新学術領域研究「柔らかな分子系」ニュースレター

No. 8

平成 26 年 4 月

第 2 回ワークショップ 開催報告中西 尚志

（物材機構・A03 計画研究代表者）分）オーバーする程、議論が白熱する事態を招いた。

本新学術領域のねらいの一つに、若手の育成が挙げランダムに指名した領域内部の若手研究者、世話人らられている。全体・公開・班会議等での積極的な若手には、自らの思う「柔らかな分子系」について、自己発表はもとより、博士課程の学生を含む、領域内の若紹介を兼ねて一人 1 分以内で述べてもらい、司会の中手研究者が主体となり、発案・運営するワークショッ

西がコメントを返すスタイルで進行された。その中でプ（10～30 人規模）の開催が奨励されている。

印象深かったのは、柔らかな分子系を理解するためにその後、自由討論が行われた。複数の外部参加者とその最初の試みとして、A03・創成班の若手研究者

は、周りの「硬さ」の理解も合わせて重要であるとの（吉沢氏（東工大）、岩田氏（名工大）、井上氏（名工意見があった。また、本新学術領域のスタンスである大）、中西）が中心となり、2014 年 3 月 26 日（水）理論・計測・創成の連携や国際化支援に対する期待度、名13:30~18:00（日本化学会春季年会＠名大の前日）が、若手視点からも十分に高いことが分かった。さら

古屋工業大学 2 号館 3 階 0233 室にて、第 2 回ワークに、3 名の班長（北尾氏、水谷氏、神取氏）から、若ショップが開催された。当日は生憎の雨模様であった

手を刺激・激励する熱いメッセージが送られ、最後にが、領域内に限らず外部（名工大、神戸大、大阪市立村橋氏（分子研・A03 計画研究代表者）が総括し、閉大）からも含めて 36 名もの参加者があり、大盛況で会の辞を述べられた。

あった。神取氏（総括班・A03 班長）による「柔らかまた講演会終了後、特別イベントとして神取研究室な分子系」の紹介および若手を鼓舞する内容の講演にの見学を行い、名工大キャンパス内「カフェ・サラ」

始まり、領域内の若手研究者（助教、ポスドク研究員）にて懇親会が催された。ここでも、アルコールの触媒と博士課程学生の総勢 10 名によるそれぞれの考えるを作用させ、さらに活発な意見交換がなされていた。

「柔らかな分子系」に関する講演（質疑込み一人 15

今回のもう一つの目的として、ワークショップ若手版分）が行われた。の運営ひな形作成が掲げられていたが、アブストラク

前半は、加藤善隆氏（名工大）、I Made Mahaputra

ト様式の確定、化学と工業や分子科学会速報への積極

Wijaya 氏（名工大）、神谷基司氏（京都大）、矢崎昇平的な発信など、そのミッションは十分に達成された。

氏（東工大）による発表が行われた。世話人らの心配

次回開催は、A01・理論班の林氏（京都大）を世話人をよそに、最初から、多数の質問が飛び交う活発な議代表として執り行われることまで決定している。今後論が繰り広げられた。休憩を挟み後半は、山科雅裕氏

は公募班メンバーの参加、運営協力も加わるため、「柔（東工大）、堀内新之介氏（分子研）、石山達也氏（東らかな分子系」に対するさらに多様な意見交換が繰り北大）、井上賢一氏（理研）、宮崎充彦氏（東工大）、山広げられると期待できる。

守優氏（東大）の発表が行われ、予定時間を大幅に（30ワークショップの様子。

若手主導の領域最初のワークショップ集合写真。

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平成 26 年 4 月

柔らかな分子系のアウトリーチ活動、始まる！
北尾 彰朗（A01 班班長、総括班連絡・アウトリーチ担当）「柔らかな分子系」では、一般の方々にわれわれの研究を知っていただくために、アウトリーチ活動を積極的に行うことにしています。その活動の第一弾として、領域代表・A02 班計画班の田原太平さんのグループの協力の下に理化学研究所（理研）和光キャンパス
田原グループの体験型展示の一般公開に合わせてアウトリーチ活動を行いました。
理研は全国に複数のキャンパスを持ちますが、それぞれのキャンパスを毎年一回、一般公開する日をもうけています。この一般公開日には家族連れの方、学生の方、また専門的な興味をもつ技術者の方まで、科学・技術に興味を持たれる多くの方々が理研を訪れます。
理研の本部がある和光キャンパスでは、さる 4 月 19日に一般公開をしました。好天に恵まれ、また最近理研がマスコミを賑わしていることもあって、例年を大きく超える 1 万 1 千人以上の方が見学に来られました。
一般公開日には、各研究室は科学・技術のおもしろ大人気の柔らかな分子系コーナーさを一般の方々に知ってもらうためにいろいろな工夫表示したタンパクを触ってもらい、タンパク質の構造、を凝らした展示を用意します。田原さんの研究室では柔らかさ、堅さなどを体感してもらいました。

毎年「不思議な光レーザーで探る分子ミクロ世界」とこのデモンストレーションは大変人気で、タンパクいう体験型の展示を行っているのですが、今年はここ質を触ろうとする人が列を作って順番待ちができるほに新しく「柔らかな分子系コーナー」を設け、「タンパどでした。アンケートに答えてくださった方々の感想

ク質に触れてみよう」という Haptic デバイスを使っを幾つか抜粋すると、たデモンストレーションを行いました。Haptic デバイ－タンパク質のさわりごこちがおもしろかったですス（触覚装置）はディスプレイに表示されたコンピュ（小学生・女性）。

ーターグラフィックスをこのデバイスを使って“触る”－本当にふれたような感じになれるので不思議だったと堅さや柔らかさを体感できる仮想現実デバイスで、（中学生・男性）。

われわれの領域ではアウトリーチ活動の為に総括班で－初めて経験した感覚だった♡（高校生・女性）購入しました。今回はこれを使って、ディスプレイに－分子模型と違い、内側に触れられる、内側から見られるというのが新鮮でした（大学／大学院生・男性）－とても面白かったです。またさわってみたいと思います（30 代・男性）－実際さわる感覚がおもしろかったです！（40 代・女性）と大変幅広い方々から好評でした。
われわれの「柔らかな分子系」では、このようなアウトリーチ活動によって一般の方々に対しても積極的に情報発信をやっていきます。Haptic デバイスとノート PC のセットはアウトリーチ活動のために貸出可能ですので、興味のある方はお問い合わせください。

多くの人が訪れる理研（和光）の一般公開

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平成 26 年 4 月

業績紹介：動物型ロドプシンと微生物型ロドプシンのキメラタンパク質の機能
吉田 一帆（名工大・A03 計画研究協力者 M2）
井上 圭一（名工大・A03 計画研究連携研究者）
神取 秀樹（名工大・A03 計画研究代表者）

本研究では、膨大な種類の微生物型ロドプシンの中から安定性が高く、発現量も大きいプロトンポンプ型ロドプシンである Proteorhodopsin（PR）と Gloeobaacterrhodopsin（GR）を鋳型として新たなキメラタンパク質論 文 題 目 ： “Chimeric Proton-Pumping Rhodopsins
Containing the Cytoplasmic Loop of Bovine Rhodopsin”
著者：K. Sasaki, T. Yamashita, K. Yoshida, K. Inoue,
Y. Shichida, and H. Kandori
雑誌巻号：PLOS ONE 9, e91323 (2014)を作製した。PR キメラによる G タンパク質の活性化は見られなかったものの、ウシロドプシンの細胞質側第 3 ループを組み込んだ GR キメラでは光依存的な Gタンパク質の活性化が見られた。両者における活性化能の違いは、ヘリックスにおける構造変化の大きさにG タンパク質共役型受容体（GPCR）は光・味・匂由来することが光誘起赤外分光解析により示唆された。

いなどの外因性刺激や、ホルモン・神経伝達物質など

一方、GR キメラに細胞質側第 2 ループを導入したダの内因性刺激を受け取り、細胞内の G タンパク質へと

ブルループキメラでは活性に約 5 倍の増大が見られ、情報を伝達する膜タンパク質である。動物型ロドプシ加えて長寿命化の変異を導入することで、最終的に従ンは網膜の視細胞に存在する GPCR であり、視覚の光来のものより 10 倍高い活性化能を持つキメラの作製センサーとしてはたらいている。一方、真正細菌や古に成功した。

細菌などが持つ微生物型ロドプシンは光センサーだけ

我々は本領域において、分子の柔らかさを利用するでなく、イオンポンプによる光エネルギー変換のなどことで、新たな機能や特徴を持つ分子を創成すること様々な機能も有している。これら 2 種類のロドプシンを目指している。本研究で達成した新規機能を持つロはいずれも 7 本のαヘリックスが細胞膜を貫通した構

ドプシンの分子デザインは、正にその目的に合ったも造を持つ膜タンパク質であり、7 番目のヘリックスにのであり、一つの微生物型ロドプシンに多様な機能をある Lys 残基と発色団レチナールがシッフ塩基結合を持たせるという大きな可能性を示した。本論文の内容形成するものの、両者のアミノ酸配列に相同性はなく、は、神取研の卒業生である佐々木さんのデータが中心となっているが、私は現在、他の種類の G タンパク質別々の進化をたどってきたと考えられている[1]。
神取グループはこれまで京大・七田研との共同研究についても光による活性化が可能な分子デザインを行

により、走光性センサーである微生物型ロドプシンっており、最終的には細胞や生体内の酵素反応を制御

Sensory rhodopsin II（SRII）にウシロドプシンの細胞質できるようなツール作りを目指してゆきたい。

側第 3 ループを組み込んだキメラタンパク質が、G タ

引用文献ンパク質を光依存的に活性化できることを見出した[1] Ernst et al. Chem. Rev. 114, 126-163 (2014).

[2]。しかしながら動物型ロドプシンと比べ、その活性[2] Nakatsuma et al. Biophys J. 100, 1874-1882 (2011).

化の効率は非常に低いものであった。

図 1 キメラタンパク質の光反応の模式図

図 2 キメラタンパク質の G タンパク質活性化能34

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平成 26 年 4 月

東京工業大学・藤井正明教授が 「日本化学会第 31 回学術賞」を受 賞
酒井 誠	  （東工大・A02 計画研究連携者）
このたび、本新学術研究 A02 項目の計画研究代表者である藤井正明・東京工業大学教授が、「多波長レーザー赤外分光法の開発と気相クラスター内ダイナミクスの直接観測」という業績により、日本化学会第 31 回学術賞を受賞されました。この賞は、化学の基礎及び応用のそれぞれの分野において先導的・開拓的な研究業績を挙げた優れた研究者に授与されるものです。15年に渡り研究を一緒に行ってきた者として、また、本新学術研究のメンバーの一員として、藤井教授の受賞に心よりお祝い申し上げたいと思います。以下に、今藤井正明・東京工業大学教授（右：授賞式にて）回の受賞対象となった主たる研究業績をご紹介いたします。
藤井教授は、まず、ピコ秒時間分解赤外分光法の開めて実証することに成功した。さらに、時間分解赤外発とイオン化誘起溶媒再配向反応についての研究を展スペクトルによりクラスター構造による反応の特異性開した。赤外スペクトルは分子の構造や環境を鋭敏に（メモリー効果）や反応生成物内で逐次的に起きる構反映するいわば分子の指紋であり、赤外スペクトルを造最適化反応などその反応メカニズムを明らかにした。

ごく短い時間ごとに測定する方法があれば反応中の分	  また、藤井教授は、多波長ピコ秒時間分解赤外分光子が変化していく姿をコマ落としのように観測できる。

法に留まらず、中赤外領域（5-10 µm）の波長可変赤藤井教授は、分子振動を区別できる波長分解能と化学外レーザーの開発とそれを用いる多波長レーザー分光反応の変化を追跡できるピコ秒の時間分解能を両立さ法、さらには非芳香族分子に研究対象を拡大することせた多波長ピコ秒時間分解レーザー装置と時間分解赤ができる真空紫外−赤外二重共鳴法など、分子クラスタ外分光法を開発した。これを、アセトアニリド水和クーの化学反応追跡を実現する新たな多色レーザー赤外ラスターなど種々のクラスターに適用し、イオン化に分光法を開発した。特に、中赤外領域での測定は水素より溶媒が結合部位を移動する過程を赤外スペクトル

結合による振動バンドのブロードニングの影響を回避の時間変化として初めて実時間で捉えることに成功しできる骨格振動による反応の直接観測を可能とし、例た。時間分解赤外スペクトルは、質量スペクトルの時えば、フェノール分子の酸解離には強塩基であるアン間変化を測定するポンプ−プローブ法とは質的に異なモニアでも 6 分子が必要であることなど、クラスターり、反応に関与する分子の状態を分子振動から多面的内反応研究での高い有効性を実証した。に観測できるため反応経路全体が「可視化」されるに以上のように、藤井教授は独自に開発した多波長ピ等しい。すなわち、溶質の光励起により第一溶媒和圏

コ秒時間分解赤外分光法などにより気相分子クラスタの水分子が配向反転するダイナミクスの実時間観測のー内の反応を分子構造の時間変化として捉えることに成功は、その分子論的理解に大きく寄与した。

成功し、化学反応ダイナミクス研究に新たな局面をも次に、光励起によりプロトンや水素原子を放出するたらした。これらの研究は、独創性溢れるものであり、ことが知られているフェノール、ナフトールなどの芳その業績は国際的にも高く評価されている。

香族酸・溶媒和クラスターに多波長ピコ秒時間分解赤	  藤井教授は、本新学術研究においては、神経伝達物外分光法を適用し、クラスター内プロトン・水素原子質、ポリペプチド、超分子など柔らかな分子系の取る移動反応の研究を展開した。酸塩基対であるフェノー構造多様性を明らかにし、その特異な機能の分子論的ル・アンモニアクラスターなどで、従来予想されていな理解に挑戦しています。今後さらにどのような新したプロトン移動反応ではなく、中性の水素原子が溶媒い化学が展開していくのか、私自身も楽しみにしたいに移動する励起状態水素原子移動反応であることを初と思います。

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平成 26 年 4 月

神取グループの井上圭一さんが平成 26 年度文部科学大臣表彰・若手科学者賞を受賞
神取 秀樹（名工大・A03 計画研究代表者）

11 シスと 3 種類のレチナール構造をもつロドプシンの反応ダイナミクスを見事に分離した仕事は、分光学者

A03 計画研究神取グループ（名工大）連携研究者のとしての彼の真骨頂と言えます[2]。バクテリオロドプ

井上圭一さんが、平成 26 年度文部科学大臣表彰・若手シンの三量体効果を調べた論文では、分光解析の責任科学者賞を受賞しました。本賞は、萌芽的な研究、独者として高速原子間力顕微鏡のグループと共同で、得創的視点に立った研究等、高度な研究開発能力を示すられたデータの意味を明らかにしました[3]。現在では顕著な研究業績をあげた 40 歳未満の若手研究者を対構造変化過程に関わるタンパク質のゆらぎを見るため象としたもので、井上さんは審査の結果高い研究成果の一分子観察法の開発も始めています。

を示したことが認められ今回の受賞に至りました。

このように井上さんは生体分子の先端計測における受賞対象となった井上さんの研究テーマは「微生物若手のホープですが（本領域では A02 的）、A03 的な型ロドプシンの物理化学研究」です。井上さんはこれ機能の創成にも大きな関心を持っています。昨年には、まで 10 年以上にわたり、真正細菌や古細菌などの微生彼の注意深い配列観察がきっかけとなって、ロドプシ物がもつ光受容型膜タンパク質である微生物型ロドプン研究の歴史に残るナトリウムポンプ発見の論文を筆シンについて、レーザー分光法や赤外分光法を用いて、頭著者として発表、世界を驚かせました[4]。また今月機能発現に関わる構造変化や反応ダイナミクスの物理号に発表している 2 つの機能をもったロドプシンの創化学研究を行ってきました。井上さんが微生物型ロド成に関する論文は、彼に論文リバイズの過程を任せてプシンの研究を開始したのは京都大学大学院に在籍時います[5]。このような常日頃のハードワークの中でどからです。理学研究科化学専攻の寺嶋正秀教授のもと、のように時間をつくったのか不思議ですが、「一家に１過渡回折格子法を用いて、走光性に関わるロドプシン枚」のプロジェクトにも手を抜くことなく参加し、仲であるセンサリーロドプシンⅡとトランスデューサー間との絆を強くしたことは頼もしい限りです。今回、タンパク質との複合体について構造変化ダイナミクス

これまでの 22 報の論文などが評価されての受賞となの解明を試み、信号伝達時にトランスデューサーの大りましたが、今後はさらに周辺の若手研究者や大学院きな構造変化があることを明らかにしました。

生なども巻き込んで、彼らの刺激となるようなより大博士課程を修了した後、生体観察に重要な顕微鏡技きな研究の発展を期待しています。

術の修得を目指して、A02 計画研究代表者の藤井正明[1] Inoue et al. J. Phys. Chem. B 115, 4500-4508 (2011).

教授（東工大資源研）のもとでピコ秒赤外超解像顕微[2] Inoue et al. J. Phys. Chem. B 116, 5888-5899 (2012).

鏡の開発に携わり、そして 2007 年 11 月からは神取グ[3] Yamashita, Inoue et al J. Struct. Biol. 184, 2-11 (2013).

ループへ加わり、再びロドプシンを主なターゲットと[4] Inoue et al. Nature Commun. 4, 1678 (2013).

した研究を開始しました。新たな信号伝達型ロドプシ[5] Sassaki et al. PLOS ONE 9, e91323 (2014).

ンについての分光研究から、スペクトル変化を伴わない反応過程が数多くあり、それが機能発現に重要であることを明らかにしました[1]。全トランス、13 シス、

図：これまでに井上さんが研究を行った

写真：平成 26 年度文部科学大臣表彰・主な微生物型ロドプシン

若手科学者賞を受賞した井上さん

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平成 26 年 4 月

一家に１枚の「動く！タンパク質」の制作秘話
鎌形 清人（東北大多元研・A02 連携研究員）
井上 圭一（名工大・A03 連携研究者）
林 久美子（東北大工・A01 公募研究代表者）

繁に集まり議論をしていましたが、全員のメンバーが集まる機会はありませんでした。今後、メンバー全員で集まり、お酒を飲みつつポスター作製の苦労話で盛り上がりたいと思っています。最後に、4 名の優秀なメンバーとともにポスターを作製できたこと、また、ポスターの制作に協力してくださった方々に感謝致します。
【井上】私自身は高校で生物を専攻しなかったこともあり、大学から初めてタンパク質を学び、その精緻な構造と多様な機能に心底驚いて、ついには生涯の研究テーマとしました。従ってそれまでは正に「三大栄養素の一つ」としか捉えていなかった訳で、そのような経験から、常々本来のタンパク質の面白さと初等教育の内容との間の大きな乖離に問題を感じていていました。そのため今回の製作に携われたことは非常に大きな喜びで、メンバーの皆様には心から御礼申し上げます。本領域に先んじて始まったプロジェクトですが、タンパク質の動きには「柔らかさ」が極めて重要であり、両者のつながりは非常に大きいと感じています。
【林】日本生物物理学会の理事（運営委員）の仕事として応募したらあっさり採用されたので驚いています。
女子の夢としてキティやキキララのような細胞村を描くことが私のモチベーションでした。そんなトンチンカンなモチベーションに振り回されつつも制作を助けてくださった文科省の皆様、企画会社の皆様、ワーキンググループの皆様、有り難うございました。

【一一家に１枚の「動く！タンパク質」の作製】
林、井上、鎌形に加えて、福岡創さん（東北大多元研）、鈴木博文さん（阪大蛋白研）、文部科学省、生物物理学会が協力して、小中高校生向けのポスター「動く！タンパク質」を作製しました。タンパク質には栄養素としての静的なイメージがありますが、細胞の中で働く小さな機械としての動的なイメージを持ってもらうことを目的としました。ポスターは、細胞の実写に近い図、キャラクター化したタンパク質、タンパク質の立体構造、顕微鏡で撮影されたきれいな細胞の画像、タンパク質の誕生や機能に関する解説から構成されています。タンパク質をキャラクター化したイラストで描くことで、大人だけでなく子供、男性だけでなく女性も楽しめるポスターを目指しました。
【鎌形】まず、鎌形の目線で作製について話したいと思います。2013 年の夏ごろ、林さん（代表）から一家に１枚のポスター作製への協力を依頼され、ワーキンググループに加わりました。私達は、ポスターの作製にあたり、以下の点に注意しました。
・動きの面白いタンパク質を紹介する。
・タンパク質をキャラクター化する。
・魅力的なタンパク質の立体構造をつくる。
・きれいな細胞の図を伝える。
・斬新なデザインで理系女子を増やす。
私は、主に、タンパク質の選定やコラムの作製を担当しました。タンパク質の選定に関して、タンパク質科学が専門である私にとっては難しいことではありませんでしたが、一般の人に学校で習っていないことを分かりやすく説明することに苦労しました。分かりやすい表現をつきつめると、科学として間違った表現になることもありました。そこで、5 名のメンバーや制作会社の方と知恵を絞り、言葉を選んでいきました。
この過程で、一般の人がタンパク質の説明を理解することの難しさや分かりやすい説明の難しさを学びました。今後、タンパク質科学の面白さを分かりやすい表現で社会に発信していくことが大事だと感じました。
ポスター作製の最終段階に入り、大幅な変更をする必要があり、私達は焦りつつ最善のポスターを模索しました。タンパク質の“動き”を上手に表現できていないことが問題でした。この最終段階を一致団結して乗り越える過程で、ワーキンググループのメンバーの絆が深くなったような気がします。東北大の 3 名は頻（上）ワーキンググループ（林、福岡、鎌形）＋東北
大高橋研の方々（下）ワーキンググループ（井上）＋名工大神取研の方々

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