BioResource Now ! Vol.8 No.10

BioResource Now !
Issue Number 8 October 2012

国内外のバイオリソースを巡る様々な問題や取り組みについて、毎月ホットな話題をこのニュースレターで紹介していきます。

リソースセンター紹介
No.42

江面浩 ( 筑波大学生命環境系 )リソース整備で加速するトマト研究

じょうほう通信
No.74

Google サービスをストレージとして使用する

お薦め Book!
No.10「知恵の樹」

P1 - 2

NewsLetter に掲載されているあらゆる内容の無断転載・複製を禁じます。すべての内容は日本の著作権法、及び国際条約により保護されています。

P2

ニュースレターのダウンロード先
URL: www.shigen.nig.ac.jp/shigen/news/

P2

リソースセンター紹介〈NO.42〉

リソース整備で加速するトマト研究第 3 期 NBRP がスタート

第 3 期ナショナルバイオリソースプ
ロジェクト (NBRP) が始まりました。
トマトは、中核機関・筑波大学（代表：江面浩）、分担機関・大阪府立大学（代表：青木考）、バックアップ機関・岡山大学（代表：久保康隆）及び東北大学（代表：金山喜則）の体制で実施し、筑波大学及び岡山大学が個体レベルリソース、大阪府立大学及び東北大学が DNA レベルリソースを担当します。今 期 は、リ ソ ー スの質の向上を目標に掲げています。
現在までに収集整備した形態変異体に新たに果実成分データを付加します。
果実成分は、果実の重要形質であり、そのため研究者コミュニティーの要望の多い形質です。これらの情報付加ができれば、リソース利用の一層の促進が期待されます。
マイクロトムの利用増加

トマト NBRP は、矮性小型品種マイクロトム（Micro-Tom）を基盤として、変異誘発系統、個別変異体及びA

完全長 cDNA クローン、BAC クローンの整備に取り組んできました。更に、NBRP 事業の中で BAC エンドシークエンス及びマイクロトムの全ゲノム配列解読に取り組み、これらの情報を順次公表しています。
こ の 間、ト マ ト 研 究 者 コ ミ ュ ニ
ティーでは、NBRP リソースを効果的に利用するための TILLING*1 プラットホームの構築や、トマトを実験植物として利用するための形質転換体作成の支援（理研植物形質転換ネットワーク）、新たなリソースとしての、トマト FOX*2 変異誘発系統開発などが行われています。トマト
NBRP は 2007 年に開始し、リソース及び関連情報の提供を行ってきました。その結果、マイクロトムを材料とした研究が世界的に活発になり、特に、2009 年以降顕著で、マイクロトムを使った論文数、被引用数とも飛躍的な増加を示しています（トムソンロイター・Web of Science）。
A

筑波大学生命環境系 教授

リソースを使った研究事例

トマト NBRP リソースを活用した果実重要形質研究の事例を２つ紹介します。１つめは、日持ち性形質の研究です（図１）。果実の日持ち性が短いと、生産、流通、消費の各段階で多くの果実が消費されずに廃棄されてしまいます。そのため、果実の日持ち性を向上させる研究が果実研究の重要テーマとして取り組まれています。NBRP リソースを最大限活用し、トマト重要形質制御遺伝子を見つけ出す TILLING 技術が開発され、果実の日持ちを制御する新規遺伝子変異が見つかりました。
こ の 遺 伝 子（変 異）が あ る と、収穫果実を室温で２ヶ月以上保存できます。今後、トマトの日持ちを制御する有用遺伝子として利用されることが期待されます。２つめは、果実の着果性の研究です（図２）。

B

B

Sletr1-2 (V69D)

江面浩

CSIETR1
WT

C

etr1-2

Sletr1-2
遺伝子保有
F1 系統

WT

育種系統

etr1-2

0 日後

D

0 日後

10 日後

E

F

60 日後

30 日後

図 1：マイクロトムの日持ち性変異体の選抜と育種素材としての性能評価
A: 新規遺伝子から作られるタンパク質の一次構造と変異の位置
B : 変異体（Sletr1-2 ）と原系統（WT）の日持ち性の比較
C: 変異体（上段）と育種系統 ( 下段 ) との F１系統果実の日持ち性比較

図２：マクロトムの単為結果性変異体の選抜
A, B, C: 変異体 ( iaa9-1, -2, -3 ) の IAA9 遺伝子変異
D: 変異体の葉の形態、E, F: 変異体の着果性
次ページへ続く

BioResource Now ! Vol.8 No.10

周年栽培が行われるトマトは、着果性が収穫量を決定する重要な形質です。
トマトの周年栽培では、冬期と夏期に花粉発達の異常により、着果率が低下し、収量減の大きな要因となっています。そのため、花粉がなくても着果する性質、単為結果性は重要な形質で、精力的に研究が行われています。トマト NBRP リソースの中から単為結果性変異体が選抜され、その原因遺伝子の研究が進んでいます。今後、単為結果 *3 の分子機構が明らかにされ、その制御技術の開発が期待されています。

ゲノム解読で益々ホットに
本年、国際コンソーシアムによりトマト詳細全ゲノム解読情報が公表され、この情報を基にリシークエンスを行ったマイクトロトム全ゲノム解読情報も直に公表されます。現在、これらの情報と次世代シークエンサーを組み合わせたトマト変異体の解析が行われており、重要形質に係わる遺伝子が次々に解明される見込みです。新しい植物育種技術として注目されている、人工ヌクレアーゼ *4を活用したゲノム編集技術の開発もトマトで始まっています。トマトをGoogle サービスをストレージとして使用する
Google ではたくさんの便利なサービスを提供しています。
BioResource now! Vol8 No.5 のじょうほう通信 No.69 で紹介しました
SkyDrive と同様のストレージ機能が Google からも提供されています。
GoogleDrive では、より直感的にドラッグ＆ドロップでファイル操作をすることができます。
使用までの手順も簡単です。

インストールする
1）下記 URL よりインストールできます。
https://www.google.com/intl/ja/drive/start/download.html
リンク先では図 1 のページが表示されます。

実を形成すること。果実は通常種なしである。

*4 DNA に特異的に結合するドメインと、DNA 切断ドメインを連結させたキメラタンパク質で、
Zinc-Finger Nuclease（ZFN),TranscriptionActivator-Like Eﬀector Nuclease (TALEN) などが使われている。２つの人工ヌクレアーゼが近接する標的配列に結合すると DNA 切断ドメインが２量体となり DNA を切断する。切断された DNAは、相同組換えあるいは非相同末端連結により修復されるが、この時に目的の遺伝子を改変することが可能となる。

じょうほう通信 [ 第 74 回 ] 10 分

スタートガイド 2 ページ目に、同期するフォルダを選択するメニューがあります。
詳細設定を開き、フォルダの場所を設定してください。
そのほかいくつか設定できる部分がありますので、必要に応じて設定を行ってください。( 図 4)
同期を開始ボタン
図 4．詳細設定画面

図 1．ダウンロードページ

同意してインストール

Google アカウントにログインする
インストール完了後、Google ページへ行き ログインすると、新しくドライブメニューが追加され、サービスを利用することができます( 図 5)。

図 5．ドライブの利用画面

ドライブサービスでは先にも述べたように、ドラッグ＆ドロップでファイルをアップロード・ダウンロードすることができます。
是非一度、利用してみてください。
（相場 厚輝 )GoogleDrive について重要な注意事項
利用規約を理解して頂きたいのですが、簡潔に言えば、アップロードしたデータの機密性が守られない可能性があるということです。機密性の高いデータを取り扱っている場合は十分に気を付けてください。

図 3．スタートガイド

お薦め Book！〈NO.10〉「知恵の樹」*1 Targeting Induced Local Lesions IN Genomesのことで、ゲノムや遺伝子上の遺伝子置換を検出する方法。塩基対を形成できない変異点を特異的に切断する事により、野生型と異なる塩基の位置を知る方法である。
*2 FOX は Full-length cDNA Over-eXpressing のこと。
目的の遺伝子を過剰に発現させることによって生じる変異。
*3 受精が行われずに子房壁や花床が肥大して果“同期を開始ボタン” を押せば、インストール完了です。

2）今回は Windows 版をダウンロードしてみます。ダウンロードボタンを押すと、ページが移動します。移動先では、利用規約が表示されるので、熟読し同意した上でインストールボタンを押し
図 2．利用規約てください ( 図 2)。
3）同意し、インストールボタンを押すと、アカウント情報を入力するフォームが表示されるので、ログインしてください。
4）ログインが完了すると、スタートガイドが表示されます。( 図 3)

研究材料とした研究が益々ホットになってきました。■

Contact Address

H. マトゥラーナ、F. バレーラ 著

菅 啓次郎訳（ちくま学芸文庫、1997 年）
この本は、オートポイエーシス（自己創出）概念を提唱したチリの二人の生物学者による「認識の生物学」の試みだとある（訳者あとがきより）。ただし、ふつうの生物学とは異なり、DNA や遺伝子にはほとんど触れることなく、むしろ自律的システムとしての細胞に注目する。細胞は、自分自身の力によって立ち上がり、自分自身のダイナミックスによって環境から区別され、自身の境界（膜）を作りだす。境界によって区切られたシステムを単体と呼べば、細胞は典型的なオートポイエーシス単体だという。これは細胞とその働きに基礎をおく一種の有機体論であって、DNA の遺伝情報やタンパク質の機能に基礎をおく分子生物学の機械論的理解とは対照的である。たとえば「遺伝」という現象は、歴史的に連結された単体群において、なんらかの構造的特徴が世代を超えて維持されてゆくこと、とされる。また生物の進化はナチュラル・ドリフトとして捉えられ、適応（生物と環境との正常な相互作用）と淘汰（同破壊的相互作用）はよいが、「自然選択」は観察者の主観的解釈にすぎないとされる。さらに考察の対象は、神経システム、認識、言語にまで及ぶ。
全体に親しみやすく平易な文章で書かれているが、内容は何やら古代の賢人が語る深淵な「知恵」のようでもある。既成の学問にとらわれることなく、生命現象を根本から問い直してみたいという向きにはお薦めの書。(K.N.)

連絡先 〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
国立遺伝学研究所 生物遺伝資源センター
TEL 055-981-6885 ( 山崎 ) E-mail：brnews@shigen.info

Editor's Note
トマトは本ニュースレター Vol.3(No.1) でも一度ご紹介しましたが、今年は全ゲノム配列が解読され、トマト研究者にとって記念すべき年になりました。
日本の研究者が大きく貢献をしていることも注目に値します。
今後トマト研究の発展が加速することは間違いなく、リソースのニーズがますます高まることでしょう。（Y.Y.)

バイオリソース情報(NBRP) www.nbrp.jp/(SHIGEN) www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm(WGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/(JGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp

BioResource Now !

Issue Number 8 October 2012