2013.3.19.最終講義（於理学部南館大講堂）	

生物時計に魅せられて	 石浦正寛	
名古屋大学遺伝子実験施設	
	

1

略歴	
1967年 京都府立北桑田高等学校卒業	
1971年 金沢大学理学部生物学科卒業	
1973年 大阪大学理学研究科修士課程生理学専攻修了	
1976年 大阪大学理学研究科博士課程生理学専攻単位取得退学	
1977年 大阪大学微生物病研究所助手（岡田善雄教授）	
1979年 基礎生物学研究所細胞融合部門助手（岡田善雄教授）	
1995年 名古屋大学理学部生物学科助教授（近藤孝男教授）	
1999年 名古屋大学遺伝子実験施設教授	
2金沢大学理学部生物学科卒業研究生
	
梅鉢幸重教授（故人） キアゲハの色素合成	
「トリプトファンオキシゲナーゼの酵素
キネティックス」	
酵素学	
研究室には昼前に出て深夜に帰る	

3

大阪大学修士課程院生
	
巌佐耕三助教授（後に教授） 藻類の生理学	「クラミドモナスの配偶子形成に関する生理学的研究」	
一から系の立ち上げ	
関連論文をすべて読む。生物時計の関与？	
生物材料の取扱い、生理学	
一通りやれることをやり尽くすとできることがなくなってしまった。	
4大阪大学博士課程院生、微生物学研究所助手	
岡田善雄教授（微生物学研究所；故人）
HVJによる細胞融合機構の研究と応用、細胞工学
内田驍助教授（後に教授；故人） ジフ
テリア毒素の研究、アイデアマン	
山泉克助手（後に助教授、熊大教授：故人） 実験の名人	
「HVJによる細胞融合機構の研究：非筋細胞におけるアクチン機能の生化学的研究「ゲリラ戦（ニッチ？）」、「ひとの論文ばかり読んでる奴はあほだ」、「人のまねをするな、人のやってないことをやれ」「一座建立」 トラウマ	
方法論に傾きがちで生物現象に欠けるところがあった。	
 5
徹夜実験	

大阪大学博士課程院生（岡田研から出向）
	
殿村雄治教授（故人）、柴田和子助手	
「非筋細胞におけるアクチン機能の生化学的研究」	
酵素キネティックス	「自分の専門分野のことは全てを知っているべき」	
タンパク質を調製したら全ての測定が終わるまで実験を続ける。
効率の良い工場の趣	

6基礎生物学研究所助手（岡田善雄教授）

	
HVJによる細胞融合機構の研究	
培養細胞への遺伝子移入の研究	
高等生物遺伝子のクローニングに関する研究：コスミドクローニング系の開発と応用	
鈴木義昭教授、広瀬進助教授（後に遺伝研教授）（細胞分化部門）	
遺伝子操作	

7

基礎生物学研究所助手

	

太田行人教授、中島秀明助教授（後に岡大教授）、近藤孝男助手（後に名大教授）（計時機構部門）
生物時計（アカパンカビ、藍色細菌）の分子遺伝学的研究
近藤さんと話したこと：	
研究目標「時計遺伝子のクローニング」	
優位性のある新しい研究手法「ルシフェラーゼ遺伝子を利用した生物発光
リアルタイム測定」を確立する。	
研究材料「優位性のある生物材料」を探す。	
	
近藤さんの生理学のセンス、自動計測のための装置開発・プログラミング技術	
遺伝子クローニング技術の藍色細菌への応用：ターゲティングライブラリーの考案、遺伝子操作のツールの整備	
Susan Golden (Texas A&M Univ.), Carl Johnson (Vanderbilt Univ.)
Peter Wolk, Jeff Elfai (Michigan State Univ.)	
青木摂之さん（博士課程；現名古屋大学准教授）、沓名伸介さん（修士課程；
現横浜市立大学准教授）	
8

基礎生物学研究所助手	
神谷宣郎教授（故人）黒岩常祥助教授（後に教授、東大教授；細胞機構部門）	
金谷晴夫教授（後に所長）	
伊藤繁助教授（後に名大教授）「素晴らしい共同利用システム、元気な
仲間、自由な研究環境、精神的支援」 	
9

名古屋大学理学部生物学科助教授（近藤孝男教授）

	「藍色細菌の生物時計の分子遺伝学的研究」	
	

10名古屋大学遺伝子実験施設教授

	
新しい実験系で研究する
1. 好熱性藍色細菌「生物時計分子装置（タンパク質複合体）の原子レベルでの研究」	
2. クラミドモナス「生物時計の分子遺伝学的研究」
3. シロイヌナズナ「生物時計の分子遺伝学的研究	
4. 生物発光リアルタイム測定系のさらなる開発	11

生物時計の研究法	
どのように研究するのか？	
	
	
生理学
	
	
 時計現象(リズム)の測定、解析			
分子遺伝学	
	
突然変異体の分離、時計遺伝子の同定・クローニング			
タンパク質科学、生物物理学（新しい時計研究）	
	
時計タンパク質、時計分子装置の構造と機能の解明	
	
	
 
	
 

生物界と時計遺伝子	
菌界	

植物界	
PCL1

動物界	
Per

frq

wc-1
wc-2

LHY

TOC1 CCA1

Clock Bmal/Cyc
Cry

高等植物	
陸上化	
多細胞化	

?
?

緑藻	

?

?
?

Cry?

Tim

原生生物界	

?

葉緑体化	
藍藻	

kaiA
kaiC

モネラ界	
kaiB

13

時計の進化、多様性、普遍性	
１．全ての生物に共通な時計因子（時計遺伝子、
時計タンパク質）は見つかっていない。	
２．進化の過程で生物は時計を獲得したが、ある段階で古い時計を捨てて、新しい時計を再獲得してきたらしい。	
３．時計の進化、多様性、普遍性。	
４．不思議なことに共通な因子がなくても生理的に普遍的な時計機能が実現されている。	
14

私の興味:
植物系細胞の生物時計（植物時計）	
1. 生物時計（分子装置）の働くしくみを原子レベルで解明したい。	
2. 藍色細菌、藻類、コケ、シダ、高等植物に共通の時計因子は存在するか？	
3. 植物時計の進化。	
15

波打ち際での夜光虫の生物発光	

（著作権の都合により削除）	

16

生物発光リアルタイム測定法を開発する	
1. リズムを自動測定したい。	
2. 精度の高い自動測定には光が一番である。
正確な光計測法がある。	
3. 夜光虫はほぼ24時間周期で発光する(生物発光リズム)。	
4. 夜光虫は遺伝子の研究には適していない。	
5. なければ、遺伝子の実験に便利な他の細胞で「人工的な夜光虫」を自分で作ろう。	
17

人工生物発光細胞(人工夜光虫)のしくみ	
細胞	
プロモーター	DNA	
発光レポーター遺伝子

	

mRNA	
翻訳	

発光タンパク質	
基質	

発光基質の投与	

シロイヌナズナの	
発光レポーター株	

藍色細菌の	
発光レポーター株	

生物発光	

人工生物発光細胞を用いた概日リズムのリアルタイム測定	
生物時計	

特徴	

12

• 生物発光を人工的な「時計の針」として利用	

9

3
6

利点	

転写制御	

生物発光量	

• 生きたままの細胞での連続自動測定（リアプロモーター	
 発光遺伝子	
ルタイム測定） 	
• 高感度、高精度、高時間分解能	
リズミックな発現	• 多くの試料の全自動測定	（転写と翻訳→生物発光）	
• リズム変異体の大規模スクリーニング	• 時計遺伝子（リズム変異の原因遺伝子）の迅速なクローニング	
0	

24	
48	
72	
測定開始からの時間	新しい生物材料のための生物発光自動測定装置を作ろう（近藤さんに学ぶ）	

20

作った生物発光自動測定装置	
• 平板型試料交換機付生物発光測定装置	
Ø1,920試料が同時に測定できる。	
Ø大きくて高価なのが欠点である。	

• 巡回型試料交換機付生物発光測定装置	
Ø960試料が同時に測定できる。	
Ø小型、軽量で安い。	
Ø50℃までの高温条件下で測定	可能である。	
	リズムの自動表示・解析プログ
ラムを作ろう（近藤さんに学ぶ）	

22

生物発光量（cps）	

生物発光リアルタイム測定・リズム解析プログラムの開発	
多検体の同時モニタリング	

0

24

48

72

96

120

144

測定開始からの時間	

168

192	

測定データ
の解析	

• 測定データのリアルタイム表示と自動記録	
• 様々なアルゴリズムによるリズム成分の解析	
• データベース機能と統計処理機能を内蔵	• 他のプログラムのファイル形式の入出力	
• 強力な表示・印刷機能	
• 発光測定以外のデータも解析できる汎用性	
Okamoto et al., 2005, Anal Biochem 340:193-2000

24

新たな生物発光リアルタイム測定解析
システムの開発― 有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システムの開発 ―	新システムの開発目標	
従来のシステムと比較して、「より迅速な大規模スクリー
ニング」や「より高精度（高感度）な遺伝子発現の解析」を実現し、次世代シーケンサと連携運用することで、有用遺伝子を高速探索するためのインフラを整備する。	

• 従来システムよりも10倍の大規模化	
ハイスループット生物発光測定装置	

• 従来システムよりも10倍の高感度化	
高感度生物発光測定装置	

• 大規模な試料調製の全自動化	
自動試料調製装置	

25	

26	

有用生物株や有用遺伝子の高速探索のワークフロー	「ハイスループット生物発光測定装置」、「自動試料調製装置」	

• ある特定の表現型を示す突然変異体を網羅的に大規模スク
リーニングする（例えば100株以上）。	
「高感度発光測定装置」	

• 表現型を詳細に解析して、突然変異体を分類する。	
「次世代DNAシーケンサー」	

• 変異体をグループごとにプールしてゲノム配列を決定し、変異部位をゲノムワイドに特定する。	
• 変異が集中する幾つかの遺伝子座が候補遺伝子群である。	
• 遺伝子移入や操作によって、目的遺伝子であることを確認す
る。変異体は有用株として利用できるか検討する。	
• 遺伝子操作やTILLING法によって有用形質を創出する。	

次世代DNAシーケンサーによる	
変異体の原因遺伝子の探索方法	
• ある特定の表現型を示す突然変異体を網羅的に分離収集する。	

変異部位	
変異体１	
変異体２	

• 分離した変異体の全ゲノム塩基配列
を次世代DNAシーケンサで解析して変異部位を網羅的に同定する。	

変異体３	
変異体４	
変異体５	

• 突然変異が集中する幾つかの特定の遺伝子座が変異形質に関係する遺伝子（左図の場合ならば遺伝子Bと遺伝子Fが該当）であると推測できる。	

変異体６	
変異体７	
変異体８	
変異体９	
・・・	
ゲノム	
A	
 B	
 C	
 D	
 E	
遺伝子	

27

F	

G	

• 同じタイプの変異体が多数あれば、有用遺伝子が精度良く網羅的に探索
できる。	

28	
① 生物発光レポーター株の作製	

② 生物発光レポーター株の変異原処理	

鍵遺伝子のプロモーター	
ルシフェラーゼ遺伝子CDS	
転写	
mRNA	

ゲノム	

ゲノム	

ATP	

生物発光	

ルシフェラーゼ	
翻訳	

ルシフェリン	• 発光レポーター株のゲノム上に変異
原でランダムに突然変異を誘発した変異体集団を作製	

培地から連続投与	

「生物発光リアルタイム測定解析システム」と	「次世代シーケンサ」の連携運用の概要	
⑦ 変異体の原因遺伝のクローニング 	
（有用遺伝子のクローニング）	

⑥ 詳細な生物発光リアルタイム測定	
（2nd スクリーニング)	

• ゲノム配列の比較による変異部位の網羅的特定と原因遺伝子の迅
速なクローニング	

⑤ 変異体候補の	回収と培養	

プレート200枚	
（19,200試料）	
特願2010-095985	

自動試料調製装置	

④ 大規模な生物発光リアルタイム測定	
(1st スクリーニング)	

特願2010-070074	

特願2010-070075	

SOLiD 4 Plus

③ 試料の自動調製	

19,200試料 /アッセイ	
40万コロニー/アッセイ	

高感度生物発光測定装置 	

次世代DNAシーケンサ	

⑧ 表現型の確認と有用株の作出	
• クローニングした遺伝子が目的の遺伝子であることを遺伝子移入で確認	
• 変異体が有用株として利用できるか検討	
• 遺伝子操作によって有用形質を創出	

特許第3787631号	
特許第3837535号	
特許第3950972号	

種々の生物発光測定装置 	

遺伝子発現を生物発光として
リアルタイム測定して変異体候補を網羅的に分離	

ハイスループット	
生物発光測定装置	

29

ハイスループット生物発光リアルタイム測定装置	
装置の写真	

特願2010-070074	

測定例	
マルチウェルプレート	で培養した植物体、	
藻類、動物細胞など	

藻類やバクテリア	
のコロニー	

試験管で培養した	
植物体や藻類	

発光試料	

特長	
l 様々な容態や形状（A4の面
積 高さ13cm まで）の生物
試料（例えばイネの苗、バクテリアや藻類のコロニー、培
養細胞、動植物の個体など）の生物発光がリアルタイム
測定できる。	

発光画像	

測定結果	

l 多検体（19,200試料（96ウェルプレートできる。	

200枚）または40万コロニー）が一度の実験で測定l 独自の高速処理方法を搭載することで、上記の試料数を最短107分間隔で自動測定できる。

30

高感度生物発光測定装置 CL24	

特願2010-070075	

測定感度の比較	

ホタルルシフェラーゼLUC（ピーク波長565nm）	
「培養機能付き搬送装置CI」	
と接続した状態	

CL24-W (開発品)	
(24ウェルプレート）	

A社 汎用装置	

(24ウェルプレート)	

測定解析ソフトウェア	

(300〜500万円)	

500倍	

A社 汎用装置	

(96ウェルプレート)	
(300〜500万円)	

l 24ウェルプレートの測定に最適化した。	
l 新開発の超高感度光電子増倍管（浜松ホトニクスおよび中立電機との共同開発品）を搭載して光学系を最適化した。	
l 従来の高感度装置に比べ、ホタルルシ
フェラーゼ（黄緑色, ピーク波長565nm）に対して10倍（汎用装置の500倍）、赤色発
光ルシフェラーゼ（ピーク波長630nm）に対して50倍（汎用装置の1,700倍）の超高感度を達成した。	

10倍	
B社 高感度装置	
(96ウェルプレート)	
(2,000万円)	

測定感度（相対値）	

赤色発光ルシフェラーゼSLR（ピーク波長630nm）	
CL24-W (開発品)	
(24ウェルプレート）	

A社 汎用装置	

(24ウェルプレート)	
(300〜700万円)	

1,700倍	A社 汎用装置	

(96ウェルプレート)	
(300〜700万円)	

50倍	

B社 高感度装置	
(96ウェルプレート)	
(2,000万円)	

l 「培養機能付き搬送装置CI」を接続することで、最大16枚（384試料）が全自動測定できる。	

測定感度（相対値）	

※市販化	

高感度生物発光測定装置 CL96	

31

検出感度の比較	CL96	（開発品）	
A社 汎用装置	

16倍	

300〜700万円	

B社 高感度装置	
2,000万円	

A社 高感度装置	
2,500万円	

※ 96ウェルプレートを使用して試験を実施	

l 96ウェルプレートに最適化した小型高感度生物発光測定装置である。	
l 従来の高感度装置と比べ、550nmの光（ホタルルシフェラーゼとほぼ同じ波長）に対して同程度の感度（同価格帯の汎用装置の16倍高感度）を達成した。	
l 「培養機能付き搬送装置CI」を接続することで、最大16枚（1,536試料）が全自動測定できる。	
※市販化	

32

自動試料調製装置	
装置の写真	

模式図	特願2010-095985	
小型固形物の分注ユニット	

プレートスタッカー

4機	

プレートの搬送路	

制御盤	
タッチパネル・操作SW	

寒天培地・	
液体分注・	
液体ポッ
ティングユ
ニット	

コロニー
ピッキング
ユニット	

各ユニットのヘッドがアームで移動	

ノート型PC	
操作ソフトウェア	

機能	
・種子の播種機能	
処理速度： 	96種子/2分間	

・液体スポッ	
ティング機能	（新規開発）	
・寒天培地分注	
機能	
（新規開発）	
	

・液体分注機能	

・非粘着性コロ	ニー対応の	
コロニーピッ	
キング機能	
（新規開発）	

33

34

Synechococcus sp. PCC 7942 とThermosynechococus elongatus BP-1 の比較	Synechococcus sp.
PCC 7942

Thermosynechococcus
elongatus BP-1

至適生育温度

30℃

57℃

生化学的研究可能

容易

X線構造学的研究

可能

比較的容易

ゲノムサイズ

2.7Mbp2.6Mbp

ゲノムプロジェクト

完了（2007年, JGI）

完了（2002年, Kazusa）

遺伝子移入・操作

可能

可能

概日リズム

存在

存在

生物発光リズム系

構築済み

構築済み

時計遺伝子

kaiABC

kaiABCT. elongatus の顕微鏡写真	

• 好熱性藍色細菌T. elongatus は、概日時計の分子メカニズムを
原子レベルで解明するための最適なモデル生物である。	

35

T. elongatus における遺伝子移入系の開発	
• 遺伝子移入部位と遺伝子移入ベクター	

• 遺伝子移入ベクターと遺伝子移入効率	
遺伝子移入株の選択
遺伝子移入	
  遺伝子移入	  選択マーカー	
 培養と維持培養に用
	
 
	
 
ベクター	
 
標的部位
遺伝子
いる抗生物質	
 固体培地 遺伝子移
遺伝子移入効率	  遺伝子移入上の選択 入株を得る[(コロニー/μg	
 株の維持培
培養温度 ために要す
D N A ) 標準偏差]	
  養温度（
℃）
	
 
（
℃）
	
 
る日数	
 

pT S1T e/kmT e	
 T S1T e	 kmT e	 カナマイシン	
 

45	
 

10	
 

1187	
  	
 64	
 

55〜60	
 pT S2T e/kmT e	
 T S2T e	 kmT e	 カナマイシン	
 

45	
 

10	
 

	
 17	
  	
 2	
 

55〜60	
 pT S3T e/kmT e	
 T S3T e	 kmT e	 カナマイシン	
 

45	
 

10	
 

	
 	
 65	
  	
 14	
 

55〜60	
 pT S4T e/kmT e	
 T S4T e	 kmT e	 カナマイシン	
 

45	
 

10	
 

1687	
  	
 35	
 

55〜60	
 pT S1T e/kmT e	
 T S1T e	 kmT e	 カナマイシン	
 

52	
 

8	
 

	
 28	
  	
 7	
 

55〜60	
 pT S1T e/cm	
 T S1T e	 cm

クロラムフェニコール	
 

45	
 

10	
 

120	
  	
 8	
 

45	
 

pT S2T e/cm	
 T S2T e	 cm

クロラムフェニコール	
 

45	
 

10	
 

	
 	
 2	
  	
 1	
 

45	
 

pT S3T e/cm	
 T S3T e	 cm

クロラムフェニコール	
 

45	
 

10	
 

	
 	
 1	
  	
 1	
 

45	
 

pT S4T e/cm	
 T S4T e	 cm

クロラムフェニコール	
 

45	
 

10	
 

	
 142	
  	
 13	
 

45	
 

pT S1T e/Ω	 T S1T e	 aadA

ストレプトマイシン	
 

45	
 

11	
 

	
 250	
  	
 70	
 

45	
 

pT S2T e/Ω	
 T S2T e	 aadA

ストレプトマイシン	
 

45	
 

11	
 

	
 	
 5	
  	
 2	
 

45	
 

pT S3T e/Ω	
 T S3T e	 aadA

ストレプトマイシン	
 

45	
 

11	
 

	
 10	
  	
 5	
 

45	
 

pT S4T e/Ω	 T S4T e	 aadA

ストレプトマイシン	
 

45	
 

11	
 

	
 330	
  	
 50	
 

45	
 

	
 

• ４カ所の遺伝子移入部位と12種類の遺伝子移入ベ
クターを開発し、遺伝子移入法を最適化した。	
• T. elongatus に最適化した耐熱性カナマイシン耐性遺伝子kmTeを開発した。最近、耐熱性クロラムフェ
ニコール耐性遺伝子cmTeも開発した（未発表）。	
• これらによって、T. elongatus の遺伝子操作が自在に行えるようになった。	

T. elongatus における生物発光リズム系の開発	

36• 発光レポーター株の作製	

野生型	
ゲノム	
相同組換	

• Xl luxAB : Xenorhabdus luminescens
由来の耐熱性バクテリアルシフェラー
ゼオペロン	

生物発光量 (ｃｐｓ/colony)	

• 測定温度： 41℃	• レポーター： 耐熱性バクテリアルシフェラーゼ遺伝子	

連続明(h)	
 96ウェルプレートに入れた
シングルコロニー	

• 耐熱性バクテリアルシフェラーゼ遺伝子や耐熱性ホタルルシフェラーゼ遺伝子をレポーターに使用して、T. elongatus における生物発光リズム系を開発した。	

37

T. elongatus におけるリズム周期の温度補償性	

周期（時間）
27.4
1.0
24.7
0.3
24.8
0.7
24.6
0.3
22.3
1.2

温度（℃）
30
35
41
55
60

n
14
6
32
7
5

• 温度係数： Q10 = 1.08	
15000

1500

10000

1000

5000

500
0

0

• T. elongatus の生物発光リズムの周期は、30℃から60℃という幅広い温度範囲において温度補償された。	
 
0

24

48

72

96

120

144

0

24

48

72

96

120

144

遺伝子クラスターの転写制御	

Ishiura et al., 1998, Science 281:1519-1523

分子遺伝学から構造生物学・生化学へ	

生物時計を「精巧な分子装置」として捉えて、原子レベルで解明したい	
発振の継続性、周期の安定性（正確で温度に影響されない、24-h、時計の時刻合
わせ（リセット））	
・時計タンパク質、時計関連タンパク質は時計の部品	
・構造の解明＝部品の形状（大きさ、歯の数など）、種類（振り子、歯車など）の決定	
39
・機能の解明＝歯車と歯車の相互作用、針が動く仕組みの決定	

藍色細菌の時計分子装置	

生物時計を精巧な分子装置（タンパク質複合体）と捉えて、時計発振
を原子レベルで解明したい（構造解析と機能解析）。	
	
3つの時計タンパク質
KaiA、 KaiB、 KaiCを
Mg2+-ATP存在下で反応させると、24時間周期のリン酸化リズムが生じる（名古屋大近藤
グループ、2005）。	
40

結晶構造解析、NMR解析	
1. タンパク質の研究に適した耐熱性タンパク質が利用できる別府温泉産の好熱性藍色細菌で人工生物発光リズム細胞をつくる。	
2. 時計タンパク質を大腸菌で大量生産し、結晶化
し、X線結晶構造解析でタンパク質の原子構造を解明する。	
3. NMR解析でタンパク質間相互作用を解明する。	

41

ターゲットとするタンパク質	
時計タンパク質	
・KaiA（終了）	
・KaiB（終了）	
・KaiC（アメリカの研究グループが決定）	
時計タンパク質複合体	
	 	
 ・種々の存在状態のKaiC
・KaiA-KaiC
	
 ・KaiA-KaiC-KaiB、経時変化		 	
 ・KaiC-SasA
時計関連タンパク質		 	 ・ Pex（終了）	
	
 	
 ・ SasA

42

The clock:

KaiA, KaiB, KaiC・振動子	・リズム発振に不可欠		
1. Uzumaki et al., 2004, Nature Struct. Mol.
Biol., 11:623- 631
2. 宇津巻等, 2005, 蛋白質核酸酵素 50:111-120（京都大学薬学研究科加藤博章研究室との共同
研究）	

43

KaiAのアライメント解析	

N末端ドメイン	
中央ドメイン	
C末端ドメイン	
C	
N	

44

KaiAドメイン欠失変異体のリズム	

：	 " C末端ドメイン：リズムを発振	" 中央ドメイン： 周期を24時間に調節	" N末端ドメイン：振幅を増幅	

PkaiBC::luxAB from Vibrio harveyi 	

45

KaiAの３つの機能ドメイン	
1	

137	

174	

283	

C	

N	

N末端ドメイン	
 中央ドメイン	 C末端ドメイン	
振幅の増幅	
周期の調節	
リズムの発振	(Amplitude amplifier)	
 （Period adjuster）	
 (Clock oscillator)	
	

	
二量体形成	
	
KaiCとの結合		
KaiCリン酸化の促進	

46

保存残基のマッピング	
"

赤と緑は保存残基	

保存残基の多くは、二量体形成面に並んでい
る。	
 

	
 
" Tyr204、Asp266、His270は、二量体によって形成される曲面の最深部に位置し、水素結合で連結されている。	
 	
 " Asp266、His270は、KaiA分子の外側（溶媒側）に側鎖を伸ばしている。	
 	
 " Tyr204は、	
 Asp266、His270の位置を固定して
いる。	
 
	
 
" これらの残基は何らかの機能を担っていると予想される。	
 47

His270Ala変異タンパク質の解析	
リズム測定は測定が容易なSynechococcus を宿主細胞を用いて行った。	
	
Synechochococcus KaiA
His271Ala変異株のリズム	h6
His270Asp266h2

Tyr204

His

Ala

Synechococcus	
 KaiA	
 His271Ala変異株では、リズム発振
48は全く認められなかった。	
 時計発振ドメインの機能-構造相関	49

The clock:

KaiA, KaiB, KaiC・振動子	・リズム発振に不可欠		
1. Iwase et al., 2004, Acta Crysta. D60:727-729
2. Iwase et al., 2005, J. Biol. Chem. 280:43141-43149（大阪大学生命機能研究科難波啓一研究室との共同研究）	

50

KaiB重合体	
KaiB サブユニットの計算上の分子量は 12,026 Da	
ゲルろ過クロマトグラフィー	Absorbance at 280 nm

66 29 12.4 (kDa)
約60kDa0

化学架橋/SDS-PAGE	

分析超遠心	

Linker + + + + min 1 15 60 120
97
66
45
30
20.1
14.4
(kDa
)

10
20
15
5
Elution volume (ml)

6.9

7.0

7.1

Radius(cm)

KaiB は四量体で存在する	
51

結晶化、構造解析	
l 最大約 0.5 mm の結晶が得られた	
l SPring-8 （BL38B1、BL41XU）
でデータ収集	100 µm	l Osを付加した結晶を作製し、MAD法を利用して位相決定	l 2.6Åの解像度で構造解析	

KaiB 結晶の一例	
52

KaiB 分子モデル	
C

D

A

B

KaiB は、AB、CD がそれぞれ密に結合して ２量体を形成し、	それらが少しずれて結合し ４量体構造 を形成している。	
53

表面電荷分布	

red：negative

blue：positive	

54

表面電荷分布	
表面側に比べ､裏面側には特徴が乏しい。	
表面	

red：negative裏面	

blue：positive	

55

部分構造	KaiB 四量体上の部分構造を以下のように命名した。	
負電荷の尾根状構造	

Negative ridge	

正電荷の溝状構造	

Positive cleft	

正電荷の窪み構造	Positive hollow	
56

Positive cleft の変異	l K11、K43 に変異を入れるとリズムが検出できなくなった。	
l K58 に変異を入れるとリズムは不安定化。	

positive cleft は KaiB の	機能部位と考えられる。	

K43
K11

K6
K67

K6 K58K58 K6

K11
K43

K67
K6

57

-MSPRKTYILKLYVAGNTPNSMRALKTLRNILETEFRGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILMVNFKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEDEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILMSPLKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKEILEQEFQGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILMIKAKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFEGVYALKVIDVLKSPQLAEEDKILMNKARKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL-MSPRKTYILKLYVAGNTPNSMRALKTLRDILENEFRGVYALKVIDVLKNPQLAEADKIL-MVARKTYILKLYVAGNTPNSMRALNTLKEILENEFKGVYALKVIDVLKQPQLAEEDKIL

59
60
60
60
60
59
59

Thermosynechococcus elongatus BP-1
Synechococcus sp. strain PCC 7942
Synechocystis sp. strain PCC 6803
Synechococcus sp. strain WH 8102
Cyanothece sp. strain PCC 8801
Trichodesmium erythraeum IMS101
Nostoc punctiforme ATCC 29133
Anabaena sp. strain PCC 7120
Prochlorococcus marinus MIT9313
Prochlorococcus marinus MED4MAPLRKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL
60
Thermosynechococcus elongatus BP-1 ATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIGLDLLYEEIGDQAEDDLGLE*-MSPRKTYILKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEVEFQGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL59
ATPTLAKVLPLPVRRIIGDLSDREKVLIGLDLLYGELQDSDDF*
Synechococcus sp. strain PCC 7942
MSPFKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKMLKNILEQEFQGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL
60
ATPTLAKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYDEIREREAEDQ*
Synechocystis sp. strain PCC 6803
-MSPRKTYILKLYVAGNTPNSMRALKTLRNILETEFRGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL59
ATPTLSKILPPPVRRIIGDLSDRERVLIGLDLLYDELADNAFSSG*
Synechococcus sp. strain WH 8102
MVNFKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEDEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL
60
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYEEIRERESEL*
Cyanothece sp. strain PCC 8801
MSPLKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKEILEQEFQGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL
60
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYEELNEDEYNL*
Trichodesmium erythraeum IMS101
MIKAKKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFEGVYALKVIDVLKSPQLAEEDKIL
60
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEELSEGDFEE*
Nostoc punctiforme ATCC 29133
MNKARKTYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKIL
60
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEELTEEDWEAQSNL*
Anabaena sp. strain PCC 7120
-MSPRKTYILKLYVAGNTPNSMRALKTLRDILENEFRGVYALKVIDVLKNPQLAEADKIL59
ATPTLAKILPPPVRRIIGDLSDRERVLIGLDLLYDEISEEMLGSAELDTLADDDIASPDS*
Prochlorococcus marinus MIT9313-MVARKTYILKLYVAGNTPNSMRALNTLKEILENEFKGVYALKVIDVLKQPQLAEEDKIL59
ATPTLAKILPPPVRRIIGDLSDREKVLIGLDLLFDELSESEYSGGTKN*
Prochlorococcus marinus MED4

108
102
105
104
104
104
104
108
119
107

Thermosynechococcus elongatus BP-1
Synechococcus sp. strain PCC 7942
Synechocystis sp. strain PCC 6803
Synechococcus sp. strain WH 8102
Cyanothece sp. strain PCC 8801
Trichodesmium erythraeum IMS101
Nostoc punctiforme ATCC 29133
Anabaena sp. strain PCC 7120
Prochlorococcus marinus MIT9313
Prochlorococcus marinus MED4ATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIGLDLLYEEIGDQAEDDLGLE*
ATPTLAKVLPLPVRRIIGDLSDREKVLIGLDLLYGELQDSDDF*
ATPTLAKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYDEIREREAEDQ*ATPTLSKILPPPVRRIIGDLSDRERVLIGLDLLYDELADNAFSSG*
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYEEIRERESEL*ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDREKVLIGLDLLYEELNEDEYNL*
ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEELSEGDFEE*ATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEELTEEDWEAQSNL*ATPTLAKILPPPVRRIIGDLSDRERVLIGLDLLYDEISEEMLGSAELDTLADDDIASPDS*ATPTLAKILPPPVRRIIGDLSDREKVLIGLDLLFDELSESEYSGGTKN*

Synechococcus sp. strain WH 8102
Cyanothece sp. strain PCC 8801
Trichodesmium erythraeum IMS101
Nostoc punctiforme ATCC 29133
Anabaena sp. strain PCC 7120
Prochlorococcus marinus MIT9313
Prochlorococcus marinus MED4KaiBの特徴的な表面電荷分布：活性部位の推測	

コア構造領域	

108
102
105
104
104
104
104
108
119
107

identity = 100 %C末端酸性アミノ酸領域	

(領域内の酸性アミノ酸残基：30~50%)

identity = 100 %Positive cleft
Negative ridge"

酸性アミノ酸領域(Negative ridge)、その奥に位置する正電荷領域(Positive cleft)が機能に関与してる可能性が高い。	

58

Positive cleft はNegative ridgeに隠されている	
Positive cleft
Negative ridge

Positive cleft

Positive cleft
Negative ridge

コア構造	

"
"

C末端酸性アミノ酸領域はコア構造の上に局在し、Positive cleftを囲んでいる。	
Negative ridgeは蝶番のように動くのではないか。	
59

サブ構造のリズム発振機能の解析	

Positive cleft
Negative ridge

Hours in consist light60

The clock:
KaiA, KaiB, KaiC・振動子	・リズム発振に不可欠		
1. Hayasi et al., 2003, Genes Cells 8:287-296
2. Hayashi et al., 2004, Biochem. Biophys. Res.
Commun. 316:195-202
3. Hayashi et al., 2004, J. Biol. Chem..
279:52331-52337
4. Hayashi et al., 2006, Biochem. Biophys. Res.
Commun. 348:864-872

電子顕微鏡像の単粒子解析による立体構造モデル	
 （大阪大学生命機能研究科難波研究室との共同研

61

藍色細菌に高度に保存されている重複構造のKaiC	 1

N末端ドメイン	
268 269 Ｃ末端ドメイン	
 518

N

C
Walker’s motif A
Walker’s motif B
Deduced catalytic Glu

Identical residue
Similar residue
Walker’s motif A
Walker’s motif B
Deduced catalytic Glu

・ 	
ゲノム配列が明らかになっている７種の藍色細菌全てにKaiCは高度に保存されていた。	
・ KaiC (1-518)のN末端ドメイン(1-268)とC
末端ドメイン(269-518)のアライメント解
析：アミノ酸配列の同一性は23%、相同性は58%であった。	
・ N末端ドメインとC末端ドメインにそれぞれWalker’s motif A, Walker’s motif B,
Deduced catalytic Glu (CatE)が存在する。	
・ 	
KaiCは重複構造をとっている。	
62

KaiCのATP依存的反応	
 ① KaiCのリン酸化活性	

② 六量体ポット状構造の形成	

+ ATP, [γ-32P]ATP	
リン酸化型	

ATP

非リン酸化型	
CBB	

KaiC + ATP

KaiC

RI	

ADP

p-KaiC + ADP

ATPはADPに分解される。	

ADPは六量体形成を誘導しない。	

ATPが関与する相反する二つの反応はどのようにして両立できているのか？	

1

N末端ドメイン	
 268 269

二つのATPase motifには機 N
能分担があるのではない
Walker’s motif Aか・	

Deduced catalytic Glu

Ｃ末端ドメイン	
 518

C
Walker’s motif B 63

二つのATPase motif の役割	KaiAとの相互作用	

Walker motif A
53

Walker motif A
294

GTSGTGKTGATGTGKT

EE

EE

78 79

318 319

Deduced catalytic Glu

Deduced catalytic Glu

N末端ドメイン	

C末端ドメイン	
64

KaiCから見た時計装置	
ATP

ATP

ATP

高親和性結合部位	
（Ｎ末端ドメイン）	

低親和性結合部位	
（Ｃ末端ドメイン）	

低親和性結合部位	
（Ｃ末端ドメイン）	

?
P
ATP

６量体・不安定	

ATP

分解？	

de novo 合成	

単量体・不安定	

６量体・安定	脱リン酸化	

６量体・安定	KaiC
cycle
リン酸化状態	
ヌクレオチド状態	

KaiCリン酸化の促進	

KaiA	
KaiB	

?

＋KaiA	SasA
65

クラミドモナス（Chlamydomonas reinhardtii ）	
１．概日リズムを示す。	
２．核相が単相（一倍体）である。	
３．寒天培地上でコロニーを形成する。	
４．遺伝子操作が可能であり、核・葉緑体・ ミトコンドリアの各ゲノムに遺伝子移入 ができる。	
５．高効率な核ゲノムへの遺伝子移入法が開発されており、遺伝子相補を利用した遺伝子クローニングが可能である。	
６．核ゲノム（GC rich）と葉緑体ゲノム（AT rich）におけるコドン使用頻度が特有である。	
７．全ゲノム配列（~100 Mbp）が決定されている。であり、外来遺伝子の発現	

66

クラミドモナスの概日リズム研究の歴史	
1970 走光性と細胞分裂のリズム発見(Victor Bruce)
1973 接合活性リズムの発見（石浦ら）
1972 リズム突然変異体の分離(Victor Bruce)
per-1, per-2, per-3, per-4,
1984
per-5, per-6, S
単細胞性緑藻	 1979 ガラスへの粘着性のリズムを発見	
クラミドモナス	
 1987 微少重力下での走光性リズム測定	

Chlamydomonas

1991 走光性リズム位相変異の作用スペクトル解析	

“Green Yeast” 1992 走化性リズムの発見	
「緑の酵母」	
1994 核遺伝子の発現リズムの発見	
1996 葉緑体遺伝子の発現リズムの発見	
2000 紫外線感受性リズムの発見	

67

なぜクラミドモナスをモデルとして使うのか１	
1. ３つのオルガネラ（核、葉緑体、ミトコンドリア）ゲノムの全てが形質転換可能である（クラミドモナスのみ）。	
	
2. オルガネラ間の時間情報の流れを、発光レポーターを用いて詳細に解析できる（ようにした）。	
核のリズム	

クロストーク	クロストーク	

生物時計	

ミトコンドリアのリズム	

クロス	
トーク	

葉緑体のリズム	

68時計遺伝子	
生物時計を構成する遺伝子（時計遺伝子）は進化の過程で保存されていない。	
菌類	

動物	
Per

frq

Tim

wc-1
wc-2

Clock Bmal/Cyc
Cry

藍藻	

高等植物	

kaiA
kaiC

kaiB

PCL1 LHY
TOC1 CCA169緑藻の時計遺伝子	
緑藻の生物時計遺伝子は未だに同定されていない。	
どのような時計を持っているのかは、植物時計の進化上大変興味
深い？	
動物	
菌類	
Per Timfrq
wc-1
Clock Bmal/Cyc
wc-2
Cry
緑藻	
藍藻	
kaiA
kaiC

葉緑体化	
kaiB

?
?

?

?
Cry?

多細胞化	
 高等植物	
陸上化	
PCL1 LHY
TOC1 CCA170葉緑体生物発光レポーター株	

CPS

10000

5000

0

lucCP

葉緑体ルシフェラーゼ遺伝子	

0

24 48 72 96 120 144 168 192 216 240 264
Hours

71

核レポーター株の作製	
（松尾ら、未発表）	

72

細胞内３ゲノムの概日リズムモニタリング	
核レポーター	

?
葉緑体レポーター	

ミトコンドリアレポーター	
73

オルガネラ間の時間情報のクロストーク	
核のリズム	

クロストーク	クロストーク	
生物時計	

クロス	
トーク	
ミトコンドリアのリズム	

葉緑体のリズム	

74

葉緑体発光株を用いた概日リズム変異
体の網羅的スクリーニングと原因遺伝子の網羅的同定	（Matuo et al., 2008, Gene & Dev. ；松尾ら、進行中）	
	
遺伝子タグ配列のゲノム挿入部位の塩基配列を決定することにより、原因遺伝子を同定し、全ての変異体の原因遺伝子をクローニングする。	
75

概日リズム変異体のスクリーニング	
葉緑体レポーター株の核ゲノムにハイグロマイシン耐性遺伝子を移入	
b2-tubulin 5'

RBCS2
intron1

aph7”

RBCS2 3'

ランダムに核ゲノムに挿入され遺伝子破壊	（遺伝子タギング）	
tufA-lucCP 株	

〜１６０００のハイグロマイシン耐性クローンの葉緑体リズムを測定	

１１５の概日リズム変異体を単離	

76

遺伝子座数およびGene model	

挿入位置を決定できた変異体	
（片側のみ決定の場合を含む）	

３７	

遺伝子座	

３０	

・Gene modelあり	

２８	

（既知及びアノテーション済遺伝子）	
（未知遺伝子）	

（１６）	
（１２）	

Rhythm of Chloroplast xx
ROCxx

77

クラミドモナスの時計タンパク質	
0	

1000	

機能ドメインの配列が2000	
(a.a.)	
 類似したタンパク質	

機能	

ROC15

高等植物 (PCL1)

ROC40

高等植物 (CCA1/LHY) 	
時計	

	
時計	

ROC55
ROC66

高等植物 (CO or COL) 	
花成	

ROC75

高等植物 (PCL1)

	
時計	

ROC114GARP

Single MYB

LRR

B-box

CCT

F-box

GARP, Single MYB, B-box, タンパク質がDNAに結合する際に必要なDNA結合ドメインの一種	
LRR, ロイシンリッチリピート。ロイシン残基が繰り返す特徴的な配列。 	
CCT, 植物の花成制御遺伝子や時計遺伝子に見られる配列でタンパク質間相互作用に関与する。 	
F-box, ：これを持つタンパク質はF-boxタンパク質と呼ばれ、タンパク質分解に関わるユビキチンリガーゼの構成因子と予想される。	

78

クラミドモナスの時計遺伝子	

クラミドモナスの概日時計は、独自の部品と植物的な部品から成る。	
動物	

菌類	

Per

frq

wc-1
wc-2
緑藻	

藍藻	
kaiA
kaiC

ROC55

Clock Bmal/Cyc
Cry

ROC15
ROC40

kaiB

ROC114

ROC66

ROC75

Tim

高等植物	
PCL1 TOC1
CCA1
LHY

79

シロイヌナズナの時計遺伝子
PCL1のクローニング（小内ら）
１．生物発光リズム系の開発
２．突然変異体の分離
３．時計遺伝子のクローニング	

80

リズム変異体の大規模スクリーニング	
代表的なリズム変異体の生物発光パターン	
生物発光量（cps/seedling）	

2,500,000

野生型（周期： 23.2h）	

 極めて再現良くきれいな発
光リズムを示すレポーター株（PGI::LUC+とPFT::LUC+）を作製した。そして、EMSで突然変異を誘発し、10万個体のM2植物体をスクリーニ
ングした。	

長周期型変異体（周期： 27.0h）	

2,000,000
1,500,000
1,000,000
500,00002,500,00081

短周期型変異体（周期： 17.1h）	

2,000,000
1,500,000
1,000,000

無周期型変異体	

500,000
0

0

24

48

72

96

120 0

24

48

72

96

120

連続明（h）	

分離したリズム変異体の分類	
分類
レポーター
P GI ::LUC +P FT ::LUC +
計

無周期型

短周期型

長周期型

5
1
6

9
5
14

1
2
3

長周期
位相異常型
位相異常型
5
0
6
1
11
1

計
20
15
35

 周期や位相が3時間以上異なる、または無周期である35個のリズム変異体を分離し、5グループに分類した。	
 無周期変異体は3つの相補性群、PHYTOCLOCK 1(PCL1)、PCL2、PCL3、に分類できた。	

82

無周期変異体pcl1-1とpcl1-2 の表現型	
(c) 就眠運動	

生物発光量	 (counts/sec/seedling)	
 野生型	
 (GI::LUC+), n=96;
pcl1-1, n=96; pcl1-2, n=96

連続明(h)	
 (b) 連続暗におけるGI::LUC+ 生物発光	
野生型	
 (GI::LUC+), n=96; pcl1-1, n=96

子葉の相対位置	 (pixel)	
 (a) 連続明におけるGI::LUC+ 生物発光	

野生型	
 (GI::LUC+)

pcl1-1
0

24

48

72

96

連続明(h)	
 (d) 光周的花成	
長日(16L8D)

短日(10L14D)

連続暗(h)	
 • 概日リズムが無周期であった。	
• 光周性が日長不感受性であった。	

野生型	
 野生型	
Col-0
GI::LUC+

pcl1-1

pcl1-2

PCL1 のマップベースクローニング	
・PCL1 のクローニング	

・PCL1の核局在	

pcl1-2 pcl1-1

Q106stop
pcl1-2

PCL1（= LUX）

W149stop
pcl1-1GARP• PCL1はMyb様DNA結合モチーフであるGARPを持つ転写因子である。	
• GARPモチーフ以外では既知のタンパク質との類似性が無かったが、植物一般に広く存在していた。	
83• PCL1は核に局在する。	

課題：時計分子装置の発振機構	
1. 時計分子装置（タンパク質複合体）の存在状態ごとの構造解明
2. 素反応の解明とパラメーターの解析
3. 定量的記載とシミュレーション	84課題：真核生物の時計分子装置のモデル	

1. より単純な真核生物時計分子装置の解明
2. 試験管内モデルの構築	

85課題：生物発光リアルタイム測定系の応用	

様々な生物種、様々な生物現象への応用
ほとんどの生物に応用可能である。	

86

人のやらないことをやる	
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

自分が「面白い」と思えることをやる。
「特殊から普遍へ」
人とは異なる「概念（発想）、材料、方法」を持つ。	
必要なものは「自分で作る」。	
必要なことは「自分でやる」。
徹底的に「まねる」
足らないものは人に「助けてもらう」（共同は楽しい）。	
認められなくても「孤立に耐える」（簡単には認めてもらえな
い、ずっと無視されるかも）。	
9. 「5年間」努力すれば道は拓ける（新しいことができる、ずっとできないかも）。
10. 理学は「自由」、でも自由は苦しい。
11. 「無駄なこと」は一つもない、すべてがどこかでつながる。
87

理学（研究）の心	
1. 役に立つことは尊い。しかし「直ぐに役に立つことは直ぐに役に立たなくなる」。	
2. 直ぐに役に立つことより、「面白いこと、のめり込めること、物事の本質」を究める。	
3. 何んの役にも立たない真理はない。「いずれ必ず何かの役に立つ」。	

88

生きる力	
熱（狂）、情、知、理	89謝辞（敬称略）
	
藍色細菌の研究	
近藤孝男さんと近藤研究室の皆さん	
Susan Golden	
Carl Johnson	
Peter Wolk	

90タンパク質の研究	
京都大学薬学研究科	
加藤博章、中津亨
大阪大学生命機能研究科	
難波敬一、今田勝巳、鈴木博文、古川進朗	
柳田敏雄	
大阪大学蛋白質研究所	
池上貴久	
武藤梨沙・栗栖源嗣	
大阪大学理学研究科	
荒田敏昭	
松本卓也	
大阪大学産業科学研究所
鉾之原瞳・川合知二	
91タンパク質の研究	
九州大学農学研究科	
石野良純	
岡山大学理学部	
沈健仁	
農業生物資源研究所	
山崎俊正	
愛媛大学総合科学研究支援センター	
森田勇人	
理学研究科物質理学
神山勉、坂田宗平、長谷川大祐	
伊藤繁、青木一洋、小村理行、山川壽伯	
三野広幸、田鹿良介	
黒澤俊介	
槇亙介	
遺伝子実験施設	
高林厚史	

92

装置・プログラム開発	
パーキンエルマージャパン	
日立アロカ	
古澤孝義、宮本義章、山本晃生	
浜松ホトニクス	
長谷川寛、岡田晃行	
中立電機	
白木央、大久保充宏、中村隆司、神谷聡、太田武司、伊藤英樹、
川角康之、梶浦博志	
コーネット
鈴木正敏、布施一幸	
千葉大学園芸学部	
高橋広夫
マイクロニクス株式会社	
椿本興業株式会社名古屋支店置	
ツジコー株式会社明	93

生物発光リアルタイム測定など	
田畑哲之（かずさDNA研究所）、渡辺正勝（基礎生物学研究所）、福澤秀哉（京都大学大学院生命科学研究科）、下河原浩介（帝京大学医学部）、皆川純（基礎生物学研究所）、オリエンタル酵母工業株式会社、北海道システムサイエンス、MKリサーチ、科学技術交流財団・日本レーザ電子・モリテックス、西本行男（愛知医科大学）、南後守（名古屋工業大学大学院工学研究科）、寺内良平（岩手バイオテクノロジー研究センター）、丸山明子（理化学研究所植物科学研究センター）、長谷あきら（京都大学理学研究科生物科学専攻植物系）、井澤毅（農業生物資源研究所）、魚住信之（東北大学工学研究科）、住斉（筑波大学数理物質科学研究科）、石原健吾（椙山女学院大学）、中西徹（就実大学薬学部）、目加田英輔（大阪大学微生物病研究所）、若松祐子（名古屋大学生物機能開発センター）、木下政人（京都大学大学院農学研究科）、小保方潤一（京都府立大学）、藤堂剛（大阪大学医学研究科）、八木田和弘（京都府立大学）、中村研三（中部大学応用生物学部）、西村芳樹（京都大学理学研究科）、青木摂之（名古屋大学人間情報科学科）、黒岩常祥（立教大学理学部極限生命情報研究センター）、タイテック株式会社、マイクロニクス株式会社、椿本興業株式会社名古屋支店（名古屋市）、塙優（産業技術総合研究所特許生物寄託センター）、伊藤素行（千葉大学薬学研究科）、石黒澄衞（名古屋大学生命農学研究科）、小俣達男（名古屋大学
生命農学研究科）、九町健一（鹿児島大学理工学研究科）、矢崎一史（京都大学生存圏研究所）、村中俊哉・池澤 信博（大阪大学工学研究科）、大音徳・米倉円佳（トヨタ自動車株式会社FP）、青木直大（東京大学農学生命科学研究科）、廣瀬竜郎（農研機構94
中央農業総合研究センター）	

植物ゲノム解析分野の皆さん	
スタッフ：杉山康雄、井原邦夫、松尾拓哉	
博士研究員：小内清、林史夫、北島智美、伊関峰生、九町健一、上池伸徳、
松尾拓哉、村上怜子	
大学院生：宇津巻竜也（以下博士）、岡本和久、岩瀨亮、立川誠、赤井政郎（
生物機能開発センター）、劉致笒、武藤梨沙、Jonathan Valencia Swain、石井健太郎、飯田高広、丹羽由実、坂口誠二（以下修士）、山本晋玄、藤田真康、伊藤紫野、伊藤典代、土屋ゆか、三宅歩、和田ちひろ、尾藤恭平、
長谷川大祐（物質理学）、加藤大策、西村篤人、安井聡、石黒彩由奈	
卒業研究生：三宅麻子、杉浦知雄、西本伸、青木一洋（物理）、小村理行（
物理）、山川壽伯（物理）、野村聡司（名工大応用化学）、黒澤俊介（物理）、南正大、小松賢司、佐藤洋志、國井雄大、広瀬健太郎、田鹿良介（物理）、木下亜由美、岩田慶太	
技術補佐員：森下めぐみ、西本治美、森岡千里、田中久美子、小川仁子、横田はるみ	
学生技術補佐員：澤田俊介、田邊剛士、野口直洋、中村真知子、稲田博、中岡由貴、児島俊貴、林真一、三木麻莉子、中村有美子、三井浩嗣、佐々木
妙子、山内康久	
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事務補佐員：浅井晶子、森川環、小坂井ふじ江、山村佳美	

杉浦昌弘遺伝子実験施設長
小林猛遺伝子実験施設長	
遺伝子実験施設の皆さん
生命理学専攻の皆さん
理学研究科の皆さん	
名古屋大学の皆さん	

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楽しい研究者人生を送らせていただきまして本当に有難うございました。

皆様のご健康とご多幸を祈ります。	
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