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地域の力で切り開く、研究データ管理のこれから組織展開の切り口に関する話題提供（コアファシリティ）
コアファシリティが扱う実験系研究データの全学マネジメント：
現在とこれから
大阪大学
コアファシリティ機構
古谷 浩志

全学機器共用･コアファシリティとは？
ある巨大総合大学…….
基礎工学
研究科

生命機能研究科
工学研究科

薬学
研究科

医学系研究科
理学研究科

産業科学研究所
蛋白質研究所

どの研究科も独自･独立に運営（それぞれが単科大学のよう）⇒ 研究科ごとに研究設備を整備が基本

微生物病研究所

全学機器共用･コアファシリティとは？
例えば「有機合成」の研究
基礎工学
研究科

生命機能研究科

工学研究科

薬学研究科

医学系
研究科
理学研究科

産業科学研究所
蛋白質研究所～6000万円

日常的にNMR（400 MHz) を使う→ 各部局で準備

微生物病研究所

全学機器共用･コアファシリティとは？
例えば「有機合成」の研究

生命機能研究科

工学研究科

基礎工学
研究科

薬学研究科

医学系
研究科
理学研究科

900 MHz4億円

産業科学研究所
蛋白質研究所

微生物病研究所

高性能NMR装置は、各部局でバラバラに購入するのではなくより良い1台を購入し、みんなでシェア（共用）しましょう！

全学機器共用･コアファシリティとは？
例えば「有機合成」の研究

生命機能“全学的”な観点から研究科

薬学
研究科
工学
限られた資金やリソースを最大限に活用できるよう
基礎工学
研究科
研究科

企画・調整・統括し全学の研究力強化を図る医学系

理学
研究科

研究科
⇒ コアファシリティ機構

900 MHz
4億円

産業科学研究所

蛋白質研究所

微生物病研究所

高性能NMR装置は、各部局でバラバラに購入するのではなくより良い1台を購入し、みんなでシェア（共用）しましょう！

コアファシリティ：部局の研究リソースを全学でも共に活用出来るように全部で300機器程度・年間7万件の利用

全学
機器共用

マトリックス支援レーザー脱離
イオン化タンデム飛行時間型
質量分析計（MALDI)

ESI (or DART)-LITOrbitrap型質量分析装置

飛行時間型二次イオン質量分析装置（TOF-SIMS）

核磁気共鳴装置（600MHz NMR）液体用・固体用

電子スピン共鳴装置
透過電子顕微鏡

２次元迅速測定X線回折装置(湾曲IPX線回折装置)

多焦点ラマン分光装置

サーマル電界放出型
走査電子顕微鏡

高周波プラズマ発光分析装置（ICP-AES)

X線光電子分光装置（XPS)

円二色性分散計

核磁気共鳴装置（700MHz NMR ）液体用
（クライオプローブ付）

フーリエ変換赤外分光光度計（赤外顕微鏡付）

波長可変OPOパルス
レーザー／ナノ・マイクロ秒時間分解分光
測定システムコアファシリティが扱う共用機器を使って得られる物は何か？
共用機器

300機器
年間7万件の利用分析・測定データ

研究データ

共用機器の利用で生まれる分析・測定データは全て実験系の研究データ！
しかも、• 多くの理工生命系研究者が関わり• 利用件数も非常に多く• 限られた種類のデータフォーマット

共用機器

共用機器

実験系の研究データエコシステムとして非常に良いモデルケース

文科省 新たな共用システム導入支援プログラム・コアファシリティ構築支援プログラム 実施機関・研究組織一覧

コアファシリティ
構築支援PG

新たな共用システムPG（2016-2020) 3年/事業
28機関
63ユニットコアファシリティPG（2020-2025) 5年/事業
15機関

機器共用の仕組み作り
も大きく拡がっている

先端研究基盤共用促進事業 パンフレット（令和3年度発行）より

コアファシリティで研究データを制する者は実験系研究データを制する?!

文科省 新たな共用システム導入支援プログラム・コアファシリティ構築支援プログラム 実施機関・研究組織一覧
新たな共用システムPG（2016-2020) 3年/事業

コアファシリティ
構築支援PG

28機関
63ユニットまた、メリットも課題も共通！

コアファシリティPG（2020-2025) 5年/事業
15機関

機器共用の仕組み作り
も大きく拡がっている

先端研究基盤共用促進事業 パンフレット（令和3年度発行）より

コアファシリティで研究データを制する者は実験系研究データを制する?!

共用機器の研究DX（実験系データ）（多くの場合）根本課題：共用機器はネットワーク“非接続”！
•••

分析機器制御PCはウイルス感染防止、古いOS等の理由によりネットワークから隔離が殆ど
ユーザーへの測定データの提供は、DVDにデータを焼き込みやUSBメモリで提供
いちいちDVDを焼く手間（ユーザーの手間、機器担当者の手間。USBメモリ：ウィルス感染のリスク大

機器制御PCは完全にネットワークから隔離

機器担当者（利用支援）

機器附属PC

DVD
機器ユーザー

測定データ

電子顕微鏡

SEM制御＋データ取得

データ解析

USBメモリ

多大な手間とセキュリティリスク

解決策：ネットワーク経由での（部局内での）測定データの流通を実現
コアファシリティで小規模分析室向け測定データ集約・配信システムを開発･頒布
ONIONとの連接で、学内でのデータ共有も簡単に迅速に

解決策：ネットワーク経由での（部局内での）測定データの流通を実現
コアファシリティで小規模分析室向け測定データ集約・配信システムを開発･頒布
ONIONとの連接で、学内でのデータ共有も簡単に迅速に

S3同期

測定データ集約･配信システムの利用・導入状況（1）
工学研究科 分析センター

接続した共用分析機器：NRM装置 3台 ＋ 質量分析装置 5台（合計8台）機器担当者：2 名

R3年度 機器の総利用件数：19070 件

R4年度から稼働する小規模分析室向け測定データ集約配信システム• R4年度からUSBメモリ使用を停止し、完全ネットワーク配信へ移行• R5年5月平日の平均転送ファイル数 340⇒ 年間 約10万ファイルのペース

測定データ集約･配信システムの利用・導入状況（2）
9部局11分析室：約40機器（2024年4月1日）

各分析室で年間4～10万ファイル程度の転送稼働状況調査（注1）

No

導入年

導入年月

導入財源
令和元年度コロナ対応

導入場所

接続機器数

接続機器数内訳

平均転送ファイル数

調査日数

年間推定

ファイル転送数

工学研究科

分析センター

8

NMR: 3, 質量分析計: 5341

files/day

5102300

補正3次予算基礎工学研究科

NMR・ESR室

2

NMR: 2

121

files/day

4536300

2022年3月

学内予算

基礎工学研究科

7

分光蛍光光度計, UV, TDS, XPS, SEM,

160

files/day

3248000

2022

2022年3月

学内予算

北棟電子顕微鏡室

2SEM: 1, TEM: 152022

2022年3月

学内予算

薬学研究科

共同利用機器室

2

X線回折装置: 262023

2023年3月

NII 研究データエコシス

基礎工学研究科

質量分析室･X線回折装置室･GHAS室

7質量分析計: 2, SEM: 2, X線回折装置: 3

7

2023

2023年3月

NII 研究データエコシス

歯学研究科

マイクロX線CT室

1

マイクロX線CT装置: 182023

2023年3月

NII 研究データエコシス

接合科学研究所

共通機器棟

1

EPMA装置: 192024

2024年3月

OUマスタープラン

理学研究科

XPS室

1XPS装置:1102024

2024年3月

歯学研究科

共通顕微鏡室5

光学顕微鏡: 5112024

2024年3月

レーザー科学研究所

第2機器分析室

4

FE-SEM: 1, EDS: 1, デジタル顕微鏡: 2

1

2022

2022年3月

22022

2022年3月

32022

4

補正3次予算令和元年度コロナ対応

テム構築事業

テム構築事業

テム構築事業

加速事業
OUマスタープラン
加速事業
OUマスタープラン
加速事業

超高圧電子顕微鏡センター

9部局11分析室

附属太陽エネルギー化学研究センター
共同分析測定室SEM-EDS, 顕微レーザーラマン分光計

40

注1：年間推定ファイル転送数は、年間300日間の稼働を想定し 平均転送ファイル数 X 300 日で計算

186600基本構想：共用機器から日々生まれる研究（測定）データをネットワーク経由で一気通貫に流通・利活用する基盤を作って活用
3部門の密接な連携

基本構想

附属図書館

オープン
データ推進

サイバーメディアセンター

システム

コアファシリティ

データ
生産現場

NIIが構築している研究データマネジメント（学認RDM）を活用

測定データを“研究データエコシステム”の中に研究活動

エコシステムのサイクルにデータを入れ込む所が大変

https://rcos.nii.ac.jp/service/
小規模分析室向け測定データ集約・配信システム

コアファシリティ間での協働：阪奈機器共用ネットワークへの展開
2019年 文科省 令和元年度「先端研究基盤共用促進事業（研究機器相互利用ネットワーク導入実証プログラム」（通称SHARE事業）に大阪大学・奈良高専・大阪市立大学（現 大阪公立大学）を中心に採択され、開始した「機器共用を介した地域連携」• 特徴ある共用分析機器をもつ阪奈地区の3機関が、それぞれの強みを活かして連携し、研究支援･人材育成・産学連携の協働推進･強化を目指した地域連携• 共用分析装置の遠隔利用等を新型コロナ禍に先駆けて実施⇒ 遠隔操作など研究DXの先駆けに（日刊工業新聞などに多数取り上げられる）• 事業(2年)終了後も、本連携を継続するため、2020年に3機関でコンソーシアム協定を締結し連携･協力を継続• 近年では、機器共用だけでなく①研究（測定）データに関する連携･協力②液体ヘリウムの地域リサイクル等の連携･協力に発展

SHARE事業開始当時

機器共用を介した地域連携･リモート・遠隔測定技術の活用実験
阪奈機器共用ネットワーク

SHARE事業（2019-2020)
文部科学省 先端研究基盤共用促進事業
研究機器相互利用ネットワーク
導入実証プログラム（SHARE事業）

大阪大学

奈良高専
大阪市立大学
現大阪公立大新型コロナウィルス禍での研究DX推進の先駆けに

3

18

阪奈機器共用ネットワークへの展開

6

文科省 新たな共用システム導入支援プログラム・コアファシリティ構築支援プログラム 実施機関・研究組織一覧
新たな共用システムPG（2016-2020) 3年/事業

コアファシリティ
構築支援PG

28機関
63ユニットまた、メリットも課題も共通！

コアファシリティPG（2020-2025) 5年/事業
15機関

機器共用の仕組み作りも大きく拡がっている

先端研究基盤共用促進事業 パンフレット（令和3年度発行）より

コアファシリティで研究データを制する者は実験系研究データを制する?!

NIIに希望する学認RDMの機能追加・機能改善点（1）
阪奈機器共用ネットワークで測定データ集約・配信システムを使って分かったこと
1. 学認RDM内でのデータ共有は、学認RDM参加校の間でだけ民間企業や外国研究者とのデータのやりとりは？
安全なデータ交換の場として、学認RDMを使いたい
2. 学認RDMへのデータアップロードの基本はブラウザーで手作業
自身のPCやMacでDropBoxやOneDriveのような感覚で使いたい（＝学認RDMを“マウント”できるようにして欲しい）
3.ローカルストレージ側から学認RDMに接続できるようにして欲しい
機関ストレージを持たない小規模大学や高専等では特に必要（学認RDM ⇒ S3 ⇒ ローカルストレージの方向だけしか接続できないので現状では、ローカルストレージを直接に学認RDMに接続できない）

NIIに希望する学認RDMの機能追加・機能改善点（2）実験系研究者にメリットを与えもっと使って貰うために現状
大学･研究機関のコアファシリティ

多様な分析装置

学認RDM
証跡機能

メタデータ機能• 機能限定のCloudストレージ（学認RDM参画機関内のみで共有）• 自前のPCよりも不便な環境（データ解析や実験ノートとの連携等）

Built-In 解析機能
共有機能
学認RDM
データストレージ

実験系研究者
特に化学・生命系にとって利用するメリットがない何が欠けているのか？
何が問題なのか？
測定データをアップロード

宝塚リトリート2023で検討

AI等の活用を推進する研究データエコシステム構築事業 プラットフォーム連携チーム

宝塚リトリート2023 趣旨と参加者
2023年10月2日－10月3日 会場：兵庫県宝塚市 宝塚ワシントンホテル
真に研究者の利益となり、真に科学･技術の進歩を加速する、情報基盤・データエコシステム･枠組みといった我々の進むべき道筋や方向性を、情報科学者･実験研究者･研究経営者らと共に議論し検討する。
参加者•理化学研究所
o小林 紀郎 〇 (基盤研究開発部門 副部門長)
o實本 英之 (データ管理システム開発ユニット ユニットリーダー)o菊地 伸治 (データ管理システム開発ユニット 上級技師)

このため、研究データエコの推進会議やプラットフォーム連携推進会議等の限られた時間では議論できない、研究データ管理や研究データ利活用に関する、事例や研究環境を踏まえた建設的な議論を行う。
議論の範囲は、プラットフォーム連携に限らず、人材育成、ルール・ガイドライン、研究事例、プラットフォーム構築を含めた情報基盤全般を含むとし、特定の領域やトピックを限定しない。なお、具体的な研究事情に合わせて議論した方が良いトピックについては、例えば研究分野を限定することは差し支えない。

•大阪大学o古谷 浩志 〇 （コアファシリティ機構 機構長補佐）o甲斐 尚人 (付属図書館 研究開発室)
o田主 英之 （サイバーメディアセンター
高性能計算・データ分析融合基盤協働研究所）
o松浦 かんな （コアファシリティ機構）o三木 保孝（情報推進部）
o寺前 勇希（情報推進部）
o向園 悠 （情報推進部）
o唐牛 譲 （コアファシリティ機構）•名古屋大学o青木 学聡 〇 (情報戦略室)•東京大学o小林 博樹 〇 (情報基盤センター 教授)•国立情報学研究所
o中野 恵一 〇 (オープンサイエンス基盤研究センター 特任研究員)
o古川 雅子 （教授）o長岡 千香子 (特任助教)（計16名）

共通見解：「自然科学研究の進め方･プロセスと学認RDMの関わりを明確に意識し皆でこの絵を共有しながら、学認RDMの役割を定義し、機能を付与していくことが必要」
Research Data Life Cycle

宝塚リトリートからのOutput：“Big Picture”

機関
リポジトリ

Daily Research Cycle

研究プロジェクトの始まり
研究
DMP
ステップ Projectに紐付け

要素共有･公開？

「研究Project
管理ツール（電子実験ノート）

学認RDMが提供する機能

自然科学研究の進め方とプロセス
学認RDMの機能 1

学認DMの機能 2

学認RDMの機能 3

学認RDMの機能 4

学認RDMの機能 5

青木学聡 (2021)を基に改変
学認RDMの機能 6

青木学聡 (2021)，“組織的RDM 支援サービスのためのエンタープライ
ズアーキテクチャの検討”，情報学
会研究報告，2021-IOT-055.
http://id.nii.ac.jp/1001/00212548/

解析・変換機能等を充実させ、学認RDMの利用価値を高める→ 学認RDMを、日本の中核的な研究DXプラットフォームへ
各大学で独自に作るよりも、学認RDMで1つ作る方が、より効果的かつコスト小

学認RDMにアップロードすると良いことが一杯ある！ようにしたい

大学･研究機関
多様な分析装置

学認RDM

Web解析環境等

証跡機能

機器メーカー・大学等が提供

メタデータ機能

A社（UV-VIS, IR, Raman)

Built-In 解析機能
共有機能

B社（X線回折, CT)

解析処理

学認RDM
データ
ストレージ

測定データをアップロード

C社（NMR, MS, 電子顕微鏡）
D社（電子顕微鏡, 元素分析）
E社（質量分析, NMR）
F社（質量分析, 電子顕微鏡）
G社（バイオイメージング ）X大学（NMR-MS複合解析 ）Y大学（4Dデータ解析 ）Z大学（シミュレーション統合 ）まとめ
1. 多くの分析機器が集まり、多くの研究者が利用するコアファシリティは、「実験系研究データ」に関するモデルケースとして最適
2. 全国の大学・高専・研究機関に「コアファシリティ」が設置されており、コアファシリティで学認RDM活用モデルが確立できれば、その波及効果は非常に大きい
3. 「実験系の研究者」に真に活用される学認RDMとなるため、実験系研究者に寄り添った機能向上や機能改善をお願いしたい

学認RDMが「日本の研究DXの中核基盤」となって新しい研究展開や研究効率化に大いに貢献して欲しい！