「富岳」成果創出加速プログラム ②国民の生命・財産を守る取組の強化の領域「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」
課題責任者：奥野恭史■
No.

学会等における口頭・ポスター発表（国際会議）発表した成果（発表題目）

East Asian population-specific variants and cross-disease
1 variants: Detailed analysis based on MGeND records anddatabase improvement

発表者氏名発表した場所（学会名等）

Rei Ashine, Mayumi Kamada, Masahiko Nakatsui, American Society of Human Genetics (ASHG)
Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno
2020 Annual Meeting

発表した時期

国内外の別開催地

2020年10月

国際

Online

The effect of conformational flexibility of protein-ligand binding
2 free energy computation and its significance in predicting
Araki M and Okuno Y
mutation-induced drug sensitivity changes in oncogenic kinases.

Fall 2020 ACS National Meeting

2020年8月

国際

OnlineProtein-drug binding free energy computation incorporating
3 protein flexibility and its significance in predicting mutationinduced drug resistance in oncogenic kinases.

Spring 2020 ACS National Meeting

2020年4月

国際

Telluride, Co, USA(online)Molecular dynamics simulations reveal the protein-protein
4
Takefumi Yamashita
interaction mechanism

16th International Conference ofComputational Methods in Sciences andEngineering (CC symposium of ICCMSE
2020)

2020年9月

国際

onlineRelationship between the void formation and stress change
5
Naoyuki Shoji and Takefumi Yamashita
during the deformation of epoxy resin

16th International Conference ofComputational Methods in Sciences andEngineering (CC symposium of ICCMSE
2020)

2020年9月

国際

OnlineAraki M and Okuno Y

6

Conformational flexibility and stability of SARS-CoV-2 spike
protein in solution

Yuji Sugita

ACS Spring 2021

2021年4月

国際

online7

Intrinsic Conformational Flexibility of SARS-CoV-2 Spike
Protein Simulated on Fugaku

Yuji Sugita

2021 R-CCS Symposium

2021年2月

国際

Online, Japan

Yuji Sugita

The 1st Fugaku Bio-supercomputing Workshop
on Cellular-Scale Molecular Dynamics
Simulations

2021年1月

国際

Kobe, Japan

Yuji Sugita

Virtual Workshop "Biomolecular Interactions
in Cellular Environments" in Telluride Science
Research Center

2020年8月

国際

OnlineMolecular Basis of Proteinopathies

2021年2月

国際

Virtual, USA

8 Multi-scale MD simulations using GENESIS on Fugaku

9

Use of enhanced conformational sampling for the analysis ofprotein-ligand binding processes

10

Replica-exchange simulations on the conformational dynamics ofYuji Sugita
spike protein on the surface of SARS-CoV-2

202１/8/23
1

11

Developments and Applications of Free-Energy Analysis forProtein-Ligand Binding■

学会等における口頭・ポスター発表（国内学会）

2021年3月

国際

online

発表した場所（学会名等）

発表した時期

国内外の別

開催地

Kazu Ohsaki, Toru Ekimoto, Tsutomu Yamane,
Mitsunori Ikeguchi

第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロナウイルスのため要旨のみ）

2020年6月

国内Japan(Online)

奥野恭史

第47回日本毒性学会学術年会シンポジウ
ム

2020年6月

国内

オンライン

Akari Ito, Tsutomu Yamane, Toru Ekimoto,
Mitsunori Ikeguchi

第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロナウイルスのため要旨のみ）

2020年6月

国内Japan(Online)

Takashi Yoshidome, Mitsunori Ikeguchi, Masateru 第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロOhta
ナウイルスのため要旨のみ）

2020年6月

国内Japan(Online)

5

Elucidation of interaction between neurotrophin receptor TrkAd5 Maho Takahashi, Toru Ekimoto, Tsutomu Yamane, 第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロand its binding peptide
Rika Suzuki, Hideo Takahashi, Mitsunori Ikeguchi ナウイルスのため要旨のみ）

2020年6月

国内Japan(Online)

6

Regulation mechanism of agonist/antagonist activities of vitamin Toru Ekimoto, Takafumi Kudo, Tsutomu Yamane, 第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロD receptor elucidated by generalized ensemble method
Mitsunori Ikeguchi
ナウイルスのため要旨のみ）

2020年6月

国内Japan(Online)

7

Structural basis for the switching of binding partners by Ser298
phosphorylation in UHRF1

Satomi Kori, Tomohiro Jimenji, Toru Ekimoto,
第20回日本蛋白質科学会年会（新型コロMiwa Sato, Fumie Kusano, Takashi Oda, Motoko
ナウイルスのため要旨のみ）
Unoki, Mitsunori Ikeguchi, Kyohei Arita

2020年6月

国内Japan(Online)

8

Developments and applications of generalized-ensemble methods
尾嶋拓
for free-energy analysis of protein-ligand binding

第20回日本蛋白質科学会年会

2020年7月

国内

日本

9Protein-protein complex dissociation simulated by Parallel
Cascade Selection Molecular Dynamics

Yoshiki MIyazawa, Dun P. Tran, Kazuhiro
Takemura, Akio Kitao

第20回日本蛋白質科学会年会

2020年7月

国内

Oniine, Japan

10

Simulating the association/dissociation process of flexible
protein complexes

Tran P. Duy, Akio Kitao

第20回日本蛋白質科学会年会

2020年7月

国内

Online, Japan

11

Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPIColDock

Kazuhiro Takemura, Akio Kitao

第20回日本蛋白質科学会年会

2020年7月

国内

Online, JapanNo.

発表した成果（発表題目）

1

3D-RISM-AI: Prediction of protein-ligand binding free energy
based on machine learning using 3D-RISM

2 AI・シミュレーションによる薬効・毒性予測

3Comparison of molecular dynamics of cyclosporin A andcyclosporin E

Comprehensive analysis of the hydration of small molecule
4 binding sites in ligand-free protein structures: 3D-RISM
approach

Hiraku Oshima

RIKEN BDR Symposium 2021

発表者氏名

202１/8/23
2

12

DNA binding mechanisms of the p53 C-terminal domain
elucidated by MD simulation

Yuta Taira, Dun Tran Akio Kiao

第58回日本生物物理学会年会

2020年9月

国内

Online, Japan

13

Investigating the dissociation process of DBD-p53/DNA
complex by PaCS-MD and MSM

Sobeh Mohamed Marzouk, Akio Kitao

第58回日本生物物理学会年会、オンライ
ン学会

2020年9月

国内

Online, Japan

14

Kinetic rate evaluation for protein complexes by PaCSMD/MSM

Yoshiki Miyazawa, Duy Phuoc Tran, Kazuhiro
Takemura, Akio Kitao

第58回日本生物物理学会年会

2020年9月

国内

Online,Japan

Takefumi Yamashita

日本生物物理学会年会（第9回Biophysics
and Physicobiology論文賞受賞講演会/The
9th Award Seminar for outstanding Biophysics
and Physicobiology paper）

2020年9月

国内

OnlineKazuhiro Takemura, Akio Kitao

第58回日本生物物理学会年会

2020年9月

国内

Online奥野恭史

第24回日本がん分子標的治療学会学術集会

2020年10月

国内

オンライン

CBI学会2020年大会

2020年10月

国内

日本

中津井雅彦, 芦根怜, 鎌田真由美, 小島諒介, 奥
トーゴーの日2020
野恭史

2020年10月

国内

オンライン

CBI学会2020年大会

2020年10月

国内

日本（オンライン）

15 Molecular dynamics study on protein-ligand interaction

16

Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPIColDock

17 スーパーコンピュータ・AIが拓くがん分子標的治療戦略

18

タンパク質─リガンド結合の自由エネルギー計算法の開発
尾嶋拓と応用

19 日本人疾患バリアントデータベースMGeNDアップデート

20

細胞環境はどのようにタンパク質の構造・ダイナミク
ス・機能に影響を与えるか？

杉田有治

21 MGeND: Database updates and detailed analysis

Mayumi Kamada, Rei Ashine, Masahiko Nakatsui,
日本人類遺伝学会第65回大会
Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno

2020年11月

国内

online22 創薬におけるAIの現状と未来

奥野恭史

第21回日本毒性病理学会

2020年11月

国内

オンライン

23 AI・シミュレーションが拓く創薬・医療の未来

奥野恭史

けいはんなR&Dイノベーションフォーラ
ム

2020年12月

国内

オンライン

24

New parallel computing algorithm of molecular dynamics for
extremely huge scale biological systems

Jaewoon Jung, 小林千草, Cheng Tan, 笠原健人,
Michael Feig, 杉田有治

第34回 分子シミュレーション討論会

2020年12月

国内

Online25

PaCS-MD/MSM を用いたタンパク質-タンパク質複合体の 宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾
結合親和性評価彰朗

第34回分子シミュレーション討論会

2020年12月

国内

オンライン

第13回 スーパーコンピューティング技術
産業応用シンポジウム

2020年12月

国内

オンライン

26 「富岳」がもたらす創薬・医療へのインパクト奥野恭史

202１/8/23
3

27 シクロスポリンAのCHARMM力場の開発

山根努, 浴本亨, 池口満徳

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

28

スパコンを用いたタンパク質-化合物結合親和性の高精度
荒木望嗣, 奥野恭史
予測と医療・創薬への応用

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

オンライン

29

スパコンを用いたタンパク質－化合物結合親和性の高精度予測と医療・創薬への応用

荒木望嗣, 奥野恭史

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本

奥野恭史

Life Science Startup Ecosystem

2020年12月

国内

オンライン

河間光祐, 吉留崇, 池口満徳, 大田雅照

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

30 スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬の未来

31

ディープラーニングを用いたタンパク質水和分布予測法の研究

32

ニューロトロフィン受容体TrkAd5と結合ペプチド間の相 髙橋真帆, 浴本亨, 鈴木里佳, 山根努(理研
互作用様式の解明
MIH), 高橋栄夫, 池口満徳

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

33

中分子シクロスポリンAとシクロスポリンEの分子ダイナ
伊藤朱里, 浴本亨, 山根努, 池口満徳
ミクスの比較

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

34

分子動力学計算によるp53-C 末端部位のDNA 結合機構の平悠太、Tran Duy、北尾彰朗
解明

第34回分子シミュレーション討論会

2020年12月

国内

オンライン

35

幾何学的相互作用解析と機械学習による抗原ー抗体複合
体側鎖モデル構造妥当性予測

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

千葉峻太朗, 小甲裕一, 野沢優翼, 柳田駿介, 佐第48回構造活性相関シンポジウム
藤美和, 池口満徳, 大田雅照

中津井雅彦, 鎌田真由美

第43回分子生物学会 企画フォーラム「ゲノム研究と医療をつなぐデータベース」

2020年12月

国内

オンライン

機械学習を用いた3D-RISMベースの結合自由エネルギー
予測

大崎和, 浴本亨, 山根努, 池口満徳

第48回構造活性相関シンポジウム

2020年12月

国内

日本（オンライン開催）

Dynamics of Close-Open State of Candida antarctica Lipase B
38 Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation
and The Markov State Model

Wijaya Tegar Nurwahyu, Akio Kitao

第10回日本生物物理学会関東支部会

2021年3月

国内

online39「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ
統合システムの推進」

奥野恭史 ,荒木 望嗣, 鎌田真由美

富岳の創薬活用に向けたワークショップ

2021年3月

国内

オンライン

40

「産学連携コンソーシアムLINCから観たAI創薬の現状と
奥野恭史
未来」

知的財産戦略ネットワーク講演会 医療
AI 「AI創薬について」～Aishリーズ
パート2～

2021年3月

国内

オンライン

36 日本人疾患バリアントデータベースMGeND

37

202１/8/23
441 抗原-抗体界面における塩橋安定性の理論的解析

山下雄史

第1回生体分子シミュレーション・モデリ
ング研究会

2021年3月

国内

Online42 新型コロナウイルス表面のタンパク質動的構造予測

杉田有治

HPCIフォーラム

2021年3月

国内

オンライン、日本

43

GENESIS とCHARMM-GUI を用いたリガンド結合自由エ
ネルギー計算尾嶋拓, 李秀栄, 杉田有治

第21回日本蛋白質科学会年会

2021年6月

国内

オンライン

44

「医薬プロセス最適化プラットフォーム開発の現状と今
後」

奥野恭史

理化学研究所 医科学イノベーションハ
ブ推進プログラム シンポジウム

2021年7月

国内

オンライン

45

GENESIS とCHARMM-GUI を用いたリガンド結合自由エ
ネルギー計算尾嶋拓, 李秀栄, 杉田有治

第21回日本蛋白質科学会年会

2021年6月

国内

オンライン

■

学会誌・雑誌等における論文掲載
発表した時期国際共著（○を記入）

No.

掲載した論文（発表題目）

発表者氏名

発表した場所（学会誌・雑誌名等）

Edge expansion parallel cascade selection molecular dynamics
Takaba, Kenichiro, Takaba, Kenichiro, Tran, Duy JOURNAL OF CHEMICAL
1 simulation for investigating large-amplitude collective motions of
Phuoc; Kitao, Akio
PHYSICS,Vol.152(2020)
proteins2

Prediction of Protein-Ligand Binding Pose and Affinity Using
the gREST+FEP Method

3Seonghoon Kim, Hiraku Oshima, Han Zhang,
CHARMM-GUI Free Energy Calculator for Absolute andNathan R. Kern, Suyong Re, Jumin Lee, Benoit
Relative Ligand Solvation and Binding Free Energy Simulations
Roux, Yuji Sugita, Wei Jiang, Wonpil Im

Hiraku Oshima, Suyong Re, Yuji Sugita

J. Chem. Inf. Model. Vol. 60, 5382-5394(2020)

2020年7月

J. Chem. Theory Comput. 2020, 16, 7207-7218

2020年10月

Aini Gusmira, Kazuhiro Takemura, Shin Yong Lee,
Regulation of caveolae through cholesterol-depletion-dependent Takehiko Inaba, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Kayoko
4
J. Cell. Sci., V133(19), P246785(1-11)(2020)
tubulation mediated by PACSIN2
Oono-Yakura, Kazuma Yasuhara, Akio Kitao,
Shiro Suetsugu
5Group-based evaluation of temperature and pressure formolecular dynamics simulation with a large time step

6

Discovery of natural TRPA1 activators through pharmacophore- Iwata, H., Kanda, N., Araki, M., Sagae, Y.,
based virtual screening and a biological assay
Masuda, K., Okuno,Y.

7

2020年6月

2020年10月

The Journal of Chemical Physics, Vol. 153,
234115 (2020)2020年12月

Bioorg Med Chem Lett. 2021 Jan 1;31:127639

2021年1月

Miki Mori, Kohei Sato, Toru Ekimoto, Shinichi
Imidazolinium-based Multiblock Amphiphile as Transmembrane
Chemistry-An Asian Journal, Vol.16, 2, 147Okumura, Mitsunori Ikeguchi, Kazuhito V. Tabata,Anion Transporter
157 (2021)
Hiroyuki Noji, Kazushi Kinbara

2021年1月

Jaewoon Jung, Yuji Sugita〇

202１/8/23
5

Environmental effects on salt bridge stability in the protein8 protein interface: The case of hen egg-white lysozyme and its
antibody, HyHEL-10

9

Ryo Okajima, Shuichi Hiraoka, Takefumi
Yamashita

Extraction of protein dynamics information from cryo-EM maps Matsumoto S, Ishida S, Araki M, Kato T,
using deep learning
Terayama K, Okuno Y

J. Phys. Chem. B 125, 1542－1549 (2021)

2021年2月

Nature Machine Intelligence volume 3,
pages153－160(2021)

2021年2月

Gilteritinib overcomes lorlatinib resistance in ALK-rearranged
cancerMizuta H, Okada K, Araki M, Adachi J, Takemoto
A, Kutkowska J, Maruyama K, Yanagitani N, Ohhara T, Watanabe K, Tamai K, Friboulet L,
Nature Communications volume 12, Article
Katayama K, Ma B, Sasakura Y, Sagae Y,
number: 1261 (2021)
Kukimoto-Niino M, Shirouzu M, Takagi S, Simizu
S, Nishio M, Okuno Y, Fujita N, and Katayama R

2021年2月

11

New parallel computing algorithm of molecular dynamics for
extremely huge scale biological systems

Jaewoon Jung, Chigusa Kobayashi, Cheng Tan,
Akiyoshi KUroda, Kazuo Minami, Yutaka
Ishikawa, Kento Kasahara, Yuji Sugita, Shigeru
Ishiduki, Tatsuo Nishiki, Hikaru Inoue, MichaelFeig

2021年2月

12

Shuya Kate Huang, Aditya Pandey, Duy Phuoc
Delineating the conformational landscape of the adenosine A2A
Tran, Nicolas L. Villanueva, Akio Kitao, Roger K. Cell, Vol.184, pp.1884-1894.e14 (2021)
receptor during G protein coupling
Sunahara, Adnan Sljoka, R. Scott Prosser

2021年3月

13

Modification and Validation of the DREIDING Force Field for
Molecular Liquid Simulations (DREIDING-UT)

2021/3/1

10

Kohei Sasaki, Takefumi Yamashita

Journal of Computational Chemistry, Vol. 42,
4, 231-241(2021)

J. Chem. Inf. Model., 61, 1172－1179 (2021).

Novel Resistance Mechanisms Including L1196Q, P1094H, and Furuta H, Araki M, Masago K, Sagae Y, Fujita S,
14 R1248_D1249 Insertion in Three Patients With NSCLC After
Seto K, Shimizu J, Horio Y, Sasaki E, Hosoda W, J Thorac Oncol. 16(3):477-482 (2021)
ALK Tyrosine Kinase Inhibitor Treatment
Katayama R, Okuno Y, Hida T〇

2021/3/1

15

Relationship Between Void Formation and Stress Change During
Naoyuki Shoji, Takefumi Yamashita
Deformation of Epoxy ResinAIP Conf. Proc. 2343, 020009 (2021)

2021/3/1

16

Singular Spectrum Transformation for Detecting Molecular
Motion Mode Change of Protein Systems

Takefumi Yamashita, Naoyuki Shoji

AIP Conf. Proc. 2343, 020010 (2021)

2021/3/1

17Structural and dynamical insights into the PH domain of p62 inhuman TFIIH

Masahiko Okuda, Toru Ekimoto, Jun-ichi Kurita,
Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura

Nucleic Acids Research, Vol.49, 5, 29162930(2021)

2021/3/1

202１/8/23
6

Yoshizawa T, Uchibori K, Araki M, Matsumoto S,
Microsecond-timescale MD simulation of EGFR minor mutation Ma B, Kanada R, Seto Y, Oh-hara T, Koike S,
npj Precision Oncology volume 5, Article
18 predicts the structural flexibility of EGFR kinase core that
Ariyasu R, Kitazono S, Ninomiya H, Takeuchi K,
number: 32 (2021)
reflects EGFR inhibitor sensitivity
Yanagitani N, Takagi S, Kishi K, Fujita N, Okuno
Y, Nishio M, Katayama R

19

Coarse-Grained Modeling of Multiple Pathways in
Conformational Transitions of Multi-Domain Proteins

20

Exploring ligand binding pathways on
hypersound-accelerated molecular dynamics

proteins

Ai Shinobu, Chigusa
Matsunaga, Yuji Sugita

Kobayashi,

Yasuhiro Journal of Chemical Information and Modeling,
Vol.61, pp.2427-2443 (2021)

using Araki M, Matsumoto S, Bekker G.J, Isaka Y,
Sagae Y, Kamiya N, Okuno Y

Nature Communications, Vol.12, 2793 (2021)

2021年4月

2021年5月

2021年5月

Risako Tamura-Sakaguchi, Rie Aruga, Mika
Hirose, Toru Ekimoto, Takuya Miyake, Yohei
Moving toward generalizable NZ-1 labeling for 3D structure
21
Hizukuri, Rika Oi, Mika K. Kaneko, Yukinari Acta Crystallographica Section D: Structural Bio
determination with optimized epitope-tag insertion
Kato, Yoshinori Akiyama, Mitsunori Ikeguchi,
Kenji Iwasaki, Terukazu Nogi

2021年5月

Efficient Search for Energetically Favorable Molecular
22 Conformations against Metastable States via Gray-Box
Optimization

Kei Terayama, Masato Sumita, Michio Katouda,
Koji Tsuda, Yasushi Okuno

Journal of Chemical Theory and Computation(2021)

2021年7月

Optimized Hydrogen Mass Repartitioning Scheme Combined
23 with Accurate Temperature/Pressure Evaluations for
Thermodynamic and Kinetic Properties of Biological Systems

Jaewoon Jung, Kento Kasahara, Chigusa
Kobayashi Hiraku Oshima, Takaharu Mori, Yuji
SugitaJournal of Chemical Theory and Computation,
Vol.17, pp.5312-5321 (2021)

2021年7月

Structure-Based de Novo Molecular Generator Combined with
Artificial Intelligence and Docking Simulations

Biao Ma, Kei Terayama, Shigeyuki Matsumoto,Yuta Isaka, Yoko Sasakura, Hiroaki Iwata,
Mitsugu Araki, Yasushi Okuno

Journal of Chemical Information and Modeling,
Vol.61, pp.3304-3313 (2021)

2021年7月

PaCS-MD/MSM: Parallel Cascade Selection Molecular Dynamic
Duy Phuoc Tran, Hiroaki Hata, Takumi Ogawa,25 Simulation in Combination with Markov State Model as an
Yuta Taira, Akio Kitao
Efficient non-Bias Sampling Method

分子シミュレーション学会誌アンサンブ
ル, 22, 151-156 (2020).

2020年4月

X線小角散乱と分子動力学シミュレーションを組み合わせ
浴本亨, 小甲裕一, 笠口友隆, 池口満徳
た生体分子の溶液構造解析

アンサンブル (分子シミュレーション学会誌), 22巻, 3, 239-251

2020年7月

milsil 13(6), 20202020年11月

24

26『プレシジョン・メディシンを加速する「創薬ビッグ
27 データ統合システム」の推進』、「富岳」が拓く計算科
学の未来

荒木望嗣,鎌田真由美,奥野恭史

202１/8/23
728

Efficient Search for Energetically Favorable Molecular
29 Conformations against Metastable States via Gray-Box
Optimization

30

Structure-Based de Novo Molecular Generator Combined with
Artificial Intelligence and Docking Simulations

■

研究会

No.

シミュレーション (日本シミュレーション学会), Vol.40, pp.22－28 (2021)

2021年3月

Kei Terayama, Masato Sumita, Michio Katouda,
Koji Tsuda, Yasushi Okuno

Journal of Chemical Theory and Computation(2021)

2021年7月

Biao Ma, Kei Terayama, Shigeyuki Matsumoto,Yuta Isaka, Yoko Sasakura, Hiroaki Iwata,
Mitsugu Araki, Yasushi Okuno

Journal of Chemical Information and Modeling,
Vol.61, pp.3304-3313 (2021)

2021年7月

発表者氏名発表した場所（研究会名等）

発表した時期

分類

開催地

分子動力学ソフトウェアGENESISを用いたタンパク質─リ
尾嶋 拓, 李 秀栄, 新津 藍, 杉田 有治
ガンド結合の自由エネルギー計算

発表した成果（発表題目）

1 AI・シミュレーションによる薬効・毒性予測

奥野恭史

第47回日本毒性学会学術年会シンポジウム

2020年6月

招待講演

オンライン・日本

2 「 シミュレーション・AI駆動型創薬」

奥野恭史

俯瞰ワークショップ ナノテクノロジー・材
料分野 区分別分科会

2020年7月

招待講演

オンライン

3 シミュレーション・AI駆動型創薬奥野恭史

俯瞰ワークショップ ナノテクノロジー・材
料分野 区分別分科会

2020年7月

招待講演

オンライン・日本

4 創薬AIとこれからの医薬品開発、新たな産業の役割

奥野恭史

IQVIAセミナー（製薬企業向け）

2020年7月

招待講演

オンライン・日本

5 創薬AIとこれからの医薬品開発、新たな産業の役割

奥野恭史

IQVIAセミナー（メディア向け）

2020年7月

招待講演

オンライン・日本

6 スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬・医療の未来

奥野恭史奥野恭史

人事労災対策委員会・総務委員会

2020年9月

招待講演

オンライン・日本

Yuji Sugita

RIKEN-NRC HPC Workshop

2020年10月

口頭発表

Japan (Online)

8 スーパーコンピュータ・AIが拓くがん分子標的治療戦略

奥野恭史

第24回日本がん分子標的治療学会学術集会

2020年10月

招待講演

オンライン・日本

9 新型コロナウイルス 表面のタンパク質動的構造予測

杉田有治

第9回JCAHPCセミナー

2020年10月

招待講演

東京、日本（オンライン）

第一回クライオ電子顕微鏡画像からの高度情報処理研究会

2020年10月

招待講演

オンライン・日本

710All-atom molecular dynamics simulations of spike protein on thesurface of SARS-CoV-2 in solution

深層学習技術による cryo-EM密度マップデータに隠された動松本篤幸
的情報の抽出

11 AI・シミュレーションが拓く創薬・医療の未来

奥野恭史

CHUGAI DIGITAL DAY～ヘルスケア×デジ
タルの2030未来予想図

2020年11月

招待講演

オンライン・日本

12 創薬におけるAIの現状と未来

奥野恭史

第21回日本毒性病理学会

2020年11月

招待講演

オンライン・日本

202１/8/23
8

13 計算機シミュレーションで細胞の中を観る

杉田有治

京都大学MACSコロキアム

2020年11月

招待講演

京都、日本（オンライン）

14 AI・シミュレーションが拓く創薬・医療の未来

奥野 恭史

けいはんな R&D イノベーションフォーラム

2020年12月

招待講演

オンライン・日本

15 「富岳」がもたらす創薬・医療へのインパクト

奥野恭史

第13回 スーパーコンピューティング技術 産
業応用シンポジウム

2020年12月

招待講演

オンライン・日本

スーパーコンピュータが明らかにする蛋白質の動的構造と機
杉田有治
能理研・東北大学連携シンポジウム「計測科学が拓く生命科学の新展開」

2020年12月

招待講演

日本

16

17 スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬の未来

奥野恭史

第3回産学官連携情報交流セミナー

2020年12月

招待講演

オンライン・日本

18 スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬の未来

奥野恭史

Life Science Startup Ecosystem

2020年12月

招待講演

オンライン・日本

19 AIが拓く創薬イノベーション

奥野 恭史

第16回がんトランスレーショナルリサーチ（TR）ワークショップ

2021年1月

招待講演

オンライン・日本

Yuji Sugita

Molecular Basis of Proteinopathies

2021年2月

招待講演

Online, USA

奥野 恭史

IQVIAセミナー

2021年2月

招待講演

オンライン・日本

奥野 恭史

理化学研究所 医科学イノベーションハブ
推進プログラム シンポジウム

2021年3月

招待講演

オンライン・日本

近畿化学協会コンピュータ化学部会

2021年3月

招待講演

オンライン、日本

知的財産戦略ネットワーク講演会

2021年3月

招待講演

オンライン・日本発表した時期

開催地

20

Replica-exchange simulations on the conformational dynamics of
spike protein on the surface of SARS-CoV-2

21 データ駆動型

医療・医薬品・ヘルスケア産業

22 医薬プロセス最適化プラットフォーム開発の現状と今後
23

富岳を用いた新型コロナウイルス表面のスパイクタンパク質
杉田有治
動的構造予測24 産学連携コンソーシアムLINCから観たAI創薬の現状と未来

■

奥野 恭史

一般向講演 会・セミナー等No.

発表した成果（発表題目）

発表者氏名

発表した場所（研究会名等）

1 創薬AIとこれからの医薬品開発、新たな産業の役割

奥野恭史

IQVIAセミナー（メディア向け）

2020年7月

オンライン

2 創薬AIとこれからの医薬品開発、新たな産業の役割

奥野恭史

IQVIAセミナー（製薬企業向け）

2020年7月

オンライン

3 スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬・医療の未来

奥野恭史

人事労災対策委員会・総務委員会

2020年9月

オンライン

4 AI・シミュレーションが拓く創薬・医療の未来

奥野恭史

CHUGAI DIGITAL DAY～ヘルスケア×デジ
タルの2030未来予想図

2020年11月

オンライン

5 「スーパーコンピュータ・AIが拓く創薬の未来」

奥野恭史

第3回産学官連携情報交流セミナー

2020年12月

オンライン

6 AIが拓く創薬イノベーション

奥野恭史

第16回がんトランスレーショナルリサーチ（TR）ワークショップ AIが創る医薬品開発のカッティング・エッジ

2021年1月

オンライン

7 データ駆動型

奥野恭史

IQVIAセミナー

2021年2月

オンライン

医療・医薬品・ヘルスケア産業

202１/8/23
9■ 新聞・TV・Web配信・雑誌・広報誌等
No.
1

発表した成果（発表題目）

発表者氏名

発表した場所（研究会名等）

How Japan Is Using The World's Most Powerful Supercomputer To
Mayumi Kamada
Accelerate Personalized Medicine

Forbes発表した時期

分類

2021年2月

雑誌

202１/8/23
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