チュートリアル

NWChem
元素ごとの基底関数・ECP設定
V11.7.5
2024年5月7日

株式会社クロスアビリティ

Copyright 2008-2024 X-Ability Co., Ltd.

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本書について•本書はWinmostar V11の使用例を示すチュートリアルです。

•初めてWinmostar V11をお使いになる方はビギナーズマニュアルを参照してください。

•各機能の詳細を調べたい方はユーザマニュアルを参照してください。

•

本書の内容の実習を希望される方は、講習会を受講ください。
– Winmostar導入講習会：基礎編チュートリアルの操作方法のみ紹介します。

– Winmostar基礎講習会：理論的な背景、結果の解釈の解説、基礎編チュートリアルの操作方法、基礎編以外のチュートリアルの一部の操作方法を紹介します。
– 個別講習会：ご希望に応じて講習内容を自由にカスタマイズして頂けます。
•

本書の内容通りに操作が進まない場合は、まずよくある質問を参照してください。

•よくある質問で解決しない場合は、情報の蓄積・管理のため、お問合せフォームに、不具合の再現方法とその時に生成されたファイルを添付しご連絡ください。

•本書の著作権は株式会社クロスアビリティが有します。株式会社クロスアビリティの許諾な
く、いかなる形態での内容のコピー、複製を禁じます。
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概要
ブロモクロロメタン(CH2BrCl)の元素ごとの基底関数の設定、基底関数及びECPの設定をします。
基底関数のみの設定

C,Cl,Br: 6-31G*、H: STO-3G

基底関数及びECPの設定 C,H: 6-31G*、Cl,Br: LANL2DZ(基底関数、ECP共に)
注意：元素ごとに指定する場合は、最新版Winmostar(V11.7.5以降)をご利用ください。

基底関数のみCopyright 2008-2024 X-Ability Co., Ltd.

基底関数及びECP

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Winmostar V11の動作モード
V11にはプロジェクトモードとファイルモードの2つの動作モードが用意されています。
本書ではプロジェクトモードでの操作方法を解説します。
ファイルモードの操作方法はV10のNWChemチュートリアルを参照してください。

プロジェクトモード V11新機能
ユーザは個々のファイルを意識することなくジョブを管理できます。
基本的にこのモードを推奨します。
ファイルモード
ユーザは個々のファイルを明示的に作成、管理します。操作方法はV10以前と一緒です。
継続ジョブを作成するときに、ファイルモードまたはV10以前では都度継続元ジョブの最終構造を表示する必要がありますが、プロジェクトモードでは自動で最終構造が引き継がれます。
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I. 系のモデリング1. Winmostarを起動し、新規プロジェクト（3次元構造を入力）をクリックします。（すでに起動している場合はファイル｜新規プロジェクトをクリックします。）
2. プロジェクト名に「basisset」と入力し保存をクリックします。

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I. 系のモデリング1. フラグメントを選択が-CH3の状態で、その右にあるReplaceボタンを1回クリックし、メタンを作成します。
2. 水素原子が太い赤丸で選択された状態で、メインウィンドウ上部の編集操作向けの元素を選択メ
ニューからCl 17を選択し、元素を変更ボタンをクリックして、クロロメタンを作成します。
3. 別の水素原子が太い赤丸で選択された状態で、編集操作向けの元素を選択メニューからBr 35を選択し、元素を変更ボタンをクリックして、ブロモクロロメタンを作成します 。

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II. 計算の実行（基底関数のみの設定）
1. ソルバを選択メニューでNWChemを選択して、ワークフロー設定ボタンをクリックします。
2. NWChem Workflow SetupウィンドウでDetailsボタンをクリックします。

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II. 計算の実行（基底関数のみの設定）
1. NWChem Keyword SetupウィンドウでBasisのExceptionボタンをクリックします。
2. NWChem Basis ExceptionウィンドウでHのみSTO-3Gを選択して、OKボタンをクリックします。これで、HはSTO-3G、他の元素は6-31G*となります。

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II. 計算の実行（基底関数のみの設定）
1. Previewタブをクリックして、Basisの記述が* Library 6-31G* except H
H library STO-3Gとなっていることを確認してください。
2. 右下のOKボタンをクリックします。

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II. 計算の実行（基底関数のみの設定）
1. NWChem Workflow SetupウィンドウでOKボタンをクリックします。
2. ジョブの設定ウィンドウで実行ボタンをクリックします。

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III.計算の実行（基底関数及びECPの設定）
1. NWChem Workflow SetupウィンドウでResetボタンをクリックして、「変更を破棄してリセットしますか?」の質問で「はい」をクリックします。
2. Detailsボタンをクリックします。
3. NWChem Keyword SetupウィンドウでBasisのExceptionボタンをクリックします。

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III.計算の実行（基底関数及びECPの設定）
1. NWChem Basis ExceptionウィンドウでCl及びBrをlanl2dz_ecpに変更して、OKボタンをクリックします。これで基底関数部分は、CとHは6-31G*、ClとBrはLanL2DZとなります。

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III.計算の実行（基底関数及びECPの設定）
1. Advancedタブをクリックして、ECP欄に

Cl Library lanl2dz_ecp
Br library lanl2dz_ecpと記入します。ECP欄にはECPを使う元素のみ記入します。

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III.計算の実行（基底関数及びECPの設定）
1. Previewタブをクリックして、Basisの記述が* Library 6-31G* except Cl Br
Cl library lanl2dz_ecp
Br library lanl2dz_ecp
ecpの記述がCl Library lanl2dz_ecp
Br library lanl2dz_ecpとなっていることを確認してください。
2. 右下のOKボタンをクリックします。

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III.計算の実行（基底関数及びECPの設定）
1. NWChem Workflow SetupウィンドウでOKボタンをクリックします。
2. ジョブの設定ウィンドウで実行ボタンをクリックします。

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補足 リストにない基底関数・ECP指定方法
NWChemの利用可能な基底関数及びECP一覧(https://nwchemgit.github.io/AvailableBasisSets.html)に書かれているものは、基底関数
関数・ECP名をBasis欄・ECP欄に記入してください。一覧にない場合は、Basis Set
Exchangeウェブサイト(https://www.basissetexchange.org/)から、基底関数・ECPの数値を取得して、記入してください。ただし、数値を書いた場合は、分子軌道、静電ポテンシャルなどの描画はできません。

2C及びClのLanl2dzの場合：
1. 基底関数(LANL2DZ)を選択
2. 元素(C,Cl)を選択
3. フォーマット(NWChem)を選択
4. Get Basis Setをクリック

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補足 リストにない基底関数・ECP指定方法
新たに表示されたウィンドウの基底関数・ECPの情報をNWChem Keyword Setupウィンドウに記入します。
1. NWChem Keyword Setupウィンドウで、OthersタブをクリックしてOther Settings欄に基底関数のデータ(BASISからENDまで)を貼り付けます。

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補足 リストにない基底関数・ECP指定方法
1. NWChem Keyword Setupウィンドウで、AdvancedタブをクリックしてECP欄にECPのデータ(ECPの次の行からENDの前の行まで)を貼り付けます。

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最後に•

各機能の詳細を調べたい方はユーザマニュアルを参照してください。

ユーザマニュアル

Winmostar 講習会の風景•

本書の内容の 実習を希望され る方は 、Winmostar導入 講習 会 、Winmostar 基礎講習会、または個別講習会の受講をご検討ください。（詳細はP.2）•

本書の内容通りに操作が進まない場合は、まずよくある質問を参照してください。

•

よくある質問で解決しない場合は、情報の蓄積・管理のため、お問合せフォームに、不具合の再現方法とその時に生成されたファイルを添付しご連絡ください。
以上
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