ゲノム研究分野
Division of Genomics Research
〒

―

岐阜市柳戸

番

E-mail：mgrc@gifu-u.ac.jp
TEL：

―

―

FAX：

―

―

目

次

―

分野長あいさつ ……………………………………………………………

―

ゲノム研究分野職員名簿 …………………………………………………

⑴ 専任教員………………………………………………………………………
⑵ 非常勤職員……………………………………………………………………
⑶ 研究員…………………………………………………………………………
平成 年度利用登録者及び研究テーマ………………………………………
ゲノム研究分野機器紹介………………………………………………………
利用の手引き……………………………………………………………………
平成 年度活動状況報告⑴ 講習会・トレーニングコース・講演会等…………………………………
⑵ ゲノム研究分野利用状況……………………………………………………
⑶ 共同スペース利用状況………………………………………………………
⑷ 平成 年度業績論文等………………………………………………………
⑸ ゲノム研究分野教員の教育研究活動等……………………………………
⑹ 補助金関連採択状況…………………………………………………………
⑺ 新聞報道………………………………………………………………………

―

分野長あいさつバイオインフォマティクスと自動細胞解析分取システムの導入
ゲノム研究分野長

下澤伸行

ゲノム研究分野では平成 年度も DNA シークエンス受託解析や各種解析機器の学内利用は順調に推移しており（下図参照）、 年度は更なる学内生命科学研究の発展に寄与するため、学内バイオイ
ンフォマティクスの萌芽を目指して、ゲノム研究分野にマイクロアレイ解析ソフト GeneSpring と分子間ネットワーク／パスウェイ解析データベース IPA を導入し、講習会等も開催して、その普及に努めています。研究者の皆さんがお持ちのアレイ解析データの活用や、将来の次世代シークエンサーの導入も視野に、学内にも網羅的解析により入手した大規模データを活かせる人材育成に繋げて頂ければ幸いです。さらに 年度後期には補正予算により、セルアナライザー、セルソータ、イメージング
アナライザーからなる自動細胞分取システムが導入予定で、細胞レベルでのより高度な解析技術の提供が可能になります。
根幹である DNA シークエンス受託解析につきましても、岐阜薬科大学からの依頼も順調に増えており、学内利用者の利便性も鑑み、 年度も第 、 期（ ― 月、 ― 月）期間と新規利用者にはキャンペーン価格にて提供しています。運営費交付金や研究費獲得が厳しい折、維持、保守管理、更新等にかかる費用を確保した上で、出来るだけ学内研究者が利用し易い形で提供し、研究が発展されることを期待しています。輩出された論文等の業績につきましては、是非とも ARIS 等に掲載の上、年度末の利用更新時にはゲノムまでご一報頂きます様、重ねてお願い致します。

―

―

―
⑴

ゲノム研究分野職員名簿（平成 年以降）
専任教員

．教授（分野長）
．准教授
．助教

⑵

非常勤職員（注：＊は、教員個人の研究費で雇用）．事務補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員＊．研究補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊

⑶

下澤 伸行
須賀 晴久
高島 茂雄

小林
平井
脇原
船坂
本田
梶原
豊吉
大場

陽子
さやか
祥子
美佳
綾子
尚美
佳代子
亜希子

研究員

．特別協力研究員

野原 大輔

―

―

平成 年度利用登録者及び研究テーマ（平成 年 月現在）
学

部

講 座 等

利用責任者

登録番号

教育学

理科教育（生物） 三 宅

崇

ED―

教育学

理科教育（生物） 須 山 知 香

登録人数

研 究 テ ー マ
野生植物の自殖率推定、野生生物の系統推定と父性解析

ED―

スミレの繁殖の特異性を究明

地域科学

地域政策

向 井 貴 彦RS―

魚類の DNA 解析

医学

腫瘍病理学

久 野 壽 也MD―

遺伝子改変マウスを用いたがん研究

医学

分子病態学

木 村 正 志MD―

蛍光顕微鏡を用いたヒト培養細胞の分裂の解析

医学

神経内科・老年学

犬 塚

貴

MD―

神経・筋疾患における自己抗体の研究

医学

病態情報解析医学

清 島

満

MD―

高脂血漿治療薬による副作用の解明

医学

神経生物

中 川 敏 幸MD―神経発生・神経変性機構の分子メカニズムの解析

医学

医療管理学

永 井

淳

MD―

核 DNA ならびにミトコンドリア DNA の多型解析

医学

病態制御学

安 田

満

MD―

尿路性器感染症分離菌に関する研究

医学

薬理病態学

西 脇 理 英MD―

低分子量ストレス蛋白質の生体内における役割について

医学

総合病態内科学梶 田 和 男MD―

成熟脂肪細胞の増殖の意義を検討する

医学

産婦人科

森重 健一郎MD―

精巣性女性化症候群の患者と正常男性のアンドロゲンレセ
プターの細胞内局在の観察と同定 アンドロゲンレセプ
ター変異体とその細胞内局在

医学

腫瘍外科学

吉 田 和 弘MD―

臨床検体、細胞株の遺伝子解析

医学

消化器病態学 清 水 雅 仁

MD―受容体型チロシンキナーゼを標的とした EGCG、及び非環式レチノイドによる肝線維化・発癌予防の検討

医学

病理部

廣 瀬 善 信MD―

固形がんにおける遺伝子の検索

医学

再生医科学

青 木 仁 美MD―

遺伝子組換えマウスおよび iPS 細胞の作製及び解析

医学

再生分子統御学江 崎 孝 行MD―

微生物の分類と同定

医学

皮膚病態学

清島 真理子MD―

皮膚疾患におけるセラミドの変化

医学

腫瘍制御学

後 藤 尚 絵MD―

paraffin 切片材料から採取した検体で、悪性リンパ腫診断における良性、悪性の鑑別のための塩基配列解析

医学

再生医科学

本 橋

力

MD―

マウス神経堤細胞の遺伝子網羅的解析

医学

病態制御学

長 岡

仁

MD―

抗体遺伝子改変の分子機構の解析

医学

神経統御学

山 口

瞬

MD―

マウス・ラットの脳組織のイメージング解析および遺伝子
発現の解析

医学

神経内科・老年学

林

祐 一

MD―

Fahr 病の遺伝子解析研究

大 沢 匡 毅MD―

各種ノックアウトマウスを作成し、色素幹細胞制御分子を
同定

竹 内

保

MD―

粘液癌形質と関係する TMEM の異常発現とそれにより影響を受ける分子経路メカニズムの検討

医学

生命機能分子設計

医学

免疫病理

工学

応用分子生物学横 川 隆 志EG―

タンパク質合成系に関わる因子の遺伝子解析とその遺伝子産物の機能解析工学

生体反応工学 喜多村 徳昭

EG―

創薬を指向した機能性オリゴ核酸の開発に関する研究

工学

生命情報工学 上 田浩

EG―目的遺伝子のシークエンスの依頼と遺伝子導入した細胞の形態観察をするためコンフォーカルレーザー顕微鏡を使用
するため

工学

生体物質工学 石 黒亮

EG―

蛋白質の高圧巻き戻り実験工学

生命情報工学 森 田 洋 子

EG―神経細胞の損傷および細胞死における神経栄養因子の働き

工学

機能材料工学 纐 纈

守EG―

フラボノイドを含む食品を経口投与したマウスの血漿中の代謝物解析またその定量工学

物質機能工学 岡夏 央

EG―

核酸類縁体の化学合成に関する研究において、合成した化合物の質量分析を行う

工学

生体物質工学 宮 地 秀 和EG―超分子ポルフィリンの自己組織化

応用生物科学 生産環境科学 百 町 満 朗

AG―

有用微生物を用いた植物病害の生物的防除

―

―

学

部

登録
人数

講 座 等

利用責任者

登録番号

生態環境学

岩 澤

淳

AG―

動物ホルモン等の遺伝子の解析ならびに関連タンパク質の定量

応用生物科学 生産環境科学 山 本 謙 也

AG―

動物卵成熟過程における細胞骨格の役割

応用生物科学 獣医微生物学 福 井 博 一AG―

キクの花芽分化に関連する遺伝子を解明する

応用生物科学 食品生命科学 矢 部 富 雄

AG―

食品成分の機能解析

応用生物科学 食品生命科学 中 村 浩 平

AG―

環境中原核生物の多様性解析、キシリトール高生産性 Aspergillus oryzae の遺伝子工学的創出、セルロース糖化液における高効率アルコール醗酵酵母のスクリーニングおよび遺伝子解析・生化学性状分析

応用生物科学 分子生命科学 中 川

応用生物科学研 究 テ ー マ寅AG―

レニン―アンギオテンシン系の生化学

応用生物科学 植物細胞工学 小 山 博 之AG―

低リン酸耐性植物の作出戦略

応用生物科学中 川 智 行AG―

ラットの腸内微生物層の解析 メチロトローフ酵母のメタ
ノール代謝制御に関する研究 出芽酵母のストレス応答機
構に関する研究 新規乳酸菌の分離と応用

応用生物科学 応用生命科学 岩 間 智 徳

AG―

細菌の走化性

応用生物科学 応用生命科学 長 岡AG―

食品成分による脂質代謝関連遺伝子発現の総合解析

食品科学

利

応用生物科学応用獣医学

鈴 木 正 嗣AG―

国内の野生動物におけるリケッチア保有状況の実態調査にむけた遺伝学的解析 タヌキ、イノシシなどの野生動物の疥癬罹患状況についての遺伝学的解析外来生物に対する避妊ワクチンの開発（遺伝学的研究）

応用生物科学獣医学

前 田 貞 俊AG―設計したプライマーによって目的の塩基配列が増幅されていることを確認する

応用生物科学 環境生態科学 土 田 浩 治

AG―

鱗翅目、膜翅目、その他の昆虫の DNA 解析

応用生物科学 食品生命科学 鈴 木 文 昭

AG―

哺乳動物由来組換え型タンパク質の定量法の確立と応用

応用生物科学 分子生命科学 光 永

徹AG―

植物ポリフェノールの構造解析に関する研究

応用生物科学

獣医解剖学

齋藤 正一郎AG―

脊椎動物脳における各種分子配列の解析

応用生物科学

獣医病理学

酒 井 洋 樹AG―

犬の血管肉腫の遺伝子発現解析

連合獣医学

臨床獣医学

深 田 恒 夫

AG―

犬子宮蓄膿症から分離される大腸菌の同定

応用生物科学 獣医微生物学 福 士 秀 人AG―ウマヘルペスの分子学的病原性機構の解析

応用生物科学獣医学

西 飯 直 仁AG―

動物の糖脂質代謝、自己抗体および MHC 遺伝子に関する研究

応用生物科学応用獣医学

石 黒 直 隆AG―

蛋白質の精製と泳動 プリオン蛋白質の生化学的性状の解析 核酸精製と分析 プリオン遺伝子の解析、各種動物由来遺伝子の構造解析

応用生物科学

応用獣医学

杉 山

誠

AG―

人獣共通感染症病原体の遺伝子解析

応用生物科学

獣医寄生虫病学

高 島 康 弘AG―

寄生虫感染による宿主への影響

連合農学

ゲノム微生物学

鈴 木

徹

AG―

ダイゼイン代謝細菌の遺伝学的解析 ビフィズス菌の遺伝学的解析

応用生物科学

獣医学

森

崇

AG―

microRNA の抗腫瘍効果について

応用生物科学 応用動物科学 松 村 秀 一

AG―

哺乳類・鳥類の遺伝的多型の研究

植物分子生理学山 本 義 治AG―

植物プロモーターの機能解析

応用生物科学 生物有機化学 柳 瀬 笑 子

AG―

植物由来成分の構造解析に関する研究

応用生物科学AG―

シバヤギの遺伝的多様性に関する研究

応用生物科学獣医学

高 須 正 規亮

AG―

ウズラのマイクロサテライト DNA マーカーの開発

神志那 弘明AG―

イヌの変性性脊髄症における変異型

応用生物科学 生産環境科学 松 村 秀 一

AG―

岐阜県下に生息する野生イノシシの遺伝的集団構造の解明

応用生物科学 生産環境科学 安 藤 正 規

AG―SSR マーカーを用いたニホンジカ地域集団の遺伝解析

応用生物科学 生物生産科学 只 野
応用生物科学

獣医学

均

AG―

酵母の高圧力耐性遺伝子の解析

連合創薬

医療情報学

桑 田 一 夫DM―

論理的創薬によるプリオン病やインフルエンザの治療薬開発

連合創薬

創薬科学

高 島 茂 雄DM―

microRNA の機能解析

連合創薬

医療情報学

丹 羽 雅 之DM―

好中球の活性酸素産生及び、炎症シグナルに関する研究

流域圏

植生資源研究部門

景 山 幸 二RY―

土壌微生物の分子分類および分子生態

応用生物科学 応用生命科学 岩 橋

―

―

学

部

講 座 等

登録番号

李

登録
人数

研 究 テ ー マ

富 生

RY―

微生物種によるセシウムの摂取量の相異に関する研究

情報メディア
情報メディア
篠 田 成 郎
開発研究部門IM―

森林内土壌微生物の生息数に及ぼす水文条件の影響に関す
る検討

生命科学

ゲノム研究分野須 賀 晴 久LS―

フザリウム菌のゲノム解析

生命科学

ゲノム研究分野

下 澤 伸 行LS―

遺伝性疾患の診断、病態解明、治療法の開発

生命科学

嫌気性菌研究分野

田中 香お里LS―

細菌ゲノムのシーケンス

生命科学

機器分析分野 犬 塚 俊 康

LS―

天然有機化合物の構造解析

生命科学

機器分析分野 鎌 足 雄 司

LS―タンパク質の立体構造および揺らぎの情報に基づいた創薬

流域圏

水質安全研究分野

利用責任者

―

―

ゲノム研究分野共同利用機器紹介⑴

識別結 果 を 見 や す く 表
示、 ＋／− ア ッ セ イ サ

DNA 関連機器〈― 〉（― ） マルチキャピラリー DNA シーケンサー
ABI Prism
Genetic Analyzer

ンプルを自動的に判定、本体前面からの簡単なプ
レートセッティング、

アプライドバイオシステム社
色蛍光標識を用いた
蛍光ジデオキシターミ

色フィルタホイールと、CCD カメラによる多色蛍光検出。

ネーター法及び 色蛍
光プライマー法による基準としたサンプルとのCT（Threshhold Cycle）
値の差を用いる相対定量

DNA の塩基配列を決定する装置。電気泳動
キャピラリを 本装

ABI PRISM

Real-time PCRの実験、自動解析が可能。発現定量・SNP タイピン
グ・細菌検査等幅広いアプリケーションに対応。

備。ポリマー充填、サ
ンプル注入、分離と検〈― 〉（― ） リアルタイム定量 PCRABI Step one plus

出、データ解析は全て
ABI
Genetic Analyzer
自動。GeneMapper により AFLP 解析、SNPs 解析にも対応。 ウェルある

アプライドバイオシステム社
色／ ウェルフォーマットで、精度の高い定量リア
ルタイム PCR を実現。FAMTM／SYBRⓇ Green、VICⓇ／JOETM、ROXTM、TAMRATM などの蛍光色素が検出でき、遺伝子発現解析、病原遺伝子の定量、SNP ジェ
ノタイピング、プラス／マイナス・アッセイなどの実験が出来る。従来の個体どうしの比較のみならず、集団間の比較を行うことが可能。

いは ウェルプレートを 枚セット可能。 . 時間で塩基× 試料の分析が可能、受託解析に使用。
台所有。本機で DNA シーケンスの受託解析も行って
いる。
〈
― 〉
（
― ） マルチキャピラリー DNA シーケンサー
ABI Prism
XL Genetic Analyzer
アプライドバイオシステム社
DNA の塩基配列決定やフラグメント解析に利用。
ジェネティックアナライザ同様、 本キャピラ
リーを搭載するが、新型ポリマーでより短時間で配列の決定が可能。

ABI Step one plus〈― 〉（― ） バイオアナライザ

ABI Prism

Bioanalyzer
アジレントテクノロジー社
通常、DNA 分析ではゲル電気泳動、タンパク質分析
では SDS­PAGE で得る結果を、専用チップを使用しGenetic Analyzer〈― 〉（― ） DNA 多型解析ソフトて短時間、簡単に得るための装置（最大 サンプルのジーンマッパーアプライドバイオシステム社

定性および定量のデジタル デ ー タ を 分 で 取 得 可能）。抽出した RNA の品質評価も可能。

DNA フラグメントのサイズコールからアレルコールを行うジェノタイピングソフトウェア。
〈― 〉（― ） リアルタイム定量 PCR
ABI PRISM
アプライドバイオシステム社
リアルタイム定量 PCR システムと専用試薬の組合せ
により、指数関数的な増幅領域での検出が可能。
Bioanalyzer

多色プローブによる検出に対応、PCR 増幅プロットのリアルタイムモニタリング、融解曲線分布、アレル

―

―

〈
― 〉
（
― ） ハイブリダイゼーションオーブン
GA

質転換、動植物細胞に DNA を導入に使用。

アジレントテクノロジー社
DNA マイクロアレイのハイブリダイゼーション〈― 〉（― ） 遺伝子導入装置
Neon Transfection System
Life Technologies - Invitrogen 社

ためのインキュベータ。
取り外 し 可 能 な ロ ー タ〈― 〉（― ） マルチビーズバイオアッセイ装置
Luminex

ラックを備え、回転速度とハイブリダイゼーショ
ン温度の設定が可能。最ミリポア社
少量（〜 µL）の試料をもとにマイクロビーズとフ

大 個のオリゴ DNA マ
イクロアレイ用ハイブリG

ローサイトメトリーを利用して最大 項目までサイトカインやリン酸化タンパク質などの定量測定ができる他、SNPs など DNA、microRNA の分析などにもA

ダイゼーションチャンバを固定可能。

利用可能。

〈
― 〉
（
― ） DNA マイクロアレイスキャナー（新）Array Scan
アジレントテクノロジー社
Cy 、Cy の二色法と単色法に対応する高機能スキャ
ナ。解像度が分析が可能。

µm でLuminex

K/枚などの高密度アレイの〈― 〉（― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置
CHEF-DRII
バイオラッド社
数百から数メガベース以上の DNA のシャープな分離が可能。クロモゾームマッピング、RFLP 分析、ジー
ンマッピング等に使用。
Array Scan〈― 〉（― ） マイクロアレイ用データ解析ソフトウェア
GeneSpring
トミーデジタルバイオロジー社
遺伝子発現アレイなどの数値解析、生物学的解析など、さまざまな機能を搭載したデータマイニングソフ
トウェア。遺伝子発現解析機能に加え、miRNA、Real-⑵ タンパク質・プロテオーム関連機器

TimePCR、CNV、SNP、Pathway 解析等も行う事が〈― 〉（― ） MALDI-TOF/TOF 質量分析装置可能。

Bruker Ultraflex
日本ブルカー・ダルトニクス社
MALDI-TOF に よ る 総 MS 解 析 と、MALDI-TOF／
TOF タンデム質量分析を用いた詳細な MS／MS 解析

CHEF-DRII

により、高い確度とハイスループットでタンパク質の同定が可能。総括的な MS／MS 情報が極微量の試料サ

GeneSpring

ンプルから数秒で得られる。 fmol 以下のペプチド
試料についてアミノ酸配列の決定が可能。

〈― 〉（― ） エレクトロポレーター
Gene Pulser II
バイオラッド社
エレクトロポレーションとは、電気パルスにより瞬間的 に 細 胞 に 穿 孔 しDNA 等の高分子を細胞に導入する方法。大腸菌をはじめとする細菌の形

MALDI-TOF / TOF
Bruker Ultraflex
Gene Pulser II

―

―

〈
― 〉
（
― ） 質量分析装置
UPLC-MS〈― 〉（― ） マルチラベルプレートリーダー
WallacDELFIA

日本ウォーターズ社
耐圧性に優れ、 液によるグラディエント分析が可パーキンエルマーライフサイエンス社
ユーロピウム（Eu）の持つ遅延蛍光特性を利用。パ

能。UV 検出器を備えている。ESI 法による質量分析が可能。

ルス状に励起光を当て、バックグラウンドの自家蛍光が消失した後に励起光を測定する装置。感度は RIAに匹敵。 穴マイクロプレートを使用。プレートワッ
シャーも装備。

WallacDELFIA

UPLC-MS⑶〈― 〉（― ） 冷却 CCD カメラ
Ez-キャプチャー AE-

光学系分析機器〈― 〉（― ） マルチ蛍光スキャナー
Typhoon

ATTO 社
冷却 CCD カメラを利用
し て 発 光 を 検 出 す る。
ウ ェ ス タ ン・サ ザ ン・
ノーザンブロットにおけるケミルミ検出などに利用可能。

アマシャムバイオサイエンス社
放射性同位体と蛍光、ケミルミネッセンスの つのス
キャンモードと、高い感度と解像度によるマイクロア
レイ解析、フラグメント解析や、二次元電気泳動解析
等に対応。

Ez-キャプチャー AE-〈― 〉（― ） 蛍光発光イメージングシステム
AEQUORIA
浜松ホトニクス社
超高感度冷却 CCD カメラにより組織レベルの蛍光・発光の検出が可能。
蛍光スキャナー Typhoon

〈
― 〉
（
― ）
、（ ） マルチラベルプレートリーダー
WallacARVOsx（ ）WallacARVO SX-DELFIA（ ）パーキンエルマーライフサイエンス社
ARVOsx は ウェルプレートをはじめ、様々プ
レートを用いて蛍光、発光、蛍光偏光をハイスループッ
トで測定可能。 、 、
ウェル標準プレート、

AEQUORIA〈― 〉（― ） 微量サンプル分光光度計、 、 、 ウェル培養プレートに対応。ARVOsxDELFIA は時間分解蛍光測定が可能。

NanoVue
GE ヘルスケアバイオサイエンス社
キュベットを使用せず、少量試料の測定が可能。
CyDye 標識、核酸濃度・純度、タンパク質濃度などの測定に使用。

WallacARVOsx（ ）WallacARVO SX-DELFIA（ ）NanoVue

―

―

〈
― 〉
（
― ）
分光光度計

⑸ バイオインフォマティクス関連機器

Ultrospecpro
GE ヘルスケアバイ〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master Platinum
アマシャムバイオサイエンス社
二次元電気泳動で分離されたタンパク質スポットパ

オサイエンス社
紫外から可視領域における試料の吸光度が測Ultrospec

ターン、等電点、分子量、ボリューム等を解析。ImageMaster D Elite、 D Database は 種類以上のゲルの比較解析からスポットの有無、増減の数値化やデー

pro

定 で き る 装 置。 µlの微量試料に対応。核酸やタンパク質の濃度測定などに利用。

⑷

タベース化をサポート。ゲル、ブロッティングメンブ
レンの画像はデスクトップスキャナー Image Scanner
またはバリアブルイメージアナライザー Typhoon な

顕微鏡

〈
― 〉
（
― ）
共焦点レーザースキャン

どの画像解析装置からは TIFF 形式の取り込みが可
能。

顕微鏡
LSM

主要機能
・スポット検知、バックグラウンド削除
・ 枚までの自動スポットマッチング

カールツァイス社
倒立型顕微鏡。光源に Ar（ nm）及 HeNe（ nm）
レーザーを搭載、ピンホー
ルの自動制御によりクリアな共焦点蛍光像が得 ら れる。細胞内におけるタンパ
ク質の局在等の解析に力を・マーカー／マーカースポットからの分子量・等電点
決定・マッチングスポットの量変化の表示
・インターネットデータベースの検索
・ D DIGE に対応
LSM発揮。また、焦点面を変化させながら Z 軸の連続画
像を取り込み、コンピュータ上で立体画像構築が可
能。
〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡
LSM
カールツァイス社、 、 、 、
nm の レ ー ザ ー
を 搭 載。タ イ ム シ
リ ー ズ、FRAP、
FRET の 他 に、スペクトルイメージン

Image Master Platinum〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master VDS
GE Healthcare Bioscience 社〈― 〉（― ） 蛋白質立体構造情報解析装置

グ（近接した蛍光の分離、スペクトルカーブの測定）も可能。

DSModeling
Accelrys 社
蛋白質・核酸の立体構造を 次元的に可視化する装置。ホモロジーモデリング法とモレキュラーダイナ

〈
― 〉
（
― ）

ミックス法により高分子の立体構造を予測するシステ

倒立型蛍光顕微鏡
Axiovert

ム。

LSM

カールツァイス社
〈
― 〉
（
― ）
正立型顕微鏡Axioscop
カールツァイス社〈― 〉（― ） 実体顕微鏡
Stemi＋

DSModeling

カールツァイス社
Axioscop

―

―

〈
― 〉
（
― ） プロテオミクス支援システム
MASCOT⑹ クロマトグラフィー・電気泳動関連機器

Matrix Science 社
タンパク質の遺伝子同定を支援するシステム。データ〈― 〉（― ） 高速液体クロマトグラフィー
HPLC（AKTA）

ベースをもとに仮想上のペプチド断片のセットを発生、MALDI-TOF によるペプチド MS フィンガープ
リンティングや TOF/TOF 解析 で 得 ら れ る 試 料 の

GE HealthcareBioscience 社
ポンプ、検出器、フラクションコレクターを内蔵した一体型の低圧クロマトグラフィーシステム。His-tag
タンパク質などの精製に利用できる。

データと照合することにより遺伝子を同定。

HPLC（AKTA）
MASCOT〈― 〉（― ） 等電点電気泳動システム
IPGphor + SE Ruby+Ettan Dalt〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム
ProteinLynx Global SERVER（PLGS）

アマシャムバイオサイエンス社
等電点電気泳動と SDS ポリアクリルアミドゲル電気泳動により、数千個のタンパク質を 次元で展開。

Waters 社
Waters Xevo QTof の精密質量データを基として、独自のフィルタリング機能や計算機能を用いて解析を行う、定量的および定性的プロテオミクス研究の MS イ
ンフォマティクスプラットフォームである。

IPGphor + SE

⑺

Ruby

遠心分離機

〈
― 〉
（
― ）
超遠心分離機Optima L- K
ベックマンコールター

ProteinLynx Global SERVER（PLGS）〈― 〉（― ） 分子間ネットワ ー ク／パ ス ウ ェ イ 解 析社

データベース
IPA
トミーデジタルバイオロジー社
マイクロアレイやメタボロミクス、プロテオミクス、

最高 krpm。 ml×本の超遠心分離が可能。

RNA-Seq などの実験より得られたデータをもとにして生物学的な機能の解釈やパスウェイ解析を行うことができるソフトウェア。豊富な相互作用情報や分子情報がデータベース化されているため、分子生物学の辞書としても使用可能。

Optima L- K〈― 〉（
― ） 微量超遠心分離機
Optima TL
ベックマンコールター社
最高 krpm。微量試料 ．ml× 本 の 超 遠
心分離が可能。

IPA

Optima TL

―

―

⑻

〈
― 〉
（
― ） マルチビーズショッカー
MB GU（S）
安井器機株式会社

培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振盪培養機
TA- R-FF

試料をガラスビーズやメタルコーンと共に撹拌することで破高崎科学器械
本のml フラ砕。試料間のクロスコン タ ミ
ネーションや RNase の混入を防止。酵母、バクテリア、カビ、

スコを往復または
旋回で振盪。温度
範囲： ℃〜 ℃。

固い動物組織、植物組織を数十秒〜数分で破砕。

振盪スピード：〜 rpm。

マルチビーズショッカー

〈
― 〉
（
― ）
凍結プレス破砕装置
MBCP-

上：往復振盪専用
下：旋回振盪専用

マイクロテック・ニチオン社
液体窒素で凍結させた試料を、ス
テンレスチャンバーに入れ、圧搾

〈
― 〉
（
― ）
ジャーファーメンター
MBFME
EYELA 社
大腸菌などの微生物を大量培
養 に 使 用。ジ ャ ー 容 量：
L。一度に最大 L の培養が可能。

空気により駆動されたハンマーで衝撃をあたえることで破砕。骨組
織や、木質等も破砕が可能。
クライオプレス CP-

MBF-

〈
― 〉
（
― ） ストマッカー
Stmacher Circulator
Seward 社
ポリエチレンの袋にサンプルを入れ、圧縮をくり返す
ことで温和な条件で組織をホモゲナイズ。食品中の微生物検査等に使用。

ME

〈
― 〉
（
― ） フレンチプレス型
大岳製作所
大岳手動式プレス型の仕様変
更により、嫌気条件下での細胞破砕を可能にした装置。従来通りの使用も可能。 ml の標準セル（〜， kgf／cm ≒ ， psi）とml の高圧対応セル（耐圧未定おそらく ，kgf ／ cm

GU（S）
クライオプレス

ストマッカー≒ ，psi）
で、酵母の粉砕等に使用。

フレンチプレス

〈
― 〉
（
― ）

〈
― 〉
（
― ） 密閉型超音波破砕機
Biorupter
コスモバイオ社

ポリトロンホモゲナイザー
PTKinematica 社
ドライブシャフトの先端にある回転密閉式で複数試料の同刃を高速で回転させることで生じる

時超音波処理が可能。
ml 用スピッ ツ な ら
最大 本、 ．ml マイ
クロチューブなら

水流と、キャビテーションによる超音波で試料を破砕。動物や植物の組織からの RNA 抽出等に使用。
ポリトロン
ホモゲナイザー本、 ml チ ュ ー ブ なら 本。マ ル チ タ イ
マーにより破砕時間のセットが可能。
Biorupter

―

―

〈
― 〉
（
― ） 電動ミンサー
MS B
南常鉄工社
精肉店等で使われているものと同じ電動ミンチ。
牛、豚等の大量の組織からの抽出作業に威力を発揮。AC働。

V で稼
電動ミンサー〈― 〉（― ）DNA 擅断装置
Hydroshear
ジーンマシーンズ社µm 程度のオリフィスを通過させる際に発生する物
理的擅断力により DNA 等の高分子を切断。ランダムな切断が起きることから、
ショットガンライブラリーの作成等に有効。

Hydroshear――

利用の手引き（平成 年 月 日改訂）
⑴ 利用登録① 生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野（以下「ゲノム研究分野」という。
）の共同利用機器・実験室等を利用する者は、利用責任者と経費負担責任者を明記した利用登録申請書を提出するものとする。
② 利用登録申請の方法については、ゲノム研究分野のホームページ内「利用登録申請」の項（http://www ．
gifu-u.ac.jp/˜lsrc/dgr/touroku／）を参照するものとする。
⑵ 共同利用機器① 共同利用機器の内容及び利用料は、別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとする。
② 利用者の資格利用できる者は、利用登録申請書を提出し、センター長の許可を得た者のうち、装置の説明会に参加した者、装置の操作に習熟した者及び装置の操作に習熟した者の下で利用する者とする。
③ 利用の手続き
利用する場合は、生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野（以下「ゲノム研究分野」という。
）のホームページ（http://www ．
gifu-u.ac.jp/˜lsrc/dgr/）にて機器予約の手続きを行うものとする。
ただし、DNA シーケンサ／
は、電話（昼休み ： 〜 ： を除く ： 〜 ：の間）にて利用の手続きを行うものとする。
予約は ヶ月先までを限度とし、 回分の予約は原則として 時間以内とする。同一グルー
プの連日予約は原則 日までとし、更に連日の使用を希望する場合はゲノム研究分野に相談することとする。
④ 機器不調の報告
機器に不調がある場合は、直ちに管理室に連絡すること。不調のまま使用してはならない。
⑤ 機器の損傷
利用者の不注意によって機器を損傷したり、不調にした場合の修理費は経費負担責任者が負うものとする。
⑥ 機器の利用記録
使用記録簿が設置されている機器を利用した場合は、その都度必要事項を記入しなければならない。
⑶ 実験室等の利用① 利用手続き
植物用グロースキャビネット、実験台、実習室、研修セミナー室、P レベル実験室、植物
栽培室、P 温室を利用しようとする場合は、それぞれ利用申込書（別紙様式第 号〜第号）により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/˜lsrc/dgr/dl／）② 利用料
別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとする。
③ 利用終了、中止の際の原状復帰
利用者は、教育・研究を終了または中止したときは、速やかに実験室等を原状に復帰し、管理室に報告してゲノム研究分野の行う利用終了確認を受けなければならない。
④ ゲノム研究分野内の禁煙と飲食ゲノム研究分野内は禁煙とし、飲食は所定の場所で行うこととする。

――

⑷ 機器の運搬① 機器の搬入利用者がゲノム研究分野に持ち込む機器は必要最小限の小型機器とし、大型機器を搬入してはならない。小型機器を搬入する場合は小型機器搬入申込書（別紙様式第 号）により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/˜lsrc/dgr/dl／）② 搬入した小型機器の所属表示、維持・管理
搬入した小型機器には利用責任者の氏名、連絡先を明記することとし、その維持・管理は、利用責任者が行うものとする。
③ 搬入した小型機器の搬出搬入した小型機器の承認期間が満了したときは速やかに搬出するものとする。
④ 機器の搬出・貸出
利用者がゲノム研究分野所有の機器の搬出・貸出を希望する場合は、当分野に相談の上、申請書を作成するものとする。
⑸ 時間外の利用
ゲノム研究分野の定められた利用時間外に本分野を使用する者は、時間外利用願いを提出しなけ
ればならない。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/˜lsrc/dgr/dl／）⑹ ゲノム研究棟出入りの方法
ゲノム研究棟及びゲノム研究棟 RI 実験室への出入りは、利用登録申請書を提出し認証登録を完了した職員証カード、学生証カード、または Felica 式施設利用証を使用するものとする。
⑺ 利用料負担額
利用料は経費負担責任者が負うものとする。料金は別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとし、運営費交付金、寄付金、受託研究費、科学研究費補助金の振替により行う。
⑻ 緊急事態発生の際の措置
緊急事態が発生した場合、各部屋に表示してある緊急避難経路、ガスの元栓の場所、電源の場所を参照して適切に対処すること。
⑼ 利用上の問題点の処理
利用者がゲノム研究分野を利用する上で、不便に感ずることなど問題が生じた場合は、ゲノム研
究分野の専任教員を通じてセンター長に申し出ることとする。センター長は、必要に応じて運営委
員会で審議の上、改善を図るものとする。
⑽ 業績の提出について
次年度に利用を継続する利用責任者は、利用登録申請書に従って、前年分（ 〜 月）の業績（論文・著書）を提出するものとする。次年度に利用を継続しない場合は、当該年度の業績（論文・著書）を提出するものとする。

――

別紙 ゲノム研究分野利用料金表
事

平成 年 月改訂
項

料金

備考， 円／人・年

年度毎の更新 ／ 〜 ／

．登録料
（ ）

登録料

．共同利用機器料金表 ※n―
〈n〉
（
― n）
は管理番号
DNA 関連機器
〈
― 〉
（
― ）
、
（ ） DNA シーケンサー、（No．〜 ）（反応済）

〈
― 〉
（
― ）
、
（ ） DNA シーケンサー、（No．〜 ）（反応前） 別紙参照

円／サンプル〈― 〉（― ） DNA 多型解析ソフトジーンマッパー

――

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI PRISM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI Step one plus

円／使用

〈
― 〉
（
― ） Agilent〈― 〉（― ） Agilent G

バイオアナライザ――

A ハイブリダイゼーションオーブン〈― 〉（― ） Agilent DNA マイクロアレイスキャナ（新）〈― 〉（― ） マイクロアレイ用データ解析ソフトウェア GeneSpring， 円／使用， 円／スキャン
――

〈
― 〉
（
― ） 遺伝子導入装置 Neon Transfection system

――

〈
― 〉
（
― ） マルチビーズバイオアッセイ装置 Luminex

円／使用

〈
― 〉
（
― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置 CHEF―DRII

円／泳動

利用は要相談タンパク質・プロテオーム関連機器〈― 〉（― ） 質量分析装置 MALDI―TOF/TOF， 円／時間〈― 〉（― ） 質量分析装置 UPLC―MS， 円／使用光学系分析機器〈― 〉（― ） マルチ蛍光スキャナ Typhoon

円／使用

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac〈― 〉（― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac

ARVO SX

円／時間

ARVO SX―DELFIA

円／時間

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac

DELFIA――〈― 〉（― ） 冷却 CCD カメラ Ez―キャプチャー AE―

円／時間

〈
― 〉
（
― ） 蛍光発光イメージングシステム AEQUORIA

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 微量サンプル分光光度計 NanoVue

――

〈
― 〉
（
― ） 分光光度計 Ultrospec

――

pro

利用は要相談顕微鏡〈― 〉（― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM， 円／使用〈― 〉（― ） 倒立型蛍光顕微鏡 Axiovert

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 正立顕微鏡 Axioscop

――

〈
― 〉
（
― ） 実体顕微鏡 Stemi――

バイオインフォマティクス関連機器〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master D Platinum， 円／使用〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master VDS

――

〈
― 〉
（
― ） タンパク質立体構造情報解析装置 DSModeling， 円／年＊ ， 円／使用〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム MASCOT

――

〈
― 〉
（
― ） プロテオミクス支援システム ProteinLynx Global SERVER

――

〈
― 〉
（
― ） 分子間ネットワーク／パスウェイ解析データベース IPA――

クロマトグラフィー・電気泳動関連機器〈― 〉（― ） 高速液体クロマトグラフィー HPLC（AKTA）

， 円／日

〈
― 〉
（
― ） 等電点電気泳動システム IPGphor+SE， 円／使用Ruby+Ettan Dalt

遠心分離機
〈
― 〉
（
― ） 超遠心分離機 Optima L― K

， 円／時間〈― 〉（― ） 微量超遠心分離機 Optima TL， 円／時間――＊専用パスワードを使用する場合

培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振とう培養器 TA― R―FF

――

〈
― 〉
（
― ） ジャーファーメンター MBF―〈― 〉（― ） フレンチプレス

ME

――

型

――

〈
― 〉
（
― ） 密閉型超音波破砕機 Biorupter〈― 〉（― ） マルチビーズショッカー MB

――
GU（S）

――

〈
― 〉
（
― ） 凍結プレス破砕装置クライオプレス CP―

――

〈
― 〉
（
― ） ストマッカー Stomacher――

Circulator〈― 〉（― ） ポリトロンホモゲナイザー PT―

――

〈
― 〉
（
― ） 電動ミンサー MS B

――

〈
― 〉
（
― ） DNA 擅断装置 Hydroshear――．
実験室・実験台（ ）動物遺伝子実験室（
央実験台半分））実験台（ スペース分：中（ ） P レベル実験室

， 円／月
， 円／週

（ ） 植物用グロースキャビネット コイトトロン（

）

， 円／月

（ ） 植物栽培室， 円／月（ ） P 温室， 円／月（ ） 研修セミナー室

円／時間

学外対象

円／使用

土日祝日他当分野が定める休館日．
時間外利用料金（ ） 時間外利用料金――

平成 年度活動状況報告⑴

講習会・トレーニングコース・講演会等◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ： 、 ： 〜 ： 、日（水） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［共焦点レーザー顕微鏡 Carl Zeiss LSM

］

参加者 名

◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［リアルタイム定量 PCR StepOnePlus］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［マルチビーズバイオアッセイ装置 Luminex］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：中学生のための生命科学体験プログラム「君にもできる DNA 鑑定」

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ： 、 日（金） ： 〜 ：高校生のための生命科学体験プログラム「ゲノムって何？」

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［リアルタイム定量 PCR StepOnePlus］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［プロテオミクス支援システム Mascot］

参加者 名◆平成 年 月 日（水） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［質量分析装置 Waters UPLC/MS Xevo Qtof］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［マイクロアレイデータ解析ソフトウェア GeneSpring］

参加者 名

―

―

⑵

ゲノム研究分野利用状況

H 年度

H 年度

DNA シーケンス

H 年度

／

利用登録数

H 年度

リアルタイム定量 PCR 及び StepOne Plus 利用推移

XL（反応前）利用推移

H 年度

DNA シーケンス

H 年度

質量分析装置 TOF/TOF 利用推移

―

―

／

XL（反応済）利用推移

質量分析装置 UPLC/MS

利用推移

H 年度

⑶

マルチ蛍光スキャナ Typhoon

H 年度

利用推移

及び

利用推移

共同スペース利用状況
室名（室番号）

利用責任者（登録番号）

動物遺伝子実験室（ ）（平成 年 月まで）
植物栽培室（ ）植物栽培室（ ）植物用グロースキャビネット
P 温室
F 実験室

⑷

共焦点レーザー顕微鏡 LSM

福井
小山
百町
須賀
百町
光永

博一（AG―
博之（AG―
満朗（AG―
晴久（LS―
満朗（AG―
徹（AG―

）
）
）
）
）
）

平成 年度業績論文等

ED―［ ］ Kiso, S., Miyake, T., Yamahira, K.（）.“Heritability and genetic correlation of abdominal andcaudal vertebral numbers in latitudinal populations of the medaka Oryzias latipes.” Environmental Biology of Fishes ： ― ．
RS―［ ］ 梅村啓太郎、二村凌、高木雅紀、池谷幸樹、向井貴彦（）
。 岐阜県産シロヒレタビラにおける外来ミトコンドリア DNA の分布。
” 日本生物地理学会会報 ： ― 。
［ ］ 向井貴彦、平嶋健太郎、古橋芽、古田莉奈、淀太我、中西尚文（）
。 三重県鈴鹿市南部のため池群におけるヨシノボリ類の分布と種間交雑。
” 日本生物地理学会会報 ： ― 。
MD―［ ］ Kuno, T., Tsukamoto, T., Hara, A., Tanaka, T.（）. “Cancer chemoprevention through theinduction of apoptosis by natural compounds.” Journal of Biophysical Chemistry （ ）
： ―
．
MD―
［ ］ Li, S., Hayakawa-Yano, Y., Itoh, M., Ueda, M., Ohta, K., Suzuki, Y., Mizuno, A., Ohta, E., Hida, Y.,
Wang, M., Nakagawa, T.（）. “Olfaxin as a novel Prune isoform predominantly expressedin olfactory system.”
： ― ．
MD―
［ ］ Aoki, H., Hara, A., Era, T., Kunisada, T., Yamada, Y. （）. “Genetic ablation of Rest leads to in
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［ ］ Takamatsu, M., Aoki, H., Hirose, Y., Kobayashi, K., Tomita, H., Kuno, T., Koumura, H., Hara, A.
（）. “Teratoma showing the features of retinal structure: A case of sacrococcygeal tera――toma.” Oncol Lett （ ）
：

―

．

MD―
［ ］ Kawamata, T.Lu Jun, S. T., Tanaka Masafumi, Nagaoka Hitoshi, Agata Yasutoshi, Toyoshima
Takae, Yokoyama Kazuaki, Oyaizu Naoki, Nakamura Naoya, Ando Kiyoshi, Tojo Arinobu, Kotani Ai（）. “Imatinib mesylate directly impairs class switch recombination through down― ．
regulation of AID: its potential efficacy as an AID suppressor.” Blood （ ）：EG―［ ］ Maruyama, H., Yoshimura, S. H., Ohno, S., Nishikawa, K., Nakayama, Y.（）. “Covalent attachment of a specific site of a protein molecule on a carbon nanotube tip.” J. Appl. Phys．
（）．
［ ］ Yoshimura, S., Khan, S., Ohno, S., Yokogawa, T., Nishikawa, K., Hosoya, T., Maruyama, H.,
Nakayama, Y., Takeyasu, K.（）. “Site-Specific Attachment of a Protein to a Carbon Nano―．
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．
tions
：
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：
― ．
EG―
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EG―［ ］ Toyoda, Y., Koketsu, M.（）. “Synthesis and Z/E isomerization of -imino- , -thiaselenolanes―．
via iodocyclization.” Tetrahedron （ ）：［ ］ Adfa, M., Hattori, Y., Yoshimura, T., Koketsu, M.（）. “Antitermite activity of ―alkoxycoumarins and related analogs against Coptotermes formosanus Shiraki.” International Biodeterioration & Biodegradation ： ― ．
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［ ］ Seki, N., Toh, U., Kawaguchi, K., Ninomiya, M., Koketsu, M., Watanabe, K., Aoki, M., Fujii, T.,
Nakamura, A., Akagi, Y., Kusukawa, J., Kage, M., Shirouzu, K., Yamana, H.（）.“Tricin inhibits proliferation of human hepatic stellate cells in vitro by blocking tyrosine phosphorylation of―．
PDGF receptor and its signaling pathways.” Journal of Cellular Biochemistry ：EG―［ ］ Oka, N., Takayama, Y., Ando, K., Wada, T.（）. “Synthesis of nucleoside -boranophosphorothioate derivatives using an H-boranophosphonate monoester as a precursor. ” Bioorganic &―．
Medicinal Chemistry Letters ：［ ］ Oka, N., Ito, K., Tomita, F., Ando, K.（）. “Synthesis of -Pyridylphosphinate and Thiophosphinate Derivatives by Nucleophilic Aromatic Substitution of N-Methoxypyridinium To―．
sylates.” The Chemical Society of Japan （ ）：AG―［ ］ Yoshioka, Y., Ichikawa, H., Naznin, H. A., Kogure, A., Hyakucachi, M.（）. “Systemic resistance induced in Arabidopsis thaliana by Trichoderma asperellum SKT- , a microbial pesticideof seedborne diseases of rice.” Pest Manag Sci ： ― ．
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resistance againstbyGP ― inand tobacco.” Plant Pathology ： ― ．
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。 菊の花芽分化を抑える二波長 LED ランプの開発。 農業電化 ： ― 。
［ ］ 庄得鳳、李蓮花、立松翼、長岡史祥、景山幸二、福井博一（）
。 ノイバラ
（Rosa multiflora）の根に含まれるフェノール化合物のバラ根腐病抵抗性活性。 園芸学研究 ： ― 。
［ ］ 小笠原利恵、住吉稔、川原勇太、加藤淳太郎、福井博一（）
。 コルヒチン処理・茎頂成長
点培養併用法によるスパティフィラム（Spathiphyllum wallisii Regel ʻMerryʼ）の四倍性個体の誘導。 園芸学研究 ： ― 。
AG―［ ］ Matsuoka, T., Kawashima, T., Nakamura, T., Kanamaru, Y., Yabe, T.（）.“solation and characterization of proteases that hydrolyze royal jelly proteins from queen bee larvae of the honeybee, Apis mellifera.” Apidologie （ ）： ― ．
［ ］ Shiokawa, M., Kanamaru, Y., Yabe, T., Aoki, T.（）. “Effect of lactose crystallization on thechange in the viscosity of concentrated skim milk at low temperature.” Milchwissenschaft． ：
― ．
―

―

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［ ］ 矢部富雄（）
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［ ］ 矢部富雄（）
。 ファージディスプレイ法を用いた硫酸化糖鎖特異的認識ペプチドの創出。
生化学 （ ）： ― 。
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AG―［ ］ 三竹由佳子、森崇、星野有希、伊藤祐典、前田貞俊、村井厚子、酒井洋樹、丸尾幸嗣（）
。
外科摘出を実施した巨大肥厚性胃炎の犬の 例。 日獣会誌 ： ― 。
AG―［ ］ Ohmori, Y., Atoji, Y., Saito, S., Ueno, H., Inoshima, Y.Ishiguro, N.（）.“Differences in extrinsic
innervation patterns of the small intestine in the cattle and sheep.” Auton. Neurosci． ： ―．
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Arai, Y., Suzuki, F., Sago, H., Ichihara, A.（）. “Soluble（pro）renin receptor and blood pres―．
sure during pregnancy: a prospective cohort study．” Hypertension．（ ）：［ ］ Fukuda, M., Kuga, K., Miyazaki, A., Suzuki, T., Tasei, K., Aita, T., Mase, M., Sugiyama, M., Tsunemitsu, H.（）. “Development and application of one-step multiplex reverse transcription―
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AG―
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外科摘出を実施した巨大肥厚性胃炎の犬の 例。 日獣会誌 ： ― 。
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H. K., Kuwata, K., Shimizu, K., Suzuki, M., Aida, Y.（）. “Identification of a novel compoundwith antiviral activity against influenza A virus depending on PA subunit of viral RNA polymerase．
” Microbes and Infection （ ）： ― ．
［ ］ 桑田一夫（）
。 量子創薬―論理的 形 態 制 御 学 の 原 理―（Non-commutative Geometrical
Drug Discovery―The Principle of Geometrical Regulation―）。 YAKUGAKU ZASSHI
（ ）
： ― 。
［ ］ 桑田一夫（）
。 寄稿「数式から物質へ、言語から現実へ」。「杉田玄白賞」のあゆみ〜第回から第 回までの記録〜： 。
DM―［ ］ Ito, T., Endo, H., Shinohara, H., Oyama, M., Akao, Y., Iinuma, M.（）.“Occurrence of stilbene―．
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” Fitoterapia （ ）：［ ］ Itoh, T., Ando, M., Tsukamasa, Y., Akao, Y.（）. “Expression of BMP- and Ets in BMP- stimulated mouse pre-osteoblast differentiation is regulated by microRNA- ．
” FEBS Lett
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LS―
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sp. nov., a novel exotic azuki bean root-rot pathogen in Hokkaido, Japan.” Mycologia―．
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GPI anchors in peroxisomal disorders, Zellweger syndrome and rhizomelic chondrodysplasia
punctata.” J Lipid Res ： ― ．
［ ］ Mizumoto, H., Akashi, R., Hikita, N., Kumakura, A., Yoshida, Y., Honda, A., Shimozawa, N., Hata,
D.（）. “Mild case of D-bifunctional protein deficiency associated with novel gene mutations.” Pediatr Int （ ）： ― ．
［ ］ Iwasa, M., Yamagata, T., Mizuguchi, M., Itoh, M., Matsumoto, A., Hironaka, M., Honda, A., Momoi, M., Shimozawa, N.（）. “Contiguous ABCD DXS
E deletion syndrome: Report ofan autopsy case.” Neuropathology.
［ ］ Matsui, S., Funahashi, M., Honda, A., Shimozawa, N.（）.“Newly identified milder phenotype
of peroxisome biogenesis disorder caused by mutated PEX gene.” Brain Dev.
LS―）. “Recent insights into［ ］ Uemura, D., Han, C., Hanif, N., Inuzuka, T., Maru, N., Arimoto, H.（―．
natural venoms.” Pure and Applied Chemistry （ ）：）. “Amdigenol A, a long carbon［ ］ Inuzuka, T., Yamamoto, Y., Yamada, K., Uemura, D.（backbone polyol compound, produced by the marine dinoflagellate Amphidinium sp.” Tetrahedron Letters （ ）
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LS―
）.
［ ］ Hamaguchi, a., Takashima, S., Okamoto, A., Imaoka, M., Okumura, T., Murakami, R.（“Dorsoventral patterning of the Drosophila hindgut is determined by interaction of genes under
the control of two independent gene regulatory systems, the dorsal and terminal systems. ”
Mechanisms of Development： ― ．
）. “Genetic control of intestinal stem cell specification and［ ］ Takashima, S., Hartenstein, V.（development: a comparative view.” Stem Cell Reviews and Reports ： ― ．

⑸

ゲノム研究分野教員の教育研究活動等① 教育活動大学院連合創薬医療情報研究科（下澤）
代謝病態制御学特論
医学部（下澤）テュトーリアル「成育」コース小児病態学「遺伝性小児神経筋疾患」 時間
学外での講義国立大学法人島根大学医学部「成長発達」講義（下澤）「ペルオキシソーム病と神経疾患」 時間 出雲、． ．
大学院連合農学研究科（須賀）副指導教員
大学院応用生物科学研究科（須賀）分子植物病原学特論 単位
主指導教員
副指導教員
応用生物科学部（須賀）応用植物科学実験実習 I 単位 人で分担
微生物学 単位人で分担（ 回講義分）
卒業研究
単位
―

―

② 研究活動〈学術論文〉（和文著書）
なし（英文原著）Noriyuki Kanzawa, Nobuyuki Shimozawa, Ronald J. A. Wanders, Kazutaka Ikeda, Yoshiko Murakami, Hans R. Waterham, Satoru Mukai, Morihisa Fujita, Yusuke, Maeda, Ryo Taguchi, Yukio
Fujiki, and Taroh Kinoshita. Defective lipid remodeling of GPI anchors in peroxisomal disorders,
Zellweger syndrome and rhizomelic chondrodysplasia punctata. J Lipid Res ： ― ， ．
Mizumoto H, Akashi R, Hikita N, Kumakura A, Yoshida Y, Honda A, Shimozawa N, Hata D. Mildcase of D-bifunctional protein deficiency associated with novel gene mutations. Pediatr Int（ ）： ― ， ．
Iwasa M, Yamagata T, Mizuguchi M, Itoh M, Matsumoto A, Hironaka M, Honda A, Momoi MY, Shimozawa N. Contiguous ABCD DXS
E deletion syndrome: Report of an autopsy case. Neuropathology. Epub
Sep ．
Shuji Matsui, Masuko Funahashi, Ayako Honda, Nobuyuki Shimozawa. Newly identified milder phenotype of peroxisome biogenesis disorder caused by mutated PEX gene. Brain Dev. Epub
Dec ．
Masashi Morita, Junpei Kobayashi, Kozue Yamazaki, Kosuke Kawaguchi, Ayako Honda, Kenji
Sugai, Nobuyuki Shimozawa, Reiji Koide, Tsuneo Imanaka. A novel double mutation in the ABCD
gene in a patient with X-linked adrenoleukodystrophy: Analysis of the stability and function of
the mutant ABCD protein. J Inher Metab Dis Reports. Epub
Feb ．
Yumi Mizuno, Yuichi Ninomiya, Yutaka Nakachi, Mioko Iseki, Hiroyasu Iwasa, Masumi Akita, Tohru Tsukui, Nobuyuki Shimozawa, Chizuru Ito, Kiyotaka Toshimori, Megumi Nishimukai, Hiroshi
Hara, Ryouta Maeba, Tomoki Okazaki, Ali Nasser, Ali Alodaib, Mohammed Al Amoudi, Minnie
Jacob, Fowzan S. Alkuraya, Yasushi Horai, Mitsuhiro Watanabe, Hiromi Motegi, Shigeharu
Wakana, Tetsuo Noda, Igor V. Kurochkin, Yosuke Mizuno, Christian Schönbach, Yasushi Okazaki.
Tysnd deficiency in mice interferes with the peroxisomal localization of PTS enzymes, causing
lipid metabolic abnormalities and male infertility. PLOS Genetics. Epub
Feb ．
Aoki Takayuki, Tanaka Fumio, Suga Haruhisa, Hyakumachi Mitsuro, Scandiani María Mercedes, Oʼ
Donnell Kerry. Fusarium azukicola sp. nov., a novel exotic azuki bean root-rot pathogen in Hok． ／ ―kaido, Japan. Mycologia． ， ―Hashimoto Yasushi, Fukukawa Satoru, Kunishi Ayako, Suga Haruhisa, Richard Franck, Sauve
Mathieu, Selosse Marc-André. Mycoheterotrophic germination of Pyrola asarifolia dust seeds reveals convergences with germination in orchids. New Phytol． ， ― ． ／Takashi Hamaguchi, Shigeo Takashima, Aiko Okamoto, Misa Imaoka, Takashi Okumura and Ryutaro Murakami. Dorsoventral patterning of the Drosophila hindgut is determined by interaction ofgenes under the control of two independent gene regulatory systems, the dorsal and terminal systems. Mechanisms of Development． ， ― ．
（英文総説）
Shigeo Takashima and Volker Hartenstein. Genetic control of intestinal stem cell specification anddevelopment: a comparative view. Stem Cell Reviews and Reports. ， ― ．
（和文原著）なし（和文総説）．下澤伸行
ペルオキシソーム病（Zellweger 症候群、原発性高シュウ酸尿症 型）――

別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 腎臓症候群（第 版） ― ．
日本臨床社、東京、
年．
．鈴木康之、下澤伸行
副腎白質ジストロフィーの造血幹細胞移植法
年．
Annual Review 神経、 ― 、中外医学社、東京、．下澤伸行
副腎白質ジストロフィー
今日の小児治療指針 第 版 大関武彦、古川 漸、横田俊一郎、水口 雅編．
医学書院、東京、
年．
pp ―
．下澤伸行
ペルオキシソーム病（副腎白質ジストロフィー）
最新ガイドライン準拠 小児科 診断・治療指針
年．
pp ― 、中山書店、東京、．下澤伸行
ペルオキシソーム代謝異常症
年．
内分泌・糖尿病・代謝内科 （ ） ― 、．下澤伸行
ペルオキシソーム病
Brain Medical （ ） ― 、
年．
．下澤伸行
ペルオキシソーム病：概論
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
ツェルウェガー（Zellweger）症候群
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
新生児型副腎白質ジストロフィー
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
乳児型レフサム病
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
Rhizomelic chondrodysplasia punctata（RCDP）type
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
副腎白質ジストロフィー
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
アシル CoA オキシダーゼ（AOX）欠損症
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第 版）下年．
pp ― 、日本臨床社、東京、――

．下澤伸行二頭酵素（D-bifunctional protein: DBP）欠損症
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
Rhizomelic chondrodysplasia punctata（RCDP）type ，RCDP type
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第年．
pp ― 、日本臨床社、東京、
．下澤伸行
レフサム病
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
アカタラセミア
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第年．
pp ― 、日本臨床社、東京、．下澤伸行
新たに分類されたペルオキシソーム病
別冊日本臨床 新領域別症候群シリーズ No 先天代謝異常症候群（第pp ― 、日本臨床社、東京、
年．
．下澤伸行
副腎白質ジストロフィーの診療アップデート―、
年．
小児内科 （ ）．下澤伸行
ペルオキシソーム病年．
小児科診療 （ ） ― 、．下澤伸行
Zellweger spectrum年．
先天代謝異常ハンドブック pp ― 、中山書店、東京、．下澤伸行
rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type
年．
先天代謝異常ハンドブック pp ― 、中山書店、東京、．下澤伸行
副腎白質ジストロフィー年．
先天代謝異常ハンドブック pp ― 、中山書店、東京、．下澤伸行
ペルオキシソーム β 酸化酵素欠損症
年．
先天代謝異常ハンドブック pp ― 、中山書店、東京、．下澤伸行
Refsum 病、rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type ・年．
先天代謝異常ハンドブック pp ― 、中山書店、東京、

版）下

版）下

版）下

版）下

版）下

〈学会発表〉（国内）．下澤伸行．副腎白質ジストロフィー 診断・治療の update
シンポジウム「神経障害をきたす先天代謝異常症 診断・治療の update」
第 回日本小児神経学会、札幌、 月――

．下澤伸行．ペルオキシソーム代謝異常症
第 回小児神経学セミナー、湘南国際村センター（葉山町）、 月、．下澤伸行．序、早期診断・早期介入への現状と診療指針
シンポジウム「副腎白質ジストロフィー診療の現状と提案―診療ガイドラインの作成に向けて」
第 回日本先天代謝異常学会、第 回アジア先天代謝異常学会、岐阜、 月．イチゴ育苗ほの萎黄病菌による土壌汚染を防ぐために有効な消毒剤 平山喜彦、浅野峻介、玉田勝也、須賀晴久、日本植物病理学会、岐阜（岐阜大学）、／．高温性 Pythium 属菌、P. aphanidermatum、P. helicoides、P. myriotylum、のリアルタイム PCRによる定量検出。石黒 泰、李 明珠、大坪佳代子、須賀晴久、景山幸二、日本植物病理学会岐阜（岐阜大学）、／．イプコナゾールの実用化後に分離されたイネばか苗病菌の感受性。竪石秀明、須賀晴久、佐久間
米子、最勝寺俊英、日本植物病理学会、岐阜（岐阜大学）、／．Fusarium fujikuroi に見出されたイネばか苗病を起こさない系統。須賀晴久、船坂美佳、深澤恵
海、新井満大、清水将文、景山幸二、百町満朗、日本植物病理学会、岐阜（岐阜大学）、／．Fusarium fujikuroi に見られるフモニシン非産生株のフモニシン産生遺伝子クラスター領域の構造。山口竜央、スコット暁子、景山幸二、百町満朗、須賀晴久、第 回日本マイコトキシン学会
学術講演会、東京（東京家政大学）、／．Fusarium fujikuroi におけるフモニシン非産生の原因マッピング。須賀晴久、北嶋美葉、スコッ
ト暁子、船坂美佳、景山幸二、百町満朗、日本植物病理学会関西部会、鳥取（とりぎん文化会館）、／．Phytophthora nicotianae お よ び Phytophthora ncactorm の マ ル チ プ レ ッ ク ス・リ ア ル タ イ ム
PCR による同時定量検出原因。李 明珠、稲田 稔、渡辺秀樹、須賀晴久、景山幸二、日本植／物病理学会関西部会、鳥取（とりぎん文化会館）、．チオファネートメチル耐性ムギ類赤かび病菌のトリコテセン系マイコトキシン産生に対するテブ
コナゾールの影響について。須賀晴久、船坂美佳、景山幸二、百町満朗、平八重一之、第 回日
本マイコトキシン学会学術講演会、沖縄（市町村自治会館）、／．Differentiation of Phytopythium species based on PCR-RFLP analysis. Baten Md. Abdul, Suga
Haruhisa, Kageyama Koji、日本菌学会第 回大会、岐阜（岐阜大学）、／．北海道のアズキに根腐病を引き起こす Fusarium 属菌の新種について。青木孝之、田中文夫、須賀晴久、百町満朗、Scandiani M. M., Oʼ Donnell K、日本菌学会第 回大会、岐阜（岐阜大学）、／⑹

補助金関連採択状況

下澤伸行
平成 〜 年度 文部科学省科学研究費基盤研究（B）（研究代表者）「網羅的ペルオキシソーム機能解析による神経・代謝性疾患の病態解明」： ， 千円（ ， 千円）
平成 〜 年度 文部科学省科学研究費挑戦的萌芽研究（研究代表者）「多角的アプローチによる副腎白質ジストロフィーの脱髄発症・病型規定因子の同定」： ， 千円（ ， 千円）
平成 年度厚生労働科学研究費補助金（難治性疾患克服研究事業）（分担研究者）「ライソゾーム病（ファブリ病含む）に関する調査研究」（ ， 千円）須賀晴久
科学研究費補助金基盤研究（C）（研究代表者）「イネに寄生する糸状菌のカビ毒産生能の遺伝的要因解明」
（
―

―

千円）

農林水産省委託プロジェクト研究（生産・流通・加工工程における体系的な危害要因の特性解明とリスク低減技術の開発、農業・食品産業技術総合研究機構）（研究代表者）「薬剤耐性を持つ麦類
赤かび病菌の遺伝子診断と伝播抑制技術の開発」（ ， 千円）⑺

新聞報道
H 年 月 日（金）岐阜新聞「高校生が遺伝子学ぶ」（転載許可済）――