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PubMed 基礎編
福井大学医学図書館

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PubMed
米 国 国 立 医 学 図 書 館 の NCBI （ National Center forBiotechnology Information)が作成する医学/生物学分野の学術文献検索システム。
・収録雑誌 約5,200誌， 40言語 （日本語は115誌）
・収録範囲 1946年～現在 （毎日更新）
3,200万件
・インターネットで世界中から利用可能
MEDLINE:PubMedのベースとなる医学文献データベース

PubMedMEDLINE1965年以降

OLD-MEDLINE
1946～1965年

Non-MEDLINEMEDLINEに収録されないもの
データ整備前のレコード出版社が直接提供するレコード※PubMed収録以前のデータ1880～1961 IndexCat3

文献検索の基本的考え方• ある目的を以て文献データベースから必要な文献を探し出す① 特定の文献を探す② 臨床に役立つエビデンスの高い文献を素早く探す③ 臨床研究のための文献を探す④診療ガイドライン作成のための文献を探す
PICOから始める医学文献検索のすすめ / 小島原典子, 河合富士美編集 南江堂 , 2019.2

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検索の基本
検索語（キーワード）を入れて検索・論文の内容（主題）を表す言葉で検索するのが一般的
・検索語は単語や熟語で考える

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入力のルール

PubMed

大文字・小文字の区別はない

CHICKENPOX

chickenpox

ストップワードは検索対象にならない

about

著者名は姓（フル）＋名（イニシャル）＋ミドルネーム（イニシャル）
2002~フルネームでも検索可能

naiki h“naiki h”[AU]naiki hironobu

熟語はダブルクォーテーション” ”で囲む

“live vaccine”

雑誌名は正式名と略誌名どちらもＯＫ

British medical journal

ギリシャ文字は読みの英語綴り
ハイフンはスペースα→alphahigh-risk

前方一致は語尾の最後に「＊」child＊→ child,children,childhood

inof…

BMJ

→ high risk

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論理演算子を使用した検索AND(論理和)、OR(論理積)、NOT(論理差)ＡＢＡＢＡＢ

演算子は記述した順に左から右へ処理される。
（）でくくればカッコ内優先
ＡA AND (B OR C)
Ｂ Ｃ

7MeSHとは• Medical Subject Headingsの略• さまざまな医学用語が体系的に階層化されまとめられた統制用語集• 索引者は論文を精査し、MeSH用語を使用してその内容を表す
文献での表現（自然語）
CancerNeoplasm
Tumor

MeSH（統制語）
Neoplasms

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自動マッピング
文献情報入力した検索語

・論文タイトル
・著者名
・雑誌名
・抄録 etc…

同義の統制語
統制語
熟語は単語に分割してAND検索される

9（例）breast cancerで検索したときの検索式"breast neoplasms"[MeSH Terms] OR("breast"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields])
OR "breast neoplasms"[All Fields] OR("breast"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR"breast cancer"[All Fields]※検索式の詳細はAdvancedのHistory and Search Detailsで確認できる

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PubMed

検索履歴など

MeSH

基本情報

雑誌名検索

ヘルプ
書誌確認

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検索結果

・著者名は姓+名のイニシャル表記

検索履歴

・検索結果の表示
・並び順
・１頁内の項目数
Filter機能(絞込み)
検索結果の文献情報
タイトルをクリックすると詳細表示へ12

検索結果の表示設定の変更
表示形式

並び順

表示件数

13

表示される内容
論文タイトル
著者名

PMID

雑誌名(省略形),出版年月,巻号頁,doi

英語以外の論文は[ ]が付く

本文の言語

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詳細表示

著者名はフルネーム
名＋姓検索結果前後の文献に移動できるカーソルを重ねると簡略表示検索結果の保存/転送

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Summary(text)：書誌事項
PubMed：文献管理ソフトへの取り込み
PMID：PMID
Abstract(text)：書誌事項＋抄録
CSV：CSV形式テキストデータ□にㇾを入れた文献が対象（複数可）
ㇾを入れなかった場合は全文献が対象

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必要な文献情報の一時保存（Clipboard)(C-1)一時的に保存した検索結果を表示～Clipboard

検索結果を一時的に保存（500件、8時間まで保存できる）最後にまとめて印刷や保存

Clipboardに保存された表示「Clipboard」をクリックすると文献が表示される

17

検索結果の絞り込み （Filter)
こどもに関するインフルエンザワクチン(influenza vaccine)の症例報告(case report)を探したい
絞り込みたい対象条件をクリック

Filterを一度設定すると、解除するまですべての検索に適用されるので、解除するときは「Reset all filters」か「Clear」をクリック
項目が表示されていない場合は全ての項目から選ぶ

・抄録/EJ全文へのリンクの有無
・参加者が付与したコメントの有無
・文献の種類・出版時期・研究対象（人または動物）
・言語・性別・主題・収載誌の分野・年齢18オンライン辞書• ライフサイエンス辞書• 英辞郎 on the WEB• Weblio英和辞典・和英辞典• 医歯薬英語辞書• 医中誌シソーラスブラウザ• MeSH Database

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PubMed 上級編

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臨床に役立つエビデンスの高い文献を素早く探す

１）疑問の定式化
カテゴリー・PICOで考える
２）論理演算AND

ORNOT

３）絞り込み研究デザイン・年齢・論文の種類等

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カテゴリー
カテゴリー
治療
診断
病因・リスク
予後
頻度

信頼性の高い研究デザイン
ランダム化比較試験
横断研究
コホート研究、症例研究
コホート研究
横断研究

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ＰＩＣＯ
Ｐ
Ｉ
Ｃ
Ｏ

： Patient 患者
どんな患者が： Intervention
介入治療A（検査A)をするのは： Comparison
比較対照
治療B（検査B)と比べて： Outcome
アウトカム
どんな結果になるか23

実習• 慢性腰痛で経過をみている50歳女性の患者さんに「腰痛でも運動したほうがいいですか？」と相談された。
カテゴリー（）ＰＩＣＯＰⅠＣＯ

キーワード（日本語）キーワード（英語）24

実習 回答例• 慢性腰痛で経過をみている50歳女性の患者さんに「腰痛でも運動したほうがいいですか？」と相談された。
カテゴリー（治療）ＰＩＣＯＰⅠＣＯ

キーワード（日本語）キーワード（英語）

腰痛のある50歳の女性

Low back pain運動

Exercise（必要に応じて設定）
運動しない

腰痛の軽減

Pain

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前の検索結果を利用して検索（Advanced Search Builder）
Add terms to the query box・・・検索項目を選択できる。
History and Search Details・・・検索履歴
これを利用して経過を見ながら検索したり，掛け合わせ検索ができる26

特定の論文を探す
PubMed Single Citation Matcher

27

特定の論文を探す
PubMed Single Citation Matcher

28

My NCBI 自分用にカスタマイズ

新たに利用者登録するか手持ちのアカウントでログイン

検索
検索式（語）の保存
自分の論文管理

過去の検索履歴気に入った論文の保存

29

アラート機能検索式（語）を設定

キーワードを入れた状態でCreate alertをクリック
×××××@u-fukui.ac.jp

メールを受け取る頻度や曜日を設定指定した曜日に指定した検索式（語）の新着情報が届くようになる

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MeSH 検索31

MeSH 検索32

MeSH用語の説明

サブヘディング（副標目）
このMeSH用語と組み合わせる副次的用語

検索式に対する絞込み条件□Major Topic（主要テーマ）に限定□下位語を含めない

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このMeSH用語の同義語

Entry Terms ： 同義語→これらのワードで検索すると「Breast Neoplasms」に自動的に置き換えられる・・

上位語
より広い意味のキーワード
下位語
より狭い意味のキーワード

１つの用語に複数の階層構造を持つ場合もあり

MeSH用語での検索はデフォルトで下位語（下位の概念）も含む

34

MeSH画面35

特定の論文のMeSH を利用＊がmajor topic
MeSHでPubMed検索
MeSHの解説

MeSHをﾎﾞｯｸｽに入れる

36MeSH on Demand
https://meshb.nlm.nih.gov/MeSHonDemand• 入力したテキストに関連する医学件名標目表（MeSH）を表示• 同時に適合文献を１０件表示

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MeSH Browser
MeSH Database
MeSH Browser

MeSH用語のPubMedでの索引法や簡単な解説のほか、MeSHとして採用された年やそれ以前に用いられていたMeSH用語などを参照できる

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PubMed福井大学版

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福井大学版Pubmed
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?otool=ijpufmlib

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ディスカバリーサービスでできること• ①電子ジャーナルの購読可否

電子ジャーナルへのリンクがあれば購読できる。
• ②冊子所蔵状況
蔵書検索画面で所蔵状況を確認できる。
• ③文献複写依頼
PubMedで検索した文献情報がそのまま入力され、依頼に係る手間を大きく省くことができる。
• ④論文の被引用数
当該論文の被引用数を確認できる。
• ⑤掲載雑誌のインパクトファクター
掲載雑誌のIFを確認できる。

①フルテキストを入手する
をクリック

学外からアクセスする
ときは青点線内の操作（学認サービス）が必要

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★Science Direct

は利用者登録が必要①Registerで利用者登録（メールアドレスは必ず大学メール）②Sign in via your institution③University of Fukui 検索→選択④総合情報基盤センター認証画面44

全文入手できる論文へのリンクサービス
Google Chrome アドオンから入手可能45②所蔵を確認する＝紙の雑誌の所蔵必要な巻号の雑誌があることを確認すること。
医学図書館１階と２階の集密書架に保存されています。

③文献複写を依頼する★料金★
受付機関によって異なりますが、用紙 １枚につき３５～６０円程度（カラーは７０～２００円）程度
プラス送料140 円程度（複写枚数によります。）★到着までの期間★
2 日～３日程度

47④論文の被引用数

48⑤雑誌のインパクトファクターを確認

インパクトファクター：雑誌の評価尺度

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おまけ
• Alliehttps://allie.dbcls.jp/ja
生命科学分野で利用されている略語とその展開形を検索• ClinicalTrials.gov
https://clinicaltrials.gov/
臨床試験のデータベース• EBMR
http://gateway.ovid.com/autologin.cgi
Cochrane LibraryのCDSRやDARE、ACP Journal Club• Epistemonikos
https://www.epistemonikos.org/
コクラン以外によるシステマティック・レビュー

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参考文献
・AJACS Webセミナー 2020/9/17
・進化するPubMed日本医学図書館協会病院部会研修会(山口直比古)
https://www.youtube.com/watch?v=5pPJw5Zrak4&t=1273s
・2019年度JMLA近畿・東海地区会共催PubMed検索中級WS資料（大瀬戸貴己）
・PICOから始める医学文献検索のすすめ
・第４回JMLA学術集会・文献検索演習中級2019資料（大崎泉、成田ナツキ）
・第４回JMLAコア研修テキスト：コア5 医中誌Web検索初級（笹谷裕子）
・図解PubMedの使い方 インターネットで医学文献を探す/ 岩下愛，山下ユミ 共著
第8版 2022.4
・臨床研究の教科書 / 川村孝 著 2016.3
・PubMed の使い方 / 東京大学医学図書館 2014.4
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
・PubMedパワーアップ講座 / 東京大学医学図書館 2017.7
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/siryo/PubMed-a.pdf
・基礎から学ぶ PubMedの使い方 / 京都大学医学図書館 2016.5
http://www.lib.med.kyoto-u.ac.jp/pdf/pubmed_howto.pdf
・PubMed@KEIO 検索の基本と検索語の選び方/ 慶應義塾大学 信濃町メディアセンター 2018.4
http://www.med.lib.keio.ac.jp/pdf/ug/ug_pubmed.pdf