第５章 PubMed
PubMed（パブメド）は、医学関連分野の文献を無料で検索できるデータベースです。PubMed には米国
国立医学図書館（National Library of Medicine）が提供する、世界中の医学文献が検索できるデータベース
MEDLINE（メドライン）が含まれています。
文献の書誌情報（タイトル、著者名、雑誌名、抄録等）を調べることができ、一部の文献は電子ジャー
ナルで全文（フルテキスト）を見ることができます。
収録データ

約 3,500 万件（2023 年 3 月現在）

収録期間

1946 年～現在

収録誌

約 5,300 誌、58 言語

アクセス URL

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ （フリー）https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?otool=ijpgumlib（群大仕様）
Full Text Finder 機能付き、学内限定、VPN 可MEDLINE は、PubMed 以外でもさまざまなプラットフォームから利用できます。本学では EBSCOhost
で MEDLINE を検索できます。（学内限定）
https://www.media.gunma-u.ac.jp/eresources/databases/cinahl.html（EBSCO 社が提供しているデータベース「CINAHL」と同じアクセス URL から「MEDLINE」にアクセスできます。）

PubMed は下記の場所からアクセスできます。（群大仕様 URL）
総合情報メディアセンターWeb ページ→「学術情報データベース」の「医学系」をクリックします。
→PubMed（群大仕様）をクリックします。

PubMed は誰でも利用できるサイトですが、群大仕様の URL からアクセスすると、「Full Text Finder」のアイコンが使用できます。
群大で契約している電子ジャーナルに素早くアクセスでき、併せて雑誌の所蔵状況なども調べることができ、とても便利です。
※学内ネットワーク限定のサービスです。
学外からアクセスする場合は、VPN 接続をした端末でご利用ください。

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5.1 キーワード検索
検索ボックスにキーワードを入力し、「Search」をクリックすると検索結果が表示されます。
キーワードは全角文字ではなく、必ず半角文字で入力してください。複数のキーワードはスペースで区切って入力します。

キーワードを入力して「Search」
または予測候補の中からキーワードをクリック

図 5.1 PubMed トップページ

検索件数が多すぎるときは、左側のメニューから条件を指定して絞り込むことができます。
「Additional filters」をクリックすると、条件を追加できます。

Results by year(年代別の文献数)

Text availability(抄録、電子ジャーナルが見られる文献に限定)※群大の契約は反映していません

Article attribute (記事の属性)
Article type (出版タイプ)

Publication date (出版時期)

Species(記事の種類)

Language(言語)

追加したい条件にチェックを入れてクリック

Additional filters
図 5.2 検索結果

48選択した条件はチェックが付きます。また、検索件数の下に「Filters applied」として条件が表示され、以後の検索にも反映されます。条件を外すには「Clear all」または「Reset all filters」をクリックします。

検索件数

選択した条件出版タイプ:レビュー論文

出版時期:直近 5 年

図 5.3 絞り込み検索

検索結果は Summary 形式で表示されます。雑誌名など書誌情報の下に、抄録（検索したキーワードに関連が高い部分を抜粋したもの）が表示され、キーワードは太字で表示されます。
論文タイトルをクリックすると、Abstract 形式で検索結果が表示され、抄録や MeSH（6.4 参照）、リンクアイコンなどが表示されます。

論文タイトル（クリックすると詳細表示）

著者

DOI（国際的な識別子）

抄録

PMID（論文固有の番号）

雑誌名（省略形）．発行年月; 巻（号）:ページ

出版タイプ

図 5.4 Summary 形式

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雑誌名の省略形にマウスカーソルをあてると正式名が表示される

リンクアイコン

抄録

キーワード

関連文献
MeSH
図 5.5 Abstract 形式

英語以外の言語で書かれている論文は、論文タイトルが［ ］で囲まれています。

原文はフランス語で書かれている[ ]内は英語に翻訳されたタイトル「Free PMC article」、「Free article」といった表記がある場合は、論文の全文を無料で閲覧できます。

リンクアイコンには電子ジャーナルのアイコンと「群馬大学 Full Text Finder」のアイコンがあります。
群馬大学で契約しているもの、無料公開されているものであれば電子ジャーナルのアイコンからすぐに全文が見られます。
全文が見られない場合は、Full Text Finder のアイコンを使うと他の文献入手方法を調べることができます。（2.5 参照）

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電子ジャーナルのアイコン(提供元によってデザインが変わります)

Full Text Finder

5.2 検索結果の保存
検索結果の保存方法は「Save」「Email」「Send to」から選べます。事前にチェックを入れた文献が対象になり、チェックを入れなかった場合は、検索結果すべてが対象になります。

図 5.6 検索結果の保存「Save」「Email」「Send to」をクリックすると、送信方法を設定する画面が出ます。
（例）「Save」で「Format : Summary(text)」を選択した場合

Save

Summary や Abstract など選択した形式でテキストファイルを生成することやcsv ファイルを生成することができ、パソコンや USB メモリに保存できる。

E-mail指定したメールアドレスへ送信できる。

Send to「Clipboard」を選択すると PubMed 上に一時的に検索結果が保存される。
（最大 500 件、8 時間まで保存可能）
保存したデータは、検索バーの下にある「Clipboard」のリンクから確認できる。

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5.3 MeSH と自動マッピング
MeSH（メッシュ）は Medical Subject Headings の略で、米国国立医学図書館が作成するシソーラスです。シソーラスとは、さまざまな医学用語をできるだけ統一して使えるようにまとめた用語集のことです。（4.4 参照）
たとえば、「乳がん」という言葉は、著者によって「Breast Cancer」「Breast Tumor」「MammaryNeoplasm」などいろいろな用語で表現されます。MeSH では、それらはすべて「Breast Neoplasms」という MeSH Terms（シソーラス用語）に統一しています。MeSH Terms は文献情報が適切に検索できるよう、各文献情報に 10～20 語程度付与されています。
PubMed のキーワード検索では、入力したキーワードに対応する MeSH Terms があれば、自動的にキーワードに追加して検索します。この機能を自動マッピングといいます。自動マッピングにより、同義語を思いつく限り検索する必要がなく、同じ MeSH Terms が付与されている文献情報が自動的に検索されます。この機能により網羅的な、漏れの少ない検索をすることができます。

文献情報 A
同義語
Breast Cancer
Breast Tumor

統制

MeSH Terms
Breast Neoplasms

Breast Cancer

索引#Breast Neoplasms

文献情報 B

Mammary Neoplasm

Breast Tumor#Breast Neoplasms

検索結果に表示される「MeSH Terms」で、その論文に付与されている MeSH Terms を確認できます。

論文の中心的主題を表す MeSHTerms（Major Topic）には、最後に「*」（アスタリスク）が付いています。

「/」で連結されているのは Subheading（副標目）です。
MeSH Terms の内容を限定する場合に付与されます。
図 5.7 Abstract 形式の検索結果に表示される MeSH Terms

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5.4 MeSH を使った検索キーワード検索をすると件数が多すぎ、目的の文献が見つからないときに MeSH を使うと、大量の文献情報から適切なものだけを効率的に検索することができます。
ただし、新しい概念が MeSH に登録されていなかったり、最新の文献に関しては索引付けされていないため検索されなかったりすることもあります。そのときは、キーワード検索と組み合わせて検索する必要があります。
MeSH を使った検索をするには、PubMed トップページにある MeSH Database を使います。

「breast cancer」で検索すると、関連する MeSH Terms が簡単な説明とともに表示されます。

用語の説明を見て、検索目的に合ったMeSH 用語を探すことができる

図 5.8 MeSH Database の検索結果

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1 番目の「Breast Neoplasms」のリンクをクリックすると、Subheadings（副標目）、Entry Terms(同義語、類義語)、階層構造を確認できます。
この画面から「乳がんの放射線治療」に関する文献を検索する手順は、以下のようになります。
① Subheadings の「radiotherapy」にチェック②「Restrict to MeSH Major Topic.」にチェック③「Add to search builder」をクリック（検索ボックスに表示される検索式を確認）④「Search PubMed」をクリック③検索ボックスに検索式を表示する

副標目（医学文献によく出てくるキーワード）④PubMed を検索①放射線治療に関する文献に絞り込む②「Breast Neoplasms」が中心的主題になっている文献だけに絞り込む

同義語、類義語「Breast Neoplasms」という
MeSH Terms に統一されている同義語・類義語の一覧【上位語】「Breast Neoplasms」を中心に見たときそれよりも広い意味のキーワード【下位語】

MeSH Terms の階層構造「Breast Neoplasms」よりも狭い意味のキーワード

図 5.9 MeSH 用語「Breast Neoplasms」の詳細画面

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5.5 いろいろな検索【検索対象項目を限定した検索】キーワードにタグを組み合わせることによって、検索対象とする項目を限定することができます。
たとえば、「論文タイトルに「smoking」が含まれているもの」を検索するときは、以下のように入力します。キーワードとタグの間にスペースは入りません。また、小文字でも入力できます。
smoking[TI][ALL] PubMed で検索可能なフィールドすべて
[AU]

著者名

[AD]

[TI]

論文タイトル[TIAB] 論文タイトル・抄録

[TA]

雑誌名

[DP]

出版年

[VI]

巻

[IP]

号

[PG]

ページ

[UID] PMID（PubMed 文献番号）[MH] MeSH Terms
図 5.10

著者の所属機関[MAJR] Major Topic

PubMed で使える主なタグ

さらに詳しく知りたい方は、以下のサイトをご覧ください。検索に使えるタグの一覧と説明（英語）があります。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/#search-tags【著者名で検索】著者名を検索するときは、ラストネーム（姓）はフルで、ファーストネーム（名）とミドルネームはイニシャルで入力します。「群馬花子さん」を検索するときは、下記のように入力します。
Gunma H[AU]2002 年以降の文献で原著に記載があるものは、フルネームで検索できます。

【論理演算子を使った検索】①AND 検索：「cancer」と「smoking」が論文タイトル・抄録に含まれる
cancer[TIAB] AND smoking[TIAB] ― （#1） ※「AND」はスペースでも同様の結果
cancer[TIAB] smoking[TIAB]― （#2）②OR 検索：「cancer」または「smoking」のどちらかが論文タイトル・抄録に含まれる
cancer[TIAB] OR smoking[TIAB]― （#3）③NOT 検索：論文タイトル・抄録に「cancer」は含むが「smoking」は含まない
cancer[TIAB] NOT smoking[TIAB]― （#4）

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【Advanced Search】
検索ボックスの下にある「Advanced」をクリックすると、検索履歴を見ることができます。

検索履歴

図 5.11

Advanced Search 画面

件数をクリックすると検索結果一覧に戻る【検索履歴を利用した検索】

検索履歴は番号付けされ、新たな検索に利用することができます。
#1 の検索結果と lung[TIAB]を AND で掛け合わせたいときは、下記のように入力します。

①掛け合わせたい検索式を選んで履歴番号の「…」をクリックし、②「Query Box」に①で選んだ検索式が表示されるので、続けて「lung[TIAB]」を入力し、「Add query」をクリックする。

「Search」をクリックする。

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5.6 その他の機能
PubMed のトップページにはユーザーガイド、便利な機能、各種情報源へのリンクがあります。

詳細検索画面①②③④

図 5.12 PubMed トップページ① Learn

FAQs & User Guide
PubMed の詳細な検索方法、よくある質問などを知りたいときに有用なツールです。

② FindClinical Queries
臨床医学領域の文献検索に有用なツールです。研究デザインに着目したフィルターが、入力したキーワードに自動的に付与されて検索されます。また、システマティックレビューや遺伝学関係の文献も検索できます。

Single Citation Matcher
ある程度の文献情報がわかっている特定の論文を探すときに有用なツールです。
雑誌名、発行年、著者名などがあいまいでも検索できます。

③Download
Batch Citation Matcher
複数の特定論文を探すときに有用なツールです。

④Explore

MeSH Database
MeSH Terms（シソーラス用語）を調べるツールです。（5.4 参照）

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