SOCIETY OF GENOME MICROBIOLOGY, JAPAN (NO.	 9)#!

2014年5月30日

日本ゲノム微生物学会
ニュースレター
大腸菌の転写因子ネットワーク 松井 求（東京大学大学院・理学研究科・生物科学専攻）

生命のいろいろな階層には多様なネットワーク構造が見られる。本研究では，大腸菌の転写因子を中心としたネットワークに着目し，その進化過程を理解することを目指した。
まず，(A) 大腸菌の全転写因子をそれぞれノードとし，転写因子のアミノ酸配列の類似性に従ってノード間にリンクを張る事でグラフを構築した。そして各ノード群を段階的なクラスタリングに基づいて６つのグループに色分けした（右下は分割パターン。この色分けはBCのパネルでも同様）。この段階的なクラスタリングの結果は転写因子がどのように進化してきたのかを示唆している。すなわち元々は赤色のグループから他の色のグループが派生したと推定される。次に，(B) 転写因子間における制御関係をRegulon DB (ver. 8.5)より取得して描画したところ，転写因子全体の複雑な制御関係が可視化されると同時に，転写因子間の配列類似性と被制御遺伝
子群間の類似性には相関関係がほとんどない事が示された。そこで最後に，(C) 転写因子以外の遺伝子を含めた包括的な遺伝子発現制御ネットワークを構築した結果，同一のグループに属する転写因子がこのネットワー
ク上では散在したパターンを示すことがわかった。以上の結果は，遺伝子制御ネットワークが発達してきた進化の過程で，各転写因子に制御されるそれぞれの被制御遺伝子群は”互いに素”になる方向へ住み分けを進めてきたことを示唆していると考えられる。
【本研究は本年3月の年会におけるポスター賞を受賞】-1-

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き、生命の本質が遺伝子にあることを明らかにし、ウ

若手賞受賞研究!

2014年5月30日

ィルスのように、自己の生存と拡散のために遺伝子そのものが戦略的に振る舞う例を明らかにしてきまし微生物と遺伝子に関する集団ゲノム科
学・疫学研究た。一方、ゲノム科学の幕開けから約20年が経過し、1000 Genomesプロジェクトに象徴されるように、同!
!

一種内の多数の個体のゲノムデータを土台とする集団
ゲノミクスの時代が到来しました。そして、今日の生命研究にとって、「遺伝子の戦略」という視点からの理解（以下、課題1）と多数のゲノムデータの比較に

矢原 耕史（東京大学基づく理解（以下、課題2）が、最も基本的かつ重要

新領域創成科学研究科、JSPS 特別研究員 PD）

な課題になっていると思います。私はこれまで、この両者を研究の基本的な柱とし、大学と企業、国内外の複数の環境を経験しながら、論文を発表してきました（https://sites.google.com/site/kojiyahara）。受賞

この度は若手賞を頂き、大変光栄に、そして励みに

講演ではまず、その中から代表的な論文を選び、これ思っております。私は約10年前、ゲノム微生物学会がまでの研究の歩みを紹介させて頂きました。

まだ、かずさで開かれる「ゲノム微生物学研究のフロンティア」というワークショップだった頃に、大学院

課題1に関しては、戦略的な振る舞いを見せる「利生として研究生活をスタートさせました。そして、ま己的」な動く遺伝子（あるいはそれに拮抗する遺伝

さに今年のゲノム微生物学会年会の直前に、学術振興子）を研究対象に選び、それらがどのような環境で拡会特別研究員としての海外での研究滞在を一段落させ

散（または消失）するのかを、数万世代に渡る生き残て帰国し、翌月の4月1日から、久留米大学の講師としり過程の理論的解析によって明らかにしてきました。

て研究の新しいステージを開始した段階です。従っ利己的な動く遺伝子については、「一気に広がり、あて、私にとっては非常に節目となるタイミングでゲノとは壊れるだけ」というのが、哺乳類や霊長類のゲノム微生物学会から受賞というかたちで背中を押して頂ムから受ける印象ですが、本当にその通りなのでしょいたことになり、心から有り難く思いました。応援しうか。私はこの問題を、もっとも単純なモデル利己的て頂いた先生方に、まず、深く御礼申し上げます。

遺伝子であるホーミング遺伝子（図1A）について解析しました。

現代の生命研究は、分子生物学の長足の進歩に基づ

図1 A: モデル利己的遺伝子の拡散戦略

B: 閉じた集団での利己的遺伝子の存続-2-

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この遺伝子は、ゲノムに一か所だけ挿入サイトを持存サイクルを通じて、遺伝子の水平伝達なしに進化的

ち、減数分裂で空サイトに出会うとそこに自分のコピに維持され得ることが明らかになりました。この研究ーを挿入します。過去の先行研究に基づく「定説」には、ウィルスの拡散過程とも類似しており、利己的遺よれば、この遺伝子は、急速に拡散し集団中のサイト

伝子の拡散に関する一般的意義をもつ研究成果に位置を埋め尽くし、やがて壊れて消失していくと考えられ付けられます（Yahara (2009), PNAS）。この研究のていました。これに対して私は、水平伝達の生じ得なベースは、こうした利己的遺伝子に拮抗する、ゲノム

い閉じた集団内でも、この遺伝子の長期的な存続が可のDNA損傷修復遺伝子の拡散が、過去の定説に反して能であることを理論的に明らかにしました（図1B）。

環境依存的であることを示した論文（Yahara (2007),

そのメカニズムとしては、まず、この遺伝子が集団

Genetics）にあります。この2つの論文は進化生態学

図2 A:インシリコ染色体ペインティング

B: 微細な集団構造 C: 遺伝情報フロー

中のすべてのゲノムに飽和（図1B、赤い線の急上昇）で用いられる方法を活用しており、それを遺伝子の拡した後に、それが壊れて生じる偽遺伝子が利己的遺伝

散・消失過程とその環境依存性という、いわば疫学的子の感染を免れるために有利になって頻度を増やしまな問題の解決に発展・結実させた意味で重要な研究成す。いわば、偽遺伝子はワクチンのような役割を果た

果だと言えると思います。研究遂行にあたっては、総すと考えられます（図1B、緑の線の急上昇）。しか

合研究大学院大学（葉山）の佐々木顕先生に大変お世し、利己的遺伝子を駆逐して多数派になると偽遺伝子話になりました。この場をお借りして深く御礼申し上は何の役にも立たなくなり、逆にそれを保持するコスげます。

トのために徐々に失われていきます。そうすると空サ

課題1の研究は、微生物が形成する集団の意味に注

イトの頻度が上昇（図1B、黒線の上昇）し、利己的目した、微生物の集団生物学（Microbial Population

遺伝子に再び増殖のチャンスが回ってくることになり

Biology）として位置付けられる研究です。アメリカます。つまり、利己的なホーミング遺伝子は、この共ではGordon conferenceの対象である一方、日本では-3-

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研究者が非常に少ない状況ですが、その中で私は、ま菌のゲノム解析に発展的に応用しました。ゲノム全域

ず理論的な側面から貢献を行ってきました。しかし、のゲノム間の相同組換えによるモザイク構造を1塩基生物学がゲノムの時代を迎え、ゲノム解読のペースが単位で明らかにし（図2A）、それから、種内の微細加速していくのを目の当たりにする中で、ゲノムデー

な集団構造（図2B）と集団間の遺伝情報フロー（図タを土台とするdata-drivenの研究にシフトする必要

2C）を明らかにしました。東アジア集団に４つの分性を感じ続けていました。そのための道筋として、IT集団を識別し、沖縄株を含む分集団に欧州由来の遺伝企 業 で ヒ ト ゲノム 解 析 の プ ロ ジェ ク ト を 経 験 して情報が多いなど、日本人の起源に示唆を与える知見もbioinformaticsの技術を磨きつつ、統計科学の大学院得ることが出来ました。これは、ゲノム全域の相同組で学位を取得するという独自の道を歩んでいきまし換えにより系統関係が極めて複雑なネットワークとなた。その中で課題2の方向性を具体化していった結る細菌種について、系統樹に依存しない方法で集団構

果、特に相同組換え率のゲノム上での分布・ランドス造を明らかにし、さらに進んで遺伝情報フローまでをケープに関する研究に注力するようになりました。

明らかにした、細菌ゲノム科学上での重要な成果だと言えるのではないかと思います（Yahara (2013),

課題2では、相同組換えと生物の適応の痕跡をゲノ

Molecular Biology & Evolution）。

ムワイドに同定できる研究対象として、胃がんの原因菌であり、遺伝的多様性が著しく高いことで知られる

こうして課題2の方向にシフトしていった私が、現ヘリコバクター・ピロリ菌を選びました。日本人の癌

在、集団レベル・数百本単位で得られるゲノムデータ

患者等から採取された複数の菌株のゲノムを完全解読に基づいて開拓を進めている研究領域は、集団ゲノムし、世界各地で得られた菌株の集団ゲノムデータと統科学（Population Genomics）と呼ばれます。適応進

合し、スーパーコンピュータを活用して全オーソログ

化のメカニズム、遺伝子型と表現型との関係等の根本問題にアプローチする王道として、世界的には既に分遺伝子解析系を構築しました。そして、ゲノム全域か野を牽引する潮流になっていますが、残念ながら日本

ら相同組換えの痕跡を網羅的に検出しました。その結では、ゲノム微生物学会でゲノムの塩基配列データ解果、組換えの痕跡の検出しやすさが遺伝子の塩基多様析に関する発表が少数派であるなど、大きく遅れをと度にほぼ直線的に比例することを示した上で、ゲノムっていると言わざるを得ません。日本がこの領域で世全体の傾向から外れて相同組換えの痕跡が特に多い遺界に対抗していく上で、その先陣として研究成果を挙伝子の同定に成功しました。その中には、基本的な細げていけるよう、今後とも努力していきたいと思いま

胞機能を司る遺伝子も含まれており、その全長に渡っす。

て組換えの痕跡が期待値よりも多く見られることを、講演当日には、なぜ若手賞ではなく奨励賞に応募し細菌ゲノムに関する研究としては初めて明らかにしまなかったのか、という望外なお言葉を何人かの先生方

し た （ Ya h a r a ( 2 0 1 2 ) , G e n o m e B i o l o g y &から頂きました。課題2の路線の研究は、現在も国際

Evolution）。

的な共同研究体制の下で継続発展中ですので、その中さらに、海外での研究滞在を通じ、ピロリ菌の系統

で一日一日の積み重ねを次の機会に繋げていきたいと

地理的な集団構造と、集団の垣根を越えた相同組換え思います。今回の学会期間中には、これまで直接お話による遺伝情報のフロー（種内の遺伝子水平伝達）のししたことのなかった多くの先生方や若手の方々と交全貌を明らかにしました。この研究では、新たに沖縄流させて頂くことも出来ました。海外から帰国したば

株の全ゲノム解読解析を行うと同時に、解析した株数

かりの私にとって、その１つ１つに背中を押して頂いを29株に増加させ、世界各地のピロリ菌株の集団ゲノムを比較しました。そのために、ヒトゲノム解析のたたように思います。ゲノム微生物学会を通じて、今後

めに最近開発された方法（インシリコの染色体ペイン

もますます研究交流を深めさせて頂ければと思います

ティング法とﬁneSTRUCTURE）を、世界で初めて細ので、どうぞよろしくお願い申し上げます。

-4-

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第８回年会におけるポスター賞
修士課程以下部門!
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遺伝子の周辺領域を解析した結果、これらの菌株のamcp 遺伝子の近傍には、二次代謝の多様性創出の鍵となる酵素である非リボソーム型ペプチド合成酵素

アミノ基結合型キャリアタンパク質を指標

NRPSをコードする遺伝子が数多く存在しており、放とした新規天然化合物の探索

線菌におけるAmCPを利用した多様な二次代謝経路の存在が示唆された。これらの遺伝子クラスターによって生合成される天然化合物の性質に関する情報は皆無

松田 研一（東京大学大学院・生物生産工学研究センター修士２年）

であり、生物活性や吸光を指標とした従来の方法では化合物を検出・単離することができない。また通常の培養条件ではクラスターそのものが不活性の状態である可能性も考えられる。

私の所属する研究室(以下、当研究室)では、全く新しいリジン・アルギニン生合成経路を見出した。このそ こ で、 目 的 とす る 化 合 物 を 同 定 す る た め に 、生合成経路では、α-アミノ基にAmCP (Amino

amcp遺伝子を持つ7株の遺伝子クラスターを異種放線

group-recognizing carrier protein)と名付けたキャリ菌に導入し、形質転換体の代謝物を網羅的に解析する

アタンパク質が結合し、α-アミノ基がタンパク質によことで目的の遺伝子クラスターの生産物を同定するこって保護されたままで以降の反応が効率的に進行すとを試みた。その結果、そのうちの１株に由来する約る。さらにごく最近当研究室では、ある種の放線菌に70 kb に及ぶ長大な機能未知遺伝子クラスターを導入

はAmCPを介した類似の生合成機構が存在し、それにした形質転換体の代謝物中に、新たなペプチド系化合

よって、新規な、タンパク質の構成成分ではないアミ物の生産が認められた。同化合物は親株の培養液中にノ酸が生合成されることを明らかにした。またこのアも見出されたことから、本研究によりその異種生産に

ミノ酸を中間体としてペプチド系の新規天然化合物が成功したといえる。現在その新規な化合物の化学構造

生合成されることも明らかになり、AmCPを利用するを決定しつつある。今後は本研究の成果を足掛かり

システムが、一次代謝産物だけでなく二次代謝産物のに、他の菌株群の遺伝子クラスターの解析を進め、ま生産にも関与していることを示した。これらの生合成

だ未同定のAmCP関連二次代謝産物を同定してその多系はアミノ基に結合するキャリアタンパク質を介した様性を明らかにしていきたいと考えている。

新しい物質変換系と言え、AmCPの関与する二次代謝産物の生合成研究を行うことにより、まだ未開拓の新規な化学構造を持つ天然化合物を得ることができると期待される。本研究では放線菌におけるAmCPを介した物質変換系の分布を探索するとともに、それを利用して生合成される多様な天然化合物を同定することを目指した。
AmCP合成に関与する amcp 遺伝子を指標とした
PCRスクリーニングを848株の放線菌ゲノムに対して行ったところ、29株がamcp遺伝子とホモロジーを示
す遺伝子を持っていることが示唆された。そこで、そのうちの17株のドラフトゲノムシークエンスを行い、13株でamcp遺伝子の存在を確認した。各菌株のamcp-5-

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2014年5月30日

として Synechocystis sp. PCC 6803の蛋白質Sll1558

新規 UDP-glucose pyrophosphorylase

を大腸菌で発現させ精製し、基質特異性と活性値を測(CugP) の同定と水平伝播定した。その結果、この一群のタンパク質は、UTPと!

グルコース-1-リン酸に対する厳密な基質特異性を持つ

前田 海成（東京大学大学院総合文化研究科・生命環境科学系
修士１年）

新規のUDP-Glc PPaseであることがわかったので、
我々はCugP (cyano-bacterial UDP-Glc PPase)と名付!

けた。前述したAlaをGlyに置換したタンパク質についUDP-グルコース (UDP-Glc) は真核・原核生物共にたので、このAla残基は基質特異性を直接決定づけてガラクトース代謝や多糖合成において重要な役割を果はいないと言える。一方でこの置換によりUTPへの親

たす生体分子であり、そのUDP-Glcを合成する酵素で和性が少し下がったため、基質への結合に何らかの役

ある UDP-Glc ピロホスホリラーゼ (PPase) は、ほぼ割を担っているものと考えられる。

ても解析を行ったが基質特異性に変化が見られなかっ全ての生物に存在する。しかしシアノバクテリアにおsll1558の遺伝子破壊株の作製を試みたが、目的といては、大腸菌など他の原核生物に広く分布する酵素

する遺伝子を完全には破壊できなかった。シアノバク(GalU型という) の遺伝子はごく一部の種に存在する

テリアにおいてUDP-Glcはチラコイド膜の主要成分でのみである。これらの事実から我々はシアノバクテリ

あるガラクト脂質合成の基質として重要な役割をもっアには新規のUDP-Glc PPaseがあるのではないかと予ており、この膜脂質合成は光合成能に必須であると考想した。

えられているので、全シアノバクテリアに存在する

GalU型を含むNTP̲transferase ファミリーに属す

CugP型酵素はシアノバクテリアの光合成機能と強くるシアノバクテリアの蛋白質の系統解析によって、結びついているのかもしれない。実際、sll1558の不UTPを基質として結合する酵素にのみ、ヌクレオチド

完全破壊株ではクロロフィルの蓄積等に異常がみられ

基質結合ドメインの直前に特異的なAla残基があるこた。また、シアノバクテリア以外では一部のプロテオとを見出した。このAla残基はシアノバクテリアに広バクテリアがCugPを持っているが、系統樹においてく分布する未同定のタンパク質サブファミリーの一つはそれらのバクテリアを含む枝がシアノバクテリアのにも保存されていたことから、この一群のタンパク質

CugP サブファミリーの内部で分岐すること、そしてを新規のUDP-Glc PPaseであろうと予想し、その代表

それらの近縁種にCugPが存在しないものもあることから、これらのバクテリアのCugPはシアノバクテリ
ア か ら 水 平 伝 播 し た の で は な い か と 考 えて い る 。
(Maeda et al. J. Bacteriol., in press)!

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プラスミドと宿主染色体にコードされるMvaTホモロ
グのホモ多量体・ヘテロ二量体形成機構

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川妻 孝平
（東京大学大学院・農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 修士１年）!

一般に知られるように、ヒトは 2 mもの長さのDNAをコンパクトに畳んで細胞内に格納しており、こ-6-

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で転写抑制に関わる。先行研究より、各ホモログはそれぞれ異なる遺伝子群を制御する事、DNA上の結合箇所はほとんど一致する事が明らかとなっており、この結果から各ホモログが持つ機能の異なる理由はDNA結合ドメインではなく、二量体／多量体化ドメインに起因するのではないかと考えられる。
今回の発表ではPmrとTurBでは多量体形成に重要な残基が異なることが明らかになり、この結果から相同性の高いH-NSファミリータンパク質間で多量体形
成メカニズムが異なる事が示唆された。また、各ホモログはこれまで知られていたホモ二量体だけではなくヘテロ二量体も形成していることが明らかになり、さらにホモログの組み合わせによってはヘテロ二量体形

図１: H-NSファミリータンパク質Pmr, TurA, TurBによる転写制御モデル

成率に差が見られた。これらのことから、菌体内の各ホモログの発現量の比率の違いが多量体の組成を変(1) PmrとTurBでは多量体形成に重要な残基が異なること
から、各タンパク質がDNAを覆う領域は異なり転写に違いが生じる。(2) 例えばヘテロ二量体の結合は、さらにその隣のホモ二量体結合を妨げるかもしれない。

え、DNAを覆う領域を変えたりDNAの高次構造を変えたりするのではないかと考えられる（図１）。
NAPsの研究は、真核生物のクロマチン構造の研究の折り畳みの主役となるヒストンについては、ヒストと比べてまだまだ未発展である。重要な研究だが複雑

ンコード仮説に代表されるように修飾に至るまで多くなのでなかなか解析が進まないことも多いのではないの研究がなされてている。一方で原核生物でも実はかと思われる。今回の成果も細かい分子メカニズムのDNAが小さく折り畳まれているが、その事実について解明に留まっており、研究目標である包括的な解明まはあまり知られていない。原核生物では、核様体タンでは長い道のりがある。しかし、個人的にはこのグロ

パク質 (NAPs) と呼ばれるタンパク質がヒストン様のーバルな転写制御機構は細菌集団内での一細胞の転写役割を果たしており、菌体内で各種のNAPsが絶妙なの「ゆらぎ」現象にも関わってくるのではないかと考バランスで数百もの遺伝子の転写を制御すると考えらえており、更なる解析が待たれる。

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れている。またNAPsは染色体だけでなく細菌間を水平伝播するプラスミドにもコードされており、宿主がプラスミドを獲得すると、プラスミド由来のNAPsが加わって新たな転写制御ネットワークが構築されると考えられる。

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私の研究目的はこの各種NAPsの協調的転写制御メカニズムの解明であり、研究対象としてカルバゾール

博士課程部門

イソプレノイド生合成系を改変した大腸菌におけ分解プラスミドpCAR1にコードされるNAPsの一種で!

あるH-NSファミリータンパク質Pmrと、モデル宿主

Pseudomonas putida KT2440株の染色体にコードさる鉄硫黄クラスター生合成系の解析田中れるTurA、TurBという3つのホモログ (アミノ酸配列尚志（埼玉大学理工学研究科・分子統御研究室
博士後期課程２年）

でそれぞれ50~60%の相同性) を用いている。H-NSファミリータンパク質はDNA結合ドメインと二量体／多!

量体化ドメインを有し、多量体がDNAを折り畳むこと

鉄硫黄（Fe-S）クラスターは非ヘム鉄と無機硫黄原-7-

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未だ保持していないFe-Sタンパク質）にクラスターを渡しているが、その具体的な機構については不明な点が多く残されている。解析が進まない要因のひとつ
は、Fe-Sクラスター生合成に関わるほとんどの因子が生物の生存に欠くことができない点である。私は、なぜFe-Sクラスター生合成系は生物の生存にとって必須なのか？という視点から、大腸菌のもつ124種類のFeSタンパク質の機能について見直してみた結果、イソ
プレノイド生合成に関わる2種類（MEP経路のIspHとIspG）のみが必須遺伝子であることに気付いた。一方、放線菌や真核生物のイソプレノイド生合成経路
鉄硫黄クラスターを全く作れない大腸菌変異株（メバロン酸経路）にはFe-S酵素が関与していない。

TCA回路や呼吸鎖、MEP経路では複数のFe-Sタンパク質が機能している。Fe-Sクラスター生合成系を破壊すると、これらのFe-Sタンパク質が機能できなくなり、イソプレノイドが合成できなくなるため致死になる。放線菌由来のメバ
ロン酸経路（Fe-Sタンパク質が関与していない）を導入することで、Fe-Sクラスター生合成系の必須性を回避できる
ことを見出した。この変異株に、改変したFe-Sクラスター
生合成遺伝子群を導入することにより、その影響を評価することが可能になった。

そこで、大腸菌のMEP経路をメバロン酸経路に改変す
ると、Fe-Sクラスターを持たなくても生育可能な大腸菌がつくれるのではないかと考えた。様々な条件検討の末、放線菌のメバロン酸経路に改変した上で、Fe-S
クラスター生合成系の完全欠損株を作り出すことに成功した（図を参考）。この変異株を用いることより、
Fe-Sクラスター生合成系のあらゆる遺伝子群を自在に改変・操作・解析することが可能になった。

子から構成されるコファクターであり、このFe-Sクラ実際にこの実験系を用いてISCとSUFについて解析

スターを持つタンパク質は総じてFe-Sタンパク質と呼したところ、これまで得られなかった多くの知見が得ばれている。Fe-Sタンパク質の構造と機能は多種多彩

られつつある。この in vivo 実験系から得られた知見であり、呼吸鎖電子伝達系などのエネルギー代謝からを足掛かりとし、さらに生化学的な解析を発展させ、遺伝子の発現制御に至るまで、生命活動の根幹を担っ最終的にはISCとSUFマシナリーの作動メカニズムのている。そして、これらのFe-Sタンパク質の機能を支

全容を明らかにしていきたいと考えている。

えているのがFe-Sクラスターの生合成系である。私達

一方、大腸菌以外の生物に目を向けてみると、Fe-Sの研究室では、世界に先駆けて2種類のFe-Sクラスタ

クラスターの生合成系には著しい多様性が見られる。

ー生合成系（大腸菌のiscオペロンにコードされるISC

今後は、クラスター生合成系の本質を理解するため

マシナリーと、sufオペロンにコードされるSUFマシナに、大腸菌変異株での相補実験を行なうことにより、リー）を同定した。現在、これらのFe-Sクラスター生

異種生物由来のクラスター合成系の解析も行っていき

合成系がどのようにしてクラスターを作っているのたいと考えている。各クラスター合成系の特性と共通

か、そのメカニズムの解明に向けて研究を行っていするメカニズムを明らかにできれば、クラスター合成

る。

系の多様化の生理学的／進化的意義を、バクテリアのFe-Sクラスター生合成系（ISC、SUFマシナリー）

生存戦略と関連付けて理解できるのではないかと期待

はいずれも少なくとも6種類の成分から構成されてい

している。

!

る。これらの成分が互いに協調してFe-Sクラスターを組み立て、最終的にアポ型タンパク質（クラスターを-8-!

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2014年5月30日

水平伝播による腸内細菌目

されており、少なくとも、16S-rRNA遺伝子は全く水

16S-rRNAの進化

平伝播しないという考えは正しくないと言える[1]。実際、実験的に大腸菌の16S-rRNAを異種由来のものと佐藤允治

置換する実験も行われており、綱を超えて異なる16S-（東京大学新領域創成科学研究科・
メディカルゲノム専攻 博士後期課程１年）

rRNAでも大腸菌の生育を相補しうることも示された!

[2]。このように、実験的に16S-rRNA遺伝子が水平伝播し得ることが示され、また、自然界においても水平16S-rRNAはリボソーム30Sサブユニットの中心骨伝播を示唆する事例が存在する。

格を成しており、翻訳に於いて極めて重要な役割を担

本研究の位置づけは、16S-rRNAの水平伝播についての、データベースを用いた網羅的解析である。水平伝播を網状構造で表現できる系統ネットワーク法を用
いて解析を行うことにより、水平伝播の有無のみならず、水平伝播が16S-rRNAの進化にどのように寄与してきたのかも明らかにする。本研究は、解析対象の分類群として、データベースが充実している腸内細菌目を選択し、共生細菌とCandidatusに分類される細菌を除くすべての細菌の16S-rRNAをゲノム配列から抽出して解析に用いた。

う大変重要な分子である。リボソームは巨大なタンパ
ク質-RNA複合体であり、rRNAは数十のリボソームタ
ンパク質と協調的に働くことにより機能する。その複雑さと重要な分子であることから、16S-rRNA遺伝子
は水平伝播しない種固有の遺伝子と考えられてきた。
そのため、16S-rRNA遺伝子は系統解析において幅広く用いられてきた。

解析の結果、多くの系統ネットワークにおいて水平伝播の存在を示唆する網状構造が見られた。水平伝播が少なくとも二回以上生じていることを示唆する系統
ネットワークも多数見られ、高頻度に16S-rRNA遺伝
子の水平伝播が腸内細菌目で生じていることがわかかった。これらの結果は、16S-rRNA遺伝子が全く水平伝播しない遺伝子だという伝統的な考え方が誤っていることを示している。面白いことに、系統ネットワー
ク解析に用いた16S-rRNAの多くが固有の塩基置換をあまり持たないことに対して、網状構造は巨大である
場合が多かったことで、これは、16S-rRNA遺伝子の多様性が点突然変異よりも水平伝播によって生じているということを示唆し、水平伝播が16S-rRNA遺伝子
にとって主たる進化の原動力である可能性を示す。こ図. Escherichia、Salmonella、Citrobacterの16S-の理由については、16S-rRNAが機能を果たす上でrRNAの系統ネットワーク。

は、配列そのものと言うよりは二次構造が重要である

Enterobacterが外群で、最も古くから存在する系統と考え
ると、CitorobacterはSalmonellaの594-1038領域がEscherichiaへと水平伝播することにより生じた配列と考えられる。

という過去の知見によって説明がつく[2]。二次構造を破壊する点突然変異よりは、二次構造を保ったまま変異を導入する水平伝播の方が進化の原動力となりやす*HLGT : Hypothetical Lateral Gene Transfer

いのであろう。
1.

この伝統的な仮説に対して、16S-rRNA遺伝子の水平伝播も報告されてきている。中には、rrn operonが2.

丸ごと異種のものと置き換わっているような例も報告-9-R. Lan and P. R. Reeves: Microbiology 144:1213–1221(1998) .
K. Kitahara, Y. Yasutake and K. Miyazaki : Proc. Natl.
Acad. Sci. Usa, 109, 19220 (2012) .

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2014年5月30日

もちろん、前述の問題を解決して商業的な藻類バイオ!
「博士研究員以上」部 門!

燃料を生産するためには、遺伝子工学や代謝工学を駆使した藻類の改良が不可欠である。ただ、高い油脂生産性を達成するために必要な藻類の炭素同化機構の解高油脂生産緑藻変異株における原因因子の探索!

明は、その”ネットワークの複雑さ”のために、いまだに十分に理解が進んでいない現状である。

早川 准平（中央大学 理工学部 生命科学科・専任研究員）

我々はこれらの問題の解決に取り組むにあたり、突!

然変異株を用いた遺伝学的なアプローチによる有用形

微細藻類は水と太陽光とCO 2 を利用して生育し、質の選抜とその解析を進め、それによって炭素代謝の我々の生活環境中に普遍的に存在する光合成微生物で理解を深めれば、実用化へ大きく前進できるのではなある。藻類は窒素飢餓に陥ると脂質を蓄積することか

かろうかと考えた。この目的のために、すでに得られ

ら、近年、バイオ燃料生産において食料と競合しないている「低クロロフィル含有突然変異株」を”親株”とバイオマスとして注目されている。その研究開発は国して、今回3株の「高油脂蓄積株」を独立に取得して内外で活発に行われており、海外では巨額の投資と広解析した。その結果、これらの変異株はすべてDYRK

大な土地を利用し、大量培養技術は実用化のレベルま(dual-speciﬁcity tyrosine phosphorylation-regulatedで進んでいると言われている。一方、国内においてはkinase) 遺伝子の変異に起因することがわかり、さら限られた国土のため大規模な培養には制約があり、遅に、これらの株の油脂生産性（油脂含有量 バイオマ

れを取っていることは否めない。そのため、実用化にス生産量）が最大で1.8倍も向上していることを確認

は「地域集約的かつ効率的」な培養から燃料化までのした（図1）。また、これらの株の変異はすべてリントータルプロセスの最適化を図ることが急務となって酸化触媒ドメインに集中していることがわかったのいる。

で、変異によってDYRKの機能が低下しているのでは

私の研究対象であるPseudococcomyxa ellipsoidea
は近年環境中から単離された油脂生産性の緑藻であり、低pHで培養可能なことから、混入するバクテリ
ア、原生生物、他種藻類などの増殖を抑えつつ、屋外
開放系においても長期間培養することが可能である。

ないかと推測した。次いでDYRK遺伝子の発現を解析すると、野生株では転写量が油脂蓄積条件である窒素
飢餓の進行とともに増加することが確認され、変異株
では野生株よりも10倍以上の転写量の増加が確認された。これは、DYRK活性によって制御されるフィード
バック機構が存在することを示唆するものであり、それが油脂の蓄積量の制御に関与しているものと考えられる。さらに、油脂の合成および代謝に関連するいく
つかの遺伝子について解析を行った結果から、変異に
よって油脂の分解が進まなくなり、その結果として油脂の蓄積量が増加したものであると考えられる結果を得た。酵母におけるDYRKの相同遺伝子は、転写因子
をリン酸化することで機能調節を行っていることが知られているので、これらの知見も踏まえて、今後は
DYRKと油脂代謝関連の遺伝子とをつなぐ要素の探索を行い、未だ不明な点の多い藻類の炭素同化経路につ

図1：高油脂蓄積変異株の油脂生産性評価

いて理解を深めていきたいと考えている。

A-C：Nile redによる油脂の染色（Bar = 5μm）D：油脂
含有量および油脂生産性の比較（2週間、連続光培養）
WT=野生株、5P=低クロロフィル含有変異株、JH1011JH1013=5P由来高油脂蓄積変異株。変異株においては油滴の大きさ、数が増加している。

【本研究は農林水産省ならびにNEDOの支援を受けて行われたものである。】- 10 -

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バイオ産業支援企業から見たを参考に、誰もが失敗なく鋳型の調製をできる方法と高速シーケンサー時代のゲノム微生物学

して普及させることに苦心しつつ、いかにして効率的

北川に（つまり「楽をして」）塩基配列決定を行うかを追正成

求していました。当社の製品開発の基本はだいたいそ（タカラバイオ株式会社）

ういうもので、いかに「楽をして」研究を進めるか、!

というコンセプトが原点にあると思います。DNA
sequencing kitしかり、DNA ligation kitしかり、最タカラバイオ株式会社は、2002年4月に前身である

近ではIn fusion cloning kit（これはClontech社のブ

宝 酒 造 株 式 会 社 （ 現 ・ 宝 ホ ール ディ ング ス 株 式 会

ランドですが）しかり。大腸菌コンピテントセルを製

社）・バイオ事業部門から分社独立して発足しまし

品として販売したのも当社が最初ではなかったかと思た。当社は、バイオ事業の開始以来、一貫して遺伝います。

子・DNAに係る事業を発展させてきました。1979年に国産初の制限酵素を発売してバイオ産業支援事業

そういう中で、なんといってもPCR技術の登場（旧：遺伝子工学研究事業）がスタートし（http://

は、当社にとっての社運の転換点であったと思われま

www.takara-bio.co.jp/kaisha/research.htm）、現在

す。1988年にPCR法による遺伝子増幅システムの国内

では、バイオテクノロジー研究に必須な研究用試薬や独占的販売権を獲得して始めた事業でしたが、その理化学機器・研究受託サービスを欧米やアジアを含む

後、1993年にPCR技術の非独占的な開発・製造・販

世界中の研究者に提供しています。私自身は、当社が売権を獲得して、自社製PCR製品の販売が始まりまし制限酵素を研究用試薬として発売した当時のことを知た。開発された「PCR製品」の中には、現在も広くごりませんが、大学の卒業研究で所属した研究室で初め愛用いただいているTaq DNA polymeraseを様々な形て制限酵素を用いた遺伝子工学実験を行った時に、とに発展させた製品群があり、LAテクノロジーを生かしても高価な試薬なので慎重に取り扱うように注意された「長くかつ正確に」増幅するEx-TaqやLA-Taqといたことを記憶しています。

ったPCR酵素もあります。また、様々な高熱性の菌株
コレクションからスクリーニングして得られたDNA

ご存知の通り、ゲノムの塩基配列決定技術はこの10年間余りで革新的な進歩を遂げました。その結果ゲノム解析のコストは格段に下がり、その利用はコモデ

polymerase遺伝子をクローン化し、さらにその変異体を構築し、あるいはDNA複製装置のパーツ酵素を取得し、PCR反応のブラッシュアップを繰り返して、

ィティ化し、だれもがゲノムデータを研究に利用でき

現在のPrimeSTARシリーズやMightyAmp、Tks Gﬂex

るようになりました。

DNA polymeraseといった製品ラインアップが生み出

当社は、このようなゲノム解析のコモディティ化をされてきました。PCR技術はその後、定量PCR法へ発積極的に推し進めてきた立場にあったと思います。今展し、単にDNAを増幅する技術から、検出測定技術になって思えば、その始まりは、制限酵素の製品化をとしてのアプリケーションの開発に進み、たとえば環行なったころにすでにあったものと思います。現在も境病原微生物等の検出と定量などの当社製品へと発展「先端技術をすべての研究者へ届ける」ということがしています。特に、PCRの弱点である「死菌」のDNA

根本的な企業理念のひとつです。私自身がこの企業活でも増幅が起きるという問題点を解決するために開発動の中で最初に行ったのも、DNA塩基配列決定技術

されたEMA-PCRを利用した「生菌」検出キットは、のキット化というものでしたから、現在の私自身も相

今後の活用分野の広がりを期待している製品です（図変わらずということかもしれません。例として最適か

１：EMA-PCRの原理を参照）。

どうかわかりませんが、当時はM13ファージのIG領域
を大腸菌プラスミドに組み込んで、シーケンスの鋳型

ところで、DNAの塩基配列の決定方法は、1990年となる一本鎖DNAを調製する技術が出回り始めたこ

ごろはラジオアイソトープ（P32）ラベルのdCTPなろでした。この技術のもとであるMessing博士の論文

どを使用した方法が一般的で、自動蛍光DNAシーケ- 11 -

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ンサーは一応存在したものの、まだ実用レベルには達ス株式会社を設立し、45台のキャピラリー型の自動シしていませんでした。タカラバイオがゲノム解析といーケンサーとサンプル自動調製ロボットおよび大型計う事業に踏み出そうとしていたのは、そういう状況の算機サーバーを装備して、日本では最初のゲノム解析

中で大腸菌ゲノムプロジェクトが立ち上がるというこ

サービスを開始しました。その当時のゲノム解析でとで、京都大学ウイルス研究所の由良先生の研究室には、ショットガン法で大量高速に大腸菌クローンライ

相談に行ったり、当時は日本に数台しか入っていなか

ブラリの鋳型プラスミドをシーケンシングしたデータ

ったABI社の自動蛍光DNAシーケンサーを京都大学生をベースコーラーソフトやアセンブルソフト等で処理

物物理学教室（小関研）の井口先生に試用していただ

してドラフトゲノムシーケンスを作成し、空いたギャ

いたり、神戸大学の磯野先生にデュポン社製のシーケ

ップ部分のDNA断片をPCRで取得して、それらをまたンサーを試していただきながら、日立製作所製のシーショットガン法でシーケンシングするということで完

ケンサーのための解析試薬キットの検討を試行錯誤し成させていました。ドラフトゲノム解析にはゲノムサていました。それぞれの装置は原理的にも、その試薬

イズの5倍から10倍程度の冗長度のデータが必要でしの面でも一長一短でしたが、最終的にはABI社のシーたので、比較的ゲノムサイズの小さな細菌のゲノムでケンサーが、蛍光ジデオキシターミネーター法やサイも、そのコストは数千万円にも達していました。した

クルシーケンシング法、あるいは装置のキャピラリー

がって、ゲノムデータを使うことが研究の進展にとっ化などの様々な改良を加えて勝ち残ったところで、日て極めて有用であることはわかっていても、実際にシ本の試薬企業として取り残されてしまったのは少々残ーケンシングする予算を持っている研究者はそう多く念なところです。

なく、年に数株の細菌ゲノムを決定するという需要にとどまっていました。また、当社が企業としての受託

そんな中、当社は2000年にドラゴン・ジェノミク

図１：EMA-PCRの原理
EMAは可視光に暴露すると、核酸に共有結合する色素である。生菌を含む検体にEMAを含む試薬を添加して光を照射しても生菌では薬剤が内部に浸透せずDNAへの化学修飾は起こらない。一方、死菌由来DNAやその他、検体に含まれるDNAはEMAによって化学修飾される。EMAにより修飾されたDNAは、PCR反応の鋳型とならず遺伝子増幅できないため、EMA処理後のPCR法による検出では生菌由来DNAのみが検出される。【※ EMA (Ethidium
monoazide)：可視光の光照射によりDNAに共有結合するインターカレート色素】- 12 -

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解析サービスを提供する一方で、官製の施設や大学なた。残念ながら、次世代シーケンサーはすべて海外製

どのアカデミア施設が共同研究などの形で「実費」でのため、日本国内での事業展開には様々な不利益を被の解析サービスを提供されてきたこともあり、商売とる点もありますが、バイオインフォマティクスを含めしてはかなり苦戦していました。

たサービスの品質向上という点では、このゲノム微生物学会の研究者の方々からのニーズに多くのヒントをそこでそれに対抗する手段として、ゲノムデータがいただいてきたと思います。

専門でない研究者への啓蒙を行いながら、顧客に使いやすいデータの提供やデータの閲覧手法の開発にも力

また、試薬の開発面でも、次世代シーケンサー時を注ぎ、さらに、ゲノムデータの活用の出口としての代に求められる試薬酵素の性能と品質を追求し、たとDNAマイクロアレイの設計作製サービスとそれを使っ

えば、PCR系全体に混入するDNAレベルを下げ、そのた遺伝子発現解析も受託し、研究手法として普及させうえで真のPCR感度を保持した試薬の開発などに成功てきたことが、海外からのサービスに対抗する能力をしています（図２：TaKaRa Taq™ HS Low DNA

鍛えてくれたのかもしれません。また、このように日の性能を参照）。

本の研究社会の中にゲノム解析の文化を広めながら企以上、ゲノム微生物学との関わりのある試薬製品と受託解析サービスを主として書かせていただきました。現在のこれらの当社製品やサービスの需要の中心はアカデミアの研究者ですが、今後、ゲノムデータの活用が社会の発展にます
ます寄与していくことを証明し、ゲノム解析の利用がより広く実用分野へ展開していくように、ゲノム微生物学会が他の微生物関連学会などと連携してアピールするような活動を推し進めていただくことを期待しています。

業活動を推し進めてきた姿勢は、やはり制限酵素開発以来の当社の伝統ではないかと思います。
この受託解析サービスにおいては、その後の次世代シーケンサーの登場にもいち早く対応し、「先端技術をすべての研究者へ届ける」ことに努力してきまし

図２：TaKaRa Taq™ HS Low DNA の性能
大腸菌16S rDNA348 bpをターゲットに、各社推奨条件で35サイクルのPCR増幅を行った。TaKaRa Taq™ HS Low
DNAは、鋳型なしの反応におけるバックグラウンドはしっかり抑えつつ、微量のターゲットを他社製品よりも短時間で高感度に検出可能であった。

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SOCIETY OF GENOME MICROBIOLOGY, JAPAN (NO.	 9)#!
!

大学院生として学会に参加して研究室の外に出ることについて丸山!

2014年5月30日

学会発表でしたが、私はそこでも同じような感想を持ちました。年令の近い年代の修士・博士課程の学生が発表する研究成果を目の当たりにしたとき、自分の至っていない点にもどかしさを感じましたが、それ以上に自分の研究をもっと高めていきたいという意欲を得ることが出来ました。また、懇親会で他機関の研究者の方々から聞いた、研究者としての生き方やこれまでの経験談など、普段仲間の学生に囲まれた環境にいては聞くことが出来ないお話は、今後の自分自身のあり方に大きな影響を与えるだろうと感じています。

徹(早稲田大学大学院・先進理工学研究科・生命医科学専攻・修士課程２年)

私は昨年の夏にカリフォルニア大学ロサンゼルス校（UCLA）の短期留学プログラムを利用して、ヒト初期胚の単一細胞トランスクリプトーム解析などで有名
な Prof. Guoping Fan※の研究室に留学しました。10週間という短い期間でしたが、それまで海外旅行も体験した事の無かった私にとって、非常に刺激的な経験となりました。

留学や今回の学会参加を通して、自らの研究のモチベーションを得るためにも、凝り固まった考え方をほぐすためにも、慣れ親しんだ環境の外へ出て、普段顔を合わせることの無い人たちと交流することは本当に重要だと感じました。是非、来年の第9回日本ゲノム
微生物学会にも参加させて頂きたいと思います。そして、そこではより面白い研究成果を披露できるよう、
日々研究に精進したいと思います。

留学する前、私は日本で留学生と英語でコミュニケーションを取ることが比較的出来ていたので、アメリカでの生活もどうにかやっていけると甘く考えていました。そのため、現地に到着してからネイティブの会
話が私の想像よりもはるかに速いことを知り、自らの英語力不足に気付かされたときには愕然としてしまいました。特に、留学先で出会った中国人留学生と交流する中で、彼らが私よりもはるかに語学に堪能であり、国内の凄まじい競争を勝ち抜いてきていた事を知った時には、自分の矮小さに大きなショックを受けました。

※ Xue et al., Genetic programs in human and mouseearly embryos revealed by single-cell RNA
sequencing. Nature, 500: 593-597 2013.

このように、アメリカに到着してあっという間にダメージを負ってしまった私も、留学先の研究室で出会った人たちに親身に接して頂いたおかげで、非常に良い時間を過ごすことができました。彼らとは今でも連絡を取っていて、現地で始めた研究は引き続きアドバ
イスを貰いながら進めることが出来ています。
今になって振り返ると、ショックを受けるような経験も含め、留学先で出会った人や物事が自分の考え方を変えるきっかけになっていることが分かります。それは、例えば「日本で通用するレベルの英語」から「海外で生きていけるレベルの英語」へと意識する基準が変わったように、また、海外での研究が少しだけ身近な物になったように、日頃から私が抱いている評
価の物差しを変えるような出来事であったからだと思います。
第8回日本ゲノム微生物学会は私にとって初めてのコールドスプリングハーバー研究所にて学会に参加しました。レベルの高さに衝撃を受けました。

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SOCIETY OF GENOME MICROBIOLOGY, JAPAN (NO.	 9)#2014年5月30日に関連しているのか？）を明らかにすることが、重要な課題として残されています。

微生物のゲノムにみられる鉄硫黄
クラスター生合成系の多様性

Fe-Sクラスターの生合成系の解析が進まない大きな要因として、関与する遺伝子群が生育に必須なため遺伝学的なアプローチに限界のあることが挙げられます。当研究室では最近、大腸菌のイソプレノイド合成
経路を改変することで、Fe-Sクラスターを作れなくても生存できる大腸菌変異株（iscとsufオペロンの二重横山 奈央(埼玉大学大学院理工学研究科
分子統御研究室 博士前期課程2年)
2014年3月、修士1年生のときに、東京農業大学で行われた第8回日本ゲノム微生物学会年会に参加し、ショートトークとポスター発表をさせていただきました。この学会では、普段触れることのない分野の方々
とも討論させていただくことができ、自分の研究を客観的に見つめなおす大変良い機会となりました。

欠損株）が構築され、この問題に対する突破口が見出されています（田中ら、2014, 第8回日本ゲノム微生物学会ポスターなど）。

鉄硫黄（Fe-S）クラスターをコファクターとして持つFe-Sタンパク質群の構造と機能は多種多様で、生命活動の根幹を担っています。このFe-Sタンパク質の機能を支えているのが、「Fe-Sクラスターの生合成系」
です。これまでに4種類の生合成系が同定されており、そのうち、NIFマシナリーは、窒素固定細菌や一部の微好気・嫌気細菌に分布しています。SUFマシナ
リーは原核生物全般から植物の葉緑体に、ISCマシナ
リーはプロテオバクテリアから真核生物のミトコンド
リアに分布しています。CIAマシナリーは真核生物の細胞質に局在する生合成系です。

!
一方、グラム陽性細菌である枯草菌のゲノムにはsuf様（sufCDS-iscU-sufB）オペロンがコードされており、これらの産物がFe-Sクラスターの合成を担うと予想されています。興味深いことに、この生合成系は、大腸菌のISC／SUFマシナリーの成分が入り交じったハイ
ブリット型です。私は、このユニークなSUF様マシナ
リーの特性を明らかにすることを計画し、研究を進めています。これまでに、枯草菌のイソプレノイド合成
経路を改変することによって、必須であるsuf様オペロ

これらの生合成系の作動機構（複数のタンパク質がどのように協調してFe-Sクラスターを組み立てているのか？）、さらに、タイプの異なるマシナリーのそれぞれの特性（生合成系の多様性は生存戦略とどのようンを欠失させることに成功し、Fe-Sクラスター生合成系の遺伝子群を操作できる実験系を構築することができました。第8回日本ゲノム微生物学会では、この系を用いて、異種生物由来のタイプの異なる生合成マシ
ナリーを導入し、機能的な互換性を見出したことについて発表させていただきました。
「Fe-Sクラスターの生合成」という研究テーマも、微生物の多様性に着目することで、より理解が深まるはずです。今後、さらに面白く展開するにはどうすればよいか？ 現在の研究テーマを様々な視点から見つめるとともに、新たな知識を求めて常にアンテナを張っていきたいと思っています。

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第8回日本ゲノム微生物学会年会を終えて日本ゲノム微生物学会第８回年会を、2014年3月7日（金）〜9日（日）の3日間、東京農業大学（東京都世田谷区）にて開催致しました。事前登録者262名、当日参加者182名、合わせて444名という多数の参加者を得て、盛況のうちに終えることが出来ました。組織委員として本学及び関東近辺の大学から10名の会員にお願いしましたが、組織委員の方々のご尽力のおかげで大変効率よく企画、運営を行うことが出来ました。いくつかの新しい試みと反省材料も含め、東京大会の報告を致します。
プログラム編成は、通常大変に労力のいる作業ですが、カテゴリーを比較的細かく分けて演題登録を依頼した
ため、演題数を集計して組み合わせるだけでスムーズに運ぶことが出来ました。また、ポスターを3日間貼りっぱなしとし、恒例になったショートトークをポスター発表より先に行うよう調整しました。ポスター賞の選考に当たっては、多くの若手、中堅の先生方に多大なご尽力をお願いしてしまいましたが、期間中貼りっぱなしだったことが結果的に見る時間の確保に繋がり、公平性の確保のために役立ったと思います。
講演に関する特徴としては、2つのシンポジウムを2日間に分けて組み込み、口頭発表にインパクトを与えました。2つのうち1つは、前々回から引継ぎ、海外から招待した若手研究者を中心に最新のトピックスを語っていただ
き、異分野の融合につなげました。もう1つは、比較的参加者が少ない応用微生物の分野に焦点を当て、ゲノムから醗酵・醸造へのアプローチを紹介していただきました。こうした取組が、新規会員の獲得と学会の発展に寄与できれば幸いです。
一般講演は各研究室から1人という従来の方針を踏襲し、すべて採択しました。講演時間を若干削ったためスケジュールがタイトになってしまった点は反省材料です。学会の拡大と発展を目指しつつ、限られた時間内で有意義な討論を行うためにどうバランスを取っていくかは、引き続き考えていく必要があります。学部学生の参加費無料
措置は、多くの賛同の声をいただきました。これを機にゲノム微生物学に興味を持つ若い力が育ち、学会を牽引す
る新しい時代の息吹に発展することを願いつつ、次回にバトンを渡したいと思います。
年会長：吉川 博文（東京農業大学・応用生物科学部）

年会会場入り口（左）と会場内の様子（上）：会場は広すぎる位でゆったりとしており、音響効果もよく、時折パソコンの切り替えに伴う軽度のト
ラブルがあった他はすべて順調に進みました。すべて吉川年会長を始めとする関係者のご努力の賜物です。ご苦労様でした。

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ゲノム微生物学会「若手賞」授賞式
今年から新しく設けられた本学会の「若手賞」は、東京大学新学領域創成科学研究科の矢原耕史（やはらこうじ）氏に授与されることが決まり、年会で表彰式と受賞講演が行なわれた。

ショートトーク
本学会の年会では恒例となった、主として大学院生のポスター発表者を対象としたショートトークで順番を待つ発表者。
それぞれ２分の持ち時間内に、自分のポスター発表の概要とそのアッピールする
点を聴衆にうまく伝えることが求められる。ショートトークは、こじんまりした
年会だからできる発表形式として概ねポジティブに評価されている。

ポスター会場風景
ポスター会場はどの年会においても常に多勢の参加者で混雑し、発表者と参加者の熱意が伝わってくる。しかし、このように背中合わせになるとゆっくり議論するのは難しいのではないか。

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第９回日本ゲノム微生物学会年会
第９回日本ゲノム微生物学会年会は、平成27年3月6〜8日の日程で神戸大学にて開催されます。
第９回年会のお世話をさせて頂きます神戸大学農学研究科の吉田です。会場は本学六甲台第2キャンパスの百年記念館（神大会館）です。会場のあるキャンパスは六甲への登山口となる丘陵地に位置しており、眼下には大阪湾を望むパノラマビューが広がります。天候が良ければ対岸に関西国際空港、そこから発着する飛行機までもが見える眺望は申し分ありません。ただ、この高さまで登ってきて頂く必要があるのが玉に傷。お越しの際は最寄りの阪急六甲から通称「定年坂」（休みのない急坂。上がれなくなったら引退の潮時？）を
10〜15分ほど徒歩で登って頂く必要があります・・・と言うのは冗談で、バスやタクシーを利用することもできますのでご安心ください。阪急六甲から神戸三宮へは僅か10分弱ですので、交通やご宿泊にご不便をおかけすることはないと思います。唯一の心配は、会場ホールが300人で一杯と手狭なことです。おそらく年会
として初めての試みとなりますが、ホール外にスライドを映写して音声を流すなど、収容不足を補う工夫を計画しております。何れにしましても、皆様のご協力を得て、実りあるディスカッションと活発な交流を促
すお手伝いができれば世話人一同この上ない喜びです。皆様のお越しを心より歓迎申し上げます。
第９回日本ゲノム微生物学会・年会長

吉田 健一（神戸大学）!
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会場外観（上）会場からの市街地の眺望（左）学会の現況
学会役員（敬称略）
会長： 小笠原直毅
庶務・会計幹事：吉田健一、大西康夫
集会幹事：久原哲、有田正規
広報幹事：中村保一、佐々木裕子、磯野克己 男女共同参画：有田正規、佐々木裕子
評議員（会長推薦を含む）：朝井計、跡見晴幸、石川淳、板谷光泰、漆原秀子、大島拓、河村富士夫、黒川顕、菅井基行、高見英人、田中寛、田畑哲之、戸邊亨、内藤真理子、永田裕二、仁木宏典、野尻秀昭、林哲也、吉川博文、北川正成
会計監査：藤田信之、和地正明

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会員の動向
全個人会員数 444名（平成26年5月19日現在）
正会員 334名；学生会員 110名賛助会員 19 団体； 機関会員 2 団体

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