第 31 回分子シミュレーション討論会

講演プログラム（平成 29 年 10 月 24 日 最終更新）

主催: 分子シミュレーション研究会

協賛: 日本化学会、日本生物物理学会、日本薬学会、日本コンピュータ化学会、分子科学会、 日本物理学会、応用物理学会、高分子学会、溶液化学研究会、化学工学会

協賛企業 : 株式会社 HPC テック、株式会社クロスアビリティ、株式会社 JSOL、株式会社ダイセル、
株式会社モルシス、ビジュアルテクノロジー株式会社、リアルコンピューティング株式会社
会期: 2017 年 11 月 29 日（水）〜2017 年 12 月 1 日（金）会場

: 金沢商工会議所〒 920-8639 金沢市尾山町 9 番 13 号
金沢駅兼六園口（東口）よりバス（3、8〜10 番乗場）にて約 10 分（南町バス停より徒歩 2 分）

HP

: http://sympo.mol-sim.jp/mssj31/

講演番号 1 桁目: 発表日

講演番号 2,3 桁目 : 通し番号
講演番号記号: L=25 分講演（発表 20 分＋討論 5 分）
: S=15 分講演（発表 12 分＋討論 3 分）
: IL=招待講演（発表 45 分＋討論 5 分）
: SL=特別講演（発表 45 分＋討論 5 分）
: AL=受賞講演（発表 30 分＋討論 5 分）
: P=ポスター発表

講演者記号記号

1 日目: ○印=発表者

11 月 29 日（水）9:00-10:00

104S

分子動力学法による界面活性剤水和結晶(177P)の融解挙動に関する研究

開場，受付（名大院工 応用物質化学専攻1 , 名大院工計算科学セ2 , 花王㈱3 ）○武田康助1,3 , 田

10:00-10:05 開会の辞

会長

田中秀樹（岡山大）— 午前の部 —10:05-11:20 口頭発表 A
座長：古石貴裕（福井大）
101S

105S

水中におけるイオンペア解離カイネティ
クスの多様性とその起源（量研機構）○米谷佳晃

ファンデルワールス式による水の相図（法政大生命）○片岡洋右

102S

渕友季子3 , 安藤嘉倫2 , 篠田渉1 , 岡崎進1,2

水‐メタノール混合系の音速〜波数及び11:30-12:30 ポスター発表 101P-181P（奇数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

温度依存性〜（広大院総）○山崎真史, 佐久間翔太, 宗
尻修治

103S

— 昼食 12:30-13:30 —— 午後の部 —Atomistic simulation on the mechanical deformation of hydrated perfluorosulfonic acid polymer membranes（旭硝子先端研1 , 名大工2 ）○郭安聰1,2 , 田
中厚1 , 入澤潤1 , 篠田渉2 , 岡崎進2

13:30-14:30 ポスター発表 101P-181P（偶数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

17:45-18:45 口頭発表 D

14:40-15:30 招待講演 I

座長：篠田渉（名大）座長：畝山多加志（金沢大）106IL

柔らかい相互作用を持つ液体のガラス転

114S

ベイズ推定による on-the-fly MD トラジェ

移(225P)

クトリ解析方法の開発（近畿大先端研1 , 近畿大生命情報工2 ）○米（名大理）○宮崎州正澤康滋1 , 宮下尚之2— 休憩 15:30-15:40 —115S

計量に依存しない自由エネルギー地形の構成方法（産総研）○中村壮伸

15:40-16:40 口頭発表 B

116S
座長：金鋼（阪大）

107S

きアンサンブル法の適用

ガラスの連続体極限におけるフォノンの（日医大・物1 , 横浜市大2 , 近畿大3 , 広島

輸送特性大4 ）○藤崎弘士1 , 森次圭2 , 米澤康滋3 , 楯
真一4（東大院総合文化）○水野英如, 池田昌司

108S

混合溶媒中のコロイド分散系のレオロジー

117S

非平衡パスアンサンブルに基づく対数平均力ダイナミクス（京大理1 , ENS-Paris2 ）○荒木武昭1 , Ar-（産総研 CD-FMat1 , 近畿大2 , 核融合研3 ）mand Barbot1,2
109S

PIN1 酵素における異性化反応への重み付○森下徹也1 , 米澤康滋2 , 伊藤篤史3

コロイド分散系の伸長流レオロジー（OIST）○瀬戸亮平, Giulio G. Giusteri

110S

アモルファス金属の雪崩的な塑性伝播特性に対する熱的構造緩和の影響（金沢大理工1 , 物質・材料研究機構2 , 阪大

2 日目

11 月 30 日（木）— 午前の部 —基礎工3 ）○新山友暁1 , 譯田真人2 , 下川智
嗣1 , 尾方成信3

9:00-10:00 口頭発表 E
座長：吉井範行（名大）— 休憩 16:40-16:50 —201S

水溶液中の二酸化炭素とアミンの反応の自由エネルギー解析

16:50-17:35 口頭発表 C（関西電力技研1 , Comenius Univ.2 , Slo-

座長：奥村久士（分子研）

111S

vak Acad.
Bučko2,3

過冷却水はなぜドロドロになるのか？：

Stokes-Einstein 則の破れのメカニズム（名大理1 , 阪大基礎工2 ）○川崎猛史1 , 金

Sci.3 ）○窪田善之1 , Tomáš

202S

共溶質存在下における DNA 水和水の熱力(138P)

学的性質の解析鋼2（理研 AICS1 , 甲南大 FIBER2 , 神戸大

112S

スリット型細孔に閉じ込められた水およ

院情報3 , 名大院理4 , 名大 ITbM5 , 甲南大(121P)

び単純液体の相転移現象

FIRST6 ）○中野美紀1 , 建石寿枝2 , 田中成（東京理科大理工）○金子敏宏

典3 , Florence Tama1,4,5 , 宮下治1 , 杉本直

113S

己2,6

速度論的阻害剤による包接水和物の結晶成長遅延化と不凍タンパク質との比較

203S

Ornstein-Zernike 理論に基づく溶媒和自由エネルギー高精度化の試み（岡大基礎研）○矢ケ崎琢磨, 松本正和, 田（愛媛大理）○宮田竜彦, 矢吹直哉

中秀樹

204S

疎水性相互作用の温度，圧力，塩濃度依存性— 休憩 17:35-17:45 —（岡山大基礎研）○甲賀研一郎

— 休憩 10:00-10:10 —10:10-11:25 口頭発表 F
座長：桜庭俊（東大）

205S

シニョリンの定温定圧２次元レプリカ置(147P)

換法による物性解析

15:40-16:30 特別企画 特別講演
座長：田中秀樹（岡山大）
211SL 祝 分子シミュレーション研究会２０周年「研究会の目標について」（研究会顧問，金沢大）○樋渡保秋— 休憩 16:30-16:40 —（総研大構造1 , 分子研2 ）○山内仁喬1,2 , 奥村久士1,2206S

分子動力学シミュレーションを用いた β(240P)

シート凝集体の自由エネルギー解析（阪大院基礎工）○増谷佳一, 金鋼, 松林
伸幸

207S

16:40-17:15 学術賞受賞講演
座長：森下徹也（産総研）
212AL 分子動力学計算による自己組織化分子集合体の物性に関する研究および高並列対応

脂質膜におけるメリチンペプチドによる汎用分子動力学計算ソフトウェア MODY-

協奏的細孔形成機構の自由エネルギー解

LAS の開発

析（名大院工）○安藤嘉倫（名大院工）○宮崎裕介, 篠田渉, 岡崎進

208S

誘電アロステリーによる分子モーターの(136P)

力発生機構（早大・物理応物）○佐藤昂人, 大貫隼, 高

17:15-17:55 研究会総会
18:30-20:30 懇親会

野光則

209S

会場：KKR ホテル金沢

DC-DFTB-MD 法によるバクテリオロド
プシンのプロトン移動反応機構に関する
理論的研究

3 日目

（ 早 大 先 進 理 工1 , 早 大 理 工 研2 , JST-

— 午前の部 —CREST3 , 京大 ESICB4 ）○小野純一1 , 今
井みの莉1 , 西村好史2 , 中井浩巳1,2,3,4

11:30-12:30 ポスター発表 201P-282P（奇数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

9:00-10:00 口頭発表 G
座長：炭竈享司（福井大）
301S

ション
（金沢大理工）○川口一朋, 長尾秀実

302S
(226P)ム P450(CYP) に対する薬物代謝部位予測
本憲明, 泰地真弘人

303S(137P)

クライオ電子顕微鏡像フィッティングシ
ミュレーションの新規並列計算法の開発（理研・杉田理論分子科学1 , 理研 iTHES2 ,14:40-15:30 招待講演 II
座長：三浦伸一（金沢大）理研 AICS3 , 名大院理4 , 理研 QBiC5 ）○森貴治1,2 , Marta Kulik1 , 宮下治3 , Florence

高速 AFM による生体分子の形状と動き

Tama3,4 , 杉田有治1,2,3,5の同時観察（金沢大理工）○古寺哲幸

分子シミュレーションを用いたシトクロ（理研・QBiC）○齋藤大明, 大塚教雄, 沖

13:30-14:30 ポスター発表 201P-282P（偶数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

210IL

Goldman-Hodgkin-Katz 方程式から得られる静止膜電位の分子動力学シミュレー— 昼食 12:30-13:30 —— 午後の部 —12 月 1 日（金）304S

第一原理経路積分分子動力学法を用いた水における原子核量子効果の研究（みずほ情報総研1 , 原子力機構2 ）○加藤

— 休憩 15:30-15:40 —幸一郎1 , 町田昌彦2 , 志賀基之2

— 休憩 10:00-10:15 —— 午後の部 —10:15-11:15 口頭発表 H
座長：志賀基之（原子力機構）

13:30-14:45 口頭発表 J座長：玉井良則（福井大）

305S

アモルファス氷表面におけるイオン拡散（明大院理工）○原典史, 青木雅矢, 深澤

313S

持した並列化手法の開発

倫子

306S

固体高分子中で形成される水構造と振動(122P)

スペクトルの解析（富山大院理工）○八十島亘宏, 石山達也

307S

（東芝メモリ1 , 核融合研2 , 総研大3 ）○加藤周一1 , 伊藤篤史2,3314S（名大院工）○藤本和士, 服部智成, 篠田

ペクトルの分子動力学シミュレーション
也1 , 高瀬航輝1 , 森田明弘1,2

308S

渉, 岡崎進315S

study of ethanol（東大物性研）○樋口祐次

316S

主鎖の剛直性に依存する高分子電解質凝(181P)

集体の構造解析（東北大院・理1 , 京大・ESICB2 , 富山大（豊田中研）○美馬俊喜, 金城友之, 山川

院・理工3 ）○王琳1,2 , 石山達也3 , 森田明
弘1,2

粗視化分子動力学法によるポリエチレンの破壊プロセスにおける応力伝播

Unified assignment method of alkyl C-H
vibrational spectra: molecular dynamics

分子動力学計算を用いたガラス状高分子
衝撃破壊の分子論的研究

固液界面におけるイオン移動と振動差ス（東北大院理1 , 京大 ESICB2 ）○城塚達

動的モンテカルロ法のイベント順序を維俊輔, 旭良司

317S

PVDF と溶媒の親和性に関する分子論的研究：PVDF 表面と溶媒との接触角計算（先端素材高速開発技術研究組合1 , 名大院— 休憩 11:15-11:30 —工2 , 東レ3 ）○北畑雅弘1,2,3 , Tseden Tad-dese2 , 岡崎進2

11:30-12:30 口頭発表 I
座長：石山達也（富山大）
309S— 休憩 14:45-15:00 —Solid harmonics を用いた高速多重極展開
法の計算量削減 − 高並列汎用分子動力学シミュレーションソフト MODYLAS の

15:00-16:15 口頭発表 K

開発状況（名大院工1 , 名大院工 計算セ2 ）○坂下達
哉1 , 安藤嘉倫2 , 吉井範行1,2 , 岡崎進1,2

310S

異方性のある系に対する周期境界条件付(207P)

き高速多重極展開法（名大院工・計算セ1 , 名大院工2 ）○吉井範行1,2 , 安藤嘉倫1 , 坂下達哉2 , 岡崎進1,2311S

全原子分子動力学計算での熱浴および圧(202P)

力浴更新時間の削減（名大院工 計算セ1 , 名大院工 応物化2 ）座長：樋口祐次（東大）

318S

全原子型分子動力学シミュレーションに(165P)

よるナノ空孔への樹脂の充填挙動の解析（デンソー1 , 阪大基礎工2 ）○森穂高1,2 , 松
林伸幸2

319S

（産総研1 , 東大2 ）○米谷慎1 , 杉澤進也1 ,長谷川達生1,2320S

特異な熱電現象の解明を指向した分子動(277P)

力学計算による熱物性の評価○安藤嘉倫1 , 吉井範行1,2 , 岡崎進1,2

312S（奈良先端大物質1 , 分子研2 ）○小島広孝1 ,連続体解析と分子シミュレーション練成阿部竜1 , 井上智史1 , 中村雅一1,2のためのアルゴリズム（旭硝子 先端研1 , UC Berkeley2 ）○浦田
新吾1 , Shaofan Li2— 昼食 12:30-13:30 —銀ナノ粒子形成過程のシミュレーション

321S

Eﬀect of Stacking Interactions on Polar-(275P)

izability of Organic Molecules（R & D Center, Mitsui Chemicals）○ Krzysztof Moorthi, Shintaro Maekawa

322S

分子動力学法を用いた Hras-GTP/GDP
複合体中のGTP/GDP108Pの命名法 2の構造と（産総研）○西尾憲吾, 宮崎剛英

GTP/GDP と溶媒水分子との水素結合との関連性の研究

109P
1

3

1

（名大理）○林卓弥, 岡本祐幸

教育院 , 金沢大理工 ）○宮川毅 , 森川良
1

1

2

3

太 , 高須昌子 , 杉森公一 , 川口一朋 , 長マルチカノニカル法における最適な状態
密度決定法（東京薬科大生命科学 , 金沢大国際基幹
2

不規則原子配列を記述するための多胞体

110P

負圧領域の氷の新しい構造（岡山大院・自然科学1 , 岡山大基礎研2 ）尾秀実3○松井貴宏1 , 平田雅典1 , 矢ケ崎琢磨2 , 田

16:15-16:20 閉会の辞

三浦伸一（金沢大）

中秀樹2 , 松本正和2111P

溶媒和イオン液体系の分極モデル開発（名大院工1 , 産総研2 , 横国大3 ）○平川真
志1 , 篠田渉1 , 岡崎進1 , 都築誠二2 , 渡邉正ポスター発表
112P

1 日目
101P

義3
界面における分子吸着の自由エネルギー

高分子物性定量予測のための異なるスケー

解析

ルの分子シミュレーション手法の接続（阪大院基礎工）○中久木一平, 石塚良介,（近畿大理工1 , 産総研2 ）○三輪谷良太1 ,

松林伸幸

高橋和義2 , 荒井規允1

102P

Kinetic energy definition in velocity Ver-

113P

関する研究

uation（金沢大院・自然）○杉澤宏樹, 井田朋智,（理研1 , 理研 AICS2 ）○ Jung Jaewoon1,2 ,

三浦伸一

小林千草2 , 杉田有治1,2
高精度分子動力学シミュレーションのた

114P

定化についての分子動力学シミュレーショ

（新日鉄住金化学1 , 東大先端研2 ）○佐々ン

木皓平1,2 , 山下雄史2（北大工1 , 北大院工2 ）○川村将也1 , 佐藤Blöchl 電荷解析による分極力場構築法の

信一郎2

検討
（阪大院基礎工）○石井良樹, 石塚良介, 松

115Pび相転移の解析

分子シミュレーションへのデータマイニ（慶大理工）○山光隆一, 野村昴太郎, 泰

ング技術応用岡顕治（金工大工）○林亮子

106P

GPU を用いた動的構造因子計算プログラ

116P

分子論的解明（広島大院総）○佐久間翔太, 山崎真史, 宗（名大院工）○島航平, 藤本和士, 篠田渉,

尻修治

岡崎進

散逸粒子動力学（DPD）シミュレーショ
ンのためのプログラム開発と性能評価（立教大理1 , 東京大生産研2 ）○土居英男1 ,斎藤天菜1 , 奥脇弘次1 , 内藤貴充1 , 望月祐
志1,2

分子動力学法による電解質水溶液中の一様に帯電した球殻内に生成される負圧の

ムの開発

107P

レプリカ交換分子動力学シミュレーショ
ンによるナノスリット内の氷/水相平衡及

林伸幸

105P

水/エタノール混合溶媒中のポルフィリン
モノカルボン酸自己組織化ダイマーの安めの分子間相互作用モデルの検討

104P

変分経路積分分子動力学法を用いたプロ
トン化水クラスターの量子構造ゆらぎに

let integration for accurate pressure eval-

103P

分子動力学シミュレーションによる固液

117P

アルカリ土類金属酸化物の水和過程における吸着物質間の相互作用解析（TherMAT1 , 産総研 CD-FMat2 , トヨタ
自動車3 ）○下堂靖代1,2 , 土田英二1,2 , 大橋
良央1,3 , 石切山守1,3 , 石田豊和1,2

118P

Fermi-Jagla モデルにおける水型液体の液131P

ングロビュール状態タンパク質の構造探液相転移の熱力学的および動力学的異常

119P

レプリカ交換傘サンプル法によるモルテの解明

索（新潟大院理1 , 阪大院基礎工2 ）○加藤大（名大・院理・物理1 , 東大・院理・物理2 ,貴1 , 樋口沙紀1 , 淡路大輔1 , 金鋼2Dept. Chem., Univ. Cambridge3 ）○清水

二酸化炭素ハイドレートの分解過程にお政宏1 , 梶川通仁1 , 桑島邦博2 , Christopher

ける分子動力学シミュレーション

M. Dobson3 , 岡本祐幸1（慶應大理工）○長谷川智大

132PTheoretical Study on Contribution of

変分経路積分分子動力学法を用いたヘリ

Long-Range Interaction to Electronic

ウム液滴中の水素分子クラスターの基底

Structure of Type I Copper Center in

状態に関する研究（金沢大院自然）○谷口雄佑, 三浦伸一

Multicopper Oxidase（Div. of Math. and Phys.

121P

112S 参照

Grad. Sch. of Nat. Sci. and Tech.,122P

306S 参照

Kanazawa University1 , Div.

of High.

123P

過冷却水中の水素結合が形成するネット

Educ.

of Lib.

ワーク構造と破断プロセスの関係

Arts and Sci., Kanazawa University2 ,（阪大院基礎工）○菊辻卓真, 金鋼, 松林

Div.

伸幸

Nat. Sci. and Tech., Kanazawa Uni-

アクリレートポリマー/水界面における水versity3 ）○ Isman Kurniawan1 , Koichiの水素結合構造

Kodama1 , Makoto Wada1 , Satoshi Nak-

（富山大院理工1 , 東北大院理2 , 京大 ES-

agawa1 , Kimikazu Sugimori2 , Kazutomo

ICB3 ）○岸中翔1 , 八十島亘宏1 , 森田明

Kawaguchi1 , Takeshi Sakurai3 , Hidemi

120P

124P

2,3

弘

125P

, 石山達也

脂質二重層膜中のコレステロール 2 分子

133P

127P

2

Sci., Grad.

Sch.

of

分子動力学法を用いた B 型肝炎抗ウイル（名大院工 , 名大院工 計算科学セ ）○松（名大院工）○深井基裕, 浦野諒, 藤本和岡漢斗1 , 安藤嘉倫2 , 岡崎進1,2士, 篠田渉, 岡崎進

共溶媒によるタンパク質構造安定性への134P

計算創薬研究における薬物結合ポケット

自由エネルギー解析の柔軟性に関する研究（阪大院基礎工）○山守優, 松林伸幸

（理研

分子力場および量子化学計算を用いた

田茂雄, 泰地真弘人

tankyrase2-リガンドの結合親和性予測

128P

of Mat.

ス剤のカプシド透過機構の研究

間側方相互作用への溶媒効果の解明

126P

and Dev., Inst.

Nagao1

1

1

Res.

Sci.,

135P

QBiC）○沖本憲明, 平野秀典, 藤

生体膜上における膜結合タンパク質間の（理研 QBiC）○平野秀典, 大塚教雄, 沖本

相互作用とタンパク質の拡散現象の解明

憲明, 泰地真弘人（慶大院理工1 , リーズ大2 , オックスフォー

タンパク質平衡揺らぎとリガンド結合のド大3 ）○山本詠士1 , Antreas C. Kalli2 ,関係に対するエネルギー相関解析

Mark S. P. Sansom3（阪大院基礎工）○伊庭輝, 山守優, 松林

136P

208S 参照

伸幸

137P

303S 参照

129P

発表取消

138P

202S 参照

130P

QM/MM 法に基づく CYP1A2 によるカ

139P

発表取消

フェインの代謝選択性の検討

140P

細胞膜の外単層膜と内単層膜間での膜物（徳島大学院・薬）○西村兆二朗, 岡尚生,

性の違いに関する研究

谷山萌, 吉田達貞（名大院工1 , 名大院工・計算セ2 ）○早川
志保1 , 安藤嘉倫2 , 岡崎進1,2

141P

一般化ハイブリットモンテカルロ法を用

151P

レーションによる高性能界面活性剤分子いたマルチカノニカルアンサンブルの新142P

規生成手法の開発の予測（金沢大院自然）○向田夏規, 三浦伸一

（近大院理工1 , トヨタ自動車株式会社2 , 近

K+ チ ャ ネ ル を 通 る 電 流 の Michaelis-

大理工3 ）○井口拓弥1 , 李娜2 , 諸星圭2 , 荒

Menten 様の飽和の分子論的説明

井規允3（福井大医）○炭竈享司, 老木成稔

143P

152P

ける内部階層構造と遅い緩和についての子シミュレーションを用いたプロトコル

分子動力学計算の開発（東北大金研）彭海龍, ○芝隼人
2

（近大生物理工 , 近大先端研 ）○高橋良153P

太1 , 古江祐也1 , 梅田拓樹1 , 上野敦大1 , 米
2（東北大理）○村島隆浩

ヘマグルチニンと GM3 分子間のリガン

154P

2

1

1

の散逸粒子動力学法シミュレーション 温（慶大理工 , 慶大院理工 ）○九十九慶之 ,
2

1

度および閉じ込めサイズの影響

山本詠士 , 井上堅斗 , 泰岡顕治 , 三上益
2（近大理工）○吉本裕貴, 荒井規允

弘

シトクロム P450 還元酵素の誘電応答が制

155P

高電場におけるコロイドの非線型電気泳御する大規模構造変化と電子伝達

動（早大・物理応物）○飯島美来, 佐藤昂人,（九大・工）○名嘉山祥也, 伊藤恵, 梶原稔
尚森竹亮太, 高野光則

146P

閉じた空間内における界面活性剤水溶液の自己集合プロセスおよび自己集合構造

ド−受容体相互作用の解析 その 22分子シミュレーションによる高分子溶融
体の伸長粘度解析

1

澤康滋 , 宮下尚之

145P

アルキルイミダゾリウムイオン液体にお

遺伝子編集タンパク質の改良に向けた分

1

144P

機械学習を用いた散逸粒子動力学シミュ

薬剤の有無によるリボスイッチの構造変156P

定量性を考慮した高分子の散逸粒子動力化

学シミュレーション（近大生物理工）○大西庸嵩, 古江祐也, 白（福井大工）○野田聖, 古石貴裕

木琢磨, 米澤康滋, 宮下尚之

157P

Dissipative Particle Dynamics Study

147P

205S 参照

on

148P

生体関連分子の AOT 逆ミセル内への導入

Nanocrystal

TripodShapeの自由エネルギー解析（近大理工）○ Bin Sazali Muhammad

Adli, 小林祐生, 荒井規允
158P

2+

多体散逸粒子動力学法を用いた親水/疎水のパターンを有する固体表面上の高分子

The Free Energy Profile for Dissociationof Ligand from Zn

液滴に関する研究

Ion of CA I Ac-

tivesite（近畿大学院総合理工）○西脇拳四郎, 荒（Division of Mathematical and Physi-

井規允

cal Sciences, Graduate School of Natu-

159P

散逸粒子動力学法を用いたナノチューブ

ral Science and Technology, Kanazawa
University）○ Saleh Arwansyah Muham-内におけるトリブロックおよびテトラブ

mad,（近大理工）○竹口琢郎, 荒井規允

Kurniawan Isman,

ロックヤヌス粒子の自己集合構造の解明

Kazutomo

Kawaguchi, Hidemi Nagao
150P

of

（阪大院基礎工）○長尾昌洋, 石塚良介, 松
林伸幸

149P

Self-Assembly

160P

散逸粒子動力学シミュレーションを用い

分子動力学シミュレーションによる超分た分子認識機能を持つトリブロックポリ

子上の GM1 糖鎖とアミロイド β の相互マーモデルによる自己集合構造作用の研究（近畿大院理工1 , 近畿大理工2 ）○荒木雄（名大院理1 , 分子研2 , 総研大3 ）○多知裕

介1 , 荒井規允2

平1,2 , 岡本祐幸1 , 奥村久士2,3

161P

フォルステライトのガラス転移（明大院理工）○西澤隼哉, 深澤倫子

162P

大規模分子動力学法を用いた低過飽和度

カニズム

ルギー解析

（金沢大自然1 , 金沢大理工2 , 新日鐵住金3 ）（慶大理工 ,AICS ）○阿由葉翔 , 野村昴○安井紀一朗1 , 下川智嗣2 , 新山友暁2 , 澤太郎2 , 徐東郁1 , 泰岡顕治1

田英明3

2

1

ナフタルイミド化合物−ハロゲン系の光

165P
166P

175P

誘起過程に関する理論的研究

有機高分子探索（鳥取大1 , 東大2 ）○大平健太郎1 , 星健夫1 ,

波大院化4 ）○大塚教雄1 , 隅田真人2 , 井澤

福島孝治2

176P

界面の構造決定挙動に関する分子動力学解析（金沢大自然1 , 金沢大数物2 ）○山口直也1 ,―リチウム塩 LiPF6 の解離度の評価―

石井史之2（関西大院1 , 関西大2 ）○高井義博1 , 齋藤

177P

104S 参照

賢一2 , 宅間正則2 , 高橋可昌2 , 佐藤知広2

178P

溶媒効果を考慮した有機系添加剤の初期
吸着過程の解析

318S 参照
ワインラクトンの立体選択的生成機構の（兵庫県大シミュレーション）○小西正
和, 鷲津仁志

理論研究
1

2

1,2

屋武茜 , 栢沼愛 , 庄司光男

169P

179P

1,2

Bi 化合物/貴金属界面の第一原理電子状態計算, 重田育照MD シミュレーションによる半導体の表（金沢大自然1 , 金沢大数物2 ）○杉田恵1 ,

面物性解析

山口直也1 , 石井史之2（京大院工）○張鳴鏑, 松本充弘

168P

大規模第一原理計算による酸化物/貴金属

LIB 電解液中のリチウムイオンの微視的（筑波大院数理物質1 , 筑波大計算セ2 ）○喜167P

データ科学と大規模電子状態計算による（理研 QBiC1 , 理研 AIP2 , 鳥取大院工3 , 筑浩則3 , 守橋健二4164P

炭素クラスターによる鉄鋼材料の強化メ

条件における液滴均一核生成の自由エネ
1

163P

174P

180P

電荷を導入した液晶エラストマーモデル

イミダゾールと酸性高分子中の水素結合の相転移挙動解析

構造と運動性（先端素材高速開発技術研究組合1 , パナ

（九大先導研）○堀優太, 塩田淑仁, 吉澤

ソニック2 , 産総研 CD-FMat3 ）○田頭健

一成

司1,2 , 高橋和義3 , 青柳岳司3

二次元 Bi のトポロジカル相図の第一原理

181P

316S 参照計算（金沢大自然1 , 京都大 ESICB2 , 金沢大数
物3 ）○澤端日華瑠1 , 山口直也1 , 小鷹浩毅2 ,
3

石井史之

2 日目
201P

電子相関を考慮した有限電子温度 LCAO

170P

発表取消

法の開発

171P

Electronic structures of 2-dimentional（高度情報研究機構）○中村賢

group-V materials : First-principles cal-

202P

culation.

203P

ロ法の経路自動探索1（金沢大学自然科学研究科 , 金沢大学数2（核融合研1 , 総研大2 , 東芝メモリ (株)3 ）NUNING1 , 斎藤峯雄2○伊藤篤史1,2 , 加藤周一3

物科学系 ）○ ANUGRAH PUTRI NA-

MARI
172P

173P

311S 参照
局所分子動力学を用いた動的モンテカル

分岐構造を持つポリマー系における吸水

204P

分子系に対する Gentlest Ascending Dy-

能の自由エネルギー解析

namics 法を利用した遷移状態探索（阪大院基礎工）○半田和也, 松林伸幸

（RIST 神戸センター1 , 原子力機構2 ）○太

ReaxFF を使った摩擦面の化学反応解析

田幸宏1 , 志賀基之2（兵庫県大シミュレーション）○秋山博
俊, 鷲津仁志205P

単一 GPU を用いる MD プログラムの開217P

イオンの電気移動度の計算

発
1

206P

分子動力学シミュレーションによる分子23（理研 AICS , 理研 , 理研 QBiC ）○神（金沢大自然研）○玉舘知也, 東秀憲, 汲

谷基司1 , 杉田有治1,2,3

田幹夫, 瀬戸章文, 大谷吉生

FDPS を用いた水の分子動力学シミュレー

218P

アルコール単分子膜/水溶液界面でのイオ
ン分布

ション
1

2

（富山大院・理工1 , 東北大院・理, 京大・

3（理研 AICS , 慶應大 , 神戸大 ）○野村
昴太郎 , 岩澤全規 , 行方大輔 , 野澤拓磨 ,ESICB2 ）○吉田俊将1 , 石山達也1 , 森田明

泰岡顕治2 , 牧野淳一郎1,3

弘2

1

1

1

2

3D-RISM 理論とストリング法を結合した

207P

310S 参照

208P

分子動力学シミュレーションによる応力

最小自由エネルギー経路計算法の開発

計算を用いた界面の解析（金沢大院自然）○水谷優斗, 岩崎宏, 三（阪大院基礎工）○木原健輔, 松林伸幸

浦伸一

209P

219P

ナノスケール空間における流体の拡散係

220P

数評価

proton diﬀusion in ordered/disordered
12

2（琉大工 , 琉大院 ）○西上正浩 , 鈴木正

water configurations

己 , 天久和正 , 永島浩樹

（ 早 大 理 工 研1 , 早 大 先 進 理 工2 , JST-

高圧下での TIP4P/2005 モデルによる新CREST3 , 京 大 ESICB4 ）○ 西 村 好 史1 ,型氷の発見

Sakti Aditya Wibawa2 , 周建斌1 , 中井浩（岡山大院自然科学1 , 岡山大異分野基礎

巳1,2,3,4

1

210P

1

1

研2 ）○平田雅典1 , 矢ヶ崎琢磨2 , 松本正和2 ,

221P

2

211P

トの相平衡条件の推定

カーボンナノチューブの周囲にできる新（工学院大大学院1 , 工学院大2 ）○中根億

しい氷士1 , 伊藤慎一郎2 , 平塚将起2

2

1

2

222P

2

研 ）○山崎大 , 矢ヶ崎琢磨 , 松本正和 ,依存性の解明（東理大理工）○土屋翼, 坂口裕宜, 金子

側鎖にオリゴエチレンオキシドを有する

敏宏, 上野一郎

223P（北大院総化 , 北大院総化 , 北大院工 ）（新潟大院自然1 , 大阪大基礎工2 , 新潟大○喜多駿弥1 , 水谷駿介2 , 佐藤信一郎3理3 ）○内山輝1 , 石井良樹2 , 大鳥範和3

1

215P

216P

WCA ポテンシャルを用いた LJ 流体の輸送係数の評価

MD 計算

214P

アルコール水溶液における表面張力温度

田中秀樹2
温度応答性ポリイソシアネート水溶液の213P

第一原理計算を用いたメタンハイドレー

田中秀樹（岡山大院自然科学1 , 岡山大異分野基礎

212P

DC-DFTB-MD simulations of excess

23

リウム４の Widom 線と物性の解明

MD シミュレーションとエネルギー表示
溶液理論によるインスリン２量化の自由（奈良女子大院・人間文化・化学）竹元亜

エネルギー解析由美, ○衣川健一（阪大院基礎工）○大矢晃久, 山守優, 松

経路積分 CMD 計算による超臨界流体ヘ

224P

林伸幸

Molecular Dynamics Study of Filled Ice
Ic and II（金沢大院自然）○ Yudha Arman, 池沢

225P

114S 参照

226P

302S 参照

将人, 三浦伸一

227P

電位依存性カリウムチャネル変異体の電氷表面における環構造の温度依存性

位依存的な構造変化の解析（富山大院・理工1 , 東北大院・理2 , 京大

（広市大・情報1 , 東北大・情報2 , 東北大・

ESICB3 ）○石山達也1 , 森田明弘2,3

メガバンク3 , 東北大・加齢研4 ）○近藤寛

低温における氷 Ih 内の水素分子の量子ゆ

子1 , 鷹野優1 , 木下賢吾2,3,4

らぎに関する理論的研究（金沢大院自然1 , 原子力機構2 ）○池沢将
人1 , Yudha Arman1 , 志賀基之2 , 三浦伸一1

228P

分割統治型励起状態密度汎関数強束縛法

230P
231P

232P

イナミクス

する理論的研究（鳥取大1 , 分子研2 , 立教大3 , 東大生産研4 ）（ 早 大 先 進 理 工 , 早 大 理 工 研 , JST-

○安部友樹也1 , 星健夫1 , 藤田貴敏2 , 望月

CREST3 , 京大 ESICB4 ）○河本奈々1 , 吉

祐志3,4

2

川武司1 , 小野純一1 , 中井浩巳1,2,3,4

240P

206S 参照

分子動力学のサンプリング間隔依存分散

241P

pg-RNA を内包した B 型肝炎ウイルスの共分散行列による蛋白質-リガンド相互作

全原子分子動力学シミュレーション用の解析（名大院工1 , 名市大院医2 , 名大院医3 , 阪（日大理工）○山中雅則

大蛋白研4 ）○山口陽平1 , 今井甫1 , 藤本和

修飾核酸の力場パラメータ決定

士1 , 浦野諒1 , 尾曲克己2 , 田中靖人2 , 石川

（東大新領域）○桜庭俊

哲也3 , 中川敦史4 , 篠田渉1 , 岡崎進1

タンパク質‐フラグメント間の結合ポー242Pズの効率的探索

ターゼキナーゼ-3β と 7-アザインドール誘導体との複合体の精密相互作用解析

浦東（徳島大院・薬）○谷山萌, 岡尚生, 西村兆四量体型サルコシン酸化酵素の生成物の二朗, 吉田達貞

243P（北里大院理 , 北里大理 ）○斎藤崇己 ,（名工大工1 , 名造大2 ）○石田雅祥1 , 尾形

中嶋大祐2 , 渡辺豪2 , 米田茂隆2

修司1 , 鍜島康裕2 , 浦長瀬正幸1 , 田村友幸1 ,気液界面でのアミロイド β(16-22) フラグ

小林亮1

1

2

1

メントの凝集シミュレーション
1

2

244P
1,2

（分子研 , 総研大 ）○奥村久士
暁

ザイム選択性の研究

親水性/疎水性界面での Aβ 単量体に対す（ 名 大 院 理1 , 京 都 府 医 大 院 医2 , JST-る分子動力学シミュレーション

CREST3 , 名大院理構造生物研4 , 名大院工（分子研1 , 総研大2 ）○伊藤暁1,2 , 奥村久計算科学研5 , 名大情報基盤セ6 ）○塚本修

士1,2

一朗1,3 , 榮慶丈1 , 伊藤幸裕2,3 , 鈴木孝禎2,3 ,野生型および変異型 FKBP とリガンドと岡本祐幸1,3,4,5,6の複合体形成に関する結合自由エネルギー245P

ゲルの引張りによる構造変化のシミュレー

変化の非経験的分子軌道法に基づく相関

ション

解析

（東京薬科大生命）○多ヶ谷翔吾, 和出沙（徳島大院・薬）○岡尚生, 谷山萌, 西村兆弥香, 糸賀響, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子

二朗, 吉田達貞

236P

分子動力学シミュレーションによるヒストン脱メチル化酵素阻害剤が持つアイソ

, 伊藤

1,2

235P

I 型不凍タンパク質の水氷界面での安定度に関する MD シミュレーション

由エネルギー計算−

234P

分子科学計算を用いたグリコーゲンシン（富士通研究所）○佐藤博之, 谷田義明, 松

移動経路探索−順過程・逆過程における自233P

生体模倣高分子系でのエキシトン波束ダを用いた光活性イエロータンパク質に関
1

229P

239P

246P

響

蛋白質の天然構造と熱変性構造の安定性（名大院工）○田村美侑, 篠田渉, 岡崎進

に関する相互作用成分解析（阪大院基礎工）○徳永好彦, 山守優, 石

脂質膜の薬物透過における脂質組成の影

247P

Langevin 動力学を用いたチラコイドルー

塚良介, 松林伸幸

メン内腔のプラストシアニンの拡散現象

237P

発表取消

に関する理論的研究

238P

Prediction of membrane protein struc-（金沢大院自然）○和田慎, 高木晶平, 中tures by replica-exchange umbrella sam-

川聖, 川口一朋, 長尾秀実

pling simulations: Case of two helices（名大理）○松原大貴

248P

QM/MM 分子動力学法を用いた金属イオ
ン存在下でのアミロイド β 凝集に対する理論的研究（分子研1 , 総研大2 ）○西澤宏晃1 , 奥村久
士1,2

249P

結晶と非晶質から成る材料の力学特性と

261P

ズム

変形挙動
1

250P

251P

252P

253P

2

1

（金沢大自然 , 金沢大理工 ）○原一輝 ,（山口大院創成科学）○下枡晴菜, 浦上直下川智嗣2 , 新山友暁2

人

粗視化ゲルモデルを用いた生体関節潤滑262P

媒抽出の分子シミュレーション（京大院・工）○矢上翔太, 佐野晃二郎, 松（住友金属鉱山）○西原泰孝, 吉尾里司, 槙

本充弘

孝一郎

散逸粒子動力学法を用いたナノチューブ

263P

密度汎関数理論による解析のシミュレーション（筑波大院数理）○添田皓輝, 松井亨, 守（近大理工）○本松崇裕, 荒井規允

橋健二

散逸粒子動力学法によるテレケリックス

264P

ミュレーションによる樹脂材料の濡れ性（近畿大理工）○小野憲司, 荒井規允

解析様々なパッチを有するナノ粒子の自己集（日立製作所）○伊藤寿, 松本茂紀, 鈴木

合構造に関する分子シミュレーション

智久, 杉井泰介, 寺崎健, 守谷浩志

2

3

265P

の解析

固体表面における水滴の衝突及び跳ね返（京都大工）○秋月聖也, 松本充弘, 向井

り条件

峻介
2

Ne-

266P

braska3 ）○古石貴裕1 , 泰岡顕治2 , Xiao C.
Zeng

学シミュレーション

散逸粒子動力学シミュレーションによる（名大院工1 , 旭硝子2 ）○竹内琴乃1 , An-

気泡生成現象を利用した分子モーターモ

Tsung Kuo1,2 , 田中厚2 , 入澤潤2 , 篠田渉1 ,デルの歩行モデル改良

岡崎進1（近畿大院総合理工1 , 近畿大理工2 ）○北
1

分子置換に伴うハイドロキシアパタイト

條雅一 , 荒井規允の構造変化

温度勾配が誘発する粒子流（明大院理工）○鈴木悠平, 並木亮太, 本（東理大理工）○田中来輝, 秋元琢磨

田みちよ, 渡邊友亮, 相澤守, 深澤倫子

液晶分子 BABH-n のキュービック相発現268P

熱硬化性エポキシ樹脂の破壊挙動解析にに関する分子シミュレーション

向けた粗視化モデルの開発（京都大院工）○管東遼, 松本充弘

（新日鉄住金化学1 , 東大先端研2 ）○庄司

ポリプロピレンの力学的破壊に関する分

直幸1,2 , 山下雄史2269P

結晶材料における不連続な亀裂進展ダイ（福井大院工）○山田忠明, 玉井良則

ナミクス

高分子ダイナミクスの普遍性を応用した（金沢大理工）○藤元大志, 新山友暁, 下分子シミュレーションの階層間接続

川智嗣

1

2

3

（産総研 , 慶應大・理工 , 名大院・工 ）○高
1

260P

267P

2

子シミュレーション

259P

側鎖の長さの違いによる高分子電解質膜の形態と機械的特性への影響の分子動力

3

258P

ボルツマンの輸送方程式を用いた熱輸送○小林祐生1 , 野村昴太郎2 , 荒井規允3（福井大工 , 慶應大理工 , Univ.

257P

実験計画法を用いた粗視化分子動力学シ

ターポリマーの自己集合構造

1

256P

銀イオン錯体内における金属-金属結合の内における界面活性剤水溶液の管内流れ（近畿大院総合理工 , 理研 , 近畿大理工 ）255P

キレート抽出剤や酸性抽出剤を用いた溶

機構の研究

1

254P

分子デイジーチェーン構造の形成メカニ

2

2

270P

2

分岐高分子ブラシを付与した微粒子系に

橋和義 , 西村龍斗 , 大和伸好 , 泰岡顕治 ,関するモンテカルロ・シミュレーション

増渕雄一3（岐阜大工1 , 岐阜大自然科学技術2 ）○寺

散逸粒子動力学シミュレーションを用いた

尾貴道1 , 水野涼2 , 奥村賢太郎2 , 小栗潤也2

ナノチューブ内における楕円型 Janus ナ

271P

全原子古典分子動力学シミュレーション

ノ粒子の自己集合によるカルバゾールデンドリマー分子集（近畿大理工）○西本淳, 荒井規允

合構造の解析
（理研 AICS1 , 東洋大理工2 , 首都大院理工3 ）○河東田道夫1 , 田代基慶2 , 今村穣3

272P

粗視化分子動力学法によるメソゲン含有
エポキシ樹脂の配向性評価（日立1 , 日立化成2 ）○杉井泰介1 , 伊藤寿1 ,松本茂紀1 , 田中慎吾1 , 守谷浩志1 , 丸山直
樹2 , 田中直敬2 , 竹澤由高2273P

カルボン酸塩・ナフタルイミド化合物錯体の光誘起過程の理論的解析（筑波大院数理1 , 理研 QBiC2 , 鳥取大院
工3 ）○大高秀仁1 , 大塚教雄2 , 隅田真人1 ,
井澤浩則3 , 松井亨1 , 守橋健二1274P

分子シミュレーションを用いたナノスケー
ルフラーレン分散液の示す流体力学的挙動の分子論的議論（阪大院基礎工）○水田圭亮, 石井良樹, 金鋼, 松林伸幸

275P
276P

321S 参照
DSMC 法による固体内の電子輸送解析（京都大工）○鍬本賢志, 秋月聖也, 松本
充弘

277P

320S 参照

278P

メタダイナミクスによる複合体構造予測とアルケミカル自由エネルギー計算（富士通研）○谷田義明, 松浦東

279P

リチウム-グラフェン系による水素貯蔵メ
カニズムの理論解明（北大院工）田地川浩人, 井山哲二, ○福
澄孝博

280P

セルロースナノファイバーのねじり変形に関する分子動力学解析−水素結合の評価と形状記憶機能の検討−（関西大院1 , 関西大2 ）○高田健太郎1 , 齋藤
賢一2 , 宅間正則2 , 高橋可昌2 , 佐藤知広2281P

ホイスラー合金における熱電効果の第一
原理計算（金沢大自然1 , 金沢大数物2 ）○見波将1 ,石井史之2 , 水田耀ピエール1 , 斎藤峯雄2

282P

QM/MM に基づく Red Moon 法におけるポテンシャルエネルギー評価（名大院情報1 , 京大 ESICB2 , CREST-

JST3 ）○藤江拓哉1 , 竹中規雄1,2 , 鈴木雄
一1 , 長岡正隆1,2,3