索 引
I N D E X

D〜F

miRCURY LNA™ miRNA PCR system… ………………………………………… 131

DDBJ…………………………………………… 71

miRNA………………………36, 131, 158, 258

ΔΔ Ct 法…………………… 28, 42, 118, 147

Mir-X™ miRNA qRT-PCR TB Green
Kit………………………………………… 131

ddPCR… ………………… 244, 251, 258, 274
Dicer………………………………………… 131

数 字5′→3′エキソヌクレアーゼ活性… …… 19

dissociation curve…………………………… 16
DNA…………………………………………… 8
DNase I… …………………………………… 39
DNA 除染…………………………………… 104
DNA 断片化… …………………………… 196
DNA チップ… …………………………… 141

欧 文

DNA マイクロアレイ… …………… 111, 141

A〜C

ELISA… …………………………………… 128

ADA………………………………………… 284
ADA 欠損症… …………………………… 288
Ago… ……………………………………… 131
AlleleID®……………………………………… 54
Ampdirect… ……………………………… 174
Argonaute… ………………………… 131, 258
ASB… ………………………………………… 66
ASP… ………………………………………… 66

DSS… ……………………………………… 149

EMBL… ……………………………………… 71
Ensembl Genome Browser… ………… 192
FAM™ プローブ… ………………………… 47
FastPCR… …………………………………… 55
FCM………………………………………… 283
FFPE…………………………………… 67, 196
forward プライマー……………… 39, 62, 77
FRET… ……………………………………… 18

BLAST…………………………………… 55, 76

G〜M

BRAF… …………………………………… 235
castPCR… ……………………………… 66, 97

GenBank… …………………………………… 71

CCGA… …………………………………… 272

Gene Reference Assay… ………………… 66

CDC… ……………………………………… 168

GenScript Online PCR Primers DesignsTool… ……………………………………… 55

cDNA 合成… ……………………………… 142

miScript® PCR system… ……………… 131
mRNA… ……………………………………… 35
MSP… ……………………………………… 203
Multiple Primer Analyze… ………… 55, 61
Mutant Allele Assay… …………………… 66
Mutation Detector™… …………………… 68

N〜O
NCBI……………………………………… 47, 71
Net Primer…………………………………… 76
non-coding RNA… ……………………… 151
NTC… ………………………………………… 46
Nucleotide-BLAST………………………… 57
N 遺伝子… ………………………………… 184
oli2go…………………………………………… 55
Oligo…………………………………………… 55
OligoAnalyzer™… ………………………… 55
OpenArray………………………………… 120

PPanelPlex™…………………………………… 54
PCR… …………………………………… 12, 15
PCR 検査…………………………………… 170
PCR 効率………………………………… 43, 46

GoTaq® 2-Step RT-qPCR System… … 93

PCR 増幅曲線………………………………… 21

HHV… ……………………………………… 149

PCR 阻害…………………………………… 258

HWE………………………………………… 196

PEG… ……………………………………… 164

LDproxy Tool… ………………………… 192

PerlPrimer… ………………………………… 54

LNA… ……………………………………… 259

PMMoV… ………………………………… 167

LSP… ………………………………………… 66

poly（A）……………………………………… 36

CopyCaller™ Software… ……………… 200

LST… ………………………………………… 66

pre-miRNA……………………………… 131

COVID-19… ………………………… 164, 183

MeDIP-seq………………………………… 272

Primer3… ……………………………… 55, 58

CpG アイランド…………………………… 204

MGB……………………………………… 47, 66

Primer3Plus… ……………………………… 73

ctDNA… ……………………………… 97, 244

miR-1… ……………………………………… 36

Primer-BLAST………………………… 55, 73

cfDNA… ………………………… 97, 244, 265
ChIP-qPCR………………………………… 205
CMV…………………………………………… 56
CNV… ………………………………… 198, 244
competitive allele-specific TaqMan®
PCR… ……………………………………… 97

Ct 値… ……………………………… 20, 23, 97

296

Primer Design Tools… …………………… 55

リアルタイム・デジタル PCR 実験スタンダード

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pri-miRNA………………………………… 131primo Multiplex3.4… ……………………… 54
p 値…………………………………………… 196

Q〜R
qPCR………………………………………… 228
qRT-PCR… ……… 34, 158, 164, 175, 184
QuantaSoft™ Analysis Pro… ………… 232

TaqMan® Genotyper Software… ……… 53®

TaqMan Human Endogenous Control
Plate……………………………………… 128
TaqMan® MicroRNA Assays…… 131, 132
TaqMan® SNP Genotyping Assay…… 224
TaqMan® プローブ……………… 19, 36, 191
TaqMan™ Copy Number Assays…… 198
TaqMan™ MGB プローブ………………… 49
TaqMan™ Mutation Detection Assay… …………………………………………… 66

遺伝子特異的プライマー… ………… 36, 97
遺伝子発現… ………………………………… 33
遺伝要因… ………………………………… 191
インターカレーション法… ………… 16, 75
イントロンスパニング… ………………… 75
インフルエンザ…………………………… 171
ウイルス感染症…………………………… 172
ウイルスベクター………………………… 283
ウェットチェック…………………………… 77
ウェブアプリケーション… ……………… 71

QuantStudio™ 3D……………………… 235

TaqMan™ SNP Genotyping Assay… … 50

QX200™… ………………………………… 228

TaqMan™ アッセイ………………………… 47

REF… ……………………………………… 274

TaqMan™ プローブ法……………………… 54

RepeatMasker… ………………………… 276

Threshold line… …………23, 147, 178, 200

reverse プライマー… …………… 39, 62, 77

TLDA… …………………………………… 113

エキソヌクレアーゼ活性… ……………… 48

RFLP………………………………………… 235

Tm……………………………………………… 48

エクソームシークエンス… …………… 191

RISC…………………………………… 131, 258
RNA… ……………………………………… 8, 33
RNAi…………………………………………… 88
RNA Seq…………………………………… 122

うつ病… …………………………………… 149
ウラシル… ………………………………… 8, 11
エアロゾル… ……………………………… 187

エクソソーム………………… 151, 158, 264

U〜V
UCSC Genome Browser… …………… 192
UCSC In-Silico PCR… ………………… 276

ROI………………………………………… 274

VCN… ……………………………………… 283

ROI アンプリコン領域… ……………… 276

VIC® プローブ… …………………………… 47

rs 番号… …………………………………… 192

VZV… ………………………………………… 56

エピゲノム… ……………………………… 203
オーダーメイド医療………………………… 47
オフターゲット効果………………………… 88

か行
概日時計… …………………………………… 79

RT-PCR… ……………………… 34, 124, 142

概日リズム… ………………………………… 79

RT 反応……………………………………… 132

外部コントロール用……………………… 152
核酸アナログ……………………………… 122

S〜T

和 文

SAA… ……………………………………… 126

あ行

がん遺伝子… ………………………………… 97

アクセプター………………………………… 18

環境 DNA…………………………………… 102

アデニン… …………………………………… 8

関節リウマチ……………………………… 128

アニーリング……………………… 10, 13, 38

感度… ……………………………………… 184

アポトーシス………………………… 149, 150

感度試験… …………………………………… 64

アレル識別… ………………………………… 49

がん抑制遺伝子……………………………… 97

アレル特異的プライマー… ……………… 97

偽陰性… ………………………… 25, 183, 190

アレル特異的ブロッカー… ……………… 97

希釈系列… ………………………… 23, 44, 128

鋳型 DNA……………………………………… 20

基準サンプル………………………… 42, 199

閾値… ………………………………………… 20

機能性 miRNA… ………………………… 131

一塩基多型… ………………………………… 47

逆転写… ……………………………………… 33

遺伝子欠失… ……………………………… 228

逆転写酵素… ………………………………… 33

SARS-CoV-2……………………………… 184
sc-ddPCR… ……………………………… 283
siDirect 2.0…………………………………… 91
siRNA… ……………………………………… 88
SITH-1……………………………………… 149
slicer 活性… ……………………………… 258
SNP… ……………………………… 47, 77, 184
SNP ジェノタイピング… ……………… 111
SYBR® Green… ………………… 16, 46, 75
TAMRA… …………………………………… 49
TaqMan® Array Cards…………… 111, 141®

TaqMan Copy Number Reference
Assays…………………………………… 198

INDEX

PrimerQuest™… …………………………… 55

がん… ………………………………… 66, 203

眼感染症… ………………………………… 172

遺伝子重複… ……………………………… 228297

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逆転写反応… ……………………………… 132

シミュレーション解析… ………………… 87

段階希釈… …………………………… 179, 239

キャリブレーター…………………………… 30

重症複合免疫不全症……………………… 288

チミン… ……………………………………… 8

キャリブレーターサンプル… ………… 234

周辺配列… …………………………………… 58

中枢時計… …………………………………… 79

嗅球… ……………………………………… 149

出生前診断… ……………………………… 290

定量… ………………………………………… 22

偽陽性… ……………………… 182, 177, 190

循環腫瘍 DNA… …………………… 97, 244

定量ストリップ……………………… 172, 179

グアニン… …………………………………… 8

消光… …………………………………… 19, 59

デオキシチミジン…………………………… 34

クエンチャー……………… 19, 48, 185, 229

新型コロナウイルス………… 164, 183, 184

デオキシリボ核酸…………………………… 8

クローン性造血…………………………… 248

シングルセルドロップレットデジタル
PCR… …………………………………… 283

デジタル PCR……………………………… 217

クロスプライマーダイマー… …………… 61
蛍光共鳴エネルギー転移… ……………… 18
蛍光色素… ………………………………… 185
蛍光物質… …………………………………… 15
下水疫学調査……………………………… 164
ゲノムアノテーション… ……………… 192
ゲノムワイド関連解析… ……………… 191
原発性免疫不全症………………………… 283
検量線… ……………21, 24, 44, 78, 148, 275
検量線法… …………………………………… 42
抗ウイルス応答……………………………… 88
交差反応試験………………………………… 65
高集積リアルタイム PCR… …………… 122
国際 HapMap プロジェクト… …………… 47
コピー数… …………………………………… 33
コピー数多型解析……… 198, 221, 228, 244
混合感染… ………………………………… 172
コンタミネーション… … 39, 46, 75, 100, 104, 179, 190, 241
コントロールサンプル… ………………… 42

さ行

神経芽腫… ………………………………… 251
伸長反応… …………………………………… 13
睡眠… ………………………………………… 79
スーパーエンハンサー… ………… 138, 262
数理モデル… ………………………………… 87
スタンダードサンプル… …………… 23, 42
ステム・ループ RT プライマー… ……… 36
ステム・ループ構造………………………… 36
スパイクタンパク質……………………… 184
スメア… …………………………………… 281
正規化… …………………………………… 158
生態系… …………………………………… 102
生物分布… ………………………………… 102
摂食… ………………………………………… 79
絶対定量… ………………… 25, 42, 221, 275
セルフダイマー……………………………… 61
全ゲノムシークエンス… ……………… 191
相対定量法… …………………………… 26, 42
増幅曲線… …………………………………… 20
相分離… …………………………………… 139
相補的 DNA… ……………………………… 33

再現性研究… ……………………………… 191

相補的配列… ………………………………… 10細胞外核酸… ………………………………… 40

阻害物質… ………………………………… 105

参照アッセイ………………………………… 97

た行

シード領域… ………………………………… 88
視交叉上核… ………………………………… 79
指数関数… ……………………………… 20, 22
次世代シークエンサー… ……………… 111
持続感染… ………………………………… 172
疾患感受性… ……………………………… 198
シトシン… …………………………………… 8298

ターゲット RNA シークエンス解析… …………………………………… 111, 122
ターゲット遺伝子…………………………… 25

デジタルデータ…………………………… 218
デジタルドロップレット PCR………… 244
転写産物… …………………………………… 33
ドキシサイクリン………………………… 259
特異性… …………………………………… 218
特異的プローブ……………………………… 49
特異度… …………………………………… 185
ドナー… ……………………………………… 18
ドライチェック……………………………… 76
ドライバー変異……………………………… 97
ドロップレット……………………… 218, 258

な行
内在性コントロール………42, 118, 124, 263
難治性遺伝性疾患………………………… 283
二次元プロット…………………………… 241
二次構造… …………………………… 76, 276
尿沈渣細胞診……………………………… 235
ヌクレアーゼ……………………………… 183
ヌクレオチド………………………………… 8
ネガティブコントロール… ……………… 89
熱耐性菌… …………………………………… 14
熱変性… ………………………………… 10, 13
濃縮操作… ………………………………… 164
ノーザンブロッティング… …………… 124
ノロウイルス……………………………… 171

は行

対照領域… ………………………………… 274

ハーディー・ワインベルグ平衡… …… 196

対立遺伝子… ……………………………… 224

バイオマーカー………… 101, 111, 249, 264

ダイレクトシークエンス… …………… 235

バイサルファイトシークエンス… …… 272

リアルタイム・デジタル PCR 実験スタンダード

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標準サンプル………………………… 78, 275

メチル化… …………………………… 203, 265

ハイブリダイゼーション… ……………… 15

標的配列… …………………………………… 56メラノーマ… ………………………………… 97

倍率… ………………………………………… 44

フィードバック制御………………………… 79

網羅的検査… ……………………………… 172

ハウスキーピング遺伝子… ………………………… 27, 124, 158, 280

フィッシャーの正確確率検定… ……… 196

薬物応答性… ……………………………… 198

フォワードプライマー… ………………… 39

野生生物調査……………………………… 102

プライマー… ……………………… 11, 17, 229

融解曲線… ………………………… 16, 78, 204

プライマーダイマー………………………… 76

油中水滴型… ……………………………… 274

プラトー現象………………………………… 22

ユニバーサルプライマー… ……………… 37

プローブ… …………………………… 17, 229

予後マーカー……………………………… 264

プローブ法… ………………………………… 75

ランダムプライマー………………………… 35

プロセスコントロール… ……………… 164

リアルタイム MSP… …………………… 203

分子バーコード…………………………… 244

リキッドバイオプシー… ………… 271, 274

変異アッセイ………………………………… 97

リバースプライマー………………………… 39

変異株… …………………………………… 184

リファレンス遺伝子………………………… 27

パスウェイ解析…………………………… 111
発現位相… …………………………………… 86
パッシブリファレンス… ……………… 142
パラバイオーシス………………………… 156
バリアント… ……………………………… 191
伴侶動物… ………………………………… 235
比較 Ct 法……………………………………… 28
微細孔分配方式…………………………… 218
微細分画… ………………………………… 217
微小残存病変……………………………… 251
非特異的増幅………………………………… 56
非特異的反応………………………………… 76
非特異的プローブ…………………………… 49
ヒトゲノム計画……………………………… 47
標準参照… ………………………………… 274

ま・や・ら行

INDEX

バイサルファイト変換… ……………… 265

リボ核酸… …………………………………… 8
臨床検査… ………………………………… 264

マイクロ RNA… …………………………… 36

レアバリアント……………… 192, 221, 235

マウス ES 細胞… …………………… 138, 259

励起… ………………………………………… 16

マルチプレックス PCR… ……… 54, 76, 229

老化… ……………………………………… 151299

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