BioResource Now ! Vol.7 No.11

BioResource Now !
Issue Number 7 November 2011

国内外のバイオリソースを巡る様々な問題や取り組みについて、毎月ホットな話題をこのニュースレターで紹介していきます。

三谷昌平 ( 東京女子医科大学医学部 教授 )リソースセンター紹介
No.38

ナショナルバイオリソースプロジェクト線虫

じょうほう通信No.63

Microsoft Oﬃce Smart Art 機能

P1 - 2
P2

NewsLetter に掲載されているあらゆる内容の無断転載・複製を禁じます。
すべての内容は日本の著作権法、及び国際条約により保護されています。

リソースセンター紹介〈NO.38〉

ナショナルバイオリソースプロジェクト 線虫
東京女子医科大学医学部 教授 三谷昌平

早いもので、線虫のナショナルバイオリソースプロジェクト中核機関業務を始めてから既に 10 年目になっている。線虫
C. elegans の 研 究 の 歴 史 は、S. Brenner
博士が英国ケンブリッジで線虫を用いた研究を始めた、1960 年代であったと思われるので、10 年間という期間はそろそろ無視できない長さになってきた。その間、我々は、東京女子医科大学医学部に、ナショナルバイオリソースプロジェクト中核機関として、「線虫」を収集・保存・提供を継続してきたが、変異体リソースを用いた研究論文発表は、着実に増えている。このことは、開始当初からここまで順調に進んで来たことが不思議な気持ちさえ感じる。というのは、新しい技術を追加することは、多少は行ってきたが、「欠失 変 異 体 を 収 集・保 存・提 供」す る 枠 組みとしては大きな変更は行ってこなかったからである。科学の分野で同じことを長年繰り返して、生産性が維持できることが驚きであると感じている。多くの方のご理解とご支援の賜物であろう。
このような業務を実施するにあたり、
日 本 の NBRP と 世 界 の 研 究 者 コ ミ ュ ニティーの関係が、より良く機能する仕組み作りは大切であると思う。そのためには、まず、線虫研究者に NBRP という活動を知っていただく必要がある。線虫を使って研究する場合、研究者は、ほぼ必ず WormBase（http://www.wormbase.org/）という統合データベースを使用している。そこには、遺伝子毎の過去の情報のアーカイブが蓄積されており（遺伝子以外の情報も大量に入っている）、知られていることなら何でも検索で き る よ う な 形 に な っ て い る。我 々 は、
WormBase チームからの要請を受けて、ここに NBRP のデータのコピーを送付することにしている（実際には、WormBase の変異体部門のキュレーターが在籍している
Sanger センターに線虫 NBRP 用のページが用意されており、そこにデータをアップロードしている）。WormBase は、多くの情報を収集しているため、ある時点で集まっているデータの全てについて、形式を整えて、新しいバージョンに組み込むには2〜3 ヶ月を要する。しかし、誰でも見ていることを考えると、意味は大きい。例えば、自分が興味のある遺伝子を検索すると、最初の画面に遺伝子構造が描出されるが、そこに、欠失変異体の欠失領域が出て来るのである（図１）。誰でも、遺伝子について知りたい場合、その遺伝子の機能喪失の表現型情報は大切な研究の糸口になるし、しばしば変異体を取り寄せてみたいと思うようになる。

図１：欠失変異体の欠失領域(○印の中)と遺伝子構造（ ）ところで、バイオリソースというのは、他の研究者が出したデータも重要だが、現物がないと実験にはならないのである。すなわち、ここから NBRP のウェブサイト（http://shigen.lab.nig.ac.jp/c.elegans/）へ誘導することになる。変異体が表示されている場合、WormBase の変異体アリルへのリンクをクリックすると、元情報を知ること が で き る。NBRP の ウ ェ ブ サ イ ト とWormBase のウェブサイトの、相互にリンクを貼ってもらうことで、WormBase を見ていて変異体に気づいた研究者を、NBRPホームページに誘導する仕組みが出来たのである（図 2）。

図２：NBRPのサイトからWormbaseへリンク

一方で、NBRP のデータベースにも、遺伝研のサーバに NBRP 専用のページがあ り、こ こ で、中 核 機 関 か ら 新 し い デ ータを随時アップロードできるようになっている。こちらは、即座に公開されるので、中核機関が新しい変異体を、NBRP サイトと WormBase サイトの両方に同時に公開するのであるが、実際に研究者が検索等で見ることができるのは、2〜3 ヶ月の時間差 が 生 じ る の で あ る。従 っ て、何 度 かNBRP ウェブサイトにアクセスして、公開の時間差を学習すると、多くの研究者はNBRP ウェブサイトにブックマークを付けるなどして、最初から頻繁にアクセスするようになる。そうする方が欲しい変異体に早く気づく可能性が高いからである。また、
我々は、500 変異体／年程度のペースで欠失 変 異 体 を 収 集・保 存 し て い る。も し、WormBase に変異体が見つからなかった
場合、上記のようなサイトを良く理解するに至った研究者は自分で欲しい変異体をスクリーニングリクエストにエントリーすることができる。こうすると、時々は、興味のある変異体が分離・公開されるのを楽しみに、NBRP のウェブサイトにアクセスして、遺伝子名で検索するという習慣ができてくる。新しい変異体を公開すると、比較的短期間でこのような変異体の分譲依頼が中核機関宛に届くことがあり、このような使われ方がされていると想像されるのである。

新しい変異体をいち早く入手して、知りたい遺伝子機能を少しでも早く解明することは研究者にとって重要な意味がある。
一方で、線虫を用いて新しい化合物の解析を行いたいというニーズもあるに違いない、と我々は考えている。線虫はモデル生物として基本的な記載が充実しており、半世紀間使われてきた。これらの情報をベースに、RNAi、変異体、トランスジェニック体などを使用することで、遺伝子機能もかなり分かるようになってきた。次は何だろう？と思うのである。
次ページへ続く

BioResource Now ! Vol.7 No.11

線虫は、96 穴プレートで液体培養が可能なので、スクリーニングも行うことができると予想される。線虫について、蓄積された遺伝情報に加えて、多くの化合物の作用を調べるツールになってくれることを期待している。単に新しい変異体で新しい遺伝子機能を解析し、データを蓄積するだけでなく、新しい化合物の作用の解析ツールとしても NBRP 線虫が多少の貢献でもできれば幸いである。■

我々は、欠失変異体の分離、表現型の解析を 行 い、面 白 い 遺 伝 子 変 異 体（acs - 20）
を 見 出 し た（E. Kage-Nakadai et al., PloSOne, 2010）（図 1〜図 3）。この変異体は、小分子化合物の線虫内への滲み込みが亢進している。表皮のバリアーを形成する脂質の合成に問題が起こっているようである。
標準的な飼育をする限り、それ以外の重篤な表現型はでないので、知りたい表現型がacs - 20 変異体バックグラウンドで変化するかどうかを解析することができるようになると期待される。この変異体は、論文を発表した後、多くの研究室から分譲依頼が来るようになった。

図3：遺伝子変異体（acs - 20）

Microsoft Oﬃce Smart Art 機能
資料を作る際に、「図を使って説明したいけど、図形を張り付けて線で繋げるなどの作業が煩わしい」と感じた事がある方は多いと思います。
今 回 は、そ ん な 時 に 役 に 立 つ、PowerPoint / Exce l / Word (Windows 版
Microsoft Oﬃce2007 以降・Mac 版 Microsoft Oﬃce2008 以降 ) を使用し、簡単に手順や階層構造などの図形を作成できる Smart Art（スマートアート）を紹介します。

じょうほう通信

メニューバーのデザインタブから他のレイアウトを選択する事で、記載した内容を変更せずに、図形のレイアウトのみを変更することもできます。
（図 4）

図 4：レイアウトの変更

まず、PowerPoint / Excel / Word を開き、メニューバーの挿入タブから Smart Art（図 1-Ａ）を選択します。すると、図 1 の Smart Art
グラフィックの選択ダイアログが表示されるので、作成したいテンプレートを選択します。

Smart Art に つ い て 解 説 し ま し た が、Microsoft Oﬃce2010 以 降 のPowerPoint / Excel / Word では、これまであまり無かった画像を付けられるテンプレートなどが、50 以上追加されました。

Ａ

図 1：図形の選択
選択したテンプレート図形内（図 2-Ａ） Bで直接テキスト編集したり、またはテキストウィンドウ（図 2-Ｂ）からテキストの入力ボックス（図 2-C）が表示されるので、記載内容を編集する事ができます。

ＡC

図 2：テキストの編集

BＡ
図 3：要素の削除[ テキスト ] を削除
し た 事 で、図 形 の表示が調節される。

お 知らせ10 分

他の図形に変更したいと思った場合は・・？

Smart Art で図形を作成しよう

また、図形に表示される要素を減らす
場合や追加する場合には、テキストの入力ボックスの要素（図 3-Ａ）を削除 (Delete Key)・追加 (Enter Key) する
事で図形の要素数を変更することができます。要素を変更した際には、図形の位置が自動調節されます。（図 3-B）

[ 第 63 回 ]ま た、Windows 版 Microsoft Oﬃce2007 の み 対 象 と な り ま す が、Microsoft Oﬃce サイトから Microsoft Oﬃce2010 の一部の Smart Art
テンプレートをダウンロードして追加する事ができます。
追加方法は、下記 URL の Microsoft Oﬃce サイト（英語）からダウンロードしたいテンプレートを選択し、詳細画面のダウンロードボタンを選択します。
ダウンロード URL：
http://oﬃce.microsoft.com/en-us/templates/CL101829681.aspx?CTT=5&origin=HA010211779※Internet Explorer 以外のブラウザをお使いの方は、ダウンロードしたファイルを解凍し [~.glox] のファイルを [C:\Users\ ユーザ名
\AppData\Roaming\Microsoft\Templates\SmartArt Graphics]（Windows7 の場合）に移動して下さい。
これで追加は完了です。PowerPoint / Excel / Word の Smart Art に追加したテンプレートが表示されます。（日本語サイトからもダウンロード可能ですが、対象のテンプレートは英語に比べて少ないです。）
リスト・手順・循環図・階層構造・集合関係・マトリックス・ピラミッドなどにカテゴリ分けされた色々な図形が用意されているので、資料を作る際に使ってみてはいかがでしょうか。
（渡辺拓貴）

詳細は http://www.nbrp.jp/ からご覧になれます

第 34 回日本分子生物学会年会
NBRP 実物つきパネル展示：「バイオリソース勢ぞろい」
日程：2011 年 12 月 13 日 ( 火 ) - 12 月 16 日 ( 金 )9:00 - 17:00 ( 最終日は 14:00 まで )会場：第 34 回日本分子生物学会年会 ポスター・展示会場
NBRP コーナー（パシフィコ横浜 展示ホール）

バ イ オリソ ー ス 情 報(NBRP) www.nbrp.jp/(SHIGEN) www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm(WGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/(JGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp

BioResource Now !
Issue Number 7 November 2011

ニュースレターのダウンロード先
URL: www.shigen.nig.ac.jp/shigen/news/
Contact Address
連絡先 〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
TEL055-981-6885 ( 山崎 )E-mail brnews@chanko.lab.nig.ac.jp
Editor's Note三谷先生は「不思議な気持ち」と表現されましたが、時期を得た質の高いリソースと、成熟した研究者コミュニティとが一緒に育て上げたスーパーモデル生物ならではの成果と言えるでしょう。この 10 年間で三谷先生が分離・提供されたリソースは 4400 種類、それを使って 600 報もの論文が発表されているのですから先生の貢献度はすごいですね。さらに分離したリソースの中から、時期のスーパーリソース候補も見つけられている様子。
スーパーモデル生物としての線虫の地位は揺らぎそうにないですね。（Y.Y.)