第 4 期 NBRP・コムギ 第 3 回 運営委員会 議事

議

事

録

日時： 令和元年 8 月 28 日（水）13：00〜15：30
場所：京都大学 農学・生命科学研究棟 115 小会議室（１）出席者：12 名（１）運営委員：
松岡 由浩（委員長）、大田 正次、川本 祥子、小林 正智、佐藤 和広、佐藤 豊（２）実施者：
那須田 周平（課題管理者）、太田 敦士、新田 みゆき（３）研究協力者：
竹中 祥太朗、西田 英隆（４）その他NBRP 推進員・プロジェクトオフィサー 田畑 哲之
議長：松岡
書記：新田

（１） 第 4 期 NBPR・コムギ 第 2 回 運営委員会議事録確認（資料 1）（資料 2）（２） 第 4 期 NBPR・コムギ 組織確認 （資料 3）[訂正]大田正次氏の所属 「福井県立大学 名誉教授」（３） 中間評価について（資料 4）
課題管理者より、「中間評価に関する報告書」を 7 月 5 日に NBRP に提出したこと、結果は秋以降に AMED から送付される予定であることの説明があった。また、現時点までの配布数が目標値を下回っていることへ指摘があることが予想されることから、この問題への対応として、
課題管理者が、世界のコムギ研究を戦略的に調整する組織である Wheat Initiative (WI) の専門家会議において、NBRP を WI 公認のジーンバンクとして位置づけ、学術研究に使用された系統
を NBRP に寄託し、誰でもアクセスできるリソースとして保存する提案を行ったことが報告された。

（４） 2018-2019/2019-2020 年事業計画等の報告

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（４−１） 種子リソース増殖（資料 5）

実施者より資料のように報告があった。一部、作業の遅れがあるとの指摘があり、今後は運営委員会の開催日までに栽培予定系統リストを確定し、審議できるようにすることとなった。

（４−２） 種子リソース配布（資料 6）

課題管理者より資料のように報告があった。

（４−３） 系統配布手数料料金の改定（予定）について（資料 7）

課題管理者より、消費税税率改正（2019 年 10 月 1 日）に伴う系統配布手数料料金の改定の予定についての報告があった。8 月 19 日からユーザーに web・メーリングリストを通じて周知
し、8 月 23 日に AMED に伝達済みである。また、輸出管理について、所属機関の輸出管理規定に沿ってリソース輸出の手続きを執ることは必須であり、大学が制度を作らなければならな
いことになっていて、大学に制度があるか確認をしておく必要がある、との指摘があった。

（４−４） 寄託システムの運用について（資料 8）

課題管理者より、国際的な部分で知財との話し合いが滞っていたが、今後解決に向けて進めていく予定であり、第 4 期中に海外からの寄託受け入れを開始できるよう制度を整える、との報告と説明があった。関連して、海外からの寄託を受ける場合の注意点等についての情報・意見交換があった。

（４−５） NAM 集団ワーキンググループ（資料 9）

研究協力者と課題管理者より資料のように報告があった。ジェノタイピングは RNAseq 法を用いて行う予定であること、最後の世代では系統当たり多くの種子を得る必要があるので栽培場所を検討中であること、が説明された。

（４−６） アーカイブ化ワーキンググループ（資料 10）

担当の運営委員より資料のように報告があった。また、NBRP コムギで保存している系統の大部分が過去の海外学術調査などを通じて導入されたものであるので、採集記録を収集したいということが趣旨であるとの補足説明があった。

（４−７） KOMUGI ワーキンググループ（資料 2）

研究協力者より資料のように報告があった。KOMUGI のホームページをユーザーに利便をもたらすためどのように充実させていくか、Slack を利用して議論を進めているとの報告があった。

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（４−８） eWIS

（資料 2）

研究協力者より資料のように報告があった。特に、eWIS の廃刊（2019 年 3 月）についての説
明があり、これからアドバーザリーボードの方々へ連絡するとの説明があった。

（４−９） 農林 61 号 blast server の設置について（資料 11）

課題管理者より NBRP ゲノム情報等整備プログラム等の支援により de novo assemble した農林 61 号ゲノム情報の公開について、資料のように報告があった。

（４−１０） 学会等での活動（資料 12）

課題管理者より資料のように報告があった。

（５） 審議事項（５−１） 実施担当者の変更について（資料 13）

課題管理者より資料のように説明があり、審議の結果、承認された。

（５−２） 種子リソース利用促進について（資料 14）

配布系統数・利用者数が減少傾向にあることを踏まえ、協議した結果、次のように対応することとなった。
・ユーザーコミュニティーとコミュニケーションを強化するため、運営委員会を拡充するとともに、生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催方法を工夫する。
・Wheat Initiative の活動の中で NBRP コムギを世界的ジーンバンクとして位置づけための活動を推進する。
・SMTA での種子を配布できないか検討する。
・寄託システムの運用を強化する。

（５−３） 運営委員会の拡充・生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催方法について （資料 15）
課題管理者より、資料のように説明があり、宅見薫雄氏（神戸大学）の運営委員会への加入が承認された。また、運営委員会は 8 月ごろの年 1 回開催とし、コムギ小委員会を 3 月ごろの春の育種学会に連動する形で年 1 回開催し、そこで出された要望を運営委員会で諮ることが承認された。

（５−４）Wheat Initiative における NBRP・コムギの位置付けについて、および（５−５）
ITPGR に従った SMTA での種子の収集・保存・配布システムと現行の MTA によるシステムの運用について （資料 15-16）

3課題管理者より、NBRP・コムギを WI に認可されたジーンバンクにすることで、国際的な研究
コミュニティとして位置付けるための活動を推進したいとの説明があった。これに関連して、WIで種子のやり取りする場合、International Treaty on Plant Genetic Resources for Foodand Agriculture (ITPGRFA) に基づく SMTA での運用となるので、AMED の方針と整合性が取れるかが問題になるのではとの指摘があり、協議された。その結果、WI との連携は望ましい
が、リソース移転の同意書にどのシステムを適用するのかは NBRP 事業にとって根幹にかかわる重要なポイントであること、ITPGRFA 発効当時は NBRP のリソースは SMTA を適用しないとの見解であったが、食糧にかかわるリソース移転を取り巻く世界の状況が時代とともに変化していることを鑑み、イネ、オオムギ、コムギで今後の同意書の扱いについて AMED と相談する必要があること、が意見として出された。そして、今後佐藤（和）委員が中心となり、NBRPと協議を進めることとなった。

（５−６） 京都大学コムギ遺伝資源保存事業のセンター化について（資料 17）

課題管理者より、資料のように説明と問題提起があり、NBRP の他の生物種での状況、コムギでのこれまでの経緯について、意見交換があった。その結果、コムギの遺伝資源事業が京都大学でセンター化するか否かは基本的には学内の問題であるが、センター化が資源の保全につながるのであれば運営委員会としては賛同するとの結論が得られた。また、センター化に関連して、課題管理者を補佐するプロジェクトマネージャーを新規雇用することについての意見交換があり、委員から、遺伝資源管理のマネージャーという役割は、非常に多岐にわたる実務を長期間行う下請的業務になりがちで、これからキャリアパスを繋げたい人にとって未来が見えないことになりかねないとの指摘があった。一方、課題管理者の負担を軽減する必要も明らかであるため、そのような人材の雇用について、継続して審議することとなった。

（５−７） DNA クローン配布事業について（資料 18）

課題管理者より、事業停止することについて説明があった。第 4 期は今の形で維持し、第 5 期に完全に廃止するか今後議論することとなった。

（５−８） KOMUGI ワーキンググループの今後について（資料 2）

研究協力者より、資料（p23）のように説明があり、協議の結果、KOMUGI ワーキンググルー
プは WG としては残し、議案ごとに活発な議論ができるようメンバーを流動的にするなど運営
方法を工夫することとなった。

（６） その他
次のようなコメントがあった。

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・ ユーザーとの距離を縮めたいとのことに関して、定期的にムギネットを使って発信したらどうか。シロイヌナズナではユーザーのメーリングリストを作って、新しいリソースや学会の案内を日本語で毎月（時には 2 か月に 1 回）、英語では 3 か月に 1 回定期的に配信している。新しいリソースが入りましたという発信を常に続けていくことが大事である。
・ 第 5 期を見据え、コミュニティとしては何をしてほしいか、何をすべきかということをそろそろ詰めて議論する必要がある。

以上

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第 4 期 NBRP・コムギ

第 3 回 運営委員会

日時： 令和元年 8 月 28 日（水）13：00〜15：30
場所： 京都大学大学院農学研究科 吉田キャンパス 北部構内
農学・生命科学研究棟 115 小会議室（1）〒606-8502 京都市左京区北白川追分町

議事（１） 第 4 期 NBPR・コムギ 第 2 回 運営委員会議事録確認

松岡（資料 1）（資料 2）（２） 第 4 期 NBPR・コムギ 組織確認

松岡（資料 3）（３） 中間評価について

那須田（資料 4）（４） 2018-2019/2019-2020 年事業計画等の報告
・

種子リソース増殖

太田・新田（資料 5）・

種子リソース配布

那須田（資料 6）・

系統配布手数料料金の改定（予定）について

那須田（資料 7）・寄託システムの運用について

那須田（資料 8）・

NAM 集団ワーキンググループ

竹中（資料 9）

・

アーカイブ化ワーキンググループ

川浦（資料 10）・

KOMUGI ワーキンググループ

西田（資料 2）・eWIS

田中（資料 2）

・農林 61 号 blast server の設置について

那須田（資料 11）

・

学会等での活動

那須田（資料 12）（５） 審議事項
・実施担当者の変更について

那須田（資料 13）・

種子リソース利用促進について

那須田（資料 14）

・

運営委員会の拡充・生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催方法について
那須田（資料 15）・

Wheat Initiative における NBRP・コムギの位置付けについて

那須田（資料 16）・

ITPGR に従った SMTA での種子の収集・保存・配布システムと現行の MTA によるシステムの運用について

那須田（資料 16）・

京都大学コムギ遺伝資源保存事業のセンター化について

那須田・寺内（資料 17）・DNA クローン配布事業について

那須田・川浦（資料 18）・

KOMUGI ワーキンググループの今後について

西田・那須田（資料 2）（６） その他

資料 １

第4期 NBRP・コムギ 第2回 運営委員会
日時：平成30年10月2日（火）13時～16時
場所：京都大学 農学・生命科学研究棟 115 小会議室（１）出席者：13名〔１〕運営委員：、大田 正次、小林 正智、佐藤 和広、土門 英司
松岡 由浩（委員長）〔２〕実施者：
那須田 周平、新田 みゆき、寺内 良平、太田 敦士〔３〕研究協力者：
西田 英隆、田中 裕之〔４〕オブザーバー：
鈴木 智広（NBRP 広報室）
議長：松岡
書記：新田
（１）第 4 期 NBRP・コムギ 第 1 回 運営委員会議事録確認（第 4 期 第２回（以降省略）資料１）（２）第 4 期 NBRP・コムギ組織、出席者を確認（資料２）P. 11 の組織表中、運営委員会に参加する NBRP メンバーは（佐藤）⇒運営委員、実施担当者、研究協力者である（松岡）

今年度 4 月から eWIS 前編集長の西田氏はデータベース WG 長に、eWIS 編集長は田中氏に交代（松岡）（３）報告事項（３－１）平成 30 年度前期事業報告（３－１－１）種子リソース 太田（資料３）
資料の通り。
栽培シーズン 2016-17 年の系統保存の増殖分は、種子を分取して北白川に保存する作業とデータ入力作業が未完⇒滞りなく進めるように（那須田）

増殖系統の選出方法を、従前ではリソースのリスト順に一定年数おきに更新していたところ、現在では在庫が少ないまたは古い系統を選ぶよう変更したため、全体として更新間隔が長くなった。発芽率を調査して品質を監視することが極めて重要であるので、進めてほしい（那須田、松岡）

在庫が古いとは具体的にどの程度古いのか（土門）⇒第一段階の選抜では 30 年としているが、該当する系統はほとんど無いので第二段階で条件を緩めて 20 年経過した種子を選定して更新している（太田）「京都大学の伝統的系統」の系統数は（小林）⇒約 260 系統（太田）

1

資料 １



発芽試験の際には殺菌剤を用いると良い（土門）⇒ベンレートはムギでは農薬登録がなくベンレート T は登録があるが含有するチラウムに根の生育阻害効果があるので注
意（佐藤）



発芽試験に 14 日間も必要ないのでは（大田）⇒休眠種子を考慮して 14 日間とした（太田）⇒エギロプス属では低温吸水で安定に発芽する（那須田）⇒農水ジーンバン
クではコムギは低温吸水していない（土門）⇒低温吸水は収穫直後の休眠打破には有効だが、古い種子には 1％過酸化水素の方が有効かもしれない（佐藤）

評価する粒数は（松岡）⇒最少 10 粒（太田）

配布した種子の発芽率についてユーザーからのフィードバックはあるか（小林）⇒不発芽の連絡を受けることがある。発芽方法が問題の場合もあるため、エギロプス属種
子の配布の際には発芽方法のマニュアルを添付（那須田）（３－１－１－１）各種コアコレクションの整備 那須田（資料６）四倍体コムギとして登録している系統の中に六倍体が含まれていることがある。四倍体
コアコレクションについては全系統、染色体数を調査（192 系統中 10 系統が六倍体、1 系
統が 2 倍体で（新田））。調査対象外の系統にも倍数性の誤認定の懸念がある。


それぞれの系統について分類の変更の履歴を付ける仕組みが必要（松岡）（３－１－１－２）コムギ出穂日の一斉調査 新田（資料６）
栽培シーズン 2003/2004 年から 2014/2015 年まで累計 4,634 系統のコムギを横浜市立大学の圃場で栽培し、一般農業形質調査のデータをウェブ上で公開している（https://shigen.nig.ac.jp/wheat/komugi/）。各年度のデータから、早・中・晩生系統を抽出し、出穂期調査の基準系統と合わせた計 43 系統を、栽培シーズン 2015/2016 年から継続して複数地点のリソースユーザーに依頼し出穂日のデータを収集している。各地での出穂開花期の尺度となるデータポイントを得て、横浜市立大学でとった出穂・開花日のデー
タの利用可能性を広げることが目的。
コムギ出穂日の一斉調査のデータは岡山大学の加藤、西田両氏が出穂関連遺伝子群のジェノタイピングをし、データを KOMUGI 上で公開する。
（３－１－２）種子リソース配布 那須田（資料４）
資料の通り。
一部、受注して発送できていないものは契約事務が進まないため。


NBRP では配布件数だけでなくユーザー数をカウントするようになった（小林）⇒従
来からのユーザーに新規ユーザーが加わりユーザー数は上昇している（那須田）（３－１－３）DNA リソース 川浦の代理で那須田（資料５）第 3 期までで配布を停止。配布依頼が無いので、理研等の他機関に配布目的の寄託はせず、凍結して長期保存する。次回の運営委員会からは報告項目から外す。

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資料 １



ゲノム解読以降はシロイヌナズナの完全長 cDNA がゲノムと配列が異なる場合や、完全長ではない場合があるなど、配布クローンの品質管理に多大な労力が必要（小林）⇒コムギの cDNA リソースも本当に完全長である保証はない（那須田）

保存については横浜と京都に重複保存（那須田）

事業項目は時代の変化に応じて見直す必要がある（土門）（３－２）NAM 集団ワーキンググループ 竹中（資料６）
第 3 期で六倍体、四倍体、二倍体コムギのコアコレクションを整備した。これらをもとに第 4 期では GWAS (genome wide association study) の好材料である NAM (nested
association mapping) 集団の作成を進めている（那須田）材料選定の経緯は資料の通り（竹中）世代促進の実務の進行状況の説明（新田）

休眠打破の条件「35℃、12 日間」の根拠は（土門）⇒古い文献を参照（新田）

岩手生工研でのイネの NAM のように大規模栽培で表現型を取るか（佐藤）⇒竹中氏が行っている冠水耐性の試験など、形質によってはデータを取れる。また協力者を得て大規模栽培を行う仕組みの模索も必要（那須田）（３－３）アーカイブ化ワーキンググループ 川浦代理で松岡（資料５）
NBRP・コムギのコレクションの多くは、木原均先生や田中正武先生らが海外探索で野生から収集し、それらを物集女に導入して系統化してきたものである。採集の記録である「フィールドノート」と導入後どのように栽培して系統化してきたかを記録した「栽培記録ノート」を収集し保存することは、コレクションの由来を担保する上で重要であり、資料を収集し、永続的に最適な場所で保存するのが最終的な目標である。
コムギ遺伝資源に関する多くの資料の所在を確認した。資料の現在の管理者、京都大学
大学文書館等と調整しながら、今後、NBRP・コムギ事業として保全活動を進めたい。


資料は様々な側面から見ることができるので、関心ある方々が利用できるように調整する（那須田）

資料は可能であれば総体として保存する方が良い（大田）（３－４）KOMUGI データベースワーキング報告 西田（資料７）
資料訂正 P. 29、２．誤「Kansas University」⇒正「Kansas State University」
2017 年 9 月 25 日に開催された第 10 回 KOMUGI データベースワーキング「データベース研究会」の議事録については資料の通り。
2018 年 8 月 28 日に開催された第 11 回 KOMUGI データベースワーキング「データベース研究会」の議事について報告があった。

3

資料 １



本 WG は山崎先生の発案で始まり、将来的にはコンテンツの発信をコミュイティサイ
ドでできるようにとのことであった。第 4 期では本 WG は NBRP・コムギとしてのコ
ンテンツの発信を積極的に議論する集団として位置づけるという話になった（松岡）

本 WG には、今後ゲノムデータなど NBRP から情報発信した時に最初のフィルターになってもらい、ユーザー目線の DB が作れるよう協力をお願いしたい（那須田）（３－５）eWIS 報告 西田（資料８）
資料の通り。
投稿数の内訳はインドからの 1 報を除いて編集委員である宅見氏の尽力。投稿が少ない
ので eWIS を活性化させるための様々な議論を行ってきた。プレプリントサーバー化する案も実現しなかった。WIS は IWGS (International wheat genetics symposium)に付随してきた経緯がある。 IWGS が WC (wheat congress)に吸収され、組織的裏付けがなくなったので継続する必要はなくなってきた。編集委員で議論し、廃刊を決定。2 月末まで投稿を受け付ける。廃刊にあたり関係者への連絡は古くから携わっている宅見氏、松岡氏の協力を得る。
（３－６）学会等での活動報告 那須田（資料９）
資料の通り。
WI の品質と安全性 (Improving Wheat Quality for Processing and Health)の EWG(expert working group)で整備する種子タンパクに関するコアセットを NBRP・コムギで保存するよう調整中（３－６）その他の報告 那須田
昨年度、NBRP のゲノム情報等開発プログラムの予算で農林 61 号のシークエンス解読を行った。京大、農研機構、横浜市立大、産総研でチームを作り、イルミナでのデータに
Hi-C のデータを加えアセンブルまで完了した。データをコミュニティに返すために、BLAST サーバを今年度内に KOMUGI のデータベースの中に作る。論文公開後は全てのデータを公開する予定（那須田）（４）審議事項（４－１）平成 30 年度後期実施計画（４－１－１）種子リソース 太田（資料３）
資料の通り。
発芽率調査はリクエストが多い「京都大学の伝統的系統」から行う。方法 1 が簡便なのでこれで進め、20 度の定温で行う。


発芽率調査は物集女だけで行うのか（松岡）⇒物集女での更新系統数が大きく減ったので物集女で発芽率調査を行う（那須田）

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資料 １



現在、北白川が種子配布の窓口になっているため、発芽率に関する苦情は北白川の新田が対応している。発芽マニュアル作成して種子配布時に添付しているなど、種子の発芽について知見を持っている新田が手法の確立に参加するべき（那須田）

参考意見を聞きつつ実務担当の太田と新田で手法を確立し、年度当たりの発芽調査予定数と調査完了数の実数を報告する（那須田）

シャーレでは数がこなせないのでペーパータオルで行う（太田）コムギ属とエギロプ
ス属では発芽条件を変え、エギロプス属については種子配布時に添付している発芽マ
ニュアルに合わせる（新田）⇒発芽マニュアルを KOMUGI に載せるようデータベー
ス WG に諮る（那須田）⇒種子配布時にマニュアルを添付するとともに URL も示すとよい（竹中）

種子の保存状態は（佐藤）⇒冷蔵のものと、一部冷凍で横浜市立大にバックアップがある（那須田）

長期的に種子の寿命を確認する方法を作っておく必要がある。オオムギでは裸麦の系
統の発芽率が落ちていたことがきっかけで古い冷凍保存の種子をチェックしたことにより、冷凍で長期保存ができていることが確認できた。データは他の研究機関のものであってもよいので長期保存できる条件を確立することが必要（佐藤）⇒これから整備すると結果が分かるのは何十年も後なので、すでに長期保存されているものを発芽率調査して確認することしかできない（那須田）⇒発芽率調査の対象を配布対象としている最新世代のみで考えていたが古い世代の調査も必要か（太田）⇒どのような条件で保存するとどれくらい持つのか知っておくべき（大田）⇒収穫した時の条件で発芽率や種子の寿命が振れるので難しい（佐藤）⇒種子の在庫数が多い「京都大学の伝統的系統」の中から 10 系統ぐらいを選んで、過去の更新の種子を調査すれば傾向はつかめるのではないか（那須田）

更新の度に、入庫前の発芽率を調査しておかなければ保存による発芽率の低下が分からないのでは（大田）⇒農水ジーンバンクでは入庫前と入庫後 5 年毎に発芽率調査を行い、80%を切ったら増殖している。データが蓄積され、種により、また、品種や系
統ごとに発芽率が落ちやすいものが分かってきているので、発芽率の落ちにくい系統
はモニタリングの間隔を長くするよう切り替えつつある（土門）。

英国キュー植物園から、種ごとに含水率と発芽率の低下の予測式が公表されている（http://data.kew.org/sid/viability/）のでそれも使えると思う（土門）

入庫前の発芽率調査をいくつかパイロットで行う（小林）

実験に種子を使えば結果的に発芽率のチェックができる。発芽率のための発芽調査では貴重な種子が勿体ないので工夫できないか（佐藤）

配布のリクエストが多い系統を優先に行う（新田）⇒「京都大学の伝統的系統」はリクエストが多い系統と言える（那須田）

雨がかからない方法で栽培しても発芽率が悪いのか（松岡）⇒晩生の系統は高温障害
により発芽率が 0 のことがある（新田）⇒経験では屋根の下での栽培より露地栽培の

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資料 １

方が良い種子が採れることが多く、どの栽培方法が良いかは一概には言えない（大田）「京都大学の伝統的系統」を使って更新年ごとの発芽率を調査すれば、そのデータは気象条件と種子の品質の関係にも知見をもたらすかもしれない。また、どの更新年度
も高発芽率であれば、入庫前の発芽率調査を省略してもよい（那須田）（４－２）NAM 集団ワーキンググループ 竹中（資料６）
NAM 集団の利用向上のために、今の段階から親系統を用いて表現型の取り方を検討しておく必要がある。


複数年度に渡って親系統を大量にオープン採種しておけば、調査に量が必要な種子の成分に関する研究などに使ってもらえる（新田）

袋掛けした自殖種子は別途確保されている（新田）

セットとして配布できるのか（松岡）⇒京都大学のシステムとして系統当たりでしか価格を付けられないので難しい（那須田）⇒リクエストの際にはワンクリックでできるようにしたい（新田）（４－３）アーカイブ化ワーキンググループ 川浦代理で松岡（資料５）
資料の収集・保全作業を円滑に進めるために大田氏に WG に加わってもらう⇒承認（４－４）データベース WG 西田
物集女でリソース管理を実施している太田氏に WG に加わってもらう⇒満場一致で承認
年 1 回の会合のほかに随時情報交換できるツール”SLACK”を使っている。
（４－５）学会等での活動

那須田（資料９）

資料訂正 P. 32、2⑤ムギ類研究会、誤「12 月」⇒正「11 月 26 日、27 日」
2.① 年に 1 回開催してきた分類講習会の講師であった大田氏は今年度で退職であるが、来年度も大田氏に講師を続けていただく⇒後継者が必要（大田）⇒人材がまだ育っていな
いので大田氏が講師として最適である（那須田）②～④ 展示について NBRP の声がかかったところには積極的に参加する予定。
⑤

ムギ類研究会 2 日目の後、生物遺伝資源委員会コムギ小委員会を開催し、コムギに関する研究の動向、ゲノム研究の動向、国際協力の動向などを情報交換する機会を設ける予定。
２．年度末実績のとりまとめについて 松岡
年度末までの事業報告を新年度の 4 月から 5 月に課題管理者である那須田がとりまとめて AMED に行っている。実施者と WG の責任者に年度の報告をしてもらう仕組み作りが必要。そのため今年度から、種子リソース、NAM、アーカイブ化、データベース WG は

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資料 １

3 月末までの活動内容をまとめて、数字を明記し、4 月第 1 週、遅くとも第 2 週までにまとめ、事務局京極まで送る。
３．その他【NBRP 外のジェノタイピングした系統の配布について】（那須田）
第 2 期に SSR でジェノタイピングした時には農水の系統は農水に配布依頼するようにしていたが、コアコレクションの DArTseq によるジェノタイピングではマーカーの量が極めて多く、すぐに形質との相関が取れるため、格段に系統配布の要請が高い。
ジェノタイピングしてコアコレクションを作成し公表すると、ジェノタイピングをした系統そのものの自殖後代の分譲の問合せがある。育成者権が切れている農水の系統や系譜が不明瞭な系統については NBRP の系統として系統化して配布できるようにしたい。


再度、NBRP で配布できる系統を精査する（那須田）

系統提供者と協議して、双方に問題がなく、かつユーザーにとって利便性の高い解決方法を模索する（那須田）（小林）【次期に向けた取り組みについて】
コムギのゲノム配列が公表された今、今後どのような研究領域に焦点を当てていくのか、コミュニティ全体で議論し、外向けに戦略説明をして次期に備える必要がある。
ゲノム解読後の研究ニーズはどこに一番焦点が当たるか考え、学術研究での切り口を主眼に、コムギの特色で研究人口が多いものをジェノタイピングにも反映させるべきなのでは。フェノタイピングの対象がコムギも成分でいいのか、他に優先すべきものは無いのかということをコミュニティ全体で考えてもらい、戦略を立て、それに沿ってフェノタイピ
ングやデータベースのコンテンツや手厚くすべき付加情報、品揃えを検討するべき。焦点を当てている研究の重点領域があってそのための準備をしていることを外向けに戦略的に宣伝する。
また、育種家の方々がゲノムの情報を活用し、われわれが配っている品種を少し改変して種苗権を取りたいというケースがないとは言えないので対応する方法を考えなければいけない。
アレルギーの問題は健康の問題と直結しているのでコムギの重要な課題の一つであるが、それができる外部の人と組む必要がある。耐病性も重要な課題。耐塩性、耐乾性などのストレス耐性は海外の大きなフィールドでなくてもできる研究であるのでできる人と組んでいきたい（那須田）⇒鳥取大乾燥地研の辻本氏が SATREPS で乾燥耐性を扱うので候補に挙がったテーマの中では取り掛かりやすい（松岡）⇒ムギ類研究会が近々あるので、そういうところで提案してみて反応を見るのも必要かと思う（小林）



NAM から直接品種が出来てしまったら成果として問題はないか（佐藤）⇒世界的に影響力があるような品種が出てくるのならいいことだとは思うが、学術的な貢献をまず説明しなければならない（小林）

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資料 １



NAM のリストはコミュニティの中だけで伝えていっているのか。外部に広く伝えればフェノタイピングの幅が広がるのでは（鈴木）⇒NAM を作っていることは学会での広報活動で書いているが、リストは論文を書く前には公表はできない（那須田）⇒
プロジェクト論文にしないのか（鈴木）⇒フェノタイピングで余程新規性があると主張できるような根拠がないと論文にすることは難しい。まとまった段階でレビューのチャンスを得て、こういうリソースを開発した、こういう風に使えるという説明を入れると研究コミュニティから興味を引くチャンスになるだろう（小林）⇒第 5 期の準備までに残り時間が少ないので成果をアピールできることはないか（鈴木）⇒次へのベースとなるような材料が整っている、これを使えばこういう研究が進むというプロ
パガンダとして使えると思うが、コムギは 1 年に 1 サイクルであるので早い成果を求めることは難しい（小林）

遺伝子改変への応用は遠いのか（鈴木）⇒コムギで CRISPR/Cas9 を試されている方はいて先月の育種学会でも成功したという発表があった（那須田）⇒これからそういった系統の受け入れもあるのか（鈴木）⇒形質転換体を受け入れる体制はできている（那須田）⇒現在パブリックコメントが始まっているので、それに研究コミュニティの意見を入れた方が良いかも（小林）⇒方向性としては CRISPR/Cas9 による改変植物は遺伝子改変ではないという認知か（那須田）⇒そうでもない（小林）

以上

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資料 2

2019 年 3 月 太田敦士
NRBP・コムギ 種子リソース （第 4 期 2 年目） まとめ
1. 業務題目
コムギ近縁野生種・コムギ在来品種の収集・調査・保存（主として種子更新など）。
2. 業務担当[京都大学 植物遺伝学分野（北白川） / 栽培植物起源学分野（物集女）]
那須田周平（責任者）、寺内良平、安井康夫、新田みゆき（実施者）、太田敦士（実施者）、他 技
術補佐員 5 名
3. 平成 30 年度（第 4 期 2 年目）の報告
 2017-18 年 系統保存
北白川と物集女で栽培した 516 系統のうち、473 系統（新規導入 87 系統含む）を収穫した（表1, 3）。これらは現在、種むき作業中である。
 2018-19 年 系統保存
在庫情報から「在庫が少ない」または「在庫が古い」系統を中心に選んだ 481 系統と、新規導入の 80 系統を播種した（表 1, 3）。
表 1 2017-18 年更新系統と 2018-19 年更新予定系統の概略。種別内訳は表 3 に記載している。
グループ †
2017-18 年
2018-19 年
播種
収穫
播種
収穫
栽培
見込み 場所 ††KU
在来品種・野生種 genus Aegilops
142
137
220
193
M
genus Triticum
176
172
150
143
M
実験系統
3
3
85
85
K
新規導入
91
87
80
75
M
KT
在来品種・野生種 genus Aegilops
2
2
K
genus Triticum
74
69
5
5
K
実験系統
8
8
K
LPGKU
実験系統
11
10
K
TACBOW 在来品種・野生種 その他
30
5
K
合計
516
473
561
521
† KOMUGI ホームページにおいて、NBRP group name が野生種または栽培品種・品種であれば「在来品種・野生種」に分類し、実験系統であれば「実験系統」とした。Triticum-Aegilops 以外の属は「その他」にした。「新規導入系統」は KOMUGI 未登録系統である。
†† 「M」は Mozume（栽培植物起源学分野）、「K」は Kitashirakawa（植物遺伝学分野）を示す。

 他殖性種の増殖方法の検討
他殖性種 Secale cereale（2 系統） および Ae. speltoides （2 系統）に異なる栽培・袋掛け方法を実施し、稔実数を比較した。なお、各系統 3 個体を一つの鉢または近接して栽培した。
栽培条件
温室・鉢植え風通しの良いアクリルハウス・鉢植え
圃場・露地植え袋掛け条件
1 穂毎に袋掛け
複数穂まとめて袋掛け
出穂期に株全体を不織布で覆う
オープン（袋掛けなし）

9

資料 2

結果は表 2 のとおりであった。
- S. cereale は圃場での栽培で、系統維持が可能かもしれない（ただし、使用した系統が自殖性の強い系統と思われる）。
- Ae. speltoides の KU-5720B はどの条件でも種子が取れなかった。一方で、KU-7820 は「複数穂まとめて袋掛け」や「株全体を不織布で覆う」方法で稔実種子が得られた。系統によっては、1株の異なる穂間または異なる株間で花粉のやりとりが可能な条件下で栽培・更新すれば、系統維持が可能かもしれない。しかし、系統により異なる結果が得られたため、遺伝的な要因（近交弱勢程度の違いや環境応答性の違い）も大きく関与していると思われる。
表 2 他殖性種 Secale cereale と Aegilops speltoides の稔実結果。
種および系統栽培方法
増殖方法
S. cereale
温室内・鉢植え1 穂毎に袋かけ
KU-S-4017
複数穂まとめて袋かけ圃場・露地植え1 穂毎に袋かけS. cereale
温室内・鉢植え1 穂毎に袋かけ
KU-S-4034
複数穂まとめて袋かけ
1 鉢まとめて不敷布で覆う
アクリルハウス・鉢植え
1 穂毎に袋かけオープン
圃場・露地植え1 穂毎に袋かけオープン
Ae. speltoides
温室内・鉢植え1 穂毎に袋かけKU-5720B
複数穂まとめて袋かけ
1 鉢まとめて不敷布で覆う
アクリルハウス・鉢植え
1 穂毎に袋かけ複数穂まとめて袋かけ
Ae. speltoides
温室内・鉢植え1 穂毎に袋かけKU-7820
複数穂まとめて袋かけ
1 鉢まとめて不敷布で覆う
アクリルハウス・鉢植え
1 穂毎に袋かけ複数穂まとめて袋かけ

収穫穂数
4
11
3
22
21
19
20
11
32
8
36
83
不明
14
17
63
99
不明
16
4

収穫粒数
0
2
31
1
232
233
0
302
335
83
0
0
0
0
0
0
19
28
0
3

Ae. speltoides に関して、さらに増殖方法に関するデータを集めるため、15 系統を播種した。下記の 9 条件で栽培し、稔実数を比較する予定である。
また、Ae. mutica についても、同様の試験をおこなうため、20 系統を播種した。そのうち 9 系統

栽培条件
温室・鉢植え圃場・鉢植え圃場・露地植え×

袋掛け条件
1 穂毎に袋掛け
複数穂まとめて袋掛け → 計 9 条件
オープン

のみ発芽したため、それらを栽培している。

10

資料 2

 発芽率試験
予備試験を実施し、その結果をもとに以下のとおり試験方法を定めた。なお、予備試験の結果も
図 2 に載せている。
試験方法:① [予冷] 10℃, 1 日。ケース底に湿らせたキッチンペーパーを敷き、1 セルあたり 1 系統分の種
子 10 粒を設置する（図 1A）。
② [インキュベート] 20℃, 7 日（図 1B）。
③ [発芽数カウント] 芽と根がともに 1cm 程度伸長した種子を「発芽」として記録する。

AB

図 1 発芽率試験方法の写真。A: 各セルに 1 系統 10 粒ずつの種子を設置している。水
道水で湿らせたキッチンペーパー（二枚重ね）をケース底に敷いている。ケースの端のセルに湿らせたキムワイプを置くことで、試験期間中に各セルが乾燥することを防いでいる。B: 20℃に設定したグロースチャンバーにケースを設置している。
以下の実施スケジュールで発芽率試験を実施予定である。今年度（2018 年度）には 1000 系統を試験した。
- 2018 年度 1,000 系統 (実施済み)- 2019 年度 4,000 系統- 2020 年度 4,000 系統- 2021 年度 3,000 系統

11

資料 2

4. 平成 31 年度（第 4 期 3 年目）の計画
 2017-18 年 系統保存
収穫した 473 系統の種むきを終え、在庫管理システムのデータを更新し、入庫を完了させる。
 2018-19 年 系統保存
現在生育中の 542 系統の袋かけ・収穫をし、その後、種むきを開始する。
 2019-20 年 系統保存
「在庫が少ない」または「在庫が古い」系統を中心に約 400 系統の増殖・更新系統を選抜し、播種する。
新規導入として、「スペイン・モロッコ収集 Aegilop」から約 100 系統を播種し、系統化に向けた 1
回目の栽培をおこなう（導入後の 2 回の更新をもって「系統化」としている）。
- Ae. ventricosa 21 系統- Ae. biuncialis, Ae. ovata, Ae. triaristata, Ae. triuncialis, Ae. variabilis から 79 系統
なお、現在、系統化途中の系統は以下のとおりである。
- USDA から導入した 2x, 4x Triticum（KU-15201 - 15955） 584 系統
このうち 88 系統は系統化済み。他は 2 回目の栽培・更新が必要である。
- スペイン・モロッコ収集 Triticum（KU-14901 - 14934 および KU 番号未付与） 266 系統
このうち 16 系統のみ系統化済み。残りは 1 回または 2 回の栽培・更新が必要である。
- スペイン・モロッコ収集 Aegilops（KU 番号未付与） 167 系統
これまでに栽培されておらず、すべて 2 回の栽培・更新が必要である。
Aegilops リソースの充実のため、2019 年度より優先して系統化する予定である。
 他殖性種の増殖方法の検討
栽培中の Ae. speltoides 15 系統から下記 9 組合せの穂を収穫し、稔実粒数を調べ、増殖方法を検討する。
Ae. mutica に関しても増殖方法の検討をおこなう。現在 9 系統を「圃場・露地植え」で栽培している。そのうち 4 系統は「圃場・鉢植え」、2 系統は「温室・鉢植え」でも栽培している。
 発芽率試験2019 年度中に 4,000 系統の発芽率試験を実施する。
試験結果を系統保存にどう反映させていくか検討する。また、試験結果をどう公開するかについても検討する。

12資料 2

表 3 2017-18 年更新系統と 2018-19 年更新予定系統の種別内訳。栽培場所の「M」は Mozume（栽培植物起源学分野）、「K」は Kitashirakawa（植物遺伝学分野）を示す。
グループ †
2017-18 年
2018-19 年
収穫
栽培
播種
収穫
播種
見込み 場所 ††genus Aegilops
在来品種・
KU
野生種
section Polyeides
Ae. umbellulata
M
14
14
17
16
Ae. ovataM
1
1
Ae. triaristata
M
7
7
7
7
Ae. columnaris
M
12
10
Ae. biuncialis
M
12
9
12
8
Ae. variabilis
M
3
3
3
3
Ae. kotschyi
M
2
2
1
1
Ae. triuncialis
M
24
24
23
23
section Cylindropyrum
Ae. caudata
M
54
52
50
41
section Comopyrum
Ae. comosa /
M
13
13
25
25
Ae. heldreichii
section Sitopsis
Ae. speltoides /
M
6
6
15
15
Ae. aucheri
Ae. longissima
M
2
2
Ae. searsii
M
5
5
Ae. bicornisM
34
34
section Amblyopyrum
Ae. mutica
M
20
9
genus Triticum
Diploid species
T. boeoticum
M
17
16
97
93
T. urartu
M
10
10
15
15
T. monococcum
M
1
0
6
6
Tetraploid species
T. araraticum
M
146
144
12
11
T. timopheeviiM22
T. dicoccoides
M4
4
T. dicoccumM1
1
T. durumM
99Hexaploid species
T. aestivum
M
6
4
K
実験系統
3
3
85
85
M
新規導入
91
87
80
75

13

資料 2

表 3 続きグループ †

2017-18 年
播種

KT

LPGKU
TACBOW

在来品種・
野生種
実験系統
実験系統
在来品種・
野生種

収穫

genus Aegilops
genus Triticum
-

91

69

その他

30

5

516

473

合計

2018-19 年
収穫
播種
見込み

栽培
場所 ††

2

2

K

5
8
11

5
8
10

K
K
K
K

561

521

† KOMUGI ホームページにおいて、NBRP group name が野生種または栽培品種・品種であれば「在来

品種・野生種」に分類し、実験系統であれば「実験系統」とした。Triticum-Aegilops 以外の属は「その他」にした。「新規導入系統」は KOMUGI 未登録系統である。
†† 「M」は Mozume（栽培植物起源学分野）、「K」は Kitashirakawa（植物遺伝学分野）を示す。

14

資料 2

材料:
- Aegilops 4 種: Ae. bicornis, Ae. cylindrica, Ae. triaristata, Ae. tauschii- Triticum 4 種 T. boeoticum, T. monococcum, T. durum, T. aestivum
方法:

予冷条件:

- 各種 1 系統 10 粒 x 3 反復A) 予冷（10℃, 7 日）
- ケース底に湿らせたキッチンペーパーを敷き、その上に播種した B) 予冷（10℃, 1 日）
- ケース内の 1 セルに 1 系統 1 反復分（10 粒）を播種したC) 予冷（5℃, 7 日）

- 下記 5 条件の予冷後、インキュベート（20℃, 7 日）したD) 予冷（5℃, 1 日）

- インキュベート後に、発芽種子をカウントし、発芽率を求めた

E) 予冷なし

図 2 発芽率予備試験の結果。予冷条件 B が全体的に良い発芽率を示した。

15

資料 2
平成30年度

実績報告書

2019年4月5日

種子リソース配布担当：

那須田

窓口担当： 新田周平

受注・配布実績（2018年4月1日から2019年3月31日まで）

平成29年度以前受注、平成30年度配布分（自家使用を含む）
受注

発送済み

遺伝

物集女

木原

遺伝

物集女

木原

国内

0 (0)

1 (7)

0 (0)

0 (0)

1 (7)

0 (0)

国外

1 (88)

2 (346)

2 (11)

0 (0)

0 (0)

1 (1)

合計 1 (88)

3 (353)2 (11)

0 (0)

1 (7)

1 (1)

件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

平成30年度受注、平成30年度配布分（自家使用を含む）
受注

発送済み

遺伝

物集女

木原

遺伝

物集女

木原

国内

4 (97)

9 (252)6 (18)

3 (95)

9 (247)6 (18)

国外

2 (71)

4 (22)4 (5)

1 (19)

3 (21)2 (2)

13 (274)

10 (23)4 (114)12 (268)

8 (20)

合計 6 (168)

件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

＜参考＞
平成29年度

受注・配布実績（2017年4月1日以降に受注し、2018年3月31日までに発送）
受注

発送済み

遺伝

物集女

木原

遺伝

物集女

木原

国内

5 (62)

15 (545)

12 (95)5 (61)

14 (528)

12 (95)国外

2 (96)

5 (378)3 (18)

1 (8)

3 (32)

2 (10)

合計 7 (158)

20 (923)

15 (113)

6 (69)

17 (560)

14 (105)

件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。
キャンセル分は除く。

上記のうち自家使用分
受注

発送済み

京大

横浜市大 京大

横浜市大

9 (104)4 (79)

9 (104)4 (79)

横浜市大 3 (76)

1 (3)2 (69)

1 （3）合計

5 (82)

11 (173)

5 (82)

京大

12 (180)

件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

16

みゆき

資料 2

Nested association mapping (NAM) 集団の作成
平成 31 年 3 月 31 日
龍谷大学農学部 竹中祥太朗
今般、パンコムギゲノム配列が決定されたことにより、遺伝子単離や GWAS (Genome
Wide Association Study)が容易になり、現在、解析のための優れた集団が世界で必要とされている。最初にゲノム配列が読解されたパンコムギ品種 Chinese Spring (以下、CS)に続き，国際コムギ 10 ゲノム構想が現在進行中であり，その中に日本のパンコムギ品種である農林
61 号 (以下、N61)が加えられ，近々に N61 のゲノム配列が公開される予定である。また、
N61 を含む世界のパンコムギコアコレクションがつくられる予定である。

NBRP 第 3 期において我々は 6 倍体コムギのコアコレクションを作成し(Takenaka et al.,2018)、さらにこれらについて N61 を片親とした F 2 集団を作成した。このような状況において、第 4 期では、遺伝的解析が完了したこれらの材料を出発点として、NAM ワーキンググループを中心に，遺伝子単離や GWAS に適した東アジアの NAM 集団を作成し、コムギ研究のコミュニティに公開する。
1.

事業担当者
新田みゆき(研究員)、竹中祥太朗(研究協力者)、那須田周平(責任者)
NAM ワーキンググループ
竹中祥太朗(代表，龍谷大学)、太田敦士(京都大学)、寺内良平(京都大学)、那須田周平(京都大学)、新田みゆき(京都大学)、松岡由浩(福井県立大学)、松中仁(農研機構・九沖農研)、
吉田健太郎(神戸大学)

2.

平成 30 年度 事業報告
初年度の平成 29 年度ではコムギの周年栽培系を確立するとともに、NAM ワーキンググ

ループでミーティングをもち、NAM 親系統の選定を行った(NAM リスト参照)。NAM 親系
統は東アジア(日本～中国～ヒマラヤ地域)由来の系統から、遺伝的集団構造、育種系譜、F 2
種子の在庫粒数を考慮し、目安として 1 組合せ 300 個体、25 組合せ程度からスタートし、最終的に不発芽などで自然縮小して 1 組合せ 200 個体、15 組合せ(計 3,000 系統)からなる
東アジアに特化した NAM 集団を作成すること、また、ユーザーの利便を鑑みて、早い段階で春化処理が不要な系統に絞り込むこととした。
NAM 集団 F 2 ⇒F 3 の栽培
平成 29/30 年の栽培シーズンにおいて、表 1 に従い F 2 個体群の栽培を行った。平成 30 年
3 月下旬から 4 月上旬に出穂し、5 月下旬から 6 月中旬に登熟した。

17

資料 2

収穫直後の種子の発芽方法の検討
収穫直後の種子を播種する場合、休眠打破処理が必要となる。F 3 世代種子を対象に複数の休眠打破処理を行い発芽試験を行った結果、35℃で 12 時間乾燥させる処理により、低温処
理によると同水準の高発芽率が得られることが明らかとなったため、世代促進にこの方法を採用することにした。
NAM 集団 F 3 ⇒F 4 の栽培
平成 30 年 7 月から 8 月に休眠打破処理、9 月上旬にチップ栽培法による室内での水耕栽培を開始した。水量過多により生育停止となった系統について 10 月上旬から中旬に再播種を行った。F 3 個体の出穂日は大きくばらつき、収穫は 11 月中旬から始まり翌 4 月上旬で未出穂の系統があり、現在継続して収穫している。NAM7 と NAM23 については、それぞれ
36 系統と 70 系統が生殖生長に入らず、出穂しても着粒しないなどの理由によりそれぞれ
累計 102 系統と 98 系統が世代促進から脱落した。
NAM 集団 F 4 ⇒F 5 の栽培収穫した F 4 種子は収穫次第、休眠打破処理を行い、平成 31 年 1 月中旬からチップ栽培法
による室内での水耕栽培を開始している。
3.

今後の予定
NAM 親 13 系統のショットガンシーケンスのプロジェクト(代表者：那須田周平(京都大学)、
分担者：清水健太郎(横浜市立大学)，
瀬々潤(ヒューマノーム研究所))が 2019 年度 NBRP
ゲノム情報等整備プログラムに採択された。

18

資料 2

表 1.

NAM リストF2

F 3 ind No.

F 4 ind No.

seedof harvestof harvest

NAM

6xcoreAbbrCountry

var. or cv.

No.

1

6x002

N10

JPN

農林 10 号

300

276

204

2

6x013

CN4

CHN

KU-479

300

267

259

3

6x025

FKK

JPN

富国

300

282

249

4

6x060

PK1

PAK

KU-3229

301

272

243

5

6x061

PK2

PAK

KU-3351

300

253

245

6

6x078

NP1

NPL

KU-4734

300

284

278

7

6x080

NP2

NPL

KU-4769

300

287

156

8

6x081

NP3

NPL

KU-4783

300

296

287

9

6x084

BT1

BTN

KU-7113

300

295

283

10

6x117

CN2

CHN

KU-13546

300

287

257

11

6x119

CN1

CHN

KU-13662

300

279

243

12

6x120

CN6

CHN

KU-13708

300

293

239

13

6x121

CN7

CHN

KU-13807

300

277

262

14

6x122

CN3

CHN

KU-13891

300

295

284

15

6x153

CN5

CHN

Chinese Spring

271

255

241

16

6x159

K107

JPN

関東 107 号

269

262

240

17

6x165

ZNK

JPN

ゼンコウジコムギ

300

283

278

18

6x167

NBB

JPN

延岡坊主小麦

300

283

248

19

6x179

MNM

JPN

ミナミノコムギ

300

266

253

20

6x180

CGW

JPN

超極早生

300

289

251

21

6x183

CKG

JPN

チクゴイズミ

300

294

265

22

6x185

SRG

JPN

シロガネコムギ

300

296

246

23

6x189

SNY

JPN

しゅんよう

300

298

196

24

6x192

AKD

JPN

アカダルマ

300

298

196

7,140

6,767

5,903

Total

19

資料 2

2018 年度 NBRP 活動報告2019 年 4 月 4 日
横浜市立大学木原生物学研究所
川浦香奈子
・DNA リソース
報告事項は特になし。
・アーカイブ化ワーキンググループ
メンバー： 川浦香奈子、太田敦士、松岡由浩、那須田周平、元ナミ、大田正次、寺内良平（大田先生、寺内先生は 2018 年度から）（１）事業計画京都大学や木原生物学研究所、木原ゆり子氏宅（旧木原生研）に残っている採集記録と栽培記録について、系統の情報に関わるデータについてアーカイブ化し、原本を京都大学文書館に保存する。
（２）進捗状況木原均博士、田中正武博士、山下孝介博士を中心とする学術探検隊が採取したサンプルに関する
学術情報のアーカイブ化することを目標に活動した。田中正武博士の資料について、杉山朋子氏（田中博士のご息女）が保管していることが分かったため、その総体を明らかにすることを中心に活動
を行った。
活動記録
・2018 年 6 月 6 日（水） 杉山氏ご自宅で田中博士の資料を見せていただいた（川浦）。
・2018 年 8 月 25 日（土）杉山氏ご自宅で田中博士の資料の全容および総量を確認した。

参加者：那須田、松岡、杉山朋子氏、木原ゆり子氏、川浦
アーカイブ化する資料の総体を明らかにするため、京都大学に全体を移送し、専門知識をもつメンバーで資料の整理をすることとした。
後日、京都大学大学院農学研究科と杉山朋子氏で合意書を交わし、資料を京都大学に寄贈していただくこととした。
・2019 年 2 月 18 日（月） 木原生物学研究所で田中正武博士、木原均博士、山下孝介博士に関する資料について検討した。
参加者：那須田、木原ゆり子氏、杉山朋子氏、川浦
田中正武博士資料については、京都大学大学院農学研究科とで合意書を交わし、所有権を譲渡す

20

資料 2

る手続きを進めることを確認した。
研究資料は公開することが原則であるため、北白川で保管することが現実的であり、杉山氏も合意した。
木原均博士資料については、種子に関する栽培記録等のノート類（前年度閲覧済み）はリスト化
し、田中博士の資料を移送する際に合わせて移送することとした。
重要資料の選別が難しいため、アーキビストとワーキングのメンバーで集まり、それぞれの視点
から資料を見て方針を決める必要があり、機会を設定することとした。後日、科学史資料のアーカ
イブ化の経験のある総研大の飯田香穂里氏、広島大学の久保田明子氏に参加の同意を得た。
山下孝介博士資料については、六ッ川の木原ゆり子氏の自宅で保管されており、木原ゆり子氏の所有物として扱えると考えられるが、山下博士の親族に確認することとした。

21

資料 2

NBRP コムギ データベースワーキング2018 年度実績報告書
西田 英隆

KOMUGI データベースに関する課題や関連する情報について検討を行った。検討内容の資料として、第 11 回 KOMUGI データベースワーキング「データベース研究会」の議事録を添付する。
資料
第 11 回 KOMUGI データベースワーキング「データベース研究会」議事録
2018 年 8 月 28 日（火）13:00～17:30
国立情報学研究所 20 階 会議室（2004）
出席者（敬称略）：石川、川浦、笹沼、田中、新田、松岡、川本、那須田（オブザーバー）、
西田（座長）
議題
１．前回の議事録および未修正部分の確認
・コアセット「京都大学の伝統的系統」「エギロプス属基本系統」について、那須田さんとワーキングメンバーで説明文を検討することになった。
・上記の「エギロプス属基本系統」については植物種の偏りが大きいため、リストに含める系統を再検討することになった。
・近く四倍体、六倍体のコアコレクションの論文が公開されるのでジェノタイプデータ（Excel 形式）を論文公表と同時に KOMUGI に掲載する。
２．Kansas State University の Wheat taxonomy の利用について（前年からの継続）
http://www.k-state.edu/wgrc
那須田さんが先方（Jone さん）と交渉した結果を受けて、Wheat taxonomy を KOMUGIに取り込むことになった。
３．種子一元管理システムのデータサーバーについて（新田）これまで RMSB 社のサーバに種子管理データベースを置いていたが同社の経営に問題がったので契約解除。2018 年 1 月にさくらインターネットにサーバーを移設。RMSB 社が開発したプログラムを買い上げ、保守を（株）ダイナコムに委託契約。今後は遺伝研と API で接続する予定。
４．情報センターDB 開発並びに運用報告（川本）

22

資料 2

・KOMUGI v5 に移行し、ログイン回数を 1 回に減らしユーザーの利便を高めた。
・WIS の PDF ファイルについて文字検索可能にしたいといった利便性向上の議論があった。
5-1. コムギ参照ゲノム配列ならびに Wheat IS Gene Nomenclature 会議（2018 年 7 月 1 日、ベルリン）報告（那須田）・Gene catalog に載っている遺伝子型のついた系統を NBRP で保存していく。
・CYMMIT が作った種子タンパク質遺伝子型のコアセットの寄託を受けた。
・配布するときに遺伝子型をチェックするのか（松岡）⇒遺伝子型が決定された個体から「自殖した」系統として、ノーチェックで配布する(那須田)・Mac Gene Web 版のリンクを KOMUGI に載せることで承認。
5-2. The 10+ Wheat Genome Project（那須田）去年の NBRP のゲノム情報等開発プログラムで農林 61 号のゲノムを解読したので、BLAST
サーバを KOMUGI に置く。
６．その他
・新規メンバーの加入について
京大の太田さんが当ワーキンググループに加入することが了承された。
・eWIS の今後の在り方について
IWGS (International Wheat Genetics Symposium) とともに刊行されてきた経緯があるので、IWGS が無くなるのに合わせて廃刊にすることについて検討、了承された。
新規投稿の受付は 2019 年 2 月まで、廃刊は 3 月末と決定した。廃刊までの諸手続きは宅見さん、松岡さん、現編集長の田中さんが進める。

・DB ワーキングの今後の在り方について（運営委員会との関係）
第 3 期の運営委員会は小委員会と同時開催であったので、当ワーキンググループメ
ンバーにとって情報交換の場となっていた。第 4 期で運営委員会が単独開催となったので運営委員との情報交換や当ワーキンググループのあり方について検討した。
・データベース WG をユーザーに利便をもたらす情報提供のシステムを充実させるための場所と位置づける。
有用なコンテンツを KOMUGI に載せていくのが WG の役割。
・投稿した論文のデータ（交配の履歴やフェノタイプなど）をデポジットする場として KOMUGI を利用することについて。NBRP の予算以外で得たデータであってもデポジットの受け皿として KOMUGI を機能させてほしいと運営委員会で提案する。
・運営委員会の内容をワーキンググループ内で共有するように努めることを確認した。

・次回の DB ワーキング開催について
年 1 回の定期開催を当面維持、将来は状況により、必要時、実施者の招集による開催
への変更もあり得る。

23

資料 2

2018 年度

NBRP・コムギ実績報告書

eWIS 報告書
平成 31 年 4 月 5 日
西田 英隆・田中 裕之
・124 号を昨年 12 月 6 日、125 号を 5 月 2 日に発刊した。124 号は Research Information
2 報、125 号は Research Information 3 報を掲載した。126 号は Research Information 1
報を掲載予定である。
・アクセスログ解析の結果、国別アクセス（2016 年）はアメリカ（2586 回/年）、インド（1556回/年）、中国（888 回/年）
、日本（613 回/年）の順で多かった。アクセス先として WIS（100号以前）の記事が比較的多く、新しく公開した号の中にもアクセスが多い記事が見受けられた。
・eWIS のあり方について、継続的に議論を行ってきた。記事を増やすために、学会の講演
要旨やプレプリントを掲載することも検討したが、著者の権利や利益の保護が困難であると考えられた。また、成果として論文出版が求められる現状では、投稿数・記事数を増やすことは容易でないとの意見もあった。
状況を総合的に判断し、eWIS を 2019 年 3 月一杯で廃刊することとした（新規投稿は同年2 月まで）。既存の記事は、アーカイブとして維持する方向で調整する予定である。
・廃刊にあたり関係者への連絡は古くから携わっている宅見氏、松岡氏の協力を得る。
・現体制は編集長が田中氏（鳥取大）、副編集長が竹中氏（龍谷大）で、任期は平成 31 年度までである。
eWIS Editorial Office
編集長：田中（鳥取大）、副編集長：竹中（龍谷大）、編集委員：石川（作物開発センター）
、川浦（横
浜市大）
、笹沼（山形大）、宅見（神戸大）、西田（岡山大）、松岡（福井県大）Advisory Board
Faris, JD (USA), Houben, A (Germany), Kianian, SF (USA), Kishii, M (Mexico), Lagudah, E(Australia), Ozkan, H (Turkey), Tsujimoto, H (Japan), Zhang, X (China)

24

資料 2

平成 31 年 3 月 31 日
第 4 期 NBRP・コムギ 平成 30 年度
学会等での活動
責任者 那須田 周平
1.

平成 30 年度 報告(1) 広報活動① Aegilops 属植物の穂の外部形態と分類形質に関する講習会の実施（7/14～7/15、京都大学（京都市）、講師 大田正次 先生（福井県立大学））② 日本植物学会第 82 回大会での NBRP 展示および遺伝資源に関するシンポジウムでの話題提供（9/14~9/16、広島大学（広島市）、リソース機関とユーザー（龍谷大学 竹中祥太朗氏）③ ムギ類研究会（11/26～11/27、横浜市立大学・木原生物学研究所（横浜市）、同所において遺伝資源コムギ小委員会開催）④ 第 41 回日本分子生物学会年会での NBRP 展示（11/28～11/30、パシフィコ横浜（横浜市））(2) 渉外活動① WI (Wheat Initiative) 那須田はコムギ遺伝資源の世界的利用に関する２つの専
門家作業部会（Global Wheat Germplasm Conservation and Use Community, andImproving Wheat Quality for Processing and Health）のメンバー。ミーティングに参加（6/30～7/4、ドイツ（那須田））2.

平成 30 年度後半および平成 31 年度前半 予定(1) 広報活動① Aegilops 属植物の穂の外部形態と分類形質に関する講習会の実施（7 月、京都大学（京都市））② 日本プロテオーム学会 2019 年大会 第 70 回日本電気泳動学会総会での遺伝資源とタンパク質発現に関するシンポジウムでの話題提供（7/24~7/27、シーガイア、リソース機関とユーザー（横浜市立大学 川
コンベンションセンター（宮崎市）
浦香奈子氏）③ 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics,
and biotechnology” (PlantGen2019)での発表（6/24～6/28、ノヴォシビルスク）（ロシア）④ 第 1 回 IWC (International Wheat Congress)でのポスター展示（7/21～7/26、サスカチュワン（カナダ））⑤ 第 41 回日本分子生物学会年会での NBRP 展示（12/3～12/6、福岡国際会議場（福岡市））⑥ ムギ類研究会（鳥取大学（鳥取市）
）

25

資料 2

(2) 渉外活動①

WI の専門家作業部会のメンバー（那須田）②

Wheat 10+ Genome Project のメンバー（那須田）③

NBRP・イネと NBRP・オオムギの運営委員（那須田）

26

資料 3

第４期

NBRP・コムギ

組織（令和元年 8 月 28 日現在）

運営委員会
委員長

松岡 由浩

マツオカ ヨシヒロ

福井県立大学 生物資源学部

大田 正次

オオタ ショウジ

川浦 香奈子カワウラ カナコ

横浜市立大学 木原生物学研究所

川本 祥子

カワモト ショウコ

国立遺伝学研究所 NBRP 情報センター

小林 正智

コバヤシ マサトモ

理化学研究所 バイオリソースセンター佐藤 和広

サトウ カズヒロ

岡山大学 資源植物科学研究所

佐藤 豊

サトウ ユタカ

国立遺伝学研究所 系統生物研究センター

辻本 壽

ツジモト ヒサシ

鳥取大学 乾燥地研究センター

土門 英司

ドモン エイジ

農研機構 遺伝資源センター

那須田 周平ナスダ シュウヘイ

京都大学大学院 農学研究科

新田 みゆきニッタ ミユキ

京都大学大学院 農学研究科

寺内 良平

テラウチ リョウヘイ

京都大学大学院 農学研究科

安井 康夫

ヤスイ ヤスオ

京都大学大学院 農学研究科

太田 敦士

オオタ アツシ京都大学大学院 農学研究科

DB ﾜｰｷﾝｸﾞ長

西田 英隆

ニシダ ヒデタカ

岡山大学大学院 環境生命科学研究科

NAM ﾜｰｷﾝｸﾞ長

竹中 祥太朗タケナカ ショウタロウ

龍谷大学 農学部

eWIS 編集長

田中 裕之

タナカ ヒロユキ

鳥取大学農学部 生物資源環境学科

石川 吾郎

イシカワ ゴロウ

農研機構 次世代作物開発研究センター

加藤 鎌司

カトウ ケンジ

岡山大学大学院 環境生命科学研究科

宅見 薫雄

タクミ シゲオ神戸大学大学院 農学研究科

寺地 徹

テラチ トオル

京都産業大学 総合生命科学部

半田 裕一

ハンダ ヒロカズ

農研機構 次世代作物開発研究センター

村井 耕二

ムライ コウジ

福井県立大学 生物資源学部

土佐 幸雄

トサ ユキオ

神戸大学大学院 農学研究科

吉田 健太郎

ヨシダ ケンタロウ

神戸大学大学院 農学研究科

ｱｰｶｲﾌﾞ化ﾜｰｷﾝｸﾞ長ﾊﾞｯｸｱｯﾌﾟ分担
機関責任者

実施担当者
代表機関課題管理者

研究協力者

コムギ研究戦略会議（運営委員、実施者以外）

NBRP・コムギ事務局 （京都大学大学院 農学研究科 応用生物科学専攻 植物遺伝学研究室気付）
那須田 周平ナスダ シュウヘイ

京都大学大学院 農学研究科

新田 みゆきニッタ ミユキ

京都大学大学院 農学研究科

京極 りえ

キョウゴク リエ

京都大学大学院 農学研究科

27

資料 3

AMED バイオバンク事業部基盤研究課

NBRP 担当

落合 雅子、笹土 隆雄、高木 千尋、鈴木 隆弘

文部科学省研究振興局ライフサイエンス課
生命科学研究・脳科学係長

佐々木

雄希

ワーキンググループの構成員（2019.8.28）【データベース】
西田（ヘッド）、笹沼、石川、宅見、田中、松岡、川本、新田、竹中、川浦、太田【eWIS】
田中（ヘッド）、竹中、石川、川浦、笹沼、宅見、西田、松岡【アーカイブ化】
川浦（ヘッド）、太田、松岡、那須田、元、大田【NAM】
竹中（ヘッド）、太田、寺内、那須田、新田、松岡、松中、吉田

28

資料 3

令和元年 8 月 28 日
NBRP・コムギ 第 4 期 第 3 回運営委員会
出席予定者（１） 運営委員：
松岡 由浩、大田 正次、川本 祥子、小林 正智、佐藤 和広、佐藤 豊（２） 実施者：
那須田 周平、新田 みゆき、安井 康夫、太田 敦士（３） 研究協力者：
竹中 祥太朗、西田 英隆（４） その他
NBRP 推進員・プロジェクトオフィサー

29

田畑 哲之

資料 4
第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
中間評価について令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平
。
中間評価に関する報告書（別添）を提出した（2019 年 7 月 5 日）

。
中間評価 質問／確認事項＿事前回答書を受領（2019 年 7 月 24 日）

（2019 年 8 月 5 日）。
中間評価 質問／確認事項＿事前回答書に回答（別添）（2019 年 8 月 8 日）。
中間評価 ヒアリングに出席（ヒアリング資料別添）



中間評価 評価結果は秋以降に AMED より送付されてくる予定

30

資料 4

ナショナルバイオリソースプロジェクト事業
第４期

中間評価報告書（２０１７年４月～２０１９年３月末まで）

プログラム名︓（どちらかに丸で囲む）

中核的拠点整備プログラム

リソース名/グループ名

コムギ

課題代表機関名

国立大学法人

課題管理者

那須田

京都大学

周平

課題分担機関（機関名・代表者名）

31

・

情報センター整備プログラム

資料 4
１．実施課題の進捗状況
ライフサイエンス研究用の基盤となるコムギ種子系統と関連情報の収集・保存・配布を行うこととして事業をスタートした。コムギ遺伝資源の重要性については、第 4 期の中核的拠点整備プログラム採択時に、「3 大作物の一つとして世界的にも貴重なリソースで維持が必要である。」と指摘されていたように疑いがない。我々は種子系統リソースについて、（1-1）高品質な種子の更新・保存・配布、（1-2）種子の寄託促進、（1−3）実験系統の非細胞学的方法による品質管理、（1−4）バックアップと長期保存、（1−5）資料のデジタルアーカイ
ブ化、（1−6）NAM 集団の整備、という 6 つの事業内容を企画して、実施してきていて、概ね順調に進行している。以下、計画通りに進行している課題と遅延が認められる課題に分けて、それぞれについて説明する。
【順調に進行している課題】（1-1）高品質な種子の更新・保存・配布：種子の更新、保存についてはほぼ計画通りの数値を達成している。海外から導入系統については 2 年間の栽培後に系統として登録すべく、進めている。発芽調査についても 2017 年度内に方法を確立し、2018 年度には 1000 系統について発芽率をチェックした。
（1−3）実験系統の非細胞学的方法による品質管理：特定染色体の存在の有無は SSR マーカーの増幅パターンで調査している。また、過去に育成された人工倍数体については、染色体構成が不安定であると予想されたので、2018-2019 年の栽培シーズン前に染色体数をカウントして、同時に分子マーカーで失われた染色体の調査を進めていて、現在データを解析しているところである。
（1−4）バックアップと長期保存：バックアップは第 3 期中に作成し終え、横浜市立大学に保存している。その後の増殖系統については、配布用ストックと保存用ストックに分け、両者を京都大学の別の建屋で保存している。
（1−5）資料のデジタルアーカイブ化：対象とする資料を木原均、山下孝介、田中正武の 3 名の残されたコムギ関連の資料とし、ユーザー有志とアーキビストとでワーキンググループを作り、保存方法を検討した。田中
正武資料については、保管者であったご遺族から資料一式を京都大学に寄贈いただいた。Aegilops 属と在来系
統に関する京都大学で保存してきた紙媒体の栽培記録について、スキャナーで取り込んで電子データ化を進めた。
（1−6）NAM 集団の整備：計画通り進め、2018 年度までに F 4 世代の栽培を終えて F 5 世代種子を得た。24 交配
組合せ（組合せあたり 200 個体以上）でスタートし、交配組合せで変動はあるものの、8 割以上の個体の種子を得ている。また、2017 年度にはゲノム情報等整備プログラムの支援を得て、固定親系統である農林 61 号のde novo sequencing を進めた。その結果、既報の標準品種 Chinese Spring より長いアセンブル長を得ている。
【進行に遅延もしくは目標を下回る懸念のある課題】（1-1）高品質な種子の更新・保存・配布：配布数の目標値を、2017 年度には 1100 系統、2018 年度には 1125 系統と設定したが、実際には 734 系統、410 系統と大幅に下回ってしまった。国内的な事情としては、コムギ研究者人口の減少傾向、しかも多様性生物学の材料としての利用が減っていることが挙げられる。国際的には、2013 年の横浜での 12th International Wheat Genetics
Symposium(IWGCS)における広報活動（ワークショップ共催）を反映した 2014 年と 2015 年をピークとする高い利用者数を維持できなかったことに原因を求めることができると推測している。この間、2017 年にウイーンで開催された 13th IWGS に参加できなかったことが悔やまれる。
（1-2）種子の寄託促進：寄託のスキームを作成し、寄託 MTA を整備したのにも関わらず、寄託を促進することができなかった。課題管理者の時間的制約に起因する部分が多いと反省している。第 4 期の残りの期間で国内外からの寄託を受けられるよう、2019 年７月に京都大学の研究推進係と対応を協議した。
【リソースの品質・付加価値の向上】参照ゲノム配列が決定されて行こう、ゲノム情報を付加した材料に対す
るリクエストが高まる傾向にある。実際に、de novo アセンブルした農林 61 号を始め、国際コンソーシアムでゲノム配列を決定した 12 品種のパンコムギ系統を NBRP・コムギから配布できるよう調整を進めている。質的な進捗状況としては、コムギの品質と安全性に関する国際的なコムギ研究者の専門家集団が、種子貯蔵タンパ
ク質や食物繊維に関する標準的な遺伝子型を持った系統群をコアコレクションとして取りまとめているので、これらを NBRP・コムギから配布できるよう整備を進めている。また、六倍体のパンコムギ系統のコアコレクシ
ョン居着いては、ジェノタイプ情報をウエブページから公開し、種子を一括してリクエストできるようデータベースの整備をしている。

32

資料 4
２．成果
【国際的に評価の高い成果が得られているか】2017 年度、2018 年度の 2 年間にリソースを利用した 33 報の研究論文が投稿されている。
その中で、Science、
Nature Plants、PNAS に各１報の掲載があったのは、リソース利用が評価の高い成果につながっている証左と言って良いだろう。とりわけ、Science 誌に掲載された、国際コムギゲノム解読コンソーシアム（IWGSC）によるコムギの標準となるゲノム配列を解読した論文は、2018 年 8 月に掲載されて１年未満の 2019 年 7 月 5 日の時点で、被引用回数 168 回（Scopus）とハイペースで引用されており、今後もコムギのゲノム配列を扱う論文に引用されるのは間違いない金字塔的論文である。
Nature Plants に掲載された Mega らによる論文は、気孔の開閉にアブシジン酸受容体が関与するという生理学的知見に基づき、形質転換した植物が実際に節水型の乾燥耐性を持つことを示した論文である。この論文は、シロイヌナズナ等で解析された生命現象に関わる遺伝子を作物で改変することで、目的の表現型を付与することができることを示した点で、基礎研究が即、応用研究に結びつくことを示した点で意義深い。実用的にも、温暖化が進行し利用できる水の量に制限がある現在の農業環境で、いかに持続的に農業を継続していくかという大きな問題に光を当てている。
PNAS に掲載された Sakuma らの論文はムギ類の穂の形態形成に関わる遺伝子の解析を行った。特筆すべきなのは、研究手法が従来、イネやシロイヌナズナで行われていた方法とほぼ同様に、候補遺伝子の探索、ミュー
タントのスクリーニング、そして形質転換による相補性試験と展開されていることである。とかく、ゲノムが大きくて候補遺伝子が見つけられにくい、形質転換がしにくいなどと、分子生物学的には敬遠されてきたコム
ギでも、普通に王道の方法をとることで、表現型の原因遺伝子を特定できることを示している点が新しい時代のコムギ研究の幕開けを告げている。このような研究を知った他の生物種を材料としている研究者がコムギを扱い始めれば、コムギで長く知られていた面白い生命現象の解明が進み、ライフサイエンス分野の進展に寄与できると確信している。
そのほかにも、第 3 期で我々が整備したパンコムギのコアコレクションを利用した研究が 2 報公表されている。リソース整備によって、利用が促進した例としてポジティブに捉えている。
成果論文数の推移を見ると、年次変動はありつつも、2018 年度には、これまでで最多の成果論文が世に出ている。ゲノム時代に入り、過去に比べて純度の高い、高品質な研究材料が望まれている中で、論文数が増加したことは、我々のリソースに対して一定の評価が得られているものと解釈している。
【社会的・学問的ニーズとの対応】
コムギを研究材料とする点で、全ての研究は、直接的もしくは間接的に作物としてのコムギの育種や栽培方法の改良につながっている。広く社会では、国連の設定した持続可能な開発目標（Sustainable Development
Goals; SDGs）の設定が求められている。SDGs の中で設定されている 17 の開発目標のうち、コムギの研究は直接的に（1）貧困をなくす、（2）飢餓をゼロに、の 2 目標に完全に一致し、さらには、（13）気候変動に具体的な対策を、そして（15）陸の豊かさを守ろう、に関連している。すなわち、コムギのライフサイエンスのためのリソース整備とリソースを使った研究成果は、社会的ニーズの沿っていると言って良い。
提供リソースによって、生み出された成果が学問的ニーズに沿っているということは、ほぼ全ての成果論文
が国際誌への投稿論文であり、ピアレビューを経て掲載されていることからも疑いがない。

33

資料 4
３．実施体制【実施体制とバックアップ】第 4 期開始から実施者の構成が変わった。横
浜市立大学は、 DNA クローンの配布停止を理由として、分担機関から外れてもらった。第 3 期までに横浜市立大学で分担していた、在来系統等の種子リソースの維持・管理は京都大学で行なっている。これにより、組織の簡素化をはかることができ、右図のようなシンプルな実施体制で事業を推進している。なお、横浜市立大学にはバックアップ機関として協力してもらっている。バックアップについては、種子リソースの一次バックアップを横浜市立大学に保存すると同時に、全種子リソースを配布用ストックと保存用ストックの 2 部構成とし、京都大学の別の建屋で保存している。
すなわち、複数のレベルでのバックアップを確保できている。
京都大学内では、課題管理者の所属する植物遺伝学分野と栽培植物起原
学分野で分担している。本事業に従事する定員内教員は 3 名挙げてあるが、実際的には、課題管理者と技術職員（栽培植物起原学分野所属）とプロジェクトの予算で雇用している特定研究員（植物遺伝学分野所属）に加え、時間雇用職員で事業を進めている。栽培植物起原学分野が、主にコムギ近縁野生種 Aegilops（第 4 期採択時にこの分類群の維持・配布の国際的重要性の指摘を受けた）とコム
ギ在来系統、植物遺伝学分野が実験系統群を分担している。
【運営委員会と研究コミュニティーとの連携】運営委員会は 9 名で構成し、うち 5 名がコムギを研究材料とするユーザーである。実施者は運営員会のメンバーではない。そのほか、同じイネ科植物であるイネ、オオムギの NBRP 課題管理者、情報課題管理者を運営員として迎えている。第 4 期はライフサイエンス用のコムギリソースの整備を目指しているので、コムギ育種現場の研究者の人数が減っている。また、運営委員会は年に一度だけ開催することを試行したが、運営委員と実施者とのコミュニケーションを円滑するためにも、年二度の開催に戻すべきと判断している。さらに、ゲノム配列決定ののち急速にコムギ科学はゲームチェンジとも言えるほど枠組みが変わっている。この現状を反映すべく、新しいゲームのプレイヤーを運営員会に迎え入れるべきと考えている。なお、研究コミュニティーの意見聴取の場として、毎年開催されているムギ類研究会に帯同して生物遺伝資源コムギ小委員会（ユーザーが誰でも参加できる）を開催してきた。NAM 集団作成の要望、NAM
集団に入れるべき系統の選択、東アジアを代表するコムギ系統としての農林 61 号の de novo ゲノムアセンブ
ル（2017 年度ゲノム情報等整備プログラム採択）、NAM 集団親系統のゲノムスキムシーケンス（2019 年度ゲノム情報等整備プログラム採択）等について、ユーザーの意見を反映して事業を行ってきた。
【京都大学の関与】実施機関たる京都大学は研究施設の無償供与以外にも、経理事務、契約事務、知財などの各面でサポートをしている。第 4 期から開始した種子リソースに関連する資料（フィールドノート、栽培記録、旅行記、地図、スライド等）のアーカイブ化と保管については、京都大学の大学文書館と総合博物館が連携してサポートしてくれている。これにより、コムギ野生種・在来種の最終を行った田中正武名誉教授の遺族が保管していた資料を京都大学に寄贈してもらうことができた。実施体制の構成の鍵となる（若手）教員の定員内充当については、人事権が大学組織ではなく教授会にあるため、リソース管理者をさらに採用する人事が実際に行われる見通しは不透明である。
【海外の類似機関との関係】世界的なコムギ関連のジーンバンクとしては、IPK（ドイツ）、カンザス州立大学（米）、John Innes Institute（英）、Vavilov Institute（ロシア）、CIMMYT（CGIAR 傘下、メキシコ）、ICARDA（CGIAR 傘下、レバノン）、などがある。課題管理者は世界的なコムギ研究のコーディネート機関である Wheat
Initiative (WI)のジーンバンクに関する専門家ワーキンググループ Global wheat germplasm conservation anduse community のメンバーであり、またゲノム研究の国際コンソーシアムのメンバーとして共同研究を展開しているので、それぞれの組織と連携して、事業を進めている。特に、ゲノム情報や特定の形質に関する遺伝子型情報を付加したコムギ系統の収集・保存・配布については、密に連絡を取り合いながら事業を進めている。
我々NBRP・コムギの保存する Aegilops 属植物は世界 2 位の系統数を誇る（第 4 期採択時にリソースとしての国際的重要性が指摘事項として挙げられた）。また、先人の努力により、袋掛けによる自殖で維持されてきているので、純系化も進んでいる。加えて、最終地に関する情報も揃っているため、ライフサイエンス研究に適した品質の高い材料を提供できるのが他のジーンバンクと比較して優位にある。

34

資料 4
４．今後の見通し【順調に進行している課題】（1-1）高品質な種子の更新・保存・配布（1−3）実験系統の非細胞学的方法による品質管理（1−4）バックアップと長期保存（1−5）資料のデジタルアーカイブ化（1−6）NAM 集団の整備
以上の 5 項目（1-1 の配布については後述）に関しては、第 4 期の残りの期間もたゆまず努力を継続し、計画通りに課題を進めていく。
【進行に遅延もしくは目標を下回る懸念のある課題】（1-1）高品質な種子の更新・保存・配布：
第 4 期最初の 2 年度は配布数の目標値を大幅に下回った。国内的には、これまでコムギを扱ってこなかった研究者へのアピールを加速し、コムギの研究利用への垣根を低くする努力を続ける。コムギ栽培方法や基礎実験方法の周知など、面白いコンテンツを増やしていく必要がある。一方で、ゲノム配列が決定した系統や NAMの親系統に関して、非公式な利用希望のコンタクトがあるので、それほど悲観しすぎる必要はないかもしれない。
国際的には、本事業で派生した研究論文の国際誌への公表、または、国際学会等でのアピールを進め、利用の促進を図る。特に、ジーンバンクの整備されている欧米の各国だけでなく、ロシアやカザフスタンといった国々へのアピールを強めていく。
目標値については、現状では第 4 期終了時に 1200 系統配布するのは困難であろうと推測する。第 3 期に目標値として掲げ、ほぼ達成してきていた毎年 1000 系統の配布を目標値として再設定することを希望する。
（1-2）種子の寄託促進：寄託のスキームを作成し、寄託 MTA を整備したのにも関わらず、寄託を促進することができなかった。課題管理者の多忙による時間的制約に起因する部分が多いと深く反省している。寄託の促進は活発のリソース利用のための鍵となる重要な案件であると認識している。実際に寄託に関わるリサーチと契約事務等を分担してもらえる research administrator 的な人員（寄託関連のほか、資料のアーカイブ化等の NBRP・コムギ事業全体の運営にも関与する）を雇用して、第 4 期終了までに寄託の本格的運用を進めたい。
この人員はコムギ科学の世界的趨勢を理解してもらわねばならないので、博士号取得者が望ましい。京都大学での定員内の教員の補充は望めないため、プロジェクト研究員として人員を雇用する費用を追加でサポートい
ただくことを希望する。

35

資料 4
５．事業で定める項目及び総合的に勘案すべき項目
５－１） 生命倫理、安全対策に対する法令等を遵守されていますか？
本学においては、京都大学におけるライフサイエンス研究等に係る倫理の保持、安全の確保等に関する規程
及び関連規定を定め、各種の審査やこれらの研究の適正な実施と管理及び監督を行う体制を整えている。更に、「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」（平成15年 法律第９７号）「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律施行規則 」（平成１５年１１月
２１日財務省・文部科学省・厚生労働省・農林水産省・経済産業省・環境省令第１号）、「研究開発等に係る遺伝子組換え生物等の第二種使用等に当たって執るべき拡散防止措置等を定める省令」（平成１６年文部科学省・環境省令第１号）やこれらに基づく「研究開発等に係る遺伝子組換え生物等の第二種使用等に当たって執るべき拡散防止措置等を定める省令の規定に基づき認定宿主ベクター系等を定める件」(平成１６年文部科学省
告示第７号)の定めに従い、京都大学組換えＤＮＡ実験安全管理規程および同施行細則を定め、京都大学における組換えＤＮＡ実験に係る安全の確保を図るとともに管理方法を定めている。
海外生物遺伝資源を利用する場合、生物多様性条約、名古屋議定書、ABS 指針を遵守し、またそれらの精神を尊重している。提供国、日本の法令遵守が確認できない、または収集・配布の許可が確認できない遺伝資源については、データベースには公開せず配布も行っていない。

５－２） 若手の課題実施者のキャリアパスへの考慮がなされていますか？
遺伝資源を扱うエキスパートの養成をすべく、当該研究室に所属の大学院生の教育に当たっている。一方で、
生物遺伝資源の維持管理に適性を持った若手研究者をリクルートすべく、国内のコムギとその近縁種を扱う若手研究者の研究活動を毎年開催される「ムギ類研究会」や関連学会（日本遺伝学会、日本育種学会）で注視してきた。
遺伝資源を扱う若手研究者を特定研究員（ポスドク）または特定助教として採用できるように、人件費を計上してきた。2018 年度までは適切な該当者が見つからず採用を見合わせてきたが、2019 年度以降に本予算で特定助教または Research Assistant(RA)として雇用するに値する人員を確保した。
第 3 期に本 NBRP でコムギとその近縁種の多様性解析に従事していた課題実施者（特定研究員）が第 3 期中に新設された龍谷大学農学部に助手として採用され、第 4 期に当たる時期にも継続して NBRP 事業に関連した共同研究を進めてきた。幸いなことに、第 4 期実施期間中に数本の学術論文を共同で公表することができ、2018
年度にあった同大学の講師のポストに応募し、めでたく 2019 年 4 月より同大学の講師に昇任した。若手の課
題実施者がアカデミックポストを獲得することをサポートできた好例であると自負している。

５－３）事業内容や成果について科学技術コミュニケーション活動（アウトリーチ活動）を図られていますか
NBRP が企画・主催・共催・協賛する学会等での展示・広報活動には積極的に取り組んできた。第 4 期の過年度２年間についても、5 回の学会での広報活動に参加した。加えて、学会でのシンポジウム・ワークショップ企画にも積極的に参加してきた（２０１９年３月までに以下に示す 4 回）。
1. 日本遺伝学会 第 89 回大会でのコムギ染色体基本数・倍数性発見 100 周年記念国際シンポジウム（共催）、オーガナイザー・座長、那須田周平、岡山大学（岡山市）、2017/9/15、国内
2. 日本植物学会 第 82 回大会での遺伝資源に関するシンポジウム、那須田周平、広島国際会議場（広島市）、2018/9/16、国内、
3. 日本植物学会 第 82 回大会での遺伝資源に関するシンポジウム、竹中祥太朗（リソースユーザー）
広島国際会議場（広島市）、2018/9/16、国内、久野裕、佐藤豊、那須田周平、岡山
4. 日本育種学会 第 134 回講演会での NBRP シンポジウム（主任）
大学（岡山市）、2018/9/22、国内
これらの広報活動時には、コムギ研究の入門書である「コムギの研究」の冊子体を配布して、新規にコムギを実験材料として扱う人の確保に努めている。また、ムギ類研究者向けには毎年開催している「ムギ類研究会」でリソース整備の現状を報告してきた。

36

資料 4
＊下記は各個別の評価項目には 関連しません が、総合評価付与にあたっての情報となる項目です。
ご記載できる内容がある場合、ご記入下さい
自由記述【アピールしたい点】（１）実験材料としてのコムギ
2018 年にゲノム配列が決定し、今まさに研究の旬を迎えた生物種である。100 年以上の長い研究史の中で見つかった、面白い現象（減数分裂時に相同な染色体を同祖染色体とどのように見分けているか？2n gamete は
どのように形成されるか？細胞質置換系統の稔性回復現象はどんな分子機構で起きているか？などなど、数知れず）はたくさん手付かずで眠っている。今、コムギを研究せずにいつするのかという勢いである。欧米では、
シロイヌナズナやイネの研究者がコムギ研究に次々と乗り込んできている。このような動向のさきがけが、日本においても散見する（新学術や CREST の課題等で新規参入者あり）。
生命科学研究の基本が比較であるので、遺伝的多様性はあらゆる研究の前提条件となっている。我々のリソースの持つ多様性を研究者の利用しやすい形で提供するのが、大切な業務であると心得ている。利用しやすい形とはと考えると、それはまず、「正しい材料であること」、「ゲノム情報が付加されていること」、そして「解析が容易なプラットフォームに乗っていること（マッピング集団がすでにできている等）」だと考える。私たちは、第 3 期から第 4 期を通じて、この方向でコムギのリソースを整備してきている。
特に、第 4 期には 2017 年度と 2019 年度にゲノム情報等整備プログラムに採択いただき、日本を代表する（正確にはアジアを代表する）パンコムギ品種農林 61 号の de novo sequence とアジアの遺伝的多様性を代表する
NAM 親系統の resequencing を進めた。その成果によって今後、シーケンス情報がついた系統群の利用が進んでいくように、国際的に論文そして学会発表等でアピールしていく。ゲノムシーケンシングで諸外国に遅れをとった日本のコムギ研究が失地回復できるよう、情報の発信に努めていく。
日本国内はもとより世界の研究者が今旬であるコムギを材料として研究を進め、成果を得ることを促進する
ため、NBRP・コムギに変わらず支援をいただけますことを切にお願いしたい。
（２）スタッフの確保について
NBRP・コムギの現在の体制では、栽培管理や種子の整理の現場を取り仕切るスタッフ 2 名はリソース事業の重要性を理解し、誠心誠意事業を進めてくれている。この 2 人のスタッフがいれば収集・増殖・配布といった
NBRP に課せられた第一義的な仕事は滞りなく回っていく。一方で、研究現場に近く、コムギ研究をはじめとする世界の一線級のライフサイエンスの動向を知っていることが、リソース事業の長期的ビジョンの策定には欠かせない。また、どんな種子の寄託を受けるべきかの判断は、ライフサイエンスの先端を知らねばできない。
私たちの NBRP・コムギが円滑に運用されていくために、博士号を取得したリサーチアドミニストレーターもしくはプロジェクトマネージャー的な人員の雇用を認めていただければ幸いである。現時点で遅滞があると認めざるを得ない「寄託」関連や、順調ではあるが折衝ごとの多い「資料のアーカイブ化」の業務遂行を促進できると考えている。

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資料 4

別紙
リソース提供先（配布先）がリソースを利用して発表した論文数・リスト提出依頼
プロジェクト開始後（2012 年度以降）リソース提供先（配布先）が、本プロジェクトのリソースを利用した成果として発表した論文数を記入してください。
＊課題実施者（代表機関・分担機関）自らがそのリソースを利用して発表した論文も含みます。
但し前期(第 3 期)NBRP に参加されていなかった場合、記入は不要です。
併せて、2017 年４月以降に出版された論文の全リスト（ただしリストに挙げる全論文数が１００を超える場合には、新しいものから１００件程度まで、でも結構です）を記入し、主要論文（リソースの利用成果として顕著な論文、数件～10 件程度）にマーク（★）をつけ、2-3 行の紹介文をつけてください（論文リストを新しいもの 100 件程度に絞り込んだ
場合でも、成果が顕著な論文は下記条件に該当する全論文からの選択で構いません）。リス
トに挙げる論文は、以下の１～３に該当するものとして下さい。また、リストに挙げた論文については、とりまとめの上、本成果シートの提出期限までにナショナルバイオリソー
スプロジェクト情報公開サイトへの登録をお願いいたします。
１．

2017 年 4 月～2019 年 3 月末までの間に出版されたもの

２．

査読のある学術誌・電子ジャーナルに掲載された論文（出版・web page 公開前でも受理済みものは含まれる）

３．

2017 年 4 月以前にも発表された論文がある場合は、リストに参考として記入して構いません。ただし、評価には含みません。

ナショナルバイオリソー
課題実施者以含まれる論文外による論文

数

数

21

4

17

19

20

9

11

20

14

6

8

18（2015 年度とすべき論

総論文数2012 年度
2013 年度
2014 年度

ス

課題実施者がプロジェクト第 3 期事後評価において報告済みの論文数

文を誤って報告していた）2015 年度

19

4

15

38

13

資料 4

2016 年度
2017 年度
2018 年度
合計

11

3

8

-

9

2

7

-

24

9

15

-

118

37

81

70

成果全論文リスト（2017 年４月～2019 年 3 月末）＊全数が１００以上有る場合は新しい論文から１００ヶ程度までで良い

論文リスト

論文中にリソース（著者名、論文名、発表雑誌名、発表年、Pubmed ID または DOI、利用の明示が有る

及び主要な論文（１０件以内、★マーク付き）の紹介文）か︖（○、または判断理
由）★ International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC). Shifting
the limits in wheat research and breeding using a fully annotatedreference genome. Science. 2018 Aug 17;361(6403). pii: eaar7191. doi:
10.1126/science.aar7191. Epub 2018 Aug 16.
【コムギゲノム科学の金字塔的論文。パンコムギの標準品種である Chinese
Spring の参照ゲノム配列と遺伝子発現アトラスが報告されている。国際コンソーシアムによる多数の著者による論文で、NBRP・コムギの課題管理者も参画して、ゲノム配列解析用にリソースを提供した。
】★ Handa H, Kanamori H, Tanaka T, Murata K, Kobayashi F, Robinson SJ,
Koh CS, Pozniak CJ, Sharpe AG, Paux E; International Wheat Genome
Sequencing Consortium, Wu J, Nasuda S. Structural features of two major
nucleolar organizer regions (NORs), Nor-B1 and Nor-B2, andchromosome-specific rRNA gene expression in wheat. Plant J. 2018
Dec;96(6):1148-1159. doi: 10.1111/tpj.14094. Epub 2018 Oct 27.
【上記参照ゲノム決定論文を補完する論文。配列を読むことが困難である
NOR 領域の構造を解析した論文。これにより、参照ゲノム論文でアセンブルできなかった領域のほとんどが NOR 領域であることが明らかになった。
】★ Edet OU, Gorafi YSA, Nasuda S, Tsujimoto H. DArTseq-based analysis
of genomic relationships among species of tribe Triticeae. Sci Rep.
2018 Nov 6;8(1):16397. doi: 10.1038/s41598-018-34811-y.
【パンコムギの参照ゲノム配列とパンコムギで開発されたマーカーシステ
ムを利用することで、近縁野生種 Aegilops 属植物の類縁度を定量的に推測できることを示した論文】
Murata K, Watanabe S, Tsujimoto H, Nasuda S. Cytological observationof chromosome breakage in wheat male gametophytes caused by gametocidal
action of Aegilops triuncialis-derived chromosome 3Ct. Genes Genet
Syst. 2018 Oct 30;93(3):111-118. doi: 10.1266/ggs.18-00010. Epub 2018
Aug 9.

39

リソース利用に関する著者より
の情報

◯

◯

◯

資料 4

Tanaka C, Itoh T, Iwasaki Y, Mizuno N, Nasuda S, Murai K. Directinteraction between VRN1 protein and the promoter region of the wheat
FT gene. Genes Genet Syst. 2018 Jul 13;93(1):25-29. doi:
10.1266/ggs.17-00041. Epub 2018 Jan 17.
Altenbach SB, Chang HC, Simon-Buss A, Jang YR, Denery-Papini S, Pineau
F, Gu YQ, Huo N, Lim SH, Kang CS, Lee JY. Towards reducing theimmunogenic potential of wheat flour: omega gliadins encoded by the
D genome of hexaploid wheat may also harbor epitopes for the serious
food allergy WDEIA. BMC Plant Biol. 2018 Nov 21;18(1):291. doi:
10.1186/s12870-018-1506-z.
Jang YR, Kang CS, Lim SH, Lee JY. Screening and identification ofomega-5 gliadin mutants in wheat doubled-haploid lines. Korean J Breed
Sci. 2018 50(3): 181-192. doi: 10.9787/KJBS.2018.50.3.181.
Jang YR, Choi SJ, Lim SH, Kim CK, Yoon UH, Kang SH, Lee JY.
High-throughput profiling of wheat gliadin proteins using LabChip
system in Chinese Spring and its aneuploid lines. Korean J Breed Sci.
2018 50(2): 81-89. doi: 10.9787/KJBS.2018.50.2.81.
Danilova TV, Friebe B, Gill BS, Poland J, Jackson E. Chromosome
rearrangements caused by double monosomy in wheat-barley group-7
substitution lines. Cytogenet Genome Res. 2018;154(1):45-55. doi:
10.1159/000487183. Epub 2018 Feb 28.
Said M, Hřibová E, Danilova TV, Karafiátová M, Čížková J, Friebe B,Doležel J, Gill BS, Vrána J. The Agropyron cristatum karyotype,
chromosome structure and cross-genome homoeology as revealed byfluorescence in situ hybridization with tandem repeats and wheat
single-gene probes. Theor Appl Genet. 2018 Oct;131(10):2213-2227. doi:
10.1007/s00122-018-3148-9. Epub 2018 Aug 1.
Nishimura K, Moriyama R, Katsura K, Saito H, Takisawa R, Kitajima A,
Nakazaki T. The early flowering trait of an emmer wheat accession(Triticum turgidum L. ssp. dicoccum) is associated with the cis-elementof the Vrn-A3 locus. Theor Appl Genet. 2018 Oct;131(10):2037-2053. doi:
10.1007/s00122-018-3131-5. Epub 2018 Jun 30.
Kurihara-Yonemoto S, Matsunaka H. A Ssimple method for genotyping of
wheat seed coat color genes by multiplex PCRs. Bulletin of the NARO,
Agricultural Research for Hokkaido Region. 2018 207: 35-49. doi:
10.24514/00002276.
Noma S, Hayakawa K, Abe C, Suzuki S, Kawaura K. Contribution of
α-gliadin alleles to the extensibility of flour dough in Japanese
wheat cultivars. J Cereal Sci. 2018: 86(2):15-21. doi:
10.1016/j.jcs.2018.12.017.
★ Kawaura K, Miura M, Kamei Y, Ikeda TM, Ogihara Y. Molecularcharacterization of gliadins of Chinese Spring wheat in relation toceliac disease elicitors. Genes Genet Syst. 2018 Jul 13;93(1):9-20.
doi: 10.1266/ggs.17-00034. Epub 2018 Jan 17.
【マイナーな雑誌に投稿された地味な論文ながら、異数体リソースを駆使しセリアック病に関連するグリアジンたんぱく質の二次元電気泳動による解析をおこなった好論文。将来の解析に基準を与えた。
】★ Sakuma S, Golan G, Guo Z, Ogawa T, Tagiri A, Sugimoto K, Bernhardt
N, Brassac J, Mascher M, Hensel G, Ohnishi S, Jinno H, Yamashita Y,
Ayalon I, Peleg Z, Schnurbusch T, Komatsuda T. Unleashing floret
fertility in wheat through the mutation of a homeobox gene. Proc Natl
doi:
Acad
Sci
USA.
2019
Mar
12;116(11):5182-5187.
10.1073/pnas.1815465116. Epub 2019 Feb 21.

【コムギの花機器官である小花は、小穂の基部から数個しか通常種子を

40

◯

◯

◯
◯

◯

◯

◯

◯

◯

◯

◯

資料 4

つけない。この仕組みを多様な遺伝資源と突然変異体、そして遺伝的な相補実験で明らかにした論文。高収量系統の育種にも繋がる高い波及効
果のある論文】★ Mega R, Abe F, Kim JS, Tsuboi Y, Tanaka K, Kobayashi H, Sakata Y, ◯Hanada K, Tsujimoto H, Kikuchi J, Cutler SR, Okamoto M. Tuning water-use
efficiency and drought tolerance in wheat using abscisic acidreceptors.
Nat
Plants.
2019
Feb;5(2):153-159.
doi:
10.1038/s41477-019-0361-8. Epub 2019 Feb 8.

【アブシジン酸受容体の過剰発現コムギを作出することで、乾燥耐性を持つ節水型のコムギを作り上げた。生化学的なパスウエイを理解した上で、ターゲットを決めて遺伝子改変植物を作成すれば、目的に合致した表現型を持つ個体を育成しうることを実証して見せている。
】

Okada M, Ikeda TM, Yoshida K, Takumi S. Effect of the U genome on grain
hardness in nascent synthetic hexaploids derived from interspecifichybrids between durum wheat and Aegilops umbellulata. J Cereal Sci.
2018: 83:153-161. doi: 10.1016/ j.jcs.2018.08.011.
Ohno R, Teramura H, Ogino C, Kondo A, Takumi S. Genotypic effects on
sugar and by-products of liquid hydrolysates and on saccharificationof acid-insoluble residues from wheat straw. Genes Genet Syst. 2018
Jul 13;93(1):1-7. doi: 10.1266/ggs.17-00027. Epub 2018 Jan 17.
Nishijima R, Tanaka C, Yoshida K, Takumi S. Genetic mapping of a novel
recessive allele for non-glaucousness in wild diploid wheat Aegilops
tauschii: implications for the evolution of common wheat. Genetica.
2018 Apr;146(2):249-254. doi: 10.1007/s10709-018-0012-4. Epub 2018
Feb 3.
Okada M, Yoshida K, Nishijima R, Michikawa A, Motoi Y, Sato K, Takumi
S. RNA-seq analysis reveals considerable genetic diversity andprovides genetic markers saturating all chromosomes in the diploid wild
wheat relative Aegilops umbellulata. BMC Plant Biol. 2018 Nov
8;18(1):271. doi: 10.1186/s12870-018-1498-8.
Nishijima R, Yoshida K, Sakaguchi K, Yoshimura SI, Sato K, Takumi S.
RNA sequencing-based bulked segregant analysis facilitates efficient
D-genome marker development for a specific chromosomal region ofsynthetic hexaploid wheat. Int J Mol Sci. 2018 Nov 26;19(12). pii:
E3749. doi: 10.3390/ijms19123749.
Kishii M, Huerta J, Tsujimoto H, Matsuoka Y. Stripe rust resistancein wild wheat Aegilops tauschii Coss.: genetic structure andinheritance in synthetic allohexaploid Triticum wheat lines. Genet
Resour Crop Ev. 2019 66(4): 909-920. doi: 10.1007/s10722-019-00758-w.
★ Takenaka S, Nitta M, Nasuda S. Population structure and association
analyses of the core collection of hexaploid accessions conserved exsitu in the Japanese gene bank NBRP-Wheat. Genes Genet Syst. 2019 Jan
19;93(6):237-254. doi: 10.1266/ggs.18-00041. Epub 2018 Dec 15.

◯

◯

◯

◯

◯

◯

◯

【NBRP・コムギの保有する六倍性コムギのコアコレクションを作成し、遺伝的多様性について解析した論文。本解析に基づいて、第 4 期に東アジアのパンコムギの多様性を含む NAM 集団が育成されている。
】★ Miki Y, Yoshida K, Mizuno N, Nasuda S, Sato K, Takumi S. Origin of ◯wheat B-genome chromosomes inferred from RNA sequencing analysis ofleaf transcripts from section Sitopsis species of Aegilops. DNA Res.
2019 Apr 1;26(2):171-182. doi: 10.1093/dnares/dsy047.

【長く議論され続けてきたパンコムギの B ゲノム提供親について、RNAseq に基づくゲノムワイドな SNPs の解析により、現存の種の中ではAegilops speltoides が妥当であることを示した論文。】

41

資料 4

Nishiura A, Kitagawa S, Matsumura M, Kazama Y, Abe T, Mizuno N, Nasuda
S, Murai K. An early-flowering einkorn wheat mutant with deletions of
PHYTOCLOCK 1/LUX ARRHYTHMO and VERNALIZATION 2 exhibits a high levelof VERNALIZATION 1 expression induced by vernalization. J Plant
Physiol. 2018 Mar;222:28-38. doi: 10.1016/j.jplph.2018.01.002. Epub
2018 Jan 20.
Onishi K, Yamane M, Yamaji N, Tokui M, Kanamori H, Wu J, Komatsuda T,
Sato K. Sequence differences in the seed dormancy gene Qsd1 among
various wheat genomes. BMC Genomics. 2017 Jun 29;18(1):497. doi:
10.1186/s12864-017-3880-6.
Matsuda R, Iehisa JCM, Sakaguchi K, Ohno R, Yoshida K, Takumi S. Global
gene expression profiling related to temperature-sensitive growthabnormalities in interspecific crosses between tetraploid wheat andAegilops tauschii. PLoS One. 2017 May 2;12(5):e0176497. doi:
10.1371/journal.pone.0176497. eCollection 2017.
Yoshioka M, Iehisa JCM, Ohno R, Kimura T, Enoki H, Nishimura S, Nasuda
S, Takumi S. Three dominant awnless genes in common wheat: Fine mapping,interaction and contribution to diversity in awn shape and length. PLoS
One. 2017 Apr 24;12(4):e0176148. doi: 10.1371/journal.pone.0176148.
eCollection 2017.
Danilova TV, Akhunova AR, Akhunov ED, Friebe B, Gill BS. Major
structural genomic alterations can be associated with hybrid
speciation in Aegilops markgrafii (Triticeae). Plant J. 2017
Oct;92(2):317-330. doi: 10.1111/tpj.13657. Epub 2017 Sep 22.
Nishijima R, Okamoto Y, Hatano H, Takumi S. Quantitative trait locus
analysis for spikelet shape-related traits in wild wheat progenitor
Aegilops tauschii: Implications for intraspecific diversification andsubspecies differentiation. PLoS One. 2017 Mar 6;12(3):e0173210. doi:
10.1371/journal.pone.0173210. eCollection 2017.
Okada M, Yoshida K, Takumi S. Hybrid incompatibilities in interspecificcrosses between tetraploid wheat and its wild diploid relative Aegilops
umbellulata. Plant Mol Biol. 2017 Dec;95(6):625-645. doi:
10.1007/s11103-017-0677-6. Epub 2017 Oct 31.
Nishijima R, Ikeda TM, Takumi S. Genetic mapping reveals a dominant
awn-inhibiting gene related to differentiation of the variety anatherain the wild diploid wheat Aegilops tauschii. Genetica. 2018
Feb;146(1):75-84. doi: 10.1007/s10709-017-9998-2. Epub 2017 Nov 3.
Danilova TV, Friebe B, Gill BS, Poland J, Jackson E. Development of
a complete set of wheat-barley group-7 Robertsonian translocation
chromosomes conferring an increased content of β-glucan. Theor Appl
Genet. 2018 Feb;131(2):377-388. doi: 10.1007/s00122-017-3008-z. Epub
2017 Nov 10.

42

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資料 4

NBRP 第４期中間評価：

評価委員からの確認事項

リソース名（課題名）：

コムギ

回答者（課題管理者）︓所属︓

京都大学

名前︓

那須田

周平

＊ 提出戴いた中間評価報告書を査読された課題評価委員の評価シートから抽出した
各課題管理者への確認／質問事項、及びリクエスト事項です。（類似した内容の質問やリクエストはある程度整理行って記載しています） それぞれの確認／質問事項に関しては現況に基づいたご回答・ご説明を、リクエスト事項に関しては今後どのようにしていくご予定か（改良／改変していく場合、その具体的方向性などを）、や課題評価好委員コメントへのご返答などを各々項目毎に続けてご記入下さい。
各項目の下に２行づつ空白を設けていますが、回答はこのスペース(行数)にこだわ
らず、御自由にご記入下さい。ご回答頂いた内容は課題評価委員に提出し、評価の参考資料として扱います。

＜課題評価委員からの確認／質問事項・リクエスト事項＞
・指摘事項１（リソース利用の減少） 個体の提供数と利用者数が，目標をかなり下回っている／需要が目標を下回っている／寄託増に向けた対応はなされている。利用者増についてさらに検討していただきたい／個体の収集数は概ね順調と言えるが，提供数が第 3 期平成 26 年から連続４年間減少している．特に，平成 30 年度は提供数と利用者数も目標値を大幅に下回っている／全体としては概ね順調に進捗しているが、利活用するユーザーコミ
ュニティは限られているといえる／利用の大きな拡大は期待できない。コムギ以外への応用などバイオロジーとしての劇的な展開は難しい／作物系リソースに関しては、劇的なコ
ミュニティの拡大は難しく数値目標に対する厳密な評価はなじまないように思う／国内のコムギ研究者人口の減少も一因と考えられることから，海外への事業の発展に尽力して
ほしい．

43

資料 4

【回答】
（提供数の減少について）ご指摘の通り、平成 26 年度より提供数が減少しております。平成 26 年度の高い配布系頭数は前年度に横浜市で開催した国際コムギ遺伝学シンポジウム（IWGS）での広報活動が奏功したものと分析しています。以後の逓減、特に第４期に入ってからの配布数の減少について、一つの要因は、2017 年にオーストリアで開催された IWGS に参加して NBRP・コム
ギのプレゼンスを示すことができなかった点にあると分析しています。不参加の理由は、開催時期がコムギ繁忙期の 4 月後半に設定されていたためです。また、長期的な配布数の変動について、NBRP 開始以前の 30 年間の京都大学からの配布数を振り返ってみました
（下
図）
。

配布系頭数

8000
6000
4000

系統数（合計）2000

系統数（海外）
2000

1998

1996

1994

1992

1990

1988

1986

1984

1982

1980

1978

1976

1974

1970

1972

0

系統数（国内）

配布年度

この記録は、現在の NBRP・コムギのコレクションの中核をなす京都大学の野生種・在来系統の配布数を集計したものです。全体的に配布数の年次変動が大きいこと、配布数のピークを迎えた後、数年は配布数が激減する周期性があることが見て取れます。
翻って、今回の利用者数の減少への対応ですが、（１）国際的な認知度の上昇を目標として、2019 年 6 月にロシアで開催された国際学会での講演、同 7 月に IWGS の後継国際学会
として初めて開催された International Wheat Congress (IWC)において NBRP・リソース広報のポスター発表をしました。ご指摘にありますように、国内のコムギ研究者人口はやや減少傾向にあります。一方で、第１回 IWC の参加者は 900 名を超え（主催者発表）、世界の主要作物であるコムギを研究対象とする科学者は少なくありません。NBRP・コムギの利用者として、海外の研究者により広報の対象をフォーカスすべきだと実施者も考えます。
以上の状況のもと、NBRP・コムギを世界のコムギ研究の中に位置づけるため、コムギ研
究の国際コーディネーション組織である Wheat Initiative (WI)に次の２ページに示した提言をいたしました。この提言は、コムギ研究の基盤形成を目的として、論文公表時に遺伝資源をジーンバンクに寄託（配列情報を Genbank/EMBL/DDBI に登録することのアナロジー）するルール作りを進める提言で、2019 年７月 27 日の WI の Scientific Board の会議

44

資料 4

に計られ承認を得ました。NBRP の目指すべき方向と合致していると確信しています。今後、制度の具体化によって、研究材料の寄託を世界から受け入れ、安定的に研究材料を広く提供する体制を整えられるよう努力を続けてまいります。
＞＞＞＞＞＞＞＞＞＞提言書（ここから）＞＞＞＞＞＞＞＞＞＞
Proposal to establish the germplasm depository system（遺伝資源のデポジットシステムの設立に関する提言）
Exchanging germplasms or research plant materials has promoted plant sciences. Many
important discovery and progress were realized through exchange of research materials. At
the very beginning of modern wheat sciences, Sakamura could identify the basic number ofwheat chromosomes and polyploidy through analyzing the materials that has been provided
from Flaksberger in Russia. We all are benefited by the set of aneuploids that Ernie Sears
created and distributed to any person who needed them. Likewise, exchange of genetic
resources has nourished wheat sciences.
As is evident form the presentations given in the 1st IWC in Saskatoon, we analyze varietiesof wheat germplasms and characterize them phenotypically and genotypically. Thosematerials together with associated information should be in public domain and be available
to the researchers who need them.
I would like to propose establishment of germplasm depository system that is authorized by
the

Wheat

Initiative.

The

systemisanalogous

tothesequence

repository

Genbank/Emble/DDBJ. The responsible gene banks that WI nominates receive seed ofresearch plant materials form the authors of scientific paper, propagate, and distribute to theresearchers with minimum cost of handling and shipping fees (Figure below). Basically thematerials should be transferred with the SMTA under ITPGRFA.
National BioResource Project (NBRP)-Wheat that succeed the resources of Plant
Germplasm Institute, Kyoto University and aneuploids and deletion stocks of Chinese
Spring wheat would like to take part of the germplasm depository system in good
coordination with other gene banks. NBRP-Wheat is a Japanese government-funded
nonprofit organization that has been aimed to promote worldwide wheat sciences. We havesufficient experience of accepting from and distributing to the worldwide community.
I would be more than happy if my proposal is considered by honorable members of the

45

資料 4

Scientific Board of WI. Thank you so much for your time.

Shuhei Nasuda
Director of NBRP-Wheat
Associate Professor
Laboratory of Plant Genetics
Graduate School of Agriculture
Kyoto University, Japan

Fig. A proposed scheme of the Germplasm Depository System＞＞＞＞＞＞＞＞＞＞提言書（ここまで）＞＞＞＞＞＞＞＞＞＞

さて、一方で、ユーザーにとって魅力ある材料の提供を目指して、ジェノタイプ情報のついた遺伝資源の集積を進めています。日本、さらにいえば、東アジアのコムギを代表す

46

資料 4

る系統として 2017 年度の NBRP のゲノム情報等整備プログラムの補助を得て NBRP で保存・配布してきた農林 61 号のゲノム配列を de novo アセンブルしました。さらには、現在育成中の NAM 集団の親系統 24 系統のリシークエンスも 2019 年度の NBRP のゲノム情報等整備プログラムの補助を得て進めています。これらの系統については、2019 年 6 月 27
日にリソースデータベースからリリースしましたところ、この約１ヶ月間に、７名から合計 175 系統のリクエストを得ました。このリクエスト状況は、特徴付けのされた系統群がユーザーからの要望が高いことを示すもので、今後も、遺伝子型情報等の特徴づけのされた系統群の保存・増殖・配布を強く進めていく所存です。

・指摘事項２（リソース数値目標について） 目標値の修正も含めて検討の余地あり／平成
30 年度は提供数と利用者数も目標値を大幅に下回っている／配布目標数の変更について、ヒアリングで直接お話をお聞きする、あるいは書面で追加情報の提出をお願いしてはどうでしょうか／提供数が第 3 期平成 26 年から連続４年間減少している．特に，平成 30 年度
は提供数と利用者数も目標値を大幅に下回っている．
【回答】（リソース数値目標について）
前の指摘事項に対する回答に記しましたが、過去の配布実績から配布の年次変動が大き
いことがわかります。また、国内的には研究者数が増加していないこと、国際的には前項に述べたような遺伝資源管理体制づくりを進めて行くとしても波及効果を得るには時間がかかることを考慮して、第３期にほぼ達成できていた年度あたり 1000 系統の配布を第４期の残りの期間の数値目標として再設定することをお認めいただければ幸いです。

・指摘事項３（Aegilops 属植物） 採択時に特筆された Aegilops 属植物についてはどのよ
うな進展があったのかヒアリング時に聞きたい／Aegilops コレクションは分類学的に確かな検討がされておりためしっかり維持してほしい／採択時に特筆された Aegilops 属植物は
どのような進展があったのかは書面等で報告を求めたい。
【回答】（Aegilops 属植物について）ご指摘のように、Aegilops 系統はイスラエルのテルアビブ大学についで世界で２番目のコレクション数を誇る系統群です。リソースセンターとしての最大の任務は資源の保全です。まず、設備的には、この第 4 期の間に Aegilops 系統の採集と初期増殖ストックを保管する種子貯蔵庫の空調設備を更新することができました。事業実施面での Aegilops 系統の

47

資料 4

保存・増殖・配布に関する取り組みですが、（１）難増殖である他殖性 Aegilops 属植物（Aegilops speltoides と Aegilops mutica）の増殖方法の検討を進めています。Ae. speltoides（International Union for Conservation of Nature and Natural Resources; IUCN Red List
2019 で Least concern）に関しては著粒率の系統間差が大きく、自殖維持が難しい系統が未だあります。低い着粒率の系統でも系統のバルク栽培で系統維持に必要な程度の種子を得られることが明らかになりました。Ae. mutica（IUCN Red List 2019 で Endangered）については、意外にもポット栽培をすると着粒率が下がり、圃場での屋外栽培が望ましいことがわかりました。さらに、順次、発芽率チェックにより、保存系統の品質チェックを進めています。
（２）ユーザーの視点からは、Aegilops 属植物はコムギよりも扱いにくいと感じられていますので、特に初期生育に影響する発芽方法について推奨方法を種子配布時に添付しています。
（３）Aegiloips 属植物の特徴づけとして、Ae. sharonensis（IUCN Red List
2019 で Vulnerable）と Ae. longissima（IUCN Red List 2019 で Least Concern）のゲノム

ワイドマーカーによるジェのタイピングを進めました。外部形態により別種とされる両種ですが、同種とみなすべきとの結論を得ました。他の Aegilops 属植物についても、ジェノ
タイプ情報を寄託してもらえるよう努力していきます。

新規 Aegilops 系統の登録については、生物多様性条約に従って慎重に進めています。米国カンザス州立大学から寄託を受けた 30 系統の Ae. tauschii（IUCN Red List 2019 で Least

Concern）と Ae. cylindrica（IUCN Red List 2019 で Least Concern）については京都での栽培を経て、登録準備中です。また、福井県立大学を 2019 年 3 月に退職された Aegilops 属

植物の権威である大田正次博士らが採集したサンプル（1995 年にスペイン・モロッコで採集）について、順次 NBRP・コムギに組み入れるための作業を開始しています。

長期的には Aegilops 属植物の分類をしっかりできる人材の確保が急務です。NBRP・コ

ムギでは、上記の大田正次博士による講習会を毎年開催し、外部形態による分類のできる人材育成に取り組んでいます。
・指摘事項４（事業の進捗） 「課題管理者の時間的制約に起因」して「寄託を進められな
かった」「課題管理者の多忙による時間的制約に起因する部分が多いと深く反省している」とあるなど、順調とは言えない。
【回答】（事業の進捗）
報告書において、ネガティブな表現をしましたことを強く反省いたしております。
「寄託」
について、最終的にデータベースに登録したものが１件と少なかったことは反省点ではありますが、前項目までの回答に記しましたように、登録前の段階を進めている対象系統があります。寄託の制度設計も終わっており、着実に前に進んでいます。上記以外に、WI の
コムギ穀粒の品質に関するワークンググループと連動して、種子貯蔵タンパク質グルテン

48

資料 4

の構成要素であるグルテニンタンパク質の標準系統セット 196 系統の受け入れていますし、
今後、食物繊維関係の標準系統セットも受け入れる予定です。これらの系統は、栽培して外部形態により系統の純度を確認して、種子を増殖したのち、公開します。なお、上記（指摘点１への回答）の WI への提案により、今後海外からの寄託が増大すると想定しています。

・指摘事項５（事業体制） 実施体制に不足点が多いように見受けられる／陣容の強化と運営委員会開催の増加など、よりエフォートを本活動に割く必要があろう／「新しいゲームのプレイヤーを運営員会に迎え入れるべきと考えている。」とあるように改革が必要／「博士号を取得したリサーチアドミニストレーターもしくはプロジェクトマネージャー的な人員」の雇用の希望について追加情報を提出してもらう／実施体制の簡素化は評価できる【回答】（実施体制の強化）
具体的に対策を講じつつあります。
（１）運営委員会のメンバーを増員すること：国内最大のユーザー１名を運営委員会に招じ入れます。
（２）運営委員会との密な連携：運営委員会の開催数を年に 2 回に戻します。
（３）新しい研究潮流をサポートする体制を整えること：若い研究者（新しいゲームプレーヤー）との接点を保つため、コムギに関係のある研究者が誰でも参加できるコムギ小委
員会を学会の講演会と連動して開催します。
（４）「リサーチアドミニストレーターもしくはプロジェクトマネージャー的な人員」の雇用の希望について：
私共コムギリソースは研究所ではなく京都大学農学研究科の２分野で実施しています。
現在の体制は、２分野の定員内教員３名（教授１（栽培植物起原学・イネのゲノミクスと植物病理学）、准教授１（コムギの分子細胞遺伝学）、助教１（ソバとキノアの進化ゲノミクス）と定員内技術職員１名、NBRP で雇用している特定研究員１名と、数名の時間雇用
職員で運営しています。実務については、准教授１名（課題管理者）と技術職員１名と特定研究員１名で回しているのが実情です。教員は学務やそのほかの業務と本事業を並行的に行うようエフォートを配分しています。
バイオリソース事業にはリソースを使った研究の進展を知り、いま必要とされる材料を必要とする人に届けることができる人材が必要です。そして、バイオリソースを利用して研究を展開し、論文を書いて世に成果を問う研究者としての能力も必要とします。この力無くして、当該分野の最新の研究動向を知ることもできませんし、自身の従事している事
業の重要性を外に向けて発信していくこともできません。加えて、若い研究者が将来的にポストを確保してバイオリソース業務を続けていくためには研究論文の発表は大変重要で

49

資料 4

す。このように、バイオリソース事業の本来必要とする業務の幅は広く、専従の人員をプ
ロジェクト進行のマネジャー役に当てるのが望ましいと考えます。現在採用している特定研究員は実務能力が非常に高く本事業には欠かせぬ人材ですが、事業全体を包括的に捉えることはないため、プロジェクトマネージャーの重責は任せられません。
京都大学でも定員が削減されており、教員の退職がなければ補充されません。従いまして、若い教員を定員内で採用してプロジェクトを分担していただける可能性は極めて低いです。本事業を順調に推進し、リソースを担っていく次世代を育成するためにも、研究能力を持ち、かつ、事業全体を包括的に把握する能力を持つリサーチアドミニストレーター
を本事業の経費で採用することをお認めいただきたいと考えます。

・指摘事項６（広報活動） 「13th IWGS に参加できなかった」ために広報活動も足りなかったとも記述がある／国際的な発信強化が求められる【回答】（広報活動）
指摘事項１への回答に記した通り、国際的な広報活動を強化しています。2019 年６月にはロシアで開催された主に旧ソビエト圏各国の研究者を中心とした国際会議で NBRP・コ
ムギで進めているコアコレクションの選定と NAM 集団の育成について講演してきました。
同 7 月には第１回国際コムギ会議（International Wheat Congress; IWC）でも広報してきました。
NBRP・コムギの課題管理者の那須田は WI の 2 つの Expert Working Group (EWG)のメンバーです。IWC の前に開催された EWG の会義において NBRP・コムギの活動の報告をし、WI に対し、新たに WI によってオーソライズされた gene bank のネットワークによってコムギの研究材料を包括的に管理・保存・配布する体制をつくる提言をしました（指摘事項１への回答参照）
。

50

資料 4

51

資料 4

52

資料 4

53

資料 4

54

資料 4

55

資料 5

2019 年 8 月 太田敦士
NRBP・コムギ 種子リソース （第 4 期 3 年目） 報告
1. 業務題目
コムギ近縁野生種・コムギ在来品種の収集・調査・保存（主として種子更新など）。
2. 業務担当[京都大学 植物遺伝学分野（北白川） / 栽培植物起源学分野（物集女）]
那須田周平（責任者）、寺内良平、安井康夫、新田みゆき（実施者）、太田敦士（実施者）、他 技術補佐員 5 名
3. 平成 30 年度（第 4 期 2 年目）の報告（一部再掲）
2017-18 年 系統保存
収穫した 473 系統（表 1, 4）の種むきを終え、在庫管理システムのデータを更新し、入庫を完了させる。
=> 種むきと在庫管理データベースへの登録までは終えているが、入庫作業中である。


2018-19 年 系統保存
現在生育中の 521 系統の袋かけ・収穫をし、その後、種むきを開始する。
=> 収穫まで実施済み

表 1 2017-18 年更新系統と 2018-19 年更新予定系統の概略。詳細な内訳は表 4 に記載している。
グループ 12017-18 年
2018-19 年
播種
収穫
播種
収穫
栽培
見込み 2
場所 3
KU
在来品種・野生種
genus Aegilops
142
137
220
193
M
genus Triticum
176
172
150
143
M
実験系統
3
3
85
85
K
新規導入
91
87
80
75
M
KT
在来品種・野生種
genus Aegilops
2
2
K
genus Triticum
74
69
5
5
K
実験系統
8
8
K
LPGKU
実験系統
11
10
K
TACBOW
在来品種・野生種
その他
30
5
K
合計
516
473
561
521
1 KOMUGI ホームページにおいて、NBRP group name が野生種または栽培品種・品種であれば「在来品種・野生種」に分類し、実験系統であれば「実験系統」とした。Triticum-Aegilops 以外の属は「その他」にした。「新規導入系統」は KOMUGI 未登録系統である。
2 収穫済みであるが、最終的な確認を終えていないため「見込み」としている。
3 M: 京都大学栽培植物起原学分野（物集女）で栽培; K: 京都大学植物遺伝学分野（北白川）で栽培

56

資料 5



発芽試験
予備試験を実施し、その結果をもとに以下のとおり試験方法を定めた。2018 年度には1000 系統を試験した。
=> 試験結果は、現在まで（2019 年 8 月）までのデータと併せて後述。
発芽試験の実施方法- プラスチック製のケースの底に水道水で湿らせたキッチンペーパーを敷き、その上に播種する（図 1 左）。
- 1 系統 10 粒を播種する。
- 低温給水処理（10℃, 24 時間）後、20℃で 7 日間インキュベートする（図 1 右）。
- インキュベート後、発芽状況を記録する。なお、芽と根が両方とも 1cm 以上伸びた種子を「発芽した」とみなす。

図 1 発芽試験の様子。左: 播種方法。各セルに 1 系統 10 粒ずつの種子を設置している。水道水で湿らせた
キッチンペーパー（二枚重ね）をケース底に敷いている。右: インキュベート。グロースチャンバー（20℃）内で



他殖性種の系統維持の検討
Ae. speltoides の KU-5720B はどの条件でも種子が取れなかった。一方で、KU-7820 は「複数穂まとめて袋掛け」や「株全体を不織布で覆う」方法で稔実種子が得られた。系統によっては、1 株の異なる穂間または異なる株間で花粉のやりとりが可能な条件下で栽培・更新すれば、系統維持が可能かもしれない。しかし、系統により異なる結果が得られたため、遺伝的な要因（近交弱勢の程度や環境応答性の違い）も大きく関与していると思われる。
=>データをさらに収集するため、2018-19 年に 15 系統の栽培をおこなった（後述）
表 2 他殖性種 Secale cereale と Aegilops speltoides の稔実結果 (2016-17 年栽培)
種および系統栽培方法

Ae. speltoides

温室内・鉢植えKU-5720B

袋かけ方法

Ae. speltoides

温室内・鉢植え1 穂毎に袋かけ

36

0

83

0

不明

0

14

0

複数穂まとめて袋かけ

170

1 穂毎に袋かけ63

0

1 穂毎に袋かけ複数穂まとめて袋かけ

KU-7820

99

19

不明

28

1 穂毎に袋かけ160

複数穂まとめて袋かけ

43

1 鉢まとめて不織布で覆う
アクリルハウス・鉢植え

収穫粒数

複数穂まとめて袋かけ
1 鉢まとめて不織布で覆う
アクリルハウス・鉢植え

収穫穂数

57

資料 5

4. 平成 31 年度（第 4 期 3 年目）の実施状況と今後の予定
2018-19 年 系統保存
更新系統 446 系統と新規導入 75 系統を収穫した（表 1, 4）。これらは現在種むき中である。種むき完了後、在庫管理データベースへの登録と入庫処理をする。


2019-20 年 系統保存
現在更新系統の選定をおこなっている。計 400 系統程度を播種する予定である。
栽培植物起源学分野（物集女）: Triticum 約 200 系統、Aegilops 約 100 系統
植物遺伝学分野（北白川）: 実験系統 約 100 系統
また、Aegilops リソースの拡充のために、「1995 年にスペイン・モロッコで収集された

Aegilops 167 系統」の系統化を第４期中に進める。今年度に 100 系統の栽培を予定している。
表 3 スペイン・モロッコ収集 Aegilops 167 系統の系統化栽培の予定表。
系統数

Ae. biuncialis

10 系統

Ae. ovata73 系統

Ae. triaristata

19 系統

2019-20 年

2020-21 年
10 系統

2021-22 年
10 系統

37 系統

37 系統
36 系統

19 系統

19 系統

20 系統

20 系統

Ae. triuncialis

41 系統

Ae. variabilis
Ae. ventricosa

3 系統
21 系統

21 系統

21 系統

Total

167 系統100 系統100 系統



36 系統

21 系統
3 系統

21 系統

3 系統
114 系統他殖性種の増殖方法の検討
Ae. speltoides の栽培データをさらに収集するために、以下の条件で栽培した Ae.

speltoides 15 系統の穂を 2019 年夏に収穫した。
また、別の他殖性種 Ae. mutica も、隔離栽培以外の栽培方法を検討するため、9 系統を栽培し、収穫した。これらは現在、種むき（稔実数データを収集）中である。
栽培条件:-

栽培方法（3 条件）:-

袋かけ方法（3 条件）: 1 穂毎、複数穂、オープン（袋かけなし）

温室・鉢植え、圃場・鉢植え、圃場・露地植え

今年度（2019 年秋）からも、隔離栽培を含めた栽培をおこない、データを収集する。


発芽試験
第 4 期中の発芽試験を実施する系統数は以下の通りである。
2018 年度 1000 系統（実施済み）
2019 年度 4000 系統（実施中）2020 年度 4000 系統
2021 年度 3000 系統

58

資料 5

現在までの試験結果から、次のような傾向がみられた（図 2, 3）。
- 約 20 年間は全体的に高い発芽率を維持している。
- Triticum の系統は、20-30 年の間に発芽率の下降がみられる。Aegilops の系統については 1995 年より前に収穫した種子をまだ試験していないため不明である。
-

30 年以前の種子でも発芽はするが、発芽率は低い。

図 2 発芽率のボックスプロット。この結果には、20 サンプル以上を試験した種のデータのみを使用している（8 種 1030 系統 1081 サンプル）。また、Triticum（白色）と Aegilops（灰色）で色分けしている。内訳は次のとおりである。なお、複数の収穫年を調べている系統もあるため、ここでは系統数ではなく「サンプル」と表記している。
T. boeoticum (259 サンプル)、T. araraticum (202)、T. turgidum (115)、T. durum (100)、T. monococcum(29) Tti(20) Ab ll l t (213) A t i
i li (143)

図 3 各種の発芽率のボックスプロット。種名の右の括弧内の数字はサンプル数。

59

資料 5

表4

2017-18 年更新系統と 2018-19 年更新系統の内訳
2017-18 年
播
収KU

在来品種・野生種

KT

実験系統
新規導入系統在来品種・野生種

LPGKU
TACBOW

実験系統
実験系統
その他

genus Aegilops
section Polyeides
Ae. umbellulata
Ae. ovataAe. triaristata
Ae. columnaris
Ae. biuncialis
Ae. variabilis
Ae. kotschyi
Ae. triuncialis
section Cylindropyrum
Ae. caudata
section Comopyrum
Ae. comosa / Ae. heldreichii
section Sitopsis
Ae. speltoides / Ae. aucheri
Ae. longissima
Ae. searsii
Ae. bicornis
section Amblyopyrum
Ae. mutica
genus Triticum
Diploid species
T. boeoticum
T. urartu
T. monococcum
Tetraploid species
T. araraticum
T. timopheevii
T. dicoccoides
T. dicoccum
T. durum
Hexaploid species
T. aestivum
genus Aegilops
genus Triticum
-

14

14

7

7

12
3
2
24

9
3
2
24

17
1
7
12
12
3
1
23

16
1
7
10
8
3
1
23

54

52

50

41

13

13

25

25

6
2
5

6
2
5

15

15

34

34

20

9

17
10
1

16
10
0

97
15
6

93
15
6

146
2

144
2

12

11

4
1
9

4
1
9

6
85
80
2
5
8
11

4
85
75
2
5
8
10

561

521

3
91

3
87

74

69

30
5
合計 516 473
1
収穫済みであるが、最終的な確認を終えていないため「見込み」としている
2
M: 京都大学栽培植物起原学分野で栽培; K: 京都大学植物遺伝学分野で栽培

60

2018-19 年
播種 収穫見込み 1

栽培場所
2

M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
M
K
M
K
K
K
K
K

資料 6-1

第 4 期 NBRP・コムギ

平成 31/令和元年度前半

事業報告
令和元年 8 月 28 日

京都大学大学院農学研究科 那須田周平
1. 種子リソース（他で報告のある項目以外）
1-1. 各種コアコレクションの整備
・第 3 期から二倍体、四倍体、六倍体の各コムギのコアコレクションを整備している。
・第 4 期では随時、不足している種子の増殖、形質データの蓄積、倍数性の確定を行っている。

・六倍体コムギコアコレクションについては論文が公表された（Takenaka et al. 2018.

Genes Genet. Syst. DOI: https://doi.org/10.1266/ggs.18-00041）。コアコレクションの種子

リソースを KOMUGI データベースから一括でオーダーできるよう準備中。また、ジェノタ

イプデータ（Excel 形式）を遺伝研に送付済みで、KOMUGI に掲載するよう準備中。

・四倍体コムギコアコレクションにおいて当初選定した 192 系統のうち AABB ゲノムの172 系統の染色体数を調査した結果、10 系統が六倍体、1 系統が 2 倍体であることが判明したため、これらを除外して 181 系統をコアコレクションとして再選定した。論文投稿中。
・二倍体コムギコアコレクションについては投稿準備中。

1-2. NBRP コムギ出穂日の一斉調査

NBRP コムギでは平成 16 年から平成 27 年まで多数系統の形質調査を行ってデータを蓄積し、その情報はデータベース KOMUGI で公開してきた。これらのデータをより有効に活用できるよう、平成 27/28 年シーズンから、過去調査した各栽培年次の系統群と六倍体、四倍体、二倍体のコアコレクションの早晩性の多様性を網羅する系統群、および実験標準
系統からなる早晩性に関するコアコレクションを作成し、これらの出穂日データについて、毎年国内で協力者を募り調査を続けている。これらの系統は「NBRP・コムギ 出穂日調査
用コアコレクション」として整備する。
現在、栽培シーズン平成 30/31 年の出穂日データをとりまとめ中。データ取得後は、岡山大学の加藤、西田両氏が出穂関連遺伝子群のジェノタイピングとデータ解析を行い、論文公表するとともにデータを KOMUGI 上で公開する予定。

平成 30/31 年シーズンでは次表の 12 地点（高緯度順）で一斉調査を行った。

61

資料 6-1

表. NBRP コムギ出穂日の一斉調査の協力者リスト（平成 30/31 年シーズン）
No.

協力者（敬称略）

都市名

所属

1 笹沼 恒男

鶴岡市

山形大学

2 村井 耕二

福井県永平寺町

福井県立大学

3 半田 裕一

つくば市

農研機構

4 田中 裕之

鳥取市

鳥取大学

5 西尾 善太

厚木市

東京農業大学6 川浦 香奈子

横浜市

横浜市立大学7 新田 みゆき京都市

京都大学（北白川）

8 太田 敦士

向日市

京都大学（物集女）

9 中﨑 鉄也

木津川市

京都大学（附属農場）

10

宅見 薫雄

神戸市

神戸大学

11

加藤 鎌司

岡山市

岡山大学

12

松中 仁

福岡県筑後市

九州沖縄農研筑後

62

作物開発センター

資料 6-2

2019年8月28日

平成31年度/令和元年度前半 実績報告書
種子リソース配布

担当： 那須田 周平
窓口担当： 新田 みゆき
受注・配布実績（2019年4月1日から2019年8月20日まで）
平成30年度以前受注、平成31/令和元年度配布分（自家使用を含む）

国内
国外

受注
物集女
0 (0)
3 (347)
3 (347)遺伝
1 (1)2 (140)
合計 3 (141)

木原
0 (0)
3 (13)
3 (13)

遺伝
0 (0)
0 (0)
0 (0)

発送済み
物集女 木原
0 (0)
0 (0)
0 (0)
0 (0)
0 (0)
0 (0)

件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

平成31年度/令和元年度受注、平成31年度/令和元年度配布分（自家使用を含む）
遺伝
国内
7 (151)国外
3 (51)
合計 10 (202)

受注
物集女
木原
7 (327)
2 (118)1 (2)0 (0)8 (329)2 (118)遺伝
3 (75)1 (1)
4 (76)

発送済み
物集女
木原
4 (203)
1 (3)
0 (0)
0 (0)
4 (203)1 (3)件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

＜参考＞
平成30年度 受注・配布実績（2018年4月1日以降に受注し、2019年3月31日までに発送）
遺伝
国内
4 (97)
国外
2 (71)
合計 6 (168)

受注
物集女
木原
9 (252)6 (18)
4 (22)4 (5)
13 (274) 10 (23)遺伝
3 (95)
1 (19)
4 (114)

発送済み
物集女
木原
9 (247)6 (18)
3 (21)2 (2)
12 (268) 8 (20)件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。
キャンセル分は除く。

上記のうち自家使用分
京大
京大
6 (141)横浜市大 1 (1)合計
7 (142)

受注
発送済み
横浜市大 京大
横浜市大
2 (2)6 (140)
2 (2)
0 (0)
1 (1)
0 (0)
2 (2)
7 (141)2 (2)件数（系統数）で表示。受注データには、配布不可と未発送の数字を含む。

63

資料 7

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
系統配布手数料料金の改定（予定）について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平


消費税税率改正（令和元年 10 月 1 日）に伴い、京都大学内（京都大学北部構内管理課
第二予算・決算掛 と課題管理者）で原案を作成し、研究科運営委員会で承認を得た。これに対応するべく、京都大学大学院農学研究科コムギ遺伝資源管理規程を改正した（改正内容は料金体系のみ）。


料金改定の予定を KOMUGI ページより広報した（2019 年 8 月 19 日）。



料金改定の予定を Muginet で広報した（2019 年 8 月 20 日）。



料金改定の予定を AMED に報告した（2019 年 8 月 23 日）。

＞＞＞＞＞＞＞ 広報のメールのコピー ＞＞＞＞＞＞＞
2019 年 10 月 1 日に予定されている消費税率の変更を契機として、京都大学内で配布にかかる手数料料金の見直しをしました。
その結果、（１）配布基本料、（２）系統手数料を共に改定することにいたしました。新しい料
金は 2019 年 10 月 1 日の午前 0 時 0 分以降のリクエストに対して適用致します。技術的な問題、そして混乱を避けるため、９月から１０月への変わり目に一定のリクエストを受け付けない期間を設定させていただく予定です。改定後の手数料は以下の通りです（カッコ内に現行料金を示します）。
［配付手数料 体系 （2019 年 10 月 1 日以降）］
配布料は次の区分（１）配布基本料と区分（２）系統手数料に配布する系統数を乗じて得た価格の合計額から 100 円未満端数切り上げて得た価格とし、次式による。
（式）配布料（請求価格）＝配布基本料＋系統手数料×配布系統数
区分（１）配布基本料
国内機関

国外機関

学術研究機関

950 円（900 円）

非学術研究機関1,900 円（1,800 円）

学術研究機関7,000 円（5,200 円）

非学術研究機関14,000 円（10,400 円）

区分（２）系統手数料（配布系統数を乗じる）
国内機関

国外機関

学術研究機関320 円（110 円）

非学術研究機関640 円（220 円）

学術研究機関

290 円（110 円）

非学術研究機関580 円（220 円）

64

資料 7

実情を反映させて、実費のみを徴収いたしております。
ユーザーの皆様にはご理解いただけますようにとお願い申し上げ、ますますのご利用をお待ち申し上げております。
NBRP・コムギ 課題管理者
京都大学大学院農学研究科
那須田 周平

65

資料 8

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
寄託システムの運用について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平
寄託の制度について、京都大学北部事務部研究推進掛と 2019 年 7 月 3 日に打ち合わせをおこなった。
日時：令和元年７月３日（水）１７：００～１８：００（農学・生命科学研究棟２階 那須田先生研究室）

出席者：那須田准教授（農学研究科）、研究推進掛担当者２名（研究推進掛）■打合せ概要（研究推進掛のメモから抜粋し、那須田が加筆）
NBRP コムギの寄託の受入れ開始に関する手続き等の確認① 経緯
2016.2 に当時の研究推進掛担当者とコムギの寄託受入れ手続について内容を固めていたが、運用開始直前に担当者の異動や植物遺伝学研究室の研究者の退職などが重なり、運用に至っていなかった。
（2016.2 に規程の一部改正や同意書の様式（日本語版のみ）については調整が済んでおり、運用できる状態ではあった。）
今回、実際に運用を開始したいとのことで那須田が研究推進掛に連絡し、改めて様式の制
定状況や手続きの流れについての確認を行った。
② 確認事項
・現時点では外部から寄託されたコムギおよび遺伝子組換えコムギは取扱いなし。
・寄託受入れを開始するにあたり、
1.もともと研究室で保管しているコムギ
2.寄託のコムギ
3.遺伝子組換えコムギ
は手続きの関係上、それぞれ別に MTA を締結する必要があるため、配布基本料が別途かかる。
・遺伝子組換えコムギを寄託で受入れ、また提供する場合は MTA の締結の前に安全管理掛にて遺伝子組換え生物受入・譲渡の手続きをする必要がある。

66

資料 8

③ 今後必要な対応
海外からの寄託も積極的に受入れていくことを検討しているため、寄託同意書の英語版を至急作成する必要がある。日本語版が作成された当時も、知財部門担当者との間で英語版について協議していたが、寄託者が海外企業である場合の知財の取扱い等、懸念事項があったことも原因となり話が進まなかった。
④ AMED からの指摘事項
AMED からは積極的に寄託を受け入れるように指導されている。また、寄託受入れに際し、AMED より ABS への対策が取れているかという確認が入った。寄託同意書には「法令に従って手続きを行うこと」との記載があるが、それで十分な対応ができているか、研究倫理・安全推進室（RESPO）へ相談する必要がある。
⑤ 那須田からの提案
今後、食料及び農業のための植物遺伝資源に関する国際条約（ITPGR）に基づいて作成された MTA ひな型（SMTA）と、本学で作成した寄託同意書を併用し、コムギのリソースによって使い分けることを検討していきたい。
理由：

相手機関によっては寄託の際に SMTA で締結することを条件とされる場合がある
ため、導入することで利用増が見込める。



寄託の際に SMTA で受け入れたものは同じように SMTA を使用して提供する必要がある。



しかしながら、SMTA は第三者への配布が可能である等、制限が比較的緩いため、全てのリソースに適用すると中核機関としての本学の存在意義が薄れてしまう。



そこで、SMTA で管理するリソースと本学の同意書で管理するリソースを分けて併用することで、利用者の増加を図るとともに、京大の存在意義も守ることを目指せ
るのではないか。

（注記）AMED からも、SMTA への参画をするか検討するように言われている。
（他の
NBRP オオムギ、イネ、ダイズなど検討中だが）ちなみに、SMTA に参画するためには、別途国の定める手続きが必要（NBRP・コムギ運
営委員会 土門委員に要相談）。
⑥ 決定事項および今後について
・国内機関からの寄託に関しては寄託同意書・提供承諾書は決裁が完了しているため、申し込みがあればいつでも手続きを進めて頂いて問題ない。
・研究推進掛から知財部門へ寄託同意書の英語版作成について相談

67

資料 8

（他の NBRP や寄託機関の英語のひな型を確認しておく）
・研究推進掛から RESPO へ寄託同意書の ABS への対応について確認
・研究推進掛内で SMTA の導入すべきかを検討

68

資料 9

Nested association mapping (NAM) 集団の作成
令和元年 8 月 28 日
龍谷大学農学部 竹中祥太朗
今般、パンコムギゲノム配列が決定されたことにより、遺伝子単離や GWAS (Genome
Wide Association Study)が容易になり、現在、解析のための優れた集団が世界で必要とされている。最初にゲノム配列が読解されたパンコムギ品種 Chinese Spring (以下、CS)に続き，国際コムギ 10 ゲノム構想が現在進行中であり，その中に日本のパンコムギ品種である農林
61 号 (以下、N61)が加えられ，近々に N61 のゲノム配列が公開される予定である。また、
N61 を含む世界のパンコムギコアコレクションがつくられる予定である。

NBRP 第 3 期において我々は 6 倍体コムギのコアコレクションを作成し(Takenaka et al.,2018)、さらにこれらについて N61 を片親とした F 2 集団を作成した。このような状況において、第 4 期では、遺伝的解析が完了したこれらの材料を出発点として、NAM ワーキンググループを中心に，遺伝子単離や GWAS に適した東アジアの NAM 集団を作成し、コムギ研究のコミュニティに公開する。
1.

事業担当者
新田みゆき(研究員)、竹中祥太朗(研究協力者)、那須田周平(責任者)
NAM ワーキンググループ
竹中祥太朗(代表，龍谷大学)、太田敦士(京都大学)、寺内良平(京都大学)、那須田周平(京都大学)、新田みゆき(京都大学)、松岡由浩(福井県立大学)、松中仁(農研機構・九沖農研)、
吉田健太郎(神戸大学)

2.

平成 31/令和元年度前半 事業報告
初年度の平成 29 年度ではコムギの周年栽培系を確立するとともに、NAM ワーキンググ

ループでミーティングをもち、NAM 親系統の選定を行った(表 1)。NAM 親系統は東アジ
ア(日本～中国～ヒマラヤ地域)由来の系統から、遺伝的集団構造、育種系譜、F 2 種子の在庫粒数を考慮し、目安として 1 組合せ 300 個体、25 組合せ程度からスタートし、最終的に不発芽などで自然縮小して 1 組合せ 200 個体、15 組合せ(計 3,000 系統)からなる東アジアに特化した NAM 集団を作成すること、また、ユーザーの利便を鑑みて、早い段階で春化処理が不要な系統に絞り込むこととした。
NAM 集団 F 2 ⇒F 3 の栽培
平成 29/30 年の栽培シーズンにおいて、表１に示した F 2 個体群の栽培を行った。平成 30
年 3 月下旬から 4 月上旬に出穂し、5 月下旬から 6 月中旬に登熟した。

69

資料 9

収穫直後の種子の発芽方法の検討
収穫直後の種子を播種する場合、一次休眠の打破処理が必要となる。F 3 世代種子を対象に複数の休眠打破処理を適用して発芽試験を行った結果、35℃で 12 時間乾燥させる処理によって低温処理によると同水準の高発芽率が得られることが明らかとなったため、世代促
進にこの方法を採用することにした。
NAM 集団 F 3 ⇒F 4 の栽培
平成 30 年 7 月から 8 月に休眠打破処理、9 月上旬にチップ栽培法による室内での水耕栽培を開始した。F 3 種子の一次休眠は前述の方法によりほぼ全ての種子で問題なく打破できた。
水量過多により生育停止となった系統について 10 月上旬から中旬に再播種を行った。
F 3 個体の収穫日は 11 月中旬から翌 6 月上旬までと大きくばらついた。これは、春化要求
性程度の影響によると考えられた。生殖成長に入らなかった個体の一部は枯死したが、生存していた個体について春化処理を行うことにより収穫できた。
NAM 集団 F 4 ⇒F 5 の栽培
F 4 種子の収穫日が大きくばらついたため、世代促進はこれまでのリスト順の播種ではなく収穫できた順に播種を行う方法に変更した。
F 4 種子は順次、35℃12 時間乾燥の休眠打破処理を行い、平成 31 年 1 月中旬からチップ栽培法による室内での水耕栽培を開始した。
晩生個体に着粒した F 4 種子は、35℃12 時間乾燥処理後一度常温で吸水させるとその後低温においても全く発芽しない種子が多く、二次休眠に入る傾向がみられた。これらは高温乾燥処理後に数日間低温吸水させることでほとんどの種子が発芽した。これを踏まえて、晩生個体に着粒した F 4 種子については高温乾燥、低温吸水および 3 週間の春化処理を行っている。晩生個体の栽培は現在進行中である。
NAM 集団 F 5 ⇒F 6 の栽培
令和元年 7 月上旬から F 5 種子の播種を行い、現在進行中である。全て高温乾燥、低温吸水を行っているが、全ての系統を春化処理できる設備がないため、春化処理は行わず、今後、生殖成長しない系統のみピックアップして春化処理を行う予定である
NAM 集団 F 6 ⇒F 7 の栽培
令和元年秋のシーズンでは、収穫が間に合った F 6 種子を播種する予定。1 個体から多くの種子を得られる栽培方法を検討中である。

70

資料 9

表１．NAM 系統リスト
# of

300

276

139

2

6x013

CN4

CHN

KU-479

300

267

253

3

6x025

FKK

JPN

富国

300

282

201

4

6x060

PK1

PAK

KU-3229

301

273

218

5

6x061

PK2

PAK

KU-3351

300

253

233

6

6x078

NP1

NPL

KU-4734

300

284

274

7

6x080

NP2

NPL

KU-4769

300

287

120

8

6x081

NP3

NPL

KU-4783

300

296

271

9

6x084

BT1

BTN

KU-7113

300

295

278

10

6x117

CN2

CHN

KU-13546

300

287

248

11

6x119

CN1

CHN

KU-13662

300

279

221

12

6x120

CN6

CHN

KU-13708

300

293

231

13

6x121

CN7

CHN

KU-13807

300

277

237

14

6x122

CN3

CHN

KU-13891

300

295

281

15

6x153

CN5

CHN

Chinese Spring

271

255

231

16

6x159

K107

JPN

関東 107 号

269

262

237

17

6x165

ZNK

JPN

ゼンコウジコムギ

300

283

278

18

6x167

NBB

JPN

延岡坊主小麦

300

283

233

19

6x179

MNM

JPN

ミナミノコムギ

300

266

251

20

6x180

CGW

JPN

超極早生

300

289

251

21

6x183

CKG

JPN

チクゴイズミ

300

294

265

22

6x185

SRG

JPN

シロガネコムギ

300

296

245

23

6x189

SNY

JPN

しゅんよう

300

298

150

24

6x192

AKD

JPN

アカダルマ

300

298

164

Total

7,140

6,768

5510

F4

indvs

農林 10 号

F3

harvested# ofvar. or cv.

indvs

Country

harvested

Code

JPN

F2

Maternal

N10

71

# of

parent6x002

indvs grown

NAM1

資料 10

第4期

第3回

NBRP・コムギ運営委員会

資料2019 年 8 月 28 日（水）於京都大学 農学・生命科学研究棟

担当 横浜市立大学木原生物学研究所・川浦香奈子
・アーカイブ化ワーキンググループ
メンバー： 川浦香奈子、太田敦士、松岡由浩、那須田周平、元ナミ、大田正次、寺内良平（大田先生、寺内先生は 2018 年 11 月から）
（１）事業計画京都大学や木原生物学研究所、木原ゆり子氏宅（旧木原生研、横浜市南区六ッ川）に残っている採集記録と栽培記録について、系統の情報に関わるデータについてアーカイブ化し、原本を京都大学文書館に保存する。
（２）進捗状況木原均博士、田中正武博士、山下孝介博士を中心とする学術探検隊が採取したサンプルに関する
学術情報のアーカイブ化することを目標に活動した。田中正武博士の資料について、杉山朋子氏（田中博士のご息女）が保管していることが分かったため、その総体を明らかにすることを中心に活動
を行った。
活動記録
・2018 年 6 月 6 日（水） 杉山氏ご自宅（横浜市戸塚区）で田中博士の資料を閲覧した（川浦）。
・2018 年 8 月 25 日（土）杉山氏ご自宅で田中博士の資料の全容および総量を確認した。

参加者：那須田、松岡、杉山朋子氏、木原ゆり子氏、川浦
アーカイブ化する資料の総体を明らかにするため、京都大学に全体を移送し、専門知識をもつメンバーで資料の整理をすることとした。
後日、京都大学大学院農学研究科と杉山朋子氏で合意書を交わし、資料を京都大学に寄贈していただくこととした。
・2019 年 2 月 18 日（月） 木原生物学研究所で田中正武博士、木原均博士、山下孝介博士に関する資料について検討した。
参加者：那須田、木原ゆり子氏、杉山朋子氏、川浦
田中正武博士資料については、京都大学大学院農学研究科とで合意書を交わし、所有権を譲渡する手続きを進めることを確認した。
研究資料は公開することが原則であるため、北白川で保管することが現実的であり、杉山氏も合
意した。

72

資料 10

木原均博士資料については、種子に関する栽培記録等のノート類（前年度閲覧済み）はリスト化
し、田中博士の資料を移送する際に合わせて移送することとした。
重要資料の選別が難しいため、アーキビストとワーキングのメンバーで集まり、それぞれの視点
から資料を見て方針を決める必要があり、機会を設定することとした。後日、科学史資料のアーカ
イブ化の経験のある総研大の飯田香穂里氏、広島大学の久保田明子氏に参加の同意を得た。
山下孝介博士資料については、六ッ川の木原ゆり子氏の自宅で保管されており、木原ゆり子氏の所有物として扱えると考えられるが、山下博士の親族に確認することとした。
・2019 年 5 月 13 日（月） 田中博士の資料一式を杉山氏の自宅から京都大学大学院農学研究科
遺伝学分野の研究室（北白川）に輸送した。
参加者：（搬出）松岡、杉山朋子氏、川浦 （受け取り）那須田・2019 年 5 月 13 日（月） 六ッ川の木原ゆり子氏の自宅で保存されている山下孝介博士の資料の総量を確認した。
参加者：松岡、木原ゆり子氏、川浦

73

資料 11

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
農林 61 号 blast server の設置について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平


平成２９年度 NBRP ゲノム情報等整備プログラム、農研機構研究予算、新学術領域、CREST 等の研究資金によって、日本国産コムギの代表系統として NBRP・コムギ保管の農林６１号のゲノム配列を de novo assemble した。

本プロジェクトは Wheat Initiative によりオーソライズされた国際コムギ 10＋ゲノム
プロジェクトの一環として、同プロジェクトが進めるほかの品種のゲノム配列アセン
ブ ル と 同 じ 方 法 で 進 め ら れ た （ 2019 年 の カ ナ ダ に お け る International Wheat
Congress で IPK の Nils Stein が概要を報告。論文作成中）。



NBRP のゲノム情報等整備プログラムのポリシーに従って、ゲノムアセンブルの一部
を blast server 経由で公開。ゲノム配列は、IPK から Toronto 合意に基づく形で公開予定（準備中）。



Muginet、nazuna、Ricenet に広報（下記参照）（2019 年 8 月 20 日）。

＞＞＞＞＞＞＞ 広報のメールのコピー ＞＞＞＞＞＞＞
皆様（マルチポスト、ご容赦いただけますようお願いいたします）

農林 61 号ゲノム解読チームは日本の西南暖地で長く栽培されてきたコムギ品種農林 61 号のゲノム配列を de novo assemble しました。
日本だけでなく東アジアを代表するコムギ品種のゲノム配列を得ることができました。
ゲノム配列の公開に先立ち、blast server を立ち上げました。
Toronto 合意に基づき、ゲノム全体の解析の権利は農林 61 号ゲノム解読チームならびに国際コムギ 10+ゲノム解読コンソーシアムが保有します。
また、blast には以下の制限がついています。
・論文公開前のデータへのアクセスとなりますので、Toronto 合意を承諾してください。登録サイトにご登録いただくことで、ご承諾いただいたものとさせていただきます。
・検索用のクエリシーケンスについては先頭から 2000 文字までを受け付け、それ以上の文字数を入力された場合は先頭から 2000 文字までを使います。
・一定の、アクセス制限を設定しています。

74

資料 11

・同時実行数は理論上最大 8 です。
ご興味をお持ちの方は、以下のサイトから登録してご利用ください。登録作業に時間をいただくため、PW のご送付には数日程度の猶予をいただきます（直ちに PW が発行されな
くてもエラーではございません。内部処理に時間を頂戴いたします。ご理解ください）。
<Registration form>
https://forms.gle/yd5jY2ZfA1ji8gry6
Blast Server はナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）の情報センターである国立遺伝学研究所 川本研究室に構築・管理していただいています。
お気付きの点などありましたら、 nasushu@kais.kyoto-u.ac.jp（那須田）までご連絡ください。
どうぞよろしくおねがいいたします。
<<<農林 61 号ゲノム解読チーム>>>
清水 健太郎（横浜市立大学・チューリッヒ大学）
瀬々 潤（産業技術総合研究所・ヒューマノーム研究所）
辻 寛之（横浜市立大学）
川浦 香奈子（横浜市立大学）
半田 裕一（農研機構、現 京都府立大学）
Curtis Pozniak（University of Saskatchewan）
Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research)
那須田 周平（京都大学）

75

資料 12

令和元年 8 月 28 日
第 4 期 NBRP・コムギ 平成 31/令和元年度前半 事業報告
学会等での活動
責任者 那須田 周平
1.

年度前半の報告(1) 広報活動① Aegilops 属植物の穂の外部形態と分類形質に関する講習会の実施（7/30～
7/31、京都大学（京都市）、講師 大田正次 先生（福井県立大学名誉教授））、
参加者 16 名（企画・実施：新田）② 日本プロテオーム学会 2019 年大会 第 70 回日本電気泳動学会総会での遺伝資源とタンパク質発現に関するシンポジウムでの話題提供と NBRP 展示（7/24~7/27、シーガイア コンベンションセンター（宮崎市）、リソース機関（新田）とユーザー（横浜市立大学 川浦香奈子氏）③ 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics,
and biotechnology” (PlantGen2019)での発表（那須田）（6/24～6/28、ノヴォシ
ビルスク （ロシア））④ 第 1 回 IWC (International Wheat Congress)でのポスター展示（那須田）（7/21～7/26、サスカチュワン（カナダ））⑤ 第 1 回 IWC の遺伝資源とプレブロイーディングに関する EWG サテライトミー
ティングで発表（那須田）（7/21、サスカチュワン（カナダ））(2) 渉外活動① WI (Wheat Initiative) 那須田はコムギ遺伝資源の世界的利用に関する２つの専
門家作業部会（Global Wheat Germplasm Conservation and Use Community,and Improving Wheat Quality for Processing and Health）のメンバーとして活動中。那須田はミーティングにおいて、論文公表時に遺伝資源をジーンバンクに寄託するルール作りを進めるデポジットシステムの設立に関する提言を行い、2019 年 7 月 27 日の WI の Scientific Board の会議に計られ承認を得た。詳細は別紙。 （（サスカチュワン（カナダ）、（那須田））② Wheat 10+ Genome Project のメンバー（那須田）③ NBRP・イネと NBRP・オオムギの運営委員（那須田）2.

年度後半および来年度の予定(1) 広報活動① 日本育種学会 第 136 回講演会での発表（那須田）（9/6～9/7、近畿大学奈良キャンパス（奈良市））

76

資料 12② 11th ANRRC International Meeting でのポスター展示（新田）（10/16～6/18、
ロスバニョス（フィリピン））③ ムギ類研究会およびコムギ小委員会（11/2～11/3、鳥取大学（鳥取市））④ 第 41 回日本分子生物学会年会での NBRP 展示（12/3～12/6、福岡国際会議場（福岡市））⑤ 第 61 回日本植物生理学会年会での展示（3/19～3/21、大阪大学吹田キャンパス（吹田市））⑥ Aegilops 属植物の穂の外部形態と分類形質に関する講習会の実施（7 月～８月、京都大学（京都市））「今夜は寝るまで探索について語ろう会」（仮称）開催予定⑦ コムギの染色体観察法講習会（時期未定）(2) 渉外活動①

生物遺伝資源委員会委員（那須田）②

WI の専門家作業部会のメンバー（那須田）③

Wheat 10+ Genome Project のメンバー（那須田）④

NBRP・イネと NBRP・オオムギの運営委員（那須田）77

資料 13

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
実施担当者の変更について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平
現在の実施担当者である京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻栽培植物起原学分野
安井康夫 氏と協議したところ、安井氏が新たに地球規模課題対応国際科学技術協力プログラム(SATREPS)の課題分担者となり、NBRP・コムギにエフォートを割けないことが判明した。本人が、本事業からの離脱を希望している。
安井氏が NBRP・コムギの実施担当者から外れることをお認めいただきたい。
以上78

資料 14

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
種子リソース利用促進について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平
中間評価の報告書作成にあたって、配布系統数・利用者数の集計をしたところ、平成２９
年度より減少傾向にあり、特に平成３０年度は目標値の４割程度にとどまっていることが判明した。
利用促進の方策として、次の４点を挙げる。
（１）ユーザーコミュニティーとの良好なコミュニケーション
審議事項「運営委員会の拡充・生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催方法について」で検討（２）海外ユーザーへの広報
報告事項「学会等での活動」で報告（３）国際的な研究コミュニティーに接続し、貢献審議事項「ITPGR に従った SMTA での種子の収集・保存・配布システムと現行の MTA によるシステムの運用について」で検討（４）寄託の推進
報告事項「寄託システムの運用について」で報告＜参考となる事象＞
２０１９年６月２７日に NAM 集団親系統２５系統（ゲノム配列のリシーケンシング進行中）を新しい系統番号を付して公開したところ、２０１９年８月２６日までの２ヶ月間に国内の８名、国外の３名の研究者からのリクエストがあった。

79

資料 15

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
運営委員会の拡充・生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催方法について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平
運営委員会による、業務の円滑な進行のチェック機能の発揮、そして、新しいコムギ研究
分野への対応の目的を達成するため、（１）運営委員会のメンバーの拡充、（２）運営委員
会開催数の適正化を検討していただきたい。
具体的には、次の２点を審議していただきたい。
（１）ユーザーを代表する研究者若干名を運営委員として追加する。
（２）運営員会を年２回開催にする。１回は８月から９月に京都で、もう一度は、３月に春の育種学会講演会と前後して（学会開催日とは別の日に）開催する。

ユーザーコミュニティーとの情報交換の場として生物遺伝資源委員会コムギ小委員会を活用できるよう、開催時期と場所を以下のように変更することを審議していただきたい。
（現行）ムギ類研究会に連動（年一度、１１月か１２月）（改定案）春の育種学会に連動（年一度、３月）
生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の設立意義については、「京都大学コムギ遺伝資源保存事業のセンター化について」の資料（遺伝研元所長、 NBRP 推進委員会主査の小原雄治先生の書かれた文章）参照。従来、コムギでは、ユーザーコミュニティーとの情報交換の場として捕らえられてきたが、より明確に「センター化準備のためのユーザーと中核機関との連絡組織」と定義し直すべきか（後で審議）
。

以上

80

資料 16

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
Wheat Initiative における NBRP・コムギの位置付けについて
ならびに
ITPGR に従った SMTA での種子の収集・保存・配布システムと現行の MTA によるシステムの運用について令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平•

コムギ遺伝資源アクセスへの国際的な協力体制を Wheat Initiative (WI)に提案した（2019 年 7 月 27 日の Scientific Board 会議で（半田さん経由））•

NBRP・コムギ側からの狙いは、 NBRP・コムギを世界的なコムギ研究コミュニティ
ーのなかに位置付けること。そして、世界のコムギ研究者からのリクエストを得ること。

•

提案書は報告事項「中間評価」の資料中•

Scientific Board では基本的にアクセプト。

•

詳細については、今後、以下のエキスパートワーキンググループ（EWG）と連携して詰めていき、制度を具体化していく。
GLOBAL WHEAT GERMPLASM CONSERVATION AND USE
COMMUNITY
IMPROVING WHEAT QUALITY FOR PROCESSING AND HEALTH
WHEAT INFORMATION SYSTEM＜考慮すべき事項＞•

現行の配布システムは bilateral な契約•

WI で想定している種子のやり取りは multilateral な合意（具体的には FAO の定める
ITPGRFA: International Treaty on Plant Genetic Resources for Food and Agriculture）。

•

ITPGRFA に基づく運用を京都大学、AMED が認めるか、否か？

＜ITPGRFA メリットとデメリット＞
メリット：SMTA による運用（契約手続きが簡便）デメリット：第三者配布可、配布物の爾後のクオリティーコントロールが困難、リソースリストの登録が必要以上81

資料 17

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
京都大学コムギ遺伝資源保存事業のセンター化について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平＜発端＞（１）今年度のムギ類研究会主催の鳥取大学辻本壽氏と生物遺伝資源委員会コムギ小委員会の開催について協議中、「小委員会とはなんぞや」という疑問に直面。
•

小委員会について調査。その結果、小原雄治 NBRP 推進委員会主査の文章（次ページ以降に全文紹介、http://shigen.nig.ac.jp/shigen/grc/grc.jsp?language=ja）を再発見。

•

小委員会 ＝ リソースセンターの準備組織？

（２）NBRP・中核的拠点整備プログラムの中間評価ヒアリングにて、「京都大学は良い遺伝資源を持ちつつもサポートしないのか」、「リソース業務の永続的継続に関する組織的取り組みは」という質問を受ける。
•

NBRP 事業の多くの生物種は、リソースセンターが行なっている（オオムギ、（イネ）、
ミヤコグサ・ダイズ、カイコ、ラットなど）。大学の分野単位で事業を担っているケースは少ない。

•

大学の分野の人事はリソース事業とは切り離されて行われることが多い。従って、安定的な人材の確保は難しい。

•

そもそも、教育・研究を主務とする大学の分野で、サービス業の側面の強いリソース
業務を行うことの問題。

コムギにおいても、過去においてセンター化するチャンスがあったのではないか？今後もセンター化することを検討すべきではないか？
＜センター化に関する要考慮事項＞•

大学の教育・研究単位（専攻、系、講座、分野）の運営や人員構成と、センター化との間で利害が衝突する可能性がある。

•

京都大学の問題（京都大学がコムギ遺伝資源をどうしていきたいのか？）。まずもって、
那須田と寺内がよく相談すべき。

•

学内、特に農学研究科内に、センター化をサポートしてくれる勢力があるか？

以上

82

資料 17

生物遺伝資源委員会と資源センター小委員会について
実験生物の多様な系統は生命科学の研究にとって不可欠のものである。さらに最近では、ゲノム研究など生物学の爆発的な発展によって、莫大な数の突然変異系統が体系的に作り出され、それを用いた遺伝子機能の研究が世界的に進行している。 このように増大する様々な生物系統の開発と解析、それらを保存して研究者の要望に応じて分譲する事業、そして増大する生物系統に関する情報を有効利用 する ためのデータバンク事業は、生命科学の基礎研究だけでなく、医学や農学などの応用分野でも極めて重要になってきた。

このような状況に対して、学術審議会学術情報資料分科会において報告「学術研究用生物遺伝資源の活用について」が出された(1996 年 6 月)。この報告では「生物遺伝資源」を「遺伝子を基盤において取り扱う 学術研究用の系統生物、学術研究の対象となる野生生物及びそれらの生物の細胞・DNA を包含する」と定義し、これらの広範かつ効果的な利用のためにその所在情報・特性情報のデータベース化とネットワークの整備を 中心に提言したものである。このための体制作りの具体策の第 1 が、生物種毎の遺伝資源センターであった。主要な生物種毎に
生物遺伝資源センターを整備し、各センターにおいては各生物系統の特性開発、維持保存、供給、データベースの構築の中心的な役割を果たすことが期待したものである。このため、各センターには 当該生物遺伝資源に関する小委員会を設け、関連活動の推進、検討をはかることとした。第 2 に、それらの 上部機構として生物遺伝資源委員会と系統情報データベース活動である。これは、わが国の生物遺伝資源の確保と活用に関して様々な学術的立場から総合的な検討・調整をすること、及び情報の総合的な収集発信の拠点作りを目的とするものである。
この報告などを受け、1997 年度から、いくつかの大学において後述の資源センターが設置されてきた。国立遺伝学研究所においては遺伝実験生物保存センターを改組し、3 つ生物種の資源センターの機能をもつ系統生物研究センターと生物遺伝資源委員会と系統情報データベースを運営する生物遺伝資源情報総合センターが設置された。

生物遺伝資源委員会はある意味では「遺伝資源事業」の国会であり、本来中央に置かれるべき性格のものといえる。 これを国立遺伝学研究所で運営することになったため、性格がわかりづらくなった面があるが、別図に示す
ように、国立遺伝学研究所を管轄するものではなく、わが国の(特に) 大学等における遺伝資源事業全体を検討・調整するものである。このためには遺伝資源事業の現状を把握し 現場の声を反映することはもちろんであるが、一方で、バイオサイエンスにおける遺伝資源事業の位置づけなど 大所高所からの将来計画策定が求められている。
このような観点から、 別表 1 に示すような様々な生物種の資源センター責任者や今後資源センターを作ろうとする関連研究者さらには他省庁の関係者を結集するとともに、関係する学識経験者からなる幹事会(ステアリング
コミッティー)を設けて有機的な運営をはかることとした。通常の研究所委員会とは異なることもあり準備に手間取ったが、1999 年 6 月に幹事会を開き、さらに同年 10 月に 全体会議を開催し、規約を決めると共に活動を開始した。今後は、委員会の目的でもある遺伝資源事業のあるべき 方向の検討、新資源センター設立の支援、などの活動が予定されている。

83

資料 17

遺伝資源小委員会は各資源センターにおかれるものであり、各資源センター自体は所属大学等の概算要求によって設置されるものである。 したがって、その運営・規則は所属大学・研究所に依存するが、委員会の主務は当該生物種の系統保存事業が円滑かつ有効に進むよう情報交換や調査検討をおこなうことであり、このため センター
責任者と関連研究者で構成される。また、所在情報・特性情報のデータベース化も任務に含まれるが、これは後述のように生物遺伝資源情報総合センターの系統情報データベース事業の支援を受けて進められることが多い。
別表 2 のように、これまでのところ、国立遺伝学研究所系統生物研究センターにマウス、イネ、大腸菌の資源センター及び小委員会が立ち上がっている。他大学では、オオムギ(岡山大学資源生物研究所)、ショウジョウバエ(京都工芸繊維大学)培養細胞(東北大学加齢医学研究所)、カイコ(九州大学遺伝子資源開発研究センター)について資源センターが設立されている。 資源センターの設立には至っていないが、小委員会活動などセンター設立に向けた準備を進めている生物種としては、コムギ、メダカがある。

ゲノム研究や生物多様性・進化研究の発展に伴って、系統保存事業には新しい光が当てられようとしている。バ
イオサイエンスの大きな流れに対応すべく系統保存事業も、ダイナミックに変革していくことも重要である。各種センター・委員会活動がこれらの動きを加速し、よい方向に導くことが期待されている。

小原雄治
生物遺伝資源情報総合センター
国立遺伝学研究所

84

資料 18

第４期 NBRP・コムギ運営委員会資料
DNA クローン配布事業について
令和元年 8 月 28 日
京都大学大学院農学研究科 那須田周平•

第 3 期までで横浜市立大学が分担機関としての任務を終了（バックアップ協力機関として協力を仰いでいる）。

•

2017 年 3 月末日をもって DNA クローンの配布を一時中止。

•

cDNA クローン、genomic DNA クローンの配布業務受け入れ先を模索。

•

第 4 期の２年半に、クローンの新規配布リクエストは無かった（配布済みクローンの移動に関する MTA の再契約が１件のみ）。

•

ゲノム配列公開（2017 年 8 月）
、RNA-seq による発現遺伝子アトラス（2018 年 Science）
で cDNA クローン、ゲノミッククローンの役割は終了したと思われる。

•

今後もしばらくは、クローンのオリジナルを横浜市立大学で。バックアップを京都大学で保管する。

•

KOMUGI データベースにある cDNA に関する情報は維持する。

＜配布停止に関する交渉経過＞•

2019 年 8 月 8 日に那須田より、横浜市立大学川浦准教授に NBRP・コムギとして DNA クローンの配布を停止することの提案（メールにて）。

•2019 年 8 月 8 日に川浦准教授より、配布停止に合意のメール（横浜市立大学の事務的にも問題がないことの確認）。

＜今後の対策＞•

今後もしばらくは、クローンのオリジナルを横浜市立大学で。バックアップを京都大学で保管する。

•

DNA クローン配布に関する KOMUGI データベース上の情報（MTA など）を削除（2019 年 8月実行済み）。

•

基本的な Blast 検索や発現量のヒートマップ（Virtual Display）などは、当座 KOMUGI データベースに留置しておく。

•

NBRP で集めたクローンを横浜市立大学が独自に配布することは妨げない。配布リクエストをモニターするために、横浜市立大学にはリクエストの記録を依頼。

以上85