ISSN 2186−4918
CODEN:OSSHEN

岡山大学
資源植物科学研究所報告（Annual Report 2023）− 第31巻 −岡山大学資源植物科学研究所
Institute of Plant Science and Resources
Okayama University

表紙の写真：左：昭和初期の昭和天皇行啓の記念碑と樟
右：令和５年の記念碑と樟目

次 （Contents）

研究活動（Research Activity）
植物ストレス科学共同研究コア（Research Core for Plant Stress Science）
大気環境ストレスユニット（Atmospheric Stress Unit）
光環境適応研究グループ（Plant Light Acclimation Research Group）
環境応答機構研究グループ（Group of Environmental Response Systems）
環境機能分子開発グループ（Group of Functional Biomolecular Discovery）
土壌環境ストレスユニット（Soil Stress Unit）
植物ストレス学グループ（Group of Plant Stress Physiology）
植物分子生理学グループ（Group of Plant Molecular Physiology）
環境生物ストレスユニット（Biotic Stress Unit）
植物・微生物相互作用グループ（Group of Plant-Microbe Interactions）
植物・昆虫間相互作用グループ（Group of Plant-Insect Interactions）
植物免疫デザイングループ（Plant Immune Design Group）
植物環境微生物学グループ（Group of Plant Environmental Microbiology）
大麦・野生植物資源研究センター（Barley and Wild Plant Resource Center）
遺伝資源ユニット（Genetic Resources Unit）
ゲノム多様性グループ（Group of Genome Diversity）
野生植物グループ（Group of Wild Plant Science）
ゲノム育種ユニット（Applied Genomics Unit）
遺伝資源機能解析グループ（Group of Genetic Resources and Functions）
統合ゲノム育種グループ（Group of Integrated Genomic Breeding）
次世代作物共同研究コア（Research Core for Future Crops）
作物デザイン研究チーム（Crop Design Research Team）
フィールドフローラ研究チーム（Field Flora Research Team）
作物機能イノベーション研究チーム（Crop Functional Innovation Research Team）
作物・環境デザイン研究チーム（Crop and Environmental Design Research Team）
RECTOR プログラム（RECTOR Program）

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構成員
（Member）
出版物リスト（List of Publication）
国際会議およびシンポジウム（List of International Conferences and Symposia）
講演およびシンポジウム発表（List of Domestic Conferences and Symposia）
研究所員が主催したシンポジウム等（List of Symposium Superintended by the Member of Institute）
学会賞等（Awards）
共同研究リスト（共同利用・共同研究拠点事業）（List of Joint Projects at the Joint Usage/ Research Center）
拠点事業以外の共同研究（国内／国際）（List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage/
Research Center（Domestic/ International））

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研究活動 (Research Activity)
大気環境ストレスユニット
光環境適応研究グループ(Atmospheric Stress Unit)
Plant Light Acclimation Research Group

本グループでは、光合成機能を担うオルガネラである葉緑体（色素体）の分化と維持の分子機構に注目し、環境ス
トレス下での葉緑体の機能解析ならびに色素体の多面的な機能について様々な手法を用いて研究を行っている。

Our group studies plant adaptation to environmental
stresses at the molecular level. Especially, we focus on
chloroplasts that participate in the energy transfer systemsof photosynthesis.
1.	S tudies for the chloroplast membrane-maintaining
protein VIPP1
VIPP1 (Vesicle Inducing Protein in Plastid1) protein
is widely found through photosynthesis organisms
and known to be required for maintaining chloroplast
membranes. To understand the mechanisms of the actionof VIPP1, we are currently analyzing its non-canonical
GTP/ATPase activity and high-ordered oligomer structure.
Analysis using Arabidopsis transformants suggests that
its N-terminal helix is impor tant for the formation offunctional VIPP1, and co-immunoprecipitation analysis
reveals that VIPP1 interacts with chloroplastic HSP70.

１．植物の光合成と環境耐性を支えるタンパク質 VIPP1の研究
VIPP1 は植物や藻類に広く見出されるタンパク質で、葉緑体を形作る膜（チラコイド膜、包膜）の機能維持に重要である。そのメカニズムの解明を目指し、我々はこのタ
ンパク質の非典型 GTP/ATPase 活性と高次多量体構造に注目して解析を進めている。シロイヌナズナの形質転換体を使った解析から、N 末端側のヘリックスが機能的な VIPP1の形成に必要であることを示唆する結果を得ている。また
共免疫沈降解析から VIPP1 がヒートショックタンパク質である HSP70 と相互作用することが明らかになった。
２．葉緑体膜の形状を支えるタンパク質 FZL の研究
光合成明反応の場である葉緑体内部の膜構造チラコイ
ド膜は、ネットワークのような複雑な構造をしている。シロイヌナズナの突然変異株を解析することで、FZL タン
パク質がこの構造を保つのに必要であることが明らかになった。現在はその生理的な影響を詳細に解析している。

2.	Studies on FZL, a protein sustaining the structure ofchloroplast membranes
The thylakoid membranes of chloroplasts display unique
network-like structures. Using Arabidopsis mutants, wefound that a protein called FZL is required to maintain the
intricate structures likely by interconnecting subdomainsof thylakoids. Cur r ently, we ar e also geneticallyinvestigating the physiological impacts of lack of FZL toreveal the biological significance of the peculiar structuresof thylakoids.

３．光化学系 II タンパク質の機能維持に関する研究
光化学系 II（PSII）の迅速な分解から始まる修復機構は光合成の維持に重要である。我々は PSII の反応中心タン
パク質である D1 分解の主要プロテアーゼである FtsH と関連した D1 の酸化修飾に着目した解析を進めている。ク
ラミドモナスの形質転換体を用いた解析から、D1 の N 末
端のトリプシン残基の酸化が PSII の修復において重要な酸化であることを明らかにした。

3.	Studies in the post-translational protein modification of
Photosystem II
A major target site of photo-damage is D1 protein in
Photosystem II (PSII), and rapid degradation of D1 isprerequisite for maintaining photosynthesis. We focus
on the oxidation of tr yptophan residues in PSII, whichcorrelates with D1 degradation mediated by FtsH protease.
Using Chlamydomonas transformants, we found thatoxidation of the N-terminal tr yptophan residue of D1 iscrucial in PSII repair.

４．オルガネラ DNA に関する研究
葉緑体に存在する葉緑体 DNA は、葉の老化初期に分解される。我々が花粉において同定したオルガネラ DNA 分
解酵素は老化葉においても発現しており、老化葉でも機能していることが予想された。現在、老化葉での葉緑体
DNA 分解が、新たな養分転流に寄与する可能性について解析を進めている。

4.	Molecular mechanism of organellar DNA degradation
during plant senescence
In plant cells, mitochondria and plastids contain theirown genomes. Despite their limited genetic capacity, these
multicopy organelle genomes account for a substantial
fraction of total cellular DNA, raising the question ofwhether and how organelle DNA quantity is controlled
spatially or temporally. Now, we are studying the organelle
DNA degradation in leaves during senescence using
Arabidopsis mutants.

５．澱粉粒の形状に異常を示す突然変異体の単離とその利用植物において合成された澱粉は、我々の主食としてだけでなく、様々な加工製品としても利用されている。澱粉は、細胞内では不溶性の粒子である澱粉粒を形成する。澱粉粒の形状が変化した突然変異体には、その澱粉特性が変化しているものが存在している。我々は、澱粉粒の形状に異常を示す突然変異体のスクリーニングをオオムギとイネを用いて行い、新規の澱粉特性を持つ系統の作出を進めている。

5.	I solation and use of mutants with various shapes ofstarch grains
Starch synthesized in plants is used not only as ourstaple food, but also as processed products such as
saccharified products, food additives, and industrial
applications. Starch forms starch grains, which are
insoluble particles inside cells. Mutants developing starchgrains with altered shapes sometimes shows dif ferent
starch properties compared to the wild type. We are trying
to isolate mutants showing various shapes of starch grains
to create breeding materials with a broad range of starchproperties.

６．変動する光環境下での光防御機構に関する研究
光合成には光が必要だが、強すぎる光は植物にとってス
トレスとなり、光合成の能力を低下させる。植物はこれらのストレスに対応するために様々な仕組みを備えている。
我々は光合成の調節因子であるチオレドキシンに注目し、チオレドキシンが変動する光ストレス環境条件で光合成装置を守ることを明らかにした。現在はその防御機構について研究を進めている。

6.	S tudies on the photoprotective mechanism underfluctuating light conditions
Light is necessar y for photosynthesis, but excess
light causes severe oxidative damage and decreases
photosynthetic capacity. Plants use various mechanisms
to cope with these stresses. We focused on thioredoxin
protein, a regulator of photosynthesis, and found thatthioredoxin protects the photosynthetic apparatus underfluctuating light stress conditions. We are cur rently
studying its photoprotective mechanism.

1環境応答機構研究グループ

Group of Environmental Response Systems

本グループでは、植物の非生物的ストレスに対する応答について、遺伝子レベルから個体レベルまで、広くシステ
ムを理解することを目指して研究を行っている。特に、植物ホルモン応答機構に着目し、生理学、分子生物学、分子遺伝学的手法により解析を行っている。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。

Our research aim is to understand the molecular systemof the response to abiotic stress in plants at the levels fromgene expression to individual behavior. We are mainlyinterested in the plant hormone response system and havebeen analyzing the system using physiological, molecularbiological and molecular genetic approaches. Our mainachievements in 2023 are described below.

１．植物ミトコンドリア mRNA 転写後調節機構の解析
昨年までに、ahg2-1 の表現型を抑圧する ags2 変異は、
ahg2-1 の表現型の原因と考えられる polyA 付加ミトコン
ドリア（mt）mRNA の蓄積には影響しないことが示唆された。本年度は、これを確認するため網羅的転写物解析を実施した。その結果、ags2 は全ての mt-mRNA の polyA 付
加には影響しないことが確認された。一方、ahg2-1 において一部の mt-mRNA で RNA 編集の効率が低下しており
ags2 では回復傾向にあることが見出された。今後は、mtで機能する RNA helicase である AGS2 の酵素活性や相互作用因子の解析を進め、AGS2 の生理機能を明らかにしていく。

1. Analysis of the post-transcriptional mitochondrial mRNA
regulation
Until last year, ags2 was not known to affect theaccumulation of polyadenylated mitochondrial (mt) mRNA in
ahg2-1, despite repressing the ahg2-1 phenotype. This year,
we first investigated the impact of ahg2-1 and ags2 on the
structure of mt-mRNA through comprehensive transcriptome
analysis. As a result, we confirmed that ags2 does not influencepolyadenylation. However, in some mt-mRNA, a decrease
in RNA editing efficiency was observed in ahg2-1, with atendency for recovery in ags2. Moving forward, we will further
analyze the enzymatic activity of AGS2, an RNA helicase
functioning in the mitochondria, and explore interaction factors
to elucidate the physiological functions of AGS2.
2. Establishment of crop design technology using a model
to predict agronomical traits
L a s t y e a r, w e i d e n t i f i e d h o r m o n e f l u c t u a t i o n s
associated with temperature-induced growth in theoutdoor environment. This year, we conducted controlled
experiments in artificial environments and confirmed thehormone fluctuations responsive to temperature changes.
In our future studies, we will conduct comprehensive
transcriptome analysis to investigate the mechanism
underlying the hormone fluctuations.

２．オオムギ出穂期予測モデル構築による作物デザイン技術基盤の開発昨年度までに、野外環境において気温変化に伴う新規といえるホルモン変動を見出した。このホルモン変動の生理的意義を明らかにするため、今年度は、人工的環境下での再現実験を行った。その結果、野外で観測したような気温に応答したホルモン変動が確認された。今後、網羅的転写物解析を行いホルモン変動の機作について調査する予定である。
３．ナス科植物の着果量に及ぼすトレハロースの効果
トレハロースがストレス条件下においてピーマンのようなナス科作物の着果量を増加させることが知られていたが、その作用機作は不明だった。本研究では、トレハロー
スがナスおよびトマトの雌蕊の伸長を促進し、着果に不利である短花柱花の発生を抑制することを明らかにした。

3. Effects of trehalose on the alleviation of short-styled
flowers in Solanaceous plants
While positive effects of trehalose on enhancing crop
yields in Solanaceous crop like bell peppers under stressed
conditions are well known among farmers, the underlying
mechanisms have remained elusive. Our studies revealed
that trehalose treatment promoted style elongation in
eggplants and tomatoes, consequently mitigating theoccurrence of short-styled flowers.

４．オオムギ芒形成に関与するエピゲノム制御因子の解析
オオムギにおける芒が短く曲がった変異体の原因遺伝子候補として、エピゲノム制御因子が同定された。野生型と変異体の芒における遺伝子発現を RNA-seq 解析により比較し、特定の花器官形成遺伝子の発現が有意に上昇していることを見出した。さらに、これらの遺伝子のエピゲノ
ム変化を解析し、芒形成に関与するエピゲノム制御因子の機能を明らかにしていく。

4. A nalysis of epigenome regulator involved in awn
formation in barley
In barley, the mutants which show short awn phenotype
were identified and one epigenome regulator have beenfound as a candidate gene responsible for the mutants.
RNA-seq analysis using WT and mutant awn shows upregulation of specific floral identity genes. Next, we will
analyze the epigenome change in the target genes to
elucidate the regulator y mechanism of awn formation
through the epigenome regulator.

５．低アポプラスチックバイパスフローイネの作出
イネにおいてアポプラスチックバイパスフローは、ナト
リウムイオンの主要な取込み経路であるとともに、カドミウムの侵入経路のひとつである。本年度は、日本晴 / カサラスの交配系統集団を用いて、日本晴よりも低いカサラスのバイパスフロー形質に関連する遺伝子座が、第 5 染色体に座乗していることを明らかにした。今後は交配後代を解析していく。

5. Development of a low apoplastic bypass flow in rice
Apoplastic bypass flow is the primar y pathway for
sodium ion entry and constitutes one of the mechanisms
for cadmium ion uptake in rice. This year, we analyzed
the bypass flow rate within the genetic population ofchromosome segment substitution lines, comprising
Nipponbare as the recurrent parent and Kasalath as
the donor parent. Our finding indicates that the lociresponsible for Kasalath’s low bypass flow rate are locatedon the 5 th chromosome of rice. We will subsequently
analyze the offspring generations to identify the specificgenes responsible for this trait.

2

環境機能分子開発グループ

Group of Functional Biomolecular Discovery

本グループでは、環境ストレスに対する植物の耐性獲得に関与する酵素、タンパク質、発現制御因子の機能について生化学的分子生物学的手法を用いて解析し、劣悪環境で生育可能な作物の開発を目指している。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。

Our group has elucidated the function of enzymes,
proteins, and gene regulation factors associated withthe stress tolerance of plant cells using biochemical andmolecular biological techniques, and their application
to development of stress-tolerant plants. Our mainachievements in 2023 are described below.

１．イネ Nudix hydrolase 遺伝子の環境ストレス応答と機能解析
Nudix hydrolase（NUDX） は 8-oxo（d）GTP を 加 水 分
解して細胞内の酸化ヌクレオチドのレベルを低下させる。
ROS によって生成される 8-oxo（d）GTP は DNA/RNA に取り込まれアデニンと誤って対合し複製エラーや転写エラーを引き起こす。そこで UV-C 照射下で発現量が 15 倍に増加するイネ OsNUDX2 遺伝子を同定した。776 アミノ酸残基をコードする OsNUDX2 遺伝子の ORF 領域を大腸菌で発現し 100kDa のタンパク質を精製した。組換えタンパク質はシロイヌナズナ AtNUDX1 と同様に DMAPPと IPP に加え 8-oxo-dGTP を加水分解した。OsNUDX2 のアミノ酸配列は AtNUDX1 と 18% の相同性を示し、8-oxodGTP および ApnA を加水分解するオオムギ HvNUDX12と 14% の 相 同 性 を 示 し た。8-oxo-GTP の mRNA へ の組 み 込 み に よ り 引 き 起 こ さ れ る lacZ ア ン バ ー 変 異 は、
OsNUDX2 を mutT 欠損大腸菌細胞で発現させると大きく阻止された。これらの結果、植物の 8-oxo-dGTP 加水分解
NUDX と OsNUDX2 の間で異なる基質特異性と相同性があり、OsNUDX2 は酸化ヌクレオチドを除去することにより UV ストレスを軽減することが示唆された。

1.	Environmental stress response and functional analysis ofrice nudix hydrolase gene
Nudix hydrolase (NUDX) hydrolyzes 8-oxo-(d)GTP
to reduce the levels of oxidized nucleotides in the cells.
8-oxo-(d)GTP produced by ROS is incorporated into DNA/RNA and mispaired with adenine, causing replicational
and transcriptional errors. Here, we identified a rice
OsNUDX2, whose expression level was increased 15fold under UV-C irradiation. The open reading frame of
the OsNUDX2, which encodes 776 amino acid residues,
was cloned into E. coli cells to produce the protein of 100
kDa. The recombinant protein hydrolyzed 8-oxo-dGTP, in
addition to DMAPP and IPP, as did Arabidopsis AtNUDX1;
whereas the amino acid sequence of OsNUDX2 had 18%
identity with AtNUDX1. OsNUDX2 had 14% identity withbarley HvNUDX12, which hydrolyzes 8-oxo-dGTP and
ApnA. Suppression of the lacZ amber mutation caused by
the incorporation of 8-oxo-GTP into mRNA was prevented
to a significant degree when the OsNUDX2 was expressedin mutT-deficient E. coli cells. These results suggest thatthe different substrate specificity and identity among plant8-oxo-dGTP-hydrolyzing NUDXs and OsNUDX2 reduces
UV stress by sanitizing the oxidized nucleotides.

２．MutMap 法を用いたコムギの種子休眠性低下突然変異
RSD32 の同定
コムギ栽培に甚大な経済的損失を引き起こす穂発芽の 主 要 な 制 御 因 子 は 種 子 休 眠 性 で あ る。Reduced Seed
Dormancy 32（RSD32）は穂発芽耐性品種である普通系コ
ムギ農林 61 号より作成された種子休眠性低下突然変異系
統で、種子特異的に発現する単因子劣性の変異である。本
研究では MutMap 法による RSD32 の同定を試みた。変異
原処理により作出された系統には多数の変異が挿入される。MutMap 法とはこれら多数の変異と突然変異形質の連鎖解析を行い、突然変異形質の原因遺伝子を迅速に同定する技術である。まず、原品種である農林 61 号と RSD32 を交配し、F2 集団を作成した。F2 集団より変異型（低休眠性）
を示す 20 個体を選抜し、そのゲノム DNA を均等に混合し、次世代シークエンサーにより塩基配列を決定した。得られたリードの配列を農林 61 号の基準配列にアライメントし、
SNP-index を計算した。SNP-index とは、アライメントされたリード全体のうち、基準配列と異なる塩基を持つリードの割合である。変異形質を示す F2 個体では、すべての個体が変異の原因 SNP をホモ接合で持っていることから、バルクした DNA では SNP-index は１となる。一方で、変異形質と無関係の SNP はランダムに分離することから 0.5になる。MutMap 解析の結果、多数の SNP が検出されたが、SNP-index が 1 になる領域は 3A 染色体短腕末端部だけであった。

2. Identification of wheat mutant RSD32 with reduced seed
dormancy by MutMap
Seed dormancy, a major factor regulating pre-har vest
sprouting, can severely hinder wheat cultivation. Reduced
Seed Dormancy 32 (RSD32), a wheat mutant with reduced
seed dormancy, is derived from the pre-harvest sprouting
tolerant cultivar, Norin61. RSD32 is regulated by a single
recessive gene and mutant phenotype expressed in aseed-specific manner. In this study, we examined theidentification of RSD32 by MutMap method. Mutagen
treatment induces numerous mutations (SNP and indel)
throughout the entire genome. MutMap method proves tobe a valuable technique for efficiently identifying the causal
genes of mutation, conducting linkage analysis between
mutations and mutant phenotypes. Initially, Norin61 and
RSD32 were crossed to produce an F2 population. Twenty
F2 plants representing the mutant phenotype were selected.
The genomic DNA of these F2 plants was equally mixed(bulked DNA) and sequenced using NGS. The resulting
reads were aligned to genome sequence of Norin61 as areference, and the SNP-index was calculated. SNP-index
indicates the ratio of reads with different nucleotides fromthe reference sequence to all aligned reads. Given that all
selected 20 F2 plants with the mutant phenotype possess
homozygous alleles for the causal SNP responsible for the
mutation, the bulked DNA exhibited an SNP-index equal to
1. In contrast, SNPs independent of the mutant phenotype
were randomly segregated, resulting in an SNP-index
close to 0.5. Although numerous SNPs were detected inbulked DNA, the region with an SNP-index equal to 1 was
confined to the terminal of chromosome 3A.

3土壌環境ストレスユニット
植物ストレス学グループ(Soil Stress Unit)
Group of Plant Stress Physiology

本グループでは植物の必須元素、有用元素及び有害元素の吸収・集積機構、ミネラルストレスに対する植物の応答
反応や耐性機構について個体レベルから遺伝子レベルまでの研究を行っている。今年度の主な研究成果は以下の通りである。

Our group has been analyzing the mechanisms of
uptake and accumulation of essential, beneficial andtoxic minerals, and the mechanisms of the response andtolerance of plants to mineral stresses at different levels
from intact plants to genes. Our main achievements in 2023
are described below.

１．イネのケイ素蓄積に関与する輸送体遺伝子の同定
イネを含む多くの植物は、ケイ素を特定の組織に積極的に蓄積することで、さまざまなストレスから身を守っている。我々は、イネの特定の細胞へのケイ素の蓄積に必要な輸送体タンパク質 SIET4（Silicon Efflux Transporter 4）を同定し、イネの正常な生育には適切なケイ素の蓄積が不可欠であることを明らかにした。SIET4 遺伝子はすべての生育期間を通じて恒常的に葉に高発現し、細胞膜タンパク質をコードする。また SIET4 タンパク質はケイ酸を排出する活性を持ち、ケイ素が蓄積する葉の表皮細胞とケイ化
機動細胞の隣の細胞に局在する。すなわち SIET4 は葉の表面やケイ化機動細胞へとケイ素を排出する役割を持つ。
SIET4 遺伝子を破壊したイネは、ケイ素のない水耕液で栽培した場合、野生型イネと変わらない生育を示したが、土耕栽培やケイ素を添加した水耕液で栽培した場合は、生育が著しく抑制され、最後は死に至った。通常はケイ素が蓄積しない葉の内部の葉肉細胞にケイ素が蓄積してしまい、
さまざまなストレス応答に関わる数百の遺伝子の発現が誘導され、この異常で不必要なストレス応答によって生育が著しく抑制された。

1. Identification of a gene involved in proper accumulationof silicon in rice
Silicon protects the rice plant from various stresses
through accumulation in specific tissues. We identified agene (SIET4) required for the cell-specific deposition of Si
in rice, and demonstrated that proper accumulation of Si isessential for normal growth of rice. SIET4 is constitutively
expressed in leaves throughout the growth period. It
encodes a plasma membrane-localized transporter of Si,
which is polarly localized at the distal side of epidermal
cells and cells surrounding the bulliform cells (motor
cells) of the leaf blade, where Si is deposited. Knockoutof SIET4 led to the death of rice grown in soil or nutrient
solution containing Si, but not in that without Si supplied.
Further analysis showed that knockout of SIET4 induced
abnormal Si deposition in the mesophyll cells, resulting in
induction of hundreds of genes involved in various biotic/
abiotic stress responses.
2. Mechanism controlling polar localization of Lsi1
High silicon (Si) accumulation is important for stable
and high yields in rice. Si uptake is mediated by Lsi1,
which is polarly localized at the distal side of cells of theroot exodermis and endodermis. We identified aminoacid residues critical for the polar localization of Lsi1.
Detailed site-directed mutagenesis analysis showed that
Ile18 at the N-terminal region and Ile285 at the C-terminal
region were essential for the polar localization of Lsi1.
Moreover, a cluster of positively charged residues at the
C-terminal region is also required for polar localization.
Phosphor ylation and L ys modifications of Lsi1 areunlikely to be involved in its polar localization. We also
demonstrated that the polar localization of Lsi1 is required
for efficient uptake of Si.

２．ケイ素輸送体 Lsi1 の極性局在機構の解析
ケイ素の高集積はイネの安定多収に欠かせない。イネのケイ素吸収には根の外皮と内皮で遠心側に偏在する輸送
体 Lsi1 が関与する。我々はこの極性局在に必要なアミノ酸残基を同定した。種々の欠失や部分置換を加えた変異型
Lsi1 を lsi1 変異体に導入し、得られた形質転換イネを用いた局在解析から、N 末端の 18 番と C 末端の 285 番のイソ
ロイシン残基と C 末端の正電荷を持つアミノ酸のクラス
ターが Lsi1 の偏在に必要であることを突き止めた。また
極性を持たない Lsi1 を導入したイネはケイ酸吸収能が大きく低下したことから、Lsi1 の極性局在が効率的なケイ酸吸収に必要であることを証明した。さらにリン酸化やリジン残基の修飾は Lsi1 の極性局在に関与しないことを示した。

3. I dentification of a transporter involved in local distributionof manganeseAfter taken up by the roots, manganese (Mn) is delivered
to dif ferent organs and tissues for its physiological
functions. We found that Nramp5, a Mn transporter forroot Mn uptake is also involved in the local distribution of
Mn to the leaf sheath in rice. Nramp5 is polarly localized
at the parenchyma cells of the vascular bundles of theleaf sheath. Knockout of this gene resulted in decreased
distribution of Mn to the leaf sheath, but increased
distribution to the leaf blade. As a result, the growth of theleaf sheath was inhibited in the mutants irrespective of
the Mn concentration in the nutrient solution. Our results
indicate that OsNrtamp5 is required for local distributionof Mn to the leaf sheath for its growth.

３．イネ葉鞘へのマンガン分配に関与する輸送体 Nramp5の同定
根によって吸収されたマンガンは各器官・組織へ分配する必要があるが、イネの Nramp5 が根のマンガン吸収だけ
で無く、葉鞘へのマンガン分配に関与していることを突き止めた。Nramp5 は葉鞘の維管束柔細胞の導管側に極性を持って偏在し、導管からマンガンを運び出す役割をしている。この遺伝子を破壊すると、葉鞘へのマンガンの分配が減少し、その結果葉身へのマンガンの分配が増加した。また変異体の葉鞘の成長が培養液中のマンガン濃度に関わらず阻害された。

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Group of Plant Molecular Physiology

植物分子生理学グループ
本グループでは環境ストレスに対する植物の応答と適応機構を分子、細胞、生理学的に研究している。今年度はアクアポリンの輸送基質に関する研究、水輸送活性の異なる液胞膜型のアクアポリン、気孔を構成する孔辺細胞の「気孔タイプ ALMT」のリンゴ酸輸送の機能と構造についての研究成果を報告する。

Our research has been focusing on the molecular,
cellular and physiological response and adaptation
mechanisms of plants under environmental stresses.
We repor t substrates of aquaporins, water conducting
aquaporins in the tonoplast. We also report the relationshipof transport function and structure regarding guard-celltype ALMT family malate transporters.

１．アクアポリンの輸送基質
アクアポリンは水輸送体として知られているが、アクア
ポリン分子種の中には水以外の低分子を輸送するものも存在する。シグナル伝達物質としての H2O2 を輸送するア
クアポリン HvPIP2;5 を私たちは酵母実験系を使って以前に同定しているが、今年度は蛍光試薬によって植物根が放出する H2O2 を高感度で検出する実験系の構築を進めた。
また CO2 透過性アクアポリンについては森准教授らとともに研究している。さらに Na+ や K+ を輸送するアクアポ
リンの分子機構に関してアクアポリン四量体に存在する
未知のイオン透過経路の解明を進めている。

1. Transport substrates of aquaporins
Although aquaporins are known as water transporters,some aquaporin molecules transpor t small moleculeso t h e r t h a n w a t e r. We h a v e p r e v i o u s l y i d e n t i f i e daquaporin HvPIP2;5, which transpor ts H 2 O 2 , using ayeast experimental system. This year we constructed anexperimental system to detect H2O2 released from plantroots with high sensitivity using fluorescent reagents.
We have also been studying CO2-permeable aquaporins
together with Associate Professor Mori and his colleagues.
We have examined the molecular mechanism of apreviously unknown ion-transpor ting pathway in thetetramer of aquaporins that transport Na+ and K+.

２．アクアポリンの構造と機能解析
種子登熟と乾燥に関与するシロイヌナズナの液胞膜型
アクアポリン AtTIP3 の解析を行った。AtTIP3 サブファミ
リーには 2 種類のホモログ AtTIP3;1 と AtTIP3;2 が存在しており、共に発達後期の種子で発現するが、それぞれ水の透過性が異なることが明らかになった。これらの AtTIP3;1と AtTIP3;2 の配列を置換したキメラタンパク質の解析か
ら、シロイヌナズナ AtTIP3;1 は、54 番目のアミノ酸をヒスチジンからスレオニンに、142-143 番目のアミノ酸をア
ルギニン - ロイシンからヒスチジン - バリンに置換することで、AtTIP3;2 と同等の水輸送活性を示すことが明らかとなった。また、少なくともこれらの領域は、リン酸化修
飾や酸性条件による AtTIP3s の活性化には関与しないことを確認した。このことから、AtTIP3 ファミリーの水輸送
活性は、これらの Loop 領域の立体構造の変化により調節されていると推測された。

2. Structural and functional analysis of aquaporins
We analyzed Arabidopsis tonoplast intrinsic proteins 3,
AtTIP3s, which participated in ripening and desiccation ofseeds. There were two homologs, AtTIP3;1 and AtTIP3;2,
in the AtTIP3 subfamily, and they were expressed in thelate stage of seed development. However, in Xenopus
oocytes, they showed clearly different water permeabilities:
AtTIP3;2 could transport water but AtTIP3;1 could not.
Analysis of chimeric proteins based on the sequence
information of AtTIP3;1 and AtTIP3;2 revealed that mutated
AtTIP3;1 replaced 54 th , 142 nd and 143 rd amino acids,
histidine, arginine and leucine with threonine, histidine
and valine could transport water at same level as that of
AtTIP3;2. We also confirmed that these regions were not
involved in the activation of AtTIP3s by phosphorylationor under acidic conditions. This suggests that the watertransport activity of the AtTIP3 family is controlled by
conformational changes in these Loop regions.

３．気孔タイプ ALMT 活性化の相互作用因子
気孔タイプ ALMT のシロイヌナズナ AtALMT12 とトマ
ト SlALMT11 について、乾燥時に上昇するアブシジン酸（ABA）に応答した気孔閉口応答が異なったため、植物間で ABA シグナル伝達因子に違いがあると推測された。そのメカニズム解明のため、気孔タイプ ALMT と相互作用する因子の探索を行った。最初に、プロテインキナーゼのOpen Stomata 1（OST1）を AtALMT12 とアフリカツメガ
エル卵母細胞に共発現させ、電気生理学的にリンゴ酸放出
活性を測定した。しかし、OST1 それ自体は AtALMT12 の活性化を示さず、それぞれにスプリット蛍光タンパク質を融合して相互作用を促すことで、AtALMT12 のリンゴ酸放出の活性化が確認できた。従って、AtALMT12 の活性化には OST1 の強い相互作用が必要であると示唆された。現在、他の因子についても解析を進めている。

3. Interactive factor activating of guard-cell-type ALMT
proteins
Guard-cell-type ALMT proteins, AtALMT1 of Arabidopsis
and SlALMT11 of tomato showed differences in stomatalclosure in response to abscisic acid (ABA). To reveal themechanisms, we explored the factor(s) required to accept
ABA signaling by the guard-cell-type ALMT proteins.
We examined the role of a SnRK2 protein kinase, OpenStomata 1 (OST1), by co-expression with AtALMT12
in Xenopus oocytes and measured the malate transport
function by electrophysiological measurements. However,malate ef flux through AtALMT12 did not seem to beenhanced by co-expression of native protein of OST1. In
contrast, malate efflux was activated by co-expression ofa split fluorescent protein fused to AtALMT12 and OST1,
which may enhance the interaction between them. Thesefindings suggest that AtALMT12 activation requires
imposed linkage of the OST1 protein kinase. We also
examined another possible factor for its ability to enhance
guard-cell-type ALMT proteins.

5環境生物ストレスユニット
植物・微生物相互作用グループ(Biotic Stress Unit)
Group of Plant-Microbe Interactions

本グループでは、ウイルスを主役として宿主へ有害なあるいは有益な影響を及ぼすいくつかの系を解析すること
で、植物・微生物間相互作用の分子、細胞、個体レベルでの理解を目指している。以下に本年の成果を記す。

Plant growth is influenced by various vir uses andmicroorganisms. Our group explores, at molecular, cellularand individual levels, the plant/microbe interplays ofseveral selected pathosystems in which viruses as main
players exert beneficial or harmful effects on plants.

１．キャプシドレス 1 本鎖 RNA ウイルス YkV3・2 本鎖RNA ウイルス RnMBV3 が織りなす宿借性／宿主性の解析
宿借性／宿主性は、最近発見された新規ウイルスライフ
スタイルの一つである。宿借性はキャプシドレスプラス 1
本鎖 RNA ウイルス（ヤドカリウイルス）が無関係のキャ
プシド型 2 本鎖（ds）RNA ウイルス（パートナーウイルス）のキャプシドをハイジャックし、複製場所として利用する性質をさし、宿主性はヤドカリウイルスにキャプシドを提供する性質である。ヤドカリウイルスは複製サイクルにパートナーウイルスを必要とするが、パートナー dsRNA
ウイルスはヤドカリウイルスを必要としない。このウイルス間相互作用（宿借性／宿主性）は一部の系が証明されているに過ぎない。本研究では、ヤドカリウイルス YkV3 とヤドヌシウイルス RnMBV3 の相互作用を自然宿主（白紋羽病菌）とモデル糸状菌宿主（クリ胴枯病菌）系で解析した。YkV3 ゲノムは約 4.3kb の RNA 合成酵素と 2A 様プロ
テアーゼドメインをコードする単一の ORF を持つ。逆遺伝学を用いた白紋羽病菌宿主での結果から、1）5ʼ 末端の塩基を U から C に置換しても YkV3 複製能を保持すること、2）2A 様プロテアーゼドメインで切断される下流のタンパク質は複製に必須であること、を証明した。白紋羽病菌から YkV3 ／ RnMBV3 粒子画分を得、クリ胴枯病菌 2系統（野生型株と抗ウイルス RNA サイレンシング欠損株）に導入し、両系統でのウイルス蓄積量を比較した。その結果、YkV3、RnMBV3 はクリ胴枯病菌中で抗ウイルス RNA
サイレンシングに対し、感受性であることが示された。以上の結果は、宿借性／宿主性を解析するための遺伝学的に改変可能な宿主・ウイルスを開発したことになる。

1. Exploration of the yadokari / yadonushi nature of YkV3
and RnMBV3 in the original host and a model filamentous
fungusThe yadokari / yadonushi nature is a recently discovered
virus lifestyle; “yadokari” refers to the ability of capsidless
positive-sense (+) RNA viruses (yadokariviruses) to utilize
the capsids of phylogenetically distant double-stranded
RNA (dsRNA) viruses possibly as the replication site,while “yadonushi” refers to the ability of dsRNA viruses
to provide capsids to yadokariviruses. This virus–virusinteraction, however, has been only studied with limited
pathosystems. Here, we established a new study modelwith a capsidless (+) RNA yadokarivirus YkV3 (family
Yadokariviridae) and its capsid donor RnMBV3 (family
Megabirnaviridae) in the original host fungus Rosellinia
necatrix and a model filamentous fungal host Cryphonectria
parasitica. YkV3 has a simple genome structure with one
open reading frame of 4305 nucleotides encoding a single
polyprotein with an RNA-dependent RNA polymerase anda 2A-like self-cleavage peptide domain. Reverse genetics ofYkV3 in R. necatrix showed that YkV3 tolerates a nucleotide
substitution in the extreme 5′-terminus. The insertion of
two termination codons immediately downstream of the
2A-like cleavage site abolished YkV3 viability, suggesting
the importance of the C-terminal portion of the polyproteinof unknown function. Transfection of RnMBV3 andYkV3 into an RNA silencing-deficient mutant ∆dcl2 of C.
parasitica showed the replication competency of bothviruses. Comparison between the wild-type and ∆dcl2
strains of C. parasitica in virus accumulation suggested
that RnMBV3 and YkV3 are susceptible to RNA silencing
in C. parasitica. Taken together, we have established aplatform to fur ther explore the yadokari / yadonushi
nature using genetically manipulable host fungal and virus
strains.

２．植物と糸状菌間の生物界を跨ぐウイルス感染
植物と糸状菌類（カビ）は遺伝的・構造的に大きな相違が存在することから、この 2 つの生物界間でのウイルス往来は妨げられると考えられてきた。しかし、植物や糸状菌
ウイルス（菌類ウイルス）の系統学的解析に加え、自然界
で植物ウイルスが糸状菌に感染している事実から、植物と菌類間でウイルスの生物界を跨ぐ水平伝搬（感染）が起こ
りうることが理解されつつある。さらに、人工的なウイル
ス接種実験でも、いくつかの植物ウイルスが糸状菌類で複製する能力を有すること、またその逆の能力が菌類ウイルスでも証明されている。そこで、この新しいウイルス学的なトピックに注目し、植物と糸状菌間の生物界を跨ぐウイルス感染に関連する最新の知見を網羅することで、新たに総説として取りまとめた。そこでは、特にウイルスの拡散、出現、病原性、進化、さらには宿主である植物と菌類の相互作用にこの生物界を跨ぐウイルス感染がどのように関与しているかを論じた。また、自然界における植物と菌類
間ウイルス伝播の想定されるメカニズムや、病原性糸状菌の制御（ヴァイロコントロール）へ菌類ウイルスの新たな活用法開発へ向けた可能性についても議論を行った。

2. Cross-kingdom virus infections between plants and fungi
The genetic and structural differences between plants
and fungi (or fungal-like organisms) suggest that these
dif ferences may prevent vir us transmission between
the two kingdoms. However, recent evidence from virus
phylogenetic analyses and the obser vation of naturalvirus cross-infections indicate the occurrence of virustransmission between plants and plant-associated fungi.
Artificial virus inoculation experiments also demonstrate
the ability of several plant viruses to replicate in fungi andvice versa. We have attempted to summarize the current
knowledge on cross-kingdom virus infection between
plants and fungi and to discuss this emerging virological
topic. We have highlighted the importance of viral crossinfection (via horizontal virus transmission) in the spread,emergence and evolution of plant and fungal viruses andin promoting interactions between the two kingdoms. We
also discuss in detail the possible mechanisms of virustransmission between plants and fungi in nature and thedevelopment of strategies to control plant diseases using
fungal viruses as biocontrol agents.

6

Group of Plant-Insect Interactions

植物・昆虫間相互作用グループ
本グループでは植食性昆虫に対する防御機構の解析を、代表的な単子葉のモデル植物であるイネを用いて行っている。2023 年に行った主要な 2 課題を以下に記す。

We are studying mechanisms of plant defense against
herbivores using rice as an impor tant monocot model
plant. Two main topics investigated in 2023 are highlighted
below.

１．植食性昆虫に対するイネの防御機構におけるケイ素の幅広い役割
ミネラルは植物の成長に不可欠であるが、植物の防御にどのように寄与しているかは不明な点も多い。我々はこの数年間で、咀嚼性植食性昆虫に対するイネの防御の一つである物理的障壁の形成において、ケイ素（Si）が重要な役割を果たすことを明らかにしている。防御機構におけるケイ素の役割を十分に理解するために、我々はケイ素添加
時および欠乏時のイネを用いて、様々な要素の解析を行った。特に、イネがケイ素を介した防御を構築するのにどの程度の時間を要するのかを調べた。さらに、揮発性有機化
合物の放出に対してケイ素欠乏がおよぼす影響を解析した。揮発性有機化合物は害虫に対する天敵を誘引する重要な環境シグナルとして働くことが知られている。解析の結果、我々はケイ素が存在することにより揮発性有機化合物の放出が促進されることを見出した。この結果は、ケイ素
は植食性昆虫に対する防御機構を増強することを示唆している。また、メタボリックフィンガープリンティングを行うことで、我々は培養液中のケイ素の有無に関連する重要な代謝物シグネチャーを発見し、イネが代謝を最適に行うためにケイ素が必要であることが示唆された。同じこと
がストレス誘導性の防御関連代謝物にも当てはまり、一部の防御関連代謝物はケイ素により蓄積が促進された。全体
として、ケイ素はイネの防御機構と代謝系に多面的に影響しており、イネの成長や収量に関連したケイ素の役割を完全に理解するには、さらなる研究が必要である。

1. E xtended role of silicon in rice defense against
herbivores
Minerals are essential for plant growth but it is less
known how minerals contribute to plant defense. In thepast years, we established the importance of silicon (Si)in formation of mechanical barriers against chewing
herbivores in rice. In order to fully understand the role ofsilicon in defense, we conducted further studies on various
parameters in plants growing under Si-supplemented andSi-deprived conditions. Among others, we investigatedthe minimal time required for establishment of Simediated defense in rice. Furthermore, we investigated
the impact of Si deficiency on emissions of volatilecompounds from rice plants, which ser ve as importantenvironmental signals to attract natural enemies ofherbivores to plants. As a result, we found that Si presence
facilitates higher release of defense volatiles that is likely
to enhance the rice protection against herbivores. In
metabolomics fingerprints, we found many impor tantsignatures associated with the presence and absence of
Si in nutritional media, suggesting that rice plants needsilicon for their optimal metabolic performance. The same
applied to the accumulation of stress-induced defense
metabolites in rice, some of which have been promoted by
Si. Overall, Si shows pleiotropic effects on rice defense andmetabolism that warrants further investigations to assure
our full understanding of Si role in the improvement of rice
growth and yield performance.

２．ソルガムバイオリソースの開発
ソルガム（Sorghum bicolor）は重要な作物であるが、植食性昆虫による大きな被害を受けている。そこで我々は、
ヒエノアブラムシ（Melanaphis sacchari）などの吸汁性昆虫に対する抵抗性を向上させたソルガム系統の開発を目的とした。以前に我々は、サブサハラアフリカ在来種からアブラムシに高い抵抗性を示すソルガム遺伝資源を同定した。今年度は、アブラムシ抵抗性の分子解析が可能な
F5 世代までの組換え自殖系統（RILs）の構築を完了した。
このリソースは、アブラムシ抵抗性に関連する量的形質遺伝子座（QTL）の同定に向けて、2024 年に予備的な圃場
試験に用いる。

2. Development of sorghum bio-resources
Sorghum (Sorghum bicolor) is an important crop that,
however, significantly suf fers from herbivore damage.
Therefore, we aim on development of sorghum lines
with improved resistance to sucking herbivores, such as
sugarcane aphids (Melanaphis sacchari). Previously, we
identified sorghum germplasm that is highly resistant
to aphids amongst landraces originating from the SubSaharan Africa. This year, we have completed theconstruction of recombinant inbred lines (RILs) up to F5
generation that are now ready for molecular analysis ofaphid resistance. This resource will be used in pilot fieldstudy in 2024 to identify the quantitative trait loci (QTLs)
associated with aphid resistance.

7

Plant Immune Design Group

植物免疫デザイングループ
我々の究極の目標は、生物的ストレスに対する抵抗性を向上させた新しい植物を設計することである。この目標を遂行するために、私たちは、植物と微生物の相互作用のメ
カニズムの解明を試みている。2023 年の主な成果は以下の通りである。

Our ultimate goal is to design new plants to cope withbiotic stresses and improve important agronomic traits.
To accomplish this goal, we have been trying to decipher
the mechanisms of plant-microbe interactions. Our mainachievements in 2023 are described below.

Immune response peptide 1 はイネ免疫における植物サイ
トカインとして機能する植物の内因性ペプチドは、発生、免疫、共生などの細胞機能を規定する重要な分子である。しかしながら、新奇内因性ペプチドを同定し、その機能を解明することは非常に困難である。パターン誘導性免疫では、細胞表面に局在するパターン認識受容体が病原体由来の病原体関連分子パターンを検知し、防御遺伝子発現、MAPK 活性化、ROS
産生などのさまざまな免疫応答を誘導する。さらに、パターン認識受容体は、植物サイトカインと呼ばれる内因性ペプチドの発現も誘導する。植物サイトカインは、前駆体ペプチドがプロセッシングを受けると成熟型になりア
ポプラストに分泌され、受容体を介してパターン誘導性免疫を増幅させる。我々の知る限りでは、イネにおいては、
1 種類の植物サイトカインファミリーに関する報告しかな
く、イネサイトカインの下流のシグナル伝達に関する研究は限られていた。
最近、我々は、プロテオームとトランスクリプトームを組み合わせた解析法を開発し、イネ免疫に関与する植物
サイトカインを同定する手法として用いた（Wang et al.,Plant Biotech J 2020）。我々は、いもち病菌の細胞壁の構成成分であるキチンにより誘導される分泌ペプチドを同定し、これを Immune response peptide 1（IRP1）と名付けた（Wang et al., J Exp Bot. 2023）。本研究により、IRP1のイネ免疫における機能をさらに明らかにし、IRP1 がキチンシグナルの下流で植物サイトカインとして機能することを明らかにした。IRP1 は、MAPK 活性化と WRKY 転
写因子の発現を調節し、イネ免疫を強化していた。IRP1
はイネいもち病菌に対する抵抗性に関与することが報告された最初の植物サイトカインである。本研究は、植物がサイトカインを介して免疫を制御するメカニズムの理解に貢献した。

The secreted immune response peptide 1 functions as aphytocytokine in rice immunity
Plant endogenous peptides are key components
to coordinate and specify cellular functions such as
development, immunity, and symbiosis. Identifying novel
hormone-like peptide families and, moreover, deciphering
their functions are challenging goals. In pattern-triggered
immunity (PTI), sur face-localized pattern recognition
receptors (PRRs) sense microbe-associated molecularpatterns (MAMPs) and trigger various immune responses
such as defense gene expression, MAPK activation,
and ROS production. In addition, PRRs also induce
several endogenous peptides termed phytocytokines.
Phytocytokines are processed from larger precursors
and secreted into the apoplast to amplify PTI responses
through their receptors. A few peptides have beencharacterized as phytocytokines in plants, but to ourknowledge, there is only one report on phytocytokine inrice. Thus, our understanding of the signaling downstreamof the phytocytokines is limited.
We have ver y r ecently developed a pipeline bycombining proteome and transcriptome analyses as an
approach to isolating hormone-like peptides involved
in rice immunity (Wang et al., Plant Biotech J 2020). We
successfully identified one novel small secreted protein
induced by the fungal PAMP chitin and named it an
immune response peptide (IRP). In this project, we further
clarified its functions in rice immunity and revealed that
IRP ser ves as a phytocytokine, working downstream ofchitin signaling. IRP evidently regulates MAPK activationand the expression of WRKY transcription factors,
resulting in enhanced rice immunity. IRP is the first
peptide phytocytokine found to be involved in resistanceto rice blast fungus. Our study broadens and deepens ourunderstanding of how plants control immunity throughendogenous peptides.

8植物環境微生物学グループ

Group of Plant Environmental Microbiology

１．Methylobacterium 属細菌のランタノイドに応答したメ
タノール代謝とメタノールへの走化性
Methylobacterium 属細菌は植物葉上の主要な共生細菌であり、植物が放出するメタノールを利用して生育し、植物の生育を促進する。本属細菌はカルシウム（Ca）依存とランタノイド（Ln）依存の二つのメタノール脱水素酵素（MDH）を持っている。M. aquaticum 22A 株はメタノー
ルに走化性を示す。細菌の走化性には Methyl-Accepting
Chemotaxis Protein（MCP） が セ ン サ ー と し て 働 く。M.
aquaticum 22A 株ゲノムには 52 個もの MCP 遺伝子が存在する。これまでメタノール走化性に関わる MCP は全く同定されていなかった。メタノール生育時の遺伝子発現プロ
ファイルから、メタノールで誘導される MCP 遺伝子を順次欠失させると 3 つの遺伝子が関わることが分かった。また二つの MDH との関わり、MCP タンパク質の局在解析などから、一つは細胞内でホルムアルデヒドの感知に関わるセンサー、一つは Ln 存在下で誘導され Ln 依存 MDHの活性に依存するセンサー、そしてもう一つは Ln 非存在
下で Ca 依存 MDH の活性に依存するセンサーであることが分かった。さらに 3 つの MCP 遺伝子欠失株は植物の根に対する走化性を失ったことから、植物が放出するメ
タノールとメタノールへの走化性が両者の共生開始に関わっていることが分かった。

1. L anthanide-dependent methanol metabolism andchemotaxis for methanol in Methylobacterium species
Methylobacterium species, ubiquitous bacteria livingon the plant sur face can utilize the methanol emitted
from plants and promote plant growth. Generally,
Methylobacterium species have two dif ferent methanol
dehydrogenases (MDHs), which are either calcium (Ca)dependent or lanthanide (Ln)-dependent. M. aquaticum
strain 22A exhibits chemotaxis for methanol. MethylAccepting Chemotaxis Protein (MCP) plays a crucialrole in bacterial chemotaxis. There are 52 MCP genes
encoded in the genome of strain 22A. There have been noreports on methanol chemotaxis sensors. We identified
three MCPs that par ticipate in methanol chemotaxis,
by phenotyping MCP gene mutants. Through protein
localization analysis combined with MDH gene mutations,
we found a sensor for formaldehyde in the cell, a sensor
associated with Ln-dependent MDH, and a sensor
associated with Ca-dependent MDH. In addition, the triple
gene mutant lost taxis toward the plant root, indicating thatmethanol emitted from plants and methanol chemotaxis
mediates the initiation of plant-Methylobacterium symbiosis.
2. Study on the bacterivor y activity of a bloom-forming
phytoplankton, Heterosigma akashiwo
A bloom-forming phytoplankton H. akashiwo is known
to conduct bacterivory, while its physiological importancehas not been studied in detail. We found that H. akashiwo
under a phosphate-depleted condition phagocytosed
various species of bacteria and propagated to an extent
depending on the prey species. Particularly, a bacterial
strain that accumulated polyphosphate at a high levelpromoted the growth of H. akashiwo, suggesting that thephytoplankton can utilize bacterial polyphosphate as aphosphorous source. Eutrophication, i.e., accumulation ofdissolved nutritional source, has been regarded to be themain cause of algal bloom. Our findings suggest that the
microbiome structure in the area has an important role inH. akashiwo bloom occurrence.

２．赤潮原因藻ヘテロシグマの細菌貪食に関する研究
ヘテロシグマ（学名 Heterosigma akashiwo）は、光合成を行う微細藻であり、時に爆発的に増殖して赤潮を引き起こす。ヘテロシグマが、細菌を貪食するという報告が過去に散見されるが、その生理的な重要性については不明であった。本グループは、リン酸飢餓状態にあるヘテロシグ
マが多様な細菌を貪食し、それを栄養源として増殖すること、細菌種によって，増殖促進能に顕著な違いがあること、
特に無機リン酸のポリマーであるポリリン酸を蓄積する
細菌が、顕著なヘテロシグマ増殖能を有することを見出した。以上より、ヘテロシグマが、溶存栄養素の摂取に加えて、細菌の貪食により増殖に必要な栄養を摂取する能力を保つこと、特に細菌が蓄積するポリリン酸をリン源として活用する能力があることが明らかになった。赤潮の原因としては、富栄養化、つまり海水中の溶存栄養素濃度の上昇が重要な要素と認識されてきたが、本研究は、水域に生存する細菌種がヘテロシグマ赤潮の発生しやすさに影響を与え得ることを示唆する。

9

遺伝資源ユニット
ゲノム多様性グループ(Genetic Resources Unit)
Group of Genome Diversity

ゲノム多様性グループでは、実験系統を含む栽培オオム
ギ約 14,000 系統と野生オオムギ約 900 系統を保有し、（1）種子の増殖、収集、保存および種子配布等の系統保存事業、（2）遺伝的多様性の評価ならびに特性形質のデータベース
化、（3）ゲノム解析の諸手法を用いたオオムギ遺伝資源の機能開発に関する研究に取り組んでいる。

Our group has preser ved ca. 14,000 accessions ofcultivated barley including experimental lines and ca.
900 accessions of wild relatives. The objectives of ourresearch are 1) collection, multiplication, preservation anddistribution of barley germplasm, 2) evaluation of genetic
diversity and development of the database of genotype
and phenotype data, and 3) application of barley genetic
resources to breeding and basic research by the genome
analysis using new technologies, e.g., NGS, microarraygenotyping and genetic transformation.

１．オオムギ遺伝資源の系統保存事業
当グループは、ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）に参画し、オオムギ種子ならびにオオムギゲノ
ムリソースの配布事業を担っている。
（a）系統種子の配布と保存
当事業では、在来系統、実験系統および野生系統を含むオオムギ種子の増殖ならびに配布を行っている。ノルウェー・スバルバル世界種子貯蔵庫へのオオムギ種子預託も実施している。これらのオオムギ種子は、未来の食糧確保のために必要な品種改良の基礎となる重要な遺伝資源であり、重複保存によって長期的な食糧安全を保証することに繋がる。
（b）ゲノムリソースの配布保有するゲノムリソースは，国内外の研究者のリクエス
トに応じて分譲している。これらのリソースは、BAC ラ
イブラリーの全クローンセット、選抜用プール DNA、高密度フィルターならびに完全長 cDNA クローン、保存系
統のゲノム DNA 等が含まれている。

1. Preservation and distribution of barley genetic resources
Our group has been taking par t in the National
BioResource Project (NBRP) and has been preserving anddistributing the barley seeds and DNA clones.
(a) Preservation and distribution of barley germplasms
We ar e multiplying and distributing the barley
germplasms including landraces, experimental lines,
and wild relatives. We are depositing barley seeds in the
Svalbard Global Seed Vault in Spitsbergen, Norway. Thesebarley seeds are important genetic resources to be utilized
as barley breeding materials for food security, and storageof duplicate samples is important.
(b) Distribution of barley genome resources
We are distributing the barley genome resources todomestic and international institutions and researchers
upon request. These resources include the complete BAC
clone sets, pooled BAC DNA for clone screening, its highdensity replica membranes, full-length cDNA clones andgenomic DNA samples from the barley accessions.

２．オオムギ遺伝資源の評価
当グループでは、オオムギ遺伝資源を用いた有用形質の原因遺伝子単離と解析を進めている。
（a）エチオピア南部の在来品種の収集・評価
エチオピア南部グマ地区のオオムギ在来品種を収集し、その遺伝的多様性と集団構造をゲノム科学の手法を用いて解明し、現地向けの育種と保全にむけて活用する基盤を構築した。
（b）亜熱帯環境におけるオオムギ栽培特性の評価
地球温暖化に先制的に対応する育種を進めるために、亜熱帯気候の圃場を地球温暖化環境に見立てて、オオムギの温暖化環境下での安定生産に必要な遺伝構造の解明に取り組んでおり、現代品種の収量性を改善する QTL を見出した。

2. Evaluation of barley genetic resources
Our group is working on the isolation and analysis ofgenes responsible for useful traits using barley genetic
resources.
(a) C ollection and evaluation of landrace in southern
Ethiopia
The group has collected and characterized the genetic
diversity and population structure of the barley landracesin the Guma distinct of southern Ethiopia using genomic
technology, and has established a foundation to be used forbreeding and conservation of local varieties.
(b) E valuation of barley cultivation characteristics insubtropical environments
To promote breeding that preemptively responds toglobal warming, we have been working to elucidate thegenetic structure required for stable production of barley
under a warming environment by simulating a subtropicalclimate field as a global warming environment, and havefound QTL that improves the yield potential of modern
varieties.

３．オオムギの形質転換とゲノム編集
当グループでは、オオムギの形質転換効率に関わる遺伝子の探索やゲノム編集効率の改善に取り組んでいる。オオ
ムギの CRISPR/Cas9 法によるゲノム編集については、複数のガイド RNA を発現するマルチターゲットシステムの構築により、複数遺伝子への同時変異導入が可能となり、その変異導入効率も向上した。

3. Transformation and genome editing of barley
Our group is researching the genes involved intransformation ef ficiency and improving the ef ficiency
of genome editing in barley. The construction of a multitarget system that expresses multiple guide RNAs in the
CRISPR/Cas9 system for genome editing has enabledsimultaneous mutagenesis of multiple genes and improved
the mutagenesis efficiency in barley.

10Group of Wild Plant Science

野生植物グループ
本グループでは，地球上に植物の多様性が進化した仕組
みの理解を目指した研究を行っている。また，併せてこれまでに収集された野生植物の遺伝資源を保存している。今
年度の研究成果の一部は以下の通りである。

Our group has been investigating the mechanistic basis
for evolution of the diversity of plant species. In addition,
we are preser ving resources of wild plant seeds. The
followings are our main achievements during 2023.

１．緯度に応じて異なる環境に対する植物の適応機構に関する研究
日長や気温をはじめとする緯度に応じて変化する環境
は植物の生育に大きな影響を与える。こうした緯度に伴い変化する環境の違いに植物が適応する中で獲得した仕組みを明らかにすることを目指し，北極圏から温帯の高山帯にかけて広範囲の緯度に分布する周北極―高山植
物を材料に研究を進めている。これまでに 2 種の姉妹種（Cardamine nipponica-C. bellidifolia；アブラナ科）が温度に対する感受性の異なるフィトクロム（phyB）を持つことを明らかにしてきた。本年度は両種の PHYB（CnPHYB/CbPHYB）遺伝子を形質転換したシロイヌナズナを用い，
phyB の温度に対する感受性の違いが開花特性に影響するかを調べる栽培実験を行った。野外で想定される光条件（赤色光：遠赤色光≒１：１）で植物を育成する環境を整備し，様々な日長や温度における栽培実験を行った。その結果，単色光の LED を光源とした光条件では植物を正常に開花まで成長させることが困難であり，phyB 変異体における早咲きの表現型を明瞭に再現することができなかった。したがって，phyB 変異体の表現型を再現できる光条件（主に強度と比率）を検討することで CnphyB/
CbphyB における開花への影響を評価する実験を継続することが課題として挙げられた。

1. Study on mechanisms of adaptation to environments
varying along latitude
Adaptation to environments var ying along latitude
such as photoperiod and temperature are important for
regulating the plant’s life cycle and reproductive success.
To understand how plants adapt to different environments
along latitude, we are focusing on arctic-alpine plants,
whose distributions encompass high mountains intemperate regions and circumarctic region. We havepreviously reported that two sister species (Cardamine
nipponica-C. bellidifolia; Brassicaceae) have phyB withdifferent thermal stability (sensitivity). In this year, wehave attempted to evaluate effects of phyB variation on
flowering phenotypes by performing growth experiment oftransgenic Arabidopsis thaliana overexpressing PHYB of C.
nipponica-C. bellidifolia (CnPHYB/CbPHYB). Although wehave repeated multiple experiments including FR-rich light
conditions, we did not observe clear phenotypic difference
across A. thaliana including mutants deficient phyB
function. Thus, further careful experiments are required
for evaluating functional divergence between CnphyB andCbphyB.

２．岡山県の絶滅危惧種に関する調査研究
岡山県内に生育する絶滅危惧植物および準絶滅危惧植物のうち，岩角地，渓流帯などに生育する種を中心に約20 種を対象として，過去の標本や文献から既知の生育地を把握するとともに，集団の現状を調査した。これまでに調査できた集団の多くは現存が確認されたが，イヌイワデ
ンダ，マメヅタランなどの一部の集団は現存が確認できず，恐らく消滅したと考えられた。今回初めて具体的な生育状況が明らかになった集団も多い。また，調査対象種を含む下記の 23 種について，これまで知られていなかったと思われる 35 ヶ所の生育地を見いだし，集団規模や生育環境を記録した（括弧内は確認地点数）： アカハナワラビ（1），コケシノブ（2），フジシダ（1），オオフジシダ（1），シモツケヌリトラノオ（1），オクタマシダ（1），アオガネ
シダ（1），コガネシダ（1），メヤブソテツ（1），ウスバミ
ヤマノコギリシダ（1），シロヤマシダ（1），サクライカグ
マ（1），ミヤマクマワラビ（1），イワイタチシダ（3），イ
ワオモダカ（1），ヒメコマツ（1），マメヅタラン（2），ムギラン（5），ナツエビネ（2），カヤラン（3），ダイモンジ
ソウ（1），コギシギシ（1），ホンシャクナゲ（2）。これらの生育地については，過去の標本や文献等の記録の存在が確認できなかった。これまでの調査で得られた情報に基づ
き，県内における調査種の絶滅リスクを評価し直す必要がある。

2. F ield sur veys on endangered plants of Okayama
Prefecture
Focusing on 20 threatened species in Okayama
Prefecture growing on rocky places or riversides,
their known habitats based on previous records weresurveyed. Most of surveyed populations turned to be alive.
Some populations of a few species (Woodsia commixta,
Bulbophyllum drymoglossum, etc.) might have become
extinct. Some population sizes were revealed for the firsttime in this study. Besides, 35 populations of 23 threatened
species (Botr ychium nipponicum, Hymenophyllum
wrightii, Monachosorum maximowiczii, M. nipponicum,
Asplenium boreale, A. pseudowilfordii, A. wilfordii, Woodsia
macrochlaena, Cyr tomium car yotideum, Diplazium
deciduum, Di. hachijoense, Dr yopteris gymnophylla,
Dr. polylepis, Dr. saxifraga, Pyrrosia hastata, Pinus
parviflora var. parviflora, Bulbophyllum drymoglossum, B.
inconspicuum, Calanthe puberula var. reflexa, Thrixspermum
japonicum, Saxifraga for tunei, Rumex dentatus subsp.
klotzschianus, and Rhododendron japonoheptamerum var.
hondoense) were newly found. No record as specimen or
article was found about all these populations. It may benecessary to recategorize at least 10 of surveyed species in
the red list of Okayama.

本研究グループは，教員の転出により存続できなくなったため，10 月 1 日付で遺伝資源機能解析グループに統合された。

“Group of Wild Plant Science” was merged with “Groupof Genetic Resources and Functions” on October 1, 2023.

11ゲノム育種ユニット
遺伝資源機能解析グループ(Applied Genomics Unit)
Group of Genetic Resources and Functions

本グループではオオムギを中心とするイネ科作物の形
態、種子成分および土壌伝染性のウイルス病抵抗性を制御する有用遺伝子の特定と機能解析を行っている。本年度の主要成果は以下の通りである。
日本産の最近の主力高品質ビールオオムギ 2 品種、すな
わち ʻ スカイゴールデン ʼ と ʻ サチホゴールデン ʼ の開花
後 20 日目の内外穎を含む穎果から RNA を抽出し、RNAシーケンシング解析に供した。シーケンスは東京農業大学
生物資源ゲノム解析センター拠点共同研究の支援を受け実施した。配列データは金 俊植クロスアポイントメント
教員の解析支援を受け、オオムギゲノムシーケンスの標準
品種 ʻMorexʼ および ʻ はるな二条 ʼ のゲノム配列と比較しつつ分析を行った。両品種とも系譜解析から ʻ はるな二条 ʼと約 50% の類縁度を持つとみられるにも拘わらず、2,419
個のスカイゴールデン固有の一塩基多型（SNP）ならびに
3,058 個のサチホゴールデン固有の SNP がそれぞれ検出された。SNP の顕著なクラスターが 2 箇所検出された。すなわち、（1）オオムギ縞萎縮病抵抗性育種で非醸造・六条 中国在来系統 木石港 3 由来の resistance to yellow mosaic
5（rym5）を導入したことによる 3H 染色体端部付近の痕跡、（2）アントシアニンレス anthocyanin-less 2（ant2）をオランダの ʻCambrinusʼ から導入したことに伴う 2H 染色
体長腕の痕跡が、それぞれ検出された。両方の SNP クラ
スターとも ʻ スカイゴールデン ʼ だけで検出された。ʻ イ
シュクシラズ ʼ と ʻ ニシノチカラ ʼ の組換自殖系統 F11 世
代 221 系統を用い、もう一つのオオムギ縞萎縮病抵抗性遺伝子 rym3 を 5H 染色体基部の 0.4-cM の範囲にマップした。
この抵抗性遺伝子は非醸造・六条品種 ʻ はがねむぎ ʼ に由来するが、両品種には異なる経路で導入されたことが系譜上の品種の解析から判明した。ʻ スカイゴールデン ʼ の方が rym3 周辺の抵抗性遺伝子供与親 ʻ はがねむぎ ʼ 由来の残存染色体セグメントが大きかった。オオムギ縞萎縮病抵抗性育種の過程で、非醸造かつ六条の抵抗性遺伝子供与親からの残存セグメント内には醸造品質に悪影響を与える
遺伝子が少なからず含まれるものと予想される。そのため、マーカー選抜で rym3 遺伝子の近傍の希な組換を選抜し、連鎖染色体セグメントを削減することができれば、醸
造品質の一層の改良が期待される。

Our group has been identifying and characterizing
important genes controlling morphogenesis, seed chemicalcompositions and viral disease resistance, of cereal crops,
particularly barley (Hordeum vulgare L.). Our researchmainly focuses to reveal molecular mechanisms underlying
beneficial agricultural traits. Our main achievements in
2023 are described below.
Two moder n high-quality Japanese malting barleycultivars, ‘Sukai Golden’ and ‘Sachiho Golden’, were
subjected to RNA-sequencing of transcripts extracted from20-day-old immature seeds. Despite their close relation,
2,419 Sukai Golden-specific and 3,058 Sachiho Goldenspecific SNPs were detected in comparison to the genome
sequences of two reference cultivars: ‘Morex’ and ‘Haruna
Nijo’. Two single nucleotide polymorphism (SNP) clusters
respectively showing the incorporation of (1) the barleyyellow mosaic vir us (BaYMV) resistance gene r ym5
from six-row non-malting Chinese landrace Mokusekko
3 on the long arm of 3H, and (2) the anthocyanin-lessant2 gene from a two-row Dutch cultivar on the longarm of 2H were detected specifically in ‘Sukai Golden’.
Using 221 recombinant inbred lines of a cross between‘Ishukushirazu’ and ‘Nishinochikara’, another BaYMV
resistance rym3 gene derived from six-row non-malting
Japanese cultivar ‘Haganemugi’ was mapped to a 0.4cM inter val on the proximal region of 5H. Haplotype
analysis of progenitor accessions of the two modern
malting cultivars revealed that r ym3 of ‘Haganemugi’
was independently introduced into ‘Sukai Golden’ and‘Sachiho Golden’. Residual chromosome 5H segmentsof ‘Haganemugi’ surrounding rym3 were larger in ‘Sukai
Golden’. Available results suggest possibilities for malting
quality improvement by minimizing residual segments
surrounding rym3.

12

統合ゲノム育種グループ

Group of Integrated Genomic Breeding

各種環境ストレスに適応した画期的な作物の開発に貢献するため、アフリカ栽培イネおよび野生イネに注目した
有用遺伝子の探索と、限られた育種母本から有用な遺伝変異を創出する新しい育種法の研究開発を行っている。また、動原体の機能低下を利用した普遍的かつ効率的な半数体誘導系統の作出系の開発を行っている。2023 年の研究進捗は以下のとおりである。

Our goal is the development of innovative crop varieties
which enable stable food production even under harshenvironments. For the sake, we explore useful gene(s)inherent in diverse germplasm such as African ricecultivars and wild rice, and tr y to establish a novel rice
breeding system creating useful genetic variations fromrestricted breeding materials. In addition, we have been
conducting molecular cytogenetic studies on the structureand function of nuclei and chromosomes using plant
species.

１．遺伝子シンテニーに基づくオーソログ遺伝子同定ツー
ルの開発
次世代シーケンサーを用いた遺伝子型判定法は、迅速かつ多検体を一度に処理できる反面、データに大量のエラーを含んでいる。本年度は、遺伝子型判定を行う解析パイプ
ライン「MCPtagg」および遺伝子型データのエラー修正
ツール「GBScleanR」について論文発表を行った。さらに、２つのゲノム上の遺伝子シンテニーに基づいたオーソロ
グ遺伝子同定ツールを開発した。ゲノム情報の育種利用を考えたとき、異なる品種間や交配可能な近縁種間においてゲノム上に存在するオーソログ遺伝子のペアを可能な限り１対１対応させて同定することで、品種間差や種間を明確に記述し有用遺伝子探索を効率的に行うことができると期待される。

1. Development of a gene-synteny aware orthologous gene
identification tool
Genotyping using next-generation sequencers canprocess multiple samples rapidly at once, but they often
contain a significant amount of errors in the data. This
year, we published papers on the genotyping pipeline"MCPtagg" and an error correction tool "GBScleanR".
Additionally, we have developed a tool that identify
orthologous gene based on the conservation of sequenceand synteny of genes. Our tool tr y to identify pairs oforthologous genes on the genomes as much as possible
in a one-to-one correspondence. When considering theapplication of genomic information for breeding, thesedetailed description of inter-variety and inter-species
variations in one-to-one paired orthologous genes will help
to identify agriculturally valuable genes and alleles.

２．限られた育種母本から有用な遺伝変異を創出する新しい育種法の研究開発
アフリカ栽培イネ（オリザグラベリマ）とアジア栽培イ
ネ（オリザサティバ）の F1 の雑種 4 倍体系統に由来する
複数の自殖分離集団を用いて 12 種類の農業形質の GWAS
解析を行った。解析モデルに修正を加えることで検出精度を高め、検出 QTL の遺伝的効果をタイプ別（相加・優性・量的）に分類することができた。さらに、検出された 88個の遺伝子座のいくつかは既報の単離済み遺伝子と対応することが明らかになった。
ゲノムシャッフリング集団では、同じ 8 系交雑に由来す
る MAGIC 集団と比較してハプロタイプブロックの数が増加することから、集団内の遺伝的組換えが促進されることが示唆された。また、ワラおよび玄米中の元素含量に関する GWAS 結果を比較したところ、MAGIC 集団よりも検出
QTL の数が減少する傾向が見られた。

2. D evelopment of a novel breeding systems to create
useful genetic variants from restricted materials
GWAS of 12 agronomic traits were performed using
progenies of tetraploid interspecific hybrids between
African rice (Oryza glaberrima) and Asian rice (O. sativa).
Modifications of the statistical model could improve thedetection accuracy and allowed to classify the genetic
ef fects of the detected QTL into three types (additive,
dominant and quantitative). Furthermore, some of the
88 detected loci were found to correspond to previously
isolated genes.
Genetic recombination was enhanced in the genome
shuffling population compared to the MAGIC population
derived from the same 8-way crosses, as evidenced byan increase in haplotype blocks within the population.
Comparison of GWAS results for elemental content instraw and grain revealed a trend toward a reduced numberof detected QTLs in the genome shuf fling populationcompared to the MAGIC population.

３．高精度ゲノム配列を利用したセントロメア領域の再定
義次世代シーケンシング技術の進展により、非モデル生物を含む多くの生物種で、染色体レベルのスカッフォールドをもつ高品質なゲノム配列が得られる様になってきた。特に、ロングリードシーケンシングは、従来法ではアッセン
ブルすることが難しかった高次反復領域のアッセンブルも可能にした。これまで部分的に報告されてきた多くの植物のセントロメア領域も高次反復領域を含み解析不能であったが、これらの技術で解析可能となった。そこで、抗セントロメア特異的ヒストン H3 抗体を用いたクロマチン
免疫沈降により、セントロメア領域の詳細マッピングを行った結果、植物セントロメア領域の多様な形態が明らかになった。

3. Redefinition of centromere regions using high accuracy
genome sequences
Advances in next-generation sequencing technologies
have made it possible to obtain high-quality genome
sequences with chromosome-level scaf folds for many
species, including non-model organisms. In particular, longread sequencing has made it possible to assemble highorder repeat regions that have been difficult to assemble
using conventional methods. Many plant centromere
regions that have been partially reported so far, including
higher-order repeat regions, were also unanalyzable, butthese technologies have made it possible to analyze them.
In this study, detailed mapping of centromere regions bychromatin immunoprecipitation using anti-centromerespecific histone H3 antibodies revealed the diverse
morphologies of plant centromere regions.

13

次世代作物共同研究コア
作物デザイン研究チーム(Research Core for Future Crops)
Crop Design Research Team

本チームは、データ科学を中心に、研究所が蓄積する植物に関する多様な情報と遺伝資源を活用し、作物の生産性の鍵となる遺伝子を探索し、その生理学的および遺伝学的機能を理解する研究を推進している。今年度は、冬季の圃場栽培におけるオオムギの時系列トランスクリプトーム
データを解析し、出穂との関連性を解明する研究に取り組んだ。同じ冬を経験した冬播性系統に比べて、春播性系統が示すさらに早い出穂に関連する遺伝子の発現パターンを特定し、その遺伝子発現に出穂を促進する効果があることを明らかにした。同時に、所内外との共同研究を通して、いろいろな生物種の遺伝子やゲノム解析研究を推進した。

Our team leverages data science and diverse plantrelated resources of IPSR to identify key genes forenhancing crop productivity and to understand theirfunctions. In this fiscal year, we conducted research
aimed at modeling the time-series dynamics of genes inbarley during winter field cultivation. We investigatedthe differential gene expression related to the different
heading time of spring and winter barley, even upon thesame winter experience. Our analysis revealed uniquegene expression patterns specific to spring barley, andwe established their significant role in promoting earlyheading. Additionally, we have been actively engaged incollaborative research with our research partners working
in our facility and other institutions; which has contributed
to the genetic and genomic analyses of various livingorganisms.

Field Flora Research Team

フィールドフローラ研究チーム
本班はイネ、オオムギを対象として二毛作体系における年間を通じた植物の生長とその根圏の微生物叢、並びに環境要因として施肥、土壌イオンや野生植物の測定・観察を通じ、これら要因が複雑に絡み合うネットワークの変動を明らかにしていくことで、病徴や金属イオンストレスに関わる重要な因子を見いだすことを目的としている。3 年間のサンプリングと微生物叢の解析を通じて、3 年間の二毛作圃場では微生物叢の構成変化が繰り返されること、オオ
ムギ・イネに特有の細菌、共通するもの、根にまたは根圏土壌に多く存在する細菌が見つかるなど、生育環境に応じた生息域に特異的な微生物が存在することが明らかになった。単作区との比較を進めると共に、さらに多くの品
種間の比較、酸性・中性・アルカリ性の圃場、一般農家サンプルも含めて解析を行っている。

This team was star ted to analyze the plant growth
and rhizosphere microbiome of double-cropping of riceand barley in relation to environmental factors suchas fer tilization, diseases and metal ion stress and tofind changes in the complex network of these factors
throughout the year. Through 3 years of sampling andanalysis of the microbiome we found that the microbiome
structure changed stably in a cycle in the 3-year double
cropping field. Also, we found bacteria specific to barleyor rice, or common to both plants, and root or soil-specificbacteria, suggesting their specificity in their environmental
niches. In addition to the comparison with the singlecropping data, we started sampling and analysis of the
microbiome in acid, neutral, and alkali soils, using more
cultivars including general farmers’ samples.

14

作物機能イノベーション研究チーム

Crop Functional Innovation Research Team

本研究チームは、オオムギの遺伝子改変技術の高度化とオオムギを利用した作物イノベーション研究拠点の構築を行っている。オオムギ―微生物間相互作用、種子成分工学、環境ストレス耐性育種などの分野で共同研究体制を整え、資源植物科学の発展に寄与することを目的としている。

Our research aims to upgrade the genetic modification
technology in barley and to establish the research corefor crop innovation using barley. We are conducting joint
research in the fields of barley-microbial interaction,
grain component engineering and environmental stress
tolerance breeding.

１．オオムギの遺伝子改変技術の高度化
オオムギ研究の加速化を目指して遺伝子改変技術（形質転換およびゲノム編集技術）の高度化を行っている。

1. A dvancement of genetic modification technology inbarleyWe are upgrading the genetic modification technologies(genetic transformation and genome editing technologies)
to accelerate barley research.

２．ムギ類生存圏におけるウイルス叢の解明
オオムギおよびコムギの生存圏に存在するウイルスを網羅的に解析し、カタログ化を行っている。これらの成果を元に、イネ科作物の遺伝子解析・改変に有効なウイルス
ベクターの構築ならびにその耐病性メカニズムや生物間相互作用研究への応用を目指している。

2. Analysis of viromes in the ecosphere of Triticeae species
We are comprehensively analyzing the viromes in thebarley and wheat ecosphere to construct effective viral
vectors for genetic transformation and to understand thedisease resistance and biological interaction in Triticeae
crops.

３．オオムギ種子の澱粉粒の形状育種
オオムギ種子の澱粉粒の形状の改変を行い、新しい澱粉
特性を有するオオムギの開発を行なっている。また、オ
オムギの澱粉粒の形成機構の解明を目指した基盤研究を行っている。

3. Morphological breeding of starch grains in barley seeds
Modification of starch grain morphology of barley seeds
is in progress. We aim to develop barley plants with novel
starch properties and increase the availability of barley.
We are also conducting basic research to elucidate themolecular mechanism of starch grain formation.

４．オオムギの環境ストレス耐性育種のための基盤研究
高／低温ストレス耐性遺伝子の導入やミネラルストレス関連遺伝子を改変した形質転換オオムギのセットを作製し、オオムギの環境ストレス耐性機構の網羅的解析を目指している。

作物・環境デザイン研究チーム

4. Elucidation of environmental stress tolerance in barley
We are working to introduce environmental stress-related
genes, such as mineral uptake/exclusion genes into barley.
We will generate transgenic barley plants over-expressing
or down-regulating these genes to comprehensively
analyze the stress tolerance mechanism.

Crop and Environmental Design Research Team

岡山県を含む西南暖地では季節毎に複数の作物を同一圃場で栽培する二毛作が伝統的に実践されている。持続的な農業生産のためには、栽培環境の季節変動、適応的な作物の遺伝子型そしてそれらの相互作用を理解し育種に繋げていくことが必要である。2022 年に開始した本チー
ムでは、植物研で継続的に取得してきたオオムギのコア・コレクションの複数年、複数環境での農業形質データおよび、イネ・オオムギの二毛作圃場における土壌ミネラル、
根圏微生物叢、圃場環境データをプロジェクトの原資として、作物ｘ環境相互作用に遺伝構造に関する理解を深化させ、数理モデルによる形質影響予測から多系交配集団などのリソースを使った検証研究への展開を図る。
2023 年には、オオムギのコア・コレクションで取得した施肥条件が異なる複数圃場における農業形質データを分析し、施肥応答を定量化して変異の全体像を明らかにした。その中では、施肥区に対して無施肥環境で形質値が増えるといった特徴的な応答を示す系統群を見出した。現在、全ゲノム関連解析を実施中である。

Double cropping, in which multiple crops are cultivatedin the same field each season, is traditionally practiced
in southwestern Japan including Okayama Prefecture.
For sustainable agricultural production, it is important tounderstand the seasonal transition of the field environment,
adaptive crop genotypes, and their interactions; and,
connect them to crop breeding. We have been collecting
the multi-year, multi-environment agronomic trait dataobtained on the barley germplasm at IPSR, as well as
the soil minerals and rhizosphere microbiota in doublecropping fields of rice and barley.
Our team was star ted in 2022 to deepen our
understanding of the genetic str ucture of cropenvironment interactions, and pursue verification researchusing resources such as multi-parent populations andmathematical models predicting the effect on agronomic
traits.
In 2023, we analyzed the agronomic trait data obtained
from the barley core collection in multiple plots under
dif ferent fer tilizer conditions to quantify the fer tilizer
response and to reveal the overall picture of variation.
Among them, we found a group of lines that showed acharacteristic response, such as an increase in trait values
in the no-fertilizer environment relative to the fertilizerapplied zone. Whole genome association analysis iscurrently underway.

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RECTOR program

RECTOR プログラム
本グループでは本研究所の光環境適応グループ、本学の異分野基礎科学研究所の光合成・構造生物学研究コア、ドイツミュンスター大学のミハエルヒップラー教授、の研究
室と研究協力・支援体制を整え、植物の生育に重要な光合成反応を起点として植物で行われる多くの代謝反応との関わりを明らかにするため遺伝学・分子生物学・生化学・
構造生物学を駆使し光合成反応で得られたエネルギーが植物に利用される機構を明らかにする。また、
7 月にはヒップラー教授が統括するドイツ科学振興財団の "Dynamic
Regulation of the Proton Motive Force in Photosynthesis GoPMF" 研究プロジェクト（予算名：FOR 5573/1）が採択された。FOR 5573/1 は日独蘭瑞に所属する 15 名の研究者で構成される四年間の国際研究プロジェクトであり、期間合計の予算は 500 万ユーロである。日本からは RECTOR
プログラムのヒップラー教授、小澤と異分野基礎科学研究所の高橋裕一郎、大阪大学の栗栖源嗣が参画する。
今年度の研究成果では、1）Photosynthetic control の制御、
2）葉緑体の酸化還元状態に応答した制御、3）PSII の代
謝回転の制御について、新たな知見が得られた。

In this RECTOR program, we have established aresearch collaboration system with three research groups;
the laborator y of photo-environmental adaptation groupat IPSR, a group at RIIS, and the laboratory of Professor
Michael Hippler at the University of Münster, Germany. We
aim to provide mechanistic insights into the photosynthetic
process. To achieve this aim, we are studying themechanism of light energy utilization in photosynthesis
using genetics, molecular biology, biochemistr y, andstructural biology. The results of this year's research are
as follows.
To this end, the research has focused on three
independent aspects (i) the regulation of photosynthetic
control, (ii) the modulation of the chloroplast redox poiseand (iii) the regulation of photosystem II (PSII) turnover.
In photosynthesis, electron transfer will establish a
proton-motive force that consists of a ΔpH and a ΔΨcomponent. In turn, elevated acidification of the lumen,
will slow down the oxidation of PQH2 at the Cyt b6 f leading
to a slowdown of overall photosynthetic electron transfer,
designated as photosynthetic control. Interestingly, ourwork provided insights that photosynthetic control isparticularly established under anoxic cyclic electron flow(CEF) promoting conditions (Ozawa et al, 2023). For thiswork, we introduced the Pro194Leu substitution in the
Cyt b 6 f PETC subunit and generated the PETC-P171L
mutant in C. reinhardti. In another work, we analyzed thephosphorylation dynamics of proteins from C. reinhardtti(Younas et al, 2023). To analyze the modulation of thechloroplast redox poise we investigated the function ofcalredoxin (CRX), a calcium (Ca2+)-dependent thioredoxin(TRX) in the chloroplast of C. reinhardtii. Our data
provided evidence that the chloroplast NADPH-dependent
TRX reductase (NTRC) is co-regulated with CRX andthat the function of the NADPH-NTRC complex is understrict control of CRX (Zinzius et al, 2023). In anotherwork line we revealed that an oxidative post-translational
modification of Trp residue at the N-terminal tail of D1 in
PSII is correlated with D1 degradation by the protease
FtsH during high-light stress (Kato et al, 2023). It should
also be mentioned that thanks to the ef for ts of the
RECTOR program group, a research group (FOR 5573/1)
funded by the German Research Foundation (DFG)
entitled "Dynamic Regulation of the Proton Motive Forcein Photosynthesis - GoPMF" was approved. This researchgroup (FOR 5573/1) consists of 15 Principal Investigators(PI) working on 10 projects and 2 central projects and will
run for four years. Prof Hippler is the spokesperson of FOR
5573/1 and Dr. Ozawa and Prof Takahashi (both Okayama
University) are working together with Prof Hippler andProf Kurisu (Osaka University) on Project 1 (P1). The total
financial volume of FOR 5573/1 is around 5 million euros.

１．Photosynthetic control の誘導に関する新たな知見
光合成の電子伝達と共役する葉緑体ストロマからチラ
コイド膜内腔へのプロトン移動によって、チラコイド膜内外のプロトン濃度勾配が発生しチラコイド膜内腔は酸化する。Photosynthetic control では、チラコイド膜内腔の過剰な酸化はシトクロム b6 f 複合体によるプラストキノー
ル酸化を抑制し光合成の電子伝達速度が低下する。今回、シロイヌナズナ pgr1 株に相当する変異を緑藻クラミドモ
ナスに導入した PETC-P171L 変異株解析で、プラストキ
ノールを人為的に還元させる無酸素状態で Photosynthetic
control が誘導される知見を得た（Ozawa et al, 2023）。
２．葉緑体の酸化還元状態に応答した制御
カルレドキン（CRX）は緑藻クラミドモナスにおいて報告された葉緑体に局在するカルシウムイオン依存型チオレドキシン（TRX）である。葉緑体の NADPH 依存型 TRX
還 元 酵 素（NTRC） は CRX に よ る 制 御 を 受 け NADPHNTRC 複合体の機能もまた CRX の制御を受けることが示された（Zinzus et al, 2023）。
３．翻訳後修飾がもたらすタンパク質機能の制御機構
緑藻クラミドモナスを材料として、リン酸化修飾を解析
し動的な変化を記述した（Younas et al, 2023）。光化学系
II 複合体の D1 タンパク質の N 末端部分に存在するトリ
プトファン残基の翻訳後酸化修飾が強光下における FtsH
による D1 分解と相関することを見いだした（Kato et al,2023）。

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出版物リスト (List of Publication)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group)（1） Matsushima, R., Hisano, H., Galis, I., Miura, S., Crofts, N., Takenaka, Y., Oitome, N. F., Ishimizu, T., Fujita, N., Sato, K.
FLOURY ENDOSPERM 6 mutations enhance the sugary phenotype caused by the loss of ISOAMYLASE1 in barley.
Theor. Appl. Genet. 136: 94. doi.org/10.1007/s00122-023-04339-5 (2023. 4.)（2） Sakamoto, W., Takami, T. Maternal plastid inheritance: two abating factors identified. Trends. Genet. 39: 342-343. doi.
org/ 10.1016/j.tig.2023.03.002 (2023. 5.)（3） Sakamoto, W. Greetings from the PCP Editor-in-Chief. Plant Cell Physiol. 64: 701-703. doi.org/10.1093/pcp/
pcad061(2023. 7.)（4） Ogawa, Y., Iwano, M., Shikanai, T., Sakamoto, W. FZL, a dynamin-like protein localized to curved grana edges, is required
for efficient photosynthetic electron transfer in Arabidopsis. Front. Plant Sci. 14: 1279699. doi.org/10.3389/
fpls.2023.1279699 (2023. 9.)（5） Okegawa, Y. PCP Research Highlights: Regulator y Role of Three Important Post-Translational Modifications in
Chloroplast Proteins. Plant Cell Physiol. 64: 1119-1123. doi.org/10.1093/pcp/pcad097 (2023. 10.)（6） Okegawa, Y., Sato, N., Nakakura, R., Murai, R., Sakamoto, W., Motohashi, K. x- and y-type thioredoxins maintain redox
homeostasis on photosystem I acceptor side under fluctuating light. Plant Physiol. 193: 2498-2512. doi.org/10.1093/
plphys/kiad466 (2023. 11.)（7） Kato, Y., Kuroda, H., Ozawa, S. I., Saito, K., Dogra, V., Scholz, M., Zhang, G., de Vitry, C., Ishikita, H., Kim, C., Hippler,M., Takahashi, Y., Sakamoto, W. Characterization of tryptophan oxidation affecting D1 degradation by FtsH in thephotosystem II quality control of chloroplasts. Elife 12: RP88822. doi.org/10.7554/eLife.88822 (2023. 11.)（8） Sakamoto, W., Takami, T. Plastid inheritance revisited: emerging role of organelle DNA degradation in angiosperms.
Plant Cell Physiol. doi.org/10.1093/pcp/pcad104 (2023. 9. Online preview)

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)（1） Hirano, T., Okamoto, A., Oda, Y., Sakamoto, T., Takeda, S., Matsuura, T., Ikeda, Y., Higaki, T., Kimura, S., Sato, M. H.
Ab-GALFA, A bioassay for insect gall formation using the model plant Arabidopsis thaliana. Sci. Rep. 13: 2554. doi.
org/10.1038/s41598-023-29302-8 (2023. 2.)（2） Kim. J. S., Takahagi, K, Inoue, K., Shimizu, M., Uehara-Yamaguchi, Y., Kanatani, A., Saisho, D., Nishii, R., Lipka, A. E.,
Hirayama, T., Sato, K., Mochida, K. Exome-wide variation in a diverse barley panel reveals genetic associations
with ten agronomic traits in Eastern landraces. Journal of Genetics and Genomics 50: 241-252. doi.org/10.1016/
j.jgg.2022.12.001 (2023. 4.)（3） Mori, I. C., Matsuura, T., Otao, M., Ooi, L., Nishimura Y., Hirayama, T. Application of trehalose mitigates short-styled
flowers in Solanaceous crops. J. Agric. Food Chem. 71: 5476-5482. doi.org/10.1021/acs.jafc.2c08479 (2023. 4.)（4） Himi, E., Matsuura, T., Miura, H., Yoshihara, N., Maekawa, M. A new method for detecting proanthocyanidin content
in wheat reveals the relationship between R-1 gene to grain color deepness. Cereal Chemistry 100: 512-521. doi.
org/10.1002/cche.10629 (2023. 4.)（5） Ishii, C., Nagano, M., Kobayashi, M., Matsuura, T., Konishi, J., Aoki, K., Daimon, H., Mori, I. C., Fukao, Y. Wood vinegar
promotes rice growth by increasing gibberellin and cytokinin levels. The Japan Carbonization Research Society 1: 4150. (2023. 4.)（6） Kimura, S., Vaattovaara, A., Ohshita, T., Yokoyama, K., Yoshida, K., Hui, Agnes, Kaya, H., Ozawa, A., Kobayashi, M., Mori, I.
C., Ogata, Y., Ishino, Y., Sugano, S. S., Nagano, M., Fukao, Y. Zinc deficiency-induced defensin-like proteins are
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植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)（1） Tazawa, M., Katsuhara, M., Wayne, R. Calcium Control of the Hydraulic Resistances in Cells of Chara corallina.
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doi.org/10.1093/bbb/zbad020 (2023. 4.)（3） 且原真木・松波麻耶 根っこはどうやって水を吸収するの．根っこってなんだろう？（中野明正 監修）pp. 10-11.
ISBN: 978-4-580-82597-0 (2023. 8.)

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)（1） Sato, Y., Turina, M., Chiba, S., Okada, R., Bhatti, M. F., Kotta-Loizou, I., Coutts, R. H. A., Kondo, H., Sabanadzovic, S.,
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journal.ppat.1011726 (2023. 10.)

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)（1） Osinde, C., Sakamoto, W., Kajiya-Kanegae, H., Sobhy, I. S., Tugume, A. K., Nsubuga, A. M., Galis, I. Identification ofquantitative trait loci associated with sorghum susceptibility to Asian stem borer damage. J. Plant Interact. 18:2153182. doi.org/10.1080/17429145.2022.2153182 (2023. 1.)（2） Matsushima, R., Hisano, H., Galis, I, Miura, S., Crofts, N., Takenaka, Y., Oitome, N. F., Ishimizu, T., Fujita, N., Sato, K.
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27

植物環境微生物学グループ (Group of Plant Environmental Microbiology)（1） Gajardo, G., Morón-López, J., Vergara, K., Ueki, S., Guzmán, L., Espinoza-González, O., Sandoval, A., Fuenzalida, G.,
Murillo, A. A., Riquelme, C., Camerón, H., Nagai, S., Maruyama, F., Fujiyoshi, S., Yarimizu, K., Perera, I., Kawai, M.,Ávila, A., Larama, G., Gonzalez, M. A., Jorquera, M. A. The holobiome of marine harmful algal blooms (HABs): A
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遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
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implicates histidine N-pi-methyltransferase as a key enzyme in N-methylhistidine biosynthesis in Arabidopsis
thaliana. Front. Plant Sci. 14: 1201129. doi.org/10.3389/fpls.2023.1201129 (2023. 6.)（2） Mega, R., Kim, J. S., Tanaka, H., Ishii, T., Abe, F., Okamoto, M. Metabolic and transcriptomic profiling during wheat seeddevelopment under progressive drought conditions. Sci. Rep. 13: 15001. doi.org/10.1038/s41598-023-42093-2 (2023.
9.)（3） Kamal, N. M., Gorafi, Y. S. A., Tomemori, H., Kim, J. S., Elhadi, G. M. I., Tsujimoto, H. Genetic variation for grain
nutritional profile and yield potential in sorghum and the possibility of selection for drought tolerance underirrigated conditions. BMC genom. 24: 515. doi.org/10.1186/s12864-023-09613-w (2023. 9.)（4） Taketa, S., Kim, J. S., Takahashi, H., Yajima, S., Koshiishi, Y., Sotome, T., Kato, T., Mochida, K. Genomic traces ofJapanese malting barley breeding in two modern high-quality cultivars, ʻSukai Goldenʼ and ʻSachiho Goldenʼ. Breed.
Sci. doi.org/10.1270/jsbbs.23031 (2023. 10. Online preview)29RECTOR プログラム (RECTOR Program)（1） Scholz, M., Zinzius, K., Hippler, M. Chapter 12 - The chloroplast in a changing environment: from genome to proteome.
In The Chlamydomonas Sourcebook (Third Edition). Grossman, A.-R., Wollman, F.-A. eds, pp. 413-442. Academic
Press. ISBN 978-0-12-821430-5 doi.org/10.1016/B978-0-12-821430-5.00017-1 (2023. 1.)（2） Younas, M., Scholz, M., Marchetti, G.-M., Hippler, M. Remodeling of algal photosystem I through phosphorylation.
Biosci. Rep. 43: BSR20220369. doi.org/10.1042/BSR20220369 (2023. 1.)（3） Akiyama, K, Ozawa, S.-I., Takahashi, Y., Yoshida, K., Suzuki, T., Kondo, K., Wakabayashi, Ki., Hisabori, T. Two specificdomains of the γ subunit of chloroplast FoF1 provide redox regulation of the ATP synthesis through conformationalchanges. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 120: e2218187120. doi.org/10.1073/pnas.2218187120 (2023. 2.)（4） Ozawa, S.-I., Buchert, F., Reuys, R., Hippler, M., Takahashi, Y. Algal PETC-Pro171-Leu suppresses electron transfer incytochrome b6 f under acidic lumenal conditions. Plant Physiol. 191: 1803-1817. doi.org/10.1093/plphys/kiac575(2023. 3.)（5） Zinzius, K., Marchetti, G.-M., Fischer, R., Milrad, Y., Oltmanns, A., Kelterborn, S., Yacoby, I., Hegemann, P., Scholz, M.,
Hippler, M. Calredoxin regulates the chloroplast NADPH-dependent thioredoxin reductase in Chlamydomonas
reinhardtii. Plant Physiol. 193: 2122-2140. doi.org/10.1093/plphys/kiad426 (2023. 10.)（6） Kato, Y., Kuroda, H., Ozawa, S.-I., Saito, K., Dogra, V., Scholz, M., Zhang, G., de Vitry, C., Ishikita, H., Kim, C., Hippler,M., Takahashi, Y., Sakamoto, W. Characterization of tryptophan oxidation affecting D1 degradation by FtsH in thephotosystem II quality control of chloroplasts. Elife 12: RP88822. doi.org/10.7554/eLife.88822 (2023. 11.)
（7） Sommer, K., Reuter, S., Elinkmann, M., Kohrer, A., Quarles, C.-D., Jr., Hippler, M., Karst, U. Species-dependent
uptake of gadolinium in Chlamydomonas reinhardtii algae. Sci. Total Environ. 905: 166909. doi.org/10.1016/
j.scitotenv.2023.166909 (2023. 12.)（8） Chaux, F., Jarrige, D., Rodrigues-Azevedo, M., Bujaldon, S., Caspari, O.-D., Ozawa, S.-I., Drapier, D., Vallon, O., Choquet,Y., de Vitr y, C. Chloroplast ATP synthase biogenesis requires peripheral stalk subunits AtpF and ATPG andstabilization of atpE mRNA by OPR protein MDE1. The Plant Journal doi.org/10.1111/tpj.16448 (2023. 10. Online
preview)30

国際会議およびシンポジウム(List of International Conferences and Symposia)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group)（1） Ogawa, Y. The function of thylakoid membrane remodeling in plant chloroplasts in optimizing photosynthesis. FY2022
International Symposium on Environmental and Life Science, Okayama, Japan, Jan. 24, 2023.
（2） Wacera, W. F. Grain ionomics of a sorghum recombinant inbred population reveals a major QTL for differential cadmium
accumulation. FY2022 International Symposium on Environmental and Life Science, Okayama, Japan, Jan. 24, 2023.
（3） Sakamoto, W. Exploiting sorghum, a crop of African origin with cutting-edge genome technology. 60th Anniversary of
Kenya-Japan Partnership Commemoration Lecture, Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology,
Nairobi, Kenya, March 22, 2023.
（4） Sakamoto, W. Exploiting sorghum, a crop of African origin with cutting-edge genome technology. Webinar Series on
Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, IPB University, Indonesia (online), April 15, 2023.
（5） Ogawa, Y., Iwano, M., Kawamoto, A., Kurisu, G., Shikanai, T., Sakamoto, W. The function of thylakoid membrane fusion
by FZL protein in sustaining optimized photosynthetic electron transfer. The 33rd International Conference on
Arabidopsis Research, Makuhari, Japan, June 5-9, 2023.
（6） Matsushima, R., Hisano, H., Galis, I., Fujita, N., Sato, K. FLOURY ENDOSPERM 6 mutations enhance the sugar yphenotype caused by the loss of ISOAMYLASE1 in barley. The 3rd Barley Mutant Conference, Kurashiki, Oct. 8-10,
2023.
（7） Ogawa, Y., Iwano, M., Kawamoto, A., Kurisu, G., Shikanai, T., Sakamoto, W. The functional significance of membrane
remodeling at grana edges in photosynthetic responses to different light intensities in Arabidopsis. Taiwan-Japan
Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
（8） Gachie, S.W., Sakamoto, W. Site-directed mutagenesis and in vivo observation of VIPP1, an ESCRT-III super family
protein involved in thylakoid membrane remodeling in Arabidopsis chloroplasts. Taiwan-Japan Plant Biology 2023,
Taipei, Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
（9） Li, D., Ozawa, S. I., Sakamoto, W. Thylakoid membrane remodeling molecule VIPP1 interacts with HSP70 through its
C-terminal tail in Arabidopsis. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
（10）Okegawa, Y., Motohashi, K., Sakamoto, W. x- and y-type thioredoxins protect photosystem I from photoinhibition underfluctuating light. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
（11）Ogawa, Y., Iwano, M., Kawamoto, A., Kurisu, G., Shikanai, T., Sakamoto, W. Maintenance of thylakoid membranes andphotosynthesis by FZL, a dynamin-like protein enriched on curved grana edges. Taiwan-Japan Joint Seminar on
Photosynthesis Research 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 16, 2023.
（12）Sakamoto, W. Thylakostasis: versatile roles of thylakoid membrane remodeling proteins Arabidopsis chloroplasts. 2023
International Symposium on Plant Cell and Developmental Biology, Shanghai, Jiao Tong University, Shanghai,
China, Nov. 2-3, 2023.
（13）Sakamoto, W. Thylakostasis and membrane remodeling molecules. US-Japan Binational Photosynthesis Workshop,
Tempe, Alizona, USA, Nov. 6-8, 2023.
（14）Okegawa, Y. Redox regulation of photosynthesis by the thioredoxin system in Arabidopsis. US-Japan Binational
Photosynthesis Workshop, Tempe, Alizona, USA, Nov. 6-8, 2023.

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)（1） Hirayama, T., Kim. J. S., Sorokin, A., Mochida, K. A defect in an RNA metabolic enzyme suppresses the adverse effectof the accumulation of polyadenylated mitochondrial mRNA in Arabidopsis. The 33rd International Conference on
Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June 5-9, 2023.
（2） Nishimura, N., Tsuchiya, W., Suzuki, N., Hirayama, T., Yamazaki, T. Functional analysis of DOG1-dependent ABA
signaling cascade. The 33 rd International Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June 5-9, 2023.
（3） Mamiya, A., Yamamoto, K., Kobayashi, Y., Yagi, Y., Nakamura, T., Hirayama, T., Fukaki, H., Sugiyama, M. Interaction
between polyadenylation and C-to-U editing of mitochondrial mRNA involved in cytochrome c maturation. The 33rd
International Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June 5-9, 2023.
（4） Takayanagi, N., Arae, T., Shimizu, T., Horiguchi, G., Aida, M., Fukaki, H. Masuda, T., Notaguchi, M., Hirayama,T., Ohtani, M. Role of pre-mRNA splicing in lateral root morphogenesis regulated by plastid signal. The 33 rd
International Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June 5-9, 2023.
（5） Kim. J. S., Ito, J., Takahagi, K, Kanatani, A., Shimizu, M., Uehara-Yamaguchi, Y., Inoue, K., Okada, S., Matsuura, T.,
Hattori, K., Ikeda, Y., Saisho, D., Tsuji, H., Hirayama, T., Sato, K., Mochida, K. Field transcriptome dynamics of31barley during winter cultivation. The 33rd International Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June
5-9, 2023.
（6） Ushio, M., Ishikawa, T., Matsuura, T., Mori, I. C., Kawai-Yamada M., Fukao, Y., Nagano, M. MHP1 and MHL generate
odd-chain fatty acids from 2-hydroxy fatty acids in sphingolipids in Arabidopsis thaliana. The 33rd International
Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), Japan, June 5-9, 2023.
（7） Kimura, S., Vaattovaara, A., Kaya H., Kobayashi M., Mori, I. C., Nagano M., Fukao, Y. Defensin-like proteins inducedby zinc deficiency are involved in Arabidopsis root elongation. The 33rd International Conference on Arabidopsis
Research. Chiba (Hybrid), Japan, June 5-9, 2023.
（8） Ito, H., Niu, X., Ikeda, Y., Saze, H., Kanehira, R., Son, N. Novel mechanism of transposon repression by histone
deacetylases. The 33rd International Conference on Arabidopsis Research, Chiba (Hybrid), June 5-9, 2023.
（9） Nishimura, N., Tsuchiya, W., Suzuki, N., Hirayama, T., Yamazaki, T. Functional analysis of DOG1-dependent ABA
signaling cascade. 15th International Symposium on Pre-Harvest Sprouting in Cereals, Tsukuba, Oct. 4-6, 2023.
（10）Hirayama, T., Saisho, D., Kim, J. S., Okada, S., Ito, J., Matsuura, T., Hattori, K., Tsuji, H., Koda, S., Nishii, R., Umezaki,T., Mochida, K. Life course monitoring of plant hormones of barleys grown in the field conditions. The 3rd Barley
Mutant Conference, Kurashiki, Oct. 8-10, 2023.
（11）Nakamura, K., Hisano, H., Ikeda Y. Ectopic expression of HvMADS58, an ortholog of AGAMOUS, caused homeotictransformations of floral organs in Barley. The 3rd Barley Mutant Conference, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（12）Ito, J., Nomura, Y., Takahagi, K., Kim, J. S., Kashima, M., Okada, S., Sato, N., Shimizu, M., Saisho, D., Mochida, K.,
Hirayama, T., Tsuji, H. Dissection of developmental state transition in the shoot apical meristem of barley by single
meristem RNA-seq, The 3rd Barley Mutant Conference, Kurashiki, Oct. 8-10, 2023.
（13）Takayanagi, N., Arae, T., Shimizu, T., Horiguchi, G., Aida, M., Fukaki, H. Masuda, T., Notaguchi, M., Hirayama, T.,
Ohtani, M. Photosynthetic activity regulates lateral root morphogenesis via pre-mRNA spicing. Taiwan-Japan Plant
Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（14）Ikeda, Y. Regulation of DNA demethylation in Marchantia polymorpha. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan,
Oct. 13-16, 2023.
（15）Tania, S. S., Utsugi, S., Tsuchiya, Y., Sasano, S., Katsuhara, M., Mori, I. Carbon dioxide transport by Arabidopsis PIP2
aquaporins. Taiwan-Japan Plant Biology, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（16）Tamaoki, M., Mori, C, M., Matsuura, T., Aono, M. Low-dose radiation promotes flowering by decreasing the levels ofphytohormones. Taiwan-Japan Plant Biology, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（17）Mori, A., Gaudin, V., Matsuura, T., Ikeda, Y., Tamura, K. Importin α, a nuclear transport factor, negatively regulates
immunity responses in Arabidopsis. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（18）Ikeda, Y. DNA de-methylation control in Marchantia polymorpha. International Research Network France-Japan
Frontiers in Plant Biology Symposium, Kyoto, Japan, Oct. 23-24, 2023.

環境機能分子開発グループ (Group of Functional Biomolecular Discovery)（1） Rikiishi, K., Sugimoto, M., Maekawa, M. RNA-seq analysis of developing seeds in a wheat mutant RSD32 with reduced
seed dormancy. 15th International Symposium on Pre-Harvest Sprouting in Cereals, Tsukuba, Japan, Oct. 4-6, 2023.
（2） Sugimoto, M., Mita, H., Yokobori, S. Effect of anthocyanin on viability of rice seeds in space. 7 th Global Moon Village
Workshop & Symposium, Kurashiki & Tottori, Japan, Dec. 6-10, 2023.

土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ (Group of Plant Stress Physiology)（1） Ma, J. F., Konishi, N. Mechanisms controlling polar localization of Si transporter in rice. 19th International Workshop on
Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31, 2023.
（2） Mitani-Ueno, N., Yamaji, N., Huang, S., Yoshioka, Y., Miyaji, T., Ma, J. F. A transporter essential for proper deposition of
Si in rice. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31, 2023.
（3） Konishi, N., Ma, J. F. Clathrin-mediated endocytosis is not required for maintaining the polar localization of mineraltransporters in rice. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31, 2023.
（4） Wang, P., Yamaji, N., Mitani-Ueno, N., Konishi, N., Ma, J. F. A K+/Ca2+ transporter OsSKOR is involved in Ca accumulationin rice grain. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31, 2023.
（5） Huang, S., Yamaji, N., Konishi, N., Ma, J. F. Local distribution of manganese to leaf sheath is mediated by OsNramp5 inrice. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31, 2023.
（6） Ge, J., Yu, E., Che, J., Lin, S-H., Tsay, Y-F., Ma, J. F. Functional characterization of a rice NPF member, OsNPF4.2 with32

high expression in the node. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology, Taipei, Taiwan, March 27-31,
2023.
（7） Ma, J. F. Exploring mineral transporter genes for better and safe barley production. 3rd Barley Mutant Conference,
Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（8） Huang, H. L., Hisano, H., Yamaji, N., Mitani-Ueno, N., Sato, K., Ma, J. F. HvSPDT-L is probably involved in redistributionof phosphorus in barley. 3rd Barley Mutant Conference, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（9） Ma, J. F. Molecular mechanisms of crops for high tolerance to mineral stresses in acid soils. The 11th International
Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH (PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.
（10）Yamaji, N., Yoshioka, Y., Huang, S., Miyaji, T., Sasaki, A., Ma, J. F. OsOPT7 mediates xylem unloading of Fe for its
preferential distribution in rice. The 11th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH (PSILPH),
Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.
（11）Konishi, N., Ma, J. F. Posttranslational regulation of ART1 in rice. The 11th International Symposium on Plant-Soil
Interactions at Low pH (PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.
（12）Huang, H. L., Gu, M., Hisano, H., Yamaji, N., Mitani-Ueno, N., Huang, S., Ma, J. F. Functional characterization of two
novel phosphorus transporters in barley. The 11th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH(PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.
（13）Che, J., Qu, Y. T., Mitani-Ueno, N., Yamaji, N., Shen, R. F., Ma, J. F. OsPHO1;3 mediates redistribution of phosphorus inrice. The 11th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH (PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21,
2023.
（14）Lei, G. J., Zhou, K. X., Ma, J. F. Rice OsRPY1 plays a negative role in P accumulation and grain yield. The 11th International
Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH (PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.
（15）Liu, Z., Xia, Y., Qu, Y-T., Ma, J. F., Zhao, F-J., Shen, R. F., Che, J. A tonoplast-localized transporter OsNRAMP2 is involved
in distribution of manganese to young tissues and grain. The 11th International Symposium on Plant-Soil Interactions
at Low pH (PSILPH), Nanjing, China, Oct. 16-21, 2023.

植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)（1） Utsugi, S., Kawahigashi, H., Tagiri, A., Nakagawa-Kikuchi, R., Mishina, K., Morishige, H., Nakamura, S. Conserved cisacting motifs and localization of transcripts and proteins of MFT2 from barley and rice. 15th International Symposiumon Pre-harvest Sprouting in Cereals, Tsukuba, Japan, Oct. 4-6, 2023.
（2） Yamada, H., Bunthara, L. R., Tanaka, A., Kohama, T., Maruyama, H., Tanaka, W., Nishida, S., Sasaki, T., Wasaki, J.
HalALMT1 in cluster roots formed by Phosphorus-deficient-tolerant plant, Hakea laurina. Royal Society of Western
Australia, Student Poster Competition, University Club, University of Western Australia, Perth, Australia, Oct. 6-7,
2023.
（3） Yamada, H., Bunthara, L. R., Tanaka, A., Kohama, T., Maruyama, H., Tanaka, W., Nishida, S., Sasaki, T., Wasaki, J.
HalALMT1 encoding malate transporter in cluster roots formed by Hakea laurina. The Biodiversity Conference
2023, Perth, Australia, Oct. 10-12, 2023.
（4） Tran, T. H. S., Ono, S., Tomoaki, H., Katsuhara, M. Identification, characterization, and molecular mechanisms of ionchannel aquaporins in plants. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct.13-16, 2023.
（5） Ono, S., Katsuhara, M. Na ion and K ion transport mechanism of ion channel aquaporins. Taiwan-Japan Plant Biology
2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（6） Imran, S., Ono, S., Tomoaki, H., Katsuhara, M. Salt-tolerant Pokkali Rice OsHKT1;1 Variants: Expression and Ion
Transport Activity. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct.13-16, 2023.
（7） Tania, S. S., Utsugi, S., Tsuchiya, Y., Sasano, S., Katsuhara, M., Mori, I. Carbon dioxide transport by Arabidopsis PIP2
aquaporins. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taipei, Taiwan, Oct. 13-16, 2023.
（8） Katsuhara, M. Plant molecular physiology of salt stress and salt tolerance mechanisms. The 6 th IBOC International
Biology Conference 2023, Surabaya, Indonesia (Online), Oct. 25, 2023.
（9） Yamada, H., Bunthara, L. R., Tanaka, A., Kohama, T., Maruyama, H., Tanaka, W., Nishida, S., Sasaki, T., Wasaki, J. Malate
release in cluster root formed by Hakea laurina. Australian Society of Plant Scientists Conference 28th Hobart,
Australia, Nov. 28 - Dec. 1, 2023.

33

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)（1） Gil-Cantero, D., Novoa, G., Martínez-Romero, J. M., Luque, D., Suzuki, N., Castón, J. R. Structure and assembly of fungal
dsRNA viruses. 8th European Congress of Virology, Gdansk, Poland, May 4-7, 2023.
（2） Hatvani, L., Kondo, H., Suzuki, N., Kocsubé, S., Grogan, H. Viruses in the causal agents of dr y bubble disease:
Novel candidates for biological candidates for biological pest management. Mushroom Days, Brabanthallen's-Hertogenbosch, Netherlands, May 10 -12, 2023.
（3） Sato, Y, Suzuki, N. Yadokari/yadonushi nature: A virus in a virus in a fungus in a plant. The Second International
Molecular Plant Protection Congress, Orhangazi-Türkiye, Turkey, May 14- 21, 2023.
（4） Kondo, H. Screening for viruses in RNA-Seq data. Mini-symposium on Armillaria viruses, Swiss Federal ResearchInstitute WSL, Zurich, Switzerland, June 20, 2023.
（5） Fadli, M., Hisano, S., Kondo, H. Suzuki, N. Possible yadonusi/yadokari nature observed in a Japanese strain NBRC 4031
of Aspergillus foetidus. The 42nd Annual Meeting of the American Society for Virology 2023, Athens, Georgia, USA,
June 24-28, 2023.
（6） Telengech, P. K., Hyodo, K., Ichikawa, H., Kondo, H. Suzuki, N. Replication of single partitiviruses in hosts across three
kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia. The 42nd Annual Meeting of the American Society for Virology 2023, Athens,
Georgia, USA, June 24-28, 2023.
（7） Telengech, P. K., Hyodo, K., Ichikawa, H., Kondo, H., Suzuki N. Replication of single partitiviruses in hosts across three
kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia. 2023 IPSR International Forum on Plant Stress Sciences by/for JuniorResearchers, IPSR, Kurashiki, Japan, Dec. 1, 2023.

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)（1） Unoki, M., Inagaki, H., Miyamoto, K., Takaoka, Y., Shinya, T., Galis, I., Nozawa, A., Sawasaki, T., Nojiri, H., Ueda, M.,
Okada, K. Conserved transcriptional regulation system on the momilactone biosynthetic pathway in the moss with
distinct oxylipins as ligands. 24th International Conference on Plant Growth Substances (IPGSA 2023), Gyeongju,
Korea, July 4-8, 2023.
（2） Liu, Y., Yamamoto, N., Mori, M., Kuroda, M., Miyamoto, K., Wari, D., Shinya, T., Galis, I., Arimura, G. I., Sakamoto, T.,
Nojiri, H., Okada, K. Fate of diterpenoid phytoalexins: from induced biosynthesis to degradation, TERPNET 2023,
Davis, CA, Kazakhstan, July 31- Aug. 4, 2023.
（3） Galis, I. A path for the use of natural products in plant protection against insect herbivores. 3rd International Conference
On Tropical Agrifood, Feed & Fuel (ICTAFF) 2023, Balikpapan, Indonesia, Sep. 19, 2023.

植物環境微生物学グループ (Group of Plant Environmental Microbiology)（1） Pichaikarn, R., Tani, A. Isolation Characterisation of Barley Root-associated Bacteria. Plant Microbiota Research Network(PMRN), Online. Aug. 25, 2023.
（2） Grossi, E. M. C., Tani, A., Ulloa, M. R. Signal crosstalk between Methylobacterium sp. 2A and Arabidopsis thaliana. Plant
Microbiota Research Network (PMRN), Online, Aug. 25, 2023.
（3） Usami, F., Ohara, S., Kondo, K., Onduka, T., Koike, K., Ueki, S. Characterization of marine bacteria that support growthof Heterosigma akashiwo under phosphate-limiting conditions. The 20th International Conference on Harmful Algae,
Hiroshima, Nov. 5-10, 2023.
（4） Kishiro, K., Tani, A. Violacein production and its ecological advantages in a barley-root isolate, Duganella sp. R57. The
36th JSME and the 13th ASME, Hamamatsu, Shizuoka, Nov. 27-30, 2023.
（5） Fukuyama, S., Usami, F., Ohara, S., Onduka, T., Kondo, K., Koike, K., Ueki, S. A marine bacterium promotes the growthof a bloom-forming phytoplankton under phosphorus-depletion. The 36th JSME and the 13th ASME, Hamamatsu,
Shizuoka, Nov. 27-30, 2023.

遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ (Group of Genome Diversity)（1） Hisano, H. Regulation of pre-har vest sprouting by targeted mutagenesis of grain dormancy genes in barley. 15th
International Symposium on Pre-Harvest Sprouting in Cereals, Tsukuba, Japan, Oct. 4-6, 2023.
（2） Asuke, S., Tagle, G. A., Hyon, G. S., Niwamoto, D., Hisano, H., Sato, K., Tosa, Y. Cloning of Rmo2, a gene for resistance34

of barley to various host species-specific pathotypes of the blast fungus. The 3rd Barley Mutant Conference 2023,
Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（3） Hamada, Y., Anwar, N., Chen, G., Mishina, K., Sakuma, S., Nagano, A. J., Fukuoka, S., Milner, S., Hisano, H., Ning, S.,
Pourkheirandish, M., Tagiri, A., Kikuchi, S, Sassa, S., Mascher, M., Sato, K., Oono, Y., Koba, T., Komatsuda, T.
Identification of Super-open flowering 1 mutant gene in barley. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki,Japan, Oct. 8-10, 2023.
（4） Ma, J. F., Fujii-Kashino, M., Lei, G. J., Gu, M., Huang, H. L., Yamaji, N., Hisano, H., Saisho, D., Sato, K. Exploring mineraltransporter genes for better and safe barley production. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan,
Oct. 8-10, 2023.
（5） Abe, F., Kishi-Kaboshi, M., Yamaji, N., Chono, M., Hisano, H., Sato, K. Genome editing of TaQsd1 in common wheat. The
3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（6） Hisano, H. Regulation of pre-harvest sprouting by site-directed mutagenesis of grain dormancy genes in barley. The 3rd
Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（7） Huang, H. L., Hisano, H., Yamaji, N., Mitani-Ueno, N., Sato, K., Ma, J. F. HvSPDT-L is probably involved in redistributionof phosphorus in barley. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（8） Islam, M. T., Asuke, S., Hisano, H., Sato, K., Tosa, Y. A novel resistance resource found in Sv196, a Turkish accessionof barley (Hordeum vulgare), conferring resistance against Triticum isolates of Pyricularia oryzae. The 3rd Barley
Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（9） Matsushima, R., Hisano, H., Galis, I., Fujita, N., Sato, K. FLOURY ENDOSPERM 6 mutations enhance the sugar yphenotype caused by the loss of ISOAMYLASE1 in barley. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan,
Oct. 8-10, 2023.
（10）Nakamura, K., Hisano, H., Ikeda, Y. Ectopic expression of HvMADS58, an ortholog of AGAMOUS, caused homeotictransformations of floral organs in barley. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（11）Hisano, H., Sato, K. National Bioresource Project –Barley– Genetic resources for research of barley genome diversity.
The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（12）Saisho, D., Okada, Y. Empirical genetic research for sustainable barley production under warming environment. The 3rd
Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（13）Hirayama, T., Saisho, D., Kim, J. S., Okada, S., Ito, J., Matsuura, T., Hattori, K., Tsuji, H., Koda, S., Nishii, R., Umezaki,T., Mochida, K. Life course monitoring of plant hormones of barleys grown in the field conditions. The 3rd Barley
Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 8-10, 2023.
（14）Ito, J., Nomura, Y., Takahagi, K., Kim, J. S., Kashima, M., Okada, S., Sato, N., Shimizu, M., Saisho, D., Mochida, K.,
Hirayama, T., Tsuji, H. Dissection of developmental state transition in the shoot apical meristem of barley by single
meristem RNA-seq. The 3rd Barley Mutant Conference 2023, Kurashiki, Japan, Oct. 9-10, 2023.

ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
遺伝資源機能解析グループ (Group of Genetic Resources and Functions)（1） Taketa, S. Barley diversity preserved in genebanks is indispensable for gene hunting and pre-breeding. Use of Genetic
Resources in Breeding for Climate Change in the Nordic Region- Why Research and Innovation Do Matter,
NordGen PPP Conference, Malmö, Sweden (Hybrid), Feb. 1-2, 2023.
（2） Taketa, S. Barley albino lemma 1 mutants. The 3rd Barley Mutant Conference (3BMC), Kurashiki, Japan, Oct. 9-10, 2023.

統合ゲノム育種グループ (Group of Integrated Genomic Breeding)（1） Zhang, Q., Furuta, T., Kashihara, K., Ogawa, D., Yonemaru, J., Ma, J. F., Yamamoto, T. GWAS for elemental compositionin rice grain and straw across two multi-parental populations. IPSR International Forum on Plant Stress Sciences
2023, Kurashiki, Okayama, Dec. 1, 2023.

35

次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
作物デザイン研究チーム (Crop Design Research Team)（1） Kim, J. S., Ito, J., Takahagi, K., Kanatani, A., Shimizu, M., Uehara-Yamaguchi, Y., Inoue, K., Okada, S., Matsuura, T.,
Hattori, K., Ikeda, Y., Saisho, D., Tsuji, H., Hirayama, T., Sato, K., Mochida, K. Field transcriptome dynamics ofbarley during winter cultivation. 33rd International Conference on Arabidopsis Research, Chiba, Japan, June 5-9,
2023.

RECTOR プログラム (RECTOR Program)（1） Hippler, M. The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas, Princeton, New
Jersey, the USA, June 4-9, 2023.
（2） Hippler, M. Nordic Algae Symposium and the Nordic Photosynthesis Congress, Umeå, Sweden, June 19-21, 2023.
（3） Hippler, M. European Photosynthesis Workshop 2023, Lautrach, Germany, July 11-17, 2023.
（4） Hippler, M. Perspectives in Bioenergetics, Study Group "Bioenergetics" of the German Biochemical Society,
Rauischholhausen, Germany, Sep. 25-27, 2023.

36

講演およびシンポジウム発表(List of Domestic Conferences and Symposia)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group)（1） 小川 由・岩野 惠・川本晃大・栗栖源嗣・鹿内利治・坂本 亘 シロイヌナズナのグラナマージン局在性ダイナミン様タンパク質 FZL によるチラコイド膜の維持．第 64 回日本植物生理学会，仙台，3 月 15-17 日，2023．
（2） 八木宏樹・吉田善葵・三原衣織・高見常明・坂本 亘・嶋田知生・西村いくこ・上田晴子 ICP-MS によるシロイヌナ
ズナ溢泌液のイオノーム解析．第 64 回日本植物生理学会，仙台，3 月 15-17 日，2023．
（3） 桶川友季・佐藤 望・本橋 健・坂本 亘 シロイヌナズナの x- 型，y- 型チオレドキシン欠損変異株の解析．第 64 回日
本植物生理学会，仙台，3 月 15-17 日，2023．
（4） 高見常明・坂本 亘 オルガネラ DNA 分解異常が引き起こすオートファジー変異株早枯れ表現型の抑制機構について．
第 64 回日本植物生理学会，仙台，3 月 15-17 日，2023．
（5） Islam, M. F., Yamatani, H., Takami, T., Kusaba, M., Sakamoto W. Characterization of rice mutants lacking organelle
exonuclease DPD1．第 64 回日本植物生理学会，仙台，3 月 15-17 日，2023．
（6） 松島 良・久野 裕・金 俊植・Ivan Galis・三浦聡子・クロフツ尚子・追留那緒子・藤田直子・佐藤和広 多重変異体を用いたオオムギ澱粉変異の遺伝的相互作用解析 . 第 143 回 日本育種学会（春季大会）, 静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（7） Li, D., Sakamoto, W. Co-immunoprecipitation analysis of the protein interacting with VIPP1 involved in thylakoid
membrane remodeling．第 13 回日本光合成学会，名古屋，6 月 3-4 日，2023．
（8） 小川 由・岩野 惠・鹿内利治・坂本 亘 グラナマージン局在性膜リモデリングタンパク貨 FZL は過剰な pmf 存在下
でチラコイド膜を保護する．第 13 回日本光合成学会，名古屋，6 月 3-4 日，2023．
（9） 桶川友季・本橋 健・坂本 亘 x 型および y 型チオレドキシンは光化学系 I の電子受容体側の制御に寄与する．第 13回日本光合成学会，名古屋，6 月 3-4 日，2023．
（10）小川 由 「光合成の足場」チラコイド膜を整備する膜リモデリングタンパク質 . 第 28 回光合成学会若手の会セミ
ナー , 伊東 , 11 月 11-12 日 , 2023.
（11）松島 良・久野 裕・金 俊植・David Seung・藤田直子・佐藤和広 オオムギにおける澱粉関連酵素の多重変異体の解析 .
第１８回ムギ類研究会 , 瀬田 , 12 月 23-24 日，2023．

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)（1） 森 泉 岡山大における植物ホルモン定量解析の取り組み．第 64 回日本植物生理学会 植物ホルモン分析ワークショッ
プ，仙台，3 月 14 日 , 2023.
（2） 光本晏理・宇都木繁子・土屋善幸・且原真木 トマト原形質膜局在型アクアポリンの CO2 輸送活性の解析．第 64 回
日本植物生理学会，仙台 ( ハイブリッド )，3 月 10-17 日 , 2023.
（3） 平山隆志・金 俊植・持田恵一 ミトコンドリアにおける polyA 付加 mRNA の蓄積の影響を抑制するシロイヌナズナの変異について . 第 64 回日本植物生理学会 , 仙台 ( ハイブリッド ), 3 月 10-17 日 , 2023．
（4） 間宮章仁・山本荷葉子・小林健人・八木祐介・中村崇裕・平山隆志・深城英弘・杉山宗隆 植物ミトコンドリアのシトクロム c 成熟に関わる mRNA 編集とポリ A 付加の関係性について . 第 64 回日本植物生理学会、仙台 ( ハイブリッド )，3 月 10-17 日 , 2023.
（5） 中村光希・菊池優一・白神美瑞穂・小竹敬久・武田 真・池田陽子 オオムギの芒形成を担うエピゲノム制御因子 . 第64 回日本植物生理学会，仙台 ( ハイブリッド )，3 月 10-17 日 , 2023.
（6） 平田峻也・大河優奈・池田陽子・西村泰介・小林括平・賀屋秀隆 シロイヌナズナにおける de novo DNA メチル化技術の開発 . 第 64 回日本植物生理学会，仙台 ( ハイブリッド )，3 月 10-17 日 , 2023.
（7） 槻木竜二・池田陽子・森 仁志 転写伸長過程に着目した幹細胞らしさの生化学的解析 . 第 64 回日本植物生理学会，仙台 ( ハイブリッド )，3 月 10-17 日 , 2023.
（8） 氷見英子・松浦恭和・三浦秀穂・𠮷原尚哉・前川雅彦 コムギの種子色に及ぼす R-1 の遺伝子量効果 . 日本育種学会
第 143 回講演会 , 静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（9） 中村光希・菊池優一・白神美瑞穂・小竹敬久・武田 真・池田陽子 エピゲノム制御が担うオオムギの芒形成 . 第 1 回
植物生理若手の会 , 千葉 , 8 月 9-10 日 , 2023.
（10）池田陽子 ゼニゴケの DNA メチル化とトランスポゾン . 転移因子と宿主の相互作用による生命機能と進化（第 6 回転移因子研究会）, 8 月 24-25 日 , 2023.
（11）池田陽子・中村光希・十川太輔・西浜竜一・山岡尚平・荒木 崇・河内孝之・Mathieu Olivier・大和勝幸 ゼニゴケにおける生殖を介した DNA メチル化の伝達機構 . 日本植物学会第 87 回大会 , 札幌 , 9 月 7-9 日 , 2023.
（12）平田峻也・大河優奈・池田陽子・西村泰介・小林括平・賀屋秀隆 DNA メチル化酵素を用いたシロイヌナズナにおける de novo DNA メチル化技術の試み . 日本植物学会第 87 回大会 , 札幌 , 9 月 7-9 日 , 2023.
（13）森 愛理・Gaudin Valerie・松浦恭和・池田陽子・田村謙太郎 植物の免疫応答におけるインポーチン α の役割 . 日
本植物学会第 87 回大会 , 札幌 , 9 月 7-9 日 , 2023.

37

（14）井藤 純・野村有子・高萩航太郎・金 俊植・鹿島 誠・岡田聡史・佐藤奈緒・清水みなみ・最相大輔・持田恵一・平山隆志・
辻 寛之 シングルメリステム RNA-seq 解析によるオオムギ茎頂メリステムの発生ステート推移の解明 . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（15）中村光希・菊池優一・白神美瑞穂・小竹敬久・武田 真・池田陽子 エピゲノム制御を介したオオムギの芒形成機構の解析 .
日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（16）甲斐浩臣・尾上明日香・松浦恭和・最相大輔・田中 剛・原口雄飛・轟 貴智・安彦友美 オオムギにおける物理的な刺激による種子休眠の覚醒と植物ホルモンの発生消長 . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（17）間宮章仁・山本荷葉子・小林健人・八木祐介・中村崇裕・平山隆志・深城英弘・杉山宗隆 植物ミトコンドリア
mRNA のポリ A 付加はシトクロム c 成熟因子 ccb3/ccmC の mRNA 編集抑制によりシトクロム呼吸経路を負に制御する . 第 46 回日本分子生物学会 , 神戸 , 12 月 6-8 日 , 2023.

環境機能分子開発グループ (Group of Functional Biomolecular Discovery)（1） 杉本 学・力石和英・近藤雄基 酸化ヌクレオチド消去をするイネ OsNUDX2 の転写エラー抑制機能．日本宇宙生物科学会第 37 回大会，長崎，9 月 22-24 日，2023.
（2） 鈴木克周・清川一矢・山篠貴史・力石和英 コムギ内生菌アグロバクテリウムのサイトカイニン合成と合成遺伝子クラスター．第 46 回日本分子生物学会年会，神戸，12 月 6-8 日，2023.

土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ (Group of Plant Stress Physiology)（1） 山地直樹・三谷奈見季・小西範幸・馬 建鋒 イネのケイ素吸収を制御する長距離シグナルタンパク質の同定 . 第 64回日本植物生理学会年会 , 仙台 , 3 月 15-17 日 , 2023.
（2） 小西範幸・馬 建鋒 イネケイ酸輸送体 Lsi1 の偏在制御に対するホスファチジン酸の関与の検討 . 第 64 回日本植物生理学会年会 , 仙台 , 3 月 15-17 日 , 2023.
（3） Huang, S., Yamaji, N., Ma, J. F. OsMGT2 mediates the translocation and preferential distribution of magnesium in rice. 第 64 回
日本植物生理学会年会 , 仙台 , 3 月 15-17 日 , 2023.
（4） Huang, H., Hisano, H., Huang, S., Mitani-Ueno, N., Sato, K., Yamaji, N., Ma, J. F. Functional characterization of two genes
involved in phosphorus loading into barley grains. 第 64 回日本植物生理学会年会 , 仙台 , 3 月 15-17 日 , 2023.
Ge,
J.,
Ma, J. F. Physiological and molecular characterization of high Mn tolerance in Cd/Zn hyperaccumulator Sedum alfredii.
（5）
第 64 回日本植物生理学会年会 , 仙台 , 3 月 15-17 日 , 2023.
（6） 藤井理樹・山地直樹・馬 建鋒 イネのホウ酸吸収と根の形態及び構造との関連 . 第 64 回日本植物生理学会年会 , 仙台 ,3 月 15-17 日 , 2023.
（7） 黄 勝 イネのミネラル輸送体の機能解明．日本土壌肥料学会奨励賞 , 日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 , 愛媛 , 9
月 12-14 日 , 2023.
（8） 山地直樹・櫻井 玄・三谷奈見季・黄 勝・馬 建鋒 イネのケイ酸チャネル Lsi6 の変異体を用いたケイ素吸収・分配制
御の詳細解析．日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 , 愛媛 , 9 月 12-14 日 , 2023.
（9） 三谷奈見季・山地直樹・小西範幸・馬 建鋒 ケイ素応答性長距離シグナルの同定．日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 ,愛媛 , 9 月 12-14 日 , 2023.
（10）小西範幸・馬 建鋒 アルミニウム処理による ART1 のリン酸化と核蓄積．日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 , 愛媛 ,9 月 12-14 日 , 2023.
（11）黄 衡亮・久野 裕・三谷奈見季・馬 建鋒 Functional characterization of a HvSPDT-like gene in barley. 日本土壌肥料学会
2023 年度愛媛大会 , 愛媛 , 9 月 12-14 日 , 2023.
（12）葛 俊・車 景・余 恩・林 珊華・蔡 宜芳・馬 建鋒 Functional characterization of a rice NPF member, OsNPF4.2 with highexpression in the node. 日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 , 愛媛 , 9 月 12-14 日 , 2023.
（13）井上晋一郎・林 真妃・黄 勝・横正健剛・奥村将樹・木下俊則・馬 建鋒 シロイヌナズナにおける液胞へのマグネシウム輸送調節機構の解明．日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会 , 愛媛 , 9 月 12-14 日 , 2023.
（14）馬 建鋒 作物のミネラル輸送機構．紫綬褒章受賞講演，第 119 回日本土壌肥料学会関西支部講演会，神戸，12 月 7 日，
2023.

植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)（1） 宇都木繁子・且原真木 シロイヌナズナ液胞膜型アクアポリン AtTIP3 サブファミリーの水輸送活性調節と種子発達と発芽への影響．第 64 回日本植物生理学会，仙台（オンライン），3 月 13，15-17 日，2023．
（2） 小野峻太郎・且原真木 イオン透過性アクアポリンの Na+ イオンおよび K+ イオン輸送メカニズム．第 64 回日本植物38

生理学会，仙台（オンライン），3 月 13，15-17 日，2023．
（3） 佐藤良介・榊原 光・水口慎太郎・御堂育子・鈴木孝征・堀部貴紀・柘植尚志・且原真木・前島正義 サボテンの高温・乾燥耐性を支えるアクアポリンの組織分布と生理機能の解明．第 64 回日本植物生理学会，仙台（オンライン），
3 月 13，15-17 日，2023．
（4） 光本晏理・宇都木繁子・土屋善幸・且原真木・森 泉 トマト原形質膜局在型アクアポリンの CO2 輸送活性の解析．
第 64 回日本植物生理学会，仙台（オンライン），3 月 13，15-17 日，2023．
（5） Sasaki, T., Yamamoto, Y., Mori, I. C. Functional analyses of guard-cell-type ALMT proteins. 第 64 回日本植物生理学会，
仙台，3 月 13，15-17 日，2023．
（6） 且原真木・Sen Tran・小野修太朗・堀江智明 植物のイオン輸送性アクアポリン．第 17 回トランスポーター研究会，
名古屋，5 月 27 日，2023．
（7） 大西亜耶・且原真木 耐塩性オオムギの根水透過性（Lpr）下方制御に関わるアクアポリン HvPIP2;1 の Phos-tag®
SDS-PAGE を使ったリン酸化解析．第 17 回トランスポーター研究会，名古屋，5 月 27 日，2023．
（8） 山田大綱・Lydia Ratna Bunthara・田中 輝・小濱卓郎・丸山隼人・田中若菜・西田 翔・佐々木孝行・和崎 淳 低リ
ン耐性種 Hakea laurina のリンゴ酸輸送体 HalALMT1 の機能解析 . 植物の栄養研究会，北海道大学，9 月 5-6 日，
2023．
（9） 我妻忠雄・Toan Nguyen Sy・程 為国・田原 恒・且原真木・土屋善幸・俵谷圭太郎 根圏での H2O2 と Fe による
Fenton 反応を制御して、有機質資源利用と地球温暖化阻止を進める．日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会，松山，
9 月 12-14 日，2023．
（10）山田大綱・Lydia Ratna Bunthara・田中 輝・小濱卓郎・丸山隼人・田中若菜・西田 翔・佐々木孝行・和崎 淳 低リン耐性植物 Hakea laurina が形成するクラスター根における HalALMT1 の機能解析．日本土壌肥料学会 2023 年度
愛媛大会，松山，9 月 12-14 日，2023．

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)（1） Teklengech, P. K., Hyodo, K., Ichikawa, H., Kondo, H., Suzuki, N. Replication of single partitiviruses in hosts across three
kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia. The Online Annual Meeting of the Japanese Phytopathological Society,
Tokyo University of Agriculture, Atsugi, Kanagawa (Online), March 27-29, 2023.
（2） Shahi, S., Chiba, S., Takaki, Y., Suzuki, N. Low-level IRES activity likely contributes to the replication restrictionof Cr yphonectria hypovir us 1 in Cr yphonectria carpinicola. The Online Annual Meeting of the JapanesePhytopathological Society, Tokyo University of Agriculture, Atsugi, Kanagawa (Online), March 27-29, 2023.
（3） Hatvani, L., Kondo, H., Grogan, H., Suzuki, N. Examination of the potential impact of mycoviruses on the mushroom
pathogenic fungus Lecanicillium fungicola. The 37th Annual Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology
Society, Tokushima University Medical School, Tokushima, Sep. 2-3, 2023.
（4） 鈴木信弘 部会長講演 ネオウイルス学から植物病理学へ．令和 5 年度日本植物病理学会関西部会 , 近畿大学農学部 , 奈
良 , 9 月 23-24 日 , 2023.
（5） Abbhi Vanshika・佐藤友理沙・金森光太郎・水谷行善・佐藤育男・竹本大吾・近藤秀樹・鈴木信弘・須賀晴久・千葉壮太郎 FbLFV1 および D-RNA コードタンパク質は協調的に宿主 Fusarium boothii の生育阻害と病原性低下を誘導する . 令和 5 年度日本植物病理学会関西部会 , 近畿大学農学部 , 奈良 , 9 月 23-24 日 , 2023.
（6） 上田 茜・ニアン ソックティ・佐藤育男・竹本大吾・鈴木信弘・千葉壮太郎 Neurospora crassa 無細胞タンパク質合成系での菌類ウイルス IRES 活性の立証 . 令和 5 年度日本植物病理学会関西部会 , 近畿大学農学部 , 奈良 , 9 月 23-24
日 , 2023.
（7） 近藤花保・佐藤育男・竹本大吾・近藤秀樹・千葉壮太郎 BNYVV 病原性セグメント RNA3 を標的としたクロスプロテ
クションの検討 . 令和 5 年度日本植物病理学会関西部会 , 近畿大学農学部 , 奈良 , 9 月 23-24 日 , 2023.
（8） Hatvani, L., Kondo, H., Grogan, H., Suzuki, N. Viruses host viruses: Diverse dsRNA viruses host specific capsidless(+)
ssRNA yadokariviruses. The 70th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology, Sendai International Center,
Sendai, Sep. 26-28, 2023.
（9） Telengech, P. K., Hyodo, K., Ichikawa, H., Kondo, H., Suzuki, N. Replication of single partitiviruses in hosts across threeterrestrial kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia. The 70th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology,
Sendai International Center, Sendai, Sep. 26-28, 2023.

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)（1） Wari, D., Hojo, Y., Tani, A., Shinya, T., Galis, I. Brown planthopper harbors an abundance of microbes for utilization as
innovative source of plant defense elicitors．第 64 回日本植物生理学会年会，仙台（ハイブリッド），3 月 10-17 日，

392023．
（2） Osibe, D. A., Hojo, Y., Shinya, T., Galis, I. Rapid silicon distribution and defense in rice exposed to herbivory stress． 第
64 回日本植物生理学会年会，仙台（ハイブリッド），3 月 10-17 日，2023．
（3） 松島 良・久野 裕・金 俊植・Galis Ivan・三浦聡子・クロフツ尚子・追留那緒子・藤田直子・佐藤和広 多重変異体を用いたオオムギ澱粉変異の遺伝的相互作用解析．日本育種学会第 143 回講演会，静岡，3 月 17-18 日，2023．
（4） 神田恭和・新屋友規・前田 哲・Mujiono Kadis・北條優子・富田啓介・岡田憲典・鎌倉高志・Galis Ivan・森 昌樹 イ
ネ複合病害抵抗性遺伝子 BSR1 の過剰発現は植食性昆虫に対するファイトアレキシン蓄積および抵抗性を向上させる．令和 5 年度日本植物病理学会大会 , 厚木（オンライン），3 月 27-29 日，2023．
（5） 新屋友規 植物の昆虫食害認識における腸内細菌の関与．第 120 回醗酵学懇話会，大阪，8 月 8 日，2023．
（6） 新屋友規 植物はどのような分子を認識することで昆虫食害を感知するのか？第 17 回関西創農薬研究会，草津，10
月 13 日，2023．
（7） 出﨑能丈・吉岡裕司・林 海斗・二宮直也・野澤 彰・澤崎達也・新屋友規・Galis Ivan・有村源一郎 RALF ペプチド/ マレクチン型受容体キナーゼを介した害虫抵抗性機構の解析．生物環境イノベーション研究部門 第 4 回シンポジウム，東京，10 月 27 日，2023．
（8） 遠藤有希子・田中未来・谷村香織・出崎能丈・小澤理香・Maffei Massimo・新屋友規・Galis Ivan・有村源一郎 ナ
ミハダニ分泌エリシター「テトラニン」が担う植物防御応答の調整機構．生物環境イノベーション研究部門 第 4
回シンポジウム，東京，10 月 27 日，2023．
（9） 遠藤有希子・田中未来・谷村香織・出崎能丈・小澤理香・Maffei Massimo・新屋友規・Galis Ivan・有村源一郎 ナ
ミハダニ分泌エリシター「テトラニン」の植物―植食者共適応機構における機能．植物化学調節学会第 58 回大会，
川崎，11 月 17-19 日，2023．
（10）出﨑能丈・吉岡裕司・林 海斗・二宮直也・野澤 彰・澤崎達也・新屋友規・Galis Ivan・有村源一郎 RALF ペプチ
ド / マレクチン型受容体キナーゼを介した害虫抵抗性機構の解明．植物化学調節学会第 58 回大会，川崎，11 月
17-19 日，2023．

植物免疫デザイングループ (Plant Immune Design Group)（1） Fukada, F., Rössel, N., Glatter, T., Münch, K., Happel, P., Kahmann, R. A secreted virulence effector protein of thebiotrophic fungal plant pathogen Ustilago maydis. 第 96 回日本細菌学会 , 姫路，3 月 16-18 日 , 2023.
（2） Pingyu Wang・河野洋治 分泌ペプチド IRP1 はイネ免疫の サイトカインとして働く . 令和 5 年度日本植物病理学会
大会 , 神奈川（オンライン）, 3 月 27 日 , 2023.

植物環境微生物学グループ (Group of Plant Environmental Microbiology)（1） Wari, D., Hojo, Y., Tani, A., Shinya, T., Galis, I. Brown planthopper harbors an abundance of microbes for utilization as
innovative source of plant defense elicitors．第 64 回日本植物生理学会年会，仙台（ハイブリッド），3 月 10-17 日，
2023．
（2） 藤谷良子・柴田 猛・谷 明生 Methylobacterium aquaticum 22A における Lanmodulin の機能解析 . 日本農芸化学会
2023 年度大会 , 広島 ( オンライン ), 3 月 14−17 日 , 2023.

遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ (Group of Genome Diversity)（1） 久野 裕・加星光子・安倍史高・濱岡美香・宗森広美・八丈野 孝・Jochen Kumlehn・佐藤和広 近接ガイド RNA を使用した CRISPR/Cas9 法によるオオムギの高効率標的変異導入 . 日本育種学会第 143 回講演会 , 静岡 , 3 月 17-18
日 , 2023.
（2） 松島 良・久野 裕・Ivan Galis・三浦聡子・クロフツ尚子・追留那緒子・藤田直子・佐藤和広 多重変異体を用いたオ
オムギ澱粉変異の遺伝的相互作用解析 . 日本育種学会第 143 回講演会 , 静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（3） 加星光子・安倍史高・蝶野真喜子・久野 裕・佐藤和広 ゲノム編集で作出した TaQsd1 三重変異を持つコムギの野外栽培での休眠性評価 . 日本育種学会第 143 回講演会 , 静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（4） 最相大輔・岡田吉弘 温暖化環境で生じるオオムギ一穂粒数低下に関わる QTL の検出 . 日本育種学会第 143 回講演会 ,静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（5） 久野 裕 オオムギの組織分化における色素体制御の解明に向けて . 日本植物学会第 87 回大会・シンポジウム , 北海道 ,9 月 7-9 日 , 2023.
（6） 加星光子・安倍史高・山地奈美・蝶野真喜子・久野 裕・佐藤和広 ゲノム編集で作出した TaQsd1 三重変異を持つ
コムギの実験環境と野外栽培での形質評価 . 第 40 回日本植物バイオテクノロジー学会大会 , 千葉 , 9 月 10-13 日 ,

40

2023
（7） 久野 裕・坂井寛章・濱岡美香・宗森広美・安倍史高・佐藤和広・Patrick M. Hayes 標的変異導入による醸造用裸性オ
オムギの創出 . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（8） 白土寛子・最相大輔・久野 裕 土壌 pH がオオムギの農業関連形質に及ぼす影響 . 第 15 回中国地域育種談話会 , 鳥取 ,9 月 23-24 日 , 2023.
（9） 澤田真衣・久野 裕・佐久間 俊 Golden Promise から新たに見つかった六条突然変異体の遺伝解析 . 第 15 回中国地域育種談話会 , 鳥取 , 9 月 23-24 日 , 2023.
（10）小出陽菜・長野眞依・渡邊隆文・小林括平・吉田健太郎・久野 裕・八丈野 孝 GCaMP6f を利用したオオムギうどん
こ病菌侵入抵抗性におけるカルシウムイオンの動態解析 . 令和 5 年度日本植物病理学会関西部会 , 近畿大学 , 9 月
23-24 日 , 2023.
（11）久野 裕・金 俊植・永田典子・松島 良・藤井 祥・岩瀬 哲・八丈野 孝・小林康一 オオムギのプラスチド相転換ダイ
ナミクス ～組織分化における色素体制御を明らかにする～ . 第 18 回ムギ類研究会 , 龍谷大学 , 12 月 23-24 日 ,2023.
（12）白土寛子・最相大輔・久野 裕 酸性土壌およびアルカリ性土壌で栽培したオオムギの農業関連形質に関する遺伝学的解析 . 第 18 回ムギ類研究会 , 龍谷大学 , 12 月 23-24 日 , 2023.
（13）Rajaei, N., Hisano, H., Taketa, S. Genetic analysis of Japanese semi-dwarf and stiff culm barley accessions with a focus on
the cultivar ʻHaganemugiʼ. 第 18 回ムギ類研究会 , 龍谷大学 , 12 月 23-24 日 , 2023.
（14）加星光子・安倍史高・神谷容子・川浦香奈子・久野 裕・佐藤和広・水野信之・小林史典・吉田健太郎・松岡由浩・
宅見薫雄 コムギのゲノム編集効率の向上と合成コムギのゲノム編集系の開発 . 第 18 回ムギ類研究会 , 龍谷大学 ,12 月 23-24 日 , 2023.

ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
統合ゲノム育種グループ (Group of Integrated Genomic Breeding)（1） 山本敏央・古田智敬・柏原壱成・張 乾・山本英司・大谷寿一・溝淵律子・小川大輔・米丸淳一・矢野昌裕 イネゲノムシャッ
フリング集団の遺伝構造 . 日本育種学会第 143 回講演会 , 静岡 , 3 月 17-18 日 , 2023.
（2） 鳴坂真理・関根健太郎・畑中唯史・長岐清孝・鳴坂義弘 ゲットウ由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物
ウイルス剤の開発研究 . 令和 5 年度日本植物病理学会大会 , オンライン開催 , 3 月 27-29 日 , 2023.
（3） 長岐清孝・田中啓介・赤木剛士・杉山立志・和久井健司 ショウガセントロメア領域の解析 . 日本遺伝学会第 95 回大会 ,熊本 , 9 月 6-8 日 , 2023.
（4） 古田智敬・佐藤 豊・吉村 淳・芦苅基行 アジアイネゲノムとの網羅的オーソログ解析に基づくアフリカイネゲノムの特徴づけ . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（5） 岡 大晴・古田智敬・牟 竑瑞・柏原壱成・長岐清孝・貴島祐治・山本敏央 イネ種間雑種 4 倍体の後代分離集団の
GWAS 結果から予測される QTL の dosage 効果とヘテロシス . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸市 , 9 月 16-17 日 ,2023.
（6） Mu, H., Furuta, T., Oka, T., Nagaki, K., Kishima, Y., Yamamoto, T. Comparison of gene expression profiles between
interspecific tetraploid rice and its cultivated rice parents. 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（7） 岡 大晴・古田智敬・柏原壱成・牟 竑瑞・貴島祐治・長岐清孝・山本敏央 O. sativa と O. glaberrima の 4 倍体種間雑種イネで見い出だされた種子および花粉稔性の向上に関わる遺伝領域 . 日本育種学会第 144 回講演会 , 神戸 , 9 月
16-17 日 , 2023.
（8） Zhang, Q., Furuta, T., Kashihara, K., Ogawa, D., Yonemaru, J., Ma, J. F., Yamamoto, T. Comparison of QTLs of elemental
content in rice grain and straw estimated by GWAS of two multi-parental populations. 日本育種学会第 144 回講演会 ,神戸市 , 9 月 16-17 日 , 2023.
（9） Mu, H., Furuta, T., Oka, T., Nagaki, K., Kishima, Y., Kato, H., Koshiishi Y., Yamamoto, T. Differentially expression
analysis between synthetic interspecific hybrids and its cultivated parents in rice. 第15 回中国地区育種談話会 , 鳥取 ,9 月 23 日 , 2023.
（10）Zhang, Q., Furuta, T., Kashihara, K., Ogawa, D., Yonemaru, J., Ma, J. F., Yamamoto, T. Comparison of phenotypes andhaplotypes at candidate gene loci involving elemental contents revealed by rice multi-parental populations. 第 15 回
中国地区育種談話会 , 鳥取 , 9 月 23 日 , 2023.
（11）岡 大晴・古田智敬・牟 竑瑞・柏原壱成・長岐清孝・貴島祐治・山本敏央 イネ種間雑種 4 倍体の後代分離集団で検出された農業形質関連 QTL の dosage 効果とヘテロシスの予測 . 第 15 回中国地区育種談話会 , 鳥取 , 9 月 23 日 ,2023.
（12）長岐清孝・鳴坂真理・鳴坂義弘 南西諸島に自生する Alpinia 属植物のセントロメア DNA 配列の解析 . 染色体学会第74 回年会 , オンライン開催 , 10 月 21-22 日 , 2023.
（13）鳴坂義弘・関根健太郎・長岐清孝・鳴坂真理 月桃由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物ウイルス剤の開41

発研究．第 46 回日本分子生物学会年会，神戸ポートアイランド，12 月 6-8 日，2023.

次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
フィールドフローラ研究チーム (Field Flora Research Team)（1） 谷 明生・最相大輔・山地直樹・山下 純・小橋理絵子・山本敏央・門田有希・中川智行・持田恵一 イネ・オオムギ二
毛作における根圏微生物群集構造の時系列変遷 . 日本農芸化学会 2023 年度大会 , 広島 ( オンライン ), 3 月 14−17
日 , 2023.
（2） 谷 明生・最相大輔・山地直樹・山下 純・小橋理絵子・山本敏央・門田有希・中川智行・持田恵一 イネ・オオムギ二
毛作における根圏微生物群集構造の時系列変遷と機能 . 日本農芸化学会中四国支部西日本支部合同大会 , 高知 , 9
月 21-22 日 , 2023.

RECTOR プログラム (RECTOR Program)（1） 小澤真一郎 光捕集タンパク質複合体構成サブユニットの安定性．第 16 回クラミドモナス研究会，東京（ハイブリッド），3 月 3-4 日，2023.
（2） Ozawa, S. I., Buchert, F., Reuys, R., Hippler, M., Takahashi, Y. The amino acid substitution, PETC-Pro171Leu, slowdown
electron transfer in the cytochrome b 6 f complex under anoxic conditions in the green alga Chlamydomonas
reinhardtii. 第 64 回日本植物生理学会，仙台（ハイブリッド），3 月 15-17 日，2023.
（3） 黒田洋詩・小澤真一郎・高橋裕一郎 緑藻クラミドモナス集光性クロロフィルタンパク質の輸送に関与する cpSRPのアフィニティ精製．第 64 回日本植物生理学会，仙台（ハイブリッド），3 月 15-17 日，2023.
（4） Ozawa, S. I., Buchert, F., Reuys, R., Milrad, Y., Baymann, F., Hippler, M., Takahashi, Y. The mutant analysis of amino acidsubstitution at PETC subunit in the cytochrome b6 f complex in the green alga Chlamydomonas reinhardtii. 第 13 回
日本光合成学会年会およびシンポジウム，名古屋，6 月 3-4 日，2023.
（5） Sireesha Kodru・Sreedhar Nellaepalli・小澤真一郎・佐藤千紘・黒田洋詩・田中亮一・Krishna K. Niyogi・高橋裕一
郎 ラニルゲラニルクロロフィルをもつクロロフィルタンパク複合体の解析．第 13 回日本光合成学会年会およびシンポジウム，名古屋，6 月 3-4 日，2023.
（6） Kodru Sireesha・Nellaepalli Sreedhar・小澤真一郎・佐藤千紘・黒田洋詩・田中亮一・Niyogi Krishuna・高橋裕一郎
LIL3/GGR を欠損した変異株のクロロフィルタンパク質の機能解析．第 87 回日本植物学会年会，札幌（ハイブリッド），9 月 7-9 日，2023.
（7） 小澤真一郎 緑藻クラミドモナスにおける、光捕集タンパク質複合体構成サブユニット欠損株の解析．第 17 回クラミドモナス研究会，高知（ハイブリッド），9 月 26-27 日，2023.

42

研究所員が主催したシンポジウム等(List of Symposium Superintended by the Member of Institute)
オオムギ研究の未来開拓ワークショップ（第 5 回 作物イノベーション研究 WS）
日程：2023 年 2 月 8 日、9 日
場所：岡山大学資源植物科学研究所
オーガナイザー：久野 裕・近藤秀樹・松島 良・三谷奈見季（岡山大学・植物研）
１．ゲノム改変技術とライブイメージングの現状
久野 裕（岡山大学・植物研）
２．うどんこ病菌との相互作用
八丈野 孝（愛媛大学）
３．小麦育種家から見た大麦育種と研究加藤啓太（農研機構）
４．穂の形態形成遺伝子
佐久間 俊（鳥取大学）
５．シングルメリステム RNA-seq とイメージングから探る茎頂部の発生ステート遷移
井藤 純（横浜市立大学）
６．澱粉関連遺伝子間の遺伝的相互作用
松島 良（岡山大学・植物研）
７．育種につながる大麦研究中田 克（農研機構）
８．農業生態系のウイルス叢解明
近藤秀樹（岡山大学・植物研）
９．ウイルス多様性解明と抵抗性遺伝の同定
大野陽子（農研機構）
10．オオムギ遺伝資源ｘ環境相互作用の育種利用基盤の開発
最相大輔（岡山大学・植物研）
11．出穂期チューニングに向けた早生遺伝子の解明
西田英隆（岡山大学）

38th IPSR International Symposium and 14th Symposium on Plant Stress Science-Toward a better understanding of interactions among plants,
other organisms and environmentsFebruary 27-28, 2023
Venue: Kurashiki Geibunkan
Organizers: Jian Feng Ma (IPSR, Okayama University)
Feb. 27
1. Special lecture
Commemorative lecture of receiving national medal with purple ribbon
Transport of mineral elements in plants and me
Jian Feng Ma (IPSR, Okayama University, Japan)
2. Genomic signatures for environmental adaptation in barley
Chengdao Li (Murdoch University, Australia)
3. Evolution of light sensitivity of phytochrome and plant speciation
Hajime Ikeda (IPSR, Okayama University, Japan)
4. Peptide ligand-mediated trade-off between plant growth and stress response
Yoshikatsu Matsubayashi (Nagoya University, Japan)
5. Silicon in rice: a long journey from uptake to deposition
Namiki Mitani-Ueno (IPSR, Okayama University, Japan)

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6. Adaptive mechanisms of leguminous plants to nitrogen environment
Takuya Suzaki (University of Tsukuba, Japan)
7. Cross-kingdom viral infection in agroecosystems
Hideki Kondo (IPSR, Okayama University, Japan)
Feb. 28
8. Lessons from rice defense against herbivores: What really matters?
Ivan Galis (IPSR, Okayama University, Japan)
9. Molecular mechanism of host recognition in parasitic plants
Ken Shirasu (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Japan)
10. Unravelling the plant manipulation by geminiviruses
Rosa Lozano-Duran (Universität Tübingen, Germany)
11. Evolution of plastic sexes in plants : recurrent scrap and rebuild
Takashi Akagi (Okayama University, Japan)

植物ホルモン分析ワークショップ
日程：2023 年 3 月 14 日
場所：仙台市（ハイブリッド）
オーガナイザー：朝比奈雅志（帝京大学）・森 泉（岡山大学・植物研）
始めに

朝比奈雅志
１．「レーザーマイクロダイセクションを用いた時空間的ホルモン解析」
朝比奈雅志（帝京大学 ･ バイオサイエンス学科）
２．「ブラシノステロイドとストリゴラクトンの定量分析」
野村崇人（宇都宮大学・バイオサイエンス教育研究センター）
３．「実は誰も見たことがないオーキシンの細胞間の移動」
土屋雄一朗（名古屋大学・ITbM）
４．「岡山大における植物ホルモン定量解析の取り組み」
森 泉（岡山大学・資源植物科学研究所）
５．「虫こぶ形成のしくみ；ホルモン分析からのヒント」
平野朋子（京都府立大学・生命環境科学研究科）
６．「植物ホルモンと性における進化の多様性」
赤木剛士（岡山大学・環境生命科学研究科）
総合討論
終わりに
森泉

第 15 回植物生体膜シンポジウム
日程：2023 年 3 月 17 日
場所：東北大学川内北キャンパス（仙台）オーガナイザー：且原真木・森 泉（岡山大学・植物研）
招待講演
１．Regulation of vacuolar phosphate transporters and their impact on plant immunity
Tzyy-Jen Chiou（中央研究院）
２．植物電気生理学から始まった 40 年
三村徹郎（国立成功大学）

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第 6 回 植物病理を紡ぐ会
日程：2023 年 3 月 25 日
場所：オンライン
オーガナイザー：浅井秀太（理化学研究所）・安達広明（京都大学）・鵜家綾香（国際農研）
・深田史美（岡山大学・植物研）・峯 彰（京都大学）
招待講演
１．博士号取得までの道のり～経験 × 選択の積み重ね～
坂田七海（筑波大学）
２．農機メーカーであるヤンマーが取り組む「植物病理研究」について
藤原正幸（ヤンマーホールディングス株式会社）
３．発病抑止土壌をつくるという夢を叶えたい
清水将文（岐阜大学）
４．植物マイクロバイオータ研究の新時代を創り出すために
中野亮平 トーマス（マックスプランク植物育種学研究所）
５．植物病理学との出会いが創った道
眞山滋志（吉備国際大学）

第 55 回 岡山植物病理セミナー
日程：2023 年 5 月 17 日
場所：岡山大学資源植物科学研究所（ハイブリッド）
オーガナイザー：河野洋治（岡山大学・植物研）
招待講演
１．Type III effector の標的から見えてきたタバコ野火病菌の感染戦略
松井英譲（岡山大学）
２．糖は植物の免疫応答の調節を行うカギとなる
山田晃嗣（徳島大学）
３．微生物を活用した生物防除のヤンマーにおける意義と実際の取組
梅木大輔（ヤンマーホールディングス株式会社）

第６回転移因子研究会：転移因子と宿主の相互作用による生命機能と進化
日程：2023 年 8 月 24 日、25 日
場所：国立遺伝学研究所（ハイブリッド）
オーガナイザー：池田陽子（岡山大学・植物研）・一柳健司（名古屋大学）・齋藤都暁（国立遺伝学研究所）

8 月 24 日
はじめに

一柳健司（名古屋大学）
１．ゼニゴケの DNA メチル化とトランスポゾン
池田陽子（岡山大学・植物研）
２．シロイヌナズナはトランスポゾンと遺伝子をどのように識別するのか
藤 泰子（東京工業大学）
３．ミヤコグサの交雑集団におけるレトロトランスポゾンの活性化
深井英吾（新潟大学）
４．エピジェネティクスの遺伝学―シロイヌナズナ自然集団の一例
佐々木江理子（九州大学）

45

５．アサガオの主要な変異原 Tpn1 ファミリーについて
水成友紀（九州大学）
６．アズキ近縁種における WOX 転写因子の大増殖
内藤 健（遺伝資源研究センター）
７．有羊膜動物におけるトランスポゾン由来遺伝子の多様性
北尾晃一（名古屋大学）
８．ウイルス由来の遺伝子の進化モデル再検証
中川 草（東海大学）
９．大規模並列レポーターアッセイ（MPRA）による転移因子エンハンサーの機能解析
井上詞貴（京都大学）
8 月 25 日
10．哺乳類の SINE の発現制御機構
一柳健司（名古屋大学）
11．マウス全能性細胞におけるレトロトランスポゾン MERVL の機能
石津大嗣（慶應大学）
12．テトラヒメナのトランスポゾン排除機構
片岡研介（基礎生物学研究所）
13．出芽酵母 Ty1 の +1 Nucleosome はどこにあるか？
増本博司（長崎大学）
14．出芽酵母 Ty1 の転移は選択的オートファジーによって抑制される
鈴木邦律（東京大学）
15．分断化された tRNA および rRNA 遺伝子と転移因子
金井昭夫（慶應大学）
16．Torimochi は外来配列を捕獲する piRNA cluster であると同時に、カイコ培養細胞において最も活発に転移しているト
ランスポゾンである
庄司佳祐（東京大学）
17．ショウジョウバエ TE 由来タンパク質の動態と機能
齋藤都暁（国立遺伝学研究所）
おわりに
池田陽子（岡山大学・植物研）

Plant Microbiota Research Network 第３回オンラインシンポジウム
日程：2023 年 8 月 25 日
場所：オンライン
オーガナイザー：大津美奈（奈良先端科学技術大学院大学）
・川原田泰之（岩手大学）
・亀岡 啓（CAS-JIC）・杉山暁史（京都大学）
・深田史美（岡山大学・植物研）・中野亮平 トーマス（北海道大学）
１．植物―微生物相互作用研究から始まったバクテリアゲノム研究のフロンティア
按田瑞恵（東京大学）
２．微生物が支える米づくり ―養分獲得促進とメタン発生抑制―
新庄莉奈（名古屋大学）
３．単一の変異で大腸菌は昆虫必須共生細菌へと進化する
古賀隆一（産業技術総合研究所）
４．従属栄養植物の進化における免疫機能の役割について
富永貴哉（奈良先端科学技術大学院大学）
５．自然環境下でカブモザイクウイルスのハクサンハタザオへの感染はアブラムシ個体数を減少させる
大坪 雅（京都大学）
６．細菌から見た植物特化代謝物を介した植物マイクロバイオータ形成
島﨑智久（北海道大学）

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令和 5 年度日本植物病理学会関西部会
日程：2023 年 9 月 22 日
場所：近畿大学・農学部
オーガナイザー：安達広明（京都大学）・大津美奈（奈良先端科学技術大学院大学）
・佐藤育夫（名古屋大学）・津島綾子（大阪府立大学）・都筑正行（高知大学）・兵頭 究（岡山大学・植物研）
・深田史美（岡山大学・植物研）・松井英譲（岡山大学）・峯 彰（京都大学）・山口公志（近畿大学）
１．顕微鏡観察から見えてくる植物ウイルスの感染メカニズム高田昌汰（京都大学）
２．ゲノムから見る Fusarium oxysporum の植物病原性 / 非病原性と宿主適応
齊藤大幹（石川県立大学）
３．小さな大敵、植物に寄生する線虫のはなし
大津美奈（奈良先端科学技術大学院大学／ JST さきがけ）

70th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology Symposium III"Viral ways of life: their origin and diversification"
September 27, 2023
Venue: Sendai International Center, Japan
Conveners: Nobuhiro Suzuki (IPSR, Okayama University) and Hideki Takahashi (Tohoku University)
1. Introduction to Symposium III
Nobuhiro Suzuki (IPSR, Okayama University)
2. Cross-kingdom infection: An alternative route of fungal viruses spread in nature Widespread occurrence of viroid-like
replicators in fungi: a glimpse at the origin of new viral forms?
Massimo Turina (Institute for Sustainable Plant Protection, National Research Council of Italy)
3. Insight into the evolution of positive-strand RNA viruses through the identification of the membrane-associated domain of a
replicase
Ken Komatsu (Graduate School of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology)
4. The hunt for 5ʼ-Caps by plant- and animal/human infecting viruses belonging to the segmented Negative Strand RNA
Viruses
Richard Kormelink (Department of Plant Sciences, Wageningen University)
5. Unexpected survival strategy of Y-satellite RNA of cucumber mosaic virus
Chikara Masuta (Research Faculty of Agriculture, Hokkaido University)

The 3rd Barley Mutant Conference (3BMC)
October 8-10, 2023
Venue: IPSR, Okayama University and Kurashiki Geibunkan
Organizers: Kazuhiro Sato (IPSR, Okayama University), Hiroshi Hisano (IPSR, Okayama University), Ryo Matsushima (IPSR,
Okayama University), Katsuyuki Kakeda (Mie University), Shun Sakuma (Tottori University)
1. The genetic control of short rachilla hair 1
Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK))
2. Identification of a dense spike gene deficient in Japanese landraces and in a Scandinavian barley collection
Mats Hansson (Lund University)
3. Identification of Super-open flowering 1 mutant gene in barley
Takao Komatsuda (Shandong Academy of Agricultural Sciences)
4. Establishing a genetic blueprint for floral organ development in barley
Matthew Tucker (University of Adelaide)
5. Surgical manipulation of barley inflorescence meristem

47

Hiroyuki Tsuji (Nagoya University)
6. Genetic factors controlling grain number per spike
Thorsten Schnurbusch (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK))
7. Hunting the Hidden: Exploring a Developmental Gene in Barley
Agatha Walla (Institute of Plant Genetics, Heinrich Heine University)
8. Genetic control of awn roughness in barley
Muhammad Awais (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK))
9. Mutant collections derived from wild barley with chronic irradiation accelerate gene cloning
Shun Sakuma (Tottori University)
10. Exploring mineral transporter genes for better and safe barley production
Jian Feng Ma (IPSR, Okayama University)
11. Functional mutations of HvHKT1;5 influence yield related traits and composition of barley grain
Kelly Houston (The James Hutton Institute)
12. Ca2+ signal pathway negatively regulates barley salt tolerance
Qiufang Shen (Zhejiang University)
13. Interplay of starch debranching enzyme and its inhibitor is mediated by Redox-Activated SPL transcription factor
Zhou Zhou (McGill University)
14. Natural and induced variations in the grain dormancy gene MKK3
Morten Egevang Jørgensen (Carlsberg Research Laboratory)
15. How will cheap genome sequences help mutant research?
Martin Mascher (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK))
16. Cloning of Rmo2, a gene for resistance in barley to various host species-specific pathotypes of the blast fungus
Soichiro Asuke (Kobe University)
17. Genome-wide association mapping of leaf rust resistance in wild barley based on whole genome sequence data
Brian J. Steffenson (University of Minnesota)
18. Manipulation of mixed-linkage (1,3;1,4)-ꞵ-glucan in barley using gene editing technology
Guillermo Garcia Gimenez (La Trobe University)
19. Using whole genome shotgun sequencing to explore mutants of the Bomwan NIL collection
Miriam Schreiber (The James Hutton Institute)
20. JUST FIND-IT. Harnessing the powers of induced mutagenesis
Christoph Dockter (Carlsberg Research Laboratory)
21. Rapid evolution of domesticated barley
Robbie Waugh (The James Hutton Institute)
22. Boosting photosynthesis to deliver next generation barley plants for the circular bioeconomy
Paolo Pesaresi (University of Milano)
23. Utilization of mutation genes in Australian barley breeding
Chengdao Li (Murdoch University)
24. HTX mutagenesis population for forward and reverse genetic studies in barley
Ping Yang (Chinese Academy of Agricultural Sciences)
25. HvGA20ox2 synergistically regulates plant height and malt quality traits in barley
Lingzhen Ye (Zhejiang University)

IPSR Joint Usage/Research Center Workshop
October 11, 2023
Venue: IPSR, Okayama University
Organizers: Kazuhiro Sato, Hiroshi Hisano (IPSR, Okayama University)
1. Employing barley mutants to dissect a chlorophyll biosynthetic enzyme
Mats Hansson (Lund University)
2. Pre-breeding for climate-resilient cereals adapted to Nordic growing conditions
Therése Bengtsson (Swedish University of Agricultural Sciences)
3. Metabolic responses to early-season drought stress in Nordic spring wheat
Ronja Wonneberger (Swedish University of Agricultural Sciences)48

4. Acceleration with a purpose - Trait development for sustainable beer production
Christoph Dockter (Carlsberg Research Laboratory)
5. Investigating covered smut resistance in naked barley
Brigid Meints (Oregon State University)
6. High resolution mapping of Spt2: a novel hybrid susceptibility locus within barley
Shaun Clare (Washington State University)

令和 5 年度岡山大学資源植物科学研究所公開講座プログラム（倉敷市大学連携講座）
日程：2023 年 10 月 28 日
場所：岡山大学資源植物科学研究所
１．悪いヤツだけじゃない！植物と関わるウイルスたち
近藤秀樹（岡山大学・植物研）
２．遺伝子発現スイッチをみる
長岐清孝（岡山大学・植物研）

2023 International Forum on Plant Stress Sciences by/for Junior Researchers
December 1, 2023
Venue: IPSR, Okayama University, Japan (Hybrid)
Organizers: Paul Telengech, Yuki Okegawa, Fumi Fukada, Noriyuki Konishi, Toshio Yamamoto, Nobuhiro Suzuki(IPSR, Okayama University)
OPENING REMARKS
Sarah Ibiang (IPSR, Okayama University, Japan)
SESSION I
1. Potential of entomopathogenic nematodes of the genus Heterorhabditis in controlling fall armyworm pests (Spodoptera
frugiperda J. E Smith)
Norma Gupita (Mulawarman University, Indonesia) – Onsite
2. Chloroplast envelope protein RER3 maintain chloroplast transcription with nucleoid protein PTAC5 under heat stress in C4
Flaveria
Ryusei Inoue (Kwansei Gakuin University, Japan) – Onsite
3. Replication of single partitiviruses in hosts across three kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia
Paul Telengech (IPSR, Okayama University, Japan) – Onsite
4. Effect of abiotic stresses on kimchi cabbage (Brassica rapa) production in Korea: Historical patterns, future projections, andadaptation strategies
Kwang-Hyung Kim (Seoul National University, South Korea) – Onsite
5. Effects on the sporogenesis and biocontrol functions of Trichoderma spp. by the mycoviruses
Beilei Wu (Chinese Academy of Agricultural Sciences, China) – Online
6. Adapting to adaptive: Evolutionary insights into biological networks and stress homeostasis in land plants
Ting-Ying Wu (Institute of Plant and Microbial Biology, Academia Sinica, Taiwan) – Online
SESSION II
1. GWAS for elemental composition in rice grain and straw using two multi-parental populations
Qian Zhang (IPSR, Okayama University, Japan) – Onsite
2. Effect of the commensal bacterium Rhizobium vitis VAR03-1 on arabidopsis root growth under various nutrient deficiency
conditions
Niarsi Merry Hemelda (Okayama University, Japan) – Onsite49

3. Iron deficiency specific enzyme evolved for efficient Fe homeostasis
Jyoti Aggarwal (National Chung Hsing University, Taiwan) – Onsite
4. Nitrogen deficiency alters cell wall structures of Sorghum bicolor
Reza Ramdan Rivai (Kyoto University, Japan) – Onsite
5. Revealing the secrets of plant viral genomes: New starts for protein synthesis and their pathogenesis
Ching-Wen Chiu (Biotechnology Center in Southern Taiwan, Academia Sinica, Taiwan) – Online
6. Chromosomal engineering of a plant pathogenic fungus Verticillium dahliae to investigate its genome evolution process
Yukiyo Sato (University of Cologne, Germany) – Online
KEYNOTE LECTURE
Plant stress sciences with a focus on plant/virus interactions
Aiming Wang (Agriculture and Agri-Food Canada - AAFC and University of Western Ontario, Canada) – Onsite
OPEN DISCUSSION: HOW TO ENJOY YOUR ACADEMIC LIFE AND NAVIGATE YOUR CAREER PATH
Panelists:
Aiming Wang (Agriculture and Agri-Food Canada - AAFC and University of Western Ontario, Canada)– Onsite
Ivan Galis (IPSR, Okayama University) – Onsite
Massimo Turina (IPSP-CNR, Italy) – Online
Carolina Cornejo (Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL, Switzerlamd)– Online
Ting-Yang Wu (Institute of Plant and Microbial Biology, Academia Sinica, Taiwan) – Online

第 56 回岡山植物病理セミナー
日程：2023 年 12 月 9 日
場所：岡山大学資源植物科学研究所（ハイブリッド）
オーガナイザー：兵頭 究（岡山大学・植物研）
１．ER—細胞膜接着部位と植物ウイルス細胞間移行の関係
石川一也（岡山大学 学術研究院医歯薬学域）
２．六倍体サツマイモにおける線虫抵抗性遺伝子の同定と育種基盤の構築
門田有希（岡山大学 学術研究院環境生命自然科学学域）

50

学会賞等 (Awards)
光 環 境 適 応 研 究 グ ル ー プ , Ogawa, Yu. (Doctor course Student), Best Poster Award, The function of thylakoid membrane
remodeling in plant chloroplasts in optimizing photosynthesis. FY2022 International Symposium on Environmental
and Life Science, Japan, Jan. 24, 2023.
光 環 境 適 応 研 究 グ ル ー プ , Wacera Fiona Wahinya (Technical Assistant), Best Poster Award, Grain ionomics of a sorghum
recombinant inbred population reveals a major QTL for differential cadmium accumulation. FY2022 International
Symposium on Environmental and Life Science, Okayama, Japan, Jan. 24, 2023.
植物ストレス学グループ，Konishi Noriyuki (Assistant Professor), Best Poster Award, Clathrin-mediated endocytosis is not
required for maintaining the polar localization of mineral transporters in rice. 19th International Workshop on Plant
Membrane Biology, March 27-31, 2023.
植物ストレス学グループ，Huang Sheng (Special Contract Personnel: Assistant Professor), Best Poster Award, Local distributionof manganese to leaf sheath is mediated by OsNramp5 in rice. 19th International Workshop on Plant Membrane
Biology, March 27-31, 2023.
植 物 ス ト レ ス 学 グ ル ー プ，Wang Pei Tong (JSPS Foreign Postdoctoral Fellow), Best Poster Award, A K+/Ca2+ transporter
OsSKOR is involved in Ca accumulation in rice grain. 19th International Workshop on Plant Membrane Biology,
March 27-31, 2023.
植物ストレス学グループ，Ma Jian Feng (Professor), Frontiers Planet Prize, Frontiers Research Foundation, April 27, 2023.
植物・微生物相互作用グループ，Paul Telengech（JSPS Fellow），American Society for Virology Postdoctoral Scholar TravelAward, Replication of single partitiviruses in hosts across three kingdoms; Fungi, Plantae and Animalia. The 42nd
Annual Meeting of the American Society for Virology 2023, Athens, Georgia, USA, June 24-28, 2023.
環境応答機構研究グループ，中村光希（博士後期課程 2 年）, 第 1 回植物生理若手の会 アグロデザインスタジオ賞 副賞 , エ
ピゲノム制御が担うオオムギの芒形成 , 8 月 10 日 , 2023.
植物ストレス学グループ，黄 勝（特別契約職員助教），日本土壌肥料学会奨励賞，日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会，
イネのミネラル輸送体の機能解明，9 月 12-14 日，2023.
植物ストレス学グループ，黄 衡亮（博士後期課程 3 年），日本土壌肥料学会優秀発表賞，日本土壌肥料学会 2023 年度愛媛大会，
Functional characterization of a HvSPDT-like gene in barley, 9 月 12-14 日，2023.
統合ゲノム育種グループ，古田智敬（助教），日本育種学会第 144 回講演会優秀発表賞，「アジアイネゲノムとの網羅的オーソログ解析に基づくアフリカイネゲノムの特徴づけ」，9 月 16 日 , 2023.
統合ゲノム育種グループ，岡 大晴（博士前期課程 2 年），日本育種学会第 144 回講演会優秀発表賞，「O. sativa と O.
glaberrima の 4 倍体種間雑種イネで見い出だされた種子および花粉稔性の向上に関わる遺伝領域」，9 月 17 日 ,2023.
統合ゲノム育種グループ，岡 大晴（博士前期課程 2 年），第 15 回中国地区育種談話会優秀発表賞，「イネ種間雑種 4 倍体の後代分離集団で検出された農業形質関連 QTL の dosage 効果とヘテロシスの予測」，9 月 23 日 , 2023.
植物・微生物相互作用グループ , Paul Telengech（JSPS Fellow）, Japanese Society for Virology Young Researchers Excellent
Presentation Award, Replication of single partitiviruses in hosts across three terrestrial kingdoms; Fungi, Plantae
and Animalia. The 70th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology, Sendai, Sep. 26-28, 2023.
光環境適応研究グループ , 坂本 亘（教授）, 米国植物生物学会 (American Society of Plant Biologists, ASPB), 在外終身名誉会員賞 (Enid MacRobbie Corresponding Membership Award), 9 月 29 日 , 2023.
環境応答機構研究グループ，中村光希（博士後期課程 2 年）, The 3rd Barley Mutant Conference Poster Award, Ectopic
expression of HvMADS58, an ortholog of AGAMOUS, caused homeotic transformations of floral organs in barley.
Oct. 10, 2023.

51光環境適応研究グループ , Gachie Sarah Wanjiru (Doctor course Student), Poster Presentation Honorable Mention Award,
Site-directed mutagenesis and in vivo observation of VIPP1, an ESCRT-III super family protein involved in thylakoid
membrane remodeling in Arabidopsis chloroplasts, Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
光環境適応研究グループ , Di Li (Doctor course Student), Poster Presentation Excellence Award, Thylakoid membrane remodelingmolecule VIPP1 interacts with HSP70 through its C-terminal tail in Arabidopsis, Taiwan-Japan Plant Biology 2023,
Taiwan, Oct. 13-15, 2023.
植物ストレス学グループ，馬 建鋒（教授），第 6 回金光功労賞，10 月 21 日，2023.
ゲノム多様性グループ，佐藤和広（教授），紫綬褒章，11 月 3 日，2023．
植物ストレス学グループ，馬 建鋒（教授），Highly Cited Researchers，高被引用論文著者リスト 2023 年版，Clarivate 社，
11 月 15 日，2023.
植物ストレス学グループ，山地直樹（准教授），Highly Cited Researchers，高被引用論文著者リスト 2023 年版，Clarivate 社，
11 月 15 日，2023.
植物ストレス学グループ，Ma Jian Feng (Professor), The IFA Norman Borlaug Plant Nutrition Award, International Fertilizer
Association (IFA), Nov. 29, 2023.

52

53

上級研究員

准教授

甲南大学・理工学部

農業・食品産業技術総合研究機
構・九州沖縄農業研究センター
暖地水田輪作研究領域

教授

名明治大学・農学部生命科学科

所属機関・部局職

助教

立命館大学・立命館グローバ
ル・イノベーション研究機構（R-GIRO）

一般研究

主任研究員

量子科学技術研究開発機構・高崎量子応用研究所・量子ビーム
科学部門 高崎量子応用研究所
量子バイオ基盤研究部

名

助教

職

東京大学・大学院総合文化研究科

所属機関・部局

若手奨励研究助教

長崎大学・情報データ科学部

名

教授

職

奈良先端科学技術大学院大学・
先端科学技術研究科

所属機関・部局

重点研究

名

中田 克

上田 晴子

吉本 光希

氏

田原 緑

山谷 浩史

神保 晴彦

オオムギ穀粒のデンプン特性が変化した変
異体の解析

Analysis of mutant lines with altered grain starchproperties in barley

松島

坂本

Compositional analysis of guttation dropletscollected from model plants

モデル植物から採取した溢泌液の成分解析

坂本

Analysis of the mechanism of plastid degradation
responding to external nutrients

外部栄養環境に応答する葉緑体分解機構の
解析

受入教員名

鈴木

課題名（英語名）

The characterization of a novel narna-like virus in
pepper

坂本

坂本

受入教員名

最相

Galis

受入教員名

課題名

トウガラシに潜伏する新規ナルナ様ウイル
スの性状解析

Analysis of rice stay green mutantsRole of lipid turnover in the plant response tostrong light

植物の強光ストレス応答における膜脂質代
謝回転の役割イネステイグリーン突然変異体に関する解析

課題名（英語名）

課題名

Development of segmentation methods for crop
growth image by self-supervised learning

自己教師あり学習による作物成長画像に対するセグメンテーション法の開発

Muthu Subash
Kavitha名

Analysis of rice metabolites for breeding of golden
apple snail resistant crops

スクミリンゴガイ耐性育種に向けたイネ代
謝物の解析

吉田 聡子

氏

課題名（英語名）

名

課題名

氏

共同研究リスト（共同利用・共同研究拠点事業）(List of Joint Projects at the Joint Usage/ Research Center)

54

教授

愛媛大学・大学院農学研究科

名

伊藤 秀臣

准教授

教授

特任教授

北海道大学・大学院理学研究院

吉備国際大学・農学部海洋水産
生物学科

広島大学・大学院統合生命科学
研究科
鈴木 克周

氷見 英子

小林 正樹

槻木 竜二

玉置 雅紀

小林 括平

深尾 陽一朗加藤 壮英

大谷 美沙都

中川 直樹

孫田 佳奈

氏

国際農林水産業研究センター・
主任研究員
林業領域

助教

教授

立命館大学・生命科学部生命情報学科

京都大学・大学院理学研究科

助教

奈良先端科学技術大学院大学・
先端科学技術研究科室長

准教授

東京大学・大学院新領域創成科
学研究科先端生命科学専攻

国立環境研究所・生物多様性領域・環境ストレス機構研究室

助教

広島大学・大学院統合生命科学
研究科

名

助教

職

富山県立大学・工学部教養教育
センター

所属機関・部局

平山

平山

森

森

池田

池田

Analysis of novel hormonal effects exerted by theplant growth regulator fenclorim
Elucidation of roles for iron-mediated organelle
signal transduction in lateral root formation
Genetic approach to novel factors of droughttolerance mechanisms in plant cells using
Marchantia polymorpha
Analysis of Zn deficiency inducible DEFL peptides
in Arabidopsis roots
Roles of salicylic acid biosynthetic and regulatory
pathways in chlorosis development in inducible
chlorosis model tobacco and Nʼ tobamovir us
resistanceRole of phytohormones on early flowering induced
by low level of radiation
Studies on genes involved in stem-celldifferentiation in Arabidopsis
Evaluation of the effects of natural variations ofclock genes on temperature-responsive growth inQuercus serrata
Analysis of a Novel Transposon Suppression
Mechanism by Histone Deacetylases

植物化学調節剤 fenclorim が示す新規なホルモン作用の分析
鉄を介したオルガネラ間情報伝達が側根形態形成に果たす役割の解明
ゼニコケを用いた植物細胞の乾燥耐性機構の新規因子の遺伝学的探索
シロイヌナズナの根において亜鉛欠乏時に発現量が上昇する DEFL ペプチドの解析
誘導型退緑モデルタバコにおける退緑発症と Nʼ トバモウイルス抵抗性におけるサリチル酸合成制御系の役割
低線量放射線による花成促進における植物
ホルモンの関与
植物幹細胞の分化制御に関わる遺伝子の解析
コナラ時計遺伝子の地域変異が温度応答性
成長に与える影響の評価
ヒストン脱アセチル化酵素による新規トラ
ンスポゾン抑制機構の解明

力石

力石

Analysis of novel dormancy-related genes on
wheat
Str uctural characterization of the hair y-rootdisease inducing (Ri) plasmid of wheat endophyte
bacteria

コムギ新規休眠関連遺伝子の解析
小麦内生菌アグロバクテリアで見つかった
Ri プラスミドの構造決定と活用

池田

森

平山

桶川

Adaptive divergence of photosynthetic variation inwild plants

光適応を介した野生植物の多様化機構の解
明

受入教員名

課題名（英語名）

課題名

55

助教

准教授

岐阜大学・応用生物科学部

准教授

岡山大学・学術研究院環境生命科学学域

北海道大学・農学研究院

主席研究員

農 業・ 食 品 産 業 技 術 総 合 研
究 機 構・ 果 樹 茶 業 研 究 部 門
果樹品種育成研究領域・果樹茶
育種基盤グループ

准教授

筑波大学・生命環境系教授

信州大学・繊維学部応用生物科
学科

准教授

上級研究員

農業・食品産業技術総合研究機
構・農業環境研究部門土壌環境
管理研究領域

名古屋大学・高等研究院

教授

准教授

九州大学・大学院農学研究院

東京大学・大学院農学生命科学
研究科

准教授

神戸大学・大学院農学研究科

名

講師

職

名古屋大学・大学院理学研究科

所属機関・部局名

小林 佑理子

丸山 隼人

宗正 晋太郎

川東 広幸

古川 純

菅野 里美

堀江 智明

櫻井 玄

田野井 慶太朗

丸山 明子

石川 亮

井上 晋一郎氏

三谷・山地

Decreased arsenate tolerance under sulfur
limitation

佐々木Functional analysis of organic acid transporters
involved in soil-insoluble phosphorus acquisition
and aluminum accumulation
Activation of the malate transporter ALMT1 byamino acids

土壌難利用性リン獲得およびアルミニウム
集積に関わる有機酸輸送体の機能解析
リンゴ酸トランスポーター ALMT1 の遊離アミノ酸による活性化

佐々木

佐々木・森

Using ion channels to engineer crop stressresistance

イオンチャネルを利用した環境ストレス耐性作物作出技術の開発

宇都木・
且原

且原・山地

Functional analysis of sugar transporter, sweet
family genes

Functions and localizations of OsHKTs regulated
by sodium in rice

ナトリウムによって発現が制御されるイネ
HKT 輸送体の機能と局在の解析

且原

糖輸送に関わる sweet 遺伝子の機能解析

Exploring the origin of the phosphorus transport
function of the PHT1 gene

且原

Elucidation of transport property and regulatory
mechanism of transport activity of Na+ permeablechannels in rice

イネの Na+ 透過性チャンネルの輸送特性と活性制御機構の解明
PHT1 遺伝子のリン輸送機能の起源を探る

山地

Modeling of the system of silicon transportationand the feedback mechanism in rice

イネにおけるケイ酸輸送過程とフィードバック機構のモデル化

Na+/H+ アンチポーター SOS1 輸送体の植物根における局在解析

山地馬

Genetic analysis on qGZn9b increasing grain zincconcentration in rice

イネの種子亜鉛濃度向上に働く qGZn9b の遺伝学的解析

Analysis of the localization of the Na+/H+ antiporter
SOS1 in plant roots

馬

Elucidation of the maintenance mechanism of
Arabidopsis Mg homeostasis and development of
Mg stress-tolerant plants

シロイヌナズナの Mg ホメオスタシス維持機構の解明と Mg ストレス耐性植物の開発

硫黄不足によるヒ素耐性低下機構

受入教員名

課題名（英語名）

課題名

56

教授

教授

准教授

京都大学・大学院農学研究科

吉備国際大学・農学部地域創成
農学科

専任研究員

理化学研究所・バイオリソース
研究センター実験植物開発室

神戸大学・大学院農学研究科

准教授

京都先端科学大学・バイオ環境学部

准教授

山形大学・農学部

准教授

教授

東京家政大学・家政学部環境教
育学科

東京農業大学・生命科学部バイオサイエンス学科

准教授

岡山理科大学・獣医学部獣医学
科

講師

准教授

名古屋大学・大学院生命農学研
究科

立命館大学・生命科学部生命情報学科

助教

福井大学・学術研究院医学系部
門

名

主席研究員

職

農業・食品産業技術総合研究機
構・作物デザイン研究領域

所属機関・部局名

桧原 健一郎那須田 周平

土佐 幸雄

安部 洋

井口 博之

渡辺 智

長野 稔

網干 貴子

藤森 文啓

鍬田 龍星

千葉 壮太郎

本田 信治

中村 信吾

氏

Molecular analyses of evolutionary processes of
the Rmo2 locus conditioning resistance of barleyto Pyricularia oryzae
Real-time imaging analysis of the crossability locus
Kr in wheat

オオムギのいもち病抵抗性遺伝子座 Rmo2の分子進化学的解析
コムギの交雑親和性を支配する遺伝子座
Kr のリアルタイム画像解析

Embryo size control in barley

佐藤・久野Study of interaction mechanism between
Methylobacterium and plants using model systems

モデル植物を用いたメチロバクテリウムと植物との相互作用メカニズムの研究

オオムギにおける胚サイズ制御機構の解析

谷

Study on the function of bacteriochlorophyll in thephyllosphere bacteria

植物葉面細菌が保有するバクテリオクロロ
フィルの葉上での機能に関する研究

久野・松島

久野

谷

谷

Studies on the str uctural evolution of plantsymbiotic Methylobacterium sp.Genome

植物共生 Methylobacterium 属細菌のゲノム
構造進化に関する研究

河野Galis・
新屋

Analysis of 2-hydroxy fatty acid catabolic enzymes,
MPO, in Arabidopsis thaliana

Investigation of the gene to produce
isopentylamine in rice

イネにおけるイソペンチルアミン生合成遺
伝子の解明

近藤

シロイヌナズナの 2-ヒドロキシ脂肪酸分解
酵素 MPO の解析

Molecular characterization of mycovir uses
infecting the useful food fungi

食品利用の有用菌類に見出されたマイコウ
イルスの分子生物学的解析

鈴木・近藤

鈴木

Development of a multiple gene expression systemusing RNA viral elements in phytopathogenic
filamentous fungi

RNA ウイルス因子を利用した植物病原糸状菌における多重遺伝子発現系の構築

Exploring the interface between plant and insect
virus

鈴木

Comprehensive analysis of interactions between
fungal plant pathogens and vir uses using themodel organism Neurospora crass

モデル生物アカパンカビを用いた植物病原
糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析

植物と昆虫ウイルスの接点を探る

宇都木

Functional analysis of MFT gene involved in seed
dormancy regulation

種子休眠制御に関わる MFT 遺伝子の機能
解析

受入教員名

課題名（英語名）

課題名

57

准教授

准教授

熊本大学・大学院先端科学研究部

三重大学・大学院生物資源学研
究科

教授

助教

研究員

専門研究員

北海道大学・大学院農学研究院

名古屋大学・生物機能開発利用
研究センター

愛媛県農林水産研究所・果樹研
究センター栽培開発室

岡山県農林水産総合センター生
物科学研究所・植物活性化研究
グループ

准教授

助教

自然科学研究機構基礎生物学研
究所・IBBP センター

信州大学・理学部教授

鳥取大学・農学部

特命助教

国立遺伝学研究所・植物遺伝研
究室

名

准教授

職

近畿大学・農学部農業生産科学
科

所属機関・部局名

鳴坂 義弘

小佐見 謙一

永井 啓祐

貴島 祐治

髙梨 功次郎

水野 隆文

藤井 紀行

栂根 一夫

石原 亨

吉川 貴德

築山 拓司

氏

Elucidation of flood tolerance mechanism ofAfrican rice Oryza glaberrima
Genetic analysis of the bacterial disease citrus
canker resistance using citrus crossbreeds

アフリカ栽培イネ Oryza glaberrima の洪水耐性機構の解明
カンキツの交雑種子を用いたカンキツかいよう病抵抗性に関する遺伝的解析

Genetic analysis of Alpinia zerumbet

The studies on the rice tetraploidy in the genetic
issues and breeding utilities

イネの四倍体における遺伝的問題点の解決と育種利用に関する研究

月桃の遺伝学的解析

Phylogeographic analysis of plants of the genus
Oxytropis

長岐

古田・山本

山本・古田

山本・長岐・
古田

山下

山下

Construction of an element accumulation databasefor wild plants using herbarium and X-ray
fluorescence analyzer

植物標本と蛍光 X 線分析計を用いた野生植
物の元素集積データベースの構築
オヤマノエンドウ属植物の系統地理学的解析山下

Molecular phylogeographic study using alpine
plant Anemone narcissiflora -Reexamination of thenorthern origin of Japanese alpine flora

高山植物ハクサンイチゲを用いた分子系統
地理学的研究～日本産高山植物の北方起源を再検証する～山下

武田

Development of cr yopreserevation method for
drought sensitive (recalcitrant) seeds

Evolution of str ess r esponsive secondar ymentalism in Poaceae

イネ科植物におけるストレス応答性二次代
謝の進化

武田

最相

受入教員名

短寿命種子の長期保存法の開発

Genetic analysis of barley split palea mutants

Analysis of functional dif ferentiation of thechitinase gene family in Poaceae

イネ科植物におけるキチナーゼ遺伝子ファミリーの機能分化の解明
オオムギ内穎裂開変異体 split palea の解析

課題名（英語名）

課題名

58

Professor
emeritusand senioradvisor

Professor

Swedish University ofAgricultural Science,
Department of Plant Breeding,SwedenOregon State University, Crop
Science, USA

名

Group
Leader

職

Swiss Federal Research Institutefor Forest, Snow and LandscapeResearch WSL, Forest Healthand Biotic Interactions,
Switzerland

所属機関・部局名

Patrick Hayes

Roland vonBothmerSimoneProspero

氏

国際共同研究 (International programs)

オオムギの育種と変異体に関する共同研究

植物遺伝資源およびストレス科学に関する共同研究（部局間協定締結に向けて）ウイルス導入によるトネリコダイバック（枝枯）病病原糸状菌の病原力衰退系統株
の作出

課題名

佐藤

佐藤

Collaborative research on barley breeding andmutations

鈴木

受入教員名

Collaborative research on plant genetic resources
and stress science (toward the establishment of aninterdepartmental agreement)

Creation of hypovirulent Hymenoscyphus fraxineus
strains via experimental virus introduction

課題名（英語名）

59

持田 恵一
・チームリーダー

辻 寛之・准教授

梅崎 太造・教授

林 靖彦・教授

西村 安代・准教授，
その他

理化学研究所・環境資源科学研究センター

横浜市立大学・
植物遺伝資源部門

名古屋工業大学・情報工学教育類メディ
ア情報分野

岡山大学・
自然科学研究科

高知大学，
株式会社林原藤田 直子・教授

秋田県立大学大学院・生物資源科学研究科

持田 恵一
・チームリーダー

川本 晃大・助教

大阪大学・
蛋白質研究所

理化学研究所・環境資源科学研究センター

草場 信・教授

広島大学・理学研究科

寺地 徹・教授

石北 央・教授，
斎藤 圭亮・助教

東京大学・先端科学技
術研究センター

京都産業大学・生命科学部

高橋 裕一郎・特任教授

共同研究者名・職名

岡山大学・
異分野基礎科学研究所

所属機関・部局

坂本 亘
坂本 亘

松島 良

CRISPR-CAS9 を 用 い た イ ネ へ の 変 異 導 入 法 に よ る
DPD1 ヌクレアーゼ欠失変異体の作出と解析
クライオ電子顕微鏡トモグラフィーにより VIPP1 タ
ンパク質と FZL タンパク質の構造を解析する
双方が独自に単離したデンプン粒の形状に異常を示
すイネの突然変異体の解析を行っている。澱粉物性の測定ならびに顕微鏡観察を分担して行っている
タバコの psbA 遺伝子の欠失変異体を用いて、光合成の電子伝達、光損傷を解析する

イネ DPD1 変異体の解析
チラコイド膜リモデリングタンパク質の構
造解析
澱粉粒の形状に異常を示す突然変異体の解析マーカーフリーな葉緑体の遺伝子組換え植物の作出

ナス科作物へのトレハロースの影響に関する研究

CNT 生体ナノセンサーの開発

トレハロースによるナス科の短花柱花の割合の抑制の機構を解明する

CNT を用いた生体物質認識ナノセンサーを開発

圃場植物の画像解析手法の開発

圃場オオムギの生長動態解析

データ科学に基づく作物設計基盤技術の構
築
データ科学に基づく作物設計基盤技術の構
築

機械学習モデル構築

植物短鎖機能性ペプチド遺伝子の探索・解析基盤の開発データ科学に基づく作物設計基盤技術の構築圃場オオムギの生長動態モデル構築

坂本 亘

光阻害における D1 の酸化修飾による光化学系 II の安定性を構造モデルにより検討する

D1 タンパク質酸化修飾のモデル構造解析

平山 隆志・森 泉

平山 隆志

平山 隆志

平山 隆志

平山 隆志

平山 隆志

桶川 友季

坂本 亘

シロイヌナズナ・クラミドモナス等のチラコイド膜
タンパク質リン酸化を質量分析により解析する

チラコイド膜リン酸化タンパク質の解析

受入研究者名概要

共同研究課題名(List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage/Research Center (Domestic))

拠点事業以外の共同研究（国内）60

共同研究者名・職名

村田 芳行・教授，
宗正 晋太郎・准教授

後藤 丹十郎・教授

森田 重人・准教授

稲葉 丈人・准教授

梅澤 泰史・教授

鵜川 信・准教授

平井 儀彦・准教授，
村田 芳行・教授

星野 敦・助教

西村 泰介・准教授

賀屋 秀隆・准教授

赤木 剛士・教授

横堀 伸一・准教授

鈴木 克周・教授

石川 亮・准教授

所属機関・部局

岡山大学・大学院自然科学研究科

岡山大学・大学院自然科学研究科

京都府立大学・
生命環境科学研究科

宮崎大学・農学部

東京農工大学・生物シ
ステム応用科学府

鹿児島大学・農学部

岡山大学・大学院環境
生命科学研究科

基礎生物学研究所・
進化多様性生物学領域

長岡技術科学大学大学
院・工学 ( 系 ) 研究科

愛媛大学・
大学院農学研究科

岡山大学・大学院自然科学研究科

東京薬科大学・
生命科学部

広島大学・
統合生命科学研究科

神戸大学・
農学生命科学研究科

短期宇宙曝露実証実験システムの構築と「非」極限環境生物の宇宙曝露における生存に関する解析
アグロバクテリア内生菌を利用した穀類植物の形質転換効率の向上を目指す

地球生物の宇宙生存可能性検証のための短期宇宙曝露実証実験システムの構築
ムギ類由来のアグロバクテリア内生菌による穀類植物の形質転換
イネ亜鉛集積機構の解明

イネ種子中の亜鉛の測定

カキにおけるエピゲノム制御を介した花の性の制御について解析する

カキにおけるエピゲノムを介した雌雄の制
御

馬 建鋒

力石 和英

杉本 学

池田 陽子

池田 陽子

作物においてゲノム編集法に基づく DNA メチル化の書換え技術を開発する

作物におけるエピゲノム編集技術の開発

作物におけるエピゲノム編集技術の開発

作物におけるエピゲノム編集技術の開発

池田 陽子

泉

作物においてゲノム編集法に基づく DNA メチル化の書換え技術を開発する

森

イネのアポプラスチックバイパスフローによるカドミウムの導管負荷現象を解析する

泉

池田 陽子

森

スギの休眠の深さの変動における植物ホルモン含量
の解析

泉

泉

泉

泉

泉

作物においてゲノム編集法に基づく DNA メチル化の書換え技術を開発する

イネのカドミウム吸収に関する研究

スギの休眠の解析

気孔閉口運動の解析

森

森

CO2 濃度変動における植物ホルモンの役割を解析す
る

植物の CO2 応答の解析

気孔運動におけるイオンチャネル活性調節の解析

森

イネ幼猫の成長過程における植物ホルモンの含量を解析する

イネの成長におけるホルモンの役割の解析

森

花器官の形成過程における植物ホルモン含量の解析

花卉の八重咲におけるホルモンの役割の解明

森

受入研究者名

サリチル酸、イソチオシアネート、光、アブシシン酸、
ジャスモン酸による気孔閉口に関与する信号伝達機
構を解明する

概要

気孔の環境応答に関する研究

共同研究課題名

61

三村 徹郎・名誉教授

我妻 忠雄・客員教授

和崎 淳・教授

須賀 晴久・准教授

兼松 聡子・領域長

宮崎 直幸・研究員

千葉 壮太郎 ･ 准教授

小竹 敬久・教授

岡田 憲典・准教授

秋山 佳丈・教授

森 英樹・准教授

寺内 良平・教授

川﨑 努・教授

吉田 健太郎・教授

山形大学・農学部

広島大学・大学院総合生命科学研究科

岐阜大学・科学研究基盤センター

NARO 植物防疫研究部
門・果樹茶病害虫防除
研究領域

大塚製薬・
創薬基盤研究所名古屋大学・大学院生
命農学研究科

埼玉大学・理工学研究科

東京大学・アグロバイ
オテクノロジー研究センター

信州大学・繊維学部

大阪公立大学・
大学院理学研究科

京都大学・農学研究科

近畿大学・農学部

京都大学・農学部

共同研究者名・職名

神戸大学

所属機関・部局

佐々木 孝行鈴木 信弘

H2O2 高分泌機構におけるアクアポリンの役割の解明
クラスター根形成作物の有機酸輸送体特性の解析
エチオピア産 Fusarium spp. に感染しているウイルスの宿主菌への影響の解明

H2O2 高分泌植物種の網羅的探索、細胞壁
高 H2O2 機構の解析
持続的作物生産に向けたクラスター根の形
成能とリン供給能の活用

近藤 秀樹

テンサイ叢根病の原因ウイルス BNYVV が保持するサ
テライト様ゲノム RNA 分節の解析
クサシロキヨトウ食害認識に関わるイネ細胞壁由来
エリシターを解析する

BNYVV の病原学的研究
植食性昆虫認識に関わる細胞壁由来エリシ
ターの解析

新屋 友規・Galis Ivan
新屋 友規・Galis Ivan
河野 洋治
河野 洋治
河野 洋治

植食性昆虫の植物素材接着剤を使った蛹室作りの解析と 3 次元造形への応用
植食性昆虫の植物素材接着剤を使った蛹室作りの解析と 3 次元造形への応用
バイオインフォマティクス技術を用いた、いもち病
菌エフェクター Avr-Pit の同定
植物免疫に関わるホルモン様ペプチドのシグナル伝
達の解析
バイオインフォマティクス技術を用いた、NLR の進化解析

いもち病菌エフェクター Avr-Pit の同定
植物免疫に関わるホルモン様ペプチドの解析
NLR タンパク質の進化解析

植食性昆虫の蛹室作りの解析

植食性昆虫の蛹室作りの解析

Galis Ivan・新屋 友規

イネにおけるファイトアレキシンの耐虫性に関する
機能解析

イネファイトアレキシンの機能解析

Galis Ivan・新屋 友規

鈴木 信弘

メガビルナウイルスのクライオ電子顕微鏡観察による構造解析

メガビルナウイルスの構造解析

鈴木 信弘

日本産白紋羽病菌のウイルスの性格付け

白紋羽病菌のウイルスの探索

エチオピア産 Fusarium 属菌の解析

且原 真木

シャジクモ節間細胞から単離した細胞膜リン酸輸送
体の共役輸送イオンの同定

植物のリン酸輸体の研究
且原 真木

受入研究者名概要

共同研究課題名62

小林 康一・准教授

岩瀬 哲・上級研究員

八丈野 孝・教授

永田 典子・教授

藤井 祥・助教

大阪公立大学・理学部

理化学研究所・環境資源科学研究センター

愛媛大学・農学部

日本女子大学・理学部

弘前大学・
農学生命科学部

プラスチド相転換ダイナミクス

プラスチド相転換ダイナミクス

プラスチド相転換ダイナミクス

プラスチド相転換ダイナミクス

プラスチド相転換ダイナミクス

ジベレリン関連遺伝子の機能解析

ヘテロシグマのトランスクリプトーム解析により、発現遺伝子配列のデータベース作成を行なっている

植物プランクトン ヘテロシグマの発現遺伝子配列の網羅的解析

久野 裕・佐藤 和広

久野 裕
久野 裕
久野 裕
久野 裕
久野 裕

オオムギの組織分化転換における色素体の制御機構を解明する
オオムギの脱分化・再分化における色素体の制御機構を解明する
オオムギの絶対寄生菌侵入時における色素体の制御機構を解明する
オオムギの組織分化転換における色素体状態を観察する
オオムギの脱分化・再分化における色素体の制御機
構遺伝子を解明する

佐藤 和広

植木 尚子

谷 明生

谷 明生

谷 明生

谷 明生

河野 洋治

オオムギのジベレリン関連遺伝子を同定し、形質転換オオムギの表現型を解析する

チガヤのゲノム解読による生態型解析への応用

Methylobacterium 属細菌におけるメタノール走化性の分子メカニズムの解明

メタノール資化性細菌におけるメタノール
への走化性の分子機構解析

芦苅 基行・教授 ,辻 寛之・教授 ,永井 啓祐・助教

由里本 博也・准教授

京都大学・
大学院応用生命科学

Methylobacterium 属細菌におけるメタノール走化性の分子メカニズムの解明

メタノール資化性細菌におけるメタノール
への走化性の分子機構解析

名古屋大学・農学部

加藤 純一・教授

広島大学・統合生命科学研究科

モデル細菌を用いたメタノール資化経路に関わる酵素のランタノイド依存性に関する研究

メチロトロフ細菌のランタノイド依存性メ
タノール代謝チガヤのゲノム解読

中川 智行・教授

岐阜大学・応用生物科学部

モデル細菌を用いたメタノール資化経路に関わる酵素のランタノイド依存性に関する研究

メチロトロフ細菌のランタノイド依存性メ
タノール代謝冨永 達・名誉教授

三井 亮司・教授

岡山理科大学・理学部

イネ免疫に関わる分子の立体構造解析

解糖系酵素 GAPC1 を介したヒストンアセ
チル化の制御機構

京都大学・農学部

小佐見 謙一・研究員

愛媛県農林水産研究所・果樹研究センター

イネ免疫のシグナル伝達に関与する分子のプロテオ
ミクス解析

イネ免疫のシグナル伝達に関与する分子の
同定

河野 洋治

河野 洋治

バイオインフォマティクス技術を用いた、NLR の進化解析

NLR タンパク質の進化解析

佐藤 昌直・助教

深尾 陽一朗・教授

立命館大学・
生命科学部

受入研究者名概要

共同研究課題名

北海道大学・
農学研究院

寺内 良平・教授

共同研究者名・職名

京都大学・農学部

所属機関・部局63

鳥羽 大陽・准教授

宮城大学・食産業学群

ゲノム情報を中心にオミクス情報に基づく効率的遺伝子探索手法を確立する

黒羽 剛・
上級研究員

国立研究開発法人農業
食品産業技術総合研究
機構・生物機能利用研
究部門

有用遺伝子探索を革新するオミクスベース
クローニング法の実証

ゲノム情報を中心にオミクス情報に基づく効率的遺伝子探索手法を確立する

有用遺伝子探索を革新するオミクスベース
クローニング法の実証永井 啓祐・助教

名古屋大学・農学部

ゲノム情報を中心にオミクス情報に基づく効率的遺伝子探索手法を確立する

ChIP-Seq 解析によりショウガ目植物の動原体 DNA
配列を明らかにする

ChIP-Seq 解析によるショウガ目植物の動原体 DNA 配列の同定

和久井 健司・教授 ,杉山 立志・准教授 ,田中 啓介・准教授

東京農業大学・農学部

有用遺伝子探索を革新するオミクスベース
クローニング法の実証

種間雑種の倍化個体を用いて倍加とヘテロシスによる遺伝子発現の変化の違いを明らかにする

雑種稔実 4 倍体イネを利用したヘテロ接合
性と倍数性が引き起こす遺伝子発現変動の解析

東京農業大学・生物資
輿石 雄一・研究員 ,源ゲノム解析センター・
加藤 浩・教授
デザイン農学科

九州大学・
大学院農学研究院

ミャンマーにおいてイネゲノム育種を実施する基盤を構築する

貴島 祐治・教授

北海道大学・
大学院農学研究院

古田 智敬

古田 智敬

古田 智敬

長岐 清孝

山本 敏央・
長岐 清孝・
古田 智敬

古田 智敬

山本 敏央・長岐 清孝

山本 敏央・古田 智敬

オオムギ遺伝資源を用いて、紋枯病菌に対する抵抗
久野 裕・松島 良・性の評価を行っている
近藤秀樹・三谷奈見季

ミャンマーにおけるイネゲノム育種システ
ム強化

米丸 淳一・
ユニット長

農研機構・次世代作物開発研究センター

オオムギと紋枯病菌の感染生理学的研究

吉村 淳・特任教授

能年 義輝・教授

岡山大学・農学部

オオムギの形質転換体を用いて、うどんこ病菌の感久野 裕・松島 良・
染時の生理現象について調査している
近藤秀樹・三谷奈見季

絶対寄生および半活物寄生に対する Ca2+流動の制御機構と生理的意義の解明

アジアイネとアフリカイネの４倍体がなぜ雑種不稔性を回避できたのか倍数化能と関連させて探る

八丈野 孝・教授

愛媛大学・農学部

武田 真

土壌伝染性の大麦縞萎縮病の抵抗性とビール醸造特性の原因遺伝子の特定を目指している

大麦縞萎縮病抵抗性とビール醸造特性の遺伝解析

アジアとアフリカ栽培イネの異種間４倍体雑種の生殖維持機構と育種利用に関する研究渡邉 浩久・室長

栃木県農業試験場武田 真

オオムギ種子の水溶性食物繊維含量等にかかわる遺伝子を探索し、実証試験をしている

受入研究者名オオムギ種子の機能性成分を制御する遺伝
子の解明

概要

自殖性作物において表現型選抜効率に優れた高能率のゲノム選抜育種技術を構築する

塔野岡 卓司・
プロジェクトリーダー

NARO 農業・食品産業
技術総合研究機構

共同研究課題名

限られた育種母本から高能率に遺伝的多様性を生み出す多系交雑育種システムの開発

共同研究者名・職名

所属機関・部局

64

馬 建鋒

イネを中心に植物のミネラル輸送に関する生
理、分子生物学的研究
植物ミネラル輸送機構に関する研究

Renfang Shen, Jing Che,
Professor

中国科学院南京土壌研究
所

China

馬 建鋒

イネカドミウムやヒ素の集積に関与する遺伝子の同定
イネ重金属集積に関する研究

Fangjie Zhao,
Professor

中国南京農業大学

China

杉本 学

Genes expressed in Brachypodium under UV
irradiation were identified to examined function

杉本 学

池田 陽子

Function of genes and proteins inplnats produced under extreme
environment

Institute of Fundamental
Medicine and Biology,
Kazan Federal University

RussiaFunctional analysis of gene silencing mutant inArabidopsis

泉

Rushan Sabirov,
Professor

Vladimir Sychev,
Vice President

Institute of Biomedical
Problems, Russian
Academy of Science

RussiaAnalysis of gene silencing mechanism

森Barley seeds exposed to outer space were
examined for seed germination and gene
expression

Olivier Mathieu,
Principal Investigator

Universite Clermont
Auvergne, CNRSFranceアブシシン酸が気孔開口に及ぼす影響について
分枝遺伝学的に解析している

孔辺細胞におけるアブシシン酸受容体の多様性に関する研究

平山 隆志

松島 良

The size distirbution and morphologicalquantifiation of starch granules in barley mutannts
were analyzed
Determination of the genome structure of 20
accessions

坂本 亘

坂本 亘

坂本 亘

Accepted
staff

Degradation of D1 reaction center protein is being
characterized in Chmamydomonas ftsh mutant

GTP-hydrolysis activity detected in VIPP1 protein
in vitro is being characterized

Barley pan-genome project

Characterization of GTPase activity in
VIPP1 protein

Specific oxidation of amino acid residues in
D1 protein is being characterized by mass
spectrometry

Summary

Effect of space environment on plantviability and adaptation

Yin Ye, Lecturer

Sun Yat Sen University

China

Nils Stein, professor, et al.

David Seung , Group
Leader

The John Innes Centre

England

IPK, etc

Characterization of starch-related
mutations of barley

Cathrine de Vitry,
Senior Researcher

Institute de Biologie
Physico-Chimique, CNRSFranceGermany,etc

Influence of FtsH in oxidataed D1
protein in Chlamydomonas

Lingang Zhang,
Professor

Inner Mongolia Universityof Science and Technology

China

Characterization of photodamaged D1
in the Photosystem II repair cycle

Chanhong Kim,
Principal Investigator

Shanghai Center for Plant
Stress Biology, Chinese
Academy of Sciences

Subject of collaborative research

China

Researcherʼs Name, Title

Affiliation

Country(List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage/Research Center (International))

拠点事業以外の共同研究（国際）65Zhichang Chen,
Professor

Catherine Curie,
Professor

Nicolaus von Wirén,
Professor

Guijie Lei, Professor

Hungchen Emilie Yen,
Professor

Toshihiro Obata,
Assistant Professor

Bradley I. Hillman,
Professor

Ioly Kotta-Loizou,
Assistant Professor

José R. Castón,
Professor

Carlos José López
Herrera, Researcher

Eeva Vainio,
Researcher

Centre National de laRecherche Scientifique

Leibniz-Institute of Plant
Genetics & Crop Plant
Research

雲南大学

National Chung Hsing
University

Center for Plant Science
Innovation, University of
Nebraska Lincoln

Plant Biology andPathology,
Rutgers University

Faculty of Natural
Sciences, Imperial College
LondonCentro Nacional
Biotecnología/CSIC

Instituto de Agricultura
Sostenible C.S.I.C.

Natural Resources
Institute Finland (Luke),
Forest health andbiodiversity

FranceGermany

China

Taiwan

USA

USA

UK

Spain

Spain

FinlandResearcherʼs Name, Title

福建農林大学

Affiliation

China

Country

Taxonomical organization of fungal partitiviruses

Search for fungal viruses with potential as
biocontrol agents against white root rot in
avocadoUtilization of fungal viruses as
biocontrol of the white root rot
diseaseTaxonomy of fungal viruses

鈴木 信弘

Cryo-EM and 3D-reconstruction of Rosellinia
necatrix quadriviruses

Quadrivirus structural analysis

鈴木 信弘

鈴木 信弘

鈴木 信弘

鈴木 信弘

佐々木 孝行

Taxonomical organization of fungal and plantchrysoviruses

Taxonomy of fungal viruses

Investigation of host range of and host defense
against a mitochondrially replicating mitovirus

We are collaborating to determine metabolites intomato fruit, to assess physiological function of
the SlALMT genes

Metabolome analysis in tomato fruit
which suppressed or over-expressed
SlALMT gene
Characterization of mitoviruses
infecting the chestnut blight fungus

Ice Plant 由来のイノシトール輸送体の機能解析

耐塩性植物のイノシトール輸送体に
関する研究

且原 真木

馬 建鋒

イネのリン酸高集積変異体の解析と遺伝子の同定

イネのリン酸集積機構の解析

馬 建鋒

マンガン輸送体の AtNramp1 の細胞局在に関す
る研究

馬 建鋒

馬 建鋒

Accepted
staff

イネのマグネシウム輸送体の同定と機能解析

Summary

オオムギマンガン輸送体の機能解析

オオムギマンガン集積機構の解析

マンガン輸送体の機能解析

イネマグネシウム輸送に関する研究

Subject of collaborative research

66
Characterization of fungal viruses

Characterization of cross-kingdom
virus transmission
Analysis of the crop virome in thefieldsTaxonomy of Rhabdoviridae

Ana Eusebio-Cope,
Program Manager

Md. Iqbal Faruk, Senior
Scientific Officer

Kenta Okamoto,Forskare (Researcher)Muhammad Faraz Bhatti,
Professor

Liying Sun,
Professor

Ida Bagus Andika,
Professor

Peter Walker,
Professor,
Ralf Dietzgen,
Associated Professor

Carolina Cornejo,
Principal Investigator

International Rice
Research InstitutePlant Pathology Division,
Bangladesh Agricultural
Research InstituteDepartment of Celland Molecular Biology,
Uppsala University

Atta-ur-Rahman Schoolof Applied Biosciences(ASAB), National
University of Sciences andTechnology

Northwest A&F University

Qingdao Agricultural
University

University of Queensland

Forschungsanstalt
für Wald, Schnee undLandschaft WSL

Philippines

Bangladesh

SwedenPakistan

China

China

Switzerland

Australia

Study on the virus diversity inArmillaria spp.

Megabirnavirus structural analysis

Characterization of viruses soilinhabitant fungiCharacterization of viruses infecting
rice-associated fungi

Virocontrol of chestnut blight

Daniel Rigling,
Group Leader

Forschungsanstalt
für Wald, Schnee undLandschaft WSL

China

Taxonomy of fungal viruses

Subject of collaborative research

Switzerland

Researcherʼs Name, Title

Jiatao Xie,
Professor

Affiliation

College of Plant Scienceand Technology,
Huazhong Agricultural
University

Country

Deep sequencing analysis of viral communities inthe soil-borne fungi Armillaria spp.

Virus classification in the family Rhabdoviridae

Identification of a novel dicistro-like virus fromthe tomato roots

Investigation of cross-kingdom virus infections
between plants and fungi

Molecular and biological characterization of anovel botybirnavirus identified from a Pakistaniisolate of Alternaria alternata

近藤 秀樹

近藤 秀樹

近藤 秀樹

近藤 秀樹

鈴木 信弘

鈴木 信弘

鈴木 信弘

Molecular haractgerization of viruses isolated
from Bangladeshi isolates of plant pathogenic
soil-inhabitant fungi
Cryo-EM and 3D-reconstruction of Rosellinia
necatrix megabirnaviruses

鈴木 信弘

鈴木 信弘

鈴木 信弘

Accepted
staff

Virus hunting of rice blight fungal isolates andtheir characterization

Exaination of various viruses for their biocontrol
potential

Taxonomical organization of fungal
megabirnavirus

Summary

67

NLR 型受容体のバイオインフォマティクス解析
植物免疫に関わるホルモン様ペプチドのシグナ
ル伝達の解析
Isolation of halotolerant C1-compound utilizing
bacteria from mangrove forest trees
Reuse of treated sewage effluent for fodder
production

NLR 型受容体によるイネ免疫の制御機構の解析
植物免疫に関わるホルモン様ペプチ
ドの解析
Isolation of halotlerant lanthanidedependent methylotrophs
Conventional and non-conventionalorganic amendments to improve soil
structure and productivity in Qatar

Huimin Jia
Assistant Professor

Pingyu Wang
Associate Professor

Nurettin Sahin,
Professor

Helmi Hamdi, Research
Assistant Professor

Cecilia Grossi, PostDoc;
Rita María Ulloa,
Professor

Jiangxi Agricultural
University

Jiangxi Agricultural
University

Mugla Sitki Kocman
University

Qatar University

Laboratorio deTransducción de Señales
en Plantas, Institutode Investigaciones
en Ingeniería
Genética y Biología
Molecular (INGEBI),
Consejo Nacional deInvestigaciones Científicas
y Técnicas (CONICET)

China

China

TurkeyQatar

Argentina

Analysis on the plant growth promoting ability ofMethylobacterium sp. A2NLR 型受容体の分子生物学的、生化学的解析

NLR 型受容体によるイネ免疫の制御機構の解析

Yuying Li,
Doctoral Research Fellow

Chinese Academy ofAgricultural Sciences

China

Plant growth promoting ability ofMethylobacterim sp. A2NLR 型受容体の分子生物学的、生化学的解析

NLR 型受容体によるイネ免疫の制御
機構の解析

Qiong Wang,
Professor

Yangzhou University

China

解糖系酵素 GAPC1 を介したヒストンアセチル化の制御機構の解析

解糖系酵素 GAPC1 を介したヒスト
ンアセチル化の制御機構

Switzerland

Daisuke Miki,
Principal Investigator

Shanghai Center for Plant
Stress Biology

Summary
Five RNA mycoviruses were detected in two
native populations of H. fraxineus, the causal
fungal agent of ash dieback

Subject of collaborative research

Study on the virus diversity inHymenoscyphus fraxineus

China

Researcherʼs Name, Title

Wajeeha Shamsi,
Postdoctoral Researcher
Simone Prospero,
Principal Investigator

Affiliation

Forschungsanstalt
für Wald, Schnee undLandschaft WSL

Country

谷 明生

谷 明生

谷 明生

河野 洋治

河野 洋治

河野 洋治

河野 洋治

河野 洋治

近藤 秀樹

Accepted
staff

68

Barley pan-transcriptome project
Sequencing analysis of barley genetic
resources
Cloning of barley disease resistancegenes
Food barley development

Robbie Waugh,
Professor

Nils Stein,
Professor

Matthew Moscou,
DoctorPatrick Hayes,
Professor

Genetic modification of lingnin biosynthesis isperformed to increase the efficiency of processing
for biomass in barley
オオムギ内穎裂開遺伝子のゲノム編集を利用した遺伝形態学的解析

Genome editing for producing hullless barley
Genome editing of the genes related
to seed dormancy in barley
Genetic modification of lingnin
biosynthesis in barley
オオムギの内穎裂開遺伝子の機能解析Jochen Kumlehn,
DoctorChunxiang Fu,
Professor

Jochen Kumlehn,
DoctorIPK

Chinese Academy of
Sciences

Germany

China

Germany

IPK

Oregon State University

Patrick Hayes,
Professor

U.S.A.

Development of acid soil tolerantbarleyDegu Hewan Demissie,
DoctorHawassa University

Ethiopioa

久野 裕・
佐藤 和広

Site-directed mutagenesis is performed formodification of the genes related to seed
dormancy in barley

武田 真

久野 裕

久野 裕・
佐藤 和広

佐藤 和広

佐藤 和広

Genome editing method is performed to produce
hull-less barley using lines generated in OSU

Introduction of acid soil tolerant barley andmolecural selection techniques in Ethiopia

Evaluation and analysis of barley germplasm inthe dry land conditions in Kazakhstan

Evaluation of barley in semi-arid
environment

Yerlan Turuspekov,
DoctorInstitute of plant biology
and biotechnology

Kazakhstan

佐藤 和広

佐藤 和広

Development of functional food barley cultivar in
the USA
Establishment and utilizaztion of core set ofbarley genetic resourdes in the world

佐藤 和広

佐藤 和広

佐藤 和広

佐藤 和広

植木 尚子

Accepted
staff

Isomation and annotation of barley disease
resitance genes

Partial sequencing analsis of barley accessions in
genebanks

De novo analysis of barley haplotypes

De novo assembly of principal barley haplotypes

Roland von Bothmer,
Professor
International Barley Core Collection

Barley pan-genome project

Nils Stein,
Professor

Marine bacteria that promote or terminate algal
bloom are being isolated and their effect on algal
growth is bein characterized

Summary

Swedish University ofAgriculture

Oregon State University

U.S.A.

Isolation and characterization ofmarine microbe that affect algal
bloom dynamics

Subject of collaborative research

Gonzalo Gajardo,
Professor

Researcherʼs Name, Title

International

The Sainsbury Institute

IPK

The James Hutton Institute

IPK

Los Lagos University

Affiliation

U.K.

Germany

U.K.

Germany

Chile

Country

69

Affiliation

Queen Mary University of
LondonCountryUK

Guy Hanke, Doctor

Researcherʼs Name, Title
オオムギの GLK2 遺伝子の機能解析

Subject of collaborative research

Accepted
staff
武田 真

Summary
オオムギ GLK2 遺伝子の CRISPER 系統を利用した遺伝生理学的解析

Annual Report 2023
Director:  Takashi Hirayama
Editorial Members:  Yuko Hojo
Sanae Rikiishi
Manabu Sugimoto
Published by Institute of Plant Science and Resources, Okayama University
Chuo 2-20-1, Kurashiki 710-0046, Japan
TEL: +81-86-424-1661
FAX: +81-86-434-1249

岡山大学資源植物科学研究所報告 第 31 巻
（Annual Report 2023）
令和 6 年 3 月 25 日
令和 6 年 3 月 31 日
発行

所

岡山大学資源植物科学研究所
710-0046 倉敷市中央 2 丁目 20-1
TEL：086-424-1661
FAX：086-434-1249

編集委員

北條
力石
杉本

印

友野印刷株式会社

刷

所

印刷
発行

優子
早苗
学