Image Lab™ ソフトウェア
ユーザーガイド
Image Lab™ソフトウェア Ver. 6.1～

バイオ・ラッド テックコール
製品の学術的お問い合わせ並びに修理・メンテナンスに関するお問い合わせは弊社テックコールにお問い合わせください。
受付時間： 月曜日～金曜日（祝祭日を除く）
AM 9:00 ～ PM5:00
電話：
03-6404-0331
Fax：
03-6404-0334
E-Maillife_ps_jp@bio-rad.com

注意事項
本マニュアルの全てまたは一部をバイオ·ラッド ラボラトリーズ株式会社からの書面による許可なしに複製、編集、再配布、することを禁じます。
ここで言う複製には電子的コピーおよびハードウェアコピー、録画、撮影、その他あらゆるメディアへの保存を含みます。
バイオ·ラッド ラボラトリーズ株式会社は、その製品やサービスをいつでも変更する権利を所有します。この取り扱い説明書も予告なしに内容を変更することがあります。
正確性を確保するために万全を期していますがバイオ·ラッド ラボラトリーズ株式会社では、この情報やアプリケーションに起因するいかなる失敗、発生した損害について、法的責任を負いません。
本書で使用されているすべての商標は、それぞれの所有者に帰属します。
Copyright © 2021 by Bio-Rad Laboratories. All rights reserved.

目次
はじめに ................................................................................................................................. 1
第 1 章 Image Lab ソフトウェアのセットアップ ........................................................................ 3
コンピューターの推奨仕様 （バージョン 6.1） .................................................................................. 3
セキュリティエディションをインストールする前に .............................................................................. 4
Image Lab ソフトウェアのインストール ............................................................................................ 4

第 2 章 Image Lab ソフトウェアの概要 ................................................................................... 9
メイン画面 ...................................................................................................................................... 9
スタートページ .............................................................................................................................. 10
メインツールバー .......................................................................................................................... 10
解析用ツール ................................................................................................................................ 11
ステイタスバー ............................................................................................................................. 12
上部メニューコマンド..................................................................................................................... 12

第 3 章 プロトコル .................................................................................................................19
プロトコルのセットアップウィンドウについて ................................................................................... 20
プロトコルの作成 .......................................................................................................................... 22
プロトコルの設定内容の確認 ........................................................................................................ 30
保存済みのプロトコルの編集 ........................................................................................................ 30
プロトコルの実行 .......................................................................................................................... 30
回帰法の選択 .............................................................................................................................. 31

第 4 章 イメージの表示..........................................................................................................33
解析結果の概要 ........................................................................................................................... 33
Image Transform （色調補正）..................................................................................................... 36
マルチチャンネルイメージの表示 .................................................................................................. 42
マルチチャンネルイメージの分割 .................................................................................................. 45
シングルチャンネルイメージからマルチチャンネルイメージの作成 ................................................. 46
解析結果の表示 ........................................................................................................................... 48
Analysis Table （解析一覧表） ..................................................................................................... 48
Lane Profile （レーンプロファイル） ............................................................................................... 54

第 5 章 イメージの解析..........................................................................................................61
イメージタイプ ............................................................................................................................... 61
自動解析ツール ........................................................................................................................... 63
Analysis Tool Box の解析ツール.................................................................................................. 66(1) Image Tools ：画像編集ツール .............................................................................................. 66(2) Lane and Bands ：レーンとバンドの修正ツール ..................................................................... 69(3) Molecular Weight (MW) Analysis Tools ：分子量解析ツール ................................................ 87(4) Quantity Tools ：濃度定量ツール........................................................................................... 92(5) Annotation Tools ：テキスト注釈ツール .................................................................................. 95(6) Volume Tools ：ボリューム（定量）ツール ............................................................................... 97

第 6 章 レポートの作成 .......................................................................................................103
レポートの作成 ........................................................................................................................... 103
レポート表示項目の設定 ............................................................................................................ 104
レポートの出力 ........................................................................................................................... 107

第 7 章 結果の出力.............................................................................................................109

イメージデータの出力 ................................................................................................................. 109
出力コマンド ：Export ................................................................................................................ 109
解析結果の出力 ..........................................................................................................................112

第 8 章 各種 Log の閲覧 ....................................................................................................113
System log の閲覧 .....................................................................................................................113
Instrument log の閲覧 ................................................................................................................115
Log Data の表示.........................................................................................................................116
フィルタ機能による Log の抽出....................................................................................................117
行の表示形式の変更 ..................................................................................................................117
Log の出力 .................................................................................................................................118
Print Log （PDF ファイルの作成を含む） .....................................................................................118

付録 A ：回帰法の計算 .......................................................................................................120
付録 B ：トラブルシューティング ...........................................................................................121
付録 C ：アクセサリー .........................................................................................................122
付録 D ：Mitsubishi P95D サーマルプリンター .......................................................................123はじめにImage Lab™ ソフトウェアはバイオ・ラッドのイメージャーでゲルやブロットの画像を撮影し、データ解析するためのソフトウェアです。撮影条件を指定したプロトコルを用いることで、最小限の時間でス
ムーズに、再現性ある最適なデータを取得することができます。さらに解析後のデータはカスタマイ
ズされたレポートとして出力することもできます。
Windows をインストールしたコンピューターにおいて、Image Lab 6.1 は次の機器での画像撮影に対応しています。
• ChemiDoc™ MP （タッチスクリーンではない Universal Hood III モデル）
• ChemiDoc XRS+
• Gel Doc™ EZ• Gel Doc XR+• GS-900™ Calibrated Densitometer
Mac OS において、Image Lab 6.1 による画像撮影は Gel Doc™ EZ、Gel Doc XR+ でのみ対応
しています。
画像撮影のための設定やプロトコルの詳細は、それぞれの撮影装置の取扱説明書をご参照ください。
Image Lab セキュリティエディションの設定方法、使用方法について、本取扱説明書では説明をいたしません。セキュリティエディションの詳細については、Image Lab セキュリティエディションの取扱説明書をご参照ください。

参考：ChemiDoc Touch, ChemiDoc Touch MP （スタンドアローンタイプ）では、Image Lab Touch ソフト
ウェアにより画像撮影を行います。別に用意されたコンピューターにインストールされた Image Lab
ソフトウェア 6.1 を使用し、それらの撮影装置からエクスポートした画像を解析することができます。

Image Lab セキュリティエディションは、アメリカ食品医薬品局（FDA）の連邦規則第 21 条第 11 章
（21 CFR Part 11）に準拠した組織運営を支援するためのツールです。

1

2

第 1 章 Image Lab ソフトウェアのセットアップ
Image Lab ソフトウェアは、Microsoft Windows または Mac OS の動作するコンピューターにインストールすることができます。Image Lab の動作に必要となるメモリ容量は、撮影や解析を行いたい
画像のサイズに依存します。高い解像度で撮影するほど、ファイルサイズは大きくなります。そのため、画像データはネットワークファイルサーバやリムーバブルメディアにバックアップすることが推奨
されます。
ヒント：
バイオ・ラッドでは、それぞれの撮影装置に適した仕様のコンピューターも取り扱っております。詳細は最寄りのバイオ・ラッドのお問い合わせ窓口（テックコール）までご連絡ください。

コンピューターの推奨仕様 （バージョン 6.1）
仕様

必要仕様
Microsoft Windows 7 (64-bit)

オペレーティング
システム（OS）

Microsoft Windows 10 (64-bit)
Mac OS X 10.14 or 10.15 *1

プロセッサーIntel Core i3 又は同等

ハードディスク空き

60 GB

メモリ（RAM）

4 GB

機器接続ポート

USB2.0 ポート 1 個以上*1 ： Image Lab セキュリティエディションは、Mac OS には対応していません。

3

セキュリティエディションをインストールする前に
Image Lab をインストールする際に、通常版とセキュリティエディションのどちらをインストールする
か選択する画面が表示されます。セキュリティエディションを使用する場合は、あらかじめ Windowsの OS のグループ設定や権限設定を行い、Image Lab の Administrator 権限（OS の権限とは異なる）をユーザーに付与する必要があります。Image Lab をインストールする前にあらかじめこれらのグループ設定を行っておくことを強く推奨します。詳細は、セキュリティエディションの取扱説明書をご参照ください。

Image Lab ソフトウェアのインストール
Image Lab ソフトウェアは、Microsoft Windows または Mac OS の動作するコンピューターにインストールすることができます。ただし、セキュリティエディションは、Windows のコンピューターにのみインストール可能です。

Macintosh への Image Lab ソフトウェアのインストール
Macintosh へのインストール
1. Image Lab インストール用 USB メモリを、USB ポートにさします。
2. 内容が表示されたら、アイコンをダブルクリックします。
Mac と Windows の２つのフォルダが現れます。
3. Mac フォルダを開きます。
4. “Image Lab.dmg” のファイルをダブルクリックします。
5. その中にある Image Lab のアプリケーションアイコンを Macintosh の Application Folder へド
ラッグします。
以上で Macitntosh へのインストールは終了です。

4

Windows への Image Lab ソフトウェアのインストール
通常版の Image Lab のインストールにはライセンスコードを必要としませんが、セキュリティエディ
ションのインストールにはライセンスコードが必要です。
重要：セキュリティエディションをインストールする際には、製品に付属する 18 桁のライセンスコードをあらかじめご準備ください。もし、ライセンスコードを示す書類が見当たらない場合には、インストールを試みる前にバイオ･ラッドの担当者までお問い合わせください。
通常版またはセキュリティエディションのインストールにあたっては、次の事項もご参考ください。
•

通常版をインストールした後に、セキュリティエディションをインストールする場合は、まず通常版をアンインストールしてから、セキュリティエディションをインストールする必要があります。

•

セキュリティエディションのライセンスを持ち、インストールが完了しても、その機能を有効化するためには Image Lab の Administrator 権限が必要です。この権限を持つユーザーのみセキュリティモードの有効化/無効化の切り替えを行うことができます。
参考：Image Lab の Administrator 権 限 を 持 つ ユ ー ザ ー は 、 必 ず し も ネ ッ ト ワ ー ク 上 のAdministrator や IT の管理者である必要はありません。

•

もし、セキュリティエディションのライセンスを持たないユーザーがセキュリティエディションをインストールした場合には、Image Lab 起動時に毎回コード入力画面が表示されます。セキュリティ
エディションのライセンスが無い場合は必ず通常版をインストールしてください。

Windows へのインストール
1. Image Lab インストール用 USB メモリを、USB ポートにさします。
2. 内容が表示されたら、アイコンをダブルクリックします。
Mac と Windows の２つのフォルダが現れます。
3. Windows フォルダを開き、ImageLabSetup.exe をダブルクリックしてインストーラーを起動します。
4. インストーラーの Wellcome 画面が表示されたら Next をクリックします。
5. ライセンス確認の画面が表示されたら、内容を確認した上で I accept the terms・・・ にチ
ェックを入れ Next をクリックします。

I accept the terms ・・・を選択
Next

Next

5

6. インストールするライセンスの種類を選択する画面が表示されます。
通常版（Standard Edition）をインストールする場合はデフォルト設定のまま（Install Standard
Edition にチェック） Next をクリックします。
セキュリティエディション（Security Edition）をインストールする場合は Install Security Editionにチェックを変更します。

（セキュリティエディションを選択した場合のみ）
セキュリティエディションのライセンスコードの入力画面が表示されます。18 桁のコードを 3 つのウィンドウに分割して入力して Next をクリックします。

もし、正しいライセンスコードが分からない場合には、次のどちらかを行います。
•

Back キーをクリックし元の画面に戻り、通常版（Standard Edition）をインストールします。

•

仮に任意の 18 桁の数字を入力すると、セキュリティエディション（Security Edition）をインストールすることができます。ただし、正しいライセンスコードを入力するまで、セキュリティモ
ードを起動することはできません。
後から、正しいライセンスコードを入力してアクティベーションする作業の詳細については、
セキュリティエディションの取扱説明書をご参照ください。

6

7. インストール先フォルダの確認画面が表示されたら、そのまま Next をクリックします。

Next

8. インストール開始の確認画面が表示されたら Install をクリックします。

Install

9. ドライバーのインストール確認画面が表示された場合は、その都度 Install をクリックしてインストール作業を継続します。

Install をクリック

710. インストールが完了すると以下の画面が表示されます。Finish をクリックしてインストーラー
を終了します。

Finish参考：デフォルトの設定では、インストーラー終了時にリリースノートを表示するオプションが On になっています。不要であれば設定を変更します。
参考：デフォルトの設定では、インストーラー終了時にインストールログを表示するオプションが Oｆｆになっています。必要であれば設定を変更します。インストールログを表示すると以下の例のような画面が表示されます。

参考：
Windows 7 では、Image Lab のインストール中に各種デバイスドライバーもインストールされますが、以下のようなメッセージが表示されることもあります。このメッセージは、必要なドライバ
ーがインストールできていても表示されることがあるので、無視してください。

以上で Windows 版の Image Lab のインストールは終了です。

8

第 2 章 Image Lab ソフトウェアの概要
Image Lab ソフトウェアは、バイオ・ラッドの画像撮影装置の制御、データ解析、プロトコルファイルへの撮影条件の保存を行うのに用います。

メイン画面
Image Lab を起動すると、次のメイン画面が表示されます。
上部メニュー
メインツールバー
スタートページ

解析ツール
ボックス

ワークスペース

Image Lab ソフトウェアではイメージ画像、プロトコル、および各種選択画面は、全てワークスペー
ス（メインウィンドウの灰色の領域）に開かれます。
ウィンドウの大きさを調整することで複数の画像やプロトコルを同時に表示することができ、解析結果を並べて比較することができます。
デスクトップに複数のファイルを開いている場合、Window メニューにそのファイル名が表示されます。Window メニューのファイル名をクリックするか、直接そのウィンドウをクリックすることで、アクティブ（使用中）にすることができます。アクティブのファイルは、画面上部のバーが濃紺色となります。

9スタートページ
ソフトウェアを起動したときに表示されるスタート
ページでは、最近使用したプロトコルやイメージフ
ァイルがリストとして表示されます。前回と同じ条
件（イメージサイズ等）でゲルを撮影したい場合は、
ここからプロトコルファイルを選択するだけで条件設定が終了します。
Image Lab で保存したファイル（拡張子.scn）だ
けでなく、8-, 16-ビットのグレースケール TIFF イメージ（拡張子.tif）のファイルも開くことができます。
ソフトウェア起動時にスタートページを表示させたくない場合は、左下の Always show on startupのチェックを外します。

メインツールバー
ソフトウェア上部に位置するツールバーのアイコンは、いつでも利用することが可能です。解析結果の表示方法に関する様々なボタンがあります。また、Screenshot（スクリーンショットツール）をクリッ
クすると、表示している画面のキャプチャをクリップボードに送ったり、ファイルとして保存したりすることができます。また Undo および Redo ボタンには回数の制限がないので、間違った操作を容易に訂正することができます。
プロトコルを表示するためのツールおよび解析結果の様々な表示形式を以下に示します。これらのツールに関する詳細は、第 4 章 イメージの表示（33 ページ～）で説明しています。

解析結果の表示

解析結果の表示ツール

ゲルイメージを解析した結果は、Analysis Table（解析値一覧表）、Lane Profile（デンシトグラム）、
Standard Curve（標準曲線）、または Report（レポート形式）で表示することができます。これらの解析結果は、選択されている画像もしくはレーンについて表示されます。複数の解析結果を一度に表示することもできます。

画面表示に関するツール
イメージ画像ウィンドウの上方にある Display Toolbox を使うと、目的に応じた表示形式で画像を表示することができます。

ゲ
ル
オ
プ
シ
ョ
ン
表
示

ズ
ー
ム
イ
ン

ズ
ー
ム
ア
ウ
ト

全
体
表
示

色
調
調
整

画
像
色
の
変
更

立
体
画
像
表
示

10

画
像
情
報

解析用ツール
Analysis Tools は撮影した画像の分子量や濃度を解析するための解析用ツールです。
ボタンを押すと、全自動で画像を迅速にAuto Analysis
解析します。

以下のツールは、解析をカスタマイズしたい場合に使用します。
1. Image Tools は画像を反転、回転させることができます。また、イメー
ジファイルから必要部分を切り取ったり、合成（重ね合わせ）を行ったりすることができます。
2. Lane and Bands はバンドやレーンの検出機能を制御します。レーンの数や太さの変更、調整を行うことができます。またバンドの検出、追加、削除などを行うことができます。
3. MW Analysis Tools は分子量（核酸ゲルを使う場合は塩基対）を算出します。スタンダードのレーンを選択し、検量線を作成することができます。
4. Quantity Tools は相対値または絶対値を用いて自動的にバンドを定量します。
5. Annotation Tools は研究者が関心をもったレーンやバンドにテキスト情報を付与します。
6. Volume Tools は自ら定義した境界領域内のシグナルを積算し定量化します。
これらのツールの詳細は、第 5 章 イメージの解析 （61 ページ～）にて説明します。

11

ステイタスバー
メインウィンドウの右下のステイタスバーは、使用している撮影装置の機種名およびイメージファイ
ル上でマウスが示す位置の X 値および Y 値を示しています。また、その位置における Intensity(Int) または Optical Density (OD) も表示しています。数値の単位や最大範囲は、撮影に用いたイメージャーの機種や撮影条件に依存します。

装置名

ｶｰｿﾙ位置ｼｸﾞﾅﾙ強度

上部メニューコマンド
ここでは上部メニューに含まれる全てのコマンド（File, Edit, View, Window, Help）について説明します。これらの機能の多くはツールバーやスタートページからも使うことができます。
ファイル ：File◼

ファイル管理File > New Protocol により、新しいプロトコルを作成することができます。この機能はスタンド
アローンタイプの ChemiDoc Touch (MP) では使用しません。
File > Open により、ファイルを閲覧したり、以前に保存したプロトコルファイルまたはイメージフ
ァイルを検索したりすることができます。
参考：
Strip または Tile フォーマットで保存された、非圧縮または LZW 圧縮されたほとんどの 8-,
16-bit TIFF イメージを開くことができます。多くのグレースケール TIFF はこの形式で保存されています。
File > Recent Images により、最近使用したイメージファイルを選択して開くことができます。
File > Recent Protocols により、最近使用したプロトコルを選択して開くことができます。
File > Save により、プロトコルファイルまたはイメージファイルを保存することができます。プロ
トコルは拡張子.ptl (または.sptl)で保存されます。イメージファイルは拡張子.scn (または.sscn)で保存されます。
File > Save As により、プロトコルまたはイメージファイルに名称をつけ保存することができます。
通常は元ファイルとは別名で保存するために使用します。
File > Create Multichannel Image により、現在開いている 2 枚以上の画像（Single Channel
で撮影したもの）を重ねた Multichannel の画像を合成することができます。
File > Split Multichannel Image により、Multichannel 画像から各画像を分離することができます。このコマンドは Multichannel 画像解析時のみ表示されます。

12

File > Close により、操作中のアクティブな画面を閉じることができます。
File > Close All により、ImageLab のデスクトップ上にある全ての画面を閉じることができます。

◼

出力 (Export)
File > Export により、ゲル画像または解析結果一覧を出力することができます。出力形式には 7 つの選択肢があります。
• 表示画像の出力 ：Export for Publication
主として閲覧、プレゼンテーション用のゲル画像を出力します。出力形式として.bmp, .png, .jpg, と.tif フォーマットを選択することができます。ゲルは全てのレーン、バンドおよびテキスト情報とともに出力されますが、定量性は維持されません。単なるスクリーン
ショットと同じレベルの画像になるため、別のソフトウェアで解析をすることはできません。
• 解析用画像の出力 ：Export for Analysis
全ての画像データを保持した.tif フォーマットでファイルを出力します。解析した数値データやテキスト情報は含まれません。このファイル形式は Quantity One® 等の別のソフトウェアで画像を解析するために使用することができます。
• Pulse Net への出力 ：Export for Pulse Net
8-bit の.tif フォーマット、解像度 300 dpi に調整して画像を出力します。
• レーンとバンド解析結果の Excel への出力 ：Lane and Band Table to Excel
あらかじめコンピューターに Excel などの表計算ソフトウェアをインストール済みの場合、レーンとバンドのデータ表がその表計算ソフトウェア上で立ち上がります。
• レーンとバンド解析結果の CSV への出力 ：Lane and Band Table to File
レーンおよびバンドの情報を CSV（カンマ区切りフォーマット）ファイルとして出力します。CSV
ファイルはデータベースアプリケーションで開くことができます。
• ボリューム解析結果の Excel への出力 ：Volume Table to Excel
あらかじめコンピューターに Excel などの表計算ソフトウェアをインストール済みの場合、ボリューム解析したデータ表がその表計算ソフトウェア上で立ち上がります。
• ボリューム解析結果の CSV への出力 ：Volume Table to File
ボリューム解析したデータ表を CSV（カンマ区切りフォーマット）ファイルとして出力します。
CSV ファイルはデータベースアプリケーションで開くことができます。

ファイルの出力に関する詳細な情報については第 7 章 結果の出力（109 ページ～）をご参照
ください。

13

◼

画像情報表示File > Image Info により、ゲルおよびブロットイメージの基本情報が表示されます。情報には
解像度、濃度範囲、および撮影条件、使用した光源などが含まれます。
情報は 4 つのタブ（Image Details、Analysis Settings、Calibration Report, Notes）に分類されています。
画像情報表示 Image Info に関する詳細な情報については 41 ページをご参照ください。

◼

印刷
File > Page Setup により、用紙の向き（縦向、横向）、余白、使用プリンタおよびサイズなどのプリントの設定を行います。
File > Print により、ゲルのプリントプレビューおよびヘッダー情報が表示されます。ヘッダー情報にはイメージのファイル名、ユーザー名およびプリント日／時間が含まれます。プリンタの機
種、印刷数を設定することができます。

◼

終了
File > Exit により、（プロトコルまたはイメージの変更を保存するかを確認した後）Image Lab
を終了します。

編集 ：Edit◼

操作の取り消し
Edit > Undo により、最後のアクションを元に戻します。
Edit > Redo により、最後のアクションをやり直し（Undo のキャンセル）します。

◼

画像キャプチャ
Edit > Screenshot により、表示されている画面やレーンプロファイルをキャプチャすることができます。このキャプチャ画像はクリップボードに貼り付けたり、名称をつけてファイルに保存したりすることができます。

14

◼

装置の設定
Edit > Default Imager により、2 つ以上の撮影装置を所有しているユーザーはそれを切り替えることができます。
Edit > Instrument Setup により、機器のシリアル番号および撮影システムの調整状態が確認できます。システムの再キャリブレーションを行うこともできます。

◼

レポートの設定
Edit > Report Settings により、レポートの内容を設定することができます。このダイアログは
4 つのタブを含んでいます。Lane Statistics タブ以外の 3 つのチェックボックスはデフォルトでON になっています。レポートに含めたくない項目がある場合は、ボックスのチェックを外します。
この設定は再び変更するまで、全てのレポートに適用されます。詳細は第 6 章 レポートの作製（103 ページ～）をご参照ください。
• General タブでは、画像の基本情報の表示／非表示の設定を行います。
• Lane and Band Table タブでは、出力レーンの選択や、出力項目の選択を行います。
• Volume Table タブでは、ボリューム解析での出力項目の選択を行います。
• Lane Statistics タブでは、レーン間の補正(Normalization) に関係する値の表示／非表示の設定を行います。
Edit > Preferences は 2 つのタブを含んでいます。
• プロトコルタブは、画像ファイル保存時のデフォルトファイル名の設定を行います。ファイル名にユーザー名、日付／時間を入れるかどうかを選択することができます。
• Colors タブは、Lane Frame、Lane、Band、Band Attribute および MW Legend などのゲル中の図形要素の配色を選択することができます。異なる色彩配合で画像を表示すると、画像の全ての構成要素を容易に識別することができます。

表示 ：View◼

サブウィンドウの設定
View > Image Overview により、画像の全体を示す小さいサブウィンドウを開きます。またサ
ブウィンドウ内にメインウィンドウに表示している領域の輪郭を描いた赤色の長方形を描きます。
この長方形をつかんで移動（Grab 機能）することで、メイン画面の画像の表示範囲を変更することができます。画像を拡大したときに使用すると便利です。
View > Operations History により、作業履歴を示すウィンドウを開きます。
View > View System Log により、Image Lab の内部コマンド実行履歴を表示します。
View > View (Instrument) Log により、撮影装置に関するコマンド実行履歴を表示します。このコマンドは撮影装置が接続されている場合のみ表示されます。
View > View (Document) Log により、セキュリティ管理に関するコマンド実行履歴を表示します。この Log はセキュリティエディションのみ作成されます。

15

セキュリティメニュー ：Security Menu Commands
本コマンドはセキュリティエディションでのみ表示されます。通常版で使用している場合は表示されません。
詳細は、セキュリティエディションの取扱説明書をご参照ください。

◼

セキュリティ設定の変更
Security > Security Preferences
Image Lab Adminisotrator の権限を持っているユーザーはセキュリティモードと通常モードを切り替えることができます。
またドメイン設定やローカルグループのセキュリティレベルの変更をすることもできます。
Security > Rename Security Groups
Windows の Administrator の権限を持つユーザーでログインしている場合には、Image Labのセキュリティレベルを決定するグループ名を変更することができます。デフォルトのグループ
名は TDS_Administrator, TDS_User, TDS_Tech, TDS_Guest です。
このオプション変更はローカルユーザーとして Windows Administrator の権限を持つユーザーがログインしているときのみ表示されます。
ここで入力されるグループ名は Windows に登録されているグループ名と一致している必要が
あります。

◼

署名
Security > Sign Document
ユーザーは画像やプロトコルファイルに署名を行うことができます。ユーザーはユーザー名およびパスワードを入力し、署名をする理由も記入します。書類に署名がなされると、システムログ
ファイルに署名理由とともに記録されます。

◼

セキュリティエディションのライセンス削除
Security > Deactivate Security Edition
セキュリティエディションのライセンスをコンピューター上から削除します。
通常モードへの切り替えとは異なり、ライセンスそのものを削除します。

16

ウィンドウ ：Window
ウィンドウメニューは、ワークスペース上に開いている複数の画像ファイルの表示を制御します。
開いている全ての画像およびプロトコルのリストが本メニューの一番下に表示されます。
◼

ウィンドウの整列
Window > Tile により、開いている全ての画像ファイルを一度に見ることができるように、それらを等間隔に整列させます。
Window > Tile Horizontal により、開いている全ての画像ファイルを上下に並べます。
Window > Tile Vertical により、開いている全ての画像ファイルを左右に並べます。
Window > Cascade により、開いている全ての画像ファイルおよびプロトコルをタイトルバー分だけずらして積み重ねます。タイトルバーを確認することでファイルを容易に選択することができます。

◼

ウィンドウの同調
Window > Imitate Zoom により、開いている全ての画像のズーム設定を、現在選択されている画像ファイルと同じズーム率に変更します。
Window > Imitate Transform により、開いている全ての画像のコントラストを、現在選択されている画像ファイルと同じ設定に変更します。

◼

ウィンドウの順送り
Window > Next により、開いている全ての画像ファイルを最も古いものから最も新しいものの順に表示します。
Window > Previous により、開いている全ての画像ファイルを最も古いものから最も新しいものの順に表示します。

ヘルプ ：Help◼

ヘルプコマンド
Help > Image Lab User Guide により、Image Lab のマニュアル PDF（英文）を表示します。
Help > Instrument User Guides により、各種撮影装置のマニュアル PDF（英文）を表示します。
Help > About により、Image Lab ソフトウェアのバージョンおよびリリース情報を表示します。

17

18

第 3 章 プロトコル
Image Lab ソフトウェアを用いた画像撮影では、まず撮影条件を設定したプロトコルを作成します。プロ
トコルでは、撮影条件の他に、データ解析条件、カスタマイズしたレポートの作製までを設定することができます。プロトコルファイルは修正や再利用することも可能で、シングルチャンネル（単一条件）での撮影だけでなく、イメージャーの機種によってはマルチチャンネル（複数条件）の撮影にも対応しています。
データ解析については、ChemiDoc Touch, ChemiDoc Touch MP のようなスタンドアローンタイプのイメージャーで撮影した画像にも対応しています。
重要：本章では、プロトコルの作製と実行に関する主な手順を説明しますが、設定内容の詳細は使用された
画像撮影装置に依存して変わります。詳細は、お使いの画像撮影装置の取扱説明書をご参照ください。

イメージャーの機種による表示の違い
Image Lab ソフトウェアをインストールしたコンピューターにイメージャーが接続されていた場合には、Image Lab ソフトウェアはイメージャーの機種に対応した画面表示となります。コンピューターにイメージャーが正しく接続されているかを確認するには、画面右下のステイタスバーを確認してください。接続しているイメージャーの機種名がステイタスバーに表示されています。緑色のチェック
マークは、Image Lab ソフトウェアによってイメージャーが正しく認識されていることを示します。

注意：
本章では、プロトコルの機能により、撮影、解析、データ出力の工程を自動的に行う手順をご説明します。撮影済みのイメージの解析方法については、第 5 章 イメージの解析（61 ページ～）をご参照ください。

19

プロトコルのセットアップウィンドウについて
スタートページの New を選択するか、ツールバーまたはメニューバーから New Protocol を選択してプロトコルの編集を開始します。カスタムプロトコルを作成するには各画面でパラメータの設定を行う必要があります。
プロトコルを新規作成すると以下の画面が表示されます。画面の左側にいくつかのステップ名が表示されます。
Step 1. Gel Imaging
Step 2. Lane and Band Detection
Step 3. Analyze Molecular Weight
Step 4. Specify Output
プロトコルで自動的に実施したいステップにのみチェックを入れます。例えば撮影だけで解析までは実施しないのであれば、Gel Imaging のステップにのみチェックを入れます。
各ステップを選択すると設定項目が表示され、必要な条件を変更することができます。

参考：
この画面は GS-900 でのプロトコル作成の初期画面です。機種に応じてプロトコルの設定画面は異なります。

20

既存のプロトコルを選択すると、Protocol Summary 画面が開きます。そのプロトコルを編集した
い場合は、画面左側にある Protocol Setup のウィンドウから編集したいプロトコルのプロセス名をクリックします。

参考：
この画面は GS-900 でのプロトコル作成の初期画面です。機種に応じてプロトコルの設定画面は異なります。

21

プロトコルの作成
画面の左側に表示されている各ステップについて、順に設定していきます。すべての設定が終わったら、Protocol Summary から設定内容を確認することができます。また、元のステップ画面に戻って設定しなおすこともできます。
参考：イメージャーの機種に応じてプロトコルの設定画面は異なるため、本取扱説明書の図とは少し異なることがあります。
Step 1. Gel Imaging （画像撮影条件の設定）
画像撮影のための条件を指定するため、次の事項について設定を行います。
• Application
染色剤の種類に応じて、設定済みの画像撮影条件の中から選択します。
• Imaging Area
画像撮影エリアを指定します。
• Image Exposure
撮影の露光時間を指定します。自動露光の条件、または任意の時間を設定します。
• Display Options
画面表示のオプションを指定します。

22

Custom Applications
画像撮影のために選択可能なアプリケーションは、サンプルタイプ（染色剤など）に応じて最適な条件があらかじめ定義されています。選択肢の種類は、画像撮影装置の種類に応じて異なります。
アプリケーションメニューの中には、個別に条件を設定できる Custom という選択肢もあります。
設定済みのアプリケーションと同じ条件をカスタムで作成し、別名で保存することもできます。いったん保存したカスタムアプリケーションは、再利用したり編集したりすることもできます。

Custom Application を作成することにより、次のような設定を組み合わせた撮影条件を設定することができます。
•
•
•
•
•
•

Light Source
FilterTray
Image Color
Binning
Scan mode

参考：
Custom Application の設定方法の詳細は、お持ちの画像撮影装置の取扱説明書をご参照ください。

Multichannel 撮影の設定
マルチチャネルプロトコルで画像を撮影できるイメージャー（ChemiDoc MP）では、チャネルごとに撮影条件の設定画面が表示されます。ひとつのチャンネルの設定を行うと、他のチャンネルのアプリケーションの選択肢には、残りの設定可能な条件が表示されます。

23

Step 2. Lane and Band Detection （レーンおよびバンドの検出）
イメージ解析の方法を指定するため、まずレーンとバンドの検出条件から設定します。

Image Lab ソフトウェアはゲルやブロットの解析にあたって、まずレーンとバンドの検出を行う必要があります。画像上の薄いバンドを検出できるように、バンド検出を高感度に設定することもできます。また、Image Lab はバックグラウンドを自動的に差し引くこともできます。バンド検出の感度を高く設定しすぎると、バックグラウンドレベルのノイズまでバンドとして検出してしまうこともあります。逆にバンド検出の感度を低く設定しすぎると、興味のあるバンドを検出できないこともあります。バンド検出の設定方法に関する詳細は、第 5 章 の「バンドの検出（78 ページ～）」をご参照く
ださい。
参考：（マルチチャンネル撮影が可能な ChemiDoc MP のみ）
マルチチャンネルでの撮影と解析において、バンド検出の感度を個別に設定することはできません。
同じバンド検出の設定で、すべてのチャンネルが自動解析されます。プロトコルによる撮影後であれば、Lane and Bands ツールを使って、個別にバンド検出の感度を調整することができます。

レーンとバンド検出の設定方法
1. Protocol Setup ウィンドウにある 2. Lane and Band Detection のチェックボックスを、On にします。
2. レーンとバンドの検出オプションを設定します。
◼

Low Band Detection Sensitivity ：低感度検出
この設定はシグナルの強いバンドを含むイメージに対して、感度を低め（Custom 設定では
25 に相当）にしてバンドの検出を行うものです。この設定では薄いバンドは検出されません。

◼

High Band Detection Sensitivity ：高感度検出
この設定はシグナルの弱いバンドを含むイメージに対して、感度を高め（Custom 設定では
75 に相当）にしてバンドの検出を行うものです。薄いバンドまで検出されます。不要なバンド
はあとで、Analysis Tool Box の Bands ツールを使って削除することができます。具体的な方法は、第 5 章 の「バンドの修正（81 ページ）」をご参照ください。

24

◼

Custom ：カスタム検出
この設定はバンド検出の設定値をマニュアルで入力します。
サンプルに最も適した検出感度を選択するために、1～100 の数値を入力します。

◼

Advanced ：高度なバンド検出の設定
バンド検出に関する様々なパラメータ（Sensitivity、Size Scale、Noise Filter、Shoulder
value、Band Limit）を設定します。具体的な方法は、第 5 章 の「バンドの検出（78 ページ～）」をご参照ください。

補正条件（Normalization）の設定方法（マルチチャンネル撮影が可能な ChemiDoc MP のみ）
マルチチャンネル撮影した画像の中で、補正用のチャンネルを指定し、レーン間のシグナルの補正に用いることができます。

具体的な方法は、第 5 章 の「Volume データのノーマライズ（82 ページ～）」をご参照ください。

25

Step 3. Analyze Molecular Weight （分子量の解析）
このステップを用いて使用中のスタンダードの種類（大きさ）を選択し、さらにスタンダードを流したレーンを指定することでゲル中のバンドの分子量（塩基対）を推定することができます。

サンプルの分子量解析の設定方法
1. Protocol Setup ウィンドウにある 3. Analyze Molecular Weight のチェックボックスを On にします。
2. Mol. Wt. Standard の横にある Change をクリックすると Manage Standards ダイアログボック
スが開きます。これにより、リストにないスタンダードを追加したり、分子量を編集したりすることができます。

参考：
ただし赤い文字で表示されているプリインストールのリストは編集（Edit、Delete、Rename）することができません。このリストを編集したい場合は一度 Copy を使ってリストを複製し、複製した新
しいリスト（黒い文字で表示）を編集します。
26

3. リストからスタンダードを選択して、OK をクリックします。
もし使用したスタンダードがリストにない場合は、次の I～III のどれかを行います。
I. リストに表示されるスタンダードのタイプを変更
画面下の Show (Protein) のドロップダウンリストをクリックして、All Standards に変更します。リストの中に使用したスタンダードがあれば、それを選択します

II. 設定済みスタンダードをコピーして編集(1) Mol. Wt. Standard の横にある Change をクリックすると Manage Standards ダイアログボ
ックスが開きます。これにより、リストにないスタンダードを追加したり、分子量を編集したりすることができます。
(2) 使用したスタンダードに近い内容のスタンダードを選択します。
(3) Copy をクリックします。
リストにコピーされたスタンダードが追加されます。
(4) コピーされたスタンダードを選択します。
(5) Edit をクリックします。
Edit Standard ダイアログボックスが開きます。
(6) 使用したスタンダードに一致するように、Name、Type、Units、Value を編集します。
(7) 編集が終わったら OK をクリックします。

III. 新たにスタンダードの情報を追加(1) Mol. Wt. Standard の横にある Change をクリックすると Manage Standards ダイアログボ
ックスが開きます。これにより、リストにないスタンダードを追加したり、分子量を編集したりすることができます。
(2) New をクリックします。
Edit Standard ダイアログボックスが開きます。

27

(3) 使用したスタンダードの名前を Name に入力します。
(4) Type のドロップダウンリストから、Protein Standard または Nucleic Acid Standard を選択します。
(5) Units のドロップダウンリストから、スタンダードの単位（kDa, pI, bp, kb, Mb）を選択します。
(6) Add をクリックします。
Edit ダイアログボックスが開きます。

(7) スタンダードの値（分子量等）を入力し、OK をクリックします Description は任意です。
参考： 少なくとも 2 点以上を入力する必要があります。
(8) 値の入力が終了したら、OK をクリックします。

4. Standards Lanes ボックスに、分子量スタンダードを泳動したレーン番号を入力します。
レーン番号または First、Last という単語を入力することで、スタンダードを流したレーンを指定することができます。複数のレーンを指定する場合はカンマで区切ります。例えば、18 ウェルゲルを使用していて、1、10、18 レーンにスタンダードを流した場合、First, 10, Last と入力します（1,10, 18 と入力することも可能です）。
参考：
スタンダードは最初と最後のレーンに配置すると、効果的に働きます。
核酸サンプルの場合は、タンパク質と同様にバンドのサイズ(bp) を確認することができます。
5. 適切な回帰式を選択します。
• Point-to-Point (semi-log)• Linear (semi-log)• Logistic• Cubic Spline
回帰法の計算に関する情報は、後述の回帰法の選択（31 ページ～）をご参照ください。

28

Step 4. Specify Output （レポート設定）

1. Protocol Setup ウィンドウにある 4. Specify Output のチェックボックスを On にします。
2. プロトコルが終了したあと、レポートを自動的に表示するか、プリントアウトするかを選択することができます。
◼

◼

Output Action• Automatically Print Image：撮影後に自動的に画像印刷まで行います。

• Automatically Print Report：撮影後に自動的解析し、結果印刷まで行います。

• Display Report：撮影後にレポートを画面に表示します。

Custom Report Title
レポートに任意のタイトルをつけることができます。

レポートは上部メニュー Edit > Report Settings のオプションを用いてカスタマイズすることができます。
レポートオプションの設定に関する詳細は、第 6 章 レポートの作成（103 ページ～）をご参照ください。

29

プロトコルの設定内容の確認
Protocol Setup ウィンドウにある Protocol Summary をクリックすると、プロトコルの設定内容を確認することができます。

保存済みのプロトコルの編集
保存済みのプロトコルを開いて、編集して別名で保存することもできます。

プロトコルの実行
プロトコルの実行方法の詳細は、お使いの画像撮影装置の取扱説明書をご参照ください。
参考： 機種によってプロトコルの実行手順が少し異なります。

プロトコル実行の方法
1. ゲルをイメージャーにセットします。
2. プロトコルの設定画面で、Run Protocol をクリックします。

30

プロトコルが実行されると、画面が撮影モードになります。
画像撮影後、プロトコルで指定された工程（検出、解析、出力など）を実行します。プロトコルのステップが画面上部に示され、どの工程を実行しているかハイライト表示します。
プロトコルが終了すると、ワークスペースに画像が現れます。さらなる解析を実施したり、編集、保存したりすることができます。
プロトコルの中断
Cancel Run をクリックします。

回帰法の選択未知のバンドの分子量/塩基対を算出するために、回帰法を指定します。ソフトウェアは標準曲線を算出するためにスタンダードバンドの Rf (Relative Front)値および分子量値を用います。次に、標準曲線を用いて、未知のバンドの値を算出します。標準曲線の形状は選択した回帰法に基づいています。
Protocol Setup ウィンドウにある 3. Analyze Molecular Weight のステップにおいて、次の 4 つの回帰法のいずれかを選択します。
スタンダードバンドの必要最小数
2
2
5
5

回帰法
Linear (semi-log)
Point-to-Point (semi-log)
Logistic
Cubic Spline

未知バンドの分子量は、Analysis Table の Mol.Wt. / Base Pair のカラムに表示されます。もし、スタンダードのバンドの数が必要最小数に満たなかった場合には、未知バンドの分子量は計算されません。
各回帰法が標準曲線ウィンドウのデータにどれほど適合するか、グラフで確認することができます。
詳細は、第 4 章 の「スタンダードカーブ（59 ページ）」をご参照ください。
Linear (semi-log)法では R2 値をみることで標準曲線の適合性を判断することができます。R2 値が1.0 に近ければ近いほど、データは標準曲線に適合します。

スタンダードカーブの表示
1. ツールバーの Standard Curve をクリックします。
2. Standard Curve ダイアログボックスで、Mol.Weight Standard Curve タブをクリックします。

回帰法の計算に関する情報は、付録 A 回帰法の計算（120 ページ～）をご参照ください。
MW Analysis Tools の詳細は、第 5 章の「(3) Molecular Weight (MW) Analysis Tools（87 ページ～）」をご参照ください。

31

32

第 4 章 イメージの表示
ゲルが撮影されると、イメージはワークスペースに表示されます。
イメージの色調最適化や解析のための多くの機能がソフトウェアに搭載されています。

解析結果の概要

レーンラベル

テキスト情報

分子量ラベル

レーンフレーム

バンド

レーン

スタンダードレーン

上のイメージは、バンドおよびレーンを検出したゲルイメージをテキスト情報つきで示したものです。
テキスト情報はオーバーレイとして表示されており、表示または非表示を選択することができます。
詳細情報は次ページをご参照ください。
解析結果を表示するための様々な機能があります。データは結果一覧表、レーンプロファイル、標準曲線およびレポートなどの形式で表示することができます。

ゲルイメージ上の表示項目
ゲルイメージの上のツールバーにあるアイコンから、画面に表示する情報の選択、表示形式などを設定することができます。

ゲ
ル
オ
プ
シ
ョ
ン
表
示

ズ
ー
ム
イ
ン

ズ
ー
ム
ア
ウ
ト

全
体
表
示

色
調
調
整

画
像
色
の
変
更

立
体
画
像
表
示

33

画
像
情
報

表示項目の選択 ：Display Gel Options
イメージを表示しているときにツールバーにある Display Gel Options ボタンをクリックすると、画面に表示する情報を取捨選択することができます。

◼

テキスト情報 ：Annotations
イメージ上に描かれたテキスト情報および矢印などの表示／非表示を選択することができます。

◼

レーンおよびバンド ：Lanes And Bands
レーンフレーム、レーン、バンド、レーンラベルおよび分子量のイメージオーバーレイについて、
表示／非表示を選択することができます。

◼

バンドの特性 ：Band Attributes
選択したレーンまたは全てのレーンについて、以下のいずれかの情報をレーン上に表示することができます。表示したい項目をプルダウンメニューから選択します。
• Band No. ：バンド番号• Band Label ：バンドラベル• Mol. Wt. （Molecular Weight） ：分子量
• Relative Front ：Rf 値• Adj. Volume ：補正後の Volume 値• Volume ：バンドのシグナル強度の積分値• Abs. Quant. （Absolute Quantity） ：絶対定量値• Rel. Quant. (Relative Quantity) ：相対定量値• Band % ：レーン中の全てのバンドの積分合計値と比較したバンド積分値の百分率• Lane % ：レーンの全積分値と比較したバンド積分値の百分率

34◼

定量領域 ：Volumes
Volume Tools を使用してゲル上に定量用の境界を描いた場合、定量領域とそれらのラベルを表示することができます。これは自動的に行われるレーン解析の定量領域とは異なるため
Volume Tools を使用していない時は使用することができません。

イメージの拡大と縮小 ：Zoom Tools
Zoom Tools により、ゲルイメージのサイズを変更することができます。イメージを拡大する場合は、プラス（＋）のついた虫メガネのアイコンをクリックします。縮小する場合は、マイナス（－）のついた
虫メガネのアイコンをクリックします。

マウスのドラッグ操作による拡大と縮小
1. Alt キーを押したまま、マウスの左ボタンをクリックしたまま移動し（ドラッグ操作）、興味のあるエリアを囲みます。
囲ったエリアが、画面いっぱいに表示されます。
2. ダブルクリックすると、画像全体の表示に切り替わります。

スクロールホイールによる拡大と縮小
1. Ctrl キー(Windows) または Command キー(Mac) 押したまま、マウスのスクロールホイールを回すと、イメージが拡大、縮小します。
2. ダブルクリックすると、画像全体の表示に切り替わります。

イメージの全体表示 ：Fit in Window
イメージ領域を拡大／縮小しているときに Fit in Window ボタンをクリックすると、イメージ全体を表示することができます。

35

Image Transform （色調補正）
イメージが持つ階調範囲（明暗値）により画面に表示される最小値(Min)～最大値（Max）の範囲
はイメージごとに様々です。ソフトウェアであれば非常に小さい階調差も識別することができます。
しかし、残念ながら人間の眼では、この階調をすべて識別することができません。
Image Transform コマンドは、イメージの輝度およびコントラストを調整し、薄い部分がはっきりと見えるようにイメージ表示を最適化することができます。それにより、人間の眼でも微妙な色調差を認識することが可能となります。
注意 ：Image Transform コマンドでの調整はイメージの表示法（見た目）のみ変更するだけで、定量値には影響を与えません。

Image Transform の設定画面
イメージを表示しているときにツールバーにある Image Transform ボタンをクリックすると、Image Transform ダイアログボックスが表示されます。
度数分布ヒストグラムは、イメージの全データ範囲および、その範囲内の各ポイントでのデータ量を示しています。

36◼

色調補正の方法
Image Transform 画面に表示されている Auto Scale ボタンを押すと、イメージ色調が自動的に最適な階調に調整されます。
Image Transform ウィンドウ内にある以下の機能により表示をカスタマイズすることができます。
• High スライダー ：ゲルイメージ中の最大グレースケールの指定。この数値を下げると、薄いものが濃く見えます。
• Low スライダー ：ゲルイメージ中の最小グレースケールの指定。この数値を上げると、薄いものがより薄く（例：バックグラウンドが白く）なります。
• Gamma スライダー ：グレースケール曲線を変更します。この数値を変えることで、濃いものと薄いものの差をより際立たせることができます。
1.0 は線形です。1 より小さい値はグレースケールの大部分を強度値の前半に再配置します。
1 より大きい値はグレースケールの大部分を強度値の後半に再配置します。
スライダーはドラッグして動かすほかに、スライダー横のテキストボックスの中に数値を入力することもできます。スライダーバーをクリックすると一定間隔で大きく移動します。

◼

オプション ：Options
Image Transform ウィンドウにあるオプションにより、表示形式を変更することができます。
• Invert Image display ：イメージ表示を白黒反転します。「明るい背景上の暗いバンド」を「暗い背景上の明るいバンド」に反転します。その逆も可能です。
• Highlight saturated pixel ：
飽和したピクセルを赤くハイライトします。このチェックボックスを選択すると、飽和（測定可能な範囲以上に強い）シグナル強度を有するイメージ領域が赤色にハイライトされます。
マルチチャンネルイメージでは、個別のチャンネル上で飽和したピクセルを赤くハイライト表
示することはできますが、合成イメージ上では赤いハイライト表示はされません。
• Linear or Logarithmic histogram ：各強度値でどれほど多くのピクセルがあるかを表示するためにヒストグラムの Y 軸を変更します。

37

マルチチャンネルイメージでの色調補正の方法
マルチチャンネルイメージでは、チャンネルごと色調の補正を行うことができます。
まず、ダイアログボックスの下部でチャンネルを指定し、個別に色調を補正して、すべてのチャンネ
ルについても同様に調整を行います。
また、チャンネルごとの表示色を個別に変更することもできます。
Image Transform ダイアログボックスで表示色を変更すると、マルチチャンネルイメージ上のタイ
トルバーやチャンネルボタンの色も同様に変更されます。さらに、合成イメージ上でのバンドの表示色も指定された色に変わります。

38イメージへの配色 ：Image Colors
イメージ表示の配色パターンを選択することができます。
配色パターンを調整することにより、染色剤の種類やバンドの濃淡を認識しやすくなります。配色
パターンを変更しても定量値には影響を与えません。
多くのカラーパターンから表示色を選択することができます。上から 8 色は染色剤の色をイメージしたものです。残りの 4 色は、濃淡のわずかな違いを強調するための配色となっています。
参考：
マルチチャンネルイメージでは、個々のチャンネルのイメージ色を変更できますが、合成イメージ
上の配色をここで変更することはできません。

39

3-D イメージ表示 ：3-D Projection
3-D アイコンをクリックすると、ゲルイメージが、x、y、z 軸を有する 3 次元モデルに変形します。マウスでドラッグすることにより、イメージを回転させることもできます。画面下部のスライダーを左右に動かすことによって、データポイントの相対的高さを調整することができます。
参考：
マルチチャンネルイメージでは、個々のチャンネルごとに 3-D イメージを表示することができますが、
合成イメージ上では表示できません。

スライダー

逆円錐形が指す位置の座標と強度

3-D イメージの表示方法
1. ツールボックスの 3-D アイコンをクリックします。
3-D イメージが表示されます。
2. マウスをドラッグして、3-D イメージを見たい位置まで回転させます。
3. イメージを拡大している場合は、「右クリック＋ドラッグ」でイメージを掴んで、表示枠を移動することができます。

任意のポイントにおける強度の確認方法
1. 3-D イメージの表示中にキーボードの「c」を押すと、緑色の逆円錐形（Cone）が表示されます。
2. 緑色の逆円錐形は、マウスの動きに合わせて移動します。逆円錐形が指す位置における強度と座標が、画面右下（3-D ウィンドウではなく、ImageLab の外枠）に表示されます
3. もう一度キーボードの「c」を押すことで逆円錐形を消すことができます。

40

イメージ情報の表示 ：Image Info
Image Info コマンドにより、操作中のイメージ情報を表示することができます。
イメージ情報の表示方法
1. ツールボックスの Image Info アイコンをクリックします。
Image Info ダイアログボックスが表示されます。

2. （マルチチャンネルイメージの場合のみ）チャンネルを選択します。
選択したチャンネルにおけるイメージ情報が表示されます。

イメージツールバー上のアイコンをクリックしてイメージ情報に関する 3 つのタブを表示します。
• Image Details： 撮影条件と画像に関する情報• Analysis Settings： ゲルを解析（バンド検出や分子量解析）したときに用いた設定• Notes： テキスト情報の追加や各レーンのカスタムラベルの作成、用いたサンプルタイプやその他の結果についてコメントします。

41

マルチチャンネルイメージの表示
マルチチャンネルイメージでは、各チャンネルのイメージと合成イメージを並べて表示します。合成イ
メージのタイトルバーには Multichannel と表示され、個々のチャンネルには撮影した Application
名が表示されます。選択中のイメージは、黄色い枠で囲まれます。

マルチチャンネルの表示に関する設定
マルチチャンネルイメージを表示している場合、ツールボックスにはマルチチャンネルの表示設定
用のツールが追加されます。これらの設定を使用すると、マルチチャンネルイメージの表示をカラー／白黒に切り替えたり、マルチチャンネルイメージで表示するチャンネルの追加／削除、各チャンネルの表示／非表示、イメージのレイアウトを変更したりできます。

1
2
3
4
5

合成イメージの RGB カラー／白黒 の表示切り替え
Channel 1 の表示／非表示の切り替え
Channel 2 の表示／非表示の切り替え
Channel 3 の表示／非表示の切り替え
レイアウトの変更

合成イメージの表示／非表示の切り替え
RGB アイコンをクリックすると、合成イメージの表示／非表示を切り替えます。

42

RGB カラー／白黒の表示切り替え
RGB アイコンの右横のドロップダウンリストをクリックし、次のどちらかを選択してください。
• Show Grayscale Composite をクリックして白黒表示に切り替えます• Show RGB Composite をクリックしてカラー表示に切り替えます

ドロップダウンリストの表示は、Grayscale と RGB のどちらを選択中かに応じて変わります。
参考： 表示中の設定は、レポート、プリントアウト、データ出力の設定にも反映されます。

各チャンネルの表示／非表示の切り替え
ツールボックスのチャンネル表示（C1, C2, C3）をクリックします。

合成イメージ上の各チャンネルの表示／非表示の切り替え
ドロップダウンリストの Show/Hide Channel 1～3 をクリックします。

43

マルチチャンネルのレイアウト表示の変更
レイアウト変更ドロップダウンリストの中からレイアウトを選択します。

Grid View グリッド表示 （デフォルト表示）

Vertical View 縦表示

Horizonal View 横表示

Single View 選択チャンネルの表示

44

マルチチャンネルイメージの分割
マルチチャンネルイメージを、チャンネルごとに分割してファイルに保存することができます。マルチチャンネルイメージを分割すると、RGB の合成イメージを除く各チャンネルのイメージが表示されます。各チャンネルのファイル名は、マルチチャンネルと同じ名称に撮影アプリケーション名をカ
ッコ付きで示したファイル名となります。すべての撮影条件とデータ解析情報は、分割した新しいフ
ァイルにもコピーされます。
1. マルチチャンネルイメージを開きます。

2. ファイルメニューから、Split Multichannel Image をクリックします。
RGB の合成イメージを除く、各チャンネルのイメージが別のウィンドウに表示されます。
3. 新しいファイルとして、各チャンネルのイメージを保存します。
4. 別のチャンネルを表示するには、Windows メニューから選択します。
5. 他のチャンネルも別のファイルとして保存します。

45

シングルチャンネルイメージからマルチチャンネルイメージの作成
シングル撮影用プロトコルで作成したイメージ、または Image Lab ソフトウェアで開いているマルチチャンネルイメージ中の任意のイメージから、「リンク無しマルチチャンネルイメージ」を作成することができます。マルチチャンネルイメージとして合成できるのは、縦横の寸法比率が同一の画像のみです。各チャンネルのイメージ間には情報がリンクされていないため、あるチャンネルに加えた変更は、他のチャンネルには影響しません。
参考：
シングルチャンネルイメージやマルチチャンネルイメージのようなイメージタイプに関する詳細は、第 5 章の「イメージタイプ（61 ページ）」をご参照ください。
マルチチャンネル用のプロトコルで撮影することにより、「リンク付きマルチチャンネルイメージ」が作成されます。ここでは、シングルチャンネルイメージから合成して作成する「リンク無しマルチチャ
ンネルイメージ」について説明します。

シングルチャンネルイメージからの作成
1. シングル撮影した複数のイメージを、Image Lab ソフトウェアで開きます。
2. 上部 File メニューから、Create Multichannel Image をクリックします。ダイアログボックス
が開き、イメージのリストが表示されます。
3. 画面左側のリストから、合成したいファイルを右側のチャンネルボックスにドラッグします。チャ
ンネルボックスに１つ目のファイルを追加すると、画面左側のリストには、縦横の寸法比率が同一の合成可能なファイルのみが残ります。
4. （必要に応じて）各チャンネルの表示色を、ドロップダウンリストから選択します。プレビュー画
面には、指定した表示色のマルチチャンネルイメージが表示されます。
5. 画面右下の OK をクリックし、マルチチャンネルイメージを保存します。

46

マルチチャンネルイメージからのチャンネルの入れ替え
1. 編集したいマルチチャンネルイメージと、追加したいシングルイメージを開きます。
2. 上部 File メニューから、Create Multichannel Image をクリックします。ダイアログボックス
が開き、イメージのリストが表示されます。
3. 画面左側のリストから、合成したいファイルを、右側のチャンネルボックスにドラッグします。同
様にマルチチャンネルイメージから編集したいチャンネルを、右側のチャンネルボックスにドラッグします。
4. 画面右下の OK をクリックし、マルチチャンネルイメージを保存します。

47

解析結果の表示
イメージの解析結果は、Analysis Table（解析一覧表）、Lane Profile（レーンプロファイル）、
Standard Curve（標準曲線）および Report（レポート）として出力することができます。
これらの結果の表示切替えボタンは、メインツールバーにあります。全ての解析結果は一度に表示することができます。それぞれ項目のオプションについては後述します。

Analysis Table （解析一覧表）
メインツールバーの Analysis Table ボタンをクリックすると、選択中のイメージに関する解析結果の一覧表が表示されます。左下のタブから、次の 3 種類のデータを閲覧することができます。
• Lane and Band Table• Volume Table• Lane Statistics
Lane and Band Table
この一覧表では、Lane and Band によるバンドの解析結果を、レーン番号順に表示します。マルチ
チャンネルイメージの場合には、各チャンネルの表示色に対応した背景色となります。

48

Lane and Band の各項目の説明

表示

項目名

内容

ChannelChannel

チャンネルの名称

Lane

Lane

バンドのレーン番号Band No.

Band Number

レーンごとに、各バンドに上から順につけられた番号

Band LabelBand Label

Mol.Wt.(kDa) Molecular Weight
Relative
Front

Relative Front

Adj. Volume

Adjusted Volume

VolumeVolumeAbs. Quant.

Absolute Quantity

Rel. Quant.

Relative Quantity

Band %

Band %

Lane %

Lane %

Norm.Factor
Norm. Vol.

Normalization
FactorNormalized
Volumeユーザーが任意に入力したカスタムラベル名（表中の Band Label ボックスをダブルクリックすると入力可能）
ユーザーが定義したスタンダードと回帰法に基づいて算出されたバンドの分子量または塩基数
イタリック体の値は外挿値（検量線外）であることを示す
泳動の開始点から先端までに対するバンドの相対的な移動度で、0～1 の数値で示される（Rf 値）
バックグラウンド補正後積分値
Volume 値からバックグラウンドを差し引いた値
積分値検出したバンドのシグナル強度の合計値
絶対的な定量値
濃度スタンダードと回帰法に基づいて、バンドの補正後積分値（Adj. Volume）から算出された値
相対的な定量値
リファレンスのバンドの補正後積分値（Adj.Volume）を１とした相対値
レーン中で検出された全バンドの積分合計値に対する各
バンド積分値の百分率
レーン中の全てのシグナル積分値（バンドとして検出されていないシグナルも含む）に対する各バンド積分値の百分率
レーン間のシグナル強度を補正するための補正係数
Norm. Factor で補正した Adj. Volume

49

Volume Table
この一覧表では、Volume Tools による解析結果を表示します。Volume Tools による解析では、Lane and Bands とは異なる 2 種類のバックグラウンド補正方法を選択できます。

Volume Table の各項目の説明

表示

項目名

内容

No.

Volume Number

各エリアに割り当てられた独自の番号

Label

Volume Label

指定エリアの属性に応じて割り当てられたラベル
U＝Unknown、B＝ Background 、S＝Standard のいずれかの接頭語＋通し番号

Type

Volume Type

バンドの属性（Unknown、Background、Standard）

VolumeVolumeAdj. Vol.

Adjusted Volume

Mean Bkgd.

Mean Background

積分値
指定エリア内の全てのシグナル強度の合計値
バックグラウンド補正後積分値
Volume 値からバックグラウンドを差し引いた値
バックグラウンドの 1 ピクセルあたりの平均値
絶対的な定量値
濃度スタンダードと回帰法に基づく、指定エリアの補正後積分値（Adj. Vol.）から算出された値
相対的な定量値
リファレンスの補正後積分値（Adj. Vol.）を１とした値

Abs. Quant.

Absolute Quantity

Rel. Quant.

Relative Quantity# of Pixels

Number of Pixels

指定エリア内のピクセル数

Min. Value

Minimum Value

指定エリア内での最小強度（1 ピクセルの強度）

Max. Value

Maximum Value

指定エリア内での最大強度（1 ピクセルの強度）

Mean Value

Mean Value

指定エリア内での強度の平均値（1 ピクセルの強度）

Std. Dev.

Standard Deviation 指定エリア内での全ピクセルの標準偏差

Area

Area

指定エリア内の面積、単位は mm250Lane Statistics Table
この一覧表は、Lane and Bands の解析結果に関係するレーンごとの補足情報です。
参考：
Lane Statistics Table の表示方向を、表示オプションから変更することはできません。

Lane Statistics Table の各項目の説明

表示

項目名

内容

ChannelChannel

チャンネルの名称

Lane No.

Lane Number

レーン番号

Adj.Total Band Vol.

Adjusted Total Band
VolumeTotal Band Vol.

Total Band Volume

Adj.Total Lane Vol.

Adjusted Total Lane
Volume

レーンごとの全ての検出バンドに関する
Adj.Volume の合計値
レーンごとの全ての検出バンドに関する
Volume の合計値
レーンごとのバックグラウンドを差し引いた全てのシグナル積分値

Total Lane Vol.

Total Lane Volume

レーンごとの全てのシグナル積分値

Bkgd. Vol.

Backgound Volume

レーンごとのバックグラウンドの積分値

Norm. Factor

Normalized Factor

レーン間のバンドの強度を補正するための補正係数51データのオプションの表示 Display Data Options
Display Data Options のコマンドから Analysis Table に表示する内容を設定することができます。
このコマンドには Measurements、Display、Export の 3 つのタブがあります。

◼

表示項目 ：Measurements
一覧表の表示項目を切り替えることができます。表示したい項目は Displayed に、表示しない
項目は Not Displayed フィールドに移動します。変更したい項目にカーソルを合わせ→ボタンで切り替えます。項目の詳細については前ページをご参照ください。

◼

表示形式 ：Display
表示形式を設定します。
• Default display settings「Move selected lane to top」にチェックを入れると、画像上で選択されているレーンの情報を、
Analysis Table からスクロールして表示します。デフォルト設定では、選択された状態となっています。
• Per Measurement Precision
Lane and Band Table および Volume Table の両方において、測定の精度（小数点以下の桁数）を項目別に設定することができます。

• Example
Per Measurement Precision で選択した桁数で、小数点以下の数値を例示します。

52

◼

出力形式 ：Export

ファイル出力形式を設定します。
• Export formatting
出力したファイルにレーンヘッダー（Lane and Band Table のみ）、またはコラムヘッダーを含め
るか、チェックボックスで指定します。
• Export delimiter
出力するファイルのデータ区切り形式を、次の後の形式にするか指定します。
- コンマ区切り（CSV）- タブ区切り- その他のユーザー定義の区切り

解析一覧表の方向切り替え ：Change Analysis Table Orientation
解析一覧表の表示方向を、縦方向と横方向のどちらにするか切り替えることができます。
ただし、Lane Statistics Table の表示方向を切り替えることはできません。
• Horizontal
Horizontal を選択するとレーンごとのデータを横に並べて表示します。
ユーザーは表を左から右にスクロールしてデータを閲覧することができます。
• Vertical
Vertical を選択するとレーンごとのデータを縦に並べて表示します。
ユーザーは表を上から下にスクロールしてデータを閲覧することができます。

解析一覧表の出力 ：Export an Analysis Table
解析一覧表のデータをファイルとして出力することができます。データの出力に関する詳細な情報については第 8 章をご参照ください。
• Copy Analysis Table to the Clipboard
解析一覧表をそのままワープロまたはプレゼンテーションアプリケーションにペーストします。
このボタンをクリックすると表がクリップボードにコピーされます。ペースト先のスペースを確保する関係で、上述の方向設定を Vertical で展開した表を出力することを推奨します。
• Export Analysis Table to a File
CSV（コンマ区切り）ファイルとして出力します。データファイルはデータベースアプリケーショ
ンで開くことができます。
• Export Analysis Table to EXCEL
このボタンで出力されたファイルは、Excel の公式機能に対応します。プログラムをすでにコンピューターにインストールしている場合には、Excel（Mac では Numbers）が立ち上がり、データが表示されます。

53

Lane Profile （レーンプロファイル）メインツールバーにある Lane Profile コマンドは、選択したレーンのデンシトグラムを横に展開して表示します。Lane Profile ウィンドウを開いているときに、画像上の別レーンをクリックすると、新たに選択したレーンのデンシトグラムを表示します。

Rf 値と強度

Background Subtraction

Lane Profile 画面の左下には、バックグラウンド補正(Background Subtraction) 用のバーがあります。Lane Profile 画面の右下には、マウスのポインターが指す位置の Rf 値およびシグナル強度が表示されます。
選択したレーンのイメージ（ゲルまたはメンブレン）が、デンシトグラムの下に横向きに示されています。Transform や Image Color での設定が反映されています。

Lane Profile 画面のタイトルバーには、Lane 1 , Lane 2 のようにレーン番号が表示されています。
また、マルチチャンネル画像の Lane Profile ではチャンネル名も表示されます。
例： Lane 2 (DyLight 650)
Lane Profile 画面のツールバーには、次のような機能があります。
• Zoom in と Zoom out ： 拡大と縮小• Scale to fit graph ： 表示中のデンシトグラムで最も高いピークを最大表示• Include Background ： バックグラウンドを含めた表示• Identify Band by ： 検出したバンドの表示• Detect bands ： バンド検出• Lane ： 前後の番号のレーンへの表示変更

54

別のレーンに切り替える方法
次のいずれかの方法をとります。
• Lane Profile 画面のツールバーの左右矢印キーをクリックする• ゲル（またはメンブレン）イメージから任意のレーンをクリックする
マルチチャンネルイメージで、別のチャンネルに切り替える方法
1. ゲル（またはメンブレン）イメージから、見たいチャンネルをクリックします。
2. Lane Profile 画面のツールバーの左右矢印キー
を選択します。

をクリックして、表示したレーン◼ Background subtraction
Lane Profile 画面の左下にある Background Subtraction のスライドバーを動かすか、Disk Sizeに数字を入力することによって、ベースラインの調整を行うことができます。バックグラウンドレベルの変更はレーンごとに設定することができ、Apply to all lane をクリックすると、全てのレーンに同じ
バックグラウンドレベルが適用されます。
スライドバーを左端の None にあわせると、バックグラウンドを差し引かない設定となります。

◼ Disk Size の設定
バックグラウンドはローリングディスク法で算出されます。ローリングディスクは、仮想の円盤をレーン下に沿わせて転がし、円盤の軌跡をもとにバックグラウンドを設定します。
ローリングディスクは 0.1～100mm の範囲で 0.1mm 刻みのサイズで指定することができます。ディ
スクのサイズはバックグラウンドレベルに影響します。
Disk Size を大きくすると、ディスクはベースラインから大きく離れず、レーンのピークとの接触点はほとんどないためバックグラウンドはあまり削除されません。ディスク径を小さくすると、ディスクはピークの内側に接近し、バックグラウンドを多く除去します。
大きすぎるディスク半径はバックグラウンドがあまり削除されず、小さすぎるディスク半径は実際のデータから余計にバックグラウンドを差し引くと考えられます。
通常ほとんどのサンプルについて、ディスク半径は 10mm 以下のサイズが適切です。
Stain-Free ゲル等の総タンパク質検出によるノーマライズを行う場合は、70mm が適切です。
Lane Profile コマンドで確認できるバックグラウンドが十分に削除されるまで、ディスク径の検討を何回でも行うことができます。
◼ Detect Bands
Detect Bands をクリックすると、バンドを検出するためのダイアログボックスが開きます。バンド検
出の感度 Sensitivity、対象レーンを指定し、Detect をクリックします。
バンド検出に関する詳細は、第 5 章 の「バンドの検出（78 ページ）」をご参照ください。

55

◼ Scale to Fit Graph
チェックボックスをにチェックすると、表示中のデンシトグラムで最も高いピークを、画面に最大表示します。これにより目的のバンドの Lane Profile がより見やすくなります。
Scale to Fit Graph チェックボックスのチェックを外すことで、縦軸は全範囲表示となります。この場
合、レーン間でのピーク高さの比較がしやすくなります。
◼ Include Background
バンドの定量に用いられるのは、デンシトグラム上でピーク（赤線）とベースライン（青線）の間にある緑色のエリアです。
Include Background ボックスにチェックを入れると、バックグラウンドとして差し引かれたエリアが、グレーで表示されます。

Include Background ボックスのチェックを外すと、グレーのエリアが消え、バックグラウンドを差し引いた強度でピーク（赤線）が表示されます。

56

◼ Identify Bands by
デフォルト設定では、検出されたピークは Lane Profile 上ではバンド番号で示されます。ピークに付けられるラベル表示を、ドロップダウンリストにある次のいずれかの情報に変更することができます。
• Band Number ：バンド番号• Band Label ：バンドラベル• Mol. Wt. （Molecular Weight） ：分子量
• Relative Front ：Rf 値• Adj. Volume ：バックグラウンド補正後の積分値• Volume ：バンドの積分値（ボリューム値）• Abs. Quant. （Absolute Quantity） ：絶対定量値• Rel. Quant. （Relative Quantity） ：相対定量値• Band % ：レーン中の全てのバンドの積分合計値と比較したバンド積分値の百分率• Lane % ：レーンの全積分値と比較したバンド積分値の百分率• Norm. Factor <Multichannel 専用> ：Normalization 用の補正係数• Norm. Vol. <Multichannel 専用> ：Normalization Factor で補正後の積分値

バンド境界線の変更
Lane Profile の下にあるバンドの抜粋図には、バンドの境界線が青い線で表示されています。
この境界線にカーソルを合わせ（カーソルの形が横矢印に変わった後）、境界線をドラッグすると、バンドの境界線を移動させることができます。

境界線をつかんで右へ

境界線は隣のバンドの境界線と交差させることはできません。
ここで境界線を変更すると、全ての解析値（Volume 値、Rf 値を含む）も直ちに変更されます。

57

Lane Profile からのバンドの追加／削除
Lane Profile 画面でも、バンドの追加と削除を行うことができます。
ただし、イメージを編集する権限がなければ、追加や削除を行うことはできません。Lane Profile
画面上をマウスで指すと、ポインターが＋（プラス）型となります。もし、イメージを編集する権限も持たない場合には、ポインターの形は変わらず、バンドの追加削除を行うことはできません。

バンドの追加方法
1. Lane Profile 上のバンドを追加したい位置に、マウスのポインターを移動します。
2. Ctrl キー（Windows の場合）または Command キー（Mac の場合）を押します。
ポインターが＋（プラス）型となります。
3. そのままマウスをクリックすると、バンドが追加され、バンド番号に反映されます。

バンドの削除方法
1. Lane Profile 上のバンドを削除したい位置に、マウスのポインターを移動します。
2. Ctrl キー（Windows の場合）または Command キー（Mac の場合）を押します。
ポインターが×（エックス）型となります。
3. そのままマウスをクリックすると、バンドが削除され、バンド番号に反映されます。

58

スタンダードカーブ

Standard Curve コマンドは定義したスタンダードとバンドの関係に最もよく適合する曲線を表示します。画面下のタブにより 3 つの異なる解析に対する標準曲線を表示します。
既知のスタンダードは緑色で表示され、未知の試験サンプルは赤色で表示されます。左上方のLogY‐axis ボックスをクリックすると対数スケールの Y 軸を表示することができます。Molecular
Weight Analysis Tools で選択した回帰法が表示され、回帰法の式（適用がある場合）および R2 値も表示されます。
このウィンドウ内のタブによって Mol. Weight Standard Curve（分子量標準曲線）、Abs. Quantity
Standard Curve（絶対定量標準曲線）、Volume Standard Curve（ボリューム値標準曲線）を表示することができます。

解析レポートの作成

解析結果はレポートをクリックすることでレポートとして表示することができます。
レポートの内容を決定したり、項目を確認したりする具体的な方法はページをご参照ください。
第 6 章 レポートの作成（103 ページ～）をご参照ください。

59

60

第 5 章 イメージの解析
Analysis Tool Box はイメージファイルが開かれ、ウィンドウがアクティブになると使用可能になります。Windows PC では操作中のウィンドウには濃紺色のメニューバーが表示されます。Mac では操
作中のウィンドウはウィンドウ制御アイコンが明るく表示されます。これらを識別することによってデスクトップ上に開いている複数のイメージファイルを区別しながら編集することができます。

イメージタイプ
Image Lab ソフトウェアでは、次の 3 種類のファイルを取り扱います。

シングルチャンネルイメージ
単一条件で撮影するためのプロトコルで撮影して得られたイメージファイルです。

（拡張子 .scn）

リンク付きマルチチャンネルイメージ
ChemiDoc MP、ChemiDoc Touch MP のような複数の落射光源を搭載した画像撮影装置では、マルチチャンネル用のプロトコルで撮影することにより、マルチチャ
ンネルイメージを作成することができます。マルチチャンネルイメージは、最大で 3チャンネルの合成まで可能です。マルチチャンネルプロトコルで撮影すると、チャン（拡張子.mscn）
ネル間で情報がリンクされた「リンク付きマルチチャンネルイメージ」となります。この場合、あるチャンネルでレーンの検出を行うと、自動的に他のチャンネルにもレーンの検出が反映されます。

リンク無しマルチチャンネルイメージ（拡張子.mscn）

複数のシングルチャンネルイメージを Create Multichannel Image の機能で合成して作成したファイルです。この場合、あるチャンネルでレーン検出を行っても、他のチャンネルには反映されません。レーン検出はチャンネルごとに、個別に行う必要があります。

参考 ：アイコンやファイルを表示しただけでは、リンク付きとリンク無しのマルチチャンネルイメージは区別することができません。

61

Analysis Tool Box
Analysis Tool Box には以下のコマンドがあります。

Auto Analysis は全自動で画像を迅速に解析します。
Image Tools は画像を反転、回転させます。また、イメージファイルから必要部分を切り取ったり、合成（重ね合わせ）を行ったりすることができます。
Lane and Bands はバンドやレーンの検出機能を制御します。レーンの数や太さの変更、調整を行うことができます。またバンドの検出、追加、削除などを行うことができます。
MW Analysis Tools は分子量（核酸ゲルを使う場合は塩基対）を算出します。
スタンダードのレーンを選択し、検量線を作成することができます。
Quantity Tools は相対値または絶対値を用いて自動的にバンドを定量します。
Annotation Tools は研究者が関心をもったレーンやバンドにテキスト情報を付与します。
Volume Tools は自ら定義した境界領域内のシグナルを積算し定量化します。

62

自動解析ツール
Auto-Analysis を行うと、イメージ上のレーンとバンドを自動的に検出し、バンドの分子量解析まで行うこともできます。
Analysis Tool Box の Auto-Analysis ボタンをクリックすると、次ページの Detection Setting 画面が開き、パラメータを設定することで以下のことが可能になります。
• 撮影時に自動解析を行っていないイメージを解析する。
• 解析パラメータを変更してイメージを再解析する。
注意 ：解析したゲルに対する設定を変更する場合、最初の解析結果は消去され上書きされます。古い
解析結果を残しておくためには Save as コマンドで別のファイル名をつけ、イメージファイルを別ファイルとして保存します。
（マルチチャンネルイメージの場合） Auto-Analysis で「リンク付きマルチチャンネルイメージ」の解析を行うと、バンド検出の感度や分子量解析の設定は全てのチャンネルに適用されます。
Auto-Analysis の後に Lane and Bands ツールを使えば、バンド検出の感度をチャンネルごとに変えることもできます。
「リンク無しマルチチャンネルイメージ」で Normalization 用チャンネルを設定していない場合は、チャンネルごとで個別にレーンとバンドの検出を行う必要があります。「リンク無しマルチチャンネ
ルイメージ」で Normalization を行う場合は、まず Normalization チャンネルでレーン検出を行い、そのレーン検出結果をコピーして別のチャンネルにも貼り付けてください。バンド検出はサンプルのチャンネルでのみ実施してください。（Normalization チャンネルではバンドの検出まで実施しなくても、補正を実施できます。）

63

Auto Detection Settings ： 検出の設定
自動解析のパラメータは以下の画面で設定します。

◼

バンドの自動検出の感度設定 ：Band Detection Sensitivity
バンド検出感度には以下の選択肢があります。
• Low
この設定を選択すると濃いバンドが存在するイメージに対して、感度を下げたバンドの検出を行います。この設定では薄いバンドは検出されません。
• High
この設定を選択すると薄いバンドを含むイメージに対して、感度を上げた検出行います。多くのバンドが検出されるので、不要なバンドがある場合は Analysis Tool Box の Band Tools を用いて削除します。具体的な方法は 81 ページ（バンドの修正）をご参照ください。
• Custom
検出感度を任意に設定することができます。1～100 の数値を入力します。
上述の Low / High の検出に設定されている数値は Custom では以下に相当します。
・Low Band Detection Sensitivity＝25
・High Band Detection Sensitivity＝75• Advanced
より高度な設定でバンドを検出することができます。
具体的な方法は「バンドの検出（78 ページ）」をご参照ください。

64◼

分子量解析設定 ：Molecular Weight Analysis Settings
分子量自動解析を行うためのスタンダードに関する設定を行います。
• Molecular Weight Standard ：分子量スタンダード
分子量の測定を行なうには適切なスタンダードを選択する必要があります。多くのバイオ・ラッド ラボラトリーズ社のタンパク質スタンダードが利用可能です。他社のスタンダードを使用することもできます。また、様々な DNA スタンダードも利用可能です。
• Standard Lanes ：スタンダードレーン
スタンダードレーンを選択または変更することができます。
• Regression Method ：回帰法
4 つの回帰法の中から選択することができます。詳細については、付録 A 回帰法の計算（120 ページ）をご参照ください。

65

Analysis Tool Box の解析ツール
解析ツール＝Analysis Tool は撮影したイメージファイルを編集したり、自動解析の結果をカスタマイズしたりするためのツールです。これらのコマンドはイメージファイルがアクティブになっているときのみ使用することができます。

各ツールにアクセスするために、Tool Box アイコンをクリックします。Analysis Tool Box メニューに戻るためにはツール名の左側にある逆向き矢印ボタン
をクリックしてください。
ツール名の右側にある二重の矢じりボタン
をクリックすると、Analysis Tool Box が最小化し、画像を閲覧するためのワークスペースを広げることができます。もう一度クリックすると、Analysis
Tool Box が元の大きさに戻ります。

(1) Image Tools ：画像編集ツール
Image Tools を使用すると、イメージに切り取りや反転などの編集を行うことができます。
なおイメージは反転、回転、切り取りすると、解析結果がすべてリセットされます。そのため、解析を行ったイメージを編集するときには本当に操作を継続するか（Continue）かキャンセル（Cancel）
するかを確認するメッセージが表示されます。続行する場合は Continue をクリックします。

逆向き矢印
をクリックすると、一つ上のメニュー（Analysis Tool Box）に戻ることができます。

66

◼

反転 ：Flip
ゲルイメージを水平（Horizontal）または垂直（Vertical）方向に反転することができます。

◼

回転 ：Rotate
右回転アイコンまたは左回転アイコンを用いてイメージを 90°回転することができます。任意の角度回転させたい場合（斜めのゲルを修正する場合）には、Custom ボタンをクリックし、以下の作業を行います。
1. ゲルの上に現れる赤色の矢印をマウスでクリック／ドラッグして 0～360°の任意の角度を指定します。
2. ゲルイメージ上でマウスを右クリックして Rotate を選択するとゲルが回転します。
3. 回転をキャンセルしたい場合は、右クリックから Cancel を選択します。

◼

切り取り ：Crop
撮影したイメージから必要な部分だけを切り取りたい場合には、以下の作業を行います。
1. 切り取りたい画像を開き、Image Tool にある Crop ボタンをクリックします。
2. 画像上に四角形の赤色ボックスが表示されるので、このボックスの境界線をドラッグし残したい領域を微調整します。
3. 複数の画像を同じ大きさで切り取りたい時など、切り取り範囲を保存したい場合は赤色ボックス内でマウスを右クリックして Save Crop Settings を選択し、ファイル名をつけて保存します。
4. 選択範囲を切り取るには、赤色ボックス内でマウスを右クリックして Crop を選択します。
5. 切り取りをやめたい場合は、マウスを右クリックして Cancel を選択します。

保存した Crop Settings の再利用
1. 切り取りたい画像を開き Image Tool にある Crop ボタンをクリックします。
2. 画像上でマウスを右クリックして Load Crop Settings を選択します。
3. 利用したいファイルを選択し Load をクリックます。
4. 選択範囲を切り取るには、赤色ボックス内でマウスを右クリックして Crop を選択します。

保存した Crop Settings の廃棄
1. 任意の画像（なんでもよい）を開き Image Tool にある Crop ボタンをクリックします。
2. 画像上でマウスを右クリックして Delete Crop Settings を選択します。
3. 廃棄したい setting ファイルを選択し Delete をクリックます。

67

◼

データの白黒反転 ：Invert data
ゲルの解析を行うためには、バンドのシグナル強度値はバックグラウンドよりも大きくなければなりません。そのためネガティブ染色およびザイモグラムの解析にはデータの白黒反転が必要です。
データの白黒反転処理が必要かどうか不明な場合は、ゲルの 3-D ビュー
を表示します。3-D ビューでバンドが山（上に凸）になっている場合には反転は不要、谷（下に凹）になっている場合は反転が必要です。
反転が必要な場合は、以下の作業を行います。
1. Invert Data をクリックします。
2. 確認メッセージが表示されるので、反転を実行する場合は Yes をクリックします。

◼

イメージの重ね合わせ ：Merge
同一サイズで撮影した 2 つのシングルチャンネルイメージを重ね合わせて、両イメージのシグナルを有する合成イメージを作成することができます。
化学発光検出において発光しないプレステインのスタンダードを用いた場合、スタンダードを撮影した可視（epi-white）イメージとターゲットを撮影した化学発光（Chemi）イメージを別々に撮影することになります。
この Merge 機能を用いると、化学発光法で検出したターゲットのイメージと、可視で検出したス
タンダードレーンのイメージを融合し、ターゲットバンドとスタンダードバンドが並んだ画像を合成することができます。
イメージの合成は定量に影響をきたす場合があります。正確な定量が必要な場合、合成前のイメージで解析してください。なお、合成できるのは同じサイズのイメージのみとなります。重ね合わせする場合は Zoom やゲルの大きさを変えずに光源だけ変更して撮影する必要があります。
イメージの合成は以下の方法で行います。
1. 重ね合わせしたい画像を同時に開きます。
2. Merge のボタンを押します。
3. 合成可能なイメージのリストが表示されるので、イメージ名を選択し OK を押します。
4. 両方のイメージのシグナルを持った画像が表示されます。

Merge と同じような効果が得られる機能として、Multichannel イメージがあります。使い勝手や機能が異なりますので、目的に応じて使い分けます。
Multichannel イメージの作成方法については、46 ページをご参照ください。

68

(2) Lane and Bands ：レーンとバンドの修正ツール
Lane and Bands はレーンツールとバンドツールから構成されており、レーンやバンドをカスタムで作成、変更することができます。レーンツールとバンドツールはタブにより機能を選択します。
Normalize の設定も Lane ツールから行います。
Lane ツール（Lanes タブ）によるレーンの検出
レーンの追加や削除は Lane ツールを使用して行います。Automatic または Manual Lane
Finder ボタンを用いて、レーン検出の方法を選択することができます。
Automatic
ゲルイメージにゆがみが少ない場合、Automatic ボタンをクリッ
クしてレーンを自動検出します。
Manual
任意のレーン数を指定したい場合、または自動レーン検出で期待した検出結果が得られなかった場合は Manual ボタンをクリックします。
Manual Create Lanes のウィンドウにレーン数を入力して、OKをクリックします。

全レーンフレームの編集 （71 ページ~）
Adjust Frame
レーン全体を含む「レーンフレーム」の形を調整します。
四隅のアンカーをドラッグして、バンドの位置にあわせます。
Resize Frame
レーン全体を含む「レーンフレーム」のサイズを調整します。
四隅のアンカー、または外周の辺をマウスでドラッグして、バンドの位置にあわせます。

各レーンの個別編集 （73 ページ~）
Adjust Frame, Resize Frame を選択しない状態でレーンをクリックすると、各レーンを個別に選択することができます。レーンのアンカーをドラッグすることで、位置やサイズを微調整することもで
きます。

69

マルチチャンネルイメージでのレーンの検出
マルチチャンネルイメージで Automatic によるレーン検出を行った場合、リンクの有無によって動作が異なります。

◼

リンク付きマルチチャンネルイメージでのレーン検出方法

リンク付きマルチチャンネルイメージの場合、まず選択しているチャンネルでレーン検出を行うと、全てのチャンネルで自動的にレーン検出が行われます。
1. 適当なチャンネルを選択し、Automatic をクリックします。Manual の場合は、レーン数も入力します。
2. 自動的に他のチャンネルにもレーン検出が適用されます。
◼

リンク無しマルチチャンネルイメージでのレーン検出方法

リンク無しマルチチャンネルイメージの場合、選択しているチャンネルでのみレーン検出を行います。レーン検出はチャンネルごとに個別に行う必要があります。リンク無しマルチチャンネルイメー
ジで撮影したイメージは、サンプル位置が全く同じとは限らないため、レーン位置もチャンネルごとに少し異なるため位置調整が必要となる可能性があります。
1. 適当なチャンネルを選択し、Automatic をクリックします。Manual の場合は、レーン数も入力します。
2. 別のチャンネルについて、次のどちらかを行います。
・各チャンネルで 1. の操作を繰り返します。
・検出したレーンをコピーし（Ctrl + C）、残った他のチャンネルに貼り付け（Ctrl + V）して、レーン位置の微調整を行います。

70

全レーンフレームの編集
レーン検出を行うと、左から右にレーン番号の振られたレーン枠が現れます。選択されたレーンは赤色の枠で示されます。
（マルチチャンネルイメージの場合）リンク付きマルチチャンネルイメージでは、レーン検出の編集は全てのチャンネルに適用されます。
リンク無しマルチチャンネルイメージでは、レーン検出の編集はそのチャンネルだけに適用されます。
Lanes タブのコマンドから、全てのレーンを含むレーンフレームの形状を編集することができます。
レーンフレームの移動、サイズ変更、削除も行うことができます、レーンフレームを選択すると、フレーム全体が赤色になります。

◼

全レーンフレーム編集の開始
Analysis Tool Box の Lane and Bands をクリックします。
Lane and Bands の編集が可能な状態となります。デフォルトでは Lanes タブが選択されています。

◼

全レーンフレームの形状の調整

1. Lanes タブから Adjust Frame をクリックします。
2. 赤色のレーンフレームの四隅にマウスのポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（）となります。そのままマウスでドラッグすると、フレーム全体の形状を調整することができます。
3. （必要に応じて）もしゲルの泳動がスマイリングしていた場合には、アンカーを追加することで微調整を行うことができます。
参考：
フレームの上辺または底辺にマウスのポインターを合わせると、ポインターに＋が付属します。
右クリックして、Add Anchor をクリックすると、アンカーが追加されます。アンカーをドラッグして移動することによって、フレームの形状を微調整します。
4. レーンフレームの形状の調整が終わったら、Adjust Frame をクリックして、編集を終了します。

◼

全レーンフレームのサイズ比の変更

1. Lanes タブから Resize Frame をクリックします。
2. 赤色のレーンフレームの四隅にマウスのポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（）となります。
3. そのままマウスでドラッグすると、フレームの高さと幅を同時に変更することができます。
4. フレームのサイズ比の変更が終わったら、Adjust Frame をクリックして編集を終了します。

71◼

全レーンフレームの高さの変更

1. Lanes タブから Resize Frame をクリックします。
2. 赤色のレーンフレームの上辺または底辺にマウスのポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（）となります。
3. そのままマウスでドラッグすると、フレームの高さを変更することができます。
4. フレームの高さの変更が終わったら、Resize Frame をクリックして編集を終了します。
◼

全レーンフレームの幅の変更

1. Lanes タブから Resize Frame をクリックします。
2. 赤色のレーンフレームの左右のどちらかの辺にマウスのポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（）となります。
3. そのままマウスでドラッグすると、フレームの幅を変更することができます。
4. フレームの幅の変更が終わったら、Resize Frame をクリックして編集を終了します。
◼

全レーンフレームの移動

1. Lanes タブから Adjust Frame または Resize Frame をクリックします。
2. 赤色のレーンフレームの内部にマウスのポインターを合わせると、ポインターが十字矢印（）となります。
3. そのままマウスでドラッグすると、フレームを移動することができます。
4. フレームの移動が終わったら、Adjust Frame または Resize Frame をクリックして編集を終
了します。

72

各レーンの個別編集
レーン検出を行うと、左から右にレーン番号の振られたレーン枠が現れます。Adjust Frame やResize Frame ボタンが選択されていない状態で、個々のレーンをクリックすると 1 レーンずつ選択することができます。選択されたレーンは赤色の枠で示されます。マウス操作により、レーンの編集を個別に行うことができます。マウスのポインターをレーン上で静止させると、操作方法に関するヘルプメッセージが表示されます。レーン検出に関する編集は、Lanes タブから行います。

◼

各レーンの個別編集の開始

1. Analysis Tool Box の Lane and Bands をクリックします。
Lane and Bands の編集が可能な状態となります。デフォルトでは Lanes タブが選択されています。
2. （必要に応じて）Adjust Frame または Resize Frame ボタンが選択されている場合には、そのボタンをクリックすると解除されます。これにより、個別にレーンの編集を行うことができます。

◼

レーンの選択
次のいずれかを実施すると、選択されたレーンが赤色の枠で示されます。

◼

•

レーンにマウスのポインターを合わせてクリックします。

•

連続した複数のレーンを選択する場合、Shift キーを押したまま、初めのレーンと最後のレーンをクリックします。

•

連 続 しない複数 のレー ンを選 択する 場合 、 Ctrl キー を押 したまま（ Mac の場 合はCommand キー）、各レーンをクリックして選択します。

•

全てのレーンを選択する場合、Ctrl キーと A（Mac の場合は Command キーと A）を押します。

選択した複数レーンの移動

1. ポインターを選択したレーンにあわせると、ポインターが左右三角矢印（
ままマウスをドラッグして、目的の位置まで移動します。
2. 選択したすべてのレーンが同時に移動します。
必要に応じてレーン番号も自動的に修正されます。

73）となります。その◼

レーン幅の変更

1. レーンを選択します。
白色のアンカーポイントが表示されます。
2. レーンの左右の辺上にあるアンカーにポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（となります。

）

3. アンカーをドラッグして、適したレーン幅となるように変更します。

アンカー

◼

指定したサイズへのレーン幅の変更

1. １つまたは複数のレーンを選択します。
2. Lanes タブから mm 単位で幅を指定し、Set Width をクリックします。
Image Lab は、指定されたレーンのレーン幅に変更します。

◼

複数のレーンサイズの一括変更

1. １つまたは複数のレーンを選択します。
2. いずれかのレーンで、左右の辺上にあるアンカーにポインターを合わせます。マウスのポイン
ターが両側矢印（）となります。
3. アンカーをドラッグして、適したレーン幅となるように変更します。選択したすべてのレーンの幅が一括して変更されます。

74◼

レーンの途中で曲げた形状に変更したい場合

1. レーンを選択します。
2. レーンの中央にあるアンカーにポインターを合わせると、ポインターが十字矢印（
す。

）となりま

3. アンカーを左右にドラッグして、レーンの形状を曲げます。
◼

レーンの上端または下端を傾けたい場合

1. レーンを選択します。
2. レーンの上端または下端にあるアンカーにポインターを合わせると、ポインターが両側矢印（）となります。
3. アンカーを左右にドラッグして、レーンの形状を曲げます。
◼

レーンへのアンカーの追加

1. レーンを選択します。
2. レーンの中央にポインターを合わせて右クリックし、Add Anchor をクリックします。
参考：
いわゆるスマイリングのあるゲルの場合、アンカーの追加によりレーンを調整することができます。レーンフレームの編集も併せて行うと効率的です。

◼

レーンからのアンカーの削除

1. 削除したいアンカーにポインターを合わせて、右クリックします。
2. Remove Anchor をクリックします。
参考：
上端と下端のアンカーは削除することができません。

75

レーンの追加と削除
レーンツールを使って、レーンの追加と削除を行うことができます。
◼

レーンの追加
1. Lanes タブの Add Lanes をクリックします。
2. 画像上で、レーンを追加したい場所をクリックします。
3. （必要に応じて）複数のレーンを追加する場合には、フレーム内の複数の箇所をクリックします。
クリックした場所にレーンが追加されます。
4. レーンの追加を終了するには、再度 Add Lanes をクリックします。
5. 追加したレーンの場所を、微調整します。
6. （必要に応じて）レーンに重なりがある場合には、追加したレーンをフレームの左端か右端に移動します。
レーンフレームは、レーンにあわせて形が変わり、レーン番号は自動的に割り振られます。

◼

レーンの削除
1. 不要なレーンをクリックして選択します。
2. （必要に応じて）Ctrl キーを押したまま（Mac の場合は Commandキー）、不要なレーンをクリックして、複数のレーンを選択します。
3. Lanes タブの Delete Lanes をクリックします。
4. 削除の確認のウィンドウが開くので、Yes をクリックします。
選択したレーンが削除されます。
6. （必要に応じて）残ったレーンの位置やサイズを微調整します。

76◼

レーンフレームのコピーあるイメージのレーンとレーンフレームを別のイメージにコピーすることができます。この機能は、同じサンプル（ゲルまたはメンブレン）を、複数の染色方法で撮影したときに便利です。例えば、Stain-Free のような総タンパク質染色のイメージで調整したレーンフレームを、同一サンプルの蛍
光ウェスタンのイメージにコピーすることができます。レーンフレームのコピーは、リンク無しマルチチャンネルイメージで、特に有用な機能です。
参考：
コピーできるのは全体のレーンフレームだけであり、個々のレーンはコピーできません。
１つのチャンネルには、１つのレーンフレームしか設定することができません。すでにレーンフレー
ムを設定してあるチャンネルに、別のチャンネルからのレーンフレームをコピー&ペーストした場合には、既存のレーンフレームは削除され、コピー&ペーストされたレーンフレームに置き換わります。
参考：
リンク付きマルチチャンネルイメージのあるチャンネルにレーンフレームをコピー&ペーストした場
合には、全てのチャンネルに新しいレーンフレームがコピーされて置き換わります。

チャンネル間でレーンフレームのコピー方法
リンク無しマルチチャンネルイメージでは、次の手順でレーンフレームのコピーをチャンネル間で行うことができます。
1. Analysis Tool Box の Lane and Bands をクリックします。
2. コピーしたいレーンフレームを含むチャンネルを選択します。
3. メニューから Edit > Copy をクリックします。
4. コピー先のチャンネルを選択します。
5. メニューから Edit > Paste をクリックします。
もし、コピー先のチャンネルで設定済みのレーンフレームがあった場合には、古いレーンフレー
ムが削除されることを確認するメッセージが表示されます。
6. Yes をクリックします。
7. （必要に応じて）コピーしたレーンフレームの位置を微調整します。

バックグラウンドの調整
Lanes タブの Adjust background をクリックすると、Lane Profile 画面が開きます。
バンドのパターンが赤色のデンシトグラムで示されており、バンド定量のためのベースラインは青線で示されています。青線のベースラインの下側はバックグラウンドであり、グレーで示されています。
バックグラウンドレベルの調整方法の詳細は、54 ページ～をご参照ください。

77

バンドの検出
Analysis Tool Box の中から Lane and Bands ツールの Bands のタブをクリックすると、バンドを検出するための様々なツールを使用することができます。
バンドの自動検出（Band Finder）
Band Finder の Detect Bands をクリックすると、バンドを自動検出するためのパラメータ設定画面が表示されます。
全てのレーンでバンド検出を行うこともできますし、特定のレーンでのみ行うこともできます。

◼

マルチチャンネルイメージでのバンド検出

マルチチャンネルイメージでは、リンクの有無に関わらず、チャンネルごとにバンド検出を行う必要があります。マルチチャンネルの合成イメージ上では、バンドを検出することはできません。合成イ
メージのバンドではシグナルが加算されたイメージとなっているため、定量を目的としたバンド検出は実施できないようになっています。

◼

バンド検出条件の設定
バンド検出（Detection Settings）には、以下の選択肢があります。
• Low
この設定を選択すると濃いバンドが存在するイメージに対して、感度を下げたバンドの検出を行います。この設定では薄いバンドは検出されません。
• High
この設定を選択すると薄いバンドを含むイメージに対して、感度を上げた検出行います。多くのバンドが検出されるので、不要なバンドがある場合は Analysis Tool Box の Band Tools を用いて削除します。具体的な方法は次ページをご参照ください。
• Custom
検出感度を任意に設定することができます。1～100 の数値を入力します。
上述の Low / High の検出に設定されている数値は Custom では以下に相当します。
・Low Band Detection Sensitivity＝25
・High Band Detection Sensitivity＝7578• Advanced
パラメータ設定画面にある Advanced チェックを入れることで、より高度な設定でバンドを検出することができます。

Advanced Detection のパラメータは以下の 6 つです。

1. Sensitivity
バンドとして認識するシグナルの下限値を決めるパラメータです。この数値を高くすると弱いシ
グナルもバンドとして認識するため結果的にバンドの数は増えます。
この数値を高くしすぎるとバックグラウンドまでバンドとして認識する可能性があがります。この
数値を低くしすぎると、興味のあるバンドが認識されないことがあります。
デフォルト値は 10.0 です。OD 値が 0.05 以下、またはカウント値が 2,000 以下であるような弱いバンドを検出したい場合は 20.0 程度まで Sensitivity を上げます。

2. Size Scale
バンドとランダムノイズを区別するためのパラメータです。
Size Scale は、バンドとして認識するかどうかを決定するための垂直方向のピクセル数を意味しています。垂直方向に設定値以上の厚み（ピクセル）を持っていればバンドとして認識します。
画像のバックグラウンドが高い場合、より大きな Size Scale 値が適切です。
低ノイズであれば、Size Scale 値は小さいほうがよい結果が得やすくなります。
また、数本の太いバンドが検出されたゲルを高解像度でスキャンしている場合にも、Size
Scale 値を大きくした方が認識しやすくなります。

79

3. Noise Filter
バンドとして認識されているランダムノイズを減らすためのパラメータです。Sensitivity の数値を高く設定した際に、この Noise Filter の設定が重要となり、ノイズの誤認識を少なくすることができます。
Noise Filter で設定された値は、ピクセル数で示したフィルタの大きさです。たとえば Noise
Filter の設定を 2.50 にすると、2.50 x2.50 ピクセルのフィルタを設定したことを意味します。このフィルタサイズより小さいシグナルは、ノイズと認識してバンドの検出対象外となります。
Noise Filter 値を 0 にすることで、この機能を OFF にすることができます。
2 本のバンドが太い 1 本のバンドと認識されてしまう場合には、Noise Filter 値を小さくするか、Sensitivity 値を大きくしてみてください。
参考 ：近接したバンドの認識がうまくいかない場合、Noise Filter 値ではなく Size Scale 値を小さくするのも有効です。ただし、Noise Filter 値と Size Scale 値の両方を小さくすると、バンド周辺のあいまいなシグナルをバンドとして誤認識する可能性が高くなります。

4. Shoulder
バ ン ド の 境 目 を 区 別 す る 際 に 、 デ ン シ ト グ ラ ム （ Lane Profile ） で 得 ら れ る ピ ー ク の 肩（Shoulder）を考慮したバンドの検出を行います。近接した２つのバンド（ピークの谷間は小さい）について、Shoulder 値を大きく設定すると、小さな肩もバンドの境界として認識するようになります。この数値を 0 にすると、バンドを認識する際に曲線の肩を考慮しなくなります。
2 本のバンドが太い 1 本のバンドと認識されてしまう場合には、Lane Profile から 2 つのピークの間に谷があるか確認してください。ピークの間に十分な谷がない時には、Shoulder 値を大きくすると 2 本に分離することがあります。

5. Band Limit
各レーンにおいて検出するバンド数の上限を設定します。これによりバンド本数の修正の手間を軽減することができます。

6. Normalize Sensitivity
レーン間のシグナル強度差によるバンド検出の感度差を補正します。
各レーンで最も濃いバンドのシグナル強度を元に、バンド検出の感度を相対化します。
例えば一番濃いバンドが 50,000 カウントのレーン A と 25,000 カウントのレーン B があったとします。このとき、レーン B のバンド検出パラメータのうち Sensitivity を 2 倍（25,000/50,000）にして、バンド検出の感度を調整します。
注意 ：この Normalize はバンドの定量結果には影響を及ぼしません。

80

• Apply to （個別の条件でのレーン検出）
デフォルトでは全レーン同一のパラメータでバンドを検出します。 しかし、レーン個別にバンドの自動検出を行うこともできます。Apply to の設定ウィンドウにあるチェックボックスをLane に変更し、バンド検出したいレーンを選択します。その後 Detect ボタンを押せば、選択したレーンにのみに指定しているバンド検出パラメータを適用させることができます。

バンドの修正 （Bands）
このエリアにある 3 つのコマンドにより、バンドのマニュアル調整を行うことができます。

◼

バンドの追加 ：Add
このコマンドを用いると、薄くて自動検出できなかったバンドを手動で追加することができます。
最初に Add ボタンをクリックし、次にそのレーン内部をクリックすることによって新しいバンドを追加します。
参考：
イメージ全体の色調を暗く調整することによって、薄いバンドもより見やすくなります。
ツールバーの中の Image Transform をクリックし、ダイアログ内の各種スライダーを用いて、調整を行ってください。Image Transform の詳細については、36 ページをご参照ください。

◼

バンドの削除 ：Delete
解析に不必要なバンドを削除することができます。最初に Delete ボタンをクリックし、次に削除
したいバンドをクリックします。

◼

バンドの調整 ：Adjust
バンドの縦幅（厚さ）を調整することができます。最初に Adjust ボタンをクリックします。各バンドの周囲に 2 つの境界線（点線）が現れます。マウスのポインターを境界線上にあわせると、ポインターが両矢印に変わります。そのままドラッグして、境界線を上下に移動させます。バンドの中心が再計算され、バンドが現れます。
また Lane Profile の画面から、バンド境界を調整することもできます。
詳細は、第 4 章の「バンド境界線の変更（57 ページ）」をご参照ください。

81

Volume データのノーマライズ
マルチチャンネルイメージでは、次のような場合に Volume データのノーマライズ（補正）を行うことが有効です。
• ゲルの各レーンにアプライしたサンプル容量は一定でも、総タンパク量が一定であるか疑わしい場合• ピペッティング誤差により、レーンごとにアプライした容量にも誤差が疑われる場合• ゲルからメンブレンへの転写の均一性が疑われる場合
Lanes タブの Normalization から、次のいずれかを選択することによって、これらの誤差を補正することができます。
• Total Lane Protein - 補正用に指定したチャンネル（総タンパク質染色）における、レーン全体のシグナル総和に基づいて補正係数を計算します。
• Housekeeping Protein Bands - ハウスキーピングタンパク質の検出されたチャンネルにおける、検出バンドのシグナル強度の比に基づいて補正係数を計算します。正確な結果を得るためには、ハウスキーピングタンパク質は安定であり、実験条件の影響を受けないものである必要があります。
いずれの設定に置いても、Normalization Factor（補正係数）を用いて定量値（Volume 値）を相対化し、Normalized Volume 値を算出します。

ノーマライズの設定
ノーマライズの設定は、Lane and Bands の Lanes タブで行います。
デフォルトでは、Normalization Lane としてスタンダードではない左端のレーンが選択されています。必要に応じて、スタンダードではない
任意のレーンに変更することができます。
Normalization Channel として、マルチチャンネルイメージ内のチャンネルリストの中から指定します。

シングルチャンネルイメージの場合は、ドロップダウンリストの中から
Add Channel を選択することができます。同時に開いている他のチャ ン ネ ル との マル チ チャン ネ ル イ メー ジ をつ く り 、 Normalization
Channel とすることもできます。

（リンク無しマルチチャンネルイメージの場合）
Normalization Channel で指定したチャンネルでレーンフレームの調整を行った後、Sync Norm. Lanes をクリックすると、他のチャンネ
ルにも変更が反映されます。

82

ノーマライズのワークフロー
Volume データのノーマライズは次のような手順で行います。
1. レーンの検出
Lanes タブから、Lane Finder の Automatic または Manual をクリック
して、イメージ上のレーン検出から行います。
リンク無しマルチチャンネルの場合には、チャンネル間でサンプル位置が異なる可能性があるので、レーンの位置が正しく検出されているか各チャ
ンネルで確認を行います。
参考：
検出したレーンのフレームは、別のチャンネルにコピーすることができます。

2. レーンの修正
重要：
レーン検出の後は、レーンの境界をよく確認して、レーン内のバンドをすべてカバーしているか、レーンに重なりがないかをチェックしてください。
以下のイメージは、Automatic でレーンを検出した例です。いくつかのバンドがレーンの枠から外れてしまっています。
＜修正前＞

＜修正後＞
Lane and Bands の機能により修正を行った画像です。
レーン幅を少し広げて、位置を微調整しました。

83

3. バンドの検出
Bands タブの設定を用いて、イメージ上のバンドを検出します。
参考：Total Lane Protein によるノーマライズを行う場合には、Normalization Channel で指定したイ
メージについてレーン検出まで実施し、バンド検出までは実施しないのをお勧めします。結果の一覧である Analysis Table 上で、目的とするチャンネル以外のバンドのデータが多数表示されるようになってしまい、データの閲覧が煩雑になります。
Normalization Lane として Housekeeping protein bands を指定する場合には、そのチャンネ
ルで検出されているバンドが 1 本だけである必要があります。Housekeeping protein 以外のバンドが検出されていた場合には、Delete Bands を選択した状態で不要なバンドをクリックして、検出対象から除外してください。最終的に、各レーンで一つのバンドだけが検出された状態とします。

4. バックグラウンドレベルの確認
各レーンの Volume データはバックグラウンドを差し引いた値として算出されています。各レーンで適用されたバックグラウンドレベルは、Lane Profile から確認することができます。バックグ
ラウンドレベルの認識が、Normalization Channel の全てのレーンで一定であることを確認してください。必要に応じて、Background Subtraction の Disk Size を調整し、一定なバックグラウン
ドレベルとなるようにしてください。この操作は、より正確な Normalization Factor（補正係数）を求めるのに重要です。一般に Stain-Free ゲル等の総タンパク質検出によるノーマライズを行う
場合は、Disk Size を 70mm に設定するのが適切です。

5. 不適切なデータの除外
次のようなレーンがあれば、解析の対象から除外します。
• 空のレーン
Normalization Channel では、分子量スタンダードではない左端のレーンが Normalization
Factor（補正係数）を算出するため基準のレーン（Normalization Lane）となります。もしここに空のレーンなど無効なデータがある場合には、そのレーンを削除するか、別のレーンをNormalization Lane に指定するようにしてください。

84• 飽和したピクセルを含むレーン
イメージの中に、シグナルの飽和したピクセル（赤色でハイライトされた部分）がないか確認してください。このようなシグナルは定量的に検出できていないので、Volume データのノーマライズの対象から除外してください。
• 不均一な転写
イメージの中に、不均一に転写されたエリアがないか確認してください。バンドがまだらになった
り、にじんだりしている部分がある場合には、Volume データのノーマライズの対象から除外してください。

6. Analysis Table でデータの確認
Normalization Lane で指定されたレーンに基づいて算出された Normalization Factor（補正係数）を使って、全てのチャンネルの全てのレーンの Volume データの補正が行われます。
Normalization Factor はバックグラウンド補正されたシグナル（Total lane protein の場合はレーン全体、Housekeeping protein bands の場合は指定されたバンド）に基づいて算出されます。
ツールバーの Analysis Table をクリックすると、データの一覧となる Analysis Table を閲覧できます。Lane and Band Table タブをクリックすると、次のようなデータが表示されます。
• Volume ： 指定エリア内の全てのシグナル強度の合計値＝積分値• Adj. Volume ： バックグラウンドを差し引いた積分値• Norm. Factor ： Normalization 用の補正係数• Norm. Volume ： Norm. Factor で補正した Adj. Volume（積分値）
Lane Statistics タブから、レーン間の補正に関係する値を確認することができます。
• Adj. Total Band Vol. ： レーンごとのバックグラウンドを差し引いた検出バンドの合計値• Adj. Total Lane Vol. ： レーンごとのバックグラウンドを差し引いた全てのシグナル積分値• Norm. Factor. ： バンドの強度を補正するためのレーンごとの補正係数（Normalization Lane の Adj. Total Lane Vol. に対する各レーンの比）85シングルチャンネルイメージへのチャンネルの追加
Volume データのノーマライズは、マルチチャンネルイメージでのみ実施できます。シングルチャ
ンネルイメージの場合は、あらかじめ File > Create Multichannel Image によりマルチチャンネ
ルイメージを作成する必要がありますが、Normalization の設定画面からチャンネルを追加することもできます。
マルチチャンネルイメージを作成するためのイメージは、縦横の寸法比率が同一の画像のみです。異なる撮影装置で取得したイメージや、Crop により編集した画像は縦横の寸法比率が異なることがあります。Image Lab ソフトウェアは縦横の寸法比率を確認し、異なる場合には合成するための対象となるファイルリストに表示されません。

チャンネル追加の手順
1. 補正したいイメージを開いた状態で、Analysis Tool Box の Lane and Bands をクリック
2. Lanes タブの Normalization Channel から Add channel をクリック
Add Normalization Channel ダイアログボックスが開き、他に開いているイメージの中で縦横の寸法比率が一致しているものがあれば、左側の Compatible Open Images のリストに表示されます。
Add channel をクリックしたときにアクティブ表示していたイメージが、Add Normalization
Channel ダイアログボックスの右下に表示されます。
3. Compatible Open Images のリストから、右側の Normalization Data へファイルをドラッグ
ボックスの下部の Browse をクリックしてファイルをリストに追加することもできますが、縦横の寸法比率が異なるファイルはリストに表示されません。
右下に合成したイメージが表示されます。
4. OK をクリック
Auto-Analysis ダイアログボックスが開きます。
5. バンド検出のための Sensitivity レベルを選択し OK
２つのイメージが合成されたマルチチャンネルイメージが表示されます。必要に応じてレーンの修正を行います。

86

(3) Molecular Weight (MW) Analysis Tools ：分子量解析ツール
この Molecular Weight Analysis Tools により、既知のスタンダードを元に検量線を作成し、未知サンプルの分子量（核酸の場合は塩基対）を算出することができます。
参考：
Molecular Weight Analysis Tools を使用する前に、あらかじめレーンとバンドの検出を行っておく必要があります。
この機能により Analysis Table の Lane and Band タブから、検出したバンドの分子量情報を表示することができます。

ゲルイメージ上に、バンドの分子量を表示するように設定することもできます。この場合は、Display Gel Options から、Band Attributes のドロップダウンリストから Mol. Wt. を選択してください。Display Gel Options の詳細は、34 ページをご参照ください。

分子量スタンダード :Molecular Weight Standard
未知サンプルの分子量を決定するために用いるスタンダードを、選択／変更することができます。
Standards ウィンドウの中にある Change ボタンをクリックすると、Manage Standards ダイアログ（下図右）が開きます。

このウィンドウで別のスタンダードを選択したり、他社のスタンダードを追加したりすることができます。
スタンダードの種類を核酸用などに変更したい場合は、リストの下にある Show のドロップダウン
からカテゴリー（All Standards / Protein / DNA） を変更します。次の手順で新規にスタンダードを登録する事ができますが、設定済みスタンダードをコピーして編集する手順については、サンプルの分子量解析の設定方法（26 ページ）をご参照ください。

87

新たにスタンダードの情報を追加(1) Mol. Wt. Standard の横にある Change をクリックすると Manage Standards ダイアログボッ
クスが開きます。これにより、リストにないスタンダードを追加したり、分子量を編集したりすることができます。
(2) New をクリックします。
Edit Standard ダイアログボックスが開きます。

(3) 使用したスタンダードの名前を Name に入力します。
(4) Type のドロップダウンリストから、Protein Standard または Nucleic Acid Standard を選択します。
(5) Units のドロップダウンリストから、スタンダードの単位（kDa, pI, bp, kb, Mb）を選択します。
(6) Add をクリックします。
Edit ダイアログボックスが開きます。

(7) スタンダードの値（分子量等）を入力し、OK をクリックします Description は任意です。
参考： 少なくとも 2 点以上を入力する必要があります。
(8) 値の入力が終了したら、OK をクリックします。

88

スタンダードレーン ：Standard Lanes
未知サンプルの分子量を計算するために、どのレーンにスタンダードを泳動したかを指定します。
スタンダードのレーンには、イメージの各レーン下にあるチェックボックスにチェックを入れて指定します。また、Standard Lanes の入力欄にレーン番号または First、Last という単語を入力することでも指定することができます。例えば、18-ウェルゲルを使用していて、1、10、18 レーンにスタンダードを流した場合、First, 10, Last （1,10,18 も可）と入力します。
レポート画面ではスタンダードレーンはレーンの下に「Std」というラベルが表示されます。
Display Gel Options で Lane Label を表示すると画面上でより識別しやすくなります。

回帰法 ：Regression Methods
未知のバンドの分子量/塩基対を算出するために、回帰法を指定します。ソフトウェアは標準曲線を算出するためにスタンダードバンドの Rf (Relative Front)値および分子量値を用います。次に、標準曲線を用いて、未知のバンドの値を算出します。標準曲線の形状は選択した回帰法に基づいています。次の 4 つの回帰法のいずれかを選択します。
回帰法
Linear (semi-log)
Point-to-Point (semi-log)
Logistic
Cubic Spline

スタンダードバンドの必要最小数2255

未知バンドの分子量は、Analysis Table の Mol.Wt. / Base Pair のカラムに表示されます。もし、スタンダードのバンドの数が必要最小数に満たなかった場合には、未知バンドの分子量は計算されません。
各回帰法が標準曲線ウィンドウのデータにどれほど適合するか、グラフで確認することができます。
詳細は、第 4 章 の「スタンダードカーブ（59 ページ）」をご参照ください。
Linear (semi-log)法では R2 値をみることで標準曲線の適合性を判断することができます。R2 値が1.0 に近ければ近いほど、データは標準曲線に適合します。

スタンダードカーブの表示
1. ツールバーの Standard Curve をクリックします。
2. Standard Curve ダイアログボックスで、Mol.Weight Standard Curve タブをクリックします。
回帰法の計算に関する情報は、付録 A 回帰法の計算（120 ページ～）をご参照ください。

89

分子量計算を行ったデータ例◼

シングルチャンネルイメージにおける分子量計算
以下の図の例では、3 つの分子量スタンダード（レーン 1, 16, 17）が設定されています。各レーンの下にあるチェックボックスで、スタンダードに指定したレーンの下にはチェックが入っています。全体のレーンフレームの左右には、分子量スタンダードの各バンドのサイズが表示されています。ゲル全体を赤いラインが横切っており、未知サンプルの分子量計算に用いられるスタ
ンダードの位置を示しています。これにより、未知サンプルのバンドとスタンダードのバンドとの相対的な位置関係が分かります。
Image Info の Notes タブで指定したサンプル名（カスタムラベル）がレーン番号の上に表示されています。カスタムラベルの詳細については、41 ページをご参照ください。

Analysis Table の Lane and Bands Table タブで、検出したバンドの分子量情報を確認できます。スタンダードレーンの分子量情報は太字で表示されており、その他のレーンでは算出された分子量情報が表示されています。

90◼

マルチチャンネルイメージにおける分子量計算

マルチチャンネルイメージにおける分子量計算では、チャンネル間でのリンクの有無に応じて作業手順が異なります。「リンク付きマルチチャンネルイメージ」では、あるチャンネルで設定した分子量の設定は全てのチャンネルでも適用されます。「リンク無しマルチチャンネルイメージ」では、分子量を設定したチャンネルでのみ個別に適用されます。
リンク付きマルチチャンネルイメージの場合リンク付きマルチチャンネルイメージの場合、あるチャンネルで分子量スタンダードを設定すると、全てのチャンネルで同じレーンが分子量スタンダードとして設定されます。スタンダードのバンドの情報はすべてのチャンネルに同期して用いられ、未知サンプルのバンドの分子量計算も全てのチャンネルで行われます。分子量スタンダードとしての設定を解除すると、全てのチャンネルでも設定が解除されます。
次の画像の例では、リンク付きマルチチャンネルイメージにおいて、レーン１を分子量スタンダードとして設定した様子を示しています。すべてのチャンネルで同期してレーン１がスタンダードとして設定され、分子量スタンダードの位置を示す赤色のラインが全てのチャンネルで表示されます。未知サンプルで検出された全てのバンドの分子量が計算され、Analysis Table 上でチャンネルごとに確認することができます。

リンク無しマルチチャンネルイメージの場合リンク無しマルチチャンネルイメージの場合、各チャンネルがシングルチャンネルイメージであるような挙動をします。つまり、あるチャンネルで分子量スタンダードを設定すると、そのチャンネルでのみ分子量スタンダードの位置を示す赤色のラインが表示され、Analysis Table で分子量を確認することができますが、他のチャンネルには適用されません。

91

(4) Quantity Tools ：濃度定量ツール
Quantity Tools にある相対定量機能、または絶対定量機能を用いて、未知試験サンプル中のバンドを定量することができます。
Quantity Tools のウィンドウの上部にあるタブをクリックしてツールを開きます。
相対定量 ：Relative Quantity タブ
特定の１バンドをリファレンスとして指定し、そのバンドと未知試験サンプルの相対量を比較することができます。最初に Quantity Tools から Relative タブを選択します。

相対定量を行うために、まず Select ボタンをクリックします。次にレファレンスとして使用したいバ
ンドをクリックします。選択されたバンドに小さい「R」が表示されます（下図赤色の丸の中）。
複数のバンドをレファレンスとして選択したり、レーンごとにレファレンスを設定したりすることはできません。
相対定量の結果は、上部メニューAnalysis Table から Lane and Band タブを選択すると Rel.
Quant.の欄に表示されます。

相対量は未知試験サンプルのバンドボリュームをリファレンスバンドボリュームで割った比です。
リファレンスバンド以外の他のバンドは、全てのリファレンスバンドとの相対的な数値を表示しています。1.00 を越える値は、バンドがリファレンスバンドよりも強いことを示しています。1.00 以下の値はリファレンスよりも薄いバンドであることを示しています。

92

絶対定量 ：Absolute Quantity タブ
既知量のスタンダードバンドから検量線を作成し、未知サンプルのバン
ドを絶対定量することができます。バンドの絶対量を求める場合は、まず Quantity Tools から Absolute タブを選択します。

1. Select ボタンをクリックします。
2. 少なくとも 2 つの既知スタンダードバンドを選択し、濃度を入力します。濃度の値が Standard bands 表の中に表示されます。イメージ上の選択されたバンドに小さい「A」が表示されます。
スタンダードバンドの数が多いほど、その値の範囲は広くなり、未知のバンドの絶対量の算出がより正確になります。
3. 選択したスタンダードは削除可能です。Standard Bands ウィンド
ウ上にエントリーされているリストから削除したいバンドをクリック
し、次に下の Delete ボタンをクリックします。
4. 必要であれば Units ドロップダウンメニューにリストとして示された選択肢から測定単位を選択します。
5. ドロップダウンメニューにリストとして示された 3 つの中から回帰法を選択します。次のガイドラインに留意して選択肢を選びます。
• Linear （線形）最もよく一致する直線的な一次方程式を求めます。一般的によく用いられる方法です。
• Point-to-Point
この方法は現れた曲線の形にかかわらず、各データポイントを結び曲線を作成します。
• Cubic spline
この方法は各データポイントを接続する円滑な曲線を作成します。最小自乗多項式フィットの本法を用いるには少なくとも 4 つのポイントが必要です。

回帰法

スタンダードバンドの最小数

Force Through Origin
選択時の最小バンド数

2
2
5

1
1
4

Linear （線形）Point-to-Point
Cubic spline

参考：Force Through Origin のチェックボックスを選択すると、曲線フィットに関係なく常にゼロ
点（0.0）を通過するグラフを作成します。

93

6.

上部ツールバー中の Standard Curve ボタン上をクリックし、画面下にある Abs.
Quantity Standard Curve タブを選択すると検量線が表示されます。全てのスタンダ
ードは緑色の三角形で表され、未知試験バンドの値は赤色の三角形で表されます。

参考 ：
検量線上の任意の点をクリックすると、その位置における濃度と強度が表示されます。

7.

絶対定量の結果は、上部メニューAnalysis Table から Lane and Band タブを選択す
ると Abs. Quant.の欄に表示されます。
Analysis Table の詳細は、Lane and Bands Table（49 ページ）をご参照ください。

注意 ：マルチチャンネルイメージでは、Quantity Tools による相対定量（Relative Quantity）、絶対定量（Absolute Quantity）の解析を行うことはできません。

94

(5) Annotation Tools ：テキスト注釈ツール
Annotation Tools を使用すると、興味のある部分に注目するために結果にテキストと矢印を用いて注釈をつけることができます。

注釈の追加 ：Add Annotations◼

Text
興味のある情報に注目するために、ゲルイメージにテキストの注釈を追加することができます。最初に Text ボタンをクリックし、次に強調したい領域の上をクリックします。点線の境界線がついた
テキストボックスが現れます。テキストボックスにコメントをキーボードから入力します。位置を変更するにはそのボックスをクリック／ドラッグします。
テキストを編集中に改行したい場合は、Shift-Enter を押します。
Multichannel Image では注釈は入力した画像にのみ反映されます。注釈は他の画像へコピー可能です。

◼

Arrow
矢印を追加するには、最初に Arrow ボタン上をクリックします。矢
印を開始させたい領域をクリックし、次に矢印ポイントをドラッグして、強調したい位置まで広げます。
矢印を移動する時には、矢印をクリックしドラッグします。
矢印の方向を変更するには、矢印をクリックし、両端に現れた四角形の点線ボックスをドラッグして、矢印の長さまたは方向を調整します。

オブジェクトの再配置 ：Alignment

これらのアイコンによって、追加した複数のオブジェクトを整列させることができます。このコマンドを使用するには、あらかじめ下記の方法で複数オブジェクトの選択しておく必要があります。
複数オブジェクトの選択
Ctrl キー（Mac の場合は Command キー）を押したまま、複数のオブジェクト上でクリックするか、
対象オブジェクトを全て含むように選択ボックスをドラッグすることによって、いくつかのオブジェ
クトを同時に選択することができます。
オブジェクトのコピー
イメージ内またはイメージ間で注釈をコピーすることができます。最初に、コピーしたい注釈を選択します。次に Ctrl キーとキーボードの「c」を押すと注釈がコピーされ、Ctrl キーと「v」を押すとペーストされます。

95

テキストのプロパティ ：Text Properties
注釈のサイズおよびフォントを変更することができます。
◼

フォントの変更 ：Font
変更したいテキストボックス上をクリックします。次にプルダウン（画面左の Annotation Tool中）の Font メニュー上をクリックしてシステムにインストールされている全てのフォントを表示します。テキスト注釈のスタイルを変更するために、フォント名の上をクリックします。

◼

文字サイズの変更 ：Size
サイズを変更したいテキストボックス上をクリックします。プルダウンメニューでフォントサイズをセットすることができます。またテキストフィールドに 6～72 ポイントのサイズを入力してセットすることもできます。

複数の項目を同時に変更するためには、Ctrl キーを押したままにし、マウスで各オブジェクトを左クリックして同時選択してから変更します。

配色 ：Color
テキストや矢印の色を変更して、見やすくすることができます。また注釈の背景（デフォルトでは透明）に色を加えて強調することもできます。
複数オブジェクトの色を同時に変更するためには、Ctrl キーを押したままマウスで各オブジェクトを
左クリックし、複数オブジェクトを選択します。
◼

文字色の変更 ：Foreground
テキスト注釈または矢印上をクリックします。これにより文字色（Foreground）フィールドが有効になり、プルダウンメニューから望む色を選択することができます。

◼

文字背景の変更 ：Background
テキスト注釈または矢印上をクリックします。これにより文字背景（Background）フィールドが有効になりプルダウンメニューから異なる背景色を選択することができます。

回転 ：Rotate
Rotate ボタンをクリックして、テキスト注釈を 90°左右に回転することができます。

96

(6) Volume Tools ：ボリューム（定量）ツール
この Volume Tools は、サンプルイメージ上の定量を手動で行うためのツールです。例えばウェス
タンブロッティングのように特定のバンドのみが定量対象となる場合、ドットブロットのように Lane
and Bands ツールで指定できない場合などで、有用な定量方法です。
バンド、スポット、アレイ、その他のイメージデータのシグナル強度を定量化するために、Volume Tools を用いることができます。
１．エリアの指定
最初に輪郭を囲むことによって関心領域を定義します。Volumes
フィールド下のボタンをクリックすることによって囲い方を長方形（Rectangle）、円（Round）、フリーハンド（Freehand）、またはレーン（Lane）から選択することができます。

２．ボリュームタイプの指定
囲んだ領域の名称は描いた領域の内側に表示されます。
ボリューム値のラベルには、次の 3 つの種類があります。
⚫
⚫
⚫

U － Unknown （未知サンプルバンド）
Std － Standard （スタンダード）
B － Background （バックグラウンド）

デフォルトでは、これらの接頭文字から始まり、連続的に割当てられる数字からなるラベルが、イメージ上に表示されます。
ボリューム領域の種類を変更するには積分領域上をダブルクリックします。Volume type（Unknown、Standard、Background）
を選択し、Standard の場合はさらに量を定義します。また任意の名称を入力することもできます。

３．バックグラウンドの補正方法の指定
バンドの積分値（Volume）からバックグラウンド補正をした積分
値の Adj. Volume を計算します。その際のバックグラウンドを
次の 2 つのどちらかから指定します。
⚫
⚫

Local － Unknown で指定したエリアの 1 ピクセル外側
Global － ボリュームタイプを Background としたエリア

４．相対定量または絶対定量の指定
５．Volume データの確認
Analysis Table をクリックし、Volume タブを選択します。
Volume または Adj.Volume の値を確認します。

97

１．エリアの指定
ボリューム解析を行う対象となるエリアを指定します。
次のいずれかのツールを選択し、マウスでドラッグすることによって、エリアの指定を行います。
••••

Rectangle － 四角い形に囲います。
Round － 丸い形に囲います。
Freehand － マウス操作の軌跡に沿って囲います。十分にズームしてご使用ください。
Lane － レーン全体を囲うのに用います。
アンカー付なので泳動の歪みにあわせて変形させることもできます。

ボリューム領域の境界線には赤色の境界と青色の境界線があります。赤色の境界線は、そのボリューム領域が選択されたアクティブな状態にあることを示しています。イメージ上の別のところをクリックすると、境界は青色に変わりますが、それはボリューム領域が選択されていないことを示しています。
Multichannel Image ではボリューム領域は、設定したチャンネルでのみ反映されます。なおボ
リューム領域は合成イメージ（Multichannel）には作成できません。

２．ボリュームタイプの指定指定したエリアのボリュームタイプ（Unknown、Standard、Backgroaund）を指定します。ボリューム領域の種類を変更するにはエリア上でマウスをダブルクリックします。ボリュームタイプには、次の 3 つの種類があります。
•••

U （Unknown）： 定量の対象となる未知バンド
Std （Standard） ： 絶対定量を行う場合のスタンダード
Quantity フィールドにスタンダードの値を入力します。詳細は、後述の「ボリューム解析による絶対的定量」をご参照ください。
B （Background） ： ボリュームのバックグラウンド補正を行う際のバックグラウンド領域
バックグラウンドの補正方法として、Global を指定した場合に必要な設定となります。バックグラウンド補正後のボリューム値が、Analysis Table 上の Adj. Volume となります。

デフォルトでは、これらの接頭文字から始まり、連続的に割当てられる数字からなるラベルが、イメージ上に表示されます。Custom Label フィールドに文字列を入力すると、エリアのラベルを編集することもできます。

98

３．バックグラウンドの補正方法の指定
ボリューム領域を描くとき、領域の内部にシグナルではないバックグラウンドを、かなりの強度で含む場合があります。これらのバックグラウンドは、通常は定量に含めないほうが良いと考えられます。Image Lab ではバックグランドの補正を以下の 2 つの方法で行うことができます。
• Local
作成した未知／スタンダードの領域について、領域個別でのバックグラウンド補正を行います。
各領域に対して、領域の 1 ピクセル外側部分を境界ピクセルとし、これらピクセルの強度を加算
し、境界ピクセルの総数で割り算します。
これにより、それぞれの領域の境界ピクセルの平均強度が得られます。次にそれをボリューム
領域内部のピクセルの強度から引き算します。
バックグラウンド（＝境界ピクセル平均値）がボリューム領域内部の各ピクセル値よりも大きい
場合には、ボリューム領域の補正後のボリューム値は 0 未満になると考えられます。この場合はこの領域の境界線を再設定することを推奨します。
• Global
全てのボリューム領域に対して単一のバックグランド補正値を算出します。次にこの補正値をゲル中の全てのボリューム領域から引き算します。
Global background は以下の方法で算出します。
1. イメージの代表的なバックグラウンド領域（すなわち、周辺のシグナルのない領域）において、VolumeTools の一つを用いてボリューム領域を指定します。
2. そのボリューム領域上をダブルクリックしボリューム領域のプロパティを開きます。
3. ここで領域の種類（Volume Type）を Background に切り替えます。すると、そのボリューム
領域中のピクセルの平均強度が算出されます。この平均強度が他のボリューム領域の各ピクセルから引き算されます。平均値が使用されるためバックグラウンドの領域がその他の領域と同じサイズである必要はありません。
注意 ：Volume Tools で Background Type に Global を選択しても、上記のように領域の種類をBackground として定義しない場合、補正は行われません。
2 つ以上のバックグラウンド領域を作った場合、複数の領域の全てのピクセルをもとに平均値が算出されます。バックグラウンド領域は作成された順序に B1、B2 などのデフォルト名がつけられます。
バックグラウンドとして定義した領域がデータ領域よりも高い平均強度値を有する場合、補正後のボリューム値は解析表で負の値を表示します。このようなことが起こる場合、対象よりも強度の低い別の領域をバックグランドとして再設定する必要があります。

99

４．相対的定量または絶対的定量の指定◼

ボリューム解析による相対的定量（Relative Quantity）
ボリューム領域のプロパティ内（領域をダブルクリックで表示）の Reference Volume オプションにチェックを入れること
により、そのボリューム領域をリファレンスに指定することができます。リファレンス領域には U1*のように領域名称の右上に星印が表示されます。
相対量は上部メニューAnalysis Table 内の Volume Table タブ、Rel. Quant. の欄に表示されます。バックグラウンドを設定していれば、ここに補正後の値が表示されます。
レファレンス以外のボリューム領域はすべてリファレンスと比較した相対値を表示しています。1.00 を越える値はボリューム値がリファレンスよりも大きいことを示しており、1.00未満の値はボリューム値が小さいことを示しています。

◼

ボリューム解析による絶対的定量 （Absolute Quantity）

既知濃度のバンドを含むエリアを Standard として定義して検量線を作成し、未知サンプルのバン
ドの Volume 値に基づいて、絶対量を算出することができます。
1. ボリュームタイプを Standard として定義するために、その領域上をダブルクリックします。
2. 領域の種類（Volume Type）を Standard に変更し、次に Quantity フィールドに濃度を入力します。OK をクリックしてダイアログを閉じます。スタンダード領域は作成された順に S1,S2 などのデフォルト名が付けられます。未知試験サンプルの濃度はスタンダード領域および選択した回帰法に基づいて算出されます。
回帰曲線を検討するために、Standard Curve ウィンドウを開いて Volume Standard Curve タ
ブを選択します。スタンダードは緑色、未知試験サンプルは赤色でラベルされます。
Force through origin にチェックを入れると、検量線は常に原点（0, 0）を通過します。

注意 ：マルチチャンネルイメージでは絶対定量（Absolute Quantity）の解析を行うことはできません。

100

◼

回帰法（Regression Methods）
検量線を作成するために次の 3 つの回帰法が選択可能です。
それぞれの方法がどのように算出されるかは「付録 A 回帰式の計算（120 ページ）」をご参照ください。
• Linear （線形）最もよく一致する直線的な一次方程式を求めます。
• Point-to-Point
この方法は現れた曲線の形にかかわらず、各データポイントを結び曲線を作成します。
• Cubic spline
この方法は各データポイントを接続する円滑な曲線を作成します。
最小自乗多項式フィットの本法を用いるには少なくとも 4 つのポイントが必要です。
参考：
Force Through Origin のチェックボックスを選択すると、曲線フィットに関係なく常にゼロ点（0.0）を通過するグラフを作成します。
Units のプルダウンリストから、絶対定量によって算出された値の単位（nanogram、picogram など）を指定できます。

スタンダードカーブの表示
上部ツールバー中の Standard Curve ボタンをクリックし、画面下にある Abs. Quantity Standard
Curve タブを選択すると検量線が表示されます。

◼

オブジェクトの整列 （Alignment）
適切なアラインメントアイコンを用いてボリューム領域（オブジェクト）を整列させることができます。Ctrl キーを押したまま、複数のオブジェクト上でクリックするか、対象オブジェクトクトを全て含むように選択ボックスをドラッグすることによって、いくつかのオブジェクトを同時に選択することができます。
複数のオブジェクトを選択した後に、アラインメントボタンをクリックすると、ボタンで指定した方向にオブジェクトが整列します。
イメージ内またはイメージ間でオブジェクトをコピーすることができます。最初に、コピーしたい
注釈を選択します。次に Ctrl キーとキーボードの「c」を押すとオブジェクトがコピーされ、Ctrl キーと「v」を押すとペーストされます。

101

５．Volume データの確認
ボリューム解析を行った場合、Analysis Table 機能にある Volume タブから結果を一覧表示す
ることができます。Analysis Table の詳細は、Volume Table（50 ページ）をご参照ください。
• Volume ： 指定エリア内の全てのシグナル強度の合計値＝積分値• Adj. Volume ： バックグラウンドを差し引いた積分値• Abs. Quant. ： 絶対的な定量解析を行った値• Rel. Quant. ： 相対的な定量解析を行った値（Reference Volume で指定したバンドを 1 とした相対値）

102

第 6 章 レポートの作成
データ解析の後に、ゲルイメージ、プロトコルに用いた全ての設定、表示したいデータなどを含むレポートを作成することができます。
レポートの表示項目設定は上部 Edit メニューの Report Settings ウィンドウから、レポートの作成はメイ
ンツールバーの Report ボタンから行うことができます。

レポートの作成
ツールバーの Report アイコンをクリックし、レポートのプレビューを作成します。

Print アイコンをクリックするとプレビューに含まれる全ての情報を印刷します。

レポートから不必要な情報を削除するには以下に説明するオプション画面を用いて設定を行います。この設定はデータそのものを削除するのではなく、レポートの表示のみを変更します。

103レポート表示項目の設定
表示項目を変更するためには、レポート画面の左上にある Display Report Optionsをク
リックします。もしくは上部メニュー Edit > Report Settings を選択します。画面上部に３つのタブがあり、目的に応じてタブを切り替えます。
表示項目選択 ：General タブ
レポートのデフォルト設定では全ての情報が表示されます。表示項目の選択は別のコマンドでも行うことができますが、ここでは作成されたレポート情報に基づいて項目をカスタマイズします。

◼

Custom Report Title
レポートに任意のタイトルを付けることができます。

◼

Include Gel Image
以下のオプションはゲルイメージに解析結果を表示するか否かを設定します。チェックボックスのチェックを外すと項目がレポートから削除されます。
•
•
•
•

◼

Show Lanes and Bands： Lane and Bands 解析の結果
Show Volumes： Volume 定量解析の結果
Show Annotations： 注釈
Include Unannotated Image ： 解析結果なしの画像の表示 （結果ありと並列表示）
Image Info

以下のオプションはゲルイメージに関する情報を表示するか否かを設定します。チェックボック
スのチェックを外すと項目がレポートから削除されます。
•
•
•
•
◼

Acquisition Information
Analysis Settings
Image Information
Notes：イメージ撮影情報＝光源、露光時間など：解析設定：イメージ情報＝大きさ、解像度など：特記事項

Signature History （セキュリティエディション限定機能）
セキュリティエディションにおいて署名の履歴を表示します。

104レーンおよびバンドの解析表の設定 ：Lane and Band Table タブ
Lane and Bands 解析に関する結果のレポート表示項目を設定します。
レポートに表示したい内容にチェックを入れます。

◼

Include Lanes and Band Table ：レーンおよびバンドの解析数値の表示
Analysis Table の Lane and Bands 解析結果を、レポートに表示する場合にはチェックを入れます。

◼

Lanes to show ：データを表示するレーンの選択
解析結果を表示するレーンを選択します。
• All lanes ：全てのレーンのデータを表示• Lanes ：ユーザーがここで指定したレーンのみ表示◼

Show Lane Profile ：各レーンのレーンプロファイル（デンシトグラム）の有無
レポートにレーンプロファイルを表示する場合はチェックを入れます。

◼

Print one lane per page ：改ページの設定
1 レーン１ページ（各レーンで改ページ）で印刷する場合はチェックを入れます。できるだけ詰めて印刷する場合はチェックを外します。

◼

Not Display / Displayed ：表示項目の選択
レポートに表示したい項目は右側に、表示したくない項目は左側にリストを移動します。

105

ボリューム定量解析表の設定 ：Volume Table タブ
ボリューム定量の解析結果のレポート表示項目を設定します。
レポートに表示したい内容にチェックを入れます。

◼

Include Volume Table ：ボリューム定量の解析数値の表示
ボリューム定量解析の結果を表示しない場合は該当するチェックを外します。

◼

Not Display / Displayed ：表示項目の選択
レポートに表示したい項目は右側に、表示したくない項目は左側にリストを移動します。

ノーマライズに関係するレーン解析表の設定 ：Lane Statistics タブ
ノーマライズ係数（Norm. Factor）などのノーマライズに関係するレーン解析結果のレポート表示
項目を設定します。レポートに表示したい内容にチェックを入れます。

106

◼

Include Lane Statistics ：ノーマライズに関係するレーン解析結果の表示
ノーマライズに関係するレーン解析の結果を表示しない場合は該当するチェックを外します。

◼

Not Display / Displayed ：表示項目の選択
レポートに表示したい項目は右側に、表示したくない項目は左側にリストを移動します。

レポートの出力レポートの印刷 ：Print Report
レポートを印刷するには Print Report

アイコンをクリックします。

レポートを pdf ファイルに出力 ：Print Report to .pdf
レポートを PDF ファイルに出力するためには Print Report to .pdf
保存先を指定します。

アイコンをクリックし、

プリンタ設定 ：Adjust the Printer Settings
Printer Settings
す。

アイコンをクリックし用紙サイズ、縦横の向き、ページの余白を設定しま

107

108

第 7 章 結果の出力
解析結果を一般的な形式で保存する最も便利な方法は、レポートを作成することです。
ゲルイメージだけ、Analysis Table の数値データ一覧だけを別なソフトウェア（Quantity One や Excelなど）で解析するために出力することもできます。
また、プレゼンテーションまたは論文用に、ゲルやメンブレンのイメージを出力することも可能です。

イメージデータの出力
目的に応じて、ゲルイメージを出力する形式が決まります。
画面に表示された画像の出力
プレゼンテーション、および論文提出などの目的で、画面に表示されているままの画像を出力した
い場合は Export for Publication のモードで出力することをお勧めします。
このモードはファイルを.tif, .png, .bmp, または .jpg ファイルとして保存することができます。
画像の生データの出力
別の解析プログラムで使用するため Raw Data ファイルとして出力したい場合は 16-bit の TIFF ファイルとして出力する、Export for Analysis モードで出力することをお勧めします。
Pulse Net 用データの出力
画像を PulseNet へ投稿する場合は、解像度を限定し、ファイルサイズも 300 Kb に制限した 8-bitの TIFF ファイルとして出力する、Export for PulseNet モードで出力することをお勧めします。
スプレッドシートの出力
Lane and Bands Table や Volume Table の情報を CSV 形式などに出力することもできます 。

出力コマンド ：Export
上部メニューFile > Export により、画像と解析データを出力することができます。
ファイルメニューからの出力は以下の方法で行います。
1. File > Export を選択し、下に表示された選択肢の 1 つを選択します。

2. ファイルの書式、新しいファイル名（必要な場合）、およびファイルを保存する場所を選択します。
3. Save ボタンをクリックしデータを出力します。
出力可能なファイル形式の特徴は、次のとおりです。

109

出力形式の種類◼

Export for Publication
表示された画像の視覚情報のみ目的として出力するときには、このモードで出力します。
ゲルはレーン、バンド、および注釈をつけて表示されます。
.tif, .bmp, .png または .jpg から保存形式を選択することができます。
このフォーマットは PowerPoint または Word などのプレゼンテーションソフトウェアまたはワー
プロソフトウェアに画像情報を出力するためにのみ用いることをお勧めします。

Publishing Source より出力時の画像の大きさを選択します。
• Entire Image ＝ゲル全体を出力する• Current View ＝画面のまま（拡大表示したまま）出力する
Publishing Resolution より出力時の解像度 300dpi、600dpi、Specify （72-1200）を選択します。解像度が高いほど、ファイル容量が大きくなります。
このモードは画面に解析結果やテキスト情報が表示されていると、その情報ごとファイルに出力されます。テキスト情報が不要な場合は、画像上部の Display Gel Optionsのコマンドから画面表示項目を設定します。
◼

Export for Analysis
全てのデータを保持したいときは 16bit の TIFF フォーマットで出力します。この形式は加工していない画像ファイルのみが出力されます。Transform による調整も反映されません。
この形式で出力するとファイル容量が大きくなりますが、Quantity One などの他のソフトウェア
で画像を解析することができます。
なお、16bit の TIFF ファイルは扱うことのできるアプリケーションプログラムが限られます。適切なプログラムがインストールされていない場合は、閲覧できないことがあります。
Multichannel Image をこのモードで出力すると、各チャンネルをそれぞれ別の TIFF ファイルとして出力します。ただしマルチチャンネル画像（合成画像）は出力することができません。

110

◼

Export for Pulse Net
画像を PulseNet (パルスフィールドゲル電気泳動のデータベース)へ投稿するために、8-bit
TIFF, 300Kb に圧縮した形式で出力します。
マルチチャンネルイメージは、この出力コマンドに対応していません。

◼

Lane and Band Table to Excel
Excel（Mac の場合は Numbers）をインストール済みの場合は、File > Export > Lane andBand Table to Excel により、Excel で直接データを開くことができます（Excel が自動起動します）。このコマンドだけではファイルは保存されないため、Excel の Save as を用いてファイルを保存する必要があります。

◼

Lane and Band Table to File
CSV（コンマ区切り）ファイルとしてデータを出力します。ファイルはデータベースアプリケーショ
ンで開くことができます。
参考：
Lane and Bands Table と同様に、Volume Table と Lane Statistics Table も Excel 形式やCSV ファイル形式で出力することができます。

スクリーンショットによる出力 ：Screenshot Export
画面に表示されている画像をそのままファイルにしたい場合は、上部メニューにある Screenshot
Tool を利用します。
次のいずれかのウィンドウを開いた状態で、Screenshotのアイコンをクリックします。
• Current Image View ＝ コントラスト調整をした現在のゲルイメージ• Lane Profile Window ＝ 表示しているレーンの Lane Profile• Standard Curve Window ＝ 表示している検量線
出力したいウィンドウを選択してから、To Clipboard を押してクリップボード（メモリ）にコピーする
か、To File を押して画像ファイル（.tif, .png, .bmp, .jpg ）として保存します。

111

解析結果の出力
解析結果の一覧である Analysis Table データを出力する際には、File メニュー > Export の他にも Analysis Table ウィンドウの左上にある Export ボタンから行うこともできます。

Analysis Table ウィンドウには、異なるフォーマットでデータを出力するためのボタンがあります。
◼

解析表をクリップボードにコピー ：Copy Analysis Table To the Clipboard
Copy Analysis Table To the Clipboard
ボタンをクリックすると、解析結果をクリップボ
ードにコピーします。ワープロソフトやプレゼンテーションアプリケーションにペーストすることが
できます。

◼

解析表をファイルに出力 ：Export Analysis Table To a File
Export Analysis Table To a File
ボタンをクリックすると、CSV（コンマ区切り）ファイルとしてデータを出力します。データファイルはデータベースアプリケーションで開くことができます。

◼

解析表を表計算ソフトに出力 ：Export Analysis Table To a Spreadsheet
Export Analysis Table To a Spreadsheet
ボタンをクリックすると、Excel（Mac では
Numbers）をコンピューターにインストール済みの場合、データを Excel で開きます。このコマンドだけではファイルは保存されないため、Excel の Save as を用いてファイルを保存する必要があります。

112

第 8 章 各種 Log の閲覧
Image Lab ソフトウェアでは、3 種類の操作 Log を確認することができます。
• System log
Image Lab の起動、運用に関する Log です。ログイン情報などを含みます。セキュリティエデ
ィションが使用されていても、いなくても見ることができます。
• Document log （セキュリティエディション限定機能）
セキュリティモード上で、画像やプロトコルの変更履歴を記録した Log です。
セキュリティエディションのみで見ることができます。
• Instrument log
撮影装置に関連する Log です。キャリブレーションの合否などを含みます。この Log ファイルは Image Lab と装置が接続（通信）されている状態でのみ確認することができます。

System log の閲覧
Image Lab の運用に関する履歴が System log で確認できます。例えばログイン情報や、セキュリ
ティモードのアクティベーション履歴などを含みます。
System log は上部メニュー View>

System log から確認することができます。

113

Document log の閲覧 （セキュリティエディション限定機能）
現在開いているドキュメント（画像を含む）に関する履歴が Document log です。プロトコルの作成や編集履歴が含まれます。
参考 ：Document log は Image Lab のセキュリティエディションのみで有効な機能です。またセキュリティ
エディションは Windows 版のみの対応で Mac 版には対応していません。
Document log は以下の機能を使用した履歴を記録します。
• Image Tools• Lane and Bands• MW Analysis Tools• Quantity Tools• Volume Tools
セキュリティエディションでは、ソフトウェア上に開いている全てのファイルの Document log を見ることができます。すでに保存しておいたファイルでも、作った直後で保存されていない画像やプロト
コルファイルでもどちらでも同じです。
Document log のリストは、上部メニュー View をクリックすると、確認することができます。
保存済みのファイルの場合はファイル名で、未保存の場合
は撮影日時が、Document log のリストに表示されます。このとき複数のファイルが開いていた場合は、複数の候補がリストに表示されます。

Document log を見るためには、リストにあるファイル名をクリックします。
以下に一例を示します。

114

Instrument log の閲覧装置を操作した履歴は Instrument log として Image Lab に記録されています。
Instrument log は上部メニュー View> View （装置名前） Log・・・ から確認することができます。このとき、このメニューは接続されている装置がある場合のみ表示されます。

参考 ：Insturment log は装置が接続されて状態でのみ閲覧することができます。
この Insturment log にはデフォルトでは以下の項目が含まれます。
• 作業した日時• その操作を操作したときにログインしていたユーザー名• そのユーザーの権限• ログインしているドメイン• 操作の内容• その操作の結果（キャリブレーション結果を含む）• その操作を必要とした理由（要入力）115

Log Data の表示
System log や Document log を開くと Log の上部にツールバーが表示されます。
このツールを使って、表示内容を変更したり、ファイル出力を行ったりすることができます。

表示項目の変更
表示内容を変更する場合は、Display log viewer optionsのボタンをクリックします。

画面左に非表示項目（Not Displayed）と、右側に表示項目（Displayed）を分類するウィンドウが表示されます。非表示にしたい項目を選択し、左矢印で左側に移動します。
移動が終わったら、OK をクリックしてウィンドウを閉じます。

116

フィルタ機能による Log の抽出
Image Lab 上の Log ファイルはフィルタ機能により、以下の項目の絞込みが可能です。
• Date and Time
• User Full Name
• Type
例えばフィルタ機能により Type（操作内容）＝File に設定すると、Log の Type 属性が File のものだけを表示させることができます。

フィルタの設定方法
Log ファイルを開いた状態で、上述のカラム最上段（ヘッダー）を右クリックすると、右図のようなその項目に入力されている値の一覧が表示されます。
また、上述のカラム最上段（ヘッダー）をクリックして選択するとウィンドウ上部のツールバーのフィルターアイ
コン がアクティブになります。

アクティブになったフィルターアイコンをクリックすると、同様に右図の一覧が表示されます。
抽出したい値を選択して OK をクリックすると表示項目にフィルタがかかります。
ここでは Ctrl キーを押しながら選択することで、複数の値を同時に選択することもできます。

フィルタの解除方法
フィルタのかかった状態の Log ファイルを開くとウィンドウ上部のツールバーのフィルタ解除アイコ
ンがアクティブになります。

フィルタ解除アイコンをクリックすると、フィルタが解除され全項目表示に戻ります。

行の表示形式の変更
Log を表示している行の高さを変更することができます。

ツールバーの青い矢印をクリックすることで、Log を 1 行表示/全内容表示を切り替えることができます。複数行にわたる既述が無い行は、表示に変化はありません。

117

Log の出力
Image Lab は上部のツールバーのアイコンを使用することで画面に表示されている Log を出力することができます。

Copy log entires to the clipboard
このボタンをクリックすると全 Log がクリップボードにコピーされます。任意のプレゼンテーション
ソフトやテキストエディタに Log をペーストすることが可能です。
このコマンドは Log を表示した状態で Ctrl + C を押すことでも実行できます。

Export log entires to File
CSV（コンマ区切り）ファイルとして全 Log を出力します。ファイルはデータベースアプリケーショ
ンで開くことができます。

Export log entires to Excel
Excel をインストール済みの場合は、File > Export > Lane and Band Table to Excel によりExcel で直接データを開くことができます（Excel が自動起動します）。このコマンドだけではファ
イルは保存されないため、Excel の Save as を用いてファイルを保存する必要があります。

Print Log （PDF ファイルの作成を含む）

Log をプリンタに出力します。アイコンをクリックするとプレビュー画面が開きます。プレビュー画
面にあるプリンタのアイコンをクリックすると紙媒体へ出力します。プレビュー画面にある PDFのアイコンをクリックすると Log を PDF ファイルとして保存します。

118

119

付録 A ：回帰法の計算
各回帰法により検量線（標準曲線）を算出します。近似式を提示する回帰法もあります。この場合には、分子量は下記によって算出することができます。
x=関心あるバンドの Rf 値
y=関心あるバンドの分子量
線形 ：Linear (semi-log)
近似式は一次方程式で y=a+bx、 ここで a は切片、b は傾き。
参考 ：一次方程式は分子量値の対数によって算出されます。
R‐平方値（R2）は近似式の適合性を決定するために用いることができます。
0.99 よりも大きい R2 値が得られた場合、線形回帰に非常によくフィットしていると考えられます。
この方法は計算が非常にシンプルなことが利点ですが、データが線形回帰にフィットしない場合には結果が大きくずれるという欠点もあります。

ポイント・ツー・ポイント ：Point-to-Point (semi-log)
ポイント・ツー・ポイント法には利用できる近似式はありません。データポイント間の各セグメントの傾きを独立に算出します。
参考 ：分子量値の対数が曲線の各セグメントに対する傾きを算出するために用いられます。

ロジスティック 4PL ：Logistic（Logistic 4PL）
近似式は

ここで:
x は移動度y は分子量a は無限大における推定分子量b は中点での正接の傾き
c は中点
d は移動ゼロでの推定分子量
Logistic‐4PL 回帰法によって生成された曲線は S 字曲線を示すため、必ずしも全てのケースに適用できるとは限りません。

キュービックスプライン ：Cubic Spline
キュービックスプライン曲線は全てのデータポイントを通る滑らかな曲線です。モデルはデータポイ
ント間の各間隔での立体多角形です。スプライン曲線を外挿の標準曲線として用いることができる
場合もありますが、曲線は全てのポイント対について個別に算出するので、いかなる単一方程式にも対応しません。

120

付録 B ：トラブルシューティング症状
カメラが応答しない、もしく

原因

解決策

カメラの電源が切れているは見つからないとメッセー
ジが出る

カメラの電源が入っているか確認す
る

カメラのケーブル接続が間違っ

すべてのケーブルが正しくつながっているているか確認する

カメラのソフトウェアドライバーがカメラのドライバーが見つからない

ない

場合、ImageLab ソフトウェアの CD
からカメラのドライバーを再インスト
ールする

PC が省電力モードになって、カPC の省電力モードを無効にする

メラのドライバーを妨害している

ケーブルに問題がある

ケーブルを交換するカメラが故障している

カメラを交換する

画像がモニターに表示さモニターの設定が正しくない

PC とモニターの設定を確認する

れない

レンズキャップが付いている

レンズキャップが外れていることを確認する

印刷物がモ ニターのイメ

モニターの設定が間違っているージと異なる

モニターのマニュアルを参照し、適切な設定にするプリンタの設定が間違っている

プリンタのマニュアルを参照し、適切な設定にする

可視トランスイルミネータ

使用する光源によるキャリブレ

Edit > Instrument Setup を選択しーやコンバージョンスクリ

ーションができていないて、フォーカスのキャリブレーションーンを使用した時に、サンを再度行う

プルのフォーカスが合わない121

付録 C ：アクセサリー
カタログ番号

製品説明

プロテインスタンダード
1610363

プレシジョン Plus スタンダード（未着色） 1mL

1610373

プレシジョン Plus ブルースタンダード 500uL

1610374

プレシジョン Plus デュアルスタンダード 500uL

1610377

プレシジョン Plus デュアルエクストラスタンダード

1610375

プレシジョン Plus カレイドスコープスタンダード

1610376

プレシジョン Plus WesternC スタンダード

1610385

プレシジョン Plus WesternC パック （スタンダード+ストレプタクチン HRP）

1610396

プレシジョン Plus スタンダード（未着色） ValuePack （1mL, 5 本入）1610393

プレシジョン Plus ブルースタンダード ValuePack （500uL, 5 本入）1610394

プレシジョン Plus デュアルスタンダード ValuePack （500uL, 5 本入）1610397

プレシジョン Plus デュアルエクストラスタンダード ValuePack （500uL, 5 本入）1610395

プレシジョン Plus カレイドスコープスタンダード ValuePack （500uL, 5 本入）1610399

プレシジョン Plus WesternC スタンダード ValuePack （500uL, 5 本入）DNA スタンダード
1708351

EZ Load Molecular Ruler 20 BP

1708352

EZ Load Molecular Ruler 100 BP

1708353

EZ Load PCR Molecular Ruler 100 BP

1708854

EZ Load Molecular Ruler 500BP

1708355

EZ Load Molecular Ruler 1.0KB

1708205

Molecular Ruler 2.5KB

1708200

AmpliSizeDNA Ruler

パルスフィールド用 DNA スタンダード
1703624

CHEF DNA サイズスタンダード 5kb ラダー

1703707

CHEF DNA サイズスタンダード 8-48kb

1703635

CHEF DNA サイズスタンダード lambda ラダー

1703605

CHEF DNA サイズスタンダード S. cerevisiae

1703667

CHEF DNA サイズスタンダード H. wingei

122

付録 D ：Mitsubishi P95D サーマルプリンター
プリンタの設定コンピューター（Windows10）のUSB2.0ポートにP95D をUSBケーブルで接続します。
USB3.0ポートしかない場合は、USB2.0のUSBハブを使用して接続してください。
付属のCD-ROM から、ドライバーをインストールします。
手順の詳細は、CD-ROM内の Readme フォルダ内の手順を参考にするか、分からない場合は、バイオ・ラッドのテックコールまでお問い合わせください。

次にプリンタの設定を行います。
1. 次の手順で（または検索窓で Device と検索してヒットした項目から選択）、Devices and Printersを開き、Mitsubishi P95D をダブルクリックします。
Windows メニューの歯車(Settings) をクリック → Devices をクリック → Bluetooth & otherdevices をクリック → 右下の Related settings の中にある Devices and printers をクリック

P95D をダブルクリック

123

2. プリンタコントロール画面の上部メニュー Printer から Printing Preferences を選択します。

3. Printing Preferences の設定を次のように変更します
表示画面でPaper Type を変更します。このとき製品にバンドルされている用紙を確認し、それと同じタイプ（High glossy paper 又は High density paper ）に変更します。通常は High glossy
paper が添付されています。
さらに、Paper Size を 1280x1280 に変更します。
また同じ画面にある Orientation を Landscape に変更します（推奨条件ですが必須ではありません）。上部タブを Option に変更し、Enlarge image to fit paper のオプションにチェックを入れます。画面下のOK を押して変更を確定します。
Paper Type: High glossy paper（又は High density paper）
Paper Size: 1280ｘ1280 を選択

タブ切り替えEnlarge image to fit paper

Landscape以上で設定は終了です。
必要であれば、ソフトウェアからテストプリントを行い動作確認してください。

124

125

バイオ･ラッド ラボラトリーズ株式会社

ライフサイエンス
本社

www.bio-rad.com〒140-0002

東京都品川区東品川 2-2-24※ 学術的お問い合わせは天王洲セントラルタワー

Tel : 03-6361-7000

Fax : 03-5463-8480

Email: life_ps_jp@bio-rad.com

Tel : 03-6404-0331

Fax : 03-6404-0334

M11300L 2108b