京都⼤学⽣態学研究センター

業績⽬録Publication List
Center for Ecological Research, Kyoto University

第 31 巻 （2021 年）
2022（令和 4）年 3 ⽉
Volume 31（2021）
March, 2022

京都⼤学

⽣態学研究センター・業績⽬録

第31巻

京都⼤学⽣態学研究センター〒520-2113 滋賀県⼤津市平野2丁⽬509-3
Tel : (077) 549-8200（代表）
Fax : (077) 549-8201
センター⻑

中野伸⼀

Center for Ecological Research,
Kyoto University
2-509-3 Hirano, Otsu, Shiga,
520-2113, Japan
Home page: https://www.ecology.kyoto-u.ac.jp

はじめに⽣態学研究センター・業績⽬録 第31巻をお届け致します。2021年度における⽣態学研究センターのスタッフ、研究員、⼤学院⽣、研究⽣、および協⼒研究員の研究成果のリスト、ならびに共同利⽤・共同研究拠点としての活動状況の概要をまとめたものです。
⽣態学研究センター（以下、⽣態研）は「⽣態学の基礎研究の推進と⽣態学関連の国際共同研究の推進」を⽬的に、1991年度に全国共同利⽤施設として設置されました。その後、2001年度からは第⼆期⽣態学研究センターとなり、2010年度には「共同利⽤・共同研究拠点」として⽂科省の認定を受け、2016年度からは⽂科省により同拠点の継続を認定されています。2021年度、我々の拠点は⽂科省による期末評価を受け、評価結果「A」と⾼い評価を受けました。さらに、京都⼤学が⽣態研に対して課していた時限が2016年度より撤廃され、より⾃律的な運営を⾏っております。
⽣態研は、先端研究拠点事業、環境省地球環境研究推進費、CREST、最先端・次世代研究開発⽀援
プログラムなどの⼤型プロジェクトも進め、数多くの重要な研究成果を上げてきただけでなく、⻄太平洋アジア⽣物多様性研究ネットワーク（DIWPA）活動を通じて国際的な⽣物多様性研究の促進にも貢献しています。さらに、理学研究科の⼤学院教育を通じた教育活動も⾏ってきました。
⽣態研は、⽣物間相互作⽤から⽣まれる多様性創出のメカニズム、群集構造の解明、さらに物質循環プロセスから⽣じる⽣態系サービスを保全するための理論を構築することを⽬指しています。私達は、このような研究が、⽣物多様性を保全する意義を明確にし、⼈間と⾃然の持続的な共⽣を達成するために必要不可⽋なものと考えています。皆様におかれましては、今後ともご⽀援とご指導、ご鞭撻を賜りますよう、よろしくお願い申し上げます。
2022年3⽉
京都⼤学⽣態学研究センター⻑ 中野伸⼀

1

⽬ 次
活動報告 .......................................................................................................................................................................... 3
プロジェクト ................................................................................................................................................................ 8
著作リストの収録内容 ................................................................................................................................................ 13
A. Faculty 教員 ............................................................................................................................................................ 14
B. Graduate Students and Research Fellows 研究員・⼤学院⽣・研究⽣ ............................................................. 25
C. Collaborative Researchers 連携教員 ...................................................................................................................... 29
D. Affiliated Scientists 協⼒研究員 ............................................................................................................................. 30

⽣態研セミナー ............................................................................................................................................................ 36
共同利⽤・共同研究拠点事業 共同研究b採択⼀覧 ............................................................................................. 38
調査船「はす」運航及び利⽤実績表 ........................................................................................................................ 41

2

活動報告
⽣態学研究センターでは、2021年度に次のような共同利⽤事業およびセンター運営の活動を⾏いました。

１．プロジェクト
2021年度にセンターが⾏ったプロジェクトは46件であった（本号8-12ページ）。科学研究費助成事業による研究などが進められた。
２．DIWPA の活動

DIWPAは、ニュースレターNo.45を2021年7⽉に、No.46を2021年3⽉に、計⼆号を発⾏した。環境保全の観点
から紙媒体をとりやめ、Webでの発⾏のみで⾏うことにした。またDIWPAのWeb Siteの更新を⾏なった。また毎年⾏ってきたDIWPA International Field Biology Courseについては、世界的なCOVID-19の蔓延により、やむなく中⽌とした。

３．協⼒研究員センターとしての研究活動をより推進するために、学内外の研究者に協⼒研究員を委嘱している（任期2年間）。2021年度は23名が任命されていた（センターニュースNo.148にリスト、No.149に追加リスト）。

４．研究会など公募型共同利⽤・共同研究拠点事業

京都⼤学⽣態学研究センターは、設⽴以来、⽣態学に関する共同研究を推進する全国共同利⽤施設として機能してきたが 、2010年度4⽉より、「⽣態学・⽣物多様性科学における共同利⽤・共同研究拠点」として新たに発⾜した。この拠点始動にともない、これまでの「共同利⽤事業」を「共同利⽤・共同研究拠点事業」と改めた。これは、⽣態学の基礎研究の推進と⽣態学関連の共同研究の推進を⽬的として、本センター以外の機関に所属する教員または研究者と本センターの教員とが協⼒して⾏う共同研究を公募するものである。公募内
容は、国際共同研究、共同研究a・b、研究集会、ワークショップ、資料利⽤である。
予算措置のあるものとしては、以下のとおり2021年度に1件の国際共同研究、6件の共同研究a、2件の研究集会、4件のワークショップを採択した。新型コロナウイルス感染症拡⼤の影響を受け、国際共同研究が中⽌となった。
共同研究bの採択⼀覧は38-40ページに掲載。

国際共同研究：1)「Molecular mechanisms of circadian gating in plants across the seasons」
代表者：Antony Dodd（Department Cell & Developmental Biology, John Innes Centre, Norwich, UK）（新型コロナ感染症拡⼤の影響を受け、中⽌）共同研究 a：1)「異質倍数体植物の遺伝⼦発現パターンと気象情報からの表現型モデリング」
代表者：清⽔（稲継）理恵（Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of
Zurich, Switzerland）（センターニュースNo.150に掲載予定）

3

2)「冬春季の降⽔パターンが沿岸植物プランクトンに与える影響」
代表者：鈴⽊啓太（京都⼤学・フィールド科学教育研究センター（舞鶴⽔産実験所））（センターニュースNo.150に掲載予定）

3)「クローン性植物におけるエピジェネティック変異の継承とその適応的意義」
代表者：荒⽊希和⼦（⽴命館⼤学・⽣命科学部）（センターニュースNo.150に掲載予定）

4) 「微量測定⼿法による脊椎⾻の安定同位体⽐を⽤いたメコンオオナマズの⾷性解析」
代表者：三⽥村啓理（京都⼤学・フィールド科学教育研究センター）（センターニュースNo.150に掲載予定）

5)「洞爺湖内における⾷物網と⽔銀の⽣物蓄積課程におよぼす外来⽣物の影響解明」
代表者：中⾕暢丈（酪農学園⼤学⼤学院・酪農学研究科）（センターニュースNo.150に掲載予定）

6)「Molecular mechanisms of circadian gating in plants across the seasons」
代表者：Antony Dodd（Department Cell & Developmental Biology, John Innes Centre, Norwich, UK）（センターニュースNo.150に掲載予定）

研究集会：

1)

「シカの脅威と次世代型森林再⽣のロードマップ研究集会 Ashiu Ecosystem Restoration (AER) Project」
代表者：⾨脇浩明（京都⼤学・⽩眉センター（連携：農学研究科））
実施期⽇（場所）：2021年7⽉29⽇・30⽇（オンライン開催）
講師：8名
参加者：223名（センターニュースNo.149に掲載）

2)「アナンデールの極東旅⾏から100年-琵琶湖の⽣物多様性はどこまで明らかになったか」
代表者：⻄野⿇知⼦（元・びわこ成蹊スポーツ⼤学）
実施期⽇（場所）：2021年8⽉21⽇（オンライン開催）
講師：14名
参加者：84名（センターニュースNo.149に掲載）

4

ワークショップ：1)「若⼿研究者のための夏季観測プログラム in 琵琶湖」
代表者：中野伸⼀（京都⼤学・⽣態学研究センター）（新型コロナ感染症拡⼤の影響を受け、中⽌）2)「脱窒菌同位体⽐測定法ワークショップ 2021」
代表者：⽊庭啓介（京都⼤学・⽣態学研究センター）
実施期⽇（場所）：2021年5⽉25・27⽇（京都⼤学⽣態学研究センター・オンライン）
スタッフ：5名
参加者：8名（センターニュースNo.149に掲載）

3)「安定同位体⽣態学ワークショップ 2021」
代表者：⽊庭啓介（京都⼤学・⽣態学研究センター）
実施期⽇（場所）：2021年7⽉26⽇〜9⽉15⽇（京都⼤学 ⽣態学研究センター・オンライン）
スタッフ：7名
参加者：19名（センターニュースNo.150に掲載予定）

4)「微⽣物を軸とした群集構造研究の統合とさらなる展開」
代表者：⼭内淳（京都⼤学・⽣態学研究センター）
実施期⽇（場所）：2021年9⽉24⽇（オンライン開催）
講師：9名
参加者：219名（センターニュースNo.149に掲載）

５．シンポジウム等

シリーズ公開講演会第13回「病気をめぐる⽣態学：疫学モデルから⾒えること」を2022年2⽉19⽇に開催した。
新型コロナウイルス感染症拡⼤防⽌のため、オンラインにより配信を⾏い、当⽇は80名ほどのアクセスがあった。3名の講師の⽅をお招きし、疫学の歴史から紐解いてその発展をお話しいただいた。

６．⽣態研セミナー

このセミナーは⽣態学研究センターの共通セミナーとして定期的に開催。2021年度には10回開催した。毎⽉1回（原則として第3⾦曜⽇）、通常毎回2名に話題を提供していただいた。今年度は新型コロナウイルス感染症
拡⼤防⽌のため、オンラインにより配信を⾏った。センター外から20名の講演者があった。参加⼈数は各回30名から80名、延べ501名であった（本号36-37ページ）。

5７．オープンキャンパス、公開授業

⽣態学や⽣態学研究センターの研究を紹介するイベントとして、オープンキャンパス2021を4⽉2⽇、新型コロ
ナウイルス感染症拡⼤防⽌のため、オンライン配信により開催した。また、理学研究科⽣物科学専攻と共同で⽣物系合同⼊試説明会を4⽉24⽇に開催した。
その他の講演会等は以下の通り。
・10⽉23⽇ ⼀般公開「学校で習わない⽣き物の不思議」（⽣態研にて開催、26名参加）
・⾼校⽣および中学⽣対象の講義2回（詳細はセンターニュースNo.150に掲載予定）

８．ニュースレターの発⾏センターの活動を全国の⽣態学に興味を持たれている⽅々に知っていただくため、ニュースレターを発⾏した。2021年度は第148号（7⽉31⽇）、第149号（1⽉31⽇）
を発⾏した。現在、個⼈229件、機関275件、計504件に送付している。ニュースレターでは、⽣態学研究センターの活動のみならず、広く⽣態学⼀般の情報を提供している。

９．共同利⽤施設の使⽤状況

1)

⼤型分析機器：安定同位体関係では、2021年度は、2009年度導⼊の炭素・窒素同位体⽐オンライン⾃動分析装置（元素分析計）、酸素・⽔素同位体⽐オンライン⾃動分析装置（熱分解型元素分析計）、
GC/C（ガスクロ燃焼装置付き前処理装置）、LC/C（⾼速液体クロマトグラフ付き前処理装置）を装備
した安定同位体⽐質量分析計DELTA V Plus、2013年度導⼊のPreCon-GasBench II（⾃動濃縮装置付き気体導⼊インターフェイス）、元素分析計、GC/C を装備した安定同位体⽐質量分析計DELTA V
Advantage の計2台が稼働した。2021年度に おける利⽤⽇数はDELTA V Plus、DELTA V Advantageそれ
ぞれ、122⽇、101⽇であった。利⽤延べ⼈数は、それぞれ189⼈、150⼈で、このうち98⼈、63⼈が学内・学外からの共同利⽤・共同研究であった。新型コロナウイルス感染拡⼤防⽌のために、共同利⽤停⽌期間がのべ3.5ヶ⽉あり、来訪⼈数、部屋あたりの作業⼈数を制限したために、稼働⽇数および利⽤延
べ⼈数は減少している。

2021年度の「安定同位体⽣態学」に関する共同利⽤者及び共同研究者の所属機関・部局は、学内では理学部、地球環境学堂、情報学研究科、学外では、北海道⼤学、酪農学園⼤学、福井県⽴⼤学、近畿⼤学、
神⼾⼤学、滋賀県琵琶湖環境科学研究センター、（地独）⼤阪府⽴環境農林⽔産総合研究所などであった。
2021年度も前年度に引き続き「安定同位体⽣態学ワークショップ」および「脱窒菌同位体⽐測定法ワー
クショップ」を開催した。どちらも完全オンラインで実施した。これらのワークショップは、安定同位体⽣態学に関する意⾒交換および初⼼者に対する講習を⾏うこと、さらには発展的な内容の測定⽅法を共有することで、共同利⽤・共同研究拠点としての機能を果たすことを⽬的としている。また、安定同位体メーリングリストを主催し、利⽤に関するスケジュール調整を⾏うほか、研究情報の交換も⾏っている。さらに、新しい利⽤者に情報提供するために、安定同位体⽣態学共同研究・安定同位体⽐質量分
析計共同利⽤に関するホームページを設けて、情報発信を⾏なっている。ホームページアドレスは、
https://www.ecology.kyoto-u.ac.jp/~cermass/cermass/である。
分⼦解析関係の DNA 分析システムは、PCR、リアルタイム PCR（遺伝⼦発現定量装置）、DNA シーケ
ンサー、次世代シーケンサー、フローサイトメーターから構成されている。2021年度における、これらの機器の利⽤⼈数は43名で、うち10名が学外からの共同利⽤であった。あわせて延べ1433⼈⽇の利⽤があった。

シンバイオトロン：シンバイオトロンは、物理・化学・⽣物的複合環境を⼈為的に制御できる⼤型実験施設である。本施設は、⿂類などの⼤型⽔⽣動物の相互作⽤も対象とした⽔域研究のためのモジュール、動植物の⽣物間相互作⽤を解析する陸域研究のためのモジュールから構成される。本年度は、三栄養段階⽣物間
相互作⽤、植物間コミュニケーション、植物の揮発性物質受容機構、植物の誘導的間接防衛の分⼦機構等

6に関する共同研究を実施した。今後もシンバイオトロンの稼動状況を⾼めるために、国内外を問わず、広く共同利⽤・共同研究の促進を図っていきたい。

実験圃場および森林区（CER の森）
・鉢棚・実験池：⽣態学研究センターには実験圃場（実験林園を含む）、

森林区（CER の森）、鉢棚、実験池があり、センターのメンバーだけでなく全国共同利⽤施設としてセンター外の研究者・学⽣にも利⽤されている。実験圃場・林園、鉢棚、実験池では操作実験等が、CER の森
ではできるだけ⾃然のままの状態での⽣物観察が⾏われている。2021年度は、5件の共同利⽤を受け⼊れ、センター外の利⽤者は14名であった（センター構成員の利⽤をのぞく）。

琵琶湖調査船「はす」：⾼速調査船「はす」（全⻑12.5m、総トン数8.5トン、巡航速度20ノット）は、琵琶湖における調査・実習に関わる全国共同利⽤に広く活⽤されている。主な航海・観測機器として、DGPS、レー
ダー、オートパイロット、⿂群探知機、真⾵向⾵速計、流向流速計、ジャイロコンパス、デジタル⽔温計、
航法インターフェイス、ダビットウィンチ、アーマードケーブルを備え、CTD観測（SEB911、RINKOProfiler）、採⽔、採泥、プランクトン・ベントス採集など、⾼度な陸⽔観測を含む様々な調査・研究に対応している。本調査船の運航および共同利⽤の窓⼝は、技術職員と研究員の2名が担当している。
「はす」を⽤いて実施している定期観測の結果は、⻑期陸⽔モニタリング・データベースとしてセンターHPにおいて⼀般公開されており、琵琶湖研究の貴重な基礎資料として活⽤されている。2021年度は、琵琶湖の⽣態系や⽣物多様性に関する研究、および⽣物地球化学的な循環に関する研究のために利⽤され、総運航⽇数は52⽇、延べ乗船者数は196名、延べ共同利⽤者数は230名、延べ研究課題数は120件であった（本号41-43ページ）。

１０．運営委員会・共同利⽤運営委員会の開催

2021年
11⽉2⽇

共同利⽤運営委員会（第30回）

2022年
3⽉10⽇

運営委員会（第74回）

3⽉10⽇

共同利⽤運営委員会（第31回）（オンライン開催）

7

プロジェクト
2021年度の、⽂部科学省科学研究費などによるプロジェクトをまとめました。研究者は代表者を筆頭とし、センタースタッフは下線で⽰し、センタースタッフ以外の研究分担者については省略してあります。

⼯藤洋・本庄三恵他
変動環境下での頑健な応答を⽀える⻑期クロマチン記憶
2021-2025 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別推進研究）

彦坂幸毅（東北⼤学）
・⽊庭啓介他
炭素貯留を最⼤にする最適な森林の予測
2021-2025 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（学術変⾰領域研究（A））

髙林純⽰
植物間コミュニケーション現象を利⽤した農業⽣産技術の基盤形成
2018-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

東樹宏和・⽊庭啓介他
先端技術の融合で解き明かす地下⽣態系のブラックボックス
2018-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

⽊庭啓介
多重同位体標識窒素化合物（MILNC）による超⾼精度窒素循環解析
2018-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

東⾕篤志（東北⼤学）
・⼯藤洋他
イネ冷害におけるエピジェネティックな制御機構の解明
2018-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

⽯⽥厚
世界⾃然遺産の⼩笠原の乾性低⽊林樹⽊の乾燥耐性の解明と温暖化影響下での森林保全
2018-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

⼯藤洋
季節応答におけるエピジェネティックヒストン修飾の機能
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

8

⼭路恵⼦（筑波⼤学）
・⽯⽥厚他
鉱⼭跡地の⾃⽣植物と⼟着微⽣物を利⽤した新しい緑化技術の構築
2019-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

⼤河内直彦（海洋研究開発機構）
・⽊庭啓介他⽣物アーカイブ試料を⽤いた⼈新世の解析：琵琶湖におけるケーススタディ
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A））

⽯⽥厚
タイ低地熱帯季節林の森林タイプの成⽴要因と降⽔量シフトによる森林機能への影響評価
2016-2021

⽇本学術振興会

科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（A）海外）

中野伸⼀
湖沼深⽔層に卓越する微⽣物の世界
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

森茂太（⼭形⼤学）・⽯⽥厚他
芽⽣え〜⼤⽊への成⻑を牽引する個体呼吸の根系/地上配分シフト
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

松井健⼆（⼭⼝⼤学）
・髙林純⽰他
植物「嗅覚（揮発性化合物を認識し⽣体シグナルへと変換する過程）」の解明
2019-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

宮正樹（千葉県⽴中央博物館）
・潮雅之
多地点・⾼頻度環境ＤＮＡ観測に基づく⿂類群集構造の変動様式と形成・維持機構の解明
2019-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

尾坂兼⼀（滋賀県⽴⼤学）・⽊庭啓介他
温暖化に伴う湖沼の⽔循環プロセスの変化が湖底堆積物中の脱窒に与える影響
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

酒井章⼦
花圏に優占するスフィンゴモナス属細菌の植物との共⽣関係と地理的変異
2020-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

9

潮雅之
⽔域⽣態系の宿主-寄⽣者系をモデルとした野外⽣態系動態の制御に向けた枠組み構築
2020-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

太⽥⺠久（富⼭⼤学）
・佐藤拓哉他
ウロコの同位体⽐を利⽤した、⿂類の⽣活史推定⼿法の開発とその応⽤
2020-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

佐藤拓哉
⽣物群集が創発する寄⽣者制御：宿主多様性による感染動態安定化機構の理論と実証
2021-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

⼭⼝保彦（琵琶湖環境科学センター）
・中野伸⼀・⽊庭啓介他
微⽣物窒素ポンプ：貧栄養⽔域への未知の栄養塩供給経路を実証する
2021-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

阪⼝翔太（京都⼤学地球環境学堂）
・福島慶太郎他
⽣態ゲノミクスによる野⽣植物の平⾏進化機構の解明
2021-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

⾨脇浩明（京都⼤学⽩眉センター）・本庄三恵他
シカ⾷害が招く森林衰退：植物⼟壌フィードバックに着⽬して2021-2025 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（基盤研究（B））

⼩澤理⾹
チョウ⽬昆⾍が植物の防衛機構を回避するシステムの解明
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（基盤研究（C））

⼭内淳
単細胞⽣物におけるプログラム細胞死の進化に関する数理⽣態学的研究
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（基盤研究（C））

後藤晶⼦
シダ、裸⼦植物の直鎖飽和アルキル脂質の同位体⽐測定：陸上植物指標の理解に向けて
2020-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（基盤研究（C））

10

⼩林剛（⾹川⼤学）
・福島慶太郎他
⽇本におけるタケ類の開花現象の実態とその⽣態系影響2020-2024 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（基盤研究（C））

槻⽊玲美（松⼭⼤学）
・本庄三恵他
湖沼⽣態系への温暖化対策の影響解明に向けた環境DNAによる新たな評価⼿法の構築
2021-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（基盤研究（C））

東樹宏和
微⽣物群集10000実験による多種⽣命システムの動態予測と制御
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（挑戦的研究（開拓））⽯⽥厚
葉内ポリアミンによる光合成低下の補償作⽤の検証と陸域⽣態系保全
2021-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（挑戦的研究（萌芽））佐藤拓哉
景観構造が創発する⽣活史多様性とそれがもたらす集団動態の安定化機構の解明
2020-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（国際共同研究強化（B））

古川沙央⾥
種⼦⾷性昆⾍の送粉共⽣系における寄⽣者の進化的背景の解明
2020-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（研究活動スタート⽀援）

福島慶太郎
森林における植物 - ⼟壌系内部循環と斜⾯⽔移動の統合モデルによる窒素流出機構の解明
2017-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（若⼿研究（B））

⼤⻄雄⼆微⽣物核酸の同位体⽐測定による新たな⽣態系構造解析⼿法の確⽴
2021-2023 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（学術研究助成基⾦助成⾦）（若⼿研究）

湯本原樹
標⾼適応と季節的可塑性における葉の温度適応メカニズムの解明
2019-2021 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別研究員奨励費）

11

⼤⻄雄⼆
⽔⽣動物における安定同位体濃縮係数の変動要因：栄養⽣態と安定同位体の統合
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別研究員奨励費）

藤⽥博昭
複雑細菌群集の時系列データを⽤いた安定性予測と操作実験による群集動態の制御
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別研究員奨励費）

東樹宏和・CANARINI Alberto
化学⽣態学で解き明かす植物-微⽣物叢相互作⽤：鉄⽋乏⼟壌における共⽣系
2020-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別研究員奨励費）

蒋梦琦
⽣態学的化学量論による植物プランクトンと細菌群集との相互作⽤の検討
2021-2022 ⽇本学術振興会 科学研究費助成事業（科学研究費補助⾦）（特別研究員奨励費）

⼯藤洋
フィールド・エピジェネティクス：環境変動下での頑健性の基盤
2015-2021 科学技術振興機構 CREST

東樹宏和
⽣態系レベルの⽣物機能最適化を実現する越境科学フロンティア
2021-2023 科学技術振興機構 創発的研究⽀援事業

東樹宏和
N2O 無害化の機能を安定的に実装する微⽣物叢制御⼿法の開発
2020-2022 国⽴研究開発法⼈新エネルギー・産業技術総合開発機構 ムーンショット型研究開発事業

佐藤拓哉
流域⽣態系における回遊性甲殻類の移動とその⽣態系機能の評価⼿法開発
2021 公益財団法⼈リバーフロント研究所 国交省（河川⽣態系ネットワーク保全⼿法調査検討業務）

東樹宏和
DNA分析による⽣物多様性評価の⼿法検討
2021-2023 農林⽔産省 連携研究スキームによる研究（委託研究課題）

その他、企業との共同研究2件が進められた。

12

著作リストの収録内容
1． 第31巻著作リストには⽣態学研究センターの構成員（教員、研究員、⼤学院⽣、研究⽣）および連携教員、協⼒研究員が、2021年（2021年1⽉1⽇から2021年12⽉31⽇まで）に印刷物あるいは電⼦出版物として発表した著作を、原則として印刷物としての発表を優先して収録します。
（当センターの業績⽬録を「年度」ではなく、「年」で区切るのは、英⽂の原著論⽂や本の場合、出版された「⽉」までは記載されず、発表された年度を判別することが困難なためです。
）
ただし、業績⽬録作成時には発表年が確定していない印刷中（in press）のもの、あるいは印刷物としての発表年が2022年以降になるものでも、電⼦ジャーナルに2021年に掲載が確定しているものにつきましては、電⼦出版物としての発表を優先します。その場合、DOI（Digital Object Identifier：電⼦化された著作物につけられる識別コード）をつけて2021年の業績として収録することになります。（業績の早期掲載と収録漏れを防ぐためです。DOI により⽂献検索が可能です。
）

2． 配列は、（A）教員（B）研究員・⼤学院⽣・研究⽣（C）連携教員（D）協⼒研究員 のそれぞれについて、名前のアルファベット順です。教員については、著作の種別（「査読付き英⽂論⽂（総説含む）」、「その他出版物（著書・⽇本語論⽂・エッセイなど）」、「講演（学会発表・アウトリーチ活動など）」）ごとに⽰しています。

3． 協⼒研究員については、著作リストに載せる・載せないは、各研究員の⾃由意志とし、「載せてもよい」と判断された⽅の、そして判断された著作だけを収録しています。
ご協⼒ありがとうございました。

13

A. Faculty

教員

査読付き英⽂論⽂（総説含む）

ISHIDA, Atsushi

⽯⽥ 厚（教授）

Ishida A, Nakamura T, Saiki ST, Yoshimura J, Kakishima S (2021) Evolutionary loss of thermal acclimation accompaniedby periodic monocarpic mass flowering in Strobilanthes flexicaulis. Scientific Reports 11: 14273. DOI:
10.1038/s41598-021-93833-1.
Nakamura T, Ishida A, Kawai K, Minagi K, Saiki ST, Yazaki K, Yoshimura J (2021) Tree hazards compounded bysuccessive climate extremes after masting in a small endemic tree, Distylium lepidotum, on subtropical islands inJapan. Global Change Biology 27(20): 5094-5108. DOI: 10.1111/gcb.15764.
Doyama K, Yamaji K, Haruma T, Ishida A, Mori S, Kurosawa Y (2021) Zn tolerance in the evergreen shrub, Aucuba
japonica, naturally growing at a mine site: Cell wall immobilization, aucubin production, and Zn absorption on
fungal mycelia. Plos One 16(9): e0257690. DOI: 10.1371/journal.pone.0257690.

KOBA, Keisuke

⽊庭 啓介（教授）

Wei W, Isobe K, Shiratori Y, Yano M, Toyoda S, Koba K, Yoshida N, Shen HY, Senoo K (2021) Revisiting the
involvement of ammonia oxidizers and denitrifiers in nitrous oxide emission from cropland soils. Environmental
Pollution 287: 117494. DOI: 10.1016/j.envpol.2021.117494.
Ding XH, Lan WS, Li YL, Yan AX, Katayama Y, Koba K, Makabe A, Fukushima K, Yano M, Onishi Y, Ge QY, Gu JD(2021) An internal recycling mechanism between ammonia/ammonium and nitrate driven by ammonia-oxidizing
archaea and bacteria (AOA, AOB, and Comammox) and DNRA on Angkor sandstone monuments. International
Biodeterioration & Biodegradation 165(1): 105328. DOI: 10.1016/j.ibiod.2021.105328.
Chen CJ, Liu XY, Wang XW, Hu CC, Xu SQ, Mao R, Bu ZJ, Fang YT, Koba K (2021) Different leaf carbon, nitrogen,and phosphorus stoichiometry and carbon and nitrogen isotopes among peatland plants in northeastern China. Plant
and Soil 467(1-2): 345-357. DOI: 10.1007/s11104-021-05085-7.

KUDOH, Hiroshi

⼯藤 洋（教授）

Kawakatsu Y, Sakamoto T, Nakayama H, Kaminoyama K, Igarashi K, Yasugi M, Kudoh H, Nagano AJ, Yano K, Kubo N,
Notaguchi M, Kimura S (2021) Combination of genetic analysis and ancient literature survey reveals the divergenceof traditional Brassica rapa varieties from Kyoto, Japan. Horticulture Research 8: 132. DOI: 10.1038/s41438-02100569-0.
Araki KS, Tsujimoto M, Iwasaki T, Kudoh H (2021) Life-history monographs of Japanese plants 14: Cardamine leucantha(Tausch) O. E. Schulz (Brassicaceae). Plant Species Biology 36(4): 542-553. DOI: 10.1111/1442-1984.12345.
Akiyama R, Briskine, RV, Gan XC, Hatakeyama M, Kudoh H, Lischer HEL, Sese J, Shimizu KK, Shimizu-Inatsugi R,
Sun JQ (2021) Fine-scale empirical data on niche divergence and homeolog expression patterns in an allopolyploidand its diploid progenitor species. New Phytologist 229 (6): 3587-3601. DOI: 10.1111/nph.17320.
Soga E, Sugisaka J, Watanabe M, Kudoh H (2021) Population differentiation in the leaf shape and growth form of
Cardamine scutata Thunb. in tidal and non-tidal habitats. Plant Species Biology 36 (3): 399-411. DOI: 10.1111/14421984.12325.
Buzas DM, Nishio H, Kudoh H (2021) The flowering season-meter at FLOWERING LOCUS C across life histories in
Crucifers. Frontiers in Plant Science 12: 640442. DOI: 10.3389/fpls.2021.640442.

14

Yumoto G, Sasaki-Sekimoto Y, Aryal B, Ohta H, Kudoh H (2021) Altitudinal differentiation in the leaf wax-mediatedflowering bud protection against frost in a perennial Arabidopsis. Oecologia 195 (3): 677-687. DOI: 10.1007/s00442021-04870-6.
Kyan R, Kimura T, Yamashiro T, Fujii S, Sakaguchi S, Ito M, Nagano AJ, Kudoh H, Maki M (2021) Phylogeographic anddemographic modeling analyses of the multiple origins of the rheophytic goldenrod Solidago yokusaiana Makino.
Heredity 126: 831–845. DOI: 10.1038/s41437-021-00408-x.

NAKANO, Shin-ichi

中野 伸⼀（教授）

Jiang MQ, Nakano S (2021) Application of image analysis for algal biomass quantification: a low-cost and non-destructive
method based on HSI color space. Journal of Applied Phycology 33: 3709-3717. DOI: 10.1007/s10811-021-02571-4.
Liu Y, Chen YX, Fang HY, Lu HY, Wu XQ, Yu GL, Nakano S, Li RH (2021) Relationship between morphospecies andmicrocystin-producing genotypes of Microcystis species in Chinese freshwaters. Journal of Oceanology and
Limnology 39(9): 1-12. DOI:10.1007/s00343-020-0276-2.
Takeuchi Y, Muraoka H, Yamakita T, Kano Y, Nagai S, Bunthang T, Costello MJ, Darnaedi D, Diway B, Ganyai T,
Grudpan C, Hughes A, Ishii R, Lim PT, Ma KP, Muslim AM, Nakano S, Nakaoka M, Nakashizuka T, Onuma M, Park
CH, Pungga RS, Saito Y, Shakya MM, Sulaiman MK, Sumi M, Thach P, Trisurat Y, Xu XH, Yamano H, Yao TL, Kim
ES, Vergara S, Yahara T (2021) The Asia-Pacific Biodiversity Observation Network: 10-year achievements and new
strategies to 2030. Ecological Research 36(2): 232-257. DOI: 10.1111/1440-1703.12212.
Cai J, Hodoki Y, Nakano S (2021) Phylogenetic diversity of the picocyanobacterial community from a novel winter bloomin Lake Biwa. Limnology 22(2): 161-167. DOI:10.1007/s10201-020-00649-5.
Okazaki Y, Fujinaga S, Salcher MM, Callieri C, Tanaka A, Kohzu A, Oyagi H, Tamaki H, Nakano S (2021) Microdiversity
and phylogeographic diversification of bacterioplankton in pelagic freshwater systems revealed through long-read
amplicon sequencing. Microbiome 9(1): 24. DOI: 10.1186/s40168-020-00974-y.
Weilhoefer CL, Nakano S, Deb S, Fukushima K (in press) Nutrient limitation of primary production in rivers in the Lake
Biwa Basin, Shiga Prefecture, Japan. Aquatic Ecology.

SAKAI, Shoko

酒井 章⼦（教授）

Ueno H, Araya K, Meleng P, Kaliang CH, Sakai S, Kishimoto-Yamada K, Kon M, Itioka T, Satake A (2021) Six-year
population dynamics of seven passalid species in a humid tropical rainforest in Borneo. Entomological Science 24(4):399-409. DOI: 10.1111/ens.12490.
Marre M, Ushio M, Sakai S (2021) Contrasting microbial communities on male and female flowers of a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Environmental DNA. DOI: 10.1002/edn3.271.
Marre M, Ushio M, Sakai S (in press) The effects of the floral infection by a bacterial pathogen in a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Population Ecology. DOI: 10.1002/1438-390X.12110.

SATO, Takuya

佐藤 拓哉（准教授）

Uno H, Fukushima K, Kawamura M, Kurasawa A, Sato T (in press) Direct and indirect effects of amphidromous shrimps
on nutrient mineralization in streams in Japan. Oecologia 198(2): 493-505. DOI:10.1007/s00442-022-05119-6.
Noda S, Ueda R, Tanaka T, Shirai K, Kishi D, Sato T (2021) Anadromous red-spotted masu salmon (Oncorhynchus masou
ishikawae), a southernmost sea-migration form of salmonid, displays low variation in both age at seaward migrationand sea age. Journal of fish biology 99(4): 1497-1502. DOI: 10.1111/jfb.14818.

15

Ueda R, Takeshima H, Sato T (2021) Difficulty in sex identification of two local populations of red-spotted masu salmon
using two salmonid male-specific molecular markers. Ichthyological Research 69: 275–279. DOI: 10.1007/s10228021-00837-y.
Obayashi N, Iwatani Y, Sakura M, Tamotsu S, Chiu MC, Sato T (2021) Enhanced polarotaxis can explain water-entry
behaviour of mantids infected with nematomorph parasites. Current biology: CB 31(12): R777-R778. DOI:
10.1016/j.cub.2021.05.001.
Sato T, Ueda R, Takimoto G (2021) The effects of resource subsidy duration in a detritus-based stream ecosystem: A
mesocosm experiment. The Journal of animal ecology 90(5): 1142-1151. DOI: 10.1111/1365-2656.13440.

TAKABAYASHI, Junji髙林 純⽰（教授）

Sugimoto K, Iijima Y, Takabayashi J, Matsui K (2021) Processing of airborne green leaf volatiles for their glycosylation in
the exposed plants. Frontiers in Plant Science 12: 721572. DOI: 10.3389/fpls.2021.721572.
Fukushima J, Kuramitsu K, Takabayashi J, Kainoh Y (2021) Delayed response after learning associated with oviposition
experience in the larval parasitoid Cotesia kariyai (Hymenoptera: Braconidae). Journal of Insect Behavior. DOI:
10.1007/s10905-021-09786-w.
Valea I, Motegi A, Kawamura N, Kawamoto K, Miyao A, Ozawa R, Takabayashi J, Gomi K, Nemoto K, Nozawa A,
Sawasaki T, Shinya T, Galis I, Miyamoto K, Nojiri H, Okada K (2021) The rice wound-inducible transcription factor
RERJ1 sharing same signal transduction pathway with OsMYC2 is necessary for defense response to herbivory andbacterial blight. Plant Molecular Biology. DOI:10.1007/s11103-021-01186-0.
Yoshida K, Uefune M, Ozawa R, Abe H, Okemoto Y, Yoneya K, Takabayashi J (2021) Effects of prohydrojasmon on thenumber of infesting herbivores and biomass of field-grown Japanese radish plants. Frontiers in Plant Science 12:695701. DOI: 10.3389/fpls.2021.695701.
Hagiwara T, Ishihara MI, Takabayashi J, Hiura T, Shiojiri K (2021) Effective distance of volatile cues for plant-plantcommunication in beech. Ecology and Evolution 11(18): 12445-12452. DOI: 10.1002/ece3.7990.
Nishidono Y, Niwa K, Kitajima A, Watanabe S, Tezuka Y, Arita M, Takabayashi J, Tanaka K (2021) α-Linolenic acid in
Papilio machaon larvae regurgitant induces a defensive response in Apiaceae. Phytochemistry 188: 112796. DOI:
10.1016/j.phytochem.2021.112796.
Uefune M, Yoneya K, Yamamoto M, Takabayashi J (2021) The use of synthetic herbivory-induced plant volatiles that
attract specialist parasitoid wasps, Cotesia vestalis, for controlling the incidence of diamondback moth larvae in open
agricultural fields. Frontiers in Ecology and Evolution 9: 702314. DOI: 10.3389/fevo.2021.702314.
Shiojiri K, Ozawa R, Uefune M, Takabayashi J (2021) Field-grown rice plants become more productive when exposed toartificially damaged weed volatiles at the seedling stage. Plants. Frontiers in Plant Science 12: 692924. DOI:
10.3389/fpls.2021.692924.

TOJU, Hirokazu

東樹 宏和（准教授）

Kadowaki K, Yamamoto S, Sato H, Tanabe AS, Toju, H (2021) Aboveground herbivores drive stronger plant speciesspecific feedback than belowground fungi to regulate tree community assembly. Oecologia 195(3): 773-784. DOI:
10.1007/s00442-021-04868-0.
Hori Y, Fujita H, Himura K, Narisawa K, Toju H (2021) Synergistic and offset effects of fungal species combinations onplant performance. Frontiers in Microbiology 12:713180.

16

UNO, Hiromi

宇野 裕美（特定准教授）

Fitzgerald KA, Haworth MR, Bestgen KR, Farrell CJ, Utsumi S, Kishida O, Uno H, Kanno Y (2021) Hatching timing of
two subarctic salmonids in a stream network estimated by otolith increments spatial scales. Fisheries Managementand Ecology 28(6): 507-515. DOI: 10.1111/fme.12504.
Kanno Y, Harris AC, Kishida O, Utsumi S, Uno H (2021) Complex effects of body length and condition on stream
salmonid movement at multiple. Ecology of Freshwater 00: 1-13. DOI: 10.1111/eff.12632.
Uno H, Yokoi M, Fukushima K, Kanno Y, Kishida O, Mamiya W, Sakai R, Utsumi S (2021) Spatially variablehydrological and biological processes shape diverse post-flood aquatic communities. Freshwater Biology. DOI:
10.1111/fwb.13862.
Uno H, Fukushima K, Kawamura M, Kurasawa A, Sato T (in press) Direct and indirect effects of amphidromous shrimps
on nutrient mineralization in streams in Japan. Oecologia 198(2): 493-505. DOI:10.1007/s00442-022-05119-6.

YAMAUCHI, Atsushi

⼭内 淳（教授）

Yamauchi A, Ito K, Shibasaki S (2021) Colonization process determines species diversity via competitive quasi-exclusion.
Ecology and Evolution 11(9): 4470-4480. DOI: 10.1002/ece3.7342.
Yamauchi A, Ikegawa Y, Ohgushi T, Namba T (2021) Density regulation of co-occurring herbivores via two indirect
effects mediated by biomass and non-specific induced plant defenses. Theoretical Ecology 14: 41–55. DOI:
10.1007/s12080-020-00479-2.

＜⽩眉プロジェクト教員＞
USHIO, Masayuki

潮 雅之（特定准教授-⽩眉-）

Marre M, Ushio M, Sakai S (2021) Contrasting microbial communities on male and female flowers of a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Environmental DNA. DOI: 10.1002/edn3.271.
Chang C-W, Miki T, Ushio M, Ke P-J, Lu H-P, Shiah F-K, Hsieh C-H (2021) Reconstructing large interaction networks
from empirical time series data. Ecology letters 24(12): 2763-2774. DOI: 10.1111/ele.13897.
Sato M, Inoue N, Nambu R, Furuichi N, Imaizumi T, Ushio M (2021) Quantitative assessment of multiple fish species
around artificial reefs combining environmental DNA metabarcoding and acoustic survey. Scientific Reports 11(1):19477. DOI: 10.1038/s41598-021-98926-5.
Matsuoka S, Sugiyama Y, Shimono Y, Ushio M, Doi H (2021) Evaluation of seasonal dynamics of fungal DNA
assemblages in a flow-regulated stream in a restored forest using eDNA metabarcoding. Environmental Microbiology
23(8): 4797-4806. DOI: 10.1111/1462-2920.15669.
Doi H, Yasuhara M, Ushio M (2021) Causal analysis of the temperature impact on deep-sea biodiversity. Biology Letters
17(7): 20200666. DOI: 10.1098/rsbl.2020.0666
Fukasawa Y, Matsukura K, Stephan JG, Makoto K, Suzuki SN, Kominami Y, Takagi M, Tanaka N, Takemoto S, Kinuura
H, Okano K, Song Z, Jomura M, Kadowaki K, Yamashita S, Ushio M (2021) Patterns of community composition anddiversity in latent fungi of living Quercus serrata trunks across a range of oak wilt prevalence and climate variables inJapan. Fungal Ecology. DOI: 10.1016/j.funeco.2021.101095.
Kawatsu K, Ushio M, van Veen FJF, Kondoh M (2021) Are networks of trophic interactions sufficient for understanding
the dynamics of multi-trophic communities? Analysis of a tri-trophic insect food-web time-series. Ecology Letters24(3): 543-552. DOI: 10.1111/ele.13672.

17

Kitayama K, Ushio M, Aiba S-I (2021) Temperature is a dominant driver of distinct annual seasonality of leaf litter
production of equatorial tropical rain forests. Journal of Ecology 109 (2):727–73. DOI: 10.1111/1365-2745.13500.
Marre M, Ushio M, Sakai S (in press) The effects of the floral infection by a bacterial pathogen in a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Population Ecology. DOI: 10.1002/1438-390X.12110.

その他出版物（著書・⽇本語論⽂・エッセイなど）

KOBA, Keisuke

⽊庭 啓介（教授）⽊庭啓介, ⽊下桂, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 尾坂兼⼀, 松尾奈緒⼦, ⾈川⼀穂, 瀬古祐吾, ⽬⼾綾乃, 平澤理世, ⼩川
奈々⼦, 兵藤不⼆夫, 由⽔千景. (2021) 元素分析計連結型安定同位体⽐質量分析計の簡易改造による微量試料炭素窒素安定同位体⽐測定. RADIOISOTOPES 70: 291-299. DOI: 10.3769/radioisotopes.70.291.

KUDOH, Hiroshi

⼯藤 洋（教授）

藤井伸⼆, ⼯藤洋, 梅原徹, 堀内洋 (2021) コカイタネツケバナ（コタネツケバナ）［アブラナ科］の発⾒から記載までの経緯. 植物地ロ・分類研究 69(1): 107-116. DOI: 10.18942/chiribunrui.0691-16.
⼯藤洋 (2021) 植物⽣態学からみた「藤の実」．⼭⽥功・⼯藤洋・松下貢・川島禎⼦(著). 『寺⽥寅彦「藤の実」を読む』．PP. 132. 窮理舎. 東京．

SATO, Takuya

佐藤 拓哉（准教授）佐藤拓哉, 宇野裕美. (2021) 流域⽣態系における⽣物の移動とその⽣態系機能の評価⼿法開発. River Front Vol.
92: 24-25.

TAKABAYASHI, Junji髙林 純⽰（教授）髙林純⽰. (2021) 助けを呼んだり⽴ち聞きしたり−植物と他の⽣物とのコミュニケーション−. 国⽴科学博物館
特別展「植物 地球を⽀える仲間たち」2021年7⽉10⽇〜9⽉20⽇ 公式ガイドブック. Chapter 1-3. 2829(203⾴).
上船雅義, 阿部順⼀朗, 髙林純⽰. (2021) 植物が害⾍に⾷べられた時に出す特別なにおい〜天敵誘引剤の作製〜（特集 ⾃然に学ぶにおい・⾹りの⼒）. フレグランスジャーナル社. AROMA RESEARCH 22(2): 116-121（192⾴）.

UNO, Hiromi

宇野 裕美（特定准教授）

根岸淳⼆郎, 川⻄亮太, 宇野裕美, 東城幸司. (2020) 河川と⽔辺環境保全のための地下⽣物指標による⽣態系健全度評価. 昆⾍と⾃然 55(12): 26-29. ニューサイエンス社.
佐藤拓哉, 宇野裕美. (2021) 流域⽣態系における⽣物の移動とその⽣態系機能の評価⼿法開発. River Front Vol.
92: 24-25.

18

YAMAUCHI, Atsushi

⼭内 淳（教授）

Yamauchi A, Tokita K, Namba T, Chon T-S (2021) Short Notes on Theories of Species Diversity. In: Creative Complex
System. Eds. Nishimura K, Murase M, Yoshimura K. Springer. P33-53.

＜⽩眉プロジェクト教員＞
USHIO, Masayuki

潮 雅之（特定准教授-⽩眉-）

潮雅之 (2021) (分担執筆) 5.6 哺乳類の検出. ⼀般社団法⼈ 環境DNA学会（企画）. ⼟居秀幸, 近藤倫⽣（編）. 環
境DNA–⽣態系の真の姿を読み解く–. 204–216. 共⽴出版.
⽩垣友寛, 井上拓, 福⽥秀樹, 潮雅之, ⽇下美樹, 岡野孝哉, ⾼巣裕之 (2021) 海洋堆積物に残存する環境DNAを⽤いた⿂類相把握の試み. ⽔環境学会誌 44(4):79-84. DOI: 10.2965/jswe.44.79.

講演（学会発表・アウトリーチ活動など）

HONJO, Mie○：招待講演本庄 三恵（准教授）〇本庄三恵. 「ウイルス⽣態学：⽔域から陸域へ」. ⽚岡奨励賞受賞講演. 第53回種⽣物学シンポジウム. 2021年
12⽉4⽇. オンライン（東北）.
本庄三恵, ⻄尾治幾, 村中智明, ⼯藤洋. 「⾃然条件下でのカブモザイクウイルス感染によるハクサンハタザオの死亡と遺伝⼦発現の関係」. 第53回種⽣物学シンポジウム. 2021年12⽉3-5⽇. オンライン（東北）.
⼯藤洋, 杉阪次郎,本庄三恵. 「ハクサンハタザオの４年間毎週トランスクリプトームからわかる ⾃然条件下での遺伝⼦発現の特徴」. 第53回種⽣物学シンポジウム. 2021年12⽉3-5⽇. オンライン（東北）.
〇本庄三恵. 「RNA-seqで⾒る継続感染下での植物―ウイルス相互作⽤」. 第17回京⼤植物縦横無尽の会ワーク
ショップ. 2021年11⽉12⽇. オンライン.
本庄三恵. 「遺伝⼦発現解析から⾒る植物とウイルスの相互作⽤」. 研究集会「シカの脅威と次世代型森林再⽣のロードマップ」. 2021年7⽉29⽇. オンライン（京都⼤学）.
〇本庄三恵.「RNA-seqで解明する⽣物間相互作⽤のダイナミクス」. シンポジウム「⽣物間相互作⽤学のフロ
ンティア： 分⼦・野外・理論を統合せよ」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
湯本原樹, ⻄尾治幾, 村中智明, 杉阪次郎, 本庄三恵, ⼯藤洋. 「多年草ハクサンハタザオにおける葉寿命の季節的可塑性および決定要因の解析」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
⼯藤洋, 湯本原樹, 杉阪次郎, 伊藤佑, 村中智明, ⻄尾治幾, 本庄三恵. 「植物の分⼦フェノロジー：トランスクリ
プトーム、エピジェネティクス、⽣物間相互作⽤」. シンポジウム「分⼦、野外、モデルで繋ぐ季節性研
究の今」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
畠⼭隆平, 村中智明, ⻄尾治幾, 本庄三恵, ⽯森裕貴, 遠藤貴司, 寺⻄美佳, ⼯藤洋, 東⾕篤志. 「イネ冷害におけるエピジェネティックな変化の影響」. 第62回⽇本植物⽣理学会. 2021年3⽉14⽇-16⽇. オンライン（島根）.

19

ISHIDA, Atsushi

⽯⽥ 厚（教授）

Minagi K, Ishida A（他 3 名）. 「Hydraulic failure and carbon starvation between extreme and mild drought events
across 20 drought-tolerant woody plants in the Ogasawara islands.」. 第 9 回東アジア⽣態学連合国際会議. 2021
年 7 ⽉ 10-13 ⽇. オンライン（ホフホト, 中国）.
辻祥⼦, ⽯⽥厚（他 5 名）. 「強光ストレス下における樹⽊の⾊素含有量の変化と光阻害耐性の多種⽐較」. 第
132 回⽇本森林学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 20-23 ⽇. オンライン（東京）.
中村友美, ⽯⽥厚（他 5 名）. 「台⾵攪乱とマスティングの同時発⽣は⼩笠原諸島のシマイスノキの被害を拡⼤する」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
皆⽊寛司, ⽯⽥厚（他 4 名）. 「⼩笠原諸島における夏の極端な乾燥条件下での通⽔⽋損障害の進⾏と⽊部の通⽔⽋損耐性」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
松⼭秦, ⽯⽥厚（他 8 名）. 「⼩笠原諸島における強光下で⽣育する個葉の光ストレスに対する⽣理⽣態反応」.
第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
辻祥⼦, ⽯⽥厚（他 5 名）. 「⼩笠原諸島における強光下で⽣育する個葉の光ストレスに対する⽣理⽣態反応」.
第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
前⽥⾼尚, ⽯⽥厚（他 5 名）. 「タイ東北地⽅の乾燥フタバガキ林における⽕災実験 -2018 年度および 2019 年
度実験の概要-」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
森茂太, ⽯⽥厚（他 5 名）. 「草本と⽊本の呼吸スケーリング」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21
⽇. オンライン（岡⼭）.

KOBA, Keisuke

⽊庭 啓介（教授）倉澤央, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 横井瑞⼠, ⽊庭啓介, 宇野裕美. 「琵琶湖からの遡上⿂が河川⽣物群集に与える影響」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
藤巻玲路, 清本芽⽣, 福島慶太郎, ⼤⻄雄⼆, ⽊庭啓介. 「窒素・酸素安定同位体⽐を⽤いた落葉広葉樹林の⼟壌
⽔硝酸態窒素の解析」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
⼤⻄雄⼆, 後藤(桜井)晶⼦, 福島慶太郎, ⽊庭啓介. 「バクテリアからの核酸抽出と安定同位体⽐測定」. 第 68 回
⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
稲垣善之, 鵜川信, ⽊庭啓介. 「スギおよびヒノキの葉分解に伴う窒素炭素安定同位体⽐の変化」. 第 68 回⽇本
⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
⽊下桂, 浦部美佐⼦, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, ⽊庭啓介. 「安定同位体微量測定を⽤いた淡⽔寄⽣⽣物の系統群ごとの同位体濃縮の⽐較」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
横井瑞⼠, 福島慶太郎, ⽊庭啓介, 宇野裕美. 「河川との接続性の違いが河跡湖の⽣物群集構造に与える影響」.
第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
鎌⽥⼀徹, ⽊庭啓介, 酒井章⼦. 「オオバギの送粉共⽣:花序で繁殖するカメムシの個体群および安定同位体⽐の動態」. 第 68 回⽇本⽣態学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 17-21 ⽇. オンライン（岡⼭）.
⽩井崚太, 勝⼭正則, 福島慶太郎, ⼤⻄雄⼆, ⽊庭啓介. 「森林流域における湧⽔・渓流⽔NO3-濃度形成への脱窒の影響とその地点間⽐較」. 第132回⽇本森林学会⼤会. 2021年3⽉19-23⽇. オンライン.
⾼橋悠太朗, 勝⼭正則, ⽩井崚太, 尾坂兼⼀, 福島慶太郎, ⼤⻄雄⼆, ⽊庭啓介. 「⽔抽出⽅法の違いによる⼟壌中
窒素安定同位体⽐を⽤いた脱窒進⾏程度の⽐較」. 第132回⽇本森林学会⼤会. 2021年3⽉19-23⽇. オンライン.
○⽊庭啓介. 「⾒えない窒素フローを追いかける」. ⽇本地球惑星科学連合⼤会2021. ランチタイムスペシャル
レクチャー. 2021年6⽉5⽇. オンライン.
能勢貴司, ⽬⼾綾乃, 児嶋⼤地, ⼤⼿信⼈, ⽊庭啓介, ⻄澤秀明, 久⽶学, 荒井修亮, 光永靖, 三⽥村啓理. 「バイオテ20レメトリーによる⽔圏⽣物の⾏動情報の取得-7 安定同位体⽐分析を⽤いたカイヤンの⾷性解析」. ⽇本⽔産学会2021. 2021年9⽉13-16⽇. オンライン（北海道⼤学）.
李若氷, ⼤⻄雄⼆, ⽊庭啓介, 蔡吉, 中野伸⼀. 「浅い湖沼におけるベントスと植物プランクトンの⾷物連鎖の解明」. ⽇本陸⽔学会第85回⼤会. 2021年9⽉20-22⽇. オンライン（東京農⼯⼤学）.
⽯橋孝晃, ⼤⼿信⼈, 尾坂兼⼀, ⽊庭啓介, 中村⾼志, ⻄⽥継. 「冬季の琵琶湖⽔における窒素循環構造の変化」.
⽇本陸⽔学会第85回⼤会. 2021年9⽉20-22⽇. オンライン（東京農⼯⼤学）.
堀井幸⼦, 堀井幸⼦, ⾼橋⼀⽣, 福島慶太郎, ⼤⻄雄⼆, ⽊庭啓介, 古⾕研. 「北太平洋亜熱帯循環域漂泳⾷物網における窒素・炭素安定同位体⽐の東⻄変化」. ⽔産海洋学会2021. 2021年11⽉20-22⽇. オンライン（⻑崎⼤学）.

KUDOH, Hiroshi

⼯藤 洋（教授）〇Kudoh H. “Molecular Phenology: Seasonal changes in leaf longevity”. Kyoto-Zurich Workshop in Plant Science 2021.
December 6 and 13, 2021. Online (Kyoto).
⼯藤洋, 杉阪次郎, 本庄三恵. 「ハクサンハタザオの４年間毎週トランスクリプトームからわかる⾃然条件下での遺伝⼦発現の特徴」. 第53回種⽣物学シンポジウム. 2021年12⽉3-5⽇. オンライン（東北）.
本庄三恵, ⻄尾治幾, 村中智明, ⼯藤洋. 「⾃然条件下でのカブモザイクウイルスの感染によるハクサンハタザオの死亡と遺伝⼦発現の関係」. 第53回種⽣物学シンポジウム. 2021年12⽉3-5⽇. オンライン（東北）.
Iwasaki T, Ebisaw A, Tamura Y, Shiga T, Kucera J, Zozomova-Lihova J, Marhold K, Li P, Pak J-H, Choi HJ, Kim Y-D,
Sabirov R, Matsuo A, Tsunamoto Y, Suyama Y, Shimizu-Inatsugi R, Shimizu KK, Kudoh H. “Eurasianphylogeographic study of a widely distributed plant, Cardamine impatiens, based on the genome-wide SNPs by MIGseq”. East Asian Plant Diversity and Conservation 2021. October 29-30, 2021. Online (Korea).
荒⽊希和⼦, ⻄尾治幾, ⾦岡雅浩, ⼯藤洋. 「⻑期環境変化に対するクローン繁殖を介した応答性の解析」. ⽇本
植物学会第85回⼤会. 2021年9⽉16, 18-20⽇. オンライン（東京）.
○⼯藤洋. 「フィールド・エピジェネティクス：環境変動下での頑健性の基盤」. ⽇本植物学会第85回⼤会.
2021年9⽉16, 18-20⽇. オンライン（東京）.
湯本原樹, ⻄尾治幾, 村中智明, 杉阪次郎, 本庄三恵, ⼯藤洋. 「多年草ハクサンハタザオにおける葉寿命の季節的可塑性および決定要因の解析」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
⻄尾治幾, 永野惇, 伊藤佑, 鈴⽊穣, ⼯藤洋. 「ヒストン修飾による季節的な遺伝⼦制御の進化」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
⼯藤洋, 湯本原樹, 杉阪次郎, 伊藤佑, 村中智明, ⻄尾治幾, 本庄三恵. 「植物の分⼦フェノロジー：トランスクリ
プトーム、エピジェネティクス、⽣物間相互作⽤」. シンポジウム「分⼦、野外、モデルで繋ぐ季節性研
究の今」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉17-21⽇. オンライン（岡⼭）.
畠⼭隆平, 村中智明, ⻄尾治幾, 本庄三恵, ⽯森裕貴, 遠藤貴司, 寺⻄美佳, ⼯藤洋, 東⾕篤志. 「イネ冷害におけるエピジェネティックな変化の影響」. 第62回⽇本植物⽣理学会. 2021年3⽉14⽇-16⽇. オンライン（島根）.

NAKANO, Shin-ichi

中野 伸⼀（教授）

Nakano S. “Global Ecological Literacy Youth Forum”. November 10, 2021. Online (Seocheon, South Korea).
〇Nakano S. “A Unique Microbial Loop in the Hypolimnion of Lake Biwa". Plenary lecture, 35th Congress of theInternational Society of Limnology. August 25, 2021. Online (Gwangju, South Korea).
Nakano S. “Long term research in Lake Biwa with special reference to global climate change”. The 9th EAFES (East
Asian Federation of Ecological Societies) International Congress. July 12, 2021. Online (Hohhot, China).

21

〇Nakano S. “Ecology of cyanobacterial blooms with special reference to human activities”. Special lecture. Organized by
Nanyang Normal University, Henan Normal University, Wenzhou University. July 2, 2021. Online (China).

SAKAI, Shoko

酒井 章⼦（教授）○酒井章⼦. 「花に⾒るオスの都合・メスの事情」. 植物分類学会講演会. 2021 年 12 ⽉ 18 ⽇. ⼤阪学院⼤学.

SATO, Takuya

佐藤 拓哉（准教授）野⽥祥平, ⽥中達也, 上⽥るい, ⽩井厚太朗, 岸⼤弼, 佐藤拓哉. 「サツキマスは 2 通りの降海パターンしか持たない」. 第 55 回⽇本⿂類学会年会. 2021 年 9 ⽉ 10 ⽇. オンライン.

TAKABAYASHI, Junji髙林 純⽰（教授）〇Takabayashi J. “The use of phytogenic volatile organic compounds for crop production: two case studies”. International
Tea Conference & 3rd Global Forum for Directors of Tea Research Institutes. November 26, 2021. Online.
Sugimoto K, Ono E, Ohnishi T, Matsui K, Ezura H, Takabayashi J. “Discovery of tomato glycosyltransferase geneassociated with the conversion of airborne green leaf volatiles into the non-volatile diglycosides”. 第 17 回 ⽇本ナス科コンソーシアム年会. November 26, 2021. Online.
髙林純⽰. 「昆⾍と植物とのコミュニケーションを解読する」. 京都⼤学サマープログラム 「暑い夏の⽇、京⼤⽣になろう」. 2021 年 10 ⽉ 25-29 ⽇. 期間中オンデマンド配信.
髙林純⽰. 「葉の⾹りは⾃然の中でどのような役割をはたしているのだろう？」. 滋賀県⽴膳所⾼校特別授業.
2021 年 10 ⽉ 1 ⽇. 膳所⾼校.
〇髙林純⽰. 「植物揮発性の⽣態機能と利⽤可能性」. EDGE-NEXT ガストロノミーシンポジウム「Opportunities in Sustainable Gastronomy」. 京都⼤学産官学連携本部 イノベーション・マネジメント・サ
イエンス研究部⾨. 2021 年 9 ⽉ 13 ⽇. オンライン.
髙林純⽰. 「昆⾍と植物とのコミュニケーション」. 京都⼤学アカデミックデイ. 2021 年 9 ⽉ 1 ⽇. オンライン.
Rim H, Seo M, Takabayashi J. “Plant-plant communication induced by volatiles from eggplants infested by omnivorous
predators, Nesidiocoris tenuis”. 2021 Spring International Conference of KASE (Korean Society of Applied
Entomology). April 30, 2021.
⼩澤理⾹, 塩尻かおり, 藤⽥涼平, 松井健⼆, 髙林純⽰. 「植物のみどりの⾹りがコナガ幼⾍の成⻑を抑制する」.
第 65 回⽇本応⽤動物昆⾍学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 23-26 ⽇. オンライン（島根⼤学）.
松原芳乃, ⼩澤理⾹, 松井健⼆, 髙林純⽰, ⼭岸健三, 上船雅義. 「ゼニゴケにとって⾷害は損ばかりなのか？ −植
⾷者による分布拡⼤−」. 第 65 回⽇本応⽤動物昆⾍学会⼤会. 2021 年 3 ⽉ 23-26 ⽇. オンライン（島根⼤学）.

TOJU, Hirokazu

東樹 宏和（准教授）〇東樹宏和. 「⽣物間の複雑化学ネットワークと共進化- ⽣態系と天然物 -」. ⽇本学術会議公開シンポジウム「地球と⽣命をつなぐ⾼度な化学物質ネットワーク‐天然物化学再考‐」. 2021年12⽉8⽇. オンライン.
〇東樹宏和. 「⼟壌微⽣物・植物共⽣微⽣物と持続可能な農業⽣態系」. 東京⼤学⼤学院農学⽣命科学研究科⽣圏システム学専攻セミナー. 2021年12⽉7⽇. 東京⼤学⼤学院農学⽣命科学研究科.
〇東樹宏和. 「「共⽣体」としての植物の姿を読み解く⽣物間相互作⽤学」. シンポジウム「植物の個体性―植物にとって「個体」とは何か」. ⽇本植物学会 第85回⼤会. 2021年9⽉18⽇. オンライン.
〇東樹宏和. 「異分野融合で解き明かす⽣物間相互作⽤と⽣態系動態」. ⾼遠分⼦細胞⽣物学シンポジウム.
2021年8⽉19⽇. オンライン.

22

〇東樹宏和. 「むし・きのこ・植物：⽣物どうしのつながりを読み解く科学」. 京都府⽴⼤学新⾃然史科学創⽣
センター設⽴記念シンポジウム. 2021年8⽉8⽇. オンライン.
〇東樹宏和. 「微⽣物叢の制御は可能か？ 相互作⽤の科学が切り拓くフロンティア」. 京都⼤学ウイルス・再⽣医学研究所⽥畑泰彦研究室セミナー. 2021年6⽉14⽇. オンライン.
〇東樹宏和. 「⽣物種間の関係性ネットワークと微⽣物叢設計」. ワークショップ「細菌学とマイクロバイオー
ム研究」. コンビーナー: 秋⼭ 徹. 第94回⽇本細菌学会総会. 2021年3⽉23⽇. オンライン.
東樹宏和. 「⾷物網、共⽣ネットワーク、そして⽣態系の再⽣へ」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. シンポジウム「⽣物間相互作⽤学のフロンティア： 分⼦・野外・理論を統合せよ」. 企画: 東樹宏和. 2021年3⽉17⽇.
オンライン.
〇東樹宏和. 「農業⽣態系の総合的管理による持続可能な⾷糧⽣産に向けて」. 農林⽔産省. 2021年1⽉27⽇. オ
ンライン.

UNO, Hiromi

宇野 裕美（特定准教授）

宇野裕美. 「ブトカマ氾濫原の仕組みを紐解く」. シンポジウム基調講演＆パネルディスカッションパネラー.
『あのころの川へ戻したい』. イトウ保護連絡協議会. 2021年11⽉6⽇. 北海道.
宇野裕美. 「両側回遊性甲殻類の⽣態系への影響」. 第23回 河川⽣態学術研究発表会&河川⽣態学術研究会25周年記念シンポジウム、パネルディスカッション『今後の河川⽣態学術研究会について』パネラー. 2021年
10⽉29⽇. 東京.
宇野裕美. 「未知なる川の謎を追って」. 京都⼤学附置研究所・センター第１６回シンポジウム 、パネルディス
カッション「未知の原野を⾏く学問とは」パネラー. 2021年3⽉ 6⽇. 熊本.

YACHI, Shigeo

⾕内 茂雄（准教授）

Yachi S, Asano S, Ikeya T, Ishibashi H, Ishida T, Saizen I, Uehara Y, Wakita K, Okuda N. “For better governance ofwater resource utilization in Lake Biwa Watershed”. The 9th EAFES (East Asian Federation of Ecological Societies)
International Congress. July 12, 2021. Online (Hohhot, China). Oral.
武⽥結花, ⾕内茂雄. 「環境保全型農業における⼟壌⽣物と作物の相互作⽤が駆動する栄養循環の数理的検討」.
第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉18⽇. オンライン（岡⼭）. ⼀般公演（ポスター発表）.

YAMAUCHI, Atsushi

⼭内 淳（教授）◯Yamauchi A. “Competition model explains trends of long-term fertilization in plant communities”. International
Symposium on the Advances of Ecology. November 10, 2021. Lanzhou University, China. Online.
◯Yamauchi A, Ito K, Shibasaki S. “Theory of species replacements under long-term fertilization in plant communities”.
International Workshop "From Behavior to Biodiversity Liking with Population Invasion and Establishment".
November 25, 2021. Daejeon Metropolitan City, Korea. Online.
瀬川有太郎, ⼭内淳, 伊藤公⼀. 「植物の個体間相互作⽤が被⾷防衛と資源獲得への投資の共進化に及ぼす影響」. 第37回個体群⽣態学会⼤会. 2021年11⽉6-7⽇. オンライン（⿓⾕⼤学）. ポスター発表.
瀬川有太郎, ⼭内淳, 伊藤公⼀. 「植物の個体間相互作⽤が被⾷防衛と資源獲得への投資の共進化に及ぼす影響」. ⽇本数理⽣物学会. 2021年9⽉13-15⽇. オンライン（宮崎⼤学）. ポスター発表.
⼭内淳, 伊藤公⼀, 柴﨑祥太, 難波利幸. 「競争的群集における無数の不規則な軌道を伴う多種共存」. ⽇本数理
⽣物学会. 2021年9⽉13⽇. オンライン（宮崎⼤学）.
⼭内淳, 伊藤公⼀, 柴﨑祥太. 「トレードオフをともなう移住過程による種多様性：理論と検証」. 第68回⽇本⽣態学会⼤会. 2021年3⽉18⽇. オンライン（岡⼭）.

23

＜⽩眉プロジェクト教員＞
USHIO, Masayuki

潮 雅之（特定准教授-⽩眉-）◯Ushio M. “Computational capability of ecological dynamics”. Organized by Nakajima K. Special Invited Open Lecture,
Reservoir Computing Seminar Group, The University of Tokyo. December 2, 2021. Online.
◯潮雅之. 「環境DNAメタバーコーディング Q & A」. 世話⼈: 環境DNA学会. 第4回環境DNA学会⼤会・第2回
技術セミナー. 2021年11⽉21⽇. オンライン（北海道⼤学）.
武⽅宏樹, 潮雅之. 企画シンポジウム. 「南の⽣物と時間」. 第28回⽇本時間⽣物学会学術⼤会. 2021年11⽉20⽇.
ハイブリッド（那覇市）.
◯潮雅之, 伊藤公⼀, 三⽊健. 「RStudioで広がるデータ解析 ~ R, Python, Cpp ~」. 世話⼈: 三⽊健. 第37回個体群
整体学会・⼤会企画シンポジウム・新しい分野に挑戦するために. 2021年11⽉7⽇. オンライン（⿓⾕⼤学）.
◯潮雅之. 「環境DNA情報から読み解く⽣態系の過去･現在･未来」. 世話⼈: 京都リサーチパーク. ふれデミック
カフェ＠KRP with京⼤オリジナル Vol.14. 2021年10⽉15⽇. オンライン（京都リサーチパーク/京都）.
◯潮雅之. 「Ecological Reservoir Computing: ⽣態系による計算」. 世話⼈: ⼟居秀幸. 兵庫県⽴⼤学情報科学研究
科 オンラインセミナー. 2021年10⽉4⽇. オンライン（兵庫県⽴⼤学）.
◯潮雅之. 「Ecological Reservoir Computing: 微⽣物による近未来予測」. 世話⼈: ⼭内淳. 京都⼤学⽣態学研究センター・共同利⽤ワークショップ –微⽣物を軸とした群集構造研究の統合とさらなる展開–. 2021年9⽉24⽇.
オンライン（京都⼤学⽣態学研究センター）.
◯潮雅之. 「環境DNAメタバーコーディングのライブラリ調整迅速化・省⼒化に向けて」. 世話⼈: ⾚松良久. 第4回⼭⼝⼤学・環境DNA研究センターシンポジウム〜環境DNAの最前線〜. 2021年9⽉6⽇. オンライン（⼭⼝⼤学・環境DNA研究センター）.

24

B. Graduate Students and Research Fellows
研究員・⼤学院⽣・研究⽣

出版物

CAI, Ji

蔡 吉（⼤学院⽣・研究員）

Cai J, Hodoki Y, Nakano S (2021) Phylogenetic diversity of the picocyanobacterial community from a novel winter bloomin Lake Biwa. Limnology 22(2): 161-167. DOI:10.1007/s10201-020-00649-5.

DEB, Soumya（⼤学院⽣）
Weilhoefer CL, Nakano S, Deb S, Fukushima K (in press) Nutrient limitation of primary production in rivers in the Lake
Biwa Basin, Shiga Prefecture, Japan. Aquatic Ecology.

FUJITA, Hiroaki

藤⽥ 博昭（⼤学院⽣）

Hori Y, Fujita H, Himura K, Narisawa K, Toju H (2021) Synergistic and offset effects of fungal species combinations onplant performance. Frontiers in Microbiology 12:713180.

FUKUSHIMA, Keitaro

福島 慶太郎（研究員）

Ding XH, Lan WS, Li YL, Yan AX, Katayama Y, Koba K, Makabe A, Fukushima K, Yano M, Onishi Y, Ge QY, Gu JD(2021) An internal recycling mechanism between ammonia/ammonium and nitrate driven by ammonia-oxidizing
archaea and bacteria (AOA, AOB, and Comammox) and DNRA on Angkor sandstone monuments. International
Biodeterioration & Biodegradation 165(1): 105328. DOI: 10.1016/j.ibiod.2021.105328.
Uno H, Yokoi M, Fukushima K, Kanno Y, Kishida O, Mamiya W, Sakai R, Utsumi S (2021) Spatially variablehydrological and biological processes shape diverse post-flood aquatic communities. Freshwater Biology. DOI:
10.1111/fwb.13862.
Uno H, Fukushima K, Kawamura M, Kurasawa A, Sato T (in press) Direct and indirect effects of amphidromous shrimps
on nutrient mineralization in streams in Japan. Oecologia 198(2): 493-505. DOI:10.1007/s00442-022-05119-6.
Nagano H, Nakayama M, Katata G, Fukushima K, Yamaguchi T, Watanabe M, Kondo T, Atarashi-Andoh M, Kubota T,
Tateno R, Koarashi J (2021) Soil microbial community responding to moderately elevated nitrogen deposition in a
Japanese cool temperate forest surrounded by fertilized grasslands. Soil Science and Plant Nutrition 67(5): 606-616.
DOI: 10.1080/00380768.2021.1974799.
Sakai M, Fukushima K, Nakagawa H (in press) Indirect effects of deer overgrazing on stream ecosystems. In: Sika Deer:Life History Plasticity and Management. Kaji K, Uno H, Iijima H (eds.). Springer Nature
福島慶太郎. (2021) 酸性降下物による森林⽣態系の物質循環への影響：乾性沈着の重要性. 環境技術50: 19-23.
Weilhoefer CL, Nakano S, Deb S, Fukushima K (in press) Nutrient limitation of primary production in rivers in the Lake
Biwa Basin, Shiga Prefecture, Japan. Aquatic Ecology.
⽊庭啓介, ⽊下桂, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 尾坂兼⼀, 松尾奈緒⼦, ⾈川⼀穂, 瀬古祐吾, ⽬⼾綾乃, 平澤理世, ⼩川
奈々⼦, 兵藤不⼆夫, 由⽔千景. (2021) 元素分析計連結型安定同位体⽐質量分析計の簡易改造による微量試料炭素窒素安定同位体⽐測定. RADIOISOTOPES 70: 291-299. DOI: 10.3769/radioisotopes.70.291.

25

FUNAKAWA, Kazuho

⾈川 ⼀穂（⼤学院⽣）

⽊庭啓介, ⽊下桂, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 尾坂兼⼀, 松尾奈緒⼦, ⾈川⼀穂, 瀬古祐吾, ⽬⼾綾乃, 平澤理世, ⼩川
奈々⼦, 兵藤不⼆夫, 由⽔千景. (2021) 元素分析計連結型安定同位体⽐質量分析計の簡易改造による微量試料炭素窒素安定同位体⽐測定. RADIOISOTOPES 70: 291-299. DOI: 10.3769/radioisotopes.70.291.

FURUKAWA, Saori

古川 沙央⾥（研究員）

古川沙央⾥ (2021) 相利共⽣系の存続に関わる要因. 京都⼤学⽣態学研究センターニュース 147: 5.

ITO, Koichi

伊藤 公⼀（研究員）

Yamauchi A, Ito K, Shibasaki S (2021) Colonization process determines species diversity via competitive quasi-exclusion.
Ecology and Evolution 11(9): 4470-4480. DOI: 10.1002/ece3.7342.

JIANG, Mengqi

蒋 梦琦（⼤学院⽣）

Jiang MQ, Nakano S (2021) Application of image analysis for algal biomass quantification: a low-cost and non-destructive
method based on HSI color space. Journal of Applied Phycology 33: 3709-3717. DOI: 10.1007/s10811-021-02571-4.

KINOSHITA, Kei

⽊下 桂（⼤学院⽣）

⽊庭啓介, ⽊下桂, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 尾坂兼⼀, 松尾奈緒⼦, ⾈川⼀穂, 瀬古祐吾, ⽬⼾綾乃, 平澤理世, ⼩川
奈々⼦, 兵藤不⼆夫, 由⽔千景. (2021) 元素分析計連結型安定同位体⽐質量分析計の簡易改造による微量試料炭素窒素安定同位体⽐測定. RADIOISOTOPES 70: 291-299. DOI: 10.3769/radioisotopes.70.291.

KURASAWA, Akira

倉澤 央（⼤学院⽣）

Uno H, Fukushima K, Kawamura M, Kurasawa A, Sato T (in press) Direct and indirect effects of amphidromous shrimps
on nutrient mineralization in streams in Japan. Oecologia 198(2): 493-505. DOI:10.1007/s00442-022-05119-6.

MARRE, Maxime（⼤学院⽣）

Marre M, Ushio M, Sakai S (2021) Contrasting microbial communities on male and female flowers of a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Environmental DNA. DOI: 10.1002/edn3.271.
Marre M, Ushio M, Sakai S (in press) The effects of the floral infection by a bacterial pathogen in a dioecious plant,
Mallotus japonicus (Euphorbiaceae). Population Ecology. DOI: 10.1002/1438-390X.12110.

MINAGI, Kanji

皆⽊ 寛司（⼤学院⽣）

Nakamura T, Ishida A, Kawai K, Minagi K, Saiki ST, Yazaki K, Yoshimura J (2021) Tree hazards compounded bysuccessive climate extremes after masting in a small endemic tree, Distylium lepidotum, on subtropical islands inJapan. Global Change Biology 27(20): 5094-5108. DOI: 10.1111/gcb.15764.

26

NAKAHATA, Ryo

仲畑 了（研究員）

Nakahata R, Naramoto M, Sato M, Mizunaga H (2021) Multifunctions of fine root phenology in vegetative andreproductive growth in mature beech forest ecosystems. Ecosphere 12(10): e03788.

NAKAMURA, Tomomi

中村 友美（⼤学院⽣）

Ishida A, Nakamura T, Saiki ST, Yoshimura J, Kakishima S (2021) Evolutionary loss of thermal acclimation accompaniedby periodic monocarpic mass flowering in Strobilanthes flexicaulis. Scientific Reports 11: 14273. DOI:
10.1038/s41598-021-93833-1.
Nakamura T, Ishida A, Kawai K, Minagi K, Saiki ST, Yazaki K, Yoshimura J (2021) Tree hazards compounded bysuccessive climate extremes after masting in a small endemic tree, Distylium lepidotum, on subtropical islands inJapan. Global Change Biology 27(20): 5094-5108. DOI: 10.1111/gcb.15764.

NISHINO, Takanori⻄野 貴騎（研究員）

Nishino T, Hosokawa T, Meng XY, Koga R, Moriyama M, Fukatsu T (2021) Environmental acquisition of gut symbiotic
bacteria in the saw-toothed stinkbug, Megymenum gracilicorne (Hemiptera: Pentatomoidea: Dinidoridae). Zoological
Science 38(3): 213-222. DOI: 10.2108/zs200163.

NISHIO, Haruki

⻄尾 治幾（研究員）

Buzas DM, Nishio H, Kudoh H (2021) The flowering season-meter at FLOWERING LOCUS C across life histories in
Crucifers. Frontiers in Plant Science 12: 640442. DOI: 10.3389/fpls.2021.640442.

ONISHI, Yuji

⼤⻄ 雄⼆（学振特別研究員）

Onishi Y (2021) Digestion efficiency during alkaline persulfate oxidation for determination of total phosphorus content of
biological samples. Analytical Sciences 37(12): 1771-1774. DOI: 10.2116/analsci.21P116.
Ding XH, Lan WS, Li YL, Yan AX, Katayama Y, Koba K, Makabe A, Fukushima K, Yano M, Onishi Y, Ge QY, Gu JD(2021) An internal recycling mechanism between ammonia/ammonium and nitrate driven by ammonia-oxidizing
archaea and bacteria (AOA, AOB, and Comammox) and DNRA on Angkor sandstone monuments. International
Biodeterioration & Biodegradation 165(1): 105328. DOI: 10.1016/j.ibiod.2021.105328.
Kawagucci S, Matsui Y, Makabe A, Fukuba T, Onishi Y, Nunoura T, Yokokawa T (2021) Hydrogen and carbon isotope
fractionation factors of aerobic methane oxidation in deep-sea water. Biogeosciences 18(19): 5351–5362. DOI:
10.5194/bg-18-5351-2021.
⽊庭啓介, ⽊下桂, ⼤⻄雄⼆, 福島慶太郎, 尾坂兼⼀, 松尾奈緒⼦, ⾈川⼀穂, 瀬古祐吾, ⽬⼾綾乃, 平澤理世, ⼩川
奈々⼦, 兵藤不⼆夫, 由⽔千景. (2021) 元素分析計連結型安定同位体⽐質量分析計の簡易改造による微量試料炭素窒素安定同位体⽐測定. RADIOISOTOPES 70: 291-299. DOI: 10.3769/radioisotopes.70.291.

OZAWA, Rika

⼩澤 理⾹（研究員）

Valea I, Motegi A, Kawamura N, Kawamoto K, Miyao A, Ozawa R, Takabayashi J, Gomi K, Nemoto K, Nozawa A,
Sawasaki T, Shinya T, Galis I, Miyamoto K, Nojiri H, Okada K (2021) The rice wound-inducible transcription factor
RERJ1 sharing same signal transduction pathway with OsMYC2 is necessary for defense response to herbivory andbacterial blight. Plant Molecular Biology. DOI:10.1007/s11103-021-01186-0.

27

Yoshida K, Uefune M, Ozawa R, Abe H, Okemoto Y, Yoneya K, Takabayashi J (2021) Effects of prohydrojasmon on thenumber of infesting herbivores and biomass of field-grown Japanese radish plants. Frontiers in Plant Science 12:695701. DOI: 10.3389/fpls.2021.695701.
Shiojiri K, Ozawa R, Uefune M, Takabayashi J (2021) Field-grown rice plants become more productive when exposed toartificially damaged weed volatiles at the seedling stage. Plants. Frontiers in Plant Science 12: 692924. DOI:
10.3389/fpls.2021.692924.

SHIBATA, Akari

柴⽥ あかり（研究員）

Shibata A, Kameyama Y, Kudo G (2021) Low seed fertility of hermaphrodites is maintained in a gynodioecious species
throughout the distribution range in Japan. Plant Systematics and Evolution 307(5): 55. DOI:10.1007/s00606-02101780-1.
Kudo G, Shibata A (2021) Is increased male flower production a strategy for avoidance of predispersal seed predation in
andromonoecious plants? Ecology and Evolution 11(10): 5646-5656. DOI: 10.1002/ece3.7468.

SUGISAKA, Jiro

杉阪 次郎（研究員）

Soga E, Sugisaka J, Watanabe M, Kudoh H (2021) Population differentiation in the leaf shape and growth form of
Cardamine scutata Thunb. in tidal and non-tidal habitats. Plant Species Biology 36(3): 399-411. DOI: 10.1111/14421984.12325.

YANO, Eizi

⽮野 栄⼆（研究員）

Yano E (2021) Augmentative biological control in greenhouses in Japan. CAB Reviews 16(060): 1-12. DOI:
10.1079/PAVSNNR202116060.
⽮野栄⼆ (2020) 総論：捕⾷性昆⾍の⽣態―特集によせて―．昆⾍と⾃然55(3): 2−3.
⽮野栄⼆ (2020) ナミヒメハナカメムシ．昆⾍と⾃然55(3): 16−19.

YUMOTO, Genki

湯本 原樹（⼤学院⽣）

Yumoto G, Sasaki-Sekimoto Y, Aryal B, Ohta H, Kudoh H (2021) Altitudinal differentiation in the leaf wax-mediatedflowering bud protection against frost in a perennial Arabidopsis. Oecologia 195(3):677-687. DOI: 10.1007/s00442021-04870-6.

28

C. Collaborative Researchers 連携教員
TAYASU, Ichiro

陀安 ⼀郎（連携教員）

Suetsugu K, Haraguchi TF, Tanabe AS, Tayasu I (2021) Specialized mycorrhizal association between a partially
mycoheterotrophic orchid Oreorchis indica and a Tomentella taxon. Mycorrhiza 31: 243-250.
Ko C-Y, Asano S, Lin M-J, Ikeya T, Peralta EM, Triño, EMC, Uehara Y, Ishida T, Iwata T, Tayasu I, Okuda N (2021)
Rice paddy irrigation seasonally impacts stream benthic macroinvertebrate diversities at the catchment level.
Ecosphere 12: e03468.
Oishi Y, Shin K-C, Tayasu I (2021) Lead isotope ratios in moss for the assessment of transboundary pollutants in
Yatsugatake Mountains, central Japan. Ecological Research 36: 401-408.
Kato Y, Togashi H, Kurita Y, Osada Y, Amano Y, Yoshimizu C, Kamauchi H, Tayasu I (2021) Segmental isotope
analysis of the vertebral centrum reveals the spatiotemporal population structure of adult Japanese flounder
Paralichthys olivaceus in Sendai Bay, Japan. Marine Biology 168: 57.
Suetsugu K, Yamato M, Matsubayashi J, Tayasu I (2021) Partial and full mycoheterotrophy in green and albino
phenotypes of the slipper orchid Cypripedium debile. Mycorrhiza 31: 301-312.
Suetsugu K, Haraguchi TF, Okada H, Tayasu I (2021) Stigmatodactylus sikokianus (Orchidaceae) mainly acquires carbon
from decaying litter through association with a specific clade of Serendipitaceae. New Phytologist 231: 1670-1675.
Umezawa Y, Toyoshima K, Saitoh Y, Takeda S, Tamura K, Tamaya C, Yamaguchi A, Yoshimizu C, Tayasu I, Kawamoto
K (2021) Evaluation of origin-depended nitrogen input through atmospheric deposition and its effect on primary
production in coastal areas of western Kyusyu, Japan. Environmental Pollution 291: 118034.
Fujii S, Haraguchi TF, Tayasu I (2021) Radiocarbon signature reveals that most springtails depend on carbon from living
plants. Biology Letters 17: 20210353.
Osada Y, Matsubayashi J, Tayasu I (2021) Diagnosing underdetermination in stable isotope mixing models. Plos ONE 16:
e0257818.
陀安⼀郎 (2021) 環境トレーサビリティとは何か. In:近藤康久, ⼤⻄秀之編. 環境問題を解く ひらかれた協働研
究のすすめ. かもがわ出版. pp.178-184.
陀安⼀郎, 申基澈編 (2021) 同位体環境学がえがく世界：2021 年版. 総合地球環境学研究所. 182pp.
陀安⼀郎, 三村豊 (2021) 同位体環境学の 10 年、この先の 10 年. 地球研ニュース No.84: 6-10.
栗⽥豊, 富永修, ⽩井厚太朗, 陀安⼀郎 (2021) 多元素同位体を⽤いた⿂類の移動履歴推定̶最新の技術と応⽤. ⽉
間海洋 53: 599-602.
陀安⼀郎 (2021) 同位体地図（Isoscape）を⽤いた⽣態学的研究. ⽉間海洋 53: 605-612.

29

D. Affiliated Scientists 協⼒研究員
ARAKI, Kiwako

荒⽊ 希和⼦Araki KS, Tsujimoto M, Iwasaki T, Kudoh H (2021) Life-history monographs of Japanese plants 14: Cardamine leucantha(Tausch) O. E. Schulz (Brassicaceae). Plant Species Biology 36: 542-553.
Tran QT, Araki KS, Kubo M (2021) An investigation of upland soil fertility from different soil types. Annals of
Agricultural Sciences 66: 101-108.

HARAGUCHI, Akira

原⼝ 昭

Yanagawa K, Haraguchi A, Yoshitake K, Asamatsu K, Harano M, Yamashita K, Ishibashi J-I (2021) Ubiquity of Euglena
mutabilis population in three ecologically distinct acidic habitats in Southwestern Japan. Water 13: 1570. DOI:
10.3390/w13111570.
Haraguchi A, Zheng J (2021) Effect of pH on photosynthesis of Euglena mutabilis Schmitz, an acidophilic benthic
flagellate. Hydrobiology 1: 2-9. DOI: 10.3390/hydrobiology1010002.
Haraguchi A (2021) Chemical and biochemical processes of watershed ecosystems and their impacts on water quality.
Water 13: 1979. DOI: 10.3390/w13141979.
Osaki M, Kato K, Kohyama T, Takahashi H, Haraguchi A, Yabe K, Tsuji N, Shiodera S, Rahajoe JS, Atikah TD, Oide A,
Matsui K, Wetadewi RI, Silsigia S (2021) Basic information about tropical peatland ecosystems. In: TropicalPeatland Eco-management. Eds. Osaki M, Tsuji N, Foead N, Rieley J. Springer, Singapore. p3-62. DOI:
10.1007/978-981-33-4654-3.

IMAI, Ichiro

今井 ⼀郎

Onishi Y, Tuji A, Yamaguchi A, Imai I (2021) Distribution of growth-inhibiting bacteria against the toxic dinoflagellate
Alexandrium catenella (Group I) in Akkeshi-ko estuary and Akkeshi Bay, Hokkaido, Japan. Applied Sciences 11:172. DOI: 10.3390/app11010172.
Imai I, Inaba N, Yamamoto K (2021) Harmful algal blooms and environmentally friendly control strategies in Japan.
Fisheries Science 87: 437-464. DOI: 10.1007/s12562-021-01524-7.
今井⼀郎 (2021) 地球環境問題としての海洋汚染. ⽔環境の事典（＜公社＞⽇本⽔環境学会編），pp.90-91，朝倉書店，東京.
今井⼀郎, ⾚穗那海, 中野温美, 松野孝平, ⼭⼝篤, ⼩原静夏, ⽮野涼⼦, ⼩池⼀彦 (2021) 内湾域の港湾において形成される貧酸素⽔塊は有害⾚潮のインキュベーターか？ ⽉刊海洋 53 (9): 478-488.
今井⼀郎 (2021) 環境に優しい実効的な⾚潮対策を求めて. ⽇本⽔産学会誌 87 (4): 313.
今井⼀郎 (2021) ⽇本藻類学会学術賞（⼭⽥賞）を受賞して：有害有毒藻類研究の旅. 藻類 69: 117-122.
⼩林淳希, 宮下洋平, ⼤洞裕貴, 織⽥さやか, ⽥中邦明, 松野孝平, ⼭⼝篤, 今井⼀郎 (2021) 北海道雄島⼤沼および⼩沼における植物プランクトンの季節的変動. 北⼤⽔産紀要 60: 33-67.

MIKI, Takeshi

三⽊ 健

Chang C-W, Miki T, Ushio M, Ke P-J, Lu H-P, Shiah F-K, Hsieh C-H (2021). Reconstructing large interaction networks
from empirical time series data. Ecology Letters 24(12): 2763-2774 DOI: 10.1111/ele.13897.
Yoneya K, Miki T, Wyngaert SVd, Grossart H-P, Kagami M (2021) Non-random patterns of chytrid infections on
phytoplankton host cells: mathematical and chemical ecology approaches. Aquatic Microbial Ecology 87: 1-15. DOI:
10.3354/ame01966.
Cheung P-Y, Nozawa Y, Miki T (2021) Ecosystem engineering structures facilitate ecological resilience: a coral reef30

model. Ecological Research 36(4): 673–685. DOI: 10.1111/1440-1703.12230.
Tomaru Y, Yamaguchi H, Miki T (2021) Growth rate-dependent cell death of diatoms due to viral infection and theirsubsequent coexistence in a semi-continuous culture system. Microbes and Environments 36(1). DOI:
10.1264/jsme2.ME20116.
吳嘉⽂, 三⽊健 (2021) 臺⼤教授帶你留學⽇本. 書泉出版社（台湾）.

MINAMOTO, Toshifumi

源 利⽂

Jo T, Sakata MK, Murakami H, Masuda R, Minamoto T (2021) Universal performance of benzalkonium chloride for thepreservation of environmental DNA in seawater samples. Limnology and Oceanography: Methods 19: 758-768.
Fukuda A, Usui M, Uchiyama K, Shrestha D, Hashimoto N, Sakata MK, Minamoto T, Yoshida O, Murakami K, Tamura Y,
Asai T (2021) Prevalence of antimicrobial-resistant Escherichia coli in the migratory bird (Anser albifrons) and theirhabitat in Miyajimanuma, Japan. Journal of Wildlife Diseases 57: 954-958.
Osathanunkul M, Minamoto T (2021) eDNA based detection of a vulnerable crocodile newt (Tylototriton uyenoi) to
influence government policy and raise public awareness. Diversity and Distributions 27: 1958-1965.
Ogata M, Masuda R, Marino H, Sakata MK, Hatakeyama M, Yokoyama K, Yamashita Y, Minamoto T (2021)
Environmental DNA preserved in marine sediment for detecting jellyfish blooms after a tsunami. Scientific Reports
11: 16830.
Wu Q, Sakata MK, Wu D, Yamanaka H, Minamoto T (2021) Application of environmental DNA metabarcoding in a lakewith extensive algal blooms. Limnology 22: 363-370.
Fukaya K, Murakami H, Yoon S, Minami K, Osada Y, Yamamoto S, Masuda R, Kasai A, Miyahira K, Minamoto T,
Kondoh M (2021) Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA andhydrodynamic modeling. Molecular Ecology 30: 3057-3067.
Jo T, Ikeda S, Fukuoka A, Inagawa T, Okitsu J, Katano I, Doi H, Nakai K, Ichiyanagi H, Minamoto T (2021) Utility ofenvironmental DNA analysis for effective monitoring of invasive fish species in reservoirs. Ecosphere 12: e03643.
Jo T, Minamoto T (2021) Complex interactions between environmental DNA (eDNA) state and water chemistries on
eDNA persistence suggested by meta-analyses. Molecular Ecology Resources 21: 1490-1503.
Osathanunkul M, Minamoto T (2021) Molecular detection of giant snakeheads, Channa micropeltes (Cuvier, 1831), one of
the most troublesome fish species. Scientific Reports 11: 9943.
Yasashimoto T, Sakata MK, Sakita T, Nakajima S, Ozaki M, Minamoto T (2021) Environmental DNA detection of aninvasive ant species (Linepithema humile) from soil samples. Scientific Reports 11: 10712.
Doi H, Minamoto T, Takahara T, Tsuji S, Uchii K, Yamamoto S, Katano I, Yamanaka H (2021) Compilation of real-time
PCR conditions toward the standardization of eDNA methods. Ecological Research 36(3): 379-388.
Tenma H, Tsunekawa K, Fujiyoshi R, Takai H, Hirose M, Masai N, Sumi K, Takihana Y, Yanagisawa S, Tsuchida K,
Ohara K, Jo T, Takagi M, Ota A, Iwata H, Yaoi Y, Minamoto T (2021) Spatio-temporal distribution of Flavobacterium
psychrophilum and ayu Plecoglossus altivelis in rivers revealed by environmental DNA analysis. Fisheries Science87: 321-330.
Sakata MK, Watanabe T, Maki N, Ikeda K, Kosuge T, Okada H, Yamanaka H, Sado T, Miya M, Minamoto T (2021)
Determining an effective sampling method for eDNA metabarcoding: a case study for fish biodiversity monitoring ina small, natural river. Limnology 22: 221-235.
Hoshino T, Nakao R, Doi H, Minamoto T (2021) Simultaneous absolute quantification and sequencing of fish
environmental DNA in a mesocosm by quantitative sequencing technique. Scientific Reports 11: 4372.

31

Doi H, Akamatsu Y, Goto M, Inui R, Komuro T, Nagano M, Minamoto T (2021) Broad-scale detection of environmental
DNA for an invasive macrophyte and the relationship between DNA concentration and coverage in rivers. BiologicalInvasions 23: 507-520.
Tsuri K, Ikeda S, Hirohara T, Shimada Y, Minamoto T, Yamanaka H (2021) Messenger RNA-typing of environmental
RNA (eRNA): a case study on zebrafish tank water with perspectives for the future development of eRNA analysis on
aquatic vertebrates. Environmental DNA 3: 14-21.
Minamoto T, Miya M, Sado T, Seinn S, Doi H, Kondoh M, Nakamura K, Takahara T, Yamamoto S, Yamanaka H, Araki H,
Iwasaki W, Kasai A, Masuda R, Uchii K (2021) An illustrated manual for environmental DNA research: Water
sampling guidelines and experimental protocols. Environmental DNA 3: 8-13.
Sugiura K, Tomita S, Minamoto T, Mishina T, Iwata A, Abe T, Yamamoto S, Watanabe K (2021) Characterizing the spatial
and temporal occurrence patterns of the endangered botiid loach Parabotia curtus by environmental DNA analysis
using a newly developed species-specific primer set. Ichthyological Research 68: 152-157.
Chen J-W, Chen Z, Liu S-S, Guo W-J, Li D, Minamoto T, Gao T-X (2021) Revealing an invasion risk of fish species in
Qingdao Underwater World by Environmental DNA metabarcoding. Journal of Ocean University of China 20(1):124-136.
Chen Z, Minamoto T, Lin L-S, Gao T-X (2021) An optional low-cost method of extracting environmental DNA of macroorganisms from filter membranes in large scale eDNA surveys. Pakistan Journal of Zoology 53(1): 263-372.
Aratani T, Koide N, Hayami K, Sugiyama M, Minamoto T, Asai T (2021) Continuous prevalence of VEB-3 extendedspectrum β-lactamase-producing Aeromonas hydrophila in a local river in Gifu City, Japan. Microbiology and
Immunology 65: 99-100.
瀬⼝雄⼀, ⼭本義彦, ⽵⾨康弘, 源利⽂ (2021) 淀川⼤堰湛⽔域における琵琶湖産アユの河川残留個体の存在. ⿂類
学雑誌 68: 163-172.
⾚塚真依⼦, ⾼⼭百合⼦, ムチェブエ エドウィン, 伊藤⼀教, 渡辺謙太, 桑江朝⽐呂, 源利⽂ (2021) 藻場モニタリングのための環境 DNA 分析プロトコル作成に向けた検討. ⼟⽊学会論⽂集 B2（海岸⼯学） 77, I_895I_900.
坂⽥雅之, 徐寿明, 源利⽂ (2021) 環境 DNA 分析の概要 （⼟居秀幸・近藤倫⽣編）環境 DNA−⽣態系の真の姿を読み解く−. 共⽴出版, pp 1-35.
源利⽂ (2021) 環境 DNA 分析における⼿法の標準化 （⼟居秀幸・近藤倫⽣編）環境 DNA−⽣態系の真の姿を読み解く−. 共⽴出版, pp 249-253.

NOZAKI, Kentaro

野崎 健太郎

野崎健太郎, 渡邊明⾹⾥, 松本義孝 (2021) 尾張丘陵南部の変成岩体における湧⽔の湧出量, ⽔温および⽔質の季
節変化−愛知県⽇進市の岩崎御岳⼭における事例研究−. 湿地研究 11: 59-73．
野崎健太郎 (2021) ⽮作川中流域における⽔中光の消散係数. ⽮作川研究 25: 33-37．
野崎健太郎 (2021) ⼩学校教員養成課程の⽣活科におけるサツマイモ（Ipomoea batatas）の葉を⽤いた卵とじの調理実践. 椙⼭⼥学園⼤学教育学部紀要 14: 277-281．
内⽥朝⼦, 野崎健太郎, ⼭⽥佳裕 (2021) 室内および野外培養法から推定された⽮作川の付着藻の河川⼀次⽣産⼒とその特徴. 応⽤⽣態⼯学 24: 1-25．
宇佐⾒亜希⼦, ⽥代喬, 野崎健太郎, 松本嘉孝, ⼋⽊明彦, 岩⽉栄治 (2021) ⽕⼭麓における強酸性河川の流下藻類への影響評価：御嶽⼭南麓の王滝川⽔系の現地観測より. 河川技術論⽂集 27: 363-368.

32

OHGUSHI, Takayuki

⼤串 隆之

Yamauchi A, Ikegawa Y, Ohgushi T, Namba T (2021) Density regulation of co-occurring herbivores via two indirect
effects mediated by biomass and non-specific induced plant defenses. Theoretical Ecology 14: 41-55.
⼤串隆之 (2021) 北海道でフィールドワークを⾏う. 個体群⽣態学会会報 78: 26-33.

OKAZAKI, Yusuke

岡崎 友輔

Okazaki Y, Fujinaga S, Salcher MM, Callieri C, Tanaka A, Kohzu A, Oyagi H, Tamaki H, Nakano S (2021) Microdiversity
and phylogeographic diversification of bacterioplankton in pelagic freshwater systems revealed through long-read
amplicon sequencing. Microbiome 9: 24

OKUDA, Noboru

奥⽥ 昇

Ho P-C, Okuda N, Yeh C-F, Wang P-L, Gong G-C, Hsieh C-h (2021) Carbon and nitrogen isoscape of particulate organic
matter in the East China Sea. Progress in Oceanography 197: 102667.
Wang K, Onodera S, Saito M, Okuda N, Okubo T (2021) Estimation of phosphorus transport infuenced by climate change
in a rice paddy catchment using SWAT. International Journal of Environmental Research 15: 759–772.
Kakioka R, Sutra N, Kobayashi H, Ansai S, Masengi KWA., Nagano AJ, Okuda N, Tanaka R, Sato M, Yamahira K (2021)
Resource partitioning is not coupled with assortative mating in sympatrically divergent ricefish in a Wallacean
ancient lake. Journal of Evolutionary Biology 34:1133–1143.
Ko C, Asano S, Lin M, Ikeya T, Peralta EM, Triño EMC, Uehara Y, Ishida T, Iwata T, Tayasu I, Okuda N (2021) Rice
paddy irrigation seasonally impacts stream benthic macroinvertebrate diversity at the catchment level. Ecosphere12(5): e03468.
Kondo Y, Fujisawa E, Ishikawa K, Nakahara S, Matsushita K, Asano S, Kamatani K, Suetsugu S, Kano K, Kumazawa T,
Sato K, Okuda N (2021) Community capability building for environmental conservation in Lake Biwa (Japan)
through an adaptive and abductive approach. Socio-Ecological Practice Research 3: 167-183.
Mendoza-Pascual MU, Itoh M, Aguilar JI, Padilla KSAR, Papa RDS, Okuda N (2021) Controlling factors of methane
dynamics in tropical lakes of different depths. Journal of Geophysical Research: Biogeosciences126(4).
DOI:10.1029/2020JG005828.
⾼橋卓也, 内⽥由紀⼦, ⽯橋弘之, 奥⽥昇 (2021) 森林に関わる主観的幸福度に影響を及ぼす要因の実証的検討：
滋賀県野洲川上流域を対象として. ⽇本森林学会誌 103(2): 122-133.
奥⽥昇 (2021) 地域と流域の超学際研究をゼロから始める. In: 環境問題を解く：ひらかれた協働研究のすすめ.
近藤康久, ⼤⻄秀幸(編). かもがわ出版. 京都. p139-151.
Takahashi T, Uchida Y, Ishibashi H, Okuda N (2021) Subjective well-being as a potential policy indicator in the context ofurbanization and forest restoration. Special Issue “Urban Agriculture, Forestry and Green-Blue Infrastructure as ‘Rediscovered Commons’: Bridging Urban-Rural Interface” Sustainability 13(6): 3211. DOI: 10.3390/su13063211.
奥⽥昇 (2021) 若い⼒が拓く⽣態学の未来. 京都⼤学⽣態学研究センターニュース 147:7.

OZAWA, Seiji

⼩沢 晴司

Ozawa S (2021) Environmental remediation and reinforcement of the connection in Tohoku coastal area after the 2011
earthquake (A study of extending the Michinoku Coastal Trail to the southern area of the Fukushima coastal area).
Miyagi University Research Journal 1-1: 138-145.

33

Ozawa S (2021) Radiation contamination in Fukushima and environmental remediation. Life and Environment 767: 3136.
Ozawa S (2021) Fukushima and Fungi. Chiba mycological club bulletin 37: 73-75.
⼩沢晴司 (2021) 震災と東北の景観の再⽣. 書の光631: 2-4.
⼩沢晴司 (2021) みえないもの．公衆衛⽣情報みやぎ 522: 4-5.
⼩沢晴司 (2021) ふくしまのつちはとわに浄らか．福島 環境再⽣100⼈の記憶: 234.
⼩沢晴司 (2021) 新刊紹介 森林の放射線⽣態学−福島の森を考える―. ATMOΣ 63(10): 707.

SAKATA, Yuzu

坂⽥ ゆず

Sakata Y, Craig TP (2021) An exotic herbivore reinforces competition between exotic and native plants. Journal of
Ecology 109: 2740-2753.
Sakata Y (2021) Geographic variation and temporal changes in plant–herbivore interaction: Case studies with Solidago
altissima in native and introduced ranges. Plant Species Biology. DOI:10.1111/1442-1984.12353

SAKIO, Hitoshi

崎尾 均

Worth JRP, Tamaki I, Tsuyama I, Harrison PA, Sugai K, Sakio H, Aizawa M, Kikuchi S (2021) Genetic distinctiveness but
low diversity characterizes rear-edge Thuja standishii (Gordon) Carr. (Cupressaceae) populations in southwest Japan.
Diversity 13: 185. DOI:10.3390/d13050185
Hino T, Kanno Y, Abe S, Abe T, Enoki T, Hirao T, Hiura T, Hoshizaki K, Ida H, Ishida K, Maki M, Masaki T, Naoe S,
Noguchi M, Otani T, Sato T, Sakimoto M, Sakio H, Takagi M, Takashima A, Tokuchi N, Utsumi S, Hidaka A,
Nakamura M (2021) Assessing insect herbivory on broadleaf canopy trees at 19 natural forest sites across Japan.
Ecological Research 36: 562–572.
Sakio H, Kubo M (2021) Flowering and fruiting of the dioecious canopy tree Cercidiphyllum japonicum over an 8-year
period in central Japan. Journal of Forest Research. DOI: 10.1080/13416979.2021.1991551
崎尾均 (2021) 屋久島のスギ，佐渡島のスギー異なる環境下でスギはいかに⽣きるか？ー. ⽇本の科学者 56(6):48-51.
崎尾均 (2021) 佐渡島の⾃然環境について―森林と草地―. フォレストコンサル 165: 27-36.

TAKANO, Kohei Takenaka

髙野（⽵中） 宏平

Takano KT, Gao J-J, Hu Y-G, Li N-N, Yafuso M, Suwito A, Repin R, Pungga RAS, Meleng PA, Kaliang CH, Chong L,
Toda MJ (2021) Phylogeny, taxonomy and flower-breeding ecology of the Colocasiomyia cristata species group(Diptera: Drosophilidae), with descriptions of ten new species. Zootaxa 5079: 170. DOI: 10.11646/ZOOTAXA.5079.1.1.
相原隆貴, ⼩林慧⼈, 髙野（⽵中）宏平, 深澤圭太, 中園悦⼦, 尾関雅章, 松井哲哉 (2020) ⻑野県⽣坂村の無居住化
地域における⽵林拡⼤：1977年と2014年の空中写真を⽤いた⽐較．景観⽣態学 25(2): 137-146. DOI:
10.5738/jale.25.137.
⼤上迪⼠, 遠藤昭太, 平⽥識穏, 佐藤光彦, 髙野（⽵中）宏平, 植⽊玲⼀ (2021) ヒメザゼンソウ（Symplocarpus
nipponicus）の2014–2016年の個体群構造，開花及び葉数と葉サイズ．⻑野県環境保全研究所研究報告 17:
31-37.

34

TSUJI, Kaoru

辻 かおるÁlvarez-Pérez S, Baker LJ, Morris MM, Tsuji K, Sanchez VA, Fukami T, Vannett RL, Lievens B, Hendry TA (2021)
Acinetobacter pollinis sp. nov., Acinetobacter baretiae sp. nov., and Acinetobacter rathckeae sp. nov., isolated fromfloral nectar and honeybees. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71: 004783.
Álvarez-Pérez S, Tsuji K, Donald M, Assche AV, Vannette RL, Herrera CM, Jacquemyn H, Fukami T, Lievens B (2021)
Nitrogen assimilation varies among clades of nectar- and insect-associated acinetobacters. Microbial Ecology 81:
990-1003.

35

⽣態研セミナー
第 324 回 2021 年 4 ⽉ 16 ⽇（⾦）
「Soil microorganisms and climate change: current knowledge and prospects」
Alberto Canarini (Center for Ecological Research, Kyoto University)「ノコギリカメムシにおける新規な微⽣物共⽣系」
⻄野 貴騎（京都⼤学⽣態学研究センター）
第 325 回

2021 年 5 ⽉ 21 ⽇（⾦）

「極微量炭酸塩の⾼精度安定同位体⽐分析システムの開発と応⽤研究」
⽯村 豊穂（京都⼤学⼤学院⼈間・環境学研究科）「様々な環境傾度に沿った森林⽣態系の窒素循環の変化」
舘野 隆之輔（京都⼤学フィールド科学教育研究センター）
第 326 回 2021 年 6 ⽉ 25 ⽇（⾦）
「コムギ、エギロプス属植物の⼩進化と異質倍数化」
吉⽥ 健太郎（京都⼤学⼤学院農学研究科）「植物と⾍の分⼦レベルでの駆け引き」
有村 源⼀郎（東京理科⼤学先進⼯学部）

第 327 回 2021 年 7 ⽉ 16 ⽇（⾦）
「⽣物から学ぶ可逆的接着技術」
細⽥ 奈⿇絵（国⽴研究開発法⼈ 物質・材料研究機構）「東南アジア熱帯に⾒られる⾵変わりな葉形態形成の仕組みを探る」
塚⾕ 裕⼀（東京⼤学⼤学院理学系研究科⽣物科学専攻）

第 328 回 2021 年 9 ⽉ 17 ⽇（⾦）
「多種共存の⽣態-進化フィードバック」
⼭道 真⼈（クイーンズランド⼤学⽣物科学科）「ヒト-腸内微⽣物の共多様化と哺乳類の⽣態や進化に与える微⽣物の意義」
鈴⽊ 太⼀（マックスプランク発⽣⽣物学研究所 腸内微⽣物科学グループ）

第 329 回 2021 年 10 ⽉ 15 ⽇（⾦）
「Individual Variation in Communication Among Plants」
Richard Karban (University of California, Davis / Visiting Professor, Center for Ecological Research, Kyoto
University)「⾎縁認識に基づいた植物間コミュニケーション」
⼭尾 僚（弘前⼤学農学⽣命科学部）

36

第 330 回 2021 年 11 ⽉ 26 ⽇（⾦）
「樹⽊の個体間競争は個体のどのような変化をともなうか？」隅⽥ 明洋（京都府⽴⼤学⼤学院⽣命環境科学研究科）「ブナ個体の根系/地上部（呼吸、重量、表⾯積）配分スケーリング―⽔獲得から炭素獲得型へのシフト―」
森 茂太(⼭形⼤学農学部)

第 331 回 2021 年 12 ⽉ 17 ⽇（⾦）
「⽣物群集による寄⽣者感染動態の制御：ハリガネムシ感染経路における中間・終宿主の種多様性効果」
佐藤 拓哉（京都⼤学⽣態学研究センター）「⽣物多様性と感染症：ベクター媒介性感染症リスクへのベクター種数の効果」
瀧本 岳(東京⼤学⼤学院農学⽣命科学研究科)

第 332 回 2022 年 1 ⽉ 21 ⽇（⾦）
「シロイヌナズナにおける⾼温順化の分⼦機構」
⼭⼝ 暢俊（奈良先端科学技術⼤学院⼤学）「季節トランスクリプトームで迫る植物の適応進化」
⻄尾 治幾（滋賀⼤学データサイエンス教育研究センター）

第 333 回 2022 年 2 ⽉ 18 ⽇（⾦）
「⾼頻度観測と国際連携による新たな湖沼研究の展開」
松崎 慎⼀郎（国⽴環境研究所・⽣物多様性領域）「⽔圏⽣態系におけるウイルスの役割」
沈 尚（京都⼤学⼯学研究科、現・国⽴環境研究所琵琶湖分室）

37

共同利⽤・共同研究拠点事業 共同研究 b

採択⼀覧

2021年度には、56件の共同研究 b が採択されました（申請順に掲載）
。

申請者
⼭中 寿朗
徳地 直⼦
松⽥ ⼀彦
藤井 ⼀⾄

⾼橋 純⼀

中務 真⼈

⾓皆 潤
藤原 務
⽊村 祐貴

沈尚

所

属

研

東京海洋⼤学・学術研究院・教授
京都⼤学・フィールド科学教育研究センター・教授
近畿⼤学・農学部・教授
国⽴研究開発法⼈森林研究・整備機構森林総合研究所・主任研究員
京都産業⼤学・総合⽣命科学部・准教授

究

課

題

⽊庭

我が国における河川⽔中の⼤気由来窒素に関する研究

⽊庭

⽣態三者系相互作⽤の駆動機構に関する研究

髙林

N2Oの挙動解析カシバの誘引物質探索

⽊庭

環境DNA解析による琵琶湖に⽣息するナマズ属の⽣息密度推定および遺伝的多様性の調査
先史時代⼈⾻コラーゲン炭素窒素安定同位体⽐測定による

攻・教授

⾷性解析
名古屋⼤学

⼤学院・環境学研究科・教授
滋賀県琵琶湖環境部琵琶湖保全再⽣課・主査
地⽅独⽴⾏政法⼈⼤阪府⽴環境農林⽔産総合研究所・⽔産研究部・研究員
京都⼤学⼤学院⼯学研究科附属流域圏総合環
境質研究センター・研究員

教員

深海を対象として⽣物多様性モニタリング技術の開発

京都⼤学⼤学院・理学研究科・⽣物科学専

国⽴⼤学法⼈東海国⽴⼤学機構

担当

中野

⽊庭

三酸素同位体組成を指標に⽤いた琵琶湖の物質循環定量中野

琵琶湖第2湖盆の底層DOの把握

中野

⼤阪湾における漁業資源と漁場環境に関する研究

⽊庭

湖沼の原⽣⽣物による細菌とウィルスの摂⾷

中野

曽⽥ 貞滋

京都⼤学⼤学院・理学研究科・教授

微⽣物群集における動態変化と機能的安定性の統⼀理解

東樹

光永 靖

近畿⼤学・農学部・准教授

在来⿂と外来⿂の⾷物網における相互関係

⽊庭

塩尻 かおり⿓⾕⼤学・農学部・准教授

セイタカアワダチソウの匂いによる⾎縁認識髙林

塩尻 かおり⿓⾕⼤学・農学部・准教授

植物における迅速な防衛形質の獲得について髙林

ヒストン修飾による季節的な遺伝⼦制御の進化プロセス

⼯藤

⻄尾 治幾

滋賀⼤学・データサイエンス教育研究センター・助教

根岸 淳⼆郎北海道⼤学・地球環境科学研究院・准教授

河川⾷物網の空間的つながりの解明

⽊庭

富永 修

福井県⽴⼤学・海洋⽣物資源学部・教授

沿岸域⽣態系の⾷物網と⽣産構造

⽊庭

柴⽥ 誠

京都⼤学⼤学院・地球環境学堂・助教

岡崎 友輔

京都⼤学・化学研究所・助教

環境ゲノム解析を活⽤した琵琶湖微⽣物⽣態系の研究

中野塩尻 かおり⿓⾕⼤学・農学部・准教授

⾷害抵抗性の獲得：迅速な進化か表現型可塑性か？

⼯藤

槻⽊ 玲美

松⼭⼤学・法学部・教授

⽶⾕ ⾐代

近畿⼤学・農学部・講師

ヒノキ林の斜⾯位置の違いが⼟壌中の窒素の形態変化および樹⽊による窒素の吸収形態に与える影響の解析

堆積物の環境DNAを⽤いた過去100年にわたる微⽣物相復元
の試み

⽊庭

本庄
髙林

さまざまな植物の⾹りの害⾍に対する忌避作⽤を調べる
⼯藤

中野 隆⽂

京都⼤学⼤学院・理学研究科・准教授

炭素窒素安定同位体⽐分析を⽤いた琵琶湖に⽣息するカワニナ属を中⼼とする⾷物網の解明

38

⽊庭

申請者

早坂 ⼤亮

永⽥ 貴丸
上⽥ 拓史
奥⽥ 昇

奥⽥ 昇

所

属

研

近畿⼤学⼤学院・農学研究科・准教授

滋賀県琵琶湖環境科学研究センター・総合解析部⾨・主任研究員
元・⾼知⼤学・名誉教授
神⼾⼤学・内海域環境教育研究センター・教
授

究

課

題

担当
教員

アルゼンチンアリの体表炭化⽔素の分析

⽊庭

湖沼の円滑な物質循環につながる要件と指標に関する研究

中野

琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究

中野

⽔⽥の⽣物多様性と⽣態系多機能性：実験的検証

⽊庭神⼾⼤学・内海域環境教育研究センター・教

気候変動に対する湖沼⽣態系のメタン動態：全球的理解に授向けた緯度間⽐較
⼟性の異なる⼟壌におけるメタン発酵消化液由来の窒素動

中野

柴⽥ 誠

京都⼤学⼤学院・地球環境学堂・助教

辻 かおる

スタンフォード⼤学・⽣物科学科・研究員

花や種⼦に住む微⽣物の解明

髙林

吉⼭ 洋⼦

⿓⾕⼤学・農学部・ラボラトリー専⾨助⼿

琵琶湖藻類の光合成リズムの解明

本庄⽇本周辺海域の窒素循環理解のための硝酸塩同位体⽐分析

⽊庭

国⽴研究開発法⼈⽔産研究・教育機構
堀井 幸⼦

資源研究所

海洋環境部

態の解析

⽊庭

⽔産

暖流第2グループ・研究員
マンリョウの葉、根、根圏⼟壌の微⽣物群集のメタ解析に

北島 薫

京都⼤学⼤学院・農学研究科・教授

吉⽥ 天⼠

京都⼤学⼤学院・農学研究科・教授

琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態

本庄

河内 ⾹織

近畿⼤学・農学部・講師

奈良県吉野川におけるコクチバスの⾷性解明

⽊庭

⽥中 周平

京都⼤学・地球環境学堂・准教授

琵琶湖底質に含まれる炭素安定同位体の鉛直分布調査

⽊庭

東 若菜

神⼾⼤学⼤学院・農学研究科・助教

巨樹上の林冠⼟壌と着⽣植物群集に関する研究

⽊庭

⾨脇 浩明

京都⼤学・⽩眉センター（受け⼊れ：農学研究科）・特定准教授

よる⽐較

東樹

本庄
シカによる過採⾷の影響が⼟壌微⽣物群集に与える影響
⼯藤

東⾕ 篤志

東北⼤学⼤学院・⽣命科学研究科・教授

イネ冷害におけるエピジェネティックな制御機構の解明

⼯藤

⼭尾 僚

弘前⼤学・農学⽣命科学部・助教

樹⽊の⽇⻑認識機構の解明

⼯藤

伊藤 雅之

兵庫県⽴⼤学・環境⼈間学部・准教授

琵琶湖のメタン動態・微⽣物代謝評価の解明

中野

井上 みずき

⽇本⼤学⼤学院・基礎科学研究科・准教授

⾵衝ハイマツ群落下のコケモモの定着・衰退過程の解明

⽊庭

下野 裕之

岩⼿⼤学・農学部・教授

阿部 晴恵

ニズム解明

新潟⼤学・佐渡⾃然共⽣科学センター演習

シマヘビによる⿂⾷が佐渡島の森川海間の物質循環に与え

林・准教授

る影響

⼩⽥ あゆみ信州⼤学・農学部・助⼿

野村 康之

⿓⾕⼤学・⾷と農の総合研究所・博⼠研究員

細川 宗孝

近畿⼤学・農学部・教授

三⽥村 啓理イネの穂ばらみ期耐冷性の施肥窒素による変動要因のメカ

京都⼤学・フィールド科学教育研究センター・教授

⼟壌と葉内の硝酸態窒素同位体⽐測定による北⽅林樹⽊の硝酸態窒素利⽤実態の解明
チガヤ2⽣態型およびそれらのF1雑種のゲノムサイズ変異の
解明

⼯藤

⽊庭

⽊庭

⼯藤

アブラナ科植物の体細胞雑種の作出

⼯藤

沿岸域の⾷物網構造に対する⼈間活動の影響評価

⽊庭

39

申請者

所

属

研

究

課

題

葉⽼化におけるエチレン合成と受容に関するトランスクリ

担当
教員

草場 信

広島⼤学⼤学院・統合⽣命科学研究科・教授

早坂 ⼤亮

近畿⼤学⼤学院・農学研究科・准教授

⽔⽥⽣態系における⾷物網解析

⽊庭

伊藤 雅之

兵庫県⽴⼤学・環境⼈間学部・准教授

琵琶湖のメタン動態・微⽣物代謝評価の解明

⼯藤

三⾕ 曜⼦

京都⼤学・野⽣動物研究センター・教授

海棲哺乳類の摂餌⽣態と回遊に関する研究

⽊庭Comammox細菌の窒素・酸素同位体分別の解析

⽊庭

岡部 聡

北海道⼤学⼤学院・⼯学研究院・環境創⽣⼯
学部⾨・教授

プトーム解析

樹洞および不定根と関連した熱帯樹⽊の成⻑戦略の解明の⾨⽥ 有佳⼦

京都⼤学⼤学院・農学研究科・研究員

Xin Cao

Donghua University, College of Environmental
Science and Engineering・Associate Professor

Analysis of bacterial diversity in the phycosphere of bloomforming cyanobacteria

お茶の⽔⼥⼦⼤学・基幹研究院・⾃然科学

酸性霧暴露がブナ実⽣に与える影響についての遺伝⼦発現

系・講師

解析

岩崎 貴也

ための予備調査

40

⼯藤

⽊庭

中野

⼯藤

調査船｢はす｣運航及び利⽤実績表（2021年度）

船：調査船職員
教：CER 教員

延べ運航日数 52 日
院：CER 大学院生等

延べ乗船者数

196

名

延べ共同利用者数（非乗船者を含む）
延べ研究課題数
⽉⽇

時間

研：CER 研究員

230 名

共：外部共同利用者
CER：CER 構成員

120 件

研究課題・⽤務内容

乗船利⽤

2021

船

4

1

8:10 〜 11:29 三酸素同意体組成を指標に⽤いた琵琶湖の物質循環速度定量

467:54 〜 10:52

4

7

定期観測

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
Seasonal diversity and cell size changes of diatoms in lake Biwa with respect tovarious environmental parameters
8:04 〜 10:52 琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

教

⾮乗船利⽤
院

2

研

共

CER

CER
以外

4

1

11

1

3

2

2

2

1

3

2

3

2

4

2

1

1

3

2

1

1

3

1

3

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
Seasonal diversity and cell size changes of diatoms in lake Biwa with respect tovarious environmental parameters
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
421

8:06 〜 11:36 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
琵琶湖で⽔深別に⾒られる線⾍ eDNA

427

8:40 〜 11:19

5

6

8:01 〜 10:46

5

10

7:51 〜 12:22

5

14

5

26

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
定期観測

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
Seasonal diversity and cell size changes of diatoms in lake Biwa with respect tovarious environmental parameters
7:57 〜 11:12 琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
Seasonal diversity and cell size changes of diatoms in lake Biwa with respect tovarious environmental parameters
8:00 〜 10:59 琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

2

2

2

2

4

2

2

1

3

1

3

2

5

1

10

1

4

1

3

1

4

1

5

1

3

1

3

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
定期観測

6

2

8:00 〜 11:03

6

9

8:05 〜 11:48 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
Seasonal diversity and cell size changes of diatoms in lake Biwa with respect tovarious environmental parameters
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

2

2

2

堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
湖沼の原⽣⽣物による細菌とウィルスの摂⾷
621

8:06 〜 14:45 三酸素同意体組成を指標に⽤いた琵琶湖の物質循環速度定量

25

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
623

8:06 〜 14:45 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究
定期観測

7

6

8:04 〜 10:48

2

7

13

8:30 〜 10:48 琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

2

1

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
環境ゲノム解析を活⽤した琵琶湖琵琶⽣物⽣態系の研究

716

8:24 〜 12:19

7

19

8:10 〜 10:24

8

2

7:54 〜 11:55 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2
2

6
1

定期観測
2

⽣態学的化学量論による植物プランクトンと細菌群集との相互作⽤の検討

41

⽉

⽇

時間

研究課題・⽤務内容

乗船利⽤

2021

船

教

⾮乗船利⽤
院

研

共

CER

CER
以外

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
84

8:09 〜 10:33 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

1

4

2

1

2

4

2

1

1

3

2

1

1

4

琵琶湖藻類の光合成リズムの解明
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
823

8:07 〜 10:30 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
定期観測

9

10

8:08 〜 11:20 琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

924

7:59 〜 10:07 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
湖沼の原⽣⽣物による細菌とウィルスの摂⾷
ガス試料⽤採⽔デモンストレーション

927

8:24 〜 14:37 成層期における琵琶湖深層堆積物中の硫⻩循環

2

1

2

3

2

2

2

2

1

琵琶湖底泥からの脂質抽出の試み
ガス試料⽤採⽔デモンストレーション
929

7:52 〜 11:13 琵琶湖底泥からの脂質抽出の試み
鉤頭⾍類の中間宿主である⼩型甲殻類の採集1019:16 〜 10:34

104

7:58 〜 15:47

気候変動に対する湖沼⽣態系のメタン動態：全球的理解に向けた緯度間⽐較
気候変動に対する湖沼⽣態系のメタン動態：全球的理解に向けた緯度間⽐
較

2

2

1

3

2

3

1

2

2

11

定期観測
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
10

6

8:09 〜 11:56 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
環境ゲノム解析を活⽤した琵琶湖琵琶⽣物⽣態系の研究
1011

7:48 〜 14:27

10 12

8:12 〜 12:40

10 15

7:49 〜 13:32

10 19 10:01 〜 13:40

気候変動に対する湖沼⽣態系のメタン動態：全球的理解に向けた緯度間⽐
較
炭素窒素安定同位体⽐分析を⽤いた琵琶湖に⽣息するカワニナ属を中⼼とする⾷物網の解明
気候変動に対する湖沼⽣態系のメタン動態：全球的理解に向けた緯度間⽐較
琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

10 21

8:15 〜 10:19

11

8:25 〜 13:28 琵琶湖のメタン動態・微⽣物代謝評価の解明

1

11

4

8:06 〜 10:18

11

11

8:13 〜 10:21

11

16 10:02 〜 13:111117琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

3

1

2

2

3

1

1

2

3

1

2

2

4

2

5

1

3

2

1

2

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

2

1

1

3

2

1

1

3

2

5

2

4

1

3

1

3

2

4

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
8:18 〜 11:32 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

堆積物の環境 DNA を⽤いた過去 100 年にわたる微⽣物相復元の試み
定期観測

11

18

8:05 〜 12:08

2

11

26

7:56 〜 10:04

122

9:15 〜 12:46 琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

定期観測
2

1

1

1

3

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
12 10

8:18 〜 10:30

12 14

9:43 〜 13:08

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握
琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

42

2
2

1
3

1

3

2

6

⽉

⽇

時間

研究課題・⽤務内容

乗船利⽤

2021

船

教

⾮乗船利⽤
院

研

共

CER

CER
以外

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
12 15

8:18 〜 10:50 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

1

1

4

2

1

1

3

CER

CER
以外

1

3

1

3

2

6

1

3

2

6

琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究
12 23

8:18 〜 10:33

琵琶湖における浮遊性タイヨウチュウの季節的空間的変化
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2022

船

定期観測

1

11

8:05 〜 10:06

1

20

9:49 〜 10:11 堅⽥ ドック⼊り

2

1

27 14:18 〜 15:04 下阪本沖湖底地形調査

2

2

4

11:29 〜 12:17 堅⽥ ドック引き取り

2

2

7

10:08 〜 14:35 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

教

院

研

共

2

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

定期観測2

琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究
琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態

2

10

9:40 〜 12:57

3

2

8:13 〜 11:18 琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握

2

3

定期観測
2

琵琶湖深層部の浮遊性・底⽣性カイアシ類の分類学的研究
389:36 〜 12:36

琵琶湖湖底からの⼀酸化炭素酸化菌の探索とその⽣態
琵琶湖第 2 湖盆の底層 DO の把握※1 ⽉ 27 ⽇は調査船「ElodeaⅡ」を使⽤した。

4323