平 成 27 年 度

研究開発実施報告書

ライフサイエンスデータベース統合推進事業（統合化推進プログラム）
研究代表者

有田 正規
理化学研究所 環境資源科学研究センター
統合メタボロミクス研究グループ メタボローム情報研究チーム
チームリーダー「生物種メタボロームモデル・データベースの構築」

1§１．研究実施体制（１）「理研」グループ① 研究代表者： 有田 正規 （理化学研究所環境資源科学研究センター 統合メタボロミクス研
究グループ メタボローム情報研究チーム チームリーダー）② 研究項目1.

リファレンススペクトルサーバーの構築

2.

モデル植物のリファレンススペクトル構築

3.

代謝物情報の検索用ガジェット作成（２）「奈良」グループ① 主たる共同研究者： 金谷重彦 （奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 教授）② 研究項目
1.

生物種と代謝物の関係データベースの充実

2.

代謝物と生物活性の関係データベース（３）「かずさ」グループ③ 主たる共同研究者： 櫻井望 （かずさ DNA 研究所 メタボロミクスチーム チーム長）④ 研究項目1.

メタボロームデータの大規模整備

2.

アノテーションおよびデータ公開加速のための技術開発

3.

RDF を直接生成するインターフェースの作成

2§２．研究実施内容（１）通期及び本年度の研究開発計画と達成目標
理研グループ
生物活性・効能の観点から各生物種と関連づけられてきた代謝物の文献情報とリファレンススペクトルを照合し、そこに生物サンプルから同定されたメタボローム実測結果をリンクさせる。この作業を通じて、それぞれの生物種が持つと考えられる代謝物リストをブラウザ上でクリックしながら閲覧できる、メタボモデル・データベースを構築する。
変更点：新しいリファレンス・スペクトルサーバを年度内に公開予定だったが、質量分析学会との協議が遅れた。また公開元をレンタルサーバではなく国立遺伝学研究所内に設置することになり、対応が遅れている。また MS/MS スペクトルから母核構造の指定をせずに代謝物を直接予測するソフトウェアを作成した。そのため、化合物構造を考慮した検索システムの作成は中止し、母核や部分構造の入力を必要とせずに直接化合物を予測（検索）できるようになった。
奈良グループ
医薬・健康だけでなく環境・生態に及ぶ広範なメタボロミクス研究に対応すべく、生態学と医薬学という二分野に重点をおいて代謝物と生物活性のデータベースを充実させる。
具体的には天然物-対象生物-生物活性の三組の関係からなるデータを文献から抽出し、蓄積する。また生物種ならびに二次代謝物をキーとして、ゲノムならびに遺伝子情報に関わるプロジェクトとのリンクを作成する。
かずさグループ
代謝プロファイルデータの大規模公開を行い、理研チームを中心に構築されるメタボモデルを一般研究者が実験データを使って活用できる基盤を構築する。またデータベース間の連携のため、メタデータのRDF化を進める。
（２）本年度の研究開発進捗状況
理研グループ1.

リファレンススペクトルサーバーの構築
複数のマススペクトルを拡大縮小しながら複数比較できる JavaScript インターフェースを完成させ、MediaWiki サーバ上で動作するようにした。また質量やピーク値に基づく検索インターフェースを作成し、テストサーバ上で稼働させている。

2.

モデル植物のリファレンススペクトル構築
シロイヌナズナの GC/MS スペクトル情報は整理できたが、イネはまだ整理途上である。そのため、当初計画した Metabolonote に登録した論文データの整理が終わっていない。今後、精力的にデータ整理と登録を進める予定である。

3.

代謝物情報の検索用ガジェット作成
複合脂質の構造をあらかじめおおまかに指定しておいて、精密質量や MS2 スペクトルから化合物を絞り込むツールの作成を計画していたが、母核構造を一切指定せずに直接3化合物を予測、候補をランキングできるソフトウェアシステム MS-FINDER を構築した。
このシステム作成に伴い、化合物の組成式リストおよび InChIKey 一覧表も作成した。これらのデータは作成中の MassBank-Wiki サーバに掲載予定である。
奈良グループ1.

生物種と代謝物の関係データベースの充実
標準的かつ人間が読める方法で分子情報を提供する目的で、生物種と代謝物の関係デー タ ベ ー ス に 含 ま れ る ５ 万 種 の 全 て の 代 謝 物 に つ い て InChI(International ChemicalIdentifier)キーを付加した。これにより、理研グループとかずさグループとの連携を強化した。また、InChI キーを付加することにより、他のデータからの本データベースへ簡便にリンクづけることが可能になった。また、本プロジェクトでデータ充実を図っている
生物種-代謝物関係データベースの論文は、2015 年にトムソンロイターにより、本分野の上位 5%論文として選定されるに至っている。

2.

代謝物と生物活性の関係データベース
環境・生態に及ぶ広範なメタボロミクス研究に対応すべく二次代謝物による生物間の関係性を体系化する目的で、データベース Metabolite Ecology DB の設計を行い、データの蓄積を進めた。二次代謝物を、大気中(VOC)、その他、植物体の葉、根、根茎という４種の分布様式に分類した。また、それぞれの代謝物によるエコロジーとして抗カビ、抗菌、誘引、防御、成長促進、成長阻害、忌避などの生物活性に注目し、8285 組の代謝物、代謝物質の生態 学的活性とその対象生 物という３組のデータ を実際に Metabolite
Ecology DB に格納し、公開を進めた。また生物種ならびに二次代謝物をキーとした遺伝子ならびに代謝経路に関する情報の蓄積の充実を図っている。また、代謝物と生物活性の関係データベース Metabolite Activity DB データのネットワーク解析により、３千種の代謝物と生物活性の関係から、代謝経路の生物活性としての役割について説明することができた。この成果は、Molecular Informatics において 2014 年の論文賞として評価された。

かずさグループ
1.

メタボロームデータの大規模整備
20 種類の植物に関して平均約 5000 化合物のアノテーションを付与したデータを構築した。下記２の化合物アノテーション技術を適用したデータを整備中である。

2.

アノテーションおよびデータ公開加速のための技術開発
ピーク抽出ソフトウェア PowerGet を改良し有効ピーク数を約 3～7 倍増強した。フラボノイド同定ソフトウェア FlavonoidSearch を完成させた。各化合物データベース間での構造の重複を除去したデータベース N2D を構築した。

3.

RDF を直接生成するインターフェースの作成
H27 年度は高精度なピーク解析技術の開発に注力したため、RDF の構築は予定より遅延している。DBCLS により作成された D2RQ Mappar を用いメタデータの RDF 形式を検討している。

4§３．成果発表等（３－１） 原著論文発表① 発行済論文数（国内（和文） 0 件、国際（欧文） 10 件）② 未発行論文数（国内（和文） 0 件、国際 （欧文）0 件）③ 論文詳細情報
1.

Okada T, Afendi FM, Yamazaki M, Chida KN, Suzuki M, Kawai R, Kim M, NamikiT, Kanaya S, Saito K, Informatics framework of traditional Sino-Japanese medicine(Kampo) unveiled by factor analysis, J Nat Med. 70, 107-14, 2016 doi
10.1007/s11418-015-0946-02.

Lange KW, Hauser J, Nakamura Y, Kanaya S, “Dietary seaweeds and obesity” Food
Science and Human Wellness, 4, 87-96, 2015 doi:10.1016/j.fshw.2015.08.001

3.

Abdullah AA, Altaf-Ul-Amin M, Ono N, Sato T, Sugiura T, Morita AH, Katsuragi T,
Muto A, Nishioka T, Kanaya S “Development and mining of a volatile organic
compound database” Biomed Research International 2015:139254, 2015 doi:
10.1155/2015/139254

4.

Hirose Y, Suda K, Liu YG, Sato S, Nakamura Y, Yokoyama K, Yamamoto N, Hanano
S, Takita E, Sakurai N, Suzuki H, Nakamura Y, Kaneko T, Yano K, Tabata S,Shibata D “The Arabidopsis TAC Position Viewer: a high-resolution map oftransformation-competent artificial chromosome (TAC) clones aligned with theArabidopsis thaliana Columbia-0 genome” Plant Journal 83(6), 1114-1122, 2015 doi:
10.1111/tpj.12949

5.

Tanaka K, Arita M, Sakurai H, Ono N, Tezuka Y "Analysis of Chemical Propertiesof Edible and Medicinal Ginger by Metabolomics Approach" Biomed ResearchInternational 2015:671058, 2015 doi: 10.1155/2015/671058

6.

Suzuki M, Nakabayashi R, Ogata Y, Sakurai N, Tokimatsu T, Goto S, Suzuki M,Jasinski M, Martinoia E, Otagaki S, Matsumoto S, Saito K, Shiratake K.
“Multiomics in grape berry skin revealed specific induction of the stilbene synthetic
pathway by ultraviolet-C irradiation” Plant Physiology, 168(1), 47-59, 2015 doi:
10.1104/pp.114.254375

7.

Tsugawa H, Cajka T, Kind T, Ma Y, Higgins B, Ikeda K, Kanazawa M,
VanderGheynst J, Fiehn O, Arita M "MS-DIAL: data-independent MS/MS
deconvolution for comprehensive metabolome analysis" Nature Methods 12(6),523-526, 2015 doi: 10.1038/nmeth.3393

8.

Li D, Ono N, Sato T, Sugiura T, Altaf-Ul-Amin M, Ohta D, Suzuki H, Arita M,Tanaka K, Ma Z, Kanaya S "Targeted Integration of RNA-Seq and Metabolite Datato Elucidate Curcuminoid Biosynthesis in Four Curcuma Species" Plant Cell
Physiology, 56(5), 843-851, 20159.

doi: 10.1093/pcp/pcv008

Ara T, Enomoto M, Arita M, Ikeda C, Kera K, Yamada M, Nishioka T, Ikeda T, Nihei
Y, Shibata D, Kanaya S, Sakurai N "Metabolonote: a wiki-based database for5

managinghierarchicalmetadata

ofmetabolome

analyses"Frontiersin

Bioengineering and Biotechnology, 3:38, 2015 doi: 10.3389/fbioe.2015.00038
10. Tanaka K, Arita M, Li D, Ono N, Tezuka Y, Kanaya S "Metabolomic
Characterization of a Low Phytic Acid and High Anti-oxidative Cultivar ofTurmeric" Natural Product Communications, 10(2), 329-334, 2015（３―２）データベースおよびウェブツール等の構築と公開
別紙１参照。
（３－３） その他の著作物（総説、書籍など）
1.

Rocca-Serra P, Salek RM, Arita M, Correa E, Dayalan S, Gonzalez-Beltran A,Ebbels T, Goodacre R, Hastings J, Haug K, Koulman A, Nikolski M, Oresic M,
Sansone SA, Schober D, Smith J, Steinbeck C, Viant MR, Neumann S "Datastandards can boost metabolomics research, and if there is a will, there is a way"
Metabolomics 12(1):14, 20162.

Altaf-Ul-Amin M, Katsuragi T, Sato T, Kanaya S “A Glimpse to Background andCharacteristics of Major Molecular Biological Networks” Biomedical ResearchInternational, 2015:540297, 20153.

doi: 10.1155/2015/540297

Kanaya S, Altaf-Ul-Amin M, Kiboi SK, Afendi FM “Big Data and Network Biology
2015”

BiomedicalResearchInternational,由紀子, 黄銘, 佐藤

2015:604623,

2015

doi:直亮, 西岡孝明, 白井

10.1155/2015/604623
4.

平井（森田）晶, 中村剛, 金谷哲大, 小野重彦, “ビッグ・データ・バイオロジー 医食同源と生態学の体系化に向けて,”

化学と生物, vol.53, no.9, pp600-607, 2015.8
5.

櫻井 望、有田正規 「バイオインフォマティクス入門」日本バイオインフォマティクス学会, 慶
應義塾大学出版会 (2015 年) 執筆分担

（３－４） 国際学会および国内学会発表
1.

招待講演

（国内 １０件、国際 ３件）〈国内〉
１． 有田 正規 「Comprehensive lipidomics and Mass/LipidBank databases」日本分子生物・生化学会大会（BMB2015）シンポジウム「リピドミクスから見えてきた脂質の新機能 –基礎から臨床まで-」神戸, 12/4 2015
２． 有田 正規 「科学者から見た学術のオープン化」林和弘氏、有田正規氏講演会「オープンな知がイノベーションを生む -オープンサイエンスの潮流と図書館の可能性-」(東大新図書館トークイベント 14) 東京, 10/17 2015
３． 櫻井望「Sirius2 をつかった組成式の推定」第 63 回質量分析総合検討会, 6/17, 2015
４． 櫻井望「かずさ DNA 研究所におけるメタボローム解析」千葉県バイオ・ライフサイエンス・ネットワーク会議平成 27 年度 総会・事例報告会,幕張, 7/14, 20156

５． 櫻井望「地場産業振興のためのメタボローム解析による食品分析」千葉県バイオ・ライフサイエンス・ネットワーク会議, 幕張, 1/29, 2015
６． 櫻井望「メタボローム解析の紹介」AJACS 津軽,弘前, 9/3, 2015
７． 櫻井望「メタボローム解析の紹介」AJACS 薩摩,弘前, 1/27, 2016
８． 櫻井望「メタボローム解析の技法とデータベース構築の実際」植物バイオ研究会第５回会
合, 東京, 2/23, 2016
９． 金谷 重彦「ビッグデータを活用した新規ビジネスの可能性」, 第 2 創業・新事業創出セミ
ナー, 東京 2015.11
１０． 金谷 重彦「ビッグ・データ・バイオロジー～医食同源と生態学の体系化に向けて」, 関
西文化学術研究都市 8 大学連携 市民公開講座,京都,9/15, 2015
〈国際〉
１． Arita M "Comprehensive Acquisition of MS/MS Spectra Benefits Database Research" 6thInternational Singapore Lipid Symposium, Singapore, December 1 (Nov30-Dec1), 2015
２． Kanaya S, “KNAｐSAｃK Family DB:Data-driven Nutrition Science from Accessibility ofEdible Species to Cuisine,” 第 4 回ケモインフォマティックス秋の学校, 東京, 11/25. 2015
３． Kanaya S, “KNApSAcK Edible Species Database and Data-Driven Nutrition Science,”
International Conference on Movement and Nutrition in Health and Disease, ドイツ、レーゲンスブルグ、6/11. 2015
2.

口頭講演

（国内 ６件、国際 ５件）〈国内〉
１． 有田正規 「メタボロームデータベースの構築と活用」 第９回メタボロームシンポジウム
三島 9 月 30 日
２． 津川裕司 「MS-DIAL プログラムを用いたリポクオリティ解析とデータベースへの連携」第９回メタボロームシンポジウム 三島 9 月 30 日
３． 津川裕司 ほか 「マスシフト則を適用することによる自動 MS/MS 生成および未知化合物の同定戦略」９回メタボロームシンポジウム 三島 10 月 2 日
４． 福 島 敦 史 ほ か「 AtMetExpress: Development of metabolite-profiling database inArabidopsis」 ９回メタボロームシンポジウム 三島 10 月 2 日
５． 櫻井望ほか「植物が生産する代謝産物の基本台帳整備」第 33 回日本植物細胞分子生物学会 東京大学 8 月 11 日
６． 秋元奈弓ほか「MSMS Flavonoid Search : MSMS スペクトルの経験的な開裂予測に基づくフラボノイド化合物アノテーションシステムの構築」第 33 回日本植物細胞分子生物学会 東京大学 8 月 11 日
〈国際〉
１． 発表者、タイトル、学会名、場所、月日Masanori Arita “Toward a true reference: establishing spectral standards”, “Compoundidentification and databases” workshop in Metabolomics2015, San Francisco, 29 June 2015
２． Atsushi Fukushima “Development of metabolite-profiling database in Arabidopsis:
7

AtMetExpress – Meta-analysis of metabolome data” Metabolomics 2015, San Francisco,30 June 2015
３． Hiroshi Tsugawa “MS-FINDER: Integrated Strategy for Structure Elucidation on
LC-MS/MS by using Chemo- and Bioinformatics Resources” Metabolomics 2015, SanFrancisco, 1 July 2015
４． Wijaya SH, Tanaka Y, Katsuragi T, Morita AH, Afendi MF, Batubara I, Ono N,Altaf-Ul-Amin MD, Takahashi Y, Darusman LD, Kanaya S, “Utilization of KNApSAcKFamily Databases for Developing Herbal Medicine Systems,”Indonesia, Jakarta,

PRAGMA 29, Oct. 2015
５． Li D, Ono N, Sato T, Sugiura T, Altaf-Ul-Amin MD, Arita M, Tanaka K, Ma Z andKanaya S, “Comparison of Curcuminoid Biosynthesis of Curcuma longa and its Cultivars
Using a Pathway Based RNA-Seq Analysis Method,” Metabolomics, 米国、サンフランシス
コ、2015, Jun. 20153.

ポスター発表 （国内 ５件、国際 ５件）〈国内〉
１． 発表者、タイトル、学会名、場所、月日
２． 有田正規ほか「代謝物リストの見本を載せるデータベース」トーゴーの日シンポジウム 東京 10 月 5～6 日
３． 櫻井望ほか「安定同位体を用いた植物代謝成分の基本台帳整備」第 9 回メタボロームシンポジウム 三島 10 月 1～2 日
４． 秋元奈弓ほか「MSMS スペクトルの経験的な開裂予測に基づくフラボノイド化合物アノテーションシステム MSMS Flavonoid Search の構築と展開」第 9 回メタボロームシンポジ
ウム 三島 10 月 1～2 日
５． 櫻井望ほか「メタボロミクス技術による成分基本台帳整備と食品研究への応用」日本農芸化学会 2016 年度大会 札幌 3 月 29 日
〈国際〉
１． Azian Azamimi Abdullah et al. “KNApSAcK Metabolite Ecology Database forInvestigating the Relationships Between VOCs and Biological Activities”
Metabolomics2015, San Francisco, 29 June – 2 July２． Donghan Li et al. “Comparison of curcuminoid biosynthesis of Curcuma longa
and its cultivars using a pathway based RNA-Seq analysis method”
Metabolomics2015, San Francisco, 29 June – 2 July
３． Saravanan Dayalan et al “Distributed data sharing node for mass spectra
repositories in the Metabolomics Node Network” Metabolomics2015, SanFrancisco, 29 June – 2 July
４． Sakurai N et al., “Construction of a pipeline for the comprehensive annotation
ofplant

metabolites

byliquidchromatography-high-resolution

spectrometry” Metabolomics2015, San Francisco, 29 June – 2 July
8mass５． Akimoto N et al., “Flavonoid Search: Enhanced annotation of flavonoids
through construction of empirical dissociation rules and a predicted massfragment database” Metabolomics2015, San Francisco, 29 June – 2 July
（３－５ 知的財産権の出願該当無し（３－６） 受賞・報道等
1.

受賞
１． 第 63 回質量分析討論会 最優秀賞（口頭発表部門）、津川裕司、6/19, 2015
２． 理化学研究所研究奨励賞、津川裕司、4 月, 2016
３． 2014 年 Molecular Informatics 論文賞、Ohtana Y, Abdullah AA, Altaf-Ul-Amin MD,Huang M, Ono N, Sato T, Sugiura T, Horai H, Nakazawa Y, Morita A.H, Lange
K, Kibinge N, Katsuragi T, Shirai T Kanaya S 1/1, 2015

§４．研究開発期間中に主催した活動（主催したワークショップ等）
年月日

名称

場所

2015 年 9 月 30
日―10 月 2 日

第９回メタボロームシンポジウム

三島市民ホール

302 人2015 年 6 月 29
日―7 月 2 日

Metabolomics2015

HyattRegency
San
Francisco
Airport300 人（シンポジウムの参加者。会議全体は1000 人超）

9

参加人数

概要

全国のメタボローム関連研究者が集まる年会を主催
国際会議の国際オーガナイザ。さらにシンポジウム ”Compoundidentification anddatabases”を企画講演。ハッカソン等にも参加。

別紙１ 既公開のデータベース・ウェブツール等
No.

状態

1 継続

研究開発課題名

データベース、ウェブツール等の
名称

6 継続

生物種メタボロームモデ Bio-MassBank
ル・データベースの構築

本DBは、植物の組織や微生物試料をLC-, GC-, CE-MSで分析して http://bio.massbank.jp/得られたマススペクトルを代謝物を同定できた、できないにかかわらず収集します。未同定代謝物のマススペクトルをその化学構造を表現する化学的descriptorとして利用することによって、異なる試料間で同じあるいは類似したマススペクトルがあれば同じ未同定代謝物が含まれている、と考えることができます。このように代謝物を同定することができなくても、その存在を知ることができます。現在、シロイヌナ
ズナの葉、ミヤコグサの花をLC-MS, MS2分析したデータそれぞれ664件、636件を公開しています。

生物種メタボロームモデ KomicMarket
ル・データベースの構築

本DBは、主にLC-MSによるメタボローム解析で得られた化合物ピー http://webs2.kazusa.or.jp/ko 2007年8月7日
クについて、化合物の同定・推定（アノテーション）を行った結果を蓄 micmarket/積・公開しているDBです。

生物種メタボロームモデ MassBank
ル・データベースの構築

本DBは、代謝物質あるいはそれらの関連物質をEI-, FAB-, ESI-,
http://www.massbank.jp/
MALDI-MS, MS2などを用いて分析したマススペクトルを収集、公開しています。データの公開状況（2015年2月末）は次のとおりです。28研
究グループが13,534化合物について分析した合計41,092マススペクト
ルデータを日本とドイツのミラーサーバから公開しています。

生物種メタボロームモデ MassBase
ル・データベースの構築

本DBは、主に質量分析の未加工データ（生データ）、生データをテキ http://webs2.kazusa.or.jp/ma 2008年1月7日
スト型式に変換したデータ、同定・推定（アノテーション）を行わない
ssbase/
ピークデータを、蓄積・公開するためのDBです。

生物種メタボロームモデ Metabolome Activity DB
ル・データベースの構築

本DBは、文献情報をもとに代謝物の活性情報を収集し、公開しています。現在までに、10758種の代謝物-活性の関係が蓄積されており、メタボロミクス研究の標準データベースとなっています。

生物種メタボロームモデ metabolomics.jp
ル・データベースの構築

本DBは、メタボロミクスを中心とした有田研究室の活動全般を対象と http://metabolomics.jp
したポータルサイトです。フラボノイド、基礎代謝物、生薬、植物系統分類データベースのほか、ファイトレメディエーションを含めた放射線情報、講義資料も掲載しています。

生物種メタボロームモデ MFSearcher
ル・データベースの構築

本DBは、精密質量分析で得られた精密質量値から、組成式を迅速に http://webs2.kazusa.or.jp/mf 2010年11月30日推定するためのウェブサービスです。また、KNApSAcK, KEGG,searcher/PubChem, LipidMAPS, FlavonoidViewer, HMDB等の化合物データベースに対して、精密質量値からの検索も高速に行うことができます。ハイスループットなピークアノテーションに利用されています。

生物種メタボロームモデ MS-MS FragmentViewer
ル・データベースの構築

本DBは、フラボノイド標品のMS/MSフラグメントを化学構造に帰属さ http://webs2.kazusa.or.jp/ms 2008年8月25日
せ、分子開裂モデルを提示しているデータベースです。化合物ピーク msfragmentviewer/のアノテーションに利用されています。

生物種メタボロームモデ Metabolonote
ル・データベースの構築

本DBは、メタボロミクス実験の詳細な実験手法に関する情報（メタhttp://metabolonote.kazusa.o 2012年10月5日データ）だけを専門的に取り扱うデータベースです。セマンティック
r.jp/
MediaWikiを利用したシステムにより、ユーザー登録（無料）をすることでだれでも気軽にご自身のメタデータを記録・編集することができます。メタデータを実際のデータ（生データファイルや、ピークアノテーション情報、ピークのスペクトル情報など）と切り離して管理することにより、１）実験後すぐに、さらには実験前であっても、メタデータを記載することができるので、実験設定の詳細を忘れてしまう前に記録に留めておくことができます。また、２）一度記録したメタデータは、論文や実際のデータを管理するその他のデータベースから共通して参照できるというメリットがあります。Metabolonoteのコアシステムは公開されているので、ユーザー独自のMetabolonoteをLIMSや公開サイトとして構築できるほか、フォーマットを独自に定義することで、メタボロミク
ス以外のデータ管理についても使用することが可能です。

7 継続

8 継続

9 継続

10 継続

公開開始日

本DBは、文献情報をもとに生物種代謝物の関係を収集し、公開しています。現在までに、111,199件の生物種-代謝物関係が蓄積されており、メタボロミクス研究の標準データベースとなっています。

4 継続

5 継続

URL

生物種メタボロームモデ KNApSAcK Core DB
ル・データベースの構築

2 継続

3 継続

概要
（150字程度）

関連論文（論文リストに記載があれば、その番号でも可）

http://kanaya.naist.jp/knapsa
ck_jsp/top.html

http://kanaya.naist.jp/Metabo
liteActivity/top.jsp

No.7

生物種メタボロームモデ
ル・データベースの構築
11 継続

12 継続
13 継続
14 継続16 継続
17 継続
18 継続
19 継続
20 継続
21 継続
22 継続
23 継続

KOMICS

生物種メタボロームモデ
MassBank Fragementation Library
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
Motorcycle DB
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
Natural Activity
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
World Map DB
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
KAMPO DB
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
JAMU DB
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
Tea Pot DB
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
Lunch Box
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
Diet Navi
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
FoodProcessor
ル・データベースの構築
生物種メタボロームモデ
ル・データベースの構築 YAKUZEN

生物種メタボロームモ
体質判定・改善アプリ 体質九分類
24 新規 デル・データベースの判定・改善支援ツール
構築
生物種メタボロームモ
25 新規 デル・データベースの Metabolite Ecology DB
構築

2012年3月13日
本DBは、質量分析によるメタボローム解析とメタボロームを活用したオミクス解析のためにかずさDNA研究所でこれまで開発されてきた解析ツールやデータベースを公開しているポータルサイトです。LC-精密質量MSの強力な解析ツールPowerGetや、世界最大級のデータ量
http://www.kazusa.or.jp/komiを持つ分析生データのレポジトリMassBase等、ユニークなリソースがcs/整備されています。また、メタボロミクス関係のリソースへのリンク集など、これからメタボロミクス分野へ参入する研究者にとっても役立つ情報を提供しています。
マススペクトルの開裂パターンをWiki上に整理したDB
二次代謝酵素DB
薬用植物、食用植物と生物への影響（ヒトへの効能）に関するDB
世界で使われている薬/食用植物と使用国の関係DB
漢方配合生薬における配合に関するDB
インドネシア配合生薬Jamuにおける配合に関するDB
ハーブとして使用される植物DB
食用生物DB
食用生物DB
加工品に含まれる食用生物DB

http://metabolomics.jp/wiki/I
ndex:MassBank
http://kanaya.naist.jp/motorc
ycle/top2.html
http://kanaya.naist.jp/Biologi
calActivity/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/KNApS
AcK_World/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/kampo/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/jamu/t
op.jsphttp://kanaya.naist.jp/TeaPot/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/Lunch
Box/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/DietNa
vi/top.jsp
http://kanaya.naist.jp/FoodPr
ocessor/top.jsp

食材(例:豚肉)、効能(例:花粉症)、体質九分類(例:平和質)から薬膳レ
http://kanaya.naist.jp/YAKUZ
シピを検索できます。
EN/top.jsp
体質改善にオススメの食材をご提案、さらにその食材を使った薬膳料
http://taishitsu.e理をご提案いたします。
growth.net/
植物の二次代謝物を分布様式、生物活性ごとに分類し、代謝物、代謝物質の生態学的活性とその対象生物という関係を検索できます。

http://kanaya.naist.jp/Metabo
liteEcology/top.jsp