Journal of Environmental Biotechnology（環境バイオテクノロジー学会誌）
Vol. 6, No. 2, 87–92, 2006ƷἕƷƷ◻⾷ᣀ⮥⾸ƷɗɵȪɳȳɻɏɗɵȺɒʀɄǽᐦ⢧Ƿᑿ⃆Structure-Function Relationships of Haloalkane Dehalogenases
永田裕二*，津田雅孝

YUJI NAGATA and MASATAKA TSUDA
東北大学大学院生命科学研究科生態システム生命科学専攻 〒980–8577 宮城県仙台市青葉区片平2–1–1* TEL: 022–217–5682 FAX: 022–217–5699* E-mail: aynaga@ige.tohoku.ac.jp
Department of Environmental Life Sciences, Graduate School of Life Sciences, Tohoku University,
2–1–1 Katahira, Aoba-ku, Sendai 980–8577, Japanȵʀɷʀɑ：ハロアルカンデハロゲナーゼ，有機塩素系化合物，環境汚染物質，タンパク質工学
Key words: haloalkane dehalogenases, organochlorine compounds, environmental pollutants, protein engineering（原稿受付

2006年10月 3 日／原稿受理

1.ƷǾ ǧ Ȑ Ǻ
ハロアルカンデハロゲナーゼは，元々有機ハロゲン系
環境汚染物質分解資化能を有する細菌から，それら物質の分解資化に関わる酵素のひとつとして同定され，主に環境汚染物質分解の観点から研究が進められてきた。本酵素は，加水分解による反応機構が比較的単純で insilico 解析しやすいこともあり，変異導入などのタンパ
ク質工学的研究を中心とした酵素研究のよいモデル材料である。また，本酵素は基質特異性が広いことから応用範囲が広く，実用的な面からも注目されている。さらに，
最近，本酵素遺伝子ホモログが全ゲノム配列が解読された根粒菌や結核菌およびその類縁菌などに比較的広く分布していることが明らかになり，その生理的意義や酵素進化の観点からも興味が持たれている。本稿では，ハロ
アルカンデハロゲナーゼに関する著者らの最新の研究成果を中心に紹介し，本酵素の基礎学問領域と応用研究領域での可能性について論じてみたい。

2006年11月 5 日）

ミノ酸残基の番号を表記する）と，水を活性化するためのヒスチジン (H272) と酸 (E132) からなる catalytic triadが反応に必須である。さらに，遊離したハロゲンイオン
X– を一時的に安定化させるためのアミノ酸残基（W109と N38）も反応に必要であり，これらを含めて catalytic
pentad と総称することもある。逆に，こうしたアミノ

2.ƷɗɵȪɳȳɻɏɗɵȺɒʀɄ
細菌由来の脱ハロゲン酵素であるハロアルカンデハロ
ゲナーゼ (EC 3.8.1.5) は，α/β-hydrolase familyに属する
加水分解酵素の一員であり，水を利用して基質のハロゲ
ンを水酸基に置換し，アルコールとハロゲン化水素を生じる反応を触媒する5)。反応機構は図 1 に示した通りで，求核置換反応（SN2 反応）により，基質–酵素がエステル結合したアルキル中間体を生じ (a)，これが活性中心で活性化された水によって加水分解される (b)。従って，
求核性のアミノ酸残基（D108: 以下，特に断らない限り
は α-プ ロ テ オ バ ク テ リ ア の Sphingobium japonicum
UT26 株由来のハロアルカンデハロゲナーゼ LinB のア

図 1 ．ハロアルカンデハロゲナーゼ LinB の反応機構。
求核置換反応により基質−酵素がエステル結合したアルキル中間体が生じ (a)，これが活性化された水により加水分解される (b)。詳細は本文参照。

88

永田，津田

酸残基を有することがハロアルカンデハロゲナーゼの特徴といえる。
ハロアルカンデハロゲナーゼは，(i) 加水分解による反応機構の詳細が明らかになっている，(ii) 約 30 kD の比較的低分子の単量体であり，コンピューター解析が比較的容易である，(iii) 基質となるハロアルカン類の種類が多く，それらの構造が多様性に富む，(iv) 基質特異性の異なる複数の酵素の立体構造が既に解かれている，な
どの理由により，酵素の構造-機能相関の研究に最も適した材料のひとつとなっている。
広い基質域を持つ本酵素は，応用面でも注目されている。まず，有機塩素系農薬などの様々なハロアルカン系
環境汚染物質の分解に応用可能で，本酵素活性を有する
細菌細胞を固定化させたバイオリアクターが欧州では実用化されている。また，後述するように，物質の化学合成の際に生じる反応副産物の除去や，毒ガス（マスタードガス）の分解への応用も可能である。さらに，脱ハロ
ゲン反応により酸が生じることを利用して，pH メー
ターと本酵素を組み合わせ，ハロゲン系物質による汚染を感知するためのバイオセンサーとしての利用も検討されている。一方，最近では，アルキル中間体を加水分解できない変異酵素を目的のタンパク質と融合させ，長鎖アルカン系の蛍光物質を咬ませることによりそのタンパ
ク質の局在を明らかにする真核細胞用の分子生物学ツールとしても用いられるなど，用途は様々である。このような応用面を考えても，本酵素の反応機構の詳細および構造-機能相関を明らかにすることは重要である。
3.ƷɗɵȪɳȳɻɏɗɵȺɒʀɄ LinB
著者らは，長年，有機塩素系殺虫剤 γ-hexachlorocyclohexane (HCH) 分 解 資 化 能 を 有 す る グ ラ ム 陰 性 細 菌
Sphingobium japonicum UT26 株の研究を行ってきた4,12,15)。その研究過程で，γ-HCH分解の 2 段階目の反応を触媒する酵素として LinB を同定した9)（図 2 ）が，本酵素は γ-HCH の分解代謝中間体以外にも，1-chlorobutane をはじめとする様々なハロアルカン類を基質にできるハロアルカンデハロゲナーゼであることを見出した10)。著者らは X 線結晶構造解析により LinB の立体構造を決定すると共に7)，基質特異性の異なる他の 2 種類のハロアルカンデハロゲナーゼ (Xanthobacter autotrophicus 由来の DhlA と Rhodococcus 属細菌由来の DhaA)の立体構造情報と併せて，本酵素群の構造−機能相関に関する研究を進めている。これら 3 種の酵素の基質特異性の違いは，活性中心ポケットの形と大きさでおおむね説明できるが，酵素反応全体を解析するには酵素のダイナミクスも考慮する必要がある。また，これら 3 種の酵
素は，反応に必要である遊離したハロゲンイオンを一時

図 2 ．Sphingobium japonicum UT26 株の有機塩素系農薬 γ-HCH 分解代謝経路。
カッコ内の物質は不安定であり，直接の検出はできていない。物質名: 1, γ-HCH; 2, γ-pentachlorocyclohexene; 3, 1,3,4,6-tetrachloro1,4-cycloheadiene; 4, 1,2,4-trichlorobenzene; 5, 2,4,5-trichloro-2,5-cyclohexadiene-1-ol; 6, 2,5-dichlorophenol; 7, 2,5-dichloro-2,5cyclohexadiene-1,4-diol; 8, 2,5-dichlorohydroquinone; 9, chlorohydroquinone; 10, hydroquinone; 11, acylchloride; 12, γ-hydroxymuconic
semialdehyde; 13, maleylacetate; 14, β-ketoadipate. 略称：GSH, グルタチオン（還元型）；GS-SG, グルタチオン（酸化型）

89

ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能的に安定化させるためのアミノ酸残基に多様性が見られた1)。先に，このようなアミノ酸残基がハロアルカンデ
ハロゲナーゼとしての特徴として必要と述べたが，相同性のレベルが低い場合，単純に配列情報からだけではこれらを予測することは困難である。さらに，生化学的解析の結果，これら 3 種の酵素は反応の律速段階がそれぞれ異なっていた17)。すなわち，それぞれ基質が異なるが，LinB ではエステル中間体の加水分解のステップ，DhlA
ではハロゲンイオンの放出のステップ，DhaA ではアルコール産物の放出のステップが律速段階となっていた。
このことは，極めて類縁性の高い酵素であっても，反応効率を上げたい場合にどのステップを改変するのが最も効率的であるかは，それぞれのケースに応じて異なっている可能性があることを意味している。

する活性中心付近に注目し，その近辺のアミノ酸残基を操作するケースが多いが，劇的な効果が期待される反面，それだけ変異酵素が失活する確率も高い。そこで，著者
らは基質や産物の出入りも酵素の反応特性を規定する重要な因子であることを考慮し，酵素の表面から活性中心へ至るトンネル部分に注目した機能改変を実施した3)。
LinB の177番目のロイシン (L177) は，立体構造上，トンネル部分の内側に突き出している。さらに，他のハロ
アルカンデハロゲナーゼと比較したところ，L177 に相当するアミノ酸残基は活性中心ポケットを構成するアミノ酸残基の中で最も多様性が見られるものでもあり，系
統学的な観点からも基質特異性への関与が予想された。
そこで，この L177 を他の19種類全てのアミノ酸への置換を実施したところ，作製した19種類の変異酵素のうち15種類が活性を保持していた。さらに，これら15種類の変異酵素について12種類の基質に対する特異性を検討したところ，これら全ては，わずか 1 アミノ酸残基の違い
で互いに異なる基質特異性を示した（表 1 ）3)。以上の結果は，変異導入による失活の可能性の低いトンネル部分の操作というアプローチでの酵素の機能改変が有効であることを意味している。LinB の L177 にあたるアミノ酸残基は，後述する DhaA の進化工学的研究2) や，LinBの活性中心を結核菌由来のハロアルカンデハロゲナーゼの活性中心に累積置換する実験11) でも基質特異性に重4.ƷɗɵȪɳȳɻɏɗɵȺɒʀɄǽᑿ⃆ტং
反応機構の詳細が明らかになれば，理論に基づいた機能改変がある程度可能になると期待できる。以下に，著者らが行った理論に基づいたハロアルカンデハロゲナー
ゼの機能改変を 3 例ほど紹介する。
4.1.ƷLinB ǽɐɻɕɳ⤴Ȫɧɖ⥫ᔞ࣠ǽტং
酵素の理論的機能改変を試みる際，基質が結合し反応

表 1 ．ハロアルカンデハロゲナーゼ LinB の L177 変異酵素の相対活性a（文献3より）。
Substrate

WT

A

C

G

F

K

T

W

1-chlorobutane
1-chlorohexane
1-bromobutane
1-iodobutane
1,2-dichloroethane
1,2-dibromoethane
1,3-diidopropane
1,2-dichloropropane
1,2,3-trichloropropane
chlorocyclohexane
bromocyclohexane
3-chloro-2-methylpropene

100
100
100
100
ND
100
100
ND
ND
100
100
100

142
106
356
133
ND
155
360
ND
ND
ND
115
199

37
179
243
210
ND
52
192
ND
ND
ND
298
157

94
125
380
344
ND
78
164
ND
ND
33
398
200

229
215
243
126
ND
70
130
ND
ND
ND
267
98

61
100
201
131
ND
97
132
ND
ND
ND
117
110

ND
143
553
424
ND
107
108
ND
ND
ND
198
96

138
89
60
58
ND
7
117
ND
ND
139
80
91

Substrate

WT

D

H

Ib

M

Pb

Q

R

S

V

Y

1-chlorobutane
1-chlorohexane
1-bromobutane
1-iodobutane
1,2-dichloroethane
1,2-dibromoethane
1,3-diidopropane
1,2-dichloropropane
1,2,3-trichloropropane
chlorocyclohexane
bromocyclohexane
3-chloro-2-methylpropene

100
100
100
100
ND
100
100
ND
ND
100
100
100

104
44
347
259
ND
77
209
ND
ND
38
63
25

56
75
224
208
ND
55
140
ND
ND
ND
43
82

ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND

144
162
227
187
ND
126
202
ND
ND
79
104
100

ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND
ND

54
165
458
373
ND
123
159
ND
ND
ND
120
138

46
31
165
161
ND
68
127
ND
ND
ND
37
83

60
104
381
363
ND
84
123
ND
ND
21
156
65

74
80
132
101
ND
84
206
ND
ND
91
41
79

55
80
112
97
ND
16
102
ND
ND
ND
41
78

各変異酵素の12種類の基質に対する活性を野生型酵素 (WT: L) の活性を100とした相対活性で表した。
変異酵素 I と P は，タンパク質の折りたたみが異常であることをCDスペクトルで確認した。
ND=Not Detectable（活性が検出限界以下）

a

b

90

永田，津田

要であることが明らかになっており，理論的アプローチ
が進化工学的手法などの理論的裏付けを必要としないア
プローチと同様の結果を得た好例であるといえる。また，T の変異を導入した場合，野生型 LinB の良好な基質である 1-chlorobutane が基質とならなくなる（表 1 ）などのケースは，本アプローチがそれなりに劇的な変化も期待できることを示している。しかし，残念ながら，逆に元々 LinB が全く，あるいはほとんど基質としない
1,2-dichloroethane, 1,2-dichloropropane, 1,2,3-trichloropropane (1,2,3-TCP) などの物質が変異導入により新たに基質になるという，応用的により意味の大きい結果は得られなかった（表 1 ）。
4.2.ƷDhaA ǽɁɵɋɐ⤴ǽტং
1,2,3-TCP は，エポキシ樹脂等の原料である epichlorohydrin を化学合成する際の副産物として生じる有害な塩素化合物である。DhaA は微弱ながらも 1,2,3-TCP 分
解活性を示し，error-prone PCR により，触媒係数が約 8 倍上昇した変異酵素 M2 (C176Y+Y273F) が取得されている2)。コンピューターによる Molecular dynamic シ
ミレーションの結果，M2 の 1,2,3-TCP に対する活性の上昇の主要因は，C176Y 変異により，基質および反応産物の出入り口がメイントンネルから脇のスロットに変わったことによるものと予想された（図 3 ）。さらに，
立体構造情報からスロットの大きさを規定する主因子として I135, W141, V245, L246 が同定された（図 3 ）。このうち，W141 にあたるアミノ酸残基はほぼ全てのハロ
アルカンデハロゲナーゼで W か F であり，このいずれかのアミノ酸残基でなければならない機能上の必然性が予想されたため，まず M2 に W141F の変異を導入し，変異酵素 M3 (C176Y+Y273F+W141F) を作製した。M3
は M2 より若干強い 1,2,3-TCP 分解活性を示した。さら

図 3 ．ハロアルカンデハロゲナーゼ DhaA の活性中心ポケットの構造。
DhaA タンパク質の表層を描画し，その断面図を示す。活性中心の D106，1,2,3-TCP に対する活性が上昇した変異
酵素 M2 の活性上昇の主因であると考えられる変異が導入された C176，スロットを形成するアミノ酸残基 (I135,
W141, V245, L246) を示した。C176Y の変異導入により，基質及び産物の出入りがメイントンネル（左上矢印）から，スロット（左下矢印）に変わることによって活性が上昇したと予想されている。

に，M2 と M3 の I135, V245, L246 に対して saturated
mutagenesis を実施したところ，M2 の数倍から10倍程
度，すなわち野生株の100倍程度に活性が上昇した変異
酵素が複数取得できた（Pavlova, M. et al. 未発表データ）。
これは，実用化を検討するレベルの活性の強さであり，
現在，これら変異酵素の詳細な解析を進めている。
4.3.ƷLinB ǽ β-HCH ո╫ͦ♢⃆
β-HCHは，6 つの塩素原子がすべてエクアトリアルの位置に存在することから，γ-HCH 合成の際の HCH 工
業原体に含まれる 4 つの主な立体異性体（α-, β-, γ-, δ異性体）の中で化学的に最も安定であり，環境への残留性も高く，汚染も深刻である。我々は γ-HCH 分解においては 2 段階目の反応を触媒する LinB（図 2 ）が直接
β-HCH に対する分解活性を微弱ながら持つことを明らかにした13)（図 4 ）。さらに，我々が HCH 汚染土壌より新たに単離した γ-HCH 分解資化菌 Sphingomonas sp.
MI1205 株は，UT26 株に比べて顕著に強い β-HCH 分解
活 性 を 示 す と 共 に，β-HCH が 変 換 さ れ て 生 じ る
2,3,4,5,6-pentachlorocyclohexanol (PCHL) を 2,3,5,6-tetrachlorocyclohexane-1,4-diol (TCDL) に変換する活性も有していた。そこで，MI1205 株中で PCHL から TCDLの変換活性を担う酵素を明らかにしたところ，LinBUT26と極めて高い相同性（98％）を示す LinBMI1205 が同定された。LinBMI1205 は，LinBUT26 とわずか 7 アミノ酸残基の違い（296アミノ酸残基中）にもかかわらず，β-HCH に対して強い活性を示すのみならず，2 段階目の PCHL から TCDL を生じる反応も触媒した（Ito, M. et al. 未発表
データ）（図 4 ）。同様の結果は，最近，インドと中国の研究グループにより，Sphingobium indicum B90A 株の
LinBB90A と Sphingomonas sp. BHC-A 株の LinB2（いずれもLinBMI1205 と100％同一）でも報告された19,20)。さらに，LinBMI1205 と LinBUT26 の間で異なる 7 つのアミノ酸残基のうち，134番目と247番目の 2 つのアミノ酸残基（MI1205 ではそれぞれ V と H，UT26 では I と A）が立体構造上，活性中心ポケットの表面に出ていることから，
LinBMI1205 と LinBUT26 のこの 2 つのアミノ酸残基にそれぞれ変異を導入する実験を我々は行った。その結果，
LinBUT26 の変異酵素 I134V+A247H には PCHL 変換能が付 与 さ れ，LinBMI1205 の 変 異 酵 素 V134I+H247A のPCHL 変換活性は著しく弱まったことから，この 2 つのアミノ酸残基が PCHL 変換活性に重要であることを確認した（Ito, M. et al. 未発表データ）。しかし，この 2 つのアミノ酸残基だけでは反応特性の違いを完全に説明することはできず，両者の DNA レベルでの相違が全て非同義置換であることとも併せて，他の 5 つのアミノ酸残基も反応性の違いに少なからず関与していることが示唆された。また，δ-HCH に対しても LinBUT26 が 1 段階の反応しか触媒しないのに対して，LinBB90A は 2 段階の反応を触媒することをインドの研究グループが示している19)。UT26 株が γ-HCH だけをまき続けた試験圃場から単離された分解菌であるのに対して，MI1205 株，
BHC-A 株，B90A 株が他の異性体も含む汚染土壌から単離されたものであることから，選択圧の違いが反応特性の大きく異なる 2 種類の LinB を産み出したのではな
いかと推測している。反応特性の相違を産み出す詳細なハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能

91

図 4 ．LinB による β-HCH の分解経路。
UT26 株由来の LinB は最初の反応しか触媒せず活性も弱いのに対して，
MI1205 株の LinB は 2 段階の反応を触媒し，活性も強い。
詳しくは本文参照。

機構については不明であるが，以上の結果は，少なくとも数アミノ酸残基の置換で酵素の反応特性を劇的に改変することが可能であることを示している。
5.ƷɈȬɂጔḩ≗ᨁቻǽ LinB ɣɪɵȸ DbjA
前項で述べたように，ハロアルカンデハロゲナーゼでは，改変のターゲットを絞り既存の酵素の機能改変を行うことはある程度有効であるが，完全に理論に基づいた
思いのままの機能改変は少なくとも現段階では不可能である。逆に，4.3で挙げた例のように，自然に存在する酵素が機能改変のホットスポットを教えてくれる場合もある。そこで，我々は，より多くの遺伝子資源からハロ
アルカンデハロゲナーゼ遺伝子を取得するために，これまでの研究で未開拓であったと考えられる遺伝子資源として (i) 細菌のゲノム情報と (ii) 難培養性細菌の遺伝情報も含む環境 DNA に注目した研究を進めている8,14)。
本稿では，遺伝子の取得と解析が進んでいる前者についてのみ紹介する。
LinB のホモログ遺伝子は，結核菌を含む Mycobacterium 属細菌6) や根粒菌18) など，比較的多くの細菌株のゲノム配列中に見出される。我々は，このうち，特にダイズ根粒菌 Bradyrhizobium japonicum USDA110 株由来のハロアルカンデハロゲナーゼ DbjA について X 線結晶構造解析を含めた詳細な研究を進めている。その大きな理由のひとつに，DbjA が大腸菌中で良好に高発現
し，大量の精製酵素が比較的容易に取得できることが挙 げ ら れ る。 ミ ヤ コ グ サ 根 粒 菌 Mesorhizobium loti
MAFF303099 由来の DmlA は，融合タンパクにしたり，
シャペロンタンパク質を用いたりするなどの複雑な方法
で発現・精製が可能である18) が，構造解析や詳細な生化学的解析に資するほどの量を精製することは現時点では不可能である。また，Mycobacterium avium N85 由来の DhmA は，大腸菌の系では十分量の酵素を精製することは不可能であったが，Mycobacterium 属細菌と同じグラム陽性菌の Rhodococcus を用いた発現システムである程度の量の酵素が精製でき，catalytic pentad を明らかにすることができた16)。このように，酵素の発現・精製は未開拓遺伝子資源から取得した新規酵素遺伝子の機能解析を行う上でも大きな障害となっている。さて，
DbjA は精製が容易であるだけでなく，既知のハロアル
カンデハロゲナーゼに比べて，枝分かれするなどしてかさ高い（bulky な）基質に対して強い活性を示した。さ

図 5 ．根粒菌由来のハロアルカンデハロゲナーゼ DbjA と LinBの立体構造比較。
DbjA に特異的な EB 配列に相当する部分を丸で囲った。

らに，LinB など解析の進んでいる既知のハロアルカン
デハロゲナーゼは，一般に鏡像異性体認識のレベルが低
く，生理活性物質の生産などには向かないが5)，DbjA
は 2-bromopentane などに対して高い鏡像異性体認識活性を示した（Prokop, Z. et al. 未発表データ）。ハロアル
カンデハロゲナーゼは，保存性の高いメインドメインと，多様性に富み基質特異性を左右するキャップドメインから構成され，活性中心はその間に位置する（図 5 ）。X
線結晶構造解析の結果，DbjA は，メインドメインから
キャップドメインへ繋がるループと，それに続くキャップドメインの α-helix（図 5 中，丸で囲った部分：EB 配列と命名）が他のハロアルカンデハロゲナーゼに比べて長い特徴を持つことが明らかになった（Sato, Y. et al. 未発表データ）（図 5 ）。さらに EB 配列を削った変異酵素
や，逆に EB 配列を付与した他のハロアルカンデハロゲ
ナーゼの解析から，DbjA 特異的な性質が EB 配列に由来することを強く示唆する結果を得ている（Sato, Y. et
al. 未発表データ）。高い鏡像異性体認識機構の詳細については現在解析中であるが，DbjA はゲノム情報を遺伝子資源として有効活用した好例であると考えている。
一方，なぜ結核菌や根粒菌などがハロアルカンデハロ
ゲナーゼ活性を有しているのか，その生理的意義や本来の基質については未だ不明である。有機ハロゲン系の化合物を産生する真核生物との生物間コミュニケーションに関与している可能性も考えられるが，現段階では推測の域を出ない。今後，遺伝子破壊株を用いた実験などにより，こうした可能性が検証されよう。

92

永田，津田

6.ƷȍǷȐǷ͑ൖǽୠሿ
基質特異性が広く，環境汚染物質・毒ガス・有害な工業的副産物の分解など応用範囲の広いハロアルカンデハ
ロゲナーゼは，反応機構の詳細までかなり理解が進んだといえよう。さらに，理論的にターゲットを絞ることにより，本酵素群の実際の応用面を見据えた機能改変がある程度可能であることも示された。このような意味において，ハロアルカンデハロゲナーゼは酵素工学の可能性を示す良い例であると考えられる。しかし，それでも，
完全に理論に基づいて思いのままの活性を有する酵素を作り出すことは現段階では困難であり，さらなる知見の蓄積が必要である。そのためには，実験室内で創出した変異酵素の反応特性の理論的な理解と共に，未開拓遺伝
子資源から取得した新規機能を有する本酵素遺伝子のホモログを解析することが有効であろう。
♢ƷƷƷ⡅
本研究は東北大学大学院生命科学研究科において南澤究教授，大坪嘉行博士，佐藤優花里氏，伊藤通浩氏，Martina Pavlova 氏らと行ったものである。また，コン
ピューター解析等はチェコ・マサリク大学の Jiri Damborsky 教授，Zbynek Prokop 博士らの研究グループ，X線結晶構造解析は産業技術総合研究所の千田俊哉博士らの研究グループとの共同研究である。ここに記すと共に謝意を表したい。また，筆者グループらの研究は，文部科学省科学研究費補助金の特定領域研究，日本学術振興会科学研究費補助金の基盤研究，農林水産省から助成を受けている。
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