23 DDrare − 難病の開発薬物と標的遺伝⼦・パスウェイのデータベース −○坂⼿⿓⼀1、深川明⼦2、⽔⼝賢司2、鍵井英之3、佐々⽊隆之3、森⽥正実3 、⽊村友則1
1. 国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所
2. 国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所
3. ⽇本製薬⼯業協会 医薬産業政策研究所

難治性疾患研究開発・⽀援センター
AI健康・医薬研究センター

DDrare（ディーディーレア；Database of Drug Development for

発薬物情報（DrugBank等）と標的遺伝⼦・パスウェイ情報（KEGG）

Rare Diseases；難病・希少疾患創薬データベース）1)は、厚⽣労働省等をつなぐことで、創薬標的の探索に有⽤なデータベースとなることの指定難病を対象とする臨床試験データから抽出した開発薬物と、そを⽬的としている。

れらの標的遺伝⼦・パスウェイの情報を提供している2)。DDrareは医薬基盤・健康・栄養研究所と医薬産業政策研究所との共同研究で開発

1) DDrare：https://ddrare.nibiohn.go.jp

され、改良を重ねている。疾患名と薬物名の同義語等の拡充や解析⼿

2) 「指定難病のデータベース“DDrare”の紹介」政策研ニュース法の改良により、2020年7⽉時点で、226疾患について、15,194件のNo.54 2018.7

臨床試験、1,666薬物、551遺伝⼦、275パスウェイの情報を提供している。DDrareは疾患横断的な情報探索が可能である。例えば、ドラッグ・リポジショニングについては、2001年以降の臨床試験で、のべ12,153薬物、5,570疾患ペアで試みられていた。DDrareは、難病の開Licensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス©2020 坂⼿⿓⼀（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）

1. DDrare（ﾃﾞｨｰﾃﾞｨｰﾚｱ）とはDDrare サイトマップ：Disease（疾患リスト）からのページ遷移
・英語版公開・全データ更新・臨床試験データ、オントロジー（疾患名、薬剤名）の拡充
・全体検索、並べ替え、ダウンロード機能等（開発進⾏中）国の指定難病を対象とする臨床試験（⽇⽶欧中）データの解析により、開発薬物、標的遺伝⼦・パスウェイの情報を紐づけている。

⽇⽶欧中の指定難病の臨床試験における開発薬物数
Licensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス ©2020 坂⼿⿓⼀（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）

2. DDrare更新（2020年3⽉公開版）■ テキストマイニング⼿法の改善■ 更新情報2020 年 3 ⽉ 公 開 版 は 、 2019 年 11 ⽉ 取 得 デ ー タ ： 臨 床 試 験 （ WHO ） 、 薬 物（DrugBank）、遺伝⼦／パスウェイ（KEGG）にもとづく。６⽉に英語版を公開

疾患名の拡充（同義語、細分名の追加：計1,294疾患名）、薬物名の拡充（製品名の追加、⽇本語検索の実装）、臨床試験データのテキストマイニング⼿法の改し、システム改良（検索、並べ替え、ダウンロード機能等）が進⾏中。

善等により、網羅性、正確性を向上させている。
1. 疾患名告⽰
指定難病名（含：細分名、同義語） 英名（含：細分名、同義語）
番号
Spinal and bulbar muscular atrophy;Spinobulbar muscular
1 球脊髄性筋萎縮症;
同義語 atrophy;Kennedy disease;
2 筋萎縮性側索硬化症;
Amyotrophic lateral sclerosis;
3 脊髄性筋萎縮症;
Spinal muscular atrophy;Myelopathic muscular atrophy;
3-1 脊髄性筋萎縮症I型;
Spinal muscular atrophy type I;SMA I;Werdnig-Hoffman disease;3-2 脊髄性筋萎縮症II型;
細分名 Spinal muscular atrophy type II;SMA II;Dubowitz disease;3-3 脊髄性筋萎縮症III型; （階層性）Spinal muscular atrophy type III;SMA III;Kugelberg-Welander disease;3-4 脊髄性筋萎縮症IV型;
Spinal muscular atrophy type IV;SMA IV;
4 原発性側索硬化症;
Primary lateral sclerosis;
5 進⾏性核上性⿇痺;
Progressive supranuclear palsy;
6 パーキンソン病;
Parkinson disease;
7 ⼤脳⽪質基底核変性症;
Corticobasal degeneration;Corticobasal syndrome;
8 ハンチントン病;
Huntington disease;Huntington chorea;
9 神経有棘⾚⾎球症;
Neuroacanthocytosis;

統計情報：Disease（疾患リスト）ページ

2. 薬剤名（DrugBank）

DDrare公開情報の変遷
2018

2019

2020

152 / 306

207 / 331

226 / 333

臨床試験数

4,399

11,765

15,194

薬物数（DrugBank）

642

1,303

1,666

標的遺伝⼦数

284

423551

標的パスウェイ数

108154275

指定難病数（情報有／全疾患数）

Accession Number DB00770
Name
Alprostadil
Synonyms(11α,13E,15S)-11,15-dihydroxy-9-oxoprost-13-en-1-oic acid | (13E)-(15S)-11alpha,15Dihydroxy-9-oxoprost-13-enoate | 11α,15α-dihydroxy-9-oxo-13-trans-prostenoic acid
| Alprostadil | Alprostadilum | PGE-1 | PGE1 | Prostaglandin E1
Alprostadil | Alprostadil Injection USP | Alprostadil Injection, USP | Caverject |製品名 Caverject Impulse | Caverject Sterile Powder - Kit 11.9mcg /vial | Caverject Sterile
Products

Powder - Kit 23.2mcg/vial | Caverject Sterile Powder - Pws 11.9mcg/vial | Caverject
Sterile Powder - Pws 23.2mcg/vial | Edex | Muse | Prostin Vr Pediatric | Prostin VrSterile Solution | Vitaros |Licensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス ©2020 坂⼿⿓⼀（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）

3. DDrareから探るドラッグ・リポジショニング■ 解説
DDrareの情報探索として、ドラッグ・リポジショニング（DR）の候補事例を抽出した。臨床試験開始年 (Enrollment year) が2019年（11⽉）までの189疾患、753薬物（標的遺伝⼦情報あり）を対象とし、疾患ペアごとに2001年からDR事例(Fig 1)をカウントした。
その結果、難病において、DRの頻度は疾患の組合せによって偏り(Fig 2)があること、また、年々、疾患の組合せ数（Disease Pair数）(Fig 3)及び、薬物数（のべ数）(Fig 4)が急速に増⼤している傾向が明らかとなった。
これらの情報は、創薬標的の探索に有⽤な⼿がかりになると考えられるため、さらに分析を進めている。
Fig 3. 疾患数と疾患ペア数の年次変化

Fig 1. 疾患ペアのDR（例：2002年に１薬物について発⽣）

Fig 2. DRネットワーク（DR数トップ10疾患ペア（35疾患））
Fig 4. 薬物数（ユニーク数、のべ数）の年次変化■ 謝辞

DDrareは⽇本製薬⼯業協会 医薬産業政策研究所と医薬基盤・健康・栄養研究所との共同研究により構築されました。アンケート回答等、DDrareの開発にご意⾒をお寄せいただいた製薬企業の皆様に感謝いたします。
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