H23年度 統合化推進プログラム進捗報告会
メタボローム・データベースの開発
金谷 重彦・西岡孝明
奈良先端科学技術大学院大学（NAIST)
情報科学研究科・情報生命科学専攻
・計算システムズ生物学講座
櫻井 望(財)かずさDNA研究所・産業基盤開発研究部
有田 正規(独)理化学研究所
植物科学研究センター
平成24年2月24日©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

1

メタボローム・データベースの意義
日本は二次代謝物研究で世界をリード

7000

薬用植物の報告数

Indonesia
China

ゲノム
トランスクリプトーム
プロテオームメタボローム

生理活性

メタボローム研究の課題検出できるが、同定率が低い。
(1)代謝物MSデータを集約・共有するDBが必要
日本は微生物・植物・海洋生物の資源大国
２次代謝物は生理活性の宝庫(2)メタボロームと生理活性のリンクが必要(3)２次代謝DBとゲノム情報のリンクが必要

India
the US日本

メタボローム・・・

・・・・・・・・・・・・

Nature (2007)
Curr Comput Aid Drug Des (2011)

ゲノム
トランスクリプトーム
プロテオーム・・・

薬用植物配合ヒト・・・

機能性有用生物・・・

薬/食用知識VietnamThailand
Malaysia
Philippines

0Hungary0

Schippmann et al.,(2006)を改変
40,000

自生植物数©2012金谷重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

2メタボローム・データベース構想
質量スペクトルから生理活性情報の統合化をめざす。
メタボロミクス研究者、一般ユーザ
デポジット・閲覧・アノテーション・キュレーション

日本メタボローム・データベース
パブリック・リポジトリ[3]メタボローム統合DB[1] 質量スペクトルDB (MS DB)・学会MSDB
MassBank, LipidBank・研究グループMSDB
PRIMe[1-1] 化合物MS
DB

・個別研究における代謝物の同定
文献情報
・大規模メタボロームMSDBMassBase, MS2T, KomicMarket[1-2] メタボローム
MS DB[3-1] ウィキＤＢによるメタボロー
ムデータの統合管理[2] 代謝物情報DB
KNApSAcK DB[2-1] 代謝物｛生物種, 生理活性｝関係DB・質量スペクトルのアノテーション
MassBankフラグメンテーション・ライブラリ[2-2] MS-化合物構造の関係知識DB・文献情報[3-2] メタボローム・アノテーショ
ン・システム[3-3] ゲノム情報とのリンク

基礎研究：持続可能社会に向けた生物資源の有効利用、生物種、分野、目的に応じた基礎研究
産業応用：新規有用代謝物質の探索、ゲノム育種による有用/新規代謝物質の生産 など©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

研究開発項目

Ｈ23

1.質量スペクトルDB（化合物MSDBとメタボロームMSDB）の拡充
公開
1.1化合物MS DBの開発
・プロトタイプシステムの開発
・データのDBへの蓄積ならびに公開

2.2 MS データと化学構造の関係知識DBと化学構造式推定ツールの開発・実装
・システム開発
・データの充実ならびに公開
3.メタボローム統合DB・wikiを中心としたデータ統合技術開発
・wikiを中心とした統合データの公開

Ｈ25

公開 MassBank

1.2メタボロームMS DBの開発
・DBプロトタイプシステムの開発
・データのDBへの蓄積ならびに公開
2.代謝物質情報DBの構築
2.1 代謝物質と生物活性の関係データベース
・データベース構築
・データ蓄積ならびに公開

Ｈ24

公開 BioMassBank
公開

公開 Metabolite
Activity
公開 MassBank
公開©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

MassBank Wiki

メタボローム・データベース構想
質量スペクトルから生理活性情報の統合化をめざす。
メタボロミクス研究者、一般ユーザ
デポジット・閲覧・アノテーション・キュレーション

日本メタボローム・データベース
パブリック・リポジトリ[3]メタボローム統合DB[1] 質量スペクトルDB (MS DB)・学会MSDB
MassBank, LipidBank・研究グループMSDB
PRIMe[1-1] 化合物MS
DB

・個別研究における代謝物の同定
文献情報・大規模メタボロームMSDBMassBase, MS2T, KomicMarket[1-2] メタボローム
MS DB[3-1] ウィキＤＢによるメタボロー
ムデータの統合管理[2] 代謝物情報DB
KNApSAcK DB[2-1] 代謝物｛生物種, 生理活性｝関係DB・質量スペクトルのアノテーション
MassBankフラグメンテーション・ライブラリ[2-2] MS-化合物構造の関係知識DB・文献情報[3-2] メタボローム・アノテーション・システム[3-3] ゲノム情報とのリンク

基礎研究：持続可能社会に向けた生物資源の有効利用、生物種、分野、目的に応じた基礎研究
産業応用：新規有用代謝物質の探索、ゲノム育種による有用/新規代謝物質の生産 など©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

5

[1-1] 化合物スペクトルDB (MS DB)
分散型DB(MassBank)による世界貢献
化合物MS DB (BIRD II期)
MS データを共通のレコード形式にする

MS データを共通のレコード形式にする
公開する研究者B

公開する研究者A
データ・サーバ

データ・サーバ

サーバを提供インターネット

データサーバアクセス・ポイント

利用する
研究者

massbank.jpにアクセス○分散型学術データベース
提供者に権限を一任できる。
メタボロームMS DBの構築へ拡張
構造未知の代謝物のMS DB化(ゲノムにおける機能不明の遺伝子と対応)

20 研究グループが13,463化合物について測定した30,574 MS データを公開
訪問者数(1ヶ月間のユニークIP数= 10,063○豊富なツールを開発
・MSから既存代謝物の同定（バッチ検索も可能）
・分子式、部分化学構造による既存代謝物検索を用いた既存代謝物の同定©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

6

[1.1]化合物スペクトルDB (MS DB)(理研、奈良先端大)(23年度）(a) プロトタイプシステムの開発(b) 学会と連携した活動(c) Mass++との連携。大量クエリのための batch 検索機能を開発(24年度）(a) ミラーサーバの設置安定なサービス提供
大量のLC-MS2データをクエリーとするバッチ検索の効率化(b) 国際学会投稿システムの開発
日本質量分析学会、アジア、オセアニア地域の質量分析学会 ：“MassSpectrometry”を刊行予定。投稿規定、「著者はマススペクトルデータをMassBankで公開することがのぞましい」(c) 専門家によるデータ監修会の開催(d)Mass++との連携。大量クエリのための batch 検索機能を開発©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[1-2] メタボロームDB (かずさＤＮＡ研究所・理研)
日本のメタボローム情報は世界一
多種多様な測定

代謝物の同定アノテーション

メタボロームデータの定式化(代謝物ピークの抽出）

ガスクロマトグラフィー
質量分析装置（GC-MS）
キャピラリー電気泳動
質量分析装置（CE-MS）

かずさDNA研
高機能代謝データベース
UC-Davis(USA)

液体クロマトグラフィー
質量分析装置（LC-MS）

理研 PSC

液体クロマトグラ
フィー・フーリエ変換型
質量分析装置（LC-FT-MS）

DB公開件数：2.4万件(世界一の蓄積量)

分析総数：9.7万件
メタボローム解析のプロトタイプ構築に成功

KNApSAcK (BIRD II期)
生物種-代謝物関係DB(世界最大)
代謝物(５万)、生物種-代謝物関係(10万対)(ＮＡＩＳＴ)○MassBank、Mass++プロジェクトと資産を活用し、生物の総体としてのメタボロームDBの統合により世界をリード。
○構造未知の質量スペクトルも含めデータベース化○目標数3.6万件を目指す。

©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

8

LC-MS

Hiroki Takahashi et al, BMC Bioinformatics,12.259(2011) AMDORAP: Non-targeted metabolic
profiling based on high-resolution LC-MSm/z©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボロームデータフォーマットの設計(かずさＤＮＡ研究所、理研)(23年度）
メタデータ(実験条件など）、高次ピーク情報の格納方式
KNApSAcK、MassBankとスムーズに連携(24年度)
データの拡充
メタボロームデータの登録と、データ処理パイプラインの更なる効率化
アノテーション用語のオントロジー構築の検討①メタデータ階層構造の検討②記載項目・書式の検討③フォーマットに従ったサンプルデータの提供④フォーマットの公開

http://webs2.kazusa.or.jp/togodb©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボロームデータの整理
メタボロームデータ変換するためのパイプラインの効率化を行った（LC-FT-MS,LC-Orbitrap-MS）
分析結果ファイル
ピーク抽出、MS/MSデータ抽出、MS/MSスペクトルの品質チェック、化合物・化合物グループ名のアノテーション
ピーク情報データ処理スキームの効率化（パラメータの最適化とその適用処理）

アノテーションされた化合物群内訳
Aminocarboxylic acids
Sugarsフォーマット変換

Nucleotide
Fatty acid derivatives

半自動処理システムの構築共通フォーマット
アノテーション用語の整理

Organic acids
Phenolics

A. thaliana

L. japonicus

Flavonoids
Glucosinolates
Iridoids
Others化合物カテゴリー名：Sugar, Aminocarboxylic acid, Nucleotide, Fatty acid derivative, Carotenoid, Coumarin, Glucosinolate,
Flavonoid , Iridoid, Lignin, Organic acid, Phenolic, Porphyrin, Steroid, Terpenoid, dimer, trimer, tetramer, phosphate, sulfate,+Hex,
アノテーション状態名：putative, hypothetical candidate,
エビデンス名：MS2 spectra suggested substructure of X(-COOH, carboxyl, ...) group
This species have this compound/related compounds/pathway/...
PDA spectra suggested substructure of X group©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[1-2]メタボロームDB:Bio-MassBank の開発(理研、奈良先端大)
生物サンプル間の比較
メタボローム
MS測定

LC-MS2

研究室内Windows PC

統合検索

MassBank Server

http://bio.massbank.jp/
search大量MS2データ

MassBank
レコード作成InternetInternet

かずさDNA研公開データ
シロイヌナズナの葉
MS：335, MS2：329
ミヤコグサの花
MS：318, MS2：318（同定された基礎代謝物は含まれない）©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[1-2] メタボロームDB
Bio-MassBank の開発(理研、奈良先端大、かずさDNA研究所)
MS2 データの類似性を利用して検索
シロイヌナズナ葉（赤地） と ミヤコグサ花（緑地） に同じ未同定代謝物質の探索

ミヤコグサにある代謝物シロイヌナズナにある代謝物

・・・

ミヤコグサとシロイヌナズナの両方にある代謝物
前駆イオンm/z 360.15

KZSLJ00250 ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ データ ID
Prec: 213.01846 ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ 前駆イオン m/z
RTIME: 5.145 ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ 保持時間
[M03] ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ メタデータ ID
Æ共通代謝経路の探索
凡例©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボローム・データベース構想
質量スペクトルから生理活性情報の統合化をめざす。
メタボロミクス研究者、一般ユーザ
デポジット・閲覧・アノテーション・キュレーション

日本メタボローム・データベース
パブリック・リポジトリ[3]メタボローム統合DB[1] 質量スペクトルDB (MS DB)・学会MSDB
MassBank, LipidBank・研究グループMSDB
PRIMe[1-1] 化合物MS
DB

・個別研究における代謝物の同定
文献情報
・大規模メタボロームMSDBMassBase, MS2T, KomicMarket[1-2] メタボローム
MS DB[3-1] ウィキＤＢによるメタボロー
ムデータの統合管理[2] 代謝物情報DB
KNApSAcK DB[2-1] 代謝物｛生物種, 生理活性｝関係DB・質量スペクトルのアノテーション
MassBankフラグメンテーション・ライブラリ[2-2] MS-化合物構造の関係知識DB・文献情報[3-2] メタボローム・アノテーショ
ン・システム[3-3] ゲノム情報とのリンク

基礎研究：持続可能社会に向けた生物資源の有効利用、生物種、分野、目的に応じた基礎研究
産業応用：新規有用代謝物質の探索、ゲノム育種による有用/新規代謝物質の生産 など©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

14

[2-1] 代謝物情報DB： 代謝物-生理活性DB
生理活性からの有用２次代謝物探索が可能になる。

配合例Ａクミン
クルクミン
コリアンダー
クルクモール
唐辛子
アズレン
胡椒
ニンニク
カプサイシン
TRPV1
ショウガ
ウコン
サフラン
アリシン
ビタミンB1
パプリカ
クローブ
アリチアミン
シナモン
カルダモン
ナツメグ
オールスパイス
代謝物-生理活性DB
キャラウェイ(5034レコード)
フェンネル
フェヌグリーク
ジャガイモ
生物種-生理活性DB
タマネギ(38,555 レコード)
ニンジン©2012金谷重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボローム

生理活性・・・

トランスクリプトーム
プロテオーム・・・

メタボローム・・・

トランスクリプトーム
プロテオーム

ヒト

・・・

生物

・・・

配合

・・・

・・・

機能性

有用生物

・・・

薬/食用知識エネルギー代謝促進
抗ガン作用・ガン抑制
解毒機能
リラックス効果
解毒解熱
強壮
駆風
高血圧予防 ・血圧降下
血行を高める
健胃
抗菌・殺菌
動脈硬化予防
滋養強壮
消化促進
食欲増進
新陳代謝亢進
整腸鎮咳疲労回復15

[2-1] 代謝物情報DB： 代謝物-生理活性DB
生理活性からの有用２次代謝物探索が可能になる。

2012.2.22
NBDCのアーカイブシステムに格納完了(松矢さん 調査担当)

http://kanaya.naist.jp/KNApSAcK_Family/©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

Arabidopsis

代謝物情報
生物活性
生物種から検索できる(23年度)
代謝物-生理活性ＤＢ のプロトタイプ
Metabolite Activityを開発。
(24年度)
悉皆的データの充実を図る。
©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[2-2] 代謝物情報DB： MS-化合物構造の関係知識DB
部分構造による同定率の向上をめざす。
イオンピークと部分化学構
造式の関係ルールDB

1.0

136.057
C5H6N5+0.57(BIRD II期)

NH3N

N

N
HN標品サンプル: 3000種
報告代謝物数：5-6万種

0.76

78.031C5H4N+0.74

H

質量スペクトル252.111

136.057m/z

部分構造推定N

NH3N

NNH
C5H6N5HOO

N

NH3N

N

N

HOO

N

N

N
N

HO C10H11N4O3

構造情報に基づいた絞込み：生物種-代謝物関係DB(KNApSAcK)など©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

HO

C10H14N5O318

[2-2] 化学構造式推定ツール(1) (奈良先端大)23年度 化学構造式推定ツールの開発
24年度 予測精度の向上（二次代謝物質）

イオン強度

LC-MS(5 ppm)
MS2
[M+1]+イオン保持時間(1) 分子式推定Product ions
部分構造式A, B, C,,,,

化合物 DB
KNApSAcK, ChemSpider(2) 分子式が一致する化合物のリスト(3) 絞り込み
(4) 候補化合物のリスト出力©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[2.2] 化学構造式推定ツールの開発 (2)ピークと部分構造式の関係
C2H4NO2

Step 1解裂スキームの作成

ピークの分子式（269）

C2H4NO2

Step 2ピークの分子式ごとに部分化学構造式を収集

C2H4NO
2

C5H3N4

Step 3分子式に共通な部分化学構造式を収集

CH6N3

部分化学構造式（94）
ピークと部分化学構造式の関係（630 ペア）©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本・・・

[2.2] 化学構造式推定ツールの開発 (3)クエリMS
クエリMS22データ
データ
ピーク
ピークm/zm/z と分子式と分子式[M+1]+
C6H10N3O2

分子式に関係づけら
分子式に関係づけられた部分化学構造式
れた部分化学構造式

推定された
推定された化合物の候補
化合物の候補©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボローム・データベース構想
質量スペクトルから生理活性情報の統合化をめざす。
メタボロミクス研究者、一般ユーザ
デポジット・閲覧・アノテーション・キュレーション

日本メタボローム・データベース
パブリック・リポジトリ[3]メタボローム統合DB[1] 質量スペクトルDB (MS DB)・学会MSDB
MassBank, LipidBank・研究グループMSDB
PRIMe[1-1] 化合物MS
DB

・個別研究における代謝物の同定
文献情報
・大規模メタボロームMSDBMassBase, MS2T, KomicMarket[1-2] メタボローム
MS DB[3-1] ウィキＤＢによるメタボロー
ムデータの統合管理[2] 代謝物情報DB
KNApSAcK DB[2-1] 代謝物｛生物種, 生理活性｝関係DB・質量スペクトルのアノテーション
MassBankフラグメンテーション・ライブラリ[2-2] MS-化合物構造の関係知識DB・文献情報[3-2] メタボローム・アノテーショ
ン・システム[3-3] ゲノム情報とのリンク

基礎研究：持続可能社会に向けた生物資源の有効利用、生物種、分野、目的に応じた基礎研究
産業応用：新規有用代謝物質の探索、ゲノム育種による有用/新規代謝物質の生産 など©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

22[3-1] メタボローム統合DB: ウィキ・データベース
分散ＤＢによるメタボローム知の共有をめざす。
[1-1] 化合物MS DBMediaWikiで情報統合：各データを名前空間に分けて登録。検索によりページを再構成。

[1-2] メタボローム DB
一般ユーザから情報収集

サーバ間も検索を可能にし、見かけ上は単一ＤＢとして機能[2-1] MS‐化合物構造の関係知識 DB
専門家による注釈、編集

DB型ウィキ「フラボノイド・データベース」「ウィキによるフラグメント・ライブラリ」「イオンと部分化学構造式の関係」○一貫性の維持、○分散して複数のサーバを配置可能、○知識の集約、○持続可能なDB、としての有用性を実証した。

[2-2] 代謝物‐{生理活性, 生物種}
関係DB[3-3] ゲノム情報とのリンク[3-2] メタボローム・アノ
テーション・システム©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

23

[3-3] 統合化、標準化に向けて(理研)(23年度)
CAS, InChIコード逆引き辞書の作成
基礎代謝物1800化合物についてCAS, InChIコードか構造情報を逆引きするwikiページを構築した。KNApSAcKおよびFlavonoid DBのデータも追加する予定。
MassBankのローカル版構築
個別のPC上で動くMassBankの検索エンジンを実装し、化合物名や計測条件など文字列検索も自由におこなえるJavaアプリケーションを作成した。
トリ、セスキテルペンの構造分類
トリ・セスキテルペンの骨格を生合成経路に基づいて分類し、とりわけ合成酵素における骨格のリアレンジメントがわかる形でまとめた
wikiページを作成した。
メタボローム国際ワークショップの開催：標準化
日米欧の主要PIを集め、データの公開とInChIとPubChem番号をIDとして利用することに同意した。
(24年度)
日米欧(2012.2.17-19)の合意に基づいたデータの標準化ならびに統合を図る。(「低炭素社会のためのメタボロミクス」)©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

[3-3] ゲノム情報とのリンク(奈良先端大)
２次代謝物から遺伝情報とのリンク
プロテオームトランスクリプトーム

ゲノム
メタゲノム・・・

メタボローム

酵素反応-配列-ドメイン関係DB（新領域「生合成マシナリ・プロジェクト」とMassBank
質量スペクトル

化学構造情報の連携）

差分質量スペクトル

反応差分情報反応様式

共通ドメイン情報

有用酵素、有用代謝パスウェイの探索

配列情報

1.多様ユニット一挙構築型（テルペン）
2.アセンブリーライン型（ポリケタイドなど）
3.ユニット連結型（アルカロイドなど）…

将来的には、新型シーケンサから出力されるトランスクリプトームをもとに二次代謝経路の推定を行いたい。
©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

25

生物種、酵素名、遺伝子名から酵素反応の検索
アミノ酸配列から酵素反応の検索
特定領域研究「バイオマシナリー」との協同作業©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

生物種-代謝物関係データへのリンク
相同性検索BLASTP

反応情報

代謝物-生物関係情報

反応メカニズムへのリンク©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

連携体制：世界最大級の連携体制をめざす。
[1-1]化合物MS DB, [1-2]メタボロームMS DB (かずさDNA研究所、理研)
1.日本脂質生化学会(LipidBankデータベース)
2.日本質量分析学会(MassBankデータベース)
1.富山大学・和漢医薬学総合研究所・資源開発研究部門(田中 謙先生)
2.理研・植物科学センターメタボローム研究推進部門(斎藤和季先生)
3.かずさDNA研究所・産業基盤開発研究部(柴田大輔先生)
4.中部大学生命健康科学部(田口 良先生)
5.千葉大学・院・薬学研究科(山崎真巳先生)
6.大阪府立大学・院・生命環境科学研究科(太田大策先生)
7.広島大学・院・医歯薬学総合研究科(升島 努先生)など
1.ドイツ・ライプニッツ植物化学研究所(Dr. Steffen Neumann)
2.フィンランド・ヘルシンキ大学計算機科学科(Prof. Juho Rousu)
3.スウェーデン・ウメオ植物科学研究センター(Prof. Thomas Moritz)
4.ドイツ・マックスプランク植物分子生理学研究所 (Dr. Dirk Walther)

酵素反応-ペプチド配列- 塩基[2-1] MS‐化合物構造の[2-2]代謝物‐{生理活性, 生物 配列関係DB(新領域「生合成関係知識 DB (NAIST)種}関係DB (NAIST)
マシナリープロジェクト」)[3]メタボローム統合DB: ウィキ・データベース(理研）©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

28

データの統合に向けて・・・

PhysiologicalActivity5043レコード

Connect with Therapeutic Usage

・・・

Metabolomics

・・・

Metabolomics

Proteome
Interactome
Transcriptome

・・・

Medicinal Herb.

Proteome
Interactome
Transcriptome

・・・

Prescription

・・・

・・・

Connect with Physiological Activity

TherapeuticUsage

Human Omics

Plant Omics

・・・

Traditional & Modern
Knowledge of MedicinalPlants

38,555レコード

336種の漢方処方
278種生薬5310の配合処方1133種生薬709種の食用生物

50048種の代謝物
101500対の生物種-代謝物の関係
163ヵ国：
41,548対の薬用植物と使用国の関係©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

29科学的・社会的なインパクト○メタボローム研究の世界の拠点(パブリック・リポジトリ)○低コスト運営、持続可能なメタボロームを中心とした知の集約○生物種、分野、目的に応じたメタボロミクス研究基盤○新規有用代謝物質の探索の基盤○ゲノム育種による有用/新規代謝物質の生産へ向けた基盤○ゲノム科学への入り口としての啓発活動による社会貢献○持続可能社会に向けた生物資源の有効利用
LC-MS2・・・

・・・

メタボロームトランスクリプトーム
プロテオーム©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

メタボローム

生理活性・・・

トランスクリプトーム
プロテオーム

・・・

薬用植物

ヒト・・・

配合・・・

・・・

機能性

有用生物・・・

薬/食用知識30

メタボローム・データベースの開発
金谷 重彦・西岡孝明
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情報科学研究科・情報生命科学専攻
・計算システムズ生物学講座
櫻井 望(財)かずさDNA研究所・産業基盤開発研究部
有田 正規(独)理化学研究所
植物科学研究センター
平成24年2月24日©2012金谷 重彦(奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示2.1日本

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