Thermo Fisher Cloud
フラグメントデータ 閲覧・再解析 操作簡易資料
http://www.thermofisher.com/cloud※使用には事前登録が必要になります※画面は予告なく変わることがあります

The world leader in serving science
1Thermo Fisher Cloudとは？
キャピラリシーケンサ、リアルタイムPCRなどの解析アプリケーションを提供
10 GBまでのStorageを無償提供
PC機種、環境に関係なくアクセス
機種、環境に関係なくアクセス解析ソフトウェアを統合
Next-generation
Confirmation
Variant
AnalysisStandard
Curve
Quality
Check

Macからでもアクセス可能からでもアクセス可能

2次解析のフローが簡単に
次解析のフローが簡単に

データのバックアップに

10 GBののStorageを提供
を提供

データはクラウド上で保管しているので、PCが故障した時も安心が故障した時も安心

1アカウントでアカウントで10のStorageを提供を提供アカウントで GBのデータのシェアも簡単に
2アカウント登録およびサインイン
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10.x

10.x

Windows 7.1+

25.x

36.x

Windows XP+
OSX 10.6+

5.x

7.x

6: OSX 10.7+
7: OSX 10.9+

16.x

31.x

Windows XP
SP2+
OSX 10.6+®

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最初にご登録が必要※メールアドレスのみの登録で利用可

ご登録後はユーザー名とパスワードを記入しサインイン
サインインします
サインイン
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Thermo Fisher Cloudのメイン画面（Dashboard）

Dashboardを表示するボタン

アップロード/作成したファイルの一覧の表示ボタン

ファイルのUpload、プロジェクトの作成(Storageを10 Gbまで無償で提供)

利用可能なアプリケーションが表示されています

フラグメント解析用アプリケーション

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Peak Scannerの使用方法
Give your project a nameにプロジェクト名を記入します（日付など）
Create projectをクリックして、新規プロジェクトを作成します

必要に応じて、プロジェクトを保存するフォルダを選択します

My Appsを下にスクロールして、Appをクリックしても始まります※ Thermo Fisher Cloudは、プロジェクト単位でデータが管理できるので、Use Existing Projectから過去のプロジェクトにデータを追加して閲覧することができます5サンプルファイルとプロジェクト設定の読み込み①Import from …をクリックし、コンピュータまたはThermo Fisher Cloudに保存されているデータファイル（.fsa1ファイル）を読み込みます②データを読み込んだら左側のPSボタンボタンをクリックしますボタン

過去のプロジェクトをテンプレートにして解析設定を呼び出す場合、適切なプロジェクトを選択してImport Settingsをクリックします

必要に応じて過去のプロジェクトの解析設定を呼び出します
解析設定に関しては後半スライドを参照

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サンプルファイルとプロジェクト設定の読み込みサンプルデータが読み込まれます7解析結果の検証
解析後のSQ、OSのカラムで、データの状態を確認できます• OS(Off Scale): 各サンプルの検量線の範囲内で、検出限界を超えるピークがある場合が表示されます• SQ(Sizing Quality):サイズスタンダードによる検量線のクオリティの評価ですの場合、データのサイズ値の精度が低下する恐れがあります8ピークのサイズ値の確認①Resultsタブに切り替えます
データの拡大縮小ができます②データを選択しますスクロールバー③ピークをクリックするとSize値が確認できます

プロット画面でカーソルをドラッグして画面を移動させます
プロット画面でカーソルをドラッグして画面を拡大縮小します
拡大縮小をリセットします
複数サンプルを同時に拡大縮小します9Size Standardの確認方法①データを選択します②ActionよりView Size
Match Editorを選択します

1サンプルずつ表示します>ボタンで次のサンプルへ移行します10解析結果の出力
プロットデータ、サイズ値を出力することができます①ActionsよりExport Sizing Table
もしくはExport Plotを選択します• Export sizing table: Sizing tableをcsvファイルでエクスポートします• Export Plot:プロットデータをPNGもしくはJPEGでエクスポートします11サイズスタンダードの編集(オプション)
サイズスタンダード内のすべてのピークが存在しないもしくは正確に標識されていな場合はサイズスタンダードの編集後再解析が可能です①Setupを選択します②Size Standardをクリックします③Clone size standard to make changes
をクリックします
Locked factory defaultの記載があるサイズスタンダードは編集できません。名前を変更し保存したサイズスタンダードは次回以降使用できるようになります12サイズスタンダードの編集(オプション)④名前を記入します⑤数値の削除等で編集できます

Reanalyze all files with this size standardにチェックを入れてApplyボタンをクリックすると、すべてのデータを自動で編集したサイズスタンダードで再解析します⑥Applyをクリックします13サイズスタンダードの編集(オプション)⑦ReanalyzeをクリックしますReanalyze all files with this size standardにチェックを入れた場合は、自動で再解析されます14

Size Standardの編集(オプション)
サイズスタンダードのピークを選択し直接編集することが可能です①データを選択します②ActionよりView Size
Match Editorを選択します15サイズスタンダードの編集(オプション)③ピーク拡大します④目的ピークをクリックしピークの数値を付け替えることができます
Reanalyze all files with this size standardにチェックを入れてApplyボタンをクリックすると、すべてのデータを自動で編集したサイズスタンダードで再解析します⑤Doneをクリックします16プロット画面表示の変更方法(オプション)

Plot Settingsよりプロット画面表示の変更ができます

表示する蛍光色素を選択できます• Combine Dyes:：サンプルごとのプロットが表示されます• Separate Dyes：蛍光色素ごとのプロットが表示されます• Overlay samples：サンプルを全て重ねたプロットが表示されます

••
••
•

Analyzed：解析後のデータが表示されます
Raw：Rawデータが表示されます
Analyzed+Raw：解析後とRawデータが同時に表示されます
Basepairs：横軸がベースペアで表示されます
Scan：横軸がData pointで表示されます• Sizing Tableの表示を切り替えます

次ページへ続く
17

プロット画面表示の変更方法(オプション)• 1画面に表示させるデータ数を変更します• Plot画面のX軸、Y軸のStart,Stopポイントを変更します• Plot画面に表示させる注釈を変更します• Plot画面のX軸、Y軸の表示範囲を変更します• Plot画面に検量線、ピーク位置、オフスケールピークを表示させます• 各ピークのシグナル強度を変更します18

プロット画面表示の変更方法(オプション)• ラベル表記させるピークの変更ができます• ラベル表記内容を変更できます• ラベル表記の文字の大きさを変更できます• ラベル表記の色を変更できます19

Analysis Settingの詳細設定(オプション)
必要に応じて解析パラメータの設定の変更が可能です①Settingをクリックします• データの解析範囲を変更できます• 検出するピーク高の範囲を変更できます20

Analysis Settingの詳細設定(オプション)• ピークのクオリティ判定の設定を変更できます• ピークのベースラインの設定を変更できます③サンプルを指定しReanalyzeをクリックしますReanalyze all files with Settingにチェックを入れてDoneをクリックすると、すべてのデータを自動で再解析します②解析設定変更後Doneをクリックします21トラブルシューティング• ブラウザのキャッシュの状態によってThermo Fisher Cloudの結果が正しく表示されないことがあります．この場合、1. シークレットウィンドウ（Google Chrome）、 プライベートウィンドウ（MozillaFirefox）、InPrivateウィンドウ（Microsoft Internet Explorer）を開き、エラーが表示されたウィンドウのURLをペーストします

2. キャッシュをクリアします．それでも改善しない場合、ブラウザの設定をリセットします3. ブラウザの種類を変更します (例: Google Chrome → Mozilla Firefox)22

ご不明な点などがございましたら、テクニカルサポートまでご連絡ください• 電話• 0120-477-392• E-mail:• jptech＠thermofisher.com

23© 2017 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved. All
trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its
subsidiaries unless otherwise specified.
For research use only. Not for use in diagnostic
procedures.

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