ISSN 2186-4918
CODEN: OSSHEN

岡山大学
資源植物科学研究所報告(Annual Report 2018)－ 第26巻 －岡山大学資源植物科学研究所
Institute of Plant Science and Resources
Okayama University

目

次 （Contents)

研究活動 (Research Activity)
植物ストレス科学共同研究コア (Research Core for Plant Stress Science)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ(Plant Light Acclimation Research Group) ･････････････････････････････
環境応答機構研究グループ(Group of Environmental Response Systems) ･･････････････････････････
土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ(Group of Plant Stress Physiology) ････････････････････････････････････
植物分子生理学グループ(Group of Plant Molecular Physiology) ･････････････････････････････････
環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ(Group of Plant-Microbe Interactions) ･････････････････････････････････
植物・昆虫間相互作用グループ(Group of Plant-Insect Interactions) ･･･････････････････････････････････
植物環境微生物学グループ(Group of Plant Environmental Microbiology) ･･･････････････････････････

1
2

3
4

5
6
7

大麦・野生植物資源研究センター (Barley and Wild Plant Resource Center)
遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ(Group of Genome Diversity) ･････････････････････････････････････････ 8
遺伝資源機能解析グループ(Group of Genetic Resources and Functions) ･･･････････････････････････ 9
野生植物グループ(Group of Wild Plant Science) ･････････････････････････････････････････ 10
ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
核機能分子解析グループ(Group of Nuclear Genomics) ･････････････････････････････････････････ 11
ゲノム制御グループ(Group of Genome Regulation) ････････････････････････････････････････ 12
次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
作物デザイン研究チーム(Crop Design Research Team) ･････････････････････････････････････････ 13
国際共同研究チーム(International Collabolation Team) ････････････････････････････････････ 13
エコフィジオロジー研究チーム (Ecophysiology Research Team)
イオンダイナミクス班(Ion Dynamics Section）･････････････････････････････････････････････ 14
根圏生態班(Rhizosphere Microbiome Section）･･･････････････････････････････････ 14
作物イノベーション研究チーム(Crop Innovation Research Team)
エピジェネティクス班(Epigenetics Section）････････････････････････････････････････････････ 15
オオムギ遺伝子改変班(Barley Genetic Modification Section）････････････････････････････････ 15

構成員(Staff) ･････････････････････････････････････････････････････････････････････ 16
出版物リスト(List of Publication) ････････････････････････････････････････････････････････ 23
国際会議およびシンポジウム(List of International Conferences and Symposia) ･･･････････････････････････････ 32
講演およびシンポジウム発表(List of Domestic Conferences and Symposia) ･････････････････････････････････ 38
研究所員が主催したシンポジウム等(List of Symposium Superintended by the Member of Institute) ･････････････････ 47
学会賞等(Awards) ･･･････････････････････････････････････････････････････････････････ 60
共同研究リスト(共同利用・共同研究拠点事業)(List of Joint Projects at the Joint Usage/ Research Center) ･････････････････････ 61
拠点事業以外の共同研究 (国内／国際）(List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage/Research Center(Domestic/ International)) ･････････････ 65

研 究 活 動 (Research Activity)
大気環境ストレスユニット(Atmospheric Stress Unit)

光環境適応研究グループ

Plant Light Acclimation Research Group

本グループでは、光合成機能を担うオルガネラである葉緑体(色素体)の分化と維持の分子機構に注目し、環境ストレス
下での葉緑体の機能解析ならびに色素体の多面的な機能について様々な手法を用いて研究を行っている。

Our group has been studying plant adaptation toenvironmental stresses at the molecular level. Especially,
we have been focusing on chloroplasts that participate in
the energy transfer systems of photosynthesis.

１．ステイグリーンと作物生産性の向上に関する解析
植物において、葉の光合成能が持続するステイグリーン形
質は農業上有用な形質になり得る。我々はソルガム(Sorghum
bicolor)の 2 系統(NOG 及び BTx623)から作出した組換え自植系統を用いて QTL 解析を進めており、新規なステイグリーン遺伝子の同定及びステイグリーンに関する分子機構の解明を行っている。

1. Quantitative trait locus (QTL) analysis of stay-green
phenotype in sorghum
Stay-green is an important agronomic trait for plants,
possibly leading to higher yield and biomass. Currently, weare trying to identify new QTLs of sorghum stay-green byusing 252 recombinant inbred lines (RILs), which wereobtained from a cross between a stay-green parent(BTx623) and a faster senescing parent (NOG).

２．オルガネラ DNA の代謝機構に関する研究
葉緑体内部に保持されている葉緑体 DNA は、葉の老化初期に分解されている。我々が花粉において同定したオルガネ
ラ DNA 分解酵素（DPD1 エキソヌクレアーゼ）は老化葉においてもその発現が誘導されており、老化葉で何らかの生理学的機能を持つことが予想された。シロイヌナズナ突然変異体を用いた解析の結果、変異体はステイグリーンを示し、葉老化における葉緑体遺伝子発現の抑制が遅延することが明らかとなった。葉緑体 DNA の老化葉での積極的な分解が、新
たな養分転流に寄与する可能性について現在解析を進めている。
３．光色の違いによる光化学系 II タンパク質分解メカニズムの変化
光化学系 II は光エネルギー転換の初期反応を担うが、光傷害を最も受けやすい。光損傷メカニズムは過剰な光エネルギ
ーによる損傷と Mn クラスターの崩壊が引き金となる損傷(Two-step 説)が提唱されており、後者は短波長の光(紫外光~青色)で起き易い。異なる光色が反応中心タンパク質 D1 の分解に及ぼす影響を解析した結果、青色光下で D1 断片化が促進される一方、赤色光下で断片化が抑制された。この結果は
Two-step 説による損傷が D1 断片化に関連することを示唆した。
４．澱粉粒の形状多様性を支配する分子機構の解析
澱粉粒は、植物が光合成産物としてアミロプラスト(色素体の一種)内に蓄積するグルコースの多量体である。澱粉粒の形
状と大きさは植物種によって異なっている。その形状を決定する分子機構の解明を目指して研究を進めている。これまでに、突然変異体の解析から澱粉粒の大きさを制御する遺伝子である SSG4 遺伝子ならびに SSG6 遺伝子をイネで同定した。
今年度は、澱粉粒の形状に関する新規の突然変異体を単離するために、イネとオオムギを用いて新しくスクリーニングを開始した。

2. Molecular mechanism of organellar DNA degradation
during plant senescence
In plant cells, mitochondria and plastids contain theirown genomes derived from the ancestral bacteria
endosymbiont. Despite their limited genetic capacity, these
multicopy organelle genomes account for a substantial
fraction of total cellular DNA, raising the question ofwhether and how organelle DNA quantity is controlled
spatially or temporally. Now, we are studying the organelle
DNA degradation in leaves during senescence using
Arabidopsis mutants.
3. D1 fragmentation in photosystem II repair under
different photo-damage
A major target site of photo-damage is a reaction center
protein, D1 in photosystem II. We tested whether the D1
degradation process can be affected by qualitatively
different photo-damage that occurs according to thetwo-step model. The significant increase in D1
fragmentation under blue light irradiation suggested thatprimary damage resulting from the absorption of lightenergy in the Mn-cluster in the two-step model was
involved in D1 fragmentation.
4. Molecular mechanism underlying the diversity of starchgrain morphologies among plant species
Starch is a biologically and commercially importantpolymer of glucose and is synthesized to form starch grains(SGs) inside the plastids (amyloplasts). Despite the simple
composition of glucose polymer, SG exhibits various
morphologies and sizes depending on the plant species.
However, the molecular mechanisms underlying this SG
diversity remain unknown. To answer this question, we are
now screening and analyzing rice and barley mutants
related to SG morphology and size.

環境応答機構研究グループ

Group of Environmental Response Systems

本グループでは、植物の非生物的ストレスに対する応答について、遺伝子レベルから個体レベルまで、広くシステムを理解することを目指して研究を行っている。特に、植物ホル
モン応答機構に着目し、生理学、分子生物学、分子遺伝学的手法により解析を行っている。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。
１．ABA 応答に関わる因子、細胞機能に関する研究
環境応答に関わる植物ホルモンのアブシシン酸（ABA）の作用機作を理解するためにシロイヌナズナを用いて分子遺伝学的解析を行っている。これ迄に、ミトコンドリア機能異常とストレス応答との関連を明らかにするため、新奇短鎖ペプ
チド FEP1 の機能解析を行った。ゲノム編集技術で獲得した
fep1 変異は、地上部での鉄応答の異常がみられ、FEP1 が個
体全体の鉄応答の統括に関わる重要な役割を持つことが示唆された。
２．圃場オオムギの生長解析
植物の表現型を制御する遺伝的要因と環境要因の相互作用を明らかにする方法を確立することを目的として、圃場オオ
ムギの生長をモニターする解析基盤の構築を、理化学研究所、
横浜市立大学、名古屋工業大学との共同研究で進めた。我々は、昨年度に引き続き、オオムギ４系統の圃場における経時的生長動態、代謝物動態、ホルモン動態データを取得し、そのデータ解析から農業形質発現までの生長過程の指標となる
状態形質候補を抽出した。また、圃場オオムギ経時的エピゲ
ノム解析の作業工程の確立と解析を実施した。
３．亜硫酸による気孔閉口機構の解析
気孔閉口は有害ガスから植物が身を守るための機構の一つだと考えられているが、亜硫酸ガスによる気孔閉口機構はよくわかっていなかった。本研究では亜硫酸ガスは気孔閉口を誘導するだけでなく、低濃度では気孔開口を誘導し、高濃度になると気孔閉口を誘導することをシロイヌナズナの気孔を通じて明らかにした。さらに、高濃度の亜硫酸ガスによる気孔閉口は孔辺細胞が非アポトーシス的に細胞死することによって生じることを示した。
４．ゼニゴケにおける DNA メチル化制御機構の解析
DNA メチル化は、遺伝子やトランスポゾンの発現に影響を与えるエピジェネティックな修飾である。これまで、種子植物を用いて DNA メチル化の制御機構が明らかにされてきたが、基部植物においては殆ど明らかになっていなかった。我々はゼニゴケにおける CG メチル化酵素変異体の解析により、ゼニゴケにおいて CG メチル化は分化細胞の維持に必要であり、non-CG メチル化を抑制する機能があることを明らかにした。

Our research aim is to understand the molecular systemof the response to abiotic stress in plants at the levels fromgene expression to individual behavior. We are mainlyinterested in plant hormone response systems and we havebeen analyzing the systems using physiological, molecularbiological and molecular genetic approaches. Our mainachievements in 2018 are described below.
1. Analysis of components involved in the ABA response
To understand the ABA response mechanisms, we havebeen studying ABA-related mutants of Arabidopsis. We
have shown that a mitochondrial defect causes abnormal
stress responses in Arabidopsis and that a novel short
peptide, FEP1, has a pivotal role in the stress response insuch mutants. This year, we characterized the fep1
mutants of Arabidopsis that were obtained using the
genome editing technology. We found that fep1 was
defective in the iron-deficiency response especially in theaerial part. This result suggests that the FEP1 peptide
plays a pivotal role in the systemic iron-deficiency responsein plants.
2. Establishing a phenomics of field barley
To understand the gene x environment interaction in thefield crops, we attempted to establish the phenomics
platform to monitor the growth states and physiologicalfluctuations of the field barley through its life-cycle.
According to the procedures in the we used last year, we
obtained the weekly data of growth rate, RNAseq, andhormones of field barley. From the analysis of these data,
we successfully identified several state traits that are thehallmark of the growth stages toward the important
agricultural traits. We also established the epigenome
analysis of field barley and started genome wide analysis.
3. Analysis of the mechanism of sulfur dioxide-induced
stomatal closure
Closing the stomata is a mechanism in plants usedagainst hazardous gases. However, the mechanism of
sulfur dioxide-induced stomatal closure has not been
elucidated. This year we revealed that a low concentrationof sulfur dioxide induces stomatal opening and, on thecontrary, of sulfur dioxide, at a high concentration, induces
stomatal closure in Arabidopsis stomata. We also foundthat the high concentration of sulfur dioxide induced
stomatal closure by non-apoptotic cell death of guard cells.
4. Analysis of regulatory mechanism of DNA methylationin Marchantia polymorpha
DNA methylation is an epigenetic modification that
affects gene expression and transposon silencing. In
flowering plants, the DNA methylation regulatory
mechanism has been characterized considerably, but less isknown about DNA methylation regulation in basal land
plants. We analyzed a CG methylase mutant inMarchantia polymorpha and found that CG methylation isrequired for maintaining differentiated cellular identities
and is necessary for repressing non-CG methylation in M.
polymorpha.

土壌環境ストレスユニット(Soil Stress Unit)

植物ストレス学グループ

本グループでは植物の必須元素、有益元素及び有害元素の吸収・集積機構、ミネラルストレスに対する植物の応答反応や耐性機構について個体レベルから遺伝子レベルまで研究を行っている。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。
１．イネのホウ素優先分配に関与する輸送体
ホウ素は植物の生育に欠かせない必須栄養素で、特に成長が活発な新しい組織（新葉や生殖器官）に必要である。イネの節で高発現する OsNIP3;1 の機能解析を行った結果、OsNIP3;1 は、根から吸収したホウ素を新葉などの新しい組織に優先的に分配させる役割があることを明らかにした。
OsNIP3;1 タンパク質は節の肥大維管束木部に局在し、導管から細胞内にホウ素を取り込むことによって、ホウ素の維管束間輸送が促進される。この遺伝子を破壊すると、新しい組織へのホウ素の分配が減少する。また、環境中のホウ素濃度の変動に対して、遺伝子レベルとタンパク質レベルで応答することが分かった。環境中のホウ素濃度が高くなると、
OsNIP3;1 遺伝子の発現が抑制され、また OsNIP3;1 タンパ
ク質も素早く分解してしまう。ホウ素が不足となると、逆に遺伝子の発現やタンパク質の量が上昇する。
２．イネのカドミウム集積の低減技術
これまでに我々は、OsHMA3 が根で発現し、カドミウムの液胞への隔離に関与すること、OsHMA2 は根や節など、他の組織にも高発現し、根から地上部へのカドミウムの輸送や節での分配に関与することを明らかにしてきた。このような発現パターンの違いを利用して OsHMA2 のプロモーター
制御下に OsHMA3 をイネに発現させると、コメ中のカドミ
ウム濃度を著しく低下させることができた。
３．ソバのアルミニウム耐性に関与する ABC 輸送体遺伝子の解析
ソバのアルミニウム耐性に関わる細菌型 ABC トランスポーターFeSTAR1 と FeSTAR2 について機能解析を行った。
FeSTAR1 と FeSTAR2 の発現ははともにアルミニウムによって誘導され、またその発現レベルはイネやシロイヌナズナの相同遺伝子よりかなり高い。
さらにFeSTAR1とFeSTAR2は複合体を形成して機能していることを明らかにした。
FeSTAR1 と FeSTAR2 をシロイヌナズナのそれぞれの変異体に導入したところ、アルミニウム耐性を回復させた。これ
らの結果は、FeSTAR1 と FeSTAR2 の高発現がソバのアル
ミニウム耐性に寄与していることを示している。
４．イネ科植物のアルミニウム耐性機構解析
イネのアルミニウム耐性に関与する転写因子 ART2 を同定した。ART2 の発現はアルミニウムによって素早く応答する。またこれまで同定された ART1 とは異なり、制御する
下流の遺伝子も異なって、イネのアルミニウム耐性に新たな経路があることが示唆された。ART2 を破壊すると、アルミニウム耐性が弱くなるが、耐性への寄与は ART1 ほど大きくなかった。
一方、オオムギのアルミニウム耐性の主要遺伝子
HvAACT1 の発現制御機構を調べたところ、耐性品種において HvAACT1 上流に 15.3kb の新規レトロトランスポゾンの挿入を見つけた。その挿入はプロモーターの役割をし、HvAACT1 の発現レベルの向上と根先端への発現を制御する。しかも、この挿入の脱メチル化が HvAACT1 の発現に関与していることを突き止めた。さらにこの挿入はヨーロッパのオオムギ品種にしか存在しないこともわかった。

Group of Plant Stress Physiology
Our group has been analyzing the mechanisms of uptake
and accuulation of essential, beneficial and toxic mineralelements, and the mechanisms of the response andtolerance of plants to mineral stresses at different levels
from intact plants to genes. Our main achievements in2018 are described below.
1.

Identification of a transporter for preferential
distribution of boron in rice
Boron (B) is an essential nutrient for plant growth.
Especially, the developing tissues require high B for theiractive growth. We identified a transporter for preferential
distribution of B in rice; OsNIP3;1. OsNIP3;1 is localized
at the xylem transfer cells of enlarged vascular bundle ofnodes and is required for intervascular transfer of B.
Knockout of this gene resulted in decreased distribution of
B to the developing tissues. Furthermore, OsNIP3;1
responded to the external B level at both transcriptional
and protein level. At a high B level, the expression of
OsNIP3;1 was down-regulated and the protein was rapidly
degraded. Conversely, the expression of OsNIP3;1 was
up-regulated in response to B-deficiency.
2. A new approach for reducing Cd accumulation in rice
We previously found that OsHMA3 is mainly expressedin the roots and is involved in vacuolar sequestration of
cadmium (Cd), while OsHMA2 is highly expressed in othertissues in addition to the roots. By utilizing such different
expression patterns, we generated transgenic rice plants
expressing OsHMA3 under the control of the OsHMA2
promoter. As a result, the Cd accumulation in rice grains
was significantly reduced.
3. Functional characterization of two ABC transporter
genes related to Al tolerance in buckwheat
We functionally characterized two genes (FeSTAR1 andFeSTAR2) belonging to the bacterial-type ABC transporterfamily. The expression of both FeSTAR1 and FeSTAR2
was induced by Al toxicity. Furthermore, the expression
level was much higher than that of their homologous genes
in rice and Arabidopsis. FeSTAR1 and FeSTAR2 form acomplex when expressed in onion epidermal cells.
Introduction of FeSTAR1 and FeSTAR2 into theircorresponding Arabidopsis mutants rescued the Al
tolerance. These results indicate that high expression of
FeSTAR1 and FeSTAR2 contributes to high Al tolerance inbuckwheat.
4. Molecular mechanism of Al tolerance in gramineous
plants
We identified a new transcriptional factor for Al tolerance
in rice; ART2. The expression of ART2 rapidly responded
to Al stress. The downstream genes regulated by ART2
are different from those regulated by ART1, indicating anovel pathway for Al tolerance in rice. Knockout of ART2
decreased tolerance to Al toxicity, but its contribution was
smaller than that of ART1.
We also revealed the regulation mechanism for the
expression of HvAACT1, a major Al tolerance gene inbarley. We identified a multiple retrotansposon insertion(15.3 kb) in the upstream of HvAACT1 in Al-tolerant
cultivars. This insertion functions as a promoter, which
enhances the expression of HvAACT1 and changes thelocation of HvAACT1 to the root tips. Furthermore, we
found that demethylation of this region is also involved in
the regulation of HvAACT1 expression. Interestingly, thisinsertion was only found in some Al-tolerant barleyaccessions in Europe.

植物分子生理学グループ

Group of Plant Molecular Physiology

本グループでは植物細胞の環境ストレス応答機構を分子、細胞、生理学的に研究している。塩ストレス環境での水とイオンの輸送の制御について、アクアポリンと 1 価陽イオン輸送体の研究を進めている。また、酸性土壌において植物の生育を阻害するアルミニウム（Al）イオンへの応答について研究を行っている。Al 耐性機構の解明のため、タバコ培養細胞を用いて、メタボロームおよびトランスクリプトーム解析を行い、活性酸素消去系やエネルギー代謝系の遺伝子に着目して解析を行っている。さらに、コムギ Al 耐性遺伝子の Al 活性化型リンゴ酸輸送体遺伝子 TaALMT の機能と構造解析、そして植物における ALMT ファミリーの機能多様性を解析している。本年度の研究成果は次の通りである。

Our research has been focused on molecular, cellular andphysiological mechanisms of plant stress responses. We
studied aquaporins and transporters for water andmonovalent cations in salt stress. We also focused onaluminum (Al) ion, a major inhibitory factor of plant root
growth in acid soils. We have performed metabolomic andtranscriptomic analyses using tobacco-cultured cells, andfocused on several genes involved in reactive-oxygenspecies scavenging system, and energy metabolism.
Furthermore, the functional and structural properties of
the Al-activated malate transporter gene ALMT, a major
Al tolerance gene in wheat, and functional diversity of the
ALMT family have been studied. Research outlines of thisyear are as follows:

１．イオン透過性アクアポリンの同定と解析
アクアポリンは水および低分子中性化合物の輸送体として知られていたが、最近シロイヌナズナのアクアポリン分子種の一部がイオンも輸送すると報告された。当研究室にあるイ
ネとオオムギの原形質膜型アクアポリン２０分子種を調べた
ところ、イネ、オオムギからそれぞれ一分子種ずつのイオン
透過性アクアポリンを見出した。卵母細胞二電極電圧固定測
定法によって輸送特性を解析した結果、両者とも Na＋と K＋に対する輸送性があり、ミリモル程度の濃度の外液カルシウ
ムでイオン輸送活性が部分的に阻害されることが明らかになった。このような特徴は、塩ストレス環境における Na＋流入の系として電気生理学的に存在が想定された NSCC
（non-selective cation channel）の性質に合致している。

1. Identification and analysis of aquaporins transportingions
Aquaporins are known to transport water and low
molecular compounds. Recently ion transport activity wasreported in some Arabidospis aquaporins. We examined
the ion transport activity of 20 plasma-membrane typeaquaporins from rice and barley we have. As a result, one
rice aquaporin and one barley aquaporin were detected asaquaporins transporting ions. Using the twin-electrodevoltage-clamp method in oocytes, we revealed that both
aquaporins transport both Na+ and K+ and are partiallyinhibited by external calcium at mM level concentrations.
These characteristics are consistent with the Non-Selective
CationChannel(NSCC)
thatissuggestedelectrophysiologically as a system for Na+ influx under salt
stress.

２．イネ OsHKT1;1 の機能解析
耐塩性に関与していると言われているイネの OsHKT1;1（high-affinity K transporter1;1）には複数のスプライシングバ
リアントと考えられる複数のｍRNA が報告されているが、それらの機能は不明である。今年度、耐塩生イネ Pokkali から９種類のバリアントを同定した。そのうちの 7 つにイオン輸送
活性があることがアフリカツメガエル卵母細胞を使った実験
系で明らかになった。
３．トマトの果実発現 SlALMT ファミリーの生理機能解析
トマトに存在する 16 の ALMT ファミリー遺伝子のうち、3つの遺伝子が Micro-Tom 品種の果実で発現している。本年度
は、そのうちの一つで、熟成が進む事で発現が減少し、果実の維管束で発現する SlALMT 遺伝子に着目した。アフリカツ
メガエル卵母細胞を用いた電気生理学的測定により、リンゴ
酸の高い排出活性を示した。さらに、硝酸イオンと塩素イオンの取り込みもみられたが、酸性アミノ酸のアスパラギン
酸・グルタミン酸は排出されなかった。現在、輸送基質の特異性についてさらに解析を進めている。また、この SlALMT
遺伝子の発現抑制トマトの作製を行い、2 系統を選抜した。現在、この発現抑制系統と野生系統間でのメタボローム解析を進めている。

2. Functional analysis of OsHKT1;1
Rice OsHKT1;1 (High-Affinity K Transporter1;1) is
involved in salt tolerance. Multi-splicing variants aredetected as OsHKT1;1 mRNAs but their functions are
unknown. This year we isolated 9 variants of OsHKT1;1 insalt tolerance rice Pokkali, and 7 among 9 variants showed
ion transport activities in the Xenopus oocyte system.
3. Physiological analyses of SlALMT-family transporters intomato fruit
Tomato possesses 16 ALMT-family genes, and we foundthat 3 of the 16 genes are expressed in fruit. This year, we
focused on a SlALMT gene expressed in the vascularbundles at an early stage of fruit development. We
investigatedthetransportfunctionusingelectrophysiological analysis in Xenopus oocytes, and foundthat the SlALMT protein performed the efflux of malate,but not aspartate or glutamate, and the influx of nitrateand chloride, suggesting that the SlALMT proteinfunctions as an anion transporter of malate and inorganic
anions. Furthermore, to assess the physiological function of
the gene, we are also investigating the metabolites
determined in the wild type and the transgenic suppresser
lines in tomato.

環境生物ストレスユニット
植物・微生物相互作用グループ(Biotic Stress Unit)
Group of Plant-Microbe Interactions

植物の生育は、ウイルスや微生物との相互作用により大きく影響を受ける。本グループでは、ウイルスが主役として有害なあるいは有益な影響を及ぼすいくつかの系を用いて、植物・微生物間相互作用を分子、細胞、個体レベルで解析している。以下に本年の成果を記す。

Plant growth is influenced by various viruses andmicroorganisms. Our group explores, at molecular, cellularand individual levels, the plant/microbe interplays ofseveral selected pathosystems in which viruses as main
players exert beneficial or harmful effects on plants.

１．地中海沿岸諸国産白紋羽病菌に感染している新規ウイル
スの多様性
日本産白紋羽病菌のウイルスの中には、潜在的生物防除因
子となりうる宿主菌の病原力を衰退させるウイルスが見つかっている。本年は、地中海沿岸から白紋羽病菌約７０菌株を収集し、ウイルスの探索を進めた。その結果、日本産白紋羽病菌では検出されてこなかった新規の科あるいは種に属すると考えられるdsRNA ウイルスおよび(＋)ssRNA ウイルス（例
えば、メガトティウイルス、ハイポウイルス、フザグラウイ
ルス）が多数検出された。しかし、逆に日本産白紋羽病菌から検出されたウイルスは見つからなかった。潜在的生物防除因子となりうるウイルスや新規のライフスタイルを持つ可能性があるウイルスも見つかった。また、進化の過程で dsRNA
ウイルスと(＋)ssRNA ウイルスの間で水平伝搬したと推定される機能領域が見つかった。これらの結果は、白紋羽病菌のウイルスの多様性を明らかにし、さらにそれらの進化についても興味深い洞察を与える。

1. Novel, diverse RNA viruses from Mediterraneanisolates of the phytopathogenic fungus, Rosellinia
necatrix
In this study, we have shown the great diversity ofviruses in Mediterranean field isolates of thephytopathogenic fungus, R. necatrix. All newly detectedsequenced viruses belong to new species in at least 7 virus
families including newly proposed families. Previous
extensive virus surveys of Japanese isolates of R. necatrix
led to the identification of diverse viruses. However, manyof the newly detected viruses best matched the viruses
reported from soil-inhabitant fungi sympatric to R. necatrix
instead of viruses of Japanese R. necatrix. This factsuggests that there is interspecies horizontal transmission
among the soil fungi that has not been well documented todate for fungal viruses. Also presented is very rarehorizontal gene transfer between a double-stranded RNA
virus and a positive-sense, single-stranded RNA virus.
Collectively, these provide novel interesting insight into theevolutionary biology of fungal viruses.

２．植物・昆虫アルファ様ウイルスの昆虫ゲノムへの内在化
非レトロRNAウイルスである植物･昆虫アルファ様ウイル
スの進化の一端を理解するために、ゲノムDNAデータベース
検索によりウイルス内在化配列（古のウイルス感染履歴、ウイルス化石）の探索を行った。tBlastnの結果、新規の昆虫トバモ様ウイルスグループ（植物アルファ様ウイルスに遠縁）に類似するウイルス内在化配列が多様な昆虫種のゲノムから見いだされた。このことから、植物と進化的な類縁関係を示す昆虫アルファ様ウイルス（トバモ様グループ）は既に古の時代に存在し、多様な昆虫種に感染していたことが示唆された。
３．宿主足場タンパク質 RACK1 のハイジャックによる植物
ウイルス増殖機構
RACK1 (receptor for activated C kinase 1) はタンパク質複合体の足場として様々な生理機能に関わる。植物 RACK1 は糸状菌・細菌に対する免疫に関わることが知られていたが、植物－ウイルス間相互作用での役割は未知であった。以前
我々は、red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) がウイル
ス複製酵素タンパク質 p27 を介して活性酸素種（ROS）産生を誘導し複製を有利に進めることを報告した。今回我々は、
RACK1 が RCNMV の増殖を促進する宿主因子であることを見出した。すなわち、RACK1 が、1) p27 と相互作用しウイ
ルス複製の場へとリクルートされ、2) ROS 産生に必要な宿主因子と p27 とのアダプター分子として働き、3) p27 誘導性
ROS 産生を促進し、そして 4) 効率的なウイルスタンパク質の翻訳にも必要であること、が明らかとなった。以上のことから、宿主足場タンパク質 RACK1 を介した植物ウイルス複製機構の一端が明らかとなった (Hyodo et al., 2018, New
Phytol.)。

2. Endogenization of plant/insect-infecting alphavirus-likeviruses into insect genomes
To gain insight into the long-term history and evolutionof plant and inset alpha-like viruses (non-retroviral RNA
viruses), we performed in silico analyses to search for
endogenous viral elements (EVEs) using public DNA
databases. The tBlastn search identified a large number ofEVEs related to a novel insect tobamo-like group(virgavirus/negevirus-related lineage) in the genome ofdivergent insect species. Our analyses indicate that there
has been prevalent infection by insect virga/nege-related
viruses, especially the insect tobamo-like group, sinceancient times.
3. Hijacking a host scaffold protein, RACK1, by a plant
RNA virus for its replication
Receptor for activated C kinase 1 (RACK1) is strictlyconserved across eukaryotes and acts as a versatile scaffold
protein involved in various signaling pathways. We showthat red clover necrotic mosaic virus (RCNMV), a
positive-stranded plant RNA virus, requires RACK1 forviral translation and replication. RACK1 is recruited byviral replication protein p27 into endoplasmic reticulumderived aggregates that are considered to be the replicationsites. RACK1 was shown to be required for p27-mediatedinduction of ROS, which is essential for robust RCNMVRNA replication. Interestingly, RACK1 mediated bridging
between p27 and a host kinase that activates an
ROS-generating enzyme. Together, our findings provide an
example of a viral strategy that hijacks a host multifacetedscaffold protein for viral replication (Hyodo et al., 2018,
New Phytol.).

植物・昆虫間相互作用グループ
本グループでは、主要穀物をはじめとする植物が、自然界に広く存在する植食性昆虫との生存競争の中で、どのように植食性昆虫に対する防御機構を活性化するのかに注目し研究を行っている。2018 年に以下の 3 研究課題において得られた成果を記載する。

Group of Plant-Insect Interactions
The group is focusing on basic problems of how plants,
including important crops, induce their defense systems tosurvive in natural competition with the omnipresent
herbivorous insects. Here, we report the progress we madein three major areas in 2018.

１．咀嚼性昆虫吐き戻し液由来の新規エリシター
咀嚼性昆虫の吐き戻し液は、植食性昆虫食害時に傷害部位に残存し、植物の防御応答を誘導することが知られている。
ここ数年にわたって我々は、新規昆虫由来エリシターの同定に向けて、クサシロキヨトウ（Mythimna loreyi）およびイチモンジセセリ（Parnara gutata）の吐き戻し液の解析を継続して行っており、これら吐き戻し液の高分子画分にイネに対して防御関連の二次代謝物を強く誘導するエリシター活性を見出している。本画分にはイネの細胞壁由来と推定される分子が含まれており、これら分子が昆虫腸内で分解され、エリシ
ターとして機能する可能性を調べており、現在、オリゴ糖産生過程の詳細な分子機構の解析を進めている。

1. Novel elicitors from chewing herbivore regurgitate
We have been analyzing oral secretions (OS) fromchewing rice herbivores Mythimna loreyi and Parnara
gutata, which are released in plant wounds during feeding,to find novel elicitors of plant defense. In particular, wehave focused on high molecular weight fraction of OS thatcan strongly induce accumulation of defensive secondary
metabolites in rice. In 2018, we made substantial progressin identifying the elicitor-active components in the fraction
as plant cell wall materials that are oligomerized in theinsect gut, and thus activated for triggering the plant
defense system. We are now studying the molecularmechanisms involved in the oligomerization process tounderstand how these compounds contribute to plant
defense during herbivore attack.

２．イネに対する新規のエリシターとして吸汁性昆虫の甘露
中細菌の同定トビイロウンカ（Nilaparvata lugens）はイネに対して深刻な被害を引き起こす吸汁性昆虫であるが、このような吸汁性
昆虫を植物がどのようにして認識するかは不明な点が多い。
本研究で、トビイロウンカ食害時にイネ葉に排泄された甘露（Honeydew）に、数種の共生細菌が含まれていることを見出した。これら共生細菌はイネにより認識され、害虫に対する防御応答を誘導することを明らかにした。さらに抗生物質を用いることで、共生細菌を除いたトビイロウンカを作出した
ところ、イネはこれらトビイロウンカに対する防御応答誘導能が低下した。これら結果より、植物が環境中で吸汁性昆虫を認識し抵抗性を示す防御戦略において、昆虫共生細菌が重要な一端を担っていると考えられた。

2. Honeydew bacteria identified as a new type of sucking
insect-associated elicitors in rice
Sucking insects like the rice brown planthopper(Nilaparvata lugens) cause serious damage on rice, but it is
not clear how the plants can detect their presence. Here wefound that feeding residue known as honeydew, which isdeposited on rice plants during feeding of N. lugens,contains several symbiotic bacterial species that can berecognized by the rice plants, and trigger specific defense
responses against the pest. We also show that whenbacterial symbionts are removed from the N. lugens bodyby antibiotic treatment, these insects induce less defense
responses in rice, demonstrating that microbes are indeed
an important part of the plant defense strategy to detectand fight against their insect enemy in nature.

３．アブラムシに抵抗性を示すソルガムの解析
アブラムシは多くの作物に深刻な被害を与える。現在も、アメリカ合衆国のソルガム栽培において、複数の新しい種のアブラムシが深刻な経済的脅威となっている。昨年度、光環
境適応研究グループとの共同研究により、数ラインのソルガ
ムが圃場におけるアブラムシ加害に対して耐虫性を示すことを見出した。2017 年および 2018 年に、感受性品種の NOGと新たに見出した耐虫性品種 3003 を交雑して得た F1 から、さらに F2 種子を作出した。F2 集団のソルガムを圃場で栽培
し、アブラムシに対する耐虫性スクリーニング試験を行った
後、将来的な遺伝子マッピング関連の解析に向けて F3 種子を採取した。近い将来、これら遺伝子資源を用いてアブラムシに対する新規な耐虫性関連遺伝子の同定を目指している。

3. Investigations of sorghum resistance to aphids
Aphids cause serious damage to many crops. Currently,
some new aphid strains have become a serious economic
threat to sorghum production in the US. In the previous
year, in collaboration with the Plant Light Acclimation
Group, we identified several sorghum lines that show highnatural resistance to aphid infestation in the field. In
2017/2018, we prepared F1 hybrids from the susceptible
NOG and newly identified resistant line No.3003, andfurther amplified them to produce the F2 generation seeds.
The F2 hybrids plants were then screened for aphid
resistance in the field in the summer of 2018, and F3 seeds
were collected for future genetic and mapping-related work.
With these resources, we hope to identify novel genes foraphid resistance in the near future.

植物環境微生物学グループ

Group of Plant Environmental Microbiology

本グループでは植物に共生しその生育を助けるような細菌の分離・分類や機能解析、また赤潮原因藻の生理機能や共生細菌やウイルスとの生物学的相互作用についての研究を行っている。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。

Our group has been analyzing the mechanisms of plant
growth promotion, and isolating and characterizing novel
plant-beneficial microorganisms. We have also been
studying the ecophysiology of boom-forming phytoplankton
at molecular and cellular levels. Our main achievements in2018 are described below.

１．ランタノイド(Ln)に依存するメタノール資化性細菌の分離分類
メタノール資化性細菌が持つメタノール脱水素酵素には、Ln に依存する酵素があることが最近分かってきた。そこで、イネの根圏などを分離源として、Ln の存在に依存するメタノール資化性細菌を探索した。Ln により生育が促進される新属
細菌 Oharaeibacter diazotrophicus SM30 株のゲノムを完全解
読し、Ln に依存するメタノール資化酵素遺伝子を遺伝学的に同定した。また、メタノール生育が完全に Ln に依存する新属
細菌 Novimethylophilus kurashikiensis La2-4 も分離同定した。
本細菌のゲノムも解読し、Ln 依存酵素遺伝子を同定した。

1. Isolation and characterization of lanthanide (Ln)dependent methylotrophic bacteria
Methanol dehydrogenase involved in methanol oxidationin gram-negative bacteria is a calcium-dependent enzyme.
Just recently, another enzyme that is dependent on Ln was
found. We explored new bacteria whose growth isdependent on Ln from various isolation sources including
rice rhizosphere soil. A novel bacterium, Oharaeibacterdiazotrophicus SM30 can grow faster in the presence of Ln.
We sequenced its complete genome, and geneticallyanalyzed the genes involved in Ln-dependent
methylotrophy.
Anothernovel
bacterium,
Novimethylophilus kurashikiensis La2-4, is completelydependent on Ln. The genome sequencing and proteomics
analyses revealed the genes involved in its Ln-dependent
methylotrophy.

２．Methylobacterium 属細菌における Ln 存在下でのメタノール資化性制御
Methylobacterium 属細菌は植物葉上の主要な共生細菌であり、植物が放出するメタノールを利用して生育する。本属細菌はカルシウム依存と Ln 依存の両方の酵素を持つ。Ln 存在
下でトランスクリプトーム解析を行い、メタノールとホルム
アルデヒド代謝に関わる酵素遺伝子のスイッチが起こることを明らかにした。
３．エルゴチオネインの微生物生産
エルゴチオネイン(EGT)はヒトの血液にも含まれる抗酸化アミノ酸であり、限られた微生物種だけが生産できると考えられていた。Methylobacterium 属細菌はメタノール生育時に著量の EGT を生産することを見いだした。EGT 合成遺伝子の発現強化、前駆体となるヒスチジンの分解酵素遺伝子欠失により EGT 生産能を向上させた。また、EGT 生産性の高い
カビ、酵母株をスクリーニングし、非組み換え体による生産への糸口を掴んでいる。
４．ヘテロシグマのミトコンドリアゲノムの系統地理学的解
析
真核性赤潮原因藻ヘテロシグマは、世界中の浅海に生息する。私たちは、ヘテロシグマのミトコンドリアゲノム上に三箇所の超可変領域を見出した。このうち２配列は、タンパク質をコードすると見られ、その配列は株由来水域の緯度と強く相関する。ヘテロシグマは広い気候域に高い適応性を示す
が、これらのタンパク質は、異なる緯度における環境へ適合性に関係すると推測している。
５．赤潮原因藻と環境微生物間の相互作用についての研究
赤潮形成は、赤潮原因藻の異常増殖に基づく。赤潮原因藻の増殖状態は、水温や富栄養化等の環境要因、あるいは海洋細菌との相互作用によっても変化することが明らかとなってきた。本年度より、私たちは、チリ沿海における赤潮原因藻の環境動態の継続モニタリングプログラムに参加している。
私たちは、特に時系列モニタリングとともに海洋細菌と赤潮原因藻間の相互作用についての生物学的解析を通し、環境中の赤潮原因藻動態の理解を目指して研究を行なっている。

2.

Regulation of Ln-dependent methylotrophy in
Methylobacterium species
Methylobacterium species are plant-epiphytes andutilize methanol emitted from plants. They usually containboth calcium- and Ln-dependent enzymes, and switch theirexpression depending on the availability of Ln. We
conducted transcriptomic analysis and found that theswitching of genes involved in methanol and formaldehydeoxidation occurs.
3. Microbial production of ergothioneine
Ergothioneine is an anti-oxidative amino acid derived
from histidine. Though it has been believed that only
limited microorganisms can synthesize it, we found that
Methylobacterium species are also capable of production.
We enhanced the expression of synthetic genes and deleted
His degradation gene, which resulted in increased
productionofergothioneinebyrecombinant
Methylobacterium. We also screened ergothioneineproductive fungus and yeasts, which are non-recombinant.
4. Phylogeograhic character of mitochondrial genes ofHeterosigma akashiwo
H. akashiwo is a photosynthetic, bloom-forming
eukaryotic, cosmopolitan alga. We recently identified three
hypervariable regions in the H. akashiwo mitochondrial
genome, two of which show a strong correlation with thegeographic origin of the isolate. They are apparently
protein-coding sequences, and show clear correlation withthe latitudes of the strain origins, suggesting that theprotein may be of physiological importance for adaptation
to environments at different latitudes, i.e. different watertemperature or day length.
5. Characterization of phytoplankton-marine bacteriainteraction and their effect on bloom formation in nature
Algal bloom formation is based on rapid propagation of
single or limited species of algae, and the bloom dynamics
is determined not only by environmental factors, including
water temperature, and eutrophication, but also by marine
microbial ecosystem in the area including various marine
bacteria. We participate in a binational collaboration
project to monitor harmful algal species and associating
microorganisms in coastal waters of Chile starting from
April 2018. Our mission in the project is to conduct
time-series monitoring of marine microbial ecosystem, andto characterize the effect of interaction among the species
on bloom dynamics in nature. Understanding interaction
among various marine microbes in ecosystem may yieldvaluable insights into algal bloom formation mechanism.

遺伝資源ユニット

ゲノム多様性グループ
ゲノム多様性グループでは、実験系統を含む栽培オオムギ
約 14,000 系統と野生オオムギ約 900 系統を保有し、(1) 種子の増殖、収集、保存および種子配布等の系統保存事業、(2) 遺伝的多様性の評価ならびに特性形質のデータベース化、(3)ゲノム解析の諸手法を用いたオオムギ遺伝資源の機能開発に関する研究に取り組んでいる。
１．オオムギ遺伝資源の系統保存事業
当グループは、ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)に参画し、オオムギ種子ならびにオオムギゲノムリソースの配布事業を担っている。
(a) 系統種子の配布と保存
当事業では、在来系統、実験系統および野生系統を含むオ
オムギ種子の増殖ならびに配布を行っている。ノルウェー・
スバルバル世界種子貯蔵庫へのオオムギ種子預託も進めている。これらのオオムギ種子は、未来の食糧確保のために必要な品種改良の基礎となる重要な遺伝資源であり、重複保存によって長期的な食糧安全を保証することに繋がる。
(b) ゲノムリソースの配布保有するゲノムリソースは、国内外の研究者のリクエストに応じて分譲している。これらのリソースは、国産の醸造用
オオムギ品種「はるな二条」の BAC ライブラリーの全クローンセット、選抜用プール DNA、高密度フィルターならびに完
全長 cDNA クローン等が含まれている。
２．オオムギ遺伝資源の評価
当グループでは、オオムギ遺伝資源を用いた有用形質の原因遺伝子単離と解析を進めている。
(a) 醸造形質の新規遺伝資源の探索
醸造過程で重要な役割を担うα-アミラーゼ活性の新規有用アリルの発掘を目的とし、国際オオムギコアコレクションを対象に全ゲノム関連解析を行い、7 本の染色体全てで関連す
る QTL 領域を見出した。
この結果によって日本の近代品種は、高いα-アミラーゼ活性を持つ系統のみならず低活性系統からでさえも新規な対立遺伝子を導入することによっても改良できることを示した。
(b) オオムギ生長過程の表現型可塑性
表現型可塑性の種内変異は遺伝子型・環境相互作用（GxE）
として記述され、作物の生産性を向上させる上で重要な要素である。 これらの相互作用を理解するために、我々は時系列
マルチオミクス戦略によって複数の圃場環境の下、オオムギ
生長トラジェクトリの変異を明らかにすることに取り組んでいる。
３．オオムギのゲノム解析(a) オオムギのゲノム解析とマーカー開発
現在、高速シークエンサーを用いた RNA-seq 解析を多数品種で実施し、多型解析を進めている。また，エキソーム・キャプチャーと QTL-seq とを組合せて、巨大ゲノムを持つ生物
種における迅速マッピングの手法を開発した。
(b) オオムギの形質転換とゲノム編集
オオムギのポストゲノム研究の効率化を目的として、その形質転換効率に関わる遺伝子の探索を行っている。現在、安定して形質転換が可能な品種「Golden Promise」と形質転換が困難であるがゲノム情報が充実している品種「はるな二条」の交雑後代を用いて、遺伝的評価を行っている。また、育種や遺伝子機能解析への応用が期待されるオオムギのゲノム編集技術の開発を進めている。

(Genetic Resources Unit)
Group of Genome Diversity
Our group has preserved ca. 14,000 accessions ofcultivated barley including experimental lines and ca. 900
accessions of wild relatives. The objectives of our researchare 1) collection, multiplication, preservation anddistribution of barley germplasm, 2) evaluation of genetic
diversity and development of the database of genotype andphenotype data, and 3) application of barley genetic
resources to breeding and basic research by the genome
analysis using new technologies, e.g., NGS, microarraygenotyping and genetic transformation.
1. Preservation and distribution of barley genetic resources
Our group has been taking part in the National
BioResource Project (NBRP) and has been preserving anddistributing the barley seeds and DNA clones.
(a) Preservation and distribution of barley germplasms
We are multiplying and distributing the barley
germplasms including landraces, experimental lines, andwild relatives. We are depositing barley seeds in the
Svalbard Global Seed Vault in Spitsbergen, Norway. Thesebarley seeds are important genetic resources to be utilized
as barley breeding materials for food security, and storageof duplicate samples is important.
(b) Distribution of barley genome resources
We are distributing the barley genome resources todomestic and international institutions and researchers
upon request. These resources include the complete BAC
clone set, pooled BAC DNA for clone screening, its
high-density replica membranes, EST clone and full-length
cDNA derived from the Japanese cultivar “Haruna Nijo”.
2. Evaluation of barley germplasm
Our group is focusing on the isolation andcharacterization of the genes involved in agronomicallyimportant traits using barley genetic resources.
(a) Exploring novel alleles for malting traits
To identify QTLs that control α-amylase activity, which is
critically important in the brewing industry, we performed
a genome-wide association study for the α-amylase activity
utilizing the International Barley Core Collection andidentified several QTLs located in all the sevenchromosomes of barley. These studies showed that the QTL
alleles of the Japanese modern varieties could be improvedby introducing novel alleles from an accession with highα–amylase activity, and even from an accession with low
activity.
(b) Phenotypic plasticity of the barley developmental
trajectory
Variation in intra-species phenotypic plasticity is
described as genotype–environment interaction (GxE),
which is an important factor in improving crop productivity.
To understand these interactions, we are now tackling to
uncover the barley developmental trajectory undermultiple field environments by means of time-series
multi-omics strategy.
3. Barley genome analysis(a) Genome analysis and marker development in barley
Recently, we performed RNA-seq analysis via NGS
technology utilizing several barley varieties and conducted
their SNPs analysis. We also developed a new NGS-based
gene/QTL mapping procedure in organisms with large
genomes, designated exome QTL-seq, combined withexome-capture sequencing and QTL-seq.
(b) Genetic transformation and genome editing in barley
For post-genome analysis, we are trying to find the genes
related to the efficiency of transformation in barley. For
genetic analysis, we use the progenies derived from a crossbetween "Golden Promise", a variety that can betransformed, and "Haruna Nijo", a variety that is difficult
to transform. We are currently developing a method ofmutagenesis by genome editing for future breeding andfunctional genomics in barley.

遺伝資源機能解析グループ

Group of Genetic Resources and Functions

本グループではオオムギの種子や芒の形態を司る遺伝子のOur group has been conducting molecular genetic

特定と解析を進めている。今年度の主要な研究成果は、オオ

analysis of barley mutants paying special attention to seed

ムギの芒の｢粗・滑｣を決める rough awn 1 遺伝子(raw1)のク

and awn morphology. Our main achievements during 2018

ローニングと特性解析である。

are described below.

オオムギの穂先の針状器官である芒は、鳥獣害を防止する以外に、光合成を活発に行い収量に１０－３０％程度貢献す
るなど、農業的に重要な役割を担う。オオムギの芒には表面に鋸歯(barb)が発達し粗剛な｢粗芒｣と、鋸歯が少なく滑らかな｢滑芒｣に大別される。芒表面の鋸歯は脱穀時に粉塵となって飛散し、収穫従事者や周辺環境に悪影響を与える。そのため、滑芒遺伝子を活用し収穫時の粉塵発生を軽減させる、“環境にやさしい大麦育種”が試みられている。

Molecular cloning and characterization of the rough andsmooth awn 1 (raw1) gene in barley
The awn, an apical extension from the lemma of the
spikelet, plays important roles in seed dispersal, burial,and photosynthesis. Barley typically has long and roughawns, but smooth awn variants exist. The smooth awn 1(raw1) gene, which reduces barbs on the awns significantly,
is a natural variant that is geographically restricted to the

オオムギの芒の粗・滑性は滑性が劣性で単因子遺伝する。

Western Region. Smooth awn trait is considered to be a

滑芒遺伝子 raw1 はオオムギ5H 染色体の長腕基部付近に位置

beneficial trait because use of barley cultivars with the

することが従来の研究でわかっていたものの、その分子実態

smooth awn 1 (raw1) gene can reduce the dust derived

は不明であった。我々は滑芒品種”Morex”と粗芒品種”豊年６from awn barbs during the harvest. Thus, use of barley号”の交雑 F2 世代 1,567 個体を供試し、独自の DNA マーカー

cultivars with the smooth awn 1 (raw1) gene would lead toを開発しながら、高精度マッピングを行った。この過程で、

minimize the damages to farmers and to keep the air

オオムギとイネとのマイクロシンテニーを利用した。その結果、raw1 遺伝子はオオムギ 5HL 上の 0.42 cM の範囲に絞り込まれた。このオオムギ raw1 候補領域の両端の隣接マーカー
はイネ９番染色体の約 12 Mb の物理領域に対応し、その領域内には単一のイネ遺伝子 LOC_Os09g37540 のみが含まれる
ことがイネデータベース解析からわかった。Ensamble
Database で最新のオオムギゲノム配列データベースをBLAST 検索したところ、HORVU5Hr1G086520 がオオムギ

environment near the farm land cleaner.
Positional cloning revealed that Raw1 encodes acytokinin riboside 5ʹ-monophosphate phosphoribohydrolase,which seems to encode a cytokinin synthase. The barleyrough awn 1 gene (Raw1;HORVU5Hr1G086520) is theortholog of a cytokinin synthase gene on rice chromosome 9,

オーソログとみられ、
raw1 の有力な候補遺伝子と考えられた。

which, in turn, is a homolog of the recently reported rice

マッピング親間で raw1 候補遺伝子の塩基配列に１アミノ酸

awn gene LONG AND BARBED AWN1 / An-2

置換を引き起こすとみられる１塩基置換が検出された。オオ(LABA1/An-2; LOC_Os04g43840). The present research

ムギ粗・滑遺伝子(HvRAW1)はイネの芒長と芒の粗滑を決め

demonstrates partial overlapping between barley and rice,

る （ LONG

in the genetic control mechanisms of awn morphogenesis.

AND

BARBEDAWN

1 ／ An-2;

LOC_Os04g43840)のホモログであるとわかった。イネのLBA1/An-2 遺伝子はサイトカイニン合成酵素を指定することが報告されている。このことから、オオムギにおいてもサ
イトカイニン合成酵素が芒の鋸歯の発達制御に関与することが強く示唆される。まとめると、オオムギとイネの双方で、芒の形態を制御する遺伝機構の一部にサイトカイニンが関与する点で、共通点がみられることが判明した。

野生植物グループ
本グループでは、地球上に植物の多様性が進化した仕組みの理解を目指した研究を行っている。また、併せてこれまでに収集された野生植物の遺伝資源を保存している。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。
１．緯度に応じて異なる環境に対する植物の適応機構の解明を目指した研究
日長や気温をはじめとする緯度に応じて変化する環境は植物の生育に大きな影響を与える。こうした環境への適応の仕組みを理解することを目指し、広範囲の緯度に分布する周北極-高山植物を材料にした研究を進めている。これまでに異なる 緯 度 に 分 布 す る 2 種 の 姉 妹 種 （ Cardamine

nipponica-Carcamine bellidifolia；アブラナ科）を用いた研究を行い、両種がアミノ酸配列の大きく異なる光受容体（フィトクロム）をもつことを見つけてきた。また、シロイヌナズ
ナの形質転換植物を用いた実験から、両種のフィトクロムが温度に対する生理活性に違いをもつ可能性を明らかにしてきた。本年度はこの可能性を裏付けるための実験を進め、観察した生理応答がフィトクロムの生理活性を反映していることを裏付ける傾向を確認してきた。一方で、フィトクロムが関わる生理応答のうち、野外の生育環境への適応を担うと考えられる開花特性については、種間で大きな違いが観察されなかった。
２．植物標本庫の分類体系の変更
当研究所の植物標本庫には、研究所創立以来収集された、維管束植物の幅広い分類群の腊葉標本が約 7 万点、種子標本

Group of Wild Plant Science
Our group has been investigating the mechanistic basis
for evolution of the diversity of plant species. In addition,
we are preserving resources of wild plant seeds. Our mainachievements during 2018 are described below.
1. Unraveling the mechanisms of adaptation to the local
environment that changes along latitude
Adaptation to environments that change along latitude
such as photoperiod and temperature are important for theplant’s life cycle as well as reproductive success. To
understand how plants adapt to different environments
along latitude, we are investigating arctic-alpine plantsthat are widely distributed across extensive latitude. Our
previous works on two sister species (Cardamine
nipponica-Carcamine bellidifolia; Brassicaceae) found thatthe lower latitude C. nipponica have diverged alleles fromthe higher latitude C. bellidifolia in PHYB, an ortholog ofphytochrome genes that encoded red/far-red light receptors,
where seven amino acid replacements characterize theirdivergence. By transforming Arabidopsis thaliana lacking
functional PHYB, we revealed that PHYB from
Cardamine bellidifolia (CbPHYB) and Cardamine
nipponica (CnPHYB) have differences in thermal
sensitivity. This year, we conducted further experiments toconfirm the previous findings. We revealed preliminary
evidence for the notion that PHYB itself is responsible forthe different thermal sensitivity observed in transformed
plants. However, our experiments did not show any clear
difference in flowering phenotypes between these species
nor between transformed plants with CbPHYB andCnPHYB.

が約 3 万点登録されている。これらは利用の便宜のために伝統的な新エングラー分類体系に従って整理し配架されてきたが、近年は分子系統樹を基礎にした分類体系が定着しつつあるため、学説との著しい乖離を無くすために配架を変更した。
被子植物に関しては APG 分類体系、裸子植物とシダ植物に関してはクリステンフスらの分類体系に従った。

2. Rearrangement of herbarium specimens
The plant specimens preserved in the herbarium of IPSR
were rearranged under current taxonomic systems. The
angiosperms are arranged under the APG IV (2016)
system, and the other vascular plants under the systems
by Christenhusz et al. (2011). Those specimens had beenarranged under the traditional updated Engler system(1964) due to its international convenience. However, thesystem severely differs from current taxonomic systems
based on molecular phylogeny. This herbarium has
ca.70,000 specimens of vascular plants and ca. 30,000 seedspecimens which have been collected from Asia and otherregions.

ゲノム育種ユニット(Applied Genomics Unit)

核機能分子解析グループ

Group of Nuclear Genomics

本研究グループでは、植物を材料として、核および染色体の構造と機能に関する分子細胞遺伝学的研究を行っている。
染色体の機能要素のうち動原体を主な研究対象として、それらに関する基礎研究およびそれらを利用した応用研究を展開している。また、イネ遺伝資源を活用して、従来にない遺伝的多様性を検出し品種改良手法として確立するための研究を開始した。今年度の研究成果は以下の通りである。
１. 動原体機能改変による半数体誘導系統の作出「半数体作出とその倍加」による半数体育種法では、１世代で純系を作成することが可能となり、純系の作出期間を大幅に短縮することができる。しかし、これまで半数体は花粉培養や異種交配により作出され、これらの方法を利用できる
種はごく僅かであった。そこで、本研究では動原体の機能低下を利用した普遍的かつ効率的な半数体誘導系統の作出系の開発を行っている。具体的には、（１）真核生物に普遍的に存在する動原体タンパク質をゲノム編集により改変して、その機能を低下させる、（２）この機能低下した動原体をもつ配偶子と正常な動原体をもつ配偶子を交配することにより、受精胚中で選択的に片親由来の染色体セットを脱落させ、半数体を作出する。今年度は、イネ、トマト、ミヤコグサにおいて、
動原体に部分的な機能不全を引き起こす改変動原体タンパク質を発現するコンストラクトを導入した系統に対して、内在の同遺伝子のゲノム編集による破壊を試み、ゲノム編集コン
ストラクトを保有する形質転換体を得た。現在、新たに得られた形質転換体の遺伝子破壊の有無を確認している。
２. 多様なイネ遺伝資源が持つ有用農業形質の探索と育種への活用
農業上重要な表現型変異は多くの遺伝子発現の総体として制御されているが。それらの遺伝的基礎や生物学的機能の多くは依然として不明で、このことがイネ遺伝資源の幅広い活用を妨げている。研究グループでは今年度より、多様なイネ
遺伝資源が持つ有用な表現型変異を探索し、ゲノム情報や新しい技術を活用してそれらを活用した次世代育種を提案する
ための２つの研究を開始した。
(1) アフリカ栽培種であるオリザグラベリマの遺伝的なポテ
ンシャルを明らかにし、世界の主たる栽培種であるオリザサ
ティバとの不親和性を回避した新しい方法論の開発を目指す。
(2) 多系交雑集団を用いて作出するこれまでにないハプロタ

イプ組み合わせが、現在の栽培稲育種が生み出す多様性の限界を超えることを実証する。

We have been conducting molecular cytogenetic studies
on the structure and function of nuclei and chromosomes
using plant species. Kinetochores have been our main
research subjects among functional chromosomal elements.
We have been conducting basic research on the
kinetochores and applied research utilizing them.
Additionally, new research activity aiming establishment ofnovel rice breeding system producing wide genetic diversity
has been started. Our main achievements in 2018 aredescribed below.
1. Construction of haploid-inducer lines by alteration ofcentromere function
Using doubled-haploid breeding methods by "haploid
production and its doubling", it is possible to create purelines in one generation, and to dramatically shorten the
production period of pure lines. However, so far haploids
have been produced by pollen cultivation or crossbreeding,and only a few species can be produced by these methods.
Therefore, in this study, we are developing a system forproducing universal and efficient haploid-inducer lines by
declining the function of kinetochores. The following two
steps are involved in the haploid production: (1)modification of essential kinetochore proteins bytransformation and genome editing to reduce theirfunctions, (2) selective chromosome eliminations in
fertilized embryos by mating gametes with this modified
kinetochore and gametes with normal kinetochores. This
year, we tried destroying the endogenous kinetochore
protein genes of rice, tomato and Lotus japonicus bygenome editing after introducing a construct expressing
the protein causing partial function in their kinetochores.
As a result, we found some transformants possessing the
genome editing construct, and we have been checking formutations in the transformants.
2. Exploring and utilizing of useful traits from diverse ricegenetic resources
Phenotypic variations of agricultural important traits
are controlled by the collective function of many genes on
the genome. However, the genetic bases and biological
functions are still unknown, which has prevented us fromwider practical application of germplasms into acral
breeding. Our group started two new researches to exploit
useful phenotypic variations from a wide range of rice
germplasms and to propose next generation crop breedingby aid of recent advances in genome information andtechnology.
(1) We elucidate genetic potential of Oryza glaberrima, oneof two cultivar species in genus Oryza, aiming for new
breeding methodology overcoming cross incompatibility
with Oryza sativa, another cultivar species distributing
most of rice farming area.
(2) We demonstrate that phenotypic diversity by novel
haplotype combinations produced from multiple parental
population consisting ordinary rice varieties is beyond
phenotypic variation in current cross breeding.

ゲノム制御グループ
本グループでは、効率的な食糧生産あるいは種子品質向上のために必要な遺伝要因の解明や、宇宙環境等で生育可能な植物の耐性遺伝子の解明を目的とする。
１．早生カーネルバスマティと pLIA-4d との交雑後代における低肥料条件下での収量関連形質の QTL 解析
アフリカ在来の野生種、Oryza longistaminata と台中 65 の交雑後代から育成した低投入適応系統（pLIA－4d）を選抜した。pLIA－4d の形質はバスマティイネの改良に有効であると考えられ、pLIA－4d とバスマティイネの交雑 BC1F1, F3 お
よび F4 を育成し、収量形質に関する QTL 解析を行った。
BC1F1 では、第 1 と 3 染色体を除く染色体で 11 形質に関わる 21 の QTL を検出できた。また、長穂 F３個体由来 F４では、第 6 染色体には出穂期、穂長、穂首径と 1 次枝梗数に係る QTL が 2 箇所に存在することが判明した。これらの QTL
はカーネルバスマティの改良に役立つものと考えられる。
２．宇宙空間環境下と火星環境下で太陽光に曝露した大麦種
子の生存能力大麦種子をロシア国際宇宙ステーション船外に設置している装置のトレイにセットした。トレイ１（宇宙空間環境）は
MgF2 製の蓋で封印しトレイ内を真空にし、トレイ２（火星地
表環境）は石英製の蓋で封印した。15 ヶ月間船外曝露した後にトレイを回収し地上へ搬送した。地上で４℃で同期間保管した大麦種子(GS)をコントロールとした。宇宙空間環境に曝露した種子（SG）と火星地表環境に曝露した種子（MS）の発芽率は 67 %、100 %であった。SG と MS は GS と同様に生育し、農業特性に有意な差が認められなかった。これらの結果、オオムギ種子は紫外線防御や気候制御すること無く宇宙空間や火星環境で 15 ヶ月間生存できることが明らかとなった。
３．RNA-seq によるコムギ種子休眠性低下突然変異系統
RSD32 の遺伝子発現解析
RNA-seq 解析によりRSD32 と野生型である農林61 号の種
子胚における遺伝子発現の比較を行ったところ、開花後 20-30日の種子胚において発現が変動した遺伝子の数は、種子休眠性が誘導される開花後 40 日より多かった。RSD32 の開花後
20 日の種子胚では、概日時計遺伝子や Ca2+の信号伝達に関わる遺伝子などの発現が低下していた。以上の結果は、RSD32が種子発達の初期に発現する種子休眠制御因子であることを示唆する。概日時計やカルシウムシグナルは多くの遺伝子発現系に影響を及ぼすことから、種子発達初期が種子休眠性の制御ネットワークにおいて重要な発育ステージであると考えられた。
４．オオムギ種子における液胞膜型アクアポリン(HvTIPs)の役割の解明
種子の発達と乾燥に関わる細胞内水環境調節を調べるため、
オオムギから単離された液胞型アクアポリン TIP(HvTIP)の解析を行っている。
オオムギ種子で発現するHvTIPsのうち、主なものは HvTIP3;1 は、他のタンパク質と相互作用し、その水の透過性を変化させて種子の形成に貢献していることが明らかとなった。また、我々は、ABA 合成量が低下している
Az34 系統とその親系統 Steptoe を用いて、HvTIP3;1 の発現の変化について解析し。種子形成における HvTIP3;1 の役割と ABA の影響について検証した。

Group of Genome Regulation
This group analyzes the genetic factors for improving the
production of crops and quality of seeds and also searched
for tolerant genes to grow crops in space.
1. QTL analysis for yield-related traits in the progenies of across between pLIA-4d and early Kernel Basmati under
low input conditions
We selected pLIA-4d with few tillers, many spikelets per
panicle and dwarf out of pLIA lines derived from the crossbetween Oryza longistaminata, an African wild species andT-65 showing. QTLs for yield-related traits were analyzed
in 34 BC1F1 plants and 84 F4 plants derived from a crossbetween pLIA-4d and early Kernel Basmati. In BC1F1
using early Kernel Basmati as pollen parent, 21 QTLs for
11 traits were detected in all chromosomes except for
chromosomes 1 and 3. On the other hand, two regions on
chromosome 6 were found to locate important QTLs
including DH, PL, PBD and PBN in the F4 populationfrom long panicle plant in F3.
2. Viability of barley seeds exposed to sun light in outerspace and climate of Mars.
Seeds of barley were set in trays outside of theInternational Space Station. Tray 1 was covered with an
MgF2 lid in vacuo for the outer space environment, andTray 2 was covered with a quartz lid for a Martianenvironment. Seeds stored at 4℃ on the ground were used
as a control (GS). After left for 15 months in outer space,
the seeds were transported back to earth. The germination
percentages of seeds in vacuo (SS) and those in theMartian environment (MS) were 67 and 100%, respectively.
Plants from SS and MS grew just as well as those from GS,
and the agronomic properties of SS and MS were notsignificantly different from those of GS. These results
indicated that barley seeds could survive in the outer spaceand Martian environments for 15 months unprotectedfrom UV and without climate control.
3. RNA-seq analysis of RSD32 mutant with reduced seed
dormancy in wheat
Gene expressions of embryos were compared byRNA-seq analysis between Norin61 (wild type) and RSD32
at different developmental stages of seed. There were moregenes that showed different expressions between Norin 61
and RSD32 in the embryos at 20 days and 30 days after
pollination (DAP20 and DAP30) than in those at DAP40.
Expressions of genes involved in the circadian clock andsignal transduction pathway of Ca2+ were reduced inembryos of RSD32 at DAP20. These results suggest that
RSD32 is a regulation factor expressed at an early
developmental stage of the seed. Since the circadian clock
and Ca2+ signaling affect several expression pathways, theearly developmental stage of seed is an important stage forthe regulation network of seed dormancy.
4. Investigation of the role of Hordium vulgare tonoplast
intrinsic proteins, HvTIPs, in barley seeds.
To investigate the cellular water condition and themechanism of the control in seeds, we focused on tonoplast
intrinsic proteins (TIPs), which transport water and control
the intracellular osmotic pressure in a cell, from barley(HvTIPs). Three HvTIPs, HvTIP1;2, HvTIP2;1 andHvTIP3;1, expressed in barley seeds. It was revealed thatthese HvTIPs, HvTIP1;2, HvTIP2;1 and HvTIP3;1,
interacted with each other and changed the water
permeability by the formation of hetero-tetramer. We also
analyzed the expression pattern of HvTIP3;1, thedevelopment and the water contents of the seeds in twobarley lines, Steptoe and ABA-deficient mutant, Az34, andverified the role of HvTIP3;1 in the seed formation andinfluence of ABA.

次世代作物共同研究コア
作物デザイン研究チーム(Research Core for Future Crops)
Crop Design Research Team

本グループでは、研究所が保有する遺伝資源を活用して、
これまで蓄積してきた環境応答データや植物の様々な生理応答に関する知見を統合し、作物の生産性に有用な鍵遺伝子の探索を推進している。今年度の研究成果の一部は以下の通りである。

With the genetic resources in IPSR, our group has been
integrating a broad range of data and knowledge related tothe physiological responses in plants, and promoting the
research to discover genes that are useful to improve crop
productivity. Our main achievements in 2018 are described
below.

１．オオムギ出穂関連要因の同定
研究所が保有するオオムギ系統の生育データ・ゲノム多型
データや野外オオムギのトランスクリプトームデータからオオムギの出穂時期への影響が示唆される遺伝要因を推定した。
また、推定した遺伝要因を取り入れ、オオムギの出穂日予測
モデルの予測精度を向上した。

1. Identification of genetic and environmental factors
related to barley heading date
Using trait datasets of heading date, genome-scale
genetic polymorphisms, and transcriptome under field
condition of barley accessions in IPSR, we estimatedgenetic factors that are related to barley heading date.
Then, implementing these genetic factors to our computermodel that estimate barley heading, we improved its
performance to predict the heading date of barleyaccessions.

２．オオムギのオミックス統合解析
野外で生育するオオムギに関して収集されたトランスクリ
プトームデータやホルモンデータを統合的に解析し、オオムギの成長に沿った生理状態の変化や系統間の差を形質として描出するための統合解析を進めた。
そのほかに、次世代シーケンスデータの解析をはじめとするバイオインフォマティクスに関連する技術等を所内外の研究者に提供している。

国際共同研究チーム
本チームでは植物研と農学部の教員が兼任となり、植物研の拠点研究領域である「植物遺伝資源・ストレス科学研究」
を国際的に展開するためのネットワーク作り、国際交流を行う。これまで、JSPS 国際事業「東アフリカにおける作物スト
レス科学研究ネットワーク拠点形成と次世代作物の開発」(平成 22-24 年度)、
「汎アフリカ大学院と協働する資源植物科学
イノベーション研究拠点」(平成 26-28 年度)が採択され、平成 30 年度はこのこれらの事業を引き継いだ交流を進めるとともに、農林水産省戦略的国際共同研究推進委託事業（MOU
締結支援事業）に採択された。
１．ケニア・ウガンダ研究者の受入れと共同研究
平成 30 年度は、ウガンダ国立作物科学研究所からの留学生
１名が、博士前期課程学生として植物・昆虫間相互作用グループ（ガリス）に在籍し、ネリカイネの病害虫耐性と揮発物質についての研究を立ち上げた。ケニアからの留学生が国費留学生として採用され、博士後期学生１名が植物・微生物相互作用グループ（鈴木）に平成 30 年度進学し、植物病原糸状菌に持続感染するパルティティウイルスの共同研究を進めた。
ケニア研究者１名が JSPS Bridge Fellowship Program に採択され、植物・微生物相互作用グループ（鈴木）に短期に滞在した。ウガンダ・マケレレ大学の学生１名を植物環境微生物学グループ（谷）に受け入れ（H31 年 1 月~H31 年 3 月）
、植
物根圏における微生物貪食作用について研究を行う。
２．ケニアへの研究者派遣と交流の促進
東アフリカでの資源植物科学イノベーション研究拠点とネットワークを広げるため、今年度は１名（坂本）がケニアを訪問し(H31 年 2 月)、ケニア西部におけるソルガムペレットの生産を可能にする試験栽培について国際家畜研究所とケニ
ア農業研究所を訪問し打合せを行う。また、植物研にて若手を中心とした研究交流の場として 11 月 2 日に「アフリカデー
2018」を行った。

2. Integrated omics analysis in barley
To comprehensively analyze the physiological dynamics
during barley growth, we systematically analyzed
time-course profiles of plant hormones and transcriptome
across barley accessions under field conditions,demonstrated the physiological changes throughout theirlife-course, and identified physiological signaturesdescribed by particular transcriptional and hormonal
profiles, which are conserved and specific across genotypes
and life-stages in barley.
In addition, we provided various bioinformatics
techniques to researchers inside and outside IPSR.

International Collaboration Team
This group consists of concurrent faculty members, andaims to establish an international hub and/or exchange
program on Plant Genetic Resources and Stress Science.
Our program has been supported by the Japan Society for
the Promotion of Science (JSPS), under the Asia-Africa
Science Platform (AASP) program under the title“Establishment of crop stress science network for increaseof food production in eastern Africa” (2010-2012) and “Plant
Science and Resource Innovative Research Core with Pan
African University” (2014-2016). In 2018, we continued thecollaborative research projects, and received the MAFF
grant to support making MOU with Kenyan research
institutes.
1. Accepting Kenyan and Ugandan researchers andinternational collaboration
Two researchers are studying in the Graduate School ofEnvironmental and Life Science, one Ugandan as a masterstudent (Supervisor Galis) and the other as a doctor
student (Supervisor Suzuki). One Kenyan researcher
visited IPSR under the JSPS Bridge Fellowship(Supervisor Suzuki). One Ugandan student from Makerere
University will come to IPSR (Supervisor Tani) for about
two months from January, 2019.
2. Visiting Kenya and Meeting
To promote exchange between IPSR and other east
African universities, Sakamoto plans to visit theInternational Livestock Research Institute (ILRI) andKenyan Agricultural and Livestock Research Organization(KARLO), Kakamega, Kenya. He will inspect sorghum
fields in the western Kenya, in January, 2019 to launch asorghum pellet project. To promote networking of young
researchers, we organized the “Africa (Kenya) Day 2018”
on November 2, 2018 at IPSR.

エコフィジオロジー研究チーム

Ecophysiology Research Team

イオンダイナミクス班

Ion Dynamics Section

本研究班では、フィールド環境における作物のレジリエン
スを理解するためのイオンダイナミクス研究を行っている。
今年度の研究成果の一部は以下の通りである。

This research group studies to comprehend resilience ofcrops in the field through ion dynamics research. Our mainachievements in 2018 are described below.

１．塩ストレスフィールドにおける作物のレジリエンスを理解するためのイオンホメオスタシス研究
塩は多くの作物に障害をもたらす。オオムギの根におけるナトリウムイオンの動態の理解を目指し、ナトリウムイオンを輸送するイオン輸送体 HvCNGC2 のアルカリイオンの選択性を電気生理学的手法により解明した。また陸上植物に近縁なシャジクモが持つ輸送体 CbPHT1 について、アフリカツ
メガエル卵母細胞に発現させた系において CbPHT1 が Na+との共輸送によるリン酸取り込み活性を持つことを明らかにした。

1. Ion homeostasis studies on crop resilience insalt-stressed fields
Sodium ion renders damage to crops. We analyzed alkali
ion selectivity of the barley root sodium-permeatingtransporter, HvCNGC2-3. Charophyta are algae, which areclose relatives of flowering plants. Using the Xenopus
laevis oocyte expression system, we revealed that thephosphate transporter of Chara braunii, CbPHT1,
possesses Na+-coupled phosphate import activity, which isdistinct from H+-coupled phosphate import activity inflowering plants.

２．CO2 吸収と蒸散流制御の理解のためのイオンホメオスタ
シス研究
気孔閉口に関与するイオンチャネルの解析をトマトで行った。トマトの気孔を構成する孔辺細胞に局在する ALMT ファ
ミリー遺伝子を見出し、アニオン輸送特性の電気生理学的解
析をさらに進めた。さらに、この遺伝子発現抑制系統トマトの作出を進めている。

2. Ion homeostasis studies to comprehend CO2 uptake andtranspiration control
Analyses of ion channels involved in stomatal closure
have been performed in tomato. We identified the
ALMT-family gene encoding the anion channel which
expressed dominantly in guard cells of tomato, andcharacterizedtheionchannelproperties
byelectrophysiological analysis. Furthermore, we areconstructing the transgenic suppresser in tomato, to assess
stomatal closure.

３．イオンイメージングとイオン電極を活用した生体イオン計測による細胞シグナリング研究
組織表面のイオンフラックスを非破壊的に測定するための振動微小イオン電極装置を構築した。翌年はこの装置を活用した研究を進める。

根圏生態班

3. Cell signaling studies by ion imaging and the ion
electrode
We newly developed a vibrating micro ion electrodeequipment for non-destructive analysis of ion fluxes at thesurface of plant tissues.

Rhizosphere Microbiome Section

本班はイネ、オオムギを対象として年間を通じた植物の生This section was started last year with the aim to

長とその根圏の微生物叢、並びに環境要因としてイオンや野

analyze throughout the year the plant growth and

生植物の測定・観察を通じ、これら要因が複雑に絡み合うネ

rhizosphere microbiome of rice and barley in relation to

ットワークの変動を明らかにしていくことで、病徴や金属イ

environmental factors such as diseases and metal ion

オンストレスに関わる重要な因子を見いだすことを目的としstress and to find changes in the complex network of theseて発足した。今年度は発足間もないため来年度の研究資金調

factors. This year we applied for a grant, conducted rice

達、イネの継続的なサンプリング、土壌 pH 及びミネラル測

root and rhizospheric soil sampling, measured soil pH and定、アンプリコンシーケンシングのテストラン、野生植物相の方形区調査等を行った。

mineral composition, established a sampling method,
performed a test run of amplicon sequencing, andconducted quadrat surveys on weed diversity.

作物イノベーション研究チーム

Crop Innovation Research Team

エピジェネティクス班

Epigenetics Section

エピジェネティック修飾による遺伝子発現制御は、成長、器官分化、ストレス応答など、植物の様々な生命現象に重要な役割を果たしており、エピジェネティック修飾を各植物において 1 細胞レベルの解像度で解析を行う必要性が高まっている。しかし、植物種および器官・組織によって細胞のサイ
ズ、構造などが異なり、それぞれに適した解析法を用いる必要がある。本研究班では、モデル植物だけでなく、個々の研究者が研究材料とする多様な植物種に利用可能なエピジェネ
ティック修飾解析法を開発するとともに各器官・組織に適した解析法を on demand に提供していく。本年度は、以下の解析法の開発を行った。

Epigenetic gene regulation plays a crucial role in various
biological phenomenon including growth, development,
and stress responses in plants. The cell size and structure
are different in each plant species and organs/tissues.
Therefore, it is necessary to use appropriate epigenetic
modification analysis methods for each plant species andorgans/tissues. Our research team will develop epigenetic
modification analysis methods that can be used not only formodel plants but also for various plant species that
individual researchers use as research materials. In
addition, we will provide analysis methods that aresuitable for each plant organs/tissues. In 2018, we have
tried to develop the following analysis methods.

１．植物組織内におけるエピジェネティック修飾解析法の開発とその自動化
植物器官および組織内の個々の細胞のエピジェネティック
修飾は、個別に制御されていると考えられるが、これまで主にこれらの解析に用いられてきたクロマチン免疫沈降法では原理的に組織内の個々の細胞の状態を知ることはできない。
本研究班では、この問題を解決し、個々の細胞のエピジェネ
ティック修飾情報を得るために、植物器官および組織内の個々の位置情報を保ったまま、俯瞰的かつ細胞レベルの解像度をもつ組織免疫染色を用いたエピジェネティック修飾解析法を開発している。加えて、この方法によって得られる大量のデータの自動解析法の開発も行っている。
今後は、上記手法の開発を行うとともに、他研究者からのニーズに合わせた解析法の開発を共同研究として進めていく。

オオムギ遺伝子改変班
本研究班は、オオムギの遺伝子改変技術の高度化とオオム
ギを利用した作物イノベーション研究拠点の構築を行っている。オオムギ-微生物間相互作用、種子澱粉工学、環境ストレス耐性育種などの分野で共同研究体制を整え、資源植物科学の発展に寄与することを目的としている。
１．幹細胞化メカニズムの解明とオオムギの形質転換技術の高度化
オオムギの形質転換技術を高度化するために、再分化過程の要である幹細胞化機構の実態解明を目指している。現在、再分化効率の品種間差に注目した遺伝学的解析を進めており、将来的にはメタボローム解析や再分化効率を向上するためのケミカルスクリーニングを行う予定である。
２．オオムギ生存圏におけるウイルス叢の解明
オオムギの生存圏に存在するウイルスを網羅的に解析し、カタログ化を行っている。これらの成果を元に、オオムギの遺伝子解析・改変に有効なウイルスベクターの構築ならびにオオムギの耐病性メカニズムや生物間相互作用研究への応用を目指している。
３．オオムギ種子の澱粉粒の形状育種
オオムギ種子の澱粉粒の形状の改変を行い、新しい澱粉特性を有するオオムギの開発を行なっている。また、オオムギの澱粉粒の形成機構の解明を目指した基盤研究を行っている。
４．オオムギの環境ストレス耐性育種のための基盤研究
高/低温ストレス耐性遺伝子の導入やミネラルストレス関
連遺伝子を改変した形質転換オオムギのセットを作製し、オオムギの環境ストレス耐性機構の網羅的解析を目指している。

1. Development of epigenetic modification analysis
methods in plant tissue and its automation
Epigenetic modifications of individual cells in plantorgans/tissues are thought to be individually controlled, but
it is difficult to identify them in each cell by the chromatin
immunoprecipitation method, which has been mainly used
for these analyses, in principle. In order to solve thisproblem and to obtain epigenetic modification information
on individual cells, we are developing epigenetic
modification analysis methods using immunohistochemical
methods that should have a bird's-eye view and single
cell-level resolution while keeping positional information ofindividual cells in organs/tissues.

Barley Genetic Modification Section
Our research aims to upgrade the genetic modification
technology in barley and to establish a research core forcrop innovation using barley. We are conducting joint
research in the fields of barley-microbial interaction, seed
starch engineering and environmental stress tolerance
breeding.
1. Elucidation of stem cell formation mechanism andsophistication of barley transformation technology
We are analyzing the molecular mechanism of barley
stem cell formation which is the essential part of theregeneration process. This includes genetic analysis that is
focused on varietal differences in totipotency, metabolomic
analysis and chemical screening to improve regeneration
efficiency.
2. Analysis of viromes in the ecosphere of barley
We are comprehensively analyzing the viromes in thebarley ecosphere to construct effective viral vectors forgenetic transformation and to understand the disease
resistance and biological interaction in barley.
3. Morphological breeding of starch grains in barley seeds
Modification of starch grain morphology of barley seeds
is in progress. It will develop barley plants with novel
starch properties and increase the availability of barley.
Basic research to elucidate the molecular mechanism of
starch grain formation is also conducted.
4. Elucidation of environmental stress tolerance in barley
Introduction of environmental stress-related genes, such astemperature-stress genes and mineral absorption/
exclusion-related genes into barley is in progress. We willdevelop transgenic barley plants over-/down-regulatingthese genes to analyze the stress tolerance mechanism
comprehensively in the future. these genes to analyze thestress tolerance mechanism comprehensively in the future.

出版物リスト (List of Publication)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group)(1) Szymanski, D., Bassham, D., Munnik, T. and Sakamoto, W. Cellular Dynamics: Cellular systems in the time domain.
Plant Physiol. 176: 12-15. (2018. 1.)(2) Yamatani, H., Kohzuma, K., Nakano, M., Takami, T., Kato, Y., Hayashi, Y., Monden, Y., Okumoto, Y., Abe, T.,
Kumamaru, T., Tanaka, A., Sakamoto, W. and Kusaba, M. Impairment of Lhca4, a subunit of LHCI, causes
high accumulation of chlorophyll and the stay-green phenotype in rice. J. Exp. Bot. 69: 1027-1035. (2018. 2.)(3) Ohnishi, N., Zhang, L. and Sakamoto, W. VIPP1 involved in chloroplast membrane integrity has GTPase activity invitro. Plant Physiol. 177: 328-338. (2018. 5.)(4) Tominaga, J., Nakahara, Y., Horikawa, D., Tanaka, A., Kamei, Y., Takami, T., Sakamoto, W., Unno, K., Sakamoto,
A. and Shimada H. Overexpression of the protein disulfide isomaerase AtCYO1 in chloroplasts slows
dark-induced senescence in Arabidopsis. BMC Plant Biol. 18: 80. (2018. 5.)(5) Kato, Y. and Sakamoto, W. FtsH protease in the thylakoid membrane: physiological functions and the regulation ofprotease activity. Front. Plant Sci. 9: 855. doi: 10.3389/fpls.2018.00855. (2018. 6.)(6) Nishimura, K., Matsushita, T., Shikanai, T. and Sakamoto, W. Meeting Report – Taiwan -Japan Plant Biology 2017,
Spotlight Issue: From light signals/signaling to photosynthesis and chloroplast development. Plant Cell
Physiol. 59: 1099-1103. (2018. 6.)(7) Sakamoto, W. and Takami, T. Chloroplast DNA dynamics: copy number, quality control, and degradation. Plant Cell
Physiol. 59: 1120-1127. (2018. 6.)(8) Nakamura, S., Hidema, J., Sakamoto, W., Ishida, H. and Izumi, M. Selective elimination of membrane-damaged
chloroplasts via microautophagy. Plant Physiol. 177: 1007-1026. (2018. 7.)(9) Tanaka, M., Iamshchikov, I., Kato, Y., Sabirov, R., Gusev, O., Sakamoto, W. and Sugimoto, M. Structure andmolecular characterization of diadenosine polyphosphate hydrolase in brachypodium distachyon. J. Plant
Biochem. Physiol. 6: 220. (2018. 7.)(10) Kato, Y., Hyodo, K. and Sakamoto, W. The photosystem II repair cycle requires FtsH turnover through the EngA
GTPase. Plant Physiol. 178: 596-611. (2018. 10.)(11) Takami, T., Ohnishi, N., Kurita, Y., Iwamura, S., Ohnishi, M., Kusaba, M., Mimura, T. and Sakamoto, W.
Organelle DNA degradation contributes to the efficient use of phosphate in seed plants. Nat. Plants 4:1044-1055. (2018. 12.)(12) Crofts, N., Iizuka, Y., Abe, N., Miura, S., Kikuchi, K., Matsushima, R. and Fujita, N. Rice mutants lacking starchsynthase I or branching enzyme IIb activity atered starch biosynthetic protein complexes. Front. Plant Sci. 9:
1817. doi: 10.3389/fpls.2018.01817. (2018. 12.)(13) Toyoshima, M., Sakata, M., Ohnishi, K., Tokumaru, Y., Kato, Y., Tokutsu, R., Sakamoto, W., Minagawa, J.,
Matsuda, F. and Shimizu, H. Targeted proteome analysis of microalgae under high-light conditions by
optimized protein extraction of photosynthetic organisms. J. Biosci. Bioeng. doi: 10.1016/j.jbiosc.2018.09.001.
(2018. 9. Online preview)

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)(1) Iida, M., Takano, T., Matsuura, T., Mori, I. C. and Takagi, S. Circumnutation and distribution of phytohormones in
Vigna angularis epicotyls. J. Plant Res. 131: 165-178. doi: 10.1007/s10265-017-0972-y (2018. 1.)(2) Kouzai, Y., Kimura, M., Watanabe, M., Kusunoki, K., Osaka, D., Suzuki, T., Matsui, H., Yamamoto, M., Ichinose,Y., Toyoda, K., Matsuura, T., Mori, I. C., Hirayama, T., Minami, E., Nishizawa, Y., Inoue, K., Onda, Y.,
Mochida, K. and Noutoshi, Y. Salicylic acid ‐ dependent immunity contributes to resistance against

Rhizoctonia solani, a necrotrophic fungal agent of sheath blight, in rice and Brachypodium distachyon. New
Phytol. 217: 771-783. dori: 10.1111/nph.14849. (2018. 1.)(3) Matsuura, T., Mori, I. C., Ikeda Y., Hirayama, T. and Mikami, K. Comprehensive phytohormone quantification in the
red alga Pyropia yezoensis by liquid chromatography–mass spectrometry. In Protocols for macroalgae
research. (eds.) B. Charrier, T. Wichard and C.R.K. Reddy. pp. 226 - 236. CRC Press (2018. 4.)(4) Frost, J. M., Kim, M. Y., Park, G. T., Hsieh, P. H., Nakamura, M., Lin, S. J. H., Yoo, H., Choi, J., Ikeda, Y.,
Kinoshita, T., Choi, Y., Zilberman, D. and Fischer, R. L. FACT complex is required for DNA demethylation atheterochromatin during reproduction in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 115: E4720-E4729. (2018.
5.)(5) Heng, L.Y., Ooi, L., Mori, I. C. and Futra, D. Environmental toxicity and evaluation. In Environmental risk analysis
for asian-oriented, risk-based watershed management. (eds.) M. Yoneda and M. Mokhtar. pp. 71-94. Springer,
Singapore. doi: 10.1007/978-981-10-8090-6_6 (2018. 5.)(6) Nishimura, N., Tsuchiya, W., Moresco, J. J., Hayashi, Y., Satoh, K., Kaiwa, N., Irisa, T., Kinoshita, T., Schroeder, J.
I., Yates III, J. R., Hirayama, T. and Yamazaki, T. Control of seed dormancy and germination by
DOG1-AHG1 PP2C phosphatase complex via binding to heme. Nature Commun. 9: 2132. (2018. 6.)(7) Mori, I. C., Nobukiyo, Y., Nakahara, Y., Shibasaka, M., Furuichi, T. and Katsuhara, M. A cyclic nucleoride-gatedchannel, HvCNGC2-3, is activated by the co-presence of Na+ and K+ and permeable to Na+ and K+
non-selectively. Plants 7: 61. doi: 10.3390/plants7030061 (2018. 7.)(8) Hirayama, T., Lei, G. J., Yamaji, N., Nakagawa, N. and Ma. J. F. The putative peptide gene FEP1 regulates irondeficiency response in Arabidopsis. Plant Cell Physiol. 59: 1739-1752. (2018. 9.)(9) Takagi, H., Watanabe, S., Tanaka, S., Matsuura, T., Mori, I. C., Hirayama, T., Shimada, H. and Sakamoto, A.
Disruption of ureide degradation affects plant growth and development during and after transition fromvegetative to reproductive stages. BMC Plant Biol. 18: 287. doi: 10.1186.s 12870-018-1491-2. (2018. 11.)(10) Ikeda, Y., Nishihama, R., Yamaoka, S., Arteaga-Vazquez, M. A., Grimanelli, D., Pogorelcnik, R., Martienssen, R.
T., Yamato, K. T., Kohchi, T., Hirayama, T. and Mathieu, O. Loss of CG methylation in Marchantia
polymorpha caused disorganization of cell division and reveals unique DNA methylation regulatory
mechanisms of non-CG methylation. Plant Cell Physiol. 59: 2421–2431. (2018. 12.)(11) Ooi, L., Matsuura, T., Munemasa, S., Murata, Y., Katsuhara, M., Hirayama, T. and Mori, I. C. The mechanism of
SO2-induced stomatal closure differs from O3 and CO2 responses and is mediated by nonapoptotic cell death inguard cells. Plant Cell Environ. doi: 10.1111/pce.13406. (2018. 7. Online preview)(12) Mochida, K., Koda, S., Inoue, K., Hirayama, T., Tanaka, S., Nishii, R. and Melgani, F. Computer vision-based
phenotyping for improvement of plant productivity: A machine learning perspective. GigaScience (2018. 12.
Online preview).

土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ (Group of Plant Stress Physiology)(1) Oda, Y., Kobayashi, N. I., Tanoi, K., Ma, J. F., Itou, Y., Katsuhara, M., Itou, T. and Horie, T. T-DNA tagging-based
gain-of-function of OsHKT1;4 reinforces Na exclusion from leaves and stems but triggers Na toxicity in rootsof rice under salt stress. Int. J. Mol. Sci. 19(1): 235. (2018. 1.)(2) Tsunemitsu, Y., Yamaji, N., Ma, J. F., Kato, S. I., Iwasaki, K. and Ueno, D. Rice reduces Mn uptake in response to
Mn stress. Plant Signaling & Behavior 13: e1422466. (2018. 1.)(3) Wei, J., Zheng, Y., Feng, H., Qu, H., Fan, X., Yamaji, N., Ma, J. F. and Xu, G. OsNRT2.4 encodes a dual-affinity
nitrate transporter and functions in nitrate-regulated root growth and nitrate distribution in rice. J. Exp. Bot. 69:
1095-1107. (2018. 2.)(4) Mitani-Ueno, N., Yamaji, N. and Ma, J. F. Transport System of Mineral Elements in Rice. In Rice Genomics,
Genetics and Breeding, p. 223-240. Springer, Singapore. (2018. 2.)

(5) Shao, J. F., Yamaji, N., Liu, X. W., Yokosho, K., Shen, R. F. and Ma, J. F. Preferential distribution of boron todeveloping tissues is mediated by the intrinsic protein OsNIP3. Plant Physiol. 176: 1739-1750. (2018. 2.)(6) Hu, A. Y., Che, J., Shao, J. F., Yokosho, K., Zhao, X. Q., Shen, R. F. and Ma, J. F. Silicon accumulated in the shoots
results in down-regulation of phosphorus transporter gene expression and decrease of phosphorus uptake inrice. Plant Soil 423: 317-325. (2018. 2.)(7) Shao, J. F., Xia, J. X., Yamaji, N., Shen, R. F. and Ma, J. F. Effective reduction of cadmium accumulation in ricegrain by expressing OsHMA3 under the control of the OsHMA2 promoter. J. Exp. Bot. 69: 2743-2752.
doi.org/10.1093/jxb/ery107 (2018. 4.)(8) Che, J., Yamaji, N. and Ma, J. F. Efficient and flexible uptake system for mineral elements in plants. New Phytol.
219: 513-517. doi.org/10.1111/nph.15140 (2018. 7.)(9) Tsunemitsu, Y., Genga, M., Okada, T., Yamaji, N., Ma, J. F., Miyazaki, A., Kato, S., Iwasaki, K. and Ueno, D. A
member of cation diffusion facilitator family, MTP11, is required for manganese tolerance and high fertility inrice. Planta 248: 231-241. (2018. 7.)(10) Schjoerring, J. K., Ma, J. F. and von Wirén, N. Plant nutrition for global green growth. Physiol. Plant. 163: 268.
(2018. 7.)(11) Li, G. Z., Wang, Z. Q., Yokosho, K., Ding, B., Fan, W., Gong, Q. Q., Li, G. X., Wu, Y. R., Yang, J. L., Ma, J. F.
and Zheng, S. J. Transcription factor WRKY 22 promotes aluminum tolerance via activation of OsFRDL4
expression and enhancement of citrate secretion in rice (Oryza sativa). New Phytol. 219: 149-162. (2018. 7.)(12) Sun, S. K., Chen, Y., Che, J., Konishi, N., Tang, Z., Miller, A. J., Ma, J. F. and Zhao, F. J. Decreasing arsenic
accumulation in rice by overexpressing OsNIP1;1 and OsNIP3;3 through disrupting arsenite radial transport inroots. New Phytol. 219: 641-653. (2018. 7.)(13) Che, J., Tsutsui, T., Yokosho, K., Yamaji, N. and Ma, J. F. Functional characterization of an aluminum(Al)-inducible transcription factor, ART2, revealed a different pathway for Al tolerance in rice. New Phytol.
220: 209-218. doi.org/10.1111/nph.15252 (2018. 8.)(14) 馬建鋒

第 6 章 ケイ素の人への健康作用についての考察．渡辺和彦編集，肥料の夜明け～肥料・ミネ

ラルと人の健康～．化学工業日報社 (2018. 9.)(15) Hirayama, T., Lei, G. J., Yamaji, N., Nakagawa, N. and Ma, J. F. The putative peptide gene FEP1 regulates irondeficiency response in Arabidopsis. Plant Cell Physiol. 59: 1739-1752. doi.org/10.1093/pcp/pcy145 (2018. 9.)(16) Zhang, C., Lu, W., Yang, Y., Shen, Z., Ma, J. F. and Zheng, L. OsYSL16 is required for preferential Cu distribution
to floral organs in rice. Plant Cell Physiol. 59: 2039-2051. doi: 10.1093/pcp/pcy124 (2018. 10.)(17) Deng, F., Yamaji, N., Ma, J. F., Lee, S. K., Jeon, J. S., Martinoia, E., Lee, Y. and Song, W. Y. Engineering rice withlower grain arsenic. Plant Biotech. J. 16: 1691-1699. doi.org/10.1111/pbi.12905 (2018. 10.)(18) Kashino-Fujii, M., Yokosho, K., Yamaji, N., Yamane, M., Saisho, D., Sato, K. and Ma, J. F. Retrotransposon
insertion and DNA methylation regulate aluminum tolerance in european barley accessions. Plant Physiol.
178: 716-727. (2018. 10.)(19) 馬建鋒

(20) 山地直樹

植物のミネラル制御とヒトの健康．アグリバイオ 2: 1138-1139. (2018. 11.)
コメのリン蓄積と少燐米の可能性．アグリバイオ

2: 1145-1148. (2018. 11.)(21) Che, J., Yamaji, N., Yokosho, K., Shen, R. F. and Ma, J. F. Two genes encoding a bacterial-type ATP-binding
cassette transporter are implicated in aluminum tolerance in buckwheat. Plant Cell Physiol. 59: 2502-2511.
doi.org/10.1093/pcp/pcy171 (2018. 12.)(22) Coskun, D., Deshmukh, R., Sonah, H., Menzies, J. G., Reynolds, O., Ma, J. F., Kronzucker, H. J. and Bélanger, R.
R. The controversies of silicon's role in plant biology. New Phytol. 221: 67-85. doi.org/10.1111/nph.15343(2018. 7. Online preview)(23) Chen, L., Qin, L., Zhou, L., Li, X., Chen, Z., Sun, L., Wang, W., Lin, Z., Zhao, J., Yamaji, N., Ma, J. F., Gu, M., Xu,
G. and Liao, H. A nodule‐localized phosphate transporter GmPT7 plays an important role in enhancing
symbiotic N2 fixation and yield in soybean. New Phytol. doi.org/10.1111/nph.15541 (2018. 10. Online
preview)

植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)(1) Oda, Y., Kobayashi, N. I., Tanoi, K., Ma, J. F., Itou, Y., Katsuhara, M., Itou, T. and Horie, T. T-DNA Tagging-Based
Gain-of-Function of OsHKT1;4 Reinforces Na Exclusion from Leaves and Stems but Triggers Na Toxicity in
Roots of Rice Under Salt Stress. International Journal of Molecular Science 19: 235. doi:10.3390/
ijms19010235 (2018. 1.)(2) Mori, I. C., Nobukiyo, Y., Nakahara, Y., Shibasaka, M., Furuichi, T. and Katsuhara, M. A cyclic nucleotide-gatedchannel, HvCNGC2-3, is activated by the co-presence of Na+ and K+ and permeable to Na+ and K+
non-selectively. Plants 7: 61. https://doi.org/10.3390/plants7030061 (2018. 7.)(3) Kariya, K., Tsuchiya, Y., Sasaki, T. and Yamamoto, Y. Aluminium-induced cell death requires upregulation of
NtVPE1 gene coding vacuolar processing enzyme in tobacco (Nicotiana tabacum L.). J. Inorg. Biochem. 181:152-161. (2018. 9.)(4) Maruyama, H., Sasaki, T., Yamamoto, Y. and Wasaki, J. AtALMT3 is involved in malate efflux induced byphosphorus deficiency in Arabidopsis thaliana root hairs. Plant Cell Physiol. DOI 10.1093/pcp/pcy190. (2018.
9. Online preview)(5) Tada, Y., Endo, C., Katsuhara, M., Horie T., Shibasaka, M., Nakahara, Y. and Kurusu, T. High-affinity K+
transporters from a halophyte, Sporobolus virginicus, mediate both K+ and Na+ transport in transgenic
Arabidopsis, X. laevis oocytes, and yeast. Plant Cell Physiology https://doi.org/10.1093/pcp/pcy202 (2018. 10.
Online preview)(6)Tada, Y., Hirai, M., Sato, M., Sawada, Y., Ozaki, S., Terashima, S., Okamoto, M., Kurusu, T., Endo, C., Kawano, R.,
Nishimura, H., Katsuhara, M., Yano, K. and Komatsubara, S. Functional screening of salt tolerance genes
from a halophyte Sporobolus virginicus and transcriptomic and metabolomic analysis of salt tolerant plants
expressing glycine-rich RNA-binding protein. Plant Science https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.10.019(2018. 10. Online preview)

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)(1) Vainio, E. J., Chiba, S., Ghabrial, S. A., Maiss, E., Roossinck, M. J., Sabanadzovic, S., Suzuki, N., Nibert, Xie, J., M.
L. and ICTV consortium. ICTV Virus Taxonomy Profile: Partitiviridae. Journal of General Virology 99:
17-18. doi: 10.1099/jgv.0.000985. (2018. 1.)(2) Hisano, S., Zhang, R., Faruk, M. I., Kondo, H. and Suzuki, N. A neo-virus-lifestyle exhibited by a (+) ssRNA virus
hosted in an unrelated dsRNA virus: taxonomic and evolutionary considerations. Virus Research 244: 75-83.
doi: 10.1016/j.virusres.2017.11.006. (2018. 1.)(3) Chiba, S., Jamal, A. and Suzuki, N. First evidence for internal ribosomal entry sites in diverse fungal virus genomes.
mBio 9: e02350-17. doi:10.1128/mBio.02350-17. (2018. 3.)(4) Nguyen, Q., Aritani, A., Ohkita, S., Vu, B. V., Yokoya, K., Matsubara, A., Ikeda, K., Suzuki, N. and Nakayashiki, H.
A fungal Argonaute interferes with RNA interference. Nucleic Acid Research 46: 2495-2508. doi:
10.1093/nar/gkx1301. (2018. 3.)(5) Arjona-Lopez, J. M., Telengech, P., Jamal, A., Hisano, S., Kondo, H., Yelin, M. D., Arjona-Girona, I., Kanematsu, S.,
Lopez-Herrera, C. and Suzuki, N. Novel, diverse RNA viruses from Mediterranean isolates of thephytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix: insights into evolutionary biology of fungal viruses.
Environmental Microbiology 20: 1464-1483. doi:10.1111/1462-2920.14065. (2018. 4.)(6) Hillman, B. I., Aulia, A. and Suzuki, N. Viruses of plant-interacting fungi. Advances in Virus Research 100 (Special
Issue): 99-116. doi.org/10.1016/bs.aivir.2017.10.003. (2018. 4.)(7) Walker, P. J., Blasdell, K. R., Calisher, C. H., Dietzgen, R. G., Kondo, H., Kurath, G., Longdon, B., Stone, D. M.,
Tesh, R. B., Tordo, N., Vasilakis, N., Whitfield, A. E. and ICTV Report Consortium. ICTV Virus Taxonomy
Profile: Rhabdoviridae. Journal of General Virology 99: 447-448. doi: 10.1099/jgv.0.001020. (2018. 4.)

(8) Suzuki N., Ghabrial, S. A., Kim, K-H., Pearson, M., Marzano, S-Y., Yaegashi, H., Xie, J., Guo, L., Kondo, H.,
Koloniuk, I., Hillman, B. I. and ICTV Report Consortium. ICTV Virus Taxonomy Profile: Hypoviridae.
Journal of General Virology 99: 615-616. DOI: 10.1099/jgv.0.001055. (2018. 5.)(9) Wang, L., He, H., Chen, X., Qiu, D., Kondo, H. and Guo, L. Evidence for a novel negative-stranded RNA
mycovirus in the plant pathogenic fungus Fusarium graminearumn. Virology 528: 232-240. doi:
10.1016/j.virol.2018.03.008. (2018. 5.)(10) Shinya, T., Yasuda, S., Hyodo, K., Tani, R., Hojo, Y., Fujiwara, Y., Hiruma, K., Ishizaki, T., Fujita, Y., Saijo, Y.
and Galis, I. Integration of danger peptide signals with herbivore-associated molecular pattern signaling
amplifies anti-herbivore defense responses in rice. Plant Journal 94: 626-637. DOI: 10.1111/tpj.13883. (2018.
5.)(11) Amarasinghe, G. K., et al. Taxonomy of the order Mononegavirales-update 2018. Archives of Virology 163:2283-2294. doi: 10.1007/s00705-018-3814-x. (2018. 8.)(12) Luque, D., Mata, C. P., Ghabrial, S. A., Suzuki, N. and Caston, J. R. Capsid structure of dsRNA fungal viruses.
Viruses 10(9): pii: E481. doi: 10.3390/v10090481. (2018. 9.)(13) Dietzgen, R., Freitas-Astúa, J., Chabi-Jesus, C., Ramos-Gonzalez, P. L., Goodin, M., Kondo, H., Tassi, A. D. andKitajima, E. W. Dichorhaviruses in their host plants and mite vectors. Advances in Virus Research 102:119-148. doi: 10.1016/bs.aivir.2018.06.001. (2018. 9.)(14) Mizutani, Y., Abraham, A., Uesaka, K., Kondo, H., Suga, H., Suzuki, N. and Chiba, S. Novel mitoviruses and aunique tymo-like virus in hypovirulent and virulent strains of the Fusarium Head Blight fungus, Fusarium
boothii. Viruses-Basel 10(11): pii: E584 doi: 10.3390/v10110584. (2018. 10.)(15) Kato, Y., Hyodo, K. and Sakamoto, W. The photosystem II repair cycle requires FtsH turnover through the EngA
GTPase. Plant Physiology 178(2): 596-611. doi: 10.1104/pp.18.00652. (2018. 10.)(16) Chiba, S., Castón J. R., Ghabrial, S. A., Suzuki, N. and ICTV Report Consortium. ICTV Virus Taxonomy Profile:
Quadriviridae. Journal of General Virology 99: 1480-1481. doi: 10.1099/jgv.0.001152. (2018. 11.)(17) Sato, Y., Caston, J. and Suzuki, N. The biological attributes, genome architecture and packaging of diverse
multi-component fungal viruses. Current Opinion in Virology 33: 55-65. doi.org/10.1016/j.coviro.2018.07.009.
(2018. 12.)(18) Whitfield, A. E., Huot, O. B., Martin, K. M., Kondo, H. and Dietzgen, R. G. Plant rhabdoviruses: understanding
their origins and vector interactions. Current Opinion in Virology 33: 198-207. doi:
10.1016/j.coviro.2018.11.002. (2018. 12.)(19) Hyodo, K., Suzuki, N. and Okuno, T. Hijacking a host scaffold protein, RACK1, for replication of a plant RNA
virus. New Phytologist doi: 10.1111/nph.15412. (2018. 8. Online preview)(20) Kondo, H., Chiba, S., Maruyama, K., Andika, I. B. and Suzuki, N. A novel insect-infecting alphavirus-like groupand its pervasive endogenization into insect genomes. Virus Research https://doi.org/10.1016/j.virusres.
2017.11.020 (2018. 11. Online preview)

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)(1) Shinya, T., Yasuda, S., Hyodo, K., Tani, R., Hojo, Y., Fujiwara, Y., Hiruma, K., Ishizaki, T., Fujita, Y., Saijo, Y. andGalis, I. Integration of danger peptide signals with HAMP signaling amplifies the anti-herbivore defense
responses in rice. Plant J. 94: 626-637. doi: 10.1111/tpj.13883. (2018. 5.)

植物環境微生物学グループ(Group of Plant Environmental Microbiology)(1) Masuda, S., Suzuki, Y., Fujitani, Y., Mitsui, R., Nakagawa, T., Shintani, M. and Tani, A. Lanthanide-dependent
regulation of methylotrophy in Methylobacterium aquaticum strain 22A. mSphere 3: e00462-17. DOI:
10.1128/mSphere.00462-17 (2018. 1.)

(2) Lv, H., Sahin, N. and Tani, A. Isolation and genomic characterization of Novimethylophilus kurashikiensis gen. nov.
sp. nov., a new lanthanide-dependent methylotrophic species of Methylophilaceae. Environ. Microbiol. 20:
1204-1223. doi.org/10.1111/1462-2920.14062 (2018. 3.)(3) Ekimova, G. A., Fedorov, D. N., Tani, A., Doronina, N. V., Trotsenko, Y. A. Distribution of 1-aminocyclopropane1-carboxylate deaminase and D-cysteine desulfhydrase genes among type species of the genus
Methylobacterium. Antonie Van Leeuwenhoek. 111: 1723-1734. doi: 10.1007/s10482-018-1061-5 (2018. 10.)(4) Fujitani, Y., Alamgir, M. K. and Tani, A. Ergothioneine production using Methylobacterium species, yeast, and fungi.
J. Biosci. Bioeng. 126: 715-722. https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2018.05.021 (2018. 12.)(5) Lv, H. and Tani, A. Genomic characterization of methylotrophy of Oharaeibacter diazotrophicus strain SM30T. J.
Biosci. Bioeng. 126: 667-675. https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2018.05.023 (2018. 12.)

遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ (Group of Genome Diversity)(1) Sato, K., Hisano, H., Matsumoto, S., Zhou, T. and Kihara, M. Detection of QTLs controlling alpha-amylase activity
in a diversity panel of 343 barley accessions. Mol. Breed. 38: 14. (2018. 1.)(2) Wahibah, N., Tsutsui, T., Tamaoki, D., Sato, K. and Nishiuchi, T. Expression of barley Glutathione S-Transferase13
gene reduces accumulation of reactive oxygen species by trichothecenes and paraquat in Arabidopsis plants.
Plant Biotech. 35: 71-79. (2018. 3.)(3) 小松田隆夫・佐藤和広 ムギ類に共通する有用遺伝子の構造と機能. 育種学研究 20(1): 53-58. (2018. 6.)(4) 佐藤和広 オオムギ遺伝資源の保全と活用. 農業および園芸 93: 698-706. (2018. 8.)(5) Masher, M., Sato, K. and Steffenson, B. Genomics Approaches to Mining Barley Germplasm Collections. In The
Barley Genome, Compendium of Plant Genomes. Stein, N. and Muehlbauer, G. (Eds.) Springer International(2018. 9.)(6) Kashino-Fujii, M., Yokosho, K., Yamaji, N., Yamane, M., Saisho, D., Sato, K. and Ma, J. F. Retrotransposon
insertion and DNA methylation regulate aluminum tolerance in european barley accessions. Plant Physiol.
178: 716-727. (2018. 10.)(7) Genievskaya, Y., Almerekova, S., Sariev, B., Chudinov, V., Tokhetova, L., Sereda, G., Ortaev, A., Tsygankov, V.,
Blake, T., Chao, S., Sato, K., Abugalieva, S. and Turuspekov, Y. 2018. Marker-trait associations in two-rowed
spring barley accessions from Kazakhstan and USA. PLOS ONE 13: 0205421. (2018. 10.)(8) Okada, M., Yoshida, K., Nishijima, R., Michikawa, A., Motoi, Y., Sato, K. and Takumi, S. RNA-seq analysis
reveals considerable genetic diversity and provides genetic markers saturating all chromosomes in the diploidwild wheat relative Aegilops umbellulata. BMC Plant Biol. 18: 271. (2018. 11.)(9) Nishijima, R., Yoshida, K., Sakaguchi, K, Yoshimura, S., Sato, K. and Takumi, S. RNA Sequencing-Based Bulked
Segregant Analysis Facilitates Efficient D-genome Marker Development for a Specific Chromosomal Regionof Synthetic Hexaploid Wheat. Int. J. Mol. Sci. 19(12): 3749. (2018. 11.)(10) Mashiguchi, K., Hisano, H., Takeda-Kamiya, N., Takebayashi, Y., Ariizumi, T., Gao, Y., Ezura, H., Sato, K., Zhao,
Y., Hayashi, K. and Kasahara, H. Agrobacterium tumefaciens enhances biosynthesis of two distinct auxins in
the formation of crown galls. Plant Cell Physiol. (2018. 8. Online preview)(11) Wu, Z., Wang, N., Hisano, H., Cao, Y., Wu, F., Liu, W., Bao, Y., Wang, Z.-Y. and Fu, C. Simultaneous regulationof F5H in COMT-RNAi transgenic switchgrass alters effects of COMT suppression on syringyl lignin
biosynthesis. Plant Biotechnol. J. (2018. 9. Online preview)(12) Kodama, A., Narita, R., Yamaguchi, M., Hisano, H., Adachi, S., Takagi, H., Ookawa, T., Sato, K. and Hirasawa, T.
Genotypic Difference in Grain Fertility under Salt Stress and the Responsible Quantitative Trait Loci in Barley.
Breed. Sci. (2018. 11. Online preview)

遺伝資源機能解析グループ (Group of Genetic Resources and Functions)(1) Milner, S. G., Jost, M., Taketa, S., Mazón, E. R., Himmelbach, A., Oppermann, M., Weise, S., Knüpffer, H.,
Basterrechea, M., König, P., Schüler, D., Sharma, R., Pasam, R. K., Rutten, T., Guo, G., Xu, D., Zhang, J.,
Herren, G., Müller, T., Krattinger, S. G., Keller, B., Jiang, Y., Gonzalez, M. Y., Zhao, Y., Habekuß, A., Färber,
S., Ordon, F., Lange, M., Börner, A., Graner, A., Reif, J. C., Scholz, U., Mascher, M. and Stein, N. Genebank
genomics highlights the diversity of a global barley collection. Nature Genetics (オンライン出版 2018 年 11
月 12 日, https://www.nature.com/articles/s41588-018-0266-x)

野生植物グループ (Group of Wild Plant Science)(1) Ikeda, H., Yakubov, V., Barkalov, V. and Setoguchi, H. Postglacial East Asian origin of the alpine shrub Phyllodoce
aleutica (Ericaceae) in Beringia. Journal of Biogeography 45: 1261-1274. (2018. 6.)

ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
核機能分子解析グループ (Group of Nuclear Genomics)(1) Fukuda, A., Kondo, K., Ikka, T., Takai, T., Tanabata, T. and Yamamoto, T. A novel QTL associated with rice canopy
temperature difference affects stomatal conductance and leaf photosynthesis. Breeding Science 68(3): 305-315.
(2018. 8.)(2) Matsubara, K., Yonemaru, J., Kobayashi, N., Ishii, T., Yamamoto, E., Mizobuchi, R., Tsunematsu, H., Yamamoto, T.,
Kato, H. and Yano, M. A follow-up study for biomass yield QTLs in rice. PLOS ONE 13(10): e0206054.
(2018. 10.)(3) Ogawa, D., Nonoue, Y., Tsunematsu, H., Kanno, N., Yamamoto, T. and Yonemaru, J. Discovery of QTL Alleles forGrain Shape in the Japan-MAGIC Rice Population Using Haplotype Information. G3 8: 3559-3565. (2018.
11.)(4) Jiang, M., Yamamoto, E., Yamamoto, T., Matsubara, K., Kato, H., Adachi, S., Nomura, T., Kamahora, E., Ma, J. andOokawa, T. Mapping of QTLs associated with lodging resistance in rice (Oryza sativa L.) using therecombinant inbred lines derived from two high yielding cultivars, Tachisugata and Hokuriku 193. Plant
Growth Regulation doi.org/10.1007/s10725 1-10 (2018. 12. Online preview)

ゲノム制御グループ (Group of Genome Regulation)(1) 池永幸子・谷口義則・伊藤裕之・平 将人・中村和弘・吉川 亮・前島秀和・中村俊樹・石川吾郎・池田達哉・伊藤美環子・齋藤美香・氷見英子 製パン適性に優れる寒冷地向け強力小麦新品種「夏黄金」の育成. 農研機構研究報告 東北農業研究センター 120: 1-20. (2018. 3)(2) Chiou, W. Y., Tsugane, K., Kawamoto, T. and Maekawa, M. Easy sectioning of whole grain of rice using
cryomicrotome. Breed. Sci. 68: 381-384. (2018. 6.)(3) Tanaka, M., Iamshchikov, I., Kato, Y., Sabirov, R., Gusev, O., Sakamoto, W. and Sugimoto, M. Structure andMolecular Characterization of Diadenosine Polyphosphate Hydrolase in Brachypodium distachyon. J. Plant
Biochem. Physiol. 6: 220 (2018. 7.)(4) Sugimoto, M., Houjou, Y., Maekawa, M. and Terada, R. Rice salt-tolerance enhancement by expression of
1-aminocyclopropane-1- carboxylic acid oxidase gene from salt tolerant barley. J. Plant Biochem. Physiol. 6:226. (2018. 11.)

次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
作物デザイン研究チーム (Crop Design Research Team)(1) Onda, Y., Takahagi, K., Shimizu, M., Inoue, K. and Mochida, K. Multiplex PCR Targeted Amplicon Sequencing(MTA-Seq): Simple, Flexible, and Versatile SNP Genotyping by Highly Multiplexed PCR Amplicon
Sequencing. Front. Plant Sci. 9: 201. (2018. 3.)(2) Takahagi, K., Inoue, K., Shimizu, M., Uehara-Yamaguchi, Y., Onda, Y. and Mochida, K. Homoeolog-specificactivation of genes for heat acclimation in the allopolyploid grass Brachypodium hybridum. Gigascience. 7: 1.
(2018. 4.)(3) Tamura, K., Yoshida, K., Hiraoka, Y., Sakaguchi, D., Chikugo, A., Mochida, K., Kojoma, M., Mitsuda, N., Saito, K.,
Muranaka, T. and Seki, H. The Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor GubHLH3 Positively Regulates
Soyasaponin Biosynthetic Genes in Glycyrrhiza uralensis. Plant Cell Physiol. 59: 778. (2018. 4.)(4) Ogita, S., Nomura, T., Kato, Y., Uehara-Yamaguchi, Y., Inoue, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Shinozaki, K. andMochida, K. Transcriptional alterations during proliferation and lignification in Phyllostachys nigra cells. Sci.
Rep. 8: 11347. (2018. 7.)(5) Takahagi, K., Inoue, K. and Mochida, K. Gene Co-expression Network Analysis Suggests the Existence ofTranscriptional Modules Containing a High Proportion of Transcriptionally Differentiated Homoeologs in
Hexaploid Wheat. Front. Plant. Sci. 9: 1163. (2018. 8.)(6) Chu, H. D., Nguyen, K. H., Watanabe, Y., Le, D. T., Pham, T. L. T., Mochida, K. and Tran, L. P. Identification,
Structural Characterization and Gene Expression Analysis of Members of the Nuclear Factor-Y Family in
Chickpea (Cicer arietinum L.) under Dehydration and Abscisic Acid Treatments. Int. J. Mol. Sci. 19: E3290.
(2018. 10).
(7) Mochida, K., Koda, S., Inoue, K. and Nishii, R. Statistical and Machine Learning Approaches to Predict Gene
Regulatory Networks From Transcriptome Datasets. Front. Plant Sci. 9: 1770. (2018. 11.)(8) Kouzai, Y., Noutoshi, Y., Inoue, K., Shimizu, M., Onda, Y. and Mochida, K. Benzothiadiazole, a plant defense
inducer, negatively regulates sheath blight resistance in Brachypodium distachyon. Sci. Rep. 8: 17358. (2018.
11.)(9) Mochida, K., Koda, S., Inoue, K., Hirayama, T., Tanaka, S., Nishii, R. and Melgani, F. Computer vision-based
phenotyping for improvement of plant productivity: a machine learning perspective. Gigascience. 8: 1. (2018.
12. Online preview)

エコフィジオロジー研究チーム (Ecophysiology Research Team)
イオンダイナミクス班 (Ion Dynamics Section)(1) Mori, I. C., Nobukiyo, Y., Nakahara, Y., Shibasaka, M., Furuichi, T. and Katsuhara, M. A cyclic nucleotide-gatedchannel, HvCNGC2-3, is activated by the co-presence of Na+ and K+ and permeable to Na+ and K+
non-selectively. Plants 7: 61. https://doi.org/10.3390/plants7030061 (2018. 7.)(2) Ooi, L., Matsuura, T., Munemasa, S., Murata, Y., Katsuhara, M, Hirayama, T. and Mori, I. C. The mechanism of
SO2-induced stomatal closure differs from O3 and CO2 responses and is mediated by nonapoptotic cell death inguard cells. Plant Cell Environ. doi: 10.1111/pce.13406. (2018. 7. Online preview)(3) Maruyama, H., Sasaki, T., Yamamoto, Y. and Wasaki, J. AtALMT3 is involved in malate efflux induced byphosphorus deficiency in Arabidopsis thaliana root hairs. Plant Cell Physiol. DOI 10.1093/pcp/pcy190 (2018.
9. Online preview)(4) Tada, Y., Endo, C., Katsuhara, M., Horie T., Shibasaka, M., Nakahara, Y. and Kurusu, T. High-affinity K+
transporters from a halophyte, Sporobolus virginicus, mediate both K+ and Na+ transport in transgenic
Arabidopsis, X. laevis oocytes, and yeast. Plant Cell Physiol. https://doi.org/10.1093/pcp/pcy202. (2018. 10.
Online preview)

作物イノベーション研究チーム (Crop Innovation Research Team)
エピジェネティクス班 (Epigenetics Section)(1) Frost, J. M., Kim, M. Y., Park, G. T., Hsieh, P. H., Nakamura, M., Lin, S. J. H., Yoo, H., Choi, J., Ikeda, Y.,
Kinoshita, T., Choi, Y., Zilberman, D. and Fischer, R. L. FACT complex is required for DNA demethylation atheterochromatin during reproduction in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 115: E4720-E4729. (2018.
5.)(2) Ikeda, Y., Nishihama. R., Yamaoka, S., Arteaga-Vazquez, M. A., Grimanelli, D., Pogorelcnik, R., Martienssen, R. T.,
Yamato, K. T., Kohchi, T., Hirayama, T. and Mathieu, O. Loss of CG methylation in Marchantia polymorphacaused disorganization of cell division and reveals unique DNA methylation regulatory mechanisms of
non-CG methylation. Plant Cell Physiol. 59: 2421–2431. (2018. 12.)

国際会議およびシンポジウム(List of International Conferences and Symposia)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group )(1) Sakamoto, W. Seimei (life) and plants: the potential for improving our food and environment. Keynote Lecture, Royal
Holloway. University of London, Egham, UK, April 25, 2018.
(2) Sakamoto, W. Chloroplast proteostasis controlled by FtsH protease. Special Seminar, Department of Plant Sciences.
University of Cambridge, Cambridge, UK, April 26, 2018.
(3) Sakamoto, W. Protein homeostasis and beyond: The lesson in chloroplasts. Special Seminar, Department of Life
Sciences. Imperial College London, London, UK, April 27, 2018.
(4) Sakamoto, W. Chloroplast: cellular organelle of photosynthesis. Interdisciplinary science conference. Tainan, Taiwan,
May 11, 2018.
(5) Sakamoto, W. Possible role of protein degradation as a signaling mechanism in chloroplasts. 1st Asia-Oceania
International Congress on Photosynthesis. Beijing, China, August 19-23, 2018.
(6) Kato, Y., Hyodo, K. and Sakamoto, W. Regulation of FtsH function and proper FtsH turnover in the PSII repair cycle.
1st Asia-Oceania International Congress on Photosynthesis. Beijing, China, August 19-23, 2018.
(7) Sakamoto, W. Protein degradation machineries and its possible role as a signaling mechanism in chloroplast. Special
Seminar. Shanghai, China, August 24, 2018.
(8) Sakamoto, W. and Takami, T. Chloroplast DNA degradation serving as nutrient reservoir in plants. Japan-Finland
Seminar 2018 -Shaping photosynthesis against climate change and toward efficient water and nutrient
management-. Kobe, Japan, September 24-27, 2018.
(9) Kato, Y. and Sakamoto, W. Regulation of FtsH function in Photosystem II repair cycle. Japan-Finland Seminar 2018
-Shaping photosynthesis against climate change and toward efficient water and nutrient management-. Kobe,
Japan, September 24-27, 2018.
(10) Takami, T., Ohnishi, N., Kurita, Y., Iwamura, S., Ohnishi, M., Mimura, T. and Sakamoto, W. Physiological role oforganelle DNA degradation by DPD1 during starvation. Japan-Finland Seminar 2018 -Shaping photosynthesis
against climate change and toward efficient water and nutrient management-. Kobe, Japan, September 24-27,
2018.
(11) Nakamura, S., Hidema, J., Sakamoto, W., Ishida, H. and Izumi, M. Regulation mechanism of photodamage-induced
chlorophagy. Japan-Finland Seminar 2018 -Shaping photosynthesis against climate change and toward
efficient water and nutrient management-. Kobe, Japan, September 24-27, 2018.
(12) Sakamoto, W., Nishimura, K. and Kato, Y. Chloroplast protein degradation and beyond: FtsH and a possible peptide
export. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis. Kurashiki, Japan, November
7-10, 2018.
(13) Kato, Y., Dogra, V., Li, M., Kuroda, H., Takahashi, Y., Kim, C. and Sakamoto, W. Effects of oxidative
post-translational modification in PSII repair. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast
Biogenesis. Kurashiki, Japan, November 7-10, 2018.
(14) Yamatani, H., Takami, T., Kato, Y., Tanaka, A., Sakamoto, W., Kusaba, M. Loss-of-function mutants of LHCI
subunits exhibit increased chlorophyll accumulation in rice. International Symposium on Photosynthesis andChloroplast Biogenesis. Kurashiki, Japan, November 7-10, 2018.
(15) Nishioka, K., Kato, Y., Ozawa, S.I., Takahashi, Y. and Sakamoto, W. Large-scale analysis of protein
phosphorylation in thylakoid membranes using Phos-tag. International Symposium on Photosynthesis andChloroplast Biogenesis. Kurashiki, Japan, November 7-10, 2018.
(16) Nakamura, S., Hidema, J., Sakamoto, W., Ishida, H. and Izumi, M. Selective chlorophagy – microautophagic
removal of membrane-damaged chloroplasts. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast
Biogenesis. Kurashiki. Japan, November 7-10, 2018.

(17) Takami, T. and Sakamoto, W. Contribution of chloroplast DNA degradation by DPD1 exonuclease under phosphate
deficient condition. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis. Kurashiki, Japan,
November 7-10, 2018.
(18) Ohnishi, N., Zhang, L. and Sakamoto, W. VIPP1, the membrane integrity-maintaining protein in chloroplasts, has
GTPase activity in vitro. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis. Kurashiki,Japan, November 7-10, 2018.
(19) Nishimura, K., Watson, S., Takami, T. and Sakamoto, W. Characterizing ATP-binding cassette transporters on thechloroplast envelope. International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis. Kurashiki,Japan, November 7-10, 2018.

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)(1) Hirayama, T. Field omics approach to explore physiological variations decisive for agricultural traits. Workshop：Datadriven crop design technology. Fukuoka, Japan, February 20-21, 2018.
(2) Mori, I. C. Diverse roles of abscisic acid receptors in stomata. Jilin University College of Plant Sciences Seminar.
Chang Chun, China, Mar. 19, 2018.
(3) Ito, J., Saisho, D., Mochida, K., Hirayama, T. and Tsuji, H. Plasticity of flowering time in response to environmental
cues at the shoot apex in field-grown barley varieties. 25th International Conference on Sexual Plant
Reproduction. Gifu, Japan, June 11-16, 2018.
(4) Hirayama, T., Lei G. J., Nakagawa, N., Yamaji, N. and Ma J. F. A Novel short Peptide regulates the iron-deficient
responsive genes in Arabidopsis. 29th International Conference on Arabidopsis Research. Turku, Finland, June
25-29, 2018.
(5) Saisho, D., Ito, J., Tsuji, H., Mochida, K., Ikeda, Y., Hirayama, T. Field multi-omics approaches in barley towardrobust crop development. Second International Barley Mutants Workshop 2018. Dundee, England, June 25-27,
2018.
(6) Ooi, L., Matsuura, T., Munemasa, S., Murata, Y., Katsuhara, M., Hirayama, T. and Mori, I. C. Sulfur dioxide-induced
stomatal closure is not a protection mechanism and is distinct from ozone- and carbon dioxide-induced closure.
International Plant Molecular Biology 2018. Montpellier, France, Aug. 5-10, 2018.
(7) Mori, I. Differential roles of abscisic acid receptors in stomatal regulation. Japan-Finland Seminar 2018. Kobe, Japan,
Sep. 24-27, 2018.
(8) Nishimura, N., Tsuchiya, W., Moresco, J. J., Hayashi, Y., Satoh, K., Kaiwa, N., Irisa, T., Kinoshita, T., Schroeder, J. I.,
Yates III, J. R., Hirayama, T. and Yamazaki, T. Control of seed dormancy and germination by DOG1-AHG1
PP2C Phosphatase complex via binding to heme. 6th Plant Dormancy Symposium 2018. Kyoto, Japan, Oct.
23-26, 2018.

土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ (Group of Plant Stress Physiology)(1) Ma, J. F. Control of node-based mineral element distribution for better and safe crop production. Emerging
Technologies for Global Food Security Conference 2018. Saskatchewan, Canada, June 19-21, 2018.
(2) Ma, J. F., Fujii-Kashino, M., Yamaji, N., Yamane, M., Saisho, D. and Sato, K. Regulation of aluminum tolerance inbarley. 10th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH. Putrajaya, Malaysia, June 25-28,
2018.
(3) Shao, J. F., Yamaji, N., Shen, R. F. and Ma, J. F. Transporters involved in preferential distribution of boron in rice.
10th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH. Putrajaya, Malaysia, June 25-28, 2018.

(4) Che, J., Tsutsui, T., Yokosho, K., Yamaji, N. and Ma, J. F. An Al-inducible transcription factor, ART2 is involved in Al
tolerance in rice. 10th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH. Putrajaya, Malaysia,
June 25-28, 2018.
(5) Yokosho, K., Chen, Z. C., Yamaji, N. and Ma, J. F. Functional characterization of OsBBBPI3, a putative
ART1-interactive protein in rice. 10th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH.
Putrajaya, Malaysia, June 25-28, 2018.
(6) Lei, G. J., Yokosho, K., Yamaji, N., Fujii-Kashino, M. and Ma, J. F. An alternative splicing transcript of FeALS1.1 isimplicated in Al detoxification in buckwheat. 10th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low
pH. Putrajaya, Malaysia, June 25-28, 2018.
(7) Huang, S., Horst, W. J. and Ma, J. F. Genotypic variation of manganese tolerance in rice. 10th International
Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH. Putrajaya, Malaysia, June 25-28, 2018.
(8) Ma, J. F., Song, W. Y., Zhao, F., Shao, J. F. and Yamaji, N. Reducing accumulation of toxic metal and metalloid in ricegrain. 16th International Symposium on Rice Functional Genomics. Tokyo, Japan, Sep. 5-7, 2018.
(9) Huang, S. and Ma, J. F. Physiological and genetic characterization of a rice mutant with short roots. 16th International
Symposium on Rice Functional Genomics. Tokyo, Japan, Sep. 5-7, 2018.
(10) Ma, J. F. Plant nutrition for human health. Agricultural Bioscience International Conference 2018, Technology for
Better Life. Weifang, China, Sep. 15-18, 2018.
(11) Ma, J. F. Transport system of mineral elements in plants: from soil to the seeds. International Symposium on
Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis. Kurashiki, Japan, Nov. 7-10, 2018.
(12) Ma, J. F. Molecular mechanisms to cope with metal toxicity stress in plants. The First “Tsung-lo Lo” Symposium.
Shanghai, China, Nov. 15-16, 2018.
(13) Ma, J. F. Strategies for improving nutrient-use efficiency in rice. International Workshop on Cultivated Land
Fertility and Enhanced Nutrient Use Efficiency: Theory and Technique. Nanjing, China, Nov. 19-22, 2018.
(14) Ma, J. F. and Chen, Z. C. Mg transporter and abiotic stress tolerance in rice. 3rd International Magnesium
Symposium. Guangzhou, China, Nov. 25-28, 2018.
(15) Ma, J. F. Efficient uptake system for mineral elements in rice. International Symposium on Root Development andNutrients/ Water Absorption. Hangzhou, China, Nov. 26-30, 2018.

植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)(1) Katsuhara, M. Regulation of water transport and Na+ influx. The 22nd New Phytologist Workshop ‘Energy costs ofsalinity tolerance in crop plants’. Adelaide, Australia, Apr. 10-12, 2018.
(2) Furutani, H., Hanashiro, K., Fujii, Y., Maruyama, H., Sasaki, T. and Wasaki, J. Characterization of LaMATE-PI1, a
candidate of citrate transporter isolated from cluster roots of white lupin. Symposium on Phosphorus in Soils
and Plants. Leuven, Belgium, Sep. 10-13, 2018.

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)(1) Suzuki, N. A neo-virus-lifestyle exhibited by a (+)RNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus in aphytopathogenic fungus. The Spring Meeting of the Korean Society of Plant Pathology (KSPP 2018). Korea,
April 26-27, 2018.
(2) Suzuki, N. Virocontrol and RNA silencing. KSPP 2018 Satellite Meeting on Fungal Genetics. Korea, April 27, 2018.
(3) Suzuki, N. and Kanematsu, S. Viruses as biological control (virocontrol) agents of plant fungal pathogens. The FirstInternational Congress of Biological Control. Beijing, China, May 14-16, 2018.

(4) Hisano, S., Zhang, Rui., Faruk, Md. I., Kondo, H. and Suzuki, N. A neo-virus lifestyle exhibited by a (+)ssRNA virus
hosted in an unrelated dsRNA virus: taxonomic and evolutionary considerations. American Society for
Virology 2018. USA, July 14 -18, 2018.
(5) Aulia, A., Andika, I. B., Hillman, B. I. and Suzuki, N. Synergism in the chestnut blight fungus Cryphonectria
parasitica between two RNA viruses, Cryphonectria hypoviruses 1 and 4. The 17th Awaji International Forumon Infection and Immunity. Hyogo, Japan. September 4-7, 2018.
(6) Caston, J. R., Mata, C. P., Luque, D., Suzuki, N. and Ghabrial, S. A. Structures of replicative cores of dsRNA viruses.
13th International dsRNA Virus Symposium. Houffalize, Belgium, September 24-28, 2018.
(7) Suzuki, N. Another nude virus: a capsidless ssRNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus. 13th International
dsRNA Virus Symposium. Houffalize, Belgium, September 24-28, 2018.
(8) Shahi, S., Eusebio-Cope, A., Andika, I. B., Hillman, B. I. and Suzuki, N. Investigation of host range of and hostdefense against a mitochondrially replicating mitovirus. International Neovirology Mini-symposium Series III.
Kurashiki, Japan, October 26- 27, 2018.
(9) Kondo, H. Widespread endogenization of a novel virga/nege-like virus group into insect genomes. International
Neovirology Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(10) Das, S. Mutational analyses of Yado-kari virus 1 associated with Yado-nushi virus 1. International Neovirology
Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(11) Andika, I. B. Dicer functions transcriptionally and posttranscriptionally in a multilayer antiviral defense.
International Neovirology Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(12) Sato, Y. Characterization of a novel polymycovirus with a potential neo-lifestyle. International Neovirology
Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(13) Hyodo, K. Hijacking a host ROS-generating machinery by a plant RNA virus for its replication. International
Neovirology Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(14) Aulia, A. Two related mycoreoviruses behave differently in the chestnut blight fungus, Cryphonectria parasitica.
International Neovirology Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(15) Telengech, P. K. Diversity of partitiviruses isolated from the white root rot fungus, Rosellinia necatrix. International
Neovirology Mini-symposium Series III. Kurashiki, Japan, October 26-27, 2018.
(16) Andika, I. B., Wei, S., Cao, C., Salaipeth, L., Kondo, H. and Sun L. The first evidence of natural cross kingdom
virus infection from a plant to a fungus (Symposium 1 Neo-virology: The diversity of viruses on the earth).
The 66th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology. Kyoto, Japan, October 28-30, 2018.
(17) Telengech, P. K., Micheni, C. M., Hisano, S., Kondo, H., Arjona-Lopez, J. M., Lopez-Herrera, C., Kanematsu, S.
and Suzuki, N. Novel diverse Partitiviruses from the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix. Africa Day
Symposium 2018. Kurashiki, Japan, November 2, 2018.
(18) Aulia, A. Cryphonectria hypoviruses 4 (CHV4) suppresses antiviral RNAi induced by a mutant of anotherhypovirus CHV1 in the chestnut blight fungus. Africa Day Symposium 2018. Kurashiki, Japan, November 2,2018.
(19) Shahi, S. Protoplast fusion as a means for horizontal transfer of a mitochondrially replicating positive-sense RNA
virus from a filamentous ascomycete, Cryphonectria parasitica. Africa Day Symposium 2018. Kurashiki,
November 2, 2018.
(20) Arjona-López, J. M., Suzuki N. and López-Herrera, C. J. Detection and identification of new mycoviruses in
Rosellinia necatrix isolates from avocado crops. National Congress of the Spanish Society of Phytopathology.
Toledo, Spain, November 10, 2018.

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)(1) Uemura, T., Nemoto, K., Ramadan, A., Miura, S., Hachisu, M., Hoshino, R., Shinya, T., Yoshida, A., Galis, I.,
Nishiyama, M., Sawasaki, T. and Arimura, G. Oligosaccharide elicitor perception system for herbivory defense
in plants. Plant Biology 2018. Québec, Canada, July 14-18, 2018.

(2) Galis, I., Fukumoto, K., Hojo, Y., Nakatani, H. and Shinya, T. A hormone with many tasks: Jasmonate-related
functions in defense and development of rice plants. 34th annual meeting of the ISCE. Budapest, Hungary,August 12-18, 2018.
(3) Mujiono, K., Sobhy, I., Shinya, T. and Galis, I. Jasmonates …but who are “the others” in rice defense against
herbivores? 34th annual meeting of the ISCE. Budapest, Hungary, Aug. 12-18, 2018.

植物環境微生物学グループ (Group of Plant Environmental Microbiology)(1) Yanpirat, P. and Tani, A. Formaldehyde oxidation in lanthanide-dependent methylotrophy in Methylobacterium
aquaticum strain 22A. 3rd International conference on biologically active substances, Bioactive Okayama.
Okayama, Japan, Oct. 16, 2018.
(2) Haruna, Y. and Tani, A. Molecular mechanism of methylotaxis in Methylobacterium aquaticum strain 22A. 3rd
International conference on biologically active substances, Bioactive Okayama. Okayama, Japan, Oct. 16,
2018.
(3) Fujitani, Y. and Tani, A. Functional analysis of lanthanide inducible proteins of Methylobacterium aquaticum 22A. 3rd
International conference on biologically active substances, Bioactive Okayama. Okayama, Japan, Oct. 16,
2018.
(4) Ueki, S. A hypervariable mitochondrial gene associated with geographical origin in a cosmopolitan bloom-forming
alga, Heterosigma akashiwo. The 18th International Conference on Harmful Algae. Nantes, France, Oct. 21-26,
2018.
(5) Charoenpanich, J., Pantab, J., Supakit J., Saengkla, J., Nitherttham, S., Saebea, D. and Tani, A. Exploration of marine
bacteria with the potential for biological reduction of hexavalent chromium. Final Joint Seminar of Core toCore Program. Yamaguchi, Japan, Dec. 2, 2018.
(6) Keo-oudone, C., Nitiyon, S., Sotitham, P., Nurcholis, M., Milavong, K., Thammany, M., Seeyakeo, B., Phoudphong,M., Seulo, H., Sisouvong, K., Chanthavongsa, V., Sayaket, K., Ngothachack, B., Tani, A., Lertwattanasakul, N.,
Bounphanmy, S., Limtong, S. and Yamada, M. Characterization of thermotolerant ethanologenic yeasts
isolated in Lao 81 PDR. Final Joint Seminar of Core to Core Program. Yamaguchi, Japan, Dec. 2, 2018.
(7) Ueki, S. Toward understanding ecophysiology of a bloom-forming alga, Heterosigma akashiwo. International
Symposium: “Advances in Environmental Microbiology and Microbial Biotechnology”. Pucon, Chile, Dec.
5-6, 2018.

遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ (Group of Genome Diversity)(1) Daisuke, S., Jun, I., Hiroyuki, T., Keiichi, M., Yoko, I. and Takashi, H. Field multi-omics approaches in barley towardrobust crop development. 2nd International Barley Mutant Workshop. Dundee, Scotland, June 25-27, 2018.
(2) Hiroshi, H., Hiromi, M. and Kazuhiro, S. Identification and application of TFA genomic regions that confertransformation amenability in barley. 2nd International Barley Mutant Workshop. Dundee, Scotland, June 25-27,2018.

野生植物グループ (Group of Wild Plant Science)(1) Ikeda H. The Pleistocene persistence history of alpine plants in the Japanese Archipelago. Mountain Science Center,
Tsukuba University 2nd International Symposium. Tsukuba, Japan, Nov. 15, 2018.

ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
核機能分子解析グループ (Group of Nuclear Genomics)(1) Kuya, N., Sun, J., Iijima, K., Kanno, N., Yonemaru, J., Ramaiah, V. and Yamamoto T. QTL analysis of anaerobic
germination in lowland NERICAs using simple and effective evaluation method. 16th International
Symposium on Rice Functional Genomics. Tokyo, Sep. 5-7, 2018.

ゲノム制御グループ (Group of Genome Regulation)(1) Sugimoto, M., Ishii, M., Gusev, O., Sychev, V., Levinskikh, M., Novikova, N. and Grigoriev, A. Viability andBiological Properties of Barley Seeds under Space and Mars Environments. 42th Scientific Assembly of theCommittee on Space Research. Pasadena, USA, July 14-22, 2018.
(2) Chiou, W.-Y., Rikiishi, K., Himi, E., Nishimura, H., Kawamoto, T., Tsugane, K. and Maekawa, M. Preliminary
Functional Analysis of the Large grain (Lgg) Mutant Found in nDart1-tagged Lines. 16th International
Symposium on Rice Functional Genomics. Tokyo, Japan, September 5-7, 2018.

次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
作物デザイン研究チーム (Crop Design Research Team)(1) Matsui, H. and Mochida, K. Functional regression modeling for agricultural data. CFE-CMStatistics 2018. Universityof Pisa, Italy, December 14-16, 2018.
(2) Loudya, N., Mishra, P., Takahagi, K., Uehara-Yamaguchi, Y., Inoue, K., Bogre, L., Mochida, K. and López-Juez E.
Chloroplast and cell differentiation and transcriptome map of the wheat leaf. International Symposium on
Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018. Kurashiki, Japan, November 7-10, 2018.

エコフィジオロジー研究チーム (Ecophysiology Research Team)
イオンダイナミクス班 (Ion Dynamics Section)(1) Mori, I. C. Diverse roles of abscisic acid receptors in stomata. Jilin University College of Plant Sciences Seminar.
Chang Chun, China, Mar. 19, 2018.
(2) Ooi, L., Matsuura, T., Munemasa, S., Murata, Y., Katsuhara, M., Hirayama, T. and Mori, I. C. Sulfur dioxide-induced
stomatal closure is not a protection mechanism and is distinct from ozone- and carbon dioxide-induced closure.
International Plant Molecular Biology 2018. Montpellier, France, Aug. 5-10, 2018.
(3) Mori, I. C. Differential roles of abscisic acid receptors in stomatal regulation. Japan-Finland Seminar 2018. Kobe,
Japan, Sep. 24-27, 2018.

講演およびシンポジウム発表(List of Domestic Conferences and Symposia)
大気環境ストレスユニット (Atmospheric Stress Unit)
光環境適応研究グループ (Plant Light Acclimation Research Group )(1) 三輪幸哉・七条光年・高梨秀樹・藤本 優・鐘ケ江弘美・石森元幸・矢野健太郎・山崎清志・藤原 徹・米田淳一・徳永 毅・石綱史子・小童谷利恵・大西紀和・坂本 亘・岩田洋佳・堤 伸浩 ソルガム毛状突
起の先端構造に関する遺伝子座の探索. 日本育種学会 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(2) 西村明日香・七条光年・三輪幸哉・高梨秀樹・藤本 優・鐘ヶ江弘美・小林正明・矢野健太郎・小柴太一・
徳永 毅・岩田洋佳・坂本 亘・堤 伸浩 ソルガム未熟胚の培養応答性に関する GWA 解析および QTL
解析. 日本育種学会 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(3) 山谷浩史・上妻馨梨・中野道治・高見常明・加藤裕介・田中 歩・坂本 亘・草場 信 イネ LHCI サブユニ
ット機能低下により導かれるクロロフィル高蓄積機構の解析. 日本育種学会 133 回講演会, 福岡, 3 月
25-26 日, 2018.
(4) 西村健司・関谷堂真・石森元幸・Samuel Watson・高見常明・加藤裕介・宮地孝明・坂本 亘 葉緑体ペプチ
ドトランスポーターを介した核遺伝子発現制御の可能性. 第 20 回植物オルガネラワークショップ オ
ルガネラ生化学の最前線, 北海道, 3 月 27 日, 2018.
(5) 西村健司・関谷堂真・石森元幸・高見常明・加藤裕介・宮地孝明・坂本 亘 シロイヌナズナ葉緑体ペプチ
ドエクスポーターの解析. 第 59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(6) 西岡佳司・加藤裕介・小澤真一郎・高橋裕一郎・坂本 亘 Phos-tag を用いたチラコイド膜におけるリン酸化タンパク質の網羅的検出法. 第 59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(7) 加藤裕介・兵頭 究・坂本 亘 光化学系 II 修復サイクルでの FtSH プロテアーゼ自身の品質管理の重要性. 第59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(8) 高見常明・大西紀和・栗田悠子・岩村青子・大西美輪・三村徹郎・坂本 亘 葉緑体 DNA 分解を介したリン利用効率・分配の最適化. 第 59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(9) 山谷浩史・上妻馨梨・中野道治・高見常明・加藤裕介・林 依子・門田有希・奥本 裕・阿部知子・熊丸敏
博・田中 歩・坂本 亘・草場 信 イネ stay-green 突然変異体 dye1 の分子遺伝学的解析. 第 59 回日
本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(10) 大西紀和・坂本 亘 ソルガムの在来種たかきびが出穂後に示す高温・強光耐性の光合成活性による評価.
第 59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(11) 冨永 淳・田中波累・高見常明・坂本 亘・坂本 敦・島田裕士 A chloroplastic protein disulfide reductase
OsCYO1 is essential for short-day growth in rice. 第 59 回日本植物生理学会, 北海道, 3 月 28-30 日, 2018.
(12) 大西紀和・張 林剛・坂本 亘 環境ストレス下で葉緑体包膜の機能維持に重要な VIPP1 は in vitro で GTPase
活性を示す. 第 9 回日本光合成学会年会, 仙台, 5 月 26-27 日, 2018.
(13) 加藤裕介・兵頭 究・坂本亘 光化学系 II 修復サイクルと FtsH プロテアーゼ自身の品質管理の重要性. 第9 回日本光合成学会年会, 仙台, 5 月 26-27 日, 2018.
(14) 松島 良 植物細胞の中で澱粉粒の形はいかに決定されるのか？ 第 65 回日本食品科学工学会, 仙台, 8 月
24 日, 2018.
(15) 松島 良・久野 裕・佐藤和広 イネとオオムギにおけるアミロプラストの比較イメージング解析. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-24 日, 2018.
(16) 山本雅也・西村健司・北柴大泰・坂本 亘・西尾 剛 自家不和合性シロイヌナズナを用いた自家不和合性
形質における高温の影響の解析. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-24 日, 2018.
(17) 坂本莉沙・藤本 優・高梨秀樹・鐘ケ江弘美・野下浩司・小林正明・矢野健太郎・小童谷利恵・大西紀和・
堤 伸浩・坂本 亘・岩田洋佳 Phenomics に適した QTL 解析手法の提案：ソルガム RIL 集団の葉形態を例に. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-24 日, 2018.
(18) 植村香織・高見常明・加藤裕介・坂本 亘・寺地 徹 分割された葉緑体ゲノムを持つ葉緑体形質転換タバコの特徴づけと転写・翻訳物の解析. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-24 日, 2018.

(19) 井上 博・久野 裕・松島 良・小林括平・山岡直人・中神弘史・八丈野 孝 オオムギうどんこ病菌による宿主細胞内デンプン分解メカニズムの解析. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.

(20) 大西紀和・坂本 亘 ソルガムの在来種たかきびが示す高温・強光応答の出穂前後における変化の光合成活性測定による解析. 第 9 回ソルガムワークショップ, 名古屋, 11 月 29 日, 2018.

(21) 松島 良・久野 裕・佐藤和広 オオムギを用いた澱粉粒形状決定機構についての細胞生物学的研究. 第１回オオムギ資源開発研究セミナー, 愛媛, 12 月 7 日, 2018.

環境応答機構研究グループ (Group of Environmental Response Systems)(1) 森 泉倉敷地方協との共同研究の展望. 倉敷地方新農業経営者クラブ連絡協議会発表会＆セミナー, 倉敷,
1 月 25 日, 2018.
(2) 松井 悠・鷲見典克・服部公央亮・田口 亮・保黒政大・最相大輔・梅崎太造・平山隆志 IR 画像のセグメ
ンテーションによるオオムギの生長度合いの推定. 動的画像処理実利用化ワークショップ 2018, 名
古屋, 3 月 8-9 日, 2018.
(3) 加藤有祐・鷲見典克・服部公央亮・田口 亮・保黒政大・最相大輔・梅崎太造・平山隆志 セマンティック
セグメンテーションによるオオムギ領域の抽出. 動的画像処理実利用化ワークショップ 2018, 名古屋, 3 月 8-9 日, 2018.
(4) 最相大輔・井藤 純・辻 寛之・平山隆志 葉身伸長に基づくオオムギ生長過程の表現型可塑性. 第 133 回日本育種学会, 千葉, 3 月 15-17 日, 2018.
(5) 松浦恭和・森 泉・平山隆志 発達中の小麦種子の植物ホルモンの一斉分析. 日本農芸化学会 2018 年度大会,
名古屋, 3 月 15-18 日, 2018.
(6) Saisho, D., Sumi, N., Hattori, K., Ikeda, Y., Mochida, K., Umezaki, T. and Hirayama, T. Field crop data acquisition
for the data driven crop design technology. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28−30 日, 2018.
(7) Ikeda, Y., Saisho, D., Matsuura, T., Ito, J., Tsuji, H., Mochida, K. and Hirayama, T. Field multi-omics approaches inbarley to reveal crop phenology. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(8) 高萩航太郎・松下康弘・井上小槙・山口(上原)由紀子・最相大輔・江田智尊・西井龍映・平山隆志・持田恵
一 野外トランスクリプトームデータ解析によるオオムギ成長ステージの遷移およびその多様性の解明. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28−30 日, 2018.
(9) Mochida, K., Matsui, H., Lipka, A. E., Takahagi, K., Inoue, K., Ishii, M., Sato, K. and Hirayama, T. Functional data
analysis applied to identify time-series changes of environmental factors that are related to flowering in barley.
第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28−30 日, 2018.
(10) Inoue, K., Takahagi, K., Hirayama, T. and Mochida, K. An integrated genome information resources in Pooideae
and its application to identify homoeologous relations of transcription factors in barley and wheat. 第 59 回日
本植物生理学会, 札幌, 3 月 28−30 日, 2018.
(11) 井藤 純・野村有子・最相大輔・平山隆志・辻 寛之 フィールド環境下のオオムギの花芽形成過程における茎頂メリステムの応答性の系統間差. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28−30 日, 2018.
(12) Mori, I. C., Ooi, L. H2SO3 is the chemical species that induces stomatal closure in aqueous solution of sulfur
dioxide. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(13) Ooi, L., Munemasa, S., Murata, Y. and Mori, I. C. Sulfur dioxide-induced stomatal closure is mediated by guard cell
death and the mechanism is unshared with ozone-induced closure. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3
月 28-30 日, 2018.
(14) Nakahara, Y., Mori, I. C., Taniguchi, Y., Shibasaka, M., Horie, T., Kaneko, T. and Katsuhara, M. CO2 輸送体候補
アクアポリン OsTIP2;2 の同定と機能解析. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(15) 森 泉 アブシシン酸受容体の孔辺細胞における機能分化. 大阪大学・生物科学セミナー, 吹田, 7 月 3 日,2018.
(16) 池田陽子 Plant mobile domain を介した新規サイレンシング機構. 遺伝研研究会「転移因子と宿主の相互作用による生命機能と進化」, 三島, 8 月 20-21 日, 2018.

(17) 池田陽子・西浜竜一・山岡尚平・Arteaga-Vazquez, Mario A・Grimanelli, Daniel・Martienssen, Robert A・
Pogorelcnik, Romain・Mathieu, Olivier・大和勝幸・河内孝之・平山隆志 ゼニゴケにおける DNA メチル化制御. 第 82 回日本植物学会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.
(18) 松井 悠・鷲見典克・服部公央亮・田口 亮・保黒政大・最相大輔・梅崎太造・平山隆志 IR 画像のセグ
メンテーションによるオオムギの生長度合いの推定. 第 17 回情報科学技術フォーラム, 福岡, 9 月
19-21 日, 2018.
(19) 加藤有祐・鷲見典克・服部公央亮・田口 亮・保黒政大・最相大輔・梅崎太造・平山隆志 DNN を用いた
オオムギ領域の抽出および生長推定への活用. 第 17 回情報科学技術フォーラム, 福岡, 9 月 19-21 日,2018.
(20) 堀 清純・永田和史・福岡修一・最相大輔・平山隆志・持田恵一 水稲品種 Khao Nam Jen に由来する日長
非依存的な出穂期 QTL の検出. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(21) 平山隆志 植物の鉄欠乏応答で機能する新規短鎖ペプチド FEP1. 国際基督教大学セミナー, 東京, 9 月 27
日, 2018.
(22) 最相大輔・井藤 純・辻 寛之・持田恵一・池田陽子・平山隆志 オオムギ生長過程の表現型可塑性. 第 13回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(23) 井藤 純・野村有子・最相大輔・平山隆志・辻 寛之 オオムギ茎頂メリステムの発生フェノロジー.第 13
回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(24) 井藤 純・野村有子・最相大輔・持田恵一・平山隆志・辻 寛之 野外環境におけるオオムギ茎頂メリステ
ムの成長過程の系統間比較. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.

土壌環境ストレスユニット (Soil Stress Unit)
植物ストレス学グループ (Group of Plant Stress Physiology)(1) Yamaji, N. and Ma, J. F. Imaging of mineral element distribution in rice node with laser ablation ICP-MS. The 59th Annual
Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists, Sapporo, March 28-30, 2018. （レーザーアブレーション
ICP-MS によるイネ節の元素分布イメージング. 第 59 回日本植物生理学会年会）(2) Shao, J. F., Yamaji, N. and Ma, J. F. Transporters involved in preferential distribution of boron in rice. The 59th Annual Meetingof the Japanese Society of Plant Physiologists, Sapporo, March 28-30, 2018. （ホウ素の優先的分配に関わる輸送体.
第 59 回日本植物生理学会年会）(3) Che, J., Tsutsui, T., Yokosho, K., Yamaji, N. and Ma, J. F. Functional characterization of a transcription factor (ART2)
implicated in aluminum tolerance of rice. The 59th Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists,
Sapporo, March 28-30, 2018.
(4) Lei, G., Kashino, M., Wu, D., Yamaji, N., Sato, K. and Ma, J. F. Fine mapping of a QTL gene for Cd accumulation in barley.
The 59th Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists, Sapporo, March 28-30, 2018. （オオムギのカ
ドミウム集積に関与する QTL 遺伝子のファインマッピング. 第 59 回日本植物生理学会年会）(5) 馬 建鋒 人間の栄養に資する植物のミネラル輸送．第 72 回日本栄養・食糧学会大会，岡山，5 月 11-13 日，2018.
(6) 山地直樹・馬 建鋒 レーザーアブレーション ICP-MS を用いたイネ節の維管束間輸送過程の解析. 日本土壌肥料学会 2018 年度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.
(7) 横正健剛・陳 志長・山地直樹・馬 建鋒 イネの ART1 と相互作用するタンパク質 OsBBPIs の機能解析．日本土壌肥料学会 2018 年度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.
(8) Lei, G., Yamaji, N. and Ma, J. F. Functional characterization of two metallothionein genes highly expressed in rice nodes. 日本
土壌肥料学会 2018 年度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.
(9) 邵 継鋒・山地直樹・馬 建鋒 イネにおけるホウ素の優先的分配に関与する輸送体．日本土壌肥料学会 2018 年
度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.
(10) Wang, W. and Ma, J. F. Mapping of QTL genes for Cd accumulation in rice by using chromosome segment substitution lines(CSSL). 日本土壌肥料学会 2018 年度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.

(11) Yu, E. and Ma, J. F. Physiological characterization of rice mutants with low Cd accumulation and rough mapping of
responsible genes. 日本土壌肥料学会 2018 年度神奈川大会，神奈川，8 月 29-31 日，2018.
(12) Huang, S. and Ma, J. F. Characterization of a short-root mutant of rice. 日本土壌肥料学会関西支部会講演会，松江，12
月 6 日，2018.
(13) Wang, P. and Ma, J. F. QTL analysis for As accumulation in rice shoot. 日本土壌肥料学会関西支部会講演会，松江，12
月 6 日，2018.

植物分子生理学グループ (Group of Plant Molecular Physiology)(1) 且原真木 塩ストレス下でのナトリウム流入と水輸送の制御. 第 34 回資源植物科学シンポジウム及び・第10 回植物ストレス科学研究シンポジウム, 倉敷, 3 月 5-6 日, 2018.
(2) 中原由揮・柴坂三根夫・谷口洋二郎・且原真木 CO2 輸送体候補 OsTIP2;2 の細胞内局在. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(3) 中原由揮・柴坂三根夫・森 泉・谷口純一郎・堀江智明・金子智之・且原真木 CO2 輸送体候補アクアポリ
ン OsTIP2;2 の同定と機能解析. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(4) 野澤 彰・名樂 仁・松井 司・井上寛之・佐々木孝行・山本洋子・有村源一郎・澤崎達也 シロイヌナズナ
色素体局在型 PAPS 輸送体 PAPST2 の解析. 第 59 回日本植物生理学会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(5) 佐々木孝行・有吉美智代・森 泉・山本洋子 トマトにおけるリンゴ酸輸送体 ALMT ファミリーの多様性. 日本土壌肥料学会, 神奈川, 8 月 29-31 日, 2018.
(6) 古谷浩章・花城清俊・藤井友美・西田 翔・佐々木孝行・和崎 淳 シロバナルーピンのクラスター根で発現する MATE ファミリートランスポーターの解析. 第４回植物の栄養研究会, 京都, 9 月 7-8 日, 2018.
(7) 三村徹郎・大西美輪・村西直樹・藤原ひとみ・石崎公康・深城英弘・西山智明・坂山英俊・Rob J.Reid・且原真木 シャジクモ細胞膜リン酸輸送体の分子機能解析. 日本植物学会第 82 回大会, 広島, 9 月 14-16
日, 2018.
(8) 藤田知美・奥村綾子・且原真木・奈良久美 シロイヌナズナの根と根細胞の水透過性測定. 日本植物学会第82 回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.
(9) 山成由佳子・中原由揮・且原真木・奈良久美 シロイヌナズナの液胞膜型アクアポリン AtTIP2;2 と AtTIP2;3の水透過性. 日本植物学会第 82 回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.
(10) 佐々木孝行・有吉美智代・森 泉・山本洋子 植物の ALMT リンゴ酸輸送体の多様性. 日本植物学会第 82回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.
(11) 且原真木・堀江智明 Na+/K+透過性をもつアクアポリン：イネ OsPIP2;4 およびオオムギ HvPIP2;8 の解析.
第 49 回根研究集会, 盛岡, 10 月 27-28 日, 2018.
(12) 大西亜耶・且原真木 オオムギの根水透過性制御にかかわる遺伝因子の探求. 第 49 回根研究集会, 盛岡,
10 月 27-28 日, 2018.

環境生物ストレスユニット (Biotic Stress Unit)
植物・微生物相互作用グループ (Group of Plant-Microbe Interactions)(1) 近藤秀樹・広田恵介・鈴木信弘 分節型ラブドウイルスに見いだされたゲノムリアソートメント. 平成 30
年度日本植物病理学会大会，神戸，3 月 25–27 日，2018．
(2) Micheni, C. M., Telengech, P. K., Hisano, S., Kondo, H., Arjona-Lopez, J. M., Lopez-Herrera, C., Kanematsu, S. andSuzuki, N. Characterization of diverse partitiviruses from the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix. The
Annual Meeting of the Japanese Phytopathological Society, Kobe, March 25-27, 2018.
(3) 兵頭 究・鈴木信弘・奥野哲郎 宿主足場タンパク質 RACK1 は植物 RNA ウイルスの増殖を正に制御する. 平
成 30 年度日本植物病理学会大会，神戸，3 月 25–27 日，2018．

(4) Shahi, S., Eusebio-Cope, A., Chiba, S., Hillman, B. I. and Suzuki, N. Host expansion of Cryphonectria mitovirus 1
revealed its avoidance of antiviral RNA silencing. The Annual Meeting of the Japanese PhytopathologicalSociety, Kobe, March 25-27, 2018.
(5) 兵藤 究 植物 RNA ウイルスの複製機構．第 13 回植物ウイルス病研究会，神戸，3 月 28 日，2018．
(6) 佐藤有希代 キュウリモザイクウイルスに対する NB-LRR 型抵抗性タンパク質 RCY1 の蓄積量を制御する
分子機構の解析．第 43 回岡山植物病理セミナー，岡山，5 月 19 日，2018．
(7) 鈴木信弘 今だから聞けるウイルス学講座「菌類ウイルスに魅せられて」．湯河原ウイルスキャンプ，静岡，
6 月 6-7 日，2018．
(8) Shahi, S., Eusebio-Cope, A., Andika, I. B., Hillman, B. I. and Suzuki, N. Host range expansion of and avoidance ofantiviral RNA silencing by a mitochondrially replicating virus, Cryphonectria mitovirus 1. 33rd Annual
Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology Society, Okayama, June 23-24, 2018.
(9) Aulia, A., Andika, I. B., Hillman, B. I. and Suzuki, N. Cryphonectria hypovirus 4 strain C18 exerts synergistic effects
in the host fungus Cryphonectria parasitica. 33rd Annual Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology
Society, Okayama, June 23-24, 2018.
(10) Telengech, P. K., Micheni, C. M., Hisano, S., Kondo, Arjona-Lopez, J. M., Lopez-Herrera, C., Kanematsu, S. andSuzuki, N. Novel diverse partitiviruses from the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix. 33rd Annual
Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology Society, Okayama, June 23-24, 2018.
(11) 近藤秀樹 ウイルスハンティング最前線－自然界に存在する生物界をまたいだウイルス感染－．室内環境学会・微生物分科会－勉強会－，倉敷， 8 月 8 日，2018．
(12) 鈴木信弘 ネオウイルス学：ウイルスいろいろ．室内環境学会・微生物分科会－勉強会－，倉敷，8月8日，2018．
(13) 鈴木信弘 白紋羽病菌で繰り広げられるRNAウイルスのネオ・ライフスタイル．第53回植物感染生理談話会，高知， 8月21-23日，2018．
(14) 兵頭 究 植物ウイルス感染がパターン誘導性免疫に及ぼす影響．第53回植物感染生理談話会，高知，8
月21-23日，2018．
(15) Shahi, S. Investigation of hostrange of and host defense against a mitochondrially replicating mitovirus. ネオウイ
ルス学シンポジウムI，倉敷，9月20日，2018．
(16) Aulia, A. Natural variation insusceptibility to viruses in the chestnut blight fungus. ネオウイルス学シンポジウム
I，倉敷，9月20日，2018．
(17) Das, S. Mutational analysis of yado-kari virus 1. ネオウイルス学シンポジウムI，倉敷，9月20日，2018．
(18) 兵頭 究・鈴木信弘・奥野哲郎 宿主足場タンパク質 RACK1 のハイジャックによる植物ウイルス増殖機構.
平成 30 年度日本植物病理学会関西部会，山口， 9 月 27-28 日，2018．
(19) 鈴木信弘 （菌類）ウイルスに魅せられて．第 44 回岡山植物病理セミナー，岡山，12 月 18 日，2018．

植物・昆虫間相互作用グループ (Group of Plant-Insect Interactions)(1) 照屋美優・藤原 薫・宮本皓司・山根久和・新屋友規・Ivan Galis・林謙一郎・宮崎 翔・中嶋正敏・野尻秀
昭・岡田憲典 蘚類におけるジャスモン酸類の探索と生理活性の追究. 日本農芸化学会 2018 年度大会, 名古屋, 3 月 15-18 日, 2018.
(2) 叶 文秀・新屋友規・木下俊則・賀来華江・渋谷直人・村田芳行 キチンオリゴ糖は CERK1 を介して気孔閉口を誘導する. 日本農芸化学会 2018 年度大会, 名古屋, 3 月 15-18 日, 2018.
(3) 新屋友規・北條優子・宮本皓司・内田健一・山根久和・岡田憲典・Galis Ivan イネの防御応答における OPDA
シグナルによるフェノールアミド生合成制御. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日,
2018.
(4) 高橋弘輝・Andama Joackin B.・北條優子・新屋友規・中谷容子・Galis Ivan イネにおけるフェノールアミ
ド生合成および制御に関わる新規遺伝子の同定. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日,
2018.

(5) Galis Ivan・福元華織・北條優子・中谷容子・新屋友規 Phytohormone levels and associated gene expression indeveloping rice panicles. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(6) Andama B. Joackin・Osinde Cyprian・新屋友規・Galis Ivan Characterization of herbivory resistance traits in
NERICA rice varieties. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(7) Andama B. Joackin・新屋友規・Galis Ivan Update on herbivory resistance traits in NERICA rice varieties. Africa Day
2018, Okayama, 11 月 2 日, 2018.
(8) Mujiono Kadis・新屋友規・Galis Ivan Hormonal crosstalk in regulation of herbivory-induced volatile emissions inrice. Africa Day 2018, Okayama, 11 月 2 日, 2018.
(9) 高藤健人・林 鎬俊・河内健太郎・下川 咲・安東義乃・塩尻かおり・稲毛直人・小島秀一・Ivan Galis・ 有
村源一郎 セイタカアワダチソウの防御応答におけるエチレン応答因子 ERF の機能解明. 第 40 回日
本分子生物学会, Yokohama, 11 月 28-30 日, 2018.

植物環境微生物学グループ (Group of Plant Environmental Microbiology)(1) 春名優希・加藤純一・谷 明生 Methylobacterium 属細菌におけるメタノール走化性センサーの機能解析. 日本農芸化学会大会, 名古屋, 3 月 15 日, 2018.
(2) 平賀翔大・藤谷良子・谷 明生 Methylobacterium aquaticum strain 22A におけるメタノール脱水素酵素遺伝子のランタノイド依存的制御.

日本農芸化学会大会, 名古屋, 3 月 15 日, 2018.

(3) Lyu, H. and Tani, A. Draft genome and description of Novimethylophilus kurashikiensis gen. nov. sp. nov., a newlanthanide-dependent methylotrophic species of Methylophilaceae. 日本農芸化学会大会, 名古屋, 3 月 15 日,
2018.
(4) Yanpirat, P. and Tani, A. Multiple formaldehyde oxidation pathways in Methylobacterium aquaticum strain 22A. 日
本微生物生態学会第 32 回大会, 沖縄, 7 月 11−13 日, 2018.
(5) Fujitani, Y. and Tani, A. Functional analysis of lanthanide inducible protein in Methylobacterium aquaticum 22A. 日
本微生物生態学会第 32 回大会, 沖縄, 7 月 11−13 日, 2018.
(6) Haruna, Y., Kato, J. and Tani, A. Molecular mechanism of methylotaxis in Methylobacterium aquaticum strain 22A.
日本微生物生態学会第 32 回大会, 沖縄, 7 月 11−13 日, 2018.
(7) 吉川友理・北村純一・矢野嵩典・中川智行・谷 明生・三井亮司 Methylobacterium extorquens AM1 のランタ
ノイド依存型メタノールデヒドロゲナーゼの解析. 第 70 回日本生物工学会大会, 大阪, 9 月 5−7 日,2018.
(8) 王 倫・菅沼宗矢・日比野歩美・谷 明生・三井亮司・海老原章郎・岩本悟志・稲垣瑞穂・島田昌也・早川
享志・中川智行 ランタノイド依存型メタノール脱水素酵素 XoxF1 の酵素活性と安定性はランタノイ
ド種に依存する. 農芸化学会中部支部支部例会, 名古屋, 9 月 15 日, 2018.
(9) 阪口由佳・繁原安美・王 倫・谷 明生・中野浩平・稲垣瑞穂・島田昌也・早川享志・中川智行 ホウレンソ
ウにおける収穫後の Methylobacterium 属細菌の挙動とその成育を制御する微生物の探索. 美味技術学会第 18 回大阪例会, 大阪, 11 月 8−9 日, 2018.

遺伝資源ユニット (Genetic Resources Unit)
ゲノム多様性グループ (Group of Genome Diversity)(1) 佐藤和広・大西一光・小松田隆夫・呉 健忠 種子休眠性遺伝子 Qsd1 のコムギゲノムにおける配列の多様性. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(2) 笠澄 望・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 パンコムギ準等質遺伝子系統の RNA-seq 解析によるハイブ
リッドネクローシスの解析. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.

(3) 田中 剛・石川吾郎・小木曽映里・柳澤貴司・佐藤和広 RNA-Seq に基づく国内オオムギ品種多様性解析と育種利用. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(4) 道川麻美・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 RNA-seq データに基づく一粒系コムギのゲノムワイド多型の検出とその利用. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(5) 笹沼恒男・澤田小春・田中裕之・佐藤和広・高田兼則・朱 明婧・龍 春林 中国青海省で収集したパンコ
ムギ遺伝資源の基本農業形質及び製パン性関連形質に関する多様性評価. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(6) 三木祐香・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 RNA-seq データからみたエギロプス属 Sitopsis 節の種間関係とパンコムギ B ゲノムの起原. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(7) 久野 裕・宗森広美・佐藤和広 形質転換能遺伝子座に関わるオオムギ準同質遺伝子系統の開発. 日本育種学会第 133 回講演会, 福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(8) 最相大輔・井藤 純・辻 寛之・平山隆志 葉身伸長に基づくオオムギ生長過程の表現型可塑性. 日本育種学会第 133 回講演会，福岡, 3 月 25-26 日, 2018.
(9) 久野 裕 品種の壁を越える：オオムギの形質転換や再分化を可能にするゲノム領域の同定. 日本植物学会
第 82 回大会・シンポジウム「植物細胞のリプログラミング制御 ～その鍵は動的恒常性の維持と打破にあり～」, 広島, 9 月 14-16 日, 2018(10) 安倍史高・久野 裕・三上雅史・神谷容子・大西一光・ハク エムダドウル・田中 剛・遠藤真咲・川浦香
奈子・佐藤和広 パンコムギにおける CRISPR/Cas9 を用いた TaQsd1 全同祖遺伝子のゲノム編集
１：編集ホモ系統の効率的な作出. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(11) 神谷容子・川浦香奈子・安倍史高・田中 剛・ハク エムダドウル・三上雅史・遠藤真咲・久野 裕・ 佐藤
和広 パンコムギにおける CRISPR/Cas9 を用いた TaQsd1 全同祖遺伝子のゲノム編集２：導入遺伝
子の分離除去. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(12) ハク エムダドウル・安倍史高・林 武司・久野 裕・田中 剛・神谷容子・川浦香奈子・佐藤和広 パンコ
ムギにおける CRISPR/Cas9 を用いた TaQsd1 全同祖遺伝子のゲノム編集：3. 編集ホモ系統の形質評
価. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(13) 松島 良・久野 裕・佐藤和広 イネとオオムギにおけるアミロプラストの比較イメージング解析. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(14) 佐藤和広 オオムギリソースの紹介. 日本育種学会第 60 回シンポジウム・ワークショップ, 「バイオリソースと育種学のこれからを考える：NBRP リソースの活用事例から」, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(15) 堀 清純・永田 和・福岡修一・最相大輔・平山隆志・持田恵一 水稲品種 Khao Nam Jen に由来する日長
非依存的な出穂期 QTL の検出. 日本育種学会第 134 回講演会, 岡山, 9 月 22-23 日, 2018.
(16) 久野 裕・宗森広美・関 真秀・鈴木 穣・佐藤和広 幹細胞化関連遺伝子を過剰発現する形質転換オオムギ
カルスにおいて発現変動する遺伝子の検出. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(17) 文屋慧亮・久野 裕・佐藤和広 オオムギ種子休眠に関わる QTL 間相互作用の解析（予報）. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(18) 安倍史高・ハク エムダドゥル・田中 剛・神谷容子・久野 裕・三上雅史・川浦香奈子・遠藤真咲・大西
一光・林 武司・佐藤和広 パンコムギにおける CRISPR/Cas9 を用いたゲノム編集. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(19) 大野良子・久野 裕・山根美樹・佐藤和広・荻野千秋・近藤昭彦・宅見薫雄 外来遺伝子発現用のコムギ細胞外排出シグナルと乾燥誘導性プロモーターの効果. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日,
2018.
(20) 最相大輔・井藤 純・辻 寛之・持田恵一・池田陽子・平山隆志 オオムギ生長過程の表現型可塑性. 第 13回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(21) 井藤 純・野村有子・最相大輔・平山隆志・辻 寛之 オオムギ茎頂メリステムの発生フェノロジー. 第 13回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(22) 井藤 純・野村有子・最相大輔・持田恵一・平山隆志・辻 寛之 野外環境におけるオオムギ茎頂メリステ
ムの成長過程の系統間比較. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(23) 井上 博・久野 裕・松島 良・小林括平・山岡直人・中神弘史・八丈野孝 オオムギうどんこ病菌による宿主細胞内デンプン分解メカニズムの解析. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.

(24) 高松鮎美・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 RNA-seq 解析による二粒系コムギと Aegilops cylindrica 間の交雑種子の発生異常の解析. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(25) 道川麻美・吉田健太郎・岡田萌子・佐藤和広・宅見薫雄 野生一粒系コムギの RNA-seq データに由来する多型情報の利用. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(26) 田中紗弥夏・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 RNA-seq データに基づくコムギ C, M, N ゲノム 2 倍体近縁種間の遺伝的関係. 第 13 回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(27) 笠澄 望・吉田健太郎・佐藤和広・宅見薫雄 パンコムギハイブリッドネクローシスの RNAseq 解析. 第 13回ムギ類研究会, 横浜, 11 月 26-27 日, 2018.
(28) 久野 裕 オオムギの遺伝子改変技術の現状と将来展望. 第 1 回オオムギ資源開発研究セミナー, 松山, 12
月 7 日, 2018.
(29) 久野 裕・宗森広美・関 真秀・鈴木 穣・佐藤和広 幹細胞化関連遺伝子を過剰発現するオオムギカルスにおける網羅的遺伝子発現解析. 第 10 回中国地域育種談話会, 鳥取, 12 月 15-16 日, 2018.
(30) 文屋慧亮・久野 裕・佐藤和広 オオムギ種子休眠に関する QTL 間相互作用の解析(予報). 第 10 回中国地域育種談話会, 鳥取, 12 月 15-16 日, 2018.
(31) 最相大輔・金森裕之・片寄裕一・半田裕一 オオムギ変動日長応答出穂期 QTL の準同質遺伝子系統の作
出. 第 10 回中国地域育種談話会, 鳥取, 12 月 15-16 日, 2018.

野生植物グループ (Group of Wild Plant Science)(1) 長谷川慎平・川井友裕・瀬尾直登・池田 啓・佐藤修正・矢崎一史・髙梨功次郎 日本におけるオヤマノエ
ンドウの系統地理学的解析. 日本植物分類学会第 17 回大会, 金沢, 3 月 8-11 日, 2018．
(2) 佐多陽奈・清水 翠・岩崎貴也・副島顕子・池田 啓・東 隆行・永野 惇・藤井紀行 キスミレの遺伝構造解析と満鮮要素の分布変遷に関する考察．日本植物分類学会第 17 回大会, 金沢, 3 月 8-11 日, 2018．
(3) 池田 啓・Pernille Bronken Eidesen・Viachenslav Barkalov・Valentin Yakubov・Christian Brochmann・瀬戸口浩
彰 周北極-高山植物コケモモ (Vaccinium vitis-idaea)の系統地理. 日本植物分類学会第 17 回大会, 金沢, 3 月 8-11 日, 2018．
(4) 池田 啓 分子データから見えてきた東北アジアにおける高山植物の生物地理. 日本生態学会第 65 回大会
シンポジウム, 札幌, 3 月 14-18 日, 2018．
(5) 池田 啓 系統地理学が描く分布形成の歴史の進展と制約－高山植物の研究を例に－．日本進化学会第 20
回大会夏の学校, 東京, 8 月 22-25 日, 2018．
(6) 池田 啓・鈴木友美・岡 義人・Lovisa Gustafsson・Christian Brochmann・長谷あきら 異なる緯度に生育す
るタネツケバナ属(Cardamine)の姉妹種におけるフィトクロム(PHYB)の環境感受性の進化. 日本植物学会第 82 回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018．

ゲノム育種ユニット (Applied Genomics Unit)
核機能分子解析グループ (Group of Nuclear Genomics)(1) 山本敏央 タカナリを用いた遺伝解析用の実験系統群の作出と利用. 多収イネ品種タカナリに関する研究会，東京, 12 月 11 日, 2018.

ゲノム制御グループ (Group of Genome Regulation)(1) 邱 琬貽・川本忠文・力石和英・氷見英子・西村秀希・栂根一夫・前川雅彦

Morphological characterization of

spikelet and microarray analysis of the Large grain mutant found in transposon-tagged lines in rice (Oryza
sativa L.). 第 133 回日本育種学会講演会，福岡，3 月 25-26 日，2018.

(2) 杉本 学・石井誠・Gusev,

O.・Sychev，V.・Levinskikh，M.・Novikova, N.・Grigoriev, A.

宇宙空間環境

下と火星地表環境下で太陽光に曝露した大麦種子の生存能力. 日本宇宙生物科学会第 32 回大会，仙台，9 月 22-23 日, 2018.
(3) 氷見英子・栗原志保・安倍史高・田中啓介・高橋秀和・松浦恭和・前川雅彦

RNA-seq 解析によるコムギ

Tamyb10 遺伝子が制御する種子休眠関連遺伝子の探索. 第 134 回日本育種学会講演会, 岡山, 9 月
22-23 日, 2018.

次世代作物共同研究コア (Research Core for Future Crops)
作物デザイン研究チーム (Crop Design Research Team)(1) Mochida, K. A life course approach aiming to design climate-resilient crops. Workshop：Data driven crop design
technology, 福岡, 2 月 20-21 日, 2018.

エコフィジオロジー研究チーム (Ecophysiology Research Team)
イオンダイナミクス班 (Ion Dynamics Section)(1) Mori, I. C., Ooi, L. H2SO3 is the chemical species that induces stomatal closure in aqueous solution of sulfur dioxide.
第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(2) Ooi, L., Munemasa, S., Murata, Y., Mori, I. C. Sulfur dioxide-induced stomatal closure is mediated by guard cell
death and the mechanism is unshared with ozone-induced closure. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3
月 28-30 日, 2018.
(3) 森 泉 アブシシン酸受容体の孔辺細胞における機能分化. 大阪大学・生物科学セミナー, 吹田, 7 月 3 日,
2018.
(4) 佐々木孝行・有吉美智代・森 泉・山本洋子 トマトにおけるリンゴ酸輸送体 ALMT ファミリーの多様性. 日本土壌肥料学会, 神奈川, 8 月 29-31 日, 2018.
(5) 三村徹郎・大西美輪・村西直樹・藤原ひとみ・石崎公康・深城英弘・西山智明・坂山英俊・Rob J. Reid・且原真木 シャジクモ細胞膜リン酸輸送体の分子機能解析. 日本植物学会第 82 回大会, 広島, 9 月 14-16
日, 2018.
(6) 佐々木孝行・有吉美智代・森 泉・山本洋子 植物の ALMT リンゴ酸輸送体の多様性. 日本植物学会第 82回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.

作物イノベーション研究チーム (Crop Innovation Research Team)
エピジェネティクス班 (Epigenetics Section)(1) Ikeda, Y., Saisho, D., Matsuura, T., Ito, J., Tsuji, H., Mochida, K. and Hirayama, T. Field multi-omics approaches inbarley to reveal crop phenology. 第 59 回日本植物生理学会年会, 札幌, 3 月 28-30 日, 2018.
(2) 池田陽子 Plant mobile domain を介した新規サイレンシング機構. 遺伝研研究会「転移因子と宿主の相互作
用による生命機能と進化」, 三島, 8 月 20-21 日, 2018.
(3) 池田陽子・西浜竜一・山岡尚平・Mario A. Arteaga-Vazquez・Daniel Grimanelli・Robert A. Martienssen・Romain
Pogorelcnik・Olivier Mathieu・大和勝幸・河内孝之・平山隆志 ゼニゴケにおける DNA メチル化制御.
日本植物学会第 82 回大会, 広島, 9 月 14-16 日, 2018.

研究所員が主催したシンポジウム等(List of Symposium Superintended by the Member of Institute)
岡山大植物研・作物イノベーション研究ワークショップ（第1回）「作物イノベーションのための基盤作り～分子からフィールドまで～」
日程：2018年1月18日
場所：岡山大学資源植物科学研究所
オーガナイザー：久野 裕・松島 良・近藤秀樹（岡山大学・植物研・オオムギ遺伝子改変班）
１. 胚−胚乳サイズ制御と新しい植物ホルモン桧原健一郎（東京大学・大学院農学生命科学研究科）
２. 植物の高い器官再生能力を支える分子機構〜あらたなクローン増殖技術の展開を探る〜
大谷美沙都（奈良先端大・バイオ／理研・CSRS）
３. ゲノムに大規模同義置換を導入した小球形RNAウイルスの病原性と進化，および，ウイルスベクターへの応用の可能性望月知史（大阪府立大学・生命環境科学研究科）
４. ウイルス・宿主・媒介者相互関係；圃場観察からみえてきたもの
玉田哲男（ホクレン農業協同組合連合会・農業総合研究所）

Workshop：Data driven crop design technology
Feb. 20-21, 2018
Venue: Ito Campus, Kyushu University
Organizing Committee: Hirayama, T. (IPSR, Okayama University), Mochida, K. (RIKEN/ IPSR, Okayama University)
Tanaka, S. (Hiroshima University), Nishii, R. (Kyushu University)
February 20
1. Statistical gene data analysis and applications to plant growth
Koda, S. (Graduate School of Mathematics, Kyushu University), Yoshihiko Onda (RIKEN Center for
Sustainable Resource Science), Matsui, H. (Faculty of Data Science, Shiga University), Nishii, R. (Institute ofMath for Industry, Kyushu University), Mochida, M. (RIKEN Center for Sustainable Resource Science/ IPSR,
Okayama University)
2. Estimation of gene expression from shallow RNA-Seq by topic model
Iwayama, K. (The Center for Data Science Education and Research, Shiga University), Kashima, M. and J.
Nagano, A.
3. Quantification of the Genomic Contribution towards Food and Energy-related Crop Traits
Alexander E. Lipka (Department of Crop Sciences, University of Illinois)
4. The Plant-Microbe nexus: emerging frontiers in engineering sustainable crop production systems
Bhalerao, K. (Department of Agricultural and Biological Engineering, University of Illinois, UrbanaChampaign)
February 21
5. A life course approach aiming to design climate-resilient crops
Mochida, K. (RIKEN Center for Sustainable Resource Science/ IPSR)
6. Field-omics approach to explore physiological variations decisive for agricultural traits
Hirayama, T. (IPSR, Okayama University)

7.

8.
9.

TERRA REF: Open Software, Data, and Computing to Advance High Throughput Phenomics
Shaner LeBauer, D. (Carl R. Woese Institute for Genomic Biology, National Center for Supercomputing
Applications, University of Illinois, Urbana-Champaign)
Miniaturized Chemical Analyzers for Water Quality Monitoring
Miyake, R. (Institute Graduate school of Engineering, The University of Tokyo)
Understanding mushroom fruiting: a data-driven approach
La Porta, N. (Environmental Biotechnology Platform at the Research and Innovation Centre of Fondazione
Edmund Mach)

第34回資源植物科学シンポジウム及び第10回植物ストレス科学研究シンポジウム－植物の多彩なストレス克服戦略－
日時：2018 年 3 月 5-6 日
場所：倉敷市芸文館アイシアター
オーガナイザー：馬 建鋒（岡山大学・植物研）
3月5日
１. ゼニゴケゲノム解析から探る陸上植物の進化
河内孝之（京都大学）
２. 全ゲノム解析は品種をどこまで紐解けるか～イチゴの場合～
磯部祥子（かずさDNA研究所）
３. 野生イネOryza longistaminataの有用性
前川雅彦（岡山大学・植物研）
４. 植物と炭疽病菌の攻防戦
高野義孝（京都大学）
５. 微生物情報と栄養環境情報の統合による植物免疫の制御
西條雄介（奈良先端科学技術大学院大学）
６. 植物が持つ多様な栄養環境適応のための巧妙な仕組み
柳澤修一（東京大学）
７. オオムギの形質転換成否を決めるゲノム領域の特定とその利用
久野 裕（岡山大学・植物研）
3月6日
８. ソルガムのバイオマス生産性に関連する遺伝子のゲノムワイドな同定
藤本 優（東京大学）
９. 塩ストレス下でのナトリウム流入と水輸送の制御
且原真木（岡山大学・植物研）
10. イネ節の効率的な気体透過性による耐水性機構の解明
永井啓祐（名古屋大学）
11. 植物の根への酸素供給システムの制御
中園幹生（名古屋大学）

第20回植物オルガネラワークショップ
オルガネラ生化学の最前線
日程：2018年3月27日 (火)場所：北海道大学 低温科学研究所
オーガナイザー：小保方潤一（京都府立大学）・加藤裕介（岡山大学・植物研）
・河野重行（東京大学）
・楠見健介（九州大学）
・小林裕和（静岡県立大学）
・高林厚史（北海道大学）
・西村芳樹（京都大学）
・林田信明（信州大学）
・宮沢 豊（山形大学）
セッション１
１. 葉緑体ペプチドトランスポーターを介した核遺伝子発現制御の可能性
西村健司1・関谷堂真1・石森元幸2・Samuel Watson1・高見常明1・加藤裕介1・宮地孝明1・坂本 亘1（1岡山大学・植物研, 2東京大学）
２. 葉緑体DNA遺伝に必須なHolliday ジャンクション切断機構の発見
小林優介（遺伝学研究所）
３. 細菌学的視点から見た葉緑体成立機構
児島征司（東北大学）
セッション２
１. フィトクロムによるゲノムワイドな転写開始点制御の発見
牛島智一（九州大学）
２. アブラナ科植物のメス側自家不和合性因子 SRK の機能における N 結合型糖鎖修飾の役割の解析
山本雅也1・June B. Nasrallah2（1東北大学・2コーネル大学）
３. 植物細胞の極性形成機構の細胞生物学的解析
楢本悟史1・古谷将彦2・田坂昌生3・福田裕穂4・経塚淳子1（1東北大学・2名古屋大学・3奈良先端科学
技術大学院大学・4東京大学）
特別講演
クロロフィル代謝の機能と進化
田中 歩 （北海道大学）

第13回 植物ウイルス病研究会
日程：2018 年 3 月 28 日
場所：神戸大学滝川記念学術交流会館
オーガナイザー：三瀬和之（京都大学）・鈴木信弘（岡山大学・植物研）
１. ラズベリー黄化ウイルスの花粉伝染
磯貝雅道（岩手大学）
２. ブドウとカキから新たに検出されたウイルス・ウイロイド
伊藤隆男（農研機構果茶研）
３. ウメ輪紋ウイルスの宿主範囲と伝染リスク
鍵和田聡（法政大学）
４. イネ縞葉枯ウイルスの多発要因の解明と新たな防除対策への取り組み
奥田 充（農研機構中央農業研究センター）
５. 青しその生産地におけるシソモザイクウイルスと媒介虫シソサビダニの発生生態
久保田健嗣（農研機構中央農業研究センター）

６. ダイズ栽培化で選抜されたかもしれないクローバ葉脈黄化ウイルス抵抗性ついて
中原健二（北海道大学）
７. トランスジェニックモデル植物を用いた植物ウイルス病発症機構の解析小林括平（愛媛大学）
８. 植物 RNA ウイルスの複製機構
兵頭 究（岡山大学）
９. テンサイ黄化病とニンジン黄化病に関与するウイルスの生物学的・遺伝的特性
吉田直人（ホクレン農業総合研究所）
10. ポストゲノム時代の病原ウイルス探索の現状と課題
関根健太郎（琉球大学）

植物生体膜シンポジウム：植物の光応答と物質輸送のダイナミズム
日程：2018年9月14日
場所：広島国際会議場
オーガナイザー：森 泉・且原真木（岡山大学・植物研）・村田芳行（岡山大学・環境生命）
１. 植物における光・ホルモン応答と生体膜機能
飯野盛利（大阪市立大学）
２. 生体膜で輝く分子：プロトンポンプと Ca 情報変換分子から見えてきたこと
前島正義（名古屋大学）

ネオウイルス学ミニシンポジウム I
日程: 2018 年 9 月 20 日
場所: 岡山大学資源植物科学研究所
オーガナイザー：鈴木信弘（岡山大学・植物研）
１. モデル糸状菌アカパンカビとマイコウイルスの実験系の構築
本田信治（福井大学）
２. アカパンカビの siRNA 生成酵素 DCL2 の生化学的解析
田原 緑（東京農工大学）
３. 星咲き品種ペチュニアにおける内在性ウイルス制御機構と RNA 干渉機構の関係
栗山和典（東京農工大学）
４. 植物病原性 Verticillium 属菌の RNA ウイルス宮下脩平（東北大学）
５. Investigation of hostrange of and host defense against a mitochondrially replicating mitovirus
Sabitree Shahi（IPSR, Okayama University）
６. Natural variation insusceptibility to viruses in the chestnut blight fungus
Annisa Aulia （IPSR, Okayama University）
７. Mutationalanalysis of yado-kari virus 1
Subha Das（IPSR, Okayama University）
８. フザリウム属菌から分離された新規 Tymovirus 様マイコウイルス
千葉壮太郎（名古屋大学）

バイオリソースと育種学のこれからを考える：NBRPリソースの活用事例からPerspectives on the use of bioresources in breeding sciences: Lessons from successful studies
日程：2018年9月22日
場所：日本育種学会第134回講演会・第3会場（岡山大学津島キャンパス）オーガナイザー：久野 裕（岡山大学・植物研）・佐藤 豊（遺伝研）・那須田周平（京大院・農）１. オオムギリソースの紹介（Resources of barley）
佐藤和広（岡山大学・植物研）
２. 標準になったオオムギ「標準品種」コレクション（The standard variety of barley collection）
小松田隆夫（農研機構・次世代作物セ）
３. NBRPイネリソースの紹介（Introduction to NBRP RICE resources）
佐藤 豊（遺伝研）
４. イネ育種における野生イネ利用の可能性（Potential of wild rice in rice breeding）
石川 亮1・宮崎直哉1・杉山昇平1・窪田芳生1・馬 建鋒2・石井尊生1（1神戸大院・農, 2岡山大学・植物研）
５. マメ科植物における基礎から応用研究のためのミヤコグサ・ダイズバイオリソース（Lotus and Glycine bioresources for basic and applied research in legumes）
橋口正嗣1・佐藤修正2・橋口拓勇1・田中秀典3・明石 良1, 3（1宮崎大・農, 2東北大院・生命, 3宮崎大・IR推進セ）
６. マメ科植物における窒素固定関連遺伝子SEN1の多型と表現型（Effect of polymorphism of SEN1 gene on symbiotic nitrogen fixation）
鈴木章弘1・江上由佳1・河野里実1・中尾隆寛1・千々岩諒汰1・中島菜摘1・原田克哉1・河済英紀1・渡邊啓史1・穴井豊昭1・菅沼教生2・有馬 進1（1佐賀大・農, 2愛教大・教育）
７．果実発達研究のための 'Micro-Tom-Japan' を基盤としたトマトバイオリソース（Tomato Bioresources based on ‘Micro-Tom-Japan’ to accelerate the fruit biology）
星川 健1・伊藤直子1・有泉 亨1・福田直也1・金山喜則2・久保康隆3・矢野健太郎3, 4・青木 考5・江面浩1（1筑波大・生命環境, 2東北大院・農, 3岡山大院・自然科学, 4明治大・農, 5大阪府大院・生命環境）
８．マイクロトム果実形成と品質維持における液胞輸送の役割（Function of vacuolar trafficking in fruit development of dwarf tomato cultivar 'Micro-Tom'）伊藤瑛海1・崔 勝媛1・星川 健2・溝口 剛2・江面 浩2（1国際基督教大・アーツ・サイエンス, 2筑波大・
生命環境）

一般社団法人 日本育種学会 2018 年秋期 岡山大学 ワークショップ
イネとオオムギのボタニカル・トーク(作物対話)：形態篇
日程：2018 年 9 月 22 日
場所：岡山大学一般教育棟
企画者：武田 真（岡山大学・植物研）・吉田 均（農研機構・生物機能利用研究部門）
はじめに

吉田

均

講演
１. イネとオオムギの形態の違い
武田 真 （岡山大学・資源植物科学研究所）
２. オオムギ細葉矮性変異体 narrow leafed dwarf1 の解析
吉川貴徳（京都大学・大学院農学研究科）
３. オオムギ半矮性自然変異体 uzu と brachytic 1 の植物生理学的特徴
本多一郎（前橋工科大学・工学部生物工学科)

４. イネにおける閉花受粉性の分子機構
吉田 均（農研機構・生物機能利用研究部門）
総合討論

武田

真・吉田

均

Japan-Finland Seminar 2018
-Shaping photosynthesis against climate change andtoward efficient water and nutrient managementSeptember 24 -27, 2018
Venue: Ikuta Shrine Hall (Kobe, Japan)
Organizers: Wataru Sakamoto (IPSR, Okayama University), Eva-Mari Aro (University of Turku)
Session I: Shaping Photosynthesis: Water Splitting and Electron Transport
1. Molecular mechanism of photosynthetic water oxidation
Jian-Ren Shen (Okayama University)
2. The specific roles of photosystem II and photosystem I in chloroplast signalling
Eva-Mari Aro (University of Turku)
3. Machinery and function of pmf regulation
Toshiharu Shikanai (Kyoto University)
4. Photosystem I complex assembly
Yuichiro Takahashi (Okayama University)
5. Acetylation in regulation of photosynthetic reactions
Paula Mulo (University of Turku)
Session II: Shaping Photosynthesis: Regulatory Mechanisms
1. Chloroplasts thioredoxin systems: Regulation of photosynthesis under fluctuating light
Eevi Rintamaki (University of Turku)
2. Dark metabolism probed by chlorophyll fluorescence
Kintake Sonoike (Waseda University)
3. Multiple roles of light-harvesting-like proteins in the regulation and maintenance of the photosynthetic machinery
Ryouichi Tanaka (Hokkaido University)
4. Investigation of S/T/Y phosphorylation signalling network in cyanobacteria
Natalia Battchikova (University of Turku)
5. Roles of lipids in photosynthesis
Hajime Wada (The University of Tokyo)
6. Use of PSI inhibition tool: The effect of PSI photoinhibition for excitation energy and electron transfer andretrograde signaling
Mikko Tikkanen (University of Turku)
7. Effects of visible light wavelengths on the plastoquinone pool: state transitions and gene regulation
Heta Mattila (University of Turku)
Session III: Integrating Photosynthesis: Cellular Orchestration
1. Role of translational regulation in the repair of photosystem II
Yoshitaka Nishiyama (Saitama University)
2. Molecular aspects of CO2-concentrating mechanism in marine diatoms
Yusuke Matsuda (Kwansei Gakuin University)
3. Light as a modulator of plant secondary metabolism
Saijaliisa Kangasjärvi (University of Turku)

4.
5.

6.
7.

NAD(P)(H) metabolism and photosynthesis
Maki Kawai-Yamada (Saitama University)
Post-translational modifications and dynamics of thylakoid proteins in Arabidopsis: what we have learned using atargeted proteomics approach
Andrea Trotta (University of Turku)
Role of cyclic electron transport around photosystem I in C4 Flaveria bidentis
Yuri N. Munekage (Kwansei Gakuin University)
Quick detection of viruses in photosynthetic organisms
Jari Valkonen (University of Helsinki)

Session IV: Challenge toward Climate Change: Stress Response and Signaling
1. Molecular mechanism of blue light signaling for stomatal opening
Atsushi Takemiya (Yamaguchi University)
2. Coordination of Chloroplastic and Mitochondrial retrograde signaling
Jaakko Kangasjarvi (University of Helsinki)
3. Differential roles of abscisic acid receptors in stomatal regulation
Izumi Mori (IPSR, Okayama University)
4. The role of reactive oxygen species in receptor-like kinase signaling
Michael Wrzaczek (University of Helsinki)
5. Regulation of Plant Development, Stress Responses and Programmed Cell Death by the ROS-Ca2+ Signal Network
Kazuyuki Kuchitsu (Tokyo University of Science)
Session V: Challenge toward Climate Change: Environmental Adaptation and Development
1. Harnessing transcription for bioproduction in cyanobacteria
Taina Tyystjarvi (University of Turku)
2. Information processing from light reaction to gene expression in cyanobacteria
Kan Tanaka (Tokyo Institute of Technology)
3. Ray parenchymal cells actively contribute to lignification of tracheids in developing xylem of Norway spruce
Kurt Fagerstedt (University of Helsinki)
4. Developmentally and stress controlled stilbene biosynthesis in Scots pine
Teemu Teeri (University of Helsinki)
5. Regulation of leaf nitrogen metabolism at the posttranslational level by ACR11
Atsushi Takabayashi (Hokkaido University)
6. De novo transcriptome of Bilberry a tool for development related studies
Hely Haggman (University of Oulu)
7. Selective turnover of photodamaged chloroplasts by autophagy
Masanori Izumi (Tohoku University)
8. The Arabidopsis MILDEW LOCUS O2 integrates pathogen response, abiotic stress, and reactive oxygen species
signaling
Kirk Overmyer (University of Helsinki)
9. Chloroplast DNA degradation serving as nutrient reservoir in plants
Wataru Sakamoto (IPSR, Okayama University)
Session VI: Engineering and Systems Biology
1. New approach for sustained hydrogen production by microalgae
Sergey Kosourov (University of Turku)
2. Photosynthetic production of sorbitol: Engineering of carbon flow and NADPH supply and discovery of sorbitol6-phosphatase
Masahiko Ikeuchi (The University of Tokyo)

3.
4.
5.

Cyanobacteria platform for production of high-value chemicals
Kaarina Sivonen (University of Helsinki)
Versatile templates from cellulose nanofibrils for photosynthetic microbial chemical production
Yagut Allahverdiyeva-Rinne (University of Turku)
Redirecting photosynthetic electron flux to product formation in the cyanobacterium Synechocystis
Pauli Kallio (University of Turku)

Session VII: Poster Session by Young Scientists
1. Roles of galactolipids in plastid development during skotomorphogenesis to photomorphogenesis
Koichi Kobayashi (Osaka Pref. University)
2. Regulation of FtsH function in Photosystem II repair cycle
Yusuke Kato (IPSR, Okayama University)
3. Roles of thioredoxin-dependent redox regulation in photosynthesis
Yuki Okegawa (Kyoto Sangyo University)
4. Role of translation factor EF-Tu in the response of photosynthesis to photo-oxidative stress
Haruhiko Jimbo (The University of Tokyo)
5. Physiological role of organelle DNA degradation by DPD1 during starvation
Tsuneaki Takami (IPSR, Okayama University)
6. Structure of aquatic chloroplast enabling CO2-concentrating mechanism
Yoshinori Tsuji (Kwansei Gakuin University)
7. Regulation mechanism of photodamage-induced chlorophagy
Sakuya Nakamura (Tohoku University)
8. Critical roles of autophagy and ROS in the regulation of tapetal programmed cell death in rice
Takamitsu Kurusu (Suwa University of Science)
9. Analysis of photosynthesis and photoinhibition according to intracellular circadian rhythm in a cyanobacterium
Synechococcus elongatus PCC 7942
Tatsuhiro Tsurumaki (Tokyo Institute of Technology.)
10. C4-photosynthetic caracters in F2 hybrids between Flaveria floridana (C3-C4) and Flaveria brownii (C4-like)
Yukimi Y. Taniguchi (Kwansei Gakuin University)
11. Contribution of cyclic electron flow around photosystem I to C4 photosymthesis in Flaveria bidentis
Takako Ogawa (Kwansei Gakuin University)
12. Function of thylakoidal anion transporters in the marine diatom, Thalassiosira pseudonana
Ryousuke Amano (Kwansei Gakuin University)
13. Function of thylakoidal anion transporters in the marine diatom, Phaeodactylum tricornutum
Kansei Yamagishi (Kwansei Gakuin University)
14. Genetic identification of factors for extracellular cellulose accumulation in the thermophilic cyanobacterium
Thermosynechococcus vulcanus: proposal of a novel tripartite secretion system
Kaisei Maeda (The University of Tokyo)

13th International dsRNA Symposium
Workshop 1b: Viral Diversity
September 24-28, 2018
Venue: Vayamundo Houffalize, Belgium
Organizers: Andrej Steyer (University of Ljubljana), Nobuhiro Suzuki（IPSR, Okayama University）
1.

Evolution in the Family Partitiviridae and Novel Aspects of the Polymerases
Marilyn J Roossinck (Penn State University)

2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

Bluetongue virus replication in culicoides cells increases the number of genetic variants in the viral population
Joseph Hughes (MRC- University of Glasgow)
Impact of host microbiota on enteric RNA virus evolution.
Andrea Kaup Erickson (University of Texas Southwestern Medical Center)
The Reovirales a new taxonomic order: families Sedoreoviridae and Spinareoviridae
Houssam Attoui (INRA-ANSES-ENVA)
BTV-GLUE: A web-based bioinformatics resource for bluetongue virus sequence data
Kyriaki Nomikou (MRC- University of Glasgow)
Rotavirus species tropism: new insights on P-type classification
Samuel Miño (Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria)
Exploring the diversity and dynamics of the gut virome of infants during the first year of life
Leen Beller (Katholieke Universiteit Leuven)
Piscine orthoreovirus (PRV); in vivo propagation in erythrocytes enables virus purification, causality to importantdisease in farmed Atlantic salmon and protection by inactivated vaccineØystein Wessel (Norwegian University of Life Sciences)

平成 30 年度岡山大学資源植物科学研究所公開講座プログラム（倉敷市大学連携講座）
日程：2018 年 10 月 13 日
場所：岡山大学資源植物科学研究所
１. 植物ホルモンは魔法のクスリ
力石和英（岡山大学・植物研）
２. 大発見！葉っぱに潜む微生物の意外な働き
谷 明生（岡山大学・植物研）

International Neovirology Mini-symposium Series III
October 26 - 27, 2018
Venue: IPSR, Okayama University
Organizer: Nobuhiro Suzuki（IPSR, Okayama University）
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

Chloroviruses as Chemotactic AgentsDavid Duniagan (University of Nebraska-Lincoln)
Mutational analyses of Yado-kari virus 1associated with Yado-nushi virus 1
Subha Das (IPSR, OkayamaUniversity)
Dicer functions transcriptionally and posttranscriptionally in a multilayer antiviral defense
Ida Bagus Andika (IPSR, Okayama University)
Characterization of a novel polymycovirus with a potential neo-lifestyle
Yukiyo Sato (IPSR, Okayama University)
Hijacking a host ROS-generating machinery by a plant RNA virus for its replication
Kiwamu Hyodo (IPSR, Okayama University
Widespread endogenization of a novel virga/nege-like virus group into insect genomes
Hideki Kondo (IPSR, Okayama University)
Two related mycoreoviruses behave differently in the chestnut blight fungus, Cryphonectria parasitica
Annisa Aulia (IPSR, Okayama University)

8.

Diversity of partitiviruses isolated from the white root rot fungus, Rosellinia necatrix
Paul Telegech (IPSR, Okayama University)
9. Investigation of host range of and host defense against a mitochondrially replicating mitovirus
Sabitree Shahi (IPSR, Okayama University)
10. Origins and Evolution of the Global RNA Virome
Valeriane Dolja (Oregon State University)
11. The diversity and evolution of RNA viruses
Yongzheng Zhang (CDC China)

Neo-virology: The diversity of viruses on the earth
October 28, 2018
Venue: KYOTO TERRSA
Organizers: Keizo Nagasaki (Kochi University), Nobuhiro Suzuki（IPSR, Okayama University）
1.
2.
3.
4.
5.

The diversity and evolution of RNA viruses
Yongzheng Zhang (CDC China)
New Concepts in Virus Population Dynamics
David Duniagan (University of Nebraska-Lincoln)
The first evidence of natural cross kingdom virus infection from a plant to a fungus
Ida Bagus Andika (IPSR, Okayama University)
Viruses from ticks, mosquitoes, animals and humanKen Maeda (Yamaguchi University）
Origins and Evolution of the Global RNA Virome
Valerian Vladimirovich Dolja (Oregon State University）

International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis
November 7-10, 2018
Venue: Kurashiki Kokusai Hotel (Nov. 7), Kurashiki Civic Hall (Nov. 8-10)
Organizers: Wataru Sakamoto (IPSR, Okayama University), Toshiharu Shikanai (Kyoto University),
Yuichiro Takahashi (Okayama University), Hsou-min Li (Institute of Molecular Biology, Academia Sinica),
Micheal Hippler (University of Muenster), Stefan Hörtensteiner (University of Zurich)
Plenary lectures
1. Mitochondrial biogenesis: machineries and pathways
Toshiya Endo (Kyoto sangyo University)
2. Transport system of mineral elements in plants: from soil to the seeds
Jian Feng Ma (IPSR, Okayama University)
Sesson 1 Photosynthetic Machineries: Structure and Assembly
1. Structural biological studies of photosynthetic membrane-protein complexes
Jian-Ren Shen (Okayama University)
2. Structural atlas of the electron transfer complexs of ferredoxin and its partner protein
Genji Kurisu (Osaka University)
3. Photosynthetic reaction centers - Robustness with increased complexity
Nathan Nelson (Tel Aviv University)
4. Structure and assembly of photosystem I complex
Yuichiro Takahashi (Okayama University)

Session 2 Mechanisms of Photsynthetic Regulation I
1. Photoacclimation in Chlamydomonas reinhardtiia
Roberta Croce (Vrije Universiteit Amsterdam)
2. Algal photoprotection: Mechanism and signal transduction
Jun Minagawa (National Institute for Basic Biology)
3. Molecular players of sustained energy dissipation in plants
Alizée Malnoë (Umeå University)
Session 3 Mechanisms of Photsynthetic Regulation II
1. Redox regulation machineries in photosynthetic organisms
Toru Hisabori (Tokyo Institute of Technology)
2. Regulation of photosnthesis via calredoxin: New insights into a calcium-regulated chloroplast thioredoxin
Michael Hippler (University of Münster)
3. Regulatory network of photosynthetic electron transport
Toshiharu Shikanai (Kyoto University)
Session 4 Gene Expression and Engineering
1. Engineering photosynthesis in C3 plants
Maureen R. Hanson (Cornell University)
2. Regulation and function of thylakoid protein phosphorylation in Arabidopsis and Chlamydomonas
Michel Goldschmidt-Clermont (University of Geneva)
3. Regulation of chloroplast translation by light
Alice Barkan (University of Oregon)
4. A systems view of chloroplast biogenesis
Ralph Bock (Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology)
5. Systems biology and metabolic engineering of photosynthetic organisms
Hiroshi Shimizu (Osaka University)
Session 5 Chloroplast Biogenesis I
1. Tic236 links the chloroplast outer and inner membrane translocons
Hsou-min Li (Institute of Molecular Biology, Academia Sinica)
2. Molecular machineries for chloroplast protein import and their evolution
Masato Nakai (Osaka University)
3. Protein import into chloroplasts and its regulation by the ubiquitinproteasome system
Paul Jarvis (University of Oxford)
Session 6 Chloroplast Biogenesis II
1. Evolutionary aspects of chlorophyll breakdown
Stefan Hörtensteiner (University of Zurich)
2. Revealing new structure and functions of the aquatic chloroplast bundling the photosystem and theCO2-concentrating mechanism
Yusuke Matsuda (Kwansei Gakuin University)
3. Mechanisms and significant of retrograde signaling in higher plants
Lixin Zhang (Institute of Botany, Chinese Academy of Science)
Session 7 Chloroplast Homeostasis
1. FtsH, a major housekeeping and regulatory protease of the thylakoid membrane
Catherine de Vitry (Sorbonne Université)

2.
3.

Oxidative PTM: a step toward deciphering ROS sensor residing in chlorplast
Chanhong Kim (Shanghai Center for Plant Stress Biology, Chinese Academy of Sciencs)
Chloroplast protein degradation and beyond: FtsH and a possible peptide export
Wataru Sakamoto (IPSR, Okayama University)

5 min presentation from poster session
1. Cryo-EM structures of diatom PSII-FCPII supercomplexes
Ryo Nagao (Okayama University)
2. Proton release and water incorporation in photosystem II
Keisuke Saito (The University of Tokyo)
3. Relaxation of QH1 (ROQH1) functions in sustained energy dissipation in Arabidopsis
Cynthia Amstutz (University of California, Berkeley)
4. Biochemical characterization of Photosystem I assembly apparatus in green alga Chlamydomonas reinhardtii
Nellaepalli Sreedhar (Okayama University)
5. Modification of excitation energy-transfer processes of the glaucophyte Cyanophora paradoxa in response todifferent light qualities
Yoshifumi Ueno (Kobe University)
6. The structure of PSI-LHCI complexes in Chlamydomonas reinhardtii and potential implications on photosynthetic
electron transport regulation
Laura Mosebach (University of Münster)
7. Structural analysis of the homodimeric photosynthetic reaction center from Helicobacterium modesticaldum
Tetsuko Nakaniwa (Osaka University)
8. Photosynthesis revisited by fluorescence ATP sensor
Boon Leong Lim (University of Hong Kong)
9. Role of Cyclin-dependent kinase-like protein in the accumulation of psbA transcripts in Chlamydomonas reinhardtii
Haruhiko Jimbo (The University of Tokyo)
10. Revisiting the origin of photosynthetic eukaryotes and eukaryotic photosynthesis
Shinichiro Maruyama (Tohoku University)
11. Identification of new molecular components supporting active carbon fixation by marine diatoms
Yoshinori Tsuji (Kwansei Gakuin University)
12. Chloroplast carbonic anhydrases function in photosynthesis and plant development
Kevin Hines (Cornell University)
13. Relationship between increased production of PHB and photosynthesis due to overexpression of ntcA in
Synechocystis sp. PCC 6803
Satomi Arisaka (Meiji University)
14. SUMOylation of TOC159 regulates chloroplast biogenesis in early plant development
Sonia Accossato (University of Neuchâtel)15. Selective chlorophagy – microautophagic removal of membrane-damaged chloroplasts
Sakuya Nakamura (Tohoku University)
16. VIPP1, the membrane integrity-maintaining protein in chloroplasts, has GTPase activity in vitro
Norikazu Ohnishi (IPSR, Okayama University)
17. Role of phosphorylation of chloroplast Ca2+ binding protein CAS in the regulation of stomatal movement
Yuna Uemura (Kyoto Prefectural University)

共同利用・共同研究ワークショップ「植物・微生物相互作用ワークショップ」
日程：2018年11月21日
場所：岡山大学資源植物科学研究所
オーガナイザー：兵頭 究（岡山大学・植物研）・新屋友規（岡山大学・植物研）
１. 細胞表層パターン認識受容体を介した免疫シグナル伝達
出﨑能丈（東京理科大学・基礎工学部）
２. 糖を巡る植物－病原菌間の攻防の分子メカニズムを探る－糖トランスポーター制御を介した植物の防御戦略－
山田晃嗣（徳島大学・大学院社会産業理工学研究部）
３. 病原菌エフェクターと植物免疫の攻防を分子レベルで紐解く
山口公志（近畿大学・農学部）
４. エフェクター誘導性免疫によるダイズ遺伝型特異的な根粒共生不全
菅原雅之（東北大学・大学院生命科学研究科）
５. 植物と根圏微生物群の協調的及び拮抗的相互作用機構
晝間 敬（奈良先端科学技術大学院大学・バイオサイエンス領域）

学会賞等 (Awards)
植物ストレス学グループ，黄 勝（博士後期課程 2 年）
，16th International Symposium on Rice Functional Genomics,
Best Posters Prize, 9 月 5-7 日（東京），2018.
植物ストレス学グループ，横正健剛（助教），第 37 回日本土壌肥料学会奨励賞，10 月 19 日，2018.
植物・微生物相互作用グループ, 佐藤有希代（特別契約職員）, ベスト・ポスタープレゼンテーション賞, 「ネオウイルス学」第 5 回領域班会議（淡路）,「ネオライフスタイル（裸性）を持つ可能性がある新規
ポリマイコウイルスの同定」, 11 月 11-13 日，2018.

共同研究リスト（共同利用・共同研究拠点事業） (List of Joint Projects at the Joint Usage/ Research Center)
所属機関・部局職課題名

課題名(英語名)

受入
教員名

名

氏

名

東北大学・大学院農学研究科

助教

山本

雅也

Study on effects of high-temperature growth
アブラナ科植物の自家不和合性形質が弱condition on self-incompatible response in
くなる高温条件に関する研究
Brassicaceae

坂本

大阪大学・大学院理学研究科

教授

高木

慎吾

Roles of actin-binding protein villin in organelle
ゼニゴケのオルガネラ動態、形態形成に
behavior and morphogenesis in Marchantia
おけるアクチン結合蛋白質ビリンの役割
polymorpha

坂本

京都産業大学・総合生命科学部

教授

寺地

徹

葉緑体形質転換用シャトルベクターを用 Production of stress-tolerant plants using shuttle
いたストレス耐性植物の作出
vector for chloroplast transformation

坂本･高見広島大学・大学院理学研究科

准教授

島田

裕士

CYO1/CYO2遺伝子高発現植物の光合成活 Analysis of photosynthesis in CY01/CY02 overexpression plants
性測定

坂本･高見

福岡県農林業総合試験場・生産
環境部

専門研究員

和田

卓也

Characterization of starch structure mutated rice
難消化性デンプンを保有するイネデンプ
strains with resistant starch focusing on endosperm
ン構造変異系統の胚乳特性解析
properties

松島

奈良先端科学技術大学院大学・
先端科学技術研究科

助教

大谷

美沙都

植物ストレス応答におけるsnRNAキャッ Elucidation of roles for snRNA cap modification inplant stress response
プ修飾制御の意義の解明

平山

国立高等専門学校機構・熊本高等専門学校・生物化学システム
工学科

准教授

木原

久美子

イグサの成長に影響を及ぼすストレス応 The growth response of mat rush（Juncus effuses ）答と植物ホルモンに関する研究
to environmental stress and plant hormone

平山

東京農工大学・大学院生物シス
テム応用科学府

准教授

梅澤

泰史

シロイヌナズナ種子におけるmRNA選択
的スプライシング制御の解析

A large-scale analysis of mRNA alternative splicing
patterns in Arabidopsis seeds

平山立命館大学・生命科学部

准教授

深尾

陽一朗

シロイヌナズナにおいて亜鉛欠乏時に機 Molecular mechanisms of peptides under zinc
能するペプチドの機能解析
deficiency in Arabidopsis

北海道大学・大学院理学研究院

助教

伊藤

秀臣

環境ストレス活性型転移因子を制御する Analysis of chromatin structures which regulate an
クロマチン構造の解析
environmental stress-activated transposon

池田 陽

神戸大学・大学院農学研究科

助教

石川

亮

野生イネ由来の種子亜鉛濃度を向上させ Breeding of high quality rice by a gene increasing
る遺伝子を用いた高機能性イネの育種
zinc concentration of the seed from wild rice馬森

所属機関・部局

職課題名

課題名(英語名)

受入
教員名

名

氏

名

奈良先端科学技術大学院大学・
先端科学技術研究科

助教

國枝

正

インドネシア在来イネのアルミニウムス Functional analysis of an aluminum tolerance gene in
トレス耐性遺伝子の機能解析
indonesian local rice

馬名古屋大学・大学院生命農学研
究科

准教授

白武

勝裕

接ぎ木によるトマト果実の高糖度化と低 Mechanism of increases of fruit Brix and cold stress
温ストレス耐性向上の機構解明
resistance in tomato by grafting馬

鳥取大学・農学部

助教

佐久間

俊

イネ科作物の花序形成に関する分子機構 Deciphering molecular mechanism of inflorescenceの解明
form in cereal grasses

馬・山地

農業・食品産業技術総合研究機
構・農業環境変動研究センター

研究員

櫻井

玄

作物におけるミネラル輸送の調節過程の Modeling of the regulation processes of the mineral
モデル解析
transportation in crops

馬・三谷

筑波大学・生命環境系

准教授

古川

純

モデル樹木ポプラにおけるカリウムチャ Localization analysis of potassium channel, SKOR,
ンネルＳＫＯＲの局在解析
in the model tree poplar

山地・馬名古屋大学・大学院理学研究科

講師

井上

晋一郎

気孔開口を制御する新規金属イオン輸送 Functional analysis of the novel metal transporter in
体の機能解析
stomatal opening

横正・馬奈良女子大学・研究院自然科学
系生物科学領域准教授

奈良シロイヌナズナの液胞膜アクアポリン
久美 AtTIP2;2の水及び過酸化水素透過性の測定信州大学・繊維学部准教授

堀江

広島大学・大学院生物圏科学研
究科

教授

和崎

岡山大学・大学院環境生命科学
研究科

助教

宗正

晋太郎

東京農工大学・大学院農学研究
院

教授

福原

敏行 クリ胴枯病菌のダイサーの生化学的解析

福井大学・学術研究員医学系部
門

助教

本田

モデル糸状菌アカパンカビを利用した植 Study of fugal plant pathogen/virus interactions in the
信治 物病原糸状菌とウイルスの相互作用の研
model filamentous fungi Neurospora crassa
究

Analysis of the water and hydrogen peroxide
permeability of AtTIP2;2 in Arabidopsis thaliana

且原

智明

Elucidation of the physiological function of ion
植物の塩ストレス耐性機構に関与するイ
channels that work in the mechanism of plant salt
オンチャンネル分子の生理機能の解明
tolerance

且原淳

低リン耐性の高い植物による有機酸分泌 Analyzes of molecular mechanisms involved inの分子機構の解析
organic acid exudation by low-P tolerant plants

佐々木

イオンチャネルを基盤とした環境ストレ Engineering crop stress resistance through
ス耐性作物作出技術の開発
manipulating ion channels

佐々木Biochemical characterization of Dicers in
Cryphonectria parasitica鈴木鈴木

所属機関・部局
東北大学・大学院農学研究科
名古屋大学・アジアサテライト
キャンパス学院

職課題名

課題名(英語名)

受入
教員名

名

氏

名

助教

宮下

脩平

RNAウイルスを用いたVerticillium属菌の Use of RNA viruses to control the pathogenicity ofVerticillium sp.
病原性制御

鈴木

特任准教授 千葉壮太郎

ヴァイロコントロール因子（菌類ウイル Mechanism underlying infection of virocontrolス）の宿主糸状菌感染機構
factors (mycoviruses) to host filamentous fungi鈴木Amine - mediated regulation of responses toherbivory in riceGalis

山形大学・農学部助教

網干

貴子 アミン類を介したイネの食害応答の解析

岡山大学・農学部

教授

久保

康隆

果実の低温誘導成熟機構の分子生物学的 Study on molecular mechanism of low-temperature
解析
induced fruit ripeningGalis

東京理科大学・基礎工学部

准教授

有村

源一郎

植物の害虫誘導性防御における分子シス Molecular mechanisms for induced plant defense
テムの解明
against herbivores

Galis・新屋東京大学・生物生産工学研究セ
ンター

准教授

岡田

憲典

植物の化学防御におけるオキシリピン情 Molecular mechanisms and evolutionary trajectory of
新屋・Galis
報伝達の分子機構とその進化
oxylipin signaling on chemical defense in plants

東京農工大学・大学院農学研究
院

教授

大川

泰一郎

オオムギの耐塩性QTLの単離に関する研
Identification of a QTL for salt tolerance in barley究佐藤

福井県立大学・生物資源学部

准教授

松岡

由浩

耐塩性研究のためのタルホコムギ水耕栽 Hydroponics of Aegilops tauschii for salinity
培法の開発
tolerance studies

最相神戸大学・大学院農学研究科教授

土佐

オオムギのいもち病抵抗性遺伝子Rmo2ア Cloning of Rmo2 alleles conditioning resistance of
幸雄 リルのクローニングと対応する非病原力 barley to Pyricularia oryzae and analyses of their
遺伝子との相互作用解析
interaction with corresponding avirulence genes

久野・佐藤

京都大学・大学院農学研究科

助教

吉川 貴徳

オオムギおよびイネの細葉変異体および Comparative molecular genetic analysis of narrow
多節矮性変異体の比較分子遺伝学的解析 leaf and plastochron mutants between barley and rice武田

鳥取大学・農学部

教授

石原

亨

Analysis of defensive secondary metabolism and its
抵抗性育種を志向したオオムギにおける
diversity in barley as the basis of breeding of
防御関連二次代謝とその多様性の解明
resistant lines against pathogens and herbivores

武田

龍谷大学・農学部

教授

古本

強

オオムギ温度不感受変異系統の遺伝解析

Genetic Analysis of Barley Resources for
Temperature Adaptation

武田・佐藤所属機関・部局

職

名

氏

名

課題名

課題名(英語名)

受入
教員名

信州大学・山岳科学研究所准教授

髙梨 功次郎

マメ科高山植物－根粒菌共生系の分布変 Historical biogeography and host specificity of
遷と宿主特異性symbiosis between alpine legumes and rhizobia

池田 啓

熊本大学・大学院先端科学研究
部

准教授

藤井

紀行

大陸系遺存植物の遺伝資源としての多様 Genetic diversity of plant species representing the
性の解析
continental-grassland relicts

池田 啓

首都大学東京・理工学研究科

教授

岡本

龍史

異質倍数性受精卵の発生過程における染 Dynamics of chromosome during development of
色体動態
allopolyploid zygote

長岐

名古屋大学・生物機能開発利用
研究センター

助教永井啓祐

イネ突然変異系統を用いた湛水耐性機構 Elucidation of water logging tolerance of rice usingの解明と育種的応用
mutant library and application for agriculture

前川

情報・システム研究機構・国立遺伝学研究所

准教授

野々村

賢一

イネnDARTタグラインを用いた生殖関連 The analysis of reproduction-related mutants selectedfrom nDART-tagged lines in rice
突然変異体の選抜と解析

前川自然科学研究機構・基礎生物学
研究所

助教

栂根

一夫

DNAトランスポゾンnDart1の挿入による Analysis of dominant mutations induced by insertionof DNA transposon,nDart1 in rice
優性変異の解析前川

前川

北海道大学・大学院農学研究院

教授

橋床Genetic trait and symbiotic mechanisms of the low
イネ内生窒素固定細菌Burkholderia
kururiensisが低窒素耐性アフリカイネ交雑 nitrogen-tolerant,African wild rice hybrid LIA-1 with泰之
後代系統イネLIA-1の宿主になる理由を受 endophytic nitrogen-fixing bacterium Burkholderia
kururiensis
容体タンパクとイネゲノムに求める

名古屋大学・大学院生命農学研
究科

准教授

伊藤

正樹

イネ科植物におけるDNA倍加の制御に関 Study on regulation of endoreplication in species
within the grass family
する研究

前川・佐藤

岡山大学・大学院ヘルスシステ
ム統合科学研究科

准教授

佐藤あやの

ヘテロシグマへの効果的な遺伝子導入方 Optimization of gene transfection methods for a法の開発
bloom forming alga, Heterosigma akashiwo

植木拠点事業以外の共同研究(国内)(List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage /Research Center (Domestic ))
所属機関
・部局

共同研究者名・職名

共同研究課題名

概要

受入研究者名岡山大学・異分野基礎
高橋裕一郎・教授
科学研究所

チラコイド膜リン酸化タンパク質の解析

シロイヌナズナ・クラミドモナス等のチラコイド膜
タンパク質リン酸化を質量分析により解析する

坂本 亘・加藤裕介

東京大学・先端科学技 石北 央・教授
術研究センター斎藤圭亮・助教

D1タンパク質酸化修飾のモデル構造解析

光阻害におけるD1の酸化修飾による光化学系IIの安定性を構造モデルにより検討する

坂本 亘・加藤裕介

大阪大学・情報科学研究科

清水 浩・教授

チラコイド膜タンパク質の質量分析による タンデム型LC質量分析装置によるチラコイド膜タン定量化
パク質の定量化

坂本 亘・加藤裕介

東京工業大学・
化学生命科学研究所

久堀 徹・教授

葉緑体FoF1ATPaseのリン酸化

Phos-tagを用いた葉緑体ATPaseのリン酸化サブユ
ニットの検出坂本 亘・加藤裕介

東京大学
堤 伸浩・教授
・農学生命科学研究科

ソルガム有用形質QTLの解析

たかきび由来RILを用いた有用形質QTLの検出とゲノ
ム解析による遺伝子同定

坂本 亘

広島大学・理学研究科 草場 信・教授

イネDPD1変異体の解析

CRISPR-CAS9を用いたイネへの変異導入法によるDPD1
ヌクレアーゼ欠失変異体の作出と解析

坂本 亘

神戸大学・理学研究科 三村徹郎・教授

ポプラの落葉におけるオルガネラDNA分解

ポプラの落葉におけるオルガネラDNA分解作用とDPD1
ヌクレアーゼとの関連性を野外サンプルを用いて解析

坂本 亘

東北大学・学際科学フ
泉 正範・助教
ロンティア研究所

クロロファジーによる光阻害を受けた葉緑 VIPP1タンパク質変異体を用いたクロロファジー現象
体の分解
の検証

坂本 亘

東京大学・
農学生命科学研究科

岩田洋佳・准教授

画像解析によるソルガムQTLの解析

たかきび由来RILを用いた画像解析とQTL解析および遺伝子の同定坂本 亘

東京大学・
農学生命科学研究科

藤原 徹・教授

ソルガムの木質化とバイオコールの開発利 ソルガムのネットワーク解析による木質化とペレッ用ト作成に関する共同研究坂本 亘

秋田県立大学大学院・
藤田直子・教授
生物資源科学研究科

澱粉粒の形状に異常を示す突然変異体の解の突然変異体の解析を行っている。澱粉物性の測定ならび
析
に顕微鏡観察を分担して行っている

双方が独自に単離したデンプン粒の形状に異常を示すイネ

松島 良

所属機関
・部局

共同研究者名・職名

共同研究課題名

概要

受入研究者名京都府立大学・生命環
境科学部・農学生命科 板井章浩・教授
学科

ニホンナシのキセニア現象に関する研究

キセニアによるニホンナシの肥大に関わる因子を解
明する

平山隆志

熊本高専・生物化学シ 木原久美子
ステム工学科・准教授

イグサの栽培化と畳の起源の解明

イグサの花茎伸長に関与する植物ホルモンの探索平山隆志

農研機構・次世代作物 西村宣之
開発研究センター
・主任研究員

発芽制御機能の解明

発芽制御に関わる制御機構の解明を目指す研究

平山隆志

東京大学・
理学系研究科

側根形成に関わるミトコンドリアRNAプロ
セッシング因子の解析

側根形成に関わるミトコンドリアRNAプロセッシング
因子の解析

平山隆志

杉山宗隆・准教授

横浜市立大学・植物遺辻 寛之・准教授
伝資源部門

データ科学に基づく作物設計基盤技術の構圃場オオムギの生長動態解析
築平山隆志

名古屋工業大学・情報工学教育類メディ 梅崎太造・教授
ア情報分野

データ科学に基づく作物設計基盤技術の構
圃場植物の画像解析手法の開発
築

平山隆志

高知大学，
株式会社林原ナス科作物へのトレハロースの影響に関す トレハロースによるナス科の短花柱花の割合の抑制る研究の機構を解明する

西村安代・准教授
その他

平山隆志・森 泉

大阪大学・理学研究科 高木慎吾・教授

アズキ緑化上胚軸の回旋運動における植物 アズキの回旋伸長運動における植物ホルモンの動態
ホルモンの役割に関する研究
を解明する

森

泉

宮崎大学・植物生産環
稲葉丈人・准教授
境科学科

合成生物学的手法を用いた高効率CO2流入 合成生物学的手法を用い，高効率CO2流入経路を構築
経路の構築とそれに基づく光合成能の改良 することにより光合成能を改良した植物を作出する

森

泉

マスカットオブアレキサンドリアの軸ぶく マスカットオブアレキサンドリアの軸ぶくれ障害のれ障害の解決に関する研究
原因を解明する

森

泉

森

泉

森

泉

森

泉

株式会社平本農園
河西ぶどう園他

平本純大・社長
他 他船穂町のブドウ農家
河西康宏・専務
他きびじ農業後継者クラブ会員等

岡山大学・大学院自然 村田芳行・教授，
科学研究科
宗正晋太郎・助教
岡山大学・大学院自然久保康隆・教授
科学研究科

ブドウ（ピオーネ）の加温ハウス栽培における二酸
ブドウ（ピオーネ）の加温ハウス栽培にお化炭素施肥の効果の検証およびその作用機作を解明
ける二酸化炭素施肥の効果に関する研究する
サリチル酸，イソチオシアネート，光，アブシシン
気孔の環境応答に関する研究
酸，ジャスモン酸による気孔閉口に関与する信号伝達機構を解明する
洋ナシ果実の軟化における植物ホルモンの 洋ナシの軟化の温度依存性における植物ホルモンの動態の解析
動態を解明する

所属機関
・部局

共同研究者名・職名

共同研究課題名

概要

受入研究者名岡山大学・大学院環境後藤丹十郎・教授
生命科学研究科

環境要因によるシクラメン花柄の徒長機構 夜温および日照不足によるシクラメンの花茎の徒長の解明に関する研究に関わる植物ホルモンの動態を解明する

森泉

岡山大学・大学院環境 平井儀彦・准教授，
村田芳行・教授
生命科学研究科

イネのカドミウム吸収に関する研究

イネのアポプラスチックバイパスフローによるカドミウムの導管負荷現象を解析する

森

泉

温湯消毒処理による水稲種子の低温発芽促 高温処理による水稲の発芽促進に関与する因子を解
進効果の分子機構の解析
明する

森

泉

難発芽性モモ台木の種子発芽促進に関する 難発芽性モモ台木を効率よく発芽させる処理方法を研究開発しその作用機作を解明する

森泉

北海道農業研究セン
提箸祥幸
ター・作物開発研究領・主任研究員域
岡山県農林水産総合セ
荒木有朋・研究員,
ンター，岡山大学・環
福田文男・准教授
境生命科学研究科
京都府立大学・
生命環境科学研究科

武田征士・准教授,
ゴール（虫こぶ）形成機構に関わる研究
大島一正・准教授

ゴール（虫こぶ）形成に関わる植物ホルモンを同定
する

池田陽子

河内孝之・教授,
京都大学・大学院生命
西浜竜一・准教授, ゼニゴケDNAメチル化制御機構の解析
科学研究科
山岡尚平・准教授

ゼニゴケDNAメチル化制御機構についてゲノム編集による変異体を作成し解析する

池田陽子

近畿大学・生物工学科 大和勝幸・教授

ゼニゴケDNAメチル化制御機構の解析

同上

池田陽子

基礎生物学研究所・進星野 敦・助教
化多様性生物学領域

作物におけるエピゲノム編集技術の開発

作物においてゲノム編集法に基づくDNAメチル化の書換え技術を開発する

池田陽子

長岡技術科学大学大学
西村泰介・准教授
院・工学(系)研究科

作物におけるエピゲノム編集技術の開発

同上

池田陽子

北海道大学・
水産科学研究科

三上浩司・准教授

海藻におけるストレス応答のエピジェネ
ティック制御海藻におけるストレス応答に関わるヒストン修飾変化等のエピジェネティック制御を明らかにする

京都大学・
大学院農学研究科

山根久代・准教授

リンゴの休眠に関わる植物ホルモンの解析 リンゴの休眠に関わる植物ホルモンを同定する

東京大学・
農学生命科学研究科

吉田

種子フェチン酸の解析

薫・教授

イネ種子中のフェチン酸の測定

池田陽子・平山隆志
池田陽子・平山隆志
馬

建鋒

所属機関
・部局

共同研究者名・職名

共同研究課題名

概要

受入研究者名神戸大学・大学院理学研究科

三村徹郎・教授

植物のリン酸輸体の研究

シャジクモ節間細胞から単離した細胞膜リン酸輸送体の遺伝子を、アフリカツメガエル未受精卵に入れ、その共役輸送イオンの同定を行った

且原真木

北川科学総合研究所

北川良親
・代表社員

低分子化合物輸送性アクアポリンの研究

アフリカツメガエル卵母細胞を使ってアクアポリンの低分子化合物に対する輸送活性を調べる

且原真木

神戸大学・
大学院農学研究科

中屋敷 均・教授

イネいもち病菌のRNA サイレンシング

イネいもち病菌にはAGOタンパク質が３つあるが、その中の一つAGO2の機能解析を進める

鈴木信弘

エチオピア産Fusarium 属菌の解析

エチオピア産Fusarium spp.に感染しているウイルスの宿主菌への影響の解明

鈴木信弘

NARO 果樹茶業研究部
八重樫 元・研究員 白紋羽病菌のRNAサイレンシング
門・リンゴ研究領域

パルティティウイルスに対するRNAサイレンシング機
構の解明

鈴木信弘

NARO 果樹茶業研究部
兼松聡子・室長門・リンゴ研究領域

白紋羽病菌のウイルスの探索

日本産白紋羽病菌のウイルスの性格付け

鈴木信弘

大阪大学・
タンパク質研究所

宮崎直幸・助教

メガビルナウイルスの構造解析

メガビルナウイルスのクライオ電子顕微鏡観察によ
る構造解析

鈴木信弘

京都大学・
ウイルス研究所

朝長啓造・教授

内在化ウイルスの機能解析

真核生物の核内在化ウイルスの機能解析

鈴木信弘

岐阜大学・
須賀晴久・准教授
科学研究基盤センター

名古屋大学・大学院生
新規植物・昆虫アルファ様ウイルスの昆虫ゲノムへ
千葉壮太郎･准教授 生物ゲノムに存在するウイルス化石の解析
命農学研究科の内在化イベントの探索を行った

近藤秀樹

東京家政大学･
家政学部

藤森文啓･教授

菌類ウイルスハンティング

近藤秀樹

埼玉大学・
理工学研究科

小竹敬久・教授

植食性昆虫認識に関わる細胞壁由来エリシ クサシロキヨトウ食害認識に関わるイネ細胞壁由来
ターの解析
エリシターを解析する

Galis Ivan・
新屋友規

植食性昆虫認識に関わるデンジャーシグナ イネを食害するクサシロキヨトウ認識に関わるデン
ルの解析ジャーシグナルを解析する

Galis Ivan・
新屋友規

奈良先端科学技術大学
院大学・バイオサイエ 西條雄介・准教授
ンス領域

有用糸状菌類のウイルスを探索、新規ウイルスについてはその特徴付けを行っている

所属機関
・部局

共同研究者名・職名

共同研究課題名

概要

受入研究者名岡山理科大学・理学部 三井亮司・教授

メチロトロフ細菌のランタノイド依存性メ モデル細菌を用いたメタノール資化経路に関わる酵
タノール代謝素のランタノイド依存性に関する研究

谷 明生

岐阜大学・
応用生物科学部

中川智行・教授

メチロトロフ細菌のランタノイド依存性酵 モデル細菌を用いたメタノール代謝に関わるランタ
素
ノイド依存性酵素の特性に関する研究

谷 明生

神戸大学・農学部

宅見薫雄・教授

形質転換オオムギを用いた環境適応性に関 コムギ細胞外排出シグナルと乾燥誘導性プロモーする研究ターを導入したオオムギの解析

久野 裕・佐藤和広

神戸大学・農学部

宅見薫雄・教授

オオムギRNA-Seq法のコムギ解析への応用

東京大学・農学部

高梨秀樹・助教

オオムギの形態形成に関わる遺伝子の機能 ソルガムで見いだされた花器の形態形成に関わる遺解析
伝子の機能解析久野 裕・坂本 亘

京都大学・農学部

吉川貴徳・助教

オオムギの形態形成に関わる遺伝子の機能
オオムギの穂の形態形成に関わる遺伝子機能の解析
解析

久野 裕・武田 真

京都大学・農学部

岩上哲史・助教

オオムギにおける除草剤成分に対する応答

除草剤の成分に応答する遺伝子を機能低下させたオ
オムギの作出久野 裕・佐藤和広

秋田県立大学大学院・
高橋秀和・准教授
生物資源科学研究科

イネ紫米発現制御遺伝子の解析

イネの玄米にアントシアニンを抑制的に発現させる遺伝子の解明を行う

前川雅彦

愛媛大学・農学部

八丈野 孝・准教授

形質転換オオムギを用いたうどんこ病抵抗 オオムギの形質転換体を用いて、うどんこ病菌の感性に関する研究
染時の生理現象について調査している

久野裕・松島 良・近藤秀樹
・三谷奈見季

岡山大学・農学部

能年義輝・准教授

オオムギと紋枯病菌の感染生理学的研究

オオムギ遺伝資源を用いて、紋枯病菌に対する抵抗性の評価を行っている。

久野裕・松島 良・近藤秀樹
・三谷奈見季高温障害耐性オオムギの作出

高温障害による不稔を克服するためのオオムギ形質転換体を作成している

久野裕・松島 良・近藤秀樹
・三谷奈見季東京農工大学・グローバ
笠原博幸・教授
ルイノベーション研究院

信州大学・繊維学部

堀江智明
・准教授

コムギの遺伝子配列取得にオオムギで確立したRNASeq解析法を応用する

気候変動に伴う土壌劣化に対応する穀類耐 オオムギ遺伝資源を用いた耐塩性機構の理解と新規性品種開発
耐塩性遺伝資源探索を実施している佐藤和広

最相大輔・且原真木

拠点事業以外の共同研究 （国際）(List of Collaborations besides the Joint Projects at the Joint Usage /Research Center (International ))Researcher's Name,
Title

Subject of collaborative
research

Shanghai Center for Plant
Stress Biology, Chinese
Academy of Sciences

Chanhong Kim,
Principal Investigator

Characterization ofphotodamaged D1 in the
Photosystem II repair cycle

Specific oxidation of amino acid residues in D1 protein is being
characterized by mass spectrometry

坂本

亘International LivestockResearch Institute

Josiah Musembi Mutuku, Development of bio-pellets
Researcher
using sorghum

Establishment of collaborative platform for sorghum field tests in
Kakamega, Kenya

坂本

亘

Lingang Zhang,
Professor

Characterization of GTPase
activity in VIPP1 protein

GTP-hydrolysis activity detected in VIPP1 protein in vitro is being
characterized

坂本

亘

Cathrine de Vitry,
Senior Researcher

Influence of FtsH inoxidataed D1 protein in
Chlamydomonas

Degradation of D1 reaction center protein is being characterized in
Chmamydomonas ftsh mutant

坂本 亘・
加藤裕介

コショウ果実登熟の不均一性の解決に関する研究

コショウの果実の登熟のタイミングをホルモン処理により解決するための研究平山隆志

新規環境応答制御因子の機能解析

新規環境応答制御因子の機能を明らかにする

平山隆志

Country

Affiliation

China

Kenya

China

FranceInner Mongolia
University of Scienceand Technology
Institute de Biologie
Physico-Chimique,
CNRS

Summary

Accepted
staff

Khew, Choy Yuen,

Malaysia

Malaysia Pepper Board/ Researcher
Hwang, Siaw San,
Swinburn University
Professor

Spain

Plant Biotechnology and Jose A. Jarillo,
Genomics Centre
Professor

China

Sun Yat Sen University

Yin Ye,Lecturer

孔辺細胞におけるアブシシン酸受容体の多様性に関する研究

アブシシン酸が気孔開口に及ぼす影響について分枝遺伝学的に解析している

森

泉

Korea

Kyung Hee University

An, Gene,
Professor

イネの開花時期へのサイ
トカイニンの影響に関す
る研究

開花期のイネに合成サイトカイニンを処理すると開花が遅くなる．この現象について分子生物学的に解析した．その一部として合成サイトカイニン
が内生サイトカイニンに及ぼす影響の解析が共同研究の主な内容である

森

泉

FranceUniversite Clermont
Auvergne, CNRS

Olivier Mathieu,
Principal Investigator

Analysis of gene silencing
mechanism

Functional analysis of gene silencing mutant in Arabidopsis

池田陽子

FranceUniversite deMontpellier, IRD

Daniel Grimanelli,
Senior Researcher

Analysis of DNA methylation
functionin Marchantia
polymorpha

Analysis of CG methylase mutant DNA methylation in Marchantia
polymorpha

池田陽子

Country

Affiliation

Researcher'sName・Title

Subject of collaborative
research

Summary

Analysis of DNA methylation
Analysis of CG methylase mutant DNA methylation in Marchantia
functionin Marchantia
polymorphapolymorpha
Analysis of DNA methylation
Analysis of CG methylase mutant DNA methylation in Marchantia
functionin Marchantia
polymorphapolymorpha

Accepted
staff

MexicoUniversidad
Veracruzana,
INBIOTECA

Mario A. Arteaga
Vazquez, Professor

USA

Cold Spring Harbor
Laboratory

Robert A. Martienssen,
Professor

China

中国南京農業大学

Fangjie Zhao,
Professor

イネ重金属集積に関する研究

イネカドミウムやヒ素の集積に関与する遺伝子の同定

馬

建鋒

China

中国科学院南京土壌研 Renfang Shen,
究所
Professor

植物アルミニウム耐性機
構の研究

イネを中心に植物のアルミニウム耐性に関する生理、分子
生物学的研究

馬

建鋒

China

福建農林大学

Zhichang Chen,
Professor

イネマグネシウム輸送に関する研究

イネのマグネシウム輸送体の同定と機能解析

馬建鋒

England

University of Nottingham

David Salt,
Professor

イネ根系に関する研究

根の形態と養分吸収に及ぼす影響に関する研究

馬

建鋒

USA

Department of Biochemistry/
Center for Plant Science
Innovation, University of
Nebraska Lincoln

Toshihiro Obata,
Assistant Professor

Metabolome analysis in tomato
fruit which suppressed or overexpressed SlALMT geneWe are collaborating to determine metabolites in tomato fruit, toassess physiological function of the SlALMT genes

佐々木孝行

USA

Plant Biology andPathology,
Rutgers University

Bradley I. Hillman,
Professor

Characterization of
mitoviruses infecting thechestnut blight fungus

Investigation of host range of and host defense against a
mitochondrially replicating mitovirus

鈴木信弘

USA

Plant Pathology,
University of Kentucky

Said A. Ghabrial,
Professor

Taxonomy of fungal viruses

Taxonomical organization of fungal hypoviruses and quadriviruses.

鈴木信弘

USA

Harvard Medical Schol

Max Nibert,
Professor

Partitivirus structural analysis

Cryo-EM and 3D-reconstruction of Rosellinia necatrix partitivirus
2

鈴木信弘

Spain

Department of Structure of
Macromolecules, Centro
Nacional Biotecnología/CSIC

José R. Castón,
Professor

Quadrivirus structural
analysis

Cryo-EM and 3D-reconstruction of Rosellinia necatrix
quadriviruses

鈴木信弘

池田陽子

池田陽子

Researcher'sName・Title

Subject of collaborative
research

Summary

Accepted
staff

Carlos José López
Herrera, Researcher

Utilization of fungal viruses
as biocontrol of the whiteroot rot disease

Search for fungal viruses with potential as biocontrol agents against
white root rot in avocado

鈴木信弘

Natural Resources InstituteEeva Vainio,
Finland (Luke), Forest
Researcher
health and biodiversity

Taxonomy of fungal viruses

Taxonomical organization of fungal partitiviruses

鈴木信弘

College of Plant Science
Jiatao Xie,and Technology, Huazhong
Professor
Agricultural University

Taxonomy of fungal viruses

Taxonomical organization of fungal megabirnavirus

鈴木信弘

Philippines

International Rice
Research InsituteAna Eusebio-Cope,
Program Manager

Characterization of viruses
infecting rice-associatedfungi

Virus hunting of rice blight fungal isolates and theircharacterization

鈴木信弘

Bangladesh

Plant Pathology Division,
Bangladesh Agricultural
Research Institute

Md. Iqbal Faruk,Senior
Scientific Officer

Characterization of virusessoil-inhabitant fungi

Molecular haractgerization of viruses isolated from Bangladeshi
isolates of plant pathogenic soil-inhabitant fungi

鈴木信弘

Pakistan

Crop Diseases ResearchInstitute (CDRI), National
Agricultural Research Centre(NARC)

Atif Jamal, Senior
Scientific Officer

Characterization of
megabirnaviruses

Identification of internal ribosomal entry sites in fungal
megabirnaviruses

鈴木信弘

Pakistan

Atta-ur-Rahman School ofApplied Biosciences (ASAB), Muhammad Faraz Bhatti, Characterization of fungal
National University of Sciences Professor
virusesand Technology

Molecular and biological characterization of a novel botybirnavirus
identified from a Pakistani isolate of Alternaria alternata

鈴木信弘

China

Chinese Academy ofAgricultural Sciences

Lihua Guo,
Professor

Australia

University of Queensland

Ralf Dietzgen,
Associated Professor

North Carolina State
University

Anna Whitfield,
Professor

University of Queensland

Peter Walker,
Professor

Country

Affiliation

Spain

Instituto de Agricultura
Sostenible C.S.I.C.

Finland

China

USA

Australia

Molecular characterization of Evidence for a novel negative-stranded RNA mycovirus, Fusarium
a novel mycovirus of thegraminearum negative-stranded RNA virus 1 (FgNSRV-1), isolatedfamily Mymonaviridae
from the plant pathogenic fungus Fusarium graminearum
Study of the evolutionary
Phylogenetic analyses of dichorhaviruses and other plant
relationships among
rhabdoviruses (varicosaviruses, nucleorhabdoviruses anddichorhabdoviruses
cytorhabdoviruses) based on the L (RdRp) proteins
Study of the evolutionary
Phylogenetic analyses of plant rhabdoviruses (dichorhaviruses,
relationships among plantvaricosaviruses, nucleorhabdoviruses and cytorhabdoviruses) based
rhabdoviruseson the L (RdRp) proteins
Taxonomy of Rhabdoviridae

The International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) 10th
Report on the taxonomy of Rhabdoviridae has been published

近藤秀樹

近藤秀樹

近藤秀樹

近藤秀樹

Country

Affiliation

Researcher'sName・Title

Subject of collaborative
research

Summary

Isolation and characterization
Marine bacteria that promote or terminate algal bloom are beingof marine microbe that affectisolated and their effect on algal growth is bein characterizedalgal bloom dynamics
Isolation of halotlerant
Isolation of halotolerant C1-compound utilizing bacteria fromlanthanide-dependent
mangrove forest trees
methylotrophs

Accepted
staff

Chile

Los Lagos University

Gonzalo Gajardo,
Professor

TurkeyMugla Sitki Kocman
University

Nurettin Sahin,
Professor

ThailandBurapha University

Jittima Charoenpanich,
Associate professor

Isolation of chromiumreducing bacteria

Isolation and characterization of chromium-reducing bacteria toremove heavy metal contaminants

谷 明生

UgandaMakerere University

Andrew Mutalya,
Researcher

Chemotaxis in Oharaeibacter Characterization of chemotaxis in Oharaeibacter diazotrophicus,
diazotrophicus
which is a methylotrophic and diazotrophic bacterium

谷 明生

RussiaInstitute of Biochemistry
Dmitry N. Fedorov,and Physiology of
Researcher
Microorganisms RAS

Distribution of 1-aminocyclopropane-1ACC deaminase and D-cysteine desulfhydrase gene distribution incarboxylate deaminase and d-cysteine
desulfhydrase genes among type species of Methylobacterium speceis
the genus Methylobacterium

谷 明生

Germany

IPK

Nils Stein,
Professor

Barley pan-genome project佐藤和広

Germany

IPK

Nils Stein,
Professor

Sequencing analysis of barley
Partial sequencing analsis of barley accessions in genebanks
genetic resources

佐藤和広

U.K.

The Sainsbury Institute

Matthew Moscou,
DoctorCloning of barley disease
resistance genes

Isomation and annotation of barley disease resitance genes

佐藤和広

U.S.A

Oregon State University

Patrick Hayes,
Professor

Food barley development

Development of functional food barley cultivar in the USA

佐藤和広

International

Swedish University ofAgriculture

Roland von Bothmer,
Professor

International Barley Core
Collection

Establishment and utilizaztion of core set of barley genetic
resourdes in the world

佐藤和広

U.S.A

Oregon State University

Patrick Hayes,
Professor

Genome editing for
producing hull-less barley

Genome editing method is performed to produce hull-less barleyusing lines generated in OSU

久野 裕・
佐藤和広

De novo assembly of principal barley haplotypes

植木尚子

谷 明生

Country

Affiliation

Researcher'sName・Title

Subject of collaborative
research

Summary

Accepted
staff

Germany

IPK

Jochen Kumlehn,
Doctor

Genome editing of the genes
Site-directed mutagenesis is performed for modification of therelated to seed dormancy ingenes related to seed dormancy in barleybarley

久野 裕・
佐藤和広

China

Chinese Academy of
Sciences

Chunxiang Fu,
Professor

Genetic modification of
Genetic modification of lingnin biosynthesis is performed to
lingnin biosynthesis in barley increase the efficiency of processing for biomass in barley

久野 裕

Kenya

Kenya Agricultural andLivestock Research
Organization

Emily W. Gichuhi,
Researcher

Utilization of wild rice species, Longistaminata Chromosome Segment introgressed lines (LCSILs)
Oryza longistaminata , forbred from the cross between O. longistaminata and Kernel Basmati
improving Basmati rice in Kenya were evaluated under several conditions in Kenya

前川雅彦

Vietnam

Faculty of Agronomy,
University of Agriculture andForestry, Hue University

Phan Thi Phuong NHI,
Associate Professor

Selection of saly-tolerantlines in nDart1-tagged linesof Koshihikari

Screening of salt-tolerant lines from nDart1-tagged lines ofKoshihikari under saline paddy fields in Vietnam

前川雅彦

Pakistan

Centre of Agricultural
Biochemistry andBiotechnology, University ofAgriculture

Nisar Ahmed,
Associate Professor

Breeding of nDart1-taggedlines in Basmati

Introduction of nDart1/aDart1-27 system into Basmati to breed
nDart1-taggedlines

前川雅彦

Barley seeds exposed to outer space were examined for seedgermination and gene expression

杉本学

Genes expressed in Brachypodium under UV irradiation wereidentified to examined function

杉本学

RussiaRussiaInstitute of Biomedical
Vladimir Sychev,
Problems, RussianVice President
Academy of Science
Institute of Fundamental
Rushan Sabirov,
Medicine and Biology,
Professor
Kazan Federal University

Effect of space environment
on plant viability andadaptation
Function of genes andproteins in plnats produced
under extreme environment

Annual Report 2018

Director:

Masahiko Maekawa

Editorial Members:

Yuko Hojo
Sanae Rikiishi
Izumi Mori

Published by Institute of Plant Science and Resources, Okayama University
Chuo 2-20-1, Kurashiki 710-0046, Japan
TEL: +81-86-424-1661
FAX: +81-86-434-1249

岡山大学資源植物科学研究所報告 第 26 巻
(Annual Report 2018)

平成 31 年 3 月 25 日
平成 31 年 3 月 31 日
発 行

所

編 集 委 員印刷
発行

岡山大学資源植物科学研究所
710-0046 倉敷市中央 2 丁目 20-1
TEL： 086-424-1661
FAX： 086-434-1249
北條 優子
力石 早苗
森
泉