平成27年1月8日、15日
募集説明会

ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合化推進プログラム（統合データ解析トライアル）」

プログラムの概要及び募集・選考・プログラム運営の方針説明
研究総括
長洲 毅志
（エーザイ株式会社 プロダクトクリエーション本部 ポートフォリオ戦略・推進部 顧問）© 2015

JST-NBDC（科学技術振興機構

バイオサイエンスデータベースセンター）licensed under CC表示2.1日本

統合データ解析トライアル

ライフサイエンスにおける情報爆発
 データ爆発超高速ゲノム配列決定装置

１００億文字/台/日コンピューターの性能の伸び（ムーアの法則）を凌駕
１万を超える生物のゲノムプロジェクト進行中
画像、動画データも急増 知識爆発論文数 ２,０００万件
フルペーパも利用可
ライフサイエンスはpeta(1015=
 データベース爆発千兆）オーダーのデータ量の世界１万時代に突入日本
１千解析ツール ２千内容も多様化
1統合データ解析トライアル

ライフ分野におけるデータの共有・統合の重要性
 データベースを指向した種々の大規模プロジェクト
多額の研究費がデータに化けている 仮説駆動型からデータ駆動型（データ中心科学）へ
法人化、バイドール法→ データの囲い込み

 データや知識の分断、断片化
 イノベーションには共有・統合化必要ブラウズ（検索）や一部のデータ公開では不十分
データ生産者以外の不特定多数のイノベーターの存在
再利用、 転用、マッシュアップが自由にできることが不可欠

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統合データ解析トライアル

ライフイノベーションのためにデータ共有、統合によるオープンイノベーションが不可欠 ブラウズ（検索だけでは）不十分 狭い意味の公開だけではだめ データ生産者以外の不特定多数のイノベーターの存在
 再利用、 転用、マッシュアップが重要
 そのためにはコピー、再配布が自由に 巨人の肩の上に立つという精神で33

統合データ解析トライアル

我が国におけるライフサイエンスDBの問題点
 DBが散在していて所在情報や利用法が分からない

我が国で1,000、世界で10,000ものDB
似たようなものがいくつもありどれを使ってよいか分からない
 DBやDBのエントリに信頼性の高い注釈がついていない

DB構築、維持を行える人材不足、DB構築への評価の低さ
 大型プロジェクトの成果公開、共有が不十分

我が国のライフ関係予算は年間３,０００億円以上
公開されているものもプロジェクトが終了すると更新ストップ
 ばらばらに構築・管理されていて検索・解析・応用が困難

現在の統合化は分子レベルで行われていて医療などへの応用困難日本語化されていないので研究動向や分野の状況の把握困難我が国にはDB戦略、中核センターがない
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統合データ解析トライアル

統合データベース整備のロードマップ

総合科学技術会議統合DBタスクフォース報告書（H21.5.21)より

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統合データ解析トライアル

文科省統合データベースプロジェクトポータルサイト

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統合データ解析トライアル

主なサービスのデータベース収録数とアクセス数
生命科学系データベースカタログ
生命科学データベース横断検索
名称

概要説明
カテゴリー別
ツリー表示

カテゴリー別ツリー表示

1,381DB

サムネイル

検索結果
外部リンク

462DB

生命科学系データベースアーカイブ
アーカイブの概要説明

約４００万ページビュー／年
アーカイブデータベース一覧
サムネイル、名称
運用場所、代表者
カテゴリー、生物種要約、利用許諾条件など（平成26年12月現在）

92DB
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統合データ解析トライアル

各省のデータベース統合

バイオサイエンスデータベースセンター（文部科学省）

医薬基盤研究所（厚生労働省）

農業生物資源研究所（農林水産省）バイオメディシナル情報研究センター（経済産業省）8

RDFによるすべてのDBの統合

連邦型統合DB③ＤＢ統合化基盤技術の開発

ＤＢ統合化基盤技術の開発
微生物DB

目的別統合DB

植物DB

ヒトDB
メタボロームゲノム

データバンク的DB

タンパク質立体構造

DBをまとめることで使いやすく統合化推進プログラム④国内バイオ関連ＤＢ統合の促進（１０課題）

個々のDBを使いやすく

カタログ

横断検索

…

②ポータルサイトの構築・運用

データベース

DB1aプロジェクト

P1

測定装置

顕微鏡

糖鎖

…

DB1b

DB2

P2
MRI

アーカイブ

chip

DB3

P3
NGS

DB4a

標準化DB３
標準化DB4bDB4bP4
質量分析

NMR

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統合データ解析トライアル

統合化のロードマップ
第一期中（平成 年度まで）に実施予定

25（１） ポータル構築連携「生命科学系データベースカタログ」への記載、リンクの実施
新センターのポータルサイトに、各省のデータベースに関する情報を記載・登録し、各省のデータベースに対して、リンクが行われる状態を実現する。

（２） 横断検索連携「横断検索サーバー」の設置、一括横断検索の実現
各省における適切なサイトに、横断検索サーバーを設置するとともに検索インデックスを統一化し、各省のデータベースに対して、相互に一括横断検索が可能となる状態を実現する。

（３） アーカイブ構築連携「統一フォーマット」でのダウンロードの実現

第二期以降を想定

新センターのポータルサイトに、各省のデータベースをガイドラインに沿ってアーカイブ化して保存し、各省のデータベースに対して、統一形式でのデータダウンロードが可能となる状態を実現する。

（４） データベース構築連携「データベースの再構築」による統合の実現
新センターのポータルサイトに、各省から譲り受けたデータベースを再編して収容し、各省のデータベースが、統一化したフォーマットで再構築された状態を実現する。
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統合データ解析トライアル

生命科学系データ合同ポータルサイト

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統合データ解析トライアル

本プログラムの目的（全体の考え方）（募集要項 ９ページ）• 本トライアルは、統合化推進プログラムで統合された（または統合中の）データベースについて、データベース利用者視点での新たな活用方法を探ることを目的としています。
• そこで、本トライアルは、統合化推進プログラムのデータベースの有用性を高めるツールの開発を実施することを目標としました。具体的には、統合化推進プログラムで統合されたデータベースや他のデータベースを更に組み合わせて解析するためのツール、統合化推進プ
ログラムのデータベースに付加価値をつけるためのツール（新たなデータ抽出法、他のデータとのリンクの付与など）の開発などが想定されます。

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統合データ解析トライアル

主な統合化推進プログラムデータベース（募集要項 １０ページ）

メタボローム関連データベース
 疾患・医薬品・環境物質関連データベース
 微生物関連データベース
 植物関連データベース
 ヒトゲノム多様性関連データベース
 フェノーム関連データベース
 蛋白質構造関連データベース
 糖鎖関連データベース
 ゲノム疫学関連データベース
 バイオイメージ関連データベース

詳細は「研究開発成果データベースリンク」
http://biosciencedbc.jp/tec-dev-prog/db-link をご覧ください。

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統合データ解析トライアル

研究開発提案のタイプ（募集要項 １０ページ）

研究開発提案タイプ（Ａ）：
本トライアルの要件を満たす課題を自ら設定し、研究開発提案を行うものです。

研究開発提案タイプ（Ｂ）：
NBDCが提示した具体的な課題に基づき、その課題を解決するためのツールについて研究開発提案を行うものです。

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統合データ解析トライアル

研究開発提案が満たすべき条件（募集要項 １１ページ）


統合化推進プログラムで統合された（または統合中の）データベースの有用性を高めるツールを開発するものであること。実験等による、データの算出を目的とした活動は対象外です。

作成したツールは、広く研究者に活用されるよう、公開すること。また、特別な事情を除き、ソースコードも公開することを期待します。



まだ公開されていないデータを用いる場合、研究開発提案書においてそのデータ内容を明らかにするとともに、データの利用許諾を取得すること。また、得られた解析結果は公開すること。ただし、論文作成や特許出願のための猶予期間を設けたりすることは可能です。

本提案で使用するデータは、研究開発提案者自身で取得すること。

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統合データ解析トライアル

今年度の試み （願い）Bioinformaticianが増えてほしい。
ほかの分野から入ってきていただきたい。

そのためには、非専門分野に入るには2人チームはよいかもしれない。
→そのための資金措置
非専門領域の人にとって課題設定が難しいかもしれない→研究開発提案タイプ（Ｂ）の新設

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