博士（医学）山本洋一
学 位 論 文 題 名PNA― MGB法 に よ る 変 異 株 別 HBV− DNAの 定 量
学位論文内容の要旨【背景と目的】B型肝炎ウイルスは急性肝炎を引き起こし，´慢性化しで慢性肝炎，肝硬変，肝癌と病期を進行させる．ラミブジンは強い抗ウイルス効果から病期の進展を抑制し得るが，長期投与による薬剤耐性が問題となっている．ラミブジン耐性には，ポリメラーゼ領域のrev
ers
etr
anscr
iptase（ 啣 180と 204番 の遺伝 子変異 が関与 してお り，L180M， M204I，M204Vな どのア ミッ′ 酸変異 が出現することが明らかにされてきた．これらの変異を早期に検出し，定量的に評価することは治療上有益であるが，複数株の存在下で特定株の高感度な定量測定をすることはできなかった，単一株の変 異株定 量につ いては ，リア ルタイム PCR法に より高 感度測定が可能となったが，複数株混在下で の特定の株の正確な定量測定は困難であり，測定系の改良が必要であった．

rru
nor groove

binder (MGB)は標的配 列への アニー リング を安定 化する 作用を 持つ分 子であり ，リアルタイム
PCR用プ ロープ の3 末 端にMGBを結合さ せるこ とによ り相補鎖への結合能が改良され，測定系の感度 ・特異度が高められた．

peptidenucl
eic acid (PNA)はぺプチド骨格を持つDNA
類似化合物

であ るが， 相補鎖 にハイ ブリダ イズして もDNAポ リメラ ーゼによる伸長反応を起こさない特徴を持つ ．そこ で本研 究では 複数株 の混在下 で特定 の株の 定量測 定を行 うこと を目的に，PNAとMGB
プ 口 ーブ を 用 い たり ア ル タ イム PCRを 測 定原 理 と す るPNA‑MGB法 を 開 発 した の で 報 告す る．
【対 象と方 法】HBs抗 原陽性 のB型慢 性肝疾 患患者 から採 取され，遠心分離後‑30℃で凍結保存され て い る 血 清 サ ン プ ル を 使 用 した ． HBVDNAのポ リ メ ラ ーゼ 領 域 Bド メ イン に 位 置 する LLAQ
モ チ ーフ (rt179〜 182)と Cド ヌ イ ンに 位 置 す るYMDDモチ ー フ (rt203〜 206） の 野生 株 （uAQ株 ， YMDD株 ） と 変 異 株 （ IMAQ株 ， YmD株 ， V江 ） D株 ） の 各 株 を 測 定 す る ため n岨 と M（ 迅プ 口 ーブ を 株 毎 に設 計 し た ，YIDD株測 定 用 の PNAと MGBプ 口 ーブ は ， rt2041の対 応 コド ンが
觚 ℃ で あ る uDD1株 用 と 觚 Tで あ る ￣ nDD2株 用 の 2組 を 作成 し た ． 各野 生 株 ・ 変異 株 毎 に モノク 口ーナ ルHBVプラ スミド を精製し標準用サンプルとした．各株のプラスミドを1010gcopies／m1に調 整し， 10から110gcopies／mlま で10倍毎 に段階 希釈し た系列を 内部コ ント口ール用テン
プ レ ート と し た ．リ ア ル タ イム PCRの各反 応には ，測定 対象株 に相補 的なMGBプ 口ーブ と，そのモ チーフ の測定 対象株 以外の 株には特異的で対象株には非相補的なすべてのn乢Aを用い，定量測 定 を行 っ た．PCRの条件 設定は， 50℃で 2分，95℃ で10分に 続き， 95℃15秒， 71℃1分， 60℃1分の セッ卜を50サイクルとした．各サイクルの最後に螢光シグナルを自動計測し，シグナル増加量の直線領域に閾値を設定した．閾値に達したサイクル数（Ct）と，標準用サンプルの測定で作成した検量線から測定検体のHBvニDNA量を計算した．
【 結 果】 lOか ら110gcopies／ ndまで 10倍 毎に 段 階 希 釈し た 各株 の標準 用HBVプラ スミド を測定したところ，プラスミドの対数濃度とCtは強い負の相関を示し，その回帰直線を検量線とした．
ー 341―

いずれ の株も 3から10 log copies／mlの 範囲で 直線性 を認め ，単独株 の定量 範囲は3から10logcopies／mlで あった ．一方 ，複数 株の標 準用プ ラスミ ドが混在 する場 合，MGBプロープ単独では優勢株 のみ定 量可能 であり ，非優 勢株を 定量的 に測定す ること ができ なかっ た．しかしPNAを用いた複 数株混在下での優勢株の測定では単独株の測定と比較し定量性に変化はなく，非優勢株の測定では優勢株から・4 logcopi
es／ ml，すなわちO.
Ol％まで定量測定が可能であった，ラミブジンを投 与し た B型 ´ 慢 性肝 炎 症 例 のHBV DNA量を PNA‑MGB法に より経 時的に測 定した （症例 提示） ．
ラミブ ジン開 始後， すべて の株の ウイル ス量は りアルタ イムPCRで測定 感度以下に抑えられていた が， ラ ミブジン 開始16力月後， LLAQ株と ￣irIDD2株が 同時期 に測定 可能と なり， ウイル ス量は 増加 し た ． LLAQ株 とYIDD2株 が7log copies／rnlに達 した頃 に，総 ウイルス 量には 著変が な
い ま ま u江 AQ株 が 出現 し ， 続 いて ￣ WDD株 が出 現 し た ，u心LQ株 と YVDD株 それ ぞ れ が ，u』峨株とYmD2株に代わり優勢となった時，肝炎が再燃した．
【 考察 】 ラ ミ ブジ ン 耐 性 獲得 に は rt180， rt204が 関 与 して おり， wdd／M2041→ L180M／M2041→ L180M／M204Vの 順に変 異が出 現し，肝 炎が再 燃する ，ラミ ブジン に続き アデホ ピルや エンテ
カビル などの核酸アナ口グが使用可能となったが，ラミブジン治療中に他剤への変更や追加を考慮
する際 には，変異株を検出し更に変異株別のウイルス量を定量することは臨床的に非常に有益である，従 来HI町DNA量の測 定結果 は各株の 総量で あり， 混在す る特定 の株の みを個別に定量することはで きなか った． リアル タイム P（mの測 定法の ーつで あるT缸 lMan＠プ口 ーブ法は，レポ一夕ー色素 とクエ ンチャ ー分子 で両端をラベルしたオルゴヌクレオチドプ口ーブを使用する螢光gヌク
レ アー ゼ ア ッ セイ で あ る ．Ta（ lMan＠プ 口ーブ の3 末 端にMGBを 接合さ せたTaqM， an正mGBプ口ーブ は，標的配列へのア二一リングをより安定化し，感度・特異度は更に改善された．しかし条件を調 整してもなおミスマッチは阻止できず，変異株が混在する検体において非優勢株を定量測定
す るこ と はできな かった ．この ミスマ ッチを 減少さ せるた め，n岨 を反応 系に導入 した， HBV野生株・ 変異株 混在下 で，変 異株を 定陸検 出する PNAクラン ピング 法が報 告されているが，これまで PNAを 定 量 系 に 用 い た 報 告 は な か っ た ． 今 回 PNAと MGBプ ロ ー ブ を 設 計 す る際 に は ， PNAの memngtemperaれ ぱ e（ Tm） が MGBプ 口 ー ブの Tmよ りも 約 3℃ 高 く な るよ う に 設 定し た ． この温度 差によ り複数 株混在 下での りアル タイム PCRでは，まずPNAが非測定対象株をクランプし，続いて MGBプロ ーブカ測 定対象 株にア ニール する． その結 果，プ 口ーブ の非測定対象株へのミスマッチ を大幅 に減少 させる ことが可能となった．提示した症例のように，治療中HIjv・DNA量が増加し始 めた場合の詳細なウイルス学的解析を，肝炎再燃前に行うことも可能となった，本法は汎用性 が高 い ため，今 後HBVの 新たな 領域に変 異が確 認され た場合 にも応 用可能 であり ，更に はHBVに 限 ら 寸 弦 く ー 般 の DNAに お け る 点 突 然 変 異 体の 定 量 測 定へ の 応 用 も司 能 と 考 えら れ る ．
【 結 論】 PNA．MGB法に より， 3から1010gcopies／mlま での測 定範囲 でO．01％ までの HBV混在
株を定 量測定することが可能となり，変異株別の出現とその変化を経時的・定量的に観察することが でき た ． ポ リメ ラ ー ゼ 領域 の 変 異 株で あ る M2041・ M204Vと 同 時 に ，L180Mを 検出 し定量 することは，治療評価と肝炎再燃の予測に有用と考えられた．

ー 342 ‑，

学位論文審査の要旨
主 査教 授浅 香 正 博副 査教 授有 川 二 郎副 査教 授藤 堂

省

学 位 論 文 題 名PNAー /IGB法に よ る 変異 株 別HBV−DNAの 定 量
B型肝炎ウイルス治療薬のラミブジンは、高い抗ウイルス効果を有する一方で耐性遺伝
子 変異 の出 現が問題となって いる。DNA
ポリメラーゼ阻害 剤であるラミブジンの耐性獲得 には 、HBV‑DNAのポ リメ ラー ゼ領 域rt180と 204番ア ミノ 酸変 異が 関与していることが報告されている。変 異株は定性検査での検出が可能であったが、変異出現初期での検出は困難であり、複数株 の混在下で特定の株を定量測定するには、新たな測定系が必要であった。
本研 究で はラミブジン耐性 株のウイルス動態を明らかにするため、リアルタイムPCR法 に よ り rt180と204の各 野生 株と 変異 株の HB
V‑ D
NA量 を測 定し た。 感度 ・特 異度 を向 上 さ せ る ため 3
末 端に MGB (minor groove binder)を 付加 した M
GBプロ ーブ と、 PCRにおいて相補鎖に結合 してアンチセンスとして機能するPNAくpeptidenucleieacid)を測
定 に 用 い た 。 PNAと MGBを 用 い た り ア ル タ イ ム PCR法 を PNA‑MGB法 と し た 。
PNA‑MGB法 によ る単独株の測定では、測定可能域は3〜10l
og copies／mlであった。複数 株 混 在 下 に お け る 特 定 の 対 象 株 の 測 定 限 界 は 0.01％ で あ っ た 。
こ の PNA‑M
GB法に より 、 ラミ ブジ ン投 与例 の肝 炎再 燃時 と、 ラミ ブジ ン耐 性HBVにも抗ウイルス活性を持 っアデホビルを併用した時の変異株別ウイルス動態を臨床的に検討した。ラミブジン耐性 変異は、rt180／204の組み合わせがwild/ wildからwild／YID
D、LMAQ′ YIDD、 LMAQ′ YVDDの 順 に 進 行 する が、 変異 パ ター ン別 に肝 炎再 燃時 の状 態を 比較 する と、 AL
T値 、HBV‑DNAに 量は 有意差を認めない ものの変異の進行と共に、より強い肝炎が引き起こ される傾向を認めた。また変異の各段階におけるウイルス動態を
PNA‑MGB法 の測 定により解析し、症例を提示した。既に出 現している変異株が高いウイルス量で安定している 場合には、水面下で出現している新たな変異を従来の定性検査は捉えることができなかっ たが、本法では測定可能であった。アデホビル投与によるラミブジン 耐性 株の 減少 量は 、LLAQと YMDDモチ ーフの各株間にお いて有意差を認めなかった。
肝炎再燃前の直線的ウ イルス増加部分から変異株別のウイルス増殖速度を計算すると、肝炎 再 燃 時 の 肝 障 害 が 強 い 変 異 株 ほ ど 増 殖 速 度 が速 い と い う 結 果 で あ っ た 。
発表後、副査有川教 授から変異株と肝障害惹起の関係、変異株出現後の野生株の動態、
ど のよ うな D
NA測定に応用可能かについて質問があり、申 請者は以下の通り回答した。
ラ ミブ ジン 耐性に関与するポ リメラーゼ領域の遺伝子はウイルスDNAの転写・複製に関与する領域であり肝細 胞への直接作用は報告されていないが、今回の研究で強い肝障害を引き起こす変異株ほど 増殖速度が速いという結果が得られたことから、変異株は肝障害をー 343―

起こす閾値ウ イルス量に達するのが早いことが強い肝障害を引き起こすことに関与していると考えられ る。変異株出現後の野生株は、LLAQ
モチーフ領域については変異出現前の水準で経過す るケースと、減少して測定できなくなるケースの両者があった。応用可能なDNAとし ては 、ラ ミブ ジン 以外 の核酸アナログ剤耐性H
BVの他、ポイントミューテーシ
ヨ ンが混在する場面として各 種臨床検体中のウイルス・細菌DNAが考えられる。次に副査藤堂教授か ら本測定法の臨床応用と臨床上の有用性についての質問があり、申請者は以下の通り回答 した。ラミブジン投与中に本測定法で耐性株の出現・増加が確認されれば、肝炎再燃が懸 念される。肝予備能不良症例では、肝炎再燃前にアデホビルを併用することで肝炎再燃リ スクを軽減できる。またラミブジン投与中に、交叉耐性はあるが、より耐性の出現率が低 いエンテカビルへの切り替えを考慮する場合に、本測定法での変異株検出は切り替えの可 否を判断する指標となる。最後に主査浅香教授から研究の発想や過程、今後の 展望についての質問があり 、申請者は以下の通り回答した。変異株はPC
R産物のダイレクトシーク エンスや、検査キットにて定性検査を行っていたが臨床的に感度・特異度改善の必要性を 感じ本測定法開発に至った。今後は症例を蓄積し、また異なる遺伝子変異株の測定も行い たいと考えている。申請者は方法論と、それに基づく測定結果から論理的に回答し、内容 は適切と考えられた。
本研究はラ ミブジン耐性変異を分子生物学的に解析し、いくっかの新知見を得ることに成功しており 、臨床におけるB型慢性肝炎 の治療法選択やラミブジン以外の薬剤耐性HBV解析への応用 が期待された。審査員一同は、これらの成果を高く評価し、大学院課程における研鑽や取 得単位なども併せ申請者が博士（医学）の学位を受けるのに十分な資格を有するものと判 定した。

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