巻頭言

Vol.22, No.2 号の発刊に当たって京都大学学術情報メディアセンター

牛島 省

本号では，京都大学学術情報メディアセンターにおいて実施された 2022 年度の共同研究報告について特集いたします．また，Top500 などが発表される HPC 分野の主要な国際会議である SC23の参加報告も紹介いたします．

2022 年度は，スーパーコンピュータシステムのリプレイスが行われる時期と重なり，7 月末以降

システム停止期間が数ヶ月続いたこと，また新システムの納入が遅れたため，年度末の約 3ヶ月間

は代替システム等での運用となり，例年とは異なる変則的な共同研究の実施とならざるを得なかったことをお詫び申し上げます．

新システムの稼働が遅れる見込みとなったため，2022 年度は，同システムを利用する「プログラム高度化共同研究」は実施しないこととしました．また，「大規模計算支援枠」は旧システムを利「若手・女性研究者
用して，4 月から 6 月の間に実施頂くことを想定して募集を行いました．一方，奨励枠」は，(1) 旧システムが稼働する年度当初から 7 月末まで，(2) 希望があれば年度後半（予定では 1 月から 3 月）に納入されるシステムでも継続利用可能，という期間設定で募集を行うこととしました．応募課題の採否は，スーパーコンピュータ共同研究企画委員会にて審査しました．

上記のような募集を行った結果，2022 年度は，1 件の「大規模計算支援枠」と，6 件の「若手・女性研究者奨励枠」が採択され，これらの共同研究が実施されました．

「大規模計算支援枠」は，一定規模の計算資源を 2 週間程度占有できる共同研究制度で，利用負担金は本センターが全額負担するものです．2022 年度は，地震前兆時に観測される地表面プラズ
マ波の特性を解明するために FDTD 法による大規模計算が行われました．旧システムの Laurel2(System B) の 64 ノードを利用する大規模計算を複数の地点を対象として行い，観測結果と計算結果の比較から，今後の精度向上により地震発生地点を予測できる可能性が示されました．

一方，「若手・女性研究者奨励枠」の応募資格は，(1) 40 歳未満の若手研究者 (学生を含む, 性別は問わない)，あるいは，(2) 女性研究者 (年齢は問わない)，としています．この「若手・女性研究者奨励枠」では，スーパーコンピュータを利用することで学術的にインパクトがある成果を創出できる課題に対して，計算機利用負担金の全額または一部を本センターが負担しています．さらに，「若手・女性研究者奨励枠」は，JHPCN (学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点) の活動の一環と位置づけられており，優れた課題は，JHPCN の萌芽型共同研究へ推薦されます．推薦された課
題は，JHPCN シンポジウムにてポスター発表を行うことが可能となるなどの特典があります．

本号に掲載された 6 件の「若手・女性研究者奨励枠」の研究成果報告では，計算化学アプリケー

ション Gaussian を利用する光機能性分子や飛石型共役系高分子構造に関する研究，また，津波リ

スク評価のための教師なし学習の利用，惑星間空間磁場の不連続による磁気圏構造の変化，構造不安定な力学系を対象とする機械学習モデルの利用，といった広い分野にわたる研究が行われまし
た．JHPCN の萌芽型共同研究には 3 件の課題を推薦し，それらが採択されました．

なお，「プログラム高度化共同研究」では，京都大学のスーパーコンピュータをグループコース

または専用クラスタコースでご利用の研究者 (JHPCN および HPCI にて京都大学のスーパーコン

ピュータを利用する研究者も含む) を対象に，プログラムの制御構造・データ構造の改良による性

能チューニングや並列化手法の改良，問題分割・負荷分散方式などの改良による大規模計算プログ
ラムの高度化・高性能化などを支援しています．

2024 年度は，新スーパーコンピュータシステムを利用する上記すべての研究支援事業を実施する

予定ですのでご期待下さい．本共同研究制度への応募方法や申込み時期等の詳細につきましては，

http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/comp/support/kyodo/ にてご確認ください．
今後も皆様の研究，教育にご活用いただけるようにセンター教職員も尽力していきますので，ご利用・ご支援のほど、よろしくお願い申し上げます．

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 1

会議参加報告SC23 参加報告
深沢 圭一郎京都大学学術情報メディアセンター

1 SC とはSC とは、The International Conference for High
Performance Computing, Networking, Storage,
and Analysis が正式名称である世界最大の HPC の会議です。年二回発表されるスパコンランキングである Top500 もここで発表されます。
今回は 2023 年

京大ブースの場所
RISTの隣
理研も近く

11 月 12 日―17 日にアメリカのデンバーで開催されました。SC は 1998 年に始まり今回で 35 年目となりました[1]。今年の参加人数は、過去最大で14,295 人となり、新型コロナウイルスによる影響か
ら復活した回となりました[2]。また、この会議では研究発表だけで無く、HPC 関連企業や大学などの研究期間がブースを出展するエキシビションがあります。今回のブースの出展数は 438 となり、こちらも過去最高の数字となりました[2]。

2 京都大学ブース
京都大学学術情報メディアセンターでは、これま
でにこのエキシビションにブースを出展してきて図 1 SC23 エキシビジョンフロアマップっていたこともあり、例年より多くの訪問者がありました。

おり、今回も小さいながらブースの出展を行いまし京都大学のブースサイズは例年10ft×20ft となった。日本の学術機関からのブースは大学のスーパーており、最低ブースサイズ（10ft×10ft）の 2 倍でコンピュータセンターや理研や JAXA、JAMSTECなどの大きなスーパーコンピュータを持つ研究所、いくつかの大学がブースを出しています。
ブースを出す場合、前年度の SC 期間中に（SC23のブース出展であれば、SC22 期間中）どこにブースを出展するのかの Selection が行われます。これは過去に出展したブースの広さから積算計算されす。このようにそこまで大きくないため、ほとんど手作りブースデザインとなっています。図 2 に実際のブースの様子を載せていますが、京都大学学術情
報メディアセンターの新しいスパコンの紹介、HPCに関連する研究紹介、JHPCN や HPCI の紹介をパネルで行い、ディスプレイでセンターの研究紹介を行っています。

るポイントによって選ぶ順番が決まるシステムとなっており、企業に比べてブースサイズの小さい大学はなかなか良い立地が選べません。今回は比較的良い場所にブースを出すことができ（図 1 参照）、
HPCI 資源提供機関のスタンプラリーを RIST が行

2 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

3 新システムの Top500 ランク
Top500 は HPL ベンチマークによるスパコンの性能ランキングです。ベンチマークの性質上、スパ図 2 京都大学ブース
コンの演算性能が評価されます。SC23 で報告されの共同研究成果も展示可能ですので、ご興味があれるランキングに登録するには 2023 年 10 月 22 日まば深沢までお問い合わせください。また、最先端のでに、測定結果を報告する必要があり、2023 年 10

HPC の研究やスパコンに関連する機器に触れるこ

月から稼働を開始した新スパコンのメインシステとができますので、ご参加をおすすめします。

ムである Camphor3 の登録を行いました。
Top500 は SC23 期間中の 11 月 13 日
（現地時間）

参考文献に発表があり、Camphor3 は 114 位（国内 12 位）となりました[3]。新スパコンに関しては、この広報[1]

history/

誌でも紹介してきましたが、半導体不足や円安の影響を強く受け、システムのノード数が想定より少な

https://supercomputing.org/conference-[2]

https://sc23.supercomputing.org/2023/12/a

くなっています。その結果、理論性能では-record-breaking-confluence-of-innovation-

Camphor3 は Camphor2 から約 1.4 倍の向上とな

inspiration-and-inclusivity-at-sc23/っていました。一方で Top500 に登録された性能はCamphor2 から 2.2 倍の向上となっています。HPL[3]https://www.top500.org/lists/top500/2023/1
1/

ベンチマークはメモリバンドが性能にほとんど影響を与えないため、ここでの性能向上分はCamphor2 の Xeon Phi KNL の演算性能の活用自体が難しいことに依っています。ユーザの皆さんが利用されるアプリは高いメモリバンドによる性能向上も期待されるため、3－4 倍の性能向上を感じる
ことができると思います。

4 SC24
次回の SC24 は、アメリカのアトランタで開催されます。京都大学学術情報メディアセンターでは、
SC24 でもブースを出展します。図 2 の写真からも分かりますが、ブースに空きがありますので次回は10ft×10ft で SC23 と同様の展示を行う予定です。
スパコンユーザの皆さんの研究成果やセンターと京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 3スーパーコンピュータ共同研究制度（若手・女性研究者奨励枠）研究報告

高効率有機系太陽電池の実現に向けた光機能性分子の構造と電子物性の相関解明
東野 智洋
京都大学大学院工学研究科 分子工学専攻

1 緒言

酸化ニッケルと増感色素間での電荷再結合を抑制
でき、長寿命の電荷分離状態が生成するために太n 型半導体である酸化チタン電極を用いた n 型

陽電池性能が向上することが知られている[3]。ま色素増感太陽電池は、エネルギー変換効率 PCE =た、
ポルフィリン−フラーレン連結分子では長寿命

10〜15%という高い値が報告されており、次世代の電荷分離状態を実現できることから[4]、フラーのエネルギー源として期待されている[1]。また最レンをアクセプターとして用いた増感色素では電近では、タンデム型色素増感太陽電池が注目を集

荷分離状態の長寿命化と p 型色素増感太陽電池性

めるようになってきており、p 型半導体である酸能の向上が可能であると期待した。

化ニッケル電極を用いた p 型色素増感太陽電池がそこで本研究では、ドナー–π–アクセプター

タンデム太陽電池の構成要素として研究されてい（D-π-A）構造を有するポルフィリン色素 ZnP2

る 。しかし p 型色素増感太陽電池のエネルギー

およびポルフィリン−フラーレン連結分子 ZnPC2

変換効率は未だ2%程度と低い値に留まっており、を設計・合成し、これらの色素を用いた p 型色素

p 型色素増感太陽電池においては、高性能な色素増感太陽電池の性能評価を行った。
（Figure 1）。

[2]の開発が望まれている。
一方、増感色素のアクセプター部位として高い2 結果と考察

電子受容性を有する骨格を導入することにより、

2.1 ポルフィリン色素の物性と太陽電池性
能評価
MeOOC

C8H17ON

MeOOC

OC8H17
NN

Zn

ポルフィリン色素 ZnP2 およびポルフィリン−

NO

フラーレン連結分子 ZnPC2 を吸着させた酸化ニ

NNH

ッケル電極の吸収スペクトル測定を行ったところ、

C8H17O

これら 2 つの色素間にはほとんど差がなく、フラOC8H17
ZnP2

MeOOC

C8H17ON

MeOOC

C8H17Oーレン骨格の有無は光捕集特性に影響を与えないことがわかった。次に、p 型色素増感太陽電池を

OC8H17
N
N

Zn

作製しセル性能評価を行ったところ、ZnPC2 を用

N

O

N

NH

N

いたセルでのエネルギー変換効率（0.012%）はZnP2 を用いた場合（0.004%）よりも高くなった（Figure 2a）。このエネルギー変換効率の向上は主OC8H17
ZnPC2

Figure 1. Molecular structures of porphyrin andporphyrin-fullerene dyes.

4 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto Universityに短絡電流密度の向上によるものといえ、実際に外部量子効率（IPCE）も ZnPC2 を用いたセルのほうが大きくなっていることがわかった（Figure2b）。
どちらの色素もほぼ同じ光捕集特性を有していることから、外部量子効率の向上は電荷再結合

HOMO のエネルギー準位は ZnP2 と ZnPC2 でほを抑制できたためと考えられる。また、過渡吸収

ぼ同じであり、フラーレン骨格の導入によってポ測定によりフラーレン骨格の導入により長寿命のルフィリン色素部分の電子構造にはほとんど変化

電荷分離状態が生成していることを確認した。すがないことがわかった。したがって、ポルフィリ

なわち、フラーレン骨格の導入により長寿命の電ン色素による光吸収・酸化ニッケルからの電子移

荷分離状態を実現し、電荷再結合を抑制できたこ

動過程に影響を与えることなく、フラーレン骨格とが、エネルギー変換効率の向上に繋がったといの導入によって長寿命の電荷分離状態を実現した

える。したがって、ポルフィリン色素にフラーレことが、太陽電池性能の向上に繋がったと考えら

ン骨格を導入するという分子設計指針により、pれる。このように、本計算結果は実験結果の理論

型色素増感太陽電池のさらなる性能向上が期待で的解釈の一助となった点で意義がある。

きる。
(a)

(a)

(b)

LUMO

–2.44 eV

–3.02eV–4.90 eV

–4.93 eV

HOMO

(b)

Figure 3. Selected Kohn−Sham orbitals for (a) ZnP2 and(b) ZnPC2 obtained by DFT calculations with the
B3LYP/6-31G(d) level.

3 参考文献Figure 2. (a) Photocurrent-voltage characteristics and(b) photocurrent action spectra of p-DSSCs with
ZnPC2 (blue) and ZnP2 (red).

2.2 理論計算
ポルフィリン色素の最安定化構造およびそのフロンティア軌道の電子構造について知見を得るた
めに、Gaussian09 プログラムを用いて密度汎関数
法（DFT）による理論計算を行った（B3LYP/
6-31G(d)）
。ZnP2 では HOMO/LUMO のどちらもポルフィリン骨格に分布しているが、ZnPC2 では[1] Y. Ren, D. Zhang, J. Suo, Y. Cao, F. T.
Eickemeyer, N. Vlachopoulos, S. M. Zakeeruddin,
A. Hagfeldt, M. Grätzel, Nature 2023, 613, 60.
[2] I. R. Perera, T. Daeneke, S. Makuta, Z. Yu, Y.
Tachibana, A. Mishra, P. Bäuerle, C. A. Ohlin, U.
Bach, L. Spiccia, Angew. Chem., Int. Ed. 2015, 54,3758.
[3] L. Zhang, L. Favereau, Y. Farre, A. Maufroy, Y.
Pellegrin, E. Blart, M. Hissler, D. Jacquemin, F.
Odobel and L. Hammarström, RSC Adv. 2016, 6,77184.
[4] H. Imahori, Y. Kobori and H. Kaji, Accounts
Mater. Res. 2021, 2, 501.

HOMO がポルフィリン骨格に分布している一方、
LUMO はフラーレン骨格に局在化していた。また、

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 5計算化学的手法による飛石型共役系高分子の電子輸送能力の解明
北山大介**関西大学化学生命工学部

未許諾のため本文は非公開

6 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University未許諾のため本文は非公開

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 7

津波シミュレーションと教師なし学習の融合によるリアルタイム最尤津波リスク評価手法の開発
野村怜佳 ∗∗

東北大学災害科学国際研究所

未許諾のため本文は非公開

8 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University未許諾のため本文は非公開

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 9

大規模数値計算による惑星間空間磁場の南北不連続面に伴う磁気圏構造変化の解明

橋本 翼
九州大学大学院理学府地球惑星科学専攻

1 はじめに

コード、REProduce Plasma Universe (REPPU)
コード(Tanaka, 2015[3])を用いた。磁気圏は電磁

地球には常時、太陽から惑星間空間磁場

流体力学(MHD : MagnetoHydroDynamics)基本（Interplanetary Magnetic Field; IMF）が吹き方程式で計算され、解像度は約 300×300×300、続けており、地球の磁場と相互作用を起こしてい物理量は 50 種類の計算を行っている。さらに、る。その相互作用の一つに磁力線つなぎ代わり現

ハイブリッド並列を組み高速化を図りながら、ス象（リコネクション）があり、これにより太陽のーパーコンピュータを用い計算を行った。

磁場と地球の磁場が接続されることで、地球に太陽のエネルギーが流れ始める。電離圏や磁気圏で3 研究結果の諸現象はリコネクションを契機に発動するため、IMF の状況に応じたリコネクションの発生有無

リコネクションにより発動する磁気圏への影響

やそれにともなうプラズマ構造変化の理解は、この定量的調査について、リコネクションが発生すの分野の基盤となり学術の進展に貢献する。

ると、磁力線が大きく曲げられ曲率を持つため、

 本研究は、特に IMF の向きが北向きから南向

それが元に戻ろうとするときに発生するアンペー

きに不連続に変化した際の状況をシミュレーショ

ル力（磁気張力部分）がプラズマを加速させる。

ンで再現している。先行研究では、この不連続面

シミュレーションでは、この磁気張力により加速がバウショックに到達したとき、IMF 同士でリコされた、周囲より 25km/s ほど早いプラズマを再ネクションを起こすことが分かっており、磁気圏

現することができた ( 図１) 。また人工衛星の磁場構造やプラズマ分布を大きく変化させるこ(GEOTAIL)の観測データでも、IMF が北向きかとを明らかにしている（Maynard et al.,2002[1];ら南向きに不連続変化した際に、75km/s ほど加Samsonov et al., 2018[2]）。そこで現状の課題と速されているプラズマを確認できた（図２）。これしては、IMF 同士のリコネクションにより発動すらの結果から、シミュレーションで再現された

る磁気圏への影響を定量的調査すると同時に、そIMF 不連続面におけるリコネクションは現実での状況時の観測データとシミュレーション結果をも発生していることを明らかにした。

比較することにより、IMF 同士のリコネクション

 また本研究では、IMF リコネクションの発生頻が現実的に発生している事を検証する必要がある。

度が少ないことも明らかにした。
上記の結果より、数値シミュレーションは地球周辺の宇宙環境

IMF 同士のリコネクションでは数十 km/s ほどの（太陽風―磁気圏―電離圏）を複合的に計算およ速度上昇が確認されたが、この値は IMF と地球び再現が可能であるが、各物理量をグリッドごと

磁力線のリコネクションに比べると 1-2 オーダーに短いタイムスケールで計算するためには大規模小さい値である。これは IMF リコネクションがな計算処理能力が必要になる。そのため、スーパ

発生する磁気シース領域の磁場強度が弱いことにーコンピュータを利用し研究を実施した。

由来し、磁力線に垂直なプラズマ速度をシミュレ

2 研究手法ーションで再現すると、この IMF リコネクショ
ンが間欠的に生じていることが明らかになった（図３）。

本研究では、非構造格子 3 次元シミュレーション

10 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

4 おわりに本研究では、IMF が北向きから南向きに不連続に変化したときに生じる IMF リコネクションについて、大きく二つのことを明らかにした。一つは、シミュレーション結果と人工衛星観測データの比較により、加速されたプラズマ速度が概ね一致し、現実的にも発生している現象だと示した。
また、
この IMF リコネクションは間欠的に生じ、シミュレーションでその構造を再現することができた。今後は、IMF リコネクションが電離圏などの地球に近い環境において発動する局所的ダイナ
図１：IMF 同士のリコネクションにともなうプ

ミクスの可視化を行い、宇宙環境（太陽風―磁気ラズマ加速の可視化。ラインは磁力線を示し、背圏―電離圏）の結合研究として発展させていく。

景の色は北向きのプラズマ速度を示す。

5 謝辞
 本研究の計算の一部は、京都大学のスーパーコ
ンピュータ共同研究制度（若手・女性奨励枠）に基づくものであり、ここに感謝の意を表す。

6 参考文献[1] Maynard, N. C., Sonnerup, B. U. Ö, Siscoe,
G. L., Weimer, D. R., Siebert, K. D., Erickson, G.
M., et al. (2002). Journal of Geophysical
図 2：2013 年 5 月 4 日、IMF の方向不連続が
GEOTAIL 衛星を通過した際の観測データ。
15:24:00-15:25:00 の間に磁場の方向が反転し、同時にプラズマ速度が上昇している。

Research, 107(A12), 1456.
[2] Samsonov, A.A., Sibeck, D.G., Dmitrieva,
N.P., Semenov, Geophys. Res. Lett. (2017)[3] Tanaka, T. (2015). In Auroral Dynamics andSpace Weather (pp. 177–190). Hoboken, NJ:
John Wiley & Sons, Inc.

図 3：ラインは磁力線を示し、背景の色は磁場に垂直で z 方向のプラズマ速度を示す。IMF リコ
ネクションにともなう間欠的な速度分布が現れている。

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 11

Coupled logistic map ʍՑҗӌࡌʇ҈উ઺π ٩‫∗ ڭ‬∗т‫ޗ‬੝ӌӌࡱٰ֖ϙ Ԗֻॲ෡߭োѠӌӌςච‫ۮ‬ʎࢬັ Ԇ߅ (ງ९੝ӌ‫ݗؼ‬ӌ೼) Ɛঀ෼ ոຒ߅ (φׄ੝ӌ‫ؼ‬ϼԛ๽ٰ֖Ѡ) ʇʍִடٰ֖ʊՂʄɮ
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3

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3.1

ঙଜ

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n+1 = (1 − ϵ)r1 Xn (1 − Xn ) + ϵr1 Yn (1 − Yn )Y
= (1 − ϵ)r Y (1 − Y ) + ϵr X (1 − X )
n+1

2 n

n

2

n

n

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1

2

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0.8ʉʪʧɥʉߢԨౙୈ˴˙˽ʱՑҗӌࡌʊʧʂʅ‫ۥ‬ય

Xn

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0.4
0.2

reservoir
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n

30

40

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[2] Z. Lu, J. Pathak, B. Hunt, M. Girvan, R. Brockett,and E. Ott, Chaos 27, (2017), 041102.

30

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3.2[3] K. Nakai, and Y. Saiki, Physical Review E 98,(2018), 023111:1-6.
[4] K. Nakai, and Y. Saiki, Discrete and Continuous
Dynamical Systems Series S, (2021), 14:1079-1092.
[5] M. Kobayashi, K. Nakai, Y. Saiki, and N. Tsutsumi, Physical Review E 104, (2021), 044215:1-7.
[6] E. Lorenz, and K. Emanuel. Journal of the Atmospheric Sciences 45, (1998), 399–414.
[7] Y. Saiki, H. Takahasi, and J. A. Yorke, Nonlinearity 34, (2021), 5744.

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[8] Y. Saiki, M. A. F. Sanjuán, and J. A. Yorke. Chaos
28, (2018), 103110.

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 13

計算化学的手法による含白金ポリウレタンのメカノクロミズム挙動の解明
曽川 洋光
関西大学化学生命工学部

1 緒言ーションならびに蛍光スペクトルシミュレーショ
ンを実施した。

白金 (Pt)は d 軌道や f 軌道に基づく多様な錯体形
成能，光電気特性を示す。近年，申請者らは反応性
アルコールを置換した(bpy)Pt-acetylide 錯体を合成し，これをモノマーに用いた含 Pt ポリウレタンを得ている 1)。
(bpy)Pt-acetylide 錯体 (1)および得られたポリ

H 3C
HO

OH
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N

N
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O

O

O
N

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N
H

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ウレタン (P1)はいずれもすり潰すことによって蛍光挙動が変化するメカノクロミック挙動を示した（図 1）。一方で，1 と P1 が示す吸収波長や発光波

11’Figure 2. Chemical structure of 1 and 1’

長には違いが観測されたことから，本申請研究では，これらの違いを計算化学的アプローチで明らかと3 結果・考察することを目的とした。
構造最適化された 1 および 1’の TD-DFT 計算より求められた理論 UV–vis 吸収スペクトルを，DMF 溶
媒中で測定した 1 と P1 の実測値とともに図 3 に示す。TD-DFT 計算より算出した理論スペクトルは実測の傾向と良く一致し，280 nm 付近に観測される吸収はほぼ同じであるにもかかわらず，400 nm 付近の
MLCT 遷移に由来する吸収領域では 1’ないし P1 (青線)が 1 (赤線)よりも長波長側に吸収を示した。図 4および図 5 には，1 および 1’の HOMO/LUMO を含
Figure 1. Mechanochromic behavior of 1 and P1.

2 実験

むいくつかの分子軌道を示す。1 では 400 nm 付近の吸収は HOMO–2 ® LUMO への遷移の寄与が強かった。1’では，これに加えて，HOMO–1 ® LUMO への遷移もその吸収に大きく寄与していた。いずれのメカノクロミック挙動を示すポリウレタンのモ

分子軌道においても1’のカルバメート部分への非局

ノマーとして用いる(bpy)Pt-acetylide 型ジオール (1)，

在化は見受けられなかったが，この置換基を導入す及び得られるポリウレタンのモデル化合物であるることにより，HOMO–1 で特にアセチリド配位子側(bpy)Pt-acetylide 型ジカルバーメート (1’)の DFT 計の非局在化が大きくなり，吸収が長波長側へシフト

算（ωB97XD/6-31G*）を実施した (図 2)。Pt 部分にしたものと考えられる。次いで，1 および 1’の理論

は lanl2z 関数を用いた。得られた最適化構造に対し，

蛍光スペクトルを比較したが，実測で観測されたよ

TD-DFT 計算を実施し，UV–vis スペクトルシミュレ

うな有意な蛍光色の差は見受けられなかった。

14 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

70

60

40

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50

30

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Figure 5. Shapes of LUMO, HOMO, HOMO–1,

10

HOMO–2, HOMO–3 and HOMO–4 of 1’ obtained by the

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200

300

400

Wavelength (nm)

500

600

Figure 3. UV–vis absorption spectra of 1 (red) and P1(blue) measured in DMF (c = 0.03 mM) (top), and 1 (red)DFT calculation [ωB97XD/6-31G* (C, H, N, O),
LANL2DZ (Pt)].

4 まとめと今後の展望

and 1’ (blue) simulated by the TD-DFT method (ωB97XD/6-31G* (H, C, N, O)-LANL2DZ (Pt)], nstates = 40,

本研究では，メカノクロミック挙動を示す(bpy)Pt-

plotted with peak half-width at half height = 0.2 eV using

acetylide 錯体とそれから得られるポリウレタンの構

GaussView 6 (bottom).

造と吸収/蛍光スペクトルの相関を計算科学的手法から検討した。UV–vis 吸収スペクトルについては，実測と良く一致した傾向が得られ，その分子軌道を比較することで，置換基の寄与に関する情報が得られた。今後，蛍光スペクトルについてもその汎関数/基底関数を検討することで，実測と一致した傾向のものが得られると期待される。これは，今後の分子設計の指針としても，大いに役立つと考えられる。

5 謝辞
本共同研究制度(若手奨励枠)を活用させて頂きましたことを，この場を借りて感謝致します。

6 引用文献Figure 4. Shapes of LUMO, HOMO, HOMO–1,
HOMO–2, HOMO–3 and HOMO–4 of 1 obtained by the

1. H. Sogawa, M. Abe, R. Shintani, T. Sotani, K. Tabaru,

DFT calculation [ωB97XD/6-31G* (C, H, N, O),

T. Watanabe, Y. Obora, F. Sanda, Polym. J. 2023, doi:

LANL2DZ (Pt)].

10.1038/s41428-023-00822-4.

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 15

スーパーコンピュータ共同研究制度（大規模計算支援枠）研究報告

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16 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto Universityਤ 3: Ԟึߴַࢁ௖ʢඪߴ 3189.5 mʣͷ 3 ࣍‫ݩ‬ղੳ(a) 2017 ೥ 1 ݄ 1 ೔͔Β 2022 ೥ 12 ݄ 31 ೔ͷ‫؍‬ଌ݁ՌϞσϧɻਫฏ໘಺࠲ඪ‫఺ݪ‬͸ࢁ௖ҐஔɻσΟδλϧ
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2.2

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京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 17

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2.3

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18 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

(a) ղੳ஍‫ܗ‬ͷਫฏஅ໘ਤ

ਤ 9: ࢳ‫ڕ‬઒ࢢ෇ۙͷ੢ւ‫؛‬๺෦ʢ೔ຊւଆʣͷւ‫؛‬ઢͷ 3 ࣍‫ ݩ‬FDTD ղੳ‫ܗ‬ঢ়ɻඪߴ h ͸ y ํ޲ɻ(b) ஍ද໘ిՙͷͳ͍৔߹͕‫ݦ‬ஶʹ‫ݱ‬ΕΔ͜ͱ͕ਪ࡯͞ΕΔɻͦͯ͠ɺࢳ‫ڕ‬઒ʹ͸ࢳ‫ڕ‬઒-੩Ԭߏ଄ઢ͕ଘࡏ͠ి೾͕ͦͷߏ଄ઢΛԣ
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͸੢͔Β౦΁఻ൖ͢Δਫฏภ೾ (Ex ) Ͱ͋Γɺిքͷਫฏ੒෼ (Ez ) Λϓϩοτ͍ͯ͠ΔɻΓ ͸ Drude ෼ࢄͷ‫ݮ‬ਰप೾਺Ͱ͋Δɻ

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194 m ͱͨ͠ɻࡐྉύϥϝʔλ͸্‫ه‬ͷྫͱಉ༷Ͱ
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ࢳ‫ڕ‬઒෇ۙͷ஍‫ܗ‬ͷղੳ݁ՌΛਤ 10 ʹࣔ͢ɻೖࣹ
೾͸ɺ࣮ࡍͷ৽ׁࢢͷ์ૹ‫͔ہ‬Βͷి೾Λ໛ٖͨ͠౦͔Β੢΁఻ൖ͢Δप೾਺ 70 MHz ͷਫฏภ೾ (ภ೾੒෼͸ Ex ) ͱ͠ɺx = 30 m ͔Β 370 mɺy = 112.4 m
͔Β 180.3 m ͷۣ‫ྖܗ‬Ҭ͔Βྭ‫ͨ͠ى‬ɻ͜ͷ஍Ҭ͸ಛʹ‫ٸ‬फ़ͳࢁ஍͕ଟ͘ෳࡶͳࣼ໘͕ւ
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ͳ͓ɺ͜ͷղੳྖҬͷ஍‫ʹܗ‬͸‫ٸ‬फ़ͳมԽ͕ෳ਺ଘ
ࡏ͠ɺਤͰ͸໌ྎͰͳ͍͕ɺೖࣹ೾ͷઌ಄෦͕ղੳ
ྖҬͷಛఆͷҐஔʹୡͨ͠ͱ͖ʹ਺஋తͳෆ҆ఆੑਤ 8: 2023 ೥ 5 ݄ 5 ೔ೳొ൒ౡ஍਒ʢM 6.5ʣલ‫ʹޙ‬෋ࢁɺീඌɺ൬ాͰ‫؍‬ଌ͞Εͨલஹ৴߸ൺֱɻ੕ҹΛҾ͖‫͕ͨͬ͋ͱ͜͢͜ى‬ɻ͜ͷ໰୊͸ Γ ஋ʹґଘ͠ͳ͔͕ͬͨࠓ‫ޙ‬ͷ‫ڀݚ‬՝୊Ͱ͋Δɻ

͸஍਒ൃੜ࣌ࠁɻ‫؍‬ଌͨ͠ి೾͸ਤ 5 ͷදࣔͱಉ༷ɻ

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 19

2.4

݁Ռ͓Αͼߟ࡯

Ҏ্ͷ‫؍‬ଌ݁Ռͱղੳ݁ՌͷൺֱʹΑΓɺ஍਒ʹ൐͏ి࣓೾ҟৗ఻ൖ‫ݱ‬৅Λి೾ͱిՙͷ૬‫ʹ༻࡞ޓ‬Αͬͯઆ໌Ͱ͖Δ͜ͱΛࣔͨ͠ɻ‫ݱ‬ஈ֊Ͱ͸ɺਫ਼ີͳి೾‫؍‬ଌʹΑͬͯൺֱతେ‫ن‬໛ͳ஍਒Λ਺࣌ؒલʹ༧ଌͰ͖Δ͜ͱ͕ࣔ͞Ε͍ͯΔɻ·ͨɺෳ਺ͷ஍఺ʹ͓͚Δి೾‫؍‬ଌ݁ՌΛൺֱ͢Δ͜ͱʹΑΓɺ਒‫ݯ‬ҐஔΛଠฏ༸ଆ͔೔ຊւଆ͔ͷఔ౓Ͱ൑ผՄೳͰ

(a) ղੳ஍‫ܗ‬ͷਫฏஅ໘ਤ

͋Δɻ͞Βʹɺ‫؍‬ଌ‫఺ڌ‬Λ૿ઃ͢Δ͜ͱʹΑΓ஍਒ͷൃੜ஍఺ΛΑΓਖ਼֬ʹ༧ଌ͢Δ͜ͱ͕ࠓ‫ޙ‬ͷॏཁ՝୊Ͱ͋Δɻࠓ‫ޙ‬ɺ͜ΕΒͷ‫ڀݚ‬੒Ռͱཧ࿦ʹ‫ͮج‬͖ి࣓೾‫؍‬ଌΛ࣮ࢪ͠ɺ਺ඦ km ͷൣғͷ஍֪‫׆‬ಈͷϞχλϦϯά͓Αͼ஍਒ͷ୹‫ظ‬༧ଌͷਫ਼౓Λ޲্
ͤ͞Δ͜ͱ͕ॏཁͰ͋Δɻ͜ͷΑ͏ͳ༧ଌ͸ɺ͜Ε
·Ͱࠃ಺֎ʹ͓͍ͯඇৗʹࠔ೉ͱ͞Ε͖͕ͯͨɺຊ
‫͚͓ʹڀݚ‬Δ෺ཧ‫ߏػ‬ͷղ໌ͱ‫؍‬ଌख๏ͷվྑɺ͓(b) ஍ද໘ిՙͳ͠ɺന௕ํ‫ܗ‬ͷྖҬΛԼਤͰ֦େ

Αͼେ‫ن‬໛਺஋γϛϡϨʔγϣϯʹΑΔ‫ʹূݕ‬ΑͬͯՊֶతͳཪ෇͚͕༩͑ΒΕͨɻͦͷࣾձత͓Αͼֶज़తՁ஋͸খ͘͞ͳ͍ͱߟ͑ΒΕΔɻ(c) ஍ද໘ిՙͳ͠ɺਤ (b) ͷന௕ํ‫ܗ‬෦Λ֦େͨ͠΋ͷࢀߟจ‫ݙ‬[1] Y. Kushida and R. Kushida, ”On a possibility of earthquake forecast by radio observation in the VHF band”,
Riken Rev., v.19, p.1-13, 1998.
[2] F. Freund, ”Charge generation and propagation in
igneous rocks”, J. of Geodynamics, v.33, p.543-570,
2002.
[3] M. Fujii, ”Theory of ground surface plasma wave associated with pre-earthquake electrical charges”, Radio
Science, v.48, pp.122-130, Mar. 2013.

(d) ஍ද໘ిՙ͋Γ Γ = 2π × 106 rad/s, ന௕ํ‫ܗ‬ྖҬΛԼਤͰ֦େ

[4] M. Fujii, ”Fundamental correction of Mie’s scattering
theory for the analysis of plasmonic resonance of ametal nanosphere”, Phys. Rev. A, vol.89, no.3, 033805,
Mar. 2014.
[5] M. Fujii, ”A new mode of radio wave diﬀraction via the terrestrial surface plasmon on mountain range”, Radio Science, v.51, pp.1396-1412,
doi:10.1002/2016RS006068, Sep. 2016.

(e) ஍ද໘ిՙ͋Γɺਤ (d) ͷന௕ํ‫ܗ‬෦Λ֦େͨ͠΋ͷਤ 10: ೔ຊւଆʢࢳ‫ڕ‬઒෇ۙʣͷ FDTD ղੳ݁Ռͷిք‫౓ڧ‬෼෍Λւൈ 112.4m ͷਫฏஅ໘্Ͱϓϩοτͨ݁͠Ռɻి࣓೾͸౦͔Βೖࣹͨ͠ਫฏภ೾ (Ex )Ͱ͋Γɺಉ͡ਫฏภ೾੒෼ (Ex ) Λϓϩοτͨ͠ɻ20 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University[6] L. Crane, ”Earthquakes could funnel radio waves
to dark zones in mountains”, American GeophysicalUnion Eos, 97, doi:10.1029/2016EO059987, Sep. 2016.
[7] M. Fujii, ”Detection of Electromagnetic Precursors ofEarthquakes Mediated by the Terrestrial Ground Surface Plasma Wave”, URSI GASS 2023, Aug. 19-26,
Sapporo, Japan, abstract ID.145, 2023.
[8] M. Fujii, ”Numerical Analysis of Polarized Anomalous
Electromagnetic Diﬀraction via the Ground Surface
Plasma Wave Associated with Earthquakes”, URSIGASS 2023, Aug. 19-26, Sapporo, Japan, abstract
ID.464, 2023.

サービスの記録・報告システム B 運転状況 ( 2023 年 4 月 ～ 2023 年 9 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時

サービス再開日時

システムダウン障害発生状況
保守時間[h]2023/06/13

9:00

2023/06/15

13:00

52.0

2023/08/07

9:00

2023/08/09

13:00

52.0

2023/09/18

6:30

2023/09/21

13:00

78.5

障害発生日時

ダウン時間[h]サービス再開日時なし

２）サービス状況
ジョブ

サービス
時間[h]

処理
件数

経過
時間[h]

4月

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

ノード
利用率

設備工事に伴う運転休止期間

5月

744.00126,366

224,171

28,254,645

10,787,952

360.3

51.3

%

6月

668.00163,392

206,541

28,381,143

10,878,110

323.0

57.2

%

7月

744.00

182,529

323,568

36,235,505

14,718,778

290.8

63.0

%

8月

692.00142,974

340,544

34,327,963

12,477,778

282.5

64.4

%

9月

641.50137,635

334,790

33,169,809

11,634,026

310.2

65.8

%

計

3,490

752,896

1,429,613

160,369,065

60,496,644

313.4

60.3

%

8月

9月

ノード利用率
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

4月

5月

6月

7月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 21

システム C 運転状況 ( 2023 年 4 月 ～ 2023 年 9 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時

サービス再開日時

システムダウン障害発生状況
保守時間[h]2023/06/13

9:00

2023/06/15

13:00

52.0

2023/08/07

9:00

2023/08/09

13:00

52.0

2023/09/18

6:30

2023/09/21

13:00

78.5

障害発生日時

ダウン時間[h]サービス再開日時なし

２）サービス状況
ジョブ

サービス
時間[h]

処理
件数

経過
時間[h]

4月

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

ノード
利用率

設備工事に伴う運転休止期間

5月

744.00751

13,848727,732

27,753

16.0

39.8

%

6月

668.001,490

13,106655,235

54,235

12.4

39.5

%

7月

744.001,199

16,739494,672

88,434

10.0

31.2

%

8月

692.001,218

10,268291,020

50,804

9.7

20.5

%

9月

641.50565

9,604

249,744

34,692

11.5

17.3

%

計

3,490

5,223

63,5662,418,403

255,918

11.9

29.7

%

8月

9月

ノード利用率
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

4月

5月

6月

7月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

22 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

システム G 運転状況 ( 2023 年 4 月 ～ 2023 年 9 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時

サービス再開日時

システムダウン障害発生状況
保守時間[h]2023/06/13

9:00

2023/06/15

13:00

52.0

2023/08/07

9:00

2023/08/09

13:00

52.0

2023/09/18

6:30

2023/09/21

13:00

78.5

障害発生日時

ダウン時間[h]サービス再開日時なし

２）サービス状況
ジョブ

サービス
時間[h]

処理
件数

経過
時間[h]

4月

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

ノード
利用率

設備工事に伴う運転休止期間

5月

744.00

1,896

6,733

297,807

25,247

16.0

13.9

%

6月

668.00732

1,971

106,235

4,998

11.4

11.3

%

7月

744.00787

11,346449,106

12,786

8.0

35.4

%

8月

692.00411

3,952

271,495

19,087

8.3

21.9

%

9月

641.50924

4,408

360,040

10,784

11.7

33.2

%

計

3,490

4,750

28,4091,484,683

72,902

11.1

23.1

%

8月

9月

ノード利用率
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

4月

5月

6月

7月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 23

センター利用による研究成果―2022 年度計算機利用結果報告書から―【1001 情報学基礎】

flanking residues： Journal of Autoimmunity,1.

Vol.140, pp.103094 -,Hidetomo Nabeshima, Tsubasa Fukiage, Yuto
Obitsu, Xiao-Nan Lu, Katsumi Inoue： DPS: A【4403 超高層物理学】

Framework for Deterministic Parallel SAT

6.

Solvers ：Sakata, R., Seki, K., Sakai, S., Terada, N.,
Shinagawa, H., & Tanaka, T.： Multispecies

The 13th Pragmatics of SAT

International Workshop, pp.1 - 15, 2022

MHD study of ion escape at ancient Mars:【4103 数学一般（含確率論・統計数学）】

Effects of an intrinsic magnetic field and solar

2.

N. Tsutsumi and K. Nakai and Y. Saiki ：XUV radiation ：Constructing differential equations using only

Research:a scalar time-series about continuous timeNo.e2022JA030427, 2022

chaotic dynamics： Chaos, Vol.32, pp.091101 -,

7.

Space

Physics,

Vol.127,

Ibuki Fukasawa, Yohei Miyake, Hideyuki Usui,
Koshiro2022

Journal of GeophysicalKusachi,Satoshiand【4305 原子・分子・量子エレクトロニクス・プラズ

Hirotsugu

マ】

Simulations on Interferometry Technique by a

3.

Single Spacecraft： URSI RADIO SCIENCE

Takuya Majima, Yuki Mizunami, Takahiro
Teramoto,

Hidetsugu

Tsuchida,

Saito ：

Fast Heavy-Ion-Induced Anion –Particle-in-Cell

LETTERS, Vol.4, 2022

ManabuMolecule Reactions on the Methanol Droplet

Kojima ：Kurita,【4601 物理化学】
8.

Chihiro Tabata, Hirohito Watanabe, Kenji

Surface： The Journal of Physical Chemistry

Shirasaki,

A, Vol.126, pp.8988 - 8996, 2022

Fukuda,Dexin

Ayaki
Li,

Sunaga,Tomoo

Takamitsu

Yamamura ：【4306 生物物理・化学物理】

Crystallographic and/or magnetic properties of4.

Aya Okuda, Masahiro Shimizu, Rintaro Inoue,

neutral and cationic uranium(IV) sandwiched

Reiko Urade, Masaaki Sugiyama： Efficientphthalocyanine complexes ：Multiple Domain Ligation for Proteins using

Molecular Structure, Vol.1277, pp.134870 -,Asparaginyl Endopeptidase by Selection of2023

Appropriate Ligation Sites Based on StericHindrance ：International
5.

Angewandte
Edition,ChemieVol.62,

-

No.1,

9.

Journal of

Kenneth G. Dyall, Paweł Tecmer, Ayaki
Sunaga ：Diffuse Basis Functions for

Relativistic s and d Block Gaussian Basis Sets：

pp.e202214412 -, 2022

Journal of Chemical Theory and Computation,

Youwei Lin, Shun Sakuraba, Chandirasegaran

Vol.19, No.1, pp.198 - 210, 2023

Massilamany, Jayagopala Reddy, Yoshimasa

10. Ayaki

Sunaga,ChihiroTabata,Tomoo

Tanaka, Sachiko Miyake, Takashi Yamamura：

Yamamura： Linearity and Chemical Bond ofHarnessing autoimmunity with dominant self-

UO2(2+) Revisited: A Comparison Study withpeptide: Modulating the sustainability of

UN2 and UE2(2+) (E = S, Se, and Te) Based on

tissue-preferential antigen-specific Tregs byRelativistic Calculations ： The Journal ofgoverning the binding stability via peptide

Physical Chemistry A, Vol.126, No.46, pp.8606

24 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

variation of combustion instability intensity in- 8617, 2022
11. Ayaki Sunaga, Maen Salman, Trond Saue： 4component
effective

relativistic

QED

Hamiltonian

potentials

for

with

molecular

calculations： The Journal of Chemical Physics,

a back step combustor using LES： Journal of
Thermal Science and Technology, Vol.15, No.3,
2020
19. Reo Kai, Abhishek Lakshman Pillai, Umair
Ahmed, Nilanjan Chakraborty, and Ryoichi

Vol.157, No.16, pp.164101 -, 2022
【5001 機械材料・材料力学】

Kurose ： Analysis of the Evolution of the

12. 土 木 材 料 ・ 施 工 ・ 建 設 マ ネ ジ メ ン ト ：Surface Density Function During Premixed V-

Peridynamics 理論と有限要素解析による複合

Shaped Flame–Wall Interaction in a Turbulent

材料積層板の衝撃損傷のモデル化： 第 13 回日

Channel Flow at Reτ = 395： Combustion

本複合材料会議（JCCM-13）講演論文集, 2022

Science and Technology, 2022

13. M. Nishikawa, R. Shinohara, A. Ito, N.

20. Abhishek Pillai, Reo Kai, Jing Li, Ryoichi

Matsuda and M. Hojo： Multiphysics Modeling

Kurose： Assessment of LES for Investigating

for CFRP Flammability Using FDS-FEM ：Spray Flame Impinging on a Wall under

US-Japan and Euro-Japan Joint Conference

Compression-Ignition

on Composite Materials（口頭発表）, 2022

Environment： International Conference on

14. Togo Mizuta, Masaaki Nishikawa, Masato

Liquid Atomization and Spray Systems

Nishi, Naoki Matsuda, Masaki Hojo： Coupled

Engine-like(ICLASS), 2021

structural thermal analysis of the defect

21. A. A. Zaidi, T. Tsuji & T. Tanaka： A newformation process during CFRP tape layup：

relation of drag force for high Stokes number

Proc. 37th Annual Technical Conference ofmonodisperse spheres by direct numerical

American Society for Composites(ASC), 2022

simulation ： Advanced Powder Technology,
Vol.25, pp.1860 - 1871, 2014

【5004 流体工学】
15. Jun Nagao, Abhishek Lakshman Pillai,

22. A. A. Zaidi, T. Tsuji & T. Tanaka ： Direct

Takeshi Shoji, Shigeru Tachibana, Takeshi

numerical simulation of finite sized particles

Yokomori, Ryoichi Kurose ：Numerical

settling for high Reynolds number and dilute

investigation of wall effects on combustion

suspension： International Journal of Heatnoise from a lean-premixed hydrogen/air low-and Fluid Flow, Vol.50, No., pp.330 - 341, 2014

swirl flame ：Physics of Fluids, Vol.35,

23. M. Kobayakawa, S. Miyai, T. Tsuji & T.
Tanaka ： Local dilation and compaction of

No.14109, 2023
16. Abhishek Lakshman Pillai, Shimpei Inoue,

granular materials induced by plate drag ：Takeshi Shoji, Shigeru Tachibana, Takeshi

PHYSICAL REVIEW E, Vol.98, pp.052907 -,Yokomori, Ryoichi Kurose： Investigation of2018

combustion noise generated by an open lean-

24. M. Kobayakawa, S. Miyai, T. Tsuji & T.

premixed H2/air low-swirl flame using the

Tanaka： Interaction between dry granularhybrid LES/APE-RF framework： Combustion

materials and an inclined plate (comparisonand Flame, Vol.245, No.112360, 2022

between large-scale DEM simulation and

17. Hiroki Muramatsu, Abhishek L. Pillai, Kenya
Kitada,Ryoichi

Kurose ：Numerical

three-dimensional wedge model)： Journal of
Terramechanics, Vol.90, No., pp.3 - 10, 2019

simulation of bi-component fuel droplet

25. Z. Jiang, T. Tsuji, K. Washino & T. Tanaka：

evaporation using Level Set method： Fuel,

Influence of model particle size and spatial

Vol.318, No.123331, 2022

resolution

18. Jun NAGAO, Abhishek L. PILLAI, Ryoichi
KUROSE ：Investigation of temporalincoarse-graining

DEM-CFDsimulation ： Advanced Powder Technology,
Vol.32, pp.3525 - 3539, 2021

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 25

26. T. Tsuji, A. Penn, T. Hattori, K. P. Pruessmann,electronic structures of oxygen vacancies in

C. R. Müller, J. Oshitani, K. Washino & T.

amorphous SnO2 from first principles andTanaka： Mechanism of anomalous sinking of

informatics： J. Phys. Chem. C, Vol.126, No.44,

an intruder in a granular packing close to

pp.18833 - 18838, 2022

incipient fluidization ：PhysicalReview

Hiramatsu, and F. Oba： Defect formation and

Fluids, Vol.6, pp.064305 -, 2021
27. Z. Jiang, T. Tsuji, J. Oshitani, K. Washino & T.
Tanaka ：35. T. Gake, Y. Kumagai, A. Takahashi, H.
carriercompensationinlayeredReverse to forward density

oxychalcogenide La2CdO2Se2: An insightsegregation depending on gas inflow velocity infrom first principles ： J. Mater. Chem. C,

vibrated fluidized beds： Physics of Fluids,

Vol.10, pp.16828 - 16837, 2022

Vol.35, pp.033313 -, 2023

36. 我 毛 智 哉 , 熊 谷 悠 , 高 橋 亮 , 大 場 史 康 ：【5102 電子・電気材料工学】

La2CdO2Se2 中の固有点欠陥に関する理論的検28. Kosuke O. Hara ：efficiency

BaSi2

simulation

andDesigning limiting-

solar

cells

by

device討： 日本セラミックス協会第 35 回秋季シンポジウム, 2022

material

37. 大場史康： 第一原理計算による窒化物･酸化物

screening： Solar Energy, Vol.245, pp.136 - 145,

半導体の設計と探索： 日本金属学会 2022 年秋

2022

期講演大会, 2022

computational

38. 大場史康： 第一原理計算による窒化物･酸化物【5104 通信・ネットワーク工学】
29. Y. Takano, H. -J. Su, Y. Shiraishi and M. Morii：
A Cache-Aided Power Optimization Techniquefor Adaptive Secure Transmission Systems：
IEEE PIMRC 2022, 2022

半導体の設計と新材料開拓： 第 48 回ニューセ
ラミックスセミナー, 2023
39. 大場史康： 計算科学に立脚した窒化物･酸化物
半導体の設計･探索： 日本セラミックス協会

30. Y. -T. Hou, H. -J. Su and Y. Takano： Blind2023 年年会, 2023

Channel Estimation for Millimeter Wave

40. Y. Mochizuki, H.-J. Sung, T. Gake, and F. Oba：

Uplink Systems with Unknown Number ofChemical trends of surface reconstruction andUsers： IEEE PIMRC 2022, 2022

band positions of nonmetallic perovskite oxides

31. Y. -C. Liu, H. -J. Su and Y. Takano： Enhanced
Multiple Angles-of-Arrival Detection Using
Non-uniform

Sub-connectioninHybridBeamforming Systems： IEEE GLOBECOM
Workshop 2022, 2023
【5201 土木材料・施工・建設マネジメント】
32. 小沢拓弥，田中良樹，古賀裕久，上仙靖： 道路
橋 コンクリート床版の上面補修界面における開口挙動： コンクリート工学年次論文集, Vol.44,
No.2, pp.295 - 300, 2022
【5202 構造工学・地震工学・維持管理工学】
33. Naotoshi Yasuda ： Hammering sound of
concrete with defects and spalling risk ：TunnellingandUndergroundSpace

Technology, Vol.131, pp.104789 - 104789, 2023
【5402 無機材料・物性】
34. S. Kiyohara, D. Mora-Fonz, A. Shluger, Y.
Kumagai, and F. Oba： Unique atomic and26 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

from first principles： Chem. Mater., Vol.35,
No.5, pp.2047 - 2057, 2023

資料

別表１

スーパーコンピュータシステム
区分

提供サービス
利用負担額

コース
エントリ

パーソナル

グループ

タイプ

セット

経過時間 ストレージ
無料
（TB)
（時間）
利用者数

-

基本

12,600 円/年

B

共有

最大0.5ノード相当((112コア、512GBメモリ)×0.5)

1

0.2

-

基本

100,000 円/年

A

共有

最大2ノード相当((112コア、128GB高速メモリ)×2)

168

8.0

-

タイプB

基本

100,000 円/年

B

共有

最大2ノード相当((112コア、512GBメモリ)×2)

168

8.0

-

タイプC

基本

100,000 円/年

C

共有

最大1ノード相当((112コア、2048GBメモリ)×1)

168

8.0

-

タイプG

基本

100,000 円/年

G

共有

最大1GPU相当((16コア、128GBメモリ＋1GPU)×1)

168

8.0

-

準々優先

1ノード((112コア、128GB高速メモリ)×1)

168

6.4

2

優先

1ノード((112コア、128GB高速メモリ)×1)

336

16.0

4

タイプA0

最小/追加

110,000 円/年

タイプA1

最小/追加

275,000 円/年

A

タイプA2

最小/追加

330,000 円/年

準優先

2ノード((112コア、128GB高速メモリ)×2)

336

19.2

6

タイプA3

最小/追加

412,500 円/年

占有

1ノード((112コア、128GB高速メモリ)×1)

336

16.0

4

タイプB0

最小/追加

120,000 円/年

準々優先

1ノード((112コア、512GBメモリ)×1)

168

6.4

2

タイプB1

最小/追加

300,000 円/年

優先

1ノード((112コア、512GBメモリ)×1)

336

16.0

4

タイプB2

最小/追加

360,000 円/年

準優先

2ノード((112コア、512GBメモリ)×2)

336

19.2

6

タイプB3

最小/追加

450,000 円/年

占有

1ノード((112コア、512GBメモリ)×1)

336

16.0

4

タイプC0

最小/追加

132.000 円/年

準々優先

1ノード((112コア、2048GBメモリ)×1)

168

6.4

2

タイプC1

最小/追加

330,000 円/年

優先

1ノード((112コア、2048GBメモリ)×1)

336

16.0

4

タイプG0

最小/追加

86,000 円/年

タイプG1

最小/追加

430,000 円/年

大規模ジョブ
タイプB

ストレージ

システム資源タイプAタイプA専用クラスタシステム バッチ

最小110,000 円/週(7日）

追加単位

27,500 円/週(7日）

最小

120,000 円/週(7日）

追加単位

30,000 円/週(7日）

B

C
G

準々優先

1GPU((16コア、128GBメモリ＋1GPU)×1)

168

6.4

2

優先

2GPU((16コア、128GBメモリ＋1GPU)×2)

336

32.0

8

A

占有

B

占有

8ノード((112コア、128GB高速メモリ)×8)
2ノード((112コア、128GB高速メモリ)×2)
8ノード((112コア、512GBメモリ)×8)
2ノード((112コア、512GBメモリ)×2)

最小900,000 円/年

追加単位

450,000 円/年

大容量ストレージ

10,000 円/年

高速ストレージ

10,000 円/年

高速ストレージ容量2TBの追加につきネットワークストレージ

5,000 円/年

ネットワークストレージ容量1TBの追加につき20,000 円/年

可視化ソフトおよびプリポストウェアの1ライセンスにつき

タイプB

ライセンスサービスB-

2ノード((112コア、512GBメモリ)×2)
1ノード((112コア、512GBメモリ)×1)

168
168
-

-

-

-

-

-

-

-

-

32.0

8

16.0

4

大容量ストレージ容量10TBの追加につき

備考
1． 利用負担額は、年度単位（大規模ジョブコースは週単位）で算定している。また、総額表示である。
パーソナルコース、グループコース又は専用クラスタコースを年度途中から利用を開始する場合及び年度途中で利用を終了する場合の利用負担額は、上記表中の利用負担額を12で除した後、利用月数を乗じて算出するものとし、100円未満に端数が出た場合は、10円単位を四捨五入するものとする。
なお、月途中から利用を開始する場合及び月途中で利用を終了する場合は、それぞれ1月の利用とする。
2． 大型計算機システムの全ての利用者は、上記表のサービスの他、次のサービスを受けることができる。
1） 大判プリンタサービス
2） その他、大型計算機システムが提供するサービス、機器の利用
3． 上記表の大規模ジョブコース、ストレージコース、ライセンスサービスの申請には、スーパーコンピュータシステムの利用者であることが必要である。
4． 上記表のバッチの種類は、次のとおりとする。
「共有」： 当該カテゴリのユーザ間で一定の計算資源を共有するベストエフォートのスケジューリングを行う。
「準々優先」： 定常稼働状況において記載値の計算資源が確保されるようにベストエフォートのスケジューリングを行う。
「準優先」： 定常稼働状況において記載値（以上）の計算資源が確保されるように準優先スケジューリングを行う。
また、稼働状況によらず記載値の1/4の計算資源が確保されることを保証する。
「優先」： 定常稼働状況において記載値（以上）の計算資源が確保されるように優先スケジューリングを行う。
また、稼働状況によらず記載値の1/2の計算資源が確保されることを保証する。
「占有」： 稼働状況によらず記載値の計算資源が確保されることを保証する。
5． システム障害、電力不足又は電気代の高騰に伴う節電、天災等の要因により、定常稼働が困難な状況においては、
上記表に規定するバッチにかかわらず、ベストエフォートのスケジューリングを行う。
6． ストレージ容量はバックアップ領域（最大で総容量の1/2）を含む。
7． グループコース及び専用クラスタコースの利用者番号は、利用者あたり年額5,000円を負担することで追加できる。
8 ．機関・部局定額制度
他機関又は学内における部局（『国立大学法人京都大学の組織に関する規程』第3章第2節から第11節で定める組織をいう。）の組織が、その組織単位でグループコースサービスを利用申請する場合の利用負担額は、別表１に規定する1.5倍の額とする。
なお、利用負担額が年額150万円未満の場合は100人、年額150万円を超える場合は、150万円毎に100人までの利用者を認める。
ストレージは、1.5倍の容量とする。
9 ．スパコン連携サービス
学術情報メディアセンターのスーパーコンピュータシステムと密な連携により、学内における部局の組織が計算サーバ等を設置する場
下記の負担額を支払うものとする。
区分
スパコン連携サービス

冷却方式

利用負担額

水冷

23,200 円/月

水冷冷却方式の計算サーバ等の定格電力 1kWにつき利用負担額算定単位

空冷

27.500 円/月

空冷冷却方式の計算サーバ等の定格電力 1kWにつき

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 27

別表２

アカデミッククラウドシステム

区

分

仮想サーバ
ホスティングサービス

利用負担額

単

位

38,400円／年 1仮想サーバにつき

備考
1．利用負担額は、総額表示である。
2．上記表の仮想サーバホスティングサービスを利用するには、
スーパーコンピュータシステムの利用者であること。
3．1仮想サーバに割当てるシステム資源は、CPU：2コア、メモリ：4GB、ストレージ：100GBである。
4．仮想サーバホスティングサービスにおいて、下記の負担額を支払うことによりCPU、メモリ、
ストレージを増量することができる。
区

分

CPU増量
メモリ増量
ストレージ増量

利用負担額

単

位

3,600円／年 2コアにつき(最大8コアまで)
3,600円／年 4GBにつき(最大64GBまで)
7,200円／年 100GBにつき(最大1,000GBまで)

5．利用負担額は、当該年度(4月から翌年3月まで)の利用に対して年額として算定するが、年度途中から利用を開始する場合及び申請時において年度途中で利用を終了することが明らかな場合には月数に応じて減額する。

28 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

別表３
システム

A

B

スーパーコンピュータシステム（民間機関利用）
経過時間
（時間）

ストレージ
（TB)

無料
利用者数

2ノード((112コア、128GB高速メモリ)×2)

336

19.2

6

1,320,000 円/年

3ノード((112コア、128GB高速メモリ)×3)

336

28.8

9

1,980,000 円/年

4ノード((112コア、128GB高速メモリ)×4)

336

38.4

12

2,640,000 円/年

2ノード((112コア、512GBメモリ)×2)

336

19.2

6

1,440,000 円/年

3ノード((112コア、512GBメモリ)×3)

336

28.8

9

2,160,000 円/年

4ノード((112コア、512GBメモリ)×4)

336

38.4

12

2,880,000 円/年

システム資源利用負担額

備考
1．利用負担額は、年度単位で算定している。また、総額表示である。
年度途中から利用を開始する場合及び年度途中で利用を終了する場合の利用負担額は、上記表中の利用負担額を12で除した後、利用月数を乗じて算出するものとし、100円未満に端数が出た場合は、10円単位を四捨五入するものとする。
なお、月途中から利用を開始する場合及び月途中で利用を終了する場合は、それぞれ1月の利用とする。
2．ストレージ容量はバックアップ領域（最大で総容量の1/2）を含む。

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 29

―1.

サービス利用のための資料一覧―

スーパーコンピュータシステム・ホスト一覧
システム A (Camphor3)：camphor.kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム B (Laurel3)：laurel. kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム C (Cinnamon3) ：cinnamon. kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム G (Gardenia)

アプリケーションサーバ ：app.kudpc.kyoto-u.ac.jp

ファイル転送サーバ：gardenia.kudpc.kyoto-u.ac.jp：hpcfs.kudpc.kyoto-u.ac.jp※ ホストへの接続は SSH(Secure SHell) 鍵認証のみ、パスワード認証は不可

2.

問い合わせ先 & リンク集


情報環境機構のホームページ
http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/



学術情報メディアセンターのホームページ
http://www.media.kyoto-u.ac.jp/



利用申請などに関する問い合わせ先【情報環境支援センター】
E-mail : zenkoku-kyo@media.kyoto-u.ac.jp / Tel : 075-753-7424
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/comp/

システムの利用など技術的な問い合わせ先【スーパーコンピューティング掛】
E-mail : consult@kudpc.kyoto-u.ac.jp
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/comp/contact.html

30 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

MEMO

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.22 No.2（ Feb. 2024）− 31京都大学学術情報メディアセンター全国共同利用版広報 Vol．22，No．2
２
０２４年
１６日
2023
年 ２月
2 月
16発行
日発行
広報編集部会
編集者 京都大学学術情報メディアセンター

深沢 圭一郎（部会長）

全国共同利用版広報編集部会

廣中 詩織（副部会長）

発行者 〒606-8501 京都市左京区吉田本町
京都大学学術情報メディアセンター

當山 達也
熊谷 真由美Academic Center for Computing and Media Studies
Kyoto University
https://www.media.kyoto-u.ac.jp/
印刷所 〒615-0823 京都府京都市右京区西京極前田町 23 番地
株式会社エヌジーピー

32 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

表紙デザイン：中山 豊（中山商店）