National Institute of Genetics
国立遺伝学研究所

2

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National Institute of Genetics
国立遺伝学研究所

4

5

Message from the Director-General
遺伝学と「遺伝研の役割」

グレゴール・ヨハン・メンデルが修道院の庭でエンドウを交配し「遺伝の単位」を見つけたとき、誰が今日の遺伝学の隆盛を予見したでしょうか。その後、遺伝学は 20 世紀を通して学問として進歩し続け、ついに生命の究極の秘密に到達しました。それは、「すべての生命活動は DNA の遺伝情報が基盤となる」、すなわち「いのちは、ことばに支えられている」という秘密です。ここから遺伝学の全面的な展開が始まり、現在では生物学全体だけでなく医・薬・農・工など様々な応用科学にまで、遺伝学の果たす役割は広がっています。
国立遺伝学研究所（遺伝研）は、1949 年に文部省の研究所として設立され、木村資生博士による分子進化の中立説をはじめ、数多くの研究業績を上げてきました。また、1984年には、大学共同利用機関として、学術コミュニティー
全体の研究を促進する役割を引き受け、1988 年には、総合研究大学院大学の遺伝学専攻を受け持って、独自の大学
院教育を行うようになりました。2004 年に法人化されて、
国立情報学研究所、国立極地研究所、統計数理研究所とともに大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構を構成し、情報とシステムという観点から未来の課題にも取り組んでいます。
現在の遺伝研では、約500人の様々な職種の人達が働き、研究、研究基盤整備、教育・人材育成という仕事をしています。研究では 34 のグループが、大腸菌からヒトまで、分子レベルから生物集団レベルまで、理論から実験まで、遺伝学に関わる幅広い分野で独創的な研究を行い、世界的な評価を受けています。研究基盤整備では、DNA データバ
ンク（DDBJ）、実験生物系統の分与、先端ゲノミクス事業などにより、学術コミュニティーの研究に貢献しています。
また、教育・人材育成では、学生当りの教員数の多さを生かした大学院教育を行うとともに、有望な若手研究者が新しい分野を開拓する新分野創造センターを作り、将来を見すえた体制作りも進めて来ました。
生物にはまだ多くの謎がありますが、遺伝情報という切り口から攻めることにより着実な成果が期待できます。私たちは、先達の努力を引き継ぎ、世界中の研究者と協力しW h o c o u l d f o re s e e t h e s u c c e s s o f
g e n e t i c s w h e n G re g o r J o h a n n M e n d e lcultivated pea plants in a monastery garden
and found the unit of inheritance? After thisgreat event, genetics, namely, the study ofinheritance and variation of biologicalorganisms, developed continuously throughthe 20th century and uncovered the ultimate
se c re t o f l i f e : t h e a c t i v i t y o f b i o l o g i c a lorganisms is based on the genetic informationof DNA, or life is supported by a simple linear
code, i.e., “words”. On this basis, genetics has
now expanded not only to all fields of basic
biology but also to many applied sciences.
The National Institute of Genetics wasestablished at Mishima in 1949, and since has
p ro d u c e d m a n y o u t s t a n d i n g s c i e n t i f i cachievements including the neutral theory ofmolecular evolution by Motoo Kimura.
Continuing the tradition, we are conducting
research in many fields of genetics and related
fields, ranging from bacteria to humans, frommolecules to populations, and from theory toexperiments. We consider this diversity of
research is essential to the stimulating
environment that fosters a community of
researchers.
We serve the scientific community inJapan and the world by providing research
infrastructure, including the DNA database(DDBJ), bio-resources of various experimentalorganisms, and advanced genomic services.
Science education is also a central part of ouractivity, and we provide graduate education as
the Department of Genetics, SOKENDAI (The
Graduate University for Advanced Studies). In
addition, constant dialog with non-scientists is
an important part of our mission.
Genetic approaches remain critical for
addressing key issues in the life sciences, andwe will continue our commitment to excellencein research, service, and education.

て研究を進め、その成果を人類全体の財産とすることが仕事と考えています。また、一般社会との対話を行いながら、この使命を果たしたいと考えています。

所長

6

桂

所長あいさつ／ Message from the Director-General

勲KATSURA, Isao Director-General

所長あいさつ／ Message from the Director-General

7

Contents

06

所長あいさつMessage from the Director-General

70

国際交流
International Activities

09

組 織Organization

72

研究を促進するための活動と行事
Activities and Events for Research Promotion

10

概 要
Outline73

遺伝学電子博物館
Cyber Museum of Genetics

14

遺伝研へのアクセス
Access to the Institute74

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻
Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI

15

遺伝研マップ
NIG Map16

研究系・研究センター等の概要
Outline of Departments, Research Centers and Experimental Farm

遺伝研の研究活動

82

運 営
Management85

研究教育職員・研究員・学生
Research Staff & Students

18

研究活動
Research Activities

89

管理部と技術課職員
Staff of Administration Department and Technical Section

54

知的財産室
Intellectual Property Unit90

沿 革
History55

リサーチ・アドミニストレーター室
Office for Research Development92

2014年に発行された論文一覧
Publications in 201456

新領域融合研究センター
Transdisciplinary Research Integration Center95

予 算
Budget57

ライフサイエンス統合データベースセンター
Database Center for Life Science

95

科学研究費
Grant-in-Aid for Scientific Research

96

バイオロジカルシンポジウム
Biological Symposium

共同利用・共同研究

8

遺伝研データ59

生物遺伝資源センター
Genetic Resource Center98

表彰・受賞歴Awards・Honors

60

先端ゲノミクス推進センター
Advanced Genomics Center

98

知的財産権
Intellectual Property Rights

61

DDBJセンター
DDBJ Center99

情報・システム研究機構
Research Organization of Information and Systems

62

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム
NIG Supercomputer System

100 国立大学法人 総合研究大学院大学

63

創薬等支援技術基盤プラットフォーム
Platform for Drug Discovery, Informatics, and Structural Life Science

64

共同研究・研究会
Collaborative Research・Research Meetings

目次／ Contents

SOKENDAI (The Graduate University for Advanced
Studies)Organization

組

運営会議

所長

Advisory Committee

Director-General桂

勲

総合企画会議副所長

KITAGAWA, Daiju

P18

荒木弘之

P19

共生細胞進化研究部門

宮城島進也

P20

ARAKI, Hiroyuki

Molecular and Developmental Biology

MIYAGISHIMA, Shin-ya

岩里琢治

P21

川上浩一

P22

IWASATO, Takuji
KAWAKAMI, Koichi

大量遺伝情報研究室

中村保一

P47

データベース運用開発研究室

高木利久

P48

遺伝子発現解析研究室

大久保公策

P49

比較ゲノム解析研究室

藤山秋佐夫

P50

豊田

P50

Comparative Genomics

斎藤成也

P23

進化遺伝研究部門

明石

裕

P24

生態遺伝学研究部門

北野

潤

P25

SAITOU, Naruya
AKASHI, Hiroshi
KITANO, Jun

核酸化学研究部門

Nucleic Acid Chemistry

Department of Integrated Genetics

育種遺伝研究部門

角谷徹仁

P27

平田たつみ

P28

Human Genetics

Agricultural Genetics

脳機能研究部門
Brain Function

INOUE, Ituro

KAKUTANI, Tetsuji
HIRATA, Tatsumi

生理遺伝研究部門

Physiological Genetics

鐘巻将人

P29

細胞空間制御研究室

小田祥久

P30

定量メカノバイオロジー研究室

島本勇太

P31

KANEMAKI, Masato
ODA, Yoshihisa
SHIMAMOTO, Yuta

Genetic Strains Research Center

哺乳動物遺伝研究室

城石俊彦

P32

発生工学研究室

相賀裕美子

P33

マウス開発研究室

小出

剛

P34

小型魚類開発研究室

酒井則良

P35

植物遺伝研究室

倉田のり

P36

原核生物遺伝研究室

仁木宏典

P37

無脊椎動物遺伝研究室

上田

P38

系統情報研究室

山﨑由紀子

P39

生物遺伝資源情報研究室

小原雄治

P40

Mammalian Development
Mouse Genomics Resource
Model Fish Genomics Resource
Plant Genetics

Microbial Genetics

Invertebrate Genetics
Genetic Informatics
Genome Biology

SHIROISHI, Toshihiko
SAGA, Yumiko

KOIDE, Tsuyoshi
SAKAI, Noriyoshi
KURATA, Nori
NIKI, Hironori

龍UEDA, Ryu

YAMAZAKI, Yukiko
KOHARA, Yuji

理論遺伝研究部門
Theoretical Genetics

生体高分子研究室

前島一博

P41

細胞建築研究室木村P42

多細胞構築研究室

澤

斉

P43

遺伝子回路研究室

鈴木えみ子

P44

Multicellular Organization
Gene Network

2015 年 4 月 1 日現在
as of April 1, 2015

応用遺伝研究部門
Applied Genetics

ベルモント，アンドリュー S．

P52

デッカー，ジョブ

P52

シェラット，デヴィト

P52

ロスステイン，ロドニー

P52

エンゲルト，フローリアン

P52

ゼン，ホンクイP53

エクスコフィエ，ローレント

P53

龍

漫遠

P53

佐々木裕之

P53

ジルバマン，ダニエルP53

BELMONT, Andrew S.

SHERRATT, DavidENGERT, Florian

EXCOFFIER, Laurent

SASAKI, Hiroyuki

ZILBERMAN, Daniel

放射線・アイソトープセンター
Radioisotope Center

生物遺伝資源センター

MAESHIMA, Kazuhiro

暁

KIMURA, Akatsuki
SAWA, Hitoshi

SUZUKI, Emiko

P59

Genetic Resource Center

バイオリソース事業部

Division of Bioresources Management

データベース事業部

Division of Bioresources Databases

先端ゲノミクス推進センター

P60

DDBJ センター

P61

Advanced Genomics Center

DDBJ Center

支援センター

Support Center

情報基盤ユニット
IT Unit

マウス研究支援ユニット

Mouse Research Supporting Unit

動物飼育実験施設
知的財産室

Structural Biology Center

Cell Architecture

P51

NONOMURA, Ken-ichi

Unit for Experimental Animal Care

構造遺伝学研究センター

Biological Macromolecules

野々村賢一（共同利用事業センター Intellectual Infrastructure Center）

系統生物研究センター

Mammalian Genetics

敦

LONG, Manyuan

分子機能研究室

Quantitative Mechanobiology

FUJIYAMA, Asao

ZENG, Hongkui

Center for Frontier Research

Cell Dynamics and Organization

OKUBO, Kosaku

ROTHSTEIN, Rodney

新分野創造センター

Molecular Function

TAKAGI, Toshihisa

DEKKER, Job

Cytoplasmic Genetics

P26

NAKAMURA, Yasukazu

Adjunct Faculty

細胞質遺伝研究部門

井ノ上逸朗

ARITA, Masanori

客員研究部門

総合遺伝研究系

人類遺伝研究部門

IKEO, Kazuho

TOYODA, Atsushi

Experimental Farm

集団遺伝研究部門

Ecological Genetics

P46

実験圃場

Department of Population Genetics

Evolutionary Genetics

有田正規

Gene-Expression Analysis

集団遺伝研究系

Population Genetics

生命ネットワーク研究室

Research and Development of
Biological Databases

Department of Developmental Genetics

初期発生研究部門

P45

Genome Informatics

個体遺伝研究系

Neurogenetics

池尾一穂

Biological Networks

微生物遺伝研究部門

形質遺伝研究部門

遺伝情報分析研究室DNA Data Analysis

Department of Cell Genetics

Symbiosis and Cell Evolution

荒木弘之

ARAKI, Hiroyuki

Center for Information Biology

北川大樹

細胞遺伝研究系

Microbial Genetics

城石俊彦

SHIROISHI, Toshihiko

生命情報研究センター

Department of Molecular Genetics
Centrosome Biology

Advisory Board

Vice-Director

分子遺伝研究系

中心体生物学研究部門

アドバイザリーボード

KATSURA, Isao

Council for Strategy Planning and Coordination

織Intellectual Property Unit

リサーチ・アドミニストレーター室
Office for Research Development

管理部

Department of Administration

鈴木睦昭

P54

広海

P55

SUZUKI, Mutsuaki

健

HIROMI, Yasushi

総務企画課

General Affairs and Project Section

P85

財務課

Financial Affairs Section
技術課

Technical Section

P85

組織／ Organization9国立遺伝学研究所は、遺伝学の基礎とその応用に関する総合的研究を行い、学術研究の発展に寄与することを目的として設置された大学共同利用機関です。

大学共同利用機関は、国公私立大学すべての共同利用の研究所です。大型望遠鏡や大型加速器といった最先端の大型装置、遺伝子や超高性能プラズマなどの大量データ、古文書や隕石といった貴重な資料など、個別の大学では整備や維持が困難なものを有し、全国の研究者との共同利用、共同研究を推進する我が国独自の研究機関です。

National Institute of Genetics (NIG) was established to carry out broad andcomprehensive research in genetics. NIG contributes to the development of academic
research as one of the inter-university research institutes constituting the Research
Organization of Information and Systems (ROIS).

Activities of NIG

遺伝研の活動p12

遺伝学の最先端研究
生命科学分野における中核研究機関として国際水準の先端的研究に取り組んでいます。

CUTTING-EDGE RESEARCH IN GENETICS

As a core institute of Genetics, NIG is acting for advanced research in the field of Life Sciences.

p13

知的基盤整備事業
生命科学を支える中核拠点として、生物遺伝資源事業、先端ゲノミクス推進事業、DDBJ 事業を行っています。

INTELLECTUAL INFRASTRUCTURE FOR LIFE SCIENCES

NIG houses Genetic Resource Center, Advanced Genomics Center and DDBJ Center, as a core institute to build
the intellectual infrastructure that supports Life Sciences.

p59

共同利用
全国の研究者のために共同研究の機会を提供し、またそのための施設の利用に応じます。

RESEARCH COLLABORATIONS

p70

NIG offers collaborative research opportunities to researchers throughout Japan.

国際交流
遺伝学の分野で国際的な学術交流を活発化するため、研究者の交流や国際シンポジウム等を開催しています。

INTERNATIONAL COLLABORATIONp74

NIG strives to promote international scientific exchanges by sponsoring international symposia and through theexchange of researchers.

大学院教育総合研究大学院大学生命科学研究科の遺伝学専攻を担当し、大学院学生の教育を行うとともにその他の大学の大学院教育に協力します。

EDUCATION FOR GRADUATE STUDENTS

NIG accepts graduate students as the Department of Genetics, School of Life Sciences, SOKENDAI (The
Graduate University for Advanced Studies), and also participates in the education of students from otheruniversities.
10

概要／ Outline

Organization

組織図

国立極地研究所

極域科学専攻国立情報学研究所

情報学専攻

統計数理研究所

統計科学専攻National Institute ofPolar Research

National Institute ofInformatics

大学共同利用機関法人

情報・システム
研究機構

Research Organization ofInformation and Systems(ROIS)The Institute of
Statistical Mathematics

Department of
Polar Science

Department ofInformatics

複合科学研究科

School of Multidisciplinary
Sciences

National Institute ofPolar Research

国立大学法人国立遺伝学研究所
National Institute of
Genetics

総合研究大学院大学

遺伝学専攻

SOKENDAI(The Graduate University
for Advanced Studies)

Department of
Genetics

基礎生物学専攻
Department of
Basic Biology

生命科学研究科
School of Life Science

生理学専攻

Department of
Physical Sciences

新領域融合研究センター
Transdisciplinary ResearchIntegration Center

ライフサイエンス
統合データベースセンター
Database Center forLife Science

概要／ Outline

11

Cutting-edge Research : A Core Institute for Life Sciences
遺伝学の中核拠点としての先端研究活動
生命はゲノムに書き込まれた遺伝情報と内外環
境との相互作用で作りだされる複雑なシステムです。
この生命システムの解明をめざして、細胞機能、発生・分化、進化・生物多様性、ゲノム情報などについて先端研究を進めています。

Life is a complex system generated by the mutual interaction
between genetic information engraved in the genome and the internaland external environments. At the National Institute of Genetics (NIG),
cutting-edge research is conducted in areas such as cell function,
development and differentiation, evolution and diversity, and genome
information, aiming to clarify the system of life.

▶ Research Highlights

最近の研究成果より

中心小体複製が１コピーに限られる仕組みを解明
北川教授らの研究では、細胞分裂や染色体分配に重要な細胞小器官である中心小体の複製開始段階における分子の働きを、世界に先駆けて明らかにすることができました。そしてその解析を基に、余分な中心小体の複製を防ぐ制御機構を、理論的にモデル化しました。中心
小体数の異常は、がんや遺伝病、男性不妊に関係し、これらの成果は治療や医薬品開発に役立つと期待されます。
娘中心小体形成開始の分子メカニズム、及びその形成が 1 個に限定されるモデル
Mechanisms for the onset of procentriole formation and how theprocentriole assembly is limited to one site around parental centriole.

Mechanisms to ensure formation of a single procentriole per parental centriole
Prof. Kitagawa and colleagues demonstrated the detailed mechanisms for the
onset of centriole formation and a “negative feedback system” by which procentriole
assembly is strictly limited to one site around parental centriole. Since aberrations incentriole number or structure are implicated in a number of diseases, including
ciliopathies, male sterility, primary microcephaly and cancer, this work is expected tohave important clinical implications.

Ohta, M., Ashikawa T., Nozaki, Y., Kozuka-Hata, H., Goto, H., Inagaki, M., Oyama, M., and Kitagawa, D. (2014). Direct interaction of Plk4 with STIL ensures formation of a single
procentriole per parental centriole. Nat. Commun. 5, 5267.

新生児マウスの大脳皮質で神経回路が成長する様子を観察
子どもの時期に脳の神経回路は、環境から様々な刺激を受けながら発達します。岩里教授
らは、独自に開発した回路標識法と二光子顕微鏡観察法を組み合わせて用いることにより、新生仔マウスの大脳皮質の中で神経回路が正常に成長する様子を直接観察することに成功しました。さらに、遺伝子操作によって刺激の入り方を変えたときの回路発達の異常の観察も行いました。
新生仔マウスの皮質細胞樹状突起の 18 時間での変化。赤：伸びた枝；青：
縮んだ枝；緑：結合相手の軸索。
Morphological changes of cortical neuron dendrites during 18 hours. Red:
elongated; Blue: retracted; Green; presynaptic axons.

Imaging circuit refinement in the neonatal cortex
During postnatal development, neuronal activities play a critical role in therefinement of neural circuits. Prof. Iwasato and colleagues performed in vivo timelapse imaging of dendritic refinement of both normal barrel cells and NMDA receptordeficient barrel cells in the somatosensory cortex layer 4 of neonatal mouse.

Mizuno, H., Luo, W., Tarusawa, E., Saito, YM., Sato, T., Yoshimura, Y., Itohara, S., and Iwasato, T. (2014). NMDAR-regulated dynamics of layer 4 neuronal dendrites during
thalamocortical reorganization in neonates. Neuron 82, 365-379.

真核藻類が夜に分裂する仕組みと意義を解明
様々な真核生物において細胞分裂の起こる時間帯が概日リズムによって限定されていることが知られています。宮城島教授らは単細胞性の藻類を用いて、細胞分裂を夜間に限定する
仕組みを解明しました。また、光合成酸化ストレスの生じない夜間に DNA 複製と細胞分裂を行うことが、真核藻類の生存にとって重要であることがわかりました。

Mechanism and significance of circadian gating of algal cell division
単細胞紅藻シアニディオシゾンにおけるRB-E2F-DP 複合体によるS 期開始の夜間への限定機構
The circadian gating of the G1/S transition by the RB-E2F-DP complex in
the red alga Cyanidioschyzon merolae.

Circadian rhythms of cell division have been observed in several lineages of
eukaryotes. However, the mechanism underlying the circadian regulation of the cell
cycle and the nature of the advantage conferred remain unknown. Using theunicellular red alga Cyanidioschyzon merolae, Prof. Miyagishima and colleagues
found that circadian inhibition of cell cycle progression during the daytime by RBE2F-DP pathway protects cells from photosynthetic oxidative stress by temporallycompartmentalizing photosynthesis and cell cycle progression.

Miyagishima, S., Fujiwara, T., Sumiya, N., Hirooka, S., Nakano, A., Kabeya, Y., and Nakamura, M. (2014). Translation-independent circadian control of the cell cycle in a unicellular
photosynthetic eukaryote. Nat. Commun. 5, 3807.

12

概要／ Outline

Intellectual Infrastructure Supporting Life Sciences
生命科学を支える知的基盤整備事業
生物遺伝資源（バイオリソース）、先端ゲノミクス
推進、DDBJ（日本 DNA データバンク）の 3 つの研究事業を国際的な中核拠点として運営しています。
他の大学や研究機関とも連携したこれらの事業により生命科学を先導し、研究コミュニティを支援しています。

NIG operates three research infrastructure projects as aninternational center of life sciences: BioResource Project, Advanced
Genomics Project, and DDBJ Project. Through promoting researchcollaborations with other universities and research institutions, NIG
advances the frontier of life science and supports the entire scientificresearch community.

生物遺伝資源（バイオリソース）事業
学術研究用生物系統の開発、収集、提供を主体としたバイオリソース事業を展開し、全国の中核拠点とし機能しています。内閣府日本医療研究開発機構 NBRP の生物種別の中核代表機関としても活動し、さらに情報センターとして大学等と連携してバイオリソースデー
タベースの構築と公開運用を進めています。

BioResource Project
NIG serves as a center for developing, collecting, and distributing biologicalresources of various strains of experimental organisms for academic research.
NIG also plays an important role as a central institution for individual National
BioResource Projects and functions as its information center to promote
development of biological resource databases in collaboration with universities
and other organizations.

先端ゲノミクス推進事業
2011 年度から、先端ゲノミクス推進センターを中心に活動しています。これまでに、
900 検体を越える試料について最新のシーケンシング技術を駆使してゲノム情報を産出しており、学術分野における先端ゲノミクス推進の中核として事業を進めています。

Advanced Genomics Project
NIG is top in the nation for technical know-how for complete sequencing ofmulticellular organism genomes. NIG has conducted analyses of genes andgenomes of >44 species in collaboration with many organizations (universities
and research groups). NIG is a key producer of genomic information.

DDBJ（日本 DNA データバンク）事業
DDBJ（DNA Data Bank of Japan）は 1987 年に設立され学術論文や特許公報等を通じて公知にされる塩基配列データをすべて網羅し、世界の公共財として維持管理すDNA Data Bank of JapanDDBJ Sequence Read Archive
DDBJ Trace Archive
BioProject

る国際学術事業を行っています。この事業は、欧州の ENA/EBI および米国の NCBIとの3 者の協力体制で行われており、3 者の間では受付後公開されるデータは毎日交換され、世界共通のデータベース『INSD 国際塩基配列データベース』がつくられます。3 者のどこで登録を受けても世界で同時に公開されます。

IAC
ICM
GenBank
Sequence Read Archive
Trace Archive
BioProject

DDBJ Project
EMBL-Bank
Sequence Read Archive
Trace Archive
BioProject

DDBJ (DNA Data Bank of Japan) was established in 1987 and joinedinternational data exchange and archiving scheme between NCBI and ENA/EBI.
This tripartite collaboration is called INSDC (International Nucleotide Sequence
Database Collaboration). DDBJ, as well as NCBI and EBI, is serving as one of thethree data inlets and outlets to the “INSD”.
概要／ Outline

13

Access to the NIG

遺伝研へのアクセス

遺伝研周辺地図
大
場
川

三島a駅
n
Statiohim

JR Mis

東海
道
道本
本線
線

OUTH 市立公園

南口 S

楽寿園

三島広小路駅

錦田中学校
錦田中学校

国立遺伝学研究所

National Institute of Genetics

至東京

谷田宿舎

や た

谷田

三島田町駅

Yata

三島警察署
三島警察署

錦田小学校

三島二日町駅

国道136号

1号
国道 e1
t
Rou

至沼津

三島東海病院

三嶋大社

伊豆
箱
箱根
根鉄
鉄道
道

至箱根

東海
道
道新
新幹
幹線
線

H

RT
口 NO

北

駿

三島塚原 IC

市民体育館
市民体育館

至静岡
至静岡

東

日本大学国際関係学部
日本大学国際関係学部

道
車 ）
動
自 道路
貫
縦 環状
豆
伊 河湾

文教宿舎

（

至沼津 IC

富士山

Mt.Fuji

遺伝研詳細地図
至箱根三島塚原 ICNIG 国立遺伝学研究所

通用門

遺伝研坂下
バス停 A
や た

谷田
1
国道
伊

豆

箱

根

そば店

JA

道

コンビニエンスストア

三島二日町駅

遺伝研前
バス停

大阪市

名古屋市

Nagoya City

スーパー
マーケット

東京都
Tokyo

成田空港

Narita Airport

羽田空港

Haneda Airport

Osaka City

三島市

Mishima City
Shizuoka Prefecture

静岡県

銀行

三島警察署

鉄

京都市

Kyoto City薬局

自動車販売店

号

正門

遺伝研坂下
バス停 B

錦田小学校

谷田公民館

踏切

三島駅までのアクセス

三島駅から遺伝研までのアクセス

How to get to JR Mishima Station
●

羽田空港

品川駅

Haneda Airport

JR Shinagawa Station
京急 約 20 分

成田空港

1hr by JR Narita Express

新大阪駅

JR Shin-Osaka

三島駅

JR Mishima Station

2hr by Shinkansen (Hikari)

遺伝研へのアクセス／ Access to the Institute

三島駅からの距離 約 4km
About 4km from JR Mishima Station●

シャトルバス
北口 4 番乗り場から約 15 分（平日のみ運行）
15min by the NIG Free Shuttle Bus (North Exit #4)●

路線バス
南口 5 番乗り場から約 20 分
「柳郷地行き」遺伝研前下車、または、「夏梅木行き」「玉沢・社会保険病院行き」遺伝研坂下下車徒歩 10 分
20min by Local Bus (South Exit #5)

新幹線こだま 約 1 時間

1hr by Shinkansen (Kodama)

JR Mishima Station

新幹線ひかり 約 2 時間

14

三島駅

JR Tokyo Station

JR 約 1 時間●

JR Mishima Station

50min by Shinkansen (Kodama)

東京駅

Narita Airport

三島駅

新幹線こだま 約 50 分

20min by Keikyu Line●

Access from JR Mishima Station to NIG●

タクシー
南口・北口共に約 15 分
15min by TaxiNIG Map

遺伝研マップ

実験動物慰霊碑

太陽光発電設備

展示室

Photovoltaic Facility

Memorial Monument for
Experimental Animals

Exhibition Room

W
M
V

H

RY

G

C
B

R
A

X

S

D

正門

Main Entrance

Z
Q

研究員宿泊施設

講堂

Guest House

食堂

Lecture Hall

Dining Room

研究所の敷地と建物

A 本館

M 電子計算機棟

W 生命情報研究センター

B 図書館

Q 研究員宿泊施設

X 動物飼育実験棟

C 研究実験棟

R 系統生物研究センター

Z 職員宿舎D 講堂棟

RY 系統生物附属プレハブ棟

G 構造遺伝学研究センター

S 系統生物西附属棟

Building Area

H RI 実験棟

V 実験圃場管理施設(Total Floor Space)

Main Building

Library

Laboratory Building

Lecture Hall

Structural Biology Center

Radioisotope Laboratory

Computer Building I

Guest House

Genetic Strains Research Center

Center for Information Biology

土地総面積

Animal Research Building

Genetic Strains Research Center Annex

Genetic Strains Research Center West Building

Administration Building for Experimental Farm

Official Residence

101,352㎡

Institute Facilities and Grounds

内訳

Details

研究所敷地 95,080㎡
Institute Area

宿舎敷地

Residential Area

建築面積

建物延面積

6,272㎡
16,745㎡
41,472㎡（2015 年 4 月 1 日現在）

遺伝研マップ／ NIG Map

15

Outline of Departments, Research Centers and Experimental Farm
研究系・研究センター等の概要■ 分子遺伝研究系■ Department of Molecular Genetics

中心体の自己複製機構と生体内動態について複合的な方法を取り入れ研究を行っている。

The mechanisms of centrosome duplication and dynamics have been studied
using innovative and multi-disciplinary approaches.

■ 細胞遺伝研究系
細胞内で観察される遺伝現象を分子レベルで解明することを目指して、生細胞及び無細胞系を用いた研究を行っている。
■ 個体遺伝研究系

Fundamental genetic phenomena are being studied in living cells and in cell-freesystems to explain the phenomena observed at the cellular level in molecular terms.
■ Department of Developmental Genetics

ゼブラフィッシュ、マウスなどのモデル生物を用い、発生や行動など動物のさまざまな生命現象における遺伝子や細胞の役割についての研究を行っている。

We study roles of genes and cells during various biological phenomena ofanimals including development and behavior by using model organisms, zebrafish,and mouse.

■ 集団遺伝研究系■ Department of Population Genetics

生物進化の歴史とその機構を解明する目的で、実験的及び理論的手法を用いて、遺伝子やゲノムのレベルから集団のレベルまで幅広く研究している。
■ 総合遺伝研究系
ヒトの高次表現型のシステム医学、脊椎動物の神経回路形成機構、および植物のエ
ピジェネティック制御に関しての総合的な研究を行っている。
■ 新分野創造センター
若手の優れた研究者が独立して研究室を運営し、遺伝学とその周辺領域に新しい分野を開拓する研究を行う。これにより、研究共同体の中で重要な役割を果たす人材を育成する。
■ 系統生物研究センター
独自に開発・収集したマウス、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、イネ、原核生物の実験系統など有用な生物遺伝資源に立脚して、特色のある先端的研究を推進している。
■ 構造遺伝学研究センター
分子から多細胞の各レベルで、遺伝学と構造生物学の境界領域で最先端の研究を行うとともに、生体内の構造を観察・解析する様々な手法を開発し、遺伝学に導入している。
■ 生命情報研究センター
生命情報学の拠点として、情報処理技術を駆使して生命現象の解明を目指した発見
研究と生命科学の推進の為の技術開発を行っている。
■ 実験圃場
遺伝研における研究と事業支援のための植物遺伝資源作成、管理、分譲及び関連研究を行っている。
■ 放射線・アイソトープセンター
放射線や放射性同位元素を、研究利用するための共同利用施設である。137Cs を線源としたガンマー線照射装置を備えている。
□ 生物遺伝資源センター
生命科学を先導する様々なバイオリソースを開発し、それらの維持と国内外の大学や研究機関への分譲を行っている。関連情報は、データベース化して世界中に公開している。また、内閣府日本医療研究開発機構のナショナルバイオリソースプロジェクトにも参加している。

We are conducting experimental and theoretical studies on the history andmechanisms of organismal evolution from the gene and genome level to the
population level using various organisms, such as human, Drosophila, fish, andmouse.
■ Department of Integrated Genetics
By integrating various approaches in genetics, we study systems medicine oncomplex human traits, neural network formation of vertebrates, and epigenetic
controls of plants.
■ Center for Frontier Research
The Center for Frontier Research provides promising young scientists withindependent positions and an opportunity of developing new frontiers in genetics andrelated research fields. The Center thereby brings up scientists who will play crucial
roles in academic fields in the future.
■ Genetic Strains Research Center
This center promotes forefront researches of life science based upon uniquebioresources of mice, zebrafishes, Drosophila, rice and microorganisms, which aredeveloped and collected by this center.
■ Structural Biology Center
This center was founded to perform the pioneering researches in the new area
between genetics and structural biology, and to develop new methods and techniques
for the area.
■ Center for Information Biology
Develop the technologies and resources to make the massive data available,
useful and meaningful for the domain. Also conducts some wet or dry experiments forknowledge discovery.
■ Experimental Farm
The farm is responsible for plant resource generation, management, distribution
and related studies to support research and service in the NIG.
■ Radioisotope Center
The Radioisotope Center has facilities for biochemical experiments using
radioactive tracers. Irradiation treatment of 137Cs is also available.
□ Genetic Resource Center
The center develops, preserves forefront bioresources of various organisms, anddistributes them to domestic and overseas universities and institutes. The related
information is open to the public through the databases. The center participates
actively in “National BioResource Project (NBRP)” of AMED.

□ 先端ゲノミクス推進センター□ Advanced Genomics Center

学術分野における超大規模ゲノム情報研究推進の中核として先端ゲノミクス研究を進めるとともに、次世代型ゲノム情報解析パイプラインの提供等による共同利用・共同研究を推進する。

This Center is designed to conduct most advanced genomic researches and toprovide resources based on new-generation sequencing pipeline to the community.

□ DDBJ センター

DDBJ (DNA Data Bank of Japan) is a member of the international collaboration
with ENA/EBI (Europe) and NCBI (USA) that releases a whole catalogue of identified
DNA sequences. DDBJ is hosted by a supercomputer that also provides powerful
analytical tools and other databases.

DDBJ（DNA Data Bank of Japan）は論文や特許で公知にされる塩基配列データを網羅し管理公開する、米国（NCBI)と欧州（ENA/EBI）との協力事業である。他の生命系主要データベースや解析ツールと共にスーパーコンピューターを用いて公開している。
□ 情報基盤ユニット
研究所全体に関わる所内ネットワークの管理や情報セキュリティ対応支援などを行う。
運営については電子計算機委員会の下に行う。
□ マウス研究支援ユニット
マウスを用いた研究のサポートを目的として、・胚及び精子凍結・マウスクリーニング・
トランスジェニックマウス及び遺伝子ノックアウトマウス作製などを行う。
□ 動物飼育実験施設
所内におけるマウス・ラットなどの実験動物の主要な飼養保管施設として、動物の飼育及び実験のサポートを行い、研究・教育の推進に貢献する。

16■ Department of Cell Genetics□ DDBJ Center□ IT Unit
Responsible for the maintenance of computer network and information security
issues relevant to whole institute. The IT Unit is operated under the supervision of theComputer Committee.
□ Mouse Research Supporting Unit
In order to facilitate mouse research in NIG, the unit offers services such asembryo freezing, in vitro fertilization, mouse cleaning, and transgenic and knockout
mouse production.
□ Unit for Experimental Animal Care
The unit run a main animal facility of NIG, and aim to contribute to research andeducation by providing suitable rearing condition and research environment to use
mice and rats.

研究系・研究センター等の概要／ Outline of Departments, Research Centers, and Experimental Farm

Research Activities
遺伝研の研究活動

Department of Molecular Genetics

分子遺伝研究系

The mechanisms of centrosome duplication and dynamics
中心体の自己複製機構と生体内動態、そして起源の解明(A) Cell cycle-dependent centriole
formation. (B) SAS-6 homodimers
dictate the universal 9-fold symmetry ofcentrioles. (C) HsSAS-6, human SAS-6,
is required for centriole formation inhuman cells. Centrin: centriole marker.
（A）細胞周期に依存した中心小体の構築。
（B）SAS-6 二量体がカートホイール構造の中心部分を形成し、９回対称性を規定する。
（C）SAS-6 は中心小体複製に必要である。ヒト培養細胞において RNAi
法によりSAS-6 を発現抑制すると中心小体複製が阻害される。Centrin: 中心
小体マーカー。

The centrosome is a conserved organelle that serves as
the microtubule organizing center and regulates many
biological processes. However, the mechanisms governing
centrosome duplication and the underlying structuralprinciples remained poorly understood and represent a longlasting important question in biology.
We mainly focus on understanding the mechanisms ofcentrosome biogenesis and dynamics by using the
combination of innovative and multi-disciplinary approaches.
We are investigating the following specific aims by using
human cells, mouse, and C. elegans as model systems.

進化上保存された細胞小器官である中心体は微小管ネットワー
ク形成、ゲノム安定性維持を含む多様な生理現象を制御すること
で細胞がん化、遺伝病、不妊症を含む様々な疾患と密接に関与しています。これらの現象を司る上で、細胞分裂時に中心体は一度だけ自己複製する必要がありますが、そのメカニズムに関しては未解明な部分が多く、生物学の最大の謎の一つとされています。
当研究室ではヒト培養細胞、マウス、線虫を材料とし、多彩な手法を融合することで中心体構築、複製、動態の基本原理を解明することを目指します。

◦新規中心体構成因子の同定◦Identification of new players for centrosome biogenesis◦中心体複製の分子機構の解明◦Analysis of centrosomal interactome◦In vitro 再構成による中心体構築の構造学的モデリング◦In vitro reconstitution and modeling of centrosome

assembly◦発生過程における中心体動態及びその生理的意義の解明◦Centrosome dynamics and function in the context ofdevelopment

Division of Centrosome Biology 中心体生物学研究部門

Kitagawa Group

北川研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/CentrBio/Centrosome_Laboratory_web_Site/Welcome.html
Publications
Shiratsuchi, G., Takaoka, K., Ashikawa, T., Hamada, H., and Kitagawa, D. (2015). RBM14
prevents assembly of centriolar protein complexes and maintains mitotic spindle integrity.
EMBO J. 34, 97-114.

KITAGAWA, Daiju
Professor

北川大樹

18

教授

研究活動／ Research Activities

Ohta, M., Ashikawa, T., Nozaki, Y., Kozuka-Hata, H., Goto, H., Inagaki, M., Oyama, M., andKitagawa, D. (2014). Direct interaction of Plk4 with STIL ensures formation of a single
procentriole per parental centriole. Nature Communications 5, 5267.
Kitagawa, D., Vakonakis, I., Olieric, N., Hilbert, M., Keller, D., Olieric, V., Bortfeld, M., Erat, M.C.,
Flückiger, I., Gönczy, P., and Steinmetz, M.O. (2011). Structural basis of the 9-fold symmetryof centrioles. Cell 144, 364-375.

Department of Cell Genetics

細胞遺伝研究系

Molecular mechanism of eukaryotic DNA replication in the cell cycle
真核生物染色体の DNA 複製機構とその細胞周期による調節(A) AFM image of ORC-chromatin complexes. ORC (origin recognition complex) binds to replication origins, where DNA replication is initiated. We revealed thatchromatin structure stabilizes origin-ORC interaction. (B) Origin association of the low abundance replication proteins Sld3, Sld7, and Cdc45 is the key todetermining the temporal order of origin firing. Simultaneous over-expression of these proteins (“ON” in the figure) allows the late-firing origins to fire earlier in S
phase (arrow in the figure).
（A）複製開始領域を決定するORC複合体は、ヌクレオソームとの相互作用を介して安定に複製開始領域に結合する。図はORC-ヌクレオソーム複合体のAFM像。
（B）
複製開始のタイミングは Sld3-Sld7-Cdc45 複合体が制御している。細胞内でこの複合体を過剰発現させる（図中 “ON”）と複製のタイミングが異常を示し、lateorigin の複製が早期に開始する（図中矢印）。

Eukaryotic chromosome DNA is replicated exactly only
once per cell cycle and segregated to daughter cells. This
process ensures cells to transmit accurate genomic
information to their progeny. Eukaryotic DNA replication
initiates from multiple sites, called replication origins,
scattered throughout chromosomes and this initiation
process is strictly regulated by the cell cycle. However,molecular mechanism of DNA replication and its regulation in
eukaryotic cell cycle have not been well elucidated. To
approach this subject, we have isolated novel replication
factors of budding yeast and analyzed their functions.
◦Study on molecular mechanism of the initiation of DNA

replication using in vitro DNA replication system◦Study on the chromosome structures affecting the initiationof DNA replication◦Study on regulation of the initiation timing of replication
origins◦Study on regulatory mechanism of the initiation of DNA
replication by the cell cycle◦Study on the relationship between DNA replication and thecell cycle checkpoints

Division of Microbial Genetics

Araki Group

真核生物の染色体 DNA は、細胞周期のＳ期に一度だけ正確に複製され、娘細胞に分配されます。この機構により、遺伝情報は親から子に過不足無く正確に伝わります。真核生物の DNA 複製は、染色体上に散在する複数の場所から開始し、その開始が細胞周期により厳密に制御されています。しかし、染色体 DNA 複製の開始がどのように行われ、どうしてＳ期のみに複製されるのか、その詳
細はよく分かっていません。本研究室ではこの問題に答えるため、出芽酵母を真核生物のモデル系として、染色体 DNA 複製機構とその制御の研究を行っています。

◦試験管内複製系を用いた複製開始機構の研究◦染色体構造による複製開始制御機構の研究◦複製開始のタイミング制御の研究◦複製開始の細胞周期による制御機構の研究◦複製と細胞周期チェックポイントに関する研究

微生物遺伝研究部門

荒木研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MicGen/index.html
Publications
Hizume, K., Yagura, M., and Araki, H. (2013). Concerted interaction between origin
recognition complex (ORC), nucleosomes and replication origin DNA ensures stable ORCorigin binding. Genes Cells. 18, 764-779.

ARAKI, Hiroyuki
Professor

TANAKA, Seiji
Assistant Professor

HIZUME, Kohji
Assistant Professor

荒木弘之

田中誠司

日詰光治

教授

助教

助教

Tanaka, S., Komeda, Y., Umemori, T., Kubota, Y., Takisawa, H., and Araki, H. (2013). Efficient
initiation of DNA replication in eukaryotes requires Dpb11/TopBP1-GINS interaction. Mol. Cell
Biol. 33, 2614-2622.
Tanaka, S., Nakano, R., Katou, Y., Shirahige, K., and Araki, H. (2011). Origin association of
Sld3, Sld7, and Cdc45 proteins is a key step for determination of origin-firing timing. Current
Biology 21, 2055-2063.

研究活動／ Research Activities

19

Department of Cell Genetics

細胞遺伝研究系

Evolutionary integration of two independent organisms by endosymbioses
細胞内共生による異種細胞の統合機構の解明

Reminiscent of their cyanobacterial (A)ancestor, chloroplasts replicate bybinary division (B, unicellular alga; C,land plant cells). Chloroplast division is
performed by the division ring (D)which involves cyanobacterial FtsZand eukaryotic dynamin (E).

祖先のシアノバクテリア（A）と同様に、葉緑体は分裂によって増殖します（B,
単細胞の藻類；C, 陸上植物の細胞）。
我々は、葉緑体分裂がその分裂面に形成される分裂装置（リング）の収縮によって行われること（D）、分裂装置
がシアノバクテリア由来の FtsZと宿主細胞が加えた Dynamin 等から構成されていることを明らかにしました（E）。

Mitochondria and chloroplasts, energy-convertingorganelles in eukaryotic cells, are relicts of ancient bacterial
endosymbionts. In addition to these particular organelles,
there are many other endosymbiotic events which haveintegrated new functions into eukaryotic host cells. In orderto maintain a permanent endosymbiotic relationship, a hostcell and an endosymbiotic cell coordinate their proliferation.
The major goal of our study is to understand how organelle (orother endosymbiotic cell) division is controlled by host cells
and how host cells proliferate depending on chemical energythat are supplied by organelles (or other endosymbiotic cells).
◦Analyses of regulatory mechanisms of chloroplast/◦真核細胞による葉緑体・ミトコンドリアの分裂・増殖制御機構の解析

mitochondrial proliferation by eukaryotic host cells◦Analyses of coordinating mechanism of eukaryotic cell

cycle and energy and reactive oxygen species which areproduced by photosynthesis/respiration of chloroplasts
and mitochondria◦Analyses of coordinating mechanisms of host andendosymbiotic cell proliferation in endosymbiotic
associations other than mitochondria and chloroplasts

真核細胞内のエネルギー変換器、ミトコンドリアと葉緑体は、バクテリアが真核細胞内に共生して誕生しました。その他にも、真核細胞が別の細胞を取り込み新機能を獲得する例は広く存在します。
このような二種の細胞の世代を超えた持続的統合には、宿主細胞と共生細胞の協調増殖機構の確立が必須です。私たちは、（1）真核細胞による葉緑体とミトコンドリアの増殖制御、（2）細胞内小器官によるエネルギー供給と細胞の増殖の関係、（3）葉緑体とミ
トコンドリア以外の細胞内共生系における宿主細胞と共生体細胞の協調増殖機構を理解することで、細胞内共生成立の基本原理の解明を目指しています。

◦細胞周期進行、光合成・呼吸活性調節、活性酸素への対応の協調機構の解析
◦葉緑体・ミトコンドリア以外の細胞内共生系における宿主細胞・共生細胞の協調増殖機構の解析

Division of Symbiosis and Cell Evolution 共生細胞進化研究部門

Miyagishima Group

宮城島研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/SyCelEvo/Index_e.html
Publications
Miyagishima, S., Fujiwara, T., Sumiya, N., Hirooka, S., Nakano, A., Kabeya, Y., andNakamura, M. (2014). Translation-independent circadian control of the cell cycle in aunicellular photosynthetic eukaryote. Nat. Commun. 5, 3807.

MIYAGISHIMA, Shin-ya
Professor

宮城島進也

20

教授

研究活動／ Research Activities

Kabeya, Y., and Miyagishima, S. (2013). Chloroplast DNA replication is regulated by the redox
state independently of chloroplast division in Chlamydomonas reinhardtii. Plant Physiol. 161,
2102-2112.
Miyagishima, S., Suzuki, K., Okazaki, K., and Kabeya, Y. (2012). Expression of the nucleusencoded chloroplast division genes and proteins regulated by the algal cell cycle. Mol. Biol.
Evol. 29, 2957-2970.

Department of Developmental Genetics

個体遺伝研究系

Neuronal circuit development and function in the mouse brain
マウスを用いた脳神経回路発達の分子から個体までの統合的解析

Two-photon images of an
RFP-labeled neuron in thebarrel cortex at P5.
Morphological changes
during the 18-h-long.
Arrowheads: dendritic tips
(yellow: elongated; white:s t a b l e ; b l u e : re t r a c t e d ) .
Green: barrel center filledwith thlamocortical axon
terminals.

二光子顕微鏡によって観察した、新生仔マウスバレル野第4 層の神経細胞が正常に成長する様子。樹状突起の先端（矢頭）が伸び縮みしている
ことが わ かりま す。
（ 4.5h,9h, 18h の白の矢頭：変化しなかった枝。黄色の矢頭：伸びた枝。青色の矢頭：縮んだ 枝 。緑 色 の 部 分は視 床 ‒軸索終末のクラスター。
）

To u n d e r s t a n d d e v e l o p m e n t o f c o m p l e x y e t
sophisticated neuronal circuits underlying higher brain
function of mammals, integrative studies which cover frommolecules to whole animals are indispensable. By using awide range of techniques, such as mouse genetics (geneknockout), 2-photon microscopy, confocal microscopy,
histology and behavioral analyses, we are studying
mechanisms of development and function of mammalian
neuronal circuits.
Specific Aims:◦Activity-dependent development of neural circuits in the

neocortex: We are using mouse somatosensory cortex as
an ideal model system of activity-dependent circuit
maturation.

◦Roles of RacGAP α-chimerin in neural circuit development

and function: We are studying roles of α-chimerin invarious aspects of neuronal circuit development andfunction such as axon guidance, synapse formation andlearning and memory.

Division of Neurogenetics

形質遺伝研究部門

Iwasato Group

岩里研究室

哺乳類の脳は高度な情報処理を行いますが、その基盤となるのは、精密に構築された複雑な神経回路です。哺乳類の神経回路が発達し機能する分子・細胞機構を、マウス遺伝学（遺伝子ノックア
ウトなど）、二光子顕微鏡、共焦点顕微鏡、組織学、行動解析など幅広い技術を用いて研究しています。

主に以下の二つのテーマに取り組んでいます。
◦大脳皮質神経回路の神経活動依存的発達：ヒトの脳表面の大部分を占める大脳皮質は、哺乳類に特有の脳構造であり、知覚、
随意運動、思考、記憶など様々な高次脳機能を担います。大脳皮質の神経回路は、生まれた後、外界などから入る様々な刺激の影響を強く受けながら発達します。大脳皮質神経回路の生後発達の分子・細胞機構を、マウス体性感覚野（バレル野）をモデルとして研究しています。
◦神経回路発達におけるRacGAP αキメリンの役割：神経回路形
成は神経細胞の形（樹状突起、軸索、シナプスなど）の変化を伴います。細胞骨格の制御に関わるαキメリン蛋白質を軸に神経回路の発達と機能を研究しています。

http://homepage3.nifty.com/iwasato/
Publications
Suzuki, A., Lee, LJ., Hayashi, Y., Muglia, L., Itohara, S., Erzurumlu, RS., and Iwasato, T. (2015).
Thalamic adenylyl cyclase 1 is required for barrel formation in the somatosensory cortex.
Neuroscience 290, 518-529.

IWASATO, Takuji
Professor

MIZUNO, Hidenobu
Assistant Professor

岩里琢治

水野秀信

教授

助教

Iwata, R., Ohi, K., Kobayashi, Y., Masuda, A., Iwama, M., Yasuda, Y., Yamamori, H., Tanaka, M.,
Hashimoto, R., Itohara, S., and Iwasato, T. (2014). RacGAP α2-chimaerin function indevelopment adjusts cognitive ability in adulthood. Cell Rep. 8, 1257-1264.
Mizuno, H., Luo, W., Tarusawa, E., Saito, YM., Sato, T., Yoshimura, Y., Itohara, S., andIwasato, T. (2014). NMDAR-regulated dynamics of layer 4 neuronal dendrites during
thalamocortical reorganization in neonates. Neuron 82, 365-379.

研究活動／ Research Activities

21

Department of Developmental Genetics

個体遺伝研究系

The genetic basis of development and behaviors in zebrafish
ゼブラフィッシュを用いた高次生命現象の遺伝学的解析

GFP expression in specific cells, tissues
and organs by gene trapping andenhancer trapping. (upper, left) skeleton,(upper, right) cells on the skin, (lower, left)blood vessels, (lower, right) sensory
neurons.

遺伝子トラップ・エンハンサートラップ法
による細胞・組織・器官特異的GFP発現。
（左上）骨格、（右上）表皮上の細胞、（左下）血管、（右下）感覚神経。

Zebrafish is an excellent model vertebrate because ofhigh fecundity, rapid embryonic development, andtransparency at the embryonic and larval stages. We
developed the highly efficient transposon transposition
system in zebrafish, and developed powerful genetic
methods, including the transgenesis, gene trap, enhancer
trap, Gal4-UAS methods. By using these methods, wecreated a large number of transgenic fish lines that express
the yeast Gal4 transcription activator in specific cells, tissues
and organs. These transgenic fish serve as valuable
resources for the studies of developmental biology,
organogenesis, and neuroscience. We have applied thesemethods and the transgenic fish resource to study functional
neuronal circuits. Currently, we are analyzing the structureand function of specific neuronal circuits that regulate
locomotion, learning and memory. Also, we visualize neuronal
activity during animal’s behaviors by calcium imaging to
identify functional neuronal circuits in the brain.

小型熱帯魚ゼブラフィッシュ（Danio rerio）は、脊椎動物の発生・器官形成・行動等の高次生命現象を遺伝学的に研究するためのモデル動物として世界中で使われています。私たちは、世界で初めてゼブラフィッシュにおいて効率のよいトランスポゾン転移システ
ムを開発し、それを用いたトランスジェニックゼブラフィッシュ作製
法、遺伝子トラップ法、エンハンサートラップ法、Gal4-UAS 法の開発に成功してきました。私たちの研究室では、これらの方法を駆使して世界最大規模のトランスジェニックフィッシュリソースを構築し、特定の組織・細胞・器官で目的とする遺伝子を自由自在に発現させ、組織や細胞を可視化すること、あるいは機能操作することを可能にしてきました。
私たちはこれらの遺伝学的方法論やトランスジェニックフィッシュ
を用いて、国内外の研究者とはばひろく共同研究を展開するとともに、脊椎動物の行動・学習・記憶などを制御する神経回路、分子メカニズムの解明に取り組んでいます。私たちは、行動・学習・記憶に重要な中枢神経回路の可視化、それらの機能阻害と行動解析、神経活動のカルシウムイメージングなどの研究を精力的に行っています。
zTrap データベース：http://kawakami.lab.nig.ac.jp/ztrap/

Division of Molecular and Developmental Biology 初期発生研究部門

Kawakami Group

川上研究室

http://kawakami.lab.nig.ac.jp/
Publications
Muto, A., Ohkura, M., Abe, G., Nakai, J., and Kawakami, K. (2013). Real- Time Visualizationof Neuronal Activity during Perception. Current Biology 23, 307–311.
Asakawa, K., Abe, G., and Kawakami, K. (2013). Cellular dissection of the spinal cord motor
column by BAC transgenesis and gene trapping in zebrafish. Front. Neural Circuits 7, 100.

22

KAWAKAMI, Koichi
Professor

ASAKAWA, Kazuhide
Assistant Professor

MUTO, Akira
Assistant Professor

川上浩一

浅川和秀

武藤

教授

研究活動／ Research Activities

助教

彩

助教

Wada, H., Ghysen, A., Asakawa, K., Abe, G., Ishitani, T., and Kawakami, K. (2013). Wnt/Dkk
negative feedback regulates sensory organ size in zebrafish. Current Biology 23, 1559-1565.

Department of Population Genetics

集団遺伝研究系

Evolution of organisms at genomic level
ゲノムレベルにおける生物進化

Numbers of lineage-specific CNSs (evolutionarily Conserved Non-coding Sequences) of plant genomes. From Hettiarachchi et al. (2014).

植物ゲノムにおける系統特異的 CNS( 進化的に保存された非コード配列 ) の数。Hettiarachchi et al.  (2014) より。

We study evolution of organisms at the genomic levels
through computer analyses and wet experiments. We areparticularly interested in evolution of modern humans andprimate and mammalian evolution toward human.
◦DNA analysis of human populations: We study genetic

affinities of modern humans with special reference to thosein Asia. We also proceed ancient DNA analysis.

◦Analysis of genome evolution: We study lineage-specificevolutionary changes at different levels of organismgroups, such as vertebrates, mammals, primates, andhuman.

生物の進化をゲノムレベルでコンピュータ解析と実験の両面から研究しています。特に現代人集団の進化とヒトにいたる霊長類と哺乳類の進化に焦点をあてています。

◦古代DNA解析をふくめた、さまざまの人類集団のゲノム規模デー
タの解析◦哺乳類や植物において進化的に保存された非コード領域の解析◦ゲノム進化学研究に有用な解析法の開発◦Development of methods useful for evolutionary genomic

stutides.

Division of Population Genetics

Saitou Group

集団遺伝研究部門

斎藤研究室

http://www.saitou-naruya-laboratory.org
Publications
Hettiarachchi, N., Kryukov, K., Sumiyama, K., and Saitou, N. (2014). Lineage-specificconserved noncoding sequences of plant genomes: their possible role in nucleosome
positioning. Genome Biol. Evol. 6, 2527-2542.

SAITOU, Naruya
Professor

JINAM, Timothy A.
Assistant Professor

斎藤成也

ジナム ティモシー A.

教授

Babarinde, I. A., and Saitou, N. (2013). Heterogeneous tempo and mode of conserved
noncoding sequence evolution among four mammalian orders. Genome Biol. Evol. 5, 23302343.

助教

Jinam, T. A., Phipps, M. E., Saitou, N., and the Hugo Pan-Asian SNP Consortium. (2013).
Admixture patterns and genetic differentiation in negrito groups from West Malaysia estimatedfrom genome-wide SNP data. Hum. Biol. 85, 173-188.

研究活動／ Research Activities

23

Department of Population Genetics

集団遺伝研究系

Population genetics and genome evolution
集団遺伝とゲノム進化

Metabolic economics and microbrial proteome evolution. A) Chemical energy allocations for biosynthesis of a bacterial cell. About
75% of the budget is used for protein synthesis. Based on data from E. coli (Neidhardt et al. 1990). B) Protein adaptation for energetic
efficiency. In Bacillus subtilis, abundant proteins employ less energetically costly amino acids.
A）バクテリアでの生合成にかかるエネルギーの割合。バクテリアの細胞では約 75% のエネルギーがタンパク質合成に使われています (Neidhardt et al. 1990)。B）エネルギーコストに関わるタンパク質の進化。枯草菌のゲノムを見てみると、量の多いタンパク質はコストの安いアミノ酸を使って合成されていることが分かります。

We combine theoretical and laboratory studies to study
mechanisms of genome evolution. Current interests include:

本研究室では、ゲノム進化のメカニズムを解明するために、理論と実験を組み合わせた研究を行っています。現在の研究テーマ
は以下のようなものです。

◦Studying lineage-specific patterns of silent and protein

evolution. Both weak selection and departures from steadystate appear to be prevalent features of molecular
evolution in Drosophila.

◦Modeling evolutionary processes. We employ computer

simulations of weak selection with genetic linkage andfitness interactions among mutations to determine
statistical methods to detect subtle forces in evolution.

◦Identifying biosynthetic constraints in protein evolution.

Natural selection is thought to act upon protein structures
to optimize their functions. Selection for efficient synthesis
may also be important to understand protein size,
composition, and evolutionary rate; relationships between
gene expression and protein evolution may reveal
adaptation for metabolic and translational efficiency.

Division of Evolutionary Genetics

Akashi Group◦サイレント座位とタンパク質との系統特異的な進化パターンの研究。キイロショウジョウバエでの分子進化は、弱い淘汰と非平衡状態が一般的特徴であると考えられます。
◦弱い力が変動する場合の進化過程のモデル化。変異間の連鎖と適応度の相互作用を組み入れたコンピューターシミュレーショ
ンを用いて、進化上の弱い淘汰を検出するための手法を開発しています。
◦タンパク質の進化と生合成過程の研究。タンパク質の構造は、細胞内での機能が自然選択によって最適化された結果であると考えられます。また、タンパク質の生合成効率に働く自然選択
もタンパク質の大きさ、組成、進化速度などを決めていると考えられます。われわれは、遺伝子発現とタンパク質進化パターンとの関連を研究することにより、代謝および翻訳の効率に関わる適応について研究しています。

進化遺伝研究部門

明石研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/EvoGen/index.html
Publications
Akashi, H., Osada, N., and Ohta, T. (2012). Weak selection and protein evolution. Genetics
192, 15-31.
Osada, N., and Akashi, H. (2012). Mitochondrial-Nuclear Interactions and Accelerated
Compensatory Evolution: Evidence from the Primate Cytochrome c Oxidase Complex. Mol
Biol. Evol. 29, 337–346.

AKASHI, Hiroshi
Professor

明石

24

裕

教授

研究活動／ Research Activities

Akashi, H. (2003). Translational selection and yeast proteome evolution. Genetics 164, 12911303.

Department of Population Genetics

集団遺伝研究系

Genetics of adaptive radiation
適応放散の遺伝機構

Our research takes an integrative approach across diverse disciplines. The first step is to conduct a detailed ecological survey of natural variation among stickleback populations collected from diverse
environments. Next, we use genetic and genomic tools to study the genetic architecture of ecologically important phenotypic traits and also identify candidate genes responsible for adaptation and speciation.
Then, we use transgenic and knockout approaches to study the detailed molecular and physiological functions of these candidate genes in vivo. Furthermore, we plan to use semi-natural ponds to get insight
into how different alleles behave within natural populations.

地道なフィールド調査と飼育室内での実験によって、野外生物にみられる行動や生理や形態の変異を解析します。ついで、古典的な遺伝的手法や最新のゲノミックス技術などを援用し、遺伝基盤や候補遺伝子を解明していきます。また、遺伝子操作法による分子機能解析に加え、ビオトープ池を用いたミクロ生態系での生態実験を用いて分子から生態までをつないでいきます。

Our research goal is to understand the molecularmechanisms underlying the evolution of biodiversity. Althoughmany genes important for animal development and behavior
have been identified in model organisms, little is known
about the molecular mechanisms underlying naturally
occurring phenotypic variation important for adaptation andspeciation in wild populations. Furthermore, little is known
about how newly evolved alleles important for adaptationand speciation spread within natural populations. To
understand these ecological and genetic mechanisms, we
mainly use stickleback fishes as a model. Our research takes
an integrative approach across diverse disciplines.

どうやって新たな種が生まれるのか。生き物がどのようにして多様な環境に適応していくのか。生物多様性進化を巡るこれらの問いに対して、トゲウオやメダカを用いながら迫ります。表現型変化に関わる遺伝子は、実験モデル生物において多く同定されてきましたが、野外生物における種分化や適応進化の分子機構は多くが未解明です。また、原因対立遺伝子が野外集団内でどのように広まっていくのかについても多くが未解明です。これらを解明するために、フィールド調査から始まり、ゲノミックスや遺伝子工学、生態実験などを統合的に用います。

◦適応放散を引き起こした鍵形質の分子基盤◦Genetic basis of key traits that trigger adaptive radiation◦Molecular mechanisms of hybrid abnormality◦Molecular mechanisms underlying variation in phenotypic

plasticity◦雑種異常の原因遺伝子の特定◦表現型可塑性変異の遺伝機構◦性的二型の進化遺伝機構◦Genetic mechanisms of the evolution of sexually dimorphic

traitsDivision of Ecological Genetics

Kitano Group

生態遺伝学研究部門

北野研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/EcoGene/
Publications
Yoshida, K., Makino, T., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Hasebe, M., Kawata, M., Kume, M., Mori, S.,
L. Peichel, C. L., Toyoda, A., Fujiyama, A., and Kitano, J. (2014). Sex chromosome turnovercontributes to genomic divergence between incipient stickleback species. PLoS Genetics, 10,e1004223.
Ishikawa, A., Takeuchi, N., Kusakabe, M., Kume, M., Mori, S., Takahashi, H., and Kitano, J. (2013).
Speciation in ninespine sticklebacks: reproductive isolation and phenotypic divergence among
cryptic species of Japanese ninespine stickleback. Journal of Evolutionary Biology 26, 1417–1430.

KITANO, Jun
Professor

北野

潤

教授

Yoshida, K., and Kitano, J. (2012). The contribution of female meiotic drive to the evolution of neosex chromosomes. Evolution 66, 3198-3208.

研究活動／ Research Activities

25

Department of Integrated Genetics

総合遺伝研究系

Genomic medicine with next generation sequencing technology
次世代シーケンサーを駆使したゲノム医学研究

The the basic unit of heredity as disease causality might well be the regulatory region and not only the gene. The integrated functional
properties based on a Next generation sequencer will open the way to understand the disease mechanisms.
疾患メカニズムの解明にはゲノム配列だけでなく、遺伝子を含む全ての転写産物とそれらを制御する領域および因子を合わせて理解する必要があります。次世代シーケンサーを使ったこれらの解析により、疾患メカニズムを明らかにすることを目指しています。

Our research goal is to elucidate disease causalities andtheir patho-etiologies, and ultimately to develop therapeutic
tool. With the advent of next generation sequencing
technologies, it becomes very handy to identify causalities ofmonogenic diseases as well as complex diseases. With thevast of genomic information at hand, we will combine gene
expression profiles of the responsible tissues together withclinical information to understand the global picture ofdiseases.

本研究室では、次世代シーケンサーで得られる膨大な塩基配列
情報を医学研究に活用し、ヒト疾患の理解、治療法の開発に寄与することを目指しています。疾患ゲノム研究は原因となっている遺伝子変異、多型を検出することを当初の目標としていますが、病変組織における遺伝子発現プロファイル、ネットワーク解析を組み合わせることにより、疾患メカニズム理解につなげる研究も推進します。また多因子疾患における疾患感受性遺伝子は進化的な意義を有することが多く、集団遺伝学的な検討も試みています。

◦Exome analyses of monogenic and complex diseases◦全エクソンシーケンスによる希少遺伝性疾患遺伝子同定◦Genetic susceptibility of intracranial aneurysms and its◦脳動脈瘤感受性遺伝子同定と疾患メカニズム解明

pathphysiology◦HLA 遺伝子のハプロイドゲノム配列決定◦Haploid seguencing of HLA genes◦Mathmatical modeling of phenome-genome relationship

Division of Human Genetics

Inoue Group◦統計数理モデルによる高次表現型と遺伝型との関連

人類遺伝研究部門

井ノ上研究室

http://humgen.lab.nig.ac.jp/
Publications
Hayano, T., Yokota, Y., Hosomichi, K., Nakaoka, H., Yoshihara, K., Adachi, S., Kashima, K., Tsuda,
H., Moriya, T., Tanaka, K., Enomoto, T., and Inoue, I. (2014). Molecular characterization of an intact
p53 pathway subtype in high-grade serous ovarian cancer. PLoS ONE. 9, e114491.

INOUE, Ituro
Professor

井ノ上逸朗

26

NAKAOKA, Hirofumi
Assistant Professor
教授

中岡博史

研究活動／ Research Activities

助教

Omer, W.H., Narita, A., Hosomichi, K., Mitsunaga, S., Hayashi, Y., Yamashita, A., Krasniqi, A.,
Iwasaki, Y., Kimura, M., and Inoue, I. (2014). Genome-wide linkage and exome analyses identify
variants of HMCN1 for splenic epidermoid cyst. BMC Med. Genet. 15, 115.
Yu, W., Zheng, H., Lin, W., Tajima, A., Zhang, Y., Zhang, X., Zhang, H., Wu, J., Han, D., Rahman, N.A.,
Korach, K.S., Gao G, F., Inoue, I., and Li, X. (2014). Estrogen promotes Leydig cell engulfment bymacrophages in male infertility. J. Clin. Invest. 124, 2709-2721.

Department of Integrated Genetics

総合遺伝研究系

Genetics of epigenetics
エピジェネティクスの遺伝学

T h e i b m 1 ( i n c re a s e i n B O N S A I
methylation) mutation induces
developmental defects, which aresuppressed by mutation in the H3K9
methylase gene KYP or non-CG
methylase gene CMT3. The results
suggest that these phenotypes are
due to ectopic deposition ofheterochromatin marks, such as
H3K9 methylation and non-CG
methylation.

シロイヌナズナの ibm1 突然変異による発生異常表現型は、H3K9 メチル化酵素遺伝子 KYP や非 CpG メチル化酵素遺伝子 CMT3 の突然変異で抑圧される。

To understand control and function of DNA methylation,
we are taking genetic approaches using mutants ofArabidopsis. An Arabidopsis protein DDM1 (decrease in DNA
methylation) is necessary for methylating transposons andrepeats. On the other hand, IBM1 (increase in BONSAI
methylation) is necessary for not methylating genes. In
mutants of genes encoding these proteins, several types ofdevelopmental abnormalities were induced. Characterizationof these abnormalities is revealing impact of DNA methylation
on genome evolution and appropriate gene expression.

Division of Agricultural Genetics

Kakutani Group

細胞分裂後に継承される遺伝情報の実体は塩基配列です。一方、
塩基配列以外の形で、遺伝子の ON ／ OFF 情報が娘細胞に伝わる現象が多くの生物で観察されます。このような「エピジェネティッ
ク」な現象の実体は、DNA のメチル化などのクロマチンの修飾であることがわかってきています。私達は、シロイヌナズナのゲノム
DNA のメチル化を制御する因子の変異体を用いたアプローチで、ゲノム進化や個体発生におけるエピジェネティックな制御の役割とその機構について研究しています。

育種遺伝研究部門

角谷研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/AgrGen/home-j.html
Publications
Tsukahara, S., Kawabe, A., Kobayashi, A., Ito, T., Aizu, T., Shin-I, T., Toyoda, A., Fujiyama, A.,
Tarutani, Y., and Kakutani, T. (2012). Centromere-targeted de novo integrations of an LTR
retrotransposon of Arabidopsis lyrata. Genes Dev. 26, 705-713.

KAKUTANI, Tetsuji
Professor

TARUTANI, Yoshiaki
Assistant Professor

INAGAKI, Soichi
Assistant Professor

角谷徹仁

樽谷芳明

稲垣宗一

教授

助教

助教

Inagaki, S., Miura-Kamio, A., Nakmura, Y., Lu, F., Cao, X., Kimura, H., Saze, H., andKakutani, T. (2010). Autocatalytic differentiation of epigenetic modifications within the
Arabidopsis genome. EMBO J. 29, 3496-3506
Tsukahara, S., Kobayashi, A., Kawabe, A., Mathieu, O., Miura, A., and Kakutani, T. (2009).
Bursts of retrotransposition reproduced in Arabidopsis. Nature 303, 423-426

研究活動／ Research Activities

27

Department of Integrated Genetics

総合遺伝研究系

Approaching brain function through studying development of nervous systems
神経発生から眺める脳機能

Top: The bundle of callosal axons(green) connecting brain hemispheres(arrow) is thinner in the M6a/M6b
double mutant brain (right). Bottom:
callosal axon trajectories traced with
Supernova system. In the double
mutant brain (right), the axons are
not simply shorter but also
disorganized, and some are evenmisdirected subcortically (arrows).

M6a/M6b 二重変異マウスの脳（右）では，左右大脳半球をつなぐ脳梁軸索（緑）の本数が著しく減少し、束が細くなる（矢印）。下：Supernova システムによりトレースした軸索の形態。
M6a/M6b 二重変異マウスの脳（右）では、軸索が短いだけでなく、走行方向が乱れ、誤った部位に伸びている（矢印）。

The brain circuitry is made up of an enormous numberof neurons. It is constructed by sequential developmental
steps, such as neuronal differentiation, migration, axon
guidance, and target recognition, under the genetic control.
The resulting wiring patterns determine the characteristics ofanimals’ behavior and mental activities. Although the brain
has a plastic feature and can change through learning andadapting, the core element of brain circuitry is almost fixedand non-rewireable after the completion. We focus on thisrigid feature of the brain constructed by the rules of neuraldevelopment and are trying to examine how thedevelopmental wiring design can shape brain function. We
are currently pursuing the following projects.

脳は膨大な数の神経細胞が織りなす回路です。遺伝子に記された発生プログラムに従って、神経細胞が生まれ、移動し、軸索を伸長して、標的細胞と配線されて作られます。この配線パターンが、動物の行動や思考といった脳機能の特徴を決めています。経験や学習によって柔軟に変化できる脳ですが、実のところ、いったん作られた配線のほとんどは固定されており、書き換え不能です。当研究室では、発生期につくられる神経回路の配線のルールを理解する事で、脳の頑固な部分に迫りたいと考えています。具体的には次のテーマで研究しています。

◦嗅覚中枢神経回路と機能の研究◦神経細胞移動の研究◦Central Olfactory Circuits and Function◦軸索ガイドの研究◦Neuronal Migration◦脳構造の進化的研究◦Axon Guidance◦Evolution of Brain Architecture

Division of Brain Function

Hirata Group

脳機能研究部門

平田研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/Brain/new/j/hirata_lab_j/toppu.html
Publications
Mita, S., de Monasterio-Schrader, P., Fünfschilling, U., Kawasaki, T., Mizuno, H., Iwasato, T.,
Nave, KA., Werner, HB., and Hirata, T. (2014). Transcallosal Projections Require Glycoprotein
M6-Dependent Neurite Growth and Guidance. Cereb. Cortex. bhu129.

HIRATA, Tatsumi
Professor

平田たつみ

28

教授

KAWASAKI, Takahiko
Assistant Professor

Zhu, Yan
Assistant Professor

川崎能彦

トウー ヤン

研究活動／ Research Activities

助教

助教

Suzuki, K., and Hirata, T. (2014). A common developmental plan for neocortical geneexpressing neurons in the pallium of the domestic chicken Gallus gallus domesticus and theChinese softshell turtle Pelodiscus sinensis. Front. Neuroanat. 8, 20.
Suzuki, I.K., Kawasaki, T., Gojobori, T., and Hirata, T. (2012). The temporal sequence of the
mammalian neocortical neurogenetic program drives mediolateral pattern in the chick pallium.
Dev. Cell 22, 863-870.

Center for Frontier Research

新分野創造センター

A new molecular genetics to understand DNA transactions in human cells
ヒト細胞における新たな分子遺伝学を用いたDNAトランスアクションの解析

The AID system(A) Schematic illustration of the AID system. TIR1 derived from aplant forms an SCF-TIR1 E3 ubiquitin ligase with the endogenous
factors when expressed in human cells. Auxin promotes theinteraction between TIR1 and AID for poly-ubiqutylation of AID.
Therefore, AID-fused proteins are degraded by the proteasome. (B)TIR1 and GFP-AID fused with a nuclear localization signal wereexpressed in human 293 cells. After addition of auxin, GFP was
detected by a time-lapse microscopy. (C) Quantification of GFP
signal. Most of GFP was degraded by 60 min.

オーキシン誘導デグロン（AID）法（A）AID 法の原理。植物由来の F-box 因子 TIR1 を発現させた細胞において、TIR1 は内在性因子とSCF-TIR1 E3 ユビキチンリガー
ゼ複合体を形成する。オーキシンは TIR1とAID タグの結合を促進することで、AID 融合タンパク質を分解に導く。
（B）TIR1 とGFP-AID に核局在シグナルを融合したタンパク質を人 293 細胞に発現させた。培地にオーキシン添加後、経時的にGFPを観察した。
（C）GFP シグナルを定量化した。60 分程度で大部分の GFP が分解されていることがわかる。

We are aiming to generate a new molecular genetics ofhuman cells by using new technologies. By transplanting aplant-specific degradation pathway to human cells, we haveestablished the auxin-inducible degron (AID) system, withwhich the expression of proteins of interest can be timely
controlled by addition of a plant hormone, auxin. By
combining the gene-editing technology with the AID system,
we wish to understand how genomic DNA is maintained inhuman cells. In particular, we are focusing on the relationshipbetween DNA replication and other DNA transactions.

当研究室では、新技術を利用することでヒト細胞における新たな分子遺伝学を創生したいと思っています。すでに、私たちは植物ホルモンオーキシンにより活性化される、植物内のタンパク質
分解メカニズムをヒト細胞に移植することで、特定のタンパク質をオーキシン依存的に分解除去する方法を開発しました（AID 法）。
さらには、ゲノム編集技術と組み合わせてAID法を利用することで、ヒト細胞のゲノム DNA がいかに維持されているのか、特に DNA
複製と他の DNAトランスアクションの関連性を明らかにしようとしています。

◦Improvement and application of the AID system in human◦ヒト細胞での利用に向けた AID 法の改良と応用

cells◦Development of genome-editing technologies for the useof the AID system◦Understanding of the relationship between DNA replicationand homologous recombination in DNA inter-strand
crosslink repair◦AID 法を発展させるためのゲノム編集技術開発◦DNA 二本鎖架橋修復に対する DNA 複製と相同組換えの関係性の理解◦複製フォークにおけるDNAトランスアクションの解明◦Understanding of DNA transactions at the replication fork

Molecular Function Laboratory

分子機能研究室

Kanemaki Group 鐘巻研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MolFunc/Molecular_Function_HP/Home.html
Publications
Nishimura, K., and Kanemaki, MT. (2014). Rapid Depletion of Budding Yeast Proteins via the
Fusion of an Auxin-Inducible Degron (AID). Current Protocols in Cell Biology, 64, 20.9.120.9.16.

KANEMAKI, Masato
Associate Professor

鐘巻将人

准教授

Kubota, T., Nishimura, K., Kanemaki, MT., and Donaldson, AD. (2013). The Elg1 Replication
Factor C-like Complex Functions in PCNA Unloading during DNA Replication. Molecular Cell,
50, 273-280.
Nishimura, K., Ishiai, M., Horikawa, K., Fukagawa, T., Takata, M., Takisawa, H., andKanemaki, MT. (2012). Mcm8 and Mcm9 Form a Complex that Functions in Homologous
Recombination Repair Induced by DNA Interstrand Crosslinks. Molecular Cell, 47, 511-522.

研究活動／ Research Activities

29

Center for Frontier Research

新分野創造センター

Molecular basis of plant cell morphogenesis
植物細胞の形態形成：空間を制御する分子システムの理解(A) Xylem vessels develop various secondary cell wall patterns. (B) Xylogenic Arabidopsis cultured cells. Red signals indicate secondary cell walls. (C) Cortical microtubules in the differentiating xylem
cell. (D) Secondary cell walls (yellow) and plasma membrane domains (green). (E) Reconstruction assay for secondary cell wall patterns. Magenta: plasma membrane domains. Green: microtubules.
A）木部道管の様々な二次細胞壁パターン。B）木部道管分化誘導系。二次細胞壁（赤）の沈着が認められる。C）二次細胞壁の沈着を誘導する微小管。D）Rho GTPase が活性化（緑）し、二次細胞壁（黄）の沈着を阻害している。E）細胞壁パターンの再構築。Rho GTPase（紫）が細胞膜ドメインを形成し、微小管（緑）と相互作用している。

A specifically patterned cell wall is a determinant of plant
cell shape. However, the precise mechanism underlying thecell wall patterning is still elusive. The main purpose of ourstudy is to reveal how plant cells establish proper cell wall
patterns. We focus on xylem vessel cells that deposit
secondary cell walls in various patterns such as spiral,
reticulate, and pitted patterns. By using our xylogenic cell
culture system and pattern reconstruction assay, we haverevealed that cortical cytoskeletons and Rho GTPases play acentral role in the secondary cell wall patterning.

多細胞生物の発生は個々の細胞が適切な形態と機能を獲得することによって成し遂げられます。植物細胞は堅い細胞壁に覆われており、この細胞壁の沈着パターンを変化させることにより様々な細胞を作り出しています。私たちの研究室では、螺旋、網目、孔紋などのパターンに従って二次細胞壁を形成する木部道管に着目し、植物細胞が空間的なパターンを創り出す仕組みを研究しています。独自に開発した木部道管分化誘導系と細胞壁パターンの再構築実験系を用い、主に細胞骨格とRho GTPase の働きを調べています。

◦Regulation of cortical microtubules and cortical actin◦表層微小管・アクチン繊維の制御因子の探索と機能解析

microfilaments◦Spatial interaction between cortical cytoskeleton andplasma membrane domains◦Spontaneous pattern formation by Rho GTPases◦細胞骨格と細胞膜ドメインの相互作用の研究◦Rho GTPase による自発的な空間パターンの構築機構の研究◦細胞壁パターン形成のモデリング◦Modeling of cell wall pattern establishment

Cell Dynamics and Organization Laboratory 細胞空間制御研究室

Oda Group

小田研究室
Publications
Oda, Y., and Fukuda, H. (2013). Rho of plant GTPase signaling regulates the behavior of
Arabidopsis kinesin-13A to establish secondary cell wall patterns. Plant Cell 25, 44394450.
Oda, Y., and Fukuda, H. (2012). Initiation of cell wall pattern by a Rho- and microtubuledriven symmetry breaking. Science 337, 1333-1336.

ODA, Yoshihisa
Associate Professor

小田祥久

30

准教授

研究活動／ Research Activities

Oda, Y., Iida, Y., Kondo, Y., and Fukuda, H. (2010). Wood cell-wall structure requires
local 2D-microtubule disassembly by a novel plasma membraneanchored protein.
Current Biology 20, 1197-1202.

Center for Frontier Research

新分野創造センター

Cellular mechanochemistry regulating eukaryotic chromosome dynamics
真核生物の染色体動態を制御する細胞のメカノケミストリー(A) Xenopus laevis, our primary modelorganism. Eggs from female frogs (B) areused to prepare cytoplasmic extracts, inwhich the spindle apparatus and the cell
nucleus can be in vitro assembled andmicromanipulated. Image in (C) shows ametaphase spindle assembled in extracts
and visualized by fluorescently labeled
tubulin. A pair of glass microfibers can beused to apply mechanical force. Inset
illustrates the geometry of the set-up（A）モデル生物として主に用いているア
フリカツメガエル。メスの卵（B）から調製される細胞質抽出液を用いて紡錘体や細胞核を in vitro 再構成し、顕微鏡下で直接力学操作することができる。
（C）の写
真は、抽出液内で形成した分裂中期紡錘体（写真中央）に２本の微小ガラスファイ
バーを用いて力の刺激を与えているところ。挿絵はその模式図。

The cell’s ability to sense and respond to mechanicalforce is crucial to many biological processes, including cell
division and differentiation. Our laboratory uses novel
biophysical methods which combine controlled
micromanipulation techniques (e.g., laser tweezers, glass
microfibers) and high-resolution fluorescence microscopy (e.g.,confocal and TIRF imaging) to characterize physicochemical
nature of the mitotic spindle and the cell nucleus. Thoroughquantitative analyses of their micromechanics and molecularbiochemistry, we aim to understand the principles of how
cells are structured to respond to defined mechanical cues
and aim ultimately to use the knowledge to control cellularbehavior.

細胞がメカニカルな力を感知して応答する能力は、細胞分裂や分化を初めとするさまざまな生命プロセスにとって必要不可欠です。
私達の研究室では、レーザーピンセットやガラスファイバーを用いたマイクロマニピュレーション技術と高解像度の蛍光イメージング手法を用いて、遺伝子動態制御の中核を担う紡錘体や細胞核がどのような物理化学特性を備えているかを調べています。それらのメカニクスと分子反応ケミストリーの関係を定量的に明らかにすることを通して、細胞が規定された機械シグナルに適切に応答す
るためにどのように構造化されているかを理解し、最終的にはその知識を使って細胞の挙動を任意に制御することを目指して研究しています。

Quantitative Mechanobiology Laboratory 定量メカノバイオロジー研究室

Shimamoto Group 島本研究室
Publications
Takagi, J., Itabashi, T., Suzuki, K., Kapoor, T. M., Shimamoto, Y., and Ishiwata, S. (2013).
Using micromanipulation to analyze control of vertebrate meiotic spindle size. Cell Rep. 5,
44-50.

SHIMAMOTO, Yuta
Associate Professor

島本勇太

准教授

Shimamoto, Y., and Kapoor, T. M. (2012). Microneedle-based analysis of the micromechanicsof the metaphase spindle assembled in Xenopus laevis egg extracts. Nat. Protoc. 7, 959969.
Shimamoto, Y., Maeda, Y. T., Ishiwata, S., Libchaber, A. J., and Kapoor, T. M. (2011). Insights
into the micromechanical properties of the metaphase spindle. Cell 145, 1062-1074.

研究活動／ Research Activities

31Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Integrative genetics of mouse complex traits
マウス高次形質の統合的遺伝解析

BA

The sexual isolation caused by incompatibility in gene regulatory system. (A) The sexual isolation is established between two mouse subspecies, M. m. domesticus and M. m. molossinus. (B) A X-chromosome
substitution strain, B6-ChrXMSM, in which X chromosome of domesticus-derived C57BL/6J is replaced by counterpart of molossinus-derived MSM strain, shows reproductive isolation. Transcriptome analysis
showed misregulation in 20% of X-linked genes expressed in the testicular cells of B6-ChrXMSM strain. This misregulation was partly caused by the regulatory incompatibility between C57BL/6J-derived transacting regulatory factors and MSM-derived cis-regulatory elements. This study was done as a project of “Life Systems” of Trans-Disciplinary Research Integration Center, ROIS. (From Oka et al. 2014).

遺伝子発現調節の不適合による生殖隔離。
（A）マウスのドメスティカス亜種とモロシヌス亜種の間には生殖隔離が成立している。
（B）ゲノムの９割以上がドメスティカス亜種由来の実験用系統 C57BL/6J の遺伝的背景に、モロシヌス亜種 MSM 系統のＸ染色体を導入すると、生殖隔離が再現されることから、X 染色体に原因遺伝子が存在すると考えられた。Ｘ染色体コンソミック系統の精巣細胞で、Ｘ染色体連鎖遺伝子の２割に発現異常がみられた。これは、MSM 由来のシス調節因子の影響、または C57BL/6J 系統由来の転写因子とMSM 由来シス調節因子との間に起こった不適合が原因と考えられた。本研究は、新領域融合研究プロジェクトの一環として行われた ( 岡ら（2014）)。

In order to understand genetic basis underlying complex
traits, such as morphology and energy metabolism, we areconducting genetic analyses based upon both of “Forward
Genetics” using existing mouse mutants and“Reverse
Genetics” using genetically engineered mice. In parallel, we
are also compiling information of the genome diversity of
inbred mouse strains, and developing new inter-subspecificconsomic strains, in which every chromosome of a classicalinbred strain C57BL/6J is replaced by the counterpart of awild mouse-derived MSM/Ms strain. These bioresources arefreely available for research community.
Current ongoing research projects are as follows:◦遺伝子発現制御の染色体ダイナミクス◦シス制御因子を中心とした遺伝子発現制御システムの進化発生学◦Chromosomal dynamics for gene regulation◦Evolution of cis-regulation systems of developmental

genes◦マウスゲノム多型情報と表現型情報の収集とデータベース構築◦Data banking of genome diversity and phenotypes ofmouse strains◦Genetic mechanism of reproductive isolation in mice
◦Genetic dissection of complex traits by use of mouseconsomic strains

Mammalian Genetics Laboratory

Shiroishi Group

当研究室では、マウス近交系統や突然変異体の表現型に着目した“順遺伝学”と遺伝子改変マウスを用いた“逆遺伝学”の両方
法論を駆使して、形態形成やエネルギー代謝などの高次生命現象を制御する遺伝メカニズムの統合的理解をめざしています。また、
生物遺伝資源事業として、野生マウス由来系統を含めたゲノム多型情報や表現型情報の収集と整備を行うとともに、亜種間コンソ
ミック系統など、マウス機能ゲノム学のためのバイオリソースの開発を進めています。個別研究課題は以下の通りです。

◦マウスコンソミック系統を利用した生殖隔離成立の遺伝メカニ
ズム◦マウスコンソミック系統を利用した形態・代謝の遺伝制御システ
ム

哺乳動物遺伝研究室

城石研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MamMalg/home-j.html
Publications
Oka, A., Takada, T., Fujisawa, H., and Shiroishi, T. (2014). Evolutionarily diverged regulation of
X-chromosomal genes as a primal event in mouse reproductive isolation. PLoS Genet. 10,e1004301.
Tamura, M., Amano, T., and Shiroishi, T. (2014). The Hand2 gene dosage effect indevelopmental defects and human congenital disorders. Curr. Top. Dev. Biol. 110, 129-152.

32

SHIROISHI, Toshihiko
Professor

TAKADA, Toyoyuki
Assistant Professor

AMANO, Takanori
Assistant Professor

城石俊彦

高田豊行

天野孝紀

教授

研究活動／ Research Activities

助教

助教

Takada, T., Ebata, T., Noguchi, H., Keane, T.M., Adams, D.J., Narita, T., Shin-I, T., Fujisawa, H.,
Toyoda, A., Abe, K., Obata, Y., Sakaki, Y., Moriwaki, K., Fujiyama, A., Kohara, Y., andShiroishi, T. (2013). The ancestor of extant Japanese fancy mice contributed to the mosaic
genomes of classical inbred strains. Genome Res. 23, 1329-1338.

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Developmental genetic studies using gene engineering technology in mice
マウス発生工学を用いた初期発生現象の解析(A-B) Notch signaling is activated onlyin the caudal part of each somite. (C)Nanos2 proteins (green) are localized in
the P-bodies in cytoplasm of embryonicmale germ cells (red). (D) A section of
adult seminiferous tubule, in which
Nanos2 (green) expression is
maintained in the spermatogonial stem
cell (magenta). Only stem cells remain,
while sperm differentiation issuppressed.
A-B．体節における Notch シグナルの活性を GFPレポーターで可視化した。
Notch シグナルは体節の後方部でのみ活性化。C．胎生期の雄生殖細胞（赤）におけるNanos2 タンパク質（緑）の局
在。D．Nanos2を持続発現（緑）すると、分化した精子細胞は失われ、幹細胞（マゼンタ）が増加する。生後６週の精細管。

We are interested in the mechanism of germ cell
development, especially the function of RNA binding
proteins, Nanos2 and Nanos3. We aim to elucidate thetarget RNAs to understand the events associated with
Nanos-mediated RNA regulation. We are also interested in
the molecular mechanism of heart formation and somite
segmentation. Mesp2 initiates somite segmentation via
repressing the upstream factor Tbx6. We are focusing on the
repression mechanism. Recently we have introduced CAS9mediated genome editing method to facilitate mutant mouseproduction. Our research themes include:

発生過程ではいろいろな遺伝子が時間的・空間的に正確な制御下で発現し、機能を発揮します。そのような遺伝子の機能及び発現調節機構を解明するためにはマウスを用いた個体レベルの解析は重要です。当研究室では発生工学的手法を用いて多くの遺伝
子ノックアウトマウス、蛍光タンパク質ノックインマウスやトランスジェ
ニックマウスを自ら作成し個体レベルで解析することにより、生体内における本来の遺伝子機能の解明を目指しています。最近はクリスパーを用いた遺伝子改変技術を導入し、研究を推進しています。
主な研究課題は、◦生殖細胞の性分化に関わる分子機構◦Sexual differentiation of germ cells◦精子幹細胞システムの構築と制御◦Establishment of spermatogonial stem cells◦生殖細胞の RNA 制御◦RNA-mediated germ cell regulation◦Somite segmentation◦脊椎動物の分節性確立機構の解析◦Heart morphogenesis◦心臓刺激伝導系の発生

Mammalian Development Laboratory

Saga Group

発生工学研究室

相賀研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MamDev/home-j.html
Publications
Zhao, W., Ajima, R., Ninomiya, Y., and Saga, Y. (2015). Segmental border is defined by
Ripply2-mediated Tbx6 repression independent of Mesp2. Dev. Biol. 400, 105-117.
Wu, Q., Fukuda, K., Weinstein, M., Graff, JM., and Saga, Y. (2015). SMAD2 and p38 signaling
pathways act in concert to determine XY primordial germ cell fate in mice. Development. 142,575-578.

SAGA, Yumiko
Professor

相賀裕美子

教授

KATO, Yuzuru
Assistant Professor

AJIMA, Rieko
Assistant Professor

加藤

安島理恵子

譲

助教

Saba, R., Kato, Y., and Saga, Y. (2014). NANOS2 promotes male germ cell development
independent of meiosis suppression. Dev. Biol. 385, 32-40.

助教

研究活動／ Research Activities

33

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Behavioral genetics using wild-derived mouse strains
野生由来マウスを用いた行動遺伝学

In a variety of behavioral studies using wild-derived and laboratory strains, we observed notable strain differences of
behavioral patterns. We aim to understand the genetic basis of behavioral differences between strains.

さまざまな行動テストを行うと、野生由来マウス系統や実験用マウス系統は系統に特徴的な行動を示すことが分かります。
これらの行動の系統差に関わる遺伝的メカニズムの解明を進めています。

Understanding the genetic basis for individual differencesin complex traits is one of the most important issues incurrent genetics. In order to clarify the mechanisms related
to behavioral diversity, we are using a series of wild-derived
mouse strains as well as standard laboratory strains. Wildderived strains originate from mice that naturally inhabit aparticular area, and they exhibit a prominent degree ofwildness and phenotypic diversity among the strains. We are
identifying genes related to behavioral differences between
the strains, and are aiming to understand the role of thesegenes in the molecular, cellular, and neural mechanisms that
underlie this behavioral diversity.
◦Comparative studies of behavioral patterns among wild-derived strains

近年の遺伝学では個人差をもたらす遺伝的機構の解明が重要なテーマとなっています。私たちは行動の多様性を生み出すメカ
ニズムを明らかにするために、世界各地から捕獲された野生由来
マウス系統をもちいて行動遺伝学の研究を進めています。野生マ
ウスをもとに樹立された近交系統は、野生に特徴的な行動に加えて、表現型の顕著な系統差を示します。このような行動の多様性に関わる遺伝子を同定し、その機能を分子レベル、細胞レベル、更には神経レベルで明らかにしてゆくことを目指しています。

◦野生由来マウス系統の行動パターン解析◦マウス家畜化の遺伝解析◦自発活動性の遺伝解析◦Genetic studies of domestication in mice

◦不安様行動の遺伝解析◦Genetic studies of home-cage activity◦社会行動・攻撃行動の遺伝解析◦Genetic studies of anxiety-like behavior◦Genetic studies of social/aggressive behavior

Mouse Genomics Resource Laboratory (MGRL) マウス開発研究室

Koide Group

小出研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MGRL/index.html
Publications
Kato, S., Ishii, A., Nishi, A., Kuriki, S., and Koide, T. (2014). Segregation of a QTL cluster forhome-cage activity using a new mapping method based on regression analysis of congenic
mouse strains. Heredity 113, 416-423.

34

KOIDE, Tsuyoshi
Associate Professor

YOSHIMI, Kazuto
Assistant Professor

小出

吉見一人

剛

准教授

研究活動／ Research Activities

助教

Takahashi, A., Shiroishi, T., and Koide, T. (2014). Genetic mapping of escalated aggression inwild-derived mouse strain MSM/Ms: association with serotonin-related genes. Frontiers in
Neuroscience 8, 156.
Takahashi, A., Nagayasu, K., Nishitani, N., Kaneko, S., and Koide, T. (2014). Control ofintermale aggression by medial prefrontal cortex activation in the mouse. PLoS ONE 9,e94657.

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Genetic modification and analyses of regulatory factors in zebrafish germ cells
ゼブラフィッシュ生殖細胞における遺伝子改変と制御因子の解析

Successful propagation and maintenance of zebrafish spermatogonial stem cells in culture. A, B. Culture of vas::egfp
spermatogonia for 3 days. C. Spermatogonia (arrows) just after a first replating on day 4. D. Spermatogonia (arrows) justafter a second replating on day 10. Arrowheads indicate chain-like structures of spermatogonia. E, F. A clump of vas::egfp
spermatogonia after culturing for one month that express GFP.

ゼブラフィッシュ精原幹細胞の培養。A, B. vas::efgp 精原細胞の培養 3 日目。C. 培養 4 日目で 1 回目の継代直後。矢印は精原細胞を示す。D. 培養 10 日目で２回目の継代直後。矢頭は精原細胞が鎖状につながったところを示す。E, F. 培養 30
日目。生殖細胞特異的な GFP が発現している。

Zebrafish have become a laboratory favorite because
their embryos are transparent: geneticists can easily observegene effects in the developing fish. We have developedt e c h n i q u e s t o c u l t u re m a l e g e r m l i n e s t e m c e l l s ,spermatogonial stem cells, and focus on developing reliable
protocols for producing transgenic lines by the culture
system. In addition, male germ cell culture systems areuseful also in analyzing the spermatogenesis. We havealready isolated several ENU-induced zebrafish mutants thathave a defect in spermatogenesis. We are working on themolecular mechanisms to regulate spermatogenesis ofvertebrates, through analyses of genes responsible for thesemutants both in vivo and in vitro.
◦Establishment of protocols for producing transgenic lines

ゼブラフィッシュは、胚が透明で発生過程で働く遺伝子を容易に見いだすことができるため、優れた実験動物として発展してきています。私たちは、この魚の雄生殖系幹細胞、精原幹細胞の培養系を確立し、細胞培養系を用いた新たな遺伝子改変魚作出技術の確立を進めています。また、雄生殖細胞の培養系は精子形成制御因子の解析にも優れています。既に、精子形成に異常をもつ
ENU 誘導変異体をいくつか単離しており、それらの原因遺伝子を
in vivoとin vitro を組み合わせて解析し、脊椎動物に普遍的な精子形成制御因子の研究を進めています。

◦精原幹細胞培養系による遺伝子改変魚作出技術の確立◦精子形成異常変異体による精子形成制御因子の解析

by the spermatogonial stem cell culture◦Analyses of genes to regulate spermatogenesis with

spermatogenic mutants

Model Fish Genomics Resource Lab

Sakai Group

小型魚類開発研究室

酒井研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/FishDev/index.html
Publications
Saito, K., Sakai, C., Kawasaki, T., and Sakai, N. (2014). Telomere distribution pattern andsynapsis initiation during spermatogenesis in zebrafish. Dev. Dyn. 243, 1448-1456.
Shinya, M., Kobayashi, K., Masuda, A., Tokumoto, M., Ozaki, Y., Saito, K., Kawasaki, T.,
Sado, Y., and Sakai, N. (2013). Properties of gene knockdown system by vector-basedsiRNA in zebrafish. Dev. Growth Differ. 55, 755-765.

SAKAI, Noriyoshi
Associate Professor

酒井則良

Kawasaki, T., Saito, K., Sakai, C., Shinya, M., and Sakai, N. (2012). Production of zebrafish
offspring from cultured spermatogonial stem cells. Genes Cells 17, 316-325.

准教授

研究活動／ Research Activities

35

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Studies on genetic diversity of Oryza genomes/species and mechanisms in reproductive isolation
イネ属の種・ゲノム多様性および生殖隔離メカニズムの研究

Genetic and geographic origins of rice domestication. a, Phylogenetic tree of 446 O. rufipogon accessions and 1,083 O. sativa varieties calculated from SNPs in
the 55 major domestication sweeps. b, Geographic locations of 62 O. rufipogon accessions, whose phylogenetic positions during domestication are indicated.
Color index represents the average of the genetic distance of O. rufipogon accessions to all cultivated rice accessions.

イネ栽培化の遺伝的、地理的起源地。
（a）446 の O. rufipogon 系統と1083 の O. sativa 系統の 55 の栽培化選抜圧領域における遺伝変異から算出した進化系統
樹（b）進化経過を説明する62 の系統群の地理的位置。系統毎の色は、遺伝的距離を示す（a における色と対比）

We are carrying out two major research subjects. One isanalysis of genetic diversity of Oryza species in genome
structure and phenotype by sequencing and phenotyping ofa large number of strains. Genetic association studies aregoing to done to identify responsible genes for genome andphenotype differentiation. The other is analysis of genetic
factors playing roles in the reproductive isolation mechanism.
This is performed by combining with the analysis of genetic
programs underlying the processes from gametogenesis toembryogenesis in rice. We are also responsible for managing,preservation, propagation, and distribution of rice genetic
resources of wild rice species collected in the NIG under the
NBRP.
◦Analysis of genetic diversity of wild species of rice forcomparative genomics and speciation studies

本研究室では、野生イネと栽培イネのゲノム多様性研究および比較ゲノム解析を進めています。次世代シークエンサーを用いた
多数系統ゲノムの解析、および発現遺伝子解析と表現型との遺伝的相関解析を行い、種や形質の分化に関わる遺伝子を同定し、種の多様性や進化の仕組みを明らかにすることを目指しています。
この中で、生殖的隔離の分子的メカニズムの解明と、生殖発生過程における遺伝的プログラムの解明にも取り組んでいます。イネ
遺伝資源事業として、突然変異系統の選抜、野生イネの特性解析などの研究、開発、分譲も行っています。

◦野生イネ遺伝的多様性、比較ゲノム、進化解析◦生殖的隔離に関わる遺伝因子の同定◦イネ生殖発生過程の遺伝的プログラムの解明◦Analysis of genetic factors working in the reproductive

isolation mechanism for speciation◦Dissection of genetic programs underlying in reproductive

development

Plant Genetics Laboratory 植物遺伝研究室

Kurata Group

倉田研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/PlantGen/japanese/home-j.html
Publications
Tsuda, K., Kurata, N., Ohyanagi, H., and Hake, S. (2014). Genome-wide study of KNOX regulatory network
reveals brassinosteroid catabolic genes important for shoot meristem function in rice. Plant Cell. 26, 3488-3500.
Kubo, T., Fujita, M., Takahashi, H., Nakazono, M., Tsutsumi, M., and Kurata, N. (2013). Transcriptome analysis ofdeveloping ovules in rice isolated by laser microdissection. Plant Cell Physiol. 54, 750-765.

36

KURATA, Nori
Professor

KUBO, Takahiko
Assistant Professor

倉田のり 教授

久保貴彦

研究活動／ Research Activities

助教

Huang, X., Kurata, N., Wei, X., Wang, ZX., Wang, A., Zhao, Q., Zhao, Y., Liu, K., Lu, H., Li, W., Guo, Y., Lu, Y.,
Zhou, C., Fan, D., Weng, Q., Zhu, C., Huang, T., Zhang, L., Wang, Y., Feng, L., Furuumi, H., Kubo, T.,
Miyabayashi, T., Yuan, X., Xu, Q., Dong, G., Zhan, Q., Li, C., Fujiyama, A., Toyoda, A., Lu, T., Feng, Q., Qian, Q.,
Li, J., and Han B. (2012). A map of rice genome variation reveals the origin of cultivated rice. Nature. 490, 497501.

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Genetic dissection of the cell division mechanism using single-cellular model organisms
モデル単細胞を使った細胞分裂の遺伝制御メカニズム

Hyphal cells of Schizosaccharomyces
japonicas. Green fluorescent protein
indicates nuclei and red fluorescentprotein indicates cytosolic region.

ジャポニカス分裂酵母の菌糸型細胞。核を緑色蛍光タンパク質で、細胞質を赤色
蛍光タンパク質で識別した。

Bacteria and yeasts are suitable model organisms tounderstand the fundamental mechanisms on cellproliferation. Our laboratory studies the mechanisms behindchromosome or plasmid DNA dynamics in the cell or themechanism underlies cell shape formation. Genetic methods
as well as cell-biological methods were used to observe
those intracellular events. We have made several novel
observations in cell proliferation mechanism by using
fluorescent-based protein or DNA imaging. Especially S.
japonicus yeast suits for those cell biological analyses, andstudies of hyphal growth and cell cycle add special value on
this organism. Novel genetic system has been elucidated byrecent our works.

大腸菌や酵母は、細胞増殖の基本メカニズムを解明する上で極めて有効なモデル生物です。これまでに原核細胞と真核細胞を適宜に取り扱い、染色体やプラスミドDNA が動く仕組み、細胞の形が決まる仕組み等の研究を進めています。遺伝学的もしくは細胞
生物学的手法を用いて、細胞内で起こる現象を観察しています。
蛍光タンパク質による DNA やタンパク質のイメージングにより、細胞増殖の過程で新しい現象を発見してきました。特に、このような細胞観察に適したジャポニカス分裂酵母は菌糸増殖と細胞周期のモデル細胞として適しており、酵母から菌糸に転換する遺伝的制御が次々と明らかになってきています。

◦Chromosome separation mechanism in E. coli and B.

◦大腸菌におけるパントテン酸合成経路の制御機構

subtilis cells◦Synthetic pathway of pantothenic acid in E. coli cells◦Genetic analysis on S. japonicus chromosomal and nuclear
envelope segregation◦Analysis of Pim1/RCC1 that is a RanGEF in S. japonicus◦Hyphal growth mechanism and photoresponse mechanism
in S. japonicus yeast◦大腸菌と枯草菌における染色体の分配機構◦ジャポニカス分裂酵母の染色体・核膜動態因子の解析◦ジャポニカス分裂酵母の RanGEF である Pim1/RCC1 の機能
解析◦ジャポニカス分裂酵母の菌糸形成の誘導機構、光応答機構
大腸菌バイオリソース http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/strain/top/top.jsp
枯草菌バイオリソース http://www.shigen.nig.ac.jp/bsub/

Microbial Genetics Laboratory 原核生物遺伝研究室

Niki Group

仁木研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MicroGen/
Publications
Niki, H. (2014). Schizosaccharomyces japonicus: the fission yeast is a fusion of yeast andhyphae. Yeast. 31, 813-890.
Aoki, K., Shiwa, Y., Takada, H., Yoshikawa, H., and Niki, H. (2013). Regulation of nuclear
envelope dynamics via APC/C is necessary for the progression of semi-open mitosis in
Schizosaccharomyces japonicus. Genes Cells 18, 733-752.

NIKI, Hironori
Professor

仁木宏典

AOKI, Keita
Assistant Professor
教授

青木敬太

助教

Okamoto, S., Furuya, K., Nozaki, S., Aoki, K., and Niki, H. (2013). Synchronous activation ofcell division by light or temperature stimuli in the dimorphic yeast Schizosaccharomyces
japonicus. Eukaryot Cell 12, 1235-1243.

研究活動／ Research Activities

37Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Comprehensive analyses of genome function in Drosophila
RNAi 変異体を使ったゲノム機能の体系的解析

Schematic representation of theinducible RNAi mutant library.

誘導型 RNAi を利用したハエ変異体バ
ンクの 作 成 。ゲノムから推 定される
15,000 の全遺伝子についてUAS- 逆
向き反復配列のベクターを構築し、それぞれを導入したハエのバンクをつくる。

Although the entire human genome sequence has been
determined, real functions of human genes are far from being
completely understood. Drosophila has a total of 15,000
genes which is about half of the genes found in humans but
a large amount of these genes (approx. 70%) werediscovered to have similar functions and shows significant
homology to humans. We are planning to investigate thefunction of fly genes comprehensively as a suitable model forstudying the functional genomics of multicellular organisms.
The RNAi is one of the post-transcriptional genesilencing phenomena, in which double-stranded RNA
produced within host cells can effectively inhibit host gene
expression in a sequence-specific manner. By combining
with GAL4-UAS gene expression system, we can utilize theRNAi for knocking down gene expression in a target cell or
tissue at a specific developmental stage. We are trying toconstruct inverted repeat transgenes and to establish
transgenic fly lines covering almost genes in Drosophila. This
RNAi mutant fly library is now providing us a fundamental
tool for understanding gene functions and genetic networks
working in the fly individuals.

ショウジョウバエの遺伝子はおよそ 1 万 5 千個と推定され、その 70% はヒト遺伝子と相同です。これらの遺伝子を壊すと生体にどのような影響が現れるのか、お互いがどのように協働して生体の機能を担っているのか、ヒト遺伝子の機能を知るためにもハエを使った包括的な遺伝学的解析が望まれています。
私たちはショウジョウバエの全遺伝子についての変異体を作製し、遺伝子の機能を網羅的に解析する系を作りました。方法は RNAiです。RNAiとは、二本鎖 RNA が細胞内で配列特異的に遺伝子の機能を阻害する現象です。ターゲットする遺伝子の断片を逆向き
反復配列の形でベクターに組み込み、ハエの染色体に導入して形質転換ハエを作ります。GAL4-UAS遺伝子強制発現法を利用して、狙った細胞や組織で二本鎖 RNA を細胞内で発現させ、配列特異的に遺伝子の機能を阻害します。このようにして構築した RNAi 変
異体バンクは、個体レベルでの遺伝子機能の理解や遺伝子間のネッ
トワークを明らかにするための有用なツールであり、多くの共同研
究が進められています。

Invertebrate Genetics Laboratory 無脊椎動物遺伝研究室

Ueda Group

上田研究室

http://www.nig.ac.jp/section/ueda/ueda-j.html
Publications
Kondo, S., and Ueda, R. (2013). Highly improved gene targeting by germlinespecific Cas9
expression in Drosophila. Genetics 195, 715-721.
De Graeve, F.M., Van de Bor, V., Ghiglione, C., Cerezo, D., Jouandin, P., Ueda, R., Shashidhara,
L.S., and Noselli, S. (2012). Drosophila apc regulates delamination of invasive epithelial
clusters. Dev. Biol. 368, 76-85.

UEDA, Ryu
Professor

上田

38

龍

KONDO, Shu
Assistant Professor
教授

近藤

研究活動／ Research Activities

周助教

Kondo, S., and Perrimon, N. (2011). A genome-wide RNAi screen identifies core componentsof the G2-M DNA damage checkpoint. Sci. Signal 4, rs1.

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Sophisticated utilization of biological resource information
遺伝資源情報の高度利用に関する研究

N a t i o n a l B i o R e s o u rc e P ro j e c t – I n t e g r a t e d
BioResource Database (BRW)The BRW provides access to a collection of 6.3
million records on bioresources and supportssummary browsing, keyword searching, andsearching by DNA Sequences, gene ontology,
disease ontology, or references.

ナショナルバイオリソースプロジェクト総合検索サイト（BRW)全リソース 約 630 万 件 を、keyword、sequence、
gene ontology、diseaseontology、Reference な
どで検索することができる。

It is important to have an intelligent data retrieval system
to extract meaningful information from huge amount of data
through the internet. One of the solutions is to use ontology.
The term “ontology” means a structure of concepts. The useof ontology enables data which were originally defineddifferently to be compatible on a conceptual level. By
applying various biological ontologies such as gene ontology,
plant ontology and disease ontology to biological resource
databases, we have been developing an advanced retrieval
system that allows users to conduct cross species searchfor experimental resources.

インターネットから入手できるデータ量は膨大ですが、かならず
しも知識量の増加にはつながりません。意味のある情報の抽出には工夫が必要です。
「概念の構造化（＝オントロジー）」とは、実験
系や材料、学問の背景などが異なるためそのままでは同じ土俵で比較できない情報を、様々な概念レベルで整理して有効に利用しようという考え方です。

◦Database construction of biological resources◦実験研究用バイオリソースのデータベース構築◦Developing cross-species data retrieval system◦生物種横断的利用システムの開発◦Construction and utilization of biological ontologies◦生物系オントロジーの構築と利用◦Gene annotation◦遺伝子情報のアノテーション

当研究室では遺伝資源情報の整理にこの方法を応用し、生物
種によってバラバラに記載されている情報を統合的かつ様々な視点から生物種横断的に利用できるようなシステムを開発しています。

Genetic Informatics Laboratory 系統情報研究室

Yamazaki Group

山﨑研究室

http://www.shigen.nig.ac.jp
Publications
Kurata, T., Nakanishi, S., Hashimoto, M., Taoka, M., Yamazaki, Y., Isobe, T., and Kato, J. (2014).
Novel Essential Gene Involved in 16S rRNA Processing in Escherichia coli. J. Mol. Biol. 427,
955-965.

YAMAZAKI, Yukiko
Associate Professor

山﨑由紀子

准教授

Shimada, T., Yamazaki, Y., Tanaka, K., and Ishihama, A. (2014). The Whole Set of Constitutive
Promoters Recognized by RNA Polymerase RpoD Holoenzyme of Escherichia coli. PLoS
ONE 9, e90447.
Laurel, C. et al. (2013). The Plant Ontology as a Tool for Comparative Plant Anatomy and
Genomic Analyses. Plant and Cell Physiology 54, 2.

研究活動／ Research Activities

39

Genetic Strains Research Center

系統生物研究センター

Genome biology of C. elegans development
線虫発生のゲノム生物学

Gene expression regulation in nerve cells of the nematode C. elegans
We have identified the regulatory sequence for the gene gcy-18 that is expressed only in the thermo-sensory neuron AFD: The regulatory sequence drove the GFP reporter only in AFD (Fig. left). We have also
revealed that a pair of homeobox transcription factors (TFs) CEH-14 and TTX-1 is necessary and sufficient for the proper expression of gcy-18: The ectopic expression of them led to the expression of gcy-18 inanother thermo-sensory neuron AWB (Fig. right).

線虫 C. elegans の神経細胞での遺伝子発現調節
温度感受神経細胞AFDだけに発現する遺伝子gcy-18の転写制御に必要な配列を明らかにしました。この配列にGFPレポーターをつなぐとAFDだけで発現が見られます（図左）。この発現には、一組のホメオボッ
クス転写因子 CEH-14とTTX-1 が同時に働くことが必要なことがわかりましたが、さらに、これらを異所発現させることによりAFDとは別の感覚神経 AWB でも gcy-18 が発現したことから（図右）、AFD におけるgcy-18 の発現には、転写因子 CEH-14とTTX-1 の協調的な働きが必要かつ十分であることがわかりました。

We are performing a systematic analysis of expression
and function of the genome of the nematode C. elegans,aiming at understanding of the genetic program fordevelopment. We have already identified 14,000 genes
through EST project, and have analyzed their expression
patterns by using of whole mount in situ hybridization andtheir function by RNAi. All the information has been
integrated in NEXTDB http://nematode. lab.nig.ac.jp/. Basedon the information, we are conducting the following studies;◦Mechanisms of localization and translational control ofmaternal mRNAs◦Clustering analysis of gene expression patterns◦Systematic identification of regulatory elements of genes◦Comparative genomics using closely related nematodes

We are also organizing a supporting system for largescale genome analysis in the academic domain.

◦マイクロRNA の機能解析◦細胞特異的発現調節領域の同定と発生の遺伝子制御機構◦近縁種の発生パターンと遺伝子発現パターンの比較解析
また、学術におけるゲノム分野の大規模解析支援体制構築を進めています。

生物遺伝資源情報研究室

小原研究室

Kohara Group◦細胞運命決定に関わる母性遺伝子の mRNA 局在や翻訳制御メ
カニズム◦遺伝子発現クラスタリング解析と遺伝子カスケードの解析◦Functional analysis of microRNAs

Genome Biology Laboratory「ゲノム情報から個体がどうやってできるのか？」そのメカニズ
ム解明のために線虫 C. elegans を用いて研究を進めています。基
盤的な情報を網羅的に得る作業と個別的な研究がバランスよく有機的に進むよう心がけています。基盤情報としてはcDNAプロジェ
クトを出発点として全遺伝子の半分以上の約 14,000 遺伝子の発現パターンを明らかにしてきました。さらに RNAi、抗体作成など
によって機能解析を進め、「どの遺伝子が、いつ、どの細胞で、何をしているか」というゲノムの発現・機能マップデータベース
NEXTDB http://nematode.lab.nig.ac.jp/ に統合化しています。
これらの情報を最大限活用した個別研究では、以下のテーマで進めています。

http://www.nig.ac.jp/labs/GenBiol/
Publications
Kagoshima, H., and Kohara, Y. (2015). Co-expression of the transcription factors CEH-14 and TTX-1
regulates AFD neuron-specific genes gcy-8 and gcy-18 in C. elegans. Dev. Biol. 399, 325-336.
Sumiyoshi, E., Takahashi, S., Obata, H., Sugimoto, A., and Kohara, Y. (2011). The β-catenin HMP-2
functions downstream of Src in parallel with the Wnt pathway in early embryogenesis of C. elegans.
Dev. Biol. 355, 302-312.

40

KOHARA, Yuji
Project Professor

ANDACHI, Yoshiki
Assistant Professor

小原雄治

安達佳樹

特任教授

研究活動／ Research Activities

助教

Mangone, M., Manoharan, A.P., Thierry-Mieg, D., Thierry-Mieg, J., Han, T., Mackowiak, S.D., Mis, E.,
Zegar, C., Gutwein, M.R., Khivansara, V., Attie, O., Chen, K., Salehi-Ashtiani, K., Vidal, M., Harkins, T.T.,
Bouffard, P., Suzuki, Y., Sugano, S., Kohara, Y., Rajewsky, N., Piano, F., Gunsalus, K.C., and Kim, J.K.
(2010). The landscape of C. elegans 3’UTRs. Science 329, 432-435.

Structural Biology Center

構造遺伝学研究センター

3D-organization and dynamics of human genome chromatin
ゲノムクロマチンの折り畳み構造とダイナミクス

In the cell, chromatin (red balls) isirregularly folded. A chromatin
fluctuation, driven by Brownian
motion, facilitates chromatin
accessibility and proteins (greenball) to target a certain site (blueball).

クロマチン（赤いボールと赤線）が細胞の中に不規則に収納されている。クロマチンの揺らぎ（小刻みな動き）のおかげで、タンパク質（緑のボール）はより自由に動ける。この結果、ターゲット（青ボール）へた
どり着きやすくなる。

Our research interest is to know how a long string ofgenomic DNA is three-dimensionally organized in the cell,and how the organized genome functions during cellular
proliferation, differentiation, and development. We are using
a novel combination of molecular cell biology and biophysics
to elucidate 3D-organization and dynamics of humangenome chromatin. Recently, we found that the chromatin in
mammalian cells is irregularly folded without a 30-nm
chromatin fiber. This kind of irregular folding has a highdynamics (chromatin fluctuation), and leads to advantage ofvarious genome functions.

本研究室では、「ヒトゲノム DNA が細胞のなかに、三次元的にどのように折り畳まれ、そしてどのようにゲノムが機能しているのか？」を研究しています。最近、細胞内のクロマチンがとても不規則な形で折り畳まれていることを発見しました。今後、この知見を、遺伝子発現、さらにはマウス細胞を用いた発生分化 ･ エピジェネ
ティックスなど、幅広い研究につなげていきます。1分子ヌクレオソー
ムイメージング、X 線散乱解析、シミュレーション、さらには新しい
クロマチン精製法などを組み合わせて、ユニークな研究を目指しています。

◦Analysis of chromatin structure and dynamics in live cells◦1 分子ヌクレオソームイメージングを用いたクロマチンの構造とダイナミクスの解析◦Structural study of nuclei and mitotic chromosomes by◦X 線散乱を用いたヒトクロマチンの高次構造解析◦Genome-wide study and epigenetics of higher-order◦マウス細胞をつかった細胞分化におけるクロマチンの高次構造
変化とエピジェネティックス◦Analysis of local chromatin function by a novel chromatin◦新しいクロマチン精製法をもちいた局所的クロマチンの機能解析by single nucleosome imaging
X-ray scattering

chromatin change(s) during mouse cell differentiation
purification procedure

Biological Macromolecules Laboratory

Maeshima Group

生体高分子研究室

前島研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/MacroMol/index.html
Publications
Maeshima, K., Imai, R., Tamura, S., and Nozaki, T. (2014). Chromatin as dynamic 10-nm
fibers. Chromosoma 123, 225-237.

MAESHIMA, Kazuhiro
Professor

IDE, Satoru
Assistant Professor

HIBINO, Kayo
Assistant Professor

前島一博

井手

日比野佳代

教授

聖

助教

助教

Hihara, S., Pack, C.G., Kaizu, K., Tani, T., Hanafusa, T., Nozaki, T., Takemoto, S., Yoshimi, T.,
Yokota, H., Imamoto, N., Sako, Y., Kinjo, M., Takahashi, K., Nagai, T., and Maeshima,K. (2012).
Local nucleosome dynamics facilitate chromatin accessibility in living Mammalian cells. Cell
Rep. 2, 1645-1656.
Nishino, Y., Eltsov, M., Joti, Y., Ito, K., Takata, H., Takahashi, Y., Hihara, S., Frangakis, A.S.,
Imamoto, N., Ishikawa, T., and Maeshima, K. (2012). Human mitotic chromosomes consist
predominantly of irregularly folded nucleosome fibres without a 30-nm chromatin structure.
EMBO J. 31, 1644-1653.

研究活動／ Research Activities

41

Structural Biology Center

構造遺伝学研究センター

Understanding cell architecture through quantification and modeling
細胞建築学：定量計測とモデル構築をとおして細胞構造を理解する

Our quantitative models on cell division at 1-cell stage (left) and on spindle elongation at different developmental stages (right) in C. elegans. The upper panels
show actual C. elegans embryos and the lower panels show our models.

我々が製作した定量的模型。
（左）線虫１細胞期の細胞分裂。
（右）異なる発生ステージにおける紡錘体構造の伸長モデル。上側が実際の細胞の顕微鏡像で、下側が我々の模型を表しています。

Cells are the minimal unit of life, and are beautiful
architecture in nature. One of the biggest mysteries in Cell
Biology is ‘how a huge number of tiny macromolecules
assemble into a cell with organized and dynamic structurethat performs a harmonized function.’ To tackle this question,
we are constructing quantitative 4-dimensional models ofcells that explain and predict the structure and function of
Cell Architecture. These models serve as compilation of ourcurrent understanding of the cell and, more importantly,
clarify future questions to be addressed. We are using thenematode Caenorhabditis elegans embryo as a model
system. The ongoing research projects are followings:

細胞は生命の最小単位であると同時に、自然が作り上げたみごとな建築物です。
「どのようにして多くの小さな分子があつまって、細胞という調和のとれた構造体ができあがり機能するのか？」この問いに答えるために、我々は細胞の 3 次元的な構造とその時間軸に伴う動きを再現し予測する「４次元模型」の製作を行っています。このような「模型」は、我々が細胞をどこまで理解できているかを表すだけでなく、我々に新たな問題を提示してくれます。我々
は、線虫という生き物を実験材料としてつかって、以下のようなテーマに取り組んでいます。

◦細胞内の構造に重要な中心体の配置を支配する力の解析◦Modeling the forces determining the intracellular positioningof the centrosomes◦Modeling the dynamics of intracellular organelles duringoocyte-to-embryo transition◦卵細胞が胚へと転換する際の細胞内小器官の動きの解析◦胚発生の際に、細胞の配置がどのように決定づけられるか◦細胞内の力の予測と測定◦Modeling the cell positioning during embryogenesis◦Prediction and measurement of the forces inside the cells

Cell Architecture Laboratory

細胞建築研究室

木村研究室

Kimura Group

http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/cell_archi_home.html
Publications
Kimura, A., Celani, A., Nagao, H., Stasevich, T., and Nakamura, K. (2015). Estimating cellularparameters through optimization procedures: elementary principles and applications. Front.
Physiol 6, 60.
Hara, Y., Iwabuchi, M., Ohsumi, K., and Kimura, A. (2013). Intranuclear DNA density affects
chromosome condensation in metazoans. Mol. Biol. Cell 24, 2442-2453.

42

KIMURA, Akatsuki
Associate Professor

KIMURA, Kenji
Assistant Professor

木村

木村健二

暁

准教授

研究活動／ Research Activities

助教

木村健二 , 木村暁 (2013). 細胞分裂の力学的理解 . 細胞工学 32, 280-284.

Structural Biology Center

構造遺伝学研究センター

Mechanisms of asymmetric division in C. elegans
線虫を用いた非対称細胞分裂機構の研究

Asymmetric localization of β-catenin during an asymmetric division. The localization before the division (A) and at telophase of division (B). Arrowheads indicate cell boundary.
Similar localization can be observed during most cell divisions in C. elegans. (C) Polarity orientation (arrows) of epithelial stem cells (light blue) is redundantly controlled by three
Wnt molecules (CWN-1, CWN-2, EGL-20).

非対称分裂中のβカテニンの非対称な局在（A）分裂前の局在（B）分裂終期での局在 矢印は細胞の輪郭を示す。同様の局在は線虫のほとんどの細胞分裂時に観察される。
（C）
表皮幹細胞（水色）の極性方向（矢印）は三種類の Wnt 分子（CWN-1, CWN-2, EGL-20）によって冗長的に制御されている。

Proper development of multicellular organisms requiresorganized production of a variety of cell types. Asymmetriccell division that produces daughter cells with distinct cellfates is a fundamental mechanism by which cellular diversity
is produced. For example, a variety of stem cells undergo
self-renewing asymmetric divisions. The nematode C.
elegans is best-suited to study asymmetric division, because
we can easily analyze cell lineages. By combining genetic
and cell lineage analyses in C. elegans, we showed thatasymmetries of a number of cell divisions that occur during
development are controlled by Wnt signaling. We will
elucidate how asymmetries of divisions are coordinately
regulated to produce functional tissues and organs.
◦Identification of genes involved in asymmetric cell division◦Elucidation of mechanisms of asymmetric cell division◦Elucidation of mechanisms that coordinate cell polarity

多細胞生物体の構築には多種多様な細胞を秩序だって作り出す必要があります。一つの細胞が分裂して生じた二つの娘細胞が異なる運命（その後の分化、分裂などのふるまい）を持つ非対称
細胞分裂は細胞の多様性を生み出す基本的な機構です。 例えば幹細胞は非対称に分裂して幹細胞自身とより分化した細胞を作り出します。私たちは生きている状態で細胞の運命を観察することができる線虫をモデルとして用い非対称分裂のメカニズムを研究しています。また数多くの非対称分裂がどのように協調され機能的な細胞集団を作り出すのか研究しています。

◦非対称分裂に関与する遺伝子の同定◦非対称分裂の制御機構の解明◦細胞極性が協調される機構の解明◦細胞浸潤の機構の解明◦Elucidation of mechanisms of cell invasion

Multicellular Organization Laboratory 多細胞構築研究室

Sawa Group

澤 研究室

http://www.nig.ac.jp/section/sawa/sawa-j.html
Publications
Ihara, S., Hagedorn, E. J., Morrissey, M. A., Chi, Q., Motegi, F., Kramer, J. M., and Sherwood,
D. R. (2011). Basement membrane sliding and targeted adhesion remodels tissue boundaries
during uterine vulval attachment in C. elegans. Nature Cell Biology 13, 641-51
Sugioka, K., Mizumoto, K., and Sawa, H. (2011). Wnt regulates spindle asymmetry to
generate asymmetric nuclear β-cateninin C. elegans. Cell 146, 942-954

SAWA, Hitoshi
Professor

IHARA, Shinji
Assistant Professor

澤 斉

伊原伸治

教授

Yamamoto, Y., Takeshita, H., and Sawa, H. (2011). Multiple Wnts redundantly control polarity
orientation in Caenorhabditis elegans epithelial stem cells. PLoS Genetics 7, e1002308

助教

研究活動／ Research Activities

43

Structural Biology Center

構造遺伝学研究センター

Molecular genetic studies on cell structure – function relation using Drosophila as a model
ショウジョウバエ分子遺伝学を用いた細胞機能−構造連関の研究

A
B

WT

cadN

C

(A) Impairment in synapse (magenta) development of motoneuron terminals (green) by genetic mutation of a cell-adhesion protein (cadN). (B) Cell competition-dependent apoptosis (arrows)
in mhj-/- clones (blue nuclei) and compensatory cellular hypertrophy (arrowheads) in wild-type clones (pale blue nuclei), induced in post-mitotic follicular epithelium. (C) Imaginal discepithelium, a model for studies on tumorigenesis.
（B）分裂終了期の濾胞上皮で誘導された、細胞競合によるmahj（A）細胞接着タンパク質の遺伝子突然変異（cadN ）による運動神経終末（緑）のシナプス（マゼンタ）発達障害。
/- クローン（青い核）の細胞死（矢印）と野生型クロ−ン（水色の核）の補償的細胞肥大（矢頭）。(C) 腫瘍形成のモデルとなる成虫原基上皮組織。

Our laboratory is interested in relation of cellular finestructures and their functions. We are studying the molecular
networks on cellular fine structures involved in various cell
activities by molecular genetics and various imaging
techniques, using a model animal, Drosophila melanogaster.
Currently, the following projects are on going.
◦Studies on the molecular and cellular mechanisms forformation, maintenance, and plasticity of the synapse◦Studies on the mechanisms for cell competition,compensatory cell proliferation and compensatory cell
hypertrophy, in homeostasis of the tissue organization◦Studies on molecular and cellular mechanism for initiationof epithelial tumorigenesis

当研究室では組織内における細胞の機能発現と細胞構造との関係をモデル生物であるショウジョウバエを用いて研究しています。
細胞内微細構造上でどのような分子ネットワークが互いにどのように協調して働いているのか、といった側面に注目し、分子遺伝学の手法と様々なイメージングの手法を駆使して解析を行っています。現在下記のテーマを中心に研究を行っています。

◦シナプス形成・維持・可塑性の分子・細胞機構の研究◦組織構築の恒常性維持における細胞競合、補償的細胞分裂、及び補償的細胞成長の制御機構の研究◦上皮内腫瘍形成における極初期過程の細胞・分子メカニズムの研究

Gene Network Laboratory 遺伝子回路研究室

Suzuki Group

鈴木研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/GenNetwk/kairo-hp/home/index.html
Publications
Tamori, Y., and Deng, WM. (2014). Compensatory cellular hypertrophy: the other strategy fortissue homeostasis. Trends Cell Biol. 24, 230-237.
Kurusu, M., Katsuki, T., Zinn, K., and Suzuki, E. (2012). Developmental changes in
expression, subcellular distribution, and function of Drosophila N-cadherin, guided by a cellintrinsic program during neuronal differentiation. Dev. Biol. 366, 204-217.

44

SUZUKI, Emiko
Associate Professor

TAMORI, Yoichiro
Assistant Professor

鈴木えみ子 准教授

田守洋一郎

研究活動／ Research Activities

助教

Suzuki, E., Masai, I., and Inoue, H. (2012). Phosphoinositide metabolism in Drosophila
phototransduction: A Coffee break discussion leads to 30 years of history. J. Neurogenet. 26,
34-42.

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Study for molecular evolution using genome sequence and gene expression
ゲノム配列と遺伝子発現からみた分子進化学

Expression of eye patterning genes, paxB and six1/2 in two species of jellyfishes. While pax6 is well known as a master control gene for eye formation, six1/2 isalso expressed in the area adjacent to ocellus and possibly takes a major role in the eye formation of these jellyfishes.

2 種の刺胞動物におけるpaxB とsix1/2 の発現。
（左）ミズクラゲ、（右）エダアシクラゲ、Ocelli：眼点。ミズクラゲはカップ眼、エダアシクラゲはレンズ眼を持つ。
pax6（paxB）は動物全般において眼の形成を司るマスター遺伝子であるが、刺胞動物においてはsix1/2 がより眼の近傍に発現しており、眼形成において重要な役割を果たしている可能性がある。

We have studied the evolutionary process for acquisitionof novel phenotypic characters by comparative genomics
and molecular evolutionary approaches, using various
materials such as an animals or bacteria. Particularly, we
have recently focused more on (1) Biodiversity and dynamics
of marine microbes based on metagenomic analysis, (2)Evolutionary dynamics of gene expression profiles underlingthe evolution of central nervous system and sensory organs, (3)Molecular mechanism of endosymbiosis between hydra andalgae and its evolutionary significance, (4) Evolutionary
process of dosage compensation in Drosophila, and (5)Study of Bioinformatics by using big-data. In addition, we
have tackled the following projects.

本研究室では、生物が新規の形質や特性を獲得するための分子基盤とその進化過程の解明を目指し、動物や細菌などを材料としてゲノム配列や遺伝子発現情報の比較解析を用いた様々な研究を行っています。特に（1）メタゲノム解析を用いた海洋微生物の多様性とダイナミクスの解明、（2）中枢神経系や感覚器の起源と進化に伴う遺伝子ネットワーク変化の解明、（3）ヒドラ‒ 緑藻間の細胞内共生の分子機構の解明とその進化的意義、（4）ショウジョ
ウバエにおける遺伝子量補償機構の進化過程の解明、（5）情報科学を用いた大規模データ解析システムの開発と知識発見に力を注
いで研究を行っております。また、以下のような研究課題にも取り組んでいます。

◦Molecular analysis of coral-algal endosymbiosis◦Gene expression analysis of apical nervous system in sea◦造礁性サンゴと褐虫藻の細胞内共生メカニズムの解明

urchin larvae◦Comparative genomic analysis of Japanese sea urchins◦Evolution of miRNA-mRNA pairs◦Comparative genomic analysis of cephalopods and thegiant brain evolution◦Evolutionary process of acquisition of fungal septa indikarya◦Developing pipelines for analyzing data from nextgeneration sequencers◦Establishing cloud computing system and its sophistication
for structural life science◦次世代シーケンサーを用いたウニ幼生頂上神経系の遺伝子発現解析◦日本産ウニ類の比較ゲノム解析◦miRNA-mRNA ペアの進化過程解明◦頭足類比較ゲノムに見る巨大脳進化のメカニズム◦隔壁形成がもたらす二核菌亜界の進化◦次世代シーケンサーから得られた配列情報の解析手法のパイプ
ライン開発◦構造生命科学データクラウドの構築運用と高度化

Laboratory for DNA Data Analysis 遺伝情報分析研究室

Ikeo Group

池尾研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/DnaData/index.html
Publications
Monma, N., Gojobori, T., and Ikeo, K. (2014). Human genome network platform: a resource
for TFRN analysis. Methods Mol. Biol. 1164, 147-162.
Liu, QX., Wang, XF., Ikeo, K., Hirose, S., Gehring, WJ., and Gojobori, T. (2014). Evolutionarily
conserved transcription factor Apontic controls the G1/S progression by inducing cyclin E
during eye development. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 111, 9497-9502.

IKEO, Kazuho
Associate Professor

NOZAWA, Masafumi
Assistant Professor

池尾一穂

野澤昌文

准教授

Yu, Q., Li, XT., Zhao, X., Liu, XL., Ikeo, K., Gojobori, T., and Liu, QX. (2014). Coevolution ofaxon guidance molecule Slit and its receptor Robo. PLoS ONE 9, e94970.

助教

研究活動／ Research Activities

45

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Finding the link between metabolic variation and evolution
生物界における代謝の多様性と進化の関係を解き明かす

Isotopic peaks of carbon is useful for metabolite identification in the MRM analysis (Figure is copied from Tsugawa et al. 2015 Frontiers in Genetics(open access) 5:471)

質量分析計を用いた MRM 解析結果において炭素の同位体情報が代謝物の同定に使えることを示した図（Tsugawa et al. 2015 Frontiers in
Genetics (open access) 5:471 から転載）

Our activity is summarized as metabolic network analysis
using genomics and metabolomics (this word comes from‘metabolism’). Biological species we focus are wide: fromlactobacilli and microalgae to higher plants and mice. Our
research goal is to clarify how various metabolites aresynthesized and utilized in the biosphere. Major research
results include databases such as MassBank (http://
massbank.jp) and LipidBank (http://lipidbank.jp), as well as
analytical software tools for genomics and metabolomics.

主なテーマはゲノミクスとメタボロミクス（代謝 ‘metabolism’からきた言葉です）による代謝ネットワークの解析です。対象とする生物種は幅広く、乳酸菌や微細藻類から、高等植物やマウスまで扱っています。様々な代謝物がどのように生成され利用されるのかを、生物界という広い視点で明らかにしたいと考えています。

MassBank（http://massbank.jp）や LipidBank（http://lipidbank.
jp）のようなデータベースのほか様々な解析ツールも作成しています。

Laboratory of Biological Networks 生命ネットワーク研究室

Arita Group

有田研究室

https://sites.google.com/site/aritalab/Publications
Tsugawa, H., Ohta, E., Izumi, Y., Ogiwara, A., Yukihira, D., Bamba, T., Fukusaki, E., and Arita,
M. (2015). MRM-DIFF: data processing strategy for differential analysis in large scale MRMbased lipidomics studies. Front. Genet. 5, 471.
Hasegawa, Y., and Arita, M. (2014). Optimal implementations for reliable circadian clocks.
Phys. Rev. Lett. 113, 108101.

ARITA, Masanori
Professor

有田正規

46

教授

研究活動／ Research Activities

Tsugawa, H., Kanazawa, M., Ogiwara, A., and Arita, M. (2014). MRMPROBS suite formetabolomics using large-scale MRM assays. Bioinformatics. 30, 2379-2380.

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Promotion of DDBJ as an infrastructure database for lifescience
生物研究の基盤データベースとしての DDBJ 事業の推進

A screenshot of reference mapping tools on a NGS automatic analytical systemNGS 自動配列解析システム「DDBJ Read Annotation Pipeline」の reference mapping のツール選択画面

Ultra high-throughput sequencing technologies allow
biologists to obtain larger amounts of nucleotide sequence
data. Reliable database operation and high-quality
annotation supply are essential. As the core part of DNA
Data Bank of Japan (DDBJ), Nakamura laboratory attempts 1)
to develop advanced database management systems, and 2)
to improve quality of annotations in DDBJ databases. We
have been constructing an automatic analytical system “DDBJ
Read Annotation Pipeline” in NIG supercomputers, and“TogoAnnotation” system as the integrated support tool for
manual curations. Structural and functional annotations byautomatic and manual processing are evaluated by using
proposed statistical methods.

Genome Informatics Laboratory

高速シークエンサの技術革新と共に、塩基配列のデータベース
は大規模化が進んでいます。これよりデータ処理が難しくなり、配列注釈不足や特徴情報の記載誤りも問題となっています。中村研
究室は、日本 DNA データバンク（DDBJ）業務担当研究室として、データベース運用の高度化と配列注釈の質向上に取組みます。特に、①次世代シークエンサ（NGS）の大量データ配列解析、②クラウド型データ解析システム構築、③ゲノム配列注釈の評価尺度研究を中心に、ゲノム配列のアノテーション・キュレーション処理の効率化を目指します。

大量遺伝情報研究室

Nakamura Group 中村研究室

http://charles.genes.nig.ac.jp/
Publications
Kodama, Y., Mashima, J., Kosuge, T., Katayama, T., Fujisawa, T., Kaminuma, E., Ogasawara, O.,
Okubo, K., Takagi, T., and Nakamura, Y. (2015). The DDBJ Japanese Genotype-phenotype
Archive for genetic and phenotypic human data. Nucleic Acids Res. 43 (Database issue), D18-22.
Iida, N., Yamao, F., Nakamura, Y., and Iida, T. (2014). Mudi, a web tool for identifying mutations bybioinformatics analysis of whole-genome sequence. Genes Cells 19, 517-527.

NAKAMURA, Yasukazu
Professor

KAMINUMA, Eli
Assistant Professor

中村保一

神沼英里

教授

助教

Fujisawa, T., Okamoto, S., Katayama, T., Nakao, M., Yoshimura, H., Kajiya- Kanegae, H.,
Yamamoto, S., Yano, C., Yanaka, Y., Maita, H., Kaneko, T., Tabata, S., and Nakamura, Y. (2014).
CyanoBase and RhizoBase: databases of manually curated annotations for cyanobacterial andrhizobial genomes. Nucleic Acids Res. 42 (Database issue), D666-70.

研究活動／ Research Activities

47

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Large scale data processing methods of genome data and biomedical knowledge
ゲノム情報・バイオメディカル知識の大規模データ処理手法の研究

Data processing tests using Hadoop distributed environmentHadoop を利用した分散データ処理のテスト

We have been conducting application study of paralleldistributed computing technology and wide area distributed
computing technology to genome data processing. We havealso been carrying out a study for statistical classification andsemantic disambiguation of large-scale unstructured text.
We conduct feasibility study for applying new paralleldistributed computing technology such as Hadoop anddistributed key-value store to genome data processing. We
conduct research to handle large genome data in distributedmemory type parallel cluster computer which has elasticity
for rapid data growth in bioinformatics.
Most biomedical knowledge are not fully utilized because
they are embedded in large unstructured databases, andalso because they are written in free text with limited machine
understandability. We are tackling the situation by exploiting
the methodologies based on computer science.

遺伝研スーパーコンピュータシステムを利用したゲノム情報処理への並列分散コンピューティング技術、広域分散処理技術の適用
研究、およびバイオメディカル知識の非構造テキストデータの統計的意味的な解析研究を行っています。
急激に容量が増大する各種遺伝子情報解析データを処理する為の技術として、ビッグデータをハンドリングするための各種並列分散処理技術（Hadoop、分散 KeyValueStore 等）の適用研究を行っています。また、従来共有メモリ型大型計算機で処理していた
各種大規模 DB データを、データ量の増大に対応が容易なコスト
パフォーマンスの高い分散メモリ型クラスタ計算機上で高速処理する為の研究を行っています。
バイオメディカル知識の多くは、未整理の大規模データ集合に埋もれており、機械で検索しにくい自然文で書かれているために十分に活用されているとは言えません。この課題に対し、情報検索・
分類、自然言語処理の観点からの取り組みを行っています。

Laboratory for Research and Development of Biological Databases データベース運用開発研究室

Takagi Group

高木研究室

http://www.nig.ac.jp/section/tt/tt-j.html
Publications
Hara, K., Suzuki, I., Shimbo, M., Kobayashi, K., Fukumizu, K., and Radovanovic, M. (2015). Localized
Centering: Reducing Hubness in Large-Sample Data. In Proc. 29th AAAI Conference on Artificial
Intelligence (AAAI), to apear, Austin, Texas, USA.

TAKAGI, Toshihisa
Professor

高木利久

48

教授

研究活動／ Research Activities

Kodama, Y., Mashima, J., Kosuge, T., Katayama, T., Fujisawa, T., Kaminuma, E., Ogasawara, O.,
Okubo, K., Takagi, T., and Nakamura, Y. (2014). The DDBJ Japanese Genotype-phenotype Archive forgenetic and phenotypic human data. Nucl. Acids Res. 43, D18-D22.
Hara, K., Suzuki, I., Okubo, K., and Muto, I. (2014). Annotating Cohesive Statements of Anatomical
Knowledge Toward Semi-Automated Information Extraction. In Proc. 6th International Conference on
Knowledge Discovery and Information Retrieval (KDIR), pp. 324-327, Rome, Italy.

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Knowledge discovery through genome-wide measurements
ゲノムワイドな測定からの知識発見

DNA database (DDBJ/EMBL/GenBank) overview and search. This enables that the DNA databases are browsed and searched in terms of research projects.

DNA データベース（DDBJ/EMBL/GenBank）総覧と検索。DNA データベースを研究プロジェクト単位で閲覧・検索することができる。

1. Sharing and Integration of Data and Knowledge in Life

Science: Science in the 21st century will be developed
through discovery from digitized data sampled fromcomplex phenomena. There, data integration is inevitable,
but there are several pragmatic problems in dealing with
scientific data. Being involved in the administration of data
sharing for DNA sequence (DDBJ) and for literature andobservatory data (DBCLS), we will find new technologies
and resources necessary for sharing and integration ofdata and knowledge.

2. Theoretical studies of gene expression evolution: Gene

expression evolution has long been hypothesized to serve
as a bridge from molecular to phenotypic evolution. The
advent of genome-wide gene expression profilingtechniques have prompted the studies of this field, butsome conflicts have arisen in the interpretation of theobservations caused by the lack of definite theoreticalmodels and the use of inadequate analogies of molecular
evolution. We are constructing theoretical models of genee x p re s s i o n e v o l u t i o n w h i c h p ro v i d e s c o n s i s t e n t
explanations of the pattern in the observations.

1．データおよび知識の統合に関する研究：今世紀の科学は生命科学に限らず複雑な現象のデジタル観測に始まる発見科学です。
データ（文献データを含む）の多角的組み合わせによる発見には、データの自在な統合が必要になります。データ統合は研究室を超えて行われるため、統合には意味上、形式上、社会制度上の課題が存在します。DDBJ および統合 DB センターに参加しながら、実際の統合に生じる問題に取り組み、その解決法や再利用可能な資源を作成しています。
2．遺伝子発現の進化モデルの構築：遺伝子発現進化は形態進化と分子進化をつなぐための鍵と考えられていますが、遺伝子発現進化の観測結果の解釈はまちまちでした。その理由は遺伝子
発現進化の明確なモデルが存在せず、配列の分子進化のアナロジーを用いて解釈されていたためと考えられます。そこで我々はこれまでの観察を統一的に説明する遺伝子発現進化のモデルの構築を行っています。

Laboratory for Gene-Expression Analysis 遺伝子発現解析研究室

Okubo Group

大久保研究室

http://www.nig.ac.jp/section/okubo/okubo-j.html
Publications
Kodama, Y., Mashima, J., Kosuge, T., Katayama, T., Fujisawa, T., Kaminuma, E., Ogasawara, O.,
Okubo, K., Takagi, T., and Nakamura, Y. (2015). The DDBJ Japanese Genotype-phenotype
Archive for genetic and phenotypic human data. Nucleic Acids Res. 43 (Database issue), D18-22.

OKUBO, Kousaku
Professor

OGASAWARA, Osamu
Assistant Professor

大久保公策

小笠原

教授

理

助教

Kosuge, T., Mashima, J., Kodama, Y., Fujisawa, T., Kaminuma, E., Ogasawara, O., Okubo, K.,
Takagi, T., and Nakamura, Y. (2014). DDBJ progress report: a new submission system for leading
to a correct annotation. Nucleic Acids Res. 42 (Database issue), D44-99.
Ikumi, S., Kazuo, H., Masashi, S., Marco, S., and Kenji, F. (2013). Centering Similarity Measures to
Reduce Hubs. In Proc. Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing (EMNLP),
pp. 613-623, Seattle, USA.

研究活動／ Research Activities

49

Center for Information Biology

生命情報研究センター

Comparative genomics through ultra-large scale sequencing
大規模比較ゲノム研究による生命の多様性と特異性の理解

Picture of the animals whose genomes have been analyzed

比較ゲノム解析研究室でゲノム解読を実施した生物たち。
上左：解剖前のシーラカンス稚魚 上右：ニホンザル 下左：カンガルー 下右：オオコオモリの一種

The Comparative Genomics Laboratory was establishedin April 2008 with the task to understand basic rules of
biological systems based on actively reading and analyzing
various genomes of interest using cutting-edge DNA
sequencing and analysis technology. Currently, we are
analyzing personalized genomes of primates in addition tothe organisms those living in the extreme environmental
conditions. The figures in the left column show examples ofsuch activities.

当研究室では、ヒトを含む霊長類から、生命研究上の重要生物
種や極地などの極限環境に棲息する生物まで、ゲノム構造多様性の徹底的な解読を通じて生命現象の原理原則を理解することを目標に研究活動を行っています。
当研究室は、先端ゲノミクス推進センターと協力して最新のゲノム解読技術とインフォマティクスをコアとする先端ゲノミクス研究を進めており、多くの外部研究機関との共同研究を積極的に進めています。
当面の課題として、以下のテーマに取り組んでいます。

◦ゲノムの特性と多様性の解明◦共生や極限環境生物の多様性解析◦新型シーケンサに関わる微量解析などの技術開発

Comparative Genomics Laboratory

Fujiyama Group

比較ゲノム解析研究室

藤山研究室

http://www.nig.ac.jp/section/fujiyama/fujiyama-j.html
Publications
Takehana, Y., Matsuda, M., Myosho, T., Suster, ML., Kawakami, K., Shin-I, T., Kohara, Y., Kuroki, Y., Toyoda, A.,
Fujiyama, A., Hamaguchi, S., Sakaizumi, M., and Naruse, K. (2014). Co-option of Sox3 as the male-determining
factor on the Y chromosome in the fish Oryzias dancena. Nat. Commun. 5, 4157.

FUJIYAMA, Asao
Professor

藤山秋佐夫

50

TOYODA, Atsushi
Project Associate Professor
教授

豊田

研究活動／ Research Activities

敦

特任准教授

Nikaido, M., Noguchi, H., Nishihara, H., Toyoda, A., Suzuki, Y., Rei Kajitani, R., Suzuki, H., Okuno, M., Aibara, M., Ngatunga,
B.P., Mzighani, S.I., Kalombo, H.W.J., Masengi, K.W.A., Tuda, J., Nogami, S., Maeda, R., Iwata,M., Abe, Y., Fujimura, K.,
Okabe, M., Amano, T., Maeno, A., Shiroishi, T., Itoh, T., Sugano, S., Kohara, Y., Fujiyama, A., and Okada, N. (2013).
Coelacanth genomes reveal signatures for evolutionary transition from water to land. Genome Research 23, 1740-1748
Huang, X., Kurata, N., Wei, X., Wang, Z.X., Wang, A., Zhao, Q., Zhao, Y., Liu, K., Lu, H., Li, W., Guo, Y., Lu, Y.,
Zhou, C., Fan, D., Weng, Q., Zhu, C., Huang, T., Zhang, L., Wang, Y., Feng, L., Furuumi, H., Kubo, T., Miyabayashi,T., Yuan, X., Xu, Q., Dong, G., Zhan, Q., Li, C., Fujiyama, A., Toyoda, A., Lu, T., Feng, Q., Qian, Q., Li, J., and Han, B.
(2012). A map of rice genome variation reveals the origin of cultivated rice. Nature 490, 497-501.

Experimental Farm 実験圃場

Molecular cytogenetics of plant germ-cell development
植物の生殖細胞発生過程の分子細胞遺伝学
Reproductive cell

F

DAPI

ZEP1

wild type

C

D

mel1

E

Meiosis is a central event of genetic inheritance, since it
generates a new gene combination different from that ofparents by homologous recombination. Meiocytes ofangiosperm species are produced by several rounds ofmitotic division of primordial germ cells, which differentiate at
hypodermis of anther (male) and pistil (female) primordia.
How do plants differentiate and maintain germ cells
subsequent to floral development, and how do they achievemeiosis? We aim to settle these questions by means ofvarious techniques from cytological observation to molecularlevel analyses, mainly using rice mutants.

Analysis of MEL1, the rice Argonaute
gene with specific expression in the
germline.
(A) The mel1 mutant is sterile. (B) MEL1 isexpressed in germ cells. (C) ZEP1, acomponent of synaptonemal complex,
did not elongate between homologous
chromosomes, suggesting that homolog
synapsis was disrupted in the mel1
m u t a n t m e i o s i s . ( D ) M E L 1 p ro t e i n
associated with 21-nucleotides small
RNAs that conserved cytosine at their5’-termini (MEL1-associating smallinterfering RNA; masiRNA). (E) 90% of
masiRNAs were dirived from non proteincoding, intergenic regions of the ricegenome. (F) A schematic illustration ofbiogenesis of MEL1-associating smallinterfering RNA (masiRNA).

生殖細胞特異的なイネ Argonaute 遺伝子
MEL1 の解析（A）mel1 変異体は種子不稔。
（B）生殖細胞で発現。
（C）mel1 変異体では、シナプトネマ複合体の構成要素 ZEP1 が伸長せず、相同染色体の対合が阻害される。
（D）MEL1 蛋白質は、5’ 末端がシトシンを保存する 21 塩基長 small RNAと結合する（MEL1-associating small interfering（E）masiRNA の 90%
RNA; masiRNA）。
は 遺 伝 子 間 領 域 に 由 来 す る 。（ F ）masiRNA 生合成経路のモデル図。

減数分裂は、両親の遺伝子が組換えによりシャッフルされ、新しい遺伝子組み合わせをもつ染色体が創出される、正に遺伝の根幹を為す現象です。被子植物の減数分裂細胞は、花の各器官の形成が完了した直後に、雄蕊および雌蕊の原基内部で分化する生殖始原細胞が数回の体細胞分裂を経ることにより形成されます。私たちは主にイネの突然変異体を用いて、植物の生殖細胞がどのように分化し、維持されて減数分裂に至るのかについて、細胞レベルの観察や分子レベルの解析など幅広い手法を駆使して研究しています。

◦種子不稔を生じる突然変異の原因遺伝子の同定と機能解析◦Analyses of causal genes for seed-sterile mutation◦Analyses of small RNA pathways promoting germ-celldevelopment and meiosis◦生殖細胞発生・減数分裂の進行に寄与する small RNA 経路の機能解析◦Studies on the mechanisms controlling transition from

◦体細胞分裂から減数分裂への移行を制御するメカニズムの解析◦Ex situ conservation and distribution of wild rice

◦野生イネ系統の保存・提供と、遺伝学的・進化学的な生殖研究への利用

mitosis to meiosis

accessions, and the use of them for genetic andevolutionary researches on reproductive events

Experimental Farm実験圃場

Nonomura Group 野々村研究室

http://www.nig.ac.jp/labs/ExpFarm/jweb/jtop/jlab.html
Publications
Komiya, R., Ohyanagi, H., Niihama, M., Watanabe, T., Nakano, M., Kurata, N., andNonomura, K. (2014). Rice germline-specific Argonaute MEL1 protein binds to phasiRNAs
generated from more than 700 lincRNAs. Plant J. 78, 385-397.

NONOMURA, Ken-ichi
Associate Professor

TSUDA, Katsutoshi
Assistant Professor

野々村賢一 准教授

津田勝利

助教

Nonomura, K., Eiguchi, M., Nakano, M., Takashima, K., Komeda, N., Fukuchi, S., Miyazaki, S.,
Miyao, A., Hirochika, H., and Kurata, N. (2011). A novel RNA-recognition-motif protein isrequired for premeiotic G1/S-phase transition in rice (Oryza sativa L.). PLoS Genet. 7,
e1001265.
Yamaki, S., Nagato, Y., Kurata, N., and Nonomura, K. (2011). Ovule is a lateral organ finallydifferentiated from the terminating floral meristem in rice. Dev. Biol. 351, 208-216.

研究活動／ Research Activities

51

Adjunct Faculty 客員研究部門

Large-scale chromatin structure and dynamics
クロマチンの高次構造とダイナミクス
Our research focuses on how chromatin folds into interphase andmitotic chromosomes, how chromosomes are organized and move withininterphase nuclei, and how chromosome organization and dynamics
impact DNA functions.



私たちはクロマチンがどのように間期や分裂期染色体に折り畳まれ、そして染色体がどのように組織化され、そのダイナミックな振る舞いが、DNA の機能に、どのように影響を及ぼしているのかに注目して研究をおこなっています。

Division of Nucleic Acid Chemistry

核酸化学客員研究部門

Belmont Group Belmont 研究室

http://mcb.illinois.edu/faculty/profile/asbel/
BELMONT, Andrew S.
Visiting Professor (University of Illinois at Urbana-Champaign)

ベルモント，アンドリュー S．
客員教授（イリノイ大学教授）

Chromosome folding
染色体の折りたたみ構造
To understand how long chromosomes are folded to fit inside thenucleus, we developed Chromosome Conformation Capture. Using thismethod we have started to uncover molecular and physical principles that
determine chromosome folding.



Chromosome Conformation
染色体が折り畳まれるメカニズムを理解するために、
Capture 法を開発し、この方法をゲノムワイドで適用しています。染色体が折り畳まれるために必要な分子的あるいは物理的な基本原理の理解が可能になります。

Division of Nucleic Acid Chemistry

核酸化学客員研究部門

Dekker Group Dekker 研究室

http://my5c.umassmed.edu/welcome/welcome.php
DEKKER, Job
Visiting Professor (University of Massachusetts Medical School)

デッカー，ジョブ

客員教授（マサチューセッツ医科大学教授）

Bacterial chromosome dynamics
バクテリア染色体の細胞内動態
Our mission is to understand the molecular process that determine
chromosome organization in bacteria and how these relate to DNA
replication, repair and recombination, and to chromosome segregationand cell division. We use high-resolution live-cell imaging.



私たちの研究目的は、バクテリアの染色体が折り畳まれる分子機構、さらにこれに関連した複製、修復、組み換え、さらに染色体分配や細胞分裂まで理解しようというものです。そのために高解像度の生細胞観察方法を活用しています。

Division of Cytoplasmic Genetics

細胞質遺伝客員研究部門

Sherratt Group Sherratt 研究室

http://www.bioch.ox.ac.uk
http://www2.bioch.ox.ac.uk/sherrattlab/
SHERRATT, David
Visiting Professor (Professor, Oxford University)

シェラット，デヴィト客員教授（オックスフォード大学教授）

Choreography and genetic control of the DNA damage response
DNA 損傷応答の動的変化と遺伝学的制御
Our goal is to study of mechanisms underlying recognition & repair of
DNA damage. We have been studying the formation of repair/recombination foci using time-lapse microscopy of multi-labeled cellularcomponents in living cells.



我々の研究室では DNA 損傷の認識とその修復のメカニズムの解明を目指しています。DNA がダメージを受けると細胞内に修復に関わるタンパク質が「集合体」を形成します。その動態について生細胞中で解析しています。

Division of Cytoplasmic Genetics

細胞質遺伝客員研究部門

Rothstein Group Rothstein 研究室

http://www.rothsteinlab.com/
ROTHSTEIN, Rodney
Visiting Professor (Professor, Columbia University Medical Center)

ロスステイン，ロドニー客員教授（コロンビア大学教授）

Neuronal circuits controlling innate behaviors
行動を制御する神経回路研究
The general goal of my laboratory is the development of the larvalzebrafish as a model system for the comprehensive identification andexamination of neural circuits controlling visually induced behaviors.



私たちは、ゼブラフィッシュ稚魚をモデルシステムとして、視覚によって誘起される行動を制御する神経回路を網羅的に同定し、解析することを目的として研究を行っています。
52

研究活動／ Research Activities

Division of Physiological Genetics

生理遺伝客員研究部門

Engert Group Engert研究室

http://labs.mcb.harvard.edu/engert/
ENGERT, Florian
Visiting Professor (Professor, Harvard University)

エンゲルト，フローリアン
客員教授（ハーバード大学教授）

Adjunct Faculty 客員研究部門

Brain circuit mapping and cell type characterization
脳回路のマッピングと神経細胞多様性の解析
We aim to unravel the diversity of neuronal cell types in the mouse
visual circuits at molecular, anatomical and physiological levels, and theirconnectivity throughout the brain.

Division of Physiological Genetics

生理遺伝客員研究部門

Zeng Group Zeng 研究室

http://alleninstitute.org/our-institute/our-team/profiles/hongkui-zeng/ZENG, Hongkui
Visiting Professor (Senior Director, Allen Institute for Brain Science)

マウス視覚系回路における神経細胞の多様性を分子生物学的、解剖学的、生理学的に明らかにし、それらの神経細胞の脳全体における結合様式を解明する

ゼン，ホンクイことを目指しています。

客員教授（アレン脳科学研究所シニアディレクター）

Computational population genomics
計算集団遺伝学
Analysis of genomic data to infer population demographic history andpatterns of selection. Describe the effects of range expansions on neutral
and functional genomic diversity.

Division of Theoretical Genetics

理論遺伝客員研究部門

Excoffier Group Excoffier 研究室

http://www.cmpg.iee.unibe.ch/content/about_us/researchers/laurent_excoffier

EXCOFFIER, Laurent
Visiting Professor (Proffessor, University of Bern)

ゲノムデータ解析による集団の人口変動と淘汰パターンの推定および、居住域拡大による中立進化と遺伝子の機能に関連したゲノム多様性への影響の解析を

エクスコフィエ，ローレント

行っています。

客員教授（ベルン大学教授）

Origin and evolution of new genes
新しい遺伝子の起源と進化
My research focuses on how genes with novel functions originate.
We integrate molecular, genomic, and population analyses to study young
genes to observe early processes of origination.

Division of Theoretical Genetics

理論遺伝客員研究部門

Long Group Long 研究室

http://longlab.uchicago.edu/?q=node/3

LONG, Manyuan
Visiting Professor (Professor, University of Chicago)

私の研究目標は、どうやって新しい機能を持った遺伝子が生まれてくるかを明らかにすることです。われわれは分子、ゲノム、集団の解析を通して、生まれて間龍もない「若い」遺伝子を観察し、研究を行っています。

漫遠

客員教授（シカゴ大学教授）

Epigenomic regulation in mammalian development
哺乳類の発生におけるエピゲノム制御
E a c h c e l l o f t h e b o d y h a s i t s o w n e p i g e n o m e ( c h ro m a t i n
modifications), which is critical for gene regulation. We study themechanisms of epigenomic regulation in mammalian development.



身体を構成する様々な細胞はそれぞれ固有のクロマチン修飾（エピゲノム）を持っており、これが遺伝子発現を制御しています。私たちは、哺乳類の発生と生殖におけるエピゲノムの制御機構について研究しています。

Division of Applied Genetics

応用遺伝客員研究部門

Sasaki Group 佐々木研究室

http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/labo/epigenome/index.htm
SASAKI, Hiroyuki
Visiting Professor (Professor, Kyushu University)

佐々木裕之

客員教授（九州大学教授）

Evolution and function of DNA methylation
DNAメチル化の機能と進化
We study the evolution, mechanism, and biological function of
eukaryotic DNA methylation and related chromatin pathways.



真核生物におけるDNAメチル化および関連したクロマチン経路について、その進化、制御機構、生物学的役割を研究しています。

Division of Applied Genetics

応用遺伝客員研究部門

Zilberman Group Zilberman 研究室

http://dzlab.pmb.berkeley.edu/
ZILBERMAN, Daniel
Visiting Associate Professor (University of California, Berkeley)

ジルバマン，ダニエル客員准教授（カリフォルニア大学バークレー校）

研究活動／ Research Activities

53

Intellectual Property Unit

知的財産室

Communicate research findings at NIG with the outer world
研究成果の社会発信と成果を活かす方策を検討・実行（2014 年度実績）
知的財産
IP

件数
QUANTITY

国内出願

Patent application

3件

特許登録

Patent registration

1件

License agreement

5件

Material Transfer Agreement

1199件

ライセンス契約
MTA

Our mission is to promote and support the research of
NIG researchers from the perspective of intellectual property
and; to give back the benefits of research results to society
by knowledge and technology transfers through thecollaboration with societies, local communities, andindustries.
We are mainly engaged in providing a full support toenable our researchers smoothly obtain materials andgenetic resources from overseas and managing ourintellectual property derived from research by patenting,
maintaining, and licensing. We recently started to focusing
on facilitating favorable environment for our researchers tocollaborate with industries and developing an appropriate
way to handle copyrights of digital contents.

知的財産室では、知的財産に関わる研究支援を担当し、社会連
携、地域連携、産学連携などによる知識移転、技術移転を通し社会への研究成果の還元を行っています。特に、研究成果有体物や海外遺伝資源などのマテリアルの円滑な入手に関する支援、特許等の知的財産権の出願、権利化、ライセンスを行っています。最近
では、より企業と連携をしやすい環境づくりや、デジタル関連の著
作権についての対応などに力をいれています。
また、全国の大学における海外遺伝資源のアクセスと利益配分（ABS）のための対応のため、名古屋議定書学術対策チームとしての活動も行っています。

We also play an active role as ABS Task Force Team for
Academia to support and promote the research utilization ofgenetic resources.

Intellectual Property Unit

知的財産室

http://www.nig.ac.jp/labs/IntProp
Publications
鈴木睦昭 (2014). 学術研究分野における名古屋議定書の国内措置検討の課題 植物科学最前線 5, 67-73.

鈴木睦昭 (2014).「研究成果有体物と遺伝資源に関する円滑な流通に向けて-課題分析と今後の課題解
決の展望-」知的財産イノベーション研究の諸相 p114-125. コンテンツシティー出版

SUZUKI, Mutsuaki
Director

鈴木睦昭

54

室長

研究活動／ Research Activities

鈴木睦昭 (2013). 遺伝資源のアクセスと利益配分に関する名古屋議定書の国内措置の現状-特に学術における課題について- Microbiol. Cult. Coll. 29, 113-120.

Office for Research Development リサーチ・アドミニストレーター室

Strengthening and support of research
研究力の強化・支援

National Institute of Genetics (NIG) aims not only to
conduct high quality research, but also to create newresearch fields for the future science and to nurture humanresources that play key roles in this process. To contribute tothis end, the Office for Research Development offers various
help to those involved in research for further development of
its research and research abilities.
Activities of our office include organizing workshops,
mediate collaborative research, support preparation ofmanuscripts and scientific presentation, arrange international
cooperation, and support research infrastructure such as
operation of common equipment. We will also act as a“sounding board” on which you can try out your ideas onyour research and research proposals. Synergizing with thesuperb research environment and the interactive atmosphereof NIG, we hope that our activities will be an additional
appeal of the Institute.

遺伝研は、優れた研究をするだけでなく、未来のサイエンスを切り開く新分野の創造と、それを担う人材の育成を使命としています。
リサーチ・アドミニストレーター室は、研究に携わる人材がその能力を最大限に発揮し、さらに能力を伸ばすために、さまざまなお手伝いをします。
私たちの活動の一環として、ワークショップ企画や異分野交流の仲介、論文発表やプレゼンテーションのサポート、国際連携活動、共通機器の運用支援、などを行います。また、研究や研究費申請についての議論や助言を通して、研究者が新しいアイデアに挑戦するための手助けをします。このような活動が遺伝研の優れた研究環境や活発な研究交流と相乗効果を及ぼし、研究所の新たな魅力となることを目指しています。

Office for Research Development
リサーチ・アドミニストレーター室

http://www.nig.ac.jp/labs/ORD/index.html
Writings and Talks
Hiromi, Y. (2015). “Present your science and present yourself --- tips on giving a talk” NIGNTU Symposium, Taipei, Taiwan (2015.03)
広海 健 (2014) “JREC-IN Portal and Beyond: 研究キャリア形成に有用なウェブツール ” 実験医学
増刊「今日から使える！データベース・ウェブツール 達人になるための実践ガイド 100 」32, 233-235.
伊東真知子 (2014) “ 学際研究の萌芽をいかに促すか : 生命科学の事例から ” 研究 技術 計画 29, 144-

HIROMI, Yasushi
Director

広海

健

室長

KURUSU, Mitsuhiko
Research Administrator

SEINO, Hiroaki
Assistant Professor

来栖光彦

清野浩明

リ
 サーチ・アドミニストレーター

159.

助教

研究活動／ Research Activities

55

Transdisciplinary Research Integration Center

新領域融合研究センター

Systems Biology of Genetic Function「遺伝機能システム学」プロジェクト
Systems biology is a data-centric inter-disciplinary study ofgenetics, informatics, and statistics focusing on complex
interactions in biological phenomena. This project aims todescribe multi-dimensional gene network systems that create
biodiversity of organisms in gene expression, morphogenesis andbehavioral pattern. Production of massive sequence, gene
expression and phenotypic variation data of unique and rich
genetic resources at the National Institute of Genetics (NIG),
development of information technology at the National Institute ofInformatics (NII), and of statistical modeling at the Institute of
Statistical Mathematics (ISM) will be performed and be combined
together to understand complex functional genetics network.

遺伝機能システム学は、多元的遺伝情報を遺伝学、情報学、統計学により統合的に解析し、複雑な生命・遺伝現象の原理やメカニズムをシス
テムとして理解することを目的としています。本プロジェクトでは、国立遺伝学研究所や参画機関が保有する自然および誘発変異を豊富に包含した遺伝資源を軸に、大量ゲノム配列多型情報、遺伝子発現多型情報、
表現型多型や経時変化等の多次元・多様な遺伝因子の網羅的データを得ます。国立情報学研究所の情報処理技術、統計数理研究所の統計モ
デリング技術を駆使して、ゲノム機能と遺伝的ネットワークの抽出を行います。生物が持つ複雑な遺伝子(ゲノム)機能を、生物表現型や行動パター
ン、進化的変異などの高次連関システムとして読み解くことで、遺伝学、情報学、統計学を統合した生命現象の新たな解析の方法論の確立を目指します。

遺伝研で研究しているメンバー
HARUSHIMA, Yoshiaki Postdoc

春島嘉章

博士研究員

WADA, Hironori Postdoc

和田浩則

KISO, Ayako Postdoc

木曽彩子

博士研究員

TANAVE, Akira Postdoc

田邉

博士研究員

MOCHIZUKI, Takako Researcher

望月孝子

Members at NIG

研究員

彰

博士研究員

HORIUCHI, Yoko Researcher

堀内陽子

研究員

参画研究機関Development of analytical systems for revealing functional genetics network.

多元的表現型と遺伝因子群のネットワーク解析システムの構築

筑波大学、東京工業大学、愛知工科大学、政策研究大学院大学、早稲田大学、九州大学、
電気通信大学、山形大学、大阪大学、高知大学、京都工芸繊維大学、首都大学東京、理化学研究所、東京大学、九州工業大学、慶應義塾大学、基礎生物学研究所、東北大学、新潟大学

Systematic Analysis for Global Environmental Change and Life on Earth (SAGE)「地球生命システム学」プロジェクト
The interaction between life and the surrounding
environmentshould have great impact on the evolution anddiversity of life. “Systematic Analysis for Global Environmental
Change and Life on Earth (SAGE)” project integrates researches
on geoscience, bioscience and informatics in order to understandthe life system on the earth. The Transdisdisciplinary ResearchIntegration Center is responsible for SAGE project, collaboratingwith National Institute of Polar Research, the National Institute of
Genetics, the Institute of Statistical Mathematics and the National
Institute of Informatics, and several universities. We are currently
approaching functional analysis of adaptation mechanisms to coldand dry environment, using microorganisms and nematodes
isolated from Antactica.

地球環境と生命活動の相互作用を調べることは、生物の進化や多様性を知る上で非常に重要です。そのためには、過去から現在までの地球環境の変動の解析データと各時代に生存していた生物学的解析データを融合し、情報学的な解析を行うことが必要になります。本プロジェク
トでは、国立極地研究所が保有している極域の様々な試料から、国立遺伝学研究所が中心となって生物のゲノム情報を解析し、統計数理研究所の統計解析技術と国立情報学研究所のデータベース技術、さらにプロジェ
クト参加大学が得意とする各専門分野のネットワーク研究により生物の時間的な変遷と環境適応システムの解明をめざします。現在、我々は南極の微生物や線虫が低温で乾燥した環境に適応するためのメカニズムの解明に取り組んでいます。

遺伝研で研究しているメンバー

YANAGIHARA, Katsuhiko

BABA, Tomoya

KAGOSHIMA, Hiroshi

柳原克彦

馬場知哉 特任准教授

鹿児島Project Associate Professor[Left] Bacteria Pseudomonas sp. isolated from “Moss Pillar”, ecosystem on bottomof an Antarctic lake. [Right] Desiccation tolerant Antarctic nematode Plectus murrayi.
[ 左 ] 南極の湖底で発見された「コケ坊主」生態系から分離された Pseudomonas
属細菌、[ 右 ] 強力な乾燥耐性を持つ南極線虫 Plectus murrayi

56

研究活動／ Research Activities

Members at NIG

特任准教授

Project Associate Professor

Postdoc

浩

博士研究員

参加研究機関
国立極地研究所、国立遺伝学研究所、統計数理研究所、国立情報学研究所、北海道大学、
筑波大学、千葉大学、東京工業大学、玉川大学、長浜バイオ大学、京都大学、京都府立大学、広島大学、海洋研究開発機構、東京大学、理化学研究所、新潟大学

Database Center for Life Science ライフサイエンス統合データベースセンター

Database Center for Life Science (DBCLS)
ライフサイエンス統合データベースセンターIn life science, thousands of database(DB)s are publicly
available worldwide, and become indispensable. However, many
comments from users complaining the hard-to-use DBs suggestthat these DBs and the surrounding environment are notsufficiently refined. DBCLS was established in ROIS in 2007 as acore organization of DB integration, and has been aiming to solvethese issues through R&D for DB reusability, international DB
standardization and various training programs. Last year, while themain lab of DBCLS moved to Kashiwa, some members moved to
NIG as the Mishima lab. It is highly expected to maximize thesynergy with DDBJ in effective use of Big Data.

ライフサイエンス分野では、世界中で数千をこえる多様なデータベース（DB）が公開されており、その活用が研究の進展に不可欠になっています。
しかし、「必要な DB が見つからない」「使い方がわからない」「データを組み合わせた高度な解析ができない」など、DB の効率的な利用のための環境整備は充分ではありません。本センターは DB 統合化の中核組織として平成 19 年に機構直轄のセンターとして設置され、以来、DB の統合化と保全に努め、利用者の利便性を高める情報技術の研究開発やサービスの開発、DB の国際標準化を行ってきました。本センターはまだ専用の施設がなく、昨年度に柏の東京大学施設に移転しましたが、同時に一部を遺伝研内に移しました。ビッグデータの有効活用の点からDDBJ セ
ンター等とのシナジーを発揮したいと考えています。

遺伝研で研究しているメンバー

DBCLS SRA (http://sra.dbcls.jp/) is a highly organized index website of huge quantities of nextgeneration sequencing data available at public databases (SRA [NCBI], ENA [EBI], DRA [DDBJ] ).
Users can download NGS data after browsing, comparing, and selecting them in various aspects.

公共データベース（SRA［NCBI］，ENA［EBI］，DRA［DDBJ］）に登録された「次世代シーケンサ」
データについて、さまざまな統計情報から閲覧、比較、データのダウンロードができる目次サイト
DBCLS SRA（http://sra.dbcls.jp/）

Members at NIG

Ono, Bono, Nakazato, Naito, Ohta (from left)

左から、小野、坊農、仲里、内藤、大田。
BONO, Hidemasa Project Associate Professor

坊農秀雅

特任准教授

NAITO, Yuki Project Assistant Professor

内藤雄樹

特任助教

ONO, Hiromasa Project Assistant Professor

小野浩雅

特任助教

NAKAZATO, Takeru Project Assistant Professor

仲里猛留

特任助教

OHTA, Tazro Researcher

大田達郎

研究員

研究活動／ Research Activities

57

Intellectual Infrastructure・Collaborative Research
共同利用・共同研究

Intellectual Infrastructure Center

共同利用事業センター

Genetic Resource Center
生物遺伝資源センター
The Genetic Resource Center is composed of two divisionsof “Bioresource Division” and “Database Division”. The
Bioresource Division takes responsibility for development,
preservation and distribution of forefront bioresources of variousorganisms including E. coli/B. subtilis, Rice, Mouse, Drosophila,
Zebrafish, C. elegans and Hydra, and of collected wild speciesof those organisms. The Database division makes the above
information available to the public through web sites shown
below. The BRC/NIG participates actively in the “National
Bioresource Project (NBRP)” under the organization of Japan
Agency for Medical Research and Development (AMED), in the
Cabinet Office of Government of Japan, and takes a role formanagement of E. coli/B. subtilis, Rice, Drosophila and Zebrafish
as central or sub-central organization for each organism in the
project. Furthermore, the Database Division also contributes to
NBRP as the national center of bioresource information, by
taking responsibility for development and management of therelevant databases.

生物遺伝資源センターは、バイオリソース事業部とデータベース事業部の 2 部門で以下の内容の事業を進めています。バイ
オリソース事業部では、大腸菌／枯草菌、イネ、マウス、ショウ
ジョウバエ、ゼブラフィッシュ、線虫、ヒドラなどの生物種について、生命科学を先導する様々な有用実験生物系統を開発するとともに、野生種系統の解析や情報整備も行い、それらの安定維持と国内外の大学や研究機関への分譲サービスを行っています。またデータベース事業部では、これらのバイオリソー
スに関する情報を、関連する知識情報とともに下記公開サイト
から世界中に発信しています。特に、大腸菌／枯草菌、イネ、ショ
ウジョウバエ、ゼブラフィッシュでは、内閣府の日本医療研究開発機構のナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）に参画し、各生物種の中核またはサブ機関として活動しています。
さらにデータベース事業部は、NBRP の情報センターとしての役割も果たしており、国内のバイオリソース関連情報発信の中核として活動しています。

遺伝研のマウス系統
NIG Mouse Genetic Resources
www.shigen.nig.ac.jp/mouse/nig/

遺伝研のヒドラ系統
Hydra Genetic Resources
www.nig.ac.jp/labs/OntoGen/keitou.html

遺伝研のゼブラフィッシュ 遺伝子・エンハンサートラップ系統
Zebrafish Gene trap & enhancer trap DB
kawakami.lab.nig.ac.jp/

マウス系統間 SNP 情報
NIG Mouse Genome Databasemolossinus.lab.nig.ac.jp/msmdb/

ナショナルバイオリソースプロジェクト情報公開サイト
National BioResource Project HP
www.nbrp.jp

イネ総合データベース
Integrated Rice Science Databasewww.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabaseV4/

日本のマウス系統
Japan Mouse/Rat Strain Resources Databasewww.shigen.nig.ac.jp/mouse/jmsr/

遺伝研のショウジョウバエ系統
NIG Fly Stocks
www.shigen.nig.ac.jp/fly/nigfly/

遺伝研の大腸菌リソース
NBRP E.coli Strainwww.shigen.nig.ac.jp/ecoli/strain/

ショウジョウバエ・体節形成蛋白質抗体
Asian Distribution Center for Segmentation Antibodies
http://www.shigen.nig.ac.jp/fly/nigfly/segmentationAntibodies/index.html

遺伝研の野生イネ系統データベース
NIG Wild Species of Rice; Strain Databasewww.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabaseV4/strain/wildCore/

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research59Intellectual Infrastructure Center

共同利用事業センター

Advanced Genomics Center
先端ゲノミクス推進センター
NIG Advanced Genomics Center was established
October 1st., 2011, with the aim to combine the latest
genomics technology, i.e., next generation sequencing, forexample, and the genetic resources, that have beencollected and constructed throughout the history of thisinstitute, to create resources for new-generation genetics.
Since such resources should have links among biological(phenotypic) annotations, data from genetic as well as
genomic researches, this center will work closely with otherlaboratories of Genetic Strains Research Center, andresearch communities around the country. This center is also
expected to become core facility for research communities
to provide latest technologies and tools of the present-day
genomics. To answer the expectations and heavy demand of
genome analyses from the universities and researchcommunities, the target projects that will be conducted inthis center will be chosen through NIG’s Collaborative
Research Program that is open to researchers outside of
NIG.

国立遺伝学研究所は、学術コミュニティからの大規模ゲノム解析の要望に応え、国内唯一のアカデミア DNA シークエンスセンターを運用してきました。この間、メダカゲノム、ホヤゲノム、原始紅藻
ゲノムの構造決定や､ 各種の生物を対象とした cDNA 解析など多くの成果を上げています。

2011年10月に設立された先端ゲノミクス推進センターは、コミュ
ニティーからの高度なゲノム解読の要請に対し、最新のゲノム解析
技術を基盤とした先端的ゲノム科学研究の共同利用・共同研究拠点として活動を進めています。
■ 先端ゲノミクス推進センターの活動◦ゲノム情報解析パイプラインの開発と提供◦所内外との連携による共同利用・共同研究の推進◦情報共有と情報セキュリティ体制の確立◦生命研究各分野への先端ゲノミクスの応用と支援◦先端ゲノミクス分野の人材育成■ 大学や他の研究機関と連携して、さまざまな生物種のゲノムや遺伝子の配列解析を行っています■ 共同研究・共同利用の流れ■ 先端ゲノミクス推進センターは、常に最先端の技術と情報をコミュニティに提供できるよう施設の整備を進めています。

60

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative ResearchIntellectual Infrastructure Center

共同利用事業センター

DDBJ Center
DDBJセンターA

B

DNA Data Bank of JapanDDBJ Sequence Read Archive
DDBJ Trace Archive
BioProject

IAC
ICM
GenBank
Sequence Read Archive
Trace Archive
BioProject

EMBL-Bank
Sequence Read Archive
Trace Archive
BioProject

DDBJ (DNA Data Bank of Japan) was established in
1987 and joined international data exchange and archiving
scheme between NCBI and ENA/EBI. This tripartite
collaboration is called INSDC (International Nucleotide
Sequence Database Collaboration).
DDBJ, as well as NCBI and EBI, is serving as one ofthree data inlet and outlet to the “INSD”.
DDBJ is reviewed and advised by its own advisory board
and also by international advisory commitee to INSDC(panel A).
In 2009, INSDC added a collaborative meeting to deal
with mass sequence data produced by the “next” generation
sequencers (Sequence Read Archive) and traces producedby traditional sequencers (Trace Archive).
Daily operation of DDBJ is performed by every about 10
bio-annotators and system engineers under staffs’supervision. Every year, sequence data are submitted to
DDBJ by almost constant number of groups, 3,000~4000,
for the last 10 years. It always consists about 10% of INSD
records (panel B).
Since 1993, sequences related to patent claims are also
submitted to DDBJ by Japan Patent Office because INSD isused as a framework of sequence data exchange among
JPO, USTPO and EPO. In 2008, KIPO started to join thisdata sharing though DDBJ with help of Korean Bioinformatics
Institute.
Researchers who use DDBJ to add their data in INSD
have been mostly Japanese (>90% of Japanese submit thedata to DDBJ), but recently researchers in neighboring
countries also uses DDBJ to some extent.
In 2013, DDBJ started a controlled access database,
Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA) in
collaboration with JST.

DDBJ（DNA Data Bank of Japan）は 1987 年に設立され学
術論文や特許公報等を通じて公知にされる塩基配列データをすべて網羅し、世界の公共財として維持管理する国際学術事業を行っています。
この事業は、欧州の ENA/EBI および米国の NCBIとの 3 者の協力体制で行われており、3 者の間では受付後公開されるデータは毎日交換され、世界共通のデータベース『INSD国際塩基配列データベース』がつくられます。
また DDBJ 事業は所外委員会であるDNA データ研究利用委員会に加えてEBI，NCBI，DDBJ がそれぞれ委嘱する外部委員会である国際諮問委員会によって監督されています（パネル A）。
2009 年からいわゆる次世代シークエンサからの出力データを収集する Sequence Read Archiveと従来のシークエンサからの出力データを収集するTrace Archiveも INSDC のメンバーに加わりました。
DDBJの日々の事業は、受付査定・データ交換・データ更新・デー
タ提供の 4 つの柱からなり教員の指導下で 10 数名ずつのエンジ
ニアとアノテーターを中心に行われています。DDBJ へは毎年3000 〜 4000 の 研 究 グループ がデータ登 録し、件 数 では全
INSD の 10% 強を占めています（パネル B）。

また日本・米国・欧州の特許庁の協力による特許配列の公開事業でも集積交換公開に国際塩基配列データベースが利用されており、日本に加えて韓国特許庁由来のデータも韓国バイオインフォ
マティック研究所（KOBIC）の協力で DDBJ に登録されます。
DDBJ へ登録する研究者は国内の研究者が中心ですが、アジア諸国や中近東の研究者も含まれます。
また、2013 年より科学技術振興機構（JST）と共同でヒトに関する研究データ共有のための制限公開データ用データベース（JGA）の運用を開始しています。

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

61

NIG Supercomputer System
国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム

NIG operates a supercomputing system that serves as theinfrastructure for building the International Nucleotide Sequence
Database (INSD) and providing domestic researchers withcomputing resources as a member of the Inter-University
Research Institute Corporation. Furthermore, beginning in
2013, NIG has opened its computing infrastructure to build theJapanese Genotype-Phenotype Archive (JGA), a controlledaccess database containing genetic data and anonymized
phenotype information of individuals.
NIG Supercomputer System features a specialized
analysis environment for the field of life science and provides arich set of public data. It includes a massive and fast storage
system (using the Lustre file system) with 7 PB capacity thatenables large-scale data analysis. The infrastructure isaccessible from its state-of-the-art distributed memorycomputing system (thin computing nodes) and shared-memorycomputing system (medium and fat computing node). Further,
there is a power-saving 5.5 PB storage disk for storing INSD
and JGA data (refer to table below).
We are always open for user registration and users canlogin and use the next-generation sequencer analysis pipeline(DDBJ read annotation pipeline) and genome annotation
pipeline for microbes (MiGAP). Please refer to the NIG
supercomputer website (http://sc.ddbj.nig.ac.jp) for further
details.

1

遺伝研は国際塩基配列データベース（INSD）構築のための計算インフラの提供および大学共同利用機関として計算機資源を国
内の研究者に提供することを目的としてスーパーコンピュータシス
テムの運用を行っています。また 2013 年から個人に由来する遺伝学的データと匿名化された表現型情報の制限公開データベース（JGA）構築のための計算インフラの提供を開始しています。
遺伝研スパコンは生命系に特化した解析環境や充実した公共
データの提供が特徴となっています。大規模なデータ解析を可能とするために大型の高速ストレージシステム（Lustreファイルシステム）7PBを持ち、これが最新鋭の分散メモリ型計算機システム（thin
計算ノード）と共有メモリ型計算機システム（Medium 計算ノード，
Fat 計算ノード）から利用可能となっています。さらに INSD および
JGA のデータを保存するための省電力ディスク5.5PB を備えています。
（下表参照）
ユーザーは随時受け付けており、ログインサービスの他、次世代シーケンサーの解析パイプライン（DDBJ read pipeline）および微生物のゲノムアノテーションパイプライン（MiGAP）が利用可能となっています。詳細は遺伝研スパコンホームページ（http://
sc.ddbj.nig.ac.jp）をご参照ください。

項 目
Items

機器仕様・用途概要
Specifications

Thin 計算ノード
Thin node

Memory 64GByte CPU Xeon E5-2670×2 16 Core
Memory 64GByte CPU Xeon E5-2680v2×2 20 Core

352 node（64 台に GPGPU 搭載）
202 node（64台にGPGPU、32台にXeon Phi搭載）

2

Medium 計算ノード
Medium node

Memory 2TByte CPU Xeon E7-4870 ×10 80 Core

10 node3

Fat 計算ノード
Fat node

Memory 10TB

1 node4

ディスク装置（省電力領域）
Electric power saving storage

バックアップ、アーカイブ用途
For archive or backup use.

5

ディスク装置（高速領域）
High performance storage

並列ファイルシステム Lustre により全計算ノードからの高速並列アクセスが可能なディスク領域。ホーム／scratch 領域に利用
Every computing node can access the high performance storage
via Lustre file system. This storage used as home area or job
scratch area
表1

62

導入数量
Amount of hardware

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

CPU Intel Xeon E7-8837 768 Core

5.5 PByte
7 PByte2012 年および 2014 年導入計算機システム概要 Table1: Computing system installed in 2012 and 2014

National Projects

国家プロジェクト

Platform for Drug Discovery, Informatics, and Structural Life Science
創薬等支援技術基盤プラットフォーム
The project titled “Platform for Drug Discovery,
Informatics, and Structural Life Science” inherits theoutcomes of the previous projects in structural biology,
consolidates the technology and promotes sharing thosecore technologies for drug discovery and related life
sciences. Through these activities, the project aims to realizea revolutionary process connecting drug and medical seeds
to pharmaceutical products.
For this purpose, the project is proceeded in thefollowing three centers; (1) Analysis Center, (2) Regulation
Center, and (3) Information Center. Analysis Center consistsof Analysis Domain, Production Domain, Bioinformatics
Domain and Functional Genomics Domain. Regulation
Center consists of Library-Screening Domain and Synthesis
Domain. Information Center consists of Information Domain.

創薬等支援技術基盤プラットフォーム事業は、創薬プロセス等に活用可能な技術基盤の整備、積極的な外部開放（共用）等を行う
ことで、創薬・医療技術シーズ等を着実かつ迅速に医薬品等に結び付ける革新的プロセスを実現することを目的としております。国立遺伝学研究所では、情報拠点としてタンパク3000プロジェクト
及びターゲットタンパク研究プログラム並びに創薬等支援技術基
盤プラットフォームの成果からなるデータベースやソフトウエアを管理・運用します。また、それらを継続的に更新し、内容の拡充や高度化を行います。
高度化では、分担機関である大阪大学蛋白質研究所東北大学、お茶の水女子大学ならびに東京大学と協力し、新たに創出する情報資源との融合によって、構造生物学と他の生命科学分野の連携の基盤となる「構造生命科学データクラウド」を実現します。

遺伝研で研究しているメンバー

Members at NIG

GOJOBORI, Takashi

NAKAMURA, Haruki

YURA, Kei

五條堀

中村春木

由良

Project Professor

孝

特任教授

Project Professor

特任教授

Project Professor

敬 特任教授参加研究機関大阪大学、東京大学、東北大学、お茶の水女子大学

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research63Collaborative Research ・ Research Meetings

共同研究・研究会

As the central institute to study various aspects of genetics, the National Institute of Genetics (NIG) positively accepts collaborative
research between NIG and universities or other institutes. In order to offer collaborative research opportunities to researchers, NIG has been
conducting “Collaborative Research” and “Research Meeting” between researchers inside and outside of NIG.
As shown in the next page, many collaborative researches are held every year. In 2014, 95 Collaborative Researches and 18 Research
Meetings have been held and achieved excellent results.
国立遺伝学研究所は、遺伝学に関する総合研究の中核として、大学、他研究機関との共同研究を積極的に受け入れています。
国内外の研究者に共同利用の機会を提供するため、従前より研究所の研究教育職員と研究所以外の研究者による「共同研究」及び「研究会」を実施
しています。
次頁に示すように、毎年多くの共同研究が行われており、2014 年度も計 95 件の共同研究と計 18 件の研究会を行い、着実な成果をあげています。

▶ Collaborative Research
Based on the application from researchers outside NIG, NIG
researchers collaborate with them for conducting the research on
the subject of application. The following two categories are
solicited for Collaborative Research: [A] and [B]. In Collaborative
Research [A], travel and accommodation expenses are provided
to visit NIG for conducting discussion and experiment. In
Collaborative Research [B], travel, accommodation and researchexpenses are provided.

共同研究「共同研究」とは、国立遺伝学研究所外の研究者からの申込みに基づき、国立遺伝学研究所内外の研究者数名により、特定の研究課題について共同して行う研究です。次の２種類に分けて募集を行っています。
「共同研究（A）」に採択されると、実験・討論のために遺伝研を訪問するための旅費・滞在費が支給されます。
「共同研究（B）」では旅費・滞在費及び研究費が支給されます。

Identification of genetic polymorphisms that determine “animal personality”
based on comparison of medaka inbred strain genomes using next-generation sequencing technology.
次世代シークエンサー技術を利用したメダカ近交系ゲノム比較による動物個性に関わる遺伝子多型の探索
Laboratory of Molecular Ethology,
Graduate School of Natural Science and Technology, Okayama University
Associate Professor, TAKEUCHI, Hideaki

准教授

Various animals exhibit intraspecific behavioral diversities. We found behavioral
differences in attenuation of startle response among medaka inbred strains. We
generated congenic lines and successfully narrowed down a genomic region for the
behavioral trait.

(Written by Satomi Tsuboko)

岡山大学大学院
自然科学研究科分子行動学研究室

竹内秀明

動物は同じ種の中でも行動の多型を示すことがある。
私たちはメダカの驚愕反応の「慣れやすさ」が、近交系
によって異なることを発見した。形質に影響する遺伝子を探すため、「慣れやすい」系統のゲノムを背景に持ち、QTL 解析での候補領域の一部を「慣れにくい」系統の配列で置き換えた複数のコンジェニック系統を作出し、領域を絞り込むことに成功した。 （文：坪子理美）

Inter-strain difference in startle response
メダカの驚愕反応と近交系間での行動差▶ Research Meetings

研究会
Based on the application from researcher outside of NIG, Research
Meetings in small groups are held to exchange information. In each meeting,researchers actively discuss their subject.
「研究会」とは、国立遺伝学研究所外の研究者からの申込みに基づき、国立遺伝学研究所内外の比較的少人数で実施する研究集会です。各研究会では、活発な討論が行われています。

64

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

NIG Collaboration Grant

2014 年度 公募による共同研究

国立遺伝学研究所は、遺伝学に関する総合研究の中核として、大学、他研究機関との共同研究を積極的に受け入れています。
「共同研究（Ａ）」に採択されると、実験・討論のために遺伝研を訪問するための旅費・滞在費が支給されます。
「共同研究（Ｂ）」では旅費・滞在費及び研究費が支給されます。

共同研究（A）
研究課題

研究代表者

1

超解像顕微鏡を用いた高次クロマチン構造尾検出

小布施力史

北海道大学大学院2

クロマチンにおけるDNA 機能発現機構の解析

胡桃坂仁志

早稲田大学

3

ニワトリDT40 細胞を用いた mRNA 品質管理と小胞体ストレス応答とのクロストーク機構の解析

榊

東京女子医科大学

4

哺乳類 X 染色体のヒストン修飾制御

佐渡

敬

近畿大学

農学部

5

ニワトリにおけるゲノムワイドな DNA シトシンのメチル化制御機構の解析

多田政子

鳥取大学

染色体工学研究センター

6

アセチル化ヒストンバリアントH2A. Z アイソフォーム機能のゲノムワイド解析

原田昌彦

東北大学大学院

農学研究科

7

DNA 複製開始因子 ‒ DNA 修復酵素複合体の X 線結晶構造解析

大山拓次

山梨大学大学院

医学工学総合研究部

8

ヒト細胞を使った出芽酵母 ARS の依存的複製系の開発

釣本敏樹

九州大学

理学研究院

9

解糖系の亢進によるDNA 損傷修復促進機構の解明

増本博司

長崎大学

医学部

10 Screening of Gal4 enhancer and gene trap lines for studying visually-guided behavior
in zebrafish

Fumi Kubo

Max Planck Institute of Neurobiology

11 Modeling pediatric soft tissue sarcomas in zebrafish

Genevieve Kendall

University of Texas Southwestern Medical Center

12 Molecular basis for the selective somato-dendritic and neurohypophyseal oxytocin
release on the zebrafish model

Janna Blechman

The Weizmann Institute of Science建二郎

先端生命科学研究院

理工学術院
医学部

共同利用研究センター

13 先天性関節拘縮症の発症原因解明に向けたゼブラフィッシュ疾患モデルの樹立

永田健一

理化学研究所

14 NGS データ解析のための高性能なパイプラインの構築

植田信太郎

東京大学大学院

15 Non-coding DNA evolution in Drosophila

高橋

首都大学東京16 Statistical models infer ancestral genomes

Ziheng Yang

University College London

17 次世代シーケンサを利用した、パーソナルゲノム解析に基づくヒト遺伝性疾患の原因
解明

要

匡

琉球大学

医学研究科

18 患者由来 iPS 細胞を用いたコーデン病の原因遺伝子の研究

佐藤健人

東海大学

医学部

19 家族性ヒルシュスプルング病遺伝子的解析加治建

鹿児島大学大学院

医歯学総合研究科

20 熱活性型トランスポゾンの転移とその制御機構の解明

伊藤秀臣

北海道大学大学院

理学研究院

21 シロイヌナズナ近縁種における転移因子の制御機構の解明

河邊昭

京都産業大学22 F1 雑種と両親系統間でのエピゲノムの比較解析藤本龍神戸大学大学院

23 Mcm8-9 複合体とミスマッチ修復因子の相互作用が DNA 損傷修復に果たす機能の
解析

高橋達郎

大阪大学

24 MCM 結合因子 MCM-BP の機能解明

田中克典

関西学院大学25 時期特異的ノックダウン技術を用いた新規染色体均等分配制御分子の同定

田中耕三

東北大学

26 酸素分圧変化により誘導される追いつき成長が個体の運動機能の発達に与える影
響の解析

亀井宏泰

東京大学大学院

文脳科学総合研究センター
理学系研究科
理工学研究科

総合生命科学部
農学研究科

理学研究科
理工学部

加齢医学研究所
農学生命科学研究科

27 ゼブラフィッシュ神経伝達系におけるオイゲノール受容機構の解析

肥塚崇男

山口大学

28 Studying defective inhibitory synaptic transmission in zebrafish

Robert J. Harvey

UCL School of Pharmacy

29 トゲウオエコタイプ間の繁殖タイミングの分化機構

日下部

東京大学

30 津波が野外魚の遺伝構造へ与える効果

森

31 メダカ属の日長応答性進化の遺伝機構

山平寿智

琉球大学

32 細胞骨格による二次細胞壁パターンの時空間的制御機構の解析福田裕穂

東京大学大学院

理学系研究科33 マウス組換えホットスポット活性化因子の機能解析

太田邦史

東京大学大学院

総合文化研究科

34 脂肪酸合成酵素阻害剤等を用いたがん予防に関する検討

折田

順天堂大学附属静岡病院

35 日本産野生マウス由来近交系 MSM/Ms を用いた次世代シーケンサーによる遺伝子
発現解析

清澤秀孔

高知大学

36 X 線 CT 装置を用いた棘皮動物の半・体内および体内寄生動物の自然史学的研究

近藤真理子

東京大学大学院

37 マウス胎仔高速表現型解析技術の開発

田村

理化学研究所

38 日本産野生マウス由来の MSM 系統およびコンソミック系統を用いた、マウス肺腫瘍
発生関連遺伝子のマッピング

宮下信泉

香川大学

39 内耳血管条構築に関わるメラノサイトの機能解析

山本博章

長浜バイオ大学

40 野生由来近交系マウス系統群を用いた薬物嗜好性の遺伝子メカニズム解析

笠井慎也

東京都医学総合研究所

41 社会的環境要因がマウスの行動に与える影響

下位香代子

静岡県立大学42 大脳基底核に発現する細胞接着分子の遺伝子欠損マウスの行動解析

霜田

長岡技術科学大学

43 Tol2 システムを使用した B6 および MSM マウストランスジェネシス技術の開発

隅山健太

誠

誠一

創

勝

靖

農学部
大気海洋研究所

岐阜経済大学経済学部

熱帯生物圏研究センター

外科

医学部
理学系研究科附属臨海実験所
バイオリソースセンター

総合生命科学研究センター

理化学研究所

バイオサイエンス学部
依存性薬物プロジェクト

食品栄養科学部
生物系

生命システム研究センター

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

65

66

研究課題

研究代表者

44 WHS を用いたジアゼパム感受性の遺伝学的解析

半澤直人

山形大学

45 琵琶湖固有魚介類における生殖細胞の培養とその分化系の開発

高田達之

立命館大学

46 低線量放射線被曝がシロサケ孵化稚魚に及ぼす遺伝的影響中嶋正道

東北大学大学院

47 Analysis of the transcriptome of the CC-genome wild rice Oryza officinalis

Benildo G. de los Reyes

University of Maine

48 イネのジテルペン生合成遺伝子の進化に関する研究

豊増知伸

山形大学

49 酵母と植物細胞の環境ストレス応答における細胞壁オートリシスと細胞内オートファ
ジー機能の解析井上雅裕

愛媛大学大学院

50 細菌細胞骨格タンパク質の動態解析

塩見大輔

立教大学

51 分裂酵母接合型変換の分子機構の解析

筒井康博

東京工業大学大学院

52 DNA 相同組換えによる染色体構造維持の分子メカニズム

菱田

学習院大学

卓

理学部
薬学部
農学研究科

農学部
理工学研究科理学部
生命理工学研究科

理学部

53 チェックポイントタンパク質のフィードバック制御の分子遺伝解析

古谷寛治

京都大学

放射線生物研究センター

54 ショウジョウバエ近縁集を利用した遺伝子・細胞機能の進化研究のための解析ツー
ルの開発

粟崎

杏林大学

医学部

55 Lactobacilus bulgaricus のギ酸による細胞壁合成および細胞分割の正常化と関連遺伝子群からの分子系統解析齋藤忠夫

東北大学大学院

56 エストロゲン受容体β(ERβ)と∆9 －テトラヒドロカナビノール (∆9-THC)との結晶構造

荒牧弘範

第一薬科大学57 4Å に代表される低分解能での構造精密化法の確立

近藤英昌

産業技術総合研究所

生物プロセス研究部門

58 膜蛋白質複合体結晶化のための膜調製方法の検討

村上東京工業大学大学院

生命理工学研究科

59 電子顕微鏡を用いたシナプスタンパク質 Dig の局在解析

浜

60 神経変性症状を呈するショウジョウバエ変異体の微細形態解析

曽根雅紀

東邦大学

健

聡
千尋

農学研究科
薬学部

京都産業大学

総合生命科学部

理学部

61 電子顕微鏡を用いたショウジョウバエ化学感覚系の構造解析

田中暢明

北海道大学

62 Evolutionary studies of marine metagenomics

John AC Archer

Computational Bioscience Research Center, King
Abdullah University of Science and Technology

63 発光プランクトン（海産カイアシ類）の遺伝的多様性と生物発光能の地球レベルでの解析

茂里

産業技術総合研究所

64 ヒト免疫老化表現型を特徴付けるトランスクリプトームおよび分子経路解析

吉田健吾

放射線影響研究所

65 バイオインフォマティクスを応用した新たなウコン変異株の生合成変動解析

田中

立命館大学

66 シニア専門家との協働作業による遺伝学関係データベースのアノテーションの高品
質化

阿部貴志

新潟大学

康

謙

創成研究機構放射線生物学／分子疫学部

薬学部
自然科学系

67 次世代シーケンサーを利用した進化研究

阿形清和

京都大学大学院

68 ピルビン酸低減清酒酵母一倍体のゲノム解析

北垣浩志

佐賀大学

69 マカクザル脳発達トランスクリプトーム・エピゲノム解析

郷自然科学研究機構康広

健康工学研究部門

理学研究科

農学部
新分野創成センター

70 毒蛇ハブの全ゲノム解析と染色体マッピング

柴田弘紀

九州大学

71 次世代シーケンサーによるパーキンソン病カイコモデル変異体 op の全ゲノム解析

天竺桂弘子

東京農工大学72 環境メタゲノム解析から大深度環境の微生物生態系の機能的特徴を見る

高見英人

海洋研究開発機構

73 島嶼環境における捕食者ヘビ類の食性、色彩パタン、体サイズ進化のエコゲノミクス

長谷川雅美

東邦大学

理学部

74 ショウジョウバエの生殖様式を決定づける遺伝的機構の解明

平井和之

杏林大学

医学部

75 イネにおける形態多様性に関わる遺伝的機構の解析

伊藤純一

東京大学大学院

農学生命科学研究科

76 イネの発生や生殖を制御する遺伝子機能の解明

平野博之

東京大学大学院

理学系研究科77 大型類人猿におけるサブテロメア近傍領域の比較ゲノム解析

黒木陽子

東北大学東北メディカル・メガバンク機構 ゲノム解析部門

78 Identification and study of new genes in the pineal gland, gonads and bone inzebrafish

Han Wang

Center for Circadian Clocks, Soochow University,
Suzhou, China

79 Screening and identification of Habenula- and neuromodulatory pathway-relevanttransgenic zebrafish

Jiulin Du

Institute of Neuroscience, Shanghai Institutes for
Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences

80 Identification and characterization of lines labeling neurons important for learning inlarval zebrafish

Martin Haesemeyer

Harvard University MCB

81 Identification and Characterization of novel regulators of liver growth

Wolfram Goessling

Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical
School, Harvard Stem Cell Institute82 三叉神経核における体部位マップ特異的 Cre マウスの作成

宮田麻理子

東京女子医科大学

83 環境依存的エピゲノム形成機構を支える分子基盤の解明

田嶋

敦

金沢大学

医薬保健研究域医学系

84 野生種マウスにおける情動伝染様式の解析

菊水健史

麻布大学

獣医学部

85 代謝シミュレーション及び構造生物学手法による泡盛芳香成分の合成機構の解明

仲宗根

近畿大学

工学部

86 計算資源の連携を目指したデータ共有機構の開発

松岡87 次世代シークエンサを利用した、新規ゲノム配列／転写産物配列決定手法の開発に
関する研究

伊藤武彦

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

薫聡

生体防御医学研究所

東京工業大学

農学研究院
海洋・極限環境生物圏領域

医学部

学術国際情報センター

東京工業大学大学院

生命理工学研究科

2014 年度 公募による共同研究

Collaborative Research
共同研究（B）
研究課題

研究代表者

1

真核細胞におけるDNA 損傷修復と複製開始制御連携の解析

滝澤温彦

大阪大学

理学研究科

2

ゼブラフィッシュの後脳血管ネットワークの形成と分子関与

藤田深里

東洋大学

生命科学部

3

AID 法とCRISPR/Cas システムの融合によるヒト Ran-GTP 濃度勾配の分裂期特異的破壊操作と機能解析

清光智美

名古屋大学大学院

4

新規巨大タンパク質ミステリンの機能解析

森戸大介

京都産業大学

5

大腸菌染色体の複製ヘリカーゼと新奇分配因子 CrfC の細胞内分子動態の解析

片山

九州大学

6

中枢シナプスの神経活動依存的な増強に伴う構造的変化

鈴木崇之

東京工業大学大学院

7

次世代シークエンサー技術を利用したメダカ近交系ゲノム比較による動物個性に関わる遺伝子多型の探索竹内秀明

東京大学大学院

8

イネ花粉突然変異体 Tos0113, Tos0251, Tos0330, Tos0403, Tos0425 の遺伝
学的解析

上田健治

秋田県立大学勉

理学研究科

総合生命科学部

薬学研究院
生命理工学研究科

理学系研究科
生物資源科学部

研究会
研究課題

研究代表者

1

クロマチンにおけるゲノム DNA の機能発現メカニズム

胡桃坂仁志

早稲田大学

2

哺乳類脳の機能的神経回路の構築メカニズム

河崎洋志

金沢大学

3

DNA から見た日本列島人の地域的多様性を生み出した要因をさぐる斎藤成也

国立遺伝学研究所

集団遺伝研究部門

4

ゲノム医科学とバイオインフォマティクスの接点と集学研究

井ノ上逸朗

国立遺伝学研究所

人類遺伝研究部門

5

転移因子と宿主の相互作用による生命進化

一柳健司

九州大学生体防御医学研究所

6

第 7 回エボデボ青年の会 「変動する環境と発生への衝撃」

北野潤

国立遺伝学研究所

生態遺伝学研究室

7

表現型と遺伝子型のミッシングリンクをつなぐ
発現の質的量的制御―

高田豊行

国立遺伝学研究所

哺乳動物遺伝研究室

8

Looking to the future of Notch signaling

松野健治

大阪大学大学院

理学研究科

9

イネ分子遺伝学への期待

伊藤純一

東京大学大学院

農学生命科学研究科

10 染色体 DNA の安定維持の分子メカニズム

石合正道

京都大学

11 第 1 回日本微生物若手連合研究会

島田友裕

東京工業大学

資源化学研究所渡辺智

東京農業大学

応用生命科学部

木村暁

国立遺伝学研究所

細胞建築研究室―ゲノムダイナミクスによる遺伝子

12 細菌細胞の増殖と代謝研究会
13 2014 年線虫発生生物学国際集会．第 6 回アジアー太平洋線虫集会
ける「形態形成」セッション

合同大会にお理工学術院
医薬保健研究域

放射線生物研究センター

14 New horizon in C. elegans Biology

澤斉

国立遺伝学研究所

多細胞構築研究室

15 ゲノム編集時代の分子進化

野澤昌文

国立遺伝学研究所

遺伝情報分析研究室

16 スフィンゴ脂質データベースワークショップ

中村和生

北里大学

17 塩基配列データアーカイブをフル活用するための大規模データ解析技術開発

坊農秀雅

情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター

18 オルガネラゲノムに支配される生命現象木下

横浜市立大学哲

Joint Research with the Private Sector

一般教育部 ( 生物学）
木原生物学研究所

2014 年度 民間等との共同研究

共同研究先

研究課題（研究題目）

研究代表者

契約期間

協和発酵キリン株式会社

トランスポゾンの哺乳動物細胞への応用に関する研究

初期発生研究部門教授

川上浩一’10.1.1 〜 ’16.3.31

株式会社ブリヂストン

パラゴムノキゲノム情報をベースにした遺伝子データベースの構築

大量遺伝情報研究室

教授

中村保一

’14.4.1 〜 ’15.3.31

理化学研究所

形態異常を示す各種突然変異マウスの解析

哺乳動物遺伝研究室

教授

城石俊彦

’08.4.1 〜 ’16.3.31

理化学研究所非対称細胞分裂に関与する遺伝子の研究

多細胞構築研究室

教授

澤理化学研究所

FANTOM5プロジェクトのための新データセットの作成

生命情報研究センター 特任教授 五條堀

理化学研究所

次世代シークエンサの定量データベース DDBJ Omics Archive（DOR）の登録補助ツール仕様構築

大量遺伝情報研究室

教授

中村保一

’11.9.1 〜 ’15.3.31

東京都医学総合研究所

被毛の有無とエネルギー代謝関連表現型変化の相関解析

哺乳動物遺伝研究室

教授

城石俊彦

’14.2.1 〜 ’15.3.31

静岡大学

イネ種子の成熟・発芽バランスを制御するメカニズムの解明

植物遺伝研究室教授

倉田のり’14.6.10 〜 ’16.3.31

東北メディカル ･ バンク機構

ゲノム情報などの機微性が高い情報の震災に備えたバックアップ データベース運用開発研究室
の研究

教授

高木利久

’14.8.1 〜 ’19.3.31

海洋研究開発機構

環境影響評価・修復法の開発へ向けた環境メタゲノム解析

比較ゲノム解析研究室

特任准教授 豊田東海大学

臍帯血を利用した再生医学、免疫学、腫瘍医学研究

人類遺伝研究部門

教授’11.10.1 〜 ’15.3.31

斉孝’11.2.18 〜 ’15.3.31

敦’14.4.1 〜 ’15.3.31

井ノ上逸朗’15.2.19 〜 ’18.3.31

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

67

Commissioned Research
委託者

2014 年度 受託研究

研究課題（研究題目）

研究代表者

契約期間

科学技術振興機構

X 線顕微鏡を用いた細胞及び染色体の観察

生体高分子研究室

教授

前島一博’12.4.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

高いバイオマス生産能及び環境耐性能を持つ藻類の作出

共生細胞進化研究室

特任准教授 宮城島進也’12.4.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

メタゲノム解析による微生物叢の動態の把握及び環境評価技術の開発

生命情報研究センター 特任教授 五條堀科学技術振興機構

デグロン変異細胞創出のための基盤技術開発

分子機能研究室准教授

鐘巻将人’13.10.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

細胞内自己組織化制御と生体ナノマシンの開発による新規木質バ
イオマス素材の創出

細胞空間制御研究室

准教授

小田祥久

’14.4.1 〜 ’15.3.31

科学技術振興機構

グリシン作動性シナプスの活動依存的形成と臨界期の分子基盤

運動神経回路研究室

准教授

平田普三

’12.4.1 〜 ’15.3.31

科学技術振興機構

有糸分裂紡錘体におけるミクロな力学反応の再構成

定量メカノバイオロジー研究室

准教授

島本勇太

’14.7.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

遺伝統計学的計算手法の開発とデータ登録

人類遺伝研究部門

教授

井ノ上逸朗

’14.4.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

微生物 DB の高度化と配列解析支援系の開発と提供

大量遺伝情報研究室

教授

中村保一

’14.4.1 〜 ’16.3.31

科学技術振興機構

HLA 遺伝子完全配列決定パイプラインの構築

人類遺伝研究部門

外来研究員 細道一善

’14.9.1 〜 ’15.3.31

科学技術振興機構

スペクトル解析プラットフォームの構築

生命ネットワーク研究室

教授

有田正規

’13.11.1 〜 ’16.3.31

産業技術総合研究所（科学技術振興機構）

生体防御系を利用した疾患診断の基盤技術開発－ HLA タイピン 人類遺伝研究部門
グ解析

教授

井ノ上逸朗

’13.10.1 〜 ’15.3.31

農林水産省

メタゲノム解析による微生物相 DNA 情報の抽出技術の開発

生命情報研究センター 特任教授 五條堀

農業生物資源研究所（農林水産省）カンキツの育種選抜に利用可能なゲノムワイドSNP の拡充

大量遺伝情報研究室

助教

神沼英里

’14.4.1 〜 ’15.3.23

高機能遺伝子デザイン技術研究組合（経済産業省）

生合成パスウェイデータベースの構築

生命ネットワーク研究室

教授

有田正規

’14.4.1 〜 ’15.2.’15

長崎大学（厚生労働省）

ゲノム不安定性を示す難治性遺伝性疾患群の症例収集とゲノム分 人類遺伝研究部門
子機能解析による病態解明研究

教授

井ノ上逸朗

’14.6.2 〜 ’15.3.31

長崎大学（厚生労働省）

ゲノム不安定性を示す難治性遺伝性疾患群の症例収集とゲノム分 大量遺伝情報研究室
子機能解析による病態解明研究

教授

中村保一

’14.6.2 〜 ’15.3.31

孝

孝’12.4.1 〜 ’16.3.31’14.4.1 〜 ’15.3.23

2014 年度 科学技術人材育成費補助金
テニュアトラック普及・定着事業（若手研究者の自立的研究環境整備促進）

文部科学省

課題名

事業実施センター責任者

生命科学の新分野創造若手育成プログラム

新分野創造センター

事業実施期間

センター長

相賀裕美子

’10.7.13 ～ ’15.3.31

2014 年度 研究開発施設共用等促進費補助金
ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）
研究課題

課題管理者

イネ属の多様性を生かすリソース基盤の構築

植物遺伝研究室教授

倉田のり’14.4.1 〜 ’15.3.31

文部科学省 モデル原核生物（大腸菌・枯草菌）遺伝資源の整備と活用

原核生物遺伝研究室

教授

仁木宏典

’14.4.1 〜 ’15.3.31

文部科学省 ショウジョウバエ遺伝資源の総合的維持管理および提供

無脊椎動物遺伝研究室 教授

上田龍’14.4.1 〜 ’15.3.31

文部科学省 ゼブラフィッシュの収集・保存および提供（トランスジェニックゼブラフィッシュ系統
及び近交系ゼブラフィッシュの収集・保存及び提供）

初期発生研究部門教授

川上浩一’14.4.1 〜 ’15.3.31

文部科学省

情報発信体制の整備とプロジェクトの総合的推進

系統情報研究室

准教授

文部科学省

野生イネリソースのゲノム多様性情報の整備

植物遺伝研究室教授

文部科学省

多様な特性を持つショウジョウバエ種のゲノム配列

無脊椎動物遺伝研究室 助教

文部科学省

研究期間

山﨑由紀子

’14.4.1 〜 ’15.3.31

倉田のり’14.4.1 〜 ’15.3.31

近藤’14.4.1 〜 ’15.3.31

周創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業

68

文部科学省

構造生命科学データクラウドの構築運用と高度化

文部科学省

創薬等支援のための大規模シーケンスによるゲノミクス解析支援と高度化
生命情報研究センター 准教授（創薬等支援のための大規模シーケンスデータのためのゲノミクス解析支援と高度化）

共同利用・共同研究／ Intellectual Infrastructure・Collaborative Research

遺伝情報分析研究室

特任教授 由良敬’14.4.1 〜 ’15.3.31

池尾一穂’14.6.1 〜 ’15.3.31

69

International Activities
国際交流■ Collaboration with Researchers from Foreign Countries

National Institute of Genetics promotes collaborations not
only with Japanese researchers but also researchers from foreigncountries. Division of Molecular and Developmental Biology(Kawakami lab) has the world largest transgenic zebrafish
re s o u rc e t h a t i s u s e f u l f o r d e v e l o p m e n t a l b i o l o g y a n d
neuroscience. In 2014, researchers from Harvard University (USA),
Harvard Medical School (USA), University of Texas South western
Medical Center (USA), Max Plank Institute of Neurobiology(Germany), The Weizmann Institute of Science (Israel), Soochow
University (China), and Chinese Academy of Science (China)
visited Kawakami lab and performed genetic screens to find fishthat will be useful for their research (“shelf-screen”). Thus, National
Institute of Genetics is aiming to establish a basis of international
collaborations.

■ NIG International Symposium

In order to contribute to advancing the frontiers of genetics,
NIG has been organizing and sponsoring international symposium
and promoting academic interactions among researchers fromdiverse backgrounds and disciplines. This year we supported aninternational symposium “3R (DNA replication, Recombination
and Repair”. Prof. Takehiko Kobayashi (Division of cytogenetics,
NIG) organized the symposium.
The conference was attended by 194 investigators (including
70 from abroad and 45 students)■ 海外の研究者との共同研究

国立遺伝学研究所では、国内の研究者のみならず国外の研究者との共同研究を推進しています。
「初期発生研究部門

川上研究室」では、発生生物学・神経科学研究に有用なトランスジェニックゼブラフィッシュの世界最大規模のリソースを有しています。このリソースを基にした共同研究を展開するために、2014 年度は、Harvard University（USA）、
Harvard Medical School（ USA ）、University of Texas Southwestern Medical Center（ USA ）、Max Plank Institute of
Neurobiology（ Germany ）、The Weizmann Institute of Science（ Israel ）、Soochow University（ China ）、Chinese Academy of
Science（China）等からの研究者を短期間受け入れ、それぞれの研究
者の研究対象となるトランスジェニックフィッシュをスクリーニングにより見つけ出す「shelf-screening」を実施しました。このような活動を通じて、
国立遺伝学研究所は、国際的な研究拠点としての発展を目指しています。

■ 国際シンポジウム

国立遺伝学研究所は、国際的な学術交流を推進することにより多様な分野の研究者との連携を強化し、遺伝学および共同研究の発展に資することを目的に、毎年国際シンポジウムを支援しています。2014 年度
は遺伝研細胞遺伝研究部門の小林武彦教授が主催者となり国際シンポジウム「3R（DNA 複製・組換え・修復）」を開催しました。
海外からは招待講演者 22 名を含む 70 名の参加があり、総勢 194 名
が 5 日間にわたり熱い議論を繰り広げました。

▪会期：2014 年 11 月 17-21 日▪ Date: Nov. 17-21, 2014

▪ Venue: Gotemba-Kogen Hotel, Gotemba, Shizuoka
70

国際交流／ International Activities▪場所：静岡県御殿場市 御殿場高原ホテル▪参加者数：194 名（内学生 45 名、外国人 70 名）

■ Support for International Researchers

NIG is committed to support international researchers so thatthey can dedicate themselves to research in a stimulating but yet
unfamiliar environment. New international NIG members will
receive assistance from the Group for Internationalization
Promotion (GIP) with their initial move to Japan – and throughout
their stay at NIG / SOKENDAI. The support offered by GIP
includes help in visa applications, administrative procedures upon
relocation/employment, flat hunting and medical care. GIP will
also provide useful information of the area to enrich your academic
and personal life in Mishima. Free Japanese lessons are offered tothose who wish to learn Japanese language.

■ 外国人研究者に対するサポート

遺伝研の国際的な研究環境を整備・発展させるために、国際化推進委員会が様々な活動を行っています。外国人研究員・留学生が言葉の壁を感じることなく研究に専念できるよう、国際化推進グループ（GIP）
が来日前のビザ申請から、来日後の事務手続き、住居探しや三島エリアの生活情報の提供に至るまで、幅広いサポートを提供しています。日本
語の無料レッスンも行っています。

For more details, visit GIP web page: http://www.nig.ac.jp/
jimu/soken/GIP/index.html
Please feel free to contact us if you have any questions about
working/studying at NIG / SOKENDAI.
▪ GIP Help Desk Coordinator (General Affairs /Education Team):

MIURA, Chikako

cmiura@nig.ac.jp▪ Chair of Internationalization Promotion Committee:

Professor AKASHI, Hiroshi

Hosting Foreign Scientists
Postdoc

hiakashi@nig.ac.jp

外国人研究者の受け入れ

Name / Subject title / Affiliation

氏名／研究課題／所属

博士研究員

Characterization of biodiversity and species variation in genus Oryza.

Plant Genetics Laboratory
植物遺伝研究室

Postdoc 博士研究員

Reception and quality control of the massive submissions at DDBJ.

DDBJ Center
DDBJセンター

Postdoc 博士研究員
智ZHOU, Zhi 周マウス雄性生殖細胞特異的因子 Nanos2 の標的 RNA の同定と機能解析

Identification of target genes of Nanos 2 in germ cell.

Mammalian Development Laboratory
発生工学研究室

SHENTON, Matthew Richard
LEE, KyungBum 李 慶範

イネ属の多様性および種間変異の調査解析

DDBJ における塩基配列大量登録情報の受入対応と高水準化

Postdoc

WU, Quan

博士研究員
泉

マウス生殖細胞の性分化決定機構の解析

Study on the mechanism of sex determination of murine germ cells.

Mammalian Development Laboratory
発生工学研究室

Postdoc

博士研究員
華Analysis of RNA-binding proteins promoting germ-cell development in rice.

Experimental Farm実験圃場

LIU, Hua 劉イネの生殖細胞発生に関わるRNA 結合蛋白質の解析

Postdoc 博士研究員
JIN, Yinhua 金 銀華

線虫の非対称分裂機構の研究

Study on asymmetric cell division in C. elegans.

Multicellular Organization Laboratory
多細胞構築研究室

Researcher

Functional analyses of common diseases using three dimensional chromatin structure.

Division of Human Genetics
人類遺伝研究部門

研究員

AHMADLOO, Somayeh

クロマチン高次元構造からの common disease 機能解析

国際交流／ International Activities

71

Activities and Events for Research Promotion
研究を促進するための活動と行事▶ Activities for Research Promotion

研究を促進するための活動

NIG Colloquium
内部交流セミナー

Biological Symposium Presented by Dr. Stephen Kowalczykowskiバイオロジカルシンポジウム Dr. Stephen Kowalczykowski 講演■ 内部交流セミナー■ NIG Colloquia

Seminars are held every Friday by researchers at the instituteto discuss their progress during the past year. Presentations are
made not only by faculty, but also by fifth year graduate students
as a part of their D5 Progress Report.

研究所内における研究成果を発表し、討論する会で、毎週金曜日に開かれます。教員による発表の他、D5プログレスレポートとして博士課
程５年生の研究紹介の場としても利用されています。

■ Biological Symposia■ バイオロジカルシンポジウム

The Biological Symposium is held throughout the year,
featuring distinguished speakers in many areas of biologicalsciences, from universities and institutions worldwide.

を行います。幅広い分野の優れた講演が年間約 90 回行われています。

先端の研究を行っている国内外の研究者を研究所に招き、講演討論▶ Events

行Open House on April 4, 2015

一般公開 2015 年 4 月 4 日■ Open House

As one of the events of the Science and Technology
Week, NIG opens its grounds and facilities to the public.
Visitors attend exhibits and special lectures as well as
enjoying cherry blossoms in the campus.
■ Public Lecture

Once every autumn, NIG holds a public lecture inTokyo, presented by its faculty.

Public Lecture Presented by Dr. Kimura Akatsuki

公開講演会 木村 暁 准教授講演■ 研究所の一般公開

科学技術週間における行事の一環として、毎年４月上旬に各研究部門の展示や学術講演を行い、研究所の一部を一般に公開しています。
■ 公開講演会

年 1 回、東京地区を中心に本研究所教員を講師として、一般を対象に遺伝学
公開講演会を開催しています。
国立遺伝学研究所

2014 年度の公開講演会◦講演タイトル
自然が創った名建築、細胞のお話／木村72

事

研究を促進するための活動と行事／ Activities and Events for Research Promotion

暁准教授

なぜ細胞は DNA を正確に複製できるのか？／鐘巻将人

准教授

マウスで迫る「こどもの脳の発達のしくみ」／岩里琢治教授

Cyber Museum of Genetics

http://www.nig.ac.jp/museum/

遺伝学電子博物館

この博物館は、1999 年に国立遺伝学研究所の創立 50 周年を記念して、遺伝学の研究の中身を、わかりやすく、楽しく知っていただけるようにと企画して作ったものです。2009 年、創立 60 周年にあたり、構成を一新するとともに、時代の流れに則した内容を新たに付け加えました。
新聞やニュースなどで、「遺伝子」、「DNA」、「ゲノム」といった言葉が毎日のように流れています。いまや、遺伝学の研究は専門家だけに任せておいてはいけない時代、沢山の方が理解して判断を迫られる時代となっているのです。この「遺伝学電子博物館」では、学生・学校の先生・ジャーナリストだけでなく、科学の研究に興味のある多くの方々に向けて、遺伝学についての正確な情報を提供しています。では、少しだけ中身を紹介しましょう。

■ 遺伝学の歴史 …… メンデルから現代まで

昔から「子は親に似る」ということわざがあるように、親子、兄弟は何となく顔や姿が似ていることは疑う余地がありません。遺伝現象の研究が近代科学として成立したのは、オーストリアの修道院の牧師であった Mendel が重要な遺伝の法則を発見したことから始まります。
■ 進化と遺伝 …… 生きものはどこから来たか

生物種の遺伝学

科学としての進化論は、C. ダーウィンが1859年に『種の起原』を発表したことから始まりました。ダーウィンは遺伝の原理を知りませんでしたので、自然淘汰の機構について充分説明できず大変悩んだようです。1968年、木村資生が提唱した中立説に始まり、分子レベルで進化を考えることが始まりました。
■ 分子遺伝学 …… DNA の視点から生命を考える

1953 年、X 線を使ってDNA の二重らせん構造が発見されました。そこには遺伝情報を正確に子孫に伝え、体のかたちを作り、生命活動を行う精巧な仕組みが秘められていました。近年活発なゲノムプ
ロジェクトについてもご紹介します。

マルチメディア資料館：DNA の複製■ 生物種の遺伝学 …… いろんな生物のゲノム研究

ゲノムプロジェクトにより、生命現象の基本プログラムの詳細な姿を明らかにするための基礎となる「情報」が日々蓄積されています。それらは、ゲノムの構造と密接に関連した生物情報知識ベースとしてコンピュータ化され、バイオサイエンス研究の基盤情報として広く使われているのです。
■ マルチメディア資料館 生物・ザ・ムービー …… ムービーで見る分子の世界

DNA が複製・転写・翻訳される様子が 3D のムービーになりました。RNA ポリメラーゼの専門家と生物・ザ・ムービータンパク質の立体構造の専門家が製作に参加し、分子生物学の正確な知見を踏まえて作られています。
■ クイズ遺伝学 ゲノムアニメ劇場 電脳紙芝居 …… 楽しく遺伝学を知ろう！

ゲノムって何？オーダーメイド医療って？研究者はどんな考え方をしているの？素朴な疑問にクイズやアニメで楽しみながら学べます。狙った遺伝子を破壊できるノックアウト技術を使ったマウスの研究の紹介アニメが新たに追加されました。

ゲノムアニメ劇場

遺伝学電子博物館／ Cyber Museum of Genetics

73

国立大学法人  総合研究大学院大学・生命科学研究科

遺伝学専攻

Department of Genetics

SOKENDAINational Institute of Genetics (NIG) functions as
the Department of Genetics, SOKENDAI (The
Graduate University for Advanced Studies) and offers
PhD programs in Genetics. Our 5-year program
accepts those with a bachelor’s degree or equivalent.
Those with Master’s degree or similar qualifications
are also eligible to apply to our 3-year program.
Our graduate programs provide interdisciplinary
education with frequent seminars, journal clubs, andworkshops on scientific writing and presentation.
Highly qualified students can receive financial aid.
For more information please visit the web site ofour graduate program.
http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/index-e.html

国立遺伝学研究所（遺伝研）は、総合研究大学院大学（SOKENDAI）
・生命科学研究科・遺伝学専攻として、大学院生の教育を行っています。遺伝学を中核に多様な分野の研究が集積する優れた環境の元で、幅広い視野をもつ研究者を育成し、次世代の生命科学研究に貢献したいと考えています。
5 年一貫制博士課程と3 年間の博士後期課程の 2 種類の課程があります。5 年一貫制課程の対象者は大学卒業、または、それと同等の資格を有する方；博士後期課程の対象者は修士号取得者、または、それと同等以上の学力があると認められた方です。
http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/index-j.html

74Department of Genetics,
School of Life Science, SOKENDAI
総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻

遺伝研で学びませんか？
▶ SOKENDAI

遺伝学専攻の特色■ 質の高い研究■ High Quality Research

United under the term “Genetics”, graduate students at NIG
continue to expand the frontiers of life sciences in molecular and cellbiology, development, neurosciences, evolution, structural biology
and bioinformatics. The quality of NIG research is evident from thefrequent citations of papers published from the institute and the highfunding rates for our grant proposals. NIG houses tremendous
resources for basic research in life sciences, such as the wellestablished DNA database (DDBJ), an extensive collection of naturalvaluable and mutant strains of various model organisms, and stateof the art research equipment.

遺伝研は国内外の研究者の共同利用を目的とした研究機関です。
整備されたDNAデータベース、数多くの実験生物系統などの遺伝資源、最先端の共通機器等、生命科学の基礎研究を遂行するための環境が全て揃っています。ここでは、約 40 の研究グループがそれぞれのテー
マに向かって自由に研究活動を展開し、得られた研究成果を世界へと発信しています。論文引用度や科学研究費の採択率がここ数年間
常にトップクラスであることも、当研究所で行われている研究が国際的にみても高水準であることを裏付けています。質の高い研究に支えられた研究主導型の教育は、SOKENDAI・遺伝学専攻で学ぶ大きな利点です。

■ Excellence in Graduate Education

Unlike most other Japanese universities that retain the “pyramid”
lab structure, professors and associate professors organize
independent research groups at NIG. Each group is small; a typicallab consists of fewer than ten people. Thus, the ratio of faculty tostudents is extremely high, an average of 2.08 faculty / student. This
enables the graduate students to have frequent and indepth
discussions with faculty-something not possible at institutions withan undergraduate program, which must accept several students per
faculty every year, not counting undergraduate students!

■ 充実した教育

遺伝研では、教授も准教授もそれぞれ独立の研究室を組織して研究を行っています。各研究室の構成員は10 人前後と小規模ですので、教員と頻繁な密度の濃い議論が可能です。博士課程の大学院生１人あたりの教員数は 2.08 人であり、大学院大学ならではの非常に恵まれた研究教育環境であるといえます。教員１人あたりの学生数、学生１人の教育にかける経費などを総合した「教育の偏差値」は、全国の国立大学のなかでトップに位置しています。

University/Research Institute
大学・機関

Number
論文数

Citation Score
引用度指数

Rank
順位

National Institute of Genetics
国立遺伝学研究所

656

132.6

2

National Institute for Physiological Sciences
生理学研究所

600

130.1

4

The University of Tokyo東京大学

36,938

125.7

6Tokyo Institute of Technology
東京工業大学11,669125.6

8Kyoto University
京都大学

27,234122.6

10

Osaka University
大阪大学

21,598122.5

11（朝日新聞出版刊

大学ランキング2015）

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI

75

■ Diverse Courses and Frequent Seminars

The Department of Genetics offers diverse courses aimed atproviding in-depth as well as basic knowledge on various fields oflife sciences. For example, in the course “Perspectives of
Frontiers”, students can obtain credit by taking two short lecture
series that deal with fundamental principles at the boundary of
biology and another field. Molecular and Cellular Biology andDevelopmntal Biology are offered in two forms: e-learning in which
you can learn basic consepts over the internet, and courses that
center on critical reading and discussion of the primary literature.
Courses on scientific presentation and scientific writing are alsooffered.
A large number of seminars covering various fields of life
sciences are held by NIG. About 90 “Biological Symposia”
featuring eminent scientists from all over the world are held
annually. In addition, members of NIG present their progress
during the past year at weekly “NIG Colloquia”. These seminars
also include question and answer session with active discussions
in which students can learn how to discuss and debate various
scientific issues. Graduate students are invited to lunch withseminar speakers, where students have a chance to personally
talk with internationally renowned scientists. Almost all theseminars are given in English, and the graduate course lectures
are also given in English. Knowledge of Japanese is not requiredfor completing the graduate program and obtaining PhD degree.

■ Team Teaching

NIG has a policy that “all” faculty members should be involvedin the education of each student. As in other institutions, mostresearch activities of a student are done in a particular researchgroup, headed by a thesis advisor. However, each student in the
NIG graduate program elects four faculty members outside theirown research group as members of their “Progress Report
Committee”. This committee meets with the student once per
year (or more often if requested by the student) and gives advice
on the student’s thesis project. Every year students will haveopportunities to present their work in poster sessions or at the
NIG Colloquium, and have discussions with the committee, as
well as the audience. By providing a friendly and stimulating
environment to have in-depth discussions with researchers inother fields, this program helps students to broaden their views
and to find breakthroughs when research is not going smoothly. It
also gives opportunity to prepare for presenting seminars atconferences.

76■ 多彩な授業と豊富なセミナー

遺伝学専攻では、生命科学をはじめとする様々な分野について基礎から最先端まで学べます。分子細胞生物学や発生生物学では、e-learning
による基礎的知識の教授と議論が中心の授業を併設し、原著論文を批
判的に読み、ディスカッションすることを通して「考える力」や「討論する力」を育てることを重視しています。SOKENDAI・遺伝学専攻で学ぶ大きな利点です。遺伝研で行われている授業だけでなく、遠隔講義システムを活用して他の専攻で実施されている幅広い分野の授業に参加することも可能です。総研大の講義リソースの中から自分の興味で授業を組み合わせて「自分の科目」を造ることもできます。また、英語による口頭発表
や論文作成など、成果発表のための実践的技術を身につけるための授業も行っています。
遺伝研では、多岐分野にわたるセミナーが頻繁に開催されています。
週 1 度の所内演者による内部交流セミナーに加えて、国内外の著名研究者を招いた Biological Symposium が年間約 90 回も開かれ、活発な論議が行われています。セミナー 演者と大学院生との昼食会に参加すれば、あこがれの研究者と実際に会って個人的に話をすることができます。
■ 複数教員による教育制度

遺伝学専攻は、「一人一人の大学院生を全教員で指導する」という理念のもとに大学院教育を行っています。もちろん各大学院生はそれぞれ一人の指導教員のもとでその研究グループに所属して研究を行いますが、それを補う形で、複数教員の指導によるユニークな「プログレスレポート
制度」を実施しています。この制度は、「各々の学生が選んだ教員が小委員会を組織し、学生の相談にのったり助言をおこなう」というものです。
５年一貫制博士課程１、３年次では、指導教員以外の教員１名との個人面談で研究計画の討論を行い、研究テーマの設定について助言を得ることができます（生命科学プログレスⅠ、Ⅲ）。２、４年次には、それまでの研究内容のレポートを提出し、指導教員以外の４人の教員からなる小委員会に対して口頭で発表を行います（生命科学プログレスⅡ、Ⅳ）。さらに５年次には、研究所全体での公開のセミナーを行い、聴衆や小委員会のメンバーと討論します（生命科学プログレスⅤ）。研究成果がまとまって学位論文を提出すると、多くの場合、プログレスレポート小委員会のメンバーに所外の委員を加えて審査委員会が組織されます。指導教員は審査委員
会メンバーにはなれません。これらの制度が、研究が行き詰まったときの助けになるのはもちろんですが、様々な分野の研究者の意見を聞く機会をもつことで、研究者としての視野を広げるのに役立っています。また、英語論文を書くための準備やプレゼンテーションの訓練という意味でも経験を積むことができます。

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI

■ 研究者間の活発な交流■ Close Network of Research Groups

NIG is famous for active interactions and discussions among
the in-house researchers. Because each research group is small,many groups have joint lab meetings with other labs, andcollaborations between groups are very common. Graduate
students also actively and freely visit other research groups toacquire new techniques and knowledge, which is another merit ofsmall groups. NIG also hosts various types of researchers, such as
postdoctoral fellows, collaborative researchers and visiting scientists
from abroad. Interacting and networking with researchers withdiverse levels and backgrounds is an ideal way for students todevelop broad and balanced views as mature scientists.

遺伝研・遺伝学専攻は、研究者間の交流や議論が活発な事で有名です。各研究室が小規模なこともあり、研究室間の合同セミナーや、共同研究が活発に行われています。大学院生も、他の研究室に出入りして自分に必要な知識や実験手技を学んだりするなど、自由で積極的な交流を行っており、講座制にはない魅力となっています。研究所には、教員や大学院生以外にも、博士研究員、共同利用研究員、外国人招へい研究者等、様々な立場の研究者がいるので、いろいろなレ
ベルでの交流が行われています。このような研究室間の垣根のない
交流は、幅広い学際的視野をもつ研究者の育成のために、非常に良い環境であるといえるでしょう。

■ 生命科学リトリート■ Life Science Joint Retreat

SOKENDAI houses the largest number of life science faculty inJapan. In addition to the Department of Genetics in Mishima, theOkazaki area has two departments the Department of Physiological
Sciences and the Department of Basic Biology and a fourth
department, the Department of Evolutionary Studies andBiosystems, is located in Hayama. These four life science
departments hold a joint retreat every year for scientific interactions.

総研大の生命科学研究科は、遺伝研を基盤機関とする遺伝学専攻、岡崎の生理研、基生研を基盤機関とする生理科学専攻、基礎生物学専攻から成り立っています。これら３専攻に葉山の生命共生体進化学
専攻を加えた 4 専攻合同の生命科学リトリートが年１回開催されています。

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI77

▶ Various Aids to Students

学生に対する様々な支援活動

NIG and the Department of Genetics conduct various activities to support graduate students and enrich its graduate program.
大学院生としての生活は人生の中で決して「楽な」時期ではありません。一人前の研究者と同様に高いレベルの研究成果をあげることを期待されているにもかかわらず、「指導を受けている」学生という身分であるため、仕事をするために授業料を支払わなければなりません。アメリカでは、大学院生の授業料は学部や指導教官が申請するグラントによって負担され、また学生には給与（stipend）が支給されるのが普通ですが、現在の日本の制度では大学院が学生に経済的な援助を与えるシステムは極めて限られています。このような制約の下でも、遺伝学専攻は、学生が「一人前の研究者に育つ」と言う目標を達成するために出来る限りの支援をしようとしています。
■ Financial Aid

Students accepted to the International Graduate Program at
NIG will be nominated as candidates to receive the scholarshipfrom the Japanese government (MEXT fellowship). Third year
students can also apply to a “Research Fellowship for Young
Scientists” grant sponsored by JSPS. Other financial aids are alsoavailable.
■ Courses on Scientific Writing and Presentation

Scientist must not only make new discoveries, but also
communicate new findings effectively to others. The ability topresent and discuss science in English is thus an essential skill
that must be learned within your graduate career. The Departmentof Genetics offers many courses and workshops on scientificwriting and presentation, including a newly developed curriculum:
English for Scientists. For details please take a look at thefollowing URLs:
Scientific writing: http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/courses/sciwri/
Scientific presentation: http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/courses/EfS/■ Aid in Finding a Job

To help our graduates find jobs after obtaining their degrees,
NIG collects recruitment information for positions such as
postdocs and assistant professors and informs the graduate
students and alumni using a web page and a mailing list.

■ 経済的支援

遺伝学専攻では、大学院生をリサーチアシスタントに採用し、給与を支給しています。額は５年一貫制１、２年次が年額 55 万円、３年次以上が年額 60 万円です。また、日本学生支援機構の奨学金の貸与を希望する
者は、入学後選考のうえ、日本学生支援機構に推薦します。最近の実績
では、希望者全員が奨学金給付を認められています。入学料、授業料については、経済的理由により納付が困難で、かつ学業優秀な者等に対し、入学後選考のうえ、半額免除又は徴収猶予が認められる制度があります。
■ 科学発表の授業

研究者にとっては、単に研究能力だけでなくその成果を外に発表する能力も大切です。特に英語で表現・議論する能力は国際的に活躍するためには是非身につけたい能力です。博士号取得までに「英語で理解・表現・議論する力」を獲得できるよう、遺伝学専攻は外部講師による英語論文
書き方講習会や独自カリキュラムによる科学プレゼンテーション授業など、様々な取り組みを行っています。詳細は以下の URL をご覧ください。
Scientific writing: http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/courses/sciwri/
Scientific presentation: http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/courses/EfS/■ 就職支援活動

遺伝学専攻では在学生や修了生を対象に、「求人情報のメーリングリスト」を作成しています。個々の教員に寄せられるポスドクなどの求人情報が素早く入手できる便利な制度です。

■ Travel Funds

Once you have obtained interesting results and polished yourpresentation skills, it’s time to show them off at international
meetings. Indeed, many NIG graduate students have been
selected to present their work as oral presentations at prestigious
international conferences. NIG students are eligible to apply toseveral travel funds to cover the costs of attending international
conferences.

78■ 海外での学会参加の助成

研究成果をあげ、英会話能力を身につけたら次は国際学会での発表です。遺伝学普及会が若手研究者に対する海外渡航費の助成を行っており、申請が認められれば旅費の援助が受けられます。国際共同研究活動や国際的研究能力育成のための長期間海外派遣で研究や研修を行う制度もあります。

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI▶ Research Internship

体験入学プログラム■ Undergraduate Research Internships at NIG

NIG offers a 10-week undergraduate research internship program forinternational students who wish to gain experience in scientific lab work.
Each intern will join ongoing research projects in a world class researchgroup, and will be provided with latitude as well as responsibility to
conduct “real” research, i.e. something that no one in the world has done
before. Interns also participate in various Departmental activities, such as
lectures for our graduate students, journal clubs, and seminars byoutstanding researchers in and out of NIG. Japanese lessons are alsoavailable. Stipend will be provided to cover travel and living expenses. If
you want to find out what it is like to do research, this is the best way tospend a summer.

■ 学部学生のための遺伝研体験プログラム

遺伝研では学部学生のための「体験入学プログラム」を実施
しています。
１週間程度、遺伝研の宿泊施設に泊まり込み、実験、セミナー参加など、たくさんのプログラムで遺伝研の研究生活を実体験することができます。旅費・宿泊費は遺伝研から支給されます。

http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/html/nyugaku/taiken.html

http://www.nig.ac.jp/jimu/soken/intern/index.html

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI

79

■ 大学院進学を考えている人へ■ Graduate education at NIG

Educating future generations of scientists is central to the mission of NIG.
Our undergraduate and graduate programs provide many opportunities forstudents to gain scientific knowledge and experimental techniques as well as
professional skills. However, though less tanglible, we also believe thatdeveloping the “spirit and attitude of research” is critical for young scientists.
The accomplishments of our students are perhaps the most importanttestament to the success of our research and education programs. The figure
below shows some NIG graduate students and their first-authored work
recently published in top scientific journals.

遺伝学専攻の大学院教育は、「自立した研究者」の育成を目指しています。しかし、この目標は優れた研究環境や充実した指導体制だけで達成できるわけではありません。大学院生が各自、何を研究したいのか目的意識をきちんと持
ち、自ら積極的に行動することが必要です。遺伝学専攻に興味を持たれた方は、まずは興味をもつ研究室の教員に直接連絡を取ってみてください。下の表は遺伝学専攻生とその発表論文の一例です。

Publications by NIG Graduate Students
Genome-wide linkage and exome analyses identify HMCN1 variants for Splenic Epidermoid Cyst.
Omer, H. W., Narita, A., Hosomichi, K., Mitsunaga, S., Hayashi, Y., Yamashita, A., Krasniqi, A.,
Iwasaki, Y., Kimura, M. and Inoue, I. (2014). BMC Med Genet. 15, 115.
OMER AAMER, Waleed Hussein (D3)
When I came to NIG, I had general information about it, however witheveryday passing; I feel I made the right decision by coming to NIG. I cansafely say now that everything here is ideal for graduate studies, startingfrom the state-of-the-art facilities to the outstanding supervision system.

Waleed Hussein Omer Aamer（D3）
遺伝研に来た当時は、遺伝研について一般的なことしか知りませんでしたが、ここで日々過ごすうち、来て良かったと思うようになりました。
最先端の設備や優れた教育システム等、どれをとっても大学院研究には理想的な環境です。

RacGAP α2-chimaerin function in development adjusts cognitive ability in adulthood.
Iwata, R., Ohi, K., Kobayashi, Y., Masuda, A., Iwama, M., Yasuda, Y., Yamamori, H., Tanaka, M.,
Hashimoto, R., Itohara, S. and Iwasato, T. (2014). Cell Rep. 8, 1257-1264.
IWATA, Ryohei (Graduated in March 2014)
Many thanks to my colleagues and friends at NIG who made my
graduate student life a wonderful experience.

岩田亮平（2014.3卒業）
遺伝研の素晴らしい環境のおかげで、楽しく大学院での研究生活を過ごすことができました。

SMAD2 and p38 signaling pathways act in concert to determine XY primordial germ cell fate in mice.
Wu, Q., Fukuda, K., Weinstein, M., Graff, JM. and Saga, Y. (2015). Development 142, 575-586.
WU, Quan (Graduated in March 2013)
In NIG, you can focus on what you interested in. Moreover, NIG
provides the opportunity to discuss with researchers across fields in theworld as well as the chance to master the novel technologies to solve thecomplex questions in science.

呉泉（2013.3卒業）

遺伝研では自分が興味がある研究に没頭できます。世界の研究者と分野を超えて議論できるし、複雑な問題を解くために新たな技術を身につける機会も提供してもらえます。

▶ Programs to host researchers
NIG accepts students who belong to other graduate programs (master’scourse or doctor’s course) and provides research environment at the Institute.
NIG also offers ample opportunity for post-graduate education andinternational exchanges. In addition to institutionally-founded posdoc
positions (NIG postdoctral fellow; http://www.nig.ac.jp/english/about/recruit.
html), one can also work at NIG through externally-funded postdoc grants (MEXT
and JSPS Programs) or grants to individual labratory. In addition, NIG
welcomes sabbatical stays of foreign faculty. Please contact your proposed
mentor/host/hostess for details on the programs.

80

遺伝研で研究しよう
遺伝研は、他大学の大学院生の教育にも貢献しています。
遺伝学またはこれに関連する学問分野を専攻している大学
院生（修士・博士課程）であれば、「特別共同利用研究員」
として遺伝研で研究することが可能です。授業料などの費用はかかりません。そのほか、企業に所属しながら遺伝研で研究する「受託研究員」制度や、大学卒業の資格で遺伝研で研究する「遺伝研研究生」の制度もあります。詳細はhttp://www.nig.ac.jp/welcome/howtowork-j.html をご覧ください。

総合研究大学院大学・生命科学研究科・遺伝学専攻／ Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAINIG Data
遺伝研データManagement（2015 年 4 月 1 日現在）

運営会議 Advisory Committee
研究所の運営に関する重要事項その他共同研究計画に関する事項で、所長が必要と認めるものについて、所長の諮問に応じる。
The Advisory Committee gives advice to the Director-General on administrative affairs including joint research programs.
漆原秀子

筑波大学名誉教授
URUSHIHARA, Hideko Professor Emeritus, University of Tsukuba

舘田英典

九州大学大学院理学研究院教授

黒田真也

東京大学大学院理学系研究科教授

西田栄介

京都大学大学院生命科学研究科教授

篠崎一雄

理化学研究所環境資源科学研究センター長

花岡文雄

東京大学大学院新領域創成科学研究科教授

松崎文雄

MATSUZAKI, Fumio

Team Leader, Center for Developmental Biology, RIKEN

東北大学大学院生命科学研究科教授

森川耿右

㈶国際高等研究所チーフリサーチフェロー

KURODA, Sinya

TACHIDA, Hidenori
NISHIDA, Eisuke

Professor, Graduate School of Sciences, The University of TokyoSHINOZAKI, Kazuo

菅野純夫

SUGANO, Sumio

HANAOKA, Fumio

Director, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN

Professor, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo

杉本亜砂子

SUGIMOTO, Asako

城石俊彦

SHIROISHI, Toshihiko

荒木弘之

ARAKI, Hiroyuki
KAWAKAMI, Koichi

斎藤成也

SAITOU, Naruya

Professor, Graduate School of Biostudies, Kyoto University

学習院大学理学部教授

Professor, Faculty of Science, Gakushuin University

理化学研究所多細胞システム形成研究センターチームリーダー

Chief Research Fellow, International Institute for Advanced Studies（所外委員 五十音順）

副所長

角谷徹仁

副所長

相賀裕美子

個体遺伝研究系研究主幹

倉田のり

KURATA, NoriHead, Genetic Strains Research Center

集団遺伝研究系研究主幹

澤構造遺伝学研究センター長

KAKUTANI, Tetsuji

Vice-Director

SAGA, YumikoVice-Director

川上浩一

MORIKAWA, Kousuke

Professor, Graduate School of Life Sciences, Tohoku University

Professor, Faculty of Sciences, Kyusyu University

Head, Department of Developmental Genetics
Head, Department of Population Genetics

総合遺伝研究系研究主幹

大久保公策

新分野創造センター長

仁木宏典

系統生物研究センター長

藤山秋佐夫

Head, Department of Integrated Genetics

斉

生命情報研究センター長

Head, Center for Information Biology

放射線・アイソトープセンター長

NIKI, Hironori

Head, Center for Frontier Research

SAWA, Hitoshi

OKUBO, Kousaku

Head, Radioisotope Center

FUJIYAMA, Asao

先端ゲノミクス推進センター長

Head, Advanced Genomics Center（所内委員 編成順）

Head, Structural Biology Center

アドバイザリーボード Advisory Board
研究所に係る重要事項について、所長又は運営会議の求めに応じ助言を行う。
The board members give advice to the Director-General and/or the Advisory Committee regarding the principles and policies of the institute.
大隅良典

OHSUMI, Yoshinori

榊佳之

WIESCHAUS, Eric Professor, Princeton University
SULSTON, John Chair, Institute for Science, Ethics and Innovation, The University of Manchester
Principal Scientist, Cancer Research UK, London Research Institute
HUNT, Tim

東京工業大学特任教授

Project Professor, Tokyo Institute of Technology

東京大学名誉教授

SAKAKI, Yoshiyuki

Professor Emeritus, The University of Tokyo

竹市雅俊

理化学研究所多細胞システム形成研究センター特別顧問

TAKEICHI, Masatoshi

総合企画会議 Council for Strategy Planning and Coordination

各種個別委員会

NIG Committees

所長の指揮の下、研究所の運営に関する基本方針の企画立案等を行うとともに、機構本部と連携する。
Under the Director-General’s supervision, the Council makes basic plansand policies on NIG management in addition to coordinating with the
ROIS headquarters.

委員会名

委員長
Chair

委員会名

研究企画担当放射線安全委員会
RI Safety

ARAKI, Hiroyuki

予算委員会

荒木弘之

遺伝子組換え実験安全委員会

上田

仁木宏典

動物実験委員会

Animal Experiment

SHIROISHI, Toshihiko

Budget

仁木宏典

施設整備委員会

荒木弘之

評価担当

上田

共通機器委員会

倉田のり

広報・知財担当広海

女性研究者活動支援室担当

KURATA, Nori健

HIROMI, Yasushi

運営会議共同利用委員会（委員長）Chair
澤 斉
SAWA, Hitoshi

Public Relations/Intellectual Property

防火・防災管理委員会

管理部長

鈴木睦昭

電子計算機委員会

有田正規

生物遺伝資源委員会

生物遺伝資源センター長

仁木宏典

図書委員会

澤

セミナー委員会

野々村賢一

事業委員会

角谷徹仁

広報委員会

前島一博

知的財産委員会

前島一博

SUZUKI, Mutsuaki

Inter-University Collaboration Committee

構造遺伝学研究センター教授

Professor, Structural Biology Center

TACHIDA, Hidenori

Professor, Faculty of Sciences, Kyusyu University

理化学研究所発生・再生科学総合研究センターグループディレクター

MATSUZAKI, Fumio

Group Director, Center for Developmental Biology, RIKEN

菅野純夫

東京大学大学院新領域創成科学研究科教授

SAWA, Hitoshi

Professor, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo

北川大樹

KITAGAWA, Daiju

角谷徹仁

KAKUTANI, Tetsuji
SHIROISHI, Toshihiko

Professor, Structural Biology Center

分子遺伝研究系教授

Professor, Department of Molecular Genetics

総合遺伝研究系教授

Professor, Department of Integrated Genetics

系統生物研究センター教授

Professor, Genetic Strains Research Center

営／ Management

城石俊彦

川上浩一

Office of Female Researcher Development NIKI, Hironori（所内委員）NIG members
構造遺伝学研究センター教授
澤 斉

NIKI, Hironori

龍

Recombinant Experiments UEDA, Ryu

KAWAKAMI, Koichi

松崎文雄

SUGANO, Sumio

Facility Management

ARAKI, Hiroyuki

荒木弘之

Common Equipment

UEDA, Ryu

（所外委員）Non-NIG members
九州大学大学院理学研究院教授
舘田英典

運

城石俊彦

NIKI, Hironori

龍

委員長
Chair

SHIROISHI, ToshihikoTransdisciplinary Research Integration Center
Evaluation

Committee

Future Planning

将来計画委員会

新領域融合研究センター担当

ARAKI, Hiroyuki

城石俊彦

Committee

城石俊彦

Research Planning SHIROISHI, Toshihiko

82（五十音順）

Senior Advisor, Center for Developmental Biology, RIKEN

Computer
Library

Seminar

NIG Projects
Publicity

Intellectual Property

ARITA, Masanori

斉

SAWA, Hitoshi
NONOMURA, Ken-ichi

KAKUTANI, Tetsuji
MAESHIMA, Kazuhiro
MAESHIMA, Kazuhiro

Fire & Disaster Prevention General Manager
Genetic Resources

マウス小委員会

Head, Genetic
Resource Center

城石俊彦

Mouse Bioresource

SHIROISHI, Toshihiko

イネ小委員会倉田のり

Rice Bioresource

大腸菌小委員会

KURATA, Nori

仁木宏典

E. Coli Bioresource

NIKI, Hironori

ハラスメント防止・対策委員会

副所長

ヒトゲノム・遺伝子解析
研究倫理審査委員会

大久保公策

安全衛生委員会

井ノ上逸朗

利益相反委員会

所長

Harassment Prevention

Vice-Director

Ethics of Human Genome OKUBO, Kosaku
Research
Safety & Health

Conflict of Interests

遺伝学博物館委員会
Museum of Genetics

国際化推進委員会
Internationalization

INOUE, Ituro

Director-General

斎藤成也

SAITOU, Naruya

明石裕

AKASHI, Hiroshi

博士研究員選考委員会 角谷徹仁
PD Selection
KAKUTANI, Tetsuji
DNAデータ研究利用委員会
DNA Database Advisory

高木利久

TAKAGI, Toshihisa

運

営（2014 年度委員）

DNA データ研究利用委員会
金城

玲

黒川

顕

KINJO, Akira

所外委員

DNA Database Advisory Committee (Non-NIG members)

大阪大学蛋白質研究所准教授

Associate Professor, Institute for Protein Research, Osaka University

東京工業大学大学院地球生命研究所教授

藤田信之

FUJITA, Nobuyuki

松岡聡

科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター企画運営室長

水島

洋

長洲毅志

エーザイ株式会社プロダクトクリエーション本部ポートフォリオ戦略推進部顧問

宮野

悟

長村吉晃

農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センターゲノムリソースユニット長

服部正平

東京大学大学院新領域創成科学研究科教授

KUROKAWA, Ken

Professor, Tokyo Institute of Technology School and Graduate School of Bioscience andBiotechnology

星

潤一

HOSHI, Jun-ichi
NAGASU, Takeshi
NAGAMURA, Yoshiaki
HATTORI, Masahira

Director, Department of Planninng and management, NBDC Japan Science andTechnology Agency

Adviser, Portfolio Strategy & Strategic Operations Department Product Creation
Headquarters Eisai Co., Ltd.
Director, Genome Resource Unit, Agrogenomics Research Center, National Institute ofAgrobiological Sciences

Professor, Graduate School of Frontier Sciences, University of Tokyo

遺伝子組換え実験安全委員会

所外委員

AKIYAMA, Yasuto

静岡県立静岡がんセンター研究所免疫治療研究部部長
Chief, Immunotherapy Division, Shizuoka Cancer Center Research Institute

動物実験委員会

所外委員

塩尻信義

静岡大学理学部教授
Professor, Faculty of Science, Shizuoka University

生物遺伝資源委員会

所外委員

阿部

ABE, Jun

純

Professor, Research Faculty of Agriculture, Hokkaido University

伊佐正自然科学研究機構生理学研究所発達生理学研究系教授

稲葉一男

INABA, Kazuo

EZURA, Hiroshi

大熊盛也

OKUMA, Moriya

Professor, Department of Developmental Physiology, National Institute for Physiological
Sciences

筑波大学下田臨海実験センター長

Director, Shimoda Marine Research Center, Tsukuba University

筑波大学生命環境系教授

Professor, Faculty of Life and Environmental Sciences, Tsukuba University

理化学研究所バイオリソースセンター微生物材料開発室長

General Manager, Microbe Division, RIKEN BioResource Center

自然科学研究機構理事

岡本

理化学研究所脳科学総合研究センター副センター長
Deputy Director, RIKEN Brain Science Institute

理化学研究所バイオリソースセンター長

OBATA, Yuichi

Director, RIKEN BioResource Center

金子嘉信

大阪大学大学院工学研究科寄付講座教授

河地正伸

国立環境研究所生物・生態系環境研究センター生物資源保存研究推進室長

草場

広島大学大学院理学研究科附属植物遺伝子保管実験施設長

KAWACHI, Masanobu

信KUSABA, Makoto

庫本高志

KURAMOTO, Takashi司

ODA, Tsukasa

日本大学法学部教授
Professor, School of Law, Nihon University

熊本大学生命資源研究・支援センター動物資源開発研究部門教授

Executive Director, National Institutes of Natural Sciences

KANEKO, Yoshinobu

小田

中潟直己

OKADA, Kiyotaka

小幡裕一

Professor, Ewha Womans University (Systems Biology Research Institute)北海道大学大学院農学研究院教授

Technology

仁Sang-Hyuk Lee

東京大学大学院新領域創成科学研究科教授

Professor, Graduate School of Frontier Sciences, University of Tokyo

Professor, Drosophila Genetic Resource Center, Kyoto Institute of Technology

奈良先端科学技術大学院大学長
OGASAWARA, Naotake President, Graduate School of Information Science, Nara Institute of Science and

OKAMOTO, Hitoshi

SUGANO, Sumio

TAKANO, Toshiyuki

小笠原直毅
岡田清孝

菅野純夫

東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター教授

Professor, Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo

高野敏行

筑波大学生命環境系教授
URUSHIHARA, Hideko Professor, Faculty of Life and Environmental Sciences, Tsukuba University

浩

MUTO, Kaori

宮崎大学農学部畜産草地科学科教授

Professor, Department of Animal and Grassland Science, Miyazaki University

漆原秀子
江面

武藤香織

東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター教授

Professor, Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo

Genetic Resources Committee (Non-NIG members)

良ISA, Tadashi

MIYANO, Satoru

国立保健医療科学院研究情報支援研究センター上席主任研究官

Chief Senior Researcher, Center for Public Health Informatics,National Institute of Public
HealthAnimal Experiments Committee (Non-NIG members)

明石

AKASHI, Ryo

MIZUSHIMA, Hiroshi

東京工業大学学術国際情報センター教授

Professor, Tokyo Institute of Technology Global Scientific Information and Computing Center

Recombinant Experiments Committee (Non-NIG members)

秋山靖人

SHIOJIRI, Nobuyoshi

MATSUOKA, Satoshi

製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター上席参事官

Senior Counsellor for Genomics and Biosafety, Biological Resource Center, National
Institute of Technology and Evaluation

Endowed Chair, Graduate School of Engineering, Osaka University

Head, Biodiversity Resource Conservation Section, Center for Environmental Biology andEcosystem Studies, National Institute for Environmental Studies

Director, Laboratory of Plant Chromosome and Gene Stock, Graduate School of Science,
Hiroshima University

京都大学大学院医学研究科附属動物実験施設准教授

Associate Professor, Institute of Laboratory Animals, Graduate School of Medicine, Kyoto
Universiry

NAKAGATA, Naomi

京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センター教授

Professor, Institute of Resource Development and Analysis Center for Animal Resources
and Development, Kumamoto University

中川恭好

製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター計画課寄託・分譲推進室長
NAKAGAWA, Yasuyoshi Genaral Manager, Collection Services Office, Planning Division, Biological Resource Center,
National Institute of Technology and Evaluation

中桐昭

NAKAGIRI, Akira

中辻憲夫

NAKATSUJI, Norio

中村太郎

NAKAMURA, Taro

中村幸夫

NAKAMURA, Yukio

長村登紀子

NAGAMURA, Tokiko

那須田周平

鳥取大学農学部附属菌類きのこ遺伝資源研究センター長

Director, Fungus/Mushroom Resource and Research Center, Faculty of Agriculture, Tottori
University

京都大学物質－細胞統合システム拠点長

Director General, Institute for Integrated Cell-Material Science, Kyoto University

大阪市立大学大学院理学研究科教授

Professor, Graduate School of Science, Osaka City University

理化学研究所バイオリソースセンター細胞材料開発室長

General Manager, Cell Engineering Division, RIKEN BioResource Center

東京大学医科学研究所准教授

Associate Professor, Institute of Medical Science, Tokyo University

京都大学大学院農学研究科准教授

NASUDA, Shuhei

Associate Professor, Graduate School of Agriculture, Kyoto University

成瀬清

自然科学研究機構基礎生物学研究所進化多様性生物学領域准教授

西尾剛

NARUSE, Kiyoshi
NISHIO, Takeshi

仁田坂英二

NITASAKA, Eiji

仁藤伸昌

NITO, Nobumasa

根本

博

伴野

豊

NEMOTO, Hiroshi

Associate Professor, Evolutionary Biology and Biodiversity, National Institute for Basic
Biology

東北大学大学院農学研究科教授

Professor, Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University

九州大学大学院理学研究院講師

Lecturer, Graduate School of Science, Kyushu University

近畿大学生物理工学部地域交流センター長

Director, Regional Exchange Center, Faculty of Biology-Oriented Science and Technology,
Kinki University

農業生物資源研究所遺伝資源センター長

Director, Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences

九州大学大学院農学研究院准教授

BANNO, Yutaka

Associate Professor, Graduate School of Agriculture, Kyushu University

理化学研究所バイオリソースセンター実験植物開発室長
KOBAYASHI, Masatomo General Manager, Experimental Plant Division, RIKEN BioResource Center

平井啓久

京都大学霊長類研究所長

小原有弘

深海

理化学研究所バイオリソースセンター情報解析技術室長

小林正智

KOHARA, Arihiro

酒泉

満

医薬基盤研究所難病・疾患資源研究部培養資源研究室主任研究員

Head Researcher, Department of Disease Bioresources Research, National Institute of
Biomedical Innovation

新潟大学自然科学系教授

SAKAIZUMI, Mitsuru

Professor, Faculty of Science, Niigata University

佐藤和広

岡山大学資源植物科学研究所附属大麦・野生植物資源研究センター教授

住田正幸

広島大学大学院理学研究科附属両生類研究施設長

SATO, Kazuhiro
SUMIDA, Masayuki

Professor, Barley and Wild Plant Resource Center, Research Institute for Bioresources,
Okayama University
Professor, Laboratory for Amphibian Biology, Graduate School of Science, Hiroshima
University

HIRAI, Hirohisa

薫

FUKAMI, Kaoru

福田裕穂

FUKUDA, Hiroo

藤島政博

Director, Primate Research Institute, Kyoto University

General Manager, Bioresource Information Division, RIKEN BioResource Center

東京大学大学院理学系研究科教授

Professor, Graduate School of Science, University of Tokyo

山口大学大学院理工学研究科教授

FUJISHIMA, Masahiro

Professor, Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University

松居靖久

東北大学加齢医学研究所附属医用細胞資源センター教授

松浦啓一

国立科学博物館名誉研究員

MATSUI, Yasuhisa
MATSUURA, Keiichi

Professor, Institute of Development, Aging and Cancer, Tohoku University
Honorary Researcher, National Museum of Nature and Science

運営／ Management

83Management
松田洋一

名古屋大学大学院生命農学研究科附属鳥類バイオサイエンス研究センター長

MATSUDA, Yoichi

Director, Avian Bioscience Research Center, Graduate School of Bioagricultural Sciences,
Nagoya University

三谷昌平

東京女子医科大学医学部第二生理学教室主任教授

MITANI, Shohei

Head Professor, Department of Physiology, School of Medicine, Tokyo Women’s Medica
University

森

名古屋大学大学院理学研究科教授

郁恵

MORI, Ikue

矢口貴志

YAGUCHI, Takashi

吉木

淳

YOSHIKI, Atsushi

千葉大学真菌医学研究センターバイオリソース管理室長

Head, Management Unit, Medical Mycology Research Center, Chiba University

理化学研究所バイオリソースセンター実験動物開発室長

General Manager, Experimental Animal Division, RIKEN BioResource Center

Mouse Bioresource Committee (Non-NIG members)

所外委員

相澤慎一

理化学研究所発生 ･ 再生科学総合研究センター特別顧問

林元展人

理化学研究所バイオリソースセンター長

松田潤一郎

AIZAWA, Shinichi

Senior Advisor, RIKEN Center for Developmental Biology

小幡裕一

OBATA, Yuichi

Director, RIKEN BioResource Center

庫本高志

京都大学大学院医学研究科附属動物実験施設准教授

KURAMOTO, Takashi

凌

実験動物中央研究所 ICLAS モニタリングセンター長代理
HAYASHIMOTO, Nobuhito Deputy Director, ICLAS Monitoring Center Central Institute for Experimental Animals
MATSUDA, Junichiro

Associate Professor, Institute of Laboratory Animals, Graduate School of Medicine, Kyoto
Universiry

八神健一

YAGAMI, Kenichi

KOMINAMI, Ryo

Visiting Researcher, Graduate School of Medical and Dental Sciences, Niigata University

新潟大学大学院医歯学総合研究科客員研究員

吉木

中潟直己

熊本大学生命資源研究・支援センター動物資源開発研究部門教授

米川博通

NAKAGATA, Naomi

イネ小委員会営

Professor, Graduate School of Science, Nagoya University

マウス小委員会

木南運

Professor, Institute of Resource Development and Analysis Center for Animal Resources
and Development, Kumamoto University

所外委員

芦苅基行

ASHIKARI, Motoyuki

石川隆二

名古屋大学生物機能開発利用研究センター教授

Professor, Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University

弘前大学農学生命科学部教授

Professor, Faculty of Agriculture and Life Science, Hirosaki University

江花薫子

農業生物資源研究所遺伝資源センター主任研究員

Chief Researcher, Genetic Resources Center, National Institute ofAgrobiological Sciences

奥野員敏

筑波大学北アフリカ研究センター研究員

奥本裕

OKUMOTO, Yutaka

京都大学大学院農学研究科教授

Professor, Graduate School of Agriculture, Kyoto University

川崎努

近畿大学農学部バイオサイエンス学科教授

OKUNO, Kazutoshi

KAWASAKI, Tsutomu

北野英己

KITANO, Hidemi

Project leader, Laboratory of Experimental Animal Models and Experimental Animals
Resource Bank, National Institute of Biomedical Innovation

筑波大学医学医療系教授

Professor, Faculty of Medicine, University of Tsukuba

理化学研究所バイオリソースセンター実験動物開発室長

General Manager, Experimental Animal Division, RIKEN BioResource Center

東京都医学総合研究所シニア研究員
YONEKAWA, Hiromichi Senior Researcher, Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science

Rice Bioresource Committee (Non-NIG members)

ISHIKAWA, Ryuji
EBANA, Kaworu

淳

YOSHIKI, Atsushi

医薬基盤研究所難病 ･ 疾患資源研究部疾患モデル小動物研究室研究リーダー

Researcher, Alliance for Research on North Africa, Tsukuba University

土井一行

Associate Professor, Graduate School of Bioagricultural Sciences, School of Agricultural
Sciences, Nagoya University

長村吉晃

農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センターゲノムリソースユニット長

NAGAMURA, Yoshiaki

松岡

信

安井

秀

MATSUOKA, Makoto

名古屋大学生物機能開発利用研究センター教授

Professor, Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University

九州大学大学院農学研究院准教授

Associate Professor, Faculty of Agriculture, Kyushu University

横井修司

岩手大学農学部准教授

吉村

九州大学大学院農学研究院教授

淳

YOSHIMURA, Atsushi

名古屋大学生物機能開発利用研究センター教授

Director, Genome Resource Unit, Agrogenomics Research Center, National Institute ofAgrobiological Sciences

YASUI, Hideshi
YOKOI, Shuji

Professor, Faculty of Agriculture, Kinki University

名古屋大学大学院生命農学研究科准教授

Doi, Kazuyuki

Associate Professor, Faculty of Agriculture, Iwate University

Professor, Graduate School of Agriculture, Kyushu University

Professor, Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University

熊丸敏博

九州大学大学院農学研究院附属遺伝子資源開発研究センター准教授
KUMAMARU, Toshihiro Associate Professor, Institute of Genetic Resources, Faculty of Agriculture, Kyushu
University

大腸菌小委員会
饗場弘二

所外委員

E. Coli Bioresource Committee (Non-NIG members)

AIBA, Hiroji

Professor, Pharmaceutical Sciences, Suzuka University of Medical Science

鈴鹿医療科学大学薬学部教授

佐藤

秋山芳展

京都大学ウイルス研究所教授

関根靖彦

板谷光泰

慶應義塾大学環境情報学部教授

田中寛

京都産業大学研究機構シニアリサーチフェロー戸邉亨

近畿大学農学部教授

林

AKIYAMA, Yoshinori
ITAYA, Mitsuhiro

伊藤維昭

ITO, Koreaki

内海龍太郎

UTSUMI, Ryutaro

SEKINE, Yasuhiko

Professor, Institute for Virus Research, Kyoto University

Professor, Faculty of Environment and Information Studies, Keio University
Senior Research Fellow, Research Organization, Kyoto Sangyo University

TANAKA, Kan
TOBE, Toru

哲也

HAYASHI, Tetsuya

Professor, Faculty of Agriculture, Kinki University

小笠原直毅

奈良先端科学技術大学院大学長
OGASAWARA, Naotake President, Graduate School of Information Science, Nara Institute of Science and Technology

矢口貴志

小倉光雄

東海大学海洋研究所海洋生物センター教授

吉川博文

九州大学大学院薬学研究院教授

吉田健一

OGURA, Mitsuo

片山勉

KATAYAMA, Tsutomu

川岸郁朗

KAWAGISHI, Ikuro青木久尚

AOKI, Hisanao

小田司

YAGUCHI, Takashi

Professor, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kyushu University

YOSHIDA, Kenichi

所外委員

日本大学名誉教授

小林設郎

Emeritus Professor, Nihon University

KOBAYASHI, Setsuro

野口基子

黒澤健司

神奈川県立こども医療センター部長

渡邉妙子

利益相反委員会

所外委員

篤

運

東京工業大学資源化学研究所教授

Professor, Chemical Resources Laboratory, Tokyo Institute of Technology

大阪大学大学院医学系研究科教授

Professor, Graduate School of Medicien, Osaka University

宮崎大学フロンティア科学実験総合センター長

Director, Frontier Science Research Center, Miyazaki University

千葉大学真菌医学研究センター准教授

Associate professor, Medical Mycology Research Center, Chiba University

神戸大学大学院農学研究科教授

Professor, Graduate School of Agricultural Science, Kobe University

Ethics of Human Genome Research Committee (Non-NIG members)

日本大学法学部教授

SETO, Atsushi

Professor, College of Science, Rikkyo University

法政大学生命科学部教授

Professor, School of Law, Nihon University

瀬戸Professor, Faculty of Bioscience and Applied Chemistry, Hosei University

立教大学理学部教授

Professor, Faculty of Bioscience and Applied Chemistry, Hosei University

ODA, Tsukasa
KUROSAWA, Kenji

法政大学生命科学部教授

東京農業大学応用生物科学部教授
YOSHIKAWA, Hirofumi Professor, Faculty of Applied Bio-Science, Tokyo University of Agriculture

Professor, Marine Biological Center, Tokai University

ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理審査委員会

84

勉

SATO, Tsutomu

Director, KANAGAWA Children’s Medical Center

WATANABE, Taeko

Conflict of Interests Committee (Non-NIG members)

小樽商科大学ビジネススクール教授

Professor,Otaru University of Commerce

営／ Management

NOGUCHI, Motoko

静岡県立三島北高等学校教諭

Teacher, Mishima Kita High School

静岡大学非常勤講師

Part-time Lecturer, Shizuoka University

佐野美術館館長

Curator, Sano Art Museum

Research Staff & Students

研究教育職員・研究員・学生（2015 年 4 月 1 日現在）



所

長

桂

勲

KATSURA, Isao

副所長

城石俊彦

Vice-Director

SHIROISHI, Toshihiko

副所長

荒木弘之

Vice-Director

ARAKI, Hiroyuki

分子遺伝研究系

研究主幹（兼） 荒木弘之

Head

▪中心体生物学研究部門
教授

北川大樹

ARAKI, Hiroyuki

Division of Centrosome Biology
Prof.

KITAGAWA, Daiju
MATSUURA, Rieko

博士研究員

松浦利絵子

Postdoc

日本学術振興会
特別研究員
日本学術振興会
特別研究員
日本学術振興会
特別研究員

太田

緑

JSPS Research Fellow OHTA, Midori

白土玄

JSPS Research Fellow SHIRATSUCHI, Gen

吉場聡子

JSPS Research Fellow YOSHIBA, Satoko

総研大 D4

土屋裕樹

D4 Student SOKENDAI TSUCHIYA, Yuki

総研大 D3

グプタ，アクシャリ D3 Student SOKENDAI GUPTA, Akshari

特任教授

深川竜郎

細胞遺伝研究系

Project Prof.



Head

Division of Microbial Genetics▪微生物遺伝研究部門
教

授

荒木弘之

Prof.

ARAKI, Hiroyuki

助

教

田中誠司

Assist. Prof.

TANAKA, Seiji

助

教

日詰光治

Assist. Prof.

HIZUME, Kohji

博士研究員

田中尚美

Postdoc

TANAKA, Yoshimi

博士研究員

矢倉

Postdoc

YAGURA, Masaru

勝

▪共生細胞進化研究部門

𠮷野彬子

総研大 D5

アイラニ，ディーパック D5 Student SOKENDAI AILANI, Deepak

総研大 D3ミラー，スティーブン アンドリュー D3 Student SOKENDAI MILLER, Steven Andrew

Postdoc

Head

SAITOU, Naruya

Division of Population Genetics

教

授

斎藤成也

助

教

ジナム，ティモシー A. Assist. Prof.

Prof.

SAITOU, Naruya
JINAM, Timothy A.

ババリンデ，アイザック アデイエミ D5 Student SOKENDAI BABARINDE, Isaac Adeyemi

総研大 D5

ヘッチアラチ，ニルミニ ナディカ D5 Student SOKENDAI HETTIARACHCHI, Nilmini Nadeeka

総研大 D2

ショケット，シャイラー D2 Student SOKENDAI XIAOKAITI, Xiayire

特別共同利用研究員（東京大学大学院） ムハモディサバ，モルテザ



教

授

Special joint researcher MAHMOUDISABER, Morteza

Division of Evolutionary Genetics▪進化遺伝研究部門

アカシ，ヒロシProf.

AKASHI, Hiroshi
MATSUMOTO, Tomotaka

博士研究員

松本知高

Postdoc

総研大 D4

ミシュラ，ネハ

D4 Student SOKENDAI MISHRA, Neha

総研大 D2

カワシマ，ケント ディエル D2 Student SOKENDAI KAWASHIMA, Kent Diel

Division of Ecological Genetics▪生態遺伝学研究部門
教授

北野

潤

Prof.

KITANO, Jun
ISHIKAWA, Asano

博士研究員

石川麻乃

Postdoc

日本学術振興会
特別研究員
日本学術振興会
特別研究員

吉田恒太

JSPS Research Fellow YOSHIDA, Kohta

ラビネット，マーク JSPS Research Fellow RAVINET, Mark

総研大 D4伊藤史博

総合遺伝研究系

Division of Symbiosis and Cell Evolution

LAL, Pradeep

Department of Population Genetics▪集団遺伝研究部門

総研大 D5TANABE, Hideyuki

D5 Student SOKENDAI YOSHINO, Akiko

研究主幹（兼） 斎藤成也

FUKAGAWA, Tatsuo

ARAKI, Hiroyuki

総研大 D5

Department of Cell Genetics

研究主幹（兼） 荒木弘之

田辺英幸

ラル，プラディープ Postdoc

集団遺伝研究系

Department of Molecular Genetics



Director-General

博士研究員
博士研究員

D4 Student SOKENDAI ITO, Fumihiro

Department of Integrated Genetics

教授

宮城島進也

Prof.

MIYAGISHIMA, Shin-ya

博士研究員

墨谷暢子

Postdoc

SUMIYA, Nobuko

博士研究員

廣岡俊亮

Postdoc

HIROOKA, Shunsuke▪人類遺伝研究部門

博士研究員

恵良厚子

Postdoc

ERA, Atsuko

教

授

井ノ上逸朗

Prof.

INOUE, Ituro

博士研究員

大沼

ONUMA, Ryo

助

教

中岡博史

Assist. Prof.

NAKAOKA, Hirofumi

日本学術振興会
特別研究員

藤原崇之

JSPS Research Fellow FUJIWARA, Takayuki

博士研究員

早野崇英

Postdoc

HAYANO, Takahide

総研大 D3

宇塚明洋

D3 Student SOKENDAI UZUKA, Akihiro

博士研究員

山田思郎

Postdoc

YAMADA, Shirou

研究員

アーマッドルー，ソマイェ Researcher

総研大 D4富山哲朗

総研大 D4

オマル，ワリード フセイン D4 Student SOKENDAI OMER, Waleed Hussein

総研大 D3

ロメロ，バネッサ D3 Student SOKENDAI ROMERO, Vanessa

総研大 D3伊東潤平

D3 Student SOKENDAI ITO, Jumpei

総研大 D3秦D3 Student SOKENDAI HATA, Chihiro

総研大研究生カシンガル，クリスティン Research Student, SOKENDAI CASINGAL, Cristine

個体遺伝研究系亮

Postdoc

Department of Developmental Genetics

研究主幹（兼） 川上浩一


▪形質遺伝研究部門

Prof.

KAWAKAMI, Koichi

Division of Neurogenetics

教

授

岩里琢治

Prof.

IWASATO, Takuji

助教

MIZUNO, Hidenobu

水野秀信

Assist. Prof.

日本学術振興会
特別研究員

香取将太

JSPS Research Fellow KATORI, Shota

博士研究員

岩田亮平

Postdoc

総研大 D5羅 ブンジュウ

D5 Student SOKENDAI LUO, Wenshu

総研大 D3（学振特別研究員） 中沢信吾

総研大 D1

研究主幹（兼） 角谷徹仁


D3 Student SOKENDAIJSPS Research Fellow DC

IWATA, Ryohei
NAKAZAWA, Shingo

カンダサーミ，ラーマサーミ D1 Student SOKENDAI KANDASAMY, Ramasamy

▪初期発生研究部門

Division of Molecular and Developmental Biology

教

授

川上浩一

Prof.

KAWAKAMI, Koichi

助

教

浅川和秀

Assist. Prof.

ASAKAWA, Kazuhide

助

教

武藤

Assist. Prof.

MUTO, Akira

彩

Head

KAKUTANI, Tetsuji

Division of Human Genetics

千比呂



AHMADLOO, Somayeh

D4 Student SOKENDAI TOMIYAMA, Tetsuro

Division of Agricultural Genetics▪育種遺伝研究部門
教

授

角谷徹仁

Prof.

KAKUTANI, Tetsuji

助

教

樽谷芳明

Assist. Prof.

TARUTANI, Yoshiaki

助

教

稲垣宗一

Assist. Prof.

INAGAKI, Soichi

博士研究員

藤

Postdoc

TO, Taiko

博士研究員

佐々木

Postdoc

SASAKI, Taku

総研大 D5保坂

碧

D5 Student SOKENDAI HOSAKA, Aoi

総研大 D1斎藤絡

D1 Student SOKENDAI SAITO, Raku

特別共同利用研究員（東京大学大学院） 伊藤佑

Special joint researcher ITO, Tasuku

泰子
卓

研究教育職員・研究員・学生／ Research Staff & Students

85

Division of Brain Function▪脳機能研究部門
教

授

平田たつみ

Prof.

HIRATA, Tatsumi

准教授

小出

剛

Assoc. Prof.

助

教

川崎能彦

Assist. Prof.

KAWASAKI, Takahiko

助

教

吉見一人

Assist. Prof.

YOSHIMI, Kazuto

助教トウー，ヤン

Assist. Prof.

ZHU, Yan

博士研究員

堀井康行

Postdoc

HORII, Yasuyuki

博士研究員

毛利亮子

Postdoc

MOHRI, Akiko

総研大 D3

松本悠貴

D3 Student SOKENDAI MATSUMOTO, Yuki

博士研究員

山内健太

Postdoc

YAMAUCHI, Kenta

総研大 D1

永山博通

D1 Student SOKENDAI NAGAYAMA, Hiromichi

センター長（兼） 相賀裕美子


Head

SAGA, Yumiko

Molecular Function Laboratory▪分子機能研究室

KOIDE, Tsuyoshi

Model Fish Genomics Resource Laboratory▪小型魚類開発研究室

新分野創造センター Center for Frontier Research

准教授

酒井則良

Assoc. Prof.

SAKAI, Noriyoshi

博士研究員

河崎敏広

Postdoc

KAWASAKI, Toshihiro

総研大 D4

竹本一政

D4 Student SOKENDAI TAKEMOTO, Kazumasa

Plant Genetics Laboratory

鐘巻将人

Assoc. Prof.

KANEMAKI, Masato▪植物遺伝研究室

博士研究員

夏目豊彰

Postdoc

NATSUME, Toyoaki

教

授

倉田のり

Prof.

KURATA, Nori

研究員

鎌田福美

Researcher

KAMADA, Fukumi

助

教

久保貴彦

Assist. Prof.

KUBO, Takahiko

研究員

水口明美

Researcher

MIZUGUCHI, Akemi

博士研究員

藤田雅丈

Postdoc

FUJITA, Masahiro

総研大 D4金原良樹

D4 Student SOKENDAI KANEHARA, Yoshiki

博士研究員

シェントン，マシュー

Postdoc

SHENTON, Matthew

准教授



▪細胞空間制御研究室

Cell Dynamics and Organization LaboratoryMicrobial Genetics Laboratory▪原核生物遺伝研究室

准教授

小田祥久

Assoc. Prof.

ODA, Yoshihisa

教

授

仁木宏典

Prof.

NIKI, Hironori

博士研究員

佐々木武馬

Postdoc

SASAKI, Takema

助

教

青木敬太

Assist. Prof.

AOKI, Keita

研究員

野口由美子

Researcher

NOGUCHI, Yumiko

博士研究員

野崎晋五

Postdoc

NOZAKI, Shingo

研究員

長谷川ふみ子Researcher

HASEGAWA, Fumiko

博士研究員

岡本

Postdoc

OKAMOTO, Sho

Special joint researcher NAGASHIMA, Yoshinobu

博士研究員

矢野晃一

Postdoc

YANO, Koichi

Special joint researcher SUGIYAMA, Yuki

日本学術振興会
特別研究員SPD
日本学術振興会
特別研究員

中井亮佑

JSPS Research Fellow NAKAI, Ryosuke

清家泰介

JSPS Research Fellow SEIKE, Taisuke

特別共同利用研究員（東京大学大学院） 長島慶宜
特別共同利用研究員（東京大学大学院） 杉山友希▪定量メカノバイオロジー研究室 Quantitative Mechanobiology Laboratory

尚



准教授

島本勇太

Assoc. Prof.

SHIMAMOTO, Yuta

▪無脊椎動物遺伝研究室

博士研究員

高木

Postdoc

TAKAGI, Jun

教

授

上田

助

潤

系統生物研究センター Genetic Strains Research Centerセンター長（兼） 倉田のり
▪哺乳動物遺伝研究室

Head

KURATA, Nori

Mammalian Genetics Laboratory

教

授

城石俊彦

Prof.

SHIROISHI, Toshihiko

助

教

高田豊行

Assist. Prof.

TAKADA, Toyoyuki

助

教

天野孝紀

Assist. Prof.

AMANO, Takanori

博士研究員

嵯峨井知子

Postdoc

SAGAI, Tomoko

博士研究員

片岡太郎

Postdoc

KATAOKA, Taro

日本学術振興会
特別研究員
日本学術振興会
特別研究員

関JSPS Research Fellow SEKI, Ryohei

亮平

毛利亘輔



▪発生工学研究室

龍Prof.

UEDA, Ryu

教

近藤

周

Assist. Prof.

KONDO, Shu

林

貴史

Postdoc

HAYASHI, Takashi

博士研究員

山本雅敏

Postdoc

YAMAMOTO, Masatoshi

Assoc. Prof.

YAMAZAKI, Yukiko▪系統情報研究室
准教授

山﨑由紀子



▪生物遺伝資源情報研究室

JSPS Research Fellow MOURI, Kousuke

Mammalian Development Laboratory

Genome Biology Laboratory

特任教授

小原雄治

Project Prof.

KOHARA, Yuji

助

教

安達佳樹

Assist. Prof.

ANDACHI, Yoshiki

博士研究員

金野宏之

Postdoc

KONNO, Hiroyuki

博士研究員

田原浩昭

Postdoc

TABARA, Hiroaki

研究員

平木秀明

Researcher

HIRAKI, Hideaki

研究員

植田ゆみ子

Researcher

UETA, Yumiko

教

授

相賀裕美子

Prof.

SAGA, Yumiko

助

教

加藤

Assist. Prof.

KATO, Yuzuru

助

教

安島理恵子

Assist. Prof.

AJIMA, Rieko

博士研究員

呉

泉

Postdoc

WU, Quan

博士研究員

周

智

Postdoc

ZHOU, Zhi

▪生体高分子研究室

譲

Invertebrate Genetics Laboratory

博士研究員

構造遺伝学研究センター Structural Biology Centerセンター長（兼） 澤


斉

Head

SAWA, Hitoshi

Biological Macromolecules Laboratory

博士研究員

平野孝昌

Postdoc

HIRANO, Takamasa

教

授

前島一博

Prof.

MAESHIMA, Kazuhiro

総研大 D5

櫻井隆順

D5 Student SOKENDAI SAKURAI, Takayuki

助

教

井手

Assist. Prof.

IDE, Satoru

総研大 D5坂口あかね

D5 Student SOKENDAI SAKAGUCHI, Akane

助

教

日比野佳代

Assist. Prof.

HIBINO, Kayo

聖

総研大 D5

プイ，ハン ピンD5 Student SOKENDAI PUI, Han Pin

総研大 D3

今井亮輔

D3 Student SOKENDAI IMAI, Ryosuke

総研大 D2福田胡桃

D2 Student SOKENDAI FUKUDA, Kurumi

総研大 D2端保

D2 Student SOKENDAI TANBO, Mai

総研大 D1

島田龍輝

D1 Student SOKENDAI SHIMADA, Tatsuki

総研大 D2佐々木飛鳥

D2 Student SOKENDAI SASAKI, Asuka

総研大 D2永島崚甫

D2 Student SOKENDAI NAGASHIMA, Ryosuke

特別共同利用研究員（慶応義塾大学大学院/
学振特別研究員）

86

Mouse Genomics Resource Laboratory▪マウス開発研究室

研究教育職員・研究員・学生／ Research Staff & Students

野崎

舞

慎

Special joint researcher,
JSPS Research Fellow

NOZAKI, Tadasu

研究教育職員・研究員・学生

Research Staff & Students
Cell Architecture Laboratory▪細胞建築研究室
准教授
助

教

木村

博士研究員

福多賢太郎

Postdoc

FUKUTA, Kentaro

KIMURA, Akatsuki

研究員

会津智幸

Researcher

AIZU, Tomoyuki

江島史緒

Researcher

EJIMA, Fumiwo

暁Assoc. Prof.

木村健二

Assist. Prof.

KIMURA, Kenji

研究員

博士研究員

近藤

興

Postdoc

KONDO, Tomo

研究員

清岡美穂

Researcher

KIYOOKA, Miho

博士研究員

菊池窯平

Postdoc

KIKUCHI, Yohei

研究員

吉田

Researcher

YOSHIDA, Satoru

総研大 D4山本一徳

D4 Student SOKENDAI YAMAMOTO, Kazunori

研究員

石﨑比奈子

Researcher

ISHIZAKI, Hinako

研究員

陳

薇

Researcher

CHEN, Wei

研究員

塚本ゆみ

Researcher

TSUKAMOTO, Yumi

研究員

許山肖子

Researcher

MOTOYAMA, Ayuko

NONOMURA, Ken-ichi

Multicellular Organization Laboratory▪多細胞構築研究室
教

授

澤

助

教

斉

Prof.

SAWA, Hitoshi

伊原伸治

Assist. Prof.

IHARA, Shinji

博士研究員

金

銀華

Postdoc

JIN, Yinhua

博士研究員

中山創平

Postdoc

NAKAYAMA, Sohei

実験圃場

悟

Experimental Farm圃場長（兼）

野々村賢一

Head

准教授

野々村賢一

Assoc. Prof.

NONOMURA, Ken-ichi

助

津田勝利

Assist. Prof.

TSUDA, Katsutoshi

博士研究員

劉

華

Postdoc

LIU, Hua

生命情報研究センター Center for Information Biology

博士研究員

小野聖二郎

Postdoc

ONO, Seijiro

センター長（兼） 大久保公策

客員研究部門Adjunct FacultyGene Network Laboratory▪遺伝子回路研究室



准教授

鈴木えみ子

Assoc. Prof.

SUZUKI, Emiko

助

田守洋一郎

Assist. Prof.

TAMORI, Yoichiro

教



Head

OKUBO, Kousaku

Laboratory for DNA Data Analysis▪遺伝情報分析研究室

教

Division of Nucleic Acid Chemistry▪核酸化学客員研究部門

准教授

池尾一穂

Assoc. Prof.

IKEO, Kazuho

客員教授

ベルモント，アンドリュー S． Visiting Prof.

助

教

野澤昌文

Assist. Prof.

NOZAWA, Masafumi

BELMONT, Andrew S.

客員教授

デッカー，ジョブ Visiting Prof.

博士研究員

金城その子

Postdoc

KINJO, Sonoko

DEKKER, Job

博士研究員

北村徳一

Postdoc

KITAMURA, Norikazu

博士研究員

松本

薫

Postdoc

MATSUMOTO, Kaoru

客員教授

シェラット，デヴィト Visiting Prof.

SHERRATT, David

博士研究員

水谷尚志

Postdoc

MIZUTANI, Hisashi

客員教授

ロスステイン，ロドニー Visiting Prof.

ROTHSTEIN, Rodney

▪細胞質遺伝客員研究部門

Division of Cytoplasmic Genetics

研究員

村岡正文

Researcher

日本学術振興会
特別研究員

湯山育子

JSPS Research Fellow YUYAMA, Ikuko

総研大 D5石川昌和

D5 Student SOKENDAI ISHIKAWA, Masakazu

客員教授

エンゲルト，フローリアン Visiting Prof.

ENGERT, Florian

総研大 D1

飯塚朋代

D1 Student SOKENDAI IIZUKA, Tomoyo

客員教授

ゼン，ホンクイ

ZENG, Hongkui

特別共同利用研究員（京都大学大学院） スルタナ，ザキア

授Special joint researcher SULTANA, Zakea

有田正規

Prof.

ARITA, Masanori
MUKAIDA, Shiho

博士研究員

向田志保

Postdoc

総研大 D3田中

D3 Student SOKENDAI TANAKA, Wataru

弥





Visiting Prof.

Division of Theoretical Genetics▪理論遺伝客員研究部門
客員教授

エクスコフィエ，ローレント Visiting Prof.

EXCOFFIER, Laurent

客員教授

龍

LONG, Manyuan

漫遠

Visiting Prof.



Division of Applied Genetics▪応用遺伝客員研究部門

Genome Informatics Laboratory▪大量遺伝情報研究室

Division of Physiological Genetics▪生理遺伝客員研究部門

Laboratory of Biological Networks▪生命ネットワーク研究室
教

MURAOKA, Masafumi

客員教授

佐々木裕之

客員准教授

ジルバマン，ダニエル Visiting Assoc. Prof.

Visiting Prof.

SASAKI, Hiroyuki
ZILBERMAN, Daniel

教

授

中村保一

Prof.

助

教

神沼英里

Assist. Prof.

KAMINUMA, Eli

放射線・アイソトープセンター Radioisotope Center

博士研究員

長崎英樹

Postdoc

NAGASAKI, Hideki

研究員

藤澤貴智

Researcher

FUJISAWA, Takatomo

センター長（兼） 仁木宏典



▪データベース運用開発研究室
教

授

高木利久

NAKAMURA, Yasukazu

TAKAGI, Toshihisa

博士研究員

原

一夫

Postdoc

HARA, Kazuo

博士研究員

奥田喜弘

Postdoc

OKUDA, Yoshihiro

▪遺伝子発現解析研究室

城石俊彦

Prof.

SHIROISHI, ToshihikoLaboratory for Gene-Expression Analysis

川上浩一

Prof.

KAWAKAMI, Koichi

教

授（兼）

上田

龍

Prof.

UEDA, Ryu

教

授（兼）

仁木宏典

Prof.

NIKI, Hironori

教

授（兼）

倉田のり

Prof.

KURATA, Nori

特任教授（兼） 小原雄治

Project Prof.

KOHARA, Yuji

准教授（兼）

酒井則良

Assoc. Prof.

SAKAI, Noriyoshi

准教授（兼）

池尾一穂

Assoc. Prof.

IKEO, Kazuho

OKUBO, Kousaku

助

教

小笠原

Assist. Prof.

OGASAWARA, Osamu

授

特任准教授

Comparative Genomics Laboratory

藤山秋佐夫

Prof.

豊田

Project Assoc. Prof.

敦

Division of Bioresources Management

授（兼）

Prof.

教

KURATA, Nori

授（兼）

大久保公策

▪比較ゲノム解析研究室▪バイオリソース事業部

Head

教

授



センター長（兼） 倉田のり


教

教

理

NIKI, Hironori

生物遺伝資源センター Genetic Resource Center

Laboratory for Reseach andDevelopment of Biological Databases
Prof.

Head

FUJIYAMA, Asao
TOYODA, Atsushi

研究教育職員・研究員・学生／ Research Staff & Students

87Research Staff & Students
准教授（兼）

野々村賢一

Assoc. Prof.

NONOMURA, Ken-ichi

助

教（兼）

高田豊行

Assist. Prof.

TAKADA, Toyoyuki

助

教（兼）

浅川和秀

Assist. Prof.

ASAKAWA, Kazuhide

助

教（兼）

武藤

彩

Assist. Prof.

MUTO, Akira

助

教（兼）

近藤

周

Assist. Prof.

KONDO, Shu

助

教（兼）

青木敬太

Assist. Prof.

AOKI, Keita

助

教（兼）

久保貴彦

Assist. Prof.

KUBO, Takahiko

助

教（兼）

津田勝利

Assist. Prof.

TSUDA, KatsutoshiDivision of Bioresources Databases▪データベース事業部
准教授（兼）

山﨑由紀子

Assoc. Prof.

YAMAZAKI, Yukiko

先端ゲノミクス推進センター Advanced Genomics Centerセンター長（兼） 藤山秋佐夫


藤山秋佐夫

Head

FUJIYAMA, Asao

Head

KOIDE, Tsuyoshi

准教授（兼）

小出剛

Assoc. Prof.

KOIDE, Tsuyoshi

助

吉見一人

Assist. Prof.

YOSHIMI, Kazuto

教（兼）新領域融合研究センター Transdisciplinary Research Integration Center▪遺伝研で研究しているメンバー Members at NIG
特任准教授

柳原克彦

Project Assoc. Prof.

YANAGIHARA, Katsuhiko

特任准教授

馬場知哉

Project Assoc. Prof.

BABA, Tomoya

博士研究員

和田浩則

Postdoc

WADA, Hironori

博士研究員

木曽彩子

Postdoc

KISO, Ayako

博士研究員

二宮洋一郎

Postdoc

NINOMIYA, Youichirou

博士研究員

趙

Postdoc

ZHAO, Wei
TANAVE, Akira

薇

博士研究員

特任教授（兼） 小原雄治

田邉彰

Project Prof.

KOHARA, Yuji

博士研究員

Postdoc

HARUSHIMA, Yoshiaki

特任准教授（兼） 豊田

敦

春島嘉章

Project Assoc. Prof.

TOYODA, Atsushi

博士研究員

Postdoc

KAGOSHIMA, Hiroshi

野口英樹

鹿児島

Project Assoc. Prof.

NOGUCHI, Hideki

研究員

堀内陽子

Researcher

HORIUCHI, Youko

研究員

望月孝子

Researcher

MOCHIZUKI, Takako

センター長（兼） 高木利久

HeadTAKAGI, Toshihisa

教

授（兼）

高木利久

Prof.

TAKAGI, Toshihisa

教

授（兼）

中村保一

Prof.

NAKAMURA, Yasukazu

教

授（兼）

有田正規

Prof.

ARITA, Masanori

教

授（兼）

大久保公策

Prof.

OKUBO, Kousaku

助

教（兼）

神沼英里

Assist. Prof.

KAMINUMA, Eli

助

教（兼）

小笠原

Assist. Prof.

OGASAWARA, Osamu

Postdoc

LEE, KyungBum

理

博士研究員

李

慶範

博士研究員

大城戸利久

Postdoc

OKIDO, Toshihisa

博士研究員

小菅武英

Postdoc

KOSUGE, Takehide

博士研究員

児玉悠一

Postdoc

KODAMA, Yuichi

博士研究員

坂井勝呂

Postdoc

SAKAI, Katsunaga

博士研究員

真島

Postdoc

MASHIMA, Jun

研究員

青野英雄

Researcher

AONO, Hideo

研究員

筒井波留

Researcher

TSUTSUI, Haru

研究員

福田亜沙美

Researcher

FUKUDA, Asami

淳

浩

ライフサイエンス統合データベースセンター Database Center for Life Science▪遺伝研で研究しているメンバー Members at NIG
センター長

小原雄治

Head

KOHARA, Yuji

教

大久保公策

Prof.

OKUBO, Kousaku

特任准教授

坊農秀雅

Project Assoc. Prof.

BONO, Hidemasa

特任助教

小野浩雅

Project Assist. Prof.

ONO, Hiromasa

特任助教

内藤雄樹

Project Assist. Prof.

NAITO, Yuki

特任助教

仲里猛留

Project Assist. Prof.

NAKAZATO, Takeru

研究員

大田達郎

Researcher

OHTA, Tazro

授（兼）創薬等支援技術基盤プラットフォーム
Platform for drug discovery, informatics and structural life science
特任教授

五條堀

Project Prof.

GOJOBORI, Takashi

特任教授

中村春木

Project Prof.

NAKAMURA, Haruki

特任教授

由良

Project Prof.

YURA, Kei

知的財産室Intellectual Property Unit

室

鈴木睦昭

長

孝
敬

Director

SUZUKI, Mutsuaki

ユニット長（兼） 有田正規

Head

ARITA, Masanori

授（兼）

有田正規

Prof.

ARITA, Masanori

室長・特任教授 広海

教

授（兼）

高木利久

Prof.

TAKAGI, Toshihisa

リサーチ・アドミニストレーター 来栖光彦

教

授（兼）

大久保公策

Prof.

OKUBO, Kousaku

助

教

清野浩明

Assist. Prof.

SEINO, Hiroaki

教

授（兼）

藤山秋佐夫

Prof.

FUJIYAMA, Asao

博士研究員

小林百合

Postdoc

KOBAYASHI, Yuri

博士研究員

伊東真知子

Postdoc

ITOH, Machiko

教

マウス研究支援ユニット Mouse Research Supporting Unit

88

剛

Postdoc

情報基盤ユニット IT Unit小出

FUJIYAMA, Asao

授（兼）DDBJセンター DDBJ Center

施設長（兼）

Prof.

教

特任准教授



Unit for Experimental Animal Care

動物飼育実験施設



研究教育職員・研究員・学生ユニット長（兼） 相賀裕美子

Head

SAGA, Yumiko

教

授（兼）

相賀裕美子

Prof.

SAGA, Yumiko

助

教（兼）

安島理恵子

Assist. Prof.

AJIMA, Rieko

研究教育職員・研究員・学生／ Research Staff & Students

リサーチ・アドミニストレーター室健

Office for Research Development

Director

HIROMI, Yasushi

Research Administrator KURUSU, MitsuhikoStaff of Administration Department and Technical Section
Department of Administration

管理部
管理部長

General Manager



総務企画課

Technical Section

技術課

井上明夫

INOUE, Akio

General Affairs and Project Section

管理部と技術課職員

課長（兼）Manager

倉田のり

KURATA, Nori

課長補佐

Deputy Manager

永口貢

EIGUCHI, Mitsugu

Animal Unit

課長

Manager

柴川芳範

SHIBAKAWA, Yoshinori

動物班

副課長

Deputy Manager

中尾

NAKAO, Makoto

第二技術係長Technical Group-II
Leader

水品洋一

MIZUSHINA, Yoichi

技術職員Technical Staff

矢野弘之

YANO, Hiroyuki

技術職員Technical Staff

木曾

KISO, Makoto

技術職員Technical Staff

前野哲輝

MAENO, Akiteru

技術職員

Technical Staff

山谷宣子

YAMATANI, Noriko

技術職員

Technical Staff

今井悠二

IMAI, Yuji

▪総務・教育チーム
係長（兼）
係長
係長

財務課

中尾

淳

NAKAO, Makoto

Personnel Team

Subsection Chief▪研究推進チームGeneral Affairs / Education Team

Subsection Chief▪人事・労務チーム

淳

齊藤麻衣子

SAITO, Maiko

Research Promotion Team

Subsection Chief

鈴木由美子



SUZUKI, Yumiko

植物・微生物班

Financial Affairs Section

課長Manager

副課長（施設担当） Deputy Manager

久保

信

堀籠利宏

▪財務チームFinancial Affairs Team

係長

Subsection Chief▪調達チームSupplies Team

係長

Subsection Chief▪施設チーム

Facilities Team

係長

Subsection Chief

HORIGOME, Toshihiro

Unit Leader

第一技術係長
第二技術係長Technical Group-I
LeaderTechnical Group-II
Leader

技術職員

Technical Staff

機器班

SUZUKI, Masatoshi

晃

WATANABE, Akira

光江一之

MITSUE, Kazuyuki

Plant-Microbial Unit

班長（兼）



鈴木政敏
渡邊

KUBO, Makoto

誠

永口

貢

EIGUCHI, Mitsugu

古海弘康

FURUUMI, Hiroyasu

宮林登志江

MIYABAYASHI, Toshie

坂本佐知子

SAKAMOTO, Sachiko

Mechanical Unit

技術職員

Technical Staff

大石あかね

OISHI, Akane

技術職員

Technical Staff

坂

SAKA, Kimiko

季美子

所長

1

Director - General教授

22

Professors

准教授

10

Associate Professors

助教

30

Assistant Professors

客員教授

10

Adjunct Professors

小計（所長、客員教授を除く）

62

管理部

20

Administration Staffs

技術課

12

Technicians

合計（所長、客員教授を除く）

94

Subtotal（excluding Director - General and Adjunct Professors）（excluding Director - General and Adjunct Professors）

Total（2015 年 4 月 1 日現在）

管理部と技術課職員／ Staff of Administration Department and Technical Section

89

History
1949 年1953 年６月１日

文部省所轄研究所として設置
庶務部及び 3 研究部で発足

８月10日

小熊

１月１日

研究部を形質遺伝部，細胞遺伝部，
生理遺伝部に改組

捍

生化学遺伝部設置

1954 年

７月１日

応用遺伝部設置1955 年

９月15日

変異遺伝部設置

10月１日

木原

均

1960 年

４月30日

人類遺伝部設置

1962 年

４月１日

微生物遺伝部設置

1964 年

４月１日

集団遺伝部設置

1969 年

４月１日

森脇大五郎 第 3 代所長就任，
分子遺伝部設置

1974 年

４月１日

植物保存研究室設置

1975 年

３月１日

田島彌太郎

10月１日

遺伝実験生物保存研究施設動物保存
研究室設置

10月１日

遺伝実験生物保存研究施設微生物保存研究室設置

第 4 代所長就任

1983 年

10月１日

松永

1984 年

４月12日

大学共同利用機関に改組 遺伝実験
生物保存研究センター（哺乳動物保存・無脊椎動物保存・植物保存・微生物保存・遺伝資源の 5 研究室），遺伝情報研究センター（構造・組換えの 2 研究室），実験圃場設置

４月１日

遺伝情報研究センターに合成・遺伝
情報分析の 2 研究室を設置

1987 年

１月12日

日本 DNA データバンク稼働

1988 年

４月８日

放射線・アイソトープセンター設置，
遺伝情報研究センターにライブラリー
研究室を設置

10月１日

総合研究大学院大学生命科学研究科
遺伝学専攻設置

1989 年

10月１日

富澤純一

1993 年

４月１日

遺伝実験生物保存研究センターに発生工学研究室を設置

1994 年

６月24日

遺伝情報研究センターに遺伝子機能研究室を設置1995 年

４月１日

生命情報研究センター設置

1996 年

５月11日

構造遺伝学研究センター設置
（遺伝情報研究センターの改組）
（生体高分子研究室設置，超分子機能・構造制御・超分子構造・遺伝子回路の 4 研究室振替）

革／ History

Three research departments were reorganized
as the Departments of Morphological
Genetics, Cytological Genetics andPhysiological Genetics.

Aug. 1

Department of Biochemical Genetics wasadded.

1954

Jul. 1

Department of Applied Genetics was added.

1955

Sep. 15

Department of Induced Mutation was added.

Oct. 1

Prof. Hitoshi Kihara was elected the 2nd
Director.

1960

Apr. 30

Department of Human Genetics was added.

1962

Apr. 1

Department of Microbial Genetics was added.

1964

Apr. 1

Department of Population Genetics wasadded.

1969

Apr. 1

Prof. Daigoro Moriwaki was elected the 3rd
Director. Department of Molecular Biology
was added.

1974

Apr. 1

Plant Genetic Stock Laboratory wasestablished.

1975

Mar. 1

Dr. Yataro Tajima was elected the 4th Director.

Oct. 1

Animal Section was added in the Genetic
Stock Center.

1976

Oct. 1

Microbial Section was added in the Genetic
Stock Center.

KIHARA, Hitoshi(2nd Director)

1983

Oct. 1

Dr. Ei Matsunaga was elected the 5th Director.

1984

Apr. 12

Reorganized as an inter-university research
institute for joint use by universities. The DNA
R e s e a rc h C e n t e r ( D N A S t r u c t u re a n d
Recombinant DNA Laboratories) and theExperimental Farm were established. The
Genetic Stock Research Center was
expanded into five laboratories: the Genetic
Resources Laboratory was added and theAnimal Section was divided into theMammalian and Invertebrate Laboratories.

1985

Apr. 1

The DNA Synthesis and DNA Data Analysis
Laboratories were added in the DNA
Research Center.

1987

Jan. 12

The DNA Data Bank of Japan began its
operations.

1988

Apr. 8The Radio-isotope Center was established.
The Gene Library Laboratory was added in
the DNA Research Center.

Oct. 1The Graduate University for Advanced Studies
was established. The Department of Genetics,
School of Life Science of the University began
accepting students.

1989

Oct. 1

Dr. Jun-ichi Tomizawa was elected the 6th
Director.

1993

Apr. 1The Mammalian Development Laboratory wasadded in the Genetic Stock Research Center.

1994

Jun. 24

The Gene Function Research Laboratory wasadded in the DNA Research Center.

1995

Apr. 1The Center for Information Biology wasestablished.

1996

May 11

The DNA Research Center was reorganized
as the Structural Biology Center consisting of
5 laboratories (Biological Macromolecules,
Molecular Biomechanism, Multicellular
Organization, Biomolecular Structure andGene Network).

第 5 代所長就任

1985 年

沿Prof. Kan Oguma was elected the 1st Director.

Jan. 1

第 2 代所長就任(1st Director)

90Aug. 10
1953

OGUMA, Kan

英Established under the jurisdiction of the
Ministry of Education, Science, Sports andCulture. Started with an administrative
department and three research departments.

初代所長就任８月１日

1976 年

Jun. 11949

第 6 代所長就任

MORIWAKI, Daigoro(3rd Director)

TAJIMA, Yataro(4th Director)

MATSUNAGA, Ei(5th Director)

沿1997 年

1998 年

４月１日

系統生物研究センター設置
（遺伝実験生物保存研究センターの改組）
（マウス系統研究分野哺乳動物遺伝研究室・発生工学研究室，イネ系統研究分野植物遺伝研究室，大腸菌系
統研究分野原核生物遺伝研究室，無脊椎動物系統研究分野無脊椎動物遺伝研究室の 5 研究室振替）
生物遺伝資源情報総合センター設置（系統情報研究室振替，生物遺伝資源情報研究室設置）

10月１日

堀田凱樹

４月９日

個体遺伝研究系に初期発生研究部門を設置，総合遺伝研究系に脳機能研究部門を設置４月１日

生命情報・DDBJ 研究センター設置（生命情報研究センターの改組）（分子分類研究室振替，データベース運用開発研究室設置，遺伝子発現解析
研究室設置）

2002 年

４月１日

系統生物研究センターに遺伝子改変
系統開発研究分野マウス開発研究室，
小型魚類開発研究室を設置

2003 年

４月１日

分子遺伝研究系に分子機構研究室，
系統生物研究センターに新分野創造
研究室，生物遺伝資源情報総合セン
ターに比較ゲノム解析研究室，広報
知財権研究室を設置

４月１日

大学共同利用機関法人情報・システ
ム研究機構国立遺伝学研究所設置

12月１日

小原雄治

2005 年

４月１日

知的財産室を設置

2006 年

４月１日

新分野創造センター設置
（細胞系譜研究室，神経形態研究室，
細胞建築研究室設置）

2011 年

10月１日

先端ゲノミクス推進センター設置

2012 年

４月１日

研究センターの改組、共同利用事業
センター（生物遺伝資源センター、
DDBJ センター）、支援センター（情報基盤ユニット）を設置

2014 年2015 年

第 8 代所長就任

12月１日

桂

４月１日

リサーチ・アドミニストレーター室を
設置

４月１日

勲

TOMIZAWA, Jun-ichi(6th Director)

Apr. 1The Genetic Stock Research Center was
reorganized as the Genetic Strains ResearchCenter consisting of 5 laboratories (Mammalian
Genetics, Mammalian Development, Plant
Genetics, Microbial Genetics and Invertebrate
Genetics), and as the Center for Genetic
R e s o u rc e I n f o r m a t i o n c o n s i s t i n g o f 2laboratories (Genetic Informatics and Genetic
Resources).

Oct. 1

Dr. Yoshiki Hotta was elected the 7th Director.

1998

Apr. 9The Division of Early Embryogenesis wasadded in the Department of Developmental
Genetics. The Division of Brain Function wasadded in the Department of Integrated
Genetics.

2001

Apr. 1The Center for Information Biology was
reorganized as the Center for Information
Biology and DNA Data Bank of Japan. The
new center consists of 5 laboratories. The
Laboratory of Molecular Classification of theformer center was renamed as the Laboratory
for Research and Development of Biological
Databases in the new center. The Laboratory
for Gene-Expression Analysis was added in
the new center.

2002

Apr. 1

Two laboratories, Mouse Genomics Resource
Laboratory and Model Fish Genomics
Resource Laboratory, were added to the
Genetic Strains Research Center.

2003

Apr. 1The Molecular Mechanisms was added to themolecular Genetics. The Laboratry for Frontier
Research was added to the Genetic Strains
R e s e a r c h C e n t e r. Tw o l a b o r a t o r i e s ,Comparative Genomics Laboratory andPublicity and Intellectual Propery Unit, wereadded to the Center for Genetic Resource
Information.

2004

Apr. 1

Reorganized as Research Organization ofInformation and Systems, Inter-University
Research Institute Corporation, together withthree other national institutes.

第 7 代所長就任

2001 年

2004 年

1997

第 9 代所長就任

動物飼育実験施設を設置

革HOTTA, Yoshiki(7th Director)

KOHARA, Yuji
(8th Director)

Dec. 1

Dr. Yuji Kohara was elected the 8th Director.

2005

Apr. 1Intellectual Property Unit was added.

2006

Apr. 1T h e C e n t e r f o r F ro n t i e r R e s e a rc h w a s
established. The Laboratory for Cell Lineage,
Neural Morphogenesis and Cell Architecture
was added in the new center.

2011

Oct.1

Advanced Genomics Center was established.

2012

Apr.1

The Research Center was reorganized, TheIntellectual Infrastructure Centers (The center
for Genetic Resource Center and DDBJ
Center) and the Support Centers (The IT Unit)
were established.

KATSURA, Isao
(9th Director)

Dec. 1

Dr. Isao Katsura was elected the 9th Director.

2014

Apr. 1

Office for Research Development was added.

2015

Apr. 1

Unit for Experimental Animal Care wasestablished.

沿革／ History91

Publications in 2014
Journal Title
Cell

ScienceNature Cell Biology
Immunity
NeuronMolecular Biology and Evolution
J. Experimental Medicine

Number
2
1
1
1
1
2
1

Journal Title

Genome Research

J. Clinical Investigation
Genes & Development
Trends in Cell Biology
Cell Research

PLOS Biology

Trends in Genetics

Akiba, T., Hibara, K., Kimura, F., Tsuda, K., Shibata, K., Ishibashi, M., Moriya, C., Nakagawa, K., Kurata, N., Itoh, J.,
and Ito, Y. (2014). Organ fusion and defective shoot development in oni3 mutants of rice. Plant Cell Physiol. 55, 4251.
Arakawa, H., Suzuki, A., Zhao, S., Tsytsarev, V., Lo, F.S., Hayashi, Y., Itohara, S., Iwasato, T., and Erzurumlu, R.S. (2014).
Thalamic NMDA receptor function is necessary for patterning of the thalamocortical somatosensory map and forsensorimotor behaviors. J. Neurosci. 34, 12001-12014.
Arakawa, T., Tanave, A., Ikeuchi, S., Takahashi, A., Kakihara, S., Kimura, S., Sugimoto, H., Asada, N., Shiroishi, T.,
Tomihara, K., Tsuchiya, T., and Koide, T. (2014). A male-specific QTL for social interaction behavior in mice mappedwith automated pattern detection by a hidden Markov model incorporated into newly developed freeware. J.
Neurosci. Methods 234, 127-134.
Arimura, Y., Shirayama, K., Horikoshi, N., Fujita, R., Taguchi, H., Kagawa, W., Fukagawa, T., Almouzni, G., andKurumizaka, H. (2014). Crystal structure and stable property of the cancer-associated heterotypic nucleosome
containing CENP-A and H3.3. Sci. Rep. 4, 7115.
Asamizu, E., Ichihara, H., Nakaya, A., Nakamura, Y., Hirakawa, H., Ishii, T., Tamura, T., Fukami-Kobayashi, K.,
Nakajima, Y., and Tabata, S. (2014). Plant Genome DataBase Japan (PGDBj): a portal website for the integration ofplant genome-related databases. Plant Cell Physiol. 55, e8.
Bachtrog, D., Mank, J.E., Peichel, C.L., Kirkpatrick, M., Otto, S.P., Ashman, T.L., Hahn, M.W., Kitano, J., Mayrose, I.,
Ming, R., Perrin, N., Ross, L., Valenzuela, N., and Vamosi, J.C. (2014). Sex determination: why so many ways of
doing it? PLoS Biol. 12, e1001899.
Berman, H.M., Burley, S.K., Kleywegt, G.J., Nakamura, H., Markley, J.L. (2014). Response to on prompt update ofliterature references in the Protein Data Bank. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 70, 2780.
Borgius, L., Nishimaru, H., Caldeira, V., Kunugise, Y., Low, P., Reig, R., Itohara, S., Iwasato, T., and Kiehn, O. (2014).
Spinal glutamatergic neurons defined by EphA4 signaling are essential components of normal locomotor circuits. J.
Neurosci. 34, 3841-3853.
Cha, J., Bartos, A., Park, C., Sun, X., Li, Y., Cha, S.W., Ajima, R., Ho, H.Y., Yamaguchi, T.P., and Dey, S.K. (2014).
Appropriate crypt formation in the uterus for embryo homing and implantation requires Wnt5a-ROR signaling. Cell
Rep. 8, 382-392.
Chisada, S., Kurokawa, T., Murashita, K., Ronnestad, I., Taniguchi, Y., Toyoda, A., Sakaki, Y., Takeda, S., andYoshiura, Y. (2014). Leptin receptor-deficient (knockout) medaka, Oryzias latipes, show chronical up-regulated levelsof orexigenic neuropeptides, elevated food intake and stage specific effects on growth and fat allocation. Gen.
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Dasgupta, B., Nakamura, H., and Kinjo, A.R. (2014). Rigid-body motions of interacting proteins dominate
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Dasgupta, B., Kasahara, K., Kamiya, N., Nakamura, H., and Kinjo, A.R. (2014). Specific non-local interactions are
not necessary for recovering native protein dynamics. PLoS One 9, e91347.
Deivasigamani, S., Verma, H.K., Ueda, R., Ratnaparkhi, A., and Ratnaparkhi, G.S. (2014). A genetic screen identifies
Tor as an interactor of VAPB in a Drosophila model of amyotrophic lateral sclerosis. Biol. Open 3, 1127-1138.
Dou, X., Kuriki, S., Maeno, A., Takada, T., and Shiroishi, T. (2014). Influence analysis in quantitative trait locidetection. Biom. J. 56, 697-719.
Fan, Z., Zhao, G., Li, P., Osada, N., Xing, J., Yi, Y., Du, L., Silva, P., Wang, H., Sakate, R., Zhang, X., Xu, H., Yue, B.,
and Li, J. (2014). Whole-genome sequencing of tibetan macaque (Macaca Thibetana) provides new insight into themacaque evolutionary history. Mol. Biol. Evol. 31, 1475-1489.
Fawcett, J.A., Iida, T., Takuno, S., Sugino, R.P., Kado, T., Kugou, K., Mura, S., Kobayashi, T., Ohta, K., Nakayama, J.,
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Federhen, S., Clark, K., Barrett, T., Parkinson, H., Ostell, J., Kodama, Y., Mashima, J., Nakamura, Y., Cochrane, G.,
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Journal Title

Number1

Autophagy

1

2
1
1
1
1
1

J. American Chemical Society
Nature Communications
Developmental Cell
Current Biology
PNAS

Plant Cell

1
4
3
6
1
2

Hettiarachchi, N., Kryukov, K., Sumiyama, K., and Saitou, N. (2014). Lineage-specific conserved noncoding
sequences of plant genomes: their possible role in nucleosome positioning. Genome Biol. Evol. 6, 2527-2542.
Hirata, A., Nokihara, K., Kawamoto, Y., Bando, T., Sasaki, A., Ide, S., Maeshima, K., Kasama, T., and Sugiyama, H.
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予算・科学研究費

Budget2015 年度(FY2015)

(×1,000yen)

収入

Revenue

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金

区

分

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補助金等収入 Various Grants
雑収入 Miscellaneous
産学連携等研究収入及び寄附金収入等額

Industry-Academia Collaboration and Donations

金449,244

補助金等 Grants

449,244

17,282

産学連携等研究経費及び寄附金事業費等845,957

845,957

合計 Total

3,990,097

Industry-Academia Collaboration and Projects

3,990,097

補助金等 11.3％

Miscellaneous

Various Grants

産学連携等
研究収入及び
寄付金収入等 21.2％

Grants

産学連携等
研究経費及び
寄付金事業費等 21.2％

運営費交付金 67.1％

Industry-Academia
Collaboration andDonations

Industry-Academia
Collaboration andprojects

Grants for Operating
Corporation

科学研究費

Grant-in-Aid for Scientific Research2014 年度(FY2014)

(×1,000yen)

教育研究経費 67.5％

Education and Research

若手研究（A）1.0％

若手研究（B）1.0％

特別研究員奨励費 1.3％

挑戦的萌芽研究 0.9％

1,286,100 ／ 26

基盤研究（B）1.8％

基盤研究（C）0.9％

基盤研究（S） For Scientific Research (S)59,300 ／ 2

基盤研究（S）3.8％

研究活動スタート支援 0.2％

基盤研究（A） For Scientific Research (A)107,000 ／ 10

基盤研究（A）6.8％

研究成果公開促進費 0.1％

研究種目交付額／交付件数

Amount / the Number of Applications Granted

新学術領域研究 For Scientific Research on Innovative Areas

基盤研究（B） For Scientific Research (B)27,700 ／ 8

基盤研究（C） For Scientific Research (C)14,800 ／ 10

挑戦的萌芽研究 For Challenging Exploratory Research

14,200 ／ 9

若手研究（A） For Young Scientists (A)15,200 ／ 3

若手研究（B） For Young Scientists (B)16,020 ／ 12

研究成果公開促進費 For Publication of Scientific Research Results

1,900 ／ 1

研究活動スタート支援 For Research Activity Start-Up

3,200 ／ 3

特別研究員奨励費 For JSPS Fellows
合計 Total

※※機構長裁量経費を除く

雑収入 0.4％

補助金等収入 11.3％

額2,694,896

教育研究経費 Education and Research※

合計 Total

Expenditure分

21,000 ／ 16

For Young Scientists (A)For JSPS Fellows

For Scientific Research (B)For Scientific Research (S)For Scientific Research (A)For Young Scientists (B)For Challenging Exploratory Research
For Scientific Research (C)For Research Activity Start -Up

For Publication of Scientific Research Results

新学術領域研究 82.1%

For Scientific Research on
Innovative Areas

1,566,420 ／ 100（2015. 3 月末現在）

予算・科学研究費／ Budget / Grant-in-Aid for Scientific Research95

Biological Symposia
開催日
演者（Speaker）（Date）

2014
4/3
Yoshiharu Yamaichi96

所属（Affiliation）

演題（Title）

Centre de Génétique Moléculaire, Centre National de la Recherche
Scientifique

Tn Insertion Sequencing and Horizontal Gene Transfer

4/10

Hiroko Bannai

Department of Biological Science Graduate School of Science, Nagoya “Brain in the Floating World” Membrane Molecular Dynamics Supporting
University
Brain Functions Revealed by Single Molecule Imaging in Live Cells

4/30

Masahiro Shin

University of Massachusetts Medical School

Vegf Signal Specifically Through ERK Controls Tip Cell Sprouting and Gene
Expression

5/9

Chihiro Horigome

Friedrich Meischer Institute for Biomedical Research

The Impact of Chromatin Remodeling on Binding Site Choice and Outcomeof DNA Double-Strand Break Repair at the Nuclear Periphery

5/14

Daniel Falush

Max Planck Institute of Evolutionary Anthropology

Inference of Fine Scale Population Structure and Admixture History by
Chromosome Painting

5/15

Arndt von Haeseler

Center for Integrative Bioinformatics Vienna

Evolutionary Dynamics of Protein Domains

5/20

Yukinobu Arata

Cellular Informatics Laboratory, RIKEN

Developmental Biology Meets Single-Molecule Detection Technologies &#8211; The Physical Basis of the Robust Cell Polarization in the C. elegance
Embryo

5/26

Han Wang

Center for Circadian Clocks, Soochow University

Molecular Genetic Analysis of Zebrafish Circadian Mechanisms

6/2

Alexander SchierDepartment of Molecular and Cellular Biology, Harvard University

The Molecular Control of Embryogenesis: Insights from Zebrafish

6/2

Fumi Kubo

Max Planck Institute of Neurobiology

How to Sense and Compensate for Motion: Neural Circuits for Processing
Whole-Field Motion in Zebrafish

6/5

Chikara Hashimoto

JT Biohistory Research Hall

New Aspects of Amphibian Gastrulation

6/9

Yuichiro Nakajima

Stowers Institute for Medical Research

Molecular and Cellular Control of the Proliferating Epithelial Architecture by
Planar Spindle Orientation

6/10

Jiulin Du

Institute of Neuroscience, Chinese Academy of Sciences

Brain Vascular Development: Pruning and Growth

6/17

Eiji Ohashi

Department of Biology, Faculty of Sciences, Kyushu University

Roles of the Human 9-1-1/TopBP1 Interaction for Cellular DNA Damage
Responses

6/19

Shinpei Kawaoka

The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Context in Biology: From a Standpoint of Chromatin Regulators
Research Institute International (ATR)

7/17

Walfram Goesslingand Maija K. Garnaas

Brigham and Woman’s Hospital, Harvard Medical School

7/18

Shigeru Saito

Department of Biosensing Research, Okazaki Institute for Integrative Functional Evolution of Thermosensitive TRP Channels and Their
Bioscience, National Institute for Physiological Sciences
Contributions to Sensory Diversity in Vertebrates

7/22

Masanori Mishima

Centre for Mechanochemical Cell Biology, University of Warwick

Molecular Mechanisms for Mechanical Robustness of Cytokinesis

7/23

Akihiro Mori

Medical School, University of Massachusetts

Hajime-no IPPO: Fat vs. Body Size

7/24

Pierre Boursot

Institute des Science de l’Evolution, Universite Montpellier

Sex Chromosome Introgression in Mice and Hares: Possible Dual
Consequences of Sex-linked Transmission and Genetic Conflicts

7/28

Suckjoon Jun

Department of Physics, University of California, San Diego

The Bacterial Chromosome: A Physical Biologist’s Apology

7/31

Takamune Saito

Department of Genetics, Harvard Medical School“Shuriken” Prevents Infertility —Genomic Integrity in Germ Cells—

9/17

Florian Engert

Harvard University

A Mechanism for Somatosensory Based Rheotaxis in Larval Zebrafish

9/18

Takeshi Izawa

National Institute of Agrobiological Sciences

Deciphering of Transcriptome Dynamics of Rice Leaf Under Fluctuating
Conditions

9/22

Bruno Lemaitre

Global Health Institute, École Polytechnique Fédérale of Lausanne

The Drosophila Antimicrobial Response at the Time of the Cas9/CRISPR
Gene Targeting Revolution

9/24

Robert J. Harvey

School of Pharmacy, University College London

Defective Inhibitory Neurotransmission in Startle Disease: Some Surprising
Findings

9/24

Kirsten Harvey

School of Pharmacy, University College London

Cellular and Molecular Mechanisms in the Pathogenesis of Familial PD

9/26

Patrick Yizhi Cai

Institute of Structural and Molecular Biology, University of Edinburgh

Synthetic Genomics: From Genetic Parts to Genomes

10/3

Miguel L Allende

FONDAP Center for Genome Regulation, Universidad de Chile

Examining Cell Behaviors Induced by Damage to the Zebrafish Nervous
System10/3

Brake C. Meyers

University of Delaware

The Diversity of Small RNAs in Anthers

10/14 Daniel Zilberman

University of California, Barkley

The Mechanism and Evolution of Genomic Imprinting in Rice

10/15 Bungo Akiyoshi

Department of Biochemistry, University of Oxford

Evolutionary Cell Biology of Chromosome Segregation

10/27 Shawn Burgess

National Human Genome Research Institute, National Institute of Health

Functional Genomics in Zebrafish to Study Hearing Regeneration

10/27 Randall Peterson

Harvard University

Small Molecule Modifiers of the Cardiovascular and Nervous Systems

10/30 Junshi Yazaki

RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS)HaloTag Protein Array Mapping of Transcription Factor Interactome Networks

10/30 Katsuyuki Shiroguchi RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS)

Absolute and Digital Quantification of Gene Expression Genome-Wide by
Using Molecular Barcoding and Its Application

バイオロジカルシンポジウム／ Biological Symposium

Novel Signaling Pathways in Liver Development and Regeneration

2014 年度 バイオロジカルシンポジウム
開催日
演者（Speaker）（Date）

所属（Affiliation）

演題（Title）

10/30 Vincent Colot

Institut de Biologie de l`Ecole Normale Supérieure (IBENS)

Transgenerational Epigenetic Inheritance: Lessons From Arabiodopsis

10/31 Ikuo Uchiyama

National Institute for Basic Biology

Microbial Genome Comparison Based on the Comprehensive Ortholog
Database MBGD

11/10 Robert Feil

Institute of Molecular Genetics (IGMM), CNRS and University of Montpellier

Role of Non-Coding RNA Expressing in Mammalian Genomics Imprinting

11/12 Helfrid Hochegger

Cell Cycle Control Laboratory, Genome Damage and Stability Centre, Analysing the First Steps into Mitosis
University of Sussex

11/13 Namiko Mitarai

The Niels Bohr Institute, University of Copenhagen

Quantitative Understanding of Gene Expression Fluctuation

11/13 Rodney Rothstein

Columbia University Medical Center

Using Budding Yeast to Uncover Synthetic Genetic Interactions and Discover
Novel Anticancer Therapeutic Targets

11/14 Rodrigo Bermejo

Instituto de Biología Funcional y Genómica, Salamanca University

Mechanisms of Replication Fork Monitoring and Protection

11/20 Takaho Endo

RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS)

Quality Control Method for RNA-seq Using Single Nucleotide Polymorphism
Allele Frequency, and Further Analyses

11/20 Jun Seita

Institute for Stem Cell Biology and Regenerative Medicine, Stanford Gene Expression Commons: Platform for Objective Gene Expression Profiling
University
Based on Global-Scale Meta-Analysis

11/21 Sa Kan Yoo

Miller Institute, University of California, Berkeley

12/1

Masatoshi Hara

Whitehead Institute of Biomedical Research, Massachusetts Institute of Global Regulation of Translation at the Oocyte-to-Embryo Transition by theTechnology
PNG Kinase Complex

12/2

Reo Maeda

Oregon Health and Science University

Exploring the Roles of Protocadherin 15 (Pcdh15) and Transmembrane
Channel-Like Proteins (Tmcs) in Mechanotransduction of Zebrafish Hair Cells

12/2

Akiko Nakamasu

Kyoto Sangyo University

Mathematical Modeling and Analysis of Branched Structures in Compound
Leaves

12/2

Kayo Hibino

RIKEN Quantitative Biology Center (QBiC)RAF & Cell-Fate Determination ~Towards Prediction & Control of Cellular
Response~

12/2

Yan Zhu

Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka University

Long Distance Tangential Neuronal Migration: From Pathfinding toTermination

12/3

Fred Berger

Temasek Life Sciences Laboratory

Histone Variants Define Chromatin Features

CC Bioinformatics, University of Applied Sciences Stralsund

Modeling Effects of Nucleosome Positioning in Short and Long Chromatin
FibersInstitute of Laboratory Animals, Graduate School of Medicine, Kyoto
University

Efficient Generation of Knockout and Knock-in Rats by the CRISPR/Cas9
System12/16 Gero Wademann2015
1/5
Kazuto Yoshimi

Wounds: To Heal or Not to Heal, That is the Question

1/5

Hirotaka Watanabe

Department of Neurology, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical The Roles of γ-Secretase and Its Substrates on the Pathogenesis of
SchoolNeurodegenerative Dementia

1/7

Katsutoshi Tsuda

Plant Gene Expression Center, University of California, Berkeley

The Function of TALE Homeodomain Transcription Factors in Shoot Meristem
Maintenance

1/7

Taiyo Toriba

National Institute of Basic Biology

Establishment of the Polarity Along Adaxial-Abaxial Axis in Floral Organ
Development

1/7

Takayuki Ohnishi

Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University

Hybridization Barriers in Oryza Endosperm

1/21

Takema Sasaki

National Institute of Basic Biology

Systemic Regulatory Mechanism of Root Nodulation in Leguminous Plants

1/22

Jun Kitano

Laboratory of Ecological Genetics, Center for Frontier Research, National Ecological Genetics of Phenotypic Diversification and Speciation
Institute of Genetics

1/26

Shin-ya Miyagishima

Symbiosis and Cell Evolution Laboratory, Center for Frontier Research, Coordinating Mechanisms of Eukaryotic Cell and Endosymbiotic Organelle
National Institute of Genetics
Proliferation

2/16

Daiju Kitagawa

Centrosome Biology Laboratory, Center for Frontier Research, National
Institute of Genetics

Mechanisms of Centriole Biogenesis: Towards Establishing a Theory ofCentriole Duplication

2/20

Yoko Mizuta

JST ERATO Higashiyama Live Holonics, Nagoya University

Two-Photon Imaging of Pollen Tube Guidance in the Arabidopsis Pistil

2/24

Toshihiro Kawasaki

Model Fish Genomics Resource, Genetic Strains Research Center, National
Institute of Genetics

Establishment of Grafting Methods Allowing to Maintain Testes and Embryos
in Zebrafish

2/24

Hirofumi Nakaoka

Division of Human Genetics, National Institute of Genetics

Allele Specific Chromatin Interaction of 9p21 Endometriosis Risk Locus
Regulates Expression Level of ANRIL

2/25

Wen-Hsiung Li

Biodiversity Research Center, Academia Sinica

The Genetic Basis of Feather Diversity in Birds

3/12

Tony DeFalco

Cincinnati Children’s Hospital Medical Center

Macrophages: Versatile Players in Stem Cell and Developmental Biology

3/19

Ralf J. Sommer

Max Planck Institute of Developmental Biology

Molecular Aspects of Developmental Plasticity: on Novel Genes, Chromatin
Remodeling and Developmental Switch Mechanisms

3/24

Marilyn Renfree
and Geof Shaw

School of Bioscience, The University of Melbourne

Reproductive and Developmental Transcriptomics of the Tammar Wallaby

バイオロジカルシンポジウム／ Biological Symposium

97

Awards・Honors

2014 年度 表彰・受賞歴内容

氏名2015 年クラフォード賞

名誉教授

太田朋子

平成 26 年度 日本学術振興会 科研費審査委員表彰

実験圃場

准教授

トゥールーズ第Ⅲ大学

集団遺伝研究部門

教授“Genetic dissection of neural circuits mediating fear-learning

初期発生研究部門

博士研究員

日本遺伝学会木原賞 「植物ゲノム進化と発生制御のエピジェネティッ

育種遺伝研究部門

教授

角谷徹仁

日本遺伝学会奨励賞 「ゲノム情報と進化理論の統合による進化機構

進化遺伝研究部門

助教

長田直樹

小型魚類研究会

Docteur Honoris Causa（名誉博士号）

Best poster award

野々村賢一
斎藤成也
Pradeep Lalin zebrafish”
日本遺伝学会第 86 回大会
ク機構の研究」
日本遺伝学会第 86 回大会の解明」
Biology of plastids -towards a blueprint for synthethic organelles Poster Award“Analyses of

共生細胞進化研究室

大学院生

宇塚明洋

photosynthetic oxidative stress responses in herbivorous unicellular organisms”
平成 26 年度（第 5 回 )総合研究大学院大学学長賞“Identifying global forces of evolution in

進化遺伝研究部門

大学院生

Neha Mishra

集団遺伝研究部門

大学院生

神澤秀明

Drosophila genomes”
総合研究大学院大学

遺伝学専攻

森島奨励賞

第 85 回日本遺伝学会

Best Papers 賞（優秀口頭発表賞） 「出芽酵母の鋳型 DNA 鎖修復機構」

細胞遺伝研究室Intellectual Property Rights

助教

飯田哲史

2014 年度 知的財産権

国内登録 1 件
哺乳類細胞におけるタンパク質分解誘導方法

鐘巻将人 ／ 深川竜郎

特許第 5605658 号

酒井則良

特願 2014-163587

原

特願 2015-11853

国内出願 2 件
魚体内での他家組織の継代維持法（発明届時：ゼブラフィッシュにおける腫瘍化組織の継代維持法）
ハブを軽減する類似度演算システム及び類似度演算方法

98

表彰・受賞歴、知的財産権／ Awards・Honors, Intellectual Property Rights

一夫 ／ 鈴木郁美

Research Organization of Information and Systems
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構

機構長

機構東京連絡所所在機構所属研究所〒105-0001
東京都港区虎ノ門 4-3-13
ヒューリック神谷町ビル 2 階
TEL（03）6402-6200
http://www.rois.ac.jp/

国立極地研究所

統計数理研究所〒190-8518 東京都立川市緑町10-3
TEL（042）512-0608 http://www.nipr.ac.jp/〒190-8562 東京都立川市緑町 10-3
TEL（050）5533-8500 http://www.ism.ac.jp/

国立情報学研究所

国立遺伝学研究所〒101-8430 東京都千代田区一ツ橋 2-1-2
TEL（03）4212-2000 http://www.nii.ac.jp/〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
TEL（055）981-6707 http://www.nig.ac.jp/

北川源四郎

KITAGAWA, Genshiro
President

National Institute of Polar Research

National Institute of Informatics

The Institute of Statistical Mathematics

National Institute of Genetics■ Message from the President■ 機構長の挨拶

With the rapid development of information and communications
technology, the modern society in which we live is experiencing
unprecedented change. Progress in information technology in thelate 20th century heightened the value of information to a level
equal to that of materials and energy, establishing an informationsociety. Currently, it has progressed to the level where enormousvolumes of information can almost automatically andinstantaneously be obtained in almost every sphere of society, notjust in the areas of scientific and technological research. As aresult, it seems that the cliche´ about quantity evolving into quality
has become a real possibility as the advent of the ubiquitous
society is increasingly a reality and both the social systems andthe course of science and technology have changed significantly.
In the world of science and technology, computation has now
been established as the third scientific methodology, next totheory and experiment, and the need for the establishment of
data-centered science, the so-called “fourth science,” is alreadyupon us.

私たちの住む現代社会は、情報通信技術の飛躍的発展を背景に、かってない大きな変革の時期を迎えています。20 世紀後半の情報技術の進展は情報の価値を物質・エネルギーと同等のものに高め、情報社会が確立しました。しかし現在ではさらに一歩進んで、科学・技術の研究の場に限らず、社会のあらゆる場面において、時々刻々大量の情報がほとんど自動的に取得されるようになっています。この結果、ユビキタス社
会の到来が現実のものとなり、社会体制も科学・技術の在り方も大きく変化して、量が質に転化するという使い古された言葉が現前した感があります。とくに、科学・技術の世界においては、従来の理論・実験に加え、計算が第三の科学的方法論として確立し、今後は第 4 の科学ともいわれるデータ中心科学の確立が必要になっています。

With the incorporation in 2004 of the Inter-University ResearchInstitutes, the Research Organization of Information and Systems(ROIS) was established to bring together the National Institute ofInformatics, the Institute of Statistical Mathematics, the National
Institute of Genetics and the National Institute of Polar Research
for the purpose of capturing and analyzing, from the perspectiveof information and systems, various of the complex phenomena
encountered in modern society. The institutes, backed by theirresearch communities, harness their own special features andpromote cutting-edge research from their unique standpoints,
attempting to construct new research paradigms and open up
new research areas in fulfillment of the Organization’s mission.
ROIS will further strive to strengthen its joint use and joint researchfunctions as an inter-university research institute paying attention
to the characteristics of each area of study. For graduate school
education, the third mission of an inter-university research
institute, ROIS functions as the core organization behind the
Graduate University for Advanced Studies, training humanresources to lead academic research in a new age.

情報・システム研究機構は、大学共同利用機関の法人化に伴って、現代社会が直面する複雑な対象を情報とシステムの観点から捉えようとする理念のもとに、国立情報学研究所、統計数理研究所、国立遺伝学研
究所、国立極地研究所が結集して構成されたものです。機構の研究所は、それぞれの研究者コミュニティーを背景に特色を活かして独自の立場か
ら先端的な研究を推進し、新しい科学的方法論の確立と新しい研究領域の開拓によって機構の理念の実現を目指しています。また、大学共同利用機関として、それぞれの学問領域の特性を考慮しつつ共同利用・共同研究の機能を強化してまいります。さらに、大学共同利用機関の第 3の使命である大学院教育に関しては、総合研究大学院大学の基盤機関として、新しい時代の学術研究の担い手を育成します。
新時代の学術研究へ向けての情報・システム研究機構の挑戦に、皆様のご支援ご鞭撻をお願い申し上げます。

We hope that you will continue to support and encourage the
Research Organization of Information and Systems as it pursues
a new era of academic research.
The Data-Centric Science Research Commons, led by the ROIS, is a unique, first-of-its-kind project, which
combines the triad of data platforms, modeling and analytical platforms, and human resource development to form acutting-edge research platform that is leading the information age, as well as forming a core hub for open
international data sharing and collaborative research.

情報・システム研究機構が推進するデータ中心科学「リサーチコモンズ」は、データ基盤、モデリング・解析基盤、人材育成の三位一体により、情報化時代を先導する先進的研究基盤と、オープンな国際共同利用・共同研究の中核的拠点を形成する、世界的にもユニークな事業です。

情報・システム研究機構／ Research Organization of Information and Systems

99

SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)
国立大学法人 総合研究大学院大学

学長

岡田泰伸

OKADA, Yasunobu
President

所在〒240-0193 神奈川県三浦郡葉山町（湘南国際村）
Shonan Village, Hayama, Kanagawa 240-0193 JapanTEL 046(858)1500

http://www.soken.ac.jp/

SOKENDAI (The Graduate University for
Advanced Studies) was established in 1988 asJapan’s first independent graduate university
without undergraduate courses. SOKENDAI
is unique in the world in that it provides
comprehensive doctoral programs in academic
fields ranging from the arts and humanities toscience and engineering in cooperation withparent institutes, such as Inter-University
Research Institutes, the excellent research andlear ning environments of which are fully
leveraged to nurture leading researchers withoutstanding expertise and broad perspectives.

総合研究大学院大学（以下、総研大）は、1988 年にわが国で最初に設立された自らは学部を持たない大学院だ
けの大学（独立大学院大学）であり、人文・理工にわたる学術分野につき総合的な博士課程教育を、大学共同利用機関等を基盤機関として、それらの優れた研究・学習環境を最大限に生かして行うことにより、高い専門性と広い視野を持った一流の研究者を養成するという世界にも類例のない
ユニークな大学です。

▶ Inter-University Research Institutes participating in the Graduate University for Advanced Studies

総研大に参加する大学共同利用機関❶ 総研大本部（生命共生体進化学専攻）

The Graduate University for Advanced Studies(Department of Evolutionary Studies of Biosystems)❷ 国立民族学博物館（地域文化学専攻・比較文化学専攻）

National Museum of Ethnology(Department of Regional Studies・Department of Comparative Studies)❸ 国際日本文化研究センター（国際日本研究専攻）

International Research Center for Japanese Studies (Department of Japanese Studies)❹ 国立歴史民俗博物館（日本歴史研究専攻）

National Museum of Japanese History (Department of Japanese History)❺ 教育支援センター（メディア社会文化専攻）

Center for Open Distance Education (Department of Cyber Society and Culture)❻ 国文学研究資料館（日本文学研究専攻）

National Institute of Japanese Literature (Department of Japanese Literature)❼ a. 分子科学研究所（構造分子科学研究科・機能分子科学専攻）

Institute for Molecular Science(Department of Structural Molecular Science・Department of Functional Molecular Science)b. 基礎生物学研究所（基礎生物学専攻）

National Institute for Basic Biology (Department of Basic Biology)c. 生理学研究所（生理科学専攻）

National Institute for Physiological Sciences (Department of Physiological Sciences)❽ 国立天文台（天文科学専攻）

National Astronomical Observatory (Department of Astronomical Science)11❾ 核融合科学研究所（核融合科学専攻）

9

National Institute for Fusion Science (Department of Fusion Science)❿ 宇宙科学研究所（宇宙科学専攻）

Institute of Space and Astronautical Science (Department of Space and Astronautical Science)

3
2

7

15

10

1

5 4

⓫ a. 加速器研究施設・共通基盤研究施設（加速器科学専攻）
Accelerator Laboratory・Applied Research Laboratory(Department of Accelerator Science)b. 物質構造科学研究所（物質構造科学専攻）

Institute of Materials Structure Science (Department of Materials Structure Science)c. 素粒子原子核研究所（素粒子原子核専攻）

Institute of Particle and Nuclear Studies (Department of Particle and Nuclear Physics)⓬ 統計数理研究所（統計科学専攻）

The Institute of Statistical Mathematics (Department of Statistical Science)⓭ 国立極地研究所（極域科学専攻）

National Institute of Polar Research (Department of Polar Science)⓮ 国立情報学研究所（情報学専攻）

National Institute of Informatics (Department of Informatics)⓯ 国立遺伝学研究所（遺伝学専攻）

National Institute of Genetics (Department of Genetics)

100

国立大学法人 総合研究大学院大学／ SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)

6
12
13

8

14

シンボルマークは減数分裂第一中期の分裂像を図案化したもので，「地球の歴史は地層に、生物の歴史は染色体に記されてある」（木原均、1946）を表している。

Symbol mark of the Institute, which
designs the metaphase plate of the firstmeiotic division and symbolizes the remark
by Dr. Hitoshi Kihara (1946): “The historyof the earth is recorded in the layers of its
crust; the history of all organisms is
inscribed in the chromosomes.”

要覧 2015 年度
http://www.nig.ac.jp

国立遺伝学研究所管理部〒411-8540 静岡県三島市谷田1111
Yata 1111, Mishima, Shizuoka-ken 411-8540 JAPANTEL 055-981-6707 FAX 055-981-6715

National Institute of Genetics
国立遺伝学研究所