NGSターゲットエンリッチメントソリューション

Mouse Exome Panel• 主要な遺伝子アノテーションデータ
ベースからの37.7 Mbの網羅的なカバレッジ• わずか5Gbのシーケンスで95%のターゲット領域を20xでカバー
主な利点• シーケンス効率のための比類なき均一性
シーケンスの全体コストを低減• 困難な領域のターゲットカバレッジをより深く
高感度バリアントコールのための複雑性の高いライブラリ• より優れた柔軟性
スケーラブルなスループットで、どんなワークフローにも円滑に統合可能

Twist Bioscience は、比類なき精度とスケールで DNA を合成するリーディングカンパニーであり、Twist Mouse Exomeパネルによってターゲットシーケンスの性能を再定義しました。

マウスは遺伝子のバリエーション、腫瘍変異、表現型の結果だけでなく、医薬品の治療効果を研究するためにも非常に重要なモデル系です。遺伝子変異データベースは継続的にアップデートされており、 Twist の Mouse Exome パネルは最新のデータベースを基に設計および構築されています。ライブラリ調製とターゲットエンリッチメント用試薬の広範な Twist ポートフォリオを組み合わせた完全なツールセットにより、研究者はシーケンスコストとサンプルスループットを最適化しながら、ターゲット領域全体にわたって、業界をリードするカバレッジを達成できます。
カバレッジ分布カバレッジ分布X倍のカバレッジでのターゲット塩基の割合(%)
X倍のカバレッジでのターゲット塩基の割合(%)
1001002.02.08080

ターゲット塩基の割合
ターゲット塩基の割合• マウスゲノムアセンブリ(mm10)に基づくターゲット塩基の割合
ターゲット塩基の割合

エクソームの定義

1.51.56060

1.01.04040

0.50.5202000

0.00.000

5050

100
100150150

カバレッジの深度
カバレッジの深度

200
20000

5050

100
100150150

カバレッジの深度
カバレッジの深度

200200

図1. Twist Mouse Exome Panelを使用したキャプチャにおける塩基カバレッジの分布。5Gbのシーケンスで、カバレッジ分布の分散が小さく、この頻度（左）でカバレッジ目標レベル以下にある塩基の数（右）が減ります。これまで典型的であった均一性の低さによる、偏ったカバレッジに起因する過剰なシーケンスとシーケンス不足の両方を改善します。広い範囲で異なるGC含量（％）に対して、バランスのとれたキャプチャプロファイルが得られます。

NGSターゲットエンリッチメントソリューション | TWIST BIOSCIENCE

ターゲットエンリッチメントの大変革
シーケンス解析を成功させるうえで重要となる要素は、読み取りの均一性に左右されるキャプチャ反応の質です。低いFold-80ベー
スペナルティで示されるように、より均一なキャプチャが、より均一なシーケンスにつながります。均一性が高いほど、シーケンスの読み取りがオンターゲットのカバレッジを上げ、無駄な読み取りを抑えることにつながります。
高い均一性は、プローブ設計アルゴリズム、シリコンベースの二本鎖DNAプローブの合成、均一な増幅を保証するキャリブレーションプ
ロセス、GC含有量、そしてすべてのターゲットにわたる濃縮性能を組み合わせた結果として達成されています。すべてのTwistプローブプールに対して行われるNGS QCによって、すべてのプローブが正しい濃度で存在していることが保証され、結果の再現性は製造工程に依存することはありません。

マウスの系統BALB
BAIT_TERRITORY

C57
41,736,401

設計効率0.9028平均ターゲットカバレッジ

63.937378

61.859357

Duplicate率(%)

3.7

4.0

均一性（Fold-80ベースペナルティ）

1.4

1.4

10x

96.1

96.6

20x

95.1

95.2

30x

92.9

92.1

ターゲット塩基%：図2. 2系統のマウスを使用したTwist Mouse ExomeキットのPicard指標。データは5 Gb (135x)シーケンスで得られました。

NGSワークフロー

設計

ライブラリ調製

ターゲットエンリッチメント

分析

シーケンス

図3. Twist Mouse Exome Panelを使用したTwistの高性能のターゲットエンリッチメントワークフローにより、高品質なデータが提供されますTWIST BIOSCIENCE | NGSターゲットエンリッチメントソリューション

Twist Mouse Exomeパネルの内容とコンポーネントのカスタマイズ
Twist Mouse Exome Panelは、既知のコード領域にフォーカスしています。スパイクインとしてTwistカスタムパネルを追加するだけでカバーされるターゲット範囲を拡大、研究のニーズに基づく差別化が可能になります。この戦略を使用して、例えば非翻訳領域(UTR)、ノンコーディングエレメント、調節エレメント、その他あらゆる興味ある領域のターゲットを追加できます。迅速な設計の最適化と生産納期を組み合わせることで、カスタムエクソームの全体的な開発時間を短縮します。
• エンリッチメントの追加
コンテンツ

均一性の高いコンテンツを追加• Core Exomeでカバーされる特定の遺伝子カバレッジを増加

拡張された
コンテンツ

• お客様によるスパイ
クイン割合の最適化

図4. カスタムコンテンツを追加した

り、特定のアプリケーション用に現在のコンテンツを増やすことができます。

あなたの研究。あなたのニーズ。あなたのキット。

すべての研究室でワークフローのニーズは同じわけではないため、汎用のソリューションに妥協してはいけません。
Twist Mouse Exomeパネルおよび関連するライブラリ調製試薬は、モジュール式にコンポーネントを選択できる柔軟性を提供します。4つのワークフロー構成に応じて組み合わせたCompleteキットを利用するか、または既存のプロセスへの影響を最小限に抑えながらコンポーネントを簡単に追加できます。

品質を妥協することなく、シーケンスランあたりのサンプルをより多く分析し、シングルプレックスまたはマルチプレックスで同様の濃縮効率を達成します。ワークフローを変える必要はありません。TwistのNGSソリューションはあらゆる研究ニーズを補完します。

NGSの製品ライン
ライブラリ調製

濃縮試薬

プローブ

Enzymatic Fragmentation

Universal Blockers

Catalog Panels

Mechanical Fragmentation

Enrichment Reagents

Custom Panels

アダプター

Fast Enrichment Reagents

Universal Adapters

Enrichment Beads

図5. Twist Mouse Exomeパネルを多様なモジュール式のキットと組み合わせることで、研究者は自身のワークフローに必要なコンポーネントを購入できます。各キットには1-plexから8-plexハイブリダイゼーションまでの16および96サンプル用試薬が含まれています。

妥協してはいけません
TWISTの利点を解明

高品質のプローブ合成

TwistのシリコンベースDNA合成プラットフォームによる優れた均一性と低エラー率で、高いライブラリ性能の指標と、マルチプレックスキャプチャでのシングルプレックスデータ品質を達成可能
改良されたデザイン

関連領域にフォーカスし、重要なデータを逃すことなくシーケンスコストを節約

二本鎖DNAプローブ

ゲノムの両方の鎖をターゲットにすることで感度を向上完成したプローブセットでのNGSベースQC

アッセイから不確実性と推測を排除柔軟でカスタマイズ可能なワークフロー

最小限の最適化でのワークフロー統合と、カスタムコンテンツの簡単な組み込みが可能なCompleteキット、モジュール式のライブラリ
調製、濃縮試薬

Twist マウスエクソームパネルは、 NGS ター
ゲットエンリッチメント用のTwist製品ポート
フォリオの一部です。
お問合せ先

twistbioscience.com/ngs
jsalescustomer@twistbioscience.com

DOC-001115 Rev 1.2

注文情報102035

Twist Mouse Exome Kit（2 反応分）
102036

Twist Mouse Exome Kit（12 反応分）
102037

Twist Mouse Exome Kit（96 反応分）

Twistの製品には Twistの供給規約と条件 (www.twistbioscience.com/supply-terms-and-conditions)に記載の一定の使用制限が適用されます。 NGSター
ゲットエンリッチメントパネルを設計および製造する Twist Bioscienceの品質管理システムは ISO 9001:2015およびISO 13485:2016認証を受けています(San Francisco, CA)。