ポストゲノム時代の生命知識科学-生命情報から生命知識へ理化学研究所
ゲノム科学総合研究センター
ゲノム情報科学研究グループ
プロジェクトディレクター

理研ゲノム科学総合研究センター(GSC)• 開所 1998• 横浜キャンパス移転 （2000年10月）• 研究グループ– 遺伝子構造・機能研究グループ (1998)– タンパク質構造・機能研究グループ (1998)– ゲノム構造情報研究グループ (1998)– 動物ゲノム機能情報研究グループ (1999)– 植物ゲノム機能情報研究グループ (1999)– ゲノム情報科学研究グループ (2000)

ＯＭＩＣ ＳＰＡＣＥ （和田昭允２００３）↓ゲノム科学総合研究センター (GSC)
遺伝子構造・機能研究グループ

タンパク質構造・機能研究グループ

ゲノム構造情報研究グループ

動物ゲノム機能情報研究グループ

植物ゲノム機能情報研究グループ

ゲノム情報科学研究グループ↑“Omic Space” by Dr. Akiyoshi Wada

ゲノム情報科学グループ
情報統合
小長谷 明彦プロジェクト
ディレクター

Grid
DN
A

モデリング

高性能計算研究歴
第五世代計算機プロジェクト
推論マシン
論理プログラミング
遺伝子情報処理
ＧＡ、ＭＤＬ
１９９２
並列マシン
隠れマルコフモデル（ＨＭＭ）

１９９７

１９８７

ＭＩＴ・ＬＣＳ

２００４ 生命知識科学
理化学研究所ＧＳＣ
統合データベース
生命モデリング
グリッド
２０００

細胞シミュレーション
細胞周期粒子シミュレーション
北陸先端大・知識科学研究科

Genome Projectsのインパクトポストゲノム時代の幕開け
ゲノムからフェノームまでの網羅的解析の時代
GenomeAtom

PhenomeMolecule

Cell

TissueOrgan

Individualバイオネットワーク研究
Phenome

Genomeバイオネットワーク研究に必要な装備

生化学データ・情報・知識

高性能計算機・ツール

専門家の共同作業

Konagaya Akihiko, Bioinformatics Group, RIKEN GSC June 2003

データｖｓ情報ｖｓ知識biotin carboxylase, Campylobacter jejuni
1 aaattacaat taaaatttcc cttataatag ggaaatttta atgtcttgca agataatttg
1 aaattacaat taaaatttcc cttataatag ggaaatttta atgtcttgca agataatttg
61 tatcgtaatt attattaata aaatcaggat tttccatcat ggaaagatga aaatctttag
61 tatcgtaatt attattaata aaatcaggat tttccatcat ggaaagatga aaatctttag
121 tcgtttttat cccacttata agcaactcat ctaaagctac tttcatcttt gcaatagctt
121 tcgtttttat cccacttata agcaactcat ctaaagctac tttcatcttt gcaatagctt
181 tattacgatc ttctgcccaa actacaagtt tgcctatcat agaatcataa taagcaggca
181 tattacgatc ttctgcccaa actacaagtt tgcctatcat agaatcataa taagcaggca
241 cgctatagtc ttgataacaa tgactttcca ttcttacatt gcgtcctgcg ggtggaatgt
そういえば、ビオチン
241 cgctatagtc ttgataacaa tgactttcca ttcttacatt gcgtcctgcg ggtggaatgt
301 atttagtaat cttacctgga cttggcaaga aggttttaga atcttcagct gtgattctac
301 atttagtaat cttacctgga cttggcaaga aggttttaga atcttcagct gtgattctac
がカルボキシラーゼ
361 attctataga atgcccatta agcttaatac tttcttgaga tggtaaggca taaccttctg
361 attctataga atgcccatta agcttaatac tttcttgaga tggtaaggca taaccttctg
421 ctactttaat catttgttct atgatatcaa カンピロバクター菌ってtcccacttac catttcactt acacagtgttの補酵素として炭酸
421 ctactttaat catttgttct atgatatcaa tcccacttac catttcactt acacagtgtt
481 caacttgcaa acgcgtattc atttctataaたしか腸炎を起こす菌じゃ
aataaaagtc taaattttta tctactaaaa
481 caacttgcaa acgcgtattc atttctataa aataaaagtc taaattttta tctactaaaa
固定反応にかかわっ541 actcaaaagt tcccgcacct tcatatccta tagctttagc tgccttaata gcagtttcat
541 actcaaaagt tcccgcacct tcatatccta なかったかな。ＢＳＥのtagctttagc tgccttaata gcagtttcat
601
gaagcctagt gcgtgttttt tcatcaagca aaatcgcagg ggattcttct ataagtttttていたな
601 gaagcctagt gcgtgttttt tcatcaagca aaatcgcagg ggattcttct ataagttttt
661 gatggcgtct ttgcatagaa caatctcttt 影響で、バーベキューでcgcccacatg aatcacattg ccaaaactat
661 gatggcgtct ttgcatagaa caatctcttt cgcccacatg aatcacattg ccaaaactat
721 ctcctataac ctgcacttct atatggcgtg gattttgtat gtatttttcc atatacatag
721 ctcctataac ctgcacttct atatggcgtg gattttgtat gtatttttcc atatacatag
781 ttccatcgcc aaatgctgtc atagcctcgc 鶏肉を食べる機会が増
tttcagccga ccaatacgct ttttcaagat
781 ttccatcgcc aaatgctgtc atagcctcgc tttcagccga ccaatacgct ttttcaagat
841 ctttttcatt ttcaaccaca cgcataccac えて、最近発生件数がgaccaccacc acctgcagct gcttttaaaa
841 ctttttcatt ttcaaccaca cgcataccac gaccaccacc acctgcagct gcttttaaaa
901 tcacaggata acctatttct ttggcaagtt ttttagctgc ttcagctcct gccaaagccc
901 tcacaggata acctatttct ttggcaagtt ttttagctgc
ttcagctcct gccaaagccc
増えているらしいよ。
961 catcgcttcc tgggatcaca ggtacgcctg ctctttgcat
gacttgtttt gcttttgatt
961 catcgcttcc tgggatcaca ggtacgcctg ctctttgcat gacttgtttt gcttttgatt
ビオチンが欠1021 tatcactcat taaattcata gcttccacag aaggacctat aaatttgatg ttatgtttag
1021 tatcactcat taaattcata gcttccacag aaggacctat aaatttgatg ttatgtttag
1081 cacaaatttc aacaaaattt tgattttcac ttaaaaatcc gtatcctgga aaaatcgcat
乏すると口唇1081 cacaaatttc aacaaaattt tgattttcac ttaaaaatcc gtatcctgga aaaatcgcat
1141 cagcttctgc tatttcagcc gctgcgatga tagctgggat atttaaataa ctttcagaac
1141 cagcttctgc tatttcagcc gctgcgatga tagctgggat atttaaataa ctttcagaac
炎になるよね1201 ttcttgcctt acctatacaa atgcttgcat cagcgtattt taaatacaaa gcatctttat
1201 ttcttgcctt acctatacaa atgcttgcat cagcgtattt taaatacaaa gcatctttat
1261 ctgcttcaga atacacacaa attgcttttt tacccatttc tttaatcgtt cttaaagcac
1261 ctgcttcaga atacacacaa attgcttttt tacccatttc tttaatcgtt cttaaagcac
1321 gcagtgctat ttctccacga ttagcaatta atatgctttt aatttccatt ttataatttc
1321 gcagtgctat ttctccacga ttagcaatta atatgctttt aatttccatt ttataatttc
1381 tccaccgcaa ataaaggcat tccaaattct acaggctgac catcagcaac taaaatttca
1381 tccaccgcaa ataaaggcat tccaaattct acaggctgac catcagcaac taaaatttca
1441 gcgatcctac aatcaaattc cgcttcaatt tcattcatga ttttcatcgc ttcgataata1441 gcgatcctac aatcaaattc cgcttcaatt tcattcatga ttttcatcgc ttcgataata
1501 gctatagtat cgcctttttt aaccgtacta cctactttta caaaaggtgc tgcacctgga
1501 gctatagtat cgcctttttt aaccgtacta cctactttta caaaaggtgc tgcacctgga
1561 cttggagctt gatagaaagt tcctaccata gggctgttta tacttggttt gtttgatttt
1561 cttggagctt gatagaaagt tcctaccata gggctgttta tacttggttt gtttgatttt
1621 acactttgac taggttgagc ttcgtttaca acgcttacat tgataggttg tggagctgga
1621 acactttgac taggttgagc ttcgtttaca acgcttacat tgataggttg tggagctgga

http://www.pref.aichi.jp/eiseiken/67f/campylobacter.html参考

生命知識の体系
表現レベル
モデル

分子シミュレーション

細胞
シミュレーション

生体シミュレーション

文献知識

意味
バイオオントロジー

関係

ゲノム
アノテーション

事実

ゲノム

アレイ
データベース

トランスクリプトーム

表現形
データベース

プロテオーム

フェノーム

複雑さ
分子

ネットワーク細胞

個体

生命知識科学とは？

生命を「知識科学」する学問分野
小長谷 ２００４

暗黙知「人間の知識について再考するときの私の出発点は、我々は語ることができるより多くのことを知ることができる、という事実である。」
マイケル・ポラニー（著）、佐藤敬三（訳）「暗黙知の次元」紀伊国屋書店、１９８０

知識スパイラル「暗黙知と形式知の相互作用の中から知が生み出される」
知識創造企業（野中郁次郎, １９９６年訳）
Genome Annotation

Literature Information
DNA

Cell Cycle Model（記号）表現ソシュール（Saussure, Ferdinand de. 1857-1913)「記号対象」を直接的に認識することはできず、「記号表現」というフィルターを通してのみ知ることができる。
言葉は、互いに他のことばとの関係でしか定義されない。
ソシュール 一般言語学講義（１９１６年）”シニフィアン”（指し示すもの＝記号表現）
例 本 書 book”シニフィエ”（指し示されるもの＝記号対象）

タンパク質のシニファン
biotin carboxylase>1BNC:A BIOTIN CARBOXYLASEMLDKIVIANRGEIALRILRACKELGIKTVAVHSSADRDLKHVLLADETVCIGPAPSVKSYLNIPAIISAAEITGAVAIHPGYGFLSENANFAEQVERSGFIFIGPKAETIRLMGDKVSAIAAMKKAGVPCVPGSDGPLGDDMDKNRAIAKRIGYPVIIKASGGGGGRGMRVVRGDAELAQSISMTRAEAKAAFSNDMVYMEKYLENPRHVEIQVLADGQGNAIYLAERDCSMQRRHQKVVEEAPAPGITPELRRYIGERCAKACVDIGYRGAGTFEFLFENGEFYFIEMNTRIQVEHPVTEMITGVDLIKEQLRIAAGQPLSIKQEEVHVRGHAVECRINAEDPNTFLPSPGKITRFHAPGGFGVRWESHIYAGYTVPPYYDSMIGKLICYGENRDVAIARMKNALQELIIDGIKTNVDL QIRIMNDENFQHGGTNIHYLEKKLGLQEK
Ec: 6.3.4.14
NiceProt View of TrEMBL: Q8FD40

オントロジー• 「存在に対する体系的な説明」（哲学）• 「人工知能システムを構築する際にもちいられる基本概念や語彙の体系」 （人工知能）• 言葉は、互いに他のことばとの関係でしか定義されない
ソシュール 一般言語学講義（１９１６年）

コマドリなのに学名はakahige【学名】Erithacus akahige【分類】スズメ目ヒタキ科ツグミ亜科【亜種】基亜種コマドリ（E. a. akahige）のほか、伊豆諸島の神津島から八丈島までと屋久島、種子島にタネコマドリ（E. a. tanensis）が生息する。
【図鑑】[FG]:p238/[600]:p228【英名】Japanese Robin【漢字】駒鳥【別名】ざらざらとり、うまおえ、くつわどり、なみこまどり（岩手）、こまおへとり（宮城）、
みやましようじよう（福島）、ひこま（山形）、とちはかり、くろこ（群馬）、まめまわし（静岡）、やまかみこま（和歌山）、とけいどり（三重）、こまんどり（奈良）、ひこま（新潟）、しまどり、あかこま、じこま、こまひき、ひごま（島根）、あつどり（広島）、
ひこま（香川）、うまおいどり、おながどり、ひつじ、こまおいどり（高知）、こまひき（徳島）、こまいどり、こまひき、こまひきどり、のごま（愛媛）、ひーかち（福岡）、な
たうしね、きんきよどり（高知）、はあごろ（奄美大島）、ほんこま、こまひきどり（栃木県）、こま（青森、秋田、山形、栃木県、群馬、埼玉、新潟、神奈川、伊豆大島、静岡、山梨、長野、大阪、奈良、和歌山、富山、鳥取、山口、香川、愛媛、高知、福岡、大分）
野鳥辞典よりhttp://www.asahi-net.or.jp/~SG4H-HRIZ/dic/tugumi/komadori.html
写真 http://www.crdc.gifu-u.ac.jp/mmdb/gifuhaku/tori/tori3/14.html

アカヒゲなのに学名はkomadori• 【学名】Erithacus komadori• 【分類】スズメ目ヒタキ科ツグミ亜科• 【亜種】アカヒゲ（E. k. komadori、男女群島・屋久島・奄美大島など）、ホントウアカヒゲ（E. k. namiei、沖縄本島・慶良間島）、ウスアカヒゲ（E. k. subrufus、石垣島・西表島・与那国島）の3亜種に区分される• 【図鑑】[FG]:p238/[600]:p228• 【英名】Ryukyu Robin【漢字】赤髭• 【別名】あかひげ、あざひぎ（奄美大島）、ちようせんごま（東京、千葉、愛知、奈良、愛媛）、ちようせんこまどり（静岡）、あかつぐめ（福岡）、あかひげ（徳之島）、りうきうごま、あかしぎ（大阪）、あかひじ（喜界が島）、あかひぢ、いそつぐし（鹿児島）、あこう（沖縄島）
野鳥辞典より写真http://www.asahi-net.or.jp/~SG4H-HRIZ/dic/tugumi/akahige.html
http://chukakunet.pref.kagoshima.jp/home/rishinka/homepage/shityokakuka/kasen/yamatodam/akahige.htm

遺伝子における名前問題
異名同義、同名異義研究分野間での一貫性の欠如（共時態）
名称の時間的変遷（通時態）

P-gp (ｐ糖タンパク質: p-glycoprotein) 薬剤耐性トランスポーター
MDR(multiple drug registance gene) 遺伝子名
ABCB1 (ABC binding cassetのサブファミリーであることが後からわかった)
Approved Gene Symbol: ABCB1
Approved Gene Name: ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1
Synonyms
Aliases: P-gp, CD243, GP170, ABC20, HGNC:2030
Previously Approved Symbols: PGY1, MDR1, CLCS
Previous Gene Names: colchicin sensitivity構造主義
ここでは、そもそも人間の知性とは実態としてはとらえられないが、その根底には言語的は流れがある。ここから創造されるものは、まったくのカオスは存在しないとする。たとえそれが狂気であっても構造的に生み出されてきているというのだ。

ソシュール １９１０年講演「構造主義は現代の専門分化の時代にあってこの間に知的架橋を有効に行なおうとする学問総合の一つの有効な手立てである。それは新しい「統一科学」であり、今日要求されている「学際的」研究を促進する最も有効な突破口となりうるものである。このような意味において、それは前世紀以来の縦割り的タコ壷的専門化の弊を脱し、それぞれの専門領域の取り扱っている素材のwhatにとらわれざることなく、それらの素材が荷っている構造のhowに専ら注目することによって、それら専門諸科学を横断的に連繋させ結びつけようとする、今世紀の知的情況から生まれ出た新しいトータルな学問的認識の方法なのである」
伊東俊太郎「数学と構造」「現代思想」1973年5月号

構造モデルと制御モデル
構造論的研究の端緒は、観察可能な複数の対象群の間に、「共通している要素」を見出すところにあります。
・・・
分類のための要素相互の間を明確な関係で結びつけたものが「構造」と呼ばれるものです。
・・・「対象となる現象」の制御のためには、「操作可能な変数」がその構造の中に含まれている必要があります。
・・・
十分に制御可能な点を越えてまで構造モデルを精緻化する意味は全くありません。
対象を「説明できる」ということと、対象を「制御できる」ということは別の概念です。

高田明典「構造主義方法論入門」１９９７年

生命現象モデリング
Phospho-receptor

原子分子
DNA
Phospho-Shc

Activated-PI3K

Activated-Raf

Activated-MEK

Activated-ERK

Activated-Akt

RNA
タンパク質
パスウェイ
細胞器官個体ErbB receptor signaling diversity
EGF/TGFαLigandHRG

ErbB4 receptor
EGF receptor
ErbB
Dimer

11121314

EGF HRG

PotentialEffector
Proteins

BiologicalResponse

EGF

32++

++

++++++

3442

44

PI3K
Src
GAP
PLCγShc
Grb2
PTP

PI3K
Shc

++

-HRG

Src
Src
Src
PI3K
Src
PI3K PI3K
GAP
GAP
GAP
Src
GAP
Src
Src
PLCγ
PLCγ
PLCγ GAP PLCγ GAP PLCγShc
Shc
Shc PLCγ Shc PLCγ Shc
Grb2
Grb2
Grb2 Shc
Grb2 Shc
Grb2
Cbl
Cbl
Cbl Grb2
Cbl Grb2
PTP
PTP+

33

++++

++++

PI3K
Shc

-Alroy and Yarden, FEBS, 410, 83, 1997

ErbB4 receptor signaling
HRG↓
ErbB4↓
Shc↓
Grb2/SOS
↓
Ras↓
Raf↓
MEK↓
ERKPI3K↓
Akt

Kinetic constants
ka, kd, Km, Vmax
Initial concentration

Hatakeyama, et al, Biochem. J. 373, 451-463, 2003

Phospho-receptor

Simulation results
HRG (□ 10 nM, ○1 nM, △0.1 nM) : Experimental results
HRG (Red, 10 nM; green, 1 nM; blue, 0.1 nM) : Simulation results

Phospho-Shc

Activated-PI3K

Activated-Raf

Activated-MEK

Activated-ERK

Activated-Akt自由エネルギー計算による結合力予測

pY0992pY1068

pY1086

pY1045

pY1148

pY1173

pY1056

pY1242

pY1188

DGcalc (kcal/mol)

8070

Corr. coeff. = 0.92

6050
40-11-10DGexp (kcal/mol)

Red：Phosphotyrosyl peptide (ErbB1+ErbB4) Blue：Grb2 SH2 Domain
Suenaga, Biochemistry, 42, 5195-5200, 2003.

生命現象モデルとしての数値シミュレーションの適用限界• 実存（分子）と表現（微分方程式）との乖離• 制御変数（濃度）の操作性• スケーラビリティ（微分方程式数）の限界

よりマクロな細胞、器官、個体のモデル化に踏み込むためには、別な方法論が不可欠

因果律を中心とした制御モデル• 風が吹けば ＝＞ 桶屋が儲かる– 強風で土埃が目に入ると、目を悪くする人が増える。
– 目を悪くすると角付け（三味線）でもしようということになるから、三味線が売れる。
– 三味線の胴には猫皮だから、猫が減って鼠が増える。
– 鼠が桶をかじって穴を開けると、桶屋に注文がくる。

薬相互作用問題• ソリブジン（SRV）とフルオロウラシル系薬剤（５FU）との併用により重篤な血液障害が発現し，死亡に至った例も報告されているので、（本療法と）併用を行わないこと。
医薬品安全性情報１５８号

薬相互作用の因果律
・ソリブジン（SRV)の代謝物、ブロモビニルウラシル（BVU)がフルオロウラシル系抗癌薬の代謝を阻害することにより、フルオロウラシル系抗癌薬（５FU）の血中濃度が上昇し、この薬剤の副作用である白血球減少や血小板減少などの重篤な血液障害を引き起こされた。

因果律の分解• ソリブジン（SRV）がデヒドロゲナーゼ（DPD）を介在して(E)-5-(2-ブロモビニル）ウラシル（BVU）を生成• ジヒドロピリミジン・デヒドロゲナーゼ（DPD）はフルオロウラシル（５FU）を無毒なデハイドロフルオロウラシル（H2FUra）に代謝分解• BVU存在下では、DPDの活性が著しく低下
５FUが代謝されず、薬剤の副作用である白血球減少や血小板減少などの重篤な血液障害を引き起こされた薬物間相互作用の「3項関係」による形式的記述
BVDU

SRV(BV-araU)
(1)
BVU
(2)

H2FUra
FUPADPD(3)

OPRTase

FUMP

FUDP

UK

FUrd
UP

5FU

TP FdUrd

F-beta-Ala

Prodrugs of 5FU

Excreted inUrine

eg. Capecitabine,Tegafur, Carmofur,
Doxifluridine, etc.

TK

ribonucleotide
reductase

FdUMP

FdUDP

FdUTP

dTMP

dTDP

dTTP

thymidylate
synthase

RNA

FUTP

dUMP

SRV
├ (es) (SRV),TP, BVU
An antiviral drug,
sorivudine
came on (1)Japanese market in 1994.
40 days, 18(2)BVUJust┤ within(ei) DPD
patients died and all of them were taking 5-FU or(3)its prodrugs.5FU ├ (es) DPD, H2FUra
SRV > 5FU (SRV enhances 5FU)
can be introduce by conjunction of (1) (2)and (3).

DNAdUDP

TPSRV

(1)
5-FU
BVU

(3)

DPD

(2)
DPD-BVU

H2FUra３項関係モデル(吉川澄美２００３）

相互作用の連結パターン
Effector

1

Object1221Output2123

3

123[A]

31221

1

2[D]
333

1[B]

3[C]

3[E]• 薬物および薬物由来物質はEffector、• 反応相手の生体物質はObjectとして扱う。
ObjectにEffectorが関与した結果がOutputとなり、次のEffectorとして作用する。

3項関係モデルに基づく薬物相互作用知識ベースの構築（吉川澄美200３)
Substance Table

Interaction Table

Drug Table

DB Interaction
Table

Metabolite
Table

DM Interaction
Table

Biomolecule
Table
Epi/Genetic
Table
DBI: Drug-Biomolecule Interaction
DDI: Drug-Drug Interaction
DM: Drug-Metabolite
IR: Information Retrieval
IE: Information Extraction

DDI Query

PubMed(MEDLINE)
Extracted
DDI abstract &sentences

Manual
DBI data
structuring

IE forDBI

Documented
DD I

DD Interaction
by Query

Retrieved
DBI abstract
Retrieved
DBI sentence

IR forDDI
Text Mining
ModuleIR forDBI
IR forDBI
Data Collection & Update

北陸先端大知識科学研究課博士論文,2003

まとめ• 生命情報から生命知識の時代へ• 専門家が持つ知見（暗黙知）を形式化し、共有化するための仕組みが必要• 生命知識の形式化には、表現と表現対象とのずれに注意が必要• 「構造」の精緻化は効用とのトレードオフ• 因果律に注目した生命現象の記述に注力

Research Organization Aug. 2004
Project Director
Dr. Akihiko Konagaya

Celluler Knowledge
Team Leader

High Performance Biocomputing
Team Leader

Seniar Research Scientist

Dr. Akihiko Konagaya

Dr. Makoto TAIJI

Dr. Shigeru Takasaki

Research Scientist

Research Scientist

Dr. Mariko Hatakeyama
Dr. Shuhei Kimura
Dr. Ryuzo AzumaDr. Sumi Yoshikawa
Dr. Junko Hosaka
Dr. Kazumi Matsumura

Dr. Noriyuki FUTATSUGIDr.Fumikazu KONISHI
Dr. Tetsu NARUMIDr. Yousuke OHNO
Dr. Atsushi SUENAGA
Dr. Naoki TAKADA

Research Associate

Research Associate

Ms. Kaori Ide

Mr.Akinobu FUKUZAKI
Mr.Aki HASEGAWA

Genomic Knowledge base
Team Leader
Dr. Tetsuro TOYODA

Research Scientist
Dr. Yoshikazu HASEGAWA
Dr. Eli KAMINUMA

Technical Scientist
Mr. Naohiko HEIDA
Mr. Yoshiki MOCHIZUKI
Mr. Tetsuya SAKURAI

Technical Staff
Mr. Kenji AKIYAMA
Ms. Katsura HIROSAWA
Mr. Kei IIDA
Mr. Masakazu SATOUCollaborating Scientist
Dr. Boris Kholdenko (TJU)
Dr. Takashi Naka (KIDr. Tomoyuki Yamamoto (JAIST)
Mr. Takuji Kawasaki (FUJIREC)

Visiting Members

Immunoinformatics
Team Leader

Mr. Naoki OKAMOTO (NECIS)
Mr. Atsushi SHIMIZU (NECIS)

Research Scientist

Collaborating Scientist
Dr. Sigehiko KANAYA (NAIST)
Dr. Kisik LEE (ETRI)
Mr. Yoshihiro KAWAMURA (IBM.)

Dr. Christian SCHÖNBACH
Dr. Igor V. KUROCHKIN
Dr. Junko HOSAKA (until Oct 2003)
Dr. Kaoru YAMAMOTO (until Oct 2003)

Research Associate
Mr. Takeshi NAGASHIMA

Collaborating Scientist
Dr.Kenji SATOU(JAIST)

Information Infrastructure
Team Leader
Dr. Akihiko Konagaya

Research Associate
Mr. Shouji Tatsumoto

Technical Scientist
Mr. Yoshiyuki Tanaka
Mr. Ryo Umetsu

Technical Staff
Mr. Shingo Ooki