QuantaSoft™ Version 1.7
Regulatory Edition Software

取扱説明書
1864011JA

バイオ・ラッドテクニカルサポート

サポートや技術的なアドバイスについては、バイオ・ラッド社のテクニカルサポート部門にお問い合わせください。日本のテクニカルサポート部門の受付時間は、月～金曜日の営業日の午前 9:00～午後 5:00 となっています。
電話：03-6404-0331
FAX：03-6404-0334
E メール：life_ps_jp@bio-rad.com（日本国内用）
各国のテクニカルサポートと事業所の連絡先については、www.consult.bio-rad.com をご覧ください。

法的通知

本書のいかなる部分も、バイオ・ラッド ラボラトリーズから書面による許可を得ることなく、写真複写や記録を含む電子的または機械的ないかなる形式や手段によっても、あるいはいかなる情報記憶または情報
検索システムによっても、複製または送信してはならないものとします。
バイオ・ラッドは、当社の製品とサービスをいつでも変更できる権利を有しています。本書は、事前の通知なく、変更されることがあります。
バイオ・ラッドは、本書の正確性に万全を期していますが、本書の誤りや、本書を利用したことによって生じた損害についての責任は一切負わないものとします。
Copyright、

及び Microsoft は Microsoft Corporation の登録商標です。FAM および VIC は Appleraの登録商標です。
EvaGreen は Biotium, Inc.の登録商標です。Bio-Rad Laboratories, Inc. は Biotium, Inc.とのライセンス契約に基づき、研究目的として使用される Real-time PCR 用の EvaGreen 色素を含む試薬を販売しております。
バイオ・ラッド社のサーマルサイクラーとリアルタイムサーマルサイクラーは、以下の１またはそれ以上の US 特許より保護されており又、米国外では Eppendorf AG が所有している特許に保護されています。
Eppendorf AG 所有の米国特許番号は 6,767,512 および 7,074,367 が該当します。
本製品および/またはその使用は、バイオ・ラッド ラボラトリーズ社が所有またはライセンスを受けている、米国特許および/また出願中特許、もしくは米国外特許によって保護されています。製品の購入には、内部での研究を目的とした製品使用に限定されており、譲渡禁止を含んでいます。診断目的での使用は権限に付与されていません。あらゆる種類の商用アプリケーション、製造、品質管理、またはそのようなサービスの契約サービスおよび料金などの商用サービスに使用する権限は付与されていません。そのような用途のためのライセンスに関する情報は、バイオ・ラッド ラボラトリーズから得ることができます。その他必要とされるいかなる追加の知的所有権取得に関しては、購入者/エンドユーザーの責任となります。

Excel Windows
Corporation

Copyright © 2014 by Bio-Rad Laboratories, Inc. All rights reservedi安全規格と規制への適合性

本装置は、試験の結果、以下に示す安全規格と電磁両立性規格の該当するすべての要求事項に適合していることが確認されています。
・ IEC 61010-1:2010（第 3 版）、EN61010-1:2010（第 3 版）－計測、制御、および実験室用電気機器の使用－第 1 部：一般要求事項
・ EN 61326-1:2006（クラス A）－計測、制御、および実験室用電気機器の EMC 要求事項－第 1 部：一般要求事項
・ UL 610-1:2004、実験室用機器、試験および計測機器と産業工程制御
・ CAN/CSA 22.2 No 61010-1-04、計測、制御、および実験室用電気機器の安全要求事項－第１部：一般
要求事項
本装置は取扱説明書に従ってインストールおよび使用されない場合、無線通信に有害な高周波エネルギーを発生し、無線通信に妨害を引き起こすことがあります。住宅地域で本装置を使用すると、有害な妨害を引き起こすことがあります。このような場合、ユーザーは自費でこの妨害の対策を講じなければなりません。
CE マークは、製品が該当する EC 指令の必須要求事項に適合していることをメーカーが保証していることを示しています。
CSA マークは、製品、工程、またはサービスがカナダあるいはアメリカの規格に適合するかどうかを試験した結果、該当する CSA 規格の要求事項に適合していたことを示しています。
本装置は、FCC 規則パート 15 に従って試験した結果、クラス A デジタル機器の規制に適合していることが確認されています。これらの規制は、商業的環境で本装置を使用した場合に、有害な妨害を引き起こさないようにするための十分な保護を規定することを目的としたものです。
WEEE 指令マークは、エンドユーザーがこの製品を廃棄したいと思ったとき、その製品を回収およびリサイクルするために個別の収集施設に送らなければならないことを示しています。

装置の安全性に関する警告本装置を改造すると、保証と安全認証が無効になるとともに、安全上の問題が発生する可能性があります。
本装置は、実験専用の装置です。バイオ・ラッド ラボラトリーズは、本来の用途以外で本装置を使用した
り、バイオ・ラッド ラボラトリーズまたは正規代理店以外が本装置の変更を行った等の結果、負傷あるいは損害が発生しても、一切の責任を負いません。本書に記載されている安全仕様を守ってください。本装
置に付属の電源コード以外は使用しないでください。また、使用する地域の電源コンセントに対応したプ
ラグアダプター以外は使用しないでください。承認されていない試薬を使用すると、装置が損傷し、保証が無効になることがあります。
PPE（個人防護具）
個人防護具）トレーニング

オイルやサンプルプレートを使用する場合は、手袋を正しく使用することをお勧めします。PPE に関する
OSHA の要求事項は、連邦規則集（CFR）の 29 CFR 1910.132（一般要求事項）、29 CFR 1910.138（手の保護）、29 CFR 1926.95（標準的な個人防護具の基準）に明記されています。保護能力が低下した手袋は廃棄して、新しい手袋と交換してください。化学物質にさらされた手袋を再使用しようとする場合は、曝露時間、保管期間、温度などの要因と化学物質の毒性を考慮してください。装置、アッセイ、オイル、および洗浄溶剤を取り扱う場合に手袋を選択しやすいように、以下に各種手袋の特徴をまとめています。
・ ブチル手袋は合成ゴム製で、過酸化物、フッ化水素酸、強塩基、アルコール、アルデヒド、およびケトンから保護してくれます。
ii

・ 天然（ラテックス）ゴム手袋は、着用感が快適で、引張強度、弾力性、および耐温度性に優れています。
・ ネオプレン手袋は合成ゴム製で、柔軟性と作業性が高く、高密度で耐引裂性にも優れています。この
手袋は、アルコール、有機酸、およびアルカリから保護してくれます。
・ ニトリル手袋は共重合体製で、トリクロロエチレンやテトラクロロエタンなどの塩素系溶剤から保護してくれます。この手袋は、オイル、グリース、酸、および苛性物質を取り扱う場合に保護してくれ
ます。

iii

目次

１ はじめに ................................................................
.....................................................................
..................................... 1
QuantaSoftTM Regulatory Edition Software ........................................ 1
ユーザーグループに関して ...................................................... 1

2 ソフトのインストール...........................................................
........................................................... 3
3 QuantaSoft Regulatory Edition Software の使用方法 ............................... 4

3.1 設定（Setup） ................................................................... 5
3.1.1 Well Editor の使用方法................................................... 6
3.1.2 Experiment Editor の使用方法 ............................................ 7
3.1.3 Advanced Option の使用方法 .............................................. 7
3.2 ラン ............................................................................ 8
3.3 解析 ............................................................................ 9
3.3.1 チャンネルデータ（1D Amplitude）の表示 ................................. 10
3.3.2 クラスタリングプロット（2D Amplitude）の表示 .......................... 123.3.3 濃度データ（Concentration）の表示 ...................................... 13
3.3.4 コピー数データ（Copy Number）の表示 .................................... 13
3.3.5 比率データ（Ratio）の表示 .............................................. 14
3.3.6 イベント（Events）の表示 ............................................... 14

Appendix A Ordering Information ...............................................
............................................... 15

１ はじめに

QuantaSoftTM Regulatory Edition Software
QuantaSoft Regulatory Edition(RE)ソフトウェアは、包括的な米国連邦規則 21 条第 11 章が求めるコンプライアンス機能を有します。QuantaSoft RE ソフトウェアは、厳格な管理下での生命科学探求を目的とする研究所のニーズを完全に満たす事ができるコンプライアン
スツールであり、次の機能を提供します。(i)データの作成及び保守機能へのアクセス制限(ii)データ及びレポート変更の永続的な記録。次の機能はコンプライアンスプログラムを統合しています。

・ セキュリティ、アクセス制限、および権限確認機能はユーザベースでの登録レベルにて管理・制限され、データファイルを変更するユーザーの名前と変更日時は記録されます。2 階層によるセキュリティ管理は、既存の Windows Active Directory を用いてQuantaSoft RE に設定する事が出来ます。

・ 記録保護はソフトウェアを使用して生成されるデータファイルの偶発的または意図的な不正操作を防止します。

・ 監査証跡は QuantaSoft RE データファイルが作成・変更されたアクションの追跡をコンピュータから生じるタイムスタンプ付きの記録として管理します。

・ 電子署名は監査証跡として維持的に保管されます。
ユーザーグループに関してQuantaSoft RE ソフトウェアには QuantaSoft 管理者と QuantaSoft ユーザーの 2 階層レベ
ルでのユーザーアクセスがあります。管理者レベルのアクセスはソフトウェアの全ての権限を有します。またユーザーレベルでのアクセスでは読み込み、実行、および視覚化の権限が制限されています。

両ユーザーグループの作成は購入者の管理部門にて作成します。
QuantaSoft RE ソフトウェ
アにアクセスするには、ユーザーはどちらかのグループメンバーである必要があります。
ユーザー認証は、プレートを実行し、ファイルを保存する、またはデータを出力する（セキュア PDF をエクスポートする場合）などの、QuantaSoft RE ソフトウェア使用時のチェッ
クポイント時に必要とされます。

1

Windows セキュリティボックスはそれぞれのステップ時に表示され、継続的にユーザーのパスワードを再入力するよう促します。

以下のファイルが監査ログとして保存されます：

・ qlps・ qlts ： 監査ログが実行時に qlps に移動した時に確認できます
チェックサムにより監査証跡が侵害されているかを確認します。 Well 属性の設定、threshold line の設定またはク ドラントリ ーションによる ーティング 、データにをるす ての変更はログとして保存されます。ログはランの完 時を全てのチェックポイント時（ユーザーのプレート実行、保存及びデータファイルのエクスポート時）に表示されます。

影響 与え

べ

オ

ゼ

2

ゲ

了

等
除く

2 ソフトのインストール

標準

ジ

同
け ば

QuantaSoft RE ソフトウェアはバー ョンの QuantaSoft ソフトウェアと じ方法でインストールします。しかし QuantaSoft RE は付 的なセキュリティとデータ統合を提供するため、ユーザーのアクセスを管理するためにユーザーグループを作成しな れ なりま。QuantaSoft RE の 動には以下の要 が必要です。(i) Windows Active Directoryをしようしたネットワークに 続している。 (ii) ユーザーは な とのユーザーグループに追 されていな れ ならない。

加

せん

起
件
接
少 く も一つ加け ば
QuantaSoft RE ソフトウェアのインストール
ソフトウェアのインストール
注 : 標準 バー ジ ョンの QuantaSoft ソフトウェアがインストールさ れた 同 じ PC に
QuantaSoft RE ソフトウェアをインストールおよび起動を行わないでください。
1. ご自身のコンピュータにソフトウェアをインストールする前に、ご自身の Windowsドメインに二つの QuantaSoft 用ユーザーグループを追加するように施設の IT 管理者にご依頼ください。IT 管理者は以下のグループを追加するようにしてください。
QS Administrator（管理者） - ソフトウェア特権への完全なアクセスを持つ
‒

ユーザー

‒

（ユーザー）ユーザー）

特QS User- ソフトウェア 権への部
（ロード、ラン、表示機能のみ）

分的なアクセスを持つユーザー

2. 管理者権限にてソフトウェアをインストールします。QuantaSoft RE ソフトウェアのインストールディスク のインストーラーフ ルにある setup をクリックします。
要求のを確認されますので、Yes をクリックします（ れは しいソフ
トウェアをインストールする時の的な Windows の操作となります）。

許諾

許可

上

立 上

標準

ォ ダ内

こ

新

指
立 上

従っ

3. InstallShield Wizard が ち がりましたら、Next をクリックし表示される 示にてインストールを めます。インストールが完 するとアイコンが ち がりますので Finish をクリックします。

進

了

注: 上記にリストされたユーザーグループに追加されたユーザーのみ QuantaSoft RE ソ
フトウェアにアクセスできます。
4.

ご自身の Windows ユーザー名とパスワードにてログインします。

5. ライセンス合意を確認して下さい。

3

3 QuantaSoft Regulatory Edition Software の使用方法

左側

ナビゲ

こ

QuantaSoft RE ソフトウェアはにあるーションバーをワンクリックする とで、ドロップレット解析の なのステップへアクセスできます。

主 ３つ・ Setup（設定） - サンプル、アッセイ、実験についての情報を入力（Section 3.1 参照）

・ Run（ラン） - ランの開始および機器の制御（Section 3.2 参照）
・ Analyze（解析） - 核酸濃度を算定（Section 3.3 と 3.4 参照）
QuantaSoft RE ソフトウェアは以下のファイルタイプを使用します。

・ Template（*.qlts） - Droplet Digital PCR（ddPCR）プレートを測定するためのユー

義のプレートレイアウト設定（データは含まれません）
・ Results（*.qlps） - ddPCR プレート用のユーザー定義のプレートレイアウト設定と測定済みデータ
注 ： QuantaSoft RE ソフトウェアによっ て生成された.qlps および .qlts ファイルはQuantaSoft RE ソフトウェアのみによって書き込みや立ち上げが可能であり、Regulatory
Edition のファイルは標準バージョンのソフトウェアでは開くことはできません。
ザー定・ 非セキュリティファイルは QuantaSoft 標準バージョンのソフトウェアにて開く事ができます。

・ セキュリティファイルは QuantaSoft RE ソフトウェアにて開く事ができます。

w

Windo s ユーザー名とパスワードで QuantaSoft RE ソフトウェアにログインします。

注： QuantaSoft ユーザーグループに追加されたユーザーのみ QuantaSoft RE ソフトウェ
アを動作させるアクセス権を持っています（Chapter 2 インストールの章を参照）。

4

3.1 設定（
設定（Setup）
Setup）

注： ddPCR プレート設定には QS administrator アクセス権が必要となります。QuantaSoft
RE ソフトウェアは.qlts 形式のプレートテンプレートのみロードすることができます。.csv
や.qlt ファイルはロードできません。
QS user は既存のテンプレートまたは.qlps ファイルのロード、ランの開始または停止、デー
タの解析およびファイルの閲覧等、限られた操作のみ許可されています。threshold の設定、プレート属性の削除、テンプレートの作成等の操作は許可されていません。

QuantaSoft ソフトウェア設定インターフェイス：
ソフトウェア設定インターフェイス：プレートマップは 96 ウェルプレートのウェル配置図として表示され、該当ウェルの解析のタイプ、Sample、Assay に関する情報が含まれています。ラン後には濃度データも記載されます。

プレート設定を開始するために

1. Sample、Assay、Experiment に関する情報を入力するために Setup をクリックします。
・ QuantaSoft RE で作成した他の実験から保存されている情報（設定やデータ）を開くためには、Plate > Load をクリックしてファイルを選択します。
・ プレートマップ（設定のみ、データなし）の保存したテンプレートを開く場合は、
Template > Load をクリックしてファイルを選択します。
・ 新しいテンプレートを作成するためには、Template > New をクリックします。
開いているプレート設定情報（Experiment のタイプと名称、Sample の名称など）を上書きする場合は、Template > Load をクリックします。Load テンプレートウインドウで、Overwrite をクリックします。

2.

ファイル名を入力し、well editor（Section 3.1.1 参照）、experiment editor（Section 3.1.2
参照）を使用して実験の設定情報を設定します。Options をクリックして、さらにオプションでのデータ解析や設定にアクセスします（Section 3.1.3 参照）。
5

3.1.1 Well Editor の使用方法を用いてプレートの設定（Sample、Experiment タイプ、検出タイプ）を行いまと Experiment タイプは異なる色で識別され、プレートマップ上で簡単に参照
す。
およびカスタマイズする事ができます。

Well Editor
SampleWell Editor

画面：
画面：一つのサンプルでのレアイベント検出での設定を示しています。

Assay タイプオプション：

1. Well Editor を開くためには、編集したいウェルをダブルクリックします。選択された
ウェルはグレーでハイライトされ、Well Editor がインターフェイス上部に表示されます。
・ 複数のウェルを選択するためには、Ctrl キーを押したままウェルを選択します。
・ 連続したウェルを選択（水平方向、垂直方向）するためには、Shift キーを押した
まま最初と最後のウェルを選択します。
・ プレートすべてのウェルを選択するためには、プレート左上隅をダブルクリック
します。
・ 行、列で選択するためには、行や列の文字や数字をダブルクリックします。
2. Sample パネルでは、サンプルの Name（名称）を入力し、ドロップダウンメニューから Experiment を選択します。
・ ドロップダウンメニューには保存されているすべての Experiment が表示されます。オプションとして add experiment…があります。
・ Sample の Name は大文字小文字の区別があります; データ解析で同一のサンプ
ル名称を持つウェルだけがマージされたウェルとして処理されます。
・ Experiment を作成および編集する場合は、Experiment editor を使用します（Section 3.1.2 参照）。
・
3. ドロップダウンメニューから Supermix を選択します（必須項目、データ取得後に変更できません）。
4. ターゲット 1（チャンネル 1、FAM チャンネル）とターゲット 2（チャンネル 2、VIC
または HEX チャンネル）を定義します。各アッセイの Name（名称）やサンプル Type（タイプ）を割り当てます。
6

入力していくと Applied Well Settings に設定内容が表示されます。入力が完了したら、Apply もしくは OK をクリックして情報を保存します。設定はプレートマップのウェルに表示されます。
（管理者）のための Tips：
を閉じること無く、プレートマップを用いて選択するウェル変更を行うことができます。
複数選択したウェル内で Sample や Assay に番号の割り振りを付加する場合は、Name の横の Auto Incのチェックボックスを選択します。
コピー、ペーストや選択解除には、標準的な Windows キーボードショートカットを使用できます（例として、選択のコピーには Ctrl+c、操作の取り消しには Ctrl+z）。

QS Administrator
Well Editor

3.1.2 Experiment Editor の使用方法（管理者）は Experiment タイプを定義するために Experiment Editor を使用することができます。
Experiment Editor を開くためには、Setup での Well Editor で Experiment > add
experiment…を選択するか、Experiment ウィンドウで New または Edit（Experiment nameをダブルクリックでも可）を選択します。4 種類の Experiment タイプ；absolute
quantification（ABS、絶対定量）、rare event detection（RED、レアイベント検出）、copy
number variation（CNV、コピー数多型）、gene expression（GEX、遺伝子発現）が選択できます。インストール時に Experiment のデフォルトリストが設定されていますが、QS
administrator（管理者）は Experiment を作成およびカスタムした Experiment を保存することができます（アップグレードを行なっても現在の Experiment リストは保存されます）。
それぞれのウェル設定は Applied Well Setting ボックス内でまとめて確認できます。ウェル
情報を保存する場合は Apply または OK をクッリクします。設定情報は Plate Map 内の各ウェルに表示されます。
QS administrator

Experiment Editor 画面。CNV 実験のオプションを示しています。
3.1.3 Advanced Option の使用方法

ウインドウの Options をクリックすると、データ取得と解析のための Advancedを見ることができます。

Setup
OptionAdvanced Option 画面。
7

3.2 ラン

ランを開始するには左のナビゲーションバーにある Run をクリックします。
ユーザー名とパスワードを入力して OK をクリックします。監査証跡として確認ウインドウが表示されますので Continue to Save…をクリックします。
3. Run Options ウインドウにて検出ケミストリーを選択します。
‒
Well Editor でプローブ系の Supermix を選択している場合はプローブの色素セットが表示されます。FAM/HEX または FAM/VIC を選択します。
‒
EvaGreen Supermix を選択している場合は EvaGreen 色素セットが表示され、ス
クリーンにはプレート上に設定された EvaGreen のウェル数が表示されます。

1.
2. Windows

Run Option

画面

１分以内に、Abort ボタンの横に緑の円が現れ、ランが進行中であることを示して点滅します。測定中および解析済みウェルはプレートマップ上で緑色にハイライトされます。
5. 各ウェルは解析されて、データは上部ナビゲーション領域に表示されます。ランが完了
すると、最終的なデータファイルのためにすべてのデータは再解析されます。
4.

測定ラン中のインターフェイス：
測定ラン中のインターフェイス：二つの検出用チャンネルのデータが測定しているウェルで示されます。

8

3.3 解析

データ解析を行うためには、Setup ウインドウで Plate ファイル（.qlps 拡張子）をロード
し Analyze をクリックします。データ解析のインターフェイスは３つのウインドウに分かれています。
・ 結果テーブル – ウェルセレクターで選択されたウェルについてまとめた結果
・ ウェルセレクター – 解析したいウェルを選択するためのウインドウ
・ 処理済みデータ/図表表示 – 選択したウェルから図表データを可視化するウインドウ

データ解析インターフェイス：
データ解析インターフェイス：CNV 解析からのデータを示しています。

結果テーブルオプション：
結果テーブルオプション：CNV 解析からのデータを示しています。
9

図表データ表示オプション：
図表データ表示オプション：CNV 解析からの濃度プロットを示しています。上部にオプションが表示されます。
3.3.1 チャンネルデータ（1DAmplitude））の表示
チャンネルデータ（

選択されたウェルの各チャンネルからの取得データを視覚化するために 1D Amplitude をクリックします。表示するチャンネルを選択するためにはラジオボタンを使用します。このタブでは各チャンネルで Positive と Negative を決定するために使用する threshold を調整するオプションも使用できます。
1 ウェルを表示させる場合、以下のオプションの一つを用いて threshold を変更します；

単一ウェル用 threshold ツールを使用します。アサインされた threshold が水平のピンク線で現れます。
または下記の方法を選択できます。
・ Set Threshold フィールドに threshold の数値を直接入力します。
複数ウェルを表示させる場合は、以下のように threshold を変更します；
・・ 1 ウェルの threshold を変更するには 単一ウェル用 threshold ツールを使用します。

処理済みデータの黄色の垂直線は各ウェルでの開始と終了のドロップレットデータを示しており、水平のピンク線がアサインされた threshold として表示されます。
・ 選択しているすべてのウェルで threshold を変更するには マルチウェル用 threshold
ツールを使用します（プロットにピンク線として表示されます）。
・ 単一またはマルチウェルにおいて手動で threshold の値を設定する場合は、プロットの下にある Set Threshold フィールドに値を入力し、Set Threshold をクリックする
か Enter キーを押します。
Auto Analyze をクリックすることで、自動での threshold 設定と算定に戻すことができます。Threshold 調整は 2D Amplitude クラスタリングプロットでも同様です（Section 3.3.2
参照）。
10

ウェルでのチャンネルデータ表示：
ウェルでのチャンネルデータ表示：1 ウェルの両方のチャンネルからの処理済みデータを示しています。単一 threshold
ツールが適用されています（threshold はピンク線で示され、値が Set Threshold フィールドに表示されます）。
1

複数ウェルでのチャンネルデータ表示：
複数ウェルでのチャンネルデータ表示：複数ウェルの両方のチャンネルからの処理済みデータを示しています。マルチ
ウェル用 threshold ツールが適用されています（threshold はピンク線で示され、値が Set Threshold フィールドに表示されます。また結果テーブルのステータスには Manual と表示されます）。

11

3.3.2

クラスタリングプロット（2DAmplitude）の表示）の表示
クラスタリングプロット（

チャンネル 1 vs. チャンネル 2 のクラスタリングプロットを表示させるために、2Dをクリックします。各検出チャンネルで、positive と negative にアサインするを手動または自動で調整するオプションが利用できます。
・ positive と negative のために自動的 threshold に戻すためには、Auto Analyze をクリックします。
・ 手動で threshold をアサインする（QS administrator（管理者）のみ）ためには：‒プロットの全体での領域分割でのアサインをするためには threshold の十字線を使用します。
‒
プロットの領域で分類するためには、楕円、矩形そして投げ縄の threshold 調整
ツールを使用します。ツールをクリックし、クラスターセレクターで領域のタイ
プをクリックします。プロット内で領域を選択して割り当てます。

Amplitude
threshold：クラスタリングプロットであるウェルからのデータをプレビューするためには、ウェルセレクター上
でそのウェル上にマウスを持っていきます。
Tips

クラスタリングプロットの表示：
クラスタリングプロットの表示：クラスタリングプロットで使用可能な threshold 調整オプションを示しています。
の値はプロットのピンク線で示されます。

threshold12

3.3.3 濃度データ（Concentration）の表示）の表示
濃度データ（各ターゲットの濃度データはプレートマップでのウェル内に表示され、結果テーブルに表として示されます。濃度プロットでデータを視覚化するためには Concentration をクリックします。表示させたいチャンネルを選択するにはラジオボタンを使用します。エラーバー
はトータルエラーまたはポアソン信頼区間 95%を反映します。これらのデータは他のスプ
レッドシートアプリケーション（例えば、Microsoft Excel）で解析するために出力することができます。

濃度データの表示：
濃度データの表示：絶対定量からのデータを示しています。プロットのポイント上にマウスを持っていくと、ウェル情報、濃度、ポアソン信頼区間がホバー表示されます。塗りつぶしのデータポイントはマージされたデータを示します；
中抜きのデータポイントは一つのウェルからのデータを示します。

Copies/20μL Well の列は ddPCR サンプルでの初期サンプルの全体量を示します。この値は、産物の濃度（μL あたりのコピー数）に 20μl（ドロップレットを作る ddPCR 反応溶液）をかけています。この値はマージされたウェルデータでは表示されません。
この列はまた*.csv ファイルに出力されます。元の濃度の列と計算は変化せずに残ります。

3.3.4 コピー数データ（Copy
Number）の表示）の表示
コピー数データ（

選択したウェル/サンプルのコピー数を表示させるには Copy Number をクリックします。

コピー数データの表示：
コピー数データの表示：プロットのポイント上にマウスを持っていくと、ウェル情報、濃度、ポアソン信頼区間がホバー表示されます。塗りつぶしデータポイント（示されていない）はマージされたデータを示します；中抜きのデータポイ
ント（示されている）は一つのウェルからのデータを示します。
13

3.3.5 比率データ（Ratio）の表示）の表示
比率データ（

選択したウェル/サンプルの比率データを表示させるには Ratio をクリックします。ラジオ
ボタンを使って、Ratio（unknown : reference）または Fractional Abundance（サンプルの存在%）のプロットを選択します；Inverse を選択すると、逆数が適用されます。

比率データの表示：
比率データの表示：絶対定量からのデータを示しています。プロットのポイントにマウスを持っていくと、ウェル情報、
濃度、ポアソン信頼区間がホバー表示されます。y log を選択すると、Y 軸がログスケールに変換されます。塗りつぶし
データポイント（示されていない）はマージされたデータを示しています；中抜きのデータポイント（示されている）
は一つのウェルからのデータを示します。
3.3.6 イベント（Events）の表示
）の表示
イベント（

選択したウェル/サンプルの計測されたドロップレットイベントの数を表示させるには Eventsをクリックします。ラジオボタンを使って、表示させるチャンネルを選択します。positive、
negative、total もしくはこれらの組み合わせのドロップレットカウントを表示します。

イベントデータの表示：
イベントデータの表示：コピー数多型実験からのデータを示しています。

14

Appendix A Ordering Information

カタログ番号
1864001JA

製品名
QX200 Droplet Digital PCR システム
＜構成内容＞QX200 Droplet Generator システム, QX200 Droplet Reader システム, ddPCR 専用解析
用ノート PC
1864001J1
QX200 Droplet Digital PCR システム C1000 Touch 付＜構成内容＞QX200 Droplet Generator システム, QX200 Droplet Reader システム, ddPCR 専用解析
用ノート PC, C1000 Touch サーマルサイクラー, 96Deep well リアクションモジュール
1864001J2
QX200 Droplet Digital PCR システム PX1 付＜構成内容＞QX200 Droplet Generator システム, QX200 Droplet Reader システム, ddPCR 専用解析
用ノート PC, PX1 PCR Plate Sealer, ddPCR 用ホイルヒートシール
1864001J3
QX200 Droplet Digital PCR システム C1000 Touch PX1 付＜構成内容＞QX200 Droplet Generator システム, QX200 Droplet Reader システム, ddPCR 専用解析
用ノート PC, C1000 Touch サーマルサイクラー, 96Deep well リアクションモジュール , PX1 PCR Plate
Sealer, ddPCR 用ホイルヒートシール
1864101JA
Automated Droplet Generator システム
1864002JA
QX200 Droplet Generator システム
1864003JA
QX200 Droplet Reader システム
1863007JA
ddPCR 専用解析用ノート PC
試薬・消耗品・その他関連製品
試薬・消耗品・その他関連製品
1863004
Droplet Reader オイル (1L ボトル×2 本、1,000 ウェル分)
1863005
Droplet Generator オイル for Probes (7ml ボトル×10 本、1,000 ウェル分)
1864005
Droplet Generator オイル for EvaGreen (7ml ボトル×2 本、200 ウェル分)
1864006
Droplet Generator オイル for EvaGreen (7ml ボトル×10 本、1,000 ウェル分)
1864007
DG8 カートリッジ&ガスケットセット (120 カートリッジ＆ガスケット、960 ウェル分)
1864008
DG8 カートリッジ (24 カートリッジ、192 ウェル分）
1863009
DG8 ガスケット (24 ガスケット、192 ウェル分)
1863051
DG8 カートリッジホルダー (1 個)
1863026
ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (1ml×2 本、200 ウェル分)
1863010ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (1ml×5 本、500 ウェル分)
1863027
ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (5ml×5 本、2,500 ウェル分)
1863028ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (5ml×10 本、5,000 ウェル分)
1863023ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (No dUTP) (1ml×2 本、200 ウェル分)
1863024ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (No dUTP) (1ml×5 本、500 ウェル分)
1863025
ddPCR Ｓupermix for Ｐrobes (No dUTP) (5ml×5 本、2,500 ウェル分)
1863021
One-Step RT-ddPCR Kit for Probes (1ml×2 本、200 ウェル分)
1863022
One-Step RT-ddPCR Kit for Probes (1ml×5 本、500 ウェル分
1864033
ddPCR EvaGreen Supermix (1ml×2 本、200 ウェル分)
1864034
ddPCR EvaGreen Supermix (1ml×5 本、500 ウェル分)
1864035
ddPCR EvaGreen Supermix (5ml×5 本、2,500 ウェル分)
1864036
ddPCR EvaGreen Supermix (5ml×10 本、5,000 ウェル分)
1863052
ddPCR Buffer Control Kit for Probes (4.5ml ボトル×2 本、2×バッファ)
1864052
ddPCR Buffer Control Kit for EvaGreen (4.5ml ボトル×2 本、2×バッファ)
1814000J1
PX1 PCR Plate Sealer
1814040
ddPCR 用 ホイルヒートシール (100 枚)
保守契約サービスプラン
SVCA1864001-CO QX200 Droplet Digital PCR Complete Support Plan
SVCEC1864001-01 QX200 Droplet Digital PCR Extended Cover Plan
SVCQ1864001-QQ QX200 Droplet Digital PCR IQOQ サービス

QX200TM Droplet DigitalTM PCR システム

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バイオ・ラッド ラボラトリーズ株式会社
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