資料１－２

バイオリソース整備戦略作業部会報告書

今後のバイオリソース整備のあり方について

平成２３年６月３０日
科学技術・学術審議会
研究計画・評価分科会
ライフサイエンス委員会バイオリソース整備戦略作業部会

目

次

はじめに
第１ バイオリソースをとりまく現状
１ 我が国のライフサイエンス研究の動向とバイオリソース整備のあり方
２ ナショナルバイオリソースプロジェクトにおけるリソースの整備について（現状）（１） 整備対象となるバイオリソース（２） バイオリソースの分類（３） 整備等の状況(平成 21 年度中間評価の概要）
第２ 今後の課題と方向性
１ 国が戦略的に支援すべきバイオリソース（１） 戦略的に支援するバイオリソースに関する考え方と留意点（２） 戦略的に支援するバイオリソースの選定について（３） 戦略的に支援するバイオリソースの見直しについて
２ 世界に貢献するライフサイエンス基盤の質的充実（１） 今後の（「世界最高水準」以降の）目標設定と評価指標（２） 提供先の研究におけるリソースの利用状況の把握・リソースの質向上に向けた取組み（３） NBRP におけるリソース開発の在り方
３ NBRP 実施体制のあり方（１） 新たなバイオリソース（系統）、他の競争的資金で開発されたバイオリソースの把握と効率的な収集（２） バイオリソースの効率的保存（３） 提供の相手先、利用目的等を考慮した受益者負担（４） 継続的・安定的な知的基盤構築（５）
他省で整備されるバイオリソースバンクとの連携
４ 人材育成５ 国際連携６ 災害等に対するリソース保護のあり方
第３ まとめ
付属資料１
付属資料２
付属資料３
付属資料４
付属資料５

第５期科学技術・学術審議会研究計画・評価分科会ライスサイエンス委員会
バイオリソース整備戦略作業部会 委員名簿
第６期科学技術・学術審議会研究計画・評価分科会ライスサイエンス委員会
バイオリソース整備戦略作業部会 委員名簿
バイオリソース整備戦略作業部会における審議の経過
NBRP 実施機関一覧
バイオリソース戦略整備に係るヒアリング調査の概要
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はじめに研究をおこなうためには研究材料が必須である。
「（リサーチ）リソースなくしてリサー
チなし」と言われるゆえんである。ライフサイエンスは、生物系統や細胞、遺伝子などの生物研究材料（バイオリソース）を研究者間で共有することにより大きく発展してきた。
バイオリソースは一度絶えたら二度と復活はできないし、継代とともに遺伝的な変化も起こるという特別の性質を持っている。ライフサイエンスの進展とともにバイオリソースは量を増やし、また多様になってきた。これを継続的に保持し、ロジスティクスとして整備することがライフサイエンスの発展のために必須である。
このような考えに基づき、ナショナルバイオリソースプロジェクトは、平成 14 年度から 5 年間のプロジェクトとして開始された。本事業については、平成 13 年度に科学技術・学術審議会 技術・研究基盤部会が取りまとめた「知的基盤整備計画について」においても、2010 年を目途に世界最高水準の知的基盤を我が国に整備するための方策が掲げられていること等を踏まえ、対象となるリソースを新たに追加した第 2 期のプロジェクトが平成
19 年度から実施されているところである。
バイオリソースのあり方については、第４期科学技術基本計画を見据え、平成 21 年 12月に科学技術・学術審議会研究計画・評価分科会ライフサイエンス委員会においてとりまとめられた「新たなライフサイエンス研究の構築と展開－第４期科学技術基本計画におけるライフサイエンス研究の基本的方向－（中間とりまとめ）」においても、「国としてライフサイエンス研究を進めていく上で必要不可欠な基盤であり、生物多様性の確保を考慮しつつ、継続的かつ戦略的な整備を進めていくことが重要である。個々の研究者や研究室任せではなく、国の施策として、リソースの開発及び一元的な管理を行い、科学材料としての妥当性を検証し、厳格な品質管理を行っていくことが肝要である」とされている。
この提言を受け、平成 21 年 11 月に同委員会に設置されたバイオリソース整備戦略作業部会において、「2020 年までに世界に貢献するライフサイエンス基盤の質的充実及び提供・活用体制の整備」を図るため、国際的な優位性、標準化等に関する戦略性を十分考慮した、知的基盤の更なる充実のための具体策等について 10 回の審議を行い、その結果を本
プロジェクトの戦略的整備等に関する提言として本報告書にとりまとめた。
また、本部会の審議期間中に発生した東日本大震災により、数多くの研究機関において被害が発生した。震災に伴う停電や断水といったライフラインの途絶等に対するバイオリ
ソースの保護については以前から対策がなされていたが、今回の大震災の経験を踏まえバ
イオリソースの保護のあり方についても提言も取りまとめたところである。
平成 23 年 6 月 30 日
バイオリソース整備戦略作業部会

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第１ バイオリソースをとりまく現状
１ ライフサイエンス研究の動向とバイオリソース整備のあり方
今日、ライフサイエンス研究に対しては、国民の健康長寿や低炭素社会の実現、新興・再興感染症への対応、食の安全の確保等の国民の安全確保に資するとともに、また、食糧自給率向上や医薬品・医療機器等の産業競争力強化、新産業創出を図る上で重要な科学技術の一つとして、そのニーズや期待が高まっている。
ライフサイエンス研究は 20 世紀後半に爆発的に進展し、DNA/遺伝子/たんぱく質を中軸に生命のメカニズム解明を大きく進めてきた。その際、古くは大腸菌・ファージに始まり、酵母、ショウジョウバエ、線虫、マウス、シロイヌナズナなどモデル生物と呼ばれる実験材料（バイオリソース）が大きな貢献をした。これらバイオリソースは研究コミュニティで共有され、このことにより再現性や結果の比較を可能にし、これらがさらに新たなバイオリソースを生み出すという好循環につながったのである。
近年は、ゲノムやオミックスという言葉に象徴されるように、細胞や個体など生命のシステムの解明に向かう研究にシフトしている。遺伝子は単独で働くものではなく他の多くの遺伝子とネットワークを作り機能している。他の生体分子も同様である。システムとして解明するためには、システムを構成するすべての因子の体系的な解析が必要である。例えば、すべての遺伝子のノックアウト系統を作成するな
ど、体系的・網羅的なバイオリソースが作成され、必須のリソースとして活用されている。さらに、幹細胞研究、がん研究、脳科学、植物科学等の進展も著しい。これらにおいても、基礎から応用研究に至る様々なステージにおいて、研究材料の適切な整備が重要である。
研究材料のボーダーレス化も近年のライフサイエンスの特徴である。研究材料は研究目的に最も適したものが使われるが、他の生物種と比較することによって様々なヒントが得られることが多い。ゲノム解読が進み、データベース化が進んだ現在、ある生物で遺伝子等が得られれば、直ちに他の生物での関連因子やその働きをデータベースサーチすることが行われる。そして必要に応じて他の生物の因子を解析することも行われ、研究の新たな展開つながっている。このためには、適切なバイオリソー
スが初心者にも使いやすい形で用意されていることが重要である。
生物はゲノムの変化によりそのシステムを変化させ、環境に適応することによって進化してきた。したがって、近縁種や種内変異は自然が与えたシステム比較研究の格好の材料とも言える。最近のゲノム解析技術の一大革新により、これらの多様な生物のゲノム解析が可能になり始めたことから、ゲノムの多様性と表現型の多様性の関係すなわち生命システムのゲノム基盤解明に向かい始めている。今後の大きな発展が期待されるが、その際には、野生由来の系統など、長年にわたって収集されてきたどちらかといえば地味なバイオリソースが極めて重要になってきている。
このように今後のライフサイエンス研究の発展のためには多様なバイオリソースの整備とゲノム情報等の関連情報の付加が極めて重要である。「もの」と「情報」を一体的に整備することが必須である。このようなバイオリソースの重要性の増大については、第 4 期の科学技術基本計画（2011～2015）においては、科学技術にイノベーションを加えた STI を旗印にしているが、研究用材料を含む知的基盤整備の必要性が掲げられており、バイオリソースの整備を促進することの重要性も謳われている。
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また、ライフサイエンス研究発展のためにバイオリソース整備が重要であることは各国で認識されており、以下のような戦略的な計画が進められている。
・米国においては、National Science Foundation で Empowering the Nation through Discovery andInnovation : Strategic Plan 2011-2016、National Center for Research Resources でも Strategic Plan
2009-2013 として進行中である。
・欧州においては、EU の FP7 (Framework Programme 7) の中で European Strategy Forum on
Research Infrastructures として進められている。
・アジアにおいては、中国ではバイオリソース関連の予算倍増がおこなわれている。韓国ではバイオリソース関連の予算が３０％増となっている。その他アジア諸国でも個別のバイオリソース整備が行われている。また、インド、インドネシア等が生物多様性条約に基づいて遺伝資源に係る権利を主張しており、今後 名古屋議定書、ABS 関連でこの動きは高まるかもしれない。
２ NBRP における整備について（現状）
上述のように、バイオリソースはライフサイエンスの振興には必須の礎となるものである。ライフサイエ
ンス研究分野においては、多くの研究者がマウスやシロイヌナズナ等のモデル生物をバイオリソースとして利用しているが、近年、その体系的、網羅的な整備が進み、大きく発展しつつある。さらに、ライフサイエンス研究の急速な発展に伴い、バイオリソースを利用した新たな研究の展開は枚挙にいとまがなく、必要となるバイオリソースもまた多様性を増すとともに、高い品質やゲノム情報といった高い付加価値を有するもの等が要求されるようになった。
これらのニーズや期待を背景として、平成 14 年にナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP: National Bio Resource Project。以下、「NBRP」という。
）が開始された。平成 19 年から第 2 期に入り、現在、以下の４つのプログラムが実施されている。

【NBRP のプログラム】
ａ）中核的拠点整備プログラム
ライフサイエンス研究の基礎・基盤となる重要な生物種等について収集・保存・提供を行う拠点（中核機関*）を整備する（*リソースによっては中核機関の他に分担機関を有するものがある。以下まとめて「中核機関等」という）ｂ）情報センター整備プログラム
バイオリソースの所在情報や遺伝情報等のデータベースの構築を行う
ｃ）基盤技術整備プログラム
バイオリソースの収集・増殖・品質管理等に関わる技術開発を行う
ｄ）ゲノム情報等整備プログラム
系統・特性情報、ゲノム配列や cDNA 等の遺伝子情報等、バイオリソースの品質や付加価値を高める
中核的拠点及び情報センター整備プログラムにおいては、個別リソース毎に研究コミュニティの代表者等で構成される運営委員会を置き、ユーザーの意見を十分に取り入れて運営するよう仕組みとしている。また、プログラム全体を調整して推進するために、関係分野の有識者からなる推進委員会
4を設置し、プログラムの状況や課題の把握、連携調整、広報を進めている。各プログラムの選定、評価については文部科学省に設置された選考委員会、評価委員会でそれぞれに行われている。以上の４つのプログラムを総合的に実施することにより、研究者が優れた品質のバイオリソースの提供を必要に応じて受けられるようになった意義は大きく、NBRP は我が国のライフサイエンス研究分野における研究基盤として必要不可欠なロジスティクスとしての役割を担うに至っている。
今後とも、我が国におけるライフサイエンス研究の新発展のためには、バイオリソースが大きく貢献
することは明らかであり、最先端の研究内容に見合ったバイオリソースの利用環境を継続的に整備し研究コミュニティに利用機会を提供することは、我が国のライフサイエンス研究の振興を図る上で極めて重要である。このため国は、最先端の研究と恒常的にそれらの研究を支えるバイオリソースとの両者が相まってバランス良く発展できるよう、国家プロジェクトとしての NBRP を引き続き適切に推進する必要がある。
（１） 整備対象となるバイオリソース
現在、NBRP においては、平成 14 年度の第 1 期のプロジェクト開始時に対象となった 22 種類のバイオリソースに 5 種を追加した２７種のバイオリソースについて、平成 19 年度から第 2 期の事
業が推進されている。本プロジェクトによる整備対象となるバイオリソースは以下の要件を満たすものとされている。
【整備すべきバイオリソースの要件】
ａ）ライフサイエンス研究の発展に不可欠であり、安定的な組織としての保存、供給体制の整備が適切であるバイオリソースｂ）利用する研究者のクリティカルマスが存在するバイオリソースの整備
ｃ）標準的な系統＊が存在するバイオリソース（＊性質が十分解析されており、再現性が保証されているもの）

ｄ）我が国の独自性を発揮した研究、あるいは既に高いポテンシャルを有する研究を進めていくうえで重要なバイオリソース（２） バイオリソースの分類
バイオリソースには、リソースとなった生物種に由来する生物学的な特性（ライフサイクル期間、生育環境等）や研究材料としての利用形態の違い、あるいは研究コミュニティの大きさや成熟度の状況等といった多くの差異による多様性があり、支援や評価等を行う上での判断や取り扱いを複雑としている。
このため、平成 18 年のバイオリソース整備戦略作業部会報告では、国が支援すべきバイオリソースについて、主にその整備の状況を参考にして以下の４つに分類・整理することで、各リソースにおける整備目標の設定や必要となる支援及び整備方策等の検討を行う際に役立てることとされた。しかしながら、個別のバイオリソースがどの分類に該当するのかについての客観的な基準を策定するには、リソース毎の多様性をどのように基準に反映させるかなど課題も多く、現時点では
各リソースからの自己申告により暫定的に分類がなされている。
【バイオリソースの分類】
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① 先進的なバイオリソース【バイオリソースの状況】
研究者コミュニティの広がり、バイオリソース整備体制、国際連携等が十分と判断される
バイオリソース【事業の視点・方向性】
研究コミュニティのニーズに対応して戦略的に整備を行うため、研究動向を把握し、ニー
ズの高い、また先導的なバイオリソースの整備を図る。またバイオリソースの標準化に向けた国際イニシアティブを確保する。
② 発展途上のバイオリソース【バイオリソースの状況】
研究者コミュニティが着実に広がりつつあり、整備が順調に進みつつあると判断される
バイオリソース【事業の視点・方向性】
研究コミュニティの拡大や国際的な情勢に対応し、収集・保存・提供事業の体制の充実、ニーズの高いバイオリソースの充実を図るとともに、普及活動を行うなど、研究コミュニティの拡大を図る。
③ 発展が見込まれるバイオリソース【バイオリソースの状況】
現状では研究者コミュニティが小さいものの、研究の動向や国際的な情勢を踏まえると、
今後５年間の間に、ニーズの高まり、当該バイオリソースを利用した研究の発展が見込まれ、整備が進められつつあるバイオリソース【事業の視点・方向性】
研究動向や国際的な情勢を踏まえた収集・保存・提供事業を体系的に行うための体制整備を進め、バイオリソースの充実を図るとともに、普及活動を行うなど、研究コミュニティの拡大を図る。
④ 維持の必要なバイオリソース【バイオリソースの状況】
現状では研究者コミュニティの広がりや、当該バイオリソースを利用した研究の発展性が乏しいが、我が国の独自性のあるバイオリソースや、基盤的な研究に必要なバイオリソースであるなど、我が国において収集・保存・提供事業を維持することが必要なバイオリソース【事業の視点・方向性】
長期的な視点から、我が国の独自性のあるバイオリソース等となる可能性等を評価しつつ、必要なバイオリソースを維持・収集するとともに、保存・提供事業を行う。
（３） 整備等の状況（平成 21 年度の中間評価の概要）
本プロジェクトの第 2 期の 3 年目にあたる平成 21 年度に実施された中間評価においては、整備等の状況について以下の評価を得たところである。

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ア 中核的拠点整備プログラムについて
多様な生物種を戦略的に保存する世界的にも類のない試みであり、２７種のバイオリソースのうち、半数の 13 種で優れた水準に達した成果が得られた。特にラットは、世界最大規模を誇る保有数と多型・ゲノム情報、ショウジョウバエについては、国際的な視野に立った運営体
制、ミヤコグサ・ダイズについては我が国独自の品揃えやゲノム解析との連携など、世界最高水準のリソースとして極めて高い評価を得た。一方、実験生物として日の浅いバイオリソースについては、今後の利用者の拡大と中核機関等としての基盤強化に向けて、なお一層の取組みが必要である。
イ 情報センター整備プログラムについてユーザーの使い勝手の良いデータベースやポータルサイトの構築・公開が適切かつ順調に進められており、優れた水準に達している。
ウ 基盤技術整備プログラムについて
意欲的な技術開発目標の達成に向けて新たな要素技術の開発が進捗しており、十分な水準に達している。
エ ゲノム情報等整備プログラムについて
目標通りにゲノム情報の整備が進められ、レベルの高いリソース情報が構築されている。
以上に鑑み、プロジェクト全体としては優れた水準に達していると評価されたものと考えられ、
特に、平成１４年度から開始された第 1 期 NBRP により、整備されたバイオリソースは、量的整備が進み、保存系統数が世界一であるものもみられる。
例えば、マウスは、4,733 系統*を整備し、米国ジャクソン研究所に次ぎ、世界第２位の系統保有数を誇っている。また、シロイヌナズナは 575,402 系統*を整備し、ABRC（米）、NARC（英）とともに世界三大拠点を形成するに至っている。これらは提供数も世界最大級の規模となっている。さらに、ショウジョウバエの維持系統数は、世界最大である。このような先進的なバイオリソースについては、世界最高水準の知的基盤として、量的目標は達成し、今後は、提供品質を維持しつつ、継続的に NBRP を運営してくことが求められている（*：数値は中間評価時点のもの）。
また、発展途上のバイオリソース、発展が見込まれるバイオリソースについても、継続的・安定的な供給を基本として、質の向上及び利用者の増を目指した運営が望まれる。また、維持の必要なバイオリソースについても、ライフサイエンス研究の中で、必要不可欠な部分について国が一定の資金で継続的に支援を行うことも NBRP の重要な使命として期待されている。
【図１：NBRP の推移】

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ＮＢＲＰ年表
年度
（平成）
中核的拠点
整備プログラム

第１期
14年度

15年度

16年度

第２期
17年度

18年度

19年度

20年度

21年度

22年度

23年度

哺乳類（ﾏｳｽ､ﾏｳｽ･ﾐｭｰﾀｼﾞｪﾈｼｽ､ﾗｯﾄ､ﾆﾎﾝｻﾞﾙ ）哺乳類（ﾏｳｽ、ﾗｯﾄ、ﾆﾎﾝｻﾞﾙ）

小動物（ｼｮｳｼﾞｮｳﾊﾞｴ､線虫､ｱﾌﾘｶﾂﾒｶﾞｴﾙ､
ｶｲｺ､ﾒﾀﾞｶ､ｾﾞﾌﾞﾗﾌｨｯｼｭ）小動物（ｼｮｳｼﾞｮｳﾊﾞｴ､線虫､ﾈｯﾀｲﾂﾒｶﾞｴﾙ､ｶｲｺ､
ﾒﾀﾞｶ､ｾﾞﾌﾞﾗﾌｨｯｼｭ､ｶﾀﾕｳﾚｲﾎﾞﾔ･ﾆｯﾎﾟﾝｳﾐｼﾀﾞ）

植物（ｼﾛｲﾇﾅｽﾞﾅ､ｲﾈ､ｺﾑｷﾞ､ｵｵﾑｷﾞ､藻類､
広義ｷｸ属､ｱｻｶﾞｵ､ﾐﾔｺｸﾞｻ・ﾀﾞｲｽﾞ）

植物（ｼﾛｲﾇﾅｽﾞﾅ､ｲﾈ､ｺﾑｷﾞ､ｵｵﾑｷﾞ､藻類､
広義ｷｸ属､ｱｻｶﾞｵ､ﾐﾔｺｸﾞｻ･ﾀﾞｲｽﾞ､ﾄﾏﾄ）

微生物（病原微生物､大腸菌､酵母）

微生物等（細胞性粘菌、病原微生物、一般微生物、
原核生物(大腸菌・枯草菌)、酵母、遺伝子材料）

細胞等（DNA､ES細胞､ﾋﾄES細胞、ﾋﾄ・動物細胞）

細胞等（ﾋﾄES細胞、ﾋﾄ・動物細胞）基盤技術
整備プログラム

マウス、ラット
ショウジョウバエ、メダカ、ＤＮＡ（動植物、微生物）

ゲノム情報等
整備プログラム

ﾒﾀﾞｶ､ｼｮｳｼﾞｮｳ
ﾊﾞｴ､ｼﾛｲ
ﾇﾅｽﾞﾅ､
ｺﾑｷﾞ

ﾒﾀﾞｶ､
ﾗｯﾄ､
ﾄﾏﾄ

ﾒﾀﾞｶ､
ﾏｳｽ､
ﾄﾏﾄ､
ｺﾑｷﾞ

マウス・ラット

ﾏｳｽ､
ﾆﾎﾝｻﾞﾙ､
ﾒﾀﾞｶ､
ﾄﾏﾄ

公 募

情報センター
整備プログラム※ゲノム情報等整備プログラムについては、第２期から実施。第 1 期は個別事業の中で行っていた。

第２ 今後の課題と方向性
１ NBRP 事業の考え方：国が戦略的に支援すべきバイオリソース（１） 戦略的に支援するバイオリソースに関する考え方と留意点
国は、整備すべきバイオリソースの要件を念頭に置きつつ、ライフサイエンス分野における知的基盤として重要なバイオリソースの収集・保存・提供等の体制の整備が、公共性の高い国家戦略であると位置付けて継続的に支援すべきである。
支援を行う期間については、研究基盤として成果が結実するまでには一定の期間を要することから、当面 5 年間を一単位として実施することが妥当である。一般的な NBRP のロードマップとしては、当初の５年間は保有する系統数の拡充等量的な整備に重点を置き、次の５年間以降は整備したバイオリソースの質的充実、研究コミュニティの利用促進を図りつつ、利用者の要望等に応じた貢献に重点を置いた活動を行うべきである
なお、NBRP の推進に当たっては、この事業が研究活動に対するロジスティクスであるとの認識を全ての関係者が共有すべきであり、整備を推進する際には、「必要なものを」、「必要な時に」、「必要な量を」、「必要な場所に」というロジスティクスの要諦を踏まえ、研究の現場と中核機関等との密接かつ有機的なつながりを維持するために必要な情報交換等の活動が常に求められていることを念頭に置く必要がある。
その他の留意点として、それぞれのバイオリソースは、学術的、生物学的そして社会的な多様性を有していること、本事業は中核機関等の研究者・技術者により支えられているという事実、さらには、現在の研究活動だけでなく未来に向けて価値を生み出すものであるという将来的な視点を持つべきであること等について踏まえる必要がある。
また、平成 22 年 10 月に「生物の多様性に関する条約の遺伝資源の取得の機会及びその利用から生ずる利益の公正かつ衡平な配分に関する名古屋議定書」が採択されたことにより、バイオリ
8ソースを含む遺伝資源については国家の主権的な権利が国際的に再認識されたことも今後考慮すべきである。
NBRP を戦略的に整備し推進するには、これらの留意点を踏まえつつ、それぞれのリソースの置かれている状況を詳細に把握し評価を行った上で、その結果を予算配分等に適切に反映させるなどし、きめの細かい事業支援を適切に行う必要がある。
（２） 戦略的に支援するバイオリソースの選定について
国として戦略的に支援するバイオリソースの生物種の選定については、中核機関等が設定する 5 年後までに達成すべき目標と達成状況の判断に必要な評価指標、および、運営方
針等について評価を行い NBRP として整備すべきリソースの要件を満たしているか否かを総合的に判断するのが適当である。また、継続して事業を行うリソースについては、前期の事後評価の結果も踏まえ継続の可否を判断する必要がある。
ただし、バイオリソースの整備状況については、安定的な供給により研究コミュニティでの利用を順調に伸ばし優れた成果が創出されるなど中核機関等として確固とした地位を築いているものもある一方で、バイオリソースとしての利用が始まってからの歴史が浅いといった様々な要因により、利用が数量的には進んでいないといったものがあるなどの差があることを踏まえる必要がある。
このため、中核機関等が設定する達成すべき目標については、評価対象となるリソース
がバイオリソースの分類のいずれに該当するかを念頭に置く必要がある。実際の設定に際しては、個々のリソースが掲げるバイオリソースの分類に沿った内容となっているか、運営委員会等を活用した研究コミュニティのニーズや研究動向を踏まえたものとなっているか、あるいは、保存すべきバイオリソースの選定や常時提供可能な系統の選別は適切か、必要とされるリソースの量的規模の見積もりは適切か、目標は達成可能なものとなっているのか等の観点から適正なものとなるようにしなければならない。
したがって、国として戦略的な支援の採否を選定する際には、このような観点から達成目標等の妥当性を評価することとなる。さらに、事業開始から 3 年目に中間評価、そして最終年度を目処として事後評価を行い、それらの結果を踏まえ必要に応じ事業の見直しを適宜促すことが適当であるともに、最終評価の結果については、上述の通り次期の事業を継続する際の判断の材料とするのが適当である。
なお、達成すべき目標については、可能な限り客観的な評価がなされるようそれぞれに評価指標（定量的数値目標や客観的に確認しうる状況）を明確に設定しておく必要がある。
これら指標としては、提供数の増加、提供したリソースを利用した論文数の増加、研究コミュニテ
ィの拡大・活性化を示す数値等が考えられる。
ただし、提供数については再提供までの期間に留意する必要がある。すなわち、利用者が提供されたバイオリソースを増殖すると遺伝的な変異が生じて特性が維持されなくなる恐れがあることから一定期間後は再提供を行うことが推奨されるが、この再提供を受けるまでの期間について
は、大腸菌や線虫、粘菌のように、これまでから利用者がある程度増殖保存してきたものと、例え9ばニホンザルのように中核機関等からの提供に頼らなければならないようなバイオリソース間では差がある。このため、提供数のみを単純に比較をするのではなく、むしろ、達成すべき目標に沿って事業の開始時点からどのように実績が変化したのかに着目した評価が適当である。また、このような評価に際しては、リソース間の比較や競争を目的としていないことに留意しなければならない。
NBRP の評価者は、究極的には利用者や研究コミュニティである。したがって、研究コミ
ュニティを代表しているバイオリソースの運営委員会は、中核機関等に対し、毎年度の収集・保存・提供数の目標達成の検証・評価のみならず、中核機関等の５年間の実施目標及び運営方針について、研究コミュニティの意見を踏まえた助言・提言等を行うべきである。
このような評価に際しての基準については、それぞれのリソースごとに明確化した上で運営委員会において運営実績等の評価・検証が行われるべきである。中核機関等は、これらの評価等の結果を踏まえ、適宜具体的な事業活動や次期の目標の設定に反映させる必要がある。
（３） 戦略的に支援するバイオリソースの見直しについて
NBRP は、国費を投入して支援がなされているものであるが、一方で特定のバイオリソース
について永続的に支援を補償するものではない。国は、支援を行うことについての必要性等について時宜評価を実施した上で検証し、その結果等を踏まえた適切な対応が求められている。特に、バイオリソースは研究に利用されることで始めて大きな学術的な価値を生み出すものであることを考えるならば、たとえ、発展途上のカテゴリーのバイオリソースであっても、利用の見込めないバイオリソースや当初掲げた目標を達成できない場合については、国からの支援を見直すことも考えられる。
国からの支援については定期的な見直しの可能性があることにより、中核機関等や研究コミュ
ニティ等に適度の緊張感が生まれリソース事業の発展につながるという考え方がある一方で、バイオリソースは、過去の研究者の多大な努力により収集された極めて貴重な成果物であること、一旦失われてしまうと復元が不可能なものがあること、さらに、将来の研究動向や社会情勢の変化により利用が拡大する可能性の有無を現在の知見だけで判断するのは困難であること等から、国からの支援の見直しについては、リソース側から提示された将来像等を適切に読み解く必要があり、
NBRP に直接関与しない第三者の研究者の意見も適宜求めるなどしつつ慎重に行わなければな
らない。
それでもなお支援を行うことが適当でないと判断されたリソースがあった場合については、中核機関等の人員や、そのリソースを利用している研究コミュニティや研究者等に与える影響を最小限とするため、適切な移行期間を設けるなどの配慮が求められる。
２ バイオリソース整備の今後の目標：世界に貢献するライフサイエンス基盤の質的充実（１） 今後の（「世界最高水準」以降の）目標設定と評価指標
国は、知的基盤整備計画に基づき世界最高水準の知的基盤の整備を進めてきており、NBRP
におけるリソースの保有件数及び提供件数は順調に伸びている。今後は、規模のみならず、
10

質の充実が求められており、バイオリソースの目指すべき質を明確に示したうえで、中核機関等の目標設定、評価の指標とすることが必要である。
バイオリソースの質とは、常に一定していること、すなわち実験の再現性を担保する品質が常に確保されていることが最低限の条件となる。寄託されるバイオリソースの約 10％に、取り違え、微生物汚染や情報の誤りが存在している（理研 BRC 調べ）。これは大学等で一般に利用されているバイオリソースの実情の一端を反映したものと考えられ、これらを完全に除去し提供することが中核機関等の役割である。このことにより、我が国の研究全体の質の向上や効率化が大きく進展することとなる。
その上で世界に貢献するライフサイエンスの基盤であるためには、提供可能なリソースの拡充や迅速な対応による利用の拡大を図るなど、多様な利用者のニーズに応える利便性の向上等も指標として考えられる。さらに、バイオリソースのゲノム配列や cDNA 等の遺伝情報が、最も基礎的で不可欠な付加情報として重要性が高まっていることから、これらへの一層の対応が求められている。
このように、品質の維持管理の徹底や有用な付加価値を付すことを達成すべき目標として設定することによって、ライフサイエンス研究に供する世界最高水準のバイオリソース
としての位置付けを確立し、NBRP が世界標準ブランドのリソースの収集・保存・提供事業となるよう目指していくべきである。
（２） 提供先の研究におけるバイオリソースの利用状況の把握
現状では、中核機関等の研究者が個人的なつながりや学会において、提供したバイオリ
ソースにより得られた成果のフィードバックの依頼を行っているものの、必ずしも全ての利用者からフィードバックがなされていないという現状にあり、一部の中核機関等では自らが、データベースで論文やバイオリソース作製情報を検索し情報収集を行っている状況である。
いうまでもなく本プロジェクトは国費を投じて実施されている以上、投入された国費に見合う実績があることやコストパフォーマンス等について、国民に対する説明責任が強く求められており、提供されたバイオリソースからどの様な研究成果が得られたのかについてのフィードバック情報は本プロジェクトを継続する上で極めて重要なものである。このため、フィードバックの必要性に関する利用者の理解促進を図ることによりこれが確実に行われるよう、中核機関等は研究者コミュニティや関連する学会と共に対策を検討する必要がある。
バイオリソースの提供を受けた研究者が、その利用から生じたデータや成果を提供機関にフィードバックすることは、NBRP で使われている提供同意書（MTA: Material Transfer
Agreement）にも明記されているだけでなく、論文発表の際に再現性を担保するためリソースの出所を開示することは、科学者として当然の責務である。このことを科学者の共通認識として定着させる努力も必要である。このためには、関連する学会における論文の査読の際に、材料の出所が開示されていることが徹底されるよう、中核機関等や研究者コミュ
11ニティが働きかけることも必要であろう。
一方で、論文等の検索により NBRP からの提供を受けたバイオリソースが利用されているという事実の確認を容易にするため、NBRP において固有の記号や番号を発行することも検討されているが、寄託を受けたリソースでは開発者の業績が見え難くなる等の弊害も指摘されている。このため、全てのリソースで一元的に導入することは困難であるが、実施可
能なリソースから順次導入する方向で検討を進めるのが適当である。
なお、先にも触れた「生物の多様性に関する条約の遺伝資源の取得の機会及びその利用から生ずる利益の公正かつ衡平な配分に関する名古屋議定書」が我が国で批准され発効すると、対象となる遺伝資源を議定書に基づいて適正に利用することが一層厳密に求められることとなる。
そのような観点からも、バイオリソースの出所を論文等で開示することは、単に NBRP のみならず、我が国の国際的な信頼性を確保するという観点からも、これまで以上に重要となると考えられ、学会や研究者コミュニティのみならず個々の研究者のモラルが強く求められることになる。
これらのためには、科学研究費補助金等競争的資金等の公的研究経費により行われた研究では、バイオリソース利用の実績があった場合、論文や成果報告書等に当該バイオリソースの出所を開示することや、新規作製バイオリソースに関する情報等の記載を研究費の交付要綱において求めることで徹底させることもバイオリソースの利用状況の把握に有効であると考えられる。
また、バイオリソースの質的向上のためには、提供したバイオリソースから解析されたゲノム情報をはじめとする新たな研究データ、論文発表情報、さらにはネガティブデータ
等も有用であり、このような関連情報についても利用者から確実なフィードバックがなされることが必要とされている。この関連情報により、当該バイオリソースの新たな付加価
値が高まれば、提供が促進されるというポジティブ・サイクルが形成されることを、利用者も含め関係者で意識を共有する必要がある。
いずれにせよ、NBRP を利用する研究者からの利用結果に関するフィードバックが適切になされることが本事業を推進するために不可欠であるとの認識を研究者間に広げることが重要である。
（３）NBRP における特性解析とリソース開発の在り方
現在の NBRP の枠組みにおいては、バイオリソースの収集は研究者等からの寄託に求めており、直接的なバイオリソースの特性解析及び開発は行われていない。NBRP により提供されるバイオリソースは、原則として研究者が提供を希望することを前提に収集・保存がなされているものであり、論文等で一定の研究成果が得られた実績のあるバイオリソースについて寄託を受けて収集・保存を行う現在の方針は本事業の目的に適った方法である。
一方で、ライフサイエンスがゲノム研究等の進展に基づいて細胞や個体の生命機能のシ
ステム全体の解明に向かっていることから、例えば全遺伝子の破壊系統のような体系的・網羅的なバイオリソースの開発と特性解析が必要になってくる。これらは研究の基盤とし
12

てのバイオリソース開発を先行して行うことになり、先導的なバイオリソースとして幅広く利用されることが期待できる。しかしこれらの開発は、規模的にも性質上も個別的研究にはなじまない。従来は大型の研究費や国家プロジェクト等に関連したものとして進められた経緯があるが、近年は、特に基礎研究分野において、そのような研究費を得ることが困難になっている。このために、NBRP リソースにおいても、国際的にも極めて有用なバイオリソース開発の技術が国内で生み出されているにもかかわらず一定以上の規模での開発ができないケースが生じている。一方、海外では新規リソース開発と特性解析の枠組みが用意され、開発も増加しているおり、国際的な競争力を失うことが危惧される。これは NBPRの先導性、先端性、戦略性、国際競争・協力の観点からも大きな欠陥である。このためには、まずは研究費の中にリソースグラントのカテゴリーの設置が必要である。また、NBRPの枠内での新規リソース開発支援の検討も必要である。
このような状況において NBRP においてバイオリソースの開発を行うに当たっては、NBRP
本来の事業活動に影響を与えないことは当然として、他の研究活動や国家プロジェクト等
では得ることが決して出来ないものであること、さらに、開発後には研究者からの提供の依頼が相当に期待できること、加えて我が国の研究活動にとって緊急性が認められるもの
であること等といったものがある場合に考慮されるべきものと考えられる。
このため、このような場合には、その都度、個別にその内容を精査した上で上記のような要件に適合性を判断し、他の事業との優先順位を含め判断するのが適当である。
３ NBRP 実施体制のあり方（１） 新たなバイオリソース（系統）、他の公的資金で開発されたバイオリソースの効率的な収集
世界最高水準のバイオリソースの中核機関等の整備には、汎用性の高いバイオリソース
を研究者の要望に応じて、提供可能な態勢を整備するとともに、保有する系統も最新の研究動向を踏まえたものを取り揃えておく必要がある。
外国の学術誌によっては、論文を掲載する場合、使用したバイオリソースの出所を明記することや新たに作製されたバイオリソースは、バイオリソースセンターに寄託し、研究
コミュニティに公開することとしている場合もある。我が国においても、科学研究費補助金等の競争的資金や国家プロジェクト等といった公的研究費で開発されたバイオリソース
は、最新の研究動向を反映した新たなバイオリソースとして効率的に集約・保存されるよう取組むことが必要である。研究者においては、バイオリソースの寄託は、研究コミュニ
ティで共有されることにより分野の発展に貢献するだけでなく、リソースの品質が維持されることや元の論文の引用がなされることなどの多大な効果があることを理解すべきである。
論文やデータベースにバイオリソースに関する情報を記載することにより、中核機関等から効率的に情報収集を行うことができ、寄託依頼が可能となる。中核機関等は、このように新規のバイオリソース作製情報を迅速に把握し、収集・保存すべきバイオリソースを適切に選択し、取り揃えるバイオリソースの充実と利用促進に努めるべきである。
13

また、NBRP の対象となっていないバイオリソースであっても、利用情報、作製情報を論文等に記載することで、利用を希望する他の研究者に所在情報の把握を可能とするため、そこから新たな研究コミュニティでの利用に繋がるなど発展が期待されるものである。
（２）バイオリソースの効率的保存研究開発の進展に応じて、新規作製されたバイオリソースが増加の一途をたどっているが、増え続けるバイオリソースの全てを保存し常時提供することは、保管場所、人員、経費にも限りがあることから困難であり、利用状況等を適切に把握し優先度を付すなど効率的な保存を行うべきである。
バイオリソースの保存には、場所の確保、温度の管理等、相当の運営コストがかかるた
め、全てを中核機関等で個体の継代保存・集積することは、保存施設、維持管理要員の面からも限りがあることから、可能な限り凍結や凍結乾燥など長期保存が可能となるよう技術開発を進めるべきである。凍結保存については、保管場所の確保や維持管理に要する人
件費の抑制、さらには無用の継代を回避することによって変異の導入やコンタミネーショ
ンを防ぐことによる質の維持、そして災害等に備えたバックアップ体制の構築等の観点から非常に効果的である。バイオリソースや系統によっては凍結保存が容易でないものもあるが、技術開発により凍結保存の実用化が見込めるものから順次積極的に導入し、経費削減による効率的な運営やバックアップ体制の構築等を加速させるべきである。
また、中核機関等は、NBRP の効率的運用を図るため、提供実績が少ない系統については、運営委員会など研究コミュニティの意見を把握したうえで優先順位を付け、最低限のバッ
クアップ保存とすることや、廃棄も含め効率的運用を行うべきである。その際、法規制、寄託者の知的財産権の確保等について確実に対応するとともに、研究コミュニティの意見も踏まえ適切に進めるべきであり、長期的な視点に基づかない過度な効率化が必ずしもコ
ストダウンにつながらないことにも留意すべきである。
また、研究者の定年や異動、あるいは研究機関そのものの活動方針の変更等に伴い、これまでの研究成果（特に公的研究資金によるもの）として蓄積された貴重な財産であるバ
イオリソースが滅失の危機に瀕することもあることから、このようなバイオリソースの維持についても何らかの対応が求められる。
（３） 提供相手先、利用目的等を考慮した受益者負担
NBRP は、大学等研究機関における非商業的研究での利用を対象としたプロジェクトである。大学等の研究者は、中核機関等に申し込むことにより簡便に希望するバイオリソースを入手することが可能となった。提供されたバイオリソースを利用した研究結果は、論文等で広く公開され他の研究にも利用されること等により、ライフサイエンス研究の推進に大きく寄与することが期待されている。
また、NBRP が数多くの研究機関で利用されることにより、バイオリソースが NBRP で集中的に維持管理されることで、個々の研究機関におけるバイオリソースの維持管理経費を14

研究費に振り向けることが可能となる、さらには、高品質のバイオリソースを用いることにより再実験等の無駄を省くことで研究費をより有効に活用できるという効果もある。
しかしながら、NBRP の利用が進みバイオリソースの提供件数が増加することで、中核機関等の経費負担が増えることになっては、NBRP として中核機関等が本来取り組むべき収集・保存の業務を圧迫し、将来的には提供されるバイオリソースの質の低下や規模の縮小を招きかねない。
このため、バイオリソースの質の向上を図りつつ、安定的・継続的な事業を行うには、受益者負担の原則により、提供に要する送料等の実費について応分の負担を求める必要がある。NBRP においては平成２２年度からすべてのリソースにおいて提供に関わる実費徴収を開始しているところであるが、貴重なバイオリソースが責任を持って研究活動に利用されることを推進する上でも、無料とせず一定の経費負担を求めることは有効と考えられる。
その際に、経費の徴収に係る事務作業が新たな中核機関等の負担とならないよう、クレジ
ットカードによる決済を可能とする等の省力化を実施機関の関係者の理解や協力を得て推進すべきである。
一方、民間企業等が商業目的の研究にバイオリソースを利用する場合は、本来であれば当該企業自らが経費を賄うべきものであるだけでなく、NBRP の利用の対象者でないことか
ら、提供に係る直接的な経費のみならず公的資金により運営されているバイオリソースの収集・保存に係る経費についても応分の負担を求めることが適当である。
（４） 継続的・安定的な基盤構築
NBRP の実施には、高度の専門知識と技術を有する人材とともに、バイオリソースの特性に応じた施設や設備が必要である。生物種によっては、圃場、畑、放飼場等大規模施設や保管のための冷凍庫、飼育水槽等様々な設備が必要である。保存数増加に伴い、施設の計画的拡充や老朽化設備の更新等も必要である。このように、NBRP の実施には中核機関等が所属する大学や研究機関等の積極的な協力が不可欠であるが、大学や独立行政法人のシス
テムや法的な制約、あるいは NBRP では補助金化以降間接経費がないこと等を踏まえつつ対応しなければならない。
また、貴重なバイオリソースを絶やさないためのバックアップ体制や、各機関の学術的背景、経験に裏打ちされた特殊な技術・技能を有する人材の確保が重要である。現在、バイオリソースは、それぞれの特性に応じて集中型および分散型の実施体制を図っているが、効率的な業務実施体制の確立とともに、適切な役割分担を行うことが必要である。
NBRP は、知的基盤として継続的・安定的な運営が求められている。知的基盤整備に共通することであるが、バイオリソースの特殊性は、専門知識、専門技術を必要とする業務が日常的かつ継続的に存在することである。また対象が生き物である以上、業務が滞ればバイオリソースは絶えてしまう。この点が物理系や情報系の知的基盤と大きく異なる点である。従って、研究者の退職や異動の場合など、その後の大学内の人事・運営方針により NBRP
を継続的に担うことのできる専門人材が確保されない場合があるなど、存続が危ぶまれる
15

場合が想定され、「人の切れ目がバイオリソースの切れ目」となる可能性がある。そのため、
NBRP の運営に携わる専門人材や技術者等の研究支援者の確実な確保が不可欠である。併せて、大学等採用機関において人事や待遇面での適切な評価等を行うことが重要である。
特殊な技術を有する技術者等の存在は NBRP の継続には不可欠であるが、任期付き・派遣等により雇用を継続できない場合がある。大学・研究機関は、NBRP の中核機関等として、継続性の確保を責務として、当該 NBRP を担う部門を大学等機関の組織としてセンター化す
るなど、事業に従事する人材配置も含めた組織的な取組みとして継続的な事業を行うことが期待される。
中核機関等の代表研究者が異動・退職することもあるため、その場合は、事前に、研究
コミュニティの代表である運営委員会は、自らの問題として検討し、NBRP の継続方法、実施機関等について提言をして、推進委員会等に報告することが必要である。推進委員会としても責任をもって検討し、判断すべきである（図２）。
また、理化学研究所や大学共同利用機関等に NBRP を担う人材等をバーチャルに集約し、中核機関等に集中的に配置させることも可能性の一つとして検討を進めるべきである。

図２

代表研究者等の異動、退職等に伴うバイオリソースの移管対応について

移管の打診

Ａ機関

Ｂ機関

バイオリソース

バイオリソース

移管の了承

報告
意見

研究コミュニティ
運営委員会において運営委員会においてバイオリソース及びバイオリソース及び設備移管等について
設備移管等について
十分に検討
十分に検討
意見

報告

推進委員会・文部科学省

16

（５） 他省で整備されるバイオリソースバンクとの連携
知的基盤整備計画では、研究開発の動向やリソースの質と量の科学的評価を踏まえた、生物遺伝資源等の保全・確保・利用が目的とされている。各省で構築されたバイオリソースバンクは、それぞれ、基礎・基盤の研究を対象とするもの、産業応用を対象とするもの、環境や医療を対象とするものなど設置目的に沿った運営体制が置かれている。
文部科学省で実施している NBRP で保存されているバイオリソースは、基礎的研究に向けたものであるが、農林水産省、経済産業省、厚生労働省等の応用研究に向けたバイオリソースバン
クと生物遺伝資源の情報の公開等を進め、府省間連携を確実に進めることが必要である。
連携により、バイオリソースの全体の質的な幅が広がり、利用者の利便性の向上が期待されることから、オール・ジャパンのバイオリソースネットワークを構築し、各バイオリソースの種類、規模を越えて連携していくことが必要である。
４ 人材育成NBRP を安定的に継続していくためには、将来の事業を担う人材養成が不可欠である。
NBRP に従事する人材に求められる能力としては、生物に関する高度の専門知識のみならず、知財等の法的知識、バイオインフォマティクス、倫理等に関する知識、技術も必要であり、そうした能力を有する研究者の育成・確保が必要である。また、分類学の理解も必要である。
また、バイオリソースに携わる若手研究者のモチベーションを維持していくため、他の研究者から感謝される、あるいは研究分野への貢献度などについての何らかの社会的評価が受けられるといった仕組みが必要である。例えば、理化学研究所は、若手の表彰制度を導入し、奨励賞を授与するなどの取組みを行っており、今後は、各大学や研究機関、研究
コミュニティにおいても同様の取組みについて導入が望まれる。
退職・異動等によりバイオリソース事業を引き継いだ研究者に対しては、特に若手研究者の場合は、運営委員会をはじめとした研究コミュニティ全体の課題と位置付けた上で適切な支援が必要である。また、NBRP への理解や認知度を高めることが、優れた人材を集める上で重要であることを認識しなければならない。
「人の切れ目がバイオリソースの切れ目」であり、NBRP 中核機関への支援の永続性が担保されるているわけではないことから、中核機関等を中心として、研究コミュニティ全体で、組織的に人材育成、キャリアパスについて検討する必要がある。
NBRP は通常の研究活動とは性格を異にするために論文等の業績には結びつきにくいが、研究者、技術者等の事業への貢献度等を正当に評価し、大学等の機関において、キャリア
パスを明確に示し、安定的な雇用を確保することにより、継続的な NBRP に資することが
望まれる。

17

そのため、前述のように、理化学研究所や大学共同利用機関等において、一括して NBRPに従事する人材を育成し、中核機関等へ派遣することも一つの方策として考えられる。また、根本的には、中核機関等は、恒常的・安定的な NBRP の運営とそのための人員を確保する組織的な取組みを行うことが望まれる。その際、NBRP は国として戦略的に進める事業であることから、リソース基盤機関への適切な配慮が望まれる。
５ 国際連携国内の一機関だけでは研究者のバイオリソースに対する幅広い要望に対応することは困難なため、他機関のみならず、海外の研究機関やバイオリソースセンターと連携し、センター機能の強化に努めることが必要である。多くの場合、個々の研究者レベルの繋がりは既に存在しており、それをリソースセンター間の連携へと進展させ、利用者の視点に立った国際ネットワークやワンストップデータベースの構築へと発展させることが必要である。
海外のバイオリソースセンターと同種の系統を相互に保有しあうことで、バックアップ
体制が相互に確保されるとともに、万一災害等が発生した場合の対応やコスト削減を図る
ことができる。海外の機関と連携して利用者にバイオリソースの所在情報、論文情報などを提供することにより、バイオリソースの利用がより幅広く進む可能性もある。特に、アジア諸国のバイオリソース提供機関と連携しつつ、アジアをリードする拠点として、収集・保存・提供についてワンストップセンターの役割を果たすなど、イニシアティブをとるべきである。
近年、韓国、中国は NBRP を手本にリソースセンターとそのネットワークの構築を進めている。また、タイ、インドネシア、ベトナム、インド等の諸国も各々の国のバイオリソー
スの豊富さ活用した研究開発を進めようとしており、我が国に人材育成と技術支援を求めている。このような状況において、NBRP の中核機関が、韓国、中国の関係機関と連携し、Asian Network of Research Resource Centers（ANRRC）を立ち上げたことは、大変有意義なことである。さらに、生物多様性を遵守しつつ、バイオリソースの学術研究への自由な利用と発表の自由を謳った憲章を制定し、バイオリソースの係わる情報工学およびヒト由
来試料に関するワーキンググループも設置した。これまで構築した ANRRC の枠組みの中で、我が国がリーダーシップを発揮し、アジア全体の研究をレベルアップさせ、究極的にはアジアの人々の生活を向上させることが望まれている。
なお、国際連携を推進するに当たっては、バイオリソースに係る知的財産に関する問題
やコピーフリーとなっている国々に関する課題等を整理しておく必要がある。
６ 災害等に対するリソース保護のあり方
平成 23 年 3 月 11 日に発生した東日本大震災により、東日本の広範囲にわたり NBRP に係る研究機関に被害が発生した。さらに、発災直後の停電や断水に加えて、長期間にわたって電力供給が不安定になるという事態にも至った。また、理研 BRC では液体窒素の供給が途絶するという事態も発生した。
バイオリソースについては、生物に由来する材料としての性格上、電気や水といったラ18

イフラインへの依存が高いことから、以前より災害等への備えを進めていたところである。
一方で、この震災の規模は我が国の首都圏を含む東日本一帯に被害を与えるという極めて大きなものであり長期にライフラインの不安定化をもたらした。今回の震災の経験を踏まえ、
NBRP においてもリソースのバックアップ等について更なる備えを追加する必要がある。
震災による具体的なバイオリソースへの影響としては、○発災直後の混乱した状況ではリソースを安全な場所に移動させることは極めて困難
なこと○ 長期の停電が続き燃料の供給が途絶えると自家発電装置ではフリーザーを維持できないこと○「計画停電」により長期に電力供給が不安定な状況になる可能性があること。
○ 液体窒素の供給が途絶する可能性があること等が想定される。これらの影響からバイオリソースを守るには、複数の機関に予めバッ
クアップを保存しておくだけでなく地理的に離れた機関を利用することが重要である。今回の震災の規模や影響を考慮するならば、西日本と東日本の機関とするのが適当であり、このようなバックアップ体制を可及的速やかに整備する必要がある。このような整備に当たっては、一義的には中核機関等において対応がなされるべきであるが、研究者コミュニティに対しても運営委員会等を通じて適宜協力を求める必要があるとともに、各省で構築されたバイオリソースバンクや海外の研究機関やリソースセンター等とも災害に備えた連携を図ることが求められている。
なお、バックアップするリソースについては、我が国の研究基盤として必要不可欠なものなのか、そして、一旦失われると復元が困難なものか、といった視点から優先順位を決定し順次バックアップの体制に組み入れることが適当である。
さらに、このバックアップ体制については長期に継続する必要があることから、保存されているリソースの維持管理に要する負担を可能な限り軽減できるよう、常温あるいは冷凍保存によることが望ましいが、現時点では幾つかのリソースは個体レベルでの保存が求められているものがある。これらのリソースについては「基盤技術整備プログラム」等を活用することにより、早期に冷凍保存等による保存を可能とするよう技術開発を急ぐべきである。
バイオリソースの保存システムのコストとメリット／デメリット
保存方法
室温

購入コスト
－

運転費
－

メリット
・利便性大
・スペースがあれば
OK

冷蔵庫
700ℓ

700ℓ
79 万円

3.5 万円/台/年
23,000 本/台
1.5 円/本/年

・利便性大

19

デメリット
・凍結乾燥できるものだけ
・定期的生存確認必要・長期保存不可・定期的生存確認必要冷凍庫（-20℃）

500ℓ
42 万円

5 万円/台/年
15,500 本/台
3.2 円/本/年

・利便性大超低温槽（-80℃～-155℃）
5～10 年毎更新必要

700ℓ
240 万円＋エアコン

30 万円/台/年
23,000 本/台
13 円/本/年・比較的長期間の安全保存が可能・利便性大液体窒素タンク(-197 ℃ 、 気 相-150℃)
15 年以上更新必要無し

430ℓタンク
350 万円

16～20 万円/台/年
12,000 本/台
13～16 円/本/年・長期間の安全保存が可能
・停電に強い(液相：2～3 週間、気相：1
週間)

・停電（～24 時間以内）
・長期保存不可・定期的生存確認必要・停電（～24 時間以内）
・消費電力：大・定期的生存確認必要（2 年～7 年で生存確認が必要）
・エアコン必要・停電（～24 時間以内）
・従事者の安全確保
・初期投資必要（外部タンク、配管、専用保管室）（理研 BRC 調べ）

第３ まとめバイオリソースはライフサイエンス研究におけるロジスティクスである。これが本報告書の基本ス
タンスである。ロジスティクスという点ではデータベースやリサーチツールなど研究基盤全体がそれを構成するが、バイオリソースは「生もの」特有の課題がある。本報告書ではそういった課題を中心にバイオリソースの整備戦略をまとめたが、以下にポイントを列挙した。
バイオリソースに重要な点は何よりも「質」である。再現性が確保され安心して使えるものを提供することが必須である。加えて、「よく使われる」ということも重要である。このためには研究コミュニ
ティがリソース機関と一体となって何を収集すべきか保存すべきか、研究分野の動向とともに戦略的に検討する必要がある。
そして継続性である。生き物である以上、一度絶えたら復元はできない。高品質のバイオリソー
ス整備を継続する体制が必須である。このためには財政支援の継続体制が必須であるし、さらに重要なことは人材の継続性である。この点でも研究コミュニティの関与が極めて重要である。
加えて今後、新たなリソース開発が重要である。NBRP が収集保存提供に焦点を絞ることは妥当であるが、先導性、国際競争・協力の観点から、どこかで新たなリソース開発が行えることが必要である。このためには国としての戦略性が必要であるとともに、研究コミュニティにおける十分な議論が必須である。
評価の視点については十分吟味される必要がある。ロジスティクスである以上、バイオリソース
事業はうまく進んでいれば意識されないし、意識されるのは問題が起きた時、というのが宿命であ20る。長期的な視点とともに見えにくい努力の扱いなどきめ細かい評価が必要である。さらに言えば究極の評価者はユーザーである研究コミュニティである。PDCA サイクルのすべてにわたって研究
コミュニティの責任ある関与が極めて重要である。
今回の東日本大震災の教訓は大きい。「一度絶えれば二度と復元できない」と枕詞のように言ってきたバイオリソースであるが、停電等により喪失の危機に瀕し、ごく一部ではあるが失われてしまった。バックアップの重要性を改めて思い知らされたところである。平時には無駄と言われかねないバックアップであるが、限られた資源の中でどこまで整備できるのか、バイオリソースが復旧・復興の必須な礎であるだけにまさに戦略が必要である。

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付属資料１
第 5 期科学技術・学術審議会研究計画・評価分科会
ライフサイエンス委員会バイオリソース整備戦略作業部会 委員名簿
（50 音順）飯島貞代

三菱化学株式会社三菱化学フェローヘルスケア企画室部長

漆原秀子

筑波大学大学院生命環境科学研究科教授

岡田清孝

自然科学研究機構基礎生物学研究所長

小幡裕一

理化学研究所筑波研究所バイオリソースセンター長

甲斐

知惠子 東京大学医科学研究所教授

笠井

文絵

国立環境研究所生物圏環境研究領域微生物生態研究室長

勝木元也

自然科学研究機構理事

河瀨眞琴

農業生物資源研究所ジーンバンク長

◎ 小原

雄治

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所長

城石俊彦

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所系統生物研究センター教授

鈴木

健一朗 製品評価技術基盤機構バイオテクノロジー本部参事官

田畑哲之

財団法人かずさＤＮＡ研究所副所長

増井徹

医薬基盤研究所難病・疾患資源研究部長

◎主査

22

付属資料２
第 6 期科学技術・学術審議会研究計画・評価分科会
ライフサイエンス委員会バイオリソース整備戦略作業部会 委員名簿
（50 音順）飯島貞代

三菱化学株式会社三菱化学フェローヘルスケア企画室部長

漆原秀子

筑波大学大学院生命環境科学研究科教授

岡田清孝

自然科学研究機構基礎生物学研究所長

小幡裕一

理化学研究所筑波研究所バイオリソースセンター長

甲斐

知惠子 東京大学医科学研究所教授

笠井

文絵

国立環境研究所生物圏環境研究領域微生物生態研究室長

勝木元也

自然科学研究機構理事

河瀨眞琴

農業生物資源研究所ジーンバンク長

◎ 小原

雄治

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所長

城石俊彦

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所系統生物研究センター教授

鈴木

健一朗 製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター参事官

田畑哲之

財団法人かずさＤＮＡ研究所副所長

増井徹

医薬基盤研究所難病・疾患資源研究部長

◎主査

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付属資料３
バイオリソース整備戦略作業部会における審議の経過
第1回
日時：平成 21 年 11 月 24 日（火） 15：00－17：00
議題：１．ナショナルバイオリソースプロジェクトの概要について
２．ライフサイエンス委員会での審議状況について
３．我が国のバイオリソース整備のあり方について
４．その他

第2回
日時：平成 22 年 2 月 10 日（水） 15：00－17：00
議題：１．ナショナルバイオリソースプロジェクト中間評価結果について
２．ＮＢＲＰ中核機関等におけるリソースの整備について（バイオリソースの整備の現状と課題に関するアンケート①とりまとめ結果）

第3回
日時：平成 22 年 3 月 10 日（水） 15：00－17：00
議題：１．「NBRP 中核機関等への支援方法」、「新たなバイオリソース開発の必要性」、「提供のあり方」について（バイオリソース整備の現状と課題に関するアンケート②とりまとめ結果）
２．その他

第4回
日時：平成 22 年 4 月 21 日（水） 15：00－17：00
議題：１．ライフサイエンス研究に必要な新たなバイオリソースについて
２．これまでの意見のまとめ

第5回
日時：平成 22 年 5 月 20 日（木） 10：00－12：00
議題：１．今後のバイオリソース整備のあり方について（取りまとめ）（原案）
第6回
日時：平成 22 年 6 月 24 日（木） 10：00－12：00
議題：１．今後の検討の進め方について
２．バイオリソースの分類に応じた方向性と評価について
３．今後のバイオリソース整備のあり方について（報告書）（案）について

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第7回
日時：平成 22 年 11 月 26 日（金） 13：00－15：00
議題：１．個別リソースからのヒアリング実施について
２．今後の議論の進め方について
３．その他

第8回
日時：平成 23 年 1 月 28 日（金） 10：00－12：00
議題：１．各リソースの現状と展望について
２．今後の進め方について
３．その他

第9回
日時：平成 23 年 4 月 20 日（水） 14：00－16：00
議題：１．部会長及び部会長代理の選任について
２．議事運営について
３．今後のバイオリソース整備のあり方について（骨子）（案）について４．その他

第 10 回
日時：平成 23 年 5 月 12 日（木） 14：00－16：00
議題：１．今後のバイオリソース整備のあり方について（案）
２．その他

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附属資料４NBRP実施機関一覧（１）中核的拠点整備プログラム
代表／
分担

リソース

マウス

機関名

課題管理者

代表

理化学研究所

吉木淳

代表

京都大学

芹川忠夫

分担

理化学研究所吉木淳

代表

京都工芸繊維大学

山本雅敏

分担

情報・システム研究機構

上田龍

分担

愛媛大学

和多田正義

分担

杏林大学

松田宗男

代表

東京女子医科大学

三谷 昌平

代表

広島大学

矢尾板芳郎

分担

東京大学

浅島誠

代表

九州大学

伴野豊

分担

東京大学

嶋田透

分担

信州大学

梶浦善太

分担

農業生物資源研究所

瀬筒秀樹

代表

自然科学研究機構

成瀬清

分担

新潟大学

酒泉満

代表

理化学研究所岡本仁

分担

情報・システム研究機構

川上浩一

分担

自然科学研究機構

東島眞一

代表

自然科学研究機構

伊佐正

分担

京都大学

岡本宗裕

代表

筑波大学

稲葉一男

分担

京都大学

佐藤ゆたか

分担

東京大学

赤坂甲治

代表

理化学研究所小林正智

代表

情報・システム研究機構

倉田のり

分担

九州大学

佐藤光

分担

名古屋大学

北野英己

分担

東京大学

長戸康郎

代表

京都大学

遠藤隆

分担

横浜市立大学

荻原保成

代表

岡山大学

佐藤和広

代表

国立環境研究所

笠井文絵

分担

神戸大学

川井浩史

分担

筑波大学

井上勲

代表

広島大学

草場信

代表

九州大学

仁田坂英二

分担

自然科学研究機構

星野敦

ラット

ショウジョウバエ

線虫
ネッタイツメガエル

カイコ

メダカ

ゼブラフィッシュ

ニホンザル

カタユウレイボヤ・ニッポンウミシダ

シロイヌナズナ

イネ

コムギ
オオムギ

藻類

広義キク属
アサガオ
26

代表

宮崎大学

明石良

分担

北海道大学

阿部純

分担

日本大学

青木俊夫

分担

佐賀大学

穴井豊昭

代表

筑波大学

江面浩

分担

かずさディー・エヌ・エー研究所

小田原真樹

代表

筑波大学

漆原秀子

分担

産業技術総合研究所

上田太郎

代表

千葉大学

亀井克彦

分担

大阪大学

堀井俊宏

分担

岐阜大学

江崎孝行

分担

長崎大学

平山謙二

代表

理化学研究所大熊盛也

代表

情報・システム研究機構

仁木宏典

分担

九州大学

片山勉

代表

大阪市立大学

中村太郎

分担

大阪大学

金子嘉信

遺伝子材料

代表

理化学研究所小幡裕一

ヒトＥＳ細胞

代表

京都大学

中辻憲夫

ヒト・動物細胞代表

理化学研究所中村幸夫

代表

情報・システム研究機構

山崎由紀子

分担

東京大学

吉川泰弘

分担

京都大学

松沢哲郎

分担

国立科学博物館

松浦啓一

代表

奈良先端科学技術大学院大学

石田靖雅

代表

理化学研究所

吉木淳

分担

京都大学

芹川忠夫

分担

熊本大学

中潟直己

ショウジョウバエ系統の長期安定保存技術の開発

代表

京都工芸繊維大学

山本雅敏

メダカ遺伝子機能解析汎用系統の開発

代表

自然科学研究機構

田中実

遺伝子資源の長期保存に関する基盤整備技術の開発

代表

理化学研究所

小林正智

代表

京都大学

芹川忠夫

分担

麻布獣医学園柏崎直巳

代表

奈良先端科学技術大学院大学

石田靖雅

ミヤコグサ・ダイズ

トマト

細胞性粘菌

病原微生物

一般微生物
原核生物（大腸菌・枯草菌）

酵母（２）情報センター整備プログラム

情報センター（３）基盤技術整備プログラム
平成19年度～平成20年度

NMD抑制に基づく新しい遺伝子破壊法

実験動物マウス及びラットリソースの輸送システムの開発

平成19年度～平成21年度

平成22年度～平成23年度

ラット精子に関する基盤技術の整備
条件的遺伝子改変ES細胞株の量産とデータベース化

27

（４）ゲノム情報等整備プログラム
平成19年度代表

自然科学研究機構

成瀬清

分担

情報・システム研究機構

小原雄治

代表

情報・システム研究機構

上田龍

分担

京都工芸繊維大学

山本雅敏

分担

愛媛大学

和多田正義

分担

杏林大学

松田宗男

新たなシロイヌナズナリソースとしてのThellungiella halophila の代表
完全長ｃＤＮＡ全長配列解析

理化学研究所小林正智

代表

横浜市立大学

荻原保成

分担

理化学研究所

河合純

代表

京都大学

芹川忠夫

分担

情報・システム研究機構

藤山秋佐夫

代表

自然科学研究機構

成瀬清

分担

情報・システム研究機構

藤山秋佐夫

マイクロトム完全長ｃDNA配列解読によるトマトリソースの高付加代表価値化

かずさディー・エヌ・エー研究所

青木考

マウスC57BL/6N亜系統のBACエンドシークエンス

代表

理化学研究所吉木淳

メダカ完全長cDNAリソースの整備

代表

自然科学研究機構

成瀬清

パンコムギ完全長cDNAリソースに基づいたコムギ系統間SNPs
代表の整備

横浜市立大学

荻原保成

マイクロトムBACエンドシークエンス

代表

筑波大学

浅水恵理香

代表

理化学研究所吉木淳

分担

情報・システム研究機構

豊田敦

代表

かずさディー・エヌ・エー研究所

青木考

分担

情報・システム研究機構

豊田敦

代表

自然科学研究機構

伊佐正

分担

情報・システム研究機構

豊田敦

代表

自然科学研究機構

成瀬清

分担

情報・システム研究機構

豊田敦

メダカ完全長ｃＤＮＡリソースの整備

ショウジョウバエ系統の品質管理にむけたゲノム・特性情報整備

パンコムギ完全長ｃＤＮＡリソースの整備
平成20年度ラットLE/StmのBACエンドシークエンス

メダカ完全長cDNAリソースの整備

平成21年度

平成22年度
マウスC57BL/6N亜系統のBACエンドシークエンスの完成

マイクロトムゲノム配列解読

ニホンザルゲノム解析

メダカ近交系リシークエンスによるゲノム多型情報の整備

28

付属資料５

バイオリソース戦略整備に係るヒアリング調査の概要＝実験動物＝＝実験植物＝＝微生物・細胞等＝

実験動物マウス....................... 1

シロイヌナズナ ..................... 33

細胞性粘菌.......................... 62

ラット............................... 4

イネ ............................... 36

病原微生物.......................... 64

ショウジョウバエ..................... 7

コムギ ............................. 39

一般微生物.......................... 68

線虫................................ 10

オオムギ ........................... 42

原核生物(大腸菌・枯草菌) ............ 72

ネッタイツメガエル .................. 12

藻類 ............................... 46

酵母................................ 75

カイコ.............................. 16

広義キク属 ......................... 49

遺伝子材料.......................... 78

メダカ.............................. 19

アサガオ ........................... 52

ヒトＥＳ細胞........................ 81

ゼブラフィッシュ.................... 22

ミヤコグサ・ダイズ ................. 55

ヒト・動物細胞...................... 84

ニホンザル.......................... 25

トマト ............................. 58

カタユウレイボヤ・ニッポンウミシダ .. 29

29

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 実験動物マウス
代表機関（課題管理者氏名） 理化学研究所バイオリソースセンター（吉木 淳）

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長 米川 博通

Ⅰ
第２期開始時の設定目標※１（平成１９年度の申請時に設定したもの）

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成２４年度頃）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①我が国の重点分野の研究により開発され ①世界第2のマウスリソースセンターとなり、 2001年、理研はオールジャパンの研究の発 ①ヒト及び哺乳類の最も優れたモデル動物とた先導的モデルを中心に収集・保存・提供 2,800名のユーザー登録、4,113系統を収集・ 展に資することを目的とし、バイオリソースセ してマウスを収集・保存・品質管理し、利用者
ンター（BRC)を設置した。実験動物（マウし、質および量において世界最高水準のマ 保存し、6,700件の高品質マウスを国内外の目的に最適な高品質なマウス系統と最新
533機関に提供し、質・量において世界最高 ス）、実験植物（シロイヌナズナ）の基盤整備 の関連情報を提供して研究コミュニティを牽
ウスリソースを実現する。
を新たに開始するとともに、既存の遺伝子材 引し、ライフサイエンス研究における優れた成水準となった。
料と細胞材料を対象に含めた。BRCの設立１ 果の創出に貢献する。
②高度な微生物検査および遺伝検査を施し ②寄託マウスの微生物汚染を除去し、遺伝 年後に開始されたNBRPに中核機関として参 ②我が国で開発されたマウス系統と付随情てマウスの品質を高め、特性情報の充実に 子および遺伝背景検査による品質管理を施 加することにより、本事業が追い風を受け、 報、利用者の成果ならびに関連技術の世界
よる付加価値向上を進める。
すとともに特性と表現型情報の付加を実施し 大学等の研究者の認知度も高まり、ナショナ への発信拠点となる。世界のマウスリソース
ルセンターとしての位置付けを確固たるもの のアジアにおける流通拠点としてアジア地域
た。
とできた。
の利用者の利便性を向上する。
③ホームページの内容充実と定期的更新に ③系統の特性情報、微生物検査書、遺伝検 【具体的状況の変化の内容】③マウスリソース事業における法令遵守と知よりウェブサイトからの情報発信を強化し、 査プロトコールの更新を毎月実施し、優れた的財産の適切な取り扱いに取り組み、国内外①欧米による全遺伝子ノックアウトプロジェク の研究コミュニティを先導する。
系統をホームページより紹介し、メール利用の促進をはかる。
ニュースの送付を行い、利用促進をはかっ トは2012年に完了する。ノックアウトES細胞は既に世界中の研究者が利用可能となってた。
いる。次期プロジェクトとして国際マウス表現 【研究コミュニティの状況】【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
型解析コンソーシアムIMPCが2011年から10①ヒトの病気を克服し健康増進に必要な研究①マウスはヒトのモデル動物として健康の理 ①利用者と提供数は年々増加し、高品質か年計画で、ゲノム解読の集大成として、「哺乳を分子レベルで進めるためには、近交系が整解と病気の克服のための実験研究に益々利 つ学術価値の高いマウス系統の普及により
類遺伝子機能の百科事典」をマウスモデル
利用者による質の高い論文成果が生まれ備され、ゲノム情報が利用でき、遺伝子操作用され、利用者が拡大した。
により創る。BRCはIMPCから活動実績を認た。
も可能なマウスが今後も優れた実験材料としめられ、参加要請を受け、参加を検討中であて必要不可欠である。
る。アジアにおいては各国が日本を猛追して②知財権の所在と品質の確かなマウスリ②理研BRCからMTAを用いて知財権の所在 バイオリソースの整備を急いでおり、我が国 ②利用者は基礎生物学の幅広い分野に広がソースを用いて、再現性の高い実験を実施 と使用条件を明確にした高品質なマウス系 が国際的に埋没してしまいかねない状況と り、ゲノム機能研究および疾患の遺伝的研究を推進し、その先導的知見を基礎から医療へする必要がある。
統を入手して良い成果が得られた。また、開 なっている。
の応用と創薬研究に橋渡しする。
発系統を寄託して知財権と品質が確保された。
③激増するマウスリソースの維持・保存は個 ③国のリソース中核機関に開発した系統を ②昨今の財政状況及び事業仕分けにより、 ③次代の研究に必要なより質の高いリソース
別研究者には益々大きな負担となり、貴重な 寄託することにより、国内で開発された系統 科学への投資の削減、研究活動の萎縮、研 を開発・研究し、優れた成果を収め、作出したリソースが常に霧散、消失、海外流出の危 は利活用可能になり、研究者の系統維持や 究基盤の縮小が発生しないように留意すべ 系統はリソース機関へ集約する。
分与の負担が解消され、国内外の共同研究 き状況となっている。
険に曝されている。
機会が増加した。
30

1

③本事業が円滑に展開するに伴い、認知度【到達度の評価事項と目標】
も上昇し、正のサイクルが回り始め、寄託と提供が急激に増加している。
（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）（項目と客観的指標）④科学技術基本計画、知的基盤整備計画①リソースの開発段階から国内外の情報を収①組織特異的Cre発現マウスの収集や、生 ①我が国で開発されたiPS関連系統、 可視
物機能の可視化モデルの収集に力を入れ、 化モデル、TETマウスおよびCreマウスを含 等、国の施策にバイオリソースの重要性が明 集・把握し、学術価値の高い優れた系統を収国際的にも独創性の高いリソースセンターと む先導的遺伝子操作系統ならびにENU誘発 記されている。特に、近々制定される予定の 集し、マウスリソースの集約機関としての機能する。
ヒト疾患モデルなど累計4,113系統を収集し 第4期科学技術基本計画においても明記され を果たす。収集数：200系統/年*、保存数：
6000を目標とする。*大型プロジェクトからのた。利用者は年々増え、質の高い論文成果 ることが本事業には極めて重要である。
寄託は除く
が生まれた。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】② 高度な微生物検査、遺伝検査、その他の ②寄託マウスの微生物汚染を除去し、遺伝特性情報を付加して高品質マウスを保存、 子操作系統の導入遺伝子の間違いと情報の不備を是正して高品質化し、動物実験の提供する。
質向上に貢献した。表現型などの特性情報も付加した。

⑤生物多様性条約、名古屋議定書により、 ②微生物学的および遺伝学的な品質管理を
バイオリソースの学術目的の利用が失速しな 施し、表現型、ゲノム、遺伝子発現等の情報
いように留意するとともに、我が国の資源・資 を加えて付加価値の高いリソースを提供する。
産を確保する必要がある。

③マウス胚・精子の凍結保存を推進し、長期 ③2,000系統を凍結胚・精子として保存し、危 【事業の継続性】
保存ストックを確立する。
険分散、長期安全保存のため播磨研究所の （該当する□内に「レ」を記入）
バックアップ施設に一部を移管した。

③研究コミュニティと密に連携して、研究ニーズに即応した優れたリソースを提供する。提供数2800件/年を達成目標とする。

④特性情報の内容充実を積極的に進め、④各系統の特性情報および微生物検査書、 ①事業実施担当者の継続性
ウェブサイトからの情報発信の強化を図る。 遺伝検査情報を毎月更新し、優れた系統を■後継者等あり □後継者等なしの紹介記事をホームページより発信し、メー②後継者の人材育成状況
ルニュースの送付を行った。さらに、国際■順調に育成中 □後継人材がいない
データベースへの登録により世界への発信を実施した。
⑤世界的に要望の高い近交系由来ES細胞 ⑤NBRP基盤技術開発により整備されたジー ③組織的な支援体制■整っている。 □支援体制がない。
について細胞材料開発室と協力して収集す ントラップES細胞713ラインや近交系る。
C57BL/6N等のマウスES細胞、iPS細胞を細胞材料開発室と連携して整備した。
【特記事項】④我が国独自の系統を整備し、世界に発信するとともに、他の系統は海外リソースとの連携により円滑に補完できる体制を構築する。
関連する国際連携への継続的な参加の有無が客観的な評価指標となる。

①現在のNBRPにはリソースの開発事業は含まれていない。研究戦略上リソースの整備が必要であるが、その開発が一般の科研費等で実施可能な規模を越える場合は、国として実施することが望まれる。

⑤事業の継続性の確保には利用者および一般国民の理解が不可欠であり、バイオリソー
スの重要性と研究成果の普及活動を継続的に実施する。さらに、高度技術の移転の為の技術研修を年1回以上開催する。

②リソースの開発整備から研究、そしてイノベーションと一気通貫に進展させるためには、国が実施する様々なプロジェクトと連携することが必要。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで③寄託マウスの清浄化繁殖施設は高品質化の為に重要な機能を担っているが築23年を経て老朽化が著しく改修等の措置が必要である。

※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
312

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：マウス
番号 分野 発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

1

7209

2010

NatureIto T, Kwon HY, Zimdahl B, Congdon KL, Blum J, Lento WE, Zhao
C, Lagoo A, Gerrard G, Foroni L, Goldman J, Goh H, Kim SH, Kim
DW, Chuah C, Oehler VG, Radich JP, Jordan CT, Reya T.

米デューク大学メディカルセンター、英Imperial College London、韓The Catholic University
Regulation of myeloid leukaemia by the cell-fateof Korea、新Singapore General Hospital、米Fred Hutchinson Cancer Research Center、米determinant Musashi.
University of Rochester School of Medicine

2

1201

2010

ScienceInoue K, Kohda T, Sugimoto M, Sado T, Ogonuki N, Matoba S,
理化学研究所、筑波大学、東京医科歯科大学、九州大学、岩手大学、蘭アムステルダム Impeding Xist Expression from the Active X Chromosome
Shiura H, Ikeda R, Mochida K, Fujii T, Sawai K, Otte AP, Tian XC,
大学、米コネチカット大学、東京大学
Improves Mouse Somatic Cell Nuclear Transfer.
Yang X, Ishino F, Abe K, Ogura A.

3

7304

2010

Stem Cells

Nakano-Doi A, Nakagomi T, Fujikawa M, Nakagomi N, Kubo S, Lu
S, Yoshikawa H, Soma T, Taguchi A, Matsuyama T.

兵庫医科大学、国立循環器病研究センター

Bone marrow mononuclear cells promote proliferation ofendogenous neural stem cells through vascular niches
after cerebral infarction.

4

7208

2010

Stem Cells

Araki R, Jincho Y, Hoki Y, Nakamura M, Tamura C, Ando S,
Kasama Y, Abe M.

放射線医学総合研究所、科学技術振興機構

Conversion of ancestral fibroblasts to induced
pluripotent stem cells.

5

7302

2009

6

7209

2009

7

1101

2009

8

1101

2009

Science

Imai T, Yamazaki T, Kobayakawa R, Kobayakawa K, Abe T, Suzuki
東京大学、理化学研究所、熊本大学
M, Sakano H.

Pre-Target Axon Sorting Establishes the Neural Map
Topography

9

7203

2008

Cell Stem
Cell

Lindsley RC, Gill JG, Murphy TL, Langer EM, Cai M, Mashayekhi
M, Wang W, Niwa N, Nerbonne JM, Kyba M, Murphy KM.

米ワシントン大学、米テキサスサウスウエスタン大学

Mesp1 coordinately regulates cardiovascular fate
restriction and epithelial-mesenchymal transition indifferentiating ESCs.

10

5805

2008

Circ. Res.

Phillips HM, Hildreth V, Peat JD, Murdoch JN, Kobayashi K,
Chaudhry B, Henderson DJ.

英ニューキャッスル大学、福島医科大学

Non–Cell-Autonomous Roles for the Planar Cell Polarity
Gene Vangl2 in Development of the Coronary Circulation

11

6909

2008

Diabetes

Dogusan Z, García M, Flamez D, Alexopoulou L, Goldman M,
Gysemans C, Mathieu C, Libert C, Eizirik DL, Rasschaert J.

Double-stranded RNA induces pancreatic beta-cell
白Libre de Bruxelles大学、仏Université de la Mediterranée、白Universitaire Ziekenhuizen
apoptosis by activation of the toll-like receptor 3 andGasthuisberg O&N, 白Katholieke Universiteit Leuven、白VIB Ghent University
interferon regulatory factor 3 pathways.

12

1101

2008

NeuronMatsuda S, Miura E, Matsuda K, Kakegawa W, Kohda K, Watanabe
慶應義塾大学、北海道大学
M, Yuzaki M.

13

6902

2007

Miyata K, Yasukawa T, Fukuda M, Takeuchi T, Yamazaki K,
Cell Death
Sakumi K, Tamamori-Adachi M, Ohnishi Y, Ohtsuki Y, Nakabeppu 高知大学、東京医科歯科大学、九州大学、（財）微生物化学研究所
Differ.
Y, Kitajima S, Onishi S, Aso T.

14

5805

2007

Circ. Res.

Distinct roles of autophagy in the heart during ischemia
Matsui Y, Takagi H, Qu X, Abdellatif M, Sakoda H, Asano T, Levine 米ニュージャージー医科歯科大学、米テキサスサウスウエスタン大学、東京大学、広島大
and reperfusion: roles of AMP-activated protein kinase
B, Sadoshima J.
学
and Beclin 1 in mediating autophagy

15

5806

2007

Dev. Cell

Niwa Y, Masamizu Y, Liu T, Nakayama R, Deng CX, Kageyama R.

京都大学、科学技術振興機構、理化学研究所、米NIH

The Initiation and Propagation of Hes7 Oscillation Are
Cooperatively Regulated by Fgf and Notch Signaling in
the Somite Segmentation Clock.

16

5805

2007

Nat.
Medicine

Nakai A, Yamaguchi O, Takeda T, Higuchi Y, Hikoso S, Taniike M,
Omiya S, Mizote I, Matsumura Y, Asahi M, Nishida K, Hori M,
Mizushima N, Otsu K.

大阪大学、東京都臨床医学総合研究所、東京医科歯科大学、科学技術振興機構

The role of autophagy in cardiomyocytes in the basal
state and in response to hemodynamic stress.

17

7406

2007

Nat.
Methods

Nakao K, Morita R, Saji Y, Ishida K, Tomita Y, Ogawa M, Saitoh M,
東京理科大学、大阪大学
Tomooka Y, Tsuji T.

18

1101

2007

NatureFimia GM, Stoykova A, Romagnoli A, Giunta L, Di Bartolomeo S,
Nardacci R, Corazzari M, Fuoco C, Ucar A, Schwartz P, Gruss P,
Piacentini M, Chowdhury K, Cecconi F.

19

1201

2007

Proc. Natl.
Honda A, Hirose M, Hara K, Matoba S, Inoue K, Miki H, Hiura H,
Acad. Sci.
Kanatsu-Shinohara M, Kanai Y, Kono T, Shinohara T, Ogura A.
USA

20

6912

2007

Science

Mareninova OA, Hermann K, French SW, O'Konski MS, Pandol SJ,
Impaired autophagic flux mediates acinar cell vacuole
米カリフォルニア大学、米Digestive Health Physicians、米ハウスイヤー研究所、米ノース
Webster P, Erickson AH, Katunuma N, Gorelick FS, Gukovsky I,
formation and trypsinogen activation in rodent models of
カロライナ大学、徳島文理大学、米イエール大学
Gukovskaya AS.
acute pancreatitis.
Randall V, McCue K, Roberts C, Kyriakopoulou V, Beddow S,
英Institute of Child Health、米テキサスA&M健康科学センター、英Wellcome Trust Sanger
J. Clin.
Great vessel development requires biallelic expression of
Barrett AN, Vitelli F, Prescott K, Shaw-Smith C, Devriendt K,
Institute、白Catholic University of Leuven、英キングスカレッジロンドン、伊Telethon
Invest.
Chd7 and Tbx1 in pharyngeal ectoderm in mice.
Bosman E, Steffes G, Steel KP, Simrick S, Basson MA, Illingworth Institute of Genetics and Medicine、伊Universita’ degli Studi di Salerno
E, Scambler PJ.
Progressive Purkinje Cell Degeneration in tambaleante
Mashimo T, Hadjebi O, Amair-Pinedo F, Tsurumi T, Langa F,
PLoS Genet.
京都大学、仏パスツール研究所、西バルセロナ大学、西Miguel Hernández 大学
Mutant Mice Is a Consequence of a Missense Mutation in
Serikawa T, Sotelo C, Guénet JL, Rosa JL.
HERC1 E3 Ubiquitin Ligase
J. Clin.
Invest.

Lee HK, Lund JM, Ramanathan B, Mizushima N, Iwasaki A.

Accumulation of AMPA receptors in autophagosomes inneuronal axons lacking adaptor protein AP-4.
Induction of apoptosis and cellular senescence in micelacking transcription elongation factor, Elongin A

The development of a bioengineered organ germ method.

伊National Institute for Infectious Diseases IRCCS ‘L. Spallanzani’、独Max Planck
Institute of Biophysical Chemistry、伊Dulbecco Telethon Institute at the Department of
Biology、伊University of Rome Tor Vergata、伊IRCCS Fondazione Santa Lucia、独University of Göttingen

Ambra1 regulates autophagy and development of thenervous system.

理化学研究所、東京大学、東京農業大学、京都大学

Isolation, characterization, and in vitro and in vivo
differentiation of putative thecal stem cells.

米イエール大学、東京医科歯科大学、科学技術振興機構

Autophagy-dependent viral recognition by plasmacytoid
dendritic cells.

32

3バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

ラット

代表機関（課題管理者氏名）

京都大学（芹川忠夫）

分担機関（課題管理者氏名）

理化学研究所（吉木 淳）

運営委員長

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

森 政之

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ
※１

Ⅲ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

Ⅳ
リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 24 年度頃）
（平成16年度の申請時に設定したもの）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】① 世界最高水準のリソースセンターと ① リソースの収集・保有数は世界最大 ラットは疾患モデルとしてひろく用いられてお ① ラットリソースセンターを創設し、その中して認識されている。
であり、ラットの研究者にとって必要不可 り、重要なモデル生物として認識されていた。 に、現在のNBRP-Rat（ラット系統の収集・
しかし、国内にリソースセンターは存在せず、 保存・提供）を担う部門をおく。
欠のプロジェクトに成長した。
個々の研究者が個別にリソースを維持していた。そのため、研究者の退職等により、貴重なリソースが消滅、散逸する場合がたびたびあった。
② 収集リソースに対して研究推進に必 ② 系統の特性情報、ゲノム情報を着実② 上記ラットリソースセンター内に、以下
要な系統情報を付加する。
の3部門をおく。但し、これらの部門はに蓄積し、それらを公開している。
NBRP-Ratの事業費以外の資金で運営す【具体的状況の変化の内容】
る。
③ ラットの研究資源としての地位を高 ③ ラットリサーチリソース研究会の開催 ① NBRP-Rat事業が推進され、ラットリソー ラットリソースの開発部門
やデータベースの公開を通して、コミュニ スの消滅、散逸がなくなった。
める。
ラットリソースの利用部門
ティの活性化、拡大に努めている。
ラットの研究部門② NBRP-Rat事業により、遺伝学的品質、微生物学的品質の保証されたラット系統が利用可能になった。

【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】① NBRP-Ratを世界最高水準のリソー ① NBRP-Ratを世界最高水準のラットリ ③ ENUミュータジェネシス法、ZFN法による ① ラットを用いた研究計画の立案と実施
遺伝子改変法が確立された。
ソースセンターとして認識している。
には、NBRP-Ratの情報やリソースに、さらスセンターとして認識している。
に依存する。
② 日欧米の研究者の連携によるコミュ ② Nature Genetics 誌でラット特集号を ④ SNPマーカーの整備により、ラット個体間 ② NBRP-Ratに対して高度に安定した運発行した。
のゲノムの詳細な比較が可能となった。
ニティの活性化
営を求める。
③ 遺伝子改変ラット作製技術の確立③ ENUミュータジェネシス法、ジンクフィ ⑤ ES細胞、iPS細胞の樹立により、遺伝子 ③ 新規リソースの利用拡大を求める。
ンガーヌークレース（ZFNs)法などによる 改変ラット作製が可能となった。
遺伝子改変ラット作製技術が確立されている。

【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）

33【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）

4

① 目標：世界最高水準のリソースセン ① リソースの収集・保有数は世界最大 ①事業実施担当者の継続性☑後継者等あり □後継者等なし
規模となった。2008年5月号の Nature
ターとしての地位を確立する。
指標：ラットリソースの世界拠点として Genetics 誌のラット特集号において、ラットリソースの世界拠点としてNBRP位置付けられている。
Ratの名前を挙げられた。

① 目標：コミュニティからの信頼をさらに高める。
指標：収集数と提供数の増加② 目標：新しい遺伝子改変技術による新規リソースを収集する。
指標：ENUミュータジェネシス凍結精子の寄託数が増加する。

② ENUミュータジェネシス凍結精子の ②後継者の人材育成状況☑順調に育成中 □後継人材がいない
寄託数は順調に増加し、平成19年度500
検体、平成20年度2370検体、平成21年度（9月末まで）1536検体である。

③ 目標：第1期で整備できた収集・保存・提供事業をさらに充実させる。
指標：ラット近交系の寄託数、胚、精子での保存数、提供数が安定的に増加している。

③ 収集数は順調に増加しており、平成 ③組織的な支援体制③ 目標：ラットを用いた研究を迅速に推進☑整っている。 □支援体制がない。
19年度は73件、平成20年度は51件、平する。
成21年度（9月末まで）は17件である。
指標：実験供試動物としてのリソース提胚および精子での保存数は順調に増加 【特記事項】
供しており、平成19年度は、6848個の胚、 NBRPの安定的な継続や発展には、国からの継続的な予算配当が不可欠である。
（実験供試動物とは、投与や採材といった動物
3415ストロー分の精子を保存した。平成
万一、NBRP-Rat事業がなくなると、これまで多大
20年度は9250個の胚、3129ストロー分 な労力を費やし収集・保存されたラットリソース系 実験に実際利用する動物をいう。一般的な動精子を保存した。平成21年度（9月末ま 統（約600系統）が消滅する。そして、これら系統 物実験では、性別や週齢を揃えた一定数の実験供試動物を準備する。これまで、NBRP-Rat
で）は1705個の胚、616ストロー分の精子 の提供が途絶える。
では、提供先での繁殖を前提とした種動物の分を保存している。
NBRP-Ratから提供されたラット系統を用いた研 与を行ってきた。そのため、研究者は実験供試
提供数は安定しており、平成19年度122 究は、国際的に高い評価を受け、世界のトップ
動物を準備するために、多大な労力と時間、経件、平成20年度95件、平成21年度（9月 ジャーナルに掲載されてきた。また、NBRP-Ratは 費をかけてきた。NBRP-Ratから民間業者が扱
世界最高水準のラットリソースセンターとして、す わない特殊なRatを実験供試動物として研究者
末まで）47件である。

② 目標：ラット胚、精子の保存をより高い
技術レベルで推進する。
指標：体外受精法や精子のフリーズドラ
イ法による保存法の改良

でに国際的に認知されている。
からの希望数を提供することができれば、研究
すなわち、NBRP-Rat事業がなくなるということ者は直ちに実験が開始でき研究が迅速に進むは、日本だけではなく海外の研究者の期待を裏上、繁殖のための経費や時間を節約できる。）
切ることであり、ラットを用いた医学生物学研究の推進を大幅に妨げる。

俯瞰的、長期的にみれば、NBRP-Ratは費用対 ④ 目標：新しく開発された有用なラットリ効果が極めて高い。
ソースの収集・保存・提供を行う。
というのは、NBRP-Ratを利用した方が、研究者
指標：多様な高品質のラットリソースのが自前で準備するよりも、実験に実際用いる「実 安定的な収集・保存・提供
験供試動物」を低コストかつ短時間で準備できるからである。
例えば、日本の研究者が雄の実験供試用ラットを⑤ 目標：コミュニティに最新研究成果に ⑤ ラットリサーチリソース研究会を、毎 50頭揃える場合、NBRP-Ratから種動物のみを提関する情報提供、情報交換の場を提供 年開催した。第1回は平成20年1月に開 供され個人で繁殖させるとすると、期間は約1年
催し、参加者は69名。第2回は平成21年 かかる。その費用は、ラットの飼育装置などを設する。
備する必要があるので、約2,000万円である。一指標：ラットリソースリサーチ研究会を 1月に開催し、参加者は86名であった。 方、NBRP-Ratから提供する場合は、期間が10ヶ定期的に開催する。
月、費用はわずか40万円である。
このように、NBRP-Ratから「実験供試動物」を提供することで、研究者は系統の飼育に関わる経費、時間、手間から解放され、迅速に研究を進め【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） ることができる。

④ 目標：リソースに高い付加価値を与える。
指標：特性情報やゲノム情報の付加された系統が増加する。

④ 109項目からなる特性情報が付加された系統は総計で203となった。機能多型のジェノタイピングが実施された系統は総計で155となった。

・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
34

5

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：
番号
分野

ラット
発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

Yan et al.

広島大学

Voltage-dependent calcium channel abnormalities in hippocampal CA3 neurons of spontaneously epileptic rats

1

1103

2007

Epilepsia

2

6913

2007

Transplantation

Nakano et al.

Chang Gung 医科大学
（台湾）

3

6913

2007

Genomics

Kose et al.

徳島大学

Maturational arrest of thymocyte development is caused by a deletion in the receptor-like protein tyrosine
phosphatase kappa gene in LEC rats.

4

7402

2007

Cell Tissue Res

Osawa et al.

新潟大学

Rat wct mutation induces a hypo-mineralization form of amelogenesis imperfecta and cyst formation in molar
teeth.

5

1201

2008

Physiol Genomics

Voigt et al.

京都大学

Evaluation of LEXF/FXLE rat recombinant inbred strains for the genetic dissection of complex traits.

6

7203

2008

Hypertens Res

Wang et al.

島根大学

Sympathetic regulation of the renal functions in rats reciprocally congenic for chromosome 1 blood pressure
quantitative trait locus.

7

5806

2008

Mol Cell Biochem

Seki et al.

群馬大学

Abnormalities of vertebral formation and Hox expression in congenital kyphoscoliotic rats.

8

5705

2008

Exp Neurol

Mochizuki et al.

東京薬科大学

9

5701

2008

Nat Genet

Saar et al.

10

7205

2008

Nat Genet

Behmoaras et al.

11

1201

2008

Nat Genet

Aitman et al.

12

5804

2008

Nat Genet

Mashimo et al.

京都大学

13

5806

2008

Stem Cells

Ishikane et al.

国立循環器病センター

Allogeneic injection of fetal membrane-derived mesenchymal stem cells induces therapeutic angiogenesis in a
rat model of hind limb ischemia.

14

7208

2008

Comp Med

Tsuchida et al.

埼玉医科大学

Phenotypic characterization of the Komeda miniature rat Ishikawa, an animal model of dwarfism caused by amutation in Prkg2.

15

5701

2008

Physiol Genomics

Kuramoto et al.

京都大学

Functional polymorphisms in inbred rat strains and their allele frequencies in commercially available outbred
stocks.

16

6905

2009

Neurochem Res

Wang et al.

New Jersey Medical
School（米国）

17

7203

2009

Hypertension

Iigaya et al.

慶応大学

Relation of blood pressure quantitative trait locus on rat chromosome 1 to hyperactivity of rostral
ventrolateral medulla.

18

5806

2009

Transgenic Res

Hirabayashi et al.

生理学研究所

Availability of subfertile transgenic rats expressing the c-myc gene as recipients for spermatogonialtransplantation.

19

1201

2009

Cancer Sci

Yoshimi et al.

京都大学

Enhanced colitis-associated colon carcinogenesis in a novel Apc mutant rat.

20

7207

2009

Exp AnimMori et al.

信州大学

Hereditarypancreatitis model WBN/Kob rat strain has a unique haplotype in the Pdwk1 region on chromosome
35
67.

Experimental and clinical significance of anti-nuclear antibodies in liver transplantation.

Injection of neural progenitor cells improved learning and memory dysfunction after cerebral ischemia.

マックス・プランク研究所
SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat.
（ドイツ）
Imperial College School ofJund is a determinant of macrophage activation and is associated with glomerulonephritis susceptibility.
Medicine（イギリス）
Imperial College School of
Progress and prospects in rat genetics: a community view.
Medicine（イギリス）
An ENU-induced mutant archive for gene targeting in rats.

Myelin Lipid Abnormalities in the Aspartoacylase-Deficient Tremor Rat.

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 ショウジョウバエ
代表機関（課題管理者氏名） 京都工芸繊維大学（山本雅敏）

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） 情報・システム研究機構（上田龍），愛媛大学（和多田正義），杏林大学(松田宗男)
運営委員長 多羽田哲也
Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】① 重要なリソース機関として国際的な ① 世界最高水準のリソース機関となっている。
認知を得る。
② 世界最大系統数を維持し、提供する。

②目標を上回って充分達成している。

③ リソースとしての高品質化と付加価値 ③ 順調に進んでいる。
の向上を目指す。
【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】① 外国のリソース機関に依存しない国 ① 質量ともに世界に誇れる最高水準。
内リソースの維持及び国際的持合いシ
ステムが研究コミュニティに高く評価される。
② 提供を受けたリソースによる優れた研 ② 謝辞記載の徹底が必要である。
究がなされる。
③ 有用なリソースの収集と提供を国際 ③リソース機関が系統の受入れを継続するために予算面での改善が必要。
規模で展開する。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】（項目※２と客観的指標）① 目標：世界最大規模のリソース。
指標：維持数が世界最大規模。

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 ３４年度頃）【NBRP開始時の状況】【具体的目標】・使用するリソースの多くを米国のリソー ① 質、量ともに世界最高水準のリソース機関として研究者に安心と信頼を与えス機関に依存していた。
・有用なリソースは研究者の個別維持、 る。
管理、配布を行うか、米国や我国のリ② 安定的・長期保存技術を開発し駆使
ソース機関からの譲渡依頼に対応。
する事で、特別な機能を有するリソース
・研究者間で自由な無料配布と第三者 機関とする。
譲渡等が行われていた。
【具体的状況の変化の内容】① 科学先進国における基礎研究用リ③リソースの維持・繁殖の分野で高い評
ソースの囲い込みの兆候が見られる。 価を得る研究機関とする。
②知的財産権の意識が向上し、従来の自由な配布等により明確なリソース情報【研究コミュニティの状況】
が必要となってきた。
③広範な研究分野での利用が増加し、リ ① 世界の研究コミュニティが安定的にリソース機関の永続性がコミュニティから ソース供給を受けられる。外国リソース
強く要望される。
機関と補完的関係を築く。
④専門性を有する人材の育成と活用法 ② 世界的に優れた高品質研究用リソーの重要性が認識されてきた。
スを研究コミュニティに提供する。
⑤動物愛護法に触れない事から、応用 ③研究コミュニティの協力で先端的重要
研究前の研究用リソースとして有用価値 リソースの開発し、研究成果を受入れが急上昇している。
る。

【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】（項目と客観的指標）① 目標：世界最大規模のリソース。
①事業実施担当者の継続性
指標：系統維持数は41,516（アメリカ☑後継者等あり □後継者等なし
合衆国で28,800)で最大であり、現在も増大している。

36【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）① 目標：世界最大規模のリソース。
指標：維持数と提供数が世界最大規模。

7

② 目標：世界の研究者から信頼とサ② 目標：世界的に認知される。
②後継者の人材育成状況
指標：世界への系統提供数が47,520☑順調に育成中 □後継人材がいな ポートを受ける規模にする。
指標：品質と情報の正確さ、それに基系統と国際的認知度が高く、アメリカ合 い
づく迅速な提供とフィードバックによる系
衆国の系統センターと重要な約5,000系
統情報の検討。さらに、保存DNAリソー
統を共通で維持するなど国際的センター
スを用いた形質転換体の作成による提として機能している。
供体制システムの構築。
③ 目標：多様な研究分野に対応できるリ③ 目標：リソースの重要度が向上する。 ③ 目標：リソースの重要度が向上する。 ③組織的な支援体制
指標：有用系統の利用者数と利用系
指標：リソースを利用した研究成果が☑整っている。 □支援体制がない。 ソースを維持する。
統数は増加したが、論文内での謝辞記
指標：基礎生物学研究だけでなく、医増加する。
載がさらに充実する必要がある。
学、農学、薬学関連の研究に全提供系
統数の3割をしめるほど、疾病、薬理、生理代謝研究等への利用を増加させる。
② 目標：世界的に認知される。
指標：世界各国から提供依頼がある。

④ 目標：品質、付加価値が向上する。
④ 目標：品質、付加価値が向上する。 ④ 目標：品質、付加価値が向上する。 【特記事項】
指標：系統情報としてのデータベース
指標：モニタリングによる品質の確認 生物学研究で、その材料の出所は極めて重要
指標：系統の品質管理ならびにデー
な研究情報である。その記載を必ず行なわれるよが徹底している。また改良データベース う、各学会所属の評議員や雑誌編集者に理解を 等の改良とプロテオームデータの追加、タベース等の充実。
(www.DGRC.jp)の提供など、系統情報が 求め、その徹底を図ることを国内科学誌がまず率 さらに国際的データベースを運営する。
充実している。
先して行なうなど、実行が求められる。
⑤ 目標：研究コミュニティのニーズに応える。
指標：提供系統数の増加とともに受入れ系統数の増加。

ショウジョウバエの凍結保存は不可能であるか、 ⑤ 目標：保存技術の開発研究を行う。
⑤ 目標：研究コミュニティのニーズに応非常に困難である。しかしながら、予算の低減化、指標：遺伝子導入によるGMOセンえる。
維持系統数の拡大、人為的系統汚染の排除は必指標：国内の研究成果を新規系統と 須である。この目的に向け、下記新技術の導入を ター（仮称）や、低温飼育による低コスト化、さらにロボテックスの応用など先駆して、また重要系統を海外研究室から受 目指した研究・開発が急務である。
入れるなど、研究者の希望や意見等を １。DNAの保存により、遺伝子導入系統(GMO系 的リソース機関とする。
運営委員会で審議し各種ニーズに応え 統）を作成提供する技術。
２。一世代の期間を数倍に長期化する低温におけている。
る継代飼育の実用化技術。
３。ロボテックスを駆使した継代飼育技術。
上の技術開発と応用を目指すために、GMOセンター（仮称）用プレハブ飼育用恒温室とインジェク
ション装置（倒立顕微鏡、マニピュレーター、ガラス
針作製機、気象制御装置付き恒温飼育室）が必要である。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

37

8

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： ショウジョウバエ
番号 分野 発行年
雑誌名

著者名

所属

タイトル

Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Brazil

Sex-specific methylation in Drosophila: an investigation of theSophophora subgenus

Universite de Bordeaux, France

What the loss of the hormone neuroparsin in the melanogaster
subgroup of Drosophila can tell us about its function

1

5804

2010

2

5705

2010

3

5804

2010

PLoS One

Funakoshi Y, Negishi Y, Gergen JP, Seino J, Ishii K, Lennarz WJ, 理化学研究所, Stony Brook University, USA, 群馬大学, 科学技術振興機 Evidence for an Essential Deglycosylation-Independent Activity
Matsuo I, Ito Y, Taniguchi N, Suzuki T
構(ERATO), 大阪大学, 科学技術振興機構(CREST)of PNGase in Drosophila melanogaster

4

1103

2010

Science

Gong Z, Liu J, Guo X, Zhou Y, Teng Y, Liu L

Chinese Academy of Sciences, People's Republic of China

Two Pairs of Neurons in the Central Brain Control Drosophila
Innate Light Preference

5

5705

2009

Curr Biol

Babcock DT, Landry C, Galko MJ

University of Texas, USA

Cytokine Signaling Mediates UV-Induced Nociceptive
Sensitization in Drosophila Larvae

6

5806

2009

Devel Biol

Gompel N, Prud'homme B

CNRS UMR, France

The causes of repeated genetic evolution

7

5701

2009

Genes Cells

Fujiyama-Nakamura S, Ito S, Sawatsubashi S, Yamauchi Y,
Suzuki E, Tanabe M, Kimura S, Murata T, Isobe T, Takeyama K-I, 東京大学, 科学技術振興機構(ERATO), 首都大学東京
Kato S

BTB protein, dKLHL18?CG3571, serves as an adaptor subunit
for a dCul3 ubiquitin ligase complex

8

5701

2009

Heredity

Kageyama D, Anbutsu H, Shimada M, Fukatsu T

東京大学

Effects of host genotype against the expression of spiroplasmainduced male killing in Drosophila melanogaster

9

6913

2009

J Immunol

Hashimoto Y, Tabuchi Y, Sakurai K, Kutsuna M, Kurokawa K,
Awasaki T, Sekimizu K, Nakanishi Y, Shiratsuchi A

金沢大学, 東京大学, University of Massachusetts Medical School, USA

Identification of Lipoteichoic Acid as a Ligand for Draper in the
Phagocytosis of Staphylococcus aureus by Drosophila Hemocyte

10

5705

2009

PLoS Genet

Dubruille R, Murad A, Rosbash M, Emery P

University of Massachusetts Medical School, USA, Howard Hughes
Medical Institute, USA

A Constant Light-Genetic Screen Identifies KISMET as aRegulator of Circadian Photoresponses

11

2301

2009

PLoS OneArsham AM, Neufeld TP

University of Minnesota, USA

A Genetic Screen in Drosophila Reveals Novel Cytoprotective
Functions of the Autophagy-Lysosome Pathway

12

6913

2009

PLoS Pathog Gendrin M, Welchman DP, Poidevin M, Herve M, Lemaitre B

Global Health Institute, EPFL, Switzerland, Centre de Genetique
Moleculaire (CGM), CNRS, France, Universite Paris-sud, Orsay, FranceLong-Range Activation of Systemic Immunity throughPeptidoglycan Diffusion in Drosophila

13

5806

2008

Devel Biol

東京大学

Larval cells become imaginal cells under the control ofhomothorax prior to metamorphosis in the Drosophila tracheal
system

14

5806

2008

Development Savla U, Benes J, Zhang J, Jones RS.

Southern Methodist University, USA

Recruitment of Drosophila Polycomb-group proteins by
Polycomblike, a component of a novel protein complex in larvae

15

5807

2008

Genetics

Ng CS, Hamilton AM, Frank A, Barmina O, Kopp A

University of California, USA

Genetic basis of sex-specific color pattern variation in
Drosophila malerkotliana

16

5702

2008

Mol EcolSchug, M.D., Baines, J.F., Killon-Atwood, A., Mohanty, S., Das, A.,
University of North Carolina Greensboro, USA
Grath, S., Smith, S.G., Zargham, S., McEvey, S.F., Stephan, W.

Evolution of mating isolation between populations of Drosophila
ananassae

17

1103

2008

NatureSprecher SG, Desplan C

New York University, USA

Switch of rhodopsin expression in terminally differentiatedDrosophila sensory neurons

18

1102

2008

California Institute of Technology, USA

Human ApoD, an apolipoprotein up-regulated inneurodegenerative diseases, extends lifespan and increases
stress resistance in Drosophila

19

5807

2007

Genetics

Low WY, Ng HL, Morton CJ, Parker MW, Batterham P, Robin C

University of Melbourne, Australia

Molecular Evolution of Glutathione S-Transferases in the Genus
Drosophila

20

5805

2007

Nat Cell Biol

Kondo T, Hashimoto Y, Kato K, Inagaki S, Hayashi S, Kageyama
Y.

奈良先端科学技術大学院大学

Small peptide regulators of actin-based cell morphogenesis
encoded by a polycistronic mRNA

Genetica

D'Avila, MF, Garcia RN, Panzera Y, Valente VLS

Insect Biochem
Veenstra JA
Mol Biol

Sato M, Kitada Y, Tabata T

Proc Natl Acad
Muffat J, Walker DW, Benzer S.
Sci USA

38

9

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名 線虫

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名） 東京女子医科大学（三谷昌平）

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長 飯野雄一

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成33年度頃）（平成16年度の申請時に設定したもの）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①2010年に世界最高のバイオリソースを整 ①単独機関で世界最高のバイオリソースを 日本と米国、カナダで全コミュニティーの1/3ず ①コミュニティー全体で、他生物の相同遺伝子
備

整備

つ分担して変異体の収集〜供給を行うこととし②研究コミュニティーの変異体の半数以上 ②中核機関が公開欠失変異体の半数を占 た。
【具体的状況の変化の内容】
取得
める③コミュニティー全体で7000〜8000の変異 ③コミュニティー全体で7000程度の変異体 ①平成22年9月末で、日本は、半数強の貢献（約12000）全ての変異体を確保②NBRPで、総計9,000〜100,00アリルの収集③年間1,000件の提供数を維持する

体【目標とした研究コミュニティの状況】①欠失変異体は２割弱しか存在しない②平成21年、成果不足で米国は予算延長せず【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①欠失変異体は全遺伝子の３割程度に増 ③平成21年7月に米国は新規収集を休止 ①提供された変異体を用いて線虫遺伝子機能の
加

研究が充実

②NBRPに対して毎日のように新規リクエスト②分譲依頼数が増えてNBRPが認知されて ④平成22年夏、米国とカナダは変異体供給停 ②線虫遺伝子機能解析がライフサイエンス全体③米国とカナダに同様の事業ありいる

止③米国とカナダの事業が休止⑤平成22年時点でコミュニティーのリクエストは継続 ③研究成果が成熟し、線虫と他の実験系を併用に波及効果する研究者が大半となる。

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①平成24年3月までに2,400アリルの欠 ①平成21年9月までに1,158アリルの収 ①事業実施担当者の継続性
レ後継者等あり □後継者等なし
集を行った。
失変異体を追加収集する。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①平成33年度末時点で、9,000アリル以上の変異体の収集を行う。さらに変異体の収集が必要な遺伝子のリストを作成し、その後の収集計画を立てる。
②平成33年度末時点で、9,000アリル以上の変異②平成24年３月までに2,400アリルの追 ②平成21年9月までに1,158アリルの追 ②後継者の人材育成状況
体の保存を行う。さらに変異体の保存が必要な遺レ順調に育成中 □後継人材がいない
加保存を行う。
加保存を行った。
伝子のリストを作成し、その後の保存計画を立てる。
③平成33年度末時点で、コミュニティー全体で、③平成24年3月までに、5,000件の提供 ③平成21年9月までに、3513件の提供 ③組織的な支援体制
12,000遺伝子の変異体を公開し、追加変異体のレ整っている。 □支援体制がない。
を行った。
を行う。
必要な遺伝子のリストを作成して、運営委員会と一緒に将来計画を見直す。
④NBRP線虫中核機関で1000件／年以上の提供
全般的に順調に推移している。外国グ【特記事項】④国内学会で展示を行い、周知を図る。 ④毎年分子生物学会等での実物付き展示を行
ループが成果不足で脱落したので、日本が世界全体 を維持する。
い、国内での活動の周知を行っている。
をサポートする必要が出てきた。もし、追加支援がい⑤シンポジウム等を行い、周知を図る。 ⑤平成20年に東京女子医科大学にて、国際シ ただける場合があれば、Applied Biosystems 3500 ⑤平成33年度末時点で、NBRPで提供した変異体を使った論文が総計1,000編以上公表されており、ンポジウムを開催した。
シーケンサー（約1,700万円）があると、欠失部位の解アクティブに研究活動に継続使用されている。
析が加速すると思われる。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

39

10

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：線虫
番号
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20

分野

発行年

雑誌名

1102

2007 Cell

6902

2007 Cell

6906

2007 Nature

5805

2007 Nature

1103

2008 Science

6902

2008 Science

5804

2008 Nature

1103

2008 Cell

5705

2008 Nature

5805

2008 Cell1103

2009 Nature

5804

2009 Cell

5805

2009 Nature

6903

2009 Science6903

2009 Nature

1102

2009 Science5805

2009 Cell

6902

2010 Science

6913

2010 Nature

5804

2010 Science

著者名
所属
タイトル
Vanhoven MK, Fetter
An Innexin-Dependent Cell Network Establishes Left-Right Neuronal
RD, Verselis VK and Rockefeller大学
Asymmetry in C elegans.
Askew YS, Naviglia
An intracellular serpin regulates necrosis by inhibiting the induction and
TL, Askew DJ, Nobar Pittsburgh小児病院 sequelae of lysosomal injury.
Petrascheck M, Ye Fred Hutchinson 癌
X, Buck LB
研究所
An antidepressant that extends lifespan in adult Caenorhabditis elegans.
Kato Y, Sato K, Sato
M, Takeda N, Ozono 群馬大学
The Rab8 GTPase regulates apical protein localization in intestinal cells.
Bacaj T, Tevlin M, Lu
Y, Shaham S
Rockefeller大学
Glia are essential for sensory organ function in C. elegans.
R, Lu DD, Maurer
Memorial SloanCeramide biogenesis is required for radiation-induced apoptosis in the
CW, HaimovitzKettering癌研究所 germ line of C. elegans.
MD, Pan Q, Ruvkun
Trans-splicing in C. elegans generates the negative RNAi regulator ERIG
Harvard大学
6/7.
JM, Conery AL,
The microRNA miR-1 regulates a MEF-2-dependent retrograde signal at
Thompson-Peer KL, Harvard大学
neuromuscular junctions.
F, Ajredini R,
A blend of small molecules regulates both mating and development in
Zachariah C, Alborn California工科大学 Caenorhabditis elegans.
Yang Y, Tong C, Lin
The amyotrophic lateral sclerosis 8 protein VAPB is cleaved, secreted,
YQ, Mohan K,
Baylor医科大学
and acts as a ligand for Eph receptors.
Flames N, Hobert O Columbia大学
Gene regulatory logic of dopamine neuron differentiation.
Boag PR, Blackwell
TK, Ambros V
Masacchusetts大学 nhl-2 Modulates microRNA activity in Caenorhabditis elegans.
Bucher T, Brost R,
Ubiquitin-related modifier Urm1 acts as a sulphur carrier in thiolation of
Costanzo M, Schmidt Zurich工科大学
eukaryotic transfer RNA.
Gentina S, Epstein S,
Riezman I, Fornallaz- Geneva大学
Protection of C. elegans from anoxia by HYL-2 ceramide synthase.
Caenorhabditis elegans dauers need LKB1/AMPK to ration lipid reserves
Narbonne P, Roy R McGill大学
and ensure long-term survival.
Patel MR, Shen K
Z, Yang P, Tian E,
Zhang K, Zhao Y, Li
Zhang K, Wang B,
Gao Z, Jian Y, Qi X,
Richardson CE,
Kooistra T, Kim DH
McIlwraith MJ,
Martin JS, Ward JD,

Stanford大学
RSY-1 is a local inhibitor of presynaptic assembly in C..elegans.
北京生物科学研究 SEPA-1 mediates the specific recognition and degradation of P granule所
components by autophagy in C. elegans.
Retromer is required for apoptotic cell clearance by phagocytic receptor
中国科学技術院
recycling.
Masacchusetts工科 An essential role for XBP-1 in host protection against immune activation
大学
in C. elegans
London癌研究所

RTEL-1 enforces meiotic crossover interference and homeostasis.

40

11バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

ネッタイツメガエル

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名） 矢尾板芳郎

第２期申請時の区分

発展が見込まれるバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） 浅島 誠
運営委員長

上野 直人

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 ３０ 年度頃）
【NBRP開始時の状況】【具体的目標】第２期開始時にはゲノム塩基配列のド ①ネッタイツメガエルのリソースとして世ラフトがウェブ上で公表された。
界３大拠点の一つとなることを目標とする。
②コミュニティが要望するリソースを収 ②コミュニティの要望するネッタイツメガ②質・量共に長期安定した利用価値のエルの系統を収集・保存するという目標
集・保存する。
高いネッタイツメガエルの提供を可能に【具体的状況の変化の内容】
を達成できた。
し、個々の研究者の飼育などにかかる負担を減らして研究を著しく促進させる
リソースとなる。
③リソースを用いた実験操作法の改③必要とする研究者にネッタイツメガエ ③利用者の希望に応じて安定的に提供 ①ポストゲノム研究の発展
プロテオミクスを用いた解析やクロマチ 良、研究ツールの開発・提供を行い、情ルを確実に提供する。
できる体制を整えた。
ンの解析、RNA-シーケンスによる解析 報収集につとめ、利用しやすい状態でコなどへの利用が急速に拡大しつつあ
ミュニティに提供し、研究を加速させる。
る④内分泌撹乱物質などの化学物質毒②ターゲッティング法開発が始まる（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】①近交化のすすんだリソースを世界に ①皮膚移植で拒絶が起こらないリソー
スを提供できるようになった。
先駆けて提供する。

【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】

今後数年以内に標的遺伝子破壊法の技術が確立する可能性が高まった。

性試験などに利用されその標準化生物のリソースとなる（新しい社会ニーズへの対応）。

①リソースの利用成果を確実にフィード ①利用者は全てMTAを提出するように ③医療・産業応用への利用
バックする。
なった。
化学物質の応用のためのスクリーニン 【研究コミュニティの状況】
グに利用されるようになった。
②ネッタイツメガエルの利用に関して輸 ②リソースの輸送に関しての受益者負 ④比較ゲノム学研究の発展送に係る費用の受益者負担を理解す 担の必要性を認識した。（平成21年度中 調節領域の解析が進んでいるネッタイに完全に理解した。）
ツメガエルのモデル動物としての生物る。
学的意義が増した。

①コミュニティが研究上必要となった場
合に、必要なリソースを総合的に、かつ迅速に得られる状況になる。

③毎年、日本発生生物学会大会の会場 ⑤生物の進化の研究の発展②コミュニティが新たな研究への参入障③コミュニティでネッタイツメガエルのNBRPの活動報告会を開催する場を設 で日本ツメガエルの会の総会が開催さ ゲノム自体の倍数化が進化の大きな引 壁の低減され、最先端の研究に集中
れ、NBRPの活動報告の機会が与えら き金の一つになっていると考えられるよ し、提供されたリソースを用いて研究成定する。
れるようになった。
うになってきている。２倍体であるネッタ 果をあげることができるようになる。
イツメガエルを人為的に倍数化する研究が始まった。

41

12

【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】（項目※２と客観的指標）①目標：ネッタイツメガエルの近交化を押し進める。
指標：近親交配の数。
②目標：近交化の程度の目安となる方法を確立し、開発中の近交系に適用する。
指標：皮膚移植等の方法で近交化を調べる。

③上記のような研究環境を得た研究コ
ミュニティは、更なる研究の加速化を目指し、開発した高価値のリソースや情報（該当する□内に「レ」を記入）（項目と客観的指標）を共有していくために本事業に寄託し、その維持や提供に伴う労力や時間を節①安田系統は７世代、浅島系統は６世 ①事業実施担当者の継続性
約できる体制をもつことができ、更なる;後継者等あり □後継者等なし
代になっている。
研究の加速を行える環境を得ることが②安田系統において皮膚移植しても拒 ②後継者の人材育成状況できる。（研究成果の共有による更なる;順調に育成中 □後継人材がいない 研究の加速化）。
絶されないところまで近交化が進んだ。
臓器移植しても問題無いところまできている。
③研究者の要望に完璧に応え、必要数 ③組織的な支援体制;整っている。 □支援体制がない。
【到達度の評価事項と目標】
を提供している。
【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】③目標：国内でネッタイツメガエルを供 ④本事業ではネッタイツメガエルの主な 【特記事項】
給できるのは本事業しかないのために、 野生型の系統を全て集め、世界の有数 反省点として、付加価値の高める、研究（項目と客観的指標）
実験に必要とする数を研究者に提供す のネッタイツメガエルのセンターになって ツールリソースの提供が不十分な点がある。プロジェクト自体がカエルの提供
る。
いる。
指標：研究者が要望した数を提供できる ⑤提供したネッタイツメガエルを用いた にとどまっており、遺伝子のクローニン ①目標：世界的なリソース拠点として位研究成果が全くないの状態から年に数 グには資金不足であることである事から 置づけられる。
かどうか。
本の論文が国際誌に発表されるように 現在ではほとんど達成できていない。 指標：ネッタイツメガエルの世界の三大なった。
拠点の一つとして認知されること。
④目標：コミュニティが望むネッタイツメ
対策として、リソース自体（カエル）の付 ②目標：安定したリソースの提供を行
ガエルの主な系統を世界から集め、世指標：提供数、品質が安定し加価値（利用しやすい系統など）を高め う。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） ると共に基本的な実験操作法等のソフ ておりコミュニティの要望に十分に対応
界の有数のネッタイツメガエルのセンターになる。
ト面の普及をウェブなどを利用して進め していること。
る。また、コミュニティがリソースを通して
指標：ネッタイツメガエルの主な野生型
得た遺伝子や発現情報などを共有して ③目標：学術研究基盤としての重要性の系統を収集できるかどうか。
研究を加速させる。この第一歩としてす を高める。
でに初期発生に関わる遺伝子や研究に 指標：提供したリソースによる学術成果
・論文については２０報まで必須なマーカー遺伝子群を１００個程度 が国際的に発表され（論文数にして年はクローニングした。しかし遺伝子は３０ 間１０以上）、活用されていること。
０００個程度存在し、研究の加速を引き⑤目標：NBRP開始時には、全く新規の起こすためには全く不十分であるので、 ④目標：収集したリソースを確実に維持リソースであったネッタイツメガエルが学資金を投入することにより本格的に押し する。
指標：維持のための人材育成と組織的術研究の基盤として重要性が徐々に高進める。
支援体制が確立され、次世代のリソーまる。
スを支える研究者を機関ごとに養成していること。
⑤目標：コミュニティが必要としているリ指標：提供したリソースによる学術成果
ソースを提供する。
が徐々に増加する。
指標：満足度の高い付加価値をもったリソースを原則一週間以内に提供していること。
※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
42

13

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： ネッタイツメガエル
番号 分野 発行年
雑誌名

著者名

所属

タイトル

Nejigane S, Haramoto Y, Okuno
Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo
M, Takahashi S, Asashima M

The transcriptional coactivators Yap and TAZ are expressed during early Xenopus development.

1

5806

2010 Int. J. Dev. Biol.

2

5702

2010 Ecotoxicol Environ Saka M

3

6909

2010 Experimental Animal

4

5705

2010 PLoS One

5

5806

Fukuda M, Takahashi S,
2010 Int. J. Dev. Biol. Haramoto Y, Onuma Y, Kim YJ, Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo
Yeo CY, Ishiura S, Asashima M

Zygotic VegT is required for Xenopus paraxial mesoderm formation and is regulated by Nodal signaling andEomesodermin.

6

5702

Katsu Y, Taniguchi E,
Urushitani H, Miyagawa S,
Okazaki Institute for Integrative Bioscience, National Institute for2010 Gen Comp Endocrinol Takase M, Kubokawa K, Tooi O,
Basic Biology, National Institutes of Natural Sciences
Oka T, Santo N, Myburgh J,
Matsuno A, Iguchi T

Molecular cloning and characterization of ligand- and species-specificity of amphibian estrogen receptors.

7

5701

2010 Mol Genet Genomics Hikosaka A, Kawahara A.

Graduate School of Integrated Arts and Sciences, Hiroshima University,

A systematic search and classification of T2 family miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs)
in Xenopus tropicalis suggests the existence of recently active MITE subfamilies.

8

5805

2010 Cell

Levy DL, Heald R

Department of Molecular and Cell Biology, University of California

Nuclear size is regulated by importin α and Ntf2 in Xenopus

9

5702

2009 Ecotoxicol Environ

Oka T, Miyahara M, Yamamoto
J, Mitsui N, Fujii T, Tooi O, Okazaki Institute for Integrative Bioscience, National Institute for
Basic Biology, National Institutes of Natural Sciences
Kashiwagi K, Takase M,
Kashiwagi A, Iguchi T

10

5806

2009 Dev Growth Differ

Ogino H, Ochi H

Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science andTechnology

Resources and transgenesis techniques for functional genomics in Xenopus.

11

6913

2009 Immunogenetics

Oshiumi H, Suzuki Y,
Matsumoto M, Seya T

Graduate School of Medicine, Hokkaido University

Regulator of complement activation (RCA) gene cluster in Xenopus tropicalis.

12

5701

2008 Chromosome Res.

Uno Y, Nishida C, Yoshimoto
S, Ito M, Oshima Y, Yokoyama
S, Nakamura M, Matsuda Y

Graduate School of Life Science, Hokkaido University,

Diversity in the origins of sex chromosomes in anurans inferred from comparative mapping of sexual
differentiation genes for three species of the Raninae and Xenopodinae.

13

7401

2008 Dev. Dyn.

Kurosaka H, Takano-Yamamoto
T, Yamashiro T, Agata K

Graduate School of Science, Kyoto University

Comparison of Molecular and Cellular Events During Lower Jaw Regeneration of Newt (Cynops pyrrhogaster) andWest African Clawed Frog (Xenopus tropicalis).

14

5806

2008 Dev. Biol.

Hitachi K, Kondow A,Danno H,
Inui M, Uchiyama H, Asashima
M

Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo

Tbx6, Thylacine1, and E47 synergistically activate bowline expression in Xenopus somitogenesis

15

5806

2007 Dev Growth Differ.

Fujimoto K, Nakajima K,
Yaoita Y.

Institute for Amphibian Biology, Graduate School of Science, Hiroshima
University

Expression of matrix metalloproteinase genes in regressing or remodeling organs during amphibian
metamorphosis.

16

5701

2007 FEBS Lett

Shibano T, Takeda M, Suetake
I, Kawakami K, Asashima M,
Tajima S. Taira M

Graduate School of Science, The University of Tokyo

Recombinant Tol2 transposase with activity in Xenopus embryos.

17

5806

2007 Int J Dev Biol

Nitta K R, Takahashi S,
Haramoto Y, Fukuda M,
Tanegashima K, Onuma Y,
Asashima M

Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo

The N-terminus zinc finger domain of Xenopus SIP1 is important for neural induction, but not for
suppression of Xbra expression.

Kyoto Prefectural Institute of Public Health and Environment,

Acute toxicity of rice paddy herbicides simetryn, mefenacet, and thiobencarbto Silurana tropicalis tadpoles

Kashiwagi K, Kashiwagi A,
Kurabayashi A, Hanada H,
Nakajima K, Okada M, Takase
M, Yaoita Y

Institute for Amphibian Biology, Graduate School of Science, Hiroshima
University

Xenopus tropicalis: an ideal experimental animal in amphibia.

Kubo Y, Takeuchi T, Okano K,
Okano T

Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University

Cryptochrome genes are highly expressed in the ovary of the African clawed frog, Xenopus tropicalis.

43

Application of metamorphosis assay to a native Japanese amphibian species, Rana rugosa, for assessing
effects of thyroid system affecting chemicals.

14

18

5806

2007 Dev Genes Evol

Haramoto Y, Takahashi S,
Asashima M

Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo

Monomeric mature protein of Nodal-related 3 activates Xbra expression.

19

5701

2007 Mol Biol Evol.

Hikosaka A, Kawahara A.

Graduate School of Integrated Arts and Sciences, Hiroshima University,

Evolution of the Xenopus piggyBac Transposon Family TxpB: Domesticated and Untamed Strategies of Transposon
Subfamilies.

20

6902

2007 Biochim Biophys Act Takase M, Iguchi T

Institute for Amphibian Biology, Graduate School of Science, Hiroshima
University

Molecular cloning of two isoforms of Xenopus (Silurana) tropicalis estrogen receptor mRNA and theirexpression during development.

44

15

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

カイコ

代表機関（課題管理者氏名）第２期申請時の区分

国立大学法人九州大学（伴野 豊）

当該リソースの区分
発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
国立大学法人東京大学（嶋田 透）
国立大学法人信州大学（梶浦善太） 独立行政法人農業生物資源研究所（瀬筒秀樹）
運営委員長

国立大学法人琉球大学(前川秀彰)

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（達成年度：平成 30 年度頃）
研究動向の社会的変化等【NBRP開始時の状況】【具体的目標】凍結保存によるリソース保存体制は無く、 ① 凍結保存によるリソース維持システムを確立する。
また提供は春の一時期に限られていた。世界的連携が不十分な状況であった。
② 高い付加価値を持つリソースを周年提供する。
【具体的状況の変化の内容】③ 国際的なセンターとして関係者に認識さ ③ NBRP活動の認知度が進んだ。特に欧州 ① 動物愛護規制の強化により創薬開発で ③ 世界で最も信頼される拠点を形成する。
れる拠点となる。
から期待される拠点となっている。
利用が増えている（予想された以上）。
② ヨーロッパでリソース維持が困難になっている（予想をしていなかった）。
【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】① コミュニティが拡大している。
① 第１期は論文数が年平均で44報であった ③ 中国でのリソース基盤整備が急ピッチで ① 世界的な利用者協議会がNBRPが主体と進展している（予想された以上）。
なって形成されている。
が第２期では56報に増加している。
② 研究基盤としてNBRPが必要となってい ② MTAはほぼ100％で交換している。論文④ 薬学・医学・理学系関係者の利用が増加 ② 基礎・応用両面の利用者がリソースを必る。
要とする。
へのNBRP記載も進んでいる。
している（予想された以上）。
③ HP、ニュースレター、展示活動等からリ ③ HP、ニュースレター「おかいこさま」、展示 ⑤ 本事業で卵巣の凍結保存が予想以上の ③ 世界的に必要なリソースが寄託されてい等がリソース情報として活用されている。
進展をしている（予想された以上）。
ソース情報が共有されている。
る。
（平成21年９月現在）（平成16年度の申請時に設定したもの）【2010年に目標とした状況】【達成状況】① リソースを安定的・効率的に保存する方 ① 卵巣凍結保存によるリソースの保存が可能であることを見出した。
法を開発する。
② 高品質なリソースを周年提供する。
② 高品質なリソースを周年提供している。

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）① 目標： 長期保存技術を開発する。
① 目標： 卵巣凍結で、長期保存することが ①事業実施担当者の継続性□後継者等あり5後継者等なし
実用的に可能になりつつある。
指標： 保存方法の実効性。
指標： 成功率が10%であったが、50％までに大幅に上昇した。
② 目標： 季節に限定されない周年に亘るリ ② 目標： 目標とした1200件から1300件の年 ②後継者の人材育成状況□順調に育成中
5後継人材がいない
ソースの提供。
間に亘る供給を行った。

45【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）① 目標： 世界一の拠点として機能している。
指標： 世界一の拠点として位置付けられている。
② 目標： 凍結保存によるリソース維持が可能となっている。

16

指標： ユーザーのリクエストに対する対指標： 提供に応じることが出来なかった事
応状況。
例は１０件程度であった。
③ 目標： 世界のセンターとして多様なリ③ 目標： 突然変異系統、野蚕、ゲノムリソー ③組織的な支援体制□整っている。 5支援体制がない。
ソースを保存する。
スを目標通り保存した。
指標： リソースの保存数で世界をリード
指標： 突然変異系統926、野蚕系統71、クする。
ローン22万は世界最大数の保存。
【特記事項】④ 目標： 遺伝子組換カイコの保存。
④ 目標： 目標を達成した。

指標： 卵巣凍結保存は200系統／年を目標とし、最終的に2000系統の維持に用いる。精巣・精子凍結は技術開発を24年度まで行い、雄側ゲノムの保存体制も実用化を目指す。30年度には1000系統には摘要可能とする。

中核機関である九州大学は移転計画が進行している。移転場所が遠く、現在NBRP事業に使用 ③ 目標： 高品質、高付加価値のあるリソー
している施設、備品を移動するには費用が派生
スが周年に亘り提供されている。
⑤ 目標： 日本がリードして国際連携を進め ⑤ 目標： イタリア、フランスとリソース維持に するがその財源が確保できていない。老朽化した
指標： リソースの高品質化、付加情報の設備、備品等はケースによっては、新規に購入する。
ついて協力することで一致した。
充実度と100％近い提供状況。
る方が長期的には有利な面も多い。移転によって指標： 国際連携の進捗度。
指標： 欧州との連携が進展した。
④
目標：
事業の継続性が確立される。
NBRP活動に支障が生じない為の支援をお願いし
指標： 人材の育成が順調に進むと共にたい。

指標： 寄託、保存件数。

指標： ２０件／年を達成。

ポストが確保されている。
⑤ 目標： 国際連携を進め、リソースのバッ
クアップも国際的に行う。
指標： 連携国の増加。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

46

17

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： カイコ
番号 分野 発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

1

6803

2003

Nat Biotechnol.

Tomita M, Munetsuna H, Sato T, Adachi T, Hino R, Hayashi M, Shimizu K, Nakamura N, Tamura 科学技術振興事業団・広島県地域結集型共同研究事業、広島大学、農業
T, Yoshizato K.
生物資源研究所

2

5701

2010

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Liu C, Yamamoto K, Cheng TC, Kadono-Okuda K, Narukawa J, Liu SP, Han Y, Futahashi R,
西南大学、農業生物資源研究所、重慶大学、産業技術総合研究所、蚕業
Kidokoro K, Noda H, Kobayashi I, Tamura T, Ohnuma A, Banno Y, Dai FY, Xiang ZH, Goldsmith
技術研究所、九州大学、ロードアイランド大学
MR, Mita K, Xia QY.

Repression of tyrosine hydroxylase is responsible for the sex-linked chocolate mutation of
the silkworm, Bombyx mori.

3

5701

2010

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Daimon T, Hirayama C, Kanai M, Ruike Y, Meng Y, Kosegawa E, Nakamura M, Tsujimoto G,
Katsuma S, Shimada T.

東京大学、農業生物資源研究所、京都大学

The silkworm Green b locus encodes a quercetin 5-O-glucosyltransferase that produces
green cocoons with UV-shielding properties.

4

2301

2010

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

d'Alençon E, Sezutsu H, Legeai F, Permal E, Bernard-Samain S, Gimenez S, Gagneur C,
Cousserans F, Shimomura M, Brun-Barale A, Flutre T, Couloux A, East P, Gordon K, Mita K,
Quesneville H, Fournier P, Feyereisen R.

仏国立農学研究所、農業生物資源研究所、仏国立情報学自動制御研究
所、仏Genoscope、豪連邦科学産業研究機構

Extensive synteny conservation of holocentric chromosomes in Lepidoptera despite highrates of local genome rearrangements

5

5701

2008

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Ito K, Kidokoro K, Sezutsu H, Nohata J, Yamamoto K, Kobayashi I, Uchino K, Kalyebi A, Eguchi
農業生物資源研究所、東京大学
R, Hara W, Tamura T, Katsuma S, Shimada T, Mita K, Kadono-Okuda K.

Deletion of a gene encoding an amino acid transporter in the midgut membrane causes
resistance to a Bombyx parvo-like virus.

6

5701

2007

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Sakudoh T, Sezutsu H, Nakashima T, Kobayashi I, Fujimoto H, Uchino K, Banno Y, Iwano H,
Maekawa H, Tamura T, Kataoka H, Tsuchida K.

東京大学、農業生物資源研究所、日本大学、国立感染症研究所、九州大学

Carotenoid silk coloration is controlled by a carotenoid-binding protein, a product of the
Yellow blood gene.

7

6005

2006

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Ohnishi A, Hull JJ, Matsumoto S.

理化学研究所

Targeted disruption of genes in the Bombyx mori sex pheromone biosynthetic pathway.

8

6005

2005

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Tan A, Tanaka H, Tamura T, Shiotsuki T.

農業生物資源研究所

Precocious metamorphosis in transgenic silkworms overexpressing juvenile hormone
esterase.

9

2304

2005

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Miao XX, Xub SJ, Li MH, Li MW, Huang JH, Dai FY, Marino SW, Mills DR, Zeng P, Mita K, Jia
中国科学院、中国ヒトゲノムセンター、中国農業科学院、米ロードアイランド
SH, Zhang Y, Liu WB, Xiang H, Guo QH, Xu AY, Kong XY, Lin HX, Shi YZ, Lu G, Zhang X, Huang
大学、中国西南大学、農業生物資源研究所、中国バイオチップ工学セン
Simple sequence repeat-based consensus linkage map of Bombyx mori.
W, Yasukochi Y, Sugasaki T, Shimada T, Nagaraju J, Xiang ZH, Wang SY, Goldsmith MR, Lu C,
ター、東京大学、印DNAフィンガープリンティングセンター、中国復旦大学
Zhao GP, Huang YP.

10

2304

2003

Proc. Natl. Acad.
Sci. USA.

Mita K, Morimyo M, Okano K, Koike Y, Nohata J, Kawasaki H, Kadono-Okuda K, Yamamoto K,
Suzuki MG, Shimada T, Goldsmith MR, Maeda S.

11

2304

2010

Nucleic Acids Res. Duan J, Li R, Cheng D, Fan W, Zha X, Cheng T, Wu Y, Wang J, Mita K, Xiang Z, Xia Q.

12

5804

2006

Nucleic Acids Res. Kusakabe T.

13

6013

2006

Biomaterials

14

6005

2010

15

2304

16

Transgenic silkworms produce recombinant human type III procollagen in cocoons.

農業生物資源研究所、放射線医学総合研究所、理化学研究所、東京大学、宇都宮大学、米ロードアイランド大学

The construction of an EST database for Bombyx mori and its application.

中国西南大学、中国重慶大学、中国北京ゲノム研究所、農業生物資源研
究所

SilkDB v2.0: a platform for silkworm (Bombyx mori ) genome biology.

九州大学大学院、理化学研究所、東京大学

Role of the silkworm argonaute2 homolog gene in double-strand break repair ofextrachromosomal DNA.

Hino R, Tomita M, Yoshizato K.

広島県産業科学技術研究所、広島大学

The generation of germline transgenic silkworms for the production of biologically active
recombinant fusion proteins of fibroin and human basic fibroblast growth factor.

Development

Niwa R, Namiki T, Ito K, Shimada-Niwa Y, Kiuchi M, Kawaoka S, Kayukawa T, Banno Y,
Fujimoto Y, Shigenobu S, Kobayashi S, Shimada T, Katsuma S, Shinoda T.

筑波大学、農業生物資源研究所、東京大学、九州大学大学院、東京工業
大学、自然科学研究機構

Non-molting glossy/shroud encodes a short-chain dehydrogenase/reductase thatfunctions in the "Black Box" of the ecdysteroid biosynthesis pathway.

2008

Genome Biol.

Yamamoto K, Nohata J, Kadono-Okuda K, Narukawa J, Sasanuma M, Sasanuma S, Minami H,
Shimomura M, Suetsugu Y, Banno Y, Osoegawa K, de Jong PJ, Goldsmith MR, Mita K.

農業生物資源研究所、三菱スペースソフトウェア、九州大学、米小児病院
オークランド研究所、米ロードアイランド大学

A BAC-based integrated linkage map of the silkworm Bombyx mori.

5804

2008

Mol. Cell. Biol.

Suzuki MG, Imanishi S, Dohmae N, Nishimura T, Shimada T, Matsumoto S.

理化学研究所、農業生物資源研究所、東京大学

Establishment of a novel in vivo sex-specific splicing assay system to identify a transacting factor that negatively regulates splicing of Bmdsx female exons.

17

5701

2010

J. Biol. Chem.

Sakudoh T, Iizuka T, Narukawa J, Sezutsu H, Kobayashi I, Kuwazaki S, Banno Y, Kitamura A,
Sugiyama H, Takada N, Fujimoto H, Kadono-Okuda K, Mita K, Tamura T, Yamamoto K,
Tsuchida K.

国立感染症研究所、農業生物資源研究所、九州大学、富士化学工業株式 A CD36-related transmembrane protein is coordinated with an intracellular lipid-binding
会社
protein in selective carotenoid transport for cocoon coloration.

18

5701

2010

J. Biol. Chem.

Ito K, Katsuma S, Yamamoto K, Kadono-Okuda K, Mita K, Shimada T.

農業生物資源研究所、東京大学

Yellow-e determines the color pattern of larval head and tail spots of the silkworm,
Bombyx mori.

19

5701

2009

J. Biol. Chem.

Meng Y, Katsuma S, Daimon T, Banno Y, Uchino K, Sezutsu H, Tamura T, Mita K, Shimada T.

東京大学、九州大学、農業生物資源研究所

The silkworm mutant lemon (lemon lethal) is a potential insect model for human
Sepiapterin reductase deficiency.

20

5701

2008

J. Biol. Chem.

Daimon T, Taguchi T, Meng Y, Katsuma S, Mita K, Shimada T.

東京大学、農業生物資源研究所

Beta-fructofuranosidase genes of the silkworm, Bombyx mori: insights into enzymatic
adaptation of B. mori to toxic alkaloids in mulberry latex.

Tsukioka H, Takahashi M, Mon H, Okano K, Mita K, Shimada T, Lee JM, Kawaguchi Y, Koga K,

47

18

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名 メダカ

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名）基礎生物学研究所（成瀬 清）

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）新潟大学 （酒泉 満）
運営委員長 山下正兼 （北海道大学）

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ※１

中間評価時の達成状況

Ⅲ
NBRP事業に影響を及ぼす

Ⅳ
リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 27 年度頃）
【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】① リソースの収集・保存・提供事業の継続と品 ①基礎生物学研究所への集中化により ①ライブリソースとしてのメダカ自身と周辺のゲノ ①ユーザーのニーズをくみ上げ、幅広い分野をカ
組織が単純化し、よい効果が見え、着実 ム情報をうまく組み合わせて、コミュニティへの利 バーできる多様なリソースを保有し、迅速かつ安質確保
今後のメダカ研究に大きく貢献すると思われる な進捗が評価できる。検疫室が整備さ 便性を拡大することによって、潜在的価値を顕在 定的に提供できる体制を構築する。
のは地域集団、標準系統、近交系と遺伝子導入 れ、健康な系統の提供体制が確立され 化することができる。
②実施機関を研究所・大学の正式な組織として系統である。これらの系統はゲノム情報を利用し た。標準化した統一的なMTAが整備さ ②リソースの周辺情報を統合整備することで、リ センター化する。
ソースの価値が十分に活用できるようにし、収集・ ③メダカ生物機能情報のアノーテションを行い、た品質管理を行う。検疫体制を確立し、健康で品 れた。
提供事業の活性化を図ることができる。
質の保証された系統が提供できる体制を整える。
総合的に検索できるインフォメーションサーバー③これまでメダカを用いていなかった研究者に、そ を運用できる体制を構築する。
遺伝子導入系統の積極的な収集を試みる。統一の利便性を提示することで利用の拡大を図ること的なMTAを用意し、提供機関と開発者との間で提ができる。
供内容に関する MTAの標準化を検討する。
② 情報窓口の一本化とデータベース統合整備に ②集中化単純化がなされ研究体制は格段に進歩した。中核とサブ機関の連携もよる高度化
リソース情報中核機関と連携し、shigen と UT 強力である。バックアップ体制も整備されている。
genome Browserを基盤とした窓口の一本化とデータベースの統合整備を行なうことによって、利
③データベースの統合整備、広報啓発、 【具体的状況の変化の内容】【研究コミュニティの状況】
用者の利便性の向上をさらにはかる。
国際ネットワークの形成については大き ①メダカを用いた研究の裾野が次第に広がり、現 ①理学部系の研究者に加えて、医学・薬学分野な進捗が認められる。
在では、発生学・遺伝学・進化学などの基礎生物 の研究者との積極的に連携によって、メダカのも科学分野、毒性学・宇宙生物学・放射線生物学な つ形態的・生理的表現型について標準データが③コミニュティー代表者を含む運営委員会を代表 総評： ゼブラフィシュに匹敵するリソー どの環境学分野、水産学分野、ゲノム科学分野、 整備される 。
機関に設置しコミュニティーとの連携を深める。日 スに育ちつつある。メダカ自体は、我が 基礎医学分野などからのリソース要求がある。
②メダカを用いた研究が具体的にどこまでヒトに本が積極的に国際的なコミュニティーを先導する 国固有の魚類におけるバイオリソースで ②ほ乳類を用いた動物実験は3R's 応用可能かという点が明確にされる。
ため国際的ネットワークを構築し、ニュースレター あるから、世界最高水準のライフサイエ Replacement, Refinement and Reduction.の観点 ③マウス、ラットなどほ乳類のモデル動物を代発行、リソースの動向を見極めた国際会議開催、 ンス基盤といって差支えはない。世界で からますます制限を受け、利用する際にはその必 替・補完できるモデル動物としての認識が高ま唯一の研究用メダカ系統センターとして 然性を問われることになる。個体レベルの研究は り、メダカを用いた研究が日本国内だけでなく欧技術講習会の開催を行なう。
国際的な貢献を果たしている。日本発の 欠かすことはできないので、ほ乳類の代替実験系 州、米国、アジアの各国で、様々な分野で利用さ研究モデル生物として国際的に存在感 として魚類はますます重要になっていく。特にマウ れる。
④
を示している。
スやラットでは近交系の利用が動物実験の必須条 ほ乳類では解析が困難な行動や進化などのより件であるので、それを満たすことができる魚類は 高次の生命現象を分子レベルで解析することが現状ではメダカしかいない。
可能な実験系（迅速な単一染色体置換系統の作製法等）が提供され、量的形質など多因子性形
質のゲノム基盤が解明される。
⑤病態モデルを用いてtranslational researchを目指した研究がおこなわれるようになる。

【到達度の評価事項と目標】【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】（項目と客観的指標）

48

19項目①： リソースセンターとしての機能強化 指
標：オンラインMTA及びクレジットカードによる実費徴収による迅速な提供システムの構築①発生学、遺伝学等の基礎研究に加えてその知 ①メダカ変異体の原因遺伝子同定から見に基づいた疾患モデル研究を推進する。
ヒト遺伝病の原因遺伝子が同定されるなど疾患モデルの開発を見据えた研究が増加している。

項目②：リソースの維持管理機能の強化
指標：研究所・大学の正式な組織としてのセンター化による支援体制の確立②環境科学研究モデル 環境毒性学分野ではメ ②環境毒性学分野での標準化を進めるダカは魚類の中で唯一標準動物として国際的に ため遺伝的背景をそろえようという動き
認定されている。特に米国では環境毒性学分野 が日欧米で議論されはじめた。GFP蛍でかなり多用されているがメダカバイオリソースの 光遺伝子導入系統を用いた環境モニタ
収集配布を目的とした組織や中核機関は存在し リング及び化学物質の毒性試験が開始ない。個別研究を行っている研究者・研究機関と されている。
連携しネットワーク化することでそれらの研究を活性化する。

項目③：メダカ生物情報データベースの設置
指標：メダカゲノム機能アノーテションの充実（リファレンスゲノム情報のアップデート、近交系のゲノム情報の充実、個別系統に関する情報の充実、新規TILLINGライブラリーの作成を含む逆遺伝学的手法による変異体作製システムの構築）③行動や種分化など高次機能を解析する新たな ③行動や進化などより高次の生命現象を解析するシステムとしてメダカを用い研究が発展する。
る研究が次第に増加している。

項目⑤：国際ネットワークの構築
指標：メダカ利用に関する国際講習会の開催 メ
ダカを中心としたPI （principal investigator) 会議の主催 英文プロトコール集の改訂

項目④：世界的なリソース拠点の樹立
指標：国際的なリソース提供件数の順調な増加【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】（項目※２と客観的指標）
項目①項目①系統の遺伝的品質管理
指標：ゲノム情報に基づく品質管理を行う。

【事業の継続性】【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目と客観的指標）①事業実施担当者の継続性
項目①系統の遺伝的品質管理■後継者等あり □後継者等なし
指標：マイクロサテライト及びトランスポ
ゾン挿入位置による近交系の遺伝的モニタリング、原因遺伝子が明らかな突然
変異体及び遺伝子導入系統のPCRによるモニタリング体制の確立②後継者の人材育成状況
項目②検疫体制の整備
項目②検疫体制の整備■順調に育成中 □後継人材がいない
指標：検疫体制を整備し、健康面でも品質の保証 指標：検疫室の整備による品質管理体
制の強化された系統が提供できる体制を構築する③組織的な支援体制
項目③MTAの標準化
項目③MTAの標準化■整っている。 □支援体制がない。
指標：NBRP Medakaとして統一したMTA
指標：MTAの標準化をおこなう。
の整備④リソースの一元的管理と提供
項目④リソースの一元的管理と提供
事業実施担当者の継続性はある程度確保されて指標：メダカリソース提供窓口を統一するとともに 指標：新たにNBRP Medaka ウエッブサ いると考えている。管理者は一定レベルの見識を分散していたデータベースの統合と整備を行う。 イトを構築し、メダカバイオリソースを一 備え、NBRP課題管理者としてコミュニティから認元的に提供知されている必要があることから、適任者を実施
機関とコミュニティで共同して探す努力が必要であ
項目⑤運営委員会の設置と国際ネットワーク構 ⑤運営委員会の設置と国際ネットワーク る。リソースの提供では実施機関内の他の研究グ
築指標：国内ではコミュニティーを代表 構築
ループへの提供も事業として公式に認めていただ
する利用者委員会（運営委員会）を組織する。積 指標：コミュニティー代表としての運営委 きたい。教育機関への提供も研究機関への提供と極的に国際ネットワークを構築し、ニュースレター 員会を組織し、基礎生物学研究所の正 同様に評価していただきたい。維持している系統
式委員会として発足。英文マニュアルの の付加情報（遺伝子、表現型情報）を明確にしてさ発行・国際会議及び技術講習会を開催する。
発行。国際学会及び国際講習会の開 らなるリソース活用を促進したい。このリソースの催【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） 更なる発展のためにも、NBRPの更なる充実が必要である。
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
49

20

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：メダカ
番号 分野 発行年
雑誌名
PLoS Genet. 6(2)15806 2010 e1000844

著者名

所属

タイトル

Herpin A, Braasch I, Kraeussling M, Schmidt C,
Thoma EC, Nakamura S, Tanaka M, Schartl M.

University of Würzburg, Physiological Chemistry I, Biozentrum, Würzburg,
Germany

Transcriptional rewiring of the sex determining dmrt1 gene duplicate by transposable elements.

2

5705

2010

PLoS One.. ５（６） e11248

Imada H, Hoki M, Suehiro Y, Okuyama T,
Kurabayashi D, Shimada A, Naruse K, Takeda H,
Kubo T, Takeuchi H.

Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, The Universityof Tokyo, Tokyo, Japan.

Coordinated and cohesive movement of two small conspecific fish induced by eliciting a simultaneous
optomotor response.

3

5701

2010

Heredity.. 2010 104(2)
191-5

Kato M, Takehana Y, Sakaizumi M, Hamaguchi S.

Graduate School of Science and Technology, Niigata University, Niigata, Japan.

A sex-determining region on the Y chromosome controls the sex-reversal ratio in interspecific hybrids
between Oryzias curvinotus females and Oryzias latipes males

4

5806

2010

Dev Biol. 2010 340(1)30-40Taneda Y, Konno S, Makino S, Morioka M, Fukuda K, Department of Biological Information, Tokyo Institute of Technology, 4259
Imai Y, Kudo A, Kawakami A.
Nagatsuta, Midori-ku, Yokohama 226-8501, Japan.

5

5806

2010

Development. 137(11)1807-13

Inohaya K, Takano Y, Kudo A.

Department of Biological Information, Tokyo Institute of Technology, Midori-ku,
Yokohama 226-8501, Japan.

Production of Wnt4b by floor plate cells is essential for the segmental patterning of the vertebral column inmedaka.

6

5806

2010

Science. 328(5985)
1561-3

Nakamura S, Kobayashi K, Nishimura T, Higashijima
S, Tanaka M.

Laboratory of Molecular Genetics for Reproduction, National Institute for Basic
Biology, Okazaki 444-8787, Japan.

Identification of germline stem cells in the ovary of the teleost medaka.

7

1102

2010

Kuroyanagi Y, Okuyama T, Suehiro Y, Imada H,
Brain Res. 2010 1323 33Shimada A, Naruse K, Takeda H, Kubo T, Takeuchi
40
H.

Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, The Universityof Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan.

Proliferation zones in adult medaka (Oryzias latipes) brain.

8

5806

2009

Hepatology. 2009 Oct
22;51(3):1037-1045.

Department of Developmental and Regenerative Biology, Medical ResearchInstitute, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan.

Retinoic acid signaling positively regulates liver specification by inducing wnt2bb gene expression in medaka.

9

5701

2009

Sasaki S, Mello CC, Shimada A, Nakatani Y,
Science. 2009 323(5912) Hashimoto S, Ogawa M, Matsushima K, Gu SG,
401-4
Kasahara M, Ahsan B, Sasaki A, Saito T, Suzuki Y,
Sugano S, Kohara Y, Takeda H, Fire A, Morishita S.

Department of Computational Biology, Graduate School of Frontier Sciences,
University of Tokyo, Kashiwa, 277-0882, Japan.

Chromatin-associated periodicity in genetic variation downstream of transcriptional start sites.

10

5806

2009

Nucleic Acids Res. 200937(5) 1510-20

Herpin A, Nakamura S, Wagner TU, Tanaka M,
Schartl M.

Physiological Chemistry I, University of Würzburg, Biozentrum, Am Hubland, D97074 Würzburg, Germany.

A highly conserved cis-regulatory motif directs differential gonadal synexpression of Dmrt1 transcripts during
gonad development.

11

5806

2008

Dev. Biol. 2008 320, 328339.

Solution Oriented Research for Science and Technology (SORST) Kondoh
Sasado, T., Yasuoka, A., Abe, K., Mitani, H., FurutaniResearch Team, Japan Science and Technology Agency (JST), 14 YoshidaSeiki, M., Tanaka, M. and Kondoh, H.
Kawaracho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8305, Japan.

Distinct contributions of CXCR4b and CXCR7/RDC1 receptor systems in regulation of PGC migration
revealed by medaka mutants kazura and yanagi.

12

5805

2008

Nature. 2008 456(7222)
611-6

Omran H, Kobayashi D, Olbrich H, Tsukahara T,
Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, University Hospital Freiburg
Loges NT, Hagiwara H, Zhang Q, Leblond G, O'Toole
Mathildenstrasse 1, D-79106 Freiburg, Germany.
E, Hara C, Mizuno H et al.

Ktu/PF13 is required for cytoplasmic pre-assembly of axonemal dyneins.

13

5806

2009

Glycobiology.. 2009 19(8)Anzai D, Tonoyama Y, Ikeda A, Kawasaki T, Oka S.
868-78

14

5804

2009

Dev Growth Differ.. 2009
51(9) 769-75

Deguchi T, Itoh M, Urawa H, Matsumoto T,
Nakayama S, Kawasaki T, Kitano T, Oda S, Mitani H, Research Institute for Cell Engineering, National Institute of Advanced Industrial
Infrared laser-mediated local gene induction in medaka, zebrafish and Arabidopsis thaliana.
Takahashi T, Todo T, Sato J, Okada K, Hatta K,
Science and Technology, 3-11-46 Nakouji, Amagasaki, Hyogo, Japan.
Yuba S, Kamei Y.

15

5806

2007

Dev Growth Differ.. 2007
49(9) 691-8

Kaftanovskaya E, Motosugi N, Kinoshita M, Ozato K, Laboratory of Freshwater Fish Stocks, Bioscience and Biotechnology Center,
Wakamatsu Y.
Nagoya University, Furo-cho, Chikusa-ku, Nagoya 464-8601, Japan.

16

5806

2007

Proc Natl Acad Sci U S A. Kurokawa H, Saito D, Nakamura S, Katoh-Fukui Y,
2007 104(43) 16958-63 Ohta K, Baba T, Morohashi K, Tanaka M.

17

5701

2007

Genetics 177: 2379–2388

18

5706

2007

Comp Biochem Physiol C
Kashiwada S, Goka K, Shiraishi H, Arizono K, Ozato
Toxicol Pharmacol.. 2007
K, Wakamatsu Y, Hinton DE.
145(1) 96-102

National Institute for Environmental Studies, Tsukuba, Japan

19

5806

2007

Dev Dyn.. 2007 236(1)271-81

Klüver N, Pfennig F, Pala I, Storch K, Schlieder M,
Froschauer A, Gutzeit HO, Schartl M.

University of Würzburg, Department of Physiological Chemistry I, Biozentrum, Wü Differential expression of anti-Müllerian hormone (amh) and anti-Müllerian hormone receptor type II (amhrII)
rzburg, Germany.
in the teleost medaka.

20

2301

2007

Nature 447: 714-719

Kasahara M, Naruse K, Sasaki S, Nakatani Y, Qu W,
Ahsan B, Yamada T, Nagayasu Y, Doi K, et al.

Department of Computational Biology, Graduate School of Frontier Sciences,
50 277-0882, Japan.
The University of Tokyo, Kashiwa

Negishi T, Nagai Y, Asaoka Y, Ohno M, Namae M,
Mitani H, Sasaki T, Shimizu N, Terai S, Sakaida I,
Kondoh H, Katada T, Furutani-Seiki M, Nishina H.

Department of Biological Chemistry, Graduate School of Pharmaceutical
Sciences, Kyoto University, Kyoto, Japan.

Laboratory of Molecular Genetics for Reproduction, Division for Sex
Differentiation, National Institute for Basic Biology, Okazaki 444-8787, Japan.

Kimura T, Shimada A, Sakai N, Mitani H, Naruse K, Department of Molecular Life Science, Tokai University School of Medicine,
Takeda H, Inoko H, Tamiya G and Shinya M
Kanagawa, Japan.

Epigenetic control of cardiomyocyte production in response to a stress during the medaka heart development.

Regulated expression of the HNK-1 carbohydrate is essential for medaka (Oryzias latipes) embryogenesis.

Ploidy mosaicism in well-developed nuclear transplants produced by transfer of adult somatic cell nuclei tononenucleated eggs of medaka (Oryzias latipes).

Germ cells are essential for sexual dimorphism in the medaka gonad.

Genetic Analysis of Craniofacial Traits in the Medaka.

Age-dependent in situ hepatic and gill CYP1A activity in the see-through medaka (Oryzias latipes).

The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution.

21

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

ゼブラフィッシュ

当該リソースの区分
第２期申請時の区分

代表機関（課題管理者氏名）理研脳センター（岡本仁）

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）国立遺伝学研究所（川上浩一）、岡崎統合バイオ（東島眞一）
運営委員長

日比正彦（名古屋大学）

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ※１（平成16年度の申請時に設定したもの）

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 26 年度頃）

【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】① 我が国の研究者により作製された変異系 ①目標値をうわまわって収集数を増加させ、北米 我が国におけるモデル脊椎動物としてのゼブラ
統、トランスジェニックフィッシュ系統を収集す のリソースセンターに匹敵する系統数を保持する フィッシュの認知度は決して高くはなかった。
る。
にいたった。

【具体的目標】①我が国の研究者により作製される我が国独自の変異系統、トランスジェニックフィッシュ系統を収集・保存し続ける、即ち成長・拡大し続けるリ
ソースセンターを目指す。
②精子凍結技術を確立し、系統保存する体 ②精子凍結技術の確立に成功し、順調に精子凍②収集・保存系統数において世界最大規模のリ制を整備する。
結保存系統数を増加させている。
ソースセンターの形成を目指す。欧米のリソース【具体的状況の変化の内容】
センターと連携し、ゼブラフィッシュリソースの国際拠点として活動する。
③独自性が高く有用なゼブラフィッシュ系統を ③目標値をうわまわって順調に国内外の研究者 ①近年動物愛護の精神から、哺乳動物モデルの ③国内外の研究者が質の高い研究を行うための国内外の研究者に安定して提供する。
に対して、我が国の研究者によって作製されたリ 代替としてゼブラフィッシュの需要が高まって来 リソースを迅速に提供する。これにより日本発のソースを提供している。また、それを基にして質量 た。
研究基盤を世界のゼブラフィッシュ研究者にひろともに豊富な研究成果があげられつつある。
める発信源となる。
②生物多様性に対する社会の認知度の高まりにより、我が国で作製された遺伝子組換え体を我【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
が国において保存する体制の整備が重要になっ 【研究コミュニティの状況】てきた①リソースを利用して質の高い研究を行う研 ①我が国において、提供されたリソースを利用し ③多くの生物のゲノム情報が大幅に整備され、 ①リソースを利用して質の高い研究を行い、それ究者コミュニティを我が国において形成する。 て質の高い研究論文をコンスタントに発表する研 ポストゲノム研究として遺伝子機能を明らかにす らを世界にむけて発信する研究者コミュニティが究者コミュニティが形成された。
るための研究を行うモデル脊椎動物の重要性が 我が国において形成されている。
増大した②リソースの普及に努め、ゼブラフィッシュを ②第２期の期間中に医学分野の新たな研究者や ④癌・心臓病・生活習慣病の克服は現代の課題 ②リソースを利用して質の高い研究を行う国際的使っていなかった医学・生命科学研究者や若 若い研究者のコミュニティへの参入を促進すること である。ゼブラフィッシュを用いて、これら病態モ な研究者コミュニティが形成されている。
い研究者のゼブラフィッシュ研究への参入を ができた。
デルの開発が可能になってきた。
促進する③リソースを利用して質の高い研究を行う国 ③我々のリソースの国際的な認知度も高まり、そ ⑤現代では「心の病」は大きな問題になってき③リソースセンターに寄託する高品質のゼブラ
際的なゼブラフィッシュ研究者コミュニティが れらを利用して質の高い研究論文を発表する研 た。ヒトの精神疾患・脳機能に関しても、ゼブラ フィッシュ系統をコンスタントに開発する研究者コ形成される。
究者コミュニティが国際的にも形成されている。
フィッシュをモデル動物として用いて研究が行え ミュニティが、我が国において形成されている。
る見通しが立った。

51

22

Ⅰ
第２期開始時の設定目標※１（平成16年度の申請時に設定したもの）

Ⅱ
中間評価時の達成状況（平成２１年９月現在）

Ⅲ
NBRP事業に影響を及ぼす
研究動向の社会的変化等

Ⅳ
リソースが目指す到達像（達成年度：平成 26 年度頃）

【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】【到達度の評価事項と目標】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）（該当する□内に「レ」を記入）（項目と客観的指標）①目標：我が国の研究者により作製された変 ①目標値をうわまわって5294系統（突然変異ライ ①事業実施担当者の継続性①目標：我が国の研究者により作製された我が異系統、トランスジェニックフィッシュ系統を収 ブラリー4000系統、I期分969系統を含む）の収集☑後継者等あり □後継者等なし
国独自の変異系統、トランスジェニックフィッシュに成功した。
系統を収集・保存・提供する集する。
指標：収集・保存・提供系統の90%以上が我が国
指標：収集数が第２期を通じて順調に増加する。
の研究者により作製された独自系統である。
②目標：精子凍結技術を確立し、系統を凍結 ②我々が開発に成功した精子凍結法は、非常に ②後継者の人材育成状況②目標：世界最大規模のリソースセンターとな
精子として保存する。
信頼性の高い方法である。目標値をうわまわって☑順調に育成中 □後継人材がいないる。
指標：凍結精子保存系統数が第２期を通じて 4964系統（I期分730系統を含む）の凍結精子保存指標；欧米のリソースセンターに勝るとも劣らない
順調に増加する。
に成功している。
世界３位以内の収集・保存系統数を保有する。
③目標：独自性が高いゼブラフィッシュ系統を ③目標値をうわまわって627系統（うち国内362系 ③組織的な支援体制③目標：国際拠点として欧米のリソースセンター
国内外の研究者に提供する。
統、国外265系統）を提供している。その後も順調☑整っている。 □支援体制がない。
と連携する。
指標：第２期を通じて国内外の研究者への総 に提供数を増加させ、平成22年12月までに1071
指標：系統情報のWEB上での公開を通じて系統
提供数が順調に増加する。
系統を提供している。それらのうち1040系統は我情報を共有する。欧米から頻繁にリクエストされが国で開発された独自のものである。
る系統に関しては輸送を考慮し、系統の相互保④目標：リソースを利用して我が国から質の ④第２期の中間評価までに参加機関を含めた主 【特記事項】①海外へのさかなの輸送の際に、 ④目標：我が国の研究者が質の高い研究を行う
高い研究を世界にむけて発信する。
に国内の研究者による英文原著論文40報が発表 fedexが使用できないこと、ショウジョウバエのよ ことができるようなリソースを迅速に提供する。
指標：リソースを利用して我が国の研究者が された。その後も順調に研究成果を発表し続け、 うに万国郵便条約の禁制品の例外として扱われ 指標：リソースを利用して我が国の研究者が器官研究成果を著名な学術誌に発表する。
平成22年12月までに合計89報以上の英文原著論 ていないこと、はたいへん不便である。これらに 形成研究や脳研究など多分野にわたる研究成果文を発表している。それらの中には器官形成研究 ついては、是非国の協力を得て、容易に輸送で を主要な学術誌に発表する。
の分野で心臓の形成の仕組みを明らかにしたも きる体制を整えたい。
の、脳研究の分野で恐怖行動の仕組みを明らか ②国外へ輸送する際に相手国が要求する検疫⑤目標：リソースを利用して世界のゼブラ⑤第２期の中間評価までに参加機関を含めない のレベルが厳しくなりつつある。これについては、 ⑤目標：国外の研究者が質の高い研究を行うこと
フィッシュ研究を発展させる。
主に国外の研究者による英文原著論文43報が発 リソースセンターで先方の要求する検査を行うこ ができるようなリソースを迅速に提供する。
指標：リソースを利用して欧米の研究者が研 表された。その後も順調に研究成果を発表し続
指標：リソースを利用して国外の研究者が器官形とができる体制を整えたい。
究成果を著名な学術誌に発表する。
け、平成22年12月までに合計113報以上の英文原 ③本リソース事業の根幹である我が国独自の系 成研究や脳研究など多分野にわたる研究成果を
著論文を発表している。それらの中には神経研究 統の開発については、我が国研究者各自の競 主要な学術誌に発表する。
の分野で未知の神経機能を明らかにしたもの、脳 争的研究資金獲得の努力に依存してきた。競争研究の分野で脳が見たものを区別する仕組みを 的研究資金はほとんどが目的志向型の研究に【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・平成22年12月までに主要学術誌に発表された脳 むけられている。網羅的なリソース開発は、その神経科学から臓器形成、医学まではばひろい分 ような目的志向型の研究とは異なるが、非常に野にわたる英文論文20報を選別し、別紙に添付す 重要である。将来的にリソース開発を目的とした研究費の設定を希望したい。
る。
④本リソース事業で保存している系統は世界でひとつしか存在しないものがほとんどである。現※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

52

23

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：

ゼブラフィッシュ

番号分野

発行年 雑誌名(インパクトファクター)

1

1101

2011

Neuron (13.260)

2

1101

2010

3

1101

4

著者名

所属

タイトル

Ohata, S., et al,

理化学研究所脳科学総合研究センター

Dual roles of Notch in regulation of spically testricted mitosis and spicobasal polarityof neuroepithelial cells.

Science (29.747)

Del Bene, et al,

University of California
San Francisco

Filtering of visual information in the tectum by an identified neural circuit.

2010

Current Biology (10.992)

Lee, A., et al,

National University ofSingapore

The habenula prevents helpless behavior in larval zebrafish.

1101

2010

Nature Neuroscience (14.345)

Agetsuma, M., et al,

理化学研究所脳科学総合研究センター

The habenula is crucial for experience-dependent modification of fear responses inzebrafish.

5

5804

2010

Genes & Development (12.075) Tsukada, Y., et al,

九州大学

KDM7 is a dual demethylase for histone H3 Lys 9 and Lys 27 and functions in brain
development.

6

6602

2009

Nature Methods (16.874)

7

1101

2009

Nature (34.480)

Wyart, C., et al,

University of California
San Francisco

Optogenetic dissection of a behavioural module in the vertebrate spinal cord.

8

1102

2009

Nature Genetics (34.284)

Lyons, D.A., et al,

Stanford University

Kif1b is essential for mRNA localization in oligodendrocytes and development ofmyelinated axons.

9

6901

2009

Science (29.747)

Kawahara, A., et al,

国立循環器病研究セン
ター

The sphingolipid transporter spns2 functions in migration of zebrafish myocardial
precursors.

10

5806

2009

PLoS Biology (12.916)

Picker, A., et al,

Dresden University ofTechnology

Dynamic coupling of pattern formation and morphogenesis in the developing
vertebrate retina.

11

5806

2009

Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
(9.432)Sugiyama, M., et al,

理化学研究所脳科学総合研究センター

Illuminating cell-cycle progression in the developing zebrafish embryo.

12

1101

2008

Nature Neuroscience (14.345)

McLean, D.L., et al,

Cornell University

Continuous shifts in the active set of spinal interneurons during changes inlocomotor speed.

13

1101

2007

Nature (34.48)

McLean, D.L., et al,

Cornell University

A topographic map of recruitment in spinal cord. Nature 446, 71-5.

14

5806

2007

Developmental Cell (13.363)

Aizawa, H., et al,

理化学研究所脳科学総合研究センター

Temporally regulated asymmetric neurogenesis causes left-right difference in thezebrafish habenular structures.

15

7203

2007

大阪大学

A cardiac myosin light chain kinase regulates sarcomere assembly in the vertebrate
heart.

16

5806

2005

Current Biology (10.992)

Kawakami, A., et al,

17

5806

2005

Developmental Cell (13.363)

Koshida, S., et al,

18

5806

2005

Current Biology (10.992)

Aizawa, H., et al,

19

5806

2005

Current Biology (10.992)

Cooke, J.E., et al,

20

5701

2004

Developmental Cell (13.363)

Kawakami, K., et al,

Siripattarapravat, K.,
et al,

Journal of Clinical Investigation
Seguchi, O., et al,(15.387)

Michigan State University

Somatic cell nuclear transfer in zebrafish.

東京工業大学・理化学研 The zebrafish-secreted matrix protein you/scube2 is implicated in long-range
究所
regulation of hedgehog signaling.
岡崎統合バイオサイエン Integrinalpha5-dependent fibronectin accumulation for maintenance of somite
スセンター
boundaries in zebrafish embryos.
理化学研究所脳科学総 Laterotopic representation of left-right information onto the dorso-ventral axis of a
合研究センターzebrafish midbrain target nucleus。
Fred Hutchinson Cancer EphA4 is required for cell adhesion and rhombomere-boundary formation in the
Research Centerzebrafish.
国立遺伝学研究所

A transposon-mediated gene trap approach identifies developmentally regulated
genes in zebrafish.

上記以外にも、Proc. Natl. Acad. Sci. USA. (9.432) 6報以上、PLoS Genetics (9.532) 2報以上、Journal of
53Neuroscience (7.178) 5報以上、Development (7.194) 17報以上、等国際的に評価が高い主要学術24
誌にリソースを用いた研究成果が多数発表されている。

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

ニホンザル

代表機関（課題管理者氏名） 伊佐 正第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） 平井啓久
運営委員長

泰羅雅登

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ※１

Ⅲ
NBRP事業に影響を及ぼす

中間評価時の達成状況

Ⅳ
リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】①年間200頭のサルを提供出来る体制 ①中核機関と分担機関の連携による繁殖・飼育体制は確立し、年間200頭の供給が可能な段階に達している

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成３０年度頃）【NBRP開始時の状況】【具体的目標】研究者コミュニティは、何よりも安定かつ継続的 ①長期安定したリソース提供。
にニホンザルが提供されることを希望している。 ・年間100～150頭の提供
動物愛護法改正等の動物愛護の高まりや人獣 ・霊長類センターの設置
共通感染症の問題など、ニホンザルを利用する
研究環境は年々厳しくなっている。一方、脳科学とゲノム科学が融合し、精神・神経疾患や認知機能の個性のもととなるSNPなどの遺伝情報と脳機能の関係を解明する「認知ゲノミクス」が新し②病原微生物学的にも安全なニホンザ ②検疫業務の一部を新たに専門の民間 い神経科学の潮流となりつつあるなどの現況を ②高い付加価値のついたリソース提供。
業者へ供給予定のサルを移動して委託 鑑みるに、それを先取りしようとする研究者の要 特定家系、特定の遺伝的背景を有するルの提供するなど検疫体制を強化して、リソース 請に対応しなければならない。
個体の提供。
の質の向上が達成された。
・ゲノム情報の整備。
【具体的状況の変化の内容】③ニホンザルに関するデータベースの構築と情報発信、啓発活動③子ザルの血液を冷凍保存、ニューズ ①動物愛護の観点から実験利用する頭数を極 ③リソース提供先の拡大
レータ-の発行、一般公開シンポジウム、 力減らす傾向や研究内容の変化など、研究環境 ・研究領域のボーダーレス化（認知ゲノミ
飼育管理に関する講習会を毎年実施し の変化により、必要とする頭数が減少する。ニホ クス）
・臨床医学、ゲノム科学、社会学
ンザル提供の適正数は年間100～150頭。
ている②欧米では霊長類を用いた研究環境がさらに厳しくなる。日本における研究環境整備の重要性がますます高まる。

【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①研究者コミュニティーは、臨床医学系 ①広報活動の成果として臨床医学系に ③認知機能や社会性を脳科学とゲノム科学の側 ①供給の安定化により、研究環境の安
おいても新規ユーザーを獲得している 面から解明しようとする「認知ゲノミクス」が潮流 定化が図れる。また、より持続的な研究の研究室にも広げる。
となりつつある。この研究領域には、先進的基盤 の参入も可能となり、長期的な展望を持
技術の開発、研究用サルの繁殖・供給、及び研 つ研究成果をあげている。
究のサポート体制が必要となる。
②研究者コミュニティとの意見交換を行 ②実験動物使用者会議（ユーザー会議） ④検疫の強化や感染症対策など、ニホンザルの ②認知ゲノミクス--精神機能の遺伝子基う連絡会を設置を毎年学会 際 開催る
微生物学的管求が年 高まる
盤と異常 疾患 対する介 的治療
54

25

う連絡会を設置。

を毎年学会の際に開催している。

微生物学的管理の要求が年々高まっている。

盤とその異常・疾患に対する介入的治療法の開発を霊長類モデルにおいて実験的に検証する--において世界をリードする研究成果をあげている。
③高次脳機能研究においてニホンザル ③研究期間が長いという脳神経科学研 ⑤飼育管理を業者へ委託することには、業者の ③研究領域のボーダーレス化により利用
を用いて日本がより一層高い国際競争 究の特性のため、中間評価の段階では 経営状況など不安定要素がある。安定した継続 者が拡大し、長期安定した供給が必要と力を発揮できるようにする。
研究論文はまだ発表されていなかった。 性のある公的施設の構築を目指し、そこで繁殖・ される。
供給とともに社会へのアウトリーチや研究者・技術職員の訓練も行えるようにすることが望ましい。
【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：ニホンザル繁殖体制の整備と ①繁殖用個体の頭数とリソース提供数 ①事業実施担当者の継続性;後継者等あり □後継者等なし
研究者へリソースを安定供給する。
は数値目標に達していないが、年間200
指標：600～1600頭の繁殖用個体と年間 頭の供給が可能な段階に達している。
200頭の供給【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：安定したリソース提供。
指標：年間100～150頭の提供。

②目標：病原微生物学的に安全かつ健 ②供給予定のサルを移動して、検疫業 ②後継者の人材育成状況;順調に育成中 □後継人材がいない康な個体を提供する。
務の一部を新たに専門の民間業者へ委
指標：一度に検疫・供給できる頭数の上 託するなど検疫体制を強化した。一度に限。
100頭まで検疫・供給できる体制ができた。

②目標：高い付加価値のついたリソースの提供
指標：遺伝子的特異性のある個体の提供。脳画像や遺伝、血液生化学等の生体情報を付加した個体の提供。

③目標：ニホンザル飼育管理の適正化。 ③専門家による供給検討委員会を設置 ③組織的な支援体制;整っている。 □支援体制がない。
指標：リソース提供時に飼育環境の審査 して、提供先での飼育環境を厳密に審を実施する。また、申請者には講習会受 査している。平成19－21年度に4回の講講を義務づける。
習会を実施し、のべ１33人が受講した。

③目標：リソース提供体制の長期的維持。
指標：公的な霊長類センターの設立により、飼育・繁殖事業とともに社会へのアウトリーチを安定して行う体制も整う。
④目標：提供する研究領域の拡大。
指標：神経科学の動向（領域のボーダーレス化）を反映して臨床医学やゲノム科学などへの提供。

平成19年度提供数20件56頭（申請数23 【特記事項】
件65頭）、平成20年度提供数21件51頭 民間業者への飼育委託では、事業の安定化に限界（申請数26件60頭）、平成21年度提供数 がある。
21件68頭（申請数21件70頭）を供給できた。
⑤目標：野生由来個体では不可能だっ ⑤年齢等の情報提供の実施。血液の保た年齢や家系に関する情報を提供でき 存をルーチン化する体制が整った。
るようにする。提供個体の血液も保存
し、遺伝子解析を可能にする。
指標：飼育個体の個体簿と血液保存に必要な設備を整備する。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
④目標：需要を満たす提供数。
指標：安定した供給数を継続している。

55

26

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： ニホンザル
番号 分野 発行年
雑誌名

著者名
Watakabe A, Komatsu Y,
Sadakane O, Shimegi S,
Takahata T, Higo N,
Tochitani S,Hashikawa T,
Naito T, Osaki H,
Sakamoto H, Okamoto M,
Ishikawa A, Hara S,
Akasaki T, Sato H and
Yamamori T

所属

大阪大学

Enriched expression of serotonin 1B and 2A receptor genes in macaque visualcortex and their bidirectional modulatory effects on neuronal responses

京都大学

Distribution of colour-selective activity in the monkey inferior temporal cortex
revealed by functional magnetic resonance imaging

Ogawa T, Komatsu
京都大学
HCondition-dependent and condition-independent target selection in macaqueposterior parietal cortex

1

6902

2008

CerebralCortex

2

6902

2009

European
Journal ofHarada et al.
Neuroscience

3

6902

2009

Journal of
Neurophysiology

4

6902

2009

5

6902

2009

6

6902

2009

PLoS
Computational
Shinomoto et al.
京都大学
Biology
Recent Advances
Jongho Lee, Yasuhiro 東京都神経科学
in Biomedical
Kagamihara,Shinji Kakei 総合研究所
Engineering

Psychologia

タイトル

Takebayashi T and京都大学
Funahashi S
Ito Y, Shimazawa M,
Chen YN, Tsuruma K,
Yamashima T, Araie M,
Hara H S, Yamada T,
OikawaMinohata T, Kobayashi
H, Furukawa A, TadaOikawa S Hiraku Y

Relating neuronal firing patterns to functional differentiation of cerebral cortex
A new method for quantitative evaluation of neurological disorders based on
EMG signals
Monkeys exhibit preference for biologically non-significant visual stimuli

金沢大学

Morphological changes in the visual pathway induced by experimental
glaucoma in Japanese monkeys.

金沢大学

Proteomic identification of carbonylated proteins in the monkey hippocampus
after ischemia-reperfusion.

金沢大学

The role of lysosomal rupture in neuronal death.

7

6902

2009

Exp Eye Res

8

6902

2009

Free Radic
Biol Med

9

6902

2009

Prog
Neurobiol

Yamashima T,
Oikawa S.

Kato S, Kobayashi K,
Inoue K, Kuramochi M,
Okada T, Yaginuma H, 京都大学
Morimoto K, Shimada T,
Takada M, Kobayashi K

A lentiviral strategy for highly efficient retrograde gene transfer bypseudotyping with fusion envelope glycoprotein

10

6902

2010

Human Gene
Therapy

11

6902

2010

Neuroscience Hirai N, Hongo T,
杏林大学
Research
Naito K, Sasaki S.

The process of learning tool-use movements in monkeys: the initial process ofpicking up and using forceps.

2010

Bulletin of the
Nanzan Institutefor Religion andCultureMetacognition: a new method to study the nature of the mind.

12

6902

Funahashi S

京都大学

56

27

13

6902

2010

Kaplamadzhiev DB,
Hisha H, Adachi Y,
Ikehara S, Tonchev AB,
Biosci Trends Boneva NB, Pyko IV, 金沢大学
Kikuchi M, Nakaya M,
Wakayama T, Iseki S,
Yamashima T.

14

6902

2010

Biochem Biophys Sahara S,
Res Commu
Yamashima T.

15

6902

Bone marrow-derived stromal cells can express neuronal markers by
DHA/GPR40 signaling

金沢大学

Calpain-mediated Hsp70.1 cleavage in hippocampal CA1 neuronal death

金沢大学

Differential expression of FABP 3,5,7 in infantile and adult monkey cerebellum

岡山大学

Heat Transfer Characteristics of a Pharyngeal Cooling Cuff for the Treatment
of Brain Hypothermia

2010

Neurosci Res

Boneva NB, Mori Y,
Kaplamadzhiev DB,
Kikuchi H, Zhu H,
Kikuchi M, Tonchev
AB, Yamashima T.

Journal of
Biomechanical
Science andEngineering

Fumoto K

Current
Biology

Yoshida K, Saito N,
理化学研究所i Iriki A, Isoda M

Representation of others' action by neurons in monkey medial frontal cortex

Journal of

Ogawa T, Komatsu
京都大学
H

Differential temporal storage capacity in the baseline activity of neurons in
macaque frontal eye field and area V4

Ma D, Zhang M, Mori Y,

金沢大学

Cellular localization of epidermal-type and brain-type fatty acid-binding
proteins in adult hippocampus and their response to cerebral ischemia.

金沢大学

Expression of fatty acid-binding proteins in adult hippocampal neurogenic
niche of postischemic monkeys

16

6902

2010

17

6902

in press

186902

in press Neurophysiology

19

6902

in press Hippocampus Yao C, Larsen CP,
Yamashima T, Zhou L.

20

6902

in press Hippocampus

Boneva NB,
Kaplamadzhiev DB,
Sahara S, Kikuchi H,
Pyko IV, Kikuchi M,
Tonchev AB,
YamashimaT.

57

28

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名 カタユウレイボヤ等研究拠点形成

当該リソースの区分
第２期申請時の区分

代表機関（課題管理者氏名）筑波大学(稲葉 一男)

発展が見込まれるバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）京都大学(佐藤ゆたか) 東京大学(赤坂甲治)
運営委員長

野中 勝

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 ２８年度頃）（平成２１年９月現在）（平成16年度の申請時に設定したもの）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①カタユウレイボヤの系統・自然集団のうち、特に研究に ①カタユウレイボヤ系統・野生型につい 海産無脊椎動物の研究は、海産物を重 ①世界最大かつ唯一のカタユウレイボ
有用なものを中心に収集・保存する体制を整える。
て、目標を達成できるペースでの収集・ 要な資源とする我が国を支える上で重 ヤリソースセンターとしての地位の確立要であるが、体系的に研究を支える試 と維持。
保存が進められている。
みは無い状態であった。
②質の高いリソースの安定的提供体制②カタユウレイボヤの収集系統・野生集団について、安定 ②カタユウレイボヤ系統・野生型のそれの充実。
的に提供できる体制の整備。
ぞれについて、提供目標を上回る・またはほぼ達成する回数の提供を行ってい 【具体的状況の変化の内容】
る。
③ニッポンウミシダの自然集団や付随 ①ゲノム科学の発展による脊椎動物の ③ニッポンウミシダの幅広い利用者コ③ニッポンウミシダ自然集団について安定的に収集・保ミュニティを支える基盤の提供。
するDNAリソースについて安定的に収 祖先型動物の理解の進歩。
存・提供する体制の整備。
集・保存・提供する体制を整備した。
【目標とした研究コミュニティの状況】①本リソースを積極的に利用するコミュニティの形成。

【研究コミュニティの状況】①リソースの提供件数は目標にほぼ達しており、本リソースがコミュニティに積極的に利用されている。
②本リソースの維持の重大性を理解し、その推進の積極 ②リソースの積極的利用やMTA締結など、コミュニティからの協力・支援が得ら的な協力・支援を行っている。
れている。
③リソースを利用することにより発展した研究を進めてい ③本リソースを利用した論文が国際誌に３４報発表されており、発展した研究る。
を推進している。

②GFPのノーベル賞受賞に代表される
海産動物からの科学技術の発信。
【研究コミュニティの状況】③①②を基盤にした海産無脊椎動物研 ①新規ユーザーの参入を含め、コミュニ
究の重要性に対する国民的理解の獲 ティサイズが現在よりも増加している。
得。
④臨海実験所の拠点化の整備事業の ②リソースを利用したハイレベルな先端開始と推進。
研究を展開している。
⑤基礎生物科学への予算縮小とそれに ③基礎科学のみならず、医学や水産対する国民的危機感の発信。
学・生態学といった幅広い分野で活躍している。

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：系統を安定的に維持・提供する体制の整備。
①目標：系統を安定的に維持・提供する ①事業実施担当者の継続性
レ□後継者等あり□後継者等なし
到達度：汎用性のある50系統を含むのべ121系統を維持し 体制の整備。
た実績がある。
指標：汎用性のある系統86系統を維持し、のべ68件の提供を行った。

②目標：飼育キャパシティの増加によるリソースの充実化。
到達度：恒温飼育室１つにより6,000匹のホヤを飼育するシステムを有する。

②目標：飼育キャパシティの増加による ②後継者の人材育成状況
レ□順調に育成中□後継人材がいない
リソースの充実化。
指標：リソースの海上隔離飼育施設・屋内飼育施設を新たに整備し飼育キャパ
シティを増加させた。
58【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：世界最大規模のカタユウレイボ
ヤリソースセンターとして確立している。
指標：保有する系統数が世界最大である。

②目標：世界唯一のリソース拠点としての地位を確立している。
指標：本リソース事業のみが有する系統が存在し、提供を実施している。

29

③目標：複数拠点でのリソースバックアップ体制の確立。
到達度：バックアップ体制は無い。

③組織的な支援体制③目標：ハイレベルな研究を支えるリ③目標：複数拠点でのリソースバックレ□整っている。
□支援体制がない。
ソース基盤を確立している。
アップ体制の確立。
指標：保有系統の入れ替えを中心とす
指標：カタユウレイボヤ野生型・系統のるリソースの質の向上がなされている。
双方において２拠点で管理するシステムを整備した。
④目標：カタユウレイボヤ自然集団の供給システムの整 ④目標：カタユウレイボヤ野生型の供給 【特記事項】④目標：新規ユーザーの獲得と提供件
本リソースは海産無脊椎動物のモデル生 数の増加。
システムの整備。
備。
指標：年20,000匹の安定的提供体制を 物のカタユウレイボヤを中心に体系的に整 指標：系統の提供実績が第２期の目標
到達度：年10,000匹の提供実績を有している。
備した世界で唯一のリソースであり、特に国 である年度あたり１０件の倍にあたる２０
整備した。
内の研究者の本リソースへの依存度は非常 件を達成している。
に高い。
⑤目標：リソースのコミュニティへのアピールによる啓蒙。 ⑤目標：リソースのコミュニティへのア⑤目標：本事業の継続体制が整備されピールによる啓蒙。
到達度：データベースを中心とする広報活動を進めるこ
平成１９年度の申請書では、系統の２０１０ ている。
指標：保有リソース系統をデータベース 年における収集・保存数が１３０と記載され 指標：長期的・体系的な視野に則った人と。
化し、公開した。MTAの締結を開始している一方で、初年度５０系統、次年度から 材育成が行われている。
２０系統を目標に収集・保存する（つまり２０た。
１０年度終了時点で110系統）と記載されて ⑥目標：ニッポンウミシダの幅広い利用いる。これは西暦と平成の混同により生じた 者コミュニティを支える基盤の提供。
矛盾であり、数値目標としては後者が正し 指標：増加するニーズに応えられる飼育
く、事業はそれに則って進められている。
設備が整い、提供を行っている。ゲノム、トランスクリプトーム等の情報基盤【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）が整い、アクセスできる環境にある。

・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

5930

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：カタユウレイボヤ・ニッポンウミシダ

番号 分野

発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

1

1101

2011 Nature

Horie T et al

University of Tsukuba, Konan University, Okinawa
Institute of Science and Technology

Ependymal cells of chordate larvae are stem-likecells that form the adult nervous system

2

5806

2011 Development

Ogura Y et al

University of Tsukuba, RIKEN BSI, University of
Hyogo, Okinawa Institute of Science andTechnology

Coordination of mitosis and morphogenesis: role ofa prolonged G2 phase during chordate neurulation

3

5801

Comparative
Biochemistry and2011
Physiology B(Molecular Biology)

Glycomics study of a novel Type-2 NYokohama City University, University ofacetyllactosamine-specific lectin
Matsumoto R et al Toky,Yokohama Science Frontier High Fujita Healthpurified from the Japanese feather star
University(Oxycomanthus japonicus) of the

4

5806

2010

Developmental
Dynamics

Terakubo HQ, etal

Keio University, University of Tsukuba, National
Institute for Basic Biology

Network structure of projections extending fromperipheral neurons in the tunic of ascidian larva

5

5805

Molecular
2010 Reproduction andDevelopment

Yokota N et al

Nagoya University

Identification of testis-specific ubiquitin-conjugating
enzyme in the ascidian Ciona intestinalis

6

5806

2010 Development

Kubo A et al

Kyoto University, University of Tokyo, Okinawa
Institute of Science and Technology

Genomic cis-regulatory networks in the early Ciona
intestinalis embryo

7

5806

2010 Development

Ikuta T et al

Tokyo Metropolitan University, Okinawa Institute ofLimited functions of Hox genes in the larval
Science and Technology, Tokyo Metropolitan
development of the ascidian Ciona intestinalis
University

8

5705

2010

Molecular Biology
and Evolution

Sakai T et al

Suntory Institute for Bioorganic Research,
University of Hyogo

9

2301

2010

Developmental
Dynamics

Hozumi A et al

10

5805

2010

Cell Stress
Chaperones

Fujikawa T et al

11

5805

2010

Developmental
Biology

Konno A et al

Functional diversity of signaling pathways through G
protein-coupled receptor heterodimerization with a
species-specific orphan receptor subtype
Efficient transposition of a single Minos transposon
University of Tsukuba, Kyoto University, Suntory
copy in the genome of the ascidian Ciona
Institute for Bioorganic Research, Okinawa
intestinalis with a transgenic line expressing
Institute of Science and Technology
transposase in eggs
Stress response in the ascidian Ciona intestinalis :Nagahama Institute of Bio-Science and Technology transcriptional profiling of genes for the heat shockprotein 70 chaperone system under heat stress andOkinawa Institute of Science and Technology
endoplasmic reticulum stress
University of Tsukuba, Keio University, National
Distribution and structural diversity of cilia in
Institute of Genetics
tadpole larvae of the ascidian Ciona intestinalis
60

31

12

5705

2009 Peptides

Kawada T et al

Suntory Institute for Bioorganic Research, Chiba
University

13

5806

2009

Developmental
Biology

14

5705

2009

Journal of Biological
Sasaki N et al
Chemistry

Suntory Institute for Bioorganic Research, Chiba
University

Journal of Biological
Yamada L et al
Chemistry

The University of Tokushima, Nagoya University

15

5805

2009

Kanda M et al

Kochi University, University of Tsukuba

A novel inhibitory gonadotropin-releasing hormonerelated neuropeptide in the ascidian, Ciona

intestinalis
Epidermal expression of Hox1 is directly activatedby retinoic acid in the Ciona intestinalis embryo
Toll-like receptors of the ascidian Ciona
intestinalis : prototypes with hybrid functionalities ofvertebrate Toll-like receptors
Comprehensive egg coat proteome of the ascidian

Ciona intestinalis reveals gamete recognition

molecules involved in self-sterilit
Interaction of notochord-derived fibrinogen-like
National Institute for Basic Biology, Keio University, protein with Notch regulates the patterning of thecentral nervous system of Ciona intestinalis
Okinawa Institute of Science and Technology
embryos in a protochordate, Ciona intestinalis
Calcitonin
the prototype of the vertebrate
Suntory Institute for Bioorganic Research,
calcitonin/calcitonin gene-related peptide
Kanazawa University, Chiba University
superfamily
A novel neuronal calcium sensor family protein,calaxin, is a potential Ca(2+)-dependent regulator
University of Tsukuba, Tohoku University
for the outer arm dynein of metazoan cilia andNational Institute of Natural Sciences
flagella
A novel biological role of tachykinins as an upSuntory Institute for Bioorganic Research,
regulator of oocyte growth: identification of an
Hokkaido University, Keio University, Kyoto
evolutionary origin of tachykininergic functions in
University
the ovary of the ascidian, Ciona intestinalis

16

5806

2009

Developmental
Biology

Yamada S et al

17

5705

2009 FEBS Journal

Sekiguchi T et al

18

5805

2008 Biology of the Cell

Mizuno K et al

19

5705

2008 Endocrinology

Aoyama M et al

20

5806

2008

Development Growth Nishiyama A
and Differentiation Fujiwara S

Kochi University

RNA interference by expressing short hairpin RNA
in the Ciona intestinalis embryo

21

5806

2008

Development Genes Yoshida K
and Evolution
Saiga HTokyo Metropolitan University

Left-right asymmetric expression of Pitx isregulated by the asymmetric Nodal signaling throughan intronic enhancer in Ciona intestinalis

61

32

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 シロイヌナズナ/植物培養細胞・遺伝子代表機関（課題管理者氏名） 理研BRC（小林正智）

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長

岡田清孝

Ⅰ

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成19年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等【NBRP開始時の状況】（達成年度：平成24年度頃）【具体的目標】第２期開始時の設定目標※１①提供するリソースについて世界最高水準 ①品質検査の結果、変異体種子系統の数 理化学研究所（理研）は1987年より遺伝子材 ①リソースの信頼性や知財・安全などのルーの品質を維持し、ユーザーの研究促進に貢 パーセントに付加情報との不一致を見出し、 料と細胞材料を対象にジーンバンク事業を ル遵守で世界の模範となる事業となる。
献する。
結果をユーザーに提供することでユーザー 設立し、その一環として植物培養細胞・遺伝の研究促進に貢献した。
子の収集、保存、提供を開始した。しかし、 ②引き続き日米欧3極の一角を担い、国際的②我が国で作成されたユニークなリソース
当時はナショナルプロジェクトとしての位置 な貢献を果す事業であり続ける。
や、我が国が優位性を持つモデル植物の完 ②シロイヌナズナに近縁で環境応答のモデ づけがなく、事業の規模と効果は限定的で
全長cDNAの収集を進める。
ルとなるThellungiella halophilaの完全長あった。またシロイヌナズナリソースの保存・ ③シロイヌナズナがハブの役割を果すことでcDNAクローン、バイオエネルギーのモデル 提供は国レベルでは行われておらず、研究 NBRPの植物課題間の連携を深めるととも③我が国の植物研究を促進するとともに、リ 植物であるキャッサバの完全長cDNAクロー 者のボランティアに依存していた。このため に、国内外の関係機関との分担と連携を進
ソース分野における我が国の貢献を国際的 ンを収集した。
国内研究者は専ら海外のリソースセンター め、植物研究コミュニティの連携の基盤となる事業となる。
に示す。
に頼らざるを得ない状況であった。そこで③ユーザーによる論文発表は国外を含め累 2001年にバイオリソースセンター（BRC)が理
計269報にのぼり、着実に増加している。ま 研に設置された際に、シロイヌナズナに既存たリソースの提供にとどまらず1st ANRRCへ の植物培養細胞・遺伝子も含めた事業を開の参加や21st ICAR（シロイヌナズナ国際研 始した。続いてNBRPが2002年に開始され、究会議）の開催準備を通じて我が国の貢献 理研BRCはシロイヌナズナ/植物培養細胞・をアピールできた。
遺伝子の中核機関として参加することとな
り、我が国で作成されたリソースの滅失・海外流出を防ぐとともに、リソースを活用した研究の促進と知財の確保、及び我が国の国際的なプレゼンスの向上が期待された。

【具体的状況の変化の内容】①欧米のセンターにおいては国外からの利用に対する制限の導入が懸念され、当センターの国際貢献が重要になっている。
②欧米では基礎研究と出口を目指した研究
を結ぶ橋渡し研究への投資が増加しつつあり、産業植物のゲノム解読も急速に進んでいる。シロイヌナズナのリソース・情報も出口を目指した研究に活用され始めている。これを 【研究コミュニティの状況】【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
背景として、我が国でも同様の取り組みが喫①シロイヌナズナのポストゲノムプロジェクト ①日米欧のリソースセンターが整備するリ ③アジアにおいては中国が科学技術への投 ①研究上の利点を併せ持つ植物種を他に見成功に向けて、ゲノムリソースのいっそうの ソースによりシロイヌナズナの全遺伝子の9 資を急激に増加させており、韓国でも成長分 出すことは今後とも難しく、モデル実験植物と整備、高度化が期待されていた。
割以上に破壊系統が、また6割以上には完 野への集中投資が実施されている。その中 してのシロイヌナズナの優位性は不変である
全長cDNAが利用可能になるなど、研究基盤 で両国は我が国のリソースプロジェクトをお と考えられる。シロイヌナズナを中心とした本の整備が進んだ。当課題では遺伝子破壊系 手本にした投資が開始されており、我が国 事業のユーザーたるべき研究コミュニティは統のホモ系統種子の整備等により高度なリ のアジアでの優位を保つための積極的な投 将来にわたって存在する。
62 資が必要である。
ソースの整備に貢献した。
33

Ⅰ
第２期開始時の設定目標※１（平成19年度の申請時に設定したもの）

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成24年度頃）②モデル植物のゲノム研究の進展により、 ②農学系研究者からの研究促進に寄与する ④生物多様性条約、特にカルタヘナ議定書 ②環境と食料の課題に貢献するため、高度農学分野におけるシロイヌナズナリソース・ 橋渡しツールへの期待がを背景に、農学上 の締結により、GMOの国際間の移動に関す に整備されたシロイヌナズナの研究基盤の活情報の有用性が向上する結果、農学系ユー の課題にシロイヌナズナのリソースを使うた る制約が生じた。また近年のABSに関わる 用が期待されている。このため従来目指してザーの増加が見込まれる。
めにデータベースの開発（植物遺伝子の串 議論も将来のリソースの移動に大きな影響 きた基礎研究の促進に加え、出口を意識した研究の促進にも貢献する整備が求められて刺しデータベースSABRE等）を進め、また農 を与える可能性が高く、状況を注視していいる。
学系学会（遺伝学会等）における広報活動を る。
実施した。
③中国、韓国等アジア諸国でシロイヌナズナ ③バイオリソース領域でのアジアのプレゼン ⑤9.11以降の国際的なテロ防止の取り組み ③基礎と出口をつなぐための情報戦略が求を用いる研究者の数が増加しているため、 スは国レベルのプロジェクト発足もあいまっ の中で、貨物輸送に関わる規制は年々強化 められており、とりわけ情報発信ツールとなる
潜在的なユーザー数の更なる増加が見込ま て着実に高まっている。その中で、ソウルで されており、国際宅急便が輸送を引き受けな リソースデータベースへのニーズが高まっての1st ANRRCに参加する、台湾からの短期 い例が発生している。また国際的な財政健 いる。
れる。
研修プログラムに講師として参加するなどに 全策の中で国際郵便の業務効率も低下がより、本課題のアジア諸国における認知度の 懸念され、状況確認を続ける必要がある。
拡大に勤めた。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】【到達度の評価事項と目標】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）（項目と客観的指標）①国際的なシロイヌナズナリソースの拠点と ①第18回から20回の国際シロイヌナズナ研 ①事業実施担当者の継続性①目標：我が国で作成された重要なモデル実■後継者等あり □後継者等なし
して認知され続ける。
究会議にて事業を紹介、同時に開催された
験植物リソースを整備する。
②世界最高レベルの品質を維持し、ユー
国際研究推進委員会に参加し国際連携につ ②後継者の人材育成状況
指標：大量一括寄託を除き、年間50系統を■順調に育成中 □後継人材がいない 収集する。
ザーの研究推進に貢献する。
いて討議、更に1st Asian Network for③我が国で作成されたユニークなシロイヌナ Research Resource Centerにて事業を紹介 ③組織的な支援体制②目標：従来の基礎基盤研究に加え、出口■整っている。 □支援体制がない。
ズナリソースを収集し保存、提供する。
等、国際的な広報活動を実施した。
志向の研究まで幅広い研究分野の発展に資④我が国が優位性を持つ完全長cDNAリ②シロイヌナズナの野生系統について、遺伝するリソースを提供する。
ソースを中核とした品揃えを行う。
型、表現型の解析結果を提供する新規デー 【特記事項】
指標：（事業仕分け指摘事項への対応に伴⑤我が国が中心となり研究が進められてき タベースの開発を実施し、付加価値向上にい提供制度の改訂を実施した）平成22年度
た植物培養細胞の品揃えを充実させる。
努めている。平成20年11月に新規データ①欧米では研究基盤整備の一環としてのリ の目標と同等の個数のリソースを提供する。
ベースに移行した際には画像データの追加 ソース開発及びゲノム情報整備に継続的な ③目標：国際的なシロイヌナズナリソースのを実施した
投資を行なっている。国際的に競争力のあ 拠点として認知され続ける。
③シロイヌナズナFOXライン、シロイヌナズナ るリソース事業を目ざすためには、研究ニー 指標：国際シロイヌナズナ研究会議におい転写制御因子ライブラリー、個別のシロイヌ ズの高い課題について、国としての開発を実 て事業の広報を実施する。
ナズナ形質転換体など、我が国で開発され 施することが望まれる。
④目標：保有する技術の普及により新規のたリソースを収集し、準備ができたリソース
ユーザー、ニーズを発掘する。
から提供を開始した。
指標：技術研修を年2課題実施する。
②公的資金で開発されたリソースの有効活④我が国で開発された完全長cDNAリソース 用を図るため、国が実施する様々なプロジェ ⑤目標：保有するリソースをいっそう活用するとして、シロイヌナズナに近縁で環境応答の クト研究と提携できる枠組みが必要である。 ため、農学系研究コミュニティへの広報活動
モデルとなるThellungiella halophilaのクローを推進する。
ン、バイオエネルギーのモデル植物である ③凍結が難しい植物培養細胞株は生細胞で 指標：農学系学会・研究集会における事業
キャッサバのクローンをそれぞれ収集した。 維持されており、また遺伝子リソースの多く の広報を毎年実施する。
またコケのモデルであり相同組換えが可能 は超低温槽（-80℃）で保管されている。震災なことから脚光を浴びているヒメツリガネゴケ 等大規模災害においてもリソースの維持をのクローン、樹木のモデルであるポプラのク 可能とする設備（非常用発電設備）の拡充がローン、及びナス科のモデルであるタバコの 必要である。
クローンを追加収集した。
⑤
ガな 遺伝 を組※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
63

34

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：シロイヌナズナ/植物培養細胞・遺伝子
番号 分野
発行年
雑誌名
Elrouby N, Coupland G.
15703 2010 Proc. Natl.

著者名

所属

タイトル

Max-Planck-Institute for Plant
Breeding ResearchTechnische Universitaet
Muenchen
岩手大学
名古屋大学

Proteome-wide screens for small ubiquitin-like modifier (SUMO) substrates identify
Arabidopsis proteins implicated in diverse biological processes.
Different functions of the C3HC4 zinc RING finger peroxins PEX10, PEX2, and PEX12 inperoxisome formation and matrix protein import.
Arabidopsis synaptotagmin SYT1, a type I signal-anchor protein, requires tandem C2 domains
for delivery to the plasma membrane.
OsSPL14 promotes panicle branching and higher grain productivity in rice.

2

5703

2010

3

5703

2010

Acad. Sci. USA
Proc. Natl.
Prestele J, Hierl G, Scherling C, Hetkamp S, Schwechheimer C,
Acad. Sci. USA Isono E, Weckwerth W, Wanner G, Gietl C.
J. Biol. Chem. Yamazaki T, Takata N, Uemura M, Kawamura Y.

4

5703

2010

Nat. Genetics

5

5801

2010

J. Biol. Chem.

Miura K, Ikeda M, Matsubara A, Song XJ, Ito M, Asano K,
Matsuoka M, Kitano H, Ashikari M.
Pye VE, Christensen CE, Dyer JH, Arent S, Henriksen A.

6

5802

2010

J. Biol. Chem.

Arent S, Christensen CE, Pye VE, Nørgaard A, Henriksen A.

Carlsberg Research Center

7

5802

2010

Brutus A, Sicilia F, Macone A, Cervone F, De Lorenzo G.

Universita di Roma Sapienza

8

5703

2010

9

5806

2010

10

5703

2010

11

5703

2010

Proc. Natl.
Acad. Sci. USA
Proc. Natl.
Acad. Sci. USA
Proc. Natl.
Acad. Sci. USA
Proc. Natl.
Acad. Sci. USA
J. Biol. Chem.

12

5703

2009

13

5703

2009

14

5703

2009

15

5703

2009

16

5703

2009

17

5703

2009

18

5703

2008

19

5703

2008

20

5807

2008

Carlsberg Research Center

Fujimoto M, Arimura S, Ueda T, Takanashi H, Hayashi Y, Nakano 東京大学
A, Tsutsumi N.
Alassimone J, Naseer S, Geldner N.
University of Lausanne
Kuromori T, Miyaji T, Yabuuchi H, Shimizu H, Sugimoto E,
Kamiya A, Moriyama Y, Shinozaki K.
Yamada K, Osakabe Y, Mizoi J, Nakashima K, Fujita Y, Shinozaki
K, Yamaguchi-Shinozaki K.
Ronceret A, Doutriaux MP, Golubovskaya IN, Pawlowski WP.

Peroxisomal plant 3-ketoacyl-coa thiolases structure and activity are regulated by a sensitive
redox switch.
The multifunctional protein in peroxisomal beta-oxidation: structure and substrate specificityof the arabidopsis thaliana protein MFP2 .
A domain swap approach reveals a role of the plant wall-associated kinase 1 (WAK1) as a
receptor of oligogalacturonides.
Arabidopsis dynamin-related proteins DRP2B and DRP1A participate together in clathrincoated vesicle formation during endocytosis.
A developmental framework for endodermal differentiation and polarity.

独立行政法人理化学研究所 ABC transporter AtABCG25 is involved in abscisic acid transport and responses.
独立行政法人国際農林水産 Functional analysis of an Arabidopsis thaliana abiotic stress-inducible facilitated diffusion
業研究センターtransporter for monosaccharides
Cornell University
PHS1 regulates meiotic recombination and homologous chromosome pairing by controlling thetransport of RAD50 to the nucleus.
Carnegie Institution
Brassinosteroid signal transduction from cell-surface receptor kinases to nuclear transcription
factors
九州大学、名古屋大学
The ethylene response factors SNORKEL1 and SNORKEL2 allow rice to adapt to deep water.

Proc. Natl.
Acad. Sci. USA
Nat. Cell Biol.
Kim TW, Guan S, Sun Y, Deng Z, Tang W, Shang JX, Sun Y,
Burlingame AL, Wang ZY.
NatureHattori Y, Nagai K, Furukawa S, Song XJ, Kawano R, Sakakibara
H, Wu J, Matsumoto T, Yoshimura A, Kitano H, Matsuoka M, Mori
H, Ashikari M.
Proc. Natl.
Jin H, Hong Z, Su W, Li J.
University of Michigan
A plant-specific calreticulin is a key retention factor for a defective brassinosteroid receptor in
Acad. Sci. USA
the endoplasmic reticulum.
Dev. Biol.
Universidad Miguel Hernandez Antagonistic interactions between Arabidopsis K-homology domain genes uncover PEPPER
Ripoll JJ, Rodriguez-Cazorla E, Gonzalez-Reig S, Andujar A,
as a positive regulator of the central floral repressor FLOWERING LOCUS C .
Alonso-Cantabrana H, Perez-Amador MA, Carbonell J, MartinezLaborda A, Vera A.
Proc. Natl.
名古屋大学
Miura K, Agetsuma M, Kitano H, Yoshimura A, Matsuoka M,
A metastable DWARF1 epigenetic mutant affecting plant stature in rice.
Acad. Sci. USA Jacobsen SE, Ashikari M.
NatureKwon C, Neu C, Pajonk S, Yun HS, Lipka U, Humphry M, Bau S, Max-Planck-Institute for Plant Co-option of a default secretory pathway for plant immune responses.
Straus M, Kwaaitaal M, Rampelt H, El Kasmi F, Jürgens G, Parker Breeding Research
J, Panstruga R, Lipka V, Schulze-Lefert P.
J. Biol. Chem. Wang YQ, Feechan A, Yun BW, Shafiei R, Hofmann A, Taylor P, University of Edinburgh
S-nitrosylation of AtSABP3 antagonizes the expression of plant immunity.
Xue P, Yang FQ, Xie ZS, Pallas JA, Chu CC, Loake GJ.
Proc. Natl.
独立行政法人理化学研究所 Evolutionary linkage between eukaryotic cytokinesis and chloroplast division by dynamin
Miyagishima SY, Kuwayama H, Urushihara H, Nakanishi H.
Acad. Sci. USA
proteins.

64

35

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

イ

当該リソースの区分

ネ

代表機関（課題管理者氏名）国立遺伝学研究所(倉田のり）

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）九州大学(佐藤光）、東京大学(長戸康郎）、名古屋大学(北野

戦略作業部会の判定（記入の必要なし）

運営委員長

奥野員敏

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 28年度頃）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①モデル植物化した野生イネの収集と① 突然変異系統など栽培イネ実験系統 ①日本型イネ（水稲品種「キタアケ」）変 ・ 限られた遺伝子・ゲノム情報
異体など、延べ1443系統の収集に成功 ・ 野生イネ実験基盤の欠如
提供の新規収集（目標値2533系統）②突然変異体の受託解析による遺伝子② 野生リソースの分類評価と情報高度 ②野生イネ211系統の耐病性試験を実
情報を含めた総合提供
化（野生イネ150系統の耐病性試験を実 施。野生イネ分類DNAマーカー38種類を【具体的状況の変化の内容】
作成。
施）③全リソースの高度付加情報の収集と③ イネ統合データベースOryzabaseを通 ③総収集数16,193系統のうち13,439系 ①諸外国の野生資源の囲い込み。
提供
じた情報公開・高度化
統のデータ情報を公開②メタゲノム解読技術の発展【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】① 提供を受けた突然変異体など実験系 ①突然変異体などイネ実験系統を安定 ③野生ゲノム多様性遺伝子の需要拡大 ①野生イネの多様性を活かし、かつてな
い画期的な育種を展開している。
統を利用して迅速に成果を得ている。
的に提供（年平均26件）。
②全ゲノムをカバーする突然変異体の② 世界に分布する野生イネ系統とその ②野生イネ材料を安定的に提供（年平 ④比較ゲノム解析の普及
分譲・受託解析によって研究スピードが系統情報を活用してハイレベルな研究を 均26件）。系統情報をインターネット上で加速・促進されている。
行っている。
配信。
③ コミュニティが国際的に拡大している。

③リソース材料とその情報サイトである
Oryzabaseを世界規模で利用している。

③海外分譲実績あり（提供実績104件中17件が海外）。

【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①野生イネ遺伝子を導入した栽培イネ ①栽培イネ実験系統を新たに632系統
実験系統の収集。 指標：収集した実験 収集・保存した。
系統数(2010年までの目標値733系統）。

【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）①事業実施担当者の継続性☑後継者等あり □後継者等なし②目標：世代短縮を可能にする突然変 ②突然変異系統を新規に811系統収集 ②後継者の人材育成状況□順調に育成中 ☑後継人材がいない
異体の収集と保存。
指標：600系統/ し、第一期から累積合計6838系統を保存している。
年を収集する。
③目標：他殖性の高い野生イネの純系維持と整理分類。 指標：野生イネの保存の安定的維持系統数。

③第１期で収集した野生イネ6801系統を ③組織的な支援体制☑整っている。 □支援体制がない。
維持保存している。

65【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：野生イネリソースのモデル植物化。指標：Cゲノム種間交雑自殖100系
統と標準地図情報収集。Cゲノム種200の変異系統。
②目標：突然変異体プールの充実化。
指標：インド型変異体1000系統の収集。
③目標：突然変異解析の総合提供。
指標：変異体スクリーニングとその種子をセットで提供する実費ベース取組みを実施。

36

④目標：イネリソースの形質データなど高度化。 指標：収集した情報点数。

④総数7594点のリソースデータを収集し 【特記事項】
た。

④目標：全リソースの高度情報提供。
指標：系統の特徴など延べ１万点をこえる情報の集積と提供。
リソース維持管理の従事者には、リソー ⑤目標：世界トップレベルのリソース機⑤目標：安定したリソース提供と学術的 ⑤毎年50件以上の安定した提供を行な貢献。 指標：年間提供件数とリソース い、重要な成果論文が報告されている スに関する充分な知識と経験が必要で 関。 指標：国内外から提供件数100件/あるが、NBRPでは有期雇用のため長期 年以上。
を利用した成果論文の報告数。
(第２期で延べ28報）。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） 的な人材確保・育成が難しい。
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

66

37

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：イネ
番号

分野

発行年

雑誌名

著者名
所属
タイトル
Hattori Y, Nagai K, Furukawa S, Song XJ,
名古屋大学、九州大学、農業生
The ethylene response factors SNORKEL1 and SNORKEL2 allow rice to adapt to deep water.
Kawano R, Sakakibara H, Wu J, Matsumoto
物資源研究所T, Yoshimura A, Kitano H, Matsuoka M, Mori
Asano K, Hirano K, Ueguchi-Tanaka M,
名古屋大学、九州大学
Isolation and characterization of dominant dwarf mutants, Slr1-d, in rice.
Angeles-Shim RB, Komura T, Satoh H,
Kitano H, Matsuoka M, Ashikari M.
Kawakatsu T, Taramino G, Itoh J, Allen J,
東京大学、米デュポン、理化学 PLASTOCHRON3/GOLIATH encodes a glutamate carboxypeptidase required for
Sato Y, Hong SK, Yule R, Nagasawa N,
研究所
proper development in rice.
Kojima M, Kusaba M, Sakakibara H, Sakai H,

1

5704

2009

Nature

2

5704

2009

Mol. Genet.
Genomics.

3

5704

2009

Plant J.

4

5704

2009

5

5703

2009

Plant Cell
Physiol.

Oki K, Inaba N, Kitagawa K, Fujioka S, Kitano 福井県立大学、理化学研究所、 Function of the alpha subunit of rice heterotrimeric G protein in brassinosteroid
H, Fujisawa Y, Kato H, Iwasaki Y.
名古屋大学signaling.

6

5706

2009

Breeding
Science

弘前大学、中央農業総合研究
Kawasaki A, Imai K, Ushiki J, Ishii T, Ishikawa
Molecular constitution of weedy rice (Oryza sativa L.) found in Okayama
センター、岡山県農業総合センR.
prefecture, Japan
ター

7

5701

2009

Breeding
ScienceKarki S, Tsukiyama T, Okumoto Y, Rizal G,
Naito K, Teraishi M, Nakazaki T, Tanisaka T.

京都大学、米ジョージア大学

Analysis of distribution and proliferation of mPing family transposons in a wild rice
(Oryza rufipogon Griff.)

8

5704

2009

PLoS Genet.

Suzaki T, Ohneda M, Toriba T, Yoshida A,
Hirano HY.

東京大学

FON2 SPARE1 redundantly regulates floral meristem maintenance with FLORALORGAN NUMBER2 in rice.

9

5701

2008

Theor. Appl.
Genet.

Chung MC, Lee YI, Cheng YY, Chou YJ, Lu 台湾中央研究院 植物微生物学
Chromosomal polymorphism of ribosomal genes in the genus Oryza.
CF.
研究所

10

6004

2008

Genetics

Huang CL, Hwang SY, Chiang YC, Lin TP.

11

5703

2008

Electrophoresis

Khan N, Katsube-Tanaka T, Iida S,
Yamaguchi T, Nakano J, Tsujimoto H.

12

5703

2008

J. Agric. Food
Chem.

Khan N, Katsube-Tanaka T, Iida S,
Yamaguchi T, Nakano J, Tsujimoto H.

13

5701

2008

DNA Res.

14

5704

2008

Mol. Genet.
Genomics.

15

5807

2008

Breeding
Science

Takahashi H, Sato YI, Nakamura I.

16

5704

2008

Genes Genet.
Syst.

Teranishi C, Yoshida K, Miyashita NT.

17

5701

2008

Genes Genet. Tsuchimoto S, Hirao Y, Ohtsubo E, Ohtsubo
Syst.
H.

18

5807

2007

Heredity

Kato H, Tezuka K, Feng YY, Kawamoto T,
Takahashi H, Mori K, Akagi H.

秋田県立大学、秋田県農林水
Structural diversity and evolution of the Rf-1 locus in the genus Oryza.
産技術センター農業試験場

19

5701

2007

GenomeKawakami S, Ebana K, Nishikawa T, Sato Y,
Vaughan DA, Kadowaki K.

農業生物資源研究所、総合地 Genetic variation in the chloroplast genome suggests multiple domestication of
球環境学研究所
cultivated Asian rice (Oryza sativa L.).

20

5807

2007

Genes Genet.
Syst.

Xu JH, Cheng C, Tsuchimoto S, Ohtsubo H,
Ohtsubo E.

Proc. Natl.
Miura K, Agetsuma M, Kitano H, Yoshimura
Acad. Sci. USA. A, Matsuoka M, Jacobsen SE, Ashikari M.

名古屋大学、九州大学、米カリ
A metastable DWARF1 epigenetic mutant affecting plant stature in rice.
フォルニア大学

台湾大学、台湾国立自然科学
Molecular evolution of the Pi-ta gene resistant to rice blast in wild rice (Oryza
博物館、国立台湾師範大学、台rufipogon).
湾国立屏東科技大学
Diversity of rice glutelin polypeptides in wild species assessed by the higher鳥取大学、近畿中国四国農業
temperature sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and
研究センター
subunit-specific antibodies.
鳥取大学、近畿中国四国農業 Identification and variation of glutelin alpha polypeptides in the genus Oryza
研究センターassessed by two-dimensional electrophoresis and step-by-step immunodetection.

上海交通大学、中国科学院、中Lu T, Yu S, Fan D, Mu J, Shangguan Y, Wang
Collection and comparative analysis of 1888 full-length cDNAs from wild rice Oryza
国復旦大学、株式会社植物ゲノ
Z, Minobe Y, Lin Z, Han B.
rufipogon Griff. W1943.
ムセンター
Suzuki T, Eiguchi M, Kumamaru T, Satoh H,
国立遺伝学研究所、九州大学、 MNU-induced mutant pools and high performance TILLING enable finding of any
Matsusaka H, Moriguchi K, Nagato Y, Kurata
広島大学、東京大学
gene mutation in rice.
N.
千葉大学、総合地球環境学研 Evolutionary analysis of two plastid DNA sequences in cultivated and wild species
究所of Oryza
京都大学

DNA polymorphism in the SUPERWOMAN1 (SPW1) locus of the wild rice Oryza
rufipogon and its related species.

東京大学

New SINE families from rice, OsSN, with poly(A) at the 3' ends.

東京大学

Phylogenetic
analysis of Oryza rufipogon strains and their relations to Oryza sativa
67
strains by insertion polymorphism of rice SINEs

38

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名 コムギ

当該リソースの区分
第２期申請時の区分

代表機関（課題管理者氏名） 国立大学法人 京都大学（遠藤隆）

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） 公立大学法人 横浜市立大学（荻原保成）
運営委員長 辻本 壽

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 ３４ 年度頃）
【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】基礎研究（遺伝学・染色体工学・ゲノム ①必要不可欠な研究基盤としてのコムギ①未整備の野生種・在来種の保存・収 ①目標系統数(2800系統）を新規に収集し、第１期収集・保存分と併せて、国内 集・保存し、安定的にリソースの配布を 研究・進化生物学・生理学）と、応用研 リソースを永続的に保存・配布する体制、および新規系統の寄託を受ける体制
究（育種）が行われていた。実験系統外の研究者に信頼性を具備したリソース 行っている。
は、国内外で主に基礎研究に利用され を確立する。
の配布を行っている。
②種子系統にジェノタイプ情報を付加し ②代表48系統に関し、目標数（1000）の ていた。一方、野生種・在来種は主に進 ②系統にジェノタイプ情報、表現型情報
マーカーのプロファイルを取得している。 化生物学的研究に利用されていた。
系統の特徴づけを行っている。
などを付加し、研究の即戦力となるコム
遺伝的多様性評価のための推奨マー
ギリソースの保存・配布体制を確立す【具体的状況の変化の内容】
カーセットを選抜している。
る。
③世界的にトップクラスのコムギ発現遺 ③世界で最大数のコムギESTクローンを ①世界的な人口増大に伴う食糧問題③「コムギリソースセンター」の設置し、伝子クローンと配列情報の収集・保存を 収集・保存している。完全長cDNAクロー （食糧戦略）の重要性が増した。
質・量ともに長期安定したリソースの提供
ンの収集・保存数も世界で最大である。
している。
を担保する。
②環境変動や地域紛争により世界的に遺伝資源が浸食されている。当リソース
は、遺伝資源浸食前の多様性を保持す【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
るリソースとして重要性を増した。
①有用遺伝子の単離に向けた研究が進 ①有用遺伝子の分子マッピングが進展 ③低炭素社会の実現や生物資源の新 ①倍数性のモデル植物であるコムギの規機能利用に対する社会的ニーズが高 遺伝学・ゲノム科学・染色体工学を進展展している。
している。
まった。
させる。アウトリーチとして、育種技術の向上・改善に貢献する。
②遺伝子の機能解析が進展している。 ②発育段階特異的、ストレス応答特異 ④ゲノミクスの進展によりゲノムワイド ②地球規模での環境変動や人口増大に的遺伝子発現解析が進展している。
マーカー利用が近い将来に実現可能に より、コムギの品種育成へのニーズが高なろうとしている。
まる。遺伝的多様性を持つリソースの安定供給を必要とする。
③リソースのもつ遺伝的多様性のコムギ ③野生種・在来種の遺伝的多様性をパ ⑤「食料・農業・農村基本計画」（平成22 ③ゲノム研究ツールにより遺伝的多様性
ンコムギに導入する基礎研究が進展し 年3月閣議決定）において自給率向上目 と表現型との相関解析が可能になる。
育種への利用が進んでいる。
ている。ジェノタイピングによるコアコレク 標（コムギ自給率40％）が設定された。 「表現型」から「遺伝子型」に向かう研究
ションの作成が望まれている。
におけるリソース利用が活発化する。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）
68【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）39

①項目：コムギ遺伝資源を国内外の研究者へ継続的に提供する。
指標：第2期を通じて提供数が安定している。

①項目：コムギ遺伝資源を国内外の研究者へ継続的に提供する。
指標：年間約80件、約2000系統の安定的な提供を行っている。

②項目：京都大学農学研究科所蔵の未整備の野生種・在来種を収集・保存し、配布可能にする。
指標：年間1400系統を収集・保存し、配布対象に加えている。

②項目：京都大学農学研究科所蔵の未 ②後継者の人材育成状況②目標：リソースの永続的な保存体制を整備の野生種・在来種を収集・保存し配☑順調に育成中 □後継人材がいな 整備する。
布可能にする。
い
指標：リソース管理の一元化とバックアッ
指標：2年間で約2800系統を収集・保存
プストックの作成を行っている。リソース
し、配布対象に加えている。
維持のための人材育成と組織的支援体制が確立している。

①事業実施担当者の継続性☑後継者等あり □後継者等なし①目標：リソースの安定的な保存・配布体制を整備する。
指標：保存数・提供数が安定している。

③目標：コミュニティーが必要とするリ③項目：既報マーカー情報を収集し、リ ③項目：既報マーカー情報を収集し、リ ③組織的な支援体制
ソースにジェノタイプ情報を付加する。 ソースにジェノタイプ情報を付加する。
☑整っている。 □支援体制がない。 ソースが提供されている。
指標：寄託体制を確立し、研究の即戦力指標：48系統に関して年間400のSSR
指標：既報3000SSRマーカー情報を収集となるリソースの保存を増強している。
マーカーの増幅プロファイルを得て、6倍 し、48系統に関して1000個のSSRマー
性コムギの遺伝的多様性調査に好適な カーの増幅プロファイルを得ている。6倍マーカーセットを選抜している。
性コムギの遺伝的多様性調査の推奨
マーカーセットを選抜している。
④目標：種子系統に対し高度に情報付加④項目：コムギ発現遺伝子クローンの体 ④項目：コムギ発現遺伝子クローンの体 【特記事項】
系的収集・保存を行う。
・中核機関・分担機関が組織的なサポー する。
系的収集・保存を行う。
指標：新規ESTクローンを年間20,000収 指標：ストレス応答に関する新規ESTク トをしている。一方で、「コムギリソースセ 指標：系統に表現型情報とジェノタイプ情集・保存している。
ローンを60,000以上収集・保存している。 ンター」の設置がユーザーから望まれて 報を付加している。
完全長cDNAクローンを約6000解読し、 おり、京都大学大学院農学研究科にリ
ソースセンターを設置する方向で検討を保存している。
始めている。
・リソース利用拡大には系統にジェノタイ ⑤目標：世界的なリソース拠点であり続⑤項目：リソースのホームページ⑤項目：リソースのホームページ
KOMUGIを拡充し、リソースへのアクセス KOMUGIを拡充し、リソースへのアクセス プ情報を付加することが望ましい。ジェノ ける。
タイピング用機器の追加、または将来的 指標：実験系統に関する世界3拠点の一がしやすい環境整備を行う。
がしやすい環境整備を行う。
指標：ものとしてのリソース（種子系統・ 指標：リソース情報の閲覧・リクエストサ に高効率マーカーシステムが適用でき つ、野生種・在来種に関する世界5拠点の一つとして位置づけられている。コム
イトを公開している。データベースワーキ れば、さらに迅速かつ安価にコムギリ
クローン）をリクエストできるサイト、リ
ソース情報（塩基配列、マーカージェノタ ングを組織し、ユーザー側からのデータ ソースにマーカージェノタイプ情報を付 ギの発現遺伝子クローンとその塩基配列加できる。
に関する世界一のリソースセンターと認イプ）取得ができるサイトとしてKOMUGI ベースへの要望を取り入れている。
知されている。
データベースを整備している。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

6940

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：コムギ
番号 分野 発行年
1

6101

2007

2

5804

2007

3

5804

2007

4

5807

2008

5

2004

2008

6

5706

2008

7

2301

2009

8

5804

2009

9

6001

2009

10

6105

2009

11

6105

2009

12

6001

2009

13

6001

2009

14

6001

2009

15

5701

2010

16

5701

2010

17

2501

2010

18

5701

2010

19

5703

2010

20

5703

2010

雑誌名

著者名

所属

タイトル

国際農林水産業研究 Can biological nitrification inhibition (BNI) genes from perennial Leymus
Plant and Soil
G. V. Subbarao et al. (著者12名）
racemosus (Triticeae ) combat nitrification in wheat farming?
センター
BMC Molecular S. A. Boden, N. Shadiac, E. J. Tucker, P. Langridge
Expression and functional analysis of TaASY1 during meiosis of bread wheat
アデレード大学
Biologyand J. A. Able
(Triticum aestivum ).
Genetic and epigenetic alteration among three homoeologous genes of a class E
Plant Cell
N. Shitsukawa et al. （著者10名）
福井県立大学
MADS box gene in hexaploid wheat.
Flowering time diversification and dispersal in central Eurasian wild wheat
PLoS ONEY. Matsuoka, S. Takumi and T. Kawahara
福井県立大学
Aegilops tauschii Coss.: Genealogical and ecological framework.
CSIRO, Adelaide,
Environmental Toxicology
M. S. Warne et al. （著者12名）
Modeling the toxicity of copper and zinc salts to wheat in 14 soils.
and Chemistry
Australia
Plant
Genealogical analysis of subspecies divergence and spikelet-shape diversification
Systematics and Y. Matsuoka, E. Nishioka, T. Kawahara and S. Takumi 福井県立大学
in central Eurasian wild wheat Aegilops tauschii Coss.
Assessment of adaptive evolution between wheat and rice as deduced from fullBMC Genomics K. Kawaura et al. （著者12名）
横浜市立大学
length common wheat cDNA sequence data and expression patterns.
A genetic network of flowering-time genes in wheat leaves, in which an
Plant Journal
S. Shimada et al. （著者11名）
福井県立大学APETALA1/FRUITFULL-like gene, VRN1 , is upstream of FLOWERING LOCUS T.
Theoretical and G. Ishikawa, T. Nakamura, T. Ashida, M. Saito, S.
農研機構 東北農研セ Localization of anchor loci representing five hundred annotated rice genes toApplied Genetics Nasuda, T. R. Endo, J. Wu and T. Matsumoto
ンター
wheat chromosomes using PLUG markers.
M. Garg, H. Tanaka, N. Ishikawa, K. Takata, M. Yanaka
A novel pair of HMW glutenin subunits from Aegilops searsii improves quality of
Cereal Chemistry
鳥取大学
hexaploid wheat.
and H. Tsujimoto
Journal of AOAC T. Hirao, S. Watanabe, Y. Temmei, M. Hiramoto and H.
Qualitative polymerase chain reaction methods for detecting major food allergens
ハウス食品
Kato
International(peanut, soybean, and wheat) by using internal transcribed spacer region.
Quantitative variation of Revolver transposon-like genes in synthetic wheat andBreeding Science M. Tomita, T. Noguchi and T. Kawahara
鳥取大学
their structural relationship with the LARD element.
S. Takumi, E. Nishioka, H. Morihiro, T. Kawahara andNatural variation of morphological traits in wild wheat progenitor Aegilops tauschii
Breeding Science神戸大学
Y. Matsuoka
Coss.
N. Mori, Y. Kondo, T. Ishii, T. Kawahara, J. Valkoun
Genetic diversity and origin of timopheevi wheat inferred by chloroplast DNA
Breeding Science
神戸大学
and C. Nakamura
fingerprinting.
Genes and
Dissection of barley chromosome 4H in common wheat by the gametocidal
M. Sakata, S. Nasuda and T. R. Endo
京都大学
Genetic Systems
system and cytological mapping of chromosome 4H with EST markers.
Genes andS. Yamano, M. Nitta, H. Tsujimoto, G. Ishikawa, T.
Molecular mapping of the suppressor gene Igc1 to the gametocidal gene Gc3-C1
京都大学
Genetic Systems Nakamura, T. R. Endo and S. Nasudain common wheat.
Y. Terasawa, K. Takata, H. Hirano, K. Kato, T.
Genetic variation of high-molecular-weight glutenin subunit composition in Asian
Genetic Resources and山形大学
Crop Evolution
Kawahara, T. Sasakuma and T. Sasanuma
wheat.
Genes and
Identification of novel Mlo family members in wheat and their genetic
S. Konishi, T. Sasakuma and T. Sasanuma
山形大学
Genetic Systems
characterization.
Plant Physiology
Utility of leaf senescence-associated gene homologs as developmental markers in
T. Kajimura, N. Mizuno and S. Takumi
神戸大学
and Biochemistrycommon wheat.
Hypersensitive response-like reaction is associated with hybrid necrosis in
PLoS ONEN. Mizuno, N. Hosogi, P. Park and S. Takumi
神戸大学
interspecific crosses between tetraploid wheat and Aegilops tauschii Coss.

70

41

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 オオムギ
代表機関（課題管理者氏名） 岡山大学（佐藤和広）

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） なし
運営委員長 三重大学 掛田克行

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】①東アジアの拠点として国内外で必要とさ ①国内外からの全ての要請に応えてリれるリソースを供給する
ソースを配付している

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成２５年度頃）【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①有用な遺伝子変異の情報と変異を持系統保存事業費での系統配付は行われつ系統の提供ていたが、cDNA情報はほとんどなく、
BACライブラリーも整備されていなかった。系統情報は電子化されておらず、出版された論文に基づいて系統を分譲依頼することが多かった。
②変異系統のゲノム情報の提供とそれ②ムギ類ゲノム解析の進展に伴ってゲノム ②配列情報を中心にデータベースに第に基づくリソース提供
リソースへのアクセスが増加する
二期月平均16486件のアクセスがある 【具体的状況の変化の内容】③オオムギコアコレクションの中心機関とし ③特性情報、画像情報を含めたデータと ①巨大なオオムギのゲノムが2011年ドラ ③遺伝子単離のために必要な遺伝学的フト解読、2015年完全解読予定である 材料の提供て東アジアコレクションを設定し、配付する 共にリソース配付を実施している②平成22年度から岡山大学資源植物科学研究所が「植物遺伝資源・ストレス科学研究拠点」となり国内外との共同研究が進められている【目標とした研究コミュニティの状況】①国内外に安定したユーザーが存在する【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①第二期を通じて安定したリソース配付 ③農林水産省が現在提唱している食料 ①遺伝子単離研究のためのリソース提の要請がある
自給率向上には麦類生産およびその基 供を望んでいる
礎研究が必須である②ゲノム解析が進展しcDNA等の配列情報 ②オオムギのゲノム解析プロジェクトへ ④地球温暖化や砂漠化による不良環境 ②オオムギのムギ類のモデルゲノムとしのリソースおよび情報提供、さらにコム に最も適応した作物であるオオムギが、 ての利用価値が高いと指摘しているへの需要が増える
ギのゲノム解析プロジェクトでの情報活 戦略的に植物科学に利用される用が行われている③リソースを利用した成果がトップジャーナ ③Science、PNASなどの一流雑誌に論 ⑤コムギのモデルゲノムとしての研究が ③岡山大学のリソースに継続的なニーズ
文掲載されているより盛んになるを予定している
ルに掲載される

71

42

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】【到達度の評価事項と目標】（該当する□内に「レ」を記入）（項目と客観的指標）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：東アジアのリソース拠点として機能 ①目標：東アジアのリソース拠点として ①事業実施担当者の継続性①目標：系統リソースのSNP等のゲノム■後継者等あり □後継者等なしする情報を公開する機能している指標：国際的な会議で重要性が認知される 指標：FAO傘下の国際的な会議で重要
指標：系統情報データベースにDNAフィ
ンガープリントデータを追加する性が認知されている②目標：世界的に独自性の高い系統を配 ②目標：世界的に独自性の高い系統を ②後継者の人材育成状況②目標：系統リソースにおける単離遺伝■順調に育成中 □後継人材がいない 子の塩基配列変異情報を公開する
付する配付している指標：他の機関に重複のないリソースを維 指標：インド以東のオオムギ品種、突然
指標：系統情報データベースにDNA配列
持する
変異情報を追加する
変異系統など他の機関に重複がない③目標：cDNAリソースの世界的拠点として ③目標：cDNAリソースの世界的拠点とし ③組織的な支援体制③目標：遺伝子単離のための遺伝学的■整っている。 □支援体制がない。
機能する材料を提供するて機能している指標：量的、質的にリソースを評価する
指標：リソースを利用した成果論文中、遺指標：世界のEST情報およびクローンの伝子単離に関する論文が増加する
約25%、完全長cDNA情報の全てを提供
している④目標：国際ゲノムシーケンシングコンソシ ④目標：国際ゲノムシーケンシングコン 【特記事項】提供数は安定しているが、増加 ④目標：寄託によってリソースの多様化
アムの基盤リソースを提供する
ソシアムの基盤リソースを提供している 傾向にはない。特にcDNA等のゲノムリソー をはかる
指標：シーケンシングコンソシアムのプログ 指標：我が国のシーケンシングプロジェ スはクローンよりも配列のアクセスが多い 指標：ユーザーに対する寄託を定期的依
ラムにリソースが組み込まれるクトの基幹リソースであり、国際コンソシ
頼し、ユーザーおよび機関内からの寄託
アムのEST情報、遺伝子予測に用いらを各年度１コレクション（マップ集団など）れている以上追加する⑤目標：リソースにユニークな特性情報、配 ⑤目標：リソースにユニークな特性情
列情報等付加価値をつけてユーザーに提 報、配列情報等付加価値をつけてユー供する
ザーに提供している
指標：データベースからの情報公開とアクセ 指標：ESTの電子地図、完全長配列のイ
スログの増加ネへのマップ、系統の画像情報などを含むデータベース全体で月平均16486件ア
クセスされている⑤目標：従前からのリソースの確実な保存と提供
指標：保存数は第二期保有分および寄託によるリソースを維持する。提供数は第二期の平均実績に加えて、①～④にかかわるリソース提供分を追加する【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

72

43

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：

オオムギ

番号

発行年

1

2

分野

5703

2302

2010

2009

雑誌名

著者名

所属

PNAS

Nair SK, Wang N, Turuspekov Y,
Pourkheirandish M, Sinsuwongwat
S, Chen G, Sameri M, Tagiri A,
Honda I, Watanabe Y, Kanamori H,
Wicker T, Stein N, Nagamura Y,
Matsumoto T, Komatsuda T.

NIAS, Japan

Cleistogamous flowering in barley arises from the suppression of microRNA-guided HvAP2
mRNA cleavage.

Plant Physiol.

Schulte D, Close TJ, Graner A,
Langridge P, Matsumoto T,
Muehlbauer G, Sato K, Schulman
AH, Waugh R, Wise RP, Stein N.

IPK, Germany

The international barley sequencing consortium--at the threshold of efficient access to thebarley genome.

Zurich Univ. Switzerland

Analysis of intraspecies diversity in wheat and barley genomes identifies breakpoints of ancient
haplotypes and provides insight into the structure of diploid and hexaploid triticeae gene pools.

Okayama Univ., Japan

Development of 5006 full-length CDNAs in barley: a tool for accessing cereal genomics
resources.

3

2302

2009

Plant Physiol.

Wicker T, Krattinger SG, Lagudah
ES, Komatsuda T, Pourkheirandish
M, Matsumoto T, Cloutier S, Reiser
L, Kanamori H, Sato K, Perovic D,
Stein N, Keller B.

4

2301

2009

DNA Res.

Sato K, Shin-I T, Seki M, Shinozaki
K, Yoshida H, Takeda K, Yamazaki
Y, Conte M, Kohara Y.

5

6001

2009

Theor Appl Genet..

6

5703

2009

Curr Opin Plant
Biol..

7

6001

2009

8

5701

2009

9

5703

2008

New Zealand Institute forMarker development and characterisation of Hordeum bulbosum introgression lines: a resource
Johnston PA, Timmerman-Vaughan
Plant and Food Researchfor barley improvement.
GM, Farnden KJ, Pickering R.
LimitedDistelfeld A, Li C, Dubcovsky J.

Tonooka T, Aoki E, Yoshioka T,
Taketa S.
Sakai K, Nasuda S, Sato K, Endo
Genes Genet Syst..
TR.
Breed. Sci.

PNAS

タイトル

Taketa S, Amano S, Tsujino Y, Sato
T, Saisho D, Kakeda K, Nomura M,
Suzuki T, Matsumoto T, Sato K,
Kanamori H, Kawasaki S, Takeda K.

Univ. California, USA

Regulation of flowering in temperate cereals.

National Crop Research A novel mutant gene for (1-3, 1-4)-β-D-glucanless grain on barley (Hordeum vulgare L.)
Institute, Japan
chromosome 7H.
Dissection of barley chromosome 3H in common wheat and a comparison of 3H physical andKyoto Univ., Japan
genetic maps.

Okayama Univ., Japan

Barley grain with adhering hulls is controlled by an ERF family transcription factor gene
regulating a lipid biosynthesis pathway.

73

44

10

6105

2008

11

2302

2008

12

6001

2008

Iimure T, Takoi K, Kaneko T,
Kihara M, Hayashi K, Ito K, Sato K,
Takeda K.

Sapporo Brewery, Japan

Novel prediction method of beer foam stability using protein Z, barley dimeric alpha-amylase
inhibitor-1 (BDAI-1) and yeast thioredoxin.

BMC Plant Biol.

Mochida K, Saisho D, Yoshida T,
Sakurai T, Shinozaki K.

RIKEN, Japan

TriMEDB: a database to integrate transcribed markers and facilitate genetic studies of the tribe
Triticeae.

Plant Breed.

Hirota N, Kaneko T, Ito K, Takeda
K.
Komatsuda T, Pourkheirandish M,
He C, Azhaguvel P, Kanamori H,
Perovic D, Stein N, Graner A,
Wicker T, Tagiri A, Lundqvist U,
Fujimura T, Matsuoka M,
Matsumoto T, Yano M.

NIAS, Japan

Six-rowed barley originated from a mutation in a homeodomain-leucine zipper I-classhomeobox gene.

J Agric Food Chem..

Sapporo Brewery, Japan Diversity and geographical distribution of seed lipoxygenase-1 thermostability types in barley.

13

5703

2007

PNAS

14

5807

2007

Ann Bot..

Azhaguvel P, Komatsuda T.

NIAS, JapanA phylogenetic analysis based on nucleotide sequence of a marker linked to the brittle rachis
locus indicates a diphyletic origin of barley.

15

5807

2007

Ann Bot..

Pourkheirandish M, Komatsuda T.

NIAS, Japan

The importance of barley genetics and domestication in a global perspective.

Univ. California, USA

The wheat and barley vernalization gene VRN3 is an orthologue of FT.

John Innes Centre, UK

The pseudo-response regulator Ppd-H1 provides adaptation ot photoperiod in barley.

16

5703

2006

PNAS

Yan L, Fu D, Li C, Blechl A,
Tranquilli G, Bonafede M, Sanchez
A, Valarik M, Yasuda S, Dubcovsky
J.

17

5703

2005

Science

Adrian Turner, James Beales,
Sebastien Faure, Roy P. Dunford,
David A. Laurie.

18

6104

2005

Biosci Biotechnol Kuroda H., Kojima H., Kaneda H.,
Biochem.
and Takashio M.

19

5703

2003

Science

20

5703

2003

Plant Physiol.

Liuling Yan, Artem Loukoianov,
Ann Blechl, Gabriela Tranquili,
Wusirika Ramakrishna, Phillip
SanMigue, Jeffrey L. Benetzen,
Viviana Echenique, Jorge
Dubcovsky.

Biosci Biotechnol
Biochem.

Univ. California, USA

Characterization of 9-fatty acid hydroperoxide lyase-like activity in germinating barley seeds
that transforms 9(S)-hydroperoxy-10(E),12(Z)-octadecadienoic acid into 2(E)-nonenal.

The wheat VTN2 gene is a flowering repressor down-regulated by vernalization.

Chono M., Honda I., Zeniya H.,
Yoneyama K., Saisho D., Takeda K., National Crop Research A Semidwarf phenotype of barley uzu results from a nucleotide substitution in the gene
Institute, Japan
encoding a putative brassinosteroid receptor.
Takatsuto S.,Hoshino T., and
Watanabe Y.
74

45バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

藻類

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名）独立行政法人国立環境研究所（笠井文絵）

第２期申請時の区分

発展が見込まれるバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）神戸大学（川井浩史）,筑波大学（井上勲）
運営委員長

白岩善博

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成37年度頃）【NBRP開始時の状況】【具体的目標】① リソース利用の促進を計る（付加価値向 ①遺伝子データ、株特性をデータベースに整 ①リソースの学術利用に関して、研究者 ①藻類リソースを集約化して我が国独自の上、株情報整備、データベース整備）備。これにより分類学的に保証され、より信 は外国産研究リソースの使用や国産研 藻類リソースを確保する
頼度の高い株の提供を実現。検索機能の強 究リソースの海外への持ち出しに寛容で化、オンライン注文の開始により、利用者の あった。
利便性を格段に増した。
②サトウキビやトウモロコシなどの畑作②長期保存体制整備（保存法開発、凍結保 ②微細藻類については現時点で凍結可能な 植物が石油代替バイオマスと考えられ、 ②藻類リソースに関するワンストップサービス
存の実施）
約600系統を凍結保存した。大型海藻では、 研究開発・栽培が拡大した。
を提供する
全ゲノム解析株を含むシオミドロ類について
新たに生殖細胞を用いる方法を開発し193
株を凍結保存した。
③世界最高水準リソース確保（重要種の確保）【具体的状況の変化の内容】③進化的重要種、生態学的重要種（ゲノム ①2010年の生物多様性条約名古屋議定書 ③高品質の藻類リソースを保有する点で世解析元株を含む）、新綱・新属・新種記載の の採択により、各国の資源管理が進み、我 界のトップランナーとなるタイプ株（正規株）など世界的標準種が国内 が国においても、今後国内の大型プロジェク
外から収集・寄託され、国際的に認知されて トで作られる日本産藻類リソースの確保がでいることを実感。また、分担機関神戸大は多 きなければ、学術基礎研究資源の外国への細胞藻類で初のシオミドロゲノム解析に貢献 依存という事態に陥り、大いに不利益をこうするとともに、本種および近縁種の系統株を むる可能性があるため、リソース確保が収集し、提供が可能になった。
益々重要となった。
②食料と競合する陸生バイオマスの問題が顕在化し、世界各国において航空燃料への藻類バイオマスの導入が報告されるなど、グリーンイノベーションの対象生物として藻類が必須のものとなった。

【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①リソースを安定的に必要とする多分野の研究コミュニティが存在し、そのコミュニティが拡大する①第2期開始当初の年間利用機関数（1大学 ③
1機関とカウント）が約100機関であったのが、平成21年度には約170機関に増加した。
4年間通算の利用機関数は356機関（国内
237機関,国外30ヶ国119機関）①新分野、新たな学会の参入により、より多分野からなる研究コミュニティが形成され、リソース機関と密接に連携している

75

46

②世界標準系統（ゲノム解析株、分類学的タ ②本事業に世界標準系統（ゲノム解析株、 ④イプ種）を寄託する
分類学的タイプ種）を寄託するコミュニティが形成されている。
③提供費用の受益者負担、提供先の論文 ③リソース利用の実費徴収や提供先の論文 ⑤への記載、研究成果のフィードバックを前提 への記述については、ぼぼすべてで実行さとしてリソースの提供を受けることを理解した れており、その点でユーザーの理解は完全
研究コミュニティの形成に得られているといえる。

②提供を受けたリソースにより学術研究成果が公表され、フィードバックされる【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）③世界的に必要とされるリソース、世界標準
系統（分類学的タイプ株、正統株、ゲノム解析株など）の寄託先として本事業が定着【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）①事業実施担当者の継続性■後継者等あり □後継者等なし①目標：コミュニティが必要とするリソースを①遺伝子データ（約1500遺伝子）・株特性
提供（約1000系統分）をデータベースに整備し、
指標：ゲノム解析株、大型プロジェクトで開株データとともに公開。遺伝子データの付加発された株、分類学的タイプ種、基準株、生により分類学的に保証され、より信頼度の高態系の主要な構成種等重要種の収集い株の提供を実現。
②目標：世界のトップランナーとしての認知を②微細藻類約600系統、大型海藻では、全 ②後継者の人材育成状況②目標：長期保存体制整備■順調に育成中 □後継人材がいない 得る
指標：凍結保存法の開発、凍結保存、バッ ゲノム解析株を含むシオミドロ類について新
指標：三大拠点の一つとして位置付けられたに生殖細胞を用いる方法を開発し193株をクアップ体制整備ている（提供数、引用数、認知度）
凍結保存した。環境研、神戸大において凍結保存株のバックアップ保存を実施。
③目標：リソース利用の利便性の拡大③データベースおよびホームページを更新 ③組織的な支援体制③目標：リソース利用の拡大
指標：ワンストップサービスが実施されてい指標：分譲件数・分譲株数の増加、分譲の し、検索機能の強化、株情報等の追加、オン■支援体制整っている。 □支援体制がる
利便性（大量培養などのサポートを含む）の ライン注文を開始し利用者の利便性を格段 ない。
に増した。これにより、株の提供件数が増加
向上した。(H19年度以前500-600株、オンライン注文を開始したH20年度740株、H21年度900株）①目標：株の付加価値の向上
指標：分類情報、遺伝子情報整備④目標：重要種の収集指標：ゲノム解析株、分類学的基準株・タ
イプ株、生態学的重要種、リソースとしてのポテンシャルを含む多様な系統群、進化のキーとなる系統群の収集⑤目標：国内外のネットワーク体制の整備
指標：ネットワーク整備とイニシアチブ④ミクロキスティス、シオミドロ（多細胞藻類 【特記事項】④目標：世界的に信頼されたリソース機関とで初）のゲノム解析株、真核最小ゲノムのオ 外国産株の保有に関して、諸外国の機関と なるストレオコッカス、クロロフィルｄ保有株、アウ MOU、MTAを締結する必要があるが、その指標：コンタミがない、分類学的に正しい高レアレア藻綱、ケルコゾアの新属・新種など 際日本の国内法が整備されていないことか 品質のリソース提供が実現されている（常識の収集。
ら対外交渉で不利な場合がある。名古屋議 的だが、現実には世界の主要コレクションで定書発効まで、外国産株の保有、日本での もしばしば問題が報告されている）
生物資源の採集に関して国としてのガイドラ ⑤目標：収集したリソースの恒久的維持⑤国内・国際的な情報センター（JSCC,
指標：リソース保存のための人材育成体制
WDCM, GBIF, AlgaeBASE, StrainInfoなど）へ インが必要。
の確立
リンクを積極的に進め、株へのアクセスの利
便性の向上を図った。国際藻類学会の下に世界の主要な系統株保存施設が情報交換・共通データベースを作成するための国際的な委員会を立ち上げ、日本から議長を選出した。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
7647

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： 藻類
番号 分野 発行年

雑誌名

著者名
Kaneko, T., Nakajima, N.,
Okamoto, et al.

所属
Kazusa DNA ResearchInstitute他

タイトル
Complete genome structure of the bloom-forming toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa NIES-843.

1

2301

2007

DNA Res.

2

2301

2008

BMC Genomics

Cattolico, R. A., Jacobs, M. A., et
University of Washingtonal..

Chloroplast genome sequencing analysis of Heterosigma akashiwo CCAM452 (West Atlantic) and NIES293(West Pacific) strains.

3

2301

2010

DNA Res.

Fujisawa, T., Narikawa, R., et al.

NITE他

Genomic structure of an economically important cyanobacterium, Arthrospira (Spirulina) platensis NIES-39.

4

4804

2010

J. Struct. Biol.

Ogawa, Y., Kimura, S., Wada, M.,
Kuga, S.

Univ Tokyo

Crystal analysis and high-resolution imaging of microfibrillar a-chitin from Phaeocystis .

5

5206

2009

Environ. Sci.
Technol.

Ha, J. H., Hidaka, T., Tsuno, H.

Kyoto
University

Quantification of toxic Microcystis and evolution of its dominance ratio in blooms using real-time PCR.

6

5701

2007

Eukaryot. Cell

Cunningham, Jr., F. X., Lee, H.,
Gantt, E.

University of Maryland

Carotenoid biosynthesis in the primitive red alga Cyanidioschyzon merolae .

7

5701

2008

Genetics

Hamaji, T., Ferris, P. J., Coleman,
Univ. of Tokyo
A.W., et al.

Identification of the minus-dominance gene ortholog in the mating-type locus of Gonium pectorale .

8

5703

2008

Plant Cell Physiol.

Makino, T., Harada, H., Ikenaga,
H., Matsuda, S.,et al.

Marine Biotechnol Inst,
KamaishiCharacterization of cyanobacterial carotenoid ketolase CrtW and hydroxylase CrtR by complementation
analysis in Escherichia coli .

9

5706

2007

Mol. Biol. Evol.

Nozaki, H., Iseki, M., Hasegawa,et al.

Univ. of Tokyo

Phylogeny of primary photosynthetic eukaryotes as deduced from slowly evolving nuclear genes.

10

5706

2008

ProtistKooistra, W. H. C. F., Sarno, et al.

Stazione Zoologica Anton
Global diversity and biogeography of Skeletonema species (Bacillariophyta).
Dohrn

11

5706

2008

BMC Evol. Biol.

Maruyama, S., Misawa, K., et al.

Univ. of Tokyo

Origins of a cyanobacterial 6-phosphogluconate dehydrogenase in plastid-lacking eukaryotes.

12

5706

2009

PLos ONETakishita, K., Yamaguchi, H., etal.

Japan Agcy Marine Earth
Sci & Technol

A hypothesis for the evolution of nuclear-encoded, plastid-targeted glyceraldehyde-3 phosphate
dehydrogenase genes in "chromalveolate" members.

13

5706

2009

Environ. Microbiol. Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe,
Rep.
M. M.

Univ. of Tsukuba

Fine-scale spatial and temporal genetic differentiation of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis
aeruginosa : revealed by multilocus sequence typing.

14

5706

2009

BMC Evol. Biol.

Tanabe, Y., Sano, T., et al.

Univ. of Tsukuba

Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of
toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa .

15

5706

2010

ProtistMarin, B., Melkonian, M.

Univ. of Koln

Molecular Phylogeny and Classification of the Mamiellophyceae class. nov (Chlorophyta) based on Sequence
Comparisons of the Nuclear- and Plastid-encoded rRNA Operons

16

5804

2008

Mol. Biol. Evol.

Cadel-Six, S., Dauga, C.,et al.

Institute of Pasteur

Halogenase genes in nonribosomal peptide synthetase gene clusters of Microcystis (Cyanobacteria): sporadic
distribution and evolution.

17

5804

2009

Appl. Environ.
Microbiol.

Ishida, K., Welker, M., et al.

Humboldt Univ

Plasticity and evolution of aeruginosin biosynthesis in Cyanobacteria.

18

6105

2010

FEBS Letters

Tanioka, Y; Miyamoto, E; et al.

Tokyo Univ Agrplatensis NIES-39

19

6301

2009

ProtistKamikawa, R., Masuda, I.,
Demura, M., et al.

Kyoto University

Mitochondrial group II introns in the Raphidophycean flagellate Chattonella spp. suggest a diatom-toChattonella lateral group II intron transfer.

20

6302

2007

J. Biol. Chem.

Sato, Y., Okuyama, S., Hori, K.

Hiroshima Univ

Primary structure and carbohydrate binding specificity of a potent anti-HIV lectin isolated from thefilamentous cyanobacterium Oscillatoria agardhii .

Methyladeninylcobamide functions as the cofactor of methionine synthase in a Cyanobacterium, Spirulina

77

48

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

広義キク属

当該リソースの区分
第２期申請時の区分

代表機関（課題管理者氏名） 草場 信

発展が見込まれるバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長 渡邉 邦秋

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成34年度頃）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①世界最大規模の広義キク属リソースで ①現在のところ、野生の広義キク属を中 広義キク属植物では分子遺伝学はほと ①世界最大の広義キク属リソースある心としたリソースは本リソースのみであ んど行われてこなかった。またモデル植物と呼べる植物種が存在しなかった。広る。
義キク属内の生物多様性を代表するよ②分子遺伝学的モデルリソースが開発さ ②二倍体キク属野生種キクタニギクを分 うなコアコレクションは存在しなかった。 ②キク科の中の代表的なリソースのひと
れている

つとなる

子遺伝学的モデル植物に選定した。
【具体的状況の変化の内容】③研究基盤リソースが充実している③判別が難しいキク属種を区別する分 ①遺伝資源の利用価値が大きく認識さ ③分子遺伝学的なリソースとして確立されるようになり、野生ギクの国外持ち出 れている
子マーカー等の開発が進んでいる。
しが難しくなった。

②【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①基礎生物学分野でのリソース利用が拡 ①基礎科学分野における論文が多数公 ③
大する
表されている【研究コミュニティの状況】①研究進展にむすびつく新しいリソース
を開発し、寄託する②新規分野研究者のコミュニティへの参加 ②野生ギクを交配に用いた新品種が発 ④が進む
表され、育種関連研究所等に関心が持たれた②リソースを有効利用し、分子遺伝学的解析研究等を進めている

③

③

③

⑤

78

49

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：広義キク属における分子遺伝学 ①キクタニギクをモデル植物として選定 ①事業実施担当者の継続性□後継者等あり ☑後継者等なしした。
的研究の基盤となるモデル植物の整備
指標：モデル植物としての適性を備えた系
統が選定されている。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：世界最大の広義キク属リソースである
指標：広義キク属の保存系統数が世界最大である②目標：DNAマーカー等によるリソース情 ②種・系統を区別するDNAマーカーが70 ②後継者の人材育成状況□順調に育成中 ☑後継人材がいない
種以上開発された。
報の整備
指標：種・系統を区別するDNAマーカーが作出される。

②目標：分子遺伝学を行う基盤が整っている
指標：分子遺伝学的手法を用いた研究業績が複数生まれている。

③目標：キク染色体の研究のためのリソー ③染色体特性が明らかにされていない ③組織的な支援体制☑整っている。 □支援体制がない。
野生種を22種リソースに加えることが出スの充実
指標：リソースを用いた染色体研究が活発 来たことなどからリソースを用いた染色体関連論文が多数（14本）公表された。
に行われる。

③目標：キク科の中で広義キク属がモデル的地位を占める植物のひとつとなっている
指標：キク科で共通の特徴に関する解析に有用なリソースを提供している。
④目標：外国産を含む広義キク属野生種 ④外国産野生種等を3145件収集した。 【特記事項】現在後継人材はいないが、実施 ④目標：リソースの安定的維持のための担当者は定年まで20年あり、それまでには 基盤が確立しているの収集
後継人材を育成していきたい
指標：研究者の希望に応じたリソースが指標：外国産野生種を含む多数の広義キ適宜提供できる体制が構築されている。
ク属植物が収集される（目標1410件）。
⑤圃場改修を含め、効率的・省力的に 本リソースの潜在的な利用者としては栽 ⑤目標：コミュニティが必要とするリソー
植物体の育成が行えるシステムが整備 培ギク研究者がもっとも多い。これまで スが提供されている
され、収集してきた植物体の活着率も7 は野生ギクのリソースとしての役割が大 指標：提供数が堅調に増加している割であったものが9割近くまで上がった。 きかったが、分子遺伝学的に解析が容易なモデル野生ギクキクタニギクを栽培
ギクのリファレンスリソースとして位置付けることにより、栽培ギク研究者への提供を増やすことを目指している。今後栽
培ギク研究者が多く参加する学会等でその有用性をアピールしていく。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

⑤目標：保存管理体制の効率化
指標：保存・管理が省力的かつ効率的に行えるシステムが構築される。

7950

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：

広義キク属

番号 分野

発行年

雑誌名

1

5706

2010

Nucl. Acid Res.

2

5706

2009

3

5701

4

著者名

所属

タイトル

Yamazaki et al.

National Institute of Genetics etc.

NBRP databases: databases of biological resources in Japan.

Chromosome botany

Masuda, Yukawa, Kondo

Tokyo University of Agriculture

Molecular phylogenetic analysis of members of Chrysanthemum and its related genera in the tribe Anthemideae, the Asteraceae
in East Asia on the basis of the internal transcribed spacer (ITS) region and the external transcribed spacer (ETS) region of
nrDNA.

2009

Chromosome botany

Hussein, El-Twab, Kondo

Tokyo University of Agriculture

Physical mapping of 5S, 45S, Arabidopsis-type telomere sequence repeats and AT-rich regions in Achillea millefolium showing
intra-chromosomal variation by FISH and DAPI.

5706

2009

ビオフィリア

谷口研至・中田政司・草場 信

Hiroshima University

広義キク属—ゲノム攪乱とリソースの役割

5

5701

2008

Chromosome
Nanoscience andNanotechnology

Taniguchi, K., Mitsueda, C., Okumura, N.,
Miyazaki, W.

Hiroshima University

Development of a sustainable chromosome imaging database

6

5703

2009

Plant Cell Physiol

Kusaba, Maoka, Morita, Takaichi

Hiroshima University

A novel carotenoid derivative, lutein 3-acetate, accumulates in senescent leaves of rice.

7

5701

2007

Chromosome Science

Fujishige, Taniguchi

Hiroshima University

In vitro production of stable new karyotype strains in culture lines of Crepis capillaris.

8

5701

2007

Chromosome Botany

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

FISH physical mapping of 5S rDNA and telomere sequence repeats identified a peculiar chromosome mapping and mutation in
Leucanthemella linearis and Nipponanthemum nipponicum in Chrysanthemum sensu lato.

9

5706

2007

Australian Systematic
BotanyWatanabe, Kosuge, Shimamura, Konishi,
Taniguchi

Kobe University

Molecular systematic of Australian Calotis (Asteraceae: Astereae)

10

5701

2007

Chromosome Science

Fujishige, Taniguchi

Hiroshima University

In vitro production of stable new karyotype strains in culture lines of Crepis capillaris.

11

5701

2007

Chromosome Botany

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

Isolation of chromosomes and mutation in the interspecific hybrid between Chrysanthemum boreale and C. vestitum using
fluorescence in situ hybridization and genomic in situ hybridization.

12

5706

2006

Chromosome Botany

Zhmyleva, A.P. and Kondo

Hiroshima University

Comparison of somatic chromosomes in some species of Chrysanthemum sensu lato in Russia.

13

5701

2006

Chromosome Botany

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

FISH physical mapping of 5S, 45S and Arabidopsis-type telomere sequence repeats in Chrysanthemum zawadskii showing intrachromosomal variation and complexity in nature.

14

5701

2005

Cytologia

Matoba, H., Soejima, A., Hoshi, Y. and Kondo, K. Hiroshima University

Molecular cytogenetic organization of 5S and 18S rDNA loci in Aster ageratoides var. ageratoides, A. iinumae (=Kalimeris
pinnatifida) and A. microcephalus var. ovatus in Japan.

15

5701

2003

Cytologia

Hanmoto, Fujikawa, Itoh, Yonezawa

Naruto University of Education

Repetitious production of similar karyotypes in different plants of Haplopappus gracilis, an annual Asteraceae, following exposure
to lonizing radiation.

16

5701

2003

Chromosome Science

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

Rapid genome changes after interspecific hybridization between Chinese Dendranthema indica X D. vestita identified byfluorescent in situ hybridization and 4’,6-diamidino-2-phenylindole.

17

5701

2003

Chromosome Science

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

Physical mapping of 45S rDNA loci by fluorescent in situ hybridization and evolution among polyploidy Dendranthema species.

18

5701

2002

19

5701

2002

Chromosome Science

Kondo, El-Twab

Hiroshima University

Analysis of inter- and intra-generic relationships sensu stricto among the members of Chrysanthemum sensu lato by using
fluorescent in situ hybridization and genomic in situ hybridization.

20

5701

2002

Chromosome Science

El-Twab, Kondo

Hiroshima University

Physical mapping of 5S rDNA in chromosomes of Dendranthema by fluorescence in situ hybridization.

Taniguchi, K., Hara, K., Fujishige I., Hiraoka, T.,
Advances in Chromosome
Nakata, M., Sera, T., Inoue, N., Chen, R., Hong, Hiroshima University
Sciences
D.-Y. and Tanaka, R.

Origin of the cultivated Dendranthema.

8051

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

アサガオ

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名）

仁田坂 英二分担機関（課題管理者氏名）

星野 敦

運営委員長

小野 道之

Ⅰ

第２期申請時の区分維持の必要なバイオリソース

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等【NBRP開始時の状況】

第２期開始時の設定目標※１（達成年度：平成３２年度頃）【具体的目標】① ほとんどの突然変異系統の収集を完了 ①大部分の突然変異系統は収集できてお アサガオの標準系統であるムラサキの種子 ①ゲノム情報と関連づけた突然変異系統のり、第２期中には、ほぼ達成できる。近縁種 が市販されており、生理学分野の研究者は 整備
し、収集対象を近縁種等に広げる。
等は強い短日要求性等により、採種困難な これを利用していた。植物のゲノム配列情報ものも多いが、栽培条件等を工夫して保存を はまだ限られた種もしくは一部の遺伝子でし進めている。
か得られておらず、個々の遺伝子情報は② DNA情報を含めた系統の特性調査・提 ②クローン化された遺伝子が増えたことに伴 ユーザー自ら解析するのが主流であった。 ②ゲノム情報と関連づけたDNAリソースの整供体制の強化備
い、これらの情報を取り入れた系統の特性調査が進んだ【具体的状況の変化の内容】③ BACクローンに重点をおいた各種DNAク ③BACクローンをはじめ当初の予定を大きく ①ムラサキを販売していた業者が撤退した ③ユーザーのニーズに対応したリソースを安ローンの整備
超えて収集でき、BACのスクリーニング法等 ため、これまでムラサキを利用していた研究 定供給
ユーザーがリソースを利用しやすい方策を 者が当リソースセンターに材料を求めるよう
工夫した
になった。
②主だったモデル植物や作物のゲノム配列の決定【研究コミュニティの状況】① リソースの広報活動によるユーザー数の ①学会等で広報活動を継続した。提供数が ③次世代シーケンサー等、ゲノム解析技術 ①ユーザーの数が現在の２倍まで拡大
拡充
目標を上回っていることから、ユーザー数は の進展、大規模化漸増傾向にある② リソース情報についてユーザーとの連携 ②ユーザーからの情報のフィードバック・寄 ④ゲノム情報に基づいたマップベースクロー ②リソース機関に協力し情報をフィードバック
強化
ニング等変異体の原因遺伝子の解析法の する託数が増加した
発達・普及⑤アサガオのゲノム配列決定の開始③ ユーザーの発掘、リソース情報の発信を ③定期的に研究集会を開催し、参加ユー③提供を受けたリソースにより高いレベルの行う研究集会等の企画
学術研究成果を上げている
ザーも増加傾向にある。

【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）

81【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）52

① 目標：既存の突然変異系統のほとんど ① 保存数は1500系統を超え、2010年まで ①事業実施担当者の継続性を収集・保存し特性調査を行う。 指標：保存 にはほぼ目標に到達できる。これらの系統□後継者等あり □後継者等なし
数が増加する。第二期申請時1200系統ほど は既存の変異をほぼ100%含んでいるため、であった。
ユーザーのリクエストにはほとんど対応できる。他にも未収集の系統が残っているが、これらは保有する変異の組み合わせが異なるだけの系統であり、優先度はそれほど高くない。
② 目標：安定的なリソースの提供を継続 ② 第２期では提供用に更新された種子も ②後継者の人材育成状況
指標：提供数が安定している。第二期申請時 増え、提供数も比較的安定している。
□順調に育成中 □後継人材がいないまではあまり安定していなかった。

③ 目標：コミュニティが必要とするリソース ③ 提供数はやや増加傾向にあり、謝辞等の提供 指標：提供数が増加し、文献にリ に記載している文献が増えた
ソースセンターの貢献について記載。申請時には記載している論文は多くはなかった。

③組織的な支援体制□整っている。 □支援体制がない。

① 目標：世界最大のリソース拠点として国内外で認知 指標： 論文への貢献度。アサガオを用いた論文の多くに貢献する。特にムラサキ、東京古型の標準系統を用いた研究では100%、 突然変異系統では50%以上に利用されている（過去提供し独自に増殖・使用している分も含む）。
② 目標：リソースの質的向上 指標：デー
タベースの整備。現在公開準備中のデータベースにゲノム情報を取り入れ、系統情報とクローン情報をリンクさせた統合的データベースが構築されている。
③ 目標：ユーザのニーズに対応したリソー
スの安定供給 指標：供給量。特に大量に利用されることが多いムラサキ系統の提供
量が需要を満たす。

④ 目標：コミュニティーの要望が高い新しいリソースの整備 指標：具体的な要望への対応。要望に応じたリソースが整備されている⑤ 分子遺伝学および生理学分野の複数の 露地栽培では各種病虫害の防除に労力を ⑤ 目標：リソースの広報啓発活動によるグループが長期にわたって研究を続けてお 要したが、今後、より効率的な採種を行うた ユーザーの拡充。 指標：提供数、提供件
り、特に後者では500報を超える論文が国内 め、また新規ユーザーが参入しやすい、より 数。現在の2倍程度までいずれかが拡大して外から出版されているように安定なユーザー 簡便な栽培方法を確立することが今後の課 いる。
コミュニティが存在している。また、提供数
題だと思われる。また、近縁種は強い短日
や、過去6回、10年以上続いている研究集会 条件が必要で採種困難な種も多いことが明への参加者数からこのことは確かであり、最 らかになった。これらの栽培目的で、日長を近では漸増傾向にある。
コントロールできる照明付インキュベーター
等の機器の導入も考慮したい。また、事業に【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） 必要な機器のメインテナンスに関して、コンプレッサーに寿命（10年程度）がある冷凍庫
は、定期的な入れ替えが必要である。NBRP
専用に利用している施設、設備備品等は、
NBRPの経費で購入したもの以外でも、
NBRPの経費で修理可能として頂きたい。代・論文については２０報まで
表機関は４年後に新キャンパスへの移転を控えており、必要な施設、圃場等は既に計画にあげているが、その際、新規に機器類が必要となる可能性がある。

④ 目標：リソース情報の整備 指標：第１ ④ 系統の画像等、収集する項目を増やし、 【特記事項】
期と比べ記載される情報量の増加。申請時 遺伝子情報も系統情報に取り入れたは最低限の系統情報にとどまっていた。
⑤ 目標：リソースの広報啓発活動によるユーザーの拡充。申請時は数十人規模のユーザー数※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

8253

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：アサガオ
番号

分野

発行年

6104

2004

2

5703

2004

3

6003

2005

4

6104

2005

N., Toki K., Morita Y., Hoshino A.,
Phytochemistory Saito
Iida S., Shigihara A., Honda T.

5

5703

2005

Plant J.

6

5703

2005

Proc. Natl. Acad.
Kitazawa D. 他11名
Sci. USA.

Tohoku Univ.

7

5703

2006

Plant Mol Biol.

Iwasaki M., Nitasaka E.

Kyushu Univ.

8

5703

2008

Plant Cell
Physiol.

Kitazawa D, Miyazawa Y, Fujii N,
Hoshino A, Iida S, Nitasaka E,
Takahashi H.

Tohoku Univ.

9

5703

2008

Adv. Space Res.

Kitazawa E, Miyazawa Y, Fujii N,
Nitasaka E and Takahashi H.

Tohoku Univ.

10

5703

2008

Physiol. Plant

Kikuchi R, Sage-Ono K,
Kamada H, Handa H, Ono M.

Tsukuba Univ.

5703

2008

Sasaki R, Kikuchi R,
Sage-Ono K, et al.

Tukuba Univ.

5704

2009

5704

2009

Plant Biotech.
J. Japan. Soc.
Hort. Sci.
J. Japan. Soc.
Hort. Sci.

14

6003

2009

Plant Physiol.

Shibuya K, Yamada T, Suzuki T,
Shimizu K, Ichimura K.

NIFS

15

6003

2009

Autophagy

Shibuya K, Yamada T,
Ichimura K.

NIFS

16

6003

2010

J Exp Bot.

Yamamizo C, Kishimoto S,
Ohmiya A.

NIFS

5703

2010

5703

2010

Sexual Plant
Reproduction
Physiologia
Plantarum

5703

2010

J Plant Physiol.

5703

2010

J Plant Res.

Hasegawa H, Yamada
M, Iwase Y, et al.
Iwase Y, Shiraya T,
Takeno K
Wada KC, Yamada M,
Shiraya T, et al.
Johzuka-Hisatomi Y,
Noguchi H, Iida S.

1

11
12
13

17
18
19
20

雑誌名

K. Toki, 著者名
N. Saito, Y.
Moria, A. Hoshino, Y.
Moria, S. Iida, A.

Heterocycles
Plant Cell
Oguchi T., Sage-Ono K.,
Kamada H., Ono M.
Physiol.
Japan. Soc. Hort. Shimizu K., Tokumura T.,
Hashimoto, F., Sakata Y.
Sci.

Morita Y.他10名

Kajita Y, Nishino E.
Kajita Y, Nishino E.

所属
Minami-Kyusu Univ.
Tsukuba Univ.
Kagoshima Univ.
Meiji-Gakuin Univ.
NIBB

Chiba Univ.
Chiba Univ.

Niigata Univ.
Niigata Univ.

タイトル
An acylated pelargonidin 3-sophoroside from the pale-brownish red flowers of
Ipomoea nil.
Characterization of transcriptional oscillation of an Arabidopsis homolog of
PnC401 related to photoperiodic induction of flowering in Pharbitis nil.
In vitro propagetion of sterile mutant strains in Japanese morning glory by subculturing embryoids derived from an immature embryo.
Acylated peonidin glycosides from duskish mutant flowers of Ipomoea nil.
Japanese morning glory dusky mutants displaying reddish-brown or purplish-gray flowers are deficient in a novel glycosylation enzyme
for anthocyanin biosynthesis, UDP-glucose: anthocyanidin 3-O-glucoside-2''-O-glucosyltransferase, due to 4-bp insertions in thegene.

Shoot circumnutation and winding movements require gravisensing cells.
The FEATHERED gene is required for polarity establishment in lateral organs
especially flowers of the Japanese morning glory (Ipomoea nil ).
The gravity-regulated growth of axillary buds is mediated by a mechanism
different from decapitation-induced release.
Characterization of a novel gravitropic mutant of morning glory, weeping2.

PnMADS1, encoding an StMADS11-clade protein, acts as a repressor offlowering in Pharbitis nil.
Immediate induction of APETALA1-like gene expression following a single
short-day in Pharbitis nil
Morphology and anatomy of leaves and flowers of wild-type and pleiotropic
maple-willow mutant in Japanese morning glory.
Development of leaves and flowers in the wild type and pleiotropic maple-willow
mutant of Japanese morning glory (Ipomoea nil).
InPSR26, a putative membrane protein, regulates programmed cell death duringpetal senescence in Japanese morning glory.
Autophagy regulates progression of programmed cell death during petal
senescence in Japanese morning glory.
Carotenoid composition and carotenogenic gene expression during Ipomoea
petal development.
Reduction in the critical dark length for flower induction during aging in the
short-day plant Pharbitis nil var. Kidachi

Flowering and dwarfism induced by DNA demethylation in Pharbitis nil
Salicylic acid and the flowering gene FLOWERING LOCUS T homolog are
Niigata Univ.
involved in poor-nutrition stress-induced flowering of Pharbitis nil
The molecular basis of incomplete dominance at the A locus of CHS-D in the
Shizuoka-pref. Univ.
83 common morning glory, Ipomoea purpurea.
54

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

ミヤコグサ・ダイズ

代表機関（課題管理者氏名）明石良

分担機関（課題管理者氏名）

阿部純，青木俊夫，穴井豊昭

運営委員長

第２期申請時の区分

当該リソースの区分
先進的なバイオリソース

磯部祥子
Ⅰ

第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（達成年度：平成 28 年度頃）
【具体的目標】①実験系統およびDNAなどの基礎研究用
リソースを中心としたリソースの整備と、農水省ジーンバンク等の他リソース機関との差別化②ミヤコグサ国際的コンソーシアムを②研究者コミュニティにおけるニーズ ②根粒菌変異株、形質転換ベクター、
ダイズ完全長cDNA等のニーズの高いリ形成し、世界的なリソース機関としての高いリソースの整備【具体的状況の変化の内容】
ソースを収集・保存したの地位確立③世界における拠点的リソース機関を ③海外からの依頼も3分の1を占めるこ ①ミヤコグサの全ゲノムが解読された ③アジアを中心とする遺伝資源教育
目指すとからミヤコグサリソースにおける世 ことによって、ミヤコグサのモデル植 （人材育成）も可能なバイオリソース界的拠点であることが認識されつつあ 物としての地位を確立した機関を目指する②ダイズの全ゲノムが解読されたことにより、自らの情報を利用して研究が【目標とした研究コミュニティの状【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
進められるようになった況】（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】①第1期で収集・保存したリソースにお ①保存リソースの特性評価を行い付加 ミヤコグサがモデルマメ科植物としてける特性等の評価による付加価値の向 情報を収集した
認知され始めていた
上①研究者コミュニティの拡大②リソース共有意識の高揚③情報共有①リソース提供数が増加したことか
ら、それを安定的に利用する研究コ
ミュニティが形成された②根粒菌変異株、形質転換ベクター、
ダイズ完全長cDNAなどの重要なリソースの寄託を受けた③ゲノムリソースは、アズキ等の他のマメ科作物に利用され、応用に近い研究の推進が可能になった④ミヤコグサがJAXAの教育プロジェク
トの一環として宇宙ステーションに行ったことから、教育材料として使われる機会が多くなった③寄託リソースと共にそれらの情報も ⑤ミヤコグサが世界のリソース拠点と寄託され情報を共有することができた して認識されたことから、更なる利用増加を図るために国際的コンソーシア
ムの形成が必要になった

84①利用者コミュニティとの連携と、ミヤコグサ国際コンソーシアムの形成②新たなリソース開発における省庁間等での連携推進と、その成果をNBRPに寄託するシステムの構築③国内に限らず諸外国の研究者へ情報を発信するとともに、リソースの寄託
を推進する

55

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達 【重点到達目標の達成状況】
目標】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：植物-微生物相互作用の研究材 ①植物−微生物相互作用分野での研究論 ①事業実施担当者の継続性
文発表が約5割を占めた料としての利用の更なる推進☑後継者等あり □後継者等なし
指標：発表論文の研究分野【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：実験系統およびDNAなどの基礎研究用リソースを中心としたリソースの整備
指標：整備リソース数と基礎研究分野における発表論文（7割以上）②目標：本リソース種における世界的②目標：モデル植物から作物への展開 ②ミヤコグサおよびダイズの両方の情 ②後継者の人材育成状況☑順調に育成中 □後継人材がい なリソース機関としての地位確立
報を用いた研究論文が発表されるよう
指標：発表論文の研究内容ないになった。
指標：海外からのリソース寄託受入と配布（海外向け配布3割以上を目指す）③目標：アジアを中心とする遺伝資源③遺伝資源専門技術者養成モデルカリ ③組織的な支援体制③目標：教育分野への波及効果☑整っている。 □支援体制がな 教育（人材育成）も可能なバイオリ
指標：どのような教育に利用されて キュラムやスーパーサイエンスハイス
いソース機関の構築
クールにもミヤコグサが利用されたいるか
指標：教育活動の実施状況④目標：国内外の関連研究機関との連 ④ダイズコンソーシアムから完全長【特記事項】④目標：安定的なリソース提供
携
cDNAの寄託受入を行った
指標：提供数が安定している（年間
指標：リソース寄託の受入提供件数延べ60機関、1,000系統を目指す）⑤目標：収集したリソースの確実な維⑤ミヤコグサおよびダイズ種子につい⑤目標：種子成分の分析の強化
持て11項目延べ約3800系統についての種
指標：分析項目数
子成分の分析を行った
指標：人材育成と組織的支援体制の確立【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

8556

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：ミヤコグサ・ダイズ
番号 分野 発行年
1

2401

2010

雑誌名
Proteomics

著者名
Mohammad et al.

所属
National institute of cropscience

タイトル
Comparative analysis of soybean plasma membrane proteins under osmotic stress using gelbased and LC MS/MS-based proteomics approaches.

2

2401

2010

Biosci Biotechnol Biochem

Ueda H, Sugimoto Y. Graduate School of Agricultural Vestitol as a chemical barrier against intrusion of parasitic plant Striga hermonthica into
Lotus japonicus roots.
Science, Kobe University

3

5804

2010

Plant Cell Physiol

Ono et al.

Nagoya University etc.

Genomewide characterization of the light-responsive and clock-controlled output pathways
in Lotus japonicus with special emphasis of its uniqueness.

4

2401

2010

Plant Cell

Takos et.al

John Innes Centre etc.

Genetic screening identifies cyanogenesis-deficient mutants of Lotus japonicus and reveals
enzymatic specificity in hydroxynitrile glucoside metabolism.

5

5703

2009

Molecular Plant-Microbe
Interaction

Okazak et al.

Nara weman university etc.

Identification and functional analysis of type III effector proteins in Mesorhizobium loti.

6

5703

2009

Plant J

Shimoda et al.

Kazusa DNA institute etc.

Overexpression of class 1 plant hemoglobin genes enhances symbiotic nitrogen fixation
activity between Mesorhizobium loti and Lotus japonicus.

7

5703

2009

BMC Plant Biology

Bo et al.

The Chinese Academy ofAgricultural Sciences etc.

Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation of Superroot-derived Lotus corniculatus
plants: a valuable tool for functional genomics.

8

2301

2009

DNA Res

Ishida et al.

Nagoya University

A genome-wide compilation of the two-component systems in Lotus japonicus.

9

5703

2009

J Plant Physiol

Kubo et al.

Kobe University

Reactions of Lotus japonicus ecotypes and mutants to root parasitic plants.

10

5804

2009

Plant Physiol

Perry et al.

John Innes Centre etc.

TILLING in Lotus japonicus identified large allelic series for symbiosis genes and revealed abias in functionally defective EMS alleles towards glycine replacements.

11

2301

2008

DNA Res

Sato et al.

Kazusa DNA institute etc.

Genome structure of the legume, Lotus japonicus.

12

2401

2008

DNA Res

Umezawa et al.

RIKEN etc.

Sequencing and analysis of approximately 40,000 soybean cDNA clones from a full-lengthenriched cDNA library.

13

5703

2008

Genetics

Hougaard et al.

University of Aarhus etc.

Legume anchor markers link syntenic regions between Phaseolus vulgaris, Lotus japonicus,
Medicago truncatula and Arachis.

14

5703

2008

Proc Natl Acad Sci U S AYano et al.

National institute ofagrobiological science

CYCLOPS, a mediator of symbiotic intracellular accommodation.

15

5703

2007

Mol Plant Microbe Interact

Günther et al.

University of california davis etc. Metabolism of reactive oxygen species is attenuated in leghemoglobin-deficient nodules of
Lotus japonicus.

16

5804

2007

DNA Res

Hisano et al.

Kazusa DNA institute etc.

Characterization of the soybean genome using EST-derived microsatellite markers.

17

6105

2007

Breeding Science

Maria et al.

Hokkaido University etc.

Genetic Analysis of High α-tocopherol Content in Soybean Seeds.

18

5703

2006

Mol Plant Microbe Interact

Sandal et al.

University of Aarhus etc.

Genetics of symbiosis in Lotus japonicus: recombinant inbred lines, comparative genetic
maps, and map position of 35 symbiotic loci.

19

5704

2006

Proc Natl Acad Sci U S AFeng et al.

John Innes Centre etc.

Control of petal shape and floral zygomorphy in Lotus japonicus.

20

5703

2005

Plant J

Madsen et al.

University of Aarhus etc.

LORE1, an active low-copy-number TY3-gypsy retrotransposon family in the model legume
Lotus japonicus.

86

57

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名 トマト

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名）

国立大学法人筑波大学（江面浩）

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

財団法人かずさDNA研究所（青木考）柴田大輔 （財団法人かずさＤＮＡ研究所）

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 32 年度頃）
【NBRP開始時の状況 産官学を含めたトマ【具体的目標】① 国際的なリソースセンターとしての位置 ①国際的な広報活動に取り組み，海外ユー 研究国内コンソーシアムメンバーにより， ①海外のリソースセンターと連携を密にしてづけを確保する
ザーからのリクエストが増加している
草の根的活動によりトマトリソースの整備世界中枢の一角を担うセンターになる② 日本独自のリソースを整備する②マイクロトム変異体や，完全長cDNAのよ 行われてきた．
②遺伝情報や生化学情報を付加して変異体
うな日本独自のリソースが整備されている 【具体的状況の変化の内容】
情報を高品質化する③リソースの体系的な維持・増殖・配布体制 ③多様な品揃えができており，利用者にとっ ①トマトゲノムの解読完了。
③安定したリソースの提供が可能になっていを整備するて魅力的な事業になりつつあるる②新規な研究者のトマトコミュニティへの参加。
【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①リソースの整備を必要とする研究コミュニ ①産官学が連携した研究コミュニティが形成 ③他国トマトリソースとの連携と役割分担。 ①物質生産に関する研究が推進される
ティが形成されている
されている②提供されたリソースによる学術研究が行 ②論文発表が増えている④生物多様性条約に沿った厳密なリソース ②未知機能性成分が同定される
われている
流通が必要とされはじめ、独自リソースの重要性増大③国際的に必要とされるリソースを寄託して ③全ゲノム解読に用いられたトマト品種⑤リソース事業実施者評価システム確立へ ③果実形成の分子基盤と進化的意義が解明いる
HeinzのBACクローンが寄託された
向けて、関連学会等の関心の高まり。
される【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①マイクロトムEMS変異誘発系統の整備
4000系統の保存・増殖・配布体制の整備②マイクロトムγ線変異誘発系統の整備
6000系統の保存・増殖・配布体制の整備③実験トマト系統の整備
100系統の保存・増殖・配布体制の整備④トマト完全長cDNAクローンの整備
297,300クローンを収集する①マイクロトムEMS変異誘発系統の整備
1800系統の保存・増殖・配布体制が完了した②マイクロトムγ線変異誘発系統の整備
2700系統の保存・増殖・配布体制が完了した③実験トマト系統の整備
83系統の保存・増殖・配布体制が完了した④トマト完全長cDNAクローンの整備
165,845クローンを収集した【事業の継続性】【到達度の評価事項と目標】（該当する□内に「レ」を記入）（項目と客観的指標）①事業実施担当者の継続性①変異体遺伝情報の整備☑後継者等あり □後継者等なし
変異体ゲノム情報を解読してデータベースを構築する②後継者の人材育成状況②生化学情報の整備☑順調に育成中 □後継人材がいない 機能性成分分析を行いデータベースを充実
さる③組織的な支援体制③完全長cDNAの情報高品質化☑整っている。 □支援体制がない。
トマトの全遺伝子数を目標に網羅性を上げる【特記事項】変異体の生化学情報を高めるこ ④バックアップ体制の確立とに資するメタボローム解析の推進が重要 リソース保存についてコミュニティとしてバッな課題である。
クアップ体制を整える⑤トマト変異体データベースの整備⑤トマト変異体データベースの整備
変異体に関する情報を蓄積して一般公開す 計876系統の変異体に関する情報を蓄積しる
た⑤MTAの強化
生物多様性条約ABS条項を反映したMTAに強化する【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで
8758

※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

8859

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：トマト
番号分野

発行年 雑誌名

著者名

所属

Biochemical mechanism on GABA accumulation during fruit development
in tomato.

タイトル

1

5703

2008

Plant Cell Physiol.

Akihiro T. et al.

University of Tsukuba,
Shimane University

2

6003

2008

Current Genomics

Matsukura C. et al.

University of Tsukuba,
Kazusa DNA ReseachInstituteComprehensive Resources for Tomato Functional Genomics Based on
the Miniature Model Tomato Micro-Tom.

3

6003

2009

J. Japan. Soc. Hort. Sci.

Saito T. et al.

University of Tsukuba

Mutant Resources for the miniature Tomato (Solanum lycopersicum L.)'Micro-Tom'.

4

6101

2009

J. Pineal Res.

Okazaki M and Ezura H.

University of Tsukuba

Profiling of melatonin in the model tomato (Solanum lycopersicum L.)
cultivar Micro-Tom.

5

6101

2009

J. Pineal Res.

Okazaki M. et al.

University of Tsukuba

Cloning and characterization of a Chlamydomonas reinhardtii cDNA
arylalkylamine N -acetyltransferase and its use in the genetic
engineering of melatonin content in the Micro-Tom tomato.

Ripening-Associated ethylene biosynthesis in tomato fruit is
autocatalytically and developmentally regulated.

Spatial and Developmental Profiling of Miraculin Accumulation inTransgenic Tomato Fruits Expressing the Miraculin Gene Constitutively.

6

6003

2009

J. Exp. Bot.

Yokotani et al.,Research Institute for
Biological Sciences,
Okayama University,
National Institute of
Vegetable and Tea
Science

7

6003

2010

J. Agric. Food Chem.

Kim et al.,

University of Tsukuba

8

5701

2010

DNA Res.

Ozaki et al.,

9

6003

2010

Plant Sci.

Yano et al.,

10

5703

2010

Plant Physiol. Biochem.

Naka et al.,Nippon Del Monte
Corporation, Chiba
University, Chiba
Coexpression analysis of tomato genes and experimental verification ofPrefectural Agriculture coordinated expression of genes found in a functionally enriched
and Forestry Research coexpression module.
Center, Kazusa DNA
Institute
Tomato is a suitable material for producing recombinant miraculin protein
University of Tsukuba
in genetically stable manner.
Tohoku University,
Josai University, Tamil Quantitative analysis of plant polyamines including thermospermine
Nadu Agiculturalduring growth and salinity stress.
University

11

5701

2010

BMC genomics,

Aoki et al.,

Tohoku University, The
University of Tokyo,
Tottori University,
Okayama University,
Large-scale analysis of full-length cDNAs from the tomato (Solanum
Tokyo University oflycopersicum).
Agriculture andTechnology, Kazusa
DNA Institute

12

5703

2010

J. Agric. Food Chem.

Hirai et al.

Plant Ecochemicals
Research Center,
University of Tsukuba

13

6101

2010

J. Pineal Res.

Okazaki et al.,

University of Tsukuba

Production of recombinant miraculin using transgenic tomato in a closedcultivation system.
Lowering intercellular melatonin by transgenic analysis of indoleamine 2,389dioxygenase from rice in tomato plants.

60

14

6003

2010

Plant Biotech.

Kim et al.,

University of Tsukuba

Gene dosage and genetic background affect miraculin accumulation intransgenic tomato fruits.

15

5703

2010

Plant Cell Physiol.

Yin et al.,

University of Tsukuba

Metabolic alterations in organic acids and γ-amino butyric acid indeveloping tomato (Solanum lycopersicum L.) fruits.

16

6702

2010

J. Plant Physiol.

Neily et al.,

University of Tsukuba,
Centre INRA de
Bordeaux, Université de Enhanced polyamine accumulation alters carotenoid metabolism at theBordeaux, Nationaltranscriptional level in tomato fruit over-expressing spermidine synthase.
Institute of Fruit
Sciences

17

6702

2010

J. Agric. Food Chem.

Kato et al.,

University of Tsukuba

Molecular breeding of tomato lines for mass production of miraculin in aplant factory.

18

6702

2010

Plant Biology

Koeduka et al.,

Kyoto University,
University of Tokyo,
University of Tsukuba

Production of prenylated flavonoids in tomato fruits expressing aprenyltransferase gene from Streptomyces coelicolor.

High-level accumulation of recombinant miraculin protein intransgenic tomatoes expressing a synthetic miraculin gene with
optimized codon usage terminated by the native miraculin
terminator.
Genetic suppression analysis in novel vacuolar processing enzymes
reveals their roles in controlling sugar accumulation in tomato fruits.

19

6003

2010

Plant Cell Rep.

Hiwasa-Tanase et al.,

University of Tsukuba,
Okinawa Institute of
Science andTechnology

20

6001

2011

J. Exp. Bot.

Ariizumi et al.,

University of Tsukuba

9061

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

細胞性粘菌

代表機関（課題管理者氏名）

漆原 秀子

分担機関（課題管理者氏名）

上田 太郎

運営委員長

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

久保原 禅

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】①遺伝子セットが保存されている①保存作業は順調に進んでいる②国内的リソース拠点を樹立する③新規ユーザーが増えている【目標とした研究コミュニティの状況】①リソースを共通基盤として相互作用

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 28年度頃）【NBRP開始時の状況】【具体的目標】基礎生物学に利用できるモデル生物とし ①提供→寄託のリソースサイクルが確立てのみとらえられるのが一般的であっ②先進的研究を共同研究として推進②国内的リソース拠点として充実しつつある た【具体的状況の変化の内容】①創薬資源として認識されるようになっ ③従来コミュニティ外の新規ユーザーを獲得③コミュニティ外の利用が増えた
た②病原微生物の感染モデルと位置付けられた【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①コミュニティの相互作用が活性化された③病原微生物の野外プールとなる例が示さ ①コミュニティのタスクとしてリソース運営に関与れた②遺伝子セットの提供等による共同研究の立 ②共同研究の実現には到達していないが、 ④SSH事業などに利用しやすいことが認識さ ②突出した先進的な研究にリソースを利用
ち上げ

グラント申請を含む議論が展開された③さまざまな分野からの新規研究者参入 ③研究者の参入が容易になった

れた⑤環境指標の一つとして認識されるようになった【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：国内研究機関に散在している株の収 ①国内研究者からの寄託を順次処理し ①事業実施担当者の継続性
集☑後継者等あり □後継者等なしている
指標：株の収集が進んでいる②目標：米国DSCと連携する
指標：DSC-NBRP間のリソース共有②国内からDSCへのリクエストはNBRP
が窓口になっている②後継者の人材育成状況☑順調に育成中 □後継人材がいない③目標：遺伝子のリソース拠点として貢献する ③提供を目標通り行い、そのリソースを ③組織的な支援体制
指標：リソース利用論文が数多く発表される 利用した成果がすでに２件の論文となっ☑整っている。 □支援体制がない。

た④目標：幅広いユーザーを獲得する④新規ユーザーが徐々に増加している
指標：従来からの研究者以外に提供している⑤目標：「研究者の卵」育成に貢献する
指標：中等教育機関に提供している⑤株の提供とワークショップの企画等により中等教育現場と連携している【特記事項】③中等教育・産業界等を含む裾野の広がり【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：コミュニティに根ざしたリソース拠点となる
指標：コミュニティの要望に応じた提供体制を②目標：発展的なリソース拠点となる
指標：研究の進展とともに常に生産される旬の新規リソースを収集する体制が整っている③目標：遺伝子リソースの国際的な拠点となる
指標：新規クローンを収集することにより、海外への提供が継続して行われている④目標：情報・技術の拠点としても機能する

指標：HPを通した情報提供や年２回程度の技
リソースを中心にコミュニティが協力、あるいは相互に活性化するようまとまりができたのは大き 術指導を定期的に開催しているな成果である。残念なことは実費徴収体制に移行 ⑤目標：幅広く認知されたリソース拠点となる
した後海外からのリクエストが減少したことであ
指標：医学系・薬学系、企業、さらに中等教育る。米国のストックセンターは。株を送料負担のみ と、広い層のユーザーに提供しているで提供していることも関係しているであろう。もっと理解を得られるとよいのだが。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
91

62

ＮＢＲＰ成果業績リスト

リソース名：細胞性粘菌
雑誌名
番号 分野 発行年

著者名

所属

タイトル

1

5801 1999 J. Biol. Chem.

Warnecke, D., R. Erdmannn, A. Fahl, B. Hube, F. Muller, T.
Zank, U. Zahringer and E. Heinz

25805 2000 EMBO J.

Traynor, D., J. L. S. Milne, R. H. Insall and R. R. Kay

UK

Ca2+ signalling is not required for chemotaxis in Dictyostelium

35805 2000 J. Biol. Chem.

Bogdanovic, A., F. Bruckert, T. Morio and M. Satre

FranceA syntaxin 7 homologue is present in Dictyostelium discoideum endosomes and controls theirhomotypic fusion.

45806 2001 Development

Li, G. C., C. Foote, S. Alexander and H. Alexander

Australia

Sphingosine-1-phosphate lyase has a central role in the development of Dictyostelium
discoideum.

55805 2001 J. Biol. Chem.

Janssen, K. P., R. Rost, L. Eichinger and M. Schleicher

Germany

Characterization of CD36/LIMPII homologues in Dictyostelium discoideum

65802 2002 Dev. Biol.

Zhang, N., Y. Long and P. N. Devreotes

USA

Ege A, a novel C2 domain containing protein, is essential for GPCR-mediated gene expression
in Dictyostelium.

72303 2002 Development

VanDriessche, N., C. Shaw, M. Katoh, T. Morio, R. Sucgang, M. Ibarra
H. Kuwayama, T. Saito, H. Urushihara, M. Maeda, I. Takeuchi, H.
USA
Ochiai, W. Eaton, J. Tollett, J. Halter, A. Kuspa, Y. Tanaka and G.

A transcriptional profile of multicellular development in Dictyostelium discoideum.

85805 2002 J. Biol. Chem.

Miura, S., J. W. Gan, J. Brzostowski, M. J. Parisi, C. J.
Schultz, C. Londos, B. Oliver and A. R. Kimmel

USA

Functional conservation for lipid storage droplet association among perilipin, ADRP, and TIP47(PAT)-related proteins in mammals, Drosophila, and Dictyostelium.

95802 2002 J. Biol. Chem.

Aubry, L., S. Mattei, B. Blot, R. Sadoul, M. Satre and G.
Klein

FranceBiochemical characterization of two analogues of the apoptosis-linked gene 2 protein in
Dictyostelium discoideum and interaction with a physiological partner in mammals, murine alix.

105806 2002 J. Biol. Chem.

Bishop, J. D., B. C. Moon, F. Harrow, D. Ratner, R. H.
Gomer, J. P. Dottin and D. T. BrazillUSA

A second UDP-glucose pyrophosphorylase is required for differentiation and development in
Dictyostelium discoideum.

116803 2002 Nature

Williams, R. S. B., L. L. Cheng, A. W. Mudge and A. J.
HarwoodUK

A common mechanism of action for three mood-stabilizing drugs.

125806 2004 J. Biol. Chem.

Ehrenman, K., G. Yang, W. P. Hong, T. Gao, W. Jang, D. A.
USABrock, R. D. Hatton, J. D. Shoemaker and R. H. Gomer

Disruption of aldehyde reductase increases group size in Dictyostelium

135804 2005 J. Biol. Chem.

Naude, B., J. A. Brzostowski, A. R. Kimmel and T. E.
Wellems

USA

Dictyostelium discoideum expresses a malaria chloroquine resistance mechanism upontransfection with mutant, but not wild-type, Plasmodium falciparum transporter PfCRT

145806 2005

USA

Peptide signaling during terminal differentiation of Dictyostelium

155806 2006 Dev. Biol.

Choi, C. H., B. J. Kim, S. Y. Jeong, C. H. Lee, J. S. Kim, S.
J. Park, H. S. Yim and S. O. Kang

Korea

Reduced glutathione levels affect the culmination and cell fate decision in Dictyostelium
discoideum

165701 2006 Dev. Biol.

Chubb, J. R., G. Bloomfield, Q. K. Xu, M. Kaller, A. Ivens, J. Skelton,
B. M. Turner, W. Nellen, G. Shaulsky, R. R. Kay, W. A. Bickmore andR. H. Singer

UK

Developmental timing in Dictyostelium is regulated by the Set1 histone methyltransferase

175806 2006 Development

MacWilliams, H., K. Doquang, R. Pedrola, G. Dollman, D.
Grassi, T. Peis, A. Tsang and A. Ceccarelli

CanadaA retinoblastoma ortholog controls stalk/spore preference in Dictyostelium

185806 2007 Dev. Biol.

Muramoto, T., H. Kuwayama, K. Kobayashi and H.
Urushihara筑波大学

A stress response kinase, Krsa, controls cAMP relay during the early development ofDictyostelium discoideum

195805 2009 PLoS One

Kuwayama, H. and Y. Kubohara

群馬大学・筑波大学

Differentiation-inducing factor-1 and -2 function also as modulators for Dictyostelium
chemotaxis

205805 2010 J. Cell Biol.

Cai, H., S. Das, Y. Kamimura, Y. Long, C. A. Parent and P.
N. DevreotesUSA

Ras-mediated activation of the TORC2-PKB pathway is critical for chemotaxis

Proc. Natl.
Anjard, C. and W. F. Loomis
Acad. Sci. USA

Germany

Cloning and functional expression of UGT genes encoding sterol glucosyltransferases from
Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Pichia pastoris, and Dictyostelium discoideum

92

63バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

病原微生物

当該リソースの区分

代表機関（課題管理者氏名） 千葉大学（亀井克彦）

第２期申請時の区分

発展が見込まれるバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名） 大阪大（飯田哲也）、岐阜大（江崎孝行）、長崎大（平山謙二）
運営委員長 北 潔（東大大学院医学系研究科）

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 27 年度頃）
【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①これまで感染例の報告のある菌種の ①国内において感染の報告がある主要 病原微生物の入手、移動は、国内、国 ①今後いかなる感染症が起っても、それ外においても比較的容易であった。まに対応する研究者のニーズを満たす病
網羅的な収集・保存を進め、今後の感染 な菌種は収集、保存できている。
た、非常勤職員の雇用の継続に期限は 原微生物株コレクションを目指す。
症対策に必要なコレクションを目指す。
設けられていなかった。
②基準株において生理性状、形態およ ②重要度の高い菌種から最新の知見にび病原情報、遺伝子情報を整備し、感染 基づき、菌株情報を整備し、データベー症対策の基礎データとする。
スに蓄積し、公開している。
【具体的状況の変化の内容】③改正感染症法に対応した収集、保存、 ③新たに制定された規制に対応した体提供体制を整備する。
制を整備した。

②変遷する病原体に対応するため、常に最新の菌株を入手・整備するなど、感染症研究に必須なリソースとして改良を続ける。
①感染症法の改正により、二種 三種病 ③後継者育成、技術指導や教育支援も実施する。
原体等の移動が困難になった。

【目標とした研究コミュニティの状況】②生物多様性条約の厳密な適用により、海外からの病原微生物の入手が困【研究コミュニティの状況】
難になりつつある。

①病原微生物を必要とする研究者、コミュニティがある。

【研究コミュニティの状況】①病原微生物を必要とする研究者、コミュニティ数は増加している（例：感染症学会の会員数は増加を続け、10,000人を超えている）。
②提供を受けたリソースにより学術研究 ②学術論文、学会発表の内容から判断を行っている。
し、研究レベルは上昇していると考えられる。
③菌株の同定、薬剤感受性、治療法などの技術支援、情報を求めている。

③大学において非常勤職員の雇用に期 ①病原微生物を扱う研究者、コミュニティ
限が設けられたため、菌株維持に習熟 があり、新たな病原微生物を必要としてしたスタッフの育成・保持に支障が生じ いる。
つつある。
④外部資金枠の減少により，資金の獲 ②新たに報告された病原微生物を使用得が困難になっている。
して、学術研究を実施している。
③菌株の同定、薬剤感受性、治療法などの技術支援、情報を求めている。

③社会問題となっている耐性菌の出現 ⑤や進行病原体の出現など、常に新たな情報を用いた社会的問題の解決に向けた研究を行っている。

9364

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①目標：これまで感染例の報告のある菌 ①状況：これまで感染例の報告のある主 ①事業実施担当者の継続性☑後継者等あり □後継者等なし
種について網羅的な収集・保存を行う。 要な菌種について収集・保存を行った。
指標：収集、保存数が目標に達している 指標：収集、保存数を確認した。
か確認する。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：感染例の報告のある主要な菌種収集・保存がもれていないかのチェッ
ク体制を確立する。
指標：収集、保存数の確認し、主要な菌種がもれていないかチェックする。

②目標：基準株において生理性状、形態 ②状況：重要度の高い菌種から最新の ②後継者の人材育成状況☑順調に育成中 □後継人材がいない
および病原情報、遺伝子情報を整備す 知見に基づき、菌株情報を整備した。
る。
指標：最新の知見を収集し、それに基づ
指標：最新の知見を収集し、それに基づ き、保存菌株の分類学的位置付けなど
いているかチェックする。
をチェックした。

②目標：基準株について最新の知見を収集し、提供する情報に反映させる体制の構築する。
指標：最新の知見を収集し、それに基づいているかチェックする。

③目標：病原株の安定的な提供を継続 ③状況：研究・教育機関などの求めに応 ③組織的な支援体制☑整っている。 □支援体制がない。
する。
じて、安定した提供数を維持している。
指標：年度ごとの提供数を確認する。
指標：年度ごとの提供数を、目標に照らし合わせて確認した。

③目標：年度ごとに安定的な提供数にあることを確認し、必要に応じて対策を迅速に検討する体制を整える。
指標：年度ごとの提供数を確認する。

④目標：提供リソースによる学術成果を④目標：病原微生物に関する情報提供 ④状況：得られた情報を菌株に付加し、 【特記事項】
千葉大学においては、専門の部署（バイオリ 把握し情報をHPなどで公開する。
体制を整備する。
データベースとして整備し公開した。
指標：情報がHPなどで公開され、学術成 指標：情報がHPなどで公開され、学術成 ソース管理室）を設ける事で、担当者の意識 指標：情報がHPなどで公開され、学術成向上に努めた。
果が論文として発表される。
果が論文として発表されているか。
果が論文として発表された。
岐阜大学においては、保存施設を講座から大学に管理を移し、責任のある体制とした。

⑤目標：改正感染症法に対応した収集、 ⑤状況：改正感染症法に対応した収集、保存、提供体制を整備する。
保存、提供体制を整備した。
指標：改正感染症法に準じた整備がなさ 指標：政令で定められた二種、三種病原れているか。
体等の維持、管理においては改正感染症法に準じているか確認し、準拠できていない点については、最優先事項として対応した。

⑤目標：後継者をルーチンの業務を通じて指導し、組織的な支援体制を確立する。また、コミュニティの要望に応える講
習会、コンサルタントを適宜実施する。
指標：後継者の職務に必要な技術をチェックする。また、講習会、コンサルタ
ントの回数、内容が適正であるか確認する。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

9465

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： 病原微生物
番号 分野 発行年
雑誌名
1

6911

著者名
所属
Okada N, Matsuda S,
Matsuyama J, Park KS, de Los
Osaka Univ
Reyes C, Kogure K, Honda T,
Iida T

2010

BMC
Microbiol

2010

Int J Syst
Otsuka Y, Akiyama Y, Sato S,
Gifu Univ
Evol Microbiol Taguchi O, Sueyasu Y, Kawabe Y,

タイトル
Presence of genes for type III secretion system 2 in Vibrio mimicus
strains

Saito H, Iwamoto T, Ohkusu K,

2

6911

Mycobacterium shinjukuense sp. nov.; a slowly growing,
nonchromogenic species isolated from human clinical specimens

Fujimoto H, Ezaki T, Butler R

3

6911

2010

Yaguchi T, Matsuzawa T,
Mycoscience Tanaka R, Abliz P, Hui Y, Horie Chiba UnivY
Okada N, Iida T, Park KS,
Goto N, Yasunaga T, Hiyoshi
Infect Immun
H, Matsuda S, Kodama T,
Honda T
Helegbe GK, Huy NT, Yanagi
T, Shuaibu MN, Yamazaki A,
Malar J
Kikuchi M, Yasunami M,
Hirayama K

Two new species of Neosartorya isolated from soil in Xinjiang,
China

Osaka Univ

Identification and characterization of a novel type III secretion
system in trh-positive Vibrio parahaemolyticus strain TH3996
reveal genetic lineage and diversity of pathogenic machinerybeyond the species level

Nagasaki Univ

Rate of red blood cell destruction varies in different strains ofmice infected with Plasmodium berghei-ANKA after chronic
exposure

4

6911

2009

5

6910

2009

6

6910

2009

Am J Trop
Med Hyg

Pandey BD, Pandey K, Kaneko
Nagasaki Univ
O, Yanagi T, Hirayama K.

Relapse of visceral leishmaniasis after miltefosine treatment in a
Nepalese patient

7

6910

2009

Parasitology

Tachibana H, Yanagi T,
Akatsuka A, Kobayashi S,
Kanbara H, Tsutsumi V

Isolation and characterization of a potentially virulent species
Entamoeba nuttalli from captive Japanese macaques

8

6911

2009

J ClinMicrobiol

Deguchi T, Yasuda M, Yokoi S,
Nakano M, Ito S, Ohkusu K,
Gifu Univ
Ezaki T, Hoshina S

2009

Proc Natl
Takeuchi O, Matsuzawa T,
Acad Sci U S Ishikawa E, Sakuma M, Tateno H, Chiba Univ
Uno J, Hirabayashi J, Mikami Y,A

C-type lectin Mincle is an activating receptor for pathogenic
fungus, Malassezia

Duc PM, Hatai K, Kurata O,
Mycopathologi
Tensha K, Yoshitaka U,
aYaguchi T, Udagawa S

Fungal infection of mantis shrimp (Oratosquilla oratoria) caused by
two anamorphic fungi found in Japan

Nagasaki Univ

Failure to detect Mycoplasma genitalium in the pharynges offemale sex workers in Japan

Yamasaki S, Matsumoto M,

9

6911

Takeda K, Akira S, Saito T

10

6911

2009

Chiba Univ
95

66

11

6911

2008

Emerg InfectDis

Nakamura S, Maeda N, Miron IM,
Yoh M, Izutsu K, Kataoka C,
Honda T, Yasunaga T, Nakaya T,
Kawai J, Hayashizaki Y, Horii T,
Iida T

12

6911

2008

感染症学雑誌

松山 純子, 余 明順, 本田
武司

Osaka Univ

海外旅行者から分離された新しい血清型組み合わせを有する腸炎
ビブリオ

2008

Trop MedHeal

Osawa H, Troye-Blomberg M,
Hirayama K, Kikuchi M,
Hombhanje F, Tanihata T,
Udomsangpetch R, Björkman A,
Kobayakawa T, Kaneko A

Nagasaki Univ

CTLA-4 polymorphisms and anti-malarial antibodies in a hyperendemic population of Papua New Guinea

Molecular detection of Leishmania parasites from whole bodies ofsandflies collected in Nepal

13

6910

Osaka Univ

Metagenomic diagnosis of bacterial infections

14

6910

2008

Pandey K, Pant S, Kanbara H,
Shuaibu MN, Mallik AK,
Parasitol Res
Nagasaki Univ
Pandey BD, Kaneko O, Yanagi
T

15

6911

2008

Toyotome T, Adachi Y,
Microb Pathog Watanabe A, Ochiai E, Ohno N, Chiba Univ
Kamei K

Activator protein 1 is triggered by Aspergillus fumigatus betaglucans surface-exposed during specific growth stages

Intraspecific diversity of species of the Pseudallescheria boydii
complex

16

6911

2008

Med Mycol

Zeng JS, Fukushima K,
Takizawa K, Zheng YC,
Nishimura K, Gräser Y, De
Hoog GS

17

6911

2007

Int J Molec
Scien

Huang X, Xu H, Sun X, Ohkusu
Gifu Univ
K, Kawamura Y, Ezaki T

Genome-wide scan of the gene expression kinetics of Salmonella
enterica serovar Typhi during hyperosmotic stress

Legionella impletisoli sp. nov. and Legionella yabuuchiae sp. nov.,
isolated from soils contaminated with industrial wastes in Japan

Chiba Univ

18

6911

2007

Syst Appl
Microbiol

Kuroki H, Miyamoto H, Fukuda
K, Iihara H, Kawamura Y,
Gifu Univ
Ogawa M, Wang Y, Ezaki T,
Taniguchi H

19

6911

2007

Int J Urol

Masue N, Deguchi T, Yokoi S,
Gifu Univ
Yamada T, Ohkusu K, Ezaki T

System for simultaneous detection of 16 pathogens related tourethritis to diagnose mixed infection

20

6911

2005

J Med
Microbiol

Yoh M, Matsuyama J, Ohnishi
M, Takagi K, Miyagi H, Mori K, Osaka Univ
Park KS, Ono T, Honda T

Importance of Providencia species as a major cause of travellers'
diarrhoea
9667バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

一般微生物
第２期申請時の区分

代表機関（課題管理者氏名）（独）理化学研究所BRC微生物材料開発室（大熊盛也）

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長

渡邉

信

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ
※１

Ⅲ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

Ⅳ
リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 24 年度頃）
【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①健康と環境の研究に資するリソースの高水準 ①健康と環境の研究に利用されるリソースの整 1981年より微生物系統保存事業として発足し、 ①環境や健康のための科学研究に必要で、の整備事業を実施しているとした。
備を実施し、質量とも高い水準を維持している。 2004年に理研BRCに統合され、第１期NBRPに かつ研究を先導する役割を果たすリソースを利用した成果として数多くの関連論文が発表さ は病原微生物の分担機関として、第２期は中 整備している。
核機関となった。この間、育成した優秀な人材れた。
がNBRCなど国内外の機関に輩出している。中核機関なった際にターゲットに設定した環境と②基準株を中心とした新規微生物の国際登録機 ②目標数値をはるかに上回る収集実績を挙げ、 健康の研究が、それぞれグリーン・ライフイノ ②環境や健康の分野で、重要な研究に用い関としての活動を高いレベルで実施しているとし 世界最高水準の地位を築いた（基準株の年間 ベーションの成長戦略と策定され、一般微生物 られたリソースとその学術研究情報の整備なのリソースはますます重要となりつつあった。 ど、学術体系化に貢献する基盤を整備していた。
登録数で世界２位または３位）。
る。
③ゲノム情報やリソース関連情報等の高い③存続の危機にある学術研究上重要なリソース ③複数の機関からそれぞれ百を超える株を移付加価値を有し、高いレベルで品質管理されを移管して持続的利用を可能としているとした。 管し、その内の多くを安定に保存し、提供可能とたリソースの整備を実施している。
した。
【具体的状況の変化の内容】【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①提供時のMTAに記載の研究目的は、分類学 ①経済状況、事業仕分け等により科学技術へ ①コミュニティは、安定的なリソースの提供の①分類学のみならず、健康と環境の研究にリソースを必要とする研究コミュニティが形成されて に加えて多くが健康または環境のための研究と の投資の削減、研究活動の萎縮、研究基盤の みならず、学術研究に先導的役割をはたすリなった。
いるとした。
縮小が発生しないよう留意すべき状況となって ソースと関連情報を必要としている。
いる。
②リソースを利用して数多くの学術研究が行われ ②毎年180を超える学術論文でリソースが利用 ②本事業により認知度もあがり、寄託と提供が ②リソースを利用して多くの研究成果をあげされた。
ているとした。
増加しているが、経済状況、価格改定により、 ている。
特に営利機関の利用減少が危惧される状況となっている。
③世界的に必要とされる学術研究の標準となる ③基準株の寄託機関として、世界最高水準の地位を築き、毎年800株以上が寄託された。
リソースを数多く寄託しているとした。

③生物多様性条約、名古屋議定書により、バ ③重要な研究成果としてのリソースと学術上
イオリソースの学術研究目的の利用が失速し 重要なリソースを寄託している。
ないよう留意し、我が国の生物資源を確保する
必要が高まる状況となった。
④欧米、アジアでは研究基盤整備に巨額の投資があり、特にアジア各国ではNBRP, BRCを規範として猛追しており、我が国が国際的に埋没しないよう留意すべき状況となっている。

97

68

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ※１（平成16年度の申請時に設定したもの）【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】（項目※２と客観的指標）①目標：高品質のリソースが提供されているとした。指標：ISO9001認証を取得し、それに基づいた品質管理を実施していること。

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）【重点到達目標の達成状況】（項目と客観的指標）①ISO9001認証を取得・継続更新し、それに基づいた徹底した品質管理を実施してきた。

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成 24 年度頃）
【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：学術研究基盤としての重要性が高まる。指標：リソースを利用した研究成果の発表が増加しており、成果も活用されている。

【事業の継続性】（該当する□内に「レ」を記入）①事業実施担当者の継続性□後継者等あり □後継者等なし②後継者の人材育成状況□順調に育成中 □後継人材がいない②目標：コミュニティが必要とする微生物のゲノム ②毎年提供可能な新規なゲノムDNAのリソース ③組織的な支援体制□整っている。 □支援体制がない。
DNAを提供しているとした。指標：ゲノムDNAの安 を拡充して、利用者の要望に応じた安定的な提定的な提供がなされ、提供可能なものが拡充し 供を継続して実施してきた。
ていること。

②目標：ニーズの高まるリソースを整備している。指標：研究の成果としてのリソースの寄託が増加している。大量寄託を除き年間400株以上の収集がある。

③目標：高い付加価値を有したリソースが整③目標：寄託者の権利と利用者の責務を明確と ③寄託・提供のそれぞれでMTAをかわし、MTA 【特記事項】①ゲノムレベルでの品質管理や関連情報の整備備されている。指標：リソースに論文情報がした提供を実施するとした。指標：寄託と提供に 自身の改善・更新も実施した。
等、従来の事業をより発展させるには新しい人材が 整備され、関連技術の研修を年１回程度実安定してMTAを利用し、MTAの改善が図られて必要であるが、所（独法）の総人員枠の制限等で雇 施している。
いること。
用ができない。

④保存条件の最適化が必要な一部の株をのぞ ②微生物は、比較的保存の容易なものも多く、同一 ④目標：高品質のリソースが継続して整備さ④目標：確実なリソースの保存を実施するとした。指標：凍結保存、凍結乾燥保存などの２通り き、原則全ての株で２通りの保存法を適用し、長 利用者へ繰り返しの提供は稀と考えられるが、新規 れている。指標：高いレベルの品質管理がなの保存法を適用し、危険分散がされていること。 期安定な凍結保存は和光と筑波の２カ所で危険 リソースと利用者を拡充して、安定して高い提供数 され、提供数が2840株以上で安定している。
であることを評価いただきたい。
（提供数は過去５年の平均から価格改定による営利機分散をした。
関への減少想定分等を引いた値で算出）⑤目標：健康と環境のための学術研究の基盤と ⑤毎年180を超える学術論文でリソースが利用しての重要性が高まるとした。指標：リソースを利 された。
用した学術研究の成果が数多く発表されていること。

③リソース整備からそれを利用した研究、イノベー ⑤目標：高水準のリソース事業が継続して実ションと一貫して推進するには、リソースの開発研究 施されている。指標：事業の効率化への試みへの支援や国の実施するプロジェクトとの強い連携 がなされており、後継者の育成とその支援体が必要である。
制が確立・維持されている。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

98

69

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： 一般微生物
番号 分野 発行年
雑誌名

著者名

所属

タイトル

Department of Bacteriology, The Staphylococcus epidermidis Esp inhibits Staphylococcus aureus biofilm formation
Iwase T, Uehara Y, Shinji H,
and nasal colonization.
Jikei University School of
Tajima A, Seo H, Takada K,
Medicine, Japan
Agata T, Mizunoe Y.
Silica deposition and phenotypic changes to Thermus thermophilus cultivated in
Department of Applied Microbial
ISME J
Satoru Iwai, Katsumi Doi,the presence of supersaturated silicia
Technology, Faculty ofYasuhiro Fujino, Takeo
Biotechnology and Life Science,
Nakazono, Kosai Fukuda,
Yoshinobu Motomura and Seiya Sojo University, Kumamoto, Japan
Plasmid pAMI2 of Paracoccus aminophilus JCM 7686 Carries N,NAppl. Envir.
Lukasz Dziewit, Michal Dmowski, University of Warsaw, Faculty ofBiology, Institute of Microbiology, Dimethylformamide Degradation-Related Genes Whose Expression Is Activated byMicrobiol.
Jadwiga Baj, and Dariusz
Department of Bacterial Genetics, a LuxR Family Regulator
Bartosik
PolandPotential of aerobic denitrification by Pseudomonas stutzeri TR2 to reduce
Appl. Envir.
Morio Miyahara, Sang-Wan Kim, Department of Biotechnology,
nitrous oxide emissions from wastewater treatment plants
Microbiol.
Shinya Fushinobu, Koki Takaki, Graduate School of Agricultural
Life Sciences, The University ofTakeshi Yamada, Akira
Tokyo, Japan.
Watanabe, Keisuke Miyauchi,
Ginro Endo, Takayoshi Wakagi,
and Hirofumi Shoun
Isolation and characterization of bacteria resistant to metallic copper surfaces
Appl. Envir.
Christophe Espírito Santo, Paula Instituto do Mar (IMAR-CMA),
Microbiol.
Vasconcelos Morais, and Gregor Portugal
Grass
Department of Applied Biological Isolation of functional single cells from environments using a micromanipulator:
Appl Microbiol
Naoaki Ashida, Satoshi Ishii,
application to study denitrifying bacteria
Biotechnol
Sadakazu Hayano, Kanako Tago, Chemistry, Graduate School of
Agricultural and Life Sciences, The
Takashi Tsuji, Yoshitaka
University of Tokyo, Japan
Yoshimura, Shigeto
OtsukaandKeishi Senoo
Department of Food Hygiene and New vector system for random, single-step integration of multiple copies of DNA
Appl. Envir.
Khalid Ibrahim Sallam, Noriko
into the Rhodococcus genome
Control, Faculty of Veterinary
Microbiol.
Tamura, Noriko Imoto, andMedicine, Mansoura University,
Tomohiro Tamura
Department of Genetics, Biology of Characterization of the serpin-encoding gene of Bifidobacterium breve 210B
Appl. Envir.
Turroni F, Foroni E, O'Connell
Microorganisms, Anthropology andMicrobiol.
Motherway M, Bottacini F,
Giubellini V, Zomer A, Ferrarini Evolution, University of Parma,
ItalyA, Delledonne M, Zhang Z, vanSinderen D, Ventura M.
Enterocin X, a novel two-peptide bacteriocin from Enterococcus faecium KU-B5,
Appl. Envir.
Hu CB, Malaphan W, Zendo T,
Laboratory of Microbial
Microbiol.
Nakayama J, Sonomoto K.
Technology, Division of Microbial has an antibacterial spectrum entirely different from those of its component
peptidesScience and Technology,
Department of Bioscience andBiotechnology, Faculty ofAgriculture, Graduate School,
Formation and Characterization of Spherelike Bacterial Cellulose Particles
Biomacromolecul Y Hu and JM Catchmark
Department of Agricultural andes
Biological Engineering and Center Produced by Acetobacter xylinum JCM 9730 Strain.
for NanoCellulosics, Pennsylvania
State University, USA
Identification of novel acetyltransferase activity on the thermostable protein
J. Bacteriol.
Zhang Z, Akutsu J, Kawarabayasi Research Institute for Cell
ST0452 from Sulfolobus tokodaii strain 7
Y.
Engineering, National Institute ofAdvanced Industrial Science andTechnology (AIST), Japan
Comparative Structural Biology of Eubacterial and Archaeal
Division of Structural Biology,
J. Biol. Chem.
Nobuo Maita, James Nyirenda,
Mayumi Igura, Jun Kamishikiryo, Medical Institute of Bioregulation, Oligosaccharyltransferases
Kyushu University, Japanand Daisuke Kohda
99
Nature

1

7309

2010

2

5704

2010

3

6102

2010

4

6102

2010

5

6102

2010

6

6101

2010

7

6102

2010

8

6102

2010

9

6102

2010

10

6102

2010

11

5802

2010

12

5801

2010

70

13

5504

2010

14

2401

2010

15

6103

2010

16

6902

2010

17

7409

2010

18

5706

2010

19

5802

2010

20

6913

2010

Detection of Single Copy Genes by Two-Pass Tyramide Signal Amplification
Microbes Environ. Shuji Kawakami, Kengo Kubota, Department of Environmental
Fluorescence in situ Hybridization (Two-Pass TSA-FISH) with Single
Systems Engineering, Nagaoka
Hiroyuki Imachi, Takashi
Oligonucleotide Probes
University of Technology, Japan
Yamaguchi, Hideki Harada andAkiyoshi Ohashi
Chemistry, North Carolina StatePart II: defining and quantifying individual and co-cultured intracellular proteomes
David Muddiman, Genna
Analytical andUniversity, USA.
of two thermophilic microorganisms by GeLC-MS2 and spectral counting
Andrews, Derrick Lewis,
Bioanalytical
Jaspreet Notey and Robert Kelly
Chemistry,
Cloning, characterization, and antifungal activity of an endo-1,3-β-D-glucanase
Key Laboratory for Feed
Appl Microbiol
Pengjun Shi & Guoyu Yao &from Streptomyces sp. S27
Biotechnology of the Ministry of
Biotechnol
Peilong Yang & Ning Li &Agriculture, Feed Research
Huiying Luo & Yingguo Bai &Institute, Chinese Academy of
Yaru Wang & Bin Yao
Agricultural Sciences, People's
Cooperation of β-galactosidase and β-N-acetylhexosaminidase from
Glycobiology
Mika Miwa, Tomohiro Horimoto, Graduate School of Biostudies,
Kyoto University, Japanbifidobacteria in assimilation of human milk oligosaccharides with type 2 structure
Masashi Kiyohara, Takane
Katayama, Motomitsu Kitaoka,
Hisashi Ashida, and Kenji
Yamamoto
Lactobacilli Are Prominent in the Initial Stages of Polymicrobial Infection of
Institute of Dental Research,
Mangala A. Nadkarni, Mary R.
Journal ofWestmead Centre for Oral Health Dental Pulp
Simonian, Derek W. S. Harty,
Clinicaland Westmead Millennium Institute,Hans Zoellner, Nicholas A.
Microbiology
Australia
Jacques, and Neil HunterAppl. Envir.
Jing Han, Jing Hou, Hailong Liu, State Key Laboratory of Microbial A novel subtype of PHA synthases with homology to bacterial type III synthases
is widely distributed in halophilic archaea
Microbiol.,Shuangfeng Cai, Bo Feng, Jian Resources, Institute ofMicrobiology, Chinese Academy ofZhou, and Hua Xiang
Sciences, People's Republic of
Coenzyme A and its thioester pools in fasted and fed rat tissues
Biochemical and Yuka Tokutake, Naoki Onizawa, Department of Applied Life
Hiroki Katoh, Atsushi Toyoda, d Science, United Graduate School
Biophysicalof Agricultural Science, Tokyoand Shigeru Chohnan
Research
University of Agriculture andCommunications
Technology, Japan.
Yakult Central Institute for
Bacterial Teichoic Acids Reverse Predominant IL-12 Production Induced by
J. Immunol.
Rumi Kaji, Junko KiyoshimaMicrobiological Research, Japan
Certain Lactobacillus Strains into Predominant IL-10 Production via TLR2Shibata, Masato Nagaoka,
Dependent ERK Activation in Macrophages
Masanobu Nanno, and Kan Shida

100

71

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 原核生物遺伝資源 (大腸菌•枯草菌)
代表機関（課題管理者氏名）情報•システム研究機構 国立遺伝学研究所 （仁木宏典）

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）九州大学 （片山 勉）
運営委員長 奈良先端科学技術大学院大学 小笠原 直毅

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成２４年度頃）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】① 第１期ナショナルバイオリソース事 ① 大腸菌のトランスポゾン破壊菌株の 微生物ゲノムの解読の爆発的な増加 ① 有用なリソースを収集•保存し、未来収集と分譲を行ない、30128株の株の提 の直前にあり、網羅的な研究が一般化 の研究者に分譲するシステムを確立す
業を発展させ世界的な原核生物のリ供を行った。３８の国や地域からの提供 していた。また、知的財産権によるMTA る。簡便で負担のない寄託システムを
ソースセンターの構築する。
依頼が来るようになり世界的なリソース などもまだなじみがなく、当然COP10 の 取り入れ、また寄託者と双方向の情報
ような生物多様性に関する意識も低センターになった。
が可能なシステムを作る。
かった。
② ゲノム配列レベルでの品質情報や② 大腸菌に加えて、枯草菌も収集•提 ② 奈良先端大（小笠原研究室）より枯 【具体的状況の変化の内容】
研究成果情報を整え、最新のリソース
供し２大原核モデル生物のリソースセン 草菌遺伝子破壊株のライブラリー（２５１５株）を収集し、品質検定を行なった。そ研究の情報を発信する情報と資源の国ターの構築する。
のうち２０９４株の公開を開始し、２大原
際的なリソースセンターを作り上げる。
核モデル生物のリソースセンターとしての活動を始めた。
③ 利用価値の高いリソースとして質を ③ 保存施設の整備、九州大学におい ① 知的財産権に関して株の作成者も ③ リソースを使った研究への関心を高高め、分譲実費の一部利用者負担制度 て菌株のバックアップを行い永続的なリ その権利意識に乏しく、特にGFPのよう める。また、リソースセンターを活用したを取り入れるなど安定した事業の体制 ソースの保存体制を構築した。また、２２ な特許に触れるリソースの取扱につい 高いレベルでの研究を行い、後継者の年度からの分譲実費の徴収に向けてシ て不明であった。本事業の推進と共にこ 育成も図る。
を作り上げる。
ステムの整備などを行ない、安定的な れらの権利に関する制度も整備され事業を体制の基盤を作った。
た。
②【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】① 国内の研究者から、積極的に本事 ① NBRP運営委員会に国内の主要な原 ③
核生物の研究者の参加し、コミュニ業への連携と支援を受け、コミュニティーから要望を元に事業の推進に建 ティーに意向を反映した事業運営体制を作った。
設的な提言を行う。
② 研究に本リソースを活用してもらうと ② 本リソースを利用し,その旨を明記し ④ともに、本リソースの活用実績を発表の た論文発表が増えた。
際に明記してもらう。

【研究コミュニティの状況】① 合成生物学研究などによる「生命の基本原理」の研究や感染症研究や細菌を利用した応用研究の方面からもリソースの需要が高まる。
② 新型シーケンサーの活用により、リソースの遺伝型を厳密に評価できるようになりつつあり、その情報付加は研究コ
ミュティにとって大きな意味を持つため、系統的なリソースの維持が重要となって
くる。
101

72

③ 枯草菌の研究者のリソースの提供 ③ 枯草菌遺伝子破壊株のライブラリー ⑤を受け、また本事業の推進に協力を求 や関連情報の提供を受けるとともに、運める。
営委員会への参加も始まり、国内の枯草菌研究者との協力が始まった。

③ モデル生物情報とモデル生物での実験結果の比較は益々重要さを増しており、国際的なリソースセンターとして一定の水準を保った運営が期待される。

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）① 目標：国際的なリソースセンターの ① 2002では119件であった国外への提 ①事業実施担当者の継続性□レ後継者等あり □後継者等なし
構築をめざす。指標：国外への提供数 供数が２００８年度では686件まで増加しの増加。
た。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）① 目標：研究と管理とを両立できる組
織体制を作りあげ、国際的なリソースセンターとして一定の水準を保った運営を行なう。指標： 国際的なリソースセン
ターとして認知される。

② 目標：ゲノム情報に基づいた網羅的 ② ASKAクローンやKEIOライブラリーの ②後継者の人材育成状況□レ順調に育成中 □後継人材がいな
一括提供を安定して行ない、KEIOライブ
なリソースの安定な供給を行なう。指標：ASKAクローンやKEIOライブラリーな ラリに関しては１４３件の一括提供を行 いなった。
どの安定的な提供実績。

② 目標： オンラインでの分譲システムを確立し、分譲に関わる諸手続きを簡便にする。国内だけでなく、国際的にも重要な菌株の寄託を受け付けるようにする。指標：海外からの寄託申請の依頼が来る。
③目標： 国際的なリソースセンターとして、菌株だけではなく、これに付随する情報の拡充を行なう。指標：付属情報へのアクセスがある。
④目標： 実験菌株の標準となるような高品質の株を提供する。指標：ゲノム配列による品質検定方法の導入。

③ 目標：国内で開発された有用なリソースの収集を行なう。指標： 国内研究者からの寄託数とその提供数。

③ 厳選したリソースを寄託者による品 ③組織的な支援体制□レ整っている。 □支援体制がない。
質の確認の上で収集した。寄託株数は
１９,８２７株であった。

④ 目標：恒久的に安全な保存体制を ④ 保管機関を２カ所にし、安全な保管 【特記事項】
築き、リソースを安定に維持する。指標： 体制とするとともに、すべての株を冷凍保存株数や保存方法、及び保存体制。 保存し、55823株の保存した。

⑤ 目標：リソースの活用により、研究 ⑤ MTAの締結を徹底し、また発表時の ① よい人材の確保のため後継者とな ⑤目標： 有用なリソースを揃え、国内外の研究者に必要なリソースを安定的開発などへの貢献を行なうとともに、リ リソースへの謝辞を統一した。発表論文 る研究員が本務のエフォート外で、リも130報に増加した。
ソースの有用性の認知させる。指標：
ソースを活用した研究に取り組めるよう に提供する。指標：世界全体に安定的
MTAの数、及び提供したリソースを利用な制度の確立。② 国際的なリソースの に菌株を提供する。
した成果が、論文として発表され、同時提供で、通関等の際に生物の手続きににその利用を明示させる。
関し規制が強まっている。安全なモデル生物として国際的な認証システムの導【主な研究成果・論文等】（別紙で添付） 入する。③必要かつ安定なセンターの選抜と維持のため学会などより大きなコ
ミュニテーの運営への参画。
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

102

73

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：原核生物遺伝資源 (大腸菌•枯草菌)
番号

分野

発行年

1 6701 2010

雑誌名

著者名

Nature Chemi.
Sinha,J., Reyes,S. and Gallivan,J.
Biol.

所属

2 5805 2010

NatureLevin-Reisman,I., Gefen.,O., Fridman.O., Ronin,O.,
Racah Institute of Physics, The Hebrew University
Shwa,D., Sheftel,H. and Balaban,N.

3 5804 2010

Aging Cell

Gonidakis,S., Finkel,E,S. and Longo,D,V.

4 5804 2010 J. Biol. Chemi. Radchenko,M., Thornton,J. and Merrick,M.

タイトル

Department of Chemistry and Center for Fundamental and Applied Molecular evolution,
Reprogramming bacteria to seek and destroy an herbicide
Emory university, Atlanta, Georgia, USA
Automated imaging with scanLag reveals previously undetectable bacterial growth phenotypes

Andrus Gerontology Center, Department of Biological Sciences, University of Southern Genome-wide screen identiﬁes Escherichia coli TCA-cycle-related mutants with extended chronological
California
lifespan dependent on acetate metabolism and the hypoxia-inducible transcription factor ArcA.
Department of Molecular Microbiology, John Innes Centre

Control of AmtB-GlnK Complex Formation by Intracellular Levels of ATP, ADP, and 2-Oxoglutarate

Proc. Natl. Létoffé,S., Heuck,G., Delepelaire,P., Lange,N. andUnitedes Membranes Bacteriennes, Departement de Microbiologie, Institut Pasteur
5 5801 2009
Acad. Sci. USA Wandersman,C.

Bacteria capture iron from heme by keeping tetrapyrrol skeleton intact.

6 5801 2009 J. Biotechnol. Umekage,S. and Kikuchi,YDepartment of Ecological Engineering, Toyohashi University of Technology

In vitro and in vivo production and puriﬁcation of circular RNA aptamer

7 5804 2009

Proc. Natl.
Nagano,K. and Nikaido,H.
Acad. Sci. USA

Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science andTechnology, Osaka University, Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka
University, Complex Systems Biology Project

Kinetic behavior of the major multidrug efflux pump AcrB of Escherichia coli.

8 5801 2009

Krieg,S., Huché,F., Diederichs,K., IzadiProc. Natl.
Pruneyre,N., Lecroisey,A., Wandersman,C.,
Acad. Sci. USA
Delepelaire,P. and Welte,W

Fachbereich Biologie, Universitat Konstanz

Heme uptake across the outer membrane as revealed by crystal structures of the receptor-hemophore
complex

9 5804 2009 J. Biol. Chemi. Pimkin, M., Pimkina, J. and Markham, GD.
10 5804 2009

EMBO J.

Ninnis, RL., Spall, SK., Talbo, GH., Truscott, KN.
and Dougan, DA.

11 5701 2009

Science

Chuang JS, Rivoire O, Leibler S.

Institute for Cancer Research, Fox Chase Cancer CenterA regulatory role of the Bateman domain of IMP dehydrogenase in adenylate nucleotide biosynthesis

Department of Biochemistry, La Trobe University, Kingsbury Drive, Melbourne

Modification of PATase by L/F-transferase generates a ClpS-dependent N-end rule substrate in
Escherichia coli

Center for Studies in Physics and Biology and Laboratory of Living Matter, The
Rockefeller University

Simpson's paradox in a synthetic microbial system

Proc. Natl.
Tal, N. and Schuldiner, S.
12 5804 2009
Acad. Sci. USA
Gaur,R., Grasso,D., Datta,P.P., Krishna,P.D.V.,
13 5804 2008
Mol. Cell
Das,G., Spencer, A., Agrawal, R. K., Spremulli, L.
and Varshney, U.
Das,G., Thotala,T. K., Kapoor,S., Sheelarani, K.,
EMBO J.
14 5804 2008
Thakur, S. S., Singh, N. S. and Varshney, U.

Department of Biological Chemistry, Alexander A. Silberman Institute of Life Sciences,
A coordinated network of transporters with overlapping specificities provides a robust survival strategy.
Hebrew University of Jerusalem

Department of Microbiology and Cell Biology, Indian Institute of Science

Role of 16S ribosomal RNA methylations in translation initiation in Escherichia coli

15 5804 2008

Genes Dev.

Wang, X., Reyes-Lamothe, R. and Sherratt, DJ.

Department of Biochemistry, University of Oxford

Modulation of Escherichia coli sister chromosome cohesion by topoisomerase IV.

16 5804 2008

Genes Dev.

Kim, KS., Manasherob, R. and Cohen, SN.

Department of Genetics, Stanford University School of Medicine

YmdB: a stress-responsive ribonuclease-binding regulator of E. coli RNase III activity.

17 5804 2008

NatureDeana, A., Celesnik, H. and Belasco, JG

Kimmel Center for Biology and Medicine at the Skirball Institute, and Department ofMicrobiology, New York University School of Medicine

The bacterial enzyme RppH triggers messenger RNA degradation by 5' pyrophosphate removal

18 5804 2008

ScienceLaboratory of Microbiology, Department of Agrotechnology and Food Sciences,
Brouns SJ, Jore MM, Lundgren M, Westra ER,
Wageningen University, Biological and Environmental Systems, Department of Chemical
Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes.
Slijkhuis RJ, Snijders AP, Dickman MJ, Makarova
and Pro-cess Engineering, University of Sheffield National Center for Biotechnology
KS, Koonin EV, van der Oost J.
Information, National Library of Medicine

19 5804 2008

Cell

20 5701 2008

NatureMethods

Department of Microbiology and Cell Biology, Indian Institute of Science

A single mammalian mitochondrial translation initiation factor functionally replaces two bacterial factors.

Howard Hughes Medical Institute Department of Biomedical Engineering, Center for
Kohanski MA, Dwyer DJ, Wierzbowski J, Cottarel
BioDynamics, and Center for Advanced Biotechnology Boston University, Boston
G, Collins JJ.
University School of Medicine

Mistranslation of membrane proteins and two-component system activation trigger antibiotic-mediated cell
death.

Typas,A., Nichols,R., Siegele,D., Shales,M.,
Collins,S., Lim,B., Braberg,H., Yamamoto,N.,
Takeuchi,R., Wanner,B., Moria,H., Weissman,J.,
Krogan,N. and Gross,C.

High-throughput, quantitative analyses of genetic interactions in E. colis.

Department of Microbiology and Immunology, University of California at San Francisco

103

74

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

酵母

代表機関（課題管理者氏名）

中村太郎

分担機関（課題管理者氏名）

金子嘉信

運営委員長

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

大矢禎一

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

※１

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成27年度頃）【2010年に目標とした状況】【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】① 魅力のある先進的なリソースを収①収集は日本トップの研究者から継続 4人の専任教員を中心とし、世界的にも集、保存、提供する。
的におこなっている。最近では海外から 認めの寄託も増えている。また、論文を検索 られる突然変異体とDNAクローンを主とし、有用なリソースの寄託をこちらからお する研究用酵母リソースに特化した日本 ① これまでに引き続き、魅力のあるリ
願いしている。年間2000件を超える提供 初の本格的リソース機関として事業を開 ソースを世界的に戦略的に収集、保存、提供する。
のうち、約60%は海外で提供先も20カ国 始した。
を超えてる。名実ともに世界トップのリソース機関となった。
② 保有リソースの安全な保存と品質管 ② リソースのうち、特に貴重なものは、中核、分担機関それぞれでバックアップ
理を保持するようにした。
を行う。
【具体的状況の変化の内容】② 提供リソースを使った論文に、NBRP
から提供されたものである旨の明記を徹底して求め、NBRP酵母の貢献を目に見える形にする。

③ リソース情報の公開と提供作業の迅 ③ ホームページおよびデータベースを大幅に改訂した。オンラインで発注でき速るシステムを構築、さらに実費徴収を可化能とした。

① 大学教員の研究以外の業務（大学③ 設置機関との連携を深め、最終的にの運営や地域貢献事業など）が莫大には増え、自分の研究を進める時間さえ非常
大学の付置機関としてのリソースセンに限られており、リソース事業の兼務にターを目指す。
対する負担が激増した。
② これまで分裂酵母の本格的なリソース機関はNBRP酵母だけであったが、ヨーロッパの酵母リソース機関【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
EUROSCARFが分裂酵母のリソース収集を開始した。
① 国内のほとんどの酵母研究者が集 ① 酵母遺伝学フォーラム（H22.8月現在 ③ 中核機関では教員定数の大幅削減 ① リソース事業が研究の発展のためにまる酵母遺伝学フォーラムとNBRP酵母 会員数580名）のみならず、酵母リソース が欠くことができないということを主張するを扱う可能性があるさまざまな学会、研 実行され（10年で30%）、後継者となるべ こと。リソース機関の存在により、研究者の連携を強める。
究会等で広報活動して認知に努めてい き教員の補充がなされなかった。
個人が負っていた労力が削減され、コる。
ミュニティとして大きな財産になっていることをアピールすること。
② 需要の多い有用なリソースを保有し② 提供を受けたリソースにより高いレ ② NBRP酵母から寄託されたリソースを ④て使った論文がトップジャーナルに掲載さ
ベルの学術研究を行っている。
いる。
れている。
③ 世界的に必要とされるリソースを本 ③ 達成状況の①で述べたように、国内 ⑤③ 第1期2期と同程度の予算規模が外にかかわらず、質の高いリソースが提事業に寄託している。
維持され、事業規模が維持されること。
供されている。
10475

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）① 目標：世界的なリソース拠点として地 ① 分裂酵母では世界随一、出芽酵母 ①事業実施担当者の継続性;後継者等あり □後継者等なし
でも世界三大拠点の１つとして位置づけ位を確立する。
指標：三大拠点の一つとして位置付 られた。
けられ続ける。

② 目標：魅力的なリソースを有している。
指標：提供数が安定している。

② 提供数は右肩上がりである。年間総 ②後継者の人材育成状況□順調に育成中 ;後継人材がいない
提供数は2000件を超えた。

③ 目標：コミュニティが必要とするリソー ③ 保存数は12万件を超えた。寄託数も ③組織的な支援体制;整っている。 □支援体制がない。
順調に伸びている。とくに、ここ数年は海スを提供している。
指標：保存・寄託数が順調に増加して 外からの寄託も増えた。
いる。

② 目標：魅力的なリソースを有している。
指標：提供数が安定している。具体的に提供リソース数が年間2000件程度を維持する。
③ 目標：コミュニティが必要とするリソースを提供している。
指標：寄託数が順調に増加している。
保有リソースについての問い合わせに半分以上保有していることを目安とする。
④ 目標：NBRP酵母の貢献を目に見える形にする。
指標：提供したリソースによる学術成果が活用される。

④ 目標：NBRP酵母の貢献を目に見え ④ Nature誌をはじめとするトップジャー 【特記事項】
る形にする。
ナルに掲載された論文にNBRP酵母が提指標：提供したリソースによる学術成 供したリソースが使用されている。
果が活用される。
⑤ 目標：リソース情報の整備
指標：リソース情報のデータベースを作成する。ゲノム情報等整備プログラ
ムで解析したクローンの情報公開を行う。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）① 目標：世界的なリソース拠点として地位を維持する。
指標：三大拠点の一つとして位置付けられ続ける。世界の研究者が自分のリソースを寄託するときにNBRP酵母を利用する。

⑤ ゲノム情報等整備プログラムで解析 大学の人員削減のため、後継者人材採 ⑤ 目標：設置機関との連携を深める。
したcDNAクローン、ゲノムDNAクローン 用の目処がたっていない。
指標：実施機関の酵母遺伝資源セ
すべての配列情報を公開した。また、情ンターを大学の正式な付置機関として位
報中核機関の協力を得て、視覚的にわ置づける。
かりやすいデータベースを作成した（http://yeast.lab.nig.ac.jp/cgibin/nig/map_fy.cgi?eng=0）。このデータ
ベースはGoogleMapを使用し、分裂酵母の染色体情報にNBRP酵母がもつリソー
スを同時に図示、検索できるシステムである。GoogleMapで世界地図を調べる感覚で、容易にリソースを調べることが可能である。

・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

105

76

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： 酵母
番号 分野 発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

Fission yeast TORC1 regulates phosphorylation of ribosomal S6 proteins in
Nakashima A, Sato T, University of
Tamanoi F.
California, Los Angeles response to nutrients and its activity is inhibited by rapamycin.
Fission yeast cells undergo nuclear division in the absence of spindle
Castagnetti S,
Cancer Research UK
Oliferenko S, Nurse P.
microtubules.
Nishimura K, Fukagawa
An auxin-based degron system for the rapid depletion of proteins in nonplant
Osaka University
cells.
T, Takisawa et al.
Takaine M, Numata O,
Fission yeast IQGAP arranges actin filaments into the cytokinetic contractile ring.
University of Tsukuba
Nakano K.
Dinh TN, Nagahisa K,
Adaptation of Saccharomyces cerevisiae cells to high ethanol concentration andOsaka University
Hirasawa T, et al.
changes in fatty acid composition of membrane and cell size.
King MC, Drivas TG,
The Howard Hughes
A network of nuclear envelope membrane proteins linking centromeres to
Blobel G.
Medical Institutemicrotubules.
Nakashima A, Maruki Y,
Kobe University
The yeast Tor signaling pathway is involved in G2/M transition via polo-kinase
Imamura Y, et al.
Pérez-Hidalgo L, Rozal
Slk1 is a meiosis-specific Sid2-related kinase that coordinates meiotic nuclear
Salamanca University
én AE, et al.
division with growth of the forespore membrane.
Yamamoto A, Kitamura National Inst.
Spindle checkpoint activation at meiosis I advances anaphase II onset via
K, Hihara D, et al.
Inform/Commun Tech, meiosis-specific APC/C regulation.
Hauf S, Biswas A,
Aurora controls sister kinetochore mono-orientation and homolog bi-orientation
University of Tokyo
Langegger M, et al.
in meiosis-I.
Kawashima SA,
Shugoshin enables tension-generating attachment of kinetochores by loading
University of Tokyo
Tsukahara T, et al.
Aurora to centromeres.
Chikashige Y, Tsutsumi National Inst.
Meiotic proteins bqt1 and bqt2 tether telomeres to form the bouquet arrangement
C, Yamane M, et al.
Inform/Commun Tech, of chromosomes.
Ding DQ, Sakurai N,
National Inst.
Meiotic cohesins modulate chromosome compaction during meiotic prophase in
Katou Y, Itoh T, et al. Inform/Commun Tech, fission yeast.
Harigaya Y, Tanaka H,
Selective elimination of messenger RNA prevents an incidence of untimely
University of Tokyo
Yamanaka S, et al.
meiosis.
Kitajima TS, Sakuno T,
University of Tokyo
Shugoshin collaborates with protein phosphatase 2A to protect cohesin.
Ishiguro K, et al.
Saito TT, Okuzaki D,
Mcp5, a meiotic cell cortex protein, is required for nuclear movement mediated by
Osaka University
Nojima H.
dynein and microtubules in fission yeast.

1

5802

2010

J Cell Sci

2

5701

2010

PLoS Biol

3

5804

2009

Nature Methods

4

5805

2009

EMBO J

5

6102

2008

PLoS One

6

5805

2008

Cell

7

5802

2008

PLoS One

8

5805

2008

J Cell Sci

9

5805

2008

J Cell Biol

10 5805

2007

EMBO J

11 5805

2007

Genes Dev

12 5805

2006

Cell

13 5805

2006

J Cell Biol

14 58042006

Nature15 5805

2006

Nature16 5805

2006

J Cell Biol

17 5805

2006

Cell

Watanabe Y

18 5804

2005

Proc Natl Acad
Sci USA

19 57012004

Nature20 61032003

NatureBiotechnol

Ganley AR, Hayashi K, National Institute for
Horiuchi T, et al.
Basic Biology
Nagao K., Adachi Y. andKyoto University
Yanagida M.
Yamada T, Iwasaki Y,
Osaka University
Tada H, et al.

University of Tokyo

A one-sided view of kinetochore attachment in meiosis.
Identifying gene-independent noncoding functional elements in the yeast
ribosomal DNA by phylogenetic footprinting.
Separase-mediated cleavage of cohesin at interphase is required for DNA repair.
Nanoparticles for the delivery of genes and drugs to human hepatocytes.

106

77

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
当該リソースの区分

リソース名 遺伝子材料代表機関（課題管理者氏名） 理化学研究所バイオリソースセンター (小幡裕一）

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長 宮崎純一

Ⅰ

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等【NBRP開始時の状況】（達成年度：平成24年度頃）【具体的目標】第２期開始時の設定目標※１①社会的ニーズや研究のニーズにあわせて、リソースの収集、管理、保存、提供を行
い、日本の生物学や医科学研究の基盤整
備、臨床研究、産業創出等の推進に貢献する。

①研究コミュニティの多大な支援を受け、我 バイオリソースの確固たる基盤の構築の必 ①遺伝子材料の世界に冠たる拠点と認知さが国最大規模の遺伝子材料リソースバンク 要性が研究者より指摘されていた。しかし、 れ、利用されることによって、科学の発展にとなり、平成21年9月時点で約6,900名のユー 具現化せず、個々の研究者の努力と海外に 貢献する。
ザー登録、約333万クローンを収集・保存し、 依存することが50年間以上続いていた。理約14万クローンを国内外418機関（30ヶ国）に 化学研究所（理研）は1981年より微生物系統 ②遺伝子材料は遺伝子から細胞、個体、そし提供した。
保存事業を、また1987年よりジーンバンク事 て集団レベルまで、あらゆるレベルでの生命②遺伝子の整備と拡充に向け事業を展開す
業として遺伝子材料と細胞材料の収集、保 科学の研究に必要不可欠であり、由緒正しくる。
②リソースの品揃え、品質管理と付加価値 存、提供を開始している。しかし、当時理研 正確なリソースを整備し、提供する。
向上を通じて、利用者の満足度を高める取り は科学技術庁所管であり、文部省所管の大③新しいリソース素材として遺伝子産物（例 組みを続けており、世界最高水準の遺伝子 学等の研究者から十分な理解と支持を得る ③遺伝子材料を産出するコミュニティ及びそえば糖質、タンパク質等）のバンキングを試 リソースを提供する国際的な機関として重要 ことができなかった。2001年、理研はオール れらを利用するコミュニティの研究動向を的
験的に試みる。
な位置づけを確保した。
ジャパンの研究の発展に資することを目的と 確に把握し、必要かつ最も効果的なリソース
し、バイオリソースセンター（BRC)を設置し を効率良く整備し、情報とともに提供する。加
③遺伝子産物（例えば糖質、タンパク質等） た。実験動物（マウス）、実験植物（シロイヌ えて、国内外の関係機関との分担と連携を進のバンキングは、それらの産物が不安定性 ナズナ）の基盤整備を開始するとともに、既 める。
であり、品質管理を十分に施した材料の提 存の遺伝子材料と細胞材料を対象に含める
供が困難であると判断された。そこで、産物 こととした。BRCの設立１年後に開始されたの精製プロトコールを遺伝子とともに提供す NBRPに中核機関として参加することにより、ることとした。
本事業が追い風を受けることとなり、大学等の研究者の認知度も高まり、ナショナルセン
ターとしての地位付けを確固たるものとできた。

【具体的状況の変化の内容】【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①本事業が円滑に展開するに伴い、認知度も上昇し、正のサイクルが回り始め、寄託と提供が増加している。
②科学技術基本計画、知的基盤整備計画
等、国の施策にバイオリソースの重要性が明記されている。特に、近々制定される予定の第4期科学技術基本計画においても明記されることが本事業には極めて重要である。 【研究コミュニティの状況】①遺伝子研究は、遺伝子のみの解析から遺 ①提供した遺伝子材料による研究成果とし ③欧米においては、研究基盤整備への巨額 ①ニーズに応えて、確かな品質の遺伝子材
伝子発現後の遺伝子産物を対象にした解析 て、160報がNature Genetics等の国際誌に の投資を引き続き行っており、また、アジア 料を迅速に提供することを継続して実施すに移行し、高付加価値の即利用可能な様々 掲載され、大きな学術貢献を果たしている。 においては各国がNBRP及びBRCをベンチ る。本事業を必要とし、支持・支援する研究コな遺伝子材料を求めていた。
また学術論文以外にも特許申請が11件あっ マークとしてバイオリソースの整備を急いで ミュニティが存在する。
おり、我が国が国際的に埋没してしまいかねた。
ない状況となっている。
107
78

Ⅰ
第２期開始時の設定目標※１（平成16年度の申請時に設定したもの）

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成24年度頃）④生物多様性条約、名古屋議定書により、
バイオリソースの学術目的の利用が失速しないように留意するとともに、我が国の資源・資産を確保する必要がある。

②遺伝子材料を利用するコミュニティは大変
幅広く、ニーズも多様である。主要な利用者
コミュニティである癌学会、分子生物学会、免疫学会等の発表をフォローすることにより、また文科省等の国の施策にも留意し、研究動向を把握する。

②健康、食料、環境等を目的とする遺伝子 ②企業が権利を有している技術を用いて作機能探索のためのリソースとして、遺伝子の 製されたバイオリソースの学術利用についコード領域を研究テーマ別に分別して「セット て、当該企業と交渉を行い、寄託と研究コ化」したリソースを必要としていた。
ミュニティでの幅広い利用を可能にした。

③生物多様性に着目した遺伝子リソースへ ③NBRPラット、カエル、ニホンザル、ホヤ等 ⑤昨今の財政状況により、科学への投資の ③リソースを生み出す主要な3種類のコミュニのDNAリソースが当室から利用可能となり、 削減、研究活動の萎縮、研究基盤の縮小が ティが存在する。ボトムアップで先導的リソーの拡充を必要としていた。
また、それぞれのWEBサイトに相互のリンク 発生しないように留意すべき状況となってい スを作製する個々の研究者、網羅的リソースを作製するナショナルプロジェクト等に参加しが張られ利便性が向上。リソースの利用も る。
ている研究者、さらにNBRPの対象となってい容易になった。
る生物種のゲノムリソースを作製する研究者である。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）（項目と客観的指標）（項目※２と客観的指標）（該当する□内に「レ」を記入）①激しく変動する遺伝子材料へのニーズを的理研DNAバンクには、長年にわたって積み①事業実施担当者の継続性確に把握し、先見性を持ちリソースを整備す上げてきた高度のバンキング能力があり、年 ①新しい生物種のゲノムリソース：世界標準■後継者等あり □後継者等なし
ると同時に、継続的なニーズのあるリソース
マウス系統のC57BL/6NのBACクローンを世 ②後継者の人材育成状況
間約500件以上（4－6万株数）の提供を行
界に先駆けて作製し、整備した。
い、累計92万株を保存している。以下のリ■順調に育成中 □後継人材がいない については安定的に整備する。具体的には、突発的に一括寄託される大型セットを除き、ソースを重点的に整備する。
③組織的な支援体制②遺伝子導入用リソース：組換えアデノウイ
毎年度100件以上の新規リソースを収集し、■整っている。 □支援体制がない。
提供ラインに載せる。
①新しい生物種のゲノムリソース（主にBAC ルス230株、アデノウイルス産生用シャトルベ
クター711株、プロモーターリソース269株を 【特記事項】
ライブラリー）②基礎基盤研究から出口志向の研究まで、収集し、提供可能にした。
②遺伝子導入用のリソースとしての「組換え①現在のNBRPにはリソースの開発や特性 幅広い研究分野の発展に資するリソースをウイルスベクター」と「プロモーター･レポター③日本人固有の遺伝形質リソース：日本人 解析事業は含まれていない。研究戦略上必 整備、提供する。具体的には、毎年度950件
リソース」に頻度の高い組織適合抗原（HLA)遺伝子40 要不可欠なリソースの開発や特性解析が一 以上のリソースを提供する。
③日本人固有の遺伝形質リソースと「生活習 株を収集し、提供可能にした。
般の科研費等で実施可能な規模を越える場
慣病関連リソース」③遺伝子材料そのもののみならず、ゲノム情合は、国として実施することが望まれる。
④遺伝子機能解析用リソース：ゲノムネット
報、発現情報、遺伝子間ネットワーク情報、④遺伝子機能解析用リソースとして有用な ワーク及びタンパク3000の国家プロジェクト ②国が実施する様々なプロジェクトと連携し 遺伝子産物精製プロトコールも提供する。さにより開発したクローンを整備した。
遺伝子の「セット化」
リソースを整備すること、また科研費等で開 らにはリソースの有効な利用技術等も年１回発されたリソースを中核機関に集約し利活 以上の研修事業を通して提供する。
⑤生物多様性関連リソース：NBRPで整備し 用する仕組みの構築が必要である。
④当室と世界の他のリソースセンターの差⑤生物多様性関連リソースとして、分類学的 ているラット（BACクローン）、ニホンザル
は、厳格な品質管理である。当室に寄託され③多数の貴重なリソースが超低温槽（に重要な生物のDNAクローンとそれの関連 （BACクローン）、カタユウレイボヤ（ESTクローン）、アフリカツメガエル（ESTクローン） 80℃，-30℃）で保管されており、安全・確実 るリソースの約5％に誤りが存在しており、こ情報及び一般微生物（ゲノムDNA)を収集し、提供 な保管のために、大規模災害時（阪神・淡路 れらを全て是正し実験の再現性を保証したリ可能にした。
大震災規模）において少なくとも一週間は供 ソースを提供し、研究の効率化に貢献する。
給可能な非常用発電設備が必要である。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）⑤原産国を明確にする等、生物多様性条約
・論文については２０報までに対応する整備・提供体制を構築する。
※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
10879

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： 遺伝子材料
番号 分野 発行年
雑誌名
1

1955

2010

2

1952

2010

3

1955

2010

4

5806

2010

5

5804

2008

6

1955

2009

7

5805

2010

8

5804

2010

9

5803

2009

10

1105

2009

11

6103

2010

12

5802

2010

13

5804

2010

14

5805

2010

15

6102

2010

16

1101

2008

17 1102

2010

18

1201

2010

19

5806

2007

20

6103

2010

著者名
所属
タイトル
Polyplex micelles prepared from ω-cholesteryl PEG-polycation block
Oba M., Miyata K., Osada K., Christie R.J., Sanjoh M., Li W., Fukushima S.,
東京大学
copolymers for systemic gene delivery.
Ishii T., Kano M.R., Nishiyama N., Koyama H., Kataoka K.
Lavazza, C., Carlo-Stella, C., Giacomini, A., Cleris, L., Righi, M., Sia, D., Di
Human CD34+ cells engineered to express membrane-bound tumor necrosis
Blood
Nicola, M., Magni, M., Longoni, P., Milanesi, M., Francolini, M., Gloghini, A., イタリア国立癌研究所、ミラノ大学、イタリ.ア学術会議神経化学研究所 factor-related apoptosis-inducing ligand target both tumor cells and tumor
Carbone, A., Formelli, F., Gianni, A.M.
vasculature.
Histone deacetylases are critical targets of bortezomib-induced cytotoxicity
Kikuchi J., Wada T., Shimizu R., Izumi T., Akutsu M., Mitsunaga K.,
自治医科大学、栃木県立がんセンター
Bloodin multiple myeloma.
Noborio-Hatano K., Nobuyoshi M., Ozawa K., Kano Y., Furukawa Y.
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand 1 (TRAIL1)
Blood
Tamura K., Mawaribuchi S., Yoshimoto S., Shiba T., Takamatsu N., Ito M. 北里大学
enhances the transition of red blood cells from the larval to adult type
during metamorphosis in Xenopus.
Repair of 2'-C-cyano-2'-deoxy-1-beta-D-arabino-pentofuranosylcytosineCancer Res. Wang Y., Liu X., Matsuda A., Plunkett W.
米テキサス大学 M. D. アンダーソンがんセンター、北海道大学
induced DNA single-strand breaks by transcription-coupled nucleotide
excision repair.
Cytosine deaminase-uracil phosphoribosyltransferase and interleukin (IL)-12
Clin. Cancer
Khatri A., Husaini Y., Ow K., Chapman J., Russell P.J.
豪プリンス・オブ・ウェールズ病院、セントビンセント病院
and IL-18: a multimodal anticancer interface marked by specific modulationRes.
in serum cytokines.
Hirota Y., Meunier A., Huang S., Shimozawa T., Yamada O., Kida Y.S.,
名古屋市立大学、フランス国立科学研究センター、東京大学、慶応大 Planar polarity of multiciliated ependymal cells involves the anterior
Development Inoue M., Ito T., Kato H., Sakaguchi M., Sunabori T., Nakaya M.A., Nonaka
学、東北大学、金沢大学、基礎生物学研究所
migration of basal bodies regulated by non-muscle myosin II.
S., Ogura T., Higuchi H., Okano H., Spassky N., Sawamoto K.
Specific splicing defects in S. pombe carrying a degron allele of the Survival
EMBO J.
Campion Y., Neel H., Gostan T., Soret J., Bordonne R.
フランスモンペリエ大学
of Motor Neuron gene.
Visualization of chemokine receptor activation in transgenic mice reveals
Jung H., Bhangoo S., Banisadr G., Freitag C., Ren D., White F.A., Miller
米ノースウエスタン大学、シカゴロヨラ大学
J. Neurosci.
peripheral activation of CCR2 receptors in states of neuropathic pain.
R.J.
Tomida S., Mamiya T., Sakamaki H., Miura M., Aosaki T., Masuda M., Niwa
名古屋大学、名城大学、ジャパン精神薬理研究所、理研バイオリソー Usp46 is a quantitative trait gene regulating mouse immobile behavior in theNatatue Genet. M., Kameyama T., Kobayashi J., Iwaki Y., Imai S., Ishikawa A., Abe K.,
スセンター、東京都健康長寿医療センター 研究所
tail suspension and forced swimming tests.
Yoshimura T., Nabeshima T., Ebihara S.
Rapid bacterial artificial chromosome modification for large-scale mouse
Nature Protoc. Gong, S., Kus, L., Heintz, N.
米ロックフェラー大学
transgenesis.
N7-Methylguanine at position 46 (m7G46) in tRNA from Thermus
Nucleic Acids
Tomikawa C., Yokogawa T., Kanai T., Hori H.
愛媛大学、岐阜大学、京都大学、理研放射光科学総合研究センター thermophilus is required for cell viability at high temperatures through aRes.
tRNA modification network.
A novel single-stranded DNA-specific 3'-5' exonuclease, Thermus
Nucleic Acids Shimada, A., Masui, R., Nakagawa, N., Takahata, Y., Kim, K., Kuramitsu, S.,
大阪大学、理研放射光科学総合研究センター
thermophilus exonuclease I, is involved in several DNA repair pathways.
Res.
Fukui, K.
CD133 suppresses neuroblastoma cell differentiation via signal pathway
Takenobu H., Shimozato O., Nakamura T., Ochiai H., Yamaguchi Y., Ohira
千葉県がんセンター研究所、東京大学医科学研究所、千葉大学
Oncogenemodification.
M., Nakagawara A., Kamijo T.
Genome-minimized Streptomyces host for the heterologous expression ofProc. Natl. Acad.
Komatsu, M., Uchiyama, T., Omura, S., Cane, D.E., Ikeda, H.
北里大学、米ブラウン大学
secondary metabolism.
Sci. U S A.
Proc. Natl. Acad. Kohyama J., Kojima T., Takatsuka E., Yamashita T., Namiki J., Hsieh J.,
奈良先端科学技術大学院大学、慶応義塾大学、名古屋市立大学、テ Epigenetic regulation of neural cell differentiation plasticity in the adultSci. USA
Gage F.H., Namihira M., Okano H., Sawamoto K., Nakashima K.
キサス大学、ソーク研究所
mammalian brain.
Tsuji O., Miura K., Okada Y., Fujiyoshi K., Mukaino M., Nagoshi N.,
慶應義塾大学、京都大学、国立病院機構村山医療センター、弘前大 Therapeutic potential of appropriately evaluated safe-induced pluripotent
Proc. Natl. Acad. Kitamura K., Kumagai G., Nishino M., Tomisato S, Higashi H, Nagai T,
学、山口大学
stem cells for spinal cord injury.
Katoh H, Kohda K., Matsuzaki Y., Yuzaki M., Ikeda E., Toyama Y.,
Sci. USA
Nakamura M., Yamanaka S., Okano H.
Genetic variation of melatonin productivity in laboratory mice underProc. Natl. Acad.
Kasahara T., Abe K., Mekada K., Yoshiki A., Kato T.
理研脳科学総合研究センター、理研バイオリソースセンター
domestication.
Sci. USA
Dali-Youcef N., Mataki C., Coste A., Messaddeq N., Giroud S., Blanc S.,
仏ルイパスツール大学、ストラスブール大学病院、フランスがんセン
Adipose tissue-specific inactivation of the retinoblastoma protein protects
Proc. Natl. Acad.
Koehl C., Champy M.F., Chambon P., Fajas L., Metzger D., Schoonjans K.,
ター連盟
against diabesity because of increased energy expenditure.
Sci. USA
Auwerx J.
Proc. Natl. Acad. Maeda-Mamiya R, Noiri E, Isobe H, Nakanishi W, Okamoto K, Doi K,
東京大学、東北大学、シミック株式会社、群馬大学
In vivo gene delivery by cationic tetraamino fullerene.
Sci. USA
Sugaya T, Izumi T, Homma T, Nakamura E
Biomaterials

109

80

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

ヒトＥＳ細胞代表機関（課題管理者氏名） 京都大学再生医科学研究所（中辻 憲夫）

第２期申請時の区分

発展途上のバイオリソース

分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長

仲野 徹

Ⅰ
第２期開始時の設定目標

Ⅱ
※１

Ⅲ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

Ⅳ
リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）【2010年に目標とした状況】① ＥＳ細胞の保存分配体制の継続（平成２１年９月現在）
研究動向の社会的変化等（達成年度：平成２８年度頃）【達成状況】【NBRP開始時の状況】【具体的目標】①第１期に樹立した細胞株は安定に保存され 医療・創薬研究への利用が見込まれるさま ①基礎研究段階においても臨床利用可能なておりその特性にも変化は認められていな
ざまな種類の幹細胞のなかでも、その増殖 水準で維持管理された品質に関する情報もい。新たな事業として、加工細胞の収集と分 能・分化能や培養技術等の安定性からヒトＥ 完備されているリソースが必要とされるため、配を開始し、より高度なリソースの構築とその Ｓ細胞は最も有用なリソースである。ユー
これに対応したリソースの構築を構築する。
利用による、研究の推進を図った。
ザーは非常に高いモチベーションをもって研究にあたっている。一方で諸外国と比較し使用研究に対する規制が非常に厳しく研究者層の拡大が遅れている。

②特性解析・品質管理の標準化②細胞株の品質管理については国際的な品 【具体的状況の変化の内容】②世界的に見た場合、様々な培養技術、品質管理基準の提言に大きな影響力を持つＩＳ ①ヒトｉＰＳ細胞の作出技術の開発によりヒト 質管理法が用いられており、実験結果の評価
ＣＩの活動に主体的に参加しており、必要十分 ＥＳ細胞研究の必要がなくなったとの誤った に支障をきたす場合が少なくない。このようななレベルで実施されている。
認識が一部に広がったことなどにより、多能 問題の解決のため国際標準といえるような培
性幹細胞研究全体の健全な発達が結果とし 養・品質管理技法の確立を行う。

て損なわれた。
③利用促進のためのＭＴＡを含めた知財管理 ③知財管理についてはＭＴＡを随時ユーザー ②上記の様な偏った認識は徐々に解消され ③加工細胞等を含め、研究の推進に資する、の利便性を増すように改訂している。（分化細 つつあるが、中期的に幹細胞研究の中心課 より優れた細胞株の選別収集を行う。状況のの見直し
胞・加工細胞の他機関への譲渡に関する規 題となるＥＳ／ｉＰＳ細胞の詳細な比較研究に 改善状況に応じて、新規の細胞株の作成を定など、指針の改定にあわせ変更している） 高水準（品質管理が行われている、長期間 行う。
一定の技術水準で継代維持された細胞など）のリソースが求められている。
③2010年アメリカにおいてヒトＥＳ細胞を用い【目標とした研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】
た臨床研究が２件開始されたことにより、国 【研究コミュニティの状況】①研究コミュニティの拡大①従来から厳しすぎるとされてきた規制も緩 内でのＥＳ細胞の早期の臨床応用を目指し ①信頼できるリソースの利用により、臨床応和されたとはいえ依然として申請に関わる研 た研究の推進が期待されるようになってい 用を目指した基礎研究を安心して行えるよう究者の負担は重いが、２１年度に入り増加傾 る。
になるため、このようなリソースの定常的な供向にようやく転じている。研究の拡大・進展に ④多くの研究者らの認識として臨床応用は 給体制の必要性が認識される。
伴い作成された加工細胞の収集も順調であ まずＥＳ細胞から始まりその後ｉＰＳ細胞の利用へと移行すると言う見方が有力とされていり、その分配も開始した。
る。そのため、規制の厳しさからｉＰＳ細胞を利用しているがＥＳ細胞を併用する必要性が認識されて来ている。

110

81

②コミュニティ全体の技術レベルの向上③高度化したリソースの利用促進②ユーザーに対する培養法を主体とする研修 ⑤上記の様な問題が認識されてきたことに ②世界標準の技術を用いることで、国際的に事業は順調であり、問題無く技術移転ができ より、ＥＳ細胞研究の推進の必要性が理解さ 最高水準の研究が行われるようになる。
れてきており、そのため従来よりも高度の品ていると考えられる。
質管理がなされた十分な数のＥＳ細胞株が必要である。関連して、政府指針による規制③これまでに分配した研究機関に於いて遺伝 や、ＥＳ細胞株がもつ生命倫理的問題点に ③研究目的に適した、細胞株を選択して利用
子改変などの加工がなされた細胞株を収集 ついての過剰な指摘について、一層の緩和 できるようになることで、研究レベルが向上する。
し、これらの分配事業を行っているおよび改善が求められている。

【事業の継続性】【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①事業実施担当者の継続性①目標：リソースの保全①目標：リソースの保全☑後継者等あり □後継者等なし
指標：リソースが安定に保持されているか
指標：品質の劣化等はみられず、安定に維持されている。
②後継者の人材育成状況②目標：安定的供給体制の維持②目標：安定的供給体制の維持☑順調に育成中 □後継人材がいない
指標：分与依頼から実際の分配まで事業者
指標：分与依頼に迅速に対応できるか側で要する時間は最大でも１週間程度であり、十分に迅速に対応できている。
③指標：コミュニティの要望に応じたリソース ③指標：コミュニティの要望に応じたリソース ③組織的な支援体制☑整っている。 □支援体制がない。
の整備・提供の整備・提供指標：加工細胞の収集・分配を行うなど、要指標：リソースの高度化に対応しているか
望に対応した事業が展開できている。

【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）①目標：リソースの保全
指標：リソースが安定に保存されているか。
②目標：安定的供給体制の維持
指標：分与依頼に１週間程度で対応できているか。
③目標：臨床研究レベルでの品質管理基準の導入
指標：臨床利用可能なレベルでリソースがリソースが管理されているか。

【特記事項】④目標：リソース活用のための技術移転④目標：リソース活用のための技術移転④目標：加工細胞を中心とした付加価値の高指標：リソースを利用する上での必要となる 指標：比較的取り扱いが難しいリソースであ ・中間評価時までの通算の分配件数は目標値に い細胞株の収集と分配技術を研究者コミュニティへ伝達できている り、分配時に求めに応じて柔軟に培養技術指 達していないが、２１年度については目標の８割
指標：研究の動向に合わせ、利用頻度の高導を行うとともに、使用の過程で生じた問題点 程度とほぼ目標に達している。指針の改定は一 い加工細胞について多様性（２０株程度）のあかの解決に必要なアドバイスを行うなどにより、 定の効果があったとも言え、研究振興のために るリソースであるか。
はより一層の緩和が期待される。
リソースに関する技術移転は順調に行われている。

⑤目標：国際共同研究の拡充
指標：主要な国際的研究コミュニティに認知されているか⑤目標：国際共同研究の拡充
・人材育成自体は順調に進行しているが、流 ⑤目標：研究者コミュニティ全体の技術水準
指標：細胞株の品質管理については国際的 動的なポストで運用する限界から、継続性に の向上のための指導な品質管理基準の提言に大きな影響力を持 関しては一定のリスクが常に存在する。
指標：要請に応じて適切な技術指導が行え
つＩＳＣＩの活動に主体的に参加しており、本リているか。世界的水準で研究を行っている研
ソースの国際的な認知度は非常に高い。
究者が増えているか。

【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。

111

82

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名： ヒトES細胞株の保存と分配
番号 分野 発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

Keiou Univ.

Nongenetic method for purifying stem cell-derived cardiomyocytes.

1

7203

2010

Nature Methods

Hattori F, Chen H, Yamashita H, Tohyama S, Satoh YS, Yuasa S, Li W,
Yamakawa H, Tanaka T, Onitsuka T, Shimoji K, Ohno Y, Egashira T, Kaneda
R, Murata M, Hidaka K, Morisaki T, Sasaki E, Suzuki T, Sano M, Makino S,
Oikawa S, Fukuda K.

2

5805

2010

Cell Stem Cell

Ohgushi M, Matsumura M, Eiraku M, Murakami K, Aramaki T, Nishiyama
A, Muguruma K, Nakano T, Suga H, Ueno M, Ishizaki T, Suemori H,
Narumiya S, Niwa H, Sasai Y.

Riken CDB

Molecular pathway and cell state responsible for dissociation-induced apoptosis in human pluripotent
stem cells.

3

6905

2010

International Stem Cell Initiative Consortium, Akopian V, Andrews PW, Beil
In Vitro Cell Dev Biol S, Benvenisty N, Brehm J, Christie M, Ford A, Fox V, Gokhale PJ, Healy L,
Anim.
Holm F, Hovatta O, Knowles BB, Ludwig TE, McKay RD, Miyazaki T,
Nakatsuji N, Oh SK, Pera MF, Rossant J, Stacey GN, Suemori H.

Shefield Univ.

Comparison of defined culture systems for feeder cell free propagation of human embryonic stem cells.

4

6905

2010

Proc Natl Acad Sci
USA

Kuroda Y, Kitada M, Wakao S, Nishikawa K, Tanimura Y, Makinoshima H,
Goda M, Akashi H, Inutsuka A, Niwa A, Shigemoto T, Nabeshima Y,
Nakahata T, Nabeshima Y, Fujiyoshi Y, Dezawa M.

Touhoku Univ.

Unique multipotent cells in adult human mesenchymal cell populations.

5

7208

2009

FEBS Letter

Taura D, Noguchi M, Sone M, Hosoda K, Mori E, Okada Y, Takahashi K,
Homma K, Oyamada N, Inuzuka M, Sonoyama T, Ebihara K, Tamura N, Itoh
H, Suemori H, Nakatsuji N, Okano H, Yamanaka S, Nakao K.

Kyoto Univ.

Adipogenic differentiation of human induced pluripotent stem cells: comparison with that of humanembryonic stem cells.

6

7310

2009

J. Cell Sci.

Fumitaka Osakada, Zi-Bing Jin, Yasuhiko Hirami, Hanako Ikeda, Teruko
Danjyo, Kiichi Watanabe, Yoshiki Sasai, and Masayo Takahashi

Riken CDB

In vitro differentiation of retinal cells from human pluripotent stem cells by small-molecule induction

7

7304

2009

J Biosci Bioeng.

Shimada H, Yoshimura N, Tsuji A, Kunisada T.

Gifu Univ.

Differentiation of dopaminergic neurons from human embryonic stem cells: modulation ofdifferentiation by FGF-20.

8

7209

2009

Blood

9

7310

2009

Nature Protocol

10

7209

2009

Stem Cells

11

5805

2009

Proc Natl Acad Sci
USA

12

5806

2009

FASEB J

13

7209

2008

Blood

14

7311

2008

15

6905

16

Yasuhisa Yokoyama, Takahiro Suzuki, Mamiko Sakata-Yanagimoto, Keiki
Kumano, Katsumi Higashi, Tsuyoshi Takato, Mineo Kurokawa, Seishi
Ogawa, and Shigeru Chiba
Osakada F, Ikeda H, Sasai Y, Takahashi M.
Koichi Saeki, Kumiko Saeki, Masako Nakahara, Satoko Matsuyama, Naoko
Nakamura, Yoshiko Yogiashi, Asako Yoneda, Makoto Koyanagi, Yasushi
Kondo, and Akira Yuo
Keiichiro Suzuki, Kaoru Mitsui, Emi Aizawa, Kouichi Hasegawa, Eihachiro
Kawase, Toshiyuki Yamagishi, Yoshihiko Shimizu, Hirofumi Suemori, Norio
Nakatsuji, and Kohnosuke Mitani
Mio Nakanishi, Akira Kurisaki, Yohei Hayashi, Masaki Warashina, Shoichi
Ishiura, Miho Kusuda-Furue, and Makoto Asashima

Okayama Univ.
Riken CDB

Derivation of functional mature neutrophils from human embryonic stem cells
Stepwise differentiation of pluripotent stem cells into retinal cells.

National Center for
Global Health andMedicine.

A Feeder-Free and Efficient Production of Functional Neutrophils from Human Embryonic Stem Cells

Saitama Med Univ.

Highly efficient transient gene expression and gene targeting in primate embryonic stem cells withhelper-dependent adenoviral vectors

AIST

Directed induction of anterior and posterior primitive streak by Wnt from embryonic stem cells cultured
in a chemically defined serum-free medium

Naoya Takayama, Hidekazu Nishikii, Joichi Usui, Hiroko Tsukui, Akira
Sawaguchi, Takashi Hiroyama, Koji Eto, and Hiromitsu Nakauchi

Tokyo Univ.

Generation of functional platelets from human embryonic stem cells in vitro via ES-sacs, VEGFpromoted structures that concentrate hematopoietic progenitors

Nature Biotechonology

Osakada F, Ikeda H, Mandai M, Wataya T, Watanabe K, Yoshimura N, Akaike
A, Sasai Y, Takahashi M.

Riken CDB

Toward the generation of rod and cone photoreceptors from mouse, monkey and human embryonic stem
cells.

2008

Proc Natl Acad Sci
USA

Morio Ueno, Michiru Matsumura, Kiichi Watanabe, Takahiro Nakamura,
Fumitaka Osakada, Masayo Takahashi, Hiroshi Kawasaki, Shigeru Kinoshita,
and Yoshiki Sasai

Riken CDB

Neural conversion of ES cells by an inductive activity on human amniotic membrane matrix

7304

2008

Eur J Neurosci.

Hayashi H, Morizane A, Koyanagi M, Ono Y, Sasai Y, Hashimoto N,
Takahashi J.

Kyoto Univ.

Meningeal cells induce dopaminergic neurons from embryonic stem cells.

17

7202

2007

Genes to Cells

Nobuaki Shiraki, Kahoko Umeda, Naomi Sakashita, Motohiro Takeya,
Kazuhiko Kume, and Shoen Kume

Kumamoto Univ.

Differentiation of mouse and human embryonic stem cells into hepatic lineages

18

6913

2007

Stem Cells

Satoru Senju, Hirofumi Suemori, Hitoshi Zembutsu, Yasushi Uemura, Shinya
Hirata, Daiki Fukuma, Hidetake Matsuyoshi, Manami Shimomura, Miwa
Haruta, Satoshi Fukushima, Yusuke Matsunaga, Toyomasa Katagiri, Yusuke
Nakamura, Masataka Furuya, Norio Nakatsuji, and Yasuharu Nishimura

Kumamoto Univ.

Genetically Manipulated Human Embryonic Stem Cell-Derived Dendritic Cells with Immune
Regulatory Function

19

5805

2007

Nature Biotechnology

Watanabe K, Ueno M, Kamiya D, Nishiyama A, Matsumura M, Wataya T,
Takahashi JB, Nishikawa S, Nishikawa S, Muguruma K, Sasai Y.

Riken CDB

20

6905

2007

Nature Biotechnology The International Stem Cell Initiative

112 Sheffield Univ.

A ROCK inhibitor permits survival of dissociated human embryonic stem cells.
Characterization of human embryonic stem cell lines by the International Stem Cell Initiative.

83

バイオリソース整備戦略に係るヒアリング調査の概要（取りまとめ様式）
リソース名

当該リソースの区分

ヒト・動物細胞代表機関（課題管理者氏名） （独）理化学研究所ﾊﾞｲｵﾘｿｰｽｾﾝﾀｰ（中村幸夫）
分担機関（課題管理者氏名）
運営委員長

第２期申請時の区分

先進的なバイオリソース

なし

中畑龍俊

Ⅰ

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成16年度の申請時に設定したもの）（平成２１年９月現在）【2010年に目標とした状況】【達成状況】

研究動向の社会的変化等【NBRP開始時の状況】

第２期開始時の設定目標※１（達成年度：平成２４年度頃）【具体的目標】①（継続性）社会的ニーズや研究のニーズに ①（継続性）細胞の品揃えの充実化及び品 20世紀終盤の生命科学研究は、ＰＣＲ技術 ①（継続性）世界に冠たる細胞バンクの地位
質管理に取り組むことで、質的にも量的に や遺伝子欠損マウス作成技術に代表される を維持し、生命科学研究の発展に貢献する。
あわせて、細胞材料の収集整備活動を行い、日本の生物学や医科学研究の基盤整 も、我が国及び世界を代表する細胞バンクと ように、「遺伝子を自由自在に操作する生命備、臨床研究、産業創出等の推進に貢献す なった。提供件数は、年間４０００件以上に達 科学研究」であったとするならば、2006年秋 ②（信頼性）細胞材料は広範な生命科学研している。
る。
に京大山中伸弥教授によってマウスiPS細 究分野において必要不可欠であり、由緒正し
胞樹立技術が開発されて以降は、「細胞を く正確なリソースを整備し、提供する。その一②（信頼性）研究者コミュニティからの信頼を ②（信頼性）品質マネジメントシステムを構築 自由自在に操作する生命科学研究」へとパ 環として、ISO 9001認証を維持し、品質管理
得て、細胞バンクとしての確固たる地位を維 し、ISO 9001認証を取得し、維持継続してい ラダイムシフトしつつあった。そして、マウス 体制を強化する。
る（ATCC, DSMZも取得）。世界最高水準の での成功例後わずか１年で、ヒトiPS細胞樹持する。
細胞材料を提供する国際的な機関として確 立技術も確立され、このパラダイムシフトは ③（先導性）細胞材料を産出するコミュニティ③（先導性）新規の細胞材料が開発された場 固たる地位を確保した。
確固たるものとなった。ヒトiPS細胞樹立技術 及びそれらを利用するコミュニティの研究動
合には、当該技術を迅速に導入し、研究者コには大きく二つの重要な意義がある。（１）Ｅ 向を的確に把握し、必要かつ最も効果的なリ
ミュニティのニーズに迅速に応じられる体制 ③（先導性）2008年４月１日、日本初のヒトＥ Ｓ細胞の代替となり得る細胞をきわめて簡単 ソースを効率良く整備し、情報とともに提供す
Ｓ細胞分配機関として、文部科学大臣の承 に作成できるため、再生医学分野での利用 るとともに、国内外の関係機関との分担と連を構築する。
認を取得した。また、日本で開発されたiPS に大きな期待が持たれること。（２）様々な疾 携を進める。
細胞技術をいち早く技術導入し、世界に先駆 患者の細胞からもiPS細胞を樹立できるた
けてiPS細胞バンク事業を実施した。京大山 め、これまでには不可能であった研究が可中伸弥教授からの信頼に基づき、山中研が 能となったこと。例）脳変性疾患者の脳神経樹立し主要学術雑誌に掲載された全ての細胞を用いた研究が、当該患者由来のiPS
iPS細胞につき寄託を受け、即時提供可能な 細胞から脳神経細胞を誘導することで可能状態に整備した。
となった。

【具体的状況の変化の内容】①（先導的細胞）ヒトiPS細胞樹立技術が確
立され、ヒトＥＳ細胞に代わる多能性幹細胞
材料として、研究者コミュニティから大きな注
目を浴びることになった。

【目標とした研究コミュニティの状況】②（先導的細胞）疾患特異的iPS細胞の樹立を介して、これまでには不可能であった疾患研究が盛んになり始めた。

【研究コミュニティの状況】【研究コミュニティの状況】①（汎用細胞）ヒトがん細胞株に代表される ①細胞の提供数（コミュニティのニーズ）は年 ③（先導的細胞）DNAシークエンサーの急速 ①（汎用細胞）ヒトがん細胞株等の汎用細胞
ような汎用細胞は、生命科学分野の基盤とし 間４０００件以上で推移している。中でも、汎 な進歩に伴い、疾患ゲノム研究用の細胞材 に関するニーズは当面不変なものであり、細て必要不可欠なものであり、そのニーズが減 用細胞に対するニーズは恒常的に大きい。 料に対するニーズが高まり始めた。
胞バンク事業としては、現状と同様な即時提少することはない。さらに多くの汎用細胞の この傾向は今後も変わらないと予想する。
供可能な体制を整備・維持していくことが重品揃えが要求される。
要である。
113

84

Ⅰ
第２期開始時の設定目標※１（平成16年度の申請時に設定したもの）

Ⅱ

Ⅲ

Ⅳ

中間評価時の達成状況

NBRP事業に影響を及ぼす

リソースが目指す到達像（平成２１年９月現在）

研究動向の社会的変化等（達成年度：平成２４年度頃）②（遺伝子解析用細胞）従来の汎用細胞の ②次世代シークエンサーの開発には目覚ま ④（品質管理）細胞誤認等の品質問題が依 ②（新規の疾患研究用細胞）がん細胞株も疾みでなく、ヒトゲノム遺伝子解析研究で必要 しいものがあり、遠からずかなり簡便（安価 然として蔓延している状況につき、学術雑誌 患研究用細胞であることは言うまでもないとなる細胞即ちゲノムインキュベータとしての で短時間）なホールゲノムシークエンスが可 が使用細胞の厳しい品質検証を求めるよう が、疾患特異的iPS細胞に代表されるような新規の疾患研究用細胞に対するニーズが増能となる。そのような状況下、遺伝子解析用 になってきた。
ヒト細胞材料のニーズが高まる。
加するものと予想する。細胞バンク事業としのヒト細胞に対するニーズは増加傾向にあては、こうしたニーズにもしっかりと対応するる。特に疾患細胞に対するニーズが高まってことが要求される。
いる。
③（幹細胞）再生医学や発生学などの分野で ③第二期ＮＢＲＰが開始される直前の2006年 ⑤（品質管理）上記への対応として、細胞バ ③（臨床応用を目指した細胞）体性幹細胞、必要とされる幹細胞材料へのニーズが高ま 秋に、マウスiPS細胞樹立が発表された。ヒト ンクから提供した細胞に関する提供証明書 ES・iPS細胞を臨床に応用しようとする研究がる。
iPS細胞の樹立にはさらに数年間が必要で の発行、あるいは、再検証のための受託解 益々盛んになることが予想される。また、前はないかという予想もあったが、たった１年 析が求められており、理研細胞バンクでも開 駆細胞株を樹立するための新技術が次々に報告されており、こうした細胞株に対する期後の2007年秋にヒトiPS細胞樹立も報じら始した。
待も大きい。細胞バンク事業には、こうした幹れ、この分野にiPS技術が席巻していること
細胞に関し、品質管理・標準化を万全に実施は周知のとおりである。
した細胞の提供が要求される。
【リソースの特徴を踏まえた重点到達目標】 【重点到達目標の達成状況】【事業の継続性】【到達度の評価事項と目標】（項目と客観的指標）（該当する□内に「レ」を記入）（項目※２と客観的指標）（項目と客観的指標）①事業実施担当者の継続性
理研細胞バンクには、長年にわたって積み①（収集）細胞の累積寄託数（保存数）を増や■後継者等あり □後継者等なし上げてきた高度のバンキング能力があり、既 ①ヒトがん細胞株に代表される汎用細胞バす。指標：大量一括寄託のような特殊案件はに研究コミュニティから一定の評価を得てい ンクのみでなく、ヒトゲノム遺伝子解析研究 ②後継者の人材育成状況
別扱いとして、培養細胞株（がん細胞株、iPS■順調に育成中 □後継人材がいない 細胞株等）を年間１００件程度収集する。
る。さらなる発展を目指して、引き続き下記に 用の細胞バンク（健常日本人細胞、園田田
島コレクション、後藤コレクション等）及び幹 ③組織的な支援体制取り組む。
細胞バンク（ヒト体性幹細胞、ES細胞、iPS細■整っている。 □支援体制がない。
②（提供）研究コミュニティが必要とする細胞を迅速に整備することで、提供数を維持す①品揃えのさらなる充実化を図り、世界屈指 胞）もかなり充実した。
る。指標：年間提供数４０００件以上を維持すの細胞バンク機関であることを維持する。
【特記事項】②即時提供可能な培養細胞を５００種類増る。
②即時提供可能な細胞を増やし、研究コミュやした。
①東北大学加齢医学研究所が実施していたニティのニーズに迅速に応じる体制を整備す
細胞バンク事業の移管を第一期NBRPから ③（品質管理）品質管理を万全に実施した細る。
③日本発の画期的な技術であるiPS細胞樹 開始し、2010年度で完了する。
胞の提供を維持する。その一環として、ISO③新しい研究トレンドを把握し、それに迅速 立技術にいち早く対応し、世界初のiPS細胞
9001認証に基づく品質管理体制を維持してに対応することで、研究コミュニティのニーズ バンク事業を開始した。
②現在のNBRPにはリソースの開発事業は いく。指標：ISO 9001認証取得の継続（外部に応じる。
含まれていない。研究戦略上リソースの整 者による継続審査で承認を受ける）。
④細胞の品質管理を万全に行う。また、幹細 ④ISO 9001認証に基づく品質管理体制を整 備が必要であるが、その開発が一般の科研備した。また、幹細胞の標準化に関しては、 費等で実施可能な規模を越える場合は、国 ④（品質管理サービス）研究者からの依頼に胞の標準化にも取り組む。
世界的な連携組織にも参画し、世界標準を として実施することが望まれる。例としては、 応じて、品質管理検査を受託する（マイコプラ
目指す体制が整備できた。
既に複数の省庁におけるプロジェクトとして ズマ汚染検査、細胞誤認検査）。指標：依頼実施されているが、疾患特異的iPS細胞の整 の全てを滞りなく実施する。
⑤寄託の依頼は幅広く受け入れ、貴重な細⑤園田田島コレクションにつき、５００人超の 備等。
胞資源の維持管理に努める。
細胞をEBVで形質転換した。山中研樹立の⑤ （技術研修）ヒトES細胞、ヒトiPS細胞に係マウス及びヒトiPS細胞株のすべてを引き受 ③細胞のバックアップとして、理研播磨研究 る技術研修を継続して開催する。指標：ヒト
け、即時提供可能な状態に整備した。
ES細胞の研修、年３回。ヒトiPS細胞の研修、所での保管も実施している。
年６回。
【主な研究成果・論文等】（別紙で添付）
・論文については２０報まで※１ Ⅰ、Ⅱの各項目については対応する内容を揃えて記載すること。
※２ 各リソース実施主体によりリソースの特徴を踏まえた重点到達目標を原則として5項目設定する。
… NRBP事業実施申請書及び中間評価資料の内容と整合性を図ること。
… 平成22年11月のヒアリング時に提出した資料と整合性を図ること。
114

85

ＮＢＲＰ成果業績リスト
リソース名：
番号分野

ヒト・動物細胞
発行年

雑誌名

著者名

所属

タイトル

1

6905

2007

J Biol Chem

Muramatsu S, Wakabayashi M, Ohno T, Amano K, Ooishi R, Sugahara T, Shiojiri S, Tashiro K,
Suzuki Y, Nishimura R, Kuhara S, Sugano S, Yoneda T, Matsuda A.

旭化成

Functional gene screening system identified TRPV4 as a regulator ofchondrogenic differentiation.

2

5808

2007

J Cell Biol

Kiuchi T, Ohashi K, Kurita S, Mizuno K.

東北大学

Cofilin promotes stimulus-induced lamellipodium formation by generating anabundant supply of actin monomers.

3

5804

2007

Mol Biol Cell

Sato MK, Takahashi M, Yazawa M.

北海道大学

Two regions of the tail are necessary for the isoform-specific functions of
nonmuscle myosin IIB.

4

6913

2007

PLoS ONE

Tabatabaei-Zavareh N, Vlasova A, Greenwood CP, Takei F.

University of British
Columbia

Characterization of developmental pathway of natural killer cells from embryonicstem cells in vitro.

5

6913

2007

Stem Cells

Senju S, Suemori H, Zembutsu H, Uemura Y, Hirata S, Fukuma D, Matsuyoshi H, Shimomura M,
Haruta M, Fukushima S, Matsunaga Y, Katagiri T, Nakamura Y, Furuya M, Nakatsuji N, Nishimura
Y.

熊本大学

Genetically manipulated human embryonic stem cell-derived dendritic cells withimmune regulatory function.

6

5805

2007

Cell

Takahashi K, Tanabe K, Ohnuki M, Narita M, Ichisaka T, Tomoda K, Yamanaka S.

京都大学

Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined
factors.

7

6905

2007

FASEB J

Ohba S, Ikeda T, Kugimiya F, Yano F, Lichtler AC, Nakamura K, Takato T, Kawaguchi H, Chung
UI.

日本学術振興会

Identification of a potent combination of osteogenic genes for bone regeneration
using embryonic stem (ES) cell-based sensor.

8

5804

2008

FEBS J

Mukai S, Fukushima T, Naka D, Tanaka H, Osada Y, Kataoka H.

宮崎大学

Activation of hepatocyte growth factor activator zymogen (pro-HGFA) by humankallikrein 1-related peptidases.

9

6905

2008

Genes Cells

Itoh S, Kanno S, Gai Z, Suemoto H, Kawakatsu M, Tanishima H, Morimoto Y, Nishioka K,
Hatamura I, Yoshida M, Muragaki Y.

和歌山医科大学

Trps1 plays a pivotal role downstream of Gdf5 signaling in promotingchondrogenesis and apoptosis of ATDC5 cells.

10 7202

2008

Hepatology

Komori J, Marusawa H, Machimoto T, Endo Y, Kinoshita K, Kou T, Haga H, Ikai I, Uemoto S,
Chiba T.

京都大学

Activation-induced cytidine deaminase links bile duct inflammation to humancholangiocarcinoma.

11 72022008

Nat Biotechnol

Sato Y, Murase K, Kato J, Kobune M, Sato T, Kawano Y, Takimoto R, Takada K, Miyanishi K,
Matsunaga T, Takayama T, Niitsu Y.

札幌医科大学

Resolution of liver cirrhosis using vitamin A-coupled liposomes to deliver siRNAagainst a collagen-specific chaperone.

12 6913

2008

Proc Natl Acad
Sci USA

Kurosawa G, Akahori Y, Morita M, Sumitomo M, Sato N, Muramatsu C, Eguchi K, Matsuda K,
Takasaki A, Tanaka M, Iba Y, Hamada-Tsutsumi S, Ukai Y, Shiraishi M, Suzuki K, Kurosawa M,
Fujiyama S, Takahashi N, Kato R, Mizoguchi Y, Shamoto M, Tsuda H, Sugiura M, Hattori Y,
Miyakawa S, Shiroki R, Hoshinaga K, Hayashi N, Sugioka A, Kurosawa Y.

藤田保健衛生大学

Comprehensive screening for antigens overexpressed on carcinomas via isolationof human mAbs that may be therapeutic.

13 7209

2008

Blood

Takayama N, Nishikii H, Usui J, Tsukui H, Sawaguchi A, Hiroyama T, Eto K, Nakauchi H.

東大医科研

Generation of functional platelets from human embryonic stem cells in vitro via
ES-sacs, VEGF-promoted structures that concentrate hematopoietic progenitors.

14 58022008

NatureNakao N, Ono H, Yamamura T, Anraku T, Takagi T, Higashi K, Yasuo S, Katou Y, Kageyama S,
Uno Y, Kasukawa T, Iigo M, Sharp PJ, Iwasawa A, Suzuki Y, Sugano S, Niimi T, Mizutani M,
Namikawa T, Ebihara S, Ueda HR, Yoshimura T.

名古屋大学

Thyrotrophin in the pars tuberalis triggers photoperiodic response

15 5804

2009

東京大学

TRAIL inhibited the cyclic AMP responsible element mediated gene expression.

16 7202

2009

Cancer Res

Shichiri M, Fukai N, Kono Y, Tanaka Y.

東京医科歯科大学

Rifampicin as an oral angiogenesis inhibitor targeting hepatic cancers.

17 5704

2009

Curr Biol

Chiba S, Ikeda M, Katsunuma K, Ohashi K, Mizuno K.

東北大学

MST2- and Furry-mediated activation of NDR1 kinase is critical for precisealignment of mitotic chromosomes.

18 5805

2009

Mol Biol Cell

Hatsuzawa K, Hashimoto H, Hashimoto H, Arai S, Tamura T, Higa-Nishiyama A, Wada I.

福島医科大学Sec22b is a negative regulator of phagocytosis in macrophages.

19 5805

2009

PLoS OneEgami Y, Araki N.

香川大学

Dynamic changes in the spatiotemporal localization of Rab21 in live RAW264 cells
during macropinocytosis.

20 7305

2009

Cancer Sci.

Yamaguchi U, Honda K, Satow R, Kobayashi E, Nakayama R, Ichikawa H, Shoji A, Shitashige M,
Masuda M, Kawai A, Chuman H, Iwamoto Y, Hirohashi S, Yamada T.

国立がんセンター
115

Functional genome screen for therapeutic targets of osteosarcoma.

Biochem Biophys Tokumoto Y, Horimoto K, Miyake J.
Res Commun

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