらを取り巻く3,000にも及ぶ種が含まれてくるから、これらをどのようにこのプロジェク■ じょうほう通信 No.16
・CMap(Comparative Map Viewer )トでカバーするかが、まず問題点として挙げられた。他方、キクは最有害雑草として君臨しており、 キク雑草除去のために莫大な資金が流れているのも事実で、本ミーテイングではこのことも経済価値の重要なポイントẮỉἝἷὊἋἾἑὊỉἒỸὅἿὊἛέ 3')ἧỳỶἽKWWSZZZVKLJHQQLJDFMSVKLJHQQHZVQHZVMVS

として頻繁に論じられていた。

ゲノム塩基配列解読研究は最重点課題であることは言うまでもἢỶỼἼἏὊἋऴ‫إ‬ỊˌɦỉἇỶἚẦỤắᚁỆễủộẴẇ

Leontodon taraxacoides spp.
無く、 キクで最小ゲノムサイズをもつ Leontodon

1%53KWWSZZZQEUSMSLQGH[MVS
6+,*(1‫ޓ‬KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSLQGH[MDKWP

Taraxacoides 〔2n=2X=8; ゲノムサイズ 1C 0.29/0.30pg(Baak・Rieseberg
Arabidopsis thaliana
未発表データー)であり、Arabidopsisthaliana ゲノムサイズ(1C 0.16 /:*5‫ޓޓ‬KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSZJU

0.16pg)の約倍であるが、イネゲノムサイズ (1C 0.49/0.50pg) よりも小さ-*5KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSZJUMJUMJU8UO/LVWMVSい〕 がモデル植物として考えられている。この種は、ヨーロッパ山岳地帯原産のキクで、アメリカ合衆国に移入され、中西部から中東部にかけてのリソース関連イベント情報

23州で雑草化し、日本にも帰化雑草として東京都や神奈川など数県で近詳細はこちらからご覧になれます
http://www.nbrp.jp/

年記録され始めた。ここから得られる基礎データーを使って、多面的に経済種を選んでキクゲノム研究の最重点課題として技術開発と斬新的研究

9月25日 -27日 ：[ 日本遺伝学会第78回大会 ] 会場：つくば国際会議場
パネル展示：9月25日(月) - 27日(水)シンポジウム：9月27日(水)13:00 - 18:00を発展させ、かつ UCデイビス Seed Biotechnology Center などを活用し、10月28日 (土）9：00-11：00：[ラット生殖技術の進歩 ] 会場：京都テルサ テルサホール
京都市南区新町九条下ル 京都府民総合交流プラザ

キク全体の遺伝子研究ならびに教育を網羅しようというものである。

教育特に育種学、分子遺伝学、ゲノム情報の解析、遺伝子操作などの技術教育、機能・比較・進化学、分類学、雑草学などの基礎教育を含め、UCデイビス ゲノム・バイオ
メディカルサイエンス施設

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なぜ広島大学大学院理学研究科附属植物遺伝子保管実験施設の&RPSRVLWDH:KLWHSDSHU0HHWLQJ

近藤にミーテイング参加を強く求められたかというと、University of California at Davis August 17, 2006

(1) ナショナルバイオリソースプロジェクトを中心に広義キク属の収集、保管ならびに研究を日本国内で最大規模に展開しているチームであること。

ȊǷȧȊȫȐǤǪȪǽȸǹȗȭǸǧǯȈ࠼፯ǭǯ‫ޓ‬࠼޽‫ܖٻܖٻ‬ᨈྸ‫ܖ‬ᄂᆮᅹ᧽‫ޓ‬ౡཋᢡˡ‫̬܇‬ሥ᬴ܱ଀ᚨ૙੉ᡈᕲѨࢠ(2) キクで、最もきれいなゲノミック・インシチュ・ハイブリダイゼーション(GISH)、蛍光インシチュ・ハイブリダイゼーション (FISH)を含む染色体写真を数多く世界に公表、発信し、しかも分子系統学的研究も進めている施設である。ファイバーFISHによる物理的地図作成に期待するとのコメントも入れられた。
(3) 日本側として同プロジェクトへの参加の可能性を知りたい。

アメリカ合衆国カリフォルニア大学デイビス校（以後UCデイビスと呼ぶ）に農学、生物学、医学の共通課題を集積してゲノム・バイオメデイカ
ルサイエンス施設が2年ほど前に建設され、その中にゲノムセンターが創設されたのを機に、キク・ゲノム・プロジェクトが最重点課題として周囲の賛同と協力の一致が得られるように動き始めた。数億ドル規模のファンドということであった。

を運用するためには、国内大学・研究所間で参加と賛同が得られるプロジェクトでなければならないし、国際的な協力、共同研究、さらには研究のミーテイングは1日9:00 am〜17:00pmのみで、UCデイビス・ゲノム国際的標準規格化が重要であり、このことが本ミーテイングを行った主要・バイオメデイカルサイエンス施設内講義室で行われた。公式発表では因と考えられる。このキク・ゲノム・プロジェクトの代表は、UCデイビス・ゲノムセンター長 Richard Michelmore 教授で参加者は55名で、 殆どがアメリカ合衆国とカナダの関連大学研究者であある。同教授は、日本の理化学研究所植物分子った。 アメリカ合衆国とカナダ（この2国で研究職についているか学生の生物学関連スタッフとの共同研究や、農林水産外国人はすべてアメリカ人とカナダ人と同じ扱いをうけている）からの研省イネ・ゲノム・プロジェクト関係でつくば市を訪究者を除くと、外国からの出席者は近藤を含めてフランス、オランダ、アル問したことのある方である。

ゼンチン、連合王国、ドイツから各1名と少なかったため、最初に名指しで紹介があった。

会議 キク・ゲノム・プロジェクト代表、UCデイビス・ゲノムセンター長 Richard Michelmore 教授

"IO2ESOURCE NOW  6OL  午前中9:00〜11:30 amは話題提供としての一般知識的講演で、ơǐƏǄƏᡫ̮

（１）本ミーテイング 代 表・U Cデイビス・ゲノムセンター 長 R i c h a r dMichelmore 教授の挨拶とミーテイングの目的、目標（２）ルイジアナ州

連載(16)

ЎᲭЎ ³&0DS &RPSDUDWLYH0DS9LHZHU ´

立大学Lowell Urbatsch教授の講演 : 分類学的全体像と種多様性（３）Richard Michelmore教授の講演 : ゲノム・プロジェクト（４）ジョー

みなさんはGMODをご存知ですか。GMODは
Generic Software Components for Model Organism
Databases の略称で、モデル生物のデータベースグループが共用するツールをオープンソースで提供している米国のサイトです（http://www.gmod.org/home）。
ゲノムブラウザーの GBrowse やテキスト検索用の Textpresso な
ど数多くのツールを無料でダウンロードすることができます。
今回はその中の一つ、CMap について紹介します。CMap は複数のマップ情報をウェブ上で比較することができる Comparative Map Viewer です。穀物の比較ゲノムデータベースであるGrameneやムギ類データベースのGrainGenes などで使われています。

ジア大学Steve Knapp教授の講演 : 生化学ゲノミックス（５）カナダ・ブリテイッシュコロンビア大学Loren Rieseberg教授の講演 : 生態学ゲノミッ
クス （６）連合王国ブリストル大学Simon Hiscock教授の講演 : 生殖生
物学、種分化、があった。
10:00〜10:30 am及び11:30〜13:00 pm は専門分野をポスター展示がカバーした。ポスター展示の主要部がヒマワリとレタスの遺伝子に関するものであり、Michelmore教授がひきいるこの分野は最も層が厚いことから、 彼らの研究ゴールはこの2種にあると推察、 再確認をさせられた。
また、Flora of North America第19, 20, 21巻に北米のキク418属2,420種がまとめられ、今年6月に出版されたことに対して、ミーテイングの至る所で紹介と宣伝がされた。私もポスター でナショナルバイオリソース広義キ

当研究室でもコムギのデータベース（KOMUGI）でCMapを使っています（http://map.lab.nig.ac.jp:8080/cmap/ 図A）。日本語チュートリアルも用意しましたので興味のある方はアクセスしてみてください.。
CMap の主な機能は (1)マップの画像作成, (2)マーカーの検索,(3)複数マップ間のリンク作成, (4)マップ間に共通するマーカーのマトリックス表示, などです。

ク属と広島大学大学院理学研究科附属植物遺伝子保管実験施設が行っている研究を発表した。この時、我々とは材料を全く異にした北アメリカ産の種を使って、属間交配を行い、 得られた雑種を分析する類似の研究を展開している研究者がアメリカ合衆国オハイオ州マイアミ大学アクロン校にいることを知った。
ポスター展示午後13:00〜15:00 pm 分科討論ということで、（１）分類学、（２）遺伝学と対立遺伝子多様性、（３）シークエンシングとゲノム特性、（４）機能分析と二次代謝、という４つの分科に別れ、予め与えられてい図A : コムギDBでのCMap

るキク研究についての以下のテーマで議論が行われた。最近ならびに将

このツールの優れている点は、利用者が選択した複数のマップとマップ間リンクを最適化してスマートに表示してくれるところです。表示の切り替えやカスタマイズ機能も充実していて、マップの拡大縮小はもちろんのこと、部分カットや反転などWeb上で簡単に操作できます。図Bは最初に選択したマップを中心に、左に１つ、右に２つのマップを表示しています。サイズに合わせて表示するマーカーの数などを最適化してくれます。
今回はじめて使ってみましたが、ドキュメントも充実しているので、 英語が読めてリレーショナルデータベー
スやUnix/Linuxの知識があれば比較的簡単に構築できると思いました。 同様の機能の搭載したツールを一から開発することを考えると、 使わない手はないという優れものだと思います。
（生物遺伝資源情報総合センター 系統
図B：リンケージマップ例
情報研究室 土屋里枝）
次回は、Google Sitemapを紹介いたします。

来のゲノムデータで応用できること、モデル植物のデーターの利用法、キクのインパクトある特性とは、どのようなユニークな研究があるか、少なくなってきた研究、要求する資源とは、短中長期的重要課題とその運用、キク研究者間の連携の仕方、多様なキク研究の調整、旧来からの運営委員会が必要か、リソース・データーベースは必要か、データーベース検索等に使う用語の改変、全ゲノム塩基配列解読の方法論と時期、全ゲノム塩
基配列解読のための種は経済価値の高い農作物を選ぶか、雑草を選ぶか、小ゲノムサイズ・モデル植物を選ぶか、使える研究ファンドは、 研究費獲得できる強力研究者と政治的背景、 キク研究の主な研究者、バイオエネルギー独創性、その他
ミーテイング後のMichelmore
代表自宅での懇親会

白書に必要な事項などについて話し合われた。

15:30〜17:00 pm 総合セッション。各分科会はそれぞれの結果を公表して、全体をまとめて、内容の共通点を見出すと共に、総合討論を行った後、ミーテイングを終えた。
なお、ミーテイング中、ナショナルバイオリソース広義キク属植物チ

編集後記： 近藤先生には国際キクゲノムプロジェクトという興味深いホットな話題を提供していただきました。ご帰国直後のお忙しいところありがとうございました。キクはわが国を代表する花であり、花き植物の中で最も生産量が高いといわれています。 また染色体数が2n=4ー90と非常に多様であり、研究素材としても大変ユニークな植物です。日本のキクはこれからがシーズンですね。

ームとして、保管植物を研究材料として使うよう宣伝をし、Michelmore代表には書類1セットを渡して内容を説明し、賛同を得た。
ちなみに、翌8月18日、Michelmore代表ならびに実行・運営委員のメンバーが集まり委員会を非公開で行ったはずである。

連絡先 : 〒411-8540

1%53&KU\VDQWKHPXPKWWSZZZVKLJHQQLJDFMSFKU\VDQWKHPXP

静岡県三島市谷田1111

国立遺伝学研究所・生物遺伝資源情報総合センター
パソコンにURLを
TEL : 055-981-6885 (山崎)
送信するのにE-mail : BRnews@chanko.lab.nig.ac.jp
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