第 25 回分子シミュレーション討論会
講演番号 1 桁目

講演プログラム（2011/12/5 版）: 発表日

講演番号 2, 3 桁目 : 通し番号（口頭発表，ポスターそれぞれに通し番号あり）
講演番号記号: L=25 分講演（発表 20 分＋討論 5 分）

IL=招待講演（発表 45 分＋討論 5 分）
AL=受賞講演（発表 30 分）

講演者記号: S=15 分講演（発表 12 分＋討論 3 分）
: P=ポスター発表: ○印=発表者

1 日目

12 月 5 日（月）— 昼食 13:00-14:00 —— 午後の部 —9:15-9:45
9:45-9:55

開場，受付
開会の辞
会長 河村雄行（岡山大環境）— 午前の部 —9:55-10:55 口頭発表 A

14:00-15:00 ポスター発表 1 後半
101P–163P（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 休憩 15:00-15:05 —15:05-15:50 口頭発表 B

座長：松本充弘（京大工）座長：松林伸幸（京大化研）

101S 高分子溶融体中のミクロスコピックな状態の履歴（京大工，JST-CREST） ○村島隆浩，谷口貴志
102S Monte Carlo simulations of short chain
branched polyoleﬁns: structure and entanglements (242P)（1 Mitsui
Chemicals,Inc.，2 Mitsui
Chemicals Analysis and Consulting Services，3 CSIC Madrid，4 National Technical
University of Athens）○1 K. Moorthi, 2 K.
Kamio, 3 J. Ramos, 4 D. N. Theodorou
103S ガラス状態の非平衡性とエントロピーに関する考察（旭硝子中研） ○高田章
104S リチウムジシリケート融体およびガラスにおけるフレームワーク構造の分子動力学（東工大総合理工） ○巾崎潤子

106S クーロンレプリカ交換法による水中のアラニンジペプチドのシミュレーション（分子研，総研大） ○伊藤暁，奥村久士
107S 脂質２重膜表面でのプロトンの振る舞い(221P)（東大先端研1 ，シカゴ大化学2 ） ○山下雄
史1 ，G. A. Voth2
108S 糖脂質分子膜の水素結合様式の解析（産総研，JST-CREST） ○高岩大輔，篠田渉— 休憩 10:55-11:10 —11:10-12:00 招待講演 1
座長：増渕雄一（京大化研）

105IL 高分子溶液の乾燥（東大工） 土井正男

12:00-13:00 ポスター発表 1 前半
101P–163P（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 休憩 15:50-16:05 —16:05-17:00 口頭発表 C
座長：吉井範行（名大工）109L 圧力分布解析によるベシクルの物性評価：分子論から弾性論への橋渡し（産総研，JST-CREST） ○中村壮伸，篠田渉
110S 脂質混合膜における形態変化（理研1 ，計算科学機構2 ） ○小串典子1 ，小林俊秀1 ，杉田有治1,2111S 脂質２重膜における粘弾性とトラップ時間のベキ則（慶大理工1 ，理研2 ，慶大医3 ）○秋元琢磨1 ，山本詠士1 ，泰岡顕治1 ，平野秀典2 ，安井正人32 日目

12 月 6 日（火）— 午前の部 —9:00-10:10 口頭発表 D
座長：志賀基之（原子力機構）

201S 第一原理拡張アンサンブルシミュレーション
による分子内プロトン移動反応の研究（名大理1 ，名大工2 ）○森義治1 ，岡本祐幸1,2
202L 水分解酸素発生を可能とする Photosystem
II における電子移動・プロトン移動（京大生命科学系キャリアパス，JST さきがけ） ○石北央，斉藤圭亮
203S 光合成蛋白質中におけるクロロフィル二量体上の正電荷分布の起源 (141P)（京大生命科学系キャリアパス，JST さきがけ）○斉藤圭亮，石北央
204S 第一原理分子動力学法による Li-N-H 水素貯蔵系に対する TiCl3 の触媒作用の研究（広大総合科1 ，熊本大自然2 ，広大先進セ3 ，広大先端研4 ） ○山根阿樹1 ，下條冬樹2 ，星野公三1 ，市川貴之3,4 ，小島由継3,4— 休憩 10:10-10:25 —10:25-11:35 口頭発表 E
座長：三浦伸一（金沢大理工）

205L 第一原理分子動力学法による光捕集性デンド
リマーのエネルギー伝達機構（熊大自然1 ，熊大衝撃セ2 ） ○大村訓史1 ，赤井一郎2 ，下條冬樹1
206S 分子動力学シミュレーョンによるπ共役系高分子 PPV の励起エネルギー移動ダイナミク
スの研究（名大工1 ，テキサス大2 ） ○山田篤志1 ，P.
J. Rossky2
207S 高密剛体球系における遅い緩和の起源：トランジェントな結晶化と高次秩序変数（ 名 工 大 工1 ，Lawrence Livermore Nat’lLab.2 ） ○礒部雅晴1 ，B. J. Alder2
208S 剛体球模型を用いたコロイドエピタキシーのモンテカルロシミュレーションにおける多結晶化の回避（徳島大ソシオテクノサイエンス研） ○森篤史，鈴木良尚，松尾繁樹

11:35-12:35 ポスター発表 2 前半
201P–262P（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 昼食 12:35-13:35 —— 午後の部 —13:35-14:35 ポスター発表 2 後半
201P–262P（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 休憩 14:35-14:40 —14:40-15:25 口頭発表 F
座長：森下徹也（産総研）

209S 古典的分子動力学法を用いたシリコンナノワ
イヤ中の熱輸送およびフォノン解析 (133P)（京大工） ○三枝琢己，鷹尾祥典，江利口浩二，斧高一
210S 原子空孔を含むグラファイトの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション（愛媛大工） ○伊藤明彦，岡本伸吾
211S 液体中の縦波と横波の mixing（広大総合科学） ○宗尻修治，星野公三— 休憩 15:25-15:40 —15:40-16:15 学術賞受賞講演
座長：泰岡顕治（慶大理工）

212AL 生体膜の粗視化シミュレーション（東大物性研） 野口博司

— 休憩 16:15-16:30 —16:30-17:20 招待講演 2
座長：河村雄行（岡山大環境）

213IL ニューガラス開発への分子動力学の応用（東工大応用セラミックス研） 伊藤節郎

17:20-18:00 研究会総会
司会：岡崎進（名大工）議長は当日選出

18:30-20:30 懇親会
食堂棟 2 階 季の味ガーデン

3 日目

12 月 7 日（水）— 午前の部 —9:00-10:25 口頭発表 G— 昼食 12:50-13:40 —— 午後の部 —13:40-14:50 口頭発表 I座長：光武亜代理（慶大理工）

座長：奥村久士（分子研）

301L 高並列汎用分子動力学シミュレーションソフ
ト Modylas の開発（ 名 大 工1 ，金 沢 大 計 算2 ，分 子 研3 ，理 研
AICS4 ，富士通5 ） ○安藤嘉倫1 ，吉井範行1 ，
藤本和士1 ，山田篤志1 ，岡崎進1 ，川口一朋2 ，長尾秀実2 ，岩橋健輔3 ，水谷文保3 ，南一生4 ，市川真一5302S 変分経路積分分子動力学法の分子系への適用について（金沢大理工） ○三浦伸一
303S マルチバーリック・マルチサーマル分子動力学シミュレーションによるシニョリンの温度・圧力変性（分子研，総研大） ○奥村久士
304S 拡張アンサンブル法によるタンパク質とリガンドの結合構造予測 (244P)（武田薬品探索研1 ，名大理2 ） ○小久保裕
功1 ，田中稔祐1 ，岡本祐幸2305S 分子数適応階層型 QM/MM-MD 法による水和構造の理論的研究（名大情報科学1 ，JST-CREST2 ） ○竹中
規雄1,2 ，北村勇吉1 ，小谷野哲之1,2 ，長岡正隆1,2310L 平均力ダイナミクスによる新しい自由エネル
ギー計算手法（産総研1 ，分子研2 ，総研大3 ） ○森下徹也1 ，伊藤暁2,3 ，三上益弘1311S エネルギー分布関数を用いた自由エネルギーの厳密計算 (234P)（分子研1 ，京大化研2 ） ○桜庭俊1 ，松林伸幸2
312S 溶媒和自由エネルギー計算を用いたアミノ酸アナログおよび cytochrome c への尿素効果に関する研究 (209P)（京大化研） ○狩野康人，松林伸幸
313S 分子動力学法による，メタン・水分子の水相から SDS ミセル核中への移行の自由エネル
ギープロフィール（名大工） ○藤本和士，吉井範行，岡崎進— 休憩 10:25-10:40 —10:40-11:45 口頭発表 H
座長：礒部雅晴（名工大工）

306L 分子動力学計算によるサブミクロン微粒子相互作用の解明（北大低温研） ○田中秀和
307S タンパク質分子の主鎖二面角についてアミノ酸ごとに最適化した力場パラメータ（名大理1 ，名大工2 ）○榮慶丈1 ，岡本祐幸1,2
308L 完全固体と完全流体の相平衡（法政大生命） ○片岡洋右，山田祐理— 休憩 11:45-12:00 —12:00-12:50 招待講演 3座長：秋元琢磨（慶大理工）309IL 細胞膜のメゾドメインを１分子追跡で調べる（京大 iCeMS / 再生医科学研） 楠見明弘

— 休憩 14:50-15:05 —15:05-15:50 口頭発表 J座長：甲賀研一郎（岡山大自然）

314S 球状錯体 M6 L8 の自己組織化シミュレーション（産総研1 ，東大2 ） ○米谷慎1 ，山口智彦2 ，藤田誠2315S 分子サイズの溶質に対する水の誘電的な性質（九大理） ○久保田陽二，秋山良
316S 生体分子表面における水分子の滞在時間を決める要素について (247P)（原子力機構） 米谷佳晃，河野秀俊— 休憩 15:50-16:05 —16:05-17:00 口頭発表 K
座長：篠田渉（産総研）

317L 振動和周波スペクトルからみえる水表面の水素結合構造（東北大理1 ，理研2 ） ○石山達也1 ，李徳冠1 ，二本柳聡史2 ，山口祥一2 ，田原太平2 ，森田明
弘1

318S Structure and dynamics of water conﬁned
between water-monolayers（岡大自然科学） ○ L. Hakim, M. Matsumoto, H. Tanaka
319S 凹凸面における水滴の接触角ヒステリシスの導出（福井大工1 ，慶大理工2 ，Univ. Nebraska3 ，理研4 ） ○古石貴裕1 ，泰岡顕治2 ，X. C.
Zeng3 ，藤川茂紀4

17:00-17:05 閉会の辞
委員長 河村雄行（岡山大環境）

ポスター発表 1 （1 日目）
101P 超好熱菌由来タンパク質を用いたタンパク質結合のシミュレーション(東京薬科大生命) ○福田真己，小松勇，森河良太，宮川毅，高須昌子，赤沼哲史，山岸明彦
102P 量子古典混合系近似に基づく分子動力学シ
ミュレーションを用いた無極性溶媒中とプロトン性極性溶媒中におけるマロンアルデヒドの分子内プロトン移動の反応機構(名大工) ○小嶋秀和，山田篤志，岡崎進
103P 積分方程式理論から求められる三体分布関数の MC による評価(九大理) 久保田陽二，○秋山良104P 古典分子動力学シミュレーションによる Liion 二次電池の有機混合溶媒電解液解析(ソニー) ○中本光則，永井さえ，森川淳子，武志一正
105P ベンゼン・クラスター (C6 H6 )n (n = 2 - 30)
における成長過程のシミュレーション(北大理) ○竹内浩
106P リポソームの安定性解析(産総研) ○篠田渉，中村壮伸
107P 光合成膜タンパク質 PSII の Mn4 O5 Ca クラスターに熱ゆらぎを取り込んだ理論的研究(東工大生命理工1 ，理研2 ，東京薬科大3 ) ○打田和香1 ，木村嘉朗1 ，畠山允1 ，若林政光2 ，中田浩弥1 ，緒方浩二2 ，横島智2,3 ，中村振一郎1,2108P ハ イ ブ リッド 汎 関 数 を 用 い た ル チ ル 型
TiO2 (110) 表面における酸素欠陥由来の磁性状態の解析(慶大理工1 ，Uppsala University2 ) ○澁谷泰蔵1 ，S. Mirbt2 ，B. Sanyal2 ，泰岡顕治1109P Computational analysis of G9a-inhibitor interactions(理研) ○沖本憲明，平野秀典，大塚教雄，森本元太郎，藤田茂雄，泰地真弘人
110P クラスター展開法によるジメチル [6] ヘリセンの円二色スペクトルの解析(阪大工) 仲井義人，○森直，楊成，福原学，井上佳久
111P キャンセル
112P NICS 値によるグラフェンフラグメントの芳香族性に関する理論的研究(京大工) ○津村佳弘，笛野博之，田中一義
113P 正常及びがん化細胞膜への薬剤低分子の膜透過自由エネルギープロフィール(名大工) ○伊藤太一，安藤嘉倫，岡崎進
114P FN-III ドメイン間ループ構造の MD シミュ
レーションを用いた解析(東大先端研 LSBM) ○篠田恵子，藤谷秀章
115P アミロイドβタンパク質と単糖間の特異的結合特性の解析：古典分子力学及びフラグメン
ト分子軌道計算(豊橋技科大情報1 ，村田製作所2 ，九大工3 )○野村和哉1 ，岡本晃澄1 ，矢野篤志1 ，檜貝信
一2 ，近藤孝志2 ，神波誠治2 ，三浦佳子3 ，栗田典之1116P 2 種類の陽イオンを含む溶融塩混合系の構造と動的性質(長岡高専) ○松永茂樹
117P Self-consistent treatment for fully relativistic eﬀects in the small bismuth clusters(1 Kanazawa University, 2 Bandung Instituteof Technology) ○ E. Aprilia1,2 , H. Katou1 ,J. Gotou1 , S. Haraguchi1 , Suprijadi2 , T.
Oda1
118P Ca3 CoMnO6 における三角格子の交換相互作用と電気分極の第一原理計算(金沢大自然1 ，金沢大理工2 ) ○西田美穂1 ，石井史之2 ，斎藤峯雄2
119P 拡張アンサンブル分子動力学による低分子系の固液相転移現象の研究(慶大理工1 ，ネブラスカ大化学2 ) ○金子敏
宏1 ，泰岡顕治1 ，光武亜代理1 ，X. C. Zeng2120P Rashba eﬀect on Tl/Si(111)1x1 surface(金沢大自然1 ，金沢大理工2 ) ○ L. Li1 , H.
Kato1 , A. Araki1 , J. Goto1 , T. Oda2

121P Hras-GTP 結合系ならびに Hras-GDP 結合系の分子動力学シミュレーション(東京薬科大生命科学1 ，金城大医療健康2 ，金沢大理工3 ) ○宮川毅1 ，森河良太1 ，高須昌子1 ，杉森公一2 ， 川口一朋3 ，齋藤大明3 ，長尾秀実3122P MD-LBM 連成計算による微小気泡の解析(京大工) ○稲岡篤志，松本充弘，並河遼
123P 光化学系 II・四核 Mn クラスターの酸化数配置に関する理論的研究(東工大1 ，理研2 ，東京薬科大3 ) ○畠山允1 ，緒方浩二2 ，横島智1,3 ，中村振一郎1,2
124P 二次元人工原子のポリヤッド内エネルギー準位構造(日大理工1 ，日大文理2 ，日大量科研3 ) ○佐甲徳栄1 ，石田浩2 ，藤川和男3
125P 分子間ポテンシャルの検討(日本 SGI) ○林宗市，福本淳司
126P アミノ酸アナログに対する尿素およびそのアルキル化物の共溶媒効果の自由エネルギー解析(京大化研) ○ 楷旻，狩野康人，桜庭俊，松林伸幸
127P 荷電コロイド粒子まわりのイオン分布(京大工) ○池田一郎，松本充弘
128P 不凝縮ガスを含んだ液体酸素中における気泡核生成の分子動力学解析(信州大工) ○田中博之，津田伸一，平田哲夫
129P トリスビピリジン鉄 (II) 錯体のポテンシャルモデルの開発：水溶液中における低・高スピン状態の分子動力学シミュレーション(名大情報科学) ○井内哲
130P 第一原理引張試験によるシリカガラスの破壊解明及び水分子が与える影響(名工大) ○水越智彦，中村貴英，田村友幸，尾形修司
131P コロイドゲルにおけるエイジング現象(岐阜大工) ○寺尾貴道
132P 二次構造を拘束した proteinA のフォールディングシミュレーション(名大理) ○森正統，岡本祐幸
133P 古典的分子動力学法を用いたシリコンナノワ
イヤ中の熱輸送およびフォノン解析 (209S)(京大工) ○三枝琢己，鷹尾祥典，江利口浩
二，斧高一
134P 高分子粗視化モデルのポテンシャル検討(トヨタ自動車) ○諸星圭，小西正晃
135P 珪酸塩ガラスのアルカリ自己拡散に関する分子動力学計算: 共存するアルカリ土類イオンの影響(日本板硝子1 ，岡山大環境2 ) ○白木康一1 ，河村雄行2

136P LIPS 法：均一系および不均一系の長距離相互作用計算に対応した一般化 IPS 法の開発
(慶大理工1 ，電通大情報2 ) ○高橋和義1 ，成見哲2 ，泰岡顕治1137P グラフェン・ナノチューブ上の固有欠陥における第一原理計算(金沢大自然) ○西田和永，林建波，斎藤峯雄
138P 膜透過ペプチドの脂質二重膜内における自由エネルギー(産総研1 ，東京薬科大2 ，金沢大学3 ，京大化研4 ) ○川本周平1 ，高須昌子2 ，宮川毅2 ，森河良太2 ，小田竜樹3 ，齋藤大明3 ，二木史朗4 ，長尾秀実3139P 水和粘土鉱物の粘性の MD 計算(岡山大環境) ○河村雄行
140P ハイブリッド量子-古典法を用いた SiO2 破壊過程の解明(名工大) ○島田貴章，中村貴英，田村友幸，尾形修司
141P 光合成蛋白質中におけるクロロフィル二量体上の正電荷分布の起源 (203S)(京大生命科学系キャリアパス，JST さきがけ) ○斉藤圭亮，石北央
142P ペリクレース (MgO) 中に含まれる空孔の分子動力学シミュレーション(京大理) ○植田康浩，三宅亮
143P Condensation on cubic seeds by moleculardynamics(慶大理工) ○ D. Suh, K. Yasuoka
144P 量子統計に従ったプロトン移動反応の経路探索(原子力機構) ○志賀基之
145P タンパク質構造変化における最小自由エネル
ギー経路の解析(理研1 ，日医大物理2 ，東大農学生命3 ，横浜市大生命ナノ4 ) ○松永康佑1 ，藤崎弘士1,2 ，
寺田透1,3 ，木寺詔紀1,4
146P タンパク質分子内の残基間エネルギー伝導度の解析(名大理) ○波多野達朗，石倉孝一，倭剛久
147P ボルツマン方程式に基づくエネルギー輸送解析(京大工) ○今西保奈美，進藤拓人，正尾裕輔，松本充弘
148P キャンセル
149P Pd 合金水素化物の電子状態計算(富山大総合情報セ1 ，富山大水素研2 ) ○布村紀男1 ，原 正憲2 ，赤丸悟士2

150P 双頭型両親媒性高分子溶液の相構造の散逸粒
子動力学シミュレーション(横国大工1 ，名大2 ，京都工繊大工芸3 ，核融合研4 ) ○白崎良演1 ，フウジュン・ジャン2 ，藤原進3 ，中村浩章4151P fcc プラスチック相の水の微視的性質(岡山大院自然) ○中田秀平，田中秀樹，松本正和
152P First-priciples calculations of hydrogen
dimers in graphene and carbon nanotubes(1 Kanazawa University, 2 Bandung Instituteof Technology, 3 University of Tokyo) ○ M.
S. Alam 1 , F. Muttaqien1,2 , A. Setiadi1,2and M. Saito1,3153P コレステロールを含んだ脂質二重膜の水分子透過性(金沢大理工1 ，産総研2 ，JST-CREST3 ) ○齋
藤大明1,3 ，篠田渉2,3154P 第一原理 QM/MM 法における効率的な長距
離静電相互作用計算のための仮想点電荷エワルド法(名大情報科学1 ，阪府大理2 ，JST-CREST3 )○山田健太1,3 ，麻田俊雄2,3 ，古賀伸明1,3 ，長岡正隆1,3
155P ミオシンの大規模構造変化と力発生機構：レプリカ交換アンブレ ラサンプリング法を用いた自由エネルギー計算からの示唆(早大先進理工) ○大貫隼，佐藤昂人，高野光則
156P 動的構造因子に基づく単純液体の熱拡散率評
価(新潟大理1 ，新潟大自然2 ，パリ第 6 大3 ，オックスフォード大4 ) ○石井良樹1 ，佐藤圭介2 ，根岸裕太2 ，大鳥範和1 ，M. Salanne3 ，P. A.
Madden4157P 自由エネルギー計算による機能性分離膜の物
質透過性の研究(東レ1 ，京大化研2 ) ○川上智教1 ，北畑雅弘1 ，茂本勇1 ，松林伸幸2158P レプリカ交換分子動力学シミュレーションによる水中 N 型糖鎖の構造多様性とその調節機構の研究(理研) ○二島渉，宮下尚之，山口芳樹，杉田有治，李秀栄
159P 単一アミノ酸ポテンシャル力場を用いた低分子ペプチドの構造探索(東海大理) ○出立兼一，下里卓，峯崎俊哉，岩岡道夫
160P 氷の熱力学的安定性(岡山大自然) ○中村竜也，松本正和，田中秀樹
161P 外圧の増加が脂質二重膜内のキセノン分子へ与える影響(慶大理工1 ，理研2 ，慶大医3 ) ○山本詠士1 ，秋元琢磨1 ，平野秀典2 ，泰岡顕治1 ，安井正人3
162P アルコールハイドレートの第一原理分子動力学シミュレーション(慶大理工) ○平塚将起，大村亮，泰岡顕治
163P ミトコンドリアへの輸送蛋白質に付加されたプレ配列認識モデルの分子動力学計算による検証(中央大理1 ，理研2 ，九大生医研3 ) ○小室靖
明1 ，森貴治2 ，宮下尚之2 ，宗行英朗1 ，齊藤
貴士3 ，神田大輔3 ，杉田有治2

ポスター発表 2 （2 日目）
201P 分子内相互作用を有するキラル有機化合物の理論円二色スペクトルに関する研究(阪大工) ○森直，楊成，井上佳久
202P 平均力を用いた二次元モデル化シミュレー
ションによる POPC 二重層膜中でのコレステロール側方配置の研究(名大工1 ，JASRI2 ) ○大野公子1 ，安藤嘉倫1 ，岡崎進1 ，八田一郎2203P 分子動力学法を用いたヒストンタンパク質の構造解析(東京薬科大生命) ○藤森亮，小松勇，宮川毅，森河良太，高須昌子
204P レプリカ交換法による主鎖のたわみを利用した膜たんぱく質の立体構造予測 (名大理1 ，名大工2 ) ○浦野諒1 ，岡本祐幸1,2
205P プロトン化した水クラスターの構造とゆらぎ(金沢大自然) ○住田由加里，三浦伸一
206P ナノチャネルに閉じ込められた界面活性剤水溶液の散逸粒子動力学シミュレーション(電通大情報理工1 ，慶大理工2 ，Universityof Nebraska-Lincoln3 ) ○荒井規允1 ，泰岡顕
治2 ，X. C. Zeng3
207P ナノ繊維構築の素材となるタンパク質の構造と安定性の分子動力学シミュレーション(東京薬科大生命科1 ，金沢大自然2 ) ○小松勇1 ，川本周平2 ，宮川毅1 ，森河良太1 ，高須昌子1 ，赤沼哲史1 ，山岸明彦1
208P 多変数シミュレーティッド・テンパリング法の開発(慶大理工) ○光武亜代理
209P 溶媒和自由エネルギー計算を用いたアミノ酸アナログおよび cytochrome c への尿素効果に関する研究 (312S)(京大化研) ○狩野康人，松林伸幸

210P ナノ液柱に関する分子動力学的研究(阪大工) ○村上太一，矢野猛
211P プラスチック氷の構造と水素結合ネットワー
ク(岡山大自然) ○樋本和大，松本正和，田中秀樹
212P Direct Coexistence 法を用いた固液または気液平衡の分子シミュレーション(慶大理工1 ，Colorado School of Mines2 ，電通大3 ) ○坂牧隆司1,2 ，アマデウスム2 ，成見哲3 ，大村亮1 ，泰岡顕治1
213P ラミニンα鎖 LG4 モジュールにおけるループ領域ペプチドの分子動力学シミュレーショ
ンによる構造解析(東京薬科大薬1 ，東京薬科大生命2 ) ○山田寛尚1 ，小松勇2 ，宮川毅2 ，森河良太2 ，片桐文彦1 ，保住健太郎1 ，吉川大和1 ，野水基義1 ，高須昌子2
214P 実在の細胞膜を模倣した混合脂質二重層膜内での脂質分子 wobble の解析(名大工) ○安藤嘉倫，岡崎進
215P アミロイドβタンパク質とトリアジン誘導体間の特異的結合特性の解析：古典分子力学及びフラグメント分子軌道計算(豊橋技科大情報知能工1 ，村田製作所2 ，九州
大工3 ) ○岡本晃澄1 ，野村和哉1 ，矢野篤志1 ，檜貝信一2 ，近藤孝志2 ，神波誠治2 ，三浦佳子3 ，栗田典之3
216P 二酸化炭素ハイドレートの熱力学的安定性(岡山大自然) ○松尾真人，松本正和，田中秀樹
217P 芳香族ポリアミド膜のナノ構造に関する分子論的考察(名大情報1 ，JST-CREST2 ) ○鈴木雄一1 ，小谷野哲之1,2 長岡正隆1,2218P タンパク質-化合物 Docking 情報データベー
ス PHABLE(理研) ○平野秀典，沖本憲明，森本元太郎，泰地真弘人
219P CO2 化学吸収液の分子動力学計算による解析(京大化研1 ，関西電力2 ) ○古川博敏1,2 ，窪田善之1,2 ，狩野康人1 ，桜庭俊1 ，松林伸幸1220P 2 −アミノエタノール水溶液中でのカーバメート生成反応の分子動力学的解析(京大化研1 ，関西電力2 ) ○窪田善之1,2 ，桜庭俊1 ，狩野康人1 ，古川博敏1,2 ，松林伸幸1221P 脂質２重膜表面でのプロトンの振る舞い(107S)(東大先端研1 ，シカゴ大化学2 ) ○山下雄史1 ，G. A. Voth2222P F1 モータータンパク質の水和自由エネルギー解析(京大化研) ○浴本亨，松林伸幸223P カーボンナノチューブ中のアルゴンの拡散係数(岡山大自然) ○秋吉宏樹，甲賀研一郎
224P 分子動力学法によるアルゴンの蒸気圧(法政大生命) ○山田祐理，片岡洋右
225P 複数へリックスを持つタンパク質のフォール
ディングシミュレーション〜αへリックス形
成順序の比較とその決定因子の探求〜(名大理1 ，名大工2 ) ○阪口剛志1 ，岡本祐
幸1,2226P 平面波擬ポテンシャル第一原理計算コードの高速化と磁気接合系への応用(金沢大自然1 ，東北大 CSIS2 ) ○後藤純平1 ，
原口辰也1 ，辻川雅人2 ，小田竜樹1
227P 氷タンパク質表面上の薄膜水の挙動(慶大理工) ○村上大介，泰岡顕治
228P 準一次元液体の連続固液相転移(岡山大自然) ○阿部紀遥，甲賀研一郎
229P MD 計算によるイオン交換ガラスの構造と変形(旭硝子1 ，東工大2 ) ○谷口健英1 ，深澤寧司1 ，伊藤節郎2
230P 疎水相互作用によるカーボンナノチューブ内でのナノバブル生成(福井大) ○山田恭平，古石貴裕
231P 酸水素混合系に対する非経験的熱物性推算手法を用いた状態方程式の精度検証(信州大工1 ，東大工2 ) ○鎌倉克訓1 ，津田伸
一1 ，平田哲夫1 ，越光男2232P 核沸騰初期過程に関する MD シミュレーショ
ン(京大工) ○山本貴大，松本充弘
233P キャンセル
234P エネルギー分布関数を用いた自由エネルギーの厳密計算 (311S)(分子研1 ，京大化研2 ) ○桜庭俊1 ，松林伸幸2235P 希薄気体シミュレーションを応用した新たな熱伝導計算手法の開発(京大工) ○正尾裕輔，松本充弘
236P First-principles calculation of healing ofadatom-vacancy pair on carbon nanotubes.
(1 Kanazawa University, 2 University ofTokyo) ○ J. Lin1 , K. Nishida1 , M. Saito1,2237P 微小液滴の蒸発に関するハイブリッドシミュ
レーション(京大工1 ，J-POWER2 ) ○弥永健太1 ，松本充弘1 ，田浦剛2
238P 金属プロテアーゼサーモライシンの機能抑制剤の提案：古典分子力場及びフラグメント分子軌道計算

(豊橋 技科大工1 ，University of Tromsø2 )○平川達也1 ，藤田聖也1 ，M. T. H. Khan2 ，I. Sylte2 ，栗田典之1
239P 溶液中グリシンの自由エネルギー地形解析−
構造最適化と振動数解析−(名大情報科学1 ，JST-CREST2 ) ○北村勇
吉1 ，竹 中 規 雄1,2 ，小 谷 野 哲 之1,2 ，長 岡 正
隆1,2240P Molecular dynamics simulations of proteins
under crowded environments(理研1 ，ミシガン州立大2 ) ○ R. Harada1 , Y.
Sugita1 , M. Feig2
241P 高圧下におけるシリケイトメルトの分子動力学シミュレーション(東工大理工1 ，岡山大環境学2 ) ○則竹史哉1 ，河村雄行2242P Monte Carlo simulations of short chain
branched polyoleﬁns: structure and entanglements (102S)(1 Mitsui Chemicals, Inc., 2 Mitsui Chemicals Analysis and Consulting Services, 3 CSIC Madrid, 4 National Technical
University of Athens) ○ K. Moorthi1 , K.
Kamio2 , J. Ramos3 , D. N. Theodorou4
243P 熱力学的積分法を用いた Hsp90 と基質分子の結合自由エネルギープロフィール(金沢大理工) ○川口一朋，A. Purqon，齋藤大明，長尾秀実
244P 拡張アンサンブル法によるタンパク質とリガンドの結合構造予測 (304S)（武田薬品探索研1 ，名大理2 ） ○小久保裕
功1 ，田中稔祐1 ，岡本祐幸2245P Lennard-Jones 液体の結晶核生成過程における不純物分子特性の影響の解明(慶大理工) ○高井北斗，泰岡顕治
246P 温度勾配によるナノバブル駆動のＭＤシミュ
レーション(京大工) 山崎隆太，○松本充弘
247P 生体分子表面における水分子の滞在時間を決める要素について (316S)(原子力機構) ○米谷佳晃，河野秀俊
248P 計算機支援による低分子ペプチドの設計(東大新領域1 ，理研2 ，産総合研3 ，シカゴ大4 )○山岸純也1,2 ，沖本憲明2 ，末永敦3 ，岡田眞理子2 ，今本公4 ，泰地真弘人2249P 2 次元モデルガラスにおける波の発生と観測(愛知工大基礎1 ，九大理2 ，金沢大3 ) ○村中
正1 ，松井淳2 ，樋渡保秋3250P 青色光受容体蛋白質の DNA 光補修反応メカ
ニズムの理論的研究(名大理) ○佐藤竜馬，倭剛久
251P Bennett Acceptance Ratio 法によるプロテインキナーゼとその阻害剤の結合自由エネルギー計算(大正製薬1 ，理研2 ，大阪薬科大3 ) ○田村勇之
進1 ，岩本邦彦1 ，坂井正彦1 ，植木智一1 ，宮川博夫1 ，姫野龍太郎2 ，野田茂穂2 ，北村一泰3252P MD 及び FMO 計算による転写制御タンパク質と DNA 間の特異的相互作用の解析(豊橋技科大) ○大山達也，野村和哉，栗田典之
253P 自由エネルギー勾配法によるアンモニアイオン化過程の反応経路探索：ab initio QM/MMMD シミュレーションにおける境界表現の重要性(名大情報科学1 ，JST-CREST2 ) ○小谷野哲
之1,2 ，竹中規雄1,2 ，北村勇吉1 ，長岡正隆1,2254P ダウンフォールディング法による核融合材料用のポテンシャルモデル作成(核融合研1 ，鳥取大工2 ，名大工3 ) ○伊藤篤
史1 ，吉本芳英2 ，高山有道1 ，斎藤誠紀3 ，中村浩章1,3255P 動的モンテカルロ法による血小板−血管壁相互作用の解析(理研1 ，東大工2 ) ○塩崎聖治1 ，伊井仁志2 ，杉山和靖2 ，高木周2
256P 水素ハイドレートの構造とゆらぎに関する研究(金沢大自然) ○東真史，三浦伸一
257P 閉じ込め液体中の拡散ダイナミクス(東北大工1 ，東北大 WPI-AIMR2 ，東北大IMRAM3 ，JST-CREST4 ) ○松原裕樹1,4 ，ピキエリファビオ1,4 ，栗原和枝2,3,4258P リングポリマー分子動力学法の定式化(東京都市大知識工) ○堀越篤史
259P 孤立デンドリマーの緩和(慶大理工) ○岩岡伸之，高野宏
260P マルチカノニカル分子動力学シミュレーショ
ンの粒子数依存性(信大理) ○志水久
261P 棒状液晶のマルチスケール分子動力学シミュ
レーション(慶大理工) ○米川伊織，泰岡顕治
262P 拡張アンサンブル分子動力学法を用いた
Lennard-Jones 流体の固液相転移温度の推定(慶大理工) ○増永充宏，金子敏宏，光武亜代理，泰岡顕治