特定非営利活動法人

日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター

学会ホームページ http://www.jsbi.org/

Tel:03-3238-1689

第32号

E-mail:jimu@jsbi.org

巻頭言···················································· 1

リレー紹介：日本のバイオインフォマティクス研究室···· 10

特集：外国人会員からの声································ 2

学会からのお知らせ···································· 11

2016年年会・·第5回生命医薬情報学連合大会開催報告················ 6

学会議事録等··········································· 12
学会の現況············································· 16

研究会・地域部会の活動報告····························· 7

巻

編集後記················································ 17

頭2017年の生命医薬情報学連合大会開催について言
特別な講演は、 鈴木章先生の第 6 回の生命医薬情報学連合大会を、北海道大学札幌キャ2010 年ノーベル化学賞受賞を記念

日本バイオインフォマティクス学会、情報計算科学生物学会、て、その他の講演は、キャンパス

ンパスにて9月27日から29日の日程で開催します。本大会も、
日本オミックス医療学会の連合大会としての開催となります。

特別な招待講 演者として、 アブドラ国王科 学技術 大学（KAUST）ディスティングイッシュト・プロフェッサーの五條堀孝

教授、東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの宮野悟
教授にご講演をお願いしています。このほか、ノンコーディン

グ RNA ネオタクソノミ、ニュートリゲノミクス、感染症、キャリ
アパス、3 学会合同などのセッションが計画中です。また、今大会でも、例年の形式を踏襲してBirds of Feather（BoF）の募集を行い、各方面の興味に沿ったセッションを開催します。

して建てられた「鈴木章ホール」に

中心部に位置する情報科学研究科

棟、ポスター発表は隣接する材料
化学研究棟を主会場とする予定です。 会場近くには、380 mに渡る

銀杏並木、 高さ30 mのポプラ並木があります。また、生協・生協食堂もすぐそばです。観光誌で紹介される特別メニューもあるので、事前研究のうえ、空き時間に是非お試しください。

北大はJR 札幌駅から正門まで徒歩 5 分という非常に便利な

BoFの内容に特別な基準は設けませんが、多くのゲノム情報が立地であると同時に、キャンパス内には原生林や復元河川のサ更に伴う課題などについて、そのほか、生物と医薬に関する情パスが広大なため、正門から情報科学研究科までは徒歩15 分

利用可能になっていること、個人情報取り扱いの基本方針変
報のさまざまな角度からのセッションや演題、活発な議論を期待しています。このほか、日本サイエンス・ビジュアリゼーション研究会から講師をお招きし、チュートリアルセッションを予定
しています。内容は、惹きつける話の組み立て方と、上手なパ

ワーポイント資料デザイン方法を中心にしたもので、学生やポ

スドクはもちろん、教員にとっても役立つものになる予定です。
大会開催支援となる、多数のスポンサー出展や広告ご提供もお待ちしております。

クシュコトニ川があり自然も豊かなところです。ただし、キャンほどかかります。会場の最寄りはさっぽろ駅からひと駅の地下
鉄「北 12 条」になります。

本州の多くは残暑の残るこの時期は、北海道では過ごしやすい季節です。また、海の幸も山の幸もおいしいところです。
皆様のご参加を実行委員一同お待ちしております。
大会長

遠藤

俊徳

（北海道大学大学院情報科学研究科）

No.32（March, 2017）1

特集「外国人会員からの声」
Bright is the Future
Christian Schönbach（Professor, Graduate School of Medical Sciences,
International Research Center for Medical Sciences, Kumamoto University）
When I received the invitation to contribute to the col-to adapt [13]. Rather than relying on adaptive plasticity, we

umn Foreign Members’ Voice I was a bit puzzled about theas members of the bioinformatics “biome” or community

USA, keywords are Brexit, travel ban, and immigrants, areegies and tools, that health policy researchers successfully

and value “Science has no country because knowledge ispolicymaking, for designing future bioinformatics poli-

word foreign. Recent political developments in Europe andat odds with a concept that I believe most of us endorse

can actively trigger constructive change by adapting strat-

developed for and deployed in evidence-informed healthpatrimony of humanity, the torch which lights the world”

cies [14, 15]. SUPPORT Tools for evidence-informed healthsubmitted to the House of Lords committee on EU mem-and Practice (GRIPP) could be employed by an appropriate

the benefits and validity of Pasteurʼs thinking. “EU fund-and communicate policies to decision makers. The higher(Louis Pasteur, 1876). Written evidence by EMBL-EBI[1]bership and UK science after the referendum [2] highlights

ing for ELIXIR, Europeʼs pan-European infrastructure for

Policymaking (STP) [16] and Getting Research Into Policy

committee of a bioinformatics society to effectively design

the projected added value and the better the convergencebiological information, allowed EMBL-EBI to manage theof interests is, the faster remaining barriers will be broken

from the UK, to host its Hub on the Wellcome Genome(e.g. silo mentality), funding improved, bioinformatics

strengthened its position as the focus of bioinformatics intranslation of bioinformatics research enhanced.

creation of the infrastructure and, with significant funding
Campus. As the ELIXIR host, EMBL-EBI has further

Europe. Without the UKʼs EU membership, we would havedown on organizational levels in education and researcheducation broadly incorporated at high school level, andAlthough history does not repeat itself, but patterns oflost this opportunity.” Thus, do we really have to distin-innovations and how we embrace them do. The internet is aimmunity? As JSBi members we all represent a local scien-

lives, and also made bioinformatics possible. Bioinformatics

guish between foreign (non-self) and self akin to adaptivetific community who interacts at various degrees of depth

and frequency locally, regionally and trans-nationally inpursuit and promotion of bioinformatics.

Since bioinformatics has matured to “adulthood” [3] it istypical example for a disruptive invention that changed ouritself can be considered another, yet smaller disruptive
invention that changed the way of doing biological andbiomedical research, and that created a market which is ex-pected to grow worldwide by 21.1% from 6.21 billion USD

time for making policies that enable “healthy ageing” ofin 2016 to 16.18 billion USD In 2021 [17]. If bioinformatics

have been published whose authors identified issues of in-success was enabled by smart policymaking in the early

our discipline. In the past three years numerous articles

terdisciplinarity [4, 5], the definition of a bioinformatician [6]translational research [7], education [8-11], and research andcareer development[12]

to cite a few. A common not ex-plicitly articulated factor that inhibits us to maximize theutility of bioinformatics for all stakeholders is of human be-havioural and social nature: resistance to change. Anxiety

over uncertainty, loss of control and/or competence may

result in resistance to change which extends in part toorganizational behaviour. From an evolutionary point ofview resistance to change is much older than humanity andcan be observed in population traits of animals and plants

resisting or succumbing to environmental changes (e.g.

specialists versus generalists) depending on their ability

follows a similar pattern as the internet whose spread and1990 -ties (e.g. information superhighway) our future isbright.

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No.32
（March, 2017）2

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bioinformatics-market.asp. Accessed 09 Mar 2017.

Conflict of Interest: C. Schönbach is President of AsiaPacific Bioinformatics Network. He has no other conflict ofinterest.

Disclaimer: This article was written by C. Schönbach inhis personal capacity. The opinions expressed in this article are the authorʼs own and do not reflect the view ofKumamoto University.

Science without barriers
Stephen Wu（Assistant Professor, The Institute of Statistical Mathematics, Tokyo, Japan）
Flying across nations, switching between disciplines, myexperience in research has cultivated my belief that there

2016. After a little jog around the Odaiba area, I walked
into the International Conference Hall in the Tokyo Inter-is no barrier in science, and there shall not be.

national Exchange Center right on time. The first invited

Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology (IIB-

presented by Dr. Okanohara from the Preferred Networks,

On September 29, 2016, I joined the 5 th conference on

MP 2016). This is the third conference related bioinformatics in Japan that I have joined since I started my new

research project in Tokyo one year ago. My impression of

the Japanese academic community was rigorousness, focus
and perfection. These attributes were consistently exhib-

ited from the previous two conferences that I have joined.
While these are important qualities to high scientificachievements, I felt that there is a lack of cross-disciplinaryinterest in the research community. The question I havein mind is that when you see research breakthroughs, how

excited will you get as a scientist in a different field? How
likely that you will get so excited to a point that motivate
you to know more in depth on the subject?

The weather was good on the first day of the IIBMP

talk of the conference was related to deep learning models
Inc. It was not surprising to see machine learning topics

in a bioinformatics conference. However, I was shockedthat the participants have shown deep interest to thetheoretical content of the methodology, and to the appli-

cations that were not related to biology. Later during theconference, I looked around talks and posters in different
parallel sessions. I observed a wide range of topics, includ-ing even Bayesian inference, machine learning modelingand parallel computing. The applications covered acrosssimulations, in vitro/vivo experiments and clinical tests.
What an interesting community, I thought.

Science has a long history of classifying itself into dif-ferent subjects for efficient distribution of manpower. Re-

searchers have been known to be good at drawing a clear

No.32（March, 2017）3

scope and drilling deep down into it. While this approach

science itself has no barrier in the first place.

beings, we may be hitting a bottleneck now. We start toI was in US. Then, I moved to Switzerland for projects on

from the ground, and the deep well we have created be-

new journal in Japan to study bioinformatics and material

has brought tremendous scientific advancements to humanlose the sense of direction once we are digging too far awaycomes a wall that blocks communications across different
wells. Maybe, it is time to break the walls. In recent years,

cross-disciplinary projects are becoming the mainstream

My research topic was on earthquake engineering whenmolecular dynamics and pharmacokinetics. Now, I begin a
informatics. This is an awkward path to many scientists,

but this has been the path that I devoted myself into. I am
pleased to be invited to share my vision here, and my ex-

in academia across the world. New discoveries are coming

perience at the IIBMP 2016 has changed my impression to

fields. More opportunities have emerged through discus-

I look forward to interacting with different researchers infrom simply merging knowledge across various researchsions with people who do not know what you are doing andvice versa. This is the time to break the barriers we havemade ourselves for a new era of scientific advancements, as

the Japanese academic community. As a member of JSBi,
Japan and enjoying the excitement of breaking barriers
during various opportunities of scientific collaborations.

生命と情報
Jiyoung Kang（兵庫県立大学大学院 生命理学研究科）
この度、「外国人会員からの声」というテーマで原稿を依頼

ようなバイオ・インフォマティクス理論を構築すればよいのか、

むことになります。大学の学部 (物理学専攻：素粒子理論 )か

生命の大きな特徴は階層性を持っている点です。各階層におされましたが、こうしたとき私はいつも何を書けばよいのか、悩

それをずっと考えています。

ら日本で勉強を始め、大学院（生命物理学・理論）修了後の研ける生体システムを理解したうえで、階層をまたがる理論体系の研究環境には詳しくないためです。それでも、生まれた韓国

命の本質に近づくことができると私は考えています。実際、私究者としてのキャリアも日本で積んできたため、私は逆に外国の文化や言語は身に沁みついていますから、いわば「ちょっと変な日本人」として、周囲の人たちには認識されています。そこで、その「変な日本人」の視点から見たバイオ・インフォマティ
クスを話してみたいと思いたち、重い筆を執りました。

初対面の人には、「まるで日本人のように日本語が上手ですね」と言っていただくことが多いのですが、実際には私の日本

語が少し韓国風にアレンジされているようです。身近な人たちにはそのことが感じられるようで、「ちょっとだけ変な日本人」になります。留学生が参加する授業などでは、勿論、英語でのコミュニケーションになりますし、韓国からの留学生の場合には母国語で話すこともあります。そのため、日本語、英語、を、バイオ・インフォマティクス理論として構築することで、生の最初の研究は、電子・分子構造レベルから生体反応のメカ

ニズムを理解することが課題でしたが、その後は、タンパク質―タンパク質間の相互作用、タンパク質に特異的に結合するリガンドの設計法、ゲノムDNA 情報の認識メカニズムを解明する
ための理論手法（ゲノム生物学）、さらに細胞内における情報の流れを解明するための解析（システム生物学）、そして最近は、
脳活動データを物理学的な概念と指導理念の元に解析する理論手法の開発など、異なるスケールとフレームワークにより、さまざまな生命システムを研究してきました。どれもが楽しい研究で、私自身の意識もどんどん発展してきました。

それぞれの生命システムは、それらがあたかもひとつひとつ

韓国語の3 つの言語が、私にとって身近な言葉ということになの宇宙のように、深い物語を含んでいます。たとえば、タンパ

理論、シミュレーションなど、さまざまな分野を横断して統合子）が誕生する分子進化の過程が異なります。またそのホストります。これは、情報科学、生物学、化学など、また実験やすることが必要なバイオ・インフォマティクスの研究手法とも、非常に似ているように思います。

生命の中で行われている情報処理がどのようなものであるのか、その点を深く考えるのが私は大好きで、それゆえに生命を研究しているといってよいひとりです。しかしまだまだ、生命とク質ひとつをとってみても、それぞれのタンパク質（つまり遺伝は異なる環境に生息するために、各生物種ごとに異なる特徴を有し、そのシステムにおいて極度に洗練された
「構造」
（立体構

造に限らない）を、タンパク質に限らず生体高分子は一般に有しています。

タンパク質が機能する時間スケールは、通常、数 psから、は何か、その情報とは何かについては、不断に生命の研究を長くて数分の単位で制御されます。たとえば、リガンドが結合ることは非常に困難です。生命や情報の本質とは何か、それらさらに大きなスケールのシステム制御にも関わります。タンパク

し、それに必要な言葉を使っているにも関わらず、正確に答えの概念を元にして、本来的に生命における情報処理のメカニズ

ムはどのようなものであるのかを理解するためには、一体どのした情報が分子内に伝わり、生体反応が生じるような情報は、
質―タンパク質相互作用が細胞の寿命を決めるなど（たとえば、RasとRasGap の相互作用は発がんに関係します）、より大きな

No.32（March, 2017）4

空間スケールのシステムが、より長い時間スケールのもとで制御されます。

さらに、あるひとつのタンパク質が分子進化のうえで出現すし、それらの階層を超えた生体システムの情報制御メカニズムを解明できる時代が遠くないと、感じます。

それらの研究成果に基づいて、医薬分子設計等の問題を解るまでの、長い時間スケールにおける変化や、それに連関する

決していくことも、毎年の日本バイオインフォマティクスの学会と、個体と環境との相互作用（あるタンパク質を持つことで、ど識する特定のリガンドを探すだけではなく、ヒトの遺伝子情報

さまざまな空間・時間スケールにおける情報とその流れを思うのぐらい生き残りやすくなるのか？）から、遺伝子に刻まれる分子スケールのレベルまで、多様な情報の流れがあり、それらの情報伝達に要する時間に至っては、大きなスケールでは数万年での重要な課題となっていると感じています。タンパク質が認を用いて設計された薬が、どれだけ個々人に対して有効である
かの評価ができる世界も、それほど遠くないと感じました。

ここまで、学会名とはあえて異なり「バイオ・インフォマティク

から数百万年以上にもなります。

ス」と記してきました。それは以下のふたつの理由に依ります。

響するという研究がなされ、個体の中に共生しているシステムと「バイオ」が決定的に大事であるという点。ふたつめは、学会

バイオ・インフォマティクスは答えていくべきであると、私は考数学的に解析できないのか？」という質問が出るのを拝見しま

また最近は、個人の腸内細菌の生体が、精神の健康にも影精神との関係も無視できなくなっています。こうした問題にも、えています。

日本バイオインフォマティクス学会・年会等での経験から感じていることは、本格的なビッグデータの時代となり、まさにさ

まざまなレベルの時間・空間スケールの情報が得られてきている点です。遺伝子情報、生体高分子の立体構造やそのダイナ

ミックス、疾病や遺伝などに連関した医療データ等々を用いて、さまざまなレベルでの生体システムの研究をユニファイ（Unify）

ひとつは、バイオ・インフォマティクスのうち、特に前の部分の等々の議論で困難な課題の部分に遭遇すると、決まって「よりすが、そのような質問は無意味なことが多く、本来は「より生
物学的にアプローチできないのか？」と問うべきである場合がほとんどです（本年度の年会の招待講演でも、似た話が語られたことを思い出します。その通りだと感じました）。

今後もまさにそうした視点から、日本バイオインフォマティク

ス学会での面白い議論ができることを楽しみに、筆をおきます。

言葉の壁と疎外感
Alexis Vandenbon（大阪大学免疫学フロンティア研究センター）
執筆依頼を引き受けた際、日本に在留する外国人研究者にく、結果的に日本にいながら日本の科学コミュニティから孤立した。バイオインフォマティシャンらしく、プロジェクトを始める

正直に言えば、これまで何度も議論されてきたこの課題を取もっとも重要と思われている課題を取り上げられればと思いましている外国人研究者は少なくありません。

前に一先ずデータ収集すなわち、知人の外国人バイオインフォ

り上げることに対して多少抵抗を感じました。一方、意見を寄課題を決めることにしました。

をここで私が取り上げることはある意味で義務のように思われマティシャン達にどのような話題が良いかを尋ねて、答えを見て私は彼らの答えの均一性に驚くことになります。一人を除いて、全員が勧めてくれた課題は外国人研究者と日本の科学コせてくれた外国人研究者の一致した意見を見れば、この話題ました。

日本国内において、少数派に過ぎない外国人の要望に応えミュニティとのコミュニケーションの難しさでした。彼らの答える必要性に疑問を感じる方もいらっしゃるでしょう。ある意味外感でした。大学事務とのコミュニケーションの難しさ、大学

国人のためではなく、日本人研究者のためであるとしたらどうに描かれていたのは「言葉の壁」によるさまざまな意味での疎や所属機関からのお知らせなどが読めないこと。同業者である日本人バイオインフォマティシャンとのコミュニケーションも難では自然な意見だと思います。しかしそれが現在日本にいる外でしょうか。

日本にいる外国人研究者が疎外感を感じるのは、日本語の

しいが、それ以上にアカデミア、産業界問わず、データを出し

情報が英語の情報に比べてはるかに充実しているためですが、た。

ほかなりません。そして、それが日本人研究者が海外へ留学してくれる生物学者との協働がさらに困難だという意見もありまし
JSBiのニュースレターやメール、さらには日本で開かれる学会のウェブサイトも多くの情報が日本語を中心に提供されており、イベントになかなか参加できないという方もいました。( 英その原因は日本人が日本語で生活することに慣れているからにたり職を得る弊害になっていることはみなさんご存知の通りです。

長田直樹 教 授と山中伸弥 教 授は 2013 年にScience 誌に語版のJSBiのウェブサイトの最終更新日はこの原稿の締切日で出版されたeditorialにおいて、 多くの若手日本人研究者がこのように、「言葉の壁」のせいで、学会などに参加できず、

anxiety about leaving Japan)」を感じていると述べられました

ある2017年 3月10日現在、なんと2016 年 3月なのです！)

同じ分野で研究をされている方々とのコミュニケーションが少な

海外で経験を得るにあたり「日本を離れる大きな不安 (great(Science, Vol. 340 Issue 6131, 2013)。日本語環境が充実して

No.32（March, 2017）5

いると同時に、英語を使う必要性が少ないために醸成された、問題点を指摘するのは簡単ですが、解決策を提案するのは科学のリンガ・フランカとしてもっとも多く用いられている英語

そう簡単にはいきません。すでにさまざまな試みがそれぞれの状の中では、科学界で英語の使用を促進させないのは「英語コ

属している大阪大学免疫学フロンティア研究センターでは、外に対する恐怖感（？）が理由の一つとも言えるでしょう。この現ンプレックス」を強めてしまう可能性があります。実際、留学する日本人の数が減少しているというレポートもあります (Science,Vol. 347 Issue 6225, 2015)。母国語で最新の科学にアクセスできる国はそう多くありません。今の日本が持つその美点を生かしながらも、日本にいるうちに英語でのディスカッション等に慣れないと、留学はもちろん国際的な共同研究のハードルも上がって、恐らく一生英語コンプレックスが続くに違いありません。そして悪いことに、その英語コンプレックスは次の世代にも引き継がれてしまうのです。日本において留学を推奨する動研究機関で進んでいることは承知しています。たとえば私が所
国人研究者向けの日本語クラスも開催されていますし、事務部
門を含め英語が流暢なスタッフも多く、日常的な生活には不自由をあまり感じません。また、複数の外国人バイオインフォマ
ティシャンたちが日本人の同僚たちは銀行振込やホテルの予約など必要な手続きをとても親切に手伝ってくれることを報告してくれました。これらはすべてとても素晴らしいことです。それでも、このようなサポートは科学コミュニティからの疎外感を解決するには至っていません。

科学界の習慣を変えるのには時間が必要ですし、少数派できがあることはみなさんご存知の通りです。それ自体はとてもいある外国人が変化の原動力になれるのかもわかりません。今破につなげるには、日本国内での英語環境が不可欠です。今ニケーションに壁を作ってしまっては本末転倒です。とはいえ、いことです。しかし、それを国際化や英語コンプレックスの打英語を使えなくても海外の留学先や職を得れば自然と英語ができるようになると思われる方もいらっしゃるかもしれませんが、実際にそうなる人は少数派ですし、日本に帰ってきてその英語能力をキープできている人はさらに少ないという実感を、多くの会員の皆さんがお持ちなのではないでしょうか。

JSBiニュースレター第 29 号の中では、中井謙太教授がアジア諸国との競争に触れました。日本の科学レベルの向上には日本人研究者の努力に加えて、いかに優秀な海外研究者を惹きつけられるかも重要です。今後も科学コミュニティの中でそのJSBi 年会の公用語を強制的に英語にしても日本人同士のコミュ

世界の状況と日本の現状「停滞((stagnation)」“Nature Index

Japan” ; Nature, Vol. 531, Issue 7594, 2016)を考慮すると、外国人研究者が日本語に熟練し、研究について日本語で議論できるようになることを期待している人は誰もいないと思います。
数年間日本で研究をして疎外感を経験した人材は、その人が優秀であればあるほどやはり日本に長く留まることはないでしょう。この状況は長期的には世界の科学コミュニティにおける日本の立場を悪くすることはあれよくすることはないと思われます。
ほんの一歩に過ぎないですが、英語版のJSBiのウェブサイ地位を向上し続けるであろうアジア諸国が、日本と近い研究レ

トをもっと頻繁に更新して、他のメーリングリストにも英語の情

ジア諸国の優秀な人材は今後どこの国を行先として選ぶでしょティシャン達にとって大きな支援になると思います。このようなベルでもっと国際的な環境を提供できるようになるとしたら、アうか。今後の10 年間は、第一希望は欧米のままかもしれませんが、日本の優先度は少しずつ低下しかねません。そんなこと言われなくてもわかってるっていう声が聞こえてきそうですね。
そのためにも今日本にいる外国人研究者が働きやすい環境を作っておくのは悪いアイデアじゃないと思います。

報を増やしていただければ間違いなく外国人バイオインフォマ
一歩からpositive feedback が生まれて、日本のバイオインフォ
マティクス界のためになれたら幸いです。

本稿の日本語を校閲してくださった山下和男博士に感謝いたします。

2016 年年会・第5回生命医薬情報学連合大会開催報告
実行委員長

瀬々 潤（産業技術総合研究所 人工知能研究センター）

2016 年の年会は 9月29日から10月1日まで、東京お台場の本大会は成功裏に終了したと自負しておりますが、実際に開プラザ平成で開催されました。本大会は、2015 年までに引き催するまでには、さまざまな不安要素の大きい運営を強いられ

薬情報学連合大会（第 5 回）」として実施し、おかげさまで 500の大半が所属する産業技術総合研究所の組織改革が開始さ続き、CBI 学会・日本オミックス医療学会との共催で「生命医名以上の方にお集まりいただき、大盛況のうちに終了することができました。これもひとえに、実行委員をはじめとする運営に関わってくださった皆様、会のスポンサーとなってくださった
さまざまな企業の皆様、お台場まで足を運んでくださった参加者の皆様のおかげです。この場を借りてお礼申し上げます。

た大会でもありました。実行委員を引き受けた後に、実行委員
れ、JSBiの皆様には馴染みがある方が多いと思われる産総研

CBRC が解体されることが決まったこと。また、それに伴って、産総研内の事務的サポート体制が不安定になったこと。以上のことにも関連する部分がありますが、JSBi自身の事務もCBRC
内で手伝っていただいていた事務スタッフではなく、外部の会

No.32（March, 2017）6

社へと委託が決まったことなど、大会自身を支えるうえで、働くとを、申し訳なく思っております。

での準備となりました。しかしながら、実行委員個々が自律的れました。口頭発表（ハイライト含む）は16 件、ポスターは 87

今回の大会は、近年話題となっている「人工知能」をキーな議論が展開されました。ポスター等で知り合った方々同士で委員のメンバーが大会運営に打ち込むことに不安を覚える状態に働いてくれたことで、大きな問題なく終了できたと思います。
ワードとした「ユビキタスな人工知能時代を先導する生命情報

科学を考える」と題し、新しい計算機のテクニックを活用した生命科学へのアプローチの一端が作れるような運営を考えました。ディスカッションのきっかけとなるよう、二題の招待講演を口頭発表やポスターでは、活発なディスカッションが開催さ件の発表がありました。それぞれのセッションでは非常に活発の共同研究や、（開催されるのであれば）来年度のBoF 提案な
どへとつなげていただければ、主催したものとして、これ以上の喜びはありません。

会員同士の交流と同様に、バイオインフォマティクス分野を開催し、一題目は、飛ぶ鳥を落とす勢いのベンチャー企業で会員外の皆様に認知していただく機会として、参加費を支払わに深層学習に関する教育的な講演を行っていただきました。二

校生に登壇していただいて未来像を語るという、斬新な企画である（株）Preferred Networksから岡野原副社長を迎え、特題目は、情報科学と実験科学を真に融合している研究者として、慶應義塾大学 先端生命科学研究所の金井教授をお迎えし、現在の研究紹介を行いつつも、異分野交流に関する示唆なくても参加いただける一般公開講演会を実施致しました。高はありましたが、学会の中に爽やかな新しい風が吹き、心に残る企画となりました。

今年も年会が生命医薬情報学連合大会として開催されます。

に富む講演を行っていただきました。

期間は 2017年 9月27日から29日、場所は北海道大学となりまる企画セッションであるBoFを10 セッション実施しました。バ

すが、自然感じる北大のキャンパスで、皆様とディスカッション

また、大会の多くの時間を使って、JSBi 会員からの応募によイオインフォマティクスという分野が、次世代シーケンサの登場によって、配列解析の比重が高まっているように感じますが、す。もう北の大地は涼しい風が吹き始めている時期かと思いま
できたらと思っています。

最後に、実行委員、大会事務局のスタッフ・学生、産総研

個人情報保護法、創薬、質量分析、画像処理、統計、分野の事務スタッフ、JSBiの事務スタッフの皆様には多大な協力をイオインフォマティクスの伸びしろがあると感じることができる

講演の先生方をはじめ、すべての発表者・スポンサーの皆様

間融合と、多様な提案や先端研究の発表があり、まだまだバ企画となりました。提案していただいた企画はいずれも魅力的でしたが、時間枠の関係上、採択できない企画がありましたこ

いただきました。また、素晴らしい発表をしてくださった招待に、この場を借りて、重ねてお礼申し上げます。

研究会・地域部会の活動報告
関西地域部会
部会長 荒木通啓（神戸大学大学院科学技術イノベーション研究科）

関西地域部会では、画期的新薬、診断薬、機能性食品、野における教育・啓発・産官学マッチング・異分野融合を促進

マティクスの利用と革新的創造を目指し、バイオメディカル分

毎年 2 回（春・秋）のバイオメディカル研究会を開催し、大学・医療用機器の創製（研究・開発両面）に役立つバイオインフォする研究会活動を行って参りました。関西地域部会発足以来、

No.32（March, 2017）7

研究機関の従事者を始め、製薬企業・食品企業・IT企業等の担当者や官公庁関係者など、産官学からの多くの参加者より高い評価をいただいております。

展望についてパネルディスカッションを開催し、研究会参加者との活発な議論が行われました。

また、秋（9月）開催の第 21回バイオメディカル研究会（2016

とりわけ春開催のバイオメディカル研究会では、学術的な研年 9月6日グランフロント大阪にて開催）では学術的な研究内オメディカル分野を支える科学技術政策、医療制度、産学連して、大阪大学・光岡薫先生、理化学研究所・仁田亮先生、

究内容を発表討論する従来型の研究会とは視点を変え、バイ
携、人材育成体制などの現状を足元から見つめ直し、その中から得られる今後の展望を討議することを目的としてきました。
こうした流れのもと、 第 20 回バイオメディカル研究会（2016
年 3月25日グランフロント大阪にて開催）では、「Precision

Medicine への展開」と題して、大阪大学（名誉教授）
・松原謙

一先生に「日本のゲノム研究の現状と今後」について基調講演をいただくとともに、京都大学医学研究科（教授）・武藤学先生、日本医療研究開発機構バイオバンク事業部・加藤治部長

容を中心に、「先端構造解析の現状と創薬展開に向けて」と題

横浜市立大学・池口満徳先生、量子科学技術研究開発機構・
河野秀俊先生をお招きし、クライオ電子顕微鏡と分子シミュ
レーションの現状・課題・取組みについてご紹介いただくとともに今後の展望について議論していただきました。ご講演の後には、先生方にパネルディスカッションにご参加いただき、研究会参加者との活発な議論が行われ、今後の先端構造解析の創薬展開に向けた提言も行われました。

関西地域部会では引き続き、バイオメディカルイノベーションをお招きして、ゲノム医療の最前線からゲノム研究政策に基づを見据えた研究会・講演会を開催していく予定ですので、会員講演の後には、今後のゲノム研究・ゲノム医科学研究の課題・です。

くAMED の目指す方向性について講演をいただきました。ごの皆様からの御意見・御希望等をお知らせいただければ幸い

第20回バイオメディカル研究会

第21回バイオメディカル研究会

中国・四国地域部会
部会長 妹尾昌治、副部会長 工藤 孝幸（岡山大学大学院自然科学研究科）

中国・四国地域部会では、これまで 9 回にわたり継続開催

してきた「次世代バイオマーカー研究会」に代わり、平成 27年から「次世代がんインフォマティクス研究会」を開催しています。
今年度は、6月に第 3 回、12月に第 4 回と年 2 回研究会を開催

笠井 智成 氏しました。

第 3 回の研究会では、現在のがん研究の中心的研究トピック

スである「がん幹細胞」を取り上げ、がん幹細胞に関する先進的な研究を展開しておられる研究者 3 名を講師として研究会を

小関 準 氏仲 一仁 氏

No.32（March, 2017）8

開催しました。岡山大学大学院自然科学研究科の笠井智成氏

者 2 名を講師として研究会を開催しました。岡山大学医歯薬学

いう演題で、iPS 細胞から人為的な遺伝子導入によらず作製可

細胞耐性メカニズム解明への挑戦 」という演題で、これまでには、「iPS 細胞から誘導して得られたがん幹細胞の解析」と能であり、自然発生的ながんを再現できる可能性を秘めたがん

幹細胞モデルに関する研究をご紹介いただきました。大阪大学大学院医学系研究科の小関準氏からは、「トランスオミック

ス解析により見い出された、がん幹細胞におけるオルニチン代
謝経路の新機能」という演題で、がん細胞の代謝産物の数理

科学的な解析に関する研究をご紹介いただきました。広島大
学原爆放射線医科学研究所の仲一仁氏には、「CML 幹細胞をターゲットとする新しい治療戦略」という演題で、慢性骨髄性白血病 (CML) 治療法としてCML 幹細胞を標的とする新規

総合研究科の江口傑徳氏には、「トランスオミックスによる癌あまり注目されていなかった MMP3とがんとの関わりに関する最新の研究成果のご紹介をいただきました。また、九州大学
生体防御医学研究所の松本雅記氏には、「iMPAQT：組換えタンパク質を利用したタンパク質絶対定量プラットフォーム〜がん代謝研究への応用〜」という演題で、定量的がんプロテオー

ム、メタボローム研究のための新規プロテオミクス手法である
iMPAQTのご紹介をいただきました。参加者からの各講演に対する質疑応答も活発に行われました。

日本バイオインフォマティクス学会中国・四国地域部会では、治療法開発に関するご講演をいただきました。各演者の講演

日本バイオインフォマティクス学会からのご支援により、今後も非常に盛会でありました。

会を継続開催していく予定です。バイオインフォマティクス研究

内容は、多岐にわたるものであり、質疑応答も活発に行われ、第 4 回の研究会は、実験化学的な手法とバイオインフォマ

ティクスを組み合わせて先進的ながん研究を展開している研究

地域部会独自行事として、次世代がんインフォマティクス研究者のみならず、がん研究に興味をお持ちの皆様のご参加をお待ちしています。

江口 傑徳 氏松本 雅記 氏

九州地域部会
部会長 倉田 博之（九州工業大学大学院情報工学研究院生命情報工学研究系バイオメディカルインフォマティクス研究開発センター）
JSBi 九州地域部会では、平成 29 年 3月10 ～ 11日、山口県

大学、長崎大学、九州大学、九州工業大学、山口大学、岡融合分野における交流の加速化」と題して、九州地域部会セ間相互作用、DNAの立体構造、遺伝子制御、転写、人工遺の海峡メッセ下関において、「生物医学・情報・システム工学のミナーを開催しました。松野浩嗣先生（山口大学）と倉田博之（九州工業大学）の2 名で幹事を務めました。バイオインフォマ

ティクス、システム生物学、合成生物学、バイオ統計、数理生
物学、生物物理学等を含む、生物医学・情報・システム工学の融合分野は、21世紀の主要な学問領域を形成している一方で、各研究者は、学会の所属が異なることが多いため、お互いの研究内容についての理解が不足している傾向があります。本セミナーでは、九州・山口地域を中心に、学会横断的な場を作り、教育・研究を連携させて活性化するとともに、研究者間の交流を深め、教育・研究ネットワークを広げることを目的に実施しました。研究者間のリアルな人間的ネットワーク構築を主眼としたので、招待講演会の形式ではなく、発表者公募制として、多数の参加者による口頭発表会の形式をとりました。宮崎

山大学から、合計16 名の先生方に登壇いただきました。SNP
伝子回路、代謝ネットワーク、シグナル伝達系、多階層モデリ
ング、トランスオミクス、バイオイメージインフォマティクス、シ

ステム創薬、HIV-1 感染メカニズム、呼吸監視と新しい呼吸監視機器等のように、DNA から医療システムまでの幅広い分

野を隙間なく埋める研究発表が行われました。初日のセミナー
後の交流会では、下関のふぐ料理を堪能しながら、研究、教育、学会運営についての話で盛り上がりながら、久しぶりに参加いただいた先生方とも旧知を温めることができました。2日目

は、九州地域部会の今年の運営方法について検討しました。
バイオインフォマティクス関連の研究者の多い九州地域部会は、今後も学会の発展のために尽力していきたいと存じます。よろしくお願い申し上げます。

No.32（March, 2017）9

リレー紹介：日本のバイオインフォマティクス研究室
早稲田大学理工学術院 浜田研究室
福永 津嵩（早稲田大学理工学術院 日本学術振興会特別研究員（PD））
浜田研究室は、早稲田大学の理工系の学生が通う西早稲田キャンパスにあります（東京メトロ副都心線西早稲田駅がキャンパス直通になっています）。平成 26 年に立ち上がったばかりの

比較的新しい研究室で、平成 29 年 3月に初めての修士課程卒
業生を送り出すことになります。一方で、研究室のメンバーは現在、教員が 1名、ポスドクが 1名（私）、学生は学部生と大学院生合わせて26 名、総計構成員数は 28 名のかなり大規模な研究室となっています。これは、浜田研の所属する先進理工学

部電気・情報生命工学科では学部 3 年生の秋から配属が始まり、一学年あたり7名の配属があることによります。大学院から進学してくる学生もいて、学部時代は数学科に所属していた学生や、生物実験をしていた学生など多様なバックグラウンド

メンバー集合写真

これだけ大所帯になると全員でラボセミナーを行うのはスペー

一回進捗報告（＋ひっそりと2人でラボ飲み）を行っています。

学生を4グループにわけて、各グループのセミナーをそれぞれ

オインフォマティクツールの開発」および「開発したツールを用り、各学生がそれぞれ異なる教科書を読んできてセミナーで内ています。そのため、機械学習やプログラミングが好きでソフトの学生が所属しています。

ス的に難しいため、全体ゼミを行うのは半年に一回で、普段は週に1回行っています。学部 3 年生は一つのグループにまとま容を紹介する形になっています。たとえば今年度の学部 3 年生

は、小西貞則先生と北川源四郎先生が書かれた「情報量基準」や岡野原大輔先生が書かれた「高速文字列解析の世界」などを読んでいます。学部 4 年生以上は学年がミックスされて、それぞれ研究の進捗と論文紹介を交互に発表することになっています。また正規のラボセミナーとは別に、学生は一つ以上の自主ゼミに参加することが推奨されており、C++プログラミングの勉強会や、廣瀬哲郎先生と泊幸秀先生が編集された「ノンコー

ディング RNA」を輪読するゼミなどが開かれ、勉強に勤しんでいます。なお、ポスドクの私は学生のセミナーとは別に、月にラボ居室

浜田研究室では、「100 年先まで利用される、本質的なバイいた生命科学のブレイクスルー」を研究の大目標としてかかげ

ウェア開発をしている学生から、既存のツールを利用して生物学的知見を得ることを目指している学生まで、学生の希望に応じて多様な方向性で研究が進められています。研究の対象としては、RNA・ゲノム・エピゲノムなどの配列データを対象としている人が多数ですが、化合物構造データや信号データを扱っている人もいます。学生は具体的な研究テーマを自分で設定することが推奨されていますが、最初の研究テーマに関しては浜田先生が与えています。テーマの引き継ぎなどは現状避ける方

針で、毎年 7個（以上）違うテーマを学生の好みに合わせて考えなければならないので、先生が非常に大変そうです。

全体ゼミの様子

No.32（March, 2017）10

浜田研の特徴として、コアタイムはおろか、平日に毎日大学に来る義務もないというのが挙げられると思います。これは、浜田先生の御出身が数学で、先生ご自身が学生時代に大学ではなく自宅などで研究されていたことによっているかもしれませ

18 席用意されています。一方で、浜田先生は研究の相談に非

常に親身に乗ってくださり、先生に研究相談をするために学生が順番で待っていることも珍しいことではありません。

以上のように、浜田研究室はきわめて自由に研究ができるだん。そのため、構成員の人数は多いのですが、実際に平日研けでなく、教員への相談も非常にしやすくサポートを受けやすす。研究室の席も、頻繁に大学に来る人は固定席として自分の生から降ってくることはなく、自分のやりたい研究を自由にしつ究室にいる人数は平均しておよそ5 〜 6 名程度と結構少ないでスペースがありますが、固有のスペースを希望しなかったりそれほど大学に来なかったりする人は、フリースペースで研究をしています。現在のところ、固定席が 5 席に対してフリースペースはいという環境が整っています。ポスドクとしても、雑用などが先

つ学生との共同研究もできるという非常に恵まれた環境です。
興味を持たれた方がいらっしゃいましたら、ぜひ見学に来ていただければと思います。

学会からのお知らせ
新役員決定のお知らせ
平成 29 年 2月から3月に行われた選挙の結果、平成 29 年 3月27日の総会において、以下の通り理事が選任されました。
役

職

新理事長
新副理事長

任

期

氏

名

（東北大学大学院情報科学研究科）
平成 29 年 4月1日〜 木下 賢吾
平成 30 年 3月31日 岩崎
渉（東京大学大学院理学系研究科）
山口敦子（ライフサイエンス統合データベースセンター）

川本祥子（ライフサイエンス統合データベースセンター）

門田 幸二（東京大学大学院農学生命科学研究科）
藤渕
新理事

航
（京都大学 iPS 細胞研究所 増殖分化機構研究部門）

川島 武士（国立遺伝学研究所）
平成 29 年 4月1日〜（九州工業大学大学院情報工学研究院生命情報工学系）
平成 31年 3月31日 倉田 博之
小寺正明（東京工業大学）

粕川 雄也（理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター大容量データ管理技術開発ユニット）
山田拓司（東京工業大学）

元池育子（東北大学情報科学研究科）

また、総会において、以下の通り監事、地域部会長がそれぞれ選任されました。
新監事（東京工業大学学術国際情報センター）
平成 29 年 4月1日〜 関嶋 政和
平成 30 年 3月31日 清水 佳奈（早稲田大学）関西地域部会長

平成 29 年 4月1日〜
中川
平成 30 年 3月31日

博之（大日本住友製薬）

No.32（March, 2017）11

第 6 回生命医薬情報学連合大会（IIBMP 2017）
生命医薬情報学連合大会（IIBMP）の2017 年大会を、日本

バイオインフォマティクス学会（JSBi）、日本オミックス医療学

開催概要

会、情報計算化学生物学会（CBI）の共催で開催します。最終日9月29日（金）午後には、JSBi 総会の開催が予定されておりますので、会員の皆様には万障お繰り合わせのうえ、ご参加
いただけますよう、お願い申し上げます。

大 会 長

遠藤俊徳
（北海道大学大学院情報科学研究科）

日程

2017年 9月27日（水）～ 9月29日
（金）

会

場

北海道大学情報科学研究科棟主催

日本バイオインフォマティクス学会（JSBi）
日本オミックス医療学会
情報計算化学生物学会（CBI 学会）

大会
http://iibmp.info/2017/index.php?id=1
ホームページOxford Journals - JSBi Prize 受賞者決定
本学会を代表する賞である「Oxford Journals - JSBi Prize」

は、将来の我が国のバイオインフォマティクスの発展を担う若手研究者を、より力強く励ましていくことを目的としたものです。
本年度は選考規定に基づき、会員の推薦による3 名の候補者から選考委員の投票により受賞者が決定しました。受賞者の発表と表彰、記念講演は「第 5 回生命医薬情報学連合大会」において2016 年 10月1日に行われました。
受 賞 者：荒川 和晴（慶應義塾大学先端生命科学研究所）
研究題目：

細胞内ダイナミクスのマルチオミクス解析

Multi-omics study of the intracellular dynamics

学会議事録等
第 16 回理事会議事録
日
場

時
所

平成 28 年 9月30日（金）12:45 〜13:45･ ISCBアフィリエイトの件

11 階会議室C･ 年会報告産業技術総合研究所 臨海副都心センター 別館

出席者（東京都江東区青海 2-4-7）

清水会長、木下副理事長、大林理事、

瀬々理事、浜田理事、松田理事、光山理事、

山口理事、浅井理事、有田理事、岩崎理事、荻島理事、五斗理事、白井理事、富井理事、
中尾理事、山西理事（表決書提出）
オブザーバ

議長

金井理事

以上 17名出席扱

遠藤次期年会長、事務局水谷

松田、齋藤（クバプロ）

清水理事長（定款第 35 条による）

配布資料

･ 議案書

･ 定款修正案･ 研究会公募要領案･ 会員資格喪失の件･ 研究会報告清水理事長より第 16 回理事会開催にあたって挨拶があり、議事録署名人として光山理事、富井理事が指名され、全会一致で承認された。
議案

第一号議案 定款の変更について

清水理事長より別紙 1の定款の変更案について以下の説明が行われた。

1. 学会所在地の変更について

学会事務局を株式会社クバプロに委託したことに伴い、学会所在地が変更になるため、第 2 条を以下のように変更する。
第2条

この法人は、主たる事務所を 東京都千代田区飯田橋三丁目11番15 号
ロ内

に置く。

UEDAビル 6 階

株式会社クバプNo.32（March, 2017）12

2. 理事の任期に関する変更

理事を半数ずつ改選する方式が定款に沿わないと、東京

都生活文化局より指摘された。東京都生活文化局の指摘によると、改選によって選任された半数の理事が「補欠のため、または増員によって就任した役員」とみなされ、非改選の理事が「現任者」となるので、改選された理事の任期が非改選の理事とそろって1年だけと解釈される。細則には毎年 10名の理事を改選するとあるが、定款は細則に優先するので、

2

前項の収益費用は、新たに成立した予算の収益費用とみなす。

3-6.「予備費の設定及び使用」の変更（予備費の設定及び使用）

第 44 条削除（以下、条ずれ）
3-7.「事業報告及び決算」の変更

定款の修正が必要となる。東京都生活文化局から「または現（事業報告及び決算）

第 16 条の5を以下のように修正する。

照表及び財産目録等の決算に関する書類は、毎事業年任者」を削ってはどうかとの助言があり、それに従って定款

第 16 条5

補欠のため、または増員によって就任した役員の任期は、それぞれの前任者の任期の残存期間とする。
3. NPO 法人法の改正にともなう定款の変更

NPO 法人法が改正され、定款に用いられる用語が変更されたことに伴い、定款を以下の通りに修正する。
3-1.「拠出金品の不返還（現行見出し）」の変更（入会金及び会費の不返還）
第 12 条既に納入した入会金、会費は、返還しない。

第 45 条

この法人の事業報告書、活動計算書、貸借対度終了後、速やかに、理事長が作成し、監事の監査を受け、総会の議決を経なければならない。
3-8.「定款の変更」の変更（定款の変更）第 48 条

この法人が定款を変更しようとするときは、総会に出席した正会員の2 分の1 以上の多数による議決を経、かつ、法第 25 条第 3 項に規定する事項を変更する場
合、所轄庁の認証を得なければならない。
3-9.「解散」の変更（解散）
第 49 条

この法人は、次に掲げる事由により解散する。

3-2.「権能」の変更（5）破産手続き開始の決定

第 23 条3-10. 条ずれに関する変更（権能）

総会は、以下の事項について議決する。

（4）事業計画及び予算並びにその変更（5）前年度の事業報告及び活動決算
3-3.「資産の構成」の変更（資産の構成）
第 39 条

この法人の資産は、次の各号に掲げるものをもって構成する。

（4）財産から生じる収益（5）事業に伴う収益（6）その他の収益

3-4.「事業計画及び予算」の変更（事業計画及び予算）
第 42 条

この法人の事業計画及びこれに伴う活動予算

は、毎事業年度ごとに理事長が作成し、総会の議決を経なければならない。

3-5.「暫定予算」の変更（暫定予算）
第 43 条

前条の規定にかかわらず、やむを得ない理由により予算が成立しないときは、理事長は、理事会の議決を経て、予算成立の日まで前事業年度の予算に準じ収益費用を講じることができる。

第 44 条を削除し、第 45 条以下を1条ずつ繰り上げる。
以上について、慎重に審議を行い全会一致で承認され、10月1日の総会で承認を得ることが確認された。
第二号議案

熊本地震で被災した学会員に対する支援

1. 被災した学会員の学会費の免除について

清水理事長より熊本地震で被災した学会員に対して支援を行いたいとの説明があった。清水理事長の指示により事務局で調査を行ったところ、熊本県、大分県在住の会員は3 名のみであり、平成 28 年度会費はすべて支払い済みであったため、平成 29 年度会費を免除することとなり、全会一致でこれを承認した。

2. チャリティー学会の開催について（報告事項）

清水理事長より、第 55 回の生物物理学会が来年 9月に熊本で開催されるにあたり、JSBiとして協力を行うことが説明され、引き続きML などで検討していくことが了承された。
第三号議案

研究会について

1. 研究会・地域部会の公募要領の規定

清水理事長より別紙 3 の公募要領改定案が示され、慎重な審議の結果、全会一致で改定案が承認された。

No.32（March, 2017）13

2. 年度後期の公募について改定された公募要領に従い、年度後期の公募を行うことが了承された。

第四号議案 Oxford Journals JSBi Prizeについて（報告事項）
1. H28 年 Oxford Journals JSBi Prize の選考結果

平成 28 年度 Oxford Journals JSBi Prizeについて、慶應義塾大学の荒川和晴会員が受賞者に選ばれたことが、清水理事長より報告された。

2. Oxford Journals JSBi Prizeに関する規定の改定（報告事
項）

Oxford Journals JSBi Prize の募集規定について、これまで39 歳未満としていたものを38 歳未満と改めることが、持ち回り理事会の審議で承認されていることが、清水理事長より報告された。
第五号議案

第六号議案

ゲノム情報の個人情報保護法改正法における取扱いについての提言（報告事項）「ゲノム情報の個人情報保護法改正法における取扱いについての提言」が取りまとめられ、平成 28 年 7月15日付で、JSBiホームページに掲載されていることが、荻島理事より報
告された。
第七号議案

ISCB Professional Member の確認と今後の関

わり方についてJSBiにISCBプロフェッショナルメンバーが 10 名以上おり、Affiliate Fee が免除されることから、JSBiとしてISCB
Affiliate Gropeを継続することについて、別紙 7-1、7-2を基に議論が行われ、全会一致で承認された。

第八号議案 会費滞納者の会員猶予期間の短縮について

クバプロへの業務委託費の縮減につながることから、会

員実数を正確に把握するために会費滞納の猶予期間を短縮

年会について1. 平成 29 年 年会開催準備の経過報告（報告事項）

平成 29 年度年会長の遠藤俊徳幹事より9月27日〜29日に北海道大学情報科学研究科にて開催する予定である旨、することについて検討してはどうかと清水理事長より提案があったが、今回の理事会では結論を出さず、引き続き検討を行うことが全会一致で承認された。

以上説明があった。

この議事録が正確であることを証します。

2. 平成 30 年 年会長の決定

特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会

平成 28 年 9月30日

平成 30 年度年会長について、慶應義塾大学の冨田勝先

理事長

生にお願いしたい旨、清水理事長より提案があり、慎重な

議事録署名人審議の結果、全会一致で承認された。

議事録署名人

清水謙多郎

光山

統泰

富井健太郎

平成 28 年度臨時総会議事録
1 日時

平成 28 年 10月1日（土）13 時 00 分〜13 時 30 分

2 場

所

出席した会員数

本人出席

委任状出席

書面による議決権行使

清水議長より定款の変更案についてスライドを基に以下の説
1. 学会所在地の変更について

東京都江東区青海 2丁目2 番1号

内訳

第一号議案 定款の変更について明が行われた。

東京国際交流館プラザ平成

3 正会員総数

5 議事の経過の概要及び議決の結果

学会事務局を株式会社クバプロに委託したことに伴い、学443 名会所在地が変更になるため、第 2 条を以下のように変更する。

157名

第2条

67名

ロ内

81名
9名

4 議事録署名人選任の経過

この法人は、主たる事務所を 東京都千代田区飯田橋三丁目11番15 号に置く。

UEDAビル 6 階

株式会社クバプ2. 理事の任期に関する変更

理事を半数ずつ改選する方式が定款に沿わないと、東京

定款第 26 条により議長は理事長が務める。議長が定足数を

都生活文化局より指摘された。東京都生活文化局の指摘にることが説明された後、議長が松田秀雄会員ならびに川島武または増員によって就任した役員」とみなされ、非改選の理確認し、定款第 24 条の定めに従い本臨時総会が開催されてい士会員を議事録署名人に指名したところ、満場異議なくこれを承認した。

よると、改選によって選任された半数の理事が「補欠のため、事が「現任者」となるので、改選された理事の任期が非改選の理事とそろって1年だけと解釈される。細則には毎年 10

No.32（March, 2017）14名の理事を改選するとあるが、定款は細則に優先するので、

3-7.「事業報告及び決算」の変更

定款の修正が必要となる。東京都生活文化局から「または現（事業報告及び決算）

第 16 条の5を以下のように修正する。

照表及び財産目録等の決算に関する書類は、毎事業年任者」を削ってはどうかとの助言があり、それに従って定款

第 16 条5

補欠のため、または増員によって就任した役員の任期は、それぞれの前任者の任期の残存期間とする。
3. NPO 法人法の改正にともなう定款の変更

NPO 法人法が改正され、定款に用いられる用語が変更されたことに伴い、定款を以下の通りに修正する。
3-1.「拠出金品の不返還（現行見出し）」の変更（入会金及び会費の不返還）
第 12 条既に納入した入会金、会費は、返還しない。

第 45 条

この法人の事業報告書、活動計算書、貸借対度終了後、速やかに、理事長が作成し、監事の監査を受け、総会の議決を経なければならない。
3-8.「定款の変更」の変更（定款の変更）第 48 条

この法人が定款を変更しようとするときは、総会に出席した正会員の2 分の1 以上の多数による議決を経、かつ、法第 25 条第 3 項に規定する事項を変更する場
合、所轄庁の認証を得なければならない。
3-9.「解散」の変更（解散）
第 49 条

この法人は、次に掲げる事由により解散する。

3-2.「権能」の変更（5）破産手続き開始の決定

第 23 条3-10. 条ずれに関する変更（権能）

総会は、以下の事項について議決する。

（4）事業計画及び予算並びにその変更（5）前年度の事業報告及び活動決算

第 44 条を削除し、第 45 条以下を1条ずつ繰り上げる。
議長は、これを議場に諮ったところ、満場一致をもって異議

3-3.「資産の構成」の変更なく可決決定した。

第 39 条事務所の移転日としたいと、議場に諮ったところ、満場一致を（資産の構成）

この法人の資産は、次の各号に掲げるものをもって構成する。

（4）財産から生じる収益（5）事業に伴う収益（6）その他の収益

また、上記第 2 条に関して、変更議案の可決をもって主たるもって併せて異議なく可決決定した。
第二号議案

活動報告

1. 熊本地震で被災した学会員に対する支援について

被災した学会員の来年度学会費の免除が理事会で承認

3-4.「事業計画及び予算」の変更されたことが、清水理事長より報告された。また、チャリ

第 42 条き続き検討していく予定であることも清水理事長より報告さ（事業計画及び予算）

この法人の事業計画及びこれに伴う活動予算

は、毎事業年度ごとに理事長が作成し、総会の議決を経なければならない。

3-5.「暫定予算」の変更

ティー学会を開催する計画であり、持ち回り理事会などで引れた。

2. 研究会・地域部会の公募について研究会・地域部会の公募について今年度は6 件の応募が（暫定予算）あり、すべて採択されていることが清水理事長より報告されより予算が成立しないときは、理事長は、理事会の議決を行うので、清水理事長より会員に応募が呼びかけられた。

第 43 条

前条の規定にかかわらず、やむを得ない理由にを経て、予算成立の日まで前事業年度の予算に準じ収益た。また、来年の研究会・地域部会の研究会について公募

費用を講じることができる。

3. Oxford Journals JSBi Prizeについてとみなす。

が行われるため、割愛された。

3-6.「予備費の設定及び使用」の変更

未満に引き下げられたことが清水理事長より報告された。

第 44 条削除（以下、条ずれ）

4. 年会について

2

前項の収益費用は、新たに成立した予算の収益費用（予備費の設定及び使用）

今年度の受賞者については、本総会に引き続いて授賞式
また募集要項について、年齢制限が 39 歳未満から38 歳

平成 29 年の年会については、総会終了後に遠藤次期年会

No.32（March, 2017）15

長より報告が行われるため、割愛された。

7. バイオインフォマティクス入門の件

塾大学の冨田勝先生が選任されたことが、清水理事長よりとが清水理事長より報告された。

平成 30 年度の年会長については、理事会において慶應義初版 2,000 部が完売となり、3,500 部の増刷が決まったこ

報告された。

5. ゲノム情報の個人情報保護法改正法における取扱いについての提言について「ゲノム情報の個人情報保護法改正法における取扱いに以上により議事が終了し、議長は13 時 30 分閉会を宣言した。

上記の議決を明確にするため、議長及び議事録署名人におついての提言」が取りまとめられ、平成 28 年 7月15日付で、いて次に記名押印する。

報告された。

平成 28 年 10月1日

JSBiホームページに掲載されていることが、清水理事長より

特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会

6. ISCBとのかかわりについて

理事長

JSBiとしてISCB Affiliate Gropeを継続することが清水議事録署名人

理事長より報告された。

議事録署名人

清水謙多郎

印

川島

印

松田

秀雄

武士

印

学会の現況
有効会員数
（平成 29 年 3月現在） 正会員：424 名

学生会員：52 名

賛助会員：19 社

特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 平成 28 年度役員一覧
会長

清水 謙多郎（東京大学大学院農学生命科学研究科）

副 会 長

木下

賢吾
（東北大学大学院情報科学研究科）

地域部会長

伊藤

公人
（北海道大学人獣共通感染症リサーチセンター）木下賢吾（東北大学大学院情報科学研究科）

荒木通啓（神戸大学・自然科学系先端融合研究環）

妹尾昌治（岡山大学大学院自然科学研究科）

倉田博之（九州工業大学大学院情報工学研究院）

池松真也（沖縄工業高等専門学校生物資源工学科）

油谷

幸代（産業技術総合研究所

大林

理

監

事

事

創薬基盤研究部門）

武（東北大学大学院情報科学研究科）

金井理（ペプチドリーム株式会社）

小寺

正明（東京工業大学

瀬々潤（産業技術総合研究所

浜田道昭（早稲田大学 先進理工学部電気・情報生命工学科）

人工知能研究センター）

大学院情報科学研究科）

生命理工学研究科）

松田

秀雄
（大阪大学

光山

統泰
（産業技術総合研究所

山口敦子（ライフサイエンス統合データベースセンター）

山田拓司（東京工業大学

人工知能研究センター）

浅井潔（東京大学大学院新領域創成科学研究科）

有田

正規（国立遺伝学研究所）

岩崎

渉（東京大学大学院理学系研究科）

荻島

創一（東北大学東北メディカル・メガバンク機構）

五斗進（京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター）

渋谷哲朗（東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター）

生命理工学研究科）任期

白井剛（長浜バイオ大学 コンピュータバイオサイエンス学科）

中尾

光輝（エーザイ株式会社 エーザイ・プロダクトクリエーション・システムス）

山西芳裕（九州大学 生体防御医学研究所・高等研究院）

関嶋政和（東京工業大学学術国際情報センター）

津田宏治（東京大学大学院新領域創成科学研究科）

富井健太郎（産業技術総合研究所

人工知能研究センター）

No.32（March, 2017）16賛助会員一覧（平成 29 年 3 月現在）
日本 SGI 株式会社

中外製薬株式会社

田辺三菱製薬株式会社

科学技術振興機構

大日本住友製薬株式会社

株式会社インテック

タカラバイオ株式会社

社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム

塩野義製薬株式会社株式会社ナベ インターナショナル株式会社富士通九州システムズ

有限会社パスウェイソリューションズ

エーザイ株式会社

株式会社理研ジェネシス

株式会社日立製作所

公益財団法人沖縄科学技術振興センター

日本新薬株式会社

株式会社 クリムゾン インタラクティブ ジャパン

三井情報株式会社

編

集

後

記

たとえばここ数年、年会の言語が日本語化されつつある中で、単

今回新しく導入しました役員 Web 投票システムも順調に稼働し、員の考えに触れる機会という意味合いから、今回の特集は「外国ニュースレターの今年度 2 号目の制作を終わり、やっと花見モード

レターへのご意見は常に募集しておりますので、ぜひ幹事までおの日々でしたが、なんとか1年すごすことができました。これも一に言語というだけではなく幅広い経験やバックグラウンドを持つ会

今週 3月27 日には理事会・総会が無事終わり、 さらに、JSBi

人会員からの声」としました。特集記事のアイデアなど、ニュースに切り替えることができそうです。事務局を担当して手探り状態

寄せください。

重に会員の皆様方のお陰と深く感謝申し上げます。今後ともご指

（岩崎

渉）

導・ご協力のほどよろしくお願いします。
（事務局

クバプロ一同）

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