BioResource now !
Vol.4 (1) 2008

Issue Number 4 January 2008

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http://www.shigen.nig.ac.jp/shigen/news/

国内外のバイオリソースを巡る様々な問題や取り組みについて、毎月ホットな話題をこのニュースレターで紹介していきます。

注目！リソース

バイオリソース情報

マウスリソースとノーベル賞

NBRP
SHIGEN
WGR
JGR

山村研一 熊本大学発生医学研究センター臓器形成分野 教授

海外ホット情報 No.22

Plant and Animal Genome XIV Conference

お知らせ「NBRPキックオフシンポジウム」

2008年3月10日（月）
場所：東京都千代田区一ツ橋2-1-1
如水会館2階 スターホール、オリオンルーム、ペガサス
http://www.kaikan.co.jp/josui

左より、ラット、マウス、かやねずみ! 注目 リソース No.1

マウスリソースとノーベル賞
山村研一

http://www.nbrp.jp/
http://www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm
http://www.shigen.nig.ac.jp/wgr/
http://www.shigen.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp

そこで、できればノーベル賞は4月ぐらいに発表してもらいたいと思っているが、欧米はクリスマスの前に授賞式をやりたいようであるので、そうはしてくれないだろう。ともかく、実際に相子同組換え法によって始めてノックアウトマウスが作製されたのは、1989年である。その後有用性は実証され続けており、2000年

熊本大学発生医学研究センター臓器形成分野 教授

程度には受賞してもおかしくない状況であったからである。噂で2008年は「ねずみ」年である。 実は私は「ねずみ」年生まれ

は候補者が多すぎたためといわれているが、ふたを開けてみれば、で、マウスを用いた研究に携わって30年以上が経過し、 人の医下馬評通りの3人が受賞者になった。

師免許証も持っているが、 もっぱらマウスドクターとして、 またMartin Evans博士は、胚盤胞からES細胞の樹立に成功し可変型遺伝子トラップ法を用いて遺伝子破壊マウスを作製し、マた人で、1981年7月にNatureに論文が発表されている。Evansウスリソースの開発にも従事している。 マウスに博士には、1987年6月AMBOの講習会が中国の北京で開かれどっぷり使った職業についているといってもよい。

たときにお会いしているが（写真1）、い日本語はあいまいさを好むが、「ねずみ」 というかにも英国の名門ケンブリッジ大学の言葉も同様で、「マウス」なのか「ラット」なのか教授という風格で、大学の歴史を感じさそれとも「 かやねずみ」 なのか不明である。 昔の絵の中のねずせる雰囲気が濃厚に漂っていた。ES細胞みや人間の近くにいて人に目撃されやすいところから「ラット」の樹立に至る歴史的経緯を説明すると、ではないかと思える。 ただ、 つい最近多数の「かやねずみ」 がその端緒となる成果は、1974年の米国空きビルに住みついているとの報道があったのBrinster博士らによる、奇形癌腫由来ので、本 当のところは わからなくなった。のEC細胞を用いたキメラマウス作製に2008年に入ってすぐ去年のことを言うのも

写真1．Evans 博士(左)と山村先生（右）北京にて 1987.06

遡ることができる。1975年にMintz博士が、再試に成功したが、気が引けるが、しかし、ねずみ年を前祝いする生殖細胞には伝わらず、またEC細胞が途絶えたということもかのごとく2007年度のノーベル医学生理学あり、EC細胞を用いての変異マウス作製は夢と終わった。

賞がノックアウトマウス関連技術を開発した
英国のMartin Evans博士、 米国のOliverEvans博士らと同年の1981年12月に米国のGail Martin

Smithies 博士とMario Capecchi 博士の3氏に贈られた。

博士もPro. Natl. Acad. Sci. USAにES細胞の樹立の論文を毎年、 報道関係者からノーベル賞の発表の日が近づくと、 電話発表している。 興味深いのは、 ES細胞の命名である。 Evansがかかってきて連絡のため携帯電話の番号をといわれ続けてき当初開発者のEvansとKaufmanの頭文字をとってEK細胞
らは、たので、 少し待ちくたびれて遅すぎる感があったが、ともかくめと命名していたが、 MartinらはES細胞 (embryonic stem

でたいことである。 ノーベル賞の発表は、毎年10月だが、せっcell) と名付け、結局これが生き残った。Martin

かくその余韻を楽しみたいと思っても、3ヵ月後には年が変わる博士が受賞者の一人として名を連ねることがでので、その望みがかなえられない。

きなかったが、ESの名前が残ることで一矢を報いたということであろうか。

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海外ホット情報

Mario Capecchi博士は、ES細胞を用いた相同組換え法、なかでも1988年11月にNatureに発表されたpositivenegative selection 法の開発者として有名である。
すでに1980年ごろから相同組み換えの研究を始め、その11月にCellにDNAの顕微注入で細胞をトランスフォームできるという論文を発表している。しかし、研究費の申請をしても不可能だからという理由で採択してもらえなかったという。
それでも信念を曲げず、研究を続けついに成功した時、審査員から、我々の忠告を聞かなくてよかったですねというコメントをもらったという。 オリジナルな研究がすぐには日の目を見ず、それでも辛抱強く継続することによって花が開くという典型のよう
写真2．
な研究である。短期的な業績を求めすぎ Cappechi博士(手前右)る現在の風潮をどう思うか聞いてみたいと山村先生（後方左）1990.01.12人である。 外貌は一見難しく見える人であるが、内実はそうではなく、非常に親切で、人格的にも優れた人である。1990年1月12日にユタ大学の研究室に尋ねたときのES細胞に相同組み換えベクターを導入するときの電気穿孔のスイッチは自分で入れるという話は今でも覚えている（写真2）。 普通だと馬鹿にしがちだが、私にも経験があるからである。
マウス受精卵の前核にDNA溶液を顕微注入するとき、ゲノム中に組み込まれろという気合いというか、念力というか、そうすると不思議に効率が上がることを経験したからである。

No.22Plant and Animal Genome
XIV Conference
私は今回「New Approaches In Oryzabase:Gene Merge And Text Mining」というタイトルでOryzabase(http://www.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/)の新しい機能の紹介をポスターで行いました。
ポスター発表会場は新しく造られた「Grand ExhibitHall」へと移り照明も明るくなって、参加者の議論・交流が例年以上に活発に行われたと感じました。
様々なワークショップやポスター発表, 企業展示が行われている中で、私はデータベースやソフトウェアを中心に発表を見て回ってきました。
データベースの中では、EcoCyc, MetaCyc データベースとゲノムが解明された微生物のデータベースのコレクションであるBioCyc (http://biocyc.org/) の活動に目を惹かれました。
様々な生物種の代謝パスウェイデータを収めたMetaCycを中心に、各生物に特化したサイトも構築しているということでした。
TAIRとの連携によりAraCyc (http://www.arabidopsis.org/biocyc/) を、Grameneと組んで RiceCyc (http://www.gramene.org/pathway/) を、
その他 Lycocyc, MedicCyc などを公開しています。
ソフトウェアの中で気になったものは、GMOD が発表していた
Community Annotation Server (CAS) (http://cas.gmod.org/)というゲノムアノテーションパッケージです。現代生物学のためのスキーマである Chado, 元々ウィキペディアのために作られたMediaWiki, ゲノムビューアである G-Browse を有機的に組み合わせて作られたもので、まだアルファ版らしいのですがどのようなソフトウェアに仕上がっていくか楽しみです。
(木村 学)

Oliver Smithies博士は、体細胞で相同組み換えを行うことに最初に成功した人で、論文は1985年9月にNatureに発表されている。 技術開発が得意な人で、実はデンプンゲル電気泳動法を発明した人でもある。奥様が日本人で研究者でもあるので、夫婦とも1993
年11月に熊本で開いた医学生物学シン
ポジムに招待し来ていただいたこともあるが（写真3）、非常に気さくな人で、政治の世界とは無縁な、実験が大好きな、純写真3．Smithies博士 然たる研究者である。

私は初めてPAGに参加し、ポスター発表を行いました。
「Shared Information Of Biological Resources」というタイトルでNBRP (http://www.nbrp.jp/)、
BioResource World (http://resourcedb.nbrp.jp/)、Research Resource Circulation(http://www.shigen.nig.ac.jp/rrc/)、さらに 将来展望としてTaxonomy Viewer (http://www.shigen.nig.ac.jp/taxonomyviewer/)、
Goall Viewer (http://www.shigen.nig.ac.jp/goallviewer/viewer.html)
について発表しました。世界に向けてNBRPやBRWなどを紹介できる良い機会となりました。今年のポスター発表は新しく建設されたホールが会場で、明るく活気のある雰囲気でした。
また、 SSWAP (http://sswap.info/index.jsp)のワークショップに参加しました。 SSWAP は Simple Semantic Web Architecture
and Protocol のことです。このSSWAPでは様々なサイトから提供されるリソースに関して「意味のある検索」ができるというものでした。
例えば、フォームに mouse と入力し検索すると、Mammalian genecollection や PredBALB/c (マウスのBALB/c系統のMHCに結合するペプチドを予測するツール)など mouse に関連付けられたwebページの情報が結果として返ってきます。
このように「意味のある検索」を実行すると、今まで気づかなかった情報にたどり着くことができたり、自分の世界が広がるように感じました。
(高橋由佳)

1993.11.20

マウスリソースは、これらの人たちの業績なくしても語れないだ
ろう。(次号へつづく)※写真は山村先生より提供いただきました。

研究者へのお願いバイオリソースを使って研究をしている皆様にお願いがあります。
研究成果を論文として発表する際には、使ったリソースの情報を必ず Materials & Methods や謝辞などに記載してください。同時に、リソース入手元への連絡もお願いいたします。
NBRPでは成果論文の登録サイトを開設しました。以下のアドレスから簡単に情報を登録することができますのでこちらも是非ご利用ください。

http://rrc.nbrp.jp/

編集後記
昨年のノーベル医学生理学賞が3名の「ノックアウトマウス関連技術開発研究者」に贈られたことによって「バイオリソース」という地味な分野に久々にスポットライトが当たったと感じた関係者も多かったのではないでしょうか。 今年の干支に因んでねずみ年の山村先生から「マウスリソースとノーベル賞」という魅力的な話題を提供していただくことができました。
来月は後編をお届けしますのでお楽しみに。(Y.Y.)

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