RDEの操作方法手引き（一般利用者向け）～ データ登録、閲覧及びDL方法について～

物質・材料研究機構
技術開発・共用部門マテリアル先端リサーチインフラセンターハブ
データ共用事務局
2023年3月17日：作成
2023年11月22日：改訂

1

目次
1.

RDEログイン方法①

2.

RDEログアウト方法①

3.

RDEデータ登録アプリへのアクセスおよびログイン
仕掛データセット一覧画面
登録先データセットの選択
送り状入力
内容確認
データ登録状況詳細

データ閲覧方法
①
②
③
④⑤⑥
⑦

5.

ログアウト

データ登録方法
①
②
③
④⑤⑥

4.

DICEアカウントによるログイン

RDEデータ閲覧アプリへのアクセス
データ一覧へのアクセス
データ詳細画面へのアクセス
データ詳細画面の表示
概要タブ
ファイルタブ
添付ファイルタブ

データダウンロード方法①②③

データセットに登録されている全データの一括ダウンロード
特定のデータだけをダウンロード
補足： 「登録ファイル」、「添付ファイル」登録データのDL先フォルダについて

補足1. データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法
補足2. 送り状入力項目の修正方法
補足3. DICEアカウント作成方法及びプロフィール修正方法（参考） データセット開設方法

2

RDEログイン方法

1. RDEログイン方法

3

１．RDEログイン方法①DICEアカウントによるログイン方法 [1/3]
1. RDEのアプリにブラウザでアクセスします。
 RDEデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/
 RDEデータ登録アプリ https://rde-entry-arim.nims.go.jp/
2. 「DICEアカウントでログイン」 をクリックします。

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１．RDEログイン方法①DICEアカウントによるログイン方法 [2/3]
1. 「Use Name」 に、DICEアカウントとして登録したメールアドレスを入力します。
2. 「→Next」 をクリックします。

125

１．RDEログイン方法①DICEアカウントによるログイン方法 [3/3]1. 「Password」 に、DICEアカウントのパスワードを入力します。
2. 「→Next」 をクリックします。

126

RDEログイン方法

2. RDEログアウト方法

7

2．RDEログアウト方法① ログアウト
1. RDEでの操作が終了したら、確実にRDEからログアウトしてください。そうしないと、前のユーザ情報が残り、次のユーザのRDEログインが正しく行えない状況が発生するおそれがあります。
2. RDEページ右上の ログアウト ボタンをクリックします。
3. ブラウザを終了します。
2※ログアウトボタン押下げ後にブラウザを閉じることでログアウトが完了します8データ登録方法

3. データ登録方法

9

3．データ登録方法①RDEデータ登録アプリへのアクセスおよびログイン
1. データ登録アプリ https://rde-entry-arim.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
2. DICEアカウントでログインします。（※）

2※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

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3．データ登録方法②仕掛データセット一覧画面
1. 仕掛データセット一覧画面が表示されます。

11

3．データ登録方法③登録先データセットの選択 [1/3]1. 検索条件に、対象装置を入れるため、「選択」ボタンをクリックします。

※装置条件から検索する以外に、
 データセット名
 課題番号
 課題名を直接入力して検索することもできます。

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3．データ登録方法③登録先データセットの選択 [2/3]
1. 「機関」で、利用する装置を所有する機関をプルダウンから選び、「検索」ボタンをクリックします。
2. 検索結果で出てきた装置のうち、目的の装置のラジオボタンをクリックします。
3. 「選択」ボタンをクリックします。

1

1
2
3
※装置の検索においては、装置タイプやローカルID、装置名でさらに絞り込むことも可能です。

13

3．データ登録方法③登録先データセットの選択 [3/3]
1.
2.
3.
4.

選択した装置情報が、検索条件に入ります。
「検索」ボタンをクリックします。
装置に紐づいているデータセットが出てきます。
目的のデータセットの行をクリックします。

1

2
14

3．データ登録方法④送り状入力1. 登録するデータの情報を入力するための「送り状入力」画面になります。

送り状入力画面は、
 基本情報 試料情報 固有情報 実験データ登録ファイルアップロード欄
 添付ファイルアップロード欄（任意）で構成されています。

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3．データ登録方法④送り状入力 基本情報の入力
1. 基本情報を入力します。

記入年月日：自動入力です。
装置：対象装置をプルダウンから選択します。
（データセットの選択で装置から選んだ場合は、目的の装置名が自動入力されます）
データ投入者：ログインの方が自動表示されます。
データ所有者：研究チームメンバの中からプルダウンで選択します。
データ名：適切なデータ名を入力します。
実験ID：任意です。
説明：任意です。

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3．データ登録方法④送り状入力 試料情報の入力
1. 試料情報を入力します（新規試料の場合）。

試料ID：新規試料の場合、データ登録時に、自動で振られます。
試料名：試料名を入力します。
化学式・組成式・分子式など：任意です。
試料管理者：試料の管理者を研究チームメンバからプルダウンで選択します。

参考ＵＲＬ：任意です。
タグ：任意です。
試料の説明：任意です。
一般項目：任意です。
分類別項目：任意です。

173．データ登録方法④送り状入力 試料情報の入力
1. 既に登録されている試料情報を利用することも可能です。
2. 「試料選択」ボタンをクリックします。

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3．データ登録方法④送り状入力 試料情報の入力
3. 試料選択画面が表示されます。
4. 検索欄に試料情報を入れて、虫眼鏡アイコンをクリックします。または、ブランクで検索することも可能です。
5. 検索一覧から目的の試料のラジオボタンをクリックします。
6. 画面下部の「選択」ボタンをクリックします。
7. 選択した試料の情報が、試料情報画面に反映されます。

34
5

619

3．データ登録方法④送り状入力 固有情報の入力
1. 固有情報を入力します。固有情報とは、データファイルからは取得できないメタデータであって、手入力で入れるものです。
2. 固有情報は、対象とする装置や工程などで異なります。必須項目がある場合は、必ず入力してください。

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3．データ登録方法④送り状入力 データファイルの登録
1. 登録するデータファイル（※）を登録ファイルアップロード欄にドラッグ&ドロップするか、「ファイル選択」からデータファイルを選びます。

111※登録ファイルアップロード欄にはデータ構造化の対象データファイルを投入してください。
データ構造化の対象データファイルは、装置や工程ごとに異なります。
適切な拡張子のデータファイルを選択して、登録してください。

21

3．データ登録方法④送り状入力 添付ファイルがある場合（添付ファイルがない場合は投入不要です）
1. 添付ファイル（※）がある場合、添付ファイルアップロード欄にドラッグ&ドロップするか、「ファイル選択」からデータファイルを選びます。

111※添付ファイルアップロード欄にはデータ構造化対象外のファイルを登録することができます。
実験データ以外のファイルを入れることが可能です。
添付ファイルが必要ない場合は投入不要です。

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3．データ登録方法④送り状入力1. 各情報入力、データ投入が完了したら「内容確認」ボタンをクリックします。

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3．データ登録方法⑤内容確認
1. 入力内容を確認し、間違いがなければ、「登録開始」ボタンをクリックします。

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3．データ登録方法⑥データ登録状況詳細
1. データ登録状況詳細画面に移ります。
2. データエントリステータスは、「受付完了」→「データ構造化開始」→「正常終了 or 異常終了」と変わり、「正常終了」で終われば、データ登録完了です。

•

データ登録が完了するまで待っている必要はありません。

•

仮にブラウザを閉じても、サーバーでの処理は続行します。

•

データエントリーステータスは自動では変わりません。ブラウザの更新ボタンを適宜クリックしてください。

25

データ閲覧方法

4. データ閲覧方法

26

4．データ閲覧方法①RDEデータ閲覧アプリへのアクセス
1. RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
2. DICEアカウントでログインします。（※）
3. データ登録を行ったデータセットをクリックします。

3※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

27

4．データ閲覧方法②データ一覧へのアクセス
1. データセット詳細画面の「データ一覧」ボタンをクリックします。

28

4．データ閲覧方法③データ詳細画面へのアクセス
詳細を確認したいデータの、データ名をクリックします。

29

4．データ閲覧方法④データ詳細画面の表示

データ詳細画面は、
 データ概要
 ファイル
 添付ファイルの３つのタブがあります。

30

4．データ閲覧方法⑤概要タブ [1/2]

概要タブでは、 グラフ等のサムネ
 登録データのメタデータを確認することができます。

31

4．データ閲覧方法⑤概要タブ [2/2]

データのメタデータの情報です。

※日本語名の右横に「」のマークがついているもの

は、送り状入力画面において、手入力で入れたメタデータ（手入力項目）です。

32

4．データ閲覧方法⑥ファイルタブ

ファイルタブでは、
 Rawデータファイル
 データ構造化により作成されたファイル
 画像ファイルの一覧を確認することができます。

画像ファイルの右横の「」をクリックすると、画像を表示させることができます。

33

4．データ閲覧方法⑦添付ファイルタブ
添付ファイルタブでは、添付ファイルとして登録した関連ファイルの一覧を確認することができます。

添付ファイルの登録の仕方は以下を参考にしてください。
・データ登録時に添付ファイルも登録する場合 → ④送り状入力 添付ファイルがある場合
・データ登録後に添付ファイルを登録する場合 → 補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法34

データのダウンロード方法

5. データのダウンロード方法

35

5．データのダウンロード方法①データセットに登録されている全データの一括ダウンロードをする場合
1.
2.
3.

RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
DICEアカウントでログインします。（※）
ダウンロードしたいデータが登録されているデータセットをクリックします。

4. データセット詳細画面の利用履歴欄にある 「Download」 ボタンをクリックします。
5. zipファイルでダウンロードされます。

※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

36

5．データのダウンロード方法②特定のデータだけをダウンロードする場合
1.
2.
3.
4.
5.

RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
DICEアカウントでログインします。（※）
ダウンロードしたいデータが登録されているデータセットをクリックします。
「データ一覧」 ボタンをクリックします。
ダウンロードしたいデータの 「データ名」 をクリックします。

6. データ詳細画面の 「データダウンロード」 ボタンをクリックします。
7. zipファイルでダウンロードされます。

※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

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5．データのダウンロード方法③補足： 「登録ファイル」、「添付ファイル」登録データのDL先フォルダについて [1/2]
送り状入力 「登録ファイル」欄に投入されたデータのDLフォルダ先及び「添付ファイル」欄に投入されたデータのDLフォルダ先は以下になります。
1. 送り状入力 登録ファイル欄からアップロードしたデータはDLの際、rawデータ（登録したデータファイル）はZIPフォルダの中の「raw」フォルダに入っています。
構造化されたデータはZIPフォルダの中の「structured」フォルダに入っています。

送り状入力画面
DLしたZIPフォルダの典型的な内容

38

5．データのダウンロード方法
補足： 「登録ファイル」、「添付ファイル」登録データのDL先フォルダについて [2/2]
2. 送り状入力 添付ファイル欄からアップロードしたデータはDLの際、添付ファイルはZIPフォルダの中の「attachment」フォルダに入っています。

送り状入力画面
DLしたZIPフォルダの典型的な内容39

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法

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補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法
はじめに添付ファイルを追加する方法は2種類あります。
 データ登録時に登録送り状入力で行います。
3.データ登録方法に記載がありますのでそちらを参照してください。
④送り状入力 添付ファイルがある場合

 データ登録後に登録する
データ詳細画面より送り状編集で行います。
本補足1で登録方法を説明します。次項より参照してください。

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補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法①RDEデータ閲覧アプリへのアクセス
1. RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
2. DICEアカウントでログインします。（※）
3. 添付ファイルを登録したいデータが登録されているデータセットをクリックします。

3※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

42補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法②データへのアクセス [1/2]
1. データセット詳細画面の「データ一覧」ボタンをクリックします。

43

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法②データへのアクセス [2/2]1. 添付ファイルを登録したいデータの、データ名をクリックします。

44

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法③送り状編集1. 概要タブの「送り状編集」ボタンをクリックします。

45

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法④添付ファイル保存
1. 「送り状編集」画面の最下部に「添付ファイル」欄があります。
2. 登録する添付ファイルをドラッグアンドドロップするか、又は「ファイル選択」ボタンから、添付ファイルを選びます。

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補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法④添付ファイル保存
1. 添付ファイルについて、「アップロード完了」（※）が表示されます。
2. 「保存」ボタンをクリックします。

※この「アップロード完了」は、サーバーへの一時的なアップロードのことであり、まだ、RDEには保存（登録）されていません。

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補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法⑤添付ファイルの確認 [1/2]1. 添付ファイルを保存したデータのデータ詳細画面の「添付ファイル」タブをクリックします。
2. 保存した添付ファイルについて、ウイルススキャンが実行されます。

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補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法⑤添付ファイルの確認 [2/2]1. 適宜「Refresh」ボタンをクリックします。
2. ウイルススキャンが終わると、添付ファイルとして保存（登録）され、一覧表示されます。

49

補足1.データ登録後 新たに添付ファイルを登録する方法⑥添付ファイルが登録されている場合のデータダウンロード
1. 添付ファイルが保存（登録）されている場合、データをダウンロードすると、「attachment」フォルダが含まれます。
2. その「attachment」フォルダ内に、添付ファイルが格納されます。

50

補足2.送り状入力項目の修正方法

補足2.送り状入力項目の修正方法

51

補足2.送り状入力項目の修正方法①RDEデータ閲覧アプリへのアクセス
1. RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
2. DICEアカウントでログインします。（※）
3. 送り状入力項目を修正したいデータが登録されているデータセットをクリックします。

3※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

52

補足2.送り状入力項目の修正方法②データへのアクセス [1/2]
1. データセット詳細画面の「データ一覧」ボタンをクリックします。

53

補足2.送り状入力項目の修正方法②データへのアクセス [2/2]1. 修正したいデータの、データ名をクリックします。

54

補足2.送り状入力項目の修正方法③送り状編集 [1/3]
1. 概要タブの「送り状編集」ボタンをクリックします。

55

補足2.送り状入力項目の修正方法③送り状編集 [2/3]
1. 送り状編集画面になります。
2. 修正すべき項目について適宜修正します。

修正56

補足2.送り状入力項目の修正方法③送り状編集 [3/3]1. 修正すべき項目について、適宜修正します。
2. 修正が終わったら、「保存」ボタンをクリックします。

修正57

補足2.送り状入力項目の修正方法④修正確認
1. 概要タブのメタ情報欄で、修正した情報が反映されているか、確認します。
修正前

修正後

58

補足3. DICEアカウントの作成方法及び修正方法

補足3.DICEアカウントの作成方法及びプロフィール修正方法

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補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [1/6]
1. https://diceidm.nims.go.jp/csp/signedup/ にアクセスする。
2. 利用申請開始画面の「続行する」をクリックする。
3. 利用許諾画面での内容を確認して、「利用許諾の内容を確認した上で同意します。」にチェックを入れ、「続行する」をクリックする。

2360

補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [2/6]
4. メールアドレス（所属機関のもの）を入力して、「送信する」をクリックする。

4・組織のメールアドレスのみ可・Gmailなどのフリーメールは不可

61

補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [3/6]
5. 記入したメールアドレス宛に、認証コードの案内メールが来る。
6. 認証コード入力画面に、メールに記載された認証コードを入力し、「登録を開始する」をクリックする。

5662

補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [4/6]7. サインアップに必要な情報を入力して、DICEアカウント登録を行う。

7
・表示名は、氏名を入力
漢字表記か英語表記で入力
例：漢字表記：山田 太郎
英語表記：YAMADA, Taro
・漢字やカナについても入力※お問い合わせをさせていただくた
めに必要となりますので、ご記入をお願いいたします63補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [5/6]
8. サインアップ登録完了画面が表示される。

864

補足3. DICEアカウント作成方法
 1.DICEアカウントの作成（サインアップ） [6/6]9. 登録メールアドレス宛に、DICEアカウントのユーザ登録完了の案内メールが届く。
＜ご注意＞
DICEアカウントのユーザ登録完了のメール文中に9「DICE利用者ポータルにログインして、ご希望のサービスの利用申請を行ってください。
https://diceidm.nims.go.jp/csp/csp-user-portal」
登録したメールアドレスが表示されますと表記されておりますが、こちらは無視してください

この完了メールの到着でDICEアカウントは作成完了しています
一般ユーザには各機関のRDE利用申請方法に従いご案内ください
管理スタッフはNIMSデータ共用事務局までご申請ください※ＤＩＣＥアカウントはＲＤＥだけでなく、他の様々なＮＩＭＳのデータベースサービスに利用されています。
そのためにこのような表記があります。

65

補足3．DICEアカウントのプロフィール修正方法
 1. DICE利用者ポータルへのアクセス
1. Webブラウザのアドレスバーに https://diceidm.nims.go.jp/csp/csp-user-portal を入力する。
2. Use Name（メールアドレス）を入力して、「Next」をクリックする。
3. Passwordを入力して、「Next」をクリックする。

2366

補足3．DICEアカウントのプロフィール修正方法
 2．プロフィール画面の表示
4. DICE利用者ポータル画面が表示される。
5. 「プロフィール」をクリックする。

567

補足3．DICEアカウントのプロフィール修正方法
 3．修正及び保存
6. プロフィール情報の入力画面が表示される。

6

7. 必要な項目について、修正を行う。
8. 「保存する」をクリックする。

7・表示名は、氏名を入力
漢字表記か英語表記で入力
例：漢字表記：山田 太郎
英語表記：YAMADA, Taro
・漢字やカナについても入力※お問い合わせをさせていただくた
めに必要となりますので、ご記入をお願いいたします868（参考）データセットの開設方法（参考） データセットの開設方法
1. データセットを開設するには、アカウントがデータセット開設権限を有していることが必要です。
2. 通常、一般ユーザーはデータセット開設権限を有していません。

69

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設
1.
2.
3.
4.

［1/12］

RDEのデータ閲覧アプリ https://rde.nims.go.jp/ にブラウザでアクセスします。
DICEアカウントでログインします。（※）
データセット一覧画面の「グループ閲覧・データセット開設」をクリックします。
プルダウンから「グループ閲覧・データセット開設」を選んでクリックします。

34※ 詳しくは 「DICEアカウントによるログイン方法」 を参照してください。

70

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［2/12］

1. 全事業グループの画面になります。
2. 「マテリアル先端リサーチインフラ事業」をクリックします。

71

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［3/12］

1. マテリアル先端リサーチインフラ事業の画面になります。
2. 自己の機関名（組織名）をクリックします。
※この画面がどのように表示されるかは、ログインしているアカウントの権限や状況に依存します。

72

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［4/12］

1. 自己の機関（組織）の画面になります。
2. データセットを開設する研究チームをクリックします。
※一覧表示されているものは、作成された研究チームです。

73

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［5/12］

1. 選択した研究チームの詳細画面になります。
2. 「データセット開設」 ボタンをクリックします。

74

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［6/12］

1. データセットテンプレートを選択する画面（データセットテンプレート一覧）になります。
2. 開設するデータセットの目的とする装置に適したデータセットテンプレートを選択する必要があります。
3. 「選択」 ボタンをクリックします。

75

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［7/12］

1. 装置選択※の画面になります。
2. 機関：自己の機関をプルダウンから選択します。
3. 「検索」 ボタンをクリックします。検索結果に出てきた装置の中から、目的の装置のラジオボタンをクリックします。
4. 「選択」 ボタンをクリックします。

※装置選択においては、装置タイプや、ローカルID、装置名を入れて、より絞り込むことも可能です。

3476

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［8/12］

1. データセットテンプレート一覧画面で、先ほど選択した装置が選ばれています。
2. 「検索」 ボタンをクリックすると、選択した装置に紐づいているデータセットテンプレートが出てきます。
3. 使用するデータセットテンプレートをクリックします。

2377

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［9/12］

1. データセットの基本情報を入力する画面になります。
2. 一連の入力が終わりましたら、「次へ」 ボタンをクリックします。
課題番号：研究チームに紐づいている課題番号のみ選べます。
データセット名：課題名など、適切な名前を入力します。
データセット管理者※1：
研究チームのメンバの中から選びます。
エンバーゴ期間終了日：
エンバーゴ期間の終了日をカレンダーから選択します。
エンバーゴ期間は、通常２年です。
開設日から2年後の日の属する年度の年度最終日がエンバーゴ期間終了日※2です。
公開範囲：初期値から変更できません。

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（参考）データセットの開設方法
 データセット開設［10/12］

1. 入力内容の確認画面になります。
2. 入力内容を確認し、「開設」 ボタンをクリックします。
3. 入力内容を変更する場合は、「戻る」 ボタンをクリックしますと、前の「(開設)データセット基本情報入力」画面に戻ります。

79

（参考）データセットの開設方法 データセット開設 ［11/12］
1. データセットが開設されました。

80

（参考）データセットの開設方法
 データセット開設 ［12/12］
補足：※1 データセット管理者
データセットの管理責任者。研究チームの「研究チーム管理者」、「研究チーム管理者代理」、「研究チームメンバ」のいずれかの役割（ロール）を与えられている人がなれます。
データセットに対するデータ登録、データ閲覧、データDL、データ削除が可能です。

※2 エンバーゴ期間終了日
開設日から2年後の日の属する年度の年度最終日（計算方法）
例1：
開設日：2023年4月1日
開設日から2年後の日：2025年4月1日
2025年4月1日が属する年度の年度最終日：2026年3月31日
よって、エンバーゴ期間終了日は、「2026年3月31日」となります。
例2：
開設日：2024年3月31日
開設日から2年後の日：2026年3月31日
2026年3月31日が属する年度の年度最終日：2026年3月31日
よって、エンバーゴ期間終了日は、「2026年3月31日」となります。

81