嫌気性菌研究分野
Division of Anaerobe Research〒501-1194〒501-1193 岐阜市柳戸 1 番１kenki@t.gifu-u.ac.jp
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FAX : 058-230-6551

目次

1. 嫌気性菌分野・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９１
2. 沿革・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９１
3. 職員構成・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９２
4. 研究と活動の方針「4 つの柱」
・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９２
5. 分野施設と主な設備・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９４
6. 嫌気性菌保存菌株の保有状況・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・９６
7. 分野の業務と支援・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・１０１
8. 支援の実績・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・１０１
9. 教員の研究･教育･社会活動・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・１０３

1.

嫌気性菌研究分野

嫌気性菌研究分野は主にヒト・動物に由来する偏性嫌気性菌（酸素存在が生存に不利に働く細菌）を幅広く扱っている国内で唯一の研究施設である。始まりは、我が国における臨床嫌気性菌研究のパイオニアである故鈴木祥一郎、故上野一惠の両岐阜大学名誉教授の業績に対して 1978 年（昭和 53年）に設置された医学部附属嫌気性菌実験施設である。以来、岐阜大学の特色ある施設として、我が国における臨床嫌気性菌学の発展に寄与してきた。現在では、科学研究基盤センターの１分野として、臨床細菌のみにかかわらず、嫌気的環境での実験についてのコンサルテーション、機器の供与、偏性嫌気性菌の分譲等の支援を行っている。施設の成り立ちと性質上、他分野と異なり、学内共同利用施設では無く、感染症領域とライフサイエンス研究に関わる嫌気性菌のレファレンスセンター機能を持つ施設として、全国的な支援を行っている。

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沿革

昭和53年10月

医学部附属嫌気性菌実験施設開設される
施設長 鈴木祥一郎（併任）、専任教授 上野一惠

昭和54年4月

施設長 上野一惠 着任

91平成5年 3月

施設長 上野一惠 退任

平成5年 4月

施設長 渡邉邦友 着任

平成15年4月

改組により生命科学総合実験センター嫌気性菌実験分野となる分野長 渡邉邦友

平成17年4月

改称 生命科学総合研究支援センター 嫌気性菌研究分野
分野長 渡邉邦友（平成25年3月まで）
田中香お里（平成25年4月〜）

平成30年4月

改組・改称により研究推進･社会連携機構 科学研究基盤センター
嫌気性菌研究分野 となる
分野長 田中香お里

令和2年4月

改組・改称により高等研究院 科学研究基盤センター
嫌気性菌研究分野 となる
分野長 田中香お里

3.

職員構成
教授：田中香お里

特任教授：武藤吉徳

助教：後藤隆次

林将大

技術補佐員：中川朗子 堀井美紀

4.

研究と活動の方針「4つの柱」

1）嫌気性菌感染症についての基礎的臨床細菌学的な研究を行う。
この研究成果により、これまでも臨床嫌気性菌学の発展に貢献してきた。分離･培養･同定ツールの発展により、臨床嫌気性菌の疫学も過渡期にあり、また、微生物は、社会情勢、生活習慣等でもたらされる環境変化により変化しうるため、情報のUp Dateが必要である。疫学情報の充実が、正しい診断法に基づく適切な治療法の選択を可能にし、治療法の改良や新しい治療法の開発に繋がるとともに、予防医学にも繋がる。

922）研究成果の応用、嫌気性菌感染症の診断法の基準化やマニュアル化、そしてその教育普及を行う。
当施設で毎年１回1週間の日程で行う嫌気性菌検査技術夏期セミナーは、すでに40年以上の歴史があり、嫌気性菌感染症診断のための技術指導と情報提供の場であり続けている。さらに、受講者に対する講習会終了後の支援活動は、電話やe-mailでのコンサルテーション、検体からの病原菌の細菌学的検査サポートの形で実施している。また、研究成果を導入した、菌感染症の診断法の標準化、マニュアル化に努める。

3）臨床現場からの嫌気性病原菌の収集と保存およびその分与を行う。
その性質上、患者からの嫌気性病原菌の収集は通性菌に比べて、極めて難しい仕事である。当分野では、嫌気性菌の参考菌株や全国各地の病院からの診断支援依頼を通して分離、同定した菌株を保存している。
現在のところ、保存株数は7,000株以上で、多様な臨床分離の偏性嫌気性菌を含むコレクションとして、国内に類を見ない。これらの菌株については当施設の重要な研究材料として用いられている
他、国内外の大学、研究所など研究教育施設や、製薬あるいは試薬の開発に関係している民間の研究所に分与されており、研究、教育、産業育成に有効利用されている。

4）医療関係者に対する嫌気性菌と嫌気性菌感染症に関する啓蒙活動を積極的に行う。
今日の大学医学部における感染症学の講義が内科学の講義全体に占める割合は、極めて少ないことがわかっている。感染症学の中でも、嫌気性細菌学に関する講義の占める割合はさらに極めて少なく、その教育のほとんどは、卒後教育に依存しなければならない現状である。嫌気性細菌学と嫌気性菌感染症の卒後教育のための、本施設の役割はわが国において極めて大きく、常に新しい情報の収集に努め、求めに応じて対応できる態勢を整えている。

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5.

分野施設と主な設備

嫌気性菌研究分野は、医学部棟７階に位置する。P2 レベルの微生物実験室と系統保存室を備えている。

I. 嫌気性グローブボックス（1 台）、嫌気性ワークステーション（1 台）

酸素を含まない混合ガス環境（窒素 82％程度、炭酸ガス 8％程度、水素 10％程度）下での作業、培養が可能

テーハー式アナエロボックス ANX-1W 【平沢製作所】
他 1台

II. ガス置換装置(1 台)

高度な嫌気状態を必要とする培地等の調整に使用する器機

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ガス置換装置(GR-8 型) 【三紳工業】

III. 菌株保存用超低温フリーザー(3 台)95

6．嫌気性菌保存菌株の保有状況a) 嫌気性菌レファレンス菌株

約290株

保有菌株概要（属）アクチノバクテリア門 ActinobacteriaI.

アクチノマイセス属 Actinomyces
モビルンカス属 Mobiluncus
キュティバクテリウム属 Cutibacterium

II. ビフィドバクテリウム属

Bifidobacterium

III. アトポビウム属 Atopobium
コリンセラ属 Collinsella
オルセネラ属 Olsenella
IV. エガーセラ属 Eggerthella
スラッキア属 Slackia

ファーミキューテス門

Firmicutes

Clostridium

クロストリジウム属

ペプトストレプトコッカス属 Peptostreptococcus
フィネゴルディア属 Finegoldia
パルビモナス属 Parvimonas
ペプトニフィルス属

Peptoniphilus

アネロコッカス属 Anaercoccus
フィリファクター属 Filifactor
ユーバクテリウム属 Eubacterium
モギバクテリウム属 Mogibacterium
シュードラミニバクター属 Pseudoramibacter
シュードフラボニフラクタ属 Pseudoflavonifracter
ディアリスター属 Dialister
ベイヨネラ属 Veillonella
ブレイディア属 Bulleidia
ソロバクテリウム属 Solobacterium
スタフィロコッカス属 Staphylococcus
ゲメラ属 Gemella
ラクトバチラス属 Lactobacillus

96プロテオバクテリア門

Proteobacteria

βプロテオバクテリア綱 Betaproteobacteria
サッテレラ属 Sutterellaδプロテオバクテリア綱. Deltaproteobacteria
デスルフォビブリオ属 Desulfovibrio
バイオフィラ属 Bilophila
εプロテオバクテリア綱. Epsilonproteobacteria
カンピロバクター属 Campylobacter

バクテロイデス門 Bacteroidetes

バクテロイデス属 Bacteroides
ポルフィロモナス属 Porphyromonas
プレボッテラ属 Prevotella
カプノサイトファーガ属 Capnocytophaga

フゾバクテリア門 Fusobacteria

フゾバクテリウム属Fusobacterium
レプトトリキア属 Leptotrichiab) 各種感染症、病態由来の嫌気性菌臨床分離株

約9,000株

菌株由来概要胆道感染症 、腹腔内感染症、腸管感染症、脳膿瘍、菌血症、皮膚軟部組織感染症、その他の産婦人科感染症、耳鼻咽喉科感染症、口腔外科領域感染症、呼吸器科領域感染症、整形外科感染症、便、鼻腔サンプル、院内環境保有菌株概要（属）アクチノバクテリア門 ActinobacteriaI.

アクチノマイセス属 Actinomyces
モビルンカス属 Mobiluncus
キュティバクテリウム属 Cutibacterium

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II.

Bifidobacterium

ビフィドバクテリウム属

ガードネレラ属 Gardnerella
パラスカルドビア属 Parascardovia
スカルドビア属 ScardoviaIII.

アトポビウム属 Atopobium
コリンセラ属 Collinsella
オルセネラ属 OlsenellaIV.

エガーセラ属 Eggerthella
スラッキア属 Slackia

ファーミキューテス門

Firmicutes

Clostridium

クロストリジウム属

ペプトストレプトコッカス属 Peptostreptococcus
フィネゴルディア属 Finegoldia
パルビモナス属 Parvimonas
ペプトニフィルス属

Peptoniphilus

アネロコッカス属 Anaercoccus
フィリファクター属 Filifactor
ユーバクテリウム属 Eubacterium
モギバクテリウム属 Mogibacterium
シュードラミニバクター属 Pseudoramibacter
シュードフラボニフラクタ属 Pseudoflavonifracter
ディアリスター属 Dialister
ベイヨネラ属 Veillonella
ブレイディア属 Bulleidia
ブラウティア属 Blautia
ソロバクテリウム属 Solobacterium
スタフィロコッカス属 Staphylococcus
ゲメラ属 Gemella
ラクトバチラス属 Lactobacillus

プロテオバクテリア門

Proteobacteria

βプロテオバクテリア綱 Betaproteobacteria
サッテレラ属 Sutterella
エイケネラ属 Eikenella

98δプロテオバクテリア綱. Deltaproteobacteria
デスルフォビブリオ属 Desulfovibrio
バイロフィラ属 Bilophila
εプロテオバクテリア綱. Epsilonproteobacteria
カンピロバクター属 Campylobacter

バクテロイデス門 Bacteroidetes

バクテロイデス属 Bacteroides
ポルフィロモナス属 Porphyromonas
プレボッテラ属 Prevotella
カプノサイトファーガ属 Capnocytophaga

フゾバクテリア門 Fusobacteria

フゾバクテリウム属 Fusobacterium
レプトトリキア属 Leptotrichia

スピロケータ門 Spirochaetes

ブラキスピラ属 Brachyspira

シネルギステス門(Synergistetes)

シネルギステス属 Synergistes

年度別内訳
年

GAI No.

収集株数

1991〜2008(# 91000～08503)

7119

2009

(# 09001～09209)

209

2010

(# 10001～10202)

202

2011(# 11001～11207)

207

2012

(# 12001～12149)

149

2013

(# 13001～13107)

107

99

2014

(# 14001～14227)

227

2015

(# 15001～15240)

240

2016

(# 16001～16135)

135

2017

(# 17001～17313)

313

2018

(# 18001～18160)

160

2019

(# 19001～19029)

29

2020

(# 20001～20216)

216

2021

(# 21001～21144)

144

2022

(# 22001～22165)

165

100

7．分野の業務と支援
1) 菌株維持・系統保存
2) 嫌気性菌の生態などに関する問い合わせへの対応
3) 培養法など研究上の技術的な相談への対応
4) 嫌気環境を必要とする研究の支援
5) 嫌気性菌を中心とした細菌同定、感受性測定
6) 嫌気性菌の国内外の研究者に対する分譲（管理体制・設備が整っている研究室対象）
日本細菌学会教育用菌株の分与
日本化学療法学会MIC測定委員会指定コントロール菌株の分与
各種同定用キットの精度管理用菌株の分与
抗菌薬、試薬開発のための菌株の分与

7) 臨床嫌気性菌についての講習会開催
嫌気性菌検査技術セミナー

8. 支援の実績（1）検査依頼・技術提供・相談・質問対応【検査依頼】
・臨床材料から分離された嫌気性菌の薬剤感受性試験（試験法による結果の差異についての検証および最終判定）： (医療機関：県外) 1件2株
・各種臨床材料からの分離菌の同定依頼（医療機関：県外3，県内1）4件15株
・重症感染症から分離された嫌気性菌の同定依頼（医療機関:県外2，県内2）4件6株
・培養陰性検体からの病原菌遺伝子検索（医療機関：県内）1件9検体
・重症感染症から分離された嫌気性菌の毒素型別精査依頼 (医療機関：県外) 1件2株
・難治性感染症から分離された多剤耐性菌の耐性遺伝子検索（医療機関：県外）1件1株 10耐性遺伝
子101

【技術提供】
・Core genome 解析の試行依頼（大学：県外）1件
・歯科衛生啓蒙イベントへの資料提供（開業医：県外）1件
・長期保存菌株の回復依頼（大学：県外）1 件 7 株

・研究で用いる難培養菌の培養依頼（大学：県外） 1 件 1 株・口腔内細菌の同定（大学:県外）1件4株【相談】・研究に係る嫌気培養法･検体輸送容器についての相談（大学：県外）1 件
・嫌気培養で分離できる食品微生物についての相談（企業：県外）1 件
・多剤耐性菌を用いる研究についての相談・情報提供 1 件（学内）1 件 4 回・嫌気性菌を用いた研究についての相談（大学:県外）1 件 1 回・学生実習に用いる細菌の取扱いについての相談（大学：県外）1 件
・実験に用いる嫌気性菌の培養条件についての相談（高校：県外） 1 件【質問】・嫌気性菌感染症について（開業医：県外）1 件
・特殊なガス環境を要求する菌について（企業：県外）1 件（2）新規保存数（3）菌株分譲

165 株

各種嫌気性菌 4 株（大学：県外 2 件各 1 株、企業：県外 1 件 2 株）

（4）臨床嫌気性菌についての講習会開催

今日の大学医学部における感染症学の講義が内科学の講義全体に占める割合は、極めて少ないことがわかっている。また、感染症学の中でも、嫌気性細菌学に関する講義の占める割合はさらに極めて少なく、その教育のほとんどは、卒後教育に依存しなければならない現状である。検査技師の教育に関しても同様のことが言える。嫌気性細菌学と嫌気性菌感染症の卒後教育における本施設の役割は、わが国において極めて大きいと考えられる。
嫌気性菌感染症は、内科、外科、整形外科、産婦人科、耳鼻咽喉科、歯科口腔外科など幅広い領域で見られ、嫌気性菌の臨床検査は感染症の診断・治療に重要である。本セミナーは、嫌気性菌および嫌気性菌感染症に興味のある方々に、最新の情報を交えた全般的な知識と検査に関わる技術を習得して頂くことを目的として講義と実習を実施している。

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《第 50 回嫌気性菌検査セミナー》まで、総参加人数：約 1770 名《第 51 回嫌気性菌検査セミナー》
開催期間：令和 4 年 7 月 29 日（金）〜7 月 31 日（日） （定員 20 名）
参加者：22 名（医療機関 13、検査センター4、大学 2、企業 3；臨床検査関係 18 名、医師 1 名、研究者 1、大学
教員 1；14 都道府県）

９．教員の研究・教育・社会活動【論文等】
原著（欧文）
1. Kimura I, Kagawa S, Tsuneki H, Tanaka K, Nagashima F, Multitasking bamboo leaf-derived
compounds in prevention of infectious, inflammatory, atherosclerotic, metabolic, andneuropsychiatric diseases. Pharmacology & Therapeutics, 235 (2022) 108159
2. Vu H, Muto H, Hayashi M, Noguchi H,Tanaka K,Yamamoto Y, Complete genome sequences ofthree Phocaeicola vulgatus strains isolated from a healthy Japanese individual,
Microbiology Resource Announcements, 2022,11(2); e01124-21
3. Vu H, Cornelia Appiah-Kwarteng1, Kaori Tanaka1,2, Ryuji Kawahara3, Diep Thi Khong4,ThangNam Nguyen4, Hoa Thi Tran4, Chinh Dang Van5, Phuc Do Nguyen5 and Yoshimasa Yamamoto1,2*,
Rapid and Practical Screening Method for the Detection of Colistin-Resistant Bacteria inFood, Biomed J Sci & Tech Res | BJSTR. MS.ID.006381. 2021 Nov
4. Toyoshima H, Tanaka K,Tanigawa M, Masuda N, Ishiguro C, Tanaka H, Nakanishi Y, and SalabeS,Vertebral osteomyelitis caused by the novel pathogen Cutibacterium modestum: a casereport. BMC Infectious Diseases, 22:305(2022)
【学会】
国際学会
なし
国内学会
1. 第 70 回日本化学療法学会西日本支部総会・第 65 回日本感染症学会中日本地方会学術集会・第 92 回日本感染症学会西日本地方会学術集会（令和 4 年 11 月 3〜5 日，長崎市，シンポジウ
ム 10「今こそ嫌気性菌」司会)田中香お里
2. 第 70 回日本化学療法学会西日本支部総会・第 65 回日本感染症学会中日本地方会学術集会・第 92 回日本感染症学会西日本地方会学術集会（令和 4 年 11 月 3〜5 日，長崎市，シンポジウ
ム 10「今こそ嫌気性菌」－ゲノム解析から探る Bacteroides fragilis のカルバペネム耐性機構解－演者）後藤隆次

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3. 第 52 回日本嫌気性菌感染症学会総会（令和 5 年 3 月 4 日，富山市，一般演題「Prevotella
属が産生するβ-lactamase と薬剤感受性プロファイルに関する検討」発表）横山颯大、林将大、後藤隆次、武藤吉徳、田中香お里【共同研究】1 件
嫌気性菌の薬剤感受性試験用培地の評価試験 （県外企業）令和 5 年 2 月〜令和６年１月【教育分担】
田中香お里：連合創薬医療情報研究科（併任）
医学部医学科 テュートリアル テューター
医学部医学科 選択テュートリアル
全学共通教育 講義
医学部看護学科 講義

後藤 隆次：医学部医学科 テュートリアル テューター
医学部医学科 選択テュートリアル

林 将大：医学部医学科 テュートリアル テューター
医学部医学科 選択テュートリアル

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