เทคนิิ ค PCR แบบเรีียลไทม์ ์ซอฟต์ ์แวร์ ์ CFX Maestro Dx SE
12014330
12014334
12014335
12014348
12014349
12016659
12016687�ปรั ับปรุุงเนื้้ อหา:พฤษภาคม 2022ปรั ับปรุุงซอฟต์ ์แวร์ ์: 2.3

คู่่ มื� อื ผู้้ ใ� ช้้เวอร์ ์ชั ัน 2.3

ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security
Editionคูม่ ือผู้ใช้
เวอร์ชัน 2.3

การสนับสนุนทางเทคนิคของ Bio-Rad™
ฝ่ายสนับสนุนทางเทคนิคของ Bio-Rad ในสหรัฐอเมริกา เปิดให้บริการวันจันทร์ถงึ วันศุกร์ เวลา 5:00 น. ถึง 17:00 น.
ตามเวลาแปซิฟิก
โทรศัพท์: 1-800-424-6723 กด 2อีเมล: Support@bio-rad.com (สหรัฐอเมริกา/แคนาดาเท่านั้น)หากต้องการความช่วยเหลือด้านเทคนิคภายนอกสหรัฐอเมริกาและแคนาดา โปรดติดต่อสำนักงานให้การสนับสนุนด้าน
เทคนิคในพืน้ ทีข่ องคุณ หรือคลิกลิงก์ Contact us (ติดต่อเรา) ที่ bio-rad.com

ประกาศ
ห้ามทำซ้ำหรือเผยแพร่สว่ นใดก็ตามในเอกสารนีใ้ นรูปแบบใด ๆ หรือด้วยวิธกี ารใด ๆ ทั้งทางอิเล็กทรอนิกส์และทางกล รวมถึงการทำสำเนา การบันทึก หรือระบบจัดเก็บหรือเรียกค้นข้อมูลใด ๆ โดยไม่ได้รบั อนุญาตเป็นลายลักษณ์อกั ษรจาก BioRad Laboratories, Inc.
Bio-Rad ขอสงวนสิทธิใ์ นการปรับเปลี่ยนผลิตภัณฑ์และบริการของบริษทั ได้ทุกเมื่อ คู่มอื นีอ้ าจเปลีย่ นแปลงได้โดยไม่ต้อง
แจ้งให้ทราบล่วงหน้า แม้ว่าเอกสารนี้จะจัดทำขึน้ เพื่อความมัน่ ใจถึงความถูกต้อง ทว่า Bio-Rad จะไม่รบั ผิดชอบต่อ
ข้อผิดพลาดหรือการละเว้น หรือความเสียหายใด ๆ ที่เกิดจากการนำไปใช้หรือการใช้ขอ้ มูลนี้
BIO-RAD เป็นเครื่องหมายการค้าของ Bio-Rad Laboratories, Inc.
SYBR เป็นเครือ่ งหมายการค้าของ Thermo Fisher Scientific Inc.
EvaGreen เป็นเครือ่ งหมายการค้าของ Biotium, Inc.
เครือ่ งหมายการค้าทั้งหมดที่ใช้ในที่นเี้ ป็นทรัพย์สนิ ของเจ้าของที่เกีย่ วข้อง
Copyright © 2022 โดย Bio-Rad Laboratories, Inc. สงวนสิทธิท์ ุกประการ

วัตถุประสงค์การใช้งาน

วัตถุประสงค์การใช้งาน
CFX Opus Dx Real-Time PCR SystemTM with ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security EditionTM มีวัตถุประสงค์
เพื่อดำเนินการ PCR แบบใช้สารเรืองแสงเพื่อตรวจจับและกักกันลำดับพันธุกรรมของกรดนิวคลีอกิ ระบบและ
ซอฟต์แวร์มวี ัตถุประสงค์เพื่อใช้ในการวินจิ ฉัยโรคภายนอกร่างกายโดยช่างเทคนิคทางห้องปฏิบตั ิการที่ผ่านการ
ฝึกอบรม ระบบนี้มไี ว้เพื่อใช้กบั การทดสอบกรดนิวคลีอกิ ของบุคคลที่สาม ซึง่ ได้รบั การผลิตและติดฉลากไว้ว่าเพื่อ
วัตถุประสงค์ในการวินิจฉัย

ความหมายตราสัญลักษณ์

ผู้ผลิต

หมายเลขล็อต

สำหรับใช้ในการวินิจฉัยโรคภายนอก
ใช้โดย

ร่างกาย

ขีดจำกัดอุณหภูมิ

หมายเลขแค็ตตาล็อก

ดูคำแนะนำในการใช้งาน

จำนวนการทดสอบ

สำหรับใช้กบ
ัหมายเลขซีเรียล

ใช้ตามใบสัง่ แพทย์เท่านั้น

ประกอบด้วยน้ำยาง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | iiiเครื่องหมาย CE - กฎระเบียบ
(EU) 2017/746 IVDRการแปล
เอกสารเกีย่ วกับผลิตภัณฑ์อาจมีให้บริการในภาษาอืน่ บนสือ่ อิเล็กทรอนิกส์

iv | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEประวัตกิ ารแก้ไข

ประวัติการแก้ไข
เอกสาร

วันที่

คำอธิบายการเปลีย่ นแปลง

คู่มอื ผู้ใช้ ซอฟต์แวร์

ธันวาคม 2020เวอร์ชัน A เปิดตัวครั้งแรก

พฤษภาคม 2022

n อัปเดตให้รองรับ CFX Opus Deepwell Dx

CFX Maestro Dx, Security
Edition เวอร์ชัน 2.0(Doc ID #10000135651)
คู่มอื ผู้ใช้ ซอฟต์แวร์
CFX Maestro Dx, Securityn ตารางพจนานุกรมสัญลักษณ์ที่อป
ั เดต

Edition เวอร์ชัน 2.3

n พิม่ บันทึกความปลอดภัยทางไซเบอร์ในการแนะนำ

(Doc ID #10000135651)

คู่มอ
ื ผูใ
้ ช้ | v

vi | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสารบัญ
วัตถุประสงค์การใช้งาน

iii

ความหมายตราสัญลักษณ์

iii

การแปล

iv

ประวัติการแก้ไข

vการปฏิบตั ิตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

17ป้ายเตือนด้านความปลอดภัย

17การปฏิบัติตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

19การปฏิบัติตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัย

19ความเข้ากันได้ทางแม่เหล็กไฟฟ้า (EMC)20คำเตือนและหมายเหตุของ EMC

21ข้อกำหนดเกี่ยวกับสภาพแวดล้อม

22อันตราย

23อันตรายทางชีวภาพ

23อันตรายทางเคมี

24อันตรายจากการระเบิดหรือเพลิงไหม้

24อันตรายทางไฟฟ้า

24การขนส่ง

25แบตเตอรี่

25การกำจัดของเสีย

25การรับประกัน

25บทที่ 1 บทนำ27คุณสมบัติหลักของซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

29ค้นหาข้อมูลเพิม่ เติม

29บทที่ 2 การติดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition31ข้อกำหนดของระบบ

32การติดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

33การตรวจจับเครื่องมือที่เชื่อมต่อ
ไฟล์ซอฟต์แวร์

34
35

คู่มอ
ื ผูใ
้ ช้ | vii

สารบัญ

บทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition37การเริ่มต้นใช้งาน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

38การเพิ่มผูใ้ ช้ Microsoft Windows ในคอมพิวเตอร์ที่มีซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

40การเพิ่มและลบผู้ใช้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

42การจัดการบทบาทของผูใ้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

43การดูบทบาทและสิทธิข์ องคุณ

บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

44

45ไฟล์ทปี่ ลอดภัย

45บทที่ 5 พืน้ ที่ทำงาน

55หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)56

Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)57

หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)58หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)59หน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)60บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)61
62คำสั่งเมนูไฟล์

63คำสั่งเมนูดู

63คำสั่งเมนูผู้ใช้

64คำสั่งเมนูการทดสอบ

64คำสั่งเมนูเครื่องมือ

65คำสั่งเมนูช่วยเหลือ

66คำสั่งแถบเครื่องมือ

66

Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)68แถบสถานะ

68บานหน้าต่างเครื่องมือทีต่ รวจพบ

69การดูคณุ สมบัติของเครื่องมือ

72ก่อนที่คณุ จะเริ่ม

73การสร้างส่วนผสมหลักสำหรับปฏิกิริยา

73การสอบเทียบสารย้อมสีใหม่

75การตั้งค่า User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้)78บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล
พารามิเตอร์และช่วงต่าง ๆ สำหรับขั้นตอนโปรโตคอล

viii | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

95
96สารบัญ

หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)98คำสั่งเมนูไฟล์

98คำสั่งเมนูการตั้งค่า

99คำสั่งเมนูเครื่องมือ

99คำสั่งแถบเครื่องมือ

99

Protocol Editing Controls (การควบคุมการแก้ไขโปรโตคอล)100การสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)103การเปิดไฟล์โปรโตคอลใหม่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)103การเปิดโปรโตคอลทีม่ ีอยู่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)104การตั้งค่าโปรโตคอลใหม่

105การเพิ่มขัน้ ตอนเข้าไปในโปรโตคอล

108การแทรกขั้นการไล่ระดับอุณหภูมิ

109การแทรกขั้นตอน GOTO

110การแทรกขั้นตอน Melt Curve110การเพิ่มหรือการนำขั้นตอนการอ่านเพลตออก

112การเปลีย่ นตัวเลือกขั้นตอน

112การลบขั้นตอน

113การคัดลอก การส่งออก หรือการพิมพ์โปรโตคอล

113การสร้างโปรโตคอลด้วยระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ

114

การใช้เครื่องคำนวณ Ta

116เกี่ยวกับเครื่องคำนวณ Taบทที่ 8 การเตรียมเพลต
หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)

116

121
122

คำสั่งเมนูไฟล์

122คำสั่งเมนูการแก้ไข

123คำสั่งเมนูการตั้งค่า

123คำสั่งเมนูเครื่องมือการแก้ไข

123คำสั่งแถบเครื่องมือ

124การสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตัวแก้ไขเพลต

125การเปิดไฟล์เพลตใหม่ในตัวแก้ไขเพลต

125การเปิดไฟล์เพลตที่มอี ยู่ในตัวแก้ไขเพลต

127

การตั้งค่าไฟล์เพลตใหม่

128การกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กับไฟล์เพลต
การกำหนดเป้าหมายให้หลุม

135
135

คู่มอ
ื ผูใ
้ ช้ | ixสารบัญ

การกำหนดชือ่ ตัวอย่างให้หลุม

137

การกำหนดชุดกลุ่มชีวภาพให้หลุม

139การกำหนดหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิคให้หลุม

141การกำหนดชุดเจือจางให้กบั ประเภทตัวอย่างมาตรฐาน

142การคัดลอกสารในหลุมไปยังหลุมอื่น

143

การเพิ่มบันทึกสำหรับหลุม

144

การเคลียร์สารทั้งหมดออกจากหลุม

144

การเปลีย่ นการตั้งค่าการทดสอบ

146การสร้างกลุม่ หลุม

149

การเปลีย่ นลักษณะการติดตาม

151การดู การส่งออก และการนำเข้าเพลตในรูปแบบสเปรดชีต

153

การสร้างเค้าโครงเพลตโดยใช้ตวั ช่วยการตัง้ ค่าเพลต

155การใช้ตัวช่วยสร้างการตัง้ ค่าเพลต

บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

155

159

หน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ)160

การเข้าสูห่ น้าต่างการตั้งค่าการทดสอบ

161แท็บ Protocal (โปรโตคอล)162แท็บเพลต

164แท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ)167

การดำเนินการทดสอบ
กล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)

168
170

แท็บสถานะการทดสอบ

170แท็บสถานะเรียลไทม์

173แท็บ Time Status (สถานะเวลา)176การดำเนินการทดสอบ PrimePCR

177

การถ่ายโอนข้อมูลสแตนด์อะโลนเพื่อการวิเคราะห์

179

การถ่ายโอนข้อมูลผ่านอีเมล

179

การถ่ายโอนข้อมูลจาก CFX Opus Dx Real-Time PCR System

179การถ่ายโอนข้อมูลผ่าน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

181การถ่ายโอนข้อมูลโดยใช้ไดรฟ์ USB

181

การถ่ายโอนข้อมูลผ่านไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้ร่วมกันโดยใช้ CFX Opus Dx Real-Time PCR System 182
การสร้างไฟล์ข้อมูล

บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ข้อมูล
หน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)x | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

182

183
183

สารบัญ

แถบเครื่องมือ Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)184แถบเมนูการวิเคราะห์ข้อมูล

185

รายละเอียดแท็บ

188ตัวเลือกหมายเลขขั้นตอน

188การดูกลุ่มหลุมในการวิเคราะห์ข้อมูล

189

การเปลีย่ นสารในหลุมหลังจากทำการทดสอบ

189

การตั้งค่าการวิเคราะห์ข้อมูล

190การปรับขีดจำกัด

190การตั้งค่าพืน
้ ฐาน

190

Analysis Mode (โหมดการวิเคราะห์)191

จำนวนรอบที่จะวิเคราะห์

192

ตัวเลือกหลุม

193

รายการเมนูคลิกขวาตัวเลือกหลุม

194การแยกช่องออกจากการวิเคราะห์ชั่วคราว

195แผนภูมิ

196

เครื่องมือแผนภูมิ

196

การขยายพื้นทีใ่ นแผนภูมิ

204การคัดลอกแผนภูมลิ งในไฟล์ Microsoft

204รายการเมนูคลิกขวาทัว่ ไปสำหรับแผนภูมิ

204สเปรดชีต
รายการเมนูคลิกขวาทัว่ ไปสำหรับสเปรดชีต
Export (ส่งออก)

206
206
208

การส่งออกชุดข้อมูลทั้งหมด

208การส่งออกไฟล์ RDML

209การสร้างไฟล์ส่งออกทีก่ ำหนดเอง

210ส่งออกไปยังโฟลเดอร์ LIMS

211การส่งออกข้อมูลที่จดั รูปแบบ Seegene

211บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ข้อมูล

213แท็บ Quantification (การหาปริมาณ)214

ตัวเลือกสารเรืองแสง

214

กล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม)215

ตัวเลือก Log Scale (ขนาดการบันทึก)216

แผนภูมิเส้นโค้งมาตรฐาน

217ตัวเลือกเมนูแผนภูมิการเพิม่ ปริมาณ

218

คู่มอ
ื ผูใ
้ ช้ | xiสารบัญ

สเปรดชีตแท็บการหาปริมาณ
แท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ)

218
220

สเปรดชีตผลการทดสอบ

220สเปรดชีตผลลัพธ์กราฟเส้นโค้งมาตรฐาน

222

สเปรดชีตเพลต

223

สเปรดชีต RFU

224แท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)การปรับข้อมูล Melt Curveแท็บข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)

225
227
228

สเปรดชีต Melt Peak

228

สเปรดชีตชีตเพลต

229

สเปรดชีต RFU

230สเปรดชีต -d(RFU)/dT

231แท็บจุดสิ้นสุด

232

Results Data (ข้อมูลผลลัพธ์)233การปรับการวิเคราะห์ข้อมูลจุดสิ้นสุด

234

สเปรดชีต RFU สำหรับการวิเคราะห์จุดสิ้นสุด

234

แท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)235

การปรับข้อมูลสำหรับการแยกอัลลีล

236

ตัวเลือกเมนูแผนภูมิ

237

สเปรดชีตการแยกอัลลีล

237

แท็บ Custom Data View (มุมมองข้อมูลทีก่ ำหนดเอง)การสร้างมุมมองข้อมูลที่กำหนดเอง
แท็บ QC (การควบคุมคุณภาพ)

238
239
240

การเปลีย่ นเกณฑ์การควบคุมคุณภาพ

240การแยกหลุมทีไ่ ม่ผ่านการควบคุมคุณภาพออก

241แท็บ Run Information (ข้อมูลการทดสอบ)242

รายงานการวิเคราะห์ข้อมูล

243ประเภทรายงานการวิเคราะห์ข้อมูล

244

การสร้างรายงานการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

247

การสร้างรายงานกลุ่มช่อง

248

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

249

การตั้งค่าเพลตสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

249

การตั้งค่าเพลตทีแ่ นะนำ

250

xii | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสารบัญ

แผนภูมิการแสดงออกของยีน

251

Graphing (การเขียนกราฟ)252

การเปลีย่ นและการทำหมายเหตุประกอบมุมมองแผนภูมิ

254

การปรับข้อมูลการแสดงออกของยีน

259

การตั้งค่าการทดสอบ

261

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา

262

สเปรดชีตข้อมูล

263

ตัวเลือกการแสดงรายละเอียด

265

Clustergram (คลัสเตอร์แกรม)268

การตั้งค่า

268

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา

268

สเปรดชีตข้อมูล

268

แผนภาพกระจาย

269

การตั้งค่า

269

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา

269

สเปรดชีตข้อมูล

270

สเปรดชีตผลการทดสอบ

271

การศึกษายีน

272

การสอบเทียบระหว่างการทดสอบ

272

กล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน)273

แท็บการตั้งค่าการศึกษา

273

การเตรียมการศึกษายีน

274

แท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การศึกษา)275

ประเภทรายงานการศึกษายีน

276

การสร้างรายงานการศึกษายีน

278

ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ข้อมูล

279

ค่าประสิทธิภาพของปฏิกริ ิยา

279

Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์)279

ปริมาณสัมพัทธ์เมือ่ มีการเลือกตัวควบคุม

280ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์

280ประสิทธิภาพทีแ่ ก้ไข Cq (CqE)281ค่าเฉลี่ยประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq (MCqE)

281การปรับระดับการแสดงออกของยีน

282

การแสดงออกของยีนเชิงปริมาณสำหรับกลุม่ ตัวอย่างชีวภาพ

283

คู่มอ
ื ผูใ
้ ช้ | xiiiสารบัญ

การปรับระดับการแสดงออกของยีนเมื่อมีการเลือกตัวควบคุม

283

ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานสำหรับการปรับระดับการแสดงออกของยีน

284

ปรับนิพจน์บรรทัดฐานเป็นระดับการแสดงออกเฉลี่ย

285

ปรับการปรับระดับการแสดงออกของยีนเป็นระดับการแสดงออกต่ำสุด

285

ปรับขนาดการแสดงออกบรรทัดฐานเป็นระดับการแสดงออกเฉลีย
่

285ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานสำหรับการแสดงออกบรรทัดฐานทีม่ ีการปรับขนาด

286

แถบแสดงข้อผิดพลาดสำหรับค่าการเบี่ยงเบนมาตรฐาน (lg) และข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย
่ (lg)

287

สัดส่วนการเปลีย่ นแปลง

288

สูตรการคำนวณค่าที่ถูกต้อง

289

การคำนวณช่วงความเชือ่ มั่นสำหรับการวิเคราะห์กลุม่ ชีวภาพ

290การคำนวณแผนภูมิ Box and Whisker

290ภาคผนวก B เส้นทางการตรวจสอบ

293การดูเส้นทางการตรวจสอบ

293กิจกรรมที่ตรวจสอบได้

295

ภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS

299

การสร้างไฟล์ข้อมูลทีใ่ ช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้

299การตั้งค่าโฟลเดอร์ LIMS และตัวเลือกการส่งออกข้อมูล

299

การสร้างโปรโตคอลระบบ LIMS

301

การสร้างไฟล์ LIMS

301

การเริ่มการทดสอบ LIMS

305การส่งออกข้อมูลไปยังระบบ LIMS

306

ภาคผนวก D การแก้ไขปัญหา ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

307ทำรายการไฟล์และโฟลเดอร์ของ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ทีป่ ลอดภัย

307

บันทึกการใช้งาน

308

การเรียกไฟล์บนั ทึกแอปพลิเคชันและเฟิร์มแวร์

309

การแก้ไขปัญหา

309

ไฟฟ้าขัดข้อง

309

การโอนไฟล์ไปยังคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE

309การติดตั้ง ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ด้วยตนเอง

310การติดตั้งไดรเวอร์อีกครั้ง

310ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

311

Software Notices

312

ZedGraph312

xiv | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสารบัญ

Standard Open License Text
LGPL-2.1

ภาคผนวก F เอกสารอ้างอิง

312
312

325

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | xv

สารบัญ

xvi | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการปฏิบตั ติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและ
กฎระเบียบ
CFX Opus 96 Dx, CFX Opus 384 Dx และ CFX Opus Deepwell Dx Real-Time PCR system (เรียกในคู่มอื นี้วา่
CFX Opus Dx system) ให้ความร้อนและเย็นเร็วมากในระหว่างการทำงาน เพื่อการทำงานที่ปลอดภัยของระบบ
PCR แบบเรียลไทม์ Bio-Rad ขอแนะนำอย่างยิง่ ให้คุณปฏิบัติตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยที่ระบุไว้ในส่วนนี้และ
ตลอดทั้งคูม่ ือนี้

ป้ายเตือนด้านความปลอดภัย
ป้ายเตือนที่แปะบนเครือ
่ ง CFX Opus Dx system รวมถึงในคู่มอื ฉบับนีจ้ ะเตือนคุณเกีย่ วกับที่มาอันจะก่อให้เกิด
การบาดเจ็บหรือเป็นอันตราย ตาราง 1 ระบุปา้ ยเตือนด้านความปลอดภัยแต่ละรายการ
ตาราง 1 คำเตือนด้านความปลอดภัยทั่วไป

ไอคอนความหมาย
การใช้งาน CFX Opus Dx system ก่อนอ่านคู่มอื นีอ้ าจก่อให้เกิดอันตรายจากการบาดเจ็บต่
อตัวบุคคล การใช้เครือ่ งมือนีใ้ นลักษณะที่ไม่ได้ระบุไว้ในคูม
่ อ
ื นีห
้ รือระบุโดย Bio-Rad อาจส่
งผลให้คณุ ลักษณะการป้องกันของเครือ่ งมือบกพร่องหรือปิดใช้งาน
ตัวเครื่อง CFX Opus Dx system ไม่มอี นั ตรายทางชีวภาพหรือกัมมันตภาพรังสี อันตรายดัง
กล่าวจะเป็นปัญหาเฉพาะเมื่อนำไปใช้งานในระบบผ่านทางสารตัวอย่างที่จะทดสอบ เมือ่ จัดก
ารสารตัวอย่างที่มอี นั ตรายทางชีวภาพหรือสารกัมมันตภาพรังสี ให้ปฏิบัติตามข้อควรระวังแล
ะแนวทางที่แนะนำเฉพาะสำหรับห้องปฏิบตั ิการและสถานที่ของคุณ คำแนะนำเหล่านี้จะรวมถึ
งวิธีการทำความสะอาด การตรวจสอบ และวิธกี ารกำจัดวัสดุอนั ตรายที่คณุ กำลังใช้งาน
นอกจากนี้ ตามที่ระบุไว้ข้างต้น ยังคงมีความเสีย่ งต่อการระเบิด การขับของเหลว หรือการระเ
หยออกจากภาชนะบรรจุตัวอย่าง เมือ่ ทำงานกับวัสดุที่เป็นอันตราย ความเสีย่ งต่อการบาดเจ็บ
จากวัสดุที่ถกู ขับออกมาประกอบกับความเสีย่ งของวัสดุที่เป็นอันตรายอาจกระจายอยูภ่ ายใน
และรอบเครือ่ งมือ ผู้ใช้ควรใช้มาตรการป้องกันที่เหมาะสม

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 17การปฏิบัตติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

ตาราง 1 คำเตือนด้านความปลอดภัยทั่วไปต่อ

ไอคอนความหมาย
CFX Opus Dx system ทำงานที่อณุ หภูมทิ ี่สงู พอที่จะทำให้เกิดการไหม้อย่างรุนแรง รอให้
บล็อกตัวอย่างกลับไปยังอุณหภูมหิ ้องก่อนการเปิดฝาและนำตัวอย่างออกเสมอ แม้ว่าบล็อกตัว
อย่างจะเย็นลงแล้ว แต่บริเวณรอบ ๆ รวมทั้งแผ่นทำความร้อนก็อาจยังคงร้อนอยู่ได้ในระยะห
นึง่ ในสถานการณ์ที่ไม่มเี วลาเพียงพอที่จะปล่อยให้เครือ่ งมือเย็นลง ขอแนะนำให้ใช้อปุ กรณ์
ป้องกันเช่นถุงมือกันความร้อนหรือ "ถุงมือสำหรับใช้กบั เตาอบ"ความปลอดภัยและประสิทธิภาพของระบบใด ๆ ที่ใช้รว่ มกับ CFX Opus Dx system ถือเป็น
ความรับผิดชอบของผู้ประกอบเครือ่ งแต่เพียงผู้เดียว

CFX Opus Dx system อาจร้อนเพียงพอในระหว่างการทำงานปกติเพื่อทำให้ของเหลว
ในตัวอย่างเดือดหรือกลายเป็นไอ และมีแรงดันต่อภาชนะบรรจุตัวอย่าง มีความเป็นไปได้ที่
ภาชนะบรรจุตัวอย่างอาจเสียหาย นำไปสูก่ ารรัว่ ไหล การพ่นของเหลว หรือการแตกระเบิด
และการขับไอน้ำหรือของเหลวภายในและรอบ ๆ เครือ่ งมือ
ผู้ใช้ควรใช้งานเครือ่ งมือโดยปิดฝาครอบหรือสวมแว่นตานิรภัย ถุงมือกันความร้อน และอุปก
รณ์ปอ้ งกันส่วนบุคคลอืน่ ๆ ในระหว่างการใช้งานเพื่อหลีกเลีย่ งการบาดเจ็บ การเปิดเครือ่ งมือในขณะที่สารตัวอย่างยังร้อนอยู่ เช่น หลังจากยกเลิกการทดสอบ อาจทำให้ภาชนะที่มแี รงดั
นเกิดรั่วไหล พ่นหรือพุ่งของเหลว ปล่อยให้ตัวอย่างเย็นก่อนเปิดฝาครอบเสมอ
ผู้ใช้ไม่ควรทดสอบปฏิกริ ยิ าโดยที่ฝาหรือซีลผนึกเปิดอยู่ หลวม เป็นรู หรือเสียหาย เพราะจะเ
พิ่มโอกาสที่จะเกิดการแตกหรือระเบิดที่เป็นอันตรายได้
ผู้ใช้ไม่ควรทดสอบปฏิกริ ยิ ากับสารทำปฏิกริ ิยาที่ระเหยได้ซงึ่ อาจเพิ่มโอกาสที่จะเกิดการแตก
หรือระเบิดที่เป็นอันตรายได้

18 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการปฏิบตั ติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

การปฏิบัติตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ
การปฏิบตั ิตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัย
CFX Opus Dx system ได้รบั การทดสอบและพบว่าเป็นไปตามข้อกำหนดที่เกีย่ วข้องทั้งหมดของมาตรฐานด้านความ
ปลอดภัยและแม่เหล็กไฟฟ้าต่างๆ ดังนี้:nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย IEC 61010-1:2010 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้
งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทั่วไป

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย IEC 61010-2-010:2019 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ส่วนที่ 2-010: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบัติการสำหรับการให้
ความร้อนวัสดุ

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย IEC 61010-2-081:2019 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ส่วนที่ 2-081: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบัติการแบบอัตโนมัติ
และกึง่ อัตโนมัติสำหรับการวิเคราะห์และวัตถุประสงค์อนื่ ๆnข้อกำหนดด้านความปลอดภัย IEC 61010-2-101:2018 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ส่วนที่ 2-101: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการ
วินจิ ฉัยโรคภายนอกร่างกาย (IVD)n

CAN/CSA-C22.2 NO. 61010-1-12:2018 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานใน
ห้องปฏิบตั ิการ ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทั่วไป

n

CAN/CSA-C22.2 NO. 61010-2-010:19 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานใน
ห้องปฏิบตั ิการ ส่วนที่ 2-010: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการสำหรับการให้ความร้อนวัสดุ

n

CAN/CSA-C22.2 NO. 61010-2-081:19 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานใน
ห้องปฏิบตั ิการ ส่วนที่ 2-081: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการแบบอัตโนมัติและกึง่ อัตโนมัติ
สำหรับการวิเคราะห์และวัตถุประสงค์อนื่ ๆn

CSA-C22.2 NO. 61010-2-101:19 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้อง
ปฏิบตั ิการ — ส่วนที่ 2-101: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการวินจิ ฉัยโรคภายนอก
ร่างกาย (IVD)nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย EN 61010-1:2010 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้
งานในห้องปฏิบัติการ ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทั่วไป

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย EN 61010-2-010:2014 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการ
ใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-010: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการสำหรับการให้
ความร้อนวัสดุ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 19การปฏิบัตติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย EN 61010-2-081:2015 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการ
ใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-081: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการแบบอัตโนมัติและ
กึง่ อัตโนมัติสำหรับการวิเคราะห์และวัตถุประสงค์อนื่ ๆnข้อกำหนดด้านความปลอดภัย EN 61010-2-101:2017 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการ
ใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-101: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการวินจิ ฉัยโรคภายนอกร่างกาย (IVD)nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย UL 61010-1:2012 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้
งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทั่วไป

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย UL 61010-2-010:2019 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการ
ใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-010: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการสำหรับการให้
ความร้อนวัสดุ

nข้อกำหนดด้านความปลอดภัย UL 61010-2-081:2019 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการ
ใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-081: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ในห้องปฏิบตั ิการแบบอัตโนมัติและ
กึง่ อัตโนมัติสำหรับการวิเคราะห์และวัตถุประสงค์อนื่ ๆnข้อกำหนดด้านความปลอดภัย UL 61010-2-101:19 สำหรับอุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้
งานในห้องปฏิบัติการ — ส่วนที่ 2-101: ข้อกำหนดเฉพาะสำหรับอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการวินจิ ฉัยโรค
ภายนอกร่างกาย (IVD)ความเข้ากันได้ทางแม่เหล็กไฟฟ้า (EMC)
CFX Opus Dx system ได้รบั การทดสอบและพบว่าเป็นไปตามข้อกำหนดที่เกีย่ วข้องทั้งหมดของมาตรฐานด้าน
แม่เหล็กไฟฟ้าต่าง ๆ ดังนี้:n

IEC 61326-1:2012 อุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ข้อกำหนด
EMC — ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทัว่ ไป ผ่านการทดสอบเป็นอุปกรณ์คลาส An

IEC 61326-2-6:2012 อุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ข้อกำหนด
EMC — ส่วนที่ 2–6: ข้อกำหนดเฉพาะของอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการวินิจฉัยโรคภายนอกร่างกาย (IVD)n

EN 61326-1:2013 อุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบัติการ — ข้อกำหนด
EMC — ส่วนที่ 1: ข้อกำหนดทัว่ ไป ผ่านการทดสอบเป็นอุปกรณ์คลาส An

EN 61326-2:-6:2013 อุปกรณ์ไฟฟ้าสำหรับการวัด การควบคุม และการใช้งานในห้องปฏิบตั ิการ — ข้อกำหนด
EMC — ส่วนที่ 2–6: ข้อกำหนดเฉพาะของอุปกรณ์ทางการแพทย์สำหรับการวินิจฉัยโรคภายนอกร่างกาย (IVD)n

FCC ส่วนที่ 15 ส่วนย่อย B ส่วน 15.107 และ 15.109 ผ่านการทดสอบเป็นอุปกรณ์ดิจทิ ัลคลาส An

CAN ICES-003v6:2019 การรบกวนที่ก่อให้เกิดมาตรฐานอุปกรณ์ อุปกรณ์เทคโนโลยีสารสนเทศ (รวมถึง
อุปกรณ์ดจิ ิทัล) — ข้อจำกัดและวิธกี ารวัด ผ่านการทดสอบถึงขีดจำกัดคลาส A

20 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการปฏิบตั ติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

คำเตือนและหมายเหตุของ EMC
nคำเตือน: การเปลีย่ นแปลงหรือแก้ไขเครือ่ งนี้ ไม่ได้รบั การรับรองอย่างชัดเจนโดย Bio-Rad จึงสามารถเพิกถอน
สิทธิก์ ารใช้เครือ่ งมือของผู้ใช้ได้

nหมายเหตุ: เครือ่ งมือนีไ้ ด้รบั การทดสอบและพบว่าเป็นไปตามขีดจำกัดสำหรับอุปกรณ์ดิจทิ ัลคลาส A ตามที่ระบุ
ในส่วนที่ 15 ของข้อกำหนด FCC ขีดจำกัดเหล่านี้ออกแบบมาเพือ่ ป้องกันอันตรายที่เกิดจากสัญญาณรบกวน
ขณะที่มกี ารใช้งานเครือ่ ง เครือ่ งมือนีส้ ร้าง ใช้ และสามารถแผ่พลังงานคลื่นความถีว่ ิทยุ ซึ่งหากไม่ได้ติดตั้งและ
ใช้งานตามคูม่ อื การใช้งาน อาจเกิดอันตรายจากสัญญาณคลื่นวิทยุ การทำงานของอุปกรณ์นใี้ นบริเวณทีพ่ ักอาศัยมีแนวโน้มที่จะก่อให้เกิดการรบกวนที่เป็นผลเสีย ซึง่ ในกรณีนผี้ ู้ใช้จะต้องรับผิดชอบแก้ไขการรบกวน
ดังกล่าวด้วยตนเอง

nหมายเหตุเกีย่ วกับการปฏิบตั ิตามข้อกำหนด FCC: แม้ว่าเครือ่ งมือนีไ้ ด้รบั การทดสอบและพบว่าเป็นไปตามส่วน
ที่ 15 ส่วนย่อย B ของข้อกำหนด FCC สำหรับอุปกรณ์ดิจทิ ัลคลาส A แต่โปรดทราบว่าการปฏิบัติตามข้อกำหนด
นีเ้ ป็นไปโดยสมัครใจ เนือ่ งจากเครือ่ งมือดังกล่าวเป็น “อุปกรณ์ที่ได้รบั การยกเว้น” ภายใต้ 47 CFR 15.103(c)เกีย่ วกับข้อกำหนด FCC ที่อา้ งถึงซึง่ มีผลบังคับใช้ ณ เวลาที่ผลิต

nหมายเหตุเกีย่ วกับสายเคเบิล: เครื่องมือนีไ้ ด้รบั การทดสอบว่าเป็นไปตามข้อกำหนด EMC โดยใช้สาย USB ที่ออกแบบมาเป็นพิเศษซึง่ มาพร้อมกับเครือ่ งมือ จะต้องใช้สายเคเบิลเหล่านี้หรืออะไหล่ทดแทนที่ได้รบั อนุญาต
ของ Bio-Rad กับเครือ่ งมือนีเ้ พื่อให้แน่ใจว่าสอดคล้องกับขีดจำกัดการปล่อยแม่เหล็กไฟฟ้าตามข้อกำหนด
EMC อย่างต่อเนือ่ งคูม่ ือผูใ้ ช้ | 21การปฏิบัตติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

ข้อกำหนดเกี่ยวกับสภาพแวดล้อม
CFX Opus Dx system ได้รับการออกแบบมาให้ใช้งานได้อย่างปลอดภัยภายใต้สภาวะแวดล้อมที่ระบุไว้ในตารางดัง
ต่อไปนี้
ตาราง 2 CFX Opus Dx Real-Time PCR System ข้อกำหนดเกีย่ วกับสภาพแวดล้อม

พารามิเตอร์

ข้อมูลจำเพาะ

สภาพแวดล้อม

ใช้ภายในอาคารเท่านัน
้ระดับความสูงในการปฏิบัตงิ านไม่เกิน 2,000 เมตรเหนือระดับน้ำทะเล

อุณหภูมหิ ้องโดยรอบ

15–31°C*อุณหภูมกิ ารขนส่งและการเก็บรักษา

–20° ถึง 60°C**–4 ถึง 140°Fความชื้นสัมพัทธ์

20% ถึง 80% (ไม่ควบแน่น)***พลังงานที่ใช้

สูงสุด 100 ถึง 240 โวลต์กระแสสลับ ±10%, 50–60เฮิรตซ์, 850 วัตต์

ความผันผวนของแรงดันไฟหลักที่จา่ ย±10%การใช้ไฟฟ้าสูงสุด

<850 วัตต์

ฟิวส์

10 A, 250 V, 5 x 20 มม., แบบขาดเร็ว (จำนวน 2)หมวดหมูแ่ รงดันไฟฟ้าเกิน

IIระดับมลพิษ

2*การใช้งานเครื่องมือนอกเหนือจากช่วงอุณหภูมนิ ี้อาจไม่เป็นไปตามข้อกำหนดด้านประสิทธิภาพ ช่วงอุณหภูมหิ ้อ ง
ระหว่าง 5–40°C นับว่าปลอดภัย
**จัดเก็บและขนส่งเครื่องมือในบรรจุภณั ฑ์สำหรับขนส่งเพื่อให้เป็นไปตามสภาวะอุณหภูมเิ หล่านี้
***ควรจำกัดการใช้งานเครื่องมือที่อุณหภูมิ 4⁰C ไว้ที่ 18 ชัว่ โมงที่สภาวะเหล่านี้ สามารถเก็บที่อุณหภูมิ 4⁰C ได้นาน
72 ชั่วโมง หากความชืน้ น้อยกว่า 60% (ไม่มกี ารควบแน่น)22 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEอันตราย

อันตราย
CFX Opus Dx system เป็นระบบที่ได้รบั การออกแบบมาให้ทำงานอย่างปลอดภัยเมื่อใช้งานในลักษณะที่ผู้ผลิต
กำหนด หากระบบหรือส่วนประกอบใด ๆ ที่เกีย่ วข้องถูกใช้ในลักษณะทีไ่ ม่ได้ระบุโดยผู้ผลิต การป้องกันโดยธรรมชาติ
ของเครือ่ งมือนัน้ อาจลดลง Bio-Rad จะไม่รับผิดชอบต่อการบาดเจ็บหรือความเสียหายที่เกิดจากการใช้อปุ กรณ์นี้
ในลักษณะทีไ่ ม่ได้ระบุแนะนำหรือโดยการดัดแปลงเครื่องมือที่ไม่ได้ดำเนินการโดย Bio-Rad หรือตัวแทนที่ได้รบ
ัอนุญาต บริการของ CFX Opus Dx system ควรได้รบั การดำเนินการโดยบุคลากรที่ผ่านการฝึกอบรม จาก
Bio-Rad เท่านัน
้อันตรายทางชีวภาพ
CFX Opus Dx system เป็นผลิตภัณฑ์สำหรับห้องปฏิบตั ิการ อย่างไรก็ตาม หากมีการใช้งานสารตัวอย่างที่มี
อันตรายทางชีวภาพ ให้ปฏิบตั ิตามแนวทางต่อไปนีแ้ ละดำเนินการตามแนวทางภายในเฉพาะห้องปฏิบัติการและ
สถานที่ของคุณ
หมายเหตุ: การใช้งานในสภาวะปกติ เครื่องนีจ้ ะไม่มกี ารปล่อยสารอันตรายทางชีวภาพ

ข้อควรระวังทั่วไป
nสวมเสือ้ กาวน์และถุงมือสำหรับห้องปฏิบตั ิการ รวมถึงแว่นครอบตาหรือแว่นตานิรภัยที่ป้องกันด้านข้างอยู่เสมอ

nไม่ใช้มือแตะปาก จมูก และดวงตา

nปกปิดบาดหรือรอยถลอกให้สนิทก่อนทำงานกับวัสดุทมี่ ีโอกาสทำให้เกิดการติดเชื้อได้

nหลังจากทำงานกับวัสดุใด ๆ ที่มโี อกาสทำให้เกิดการติดเชือ้ ให้ลา้ งมือด้วยสบูแ่ ละน้ำให้สะอาดก่อนออกจากห้อง
ปฏิบตั ิการ

nถอดนาฬิกาข้อมือและเครือ่ งประดับออกก่อนทำงานที่โต๊ะปฏิบตั ิการ

nเก็บวัสดุติดเชื้อหรือวัสดุุที่มโี อกาสทำให้เกิดการติดเชื้อไว้ในภาชนะทีป่ ิดสนิทและกันการรัว
่ ไหล

n

ถอดชุดป้องกันออกก่อนที่จะออกจากห้องปฏิบัติการ

nห้ามใช้มอื ทีใ่ ส่ถงุ มือ เขียน รับโทรศัพท์ เปิดปิดสวิตช์ไฟ หรือสัมผัสสิง่ ใดทีผ่ ู้อนื่ ทีไ่ ม่ได้สวมถุงมืออาจสัมผัสได้

n

เปลีย
่ นถุงมือบ่อย ๆ ถอดถุงมือทันทีที่เห็นว่ามีการเปือ้ นnห้ามนำวัสดุที่มีโอกาสทำให้เกิดการติดเชือ้ มาสัมผัสกับวัสดุที่ไม่สามารถกำจัดการปนเปือ้ นได้nเมือ่ เสร็จสิน้ การดำเนินการที่เกีย่ วข้องกับวัสดุที่เป็นอันตรายทางชีวภาพแล้ว ให้ขจัดสิง่ ปนเปื้อนในพื้นที่
การทำงานด้วยสารฆ่าเชื้อโรคที่เหมาะสม (ตัวอย่างเช่น น้ำยาฟอกขาวในครัวเรือนเจือจางให้มคี วามเข้มข้น
1:10)

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 23การปฏิบัตติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

การกำจัดการปนเปือ้ นบนพื้นผิว
คำเตือน! เพือ่ ป้องกันไฟฟ้าช็อต ให้ปิดเครือ่ งและดึงปลัก๊ ออกจากเครือ่ งก่อนที่จะปฏิบัติตามขั้นตอน
การกำจัดการปนเปื้อน

พื้นที่ต่อไปนีส้ ามารถทำความสะอาดได้ด้วยน้ำยาฆ่าเชื้อแบคทีเรีย น้ำยาฆ่าเชื้อไวรัส หรือน้ำยาฆ่าเชื้อราใน
โรงพยาบาล
nฝาครอบด้านนอกและโครงตัวเครือ่ งnพื้นผิวบล็อกตัวอย่างภายในและหลุมบล็อกตัวอย่าง

nแผงควบคุมและจอแสดงผล

โปรดดูคำแนะนำจากผู้ผลิตผลิตภัณฑ์เพื่อเตรียมและใช้นำ้ ยาฆ่าเชือ้ โรค ควรล้างบล็อกตัวอย่างและหลุมบล็อก
ตัวอย่างให้สะอาดด้วยน้ำหลาย ๆ ครัง้ หลังจากที่ใช้นำ้ ยาฆ่าเชื้อ หลังจากล้างบล็อกตัวอย่างและหลุมบล็อกตัวอย่าง
ด้วยน้ำแล้ว ให้เช็ดให้แห้งสนิท
สำคัญ: ห้ามใช้สารทำความสะอาดที่มฤี ทธิก์ ดั กร่อนหรือสารละลายที่มคี วามเป็นด่างรุนแรง สารเหล่านีอ้ าจสร้าง
รอยขีดข่วนบนพื้นผิวและทำให้บล็อกตัวอย่างเสียหาย ส่งผลให้ไม่สามารถควบคุมอุณหภูมไิ ด้อย่างแม่นยำ

การกำจัดวัตถุอันตรายทางชีวภาพ
กำจัดวัตถุที่มโี อกาสปนเปื้อนเหล่านีต้ ามกฎระเบียบสำหรับห้องปฏิบัติการ กฎระเบียบในท้องถิน่ ภูมภิ าค และประเทศ
nสารตัวอย่างทางคลินิก

nสารทำปฏิกิรยิ าnภาชนะบรรจุตัวทำปฏิกริ ยิ าที่ใช้แล้วหรืออุปกรณ์สนิ้ เปลืองอืน่ ๆ ที่อาจมีการปนเปื้อน

อันตรายทางเคมี
CFX Opus Dx system ไม่มสี ารเคมีที่อาจเป็นอันตราย

อันตรายจากการระเบิดหรือเพลิงไหม้
CFX Opus Dx system จะไม่กอ่ ให้เกิดอันตรายจากการติดไฟหรือการระเบิดเมือ่ ใช้ตามวิธีที่กำหนดโดย
ห้องปฏิบตั ิการ Bio-Radอันตรายทางไฟฟ้า
หากติดตั้งและใช้งานได้อย่างถูกต้อง ของ CFX Opus Dx system จะไม่กอ่ ให้เกิดอันตรายทางไฟฟ้าแก่ผู้ใช้ โดยจะ
ต้องไม่ทำการดัดแปลงทางกายภาพและเชื่อมต่อกับแหล่งจ่ายไฟที่มคี ณุ สมบัติเหมาะสม

24 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการขนส่ง

การขนส่ง
ต้องดำเนินการตามขั้นตอนการกำจัดสิง่ ปนเปื้อนก่อนเคลื่อนย้ายหรือขนส่ง CFX Opus Dx system เคลื่อนย้ายหรือ
จัดส่งเครือ่ งในภาชนะที่แยกต่างหากในวัสดุบรรจุภณั ฑ์ที่ Bio-Rad จัดเตรียมให้เสมอ ซึง่ จะช่วยป้องกันเครือ่ งจาก
ความเสียหาย
สำหรับข้อมูลเกีย่ วกับการขนส่งเครือ่ งและการขอวัสดุบรรจุภณั ฑ์ที่เหมาะสม โปรดติดต่อสำนักงาน Bio-Rad ในพืน้ ที่ของท่าน

แบตเตอรี่
CFX Opus Dx system ใช้แบตเตอรีเ่ ซลล์แบบเหรียญลิเธียมเมทัลขนาด 3 โวลต์ หนึง่ ก้อน และก้อนแบตเตอรี่ เพือ่ คงรักษาการตั้งค่าเวลาในกรณีที่เครือ่ งไม่มกี ระแสไฟฟ้า หากเวลาไม่ตรงตามค่าที่ตั้งไว้หลังจากปิดเครือ่ ง อาจเป็นสัญญ
าณบ่งบอกว่าแบตเตอรีอ่ อ่ นคำเตือน! อย่าพยายามเปลีย่ นแบตเตอรี่ดว้ ยตัวเอง ขัน้ ตอนเหล่านี้ไม่ใช่สว่ นที่ผู้ใช้สามารถดำเนิน
การเองได้ โปรดติดต่อฝ่ายสนับสนุนทางเทคนิคของ Bio-Rad เพื่อขอความช่วยเหลือแทน

สำหรับรัฐแคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกาเท่านั้น
nวัสดุเปอร์คลอเรต — แบตเตอรีล่ ิเธียมมีวัสดุเปอร์คลอเรต จะต้องดำเนินการอย่างพิเศษ โปรดดู
www.dtsc.ca.gov/hazardouswaste/perchlorateการกำจัดของเสีย
CFX Opus Dx system ประกอบด้วยวัสดุทางอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งไม่ควรทิ้งรวมกับของเสียอืน่ ๆ โดยไม่แยกประเภท
ก่อน ต้องทำการคัดแยกตามข้อกำหนดของ European Union Directive 2012/19/EU เกี่ยวกับของเสียทางอุปกรณ์
อิเล็กทรอนิกส์ - WEEE directive ก่อนการกำจัด โปรดติดต่อตัวแทน Bio-Rad ในประเทศของคุณเพื่อขอคำแนะนำ
ที่เหมาะสมสำหรับแต่ละประเทศ

การรับประกัน
CFX Opus Dx system รวมถึงอุปกรณ์เสริมที่เกีย่ วข้องจะรวมอยูใ่ นการรับประกันมาตรฐาน Bio-Rad ติดต่อ
สำนักงาน Bio-Rad ในท้องถิน่ ของคุณเพื่อสอบถามรายละเอียดเกีย่ วกับการรับประกัน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 25การปฏิบัตติ ามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยและกฎระเบียบ

26 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 1 บทนำระบบการเพิม่ ปริมาณ PCR ประสิทธิภาพสูงของ Bio-Rad มีความก้าวหน้าทางเทคโนโลยีสุดทันสมัย ให้ความแม่นยำ
และความสามารถในการทำซ้ำที่ดียิ่งขึ้นในการเพิ่มปริมาณกรดนิวคลีอกิ สำหรับการทดลองจีโนม
ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ของ Bio-Rad เข้ากันได้กบั เครือ่ งมือต่อไปนี้ และมีไฟล์การทดสอบที่
เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ไพรเมอร์ PrimePCR และการวิเคราะห์โพรบของ Bio-Radn

CFX Opus 96 Dx Real-Time PCR System (รู้จกั กันในคูม่ อื นี้ในชื่อ CFX Opus 96 Dx)n

CFX Opus 384 Dx Real-Time PCR System (รูจ้ ักกันในคูม่ ือนีใ้ นชื่อ CFX Opus 384 Dx)n

CFX Opus Deepwell Dx Real-Time PCR System (เรียกในคู่มอื นี้ในว่า CFX Opus Deepwell Dx)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 27บทที่ 1 บทนำเมือ่ ใช้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition (รูจ้ ักในคู่มอื นี้เป็น CFX Maestro Dx SE) คุณสามารถแปล
ข้อมูลทีซ่ ับซ้อนและสร้างการศึกษาทีม่ ีประสิทธิภาพสำหรับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมได้ ด้วยการคลิกเพียงไม่กคี่ รัง้
คุณสามารถตัง้ ค่าการศึกษาและทำความเข้าใจเกีย่ วกับการศึกษาการแสดงออกของยีนได้ด้วยเครือ่ งมือ เช่น t-tests,
ANOVA ทางเดียว, การวิเคราะห์การควบคุม PrimePCR และเครือ่ งมือตัวเลือกยีนอ้างอิง จากนัน้ คุณสามารถ
จัดเตรียมผลลัพธ์สำหรับเอกสารและโปสเตอร์ดว้ ยเครือ่ งมือสร้างภาพข้อมูลและเครือ่ งมือบรรณนิทัศน์ที่ปรับแต่งได้
อย่างดีเยี่ยมของ CFX Maestro Dx SEหมายเหตุ: การแสดงผลบางหน้าจอใน CFX Maestro อาจแตกต่างไปจากที่นำเสนอในคู่มอื ผู้ใช้ฉบับนี้ หน้าจอ
ในซอฟต์แวร์มคี วามถูกต้อง และมีฟังก์ชันการใช้งานเหมือนกัน
สำคัญ: การรักษาความปลอดภัยทางไซเบอร์คือการปกป้องสินทรัพย์ในพื้นที่ไซเบอร์ให้ปลอดภัยจากการโจมตีท
างไซเบอร์ การรักษาความปลอดภัยทางไซเบอร์เป็นความสามารถของ Bio-Rad ในการรักษาผู้คน ข้อมูล ระบบและชื่อเสียงในพืน้ ทีไ่ ซเบอร์ของตนให้ปลอดภัย พื้นที่ไซเบอร์คือโลกทีเ่ ชือ่ มต่อถึงกันเสมอในทางเทคโนโลยี ซึ่งประกอบไปด้วยผู้คน องค์กร ข้อมูล และเทคโนโลยี
ปฏิกริ ยิ าตอบกลับที่รวดเร็วมีความสำคัญในการแก้ปญั หาด้านความปลอดภัยทางไซเบอร์! หากคุณสงสัยว่าอาจมีปญั หาด้านความปลอดภัยทางไซเบอร์อนั เกีย่ วข้องกับเครือ่ งมือของคุณ หรือมีการละเมิดการรักษาความปลอดภัยทางไซเบ
อร์ในสถานทีท่ ำงานของคุณ โปรดติดต่อตัวแทน Bio-Rad เพื่อรับการสนับสนุนทางเทคนิคทันที

28 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEคุณสมบัตหิ ลักของซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionคุณสมบัติหลักของซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionเมือ่ คุณมี CFX Maestro Dx SE คุณสามารถทำสิง่ ต่อไปนีไ้ ด้nวิเคราะห์ข้อมูลด้วยการใช้งาน กราฟแท่ง คลัสเตอร์แกรม หรือแผนภาพกระจาย เพื่อแปลความหมายและทำ
ความเข้าใจผลลัพธ์อย่างรวดเร็ว

nปรับเปลีย่ นการนำเสนอข้อมูลและสร้างกราฟความคมชัดสูงเพื่อการเผยแพร่เป็นสาธารณะและสร้างรายงาน

nกำหนดคุณภาพ RNA และแก้ไขปัญหาในการทดลองด้วยการควบคุมการวิเคราะห์ PrimePCRnเลือกยีนอ้างอิงที่เหมาะสมและวิเคราะห์ความคงตัวของยีนด้วยเครือ่ งมือการเลือกยีนอ้างอิง (Reference Gene
selection Tool)nทำการวิเคราะห์เชิงสถิติ รวมถึง ANOVA ทางเดียวในการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

คำแนะนำผู้ใช้งานนีจ้ ะอธิบายถึงคุณลักษณะเหล่านี้และวิธใี ช้การใช้งาน

ค้นหาข้อมูลเพิม่ เติม
หลังจากทำการติดตั้ง CFX Maestro Dx SE และตั้งค่าเครือ่ งมือ PCR Bio-Rad ทีเ่ กีย่ วข้องแล้ว คุณจะสามารถเข้าถึง
คูม่ ือฉบับนีไ้ ด้ รวมถึงหัวข้อความช่วยเหลือโดยละเอียดจากเมนู Help (ช่วยเหลือ) ได้ในทุกมุมมอง
เคล็ดลับ: คลิกที่โลโก้ Bio-Rad ที่มมุ ขวาบนของหน้าต่าง CFX Maestro Dx SE ใดก็ได้เพื่อเปิดเว็บไซต์ของ
Bio-Rad เว็บไซต์นจี้ ะมีลิงก์ไปยังบันทึกย่อทางเทคนิค คู่มอื วิดีโอ ข้อมูลผลิตภัณฑ์ และการสนับสนุนด้านเทคนิค
นอกจากนี้ เว็บไซต์นี้ยงั มีแหล่งข้อมูลด้านเทคนิคเกี่ยวกับวิธกี ารและการนำไปใช้ที่หลากหลายที่เกี่ยวข้องกับ
เทคนิค PCR, PCR แบบเรียลไทม์ และการแสดงออกของยีน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 29บทที่ 1 บทนำ30 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 2 การติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx,
Security Editionบทนี้จะอธิบายถึงวิธตี ิดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition สำหรับข้อมูลเกีย่ วกับการติดตั้งเครือ่ ง
PCR แบบเรียลไทม์ที่ Bio-Rad รองรับ โปรดดูคู่มอื ที่เกีย่ วข้อง
จำเป็นต้องมี CFX Maestro Dx SE เพือ่ วิเคราะห์ขอ้ มูล PCR แบบเรียลไทม์จากเครือ
่ ง CFX Opus 96 Dx, CFX
Opus 384 Dx และ CFX Opus Deepwell Dx Real-Time PCR system นอกจากนี้ คุณยังสามารถใช้ซอฟต์แวร์นค
ี้วบคุมเครือ่ งระบบเหล่านีใ้ นโหมดควบคุมด้วยซอฟต์แวร์ได้
CFX Opus Dx system จะจัดส่งพร้อมสาย USB ในถุงอุปกรณ์เสริม ใช้สาย USB เพื่อเชื่อมต่อคอมพิวเตอร์ที่ใช้งาน
CFX Maestro Dx SE กับ CFX Opus Dx systemนำวัสดุบรรจุภัณฑ์ออกและเก็บไว้เพื่อใช้ในอนาคต หากชิ้นส่วนสูญหายหรือเสียหาย โปรดติดต่อสำนักงาน Bio-Radในพื้นที่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 31บทที่ 2 การติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionข้อกำหนดของระบบ
ตาราง 3 แสดงข้อกำหนดของระบบขัน้ ต่ำและที่แนะนำสำหรับคอมพิวเตอร์ที่ใช้งาน CFX Maestro Dx SEตาราง 3 ข้อกำหนดของคอมพิวเตอร์สำหรับใช้งาน CFX Maestro Dx SE

ระบบ

ขัน
้ ต่ำ

ที่แนะนำ

ระบบปฏิบัติการ

Microsoft Windows 10 (64 บิตเท่า

Microsoft Windows 10 (64 บิตเท่านัน้ ) บิลด์ 1511

นั้น) บิลด์ 1511 หรือใหม่กว่า

หรือใหม่กว่าพร้อมการอัปเดตความปลอดภัยล่าสุด

พร้อมการอัปเดตความปลอดภัยล่าสุด
หมายเหตุ: Windows 11 รองรับ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ด้วยเช่นกัน
สำคัญ: ต้องปิดใช้งาน Secure Boot (บูตอย่างปลอดภัย) ในคอมพิวเตอร์ที่ใช้งาน CFX Maestro Dx SE ควรกำหนดค่าคอมพิวเตอร์ที่ใช้งาน CFX Maestro Dx SE เพือ่ ไม่ให้รสี ตาร์ทโดยอัตโนมัติหลังจากการอัปเดตระบบ
หรือการรักษาความปลอดภัยหากกำลังดำเนินการทดสอบอยู่ โปรดขอความช่วยเหลือจากผู้ดูแลระบบของคุณ
พอร์ตพอร์ตความเร็วสูง 2 USB 2.0

พอร์ตความเร็วสูง 2 USB 2.0พืน้ ที่ฮาร์ดดิสก์

128 GB

128 GBความเร็ว

2.4 GHz, Dual Core

2.4 GHz, Quad CoreRAM

4 GB RAM

8 GB RAMความละเอียดหน้าจ

1024 x 768 พร้อมโหมดสีจริง

1280 x 1024 พร้อมโหมดสีจริง

ตัวประมวลผล

อ
PDF reader

Adobe PDF Reader หรือ Windows PDF Readerจาก Microsoft Office Suites ที่รองรับ:n 2016n 2019การกำหนดค่าภาย

รองรับระบบปฏิบัตกิ าร Microsoft

รองรับระบบปฏิบัตกิ าร Microsoft Windows 64-bitในWindows 64-bit ในภาษาอังกฤษ จีนในภาษาอังกฤษ จีน และรัสเซีย

และรัสเซีย

หมายเหตุ: หากคุณวางแผนเรียกใช้ซอฟต์แวร์ CFX Automation Control บนคอมพิวเตอร์เครือ่ งเดียวกับ CFX
Maestro Dx SE ตั้งค่าความละเอียดหน้าจอที่ 1280 x 1024 พร้อมโหมดสีจริง

32 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการติดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสำคัญ: คุณต้องยกเลิกการเชื่อมต่อเครือ่ งมือที่เชื่อมต่ออยูอ่ อกจากคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE ก่อนที่จะ
ติดตั้งหรืออัปเกรดซอฟต์แวร์ คุณไม่จำเป็นต้องปิดเครือ่ งมือระหว่างติดตั้งซอฟต์แวร์ ตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณได้
บันทึกการทดสอบทั้งหมดไว้แล้วและไม่ได้กำลังทดสอบอยู่
หมายเหตุ: ตรวจสอบว่า Secure Boot (บูตอย่างปลอดภัย) ถูกปิดใช้งานก่อนเริม่ ขั้นตอนการติดตั้ง ตรวจสอบให้
แน่ใจว่าคอมพิวเตอร์ได้รบั การกำหนดค่าให้ไม่รสี ตาร์ทโดยอัตโนมัติหลังจากการอัปเดตระบบหรือการรักษา
ความปลอดภัยหากกำลังดำเนินการทดสอบอยู่ โปรดขอความช่วยเหลือจากผู้ดูแลระบบของคุณ

วิธตี ิดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE
1หากจำเป็น ให้ถอดเครือ่ งมือที่เชื่อมต่ออยู่ออกจากคอมพิวเตอร์
ค้นหาตำแหน่งและถอดสาย USB ของอุปกรณ์ออกจากคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE สามารถปล่อยปลาย
สายอีกด้านให้เสียบไว้ในได้

2เข้าสูร่ ะบบคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE ด้วยสิทธิร์ ะดับผู้ดูแลระบบ

3เสียบไดรฟ์ USB ของซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE เข้ากับพอร์ต USB ของคอมพิวเตอร์

4

ใน Windows Explorer ให้ค้นหาและเปิดไดรฟ์ USB ของซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEไดรฟ์ USB มี Release Notes (บันทึกย่อประจำรุน่ ) และโฟลเดอร์ต่อไปนี้
n

CFX

n

Drivers (โปรแกรมควบคุม)n

Firmware (เฟิรม์ แวร์)n

Quick Start (คูม่ อื เริ่มต้นใช้งานด่วน)มาพร้อมกับไฟล์อนื่ ๆ โดยโฟลเดอร์ของ CFX มีโปรแกรมติดตั้งซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE(CFXMaestroDxSetup.exe)

5เปิดโฟลเดอร์ของ CFX และคลิกสองครั้งที่ CFXMaestroDxSetup.exe เพื่อเริม่ โปรแกรมติดตั้ง

6ทำตามคำแนะนำการติดตั้งบนหน้าจอ
เมือ่ ดำเนินการเสร็จสมบูรณ์แล้ว ไอคอน Bio-Rad ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition จะปรากฏบน
เดสก์ท็อปของคอมพิวเตอร์
เคล็ดลับ: ตัวติดตั้ง CFX Maestro จะติดตั้งคูม่ ือผู้ใช้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition โดยอัตโนมัติ หากต้องการค้นหาคูม่ ือนี้ ให้ไปที่เมนู Help (ช่วยเหลือ) แล้วเลือก Open User Guides (เปิดคู่มอ
ื ผู้
ใช้)

7

หลังจากทำการติดตั้งเสร็จสิน้ คุณสามารถนำไดรฟ์ USB ของซอฟต์แวร์ออกได้อย่างปลอดภัย

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 33บทที่ 2 การติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionการตรวจจับเครื่องมือที่เชื่อมต่อ
ระหว่างการติดตั้ง โปรแกรมติดตั้ง CFX Maestro Dx SE จะติดตั้งไดรเวอร์เครือ่ งมือลงในคอมพิวเตอร์ที่มี CFX
Maestro Dx SE โดย CFX Maestro Dx SE จะตรวจจับเครือ่ งมือที่เชื่อมต่อเมื่อคุณเริม่ ต้นซอฟต์แวร์

วิธตี รวจจับเครือ่ งมือทีเ่ ชือ่ มต่อ
1หากคุณยังไม่ได้ดำเนินการดังกล่าว ให้เสียบปลายสาย USB Type B สีเ่ หลี่ยม (ตัวผู้) ทีใ่ ห้มาด้วยเข้ากับพอร์ต
USB Type B ที่ด้านหลังฐานเครือ่ งมือ

2เสียบปลายอีกด้านหนึง่ (พอร์ต) เข้ากับพอร์ต USB บนคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE

3หากเครือ่ งไม่ได้กำลังทำงานอยู่ ให้กดสวิตช์เปิด/ปิดที่ด้านหลังเครือ่ งมือเพื่อเปิดเครือ
่ ง

4

เริม
่ ต้น CFX Maestro Dx SEซอฟต์แวร์จะตรวจจับเครือ่ งมือที่เชื่อมต่อโดยอัตโนมัติ และแสดงชื่อของเครือ่ งมือในแถบหน้าต่าง Detected
Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ในบานหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)หมายเหตุ: หากเครือ่ งมือไม่ปรากฏขึ้นในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ให้ตรวจ
สอบว่าได้ทำการเชื่อมต่อสาย USB อย่างถูกต้องแล้ว เมือ่ ต้องการติดตั้งไดรฟ์เวอร์อกี ครัง้ ในหน้าต่าง Home(หน้าหลัก) ใน CFX Maestro Dx SE ให้เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Reinstall Instrument Drivers (ติดตั้ง
ไดรเวอร์เครือ่ งมืออีกครัง้ )34 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEไฟล์ซอฟต์แวร์

ไฟล์ซอฟต์แวร์
ตาราง 4 จะแสดงรายการประเภทไฟล์ CFX Maestro Dx SEตาราง 4 ประเภทไฟล์CFX Maestro Dx SEประเภทไฟล์

Extension (ส่วนขยาย)Details (รายละเอียด)Protocol (โปรโตคอล).prcl

มีรายละเอียดการตั้งค่าโปรโตคอลเพือ่ ดำเนินการทดสอบ PCR

Plate (เพลต).pltdมีรายละเอียดการตั้งค่าเพลตเพือ่ ดำเนินการทดสอบ PCR

Data (ข้อมูล).pcrd

มีผลลัพธ์ของการดำเนินการทดสอบและการวิเคราะห์ PCR

PrimePCR run.csvมีเค้าโครงโปรโตคอลและเพลตสำหรับเพลต PrimePCR

Gene study (การศึกษายี

.mgxdมีผลลัพธ์ของการดำเนินการทดสอบ PCR และการวิเคราะห์การแ

น)ไฟล์ขอ้ มูลเบื้องต้นแบบสแ

สดงออกของยีนหลายผลลัพธ์
.zpcr

ตนด์อะโลน
LIMSมีการอ่านสารเรืองแสงจากการทำงานแบบสแตนด์อะโลนที่แปลงไ
ปเป็นไฟล์ขอ
้ มูล

.plrn

มีการติดตัง้ เพลตและข้อมูลโปรโตคอลที่จำเป็นในการดำเนินการท
ดสอบทีเ่ ข้ากันได้กับระบบ LIMS

JSON

.json

ไฟล์แบบอ่านอย่างเดียวที่สร้างโดย CFX Opus Dx systems เท่านั้น ไฟล์นี้มีขอ้ มูลไฟล์การทดสอบซึ่งปรากฏในบานหน้าต่างรายล
ะเอียดใน File Browser เมื่อเลือกไฟล์การทดสอบ ไฟล์นี้สร้างขึน
้หลังจากการทดสอบเสร็จสิ้น และจะถูกส่งออกไปพร้อมกับไฟล์
.zpcr และถูกบันทึกกับไฟล์ข้อมูลเมื่อตำแหน่งการบันทึกเป็นไดรฟ์
USB หรือโฟลเดอร์บนเครือข่ายทีใ่ ช้ร่วมกัน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 35บทที่ 2 การติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

36 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro
Dx, Security Editionใน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ผูใ้ ช้เข้าสูร่ ะบบด้วยชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านสำหรับ Windows ผู้ที่
ติดตั้ง CFX Maestro Dx SE แล้วจะได้รบั มอบหมายบทบาทเป็นผู้ดแู ลระบบโดยอัตโนมัติ และสามารถสร้างและจัด
การบัญชีผู้ใช้และบทบาทได้ ผู้ใช้รายอืน่ ทั้งหมดจะต้องได้รบั การกำหนดบัญชีผู้ใช้เพื่อเข้าสูร่ ะบบและใช้ซอฟต์แวร์
สำคัญ: ผู้ใช้แต่ละรายต้องมีบญั ชี Windows และรหัสผ่านในคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE ก่อนที่คณ
ุจะสามารถกำหนดบัญชีผู้ใช้และบทบาทได้ ผู้ใช้อาจเป็นสมาชิกของกลุ่มผู้ใช้ Windows หรือกลุ่มผู้ดูแลระบบ
Windows ก็ได้ สมาชิกของกลุ่มผู้ใช้ Windows สามารถเข้าถึงได้เฉพาะไฟล์และโฟลเดอร์ใน CFX Maestro
Dx SE ของตนเท่านัน้ สมาชิกของกลุ่มผู้ดูแลระบบ Windows สามารถเข้าถึงไฟล์และโฟลเดอร์ของผู้ใช้ทุกราย
บนคอมพิวเตอร์
บทนี้จะอธิบายวิธสี ร้างผู้ใช้ Microsoft Windows เพื่อเพิ่มผู้ใช้เหล่านัน้ เข้าไปที่ CFX Maestro Dx SE ส่วนนีย้ ังอธิบายวิธีเพิ่มผู้ใช้ใน CFX Maestro Dx SE และจัดการบทบาทและสิทธิ์ของผู้ใช้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 37บทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionการเริ่มต้นใช้งาน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionหมายเหตุ: ผู้ใช้แต่ละรายต้องเข้าสูร่ ะบบด้วยชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านสำหรับ Windows ของตน

วิธเี ริม่ ใช้งาน CFX Maestro Dx SE
1บนคอมพิวเตอร์เดสก์ท็อปที่มี CFX Maestro Dx SE คลิกสองครัง้ ทีไ่ อคอนเส้นทางลัดสู่ CFX Maestro Dx SEเพื่อเริม่ เปิดแอปพลิเคชัน

2ในกล่องโต้ตอบการเข้าสูร่ ะบบ พิมพ์รหัสผ่านสำหรับ Windows ของคุณแล้วคลิก OK (ตกลง)CFX Maestro Dx SE จะเปิดหน้าต่างหน้าหลักขึ้นมา แถบหัวเรื่องจะแสดงชื่อผู้ใช้ Windows ของผู้ใช้ที่เข้าสู่
ระบบ และแถบเมนูจะแสดงสติกเกอร์สนี ำ้ เงินระบุวา่ ซอฟต์แวร์เป็นไปตามข้อกำหนด 21 CFR Part 11 ดังตัวอย่าง

38 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการเริม่ ต้นใช้งาน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionคูม่ ือผูใ้ ช้ | 39บทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionการเพิ่มผู้ใช้ Microsoft Windows ในคอมพิวเตอร์ที่มซี อฟต์แวร์
CFX Maestro Dx, Security Editionผู้ใช้ทุกคนต้องเข้าสูร่ ะบบคอมพิวเตอร์ของ CFX Maestro Dx SE ด้วยชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านสำหรับ Windows ของตนเอง สำหรับการติดตามการตรวจสอบที่ถกู ต้อง ไม่สามารถเพิ่มบัญชีผู้ใช้ Windows ผ่านทางกล่องโต้ตอบ Start >Settings (การตั้งค่า) > Account (บัญชี) ต้องเพิ่มบัญชีผู้ใช้ Windows ผ่านคอนโซล Computer Management (การจัดการคอมพิวเตอร์)สำคัญ: การเปลี่ยนแปลงคุณสมบัติผู้ใช้ Windows (รวมถึงชื่อผู้ใช้และชื่อเต็ม) หลังจากที่คณุ สร้างผู้ใช้ CFX
Maestro Dx SE ที่เกีย่ วข้องจะเป็นการยืนยันผูใ้ ช้ของ CFX Maestro Dx SE ตรวจสอบว่าข้อมูลถูกต้องก่อน
บันทึกผู้ใช้ Windows และสร้างผู้ใช้ CFX Maestro Dx SE ที่เกีย่ วข้อง
เคล็ดลับ: ตรวจสอบเอกสารการดูแลระบบ Microsoft Windows และดูข้อมูลเพิ่มเติมของผู้ดูแลระบบ Windowsของคุณก่อนสร้างบัญชี Windowsวิธเี พิ่มบัญชีผใู้ ช้ Windows ในคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE
1เข้าสูร่ ะบบคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE ในฐานะสมาชิกของกลุม่ ผูด้ ูแลระบบ Windows2บนเดสก์ท็อป ให้คลิกขวาที่ My Computer (คอมพิวเตอร์ของฉัน) แล้วเลือก Manage (จัดการ) เพื่อเปิดคอนโซล
Computer Management (การจัดการคอมพิวเตอร์)3ในคอนโซล Computer Management (การจัดการคอมพิวเตอร์) ขยาย Local Users and Groups (ผู้ใช้และ
กลุ่มภายใน)4คลิกขวาที่โฟลเดอร์ Users (ผูใ้ ช้) แล้วเลือก New User (ผู้ใช้ใหม่) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบผู้ใช้ใหม่

40 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการเพิม่ ผูใ้ ช้ Microsoft Windows ในคอมพิวเตอร์ทมี่ ีซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

5

6ในกล่องโต้ตอบผู้ใช้ใหม่ คุณต้องกรอกข้อมูลในช่องต่อไปนี้
nชื่อผู้ใช้

nชื่อ-สกุล

nรหัสผ่าน

nยืนยันรหัสผ่าน

คลิก Create (สร้าง)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 41บทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionการเพิ่มและลบผู้ใช้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionเคล็ดลับ: เฉพาะผู้ใช้ที่มบี ทบาทเป็นผู้ดูแลระบบของ CFX Maestro Dx SE เท่านัน้ ที่สามารถสร้างและลบบัญชีผู้
ใช้ CFX Maestro Dx SE ผู้ที่ติดตั้ง CFX Maestro Dx SE แล้วจะได้รบั การกำหนดบทบาทเป็นผู้ดูแลระบบโดย
อัตโนมัติ บุคคลนัน้ สามารถกำหนดบทบาทผู้ดูแลระบบให้แก่ผู้ใช้รายอืน
่หมายเหตุ: ใน CFX Maestro Dx SE ผู้ใช้อย่างน้อยหนึง่ รายต้องได้รบั การกำหนดบทบาทเป็นผู้ดูแลระบบ

วิธเี พิ่มบัญชีผใู้ ช้ CFX Maestro Dx SE
1ตรวจสอบว่าผู้ใช้ที่ต้องใช้งานเครือ่ งแต่ละรายเป็นสมาชิกของกลุม่ ผู้ใช้ Windows หรือกลุม่ ผู้ดแู ลระบบ
Windows และมีรหัสผ่าน Windows บนคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE

2เริม่ เปิดเครือ
่ ง CFX Maestro Dx SE และเข้าสู่ระบบในฐานะผู้ดูแลระบบ

3ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก User (ผู้ใช้) > User Administration (การจัดการผู้ใช้)กล่องโต้ตอบการจัดการผู้ใช้จะปรากฏขึ้น

42 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการจัดการบทบาทของผูใ้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

4ในส่วน Manage Users (จัดการผู้ใช้) ให้ระบุข้อมูลต่อไปนี้สำหรับผู้ใช้แต่ละราย
nชื่อผู้ใช้ — ใน CFX Maestro Dx SE ชื่อผู้ใช้ต้องเป็นชื่อผู้ใช้สำหรับเข้าสู่ระบบ Windows ของผูใ้ ช้nชื่อ-สกุล — ชื่อและนามสกุลของผู้ใช้
ชื่อนีจ้ ะปรากฏในช่องชื่อ-สกุลของผู้ใช้ในเส้นทางการตรวจสอบ ชือ่ นีต้ ้องเป็นชื่อเดียวกับที่ปอ้ นในช่องชือ่ สกุลเมือ่ สร้างผู้ใช้ Windowsnบทบาท — บทบาทที่จะกำหนดให้แก่ผู้ใช้
หมายเหตุ: คุณสามารถเลือกได้เพียงหนึ่งบทบาทจากรายการแบบเลือ่ นลง ดูข้อมูลเพิ่มเติมที่
การจัดการบทบาทของผู้ใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionnโดเมน — โดเมน Windows ทีผ่ ู้ใช้เข้าถึงซอฟต์แวร์
ดูขอ้ มูลเพิ่มเติมจากผู้ดแู ลระบบ Windows ของคุณ

5คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงและปิดกล่องโต้ตอบการจัดการผู้ใช้

วิธลี บบัญชีผใู้ ช้ CFX Maestro Dx SE
1เริม่ เปิดเครือ
่ ง CFX Maestro Dx SE และเข้าสู่ระบบในฐานะผู้ดูแลระบบ

2ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Administration (การจัดการผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่อง
โต้ตอบการจัดการผู้ใช้

3ในแถบหน้าต่าง Manage Users (จัดการผู้ใช้) ให้เลือก Remove (ลบ) ผู้ใช้แต่ละรายที่คณุ ต้องการลบออก

4คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงและปิดกล่องโต้ตอบการจัดการผู้ใช้

การจัดการบทบาทของผู้ใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security
Editionสำคัญ: CFX Maestro Dx SE กำหนดให้มีผู้ใช้อย่างน้อยหนึง่ คนรับมอบหมายบทบาทผู้ดแู ลระบบ คุณสามารถ
มอบหมายบทบาทนีใ้ ห้กับผู้ใช้มากกว่าหนึง่ คน
CFX Maestro Dx SE มีสบี่ ทบาทสำหรับผูใ้ ช้ ผู้ใช้แต่ละคนต้องได้รบั การมอบหมายบทบาทเพื่อเข้าถึงซอฟต์แวร์
แม้ว่าจะสามารถกำหนดบทบาทแก่ผู้ใช้ได้เพียงบทบาทเดียว แต่คณุ ก็สามารถเปลี่ยนบทบาทของผู้ใช้ได้ทุกเมือ
่ยกเว้นบทบาทผู้ดูแลระบบที่คณุ สามารถเปลี่ยนสิทธิท์ ี่กำหนดให้กบั แต่ละบทบาทได้ ผู้ใช้ทงั้ หมดที่ได้รบั มอบหมายบท
บาทจะได้รบั เฉพาะสิทธิข์ องบทบาทนัน
้ตามค่าเริ่มต้น สิทธิส์ ำหรับแต่ละบทบาทมีดังนี้
nผู้ดูแลระบบ — บทบาทนีม้ ี สทิ ธิท์ ั้งหมด คุณไม่สามารถเปลี่ยนสิทธิเ์ หล่านีไ้ ด้nหัวหน้า — บทบาทนีม
้ ส
ี ท
ิ ธิท
์ ั้งหมด ยกเว้นการตั้งค่าอีเมล

nผู้ปฏิบัติการ — บทบาทนีม้ สี ิทธิ์ทั้งหมด ยกเว้นการข้ามรอบและตั้งค่าอีเมล

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 43บทที่ 3 การจัดการบัญชีผใู้ ช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionnผู้เยีย่ มชม — บทบาทนีส้ ามารถอ่านไฟล์ได้เท่านัน้เมือ่ กำหนดบทบาทใน CFX Maestro Dx SE ให้ระบุข้อกำหนดสำหรับผูใ้ ช้แต่ละรายอย่างรอบคอบ ตัวอย่างเช่น หากไม่มีสทิ ธิใ์ นการบันทึก ผู้ใช้ที่ได้รบั มอบหมายบทบาทผู้เยี่ยมชม จะไม่สามารถลงชื่อในไฟล์ได้ หากไม่มสี ทิ ธิ์ในการตั้ง
ค่าบัญชีอเี มล ก็จะไม่มีบทบาทใดที่ได้รบั อีเมลเมื่อการทดสอบเสร็จสิน้วิธแี ก้ไขสิทธิ์สำหรับบทบาท
1เริม่ เปิดเครือ
่ ง CFX Maestro Dx SE และเข้าสู่ระบบในฐานะผู้ดูแลระบบ

2ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Administration (การจัดการผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่อง
โต้ตอบการจัดการผู้ใช้

3ในส่วน Manage Rights (จัดการสิทธิ์) ให้ลา้ งแต่ละบทบาทหรือเลือกช่องทำเครือ่ งหมายของสิทธิเ์ ฉพาะตามความจำเป็น

4คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงและปิดกล่องโต้ตอบการจัดการผู้ใช้

การดูบทบาทและสิทธิข์ องคุณ
เคล็ดลับ: ผู้ใช้ที่ได้รบั การกำหนดบทบาทผูใ้ ช้เป็น Principal (ผู้ควบคุม) Operator (ผูป้ ฏิบัตงิ าน) หรือ Guest (ผู้เยี่ยมชม) สามารถดูการตั้งค่า สิทธิ์และบทบาทของผู้ใช้ของตนเองได้เท่านัน้ ผู้ใช้ที่ได้รบั การกำหนดบทบาทเป็น
ผู้ดูแลระบบสามารถดูสทิ ธิแ์ ละบทบาทของผูใ้ ช้ทั้งหมด

วิธกี ารดูบทบาทและสิทธิผ์ ู้ใช้ปจั จุบนั ของคุณuในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก User (ผู้ใช้) > User Administration (การจัดการผู้ใช้)ติดต่อผู้ดแู ลระบบ CFX Maestro Dx SE ของคุณเพื่อแก้ไขการตั้งค่า สิทธิแ์ ละบทบาทผู้ใช้ที่แสดงในหน้าต่าง User
Administration (การจัดการผู้ใช้)44 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security
Editionสำคัญ: ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ใช้ Microsoft Windows User Authentication เพื่อ
ตรวจสอบการเข้าถึงไฟล์ข้อมูล CFX ที่ปลอดภัย ติดต่อผูด้ ูแลระบบ Windows ของคุณเพื่อสร้างสภาพแวดล้อม
ที่สอดคล้องกับข้อกำหนด 21 CFR Part 11เมือ่ ใช้ CFX Maestro Dx SE ผู้ใช้สามารถทำสิง่ ต่อไปนี้ได้
nเซ็นชื่อลงในไฟล์ขอ้ มูลและไฟล์การศึกษายีน

nใส่รหัสผ่านปกป้องไฟล์ขอ
้ มูล

n

ดูและพิมพ์เส้นทางการตรวจสอบ

ส่วนนีอ้ ธิบายรายละเอียดคุณสมบัตเิ หล่านี้

ไฟล์ที่ปลอดภัย
ตามค่าเริ่มต้น CFX Maestro Dx SE จะบันทึกไฟล์ที่ปลอดภัยลงในโฟลเดอร์สว่ นตัวของผู้ใช้ที่เข้าสูร่ ะบบ ซึง่ อยูท่ ี่
C:\Users\<username>\Documents\Bio-Rad\CFX_MDX\My qPCRคุณสามารถบันทึกและแก้ไขไฟล์ .pcrd ได้ในโฟลเดอร์นนั้ โฟลเดอร์นมี้ ลี ิงก์ไปยังโฟลเดอร์อนื่ (เช่น โฟลเดอร์
Sample Files) ที่มไี ฟล์แบบอ่านอย่างเดียว อย่างไรก็ตาม ผูด้ ูแลระบบสามารถลบเนือ้ หาของโฟลเดอร์นนั้ ได้
เคล็ดลับ: มีอกี วิธหี นึง่ คือ ผู้ดูแลระบบ Windows ของคุณสามารถสร้างโฟลเดอร์ที่ใช้รว่ มกัน และผู้ดแู ลระบบ
CFX Maestro Dx SE ของคุณสามารถตั้งโปรแกรมซอฟต์แวร์เพื่อบันทึกไฟล์ทั้งหมดลงในโฟลเดอร์นน
ั้ใน CFX Maestro Dx SE ไฟล์เพลต โปรโตคอล ข้อมูล และไฟล์การศึกษายีนจะถูกทำเครือ่ งหมายว่าปลอดภัยเมื่อได้
รับการบันทึก คุณสามารถสร้างไฟล์เหล่านีใ้ นซอฟต์แวร์ CFX Maestro หรือใน CFX Maestro Dx SE หลังจากที่
ไฟล์เหล่านัน้ ถูกบันทึกใน CFX Maestro Dx SE แล้ว คุณสามารถเปิดไฟล์เหล่านีไ้ ด้เฉพาะ
ใน CFX Maestro Dx SE
CFX Maestro Dx SE จะสร้างเส้นทางการตรวจสอบสำหรับข้อมูลที่ปลอดภัยทั้งหมดและไฟล์การศึกษายีน (ไฟล์.pcrd และไฟล์ .mgxd ตามลำดับ) ซอฟต์แวร์จะบันทึกกิจกรรมทีต่ รวจสอบได้ทั้งหมดในเส้นทางการตรวจสอบของ
ไฟล์ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดดูเส้นทางการตรวจสอบ ในหน้า 293คูม่ ือผูใ้ ช้ | 45บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionการลงนามในไฟล์ที่ปลอดภัย
หลังจากบันทึกไฟล์ใน CFX Maestro Dx SE ผูใ้ ช้สามารถเพิ่มลายเซ็นอิเล็กทรอนิกส์ได้ ในการเซ็นชื่อลงในไฟล์
บทบาทของผู้ใช้ต้องมีสทิ ธิใ์ นการบันทึกไฟล์ ตัวอย่างเช่น ตามค่าเริม่ ต้น บทบาทผู้เยีย่ มชมไม่มส
ี ท
ิ ธิบ
์ ันทึกไฟล์ ดังนัน
้ผู้ใช้ที่ได้รบั บทบาทนี้จงึ ไม่สามารถเซ็นชื่อในไฟล์ได้
ใน CFX Maestro Dx SE ไฟล์ที่มกี ารเซ็นชื่อจะไม่ได้ถกู ตั้งค่าเป็นแบบอ่านอย่างเดียว จึงสามารถตรวจสอบ แก้ไข
และลงนามในไฟล์ได้หลายครั้ง การเปลี่ยนแปลงและลายเซ็นทั้งหมดจะถูกติดตามในเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์
คุณสามารถเซ็นชื่อลงในไฟล์ประเภทต่อไปนี้
nไฟล์ขอ้ มูล (.pcrd)nไฟล์การศึกษายีน (.mgxd)

หมายเหตุ: ต้องบันทึกไฟล์ก่อนจึงจะสามารถเซ็นชื่อได้ หากคุณเพิ่งดำเนินการทดสอบใน CFX Maestro Dx SEให้บนั ทึกไฟล์ข้อมูลผลลัพธ์กอ่ นวิธเี ซ็นชื่อในไฟล์
1เข้าสูร่ ะบบ CFX Maestro Dx SE ด้วยข้อมูลการเข้าสูร่ ะบบ Windows ของคุณ

2เปิดไฟล์ขอ้ มูลที่ปลอดภัยหรือไฟล์การศึกษายีนเพือ่ เซ็นชื่อ

3เลือก File (ไฟล์) > Sign (เซ็นชื่อ) กล่องโต้ตอบลายเซ็นอิเล็กทรอนิกส์จะปรากฏขึ้น

46 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

4กรอกชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านสำหรับ Windows ของคุณและเหตุผลในการเซ็นชื่อในไฟล์
ชื่อผู้ใช้และเหตุผลในการเซ็นชื่อจะรวมอยู่ในเส้นทางการตรวจสอบ (สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดดูที่เส้นทางการ
ตรวจสอบ ในหน้า 293)5คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ส่งลายเซ็นและปิดกล่องโต้ตอบ

การแก้ไขไฟล์ทปี่ ลอดภัย
ใน CFX Maestro Dx SE ผูใ้ ช้สามารถแก้ไขไฟล์ที่ปลอดภัย รวมถึงข้อมูลที่ลงชื่อและไม่ได้ลงชื่อและไฟล์การศึกษายีน ซอฟต์แวร์จะแจ้งให้คณุ ระบุเหตุผลทีท่ ำการเปลี่ยนแปลงเมือ่ คุณบันทึกข้อมูลที่ปลอดภัยที่แก้ไขแล้วหรือไฟล์
การศึกษายีน โดยจะมีการติดตามการเปลี่ยนแปลงในเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์
เคล็ดลับ: เนื่องจากซอฟต์แวร์ไม่สร้างเส้นทางการตรวจสอบสำหรับไฟล์เพลตหรือไฟล์โปรโตคอล คุณจึงจะ
ไม่ได้รับแจ้งให้ระบุเหตุผลเมือ่ คุณบันทึกการเปลีย่ นแปลงของไฟล์เหล่านี้

วิธบี ันทึกข้อมูลที่แก้ไขแล้วหรือไฟล์การศึกษายีน
1เข้าสูร่ ะบบ CFX Maestro Dx SE ด้วยข้อมูลการเข้าสูร่ ะบบ Windows ของคุณ

2เปิดและแก้ไขไฟล์ข้อมูลทีป่ ลอดภัยหรือไฟล์การศึกษายีน
เคล็ดลับ: สำหรับรายการกิจกรรมที่สามารถตรวจสอบได้ โปรดดูกจิ กรรมที่ตรวจสอบได้ ในหน้า 295

3เลือก File (ไฟล์) > Save (บันทึก) กล่องโต้ตอบเหตุผลการเปลี่ยนแปลงเส้นทางการตรวจสอบจะปรากฏขึ้น

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 47

บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionกล่องโต้ตอบนีจ้ ะแสดงข้อมูลต่อไปนี้ ซึง่ บันทึกกิจกรรมการแก้ไขแต่ละรายการไว้ในส่วนหัวของเส้นทางการ
ตรวจสอบของไฟล์
nวันที่ — วันที่เกิดการเปลีย่ นแปลง

nผู้ใช้ — โดเมน Windows และชือ่ ผู้ใช้ของผู้ใช้ที่เข้าสูร่ ะบบnความคิดเห็น — ความคิดเห็นทีบ่ ันทึกไว้ล่าสุด

nลายเซ็น — ลายเซ็นอิเล็กทรอนิกส์ของบุคคลสุดท้ายที่ลงชื่อในไฟล์

nเหตุผลที่ลงลายเซ็น — เหตุผลสำหรับการลงลายเซ็น

nแอปพลิเคชัน — CFX Maestro Dx SE (ปรากฏเป็น BioRadCFXManager.exe ซึง่ ถูกต้อง)nเวอร์ชันแอปพลิเคชัน — เวอร์ชันปัจจุบันของ CFX Maestro Dx SEnชื่อ-สกุลของผู้ใช้ — ชื่อ-สกุลของผูใ้ ช้ที่เข้าสูร่ ะบบหมายเหตุ: ชื่อนี้จะปรากฏในเส้นทางการตรวจสอบ

n

เครือ
่ ง — คอมพิวเตอร์ที่ติดตั้งซอฟต์แวร์

ตารางการเปลีย่ นแปลงจะแสดงการเปลี่ยนแปลงที่ตรวจสอบได้ทเี่ กิดขึน้ อันเป็นผลมาจากการแก้ไข คำอธิบายสัน้ ๆ สำหรับเหตุผลที่ทำการเปลีย่ นแปลงอาจปรากฏขึน้ ด้วย
เคล็ดลับ: คุณสามารถเพิ่มหรือแก้ไขคำอธิบายในคอลัมน์เหตุผลที่ทำการเปลีย่ นแปลง
4ตรวจสอบรายการการเปลี่ยนแปลง ระบุเหตุผลโดยละเอียดหากจำเป็น

5โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก Save Changes (บันทึกการเปลีย่ นแปลง) เพื่อบันทึกการเปลีย่ นแปลงที่ดำเนินการกับไฟล์ตลอดจน
การเปลี่ยนแปลงใด ๆ ที่คุณดำเนินการกับกับตาราง แล้วปิดกล่องโต้ตอบ
การเปลี่ยนแปลงในไฟล์และเหตุผลที่ทำการเปลีย่ นแปลงจะปรากฏในเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์

nคลิก Cancel Changes (ยกเลิกการเปลีย่ นแปลง) เพื่อย้อนกลับไฟล์เป็นสถานะก่อนหน้าและปิดกล่อง
โต้ตอบ
การเปลี่ยนแปลงจะไม่บนั ทึกลงในไฟล์และจะไม่มกี ารอัปเดตเส้นทางการตรวจสอบ

48 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEรหัสผ่านปกป้องไฟล์
เพื่อเป็นการเพิม่ ระดับความปลอดภัย CFX Maestro Dx SE ช่วยให้ผู้ใช้ตั้งรหัสผ่านสำหรับไฟล์ที่ปลอดภัยทัง้ หมดเมือ่ ตั้งรหัสผ่านสำหรับไฟล์ที่ปลอดภัย ให้พิจารณาเงือ่ นไขต่อไปนี้

เงือ
่ นไข

การดำเนินการ

ไม่ต้องใช้รหัสผ่าน

ผู้ใช้ทุกรายสามารถเปิด แก้ไข และบันทึกไฟล์ทปี่ ลอดภัยได้
ตามสิทธิ์อนุญาตที่ผู้ใช้มี

ไฟล์ที่ตอ้ งใช้รหัสผ่านสำหรับบันทึก

ผู้ใช้ทุกรายสามารถเปิดไฟล์ทปี่ ลอดภัยได้ และผู้ใช้ที่ทราบรหัส
ผ่านสำหรับการบันทึกสามารถแก้ไขและบันทึกไฟล์ทปี่ ลอดภัย
ได้ไฟล์ที่ตอ้ งใช้รหัสผ่านสำหรับเปิด

เฉพาะผู้ใช้ที่ทราบรหัสผ่านสำหรับเปิดไฟล์เท่านั้นทีส่ ามารถ
เปิด แก้ไข และบันทึกไฟล์ที่ปลอดภัยได้

ไฟล์ที่ตอ้ งใช้ทั้งรหัสผ่านสำหรับเปิด

ผู้ใช้บางรายสามารถเปิดไฟล์ทปี่ ลอดภัย และกลุม่ ย่อยของผูใ้ ช้และสำหรับการบันทึก

เหล่านั้นสามารถแก้ไขและบันทึกไฟล์ได้

ผู้ใช้ทุกรายสามารถดำเนินการ “บันทึกเป็น” เพื่อสร้างไฟล์ที่ปลอดภัยใหม่ด้วยชื่ออืน่ หรือบันทึกไฟล์ทมี่ ีชื่อเดียวกันใน
ตำแหน่งอื่นได้ตราบเท่าที่มหี นึง่ ในคุณสมบัติต่อไปนี้ โดยขึ้นอยูก่ ับบทบาทของผู้ใช้
nไฟล์ทปี่ ลอดภัยไม่ได้รับการปกป้องด้วยรหัสผ่าน

nผู้ใช้มรี หัสผ่านเพื่อเปิดไฟล์

เคล็ดลับ: ไฟล์ใหม่จะบันทึกโดยไม่มกี ารปกป้องด้วยรหัสผ่าน ไฟล์ต้นฉบับยังคงมีรหัสผ่านของตนอยู่
ผู้ใช้สามารถแก้ไขและบันทึกไฟล์ต้นฉบับได้หากไฟล์มคี ุณสมบัติหนึง่ ในข้อต่อไปนี้ โดยขึน้ อยูก่ บั บทบาทของผู้ใช้
nไฟล์ไม่ได้รบั การปกป้องด้วยรหัสผ่าน

nผู้ใช้มรี หัสผ่านสำหรับเปิดและรหัสผ่านสำหรับบันทึกไฟล์

หมายเหตุ: บทบาทของผูใ้ ช้ตอ้ งมีสทิ ธิใ์ นการบันทึกไฟล์เพื่อตั้งรหัสผ่าน ตัวอย่างเช่น ผู้ใช้ที่มบี ทบาทเป็นผู้เยี่ยม
ชมไม่สามารถบันทึกไฟล์ได้ ดังนัน้ จึงไม่สามารถตั้งรหัสผ่านสำหรับไฟล์ได้
สำคัญ: เฉพาะผู้ดูแลระบบ CFX Maestro Dx SE เท่านั้นที่สามารถรีเซ็ตหรือลบรหัสผ่าน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 49บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionวิธตี ั้งรหัสผ่านเพื่อปกป้องไฟล์
1เข้าสูร่ ะบบ CFX Maestro Dx SE ด้วยข้อมูลสำหรับ Windows ของคุณ

2เปิดไฟล์ที่ปลอดภัย

3เลือก File (ไฟล์) > File Passwords (รหัสผ่านสำหรับไฟล์) กล่องโต้ตอบรหัสผ่านสำหรับไฟล์จะปรากฏขึน
้

4กรอกรหัสผ่านในกล่อง Save Password (รหัสผ่านสำหรับการบันทึก) และ Open Password (รหัสผ่านสำหรับ
เปิด)เคล็ดลับ: ตามค่าเริม่ ต้น รหัสผ่านจะปรากฏเป็นอักขระดอกจันเมือ่ พิมพ์ เลือก Show Password (แสดงรหัสผ่าน) เพื่อแสดงรหัสผ่านขณะที่คณุ พิมพ์
สำคัญ: รหัสผ่านสามารถเป็นได้ทั้งพิมพ์ใหญ่และพิมพ์เล็ก CFX Maestro Dx SE ไม่มขี ้อจำกัดในการตั้ง
รหัสผ่าน สำหรับแนวทางปฏิบตั ิที่ดีที่สดุ โปรดติดต่อผู้ดูแลระบบในสถานที่ของคุณเพื่อทราบข้อกำหนด
เกีย่ วกับรหัสผ่าน

5คลิก Set Passwords (ตั้งรหัสผ่าน) เพือ่ ตัง้ รหัสผ่านและปิดกล่องโต้ตอบ

6เลือก File (ไฟล์) > Save (บันทึก) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงในไฟล์

50 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEวิธลี บรหัสผ่าน
สำคัญ: คุณต้องเป็นผู้ดูแลระบบ CFX Maestro Dx SE เพือ่ ลบรหัสผ่าน
1ในกล่องโต้ตอบต้องใช้รหัสผ่าน คลิก Remove Passwords (ลบรหัสผ่าน)กล่องโต้ตอบการเข้าสูร่ ะบบ CFX Maestro Dx SE จะปรากฏขึน
้

2ระบุชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านของ Windows สำหรับผู้ดูแลระบบ CFX Maestro Dx SE แล้วคลิก OK (ตกลง)ไฟล์ขอ้ มูลต้นฉบับจะปรากฏขึน
้สำคัญ: คุณต้องบันทึกไฟล์เพื่อลบรหัสผ่าน

3เลือก File (ไฟล์) > Save (บันทึก) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงในไฟล์

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 51บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionวิธเี ปลีย่ นรหัสผ่าน
สำคัญ: เฉพาะผู้ดูแลระบบ CFX Maestro Dx SE เท่านั้นที่สามารถเปลีย่ นรหัสผ่านได้
1เปิดไฟล์ที่ปลอดภัย

2เลือก File (ไฟล์) > File Passwords (รหัสผ่านสำหรับไฟล์) กล่องโต้ตอบรหัสผ่านสำหรับไฟล์จะปรากฏขึน
้เคล็ดลับ: รหัสผ่านสำหรับการบันทึก รหัสผ่านสำหรับเปิด และแสดงรหัสผ่าน จะปิดใช้งาน
3คลิก Reset Passwords (รีเซ็ตรหัสผ่าน)กล่องโต้ตอบการเข้าสูร่ ะบบ CFX Maestro Dx SE จะปรากฏขึน
้

52 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

4ระบุชื่อผู้ใช้และรหัสผ่านของ Windows สำหรับผู้ดูแลระบบ CFX Maestro Dx SE แล้วคลิก OK (ตกลง)กล่องโต้ตอบรหัสผ่านสำหรับไฟล์จะปรากฏขึ้น

5

6

โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการรีเซ็ตรหัสผ่านเพื่อปกป้องไฟล์ ให้พิมพ์รหัสผ่านใหม่ในช่องรหัสผ่านที่เหมาะสม

nหากต้องการลบรหัสผ่านสำหรับปกป้องไฟล์ ให้ล้างรหัสผ่านในช่อง

คลิก Set Passwords (ตั้งรหัสผ่าน) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงรหัสผ่านและออกจากกล่องโต้ตอบ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 53บทที่ 4 การใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition

54 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 5 พืน้ ทีท่ ำงาน
ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition มีอนิ เทอร์เฟซสำหรับตั้งค่าเพลต สร้างโปรโตคอล PCR และทดสอบ
ได้บนเครือ่ งมือ CFX Opus Dx Deepwell Dx และวิเคราะห์ข้อมูลจากการทดสอบ PCR
CFX Maestro Dx SE จะแสดงพื้นที่ทำงานหลัก 5 รายการดังนี้
nหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nStartup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)nหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)nหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)nหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)แต่ละพื้นที่ทำงานจะแสดงและอธิบายโดยสังเขปในบทนี้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 55

บทที่ 5 พืน้ ทีท่ ำงาน

หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)CFX Maestro Dx SE จะเปิดหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) และแสดง Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) ที่คุณ
สามารถตั้งค่าการทดลอง ทำการทดสอบหรือทำการทดสอบซ้ำ หรือวิเคราะห์การทดสอบที่มีอยู่ จากหน้าต่าง Home(หน้าหลัก) คุณสามารถดูบนั ทึกการใช้งานและบันทึกเครือ่ งมือ สร้างและจัดการผูใ้ ช้ และเข้าถึงเครือ่ งมือทีเ่ ป็นประโยชน์มากมาย ดูขอ้ มูลเพิ่มเติมใน บทที่ 6, หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)56 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)
ใช้ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้นในการตั้งค่าอย่างรวดเร็วและทำการทดลองที่กำหนดโดยผู้ใช้ หรือเลือกและทำการทดลอง
PrimePCR คุณสามารถใช้ตัวช่วยสร้างนี้ในการทำการทดสอบซ้ำหรือวิเคราะห์ขอ้ มูลการทดสอบได้ด้วย

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 57บทที่ 5 พืน้ ทีท่ ำงาน

หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) คุณสามารถสร้าง เปิด ตรวจสอบ และแก้ไขโปรโตคอลได้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถปรับอุณหภูมขิ องฝาครอบสำหรับโปรโตคอลแบบเปิดได้ ฟังก์ชัน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)มีรายละเอียดอยูใ่ น บทที่ 7, การสร้างโปรโตคอล

58 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) คุณสามารถสร้าง เปิด ตรวจสอบ และแก้ไขเพลตได้ ฟังก์ชัน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) มีรายละเอียดอยูใ่ น บทที่ 8, การเตรียมเพลต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 59บทที่ 5 พืน้ ทีท่ ำงาน

หน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) คุณสามารถดูและเปรียบเทียบข้อมูลการทดสอบ ทำการวิเคราะห์เชิง
สถิติ ส่งออกข้อมูล และสร้างรายงานที่พร้อมสำหรับพิมพ์ได้ ฟังก์ชันการวิเคราะห์ขอ้ มูลมีรายละเอียดอยู่ใน
บทที่ 10, ภาพรวมการวิเคราะห์ข้อมูล และบทที่ 11, รายละเอียดการวิเคราะห์ข้อมูล

60 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ให้อนิ เทอร์เฟซสำหรับการพัฒนาโปรโตคอล PCR, การทดสอบบน
Dx systemsของ CFX และวิเคราะห์ข้อมูลการทดสอบ PCRบทนี้แนะนำเกีย่ วกับ CFX Maestro Dx SE และอธิบายคุณสมบัติที่เข้าใช้งานได้จากหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 61บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)CFX Maestro Dx SE จะเปิดหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) และแสดง Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) ซึ่งคุณสามารถตัง้ ค่าการทดสอบ ดำเนินการหรือทำการทดสอบซ้ำ หรือวิเคราะห์การทดสอบที่ทำอยู่ จากหน้าต่าง
Home (หน้าหลัก) คุณสามารถดูบันทึกการใช้งานและบันทึกเครื่องมือ สร้างและจัดการผู้ใช้ และเข้าถึงเครือ่ งมือ
ที่เป็นประโยชน์มากมาย

คำอธิบายสัญลักษณ์
1แถบชือ่ ซอฟต์แวร์จะแสดงชื่อของซอฟต์แวร์และผูใ้ ช้ทไี่ ด้เข้าสู่ระบบ

2แถบเมนูจะมีทางลัดเพือ่ เข้าถึงเมนู File (ไฟล์), View (ดู), Users (ผู้ใช้), Run (การทดสอบ), Tools (เครื่องมือ), Window (หน้าต่าง) และ Help (ช่วยเหลือ)3คำสัง่ ของแถบเครื่องมือมีทางลัดเพื่อเข้าถึงตัวเลือกเมนู

4บานหน้าต่างด้านซ้ายจะแสดงเครื่องมือทีเ่ ชื่อมต่อกับคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE และมีปุ่มที่
สามารถใช้งานฝาครอบและดูสถานะของเครือ่ งมือได้

62 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)5บานหน้าต่างหลักจะแสดงหน้าต่างทีท่ ำงานอยู่ หน้าต่างที่ทำงานเป็นค่าเริม่ ต้นบนหน้าจอ Home(หน้าหลัก) คือ Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)6แถบสถานะจะแสดงชื่อของเครือ่ งมือทีเ่ ชื่อมต่อและผู้ใช้ที่ได้เข้าสู่ระบบ

คำสั่งเมนูไฟล์
New (ใหม่) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถเลือกสร้างโปรโตคอล เพลต หรือการศึกษายีนใหม่ได้
Open (เปิด) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คุณสามารถเลือกเพื่อค้นหาและเปิดโปรโตคอล เพลต ไฟล์ข้อมูล การศึกษายีน
ไฟล์ LIMS การทดสอบจากเครือ่ งมือแบบสแตนด์อะโลน (stand- alone run) หรือไฟล์การทดสอบ PrimePCR™
Recent Data Files (ไฟล์ข้อมูลล่าสุด) — แสดงรายการของไฟล์ PCR ที่เปิดล่าสุด
Repeat a Run (ทำการทดสอบซ้ำ) — เปิด Windows Explorer ในตำแหน่งที่บันทึกไฟล์ PCR ไว้ ซึ่งคุณจะ
สามารถค้นหาการทดสอบเพื่อทำการทดสอบซ้ำได้
Exit (ออก) — ปิด CFX Maestro Dx SEคำสั่งเมนูดู
Application Log (บันทึกการใช้งาน) — แสดงบันทึกการใช้งานซอฟต์แวร์ตั้งแต่การติดตั้งครั้งแรกจนถึงปัจจุบน
ัRun Reports (รายงานการทดสอบ) — แสดงรายการรายงานการทดสอบ
Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) — แสดง Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) ในบานหน้าต่างหลักRun Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) — แสดงหน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ในบานหน้าต่างหลัก
Instrument Summary (สรุปเครือ่ งมือ) — แสดงหน้าต่าง Instrument Summary (สรุปเครื่องมือ) ในบานหน้าต่าง
หลัก
Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) — สลับระหว่างการแสดงและไม่แสดงเครือ่ งมือที่เชื่อมต่อในบานหน้
าต่างด้านซ้าย ตามค่าเริม่ ต้น ซอฟต์แวร์จะแสดงเครือ่ งมือที่เชื่อมต่อในบานหน้าต่างด้านซ้าย
Toolbar (แถบเครือ่ งมือ) — สลับระหว่างการแสดงและไม่แสดงแถบเครือ่ งมือที่ด้านบนของหน้าจอ ตามค่าเริม่ ต้นซอฟต์แวร์จะแสดงแถบเครือ่ งมือ
Status Bar (แถบสถานะ) — สลับระหว่างการแสดงและไม่แสดงแถบสถานะทีด่ ้านล่างของหน้าจอ ตามค่าเริม่ ต้นซอฟต์แวร์จะแสดงแถบสถานะ
Show (แสดง) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คุณสามารถทำรายการต่อไปนี้
nดูหรือบล็อกบันทึกสถานะ

nเปิดและดูโฟลเดอร์ขอ้ มูล CFX Maestro Dx SEnเปิดและดูโฟลเดอร์ขอ้ มูลของผู้ใช้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 63บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nเปิดและดูโฟลเดอร์ของไฟล์ LIMSnเปิดและดูโฟลเดอร์ PrimePCRnดูประวัติการทดสอบnดูคณุ สมบัติของเครื่องมือที่เชื่อมต่อทั้งหมด

คำสั่งเมนูผใ
ู้ ช้
Select User (เลือกผู้ใช้) — เปิดหน้าจอ Login (เข้าสูร่ ะบบ) ที่คณุ สามารถเลือกผู้ใช้จากรายการ User Name (ชื่อผู้ใช้) แบบเลื่อนลงและเข้าสูแ่ อปพลิเคชัน
Change Password (เปลี่ยนรหัสผ่าน) — เปิดกล่องโต้ตอบ Change Password (เปลี่ยนรหัสผ่าน) ที่ผใู้ ช้สามารถ
เปลีย่ นรหัสผ่าน ของตนได้
หมายเหตุ: ตัวเลือกนี้ถกู ปิดใช้งานสำหรับ CFX Maestro Dx SE ผู้ใช้ต้องเปลี่ยนรหัสผ่าน Windows ของตน
CFX Maestro Dx SEเพื่อเปลีย่ นรหัสผ่าน CFX Maestro Dx SE
User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) — เปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ที่ผู้
ใช้สามารถเปลี่ยนการตั้งค่าเริ่มต้นสำหรับสิง่ ต่อไปนี้
nการส่งและการรับการแจ้งทางอีเมลเมือ่ การทดสอบเสร็จสิน
้nการบันทึกไฟล์ข้อมูล

nการสร้างโปรโตคอลผ่าน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) หรือ Protocol AutoWriter (ระบบเขียน
โปรโตคอลอัตโนมัติ)nการสร้างเพลต

nการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

nการกำหนดคุณภาพของข้อมูล

nการส่งออกข้อมูลของเครือ่ งมือ CFX

User Administration (การจัดการผู้ใช้) — เปิดกล่องโต้ตอบ User Administration (การจัดการผู้ใช้) ที่ผู้ดูแลระบบ
สามารถสร้างผู้ใช้ แก้ไขสิทธิใ์ นบทบาท และกำหนดบทบาทแก่ผใ
ู้ ช้
Bio-Rad Service Login (การเข้าสูร่ ะบบบริการ) — สำหรับให้พนักงานฝ่ายบริการด้านเทคนิคของ Bio-Radใช้งานเท่านั้น ห้ามเลือกคำสัง่ นี้คำสั่งเมนูการทดสอบ
User-defined Run (การทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด) — เปิดหน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ซึง่ คุณจะ
สามารถตั้งค่าโปรโตคอลและเพลตที่ผู้ใช้กำหนด แล้วทำการทดสอบ PCR บนเครือ่ งมือที่เลือกได้

64 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)PrimePCR Run (การทดสอบ PrimePCR) — เปิดแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) ในหน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ที่มีโปรโตคอล PrimePCR ตามค่าเริม่ ต้นและเค้าโครงเพลตทีบ่ รรจุไว้ในเครือ่ งมือที่เลือก
End-Point Only Run (การทดสอบที่จดุ สิน้ สุดเท่านั้น) — เปิดแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) ในหน้าต่าง Run
Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ที่มีโปรโตคอลจุดสิน้ สุดตามค่าเริ่มต้นและเค้าโครงเพลตที่บรรจุไว้ในเครื่องมือที่เลือก
Qualification Run (การทดสอบคุณสมบัติ) — เปิดแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) ในหน้าต่าง Run Setup(การตั้งค่าการทดสอบ) ที่มโี ปรโตคอลคุณสมบัติของ Bio-Rad ตามค่าเริม่ ต้นและเค้าโครงเพลตที่บรรจุไว้ในเครือ่ งมือ
ที่เลือก

คำสั่งเมนูเครื่องมือ
Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณ Master Mix) — เปิดเครือ่ งคำนวณ Master Mix ที่คุณสามารถสร้าง
ส่วนผสมปฏิกริ ยิ าและพิมพ์การคำนวณ
Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) — เปิดกล่องโต้ตอบ Protocol AutoWriter (ระบบเขียน
โปรโตคอลอัตโนมัติ) ทีค่ ุณสามารถสร้างโปรโตคอลใหม่ได้งา่ ย ๆเครือ่ งคำนวณ Ta — เปิดเครือ่ งคำนวณ Ta ที่คุณสามารถคำนวณอุณหภูมิ Annealingของไพรเมอร์ได้ง่าย ๆ
Dye Calibration Wizard (ตัวช่วยสร้างการสอบเทียบสารเรืองแสง) — เปิดตัวช่วยสร้าง Dye Calibration (การสอบเทียบสารเรืองแสง) ที่คณุ สามารถปรับเทียบเครือ่ งมือสำหรับสารเรืองแสงใหม่
Reinstall Instrument Drivers (ติดตั้งไดร์เวอร์เครือ่ งมืออีกครั้ง) — ติดตั้งไดร์เวอร์ที่ควบคุมการสือ่ สารกับเครือ่ งระบบ PCR แบบเรียลไทม์ของ Bio-Rad
Zip Data and Log Files (ไฟล์ข้อมูล Zip และไฟล์บันทึก) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถเลือกไฟล์เพื่อบีบอัด
และบันทึกในไฟล์ zip เพื่อจัดเก็บหรือเพื่อส่งอีเมล
Batch Analysis (การวิเคราะห์แบตช์) — เปิดกล่องโต้ตอบ Batch Analysis (การวิเคราะห์แบตช์) ที่คณุ สามารถ
ตั้งค่าพารามิเตอร์เพือ่ การวิเคราะห์มากกว่าหนึง่ ไฟล์ข้อมูลต่อครั้ง
Options (ตัวเลือก) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถทำดังนี้
nกำหนดการตั้งค่าเซิรฟ์ เวอร์อเี มลของคุณ

nกำหนดการตั้งค่าการส่งออกสำหรับ LIMS และไฟล์ข้อมูลอืน่ ๆเคล็ดลับ: คุณยังสามารถเลือกตัวเลือกเพื่อเริม
่ Seegene Viewer โดยอัตโนมัติเมือ่ ส่งออกหากคุณ
เลือกที่จะส่งออกข้อมูลของคุณในรูปแบบ Seegene

n

เปลีย
่ นภาษาที่แสดงในอินเทอร์เฟซผู้ใช้ (อังกฤษ, จีน, รัสเซีย)สำคัญ: คุณต้องรีสตาร์ท CFX Maestro Dx SE เพื่อแสดงภาษาที่เลือก
สำคัญ: ภาษาของระบบปฏิบัติการที่คุณใช้งานจะต้องตรงกับภาษาที่คณุ ต้องการให้แสดงใน
อินเทอร์เฟซของ CFX Maestro Dx SEคูม่ ือผูใ้ ช้ | 65บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)คำสั่งเมนูชว่ ยเหลือ
เคล็ดลับ: เมนู Help (ช่วยเหลือ) มีอยูบ่ นแถบเมนูในหน้าต่าง CFX Maestro Dx SE ทั้งหมด
Contents (สาร) — แสดงแท็บ Contents (สาร) ในระบบ Help (ช่วยเหลือ) ของ CFX Maestro Dx SE
Index (ดัชนี) — แสดงแท็บ Index (ดัชนี) ในระบบ Help (ช่วยเหลือ) ของ CFX Maestro Dx SE
Search (ค้นหา) — แสดงแท็บ Search (ค้นหา) ในระบบ Help (ช่วยเหลือ) ของ CFX Maestro Dx SEOpen User Guide (เปิดคูม่ อื ผู้ใช้) — เปิดไฟล์ PDF ของคู่มอ
ื นี้
Additional Documentation (เอกสารเพิม่ เติม) — ให้การเข้าถึงคูม่ ือการใช้งาน CFX Opus Dx Real-Time PCR
Systems
Release Notes (บันทึกย่อประจำรุน่ ) — เปิดเอกสาร Release Notes (บันทึกย่อประจำรุน่ ) สำหรับเวอร์ชัน CFX
Maestro Dx SE ที่ติดตั้ง
Video Resources (ทรัพยากรวิดีโอ) — เปิดเว็บไซต์ที่มที รัพยากรวิดีโอของ Bio-Rad เช่น วิดีโอคำแนะนำ
qPCR Applications and Technologies Web Site (แอปพลิเคชัน qPCR และเว็บไซต์เทคโนโลยี) — เปิดแอปพลิเคชัน qPCR และเว็บไซต์เทคโนโลยีของ Bio-Rad ที่คณุ สามารถเรียนรูเ้ พิ่มเกี่ยวกับ PCR แบบเรียลไทม์
(qPCR) ได้
PCR Reagents Web Site (เว็บไซต์น้ำยา PCR) — เปิดเว็บไซต์นำ้ ยาสำหรับ PCR และ qPCR ของ Bio-Rad ที่คุณสามารถสัง่ ซือ้ น้ำยา PCR, Supermix, สารย้อมสี และชุดอุปกรณ์ได้
PCR Plastic Consumables Web Site (เว็บไซต์วัสดุสนิ้ เปลืองจากพลาสติกสำหรับ PCR) — เปิดเว็บไซต์วัสดุ
สิน้ เปลืองจากพลาสติกสำหรับ PCR ของ Bio-Rad ที่คณุ สามารถสั่งซือ้ เพลต PCR ที่ปดิ ผนึกเพลต หลอดและจุกปิด
และอุปกรณ์เสริมอื่น ๆ ที่ทำจากพลาสติก
Software Web Site (เว็บไซต์ซอฟต์แวร์) — เปิดเว็บไซต์ PCR Analysis Software (ซอฟต์แวร์วิเคราะห์ PCR)ของ Bio-Rad ที่คณุ สามารถสัง่ ซือ้ CFX Maestro Dx SE เวอร์ชันที่อปั เดตแล้วของ Bio-Rad ได้
About (เกี่ยวกับ) — แสดงข้อมูลลิขสิทธิแ์ ละเวอร์ชันของ CFX Maestro Dx SEคำสั่งแถบเครื่องมือ
— เปิด Windows Explorer ที่คณุ สามารถนำทางไปยังและเปิดไฟล์ขอ้ มูลหรือไฟล์การศึกษายีน

— เปิด Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณ Master Mix)— เปิดหน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ)66 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)— เปิดหน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ) กับโปรโตคอล PrimePCR ค่าเริม่ ต้นและเค้าโครงเพลตที่
บรรจุในเครือ่ งมือที่เลือก

— เปิด Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 67บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)เมือ่ CFX Maestro Dx SE เริม่ ทำงาน บานหน้าต่างการทำงานจะแสดง Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)
จาก Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) คุณสามารถทำดังนี้
nเลือกเครือ่ งมือจากเครือ่ งมือที่ตรวจพบและตั้งค่าการทดสอบที่ผู้ใช้กำหนดหรือ PrimePCRnเปิดและทำการทดสอบซ้ำ

nเปิดไฟล์ขอ้ มูลเพือ่ วิเคราะห์ผลจากการการทดสอบครัง้ เดียวหรือจากไฟล์การศึกษายีนเพื่อดูผลลัพธ์จาก
การทดสอบการแสดงออกของยีนหลายการทดสอบ

จะมีการอธิบายงานเหล่านีโ้ ดยละเอียดในบทต่อ ๆ ไปแถบสถานะ
ด้านซ้ายของแถบสถานะที่ดา้ นล่างหน้าต่างซอฟต์แวร์หลัก จะแสดงสถานะปัจจุบันของเครือ่ งมือที่ตรวจพบ ด้านขวา
ของแถบสถานะจะแสดงชื่อของผู้ใช้ปัจจุบนั รวมถึงวันที่และเวลา

68 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)บานหน้าต่างเครื่องมือที่ตรวจพบ
บานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) จะแสดงเครื่องมือแต่ละตัวที่เชื่อมต่อกับ CFX Maestro Dx SEคอมพิวเตอร์ ตามค่าเริม่ ต้น เครือ่ งมือแต่ละตัวจะปรากฏเป็นไอคอน และหมายเลขซีเรียลจะปรากฏเป็นชือ่ ของเครือ่ งมือ
จากแผงนีค้ ุณสามารถสามารถทำสิง่ ต่าง ๆ ดังนี้nดูคณุ สมบัติและสารเรืองแสงที่ผา่ นการสอบเทียบสำหรับเครือ่ งมือทีเ่ ลือกสำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับคุณสมบัติของเครือ่ งมือ โปรดดูที่การดูคณุ สมบัติของเครือ่ งมือ ในหน้า 72nดูสถานะของเครือ่ งมือที่เชื่อมต่ออยู่

nเปิดฝาครอบมอเตอร์บนเครือ่ งมือที่เลือก

nปิดฝาครอบมอเตอร์บนเครือ่ งมือที่เลือก

nดูสถานะของเครือ่ งมือที่เชื่อมต่อทั้งหมด

วิธด
ี ส
ู ถานะของเครือ่ งมือทีเ่ ชือ่ มต่ออยู่uในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ให้เลือกเครื่องมือเป้าหมายและทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก View Status (ดูสถานะ) ในส่วน Selected Instrument (เครือ่ งมือทีเ่ ลือก)nคลิกขวาและเลือก View Status (ดูสถานะ) บนเมนูที่ปรากฏขึน
้กล่องโต้ตอบ Run Details (ใช้งานรายละเอียด) จะปรากฏขึ้นและแสดงแท็บ Run Status (ใช้งานสถานะ)สถานะของเครือ่ งมือที่เลือกจะปรากฏขึ้นใต้บานหน้าต่างใช้งานสถานะ เช่น:วิธเี ปิดหรือปิดฝาครอบบนเครือ่ งมือuในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ให้เลือกเครื่องมือเป้าหมายและทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 69บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nคลิก Open Lid (เปิดฝาครอบ) หรือ Close Lid (ปิดฝาครอบ) ในส่วน Selected Instrument (เครือ่ งมือที่
ตรวจพบ)nคลิกขวาและเลือกการดำเนินการที่เหมาะสมบนเมนูที่ปรากฏขึ้น

nเปิดกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ) เลือกแท็บ Run Status (สถานะการทดสอบ) แล้วคลิก Open Lid (เปิดฝาครอบ) หรือ Close Lid (ปิดฝาครอบ)

วิธด
ี ส
ู ถานะของเครือ่ งมือทีต่ รวจพบทั้งหมดuโปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nในส่วน All Instruments (เครือ่ งมือทั้งหมด) ในบานหน้าต่าง Selected Instrument (เครื่องมือที่ตรวจพบ)คลิก View Summary (ดูสรุป)nบนแถบเมนู เลือก View (ดู) > Instrument Summary (สรุปเครือ่ งมือ)กล่องโต้ตอบ Instrument Summary (สรุปเครือ่ งมือ) จะปรากฏขึน
้เคล็ดลับ: หากระบบตรวจพบเครื่องมือที่เชื่อมต่ออยูเ่ พียงเครือ่ งเดียว ส่วน All Instruments (เครือ่ งมือ
ทั้งหมด) จะไม่ปรากฏในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) วิธกี ารดูสรุปเครือ่ งมือ
สำหรับเครือ่ งมือหนึง่ ให้เลือก View (ดู) > Instrument Summary (สรุปเครือ่ งมือ)70 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)Instrument Summary Toolbar Controls (การควบคุมแถบเครือ่ งมือการสรุปเครื่องมือ)ตาราง 5 จะแสดงการควบคุมและฟังก์ชันในแถบเครือ่ งมือ Instrument Summary (สรุปเครื่องมือ)ตาราง 5 Instrument Summary Toolbar Controls (การควบคุมแถบเครือ่ งมือการสรุปเครือ่ งมือ)ปุม่ชื่อปุม
่ฟังก์ชน
ัสร้างการทำงานใหม่

สร้างการทำงานบนบล็อกทีเ่ ลือกโดยการเปิด
หน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)STOP (หยุด)หยุดการทำงานปัจจุบันบนบล็อกที่เลือก

หยุดชั่วคราว

หยุดการทำงานปัจจุบันบนบล็อกที่เลือก
ชั่วคราว

ใช้งานต่อ

ใช้งานการทำงานในบล็อกที่เลือกต่อ

กะพริบ Block Indicatorกะพริบไฟ LED ของตัวระบุบนฝาครอบของ

(ตัวระบุบล็อก)บล็อกทีเ่ ลือกOpen Lid (เปิดฝา)เปิดฝาครอบมอเตอร์ของบล็อกที่เลือก

Close Lid (ปิดฝา)ปิดฝาครอบมอเตอร์ของบล็อกที่เลือก

Hide Selected Blocks (ซ่ซ่อนบล็อกทีเ่ ลือกในรายการ Instrumentอนบล็อกทีเ่ ลือก)Summary (สรุปเครื่องมือ)Show All Blocks (แสดงแสดงบล็อกที่เลือกในรายการ Instrumentบล็อกทัง้ หมด)Summary (สรุปเครื่องมือ)Show (แสดง)เลือกบล็อกที่จะแสดงในรายการ เลือกตัวเลือก
ใดตัวเลือกหนึ่งเพือ่ แสดงบล็อกที่ตรวจพบ
ทั้งหมด บล็อกว่างทัง้ หมด บล็อกทั้งหมดที่
กำลังทำงานด้วยผู้ใช้ปัจจุบัน หรือบล็อกที่
กำลังทำงานทั้งหมด

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 71บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)การดูคณุ สมบัตขิ องเครื่องมือ
จากบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) คุณสามารถดูรายละเอียดเกีย่ วกับเครื่องมือทีเ่ ลือกได้
ซึง่ ประกอบด้วยคุณสมบัติของเครือ่ งมือ สถานะของสกรูสำหรับการจัดส่ง (สำหรับเครือ
่ ง CFX Connect และ CFX
Touch เท่านัน้ ) และรายการสารเรืองแสงที่ได้รบั การสอบเทียบ

วิธกี ารดูคุณสมบัติของเครือ่ งมือuในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ให้คลิกขวาที่เครือ่ งมือเป้าหมาย และเลือก
Properties (คุณสมบัติ) บนเมนูที่ปรากฏขึ้นมา

แท็บ Properties (คุณสมบัติ)แท็บ Properties (คุณสมบัติ) จะแสดงรายละเอียดทางเทคนิคเกีย่ วกับเครือ่ งมือที่เลือก โดยประกอบด้วยรุน่ หมายเลข
เครือ่ งของส่วนประกอบ และเวอร์ชนั เฟิรม์ แวร์ ชือ่ เริม่ ต้นของเครือ่ งมือ (หมายเลขเครือ่ ง) จะปรากฏขึ้นในหลาย
ตำแหน่ง รวมถึงในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) และในแถบส่วนหัวของกล่องโต้ตอบ
Instrument Properties (คุณสมบัติของเครือ่ งมือ) คุณสามารถเปลี่ยนชื่อเครือ่ งมือเพื่อให้สามารถระบุได้ง่ายขึ้น
หมายเหตุ: คุณไม่สามารถเปลี่ยนชื่อเครือ่ งมือ CFX Opus ที่ใช้ CFX Maestro ได้แท็บ Calibrated Dyes (สารเรืองแสงที่ได้รบั การสอบเทียบ)แท็บ Calibrated Dyes (สารเรืองแสงที่ได้รบั การสอบเทียบ) จะแสดงสารเรืองแสงและเพลตที่ปรับเทียบสำหรับ
เครือ่ งมือที่เลือก

หากต้องการดูข้อมูลโดยละเอียดเกี่ยวกับการสอบเทียบ ให้คลิกปุม
่ Info (ข้อมูล) ในคอลัมน์ Detail (รายละเอียด)72 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่ก่อนที่คุณจะเริ่ม
ส่วนนีอ้ ธิบายงานที่คณุ อาจต้องดำเนินการก่อนใช้งาน CFX Maestro Dx SE ซึ่งรวมถึง
nการสร้างส่วนผสมหลักสำหรับปฏิกริ ยิ าnการสอบเทียบสีฟลูออเรสเซนต์ใหม่

การสร้างส่วนผสมหลักสำหรับปฏิกริ ิยาเมือ่ ใช้ Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก) ของ CFX Maestro Dx SE คุณจะสามารถคำนวณ
ปริมาณที่ต้องการของแต่ละส่วนประกอบในส่วนผสมหลักของคุณได้อย่างง่ายดาย คุณสามารถพิมพ์ตารางการ
คำนวณส่วนผสมหลักไปยังเครื่องพิมพ์เริม่ ต้นของคุณ และบันทึกการคำนวณสำหรับแต่ละเป้าหมายเพื่อใช้ใน
ภายหลังได้

วิธกี ารสร้างส่วนผสมหลักสำหรับปฏิกริ ยิ าโดยใช้ Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก)1หากต้องการเปิด Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Master Mix Calculator (เครื่องคำนวณส่วนผสมหลัก)nคลิกแถบเครือ่ งมือ Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก)Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก) จะปรากฏขึน้คูม่ ือผูใ้ ช้ | 73บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)2ในหัวข้อ Reaction (ปฏิกริ ยิ า) ให้เลือกวิธกี ารตรวจจับดังนี้nSYBR® Green/EvaGreen®

n

โพรบ

3

หากต้องการสร้างเป้าหมายใหม่ ในหัวข้อ Target (เป้าหมาย) ให้คลิก Create New (สร้างใหม่) ชื่อเป้าหมาย
ใหม่จะปรากฏในรายการเป้าหมายแบบเลื่อนลง

4(ไม่บังคับ) วิธเี ปลีย่ นชื่อเป้าหมายเริม่ ต้นaไฮไลต์ชื่อเป้าหมายในรายการเป้าหมายแบบเลื่อนลงbพิมพ์ชื่อเป้าหมายใหม่ในช่อง Target (เป้าหมาย)cกดปุ่ม Enter5ปรับความเข้มข้นเริม่ ต้นและความเข้มข้นขั้นสุดท้ายสำหรับฟอร์เวิรด์ และรีเวิร์สไพรเมอร์และโพรบทั้งหมด

6ในหัวข้อ Master Mix Setup (ตั้งค่าส่วนผสมหลัก) ให้ปรับค่าสำหรับ
nจำนวนปฏิกริ ยิ าที่จะทดสอบ

74 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่nปริมาณปฏิกริ ยิ าต่อหลุม

nปริมาณเทมเพลตต่อหลุม

nความเข้มข้นของ Supermix ต่อหลุม

nปริมาณปฏิกริ ยิ าที่มากเกินไปต่อหลุม

7(ไม่บังคับ) ดำเนินการตามขั้นตอน 2–6 กับเป้าหมายในจำนวนเท่าที่จำเป็น

8ในหัวข้อ Choose Target to Calculate (เลือกเป้าหมายในการคำนวณ) ให้เลือกเป้าหมายที่จะคำนวณ
เคล็ดลับ: คุณสามารถคำนวณเป้าหมายเพียงหนึง่ เป้าหมาย หรือหลายเป้าหมาย หรือเป้าหมายทั้งหมดพร้อม
กันได้
ปริมาณที่คำนวณได้ของส่วนประกอบทีต่ ้องการสำหรับแต่ละเป้าหมายที่เลือกจะปรากฏในตารางส่วนผสมหลัก

9คลิก Set as Default (ตั้งค่าเป็นค่าเริม่ ต้น) เพื่อตั้งค่าการป้อนข้อมูลปริมาณในหัวข้อ Target and Master Mix
Setup (ตัง้ ค่าเป้าหมายและส่วนผสมหลัก) ให้เป็นค่าเริม่ ต้นใหม่

10 คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกเนื้อหาของกล่องโต้ตอบ Master Mix Calculator (เครือ่ งคำนวณส่วนผสมหลัก)วิธพี ิมพ์ตารางคำนวณส่วนผสมหลักuหากต้องการพิมพ์ตารางคำนวณส่วนผสมหลัก ให้คลิก Print (พิมพ์)ตารางคำนวณจะพิมพ์ไปยังเครือ่ งพิมพ์เริ่มต้นของคุณ

วิธบี ันทึกตารางคำนวณส่วนผสมหลักเป็นไฟล์ PDFuเปลีย่ นเครือ่ งพิมพ์เริม่ ต้นของคุณเป็นไดรเวอร์ PDF และคลิก Print (พิมพ์) บน Master Mix Calculator (เครื่อง
คำนวณส่วนผสมหลัก)วิธลี บเป้าหมายuเลือกเป้าหมายโดยใช้รายการเป้าหมายแบบเลือ่ นลง แล้วคลิก Remove (ลบ)สำคัญ: การลบเป้าหมายออกจากรายการเป้าหมายจะเป็นการลบเป้าหมายออกจากการคำนวณส่วนผสม
หลักที่เป้าหมายนัน้ ใช้ด้วย ควรใช้ความระมัดระวังเมื่อทำการลบเป้าหมาย

การสอบเทียบสารย้อมสีใหม่
CFX Opus 96 Dx และ CFX Opus Deepwell Dx System ได้รบั การสอบเทียบสารเรืองแสงที่นยิ มใช้ในเพลตหลุม
สีขาวและเพลตหลุมใสมาจากโรงงาน The CFX Opus 384 Dx System ได้รับการสอบเทียบสารเรืองแสงที่นยิ มใช้
เฉพาะในเพลตหลุมสีขาวมาจากโรงงาน ตาราง 6 แสดงรายการสารเรืองแสงและช่องทางสำหรับการสอบเทียบ
เครือ่ งมือแต่ละตัว
หมายเหตุ: The CFX Opus 96 Dx, CFX Opus 384 Dx และ CFX Opus Deepwell Dx System ยังมีช่อง
เฉพาะสำหรับเคมี FRET ด้วย ช่องทางนี้ไม่จำเป็นต้องมีการสอบเทียบสารเรืองแสงเฉพาะ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 75บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)สำคัญ: หากคุณทำการสอบเทียบสารเรืองแสงเองซึ่งได้รบั การสอบเทียบมาจากโรงงานแล้ว เครื่องมือจะใช้การ
สอบเทียบทีผ่ ู้ใช้กำหนดแทนการสอบเทียบจากโรงงาน
ตาราง 6 สอบเทียบสารเรืองแสงจากโรงงาน, ช่องทางและเครือ่ งมือ

สารเรืองแสง

ช่องทาง

การกระตุ้น, nmการตรวจจับ, nm

FAM, SYBR®

1

450–490515–530

Green Iเครือ่ งมือ
CFX Opus 96
Dx, CFX Opus
384 Dx และ
CFX Opus
Deepwell Dxsystem

VIC, HEX,

2

515–535

560–580

CFX Opus 96

CAL Fluor

Dx ,CFX Opus

Gold 540, Cal

384 Dx และ

Fluor Orange

CFX Opus

560

Deepwell Dxsystem

ROX, Texas

3560–590

610–650

CFX Opus 96

Red,

Dx, CFX Opus

CAL Fluor

384 Dx และ

Red 610, TEX

CFX Opus

615

Deepwell Dxsystem

CY5, Quasar

4

620–650

675–690670

CFX Opus 96
Dx, CFX Opus
384 Dx และ
CFX Opus
Deepwell DxsystemQuasar 705,5

672–684705–730

Cy5.5

CFX Opus 96
Dx system เท่านัน้สารเคมี FRET (ไม่ได้สอบเทียบมาจากโรงงาน)76 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่สารเรืองแสง

ช่องทาง

การกระตุ้น, nmการตรวจจับ, nmสีทไี่ ม่ได้สอบ

FRET

450–490560-580เครือ่ งมือ
CFX Opus 96เทียบมาจาก

Dx, CFX Opusโรงงาน

384 Dx และ
CFX Opus
Deepwell Dxsystemวิธปี รับสอบสารย้อมสีใหม่สำหรับระบบ CFX
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือกอุปกรณ์เป้าหมายในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่
ตรวจพบ)2เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Calibration Wizard (ตัวช่วยสร้างการสอบเทียบ) เพื่อเปิด Dye Calibration wizard(ตัวช่วยสร้างการสอบเทียบสารเรืองแสง)สารเรืองแสงที่ปรับเทียบแล้วสำหรับเครื่องมือเป้าหมายจะปรากฏในตาราง Calibrated Fluorophores (สารเรือง
แสงที่ปรับเทียบแล้ว)3ในหัวข้อ Calibrate New or Existing Fluorophores (ปรับเทียบใหม่หรือสารเรืองแสงที่มี) ให้เลือกสารเรืองแสง
ที่จะทำการสอบเทียบจากรายการแบบเลื่อนลง
หากชื่อสารเรืองแสงไม่อยู่ในรายการ ให้พิมพ์ชื่อลงในกล่องข้อความเพือ่ เพิม่ ลงในรายการ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 77บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)สำคัญ: โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ ตั้งชื่อสารเรืองแสงที่ปรับเทียบเอง หากคุณสร้างการสอบเทียบสารเรือง
แสงแบบกำหนดเองสำหรับสารเรืองแสงทีม่ ีชื่อเดียวกับสารเรืองแสงที่ได้รบั การสอบเทียบจากโรงงาน สารเรืองแสงที่กำหนดเอง (ไม่ใช่สารเรืองแสงที่ปรับเทียบจากโรงงาน) จะเป็นสารที่เครือ่ งมือใช้ในระหว่าง
การทดสอบ
4เลือกประเภทของเพลตสำหรับสารเรืองแสง
หากประเภทของเพลตไม่อยูใ่ นรายการ ให้พิมพ์ชื่อในกล่องข้อความเพื่อเพิ่มลงในรายการ

5เลือกช่องทางสำหรับสารเรืองแสง

6เลือกคอลัมน์เพลตสำหรับสารเรืองแสง

7(ไม่บังคับ) พิมพ์สเี พื่อเชื่อมโยงกับสารเรืองแสง

8คลิก Add to Plate (เพิม่ ไปยังเพลต) เพื่อเพิ่มสารเรืองแสง

9(ไม่บังคับ) ทำซ้ำขั้นตอนที่ 3–8 เพื่อเพิ่มสารเรืองแสงแต่ละรายการที่คณุ วางแผนจะทำการสอบเทียบสำหรับ
เพลต

10 เมือ่ ทำการเพิม่ สารเรืองแสงเสร็จสิน้ ให้คลิก View Plate (ดูเพลต) เพื่อเปิดหน้าต่าง Pure Dye Plate Display(แสดงเพลตสารย้อมสีบริสุทธิ์)ใช้หน้าต่างนีเ้ ป็นแนวทางในการบรรจุสารย้อมสีลงในเพลต
11 เตรียมเพลตแบบ 96 หลุม, 384 หลุม หรือแบบหลุมลึกสำหรับการสอบเทียบสารเรืองแสง
aใช้ปิเปตต์หยดสารย้อมสีลงในแต่ละหลุมตามรูปแบบทีแ่ สดงใน Pure Dye Plate Display (แสดงเพลตสาร
ย้อมสีบริสทุ ธิ์)bสำหรับสารเรืองแสงแต่ละรายการ ให้ใส่สารย้อมสีปริมาณ 300 nM ลงในหลุม 50 µl (เพลต 96 หลุมหรือ
แบบหลุมลึก) หรือ 30 µl (เพลต 384 หลุม) จำนวน 4 หลุม จะสังเกตเห็นว่าเพลตอย่างน้อยครึง่ หนึง่ เป็นหลุมเปล่า

cปิดผนึกเพลตด้วยวิธปี ิดผนึกที่คณุ จะใช้ในการทดสอบของคุณ

12 วางเพลตที่จะทำการสอบเทียบลงในบล็อกและปิดฝา
13 ใน Dye Calibration Wizard (ตัวช่วยสร้างการสอบเทียบสารเรืองแสง) ให้คลิก Calibrate (สอบเทียบ) แล้วคลิก
OK (ตกลง) เพือ่ ยืนยันว่าเพลตอยูใ่ นบล็อก
14 เมือ่ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ทำการสอบเทียบเสร็จสิน้ กล่องโต้ตอบจะปรากฏขึน้ คลิก
Yes (ใช่) เพื่อสิน้ สุดการสอบเทียบและเปิด Dye Calibration Viewer (โปรแกรมดูการสอบเทียบสารเรืองแสง)15 คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ปิดหน้าต่าง

การตัง้ ค่า User Preferences (การกำหนดค่าของผูใ้ ช้)เคล็ดลับ: ไม่จำเป็นต้องดำเนินการเหล่านีเ้ พื่อใช้ CFX Maestro Dx SE คุณสามารถข้ามส่วนนีไ้ ด้หรือ
ดำเนินการเหล่านีไ้ ด้ตลอดเวลาอย่างปลอดภัย

78 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่ใน CFX Maestro Dx SE ผูใ้ ช้แต่ละรายสามารถปรับแต่งสภาพแวดล้อมการทำงานของตนเองได้ เช่น ในเมนู Users(ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) คุณสามารถทำสิง่ ต่อไปนีไ้ ด้nตั้งค่าการแจ้งอีเมลเมือ่ การทดสอบเสร็จสิน
้หมายเหตุ: คุณลักษณะนีม้ ใี ห้เฉพาะผู้ใช้ที่ได้รบั บทบาทที่มีสทิ ธิน์ เี้ ท่านัน้ ดูการจัดการบทบาทของผู้ใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ในหน้า 43 สำหรับข้อมูล
เพิ่มเติมnเปลีย่ นการตั้งค่าเริม่ ต้นสำหรับรายการต่อไปนี้oตำแหน่งที่คุณบันทึกไฟล์oไฟล์ตั้งค่าการทดสอบoคำนำหน้าการตั้งชือ่ ไฟล์

nตั้งค่าพารามิเตอร์เริม่ ต้นเพื่อใช้เมื่อสร้างโปรโตคอลและเพลตใหม่

nตั้งค่าการวิเคราะห์ข้อมูลเริม่ ต้นและพารามิเตอร์การแสดงออกของยีน

nกำหนดพารามิเตอร์ควบคุมคุณภาพเริ่มต้นเองnวิธปี รับแต่งพารามิเตอร์การส่งออกข้อมูล

ในเมนู Tools (เครือ่ งมือ) คุณสามารถทำสิง่ ต่อไปนีไ้ ด้nสร้างน้ำยาทดสอบ (master mix)nปรับเทียบสารย้อมสีสำหรับเครือ่ งมือที่เฉพาะเจาะจง

หมายเหตุ: การสอบเทียบ master mix และสารเรืองแสงพร้อมใช้งานสำหรับทุกคนที่เข้าสูร่ ะบบซอฟต์แวร์
ส่วนนีอ้ ธิบายวิธดี ำเนินการเหล่านี้

การตั้งค่าการแจ้งเตือนทางอีเมล
คุณสามารถเชื่อมต่อ CFX Maestro Dx SE กับเซิร์ฟเวอร์อเี มลขาออกของคุณเพื่อส่งการแจ้งเตือนทางอีเมลเกี่ยวกับ
การดำเนินการทดสอบเสร็จสิน้ ให้กบั รายชื่อผู้ใช้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถเลือกที่จะแนบไฟล์สารและรายงานการ
วิเคราะห์ให้กบั รายชือ่ ผู้ใช้ได้ หากต้องการตั้งค่าการเชื่อมต่อระหว่าง CFX Maestro Dx SE และเซิร์ฟเวอร์ SMTP
ของคุณ โปรดดูที่การเชื่อมต่อ Security Edition เข้ากับเซิรฟ์ เวอร์ SMTP ในหน้า 81หมายเหตุ: ความสามารถของผู้ใช้ในการเข้าถึงคุณลักษณะการตั้งค่าอีเมลจะขึน้ อยูก่ บั บทบาทและสิทธิข์ องผู้ใช้
ที่ผู้ดูแลระบบกำหนดให้ สำหรับรายละเอียดเกีย่ วกับการจัดการผูใ้ ช้และหน้าที่ของผู้ใช้ โปรดดูที่
การจัดการบทบาทของผู้ใช้ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ในหน้า 43คูม่ ือผูใ้ ช้ | 79บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)วิธตี ั้งค่าการแจ้งเตือนทางอีเมล
1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) จะปรากฏขึน้ มาโดยแสดงแท็บ Email (อีเมล)หมายเหตุ: คุณจะได้รบั แจ้งหากระบบตรวจพบว่าคุณไม่ได้ตั้งค่าเซิรฟ์ เวอร์ SMTP ที่ถกู ต้องสำหรับ CFX
Maestro Dx SE คลิก Configure Outgoing Email (กำหนดค่าอีเมลขาออก) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ
Options (ตัวเลือก) และกำหนดค่าเซิร์ฟเวอร์อเี มล SMTP สำหรับสารเพิม่ เติม โปรดดูที่การเชื่อมต่อ
Security Edition เข้ากับเซิรฟ์ เวอร์ SMTP ในหน้า 81
2ในกล่องข้อความ To (ถึง) ให้พิมพ์ที่อยูอ่ ีเมลของแต่ละคนทีค่ ุณวางแผนจะแจ้งให้ทราบว่าการดำเนินการทดสอบ
เสร็จสิน้ ผูร้ ับทุกคนจะได้รบั อีเมลหลังจากการดำเนินการทดสอบเสร็จสิน
้หมายเหตุ: คุณต้องป้อนที่อยูอ่ ีเมลแต่ละที่อยูแ่ ยกบรรทัดกัน กด Enter หรือ Return (กลับ) หลังจากที่อยู่แต่
ละที่อยู่

3(ไม่บังคับ) ในกล่องข้อความ cc ให้พิมพ์ที่อยู่อเี มลของผู้รบั ที่คุณวางแผนจะส่งสำเนาของการแจ้งเตือนทางอีเมล
แต่ละครัง้

4(ไม่บังคับ) ตามค่าเริม่ ต้น ผู้รบั ทุกคนจะได้รบั สำเนาของไฟล์ข้อมูลเป็นไฟล์แนบ ล้างช่องทำเครือ่ งหมายนีห้ ากคุณไม่ต้องการแนบสำเนาไฟล์ข้อมูล

5(ไม่บังคับ) เลือก Attach Analysis Report (แนบรายงานการวิเคราะห์) เพื่อแนบไฟล์ PDF ของรายงานการ
วิเคราะห์ไปกับอีเมล

6คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้)หมายเหตุ: คุณอาจสามารถกำหนดค่าระบบให้สง่ การแจ้งเตือนทางอีเมลไปยังโทรศัพท์มือถือของคุณได้ ทั้งนีข้ ึ้นอยู่กบั ผู้ให้บริการของคุณ ติดต่อผู้ให้บริการโทรศัพท์มือถือของคุณ เพื่อขอข้อมูลเฉพาะเกี่ยวกับที่อยูอ่ เี มลสำหรับ
โทรศัพท์มอื ถือของคุณ ป้อนที่อยูอ่ เี มลของโทรศัพท์ (เช่น 5552221234@your_service_provider_
EmailDomain.net) ในกล่องข้อความ "To" ของหน้าจอ User Preferences (การกำหนดค่าของผูใ
้ ช้)80 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม่วิธแี ก้ไขที่อยูอ่ เี มลของผู้รบัuแก้ไขที่อยูอ่ เี มลตามที่จำเป็น แล้วคลิก OK (ตกลง)วิธกี ารลบผูร้ บั อีเมลออก
1เลือกผู้รบั อีเมลและกดปุม
่ Delete (ลบ)

2คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม่ นี้การเชือ่ มต่อ Security Edition เข้ากับเซิรฟ์ เวอร์ SMTP
สำคัญ: ผู้ให้บริการเว็บเมลเชิงพาณิชย์บางรายได้เพิ่มการรักษาความปลอดภัยสำหรับอีเมล หากคุณใช้บญั ชีเหล่านี้ คุณต้องเปิดใช้งานการตั้งค่า อนุญาตแอปที่มีความปลอดภัยต่ำ ในการตั้งค่าบัญชีเพื่อเปิดใช้งาน CFX
Maestro Dx SE เพื่อส่งอีเมล ดูสารเพิม่ เติมได้ที่สารการรักษาความปลอดภัยของผู้ให้บริการเว็บเมล
หากคุณกำลังใช้เซิร์ฟเวอร์ SMTP ของ Google Gmail หรือ Microsoft Office 365 เพื่อส่งอีเมล คุณจะต้องเปิดใช้
งานการตรวจสอบยืนยัน 2 ปัจจัยและสร้าง "รหัสผ่านสำหรับแอป" ในการตั้งค่าบัญชี Gmail หรือ Office365 สำหรับ
การตรวจสอบยืนยันในกล่องโต้ตอบการตั้งค่าอีเมลของ Maestro ให้คดั ลอกและวาง “รหัสผ่านสำหรับแอป” ลงในช่อง Password (รหัสผ่าน) แทนที่รหัสผ่านปกติของอีเมล
คุณต้องสร้างการเชื่อมต่อจาก CFX Maestro Dx SE ไปยังเซิรฟ์ เวอร์อเี มลก่อนที่ซอฟต์แวร์จะสามารถส่งการแจ้ง
เตือนอีเมลได้

วิธเี ชื่อมต่อ CFX Maestro Dx SE กับเซิรฟ์ เวอร์อเี มล1โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) และคลิก Configure Outgoing Email(กำหนดค่าอีเมลส่งออก) บนแท็บ Email (อีเมล)nเลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Options (ตัวเลือก)กล่องโต้ตอบ Option (ตัวเลือก) จะปรากฏขึ้นและแสดงแท็บ Email (อีเมล)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 81บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)2ระบุข้อมูลต่อไปนี้ของบริษทั ของคุณ
n

SMTP Server Name (ชือ่ เซิรฟ์ เวอร์ SMTP) — ชื่อของเซิรฟ์ เวอร์อเี มลขาออกทีบ่ ริษทั ของคุณ

nPort (พอร์ต) — หมายเลขพอร์ตของเซิรฟ์ เวอร์ SMTP โดยทั่วไปแล้วจะเป็น 25

n

Use SSL (ใช้ SSL) — ตัวเลือก Secure Sockets Layer (SSL) บางเซิร์ฟเวอร์ SMTP ต้องมีการตั้งค่านี้
หากบริษทั ของคุณไม่ได้กำหนดไว้ ให้ยกเลิกการเลือกช่องทำเครือ่ งหมายนี้

nใช้ที่อยู่ “จาก” ตามค่าเริม่ ต้น — ชื่อของเซิรฟ์ เวอร์อีเมลทีบ่ ริษทั ของคุณ บางเซิรฟ์ เวอร์ SMTP กำหนดให้
อีเมลที่สง่ ออกทั้งหมดต้องมีที่อยู่ “จาก” ซึ่งเป็นโดเมนที่จำเพาะ เช่น name@YourCompany.com หากเป็น
กรณีนี้ ให้ยกเลิกการเลือกช่องทำเครื่องหมายนีแ้ ละระบุที่อยู่อเี มลที่ถกู ต้อง

nAuthentication Required (ต้องมีการรับรองความถูกต้อง) — หากเว็บไซต์ของคุณต้องมีการรับรอง
ความถูกต้องของบัญชี ให้ตรวจสอบว่าได้เลือกช่องทำเครือ่ งหมายนี้แล้ว

nUser Name (ชื่อผู้ใช้) — ชื่อของบัญชีที่ได้รบั การรับรองความถูต้อง ต้องระบุหากเลือก Authentication
Required (ต้องมีการรับรองความถูกต้อง)82 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่n

Password (รหัสผ่าน) — รหัสผ่านสำหรับบัญชีทไี่ ด้รบั การรับรองความถูกต้อง ต้องระบุหากเลือก
Authentication Required (ต้องมีการรับรองความถูกต้อง)สำคัญ: หากคุณกำลังใช้เซิร์ฟเวอร์ SMTP ของ Google Gmail หรือ Microsoft Office 365 เพื่อส่งอีเมล
คุณจะต้องเปิดใช้งานการตรวจสอบยืนยัน 2 ปัจจัยจากนั้นจึงสร้าง “รหัสผ่านสำหรับแอป” ในการตั้งค่า
บัญชี Gmail หรือ Office365 สำหรับการตรวจสอบยืนยันในกล่องโต้ตอบการตั้งค่าอีเมลของ Maestro ให้คัดลอกและวาง “รหัสผ่านสำหรับแอป” ลงในช่อง Password (รหัสผ่าน) ของ CFX Maestro Dx SEแทนที่รหัสผ่านปกติของอีเมล
หากต้องการตรวจสอบการตั้งค่าของเซิรฟ์ เวอร์ SMTP ว่าถูกต้องหรือไม่ ให้กรอกที่อยู่อเี มลที่ถกู ต้องในกล่อง
ข้อความ Test Email Address (ทดสอบที่อยู่อเี มล) แล้วคลิก Test Email (ทดสอบอีเมล)หมายเหตุ: บางเซิรฟ์ เวอร์ SMTP ไม่อนุญาตให้แนบไฟล์ แต่บางเซิรฟ์ เวอร์ก็อนุญาตให้แนบไฟล์ขนาดไม่
เกินทีร่ ะบุไว้ หากคุณวางแผนส่งไล์ขอ้ มูลและ/หรือรายงานทางอีเมลโดยใช้ CFX Maestro Dx SE ให้เลือก Test Attachment (ทดสอบการแนบไฟล์) และกำหนดค่าไฟล์ที่แนบให้มีขนาดไม่เกิน 5 เมกะไบท์(MB) หรือมากกว่า
3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

การเปลีย่ นการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้นในแท็บ Files (ไฟล์) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผูใ้ ช้) คุณสามารถเปลีย่ นรายการต่อไป
นีไ
้ ด้
n

ตำแหน่งเริม่ ต้นที่จะบันทึกไฟล์ CFX Maestro Dx SEnไฟล์เริม่ ต้นสำหรับการตั้งค่าการทดสอบ

nพารามิเตอร์การตั้งชื่อไฟล์เริม่ ต้นวิธเี ปลีย่ นการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ Files (ไฟล์)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 83บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)3

ใน Default Folder (โฟลเดอร์เริม่ ต้น) สำหรับหัวข้อ File Creation (การสร้างไฟล์) ให้เลือกโฟลเดอร์เริม่ ต้นที่
คุณต้องการบันทึกไฟล์ใหม่ คุณสามารถเลือกตำแหน่งทีแ่ ตกต่างกันสำหรับไฟล์แต่ละประเภทได้
nProtocol (โปรโตคอล)nPlate (เพลต)n

Data File (ไฟล์ขอ้ มูล)

n

Gene Study (การศึกษายีน)4

ใน File Selection (การเลือกไฟล์) สำหรับหัวข้อ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ให้เลือกโปรโตคอล
เป้าหมายและไฟล์เพลตให้ปรากฏขึน้ เมือ่ คุณเปิดหน้าต่าง Experiment Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)5ในหัวข้อ Data File (ไฟล์ขอ้ มูล) ให้กำหนดค่านำหน้าและ/หรือค่าต่อท้ายสำหรับไฟล์ข้อมูล สำหรับส่วนอืน่ ๆ ให้
เลือกค่าใหม่จากรายการแบบเลือ่ นลง นอกจากนี้ คุณยังสามารถกำหนดค่านำหน้าและค่าต่อท้ายได้เองในกล่อง
ข้อความ Prefix and Suffix (ค่านำหน้าและค่าต่อท้าย)CFX Maestro Dx SE แสดงตัวอย่างชื่อไฟล์ใต้ชอ่ งสำหรับเลือก

6คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม
่ นี้

84 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่การตั้งค่าพารามิเตอร์โปรโตคอลเริม
่ ต้น
วิธต
ี ั้งค่าพารามิเตอร์โปรโตคอลเริม่ ต้นสำหรับ Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) และ Protocol
AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ)1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ Protocol (โปรโตคอล)3ในส่วน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ให้ระบุคา่ สำหรับการตั้งค่าต่อไปนีท้ ี่ปรากฏใน Protocol Editor(ตัวแก้ไขโปรโตคอล)

4

5

n

ปริมาณตัวอย่าง — ปริมาณของแต่ละสารตัวอย่างในหลุม (ในหน่วยไมโครลิตรหรือ µl)n

Lid Shutoff temperature (อุณหภูมปิ ดิ ฝาครอบ) — อุณหภูมใิ นหน่วย ºC ที่ตัวทำความร้อนของฝาครอบ
จะปิดระหว่างการทดสอบ

ในส่วน Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) ให้ระบุค่าสำหรับการตั้งค่าต่อไปนีท้ ี่ปรากฏใน
Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ)n

Annealing temperature (อุณหภูมิ Annealing) — อุณหภูมใิ นหน่วย ºC สำหรับการทดลองที่ใช้ iProof
DNA polymerase, iTaq DNA polymerase หรือ polymerase อืน่ ๆnAmplicon length (ความยาวของ Amplicon) — ความยาวของ amplicon ในหน่วย bpคลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม
่ นี้

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 85บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)การตั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม่ ต้นการเปลี่ยนแปลงที่คุณทำกับแท็บ Plate (เพลต) จะพร้อมใช้งานสำหรับผู้ใช้ซอฟต์แวร์ทุกคน การเปลี่ยนแปลงที่คณ
ุทำระหว่างการตั้งค่าเพลตจะพร้อมใช้งานสำหรับผู้ใช้หลังจากที่คณุ บันทึกและปิดไฟล์เพลตแล้ว
ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) คุณสามารถทำสิ่งต่อไปนี้
nตั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม
่ ต้น

n

เพิ่มชื่อเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุ่มชีวภาพใหม่ลงในไลบรารีที่เกีย่ วข้อง

nลบชื่อเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุ่มชีวภาพออกจากไลบรารีทเี่ กีย่ วข้อง

วิธตี ั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม่ ต้น1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ Plate (เพลต)86 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่

3กำหนดค่าในการตั้งค่าต่อไปนีส้ ำหรับไฟล์เพลตใหม่ ค่าเหล่านีจ้ ะปรากฏในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไข
เพลต)nPlate Type (ประเภทของเพลต)nPlate Size (ขนาดของเพลต)nUnits (หน่วย) — ความเข้มข้นของเทมเพลตเริม่ ต้นสำหรับหลุมที่มตี ัวอย่างมาตรฐาน
CFX Maestro Dx SE ใช้หน่วยเหล่านี้ในการสร้างเส้นโค้งมาตรฐานในแท็บ Data Analysis
Quantification (การหาปริมาณการวิเคราะห์ข้อมูล)4n

Scientific Notation (สัญกรณ์วิทยาศาสตร์) — เมือ่ เลือกตัวเลือกนี้ CFX Maestro Dx SE จะแสดงหน่วย
ความเข้มข้นในสัญกรณ์ทางวิทยาศาสตร์

n

Scan Mode (โหมดสแกน) — จำนวนหรือประเภทของช่องที่จะสแกนระหว่างทำการทดสอบ

n

Fluorophores (สารเรืองแสง) — สารเรืองแสงเริม่ ต้นที่ปรากฏในการควบคุมการบรรจุหลุมใน Plate
Editor (ตัวแก้ไขเพลต)n

Libraries (ไลบรารี) — ชื่อเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุม่ ชีวภาพที่คุณมักใช้ในการทดสอบ
oTarget Names (ชือ่ เป้าหมาย) — ชื่อของยีนและลำดับพันธุกรรมเป้าหมาย

oSample Names (ชื่อตัวอย่าง) — ชื่อของตัวอย่างการทดสอบหรือลักษณะการระบุสำหรับตัวอย่าง
(ตัวอย่างเช่น Mouse1, Mouse2, Mouse3)oBiological Group Names (ชือ่ กลุม่ ชีวภาพ) — ชือ่ สำหรับกลุ่มตัวอย่างที่คล้ายคลึงกันที่มสี ถานะ
การควบคุมตัวแปรหรือเงือ่ นไขเดียวกัน (เช่น 0 ชม., 1 ชม., 2 ชม.)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

วิธเี พิ่มชือ่ เป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพใหม่uในกล่องไลบรารีที่เหมาะสม ให้พิมพ์ชื่อสำหรับเป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพ แล้วคลิก OK (ตกลง)วิธลี บชือ่ เป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพuในกล่องไลบรารีที่เหมาะสม ให้เลือกชื่อและกดปุ่ม Delete (ลบ) แล้วคลิก OK (ตกลง)สำคัญ: ชื่อที่คณุ ลบออกจากไลบรารีจะถูกนำออกจากซอฟต์แวร์และไม่สามารถใช้งานได้อกี ต่อไป หากต้องการ
คืนค่าชือ
่ CFX Maestro Dx SE เริม่ ต้น ให้คลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) การคลิก Restore
Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผูใ้ ช้) จะรีเซ็ตค่าที่
กำหนดทั้งหมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ ทำการลบชือ่ CFX
Maestro Dx SE เริม่ ต้นและเมือ่ คลิกปุม
่ นี้

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 87บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)การตั้งค่าพารามิเตอร์การวิเคราะห์ขอ้ มูลเริ่มต้น
วิธตี ั้งค่าพารามิเตอร์การวิเคราะห์ขอ้ มูลเริม่ ต้น1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เลือกแท็บ Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)

3ในส่วน Analysis Mode (โหมดการวิเคราะห์) เลือกโหมดที่จะวิเคราะห์ขอ้ มูล (สารเรืองแสงหรือเป้าหมาย)4ในส่วน PCR Quantitation (ปริมาณ PCR) ให้ตั้งค่าพารามิเตอร์เริม่ ต้นสำหรับตัวเลือกต่อไปนี้
nBaseline Setting (การตั้งค่าพื้นฐาน) — วิธกี ารพื้นฐานสำหรับโหมดการวิเคราะห์n

Cq Determination Mode (โหมดการกำหนด Cq) — โหมดที่ใช้คำนวณค่า Cq สำหรับแต่ละการติดตาม
สารเรืองแสง (ขีดจำกัดถดถอยหรือขีดจำกัดเดี่ยว)n

Threshold Calc. Mode (โหมดการคำนวณขีดจำกัด) — ปริมาณเป้าหมายในจุดปลายทาง
ค่าเริม่ ต้นคือ Auto (อัตโนมัติ) นัน่ คือซอฟต์แวร์จะคำนวณเป้าหมายจุดปลายทางโดยอัตโนมัติ เมือ่ ต้องการ
ตั้งค่าขีดจำกัดที่เจาะจง ล้างช่องทำเครื่องหมาย Auto (อัตโนมัติ) และป้อนจำนวนจุดปลายทางของคุณที่
คำนวณในหน่วยสารเรืองแสงสัมพัทธ์ (หรือ RFU) ค่าสูงสุดคือ 65000.00 RFUs ไฟล์ขอ้ มูลสำหรับการ
ทดสอบที่ตามมาจะใช้การตั้งค่าขีดจำกัดนี้

88 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่nBaseline Calc. Mode (โหมดการคำนวณพืน้ ฐาน) — ค่าพื้นฐานสำหรับการติดตามทัง้ หมดค่าเริม่ ต้นคือ Auto (อัตโนมัติ) นัน่ คือซอฟต์แวร์จะคำนวณพืน้ ฐานสำหรับการติดตามทั้งหมดโดยอัตโนมัติ
หากต้องการตั้งค่าพืน้ ฐานที่เฉพาะเจาะจง ให้ลา้ งกล่องกาเครือ่ งหมาย Auto (อัตโนมัติ) และป้อนค่าต่ำสุด
และสูงสุดสำหรับช่วงรอบ (1 ถึง 9999) ไฟล์ขอ้ มูลสำหรับการทดสอบที่ตามมาจะใช้ช่วงรอบนี้n5

Log View (มุมมองบันทึก) — กำหนดว่าซอฟต์แวร์จะแสดงข้อมูลการเพิม่ ปริมาณอย่างไรoเปิด — ข้อมูลการเพิ่มปริมาณจะแสดงเป็นกราฟกึง่ ลอการิทึม

oปิด — (ค่าเริม่ ต้น) ข้อมูลการเพิ่มปริมาณจะแสดงเป็นกราฟเชิงเส้น

ในส่วน End Point (จุดปลายทาง) ให้เลือกจำนวนรอบสุดท้ายเพื่อหาค่าเฉลี่ยเมื่อคำนวณการคำนวณจุดปลาย
ทางn

PCR — จำนวนรอบสุดท้ายเพื่อหาค่าเฉลี่ยสำหรับข้อมูลปริมาณ (ค่าเริ่มต้นคือ 5)nการทดสอบ End Point Only (จุดสิน้ สุดเท่านัน้ ) — จำนวนรอบสุดท้ายเพื่อหาค่าเฉลีย่ สำหรับข้อมูลจุด
ปลายทาง (ค่าเริม่ ต้นคือ 2)

6ในส่วน Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ) ให้เลือกประเภทจุดยอดที่จะตรวจจับ (ค่าบวกหรือค่าลบ)7ในส่วน Well Selector (ตัวเลือกช่อง) เลือกวิธกี ารแสดงป้ายช่อง (ตามประเภทตัวอย่าง ชือ่ เป้าหมายหรือชื่อ
ตัวอย่าง)8คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม
่ นี้

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 89บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)การตั้งค่าพารามิเตอร์ไฟล์ขอ้ มูลการแสดงออกของยีนเริ่มต้น
วิธตี ั้งค่าพารามิเตอร์เริม่ ต้นสำหรับไฟล์ขอ้ มูลการแสดงออกของยีนใหม่
1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ Gene Expression (การแสดงออก
ของยีน)3กำหนดค่าสำหรับการตั้งค่าต่อไปนี้
n

Relative to (เทียบกับ) — เขียนกราฟข้อมูลการแสดงออกของยีนเทียบกับตัวควบคุม (ที่เริม่ ต้นที่ 1) หรือเทียบกับศูนย์
oZero (ศูนย์) — ซอฟต์แวร์จะไม่สนใจตัวควบคุม เป็นค่าเริม่ ต้นเมื่อไม่มีการกำหนดตัวอย่างควบคุมใน
หน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)oControl (ตัวควบคุม) — ซอฟต์แวร์จะคำนวณข้อมูลเทียบกับตัวอย่างควบคุมที่กำหนดในหน้าต่าง
Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)n

X-axis (แกน X) — เขียนกราฟตัวอย่างหรือเป้าหมายบนแกน xn

Y-axis (แกน Y) — เขียนกราฟเส้นตรง มาตราส่วน log2 หรือ log10 บนแกน yn

Scaling (การปรับขนาด) — ตัวเลือกการปรับขนาดสำหรับกราฟ (ตัวเลือกเริม่ ต้นคือ ไม่ปรับขนาด)oHighest (สูงสุด) — ซอฟแวร์จะปรับขนาดกราฟไปยังจุดข้อมูลที่สงู ที่สดุoLowest (ต่ำสุด) — ซอฟต์แวร์จะปรับขนาดกราฟไปยังจุดข้อมูลทีต่ ่ำที่สด
ุoUnscaled (ไมปรับขนาด)่ — ซอฟต์แวร์จะแสดงข้อมูลทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาดในกราฟ

nMode (โหมด) — โหมดการวิเคราะห์ ทั้งปริมาณสัมพัทธ์ (∆Cq) หรือการปรับระดับการแสดงออกของยีน
(∆∆Cq)nError Bar (แถบข้อผิดพลาด) — ความแปรปรวนของข้อมูลทีแ่ สดงเป็นค่าเบี่ยงเบนมาตรฐาน (Std. Dev.)
หรือข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลี่ย (Std. Error Mean)nError Bar Multiplier (ตัวคูณแถบข้อผิดพลาด) — ตัวคูณค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานที่ใช้เพื่อสร้างกราฟแถบ
ข้อผิดพลาด (ค่าเริม่ ต้นคือ 1)คุณสามารถเพิม่ ตัวคูณให้เท่ากับ 2 หรือ 3 ได้nSample Types to Exclude (ประเภทตัวอย่างที่จะไม่รวม) — ประเภทตัวอย่างที่จะไม่รวมในการ
วิเคราะห์
คุณสามารถเลือกตัวอย่างอย่างน้อยหนึ่งตัวอย่างเพื่อนำออกจากการวิเคราะห์ได้ หากไม่ต้องการรวมทุก
ประเภทตัวอย่าง ให้เคลียร์ช่องทำเครือ่ งหมายประเภทตัวอย่างที่เลือก

4คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

90 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม่ นี้การปรับแต่งกฎการควบคุมคุณภาพ
ใน CFX Maestro Dx SE คุณสามารถกำหนดกฎการควบคุมคุณภาพ ซึง่ จะมีผลกับข้อมูลในหน้าต่าง Data Analysis(การวิเคราะห์ข้อมูล) ซอฟต์แวร์จะตรวจสอบความถูกต้องของข้อมูลเทียบกับกฎที่คณุ ตั้งขึ้น
หมายเหตุ: ตามค่าเริม่ ต้น ระบบจะเปิดใช้งานกฎการควบคุมคุณภาพทั้งหมด
เคล็ดลับ: คุณสามารถแยกหลุมที่ไม่ผ่านพารามิเตอร์ QC (การตรวจสอบคุณภาพ) ออกจากส่วนการวิเคราะห์ใน
โมดูล QC (การตรวจสอบคุณภาพ) ของหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ได้อย่างง่ายดาย

วิธปี รับแต่งกฎการควบคุมคุณภาพ
1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preference (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ QC (การตรวจสอบคุณภาพ)จุดการปรับแต่ง
n

NTC — no template control (การควบคุมไม่มเี ทมเพลต)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 91บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)

3

4

n

NRT — no reverse transcriptase control (ไม่มีการควบคุมรีเวิรส์ แทรนสคริปเทส)n

Efficiency (ประสิทธิภาพ) — reaction efficiency (ประสิทธิภาพของปฏิกริ ยิ า)n

Std Curve R^2 (เส้นโค้งมาตรฐาน R^2) — ค่ายกกำลังสอง R สำหรับเส้นโค้งมาตรฐาน

n

Replicate group Cq Std Dev — ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่คำนวณสำหรับแต่ละกลุ่มที่ทำซ้ำ

สำหรับแต่ละกฎ QC ให้ทำหนึง่ ในข้อต่อไปนี้
nหากต้องการใช้ค่าเริ่มต้น ก็ไม่ต้องทำอะไรเลย

nหากต้องการเปลี่ยนค่า ให้คลิกกล่องข้อความ Value (ค่า) แล้วพิมพ์ค่าใหม่จากนัน้ กดปุ่ม Enternหากต้องการปิดใช้งานกฎ ให้ยกเลิกการเลือกช่องทำเครือ่ งหมาย Use (ใช้)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม่ นี้การปรับแต่งพารามิเตอร์การส่งออกข้อมูล
คุณสามารถส่งออกข้อมูล CFX Maestro Dx SE ในรูปแบบต่อไปนีไ้ ด้nข้อความ (.txt)n

CSV (.csv)

nExcel (.xls, .xlsx)n

XML (.xml)

nHTML (.html)

สำคัญ: คอมพิวเตอร์ของคุณต้องติดตั้ง Microsoft Excel เอาไว้เพื่อส่งออกข้อมูลไปยังสเปรดชีต Microsoft
Excelคุณสามารถระบุประเภทของข้อมูลที่ต้องการส่งออกและปรับแต่งเอาท์พุทของข้อมูลที่สง่ ออกเองได้

วิธปี รับแต่งพารามิเตอร์การส่งออกข้อมูล
1เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้)2ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ให้เลือกแท็บ Custom Export (การส่งออกที่
กำหนดเอง)92 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEก่อนที่คณุ จะเริม
่

3เลือกรูปแบบที่ต้องการส่งออกข้อมูลจากรายการแบบเลื่อนลง Export Format (รูปแบบการส่งออก)4ในส่วน Data to Export (ข้อมูลที่ต้องการส่งออก) ให้เลือกหรือยกเลิกการเลือกกล่องทำเครื่องหมายระบุประเภท
ของข้อมูลทีต่ ้องการส่งออก รายการที่เลือกจะปรากฏในกล่องรายการ Exported Columns (คอลัมน์ที่สง่ ออก)หมายเหตุ: ตามค่าเริม่ ต้น ข้อมูลที่จะรันผลจะรวมอยูใ่ นส่วนหัวด้วย ยกเลิกการเลือกกล่องทำเครือ่ งหมาย
หากคุณไม่ต้องการรวมข้อมูลที่รนั ผล5คุณสามารถเปลี่ยนแปลงลำดับหน้าจอเอาท์พุทของรายการทีเ่ ลือกในกล่องรายการ Exported Columns (คอลัมน์ที่สง่ ออก) ให้ไฮไลท์รายการแล้วคลิกปุม่ ลูกศรทางด้านซ้ายของ
รายการเพื่อย้ายขึน้ หรือย้ายลง

6หรืออีกทางเลือกหนึ่งคือ คุณสามารถเปลี่ยนชื่อคอลัมน์เอาท์พุทของรายการที่เลือกดังนี้
aคลิก Customize Column Names (ปรับแต่งชื่อคอลัมน์)กล่องโต้ตอบ Column Name Customizer (ตัวปรับแต่งชื่อคอลัมน์) จะปรากฏขึ้นbสำหรับชือ่ คอลัมน์เริ่มต้นแต่ละคอลัมน์ที่คณุ ต้องการเปลีย่ น ให้พิมพ์ชื่อใหม่ในช่อง Custom Name (ชื่อที่
กำหนดเอง)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 93บทที่ 6 หน้าต่าง Home (หน้าหลัก)c7โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับสูแ่ ท็บ Custom Export (การส่งออกที่กำหนดเอง) ชื่อใหม่จะปรากฏในวงเล็บข้างชื่อคอลัมน์เริม่ ต้นในกล่องรายการ Exported Columns (คอลัมน์
ที่สง่ ออก)nคลิก Cancel (ยกเลิก) เพือ่ ล้างการเปลี่ยนแปลงและกลับไปที่แท็บ Custom Export (การส่งออกที่
กำหนดเอง)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

สำคัญ: การคลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้) จะรีเซ็ตค่าทีก่ ำหนดทัง้ หมดบนทุกแท็บไปเป็นการตั้งค่าเริม่ ต้นจากโรงงาน โปรดใช้ความระมัดระวัง
เมือ่ คลิกปุม
่ นี้

94 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล
โปรโตคอลเป็นชุดขัน้ ตอนที่ดำเนินการในลำดับพันธุกรรมที่เฉพาะเจาะจง ใน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx,
Security Edition ขั้นตอนทั้งหมดเกีย่ วข้องกับตัวเลือกบนเครือ่ งมือ ตัวอย่างเช่น ขั้นตอนการสัง่ ให้เครือ่ งมือควบคุม
อุณหภูมิของบล็อกและฝาครอบ ใช้อุณหภูมทิ ี่ต่างกันในบล็อก ทำการอ่านเพลต หรือทำการวิเคราะห์ Melt Curve(กราฟการสลายดีเอ็นเอ) โดยจะระบุตัวเลือกแต่ละตัวสำหรับเพลตและประเภทการทดสอบทีแ่ ตกต่างกัน

มีสองตัวเลือกสำหรับการสร้างโปรโตคอล ตัวแก้ไขโปรโตคอลและระบบเขียนโปรโตคอล
อัตโนมัติ
คุณลักษณะ Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) มีดังต่อไปนี้
nการควบคุมโปรโตคอลมาตรฐานเพื่อสร้างโปรโตคอลได้อย่างรวดเร็ว

nความสามารถในการคำนวณการไล่ระดับอุณหภูมสิ ำหรับจำนวนแถวที่เลือกได้อย่างรวดเร็ว

nความสามารถในการคำนวณเวลาในการทดสอบสำหรับประเภทเพลตที่เลือกได้อย่างรวดเร็ว

nความสามารถในการแก้ไขขั้นตอนของโปรโตคอล

nความสามารถในการบันทึกโปรโตคอลเพือ่ นำมาใช้อกี ครั้ง

nความสามารถในการสั่งพิมพ์โปรโตคอลไปยังเครือ่ งพิมพ์เริม
่ ต้น

Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) จะสร้างโปรโตคอล PCR แบบกำหนดเองโดยอัตโนมัติโดย
ใช้ขั้นตอนการเริม่ ร้อน การแยกสายขัน้ ต้น การหลอม และการต่อขยายโดยใช้พารามิเตอร์ที่คุณป้อน จากนัน้ คุณจะ
สามารถดูการแสดงผลกราฟิกของโปรโตคอลทีแ่ นะนำ และแก้ไข ทำการทดสอบ หรือบันทึกโปรโตคอลได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 95บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

พารามิเตอร์และช่วงต่าง ๆ สำหรับขั้นตอนโปรโตคอล
ใช้ข้อมูลในตาราง 7 เพื่อเปลี่ยนการตั้งค่าเริม่ ต้นสำหรับขั้นตอนในโปรโตคอลของคุณ

ขัน้ ตอนอุณหภูมิ
อุณหภูมิเป้าหมายคือค่าระหว่าง 4.0 ถึง 100.0°C ซึ่งจะกำหนดเป็นค่าองศาไม่เกิน 10 ระบบจะเพิม่ อุณหภูมใิ ห้ถงึ ขัน้ นี้และรักษาค่านัน้ ไว้เป็นระยะเวลาที่กำหนด (เวลาคงค่าอุณหภูมิ)ขัน้ ตอนการไล่ระดับอุณหภูมิ
ช่วงการไล่ระดับอุณหภูมคิ ือความแตกต่างระหว่างอุณหภูมทิ ี่ต่ำกว่าและอุณหภูมทิ ี่สงู กว่าในขั้นตอนการไล่ระดับ
อุณหภูมิ ช่วงอุณหภูมสิ งู สุดทีอ่ นุญาตคือ 24°C อุณหภูมิที่ต่ำกว่าคือค่าระหว่าง 30.0 ถึง 99.0°C ซึ่งจะกำหนดเป็นค่า
องศาไม่เกิน 10 อุณหภูมิสงู สุดคือ 100°C Thermal Cycler จะเร่งจนไปถึงการไล่ระดับอุณหภูมิเป้าหมายในทุก
บล็อกและคงค่าอุณหภูมนิ นั้ ไว้ตามเวลาการคงค่าอุณหภูมทิ ี่กำหนด
สำคัญ: เครือ่ งมือจะคำนวณค่าการไล่ระดับอุณหภูมิ เมือ่ คุณป้อนค่าในช่องด้านบนและด้านล่างของเครื่อง
คำนวณการไล่ระดับอุณหภูมิ ซอฟต์แวร์จะคำนวณและกำหนดอุณหภูมสิ ำหรับช่องที่เหลือให้โดยอัตโนมัติ เมือ่คุณป้อนอุณหภูมิในช่องใดก็ได้ระหว่างช่องด้านบนและด้านล่าง เครือ่ งมือจะคำนวณช่องที่เหลือให้โดย
อัตโนมัติ คุณไม่สามารถป้อนค่าอุณหภูมใิ นทุกช่องได้ด้วยตนเอง
ตาราง 7 พารามิเตอร์และช่วงอุณหภูมิสำหรับขั้นตอนโปรโตคอล

พารามิเตอร์

ช่วงคำอธิบาย

อัตราเปลี่ยนแปลง

n สำหรับ CFX Opus 96 Dx systems:สั่งให้ Thermal Cycler ไปยังอุณหภูมิเป้าหมาย

อุณหภูมขิ ึ้นลง

0.1–5°C ต่อวินาที
n สำหรับ CFX Opus 384 Dx

ตามอัตราที่กำหนดในขัน้ ตอนนั้น
ใช้ได้เฉพาะกับขัน้ ตอนอุณหภูมิเท่านั้น

systems:
0.1–2.5°C ต่อวินาที
n สำหรับ CFX Opus Deepwell Dxsystems:
0.1–2.5°C ต่อวินาที
Increment (การตัวเลขตั้งแต่ –10.0 ถึง 10.0°C ต่อรอบ

เพิม่ อุณหภูมิ)สั่งให้ Thermal Cycler เปลีย่ นอุณหภูมิเป้าหมาย
ของขัน้ ตอนในแต่ละรอบ โดยทีต่ ัวเลขบวกจะ
เพิม่ อุณหภูมแิ ละตัวเลขลบจะลดอุณหภูมิ
ใช้ได้เฉพาะกับขัน้ ตอนอุณหภูมิเท่านั้น

96 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEพารามิเตอร์และช่วงต่าง ๆ สำหรับขัน้ ตอนโปรโตคอล

ตาราง 7 พารามิเตอร์และช่วงอุณหภูมิสำหรับขั้นตอนโปรโตคอลต่อ

พารามิเตอร์

ช่วงคำอธิบาย

Extend (ขยายเวลาตั้งแต่ –60 ถึง 60 วินาทีตอ่ รอบสั่งให้ Thermal Cycler ขยายเวลาคงค่าอุณหภูมิ

เวลา)ในแต่ละรอบ ตัวเลขบวกจะเพิม่ เวลาคงค่า
อุณหภูมิ และตัวเลขลบจะลดเวลาคงค่าอุณหภูมิ
ใช้ได้ทั้งขัน้ ตอนอุณหภูมิและขัน้ ตอนการไล่
ระดับอุณหภูมิ

Beep (เสียงเตือน)(ไม่มพี ารามิเตอร์)สั่งให้ Thermal Cycler ส่งเสียงบี๊บเตือนเพื่อส่ง
สัญญาณว่าเครือ
่ ง Thermal Cycler ทำงานถึง
อุณหภูมเิ ป้าหมายสำหรับขัน้ ตอนนั้นแล้ว
ใช้ได้เฉพาะกับขัน้ ตอนอุณหภูมิเท่านั้น

Plate read (การอ่านค่าเพลต)(ไม่มพี ารามิเตอร์)สั่งให้ Thermal Cycler เพิม่ การอ่านค่าเพลตลง
ในขัน้ ตอนที่เลือก
ใช้ได้ทั้งขัน้ ตอนอุณหภูมิและขัน้ ตอนการไล่
ระดับอุณหภูมิ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 97บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)ใช้ Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ในการสร้าง เปิด ตรวจสอบ และแก้ไขโปรโตคอล โดยค่าเริ่มต้น Protocol
Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะแสดงโปรโตคอล 2 ขัน้ ตอนแบบเรียลไทม์ทั่วไปสำหรับเพลต 96 หลุมคำอธิบายสัญลักษณ์
1แถบเมนูจะมีทางลัดเพือ่ เข้าถึงเมนูคำสั่ง File (ไฟล์) Settings (การตั้งค่า) และ Tools (เครือ่ งมือ)2แถบเครือ่ งมือจะมีทางลัดเพื่อบันทึกและพิมพ์โปรโตคอล กำหนดตำแหน่งที่จะแทรกขัน้ ตอน กำหนด
ปริมาตรตัวอย่าง และดูระยะเวลาในการทดสอบโปรโตคอลโดยประมาณ

3บานหน้าต่างหลักจะแสดงโปรโตคอลในรูปกราฟิก

4บานหน้าต่างด้านล่างจะแสดงโครงร่างโปรโตคอล

5บานหน้าต่างด้านซ้ายจะแสดงตัวควบคุมโปรโตคอลที่คุณสามารถเพิม่ เพือ่ กำหนดโปรโตคอลด้วยตัวเองได้

คำสั่งเมนูไฟล์
Save (บันทึก) — บันทึกโปรโตคอลปัจจุบน
ั
Save As (บันทึกเป็น) — บันทึกโปรโตคอลปัจจุบันด้วยชื่อใหม่หรือในตำแหน่งใหม่

98 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)File Passwords (รหัสผ่านของไฟล์) — ช่วยให้ผู้ใช้สามารถตั้งค่ารหัสผ่าน
สำหรับการบันทึกไฟล์และรหัสผ่านสำหรับเปิดไฟล์ได้
เคล็ดลับ: สำหรับข้อมูลเพิม่ เติม โปรดดูรหัสผ่านปกป้องไฟล์ ในหน้า 49
Close (ปิด) — ปิด Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)คำสั่งเมนูการตัง้ ค่า
Lid Setting (การตั้งค่าฝา) — เปิดกล่องโต้ตอบ Lid Setting (การตั้งค่าฝา) ทีค่ ุณสามารถเปลีย่ นแปลงหรือตั้งค่า
อุณหภูมิฝา

คำสั่งเมนูเครื่องมือ
Gradient Calculator (เครือ่ งคำนวณการไล่ระดับอุณหภูมิ) ใช้เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถเลือกประเภทของบล็
อกสำหรับขั้นการไล่ระดับอุณหภูมไิ ด้ ค่าเริ่มต้นคือ 96 หลุมRun Time Calculator (เครือ่ งคำนวณเวลาในการทดสอบ) ใช้เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถเลือกประเภทของ
เพลตและโหมดสแกนเพือ่ คำนวณเวลาในการทดสอบโดยประมาณในหน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)ค่าเริม่ ต้นสำหรับทุกช่องคือ 96 หลุมคำสั่งแถบเครื่องมือ
— บันทึกไฟล์โปรโตคอลปัจจุบนั— พิมพ์หน้าต่างที่เลือก

— ใช้คำสัง่ นีใ้ นการเลือกตำแหน่งที่จะแทรกขัน้ ตอนที่เกีย่ วข้องกับขั้นตอนที่เลือกใน
ปัจจุบัน

— ใช้คำสัง่ นีเ้ พื่อป้อนปริมาณตัวอย่างในหน่วย μl ปริมาณตัวอย่างจะแตกต่างกันไปตาม
ประเภทของบล็อก
nสำหรับบล็อก 96 หลุม ช่วงปริมาณจะเท่ากับ 0–50 µlnสำหรับบล็อก 384 หลุม ช่วงปริมาณจะเท่ากับ 0–30 µlnสำหรับบล็อก 96 หลุมลึก ช่วงปริมาณจะเท่ากับ 0–125 µlคูม่ ือผูใ้ ช้ | 99บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

— แสดงเวลาการทดสอบโดยประมาณตามขั้นตอนโปรโตคอล อัตราเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ
ขึ้นลง และประเภทของบล็อกที่เลือก

— แสดงข้อมูลวิธใี ช้เกีย่ วกับโปรโตคอล

Protocol Editing Controls (การควบคุมการแก้ไขโปรโตคอล)บานหน้าต่างด้านซ้ายของหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ประกอบด้วยกาควบคุมที่คณุ สามารถใช้
ในการสร้างโปรโตคอลได้
การควบคุมแต่ละตัวประกอบด้วยชุดของพารามิเตอร์ที่แสดงขัน้ ตอนในโปรโตคอล คุณสามารถแก้ไขพารามิเตอร์แต่
ละตัว และเพิ่มหรือลบได้เพื่อกำหนดโปรโตคอลของคุณด้วยตัวเอง ส่วนนีจ้ ะอธิบายตัวเลือกในการควบคุมแต่ละตัว
n Insert Step (แทรกขั้นตอน) — แทรกขัน้ ตอนก่อนหรือหลังขัน้ ตอนที่เลือก คุณสามารถแก้ไขอุณหภูมแิ ละเวลาคงค่าอุณหภูมิได้ในจอแสดงผลกราฟฟิกของ
โปรโตคอลหรือในโครงร่างโปรโตคอลได้
nInsert Gradient (แทรกการไล่ระดับอุณหภูมิ) — แทรกขั้นการไล่ระดับอุณหภูมิ
ตามประเภทของบล็อกของหลุมที่เลือกในเครือ่ งคำนวณการไล่ระดับอุณหภูมิ คุณสามารถแก้ไขช่วงการไล่ระดับอุณหภูมิได้ใน
บานหน้าต่าง Gradient (การไล่ระดับอุณหภูมิ) ที่ปรากฏขึน้ เมือ่ แทรกขั้นตอนการไล่ระดับ
อุณหภูมิ
n Insert GOTO (แทรกคำสัง่ GOTO) — จะแทรกขั้นตอนรอบ (ลูป) ซึง่ จะสัง่ ให้ซอฟต์แวร์ทำขั้นตอนหนึง่ ๆ ซ้ำตามลำดับและจำนวนรอบที่ระบุ การทำขั้นตอนซ้ำ
จะเริม่ ขึน้ หลังจากที่รอบแรกสิน้ สุด ตัวอย่างเช่น คุณสามารถสัง่ ให้ซอฟต์แวร์ทำ
ขั้นตอน 2–4 ซ้ำได้ 39 ครัง้ หลังการทำขัน้ ตอนซ้ำครัง้ สุดท้าย ซอฟต์แวร์จะทำ
ขั้นตอนที่ 2–4 รวมทั้งหมด 40 ครัง้ คุณสามารถแก้ไขขั้นตอนย้อนกลับ (GOTO) และจำนวนรอบได้ในจอแสดง
กราฟฟิกหรือในโครงร่างโปรโตคอล
nInsert Melt Curve (แทรก Melt Curve) — แทรกขัน้ ตอนการอ่าน Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)nInsert Plate Read to Step (แทรกคำสัง่ อ่านเพลตในขั้นตอน) — เพิ่มคำสัง่ อ่านเพลตในขั้นตอนที่เลือก การอ่านเพลตจะวัดจำนวนของสารเรืองแสงเมือ่ สิน้ สุดรอบ โดยทั่วไปแล้ว ขัน้ ตอนอ่านเพลตจะเป็นขัน้ ตอนสุดท้ายใน
ลูปคำสัง่ GOTOเคล็ดลับ: หลังเพิ่มคำสัง่ การอ่านเพลตในขัน้ ตอนแล้ว ปุม่ จะเปลี่ยนเป็น Remove Plate Read (ลบการอ่าน
เพลตออก) เมื่อคุณเลือกขัน
้ ตอน

n

Remove Plate Read (ลบการอ่านเพลตออก) — ลบคำสัง่ การอ่านเพลตออกจากขั้นตอนที่เลือก
เคล็ดลับ: หลังจากที่คณุ ลบคำสัง่ การอ่านเพลตออกจากขัน้ ตอนแล้ว ปุม่ จะเปลี่ยนเป็น Add Plate Read to
Step (เพิ่มการอ่านเพลตไว้ในขั้นตอน) เมือ่ คุณเลือกขั้นตอน

100 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)n

Step Options (ตัวเลือกขั้นตอน) — จะเปิดกล่องโต้ตอบ Step Options (ตัวเลือกขัน้ ตอน) และแสดงตัวเลือกที่มี
สำหรับขัน้ ตอนที่เลือก โปรดดูStep Options (ตัวเลือกขัน้ ตอน) ในหน้า 102 สำหรับข้อมูลอย่างละเอียดเกี่ยวกับ
ตัวเลือกขัน้ ตอนเคล็ดลับ: คุณยังสามารถเข้าถึงตัวเลือกขั้นตอนโดยการคลิกขวาที่ขนั้ ตอนในหน้าจอกราฟฟิก

n

Delete Step (ลบขัน้ ตอน) — ลบขัน้ ตอนที่เลือกออกจากโปรโตคอล

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 101บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

Step Options (ตัวเลือกขัน้ ตอน)
เปิดกล่องโต้ตอบ Step Options (ตัวเลือกขั้นตอน) เพื่อดูตัวเลือกที่คุณสามารถเพิ่ม เปลี่ยนแปลง หรือลบออกจาก
ขั้นตอนได้

nPlate Read (การอ่านเพลต) — เมือ่ เลือก จะเพิ่มการอ่านเพลตไว้ในขัน
้ ตอน

n

Temperature (อุณหภูมิ) — จะตั้งค่าอุณหภูมิเป้าหมายสำหรับขัน้ ตอนที่เลือก

n

Gradient (การไล่ระดับอุณหภูมิ) — จะตั้งค่าช่วงการไล่ระดับอุณหภูมสิ ำหรับขัน้ ตอน ช่วงคือ 1–24°Cหมายเหตุ: การไล่ระดับอุณหภูมิจะทำงานโดยใช้อณุ หภูมิตำ่ สุดที่ดา้ นหน้าของบล็อก (ในภาพนี้คอื แถว H)และอุณหภูมสิ งู สุดที่ด้านหลังของบล็อก (ในภาพนี้คอื แถว A)n

Increment (การเพิ่มอุณหภูมิ) — ปริมาณอุณหภูมทิ ี่จะเพิ่มขึ้น (หรือลดลง) ของขัน้ ตอนที่เลือก จำนวนตามค่านี้
จะถูกเพิม่ ไปยังอุณหภูมเิ ป้าหมายในแต่ละรอบ ช่วงคือ ±0.1–10°Cหมายเหตุ: ในการลดอุณหภูมิ ให้พิมพ์เครือ่ งหมายลบ (–) ก่อนค่าตัวเลข (ตัวอย่างเช่น –5°C)nRamp Rate (อัตราเปลี่ยนแปลงอุณหภูมขิ นึ้ ลง) — อัตราการเปลีย่ นแปลงอุณหภูมขิ ึ้นลงสำหรับขัน้ ตอนที่เลือก
ช่วงอุณหภูมขิ นึ้ อยูก่ บั ขนาดของบล็อก

nTime (เวลา) — เวลาคงค่าอุณหภูมหิ รับขั้นตอนที่เลือก

n

Extend (ขยายเวลา) — ระยะเวลา (เป็นวินาที) ที่จะขยายหรือลดในขัน้ ตอนทีเ่ ลือก ตัวเลือกนีจ้ ะเพิ่มไปยังเวลา
คงค่าอุณหภูมใิ นแต่ละรอบ ช่วงคือ ±1–60 วินาที

n

Beep (เสียงบี๊บ) — เมือ่ เลือก เสียงบี๊บเตือนจะดังขึน้ ระหว่างดำเนินการขัน้ ตอนเคล็ดลับ: เมื่อคุณป้อนตัวเลขที่อยูน่ อกช่วงตัวเลือก ซอฟต์แวร์จะเปลี่ยนตัวเลขให้เป็นข้อมูลที่ใกล้เคียงที่สด
ุภายในช่วง

102 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)การสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)คุณสามารถสร้างไฟล์โปรโตคอลแบบกำหนดเองได้โดยใช้ Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) นอกจากนี้ คุณยัง
สามารถแก้ไขและบันทึกไฟล์โปรโตคอลที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้า หรือไฟล์โปรโตคอลตัวอย่างที่จดั ส่งมาพร้อมกับ CFX
Maestro Dx SE ได้เช่นกัน
หากต้องการสร้างไฟล์โปรโตคอลใหม่ ให้ดำเนินการดังต่อไปนี้
nเปิดไฟล์โปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)เคล็ดลับ: คุณสามารถเปิดโปรโตคอลใหม่หรือที่มอี ยู่เดิมใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ได้nตั้งค่าโปรโตคอลใหม่

nเพิ่มขั้นตอนในโปรโตคอลจากบานหน้าต่างควบคุมโปรโตคอล

nแก้ไขคุณสมบัติของขัน
้ ตอน

n

บันทึกโปรโตคอล

เคล็ดลับ: หากต้องการสร้างโปรโตคอลใหม่จากไฟล์โปรโตคอลที่บันทึกไว้กอ่ นหน้าหรือไฟล์โปรโตคอลตัวอย่าง
โปรดดูที่การเปิดโปรโตคอลที่มอี ยู่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ในหน้า 104

การเปิดไฟล์โปรโตคอลใหม่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)CFX Maestro Dx SE มีหลากหลายตัวเลือกในการเปิดไฟล์โปรโตคอลใหม่
nจากเมนูไฟล์ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nจากกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nจากกล่องโต้ตอบ Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)หากต้องการเปิดไฟล์โปรโตคอลใหม่จากเมนู File (ไฟล์)uในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก File (ไฟล์) > New (ใหม่) > Protocol (โปรโตคอล)หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะเปิดขึน้ โดยแสดงไฟล์โปรโตคอลเริม่ ต้นเคล็ดลับ: สำหรับข้อมูลเกีย่ วกับการตั้งค่าโปรโตคอลเริม่ ต้น โปรดดูที่
การเปลี่ยนการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น ในหน้า 83วิธกี ารเปิดโปรโตคอลใหม่จากกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตัง้ ค่าการทดสอบ)1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนีเ้ พื่อเปิดกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)nเลือก Run (การทดสอบ) > User-defined Run (การทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด)nคลิก User-defined Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด) บนแถบเครือ่ งมือ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 103บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

กล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดขึน้ มาที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล) และแสดงไฟล์
โปรโตคอลเริม่ ต้น2คลิก Create New (สร้างใหม่)หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะเปิดขึน้ โดยแสดงโปรโตคอลเรียลไทม์เริ่มต้น

วิธกี ารเปิดไฟล์โปรโตคอลใหม่จากกล่องโต้ตอบ Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนีเ้ พื่อเปิด Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)
หากไม่ได้อยูใ่ นมุมมอง
nเลือก View (มุมมอง) > Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)nคลิก Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) บนแถบเครือ่ งมือ

2หากจำเป็น ให้เลือกประเภทเครือ่ งมือจากรายการแบบเลือ
่ นลง

3

คลิก User-defined (ผูใ้ ช้กำหนด) เป็นประเภทการทดสอบ
กล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดขึน้ มาที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล) และแสดงไฟล์
โปรโตคอลเริม
่ ต้น

4

คลิก Create New (สร้างใหม่)หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะเปิดขึน้ โดยแสดงโปรโตคอลเรียลไทม์เริ่มต้น

วิธเี ปิดโปรโตคอลใหม่จากเมนการทดสอบ
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนีเ้ พื่อเปิดกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)nเลือก Run (การทดสอบ) > User-defined Run (การทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด)nคลิก User-defined Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด) บนแถบเครือ่ งมือ

กล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดขึน้ มาที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล) และแสดงไฟล์
โปรโตคอลเริม่ ต้น2คลิก Create New (สร้างใหม่)หน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะเปิดขึน้ โดยแสดงโปรโตคอลเรียลไทม์เริ่มต้น

การเปิดโปรโตคอลที่มีอยู่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)CFX Maestro Dx SE มีตัวอย่างไฟล์โปรโตคอลที่คณุ สามารถแก้ไขและบันทึกเป็นโปรโตคอลใหม่ที่กำหนดเองได้
นอกจากนี้ คุณยังสามารถสร้างโปรโตคอลใหม่จากโปรโตคอลที่กำหนดเองทีม่ ีอยูไ่ ด้วิธกี ารเปิดไฟล์โปรโตคอลตัวอย่าง
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Protocol (โปรโตคอล)โดยค่าเริม่ ต้น Windows Explorer จะเปิดตำแหน่งของโฟลเดอร์ไฟล์ตัวอย่าง CFX Maestro Dx SE

104 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)2

3เปิดโฟลเดอร์ไฟล์ตัวอย่าง คุณจะเห็นโฟลเดอร์ต่อไปนี้
nConventionalProtocols — มีไฟล์โปรโตคอลตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ PCR แบบดั้งเดิม

n

DataFiles — มีไฟล์ขอ้ มูลตัวอย่างที่คุณสามารถใช้เพื่อค้นหาคุณลักษณะของ CFX Maestro Dx SE ได้n

MeltCalibration — มีไฟล์โปรโตคอลตัวอย่างสำหรับใช้กบั ซอฟต์แวร์ Precision Melt Analysis ของ
Bio-RadnPlates — มีไฟล์เพลตตัวอย่าง

n

RealTimeProtocols — มีไฟล์โปรโตคอลตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ PCR แบบเรียลไทม์

เปิดโฟลเดอร์โปรโตคอลสำหรับประเภทของการทดสอบที่คณุ วางแผนที่จะดำเนินการระหว่าง
ConventionalProtocols หรือ RealTimeProtocols

4เลือกโปรโตคอลที่ต้องการและคลิก Open (เปิด)โปรโตคอลตัวอย่างจะเปิดขึน้ ในหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)5เลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) และบันทึกโปรโตคอลด้วยชื่อใหม่หรือในโฟลเดอร์ใหม่

วิธเี ปิดโปรโตคอลทีม่ ีอยู่
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Protocol (โปรโตคอล) ค้นหาและเลือกโปรโตคอลเป้าหมาย และคลิก
Open (เปิด)nเปิดตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้นและทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้oวิธกี ารแก้ไขโปรโตคอลที่แสดง ให้คลิก Edit Selected (แก้ไขที่เลือก)oหากต้องการแก้ไขโปรโตคอลอื่นที่มอี ยู่ ให้คลิก Select Existing (เลือกทีม่ ีอยู่) และไปที่ไฟล์เป้าหมาย

โปรโตคอลจะเปิดขึ้นในหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)2เลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) และบันทึกโปรโตคอลด้วยชื่อใหม่หรือในโฟลเดอร์ใหม่

การตัง้ ค่าโปรโตคอลใหม่
เคล็ดลับ: หากไฟล์โปรโตคอลของคุณมีพารามิเตอร์ที่จำเป็น (เช่น หากคุณกำลังแก้ไขไฟล์เพลตที่มอี ยู่)
คุณสามารถข้ามส่วนนีไ้ ด้ ไปที่การเพิ่มขั้นตอนเข้าไปในโปรโตคอล ในหน้า 108ไฟล์โปรโตคอลใหม่ต้องมีพารามิเตอร์ต่อไปนี้
nBlock type (ประเภทบล็อก)nโหมดสแกนสำหรับประเภทบล็อกที่เลือก

n

Lid temperature (อุณหภูมฝิ าครอบ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 105บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

n

Sample volume (ปริมาณสารตัวอย่าง)106 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)การตั้งค่าประเภทของบล็อก
CFX Maestro Dx SE จะคำนวณการเพิ่มอุณหภูมิโดยอัตโนมัติสำหรับขั้นการไล่ระดับอุณหภูมติ ามประเภทบล็อก
หมายเหตุ: ประเภทของเพลตที่ตั้งค่าใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ต้องเป็นประเภทเดียวกับเพลต
ในโมดูลปฏิกิรย
ิ า

วิธต
ี ั้งค่าประเภทบล็อกuในหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ให้เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Gradient Calculator (เครือ่ งคำนวณการไล่ระดับอุณหภูมิ) แล้วเลือกประเภทเพลตที่เหมาะสมในรายการแบบเลือ่ นลงทีป่ รากฏ

การเลือกโหมดสแกนสำหรับประเภทบล็อกที่เลือก
หากต้องการกำหนดเวลาทดสอบสำหรับโปรโตคอล ให้เลือกประเภทบล็อกเป้าหมายและโหมดสแกน

วิธเี ลือกประเภทบล็อกและโหมดสแกนuในหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ให้เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Run time Calculator (เครือ่ งคำนวณเวลาทดสอบ) และเลือกประเภทเพลตที่เหมาะสมและโหมดสแกนในรายการแบบเลื่อนลงที่ปรากฏ

การปรับอุณหภูมขิ องฝาครอบ
CFX Maestro Dx SE จะกำหนดอุณหภูมเิ ริ่มต้นของฝาครอบดังต่อไปนี้nเครือ่ งมือแบบ 96 หลุมและหลุมลึก — 105.0°C

n

เครือ
่ งมือแบบ 384 หลุม — 95.0°Cคุณสามารถเปลี่ยนการตั้งค่าเริ่มต้นหรือปิดตัวทำความร้อนที่ฝาครอบตามความจำเป็นของโปรโตคอลได้

วิธปี รับอุณหภูมขิ องฝาครอบ
1ในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้เลือก Settings (การตั้งค่า) > Lid Settings (การตั้งค่าฝาครอบ)กล่องโต้ตอบ Lid Settings (การตั้งค่าฝาครอบ) จะปรากฏขึ้น

2

3โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก User Defined (ผูใ้ ช้กำหนดเอง) แล้วป้อนค่าอุณหภูมใิ นกล่องข้อความ

nเลือก Turn Off Lid Heater (ปิดตัวทำความร้อนที่ฝาครอบ)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 107บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

การตั้งค่าปริมาณตัวอย่าง
โดยค่าเริม่ ต้น CFX Maestro Dx SE ตั้งค่าปริมาตรตัวอย่างสำหรับแต่ละหลุมเป็น 25 µl ปริมาณตัวอย่างจะแตกต่าง
กันไปตามประเภทของบล็อก เช่นn0–50 µl สำหรับบล็อก 96 หลุมn0–30 µl สำหรับบล็อก 384 หลุมเครือ่ งมือจะใช้โหมดการควบคุมอุณหภูมหิ นึง่ ในสองโหมดในการกำหนดว่าจะให้ตัวอย่างเพิ่มอุณหภูมิถงึ อุณหภูมิ
เป้าหมายในโปรโตคอลเมือ่ ใดnCalculated Mode (โหมดที่คำนวณได้) — เมือ่ ปริมาณตัวอย่างถูกตั้งค่าเป็นปริมาณที่เหมาะสมสำหรับบล็อกที่
ไม่ใช่ค่าศูนย์ เครือ่ งมือจะคำนวณอุณหภูมิตัวอย่างตามปริมาณตัวอย่าง ซึง่ นีเ่ ป็นโหมดมาตรฐาน

nBlock Mode (โหมดบล็อก) — เมือ่ ปริมาณตัวอย่างตั้งค่าเป็นศูนย์ (0) μl เครือ่ งจะบันทึกอุณหภูมติ ัวอย่างเป็น
เช่นเดียวกับอุณหภูมขิ องบล็อกที่วัดได้

วิธกี ารตั้งค่าปริมาณตัวอย่างสำหรับบล็อกเฉพาะทีต่ ้องการuในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้พิมพ์คา่ ที่ถูกต้องในกล่องข้อความ Sample Volume (ปริมาณตัวอย่าง) บนแถบเครื่องมือ

เคล็ดลับ: คุณสามารถเปลี่ยนปริมาณตัวอย่างเริม่ ต้นในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของ
ผู้ใช้) โปรดดูการเปลี่ยนการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น ในหน้า 83การเพิ่มขั้นตอนเข้าไปในโปรโตคอล
วิธกี ารเพิม่ ขัน้ ตอนเข้าไปในโปรโตคอล
1เปิดโปรโตคอลในหน้าต่าง Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)2กำหนดตำแหน่งทีจ่ ะแทรกขัน้ ตอนใหม่ บนแถบเครื่องมือ ให้เลือก Before (ก่อน) หรือ After (หลัง) ในรายการ
แบบเลื่อนลง Step (ขัน้ ตอน)

3บนกราฟ ให้เลือกขัน้ ตอนก่อนหรือหลังจากที่คณุ วางแผนที่จะแทรกขัน้ ตอนใหม่

4ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Insert Step (แทรกขัน้ ตอน)

5หากต้องการเปลี่ยนอุณหภูมหิ รือเวลาในการระงับ ให้คลิกค่าเริม่ ต้นบนกราฟหรือโครงร่างโปรโตคอล และพิมพ์
ค่าใหม่

6(ไม่บังคับ) ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Step Options (ตัวเลือกขั้นตอน) เพื่อแสดงกล่องโต้ตอบตัวเลือกขั้นตอน และปรับเปลีย่ นตัวเลือกที่มอี ยู่สำหรับขั้นตอนที่เลือก
เคล็ดลับ: คุณสามารถเข้าถึงกล่องโต้ตอบตัวเลือกขั้นตอนได้ในเมนูคลิกขวา ทั้งในบานหน้าต่างกราฟหรือ
หรือบานหน้าต่างโครงร่างโปรโตคอล

7คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นกับโปรโตคอล

108 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)กล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) จะปรากฏขึน
้
8ในกล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) ให้พมิ พ์ชื่อไฟล์โปรโตคอลใหม่ และคลิก Save (บันทึก)การแทรกขั้นการไล่ระดับอุณหภูมิ
หากต้องการแทรกขัน้ การไล่ระดับอุณหภูมิ
1ให้ตรวจสอบว่าขนาดของเพลตสำหรับการไล่ระดับอุณหภูมมิ ขี นาดเดียวกับประเภทบล็อกของเครือ่ งมือ 96 หลุม,384 หลุม หรือหลุมลึก

2หากคุณยังไม่ได้ดำเนินการดังกล่าว ให้เลือกขนาดของเพลตสำหรับการไล่ระดับอุณหภูมิ
เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Gradient Calculator (เครือ่ งคำนวนณการไล่ระดับอุณหภูมิ) และเลือกประเภทหลุมที่เ
หมาะสม
จากรายการแบบเลือ
่ นลง

3

ในแถบเครือ่ งมือ ให้เลือก Before (ก่อน) หรือ After (หลัง) จากรายการแบบเลือ่ นลง Insert Step (แทรกขั้นตอน)4ในบานหน้าต่างกราฟหรือโครงร่าง ให้เลือกขัน้ ตอนก่อนหรือหลังจากที่คณุ วางแผนที่จะแทรกขัน้ ตอนการไล่ระ
ดับอุณหภูมิ

5ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Insert Gradient (แทรกการไล่ระดับอุณหภูมิ) ขั้นตอนการไล่ระดับอุณหภูมิให
ม่จะถูกเน้นในบานหน้าต่างกราฟหรือโครงร่าง เช่น:คูม่ ือผูใ้ ช้ | 109บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

อุณหภูมิของแต่ละแถวในการไล่ระดับอุณหภูมิจะปรากฏในตาราง Gradient (การไล่ระดับอุณหภูมิ) ในบานหน้า
ต่างด้านขวา
6ในการแก้ไขช่วงอุณหภูมกิ ารไล่ระดับอุณหภูมิ ให้ทำหนึ่งในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิกที่อณุ หภูมเิ ริม่ ต้นในบานหน้าต่างกราฟหรือโครงร่างและป้อนอุณหภูมิใหม่

nคลิก Step Options (ตัวเลือกขัน้ ตอน) เพื่อป้อนช่วงการไล่ระดับอุณหภูมใิ นหน้าต่าง Step Options (ตัวเลือ
กขั้นตอน)nเปลีย่ นค่า Range (ช่วง) ในตาราง Gradient (การไล่ระดับอุณหภูมิ)7วิธกี ารแก้ไขเวลาในการระงับ ให้คลิกเวลาเริม่ ต้นในมุมมองรูปภาพหรือข้อความและป้อนเวลาใหม่

8คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลง

การแทรกขั้นตอน GOTOหมายเหตุ: คุณไม่สามารถแทรกขัน้ ตอนคำสัง่ GOTO ภายในชุดคำสัง่ GOTO ได้ คุณไม่สามารถสร้างลูปคำสัง่
GOTO ซ้อนในได้

วิธแี ทรกขัน้ ตอนคำสัง่ GOTO
1ในแถบเครือ่ งมือ ให้เลือก Before (ก่อน) หรือ After (หลัง) จากรายการแบบเลือ่ นลง Insert Step (ใส่ขั้นตอน)2ในกราฟ ให้เลือกขั้นตอนก่อนหรือหลังจากที่คุณวางแผนที่จะแทรกขั้นตอนคำสัง่ GOTO

3ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Insert GOTO (แทรกคำสัง่ GOTO)

4ในการแก้ไขหมายเลขขัน้ ตอนคำสัง่ GOTO หรือจำนวนคำสัง่ GOTO ซ้ำกัน ให้เลือกหมายเลขเริม่ ต้นในกรอบ
กราฟหรือบานหน้าต่างโครงร่างและป้อนค่าใหม่

5คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลง

การแทรกขั้นตอน Melt Curveเคล็ดลับ: คุณไม่สามารถแทรกขัน้ ตอน Melt Curve ภายในลูปคำสัง่ GOTO ได้หมายเหตุ: ขั้นตอน Melt Curve จะรวมถึงการระงับเป็นเวลา 30 วินาทีเมือ่ เริม่ ต้นขัน้ ตอนที่ไม่ได้แสดงไว้ใน
โปรโตคอล

วิธแี ทรกขัน้ ตอน Melt Curve1ในแถบเครือ่ งมือ ให้เลือก Before (ก่อน) หรือ After (หลัง) จากรายการแบบเลือ่ นลง Insert Step (ใส่ขั้นตอน)2บนกราฟ ให้เลือกขัน้ ตอนก่อนหรือหลังจากที่คณุ วางแผนที่จะแทรกขัน้ ตอน Melt Curve110 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)3ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Insert Melt Curve (แทรก Melt Curve) ขั้นตอน Melt Curve ใหม่จะถูกเน้น
ในกราฟและบานหน้าต่างโครงร่าง ตัวอย่างเช่น:4ในการแก้ไขช่วงอุณหภูมหิ ลอมละลายหรือเวลาที่เพิ่มขึน้ ให้เลือกหมายเลขเริม่ ต้นในกราฟหรือบานหน้าต่าง
โครงร่างและป้อนค่าใหม่

5คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 111บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

การเพิ่มหรือการนำขัน้ ตอนการอ่านเพลตออก
เคล็ดลับ: หลังเพิ่มคำสัง่ การอ่านเพลตในขัน้ ตอนแล้ว ปุม่ จะเปลี่ยนเป็น Remove Plate Read (ลบการอ่านเพลตออก) เมือ่ คุณเลือกขั้นตอน

วิธเี พิ่มการอ่านเพลตในขัน้ ตอน1ในแถบเครือ่ งมือ ให้เลือก Before (ก่อน) หรือ After (หลัง) จากรายการแบบเลือ่ นลง Insert Step (ใส่ขั้นตอน)2ในกราฟ ให้เลือกขั้นตอนก่อนหรือหลังที่คุณต้องการใส่ขนั้ ตอนการอ่านเพลต

3ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Add Plate Read to Step (เพิ่มการอ่านเพลตในขั้นตอน) เพื่อเพิ่มการอ่าน
เพลตในขัน้ ตอนที่เลือก

4คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกการเปลี่ยนแปลง

วิธนี ำการอ่านเพลตออกจากขัน้ ตอนuในกราฟ ให้เลือกขั้นตอนที่มีการอ่านเพลต จากนัน้ คลิก Remove Plate Read (ลบการอ่านเพลตออก) ในบาน
หน้าต่างด้านซ้าย

การเปลี่ยนตัวเลือกขั้นตอน
หากต้องการเปลีย่ นตัวเลือกขัน้ ตอนสำหรับขัน้ ตอนที่เลือก
1เลือกขั้นตอนเป้าหมายในกราฟหรือบานหน้าต่างโครงร่าง

2ในบานหน้าต่างด้านซ้าย คลิก Step Options (ตัวเลือกขั้นตอน) เพือ่ เปิดกล่องโต้ตอบ Step Options (ตัวเลือก
ขั้นตอน)หรือคลิกขวาที่ขนั้ ตอนเป้าหมายในบานหน้าต่างหนึง่ แล้วเลือก Step Options (ตัวเลือก
ขั้นตอน) ในเมนูที่ปรากฏขึน
้

3วิธเี พิ่ม ปรับเปลีย่ น หรือลบตัวเลือกออก
nป้อนค่าในกล่องข้อความที่ถกู ต้อง

nแก้ไขค่าในกล่องข้อความเฉพาะ

nเลือกหรือล้างกล่องข้อความ

4คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ Step Options (ตัวเลือกขัน้ ตอน)

5คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกโปรโตคอล

112 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)การลบขั้นตอน
สำคัญ: คุณไม่สามารถเลิกทำฟังก์ชนั นีไ้ ด้ โปรดใช้ความระมัดระวังเมื่อลบขัน
้ ตอน

วิธก
ี ารลบขัน้ ตอนในโปรโตคอล
1เลือกขั้นตอนในบานหน้าต่างกราฟหรือโครงร่าง

2ในบานหน้าต่างด้านซ้าย ให้คลิก Delete Step (ลบขั้นตอน) เพือ่ ลบขัน้ ตอนที่เลือก

3คลิก OK (ตกลง) จากนั้นคลิก Yes (ใช่) เพื่อบันทึกโปรโตคอล

การคัดลอก การส่งออก หรือการพิมพ์โปรโตคอล
วิธคี ัดลอกโปรโตคอลuคลิกขวาที่โครงร่างโปรโตคอลและเลือก Copy Protocol (คัดลอกโปรโตคอล)คุณสามารถวางโครงร่างลงในไฟล์ .txt, .xls, .doc หรือ .ppt ได้วิธกี ารส่งออกโปรโตคอล
1คลิกขวาที่โครงร่างโปรโตคอลและเลือก Export Protocol (ส่งออกโปรโตคอล)กล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) จะปรากฏขึน
้

2(ไม่บังคับ) ใน Windows Explorer ให้ไปที่โฟลเดอร์ที่จะบันทึกไฟล์โปรโตคอล

3

ใน File name (ชือ่ ไฟล์) ให้พมิ พ์ชื่อไฟล์โปรโตคอลที่จะส่งออก

4คลิก Save (บันทึก)วิธพี ิมพ์โปรโตคอลuคลิกขวาที่โครงร่างโปรโตคอลและเลือก Print (พิมพ์)คุณสามารถพิมพ์โครงร่างโปรโตคอลไปยังเครือ่ งพิมพ์ที่คณุ ตั้งเป็นค่าเริม่ ต้นได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 113บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

การสร้างโปรโตคอลด้วยระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ
สำคัญ: Bio-Rad ไม่รับประกันว่าการเรียกใช้โปรโตคอลที่สร้างขึน้ ด้วย Protocol AutoWriter (ระบบเขียน
โปรโตคอลอัตโนมัติ) ในผลิตภัณฑ์ PCR จะได้ผลเสมอไป
Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) ของ CFX Maestro Dx SE จะสร้างรอบโปรโตคอลขึ้นมา
โดยอัตโนมัติตามพารามิเตอร์ที่ปอ้ นข้อมูลต่อไปนี้
nความยาวของ Amplicon — ความยาวของผลิตภัณฑ์ PCR ที่คาดไว้

nอุณหภูมิ Annealing — ปฏิกิรย
ิ า Ta สำหรับไพรเมอร์ที่ใช้
หากไม่ทราบค่า Ta คุณสามารถใช้เครือ่ งคำนวณค่า Ta เพื่อคำนวณโดยอัตโนมัติตามลำดับไพรเมอร์ของคุณได้
หมายเหตุ: ค่า Ta จะปรับจากข้อมูลอุณหภูมิหลอมละลายของไพรเมอร์ (Tm) ซึง่ ขึน้ อยูก่ บั เอนไซม์ที่เลือก
และความเร็วของโปรโตคอล

nประเภทเอนไซม์ — เอนไซม์ดีเอ็นเอโพลิเมอเรส (iTaq, iProof DNA Polymerase หรืออืน่ ๆ)หากคุณใช้เอนไซม์อนื่ นอกเหนือไปจาก iTaq หรือ iProof DNA Polymerase คุณสามารถป้อนข้อมูลเพิ่มเติมได้
ซึง่ รวมถึงช่วงการไล่ระดับอุณหภูมิ เวลาในการเปิดใช้งานเริม่ ร้อน (เป็นวินาที) และเวลาต่อขยายขัน้ สุดท้าย (เป็นวินาที)nความเร็วในการทำงาน — ความเร็วของปฏิกริ ยิ า (มาตรฐาน เร็ว หรือเร็วมาก)Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) จะเพิ่มประสิทธิภาพโปรโตคอลตามการตัง้ ค่าความเร็วที่
เลือก ระยะเวลาในการทำงานโดยรวมจะกำหนดจากจำนวนขัน้ ตอนและรอบ ระยะเวลาการบ่มในแต่ละขั้นตอน
และเวลาที่ใช้เพื่อให้รวมเป็นหนึ่งเดียวกันที่อณุ หภูมเิ ป้าหมาย

Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) จะสร้างโปรโตคอล PCR แบบกำหนดเองโดยอัตโนมัติ โดยใช้ขั้นตอนการเริม่ ร้อน การแยกสายขัน้ ต้น การหลอม และการต่อขยาย โดยใช้พารามิเตอร์ที่คณุ ป้อนและแนวทาง
PCR มาตรฐาน จากนัน้ คุณจะสามารถดูการแสดงผลกราฟิกของโปรโตคอลที่แนะนำ และแก้ไข ทำการทดสอบ หรือบันทึกโปรโตคอลได้

114 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างโปรโตคอลด้วยระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ

วิธกี ารสร้างโปรโตคอลใหม่โดยใช้ Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) ของ CFX
Maestro Dx SE
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก Tools (เครื่องมือ) > Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอล
อัตโนมัติ)กล่องโต้ตอบ Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) จะปรากฏขึน
้

2ในหัวข้อ Enter Target Values/Enzyme (ป้อนค่า/เอนไซม์เป้าหมาย) ให้ดำเนินการดังต่อไปนี้
nป้อนอุณหภูมิ Annealing (Ta) สำหรับไพรเมอร์ที่ใช้หากทราบ
เคล็ดลับ: ดูข้อมูลเพิม่ เติมได้ที่การใช้เครือ่ งคำนวณ Ta ในหน้า 116
หมายเหตุ: โปรดดูข้อมูลเกีย่ วกับการคำนวณทีใ่ ช้ในเครื่องคำนวณ Ta ได้ที่ Breslauer et al 1986nป้อนความยาว Amplicon ในคู่เบส (bp)nเลือกประเภทเอนไซม์จากรายการตัวเลือก (iTaq DNA Polymerase, iProof DNA Polymerase หรืออืน่ ๆ)เคล็ดลับ: หากคุณเลือก Other (อื่น ๆ) เป็นประเภทเอนไซม์ พารามิเตอร์ในหัวข้อ Additional
Parameters (Optional) (พารามิเตอร์เพิ่มเติม) (ไม่บงั คับ) จะเริม่ ทำงาน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 115บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

3หากคุณเลือก Other (อืน่ ๆ) เป็นประเภทของเอนไซม์ คุณสามารถเพิ่มพารามิเตอร์ใด ๆ หรือทัง้ หมดต่อไปนีใ้ นโปรโตคอลได้
nช่วงการไล่ระดับอุณหภูมิ

nอุณหภูมิในการเปิดใช้งานเริ่มร้อน

nเวลาต่อขยายขัน้ สุดท้าย

4ในหัวข้อ Type (พิมพ์) ให้เลื่อนแถบเลือ่ นเพื่อเลือกความเร็วของโปรโตคอล (มาตรฐาน เร็ว หรือเร็วมาก) CFX
Maestro Dx SE จะปรับเวลาในการทดสอบทั้งหมด

5เลือกประเภทของ PCR ที่จะดำเนินการ (PCR แบบเรียลไทม์เป็นค่าเริ่มต้น)CFX Maestro Dx SE จะเพิม่ ขัน้ ตอนการอ่านเพลตเพื่อเก็บข้อมูลสารเรืองแสงด้วย PCR แบบเรียลไทม์

6ในหัวข้อ Preview (แสดงตัวอย่าง) ให้ตรวจสอบโปรโตคอล คุณสามารถทำการเปลี่ยนแปลงได้ตามต้องการ

7โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกโปรโตคอลใหม่ หลังจากบันทึกแล้ว โปรโตคอลจะเปิดขึน้ ใน Startup Wizard(ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) คลิก Edit Selected (แก้ไขสิง่ ที่เลือก) เพื่อทำการเปลี่ยนแปลงใด ๆ กับโปรโตคอล
ตัวอย่างเช่น คุณอาจต้องเปลี่ยนอุณหภูมฝิ าครอบและปริมาณตัวอย่าง

nคลิก Cancel (ยกเลิก) เพือ่ ปิดหน้าต่างโดยไม่บนั ทึกโปรโตคอล

การใช้เครื่องคำนวณ Taเมือ่ ไม่ทราบอุณหภูมิ Annealingสำหรับไพรเมอร์ คุณสามารถใช้เครือ่ งคำนวณ Ta ในการคำนวณค่าได้ คุณสามารถ
ใช้ค่าใน Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) หรือใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)เพื่อสร้างโปรโตคอลของคุณ

เกีย่ วกับเครื่องคำนวณ Taตัวคำนวณ Ta จะคำนวณค่า Tm สำหรับแต่ละไพรเมอร์ รวมถึงค่า Ta สำหรับโปรโตคอลที่ความเร็วมาตรฐาน
ค่า Ta สำหรับโปรโตคอลจะขึน้ อยู่กบั ค่าเฉลีย่ ไพรเมอร์ Tm โดยใช้กฎต่อไปนี้
nหากความแตกต่างระหว่างค่าไพรเมอร์ Tm มีคา่ >4°C ค่า Ta = (ค่าต่ำของไพรเมอร์ Tm ทั้งสอง + 2) – 4°Cnหากความแตกต่างระหว่างค่า Tm มีคา่ ≤4°C ค่า Ta = (ค่าเฉลี่ยของไพรเมอร์ Tm) – 4°Cวิธกี ารนับคูเ่ บสสำหรับแต่ละไพรเมอร์ ตัวคำนวณ Ta จะใช้วธิ ีการนับคู่เบสสำหรับลำดับ 14 คู่เบส (bp) หรือน้อยกว่า
Tm = ((w*A + x*T) * 2) + ((y*G + z*C) * 4)
โดย w, x, y และ z คือจำนวนเบส A, T, G และ C ตามลำดับ

116 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการใช้เครือ่ งคำนวณ Taการจำแนกประเภทด้วย Nearest Neighbor Methodจะต้องใช้การจำแนกประเภทด้วย Nearest Neighbor Method สำหรับลำดับที่ยาวกว่า 14 คูเ่ บส ในการจำแนก
ประเภทด้วยวิธี Nearest Neighbor Method การคำนวนอุณหภูมิในการละลายอยู่นนั้ ขึ้นอยู่กบั ความสัมพันธ์ทาง
เทอร์โมไดนามิกส์ระหว่างเอนโทรปี (ลำดับหรือปริมาณความสุม่ ของโอลิโกนิวคลีโอไทด์) เอนทัลปี (ความร้อนที่ถูก
ปล่อยออกมาหรือซึมซับโดยโอลิโกนิวคลีโอไทด์) พลังงานเสรี และอุณหภูมิ
∆H = ∆G + T* ∆Sโดยn∆H = ค่าของเอนทัลปีในหน่วย Cal/Mole*Kn

T = อุณหภูมิในหน่วยเคลวิน

n∆S = ค่าของเอนโทรปีในหน่วย Cal/Mole*Kn∆G = พลังงานเสรีของกิบ๊ ส์ในหน่วย Cal/Mole*Kการเปลี่ยนแปลงในเอนโทรปีและเอนทัลปีจะถูกคำนวณโดยตรงด้วยการรวมค่าของคู่นวิ คลีโอไทด์ที่แสดงอยูใ่ นตาราง 8 (Breslauer et al. 1986)ความสัมพันธ์ระหว่างพลังงานเสรีและความเข้มข้นของตัวทำปฏิกริยาและสารในสภาพคงตัวนั้นกำหนดโดย:∆G = R*T*ln ((DNA * ไพรเมอร์)/(DNA + ไพรเมอร์))โดย R เป็นค่าคงที่ของก๊าซ (1.986 Cal/Mole*K)การสลับ G ในสมการทั้งสองและการหาค่าของ T
T = ∆H/(∆S + R*Ln((DNA * ไพรเมอร์)/(DNA + ไพรเมอร์)))คาดได้วา่ ความเข้มข้นของ DNA และ DNA ไพรเมอร์คอมเพล็กซ์นนั้ เท่ากัน
โดยสามารถกำหนดด้วยการเฝ้าสังเกตได้ว่ามีพลังงานเสรี 5 kcal (3.4 kcal) (Sugimoto et al. 1996) เปลี่ยนแปลงไป
ระหว่างการเปลี่ยนผ่านจาก DNA สายเดีย่ วเป็น DNA แบบ B ซึง่ คาดเดาได้ว่าเป็นพลังงานที่มตี ้นตอเป็นไฮโดรเจน
สุดท้ายแล้ว การเพิ่มการปรับเปลี่ยนเกลือทำให้เกิดสมการที่ตัวคำนวณ Ta ใช้งาน:T = (∆H – 5(KCal/K*Mole))/(∆S + (R * ln(1/(ไพรเมอร์)))) + 16.6 log10 (SaltMolarity)ไม่จำเป็นต้องมีการปรับเปลี่ยนค่าคงที่ของความเข้มข้นของเกลือ เนือ่ งจากความหลากหลายของพารามิเตอร์ได้ถูก
กำหนดไว้ที่ 1 M NaCl และ log10 ของ 1 คือศูนย์
การคำนวณเทอร์โมไดนามิกส์พบว่าการหลอมจะเกิดขึ้นที่คา่ pH 7.0 การคำนวณ Tm แสดงให้เห็นว่าลำดับนัน้ ไม่มี
ลักษณะสมมาตรและประกอบไปด้วยหนึง่ G หรือ C เป็นอย่างน้อย
ลำดับโอลิโกนิวคลีโอไทด์ควรมีความยาวอยูท่ ี่อย่างน้อย 14 เบสเพื่อให้มีคา่ Tm ที่เหมาะสม ความยาวทีน่ ้อยกว่า 14เบสจะใช้วิธกี ารนับคู่เบส (ดูตาราง 8 ต่อไป)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 117บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

ตาราง 8 ค่าคงที่ของปฏิกริยา Breslauerปฏิกริยา

∆H

∆S

∆G

AA

TT

9.1

24

1.5

AT

TA

8.6

23.9

1.5

AC

TG

6.5

17.3

1.3

AG

TC

7.8

20.8

1.6

TA

AT

6

16.9

0.9

TT

AA

9.1

24

1.9

TC

AG

5.6

13.5

1.6

TG

AC

5.8

12.9

1.9

CA

GT

5.8

12.9

1.9

CT

GA

7.8

20.8

1.6

CC

GG

11

26.6

3.1

CG

GC

11.9

27.8

3.6

GA

CT

5.6

13.5

1.6

GT

CA

6.5

17.3

1.3

GC

CG

11.1

26.7

3.1

GG

CC

11

26.6

3.1

118 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการใช้เครือ่ งคำนวณ Taการใช้เครือ่ งคำนวณ Taวิธใี ช้เครือ่ งคำนวณ Ta
1หากต้องการเปิดเครื่องคำนวณ Ta ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากคุณอยู่ใน Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) คลิกทีเ่ ครือ่ งคำนวณ Tanในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > เครือ่ งคำนวณ Taกล่องโต้ตอบเครือ่ งคำนวณ Ta จะปรากฏขึน
้

2ในกล่องข้อความ Forward Primer (ส่งต่อไพรเมอร์) พิมพ์หรือวางลำดับส่งต่อไพรเมอร์
เคล็ดลับ: นอกจากนีค้ ุณสามารถใช้ปม
ุ่ A, T, G, C ทางด้านซ้ายของกล่องโต้ตอบเพื่อป้อนลำดับ

3พิมพ์หรือวางลำดับย้อนกลับไพรเมอร์ในกล่องข้อความ Reverse Primer (ย้อนกลับไพรเมอร์)4คลิก Calculate (คำนวณ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 119บทที่ 7 การสร้างโปรโตคอล

เครือ่ งคำนวณ Ta คำนวณและแสดง Tm ของแต่ละไพรเมอร์และ Tm เฉลีย่ และค่า Ta เช่น:หากค่าไพรเมอร์ Tm มากกว่า 4°C Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) จะใช้ค่าไพรเมอร์
Tm ที่ต่ำกว่า + 2°C เป็นฐานในการคำนวณค่า Ta ทีค่ ุณสามารถแก้ไขเพิ่มเติมโดยเปลีย่ นเอนไซม์และความเร็ว
ปฏิกริ ยิ าเครือ่ งคำนวณ Ta สร้างอุณหภูมิ Annealingสำหรับความเร็วมาตรฐานกับ iTaq DNA polymerase เมื่อใช้เอนไซ
ม์อนื่ การตั้งค่าความเร็วจะปรับ Taโดยอัตโนมัติ
5โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากคุณเปิดเครือ่ งคำนวณ Ta จาก Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) คลิก OK(ตกลง) คุณจะกลับไปที่ Protocol AutoWriter (ระบบเขียนโปรโตคอลอัตโนมัติ) อุณหภูมิ Annealingจะได้
รับการแก้ไขโดยอัตโนมัติ

nหากคุณเปิดเครือ่ งคำนวณ Ta จากเมนู Tools (เครือ่ งมือ) บันทึกการคำนวณ และคลิก Cancel (ยกเลิก) เพือ่ปิดเครือ่ งคำนวณ

120 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 8 การเตรียมเพลต
ไฟล์เพลตจะมีข้อมูลเกีย่ วกับพารามิเตอร์การทำงาน เช่น โหมดสแกน สารเรืองแสง และสารในหลุม หลังทดสอบ
เสร็จสิน้ แล้ว ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition จะเชื่อมโยงสารในหลุมกับข้อมูลสารเรืองแสงที่เก็บ
รวบรวมระหว่างการทดสอบ และจะนำการวิเคราะห์ที่เหมาะสมในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ไปใช้
ตัวอย่างเช่น หลุมที่มปี ระเภทตัวอย่างมาตรฐานที่ใช้ในการสร้างกราฟเส้นโค้งมาตรฐาน
CFX Maestro Dx SE มีสองตัวเลือกสำหรับการสร้างเพลต Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) สำหรับการทดสอบ PCRแบบเรียลไทม์และ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) สำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐาน
Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) มีคุณลักษณะต่อไปนี้
nสารเรืองแสงมาตรฐานและประเภทตัวอย่างสำหรับกำหนดให้กับหลุมเพลต

nความสามารถในการตั้งค่าเป้าหมายอ้างอิงและตัวอย่างควบคุมสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

nความสามารถในการแก้ไขการตั้งค่าเพลตก่อน ระหว่าง หรือหลังจากการทดสอบ

nความสามารถในการบันทึกไฟล์เพลตสำหรับการใช้ซำ้

nความสามารถในการพิมพ์ไฟล์เพลตที่เครือ่ งพิมพ์เริ่มต้น

Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) จะช่วยคุณสร้างโครงร่างเพลตสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่
เป็นบรรทัดฐาน คุณสามารถใช้ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ก่อน ระหว่าง หรือหลังทำการทดสอบได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 121บทที่ 8 การเตรียมเพลต

หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)คุณใช้ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ในการสร้างเพลตแบบกำหนดเองหรือแก้ไขเพลตทีม่ ีอยู่

คำอธิบายสัญลักษณ์
1แถบเมนูจะช่วยให้สามารถเข้าถึงไฟล์และคำสั่งเมนูการตั้งค่า รวมทั้งตัวเลือกเครื่องมือแก้ไขเพลตได้อย่าง
รวดเร็ว

2แถบเครือ่ งมือจะช่วยให้สามารถเข้าถึงฟังก์ชนั การโหลดเพลตทีส่ ำคัญได้อย่างรวดเร็ว

3บานหน้าต่างหลักจะแสดงโครงร่างเพลตและตัวเลือกเพลตตามทีค่ ุณใช้

4บานหน้าต่างด้านขวาแสดงตัวเลือกที่คุณใช้ในการกำหนดเพลตของคุณด้วยตัวเอง

5บานหน้าต่างด้านล่างแสดงประเภทของเพลตและช่วยให้สามารถเข้าถึงตัวเลือกการดูอย่างรวดเร็ว

คำสั่งเมนูไฟล์
Save (บันทึก) — บันทึกไฟล์ขอ้ มูลเพลตในตำแหน่งทีร่ ะบุไว้ในแท็บ File (ไฟล์) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้) โปรดดูการเปลีย่ นการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น ในหน้า 83 สำหรับข้อมูลเพิม่ เติม รายการเมนูนจี้ ะสามารถใช้งานได้เมื่อสร้างไฟล์เพลตใหม่เท่านัน
้
Save As (บันทึกเป็น) — บันทึกไฟล์ขอ้ มูลเพลตที่เปิดอยู่ในชื่อใหม่ที่คณุ กำหนดให้ รายการเมนูนจี้ ะสามารถใช้งาน
ได้เมือ่ สร้างไฟล์เพลตใหม่เท่านัน
้

122 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)File Passwords (รหัสผ่านของไฟล์) — ช่วยให้ผู้ใช้สามารถตั้งค่ารหัสผ่าน
สำหรับการบันทึกไฟล์และรหัสผ่านสำหรับเปิดไฟล์ได้
Extract Plate (แยกเพลต) — เปิดกล่องโต้ตอบที่คณุ สามารถแยก/บันทึกไฟล์เพลต (.pltd) ได้ รายการเมนูนี้
จะสามารถใช้งานได้เมื่อดูหรือแก้ไขไฟล์เพลตที่มีอยูเ่ ดิมเท่านัน
้
Print (พิมพ์) — พิมพ์ไฟล์ขอ้ มูลเพลตที่เปิดอยู่
Close (ปิด) — ปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)คำสั่งเมนูการแก้ไข
Undo (เลิกทำ) — ยกเลิกการเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นกับไฟล์เพลตก่อนหน้าที่จะถูกบันทึกการเปลี่ยนแปลง
Redo (ทำซ้ำ) — ย้อนการเลิกทำล่าสุด นอกเสียจากว่าไฟล์เพลตจะถูกบันทึกการเปลี่ยนแปลงแล้ว

คำสั่งเมนูการตัง้ ค่า
Plate Size (ขนาดของเพลต) — จะเปิดกล่องโต้ตอบซึง่ คุณสามารถเลือกขนาดของเพลตสำหรับการทดสอบ
หมายเหตุ: ขนาดของเพลตจะต้องเท่ากับขนาดของบล็อกบนเครือ่ งมือที่ทำการทดสอบ
เลือกแบบ 96 หลุมสำหรับ:n

CFX Opus 96 Dxn

CFX Opus Deepwell Dxเลือกแบบ 384 หลุมสำหรับ:n

CFX Opus 384Dx

Plate Type (ประเภทของเพลต) — ช่วยให้คุณสามารถเลือกประเภทของหลุมในเพลตที่จะใส่ตัวอย่างของคุณว่าจะ
เป็นแบบ BR White หรือ BR Clear เพื่อการวิเคราะห์ข้อมูลทีแ่ ม่นยำ ประเภทของเพลตที่เลือกจะต้องเหมือนกับ
ประเภทของเพลตที่ใช้ในการทดสอบ
หมายเหตุ: คุณจะต้องปรับเทียบค่าประเภทเพลตใหม่ โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมได้ที่
การสอบเทียบสารย้อมสีใหม่ ในหน้า 75
Number Convention (การแสดงตัวเลข) — ช่วยให้คุณสามารถเลือกหรือยกเลิกการเลือกตัวเลือกเพื่อแสดงหน่วย
ในสัญกรณ์ทางวิทยาศาสตร์ ค่าเริม่ ต้นคือการแสดงหน่วยในสัญกรณ์ทางวิทยาศาสตร์
Units (หน่วย) — ช่วยให้คุณสามารถเลือกหน่วยที่จะแสดงในสเปรดชีตเมือ่ ดำเนินการนับจำนวนของเส้นโค้งที่
ไม่รู้จกั และเส้นโค้งมาตรฐาน

คำสั่งเมนูเครื่องมือการแก้ไข
Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) เปิด Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ซึง่ คุณสามารถกำหนด
พารามิเตอร์โครงร่างและการวิเคราะห์สำหรับเพลตปัจจุบันได้ คุณสามารถใช้ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 123บทที่ 8 การเตรียมเพลต

ก่อน ระหว่าง หรือหลังทำการทดสอบเสร็จสิน้ ได้
Spreadsheet View/Importer (มุมมอง/ตัวนำเข้าสเปรดชีต) เปิดกล่องโต้ตอบ View (มุมมอง) ซึ่งจะแสดงเค้าโครง
เพลตเป็นเทมเพลตในรูปแบบสเปรดชีต คุณสามารถใช้กล่องโต้ตอบนี้เพือ่ ส่งออกหรือนำเข้าข้อมูลเทมเพลตของเพลต
ในรูปแบบ .csv
Flip Plate (พลิกเพลต) พลิกสารในเพลต 180oคำสั่งแถบเครื่องมือ
ย้อนกลับการเปลี่ยนแปลงของเพลต CFX Maestro Dx SE รองรับการเลิกทำได้
ถึงสิบครั้ง
ย้อนกลับการเลิกทำล่าสุด CFX Maestro Dx SE รองรับการทำซ้ำได้ถงึ สิบครั้ง
บันทึกไฟล์เพลตนี้

แสดงรายการเลื่อนลงที่ซึ่งคุณสามารถเพิ่มหรือลดการขยายมุมมองเพลตได้
แสดงรายการเลื่อนลงที่ซึ่งคุณสามารถเลือกโหมดสแกน ทีค่ วบคุมเครื่องมือจาก
ช่องทางใด ๆ เพื่อเก็บรวบรวมข้อมูลของสารเรืองแสงระหว่างการทดลอง
เปิด Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุ่มหลุม) ที่คุณสามารถใช้งานเพื่อสร้าง
กลุม่ หลุมให้กบั เพลตปัจจุบันที่ใช้งาน
แสดงกล่องโต้ตอบทีซ่ ึ่งคุณสามารถเลือกสีและสัญลักษณ์สำหรับการติดตามการ
เพิม่ ปริมาณ
เปิดกล่องโต้ตอบ View (มุมมอง) ซึ่งจะแสดงเค้าโครงเพลตเป็นเทมเพลตใน
รูปแบบแผ่นงาน คุณสามารถใช้กล่องโต้ตอบนี้เพือ่ ส่งออกหรือนำเข้าข้อมูล
เทมเพลตของเพลตในรูปแบบ .csv
เปิด Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ที่ซึ่งคุณสามารถกำหนดพารามิเตอร์
โครงร่างและการวิเคราะห์สำหรับเพลตปัจจุบันได้ คุณสามารถใช้ Setup Wizard(ตัวช่วยสร้างการตัง้ ค่า) ก่อน ระหว่าง หรือหลังทำการทดสอบได้
เปิดแท็บ Plate (เพลต) ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ทีซ่ ึ่งคุณสามารถกำหนดพารามิเตอร์เค้าโครงเพลตและสร้างหรือลบเป้าหมาย
ตัวอย่าง และชือ่ ของกลุ่มชีวภาพได้ การเปลีย่ นแปลงทีค่ ุณกระทำในแท็บ Plate(เพลต) จะยังพร้อมใช้งานในครัง้ ถัดไปทีค่ ุณเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)แสดงขัน้ ตอนทีจ่ ำเป็นสำหรับการตัง้ ค่าเพลตและการโหลดหลุม

124 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตวั แก้ไขเพลต

การสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตัวแก้ไขเพลต
Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ช่วยให้คุณสามารถสร้างไฟล์เพลตที่กำหนดเองได้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถแก้ไขและ
บันทึกไฟล์เพลตที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้านี้หรือไฟล์เพลตตัวอย่างที่จดั ส่งมาพร้อมกับ CFX Opus Dx system ได้หากต้องการสร้างไฟล์เพลตใหม่ ให้ทำดังต่อไปนี้
nเปิดไฟล์เพลตใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)nเลือกประเภทของเพลต
หมายเหตุ: ประเภทของเพลตสำหรับไฟล์เพลตจะต้องเป็นประเภทเดียวกับเพลตในโมดูลปฏิกริ ยิ าnเลือกโหมดสแกนที่จะใช้ในโปรโตคอล

nเลือกสารเรืองแสงที่จะใช้ในเพลต

nเลือกประเภทตัวอย่าง เป้าหมาย และสารตัวอย่าง

nเลือกการทำซ้ำทางเทคนิค หากเหมาะสม

nบันทึกเค้าโครงเพลต

เคล็ดลับ: หากต้องการสร้างเพลตใหม่จากไฟล์เพลตที่บันทึกไว้กอ่ นหน้านีห้ รือไฟล์เพลตตัวอย่าง โปรดดูการเปิด
ไฟล์เพลตที่มอี ยู่ในตัวแก้ไขเพลต ในหน้า 127

การเปิดไฟล์เพลตใหม่ในตัวแก้ไขเพลต
CFX Maestro Dx SE ให้ตัวเลือกที่หลากหลายในการเปิดไฟล์เพลตใหม่ดังนี้
nจากหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nจากกล่องโต้ตอบ Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น)nจากกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)หากต้องการเปิดไฟล์เพลตใหม่จากหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)uเลือก File (ไฟล์) > New (ใหม่) > Plate (เพลต)หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะเปิดและแสดงไฟล์เพลตเริม่ ต้นสำหรับเครื่องมือที่เลือก
เคล็ดลับ: สำหรับข้อมูลเกีย่ วกับการตั้งค่าไฟล์เพลตเริม่ ต้นของคุณ โปรดดูการเปลีย่ นการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้นในหน้า 83คูม่ ือผูใ้ ช้ | 125บทที่ 8 การเตรียมเพลต

หากต้องการเปิดไฟล์เพลตใหม่จาก Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนีเ้ พื่อเปิด Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) หากไม่ได้อยู่ในมุมมอง
nเลือก View (มุมมอง) > Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)nคลิก Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) บนแถบเครือ่ งมือ

2หากจำเป็น ให้เลือกประเภทเครือ่ งมือจากรายการแบบเลือ
่ นลง

3

หากต้องการสร้างเพลตใหม่ ให้คลิก User-defined (กำหนดโดยผูใ้ ช้) เป็นประเภทการทดสอบ
กล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะแสดงขึน้ มาที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล)4คลิกที่แท็บ Plate (เพลต) และคลิก Create New (สร้างใหม่)หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะเปิดและแสดงรูปแบบเพลตเริม่ ต้นสำหรับเครื่องมือที่เลือก

หากต้องการเปิดไฟล์เพลตใหม่จากกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนีเ้ พื่อเปิดกล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)nเลือก Run (การทดสอบ) > User-defined Run (การทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด)nคลิก User-defined Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด) บนแถบเครือ่ งมือ

กล่องโต้ตอบ Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดขึน้ มาที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล)2หากต้องการสร้างเพลตใหม่ คลิกที่แท็บ Plate (เพลต) และคลิก Create New (สร้างใหม่)หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะเปิดและแสดงรูปแบบเพลตเริม่ ต้นสำหรับเครื่องมือที่เลือก

126 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตวั แก้ไขเพลต

การเปิดไฟล์เพลตที่มีอยูใ่ นตัวแก้ไขเพลต
CFX Maestro Dx SE มีตัวอย่างไฟล์เพลตที่คณุ สามารถแก้ไขและบันทึกเป็นเพลตใหม่ได้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถ
สร้างไฟล์เพลตใหม่จากไฟล์เพลตที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้านีไ้ ด้วิธเี ปิดไฟล์เพลตตัวอย่าง
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Plate (เพลต)Windows Explorer จะเปิดไปที่ตำแหน่งของโฟลเดอร์ไฟล์ตัวอย่างใน CFX Opus Dx system

2เปิดโฟลเดอร์ไฟล์ตัวอย่างแล้วเปิดโฟลเดอร์ Plates (เพลต)3เลือกไฟล์เพลตแล้วคลิก Open (เปิด)ไฟล์เพลตตัวอย่างจะเปิดขึน้ ในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)4เลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) และบันทึกไฟล์เพลตเป็นชื่อใหม่หรือในโฟลเดอร์ใหม่

วิธเี ปิดไฟล์เพลตที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้านี้
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Plate (เพลต) ค้นหาและเลือกเพลตเป้าหมาย แล้วคลิก Open (เปิด)nเปิดตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้นและทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้oหากต้องการแก้ไขไฟล์เพลตที่มีอยู่ ให้คลิก Select Existing (เลือกที่มอี ยู่)oหากต้องการแก้ไขไฟล์เพลตที่แสดง ให้คลิก Edit Selected (แก้ไขที่เลือก)เพลตเป้าหมายจะเปิดขึ้นในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)2เลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) และบันทึกไฟล์เพลตเป็นชื่อใหม่หรือในโฟลเดอร์ใหม่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 127บทที่ 8 การเตรียมเพลต

การตัง้ ค่าไฟล์เพลตใหม่
เคล็ดลับ: หากไฟล์เพลตของคุณมีพารามิเตอร์ที่จำเป็น (ตัวอย่างเช่น หากคุณกำลังแก้ไขตัวอย่างหรือไฟล์เพลต
ที่มอี ยู่) คุณสามารถข้ามส่วนนีไ้ ด้ ดำเนินการต่อที่การกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต ในหน้า 135ไฟล์เพลตใหม่ต้องใช้พารามิเตอร์ต่อไปนี้
nPlate Size (ขนาดของเพลต)nPlate Type (ประเภทของเพลต)n

Scan Mode (โหมดสแกน)n

One Fluorophore (สารเรืองแสงหนึง่ ชนิด) (สารย้อมสี)n

One sample type (ประเภทตัวอย่างหนึง่ ประเภท)การเลือกขนาดและประเภทของเพลต
สำคัญ: คุณต้องเลือกขนาดเพลตระหว่างตั้งค่าเพลต คุณไม่สามารถเปลีย่ นขนาดเพลตระหว่างหรือหลังจากการ
ทดสอบได้
ซอฟต์แวร์จะใช้ขนาดและประเภทเพลตกับทุกหลุมระหว่างการทดสอบ ตรวจสอบว่าขนาดเพลตทีเ่ ลือกเท่ากับเพลตที่
คุณจะใช้ในการทดสอบ
CFX Opus Dx System ของ Bio-Rad ผ่านการสอบเทียบการใช้งานสารย้อมสีเรืองแสงร่วมกับเพลตจำนวนมากจาก
โรงงาน การสอบเทียบจะดำเนินการเฉพาะเจาะจงกับประเภทเครื่องมือ สารย้อมสี และเพลต ตรวจสอบว่าสารเรืองแสง
ที่คณุ วางแผนจะใช้ได้รบั การปรับเทียบกับประเภทเพลตที่คณุ เลือก
เคล็ดลับ: หากต้องการปรับเทียบการใช้งานร่วมกันของประเภทสารย้อมสีและเพลตใหม่บนเครือ่ งมือ ให้เลือก
Tools (เครือ่ งมือ) > Dye Calibration Wizard (ตัวช่วยสร้างการปรับเทียบสารย้อมสี) ดูข้อมูลเกีย่ วกับการปรับ
เทียบประเภทสารย้อมสีและเพลตที่การสอบเทียบสารย้อมสีใหม่ ในหน้า 75การเลือกโหมดสแกน
CFX Opus 96 Dx และ CFX Opus Deepwell Dx จะกระตุ้นและตรวจจับสารเรืองแสงในห้าช่อง (รวมถึง FRET)CFX Opus 384 Dx System จะกระตุ้นและตรวจจับสารเรืองแสงในสี่ชอ
่ ง (รวมถึง FRET) ระบบทั้งหมดใช้โหมด
สแกนหลายโหมดในการเก็บรวบรวมข้อมูลสารเรืองแสงระหว่างการทดสอบ
CFX Maestro Dx SE มีโหมดสแกนสามโหมดดังนี้:nทุกช่องoสแกนช่อง 1 ถึง 5 บนเครือ
่ ง CFX Opus 96 Dx และ CFX Opus Deepwell Dxoสแกนช่อง 1 ถึง 4 บนเครือ
่ ง CFX Opus 384 Dx system

128 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตวั แก้ไขเพลตnn

SYBR®/FAMoสแกนช่อง 1 เท่านัน
้oสแกนได้อย่างรวดเร็ว

FREToสแกนเฉพาะช่อง FRET เท่านั้นoสแกนได้อย่างรวดเร็ว

การเลือกสารเรืองแสง
สำคัญ: ก่อนเริม่ ต้นการทดสอบ CFX System จะตรวจสอบว่าสารเรืองแสงที่คณุ ระบุในเพลตได้รบั การสอบเทียบ
บนเครือ่ งมือนั้นแล้ว คุณไม่สามารถดำเนินการเพลตได้หากมีสารเรืองแสงที่ยงั ไม่ได้สอบเทียบบนเครือ่ งมือนัน
้คุณต้องโหลดสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึง่ รายการไปยังเค้าโครงเพลตก่อนทำการทดสอบ คุณสามารถเพิ่มสาร
เรืองแสงได้มากเท่าที่จำเป็นในเวลานี้ แต่เพลตต้องมีสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึง่ ชุด สารเรืองแสงที่เลือกจะปรากฏเป็น
ตัวเลือกสำหรับเป้าหมายในชื่อเป้าหมาย
คุณใช้กล่องโต้ตอบ Select Fluorophores (เลือกสารเรืองแสง) ในการโหลดสารเรืองแสง (หรือสารย้อมสีเพลต)ลงในชุดควบคุมการโหลดหลุมของ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) สารเรืองแสงที่ปรากฏในกล่องโต้ตอบ SelectFluorophores (เลือกสารเรืองแสง) ขึน้ อยูก่ บั โหมดสแกนที่คณุ เลือกดังนี้
nทุกช่อง
สารเรืองแสงที่มที ั้งหมดจะปรากฏ
เคล็ดลับ: คุณสามารถเพิ่มสารเรืองแสงได้มากตามที่จำเป็น แต่คุณสามารถโหลดสารเรืองแสงได้เพียงหนึ่ง
ชุดต่อช่องในแต่ละหลุมnSYBR®/FAMเฉพาะสารเรืองแสงช่อง 1 ที่ปรากฏ

n

FRETเฉพาะสารเรืองแสงช่อง 6 ที่ปรากฏ
เคล็ดลับ: สารเรืองแสง FRET ช่อง 6 จะปรากฏเมือ่ โหมดการสแกนทีเ่ ลือกเป็น FRET เท่านัน้ ไม่สามารถ
ใช้ได้สำหรับโหมดการสแกนทุกช่อง

หมายเหตุ: คุณไม่สามารถเพิม่ สารเรืองแสงโดยตรงหรือนำออกจากกล่องโต้ตอบ Select Fluorophore (เลือก
สารเรืองแสง) คุณต้องปรับเทียบสารเรืองแสงใหม่บนเครือ่ งมือโดยใช้ Calibration Wizard (ตัวช่วยสร้างการ
ปรับเทียบ) หลังจากการปรับเทียบ สารเรืองแสงใหม่จะถูกเพิ่มไปยังรายการนีโ้ ดยอัตโนมัติ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม
โปรดดูการสอบเทียบสารย้อมสีใหม่ ในหน้า 75คูม่ ือผูใ้ ช้ | 129บทที่ 8 การเตรียมเพลต

การเลือกประเภทตัวอย่าง
สำคัญ: คุณต้องเลือกประเภทตัวอย่างอย่างน้อยหนึง่ ประเภทเพื่อกำหนดหลุมของเพลตก่อนการทดสอบ
CFX Maestro Dx SE มีตัวอย่างห้าประเภทดังนี้
nUnknown (ไม่ทราบ)nStandard (มาตรฐาน)n

NTC (no template control) (การควบคุมไม่มีเทมเพลต)n

Positive Control (การควบคุมค่าบวก)n

Negative Control (การควบคุมค่าลบ)n

NRT (no reverse transcriptase) (การควบคุมการควบคุมไม่มรี ีเวิรส์ แทรนสคริปเทส)คุณกำหนดประเภทตัวอย่างสำหรับหลุมของเพลต

การตั้งค่าเพลตใหม่
วิธกี ารตั้งค่าเพลตใหม่
1เปิดเพลตใหม่ในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)2หากต้องการตั้งค่าขนาดเพลต ให้เลือก Settings (การตั้งค่า) > Plate Size (ขนาดของเพลต) และเลือกขนาด
เพลตที่เหมาะสมจากเมนูแบบเลื่อนลง

3หากต้องการตั้งค่าประเภทเพลต ให้เลือก Settings (การตั้งค่า) > Plate Type (ประเภทของเพลต) และเลือก
ระหว่าง BR White หรือ BR Clear จากเมนูแบบเลื่อนลง

4หรืออีกทางเลือกหนึ่ง จากเมนู Settings (การตั้งค่า) คุณสามารถเปลี่ยนรูปแบบตัวเลขและหน่วยแสดงผลได้
nหากต้องการเปลี่ยนรูปแบบตัวเลข ให้เลือก Settings (การตั้งค่า) > Number Convention (รูปแบบตัวเลข)และเลือก Scientific Notation (สัญกรณ์วิทยาศาสตร์)เคล็ดลับ: สัญกรณ์วิทยาศาสตร์จะถูกเลือกไว้เป็นค่าเริม่ ต้น ในกรณีนี้ การเลือก Scientific Notation(สัญกรณ์วิทยาศาสตร์) จะเป็นการเคลียร์ค่าเริ่มต้นและกำหนดรูปแบบตัวเลขเป็นรูปแบบมาตรฐาน

n5หากต้องการเปลี่ยนหน่วยแสดงผล ให้เลือก Settings (การตั้งค่า) > Units (หน่วย) และเลือกค่าหน่วยใหม่

หากต้องการตั้งค่าโหมดสแกน ให้เลือกโหมดสแกนทีเ่ หมาะสมจากรายการแบบเลื่อนลงของ Scan Mode (โหมดสแกน) ในแถบเครื่องมือหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)130 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตวั แก้ไขเพลต

6เลือกสารเรืองแสงที่จำเป็นสำหรับเพลต
aในบานหน้าต่างด้านขวา ให้คลิก Select Fluorophores (เลือกสารเรืองแสง)กล่องโต้ตอบ Select Fluorophores (เลือกสารเรืองแสง) จะปรากฏขึ้น คุณจะเห็นสารเรืองแสงที่พร้อม
ใช้งานสำหรับประเภทของโหมดสแกนที่คณุ เลือกไว้ในขั้นตอน 5 ดังตัวอย่างbหากต้องการเลือกสารเรืองแสง ให้คลิกที่ช่องทำเครือ่ งหมาย Selected (ทีเ่ ลือก)เคล็ดลับ: หากต้องการนำสารเรืองแสงออกจากรายการ ใหเคลียร์ช่องทำเครือ่ งหมาย Selected(ทีเ่ ลือก)cหากต้องการเปลี่ยนสีของสารเรืองแสง คลิกที่กล่อง Color (สี)หมายเหตุ: สีทคี่ ุณเลือกเป็นตัวแทนของสารเรืองแสงทั้งในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) และแผนภูมิ Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)dในกล่องโต้ตอบ Color (สี) ให้เลือกสีทคี่ ุณต้องการหรือคลิก Define Custom Colors (กำหนดสีที่กำหนดเอง) และสร้างสีใหม่เพื่อเป็นตัวแทนของสารเรืองแสง

eคลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและออกจากกล่องโต้ตอบ Select Fluorophores (เลือกสาร
เรืองแสง)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 131บทที่ 8 การเตรียมเพลต

7คุณต้องเลือกหลุมอย่างน้อยหนึง่ หลุมที่จะโหลดประเภทตัวอย่าง โดยค่าเริม่ ต้น หลุม A1 จะถูกเลือกไว้
ในบานหน้าต่างเพลต ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการโหลดหลุมหลายหลุมที่อยูต่ ิดกัน ให้คลิกที่หลุมและลากไปยังหลุมเป้าหมาย

nหากต้องการโหลดหลุมหลายหลุมที่ไม่ได้อยู่ติดกัน ให้กดปุ่ม Control และคลิกที่แต่ละหลุม

nหากต้องการโหลดทั้งคอลัมน์ที่มตี ัวอย่างประเภทเดียวกัน ให้คลิกที่หมายเลขคอลัมน์

nหากต้องการโหลดทั้งแถว ให้คลิกที่หมายเลขแถว

nหากต้องการโหลดทั้งเพลต ให้คลิกที่มุมบนซ้ายของเพลต

ตัวอย่างเช่น

8กำหนดประเภทตัวอย่างให้กับหลุมทีเ่ ลือกหรือหลุมจากเมนูแบบเลื่อนลง Sample Type (ประเภทตัวอย่าง)132 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตวั แก้ไขเพลต

9กำหนดสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึง่ ชนิดให้กบั หลุมทั้งหมดที่มปี ระเภทตัวอย่าง คุณสามารถกำหนดสารเรืองแสง
มากกว่าหนึง่ ชนิดให้กบั หลุมหรือกลุ่มหลุม
หมายเหตุ: คุณสามารถกำหนดสารเรืองแสงเพียงหนึ่งชนิดต่อหนึง่ ช่องเท่านัน้ คุณไม่สามารถกำหนดสาร
เรืองแสงมากกว่าหนึง่ ชนิดจากช่องเดียวกันให้กับหลุมเดียวกันได้
เคล็ดลับ: คุณสามารถเชื่อมโยงเป้าหมายกับสารเรืองแสง หรือคุณสามารถกำหนดสารเรืองแสงให้กับหลุม
ได้ในเวลานีแ้ ละเชื่อมโยงเป้าหมายกับสารเรืองแสงหลังจากที่คุณทำการทดสอบเท่านัน
้nหากต้องการกำหนดเฉพาะสารเรืองแสงให้กบั หลุมที่เลือก ในหัวข้อ Target Names (ชื่อเป้าหมาย) ในบาน
หน้าต่างด้านขวา ให้เลือกช่องทำเครื่องหมาย Load (โหลด) สำหรับสารเรืองแสงที่ระบุ

nหากต้องการเชือ่ มโยงเป้าหมายกับสารเรืองแสง ในหัวข้อ Target Names (ชื่อเป้าหมาย) ให้เลือกชือ
่เป้าหมายจากรายการเลื่อนลงสำหรับสารเรืองแสงที่ระบุ ซอฟต์แวร์จะเลือกช่องทำเครือ่ งหมาย Load(โหลด) ของสารเรืองแสงนั้นโดยอัตโนมัติ

10 สำหรับหลุมที่มตี ัวอย่างประเภทมาตรฐาน คุณต้องโหลดความเข้มข้น หลุมแต่ละหลุมสามารถมีคา่ ความเข้มข้นที่
แตกต่างกันได้ โดยค่าเริม่ ต้น CFX Maestro Dx SE โหลดความเข้มข้น 1.00E + 06 ลงในหลุมทั้งหมดที่มี
ประเภทตัวอย่างมาตรฐาน คุณสามารถเปลีย่ นค่าได้หากจำเป็น
aในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกหลุมหรือกลุม่ หลุมมาตรฐานbในหัวข้อ Concentration (ความเข้มข้น) ให้คลิก Load (โหลด) เพื่อโหลดค่าไปยังหลุมที่เลือก

c(ไม่บังคับ) หากต้องการโหลดระดับความเข้มข้นอืน่ ให้พิมพ์ค่าใหม่ในกล่องข้อความ Concentration(ความเข้มข้น) และกด Enterdทำขั้นตอนนีส้ ำหรับหลุมทัง้ หมดที่มีตัวอย่างประเภทมาตรฐาน
เคล็ดลับ: ในการโหลดความเข้มข้นเดียวกันลงในหลุมมาตรฐานทั้งหมด รายการ <All> (ทั้งหมด) จะต้องปรากฏอยูใ่ นรายการแบบเลือ่ นลงด้านล่าง Concentration Value (ค่าความเข้มข้น) หากต้องการโหลดค่าความเข้มข้นเดียวกันลงในหลุมทั้งหมดที่มสี ารเรืองแสงที่ระบุ ให้คลิกรายการแบบ
เลื่อนลงและเลือกสารเรืองแสง

11 คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกเพลตใหม่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 133บทที่ 8 การเตรียมเพลต

รายการเมนูคลิกขวาสำหรับเครื่องมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)ตาราง 9 แสดงรายการเมนูที่มใี นเครื่องมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) หากคุณคลิกขวาบนหลุมใดก็ตามใน
เครือ่ งมือ เมนูนจี้ ะปรากฏใน Spreadsheet View/Importer (ดู/นำเข้าสเปรดชีต) เช่นกัน
ตาราง 9 รายการเมนูคลิกขวาในเครื่องมือดู/นำเข้าสเปรดชีตของเพลต

รายการ

ฟังก์ชน
ั

Copy (คัดลอก)คัดลอกสเปรดชีตทั้งหมด

Copy as Image (คัดลอก

คัดลอกสเปรดชีตเป็นไฟล์ภาพ

เป็นภาพ)Print (พิมพ์)พิมพ์แผ่นงาน

Print Selection (พิมพ์การ

พิมพ์เฉพาะเซลล์ทเี่ ลือกเลือก)
Export to Excel (ส่งออก

ส่งออกไฟล์ไปยังแผ่นงาน Excelไปยัง Excel)
Export to CSV (ส่งออก

ส่งออกไฟล์เป็นไฟล์ .csv

ไปยัง CSV)
Export to Xml (ส่งออกไป

ส่งออกเป็นไฟล์ .xml

ยัง Xml)
Export to Html (ส่งออก

ส่งออกไฟล์เป็นไฟล์ .html

ไปยัง Html)
Find (ค้นหา)ค้นหาข้อความทีร่ ะบุ

Sort (จัดเรียง)จัดเรียงแผ่นงานโดยการเลือกไม่เกินสามคอลัมน์ขอ้ มูลในหน้าต่าง Sort
(จัดเรียง)134 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

การกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต
ไฟล์เพลตจะมีข้อมูลเกีย่ วกับสารในแต่ละหลุมที่โหลดไว้พร้อมตัวอย่างเพื่อการทดสอบ หลังทดสอบเสร็จสิน้ CFX
Maestro Dx SE จะเชื่อมโยงสารในหลุมกับข้อมูลสารเรืองแสงที่เก็บรวบรวมระหว่างโปรโตคอล และจะนำการ
วิเคราะห์ที่เหมาะสมในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ไปใช้
ใน CFX Maestro Dx SE คุณสามารถกำหนดพารามิเตอร์ให้แต่ละหลุมในเพลตของคุณก่อน ระหว่าง หรือแม้แต่หลัง
ดำเนินการทดลองได้ คุณสามารถกำหนดพารามิเตอร์ให้ไฟล์เพลตที่มีอยูห่ รือไฟล์เพลตใหม่กไ็ ด้ พารามิเตอร์เหล่านีม้ ีดังนี้
nTarget names (ชื่อเป้าหมาย) — เป้าหมายหรือเป้าหมายทีส่ นใจ (ยีนหรือลำดับพันธุกรรม) ในแต่ละหลุม
ที่โหลด

n

Sample names (ชื่อตัวอย่าง) — ตัวระบุหรือสภาวะที่สอดคล้องกับตัวอย่างในแต่ละหลุมที่โหลด เช่น mouse1,
mouse2 หรือ mouse3nBiological groups (กลุ่มชีวภาพ) — ตัวระบุหรือสภาวะที่สอดคล้องกับกลุ่มของหลุม เช่น 0Hr, 1Hr หรือ 2Hrเคล็ดลับ: ชื่อเป้าหมาย ชื่อตัวอย่าง และกลุม่ ชีวภาพต้องเป็นชื่อเดียวกันในหลุ่มต่าง ๆ เพื่อเปรียบเทียบข้อมูล
ในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ของหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) แต่ละชื่อต้องมีตัวพิมพ์เล็ก-ใหญ่ เครือ่ งหมายวรรคตอน และเว้นวรรคที่เหมือนกัน ตัวอย่างเช่น “Actin” ไม่เหมือนกับ “actin”, “2Hr” ไม่เหมือนกับ “2 hr” และ “Mouse 1” ไม่เหมือนกับ “mouse1” เพื่อให้แน่ใจว่าการ
ตั้งชื่อสอดคล้องกัน ให้ปอ้ นชือ่ ในส่วน Libraries (ไลบรารี) ใน User (ผู้ใช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) > Plate (เพลต) ทีม่ ีอยูใ่ นหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)nTechnical replicates (การทำซ้ำทางเทคนิค) — แต่ละหลุมที่ใช้เพื่อวิเคราะห์คู่ตัวอย่างและเป้าหมายเดียวกัน
กล่าวคือปฏิกิรย
ิ า qPCR ทำซ้ำ

nDilution series (ชุดเจือจาง) — ปริมาณที่จะเปลีย่ นแปลงความเข้มข้นของชนิดตัวอย่างมาตรฐานภายในกลุ่ม
ทำซ้ำเพื่อสร้างข้อมูลเส้นโค้งมาตรฐานในการวิเคราะห์

การกำหนดเป้าหมายให้หลุม
เคล็ดลับ: คุณสามารถกำหนดชื่อเป้าหมายเดียวกันให้กบั หลุมเดียวหรือหลาย ๆ หลุมได้ คุณยังสามารถกำหนด
หลาย ๆ เป้าหมายให้กับหลุมเดียวกันได้ด้วย
สำคัญ: หากคลิก OK (ตกลง) หลังกำหนดเป้าหมาย จะเป็นการบันทึกการเปลี่ยนแปลงและปิดใช้งาน Undo (เลิกทำ) บนแถบเครื่องมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) โปรดใช้ความระมัดระวังเมื่อคลิก OK (ตกลง)วิธกี ำหนดเป้าหมายให้กบั หลุมหรือกลุม่ หลุม
1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจสอบว่ามีการกำหนดชนิดตัวอย่างให้กับหลุมหรือกลุม่ ของหลุม
โปรดดูการเลือกประเภทตัวอย่าง ในหน้า 130 เพื่อดูข้อมูลเกีย่ วกับการกำหนดชนิดตัวอย่างให้กบั หลุม

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 135บทที่ 8 การเตรียมเพลต

2ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกหลุมหรือกลุม่ หลุม:nในการเลือกหลุมเดียว ให้คลิกทีห่ ลุมนัน
้nหากต้องการเลือกหลุมที่อยูต่ ิดกันหลายหลุม ให้คลิกที่หลุมหนึง่ และลากไปยังหลุมเป้าหมาย

nหากต้องการเลือกหลุมหลายหลุมที่ไม่ติดกัน ให้กดปุ่ม Control และคลิกที่แต่ละหลุม

nหากต้องการเลือกทั้งคอลัมน์ที่มีประเภทตัวอย่างเดียวกัน ให้คลิกทีห่ มายเลขคอลัมน์

nหากต้องการเลือกทั้งแถว ให้คลิกทีห่ มายเลขแถว

3ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้เลือกชื่อจากรายการ Target Names (ชื่อเป้าหมาย) แบบเลือ่ นลงสำหรับ
สารเรืองแสงที่เลือกแต่ละรายการ

4ทำขั้นตอน 3 ซ้ำสำหรับแต่ละหลุมหรือกลุม่ ของหลุมที่คุณต้องกำหนดเป้าหมายให้
เคล็ดลับ: คุณสามารถกำหนดชื่อเป้าหมายเดียวกันหรือต่างกันให้กบั สารเรืองแสงที่เลือกแต่ละรายการได้

5คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต
หมายเหตุ: หากคุณเปลี่ยนเพลตผิดพลาด ให้คลิก Undo (เลิกทำ) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ก่อนที่จะคลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลง

วิธลี บชือ่ เป้าหมายuในการลบชื่อเป้าหมายออกจากหลุมหรือกลุม่ หลุมที่เลือก ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมาย Load (โหลด)สำคัญ: หากลบชื่อเป้าหมายออกจากหลุม สารเรืองแสงที่เกีย่ วข้องกันก็จะถูกลบออกด้วย โปรดใช้ความ
ระมัดระวังเมือ่ ลบชื่อเป้าหมายออกจากหลุม

วิธเี พิ่มชือ่ เป้าหมายในรายการuในการเพิ่มชื่อเป้าหมายในรายการแบบเลื่อนลง ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nพิมพ์ชื่อในรายการ Target Names (ชือ่ เป้าหมาย) แบบเลื่อนลงแล้วกด Enterเคล็ดลับ: ชื่อเป้าหมายที่คณุ เพิ่มในรายการหนึง่ จะปรากฏในรายการเป้าหมายอืน่ ๆ ทั้งหมด

nคลิกสัญลักษณ์บวก + สีเขียวทีด่ ้านขวาของรายการแบบเลื่อนลง พิมพ์ชื่อเป้าหมายแล้วกด Enternคลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ แล้วเพิ่มชื่อให้ไลบรารี Target
Names (ชือ่ เป้าหมาย) ในแท็บ Plate (เพลต)136 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

สำคัญ: ชื่อเป้าหมายที่คุณเพิม่ ในรายการแบบเลือ่ นลงจะใช้ได้กบั เพลตปัจจุบันเท่านัน้ และหากคุณกำหนด
ชื่อให้หลุมและบันทึกเค้าโครงเพลตเท่านัน้ หากคุณไม่กำหนดชือ่ ให้หลุม แล้วบันทึกเค้าโครงของเพลต ชื่อจะไม่บันทึกและจะไม่สามารถใช้ได้ในอนาคต ในการเพิม่ ชือ่ เป้าหมายอย่างถาวร ให้เพิ่มชื่อในไลบรารี
Target Names (ชื่อเป้าหมาย) ด้วยโดยใช้กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ชื่อที่คณุ เพิ่มในไลบรารีจะใช้ได้หลังจากคุณเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) อีกครัง้ โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมที่
การตั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม่ ต้น ในหน้า 86วิธลี บชือ่ เป้าหมายออกจากรายการ
1คลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ
กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) จะปรากฏขึน้ และแสดงแท็บ Plate (เพลต)2ในไลบรารี Target Names (ชื่อเป้าหมาย) ในแท็บ Plate (เพลต) ให้เลือกชื่อที่จะลบออกแล้วกดปุม
่ Delete (ลบ)

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและออกจากกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้)สำคัญ: คุณไม่สามารถลบชื่อเป้าหมายทีค่ ุณบันทึกไว้ด้วยไฟล์เพลตได้ ชื่อที่กำหนดเองที่คณุ เพิ่มใน
รายการ Target Names (ชือ่ เป้าหมาย) แบบเลื่อนลงและที่คุณไม่ใช้และบันทึกไว้ดว้ ยไฟล์เพลตจะถูกลบ
ออกจากรายการโดยอัตโนมัติ ชื่อที่คณุ ลบออกจาก Target Names Library (ไลบรารีชื่อเป้าหมาย) จะถูก
ลบออกจากซอฟต์แวร์อย่างถาวรและจะไม่สามารถใช้งานได้อกี ต่อไป โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ ลบชื่อ
เป้าหมาย

การกำหนดชื่อตัวอย่างให้หลุม
หมายเหตุ: ในการกำหนดชื่อตัวอย่าง คุณต้องกำหนดสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึง่ ชนิดให้หลุมที่เลือก หากไม่มี
การกำหนดสารเรืองแสงให้กับหลุมที่เลือก รายการ Sample Names (ชื่อตัวอย่าง) แบบเลื่อนลงจะถูกปิดใช้งาน
โปรดดูการกำหนดเป้าหมายให้หลุม ในหน้า 135 เพือ่ ดูข้อมูลเกีย่ วกับการกำหนดสารเรืองแสง
เคล็ดลับ: คุณสามารถกำหนดชื่อตัวอย่างเพียงหนึ่งชื่อให้กบั แต่ละหลุมหรือกลุ่มหลุม

วิธกี ำหนดชื่อตัวอย่างให้กบั หลุมหรือกลุม่ หลุม
1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไข์เพลต) ตรวจสอบว่ามีการกำหนดสารเรืองแสงให้หลุมหรือกลุม่ หลุมแล้ว

2ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกหลุมหรือกลุม่ หลุม

3ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้เลือกรายการ Sample Names (ชือ่ ตัวอย่าง) แบบเลื่อนลง
ซอฟต์แวร์จะเลือกช่องทำเครื่องหมาย Load (โหลด) ของสารเรืองแสงนัน้ โดยอัตโนมัติ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 137บทที่ 8 การเตรียมเพลต

4ทำขั้นตอน 3 ซ้ำสำหรับแต่ละหลุมหรือกลุม่ ของหลุมที่คุณต้องกำหนดชื่อตัวอย่างให้

5คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต
หมายเหตุ: หากคุณเปลี่ยนเพลตผิดพลาด ให้คลิก Undo (เลิกทำ) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ก่อนที่จะคลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลง

วิธลี บชือ่ ตัวอย่างuในการลบชื่อตัวอย่างออกจากหลุมหรือกลุ่มหลุมที่เลือก ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมาย Load (โหลด)วิธเี พิ่มชือ่ ตัวอย่างในรายการuในการเพิ่มชื่อตัวอย่างในรายการแบบเลือ่ นลง ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nพิมพ์ชื่อในรายการ Sample Names (ชื่อตัวอย่าง) แบบเลื่อนลง แล้วกด Enternคลิกสัญลักษณ์บวก + สีเขียวทีด่ ้านขวาของรายการแบบเลื่อนลง แล้วพิมพ์ชื่อตัวอย่าง

nคลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ แล้วเพิ่มชื่อให้ไลบรารี Sample
Names (ชือ่ ตัวอย่าง) ในแท็บ Plate (เพลต)สำคัญ: ชื่อตัวอย่างที่คณุ เพิ่มในรายการแบบเลื่อนลงจะใช้ได้กับเพลตปัจจุบนั เท่านัน้ และหากคุณกำหนด
ชื่อให้หลุมและบันทึกเค้าโครงเพลตเท่านัน้ หากคุณไม่กำหนดชือ่ ให้หลุม แล้วบันทึกเค้าโครงของเพลต
ชื่อจะไม่บันทึกและจะไม่สามารถใช้ได้ในอนาคต ในการเพิ่มชือ่ ตัวอย่างอย่างถาวร ให้เพิ่มชื่อในไลบรารี
Sample Names (ชือ่ ตัวอย่าง) ด้วยโดยใช้กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ชื่อที่คณุ เพิ่มในไลบรารีจะใช้ได้หลังจากคุณเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) อีกครัง้ โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมที่
การตั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม่ ต้น ในหน้า 86วิธลี บชือ่ ตัวอย่างออกจากรายการ
1คลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ
กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) จะปรากฏขึน้ และแสดงแท็บ Plate (เพลต)2ในไลบรารี Sample Names (ชือ่ ตัวอย่าง) ในแท็บ Plate (เพลต) ให้เลือกชื่อที่จะลบออกแล้วกดปุม
่ Delete (ลบ)

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและออกจากกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้)138 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

สำคัญ: คุณไม่สามารถลบชื่อตัวอย่างที่คุณบันทึกไว้ด้วยไฟล์เพลตได้ ชื่อที่กำหนดเองที่คุณเพิ่มในรายการ
Sample Group Names (ชือ่ ตัวอย่าง) แบบเลือ่ นลงและที่คณุ ไม่ใช้และบันทึกไว้ด้วยไฟล์เพลตจะถูกลบ
ออกจากรายการโดยอัตโนมัติ ชื่อที่คณุ ลบออกจาก Sample Names Library (ไลบรารชื่อตัวอย่าง) จะลบออกจากซอฟต์แวร์อย่างถาวรและจะไม่สามารถใช้งานได้อีกต่อไป โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ ลบชือ
่ตัวอย่าง

การกำหนดชุดกลุม่ ชีวภาพให้หลุม
หมายเหตุ: ในการกำหนดชุดกลุม่ ชีวภาพ คุณต้องกำหนดสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึ่งชนิดให้หลุมที่เลือก
การกำหนดสารเรืองแสงจะเปิดใช้งานรายการ Biological Groups (ชุดกลุม่ ชีวภาพ) แบบเลือ่ นลง โปรดดู
การกำหนดเป้าหมายให้หลุม ในหน้า 135 เพื่อดูขอ้ มูลเกี่ยวกับการกำหนดสารเรืองแสง
เคล็ดลับ: คุณสามารถกำหนดชุดกลุม่ ชีวภาพหนึ่งชุดให้กับแต่ละหลุมหรือกลุม่ หลุม

วิธกี ำหนดชุดกลุม่ ชีวภาพให้กบั หลุมหรือกลุม่ หลุม
1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจสอบว่ามีการกำหนดสารเรืองแสงให้หลุมหรือกลุม่ หลุมแล้ว

2ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกหลุมหรือกลุม่ หลุม

3ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้เลือกรายการแบบเลื่อนลงของ Biological Group (กลุม่ ชีวภาพ)CFX Maestro Dx SE จะเลือกช่องทำเครือ่ งหมาย Load (โหลด) ของสารเรืองแสงนัน้ โดยอัตโนมัติ

4ทำขั้นตอน 3 ซ้ำสำหรับแต่ละหลุมหรือกลุม่ หลุมที่คุณต้องกำหนดชุดกลุม่ ชีวภาพให้

5คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต
หมายเหตุ: หากคุณเปลี่ยนเพลตผิดพลาด ให้คลิก Undo (เลิกทำ) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ก่อนที่จะคลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลง

วิธลี บชุดกลุม่ ชีวภาพuในการลบชุดกลุ่มชีวภาพออกจากหลุมหรือกลุ่มหลุมที่เลือก ให้ลา้ งช่องทำเครือ่ งหมาย Load (โหลด)วิธเี พิ่มกลุม่ ชีวภาพในรายการuในการเพิ่มกลุม่ ชีวภาพในรายการแบบเลือ่ นลง ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nพิมพ์ชื่อลงในกล่อง Biological Group (ชุดชีวภาพ) แบบเลื่อนลง แล้วกด Enterคูม่ ือผูใ้ ช้ | 139บทที่ 8 การเตรียมเพลต

nคลิกสัญลักษณ์บวก + สีเขียวทีด่ ้านขวาของรายการแบบเลื่อนลง แล้วพิมพ์ชื่อของกลุ่มชีวภาพ

nคลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ แล้วเพิ่มชื่อให้ไลบรารี BiologicalGroup Names (ชื่อกลุ่มชีวภาพ) ในแท็บ Plate (เพลต)สำคัญ: ชื่อชุดกลุม่ ชีวภาพที่คณุ เพิ่มในรายการแบบเลื่อนลงจะใช้ได้กบั เพลตปัจจุบันเท่านั้น และเฉพาะเมือ
่คุณกำหนดชื่อให้หลุมและบันทึกเค้าโครงเพลตเท่านัน้ หากคุณไม่กำหนดชื่อให้หลุมแล้วบันทึกเค้าโครง
ของเพลต ชื่อจะไม่บนั ทึกและจะไม่สามารถใช้ได้ในอนาคต ในการเพิม่ ชื่อกลุ่มชีวภาพอย่างถาวร ให้เพิ่ม
ชื่อในไลบรารี Biological Group Names (ชื่อกลุ่มชีวภาพ) ด้วยโดยใช้กล่องโต้ตอบ User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้) ชื่อที่คุณเพิม่ ในไลบรารีจะใช้ได้หลังจากคุณเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)อีกครัง้ โปรดดูขอ้ มูลเพิม่ เติมที่การตั้งค่าพารามิเตอร์เพลตเริม่ ต้น ในหน้า 86วิธลี บชือ่ กลุม่ ชีวภาพออกจากรายการ
1คลิก User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) ในแถบเครือ่ งมือ
กล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) จะปรากฏขึน้ และแสดงแท็บ Plate (เพลต)2ในไลบรารี Biological Group Names (ชื่อกลุ่มชีวภาพ) ในแท็บ Plate (เพลต) ให้เลือกชื่อที่จะลบออกแล้วกด
ปุม
่ Delete (ลบ)

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและออกจากกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่า
ของผู้ใช้)สำคัญ: คุณไม่สามารถลบชื่อกลุ่มชีวภาพที่คณุ บันทึกไว้ด้วยไฟล์เพลตได้ ชื่อที่กำหนดเองที่คุณเพิ่มใน
รายการ Biological Group Names (ชือ่ กลุ่มชีวภาพ) แบบเลือ่ นลงและที่คณุ ไม่ใช้และบันทึกไว้ด้วยไฟล์
เพลตจะถูกลบออกจากรายการโดยอัตโนมัติ ชื่อที่คณุ ลบออกจาก Biological Group Names Library(ไลบรารีชอื่ กลุม่ ชีวภาพ) จะถูกลบออกจากซอฟต์แวร์อย่างถาวรและจะไม่สามารถใช้งานได้อกี ต่อไป โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ ลบชื่อชีวภาพ

วิธด
ี ช
ู ุดกลุม่ ชีวภาพทัง้ หมดในเพลตuคลิก Show Biological Groups (แสดงชุดกลุม่ ชีวภาพ) เพื่อดูกลุม่ ชีวภาพทั้งหมดในเพลต

แต่ละกลุ่มจะได้รบั การระบุด้วยสีเฉพาะ และปุม
่ Show Biological Groups (แสดงกลุ่มชีวภาพ) จะเปลีย่ นเป็น
Hide Biological Groups (ซ่อนกลุม่ ชีวภาพ)คลิก Hide Biological Groups (ซ่อนกลุม่ ชีวภาพ) เพื่อล้างสีในหลุม อีกวิธหี นึง่ คุณสามารถคลิกที่หลุมใดก็ได้ใน
เพลตเพือ่ ซ่อนกลุ่มชีวภาพได้

140 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

การกำหนดหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิคให้หลุม
สำคัญ: ในการกำหนดหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิค หลุมที่เลือกจะต้องมีสารในหลุมที่เหมือนกัน กล่าวคือ หลุมที่
เลือกต้องมีตัวอย่างและสารเรืองแสงชนิดเดียวกัน หากจำเป็น ให้กำหนดชื่อเป้าหมายและชื่อตัวอย่างเดียวกัน
และชุดกลุ่มชีวภาพเดียวกัน หากไม่เหมือนกัน CFX Maestro Dx SE จะไม่สามารถใช้ตัวเลือกนี้ได้

ในการกำหนดหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิคให้กบั กลุม่ ของหลุมหนึง่ กลุม
่1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจสอบให้แน่ใจว่าสารของกลุม่ ของหลุมเหมือนกันทั้งหมด

2ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกกลุ่มเป้าหมายของหลุม

3หากต้องการกำหนดหมายเลขทำซ้ำเดียวกันให้กบั หลุมทั้งหมดที่เลือก ในส่วน Replicate # (การทำซ้ำ #)ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้พมิ พ์หมายเลขทำซ้ำในช่องและเลือกโหลด

4(ไม่บังคับ) วิธใี ช้ชุดการทำซ้ำกับชุดของหลุมที่เลือก
aคลิก Technical Replicates (การทำซ้ำทางเทคนิค) ส่วน Replicate # (การทำซ้ำ #) จะเปลี่ยนไปแสดง
ตัวเลือกต่อไปนี้

n

Replicate size (ขนาดการทำซ้ำ) — ตัวเลขทีแ่ สดงจำนวนของหลุมในแต่ละกลุ่มของการทำซ้ำ

nStarting replicate # (การทำซ้ำเริม่ ต้น #) — ตัวเลขแรกในชุดการทำซ้ำสำหรับกลุ่มการทำซ้ำ
ที่เลือก

หมายเหตุ: โดยค่าเริม่ ต้น CFX Maestro Dx SE จะแสดงหมายเลขการทำซ้ำเริม่ ต้นเป็นตัวเลขหนึง่ ที่มากกว่าหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิคสุดท้ายที่กำหนดในเพลต ยกตัวอย่างเช่น หากหมายเลขทำซ้ำ
ทางเทคนิคในเพลตครัง้ ก่อนคือ 5 หมายเลขเริม่ ต้นครัง้ ถัดไปจะเป็น 6 คุณสามารถเปลี่ยนหมายเลข
เริม่ ต้นเป็นหมายเลขใด ๆ ที่ยงั ไม่ได้กำหนดไว้ได้
nทิศทางการโหลด (แนวนอนหรือแนวตั้ง)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 141บทที่ 8 การเตรียมเพลต

b5คลิก Apply (ใช้) เพื่อใช้พารามิเตอร์กับชุดทำซ้ำและกลับไปที่หน้าจอ Replicate # (การทำซ้ำ #)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต
หมายเหตุ: หากคุณเปลี่ยนเพลตผิดพลาด ให้คลิก Undo (เลิกทำ) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ก่อนที่จะคลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลง

วิธลี บหลุมออกจากชุดทำซ้ำuให้เลือกหลุมหรือกลุ่มของหลุมที่จะลบออก แล้วล้างช่องทำเครือ่ งหมาย Replicate # Load (โหลดการทำซ้ำ #)อีกวิธหี นึง่ คุณสามารถคลิก Clear Replicate # (เคลียร์การทำซ้ำ #) เพือ่ เคลียร์หมายเลขทำซ้ำออกจากหลุม
หรือกลุ่มของหลุมทีเ่ ลือกได้

วิธด
ี ก
ู ารทำซ้ำทางเทคนิคทั้งหมดบนเพลตuให้คลิก Show Technical Replicates (แสดงการทำซ้ำทางเทคนิค) เพื่อดูการทำซ้ำทางเทคนิคทั้งหมด
บนเพลต
แต่ละกลุ่มจะได้รบั การระบุด้วยสีเฉพาะ และปุม
่ Show Technical Replicates (แสดงการทำซ้ำทางด้านเทคนิค)จะเปลีย่ นเป็น Hide Technical Replicates (ซ่อนการทำซ้ำทางเทคนิค)คลิก Hide Technical Replicates (ซ่อนการทำซ้ำทางเทคนิค) เพื่อเคลียร์สใี นหลุม อีกวิธหี นึง่ คุณสามารถคลิก
ที่หลุมใดหลุมหนึ่งในเพลตเพื่อซ่อนการทำซ้ำทางเทคนิคได้

การกำหนดชุดเจือจางให้กบั ประเภทตัวอย่างมาตรฐาน
ดังที่กล่าวก่อนหน้านี้ หลุมทั้งหมดที่มปี ระเภทตัวอย่างเป็น Standard (มาตรฐาน) จะต้องได้รบั การกำหนดค่าความเข้มข้น คุณสามารถกำหนดชุดเจือจางให้กบั หลุมหลาย ๆ หลุมที่มปี ระเภทตัวอย่างเป็น Standard (มาตรฐาน)หมายเหตุ: ในการกำหนดชุดเจือจางให้กบั กลุม่ ของหลุม หลุมจะต้องรวมอยู่ในชุดทำซ้ำทางเทคนิค โปรดดูการก
ำหนดหมายเลขทำซ้ำทางเทคนิคให้หลุม ในหน้า 141 เพื่อดูขอ้ มูลเกีย่ วกับการเพิม่ หลุมให้กบั ชุดทำซ้ำ

วิธกี ำหนดชุดเจือจางให้กับกลุม่ ของหลุมตัวอย่าง Standard (มาตรฐาน)1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจสอบให้แน่ใจว่าได้ปฏิบัติตามข้อกำหนดต่อไปนี้
nประเภทตัวอย่างสำหรับกลุ่มของหลุมเป็น Standard (มาตรฐาน)nหลุมทั้งหมดในกลุ่มได้รบั การกำหนดสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึง่ ชนิด และทั้งหมดมีสารเรืองแสงชนิด
เดียวกัน

nหลุมทั้งหมดในกลุ่มจะรวมเข้าไปในชุดทำซ้ำทางเทคนิคชุดเดียวกัน
หมายเหตุ: CFX Maestro Dx SE ใช้ตัวเลือก Dilution Series (ชุดเจือจาง) เฉพาะเมื่อหลุมทั้งหมดที่
เลือกมีคุณสมบัติตรงตามเกณฑ์เหล่านี้

2ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกกลุ่มเป้าหมายของหลุม

142 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

3ในส่วน Concentration (ความเข้มข้น) ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้คลิก Dilution Series (ชุดเจือจาง) ส่วนConcentration (ความเข้มข้น) จะเปลีย่ นไปแสดงตัวเลือกต่อไปนี้

nStarting concentration (ความเข้มข้นเริม่ ต้น) — ค่าความเข้มข้นทีช่ ุดจะเริม
่ ต้น

n

Replicates from and to (ทำซ้ำตั้งแต่และถึง) — การทำซ้ำในชุดที่จะใช้ปัจจัยการเจือจาง

nDilution factor (ปัจจัยการเจือจาง) — ปริมาณทีจ่ ะเปลี่ยนแปลงความเข้มข้นภายในแต่ละกลุ่มทำซ้ำ

4ตั้งค่าสำหรับตัวเลือกหรือยอมรับค่าเริม
่ ต้น

5

โดยค่าเริม่ ต้น ชุดเจือจางจะลดลงตามปัจจัยการเจือจาง เลือก Increasing (เพิม่ ขึน้ ) เพื่อเพิ่มชุดเจือจาง

6(ไม่บังคับ) โดยค่าเริม่ ต้น ปัจจัยการเจือจางจะใช้กับสารเรืองแสงทั้งหมดในชุดทำซ้ำ หากชุดของคุณมีสารเรืองแ
สงมากกว่าหนึ่งชนิดและคุณต้องการใช้การเจือจางกับสารเรืองแสงหนึง่ ชนิด ให้เลือกจากรายการแบบเลือ
่ นลง

7

คลิก Apply (นำไปใช้) เพื่อใช้ชุดการเจือจางกับกลุม่ ของหลุมและกลับไปที่มมุ มอง Concentration (ความเข้มข้น)8คลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต

การคัดลอกสารในหลุมไปยังหลุมอืน
่คุณสามารถคัดลอกสารที่อยู่ในหลุมและวางลงในหลุมเดี่ยวหรือหลุมหลายหลุมได้ อย่างไรก็ตาม คุณสามารถคัดลอก
สารทีอ่ ยูใ่ นหลุมได้เพียงหลุมเดียวเท่านัน้ คุณไม่สามารถเลือกหลายหลุมและคัดลอกสารในหลุมเหล่านั้นได้

วิธกี ารคัดลอกสารในหลุมไปยังหลุมอื่น
1ในบานหน้าต่างเพลต ให้เลือกหลุมทีจ่ ะทำการคัดลอก

2คลิกขวาที่หลุมและเลือก Copy Well (คัดลอกหลุม)3เลือกหนึง่ หลุมหรือหลายหลุมที่จะวางสารนัน
้nหากต้องการเลือกหลุมเดียว ให้คลิกที่หลุม

nหากต้องการเลือกหลุมที่อยูต่ ิดกันหลายหลุม ให้คลิกที่หลุมหนึง่ และลากไปยังหลุมเป้าหมาย

nหากต้องการเลือกหลุมหลายหลุมที่ไม่ติดกัน ให้กดปุ่ม Control และคลิกที่แต่ละหลุม

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 143บทที่ 8 การเตรียมเพลต

4เมือ่ เลือกหลุมเป้าหมายแล้ว ให้คลิกขวาและเลือก Paste Well (วางหลุม)CFX Maestro Dx SE จะวางสารในหลุมแรกลงในหลุมที่เลือก

การเพิ่มบันทึกสำหรับหลุม
คุณสามารถเพิม่ โน้ตอธิบายในหลุมได้ คุณสามารถดูหมายเหตุสำหรับหลุมได้ในแท็บ Quantification (การหา
ปริมาณ) ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)

วิธเี พิ่มหมายเหตุให้กบั หลุม
1ในบานหน้าต่างของเพลต ให้เลือกหลุมที่คณุ ต้องการจะเพิ่มหมายเหตุ

2ในส่วน View (มุมมอง) ในบานหน้าต่างด้านล่าง ให้เลือก Well Note (หมายเหตุของหลุม)พื้นที่ Well Note จะปรากฏขึ้นในบานหน้าต่างด้านขวา

3พิมพ์เนือ้ หาของโน้ตในกล่องข้อความแล้วกด Enterข้อความจะปรากฏที่ด้านล่างของหลุมที่เลือก
เคล็ดลับ: หากคุณเคยสร้างโน้ตสำหรับหลุมมาก่อน คุณสามารถเลือกโน้ตได้จากรายการแบบเลื่อนลง จากนัน้ นำไปใช้กบั หลุมที่เลือก

การเคลียร์สารทั้งหมดออกจากหลุม
คุณสามารถเคลียร์สารในแต่ละหลุม กลุม่ ของหลุม หรือทัง้ เพลตของสารทั้งหมดได้ การเคลียร์หลุมจะไม่ลบข้อมูล
สารเรืองแสงที่เก็บรวบรวมไว้ในระหว่างการอ่านเพลต
สำคัญ: การเคลียร์หลุมจะเป็นการลบสารออกจากหลุมอย่างถาวร หากคุณคลิก OK (ตกลง) และบันทึกเพลตหลัง
จากการเคลียร์หลุม คุณจะไม่สามารถยกเลิกการเคลียร์ได้ โปรดใช้ความระมัดระวังเมื่อทำการเคลียร์หลุม

วิธกี ารเคลียร์การตั้งค่าทั้งหมดจากหลุม
1

ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้เลือกหลุมหรือกลุม่ ของหลุมในบานหน้าต่างเพลต
nหากต้องการเลือกหลุมเดียว ให้คลิกที่หลุม

nหากต้องการเลือกหลุมที่อยูต่ ิดกันหลายหลุม ให้คลิกที่หลุมหนึง่ และลากไปยังหลุมเป้าหมาย

nหากต้องการเลือกหลุมหลายหลุมที่ไม่ติดกัน ให้กดปุ่ม Control และคลิกที่แต่ละหลุม

nหากต้องการเลือกทั้งคอลัมน์ที่มีประเภทตัวอย่างเดียวกัน ให้คลิกทีห่ มายเลขคอลัมน์

nหากต้องการเลือกทั้งแถว ให้คลิกทีห่ มายเลขแถว

144 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการกำหนดพารามิเตอร์เพิ่มเติมให้กบั ไฟล์เพลต

2ในบานหน้าต่างด้านขวา ให้คลิก Clear Wells (เคลียร์หลุม)CFX Maestro Dx SE จะเคลียร์การตั้งค่าทั้งหมดจากหลุมที่เลือก

3โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากคุณทำการเคลียร์หลุมผิดพลาด ให้คลิก Undo (เลิกทำ) บนแถบเครื่องมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)ก่อนทีจ่ ะคลิก OK (ตกลง) เพื่อยอมรับการเปลีย่ นแปลง
สำคัญ: หากคลิก OK (ตกลง) ก่อนที่จะคลิก Undo (เลิกทำ) จะเป็นการบันทึกการเปลี่ยนแปลงและปิด
ใช้งาน Undo (เลิกทำ) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)nคลิก OK (ตกลง) เพือ่ ยอมรับการเปลี่ยนแปลงและบันทึกเพลต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 145บทที่ 8 การเตรียมเพลต

การเปลี่ยนการตั้งค่าการทดสอบ
ใช้กล่องข้อความ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) เพื่อดูหรือเปลี่ยนรายการของเป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุ่มชีวภาพ หรือเพือ่ ตั้งค่ากลุ่มตัวอย่างการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน โดยจะช่วยวิเคราะห์ว่าคุณได้กำหนดกลุ่ม
ชีวภาพให้กบั หลุมต่าง ๆ บนเพลตแล้วหรือไม่
ในกล่องข้อความ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) แท็บ Targets (เป้าหมาย) แสดงรายการของชื่อ
เป้าหมายสำหรับแต่ละปฏิกริ ยิ า PCR เช่น ยีนเป้าหมายหรือลำดับยีนที่สนใจ
แท็บ Samples and Biological Groups (ตัวอย่างและกลุ่มชีวภาพ) แสดงรายชื่อของตัวอย่างและชื่อกลุม่ ชีวภาพ ที่บ่ง
บอกถึงแหล่งที่มาของเป้าหมาย เช่น เก็บตัวอย่างที่ 1 ชั่วโมง (1HR) หรือจากแต่ละรายการที่ระบุ (mouse1)วิธเี ปลีย่ นการตั้งค่าเพลตโดยใช้กล่องข้อความ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)1หากต้องการเปิดกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nในบานหน้าต่างด้านขวาของ Plage Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้คลิก Experiment Settings (การตั้งค่าการ
ทดสอบ)nในแท็บ Gene Expression (การแสดงของยีน) ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ให้คลิก
Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)กล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) จะปรากฏขึน้ โดยแสดงเนือ้ หาของแท็บ Targets(เป้าหมาย)2หากต้องการเพิม่ ชือ่ เป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพใหม่ ให้พมิ พ์ชอื่ ในแท็บที่เหมาะสมในกล่องข้อความ
New (ใหม่) แล้วคลิก Add (เพิ่ม)3หากต้องการลบชื่อเป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุ่มชีวภาพออกจากรายการ ให้เลือกช่องทำเครือ่ งหมายของรายการ
ในคอลัมน์ Select to Remove (เลือกเพือ่ ลบ) ในแท็บทีเ่ หมาะสม แล้วคลิก Remove checkeditem(s) (ลบรายการที่ทำเครือ่ งหมายไว้)146 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการเปลีย่ นการตั้งค่าการทดสอบ

4

CFX Maestro Dx SE ไม่รวมตัวอย่างประเภท NTC (การควบคุมไม่มเี ทมเพลต) จากการวิเคราะห์การแสดงออก
ของยีน
หากต้องการรวมประเภทตัวอย่าง NTC ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมาย Exclude (ยกเว้น) ของ NTC ในส่วนประเภท
ตัวอย่างต่อไปนี้ คุณเลือกยกเว้นประเภทตัวอย่างต่อไปนีไ้ ด้โดยการเลือกช่องทำเครือ่ งหมายที่เหมาะสม

5n

NRT (no reverse transcriptase) (การควบคุมการควบคุมไม่มรี ีเวิรส์ แทรนสคริปเทส)n

Negative Control (การควบคุมค่าลบ)n

Positive Control (การควบคุมค่าบวก)nStandard (มาตรฐาน)ในแท็บ Targets (เป้าหมาย)aในการเลือกเป้าหมายเป็นการอ้างอิงสำหรับการวิเคราะห์สารการแสดงออกของยีน ให้เลือกในคอลัมน์
Reference (การอ้างอิง)bหากต้องการซ่อนการตั้งค่าการวิเคราะห์ที่จะนำมาใช้ในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)ในหน้าต่าง Analysis Settings (การตั้งค่าการวิเคราะห์) ให้ยกเลิกการเลือก Show Analysis Settings(แสดงการตั้งค่าการวิเคราะห์)ซอฟต์แวร์จะซ่อนคอลัมน์ต่อไปนี้
nColor (สี)

nShow Chart (แสดงแผนภูมิ)nAuto Efficiency (ประสิทธิภาพอัตโนมัติ)n

Efficiency (%) (ประสิทธิภาพ %)cหากต้องการเปลี่ยนสีกราฟของเป้าหมายในแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้คลิกที่
เซลล์ในคอลัมน์ Color (สี) เลือกสีใหม่ในกล่องโต้ตอบ Color (สี) ที่ปรากฏขึน้ แล้วคลิก OK (ตกลง)dหากต้องการแสดงเป้าหมายในสีทเี่ ลือกในแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้เลือกช่อง
ทำเครือ่ งหมายของเป้าหมายในคอลัมน์ Show Chart (แสดงแผนภูมิ)eตามค่าเริ่มต้น CFX Maestro Dx SE จะคำนวณค่าประสิทธิภาพสัมพัทธ์ให้กบั เป้าหมาย หากสาร
เป้าหมายมีกราฟมาตรฐานรวมอยู่ดว้ ยหากต้องการใช้ค่าประสิทธิภาพที่กำหนดไว้กอ่ นหน้านี้ ให้พิมพ์ค่าในเซลล์ของเป้าหมายในคอลัมน์
Efficiency (%) (ประสิทธิภาพ %) แล้วกดปุ่ม Enter CFX Maestro Dx SE จะยกเลิกการทำเครือ่ งหมายใน
ช่อง Auto Efficiency (ประสิทธิภาพอัตโนมัติ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 147บทที่ 8 การเตรียมเพลต

6

7

ในแท็บ Samples and Biological Groups (ตัวอย่างและกลุ่มชีวภาพ)aหากต้องการเลือกตัวอย่างหรือกลุม่ ชีวภาพเป็นตัวอย่างควบคุมสำหรับการวิเคราะห์ขอ้ มูลการแสดงออกของยีน ให้เลือกช่องทำเครือ่ งหมายของตัวอย่างหรือกลุ่มชีวภาพในคอลัมน์ Control (ควบคุม)bหากต้องการกำหนดเงือ่ นไขการควบคุมให้กบั ตัวอย่างหรือกลุ่มชีวภาพสำหรับการทดสอบ ให้คลิกช่องทำ
เครือ่ งหมายของตัวอย่างหรือกลุ่มชีวภาพในคอลัมน์ Control (ควบคุม)cหากยังไม่ได้เลือก ให้คลิก Show Analysis Settings (แสดงการตั้งค่าการวิเคราะห์) เพือ่ ดูหรือเปลีย่ นพารา
มิเตอร์การวิเคราะห์ที่จะนำไปใช้งานในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ซอฟต์แวร์จะซ่อน
คอลัมน์ Color (สี) และ Show Chart (แสดงแผนภูมิ)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกพารามิเตอร์ในกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) แล้วกลับ
สูห่ น้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)148 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างกลุ่มหลุม

การสร้างกลุ่มหลุม
กลุ่มของหลุมจะแบ่งเพลต ๆ หนึง่ ออกเป็นส่วนหลุมย่อยที่สามารถแยกวิเคราะห์ได้ในหน้าต่าง Data Analysis(การวิเคราะห์ข้อมูล) เมื่อตั้งค่ากลุ่มหลุมแล้วให้เลือกหนึง่ กลุ่มในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) เพื่อ
วิเคราะห์ข้อมูลในรูปแบบของกลุ่มอิสระ ยกตัวอย่างเช่น ตั้งค่ากลุ่มหลุมเพื่อวิเคราะห์การทดสอบหลายรายการที่
ดำเนินการในหนึ่งเพลต หรือเพื่อวิเคราะห์กลุ่มหลุมแต่ละกลุ่มด้วยเส้นโค้งมาตรฐานที่ต่างกัน
หมายเหตุ: กลุม่ หลุมเริม่ ต้นคือ All Wells (หลุมทั้งหมด)วิธสี ร้างกลุม่ หลุม
1หากต้องการเปิด Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุ่มหลุม) ให้ทำหนึ่งในสิง่ ต่อไปนี้
nในแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้คลิก Well Groups (กลุม่ หลุม)nในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ให้คลิก Manage Well Groups (จัดการกลุ่มหลุม)กล่องโต้ตอบ Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุ่มหลุม) จะปรากฏขึน
้

2คลิก Add (เพิ่ม) เพื่อสร้างกลุ่มใหม่ เมนูแบบเลื่อนลงจะแสดงชื่อกลุ่มเป็น Group 1 สำหรับกลุ่มแรก

3เลือกหลุมให้กับกลุ่มหลุมในมุมมองเพลตโดยการคลิกและลากข้ามกลุม่ หลุมต่าง ๆ หลุมที่เลือกจะปรากฏใน
Manager (ตัวจัดการ)4(ไม่บังคับ) หากต้องการเปลี่ยนชื่อกลุม่ ให้เลือกชื่อในเมนูแบบเลื่อนลง แล้วพิมพ์ชื่อใหม่

5(ไม่บังคับ) หากต้องการลบกลุ่มหลุม ให้เลือกชื่อในรายการแบบเลือ่ นลงแล้วคลิก Delete (ลบ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 149บทที่ 8 การเตรียมเพลต

6คลิก OK (ตกลง) เพือ่ สิ้นสุดการดำเนินการและปิดหน้าต่าง หรือคลิก Cancel (ยกเลิก) เพื่อปิดหน้าต่างโดย
ไม่เปลี่ยนแปลงค่าใด

รายการเมนูคลิกขวาสำหรับกล่องโต้ตอบ Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุม่ หลุม)ตาราง 10 แสดงรายการเมนูที่มอี ยูใ่ นกล่องโต้ตอบ Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุม่ หลุม) เมือ่ คุณคลิกขวาที่
หลุมใด ๆตาราง 10 รายการเมนูคลิกขวาในกล่องโต้ตอบ Plate Editor Well Groups Manager (ตัวจัดการ
กลุ่มหลุมในตัวแก้ไขเพลต)รายการ

ฟังก์ชน
ั

Copy (คัดลอก)คัดลอกสารในหลุมที่สามารถวางในหลุมอืน่ ๆ ได้

Copy as Image (คัดลอกเป็นภาพ)คัดลอกมุมมองตัวเลือกหลุมเป็นภาพ

Print (พิมพ์)พิมพ์มุมมองตัวเลือกหลุม

Print Selection (ตัวเลือกพิมพ์)พิมพ์เฉพาะเซลล์ทเี่ ลือกExport to Excel (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลไปยังสเปรดชีต Excel

Excel)
Export to CSV (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลเป็นเอกสารทีค่ ั่นด้วยจุลภาค

CSV)
Export to Xml (ส่งออกไปยัง Xml)

ส่งออกข้อมูลเป็นเอกสาร .xml

Export to Html (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลเป็นเอกสาร .html

Html)

150 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการเปลี่ยนลักษณะการติดตาม

การเปลี่ยนลักษณะการติดตาม
ในระหว่างการตั้งค่าเพลตและขณะที่กำลังดำเนินการอยู่ คุณสามารถปรับเปลี่ยนสีและลักษณะการติดตามการเพิม
่ปริมาณได้ จากนั้นคุณสามารถดูการติดตามได้อย่างง่ายดายในหน้าต่างสถานะแบบเรียลไทม์ในขณะที่กำลังรวบรวม
ข้อมูล

วิธกี ารเปลีย่ นลักษณะการติดตาม
1คลิก Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ในแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)กล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) จะปรากฏขึน้ มาสำหรับเพลตที่เปิด ตัวอย่างเช่น

2หากต้องการแสดงลักษณะการติดตามด้วยสารเรืองแสงที่ระบุ ให้เลือกสารเรืองแสงจากเมนูแบบเลือ่ นลง
Fluorophores (สารเรืองแสง)3วิธเี ปลีย่ นการแสดงการติดตาม
aเลือกประเภทการติดตามจากรายการแบบเลื่อนลง Wells (หลุม)bคลิกที่สใี นคอลัมน์ Color (สี)

cในกล่องโต้ตอบ Color (สี) ที่ปรากฏขึน้ มา ให้เลือกสีอนื่ สำหรับการติดตาม และคลิก OK (ตกลง)CFX Maestro Dx SE จะแสดงการเปลี่ยนสีสำหรับประเภทหลุมในตาราง

d(ไม่บังคับ) เลือกสัญลักษณ์สำหรับการติดตามจากรายการแบบเลื่อนลง Symbols (สัญลักษณ์)4หากต้องการเปลี่ยนชุดสีอย่างรวดเร็ว ให้คลิกตัวเลือกที่เหมาะสมในหัวข้อ Color Quick Set (ชุดสีด่วน)5หากต้องการดูป้ายกำกับหลุมในตาราง ให้เลือกประเภทของป้ายกำกับในหัวข้อ Well Labels (ป้ายกำกับหลุม)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 151บทที่ 8 การเตรียมเพลต

6คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลง หรือ Cancel (ยกเลิก) เพื่อยกเลิกการเปลี่ยนแปลง

152 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการดู การส่งออก และการนำเข้าเพลตในรูปแบบสเปรดชีต

การดู การส่งออก และการนำเข้าเพลตในรูปแบบสเปรดชีต
Spreadsheet View/Importer (มุมมอง/ตัวนำเข้าสเปรดชีต) จะแสดงข้อมูลสารของเพลตในรูปแบบสเปรดชีต ตัวดูจะ
มีตัวเลือกเพื่อดู นำเข้า และส่งออกข้อมูลของหลุมตามที่อธิบายด้านล่าง

การใช้ Spreadsheet Viewer เพื่อส่งออกและนำเข้าข้อมูลเพลต
คุณสามารถส่งออกชื่อเป้าหมาย ชือ่ ตัวอย่าง ชื่อกลุม่ ชีวภาพ และหมายเหตุของหลุมในเทมเพลตรูปแบบที่คนั่ ด้วยแท็บ
จาก Spreadsheet Viewer ไปยังแอปพลิเคชัน เช่น Microsoft Excel คุณยังสามารถนำเข้าข้อมูลจากแอปพลิเคชันที่
คัน่ ด้วยแท็บลงในเพลตที่กำหนดไว้ล่วงหน้าจากไฟล์ขอ้ มูลการทดลองได้เช่นกัน

หากต้องการใช้งาน Spreadsheet View/Importer (มุมมอง/ตัวนำเข้าแผ่นงาน)1สร้างและบันทึกไฟล์เพลต (ดูการสร้างไฟล์เพลตโดยใช้ตัวแก้ไขเพลต)2ที่แถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) คลิกที่แท็บ Spreadsheet View/Importer (มุมมอง/ตัวนำเข้าแผ่นงาน) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ Plate Spreadsheet View (มุมมองแผ่นงานของเพลต)3(ไม่บังคับ) คลิกที่ Show Biological Set Name (แสดงชื่อชุดชีวภาพ) และ Show Well Note boxes (แสดงกล่อง
บันทึกหมายเหตุหลุม) เพื่อแสดงคอลัมน์เหล่านี้ใน Spreadsheet View และในไฟล์ที่สง่ ออก

4คลิกปุ่ม Export Template (ส่งออกเทมเพลต) เพื่อสร้างเทมเพลตว่างในไฟล์ Excel (ฟอร์แมต .csv) ไฟล์ที่สง่
ออกจะแสดงเค้าโครงเหมือนกับเพลตของคุณ
เคล็ดลับ: ใช้ชื่อไฟล์เพลตเมื่อบันทึกไฟล์เพลตของคุณ เพือ่ ช่วยให้หาไฟล์ได้งา่ ย

5เติมข้อมูลในเซลล์ของไฟล์ Excel ด้วยสารในหลุม
หมายเหตุ: คุณสามารถแก้ไขเนือ้ หาของเซลล์ต่าง ๆ ในคอลัมน์ที่มเี ครือ่ งหมายดอกจัน (*) ถัดจากชื่อของ
คอลัมน์ได้ (เช่น *ชื่อเป้าหมาย, *ชื่อตัวอย่าง, *ชื่อกลุม่ ชีวภาพ, *หมายเหตุของหลุม)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 153บทที่ 8 การเตรียมเพลต

หมายเหตุ: คุณไม่สามารถเพิม่ ค่าลงในคอลัมน์ Standard Curve (เส้นโค้งมาตรฐาน) และ Quantity(ปริมาณ) ในไฟล์ Excel ที่สง่ ออกได้ หากต้องการแก้ไขข้อมูลดังกล่าว ให้สง่ กลับไปที่ Plate Editor แล้วเลือก Settings (ตั้งค่า) > Units (หน่วย) ในแถบเมนู หลังจากที่การทดลองของเพลตเสร็จสิน้ ข้อมูลจาก
เส้นโค้งมาตรฐานเหล่านีจ้ ะปรากฏในแผนภูมกิ ราฟเส้นโค้งมาตรฐานที่แท็บ Quantification (การหา
ปริมาณ) ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) โดยอยู่ในรูปแบบหน่วยที่คณุ เลือก
6นำเข้าไฟล์ Excel ที่เติมข้อมูลกลับเข้าไปที่ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) โดยคลิกปุ่ม Import (นำเข้า) ข้อมูล
เพลตที่นำเข้าจะปรากฏในหน้าต่าง Plate Spreadsheet View (มุมมองสเปรดชีตของเพลต)สำคัญ: หากคุณมีสารเรืองแสงหลายชนิด คุณจะต้องทำตามขั้นตอนที่ 3-5 สำหรับสารเรืองแสงแต่ละชนิด
โดยใช้เมนูดรอปดาวน์ Flours List (รายการสารเรืองแสง) ใน Plate Spreadsheet View (มุมมอง
สเปรดชีตของเพลต)7คลิกที่ปุ่ม OK (ตกลง) ข้อมูลใหม่ของเพลตจะปรากฏในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)เคล็ดลับ: คุณสามารถดูรายการเมนูที่มใี นเครือ่ งมือ Spreadsheet View/Importer (ดู/นำเข้าสเปรดชีต) หากคุณ
คลิกขวาบนหลุมใดก็ได้ในเครื่องมือ หรือบนส่วนหัวของตารางใดก็ได้ใน Plate Spreadsheet View (มุมมอง
สเปรดชีตของเพลต)154 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างเค้าโครงเพลตโดยใช้ตวั ช่วยการตั้งค่าเพลต

การสร้างเค้าโครงเพลตโดยใช้ตัวช่วยการตั้งค่าเพลต
คุณสามารถใช้ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ในการป้อนข้อมูลเค้าโครงเพลตที่จำเป็นสำหรับการวิเคราะห์
การแสดงออกยีนที่เป็นบรรทัดฐานดังนี้
nชื่อเป้าหมาย

nชื่อตัวอย่าง

nตำแหน่งของเป้าหมายและตัวอย่างบนเพลต

nยีนอ้างอิง

nตัวอย่างควบคุม

คุณสามารถใช้ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ก่อน ระหว่าง หรือหลังทำการทดสอบได้

การใช้ตัวช่วยสร้างการตัง้ ค่าเพลต
บทนี้อธิบายถึงวิธกี ารสร้างเค้าโครงเพลตโดยใช้ตัวช่วยสร้างการตั้งค่าเพลต หากต้องการดูสารของแต่ละหลุมใน
เพลตได้ง่ายขึน้ ให้คลิก Zoom (ซูม) เพลตที่ดา้ นบนของ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า)สำคัญ: หากกลับไปที่แท็บ Auto layout (เค้าโครงอัตโนมัติ) ในขณะที่อยูใ่ นแท็บอืน่ ๆ ใน Setup Wizard(ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) จะเป็นการรีเซ็ตเค้าโครงเพลต โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ เลือกแท็บนี้
เคล็ดลับ: คุณสามารถรีเซ็ตเค้าโครงโดยเลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Clear Plate (เคลียร์เพลต) ใน Setup
Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) ได้วิธใี ช้ตวั ช่วยสร้างการตั้งค่าเพลต
1เปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)2ในการเปิดตัวช่วยการตั้งค่า ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก Editing Tools (เครือ่ งมือแก้ไข) > Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า)nคลิก Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) บนแถบเครือ่ งมือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) จะปรากฏขึน้ โดยแสดงแท็บ Auto layout (เค้าโครงอัตโนมัติ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 155บทที่ 8 การเตรียมเพลต

3ในแท็บ Auto Layout (เค้าโครงอัตโนมัติ) ให้ทำดังต่อไปนี้
aคลิกที่หลุมหนึง่ ในตารางและลากผ่านลงเพื่อระบุพนื้ ทีบ่ นเพลตที่คณุ วางแผนจะโหลดตัวอย่างbป้อนจำนวนเป้าหมายและตัวอย่างที่จะโหลด
เคล็ดลับ: จำนวนเป้าหมายและตัวอย่างที่จะโหลดจะต้องเท่ากับจำนวนเซลล์ที่เลือก หากตัวเลขทีป่ ้อ น
ไม่พอดีกบั พื้นที่ที่เลือก ให้ปรับเปลีย่ นตัวเลขหรือพื้นที่การเลือกเพลต คุณสามารถระบุการจัดวาง
รายการบนเพลตและจัดกลุ่มได้

c(ไม่บังคับ) เปลีย่ นการจัดวางเพลต ตัวอย่างเช่น คุณสามารถกำหนดเป้าหมายในคอลัมน์และตัวอย่างในแถว
หรือจัดกลุ่มตามตัวอย่าง

dคลิก Next (ถัดไป) เพือ่ ไปยังแท็บ Target Names (ชื่อเป้าหมาย)หมายเหตุ: หากเค้าโครงเพลตของคุณไม่มีรปู แบบปกติ ให้ใช้แท็บ Target Names (ชือ่ เป้าหมาย) เพื่อ
กำหนดตำแหน่งเป้าหมายของคุณด้วยตนเอง หรือใช้แท็บ Sample Names (ชือ่ ตัวอย่าง) เพือ่ กำหนด
ตำแหน่งตัวอย่างของคุณบนเพลตด้วยตนเอง คลิกและลากเพื่อเลือกหลุมหลายหลุม
4ในแท็บ Target Names (ชือ่ เป้าหมาย) ให้กำหนดชื่อเป้าหมายสำหรับกลุ่มเป้าหมาย
abโปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการเปลี่ยนชื่อเป้าหมายตามกลุม่ ให้ตั้งค่าเป็น Select by to Target (เลือกโดยไปทีเ่ ป้าหมาย)nหากต้องการเปลี่ยนชื่อเป้าหมายตามหลุม ให้ตั้งค่าเป็น Select by to Well (เลือกโดยไปที่หลุม)เลือกกลุ่มเป้าหมายหรือหลุมในตาราง และพิมพ์ชื่อในรายการแบบเลื่อนลง Target Name (ชื่อเป้าหมาย)156 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างเค้าโครงเพลตโดยใช้ตวั ช่วยการตั้งค่าเพลต

เคล็ดลับ: กด Tab เพื่อเลือกกลุม่ หรือหลุมถัดไปทางขวา หรือ Enter เพื่อเลือกกลุ่มหรือหลุมถัดไปทาง
ด้านล่าง หรืออีกวิธีหนึง่ ในแท็บ Target Name (ชื่อเป้าหมาย) และ Sample Name (ชื่อตัวอย่าง)ให้กดปุม
่ Control ค้างไว้และคลิกที่หลุมเพื่อเลือกหลุมหลายหลุมที่ไม่ได้อยูต่ ิดกัน
cคลิก Next (ถัดไป) เพือ่ ไปยังแท็บ Sample Names (ชือ่ ตัวอย่าง)5ในแท็บ Sample Names (ชื่อตัวอย่าง) ให้กำหนดชื่อตัวอย่างสำหรับกลุ่มตัวอย่าง

6คลิก Next (ถัดไป) เพือ่ ไปยังแท็บ Reference Targets (เป้าหมายอ้างอิง)7ในแท็บ Reference Targets (เป้าหมายอ้างอิง) ให้เลือกเป้าหมายอย่างน้อยหนึง่ รายการเพื่อใช้เป็นข้อมูลอ้างอิง
สำหรับการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐาน และคลิก Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการต่อไปยังแท็บ Control
Sample (ตัวอย่างควบคุม)8ในแท็บ Control Sample (ตัวอย่างควบคุม) ให้เลือกตัวอย่างหนึง่ ตัวอย่างเพือ่ ใช้เป็นตัวควบคุมสำหรับการ
คำนวณการแสดงออกของยีนสัมพัทธ์

9คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกเค้าโครงเพลตและกลับไปที่ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ซึ่งคุณสามารถกำหนดค่า
พารามิเตอร์เพลตเพิ่มเติมได้ โปรดดูขอ้ มูลเพิ่มเติมได้ทกี่ ารกำหนดพารามิเตอร์เพิม่ เติมให้กบั ไฟล์เพลต ในหน้า
135หรืออีกวิธหี นึง่ คลิก Previous (ก่อนหน้า) เพื่อกลับไปยังแท็บก่อนหน้าเพื่อทำการเปลี่ยนแปลง
หมายเหตุ: หากกลับไปที่แท็บ Auto Layout (เค้าโครงอัตโนมัติ) จะเป็นการรีเซ็ตเพลตโดยอัตโนมัติ โปรดใช้ความระมัดระวังเมือ่ คลิก Previous (ก่อนหน้า)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 157บทที่ 8 การเตรียมเพลต

158 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ
บทนี้อธิบายวิธดี ำเนินการทดสอบแบบกำหนดเอง (กำหนดโดยผู้ใช้) หรือการทดสอบ PrimePCR โดยใช้ ซอฟต์แวร์
CFX Maestro Dx, Security Editionไฟล์ขอ้ มูลการทดสอบจะมีข้อมูลโปรโตคอลและข้อมูลเพลตสำหรับการทดสอบ นอกจากนี้ ไฟล์ยังประกอบด้วยข้อมูล
จากการวิเคราะห์ที่ CFX Maestro Dx SE ดำเนินการหลังจากทำการทดสอบเสร็จสิน้ ด้วย
CFX Maestro Dx SE ทำให้การตั้งค่าและการทดสอบที่ผใู้ ช้กำหนดหรือการทดสอบ PrimePCR เป็นเรือ่ งง่าย
หน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะแนะนำให้ทราบถึงขัน้ ตอนทั่วไปในการตัง้ ค่าการทดสอบ ซึ่งจะนำ
คุณไปที่กล่องโต้ตอบ Start Run (เริ่มต้นการทดสอบ) จากนัน้ คุณจะเริม่ ต้นการทดสอบได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 159บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

หน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ)หน้าต่าง Run Setup (ตั้งค่าการทดสอบ) ให้คณุ เข้าถึงไฟล์อย่างรวดเร็วและมีการตัง้ ค่าที่จำเป็นต้องดำเนินการและ
ทำการทดลอง เมื่อคุณเลือกทำการทดลองที่กำหนดโดยผู้ใช้ หน้าต่าง Run Setup (ตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดแสดง
แท็บ Protocol (โปรโตคอล) เมือ่ คุณเลือกทำการทดสอบ PrimePCR หน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ) จะเปิด
การแสดงแท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ)เคล็ดลับ: ดูข้อมูลเพิม่ เติมเกีย่ วกับ PrimePCR ที่การดำเนินการทดสอบ PrimePCR ในหน้า 177 ดูข้อมูล
เพิ่มเติมเกีย่ วกับแท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ) ในหน้า 167

160 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Run Setup (ตัง้ ค่าการทดสอบ)คำอธิบายสัญลักษณ์
1แท็บต่าง ๆ จะแนะนำคุณเกีย่ วกับการตั้งค่าและการทำการทดสอบ
n แท็บ Protocol (โปรโตคอล) — เลือกโปรโตคอลที่มอ
ี ยูท
่ จ
ี่ ะทดสอบหรือแก้ไข หรือสร้าง
โปรโตคอลใหม่ใน Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล)n แท็บ Plate (เพลต) — เลือกเพลตที่มีอยูท่ ี่จะทดสอบหรือแก้ไข หรือสร้างเพลตใหม่ใน Plate
Editor (ตัวแก้ไขเพลต)n แท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ) — ดูการตั้งค่าการทดสอบ เลือกบล็อกเครื่องมือหนึ่งหรือ
หลายบล็อก และเริ่มการทดสอบ

2หน้าต่างหลักแสดงตัวเลือกสำหรับแต่ละแท็บเมื่อคุณใช้แท็บ

3ปุ่มนำทางจะนำคุณไปยังแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ)การเข้าสู่หน้าต่างการตัง้ ค่าการทดสอบ
วิธเี ข้าสู่หน้าต่าง Run Setup (การตัง้ ค่าการทดสอบ)uโปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nในแท็บ Run setup (การตั้งค่าการทดสอบ) ใน Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริ่มต้น) ให้คลิกที่ Userdefined (ผูใ้ ช้กำหนด) หรือ PrimePCRnในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้คลิกที่ User-defined Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบที่ผู้ใช้กำหนด)หรือ PrimePCR Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ PrimePCR) บนแถบเครื่องมือ

nในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก Run (การทดสอบ) > User-defined Run (การทดสอบที่ผู้ใช้
กำหนด) หรือ Run (การทดสอบ) > PrimePCR Run (การทดสอบ PrimePCR)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 161บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

แท็บ Protocal (โปรโตคอล)แท็บ Protocal (โปรโตคอล) จะแสดงตัวอย่างของไฟล์โปรโตคอลที่คณุ วางแผนจะดำเนินการ ไฟล์โปรโตคอลมีคำ
แนะนำสำหรับขัน้ ตอนอุณหภูมิของอุปกรณ์รวมทั้งตัวเลือกอุปกรณ์ที่ควบคุมอัตราการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิขนึ้ ลงปริมาณตัวอย่าง และอุณหภูมิฝาครอบ

สำหรับค่าเริม่ ต้นซอฟต์แวร์จะแสดงโปรโตคอลที่ระบุไว้ในการเลือกไฟล์สำหรับส่วนการตั้งค่าการทำงานในแท็บไฟล์
ในกล่องโต้ตอบ User (ผูใ้ ช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้้) คุณสามารถเปลี่ยนโปรโตคอลเริม่ ต้นได้
ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) โปรดดูการเปลี่ยนการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น ในหน้า 83สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม
ในแท็บ Protocal (โปรโตคอล) คุณสามารถทำดังนี้
nสร้างโปรโตคอลใหม่สำหรับทดสอบ

nเลือกโปรโตคอลที่มอี ยู่สำหรับทดสอบหรือแก้ไข

สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการสร้างและการแก้ไขโปรโตคอลโปรดดู บทที่ 7, การสร้างโปรโตคอล

วิธสี ร้างโปรโตคอลใหม่
1ที่แท็บ Protocal (โปรโตคอล) ให้คลิก Create New (สร้างใหม่)Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) จะปรากฏขึ้น

2

ใช้ Protocol Editor (ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ในการสร้างโปรโตคอลใหม่

162 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Protocal (โปรโตคอล)3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกโปรโตคอลและกลับไปยังแท็บ Protocal (โปรโตคอล) ใน Run Setup (การตั้งค่าการ
ทดสอบ)

4ดูรายละเอียดของโปรโตคอล และทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากรายละเอียดถูกต้อง คลิก Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการต่อไปยังแท็บ Plate (เพลต)nหากรายละเอียดไม่ถกู ต้อง คลิก Edit Selected (แก้ไขสิง่ ที่เลือก) เพื่อกลับไปยังหน้าต่าง Protocol Editor(ตัวแก้ไขโปรโตคอล) แก้ไขโปรโตคอล บันทึกการเปลีย่ นแปลง จากนัน้ คลิก Next (ถัดไป) บนแท็บ
Protocal (โปรโตคอล) เพื่อดำเนินต่อไปยังแท็บ Plate (เพลต)วิธเี ลือกโปรโตคอลทีม่ ีอยู่
1บนแท็บ Protocal (โปรโตคอล) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก Select Existing (เลือกที่มอี ยู่) และไปยังโปรโตคอลทีม่ ีอยู่

nคลิก Express Load (โหลดด่วน) และเลือกโปรโตคอลจากรายการแบบเลือ่ นลงของโปรโตคอล
เคล็ดลับ: คุณสามารถเพิ่มโปรโตคอลไปยังหรือลบโปรโตคอลออกจากรายการแบบเลือ่ นลง Express
Load (โหลดด่วน) ได้ โปรดดู การเพิ่มและการลบไฟล์โหลดโปรโตคอลด่วน ที่ตามมาสำหรับข้อมูลเพิ่ม
เติม

2ดูรายละเอียดของโปรโตคอล และทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากรายละเอียดถูกต้อง คลิก Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการต่อไปยังแท็บ Plate (เพลต)nหากรายละเอียดไม่ถกู ต้อง คลิก Edit Selected (แก้ไขสิง่ ที่เลือก) เพื่อเปิด Protocol Editor (ตัวแก้ไข
โปรโตคอล) แก้ไขโปรโตคอล บันทึกการเปลี่ยนแปลง จากนัน้ คลิก Next (ถัดไป) บนแท็บ Protocal(โปรโตคอล) เพื่อดำเนินต่อไปยังแท็บ Plate (เพลต)การเพิ่มและการลบไฟล์โหลดโปรโตคอลด่วน
คุณสามารถปรับเปลี่ยนเนือ้ หาของรายการแบบเลือ่ นลง Express Load (โหลดด่วน) ที่ปรากฏใน Protocol Editor(ตัวแก้ไขโปรโตคอล) ได้ โปรโตคอลในรายการนี้จะถูกบันทึกไว้ในโฟลเดอร์ต่อไปนี้
c:\Users\Public\Public Documents\Bio-Rad\CFX_MDx\Users\<user_name>\ExpressLoad\วิธปี รับเปลีย่ นรายการ Express Load (โหลดด่วน) ของโปรโตคอล
1ค้นหาและเปิดโฟลเดอร์ ExpressLoad

2ตรวจดูไฟล์โปรโตคอล (.pcrl) ในโฟลเดอร์

3ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nลบโปรโตคอลออกจากโฟลเดอร์เพื่อนำไฟล์เหล่านัน้ ออกจากรายการแบบเลื่อนลง

nคัดลอกโปรโตคอลลงในโฟลเดอร์เพื่อเพิ่มไฟล์เหล่านั้นลงในรายการแบบเลื่อนลง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 163บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

แท็บเพลต
หมายเหตุ: หากโปรโตคอลที่เลือกในแท็บ Protocol (โปรโตคอล) ไม่ได้ประกอบด้วยขั้นตอนการอ่านเพลต
สำหรับการวิเคราะห์ PCR แบบเรียลไทม์ แท็บ Plate (เพลต) นั้นจะถูกซ่อน หากต้องการดูแท็บ Plate (เพลต) ให้เพิ่มขั้นตอนการอ่านเพลตอย่างน้อยหนึง่ ขั้นตอนไปยังโปรโตคอล
แท็บ Plate (เพลต) จะแสดงตัวอย่างของไฟล์เพลตที่คุณวางแผนจะโหลด ในการทดสอบ PCR แบบเรียลไทม์ ไฟล์เพลตจะประกอบด้วยคำอธิบายสารของแต่ละหลุมรวมทัง้ สารเรืองแสง โหมดสแกน และประเภทเพลต CFX Maestro
Dx SE จะใช้คำอธิบายเหล่านีส้ ำหรับการรวบรวมและวิเคราะห์ข้อมูล

ตามค่าเริ่มต้นแล้ว ซอฟต์แวร์จะแสดงเพลตที่ระบุไว้ในส่วน File Selection for Run Setup (การเลือกไฟล์สำหรับการ
ตั้งค่าการทดสอบ) ในแท็บ File (ไฟล์) ในกล่องโต้ตอบ User (ผู้ใช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้)คุณสามารถเปลีย่ นเพลตเริม่ ต้นได้ในกล่องโต้ตอบ User Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) โปรดดู
การเปลี่ยนการตั้งค่าไฟล์เริม่ ต้น ในหน้า 83 สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม
ที่แท็บ Plate (เพลต) คุณสามารถทำดังนี้
nสร้างเพลตใหม่เพือ่ โหลด

nเลือกเพลตทีม่ ีอยูเ่ ดิมเพือ่ โหลดหรือแก้ไข

สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการสร้างและแก้ไขเพลต โปรดดูบทที่ 8, การเตรียมเพลต

164 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บเพลต

วิธสี ร้างเพลตใหม่
1ที่แท็บ Plate (เพลต) ให้คลิก Create New (สร้างใหม่)Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะปรากฏขึน
้

2

ใช้ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ในการสร้างเพลตใหม่

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกเพลตและกลับไปที่แท็บ Plate (เพลต) ใน Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ)4ดูรายละเอียดของเพลต จากนั้นดำเนินการหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากรายละเอียดถูกต้อง คลิกที่ Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการไปยังแท็บ Start Run (เริม่ ทำการทดสอบ)nหากรายละเอียดไม่ถกู ต้อง คลิกที่ Edit Selected (แก้ไขสิง่ ทีเ่ ลือก) เพื่อกลับไปยัง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจดูไฟล์เพลต บันทึกการเปลีย่ นแปลง จากนัน้ คลิกที่ Next (ถัดไป) ที่แท็บ Plate (เพลต) เพื่อ
ดำเนินการไปยังแท็บ Start Run (เริ่มทำการทดสอบ)วิธเี ลือกไฟล์เพลตที่มอี ยูเ่ ดิม1ที่แท็บ Plate (เพลต) ให้ดำเนินการหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก Select Existing (เลือกที่มอี ยู่) และไปยังไฟล์เพลตที่มีอยูเ่ ดิมnคลิกที่ Express Load (โหลดด่วน) จากนัน้ เลือกไฟล์เพลตจากรายการแบบเลือ่ นลงเคล็ดลับ: คุณสามารถเพิ่มหรือลบเพลตออกจากรายการ Express Load (โหลดด่วน) แบบเลื่อนลงได้
โปรดดูที่การเพิ่มและการลบไฟล์โหลดเพลตด่วนต่อไปเพือ่ ดูข้อมูลเพิ่มเติม

2ดูรายละเอียดของเพลต จากนั้นดำเนินการหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากรายละเอียดถูกต้อง คลิกที่ Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการไปยังแท็บ Start Run (เริม่ ทำการทดสอบ)nหากรายละเอียดไม่ถกู ต้อง คลิกที่ Edit Selected (แก้ไขสิง่ ทีเ่ ลือก) เพื่อเปิดหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ตรวจดูไฟล์เพลต บันทึกการเปลีย่ นแปลง จากนัน้ คลิกที่ Next (ถัดไป) เพื่อดำเนินการไปยังแท็บ Start
Run (เริม่ ทำการทดสอบ)การเพิ่มและการลบไฟล์โหลดเพลตด่วน
คุณสามารถปรับเปลี่ยนเนือ้ หาของรายการแบบเลือ่ นลง Express Load (โหลดด่วน) ที่ปรากฏใน Plate Editor (ตัวแก้
ไขเพลต) ได้ เพลตที่ปรากฏในรายการนีจ้ ะถูกบันทึกไว้ในโฟลเดอร์ต่อไปนี้
c:\Users\Public\Documents\Bio-Rad\CFX_MDx\Users\<user_name>\ExpressLoad\วิธปี รับเปลีย่ นรายการ Express Load (โหลดด่วน) ของไฟล์เพลต
1ค้นหาและเปิดโฟลเดอร์ ExpressLoad

2ตรวจดูไฟล์เพลต (.pltd) ในโฟลเดอร์

3โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nลบไฟล์เพลตออกจากโฟลเดอร์เพื่อนำไฟล์เหล่านัน้ ออกจากรายการแบบเลื่อนลง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 165บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

nคัดลอกไฟล์เพลตลงในโฟลเดอร์เพื่อเพิ่มไฟล์เหล่านั้นลงในรายการแบบเลื่อนลง

166 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ)แท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ)แท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ) แสดงข้อมูลเกีย่ วกับการทดลองที่จะดำเนินการ นอกจากนีย้ ังแสดงบล็อกเครือ่ งมือที่
เชื่อมต่อที่คุณสามารถทำการทดลองได้

ในแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) คุณสามารถทำสิง่ ต่อไปนี้ได้nดูขอ้ มูลการทดสอบแบบรายละเอียด รวมถึงไฟล์โปรโตคอลที่เลือก ไฟล์เพลต และโหมดสแกน

nเพิ่มหมายเหตุเกีย่ วกับการทดสอบ

nดูรายละเอียดเกี่ยวกับเครื่องมือที่เชื่อมต่อทั้งหมด รวมถึงสถานะการทดสอบ (ที่ดำเนินการหรือที่ไม่ดำเนินการ)ปริมาณตัวอย่างในหน่วย µl อุณหภูมฝิ าครอบ โหมดการเลียนแบบ และ ID หรือบาร์โค้ดถ้ามี
หมายเหตุ: คุณสามารถแก้ไขคอลัมน์ที่ปรากฏใน Start Run (เริ่มการทดสอบ) ในตาราง Selected Blocks(บล็อกที่เลือก) ดูข้อมูลเพิม่ เติมที่การปรับเปลี่ยนรายละเอียดในตารางบล็อกที่เลือก ในหน้า 168nเลือกหนึง่ บล็อกหรือหลายบล็อกที่จะทำการทดสอบ

nเปิดหรือปิดฝาครอบของเครือ่ งมือที่เลือกจากระยะไกลnเริม่ การทดสอบ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 167บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

การปรับเปลี่ยนรายละเอียดในตารางบล็อกทีเ่ ลือกคุณสามารถปรับเปลี่ยนคอลัมน์ที่ปรากฏใน Start Run (เริม่ ทำการทดสอบ) ในตาราง Selected Block(s) (บล็อกที่
เลือก) ได้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถปรับเปลี่ยนปริมาตรตัวอย่างเริ่มต้นและค่าอุณหภูมิของฝาครอบในตารางได้
การเปลี่ยนแปลงการตั้งค่าจะใช้กบั การทดสอบทีจ่ ะดำเนินการ

วิธเี พิ่มคอลัมน์ใน Start Run (เริม่ ทำการทดสอบ) ในตาราง Selected Blocks (บล็อกที่เลือก)uคลิกขวาที่ตารางแล้วเลือกตัวเลือกในเมนูทปี่ รากฏขึน้ มาวิ ธี ลบคอลั มน์ ใน Start Run (เริ ่ มทำ การทดสอบ) ในตาราง Selected Blocks (บล็ อกที ่ เลือก)uคลิกขวาที่ตารางแล้วล้างตัวเลือกในเมนูที่ปรากฏขึ้นมา

วิธแี ก้ไขปริมาณตัวอย่างหรือค่าอุณหภูมขิ องฝาครอบสำหรับบล็อกuเลือกปริมาณตัวอย่างหรือเซลล์อณุ หภูมฝิ าครอบสำหรับบล็อกเป้าหมาย แล้วพิมพ์ค่าใหม่ลงในเซลล์

วิธเี พิ่ม ID การทดสอบหรือบาร์โค้ดสำหรับบล็อกuเลือกเซลล์ ID/บาร์โค้ดสำหรับบล็อกเป้าหมายและพิมพ์ ID หรือสแกนบล็อกด้วยเครือ่ งอ่านบาร์โค้ด

การดำเนินการทดสอบ
สำคัญ: ก่อนทีจ่ ะดำเนินการทดสอบ ให้ตรวจสอบให้แน่ใจว่าซอฟต์แวร์ป้องกันไวรัสของคอมพิวเตอร์ของคุณจะ
ไม่เริม่ การสแกนในระหว่างการทดสอบ โปรดดูการติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE ในหน้า 33 และพบผู้
ดูแลระบบของคุณสำหรับข้อมูลเพิม่ เติม

วิธดี ำเนินการทดสอบ
1ในแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) ให้ตรวจสอบรายละเอียดของเพลตและโปรโตคอลในหัวข้อ Run
Information (ข้อมูลการทดสอบ)2(ไม่บังคับ) เพิ่มบันทึกเกี่ยวกับการดำเนินการหรือการทดสอบในกล่องข้อความ Notes (บันทึก)3เลือกช่องทำเครือ่ งหมายของบล็อกอย่างน้อยหนึง่ บล็อกที่จะดำเนินการทดสอบ
เคล็ดลับ: หากต้องการดำเนินการทดสอบในบล็อกทั้งหมด ให้เลือก Select All Blocks (เลือกบล็อกทั้งหมด)ที่อยูใ่ ต้ตาราง Selected Blocks (บล็อกที่เลือก)4(ตัวเลือก) คลิก Flash Block Indicator (ตัวบ่งชี้บล็อกกระพริบ) เพื่อกะพริบไฟ LED แสดงสถานะบนบล็อกเครื่องมือ
ที่เลือก

5ใส่เพลตที่จะทำการทดสอบลงในบล็อก
aคลิก Open Lid (เปิดฝา) ฝาครอบมอเตอร์ของแต่ละบล็อกที่เลือกจะเปิดขึน
้bใส่เพลตที่จะทำการทดสอบลงในแต่ละบล็อกที่เลือก

168 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Start Run (เริ่มการทดสอบ)cคลิก Close Lid (ปิดฝา)เคล็ดลับ: บน CFX Opus Dx system แตะ Open Lid (เปิดฝาครอบ) หรือ Close Lid (ปิดฝาครอบ) บนหน้า
Home (หน้าหลัก)6คลิก Open Lid (เปิดฝาครอบ) และ Close Lid (ปิดฝาครอบ) เพือ่ เปิดและปิดฝาครอบมอเตอร์ของแต่ละบล็อก
เครือ่ งมือที่เลือก

7ดูรายละเอียดการการทดสอบ และทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากรายละเอียดถูกต้อง ให้คลิก Start Run (เริม่ การทดสอบ)nหากรายละเอียดไม่ถกู ต้องoแก้ไขรายละเอียดให้ถูกต้องในตาราง Selected Blocks (บล็อกที่เลือก) และคลิก Start Run (เริม่ การทดสอบ)oกลับไปยังแท็บที่ถกู ต้องและทำการเปลีย่ นแปลงที่เหมาะสม บันทึกการเปลีย่ นแปลงแล้วคลิก Next (ถัดไป) เพื่อกลับไปที่แท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) และเริม่ ต้นการดำเนินการทดสอบ

วิธเี ริม่ ต้นการทดสอบใหม่จากการทดสอบก่อนหน้าuโปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก File (ไฟล์) > Repeat a Run (ทำการทดสอบซ้ำ) ในแถบเมนูซอฟต์แวร์หลัก ค้นหาและคลิกสองครัง้ ที่ไฟล์ขอ้ มูลการทดสอบที่คุณต้องการจะทำซ้ำ

nเลือกแท็บ Repeat Run (ทำการทดสอบซ้ำ) ใน Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) และคลิกสอง
ครั้งที่ไฟล์ขอ้ มูลการทดสอบของการทดสอบที่คุณต้องการจะทำซ้ำ
หรืออีกทางเลือกหนึ่ง ในแท็บ Repeat Run (ทำการทดสอบซ้ำ) คุณสามารถคลิก Browse (เรียกดู) แล้วค้น
หาและดับเบิลคลิกที่ไฟล์ข้อมูลการทดสอบที่คณุ ต้องการจะทำซ้ำ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 169บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

กล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)เมือ่ คุณคลิก Start Run (เริม่ การทดสอบ) CFX Maestro Dx SE จะแจ้งให้คณุ บันทึกไฟล์ข้อมูล (.pcrd) เริม่ การทดสอบ และเปิดกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ) กล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการ
ทดสอบ) ประกอบด้วยแท็บสถานะ 3 แท็บn

Run Status (สถานะการทดสอบ) — ใช้แท็บนี้เพื่อดูสถานะปัจจุบันของโปรโตคอล เปิดหรือปิดฝาครอบ
หยุดการทดสอบชั่วคราว เพิ่มการทำซ้ำ ข้ามขัน้ ตอน หรือหยุดการทดสอบ

n

Real-time Status (สถานะเรียลไทม์) — ใช้แท็บนี้เพือ่ ดูข้อมูลสารเรืองแสงของ PCR แบบเรียลไทม์ตามที่มี
การเก็บรวบรวม

nTime Status (สถานะเวลา) — ใช้แท็บนี้เพื่อดูตัวจับเวลาถอยหลังแบบเต็มหน้าจอสำหรับโปรโตคอล

คำอธิบายโดยละเอียดสำหรับแท็บเหล่านี้อยูใ่ นหัวข้อต่อไป

แท็บสถานะการทดสอบ
แท็บ Run Status (สถานะการทดสอบ) จะแสดงสถานะปัจจุบนั ของการทดสอบที่กำลังดำเนินการอยู่ ในมุมมองนี้
คุณยังสามารถควบคุมฝาครอบและเปลี่ยนการทดสอบทีก่ ำลังดำเนินการอยูไ
่ ด้

170 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)คำอธิบายสัญลักษณ์
1

Run Status Pane (บานหน้าต่างสถานะการทดสอบ) แสดงการดำเนินการปัจจุบันของ
โปรโตคอล

2

Run Status Controls (ควบคุมสถานะการทดสอบ) ช่วยให้คุณสามารถใช้งานเครื่องมือหรือ
ขัดขวางโปรโตคอลปัจจุบันได้

3

Run Information Pane (บานหน้าต่างข้อมูลการทดสอบ) แสดงรายละเอียดการทดสอบ

คำสั่ง Run Status (เรียกดูสถานะการทำงาน)ใช้คำสัง่ ในแท็บ Run Status (สถานะการทดสอบ) เพือ่ ใช้งานอุปกรณ์จากซอฟต์แวร์หรือเปลีย่ นการทดสอบที่กำลัง
ดำเนินอยู่
หมายเหตุ: ทำการเปลี่ยนแปลงโปรโตคอลระหว่างการทดสอบ เช่น การเพิ่มการทำซ้ำ แต่อย่าเปลี่ยนไฟล์โปรโต
คอลที่เกีย่ วข้องกับการทดสอบ การดำเนินการเหล่านีจ้ ะถูกบันทึกใน Run Log (ประวัติการทำการทดสอบ)— เปิดฝาครอบมอเตอร์บนอุปกรณ์ที่เลือก
สำคัญ: การเปิดฝาครอบระหว่างการทดสอบจะเป็นการหยุดการทดสอบชั่วคราวในขัน้ ตอนปัจจุบันและอาจ
ทำให้ขอ้ มูลเปลี่ยนแปลงไป คำสั่ง Run Status (เรียกดูสถานะการทำงาน) ในหน้า 171— ปิดฝาครอบมอเตอร์บนอุปกรณ์ที่เลือก

— เพิ่มการทำซ้ำให้กบั ขั้นตอนคำสัง่ GOTO ปัจจุบนั ในโปรโตคอล มีตัวเลือกนีใ้ นกรณีที่การทดสอบกำลัง
ดำเนินการในขัน้ ตอนคำสัง่ GOTO เท่านัน
้หมายเหตุ: คุณสามารถเพิ่มการทำซ้ำได้ในขณะที่อยูใ่ นรอบ GOTO เมือ่ โปรโตคอลกำลังดำเนินการอยู่
อย่างไรก็ตาม CFX Maestro Dx SE จะรับรูก้ ารเปลี่ยนแปลงล่าสุดในจำนวนครัง้ ที่ทำซ้ำ ตัวอย่างเช่น หากคุณเพิ่มการทำซ้ำอีก 10 ครัง้ ในระหว่างที่อยูใ่ นรอบ GOTO ซอฟต์แวร์จะเปลี่ยนจำนวนทั้งหมดเป็น n + 10หากคุณเพิ่มการทำซ้ำอีกห้า (5) ครัง้ ในขณะที่อยูใ่ นรอบเดียวกัน CFX Maestro จะเปลี่ยนจำนวนการทำ
ซ้ำทั้งหมดเป็น n + 5 การเปลีย่ นแปลงครัง้ แรก (การทำซ้ำ 10 ครั้ง) จะตกไป เพื่อให้แน่ใจว่าซอฟต์แวร์
ดำเนินการตามจำนวนการทำซ้ำทีต่ ้องการ ให้ป้อนจำนวนทั้งหมด (ในกรณีนี้คอื การทำซ้ำ 15 ครั้ง)— ข้ามขั้นตอนปัจจุบนั ในโปรโตคอล
หมายเหตุ: หากคุณเริม่ การข้ามขณะอยู่ในขัน้ ตอน GOTO ระบบจะข้ามไปยังรอบถัดไปในลูป GOTO หากรอบสุดท้ายของขั้นตอน GOTO กำลังดำเนินอยู่ขณะที่คุณทำการข้าม ระบบจะข้ามไปยังขั้นตอนถัดไป

— ไฟ LED กะพริบบนอุปกรณ์ที่เลือกเพื่อระบุบล็อกที่เลือก

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 171บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

— หยุดโปรโตคอลชั่วคราว
หมายเหตุ: การดำเนินการนีจ้ ะถูกบันทึกใน Run Log (ประวัติการทำการทดสอบ)— ให้โปรโตคอลที่หยุดชั่วคราวกลับมาทำงาน

— หยุดการทำงานก่อนโปรโตคอลสิน้ สุดหมายเหตุ: การหยุดการทำงานก่อนโปรโตคอลสิน้ สุดอาจทำให้ข้อมูลของคุณเปลีย่ นแปลงไป

เปิดฝาครอบของเครือ่ งมือระหว่างการทดสอบ PCRหากเปิดฝาครอบของเครือ่ งมือระหว่างการทดสอบ PCR CFX Maestro Dx SE จะแสดงข้อความยืนยันต่อไปนี้:ขณะที่ขอ้ ความปรากฏขึน้ เครื่องมือจะยังคงดำเนินการกับโปรโตคอลต่อไป ปุ่ม OK (ตกลง) จะหยุดการทดสอบชั่วคราว และฝาครอบของเครื่องมือจะคลายและเปิดออก ปุ่ม Cancel (ยกเลิก) จะยกเลิกข้อความและดำเนินการทดสอบต่อไป

172 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)แท็บสถานะเรียลไทม์
แท็บ Real-time Status (สถานะเรียลไทม์) แสดงข้อมูล PCR แบบเรียลไทม์ที่เก็บรวบรวมได้ในแต่ละรอบในระหว่าง
ทำการทดสอบหลังจากที่มกี ารอ่านค่าสองเพลตแรก

คำอธิบายสัญลักษณ์
1

Amplification Trace Pane (หน้าต่างการติดตามการเพิม่ ปริมาณ) แสดงข้อมูลการเพิ่ม
ปริมาณแบบเรียลไทม์ในระหว่างทำการทดสอบ

2

Well Group Identifier (ตัวระบุกลุ่มหลุม) หากมีการระบุกลุ่มหลุมในการตั้งค่าเพลต ผู้ใช้
สามารถเลือกกลุม่ หลุมที่เฉพาะเจาะจงเพือ่ ดูการติดตาม หลุม และข้อมูลแบบตารางได้
Step Number Identifier (ตัวระบุหมายเลขขั้นตอน) หากโปรโตคอลเก็บข้อมูลทีข่ ั้นตอนมาก
กว่าหนึ่งขัน้ ตอน (เช่น ในขณะที่ทำการเพิ่มปริมาณและ Melt Curve) ผู้ใช้สามารถเลือก
ขั้นตอนที่เฉพาะเจาะจงและดูการติดตามที่เก็บรวบรวมได้ในขั้นตอนนั้นได้

3

Well Selector Pane (บานหน้าต่างตัวเลือกหลุม) แสดงหลุมทีใ่ ช้งาน ไม่ได้ใช้งาน และไม่มสี ารในเพลต

4

Plate Setup Table Pane (บานหน้าต่างตารางการตั้งค่าเพลต) แสดงการตั้งค่าเพลตใน
รูปแบบตาราง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 173บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

5

Run Details Pane (บานหน้าต่างรายละเอียดการทดสอบ) แสดงสถานะเรียลไทม์ของ
การทดสอบ ซึ่งประกอบด้วยรายการต่อไปนี้
n Current Step (ขั้นตอนปัจจุบัน)n Current Repeat (การทำซ้ำในปัจจุบัน)n Current Temperature (อุณหภูมปิ ัจจุบัน)n Time Remaining (เวลาทีเ่ หลืออยู่)n Sample Temperature (อุณหภูมขิ องตัวอย่าง)n Lid temperature (อุณหภูมฝิ าครอบ)6

Plate Setup (การตัง้ ค่าเพลต) เปิดกล่องโต้ตอบ Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) ซึ่งผู้ใช้
สามารถปรับเปลี่ยนการตั้งค่าเพลตปัจจุบันในระหว่างทำการทดสอบได้

ในแท็บ Real-time Status (สถานะเรียลไทม์) คุณสามารถทำดังนี้
nแสดงหรือซ่อนการติดตามแบบเรียลไทม์โดยเลือกการติดตามในบานหน้าต่างตัวเลือกหลุมหรือตาราง
การตั้งค่าเพลต

nดูการติดตามหนึ่งรายการหรือเป็นกลุม่ โดยเลือกการติดตามในกลุ่มหลุมแบบเลือ
่ นลง

n

แก้ไขเพลตหรือเปลีย่ นไฟล์เพลต

nใช้ไฟล์ PrimePCR ในการทดสอบ

การแสดงหรือซ่อนการติดตามแบบเรียลไทม์
ตามค่าเริ่มต้น หลุมที่มสี ารอยูท่ ั้งหมดจะทำงานและปรากฏในตารางการตั้งค่าเพลต หลุมที่ทำงานจะปรากฏเป็นสี
น้ำเงินในบานหน้าต่างตัวเลือกหลุม หลุมที่ซอ่ นอยูจ่ ะปรากฏเป็นสีเทาอ่อน และหลุมที่ไม่ได้ใช้จะปรากฏเป็น
สีเทาเข้มในบานหน้าต่างตัวเลือกหลุม
คุณสามารถซ่อนการติดตามจากหลุมที่ใช้งานอยูใ่ นระหว่างทำการทดสอบได้ โดย CFX Maestro Dx SE ยังคง
รวบรวมข้อมูลสำหรับทุกหลุมต่อไป เมือ่ คุณซ่อนหลุม ข้อมูลของหลุมที่ซ่อนจะไม่ปรากฏในตารางการตั้งค่าเพลต

วิธซี ่อนการติดตามแบบเรียลไทม์uในบานหน้าต่างตัวเลือกหลุม ให้คลิกหลุมที่ทำงาน (สีฟ้า) ที่คุณต้องการจะซ่อน

วิธแี สดงการติดตามแบบเรียลไทม์uในบานหน้าต่างตัวเลือกหลุม ให้คลิกหลุมที่ซอ
่ น (สีเทาอ่อน) ทีค่ ุณต้องการจะแสดง

โปรดดูขอ้ มูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับตัวเลือกหลุมได้ที่ ตัวเลือกหลุม ในหน้า 193

174 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)การแก้ไข Plate Setup (การตั้งค่าเพลต)วิธแี ก้ไขการตั้งค่าเพลตuคลิก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) แล้วเลือก View/Edit Plate (ดู/แก้ไขเพลต)หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะปรากฏขึน้ ซึ่งคุณสามารถแก้ไขเพลตได้ขณะที่กำลังดำเนินการ
ทดสอบอยู่ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการแก้ไขเพลต โปรดดูบทที่ 8, การเตรียมเพลต
หมายเหตุ: นอกจากนี้ คุณยังสามารถแก้ไขรูปแบบการติดตามได้จากหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) การเปลี่ยนแปลงจะปรากฏขึ้นในแผนภาพลักษณะการติดตามการเพิม่ ปริมาณในแท็บ Real-time
Status (สถานะแบบเรียลไทม์)การเปลีย่ นไฟล์เพลต
เคล็ดลับ: การเปลีย่ น่ไฟล์เพลตจะเป็นประโยชน์อย่างยิง่ หากคุณเริม่ ทำการทดสอบด้วยไฟล์ Quick Plate (เพลตด่วน) ในโฟลเดอร์ ExpressLoadวิธเี ปลีย่ นไฟล์เพลตuคลิก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) แล้วเลือกตัวเลือกใดตัวเลือกหนึ่งต่อไปนี้
n

Replace Plate File (เปลีย่ นไฟล์เพลต) — เลือกไฟล์เพลตใหม่จากรายการในหน้าต่างเบราว์เซอร์

n

Apply PrimePCR File (ใช้ไฟล์ PrimePCR) — ค้นหาไฟล์การทดสอบที่จะได้เค้าโครงเพลตมาโดยใช้
การค้นหาแบบสมาร์ทหรือคลิก Browse (เรียกดู) เพื่อค้นหาไฟล์ทคี่ ุณดาวน์โหลดจากเว็บไซต์ Bio-Radและไฟล์ที่ไม่ได้อยู่ในโฟลเดอร์ PrimePCRหมายเหตุ: CFX Maestro Dx SE จะตรวจสอบโหมดการสแกนและขนาดเพลตสำหรับไฟล์เพลต ซึ่งจะต้อง
เป็นไปในลักษณะเดียวกันกับการตั้งค่าการทดสอบสำหรับให้การทดสอบเริม่ ทำงาน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 175บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

แท็บ Time Status (สถานะเวลา)แท็บ Time Status (สถานะเวลา) แสดงเวลาที่เหลืออยู่ที่จะทำการทดสอบปัจจุบันให้เสร็จสิน
้

176 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการดำเนินการทดสอบ PrimePCRการดำเนินการทดสอบ PrimePCRการทดลอง PrimePCR จะใช้การวิเคราะห์แบบตามเส้นทาง (Pathway) หรือเฉพาะโรค (Disease-Specific) ที่ BioRad ได้ตรวจสอบและปรับค่า Wet-Lab แล้ว โดยสามารถใช้งานได้ในรูปแบบต่อไปนี้
nแผงอเนกประสงค์ — คือเพลตที่ประกอบไปด้วยการวิเคราะห์เฉพาะสำหรับเส้นทางหรือโรคทางชีววิทยา ซึ่งประกอบไปด้วยการควบคุม PrimePCR และยีนอ้างอิง

nแผงกำหนดค่าตามประสงค์ — คือเพลตที่สามารถตั้งค่าได้ในเค้าโครงที่กำหนดโดยผูใ้ ช้ พร้อมกับตัวเลือกใน
การเลือกการวิเคราะห์ตามความสนใจ การควบคุม และการอ้างอิงที่ต้องการ

nการวิเคราะห์แบบแยก — คือหลอดแก้วที่ประกอบไปด้วยการไพรเมอร์เฉพาะสำหรับการใช้งานในการทำ
ปฏิกริยาแบบเรียลไทม์

หากต้องการลดเวลาการทำงานโดยรวม คุณสามารถลบขั้นตอนการหลอมละลายในโปรโตคอลได้ Bio-Rad แนะนำ
ไม่ให้คุณปรับเปลี่ยนสิง่ ใดเพิ่มเติมไปยังโปรโตคอลการทดลอง PrimePCR โปรโตคอลเริม่ ต้นเป็นโปรโตคอลที่
ใช้งานสำหรับตรวจสอบการวิเคราะห์ การเปลี่ยนแปลงค่าไปจากนีอ้ าจส่งผลต่อผลลัพธ์ที่ได้ การเปลีย่ นแปลงที่เกิด
กับโปรโตคอลจะถูกทำเป็นหมายเหตุไว้ที่แท็บ Run Information (ข้อมูลการทดสอบ) ของไฟล์ข้อมูลผลลัพธ์และใน
รายงานใด ๆ ที่ถกู สร้างขึ้น

วิธเี ริม่ ต้นทดสอบ PrimePCRuหากต้องการเริม่ ต้นทดสอบ PrimePCR ให้ดำเนินการหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nใน Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) เลือก PrimePCR ทีแ่ ท็บ Run Setup (การตั้งค่า
การทดสอบ) แล้วเลือกสารเคมีที่เหมาะสม (SYBER® หรือโพรบ)nเลือกการทดลอง PrimePCR จากรายการ Recent Runs (การทดสอบล่าสุด) ที่แท็บ Repeat Run(การทดสอบซ้ำ) ใน Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น)nเลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > PrimePCR Run (การทดลอง PrimePCR) ที่หน้าต่าง Home(หน้าหลัก)nลากและวางไฟล์การทดลอง PrimePCR บนหน้าต่าง Home (หน้าหลัก)หลังจากทีค่ ุณเลือกการทดสอบ PrimePCR แล้ว หน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) จะเปิดขึ้นที่แท็บ Start
Run (เริม่ ทำการทดสอบ) พร้อมกับเค้าโครงเพลต PrimePCR เริม่ ต้นที่โหลดไว้ตามอุปกรณ์ที่เลือก

วิธลี บขัน้ ตอนการหลอมละลายในโปรโตคอลuที่แท็บ Protocol (โปรโตคอล) ให้ยกเลิกการทำเครื่องหมายในช่องทีอ่ ยูต่ ิดกับรายการ Include Melt Step (รวมขั้นตอนการหลอมละลาย)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 177บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

วิธนี ำเข้าข้อมูลเป้าหมายสำหรับเพลต PrimePCR ไปยังเค้าโครงเพลต
1โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nที่แท็บ Real-time Status (สถานะแบบเรียลไทม์) ในกล่องโต้ตอบ Run Details (รายละเอียดการทดสอบ)ให้เลือก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) > Apply PrimePCR File (ใช้ไฟล์ PrimePCR)nในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ให้เลือก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) > Apply
PrimePCR File (ใช้ไฟล์ PrimePCR)

2ในกล่องโต้ตอบไฟล์การทดสอบ PrimePCR ให้คลิก Browse (เรียกดู) เพื่อไปยังไฟล์ PrimePCR (.csv)
ที่เหมาะสม

3เลือกไฟล์ PrimePCR ที่ต้องการและคลิก Open (เปิด)CFX Opus Dx systemนำเข้าข้อมูลเป้าหมายไปยังเค้าโครงเพลต

178 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการถ่ายโอนข้อมูลสแตนด์อะโลนเพือ่ การวิเคราะห์

การถ่ายโอนข้อมูลสแตนด์อะโลนเพื่อการวิเคราะห์
สำคัญ: เมือ่ คุณถ่ายโอนไฟล์ข้อมูลจาก CFX Opus Dx system ไปยัง CFX Maestro Dx SE ไฟล์ทั้งหมดที่
บันทึกไว้ในระบบจะถูกถ่ายโอน ตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณมีเนือ้ ทีว่ ่างเพียงพอที่จะทำการถ่ายโอนข้อมูลได้
อย่างปลอดภัย
เมือ่ การทดสอบเสร็จสิน
้ CFX Maestro Dx SE จะวิเคราะห์ขอ้ มูลสารเรืองแสง หากทำการทดสอบในโหมดCFX
Maestro Dx SEสแตนด์อะโลนและบันทึกลงในเครือ
่ ง CFX Opus Dx system เองแล้ว ต้องถ่ายโอนข้อมูลไปยังคอม
พิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE เพื่อทำการวิเคราะห์
CFX Opus Dx system สามารถจัดเก็บการทดสอบ PCR แบบเรียลไทม์ได้ถึง 100 ครัง้ หลังการทดสอบเสร็จสิน้ CFX
Maestro Dx SEคุณสามารถถ่ายโอนไฟล์ข้อมูลสแตนด์อะโลนไปยังคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE ผ่านอีเมล
CFX Maestro Dx SEไดรฟ์ USB หรือผ่านซอฟต์แวร์ได้
ในส่วนนีจ้ ะอธิบายวิธกี ารถ่ายโอนไฟล์ขอ้ มูลสแตนด์อะโลนไปยังคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SEการถ่ายโอนข้อมูลผ่านอีเมล
วิธกี ารส่งอีเมลไฟล์ขอ้ มูลเมือ่ สิ้นสุดการทดสอบ
1ตั้งค่าการแจ้งเตือนทางอีเมลสำหรับเครือ่ งมือ
โปรดดูการตั้งค่าการแจ้งเตือนทางอีเมล ในหน้า 79 หรือ CFX Opus Dx Real-Time PCR System คูม่ ือการใช้
งาน

2

เมือ
่ คุณตั้งค่าการแจ้งเตือนทางอีเมล ให้ตรวจสอบให้แน่ใจว่าได้เลือก Attach Data File (แนบไฟล์ข้อมูล) ไว้แล้ว
ข้อมูลการทดสอบจะส่งทางอีเมลเป็นไฟล์ .pcrd

การถ่ายโอนข้อมูลจาก CFX Opus Dx Real-Time PCR Systemการใช้คณุ สมบัติ File Browser บน CFX Opus Dx system คุณสามารถถ่ายโอนไฟล์ข้อมูลไปยังไดรฟ์ USB ที่เชือ่ มต่อหรือไปยังโฟลเดอร์บนเครือข่ายทีใ่ ช้รว่ มกันได้ คุณยังสามารถถ่ายโอนไฟล์โปรโตคอลของ CFX Maestro Dx SEจากไดรฟ์ USB หรือไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้รว่ มกันไปยังโฟลเดอร์ของคุณหรือโฟลเดอร์สาธารณะบน CFX Opus
Dx system และทดสอบบน CFX Opus Dx system ได้เคล็ดลับ: ส่วนนี้อธิบายถึงวิธกี ารถ่ายโอนข้อมูล สำหรับข้อมูลเกีย่ วกับการตั้งค่าการเชื่อมต่อ Ethernet โปรดดูที่
การใช้งาน คำแนะนำเครือ่ งมือ CFX Opus Dx Real-Time PCR System ได้ในเมนูชว่ ยเหลือ CFX Maestro
Dx SE
1บนหน้าจอหลักของ CFX Opus Dx system ให้แตะ Files (ไฟล์) เพือ่ ดูหน้าจอ File Browser

2ในหน้าจอ File Browser ให้ไปที่ไฟล์ที่คุณต้องการคัดลอก จากนัน้ แตะไฟล์เพื่อดูบานหน้าต่างรายละเอียดไฟล์

3ในแถบหน้าต่างรายละเอียดไฟล์ ให้แตะ Options (ตัวเลือก) แล้วแตะ Copy (คัดลอก)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 179บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

กล่องโต้ตอบเลือกตำแหน่งจะปรากฏขึ้น
4ในกล่องโต้ตอบเลือกตำแหน่ง ให้เลือกทำอย่างใดอย่างหนึ่งต่อไปนี้:nไปที่โฟลเดอร์ที่มอ
ี ยู่

n

ไปที่ตำแหน่งที่ต้องการเพื่อสร้างโฟลเดอร์ที่จะบันทึกไฟล์ จากนัน้ แตะ Create Folder (สร้างโฟลเดอร์)(5) เพื่อสร้างโฟลเดอร์ใหม่ในตำแหน่งนัน
้

แตะ Select (เลือก) เพื่อคัดลอกไฟล์ไปยังตำแหน่งที่เลือกหรือ Cancel (ยกเลิก) เพือ่ กลับไปทีห่ น้าจอ FileBrowserหมายเหตุ: หากมีไฟล์ที่มีชอื่ เดียวกันอยู่ในตำแหน่งที่เลือก กล่องข้อความจะปรากฏขึน้ แตะ Yes (ใช่)เพื่อเขียนทับไฟล์ที่มอี ยูห่ รือ No (ไม่ใช่) เพื่อกลับไปที่หน้าจอ File Browser
CFX Opus Dx system จะแสดงข้อความยืนยันเมือ่ คัดลอกไฟล์สำเร็จ

180 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการถ่ายโอนข้อมูลสแตนด์อะโลนเพือ่ การวิเคราะห์

การถ่ายโอนข้อมูลผ่าน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionวิธถี ่ายโอนข้อมูลผ่าน CFX Maestro Dx SE
1ในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้คลิกขวาที่
เครือ่ งมือเป้าหมายและเลือก Retrieve Data Files (เรียกไฟล์ขอ้ มูล)CFX Maestro Dx SE จะแสดงกล่องโต้ตอบ Browse For Folder (เรียกดูโฟลเดอร์)2ในกล่องโต้ตอบ Browse For Folder (เรียกดูโฟลเดอร์) ให้เรียกดูตำแหน่งที่คณุ ต้องการบันทึกไฟล์ขอ้ มูลและ
คลิก OK (ตกลง)กระบวนการโอนย้ายจะสร้างโฟลเดอร์ที่ชอื่ ว่า Real-Time Data (ข้อมูลเรียลไทม์) ในตำแหน่งที่เลือก ข้อมูลการ
ทดสอบจะถูกบันทึกลงในโฟลเดอร์ Real-Time Data (ข้อมูลเรียลไทม์) เป็นไฟล์ .zpcr แยกต่างหาก

การถ่ายโอนข้อมูลโดยใช้ไดรฟ์ USBหากคุณใส่ USB ไดรฟ์ในพอร์ต USB บนเครือ่ งมือ ไฟล์ขอ้ มูลจะถูกบันทึกลงในไดเรกทอรีรากของไดรฟ์ USBโดยอัตโนมัติเมือ่ การทดสอบเสร็จสิน้ คุณสามารถค้นหาไฟล์ขอ้ มูลที่บันทึกก่อนหน้านีแ้ ละบันทึกในไดรฟ์ USBที่เสียบอยู่ได้

วิธถี ่ายโอนไฟล์ขอ้ มูลไปยังไดรฟ์ USB ที่เชื่อมต่อบน CFX Opus Dx systemuในกล่องโต้ตอบ Select Location (เลือกตำแหน่ง) ให้แตะ USB และไปที่โฟลเดอร์เป้าหมายที่จะคัดลอกไฟล์
หรือกด Cancel (ยกเลิก) เพื่อกลับไปที่หน้าจอ File Browserหมายเหตุ: หากมีไฟล์ที่มีชอื่ เดียวกันอยู่ในตำแหน่งที่เลือก กล่องโต้ตอบจะปรากฏขึ้น แตะ Yes (ใช่)เพื่อเขียนทับไฟล์ที่มอี ยูห่ รือ No (ไม่ใช่) เพื่อกลับไปที่หน้าจอ File Browser

CFX Opus Dx system จะแสดงข้อความยืนยันเมือ่ คัดลอกไฟล์สำเร็จ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 181บทที่ 9 การดำเนินการทดสอบ

การถ่ายโอนข้อมูลผ่านไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้ร่วมกันโดยใช้ CFX Opus Dx
Real-Time PCR Systemเคล็ดลับ: คุณสามารถถ่ายโอนข้อมูลไปยังและจากไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้รว่ มกันผ่านทาง CFX Opus Dx
system ได้เท่านัน้
CFX Opus Dx system ช่วยให้คุณสามารถเชื่อมต่อกับไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้รว่ มกันโดยใช้อเี ธอร์เน็ต เมื่อเชื่อมต่อ
สำเร็จแล้ว คุณสามารถโอนไฟล์ข้อมูลไปยังหรือจากโฟลเดอร์ในไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้รว่ มกันได้

วิธถี ่ายโอนข้อมูลไปยังและจากไดรฟ์บนเครือข่ายที่ใช้รว่ มกันuในกล่องโต้ตอบ Select Location (เลือกตำแหน่ง) ให้แตะ Network (เครือข่าย) และไปที่โฟลเดอร์เป้าหมายที่จะ
คัดลอกไฟล์ หรือกด Cancel (ยกเลิก) เพื่อกลับไปที่หน้าจอ File Browserหมายเหตุ: หากมีไฟล์ที่มีชอื่ เดียวกันอยู่ในตำแหน่งที่เลือก กล่องโต้ตอบจะปรากฏขึ้น แตะ Yes (ใช่)เพื่อเขียนทับไฟล์ที่มอี ยูห่ รือ No (ไม่ใช่) เพื่อกลับไปที่หน้าจอ File Browser

CFX Opus Dx system จะแสดงข้อความยืนยันเมือ่ คัดลอกไฟล์สำเร็จ

การสร้างไฟล์ขอ้ มูลในการวิเคราะห์ข้อมูลที่ถา่ ยโอนจากเครือ่ งมือไปยังคอมพิวเตอร์ที่มี CFX Maestro Dx SE ไฟล์ขอ้ มูลที่บบี อัด (ไฟล์.zpcr) ต้องถูกแปลงเป็นไฟล์ขอ้ มูล (ไฟล์ .pcrd) โดย CFX Maestro Dx SE จะแปลงไฟล์ .zpcr เป็นไฟล์ .pcrd
จากนัน้ จะเลือกไฟล์เพลตทีม่ ีโหมดสแกนและขนาดเพลตเหมือนกันและนำไปใช้กบั ไฟล์ .pcrdวิธสี ร้างไฟล์ขอ้ มูลจากไฟล์ขอ้ มูลแบบสแตนด์อะโลน
1

ใน CFX Maestro Dx SE ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nค้นหาไฟล์ .zpcr ที่ต้องการแล้วลากไปยังหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ของ CFX Maestro Dx SEnเลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Stand-alone Run (ดำเนินการแบบสแตนด์อะโลน) แล้วเลือกไฟล์
เป้าหมาย

CFX Maestro Dx SE จะแสดงกล่องข้อความ Save As (บันทึกเป็น)2ไปยังโฟลเดอร์ที่คณุ วางแผนจะบันทึกไฟล์ .pcrd แล้วคลิก Save (บันทึก)หลังจากคุณบันทึกไฟล์ .pcrd CFX Maestro Dx SE เปิดหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)แล้วแสดงข้อมูลผลลัพธ์

182 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ประมวลผลข้อมูล PCR แบบเรียลไทม์โดยอัตโนมัติเมือ่ สิ้นสุด
การทดสอบแต่ละครัง้ และเปิดหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) เพื่อแสดงข้อมูลเหล่านี้ (ไฟล์ .pcrd)nลากไฟล์ขอ้ มูล (นามสกุล .pcrd) มาที่หน้าต่าง Home (หน้าหลัก) แล้วปล่อย

nเลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > Data File (ไฟล์ข้อมูล) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) และเรียกดูไฟล์ .pcrd
เป้าหมาย

nเลือก File (ไฟล์) > Recent Data Files (ไฟล์ข้อมูลล่าสุด) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เพือ่ เลือกจากรายการ
ไฟล์ขอ้ มูลที่เปิดล่าสุด 10 รายการ

nเลือกแท็บ Analyze (วิเคราะห์) ใน Startup Wizard (ตัวช่วยสร้างการเริม่ ต้น) และเลือกจาก Recent Files (ไฟล์ล่าสุด) หรือคลิก Browse (เรียกดู) เพื่อค้นหาไฟล์ขอ้ มูลหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)หน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) แสดงแท็บหลายแท็บ แต่ละแท็บแสดงข้อมูลทีม่ ีการวิเคราะห์สำหรับวิธี
การวิเคราะห์เฉพาะหรือข้อมูลที่มกี ารเรียกใช้เฉพาะ แท็บจะปรากฏขึ้นเฉพาะเมื่อมีขอ้ มูลที่รวบรวมในการทดสอบ
สำหรับการวิเคราะห์ประเภทดังกล่าวเท่านั้น

เคล็ดลับ: หากต้องการเลือกแท็บให้แสดงผล เลือกแท็บจากเมนูแบบเลื่อนลง View (ดู) ในหน้าต่าง Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ในการกลับสูเ่ ค้าโครงของแท็บเดิม เลือก Settings (การตั้งค่า) > Restore
Default Window Layout (เรียกคืนรูปแบบหน้าต่างเริม่ ต้น)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 183บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลแถบเครื่องมือ Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)
แถบเครือ่ งมือในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) จะมีการเข้าถึงด่วนไปยังฟังก์ชันการวิเคราะห์ข้อมูลที่
สำคัญตาราง 11 แสดงรายการฟังก์ชนั ของปุม่ ต่าง ๆ ในแถบเครือ่ งมือ
ตาราง 11 แถบเครือ่ งมือในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)ปุม่Name (ชือ่ )ฟังก์ชัน

Plate Setup

ดู/แก้ไขเพลต — เปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) เพื่(การตั้งค่าเพลต)อดูและแก้ไขสารที่อยูใ่ นหลุม
แทนทีเ่ พลต — เลือกไฟล์เพลตเพื่อแทนที่รูปแบบเพลต
นำไฟล์ PrimePCR ไปใช้ — เลือกไฟล์การทดสอบ
เพือ่ แทนทีร่ ูปแบบเพลตสำหรับการทดสอบ PrimePCRManage Wellเปิดหน้าต่าง Well Groups Manager (ตัวจัดการกลุ่ม

Groups (จัดการหลุม) เพือ่ สร้าง แก้ไข และลบกลุ่มหลุม

กลุม่ หลุม)Well Groupเลือกชื่อกลุม่ หลุมที่มอี ยูจ่ ากเมนูแบบเลื่อนลง การเลือก

(กลุ่มหลุม)เริม่ ต้นคือ All Wells (ทุกหลุม) ปุ่มนี้จะแสดงขึ้นเฉพาะ
เมือ่ มีการสร้างกลุ่มหลุมขึ้น

Analysis Modeวิเคราะห์ขอ้ มูลในโหมด Fluorophore (สารเรืองแสง)(โหมดการวิเคราะ

หรือ Target (เป้าหมาย)ห์)Help (ช่วยเหลือ)เปิด Help (ช่วยเหลือ) เกีย่ วกับซอฟต์แวร์ ซึ่งคุณจะพบ
ความช่วยเหลือทางออนไลน์และสำเนาดิจิทลั ของคูม่ ือนีใ้ นรูปแบบ Acrobat PDF

184 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)แถบเมนูการวิเคราะห์ข้อมูล
ตาราง 12 แสดงรายการแถบเมนูในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์สาร)ตาราง 12 รายการแถบเมนูในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์สาร)รายการเมนู

Command (คำสั่ง)Function (ฟังก์ชน
ั )File (ไฟล์)Save (บันทึก)บันทึกไฟล์

Save As (บันทึกเป็น)บันทึกไฟล์ดว้ ยชื่อใหม่

รหัสผ่านของไฟล์

ช่วยให้ผู้ใช้สามารถตั้งรหัสผ่านสำหรับบันทึกและ
เปิดไฟล์

เซ็นชือ
่ช่วยให้ผู้ใช้สามารถเซ็นชือ่ ลงในไฟล์ขอ้ มูลทำการทดสอบซ้ำ

แยกโปรโตคอลและไฟล์เพลตออกจากการดำเนิน
การทดสอบปัจจุบันเพื่อทำการทดสอบใหม่

View (ดู)

Close (ปิด)ปิดหน้าต่างการวิเคราะห์ขอ้ มูล

Run Log (ประวัติการทำการทดสอบ)เปิดหน้าต่าง Run Log (ประวัตกิ ารทำการทดสอบ)เพือ่ ดูประวัติการทดสอบของไฟล์ข้อมูลปัจจุบัน

เส้นทางการตรวจสอบ

เปิดเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์

การหาปริมาณ, Melt Curve (กราฟแสดงข้อมูลที่วเิ คราะห์ในแท็บที่เลือกในหน้าต่าง

การสลายดีเอ็นเอ), การแสดงออกของ

Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ต้องเลือกแท็บ

ยีน, จุดสิ้นสุด, ดูขอ้ มูลแบบกำหนดเอง,อย่างน้อยหนึ่งแท็บ

การควบคุมคุณภาพ, ข้อมูลการ
ทดสอบ

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 185บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลตาราง 12 รายการแถบเมนูในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์สาร)ต่อ

รายการเมนู

Command (คำสั่ง)Function (ฟังก์ชนั )การตัง้ ค่าโหมดการกำหนดค่า Cq

ช่วยให้คุณสามารถเลือกโหมดรีเกรสชันหรือขีด
จำกัดเดี่ยวเพื่อกำหนดวิธีการคำนวณค่า Cq สำหรับ
แต่ละการติดตาม

Baseline Setting (การตั้งค่าพื้นฐาน)ช่วยให้คุณสามารถเลือกวิธีการลบค่าพืน้ ฐานสำหรับ
กลุ่มหลุมทีเ่ ลือกAnalysis Mode (โหมดการวิเคราะห์)ช่วยให้คุณสามารถทำการวิเคราะห์ข้อมูลตาม
สารเรืองแสงหรือตามเป้าหมาย

จำนวนรอบที่จะวิเคราะห์

ช่วยให้คุณสามารถเลือกรอบที่จะวิเคราะห์

Baseline Threshold (ขีดจำกัด

เปิดหน้าต่าง Baseline Threshold (ขีดจำกัด

พืน้ ฐาน)พืน้ ฐาน) เพื่อปรับค่าพื้นฐานหรือขีดจำกัด

Trace Styles (รูปแบบการติดตาม)เปิดหน้าต่าง Trace Styles (รูปแบบการติดตาม)Plate Setup (การตั้งค่าเพลต)เปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) เพือ่ ดูและแก้ไข
เพลต แทนทีเ่ พลตปัจจุบันด้วยเพลตหนึ่งจากไฟล์เพ
ลตที่ผใู้ ช้กำหนดหรือไฟล์เรียกใช้ PrimePCR

Include All Excluded Wells (รวมรวมหลุมที่ยกเว้นทัง้ หมดเข้าไปในการวิเคราะห์

หลุมที่ยกเว้นทัง้ หมด)
Mouse Highlighting (การไฮไลต์ด้วย

เปิดหรือปิดการไฮไลต์ขอ้ มูลพร้อมกันโดยใช้ตวั ชี้เมาส์)

เมาส์เคล็ดลับ: หากการไฮไลต์ด้วยเมาส์ปิดใช้งาน
อยู่ ให้กดปุ่ม Control (ควบคุม) เพื่อเปิดการ
ไฮไลต์ชั่วคราว

Restore Default Window Layout(เรียกคืนรูปแบบหน้าต่างเริ่มต้น)186 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEเรียกคืนค่าการจัดหน้าต่างให้เป็นค่าเริม่ ต้นหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)ตาราง 12 รายการแถบเมนูในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์สาร)ต่อ

รายการเมนู

Command (คำสั่ง)Function (ฟังก์ชน
ั )Export (ส่งออก)Export All Data Sheets (ส่งออกชุด

ช่วยให้คุณสามารถเลือกว่าจะส่งออกมุมมองสเปรด

ข้อมูลทัง้ หมด)ชีตทั้งหมดจากทุกแท็บเป็น .csv หรือ .txt Excelหรือไฟล์ .xml

Export RDML File (ส่งออกไฟล์

ช่วยให้คุณสามารถเลือกเวอร์ชัน 1.1 หรือ 1.0 ของ

RDML)

RDML เพือ่ ส่งออกไฟล์

Custom Export (การส่งออกทีก่ ำหนด

เปิดหน้าต่าง Custom Export (การส่งออกที่กำหนดเอง)เอง) ซึ่งจะมีการระบุขอบเขตข้อมูลทีจ่ ะส่งออกและ
สามารถระบุรูปแบบไฟล์ได้

Export to LIMS Folder (ส่งออกไปยัง

เปิดหน้าต่างเพื่อบันทึกสารในรูปแบบที่กำหนดไว้ล่ว

โฟลเดอร์ LIMS)

งหน้าไปยังโฟลเดอร์ LIMS

Manual Export (การส่งออกด้วย

เปิดหน้าต่างเพื่อระบุตำแหน่งที่จะบันทึกสารจาก

ตนเอง)

มุมมองสเปรดชีตทั้งหมดไปยังไฟล์ Excel ที่มี
โครงสร้างสำหรับการใช้งานโดย Seegene, Inc.
และ Bio-Rad Laboratories โดยเฉพาะ
เคล็ดลับ: คุณยังสามารถเริ่มเปิด Seegene
Viewer โดยอัตโนมัตเิ มื่อส่งออก ดูขอ
้ มูล
เพิม
่ เติมได้ทคี่ ำสั่งเมนูเครื่องมือ ในหน้า 65

Tools (เครือ่ งมือ)Reports (รายงาน)เปิดรายงานสำหรับไฟล์ขอ้ มูลนี้

Well Group Reports (รายงานกลุ่ม

เปิดหน้าต่าง Well Group Reports (รายงานกลุม
่

หลุม)

หลุม) เพื่อสร้างรายงานสำหรับกลุ่มหลุมทีร่ ะบุ

Import Fluorophore Calibration (นำเลือกไฟล์การปรับเทียบที่จะใช้กับไฟล์ขอ้ มูลปัจจุบัน

เข้าการสอบเทียบสารเรืองแสง)qbase+

เปิดใช้ qbase+ v2.5 โดยตรงจากไฟล์ .pcrd
ปัจจุบัน หากมีการติดตั้งไว้

สร้างไฟล์ LIMS PLRN

บันทึกไฟล์ขอ้ มูลเป็นไฟล์. plrn ในรูปแบบ LIMSคูม่ ือผูใ้ ช้ | 187บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลรายละเอียดแท็บ
แต่ละแท็บในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) จะแสดงข้อมูลในแผนภูมแิ ละสเปรดชีตสำหรับวิธีการ
วิเคราะห์เฉพาะ และมีตัวเลือกหลุมเพือ่ เลือกข้อมูลที่คณุ ต้องการแสดง เมื่อเปิดหน้าต่างขึน้ มา Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) จะแสดงแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) โดยค่าเริ่มต้น คุณสามารถใช้ข้อมูลกราฟ
Amplification (การเพิ่มปริมาณ) ในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) เพื่อพิจารณาการตั้งค่าการวิเคราะห์ที่
เหมาะสมสำหรับการดำเนินการทดสอบได้

หมายเหตุ: ซอฟต์แวร์จะเชื่อมโยงข้อมูลในบานหน้าต่างของแท็บ Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) แต่ละ
แท็บ ตัวอย่างเช่น หากไฮไลต์หลุมหนึง่ โดยวางตัวชี้เมาส์ไว้บนหลุมในมุมมองตัวเลือกหลุม ข้อมูลในทุกบาน
หน้าต่างอืน่ ๆ ก็จะไฮไลต์ไปด้วย

ตัวเลือกหมายเลขขัน
้ ตอน
เครือ
่ ง CFX Opus Dx System สามารถรับข้อมูลการเรืองแสงได้จากหลายขั้นตอนของโปรโตคอล ซอฟต์แวร์จะเก็บรั
กษาข้อมูลที่ได้มาในแต่ละขั้นตอนต่างหาก CFX Maestro Dx SE จะแสดงตัวเลือกหมายเลขขั้นตอนด้านล่างแผนภูมเิ
ส้นโค้งมาตรฐานบนแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) เมือ่ โปรโตคอลมีขั้นตอนการรวบรวมข้อมูลอย่างน้อยหนึ่ง
ขั้นตอน CFX Maestro Dx SE จะแสดงข้อมูลจากขัน้ ตอนการรวบรวมข้อมูลครัง้ แรกหากโปรโตคอลมีขนั้ ตอนการรวบรวมข้อมูลมากกว่าหนึ่งขั้นตอน คุณสามารถเลือกขั้นตอนอื่นจากรายการแบบเลือ่ นลงได้ ตัวอย่างเช่น

เมือ่ คุณเลือกขัน้ ตอน ซอฟต์แวร์จะใช้การเลือกดังกล่าวกับข้อมูลทั้งหมดที่แสดงในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)188 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)การดูกลุ่มหลุมในการวิเคราะห์ข้อมูล
หลุมในเพลตจะสามารถจัดกลุ่มเป็นกลุ่มย่อยสำหรับการวิเคราะห์โดยใช้กลุม่ หลุมได้อย่างอิสระ เมือ่ คุณสร้างกลุม่ หลุม
ชื่อของกลุ่มเหล่านีจ้ ะปรากฏในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) รายการแบบเลื่อนลง Well Groups(กลุม่ หลุม) บนแถบเครื่องมือ
หากคุณสร้างกลุม่ หลุม ซอฟต์แวร์จะแสดงค่ากลุ่มหลุมเริ่มต้น All Wells (ทุกหลุม) เมือ่ คุณเปิดหน้าต่าง Data Analysis(การวิเคราะห์ข้อมูล) เพื่อแสดงข้อมูลในหลุมทั้งหมดที่มสี ารในแผนภูมแิ ละสเปรดชีต เฉพาะหลุมในกลุม่ หลุมที่มกี ารบรรจุสารเท่านัน้ ทีจ่ ะปรากฏในตัวเลือกหลุม และเฉพาะข้อมูลสำหรับหลุมเหล่านั้นเท่านัน้ ที่จะรวมอยูใ่ นการคำนวณ
การวิเคราะห์ขอ้ มูลเคล็ดลับ: หากต้องการสร้าง แก้ไข และลบกลุ่มหลุม ให้คลิก Manage Well Groups (จัดการกลุ่มหลุม) ในแถบ
เครือ่ งมือ
หมายเหตุ: หากคุณไม่ได้สร้างกลุ่มหลุม รายการแบบเลื่อนลง Well Groups (กลุ่มหลุม) จะไม่ปรากฏในแถบ
เครือ่ งมือ

การเปลี่ยนสารในหลุมหลังจากทำการทดสอบ
ระหว่างทำการวิเคราะห์ขอ้ มูล การเปลี่ยนวิธกี ารแสดงข้อมูลโดยการเปลี่ยนสารในหลุมใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะไม่เปลีย่ นแปลงข้อมูลสารเรืองแสงที่เก็บไว้จากแต่ละหลุมในระหว่างการดำเนินการทดสอบ หลังจากที่
โมดูลรวบรวมข้อมูลสารเรืองแสงแล้ว คุณจะไม่สามารถลบข้อมูลเหล่านัน้ ได้ แต่คณุ สามารถเลือกที่จะลบข้อมูลออก
จากมุมมองและการวิเคราะห์ได้

วิธเี ปลีย่ นสารในหลุมหลังจากทำการทดสอบuในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ให้คลิก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) และเลือกหนึ่งตัวเลือก
ต่อไปนี้
n

Edit/View Plate (แก้ไข/ดูเพลต) — เปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ซึ่งคุณสามารถทำการเปลี่ยน
แปลงเค้าโครงได้ด้วยตนเอง

n

Replace Plate File (แทนทีไ่ ฟล์เพลต) — เปิดเบราว์เซอร์ Select Plate (เลือกเพลต) ซึง่ คุณสามารถไป
ยังไฟล์เพลตที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้านี้เพื่อแทนที่ดว้ ยรูปแบบเพลตปัจจุบัน

n

Apply PrimePCR File (นำไฟล์ PrimePCR ไปใช้) — เปิดกล่องโต้ตอบ Select PrimePCR File (เลือก
ไฟล์ PrimePCR) ซึง่ คุณสามารถค้นหาไฟล์ทดสอบ PrimePCR และนำไปใช้กบั รูปแบบเพลตได้

เคล็ดลับ: คุณสามารถเพิ่มหรือแก้ไขข้อมูลเกี่ยวกับสารในหลุมก่อนที่จะดำเนินการทดสอบ ระหว่างดำเนิน
การทดสอบ หรือหลังจากที่ดำเนินการทดสอบ PCR เสร็จสิน้ ได้ คุณต้องกำหนดโหมดการสแกนและขนาดของ
เพลตก่อนดำเนินการทดสอบ พารามิเตอร์เหล่านีไ้ ม่สามารถเปลีย่ นแปลงได้หลังจากที่ดำเนินการทดสอบ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 189บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลการตั้งค่าการวิเคราะห์ข้อมูล
ข้อมูลแผนภูมิ Amplification (การเพิ่มปริมาณ) ในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) แสดงหน่วยสารเรืองแสง
สัมพัทธ์ (RFU) สำหรับแต่ละหลุมในทุกรอบ การติดตามแต่ละครัง้ ในแผนภูมแิ สดงข้อมูลจากสารเรืองแสงเดีย่ วในหนึง่ หลุม ข้อมูลเหล่านี้ใช้ในการกำหนดค่า Cq สำหรับแต่ละหลุมต่อสารเรืองแสง ซอฟต์แวร์ใช้หนึง่ ในสองโหมด
เพื่อกำหนดค่า Cq ดังนี้
nRegression (การถดถอย) — ใช้โมเดลการถดถอยแบบหลายตัวแปรที่ไม่ใช่เชิงเส้นในการติดตามหลุมแต่ละ
หลุม และจากนัน้ ใช้โมเดลนีเ้ พื่อคำนวณค่า Cq ที่เหมาะสมที่สด
ุnSingle Threshold (ขีดจำกัดเดี่ยว) — ใช้ค่าขีดจำกัดเดี่ยวเพือ่ คำนวณค่า Cq ตามจุดตัดขีดจำกัดของการ
ติดตามสารเรืองแสงแต่ละตัว

เลือก Settings (การตั้งค่า) > Cq Determination Mode (โหมดการกำหนดค่า) เพื่อเลือกโหมดการกำหนดค่า Cq

การปรับขีดจำกัด
ในโหมด Single Threshold (ขีดจำกัดเดียว) คุณสามารถปรับขีดจำกัดสำหรับสารเรืองแสงได้โดยคลิกที่เส้นขีดจำกัด
ในแผนภูมกิ ารเพิม่ ปริมาณและเลื่อนตัวชี้เมาส์ในแนวตั้ง อีกวิธหี นึง่ คุณสามารถระบุขดี จำกัดการข้ามที่แน่นอนสำหรับ
สารเรืองแสงที่เลือกได้

การตัง้ ค่าพื้นฐาน
ซอฟต์แวร์จะกำหนดค่าพื้นฐานแต่ละรายการให้กับแต่ละหลุมโดยอัตโนมัติ การตั้งค่าพื้นฐานจะประเมินวิธกี ารลบค่า
พื้นฐานให้กบั การติดตามสารเรืองแสงทั้งหมด ซอฟต์แวร์จะให้ตัวเลือกการลบค่าพื้นฐานสามตัวเลือกดังนี้
n

No Baseline Subtraction (ไม่มกี ารลบค่าพื้นฐาน) — แสดงข้อมูลเป็นการติดตามสารเรืองแสงสัมพัทธ์
การวิเคราะห์บางส่วนไม่สามารถทำได้ในโหมดการวิเคราะห์นี้ ดังนัน้ ซอฟต์แวร์จะไม่แสดงแท็บ Gene
Expression (การแสดงออกของยีน), End Point (จุดสิน้ สุด) และ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)nBaseline Subtracted (ลบค่าพื้นฐาน) — แสดงข้อมูลเป็นการติดตามที่มีการลบค่าพื้นฐานให้กบั สารเรืองแสง
แต่ละรายการในหลุม ซอฟต์แวร์ตอ้ งมีการลบค่าพื้นฐานของข้อมูลเพื่อประเมินรอบการหาปริมาณ สร้างเส้นโค้ง
มาตรฐาน และประเมินความเข้มข้นของตัวอย่างที่ไม่รจู้ ัก ในการสร้างการติดตามที่มกี ารลบค่าพืน้ ฐานซอฟต์แวร์จะปรับเส้นตรงที่เหมาะสมที่สดุ ในข้อมูลสารเรืองแสงที่บนั ทึกไว้ของแต่ละหลุมในระหว่างรอบ
พื้นฐานแล้วลบข้อมูลที่เหมาะสมที่สดุ ออกจากข้อมูลทีม่ ีการลบเบือ้ งหลังในแต่ละรอบ

nการปรับเส้นโค้งที่มกี ารลบค่าพื้นฐาน — แสดงข้อมูลเป็นการติดตามที่มกี ารลบค่าพืน้ ฐาน และซอฟต์แวร์จะปรับ
เส้นโค้งที่มกี ารลบค่าพื้นฐานให้เรียบโดยใช้ตัวกรองค่าเฉลี่ยแบบแทนที่ตรงกลาง จะมีการดำเนินการกระบวน
การนีเ้ พื่อปล่อยให้ Cq แต่ละค่าเป็นค่าคงที่

นอกเหนือไปจากตัวเลือกเหล่านี้ คุณยังสามารถเลือก Apply Fluorescent Drift Correction (ใช้การแก้ไขการเบี่ยงเบน
ของสารเรืองแสง) ได้อกี ด้วย ในส่วนของหลุมที่มคี ่า RFU ทีเ่ บี่ยงเบนอย่างผิดปกติในระหว่างรอบการทดสอบช่วงต้น
ซอฟต์แวร์จะได้ค่าพื้นฐานโดยประมาณมาจากหลุมที่อยูต่ ิดกัน ซึ่งมีการสร้างค่าพื้นฐานในแนวนอนเสร็จสมบูรณ์
ไปแล้ว

190 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการตัง้ ค่าการวิเคราะห์ขอ้ มูลวิธเี ปลีย่ นการตั้งค่าการลบค่าพืน้ ฐานuเลือก Settings (การตั้งค่า) > Baseline Setting (การตั้งค่าพื้นฐาน)Analysis Mode (โหมดการวิเคราะห์)คุณสามารถจัดกลุ่มและวิเคราะห์ข้อมูลตามสารเรืองแสงหรือชื่อเป้าหมายได้ ในกรณีการจัดกลุ่มตามสารเรืองแสง จะมีการแสดงการติดตามข้อมูลตามสารเรืองแสงตามที่ระบุไว้ในการตั้งค่าเพลตสำหรับการทดสอบดังกล่าว ข้อมูลสารเรือง
แสงแต่ละรายการจะปรากฏในการเพิ่มปริมาณและแผนภูมเิ ส้นโค้งมาตรฐาน (ถ้ามี) หากมีการเลือกช่องทำเครือ่ งหมาย
ตัวเลือกสารเรืองแสงที่เหมาะสม ซึ่งอยู่ด้านล่างแผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ

ในกรณีการจัดกลุม่ ตามเป้าหมาย จะมีการแสดงการติดตามข้อมูลตามชือ่ เป้าหมายตามทีป่ ้อนไว้ในการตั้งค่าเพลต
สำหรับการทดสอบดังกล่าว

วิธเี ลือกโหมดการวิเคราะห์ขอ้ มูลuโปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือก Settings (การตั้งค่า) > Analysis Mode (โหมดการวิเคราะห์)nเลือกโหมดจากเมนูแบบเลื่อนลงของ Analysis Mode (โหมดการวิเคราะห์) ในแถบเครือ่ งมือ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 191บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลจำนวนรอบที่จะวิเคราะห์
คุณสามารถจำกัดจำนวนรอบที่จะทำการวิเคราะห์ได้ และคุณยังสามารถวิเคราะห์ข้อมูลจากชุดรอบที่กำหนดได้
อีกด้วย จำนวนรอบสูงสุดที่คุณสามารถทำการวิเคราะห์ได้คอ
ื 50 รอบ
หมายเหตุ: การลบรอบออกจากการเริ่มต้นการทดสอบอาจมีผลกระทบเป็นอย่างมากกับการกำหนดค่าพื้นฐาน

วิธจี ำกัดการวิเคราะห์ขอ้ มูลให้อยูท่ ี่ช่วงของรอบทีก่ ำหนด
1เลือก Settings (การตั้งค่า) > Cycles to Analyze (จำนวนรอบที่จะวิเคราะห์)กล่องโต้ตอบ Cycles to Analyze (จำนวนรอบที่จะวิเคราะห์) จะปรากฏขึ้น

2ป้อนค่าของรอบเริม่ ต้นและรอบสิน้ สุด แล้วคลิก OK (ตกลง)คลิก Restore Defaults (เรียกคืนค่าเริม่ ต้น) ในกล่องโต้ตอบ Cycles to Analyze (จำนวนรอบที่จะวิเคราะห์) เพือ่ ส่งกลับข้อมูลรอบที่แต่เดิมนัน้ ใช้กบั การวิเคราะห์

192 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEตัวเลือกหลุม

ตัวเลือกหลุม
ใช้ Well Selector (ตัวเลือกหลุม) เพื่อแสดงหรือซ่อนข้อมูลหลุมในแผนภูมหิ รือสเปรดชีตตลอดทั้งหน้าต่าง Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) สามารถเลือกได้เฉพาะหลุมที่มกี ารโหลดตัวอย่างเท่านัน้ ในตัวเลือกหลุม ซอฟต์แวร์จะ
ให้สก
ี บ
ั หลุมใน Well Selector (ตัวเลือกหลุม) ดังนี้
nBlue (สีนำ้ เงิน) — แสดงถึงหลุมที่เลือก ข้อมูลจากหลุมที่เลือกจะปรากฏในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)nLight gray (สีเทาอ่อน) — แสดงถึงหลุมที่ไม่ได้เลือก ข้อมูลจากหลุมที่ไม่ได้เลือกจะปรากฏในหน้าต่าง Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)n

Dark gray (สีเทาเข้ม) — แสดงถึงหลุมเปล่า

วิธแี สดงหรือซ่อนข้อมูลหลุมuในตัวเลือกหลุม ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการซ่อนหลุมหนึง่ หลุม ให้คลิกที่หลุมนั้น หากต้องการแสดงหลุมนั้น ให้คลิกทีห่ ลุมนัน้ อีกครัง้

nหากต้องการซ่อนหลุมหลายหลุม ให้ลากผ่านหลุมที่คุณต้องการเลือก หากต้องการแสดงหลุมเหล่านัน
้ให้ลากผ่านหลุมเหล่านั้นอีกครัง้

nคลิกที่มุมซ้ายบนของเพลตเพื่อซ่อนหลุมทั้งหมด คลิกที่มมุ ซ้ายบนอีกครั้งเพื่อแสดงหลุมทั้งหมด

nคลิกที่จุดเริม่ ต้นของคอลัมน์หรือแถวเพื่อซ่อนหลุม
เหล่านัน้ คลิกที่คอลัมน์หรือแถวอีกครั้งเพื่อแสดงหลุมเหล่านัน้คูม่ ือผูใ้ ช้ | 193บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลรายการเมนูคลิกขวาตัวเลือกหลุม
ตาราง 13 แสดงรายการตัวเลือกคลิกขวาที่มอี ยู่ในมุมมองตัวเลือกหลุม
ตาราง 13 รายการเมนูคลิกขวาในตัวเลือกหลุม

รายการ

Function (ฟังก์ชน
ั )Well XX (หลุม XX)แสดงเฉพาะหลุมนี้ นำหลุมนี้ออกจากมุมมอง กำหนดสีสำหรับหลุมนี้ หรือตัด
หลุมนี้ออกจากการวิเคราะห์

Selected Wells (หลุมทีเ่ ลือก) (คลิกแสดงเฉพาะหลุมเหล่านี้ นำหลุมเหล่านี้ออกจากมุมมอง กำหนดสีสำหรับหลุม

ขวาและลาก)เหล่านี้ หรือตัดหลุมเหล่านี้ออกจากการวิเคราะห์

Copy (คัดลอก)คัดลอกสารในหลุมลงในคลิปบอร์ด ซึ่งรวมถึงประเภทตัวอย่างและการทำซ้ำ #ทีเ่ ลือก

Copy as Image (คัดลอกเป็น

คัดลอกมุมมองตัวเลือกหลุมเป็นภาพ

รูปภาพ)Print (พิมพ์)พิมพ์มุมมองตัวเลือกหลุม

Print Selection (การเลือก

พิมพ์การเลือกปัจจุบัน

การพิมพ์)Export to Excel (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลไปยังสเปรดชีต Excel

Excel)
Export to CSV (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลเป็นเอกสาร .csv

CSV)
Export to Xml (ส่งออกไปยัง Xml)

ส่งออกข้อมูลเป็นเอกสาร .xml

ป้ายกำกับหลุม

เปลีย่ นป้ายกำกับหลุมให้เป็นประเภทตัวอย่าง ชื่อเป้าหมาย หรือชื่อตัวอย่าง

194 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEตัวเลือกหลุม

การแยกช่องออกจากการวิเคราะห์ชั่วคราว
วิธแี ยกช่องออกจากการวิเคราะห์ขอ้ มูลชั่วคราว
1คลิกขวาที่ช่องในตัวเลือกช่องในการติดตามสารเรืองแสง หรือที่จดุ ที่พล็อตบนเส้นโค้งมาตรฐาน เมือ่ ต้องการ
แยกช่องหลายช่อง คลิกขวาและลากเพือ่ เน้นหลายช่อง การติดตามหรือจุดต่าง ๆ

2จากเมนูคลิกขวา เลือกตัวเลือกที่เหมาะสม
n

Well (หลุม) > Exclude Well (แยกหลุม)n

Selected Wells (หลุมที่เลือก) > Exclude from Analysis (แยกออกจากการวิเคราะห์)n

Selected Traces (การติดตามที่เลือก) > Exclude these wells from Analysis (แยกหลุมเหล่านี้ออกจาก
การวิเคราะห์)หรือเมือ่ ต้องการแยกหลุมออกจากการวิเคราะห์ถาวร ให้ลา้ งสารจากหลุมใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) โดยคลิกที่ปุ่ม Clear Wells (ล้างหลุม)สำคัญ: คุณต้องป้อนสารในหลุมที่ถกู ล้างแล้วอีกครัง้

วิธรี วมหลุมที่แยกออกuคลิกขวาหลุมทีเ่ หมาะสมในตัวเลือกช่อง แล้วเลือก Well (ช่อง) > Include Well in Analysis (รวมหลุมในการ
วิเคราะห์)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 195บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลแผนภูมิ
แต่ละแผนภูมิในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) แสดงข้อมูลเป็นกราฟในรูปแบบอืน่ และมีตัวเลือก
สำหรับการปรับแก้และการส่งออกข้อมูลหรือกราฟิกแผนภูมิ

เครื่องมือแผนภูมิ
ตาราง 14 แสดงรายการตัวเลือกคลิกขวาที่มอี ยู่ในแผนภูมิสว่ นใหญ่
ตาราง 14 รายการเมนูคลิกขวาที่พบได้ทั่วไปในแผนภูมสิ ว่ นใหญ่

รายการ

ฟังก์ชัน

Copy (คัดลอก)คัดลอกแผนภูมิไปยังคลิปบอร์ด

Save Image As... (บันทึกรูปภาพ

บันทึกแผนภูมเิ ป็นไฟล์รูปภาพ ตั้งค่าความละเอียดและขนาดของรูปภาพ

เป็น...)

จากนัน้ เลือกประเภทไฟล์ (PNG, GIF, JPG, TIF หรือ BMP)

Page Setup... (ตั้งค่า

เลือกการตัง้ ค่าหน้ากระดาษสำหรับพิมพ์

หน้ากระดาษ...)Print... (พิมพ์...)พิมพ์แผนภูมิ

Set Scale to Default (ตั้งค่า

แสดงข้อมูลทั้งหมดในแผนภูมแิ ท่ง แถบเลื่อนจะปรากฏขึน้ หากมีจดุ ข้อมูล/การปรับขนาดไปที่ค่าเริ่มต้น)ตัวอย่างที่จะแสดงในกรอบแผนภูมมิ ากเกินไป

การตัง้ ค่าแผนภูมิ

เปิดกล่องโต้ตอบ Chart Settings (การตั้งค่าแผนภูมิ) ซึ่งคุณสามารถปรับ
เปลี่ยนตัวเลือกการแสดงผลของแผนภูมไิ ด้ดังนี้
n ชื่อของแผนภูมแิ ละแกน
n แบบอักษรและขนาดของแผนภูมิและแกน
n มาตราส่วนของแกน
n ตำแหน่งคำอธิบายสัญลักษณ์

เครือ่ งมือแผนภูมจิ ะปรากฏขึ้นมาในแต่ละแผนภูมใิ นหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) แผนภูมิจะแสดง
เครือ่ งมือต่อไปนี้:Copy to Clipboard (คัดลอกไปยังคลิปบอร์ด) — คัดลอกเนือ้ หาของมุมมองแผนภูมไิ ปยังคลิปบอร์ด
Chart Settings (การตั้งค่าแผนภูมิ) — เปิดกล่องโต้ตอบ Chart Settings (การตั้งค่าแผนภูมิ) ซึ่งคุณสามารถปรับ
เปลีย่ นตัวเลือกการแสดงผลของแผนภูมไ
ิ ด้
Export (ส่งออก) — เปิดกล่องโต้ตอบ Export Options (ตัวเลือกการส่งออก) ซึ่งคุณสามารถปรับเปลี่ยนความละเอียด
และขนาดของกราฟ และบันทึกลงในตำแหน่งที่ต้องการให้เป็นไฟล์ประเภทใดประเภทหนึง่ ต่อไปนี้
n.bmp

196 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิ

n

.jpg

n

.png

เครือ
่ งมือแผนภูมแิ ท่งนอกเหนือจากเครือ่ งมือแผนภูมิ แผนภูมิแท่งยังแสดงเครือ่ งมือต่อไปนีด
้ ้วย
Sort (จัดเรียง) — จัดเรียงเป้าหมายและตัวอย่างตามลำดับตัวอักษรก่อนหลังหรือในลำดับอักษรแบบเรียงย้อนกลับ
Color Settings (การตั้งค่าสี) — เปิดกล่องโต้ตอบ Color Settings (การตั้งค่าสี) ที่คณุ สามารถเปลีย่ นสีของเป้าหมาย
และตัวอย่าง
สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับเครือ่ งมือเหล่านี้ โปรดดูที่
การเปลี่ยนและการทำหมายเหตุประกอบมุมมองแผนภูมิ ในหน้า 254เครือ่ งมือแผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ
นอกเหนือจากรายการที่แสดงข้างต้น แผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณจะแสดงเครื่องมือต่อไปนี้
Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) — จะเปิดกล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ซึ่งคุณสามารถปรับ
เปลีย่ นลักษณะของการติดตามได้ในแผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ
Baseline Threshold (ขีดจำกัดพื้นฐาน) — จะเปิดกล่องโต้ตอบ Baseline Threshold (ขีดจำกัดพื้นฐาน) ที่คณ
ุสามารถปรับเปลี่ยนบรรทัดฐานเริม่ ต้นสำหรับหลุมทีเ่ ลือกหรือเปลี่ยนขีดจำกัดเส้นโค้งสารเรืองแสงแต่ละเส้นใน
แผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ

การคัดลอกข้อมูลแผนภูมิไปยังคลิปบอร์ด
คุณสามารถคัดลอกเนือ้ หาของมุมมองแผนภูมแิ ล้ววางในแอปพลิเคชันใด ๆ ที่ยอมรับไฟล์รปู ภาพ bitmapวิธคี ัดลอกข้อมูลแผนภูมิลงในคลิปบอร์ด
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้เลือกไอคอน Copy to Clipboard (คัดลอกไปยังคลิปบอร์ด)2เปิดแอปพลิเคชันที่ยอมรับไฟล์ bitmap เช่น Microsoft Word

3คลิกขวาแล้วเลือก Paste (วาง) เพื่อวางรูปภาพ bitmap จากคลิปบอร์ดลงในแอปพลิเคชัน

วิธเี ปลีย่ นแปลงการตั้งค่าการแสดงแผนภูมิ
ใช้กล่องโต้ตอบ Chart Setting (การตั้งค่าแผนภูมิ) เพื่อเปลีย่ นชื่อ รูปแบบและขนาดอักษร ขนาดแกน และตำแหน่ง
ของคำอธิบายสัญลักษณ์สำหรับแผนภูมทิ ี่แสดง การเปลี่ยนแปลงที่คณุ ทำมีผลกับแผนภูมทิ ี่แสดงเท่านัน้ และจะ
บันทึกไว้กบั แผนภูมดิ ังกล่าว

วิธเี ปลีย่ นการตั้งค่าการแสดงแผนภูมิ
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ คลิก Chart Setting (การตัง้ ค่าแผนภูมิ)กล่องโต้ตอบ Chart Setting (การตั้งค่าแผนภูมิ) จะปรากฏขึ้นมา

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 197บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

2

3

เลือกแท็บ Chart And Axes (แผนภูมแิ ละแกน) เพื่อทำสิง่ ต่อไปนี้
nพิมพ์ชื่อแผนภูมิ

nพิมพ์ชื่อใหม่สำหรับแกน x และปรับมุมป้ายกำกับ

nพิมพ์ชื่อใหม่สำหรับแกน yเลือกแท็บ Fonts (แบบอักษร) เพื่อเปลีย่ นรูปแบบและขนาดตัวอักษรของแผนภูมิ
เคล็ดลับ: ตามค่าเริม่ ต้น ขนาดตัวอักษรจะปรับอัตโนมัติตามการเปลี่ยนแปลงขนาดของแผนภูมิ เลือก
Change Font Size (เปลี่ยนแปลงขนาดตัวอักษร) สำหรับป้ายกำกับแต่ละประเภท

4

5เลือกแท็บ Axes Scale (ขนาดแกน) เพื่อทำสิง่ ต่อไปนี้
nล้างการปรับขนาดแกน x และ y โดยอัตโนมัติและระบุคา่ ขนาดต่ำสุดและสูงสุด

nเลือกแสดงเส้นตารางหรือทำเครือ่ งหมายบนกราฟ

เลือกแท็บ Legend (คำอธิบายสัญลักษณ์) เพื่อทำสิง่ ต่อไปนี้
nเลือกซ่อนคำอธิบายสัญลักษณ์ของแผนภูมิ

n

เปลีย
่ นตำแหน่งเริ่มต้นของคำอธิบายสัญลักษณ์ของแผนภูมิ

หมายเหตุ: หากคำอธิบายสัญลักษณ์อยูท่ างด้านซ้ายหรือขวาของแผนภูมิ คำอธิบายสัญลักษณ์จะแสดง
เฉพาะสารเรืองแสงสิบรายการแรกในแผนภูมเิ ท่านัน
้
6คลิก Apply (นำไปใช้) ได้ทุกเมือ่ เพื่อดูการเปลี่ยนแปลงการตั้งค่าแผนภูมโิ ดยไม่ต้องบันทึกไว้

7คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แผนภูมิ

198 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิ

การส่งออกแผนภูมิ
ใช้กล่องโต้ตอบนีเ้ พื่อปรับเปลีย่ นความกว้าง ความสูง และความละเอียดของกราฟเพื่อส่งออกกราฟในรูปแบบไฟล์ใด
ไฟล์หนึง่ ต่อไปนี้
n

.bmp

n

.jpg

n

.png

จากนัน้ คุณสามารถใช้กราฟที่สง่ ออกเพื่อแสดงผลลัพธ์ในเซสชันโปสเตอร์ การนำเสนอผ่าน Microsoft PowerPointและวารสารวิชาชีพได้
หมายเหตุ: เมือ่ ทำการปรับเปลีย่ นการตั้งค่า ควรพิจารณาสิง่ ต่อไปนี้
nnความกว้างสูงสุดและต่ำสุดและขีดจำกัดความสูงoที่ 72 dpi: 0.1–83 นิว้oที่ 96 dpi: 0.1–62 นิว้oที่ 150 dpi: 0.1–40 นิว้oที่ 300 dpi: 0.1–20 นิว้oที่ 600 dpi: 0.1–10 นิว้oที่ความละเอียดทั้งหมด: 2–6,000 พิกเซล

อัตราส่วนภาพขึน้ อยูก่ ับความกว้าง

วิธกี ารส่งออกแผนภูมิ
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้คลิก Export (ส่งออก)กล่องโต้ตอบ Export Preview (ภาพตัวอย่างส่งออก) จะปรากฏขึ้นมา

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 199บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

2

ปรับเปลีย่ นการตั้งค่าสำหรับการแสดงผลตามที่ตอ้ งการ

3คลิก Export (ส่งออก)4ในกล่องโต้ตอบ Export (ส่งออก) ให้ทำดังต่อไปนี้

5a(ไม่บังคับ) ไปที่โฟลเดอร์ที่จะบันทึกไฟล์แผนภูมิbพิมพ์ชื่อไฟล์และเลือกประเภทไฟล์จากรายการแบบเลื่อนลง

คลิก Save (บันทึก) เพือ่ บันทึกไฟล์แผนภูมิ

การปรับเปลี่ยนการตั้งค่าขีดจำกัดพื้นฐาน
ในโหมด Single Threshold (ขีดจำกัดเดียว) คุณสามารถปรับขีดจำกัดสำหรับสารเรืองแสงได้โดยคลิกที่เส้นขีดจำกัด
ในแผนภูมกิ ารเพิม่ ปริมาณและเลื่อนตัวชี้เมาส์ในแนวตั้ง อีกวิธหี นึง่ คุณสามารถระบุขดี จำกัดการข้ามที่แน่นอนสำหรับ
สารเรืองแสงที่เลือกได้
เคล็ดลับ: คุณสามารถระบุช่วงรอบเพื่อพิจารณาเกณฑ์พื้นฐานสำหรับไฟล์ขอ้ มูลทั้งหมดได้ในแท็บ Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ใน User (ผู้ใช้) > User Preferences (การกำหนดค่าของผูใ
้ ช้)

วิธป
ี รับรอบการเริม่ ต้นและสิน้ สุดพืน้ ฐานสำหรับแต่ละหลุม
1ในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) ให้เลือกสารเรืองแสงเดีย่ วภายใต้แผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ

2จากเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้เลือก Baseline Threshold (ขีดจำกัดพื้นฐาน)กล่องโต้ตอบ Baseline Threshold (ขีดจำกัดพื้นฐาน) จะปรากฏขึน
้

200 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิ

3

4

ในหัวข้อ Baseline Cycles (รอบพื้นฐาน) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการเลือกหนึง่ หลุม ให้คลิกที่หมายเลขแถวของหลุม

nหากต้องการเลือกหลุมที่อยูต่ ิดกันหลายหลุม ให้คลิกที่หมายเลขแถวของหลุมแรกและลากคลุมคอลัมน์ไปจน
ถึงหลุมสุดท้าย

nหากต้องการเลือกหลุมหลายหลุมที่ไม่ติดกัน ให้กดปุ่ม Control และคลิกที่หมายเลขแถวของแต่ละหลุม
เป้าหมาย

nหากต้องการเลือกหลุมทั้งหมด ให้คลิกมุมบนซ้ายบนตาราง

ปรับรอบเริม่ ต้นพืน้ ฐานและรอบสิน้ สุดพื้นฐานสำหรับหลุมที่เลือกทั้งหมด หรือเปลี่ยนหมายเลขรอบเริ่มต้นและสิน
้สุดที่ดา้ นล่างของสเปรดชีต
เคล็ดลับ: หากต้องการคืนการตั้งค่ากลับไปเป็นค่าที่บนั ทึกไว้ลา่ สุด ให้คลิก Reset All User Defined
Values (รีเซ็ตค่าที่กำหนดโดยผู้ใช้ทงั้ หมด)5คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แผนภูมิ

วิธรี ะบุชว่ งรอบสำหรับไฟล์ขอ้ มูลทัง้ หมดuในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) หรือ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ให้เลือก User (ผูใ้ ช้) > User Preferences(การกำหนดค่าของผู้ใช้) และเลือกแท็บ Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)จัดเรียงข้อมูลเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุ่มชีวภาพ
หมายเหตุ: ตัวเลือกนี้มใี ห้ใช้งานบนแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนเท่านั้น
ตามค่าเริ่มต้น รายการเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุม่ ทางชีวภาพจะปรากฏตามลำดับตัวอักษร ใช้กล่องโต้ตอบ Sort (จัดเรียง) เพื่อจัดเรียงหน้าจอตามลำดับอักษรแบบย้อนกลับ หรือเพื่อย้ายคำ ๆ หนึง่ ไปยังตำแหน่งอืน่ ในรายการด้วย
ตนเอง

วิธจ
ี ด
ั เรียงข้อมูลเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุม่ ชีวภาพ
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้คลิก Sort (จัดเรียง)กล่องโต้ตอบการจัดเรียงแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนจะปรากฏขึน้คูม่ ือผูใ้ ช้ | 201บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

2

ในกล่องโต้ตอบ คลิก Z-A เพื่อจัดเรียงรยการตามลำดับตัวอักษร

3หากต้องการย้ายลำดับคำด้วยตนเอง ให้เลือกคำแล้วคลิกปุม่ ที่เหมาะสมระหว่างแผนภูมดิ ังนี้

4nคลิกลูกศร Up (ขึน้ ) หรือ Down (ลง) เพื่อย้ายคำที่เลือกไปยังตำแหน่งหนึง่ ๆnคลิกลูกศรบนแถบ Up (ขึน้ ) หรือ Down (ลง) เพื่อย้ายคำที่เลือกไปยังตำแหน่งบนสุดหรือล่างสุดของรายชื่อ

คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)202 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิ

การเปลีย่ นแปลงการตั้งค่าเป้าหมายและสีตัวอย่าง
หมายเหตุ: ตัวเลือกนี้มใี ห้ใช้งานบนแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนเท่านั้น
ใช้กล่องโต้ตอบ Color Setting (การตั้งค่าสี) เพื่อเปลี่ยนสีของเป้าหมายหรือสีของตัวอย่าง หรือเพื่อลบรายการ
ออกจากกราฟ

วิธเี ปลีย่ นการตั้งค่าสี
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ คลิก Chart Setting (การตัง้ ค่าแผนภูมิ)กล่องโต้ตอบ Color Settings (การตั้งค่าสี) จะปรากฏขึ้น

2วิธเี ปลีย่ นสีหน้าจอสำหรับเป้าหมายหรือตัวอย่าง คลิกที่สขี องเป้าหมายหรือตัวอย่างในคอลัมน์ Color (สี)

3ในกล่องโต้ตอบ Color (สี) ที่ปรากฏขึน้ ให้เลือกสีใหม่ แล้วคลิก OK (ตกลง)4หากต้องการลบรายการออกจากกราฟการแสดงออกของยีน ให้ลา้ งช่องทำเครือ่ งหมายในคอลัมน์ Show Chart(แสดงแผนภูมิ)เคล็ดลับ: หากต้องการล้างรายการทั้งหมดออกจากกราฟการแสดงออกของยีน ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมาย
Show Chart (แสดงแผนภูมิ) ในส่วนหัวของคอลัมน์

5(ไม่บังคับ) โดยค่าเริม่ ต้นแล้ว สีแผนภูมแิ ท่งจะปรากฏในแบบไล่ระดับสี หากต้องการแสดงสีในแบบทึบ ให้เลือก
Use Solid Colors (ใช้สที ีบ )

6คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 203บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลการขยายพื้นที่ในแผนภูมิ
วิธกี ารขยายพื้นทีใ่ นแผนภูมิuคลิกและลากผ่านแผนภูมิแล้วคลิก Zoom (ซูม) ซอฟต์แวร์จะปรับขนาดแผนภูมแิ ละวางตำแหน่งพื้นที่ที่เลือกไว้
ตรงกลาง
หมายเหตุ: สำหรับแผนภูมิแท่ง คุณไม่จำเป็นต้องคลิกที่คำสัง่ Zoom pop-up (ป๊อปอัปซูม)วิธรี เี ซ็ตแผนภูมิเป็นมุมมองแบบเต็มuคลิกขวาที่แผนภูมแิ ละเลือก Set Scale to Default (ตัง้ ค่าการปรับขนาดไปที่คา่ เริม่ ต้น)

การคัดลอกแผนภูมิลงในไฟล์ Microsoft
คุณสามารถคัดลอกแผนภูมขิ ้อมูลลงในเอกสาร Microsoft Word, Excel หรือ PowerPoint ความละเอียดของรูปภาพ
จะเป็นไปตามความละเอียดของหน้าจออันเป็นที่มาของภาพดังกล่าว

วิธคี ัดลอกแผนภูมลิ งในไฟล์ Microsoft
1ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ให้คลิก Copy To Clipboard (คัดลอกไปยังคลิปบอร์ด) ที่มม
ุขวาบนของบานหน้าต่างแผนภูมิ

2เปิดไฟล์ Microsoft ทีย่ ังว่างเปล่า แล้ววางเนือ้ หาจากคลิปบอร์ด

รายการเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับแผนภูมิ
ตาราง 15 มีรายการเมนูคลิกขวาที่พร้อมให้ใช้งานบนแผนภูมิ บางรายการอาจมีแสดงในแผนภูมิทงั้ หมด รวมถึง
รายการที่เปลี่ยนวิธีการแสดงข้อมูล หรือส่งออกข้อมูลจากแผนภูมไิ ด้ง่าย
ตาราง 15 รายการเมนูคลิกขวาสำหรับแผนภูมิ

รายการ

ฟังก์ชน
ั

Copy (คัดลอก)คัดลอกแผนภูมลิ งในคลิปบอร์ด

Save Image Asบันทึกรูปภาพตามขนาด ความละเอียด และประเภทไฟล์ทรี่ ะบุ รวมถึงไฟล์ PNG (ค่าเริ่มต้น), JPG(บันทึกรูปภาพเป็

และ BMPน)Page Setup (ตั้งแสดงตัวเลือกการตัง้ ค่าการพิมพ์

ค่าหน้ากระดาษ)Print (พิมพ์)พิมพ์แผนภูมิ

204 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิ

รายการ

ฟังก์ชนั

Set Scale toกลับสู่แผนภูมิไปยังมุมมองเริ่มต้นหลังจากขยายแผนภูมิ

Default (ตั้งค่ากา
รปรับขนาดไปทีค่ ่าเริ่มต้น)Chart Optionsเปิดหน้าต่าง Chart Options (ตัวเลือกแผนภูมิ) เพื่อเปลี่ยนแผนภูมิ รวมถึงชือ่ เลือกขีดจำกัด

(ตัวเลือกแผนภูมิ)สำหรับแกน x และแกน y และแสดงเส้นตารางตลอดจนเครือ่ งหมายย่อยในแกน

หมายเหตุ: รายการเมนูที่นำไปใช้กบั แผนภูมทิ ี่เฉพาะเจาะจงมีรายละเอียดอธิบายอยูใ่ นบทที่ 11, รายละเอียดการวิเคราะห์ข้อมูล

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 205บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลสเปรดชีต
สเปรดชีตที่แสดงใน Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ประกอบด้วยตัวเลือกสำหรับการเรียงลำดับและการถ่าย
โอนข้อมูล จัดเรียงคอลัมน์ด้วยหนึง่ ในวิธตี ่อไปนี้
nคลิกและลากคอลัมน์ไปยังตำแหน่งใหม่ในตารางที่เลือก

nคลิกที่หัวคอลัมน์เพื่อเรียงลำดับข้อมูลตามลำดับจากน้อยไปมากหรือมากไปน้อย

วิธกี ารจัดเรียงข้อมูลสูงสุด 3 คอลัมน์ในหน้าต่าง Sort (เรียงลำดับ)1คลิกขวาที่สเปรดชีตและเลือก Sort (เรียงลำดับ)2ในกล่องโต้ตอบ Sort (เรียงลำดับ) ให้เลือกชื่อคอลัมน์แรกเพื่อทำการเรียงลำดับ เรียงลำดับข้อมูลตามลำดับจาก
น้อยไปมากหรือมากไปน้อย

3เลือกคอลัมน์ที่สองหรือสามเพื่อเรียงลำดับ และเลือก Ascending (จากน้อยไปมาก) หรือ Descending (จากมาก
ไปน้อย)4คลิก OK (ตกลง) เพือ่ เรียงลำดับข้อมูล หรือคลิก Cancel (ยกเลิก) เพื่อหยุดการเรียงลำดับ

เคล็ดลับ: ทำไฮไลต์ข้อมูลในแผนภูมทิ ี่เกีย่ วข้องและตัวเลือกหลุมโดยนำตัวชี้เมาส์ไปไว้บนเซลล์ คลิกในเซลล์
เพื่อคัดลอกและวางเนือ้ หาลงในโปรแกรมซอฟต์แวร์อน
ื่รายการเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับสเปรดชีต
ตาราง 16 แสดงรายการเมนูคลิกขวาที่มอี ยูใ่ นมุมมองสเปรดชีต
ตาราง 16 รายการเมนูคลิกขวาสำหรับสเปรดชีต

รายการ

ฟังก์ชน
ั

Copy (คัดลอก)คัดลอกสารในหลุมที่เลือกไปยังคลิปบอร์ด แล้ววางสารลงในสเปรดชีต เช่นExcel

Copy as Image (คัดลอกเป็น

คัดลอกมุมมองสเปรดชีตเป็นไฟล์รูปภาพและวางในไฟล์ที่รับไฟล์รูปภาพ

รูปภาพ)เช่น ไฟล์ขอ้ ความ ไฟล์รปู ภาพ หรือไฟล์สเปรดชีต

Print (พิมพ์)พิมพ์มุมมองปัจจุบัน

Print Selection (การเลือกการพิมพ์)พิมพ์การเลือกปัจจุบัน

Export to Excel (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลไปยังสเปรดชีต Excel

Excel)

206 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสเปรดชีต

ตาราง 16 รายการเมนูคลิกขวาสำหรับสเปรดชีตต่อ

รายการ

ฟังก์ชน
ั

Export to Text (ส่งออกไปยัง

ส่งออกข้อมูลไปยังโปรแกรมแก้ไขข้อความ

ข้อความ)Export to CSV (ส่งออกไปยัง CSV)ส่งออกข้อมูลไปยังไฟล์ .csv

Export to Xml (ส่งออกไปยัง Xml)

ส่งออกข้อมูลไปยังไฟล์ .xml

Export to Html (ส่งออกเป็น Html)ส่งออกข้อมูลไปยังไฟล์ .html

Find (ค้นหา)ค้นหาข้อความ

Sort (เรียงลำดับ)เรียงข้อมูลสูงสุด 3 คอลัมน์

Select Columns (เลือกคอลัมน์)เลือกคอลัมน์ที่จะแสดงในสเปรดชีต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 207บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

Export (ส่งออก)CFX Maestro Dx SE มีหลายตัวเลือกการส่งออกจากเมนูแบบเลื่อนลง Export (ส่งออก) ดังนี้
nExport All Data Sheets (ส่งออกชุดข้อมูลทัง้ หมด)nExport RDML Files (ส่งออกไฟล์ RDML)n

Custom Export (การส่งออกที่กำหนดเอง)nExport to LIMS Folder (ส่งออกไปยังโฟลเดอร์ LIMS)nManual Export (การส่งออกด้วยตนเอง)การส่งออกชุดข้อมูลทั้งหมด
คุณสามารถส่งออกมุมมองแผ่นงานทั้งหมดจากทุกแท็บของ CFX Maestro Dx SE ไปยังแต่ละไฟล์ได้

วิธสี ่งออกชุดข้อมูลทั้งหมดuเลือก Export (ส่งออก) > Export All Data Sheets (ส่งออกชุดข้อมูลทั้งหมด) และเลือกประเภทไฟล์ทคี่ ุณต้องการn

CSV (*.csv)

nText (*.txt)

nExcel Workbook (* .xlsx)
การวิเคราะห์ที่สง่ ออกจะถูกบันทึกไว้ในไฟล์ Excel Workbook หลายไฟล์โดยมีแท็บแผ่นงานข้อมูลการ
วิเคราะห์หนึง่ แท็บต่อไฟล์ เมือ่ การวิเคราะห์ประกอบด้วยสารเรืองแสงหลายชนิด ข้อมูลจากสารเรืองแสง
แต่ละตัวจะถูกส่งออกไปยังแท็บแผ่นงานแยกกัน

n

Excel Workbook - รวมกัน (* .xlsx)
การวิเคราะห์ที่สง่ ออกจะบันทึกลงในไฟล์ Excel Workbook ไฟล์เดียวที่มแี ท็บแผ่นงานหลายแท็บ แท็บหนึง่
สำหรับชุดข้อมูลการวิเคราะห์แต่ละชุด

n

Excel 97 - 2003 ( *.xls)
สำคัญ: คอมพิวเตอร์ของคุณต้องติดตั้ง Microsoft Excel เอาไว้เพื่อส่งออกข้อมูลไปยังสเปรดชีต
Microsoft Exceln

Xml (*.xml)

208 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Export (ส่งออก)การส่งออกไฟล์ RDML
RDML เป็นมาตรฐานข้อมูลที่มโี ครงสร้างและเป็นสากลสำหรับการแลกเปลีย่ นข้อมูลเชิงปริมาณของ PCR (qPCR)มาตรฐานข้อมูลเป็นไฟล์ข้อความในรูปแบบ Extensible Markup Language (.xml) โปรดดูทเี่ ว็บไซต์ International
RDML Consortium (www.rdml.org) สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับรูปแบบการแลกเปลีย่ นข้อมูล RDMLสำคัญ: ไฟล์ RDML ที่สง่ ออกจะมีข้อมูลวิเคราะห์พร้อมการตั้งค่าพื้นฐานที่คณุ ใช้ในหน้าต่างหน้าต่าง Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการตั้งค่าพื้นฐาน โปรดดูที่
การตั้งค่าพืน้ ฐาน ในหน้า 190หมายเหตุ: บันทึกไฟล์ RDML เป็นเวอร์ชัน 1.1 หากคุณใช้ซอฟต์แวร์ qbase+ เวอร์ชัน 2.3 หรือสูงกว่า

วิธสี ่งออกไฟล์ RDML
1เลือก Export (ส่งออก) > Export RDML Files (ส่งออกไฟล์ RDML) และเลือก RDML v1.1 หรือ RDML v1.0
จากรายการที่ปรากฏขึน
้กล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) จะปรากฏขึน
้

2ในกล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) ให้ระบุชื่อไฟล์และตำแหน่งที่จะบันทึกไฟล์ RDML

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกไฟล์สง่ ออกคูม่ ือผูใ้ ช้ | 209บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ้ มูลการสร้างไฟล์ส่งออกที่กำหนดเอง
วิธสี ร้างไฟล์ส่งออกทีก่ ำหนดเอง
1เลือก Export (ส่งออก) > Custom Export (ส่งออกแบบ
กำหนดเอง) กล่องโต้ตอบ Custom Export (ส่งออกแบบกำหนดเอง) จะปรากฏขึน
้

2เลือกรูปแบบการส่งออกจากรายการแบบเลื่อนลงที่แสดง

3เลือกช่องทำเครือ่ งหมายทีร่ ายการที่ต้องการส่งออก

4(ไม่บังคับ) คลิก Custom Export (ส่งออกแบบกำหนดเอง) เพื่อเปลี่ยนชื่อคอลัมน์

5คลิก Export (ส่งออก) กล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) จะปรากฏขึ้น

6ในกล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) ให้ระบุชื่อไฟล์และตำแหน่งที่จะบันทึกไฟล์ที่สง่ ออก

7คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกไฟล์สง่ ออก

210 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Export (ส่งออก)ส่งออกไปยังโฟลเดอร์ LIMS
คุณสามารถส่งออกข้อมูลในรูปแบบไฟล์ทใี่ ช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการสร้าง
การจัดการ และการใช้ไฟล์ LIMS โปรดดูทภี่ าคผนวก C, การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMSวิธสี ่งออกข้อมูลในรูปแบบ LIMS
1เลือก Export (ส่งออก) > Export to LIMS Folder (ส่งออกไปยังโฟลเดอร์ LIMS)
กล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) จะปรากฏขึน
้

2ในกล่องโต้ตอบ Save As (บันทึกเป็น) ให้ระบุชื่อไฟล์และตำแหน่งที่จะบันทึกไฟล์ที่สง่ ออก

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกไฟล์สง่ ออกการส่งออกข้อมูลที่จัดรูปแบบ Seegeneคุณสามารถส่งออกข้อมูลได้จากมุมมองแผ่นงานทั้งหมดไปยังไฟล์ Excel ที่มโี ครงสร้างสำหรับให้ Seegene, Inc. ใช้งานโดยเฉพาะ
เคล็ดลับ: คุณยังสามารถเริม่ เปิด Seegene Viewer โดยอัตโนมัติเมื่อการส่งออกเสร็จสิน้ ดูขอ้ มูลเพิ่มเติมได้ที่คำ
สัง่ เมนูเครือ่ งมือ ในหน้า 65วิธสี ่งออกสารในรูปแบบเฉพาะของ Seegene1เลือก Export > Manual Exportกล่องโต้ตอบ Browse For Folder (เรียกดูโฟลเดอร์) จะปรากฏขึน
้

2ในกล่องโต้ตอบ Browse For Folder (เรียกดูโฟลเดอร์) ให้ระบุตำแหน่งโฟลเดอร์ทจี่ ะบันทึกไฟล์ Excel (.xlsx)
รูปแบบของ Seegene ทีส่ ่งออก
การวิเคราะห์จะถูกส่งออกในไฟล์ Excel Workbook หลายไฟล์โดยมีแท็บแผ่นงานข้อมูลการวิเคราะห์หนึง่ แท็บต่อไฟล์

3คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกไฟล์สง่ ออกคูม่ ือผูใ้ ช้ | 211บทที่ 10 ภาพรวมการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

212 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ของ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ประกอบด้วย
แท็บต่าง ๆ เพื่อดูข้อมูล บทนีอ้ ธิบายแท็บเหล่านี้โดยละเอียด
เคล็ดลับ: คุณสามารถเลือกแท็บที่ต้องการดูได้ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) โดยใช้เมนู
View (มุมมอง) รูปแบบที่กำหนดเองจะบันทึกไปกับไฟล์ขอ
้ มูล

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 213บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)ใช้ข้อมูลในแท็บการหาปริมาณเพื่อตั้งเงื่อนไขการวิเคราะห์ขอ้ มูล รวมทั้งการตั้งค่าพื้นฐานสำหรับแต่ละหลุมและการ
ตั้งค่าขีดจำกัด แท็บ Quantification (การหาปริมาณ) จะแสดงข้อมูลในมุมมอง 4 มุมมองต่อไปนี้
n

Amplification Chart (แผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ) — แสดงหน่วยสารเรืองแสงสัมพัทธ์ (RFU) สำหรับแต่ละหลุมในทุก ๆ รอบ การติดตามแต่ละครั้งในแผนภูมแิ สดงข้อมูลจากสารเรืองแสงเดี่ยวในหนึง่ หลุมnStandard Curve (เส้นโค้งมาตรฐาน) — จะปรากฏขึน้ ก็ต่อเมือ่ การทดสอบได้รวมหลุมที่กำหนดให้เป็นมาตรฐาน
ประเภทตัวอย่าง (Std) เส้นโค้งมาตรฐานจะแสดงพล็อตรอบขีดจำกัดเทียบกับบันทึกของปริมาณเริม่ ต้นคำอธิบายสัญลักษณ์จะแสดงค่าประสิทธิภาพของปฏิกิรย
ิ า (E) สำหรับสารเรืองแสงแต่ละชนิดในหลุมทีม่ ีประเภทตัวอย่างมาตรฐาน

n

Well selector (ตัวเลือกหลุม) — เลือกหลุมที่มีขอ้ มูลสารเรืองแสงที่คณุ ต้องการแสดง

n

Spreadsheet (สเปรดชีต) — แสดงสเปรดชีตของข้อมูลที่เก็บรวบรวมในหลุมที่เลือก

ตัวเลือกสารเรืองแสง
หากต้องการแสดงข้อมูลสารเรืองแสงในแผนภูมแิ ละสเปรดชีตของแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) ให้เลือกสาร
เรืองแสงเป้าหมายใต้แผนภูมิ Amplification (การเพิ่มปริมาณ) หากต้องการซ่อนข้อมูลสารเรืองแสงในหน้าต่างการ
วิเคราะห์ข้อมูล ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมายนัน
้

214 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)กล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม)ในการใช้กล่องโต้ตอบลักษณะการติดตาม คุณสามารถปรับลักษณะของการติดตามในแผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณและ
Melt Curve ได้ในแท็บ Quantification (การเพิ่มปริมาณ) และแท็บ Melt Curve จากนัน้ คุณสามารถดูตัวอย่างการเป
ลี่ยนแปลงในตัวเลือกหลุมทีป่ รากฏในกล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ได้วิธกี ารปรับลักษณะการติดตาม
1เลือกสารเรืองแสงเพียงหนึง่ ชนิดภายใต้แผนภูมิ Amplification (การเพิม่ ปริมาณ)2หากต้องการเปิดกล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิก Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ในแผนภูมิ Amplification (การเพิม่ ปริมาณ)nเลือก Settings (การตั้งค่า) > Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ในแถบเมนู Data Analysis (การวิเคราะ
ห์ขอ้ มูล)nคลิกขวาที่การติดตามและเลือก Trace Styles (ลักษณะการติดตาม)กล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) จะปรากฏขึน้ มา

3ในกล่องโต้ตอบ Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) ให้เลือกชุดของหลุมที่เฉพาะเจาะจงในตัวเลือกหลุมในบาน
หน้าต่างด้านล่าง หรืออีกวิธหี นึง่ ให้เลือกหลุมที่มีประเภทตัวอย่างหนึง่ ประเภทอยูใ่ นเมนูแบบเลื่อนลงในคอลัมน์
Wells (หลุม)4ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการเลือกสีสำหรับหลุมทีเ่ ลือก ให้คลิกกล่องในคอลัมน์ Color (สี)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 215บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

หากต้องการกำหนดสัญลักษณ์ให้กบั หลุมที่เลือก ให้เลือกสัญลักษณ์จากรายการแบบเลือ่ นลง Symbol (สัญลักษณ์)nหากต้องการใส่สใี ห้กับหลุมอย่างรวดเร็วโดยใช้ปมุ่ ป้ายชื่อ ให้คลิกชุดด่วนที่เหมาะสม

n

o

สุม
่ ด้วยหลุมoสุม่ ด้วยการทำซ้ำ

o

ใช้สข
ี องสารเรืองแสง

o

ใช้สข
ี องเป้าหมาย

o

ใช้สข
ี องตัวอย่าง

หากต้องการกำหนดป้ายกำกับหลุม ให้เลือกระหว่างประเภทตัวอย่าง ชื่อเป้าหมาย ชื่อตัวอย่าง หรือสัญลักษ
ณ์ตัวเลือก Log Scale (ขนาดการบันทึก)เลือก Log Scale (ขนาดการบันทึก) ใต้แผนภูมิ Amplification (การเพิ่มปริมาณ) เพื่อดูการติดตามสารเรืองแสงในขน
าด semilogเคล็ดลับ: หากต้องการขยายพื้นที่ใด ๆ ของแผนภูมิ ให้ลากข้ามพืน้ ที่เป้าหมาย หากต้องการกลับไปยังมุมมองเต็ม
ให้คลิกขวาบนแผนภูมแิ ละเลือก Set Scale to Default (ตั้งค่าขนาดเป็นค่าเริ่มต้น)216 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)แผนภูมิเส้นโค้งมาตรฐาน
ซอฟต์แวร์จะสร้างแผนภูมิเส้นโค้งมาตรฐานในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) หากข้อมูลมีประเภทตัวอย่างที่
กำหนดเป็น Std สำหรับสารเรืองแสงอย่างน้อยหนึ่งชนิดในการทดสอบ

แผนภูมเิ ส้นโค้งมาตรฐานแสดงข้อมูลต่อไปนี้
nชื่อสำหรับเส้นโค้งแต่ละเส้น (สารเรืองแสงหรือเป้าหมาย)nสีสำหรับสารเรืองแสงหรือเป้าหมายแต่ละตัว

nค่าประสิทธิภาพของปฏิกริ ิยา (E) ใช้สถิตินใี้ นการเพิ่มประสิทธิภาพของปฏิกิรยิ าเชิงซ้อนและเพื่อทำให้ขอ้ มูลเส้น
โค้งมาตรฐานเท่ากัน
หมายเหตุ: ประสิทธิภาพของปฏิกริ ยิ าจะอธิบายว่าเป้าหมายของคุณมีการผลิตเท่าใดในแต่ละรอบใน
โปรโตคอล ประสิทธิภาพ 100% บ่งชี้วา่ คุณจะเพิ่มเป้าหมายเป็นสองเท่าในแต่ละรอบ

nค่าสัมประสิทธิ์ของการกำหนด R2 (เขียนเป็น R^2) ใช้สถิตินใี้ นการพิจารณาว่าเส้นกราฟอธิบายข้อมูลได้ถกู ต้อง
เพียงใด (ภาวะความพอดี)n

Slope (การไล่ระดับอุณหภูมิ)nจุดตัดแกน yคูม่ ือผูใ้ ช้ | 217บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลตัวเลือกเมนูแผนภูมิการเพิ่มปริมาณ
นอกเหนือไปจากตัวเลือกเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับแผนภูมแิ ล้ว (โปรดดูรายการเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับแผนภูมิ ในหน้า 204) ตาราง 17 จะแสดงตัวเลือกเมนูที่มอี ยู่ในแผนภูมิการเพิ่มปริมาณเท่านัน
้ตาราง 17 รายการเมนูคลิกขวาและซ้ายของแผนภูมกิ ารเพิ่มปริมาณ

ตัวเลือกเมนู

ฟังก์ชน
ัWell XX, Fluor Targetจะแสดงเพียงช่องนี้ ลบหลุมนีอ้ อกจากมุมมอง ตั้งค่าสีสำหรับการติดตามนี้ หรือยกเว้นหลุมนี้จากการวิเคราะห์

Selected Tracesจะแสดงเพียงช่องเหล่านี้ ลบช่องเหล่านี้ออกจากมุมมอง ตั้งค่าสีสำหรับการติดตาม

(การติดตามที่เลือก)เหล่านี้ หรือแยกช่องเหล่านี้ออกจากการวิเคราะห์

Show Threshold Valuesแสดงค่าขีดจำกัดสำหรับกราฟเส้นโค้งการเพิม่ ปริมาณแต่ละเส้นบนแผนภูมิ

(แสดงค่าขีดจำกัด)Trace Styles (รูปแบบการติด

เปิดหน้าต่าง Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) เพือ่ เปลีย่ นลักษณะการติดตามที่

ตาม)ปรากฏบนแท็บ Quantification (การเพิ่มปริมาณ) และแท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)Baseline Thresholdsจะเปิดหน้าต่าง Baseline Thresholds (ขีดจำกัดพื้นฐาน) เพือ่ เปลีย่ นพื้นฐานหรือ

(ขีดจำกัดพืน้ ฐาน)

ขีดจำกัดของสารเรืองแสงแต่ละชุด (การเปลีย่ นแปลงจะปรากฏในแผนภูมิ
Amplification (การเพิม่ ปริมาณ) ในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ))สเปรดชีตแท็บการหาปริมาณ
ตาราง 18 ระบุข้อมูลที่จะแสดงในสเปรดชีตในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)ตาราง 18 เนือ้ หาสเปรดชีตในแท็บการหาปริมาณ

ข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งหลุมในเพลต

สารเรืองแสง

สารเรืองแสงที่ตรวจจับได้

เป้าหมาย

ชือ่ เป้าหมายทีโ่ หลดในหลุม Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)สารทีบ่ รรจุ

การรวมกันของประเภทตัวอย่าง (จำเป็น) และการทำซ้ำ # (ไม่บังคับ) ที่โหลด
ไว้ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)ตัวอย่าง

ชือ่ ตัวอย่างที่บรรจุในหลุม Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)Cq

รอบการหาปริมาณสำหรับแต่ละการติดตาม

218 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)การเปลีย่ นเป้าหมาย เนื้อหา หรือข้อมูลตัวอย่าง
คุณสามารถเปลี่ยนข้อมูลในคอลัมน์ Target (เป้าหมาย) Content (เนือ้ หา) และ Sample (ตัวอย่าง) ได้โดยแก้ไขไฟล์
เพลตโดยใช้ Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) แม้ว่าคุณจะเรียกใช้การทดสอบไปแล้วก็ตาม

วิธเี ปลีย่ นข้อมูลในคอลัมน์ Content (สาร), Target (เป้าหมาย) และ Sample (ตัวอย่าง)uคลิก Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) และเลือก View/Edit Plate (ดู/แก้ไขเพลต) เพื่อเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไข
เพลต)

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 219

บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ)แท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ) จะแสดงข้อมูลการหาปริมาณที่รวบรวมได้ในแต่ละหลุม CFX
Maestro Dx SE แสดงข้อมูลในมุมมองสเปรดชีตที่แตกต่างกันสีม
่ ม
ุ มอง
n

Results (ผลการทดสอบ) — แสดงสเปรดชีตของข้อมูล ซึง่ เป็นมุมมองเริม
่ ต้น

n

Standard Curve Results (ผลลัพธ์เส้นโค้งมาตรฐาน) — แสดงสเปรดชีตของข้อมูลเส้นโค้งมาตรฐาน

nPlate (เพลต) — แสดงข้อมูลในแต่ละหลุมโดยเป็นแผนที่เพลต

n

RFU — แสดงปริมาณ RFU ในแต่ละหลุมสำหรับแต่ละรอบ

เลือกแต่ละสเปรดชีตจากรายการแบบเลื่อนลงที่ปรากฏใต้แท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ)สเปรดชีตผลการทดสอบ
สเปรดชีตผลการทดสอบจะแสดงข้อมูลแต่ละหลุมในเพลต

หมายเหตุ: การคำนวณ Std. Dev (ส่วนเบีย่ งเบนมาตรฐาน) ทั้งหมดใช้กบั กลุม่ การทำซ้ำที่กำหนดในหลุมใน
หน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) การคำนวณจะเฉลี่ยค่า Cq สำหรับแต่ละหลุมในกลุม่ การทำซ้ำ
ตาราง 19 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีตผลการทดสอบ
ตาราง 19 เนือ้ หาในสเปรดชีตผลการทดสอบ

ข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งหลุมในเพลต

สารเรืองแสง

สารเรืองแสงทีต่ รวจจับได้

เป้าหมาย

ชื่อเป้าหมายการเพิม่ ปริมาณ (ยีน)

220 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ)ตาราง 19 เนือ้ หาในสเปรดชีตผลการทดสอบต่อ

ข้อมูล

คำอธิบาย

สารทีบ่ รรจุ

ประเภทตัวอย่างและการทำซ้ำ #ตัวอย่าง

คำอธิบายตัวอย่าง

ชื่อชุดชีวภาพ

ชื่อของชุดชีวภาพ

Cq

รอบการหาปริมาณ

ค่าเฉลี่ย Cq

ค่าเฉลี่ยของรอบการหาปริมาณของกลุ่มการทำซ้ำ

Cq Std. Dev

ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของรอบการหาปริมาณสำหรับกลุม่ การทำซ้ำ

ปริมาณเริ่มต้น (SQ)การปริมาณเริม่ ต้นของเป้าหมายโดยประมาณ

บันทึกปริมาณเริ่มต้น

บันทึกของปริมาณเริม่ ต้นค่าเฉลี่ย SQค่าเฉลี่ยของปริมาณเริ่มต้น

SQ Std. Dev

ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณเริ่มต้นในทุกการทำซ้ำ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 221บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลสเปรดชีตผลลัพธ์กราฟเส้นโค้งมาตรฐาน
สเปรดชีตผลลัพธ์กราฟเส้นโค้งมาตรฐานแสดงพารามิเตอร์กราฟเส้นโค้งมาตรฐานที่คำนวณได้

ตาราง 20 แสดงข้อมูลที่ปรากฏในสเปรดชีตผลลัพธ์กราฟเส้นโค้งมาตรฐาน
ตาราง 20 เนือ้ หาสเปรดชีตผลลัพธ์กราฟเส้นโค้งมาตรฐาน

ข้อมูล

คำอธิบาย

Fluor (หรือ Target)สารเรืองแสง (หรือเป้าหมาย) ทีต่ รวจพบ

Efficiency (%)ประสิทธิภาพสัมพัทธ์

Slope (การไล่ระดับอุณหภูมิ)การไล่ระดับอุณหภูมิของกราฟเส้นโค้งมาตรฐาน

Y-interceptจุดที่กราฟเส้นโค้งตัดกับแกน yR^2สัมประสิทธิ์ในการคำนวณ

222 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Quantification Data (ข้อมูลการหาปริมาณ)สเปรดชีตเพลต
สเปรดชีตเพลตจะแสดงแผนที่เพลตของข้อมูลสำหรับสารเรืองแสงหนึง่ ชุดในเวลาหนึ่ง

วิธด
ี ข
ู ้อมูลสารเรืองแสงทีต่ ้องการuคลิกที่แท็บของสารเรืองแสงที่ด้านล่างของสเปรดชีต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 223บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลสเปรดชีต RFU
สเปรดชีต RFU จะแสดงหน่วยสารเรืองแสงสัมพัทธ์ (RFU) ที่อา่ นสำหรับแต่ละช่องทีไ่ ด้รับในแต่ละรอบของการ
ทดสอบ หมายเลขช่องจะปรากฏทีด่ ้านบนของแต่ละคอลัมน์และหมายเลขรอบจะปรากฏที่ด้านซ้ายของแต่ละแถว

224 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)แท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)สำหรับสารเรืองแสงชนิดจับกับดีเอ็นสายคู่ และไฮบริไดเซชันโพรบที่ตัดไม่ได้ สารเรืองแสงจะมีความสว่างที่สดุ เมือ
่ดีเอ็นเอสองสายจับกัน ดังนัน้ ขณะที่อณุ หภูมเิ พิม่ ขึน้ ไปจนถึงอุณหภูมทิ ี่ใช้แยกสายคู่ (Tm) สารเรืองแสงจะลดลงใน
อัตราคงที่ (ความลาดชันคงที่) ที่ T m มีการลดลงของสารเรืองแสงอย่างมากพร้อมกับการเปลีย่ นแปลงของความลาด
ชันที่สงั เกตได้ อัตราการเปลี่ยนแปลงนีจ้ ะกำหนดโดยการพล็อตรีเกรสชันแรกของสารเรืองแสงที่มคี า่ เป็นลบเทียบกับ
อุณหภูมิ (-d(RFU)/dT) อัตราการเปลี่ยนแปลงที่มากที่สดุ ในผลการทดสอบสารเรืองแสงใน Peaks ที่มองเห็นและ
แสดงถึง Tm ของโครงสร้างเชิงซ้อนของดีเอ็นเอเกลียวคู่
CFX Maestro Dx SE จะพล็อตข้อมูล RFU ที่เก็บรวบรวมระหว่างทำกราฟการสลายดีเอ็นเอในฐานะที่เป็นฟังก์ชัน
ของอุณหภูมิ หากต้องการวิเคราะห์ขอ้ มูล Melt Peak ซอฟต์แวร์จะกำหนดอุณหภูมเิ ริม่ ต้นและอุณหภูมสิ นิ้ สุดของจุด
สูงสุดแต่ละจุดโดยการเลื่อนแถบขีดจำกัด พืน้ ของพื้นที่จดุ สูงสุดระบุด้วยตำแหน่งของแถบขีดจำกัดอุณหภูมทิ ี่ใช้แยก
สายคู่ จุดสูงสุดที่ถูกต้องจะต้องมีความสูงต่ำสุดเมือ่ เทียบกับระยะห่างระหว่างแถบขีดจำกัดและความสูงของจุดที่สงู ที่สุ
ดแท็บ Melt Curve จะแสดง Tm (อุณหภูมิทใี่ ช้แยกสายคู่) ของผลิตภัณฑ์ PCR ที่เพิ่มปริมาณขึน้ ใน 4 มุมมอง
nMelt Curve — แสดงข้อมูลแบบเรียลไทม์สำหรับแต่ละสารเรืองแสง เป็น RFU ต่ออุณหภูมสิ ำหรับแต่ละหลุม

nMelt Peak — แสดงรีเกรสชันที่มคี ่าเป็นลบของข้อมูล RFU ต่ออุณหภูมิสำหรับแต่ละหลุม

n

Well selector — แสดงหลุมเพือ่ แสดงหรือซ่อนข้อมูล

nสเปรดชีต Peak — แสดงข้อมูลที่เก็บรวบรวมในหลุมทีเ่ ลือกหมายเหตุ: สเปรดชีตนีแ้ สดงจุดสูงสุดได้มากที่สด
ุ 2 จุดสำหรับแต่ละการติดตาม หากต้องการดูจดุ สูงสุดเพิ่ม
เติม ให้คลิกแท็บ Melt Curve Data (ข้อมูลกราฟการสลายดีเอ็นเอ)ตาราง 21 จะแสดงข้อมูลที่ปรากฏในสเปรดชีต Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 225บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลตาราง 21 เนือ้ หาในสเปรดชีต Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)ข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งหลุมในเพลต

สารเรืองแสง

สารเรืองแสงทีต่ รวจจับได้

สารการรวมกันของประเภทตัวอย่างและจำนวนการทำซ้ำ

ตัวอย่าง

ชื่อของตัวอย่างทีโ่ หลดลงในตัวแก้ไขเพลต

อุณหภูมทิ ี่อุณหภูมขิ อง Melt Peak สำหรับแต่ละหลุม

แยกสายคู่

หมายเหตุ: เฉพาะจุดทีส่ ูงที่สดุ เพียง 2 จุดเท่านั้นที่จะปรากฏในสเปรดชีตนี้

226 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)การปรับข้อมูล Melt Curveวิธปี รับข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)uทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nคลิกและลากแถบขีดจำกัดในแผนภูมิ Melt Peak เพื่อรวมหรือไม่รวมค่าจุดสูงสุดในการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

เลือก Positive (ค่าเป็นบวก) ในเมนูแบบเลื่อนลง Peaks (ค่าจุดสูงสุด) เพื่อแสดงข้อมูลสเปรดชีตสำหรับค่า
จุดสูงสุดที่อยู่เหนือเส้นขีดจำกัดอุณหภูมทิ ี่แยกสายคู่ หรือเลือก Negative (ค่าเป็นลบ) เพือ่ ดูข้อมูลสเปรดชีต
สำหรับค่าจุดสูงสุดที่อยูใ่ ต้เส้นขีดจำกัดอุณหภูมิที่แยกสายคู่

nเปิดหน้าต่าง Trace Styles (ลักษณะการติดตาม) เพื่อเปลีย่ นสีของการติดตามในแผนภูมิ Melt Curve(กราฟการสลายดีเอ็นเอ) และ Melt Peaknเลือกหมายเลขใน Step Number Selector (ตัวเลือกหมายเลขขัน้ ตอน) เพื่อดูขอ้ มูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ) ที่ขนั้ ตอนอืน่ ในโปรโตคอล รายการจะแสดงขั้นตอนมากกว่าหนึง่ ขัน้ ตอน หากโปรโตคอลรวมการอ่านค่าเพลตในขั้นตอน Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ) มากกว่าหนึง่ ขัน
้ ตอน

n

เลือกหลุมในตัวเลือกหลุมเพื่อเน้นดูสว่ นย่อยของข้อมูล

nเลือกกลุ่มหลุมเพื่อดูและวิเคราะห์สว่ นย่อยของหลุมในเพลต เลือกกลุ่มหลุมแต่ละกลุ่มด้วยชื่อในเมนูแบบ
เลื่อนลง Well Group (กลุ่มหลุม) ในแถบเครื่องมือ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 227บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)แท็บ Melt Curve Data (ข้อมูลกราฟการสลายดีเอ็นเอ) แสดงข้อมูลจากแท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)ในสเปรดชีตหลายรายการทีร่ วม Melt Peak ทั้งหมดสำหรับแต่ละการติดตาม CFX Maestro Dx SE มีตัวเลือก
สเปรดชีตสี่แบบเพือ่ ดูข้อมูลกราฟการสลายดีเอ็นเอ
nMelt Peaks — แสดงข้อมูลทั้งหมด รวมถึง Melt Peak ทั้งหมดสำหรับแต่ละการติดตาม ซึ่งเป็นมุมมองเริม
่ ต้น

n

Plate (เพลต) — แสดงมุมมองของข้อมูลและสารของแต่ละหลุมในเพลต

n

RFU — แสดงปริมาณ RFU ที่อณุ หภูมิแต่ละสำหรับแต่ละหลุม

n-d(RFU)/dT — แสดงอัตราการเปลีย่ นแปลงที่เป็นลบใน RFU เมือ่ อุณหภูมิ (T) เปลี่ยนแปลง โดยเป็นพล็อต
รีเกรสชันแรกสำหรับแต่ละหลุมในเพลต

เลือกแต่ละสเปรดชีตจากรายการแบบเลื่อนลงที่อยู่ใต้แท็บข้อมูล Melt Curveสเปรดชีต Melt Peakสเปรดชีต Melt Peak แสดงข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ) ทั้งหมด

ตาราง 22 ในหน้า 229 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีต Melt Peak228 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)ตาราง 22 เนือ้ หาในสเปรดชีต Melt Peakข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งหลุมในเพลต

สารเรืองแสง

สารเรืองแสงทีต่ รวจจับได้

สารประเภทสารตัวอย่างได้ทำรายการไว้ในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไข
เพลต)เป้าหมาย

เป้าหมายในการเพิ่มปริมาณ (ยีน)ตัวอย่าง

ชื่อสารตัวอย่างได้ทำรายการไว้ในหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)อุณหภูมหิ ลอมละลาย

อุณหภูมหิ ลอมละลายของสารแต่ละประเภท ได้ถูกทำรายการไว้เป็นหนึ่งพีค
(สูงสุด) ต่อแถวในสเปรดชีต

ความสูงของพีค (Peak Height)ความสูงของพีค

อุณหภูมเิ ริ่มต้น

อุณหภูมเิ ริ่มต้นของพีค

อุณหภูมสิ ิ้นสุด

อุณหภูมสิ ิ้นสุดของพีค

สเปรดชีตชีตเพลต
สเปรดชีตเพลตแสดงข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ) ในรูปแบบเพลต

หมายเหตุ: หากต้องการปรับพีคตามความต้องการของซอฟต์แวร์ ให้ปรับเส้นเกณฑ์ในแผนภูมิ Melt Peak ที่แท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)ตาราง 23 ในหน้า 230 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีตเพลต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 229

บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลตาราง 23 เนือ้ หาในสเปรดชีตเพลต

ข้อมูล

คำอธิบาย

สารการรวมประเภทตัวอย่าง (จำเป็น) และการทำซ้ำ # (ไม่จำเป็น)ตัวอย่าง

คำอธิบายตัวอย่าง

Peak 1

Melt Peak อันดับหนึ่ง (สูงสุด)Peak 2Melt Peak อันดับสอง (ต่ำกว่า)สเปรดชีต RFU
สเปรดชีต RFU แสดงการเรืองแสงสำหรับแต่ละหลุมในแต่ละรอบทีไ่ ด้รับในช่วงการทำ Melt Curve (กราฟการสลาย
ดีเอ็นเอ)ตาราง 24 กำหนดข้อมูลที่จะแสดงในสเปรดชีต RFU
ตาราง 24 เนือ้ หาในสเปรดชีต RFU

ข้อมูล

คำอธิบาย

หมายเลขหลุม (A1, A2, A3, A4, A5)ตำแหน่งของหลุมในเพลตสำหรับหลุมทีโ่ หลดอุณหภูมิ

อุณหภูมหิ ลอมละลายของเป้าหมายที่เพิม่ ปริมาณขึน
้โดยพล็อตเป็นหนึ่งหลุมต่อหนึ่งแถว และหลายหลุม
สำหรับหลายผลิตภัณฑ์ในหลุมเดียวกัน

230 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บข้อมูล Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)สเปรดชีต -d(RFU)/dTสเปรดชีต -d(RFU)/dT แสดงอัตราการเปลี่ยนแปลงที่เป็นลบใน RFU เมือ่ อุณหภูมิ (T) เปลีย่ นแปลง

ตาราง 25 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีต -d(RFU)/dTตาราง 25 เนือ้ หาในสเปรดชีต -d(RFU)/dTข้อมูล

คำอธิบาย

หมายเลขหลุม (A1, A2, A3, A4, A5)ตำแหน่งของหลุมในเพลตสำหรับหลุมที่โหลด

-d(RFU)/dT อุณหภูมิ

อัตราการเปลีย่ นแปลงที่เป็นลบใน RFU เมื่ออุณหภูมิ (T)เปลี่ยนแปลง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 231บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บจุดสิน้ สุดเปิดแท็บ End Point (จุดสิน้ สุด) เพื่อวิเคราะห์หน่วยสารเรืองแสงสัมพัทธ์สดุ ท้าย (RFU) สำหรับหลุมตัวอย่าง ซอฟต์
แวร์จะเปรียบเทียบระดับ RFU สำหรับหลุมที่มตี ัวอย่างที่ไม่ทราบทีม่ ากับระดับ RFU สำหรับหลุมที่มตี ัวอย่างควบคุม
ผลลบ และ "บอกค่า" ตัวอย่างที่ไม่ทราบที่มาว่าเป็นบวกหรือลบ ตัวอย่างที่เป็นบวกมีคา่ RFU ที่มากกว่าค่า RFU เฉลีย
่ของตัวอย่างควบคุมผลลบบวกด้วยค่า Cut Offในการวิเคราะห์ข้อมูลจุดสิน้ สุด เพลตจะต้องมีตัวอย่างควบคุมผลลบ ไม่เช่นนั้นซอฟต์แวร์จะไม่สามารถบอกค่าได้
nทดสอบโปรโตคอล Quantification (การหาปริมาณ) — ตั้งค่าโปรโตคอลมาตรฐาน หลังจากเสร็จสิน้ การทดสอบ
ให้เปิดหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ปรับการตั้งค่าการวิเคราะห์ข้อมูลในแท็บ Quantification(การหาปริมาณ) แล้วคลิกแท็บ End Point (จุดสิน้ สุด) เพื่อเลือกรอบจุดสิน
้ สุด

n

เรียกใช้โปรโตคอล End Point Only (จุดสิน้ สุดเท่านั้น) โหลดโปรโตคอล End Point Only (จุดสิน้ สุดเท่านัน้ ) ใน
แท็บ Plate (เพลต) ของหน้าต่าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) เลือกหรือสร้างเพลต และเริม่ ทำการทดสอบ

แท็บ End Point (จุดสิน้ สุด) แสดงค่า RFU โดยเฉลี่ยเพื่อประเมินว่าเป้าหมายมีการเพิ่มปริมาณจากรอบล่าสุด (สิ้นสุด)หรือไม่ ใช้ขอ้ มูลเหล่านีเ้ พื่อพิจารณาว่ามีลำดับเป้าหมายเฉพาะ (บวก) ในตัวอย่างหรือไม่ เป้าหมายที่เป็นบวกมีคา่
RFU สูงกว่าระดับ Cut Off ที่คณุ กำหนด
เคล็ดลับ: หากต้องการสร้างโปรโตคอลจุดสิน้ สุด ให้เปิดแท็บ Protocol (โปรโตคอล) (หน้าต่าง Run Setup(ตั้งค่าการทดสอบ)) แล้วเลือก Run (การทดสอบ) > End Point Only Run (การทดสอบที่จดุ สิน้ สุดเท่านัน
้ )232 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บจุดสิน
้ สุด

เมือ
่ การดำเนินการเสร็จสิน้ ไฟล์ขอ้ มูลจะเปิดขึน้ ที่แท็บ End Point (จุดสิน้ สุด) ซึง่ ประกอบด้วยหัวข้อต่าง ๆ ต่อไปนี้
n

Settings (การตั้งค่า) — ปรับการตั้งค่าการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

Results (ผลลัพธ์) — แสดงผลลัพธ์ทันทีหลังจากที่คุณปรับการตั้งค่า

n

Well Selector (ตัวเลือกหลุม) — เลือกหลุมที่มขี ้อมูลจุดสิน้ สุดที่คณุ ต้องการแสดงn

RFU spreadsheet (สเปรดชีต RFU) — แสดง RFU สิน้ สุดทีร่ วบรวมไว้ในหลุมที่เลือก

Results Data (ข้อมูลผลลัพธ์)ส่วน Results (ผลลัพธ์) จะแสดงข้อมูลต่อไปนี้
nค่า Lowest RFU (RFU ต่ำสุด) — ค่า RFU ต่ำสุดในข้อมูล

nค่า Highest RFU (RFU สูงสุด) — ค่า RFU สูงสุดในข้อมูล

n

Negative Control Average (ค่าเฉลีย่ ตัวอย่างควบคุมผลลบ) — ค่า RFU เฉลี่ยสำหรับหลุมที่มีตัวอย่างควบคุมผลลบn

Cut Off Value (ค่า Cut Off) — คำนวณโดยการเพิ่มความคลาดเคลือ
่ น (ค่า RFU หรือ Percentage of Range(ค่าร้อยละของช่วง) ที่แสดงใน Settings (การตั้งค่า)) และค่าเฉลี่ยของตัวอย่างควบคุมผลลบ ตัวอย่างที่มี RFU ที่มากกว่าค่า Cut Off จะเรียกว่า "Positive" (ผลบวก) หากต้องการปรับค่า Cut Off ให้เปลี่ยน RFU หรือค่าร้อยละ
ของช่วง

ค่า Cut Off จะคำนวณโดยใช้สตู รนี้:Cut Off Value (ค่า Cut Off) = Negative Control Average (ค่าเฉลี่ยตัวอย่างควบคุมผลลบ) + Tolerance(ความคลาดเคลื่อน)เลือกความคลาดเคลือ่ นโดยใช้หนึง่ ในวิธกี ารเหล่านี้
n

RFUs (ค่าเริ่มต้น) — เลือกวิธนี เี้ พื่อใช้ค่า RFU สัมบูรณ์สำหรับความคลาดเคลื่อน ค่าความคลาดเคลื่อนของค่า
RFU ต่ำสุด คือ 2 ค่าสูงสุดคือค่าสัมบูรณ์ของค่า RFU สูงสุดทีล่ บด้วยค่าสัมบูรณ์ของค่า RFU ต่ำสุด ค่าความ
คลาดเคลือ่ นของค่า RFU เริม่ ต้นคือ 10% ของช่วงค่า RFU ทั้งหมด

n

Percent of Range (ค่าร้อยละของช่วง) — เลือกวิธนี เี้ พื่อใช้ค่าร้อยละของช่วงค่า RFU สำหรับความคลาดเคลือ่ น ค่าร้อยละของช่วงต่ำสุด คือ 1% ค่าร้อยละของช่วงสูงสุด คือ 99% ค่าร้อยละของช่วงเริม่ ต้น คือ 10%คูม่ ือผูใ้ ช้ | 233บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลการปรับการวิเคราะห์ขอ้ มูลจุดสิ้นสุด
วิธปี รับข้อมูลในแท็บ End Point (จุดสิ้นสุด)uทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือกสารเรืองแสงจากรายการแบบเลือ
่ นลง

n

เลือกรอบสิน้ สุดเป็นค่าเฉลี่ยเพื่อกำหนดจำนวนรอบที่จะคำนวณ RFU จุดสิน้ สุดเฉลี่ย

nเลือก RFU เพือ่ ดูข้อมูลในหน่วยสารเรืองแสงสัมพัทธ์

nเลือก Percentage of Range (เปอร์เซ็นต์ของช่วง) เพื่อดูข้อมูลเป็นเปอร์เซ็นต์ของช่วง RFUnเลือกหลุมในตัวเลือกหลุมเพื่อเน้นดูสว่ นย่อยของข้อมูล

nเลือกกลุ่มหลุมเพื่อดูและวิเคราะห์สว่ นย่อยของหลุมในเพลต เลือกกลุ่มหลุมแต่ละกลุ่มด้วยชื่อในเมนูแบบ
เลื่อนลง Well Group (กลุ่มหลุม) ในแถบเครื่องมือ

สเปรดชีต RFU สำหรับการวิเคราะห์จุดสิ้นสุด
ตาราง 26 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีต RFU ในแท็บ End Point (จุดสิน้ สุด)
ตาราง 26 เนือ้ หาในสเปรดชีต RFU End Point (จุดสิน้ สุดของ RFU)

ข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งหลุมในเพลต

สารเรืองแสง

สารเรืองแสงที่ตรวจจับได้

สารการรวมกันของประเภทตัวอย่างกับ Replicate # (การทำซ้ำ #)RFU สิ้นสุด

RFU ที่รอบจุดสิ้นสุด

บอกค่าบวกหรือค่าลบ โดยตัวอย่างที่เป็นบวกมีค่า RFU ทีม่ ากกว่า RFU เฉลี่ยของตัวอย่าง
ควบคุมผลลบบวกด้วย Cut Off Value (ค่า Cut Off)ตัวอย่าง

ชื่อตัวอย่างที่โหลดไว้ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)234 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)แท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)แท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล) กำหนดจีโนไทป์ลงในหลุมที่มีตัวอย่างที่ไม่ทราบที่มา ใช้ข้อมูลเหล่านี้
เพื่อระบุตัวอย่างที่มีจโี นไทป์ที่แตกต่างกัน ได้แก่ อัลลีล 1, อัลลีล 2, เฮเทอโรไซโกต, No Call (ไม่มกี ารเพิ่มปริมาณ)หรือระบุไม่ได้
หมายเหตุ: ข้อมูลสำหรับการแยกอัลลีลต้องมาจากการใช้เทคนิคมัลติเพล็กซ์ที่มสี ารเรืองแสงอย่างน้อย 2 ชนิดสารเรืองแสงแต่ละชนิดจะเป็นตัวระบุหนึง่ อัลลีลในทุกตัวอย่าง

การวิเคราะห์ด้วยการแยกอัลลีลจำเป็นต้องมีสารในหลุมต่อไปนีเ้ ป็นอย่างน้อย
nสารเรืองแสง 2 ชนิดในแต่ละหลุม

nตัวอย่าง NTC (การควบคุมไม่มเี ทมเพลต) สำหรับการวิเคราะห์ขอ้ มูลที่ดีที่สดุ

CFX Maestro Dx SE มี 4 ตัวเลือกในการที่จะดูข้อมูลการแยกอัลลีลดังนี้
nAllelic Discrimination chart (แผนภูมกิ ารแยกอัลลีล) — แสดงข้อมูลในกราฟ RFU สำหรับอัลลีล 1/อัลลีล 2 แต่ละจุดในกราฟแสดงข้อมูลจากสารเรืองแสงทั้ง 2 ชนิดในหนึง่ หลุม คุณสามารถสลับระหว่างพิกดั คาร์ทีเซียนกับ
พิกดั เชิงขั้วได้โดยเลือกและเคลียร์ชอ่ งทำเครือ่ งหมายพิกดั เชิงขั้ว Cartesian Coordinates (พิกดั คาร์ทีเซียน)แสดง RFU สำหรับอัลลีล 1 บนแกน x และ RFU สำหรับอัลลีล 2 บนแกน y Polar Coordinates (พิกดั เชิงขั้ว)แสดงมุมบนแกน x และระยะห่างของ RFU บนแกน y จากต้นกำเนิด (ค่ามัธยฐานของ NTC ทั้งหมด)n

Well spreadsheet (สเปรดชีทของหลุม) — แสดงข้อมูลการแยกอัลลีลทีเ่ ก็บรวบรวมไว้ในแต่หลุมของเพลต

n

Well selector (ตัวเลือกหลุม) — เลือกหลุมที่มีขอ้ มูลอัลลีลที่คณุ ต้องการแสดง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 235บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

แผง Selected Fluorophores (สารเรืองแสงที่เลือก) — เปลี่ยนป้ายกำกับแกน x และแกน y ในแผนภูมกิ ารแยก
อัลลีล รอบที่จะทำการวิเคราะห์ และกำหนดว่าจะแสดงแผนที่การบอกค่าหรือไม่

การปรับข้อมูลสำหรับการแยกอัลลีล
ซอฟต์แวร์จะกำหนดจีโนไทป์ให้กบั หลุมที่มตี ัวอย่างที่ไม่ทราบทีม่ าโดยอัตโนมัติตามตำแหน่งของ NTC และมุมและ
ระยะห่างของจุดข้อมูลที่ไม่ทราบจาก NTวิธปี รับข้อมูลการแยกอัลลีลuทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการแสดงพิกัดเชิงขัว้ ให้เลือกช่องทำเครือ่ งหมายในแผนภูมกิ ารแยกอัลลีล

nหากต้องการดูสารเรืองแสงอืน่ ให้เลือกจากรายการแบบเลื่อนลงในแผงควบคุม Selected Fluorophores(สารเรืองแสงที่เลือก)nหากต้องการเปลี่ยนการเพิ่มปริมาณ ให้ลากผ่านจุดข้อมูลในแผนภูมิการแยกอัลลีล และเลือกตัวเลือกในราย
การ Selected Wells (หลุมที่เลือก)oAllele 1 (อัลลีล 1)oAllele 2 (อัลลีล 2)oHeterozygote (เฮเทอโรไซโกต)oUndetermined (ระบุไม่ได้)o

No Call (ไม่มีการเพิม่ ปริมาณ)oAuto Call (การเพิ่มปริมาณอัตโนมัติ)เคล็ดลับ: เลือก Auto Call (การเพิ่มปริมาณอัตโนมัติ) เพื่อกลับไปใช้คา่ การเพิ่มปริมาณเริ่มต้น

236 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)ตัวเลือกเมนูแผนภูมิ
นอกเหนือไปจากตัวเลือกเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับแผนภูมิ (โปรดดูรายการเมนูคลิกขวาทั่วไปสำหรับแผนภูมิ ในหน้า
204) ตาราง 27 จะแสดงรายการตัวเลือกเมนูที่มอี ยู่ในแผนภูมกิ ารแยกอัลลีล
ตาราง 27 ตัวเลือกเมนูแผนภูมิการแยกอัลลีลขวาและซ้าย

ตัวเลือกเมนู

ฟังก์ชน
ัซูมเน้นมุมมองแผนภูมไิ ปยังพื้นทีท่ ี่เลือกให้ชัดเจน (โดยคลิกและลากเคอร์เซอร์
ในแผนภูมิ)เคล็ดลับ: หากต้องการเรียกคืนการซูมเพื่อแสดงจุดข้อมูลทัง้ หมด ให้คลิกขวาและเลือก Set Scale to Default (ตั้งค่าการปรับขนาดไปที่ค่า
เริ่มต้น)หลุมสำหรับหลุมที่เลือก มีตัวเลือกคือ แสดงเฉพาะหลุมนี้ ลบหลุมนี้ออกจากมุมมอง
ตั้งค่าสีสำหรับการติดตามนี้ หรือไม่รวมหลุมนี้ในการวิเคราะห์

หลุมที่เลือก

สำหรับหลุมที่เลือก (เลือกโดยคลิกและลากเคอร์เซอร์ในแผนภูมิ) มีตัวเลือกคือ แสดงเฉพาะหลุมเหล่านี้ ลบหลุมเหล่านี้ออกจากมุมมอง ตั้งค่าสีสำหรับ
การติดตามเหล่านี้ หรือไม่รวมหลุมเหล่านี้ในการวิเคราะห์

สเปรดชีตการแยกอัลลีล
ตาราง 28 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในสเปรดชีตการแยกอัลลีล
ตาราง 28 เนือ้ หาในสเปรดชีตการแยกอัลลีล

ข้อมูล

คำอธิบาย

หลุมตำแหน่งของช่องในเพลต

ตัวอย่าง

คำอธิบายชื่อตัวอย่าง

บอกลักษณะของอัลลีล รวมถึงอัลลีล1 อัตโนมัติ, อัลลีล 2, เฮเทอโรไซโกต, ไม่มีการบอก หรือระบุไม่ได้

ชนิด

Auto (อัตโนมัติ) หรือ Manual (แมนวล) จะอธิบายถึงวิธีการบอก อัตโนมัติจะ
หมายถึงว่า ซอฟต์แวร์เลือกการบอก แมนวลจะหมายถึงว่า ผู้ใช้เลือกการบอกRFU1

RFU สำหรับ Allele1

RFU2

RFU สำหรับ Allele2คูม่ ือผูใ้ ช้ | 237

บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บ Custom Data View (มุมมองข้อมูลที่กำหนดเอง)แท็บ Custom Data View (มุมมองข้อมูลที่กำหนดเอง) แสดงบานหน้าต่างหลายบานพร้อมกันในรูปแบบที่ปรับแต่งได้
รายการแบบเลือ่ นลง Load a Preset View (โหลดมุมมองที่กำหนดไว้ล่วงหน้า) มีตัวเลือกเทมเพลตรูปแบบการแสดงที่
หลากหลาย มุมมองเริม่ ต้นที่แสดงจะขึ้นอยู่กบั ไฟล์ที่กำลังวิเคราะห์ ตัวอย่างเช่น หากมีขอ้ มูล Melt Curve มุมมอง
เริม่ ต้น Amp+Melt จะปรากฏขึ้น

238 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ Custom Data View (มุมมองข้อมูลทีก่ ำหนดเอง)การสร้างมุมมองข้อมูลที่กำหนดเอง
วิธสี ร้างมุมมองข้อมูลที่กำหนดเองuทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nเลือกมุมมองอื่นที่กำหนดไว้ลว่ งหน้าจากรายการแบบเลื่อนลง

nเลือกมุมมองแผนภูมอิ นื่ จากรายการแบบเลื่อนลงที่อยูด่ ้านบนของแต่ละบานหน้าต่าง

n

เปลีย
่ นจำนวนแถวและคอลัมน์ในแท็บ

n

เปลีย
่ นขนาดของแต่ละบานหน้าต่าง ลากแถบที่ด้านนอกของแต่ละบานหน้าต่าง

คลิก "บันทึกเป็นค่าที่กำหนดไว้ล่วงหน้า" เพื่อบันทึกมุมมองที่ปรับแต่งเป็นเทมเพลตที่กำหนดไว้ล่วงหน้า คลิก "จัดการ
ค่าที่กำหนดไว้ลว่ งหน้า" เพือ่ ลบ เปลีย่ นชื่อ หรือคืนค่ามุมมองที่กำหนดไว้ล่วงหน้าที่มีอยู่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 239

บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บ QC (การควบคุมคุณภาพ)ใช้แท็บ QC (การควบคุมคุณภาพ) เพื่อเข้าถึงคุณภาพของข้อมูลการทดสอบโดยขึน้ กับกฎทีร่ ะบุไว้ในแท็บ QC
ในตารางกฎ
CFX Maestro Dx SE ให้ตัวเลือกสีแ่ บบสำหรับการดูข้อมูล QC (การควบคุมคุณภาพ) ดังนี้
nแผนภูมิ Amplification (การเพิ่มปริมาณ) — แสดง RFU สำหรับแต่ละหลุมในทุกรอบ การติดตามแต่ละครัง้ ในแผนภูมแิ สดงข้อมูลจากสารเรืองแสงเดี่ยวในหนึง่ หลุมnตารางกฎ QC — จะแสดงกฎ QC ที่มีและการตั้งค่าที่ระบุกฎแต่ละข้อ กฎ QC ที่ใช้จะแสดงเป็นเครือ่ งหมายถูก

n

Well selector (ตัวเลือกหลุม) — จะเลือกหลุมที่มขี ้อมูลสารเรืองแสงทีค่ ุณต้องการแสดง

nบานหน้าต่างสรุปกฎ QC — แสดงกฎ QC ที่เลือกและเน้นให้เห็นหลุมที่ไม่เป็นไปตามกฎ

การเปลี่ยนเกณฑ์การควบคุมคุณภาพ
วิธเี ปลีย่ นเกณฑ์การควบคุมคุณภาพuเลือกหรือล้างช่องทำเครื่องหมาย Use (ใช้) เพื่อบังคับใช้หรือยกเว้นกฎในการควบคุมคุณภาพ

240 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแท็บ QC (การควบคุมคุณภาพ)การแยกหลุมที่ไม่ผ่านการควบคุมคุณภาพออก
CFX Maestro Dx SE แสดงหลุมที่ไม่ผา่ นเกณฑ์การควบคุมคุณภาพในคอลัมน์ Results (ผลลัพธ์) ในตารางกฎการ
ควบคุมคุณภาพและในบานหน้าต่างสรุป

วิธแี ยกหลุมทีไ่ ม่ผา่ นเกณฑ์การควบคุมคุณภาพออกuเลือก Exclude Wells (แยกหลุมออก) สำหรับแต่ละหลุมที่ต้องการคัดออก

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 241บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลแท็บ Run Information (ข้อมูลการทดสอบ)แท็บ Run Information (ข้อมูลการทดสอบ) จะแสดงโปรโตคอลและข้อมูลอืน่ ๆ เกี่ยวกับแต่ละการทดสอบ ใช้แท็บนี้
เพื่อดำเนินการดังต่อไปนี้
nดูโปรโตคอล

nป้อนหรือแก้ไขบันทึกเกีย่ วกับการทดสอบ

nป้อนหรือแก้ไข ID หรือบาร์โค้ดสำหรับการทดสอบ

nดูเหตุการณ์ที่อาจเกิดขึน้ ระหว่างทำการทดสอบ ใช้ข้อความเหล่านี้เพื่อช่วยแก้ไขปัญหาการทดสอบ

เคล็ดลับ: คลิกขวาที่โปรโตคอบเพื่อคัดลอก ส่งออก หรือพิมพ์ คลิกขวาที่ Notes (บันทึก), ID/Bar Code (ID/บาร์โค้ด) หรือบานหน้าต่างอืน่ ๆ เพื่อเลิกทำ ตัด คัดลอก วาง ลบ หรือเลือกข้อความ

242 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEรายงานการวิเคราะห์ขอ้ มูลรายงานการวิเคราะห์ข้อมูล
กล่องโต้ตอบการรายงานแสดงผลข้อมูลเกีย่ วกับไฟล์ข้อมูลปัจจุบันในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)
หากต้องการเปิดรายงาน ให้เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Reports (รายงาน) หรือคลิก Reports (รายงาน) บนแถบ
เครือ่ งมือ
กล่องโต้ตอบ Report (รายงาน) ประกอบด้วยส่วนต่าง ๆ ดังต่อไปนี้
nเมนูและแถบเครือ่ งมือ — ให้ตัวเลือกในการกำหนดรูปแบบ บันทึก และพิมพ์รายงานหรือเทมเพลต

nรายการตัวเลือก (ด้านซ้ายบนของกล่องโต้ตอบ) — ให้ตัวเลือกในการแสดงผลรายงาน

nบานหน้าต่างตัวเลือก (ด้านซ้ายล่างของกล่องโต้ตอบ) — แสดงกล่องข้อความซึ่งคุณสามารถใส่ข้อมูลเกีย่ วกับตัว
เลือกที่เลือก

nบานหน้าต่างแสดงตัวอย่าง (ด้านขวาของกล่องโต้ตอบ) — แสดงตัวอย่างของรายงานปัจจุบนัคูม่ ือผูใ้ ช้ | 243บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลประเภทรายงานการวิเคราะห์ข้อมูล
ตาราง 29 แสดงรายการตัวเลือกทั้งหมดที่พร้อมใช้งานสำหรับรายงานการวิเคราะห์ขอ้ มูล โดยขึน้ อยู่กบั ประเภทของ
ข้อมูลในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล)ตาราง 29 ประเภทรายงานรายงานการวิเคราะห์ข้อมูลในรายการตัวเลือก

ประเภท

ตัวเลือก

คำอธิบาย

หัวข้อ
ชื่อเรื่อง คำบรรยาย และโลโก้สำหรับรายงาน
ข้อมูลรายงาน

วันที่ทำการทดสอบ ชื่อผู้ใช้ ชื่อไฟล์ข้อมูล เส้นทางไฟล์ขอ้ มูล และกลุ่มของหลุมที่เลือก

ข้อมูลการตรวจสอบ

ข้อมูลเสริมที่จำเป็นสำหรับการตรวจสอบ ซึ่งรวมถึงลายเซ็น

บันทึก

บันทึกเกี่ยวกับรายงานข้อมูล

ข้อมูลการทดสอบ

วันที่ทำการทดสอบ ชื่อผู้ใช้ ชื่อไฟล์ข้อมูล เส้นการตั้งค่าการทดสอบ

ทางไฟล์ขอ้ มูล และกลุ่มของหลุมที่เลือก
โปรโตคอล

มุมมองข้อความของขั้นตอนและตัวเลือกโปรโต
คอลการแสดงเพลต

มุมมองเพลตของข้อมูลในแต่ละหลุมของเพลต

การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

หมายเลขขัน้ ตอนการเก็บข้อมูล โหมดการ

การหาปริมาณ

วิเคราะห์ และวิธีการลบพื้นฐาน
แผนภูมิการเพิม่ ปริมาณ

แผนภูมิการเพิม่ ปริมาณสำหรับำการทดสอบทีม่ ีข้อมูลการหาปริมาณ

แผนภูมิเส้นโค้งมาตรฐาน

แผนภูมิเส้นโค้งมาตรฐาน

ข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

การแสดงออกของยีน — แผนภูมแิ ท่งการตัง้ ค่าการวิเคราะห์

โหมดการวิเคราะห์ ข้อมูลแผนภูมิ ตัวเลือกการ
ปรับขนาด และข้อผิดพลาดของแผนภูมิ

244 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEรายงานการวิเคราะห์ขอ้ มูลตาราง 29 ประเภทรายงานรายงานการวิเคราะห์ข้อมูลในรายการตัวเลือกต่อ

ประเภท

ตัวเลือก

คำอธิบาย

แผนภูมิ

สำเนาแผนภูมิแท่ง

ชื่อเป้าหมาย

แผนภูมิของชือ่ เป้าหมาย

ชื่อตัวอย่าง

แผนภูมิของชือ่ ตัวอย่าง

ข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

ความคงตัวของเป้าหมาย

แผนภูมิแสดงค่าความคงตัวของเป้าหมาย

แผนภูมิ Box-and-Whiskerแผนภูมิ Box-and-Whiskerแผนภูมิจด
ุแผนภูมิจด
ุการแสดงออกของยีน — คลัสเตอร์แกรม และพล็อตการกระจาย
การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

การตัง้ ค่าสำหรับแผนภูมแิ ต่ละประเภท

แผนภูมิ

สำเนาแผนภูมิ

ข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

การแสดงออกของยีน — ข้อมูล ANOVAการตัง้ ค่า ANOVAขีดจำกัด P-value ทีใ่ ช้ในการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ ANOVAตารางผลลัพธ์จากการวิเคราะห์ ANOVA และ
Tukey's HSD post-hocเส้นโค้งอุณหภูมทิ ี่แยกสายคู่
การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

การตัง้ ค่าหมายเลขขัน้ ตอนอุณหภูมิทแี่ ยกสาย
คู่และแถบขีดจำกัด

แผนภูมิ Melt Curveแผนภูมิ Melt curveแผนภูมิ Melt Peakแผนภูมิ Melt peakข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

สารเรืองแสง รอบ และดูแผนทีก่ ารบอกค่า

การแยกอัลลีล

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 245บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลตาราง 29 ประเภทรายงานรายงานการวิเคราะห์ข้อมูลในรายการตัวเลือกต่อ

ประเภท

ตัวเลือก

คำอธิบาย

แผนภูมิการแยกอัลลีล

สำเนาแผนภูมิการแยกอัลลีล

ข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

สารเรืองแสง หยุดวงรอบไปทีค่ ่าเฉลี่ย โหมดจุดสิน้ สุด

ค่า RFU ต่ำสุด ค่า RFU สูงสุด และค่า Cut Offข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละหลุม

ข้อมูล

สเปรดชีตทีแ่ สดงรายการพารามิเตอร์สำหรับ

พารามิเตอร์การควบคุม
คุณภาพ

กฎการควบคุมคุณภาพแต่ละกฎ

246 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEรายงานการวิเคราะห์ขอ้ มูลการสร้างรายงานการวิเคราะห์ข้อมูล
คุณสามารถบันทึกเค้าโครงของรายงานให้เป็นเทมเพลต ซึง่ คุณสามารถนำกลับมาใช้งานกับรายงานที่คล้ายคลึง
กันได้

วิธสี ร้างรายงานการวิเคราะห์ขอ้ มูล1ทำการปรับสารที่อยูใ่ นหลุมครั้งสุดท้าย หลุมทีเ่ ลือก แผนภูมิ และแผ่นงานในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ก่อนที่จะจัดทำรายงาน

2เลือกเครือ่ งมือ > รายงานในแถบเมนู Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) เพือ่ เปิดกล่องโต้ตอบ Report(รายงาน)3เลือกตัวเลือกที่คณุ ต้องการใส่ไว้ในรายงาน รายงานจะเปิดขึน้ โดยตัวเลือกเริ่มต้นที่เลือกไว้ เลือกหรือล้างช่องทำ
เครือ่ งหมายเพื่อเปลีย่ นทั้งหมวดหมูห่ รือตัวเลือกแต่ละรายการภายในหมวดหมู่
ตาราง 29 ในหน้า 244 แสดงรายการตัวเลือกที่พร้อมในการแสดงผล
หมายเหตุ: ข้อมูลที่ปรากฏในรายงานจะขึน้ อยู่กบั การเลือกปัจจุบนั ภายในแท็บของหน้าต่าง Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ตัวอย่างเช่น การทดสอบเชิงปริมาณอาจไม่มเี ส้นโค้งมาตรฐาน ฉะนัน้ ข้อมูล
เหล่านีจ้ งึ ไม่ปรากฏในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) หรือในรายงานข้อมูล

4

เปลีย
่ นลำดับของหมวดหมูแ่ ละรายการในรายงาน ลากตัวเลือกไปยังตำแหน่งสัมพัทธ์ สามารถจัดเรียงรายการ
ใหม่ภายในหมวดหมู่ทรี่ ายการนัน้ อยูเ่ ท่านัน
้

5(ไม่บังคับ) ในบานหน้าต่าง Report Options (ตัวเลือกรายงาน) ให้ปอ้ นข้อมูลที่เกีย่ วข้องกับตัวเลือกทีเ่ ลือกnเลือกส่วนย่อยของข้อมูลที่จะแสดงในรายงาน

nเลือกการตั้งค่าเฉพาะสำหรับตัวเลือกทีเ่ ลือก

n

เปลีย
่ นข้อความเพือ่ แสดงตัวเลือกทีเ่ ลือก6คลิก Update Report (อัปเดตรายงาน) เพื่ออัปเดต Report Preview (การดูตัวอย่างรายงาน) เมือ่ มีการเปลี่ยน
แปลงใด ๆ

7พิมพ์หรือบันทึกรายงาน

8aคลิกปุ่ม Print Report (พิมพ์รายงาน) ในแถบเครื่องมือเพือ่ พิมพ์รายงานปัจจุบันbเลือก File (ไฟล์) > Save (บันทึก) เพื่อบันทึกรายงานในรูปแบบ PDF (ไฟล์ Adobe Acrobat Reader),MHT (เอกสาร Microsoft) หรือรูปแบบไฟล์ MHTML (เอกสาร Microsoft)cเลือกตำแหน่งทีจ่ ะบันทึกไฟล์

dเลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) เพื่อบันทึกรายงานด้วยชื่อใหม่หรือในตำแหน่งใหม่

(ไม่บังคับ) สร้างเทมเพลตรายงานที่มขี อ้ มูลที่คุณต้องการ หากต้องการบันทึกการตั้งค่ารายงานปัจจุบนั ในเทมเพลต ให้เลือก Template (เทมเพลต) > Save (บันทึก) หรือ Save As (บันทึกเป็น) จากนัน้ ให้โหลด
เทมเพลตรายงานเมือ่ คุณต้องการสร้างรายงานใหม่ในครัง้ ต่อไป

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 247

บทที่ 11 รายละเอียดการวิเคราะห์ขอ้ มูลการสร้างรายงานกลุม่ ช่อง
วิธสี ร้างรายงานกลุม่ ช่อง
1เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Well Group Reports (รายงานกลุ่มช่อง) ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์
ข้อมูล)2ในกล่องโต้ตอบ Well Group Reports (รายงานกลุ่มช่อง) ให้เลือกกลุม่ ช่อง ขัน้ ตอนการเพิม่ ปริมาณ และขั้นตอนการสลายที่ต้องการเพิม่ ลงในรายงาน

3ป้อนพาธหรือไปที่โฟลเดอร์ปลายทางที่ต้องการให้บันทึกรายงานไว้

4(ไม่บังคับ) เลือก Choose a Report Template (เลือกเทมเพลตรายงาน) และไปที่โฟลเดอร์ไฟล์เทมเพลต

5(ไม่บังคับ) เลือก Open Destination Folder (เปิดโฟลเดอร์ปลายทาง) เพื่อเปิดโฟลเดอร์ และดูรายงานหลังจากที่
สร้างรายงานแล้ว

6คลิก Create Reports (สร้างรายงาน)248 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEบทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน
คุณสามารถใช้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition เพื่อทำการทดสอบการแสดงออกของยีนเพื่อปรับ
ความแตกต่างสัมพัทธ์ในความเข้มข้นเป้าหมายของตัวอย่างให้เป็นบรรทัดฐานโดยใช้การควบคุมที่มคี ณุ ภาพอย่าง
เข้มงวดในปฏิกริ ยิ าของคุณได้ โดยปกติแล้ว จะใช้ระดับการแสดงออกสำหรับยีนอ้างอิงอย่างน้อยหนึ่งยีนในการ
ปรับระดับการแสดงออกของยีนที่สนใจให้เป็นบรรทัดฐาน ยีนอ้างอิงจะคำนึงถึงความแตกต่างในการโหลดหรือ
ตัวแปรอื่น ๆ ที่แสดงในแต่ละตัวอย่าง และระดับการแสดงออกของตัวอย่างเหล่านัน้ ไม่ควรได้รบั ผลกระทบในระบบ
ชีวภาพที่กำลังศึกษาอยู่
เลือกแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) เพื่อประเมิน
ความแตกต่างสัมพัทธ์ระหว่างปฏิกริ ยิ า PCR ในหลุมสองหลุมขึ้นไป ตัวอย่างเช่น คุณสามารถประเมินจำนวนสัมพัทธ์
ของจีโนมไวรัสหรือจำนวนสัมพัทธ์ของลำดับพันธุกรรมที่มกี ารถ่ายโอนในปฏิกริ ิยา PCR ได้ การศึกษาการแสดง
ออกของยีนที่นยิ มใช้มากที่สดุ คือการเปรียบเทียบความเข้มข้นของ cDNA ในปฏิกริ ยิ ามากกว่าหนึง่ ปฏิกริ ิยา เพื่อ
ประมาณระดับภาวะปกติของ messenger RNAซอฟต์แวร์จะคำนวณระดับการแสดงออกสัมพัทธ์ของเป้าหมายด้วยสถานการณ์ใดสถานการณ์หนึง่ ต่อไปนี้
nระดับการแสดงออกสัมพัทธ์ของลำดับพันธุกรรมเป้าหมาย (เป้าหมาย 1) เทียบกับเป้าหมายอืน่ (เป้าหมาย 2)ตัวอย่างเช่น จำนวนยีนหนึง่ ยีนทีส่ ัมพันธ์กบั ยีนอีกหนึ่งยีนภายใต้การควบคุมตัวแปรสำหรับตัวอย่าง
แบบเดียวกัน

nระดับการแสดงออกสัมพัทธ์ของลำดับพันธุกรรมเป้าหมายในตัวอย่างหนึง่ เทียบกับอีกเป้าหมายเดียวกันภายใต้
การควบคุมตัวแปรสำหรับตัวอย่างทีต่ ่างกัน ตัวอย่างเช่น ปริมาณสัมพัทธ์ของยีนหนึง่ ตัวที่สมั พันธ์กบั ตัวมันเอง
ภายใต้สภาวะเวลา ภูมศิ าสตร์ หรือการพัฒนาทีแ่ ตกต่างกัน

การตั้งค่าเพลตสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน
วิธดี ำเนินการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน สารในหลุมต้องมีดงั ต่อไปนี้
nอย่างน้อยสองเป้าหมาย — สองเป้าหมายทีแ่ สดงถึงยีนที่เพิ่มปริมาณขึ้นที่แตกต่างกันหรือลำดับในตัวอย่าง
ของคุณ

nอย่างน้อยหนึง่ เป้าหมายอ้างอิง — อย่างน้อยหนึง่ เป้าหมายต้องเป็นเป้าหมายอ้างอิงสำหรับการปรับระดับการ
แสดงออกของยีน กำหนดเป้าหมายอ้างอิงทั้งหมดในหน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)เพื่อวิเคราะห์ข้อมูลในโหมด Normalized Expression (การปรับระดับการแสดงออกของยีน) (ΔΔCq) การทดสอบที่ไม่มกี ารอ้างอิงต้องวิเคราะห์โดยใช้โหมด Relative Expression (การปรับระดับการแสดงออกของ
ยีนสัมพัทธ์) (ΔCq)

nตัวอย่างทั่วไป — ปฏิกิรยิ าของคุณต้องมีตัวอย่างทั่วไป (ต้องมีอย่างน้อยสองตัวอย่าง) เพื่อดูขอ้ มูลที่พล็อตไว้ใน
แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ตัวอย่างเหล่านีค้ วรแสดงการควบคุมหรือเงือ่ นไขที่แตกต่างกัน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 249

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

สำหรับแต่ละลำดับเป้าหมายของคุณ กำหนดตัวอย่างควบคุม (ไม่บงั คับ) ในหน้าต่าง Experiment Settings(การตั้งค่าการทดสอบ) หากไม่เลือกตัวควบคุม ซอฟต์แวร์จะใช้ Cq ต่ำสุดเป็นตัวควบคุม
ข้อกำหนดสำหรับการตั้งค่า Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) จะขึ้นอยู่
กับว่าสารในปฏิกิรยิ าเป็น singleplex PCR ที่มสี ารเรืองแสงหนึง่ ชนิดในปฏิกริ ยิ า หรือ multiplex PCR ที่มสี ารเรือง
แสงมากกว่าหนึ่งชนิดในปฏิกริ ยิ าการตั้งค่าเพลตที่แนะนำ
หากการตั้งค่าเพลตของข้อมูลไฟล์ไม่ประกอบด้วยข้อมูลที่จำเป็นสำหรับการวิเคราะห์และมีการเลือกแท็บ Gene
Expression (การแสดงออกของยีน) ช่องว่างที่มกั มีแผนภูมแิ ท่งแสดงอยู่จะมีด้วยคำแนะนำในการป้อนข้อมูลนี้
สำหรับการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐาน ให้ดำเนินการขั้นตอนต่อไปนี้:12กำหนดชื่อ Target (เป้าหมาย) และ Sample (ตัวอย่าง) โดยใช้หนึ่งในสิง่ ต่อไปนี้
nPlate Setup (การตั้งค่าเพลต) — เปิดหน้าต่าง Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต)n

Replace Plate File (แทนที่ไฟล์เพลต) — เปิดเบราว์เซอร์ Select Plate (เลือกเพลต) ซึ่งคุณสามารถไปยัง
ไฟล์เพลตที่บนั ทึกไว้กอ่ นหน้านีเ้ พื่อแทนที่ดว้ ยรูปแบบเพลตปัจจุบัน

n

Replace PrimePCR File (แทนที่ไฟล์ PrimePCR) — เปิดกล่องโต้ตอบ Select PrimePCR File (เลือก
ไฟล์ PrimePCR) ซึง่ คุณสามารถค้นหาไฟล์การทดสอบ PrimePCR และนำไปใช้กบั รูปแบบเพลตได้

เลือกอย่างน้อยหนึง่ เป้าหมายอ้างอิงรายและตัวอย่างควบคุมโดยใช้กล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้ง
ค่าการทดสอบ)หากเค้าโครงเพลตมีขอ้ มูลเป้าหมายและตัวอย่างแล้ว จำเป็นต้องใช้เฉพาะขั้นตอนที่สองเท่านัน้ และจะเน้นเป็นสีส้ม ขัน้ ตอนนีต้ ้องเสร็จสิน้ ก่อนที่การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานจะเกิดขึ้นได้
หมายเหตุ: ข้อมูลสำหรับแผนภาพกระจาย และคลัสเตอร์แกรม จะปรากฏเฉพาะเมือ่ เป็นไปตามข้อกำหนด
ทั้งหมดสำหรับการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานภายใต้ Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) สำหรับ Gene
Expression Analysis (การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน)250 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภูมิการแสดงออกของยีน

แผนภูมิการแสดงออกของยีน
CFX Maestro Dx SE แสดงข้อมูลการแสดงออกของยีนในหลายมุมมอง ตาราง 30 แสดงรายการตัวเลือกที่มอี ยู่ใน
ซอฟต์แวร์
ตาราง 30 ตัวเลือกแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีน

ปุม่Name (ชือ่ )Function (ฟังก์ชัน)Graphing (การเขียนกราฟ)แสดงข้อมูลการแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐานใน
มุมมองใดมุมมองหนึง่ ต่อไปนี้
n แผนภูมิแท่ง (ค่าเริ่มต้น)n แผนภูมิ Box and whiskern แผนภูมิจด
ุคลัสเตอร์แกรม

แสดงข้อมูลการแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐานใน
ลำดับชัน้ ตามระดับความคล้ายคลึงกันของการแสดง
ออกสำหรับเป้าหมายและตัวอย่างต่างๆ

Scatter Plot (แผนภาพกระจาย)แสดงการแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐานของเป้า
หมายสำหรับตัวอย่างควบคุมเทียบกับตัวอย่างทดสอบANOVA (การวิเคราะห์ความแปร

แสดงผลการวิเคราะห์ความแปรปรวนทางเดียวของ

ปรวน)ข้อมูลการแสดงออกของยีนโดยใช้แพ็กเกจ R ต่อไป
นี้เพือ่ ทำการวิเคราะห์ความแปรปรวน (ANOVA)และหาผล Tukeyn Companion to Applied Regression (car)n Least-square means (lsmeans)

Reference Gene Selection Tool(มีอยู่ในแท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การ

(เครื่องมือการเลือกยีนอ้างอิง)ศึกษา) ในหน้าต่าง Gene Study (การศึกษายีน))ระบุยนี อ้างอิงที่ผ่านการทดสอบและจัดหมวดหมูเ่ ป็นดีเลิศ ยอมรับได้ หรือไม่เสถียร ตามความเสถียรของ
ข้อมูล

PrimePCR Controls Analysis(มีอยู่ในแท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การ

(การวิเคราะห์ควบคุม PrimePCR)ศึกษา) ในหน้าต่าง Gene Study (การศึกษายีน))แสดงผลลัพธ์ของตัวอย่างที่ทดสอบ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 251บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

Graphing (การเขียนกราฟ)การแสดงออกสัมพัทธ์ของเป้าหมายจะแสดงในมุมมองสองแบบดังนี้
nแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — จะแสดงข้อมูล PCR แบบเรียลไทม์ในรูปแบบใดรูปแบบห
นึง่ดังต่อไปนี้o

ΔΔCq — การปรับระดับการแสดงออกของยีนสัมพัทธ์ที่คำนวณโดยใช้ตัวอย่างควบคุมและเป้าหมายอ้างอิงo

ΔCq — ปริมาณสัมพัทธ์ของยีนเป้าหมายในตัวอย่างที่สมั พันธ์กบั ตัวอย่างควบคุม

โปรดดูการเปลี่ยนและการทำหมายเหตุประกอบมุมมองแผนภูมิ ในหน้า 254 สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกีย่ วกับการดู
ข้อมูล
nสเปรดชีต — แสดงสเปรดชีตของข้อมูลการแสดงออกของยีน
เคล็ดลับ: คลิกขวาที่แผนภูมิหรือสเปรดชีตใด ๆ เพื่อดูตัวเลือก เลือก View/Edit Plate (ดู/แก้ไขเพลต) จากเมนูเลือ่ นลง Plate Setup (การตั้งค่าเพลต) เพื่อเปิด Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) แล้วเปลี่ยนเนื้อหาช่อง
ในเพลตดังกล่าว
เคล็ดลับ: เลือก Sort (จัดเรียง) จากเมนูคลิกขวาเพื่อจัดเรียงลำดับชื่อเป้าหมายและตัวอย่างในแผนภูมิ

252 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)การแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐาน
ในการทำข้อมูลให้เป็นบรรทัดฐาน ให้ใช้ระดับการแสดงออกที่วัดได้ของยีนอ้างอิงอย่างน้อยหนึง่ รายการเป็นตัวคูณ
ปรับบรรทัดฐาน ยีนอ้างอิงคือเป้าหมายที่ไม่ได้รับการควบคุมในระบบชีวภาพทีก่ ำลังศึกษา เช่น actin, GAPDH หรือtubulinวิธตี ั้งค่าการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐาน (ΔΔCq)
1เปิดไฟล์ขอ้ มูล (นามสกุล .pcrd)

2ตรวจสอบข้อมูลในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) ของหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล) ทำการปรับข้อมูล เช่น การเปลี่ยนขีดจำกัดและโหมดการวิเคราะห์

3เลือกแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีนส์)4ในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้คลิก Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)5ในกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) ให้ทำดังต่อไปนี้

6aเลือกแท็บ Samples (ตัวอย่าง) และเลือกตัวควบคุม เมือ่ มีการกำหนดตัวควบคุมแล้ว CFX Maestro Dx SE จะปรับให้ปริมาณสัมพัทธ์ของยีนทั้งหมดเป็นบรรทัดฐานต่อปริมาณการควบคุม ซึง่ ตั้งไว้ที่ 1bเลือกแท็บ Target (เป้าหมาย) และเลือกยีนอ้างอิง การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนจำเป็นต้องใช้การอ้าง
อิงหนึง่ รายการในบรรดาเป้าหมายภายในตัวอย่างของคุณ

เลือกการปรับระดับการแสดงออกของยีน (ΔΔCq) หากยังไม่ได้เลือก แล้วดูระดับการแสดงออกในแท็บ Gene
Expression (การแสดงออกของยีน)หมายเหตุ: นอกจากนี้ คุณยังสามารถใช้ Setup Wizard (ตัวช่วยสร้างการตั้งค่า) เพือ่ ตั้งค่าแผนผังเพลต
เพื่อวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานได้อกี ด้วย

Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์)ตามคำนิยามแล้ว ข้อมูลปริมาณสัมพัทธ์ (ΔCq) ยังไม่ได้กำหนดเป็นบรรทัดฐาน วิธกี ารนีจ้ ะใช้เพื่อหาปริมาณตัวอย่าง
ที่ไม่มียนี อ้างอิง (เป้าหมาย) โดยทั่วไปแล้ว ผู้วิจยั จะมั่นใจเกีย่ วกับหนึ่งในข้อพิจารณาดังต่อไปนีเ้ มือ่ ตั้งค่าการทดสอบ
nแต่ละตัวอย่างมีปริมาณ RNA หรือ cDNA เท่ากันในแต่ละหลุม

nค่าความแปรปรวนในปริมาณตัวอย่างชีวภาพที่บรรจุจะถูกกำหนดเป็นบรรทัดฐานหลังการทดสอบด้วยวิธกี ารวิเคราะห์ข้อมูลภายนอกซอฟต์แวร์ ตัวอย่างเช่น ผู้วิจยั อาจเลือกที่จะแบ่งค่าปริมาณสัมพัทธ์ด้วยตัวคูณปรับ
บรรทัดฐาน อาจเป็นมวลของกรดนิวคลีอกิ สำหรับแต่ละตัวอย่าง หรือเป็นจำนวนเซลล์จากแหล่งที่แยกกรด
นิวคลีอกิ ออกมา

วิธที ำการวิเคราะห์ Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์) (ΔCq)
uในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้เลือก Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์) (ΔCq) จากรายการแบบเลือ่ นลงของ Mode (โหมด) ในบานหน้าต่างด้านขวา
เคล็ดลับ: หากต้องการเปรียบเทียบผลลัพธ์กับข้อมูลจากการทดสอบการแสดงออกของยีนอืน่ ๆ ให้เปิดการ
ศึกษายีนอื่นหรือเพิ่มไฟล์ข้อมูลไปยังการศึกษายีนทีม่ ีอยูแ่ ล้วคูม่ ือผูใ้ ช้ | 253บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

การเปลี่ยนและการทำหมายเหตุประกอบมุมมองแผนภูมิ
การใช้คำสัง่ เมนูในแถบเครื่องมือของแผนภูมแิ ละเครือ่ งมือแผนภูมกิ ารวิเคราะห์ข้อมูล คุณสามารถเปลี่ยนมุมมองแผน
ภูมิ ทำหมายเหตุประกอบแต่ละแผนภูมิ และเปลีย่ นการแสดงแผนภูมิ แถบเครือ่ งมือของแผนภูมิจะปรากฏขึ้นระหว่าง
สเปรดชีตแผนภูมแิ ละการวิเคราะห์ขอ้ มูลที่ด้านล่างของหน้าจอ

เครือ่ งมือในแถบเครือ่ งมือแผนภูมิ
เคล็ดลับ: ดูข้อมูลเกีย่ วกับเครือ่ งมือแผนภูมทิ ี่ปรากฏที่ด้านขวาของแผนภูมกิ ารวิเคราะห์ขอ้ มูลได้จากแผนภูมิ ในหน้า 196แถบเครือ่ งมือด้านล่างแผนภูมิจะให้ทางลัดในการเข้าถึงเครือ่ งมือทำหมายเหตุประกอบ

ตาราง 31 ระบุรายการฟังก์ชนั ของปุม่ ในแถบเครือ่ งมือแผนภูมิ
ตาราง 31 แถบเครือ่ งมือแผนภูมิ

ปุม่Name (ชือ่ )ฟังก์ชน
ัแผนภูมิแท่ง

แสดงการแสดงออกสัมพัทธ์ของเป้าหมาย

แผนภูมิ Box and whiskerแสดงข้อมูลเป็นช่วงควอร์ไทล์ (ดูรายละเอียดการคำนวณจากการ
คำนวณแผนภูมิ Box and Whisker ในหน้า 290หมายเหตุ: ใช้ได้เฉพาะเมือ่ มีการตั้งค่า Analyze Using(วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Biological Groups Only (กลุ่มชีวภาพ
เท่านั้น)แผนภูมิจด
ุแสดงจุดข้อมูลตัวอย่างแต่ละชุดสำหรับแต่ละเป้าหมาย
หมายเหตุ: ใช้ได้เฉพาะเมือ่ มีการตั้งค่า Analyze Using(วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Biological Groups Only (กลุ่มชีวภาพ
เท่านั้น)Add Arrow (เพิม่ ลูกศร)ลากลูกศรบนแผนภูมิทกี่ ำลังใช้งาน

Add Circle (เพิม่ วงกลม)ลากวงกลมบนแผนภูมทิ ี่กำลังใช้งาน

Add Text (เพิม่ ข้อความ)แทรกกล่องข้อความบนแผนภูมิทกี่ ำลังใช้งาน ซึ่งคุณสามารถเพิม
่ข้อความเพือ่ ระบุรายการทีส่ นใจในแผนภูมไ
ิ ด้

254 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)ตาราง 31 แถบเครือ่ งมือแผนภูมิต่อ

ปุม่Name (ชือ่ )ฟังก์ชน
ั

Undo (เลิกทำ)ลบหรือย้อนกลับหมายเหตุประกอบที่ดำเนินการบนแผนภูมิที่
กำลังใช้งาน

Redo (ทำอีกครั้ง)ย้อนกลับไปที่การดำเนินการ “เลิกทำ” ก่อนหน้าบนแผนภูมิที่
กำลังใช้งาน

Clear All (ล้างทัง้ หมด)ล้างหมายเหตุประกอบบนแผนภูมทิ ี่กำลังใช้งาน

จัดเรียงข้อมูลเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุ่มชีวภาพ
หมายเหตุ: ตัวเลือกนี้มใี ห้ใช้งานบนแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนเท่านั้น
ตามค่าเริ่มต้น รายการเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุม่ ทางชีวภาพจะปรากฏตามลำดับตัวอักษร ใช้กล่องโต้ตอบ Sort (จัดเรียง) เพื่อจัดเรียงหน้าจอตามลำดับอักษรแบบย้อนกลับ หรือเพื่อย้ายคำ ๆ หนึง่ ไปยังตำแหน่งอืน่ ในรายการด้วย
ตนเอง

วิธจ
ี ด
ั เรียงข้อมูลเป้าหมาย ตัวอย่าง และกลุม่ ชีวภาพ
1จากเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้คลิก Sort (จัดเรียง)กล่องโต้ตอบการจัดเรียงแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนจะปรากฏขึน
้

2ในกล่องโต้ตอบ คลิก Z-A เพื่อจัดเรียงรยการตามลำดับตัวอักษร

3หากต้องการย้ายลำดับคำด้วยตนเอง ให้เลือกคำแล้วคลิกปุม่ ที่เหมาะสมระหว่างแผนภูมดิ ังนี้

4nคลิกลูกศร Up (ขึน้ ) หรือ Down (ลง) เพื่อย้ายคำที่เลือกไปยังตำแหน่งหนึง่ ๆnคลิกลูกศรบนแถบ Up (ขึน้ ) หรือ Down (ลง) เพื่อย้ายคำที่เลือกไปยังตำแหน่งบนสุดหรือล่างสุดของรายชื่อ

คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 255บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

การเปลีย่ นการตั้งค่าเป้าหมาย ตัวอย่าง และสีของกลุม่ ชีวภาพ
ใช้กล่องโต้ตอบ Color Settings (การตั้งค่าสี) เพื่อเปลี่ยนสีของเป้าหมาย ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพ หรือลบรายการ
ออกจากกราฟ

วิธกี ารเปลีย่ นการตั้งค่าสีเป้าหมาย
1ในบานหน้าต่างด้านขวาในกล่องโต้ตอบ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้ตรวจสอบว่า Sample(ตัวอย่าง) ปรากฏในรายการแบบเลื่อนลง X-Axis (แกน X)

2

ใน Chart Tools (เครือ่ งมือแผนภูมิ) ให้เลือก Color Settings (การตั้งค่าสี)กล่องโต้ตอบ Color Settings (การตั้งค่าสี) จะปรากฏขึ้น

3หากต้องการเปลี่ยนสีที่แสดงสำหรับเป้าหมาย ให้คลิกสีนั้นในคอลัมน์ Color (สี)

4ในกล่องโต้ตอบ Color (สี) ที่ปรากฏขึน้ ให้เลือกสีใหม่ แล้วคลิก OK (ตกลง)5หากต้องการลบเป้าหมายออกจากกราฟการแสดงออกของยีน ให้ลา้ งช่องทำเครือ่ งหมายในคอลัมน์ Show
Chart (แสดงแผนภูมิ)เคล็ดลับ: หากต้องการล้างเป้าหมายทัง้ หมด ให้ลา้ ง Show Chart (แสดงแผนภูมิ) ในส่วนหัวคอลัมน์

6(ไม่บังคับ) โดยค่าเริม่ ต้น แถบจะปรากฏเป็นสีทึบ หากต้องการแสดงแถบเป็นสีไล่ระดับ ให้เคลียร์ Use Solid
Colors (ใช้สที ึบ )

7คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและกลับไปที่แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)วิธกี ารเปลีย่ นการตั้งค่าสีของตัวอย่างหรือกลุม่ ชีวภาพ
1ในบานหน้าต่างด้านขวา ในกล่องโต้ตอบ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้ตรวจสอบว่าเป้าหมาย
ปรากฏขึ้นในรายการแบบเลื่อนลง X-Axis (แกน X)

2ทำตามขัน้ ตอนในวิธกี ารเปลีย่ นการตั้งค่าสีเป้าหมาย ในหน้า 256การเปลีย่ นมุมมองแผนภูมิ
วิธเี ปลีย่ นมุมมองแผนภูมิปจั จุบนัuเลือกคำสัง่ เมนูแถบเครือ่ งมือสำหรับมุมมองเป้าหมาย

หมายเหตุ: แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) จะเปิดอยูเ่ สมอ โดยจะแสดงข้อมูลในมุมมอง Bar
Chart (แผนภูมแิ ท่ง) เริม่ ต้น

256 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)การแยกจุดข้อมูลที่ผิดปกติออก
ในแผนภูมจิ ดุ คุณสามารถดูและแยกข้อมูลที่ผิดปกติออกจากการวิเคราะห์ได้

วิธแี ยกจุดข้อมูลทีผ่ ดิ ปกติออกuในแผนภูมแิ บบจุด ให้คลิกขวาที่ข้อมูลผิดปกติที่คณุ ต้องการ แล้วเลือก Exclude Well from Analysis (แยกหลุม
ออกจากการวิเคราะห์)จุดข้อมูลจะถูกลบออกจากแผนภูมิ Dot Plot และหลุมจะเปลี่ยนเป็นสีเทาใน Well Selector (ตัวเลือกหลุม) ในแท็บ
Quantification (การตรวจหาปริมาณ)วิธรี วมจุดข้อมูลทีผ่ ิดปกติuในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) ให้คลิกขวาที่หลุมใน Well Selector (ตัวเลือกหลุม) แล้วเลือก Well(หลุม) > Include in Analysis (รวมในการวิเคราะห์)การดูรายละเอียดจุดข้อมูล
วิธดี รู ายละเอียดจุดข้อมูลuในแผนภาพ Box and Whisker Plot หรือ Dot Plot ให้จอ่ เคอร์เซอร์ไปที่จุดข้อมูลแต่ละจุด

เคล็ดลับการใช้เครื่องมือจะแสดงขึน้ มา โดยแสดงชื่อตัวอย่างและการแสดงออกของตัวอย่าง (ปริมาณสัมพัทธ์หรือการ
ปรับระดับการแสดงออกของยีน โดยขึน้ อยูก่ บั โหมดที่เลือก)การทำหมายเหตุประกอบแผนภูมิ
คุณสามารถเพิม่ ลูกศร วงกลม และข้อความไปยังมุมมองแผนภูมิแท่งแต่ละรายการเพื่อแสดงข้อมูลให้ชัดเจนได้ หมายเหตุประกอบจะบันทึกไว้ดว้ ยกันกับแผนภูมแิ ท่ง และจะปรากฏในไฟล์ที่สง่ ออกและสัง่ พิมพ์ อย่างไรก็ตาม หมายเหตุ
ประกอบที่ทำกับมุมมองแผนภูมิหนึง่ รายการจะไม่ถกู เพิม่ ไปยังมุมมองแผนภูมอ
ิ น
ื่

วิธว
ี าดลูกศรหรือวงกลมบนแผนภูมิ
1ในแถบเครือ่ งมือแผนภูมแิ ท่ง ให้คลิกเครือ่ งมือที่ต้องการ

2คลิกที่แผนภูมิแท่งแล้วลากเคอร์เซอร์ไปตามแผนภูมติ ามต้องการ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 257

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

วิธเี พิ่มข้อความในแผนภูมิ
1ในแถบเครือ่ งมือแผนภูมิ ให้คลิก Add Text (เพิ่มข้อความ)2คลิกที่แผนภูมิแท่ง กล่องข้อความจะปรากฏขึน้ ที่ตำแหน่งที่คลิก

3พิมพ์ขอ้ ความในกล่องข้อความ

4คลิกตำแหน่งใดก็ได้บนแผนภูมเิ พื่อปิดกล่องข้อความ
เคล็ดลับ: กด Enter เพื่อเพิ่มเส้นในกล่องข้อความเพิ่มเติม

วิธยี า้ ยหมายเหตุประกอบ
1เลื่อนเคอร์เซอร์ไปที่หมายเหตุประกอบ ไอคอนจะเปลีย่ นเป็นรูปนิว้ ชี้และจะเน้นที่กรอบหมายเหตุประกอบ

2คลิกที่หมายเหตุประกอบแล้วลากไปที่ตำแหน่งอืน
่

3ปล่อยหมายเหตุประกอบเพื่อวางตำแหน่ง

วิธเี ลิกทำหมายเหตุประกอบuคลิก Undo (เลิกทำ)หมายเหตุประกอบที่เพิ่มล่าสุดจะถูกลบออก
เคล็ดลับ: คุณสามารถเลิกทำหมายเหตุประกอบล่าสุดได้พร้อมกันครั้งละสิบรายการ

วิธที ำหมายเหตุประกอบอีกครัง้uคลิก Redo (ทำอีกครัง้ )หมายเหตุประกอบที่ลบออกล่าสุดจะกลับมา
เคล็ดลับ: คุณสามารถทำหมายเหตุประกอบล่าสุดอีกครัง้ ได้พร้อมกันครัง้ ละสิบรายการ

วิธลี บหมายเหตุประกอบuคลิกขวาที่หมายเหตุประกอบแล้วเลือก Delete (ลบ)

258 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)การปรับข้อมูลการแสดงออกของยีน
หลังจากเลือกโหมดวิเคราะห์สำหรับการปรับระดับการแสดงออกของยีน (∆∆Cq) หรือปริมาณสัมพัทธ์ (∆Cq) แล้ว ให้ปรับข้อมูลที่คณุ ดูในแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) โดยเปลี่ยนตัวเลือกการตั้งค่าที่ด้านขวาของ
แผนภูมิ
เคล็ดลับ: คุณสามารถตั้งค่าตัวเลือกข้อมูล Gene Expression (การแสดงออกของยีน) เริม่ ต้นในกล่องโต้ตอบ User
Preferences (การกำหนดค่าของผู้ใช้) (ดูการตั้งค่าพารามิเตอร์ไฟล์ข้อมูลการแสดงออกของยีนเริม่ ต้น ในหน้า 90)

Graph Data (ข้อมูลกราฟ)ตั้งค่าแกน y เป็นระยะเชิงเส้นเพื่อเปิดใช้ตัวเลือกข้อมูลกราฟ ตัวเลือกข้อมูลกราฟช่วยให้คุณสามารถนำเสนอข้อมูลใน
กราฟโดยใช้ตัวเลือกใดตัวเลือกหนึง่ ต่อไปนี้
n

Relative to control (เปรียบเทียบกับตัวควบคุม) — ทำกราฟข้อมูลที่แกนมีระยะจาก 0 ถึง 1 หากคุณกำหนดตัว
ควบคุมในการทดสอบของคุณ ให้เลือกตัวเลือกนีเ้ พื่อแสดงภาพการเพิ่มปริมาณมากขึน้ และการลดปริมาณลง
ของเป้าหมายได้อย่างรวดเร็ว

n

Relative to zero (เปรียบเทียบกับค่าศูนย์) — ทำกราฟข้อมูลที่มจี ุดเริ่มต้นที่ศน
ู ย์

Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้)ใช้เมนูแบบเลือ่ นลงเพื่อเลือกว่าจะวิเคราะห์และพล็อตข้อมูลอย่างไร ตัวเลือกต่าง ๆ มีดงั นี้nSamples Only (ตัวอย่างเท่านั้น) — ข้อมูลจะได้รบั การวิเคราะห์และพล็อตแบบทีละตัวอย่าง

nBiological Groups Only (กลุม่ ชีวภาพเท่านัน้ ) — ข้อมูลจะได้รับการวิเคราะห์และพล็อตสำหรับกลุ่มชีวภาพ การแสดงออกของกลุ่มชีวภาพคือค่าเฉลีย่ ทางเรขาคณิตของตัวอย่างในกลุ่มดังกล่าว

n

Sample Biological Group (กลุ่มชีวภาพตัวอย่าง) — ข้อมูลจะได้รบั การวิเคราะห์และพล็อตแบบทีละตัวอย่าง
โดยมีกลุ่มชีวภาพต่อท้ายชื่อตัวอย่าง ค่า P-value ที่แสดงคำนวณโดยอิงตามกลุ่มชีวภาพ

nBiological Group Sample (ตัวอย่างกลุ่มชีวภาพ) — ข้อมูลจะได้รบั การวิเคราะห์และพล็อตแบบทีละตัวอย่าง
โดยมีกลุ่มชีวภาพอยู่หน้าชื่อตัวอย่าง ค่า P-value ที่แสดงจะคำนวณโดยอิงตามกลุ่มชีวภาพ

ใช้เมนูแบบเลื่อนลง เพื่อเลือกตัวอย่างที่จะใช้เพื่อทำให้ Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์) เป็นมาตรฐาน

Annotate P-Values (อธิบายค่า P-Values) และ P-Value Threshold (ขีดจำกัดค่า P-Value)เมือ่ เลือก Annotate P-Values (อธิบายค่า P-Values) ซอฟต์แวร์จะแสดงเครือ่ งหมายดอกจัน (*) ในแผนภูมแิ ท่งเหนือ
เป้าหมายหากค่า P-Value ต่ำกว่าขีดจำกัดทีเ่ ลือก ซอฟต์แวร์จะคำนวณค่า P-Value โดยอัตโนมัติโดยเปรียบเทียบ
ระดับการแสดงออกของตัวอย่างกับระดับการแสดงออกของตัวอย่างควบคุมที่เลือกโดยใช้การทดสอบ t-testมาตรฐาน ช่วงขีดจำกัดค่า P-value มีค่าอยู่ระหว่าง 0.000—1.000ตัวเลือกแกน X
ตัวเลือกแกน x ช่วยให้คุณสามารถเลือกข้อมูลแกน x ของแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 259

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

nTarget (เป้าหมาย) — เขียนกราฟชือ่ เป้าหมายบนแกน xn

Sample (ตัวอย่าง) — เขียนกราฟชื่อตัวอย่างบนแกน xตัวเลือกแกน Yตัวเลือกแกน Y ทำให้คณุ สามารถแสดงแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนได้ในสามระดับดังนี้
nเส้นตรง — เลือกตัวเลือกนีเ้ พือ่ แสดงระยะเชิงเส้น
เคล็ดลับ: การกำหนดให้แกน Y เป็นเส้นตรงจะเปิดใช้งานรายการ Graph Data (ข้อมูลกราฟ) แบบเลื่อนลง
ซึง่ คุณสามารถเลือกข้อมูลกราฟที่สมั พันธ์กบั ตัวควบคุมหรือสัมพันธ์กับค่าศูนย์ได้

n

Log 2 — เลือกตัวเลือกนี้เพือ่ ประเมินตัวอย่างในช่วงไดนามิกที่กว้าง

n

Log 10 — เลือกตัวเลือกนีเ้ พื่อประเมินตัวอย่างในช่วงไดนามิกที่กว้างมาก

ตัวเลือกการปรับขนาด
เลือก Normalized Gene Expression (การแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐาน) (ΔΔCq) และตั้ง (ตัวอย่างควบคุม)เป็น None (ไม่มี) เพื่อเปิดใช้งานตัวเลือกการปรับขนาดในแผนภูมกิ ารแสดงออกของยีน เลือกหนึง่ ในตัวเลือกการ
ปรับขนาดเหล่านีเ้ พื่อคำนวณและนำเสนอข้อมูลของคุณในลักษณะที่เหมาะสมกับรูปแบบในการทดสอบของคุณที่สด
ุnUnscaled (ไม่ปรับขนาด) — นำเสนอการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานที่ไม่มกี ารปรับขนาด

nHighest (สูงสุด) — ปรับขนาดการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานสำหรับแต่ละเป้าหมายโดยแบ่งระดับ
การแสดงออกของแต่ละตัวอย่างด้วยระดับการแสดงออกสูงสุดในทุกตัวอย่าง
ตัวเลือกการปรับขนาดนีใ้ ช้สตู รการปรับขนาดให้สงู ที่สด
ุnLowest (ต่ำสุด) — ปรับขนาดการแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐานสำหรับแต่ละเป้าหมายโดยแบ่งระดับ
การแสดงออกของแต่ละตัวอย่างด้วยระดับการแสดงออกต่ำสุดในทุกตัวอย่าง
ตัวเลือกการปรับขนาดนีใ้ ช้สตู รการปรับขนาดให้ต่ำที่สด
ุn

Average (เฉลี่ย) — ปรับขนาดการแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐานสำหรับแต่ละเป้าหมายโดยแบ่งระดับ
การแสดงออกของแต่ละตัวอย่างด้วยค่าเฉลี่ยเรขาคณิตของระดับการแสดงออกสำหรับทุกตัวอย่าง
ตัวเลือกการปรับขนาดนีใ้ ช้สตู รการปรับขนาดเป็นค่าเฉลีย
่เลือกตัวเลือกสำหรับประเภทของการคำนวณข้อผิดพลาด (แถบข้อผิดพลาด) ในแผนภูมิ Gene Expression(การแสดงออกของยีน)Chart Error Bar Multiplier (ตัวคูณแถบข้อผิดพลาดของแผนภูมิ)เลือกตัวคูณสำหรับแถบข้อผิดพลาดของแผนภูมิใน Gene Expression (การแสดงออกของยีน) เลือกหนึง่ ในจำนวน
เต็มเหล่านี้:n+/- 1 (ค่าเริม่ ต้น)

260 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)

n

2

n

3

ชนิดของตัวคูณจะเปลี่ยนแปลงไปเมือ่ คุณเลือกแถบข้อผิดพลาด
n

SEM สำหรับข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลี่ย

n

Std Dev สำหรับค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน

การตัง้ ค่าการทดสอบ
เคล็ดลับ: กล่องโต้ตอบนีม้ อี ยู่ใน Plate Editor (ตัวแก้ไขเพลต) ด้วยเช่นกัน โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมที่
การเปลี่ยนการตั้งค่าการทดสอบ ในหน้า 146ในกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) คุณสามารถดูหรือเปลี่ยนแปลงรายการเป้าหมาย
ตัวอย่าง หรือกลุม่ ชีวภาพ เลือกยีนอ้างอิง เลือกตัวควบคุม หรือตั้งค่ากลุ่มการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่จะทำ
การวิเคราะห์หากมีการเพิ่มกลุ่มชีวภาพลงในหลุม

วิธเี ปิดกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตัง้ ค่าการทดสอบ)uในแท็บ Graphing (การเขียนกราฟ) ให้คลิก Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) ที่ดา้ นล่างของบาน
หน้าต่างด้านขวา
กล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) จะปรากฏขึน้ และแสดงแท็บ Targets (เป้าหมาย)วิธปี รับการตั้งค่า Targets (เป้าหมาย)uในแท็บ Targets (เป้าหมาย) ให้ทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการเลือกให้เป้าหมายเป็นข้อมูลอ้างอิงสำหรับการวิเคราะห์ขอ้ มูลการแสดงออกของยีน ให้เลือกชื่อ
นัน้ ในคอลัมน์ Reference (อ้างอิง)nหากต้องการเปลี่ยนสีของเป้าหมาย ให้คลิกที่ชอ่ งนัน้ ในคอลัมน์ Color (สี) และเปลี่ยนสีในกล่องโต้ตอบ
Color (สี) ที่ปรากฏขึ้น
การเปลี่ยนสีจะปรากฏขึ้นในแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)nหากต้องการใช้ค่าประสิทธิภาพที่กำหนดก่อนหน้านี้ ให้ล้างช่องทำเครือ่ งหมายของเป้าหมายในคอลัมน์
Auto Efficiency (ประสิทธิภาพอัตโนมัติ) และป้อนตัวเลขสำหรับเปอร์เซ็นต์ประสิทธิภาพของเป้าหมาย
ซอฟต์แวร์จะคำนวณประสิทธิภาพเชิงเปรียบเทียบของเป้าหมายโดยใช้ Auto Efficiency (ประสิทธิภาพ
อัตโนมัติ) หากข้อมูลสำหรับเป้าหมายมีเส้นโค้งมาตรฐาน

วิธปี รับการตั้งค่า Sample (ตัวอย่าง)uในแท็บ Samples (ตัวอย่างและกลุม่ ชีวภาพ) ให้ทำหนึ่งในสิ่งต่อไปนี้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 261

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

nหากต้องการเลือกให้ตัวอย่างเป็นตัวควบคุมสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลการแสดงออกของยีน ให้เลือกชื่อนัน
้ในคอลัมน์ Control (ควบคุม)nหากต้องการเปลี่ยนสีของตัวอย่าง ให้คลิกที่ช่องนัน้ ในคอลัมน์ Color (สี) และเปลีย่ นสีในกล่องโต้ตอบ
Color (สี) ที่ปรากฏขึ้น
การเปลี่ยนสีจะปรากฏขึ้นในแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน)nหากต้องการแสดงตัวอย่างในแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้เลือกในคอลัมน์
Show Chart (แสดงแผนภูมิ)nหากต้องการลบตัวอย่างออกจากแผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ให้ลา้ งในคอลัมน์
Show Chart (แสดงแผนภูมิ)เคล็ดลับ: ข้อมูลตัวอย่างจะยังคงอยูใ่ นตาราง Results (ผลลัพธ์)วิธแี ยกประเภทตัวอย่างออกจากการคำนวณการวิเคราะห์uเลือกช่องทำเครือ่ งหมายของประเภทตัวอย่างนัน้ ที่ดา้ นล่างของกล่องโต้ตอบ Experiment Settings (การตั้งค่า
การทดสอบ)หมายเหตุ: การดำเนินการนีจ้ ะแยกตัวควบคุมและ/หรือมาตรฐานออกจากการวิเคราะห์การแสดงออก
ของยีน

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา
คลิกขวาที่แผนภูมกิ ารแสดงออกของยีนเพือ่ เลือกรายการที่แสดงในตาราง 32ตาราง 32 รายการเมนูคลิกขวาของการแสดงออกของยีน

รายการ

ฟังก์ชัน

Copy (คัดลอก)คัดลอกแผนภูมิไปยังคลิปบอร์ด

Save Image As (บันทึกรูปภาพ

บันทึกแผนภูมเิ ป็นไฟล์รูปภาพ ตั้งค่าความละเอียดและขนาดของรูปภาพ

เป็น)จากนัน้ เลือกประเภทไฟล์ (PNG, JPG, หรือ BMP)

Page Setup (ตั้งค่าหน้ากระดาษ)เลือกการตัง้ ค่าหน้ากระดาษสำหรับพิมพ์

Print (พิมพ์)พิมพ์แผนภูมิ

Set Scale to Default (ตั้งค่าการ

Show All (แสดงทัง้ หมด) จะแสดงข้อมูลทั้งหมดในแผนภูมแิ ท่ง Scroll Barปรับขนาดไปทีค่ ่าเริ่มต้น)(แถบเลื่อนหน้าจอ) จะแสดงแถบเลือ่ นหน้าจอหากมีตวั อย่างที่จะแสดงมากเกิน
ไปในกรอบแผนภูมิ โดยความกว้างของแผนภูมิแท่งจะยังคงเท่าเดิม

การตัง้ ค่าแผนภูมิ

262 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEเปิดหน้าต่างตัวเลือกเพือ่ ปรับแผนภูมิGraphing (การเขียนกราฟ)ตาราง 32 รายการเมนูคลิกขวาของการแสดงออกของยีนต่อ

รายการ

ฟังก์ชัน

Sort (จัดเรียง)จัดเรียงลำดับของตัวอย่างหรือเป้าหมายที่ปรากฏบนแกน X ของแผนภูมิ

ใช้ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่แก้ไข

คำนวณแถบข้อผิดพลาดโดยใช้สูตรค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่แก้ไข

ใช้แถบสีทบ
ึแสดงแถบสีทึบในแผนภูมิ

ป้ายแกน X

แสดงป้ายแกน X แนวนอนหรือทำมุม

สเปรดชีตข้อมูล
ตาราง 33 แสดงข้อมูลที่จะปรากฏในตารางข้อมูลการแสดงออกของยีน
หมายเหตุ: ค่าในตารางจะคำนวณตามประเภทกราฟและการตั้งค่าที่เลือกในบานหน้าต่างขวามือ
ตาราง 33 คำอธิบายสารในสเปรดชีตในแท็บ

ข้อมูล

คำอธิบาย

เป้าหมาย

ชือ่ เป้าหมาย (ยีนที่เพิม่ ขึน้ ) ที่เลือกไว้ในหน้าต่าง Experiment Settings (การตัง้ ค่าการทดสอบ)Biological Group (กลุ่มชีวภาพ)ชือ่ ตัวอย่างและ/หรือกลุ่มชีวภาพทีเ่ ลือกไว้ในหน้าต่าง Experiment Settings

Sample Biological Group (กลุ่ม

(การตัง้ ค่าการทดสอบ)ชีวภาพตัวอย่าง)Biological Group Sample(ตัวอย่างกลุม่ ชีวภาพ)ควบคุม

ชือ่ การควบคุมที่เลือกไว้ในหน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) เมื่อมีการตั้งค่า Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Samples Only(ตัวอย่างเท่านั้น) การควบคุมจะเป็นตัวอย่างที่เลือกในหน้าต่าง ExperimentSettings (การตัง้ ค่าการทดสอบ) เมือ่ เลือก Biological Groups Only (กลุ่ม
ชีวภาพเท่านั้น) Sample Biological Group (กลุม่ ชีวภาพตัวอย่าง) หรือBiological Group Sample (ตัวอย่างกลุม่ ชีวภาพ) การควบคุมจะเป็นกลุม
่ชีวภาพที่เลือกในหน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)ปริมาณสัมพัทธ์หรือ SEM หรือปริมาณสัมพัทธ์ (ΔCq) หรือการแสดงออกของยีนทีเ่ ป็นบรรทัดฐาน (ΔΔCq)

การแสดงออก

ขึน้ อยู่กบั โหมดที่เลือก

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 263

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

ข้อมูล

คำอธิบาย

ปริมาณสัมพัทธ์หรือ SEM การแสดง

ข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย
่ (SEM) หรือค่าเบี่ยงเบนมาตรฐาน (SD)ออก (หรือ SD)ของปริมาณสัมพัทธ์หรือการปรับระดับการแสดงออกของยีน ขึน้ อยูก่ ับตัวเลือก
ทีเ่ ลือก ใช้ได้เฉพาะเมือ่ เมือ่ มีการตัง้ ค่า Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้)เป็น Samples Only (ตัวอย่างเท่านัน้ ) Sample Biological Group (กลุ่ม
ชีวภาพตัวอย่าง) หรือ Biological Group Sample (ตัวอย่างกลุ่มชีวภาพ)Corrected Relative Quantityการคำนวณแก้ไขค่า SEM หรือ SD ของปริมาณสัมพัทธ์หรือการปรับระดับ

(ปริมาณสัมพัทธ์ทแี่ ก้ไข) หรือการแสดงออกของยีน ขึน้ อยู่กบั ตัวเลือกทีเ่ ลือก ใช้ได้เฉพาะเมือ่ มีการตัง้ ค่า

SEM การแสดงออก (หรือ SD)

Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Samples Only (ตัวอย่างเท่านั้น)Sample Biological Group (กลุม่ ชีวภาพตัวอย่าง) หรือ Biological Group
Sample (ตัวอย่างกลุ่มชีวภาพ)ค่าเฉลี่ย Cq

ค่าเฉลีย่ ของวงจรการหาปริมาณ (ไม่แสดงหากกำหนด Analyze Using(วิเคราะห์โดยใช้) เป็นกลุม่ ชีวภาพเท่านั้น )Cq SEM (หรือ SD)

SEM หรือ SD ของวงจรการหาปริมาณ ขึ้นอยูก่ ับตัวเลือกที่เลือก (จะไม่แสดง
เมือ่ กำหนด Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็นกลุ่มชีวภาพเท่านั้น)264 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)ตัวเลือกการแสดงรายละเอียด
ตาราง 34 ระบุข้อมูลที่แสดงขึ้นเมือ่ เลือก “Show Details” (แสดงรายละเอียด) จากเมนูคลิกขวาของสเปรดชีตแผนภูมิ
แท่งตาราง 34 ข้อมูลในสเปรดชีตแผนภูมิแท่งที่เลือก Show Details (แสดงรายละเอียด) ไว้ข้อมูล

คำอธิบาย

Data Set (ชุดข้อมูล)ข้อมูลการเรืองแสงจากสารเรืองแสงหนึ่งในไฟล์ข้อมูล

Relative Quantity (ปริมาณ

ปริมาณสัมพัทธ์ที่คำนวณของตัวอย่าง

สัมพัทธ์)Relative Quantity SDค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของการคำนวณปริมาณสัมพัทธ์

(SD ปริมาณสัมพัทธ์)Corrected Relative Quantity SDค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่คำนวณของปริมาณสัมพัทธ์ทแี่ ก้ไข

(SD ปริมาณสัมพัทธ์ที่แก้ไข)Relative Quantity SEMข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการคำนวณปริมาณสัมพัทธ์

(SEM ปริมาณสัมพัทธ์)Corrected Relative Quantityข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของปริมาณสัมพัทธ์ทแี่ ก้ไข

SEM (SEM ปริมาณสัมพัทธ์ที่
แก้ไข)
Relative Quantity (ปริมาณ

Log2 ของปริมาณสัมพัทธ์ทใี่ ช้เพือ่ การวิเคราะห์เชิงสถิติ

สัมพัทธ์) (lg)SD RQ(lg)ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์ (log2)

SEM Expression (lg) (SEM การข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการแสดงออก (Log2)แสดงออก (lg))
Unscaled Expression (การแสดง

Calculated unscaled expression (การแสดงออกทีไ่ ม่มีการปรับขนาดที่

ออกที่ไม่มีการปรับขนาด)คำนวณ)

Unscaled Expression SD (SDค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่คำนวณของการแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาด

การแสดงออกทีไ่ ม่มีการปรับขนาด)Corrected Unscaled Expressionค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่คำนวณของการแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาดทีแ่ ก้ไข

SD (SD การแสดงออกที่ไม่มีการ
ปรับขนาดที่แก้ไข)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 265บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

ตาราง 34 ข้อมูลในสเปรดชีตแผนภูมิแท่งที่เลือก Show Details (แสดงรายละเอียด) ไว้ต่อ

ข้อมูล

คำอธิบาย

Unscaled Expression SEMข้อผิดพลาดมาตรฐานทีค่ ำนวณของค่าเฉลี่ยของการแสดงออกที่ไม่มีการปรับ

(SEM การแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับ

ขนาด

ขนาด)
Corrected Unscaled Expressionข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาดที่

SEM (SEM การแสดงออกที่ไม่มี

คำนวณการปรับขนาดทีแ่ ก้ไข)Unscaled Expression (การแสดง

Log2 ของการแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาด

ออกที่ไม่มีการปรับขนาด (lg))
SD Unscaled Expression (SDค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของการแสดงออกทีไ่ ม่มีการปรับขนาด (log2)การแสดงออกทีไ่ ม่มีการปรับขนาด(lg))
SEM Unscaled Expressionข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาด

(SEM การแสดงออกทีไ่ ม่มกี ารปรับ

(Log2)

ขนาด (lg))การแสดงออก

การแสดงออกของยีนที่เป็นบรรทัดฐาน

Corrected Expression SD (SDค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่คำนวณของการแสดงออกทีแ่ ก้ไข

การแสดงออกทีแ่ ก้ไข)Expression SEM (SEM การแสดง

ข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการแสดงออก

ออก)Corrected Expression SEMข้อผิดพลาดมาตรฐานทีค่ ำนวณจากค่าเฉลี่ยของการแสดงออกที่แก้ไข

(SEM การแสดงออกทีแ่ ก้ไข)Expression (lg)Log2 ของการแสดงออก (การปรับระดับการแสดงออกของยีน) ซึ่งใช้สำหรับ
การวิเคราะห์เชิงสถิติSD Expression (lg) (SD การแสดง

ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของการแสดงออก (log2)

ออก (lg))
SEM Expression (lg) (SEM การข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของการแสดงออก (Log2)แสดงออก (lg))ค่าเฉลี่ย Cq

ค่าเฉลีย่ ของรอบการหาปริมาณ

Cq SD

ค่าเบี่ยนเบนมาตรฐานของรอบการหาปริมาณ

266 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Graphing (การเขียนกราฟ)ตาราง 34 ข้อมูลในสเปรดชีตแผนภูมิแท่งที่เลือก Show Details (แสดงรายละเอียด) ไว้ต่อ

ข้อมูล

คำอธิบาย

Cq SEMข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของรอบการหาปริมาณ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 267

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

Clustergram (คลัสเตอร์แกรม)คลัสเตอร์แกรมแสดงข้อมูลเป้าหมายและตัวอย่างในลำดับขั้นที่องิ ตามปริมาณความเหมือนของการแสดงออก
หมายเหตุ: คุณต้องเลือกเป้าหมายอ้างอิงเพื่อนำข้อมูลที่ไม่ใช่นพิ จน์สมั พัทธ์มาพล็อตเป็นแผนภูมิแท่ง
รูปภาพคลัสเตอร์แกรมอธิบายนิพจน์สมั พัทธ์ของตัวอย่างหรือเป้าหมายดังนี้
n

Upregulation (การเพิม่ ขึน้ ) (สีแดง) — การแสดงออกที่สงู กว่าn

Downregulation (การลดลง) (สีเขียวหรือสีนำ้ เงิน) — การแสดงออกที่ต่ำกว่า

nไม่มีกฏ (สีดำ)nไม่มีคา่ ที่คำนวณ (สีดำที่มี X สีขาว)ยิง่ เฉดสีออ่ นมากเท่าไร การแสดงออกสัมพัทธ์กต็ ่างกันมากขึน้ เท่านัน้ หากสามารถคำนวณค่า Cq มาตรฐานได้
รูปสีเ่ หลี่ยมจัตุรสั จะเป็นสีดำและมีตัว X สีขาว
ที่ขอบด้านนอกของการพล็อตข้อมูลคือเดนโดรแกรม ซึ่งจะระบุลำดับขั้นของการคลัสเตอร์ เป้าหมายหรือตัวอย่างที่มี
รูปแบบการแสดงออกใกล้เคียงกัน จะมีกงิ่ (branch) อยู่ใกล้กนั แต่หากมีรปู แบบการแสดงออกต่างกัน กิง่ ก็จะอยูห่ ่างกันมากขึ้น

การตัง้ ค่าคุณสามารถตัง้ ค่าตัวเลือกต่อไปนี้
n

Cluster By (รวมกลุม่ โดย) — เลือกจากเป้าหมาย ตัวอย่าง ทั้งสอง หรือไม่เลือกเลย

nSize (ขนาด) — ปรับขนาดภาพและเปลี่ยนระดับการขยายแผนภูมิ

n

Split Out Replicates (แยกการทำซ้ำ) — แสดงค่าสำหรับแต่ละการทำซ้ำ

เคล็ดลับ: คุณสามารถเปลี่ยนแบบแผนชุดสีสำหรับจากค่าเริม่ ต้นสีแดง/เขียวเป็นแดง/น้ำเงินได้โดยเลือกตัวเลือกนีจ้ ากเมนูคลิกขวาที่จดุ ของแผนภูมิ

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา
ตัวเลือกเมนูคลิกขวาสำหรับคลัสเตอร์แกรมมีลกั ษณะเหมือนกับตัวเลือกของกราฟแท่ง โปรดดูตัวเลือกที่พร้อมใช้งาน
ได้ที่ตาราง 32 ในหน้า 262 นอกจากนี้ ให้เลือก Color Scheme (แบบแผนชุดสี) เพื่อเปลีย่ นการแสดงออกที่ลดลง
จากค่าเริม่ ต้นสีแดง/เขียวเป็นสีแดง/น้ำเงินในแผนภูมิ

สเปรดชีตข้อมูล
สเปรดชีตข้อมูลจะแสดงค่าสำหรับเป้าหมาย ตัวอย่าง และการปรับระดับการแสดงออกของยีน

268 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแผนภาพกระจาย

แผนภาพกระจาย
แผนภาพกระจายจะแสดงการปรับระดับการแสดงออกของยีนของเป้าหมายสำหรับตัวอย่างควบคุมกับตัวอย่างทดสอบ เส้นใน
แผนภาพแสดงถึงขีดจำกัดสัดส่วนการเปลีย่ นแปลง จุดข้อมูลระหว่างเส้นแสดงว่าความแตกต่างในการแสดงออกของ
เป้าหมาย (ยีน) นัน้ ไม่สำคัญระหว่างตัวอย่างทั้งสอง จุดข้อมูลทีอ่ ยูน่ อกเส้นจะเกินขีดจำกัดการควบคุมสัดส่วนการเปลี่ยน
แปลง และอาจเป็นจุดที่นา่ สนใจภาพของแผนภาพแสดงการเปลี่ยนแปลงต่อไปนีใ้ นการแสดงออกของเป้าหมายตามขีดจำกัดการควบคุมสัดส่วนการเปลีย
่ น
แปลง
n

Upregulation (การเพิม่ ขึน้ ) (วงกลมสีแดง) — การแสดงออกที่คอ่ นข้างสูงกว่า

n

Downregulation (การลดลง) (วงกลมสีเขียวหรือสีนำ้ เงิน) — การแสดงออกทีค่ ่อนข้างต่ำกว่า

n

No change (ไม่มกี ารเปลีย่ นแปลง) (วงกลมสีดำ)คลิกและลากเส้นขีดจำกัดเพื่อปรับค่าขีดจำกัดสัดส่วนการเปลี่ยนแปลง

การตัง้ ค่าคุณสามารถตัง้ ค่าตัวเลือกต่อไปนี้
nตัวอย่างควบคุม

nExperimental Sample (ตัวอย่างทดสอบ)n

Fold Change Threshold (ค่าขีดจำกัดสัดส่วนการเปลีย่ นแปลง) เมือ่ คุณเพิ่มหรือลดค่าการควบคุมสัดส่วนการเป
ลี่ยนแปลง เส้นขีดจำกัดในแผนภาพจะย้ายไปตามการ
เปลีย่ นแปลง

ตัวเลือกเมนูคลิกขวา
ตัวเลือกเมนูคลิกขาสำหรับแผนภาพกระจายจะเหมือนกับตัวเลือกของแผนภูมแิ ท่ง โปรดดูตัวเลือกที่พร้อมใช้งานได้ที่
ตาราง 32 ในหน้า 262 นอกจากนี้ สามารถเลือก Symbol (สัญลักษณ์) เพื่อเปลี่ยนสัญลักษณ์ที่จะใช้ในแผนภาพจาก
วงกลมเริม่ ต้นให้เป็นแบบใดแบบหนึง่ ต่อไปนี้
n

Triangle (สามเหลีย
่ ม)nCross (กากบาท)n

Square (สี่เหลี่ยม)n

Diamond (ข้าวหลามตัด)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 269

บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

สเปรดชีตข้อมูล
สเปรดชีตจะแสดงค่าสำหรับเป้าหมายและการปรับระดับการแสดงออกของยีนสำหรับตัวอย่างควบคุมและตัวอย่าง
ทดสอบ นอกจากนี้ ยังระบุว่าเป้าหมายมีการเพิ่มขึ้นหรือลดลงเมื่อเทียบกับการควบคุมเป้าหมาย

270 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสเปรดชีตผลการทดสอบ

สเปรดชีตผลการทดสอบ
สเปรดชีตผลการทดสอบจะสรุปข้อมูลจากแผนภูมิทงั้ หมด ตาราง 35 ระบุขอ้ มูลที่จะแสดงในสเปรดชีต Results (ผลการทดสอบ)ตาราง 35 ข้อมูลในแท็บ Results (ผลการทดสอบ)ข้อมูล

คำอธิบาย

เป้าหมาย

ชื่อเป้าหมาย (ยีนที่เพิม่ ปริมาณขึน้ )ตัวอย่าง

ชื่อตัวอย่าง

ค่าเฉลี่ย Cq

ค่าเฉลี่ยของรอบการเพิ่มปริมาณ

ค่าเฉลี่ยประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq

ค่าเฉลี่ยของรอบการเพิ่มปริมาณหลังจากปรับค่าประสิทธิภาพของปฏิกริ ิยาการปรับระดับการแสดงออกของยีน

นิพจน์เป้าหมายปรับให้เป็นบรรทัดฐานกับเป้าหมายอ้างอิง (ΔΔCq)

Relative Normalized Expressionการแสดงออกบรรทัดฐานทีส่ ัมพันธ์กบั ตัวอย่างควบคุม เรียกอีกอย่างว่า Fold(การปรับระดับการแสดงออกของยีน

Change (สัดส่วนการเปลี่ยนแปลง)สัมพัทธ์)การควบคุม

การเปลี่ยนแปลงการแสดงออกที่สัมพันธ์กบั ตัวอย่างควบคุม

เมื่อเทียบกับ Regulationการแสดงออกที่มากขึ้นหรือลดลงของตัวอย่างทดสอบขึน้ อยู่กบั การตั้งค่า

Threshold (ขีดจำกัดการควบคุม)ขีดจำกัด

หมายเหตุ: ข้อมูลสำหรับการทำซ้ำจะพบได้เฉพาะในสเปรดชีตของแท็บการวิเคราะห์ขอ้ มูลซึง่ มีการเลือก Split
Out Replicates (แยกการทำซ้ำ) (กล่าวคือ คลัสเตอร์แกรม) อาจมีขอ้ แตกต่างระหว่างข้อมูลการแสดงออกใน
สเปรดชีตการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนหากคุณเลือก “ไม่มี” เป็นตัวอย่างควบคุมบนแผนภูมิแท่ง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 271บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

การศึกษายีน
สร้างการศึกษายีนเพื่อเปรียบเทียบข้อมูลการแสดงออกของยีนจากการทดสอบ PCR แบบเรียลไทม์อย่างน้อยหนึง่ การทดสอบโดยใช้สารสอบเทียบระหว่างการทดสอบเพื่อให้เป็นบรรทัดฐานระหว่างการทดสอบ สร้างการศึกษายีนโดยกา
รเพิ่มข้อมูลจากไฟล์ข้อมูลอย่างน้อยหนึง่ ไฟล์ (นามสกุล. pcrd) ไปยังการศึกษายีน ซอฟต์แวร์จะแบ่งกลุ่มไฟล์ข้อมูล
ให้อยูใ่ นไฟล์เดียว (นามสกุล .mgxd)
หมายเหตุ: จำนวนตัวอย่างสูงสุดที่คณุ สามารถวิเคราะห์ในการศึกษายีนจำกัดไว้ด้วยขนาดของแรมและหน่วย
ความจำเสมือนของคอมพิวเตอร์

การสอบเทียบระหว่างการทดสอบ
การสอบเทียบระหว่างการทดสอบจะดำเนินการโดยอัตโนมัติในการศึกษายีนทั้งหมดสำหรับแต่ละเป้าหมายเพือ่ ปรับ
ความแตกต่างระหว่างการทดสอบระหว่างเป้าหมายต่าง ๆ ที่ทำการวิเคราะห์ในการทดสอบ PCR แบบเรียลไทม์ที่
แยกกัน (กล่าวคือ ไฟล์ .pcrd ที่สร้างขึ้นจากเพลตต่าง ๆ)สำหรับซอฟต์แวร์ที่จะจดจำตัวอย่างเป็นสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบ ต้องร่วมใช้ชื่อเป้าหมาย ชื่อตัวอย่าง
เดียวกัน และหากมีการใช้ ต้องใช้ชื่อชุดชีวภาพในทุกเพลตที่เปรียบเทียบ
หมายเหตุ: ต้องมีตัวอย่างสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบอย่างน้อยหนึง่ ตัวในการศึกษายีนสำหรับการสอบ
เทียบระหว่างการทดสอบที่เกิดขึน้ เป้าหมายที่ไม่มตี ัวอย่างสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบที่เหมาะสมจะได้
รับการประมวลผลโดยไม่มกี ารแก้ไขในการศึกษายีน (ไม่แนะนำ)สารสอบเทียบระหว่างการทดสอบสามารถใช้งานได้สองวิธี
nต่อเป้าหมาย — ไพรเมอร์ PCR ที่แตกต่างกันอาจมีประสิทธิภาพที่แตกต่างกัน โดยค่าเริม่ ต้น สารสอบเทียบ
ระหว่างการทดสอบจะนำไปใช้กบั หลุมทั้งหมดบนเพลตเดียวกันที่มชี ื่อเป้าหมายเดียวกัน เช่น Cq สร้างขึ้นด้วย
การตรวจวิเคราะห์เดียวกัน

nการศึกษาทั้งหมด — ผูใ้ ช้เลือกสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบและนำไปใช้กบั การศึกษายีนทั้งหมด

272 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการศึกษายีน

กล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน)กล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน) ประกอบด้วย 2 แท็บnแท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา) — จัดการการทดสอบในการศึกษายีน
สำคัญ: การเพิ่มหรือลบไฟล์ข้อมูลในการศึกษายีนจะไม่มกี ารเปลี่ยนแปลงข้อมูลในไฟล์ต้นฉบับ

nแท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การศึกษา) — แสดงข้อมูลการแสดงออกของยีนสำหรับการทดสอบร่วมกัน

แท็บการตัง้ ค่าการศึกษา
ตาราง 36 แสดงข้อมูลที่ปรากฏในแท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา)ตาราง 36 แท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา) ในกล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน)Column Title (ชือ่ คอลัมน์)คำอธิบาย

File Name (ชื่อไฟล์)ชื่อของไฟล์ขอ้ มูลการทดสอบ (นามสกุล .pcrd)

File Folder (โฟลเดอร์ไฟล์)ไดเรกทอรีทจี่ ัดเก็บไฟล์ขอ้ มูลสำหรับแต่ละการทดสอบในการศึกษายีน

Date Created (วันทีส่ ร้าง)วันที่รวบรวมข้อมูลการทดสอบ

Well Group Name (ชื่อกลุ่ม

ชื่อกลุม่ หลุมที่เลือกเมื่อมีการเพิ่มไฟล์ลงในการศึกษายีน

หลุม)เคล็ดลับ: หากต้องการวิเคราะห์กลุ่มหลุมหนึ่งกลุม่ ในการศึกษายีน
คุณต้องเลือกกลุม่ หลุมในหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)
ก่อนทีจ่ ะนำเข้าไฟล์ขอ้ มูลไปในการศึกษายีน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 273บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

ตาราง 36 แท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา) ในกล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน)ต่อ

Column Title (ชือ่ คอลัมน์)คำอธิบาย

ขัน
้ ตอน

ขัน
้ ตอนโปรโตคอลทีร่ วมถึงการอ่านเพลตเพื่อเก็บข้อมูล PCR แบบเรียลไทม์

Run Type (ประเภทการ

การทดสอบที่ผู้ใช้กำหนดหรือ PrimePCR™

ทดสอบ)
Protocol Edited (โปรโตคอลที่

หากเลือก แสดงว่าโปรโตคอลที่ใช้สำหรับการทดสอบ PrimePCR ได้รับการ

แก้ไขแล้ว)แก้ไขแล้ว

View Plate (ดูเพลต)เปิดแผนที่เพลตของเพลตที่มขี ้อมูลในแต่ละการทดสอบทีร่ วมอยูใ
่ น Gene
Study (การศึกษายีน)การเตรียมการศึกษายีน
วิธกี ารเตรียมการศึกษายีน
1ก่อนนำเข้าข้อมูลลงในการศึกษายีน ให้ทำดังต่อไปนีใ้ นหน้าต่าง Data Analysis (การวิเคราะห์ขอ้ มูล)nตรวจสอบว่าตัวอย่างที่บรรจุสารเดียวกันมีชื่อเดียวกัน ในการศึกษายีน ซอฟต์แวร์จะถือว่าหลุมทีม่ ีชื่อ
เป้าหมายหรือชื่อตัวอย่างเดียวกันมีตัวอย่างเดียวกัน

nปรับค่าพื้นฐานและค่าขีดจำกัด (Cq) ในแท็บ Quantification (การหาปริมาณ) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพข้อมูล
ในแต่ละการทดสอบ

nเลือกกลุ่มหลุมที่คณุ ต้องการจะรวมไว้ในการศึกษายีน
ในการแสดงข้อมูลจากกลุ่มหลุมกลุม่ หนึง่ ในการศึกษายีน จะต้องเลือกกลุม่ ดังกล่าวก่อนที่จะนำเข้าไฟล์
ข้อมูล

แท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา) จะแสดงรายการการทดสอบทั้งหมดในการศึกษายีน
2ในกล่องโต้ตอบ Gene Study (การศึกษายีน) ให้เลือกแท็บ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา)3คลิก Add Data Files (เพิ่มไฟล์ขอ้ มูล) เพื่อเลือกไฟล์จากหน้าต่างเบราว์เซอร์
เคล็ดลับ: หากต้องการเพิ่มการทดสอบลงในการศึกษายีนอย่างรวดเร็ว ให้ลากไฟล์ขอ้ มูล (นามสกุล .pcrd)
ลงในกล่องโต้ตอบ Study Setup (การตั้งค่าการศึกษา)4

CFX Maestro Dx SE จะทำการวิเคราะห์เพือ่ ศึกษายีนโดยอัตโนมัติเมือ่ คุณเพิ่มไฟล์ข้อมูล เลือกแท็บ Study
Setup (การตั้งค่าการศึกษา) เพื่อดูผลลัพธ์

วิธลี บการทดสอบออกจากการศึกษายีนuเลือกไฟล์อย่างน้อยหนึ่งไฟล์ในรายการและคลิก Remove (ลบ)

274 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการศึกษายีน

วิธเี พิ่มบันทึกเกีย่ วกับการศึกษายีนuป้อนบันทึกเกีย่ วกับไฟล์และการวิเคราะห์ในกล่องข้อความ Notes (บันทึก)แท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การศึกษา)แท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การศึกษา) จะแสดงข้อมูลจาการทดสอบทั้งหมดในการศึกษายีน ตัวเลือกการ
วิเคราะห์ข้อมูลการแสดงออกของยีนจะเหมือนกับไฟล์ข้อมูลเดี่ยว โดยมีขอ้ ยกเว้นดังต่อไปนี้
nสำหรับแผนภูมแิ ท่ง ค่าการสอบเทียบระหว่างการทดสอบ (หากคำนวณ) จะปรากฏขึ้นเมื่อคุณคลิกการสอบเทียบ
ระหว่างการทดสอบ
หมายเหตุ: เฉพาะประเภทตัวอย่างต่อไปนีท้ ี่สามารถใช้เป็นสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบได้
oUnknown (ไม่ทราบ)oStandard (มาตรฐาน)oPositive Control (การควบคุมค่าบวก)Negative control (ตัวอย่างควบคุมค่าลบ) การควบคุมไม่มีเทมเพลต (NTC) และไม่มตี ัวอยย่างการควบคุมรีเวิรส
์แทรนสคริปเทส (NRT) ไม่สามารถใช้เป็นสารสอบเทียบระหว่างการทดสอบได้
n

n

เครือ
่ งมือ Reference Gene Selection (การเลือกยีนอ้างอิง) จะระบุยนี อ้างอิงที่ผา่ นการทดสอบและจัดหมวดหมู่
เป็น ดีเลิศ ยอมรับได้ หรือไม่เสถียร ตามความเสถียรของข้อมูลoยีนอ้างอิงที่ดีเลิศจะมีความเสถียรและแสดงถึงความแตกต่างที่นอ้ ยที่สดุ ในตัวอย่างที่ผา่ นการทดสอบoยีนอ้างอิงที่ยอมรับได้จะไม่มคี วามเสถียรตามหลักการและแสดงถึงความแตกต่างปานกลางในตัวอย่างที่
ผ่านการทดสอบ ใช้ยีนอ้างอิงเหล่านีใ้ นการวิเคราะห์หากไม่มยี ีนอ้างอิงที่ดีเลิศoยีนอ้างอิงที่ไม่มีเสถียรจะแสดงถึงความแตกต่างที่มากเกินไปในตัวอย่างที่ผ่านการทดสอบ ขอแนะนำให้ตัด
ยีนเหล่านี้ออกจากการวิเคราะห์

เครือ่ งมือ PrimePCR Controls (ควบคุม PrimePCR) จะแสดงผลลัพธ์ของตัวอย่างที่ผา่ นการทดสอบในตารางoแท็บ Summary (สรุป) จะแสดงสรุปของตัวอย่างที่ผ่านการทดสอบทัง้ หมด ตัวอย่างที่ผ่านการวิเคราะห์การ
ควบคุมทัง้ หมดจะปรากฏเป็นสีเขียว ตัวอย่างที่ไม่ผ่านการวิเคราะห์การควบคุมอย่างน้อยหนึง่ ครัง้ จะปรากฏ
เป็นสีเหลืองoแท็บ PCR จะแสดงผลลัพธ์ของการวิเคราะห์การควบคุม PCR ที่เป็นผลบวก การวิเคราะห์นจี้ ะตรวจจับการ
ยับยัง้ หรือปัญหาการทดสอบที่สง่ ผลต่อการแสดงออกของยีนoแท็บ RT จะแสดงผลลัพธ์ของการวิเคราะห์การควบคุมการถอดรหัสแบบย้อนกลับ การวิเคราะห์นจี้ ะประเมิน
ประสิทธิภาพของ RT ในเชิงคุณภาพและระบุตัวอย่างที่ประสิทธิภาพของ RT มีแนวโน้มที่จะทำให้เกิดการ
แสดงออกของยีน

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 275บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนoแท็บ gDNA จะแสดงผลลัพธ์ของการวิเคราะห์การควบคุมการปนเปือ
้ น DNA การวิเคราะห์นจี้ ะกำหนดว่า
DNA ในจีโนม (gDNA) มีอยูใ่ นตัวอย่างในระดับที่อาจส่งผลต่อผลลัพธ์ qPCR หรือไม่oแท็บ RQ จะแสดงผลลัพธ์ของการวิเคราะห์คณุ ภาพ RNA (RQ1 และ RQ2) การวิเคราะห์เหล่านี้จะประเมิน
ในเชิงคุณภาพว่าความสมบูรณ์ของ RNA อาจส่งผลต่อการแสดงออกของยีนหรือไม่

ประเภทรายงานการศึกษายีน
ใช้กล่องโต้ตอบ Gene Study Report (รายงานการศึกษายีน) เพื่อจัดเตรียมข้อมูลการศึกษายีนไว้ในรายงาน ตาราง
37 แสดงรายการตัวเลือกทั้งหมดที่พร้อมใช้งานสำหรับรายงานการศึกษายีน
ตาราง 37 ประเภทรายงานการศึกษายีน

ประเภท

ตัวเลือก

คำอธิบาย

หัวข้อ
ชื่อเรื่อง คำบรรยาย และโลโก้สำหรับรายงาน
ข้อมูลรายงาน

วันที่ ชื่อผู้ใช้ ชื่อไฟล์ข้อมูล เส้นทางไฟล์ข้อมูล และกลุม่ ของหลุมทีเ่ ลือกGene Study File Listรายการไฟล์ขอ้ มูลทัง้ หมดใน Gene Study (การศึกษา

(รายการไฟล์การศึกษายีน)ยีน)บันทึก

บันทึกเกีย่ วกับรายงานข้อมูล

การวิเคราะห์การศึกษา: แผนภูมแิ ท่งการตัง้ ค่าการวิเคราะห์

รายการพารามิเตอร์การวิเคราะห์ที่เลือก

แผนภูมิ

แผนภูมิแท่ง Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ที่แสดงข้อมูล

ชื่อเป้าหมาย

รายการเป้าหมายใน Gene Study (การศึกษายีน)ชื่อตัวอย่าง

รายการตัวอย่างใน Gene Study (การศึกษายีน)ข้อมูล

แผ่นงานทีแ่ สดงข้อมูล

ความคงตัวของเป้าหมาย

ข้อมูลความคงตัวของเป้าหมาย

Inter-run Calibration (การข้อมูลการสอบเทียบระหว่างการทดสอบ

สอบเทียบระหว่างการทดสอบ)แผนภูมิ Box-and-Whiskerแผนภูมิ Box-and-Whisker ของ Gene Expression(การแสดงออกของยีน)276 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการศึกษายีน

ตาราง 37 ประเภทรายงานการศึกษายีนต่อ

ประเภท

ตัวเลือก

คำอธิบาย

แผนภูมิจด
ุแผนภูมิจดุ ของ Gene Expression (การแสดงออกของ
ยีน)การวิเคราะห์การศึกษา: คลัสเตอร์แกรมและแผนภาพกระจาย
การตัง้ ค่าการวิเคราะห์

การตัง้ ค่าสำหรับแผนภูมแิ ต่ละประเภท

แผนภูมิ

แผนภูมิ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) ที่แสดงข้อมูล

ข้อมูล

แผ่นงานทีแ่ สดงรายการข้อมูลในแต่ละเป้าหมาย

การวิเคราะห์การศึกษา: ข้อมูล ANOVAการตัง้ ค่า ANOVAขีดจำกัดค่า P ที่ใช้ในการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ ANOVAตารางผลลัพธ์จากการวิเคราะห์ ANOVA และ Tukey's
HSD post-hocการทดสอบ Shapiro-Wilkกลุม่ ชีวภาพ จำนวน ค่า P และข้อผิดพลาดทีเ่ กิดขึน้ กับ

Normalityแต่ละเป้าหมายในการวิเคราะห์

ข้อผิดพลาด ANOVAข้อผิดพลาดทีพ่ บระหว่างการคำนวณ ANOVAคูม่ ือผูใ้ ช้ | 277บทที่ 12 การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน

การสร้างรายงานการศึกษายีน
วิธกี ารสร้างรายงานการศึกษายีน
1ปรับข้อมูลรายการการศึกษายีนและแผนภูมติ ามต้องการก่อนสร้างรายงาน

2เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > รายงานในเมนู Gene Study (การศึกษายีน) เพื่อเปิดกล่องโต้ตอบ Report (รายงาน)3เลือกตัวเลือกที่คณุ ต้องการใส่ไว้ในรายงาน รายงานจะเปิดขึน้ โดยตัวเลือกเริ่มต้นที่เลือกไว้ เลือกหรือล้างช่องทำ
เครือ่ งหมายเพื่อเปลีย่ นทั้งหมวดหมูห่ รือตัวเลือกแต่ละรายการภายในหมวดหมู่
ประเภทรายงานการศึกษายีน ในหน้า 276 แสดงตัวเลือกที่พร้อมใช้งานในการแสดงผล

4

เปลีย
่ นลำดับของหมวดหมูแ่ ละรายการในรายงาน ลากตัวเลือกไปยังตำแหน่งที่ต้องการ สามารถจัดเรียงรายการ
ใหม่ภายในหมวดหมู่ทรี่ ายการนัน้ อยูเ่ ท่านัน
้

5คลิก Update Report (อัปเดตรายงาน) เพื่ออัปเดต Report Preview (รายงานตัวอย่าง) เมือ่ มีการเปลีย่ นแปลงใด ๆ

6พิมพ์หรือบันทึกรายงาน คลิกปุ่ม Print Report (พิมพ์รายงาน) ในแถบเครื่องมือเพือ่ พิมพ์รายงานปัจจุบนั เลือก
File (ไฟล์) > Save (บันทึก) เพือ่ บันทึกรายงานในรูปแบบไฟล์ PDF (ไฟล์ Adobe Acrobat Reader) และเลือก
ตำแหน่งที่จะบันทึกไฟล์ เลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) เพื่อบันทึกรายงานด้วยชื่อใหม่หรือใน
ตำแหน่งใหม่

7(ไม่บังคับ) สร้างเทมเพลตรายงานที่มขี อ้ มูลที่คุณต้องการ หากต้องการบันทึกการตั้งค่ารายงานปัจจุบนั ในเทมเพลต ให้เลือก Template (เทมเพลต) > Save (บันทึก) หรือ Save As (บันทึกเป็น) จากนัน้ ให้โหลด
เทมเพลตรายงานเมือ่ คุณต้องการสร้างรายงานใหม่ในครัง้ ต่อไป

278 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ้ มูลซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition จะคำนวณสูตรโดยอัตโนมัติและแสดงผลลัพธ์ในแท็บ Data
Analysis (การวิเคราะห์ข้อมูล) ภาคผนวกนีอ้ ธิบายวิธกี ารที่ CFX Maestro Dx SE คำนวณสูตรโดยละเอียด

ค่าประสิทธิภาพของปฏิกิรยิ าหลักฐานแสดงให้เห็นว่าการใช้การวัดประสิทธิภาพของไพรเมอร์และชุดโพรบแต่ละชุดอย่างแม่นยำจะทำให้คณุ ได้ผลลัพธ์ที่แม่นยำมากขึ้นเมือ่ วิเคราะห์ข้อมูลการแสดงออกของยีน ค่าประสิทธิภาพเริม่ ต้นที่ใช้ในการคำนวณการ
แสดงออกของยีนคือ 100% หากต้องการประเมินค่าประสิทธิภาพของปฏิกริ ยิ า ให้สร้างเส้นโค้งมาตรฐานโดยใช้การ
เจือจางตัวอย่างที่เป็นตัวแทนอย่างต่อเนือ่ งในช่วงไดนามิกที่เกี่ยวข้อง และบันทึกประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การ
แสดงออกของยีนต่อไป หากการทดสอบของคุณมีการทำเส้นโค้งมาตรฐาน ซอฟต์แวร์จะคำนวณประสิทธิภาพโดย
อัตโนมัติและแสดงผลดังกล่าวใน Standard Curve (เส้นโค้งมาตรฐาน) บนแท็บ Quantification (การหาปริมาณ)เมือ่ ทำเครือ่ งหมายเลือก Auto Efficiency (ประสิทธิภาพโดยอัตโนมัติ) ในแท็บ Targets (เป้าหมาย) ในหน้าต่าง
Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ)ประสิทธิภาพ (E) ในสูตรคำนวณประสิทธิภาพ หมายถึง "ประสิทธิภาพ" ตามทีอ่ ธิบายโดย Pfaffl (2001) และ
Vandesompele et al. (2002) ในบทความเหล่านี้ ประสิทธิภาพของ 2 (การเพิ่มขึน้ เป็นสองเท่าที่สมบูรณ์ในทุกรอบ)จะเท่ากับประสิทธิภาพ 100% ในซอฟต์แวร์นี้ คุณมีตัวเลือกในการแปลงการคำนวณประสิทธิภาพของคุณเป็นการ
คำนวณทีใ่ ช้ในซอฟต์แวร์โดยใช้ความสัมพันธ์ทางคณิตศาสตร์ต่อไปนี้
n

E = (%ประสิทธิภาพ * 0.01) + 1

n% ประสิทธิภาพ = (E – 1) * 100

Relative Quantity (ปริมาณสัมพัทธ์)สูตรสำหรับปริมาณสัมพัทธ์ (ΔCq) สำหรับตัวอย่างใด ๆ (GOI) คือหมายเหตุ: สูตรนีใ้ ช้ในการคำนวณปริมาณสัมพัทธ์เมือ่ ไม่มกี ารกำหนดตัวอย่างควบคุม
โดยnE = ประสิทธิภาพของไพรเมอร์และชุดโพรบ ประสิทธิภาพนีค้ ำนวณด้วยสูตร
(% ประสิทธิภาพ * 0.01) + 1 โดยที่ประสิทธิภาพ 100% = 2nC q (min) = Cq เฉลีย่ สำหรับตัวอย่างที่มีคา่ เฉลีย
่ Cq ต่ำสุดสำหรับ GOIคูม่ ือผูใ้ ช้ | 279ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

C q (sample) = Cq เฉลี่ยสำหรับตัวอย่าง

n

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)ปริมาณสัมพัทธ์เมื่อมีการเลือกตัวควบคุม
เมือ่ มีการกำหนดตัวอย่างควบคุมหรือกลุ่มชีวภาพ จะมีการคำนวณปริมาณสัมพัทธ์ (RQ) สำหรับตัวอย่างที่มย
ี น
ี ทีส
่ นใจ
(GOI) โดยใช้สตู รดังต่อไปนี้

โดยnE = ประสิทธิภาพของไพรเมอร์และชุดโพรบ ประสิทธิภาพนีค้ ำนวณด้วยสูตร
(% ประสิทธิภาพ * 0.01) + 1 โดยที่ประสิทธิภาพ 100% = 2nCq (ควบคุม) = ค่าเฉลี่ย Cq สำหรับตัวอย่างควบคุมn

Cq (ตัวอย่าง) = ค่าเฉลี่ย Cq สำหรับตัวอย่างใด ๆ ที่มี GOIn

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์
สำคัญ: การคำนวณนีใ้ ช้ได้เฉพาะเมือ่ มีการตั้ง Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Samples Only (ตัวอย่าง
เท่านั้น) Sample Biological Group (กลุม่ ชีวภาพตัวอย่าง) หรือ Biological Group Sample (ตัวอย่างกลุม
่ชีวภาพ)สูตรสำหรับค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์คอ
ื

โดย
n

SD Relative Quantity = ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์n

SD CqGOI ตัวอย่าง = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานของ Cq สำหรับตัวอย่าง (GOI)nปริมาณสัมพัทธ์ = ปริมาณสัมพัทธ์สำหรับตัวอย่าง

n

E = ประสิทธิภาพของไพรเมอร์และชุดโพรบ ประสิทธิภาพนีค้ ำนวณด้วยสูตร
(% ประสิทธิภาพ * 0.01) + 1 โดยที่ประสิทธิภาพ 100% = 2n

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)280 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq (CqE)ประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq (CqE)สูตรคำนวณสำหรับประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq คือโดยnE = ประสิทธิภาพ

ค่าเฉลี่ยประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq (MCqE)สูตรคำนวณสำหรับค่าเฉลี่ยประสิทธิภาพที่แก้ไข Cq คือโดยnCqE = ประสิทธิภาพที่แก้ไข Cqnn = จำนวนการทำซ้ำ

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 281

ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ้ มูลการปรับระดับการแสดงออกของยีน
Normalized expression (การแสดงออกบรรทัดฐาน) (ΔΔCq) เป็นปริมาณสัมพัทธ์ของเป้าหมายของคุณ (ยีน) ที่ปรับ
ให้เป็นบรรทัดฐานกับปริมาณเป้าหมายอ้างอิง (ยีนหรือลำดับ) ในระบบชีวภาพของคุณ หากต้องการเลือกเป้าหมาย
อ้างอิง ให้เปิดหน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) และคลิกคอลัมน์อา้ งอิงสำหรับแต่ละเป้าหมาย
ที่ทำหน้าที่เป็นยีนอ้างอิง
สูตรสำหรับการแสดงออกบรรทัดฐาน ซึง่ ใช้การคำนวณปริมาณสัมพัทธ์ (RQ) ที่คำนวณได้ คือโดยn

RQ = ปริมาณสัมพัทธ์ของตัวอย่าง

n

Ref = เป้าหมายอ้างอิงในการทดสอบที่มเี ป้าหมายการอ้างอิงอย่างน้อยหนึง่ รายการในแต่ละตัวอย่าง

n

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)โดยมีเงื่อนไขว่า เป้าหมายอ้างอิงจะไม่เปลี่ยนแปลงระดับการแสดงออกในระบบชีวภาพของคุณ การคำนวณการแสดง
ออกบรรทัดฐานจะพิจารณาถึงความแตกต่างในการโหลดหรือความแตกต่างของจำนวนเซลล์ที่เป็นตัวแทนในแต่ละ
ตัวอย่างของคุณ

282 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการปรับระดับการแสดงออกของยีนเมื่อมีการเลือกตัวควบคุม

การแสดงออกของยีนเชิงปริมาณสำหรับกลุม่ ตัวอย่างชีวภาพ
เมือ่ ตั้งค่า Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Biological Groups Only (กลุ่มชีวภาพเท่านัน้ ) ซอฟต์แวร์จะแสดง
ผลการแสดงออกเฉลี่ย (นิพจน์บรรทัดฐานหรือปริมาณสัมพัทธ์ ตามการเลือกโหมด) ของตัวอย่างต่าง ๆ ภายในกลุม
่ชีวภาพ เนือ่ งจากนิพจน์มกี ารกระจายแบบปกติที่มกี ารบันทึกทัว่ ไป จึงมีการเฉลีย่ การแสดงออกโดยใช้ค่าเฉลี่ยเรขา
คณิต

โดย
n

Exp1, Exp2, Expn = ปริมาณสัมพัทธ์หรือนิพจน์ทเี่ ป็นบรรทัดฐานของตัวอย่างต่าง ๆ ในกลุ่มชีวภาพ

nn = จำนวนตัวอย่างในกลุ่มชีวภาพ

การปรับระดับการแสดงออกของยีนเมือ่ มีการเลือกตัวควบคุม
เมือ่ คุณเลือกตัวอย่างควบคุมในหน้าต่าง Experiment Settings (การตั้งค่าการทดสอบ) ซอฟต์แวร์จะกำหนดระดับ
การแสดงออกของตัวอย่างการควบคุมเป็น 1 ในสถานการณ์เช่นนี้ ซอฟต์แวร์จะทำการปรับบรรทัดฐานปริมาณ
สัมพัทธ์ของการแสดงออกเป้าหมายทั้งหมด (ยีน) เป็นปริมาณการควบคุม (ค่าเท่ากับ 1) การปรับระดับการแสดงออก
ของยีนนีเ้ ทียบเท่ากับการวิเคราะห์การแสดงออกบรรทัดฐานทีไ่ ม่มกี ารปรับขนาดเมือ่ เลือกตัวควบคุม
หมายเหตุ: ยังเป็นที่รจู้ ักกันในชื่อการแสดงออกสัมพัทธ์บรรทัดฐาน (RNE) และสัดส่วนการเปลี่ยนแปลง

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 283

ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ้ มูลค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานสำหรับการปรับระดับการแสดงออกของยีน
การปรับค่าการปรับระดับการแสดงออกของยีน (NE) ทำได้โดยการหารค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน (SD) ของการปรับ
ระดับการแสดงออกของยีนด้วยค่าการปรับระดับการแสดงออกของยีนสำหรับระดับการแสดงออกสูงสุดหรือต่ำสุด
โดยขึน้ อยูก่ บั ตัวเลือกการปรับที่คณุ เลือก สูตรสำหรับค่าเบี่ยงเบนมาตรฐาน (SD) ของตัวคูณปรับบรรทัดฐานคือ

โดยn

RQ = ปริมาณสัมพัทธ์ของตัวอย่าง

n

SD = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน

n

NF = ตัวคูณปรับบรรทัดฐาน

n

Ref = เป้าหมายอ้างอิง

nn = จำนวนเป้าหมายอ้างอิง

เมือ่ มีการกำหนดตัวอย่างควบคุม คุณไม่จำเป็นต้องใช้ฟงั ก์ชันการปรับขนาดนีก้ บั ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน ตามที่แสดง
ในสูตรดังต่อไปนี้

โดยnNE = การปรับระดับการแสดงออกของยีน

n

RQ = ปริมาณสัมพัทธ์ของตัวอย่าง

n

SD = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน

n

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)284 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEปรับนิพจน์บรรทัดฐานเป็นระดับการแสดงออกเฉลี่ย

ปรับนิพจน์บรรทัดฐานเป็นระดับการแสดงออกเฉลี่ย
เมือ่ การดำเนินการไม่รวมตัวควบคุม ให้ปรับการปรับระดับการแสดงออกของยีน (NE) สำหรับแต่ละเป้าหมาย (ยีน)โดยแบ่งระดับการแสดงออกของแต่ละตัวอย่างโดยใช้การแสดงออกระดับสูงสุดในตัวอย่างทั้งหมด ซอฟต์แวร์จะ
กำหนดการแสดงออกระดับสูงสุดให้เป็นค่าเท่ากับ 1 และจะปรับระดับการแสดงออกของตัวอย่างทั้งหมดอีกครัง้ สูตรสำหรับการปรับขนาดสูงสุดคือโดยn

GOI = ยีนที่สนใจ (เป้าหมาย)ปรับการปรับระดับการแสดงออกของยีนเป็นระดับการแสดงออกต่ำสุด
เมือ่ การดำเนินการไม่รวมตัวควบคุม ให้ปรับการแสดงออกบรรทัดฐาน (NE) สำหรับแต่ละเป้าหมาย (ยีน) โดยแบ่ง
ระดับการแสดงออกของแต่ละตัวอย่างโดยใช้การแสดงออกระดับต่ำสุดในตัวอย่างทั้งหมด ซอฟต์แวร์จะกำหนดการ
แสดงออกระดับต่ำสุดให้เป็นค่าเท่ากับ 1 และจะปรับระดับการแสดงออกของตัวอย่างทั้งหมดอีกครัง้ สูตรสำหรับการ
ปรับขนาดต่ำสุดคือโดยn

GOI = ยีนที่สนใจ (เป้าหมาย)ปรับขนาดการแสดงออกบรรทัดฐานเป็นระดับการแสดงออกเฉลีย่เมือ่ การดำเนินการไม่รวมตัวควบคุม ให้ปรับขนาดการแสดงออกบรรทัดฐาน (NE) สำหรับแต่ละเป้าหมาย (ยีน) โดยแบ่งระดับการแสดงออกของแต่ละตัวอย่างโดยใช้คา่ เฉลีย่ เรขาคณิตของการแสดงออกของตัวอย่างทั้งหมด ซอฟต์
แวร์จะกำหนดระดับเฉลี่ยของการแสดงออกเป็นค่าเท่ากับ 1 และจะปรับขนาดระดับการแสดงออกของตัวอย่างทั้งหมด
สูตรคำนวณการปรับขนาดเฉลีย
่ คือ

โดย
n

GOI = ยีนที่สนใจ (เป้าหมาย)n

GM = ค่าเฉลี่ยเรขาคณิตของการปรับระดับการแสดงออกของยีนสำหรับตัวอย่างทั้งหมด

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 285ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ้ มูลค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานสำหรับการแสดงออกบรรทัดฐานที่มกี ารปรับขนาด
การปรับขนาดค่าการแสดงออกบรรทัดฐาน (NE) ที่มกี ารปรับขนาด จะทำได้โดยการหารค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน (SD)ของการแสดงออกบรรทัดฐานด้วยค่าการแสดงออกบรรทัดฐานสำหรับระดับการแสดงออกสูงสุด (MAX) หรือต่ำสุด
(MIN) โดยขึ้นอยู่กบั ตัวเลือกการปรับขนาดที่คณุ เลือก
หมายเหตุ: เมือ่ มีการกำหนดตัวอย่างควบคุม คุณไม่จำเป็นต้องใช้ฟังก์ชนั การปรับขนาดกับค่าเบี่ยงเบน
มาตรฐาน
การคำนวณสูตรนี้คอ
ื

โดย
n

NE = การปรับระดับการแสดงออกของยีน

n

SD = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน

n

GOI = ยีนที่สนใจ (เป้าหมาย)n

MAX = ระดับการแสดงออกสูงสุด

n

MIN = ระดับการแสดงออกต่ำสุด

286 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEแถบแสดงข้อผิดพลาดสำหรับค่าการเบีย่ งเบนมาตรฐาน (lg) และข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย
่ (lg)

แถบแสดงข้อผิดพลาดสำหรับค่าการเบี่ยงเบนมาตรฐาน (lg) และข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลี่ย (lg)นอกเหนือจากการใช้ช่วงความเชือ่ มั่นแล้ว แถบแสดงข้อผิดพลาดอาจปรากฏขึน้ สำหรับกลุม่ ชีวภาพตามค่าเบีย่ งเบน
มาตรฐานหรือข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลีย่ ของ Log2 ของนิพจน์ แถบข้อผิดพลาดคำนวณดังนี้
RQ Lower Error Bar = 2RQ(lg)-SD RQ(lg) หรื อ 2RQ(lg)-SEM RQ(lg)RQ Upper Error Bar = 2RQ(lg)+SD RQ(lg) หรื อ 2RQ(lg)+SEM RQ(lg)โดยnRQ(lg) = log2 ของปริมาณสัมพัทธ์ของกลุม่ ชีวภาพn

SD RQ(lg) = ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณสัมพัทธ์ (log2)n

SEM RQ(lg) = ข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลี่ยของปริมาณสัมพัทธ์ (log2)

Exp. Lower Error Bar = 2

Exp.(lg)-SD Exp.(lg)หรือ 2Exp.(lg)-SEM Exp.(lg)Exp. Upper Error Bar = 2Exp.(lg)+SD Exp.(lg) หรื อ 2Exp.(lg)+SEM Exp.(lg)โดยnExp.(lg) = log2 ของนิพจน์ (นิพจน์บรรทัดฐาน) สำหรับกลุ่มชีวภาพn

SD RQ(lg) = ค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของนิพจน์ (log2)n

SEM RQ(lg) = ข้อผิดพลาดมาตรฐานของค่าเฉลี่ยของนิพจน์ (log2)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 287ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ้ มูลสัดส่วนการเปลี่ยนแปลง
Fold change (สัดส่วนการเปลี่ยนแปลง) เป็นการวัดการเพิ่มหรือลดการแสดงออกของเป้าหมายสำหรับตัวอย่าง
ทดลองเทียบกับตัวอย่างควบคุมหรือกลุ่มชีวภาพ และประเมินดังนี้
หากการแสดงออก (ทดสอบ) > การแสดงออก (ควบคุม)หากการแสดงออก (ทดสอบ) < การแสดงออก (ควบคุม)หมายเหตุ: สำหรับการเขียนกราฟ การแสดงออกจะเปลี่ยนไปตามปริมาณสัมพัทธ์หรือการแสดงออกบรรทัดฐาน
ที่ขนึ้ อยูก่ บั โหมดที่เลือก (โปรดดูGraphing (การเขียนกราฟ) ในหน้า 252) อย่างไรก็ตาม สำหรับสัดส่วนการ
เปลีย่ นแปลงของแผนภาพกระจาย และคลัสเตอร์แกรม จะคำนวณจากการปรับระดับการแสดงออกของยีนเสมอ

288 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEสูตรการคำนวณค่าที่ถกู ต้อง

สูตรการคำนวณค่าทีถ่ ูกต้อง
สำคัญ: การคำนวณเหล่านีใ้ ช้ได้เฉพาะเมือ่ มีการตั้ง Analyze Using (วิเคราะห์โดยใช้) เป็น Samples Only (ตัวอย่างเท่านัน้ ) Sample Biological Group (กลุ่มชีวภาพตัวอย่าง) หรือ Biological Group Sample (ตัวอย่างกลุม
่ชีวภาพ)โดยจะเห็นความแตกต่างระหว่างค่าที่มกี ารแก้ไขเฉพาะเมือ่ สร้างเส้นโค้งมาตรฐานเป็นส่วนหนึง่ ของการทำ PCRแบบเรียลไทม์ ซอฟต์แวร์ใช้สมการสามแบบเพื่อกำหนดการแพร่กระจายที่ผิดพลาดคือ
nข้อผิดพลาดมาตรฐาน

nข้อผิดพลาดมาตรฐานสำหรับนิพจน์บรรทัดฐาน

nข้อผิดพลาดมาตรฐานสำหรับยีนทีส่ นใจ (เป้าหมาย) ที่เป็นบรรทัดฐาน

สูตรสำหรับข้อผิดพลาดมาตรฐานคือ

โดยnn = จำนวนเป้าหมายอ้างอิง (ยีน)

n

SD = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐาน

ข้อผิดพลาดมาตรฐานสำหรับตัวคูณปรับบรรทัดฐานในสูตรนิพจน์บรรทัดฐานคือ

โดยnn = จำนวนเป้าหมายอ้างอิง

n

SE = ข้อผิดพลาดมาตรฐาน

n

NF = ตัวคูณปรับบรรทัดฐาน

n

RQ = ปริมาณสัมพัทธ์

ข้อผิดพลาดมาตรฐานสำหรับสูตรยีนที่สนใจ (GOI) ที่เป็นบรรทัดฐานคือ

โดยnSE = ข้อผิดพลาดมาตรฐาน

n

GOI = ยีนที่สนใจ (หนึ่งเป้าหมาย)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 289

ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

n

NF = ตัวคูณปรับบรรทัดฐาน

nn = จำนวนเป้าหมายอ้างอิง

การคำนวณช่วงความเชือ่ มัน่ สำหรับการวิเคราะห์กลุ่มชีวภาพ
เมือ่ ดำเนินการวิเคราะห์กลุ่มชีวภาพ (วิเคราะห์โดยใช้เฉพาะชุดกลุ่มชีวภาพเท่านั้น) จะมีการคำนวณช่วงความเชื่อมัน
่สำหรับปริมาณสัมพัทธ์และการปรับระดับการแสดงออกของยีนสัมพัทธ์
โดยมีการคำนวณช่วงความเชือ่ มัน่ ในกราฟแบบล็อกสเกลบนการกระจายค่าแบบ T โดยใช้สูตรดังต่อไปนี้

โดยn= นิพจน์คา่ เฉลีย่ ของระดับการแสดงออกแบบล็อกสเกลของตัวอย่างในกลุ่มชีวภาพ

n

SD = ค่าเบีย่ งเบนมาตรฐานของระดับการแสดงออกแบบล็อกสเกลของตัวอย่างในกลุม่ ชีวภาพ

nn = จำนวนตัวอย่างในกลุ่มชีวภาพ

nt = ได้จากการกระจายค่าแบบ T ตามองศาอิสระและระดับอัลฟา
หมายเหตุ: สามารถตั้งค่าระดับอัลฟาได้โดยใช้ช่องขีดจำกัดค่า P ในแท็บ Graphing (การเขียนกราฟ)หลังจากคำนวณช่วงความเชื่อมั่นแล้ว จะแปลเป็นระยะเชิงเส้นและแสดงใน Gene Expression Data Table (ตาราง
การแสดงออกของยีน) และแท็บ Graphing (การเขียนกราฟ)การคำนวณแผนภูมิ Box and Whiskerแผนภูมิ Box and Whisker แสดงการกระจายค่าการแสดงออกภายในกลุ่มชีวภาพโดยการพล็อตข้อมูลเป็นสีส่ ว่ นส่วนที่ 1 และส่วนที่ 3 แสดงด้วยเส้นขอบบนและขอบล่างของกล่องตามลำดับ ค่ามัธยฐานแสดงด้วยเส้นทึบตามขวาง
ของกล่อง จำนวนเพียงเล็กน้อยแสดงค่าผิดปกติต่ำสุดและสูงสุดในชุดข้อมูล ค่าผิดปกติคอื ค่าที่เกินกว่าส่วนที่ 1 และส่วนที่ 3 ไป 1.5 เท่าของพิสยั ระหว่างส่วนที่หนึง่ กับส่วนที่สามจากสีส่ ว่ นหมายเหตุ: หากมีเพียงตัวอย่างเดียวในกลุม่ ชีวภาพ จะแสดงเป็นวงกลมเดียวซึง่ ระบุจดุ ข้อมูลเดียว
แผนภูมิ Box and Whisker ต่อไปนีแ้ สดงให้เห็นวิธกี ารแสดงข้อมูลเหล่านี้

290 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการคำนวณแผนภูมิ Box and Whiskerคำอธิบายสัญลักษณ์
1ค่าผิดปกติ ค่าผิดปกตินี้คือ > Q3 + (1.5 x [Q3 - Q1])
หมายเหตุ: วางเคอร์เซอร์บนวงกลมเพื่อดูปลายเครื่องมือที่แสดงชื่อตัวอย่างและปริมาณสัมพัทธ์หรือ
ข้อมูลการปรับระดับการแสดงออกของยีนตามโหมดที่เลือก

2เส้นแบ่งค่าไม่ผิดปกติสูงสุด

3ส่วนบน/ส่วนที่ 3 (Q3) 75% ของค่าการแสดงออกน้อยกว่า Q3

4ค่ามัธยฐานหรือค่าปานกลางของค่าการแสดงออกตามลำดับขัน
้

5ส่วนล่าง/ส่วนที่ 1 (Q1) 25% ของค่าการแสดงออกน้อยกว่า Q1

6เส้นแบ่งค่าไม่ผิดปกติต่ำสุด

7ค่าผิดปกติ ค่าผิดปกตินี้เท่ากับ < Q1 - (1.5 x [Q3 - Q1])คูม่ ือผูใ้ ช้ | 291

ภาคผนวก A การคำนวณการวิเคราะห์ขอ
้ มูล

292 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก B เส้นทางการตรวจสอบ
ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition สร้างเส้นทางการตรวจสอบสำหรับข้อมูลและไฟล์การศึกษายีน (ไฟล์.prcd และ .mgxd ตามลำดับ) การเปลีย่ นแปลงหรือการดำเนินการใด ๆ กับข้อมูลที่ปลอดภัยและไฟล์การศึกษายีนจะ
บันทึกไว้ในเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์เมือ่ บันทึกไฟล์ CFX Maestro Dx SE จะสร้างเส้นทางการตรวจสอบแยก
กันสำหรับแต่ละไฟล์
คุณสามารถเลือก File (ไฟล์) > Save As (บันทึกเป็น) และบันทึกข้อมูลที่ลงนามหรือไม่ได้ลงนามที่ปลอดภัยและไฟล์
การศึกษายีนลงในโฟลเดอร์อนื่ หรือด้วยชื่ออืน่ ไฟล์ใหม่จะสืบทอดเส้นทางการตรวจสอบจากไฟล์ต้นฉบับ เส้นทาง
การตรวจสอบสำหรับไฟล์ใหม่ยงั รวมถึงกิจกรรม Save As (บันทึกเป็น) ด้วย การเปลี่ยนแปลงหรือการดำเนินการใน
ไฟล์ใหม่จะถูกบันทึกในเส้นทางการตรวจสอบของไฟล์ใหม่นนั้ ไฟล์ต้นฉบับยังคงมีเส้นทางการตรวจสอบซึง่ จะบันทึก
กิจกรรมเพิม่ เติมในอนาคตได้อีก
กิจกรรมทีต่ รวจสอบได้ ในหน้า 295 จะแสดงรายการกิจกรรมที่สามารถตรวจสอบได้ที่ซอฟต์แวร์บนั ทึกไว้

การดูเส้นทางการตรวจสอบ
แต่ละเส้นทางการตรวจสอบจะแสดงข้อมูลต่อไปนี้
nnรายละเอียดส่วนหัวของการตรวจสอบoเวอร์ชันไฟล์ — เวอร์ชันของไฟล์ที่บน
ั ทึก

o

วันที่ — วันที่ของกิจกรรมที่ตรวจสอบได้ในปัจจุบันoผู้ใช้ — โดเมน Windows และชื่อผู้ใช้ของผู้ใช้ที่เข้าสูร่ ะบบoความคิดเห็น — ความคิดเห็นที่บันทึกไว้ล่าสุดoลายเซ็น — ลายเซ็นอิเล็กทรอนิกส์ของบุคคลสุดท้ายที่เซ็นชื่อในไฟล์oเหตุผลที่ลงลายเซ็น — เหตุผลสำหรับการลงลายเซ็นoแอปพลิเคชัน — CFX Maestro Dx SEoเวอร์ชันแอปพลิเคชัน — เวอร์ชันปัจจุบนั ของ CFX Maestro Dx SEoชื่อ-สกุลของผูใ้ ช้ — ชื่อ-สกุลของผู้ใช้ที่เข้าสูร่ ะบบ

o

เครือ
่ ง — คอมพิวเตอร์ที่ติดตั้ง CFX Maestro Dx SEรายละเอียดการเปลี่ยนแปลงการตรวจสอบoรายการ — รายการทีเ่ ปลี่ยนแปลง (รายการที่ตรวจสอบ)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 293ภาคผนวก B เส้นทางการตรวจสอบoค่าเก่า — ค่าก่อนหน้าoค่าใหม่ — ค่าใหม่oคำอธิบาย — คำอธิบายที่ทำการเปลี่ยนแปลง

วิธดี เู ส้นทางการตรวจสอบuในไฟล์ข้อมูลหรือไฟล์การศึกษายีนที่เปิดอยู่ ให้เลือก View (ดู) > Audit Trail (เส้นทางการตรวจสอบ) เส้นทาง
การตรวจสอบของไฟล์จะปรากฏขึน
้ตามค่าเริ่มต้น ข้อมูลจะถูกจัดเรียงตามวันที่และเวลา และกิจกรรมทั้งหมดจะปรากฏในมุมมองแบบขยาย คุณสามารถกรองมุมมองตามชื่อผู้ใช้และรายการ และยุบมุมมองแบบขยายเพื่อจัดเรียงตามช่องข้อมูลส่วนหัวได้
อย่างง่ายดาย คุณยังสามารถดูเส้นทางการตรวจสอบเป็นรายงาน html ได้ดว
้ ย

วิธจ
ี ด
ั เรียงตามชือ่ ผู้ใช้uเลือกผู้ใช้เป้าหมายจากชื่อผู้ใช้ในรายการแบบเลื่อนลง

วิธจ
ี ด
ั เรียงตามรายการuเลือกเป้าหมายจากรายการที่อยู่ในรายการแบบเลือ
่ นลง

วิธซ
ี ่อนคำอธิบายทัง้ หมดของกิจกรรมuคลิก Collapse All (ยุบทั้งหมด)

วิธจ
ี ด
ั เรียงข้อมูลในตารางรายละเอียดการเปลีย่ นแปลงuคลิกสัญลักษณ์รปู เพชรในส่วนหัวของคอลัมน์ข้อมูลเพื่อเรียงลำดับจากน้อยไปมาก (A ถึง Z, จำนวนน้อยที่สดุ ไปหามากที่สดุ หรือก่อนสุดไปหาล่าสุด)294 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEกิจกรรมทีต่ รวจสอบได้

วิธพี ิมพ์เส้นทางการตรวจสอบ
1คลิก HTML Report (รายงาน HTML) เพือ่ แสดงเส้นทางการตรวจสอบในเว็บเบราว์เซอร์

2ในหน้าต่างเบราว์เซอร์ของคุณ ให้ดำเนินการสิง่ ใดสิง่ หนึ่งต่อไปนี้
nเลือก File (ไฟล์) > Print (พิมพ์)nคลิกขวาที่รายงานแล้วเลือก Print (พิมพ์)กิจกรรมที่ตรวจสอบได้
CFX Maestro Dx SE จะบันทึกกิจกรรมที่ตรวจสอบได้ดังต่อไปนีใ้ นไฟล์ขอ้ มูลและไฟล์การศึกษายีน

กิจกรรมทีต่ รวจสอบได้ระหว่างการทดสอบ
nเวลาเริม่ ต้นการทดสอบ

nการแก้ไขเพลตในเวลาทดสอบ

nการแก้ไขโปรโตคอลในเวลาทดสอบ

nเวลาสิน้ สุดการทดสอบ

กิจกรรมทีต่ รวจสอบได้เมื่อสร้างไฟล์ข้อมูลแล้ว
nไฟล์ขอ้ มูลที่สร้างแล้ว

nการอ่านค่าเพลตแทรกที่เพิ่มโดยระบบ

กิจกรรมทีต่ รวจสอบได้เมื่อบันทึกไฟล์ขอ้ มูลแล้ว
nทั่วไปoชื่อoการลงนามoการตั้งค่าเพลตoแสดงหลุมปฏิกิรยิ าoสารเรืองแสงที่วิเคราะห์แล้วoการแก้ไขเพลตoโหมดการวิเคราะห์oกลุ่มหลุมปฏิกริ ิยา PCR ที่ทำงานอยู่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 295ภาคผนวก B เส้นทางการตรวจสอบ

n

n

n

n

n

แท็บ Quantification (การหาปริมาณ)oขั้นตอนที่ใช้งานอยู่oการตั้งค่า — โหมดการกำหนด Cqoการตั้งค่า — การตั้งค่าพื้นฐานoการแก้ไขแนวที่ใช้oการตั้งค่า — รอบที่จะวิเคราะห์oการตั้งค่า — โหมดการวิเคราะห์oการตั้งค่า — เกณฑ์พื้นฐาน

แท็บ Melt Curve (กราฟการสลายดีเอ็นเอ)oขั้นตอนที่ใช้งานอยู่oประเภทสูงสุดที่แสดงoเกณฑ์การวิเคราะห์สงู สุดแท็บ End Point (จุดสิน้ สุด)oสารเรืองแสง/เป้าหมายที่ใช้งานอยู่oสิน้ สุดรอบเป็นค่าเฉลีย
่

o

วิธก
ี ารคำนวณความคลาดเคลื่อนoเปอร์เซ็นต์ของช่วง

แท็บ Allelic Discrimination (การแยกอัลลีล)oสารเรืองแสงแกน X และ Yoเลือกหมายเลขรอบoดูแผนที่การเรียกใช้

แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — เค้าโครงทั้งหมดoการตั้งค่าการทดสอบ — การอ้างอิงเป้าหมายoการตั้งค่าการทดสอบ — การควบคุมตัวอย่างoการตั้งค่าการทดสอบ — ประสิทธิภาพอัตโนมัติoการตั้งค่าการทดสอบ — ประสิทธิภาพ

296 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEกิจกรรมทีต่ รวจสอบได้

n

n

n

n

แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — การสร้างกราฟoโหมดการวิเคราะห์oข้อมูลกราฟ

o

แกน X

o

แกน Y

o

ตัวเลือกการปรับขนาดoแถบข้อผิดพลาดoตัวคูณแถบข้อผิดพลาดoขีดจำกัดค่า Pแท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — คลัสเตอร์แกรมoคลัสเตอร์โดยoแยกข้อมูลซ้ำออก

แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — เค้าโครงแบบกระจาย
oControl Biological Group (กลุม่ ชีวภาพควบคุม)oExperimental Biological Group (กลุ่มชีวภาพการทดสอบ)o

Fold Change Threshold (ค่าขีดจำกัดสัดส่วนการเปลีย่ นแปลง)แท็บ Gene Expression (การแสดงออกของยีน) — ANOVA (การวิเคราะห์ความแปรปรวน)onnขีดจำกัดค่า Pการตั้งค่าเพลต — ดู/แก้ไขเพลตoการตั้งค่า - PlateType (ประเภทเพลต)oการตั้งค่า — Units (หน่วย)

o

เครือ
่ งมือการแก้ไข — พลิกเพลตoกลุ่มหลุมปฏิกริ ิยาoสารเรืองแสงเพลต

การตั้งค่าเพลต — เปลี่ยนเพลตและใช้ไฟล์ PrimePCRoการนำเข้าการตั้งค่าเพลต

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 297

ภาคผนวก B เส้นทางการตรวจสอบ

การเปลีย่ นแปลงการตรวจสอบสำหรับไฟล์การศึกษายีน
ทั่วไป
nName (ชือ่ )nแท็บ Study Setup (การตั้งต่าการศึกษา)onเพิ่ม/ลบไฟล์ข้อมูล

แท็บ Study Analysis (การวิเคราะห์การศึกษา)298 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS
คุณสามารถกำหนดค่า ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition สำหรับใช้กบั ระบบการจัดการสารสนเทศ
ห้องปฏิบตั ิการ (LIMS) สำหรับการผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS CFX Maestro Dx SE ต้องการข้อมูล
การตั้งค่าเพลตที่สร้างขึ้นโดยแพลตฟอร์ม LIMS (ไฟล์ LIMS, *.plrn) ไฟล์โปรโตคอลที่สร้างขึ้นโดยใช้
CFX Maestro Dx SE (*.prcl) CFX Maestro Dx SEตำแหน่งการส่งออกข้อมูลที่กำหนดไว้ และรูปแบบการส่งออกที่
กำหนดไว้
หลังเสร็จสิน้ การทดสอบ CFX Maestro Dx SE จะสร้างไฟล์ข้อมูล (.pcrd) และบันทึกลงในตำแหน่งโฟลเดอร์สง่ ออกข้อมูลทีก่ ำหนด CFX Maestro Dx SE ยังสามารถสร้างไฟล์ขอ้ มูลที่ใช้งานได้กบ
ั LIMS ในรูปแบบ .csv และบันทึกลง
ในตำแหน่งเดียวกัน

การสร้างไฟล์ขอ้ มูลที่ใช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้ภาคผนวกนีจ้ ะอธิบายวิธกี ารตั้งค่า CFX Maestro Dx SE เพื่อสร้าง บันทึก และส่งออกไฟล์ขอ้ มูลที่ใช้งานร่วมกับ
ระบบ LIMS ได้การตัง้ ค่าโฟลเดอร์ LIMS และตัวเลือกการส่งออกข้อมูล
ตามค่าเริ่มต้นแล้ว CFX Maestro Dx SE บันทึกโปรโตคอล LIMS ไฟล์ และไฟล์การส่งออกข้อมูลไปยังโฟลเดอร์นี้:C:\Users\Public\Documents\Bio-Rad\CFX_Dx\LIMSคุณสามารถกำหนดค่า CFX Maestro Dx SE ให้บันทึกไฟล์ลงในโฟลเดอร์อื่น และสามารถเปลี่ยนตัวเลือกการส่งออก
ข้อมูล LIMS ได้วิธตี ั้งค่าโฟลเดอร์ LIMS และตัวเลือกการส่งออกข้อมูล
1บนหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก Tools (เครือ่ งมือ) > Options (ตัวเลือก)2ในกล่องโต้ตอบ Options (ตัวเลือก) ให้เลือก Data Export Settings (การตั้งค่าการส่งออกข้อมูล)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 299

ภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS

3(ไม่บังคับ) เลือกส่งออกข้อมูล LIMS โดยอัตโนมัติเมือ่ สิน้ สุดการทดสอบ
ซอฟต์แวร์จะส่งออกข้อมูล LIMS หลังจากการทดสอบแต่ละครัง้ และบันทึกลงในตำแหน่งที่ระบุโดยอัตโนมัติ

4หากต้องการเปลี่ยนตัวเลือกการส่งออกข้อมูล LIMS ค่าเริ่มต้น ให้คลิก LIMS Data Export Settings (การตั้งค่า
การส่งออกข้อมูล LIMS)
สำคัญ: เฉพาะข้อมูล LIMS ที่สง่ ออกเป็นไฟล์ .csv เท่านัน้ ที่จะสามารถนำกลับเข้ามาใน CFX Maestro Dx
SE ได้

5ในกล่องโต้ตอบ LIMS Data Export Format Settings (การตั้งค่ารูปแบบการส่งออกข้อมูล LIMS) ให้เลือก
ตัวเลือกการส่งออกทีต่ ้องการและคลิก OK (ตกลง)6ในกล่องโต้ตอบ Options (ตัวเลือก) ให้ค้นหาและเลือกโฟลเดอร์เริ่มต้นที่คณุ ต้องการบันทึกไฟล์ขอ้ มูล LIMS คุณสามารถเลือกตำแหน่งที่แตกต่างกันสำหรับไฟล์แต่ละประเภทได้

7

nProtocol (โปรโตคอล)n

LIMS File (ไฟล์ LIMS)n

Data export (การส่งออกข้อมูล)คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกการเปลีย่ นแปลงและปิดกล่องโต้ตอบ Options (ตัวเลือก)300 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์ขอ้ มูลทีใ่ ช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้การสร้างโปรโตคอลระบบ LIMS
หากต้องการเริ่มดำเนินการ LIMS ให้สร้างไฟล์โปรโตคอลสำหรับ CFX Maestro Dx SE (*.prcl) และบันทึกลงใน
โฟลเดอร์โปรโตคอล LIMS ที่กำหนด
ดูขอ้ มูลเพิ่มเติมในบทที่ 7, การสร้างโปรโตคอล

การสร้างไฟล์ LIMS
ไฟล์ LIMS (*.plrn) ประกอบด้วยรายละเอียดการตั้งค่าเพลตและชื่อไฟล์โปรโตคอล ไฟล์นสี้ ร้างโดยระยย LIMS ภายในของคุณ CFX Maestro Dx SE จะใช้ไฟล์ LIMS เพื่อสร้างไฟล์เพลตเพื่อใช้กับไฟล์โปรโตคอล
CFX Maestro Dx SE มีไฟล์เทมเพลตการนำเข้าเพลตที่คณุ สามารถแก้ไขเพื่อสร้างไฟล์เพลต LIMS แบบกำหนดเอง
ได้เคล็ดลับ: ผู้เชี่ยวชาญ LIMS ต้องเป็นผู้ดำเนินการนี้

วิธสี ร้างไฟล์ LIMS
1ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก View (ดู) > Show (แสดง) > LIMS File Folder (โฟลเดอร์ไฟล์ LIMS)

2เปิดโฟลเดอร์ LIMS Templates (เทมเพลต LIMS) แล้วเลือกไฟล์ .csv เพื่อนำเข้าไฟล์เข้ามาใน LIMS ภายใน
ของคุณ

3แก้ไขไฟล์เทมเพลตโดยการกรอกข้อมูลลงในช่องที่กำหนดที่ระบุไว้ในตาราง 384โปรดทำหนึง่ ในสิง่ ต่อไปนี้
nหากต้องการบันทึกการเปลีย่ นแปลงของคุณเพื่อใช้ในอนาคต ให้บันทึกไฟล์เป็นไฟล์. csv

nหากต้องการบันทึกการเปลีย่ นแปลงของคุณและใช้ไฟล์ทันที ให้บนั ทึกไฟล์ด้วยนามสกุล .plrnnบันทึกเทมเพลตให้เป็นไฟล์นามสกุล .plrn ไปยังโฟลเดอร์ LIMS File (ไฟล์ LIMS)

สำคัญ: CFX Maestro Dx SE เปิดได้เฉพาะไฟล์ .plrn เท่านั้น คุณต้องบันทึกไฟล์ .csv เป็น .plrn เพือ่ เริม
่ดำเนินการ LIMSคูม่ ือผูใ้ ช้ | 301ภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS

ตาราง 38 คำจำกัดความของเนื้อหาในไฟล์ .csv ของ LIMS

คอลัมน์

แถวคำอธิบาย

เนือ
้ หา

วัตถุ
ประส
งค์

A

1

ส่วนหัวของเพ

ห้ามแก้ไข

กำหน

ลต

ดค่าล่
วงหน้
า

A,B,C

2

ช่อง/ข้อมูล/คำห้ามแก้ไข

แนะนำ

กำหน
ดค่าล่
วงหน้
า

B

3

เวอร์ชน
ัห้ามแก้ไข

กำหนดค่าล่
วงหน้
า

B

4

ขนาดเพลต

ห้ามแก้ไข

กำหนดค่าล่
วงหน้
า

B

B

B

5

6

7

Plate Type (ปป้อน BR White (BR ขาว) BR Clear (BR ใส)ต้องรระเภทเพลต)หรือประเภทเพลตทีส่ อบเทียบค่าแล้วอื่น ๆะบุScan Modeป้อน “SYBR/FAM Only:” “All Channels” หรืต้องร(โหมดสแกน)อ “FRET”

ะบุ

Units (หน่วย)ป้อนข้อมูลใดข้อมูลหนึ่งต่อไปนี้ “copyต้องรnumber” “fold dilution” “micromoles”

ะบุ“nanomoles” “picomoles” “femtomoles”“attomoles” “milligrams” “micrograms”“nanograms” “picograms” “femtograms”“attograms” หรือ “percent”
B

8

Run ID (ID กาป้อนคำอธิบายสัน้ ๆ หรือบาร์โค้ดทีร่ ะบุการดำเ

ตัวเลื

รดำเนินการ)นินการนี้ (ความยาวไม่เกิน 30 อักขระ ต้องไม่มเี

อกครื่องหมายจุลภาค)302 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์ขอ้ มูลทีใ่ ช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้ตาราง 38 คำจำกัดความของเนื้อหาในไฟล์ .csv ของ LIMSต่อคอลัมน์

แถวคำอธิบาย

เนือ
้ หา

วัตถุ
ประส
งค์

B

9

Run Note (หมป้อนคำอธิบายการดำเนินการ

ตัวเลื

ายเหตุการดำเ

อกนินการ)B

10

Run Protocolป้อนชื่อไฟล์โปรโตคอลตามทีแ่ สดงในรายชือ
่(โปรโตคอลกา

ต้องร
ะบุ

รดำเนินการ)A

11

Data File (ไฟป้อนชื่อไฟล์ข้อมูล

ล์ข้อมูล)A

12-15

TBD/ว่าง

ตัวเลื
อกห้ามแก้ไข

กำหนดค่าล่
วงหน้
า

A

16

Plate Data (ข้ห้ามแก้ไข

อมูลเพลต)กำหนดค่าล่
วงหน้
า

A

17-113Well Positionห้ามแก้ไข

(ตำแหน่งหลุม)กำหนดค่าล่
วงหน้
า

B-G

Ch1 Dye,ป้อนชื่อสียอ้ มที่สอบเทียบค่าแล้วหนี่งชือ่ (เช่น

ต้องร

Ch2 Dye,“FAM”) สำหรับแต่ละช่องที่ใช้

ะบุSample Typeป้อนประเภทตัวอย่างต่อไปนีห้ นึ่งประเภท

ต้องร(ประเภทตัวอย่

“Unknown,” “Standard” “Positive Control”

ะบุ

าง)

“Negative Control” “NTC” หรือ “NRT”

Ch3 Dye,
Ch4 Dye,
Ch5 Dye,
FRET
H

คูม
่ ือผูใ้ ช้ | 303ภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS

ตาราง 38 คำจำกัดความของเนื้อหาในไฟล์ .csv ของ LIMSต่อคอลัมน์

แถว

Iคำอธิบาย

เนือ
้ หา

วัตถุ
ประส
งค์

Sampleป้อนชื่อตัวอย่าง

ตัวเลืName (ชื่อตัว

อกอย่าง)J-O

CH1 Target,ป้อนชื่อเป้าหมายสำหรับแต่ละช่องที่ใช้

CH2 Target,ตัวเลื
อก

CH3 Target,
CH4 Target,
CH5 Target,
FRET TargetPชื่อชุด

ป้อนชื่อชุดทางชีวภาพ

ตัวเลื
อก

Q

R-W

Replicate (ทำป้อนจำนวนเต็มบวกสำหรับแต่ละชุดของการทำ

ตัวเลื

ซ้ำ)ซ้ำ ค่าต้องไม่เป็นศูนย์

อก

CH1

ป้อนค่าคุณภาพสำหรับมาตรฐานใด ๆ ป้อนค่าค

ต้องร

Quantity,วามเข้มข้นในรูปแบบทศนิยม

ะบุสำ

CH2

หรับทุ

Quantity,

กมาต

CH3

รฐาน

Quantity,
CH4
Quantity,
CH5
Quantity,
FRET
Quantity304 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการสร้างไฟล์ขอ้ มูลทีใ่ ช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้ตาราง 38 คำจำกัดความของเนื้อหาในไฟล์ .csv ของ LIMSต่อคอลัมน์

แถว

Xคำอธิบาย

เนือ
้ หา

วัตถุ
ประส
งค์

Well Noteป้อนหมายเหตุของหลุม (ไม่เกิน 20 อักขระ)ตัว(หมายเหตุ

หมายเหตุ: แม้วา่ CFX Maestro Dx SEเลือกของหลุม)จำกัดจำนวนอักขระสูงสุด 20 ตัวสำหรับ
การป้อนหมายเหตุใน Well Note (หมายเหตุของหลุม) ผ่านซอฟต์แวร์ แต่ชอ
่ ง
Well Note (หมายเหตุของหลุม)สามารถมีอกั ขระได้สูงสุด 500 ตัวหาก
รวมอยูใ่ นไฟล์ .plrn ที่นำเข้า
อย่างไรก็ตาม CFX Maestro Dx SEจะแสดงเฉพาะอักขระ 20 ตัวแรก ไฟล์.pcrd ทีส่ ่งออกจะมีอกั ขระทั้งหมดใน
ช่อง Well Note (หมายเหตุของหลุม)โดยไม่มขี อ้ มูลใดสูญหายY-AD

Ch1 Wellป้อนสีลอกรูปแบบที่ผู้ใช้กำหนดเองเป็นจำนวน

ตัวColor, Ch2เต็มแบบ 32 บิท (argb) ในรูปแบบจุดทศนิยม

เลือกWell Color,
Ch3 WellColor, Ch4Well Color,
Ch5 WellColor, FRET
Well Colorการเริ่มการทดสอบ LIMS
วิธเี ริม่ การทดสอบ LIMS
1ทำตามหนึ่งในข้อต่อไปนีเ้ พื่อเปิดไฟล์ LIMS .plrn:nในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก View (ดู) > Show (แสดง) > LIMS File Folder (โฟลเดอร์ไฟล์ LIMS)
และเปิดไฟล์ .plrn ที่ต้องการ

nในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก File (ไฟล์) > Open (เปิด) > LIMS File (ไฟล์ LIMS) และเปิดไฟล์
.plrn ที่ต้องการ

ไฟล์จะเปิดในแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) ในตัวช่วยสร้าง Run Setup (การตั้งค่าการทดสอบ) แท็บ Start
Run (เริม่ การทดสอบ) แสดงข้อมูลเกี่ยวกับการทดลองที่จะดำเนินการ นอกจากนี้ยงั แสดงบล็อกเครือ่ งมือที่
เชื่อมต่อที่คุณสามารถทำการทดลองได้

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 305ภาคผนวก C การผสานการทำงานร่วมกับระบบ LIMS

2ในแท็บ Start Run (เริม่ การทดสอบ) เลือกเครือ่ งมือและคลิก Start Run (เริม่ การทดสอบ)การส่งออกข้อมูลไปยังระบบ LIMSเมือ่ ดำเนินการเสร็จสิน
้ CFX Maestro Dx SE จะสร้างไฟล์ขอ้ มูล (.pcrd) และบันทึกไว้ในตำแหน่งโฟลเดอร์สง่ ออกข้อมูลทีก่ ำหนดไว้

วิธสี ่งออกข้อมูลไประบบ LIMSuเปิดไฟล์ .pcrd และเลือก Export (ส่งออก) > Export to LIMS Folder (ส่งออกไปโฟลเดอร์ LIMS)

เคล็ดลับ: หากคุณเลือก Automatically Export Data (ส่งออกข้อมูลอัตโนมัติ) หลัง Run in LIMS Options(ดำเนินการในตัวเลือกระบบ LIMS) CFX Maestro Dx SE จะสร้างไฟล์ขอ้ มูลที่ใช้งานร่วมกับระบบ LIMS ได้ในรูปแบบ .csv และบันทึกไว้ในโฟลเดอร์เดิม

306 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก D การแก้ไขปัญหา ซอฟต์แวร์ CFX Maestro
Dx, Security Editionภาคผนวกนีใ้ ห้คำแนะนำในการแก้ไขปัญหาทีค่ ุณอาจพบขณะอัปเกรดหรือใช้งาน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx,
Security Editionทำรายการไฟล์และโฟลเดอร์ของ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx,
Security Edition ที่ปลอดภัย
แผนกไอทีของคุณอาจใช้มาตรการรักษาความปลอดภัยซอฟต์แวร์ที่เข้มงวดมากเพื่อป้องกันไวรัสและมัลแวร์
มาตรการเหล่านีอ้ าจส่งผลต่อเวลาในการอัปเกรดหรือใช้งาน CFX Maestro Dx SEเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพของCFX Maestro Dx SE Bio-Rad ขอแนะนำให้แผนกไอทีของคุณลงรายการอนุญาต
ไฟล์และโฟลเดอร์ที่ปลอดภัยต่อไปนีใ้ นการตั้งค่าไฟร์วอลล์ในซอฟต์แวร์ปอ้ งกันไวรัสของคุณทีต่ ิดตั้งในคอมพิวเตอร์
CFX Maestro Dx SEโฟลเดอร์
nC:\Program Files (x86)\Bio-Rad\CFX_MDx

n

C:\ProgramData\Bio-Rad\CFX_MDx

n

C:\Users\Public\Documents\Bio-Rad\CFX_MDxไฟล์nไฟล์ .exe ทั้งหมดที่อยูใ่ นโฟลเดอร์ C:\Program Files (x86)\Bio-Rad\CFX_MDxnR.exe และ Rscript.exe (ที่อยู่ในโฟลเดอร์ C:\Program Files (x86)\Bio-Rad\CFX_MDx\ R\
R-3.3.1\bin)คูม่ ือผูใ้ ช้ | 307ภาคผนวก D การแก้ไขปัญหา ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionบันทึกการใช้งาน
ก่อนทีจ่ ะเริม่ การทดสอบใหม่ เครือ
่ ง CFX Opus Dx system จะเริม่ การทดสอบวิเคราะห์ตัวเองเพื่อตรวจสอบว่ากำลังท
ำงานตามข้อกำหนดอยูห่ รือไม่ ซอฟต์แวร์จะบันทึกผลการทดสอบนีใ้ นไฟล์ Run Log (บันทึกการทดสอบ) และไฟล์
Application Log (บันทึกการใช้งาน) หากคุณสังเกตเห็นปัญหาในการทดลองอย่างใดอย่างหนึง่ หรือหลายการทดลอง
เปิดบันทึกการทดสอบและบันทึกการใช้งานเพื่อค้นหาว่าปัญหาเริม่ ต้นขึน้ เมือ่ ใด
CFX Maestro Dx SE Dx จะติดตามข้อมูลสถานะเครือ่ งมือระหว่างการทดสอบใน Application Log (บันทึกการ
ใช้งาน) ใช้บันทึกเหล่านีต้ ิดตามกิจกรรมที่เกิดขึน้ กับเครือ่ งมือและในซอฟต์แวร์และเพื่อการแก้ไขปัญหา

วิธเี ปิด Application log (บันทึกการใช้งาน)uในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) เลือก View (ดู) > Application Log (บันทึกการใช้งาน)หากต้องการดูบันทึกแอปพลิเคชันเป็นไฟล์ HTML ให้คลิกปุม
่ HTML Report (รายงาน HTML)308 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEการแก้ไขปัญหา

การเรียกไฟล์บันทึกแอปพลิเคชันและเฟิร์มแวร์
บันทึกของแอปพลิเคชันและเฟิรม์ แวร์ประกอบด้วยรายละเอียดการดำเนินการระหว่างที่ใช้งานซอฟต์แวร์และ
ประสิทธิภาพของการทำงาน บันทึกเหล่านีจ้ ะบันทึกข้อผิดพลาดของซอฟต์แวร์และเฟิรม์ แวร์ที่เกิดขึ้นในระหว่างการ
ใช้งานซอฟต์แวร์หรือเครือ่ งมือด้วยเช่นกัน

วิธกี ารเข้าถึงไฟล์บนั ทึกแอปพลิเคชันและเฟิรม์ แวร์มีดงั นี้:1ในแผง Detected Instruments (เครือ่ งมือทีต่ รวจพบ) ให้คลิกขวาที่เครือ่ งมือ

2เลือก Retrieve Log Files (เรียกไฟล์บนั ทึก)

3ในกล่องโต้ตอบ Browse for Folder (เรียกดูโฟลเดอร์) ให้เลือกโฟลเดอร์ปลายทางบนเครือข่ายของคุณหรือ
ไดรฟ์ในเครือ่ ง ที่คุณต้องการใช้บนั ทึกไฟล์บนั ทึกหมายเหตุ: โฟลเดอร์จะมีชื่อว่า "Logs"

4คลิก OK (ตกลง) เพือ่ บันทึกไฟล์
สำคัญ: การบันทึกไฟล์บันทึกที่มชี ื่อไฟล์เหมือนกับไฟล์บันทึกที่มี จะเป็นการเขียนทับไฟล์บนั ทึกทีม่ ีการแก้ไขปัญหา
โดยทั่วไป ปัญหาซอฟต์แวร์และการสือ่ สารกับเครื่องมือสามารถแก้ไขได้โดยการรีสตาร์ทคอมพิวเตอร์และระบบของคุณ ตรวจสอบให้แน่ใจว่าได้บันทึกงานใด ๆ ที่กำลังทำอยู่กอ่ นทำการรีสตาร์ท
หมายเหตุ: ตรวจสอบว่าคอมพิวเตอร์ของคุณมี RAM เพียงพอและมีพื้นที่ดิสก์ว่าง RAM ขั้นต่ำคือ 4 GB และพื้นที่ฮาร์ดดิสก์ขั้นต่ำคือ 128 GBไฟฟ้าขัดข้อง
เมือ่ ไฟฟ้าขัดข้อง เครือ่ งมือและคอมพิวเตอร์จะปิดลง หากไฟฟ้าดับเพียงครูเ่ ดียว เครื่องมือจะกลับมาใช้งานโปรโตคอล
อีกครัง้ แต่ Application Log (บันทึกการทำงาน) จะบันทึกว่าเกิดไฟฟ้าขัดข้อง เครือ่ งมือและซอฟต์แวร์จะพยายามทำ
งานต่อไปตามการตั้งค่าคอมพิวเตอร์และระยะเวลาที่เครื่องมือปิดไป โดยจะขึน้ อยูก่ บั ขัน้ ตอนของโปรโตคอล
nหากโปรโตคอลอยู่ในขั้นตอนที่ไม่มกี ารอ่านค่าเพลต โปรโตคอลจะทำงานต่อโดยเร็วที่สดุ เมื่อเครือ่ งมือกลับมาใช้
พลังงานไฟฟ้าได้

nหากโปรโตคอลอยู่ในขั้นตอนที่มกี ารอ่านค่าเพลต เครือ่ งมือจะรอให้ซอฟต์แวร์รสี ตาร์ทและกลับมาทำการ
ประมวลผลเพือ่ เก็บรวบรวมข้อมูล ในสถานการณ์เช่นนี้ โปรโดคอลจะดำเนินต่อไปก็ต่อเมือ่ คอมพิวเตอร์ไม่ได้
ปิดซอฟต์แวร์ด้วย เมื่อคอมพิวเตอร์และซอฟต์แวร์เริม่ ทำงานอีกครั้ง โปรโตคอลจะดำเนินต่อไป

การโอนไฟล์ไปยังคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SEคุณสามารถถ่ายโอนไฟล์ข้อมูลและไฟล์บันทึกที่อยู่บนเครือ่ งมือไปยังฮาร์ดไดรฟ์ของคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx
SE ที่เชื่อมต่ออยู่

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 309

ภาคผนวก D การแก้ไขปัญหา ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Editionเคล็ดลับ: ไฟล์ทั้งหมดในโฟลเดอร์ข้อมูลเรียลไทม์บนตัวเครือ่ งมือจะถูกถ่ายโอนไปยังคอมพิวเตอร์
หมายเหตุ: จากเครือ
่ ง CFX Opus Dx คุณสามารถถ่ายโอนไฟล์บนั ทึกได้เท่านัน้ ไฟล์บนั ทึกทัง้ หมดบนเครือ่ งมือ
จะถูกโอนไปยังคอมพิวเตอร์

วิธกี ารเรียกไฟล์จากเครือ่ งมือ
1ในบานหน้าต่าง Detected Instruments (เครือ่ งมือที่ตรวจพบ) ในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) คลิกขวาที่เครือ่ งมือเป้าหมายและเลือก Retrieve Log Files (เรียกไฟล์บนั ทึก)

2เลือกตำแหน่งของโฟลเดอร์ที่จะบันทึกไฟล์ที่เรียก

3คลิก OK (ตกลง)การติดตัง้ ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ด้วยตนเอง
วิธกี ารติดตั้ง CFX Maestro Dx SE ด้วยตนเอง
1หากจำเป็น ให้ถอดเครือ่ งมือที่เชื่อมต่ออยู่ออกจากคอมพิวเตอร์
ค้นหาตำแหน่งและถอดสาย USB ของอุปกรณ์ออกจากคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE สามารถเสียบปลาย
ด้านอีกข้างอยู่ในเครือ่ งได้

2เข้าสูร่ ะบบคอมพิวเตอร์ CFX Maestro Dx SE ด้วยสิทธิร์ ะดับผู้ดูแลระบบ

3เสียบไดรฟ์ USB ของ CFX Maestro Dx SE เข้ากับพอร์ต USB ของคอมพิวเตอร์

4

ใน Windows Explorer ให้ค้นหาและเปิดไดรฟ์ USB ของ CFX Maestro Dx SE

5เปิดโฟลเดอร์ของ CFX แล้วคลิกสองครัง้ ที่ CFXMaestroDxSetup.exe เพื่อติดตั้ง CFX Maestro Dx SE

6ทำตามคำแนะนำบนหน้าจอเพื่อติดตั้งซอฟต์แวร์
เมือ่ เสร็จสิน้ หน้าจอเริม่ ต้น ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ของ Bio-Rad จะปรากฏขึน้ บนหน้า
จอคอมพิวเตอร์ และไอคอน ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx, Security Edition ของ Bio-Rad จะปรากฏขึ้นบน
เดสก์ท็อป

7อย่างปลอดภัยและเริม่ ใช้งาน CFX Maestro Dx SEการติดตัง้ ไดรเวอร์อกี ครั้ง
วิธกี ารติดตั้งไดรเวอร์ของเครือ่ งมืออีกครัง้uในหน้าต่าง Home (หน้าหลัก) ให้เลือก Tools (เครื่องมือ) > Reinstall Instrument Drivers (ติดตั้งไดรเวอร์ของ
เครือ่ งมืออีกครัง้ )หมายเหตุ: หากคุณมีปัญหาเกี่ยวกับการสือ่ สารของซอฟต์แวร์กบั ระบบเรียลไทม์หลังจากที่คุณติดตั้งไดรเวอร์อก
ีครั้งและตรวจสอบการเชื่อมต่อ USB แล้ว โปรดติดต่อฝ่ายสนับสนุนด้านเทคนิคของ Bio-Rad

310 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source
Notices for PCR ProductsThis document includes licensing information relating to free, open-source, and public-source softwareand data (together, the “MATERIALS”) included with or used to develop Bio-Rad products and services.
The terms of the applicable free, open-source, and public-source licenses (each an “OPEN LICENSE”)
govern Bio-Rad’s distribution and your use of the MATERIALS. Bio-Rad and the third-party authors,licensors, and distributors of the MATERIALS disclaim all warranties and liability arising from all use anddistribution of the MATERIALS. To the extent the OSS is provided under an agreement with Bio-Rad thatdiffers from the applicable OSS LICENSE, those terms are offered by Bio-Rad alone.
Bio-Rad has reproduced below copyright and other licensing notices appearing within the MATERIALS.
While Bio- Rad seeks to provide complete and accurate copyright and licensing information for all
MATERIALS, Bio-Rad does not represent or warrant that the following information is complete, correct, or
error-free. MATERIALS recipients are encouraged to (a) investigate the identified MATERIALS to confirm
the accuracy of the licensing information provided and (b) notify Bio-Rad of any inaccuracies or errors
found in this document so that Bio-Rad may update this document accordingly.
Certain OPEN LICENSES (such as the Affero General Public Licenses, Common Development andDistribution Licenses, Common Public License, Creative Commons Share-Alike License, Eclipse Public
License, Mozilla Public Licenses, GNU General Public Licenses, GNU Library/Lesser General Public
Licenses, and Open Data Commons Open Database License) require that the source materials be madeavailable to recipients or other requestors under the terms of the same OPEN LICENSE.
The corresponding open source software is available for download from the links in the section that
follows.

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 311

ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

Software Notices
ZedGraph
Project homepage/download site:
https://sourceforge.net/projects/zedgraph/
Bio-Rad source code site:
https://github.com/bio-rad-lsg-open-source/ZedGraph-5.0.1
External source code site:
https://github.com/ZedGraph/ZedGraph
Project licensing notices:/LICENSE-LGPL.txt:
See LGPL-2.1 in the Standard OSS License Text appendix to this document.
/sources/ZedGraph/LICENSE-LGPL.txt:
See LGPL-2.1 in the Standard OSS License Text appendix to this document.

Standard Open License Text
LGPL-2.1
GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSE
Version 2.1, February 1999
Copyright (C) 1991, 1999 Free Software Foundation, Inc. 59 Temple
Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA Everyone is permitted tocopy and distribute verbatim copies of this license document, butchanging it is not allowed.
[This is the first released version of the Lesser GPL. It also counts
as the successor of the GNU Library Public License, version 2, hence
the version number 2.1.]

312 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text

Preamble
The licenses for most software are designed to take away your freedom
to share and change it. By contrast, the GNU General Public Licenses
are intended to guarantee your freedom to share and change free
software--to make sure the software is free for all its users.
This license, the Lesser General Public License, applies to somespecially designated software packages--typically libraries--of theFree Software Foundation and other authors who decide to use it. You
can use it too, but we suggest you first think carefully about
whether this license or the ordinary General Public License is thebetter strategy to use in any particular case, based on the
explanations below.
When we speak of free software, we are referring to freedom of use,
not price. Our General Public Licenses are designed to make sure thatyou have the freedom to distribute copies of free software (andcharge for this service if you wish); that you receive source code or
can get it if you want it; that you can change the software and use
pieces of it in new free programs; and that you are informed that you
can do these things.
To protect your rights, we need to make restrictions that forbid
distributors to deny you these rights or to ask you to surrendertheserights.
These
restrictionstranslatetocertain
responsibilities for you if you distribute copies of the library or
if you modify it.
For example, if you distribute copies of the library, whether gratis
or for a fee, you must give the recipients all the rights that we
gave you. You must make sure that they, too, receive or can get thesource code. If you link other code with the library, you must
provide complete object files to the recipients, so that they canrelink them with the library after making changes to the library andrecompiling it. And you must show them these terms so they know theirrights.
We protect your rights with a two-step method: (1) we copyright thelibrary, and (2) we offer you this license, which gives you legal
permission to copy, distribute and/or modify the library.
To protect each distributor, we want to make it very clear that there
is no warranty for the free library. Also, if the library is modified
by someone else and passed on, the recipients should know that what
they have is not the original version, so that the original author'sคูม่ ือผูใ้ ช้ | 313

ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

reputation will not be affected by problems that might be introducedby others.
Finally, software patents pose a constant threat to the existence ofany free program. We wish to make sure that a company cannot
effectively restrict the users of a free program by obtaining a
restrictive license from a patent holder. Therefore, we insist thatany patent license obtained for a version of the library must be
consistent with the full freedom of use specified in this license.
Most GNU software, including some libraries, is covered by theordinary GNU General Public License. This license, the GNU Lesser
General Public License, applies to certain designated libraries, andis quite different from the ordinary General Public License. We use
this license for certain libraries in order to permit linking thoselibraries into non-free programs.
When a program is linked with a library, whether statically or usinga shared library, the combination of the two is legally speaking a
combined work, a derivative of the original library. The ordinary
General Public License therefore permits such linking only if theentire combination fits its criteria of freedom. The Lesser General
Public License permits more lax criteria for linking other code withthe library.
We call this license the "Lesser" General Public License because it
does Less to protect the user's freedom than the ordinary General
Public License. It also provides other free software developers Lessof an advantage over competing non-free programs. These disadvantages
are the reason we use the ordinary General Public License for many
libraries. However, the Lesser license provides advantages in certain
special circumstances.
For example, on rare occasions, there may be a special need toencourage the widest possible use of a certain library, so that it
becomes a de-facto standard. To achieve this, non-free programs mustbe allowed to use the library. A more frequent case is that a freelibrary does the same job as widely used non-free libraries. In thiscase, there is little to gain by limiting the free library to free
software only, so we use the Lesser General Public License.
In other cases, permission to use a particular library in non-freeprograms enables a greater number of people to use a large body offree software. For example, permission to use the GNU C Library innon- free programs enables many more people to use the whole GNU

314 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text

operating system, as well as its variant, the GNU/Linux operating
system.
Although the Lesser General Public License is Less protective of theusers' freedom, it does ensure that the user of a program that is
linked with the Library has the freedom and the wherewithal to run
that program using a modified version of the Library.
The precise terms and conditions for copying, distribution andmodification follow. Pay close attention to the difference between a"work based on the library" and a "work that uses the library". The
former contains code derived from the library, whereas the lattermust be combined with the library in order to run.
GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSETERMS AND CONDITIONS FOR COPYING, DISTRIBUTION AND MODIFICATION
0. This License Agreement applies to any software library or otherprogram which contains a notice placed by the copyright holder orother authorized party saying it may be distributed under the termsof this Lesser General Public License (also called "this License").
Each licensee is addressed as "you".
A "library" means a collection of software functions and/or dataprepared so as to be conveniently linked with application programs(which use some of those functions and data) to form executables.
The "Library", below, refers to any such software library or work
which has been distributed under these terms. A "work based on the
Library" means either the Library or any derivative work undercopyright law: that is to say, a work containing the Library or a
portion of it, either verbatim or with modifications and/ortranslated straightforwardly into another language. (Hereinafter,translationisincluded
without
limitation
in
the
term
"modification".)"Source code" for a work means the preferred form of the work formaking modifications to it. For a library, complete source code means
all the source code for all modules it contains, plus any associatedinterface definition files, plus the scripts used to control
compilation and installation of the library.
Activities other than copying, distribution and modification are notcovered by this License; they are outside its scope. The act ofrunning a program using the Library is not restricted, and outputคูม่ ือผูใ้ ช้ | 315ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

from such a program is covered only if its contents constitute a work
based on the Library (independent of the use of the Library in a tool
for writing it). Whether that is true depends on what the Library
does and what the program that uses the Library does.
1. You may copy and distribute verbatim copies of the Library's
complete source code as you receive it, in any medium, provided thatyou conspicuously and appropriately publish on each copy anappropriate copyright notice and disclaimer of warranty; keep intact
all the notices that refer to this License and to the absence of any
warranty; and distribute a copy of this License along with the
Library. You may charge a fee for the physical act of transferring a
copy, and you may at your option offer warranty protection in
exchange for a fee.
2. You may modify your copy or copies of the Library or any portionof it, thus forming a work based on the Library, and copy anddistribute such modifications or work under the terms of Section 1
above, provided that you also meet all of these conditions:a) The modified work must itself be a software library.
b) You must cause the files modified to carry prominent notices
stating that you changed the files and the date of any change.
c) You must cause the whole of the work to be licensed at no charge
to all third parties under the terms of this License.
d) If a facility in the modified Library refers to a function or atable of data to be supplied by an application program that uses thefacility, other than as an argument passed when the facility is
invoked, then you must make a good faith effort to ensure that, inthe event an application does not supply such function or table, thefacility still operates, and performs whatever part of its purpose
remains meaningful. (For example, a function in a library to computesquare roots has a purpose that is entirely well-defined independentof the application. Therefore, Subsection 2d requires that any
application-supplied function or table used by this function must be
optional: if the application does not supply it, the squareroot
function must still compute square roots.)
These requirements apply to the modified work as a whole. If
identifiable sections of that work are not derived from the Library,and can be reasonably considered independent and separate works inthemselves, then this License, and its terms, do not apply to thosesections when you distribute them as separate works. But when you

316 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text

distribute the same sections as part of a whole which is a work basedon the Library, the distribution of the whole must be on the terms ofthis License, whose permissions for other licensees extend to theentire whole, and thus to each and every part regardless of who wrote
it.
Thus, it is not the intent of this section to claim rights or contest
your rights to work written entirely by you; rather, the intent is to
exercise the right to control the distribution of derivative orcollective works based on the Library.
In addition, mere aggregation of another work not based on the
Library with the Library (or with a work based on the Library) on a
volume of a storage or distribution medium does not bring the otherwork under the scope of this License.
3. You may opt to apply the terms of the ordinary GNU General Public
License instead of this License to a given copy of the Library. To dothis, you must alter all the notices that refer to this License, sothat they refer to the ordinary GNU General Public License, version
2, instead of to this License. (If a newer version than version 2 ofthe ordinary GNU General Public License has appeared, then you canspecify that version instead if you wish.) Do not make any otherchange in these notices. Once this change is made in a given copy, it
is irreversible for that copy, so the ordinary GNU General Public
License applies to all subsequent copies and derivative works madefrom that copy. This option is useful when you wish to copy part ofthe code of the Library into a program that is not a library.
4. You may copy and distribute the Library (or a portion orderivative of it, under Section 2) in object code or executable form
under the terms of Sections 1 and 2 above provided that you accompany
it with the complete corresponding machine- readable source code,
which must be distributed under the terms of Sections 1 and 2 aboveon amediumcustomarily
usedforsoftwareinterchange.
If
distribution of object code is made by offering access to copy from adesignated place, then offering equivalent access to copy the sourcecode from the same place satisfies the requirement to distribute thesource code, even though third parties are not compelled to copy thesource along with the object code.
5. A program that contains no derivative of any portion of the
Library, but is designed to work with the Library by being compiled
or linked with it, is called a "work that uses the Library". Such awork, in isolation, is not a derivative work of the Library, andคูม่ ือผูใ้ ช้ | 317

ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

therefore falls outside the scope of this License. However, linking a"work that uses the Library" with the Library creates an executablethat is a derivative of the Library (because it contains portions of
the Library), rather than a "work that uses the library". The
executable is therefore covered by this License. Section 6 statesterms for distribution of such executables. When a "work that uses
the Library" uses material from a header file that is part of the
Library, the object code for the work may be a derivative work of the
Library even though the source code is not. Whether this is true isespecially significant if the work can be linked without the Library,or if the work is itself a library. The threshold for this to be true
is not precisely defined by law. If such an object file uses only
numerical parameters, data structure layouts and accessors, and small
macros and small inline functions (ten lines or less in length), thenthe use of the object file is unrestricted, regardless of whether it
is legally a derivative work. (Executables containing this object
code plus portions of the Library will still fall under Section 6.)
Otherwise, if the work is a derivative of the Library, you may
distribute the object code for the work under the terms of Section 6.
Any executables containing that work also fall under Section 6,
whether or not they are linked directly with the Library itself.
6. As an exception to the Sections above, you may also combine orlink a "work that uses the Library" with the Library to produce awork containing portions of the Library, and distribute that work
under terms of your choice, provided that the terms permit
modification of the work for the customer's own use and reverse
engineering for debugging such modifications. You must give prominent
notice with each copy of the work that the Library is used in it andthat the Library and its use are covered by this License. You must
supply a copy of this License. If the work during execution displays
copyright notices, you must include the copyright notice for the
Library among them, as well as a reference directing the user to the
copy of this License. Also, you must do one of these things:a) Accompany the work with the complete corresponding machinereadable source code for the Library including whatever changes wereused in the work (which must be distributed under Sections 1 and 2
above); and, if the work is an executable linked with the Library,with the complete machine-readable "work that uses the Library", asobject code and/or source code, so that the user can modify the
Library and then relink to produce a modified executable containing
the modified Library. (It is understood that the user who changes the

318 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text

contents of definitions files in the Library will not necessarily beable to recompile the application to use the modified definitions.)b) Use a suitable shared library mechanism for linking with the
Library. A suitable mechanism is one that (1) uses at run time a copyof the library already present on the user's computer system, rather
than copying library functions into the executable, and (2) will
operate properly with a modified version of the library, if the user
installs one, as long as the modified version is interface-compatible
with the version that the work was made with.
c) Accompany the work with a written offer, valid for at least three
years, to give the same user the materials specified in Subsection
6a, above, for a charge no more than the cost of performing this
distribution.
d) If distribution of the work is made by offering access to copy
from a designated place, offer equivalent access to copy the above
specified materials from the same place.
e) Verify that the user has already received a copy
materials or that you have already sent this user a copy.

of

these

For an executable, the required form of the "work that uses the
Library" must include any data and utility programs needed for
reproducing the executable from it. However, as a special exception,
the materials to be distributed need not include anything that isnormally distributed (in either source or binary form) with the major
components (compiler, kernel, and so on) of the operating system on
which the executable runs, unless that component itself accompanies
the executable.
It may happen that this requirement contradicts the license
restrictions of other proprietary libraries that do not normallyaccompany the operating system. Such a contradiction means you cannot
use both them and the Library together in an executable that you
distribute.
7. You may place library facilities that are a work based on the
Library side-by-side in a single library together with other libraryfacilities not covered by this License, and distribute such a
combined library, provided that the separate distribution of the work
based on the Library and of the other library facilities is otherwise
permitted, and provided that you do these two things:คูม่ ือผูใ้ ช้ | 319

ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Productsa) Accompany the combined library with a copy of the same work basedon the Library, uncombined with any other library facilities. This
must be distributed under the terms of the Sections above.
b) Give prominent notice with the combined library of the fact thatpart of it is a work based on the Library, and explaining where tofind the accompanying uncombined form of the same work.
8. You may not copy, modify, sublicense, link with, or distribute the
Library except as expressly provided under this License. Any attempt
otherwise to copy, modify, sublicense, link with, or distribute the
Library is void, and will automatically terminate your rights under
this License. However, parties who have received copies, or rights,
from you under this License will not have their licenses terminatedso long as such parties remain in full compliance.
9. You are not required to accept this License, since you have notsigned it. However, nothing else grants you permission to modify or
distribute the Library or its derivative works. These actions areprohibited by law if you do not accept this License. Therefore, bymodifying or distributing the Library (or any work based on the
Library), you indicate your acceptance of this License to do so, andall its terms and conditions for copying, distributing or modifying
the Library or works based on it.
10. Each time you redistribute the Library (or any work based on the
Library), the recipient automatically receives a license from theoriginal licensor to copy, distribute, link with or modify the
Library subject to these terms and conditions. You may not impose any
further restrictions on the recipients' exercise of the rights
granted herein. You are not responsible for enforcing compliance bythird parties with this License.
11. If, as a consequence of a court judgment or allegation of patent
infringement or for any other reason (not limited to patent issues),
conditions are imposed on you (whether by court order, agreement orotherwise) that contradict the conditions of this License, they do
not excuse you from the conditions of this License. If you cannot
distribute so as to satisfy simultaneously your obligations under
this License and any other pertinent obligations, then as aconsequence you may not distribute the Library at all. For example,
if a patent license would not permit royalty-free redistribution of
the Library by all those who receive copies directly or indirectly
through you, then the only way you could satisfy both it and this320 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text

License would
Library.

betorefrainentirely

from

distribution

of

the

If any portion of this section is held invalid or unenforceable under
any particular circumstance, the balance of the section is intended
to apply, and the section as a whole is intended to apply in othercircumstances.
It is not the purpose of this section to induce you to infringe any
patents or other property right claims or to contest validity of any
such claims; this section has the sole purpose of protecting the
integrity of the free software distribution system which is
implemented by public license practices. Many people have madegenerous contributions to the wide range of software distributed
through that system in reliance on consistent application of thatsystem; it is up to the author/donor to decide if he or she iswilling to distribute software through any other system and alicensee cannot impose that choice. This section is intended to makethoroughly clear what is believed to be a consequence of the rest of
this License.
12. If the distribution and/or use of the Library is restricted incertain countries either by patents or by copyrighted interfaces, theoriginal copyright holder who places the Library under this License
may add an explicit geographical distribution limitation excluding
those countries, so that distribution is permitted only in or among
countries not thus excluded. In such case, this License incorporates
the limitation as if written in the body of this License.
13. The Free Software Foundation may publish revised and/or new
versions of the Lesser General Public License from time to time. Suchnew versions will be similar in spirit to the present version, but
may differ in detail to address new problems or concerns.
Each version is given a distinguishing version number. If the Libraryspecifies a version number of this License which applies to it and"any later version", you have the option of following the terms andconditions either of that version or of any later version publishedby the Free Software Foundation. If the Library does not specify alicense version number, you may choose any version ever published by
the Free Software Foundation.
14. If you wish to incorporate parts of the Library into other freeprograms whose distribution conditions are incompatible with these,
write to the author to ask for permission. For software which isคูม่ ือผูใ้ ช้ | 321ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

copyrighted by the Free Software Foundation, write to the Free
Software Foundation; we sometimes make exceptions for this. Ourdecision will be guided by the two goals of preserving the freestatus of all derivatives of our free software and of promoting thesharing and reuse of software generally.
NO WARRANTY
15. BECAUSE THE LIBRARY IS LICENSED FREE OF CHARGE, THERE IS NO
WARRANTY FOR THE LIBRARY, TO THE EXTENT PERMITTED BY APPLICABLE LAW.
EXCEPT WHEN OTHERWISE STATED IN WRITING THE COPYRIGHT HOLDERS AND/OR
OTHER PARTIES PROVIDE THE LIBRARY "AS IS" WITHOUT WARRANTY OF ANY
KIND, EITHER EXPRESSED OR IMPLIED, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULARPURPOSE. THE ENTIRE RISK AS TO THE QUALITY AND PERFORMANCE OF THE
LIBRARY IS WITH YOU. SHOULD THE LIBRARY PROVE DEFECTIVE, YOU ASSUME
THE COST OF ALL NECESSARY SERVICING, REPAIR OR CORRECTION.
16. IN NO EVENT UNLESS REQUIRED BY APPLICABLE LAW OR AGREED TO INWRITING WILL ANY COPYRIGHT HOLDER, OR ANY OTHER PARTY WHO MAY MODIFY
AND/OR REDISTRIBUTE THE LIBRARY AS PERMITTED ABOVE, BE LIABLE TO YOUFORDAMAGES,INCLUDING
ANY
GENERAL,
SPECIAL,
INCIDENTALORCONSEQUENTIAL DAMAGES ARISING OUT OF THE USE OR INABILITY TO USE THE
LIBRARY (INCLUDING BUT NOT LIMITED TO LOSS OF DATA OR DATA BEING
RENDERED INACCURATE OR LOSSES SUSTAINED BY YOU OR THIRD PARTIES OR A
FAILURE OF THE LIBRARY TO OPERATE WITH ANY OTHER MATERIALS), EVEN IF
SUCH HOLDER OR OTHER PARTY HAS BEEN ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
SUCH DAMAGES.
END OF TERMS AND CONDITIONS
How to Apply These Terms to Your New Libraries
If you develop a new library, and you want it to be of the greatest
possible use to the public, we recommend making it free software thateveryone can redistribute and change. You can do so by permitting
redistribution under these terms (or, alternatively, under the termsof the ordinary General Public License).
To apply these terms, attach the following notices to the library. It
is safest to attach them to the start of each source file to mosteffectively convey the exclusion of warranty; and each file shouldhave at least the "copyright" line and a pointer to where the fullnotice is found.

322 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SE

Standard Open License Text<one line to give the library's name and a brief idea of what it
does.>
Copyright (C) <year> <name of author>
This library is free software; you can redistribute it and/or modify
it under the terms of the GNU Lesser General Public License as
published by the Free Software Foundation; either version 2.1 of theLicense, or (at your option) any later version. This library is
distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public
License for more details.
You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
License along with this library; if not, write to the Free Software
Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307
USA
Also add information on how to contact you by electronic and paper
mail. You should also get your employer (if you work as a programmer)
or your school, if any, to sign a "copyright disclaimer" for the
library, if necessary. Here is a sample; alter the names:
Yoyodyne, Inc., hereby disclaims all copyright interest in thelibrary `Frob' (a library for tweaking knobs) written by James Random
Hacker.
<signature of Ty Coon>, 1 April 1990
Ty Coon, President of Vice
That's all there is to it!

คูม่ ือผูใ้ ช้ | 323

ภาคผนวก E Bio-Rad Free and Open-Source Notices for PCR Products

324 | ซอฟต์แวร์ CFX Maestro Dx SEภาคผนวก F เอกสารอ้างอิง
1

Sugimoto et al. (1996). Improved thermodynamic parameters and helix initiation factor to predictstability of DNA duplexes. Nucleic Acids Research 24, 4,501–4,505.

2

Breslauer KJ et al. (1986). Predicting DNA duplex stability from the base sequence. Proc Nat Acad
Sci 83, 3,746–3,750.

3Hellemans J et al. (2007). qBase relative quantification framework and software for management andautomated analysis of real-time quantitative PCR data. Genome Biol 8, R19.

4

Livak JL et al. (1995). Towards fully automated genome-wide polymorphism screening. Nature
Genetics 9, 341–342.

5

Pfaffl MW (2001). A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR. Nucleic
Acids Research 29, 2,002–2,007.

6

Vandesompele J et al. (2002) Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by
geometric averaging of multiple internal control genes. Genome Biology 3, 1–12.

7

Fox J (2008). Applied Regression Analysis and Generalized Linear Models. 2nd ed (New York:SAGE Publications, Inc.).

คำชี้แจงเกีย่ วกับลิขสิทธิ์ Minpack (1999) University of Chicago สงวนสิทธิท์ ุกประการ
การเผยแพร่ซำ้ และการใช้งานแหล่งข้อมูลและรูปแบบทวิบท โดยมีหรือไม่มกี ารดัดแปลง จะได้รบั อนุญาตโดยมี
เงื่อนไขดังต่อไปนี้
1การเผยแพร่ซำ้ ซึง่ รหัสต้นฉบับต้องคงคำประกาศเกีย่ วกับลิขสิทธิข์ า้ งต้น รายการเงือ่ นไขนี้ และข้อจำกัด
ความรับผิดชอบต่อไปนี้

2การเผยแพร่ซำ้ ในรูปแบบทวิบทต้องทำซ้ำคำประกาศเกีย่ วกับลิขสิทธิข์ า้ งต้นรายการเงื่อนไขนี้ และข้อจำกัด
ความรับผิดชอบต่อไปนี้ในเอกสารและ/หรือสื่ออืน่ ๆ ที่ให้มาพร้อมกับการเผยแพร่

3เอกสารสำหรับผูใ้ ช้ปลายทางที่มาพร้อมกับการเผยแพร่ซำ้ (ถ้ามี) จะต้องมีการรับทราบต่อไปนี้

"ผลิตภัณฑ์นี้มซี อฟต์แวร์ที่พัฒนาโดยมหาวิทยาลัยชิคาโกในฐานะผู้ดำเนินการห้องปฏิบตั ิการแห่งชาติอาร์กอน"คูม่ ือผูใ้ ช้ | 325

Bio-Rad Laboratories, Inc.
4000 Alfred Nobel Drive
Hercules, CA 94547

Bio-Rad3, boulevard Raymond Poincaré
92430 Marnes-la-Coquette, France
โทร: +33 (0)1 47 95 60 00แฟกซ์ ์: +33 (0)1 47 41 91 33
bio-rad.com

Bio-RadLaboratories, Inc.
Website bio-rad.com USA 1 800 424 6723 Australia 61 2 9914 2800 Austria 00 800 00 24 67 23 Belgium 00 800 00 24 67 23 Brazil 4003 0399
Canada 1 905 364 3435 China 86 21 6169 8500 Czech Republic 00 800 00 24 67 23 Denmark 00 800 00 24 67 23 Finland 00 800 00 24 67 23
France 00 800 00 24 67 23 Germany 00 800 00 24 67 23 Hong Kong 852 2789 3300 Hungary 00 800 00 24 67 23 India 91 124 4029300 Israel 0 3 9636050
Italy 00 800 00 24 67 23 Japan 81 3 6361 7000 Korea 82 2 3473 4460 Luxembourg 00 800 00 24 67 23 Mexico 52 555 488 7670
The Netherlands 00 800 00 24 67 23 New Zealand 64 9 415 2280 Norway 00 800 00 24 67 23 Poland 00 800 00 24 67 23 Portugal 00 800 00 24 67 23
Russian Federation 00 800 00 24 67 23 Singapore 65 6415 3188 South Africa 00 800 00 24 67 23 Spain 00 800 00 24 67 23 Sweden 00 800 00 24 67 23
Switzerland 00 800 00 24 67 23 Taiwan 886 2 2578 7189 Thailand 66 2 651 8311 United Arab Emirates 36 1 459 6150 United Kingdom 00 800 00 24 67 23

Life ScienceGroup

10000135651 Ver D

US/EG

22-02390422

Sig 0122