Vol.14, No.1 2 15
Vol.14, No.1 2015

[巻頭言]・Vol.14, No.1 号の発刊に当たって ......................................................................................................................................................................................... 1
深沢圭一郎[スパコン応用研究]
・GPUを用いた非対称反平行磁気再結合の磁気流体計算 ......................................................................................................................................... 3
近藤光志，淵田泰介
・非線形電磁イオンサイクロトロン放射が地球内部磁気圏の高エネルギープラズマに与える影響 .............................................. 5
小路真史
・クラウドを活用したビッグデータポスト処理環境実現のためのデータ伝送実験：基礎実験編−HPCと高速伝送の融合を目指して−............................................................................................................................................................................. 7
村田健史，山本和憲，長屋嘉明，深沢圭一郎，伊達進，木戸善之，荻野正雄，南里豪志，建部修見，木村映善[研究会開催報告]
・STEシミュレーション研究会 −エクサスケールに向けて− 開催報告........................................................................................................ 11
深沢圭一郎[サービスの記録・報告]
・スーパーコンピュータシステムの稼働状況とサービスの利用状況............................................................................................................. 14[資料]・大型計算機システム利用負担金 別表............................................................................................................................................................................. 20
・全国共同利用版広報・Vol.13(2014)総目次.................................................................................................................................................................. 23・サービス利用のための資料一覧 ........................................................................................................................................................................................ 25[編集後記]
・編集後記、奥付 ........................................................................................................................................................................................................................... 26(October,2O15)

スパコン応用研究【巻頭言】「Vol.14，No.1 号の発刊にあたって」深沢 圭一郎【スパコン応用研究】「GPUを用いた非対称反平行磁気再結合の磁気流体計算」近藤 光志，淵田 泰介●「非線形電磁イオンサイクロトロン放射が地球内部磁気圏の高エネルギープラズマに与える影響」小路 真史●「クラウドを活用したビッグデータポスト処理環境実現のためのデータ伝送実験：基礎実験編−HPCと高速伝送の融合を目指して−」村田 健史，山本 和憲，長屋 嘉明，深沢 圭一郎，伊達 進，木戸 善之，荻野 正雄，南里 豪志，建部 修見，木村 映善【研究会開催報告】「STEシミュレーション研
究会−エクサスケールに向けて− 開催報告」深沢 圭一郎

巻頭言

巻頭言
Vol. 14, No.1 号の発刊に当たって京都大学学術情報メディアセンター
深沢圭一郎

本号では，「スパコンの応用研究紹介」というタイトルで、学術情報メディアセンター計算機システムを利用している研究 3 件について特集いたします．それぞれ、GPU を用いた
磁気流体における磁力線再結合数値シミュレーション研究，地球の超高層大気における宇宙プラズマイオンハイブリッド（電子が流体でイオンは粒子とする）数値シミュレーション，
数値シミュレーション計算結果などの大規模データを効率的に広域で伝送する研究について掲載されています．GPU を用いたシミュレーションの研究では，数値シミュレーションが多く行われている流体を対象に，GPU だけで無く，CPU も同時に計算に利用したシミュ
レーションが紹介されています．ハイブリッドシミュレーションはでは，流体と粒子の組み合わせ計算が紹介されており，うまく数値計算が進み，ミクロスケールの現象が再現されている研究成果が紹介されています．大規模データ伝送では，大規模データ転送に最適化された通信プロトコルを新しく作成し，SINET や JGN といったアカデミックな機関で利用されているネットワーク上で効率的なデータ伝送を実現しています．このような計算を行いたい研究者の方や，データ転送に興味のある方に対して，良い参考だけで無く，共同研究のきっかけになればと思います．
「イベント報告」では，センターで 9 月末に開催された数値シミュレーションの研究会について報告されています．この研究会は計算・計算機科学系の研究会では無く，地球電磁気・地球惑星圏学会の数値シミュレーション研究者が集まる研究会となっています．この学会や研究分野では比較的古くから数値シミュレーションが行われてきたためか，自前でコードを（しかも Fortran で）書く文化となっており，計算結果の議論だけで無く，並列計算手法や，数値計算手法自体の講演など多種多様な興味深い講演がある研究会でした．
来年度のスーパーコンピュータシステム更新に向けて現在センターでは準備を進めています．想定される計算機システムはいくつかありますが，計算機性能にペタフロップスという文字が当たり前に出てくることに計算機の発展の早さを感じます．近年の大規模計算機
システムは，超並列計算機システムであり，GPU や MIC のような演算加速器付きシステ
ムが一般的になっており，単純に性能を出すことが難しくなっています．このため，今まで計算機システムへのアプリケーションの最適化にそれほど興味のなかった研究者も，最適化に取り組む方が増えてきたように思います．大規模シミュレーションは数ヶ月から 1 年といった長時間の計算となる場合が多いですが，最適化によって計算機の実行効率が倍になると，1 ヶ月や半年で計算が終わることになり，研究が飛躍的に進みます．計算機自体が変わらなくても，最適化により，計算効率は上げることができますので，学術情報メディア

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 1

センターにご相談いただければと思います．
現在もある程度問題になっていますが，今後は大規模計算によって生成される大規模データのポスト処理がますます難しくなり，大問題になると思います．今回の特集記事にあるようなデータ伝送の研究など，センターとしても対応をしっかりとしていきたいと思います．皆様の研究，教育にご活用いただけるようにセンター教職員も尽力していきますので，
今後ともご利用，ご支援のほど、よろしくお願いいたします．

2 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto Universityスパコン応用研究

GPU を用いた非対称反平行磁気再結合の磁気流体計算
近藤∗

愛媛大学大学院理工学研究科

緒言

研究では、このような非対称反平行磁場環境におけ太陽フレアや惑星磁気圏オーロラフレアのような

宇宙プラズマにおける爆発現象では、磁気リコネク

ション (再結合) が重要な役割を担っていると考えらる磁気リコネクションを時空間的に高解像度かつ広い空間領域について調べるために、GPU を用いて計算する。

れている。地球磁気圏の反太陽側にある磁気圏尾部

領域では、図 1 領域 B のように反平行磁場磁場領域が存在し、このようなシンプルな磁場環境における
磁気リコネクションが理論的にも観測的にも活発に研究されてきた [1, 2]。一方で、図 1 領域 A のように磁気中性面をはさんだ両側の磁場強度の異なる非対称反平行磁場領域も実際の宇宙空間では非常に多く存在している。むしろ、太陽コロナや太陽風・銀
河風終端衝撃波など、非対称反平行磁場環境の方が一般的である。しかしながら、このような非対称反平行磁場環境での磁気リコネクションは非常に複雑であり、未だ多くの問題が残されている。
太陽風

泰介 †

愛媛大学宇宙進化研究センター†1

光志 ∗ ，淵田

2

GPU を用いた高速化
磁気流体計算に関する詳細は、Ugai(2008)[1] を参照していただき、本稿では、GPU 計算を主に説明する。磁気リコネクションの磁気流体計算では、空間解像度が十分に必要な領域は、磁場のつなぎ変わる
領域（磁気拡散領域) や衝撃波等の不連続領域である。これらの領域は、磁気中性面に近い領域にあるため、そこから遠い領域は比較的空間解像度を落とすことができる。そこで、本研究では GPU の計算
領域と CPU の計算領域を設け、解像度の必要な領域を GPU が計算し、その他の領域を CPU が計算することで、計算領域についても CPU と GPU のハイA

ブリッド計算とする。そうすることで、もっとも時B
反平行磁場領域間のかかる CPU と GPU の通信時間を CPU の計算

時間側に吸収させ、GPU は数値計算に集中させるこ地球とができる。

CPU
図 1: 地球磁気圏概念図

1

4
Buffer

磁気リコネクションは、様々な方法で計算されているが、本研究ではプラズマを一流体として近似した磁気流体計算を行う [1]。我々は、これまでも非対称反平行磁場における磁気リコネクションについて

GPU

2

3

図 2: CPU-GPU 間の袖領域の通信の概念図

磁気流体計算による研究を進めてきた [3, 4] が、本

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 3

具体的には、CPU での 1 ステップの計算時間がズモイド（右側の膨らんだ領域）の前方 (右側) に衝

1) その時間差の間に CPU 側から GPU 側に設けておいたバッファ領域に袖領域を転送しておき、2)GPU間と共に磁力線のつながる点 (X 点) と上下の流れのGPU のそれより小さくなるように領域を調整して、の 1 ステップの計算が終わった時点で GPU にバッ
ファ領域から計算領域に袖部分をコピーさせ、3) さ撃波が生じていることがわかり (T=120)、また、時ぶつかる点 (S 点) が分離し、上下に移動することが見つかった。

らに別に設けておいたバッファ領域に CPU に渡す袖

T=

30

0

20

領域をコピーさせる。GPU 内の転送速度は十分に早10いのでこの部分の時間はそれほど問題にならない。4)

0

T=120

すぐに GPU の計算をスタートさせて、CPU に GPU

30
20のバッファ領域から CPU の計算領域にコピーをさ

10

T=240

の転送 (1, 4) を隠蔽して、ほぼ常時 GPU に計算を0

3.1

他の並列化との比較

ト計算の結果を示し、CPU は Intel Xeon E5-2620、

GPU は NVIDIA Tesla k20(2469core)1 枚を使用した結果を示す。まず、CPU のみの場合および OpenMP

11 スレッド並列に対して、ハイブリッド計算速度はそれぞれ、およそ 18 倍、3.6 倍であった。また、京都大学情報環境機構スーパーコンピュータシステム
B を用いた MPI 並列との比較を表 1 に示す。Tesla

k20 を 1 枚使用した結果は、MPI 12 プロセス並列相
当の速度を実現できていることが分かる。
表 1 MPI 並列との比較
並列方法
計算時間 (分)MPI(8 プロセス)

3.2

20

20

40

0
60

80

x

100

120

-0.05

140

160

Vy

180

0.05

図 3: 磁気リコネクションの時間発展

本副節では、すべて 1605x1005 格子の 2 次元テス

MPI(4 プロセス)30

10継続させることができる。

結果

89.6
50.6

MPI(16 プロセス)

24.4

GPGPU

33.6

磁気再結合のシミュレーション

4

結言
本研究では、GPU を用いて非対称な磁気リコネク

ションの磁気流体計算を行った。GPU をフル稼働するために、CPU にも計算領域を割り当て、CPU と

GPU 間の通信を CPU 側の計算時間に含ませること
で高速化を図った。本稿では、1 枚の GPU カードを使用した結果を示しているが、本方法を用いること
で、複数カードを使用した際にも GPU に数値計算に集中させることができる。今後は、複数カードを使用し、より大きな計算領域の長時間発展を調べる
予定である。

参考文献[1] M. Ugai, ”The evolution of fast reconnection ina three-dimensional current sheet system”, Phys.
Plasmas, 15, 082306 (2008)[2] G. Paschmann, ”Recent in-situ observations ofmagnetic reconnection in near-Earth space”, Geophys. Res. Lett., 35, L19109, (2008)

図 3 は、GPU 計算領域の磁力線 (白線) と速度場

[3] M. Ugai, ”Computer simulation of asymmetricspontaneous fast reconnection”, Phys. Plasmas, 7,
867-874 (2000)

まっている。今回の計算により、従来研究されてい[4] K. Kondoh, ”Computer simulation of flux transfer
event: Effect of solar wind flow”, Adv. Space Res.,29, 1119-1124 (2002)

y 成分 (コンター) の時間発展を示している。図のように、解像度の必要な領域は、GPU 計算領域内に収た領域より外側の領域まで計算を行うことで、プラ4 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto Universityy0

せる。これにより、通信時間のかかる CPU-GPU 間

3

y

y

スパコン応用研究

非線形電磁イオンサイクロトロン放射が地球内部磁気圏の高エネルギープラ
ズマに与える影響

小路 真史
名古屋大学太陽地球環境研究所

1 研究の背景と目的

2 計算手法太陽から吹き付ける磁場を伴った高速プラズマ

本研究では、イオンスケールのプラズマ波動現象

流（太陽風）と、地球固有磁場との相互作用によっに着目するため、イオンハイブリッドシミュレーシて、磁気圏と呼ばれる電磁場環境が地球周りに形成ョンと呼ばれる自己無撞着なシミュレーションをされる。地球内部磁気圏の磁気赤道域において、数使用する。イオンハイブリッドシミュレーションコ

Hz帯に電磁イオンサイクロトロン(EMIC)トリガー

ードにおいて、電子は慣性を無視した流体として扱

ド放射と呼ばれる新たなプラズマ電磁波動放射現い、イオンを粒子として取り扱う。さらに、内部磁象が CLUSTER 衛星により観測された[Pickett et

気圏の磁気赤道域における現象を詳細に解析する

al., GRL, 2010]。その後、あけぼの衛星、THEMIS

ために、沿磁力線方向の一次元コードを開発した。

衛星、Van Allen Probes 衛星でも EMIC 放射が多内部では磁気赤道領域を模擬した非一様磁場を導数観測されている。この EMIC トリガード放射は、入している。シミュレーション両端は解放境界とし、ホイッスラーモードコーラス放射と同様に強い非粒子はシミュレーション空間内部でミラー運動し線形波動粒子相互作用によって周波数上昇を伴うている。さらに、例として CLUSTER 衛星観測結果

EMIC波として観測される。
この波動の存在により、から重イオン密度比を見積もり、またリアルスケー

内部磁気圏における高エネルギーのプロトンの生

ルの時空間パラメータを使用することで、観測結果

成や散乱、及び相対論的電子の消失に大きく関わっと比較しやすいシミュレーション結果を得られるていることがこれまでの理論研究により示唆されようにしている。初期状態として、温度異方性を持ているため、日本の次世代の内部磁気圏観測ミッシった高エネルギープロトンを空間に配置し、この自ョンである ERG 衛星においても重要な観測対象と由エネルギーによって EMIC 波を励起させ、非線形なっている。

成長によって EMIC トリガード放射を再現する。ま

本研究の目的は、大規模計算機実験を使用することで、次世代衛星観測に先立ち EMIC トリガード放た、シミュレーションコードは MPI による領域分
割法により、並列化されている。

射による非線形波動粒子相互作用を再現し、内部磁一方で相対論的電子がイオンスケールの波動に

気圏プラズマ環境へ影響を定量的に評価すること与える影響は無視できる。従って、テスト粒子シミである。特に、温度異方性によって自発的に励起・ュレーションと呼ばれる手法を採用し、先のハイブ成長する EMIC トリガード放射による、数 keV のリッドシミュレーションで得られる電磁場のデー

高エネルギープロトン、及び数 MeV ほどのエネル

タを使用し、その中の電子の運動を計算した。

ギーを持つ相対論的電子に与える影響について解3 高エネルギーイオンの散乱・加速析を行った。
磁気赤道面内において、イオンの温度異方性が不安定性を引き起こし、自発的な EMIC トリガード放

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 5

射が起きる様子をハイブリッドシミュレーション内で再現した。図 1 左にダイナミックスペクトルを

4 相対論的電子の消失示す。数 Hz 帯の周波数上昇を持つ EMIC 波を 2 種

ハイブリッドシミュレーションによって得られる類再現したが、背景の磁場勾配パラメータを変える

EMIC 波動中を相対論的電子が通過するとき、異常共ことで、スペクトルの様子が変わることを示した。

鳴を引き起こして散乱が起きる。特に、今回のような

図 1(a)に対して、図１(b)では磁場勾配を 1/8 にして周波数上昇を伴う EMIC 波動の場合、強い非線形散乱

いるが、この場合は明確なライジングトーンではなを受けることがわかっている。本シミュレーション結く、ブロードなスペクトル構造が得られる。

果において、一度の波動放射の間（約 90 秒間）でのエ
ネルギー・ピッチ角(背景磁場と粒子速度の成す角)密度分布の発展を図 2 に示す。数 MeV を超すエネルギ
ーを持つ電子が非常に広いピッチ角で散乱されており、6MeV-20MeV の範囲の相対論的電子は最大で80%程散乱されることが明らかとなった。

図 1: (左)シミュレーションで得られた磁場のダイ
ナミックスペクトル。(a)は磁場勾配が大きい場合、

図 2: 相対論的電子のエネルギー・ピッチ角分布。左(b)は磁場勾配が小さい場合の結果を示す。(右)それは図 1(a)、右は図 1(b)のタイプの EMIC 波動の影響をぞれのケースにおける散乱された粒子送料とその受けて散乱される様子を表す。

微分、加速された粒子と振幅の時間発展をそれぞれ
示す。

5 まとめ

図 1 右に、2 ケースの場合の粒子散乱・加速の時

本研究において、内部磁気圏内の粒子、特に高エネ間発展を示す。励起過程において、非線形サイクロ

ルギー側の粒子に着目して、低周波数波動が与える

トロン粒子補足の影響で非常に効率の良い散乱が影響について調査した。散乱され、地球に振り込む起きる。また、飽和減衰過程において、高エネルギ

高エネルギーイオンは極域において、プロトンオー

ーイオンの一部が背景磁場に対して垂直方向に加ロラと呼ばれるオーロラの一種を引き起こすとさ速される。磁場勾配が強い場合、波動のクリアな周れており、効率のよい散乱メカニズムの解明は、地波数上昇にともなって位相空間中で非常に効率よ

上・衛星観測研究に有用な示唆をなすものである。

く粒子捕捉が起きる。補足された粒子が波動からエ

さらに、相対論的電子フラックスを非常に効率よくネルギーを得るため、結果として加速効率が非常に散乱させられるメカニズムは、内部磁気圏における高くなる。一方で、磁場勾配が緩いときに形成され放射線帯の消失過程において非常に重要な役割をるブロードな EMIC 放射は、あらゆる空間で同時多になっていると考えられ、今後の次世代衛星ミッシ

発的に発生することから、粒子散乱の時間スケール

ョンでの波動粒子の同時観測による実証が期待さが早まることを示した。

れる。

6 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto Universityスパコン応用研究

クラウドを活用したビッグデータポスト処理環境実現のためのデータ伝送実験：基礎実験編
HPC と高速伝送の融合を目指して
村田健史 1、山本和憲 1、長屋嘉明 1、深沢圭一郎 2、伊達進 3、木戸善之 3、荻野正雄 4、南里豪志 5、建部修見 6、木村映善 7
1 情報通信研究機構 統合データシステム研究開発室、2 京都大学 学術メディアセンター、3 大阪大学

サイバーメディアセンター、4 名古屋大学 情報基盤センター、5 九州大学 情報基盤研究開発センター、
6 筑波大学

計算科学研究センター、7 愛媛大学 健康領域医療情報学講座

1 はじめにレージはなく、データ伝送のボトルネックになっている。その結果、数値計算からポスト処理まで全体

計算科学基盤であるスーパーコンピュータ（以下のボトルネックが高速並列計算性能ではなくデー

スパコン）による計算規模は大規模化しており、そタファイル転送性能に依るという、本来のスパコンの結果出力されるビッグデータのポスト処理環境の高性能が発揮できない本末転倒な結果となるこの重要性が高まっている。近年のスーパーコンピュとが多い。

ータシステムは大規模なシステムストレージを有筆者らの考えでは、大規模スーパーコンピュータしており、多くの場合は高速 I/O により大量の計算により生成されたビッグデータのポスト処理を高結果をファイルとして保存できる。しかし、システ速に行うためには、スパコンからデータをユーザのムストレージの多くはデータの一時保存を前提とポスト処理環境内のストレージシステムに直接書している。一定時間経過したデータは消去されるこ

き出すことが有効である。この場合には数値計算ととが多く、長期間（たとえば数年間など）でのデー

同時に、または終了後即時にポスト処理システム上タ解析ができることは少ない。

でデータ処理を開始することができる。すなわち、

そのため、ユーザはシステムストレージに保存しスパコンは直接、遠隔地のユーザのポスト処理環境

たデータを自らのポスト処理環境に転送する必要

上のストレージを参照し、高速にデータを書き出すがある。このデータ転送時間はネットワーク環境にわけである。

も依存するが、多くの場合には期待するほど高速で

実は、遠隔高速ストレージは古くから研究開発がはない。さらに、ユーザのポスト処理環境では一般進められてきた。マルチポイント-マルチポイントのにはスパコンサイトのストレージほど高速 I/O スト

並列ストレージシステムの高速化の研究（例えば、

図１ これまでのスパコンポスト処理環境

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 7

図２ 本研究のスパコンポスト処理環境：遠隔ストレージをローカルストレージとして利用する。
（本稿では大規模ディス
プレイによる可視化については言及しない）

Henschel et al., SC12, 2012）は多くある。しかし、

HbVRS サーバを実装し、これを遠隔ストレージシ

多くの研究はデータ伝送部の高速化をマルチポイ

ステムとして利用する。これらをもとに、実データ

ント-マルチポイントの並列通信により実現してきを用いて実環境実験を行う。スパコンからの遠隔スた。これは、すなわち送受信システムのサーバ数のトレージ利用では、32～128 コアで 1 ステップあた

柔軟性が低いことを意味している。スパコンサイト

り 100GB 程度のデータファイルを数時間に一度書とポスト処理環境が独立にシステム構築・運用されき出す仕組みを実現する計画である。

る我が国の基盤センター系のスパコンシステムでは、実用性が低いと言える。
一方、シングルクライアントから利用できる遠隔2 独自通信プロトコル HpFP (Highperformance and Flexible Protocol)

高速ストレージはほとんど存在しない。これは、実用性の高いデータ伝送プロトコルが存在しない、ス

図２のシステム達成のため、情報通信研究機構でトレージ側の I/O 速度のボトルネック、データ伝送

は HbVRS の基盤として用いるための独自データ通プロトコルとストレージシステムを効果的に組み

信プロトコル（後述の HpFP）の設計と実装を進め合わせることが容易ではないことなどが理由であている。一般には、データ通信プロトコルとしてはる（図 1）。

http や ftp、rsync や rcp などの TCP を基盤として

そこで筆者らは、スパコンノードから直接データ

プロトコルを使うことが多い。しかし TCP プロトを書き出すためのシステムが有効であると主張しコルは遅延やパケットロス環境に弱く、特に両者がている。その基本的な概念図を図 2 に示す。本研究融合する環境ではパフォーマンスの低下が極端ででは、図 2 のシステムにおいてスパコンの計算ノーある傾向にある。UDP ベースの高信頼通信プロト

ドから直接データを遠隔ストレージに書き出した

コルとしては UDT（UDP-based Data Transfer

り、遠隔ストレージから直接データを読み込んでポProtocol）があるが、筆者らの実験では LFN（Long

スト処理を行ったりするためのツール（後述の
HbVRS ツール）を開発する。この HbVRS クライ
アントを京都大学、九州大学のスパコンおよび大阪
大学、名古屋大学のポスト処理環境・可視化環境に実装する。NICT サイエンスクラウドが構築・運用している Gfarm による分散ストレージシステムに

8 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

図３ HpFP と iperf 比較のための室内実験環境

図４ HpFP と iperf の比較結果（室内実験）

Fat Network）において 10Gbps 以上を達成するこ境では十分な性能を示すが、遅延が発生すると性能とができず、将来性が低い。

が低下することが分かる。性能低下はパケットロス

そこで、HbVRS の基盤プロトコルとして、本研環境下では顕著であり、片道 0.5％程度のパケット

究では状通信研究機構が開発した HpFP プロトコロスがある環境では 1msec 程度の遅延でもデータ

ル（High-performance and Flexible Protocol）を用

伝送性能は極端に低下する。

いる。HpFP は 2015 年 9 月に特許申請を終えたば

一方、図４によると HpFP は遅延やパケットロス

かりであり、その詳細設計および仕様については今に極めて強いことが分かる。片道 0.5％のパケット

後、別稿で紹介する。本稿では、HpFP プロトコル

ロスと 50msec 程度の遅延においても、その性能劣の仕様については割愛し、室内実験による基本性能化は極めて小さい。本稿では議論しないが、実際にを紹介する。さらに、HpFP プロトコルを使った京はロス 10％で 200msec の遅延環境などの極めて厳

都大学学術情報メディアセンターと情報通信研究

しい環境においても、HpFP は図４と同様の高いロ機構サイエンスクラウドシステムのおよび SINET

ス耐性・遅延耐性の振る舞いを示すことがわかってと JGN-x を用いた実環境での通信実験結果を紹介

いる。

する。
図３は、本研究の室内実験環境である。2 台の送

3 HpFP による SINET/JGN-x 基礎実験

受信サーバをネットワークシミュレータで挟み、人工的な遅延やパケットロスを与える。ネットワーク

本研究では、図４の室内実験を背景として、カードは送受信で 10G であるが、シミュレータによ

SINET および JGN-x を用いた広域通信実験を行っり実験帯域を最大で 1Gbps とした。これは、後述のた。図５は、HpFP により京都大学学術情報メディ通り、ファイアウォールを考えた時に、京都大学学

アセンターと情報通信研究機構サイエンスクラウ

術情報メディアセンターと情報通信研究機構サイドシステムの間で基礎的な通信実験を行った結果

エンスクラウドシステムの間のスループットがである。京都大学学術情報メディアセンターと情報

1Gbps を上回ることがないからである。

通信研究機構サイエンスクラウドシステム間では

図４は HpFP プロトコルと TCP の基本性能測定

パケットロスはなく、RTT は平均 15.7ms であった。

ツールとして一般に利用されている iperf（本研究でまた、両者間の SINET および JGN-ｘの帯域は十は TCP オプションを選択）との比較実験を、図３の分であり、通信ボトルネックは NICT サイエンスク

室内実験環境において行った結果を示す。図４によラウドの FW（ファイアウォール）にあることが分

ると、iperf（TCP）はパケットロスや遅延がない環

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 9

図５ HpFP による京都大学学術情報メディアセンターと情報通信研究機構サイエンスクラウドシステムの間で基礎的な通信実験結果：同じ環境で iperf（TCP）では 340Mbps 程度であった。

かっている。
（通常は、300Mbps～500Mbps 程度しTCP 系のデータ伝送ツールと同等以上の高い実用

か空き帯域がない。
）

性能が期待できる。前述のとおり、図 5 の実験では

HpFP は目標スループット（上限スループット）

両研究機関間でのパケットロスがなく、遅延もそれを設定することができるが、図５では 100Mbps～

ほど大きくなかった。図 4 でもわかるとおり、低遅600Mbps を目標スループット値として設定して実延・パケットロス環境では両者のスループットには験を行った。
300Mbps までは安定して通信できてい大きな違いはない。しかし、実験を行う時間帯におることから、HpFP による両者間での通信は、安定

いては、両機関間でのネットワーク輻輳によるパケ

して 300Mbps 以上が可能であることが分かる。

ットロスなど発生することもあり得る。この場合に

図 5 では目標スループットが 400Mbps 以上ではは、HpFP の優位性が発揮されると予想される。

目標スループット値が達成できていない。例えば、

なお、FW の影響を除外するためには両者を目標スループットを 600Mbps と設定した場合でも、

L2/VPN 等により接続する必要があるが、これにつ実測値は 440Mbps 以下となっている。本稿では述

いては今後の実験において検討する。

べていないが、事前に行った室内実験（パケットロ
スなしで 20Gbps 環境）
において HpFP は 100msec

謝辞

以上の遅延環境でも 10Gbps 以上を達成しているこ

本実験は、情報通信研究機構の NICT サイエンスとから、
HpFP の実装の制約ではない。
したがって、

クラウドおよび京都大学学術情報メディアセンタ

目標値を達成できていない理由は上記のNICT サイーを利用しました。

エンスクラウドFWの帯域変動によるものと考えられる。
なお、図 5 と同じ京都大学と情報通信研究機構間での iperf（TCP）による測定結果が 340Mbps 程度であったことを考えると、HpFP の目標スループッ
トを 400Mbps 以上に設定することで、HpFP は

10 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

研究会開催報告

STE シミュレーション研究会 ―エクサスケールに向けてー 開催報告
深沢 圭一郎京都大学学術情報メディアセンター

1 STE シミュレーション研究会とはした。招待講演にはエクサスケールに向けた可視化というテーマで京都大学の坂本尚久先生による「次STE シミュレーション研究会は名古屋大学太陽世代可視化システムの開発」、エクサスケールに向地球環境研究所の共同研究集会であり、20 年以上続けた計算機システムの電力システムというテーマ

く、毎年 1 回開かれている研究会です。この研究会で東京大学の近藤正章先生に「エクサスケールシス

では STP（太陽地球惑星科学）分野のシミュレーシ

テム向け電力制御技術の開発」というタイトルで、ョン結果の議論だけで無く、シミュレーション技法

エクサスケール向けノード間通信というテーマで、や最適化、並列化の議論が行われており、実際に手

九州大学南里豪志先生に「エクサスケールに向けたを動かしている脂ののった STP 分野のシミュレー

省メモリ通信ライブラリ実装技術」というご講演をション研究者が集まる研究会です。毎年開催場所がしていただきました。

変わり、今年度は深沢が京都大学に移動したという一般講演では、新しい計算機システムやファイル

こともあり、平成 27 年 9 月 28 日～30 日の間に京システムの紹介、通信最適化などの HPC 向け講演

都大学学術情報メディアセンター（センター）で開もあり、宇宙プラズマの流体や粒子、また、それら催となりました。3 日間の合計で 68 名（京大外 58を組み合わせたハイブリッドシミュレーションの名）の参加があり、26 件の講演が行われ、活発な議

計算結果の議論（磁気圏構造、衝撃波、加速、磁気論が交わされました。

リコネクションなど）、電離圏環境のシミュレーシ
ョン、さらに新しい計算手法の開発や精度評価などの講演が行われました。

3 研究会を終えて深沢がこの研究会を開催するのは 2 年ぶりであり、また何度か研究会の世話人を務めているが、今回は参加者が多く、盛り上がった研究会となりました。
宇宙プラズマ分野としても、その中ではさまざまな
図 研究会の様子

研究分野がある中で、シミュレーション研究でくくった領域横断型研究会となっており、参加者にも楽2 研究会の講演しんでいただけた研究会となりました。京都大学での本研究会の開催はここ 10 年では初めてであり、

今年度は研究会のサブタイトルが「エクサスケー

京都大学ご出身の参加者には、センター北館が新しルに向けて」とあるように、通常の STE シミュレー

くなっているなど懐かしさを感じられていました。

ション研究会でのテーマとは別にエクサスケール

次回の京都大学での開催はまた 10 年程度後かもしに向けたシミュレーションの取り組みについて講れませんが、より幅広く研究者が交流できるような演を募集し、付録のような講演プログラムとなりま研究会を開きたいと思います。

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 11

平成 27 年度 名古屋大学太陽地球環境研究所 研究集会

STE シミュレーション研究会－エクサスケールに向けて－
日時：2015 年 9 月 28 日（月）～ 9 月 30 日（水）場所：京都大学学術情報メディアセンター 北館 4F 大会議室

主催：名古屋大学 太陽地球環境研究所
共催：京都大学学術情報メディアセンター、SGEPSS 太陽地球惑星系科学シミュレーション分科会
研究会世話人：深沢圭一郎（京都大学学術情報メディアセンター）、梅田隆行（名古屋大学 STEL）
9 月 28 日 *は招待講演
13:00-13:25

平林孝太, 星野真弘, 天野孝伸
Non-gyrotropic な圧力テンソルを用いた温度非等方性入り MHD シミュレーション

13:25-13:50

天野孝伸
高エネルギー粒子ハイブリッドシミュレーション

13:50-14:15

簑島敬, 三好隆博
双曲型保存則に対する高解像度解法の検討

14:15-14:40

梅田隆行, 上野悟志, 中村琢磨
ケルビン・ヘルムホルツ不安定性のブラソフシミュレーション

14:40-15:05

三吉郁夫
最新スパコン PRIMEHPC FX100 のご紹介

15:35-16:25*坂本尚久
次世代可視化システムの開発

16:25-16:50

渡邉智彦，前山伸也
エクサスケールに向けたプラズマシミュレーションと磁気圏プラズマへの応用

16:50-17:15

蔡東生
Identifying 3D vortex structures and Coherency at/around the magnetopause
towards magnetotail both in obvervations and global simulations

17:15-17:40

深沢圭一郎, 森江善之, 曽我武史, 高見利也, 南里豪志
Halo スレッドの MHD シミュレーションへの導入と性能評価

17:40-18:05

鷲見治一
太陽圏外圏構造の MHD シミュレーション解析

9 月 29 日
10:00-10:50*近藤正章
エクサスケールシステム向け電力制御技術の開発

10:50-11:40*南里豪志
エクサスケールに向けた省メモリ通信ライブラリ実装技術

12 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

13:00-13:25

八木学, 関華奈子, 松本洋介, Delcourt Dominique, Leblanc Francois
極端な太陽風条件下における水星磁気圏 MHD シミュレーション

13:25-13:50

井原修一
Lustre File System 性能データ解析（仮）13:50-14:15

清水徹
三次元高速磁気再結合過程の自発性と Petscheck 型モデルの関係

14:15-14:40

淵田泰介, 近藤光志, 新田伸也, 和田智秀
非対称磁気リコネクションにおける磁気拡散領域の変動

14:40-15:05

近藤光志
非対称反平行磁場におけるマルチ X ライン磁気リコネクションの数値計算

15:35-16:00

品川裕之, 陣英克, 三好勉信, 藤原 均, 横山竜宏
GAIA を用いた電離圏擾乱予測

16:00-16:25

横山竜宏, 陣英克, 品川裕之, 三好勉信, 藤原均
高精細プラズマバブルシミュレーションと全球大気圏電離圏モデルの結合

16:25-16:50

齊藤慎司
Xeon-Phi を用いた offload 版プラズマ粒子コード開発

16:50-17:15

臼井英之
今後の惑星ミッションとシミュレーション研究の関わり方

17:15-17:40

小路真史, 大村善治
内部磁気圏における EMIC トリガード放射のシミュレーション

9 月 30 日
10:00-10:25

加藤雄人, 深沢圭一郎, 八木学
惑星磁気圏におけるコーラス放射励起過程についての電子ハイブリッド・MHD 連成シ
ミュレーション

10:25-10:50

松本洋介
衝撃波における粒子加速研究：「京」からポスト「京」に向けて

10:50-11:15

松清修一
無衝突衝撃波遷移層での微視的不安定性

11:15-11:40

山崎了, 梅田隆行, 松清修一
衝撃波静止系シミュレーションコードを用いた低マッハ数の無衝突衝撃波の研究

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 13

サービスの記録・報告システム A 運転状況 ( 2014 年 10 月 ～ 2015 年 3 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時システムダウン障害発生状況

サービス再開日時

保守時間[h]障害発生日時2014/１0/1３

9:00

2014/10/15

9:00

48.00

2014/12/15

9:00

2014/12/16

9:30

24.50

2014/12/30

13:00

2014/12/30

14:50

1.83

2015/03/03

6:00

2015/03/03

6:30

0.50

2015/03/30

9:00

2015/04/01

0:00

39.00

2014/１0/19

サービス再開日時

18:40

2014/10/19

ダウン時間[h]

19:15

0.58

２）サービス状況
バッチ

サービ
ス時間
[h]

処理
件数

経過
時間[h]

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

ノード
利用率

10 月

695.42

16,93074,857

11,277,600

9,138,490

939.984

56

%

11 月

720.0022,180116,352

12,648,500

10,246,600

939.899

59

%

12 月

717.6725,895

136,261

13,700,000

11,759,800

939.78662%

1月

744.0021,221

113,845

14,268,400

11,902,900

940

64

%

2月

672.0024,34094,183

10,922,000

9,691,730

940

53

%

3月

704.5027,67989,345

13,797,400

11,769,900

939.69259%

計4,253.59

138,245624,843

76,613,900

64,509,420

939.9

59

%

ノード利用率(棒グラフ)＋コア利用率(折れ線グラフ)
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

ノード利用率
コア利用率

10月

11月

12月

1月

2月

3月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

14 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

システム B 運転状況 ( 2014 年 10 月 ～ 2015 年 3 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時システムダウン障害発生状況

サービス再開日時

保守時間[h]2014/１0/1３

9:00

2014/10/15

9:00

48.00

2014/12/15

9:00

2014/12/16

9:30

24.50

2015/03/03

6:00

2015/03/03

6:30

0.50

2015/03/30

9:00

2015/04/01

0:00

39.00

障害発生日時2014/１0/19

サービス再開日時

18:40

2014/10/19

ダウン時間[h]

19:15

0.58

２）サービス状況
バッチ

サービ
ス時間
[h]

処理
件数

経過
時間[h]

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

10 月

695.42

246,137

552,479

3,651,920

313,128

522.1

66

%

11 月

720.00100,592

631,172

3,900,750

321,901

532.9

69

%

12 月

719.50569,543535,630

4,009,880

332,823

529.9

67

%

1月

744.0073,200335,704

3,857,640

311,806

538.4

64

%

2月

672.00167,911

380,630

3,404,750

278,515

539.0

66

%

3月

704.5049,429220,624

3,394,210

265,401

526.6

55

%

計

4,255.42

1,206,812

2,656,239

22,219,150

1,823,574

531.5

65

%

ノード
利用率

ノード利用率(棒グラフ)＋コア利用率(折れ線グラフ)
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

ノード利用率
コア利用率

10月

11月

12月

1月

2月

3月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 15

システム C 運転状況 ( 2014 年 10 月 ～ 2015 年 3 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況

保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時システムダウン障害発生状況

サービス再開日時

保守時間[h]2014/１0/1３

9:00

2014/10/15

9:00

48.00

2014/12/15

9:00

2014/12/16

9:30

24.50

2015/03/03

6:00

2015/03/03

6:30

0.50

2015/03/30

9:00

2015/04/01

0:00

39.00

障害発生日時2014/１0/19

サービス再開日時

18:40

2014/10/19

ダウン時間[h]

19:15

0.58

２）サービス状況
バッチ

サービ
ス時間
[h]

処理
件数

経過
時間[h]

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

10 月

695.42

1,258

2,449

27,044

17,792

15.5

13

%

11 月

720.00

2,042

7,578

91,73454,287

16.0

34

%

12 月

719.50

1,065

11,277140,595

68,781

16.0

49

%

1月

744.00

4,011

9,760

174,260

82,452

16.0

57

%

2月

672.0013,78812,661

156,60276,498

16.0

49

%

3月

704.50

1,248

8,668

93,04343,194

15.9

35

%

計

4,255.42

23,412

52,393

683,278

343,003

15.9

40

%

ノード
利用率

ノード利用率(棒グラフ)＋コア利用率(折れ線グラフ)
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

ノード利用率
コア利用率

10月

11月

12月

1月

2月

3月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

16 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

システム D 運転状況 ( 2014 年 10 月 ～ 2015 年 3 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時システムダウン障害発生状況

サービス再開日時

保守時間[h]2014/10/13

9:00

2014/10/17

9:30

96.50

2014/12/15

9:00

2014/12/16

9:30

24.50

2015/03/03

6:00

2015/03/03

6:30

0.50

2015/03/15

6:30

2015/03/15

20:00

13.50

2015/03/30

9:00

2015/04/01

0:00

39.00

障害発生日時2014/１0/19

サービス再開日時

18:40

2014/10/19

ダウン時間[h]

19:15

0.58

２）サービス状況
バッチ

サービ
ス時間
[h]

処理
件数

経過
時間[h]

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

10 月

646.92

2,890

13,1192,046,710

54,080

253.7

45

%

11 月

720.002,817

11,9652,812,570

93,169

256.0

56

%

12 月

719.5045,96327,584

2,963,190

43,637

263.2

55

%

1月

744.0018,884

19,7882,422,050

177,310

271.9

43

%

2月

672.005,552

16,7552,256,940

179,508

274.9

43

%

3月

691.005,926

20,1802,599,670

135,035

304.0

40

%

計

4,193.42

82,032

109,389

15,101,130

682,738

270.6

47

%

ノード
利用率

ノード利用率(棒グラフ)＋コア利用率(折れ線グラフ)
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

ノード利用率
コア利用率

10月

11月

12月

1月

2月

3月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 17

システム E 運転状況 ( 2014 年 10 月 ～ 2015 年 3 月 )１）保守作業に伴うサービス休止およびシステムダウン障害発生状況
保守作業に伴うサービス休止
保守開始日時システムダウン障害発生状況

サービス再開日時

保守時間[h]障害発生日時

サービス再開日時

ダウン時間[h]2014/１0/1３

9:00

2014/10/15

9:00

48.00

2014/１0/19

18:40

2014/10/19

19:15

0.58

2014/12/15

9:00

2014/12/16

9:30

24.50

2014/１1/27

13:50

2014/11/27

16:15

2.42

2015/03/03

6:00

2015/03/03

6:30

0.50

2015/03/15

6:30

2015/03/15

20:00

13.50

2015/03/27

9:00

2015/04/01

0:00

111.00２）サービス状況
バッチ

サービ
ス時間
[h]

処理
件数

経過
時間[h]

占有
時間[h]

CPU
時間[h]

平均稼動
ノード数

10 月

695.42

2,569

15,061

2,018,010

57,587

396.0

84

%

11 月

717.582,268

12,3282,280,370

78,866

385.0

85

%

12 月

719.503,726

11,3802,154,520

62,946

385.1

88

%

1月

744.00

4,093

13,7142,640,190

78,231

385.9

91

%

2月

672.00

1,989

7,352

1,988,850

68,460

385.7

85

%

3月

619.00

1,237

7,652

2,100,900

53,945

393.6

82

%

計

4,167.50

15,882

67,486

13,182,840

400,035

388.5

86

%

ノード
利用率

ノード利用率(棒グラフ)＋コア利用率(折れ線グラフ)
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%

ノード利用率
コア利用率

10月

11月

12月

1月

2月

3月



占有時間 = 合計(経過時間×占有コア数)

平均稼動ノード数 = 電源 ON 状態のノード数の月平均 (10 分間隔のサンプリングデータより算出)



ノード利用率 = 稼動ノードに対するジョブが実行されているノードの割合

18 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

汎用コンピュータシステムのサービス状況  1. ホ ス テ ィ ン グ ・ ホ ー ム ペ ー ジ サ ー ビ ス 利 用 状 況 	 	 VM�����������
��0�
�00�

������������
��2�

�36�

�32�

�0��

�03�

�00�

WEB�����������

��0�
�00�
3�0�
300�

27��

273�

272�

270�

26��

262�

2�0�
200�
1�0�
100�
�0�
0�

2�

2�

3�

平成26年年10⽉月� 平成26年年11⽉月� 平成26年年12⽉月�

3�

3�

3�

平成27年年1⽉月�

平成27年年2⽉月�

平成27年年3⽉月�

(平成26年年10⽉月から平成27年年3⽉月)      大型計算機システム利用承認件数について    	  	  平成27年3月末現在、大型計算機システムの利用件数は、2,860件となっています。	
 京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 19

資料

大型計算機システム利用負担金
別表１ スーパーコンピュータシステム
コース

タイプ

セット

タイプA
タイプB
タイプC
パーソナル タイプD
タイプE

基本
基本
基本

エントリ

タイプG
タイプA1
タイプA2
タイプA3
タイプB1
タイプB2
タイプB3
タイプC1
グループ タイプC2

基本
基本
基本

12,600 円/年
100,000 円/年
100,000 円/年
100,000 円/年
100,000 円/年
100,000 円/年

基本

100,000 円/年

最小200,000 円/年
200,000 円/年
240,000 円/年
120,000 円/年
600,000 円/年
300,000 円/年
250,000 円/年
250,000 円/年
300,000 円/年
150,000 円/年
750,000 円/年
375,000 円/年
400,000 円/年
200,000 円/年
240,000 円/年
120,000 円/年
300,000 円/年
150,000 円/年
360,000 円/年
90,000 円/年
900,000 円/年
450,000 円/年
280,000 円/年
140,000 円/年
336,000 円/年
84,000 円/年
840,000 円/年
420,000 円/年
250,000 円/年
250,000 円/年
20,000 円/週(7日）
5,000 円/週(7日）
24,000 円/週(7日）
6,000 円/週(7日）
20,000 円/週(7日）
10,000 円/週(7日）
30,000 円/週(7日）
7,500 円/週(7日）
28,000 円/週(7日）
7,000 円/週(7日）
24,000 円/週(7日）
12,000 円/週(7日）
750,000 円/年
375,000 円/年
20,000 円/年

追加単位

最小
追加単位

最小
追加単位

最小
追加単位

最小
追加単位

最小
追加単位

最小
追加単位

最小

追加単位
最小
タイプD1
追加単位
最小
タイプD2
追加単位
最小
タイプD3
追加単位
最小
タイプE1
追加単位
最小
タイプE2
追加単位
最小
タイプE3
追加単位

タイプG1
タイプA
タイプB

最小
追加単位

最小
追加単位

最小

追加単位
最小
タイプC
追加単位
大規模ジョブ
最小
タイプD
追加単位
最小
タイプE
追加単位
最小
タイプG
追加単位

専用クラスタ―ライセンスサービス

利用負担額

最小
追加単位

提供サービス
経過時間
（時間）

ディスク
（GB)

利用者
番号

最大1ノード相当((16コア、64GBメモリ)×1)
最大4ノード相当((32コア、64GBメモリ)×4)
最大4ノード相当((16コア、64GBメモリ)×4)
最大2ソケット相当((8コア、384GBメモリ)×2)
最大2ノード相当((28コア、64GBメモリ)×2)
最大2ノード相当((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)

1
168
168
168
168
168

60
1,000
1,000
1,000
1,000
1,000

-

共有 最大2ノード相当((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×2)

168

1,000

-

4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)
336
優先
4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)
8ノード((32コア、64GBメモリ)×8)
336
準優先
A
4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)
8ノード((32コア、64GBメモリ)×8)
336
占有
4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
336
優先
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
8ノード((16コア、64GBメモリ)×8)
336
準優先
B
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
8ノード((16コア、64GBメモリ)×8)
336
占有
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
4ソケット((8コア、384GBメモリ)×4)
336
優先
2ソケット((8コア、384GBメモリ)×2)
C
4ソケット((8コア、384GBメモリ)×4)
336
準優先
2ソケット((8コア、384GBメモリ)×2)
4ノード((28コア、64GBメモリ)×4)336
優先
2ノード((28コア、64GBメモリ)×2)
8ノード((28コア、64GBメモリ)×8)
336
準優先
D
2ノード((28コア、64GBメモリ)×2)
8ノード((28コア、64GBメモリ)×8)
336
占有
4ノード((28コア、64GBメモリ)×4)
4ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×4)336
優先2ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)
8ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×8)
336
準優先
E
2ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)
8ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×8)
336
占有
4ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×4)
2ノード((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×2)
336
B
優先
(GPU)
2ノード((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×2)
8ノード((32コア、64GBメモリ)×8)A
占有
2ノード((32コア、64GBメモリ)×2)
8ノード((16コア、64GBメモリ)×8)
B
占有
2ノード((16コア、64GBメモリ)×2)
4ソケット((8コア、384GBメモリ)×4)
C
占有
2ソケット((8コア、384GBメモリ)×2)
8ノード((28コア、64GBメモリ)×8)
D
占有
2ノード((28コア、64GBメモリ)×2)
8ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×8)
E
占有
2ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)
4ノード((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×4)
B
占有
(GPU)
2ノード((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×2)
8ノード((16コア、64GBメモリ)×8)
B
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
可視化ソフト（AVS,ENVI/IDL)およびプリポストウェアの1ライセンスにつき

8,000
8,000
9,600
4,800
16,000
8,000
8,000
8,000
9,600
4,800
16,000
8,000
8,000
4,000
4,800
2,400
8,000
4,000
9,600
2,400
16,000
8,000
8,000
4,000
9,600
2,400
16,000
8,000
4,000
4,000
16,000
8,000

8
8
16
8
16
8
8
8
16
8
16
8
16
8
16
8
8
4
16
4
16
8
8
4
16
4
16
8
8
8
16
8

システム資源システム バッチ
B
A
B
C
D
E
B
(GPU)

共有
共有
共有
共有
共有
共有

備考
1． 利用負担額は、年度単位で算定している。また、総額表示である。
2． 大型計算機システムの全ての利用者は、上記表のサービスの他、次のサービスを受けることができる。
1） 大判プリンタサービス
2） その他、大型計算機システムが提供するサービス、機器の利用
3． 上記表の大規模ジョブコース、ライセンスサービスの申請には、大型計算機システムの利用者であることが必要である。
4． 「共有」： 当該カテゴリのユーザ間で一定の計算資源を共有するベストエフォートのスケジューリングを行う。
「準優先」： 定常稼働状況において記載値（以上）の計算資源が確保されるように優先スケジューリングを行う。
また、稼働状況によらず記載値の1/4の計算資源が確保されることを保証する。
「優先」： 定常稼働状況において記載値（以上）の計算資源が確保されるように優先スケジューリングを行う。
また、稼働状況によらず記載値の1/2の計算資源が確保されることを保証する。
「占有」： 稼働状況によらず記載値（以上）の計算資源が確保されることを保証する。
5． ディスク容量はバックアップ領域（最大で総容量の1/2）を含む。

20 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

6． グループコース及び専用クラスタコースのシステム資源は、下記の負担額を支払うことにより増量することができる。
なお増量は各月１日に実施し、増量した資源は当該年度末までの期間にわたって利用されるものとする。
コース

タイプ

追加負担金額（増量単位あたり）

4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)

タイプA320,000 円/月
12,000 円/月
30,000 円/月

タイプB125,000 円/月

4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)

タイプB2

15,000 円/月
37,500 円/月
20,000 円/月
12,000 円/月

4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)

タイプA1
タイプA2

タイプB3

グループ

専用クラスタシステム資源増量単位

タイプC1
タイプC2
タイプD1
タイプD2
タイプD3
タイプE1
タイプE2
タイプE3
タイプG1

―

15,000 円/月
9,000 円/月
45,000 円/月
14,000 円/月
8,400 円/月
42,000 円/月

25,000 円/月
37,500 円/月

4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)
4ノード((32コア、64GBメモリ)×4)

4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)
2ソケット((8コア、384GBメモリ)×2)
2ソケット((8コア、384GBメモリ)×2)
2ノード((28コア、64GBメモリ)×2)
2ノード((28コア、64GBメモリ)×2)
4ノード((28コア、64GBメモリ)×4)
2ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)
2ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×2)
4ノード((10コア、32GBメモリ + 1MIC)×4)
2ノード((16コア、64GBメモリ + 1GPU)×2)
4ノード((16コア、64GBメモリ)×4)

ディスク増量
（ＧＢ）

8,000
4,800
8,000
8,000
4,800
8,000
4,000
2,400
4,000
2,400
8,000
4,000
2,400
8,000

4,000
8,000

7． グループコース及び専用クラスタコースを通年でなく利用する場合には、下記の負担額を支払うものとする。
ただし、利用期間は当該年度内に限るものとする。
利用期間
最小
追加単位
最小
タイプA2
追加単位
最小
タイプA3
追加単位
最小
タイプB1
追加単位
最小
タイプB2
追加単位
最小
タイプB3
追加単位
最小
タイプC1
追加単位
最小
グループ
タイプC2
コース
追加単位
最小
タイプD1
追加単位
最小
タイプD2
追加単位
最小
タイプD3
追加単位
最小
タイプE1
追加単位
最小
タイプE2
追加単位
最小
タイプE3
追加単位
最小
タイプG1
追加単位
最小
専用クラス
―
タ コース
追加単位

タイプA1

3ヶ月
80,000 円
80,000 円
96,000 円
48,000 円
240,000 円
120,000 円
100,000 円
100,000 円
120,000 円
60,000 円
300,000 円
150,000 円
160,000 円
80,000 円
96,000 円
48,000 円

6ヶ月
120,000 円
120,000 円
144,000 円
72,000 円
360,000 円
180,000 円
150,000 円
150,000 円
180,000 円
90,000 円
450,000 円
225,000 円
240,000 円
120,000 円
144,000 円
72,000 円

9ヶ月
180,000 円
180,000 円
216,000 円
108,000 円
540,000 円
270,000 円
225,000 円
225,000 円
270,000 円
135,000 円
675,000 円
337,500 円
360,000 円
180,000 円
216,000 円
108,000 円

75,000 円
37,500 円
90,000 円
22,500 円
225,000 円
112,500 円
70,000 円
35,000 円
84,000 円
21,000 円
210,000 円
105,000 円

150,000 円
75,000 円
180,000 円
45,000 円
450,000 円
225,000 円
140,000 円
70,000 円
168,000 円
42,000 円
420,000 円
210,000 円

225,000 円
112,500 円
270,000 円
67,500 円
675,000 円
337,500 円
210,000 円
105,000 円
252,000 円
63,000 円
630,000 円
315,000 円

100,000 円
100,000 円
300,000 円
150,000 円

150,000 円
150,000 円
450,000 円
225,000 円

225,000 円
225,000 円
675,000 円
337,500 円

8． グループコース及び専用クラスタコースの利用者番号は利用者あたり年額5,000円を負担することで追加できる。
9 ． 機関・部局定額制度
他機関又は学内における部局（『国立大学法人京都大学の組織に関する規程』第3章第2節から第11節で定める組織をいう。）の組織が、その組織単位でグループコースサービス（年間）の利用を申請する場合、料金表(年間）に掲載額の1.5倍を利用負担金とする。なお、利用負担金額が150万円未満の場合は100人、150万円を超える場合は、150万円毎に100人までの利用者を認める。
10 ． スパコン連携サービス
学術情報メディアセンターのスーパーコンピュータシステムと密な連携により、学内における部局の組織が計算サーバ等を設置する
場合、下記の負担額を支払うものとする。
冷却方式
水冷
空冷

利用負担額
10,300 円/月
12,900 円/月

利用負担額算定単位
水冷冷却方式の計算サーバ等の定格電力 1kWにつき
空冷冷却方式の計算サーバ等の定格電力 1kWにつき

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 21

別表２（汎用コンピュータシステム）
区分
VMホスティングサービス
ホームページサービス
ストリーミングサービス

利用負担額
72,000円／年
6,000円／年
6,000円／年

単位
1仮想マシンにつき1ドメイン名につき1申請につき

備考
１．利用負担額は、総額表示である。
２．上記表の汎用コンピュータシステムのサービスを利用するためには、大型計算機システムの利用者であることが必要である。
３．VM ホスティングサービスにおいて、下記の負担額を支払うことにより CPU、メモリ、ディスクを増量することがで
きる。
利用負担額
18,000円／年
18,000円／年
18,000円／年

区分
CPU増量
メモリ増量
ディスク増量単位
2コアにつき（最大8コアまで）
8GBにつき（最大64GBまで）
200GBにつき（最大1,000GBまで）

４．VM ホスティングサービスにおいて VMware を用いる場合は、下記の負担額を支払うことにより VMware の利用及びCPU、メモリ、ディスクを増量することができる。ただし、システム資源が限られているためサービスの提供を限定することがある。
区分
VMware利用
CPU増量
メモリ増量
ディスク増量

利用負担額
72,000円／年
36,000円／年
36,000円／年
18,000円／年

単位
1仮想マシンにつき2コアにつき（最大8コアまで）
8GBにつき（最大64GBまで）
200GBにつき（最大1,000GBまで）

５．ホームページサービス及びストリーミングサービスにおいて、下記の負担額を支払うことにより公開スペースの上限を拡大することができる。
区分
公開スペース20GBプラン
公開スペース50GBプラン

利用負担額
3,000円／年
9,000円／年

６．利用負担額は、当該年度（4月から翌年3月まで）の利用に対して年額として算定するが、年度途中から利用を開始する場合には月数に応じて減額する。

別表３ スーパーコンピュータシステム（民間機関利用）
システム資源

システム

A

B

D

E

8ノード(32コア、64GBメモリ)×8)
12ノード(32コア、64GBメモリ)×12)
16ノード(32コア、64GBメモリ)×16)
8ノード(16コア、64GBメモリ)×8)
12ノード(16コア、64GBメモリ)×12)
16ノード(16コア、64GBメモリ)×16)
8ノード(28コア、64GBメモリ)×8)
12ノード(28コア、64GBメモリ)×12)
16ノード(28コア、64GBメモリ)×16)
8ノード(10コア、32GBメモリ + 1MIC)×8)
12ノード(10コア、32GBメモリ + 1MIC)×12)
16ノード(10コア、32GBメモリ + 1MIC)×16)

経過時間 ディスク
（時間）
（GB)

336
336
336
336
336
336
336
336
336
336
336
336

利用者
番号

9,600
14,40019,2009,600
14,40019,2009,600
14,40019,2009,600
14,40019,200

16
24
32
16
24
32
16
24
32
16
24
32

利用負担額
960,000 円/年
1,440,000 円/年
1,920,000 円/年
1,200,000 円/年
1,800,000 円/年
2,400,000 円/年
1,440,000 円/年
2,160,000 円/年
2,880,000 円/年
1,344,000 円/年
2,016,000 円/年
2,688,000 円/年

備考
1． 利用負担額は、年度単位で算定している。また、総額表示である。
2． ディスク容量はバックアップ領域（最大で総容量の1/2）を含む。
3． 通年でなく利用する場合には、下記の負担額を支払うものとする。
ただし、利用期間は当該年度内に限るものとする。
システム

A

B

D

E

システム資源
8ノード
12ノード
16ノード
8ノード
12ノード
16ノード
8ノード
12ノード
16ノード
8ノード
12ノード
16ノード

3ヶ月
240,000 円
360,000 円
480,000 円
300,000 円
450,000 円
600,000 円

利用期間
6ヶ月
480,000 円
720,000 円
960,000 円
600,000 円
900,000 円
1,200,000 円

9ヶ月
720,000 円
1,080,000 円
1,440,000 円
900,000 円
1,350,000 円
1,800,000 円

360,000 円
540,000 円
720,000 円
336,000 円
504,000 円
672,000 円

720,000 円
1,080,000 円
1,440,000 円
672,000 円
1,008,000 円
1,344,000 円

1,080,000 円
1,620,000 円
2,160,000 円
1,008,000 円
1,512,000 円
2,016,000 円

22 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

資料

全国共同利用版広報・Vol.13(2014)総目次［巻頭言］
センター長に就任して.....................................................................................................................................1-1
Vol.13，No.1 号の発刊にあたって ...............................................................................................................1-2
Vol.13，No.2 号の発刊にあたって ...............................................................................................................2-1［スーパーコンピュータシステム増強］
スーパーコンピュータ利用ガイド－2014 年度増強システムの概要と利用方法について－..........................................................................1-3［スーパーコンピュータ共同研究制度（若手研究者奨励枠）研究報告］
円形液膜内非定常マランゴニ対流の解明......................................................................................................2-2
大規模スケールでのブロック共重合体薄膜の自己組織化形状予測 ...........................................................2-4
ジブロックコポリマーの誘導自己組織化シミュレーション.......................................................................2-6
色素増感太陽電池を指向した新奇ポルフィリン系色素の構造と電子構造の解明 ....................................2-9
流水中の自然石に働く流体力の評価 ...........................................................................................................2-11
エノン写像の周期軌道展開.......................................................................................................................... 2-13行列分解タイルアルゴリズムのスーパーコンピュータシステムでの実装............................................. 2-15
固体表面特性の違いによる乱流構造の変化と抵抗低減効果の解明 ........................................................ 2-17構造がゆらぐ希土類錯体を用いる反応の生成物選択性・立体選択性はいかにして制御されているのか ............................................................ 2-19
多地域景気循環の同期現象に関する大規模数値解析 ............................................................................... 2-21
軌道分散の評価時間依存性から見る Lorenz system の軌道の予測可能性............................................ 2-23
溶融紡糸工程におけるドローレゾナンス現象のマルチスケールシミュレーション ............................. 2-25

［プログラム高度化支援事業研究報告］
高次精度差分法による高レイノルズ数乱流場における大規模構造の直接数値シミュレーション ...... 2-28
動的スケジューリング版タイル QR 分解の MPI/OpenMP ハイブリッド実装..................................... 2-34
大規模 GPU 計算による 3D イメージベース FIT の効率化 .................................................................... 2-38
動的／静的水～土骨格連成有限変形解析コードの高度化........................................................................ 2-44
コンクリート材料の物質拡散・非線形力学を連成した経年劣化シミュレータの高度化...................... 2-48

［スーパーコンピュータ共同研究制度（大規模計算支援枠）研究報告］
Synchronized Molecular Dynamics 法による高分子潤滑の解析........................................................... 2-52

［解説］
Cray Reveal によるスレッド並列化........................................................................................................... 2-57

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 23

［サービスの記録・報告］
スーパーコンピュータシステムの稼働状況とサービスの利用状況 ...............................................1-12, 2-68
センター利用による研究成果（平成 25 年度）......................................................................................... 2-74

［資料］
大型計算機システム利用負担金 別表..............................................................................................1-16, 2-78
全国共同利用版広報・Vol.12(2013)総目次 ................................................................................................ 1-19
サービス利用のための資料一覧 .........................................................................................................1-21, 2-81

［編集後記］
編集後記、奥付 ....................................................................................................................................1-22, 2-82

24 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

資料

―
1.

サービス利用のための資料一覧―

スーパーコンピュータシステム・ホスト一覧
システム A：camphor.kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム B・C：laurel. kudpc.kyoto-u.ac.jp


システム B（SAS 利用時）：sas.kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム D：magnolia.kudpc.kyoto-u.ac.jp



システム E：camellia.kudpc.kyoto-u.ac.jp※ ホストへの接続は SSH(Secure SHell) 鍵認証のみ、パスワード認証は不可

2.

問い合わせ先 & リンク集


情報環境機構のホームページ
http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/



学術情報メディアセンターのホームページ
http://www.media.kyoto-u.ac.jp/



スーパーコンピュータシステムに関する問い合わせ先

利用申請などに関する問い合わせ先【情報環境支援センター】
E-mail : zenkoku-kyo@media.kyoto-u.ac.jp / Tel : 075-753-7424
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/comp/

システムの利用など技術的な問い合わせ先【スーパーコンピューティング掛】
E-mail : consult@kudpc.kyoto-u.ac.jp / Tel : 075-753-7426
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/comp/contact.html



ホスティング・ホームページサービス関する問い合わせ先【クラウドコンピューティング掛】
E-mail : whs-qa@media.kyoto-u.ac.jp / Tel : 075-753-7494
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/whs/

コンテンツ作成支援サービスに関する問い合わせ先【コンテンツ作成室】
E-mail : cpt@media.kyoto-u.ac.jp / Tel : 075-753-9012
URL: http://www.iimc.kyoto-u.ac.jp/ja/services/content/

京都大学 学術情報メディアセンター 全国共同利用版［広報］Vol.14 No.1（ Oct. 2015）− 25

編集後記

編 集 後 記
編
編 集
集 後
後 記
記

今年の夏は暑かった。この猛暑は１０年前から予測されていた状況ではあるが、現実に体験すると体力が年々落ちてきている老体には厳しい。地球温暖化の影響ということで、異常気象や生態系の変化等、様々な事態に遭遇し、日本では昔ながらの四季の変化も感じられなくなっているようにも思える。昨今、科学技術
今年の夏は暑かった。この猛暑は１０年前から予測されていた状況ではあるが、現実に体験すると体力が今年の夏は暑かった。この猛暑は１０年前から予測されていた状況ではあるが、現実に体験すると体力がの発展は素晴らしいものが多々あるが、その中で何か犠牲になっているものがあることも否めない。がむし
年々落ちてきている老体には厳しい。地球温暖化の影響ということで、異常気象や生態系の変化等、様々な年々落ちてきている老体には厳しい。地球温暖化の影響ということで、異常気象や生態系の変化等、様々なゃらに生きてきて、今まで気付かなかったことが、一瞬立ち止まると、いろんなことを考えてしまう。吾輩事態に遭遇し、日本では昔ながらの四季の変化も感じられなくなっているようにも思える。昨今、科学技術事態に遭遇し、日本では昔ながらの四季の変化も感じられなくなっているようにも思える。昨今、科学技術の発展は素晴らしいものが多々あるが、その中で何か犠牲になっているものがあることも否めない。がむしの発展は素晴らしいものが多々あるが、その中で何か犠牲になっているものがあることも否めない。がむしの好きな役者であるジェームスディーンの言葉で「Dream
as if you'll live forever. Live as if you'll die
ゃらに生きてきて、今まで気付かなかったことが、一瞬立ち止まると、いろんなことを考えてしまう。吾輩ゃらに生きてきて、今まで気付かなかったことが、一瞬立ち止まると、いろんなことを考えてしまう。吾輩today」という名言がある。
「永遠に生きるつもりで夢を抱け。今日死ぬつもりで生きろ。
」という意味だが、の好きな役者であるジェームスディーンの言葉で「Dream
の好きな役者であるジェームスディーンの言葉で「Dream as
as ifif you'll
you'll live
live forever.
forever. Live
Live asas ifif you'll
you'll diedie
今日この頃この言葉の意味をしみじみと感じるようになった。さあ、今日も一日がんばろう！

today」という名言がある。
today」という名言がある。
「永遠に生きるつもりで夢を抱け。今日死ぬつもりで生きろ。
「永遠に生きるつもりで夢を抱け。今日死ぬつもりで生きろ。
」という意味だが、」という意味だが、傾奇者
今日この頃この言葉の意味をしみじみと感じるようになった。さあ、今日も一日がんばろう！
今日この頃この言葉の意味をしみじみと感じるようになった。さあ、今日も一日がんばろう！

傾奇者
傾奇者

京大のスパコンで動いていた C 言語プログラムを某他大学のスパコンでコンパイルしたら、syntax errorが大量に出てしまう。エラー箇所を確かめてみても「hz[x] = 0.0;」（ちなみに hz は z 方向の磁場）とか書い
京大のスパコンで動いていた
京大のスパコンで動いていた CC 言語プログラムを某他大学のスパコンでコンパイルしたら、syntax
言語プログラムを某他大学のスパコンでコンパイルしたら、syntax error
errorてあるだけでどこが構文エラーなのかまったくわからない。しばらく悪戦苦闘の末、そのコンパイラがが大量に出てしまう。エラー箇所を確かめてみても「hz[x]が大量に出てしまう。エラー箇所を確かめてみても「hz[x]==0.0;」
0.0;」
（ちなみに
（ちなみにhz
hzははzz方向の磁場）とか書い
方向の磁場）とか書い<time.h>（だったかな）を介してインクルードするヘッダファイルの中に「#definehz 100」の定義があるてあるだけでどこが構文エラーなのかまったくわからない。しばらく悪戦苦闘の末、そのコンパイラがてあるだけでどこが構文エラーなのかまったくわからない。しばらく悪戦苦闘の末、そのコンパイラがことを発見！
これはひどい。
<time.h>（だったかな）を介してインクルードするヘッダファイルの中に「#define<time.h>（だったかな）を介してインクルードするヘッダファイルの中に「#definehz
hz100」の定義がある
100」の定義がある

TASことを発見！
ことを発見！ これはひどい。
これはひどい。

TAS
TAS

京都大学学術情報メディアセンター全国共同利用版広報 Vol．14，No．1
京都大学学術情報メディアセンター全国共同利用版広報
京都大学学術情報メディアセンター全国共同利用版広報 Vol．14，No．1
Vol．14，No．1

20152015
年 1年
0 1月
3月
033日発行2015年
100 月
00 日発行日発行
広報編集部会
広報編集部会
広報編集部会
編集者
京都大学学術情報メディアセンター
編集者
編集者
京都大学学術情報メディアセンター
京都大学学術情報メディアセンター

深沢
圭一郎（部会長）
深沢
深沢 圭一郎（部会長）
圭一郎（部会長）

全国共同利用版広報編集部会
全国共同利用版広報編集部会
全国共同利用版広報編集部会

平石拓（副部会長）平石平石 拓（副部会長）
拓（副部会長）

水谷
水谷 幸弘
幸弘
水谷
幸弘

沢田
沢田
吉広
沢田吉広
吉広

京都大学学術情報メディアセンター
京都大学学術情報メディアセンター
京都大学学術情報メディアセンター

小林
小林 寿
寿
小林
寿

山口
山口
倉平
山口倉平
倉平

Academic
AcademicCenterCenterforComputing
Computing
and
and
Media
Media
Studies
StudiesAcademicCenterforforComputingandMedia
Studies

高見
高見 好男
好男
高見
好男

元木
元木
環環
元木環

発行者
発行者
〒606-8501〒606-8501
京都市左京区吉田本町
京都市左京区吉田本町
発行者〒606-8501
京都市左京区吉田本町

Kyoto
Kyoto
University
University
Kyoto
University

Tel.075-753-7400
075-753-7400
Tel. Tel.
075-753-7400

http://www.media.kyoto-u.ac.jp/
http://www.media.kyoto-u.ac.jp/

http://www.media.kyoto-u.ac.jp/

印刷所
印刷所 〒616-8102〒616-8102京都市右京区太秦森ヶ東町
京都市右京区太秦森ヶ東町21-10
21-10

印刷所 〒616-8102 京都市右京区太秦森ヶ東町 21-10
株式会社エヌジーピー
株式会社エヌジーピー

株式会社エヌジーピー

26 − Academic Center for Computing and Media Studies, Kyoto University

表紙デザイン：谷
表紙デザイン：谷 卓司
卓司

表紙デザイン：谷 卓司（ティアンドティ･デザインラボ）（ティアンドティ･デザインラボ）（ティアンドティ･デザインラボ）

Vol.14, No.1 2 15
Vol.14, No.1 2015

[巻頭言]・Vol.14, No.1 号の発刊に当たって ......................................................................................................................................................................................... 1
深沢圭一郎[スパコン応用研究]
・GPUを用いた非対称反平行磁気再結合の磁気流体計算 ......................................................................................................................................... 3
近藤光志，淵田泰介
・非線形電磁イオンサイクロトロン放射が地球内部磁気圏の高エネルギープラズマに与える影響 .............................................. 5
小路真史
・クラウドを活用したビッグデータポスト処理環境実現のためのデータ伝送実験：基礎実験編−HPCと高速伝送の融合を目指して−............................................................................................................................................................................. 7
村田健史，山本和憲，長屋嘉明，深沢圭一郎，伊達進，木戸善之，荻野正雄，南里豪志，建部修見，木村映善[研究会開催報告]
・STEシミュレーション研究会 −エクサスケールに向けて− 開催報告........................................................................................................ 11
深沢圭一郎[サービスの記録・報告]
・スーパーコンピュータシステムの稼働状況とサービスの利用状況............................................................................................................. 14[資料]・大型計算機システム利用負担金 別表............................................................................................................................................................................. 20
・全国共同利用版広報・Vol.13(2014)総目次.................................................................................................................................................................. 23・サービス利用のための資料一覧 ........................................................................................................................................................................................ 25[編集後記]
・編集後記、奥付 ........................................................................................................................................................................................................................... 26(October,2O15)

スパコン応用研究【巻頭言】「Vol.14，No.1 号の発刊にあたって」深沢 圭一郎【スパコン応用研究】「GPUを用いた非対称反平行磁気再結合の磁気流体計算」近藤 光志，淵田 泰介●「非線形電磁イオンサイクロトロン放射が地球内部磁気圏の高エネルギープラズマに与える影響」小路 真史●「クラウドを活用したビッグデータポスト処理環境実現のためのデータ伝送実験：基礎実験編−HPCと高速伝送の融合を目指して−」村田 健史，山本 和憲，長屋 嘉明，深沢 圭一郎，伊達 進，木戸 善之，荻野 正雄，南里 豪志，建部 修見，木村 映善【研究会開催報告】「STEシミュレーション研
究会−エクサスケールに向けて− 開催報告」深沢 圭一郎