No.7

OCTOBER2006
第7号（平成18年10月）

生物学と情報科学
生命人間情報科学専攻

教授

ルで解明し、個々の生物の外見上の違いの下に隠渡邉日出海

れていた共通の分子機構の存在を明らかにしてき

最近、ある著名な先生から、高校生に人気のあ た。このような深い理解が得られたことにより、る理系分野は生物学だと伺い、大変驚かされた。 一見多様に見える生物界全体を理解し、また、得私が高校生だったころは、物理学あるいは化学で られた知識に基づいた様々な応用が可能になった。
はなく生物学を選ぶとちょっと変わり者とみなさ 現在の生物学を学んでも、だから何、という疑問れたからだ。物理学は、この宇宙に存在する万物 が生じることはおそらくあまり無い。
を支配する法則について扱う学問であり、化学は、この大変革における主役は間違いなくゲノムで物理学を基礎としてあらゆる物質を扱う分野であ ある。20世紀の生物学における最も重要な発見
り、いずれも、高い普遍性を持つ。一方、生物学 の一つは、ウイルスから、大腸菌、カビ、植物、は、広大な宇宙において点のような存在である地 そして、ヒトにいたるまでのあらゆる生物が共通球の表層に特異的に存在する有機物質の特殊な塊 に核酸という遺伝物質を持ち、その微妙な違いにである多様な生物を個別的に研究する学問であり、 よってそれぞれの性質が決定されているという事対象が極めて具体的に限定または細分化されてい 実である。その遺伝物質の総体がゲノムである。
た（過去形である理由は以下を参照）。そのよう あらゆる生物がゲノムという共通要素を持つことな学問よりも、より普遍性の高い物理学や化学の が、生物を統一的に理解することを可能にしてい方が「格」が上であるように思われた。実は、私 る。
自身も、高校では生物学を選択しなかった。

ゲノムの遺伝情報、すなわち核酸配列の決定が生物学が最近になって人気が出てきた理由は何 本格的に行われ始めた 10年ほど前から、ゲノムであろうか。以前の生物学は、遺伝学における法 や生物に関連する情報を解析するための学問分野
則などを除くと、生物全体に共通するものについ に対して、バイオインフォマティクス、あるいは、ての理解が十分に進んでおらず、博物学的色彩が 生物情報学という名前が特別に与えられるように濃かった。そのため、ある生物についての知識を なった。それまでの生物学では、実験によって得学んだところで、だから何、という疑問がつきま られる情報は、それを実施した生物学者が直接解とうことが多かった。また、生物学の研究はわけ 釈することが可能なもの、例えば、ある特定の物のわからない生き物を観察するといった、世間の 質の大きさや、形、量、分布などに関するものが営みから隔絶した世界のものというイメージも確 ほとんどを占めていた。しかし、ゲノムや細胞内かにあった。しかし、ここ 20年ほどの間に生物 全物質を扱うようになってからは、得られる情報学は大きな変化を遂げ、生物の仕組みを分子レベ が膨大かつ網羅的になり（ヒトゲノムの全遺伝情−1−

報の場合、3ギガバイト分の文字列になる）、それらは全て数値や文字列の形に抽象化されるようになった。つまり、生物は、計算機上のデータへの変換を通して丸ごと理解されるようになった。特定の生物の膨大で網羅的な情報が計算機上で誰でも利用できるようになったことは生物学者にとって大変すばらしいことである。しかし、データの量と複雑さの「理解」の生物学的理解ために従来のように、それらの情報を目で見て、を考えると、再現性を基礎とする法則や統計有用情報を引き出すといったことが難しくな学的規則の集大成である物理学によって世界ってしまった。そこで、バイオインフォマテ史を説明できないのと同様に生物学の全てをィクスという情報科学の応用分野が必要にな扱うことは不可能であることがわかる。したった。当初、この分野は、生物学の本道からがって、冒頭に書いたような生物学の格付け外れた怪しげなものと多くの生物学者から見は正しくないか無意味であると言えよう。

られていたように思う。しかし、筆者も直接以上のような見方に加えて、地球外生命や、かかわったヒトゲノムプロジェクトが国主導生命と地球、太陽系との関係についての研究で強力に推進され、バイオインフォマティク分野であるアストロバイオロジーが米国のス研究を通して短期間で膨大な成果が生み出ＮＡＳＡを中心に進められていることを考えされたことによって状況が一変した。一般の人々ると、現代生物学は既に特殊な存在でも、他にはまだ耳慣れない分野であろうが、今では、の学問分野の下位に位置するものでもなくな

バイオインフォマティクスは生物学ばかりでっていることがわかってくる。この認識が広なく医学や農学、薬学をも支える重要な学問まったことが近年における生物学の相対的な分野とみなされている。

人気の高まりをもたらしたのかもしれない。

他の分野においても、あらゆる事象を一旦もう一つ、生物学のメタ科学的側面も私にはデータ化しそれを計算機上で処理すること、魅力的に思えてならない。物理法則を発見しすなわち情報処理を通して規則を発見したりたり、生物の仕組を明らかにするといった科意思決定を行ったりすることが一般化している。

学することの本質である「理解」は、生物体

それは、あらゆる事物は、抽象化された情報の一部である脳の働きによるものであり、脳という形にしてしまえば同じように扱うことが扱える情報を脳が行える仕方で処理した結ができるからである。情報科学は、しばしば果である。その理解の場である脳の構造や働メタ科学であると言われるが、それは、実在きを生物学が解き明かそうとしている。したする事物を直接の研究対象とする様々な「実がって、生物学は、情報科学とは異なる次元科学」で得られる情報を統一的に扱うためのでの正にメタ科学であり、科学することの理学問であるからであろう。情報科学の応用分解を可能にするものである。この点が私には野に含められるようになった現代生物学は、とても魅力的に思え、私の目は明確に生物学情報科学の助けを借りて他の実科学と対等なを向いている。脳の構造や働きを規定してい存在となった。

るものはゲノムである。私は、そのゲノムの理解を通して、科学するヒトという生物の「理また、生物は物理学によって完全に理解できるはずだと考える人が少なからずいるが、それはおそらく誤りである。たとえば、いくつもの偶然が生物進化を決定付けてきたこと−2−解」を理解することを夢見ている。

平成１８年度科学研究費補助金採択状況

なお、今後専攻別に二次募集を行なうかどう前号で報告した本研究科採択分 71件に加え、かが決定されます。二次募集を行なう場合の平成 18年７月７日付で新たに特定領域研究（新日程は次の通りです（詳細は募集要項でお確規）１件 840万円が追加採択されました。

かめ願います）。

採択件数および金額は、量子集積エレクト

平成18年12月上旬

募集要項配布開始

ロニクス研究センターの５件、ベンチャー・

平成19年 １月上旬 出願資格予備審査申請期間

ビジネス・ラボラトリーの１件を合わせて計

平成19年 １月下旬〜２月上旬

78件、総額 4億 6739万円となりました（重平成19年２月21日(水)〜22日(木) 入学試験

願書受理

複制限により廃止された１件とその既使用額

情報エレクトロニクス学科コース分属は含まない）。

情報エレクトロニクス学科発足後初となる

平成19年度大学院入学試験

コース分属の結果が９月 26日に発表されまし平成 19年度北海道大学大学院情報科学研究た。対象者は在籍期間および修得単位数の要

科博士後期課程ならびに修士課程の入学試験が、件を満たした平成 17年度入学者（学部２年次８月３日、４日の両日実施されました。昨年

学生）179名、各コースへの分属数は下表の度まで８月下旬の実施でしたが、今年度は８通りです。新学科体制の下では、学生の志望月上旬に繰り上げ、試験日程も３日間から２に応じて一定の割合までコース受入定員を調日間へと短縮されました。

整することとなっています。各コースの専門科目は３年次前期（平成 19年４月）より開講

入試結果は８月 11日に発表され、下表のされます。

219名（博士後期課程 29名、修士課程 190名）が合格しました。

平成 18年度情報エレクトロニクス学科コース分属結果

平成 18年 8月実施入学試験結果
専

攻定

複合情報学
コンピュータサイエンス
情報エレクト
ロニクス
生命人間
情報科学
メディア
ネットワークシステム
情報科学
計員 志願者数
合格者数
24
28+①25+①
4
1+③
1+③
24
34
28
8
1+①
1+①
39
50
39
85+①5+①33
32
23
6
2+③2+③30
42+①38+①
8
3+④
3+④
27
36+②33+②
82+③2+③
177 222+④ 186+④
42
14+⑮
14+⑮

コース

標準定員 分属者数

情報工学

2522

コンピュータサイエンス

2531

電子情報

40

32

生体情報

3326

メディアネットワーク

3036

システム情報

27

32

計180

179

・上段：修士課程、下段：博士後期課程
・平成 19年４月入学＋平成 18年 10月入学（丸囲み）・博士後期課程 10月入学者は外国人留学生および社会人特別選抜の合計

コース説明会（7月 19日実施）の様子−3−

メンタルヘルス講演会

広報ホームページ

平成 18年７月 14日㈮ 17：00より A21教室において、北海道大学保健管理センター精神衛生相談担当の朝倉聡先生を講師にお招きし、メンタルヘルス講演会が開催されました。
近年、学業、進路、私生活などについて悩みを持つ学生が増加傾向にあり、そうした学生やその指導に当たる教職員への助言のため、保健管理センター（0117063603）
では毎週月・水・金曜日の13：00〜 15：30の間、精神衛生相談を受け付けています。相談の後、必要に応じて専門のカウンセラーによるカウンセリングを受けることもできますので、学生、教職員とも独りで悩まず、些細に思えることでも遠慮なく相談をしてほしいと呼びかけています。

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p://www.
eng.
hokudai.
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jp/news/publication/)
研究科TOP＞広報＞工学研究科・情報科学研究科・工学部広報【ニュース】●第 111回 8大学工学部会長会議開催
一覧＞ 2006/05/12●省エネルギーの取組について-光熱使用量削減効果 一覧＞ 2006/05/24●平成 18年度文部科学省科学研究費補助金交付決定
研究題目一覧および平成 17年度各種研究助成金等受領状況一覧 (PDF)一覧＞ 2006/06/22●平成 18年度 北工会大運動会・懇親会開催
一覧＞ 2006/07/
11●オープンユニバーシティ ･工学部体験入学実施
一覧＞ 2006/08/21

メンタルヘルス講演会（講師・朝倉聡先生）の様子

情報科学研究科ホームページ(http://www.
ist.
hokudai.
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jp/index̲jp.
php/)○第 8回情報系研究科長会議報告が掲載されました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
05.
30○夏季期間における工学系建物の閉鎖 (試行 )についての案内が掲載されました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
06.
21○ネットジャーナルを更新しました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
07.
01○情報科学研究科パンフレット、リーフレット 20062007を掲載しました。

【受賞】
2006年 3月 17日
溝口 知広
システム情報科学専攻 修士課程 2年
2006年度精密工学会春季大会ベストプレゼンテーシ
ョン賞 受賞
2006年 3月 24日
村井 哲也
コンピュータサイエンス専攻 助教授
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Symposium onManagementEngi
neering,受賞
2006年 5月 9日
BuiHuuPhu
メディアネットワーク専攻 博士課程２年I
EEE VTS Japan 2006 Young Resear
cher'sEncouragementAward受賞
2006年８月 21日
酒井 洋輔
情報エレクトロニクス専攻 教授
電気学会基礎・材料・共通部門特別賞 学術・貢献賞 受賞
2006年８月 24日
酒井 洋輔
情報エレクトロニクス専攻 教授
照明学会創立 90周年功績賞 受賞

研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
07.
07○研究科長インタビューを掲載しました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
07.
11○平成 18年度北海道大学大学院情報科学研究科公開講座のお知らせを掲載しました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
07.
14

ＩＳＴ ＮＥＷＳ No.
7
平成18年11月2日発行
発行：北海道大学大学院情報科学研究科○ISTNE
WS第 6号（PDF）を掲載しました。
研究科TOP＞ニュース一覧＞2006.
07.
26

−4−

広報・情報室