東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 ニュースレター

ToMMo NEWS LETTER
Svante Pääbo先生のノーベル生理学・医学賞受賞、大変嬉しいお知らせでした。前号のトップ記事でPääbo先生のご来訪を取り上げ、印刷版が刷り上がってきたまさにその日に、ノーベル賞受賞のお知らせをいただきました。ネアンデルタール人、デニソワ人といった絶滅した人類のゲノムを巡る研究が現代の医学に結びつくこと、私たちも共同研究のお話を進めている中で、教えていただいてきました。今後の連携を進めしっかり成果の形にして、また皆さまにご報告できるようにしたいと思います。

vol.

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T OP I C S

自由民主党政務調査会 科学技術・イノベーション

腸内細菌叢315人分のデータ分譲開始

戦略調査会の皆さまがToMMoを訪問
2 0 2 2 年 9月2 9日（ 木 ）、To M M oは3 1 5 人 分の腸内細 菌 叢
2022年9月26日（月）、渡海 紀三朗議員を会長とする、自由民データの分譲を開始しました。データは、2021年10月から11月

主党政務調査会 科学技術・イノベーション戦略調査会所属のに地域支援大崎センターに詳細三次調査のために来所された国会議員の皆さまがToMMoを訪問されました。

方々から同意をもとに収集した便検体から抽出・解析されたもの

山本機構長より概要説明を行った後、スーパーコンピュータ、です。本研究は、第2期SIPスマートバイオ産業・農業基盤技術

MRI、バイオバンクや地域支援仙台センターと仙台子どもけん「食によるヘルスケア産業創出コンソーシアム」の一環として行

こうスクエア、シークエンス解析設備などToMMoの施設を視察われました。ToMMoで収集済みのコホート調査による各種情いただきました。また、コホート事業について、パネルや写真を報やゲノム・オミックス解析情報と合わせた解析や、便検体を採使った説明を行いました。

取した際の健康調査データと合わせた分析も可能となります。

議員の皆さまからは、ToMMoのコホート調査やバイオバンク、近年注目を浴びている腸内細菌叢データは各機関で収集され大規模ゲノム解析などの取組について独自の意義のあるものとているものの、収集機関外での利活用は進んでいませんでした。

してご評価いただくと共に、他のプロジェクトとの連携や比較

今回のデータは、当初の段階から多くの利活用を想定して収集などの観点から多数のご質問をいただきました。

され、産学問わず幅広い利用が見込まれます。

NEWS

2022.09.26

見るためのページを追加しました。データ

2022.10.07

長鎖リードシークエンサーによるゲノムもユーザビリティもより充実したjMorp

広島県議会議員の皆さまがご来訪

構造多型の解析・公開を是非ご活用ください。

広島県議会 生活福祉保健委員会の皆最 新 型の長 鎖リードシークエンサーをさまがToMMoを訪問されました。熱心2022.09.29-10.01, 10.12-10.14

用いて333人の全ゲノム解析を行うこと

第81回日本癌学会学術総会

で、50塩基対を超える大きな挿入・欠失/BioJapan2022に出展に施設のご視察になった後、「 データに基づく生活指導などを地域医療へ投げかけることは可能なのか」「ゲノムのデー（ 構 造 多 型 ）を詳 細に解 析した結 果をまとめた論 文が2 0 2 2 年 9月2 0日付で秋の学会・展示会シーズン、ToMMoもCommunication Biology 誌に掲載され出展を続けています。2022年9月29日ました。今回の333人はトリオ（成人と（木）からは第81回日本癌学会学術総会その両親からなる3人組）で構成されてに、同10月12日（水）からはBioJapan

おり、親子間の解析結果をもとにした検2022に、同じパシフィコ横浜でそれぞれ証により、高い精度でゲノム構造多型を3日間ずつブース出展しました。前者は、検出したことを確認しています。本論文の日本全国の9機関14のバイオバンクが成果は日本人構造多型参照パネルJSV1構成する「バイオバンク・ネットワーク」として、公開データベースjMorpで公開として、「バイオバンク横断検索システム」されています。の紹介と検索体験、バイオバンク・ネット

Construction of a trio-based structural variation panel
utilizing activated T lymphocytes and long-read

タをいくつかのパターンにしてもっと大まかな見せ方は可 能なのか」など活 発なご質疑をいただきました。

ワークに参画するバイオバンクの紹介を2022.10.12

sequencing technology. (2022) Otsuki A. et al.

メインに、後者はコホート調査により蓄積

国際シンポジウムPan-cohort studies

Commun. Biol. 5, 991.

されたデータの試行的産業利用を進めを開催

る取 組 などを中 心 にご紹 介しました。
2022.09.29

コホートやバイオバンクについてこれまでBiocrates社の主催で、仙台、ミュンヘン、jMorpの搭載データを拡張ご存知でなかった方々にご案内する機会

ボストンの3か所がリレーで開催ホストとも多くあり、また、具体的な利活用に結びなる22時間以上連続の国際シンポジウ

ToMMoは2022年9月29日（木）、日本

つくお問い合わせも多数いただくなど、

ムPan-cohort studies ‒ The future of

人 多 層オミックス参 照パネル(jMorp:

充 実した出 展となりました。今 年 度 はpopulation healthが開催されました。

Japanese Multi Omics Reference

12月の日本人類遺伝学会第67回大会

日本時間で10月12日（水）朝から山本Panel)に搭載するデータを拡張し、日本はじめ更に複数の出展を計画しています。

雅之機構長のオーガナイズによりオンラ人全ゲノムリファレンスパネル 38KJPN

インで開催された日本・仙台パートに、にX染色体・ミトコンドリアのデータと、山本機構長、小柴 生造教授、菱沼 英史

唾液・歯垢検体の16s解析による細菌叢助教が登壇し、また、慶應義塾大学の末松解析を中心とした388名分のデータセッ

誠教授、国立がん研究センターの中佂 斉トを新たに追 加しました。また、ユーザ理事長はじめ錚々たるメンバーが講演し、インターフェースを大きく変更し、データドイツ・アメリカのパートを含め、世界の間 の 関 連 性 が 捉 えや すくなるようにコホートと、そこで行われるオミックス解析

再 設 計すると共に、各 階 層を俯 瞰 的にの趨勢が総覧できるイベントとなりました。

EDITORʼS NOTE

今号は、腸内細菌叢のデータ分譲開始とゲノム構造多型の論文成果を扱っています。ToMMoでは、データの公開が先に来て、そこから遅れて論文発表が続くことが多く、実際、腸内細菌叢の論文は未発表、ゲノム構造多型については21年12月にデータ公開されています。若干わかりにくい時期のずれ、少しでも早くデータを多くの方々にお届けしたいという思いゆえとご理解いただければ幸いです。
（ F.N）

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Date of publication Nov, 2022

Published Tohoku University Tohoku Medical Megabank Organization
TEL 022-717-8078

E-mail tommo@pr.megabank.tohoku.ac.jp

Editor in chief Fuji Nagami

URL www.megabank.tohoku.ac.jp

Designer Miho Kuriki© Tohoku University Tohoku Medical Megabank Organization