2022（令和 4）年度
総合研究大学院大学
統合進化科学研究センター年報目次センター長挨拶········································································· 1
統合進化科学研究センター教員と専門分野················································· 2
プレリサーチ報告······································································· 3
学生
2022 年度在籍者 ····································································· 22
博士研究············································································ 25
海外における活動···································································· 26
教員
外国人招聘研究者···································································· 27
アウトリーチ活動···································································· 28
各教員の研究教育業績································································ 31
参考資料2022 年度 センター主催 葉山セミナー ··············································· 992022 年度 年間授業計画・時間割 ···················································· 104
2022 年度 シラバス ································································ 109

統合進化科学研究センター発足

2022 年度より統合進化科学研究センターが発足した。本報告は、その初年度のものとなる。全教員がセンターの所属となり、研究に専念できる環境が整った。
「統合進化科学」とは、前身の先導科学研究
科生命共生体進化学専攻で行ってきた生命の進化の枠を超え、それを取り巻く社会など全てのものの進化を統合的に理解しようという野心的なものである。その体制を整えるべく、新規に３教員採用の人事を行った。来年度からの大幅な戦力アップは確実であり、良いスタートが切れたと思う。一方で、我々の定義する統合進化科学は、センターの教員１０数人だけで成立するものではない。センター内部の充
実だけでなく、外部との連携等も含め、今後さらなる発展を模索している。日本唯一の「進化学」を掲
げる研究機関として、我々も進化しなければ。

統合進化科学研究センター長
印南 秀樹

1

2022 年度統合進化科学研究センター教員（五十音順）

氏名

職名等

専門分野

飯田 香穂里

准教授

科学技術史

印南 秀樹

教授・センター長

集団遺伝学・ゲノム進化学

大田 竜也

准教授・多様性進化学研究部門長

分子進化学

大槻 久

准教授・統合人間科学研究部門長

数理生物学・進化ゲーム理論

大西 勇喜謙

講師

科学哲学

木下 充代

准教授

神経行動学・生理行動学

沓掛 展之

教授・コース長進化行動生態学・動物行動学

五條堀 淳

講師

自然人類学・分子進化学・集団遺伝学

佐々木 顕

教授・副コース長

数理生物学・理論進化学

颯田 葉子

教授・副センター長

ゲノム集団遺伝学・生理進化学

田辺 秀之

准教授

分子細胞遺伝学・染色体ゲノム進化学

蔦谷 匠

助教

自然人類学・霊長類学・生物考古学

寺井 洋平

助教

適応と種分化の機構・分子進化生態学

本郷 一美

准教授

環境考古学・先史人類学

渡邊 崇之

助教

神経進化発生学

松下 敦子

講師・共同利用機器支援事業担当

神経解剖学・微細形態学2

2022 年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」
プレリサーチ 報告書3

複雑適応系進化学研究部門プレリサーチ
本事業の趣旨・目的
人の経済・社会活動が地球規模の変容をもたらす現代、その複雑な課題の解決に向けた基盤研究が切に求められている。このような課題を考察するうえで、非生物・生物のあらゆる階層・環境・人間社会が一つの集合体を成していると捉える包括的な視点が必要である。生態系はもちろんのこと、人間活動の多大な影響力の背後にある科学技
術そのものの発展も、生物・非生物（人工物）を含む、様々な要素間の相互作用にもとづいている。本プロジェクトでは、複雑適応系（complex adaptive system; CAS）の概念にならい、各要素単体ではなく、多様な要素・階層間の相互関係・非線形のダイナミクスに着目し、共生・共働を促す新しい知識基盤の提供を目指す。

（単位：円)
代表者氏名
飯田 香穂里印南 秀樹

採 択 課 題三浦半島におけるナチュラル・ヒストリー研究の歴史と現在（予備的調査）
研究者コミュニティにおけるブロックチェーン技術導入の可能性考察大西 勇喜謙 分野横断的モデル流用に関する予備調査

木下 充代

木下 充代

佐々木 顕

田辺 秀之

蔦⾕ 匠

三浦半島の多様な生態系におけるチョウ類の花利用と光
環境適応
三浦半島に生息する多様な訪花行動を示すチョウ類における視覚と嗅覚の適合的進化
ネットワーク上の意見更新過程とフィルターバブル効果
キャベツウニを巡る養殖技術の開発の歴史と社会経済循
環のしくみ
ボルネオ島の熱帯⾬林における⼈獣共通感染症の包括的モニタリング

募集課題番号＊1

合 計

3, 4

180,000

3

700,000

3

80,0004

400,000

4

500,000

2

400,000

1

160,000

1

300,000

寺井 洋平

三浦半島の環境との相互作用を介した水性生物の進化

4400,000

本郷 一美

三浦半島における先史時代人類の生業活動と古環境

1, 4

480,0002

900,000

社会行動の性差はどのように生み出されるのか？〜分子渡邊 崇之

メカニズム・神経機構・脳発達の包括的理解に向けたプ
レリサーチ

4

＊1 募集課題番号は以下のとおり
1.人の経済・社会活動と生物相との相互作用（環境利用・変容を含む）やその歴史性に関する研究
2.人の社会現象や社会的課題に関する進化学的視点からの分析
3.科学知識の生成・伝播、社会的影響に関する歴史的・概念的・社会学的考察
4.三浦半島におけるCAS の視点を包含した研究
5.その他の（部門の趣旨を踏まえた）CAS 研究52022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 三浦半島におけるナチュラル・ヒストリー研究の歴史と現在（予備的調査）研究代表者： 飯田 香穂里
共同研究者： なし
研究内容・研究成果・今後の展望等
本年度は、三浦半島をケースとした科学と社会研究のプレリサーチとして、先行研究を収集し、学術的な題材を抽出することを目的とした。三浦半島における科学研究拠点、軍（日米両方）、各種産業、開発・観光と保全活動など様々な観点から広く情報収集を行った。
三浦半島における一次資料の調査に関しては、赤星直忠博士文化財資料館を訪問する機会があり、赤星氏の収集した貴重な一次資料が多数保管されているのを確認した。また、半島の鉄道や観光などに関係す
る一次資料は神奈川県立歴史博物館や金沢文庫でも見ることができる。公的な通史資料としては、逗子市
史と横須賀市史がある。
ナチュラル・ヒストリー関連の資料の探査が難航したため、今回は特に半島の化学産業の戦時動員について先行研究から整理した。葉山と逗子におけるカジメ（海藻）を利用したヨード、塩化カリウム（硝石の原料）等の生産、また、長井での官民の試験所における海水利用工業などである。前者の需要は日清戦争から拡大するが、後者は第二次世界大戦開戦前後から始まり、輸入が途絶える中、豊富にある海水から必要資源を抽出すべく官民共同で研究をしていたことがうかがえる。専売局の巨大な遺構が現在でも長井の海岸に残っている。日本の戦時中の海水利用工業についてはほとんど研究されていないため、長井をケースにした化学史研究は今後の課題としたい。
上記に加え、来年度は三浦半島と原子力の関係について、情報収集する予定である。

発表論文
なし。

6

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 研究者コミュニティにおけるブロックチェーン技術導入の可能性考察
研究代表者： 印南 秀樹
研究内容・研究成果・今後の展望等
インターネットを介した技術革新は、複雑を極める人の経済・社会において最も進化速度の速いもののひとつである。その中でも、今後迎えるであろう WEB3.0 の世界において、ブロックチェーン技術が中心的役割を担うことは間違いない。本プロジェクトは、ブロックチェーン技術を日本の研究者コミュニティー
に導入することの可能性を考えるものである。
本プロジェクトでは、スマートコントラクトの機能を持つイーサリアムというブロックチェーンに特に注目することにした。１年をかけて、書籍、インターネット、SNS、オンライン／オフラインの勉強会、講習会を通して情報収集をおこなった。そして、イーサリアムブロックチェーンを用いてコミュニティを管理する利点、問題点を洗い出した。この結果は、当統合進化科学研究センターが運営する情報統合サイト「進化学のひろば」の構築に反映されている。センターでは、このサイトを介して進化学の研究者コミュニティの構築を考えている。
まず最大の利点は、情報管理の透明性、非改竄性である。
「進化学のひろば」は、限定公開のリソー
スを持つため、会員制にしなくてはならない。しかし、会員の個人情報を厳格に管理するかたちでのサイト構
築には数千万の費用が必要になる。一方、ブロックチェーンを使えば、会員をウォレットアドレスという暗号で紐付けし、その情報をブロックチェーン上で管理すれば、個人情報を独自で保管、管理することなく会員制のサイトを構築できる。実際に、今年度のセンター広報の予算を用いて、想定より遥かに安価に「進化学のひろば」のシステムを構築することができた。
一方、ブロックチェーンを使用するには「ガス代」と呼ばれる使用量が発生する。このガス代は、一般的に仮想通貨で支払わなければならない。現状、ガス代は無視できるほど安いとは言い難い。しかし、これは業界全体の問題点となっており、数々の新技術が開発され、近い将来には解決できるであろう。
もう一つは、
国立大学法人が仮想通貨を扱うことに対するハードルである。しかしながら、本国もデジタル日本円の推進に本気になり出したように、今後迎えるであろう WEB3.0 の世界において避けてならないものとして、法的にも整備されるに違いない。今後とも、急速に進化するこの技術についていくための情報収集を継続しつつ、「進
化学のひろば」のシステム開発に還元する。
発表論文

なし

7

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 分野横断的モデル移転に関する予備調査
研究代表者： 大西 勇喜謙
共同研究者： なし
研究内容・研究成果・今後の展望等
1） 研究内容：科学では、ある分野の現象を記述するために構築されたモデルが別の分野の現象にも適用される、ということがよく見られる。こうした研究実践は「モデル転用（model transfer）」とよばれ、近年科学哲学でも注目を集め始めている。本プレリサーチでは、研究課題の探索と今後の実行可能性の検討を目的として、モデル転用に関する近年の主要な議論の予備調査を行った。
2） 研究成果：今回の予備調査によって把握できた、
現在の主な研究動向は以下の通りである。
科学哲学では、1960 年代からモデルの利用に関する分析が盛んになり、そのひとつとして、Mary Hesse（1966）によるアナロジカルな推論の分析など、分野を超えた理論的枠組の利用についても古典的な分析が行われていた。
ただ、モデル転用に関する近年の研究の直接の起源は Paul Humphreys（2004）による「計算テンプレート（computational template）」の重要性の指摘にあり、より直接的には、
Knuuttila and Loettgers（2016）
による、Humphpreys の議論に依拠したモデル転用の分析にあると思われる。Knuutila と Loettgers（2016）は、モデル転用における概念的な要素の重要性を指摘している。より最近では、こうした議論にさらなる洗練が加えられ、モデル転用が生じる際の、「着地域（landing zone）」と呼ばれる中間モデルの重要性の指摘（Price 2019）や、着地域の形成で生じうる問題とその解決策（Houkes 2023）、モデルの評価方法に着目した分析（Tielman 2022）などが行われている。
3） 今後の展望：以上の調査から、大まかな研究動向はつかめたものの、いまだ具体的な研究計画の着想には至っていないが、技術の移転は科学技術社会論でも以前から研究が行われているトピックであり、そうした分析とのつながりはさらなる検討に値すると思われる。
発表論文
なし

8

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 三浦半島の多様な生態系におけるチョウの花利用と光環境適応研究代表者： 木下 充代
共同研究者： 南木 悠，寺井 洋平，丑丸 敦史
研究内容・研究成果・今後の展望等

本課題では、多様な訪花性昆虫と植物と生息地の物理的環境が作り出す生態系を複雑適応系のいちモ
デルと位置づけ、送粉者としての知見が未だ不足している鱗翅目昆虫の訪花行動と植物・環境との関係を明らかにすることを最終目標に研究を進めている。
2022 年度は、果樹園と野菜耕作地を中心とした里山（横須賀市須軽谷）をフィールドとし、そこに生息するアゲハチョウ類の訪花性と、環境との関わりを明らかにする研究基盤の構築を試みた。特に今年度は、６月下旬から１０月までに採集したナミアゲハ５２個体とその他のアゲハチョウ（ジャコウアゲ
ハ・モンキアゲハ・キアゲハ・ナガサキアゲハ・クロアゲハ）68 個体から体表花粉を集め、主にナミア
ゲハの各個体の体表花粉を形態と種識別マーカーによる遺伝子解析を行った。
ナミアゲハでは、全ての個体に花粉の付着を確認した。形態分析では、７・８月に採集したほぼ全ての個体にカラスザンショウ・ヤブカラシの花粉を同定した。また、８月よりクサギやアメリカフロウの花粉が付着していた個体が増え、９月になるとほぼ全ての個体でクサギとヤブカラシの花粉が見つかった。また、ヤマユリ・ランタナなどいわゆるチョウ媒花の花粉も一定数の個体で同定したが、一般に言われているアゲハチョウが好む赤い花を持つ植物種は意外と少ない印象である。他のアゲハ類では、春から夏にかけ採集したジャコウアゲハは、ナミアゲハと異なり春から樹木の花利用が多いこと、キアゲハではよりオープンスペースに咲く草本の花粉の同定が多い傾向にあった。ただし、アゲハチョウの移動範囲が広く、植生との照合が難しいことから、形態分析による花種の同定は難しい傾向にあった。一方、遺伝子解析では、得られたサンプルより花粉 DNA を抽出、ITS１・2 領域を増幅したのち次世代シーケンサーで配列を決定した上で、データーベースを用いて花種の同定を終えた。これから詳細な解析を行う予定であるが、形態分析より多くの花種が同定できている。今後は得られた結果を昨年度の結果とあわせ、2023 年度中にアゲハチョウ類の通年での花利用について一定の見解を発表したいと考えている。
発表論文
該当なし

9

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 三浦半島に生息する多様な訪花行動を示すチョウ類における視覚と嗅覚の複合的適応研究代表者： 木下 充代
共同研究者： 大田 竜也，渡邊 崇之
研究内容・研究成果・今後の展望等
我々は、三浦半島の多様な生態系に生息するチョウ類と環境及び植物層の多様性との関係を複雑適応系のモデルとして位置付けている。訪花性の鱗翅目昆虫の訪花・食草選択において、彼らの感覚系特に視覚と嗅覚系の多様性が、他の昆虫と競合する複雑な生息環境において、より高い効率かつ効果的な植物の利用を実現させていると考えている。本課題では、その訪花行動・食草選択における視覚と嗅覚の関与が最も理解されているナミアゲハとその近縁種を対象に、視覚系に比べまだ知見が限られている嗅覚中枢の糸球体構成と嗅覚受
容体の多様性を明らかにした。
ナミアゲハの嗅覚中枢は、他の鱗翅目昆虫同様約６０個の糸球体からなる。ただし３個の糸球体が、メスでオス肥大しているという特徴がある。この性的二型を示す糸球体の数は、種間で異なり、モンキアゲハ３、クロアゲハ２、アオスジアゲハで１であった。またオス特異的に発生する糸球体がひとつあり、これは蛾類のメス由来のフェロモン情報を受ける糸球体に類似するものと考えている。
ナミアゲハの触角を対象にゲノム解析およびトランスクリプトーム解析を行ったところ、５８個の受容体を同定し、うち３遺伝子はメスで発現量が多いことがわかってきた。
このことは、
一般的に糸球体のサイズは、嗅覚受容体の多さと関連する可能性が高いということと関わりがありそうで興味深い。オスで発現量が多い
遺伝子は６つあり、うち一つはカイコのフェロモン受容体と系統が同じだった。この数は、オス特異的糸球体の存在と一致しており興味深い発見となった。また、ゲノム解析によって、シロオビアゲハは６２、キアゲハ
は５８の嗅覚受容体を持つことも示唆した。今後は、特定した受容体の機能を明らかにする研究と受容体の遺伝子レベルでの比較を行なって行く予定である。
学会発表
大田竜也、山上初音、志賀向子、木下充代「ナミアゲハにおける嗅覚受容体遺伝子の多様性およびその進化」
日本進化学会 第２４回 沼津大会 2022 年 8 月 4 - 7 日 プラザヴェルデ

10

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： ネットワーク上の意見更新過程とフィルターバブル効果
研究代表者： 佐々木 顕
共同研究者： 大槻 亜紀子
研究内容・研究成果・今後の展望等
研究の概要
SNS の発展した近年の社会では、個人の意見や行動はローカルなネットワーク上の意見の影響を受けやすい。
またその個人のネットワークのリンクが、より意見を共有する方向に選択的に再結合されることにより、同様の意見を持つ堅牢な意見集団が自己組織化される「フィルターバブル効果」に注目が集まっている。本研究では「マスク着用」や「ワクチン接種」に関する個人の意見が、このような「適応的」ネットワーク上で動的に変化するとき、それが伝染病の疫学動態や防除にどう影響するか理論的に探究するとともに、効果的なネット
ワークへの介入についても議論した。
これまでに得られた研究成果
Geschke et al. (2018)の attitude space（態度空間）を元に、マスク着用に関する態度空間上のランダムネッ
トワークモデルを構築した。態度空間の座標上に配置された各個人は外部や隣接した個人からさまざまな情
報を受け取り（メディアや SNS を想定）
、その情報を選択的に受け入れることで自身の態度を更新する。初期状態で態度空間にランダムに配置されていた個人は時間の経過とともにフィルターバブル効果によって意見を共有する複数の小集団（クラスタ）に分かれた。ここで、態度の大きく異なる個人同士のリンクを切り他の個人とリンクを再形成するエッジの繫ぎ替えの効果を入れると、態度空間上でお互いに孤立するクラスタに集団が分断化され、各クラスタに個人が凝集される傾向がある。ここに、態度空間上のリンクを持つ個体同士が物理的にも接触するプロセスを加えると、マスク着用忌避の意見を共有するクラスタで早期に高い密度で感染者が増加することにより急速な流行が引き起こされる傾向がある。一方で、異なる態度クラスタ間の接触頻度は低いため、パラメータによっては集団全体での伝染病の流行はむしろ抑制される場合もある。

今後の展望
これらの結果のパラメタ依存性や一般性をシミュレーションで検討することにより、フィルタバブル化による感染リスクの増加や防除困難性の増大の程度を評価し、これらを抑制するために効果的なネットワークへの介入措置についても理論的に検討する。
発表論文（態度空間上のフィルターバブル効果と疫学動態に関する上記の研究成果を論文化し、今年度中に投稿する。
）

11

引用文献
Geschke D, Lorenz J, Holtz P (2018) The triple-filter bubble: Using agent-based modelling to test a metatheoretical framework for the emergence of filter bubbles and echo chambers. Br. J. Soc. Psychol. 58: 129149.

122022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 複雑適応系進化学プロジェクト(B)キャベツウニを巡る養殖技術の開発の歴史と社会経済循環のしくみ研究代表者： 田辺秀之
共同研究者： なし
研究内容・研究成果・今後の展望【研究内容】
キャベツウニとは、三浦半島に生息するムラサキウニに、三浦半島の特産であるキャベツのうち規格外品を餌として与え、3 箇月ほどの養殖を経て、販売できるまでに成育させた美味のウニのことを指す。この開発の発
端は、神奈川県水産技術センターの臼井一茂主任研究員によりもたらされ、1）地球環境の変化（沿岸の磯焼け、海藻類の不作、ウニ生産量の減少と劣化）と社会経済への影響、および 2）偶然に見いだされた生物学的特徴（ウニがキャベツを好んで食し、生殖巣が美味になること）の２つの重なりによってもたらされたと言われている。近年の磯焼け、海藻類の不作は、大量発生したウニによる食害が原因の一つと考えられ、ウニの駆除が行われてきたが、小坪漁港や小田原漁港では、三浦産キャベツの商品化されない規格外品を農家から供与してもらって、餌として 4 月～7 月まで 3 箇月ほどムラサキウニの養殖に利用することが可能となった。その結果、地元スーパーで 7 月初旬頃、販売されるルートが実現された。キャベツウニを巡って、環境の変化に適応しつつ社会経済的な課題の克服がもたらされ、地域の活性化だけでなく、日本の様々な地域における環境と経済の好循環のモデルケースとなりうるのではないかと考えられた。本研究では、以下の 3 点の調査を進め、今後の研究課題の発掘や、進化科学的な視点から何らかの貢献ができる可能性を探ることを目的とした。
1）「キャベツウニ」を巡る現状の調査：臼井一茂主任研究員（神奈川県水産技術センター）へのインタビュー、
キャベツ農家、小坪漁業組合、逗子商店街での地域住民（漁師でシェフの座間太一氏）のそれぞれの活動や関係性について
2）ムラサキウニの生物学的調査研究：養殖技術の開発の歴史や現在取り組まれている生物学的研究の調査：
ウニの生殖巣の色や味など食品としての価値に繋がる研究について
3）キャベツウニのブランディング化、商品としての流通や社会経済的な取り組みの現状の調査等【研究成果】
臼井一茂主任研究員（神奈川県水産技術センター）へのインタビューを通じて、キャベツウニの養殖技術の開発の歴史を伺うことができた。農家の廃棄したキャベツの葉が、偶然、海中に入ってしまい、それをムラサキウニが好んで食するという現象を見出し、ダイコン、ブロッコリーなど、様々な野菜も同様にウニに与えたと
ころ、雑食性で葉物野菜ならばどれも好んで食することが判明した。しかもキャベツを食べたウニの生殖巣が美味である、ということが分かってきたので、ウニ退治からキャベツウニとして育てることへの大転換がひら
めいたという。臼井氏の人脈により、キャベツ農家、漁師（小坪漁協）、逗子商店街の方々への働きかけが功を奏して、地元スーパーでのキャベツウニの販売が実現したとのことである。ムラサキウニの生物学的調査研究として、臼井氏はウニの生殖巣の色素成分の分析による黄色色素の維持を目指した研究や非破壊法による13

身入り調査の方法の開発などを手掛けている（研究費：神奈川県総合政策課の「シーズ探求型研究推進事業」、
水産課の「三浦の野菜残渣を活用したムラサキウニの畜養技術開発」による）。水産技術センターでのプロジ
ェクト研究や予算が付けられた研究ではなく、あくまでも個人研究の一環としてキャベツウニの養殖技術開発を行っている。キャベツウニは、大量生産による商品の流通やブランディング化を目指しているものではな
く、この地域ではこの規模での実施が安定的な状態ではないか、との考えが垣間見れた。確かに、地域によって状況が異なるので、一元化した方法は提示することができないが、社会経済的な取り組みの好循環モデルケースとして注目されており、日本各地だけでなく、海外でも同様な取り組みが試みられ始めている。
本調査より、ウニの生物学的な調査研究として、磯焼けに関する生態学的な実態調査、ウニの分子細胞生物学的研究（染色体観察）と生息環境との関連、生殖巣の生体での可視化法の開発、成長速度との関連など、いくつか研究課題の候補を挙げることができた。
【今後の展望】
4 月～7 月まで 3 箇月ほど、ムラサキウニの養殖期間における経過観察を実施し、キャベツウニの市場への商品としての流通の道筋をたどる（小坪漁協、水産技術センター内の施設）。キャベツウニの調理やスーパーでの販売の実現に至るまでの貢献度が大きかったと伺っている、漁師でイタリアンレストランのシェフである、
座間太一氏からも、スーパー販売への実現に至った経緯等について伺う予定である。
三崎臨海実験所の三浦徹先生、水研機構研究員の足立賢太氏の協力のもと、ムラサキウニの生態学的実態調査の状況や染色体分析の方法を確立する。生体を生かしたままでの生殖巣の可視化法についても、様々な工夫や考案をしてみる予定である。
発表論文
なし

14

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： ボルネオ島の熱帯雨林における人獣共通感染症の包括的モニタリング
研究代表者： 蔦谷 匠
共同研究者： 金森 朝子、Vijay Kumar
研究内容・研究成果・今後の展望等
本研究は、野外調査で採取できる糞をメタゲノム・メタプロテオーム分析することで、野生動物における疾病の罹患状態、健康負荷、防御反応を総合的に評価できる新たな「健康診断」の枠組みを確立することを目的に実施した。動物の糞中に含まれる病原体、ストレス応答、生体防御関連の DNA やタンパク質を、最新のメ
タオミクス技術によって同定し比較することで、野生動物の健康状態やレジリエンスを評価できる。ヒトにもっとも近縁な大型類人猿の中で唯一アジアに生息し大きな保全価値を持つ野生オランウータンを主な対象とし、テナガザル、ヒゲイノシシ、シベット、コウモリなど共存する哺乳類についても包括的に調査を実施する
ことを目指した。
2022 年度には、蔦谷が 6 月と 3 月に、金森が 7 月と 2 月にボルネオ島（マレーシア・サバ州）に渡航し、研究対象としている調査地でデータの管理や収集を行なったほか、現地の政府機関や大学を訪れ、調査許可の申請や更新を行なった。特に、共同研究者である Kumar 教授とは研究内容について詳細な議論を行ない、特にオランウータンの糞資料について、蔦谷がメタプロテオーム解析を実施し、Kumar 教授がメタゲノム解析を実施する体制を確認した。2023 年 3 月の蔦谷の渡航では、現地の申請・許可のフローに則って、オランウ
ータンの糞の冷凍試料と、オランウータン採食植物の乾燥試料をサバ州から日本に輸出した。
2022 年度には、オランウータンの健康状態を把握する上での基本的な情報源となるオランウータンの食性についての研究も実施した。以前に輸出済みの糞および植物試料について、炭素・窒素安定同位体分析を実施
し、オランウータンの採食生態を包括的に復元した。その結果、オランウータンの食性には季節性があることがわかり、果実期と非果実期でオランウータンの食事内容がやや異なり、病原体への抵抗性にも違いが生じている可能性があることが推測された。この研究は 2022 年の 8 月に出版され、総研大よりプレスリリースを出したほか、Wiley 社との転換契約のスキーマでオープンアクセス化され広く一般に読まれることが可能となった。
発表論文
Tsutaya T, Wong A, Malim PT, Bernard H, Ogawa NO, Ohkouchi N, Hongo S, Tajima T, Kanamori T, Kuze
N. 2022. Stable isotopic investigation of the feeding ecology of wild Bornean orangutans. American Journalof Biological Anthropology 179: 276–290. DOI: 10.1002/ajpa.24598.

152022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 三浦半島の環境との相互作用を介した水性生物の進化研究代表者： 寺井洋平
共同研究者： 沓掛 展之、山田 優佳、長田 美沙 (敬称略)
研究内容・研究成果・今後の展望等
本研究では、三浦半島に生息するウミウシ類とハゼ科魚類を対象に、環境との相互作用が生物の進化にどのように関わってきたかを明らかにしようとしている。
ウミウシ類: 研究内容ウミウシの胃内容物のメタゲノム解析により、これまでほとんど知られていないウミウ
シの食性と体色の進化との関連を明らかにする。研究成果 三浦半島の一式海岸付近の磯において、春から初夏までと冬に 20 種類、合計 200 個体程度のウミウシの採集を行なった。そのうち、半分程度の個体の胃内容物を摘出し RNAlater 浸潤の後 -20 度で保存した。保存サンプルのうち 30 個体分から DNA の抽出を行なった。この DNA にはウミウシが採食した生物すべての DNA が含まれている。抽出した DNA は濃度と質を測定した。6 サンプルについては、次世代シークエンサーで配列を決定するためのライブラリの作成を行い、各サンプル 10 Gb の配列を決定した。今年度に決定した配列はまだ解析中であるが、前年度に決定した配列の解析から、ある種のウミウシは特定のバクテリアを多く採食していることが明らかになっている。今後の展望
最近、毒があり派手な警戒色を呈する両生類(カエル、サラマンダー)が腹側だけが警戒色の隠蔽色/警戒色型を介して隠蔽色の種から進化してきたことが報告された。ウミウシにも警戒色型、腹側だけ警戒色の隠蔽色/警
戒色型、隠蔽色型の種がいる。そしてある種のウミウシでは採食により毒性を得ていることが報告されているため、ウミウシの食性から警戒色の進化過程を明らかにできると期待している。
魚類: 研究内容 海水に生息するが河川に遡上するマハゼの海水集団と淡水集団の全遺伝子発現量を比較し、どのようにして塩濃度と透明度が異なる環境で生息しているのかを明らかにする。研究成果 三浦半島の田越川河口から約 1.3 km の淡水域、および付近に河川のない佐島港付近からマハゼをそれぞれ 5 個体ずつ採取した。採取した個体は眼から RNA を抽出し、次世代シークエンサーで配列を決定するためのライブラリの作成を行った。このうち、３ライブラリについては 10 Gb の配列を決定した。また、前年度に行なった海水と河川のクサフグの比較から、河川でシャペロン遺伝子群が多く発現していることが明らかになっていた。この要因が塩濃度の違いか調べるために、クサフグを淡水で飼育した後に RNA 抽出、ライブラリ作成、各個体 10
Gb の次世代シークエンサー配列決定を行なった。その結果、淡水飼育 3 日後では全発現遺伝子のうち 17%もの遺伝子の発現量が変化してしまうことが明らかになった。このことから淡水飼育３日間はクサフグ個体に相当なストレスを与えていることが推察され、短時間に条件を変えた淡水飼育実験をする必要があると考えられた。今後の展望 マハゼでのライブラリを作成しているので、マハゼでも海水と河川の集団間での全遺伝子発現量の比較を行う。その結果、マハゼとクサフグで相同な遺伝子の発現量変動が見られたならば、系統的に離れた魚類で共通の機構により、海水から淡水への進出をしていることが示すことができると期待してい
る。

16

発表論文
Osada M, Terai Y. Adaptation of the eyes of grass puffer (Takifugu niphobles) to the riverine and marine environments.
bioRxiv https://doi.org/10.1101/2022.04.28.489969 (2022)

17

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 三浦半島における先史時代人類の生業活動と古環境研究代表者： 本郷一美
共同研究者： 佐藤孝雄（慶應大学)、釼持輝久(赤星直忠考古学研究所)、杉山浩平（東京大学グローバル地域研究機構）、米田穰（東京大学総合研究博物館）、佐宗亜衣子（新潟医療福祉大学）、高橋健（横浜ユーラシア文化館）、青野圭（総合研究大学院大学先導科学研究科)、艾凱玲（慶應大学大学院）風間智裕（駒澤大学大学院）、宇根宏紀（明治大学文学部）
以上 10 名研究内容・研究成果・今後の展望等＜研究内容＞ 三浦半島における考古学調査の歴史は 100 年あまりにわたり、古東京湾、相模湾沿岸の貝塚
調査は海水面変動や古環境に関する重要な知見をもたらした。稲作が導入された弥生時代から中世には、三浦半島南端及び東岸で多くの海蝕洞窟が生業活動の場として利用された。本研究は動物遺体、骨・角・貝製品、人骨など豊富な出土遺物から気候変動や沿岸海洋環境による資源環境の変化に呼応する人類の適応について検討し、海洋資源利用、稲作の導入による食性の変化、農耕集落と沿岸部の遺跡の関係などを明らかにする。
統合進化学研究センターの立地と進化学的な研究視点という特性を生かし、三浦半島をフィールドとして研究を行っている博物館・大学・民間の研究者の拠点とするため、2022 年度はまず研究者のネットワーク構築を主眼とし、過去の発掘調査で出土し博物館に保管されている遺物の資料調査と、三浦市の白石洞穴の発掘調査を行った。
＜成果＞ 横須賀市立博物館にて間口洞穴出土の動物遺存体の分析、東京大学博物館にて毘沙門洞穴出土の人骨の分析をすすめた。白石洞穴の発掘調査を行い、地元でサイエンスカフェを開催し成果を発信した。サイエンスカフェは対面とオンラインのハイブリッドで開催した（約 40 名参加）。
<展望＞ 三浦半島南部の海蝕洞窟（毘沙門洞穴、間口洞穴、白石洞穴）は立地環境と出土する貝や動物の種類が異なっている。プロジェクトメンバーはこれまでも互いの研究活動について知っており共同研究をすることもあったが、より密接に連絡をとり研究結果をシェアすることで、これらの海蝕洞窟における生業活動や利用季節の違いを考察することが可能になると期待される。
発表論文 （著者のうち下線はプロジェクトメンバー）
佐藤孝雄, 艾凱玲 (2023a) 由比ガ浜中世集団墓地遺跡 (No.372) 由比ガ浜二丁目 1215 番 1 地点の脊椎動物遺体. 由比ガ浜中世集団墓地遺跡(鎌倉市№372 遺跡)発掘調査報告書-鎌倉市由比ガ浜二丁目 1215 番 1
地点-. 株式会社博通, pp. 12-23. (査読無)中村謙伸, 佐藤孝雄, 河野礼子 (2023) 出土人骨の形態学的特徴について. 由比ガ浜中世集団墓地遺跡(鎌倉市№372 遺跡)発掘調査報告書-鎌倉市由比ガ浜二丁目 1215 番 1 地点-. 株式会社博通, pp. 23-24. (査読無)書籍（執筆依頼、分担執筆）
杉山浩平（2022) 「関東地方弥生社会の形成と太平洋沿岸の海人」 長友朋子・石川日出志・深澤芳樹 編 『南18

関東の弥生文化 東アジアとの交流と農耕化」所収.吉川弘文館.
学会発表
佐藤孝雄, 宇根宏紀, 艾凱玲, 千葉毅 (2022 年 6 月) 「三浦市間口洞窟遺跡の脊椎動物遺体」日本動物考古学会第 9 回大会 (2022 年 6 月 豊橋市自然史博物館).（ポスター）
杉山浩平, 釼持輝久, 高橋 健「神奈川県三浦市毘沙門海蝕洞窟遺跡の出土資料と記録類の研究」第 88 回日
本考古学協会（2022 年 5 月 早稲田大学).（ポスター）
佐伯史子、萩原康雄、澤田準衛、佐宗亜衣子、奈良貴史、安達登、米田穣、遠部慎、西本志保子、小林謙一、
愛媛県上黒岩第 2 岩陰遺跡から出土した縄文早期人骨、第 76 回日本人類学会大会・第 38 回日本霊長類学会大会連合大会（京都産業会館ホール, 2022 年 9 月 16-19 日）.（ポスター）
その他の口頭発表
杉山浩平 「海」からみる東日本の弥生文化 （2022 年 8 月６日大阪府立弥生文化博物館シンポジウム）
アウトリーチ活動
サイエンスカフェ 「白石洞穴に残るさまざまな歴史」
2023 年 2 月 18 日 13 時 30 分～16 時、三浦市「うらり」2 階研修室
杉山浩平（東京大学特任研究員）「三浦市白石洞穴遺跡を掘ってみた⑤」
小山侑里子（板橋区教育委員会学芸員）「古墳時代人のアクセサリー・ガラス玉」

19

2022年度 統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ報告書

研究課題名： 複雑適応系進化学プロジェクト(A)
社会行動の性差はどのように生み出されるのか？〜分子メカニズム・神経機構・脳発達の包括的理解に向けたプレリサーチ
研究代表者： 渡邊崇之
共同研究者： なし
研究内容・研究成果・今後の展望等

本プレリサーチでは、コオロギにおいてオス化因子である doublesex 遺伝子がメス化する運命にある X 染色体に転座した結果、分子進化速度が著しく亢進したという進化的イベントに着目し、昆虫（特にコオロギ）をモデルとした性決定様式の進化・多様性や社会行動の「性差」の神経基盤の研究に向けたプレリサーチとして、以下の２サブプロジェクトを遂行した。
A. なぜ昆虫の doublesex 遺伝子は性差を生み出す転写因子として機能するのか？
B. doublesex 発現細胞はコオロギ脳内でどのような神経回路を形作るのか？

doublesex 遺伝子は、キイロショウジョウバエで雌雄差を生み出す遺伝子として同定された転写因子遺伝子である。昆虫の中でもより原始的な系統に属するコオロギでは、遺伝子破壊によってメスのみが生じる変異系統が生じることから、doublesex 遺伝子はオス化因子として機能することを明らかにしている。A. では
昆虫の系統進化の過程で doublesex 遺伝子がどのようにしてメス化機能を獲得したのかを紐解くため、メス型 Doublesex タンパク質とショウジョウバエにおいてその共役因子として知られる Intersex タンパク質との相互作用が、様々な昆虫の系統において保存されているかを検証した。2022 年度はタンパク質相互作用解
析のため、様々な昆虫に由来するメス型 Doublesex タンパク質と Intersex タンパク質の無細胞タンパク質
発現系の構築を進めた。発現ベクターの構築を完了したが、無細胞タンパク質発現系試薬の納品が遅れたため
年度内に実験を完了することができなかった。2023 年度に入り試薬を入手できたため、現在実験遂行中である。また、当初、CRISPR/Cas9 法を用いて intersex 遺伝子編集コオロギを作成し表現型解析をおこなう予定であったが、適切な Cas9 gRNA が設計できないことが明らかとなり、変異体の作成実験を中断している。
2023 年度は、よりフレキシブルなゲノム編集法である TALEN 法を導入する予定であり、この方法をもちいて intersex 変異体の作成に再度取り組む予定である。
B. では、doublesex を発現する神経回路を蛍光タンパク質遺伝子を発現させることで可視化することを試みた。フタホシコオロギ doublesex 遺伝子の上流配列 (~7 kbp) の取得に成功し、その後、遺伝子導入コオ
ロギの作成に取り掛かる予定であったが、コオロギゲノム・トランスクリプトーム解析の結果、転写調節領域と見積もられる領域が想定以上に長く、実際に神経系で doublesex 遺伝子の発現に寄与するエンハンサー領域の特定が必要となった。このため、プレリサーチの追加課題として ATAC-seq によるオープン・クロマチ
ン領域の解析を進めた。2022 年度末にコオロギ中枢神経系を材料とした ATAC-seq の条件検討が完了し、現在、本解析を進めている。さらに ATAC-seq と並行して phylogenetic footprinting 法により種間で共通する
エンハンサー配列や種特異的エンハンサー配列の特定を試みた。種間比較のためには様々なコオロギを収集20する必要があるが、これまでに 20 種を超えるコオロギを入手し、試験的に飼育を始めている。その中から 5種のコオロギより新規に doublesex 遺伝子を同定し、3 種で上流配列の取得を進めている。ATAC-seq 並びに phylogenetic footprinting 法の結果からフタホシコオロギ doublesex 遺伝子の転写調節領域が絞り込めた段階で、遺伝子導入コオロギの作成に取り掛かる予定である。また、phylogenetic footprinting 法については2023 年度以降も継続し、コオロギ doublesex 遺伝子の分子進化速度の亢進が、脳内 doublesex 発現細胞の種差を生み出したか否かを解明していく。
発表論文
2022 年度は本プレリサーチに関わる論文を発表していない。

21

学 生
2022 年度在籍者◎ 5 年一貫制課程〇2016 年度（4 月）入学

学生氏名

南木 悠

指導教員

職名

主任指導

木下 充代

准教授

副指導

蟻川 謙太郎

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

飯田 香穂里准教授

研究タイトル

アゲハ類の訪花特性○2017 年度（4 月）入学
学生氏名

西條 未来

指導教員

職名

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

大槻 久

准教授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

飯田 香穂里准教授

研究タイトル

コロニー内での捕食されやすい場所の予測○2018 年度（4 月）入学
学生氏名
青野 圭

坂本 貴洋

指導教員

職名

主任指導

本郷 一美

准教授

副指導

五條堀 淳

講 師

副指導

飯田 香穂里

准教授

主任指導

印南 秀樹

教 授

副指導

大田 竜也

准教授

副指導

大西 勇喜謙講 師

研究タイトル
先史時代琉球列島におけるイノシシ属の利用について不連続な表現型可塑性の発生過程の進化モ
デル○2019 年度（4 月）入学
学生氏名
桑野 友輔

高畑 優

山川 真徳

指導教員

職名

主任指導

佐々木 顕

教 授

副指導

大槻 久

准教授

副指導

大西 勇喜謙

講 師

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

大西 勇喜謙

講 師

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

大西 勇喜謙講 師

22

研究タイトル
温帯に生息するヒトスジシマカの休止の進化

餌付けがもたらすキタリスの繁殖成績への影響評価

ハダカデバネズミのワーカーにおける行動特性の多様性○2020 年度（4 月）入学
学生氏名
亀嶋 恵介

山田 優佳

指導教員

職名

主任指導

専攻長（仮）

副指導

沓掛 展之

副指導

未

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

木下 充代

准教授

服指導

寺井 洋平

助 教

副指導

伊藤 憲二

准教授

研究タイトル教 授

同時的雌雄同体のウミウシ類における多様な繁殖戦略および胃内容物の調査○2021 年度（4 月）入学
学生氏名
長田 美沙

指導教員

職名

主任指導

颯田 葉子

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

飯田 香穂里准教授

研究タイトル
浅海から汽水域における異なる光環境への
魚類の環境適応○2022 年度（4 月）入学
学生氏名
知久 彩楓

中井 喜隆

山口 大貴

指導教員

職名

研究タイトル
地域特異的な自然選択のヒトゲノム進化への影響 ーCYP1A2 とネアンデルタール・デ
ニソワのゲノム流入を例としてー

主任指導

颯田 葉子

教 授

副指導

五條堀 淳

講 師

副指導

飯田 香穂里

准教授

主任指導

木下 充代

准教授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

大西 勇喜謙講 師

主任指導

専攻長（仮）

副指導

未

副指導

未

ナミアゲハの脳の感覚受容領域における季節型差◎ 5 年一貫制課程（3 年次編入学）○2017 年度（4 月）入学
学生氏名
杉田 あき

濱崎 真夏

指導教員

職名

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

水島 希

助 教

主任指導

印南 秀樹

教 授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

大西 勇喜謙講 師

23

研究タイトルムササビの森林内における分布と利用

ヒトセントロメアDNA 配列の進化

○2020 年度（4 月）入学
学生氏名
安家 叶子

指導教員

職名

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

大槻 久

准教授

副指導

大西 勇喜謙講 師

研究タイトルBehavioral responses toward visual andolfactory cues in the African painted dog○2020 年度（10 月）入学
学生氏名
XUAYIRE XAOKAITI

指導教員

職名

主任指導

本郷 一美

准教授

副指導

寺井 洋平

助 教

副指導

飯田 香穂里准教授

研究タイトルArchaeological study of domestic dog in East
Asia

○2021 年度（4 月）入学
学生氏名
熊田 隆一

佐々木 未悠

指導教員

職名

主任指導

佐々木 顕

教 授

副指導

大槻 久

准教授

副指導

大西 勇喜謙

講 師

主任指導

沓掛 展之

教 授

副指導

未

副指導

未

研究タイトル
病原体に対抗する宿主応答の進化○2022 年度（4 月）入学
学生氏名
森田 慶一

指導教員

職名

主任指導

佐々木 顕

教 授

副指導

大槻 久

准教授

副指導

飯田 香穂里准教授

研究タイトル
繁殖干渉が近縁種間の形質多様性に与える影響○2022 年度（10 月）入学
学生氏名
久保 鮎子

指導教員
主任指導

専攻長（仮）

副指導

未

副指導

未

職名

研究タイトル

教 授
考古土壌を用いたプロテオミクスによる過去の人間活動の復元及びその手法の開発

24

博士研究
2022 年度 課程博士取得者
氏名

坂本 貴洋

学位取得

2022
後期

博士
(理学)

学位論文タイトル

副論文タイトル

Population genetics theoryof natural selection

Evaluation of resource allocation
strategies to scientific research from theperspective of division of cognitive labor（認知的分業の観点から考える研究資源の配分戦略の評価）

2022 年度 論文博士取得者
氏名

秋山 辰穂

論文博士取得

2022
後期

博士
(理学)

学位論文タイトル

Parallel evolution of vision among hawkmoth species through thediurnal–nocturnal transition

2022 年度 副論文合格者
氏名

副論文合格者

副論文タイトルXIAYIREXIAOKAITI

2022
前期

Ethical issues in using human remains from archaeological sites — with afocus on the United States and Japan

青野 圭

2022
後期

博物館展示と捕鯨問題

高畑 優

2022
後期

都市公園における野生動物の餌付け管理に向けた課題の抽出が餌付けする動機と専門家による想定のズレ－

山川 真徳

2022
後期

オルトメトリクスは日本のソーシャルメディアへのインパクトを正確に捉えているか

熊田 隆一

2022
後期

ワクチン接種義務化の論理学的検討

25

－市民

海外における活動
2022 年度 SOKENDAI 研究派遣プログラム
名前1

XIAYIRE XIAOKAITI

学年

５年

用務先
The Institute of Archaeology, CASS
Collaborative Research, Lanzhou University
Visit archaeological site, The Institute ofArchaeology, CASS Collaborative Research

期間2022.6.16～9.222022 年度 海外移動経費

1

名前

学年

森田 慶一

３年

用務先
クイーンズランド大学、モナーシュ大学
大学研究室訪問、口頭発表

期間2022.10.3～10.14

2022 年度 その他の経費による活動

1

名前

学年

安家 叶子

５年

用務先

期間

The Palais des congrès de Montréal
2022.12.2～12.20
モントリオール生物多様性条約締約国会議 参画

26

教 員
外国人招聘研究者（１）
研究者氏名（所属，国）：

Wen-Ya Ko（台湾国立陽明大学, 台湾）

来

日

研

究

期
テ

間

：

2022 年 7 月 2 日～ 9 月 10 日マ：

東アジア人の由来についてー

活動の概要：
活動の概要：東アジア人の由来について、台湾 biobank のデータに基づき、さまざまな遺伝子座の SNP の頻度を年齢という観点で解析した。方法は、Mostafavi et al.(2017)で開発されたものを用いた。SNP の頻
度と年齢との間に興味深い結果が得られた。同様の結果が日本人を対象とした解析でも得られるかどうか、
今後検討する。
招聘者：統合進化科学研究センター（受け入れ教員：颯田葉子）（２）
研究者氏名（所属，国）：Diddahally R. Govindaraju (Harvard University, USA)来日2022 年 9 月 19 日～ 11 月 21 日

研

究

期
テ

間

：

マ

：

ー

遺伝学から生態学、生物多様性に至るまでの統合人類学の構築・生物、文化民族の保全について活動の概要：
セミナー講演、共同研究、研究指導、論文執筆
招聘者：統合進化科学研究センター（受け入れ教員：印南秀樹）（３）
研究者氏名（所属，国）：Jinliang Wang (Zoological Society of London, UK)

来：2022 年 9 月 30 日：

DNA 情報を用いた近親度の推定法

研

校
究

テ

日
ー

マ

活動の概要：
セミナー講演、議論
招聘者：印南 秀樹

27アウトリーチ活動（１）センター主催講演会
日 付

開催形態

イベント・テーマ

講 師

生命共生体進化学専攻における研究最前線（生命共生体進化学専攻説明会）

2022. 5.14

2022.11.12

オンライン

オンライン

動物行動学・ひらめきクイズ：研究するための思考法

教 授

沓掛 展之

人類進化研究の集団遺伝学 ― 乳糖耐性
を例に ―

教 授

颯田 葉子

『知らないこと』はなぜ知らないのか― 知と無知の分布について考えよう ―准教授

飯田 香穂里ゲノム進化：遺伝子が増える？減る？

教 授

印南 秀樹

アゲハチョウの色覚とその仕組み

准教授

木下 充代

カラスのパラドックス ― 帰納と確証をめぐる哲学的パズル入門

講 師

大西 勇喜謙

公開シンポジウム
統合進化科学研究センター 開所記念シ 学長
准教授
ンポジウム ― 人の未来を考える ―准教授
2023.2.28

総研大 講堂オンライン

飯田 香穂里大田 竜也

招待講演者（敬称略）：

准教授

大槻 久

国立遺伝学研究所 名誉教授 太田 朋子

准教授

木下 充代

国立遺伝学研究所 教授 北野 潤

研究員（産総 仮屋園 志保
研・総研大）

東京大学三崎臨海実験所 教授 三浦 徹
愛媛大学 特命教授 佐藤 哲

（２）横高アカデミア 2022
日 付
2022 年度

長谷川 眞理子

先導研 5 年 坂本 貴洋
一貫制博士
課程

内 容

講 師

神奈川県立横須賀高等学校 スーパーサイエンスハイスクー

准教授

木下 充代

ル事業 (Principia II) への参画

助 教

渡邊 崇之

（３）一般市民向け講座・講演会
内 容

講 師 等

書評会『「価値を否定された人々」――ナチス・ドイツの強制断種と「安楽死」』（新評論、2021 年）コメンタリー 西洋近現代史研究会2022 年12 月（オンライン）28

准教授

飯田 香穂里（つづき）「論評 ― 利他性の進化理論」日本生物物理学会主催 市民シンポジウム“次世代にどのような社会を贈るのか？”「利他性―自然科学と社会科学の架け橋として」2022.4.2（オンライン）

准教授

大槻 久

理科ハウス サイエンスレクチャー「新しい種が生まれる時」2022.7.31

助 教

寺井 洋平

湘南国際村アカデミア講演会“カフェ・インテグラル”「ゲノムから見たニホン
オオカミとイヌの多様性の起源」かながわ国際交流財団 2022.11.27

助 教

寺井 洋平

サイエンスカフェ「白石洞穴に残るさまざまな歴史」（2023.2.18 三浦市「うら
り」
）

准教授

（４）プレスリリース・メディア出演等
内 容

（共催）

本郷 一美

教 員

＜プレスリリース2022.4.19＞ アゲハの色覚神経系の配線
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220419.html

教 授

蟻川 謙太郎
（責任著者）准教授

木下 充代

日本経済新聞（朝刊）サイエンス面「〈コロナは何を変えたのか〉(4) 信頼できる？揺らぐ協調」2022.10.30

准教授

大槻 久

＜プレスリリース2022.8.24＞ オタマジャクシは「誰が仲間か」を学ぶ：学習による血縁者識別の可塑性を発見
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220824.html

教 授

沓掛 展之

2022.11.29「新型コロナウイルスが免疫に耐性を持つよう変異する仕組み、総合研究大が解明」日刊工業新聞「ニュースイッチ」
https://newswitch.jp/p/34784

教 授

佐々木 顕

＜プレスリリース2022.11.22＞ 免疫不全宿主の存在がウイルスの免疫逃避を加速する
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20221122.html

教 授

佐々木 顕

＜プレスリリース2023.2.10＞ 生態系における種を超えた協力関係は絶滅へ向
かう逆説的な適応進化をもたらす 〜相利系が絶滅に至る新たな脆弱性の発見〜 https://www.soken.ac.jp/news/2022/20230210.html

教 授

佐々木 顕

＜プレスリリース2022.4.12＞ ヘビの遺伝子がカエルに飛び移る？ ― 寄生虫が仲介する遺伝子水平伝播のパンデミック ―https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220412.html

准教授

田辺 秀之

＜プレスリリース 2022.8.18＞ 安定同位体分析により野生オランウータンの糞から食性を探る https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220818.html

助 教

蔦谷 匠

29

（つづき）＜プレスリリース2023.3.9＞ 授乳・離乳の社会現象を人間進化の視点から解き
ほぐす https://www.soken.ac.jp/news/2022/20230309.html

助 教

蔦谷 匠

NHK 総合 ダーウィンが来た！「解明！本当のニホンオオカミ」2023.2.19 放映（再放送2023.5.5）

助 教

寺井 洋平

NHK 総合 ヒューマニエンス「家畜 それは遺伝子の共進化」2022.5.10 放映

准教授

本郷 一美

＜プレスリリース2022.5.24＞ 匂いを感じられないゴキブリ？〜ゴキブリが匂いを感じる仕組みを解明し、匂いを感じられないゴキブリを作成〜
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220524.html

助 教

渡邊 崇之

（５）執筆活動等
内 容

教 員「進化と人間行動 第２版」長谷川寿一、長谷川眞理子、大槻 久（著）
東京大学出版会准教授

大槻 久「霊長類学の百科辞典」の執筆・編集

教 授

颯田 葉子

「梅田墓所の甕棺より出土した人骨の安定同位体分析」分担執筆「大深町遺跡発掘調査報告II」大阪市文化財協会 pp.173-174

助 教

蔦谷 匠

「琉球諸島におけるヒトの食性の変遷」共著 月刊海洋54(7):347–351

助 教

蔦谷 匠

「ヒマラヤにおける家畜利用：高地の考古遺跡から出土した動物骨から」ビオストーリー Vol.37, pp.38-40

准教授

本郷 一美

30

教員の研究教育業績31飯田 香穂里（准教授：科学技術史）
１. 研究テーマ
1. 戦後日本の生物医学のトランス・アジア史研究
これまで、日本の生物・医学系研究者が放射線の健康影響に関する問題をどのように扱ったのか、また一方で原子力平和利用をどのように推進したのかについて調査を行ってきた。戦前まで遡り、戦時中の植民地における日本の研究者の活動との継続性を視野に研究を行うとともに、冷戦期の米国の日本・アジア介入についても調査を進めた。今年度は、ニューヨークにある国連のアーカイブズを訪問する機会を得て調査を行った。このほかの資料と併せて調査・分析を進めている。放射線災害・医科学研究拠点
共同研究のほか、国際共同研究の一部としても進めており、複数の国際会合で発表した。
2. 栽培植物の歴史と農業
植物学者・学術探検家が日本と世界の育種や農業について何を考え、学術分野から実践までどのような影響を与えたか。それぞれ師弟関係にある木原均、中尾佐助、西岡京治を中心に、栽培植物に対する考
え方、育種、農業支援活動の関係を分析している。今年度は、国際学会で一部を発表した。
3. 遺伝学史関連資料整理
引き続き、国立遺伝学研究所所蔵資料の調査・整理を行い（国立遺伝学研究所共同研究）、木村資生資料の一部をデジタル化した。遺伝学分野と学術会議の関係については国内学会で発表し、遺伝研設立については現在一部を論文にまとめている。

２. 教育• 担当授業1.
2.
3.

科学と社会副論文入門（１単位；分担）
生命科学と社会 II（１単位；分担）
科学・技術と社会 II（１単位；分担）• 研究指導【副論文指導担当】

1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

Xiayire Xiaokaiti
青野 圭
西條 未来
長田 美沙
森田 慶一
知久 彩楓
中井 喜隆
久保 鮎子

• 全学教育該当なし

32

• 他大学等における授業
該当なし

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

該当なし
論文（査読なし）

1.
2.

飯田香穂里「『アグノトロジー』を振り返る：科学史の中の “無知研究” のこれまでとこれから」『科学史研究』61 no.303 (2022): 250-256.
飯田香穂里「『客観性』とその先：本草図譜研究を通して考える日本の客観性」『生物学史研究』102 (2023): 17-23.

• 学会発表
学会発表

1.

2.

3.

4.
5.
6.

Iida, K. “Nuclear Medicine and the Bombs: How the new field was developed in Japan and inwhose bodies,” Symposium “Nuclear research in medicine after the Second World War,” Austrian
Academy of Sciences/Medical University of Vienna, Vienna, March 2023 (hybrid).
Iida, K. “Kyoto University mountaineering group’s alternative vision in Cold War Asia: From
Nakao Sasuke’s theory to Japan’s agricultural aid in Bhutan,” in panel “Trans-Asia sciences,interventions, and the diplomatic roles in postwar Japan and South Korea,” History of Science
Society meeting, Chicago, IL, November 2022.
Iida, K. "Trans-War Continuity and Postwar Tensions: Kawaishi Kunio's Medical Projects inColonial Taiwan and Postwar Hiroshima,” in Workshop “Trans-Asian History of Science,
Medicine, and the Environment in South Korea and Japan,” Pusan National University, Busan,
Korea, September 2022 (hybrid).
Iida, K. “Atoms for Peace in Hiroshima,” in Workshop “International Science, Imperial Transitions,and Transpacific Networks of Knowledge at the Early Cold War,” Kyoto University, June 2022.
飯田香穂里、久保田明子、小沼通二、高岩義信、兵藤友博「日本の学術体制史研究—資料整備とその歴史研究 その５」日本科学史学会（第 69 回年会）2022 年 5 月（オンライン）.
飯田香穂里「無知生産の力学：アグノトロジーの“歴史”再検討」, シンポジウム「無知研究の諸相――無知学・無知の社会学・無知の認識論」日本科学史学会（第 69 回年会）2022 年 5 月（オンライン）.

企画したシンポジウム等

1.
2.

「統合進化科学研究センター 開所記念シンポジウム 人の未来を考える」統合進化科学研究センター 2023 年 2 月.
「東大三崎臨海実験所 x 統合進化科学研究センター 第１回学生交流会」統合進化科学研究セン
ター 2022 年 11 月.

基調講演・招待講演

33

該当なし

• 外部資金
1.
2.

3.

4.
5.

令和３−５年度科学研究費（日本学術振興会）基盤研究（C）研究テーマ「『原子力平和利用』と放射線育種：貫戦期のアジアを視野に」（課題番号 21K00248）総額 2990 千円（研究代表）.
平成３０−令和２年度（コロナ禍で延長）科学研究費（日本学術振興会）基盤研究（C）研究テ
ーマ「『原子力の平和利用』キャンペーン：アイソトープと医学・生物学者の役割」総額 3,250 千円（研究代表）.
平成２９−令和２年度（コロナ禍で延長）科学研究費（日本学術振興会）挑戦的研究（開拓）「日
本の学術体制史研究：研究基盤となる日本学術会議資料整備と研究環境構築の検討」総額 18,330千円（分担）.
2022 年度 国立遺伝学研究所共同研究（Ａ）「国立遺伝学研究所所蔵資料に基づく研究所設立過程ならびに草創期の研究 」82 千円（研究代表）.
2022 年度放射線災害・医科学研究拠点共同研究（重点⑤）研究テーマ「ABCC/RERF 関連資料を利用した放射線災害による健康影響研究史の基礎的研究」200 千円（研究代表）.

• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動1.
2.
3.
4.

日本科学史学会生物学史分科会 生物学史研究 編集委員会
日本科学史学会 欧文誌 Historia Scientiarum 編集委員会
日本科学史学会 全体委員
American Philosophical Society, The Mendel Newsletter 編集委員

• 学外委員会活動
上記参照

34

• アウトリーチ活動
1.
2.

書評会『
「価値を否定された人々」――ナチス・ドイツの強制断種と「安楽死」』（新評論、2021年）コメンタリー 西洋近現代史研究会 2022 年 12 月（オンライン）.
「『知らないこと』はなぜ知らないのか：知と無知の分布について考えよう」生命共生体進化学
専攻入試説明会・講演会（オンライン）2022 年 5 月.

• 学術誌編集活動
上記参照（生物学史研究、Historia Scientiarum）

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.

学術情報基盤センター本部図書館専門部会
附属図書館運営委員会電子資料専門部会
ハラスメント防止委員会「人を対象とする研究」倫理審査委員会• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

統合進化科学研究センター運営委員会（オブザーバー）
図書委員
ハラスメント総合窓口「複雑適応系進化学研究部門」部門長、プレリサーチ選考委員会
研究倫理相談委員会• 大学事業なし

６. その他の特筆すべき活動

35

印南 秀樹（教授：集団遺伝学、ゲノム進化学）
１. 研究テーマ
遺伝学ベースのゲノム進化研究
ゲノムは生命体の設計図であり、これが突然変異によって変化すること、そしてそれが次世代に受け継がれることが、進化の源である。このプロセスを理論的に理解し、ゲノムデータを見ることによって、DNA レベルの進化のメカニズムを解明する。

２. 教育• 担当授業1.
2.

ミクロ･マクロ生物学（２単位、集中講義）
副論文の書き方（１単位、集中講義）• 研究指導
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

濱崎 真夏（主任指導）
坂本 貴洋（主任指導）日本学術振興会育志賞受賞 総研大学長賞受賞
Kent Kawashima（ポスドク）
大窪 健児（ポスドク）
荻田 悠作（ポスドク）
中村 遙奈（ポスドク）
鍋加 有佑（京都大学からの委託指導）• 全学教育なし• 他大学等における授業
３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.
2.
3.
4.

Sakamoto T, Innan H (2022) Muller's ratchet of the Y chromosome with gene conversion. Genetics
220, iyab204.
Takeuchi Y, Ohtsuki H, Innan H (2022) A Non-zero-sum neutrality test for the tropical rain forest
community using long-term between-census data Ecol. Evol. 12, e8462.
Guo B, Zou M, Sakamoto T, Innan H (2022) Frequently functional innovation through gene
duplication followed by frameshift mutation. Genes 13, 190.
Sugihara Y, Young L, Yaegashi H, Natsume S, Shea DJ, Takagi H, Booker H, Innan H, Terauchi R,
Abe A (2022) High-performance pipeline for MutMap and QTL-seq. PeerJ 10, e13170.

36

5.

Vietia RA, Innan H (2022) Pathogenic ‘germline’ variants associated with myeloproliferative
disorders in apparently normal individuals: inherited or acquired genetic alterations? Clin. Genet.
101, 371-374.
6. Diway B, Yasui Y, Innan H, Takeuchi Y (2022) New locality and bud growth of the world biggest
flower, Rafflesia tuan-mudae, in Naha Jaley, Sarawak, Malaysia. Tropics 30, 71-82.
7. Takahashi KK, Innan H, 2022 Frequent somatic gene conversion as a mechanism for loss ofheterozygosity in tumor suppressor genes. Genome Res. 32: 1017-1025.
8. Otake Y, Innan H, Ohtsuki H, Urabe J, Yamada K, Yoshida T. 2022. Population genetic dynamics
during colonization and establishment of an obligate parthenogenetic Daphnia pulex population
in a small lake of a continental archipelago. Freshwater Biology 67: 1428-1438.
https://doi.org/10.1111/fwb.13951
9. Natsume S, Sugihara Y, Kudoh A, Oikawa K, Shimizu M, Ishikawa Y, Nishihara M, Abe A, Innan
H, Terauchi R. 2022. Genome analysis revives a forgotten hybrid crop Edo-dokoro of the genus
Dioscorea. Plant Cell Physiology 63: 1667-1678. https://doi.org/10.1093/pcp/pcac109
10. Nishikawa T, Ohka F, Aoki K, Suzuki H, Motomura K, Yamaguchi J, Maeda S, Kibe Y, Shimizu H,
Natsume A, Innan H, Saito R. 2023. Easy-to-use machine learning system for the prediction of IDH
mutation and 1p/19q codeletion using MRI images of adult-type diffuse gliomas. Brain Tumor
Pathol. 40(2): 85-92. https://doi.org/10.1007/s10014-023-00459-4
学術研究図書• 学会発表
学会発表

1.
2.
3.

○高橋数冴、印南秀樹 2022 年 9 月 日本遺伝学会第 94 回大会 札幌○高橋数冴、印南秀樹 2022 年 9 月 第 81 回日本癌学会学術総会 横浜○坂本貴洋、印南秀樹 2022 年 8 月 日本進化学会 沼津企画したシンポジウム等なし
基調講演・招待講演なし• 外部資金
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.

科研費 基盤 B セントロメア進化のミステリーを解き明かす（代表）７９０万
国際水産資源変動メカニズム等解析事業共同研究（代表）３０３万
理研 iThems 共同研究（代表） 通算７００万統合進化科学研究センター複雑適応プレリサーチ ブロックチェーン（代表）７０万
寄付金 サラブレッドゲノム（代表） 通算３００万
AMED 老化リボソームの実体解明と機能強化による健康寿命の延長（分担）３００万
WEC 水源地環境センター 研究助成金 １５０万
集団ゲノミクスを用いた社会性進化の解析（分担）９万
The role of non-allelic gene conversion in the evolution of Transposable Elements（分担）１０万37• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

1.

Raju Govindaraju

総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

1.

Jin Liang Wang

• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動なし• 学外委員会活動なし• アウトリーチ活動
なし• 学術誌編集活動
1.
2.

Journal of Theoretical Biology, Associate Editor
Genes and Genetic Systems, Associate Editor

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

苦情処理相談員• 部局委員会等への貢献なし• 大学事業1.

統合進化科学研究センター長38

大田 竜也（准教授：分子進化学）
１. 研究テーマ
1. 脊椎動物における免疫システムの進化の研究
硬骨魚類（主に新鰭亜綱に属する魚類）のゲノムおよびトランスクリプトーム解析に基づき、脊椎動物
での免疫システムの分子進化・起源を探る（国際共同研究）。
2. 被子植物における生殖システムの進化の研究
ソバ属植物のゲノム・トランスクリプトーム等の NGS データを解析し、フツウソバにおける異型花型
自家不和合性を司る S 遺伝子領域の解明を行う（国内共同研究）。
3. 縄文時代の植物大型化のメカニズム解明
縄文時代の中期以降に観察される種子の大型化の進化的要因（人為選択の影響等）
を明らかにするため、アズキ等の栽培化（ドメスティケーション）の過程を考古学ならびに遺伝学的な観点から検証する（国内共同研究）。
4. 鱗翅目における嗅覚遺伝子の進化
鱗翅目における嗅覚の多様性およびその進化過程を明らかにするため、嗅覚遺伝子多重遺伝子族を分子進化学的な観点から解析する（先導科学研究科内共同研究）
。

２. 教育

• 担当授業1.

ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「分子進化学・分子系統学」を担当）• 研究指導1.

坂本 貴洋（副指導）「自然選択の理論集団遺伝学」• 全学教育1.
2.

フレッシュマンコース（２単位、集中講義、「研究者のための"伝える"技術①ライティング」を担
当）
統合進化学（２単位、集中講義、「ゲノム，染色体，細胞」を担当）• 他大学等における授業
該当なし

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

該当なし

39

学術研究図書

該当なし• 学会発表
学会発表

1.
2.
3.

Hiroo Nasu, Seiji Nakayama, Takashi Sano, Tatsuya Ota Domestication process of soybean andazuki bean by Jomon sedentary hunter-gathers in Japanese archipelago
大田 竜也,・山上 初音・志賀 向子・木下 充代 ナミアゲハにおける嗅覚受容体（OR）遺伝子の多様性およびその進化 日本進化学会第 24 回沼津大会
那須 浩郎・大田 竜也 縄文時代にアズキの種子は大型化したのか？ 第 37 回日本植生史学会大会企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

該当なし• 外部資金1.

基盤 B「考古学と遺伝学から探るダイズとアズキの栽培種誕生プロセスの解明」（代表：那須 浩郎）、研究分担者、100 万円• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動1.
2.
3.

一般社団法人日本進化学会 監事
一般社団法人日本進化学会 理事（国内渉外担当）
一般社団法人日本進化学会第 26 回神奈川大会準備委員会委員

40

• 学外委員会活動
1.

国際生物学オリンピック日本委員会 委員• アウトリーチ活動
該当なし• 学術誌編集活動
該当なし• 学術誌査読活動
1.
2.
3.
4.

Plant Gene
Molecular Biology and Evolution
Scientific Reports
植物史研究

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.

遺伝子組換え実験安全委員会
ヒトゲノム遺伝子解析実験倫理審査委員会
ハラスメント防止委員会• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.

統合部局情報セキュリティ委員会
生命共生体進化学専攻 教務担当
生命共生体進化学専攻 広報・HP 担当
統合進化科学研究センター 広報・HP 担当• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
該当なし

41

大槻 久（准教授：理論生物学、進化ゲーム理論）
１. 研究テーマ
1. 間接互恵性に関する研究
間接互恵性において他者に関する評判を複数個体間で共有できない場合について、協力が進化的に安定(ESS)になる条件を調べた。その結果、ある特定の評判の割当方法の下では協力が ESS として保たれることを発見した。
2. 血縁淘汰による協力の進化
血縁者間で社会的相互作用が行われる場合に関して、血縁淘汰を進化ゲーム理論の枠組みに統合し、その解析を可能にする一般的枠組みを開発した。その応用として非線形な公共財ゲームを分析し、協力が維持される条件を解明した。
3. 非均一環境下での分散の進化
空間的にも時間的にも非一様な環境下において分散率が進化する条件をメタ集団適応度およびアダプ
ティブダイナミクス理論を用いて理論的に導出した。
4. 文化進化に関する理論研究
文化要素が集団に広まり、また集団から失われる現象について、文化に中立性を仮定し集団遺伝学の方法論を応用することでモデル化を行い、集団中に維持される文化要素数、集団内の文化の多様性、文化が集団から失われるまでの待ち時間などの各種指標を計算するとともに、現実の文化データからパラメータ推定を行う方法論について検討した。
5. 二人非対称ゲームの確率進化モデル
二人非対称ゲームについて確率進化ダイナミクスの解析を行い、ある戦略の組が別の戦略の組よりも有利になる条件を導出した。

２. 教育• 担当授業1.
2.
3.
4.

ミクロ・マクロ生物学（社会生物学）（２単位授業の一部、集中講義）
先導科学実習（プログラミング基礎）（２単位授業の一部、集中講義）
生物統計学（２単位授業の後半、集中講義）
統合進化学（数理生物学）（２単位授業の一部、集中講義）• 研究指導
1.
2.
3.
4.
5.
6.

西條 未来（副指導）安家 叶子（副指導）桑野 友輔（副指導）熊田 隆一（副指導）森田 慶一（副指導）中井 喜隆（副指導）42• 全学教育該当なし• 他大学等における授業
東京大学教養学部前期課程非常勤講師「適応行動論」 2022.4.7 – 2022.7.14

３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.
2.
3.

Sekiguchi T, Ohtsuki H. (2023) Aggregation of correlated judgments on multiple interconnectedissues. Group Decision and Negotiation 32, 233-256.
Kristensen NP, Ohtsuki H, Chisholm RA. (2022) Ancestral social environments plus nonlinear
benefits can explain cooperation in human societies. Scientific Reports 12, 20252.
Fujimoto Y, Ohtsuki H. (2022) Reputation structure in indirect reciprocity under noisy and private
assessment. Scientific Reports 12, 10500.

学術研究図書1.

長谷川寿一、長谷川眞理子、大槻 久（著）
「進化と人間行動 第２版」2022.4.22 東京大学出版会• 学会発表
学会発表

1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

森田慶一、大槻 久、佐々木 顕「繁殖干渉が近縁種間の形質多様性に与える影響」 第 70 回日
本生態学会 2023.3.17
大槻 久 "Ancestral social environments plus nonlinear benefits can explain cooperation inhuman societies." ゲーム理論ワークショップ 2023 一橋講堂 1 階特別会議室 2023.3.4
大槻 久「ヒトの協力進化メカニズムの理論的研究」 統合進化科学研究センター開所記念シンポジウム―人の未来を考える― 総合研究大学院大学講堂 2023.2.28
森田慶一、大槻 久、佐々木 顕「繁殖干渉が近縁種間の形質多様性に与える影響」第 32 回日
本数理生物学会大会 2022.9.6
大槻 久、Claus Rueffler、Joe Yuichiro Wakano、Kalle Parvinen、Laurent Lehmann「血縁度および繁殖価を用いた自然淘汰の分解定理」 第 32 回日本数理生物学会大会 2022.9.5
藤本悠雅、大槻 久「間接互恵性での noisy で private な assessment における協力の進化的安定性」第 32 回日本数理生物学会大会 2022.9.5
Yohsuke Ohtsubo, Kohei Suzuki, Masaya Toyoda, Yuta Kawamura, Hisashi Ohtsuki.
"Cooperative Intention Signaling Is Evolutionarily Stable against Mobile Defectors." 33rd Annual
Meeting of HBES 2022.6.23

企画したシンポジウム等

該当なし

43

基調講演・招待講演

1.

大槻 久「論評 ― 利他性の進化理論」 日本生物地理学会主催 市民シンポジウム 次世代にどのような社会を贈るのか？ 「利他性―自然科学と社会科学の架け橋」 2022.4.2• 外部資金1.

2.

日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「進化動態理論の統合による自然選択の複合
的理解：進化ゲーム・血縁・繁殖価を軸として」研究代表者 大槻 久（2020-2022）2022 年度
200 千円（直接経費）
日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 B「「こころを想定するこころ」の進化と発達：「心理化傾向」仮説に基づく統合的検討」（代表：橋弥和秀）研究分担者 大槻 久（2019-2023）
2022 年度分配金 250 千円（直接経費）• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動1.
2.

日本人間行動進化学会 理事
日本数理生物学会 運営委員

• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
1.

日本経済新聞（朝刊）サイエンス面 「〈コロナは何を変えたのか〉(4) 信頼できる？揺らぐ協調」
2022.10.30• 学術誌編集活動
1.

Editorial Board, Journal of Theoretical Biology

44

2.

Associate Editor, Theoretical Population Biology

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.

教育組織・教育課程再編実務担当者
全学評価実施委員会
部局情報セキュリティ委員会（部局技術担当者）• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

教務担当
オリエンテーション担当
ハラスメント窓口
サーバー管理プリンタ、スキャナ、学生 PC 管理担当

• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.

藤本悠雅（JSPS PD)研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）

該当なし
学術研究図書

該当なし
研究室構成員による外部資金

1.

藤本悠雅、特別研究員奨励費「相互学習で情報の参照が作る社会関係の解明：囚人のジレンマで生じる非対称均衡を例に」100 万円

研究室構成員の受賞

該当なし

45

大西 勇喜謙（講師：科学哲学）
１. 研究テーマ
1. 深層学習を用いた研究の科学的実在論論争への含意に関する研究
ディープ・ニューラルネットワーク（DNN）と呼ばれる機械学習技術は 2012 年頃を境に急激な発展を遂げており、基礎研究から応用研究まで、幅広く科学研究の手法として用いられるようになってきている。本研究では、DNN を用いた研究の、科学的実在論論争への含意について考察している。2022 年度
は、前年度までに投稿・リジェクトされていた科学の目的に関する論争への含意に関する論考を、最新の先行研究もふまえて大幅に改稿し、現在再投稿中。2021 年度に新たに取り組んだ機械学習技術による人間の認識能力拡張に関する考察は、当初は先述論文の一部とする予定であったが、サイズが大きくなりすぎたため、同一論文への収録は断念し、また ChatGPT など新たな技術革新もあったことから、現在扱いを検討している。
2. データ同化についての科学哲学的分析
気象学や海洋学においては、近年、データ同化と呼ばれる、データを用いてシミュレーションモデルの精緻化などを行う手法が盛んに用いられるようになってきており、他の諸分野においてもさらなる応用が期待されている。2022 年度は、引き続きシミュレーションの哲学に関する先行研究の調査を行った
ほかは、大きな進展はなかった。
3. モデル移転に関する予備調査
科学では、ある現象を記述するために導入されたモデルが他分野の現象へ転用されることがしばしばみられる。モデルを用いたアナロジカルな推論については、20 世紀後半から研究が行われてきたが、モデルの転用に関するより実践的な分析は、近年改めて脚光を集め始めている。本研究では、複雑適応系
進化学研究部門の予備調査として、「モデル移転（model transfer）」とよばれるこうした研究実践に関する先行研究の調査を行った。
4. 科学的実在論論争への認識論的アプローチのアップデート
博士論文研究で行った、科学的実在論論争の認識論的分析について、出版可能性を探るべく、近年の研究動向を反映しながら、適宜アップデートを行っている。

２. 教育• 担当授業1.
2.
3.

副論文入門（共同担当）
科学・技術と社会 II（分担）2.5 コマ
生命科学と社会 I（分担）6 コマ• 研究指導（副論文担当）
1.
2.
3.
4.
5.

桑野 友輔
山川 真徳
熊田 隆一
安家 叶子
高畑 優

46

• 全学教育1.

フレッシュマン・コース「研究者倫理」前期・後期 各 3 コマ

• 他大学等における授業1.
2.

東京電機大学にて「研究者倫理」（前期 12 コマ）
奈良先端科学技術大学院大学にて「科学哲学」（前期集中 8 コマ）

３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり）

該当なし
学術研究図書

該当なし• 学会発表学会発表

該当なし
企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

1.

2.

大西勇喜謙. 「科学とは何か〜科学哲学の視点から」日本科学振興協会（JAAS）キックオフ・ミーティング. ワークショップ２「『科学とはなにか』を改めて問う～異なる「科学」への視点を対話する～」6 月 20 日. オンライン開催.
Yukinori Onishi. “Comments on: Soohyun Ahn, “Creating and maintaining scientific categories:
Values and entrenchment.”” The 9th online event of the Asian Epistemology Network, May 27,2022.

• 外部資金1.

日本学術振興会 科学研究費 若手研究「科学的表象理論に基づく『データのモデル』の分析と科学的実在論論争への含意の検討」2018-2020 年度（延長）. 総額 3,250 千円 （研究代表）• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

47

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動1.

査読担当：Asian Journal of Philosophy• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
該当なし• 学術誌編集活動
該当なし

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

教育開発センター 教員選考委員• 部局委員会等への貢献
1.
2.

教務係
研究倫理相談委員会• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読付き）

1.

Sakamoto, T. (2023). Is Lottery a Better Way of Resource Distribution Than Baseline Funding?
Philosophy of Science, 1-40. doi:10.1017/psa.2023.49.

48

木下 充代（准教授：神経行動学、生理行動学、認知科学）
１. 研究テーマ
1. アゲハチョウのキノコ体を構成する神経
高次中枢にあるキノコ体は、感覚情報が入力する傘・キノコ体の内在神経（ケニオン細胞）の軸索が作る柄・出力領域の基部からなる。キノコ体は多くの昆虫で嗅覚の学習・記憶の中枢とされているが、ナミアゲハでは傘部に嗅覚に加え大きな視覚入力があることが特徴の一つである。これまでチョウ類のキ
ノコ体内の細胞構成について殆ど具体的な知見がないため、シナプシン／ファロイジン重染色・免疫組
織科学・色素注入などを組み合わせ、キノコ体を形作る神経群の特徴を調べた。その結果、傘部では嗅覚が入力する領域では、中心シナプシン・周辺ファロイジンで染め出されるマイクロ糸球体構造が顕著に見られた。一方、視覚入力部分にある同様の構造は、小さくファロイジンのシグナルが弱い傾向にあった。さらに GABA 抗体を用いた免疫組織化学実験では、基部から傘部に伸びる神経群を同定することができ、他の昆虫同様抑制のフィードバック経路がナミアゲハにもあることがわかった。続いて
FMRFamid 抗体では、柄と基部の一部が染まり、特定のケニオン細胞のみがこのペプチドを持つと考
えている。
また、
少数のキノコ体出力細胞・ケニオン細胞を染める方法を確立その形態を明らかにした。
特に出力系では少なくとも４経路を新たに同定でき、キノコ体を介した情報処理経路についての理解が大きく進んだ。
2. アゲハチョウ運動感受性神経の生理応答特性
視野の広い領域を覆う視覚刺激が動くとき、眼や頭部がその動きを追随するように動く反射行動を、動眼反応（オプトモーターレスポンス）という。この動眼反応は、多くの動物で共通する重要な視覚機能のひとつで、昆虫では第２・第３視覚中枢にある巨大運動感受性神経群が関与する。我々は、このうち
第２視覚中枢と大脳とを繋ぐ神経が、左右の複眼から入る情報を統合するのに働くことを示すため、左右の複眼への入力を制限しながら応答を細胞内記録法により観察した後、色素を記録細胞に注入その形態を同定した。記録した多くの神経は、横縞が上下方向のいずれかに興奮性を示す方向選択性を示し、いずれの神経も樹上突起がある第二次視覚中枢側の眼を刺激した時には、応答が見られなくなった。このことは、記録した神経が、大脳側の樹上突起で情報の入力を受け、第二次視覚中枢で出力するフィー
ドバック神経であることを示している。事実、第二次視覚中枢の樹上突起上には、多数の結び目のような膨らみがあった。神経の形態と応答のパターンから、これらの神経は少なくとも５種類あることがわかった。
3. アゲハ類の嗅覚系と嗅受容レセプター(OR)の雌雄差と多様性
アゲハチョウ類を中心に第一次嗅覚中枢を構成する糸球体構成を調べたところ、ナミアゲハではメスで顕著に大きくなる性的二型を示す糸球体が３つであるのに対し、モンキアゲハ３、クロアゲハ２、アオスジアゲハで１であった。またナミアゲハの触角を対象にゲノム解析とトランスクリプトーム解析を行ったところ、アゲハチョウの嗅受容レセプターは５８あり、そのうち３遺伝子はメスで発現量が多いことがわかってきた。一方オスで発現量の多いレセプターが６あり、そのうちひとつはカイコ蛾のフェロ
モン受容体と系統が同じであった。分子生物学的手法で同定された受容体の数や発現量に差のある遺伝子の数が、第一次嗅覚中枢の糸球体構成から明らかになってきたこととの間に一致が見られ興味深い結果となった。本成果は、大田准教授・渡邊助教との共同研究として行ったものである。
4. 三浦半島におけるアゲハチョウの花利用
アゲハチョウ類の訪花性と、環境との関わりを明らかにする研究基盤を構築するため、６月下旬から１０月までに採集したナミアゲハ５２個体とその他のアゲハチョウ（ジャコウアゲハ・モンキアゲハ・キ49アゲハ・ナガサキアゲハ・クロアゲハ）68 個体から体表花粉を集め、花粉の形態と DNA の種識別マ
ーカー領域を用いて花種の同定を行った。全ての個体から花粉を採集でき、ナミアゲハでは形態分析により７・８月はカラスザンショウ、８・９月はアメリカフロウとクサギの花粉をほぼ全ての多くの個体で同定した。またヤブカラシは初夏から秋にかけて多くの個体で同定できた。春先に多くの個体が採集できたジャコウアゲハでは樹木の花粉が多く同定されたのに対し、キアゲハで多く同定されたのは草本の花粉だった。これは、彼らの生息環境がそれぞれ森の中とオープンスペースと異なり、そこに分布する植物相が違うことを反映しているのだろう。

２. 教育• 担当授業1.
2.

ミクロ･マクロ生物学（２単位、行動分野 集中講義）
先導科学実習（２単位、実習）• 研究指導1.
2.
3.

南木 悠（主指導）「野外におけるアゲハチョウの訪花特性」
山田 優佳（副指導）「ウミウシの繁殖」
中井 喜隆（主指導）「ナミアゲハの性と季節型における脳の多様性」• 全学教育
該当なし• 他大学等における授業1.

北海道大学（１単位、集中講義）生物学特別講義 III「視覚の神経行動学」

３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり.＊印：責任著者）

1.

2.

Matsushita, A. Stewart, F. Ilić, M. Pei-Ju Chen, P. Wakita, D. Miyazaki, N. Murata, K. Kinoshita, M.
Belušič, G. Arikawa K.＊ (2022) Connectome of the lamina reveals the circuit for early color
processing in the visual pathway of a butterfly. Current Biology. 32, 2291-99.
Céchetto, C. Arikawa, K. Kinoshita M.＊ (2022) Motion-sensitive neurons activated by chromatic
contrast in a butterfly visual system. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological
Sciences 337, 20210277.

• 学会発表学会発表（＊は発表者）

1.

2.

Arikawa, K.＊ Wakita, D. Matsushita, A. Kinoshita M. The peripheral visual system of thebutterfly, Papilio xuthus. International Congress of Neuroethology, Lisbon 2022 年 7 月 24-29 日 現地開催
Céchetto, C.＊Arikawa, K. Kinoshita, M. Chromatic motion sensitive neuron in the yellow

50

3.
4.

5.
6.

Japanese swallowtail butterfly. International Congress of Neuroethology, Lisbon 2022 年 7 月 2429 日 現地開催
大田竜也＊，山上初音，志賀向子，木下充代．ナミアゲハにおける嗅覚受容体(OR)遺伝子の多様性およびその進化．日本進化学会 年大会 第 24 回沼津大会 2022 年 8 月 4-7 日 現地開催
Takahashi, N.＊ Namiki, S. Kinoshita, M. Neural organization of the mushroom body in theswallowtail butterfly. 日本比較生理生化学会 第 44 回高知大会 2022 年 11 月 21-25 日 現地開催Nakai, N.＊ Kinoshita, M. Innate color preference of different seasonal forms of swallowtail
butterfly. 日本比較生理生化学会 第 44 回高知大会 2022 年 11 月 21-25 日 現地開催
桂宗広＊，藤井航平，川村康平，蟻川謙太郎，木下充代，石川由希. 訪花生態を示すカザリショ
ウジョウバエはどのようにして花を認識するのか？日本生態学会 第70 回大会 2023 年3 月1721 日オンライン開催

企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

1.

Kinoshita, M. Visual world of flower foraging Papilio butterfly. Plenary talk, International Congressof Neuroethology, Lisbon 2022 年 7 月 24-29 日 現地開催

• 外部資金1.
2.
3.

科学研究費 基盤研究(B) 「昆虫の脳で「色」ができる仕組みーキノコ体経路における色情報処理―」研究代表者：木下充代 (2022)
統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ「三浦半島の多様な生態系におけるチョウの花利用と光環境適応」研究代表者：木下充代 (2022)
統合進化科学研究センター「複雑適応系進化学研究部門」プレリサーチ（追加配分）「三浦半島に生息する多様な訪花行動を示す鳥類における視覚と嗅覚の複合的適応」研究代表者：木下充代(2022)• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

４. 社会貢献• 学会活動51

1.
2.

日本比較生理生化学会 原富之賞審査委員会 会長
日本比較生理生化学会 評議員• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
1.

神奈川県立横須賀高等学校 スーパーサイエンスハイスクール事業 (Principia II) への参画

• 学術誌編集活動
1.
2.
3.

Journal Comparative Physiology A (Advisory board)
Zoological Science (Advisory board)
Frontier of Insect Science (Associate Editor)

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.

ハラスメント相談員
苦情処理相談員
遺伝子組換え実験安全委員
学術情報基盤センター本部図書館専門部会の葉山図書委員• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

アカデミックアドバイザー
スーパーサイエンスハイスクール(SSH)担当
フレッシュマンコース授業担当
入試出題
研究倫理相談委員会• 大学事業
該当なし

52

沓掛 展之（教授：動物行動学、行動生態学、霊長類学）
１. 研究テーマ
脊椎動物の社会行動・コミュニケーション・認知を、野外・実験状況下にて研究した。また、系統種間比較を用いた表現型進化の研究を行った。今年度は、哺乳類の社会交渉、行動伝染、採食行動、系統種間比較に関する論文などを発表した。

２. 教育• 担当授業
1.
2.
3.

ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「認知行動の進化」を担当）
先導科学実習（野外実習）
統合人類学（１単位、集中講義、１日分を担当）• 研究指導
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

杉田 あき （主任指導） 「ムササビの生態」
安家 叶子（主任指導、JSPS DC2） 「リカオンの社会行動」
西條 未来（主任指導）「鳥の対捕食者行動」
高畑 優（主任指導、JSPS DC2） 「エゾリスの都市生態」
山川 真徳（主任指導、SOKENDAI 特別研究員） 「ハダカデバネズミの行動」
佐々木 未悠（主任指導）「ニュウナイスズメの生態」
山田 優佳（主任指導） 「ウミウシの繁殖」
亀嶋 恵介（副指導） 「コミュニケーション」• 全学教育1.

統合進化学（１単位、集中講義、１日「Animal Behaviour」を担当）• 他大学等における授業
1.
2.

東京大学・理学部「霊長類学」（6/14 コマを担当）
京都大・ヒト行動進化研究センター 集中講義、「動物社会の行動生態学」Behavioral ecology ofanimal societies

３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.
2.

3.

Ake K, Kutsukake N. in press. Contagious yawning in African painted dogs. Animal Cognition
Kutsukake N, Teramoto M, Honma S, Mori Y, Ishida T, Hasegawa T. 2023. Changes in salivary
cortisol and testosterone levels in male chimpanzees during the process of reunion with groupmembers. acta ethologica. 26, 45-58.
Oka K, Yamakawa M, Kawamura Y, Kutsukake N, Miura K. 2023. The naked mole-rat as a model

53

for healthy aging. Annual Review of Animal Biosciences, 11, 207-226.
4. Iki S, Kutsukake N. 2023. Play face in Japanese macaques reflects the sender’s play motivation.
Animal Cognition. 26, 849-859
5. Takahata Y, Uchida K, Shimamoto T, Kutsukake N. 2023. Keeping treasure safe: Eurasian red
squirrels cache valuable food far from the food source with low canopy cover. Behaviour 160, 201216.
6. Ohkubo Y, Kutsukake N, Koizumi I. 2023. A novel phylogenetic comparative method forevaluating the strength of branch-specific directional selection. Evolution. 77, 63-82.
7. Harano T, Kutsukake N. 2022. Way to big cats: directional selection in body size evolution in living
felids. Journal of Mammalian Evolution 30, 1-12.
8. Sugita A, Shigeta M, Hayashi N, Okazaki H, Kutsukake N, Terai Y. 2022. Development of genetic
markers for sex and individual identification of the Japanese giant flying squirrel (Petaurista
leucogenys) by an efficient method using high-throughput DNA sequencing. Zoological Science.
40, 24-31.
9. Hase K, Kutsukake N. 2022. Plasticity for the kin and conspecific preferences in the frog tadpoles(Rana ornativentris). Animal Cognition. 25, 1653–1664
10. Nomano FY, Kutsukake N. 2022. Aggression induced by ornament similarity is limited to females
in a mutually ornamented fish, Betta brownorum. Animal Behaviour 190, 233-240.
学術研究図書

該当なし• 学会発表
学会発表

1.
2.
3.

4.

原野智広・沓掛展之 イタチ科における子のサイズと数のトレードオフに対して水生で作用する選択 日本動物行動学会第 41 回大会 博多 2022/11/22-24
工藤慎一・原野智広・沓掛展之・吉澤和徳 ツノカメムシ科の卵形状：メス親による防衛行動と卵形状の進化的相関 昆虫学会 82 回大会 2022 年 9 月 3 日～5 日 松本
関澤麻伊沙、沓掛展之 野生ニホンザルにおける他個体のアカンボウに接触する行動の機能と制約 第 38 回日本霊長類学会大会、第 76 回日本人類学会大会連合大会（ASN-PSJ 2022）2022
年 9 月 16～19 日、京都
佐藤駿・幸田正典・沓掛展之 顔で個体識別するディスカス Symphysodon aequifasciatus における
顔表情の社会的利益 魚類生態学研究会オンライン（宮崎大学）

企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

1.

Kutsukake N. Social trajectory and reproductive value in group-living mammals. Human
Sociality: comparative studies of social evolution and historical dynamics. Tohoku Univ.
2022/8/17-18. オンライン• 外部資金1.

基盤 B「真社会性哺乳類における個体差と対立への対処」、代表、1,350 万円• 外国人招聘54

総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

４. 社会貢献• 学会活動なし• 学外委員会活動なし• アウトリーチ活動
1.

沓掛展之 動物行動学・ひらめきクイズ：研究するための思考法 生命共生体進化学専攻 講演会・説明会 2022/5/14、オンライン• 学術誌編集活動
1.
2.
3.

Primates, Editorial Board (2021-)
Journal of Ethology, Associate Editor (2011-)
Biology Letters, Editorial Board (2016-)

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.

先導科学研究科⻑
教育研究評議会
運営会議
個人情報保護委員会
危機管理委員会
環境安全管理協議会
財務・マネジメント委員会
不正防止計画室会議
全学教育委員会
SOKENDAI 賞選考委員会
全学評価委員会

55

12.
13.
14.
15.
16.
17.

発明委員会
知的財産室
学術情報基盤センター運営委員会
部局情報セキュリティ委員会
附属図書館運営委員会
動物研究検証委員会• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.

センター化計画ワーキンググループ
統合進化科学研究センター運営委員会
過半数代表補佐
研究倫理相談委員会• 大学事業なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.
2.
3.

関澤 麻伊沙（先導研・特別研究員）
佐藤 俊（JSPS PD）
戸田 和弥（JSPS PD）

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）

1.

2.
3.

4.

5.

Saeki T, Satoh S, Frommen JG, Kohda M, Awata S (2022) Kin-structured cooperatively breedinggroups due to limited dispersal in the obligate shell-brooding cichlid Neolamprologus meeli.
Behavioral Ecology and Sociobiology 76, 1-17.
Satoh S, Saeki T, Kohda M, Awata S (2022) Cooperative breeding in Neolamprologus bifasciatus, acichlid fish inhabiting the deep reefs of Lake Tanganyika. Ecology of Freshwater Fish 31, 640-649.
Kohda M, Sogawa S, Jordan AL, Kubo N, Awata S, Satoh S, et al. (2022) Further evidence for thecapacity of mirror self-recognition in cleaner fish and the significance of ecologically relevant marks.
PLoS Biology 20, e3001529.
Toda K, Mouri, K, Ryu H, Sakamaki T, Tokuyama N, Yokoyama T, Shibata S, Poiret M-L, Shimizu,
K, Hashimoto, C, Furuichi T. (2022). Do female bonobos (Pan paniscus) disperse at the onset ofpuberty? Hormonal and behavioral changes related to their dispersal timing. Horm. Behav.142,
105159.
Toda K, Furuichi T. (2022). Do immigrant female bonobos prefer older resident females asimportant partners when integrating into a new group? Primates 63, 123–136

学術研究図書なし
研究室構成員による外部資金

1.

佐藤駿、基盤 C「種間比較に基づくカワスズメ科魚類の兄弟間対立を取り巻く生活史進化の解明」143 万円

56

2.
3.

関澤麻伊沙 若手「野生霊長類において乳児に接触する経験が個体の内部状態・適応度に及ぼす影響」150 万
戸田和弥 若手「ボノボの非血縁メス間の高い凝集性に関する生理・社会学的メカニズムの解明」
370 万研究室構成員の受賞

1.
2.

佐藤駿、2022 年度日本魚類学会賞（論文賞）受賞
西條未来 第一回日本動物行動振興奨励賞、受賞

57

五條堀 淳（講師：自然人類学、分子進化学、集団遺伝学）
１. 研究テーマ
1. 古代ゲノムを用いた東アジア人の成立の過程の解明
東アジア地域では一般に土壌の条件と気候から、古人骨が発掘されにくく、また古人骨に残存している
DNA も多くはない。次世代シーケンサの登場と DNA 抽出技術の進歩により、日本を含めた東アジア
地域から出土される人骨から、全ゲノム塩基配列決定を行うことも可能になった。ゲノムの遺伝情報から、現代人と古代人のつながりや、時空間的な広がりの様子を明らかにすることができる。この研究では、旧石器時代、縄文時代、弥生時代の人骨からそれぞれ DNA を塩基配列を決定することで、東アジア人の成立の過程を明らかにすることを目的としている。
また現代日本人集団約2,000 人のデータから、古代人との遺伝的関連や、日本列島における古代人ゲノムの寄与の地域差を明らかにする。本研究は京大、関西医科大、東大、東邦大、中国杭州師範大学、農研機構、産総研との共同研究である。
2. 絶滅したニホンオオカミの遺伝的特性をゲノムから明らかにする。
ニホンオオカミは明治時代に絶滅した日本列島の本州に分布していたオオカミである。ニホンオオカミの標本や骨から DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。タイプ標本であるオランダのライデ
ンの剥製標本からも DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。また日本犬のゲノムも複数の個体について全ゲノム塩基配列を決定した。これらの結果と、先行研究で発表されている様々な犬種やハ
イイロオオカミ、古代のイヌやオオカミの全ゲノム塩基配列を比較することで、ニホンオオカミ集団の遺伝的位置づけや、ハイイロオオカミやイヌとの関連を明らかにする。本研究は先導研寺井先生、先導研本郷先生と岐阜大学との共同研究である。

２. 教育• 担当授業1.
2.

ミクロ･マクロ生物学（２単位、集中講義、「自然人類学、進化遺伝学」を担当）
先導科学実習（２単位、集中講義、「分子生物学」を担当）• 研究指導1.
2.

青野 圭（副指導）「琉球列島におけるイノシシとヒトの関係」
知久 彩楓（副指導）「地域特異的な自然選択のヒトゲノム進化への影響 ― CYP1A2 とネアン
デルタール・デニソワのゲノム流入を例として ―• 全学教育1.
2.

フレッシュマンコース（２単位、「研究者のための“伝える”技術２：プレゼンテーション」を担当）
統合進化学（１単位、「Human Evolution Genetics, Adaptation, and Environment」を担当）• 他大学等における授業
該当なし

58

３. 研究• 学術出版物
原著論文（査読あり）

該当なし
発表論文（査読なし）

五條堀淳「RFMIX」Yaponesian 第 4 巻あき号 pp.10-11
学術研究図書

該当なし• 学会発表学会発表1.

五條堀淳「複数個体のニホンオオカミゲノムを用いた集団遺伝学的解析」第 4 回ヤポネシアゲノ
ムくにうみミーティング. 2023/3/1-3 淡路夢舞台国際会議場

企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

該当なし• 外部資金1.
2.

文部科学省: 新学術領域研究(研究領域提案型) 計画研究「ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析」研究代表者:長田直樹 研究分担者:五條堀淳（2018-2022）総額 49,140 千円
学術振興会: 基盤研究 B「古代 DNA と骨格形態から探る、東アジアにおけるイヌの家畜化と日本列島への導入」研究代表者：本郷一美 研究分担者：五條堀淳（2022-2024）総額 17,290 千円• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

59

４. 社会貢献• 学会活動1.

進化学会 2024 年神奈川大会実行委員• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
該当なし• 学術誌編集活動
1.
2.
3.

Molecular Biology and Evolution 誌 Academic Editor
PLOS ONE 誌 Academic Editor
iDarwin 誌 Academic Editor

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

化学物質適正管理委員会• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.

試薬管理担当実験排水管理センター広報• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.

西山 久美子（先導研・特別研究員）

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）

なし
学術研究図書なし
研究室構成員による外部資金

1.

西山久美子、上廣倫理財団研究助成「進化学・遺伝学の基礎研究領域に見られる障害学との概念的親和性の考察」60 万円

60

研究室構成員の受賞なし

61佐々木 顕（教授：数理生物学、理論進化学）
１. 研究テーマ
適応進化の理論的研究① 宿主・病原体系の多様化を伴う適応進化の一般理論や、「同所的・側所的・異所的種分化」の包括理論を可能にする「多峰分布量的形質遺伝学」(Oligomorphic dynamics)の論文を Sébastien Lion 博士(モンペリエ), Mike Boots 博士(UC バークレー)と共同研究している。成果は Sasaki, Lion, Boots(2022, Nature Ecol Evol), Lion, Boots, Sasaki (2022, American Naturalist), Lion Sasaki Boots (2023,
Ecology Letters)に発表した。
② 病原体の免疫逃避と宿主免疫系の共進化について、免疫逃避を表現型空間上の進行波として捉える
理論的研究を行っている。成果は上述の Sasaki, Lion Boots (2022, Nature Ecol Evol)の他、Kumata
and Sasaki (2022, Proc R Soc B)に発表した。
（プレスリリース：免疫不全宿主の存在がウイルスの免
疫逃避を加速する https://www.soken.ac.jp/news/2022/20221122.html, 免疫やワクチンからの逃 避 を 繰 り 返 す 病 原 体 は 高 い 病 原 性 を 進 化 さ せ る
https://www.soken.ac.jp/news/2021/20220117.html）。
③ メタ個体群における移動分散や生産性の不均一性が病原体の毒性の進化にどのような影響を与えるかについて、メタ個体群進化動態の摂動理論を開発することによって調べることにより、移動分
散や生産力の不均一性が進化的に安定な毒性を必ず上昇させるという一般的な法則性を見出した（Sato, Dieckmann, Sasaki, submitted）④ 適応進化する分類群の進化動態の解析により、ある分類群のニッチ空間の中心域での種分化のホッ
トスポットが出現することや、ニッチ空間辺境において「生きた化石」種が必然的に出現することなどを明らかにした(Ito and Sasaki, American Naturalist, minor revision)⑤ 寄生系においては宿主と寄生者の形質の進化や共進化は、系の存続を促進する方向に働くのに対し(進化的救助)、相利共生系においては、形質の共進化が、共生する種すべてをもろとも絶滅を導く傾向をもつ（進化的心中）という一般的な傾向を個体群動態と進化動態の結合理論によって明らかにした。成果は Uchiumi, Sato and Sasaki (2022, Ecology Letters)に発表した。
⑥ ウイルスの「細胞接触感染」(cell-to-cell infection)が、抗ウイルス剤に対する多剤抵抗性の進化を促進することを、集団遺伝学の細胞レベルと個体レベルのマルチレベル淘汰モデルを用い、ウイルスの遺伝子型頻度動態の killing process を持つ拡散近似の解析で明らかにした。成果は Saeki and
Sasaki (2023, Virus Evolution)に発表した。
⑦ 動物やヒトの順次意思決定系における「集団知」の効率や「情報カスケード」（意思決定の独立性の喪失による集団知の劣化）リスクの評価についての理論的解析により、判断能力の高い個体が先に意思決定することは、集団知の効果を劣化させることなどを示す「決定票定理」を明らかにした。
成果は Ito and Sasaki (2023, PLOS ONE)に発表した。
⑧ 海藻の「子育て」(メス配偶体上に付着する子 gametophyte への投資)における「雌雄対立」の進化の理論解析により、際限のないオスによる搾取のランナウエイと、オスメス間の妥協平衡状態へそ
れぞれ進化する条件を明らかにした(Bessho and Sasaki, submitted)。
⑨ 遺伝子組み換え作物(BI 作物)や殺虫剤散布に対する食害昆虫の抵抗性出現を阻止するために国際的に採用されている強散布/保護区戦略の理論的な再検討を行い、抵抗性発達を遅らせるために、昆虫の生活史のどの段階での散布が望ましいか、散布強度によって操作可能なヘテロ接号体の抵抗性のdominanceの程度や、保護区の規模の効果の理論的解明を進めている(Suzuki and Sasaki, in prep)。
⑩ 下水で測定される新型コロナウイルスゲノム濃度の時系列データから、その流水域における感染動
態をどう予測するか、あるいはその逆に流行時系列データから下水でのゲノム濃度時系列をどう予

62

測するかの双方向予測の疫学モデルを構築するとともに、横浜市のデータを用いて検証を行なっている(Sasaki, Ohtsuki, Ozawa, Yoshida, submitted)⑪ 南極淡水湖沼のような極限的に貧栄養な環境において、分解者（バクテリア）と生産者（シアノバ
クテリア・藻類）による群集への一次遷移の過程を、制限元素である窒素の循環動態と個体群動態を結合したモデルで解析し、同じパラメータのもとでも初期にフンや死骸として投入された有機窒素の量に応じて、異なる群衆への遷移が起こることなどを明らかにした(Sasaki, Tanabe, Mizuno,
Kudo, submitted)

２. 教育• 担当授業
1.
2.
3.

ミクロ・マクロ生物学 （２単位、集中講義、「理論生物学」を担当）
生物統計学
数理生物学特論• 研究指導1.
2.
3.

桑野 友輔（主任指導） 「変動環境下の休眠の進化」
熊田 隆一（主任指導, JSPS DC1） 「ウイルスと宿主免疫の進化」
森田 慶一（主任指導, 理研 JRA/JSPS DC2） 「繁殖干渉と種分化」• 他大学等における授業
なし

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.
2.
3.
4.

5.
6.

7.

Koichi Saeki, Akira Sasaki. Cell-to-cell transmission promotes the emergence of double-drugresistance. Virus Evolution https://doi.org/10.1093/ve/vead017 (2023).
Mariko Ito, Akira Sasaki. Casting votes of antecedents play a key role in successful sequential
decision-making. PLOS ONE 18(2): e0282062 (2023).
Sébastien Lion, Akira Sasaki, Michael Boots. Extending eco-evolutionary theory witholigomorphic dynamics. Ecology Letters 2023:00: 1-25 (2023).
Ryuichi Kumata, Akira Sasaki. Antigenic escape accelerated by the presence of
immunocompromised hosts. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 289:
20221437 (2022).
Yu Uchiumi, Masato Sato, Akira Sasaki. Evolutionary double suicide in symbiotic systems.
Ecology Letters 26: 87-98 (2022).
Kouji Ishikawa, Tomohisa Kuroda, Takeshi Hori, Daisuke Iwata, Seijiro Matsuzawa, Jun
Nakabayashi, Akira Sasaki, Taketo Ashizawa. Long-term blast control in high eating quality riceusing multilines. Scientific Reports 12(1): 14880 (2022).
Sébastien Lion, Mike Boots, Akira Sasaki (2022) Multi-morph eco-evolutionary dynamics instructured populations. American Naturalist 200(3): 345-372

63

学術研究図書

該当なし• 学会発表学会発表

1.

佐々木顕 協働して侵入する２種（２エージェント）の進行波速度 第 70 回日本生態学会年会
2023 年 3 月 17-21 日
2. 内海邑、佐藤正都、佐々木顕 ゲノムコンフリクトによる胚乳の進化 第 70 回日本生態学会年会 2023 年 3 月 17-21 日
3. 森田慶一，大槻久，佐々木顕 繁殖干渉が近縁種間の形質多様性に与える影響、第 70 回日本生態学会年会 2023 年 3 月 17-21 日
4. 熊田隆一、大槻久、佐々木顕 ウイルスの利己性進化：サテライトウイルスはいつ進化するか？
第 70 回日本生態学会年会 2023 年 3 月 17-21 日
5. 佐々木顕 ガン細胞の免疫逃避と進行波：交差免疫と幹細胞エスケープの効果 第 32 回日本
数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
6. 伊藤真利子、佐々木顕 キャスティングボートが最適な逐次意思決定の鍵を握る 第 32 回日
本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
7. 森田慶一、大槻久、佐々木顕 繁殖干渉が近縁種間の形質多様性に与える影響 第 32 回日本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
8. 渡部 輝明、佐々木顕、多様性が抑制された連続抗原変異を行うウイルスの抗原多様性と進化速度 第 32 回日本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
9. 別所和博、佐々木顕、haploid-diploid 生物における配偶体による 胞子体の養育についての数理
モデル 第 32 回日本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
10. 熊田隆一、佐々木顕 免疫不全患者存在下でのウイルス抗原進化の促進 第 32 回日本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
11. 桑野友輔、佐々木顕 蚊の温帯における日長・気温・土壌含水率依存の卵休眠・休止戦略の進化
第 32 回日本数理生物学会大会 2022 年 9 月 5〜7 日
企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

1.
2.

3.
4.

R0 概念と適用範囲の拡張（メタ R0 と R0 中心性）について -- 稲葉寿教授退職記念・竹内康博
教授退職記念 with delay , 2023 年 3 月 22 日, 11:00-11:40, 東大駒場
“Mathematical Models Describing Evolutionary Immune Escapes of Pathogens” ReaDiNet 2023:
International conference on parabolic and stochastic models in mathematical biology, January 3-6,2023.
抗原エスケープが進化させる病原体の高い感染性と毒性 第 45 回日本分子生物学会年会ワークショップ 2022 年 11 月 幕張メッセ
下水のコロナウイルス調査で感染者数を推計する方法について 第 81 回日本公衆衛生学会総会
2022 年 10 月 7 日 甲府

• 外部資金1.

科学研究費補助金・基盤研究(B) 「進化疫学の新概念「メタ R0」を用いた病原体の免疫逃避プロ
セスの研究」(2023 年度〜2025 年度、総額 1,400 万円) 研究代表者 2023 年度直接経費：380 万

64

2.

3.

円
令和５年度厚生労働行政推進調査事業費補助金（新興・再興感染症及び予防接種政策推進研究事業）「環境水に含まれる新型コロナウイルス等病原体ゲノム情報の活用に関する研究」、研究課
題：「数理モデルを用いた下水ウイルス量と感染者数の双方向予測研究」（2023 年度、分担者配分額総額 950 万円）、研究分担者、2023 年度分担者配分額 950 万円
科学研究費補助金・挑戦的研究（萌芽）「R0 中心性に基づく大規模階層ネットワーク上の流行動
態・防除理論の新展開」 (2019-2022 年度、総額 650 万円) 研究代表者 2023 年度直接経費：
250 万円• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

４. 社会貢献• 学会活動なし• 学外委員会活動
1.
2.

JST 創発的研究支援事業 事前評価 外部専門委員
日本学術振興会科学研究費委員会専門委員• アウトリーチ活動
1.
2.
3.

「新型コロナウイルスが免疫に耐性を持つよう変異する仕組み、総合研究大が解明」日刊工業新
聞「ニュースイッチ」2022 年 11 月 29 日 https://newswitch.jp/p/34784（プレスリリース）免疫不全宿主の存在がウイルスの免疫逃避を加速する
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20221122.html（プレスリリース）生態系における種を超えた協力関係は絶滅へ向かう逆説的な適応進化をもた ら す〜 相 利 系 が 絶 滅 に 至 る 新 た な 脆 弱 性 の 発 見 〜
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20230210.html

65• 学術誌編集活動
1.

Journal of Theoretical Biology, Co-Editor in Chief (2020-)

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.
5.
6.

生命共生体進化学専攻長
教育研究評議会評議員
学長選考委員会委員
財務マネジメント委員会会員
ハラスメント協議会委員
生命共生体進化学専攻入試委員長• 部局委員会等への貢献
1.
2.

共働プログラムワーキンググループ
統合進化科学研究センター運営委員会• 大学事業なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.
2.
3.

伊藤 洋（先導研・特別研究員）
鈴木 清樹（先導研・特別研究員）
大槻 亜紀子（先導研・連携研究員）

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）
学術研究図書なし
研究室構成員による外部資金1.

熊田 隆一 JSPS DC1 特別研究員奨励費「メタトランスクリプトーム解析による原因不明疾患
関連ウイルスの網羅的探索と解明」 (2021-2023) 220 万円

研究室構成員の受賞

1.

桑野 友輔 第 32 回日本数理生物学会大会ポスター賞受賞

66颯田 葉子（教授：生理進化学、ゲノム遺伝学）
１. 研究テーマ
1. 旧人の異種間浸透がいつどこで起きたか？
ネアンデルタール人やデニソワ人と現生人類が交雑をして、現生人類がネアンデルタール人やデニソワ
人ゲノムを数％を受け継いでいるということはよく知られた事実である。しかし、ネアンデルタール人やデニソワ人との交雑は一様ではなく、それぞれ特徴を持っている。特にデニソワ人では、3 回（現在は 4 回目があったという報告もある）のそれぞれ異なるデニソワ系統からの浸透が確認されている。この 3 回の浸透に関与したデニソワ系統は D0, D1, D2 と区別されている。D2 の浸透によるゲノム断片は東アジア、南アジア、シベリア、アメリカ先住民など広くアジアの集団に観察されている。それに対して、D1 はパプアニューギニアをはじめとするオセアニア集団に、また D0 は日本・中国をはじめとする東アジア集団に特異的に観察される。これら、3 回の浸透がどこで、いつ起きたのかについて、明らかにすることを試みている。現在までに、現生人類の集団や古 DNA を用いて、どの集団にどれだけのデニソワの浸透があったのかを、D0,D1,D2 の区別をして定量的に記述することをおこなっている。また、それと同時に、現生人類集団での D0,D1,D2 のそれぞれの要素がゲノムのどの部分に入っているかを marker に現生人類集団の分岐や移動経路を復元することも試みている。
2. ヒトのゲノムに刻まれた環境変化への適応
ヒトの疾病に関わる遺伝子の SNP（疾病 SNP）の多くが他の霊長類で保存されている祖先型であることがあきらかになっている。これらの SNP がヒトの疾病と関わるようになったのは、ヒト特異的な環
境変化がその引き金となり、ヒトで新たに疾病抵抗性 SNP が出現したという仮説の元に、疾病 SNP と疾病抵抗性 SNP の分岐年代や疾病抵抗性 SNP の正の自然選択の可能性等について解析している。独自に開発した 2DM SFS (two dimensional site frequency spectrum)法を用いた解析を行った。特に、胃がんの非リスク SNP に働く自然選択の働き方が、集団、時間により異なることを明らかにしたので、この結果を現在まとめて論文投稿を行い、査読結果に基づき改訂後、再投稿した（2023年4月にHeredityに受理された）。この研究はポスドクとの共同研究である。
九州大学、
国立遺伝学研究所の共同研究者とともに、精神疾患に関連した遺伝子の進化を調べているが、遺伝子の転写活性の程度がヒトの脳の発達と社会性の発展に伴い自然選択のターゲットとなったことを議論した論文が 2021 年度に国際誌に掲載された。現在この研究を発展させた論文の投稿の準備をしている。
3. ニワトリの家禽化プロセスの研究
これまでニワトリで、過剰な色素沈着のみられる Fibromelanosys という突然変異が固定したインドネ
シアの Ayam Cemani という系統の進化と起源を解明する試みを行ってきた。Fibromelanosys の表現型の特徴の一つとして、羽の色が黒色になることが知られている。現在世界には、羽が黒色のニワトリの系統が多くあるが、全ての系統が Fibromelanosys ではない。Fibromelanosys の遺伝的原因は
END3(Endothelin 3)を含む断片が、逆位を伴い重複したことによる。この重複を PCR とその後の制限酵素処理でできる断片の大きさで見分ける方法をインドネシア科学院、横浜市大の研究者と共同研究で開発した。この成果を国際誌に投稿し、現在査読結果待ちである。この方法を用いることで、特にインドネシアの養鶏農場での Ayam Cemani の系統保存が効率的に行われることが期待される。

67

4. その他の共同研究
2 年前に学位を授与した学生との共同研究で、ヒトの聴覚関連遺伝子の進化の過程が、特に社会制度や医療の発達による機能的制約の緩みの影響をどのように受けたかを明らかにするプロジェクトを遂行
する。

２. 教育

• 担当授業1.
2.

ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義）
生理進化学（１単位、集中講義）• 研究指導1.
2.

長田 美沙（主任指導）「汽水域と浅海の異なる光環境への魚類視覚の適応」
知久 彩楓（主任指導）• 全学教育1.

統合進化学（２単位、集中講義）• 他大学等における授業1.

北里大学にて遺伝学（後期）を担当（2022 年 9 月〜2023 年 1 月）

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

なし
学術研究図書なし• 学会発表
学会発表

1.
2.
3.
4.

5.

颯田葉子「乳糖分解酵素に働く自然選択とヒトの移動」日本遺伝学会第 94 回 札幌大会（オンライン）（2022 年 9 月 15 日）
颯田葉子「現生人類に浸透した旧人ゲノム検出の簡便法」日本進化学会第 23 回 沼津大会（2022
年 8 月 6 日）
岩﨑理紗、颯田葉子「胃がん関連遺伝子 PSCA に見られるヒト集団間の正の自然選択ターゲッ
トの多様性」 日本進化学会年大会 第 24 回沼津大会 沼津開催（2022 年 8 月 6 日）
岩﨑理紗、颯田葉子「胃がん関連遺伝⼦PSCA に⾒られるアジア集団の正の⾃然選択ターゲットの多様性」第 76 回日本人類学会大会・第 38 回日本霊長類学会大会連合大会 京都開催（2022
年 9 月 17 日）
Risa L. Iwasaki and Yoko Satta "Spatial and temporal target changes of advantageous haplotype(s)

68

6.

at a gastric cancer-associated gene, PSCA" SMBE everywhere GS6（2022 年 11 月 22 日リアルタ
イム発表、これらをオンライン配信）
岩﨑理紗、颯田葉子「胃がん発症関連領域における正の自然選択の様相に関する検討」第 4 回ヤ
ポネシアゲノムくにうみミーティング 淡路島開催（2023 年 3 月 2 日）

企画したシンポジウム等

1.
2.

「統合進化科学研究センター開所記念シンポジウム」2023 年 2 月 28 日 9:30 〜 16:30
第 2 回 葉山セミナー ”Phenome-wide association studies of deleterious variants in the Han
Taiwanese people” Dr. Wen-Ya Ko, Associate Professor of National Yang Ming Chiao Tung
University, Taipei, Taiwan 2022 年 8 月 24 日 13:30 〜 15:00 オンライン配信

基調講演・招待講演

1.

颯田葉子「ヒトの正の自然選択」第 46 回人類遺伝学会 東京大会 シンポジウム 16「ヒトの進化と自然選択」（2022 年 12 月 17 日）• 外部資金なし• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

1.

Dr. Wen-Ya Ko, Associate Professor of National Yang Ming Chiao Tung University, Taipei, Taiwan

総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

４. 社会貢献• 学会活動1.
2.

日本進化学会会長
日本遺伝学会評議員• 学外委員会活動
1.
2.
3.
4.

日本遺伝学普及会評議員
日本遺伝学会評議員
公益信託進化学振興木村資生基金運営委員
ADRC (Asian DNA Repository Consortium) のメンバー

69

5.
6.
7.
8.

山田科学振興財団研究助成第１次審査委員
第 37 回京都賞基礎科学部門審査委員会委員
国立研究開発法人科学技術振興機構 創発的研究支援事業 事前評価外部専門家
日本学術振興会審査第１部会第 45 小委員会科学研究費委員会専門委員• アウトリーチ活動
1.

「霊長類学の百科辞典」の執筆・編集• 学術誌編集活動
1.
2.
3.
4.

Molecular Biology and Evolution, Associate Editor
Genome Biology and Evolution, Associate Editor
Scientific Reports, Senior Editor
Genes and Genetic Systems (GGS), Associate Editor

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.
5.
6.

統合進化科学研究センター運営委員会「人を対象とする研究」倫理審査委員会（委員長）
動物研究検証委員会（委員長）
遺伝子組み換え安全委員
化学物質適正管理委員会（委員長）
環境安全管理協議会（オブザーバー）• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

副専攻長
統合進化科学研究センター 副センター長
試薬管理担当実験排水管理担当
廃棄物管理担当• 大学事業1.
2.

統合進化科学研究センター運営委員会委員
安全環境協議会の環境安全協定書の別表及び別紙の書き換えを行った。

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.

岩﨑 理紗（先導研・特別研究員）

70

田辺 秀之（准教授：分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学）
１. 研究テーマ
様々な生物種に由来する細胞試料を用いて、染色体ゲノム進化学的な観点から、分子細胞遺伝学的なアプローチ（マルチカラーFISH 法、2D-/3D-FISH 法）を駆使して、以下のテーマに取り組んでいる。
1. 染色体テリトリーの核内配置分子基盤に関する研究
テナガザルにおける急速な染色体進化に着目し、ヒト染色体の R/G バンド各領域における進化的転座
切断点（Breaks of Synteny; BOS）
、LAVA 反復配列に着目した 2D-/3D-FISH 法により、eHAP1 細胞を用いた既存モデルの検証を行うとともに、新規に霊長類 iPS 細胞株を用いた共同研究を開始した。
2. マウス受精卵・初期胚および異種間ハイブリッドにおける染色体テリトリー・遺伝子領域の空間配置
解析
マウス異種間ハイブリッド細胞における核型分析、マルチカラーFISH 法による染色体解析、マウス初期胚の 3D-FISH 法に適したチャンバーグラス（EASI-FISH chamber）を用いた遺伝子空間配置解析を行った。
3. ヒト 21、18、13 トリソミー細胞における染色体テリトリーの核内空間配置解析
ヒト 21、18、13 トリソミー由来の各種細胞株および 21 トリソミー関連 iPS-アストロサイト分化誘導系
を用いて、2D-/3D-FISH 法による各種染色体テリトリーの核内空間配置解析解析を行った。
4. 遺伝子水平伝搬に関するに爬虫類、両生類を用いた分子細胞遺伝学的研究
ヘビからカエルへ遺伝子水平伝搬した LINE トランスポゾン（Bov-B）の起源と進化を探ることを目的として、アオダイショウ、ブラーミニメクラヘビの染色体標本を用いた 2D-FISH 法による解析を行った。
5. カンガルー類における反復配列 DNA の染色体動態に関する研究
カンガルー類における 2 種類のメガサテライト反復配列 DNA（kervRep、walbRep）の染色体動態に関して、2D-FISH 法による解析を行った。
6. 脊椎動物、無脊椎動物各種由来のバイオリソースとしての細胞資源化に関する研究
希少生物種由来のバイオリソースとしての各種細胞の収集・樹立・染色体標本作製、既存資料の整備を行った。現代人ヒト集団稀少サンプル DNA（宝来コレクション）を活用した分子人類学的研究を推進
した。

２. 教育

• 担当授業
1.
2.
3.

ミクロ・マクロ生物学（進化生物学分野「生体物質と細胞・遺伝情報の発現・タンパク質」を担当）
先導科学実習（「細胞組織科学」を担当）
統合生命科学 統合進化学（“Chromosome organization, dynamics, and evolution”を担当）

71

• 研究指導1.

ローテーションにて、ヒト腫瘍細胞株の細胞培養、染色体標本作製、核型分析、FISH 法による染色体解析を通じて、蛍光顕微鏡を用いた観察実験等に関する研究指導を実施した。

• 全学教育1.

フレッシュマンコース（オンライン）にオブザーバーとして参加• 他大学等における授業
該当なし

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.

Kambayashi C, Kakehashi R, Sato Y, Mizuno H, Tanabe H, Rakotoarison A, Künzel S, Furuno N,
Ohshima K, Kumazawa Y, Nagy ZT, Mori A, Allison A, Donnellan SC, Ota H, Hoso M, Yanagida
T, Sato H, Vences M, Kurabayashi A (2022) Geography-dependent horizontal gene transfer fromvertebrate predators to their prey. Molecular Biology and Evolution 39: msac052. doi:
10.1093/molbev/msac052.

学術研究図書1.

田辺秀之：第 4 章 霊長類の遺伝 4-11 染色体・クロマチン構造の多様性 In: 日本霊長類学会編：
霊長類学の百科事典（印刷中）丸善出版 東京 (2023).

• 学会発表
学会発表

1.

2.

神林千晶、大岩寛之、グラブ=ケドカー、ダルシャニ=マハールポタ、アンスレム=デ=シルバ、
太田英利、森哲、田辺秀之、小倉淳、倉林敦：ブラーミニメクラヘビにおける全ミトコンドリア
ゲノム核移行現象の実証と親種系統の探索、日本爬虫両棲類学会第 61 回沖縄大会、2022 年 11月
Akihiko Koga, Hirohisa Hirai, Roscoe Stanyon, Hideyuki Tanabe, Ornjira Prakhongcheep,
Kornsorn Srikulnath (2023) Evolution of the microlens structure in photoreceptor cells clarified
through owl monkey studies. 1st International Animal Genomics and Bioresource for ESG & SDG
seminar, Kasetsart University, Bangkok, Thailand, March 2023

企画したシンポジウム等

1.
2.
3.
4.

「ゲノム・エピゲノム編集技術を応用した分子遺伝学的研究の最前線」 日本遺伝学会第 94 回
大会ワークショップ、2022 年 9 月（北海道大学）
一般財団法人 染色体学会第 73 回年会（オンライン） 年会長として全体の企画運営に携わる「染色体の構造・機能・進化」“Structure, Function, and Evolution of the Chromosome” 染色体学会第 73 回年会 シンポジウム、2022 年 10 月
「生物多様性研究とこれからの博物学」 染色体学会第 73 回年会 公開講演会、2022 年 10 月

72

基調講演・招待講演

1.
2.

2022 年度 染色体学会賞「3D-FISH 法による染色体テリトリーの核内配置情報に基づく「染色体構築学」の確立と多様な生物科学分野への貢献」
染色体学会第 73 回年会 学会賞受賞講演、2022 年 10 月

• 外部資金1.

2.
3.

日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）一般「マダガスカルでの遺伝子水平伝播パン
デミックとヘビによる世界的な伝播因子拡散の実証」研究代表者：倉林 敦 研究分担者：田辺秀之（2018〜2023）
日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（A）一般「縄文人 iPS 細胞の構築とその応用に向けた研究」研究代表者：太田博樹 研究分担者：田辺秀之（2021〜2025）
日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（C）一般「受精卵におけるヒストン H2A.Z 除去機構の解明とリプログラミング支援技術の開発」研究代表者：三谷 匡 研究分担者：田辺秀之（2021〜2024）• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
1.
2.

2022 年度 染色体学会賞：田辺秀之「3D-FISH 法による染色体テリトリーの核内配置情報に基づく「染色体構築学」の確立と多様な生物科学分野への貢献」
2022 年度 染色体学会 Best Presentation 賞：原 一矢、田辺秀之、白澤健太、磯部祥子、津坂宜宏、櫻井美希、菊池真司：ホソバオケラにおける 2 種類の B 染色体の形態的特徴と配列決定

４. 社会貢献• 学会活動1.
2.
3.
4.

一般財団法人 染色体学会 理事長
一般財団法人 染色体学会 遺伝学用語検討委員会委員長・将来構想委員会委員長
一般財団法人 染色体学会 生物科学学会連合担当
APCC（アジア太平洋染色体コロキウム）国際組織委員• 学外委員会活動
1.

ATRC (Asian DNA Repository Consortium) のメンバー

73• アウトリーチ活動
該当なし• 学術誌編集活動
1.

一般財団法人 染色体学会 Chromosome Science 誌 動物医学分野 編集長

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

安全衛生委員会• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.

人を対象とする研究倫理審査委員会
遺伝子組換え実験安全委員会
化学物質適正管理委員会• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
1.
2.

日本人類遺伝学会 臨床細胞遺伝学 指導士・認定士（2023～2028）
Archivio per l'Antropologia e la Etnologia Advisory Board

74蔦谷 匠（助教：自然人類学、生物考古学、霊長類生態学）
１. 研究テーマ
1. 生物考古学
遺跡から発掘された古人骨や動物骨を分析し、過去の人類や動物の生きざまを調べている。
特に、出産、子育て、食べ物、死亡に注目している。これらは生物集団の人口動態や健康状態を決定する重要な要因である。どのような文化や自然環境のもとで人類や動物の生きざまが決まり、それが進化適応や社会情
勢にどう影響していくかまでを明らかにすることを目指している。
安定同位体分析や古代プロテオーム分析や古代ゲノム分析によって、遺物に残された微量の分子を調べ、そうした証拠をもとに、すでに観察することもできなくなった過去の生命現象を明らかにしている。
考古学者や骨形態学者と共同で研究を進めており、発掘調査や骨標本の整理にも参加している。
2. 霊長類生態学
チンパンジーやオランウータンなど特にヒトに近縁な霊長類を対象にして、行動観察からは知るのが難しい生命現象を調べている。観察対象の霊長類個体を識別して行動を観察すれば、多くのことがわかる
が、観察からは知るのが難しい行動や、観察から調べるにはあまりの多くの手間と労力がかかる行動も多く存在する。安定同位体分析やプロテオミクスを応用することで、そうした問題を解決したいと考えている。
糞や体毛や採食物など、個体を傷つけないで手に入る試料を安定同位体分析したりプロテオミクス分析したりすることで、コドモの発達、食性、健康状態などを明らかにした。動物園などの飼育個体で基礎検討し、野生の個体に応用を進めている。霊長類学者や生態学者と共同で研究を進めており、野外調査にも参加している。
3. 生物と文化のミスマッチ
ヒトが進化を通じて身につけてきた生物学的な性質と、現代の社会や文化の現状がミスマッチを起こしている状況について、調査をしたり議論したりしている。
「どうして現代日本ではこんなに子育てが大変なんだろう？」という自身の思いから始まった研究であり、そのため特に妊娠出産や子育てに注目している。現代人の子育てを縛る常識や「当たり前」の価値観は、実は数年から数十年で変遷する。
数百万年の時間軸を考慮する人類進化の知見を提供することで、すこし異なる視点を持ちこみ、よりすこやかな子育ての実現に貢献できると考えている。

２. 教育• 担当授業1.

生物人類学特論（２単位、集中講義）を担当• 研究指導1.

蔦谷研究室に所属する大学院生（博士後期課程）1 名の副指導を担当• 全学教育該当なし

75

• 他大学等における授業
1.
2.

⺠族学考古学特殊 XVII（２単位、半期、慶應大学）を瀧上舞研究員（国立科学博物館）と分担
して担当
リバプール・ジョン・ムーア大学（英国）およびマサリク大学（チェコ）の特別授業を１コマず
つ担当

３. 研究

• 学術出版物 (*は責任著者)
原著論文（査読あり）

1.
2.

3.
4.

Tsutaya T*, Mizushima N. (2023). Evolutionary biological perspectives on current social issues ofbreastfeeding and weaning. Yearbook of Biological Anthropology. DOI: 10.1002/ajpa.24710.
Tsutaya T*, Wong A, Malim PT, Bernard H, Ogawa NO, Ohkouchi N, Hongo S, Tajima T,
Kanamori T, Kuze N. (2022). Stable isotopic investigation of the feeding ecology of wild Bornean
orangutans. American Journal of Biological Anthropology 179, 276–290.
澤藤りかい*, 蔦谷匠, 石田肇 (2022). ホモ属の拡散と生息時期—アジア東部を中心に—.
Anthropological Science (Japanese Series) 130, 55–74.
蔦谷匠*, 市石博, 中務真人, 松本晶子, 山極寿一, 河村正二 (2022). 2021 年に実施された日本人
類学会会員に対する研究と 教育の現状に関するアンケート調査について. Anthropological
Science (Japanese Series) 130, 85–96.

書籍分担執筆（査読なし）

1.

三好哲也, 蔦谷匠. (2022). 梅田墓所の甕棺より出土した人骨の安定同位体分析. In: 大阪市文化財協会 『大深町遺跡発掘調査報告 II』 大阪市文化財協会, p. 173–174.

総説（査読なし）

1.

蔦谷匠, 米田穣. (2022). 琉球諸島におけるヒトの食性の変遷. 月刊海洋 54, 347–351.

• 学会発表
学会発表

1.

2.

Tsutaya T, Kato H, Weber AW. (2022). Diachronic changes in human diet in the Ryukyu Islands,
Japan: a meta-analysis of carbon and nitrogen stable isotope ratios. 9th World Archaeological
Congress. Prague, Czech Republic. July 4, 2022.
Tsutaya T, Yoneda M. (2022). Diachronic changes in human diet in the Ryukyu Islands, Japan: ameta-analysis of carbon and nitrogen stable isotope ratios. 22nd Congress of Indo-Pacific
Prehistory Association. Chiang Mai, Thailand. November 12, 2022.

招待セミナー

1.

2.

Tsutaya T. (2022). Recent advances in proteomics in bioarchaeology and human evolution studies.
A New Archaeology Initiative to Elucidate the Formation Process of Chinese Civilization. Online,
December 12, 2022.
Tsutaya T. (2022). Recent advances in proteomics in bioarchaeology, human evolution studies, andprimate ecology. Department of Anthropology, Masaryk University. Bruno, Czech Republic,

76

3.

October 23, 2022.
Tsutaya T. (2022). Recent advances in proteomics in bioarchaeology, human evolution studies, andprimate ecology. Research Centre for Evolutionary Anthropology and Palaeoecology, Liverpool
John Moores University. Online, October 4, 2022.

シンポジウムの企画

1.

本郷峻, 蔦谷匠 (2022). 肉食をめぐる人類学 第 76 回 日本人類学会大会・第 38 回 日本霊長類学会大会連合大会 2022 年 9 月 18 日 京都府京都市• 外部資金
1.

2.
3.

4.
5.
6.
7.

日本学術振興会科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金 （国際共同研究強化（B））
「糞メタ
ゲノム・メタプロテオーム分析による野生オランウータンの健康診断」（2022〜2027）総額 15,500
千円
日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「絶滅危惧種オランウータンの野生復帰事業改善を目的とした法医学的研究」研究代表者：久世濃子（2019〜2024）総額 3,400 千円
日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「多面的新手法による中近世日本人のライフヒストリーの復元：生物考古学の新展開を探る」研究代表者：長岡朋人（2019〜2023）総額
3,400 千円
日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「人骨から読み解く日本列島人の食生活―食物の変遷と多様性の復元―」研究代表者：澤藤りかい（2020〜2023）総額 4,400 千円
日本学術振興会科学研究費補助金学術変革領域研究（A)「同位体比分析から見たヒトとモノの動態復元」研究代表者：米田穣（2020〜2024）総額 9,600 千円
日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「北海道における海洋生産性の長期変動とその人類への影響」研究代表者：高瀬克範（2021〜2024）総額 1,000 千円
日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「南東アラビア山麓峡谷における千年持続可能な社会基盤の歴史生態学的探究」研究代表者：近藤康久（2021〜2023）総額 1,500 千円• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人

該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招へいした外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

77

４. 社会貢献• 学会活動該当なし• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
1.
2.

＜プレスリリース＞「安定同位体分析により野生オランウータンの糞から食性を」https://www.soken.ac.jp/news/2022/20220818.html＜プレスリリース＞「授乳・離乳の社会現象を人間進化の視点から解きほぐす」
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20230309.html• 学術誌編集活動
該当なし• 学術誌査読活動
1.
2.
3.
4.
5.
6.

American Journal of Biological Anthropology (2 件)
American Journal of Primatology
Isotopes in Environmental & Health Studies
Journal of Archaeological Science: Reports
PeerJ
Scientific Reports

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.

人を対象とする研究倫理審査委員会
広報
生命科学リトリート
入試出題• 部局委員会等への貢献
該当なし• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
海外学術渡航

78

1.
2.
3.
4.

2022 年 4 月〜2023 年 3 月：コペンハーゲン大学（デンマーク）
2022 年 6 月：ダナムバレイ保護区（マレーシア）
2022 年 8–9 月：ルオー学術保護区（コンゴ民主共和国）
2023 年 3 月：ダナムバレイ保護区（マレーシア）

79

寺井 洋平（助教：適応と種分化の機構、分子進化生態学）
１. 研究テーマ
1. ニホンオオカミと日本犬ゲノム、イヌの起源の研究
これまでの研究で、日本犬ゲノムにはニホンオオカミ由来の領域が存在し、このような領域が日本犬の成立に関わった可能性を示してきた。本年度は本州では縄文時代と弥生時代、北海道では続縄文時代とオホーツク文化期のイヌの古代ゲノムの決定、もしくは古代ゲノム解析を行なった。また日本犬も複数犬種ゲノム配列の決定を行なった。これらの古代 DNA をニホンオオカミと日本犬、世界各地のハイイ
ロオオカミと犬種のゲノムもしくは古代ゲノム、計 200 個体程度と合わせて解析を行なった。その結果、日本列島に渡来した人類の起源や特徴を表すような形質をそれぞれの時代のイヌが持つことがSNP 解析から推定された。また、縄文時代のイヌの古代 DNA については、ミトコンドリア DNA と核ゲノムでそれぞれ論文を執筆し、それぞれ投稿中と bioRxiv に公開する準備中である。ニホンオオカ
ミゲノムの論文はリバイス中で、出版までの最終段階にある。
2. 地衣類の共生による環境適応の研究
これまで硫黄噴出口付近に生育するイオウゴケは藻類、菌類、好酸性バクテリアの３者からなる基本構
成である可能性を示してきた。今年度は共生体の好酸性バクテリアのゲノムアッセンブルを再度行い、存在する遺伝子から、どのような経路で硫化水素を代謝しているかを推定した。そしてその代謝経路から予測した硫黄代謝物が実際にイオウゴケに存在しているか、硫黄代謝物メタボロームにより解析をした。その結果、予想される硫黄代謝物が大量に存在していることが明らかになり、イオウゴケの共生体の好酸性バクテリアが硫化水素を代謝してエネルギー源としている強い証拠を得た。これらの結果については、論文を作成し登校前に bioRxiv に公開をした。
ハコネサルオガセについては、菌類と藻類の再合成を行う際に共生バクテリアの有無で２通りの再合成
共生体を培養した。その結果、バクテリアの存在は再合成の成功率に影響を与えないが、再合成体の表面構造に影響を与えている可能性を見出した。これらの構造の違いについて詳細な解析を進めている。
3. 産卵時期の異なるサンゴの種間の違いに関わるゲノム領域
イシサンゴ目ミドリイシ科ミドリイシ属の 1 種、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)には隠蔽種とされる近縁種がいることが報告されていた。これらの 2 種は形態的な類似性が高く、交雑も可能であるが産卵時期が異なるため分化していると考えられていた。本年度は A. digitifera に加えて近縁種のゲノムを複数個体で決定し解析を行なった。その結果、これら 2 種は遺伝的に極めて近縁であり、ほとんどのゲノム領域に分化は見られなかった。しかし、2 種間で分化した短いゲノム領域が数十箇所存在し、これらの領域が２種間の形態の違いや生殖的隔離に関わっていると推定された。実際に、それらの箇所には配偶子形成に関わる遺伝子が存在し、分化したゲノム領域が産卵時期の違いにかかわると推定される。これらの結果については、論文の原稿がほぼ完成している。
4. スラウェシ島固有のマカクを用いた種分化と適応の研究
これまでインドネシア スラウェシ島固有のマカクの全エキソン配列の決定を、分布が隣接する 6 種の複数個体を用いて行っていた。本年度はまだサンプルのないスラウェシ本当から離れた島に生息する最後の１種と、この島の近くの本島に生息する１種のサンプリングを行い、インドネシア、ボゴール農科
大学にて配列決定前までの実験を行なった。exome 配列の系統解析の結果、島の種は近隣の本島の種の内部系統から派生した可能性が示された。しかし、各種 1-2 個体の全ゲノム解析から近隣の本島の種の１部と隣接する別種との間に大規模な gene flow があることが示され、島の種の分岐に関しては、よ80

り詳細な解析をする必要がある。スラウェシマカクの地域適応と種分化に関しての論文は投稿後リバイ
ス中であり、種間の大規模な gene flow に関しては論文作成中である。
5. ヒト特異的皮膚形質の遺伝子基盤に関する研究
これまでの研究で、他の類人猿の種と比較して、皮膚の構造タンパク質遺伝子の発現がヒト特異的に高くなっていることを明らかにしてきた。2020-2021 年度に４つの構造タンパク質遺伝子のプロモーター
領域をエピゲノムデータから推定し、それをベクターに組み込んでいたが、2022 年度はそれらの配列が実際にプロモーター活性もしくはリプレッサー活性を持つことを明らかにした。今後、これらの調節
配列に類人型の変異を導入し、どの変異がヒト特異的遺伝子発現を作り出しているかを明らかにする予定である。
6. 海棲爬虫類の視覚の適応の研究
2021 年度から、カメ類の海洋適応の研究を進めてきた。これまでウミガメ 2 種とヌマガメ 2 種の眼の全 RNA 次世代シークエンス解析を行なっていた。それらの解析を今年度に進めた結果、ヌマガメは青色を吸収する視物質のオプシンの発現量が少ないが、ウミガメでは発現が上がっていることが明らかになり、これは青色の光の多い生息光環境への適応のためであると考えられる。また、長波長吸収の視物
質オプシンの発現量がすべてのカメの種で共通で最も高く、これはウミヘビ類でも共通していた。現在は、オプシンの発現量、配列から推測される機能の違い、進化解析を行いカメ類の海洋適応を明らかにしようとしている。
7. 魚類の河川と海の両環境へ適応の研究
魚類は異なる光環境に生息するため、魚類の視覚は適応進化の代表的な例として知られている。しかし海産魚の多くは河川に遡上するが、これらの種が河川に生息する際に視覚を切り替えるのか、河川と海の両方の環境に適応しているのかについてはほとんど知られていない。2021 年度は河川と海の両方に生息するクサフグと比較対象のフグ類に着目して研究を進めた(2021 年度 bioRxiv に公開)。2022 年度
はクサフグ研究にデータを加えて bioRxiv に公開した論文を改訂した。また、海水魚の河川への侵入と適応の機構が魚類で共通であるかを調べるために、ハゼ類に着目してサンプリングと眼での全遺伝発現量解析を進めた。

２. 教育• 担当授業1.
2.

ミクロ･マクロ生物学（２単位、集中講義）
学生実習(分子生物学実習)• 学生研究指導
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

南木 悠（副指導）「野外のナミアゲハにおける花色選好性」(2022 年 9 月まで)
杉田 あき（副指導）「ムササビの空間分布」(2022 年 9 月まで)
西條 未来（副指導）「チドリ目における対捕食者行動の意思決定」(2023 年 3 月まで)
高畑 優（副指導）「都市に生息するエゾリスの餌付けによる影響」
山川 真徳（副指導）「真社会性哺乳類ハダカデバネズミにおける社会生態学的適応」
山田 優佳（副指導）「同時的雌雄同体のウミウシ類における多様な繁殖戦略」
XIAYIRE XIAOKAITI（副指導）「Zooarchaeological study of domestic dog in East Asia」
長田 美沙（副指導）「汽水域と浅海の異なる光環境への魚類視覚の適応」

学位論文および進級審査

81進級審査主査

1.

長田 美沙

学位論文審査委員

1.

秋山 辰穂
博士論文題目 Parallel evolution of vision among hawkmoth species through the diurnal–
nocturnal transition• 全学教育なし• 他大学等における授業
1.
2.

慶応大学での講義「イヌの起源と人類と辿ってきた歴史」
京都大学霊長類研究所の大学院生指導（2022 年 9 月まで）

３. 研究

• 学術出版物
発表論文（査読あり）

1.

2.

3.

4.

Akiyama T, Uchiyama H, Yajima S, Arikawa K, Terai Y. Parallel evolution of opsin visual pigments
in hawkmoths by tuning of spectral sensitivities during transition from a nocturnal to a diurnal
ecology. The Journal of Experimental Biology 225(23) (2022)
Sugita A, Shigeta M, Tamura N, Okazaki H, Kutsukake N, Terai Y. Development of Genetic
Markers for Sex and Individual Identification of the Japanese Giant Flying Squirrel (Petaurista
leucogenys) by an Efficient Method Using High-Throughput DNA Sequencing. Zoological Science40(1):24-31 (2022)
Yan X, Terai Y, Widayati KA, Itoigawa A, Purba LHPS, Badjeber F, Suryobroto B, Imai H
Functional divergence of pigmentation gene melanocortin-1 receptor (MC1R) in six endemic
Macaca species in Sulawesi island Scientific Reports 12(7593) (2022)
寺井洋平 全ゲノム情報から知るニホンオオカミ（総説）Mammal Study 63(1):5-13（2023）

発表論文（査読なし）

1.
2.
3.
4.
5.

Kono M, Terai Y. The third symbiotic partner of the volcano lichen Cladonia vulcani Savicz drove
adaptation to an extreme environment. bioRxiv https://doi.org/10.1101/2023.04.05.535799 (2023)
寺井洋平 日本犬とニホンオオカミの関係をゲノムから知る. BIOSTORY 印刷中（2023）
寺井洋平 ゲノムから探るニホンオオカミと日本犬の歴史 生物の科学「遺伝」76(5) (2022)
寺井洋平 「ゲノムから探るニホンオオカミと日本犬の歴史」の紹介：ニホンオオカミと日本犬
Yaponesian 第 4 巻なつ号 pp.8-9（2022）
Osada M, Terai Y Adaptation of the eyes of grass puffer (Takifugu niphobles) to the riverine andmarine environments. bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2022.04.28.489969 (2022, 改訂）

学術研究図書なし• 学会発表

82

学会発表

1.

2.
3.

4.
5.
6.
7.

Yan, X. Terai, Y., Widayati, K. A., Purba, L. H. P. S., Fahri, F., Suryobroto, B., Imai, H. Novel DNA
markers and coat color differentiation in Sulawesi macaques. The joint conference of the 76th
Anthropological Society of Nippon and the 38th Primate Society of Japan. September 2022. (Oral)
仮屋園志帆、井口亮、寺井洋平 ミドリイシ属サンゴの産卵時期の違いに関わる遺伝的基盤 日
本サンゴ礁学会第 25 回大会（2022 年 11 月 12 日）
荒川那海, Kanthi Arum Widayati, Laurentia Henrieta Permita Sari Purba, Xiaochan Yan, 今井啓雄, Bambang Suryobroto, 寺井洋平 スラウェシマカク種間における広範囲の gene flow.日本進化学会第 24 回沼津大会、2022 年 8 月
河野美恵子、田辺秀之、寺井洋平 地衣類イオウゴケの化学合成共生系の確立と極限環境への適応 日本進化学会第 24 回沼津大会、2022 年 8 月
河野美恵子、田辺秀之、寺井洋平 共生バクテリアから明らかになったイオウゴケの適応戦略
日本地衣学会第 21 回大会（オンライン）、2022 年 12 月
長田美沙、寺井洋平「浅海から汽水域における異なる環境への魚類の環境適応 日本進化学会第24 回沼津大会、2022 年 8 月
長田美沙、寺井洋平「浅海から汽水域における異なる環境への魚類の環境適応 日本遺伝学会、
札幌 2022 年 9 月

企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

1.
2.
3.
4.
5.
6.

寺井洋平 イヌの起源と日本列島でのイヌの変遷 第 3 回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会 2022 年 12 月
寺井洋平 ニホンオオカミゲノムから明らかになったイヌの起源と変遷 遺伝学若手の会 第二回研究交流会 2022 年 11 月
寺井洋平 ヤポネシアは古い系統の貯蔵庫：ニホンオオカミと古代犬から探るイヌの起源 日
本進化学会第 21 回大会 沼津 公開講演会 2022 年
寺井洋平 ゲノム解析から明らかになったヤポネシアでのイヌの変遷とニホンオオカミとの関
わり 日本遺伝学会 シンポジウム 札幌 2022 年
寺井洋平 ニホンオオカミゲノムから見えてきたイヌの初期の進化 日本遺伝学会 ワークショ
ップ 札幌 2022 年
寺井洋平 ニホンオオカミと古代犬から探るイヌの起源、日本哺乳類学会 三重 2022 年• 外部資金
1.
2.
3.

4.
5.

科学研究費補助金 新学術領域研究(公募研究)「日本列島への人類の渡来に伴って形成された日
本犬ゲノムの多重構成」研究代表者: 寺井洋平（2020〜2022）総額 750 万円
日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 B (一般)「共生の第三の主役: 地衣類の共生細菌の役割を代謝ネットワークから解明する」研究代表者: 寺井洋平（2021〜2024）総額 1,300 万円
科学研究費補助金 基盤研究 B 「古代 DNA と骨格形態から探る、東アジアにおけるイヌの家畜化と日本列島への導入」研究分担者: 寺井洋平（研究代表者: 本郷一美）（2022〜2024）総額 1,300万円
日本学術振興会 科学研究費補助金国際共同研究強化 (B)「Wallacea 周辺における哺乳類の進化に対する分子的研究」研究分担者: 寺井洋平、（代表：今井啓雄）（2021〜2025）総額 1,200 万円
科学研究費補助金 基盤研究 B 「陸から海にもどった羊膜類の適応形質進化機構の法則を探」研
究分担者: 寺井洋平（研究代表者: 土岐田 昌和）（2019〜2022）総額 1,320 万円

83

6.

7.

日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究」研究分担者: 寺井洋平（研究代表者: 石黒直隆）（2020〜2022）総額300 万円日本学術振興会 研究拠点形成事業 先端拠点形成型「大型動物研究を軸とする熱帯生物多様性
保全の国際研究拠点」（研究参加者）研究代表者：幸島司郎（2017〜2022）総額 9,000 万円• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞なし

４. 社会貢献• 学会活動1.

日本進化学会 2024 年大会準備委員• 学外委員会活動なし• アウトリーチ活動
1.
2.

理科ハウス サイエンスレクチャー「新しい種が生まれる時」
カフェインテグラルでの研究紹介

メディア出演での研究紹介

1.
2.

NHK 総合 ダーウィンが来た！「解明！本当の日本のオオカミ」2023 年 2 月 19 日（再放送2023 年 5 月 5 日）
秋田県公式 生物多様性 PR 動画「LOVE LIVES AKITA～秋田と生物多様性」• 学術誌編集活動
1.

iDarwin Associate Editor

84

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
なし• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.

研究体験実習担当（2022 年度は開催なしのため、連絡活動のみ）
アカデミックアドバイザー
実験排水管理SNS 広報• 大学事業なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.
2.
3.

荒川 那海（RCIES・特別研究員）
河野 美恵子（RCIES・特別研究員）
仮屋園 志帆（RCIES・連携研究員）

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読なし）

4.

3 の学術出版物に記載

学術研究図書なし
研究室構成員による外部資金

1.
2.
3.
4.
5.
6.

荒川那海 若手研究 「ヒトの強靭な皮膚はどうやってできてきた?ヒトの皮膚を形成した塩基置換の同定」 研究代表者、100 万円
荒川那海 基盤 B 「共生の第三の主役: 地衣類の共生細菌の役割を代謝ネットワークから解明する」研究分担者（代表：寺井洋平）、5 万円
荒川那海 国際共同研究強化 (B) 「Wallacea 周辺における哺乳類の進化に対する分子的研究」
研究分担者（代表：今井啓雄）20 万円
仮屋園志帆 若手研究 「ミドリイシサンゴの環境ストレス耐性の遺伝的基盤:ゲノムの種内多型から探る」研究代表者 100 万
仮屋園志帆 基盤研究(A) 「造礁サンゴの高水温耐性向上可能性に関する総合的研究」研究分担者（代表：酒井一彦）30 万
河野美恵子 若手研究 「ハコネサルオガセ再合成系を用いた地衣類の新たな共生メンバーと共生遺伝子の解明」（2022 年採択）総額 350 万円

85

本郷 一美（准教授：環境考古学（動物考古学）、先史人類学）
１. 研究テーマ
1. 西アジアにおける定住の開始、社会の複雑化、家畜化過程の研究
西アジアの「肥沃な三日月弧」北部では、12000 年前ごろに定住集落が形成され、急速に社会の複雑化や広域ネットワークの形成が進み、まもなく農耕と家畜飼育が始まる。初期の定住狩猟採集民による野生動物資源の利用、新石器時代の食糧生産開始（「新石器化」）、家畜化過程の初期において人間の祖先
種への様々な介入により引き起こされた変化、家畜の伝播、農耕牧畜社会の成立に至るまでの生業と社会の変化について、進化学的視点で研究を行った。複数の科研費の助成を受けている。

2. ニホンオオカミの形態と系統および古代犬の系統に関する共同研究
科研費（基盤 B）の助成を受け、ニホンオオカミの起源と系統および日本在来犬との関係に関し、先導科学研究科教員・大学院生、統合進化科学研究センター客員研究員、学外の研究者から構成される研究グループで、明治期のニホンオオカミ資料と、遺跡から出土するオオカミ、イヌの骨格形態とサイズのデータを収集した。また、縄文時代、弥生時代、平安時代の遺跡と中国の複数の遺跡から出土したイヌの骨格試料から抽出した古代 DNA の全ゲノム解析を行い、縄文時代のイヌの遺伝的特徴が家畜化初期のユーラシアのイヌにつながる可能性が示唆された。大学院生の博士論文研究に関わる共同研究であ
る。

２. 教育

• 担当授業1.
2.

ミクロ・マクロ生物学
統合人類学• 研究指導1.
2.
3.

青野 圭（主指導）「動物考古学的手法による先史時代の琉球列島におけるイノシシとヒトの関係についての研究」
ショケット・シャイラー（主指導、国費留学生）「日本と中国の遺跡から出土したイヌの系統」
久保 鮎子（主指導）研究テーマ未定• 全学教育なし• 他大学等における授業
なし

３. 研究

• 学術出版物

86原著論文（査読あり）

1.

2.

Nishioka, Y., Takai, M., Hongo, H. and Anezaki, T. (2022) Fossil and archaeological remain recordsof Japanese macaques (Macaca fuscata). In Urbani, B., Youlatos, D., Antczak, A.T. (eds) World
Archaeoprimatology: Interconnections of Humans and Nonhuman Primates in the Past, pp.516532. Cambridge University Press.
Hongo,H., Arai,S., Gündem, C. Y., Öksüz B, Miyake, Y. (2023) Faunal remains from Salat Cami
Yanı: An Early Pottery Neolithic site in the Upper Tigris Valley. Documenta Archaeobiologiae, 16,
Animals and humans through time and space: Investigating diverse relationships, pp.201-211.

学術研究図書なし
その他

1.

本郷一美（2022）「ヒマラヤにおける家畜利用：高地の考古遺跡から出土した動物骨から」ビオ
ストーリー 37 号, pp.38-40.

• 学会発表
学会発表

1.

2.

ショケット＝シャイラー・本郷一美・寺井洋平・覚張隆史・河西健二・町田賢一・山路直充・山崎京美「古代 DNA の全ゲノム解析による、縄文時代出土犬骨の系統」第 88 回日本考古学協会（2022 年 5 月 早稲田大学）（ポスター）
本郷一美「遺跡出土動物骨から家畜化過程を探る」, 日本遺伝学会第 94 回大会ワークショップ「遺伝・発達・進化・考古学から解き明かす動物家畜化 "Animal domestication unraveled fromgenetics, development, evolution, and archeology", 2022 年 9 月 14～17 日 北海道大学（招待）その他の口頭発表

1.

本郷一美「Mani (Orang Asli) の民族―動物考古学：サカイ洞窟（タイ, トラン群）出土動物骨」,
国立民族学博物館共同研究会「アジアの狩猟採集民の移動と生業 ― 多様な環境適応の人類史」（2023 年 1 月 21 日 国立民族学博物館）（招待）

メディア取材1.

NHK 「ヒューマニエンス」「家畜 それは遺伝子の共進化」2022.5.10 放映

国際学会の主催

1.

国際考古動物学会・南西アジア分科会（ICAZ-ASWA）第 15 回大会（2022 年 11 月 28 日−12 月
2 日、東京文化財研究所)。 研究発表 55 件（海外からの参加者、20 か国 45 名）。

• 外部資金代表

1.
2.

基盤 B「古代 DNA と骨格形態から探る、東アジアにおけるイヌの家畜化と日本列島への導入」（2022-2024）
統合進化科学研究センター、複雑適応系プレリサーチ「三浦半島における先史時代人類の生業活動と古環境」50 万円

分担
科研費

87

1.

2.
3.
4.
5.
6.
7.

新学術領域（研究領域提案型）（2018-22）「都市文明の本質：古代西アジアにおける都市の発生と変容の学際研究」計画研究「西アジア先史時代における生業と社会構造」（領域代表者：筑波大学・山田重郎、計画研究代表者：筑波大学・三宅 裕）
基盤 S（2019-23 年度）中東部族社会の起源：アラビア半島先原史遊牧文化の包括的研究 （研究代表者：金沢大学・藤井純夫）
基盤 A（2022-25）生命受容に基づく人間家畜相互関係の成立と深化に関する学融合的パラダイ
ムシフト（研究代表者：東京大学総合研究博物館・遠藤秀紀）
基盤 C（一般）（2020-22） 絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研
究（研究代表者：総合研究大学院大学先導科学研究科・客員研究員・石黒直隆）
基盤 B（2020-24）東南アジア大陸部における後期更新世人類の環境適応の解明（研究代表者：新潟医療福祉大学・澤田純明）
基盤 B（2021-25）アルメニア高地における初期農耕の北方適応の過程を探る（研究代表者：東海大学・有村誠）挑戦的研究（萌芽）（2021-23）古代西アジアに生息した未知のライオンの研究（研究代表者：大阪学院大学・渡辺千香子）

海外出張

1.
2.
3.
4.

2022 年 6 月 15 日−22 日 スウェーデン・ストックホルム大学 国際考古動物学会理事会・シン
ポジウム2022 年 8 月 29 日−9 月 9 日 トルコ共和国・ウルファ Çakmak Tepe 発掘調査
2023 年 3 月 16-23 日 ベトナム社会主義共和国・ホアビン省およびハノイ。Phung Quyen 遺跡
発掘調査、ハノイ考古学研究所、国立自然科学大学
2023 年 3 月 29 日−4 月 7 日 アメリカ合衆国・ロスアンゼルス・ボストン・ケンブリッジ ゲッ
ティ美術館、ハーバード大学進化学部・人類学部

学生の海外渡航1.

2022 年 8 月 3 日−10 月 27 日ショケット・シャイラー 総研大海外派遣プログラムにより、中華人民共和国に渡航（中国社会科学院考古科学研究所）• 研究活動による受賞
1.

2022 年度 Zoological Science Award 論文賞 (Shuichi Matsumura, Yohey Terai, Hitomi Hongo,
Naotaka Ishiguro (2021) Analysis of the Mitochondrial Genomes of Japanese Wolf Specimens in
the Siebold Collection, Leiden. Zoological Science 38(1): 60-66.)

４. 社会貢献• 学会活動
1.
2.
3.
4.
5.
6.

International Council for Archaeozoology 理事、国際委員
International Council for Archaeozoology, ASWA (Archaeozoology of Southwest Asia andAdjacent Areas) Working Group 代表
生き物文化誌学会 監事
日本人類学会 評議員、骨考古学分科会幹事、倫理委員
日本動物考古学会 副会長
日本西アジア考古学会 副会長

88

7.
8.
9.

文化財科学会
第四紀学会
在来家畜研究会• 学外委員会活動
1.

吉田学記念 文化財科学研究助成基金 運営委員

• アウトリーチ活動
1.

サイエンスカフェ 「白石洞穴に残るさまざまな歴史」（2023 年 2 月 18 日 13 時 30 分～16 時、三浦市「うらり」）• 学術誌編集活動
1.

日本考古学協会

Japanese Journal of Archaeology 編集委員

• 学術誌査読活動
1.
2.

Journal of Archaeological Method and Theory
LAND

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

苦情等処理協議会
全学学生支援委員会
全学入試監理委員会
ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理委員会
動物研究検証委員会• 部局委員会等への貢献
1.

入試・広報委員• 大学事業
該当なし

６. その他の特筆すべき活動
博士研究員の受け入れ

1.

澤藤りかい（JSPS CPD）

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）

1.

Gabriele Scorrano, Sofie Holtsmark Nielsen, Domenico Lo Vetro, Rikai Sawafuji, Meaghan Mackie,
Ashot Margaryan, Anna K. Fotakis, Cristina Martínez-Labarga, Pier Francesco Fabbri, Morten E.
Allentoft, Marialetizia Carra, Fabio Martini, Olga Rickards, Jesper V. Olsen, Mikkel Winther

89

2.

Pedersen, Enrico Cappellini, Martin Sikora (2022) Genomic Ancestry, diet and microbiomes ofUpper Palaeolithic hunter-gatherers from San Teodoro cave. Communications Biology 5(1). DOI
10.1038/s42003-022-04190-2.
澤藤りかい・蔦谷匠・石田肇 (2022) ホモ属の拡散と生息時期− アジア東部を中心に−Anthropological Science (Japanese Series) 130(1): 55-74.

調査報告（査読あり）

1.
2.

吉永亜紀子 2023「神奈川県間口洞窟遺跡における弥生時代の魚類遺体」『動物考古学』40:39-45.
吉永亜紀子 2023「鳥取県青谷上寺地遺跡における貝類採集活動−第 1 次調査出土貝類遺体の報告−」『動物考古学』40: 47-52.

その他

1.
2.

小宮 孟「図で見る遺跡魚類脊椎骨の同定 2 −日本産イワシ類の第１、第２脊椎を中心に−」『動物考古学』40: 19-37.
吉永亜紀子 2022「筑後久留米藩有馬家屋敷跡遺跡出土の貝類遺体」『筑後久留米藩有馬家屋敷跡
遺跡 発掘調査報告書−(仮称)港区三田一丁目計画に伴う埋蔵文化財調査−港区内近世都市江戸関連遺跡発掘調査報告 92[TM214]』三井不動産レジデンシャル株式会社・株式会社パスコ,294-296

学会発表

1.

澤藤りかい（2022）「古代 DNA・プロテオミクスと人類の肉食」シンポジウム「肉食をめぐる人
類学」第 76 回日本人類学会・第 38 回日本霊長類学会連合大会 （京都産業会館 2022 年 9 月
16-19 日）研究室構成員による外部資金
代表

1.
2.
3.

石黒直隆 基盤 C「絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究」（2022
年度直接経費 700 万円）
澤藤りかい 基盤 B「人骨から読み解く日本列島人の食生活―食物の変遷と多様性の復元―」（2022 年度直接経費 430 万円）
澤藤りかい 特別研究員奨励費 「古代土壌 DNA を用いた遺跡の居住環境の復元」（2022 年度
直接経費 240 万円）

分担
澤藤りかい

1.
2.
3.
4.
5.

基盤 B「南米アンデスの初期帝国ワリの成立と地方支配に関する研究」（代表者：南山大学・渡辺森哉）
基盤 C「多面的新手法による中近世日本人のライフヒストリーの復元：生物考古学の新展開を探る」（代表者：聖マリアンナ医科大学・長岡朋人）
基盤 C「元素・DNA 分析による土坑用途の研究-考古学・人類学・民俗学と自然科学の融合-」（代表者：島根大学・渡辺正巳）
挑戦的研究（萌芽）「糞石ゲノム解析による縄文人の栄養・衛生・健康状態のマルチプロファイ
リング」（代表者：東京大学・太田博樹）
学術変革 A 計画研究「パレオゲノミクス解析プラットフォーム開発とその応用」（代表者：金沢大学・覚張隆史）国際共同研究加速基金（国威再共同研究強化 B）「古代プロテオミクスの基盤・拠点整備のための海外共同研究」（代表者：東京大学・太田博樹）

90

渡邊 崇之（助教：神経行動学、神経遺伝学）
１. 研究テーマ
1. 性決定遺伝子 doublesex に依存した不完全変態昆虫神経系の性決定機構の解明
ショウジョウバエなどの進化的に後発な完全変態昆虫に属する昆虫は、神経系の性差を生み出す分子メ
カニズムとして、転写因子である fruitless 遺伝子と doublesex 遺伝子に依存した２つの経路を有する。一方、コオロギなどの原始的な不完全昆虫に属する昆虫では fruitless 遺伝子は性決定に寄与しないことを明らかにしてきた。本研究は、コオロギを材料に doublesex 遺伝子に依存した性決定システムが不完全変態昆虫の脳・神経回路の性決定に寄与するという仮説を立証することを目的としている。
昨年度までに進めた doublesex 遺伝子の遺伝子破壊系統樹立実験の結果から、コオロギ doublesex 遺伝
子が X 染色体上に転座している可能性が示唆されていた。今年度はこの可能性を検証すべく、フタホ
シコオロギを含む複数種のコオロギや、コオロギに近縁なケラ、キリギリス、トノサマバッタ等のバッタ目昆虫で doublesex 遺伝子のゲノム中のコピー数を調査し、これらの昆虫で doublesex 遺伝子が X 染色体上に転座しているか否かまた、転座がバッタ目の系統進化上どのタイミングで起こったかを調査した。その結果、バッタ目の中で、キリギリス・ケラ・コオロギにおいて doublesex 遺伝子が X 染色体に乗っていることが明らかとなった。このことは、トノサマバッタを含むバッタ亜目とコオロギ・ケラ・
キリギリスを含むキリギリス亜目が分岐する段階で、後者の系統で doublesex 遺伝子の X 染色体への転座が起こったことを示唆している。さらにこの転座がどのような規模で起きたのかを探るべく、
doublesex 遺伝子近傍の遺伝子群についてゲノム中のコピー数を調査した。リファレンスとして染色体地図が報告されているサバクトビバッタを採用し、サバクトビバッタ doublesex 遺伝子が存在する 1 番
染色体上に配置された２０遺伝子について、フタホシコオロギとトノサマバッタを材料に雌雄間でゲノ
ム中のコピー数を調査した。その結果、キリギリス亜目で見られる doublesex 遺伝子の X 染色体への転座は、X 染色体の新規獲得や X 染色体-常染色体間の染色体融合によるものではなく、doublesex 遺伝子を含む比較的短い染色体領域の X 染色体への転座で説明できることが明らかになった。上記実験と並行して、doublesex 遺伝子の遺伝子破壊系統の樹立実験を進めたが、遺伝子破壊個体が産卵せず、系統化に至らなかった。現在、飼育条件等を見直して再実験を進めている。
本研究では当初、フタホシコオロギを材料に蛍光タンパク質による doublesex 発現細胞の可視化を予定していたが、この実験には doublesex 遺伝子の転写調節領域の単離が必要となる。今年度進めたフタホ
シコオロギゲノム・トランスクリプトーム解析によって doublesex 遺伝子の上流 >100 kbp にわたり非遺伝子コード領域が広がっていることが明らかとなった。そのため、doublesex 遺伝子の転写調節領域を正確に推定するために①ATAC-seq 法によるオープンクロマチン領域の特定と、②phylogenetic
footprinting 法によるエンハンサー領域の探索に着手した。
昨年度までの研究から、コオロギにおける doublesex 遺伝子の X 染色体への転座は、Doublesex タンパク質の配列進化速度を亢進させているのではないか？という仮説を支持する結果を得ている。この分子進化速度の亢進はタンパク質コード領域のみならず、転写調節領域を含む遺伝子全体に波及しているはずである。特に細胞自律的性決定様式をとる昆虫においては、オス化因子である doublesex 遺伝子を発現するか否かがその細胞の性を決定的に左右する。そのため転写調節領域の分子進化速度の亢進は、特に細胞異種性に富む昆虫中枢神経系におけるオス型神経回路の種間多様性に大きく寄与すると考えられる。上記①②の解析を組み合わせることでフタホシコオロギを中心とした doublesex 遺伝子転写調節領域の機能マップや種間多様性が把握できると、コオロギ中枢神経系のオス型神経回路の種間多様性に寄与するゲノム領域が抽出できるはずである。

91

2. “コオロギ神経遺伝学”の基盤技術の開発
これまでコオロギを材料に piggyBac トランスポゾンを利用した遺伝子導入や CRISPR/Cas9 による遺伝子破壊実験を成功させている。今年度は、CRISPR/Cas9 法を活用した標的配列特異的な遺伝子導入法の確立に取り組んだ。本研究では、これまでトランスポゾンをもちいた遺伝子導入に成功しているゲノム領域について CRISPR/Cas9 法を用いて２本鎖切断を引き起こし、その修復過程で目的の遺伝子断片を組み入れる遺伝子導入系の構築に取り組んだ。コオロギゲノムを高頻度で切断する gRNA を５種類選抜し、遺伝子導入ベクターと遺伝子導入ベクターを切断する gRNA、Cas9 タンパク質とともにコオロギ受精卵に顕微微量注入した。遺伝子導入ベクターには 3xP3-蛍光タンパク質遺伝子発現カセッ
トを組み込んでおり、遺伝子導入が成功した場合、複眼で蛍光タンパク質の発現が検出できるようになっている。この実験を進めたが、現在までに残念ながらこの実験系によって効率よく遺伝子導入系統を樹立することはできていない。その理由は定かではないが、複数の gRNA/Cas9 複合体とプラスミド
DNA をカクテルとして顕微微量注入した場合に、コオロギゲノムを標的とした gRNA の切断効率が下がっていることを示唆する結果を得ているため、遺伝子導入ベクターや gRNA の濃度比を変えるな
どの条件検討が必要だと考えている。このような背景から、非相同末端結合修復を利用したよりシンプ
ルな遺伝子導入系としてホーミングエンドヌクレアーゼを利用した遺伝子導入系の構築の準備を進めている。
また昨年度に引き続いて、コオロギ神経遺伝学において有用なプロモーター領域の探索に取り組んでいる。今年度はヒートショックタンパク質遺伝子 (hsp 遺伝子) のプロモーター領域の取得を進めた。
まず、コオロギゲノムに存在する hsp 遺伝子を探索し、hsp20 ファミリー並びに hsp70 ファミリーに属する遺伝子群 17 遺伝子を同定した。その中から、コオロギ雄成虫中枢神経系において、42ºC １時間のヒートショックによって発現量が上昇する遺伝子を RT-qPCR 法によって探索し、10 遺伝子がヒートショックにより発現亢進し、１遺伝子が発現抑制を受けることを明らかにした。その中で、特に非刺激の発現量が低く発現量の上昇率が高い（300 倍）について、上流配列の取得と遺伝子発現ベクターの構築を進めている。
3. コオロギならびにゴキブリ科昆虫の性フェロモン受容体遺伝子の進化・多様性の解析
ワモンゴキブリ、クロゴキブリなどのゴキブリ科昆虫はペリプラノン誘導体を性フェロモンとして利用することが知られる。現在、渡邉英博助教、立石康介博士（福岡大学）、水波誠教授、西野浩史助教（北海道大学）と共同で、性フェロモン受容体遺伝子の同定・機能解析とゴキブリ科昆虫における分子進化
解析を進めている。ゴキブリ目昆虫 19 種のトランスクリプトーム解析によって、①ペリプラノン受容体が大きく２つのサブグループに分かれること（PAR ファミリー及び PBR ファミリー）、②PAR ファミリーがクロゴキブリを含む一部のゴキブリ科昆虫で高度に遺伝子重複を起こしていること、③PBR
ファミリーは遺伝子重複は見られず、PAR ファミリーが重複しているグループでは PBR ファミリーが欠失していることなどを見出している。ただし、この知見はトランスクリプトーム解析から推定したペリプラノン受容体遺伝子配列に基づくものであり、特に遺伝子重複が高度化している種における遺伝
子配列は不正確であると考えられる。そこで、トランスクリプトーム解析で得られた全ペリプラノン受容体遺伝子について RT-PCR 法による遺伝子配列の取得を進め、正確な遺伝子配列をもちいたペリプ
ラノン受容体遺伝子の配列比較解析に着手している。また、本研究でもちいたゴキブリの正確な系統関係がまだ明らかになっていないことから、mtDNA 配列による系統樹の作成にも着手している。
さらに今年度は、ゴキブリを材料とした触角トランスクリプトーム研究をフタホシコオロギにも適用
し、性フェロモン受容体遺伝子の探索を進めた。コオロギにおいては体表炭化水素が性フェロモンよう物質として機能していると考えられている。これまでに、コオロギ触角トランスクリプトームデータから化学感覚受容に関わる遺伝子群を探索し、その分子系統解析を進めている。また、代表的な化学受容遺伝子について、CRISPR/Cas9 法を利用した遺伝子破壊系統の作成にも着手している。

92

２. 教育• 担当授業
1.
2.
3.

ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「神経進化発生学」を担当）
先導科学実習（２単位、集中講義）
神経進化発生学特論（１単位、集中講義）• 研究指導該当なし• 全学教育
該当なし• 他大学等における授業
該当なし

３. 研究

• 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.

2.

3.

Tateishi K*, Watanabe T*, Nishino H, Mizunami M, Watanabe H (2022) Silencing the odorant
receptor co-receptor impairs the olfactory reception in a sensillum-specific manner in the cockroach.
iScience. 25(5):104272. (*equal contribution)
Hatakeyama D, Sunada H, Totani Y, Watanabe T, Felletár I, Fitchett A, Eravci M, Anagnostopoulou
A, Miki R, Okada A, Abe N, Kuzuhara T, Kemenes I, Ito E, Kemenes G (2022). Molecular andfunctional characterization of an evolutionarily conserved CREB-binding protein in the Lymnaea
CNS. FASEB J. 36:e22593.
Kulkarni A, Ewen-Campen B, Terao K, Matsumoto Y, Li Y, Watanabe T, Kao JA, Parhad SS, Ylla G,
Mizunami M, Extavour CG (2022). oskar acts with the transcription factor Creb to regulate longterm memory in crickets. PNAS, in press• 学会発表
学会発表

1.

2.

3.

藍澤優李、立石康介、渡邊崇之、渡邉英博 ワモンゴキブリ湿度受容体の探索 九州沖縄植物学会（第 71 回）
・日本動物学会九州支部大会（第 74 回）
・日本生態学会九州地区会（第 66 回）三学会合同佐賀大会 2021/6/11-12
Kosuke Tateishi, Takayuki Watanabe, Hiroshi Nishino, Makoto Mizunami, Hiroyuki Ai, Hidehiro
Watanabe. Functional and developmental analyses of the sex pheromone reception system in theAmerican cockroach during the nymphal-adult transition. International Congress Neuroethology
2022. Lisbon, Portugal, July 24-29
渡邊崇之 昆虫脳性分化機構の進化を探る〜doublesex 遺伝子の分子進化を中心に 第 93 回日
本動物学会早稲田大会 2021/9/8-10

93

4.
5.

6.

7.

立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邉英博 ワモンゴキブリの 2 種の性フェロモンの受容機構と行動的役割の違い 第 93 回日本動物学会早稲田大会 2021/9/8-10
Takayuki Watanabe, Hiroshi Nishino, Kosuke Tateishi, Hidehiro Watanabe, Makoto Mizunami.
Transcriptome analyses of chemosensory receptor genes in the antennae of cockroaches and acricket. 第 44 回日本比較生理生化学会高知大会 11/26-27
Kosuke Tateishi, Takayuki Watanabe, Hiroshi Nishino, Mana Domae, Makoto Mizunami,
Hidehiro Watanabe. Two distinct sex pheromone processing pathways in the American cockroach,from receptions to behaviors. 第 44 回日本比較生理生化学会高知大会 11/26-27 [発表論文大会
委員長賞受賞]
Yuri Aizawa, Kosuke Tateishi, Takayuki Watanabe, Hidehiro Watanabe. Ionotropic receptors forhygrosensation in the American cockroach. 第 44 回日本比較生理生化学会高知大会 11/26-27[発表論文大会委員長賞受賞]

企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

該当なし• 外部資金
該当なし• 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人

該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人

該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招聘した外国人

該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

該当なし• 研究活動による受賞
1.

共同研究として関わっている２つの研究プロジェクトについての研究発表で、第 44 回日本比較
生理生化学会高知大会で発表論文大会委員長賞受賞を受賞している。

４. 社会貢献• 学会活動該当なし

94

• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
1.

神奈川県立横須賀高等学校 スーパーサイエンスハイスクール事業 (Principia II) への参画

• 学術誌編集活動
1.

Frontiers in Behavioral Neuroscience 編集委員

• 学術誌査読活動
該当なし

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし• 部局委員会等への貢献
1.
2.

生命科学リトリート担当
スーパーサイエンスハイスクール（SSH）担当• 大学事業1.

「入試、入試広報イベント 」「オンライン入試」担当教員

95

松下 敦子（講師：共同利用機器支援事業担当）
１. 支援した研究
1. ショウジョウバエ変異体の網膜の微細構造観察
名古屋大学石川由希講師（木下准教授との共同研究）の研究室所属の修士学生の修論テーマの一環で、学生が作製したカザリショウジョウバエの変異体とその野生型、および対照群としてキイロショウジョ
ウバエの野生型と変異体のあわせて４つの群の複眼網膜の電顕観察を、学生自身が行うことになった。
このために試料作製から電顕観察までの一連の技術指導を行った。
2. アゲハ触角葉の季節型による比較
本学木下充代准教授研究室の学生のテーマの一環で、アゲハの触角葉を共焦点レーザー顕微鏡で撮像し、画像解析を学生自身が行う。このための顕微鏡撮像から画像解析までの一連の技術指導を行った。

２. 教育• 担当授業1.

先導科学実習（分担）：走査型・透過型電子顕微鏡（主担当）、細胞組織科学（副担当）• 研究指導1.

電子顕微鏡または光学顕微鏡使用者への技術指導• 全学教育
該当なし• 他大学等における授業
該当なし

３. 研究

• 学術出版物
該当なし• 学会発表学会発表

該当なし
企画したシンポジウム等

該当なし
基調講演・招待講演

該当なし

96

• 外部資金該当なし• 外国人招聘
該当なし• 研究活動による受賞
該当なし

４. 社会貢献• 学会活動該当なし• 学外委員会活動
該当なし• アウトリーチ活動
該当なし• 学術誌編集活動
該当なし

５. 大学運営• 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.
2.
3.

安全衛生委員会
化学物質適正管理委員会
環境安全管理協議会（オブザーバー）• 部局委員会等への貢献
1.
2.
3.
4.
5.

共同利用機器担当（透過型電子顕微鏡、走査型電子顕微鏡、共焦点レーザー顕微鏡）
試薬管理担当実験排水管理廃棄物管理
プリンタ、スキャナ、学生 PC 管理（年度後半〜、引継ぎ完了）• 大学事業
該当なし

97

参考資料

98

2022 年度 統合進化科学研究センター 葉山セミナー
日程

第1 回 2022 年7 月1 日

講師・所属
入江 直樹
東京大学・准教授

Wen-Ya Ko
第2 回 2022 年8 月24 日

台湾国立陽明大学・准教授
Jinliang Wang

第3 回 2022 年9 月30 日

第4 回 2022 年10 月12 日

Institute of Zoology,
Zoological Society of
LondonDiddahally R.
Govindaraju
Harvard University

タイトル

主催教員

表現型進化は生物に内在する因子により制
限される

印南 秀樹

Phenome-wide association studies ofdeleterious variants in the Han Taiwanesepeople颯田 葉子

A joint likelihood estimator of relatedness
and allele frequencies from a small sample
of individuals

印南 秀樹

Darwinian Processes in Human Health,Disease and Precision Medicine"

印南 秀樹

99

第 1 回 葉山セミナー 2022 年 7 月 1 日 （於：共通棟２階講義室・オンライン配信）
表現型進化は生物に内在する因子により制限される
入江 直樹 博士
東京大学理学系研究科 准教授
Abstract:
生物は悠久の時間をかけて積み重ねてきた突然変異と自然選択、集団遺伝学的な要因により表現型を多様化させてきた。しかし、それだけの時間をかけても生物の進化は完全に変幻自在というには程遠く、数億年の進化を通して強固に保存されてきた特徴をいくつも持つ。なぜだろうか。例えば、動物の基本的な解剖学的パターン（ボディプラン）は、体のサイズや体表の色などと比べて進化を通して変化しにくいようにみえ、
数億年単位の進化でも変わってこなかった特徴だといえる。こうした表現型進化の法則性を長らく追求してきた結果、いくつかの発見があった。まず、なぜかボディプランを形成する発生段階は、その前後の胚段階と比べて進化的に非常に保守的であるということ。これはヘッケルの反復説にはじまる初期胚保存説（漏斗モデル）を否定する予想外の結果となった。しかし、なぜボディプラン形成期は長い進化の時間を通して強固に保存されてきたのか。その進化メカニズムを探るうちに、生物に内在する２つの内的要因が関わっている可能性がみえてきた。１つは、遺伝子システムの使い回し、もう１つは発生システムの頑健性や安定性などの内的要因が進化的保存に寄与している可能性が浮かび上がった。これらの知見は、そもそもバリエーシ
ョンを生み出しにくい形質は、進化を通しても保存される傾向にあることを示唆している。従来の進化理論
では、突然変異にもとづいた表現型のバリエーションが進化の駆動力であり、そうしてうまれたバリエーシ
ョンに富んだ個体がどのように選抜されていくかによって進化過程を説明してきた。一方で、我々の知見は、そうした選抜以前に、どういった特徴をもった個体が出現しやすいかがその形質の内的要因によって左右されており、これが進化的な顛末にまで影響していることを示している可能性が高い。今後、こうした知見をもとに、進化生物学を表現型進化の予測理論を伴った学問分野に大きく転換させたいと考えている。
(Host: Prof. Dr. Hideki Innan)100

第 2 回 葉山セミナー 2022 年 8 月 24 日 （オンライン配信）
Phenome-wide association studies of deleterious variants in the Han Taiwanese people
Dr. Wen-Ya Ko
Associate professor at National Yang Ming Chiao Tung University, Taipei, Taiwan
Abstract:
The success of precision medicine relies on a comprehensive collection of interpreted genetic profiles andother health records. However, ~80% of genome-wide association studies of common diseases focused on
the populations of European ancestry. It is uncertain to what extent can these findings be translated into
the healthcare system for the non-European populations. Here, we examined the allele frequency
distributions (AFD) of single nucleotide variants (SNVs) in 23, 991 genomes of the Han Taiwanese people
for a total of 14,555,421 imputed SNVs that were pre-grouped based on their CADD (combined
Annotation-Dependent Depletion) scores. We next performed phenome-wide association analyses (with27 cardiovascular metabolic-related traits) for a subset of SNVs (36,5757) that were identified as
deleterious mutations by comparing their AFD with those of synonymous and nonsynonymous
mutations. As a result, 161 significant associations in 110 SNVs were identified in 24 traits. Among them,
85 SNVs are newly identified from this study. In particular, we have identified six variants with strong
effect sizes (|不明.png|>0.7), located at APOB, OR51L1, SLC22A12, MAP3K11, PGAP6 and LDLR.
Among them, rs144467873 and rs200990725 are associated with cardiovascular-related traits. Two
SNVs, rs147341630 and rs375498857, are associated with hematologic traits and, lastly, rs200104135
and rs202052634 are associated with chronic kidney disease-related traits. Our results facilitate genetic
profiling of several common disease susceptibilities particularly for the populations of Han ancestry.
(Host: Prof. Dr. Yoko Satta)

101

第 3 回 葉山セミナー 2022 年 9 月 30 日 （於：共通棟２階講義室・オンライン配信）
A joint likelihood estimator of relatedness and allele frequencies from a small sample ofindividuals
Dr. Jinliang Wang
Institute of Zoology, Zoological Society of London, London NW1 4RY, United Kingdom
Abstract:
As a key parameter in population genetics, relatedness has found wide applications in molecular ecology,
evolutionary biology, conservation, forensics and in studies of human inheritable diseases. It is defined as
the probability that two individuals share an allele due to recent common ancestry. Many estimators havebeen developed to estimate relatedness from genotype data. However, they are invariably biased when asample is small or contains a high proportion of close relatives, because allele frequencies required for
inferring relatedness are poorly estimated in both cases under the impracticable and yet indispensable
assumption of a large sample of unrelated genotypes.
In this study I develop a likelihood method to estimate relatedness and allele frequencies jointly from asample of multilocus genotypes. I propose an expectation maximization (EM) algorithm to update allele
frequencies and the nine condensed identity by descent (IBD) coefficients (∆_i,i=1,2,…,9) of each pair ofsampled individuals iteratively till convergence. Relatedness between and inbreeding coefficients ofindividuals are then calculated from the estimated nine IBD coefficients. The EM algorithm is also
implemented in the reduced non-inbreeding model (∆_i≡0,i=1,2,…,6) to estimate three condensed IBD
coefficients (∆_i,i=7,8,9) and relatedness.
Using simulated and empirical data, I show the new method is much less biased and more accurate thanprevious methods, providing almost unbiased relatedness and inbreeding estimates, when the sampledindividuals are few or/and contain many close relatives. The EM algorithm for the likelihood estimator isfast enough to handle a sample with thousands of individuals and millions of markers, thanks to theparallelization using openMP and MPI. The method is implemented in a software package, EMIBD9,that runs on all major computer platforms.
This study shows allele frequencies and relatedness, although highly correlated and difficult todisentangle from each other when the only information available is a sample of multilocus genotypes, canbe estimated jointly from genotype data of diallelic and multiallelic markers in a likelihood framework.
The new method and software are especially useful for analysing small samples (such as ancient samples
from museums, or samples from endangered species) and samples with a strong genetic structure.
(Host: Prof. Dr. Hideki Innan)102

第 4 回 葉山セミナー 2022 年 10 月 12 日 （於：共通棟２階講義室・オンライン配信）
Darwinian Processes in Human Health, Disease and Precision Medicine
Dr. Diddahally R. Govindaraju
Harvard University
Abstract:
Health and diseases are inextricable features of the evolutionary process. Both infectious and inherited
diseases have been suggested to influence variation and evolution in all organisms, including humans.
Subsequent investigations on the organization of biological diversity have shown that natural selection
operates on all of the component units (levels): genes, cells, tissues, organs, and the individual. In general,
however, individual phenotypes are considered as the primary targets of selection. Malthusian,Darwinian and Mendelian mechanisms influence differential fertility, survival, growth and reproductionof individual phenotypes in populations, collectively defined as Darwinian processes. From a medical
perspective, however, the individual patient is the primary target of clinical care. Factors that initiate
dysfunction and diseases (e.g., cancer, Mendelian, and complex disorders) among phenotypes may be
traced to genomic and cellular levels. For instance, frailty, dysfunction, and morbidity are initiated andpropagated from genes, epigenetic pathways, cells through tissues, organs, and organ systems, ultimately
leading to mortality of the individual. Infectious diseases follow similar sequence as well. Thus, there is anapproximate one-to-one correspondence between Darwinian processes and patterns of morbidity andmortality encountered in clinical practice. Because of these similarities, I argue that a clear
understanding of the Darwinian processes would provide useful insights toward developing moreaccurate predictive, preventive, palliative, and curative measures in relation to the origin andmanifestation of diseases. These similarities also meet the primary goals of the ambitious Precision
Medicine Initiative (PMI) by the NIH, and the more recent “Cancer Moonshot” programs toward
developing “the right drug to the right person at the right time.” I propose to author a book exploring therelationships among human health and diseases as well as patient care in the context of Darwinian
processes.
(Host: Prof. Dr. Hideki Innan)1032022年度 年間授業計画

4月
日

授業

5月
イベント・他日

授業

6月
イベント・他

日

授業

1 金

1

日

1

水

2 土

2

月

2

木

3 日

3

火

憲法記念日

3

金

4 月

4

水

みどりの日

4

土

こどもの日

5

日

5 火

アカデミア探訪・CED
入学式・アカデミア探訪

フレッシュマン
コース

5

木

6 水

研究を多角的に捉える
研究者倫理フレッシュマン
コース

6

金

6

月

7 木

研究の社会史研究を多角的に捉える

フレッシュマン
コース

7

土

7

火

伝える技術①

フレッシュマン

伝える技術②

コース

8

日

8

水

9 土

9

月

先導科学実習

9

木

10 日

10 火

先導科学実習

10 金

8 金

11 月

オリエンテーション・研究者
ガイダンス・実験安全講習会

図書館
ガイダンス

12 火
13 水

生物科学副論文入門

11 水

安全講演会?

先導科学実習12 日

13 金

先導科学実習13 月

14 木

ミクロ・マクロ生物学

14 土

15 金

ミクロ・マクロ生物学

15 日

入試説明会

先導科学
プログレス
先導科学プログレス

科学技術社会論入門

科学技術社会論入門

14 火

先導科学考究①和多

15 水

生物統計学 （佐々木）

16 土

16 月

先導科学実習16 木

生物統計学 （佐々木）

17 日

17 火

先導科学実習17 金

生物統計学 （佐々木）18 月

ミクロ・マクロ生物学

18 水

19 火

ミクロ・マクロ生物学

19 木

先導科学実習19 日

20 水

ミクロ・マクロ生物学

20 金

先導科学実習20 月

生物統計学 （大槻）

安全講演会?

18 土

21 木

21 土

21 火

生物統計学 （大槻）

22 金

22 日

22 水

生物統計学 （大槻）

23 土

23 月

先導科学実習

23 木

24 日

24 火

先導科学実習

24 金

25 月

25 水

科学と社会副論文入門 3限

学生健康診断

25 土

26 火

26 木

先導科学実習

26 日

27 水

27 金

先導科学実習

27 月

28 木

28 土

28 火

29 日

29 水

統合人類学（本郷）30 木

統合人類学（沓掛）

29 金

30 土

昭和の日

30 月

科学と社会副論文入門 3限
科学技術社会論入門

31 火

104

オープン
キャンパス

11 土

12 木

イベント・他

科学と社会副論文入門 3-4限
科学技術社会論入門

2022年度 年間授業計画

7月
日

授業

8月
イベント・他日授業

9月
イベント・他

日

授業

1 金

1 月

1

木

2 土

2 火

2

金

3 日

3 水

3

土

4 木

入試

4

日

5 火

5 金

入試

5

月

6 水

6 土

6

火

7 木

7 日

7

水

8 金

8 月

8

木

9 土

9 火

9

金

10 日

10 水

10 土

4 月

11 月
12 火

科学技術社会論入門

11 木

科学技術社会論入門

先導科学考究②
荻野

山の日

12 月

13 水

13 土

13 火

14 木

14 日

14 水

15 金

15 月

15 木

16 土

16 火

16 金

17 日

17 水

17 土

18 木

18 日

19 火

19 金

19 月

20 水

20 土

20 火

21 木

21 日

21 水

22 金

22 月

22 木

23 土

23 火

23 金

24 水

24 土

25 木

25 日

海の日

24 日
科学と社会副論文入門 3-4限

25 月

26 火

科学技術社会論入門

26 金

26 月
夏季休業

27 水

27 土

27 火

28 木

28 日

28 水

29 金

29 月

29 木

30 土

30 火

30 金

31 日

31 水

105

科学と社会副論文入門
3-4限

11 日

12 金

18 月

イベント・他

先導科学考究③佐々木
夏季休業

2022年度 年間授業計画

10月
日

授業

11月
イベント・他

日

授業

12月
イベント・他

日

授業

1

火

1

木

神経進化発生学
（渡邊）

2 日

2

水

2

金

科学英語
（Todd Gorman）

3 月

3

木

3

土

4

日

1 土
夏季休業

文化の日

統合進化学
（颯田）

EDA・CED
入学式

フレッシュマン
コース

4

金

EDA
RS1
RS2
RS3

フレッシュマン
コース

5

土

5

月

フレッシュマン
コース

6

日

6

火

CSR (Wrighting)
CSR (Presentation)

フレッシュマン
コース

7

月

7

水

ゲノム遺伝学（太田）

8 土

8

火

先導科学考究⑤佐藤

8木

ゲノム遺伝学（太田）

9 日

9

水

進化生理学（颯田）

9

金

10 木

進化生理学（颯田）

10 土

11 金

科学英語
（Todd Gorman）

11 日

4 火
5 水
6 木

7 金

10 月
11 火

スポーツの日

先導科学考究④
小田

12 水

12 土

13 木

13 日

14 金

14 月

15 土

15 火

16 日

16 水

科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

入試説明会

12 月

科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

13 火

先導科学考究⑥
中山

14 水

統合進化学
（五條堀）

15 木

統合進化学
（大槻）

数理生物学（佐々木）

16 金

科学英語
（Todd Gorman）

17 木

数理生物学（佐々木）

17 土

18 火

18 金

科学英語
（Todd Gorman）

18 日

19 水

19 土

19 月

20 木

20 日

20 火

21 月

21 水

22 火

22 木

17 月

21 金

科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

科学英語（Todd Gorman）

22 土
23 日

科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

23 水
科学史・科学技術社会論Ⅰ

勤労感謝の日先導科学プログレス

24 土

25 火

25 金

先導科学プログレス

25 日

26 水

26 土

27 木

28 金

科学史・科学技術社会論Ⅱ

入試
入試

29 土

29 火

30 日

30 水

31 月

26 月

27 日

28 月

統合進化学
（沓掛）

23 金

24 木

24 月

イベント・他

27 火
科学史・科学技術社会論Ⅰ
科学史・科学技術社会論Ⅱ

28 水

29 木

神経進化発生学（渡邊）

科学史・科学技術社会論Ⅰ

冬季休業
30 金

31 土

科学史・科学技術社会論Ⅱ106

2022年度 年間授業計画

1月
日

授業

2月
イベント・他

日

1

日

2

月

3

火

3 金

4

水

5

木

6

金

7

土

7 火

8

日

8 水

9

月

10 火

授業

3月
イベント・他

1 水
冬季休業

オープン
キャンパス

成人の日

先導科学考究⑦
石川

日

授業

1

水

2

木

3

金

4 土

4

土

5 日

5

日

6 月

6

月

7

火

8

水
木

2 木

生命科学と社会Ⅰ（大西・飯田）生命科学と社会Ⅰ（大西・飯田）先導科学考究⑧
倉林

9 木

入試

9

10 金

入試

10 金

11 水

11 土

12 木

12 日

12 日

13 金

13 月

13 月

14 土

14 火

14 火

15 日

15 水

15 水

16 月

16 木

16 木

17 火

17 金

17 金

18 土

18 土

19 日

19 日

18 水
19 木

科学・技術と社会Ⅱ（伊藤）科学・技術と社会Ⅱ
（伊藤）

建国記念日

春季休業

11 土

20 金

20 月

21 土

21 火

21 火

22 日

22 水

22 水

23 月

23 木

24 火

24 金

24 金

25 水

25 土

25 土

26 木

26 日

27 金

27 月

27 月

28 土

28 火

28 火

天皇誕生日

春季休業

29 日

30 月

20 月

23 木

26 日

29 水

統合進化学
（大田、田辺、颯田）

30 木

31 火

31 金

107

イベント・他

春季休業

生命共生体進化学専攻 時間割 (２０２２年度）
前期 時間割

１限

時間
9:00～
10:30

月

２限

10:40～
12:10

３限

13:00～
14:30

科学と社会副論文入門
前期8時限

４限

14:40～
16:10

科学技術社会論入門
前期8時限

５限

16:20～
17:50

火

水

木

金

集中講義科目（下記参照）
先導科学考究15:00～
前期３回

前期 講義日程

科学と社会副論文入門

4/25(3限）, 4/30 (3限), 6/27(3-4限),7/25(3-4限),9/5(3-4限)

科学技術社会論入門

5/30, 6/6, 6/13, 6/27, 7/4, 7/11, 7/25, 7/26

先導科学考究6/14, 7/12, 9/13

先導科学プログレス

6/2, 6/3

前期 集中講義日程

フレッシュマンコース

4/5-8

生物科学副論文入門

4/13

生物統計学

6/15-17, 6/20-22

ミクロマクロ生物学

4/14-15, 4/18,20,21

先導科学実習5/9-10, 12-13, 16-17, 19-20, 23-24, 26-27

統合人類学特論

6/29, 30

後期 時間割

時間
9:00～
１限
10:30
２限

10:40～
12:10

３限

13:00～
14:30

４限

14:40～
16:10

５限

16:20～
17:50

月

火

水

木

科学史・科学技術社会論Ⅱ

集中講義科目（下記参照）

後期8時限
科学史・科学技術社会論Ⅲ

先導科学考究15:00～
後期5回

後期8時限

後期 講義日程

統合進化学

11/4, 12/14, 15, 22, 1/30

科学英語Ⅰ～Ⅴ

10/21, 11/11, 18, 12/2, 12/16

科学史・科学技術社会論Ⅱ

10/17, 24, 31, 11/7, 14, 28, 12/5, 12

科学史・科学技術社会論Ⅲ

10/17, 24, 31, 11/7, 14, 28, 12/5, 12

先導科学考究10/11, 11/8, 12/13, 1/10, 2/7

先導科学プログレス

11/24-25

後期 集中講義日程

フレッシュマンコース

10/4-7

科学・技術と社会Ⅱ

1/18, 19

生命科学と社会Ⅰ

2/2-3

進化生理学特論

11/9, 15

神経進化発生学特論

11/30, 12/1

数理生物学特論

11/16-17ゲノム進化学特論（太田）12/7-8108

金

科学英語Ⅰ～Ⅴ
後期 全10 時限(Office hour;
14:40-16:10)

2022 年度シラバス

109

110
109
110

111
110
111

112
111
112

113
112
113

114
113
114

115
114
115

116
115
116

117
116
117

118
117
118

119
118
119

120
119
120

121
120
121

〜Ⅴ

122
121
122

123
122
123

124
123
124

125
124
125

126
125
126

太田

博樹

127
126
127

128
127
128

〜Ⅴ

2023/2/7 ： 松原和純 （中部大学・准教授）「性染色体と性決定機構の進化」

129
128
129

〜Ⅴ

2023/2/7 ： 松原和純 （中部大学・准教授）「性染色体と性決定機構の進化」

130
129
130

2022 年度先導科学考究 講師及び日程一覧
日程

講師・所属
和多 和宏
北海道大学・教授

第1 回 2022 年6 月14 日 Kazuhiro Wada
Professor, Hokkaido
University
荻野 肇
広島大学・教授
第2 回 2022 年7 月12 日 Hajime Ogino
Professor, Hiroshima
University
佐々木 謙
玉川大学・教授
第3 回 2022 年9 月13 日 Ken Sasaki
Professor, Tamagawa
University
小田 亮
名古屋工業大学・教授
第4 回 2022 年10 月11 日 Ryo Oda
Professor, Nagoya Instituteof Technology
佐藤 哲
愛媛大学・特命教授
第5 回 2022 年11 月8 日 Tetsu Sato
Distinguished Professor,
Ehime University
中山 一大
東京大学・准教授
第6 回 2022 年12 月13 日 Kazuhiro Nakayama
Associate Professor, The
University of Tokyo

第7 回 2023 年1 月10 日

第8 回 2023 年2 月7 日

タイトル

担当教員

自発的な学習が脳内の遺伝子発現を介していかにして学習発達に影響を与えるのか？
A neural transcriptional impacts on vocal
learning by self-motivated singing behavior insongbirds

渡邊 崇之

ゲノム重複に伴う遺伝子ネットワークの進化
Evolution of gene regulatory networks following
genome duplication events

颯田 葉子

社会性昆虫で見られる繁殖分業の進化
Evolution of reproductive division of labor insocial insects

木下 充代

ヒトの利他性の進化認知的基盤
Evolutionary cognitive foundations of humanaltruism

大槻 久

社会的弱者との協働による知の共創：トランスディシプリナリー研究の新たな地平
Knowledge co-creation partnering with sociallyvulnerable people: A new horizon oftransdisciplinary research

飯田 香穂里ヒトのありふれた疾患と適応進化
Human common diseases and adaptive
evolution

石川 尚人
海洋研究開発機構・副主任
研究員

生態学研究における放射性炭素と分子レベル同位体分析の利用Naoto F. Ishikawa
Researcher, JAMSTEC

Using radiocarbon and compound-specificisotope analyses in ecological research

松原 和純
中部大学・准教授

性染色体と性決定機構の進化

Kazumi Matsubara
Associate Professor, Chubu
University

Evolution of sex chromosomes and sex
determination systems

五條堀 淳

蔦谷 匠

131

田辺 秀之

2022年度 先導科学考究①： 2022年6月14日（火）
自発的な学習が脳内の遺伝子発現を介していかにして学習発達に影響を与えるのか？
A neural transcriptional impacts on vocal learning by self-motivated singing behavior insongbirds
和多和宏・北海道大学 理学研究院 生物科学部門・教授
Kazuhiro Wada, Professor, Department of Biological Sciences,
Faculty of Science, Hokkaido University
Abstract：
Birdsong, like human speech, is acquired through vocal learning during a critical period. However, the neuronalmolecular mechanisms regulating the vocal learning period remain elusive. Here we show that the zebra finch,
a closed-ended vocal learner, generated juvenile-like highly plastic songs even at adulthood after restricting vocal
practice during the critical period. This preserved vocal plasticity was accompanied by the intense induction of acluster of singing activity-driven genes in a vocal motor cortex analogous region, as observed in juveniles. The
singing-prevented birds retained the ability to develop a tutored song with species-specificity at the adult stage.
A functional association between transcriptional regulation and vocal plasticity was also observed in the canary,an open-ended learner, characterized by the re-induction of the same activity-driven genes during song redevelopment at adulthood. These results indicate an active involvement of activity-driven gene transcriptional
plasticity for modulation of song plasticity during the vocal learning period. Our study using a songbird provides
a new insight that self-motivated vocal practice acts as a non-genetic factor to regulate vocal learning plasticity.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Doupe AJ, Kuhl PK. Birdsong and human speech: Common themes and mechanisms.
Annu Rev Neurosci. 1999;22:567-631. doi: 10.1146/annurev.neuro.22.1.567.

2.

今井礼夢, 森千紘, 和多和宏「ソングバードの囀りを制御する神経回路・遺伝子」『生物の科学 遺伝』 64:40-47, 2010

3.

Hayase S, Wang H, Ohgushi E, Kobayashi M, Mori C, Horita H, Mineta K, Liu WC, Wada K. Vocal practiceregulates singing activity-dependent genes underlying age-independent vocal learning in songbirds. PLoS
Biology 16:e2006537. 2018 doi: 10.1371/journal.pbio.2006537

4.

Hayase S, Shao C, Kobayashi M, Mori C, Liu WC, Wada K. Seasonal regulation of singing-driven gene
expression associated with song plasticity in the canary, an open-ended vocal learner. Molecular Brain
14:160. 2021 doi: 10.1186/s13041-021-00869-5

受け入れ担当教員：渡邊崇之

1322022年度 先導科学考究②： 2022年7月12日（火）ゲノム重複に伴う遺伝子ネットワークの進化
Evolution of gene regulatory networks following genome duplication events
荻野 肇・広島大学・教授
Hajime Ogino, Professor, Hiroshima University
Abstract：
In general, genome duplication promotes gene evolution by reducing purifying selection pressure andaccumulating mutations in individual duplicated gene pairs. The patterns of gene evolution can be broadly
categorized as neofunctionalization, specialization, subfunctionalization, and pseudogenization. However, theprocess leading to such gene evolution and the resulting changes in gene networks remain unclear. In order toaddress this issue, it is necessary to experimentally compare the functional differences in cis- and coding
sequences of orthologous genes between an ancestral-type species with a pre-duplicated genome and those withthe duplicated genome. In this seminar, I will talk about the comparative studies using four species; amphioxus
that has split from the vertebrate lineage before the genome duplication events, Xenopus tropicalis thatmaintains the ancestral-type duplicated genome of vertebrates, Xenopus laevis that possesses a uniqueallotetraploid genome, and zebrafish that possesses the teleost-specific tetraploid genome. Through these studies,
I will also highlight the power of Xenopus system for evolutionary functional genomics.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Ochi, H. et al. Co-accumulation of cis-regulatory and coding mutations during the pseudogenization of the

Xenopus laevis homoeologs six6.L and six6.S. Dev. Biol., 427: 84-92 (2017) (doi: 10.1016/j.ydbio.2017.05.004).
2.

Session, A. M. et al. Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis. Nature, 538: 336-343 (2016)(doi: 10.1038/nature19840).

3.

荻野 肇, 全ゲノム重複に伴うシス調節配列の進化．生体の科学 66: 256-260 (2015).

4.

Ochi, H. et al. Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of pax2 and pax8
paralogues. Nat. Commun., 3: 848 (2012) (doi: https://doi.org/10.1038/ncomms1851).

5.

Cañestro, C. et al. Impact of gene gains, losses and duplication modes on the origin and diversification ofvertebrates. Semin. Cell Dev. Biol., 24: 83-94 (2013) (https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2012.12.008).

6.

Holland, L. Z. Chordate roots of the vertebrate nervous system: expanding the molecular toolkit. Nat. Rev.

Neurosci. 10: 736-746 (2009) (doi: 10.1038/nrn2703).
受け入れ担当教員：颯田葉子133

2022年度 先導科学考究③： 2022年9月13日（火）
社会性昆虫で見られる繁殖分業の進化
Evolution of reproductive division of labor in social insects
佐々木 謙・玉川大学・教授
Ken Sasaki, Professor, Tamagawa University
Abstract：
Convergent evolution of eusociality with the division of reproduction and its plastic transition in insects has long
attracted the attention of researchers. To explain the evolutionary scenario of the reproductive division of labor, I
focus on the most basic concepts, i.e., the ovarian ground plan hypothesis (OGPH). The OGPH assumes thephysiological decoupling of ovarian cycles and behavior into reproductive and nonreproductive individuals. I
introduce recent progress in the understanding of the neurohormonal regulation of reproduction and social
behavior in eusocial insects, with an emphasis on biogenic amines. Biogenic amines are key substances involvedin the switching of reproductive physiology and modulation of social behaviors. Dopamine and tyramine havepivotal roles in the formation of reproductive skew irrespective of the social system, whereas octopamine andserotonin contribute largely to non-reproductive social behaviors. These decoupling roles of biogenic amines areseen in the life cycle of a single female in a solitary species, supporting OGPH. Juvenile hormone (JH) promotes
reproduction with dopamine function in primitively eusocial species, whereas it regulates non-reproductive social
behaviors with octopamine function in advanced eusocial species. The signal transduction networks between JH
and the biogenic amines have been rewired in advanced eusocial species, which could regulate reproduction in
response to various social stimuli independently of JH action.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Sasaki, K., Harada, M. (2020) Dopamine production in the brain is associated with caste-specific morphology
and behavior in an artificial intermediate honey bee caste. PLoS ONE 15, e0244140.

2.

Sasaki, K., Yokoi, K., Toga, K. (2021) Bumble bee queens activate dopamine production and gene expression
in nutritional signaling pathways in the brain. Sci. Rep. 11, 5526.

3.

Sasaki, K., Okada, Y., Shimoji, H., Aonuma, H., Miura, T. and Tsuji, K. (2021) Social evolution withdecoupling of multiple roles of biogenic amines into different phenotypes in Hymenoptera. Front. Ecol. Evol.
9, 659160.

受け入れ担当教員：木下充代

1342022年度 先導科学考究④： 2022年10月11日（火）ヒトの利他性の進化認知的基盤
Evolutionary cognitive foundations of human altruism
小田 亮・名古屋工業大学・教授
Ryo Oda, Professor, Nagoya Institute of Technology

Abstract：
Humans are animals that exhibit a higher degree of altruism than other primate species. Extensive cooperation
supported by such altruism has enabled humans to build highly complex societies, which in turn have allowed
them to spread to various environments on earth. Traditional psychology has mainly dealt with mechanism anddevelopment of human altruism. Functional significance and evolutionary origin of altruism, however, is also
important. The condition for altruism to evolve by natural selection is “positive assortment”, and in order toguarantee the positive assortment, the variance within a group must be small, while the variance between groups
must be large, which has brought “parochial altruism”. Some features of reasoning and memory in humans arethought to have been adapted to the parochial altruism. On the other hand, humans sometimes show
“generalized altruism” beyond each group they belonging to. It is important to clarify the relationship between
the function of the mind as a legacy of evolution and the structure and history of human social groups in order tounderstand altruism. In this lecture, I will introduce the results of empirical research on the characteristics ofhuman cognition that underlie advanced altruism, and consider how these characteristics have evolved
interacting with human culture and societies.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

小田 亮 (2011) 「利他学」 新潮選書.

2.

小田 亮 (2013) 進化と人間行動 五百部裕・小田亮（編著）「心と行動の進化を探る」（pp. 1–35） 朝倉書店.

3.

Bowles, S., & Gintis, H. (2011). A Cooperative Species: Human Reciprocity and Its Evolution. New Jersey:
Princeton University Press. 竹澤正哲・高橋伸幸・大槻久・稲葉美里・波多野礼佳（訳）（2017）「協力する種」
NTT 出版.

4.

小田亮 (2020) なぜ人は助け合うのか：利他性の進化的基盤と現在. 心理学評論, 63: 308–323.

https://www.jstage.jst.go.jp/article/sjpr/63/3/63_308/_article/-char/ja
受け入れ担当教員：大槻 久

1352022年度 先導科学考究⑤： 2022年11月8日（火）
社会的弱者との協働による知の共創：トランスディシプリナリー研究の新たな地平
Knowledge co-creation partnering with socially vulnerable people: A new horizon oftransdisciplinary research
佐藤 哲・愛媛大学・特命教授
Tetsu Sato, Distinguished Professor, Ehime University

Abstract：
Vulnerable and marginalized people under poverty conditions in developing countries heavily depend on various
natural resources to sustain and improve their livelihood and well-being. We have conducted transdisciplinary
research together with these vulnerable people as a genuine partner of research、focusing on visualizing realworld challenges and innovative practices emerging among them to tackle with these challenges in complex
social-ecological systems. We have developed a transdisciplinary methodology of dialogue and deliberation withvulnerable people in Malawi, East Africa, aimed to co-design research agenda, co-produce integrated knowledge
and skills, and promote collective actions through in-depth dialogue and collective thinking. Rich local andpractice-based knowledge and scientific knowledge derived from diverse research domains have been integrated
through the transdisciplinary research. We have succeeded in identifying many innovators and their innovations
to sustainably manage natural resources and improve quality of life and well-being of vulnerable people. In thislecture, the process and mechanism of dynamic evolution of these community-based innovations will be discussed
using actual case examples. I will discuss significant potentials of knowledge and skills emerging amongcommunity-based innovators, importance of transdisciplinary dialogue to facilitate mutual learning, andemergence of dynamic and adaptive processes to transform social-ecological systems. Such transdisciplinary
research will contribute to better understanding of adaptive societal transformation mechanisms towardsustainable futures, and to co-create diverse collective actions to improve livelihood and well-being of
marginalized and vulnerable people in developing countries.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Lang DJ, Wiek A, Bergmann M, Stauffacher M, Martens M, Moll P, Swilling M, Thomas CJ (2012)
Transdisciplinary research in sustainability science: practice, principles, and challenges. Sustain Sci 7(suppl.
1):25–43. https://doi.org/10.1007/s11625-011-0149-x

2.

Sato T, Chabay I, Helgeson J (2018) Introduction. In Transformations of Social-Ecological Systems: Studies
in Co-creating Integrated Knowledge Toward Sustainable Futures, Tetsu Sato, Ilan Chabay, Jennifer
Helgeson (Eds.). pp. 1-7. Springer Nature, Singapore. https://doi.org/10.1007/978-981-13-2327-0_1

3.

Sato T, Chabay I, Helgeson J (2018) Conclusion and Way Forward. In Transformations of Social-Ecological
Systems: Studies in Co-creating Integrated Knowledge Toward Sustainable Futures, Tetsu Sato, Ilan

136

Chabay, Jennifer Helgeson (Eds.). pp. 409-416. Springer Nature, Singapore. https://doi.org/10.1007/978-98113-2327-0_22
4.

Sato T, Nakagawa C, Pemba D (2018) Innovation Emerging from Livelihoods: Natural Resource
Management in Lake Malawi. In: Sato T, Chabay I, Helgeson J (eds) Transformations of Social-Ecological
Systems: Studies in Co-creating Integrated Knowledge Toward Sustainable Futures. Springer Nature,
Singapore, pp 137-154. https://doi.org/10.1007/978-981-13-2327-0_8

5.

Sato T, Pemba D (2022) Villagers Managing Lake Fisheries Resources by Themselves: Mbenji Islands in
Lake Malawi. In: Kakuma S, Yanagi T, Sato T (eds) Satoumi Science: Co-creating Social-ecological Harmony
Between Human and the Sea. Springer Nature, Singapore (forthcoming)

6.

Wiek A, Lang DJ (2016) Transformational sustainability research methodology. In: Heinrichs H, Martens P,
Michelsen G, Wiek A (eds) Sustainability science. Springer, Dordrecht, pp 31–41. http://doi.org/10.1007/97894-017-7242-6_3

受け入れ担当教員：飯田香穂里

1372022年度 先導科学考究⑥： 2022年12月13日（火）
ヒトのありふれた疾患と適応進化
Human common diseases and adaptive evolution
中山一大・東京大学大学院新領域創成科学研究科・准教授
Kazuhiro Nakayama, Associate Professor, Graduate School of Frontier Sciences, The
University of Tokyo
Abstract：
The cause of common human diseases consists of genetic factors (genome variations) and non-genetic factors (e.g.,age and lifestyle). In addition to genetic drift, the genetic adaptation that occurred in the past human populations
is thought to have shaped the genetic variation influencing the common disease susceptibilities in modern
populations. Recent advances in understanding the human genome diversity shed light on new aspects of theevolution of common diseases. For instance, variations in obesity and its complications in modern humans havebeen considered to be driven by local adaptation to famine. Moreover, adaptation to cold environments has
emerged as part of the genetic basis for obesity resistance in modern humans. In this lecture, I will review ourand others’ studies on the evolution of common human diseases, especially of obesity and related complications
in East Asians, including Japanese.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Nakayama K., et al., Mol. Biol. Evol., 2017 34:1396-46.

2.

Nakayama K. and Iwamoto S., J. Physiol. Anthropol., 2017 36:16.

3.

Nakayama K et al., Hum. Genet., 2013 132:201-17.

受け入れ担当教員：五條堀 淳

1382022年度 先導科学考究⑦： 2023年1月10日（火）
生態学研究における放射性炭素と分子レベル同位体分析の利用
Using radiocarbon and compound-specific isotope analyses in ecological research
石川尚人・海洋研究開発機構・副主任研究員
Naoto F. Ishikawa, Researcher, JAMSTEC
Abstract：
Why are so many species coexisting with complex interactions on the Earth? What will happen to us if
biodiversity is significantly declined in the near future? To answer these questions, food web studies have beenplaying an important role in ecological science over the past century. I will review the use of radiocarbon andcompound-specific isotope analysis of some key molecules such as amino acids and chlorophylls for better
understanding food web structure in nature. Radiocarbon provides a unique signature for carbon cycling, andamino acid nitrogen isotopic composition resolves complex food webs with mixed organic matter sources.
Furthermore, by collaborating with other techniques such as environmental DNA and mathematical modelling,
we are able to identify factors controlling dynamics of the Earth ecosystem. The research approach introduced inthis talk will open a new frontier to explore the relationship between biodiversity and ecosystem functioning
under global change.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Ishikawa, N. F., Hyodo, F., & Tayasu, I. (2013). Use of carbon-13 and carbon-14 natural abundances for
stream food web studies. Ecological Research, 28(5), 759-769.

2.

Ishikawa, N. F. (2018). Use of compound-specific nitrogen isotope analysis of amino acids in trophic ecology:
assumptions, applications, and implications. Ecological Research, 33(5), 825-837.

受け入れ担当教員：蔦谷 匠

139

2022年度 先導科学考究⑧： 2023年2月7日（火）性染色体と性決定機構の進化
Evolution of sex chromosomes and sex determination systems
松原 和純・中部大学・准教授
Kazumi Matsubara, Associate Professor, Chubu University
Abstract：
Sex can be determined either by genes on specialized chromosomes (genotypic sex determination, GSD) or byenvironmental factors (environmental sex determination, ESD). Sex-determining systems are highly divergent
between different lineages of vertebrates. For example, in reptiles, birds and snakes have GSD, whereas all
crocodilians and tuataras exhibit temperature-dependent sex determination (TSD). Sex-determining
mechanisms in turtles and squamates include GSD with male heterogamety (XY type of sex chromosome), GSD
with female heterogamety (ZW type of sex chromosome), and TSD. Carrying the diversity in sex chromosomes
and sex determination systems, vertebrate is one of the best animal taxa in which to extend the study of how sex
chromosomes and sex determination systems have changed throughout the evolutionary history. In recent years,
studies on evolution and transitions of vertebrate sex chromosomes and sex determination have maderemarkable progress due to advances in genome sequencing and integration of cytogenetics knowledge. In thislecture, I will talk about 1) origin of sex, 2) theoretical process of sex chromosome evolution and 3) insights into
the transition mechanisms of sex-determination systems, transition from a GSD to another GSD and from GSD
to TSD, in vertebrates obtained from the latest researches.
予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
1.

Kikuchi K, Hamaguchi S. (2013) Novel sex-determining genes in fish and sex chromosome evolution. Dev

Dyn 242(4): 339-353.
2.

Doris B, Mank JE, Peichel CL, Kirkpatrick M, Otto SP, Ashman TL, Hahn MW, Kitano J, Mayrose I, Ming
R, Perrin N, Ross L, Valenzuela N, Vamosi JC and Tree of Sex Consortium. (2014) Sex determination: why
so many ways of doing it? PLoS Biol, 12(7): e1001899.

3.

Holleley CE, O’Meally D, Sarre SD, Graves JAM, Ezaz T, Matsubara K, Azad B, Zhang X, and Georges A(2015) Sex reversal triggers the rapid transition from genetic to temperature dependent sex. Nature523(7558): 79–82.

4.

Zhang X, Wagner S, Holleley CE, Deakin JE, Matsubara K, Deveson IW, O'Meally D, Patel HR, Ezaz T, Li
Z, Wang C, Edwards M, Graves JAM, and Georges A (2022) Sex-specific splicing of Z- and W-borne nr5a1
alleles suggests sex determination is controlled by chromosome conformation. Proc Natl Acad Sci USA
119(4): e2116475119.

5.

Zhu ZX, Matsubara K, Shams F, Dobry J, Wapstra E, Gamble T, Sarre SD, Georges A, Graves JAM, Zhou
Q and Ezaz T (2022) Diversity of reptile sex chromosome evolution revealed by cytogenetic and linked-read140

sequencing. Zool Res 43(5): 719-733.
6.

Terao M, Ogawa Y, Takada Shuji, Kajitani Rei, Okuno M, Mochimaru Y, Matsuoka K, Itoh T, Toyoda A,
Kono T, Jogahara T, Mizushima S and Kuroiwa A. (2022) Turnover of mammal sex chromosomes in the

Sry-deficient Amami spiny rat is due to male-specific upregulation of Sox9. Proc Natl Acad Sci USA 119(49):e2211574119.
受け入れ担当教員：田辺秀之

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