"IO2ESOURCE NOW  6OL  䎲䏆䏗䏒䏅䏈䏕䎃䎕䎓䎓䎙#HN3DRNTQBDMNV6OL .Oをお届けします#HN3DRNTQBDMNV
■ リソース関連イベント情報【 2 】こんなに豊富な保存・提供リソースがあります。

■ リソースセンター紹介 No.12・‫ٻ‬ᐂᓏȷȗȩǹȟȉșǯǿȸƷᢡˡ᝻เ‫׎‬ᇌᢡˡ‫ܖ‬ᄂᆮ৑ኒወဃཋᄂᆮǻȳǿȸҾఋဃཋᢡˡᄂᆮܴ૙੉ʶங‫ܨ‬χ

非病原性の系統です。そのため、どの株も組換えDNA実験に使用が可能

ここで公開し分譲しているリソースは、すべて大腸菌 K12株由来のです。また、大半の系統は非組換え体です。本リソースは、大きく３つに■ じょうほう通信 No.18・blogのサイト更新通知サービスについて別れされます。

ẮỉἝἷὊἋἾἑὊỉἒỸὅἿὊἛέ 3')ἧỳỶἽKWWSZZZVKLJHQQLJDFMSVKLJHQQHZVQHZVMVS●大腸菌の変異系統リソース●

クローン化遺伝子リソース●

クローニングベクターと宿主リソース
まず、 大腸菌の変異系統リソースですが、これにはこれまで多くの大腸菌

0$42ᄢ⣺⩶KWWSVKLJHQODEQLJDFMSHFROLVWUDLQἢỶỼἼἏὊἋऴ‫إ‬ỊˌɦỉἇỶἚẦỤắᚁỆễủộẴẇ

研究者が作成してきた代謝関係、 DNA

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複製関係、さらにタンパク合成などの遺伝子変異株があります。これに6+,*(1‫ޓ‬KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSLQGH[MDKWP

加えて、 大腸菌ゲノム配列の決定後に体系的に作成された網羅的な遺:*5‫ޓޓ‬KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSZJU

伝子破壊変異系統が収集されました。遺伝子破壊変異系統には以下の3-*5KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSZJUMJUMJU8UO/LVWMVS

種類があります。
トランスポゾン挿入変異株；トランスポゾンの挿入による遺伝子の破壊株
で、挿入後も増殖可能な系統。トランスポゾンの挿入部位がゲノム配列

リソース関連イベント情報の上で確認できた6492株が公開されている。
12月 6日（水）〜8日（金）：[日本分子生物学会2006フォーラム ] 会場：名古屋国際会議場
NBRPパネル展示予定 http://www.aeplan.co.jp/mbsj2006forum/

広域染色体欠失変異株；大腸菌の広範囲な染色体領域を除いた、いわゆる欠失変異株。最終的に、本来の染色体の29.7％、1.4Mbpを欠失させた変化株を含む、124株を公開している。

※ 詳細はこちらからご覧になれます http://www.nbrp.jp/

KEIOコレクション； 大腸菌の遺伝子を、カナマイシン耐性遺伝子で置き換えることにより遺伝子破壊を行い、そのうち増殖可能な3840変異株を提供中。

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次に、クローン化遺伝子リソースとしては、 ベクタープラスミドの性ᄢ⣺⩶࡮ࡊ࡜ࠬࡒ࠼ࡌࠢ࠲࡯ߩㆮવ⾗Ḯ状が異なる２つの網羅的クローンライブラリーを分譲しています。
ASKAクローン； 高コピー数ベクターに個々の遺伝子をクローニングしたऴ‫إ‬ȷǷǹȆȠᄂᆮೞನ‫׎‬ᇌᢡˡ‫ܖ‬ᄂᆮ৑ኒወဃཋᄂᆮǻȳǿȸҾఋဃཋᄂᆮܴ૙੉ʶங‫ܨ‬χもの。Hisタグ付きの遺伝子産物として発現する。
可動性プラスミド（Mobile Plasmid)クローン； 低コピー数のベクターに遺伝子をクローニングしており、ベクター自体に可動性領域に関する遺伝子をもっているため、細胞同士を混ぜ合わせるだけで目的とする細胞【 1 】大腸菌リソースは30年にわたる活動を続けています。

へプラスミドを移すことができる。

国立遺伝学研究所は1976年に大腸菌、枯草菌、サルモネラ菌、およ最後のクローニングベクターと宿主リソースでは、それぞれ465種類びそれらに感染するファージとプラスミドの特性開発と保存事業を行うたのクローニングベクターと83株の宿主大腸菌を公開しています。 ベクタ

めに微生物保存研究室を設置しました。約１万５千系統に達する変異系

ーは大腸菌用です。ここのベクターにはプラスミドの系統や選択マーカ

統の保存と分譲事業は国内外の研究者から高い評価を受けていました。

ーに関する情報とともに、プラスミドの地図も参照できるようになってい1997年に現在の系統生物研究センター、 原核生物遺伝研究室へと改組ます。これらの情報は冊子としても提供を行っていますので、 必要な方され、さらに2002年7月からはナショナルバイオリソースプロジェクトはクローニングベクターのホームページから注文してください。

(NBRP) 大腸菌の中核機関としてその活動を広げています。それから30年たった現在では2万3千系統を越す厳選された大腸菌の遺伝資源を提供

NBRP大腸菌のホームページでさらに情報を提供しております。

しています。ここまでの発展と整備は当初からこの事業に携わってきた西このリソースの特性を踏まえ、みなさんの研究にお役立てください。

村昭子博士のご尽力によるものです。その貢献には大腸菌研究者のみならず、これまで分譲の寄与に預かった多くの研究者が感謝しております。2005年3月に西村博士の退職された後も、そのまま本事業は引き続いています。今年度からは、 安田成一博士が行っていたクローニング・ベ
クターコレクション事業を安田博士の退職に伴い、NBRP大腸菌事業が引き継ぎました。これにさらにより多くの研究に貢献できる事業に発展しています。

(クローニングベクターのホームページ掲載情報)(1994年発行の保存・分譲系統株リストをまとめた冊子)

"IO2ESOURCE NOW  6OL  【 3 】基礎研究向けに、国内外へ分譲しています。

ơǐƏǄƏᡫ̮連載(18)

ここで紹介している大腸菌のリソースは、国内外を問わず、基礎研究ЎᲭЎ ³EORJߩ ࠨ ࠗ ࠻ ᦝ ᣂ ㅢ ⍮ࠨ ࡯ ࡆ ࠬ ߦ ߟ ޿ ߡ´者に広く提供しています。後に述べますように、一部のリソースは寄託提供機関（開発元）の知財担当者から、提供の許諾を得る必要がありますが、これ以外のものは、提供依頼があれば、すみやかに分譲をおこなってお2006年9月現在、少なくとも月に1度ブログに記事を書いたことのあるアクティブユーザの数は、170万人以上にも上っています(※)。そのため、これをご覧になっている方の中にも、ブログを利用して情報を発信している人もいるのではないでしょうか。ほとんどのブログには、サイトの更新情報を記した“RSSフィード”というものが用意されていますが、みなさんはこれを活用していますか？
今回は、Ask.jp, Google, Yahoo!などの検索サイトにRSSを利用して自分のサイトの更新情報を通知することによって、 いち早く検索結果に反映させるための方法をお伝えします。

ります。提供依頼者は、分譲した大腸菌株の受け取りを確認の後、同封しましたMTA（Material Transfer Agreement, 生物遺伝資源提供同意書）の書類に記入の上、国立遺伝学研究所へ送り返していただきます。MTAでは、 署名もしくは捺印をお願いしております。その中で機関長に関して、大学、大学院の場合は学部長、研究科長、研究所の場合は所長を想定しています。すでに知的所有権に関する担当者がいる場合は、担当者の署名捺印をお願いします。現在は、NBRP事業として支援を受けているため、特に分譲にかかる費用は請求しておりません。が、原則的に送料のみ負担をお願いしており、着払いで発送しています。

まずAsk.jpについてですが、 Ask.jp
ではPING(更新受付）サーバのアドレス(http://ping.ask.jp/xmlrpc.m)を公開しています。 ほとんどのブログサービスにはPING送信機能が備わっていて、 PINGサー バ に 更 新 通 知 を することによって、Ask.jpの検索に5分以内に反映させることが出来ます。

通常の提供依頼の流れ

図：Ask.jp

次に、Googleでは手動またはAPIを利用して、Googleにブログ の 更 新 を 通 知 す る サ ー ビ ス が ありま す 。手 動 の 場 合 は
http://blogsearch.google.co.jp/ping のページに移動して、自分のブログのアドレスまたはフィードアドレスを入力し “ブログ送信ボタン”を押せば完了です。その後、Googleはブログ検索の更新通知情報を全世界に公開してくれます。

さて、公開中のリソースのうち、KEIOコレクションとASKAクローンは、寄託者である奈良先端科学技術大学院大学の知的財産権の保護のため、その提供に当たっては寄託者の事前の承諾を必要とします。これらのリソースの分譲を依頼はホームページから受け付けていますが、受付の確認メールとともに寄託同意書とMTAが送付されます。 寄託同意書とMTAを記入し署名捺印したものを、寄託同意書は奈良先端科学技術大学院大学

図：Googleの知的財産権担当者へ、 MTAは国立遺伝学研究所の知的財産権担当者へお送りください。この2点の書類が揃いますと、分譲が行われます。や

最後にYahoo!は、“Site Explorer”(http://siteexplorer.search.yahoo.com/)というサービスを行っています。このサービスを提供しているのは米国のYahoo!なので、 米国のYahoo! IDが必要となります。まず、自分の図：Yahoo!
ブログのアドブログのアドレスを入力します。
Yaho
次に、 Yahoo!がアカウントの持ち主がサイトを管理する権限を有Yahoo!が指定するフしているのかを確認するために、Yahoo!が指定するファイルをア“Aップロードします。その後フィードアドレスを入力し、“AddFeedボタン”を押せば完了です。

や煩雑で少々時間がかかりますが、皆さんの協力をお願いします。提供
依頼の後、 寄託同意書とMTAのやりとりの状況が依頼者の皆さんへもわかるように、 ホームページでの依頼状況の確認システムを情報センターの山崎先生のお力を借り整備中です。
KEIOとASKAの菌株提供依頼の流れ

できるだけ多くのユーザに自分のブログ
これらは、できるだけ多くのユーザに自分のブログを知って有益なサービスでもらいたいというブロガーにとって、 有益なサービスであると思います。
※参
参考URI : https://www.google.com/webmasters/sitemaps/
tps://www.google.com/webmasters/sitemaps/

木村学

編集後記： 大腸大腸菌リソースプロジェクトは前任の西村昭子先生からエネルギッシュな仁木ルギッシュな仁木先生に無事引き継がれました。 ゲノムワイドの網羅的変異体の提供を変異体の提供を開始して以来分譲数が急増したそうで、うれしい悲鳴が下の階から聞こえ下の階から聞こえてきます。
そんな中、紹介記事をお寄せいただきましてありがとうございありがとうございました。
大腸菌リソースのデータベースも、PEC(Proﬁlingof E.coli Chromosome)という必須遺伝子情報を中心としたデータベースとともに世界中の多くの研究者に利用されています。(Y.Y.)

奈良先端大【 4 】研究に役立ったら、NBRP : E.coliからとお願いします。
ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)大腸菌は、世界最高水準のリソースのセンターを目指して活動を行っています。本リソースを必要とする研究者へ届けるのが私たちの役目です。その結果、みなさんの連絡先 : 〒411-8540

研究に貢献できれば、私たちの活動は報われます。

静岡県三島市谷田1111

発表の際、謝辞の中に National BioResource Project (NIG, Japan): E.coli

国立遺伝学研究所・生物遺伝資源情報総合センター

または NBRP (NIG, Japan) : E.coli と入れていただければとお願いしておTEL : 055-981-6885 (山崎)E-mail : BRnews@chanko.lab.nig.ac.jp

ります。

パソコンにURLを送信するのにお使いください。

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