DDrare

20 − 難病の開発薬物と標的遺伝⼦・パスウェイのデータベース −○坂⼿⿓⼀1、深川明⼦2、宇佐美祐⼦1 、⽔⼝賢司2、⽊村友則1
1. 国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所
2. 国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所

難治性疾患研究開発・⽀援センター
AI健康・医薬研究センター

DDrare（ディー ディー レア；Database of Drug Development for
Rare Diseases）1)は、厚⽣労働省の指定難病の創薬情報と薬物標的遺ドラッグ・リポジショニング 4) など、難病の創薬標的探索に有⽤なデータベースとなることを⽬的としている。

伝⼦／パスウェイのデータベースとして、医薬基盤・健康・栄養研究所と⽇本製薬⼯業協会 医薬産業政策研究所との共同研究で開発された。

1) DDrare：https://ddrare.nibiohn.go.jp

DDrareは、①指定難病の疾患名を階層構造を含めて翻訳・作成した疾2) 「指定難病情報のデータベースとの連結」政策研ニュース No.49

患名リスト（⽇英）2) 、②世界４⼤臨床試験レジストリから抽出した、指定難病の臨床試験と開発薬物、③開発薬物の標的遺伝⼦・パスウェ
イ情報、を提供している 3) 。2021年3⽉版では、疾患名と薬物名の同義語等の拡充とテキストマイニングの改良により、30,000件以上の臨床試験、2,000以上の薬物（DrugBank）を抽出した。薬物の標的遺伝

2016.11 https://www.jpma.or.jp/opir/news/
3) 「指定難病のデータベース“DDrare”の紹介」政策研ニュース
No.54 2018.7 https://www.jpma.or.jp/opir/news/
4) Sakate and Kimura. Sci Rep. 2021
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34117295/

⼦数は581，標的パスウェイ数は286（KEGG）となった。DDrareはLicensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス©2021 坂⼿⿓⼀（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）

1. DDrare（ディー ディー レア）とは疾患リスト（統計情報）

DDrare: Database of Drug Development for Rare Diseases

疾患ごとの臨床試験↑ トップへ← 戻る

1. 球脊髄性筋萎縮症［臨床試験数：17，薬物数：16（DrugBank：8），標的遺伝子数：10，標的パスウェイ数：15］

Searched query = "Spinal and bulbar muscular atrophy", "Spinobulbar muscular atrophy", "SBMA", "Kennedy disease", "Kennedy-Alter-Sung syndrome"
The queries were searched in Public_title, Scientific_title, and Condition. Export date: 03/15/2021. Trials are sorted by Date_enrollment from most recent to oldest in the table.
Drug = Acetate; BVS857; Clenbuterol; Creatine; Dutasteride; Goserelin; Leuprolide; Leuprorelin; Leuprorelin Acetate; MONORES*30CPR 20MCG; Mexiletine; Monores; Procedure: Electrophysiologic study;
Procedure: tissue biopsy; TAP-144-SR(3M); Testosterone

Search in Page Two or more letter word(s) / Forward match
No.

TrialID

1 NCT03555578(ClinicalTrials.gov)

2 JPRN-JapicCTI-183981

3 JPRN-UMIN000026150

国の指定難病を対象とする臨床試験（⽇⽶欧中）
データの解析により、開発薬物、標的遺伝⼦・パスウェイの情報を紐づけている。

薬物標的遺伝⼦／パスウェイ（KEGGへのリンク）

4 EUCTR2013-002608-15-DE(EUCTR )SearchResete.g. "Phase 3", "Not recruiting", "Japan"

Date_
Date_
Primary_Secondary_
Public_title
Scientific_title
Condition
Intervention
enrollment registration
sponsorsponsor
November 1/6/2018
Specified Drug- Specified Drug-Us Spinal and Bulbar Mu Drug: Leuprorelin Acetat Takeda NULL
2, 2017
Use Survey of L e Survey of Leupro scular Atrophy
eeuprorelin Aceta relin Acetate Injecti
te Injection Kit 1 on Kit 11.25 mg All
1.25 mg All-Cas -Case Investigatione Investigation: : Spinal and Bulbar
Spinal and Bulb Muscular Atrophy (ar Muscular Atro SBMA)phy (SBMA)
02/11/2017 01/06/2018 Specified Drug- Specified Drug-Us Spinal and bulbar mu Intervention name : Leupr TAKEDA NULL
orelin Acetate
Use Survey of L e Survey of Leupro scular atrophy
PHARMAeuprorelin Aceta relin Acetate Injecti
Dosage And administratio CEUTICA
te Injection Kit 1 on Kit 11.25 mg All
n of the intervention : Leu L COMP
1.25 mg All-Cas -Case Investigation
prorelin Acetate Injection ANY LTD
e Investigation: : Spinal and bulbar
Kit 11.25 mg, every 12 we .
Spinal and bulba muscular atrophy (eks subcutaneously, for ur muscular atrop SBMA)
p to at most 8 years. Partihy (SBMA)
cipants received interventi
ons as part of routine medi
cal care.
2017/04/25 31/03/2017 Safety and effica
Spinal and Bulbar Mu Mexiletine Hydrochloride Nagoya NULL
300mg daily, for 4 weeks University
cy of mexiletine
scular Atrophyhydrochroride inplacebo for 4 weeks
Graduate
spinal and bulba
School ofr muscular atropMedicine
hy (SBMA) :a multicenter, rando
mised, double-bl
ind, placebo-con
trolled trial
15/08/2014 15/04/2014 A study of the sa A two-part placebo Spinal and bulbar mu Product Code: BVS857
Novartis NULLfety and effectiv -controlled study to scular atrophy (SBMA INN or Proposed INN: Pharma
eness of BVS85 evaluate the safety )Services
7 in spinal and b , tolerability andpre MedDRA version: 18.
AGulbar muscular a liminary efficacy of 1;Level: PT;Classificattrophy
BVS857 in patients ion code 10068597;Twith spinal and bul erm: Bulbospinal musbar muscularatrop cular atrophy congenithy (SBMA)
al;System Organ Clas

https://ddrare.nibiohn.go.jp/cgi-bin/disease_who.cgi?id=1

開発薬物

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Recruitment_ Inclusion_ Inclu
Statusagemin
ageRecruiting
N/A
N/A

recruiting

Complete: foll 20years-ol 80ye
ow-up continu dding

Not Recruiting2. DDrare更新（2021年3⽉公開版）
DDrare公開情報の変遷■ テキストマイニング⼿法の改良
2021年3⽉公開版は、2021年3⽉までの臨床試験（WHO）、薬物（DrugBank）、遺伝
⼦／パスウェイ（KEGG）のデータにもとづく解析結果を掲載。
臨床試験データのテキストマイニング（疾患名、薬物名）に際し、疾患オントロジー（同義語、疾患階層性）の⾒直し、特に省略語（ALSなど）への対応とそれに伴うFalsepositiveの除去プロセスを改善した結果、抽出された臨床試験数などが増加した（右表）。

■ システム改良、患者数（年齢分布）の追加

20192020

2021

152 / 306

207 / 331

226 / 333231 / 333

臨床試験数

4,399

11,765

15,19430,029

薬物数（DrugBank）

642

1,303

1,666

2,001

標的遺伝⼦数

284423551581

標的パスウェイ数

108154275286

指定難病数（情報有／全疾患数）

各表のソートとフィルター機能などの実装。国内患者数に「医療費受給者証所持者数」を追加。

システム改良：ソート、フィルター、表⽰数切り替え、ページ移動
表⽰数切り替え

2018

フィルター
（例：myopathyのある⾏のみ表⽰）

疾患リストにおける患者数（医療費受給者証所持者数）情報
年齢分布グラフ、年齢階層ごとの患者数（ 💬アイコンまたはグラフのマウスオーバーによるポップアップ）

ソート（各項⽬：△昇順、▽降順）

ページ移動

ポップアップ

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3. DDrareから探るドラッグ・リポジショニング■ ドラッグ・リポジショニングの可能性を予測する評価指標を開発（Sakate and Kimura. 2021）
ü 難病治療薬開発の加速を⽬的とし、世界で初めての試みとして、わが国の指定難病を対象に、難病領域のドラッグ・リポジショニング（ＤＲ）動向の網羅的調査を実施
ü 薬剤標的遺伝⼦（または遺伝⼦産物）を疾患ペア間ごとに⽐較する指標Rgeneを設けて解析した結果、数値が急に上昇した場合には、数年以内にその難病間でのＤＲが進むことから、ＤＲ予測性があることを⾒いだした。
ü Rgeneを⽤いてＤＲの対象となる疾患や薬剤の探索を⾏うことにより、難病領域における治療薬開発が加速することが期待できる。

■ 今後のDDrareの開発計画
2021年度中の公開を予定。
Ø デザインの全⾯⾒直しØ データ更新（告⽰番号334以降の疾患追加など）
Ø 疾患階層の表⽰切り替えØ 全体検索Ø 疾患詳細ページ（疾患ごとの創薬状況）
開発中画⾯

■ 謝辞

DDrareは⽇本製薬⼯業協会 医薬産業政策研究所と医薬基盤・健康・栄養研究所との共同研究により構築されました。アンケート回答等、DDrareの開発にご意⾒・ご⽀援をいただいた皆様に感謝いたします。
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