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【1】事業の沿革と概要■ リソース関連イベント情報■ リソースセンター紹介

No.3

理化学研究所バイオリソースセンター（理研BRC）実験植物開発室は、・理化学研究所バイオリソースセンター

我が国におけるモデル植物のリソース事業を推進するため2001年に理化

シロイヌナズナを中心とした植物リソース事業の概要

学研究所筑波研究所内に新たに設立されました。 設立の翌年に開始され■ じょうほう通信 連載 (9)たナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）
では「シロイヌナズナ／植・3分バイオインフォマティクス

物培養細胞・遺伝子」の課題の中核機関となり、 代表的なモデル実験植物
シロイヌナズナのゲノムリソースを中心とした収集・保存・提供事業を展開

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しております。また単にリソースを提供するにとどまらずリソース関連技術の開発と普及にも取り組み、 2004年からは植物培養細胞に関わる技術研修を主催しております。

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理研BRCのリソース事業では「信頼性」、「先導性」、「継続性」の３つのキーワードを重視しておりますが、 当室のリソース事業においてはこれ

6+,*(1‫ޓ‬KWWSZZZVKLJHQQLJDFMSLQGH[MDKWPに加え「国際性」と「多様性」をモットーとしています。特に「国際性」につい:*5‫ޓޓ‬KWWSVKLJHQODEQLJDFMSZJU
-*5KWWSVKLJHQODEQLJDFMSZJUMJUMJU8UO/LVWMVSては世界のシロイヌナズナ研究ネットワークとリンクすることにより日本の貢献が世界に見えるような事業を目指しています。その結果、利用者登録を受けた1,100研究室の７割、 リソースを提供した700研究室の過半数がリソース関連イベント情報海外という実績をあげることができました。 また国内の研究者に対しては各学会での事業紹介やメイルでのリソース関連情報の提供などに力を入12月7- 9日：分子生物学会特別企画- NBRPパネル展示（12月7-9日）ヤフードーム 1F控室
- NBRPシンポジウム（12月8日) Zepp Fukuoka M会場１階Zeppホール

れ、研究コミュニティーへの事業の浸透を図ってきました。
発足から５年足らずの組織ではありますが、このように「研究者から12月7日：分子生物学会ワークショップ（W1K)「藻類：有用物質および新規遺伝子探索のための資源としての可能性」

ロイヌナズナのバイオリソース整備における貢献」に対して日本植物生

12月13日 - 15日：
「ターミナルRFLP法による腸内菌叢の解析に関する技術研修」

理学会より特別賞が授与されております。 地球温暖化や食糧不足など

3月9日：NBRPシンポジウム 東京国際フォーラム

２１世紀に人類が直面する問題の解決には植物研究の推進が欠かせま見える」活動を心掛けてきた結果、 2005年9月に実験植物開発室の「シせん。今後とも研究基盤整備を通して世界の植物研究を支え、社会に貢3月19 - 21日：植物生理学会 NBRPパネル展示など企画中献してゆきたいと考えております。

詳細はこちらからご覧になれます。http://www.nbrp.jp/index.jsp【2】保存・提供するリソースの特徴Ȫǽȸǹǻȳǿȸኰʼų1R
当室のリソースの特徴として、「ゲノムリソースを中核とすること」及び「個体、細胞、遺伝子の全てを扱っていること」をあげることができます。

理化学研究所バイオリソースセンター（理研BRC）
シロイヌナズナを中心とした植物リソース事業の概要

シロイヌナズナのゲノム塩基配列の解読終了以降、 シロイヌナズナ
研究コミュニティーは存在が予測されている遺伝子全ての機能を明らかྸ҄‫ܖ‬ᄂᆮ৑ȐǤǪȪǽȸǹǻȳǿȸ᬴ܱౡཋ᧏ႆܴܴᧈ‫ݱ‬௎ųദ୓にする大胆な目標を掲げ、日米欧を中心とした取り組みが精力的に行われています。そして目標達成の鍵を握るツールとして、 全遺伝子に対応■ 理研BRCから提供している植物材料

した完全長cDNAと破壊株（タグライン）の作成、更にはこれらゲノム情報

1 ）シロイヌナズナ種子（タグライン、変異体、野生株、近縁種など）を利用できるリソース（ゲノムリソース）のリソースセンターからの配布体

2 ）植物遺伝子（シロイヌナズナ等モデル植物の完全長cDNAなど）制が整備されてきました。 既に当室は、米国のArabidopsis Biological3 ）植物培養細胞（シロイヌナズナ等モデル植物の培養細胞株）

Resource Center (ABRC)、英国のNottingham Arabidopsis Resource
Centerと並びこれらゲノムリソースを世界に配付する拠点のひとつとなっており、 特に当室が保有するRIKEN Arabidopsis Full-Length cDNA(RAFL) cloneは標準リソースとして世界の植物研究者に配布されております。 このように「シロイヌナズナのゲノムリソース」は世界戦略上重要な位置を占めておりますが、その一方ではリソースの規模が桁違いに大きいこと、信頼性を保ちつつ効率的に取扱うためのノウハウが必要であること、開発費が巨額になるため知財の取扱いに細心の注意が必要であることなど、リソースセンターにとっての課題も多いリソースです。世界写真１:
理研筑波研究所内バイオリソース棟
最上階で実験植物開発室の業務を行っています。

から注目されるリソースセンターとして引き続き活動をしていくために、

ྸᄂᵠᵰᵡᴾᴾKWWSZZZEUFULNHQMSODEHSG

これら課題を克服して寄託者・利用者双方から信頼される事業を進めていきたいと考えています。

"IO2ESOURCE NOW  6OL  またもう１つの特徴としてあげた個体、 細胞、 遺伝子の各リソース

ơǐƏǄƏᡫ̮を揃えていることは、 研究の様々なニーズに対応していくために重要な意味を持っています。 例えばタバコBY-2細胞やシロイヌナズナT87細胞

連載(9)ßȐǤǪǤȳȕǩȞȆǣǯǹĬàßȐǤǪǤȳȕǩȞȆǣǯǹà
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は標準株として世界に知られた細胞株ですが、個体では観察不可能な細胞レベルでの現象を解析するための実験系としてニーズが急速に拡大し“BLASTをインストールしてみましょう”ております。 上述の欧米のリソースセンターでも細胞まで含めた事業は生物系の研究者であれば、1度はBLASTという名前を聞いたことがある、あるいは実行したことがあると思います。この有名なプ
ログラム “ BLAST ”を自分のパソコン(今回はWindows)にインストールして実行してみませんか？

行っておらず、細胞の事業は当室の大きな特徴となっています。多様なリソースを維持することは労力もかかりますが波及効果も大きく、今後も研究支援のために努力を続けたいと考えております。
写真2 :

1

小さな個体で生活環も短く実験室の環境で生育する

C:¥Program Files（別の場所でも構いません）に、BLASTというシロイヌナズナは代表的な実験植物として世界中で名前のフォルダを作成してください。

使われています。
また様々な環境に適応した多くの野生株が世界各地から採取され、代表的な株について2は当室で保存し特性解析を進めています。作物ではftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/release/2.2.12/から時間のかかる形質転換系統の樹立もシロイヌナズナ

blast-2.2.12-ia32-win32.exeを、①で作成したBLASTフォルダの中にダウンロードして、ダブルクリックします。

では数カ月間で可能のため、最近では作物遺伝子の機能解析にも使われるようになっています。

3
BLASTフォルダの中にbin、data、docというフォルダが出来ま【3】研究者が身近に感じるリソースセンターを目指してすのでbinフォルダにパスを通して下さい。

リソースの収集・保存・提供事業はリソースセンターの最も重要な任※パスの通し方がわからない方は、是非ともGoogle等で調べて通してみてください。
今号ではあえて方法は載せません。

務です。しかしそれだけにとどまっていては、リソースが持つ重要性を最大限に引き出すことは困難です。例えばリソースに附随する情報の収集と提供、リソース取扱い技術の開発と普及、そして明日の研究を担う旬のリソースの確保がない限り、事業の効果は限られた範囲でとどまると考えています。 理研BRCではNBRPと別途に機関としてリソース関連技術の開発と研修事業による普及、更には外部機関と協力しての旬のリソースの開発を進めており、その一環として当室も植物培養細胞の取扱い技術の開発と普及、シロイヌナズナ野生株の利用に関わる技術開発、更にはアブラナ科植物のゲノムリソースの開発を進めております。特に植物培養細胞に関わる研修では培養技術に関わる基礎コースと植物細胞の形質blastall実行結果
実は、 パスを通さなくてもBLASTはすでに実行可能になって転換と凍結保存に関わる応用コースを開催し、いずれも好評を得ております。

います。 試しにコマンドプロンプト（スタート→プログラム→アクセサリ→コマンドプロンプト）を開いてください。黒い画面にbinフォルダの中のblastall.exeをドラッグアンドドロップしてEnterキー

NBRPが立ち上がりようやく我が国においても国家レベルでの研究基盤整備が進んでおりますが、まだまだ研究コミュニティーにリソースセンターの存在意義を認めていただくための努力が必要な段階にあると思を押してください。 BLAST（blastall）が実行されて様々なオプションが画面に表示されるはずです。

います。リソース関連情報を発信したり研究者からの問い合わせや質問に丁寧に対応するだけでなく、 リソースに附随した様々な事業により新パスが通ったかどうか確認したい場合は新しくコマンドプロンプトを開きblastallとタイプしてEnterキーを押してください。
同じ画面が出ればパスが通っています。
GUI（グラフィカルユーザーインターフェース）でBLASTを実行

たなリソースや技術、 情報を生み出しそれを研究コミュニティーに還元していくことで、 研究者に身近な存在としてのリソースセンターとなるよう心掛けていきたいと考えております。■

できるBlastStation(http://www.blaststation.com/ja/index.html)のようなソフトもありますので色々と試してみて下さい。坂庭 真悟

写真3 :T87細胞は代表的なシロイヌナズナの培養細胞です。
シグナル伝達研究や蛋白の局在を調べるためのツールにとどまらず、淡緑色のT87細胞は葉緑体の発達が編集後記：理研BRCの植物部門は今や植物リソース事業のモデル的存見られることから概日リズムや光合成関連の研究に在ですが、 設立してから未だ5年足らずとのこと。シロイヌナズナの研も使われています。
より多くの研究者に利用していただくため当室ではT87細胞の形質転換や凍結保存に究コミュニティには経済植物の世界とは違うフットワークの軽さがある関わる技術の開発と普及も行っています。と思いますが、それにしても小林室長の基盤整備に徹した貢献のたまものであることは確かです。
（Y.Y.)

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連絡先: 〒411-8540
マウス特集！

静岡県三島市谷田1111

国立遺伝学研究所・生物遺伝資源情報総合センターℂ⎇%5&ታ㛎േ‛㐿⊒ቶ

TEL 055-981-6885 (山崎)E-mail :BRnews@chanko.lab.nig.ac.jp※ NewsLetterに掲載されているあらゆる内容の無断転載・複製を禁じます。すべての内容は日本の著作権法、及び国際条約により保護されています。

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