“Dynamical Ordering & Integrated Functions”
Newsletter Vol. 20

April, 2015

業績紹介：高速原子間力顕微鏡による人工タンパク質ケージのダイナミクス観察"Probing Structural Dynamics of an Artificial Protein Cage Using
High-Speed Atomic Fore Microscopy"
Motonori Imamura, Takayuki Uchihashi, Toshio Ando, Annnika Leifert, Ulirich Simon, Ali D. Maly, andJonathan G.Heddle
Nano Letters 15(2), 1331-1335, (2015), DOI: 10.1021/nl5045617

内橋貴之（金沢大学理工研究域数
物科学系/バイオ AFM 先
端研究センター・A01 公募
研究代表者）
Bacillus 属のバクテリアで、 トリプトファンの生合
成 を 制 御 す る タ ン パ ク 質 で あ る trp RNA-binding
attenuation protein (TRAP)は、 リング状の 11 量体を形成している。 システインを導入した変異体(K35C)では金ナノ粒子との混合により球殻構造を形成し、その熱安定性も高いことから、無機ナノ構造体形成の理想的鋳型として研究されている。金ナノ粒子により、タンパク質が不定形の凝集体を形成したり、ナノ粒子表面にタンパク質コロナを形成することはよく知られているが、サイズが規定された構造体を形成するタンパ

金ナノ粒子との混合後に TRAP を観察したところ、
直径約 20nm のサイズが良くそろった球状構造体が見られた（図 1a）
。 球体の表面では網目構造が解像できることから、 球体は 11 量体リングから構成された球殻構造であると考えられる（図 1b）。 詳細な解析から、
球殻は約 26 個の TRAP リングから形成されていることがわかった。 DTT を加えると球殻が壊れ、 5 分ほどで完全に脱集合してリング構造だけになる様子が観察された（図 1c）。 また、 球殻は酸性（pH4）条件でも維持されるが、リング構造は酸性条件ではモノマーに解離していくことから、 球殻構造の形成が TRAP
リング構造自体を安定化することが分かった。
本論文により、金ナノ粒子を触媒としたタンパク質
超構造体の形成メカニズムの一端を明らかにするとともに、 HS-AFM がナノ構造体のダイナミクス研究に有効な手法であることを示した。

ク質は TRAP だけである。 しかしながら、 球殻の詳細な構造や形成メカニズムについては不明であった。
高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)を用いて球殻とその脱集合過程を観察し、球殻の構造と形成メカニズムを明らかにした。
HS-AFM で野生型および K35C 変異体 TRAP を基板上で観察したところ、どちらも結晶構造解析で得られているのと同様のリング構造が見られた。HS-AFM 観
察中に直径 1.4nm の金ナノ粒子を観察溶液に加えたと
ころ、 リング中心のポア部分が 1 - 2 nm 高くなり、 金
また、 変異体 TRAP は基板表面を拡散しながらリン

図 1 変異体 trpTRAP と金ナノ粒子により形成された
zu
球殻の高速 AFM 像 (a) 直径約 20 nm の球状構造体

グが凝集していき、 還元剤(DTT)を加えるとリング凝(b)球殻の AFM 像(左)とハイパスフィルター処理後の集体が脱凝集していく過程が観察された。このことか

像 (右). (c)DTT の添加による球殻の脱集合化

ナノ粒子はリングの中心穴に吸着することがわかった。

ら、 変異体 TRAP が持つシステイン残基間のジスルフィド結合によりリングが凝集していくことが確認できた。

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April, 2015

業績紹介：カーボンナノチューブ分子とフラーレンから秩序化した
さやえんどう型分子の回り方を理論化学の手法により解明"Theoretical Studies on a Carbonaceous Molecular Bearing: Association Thermodynamics andDual-mode Rolling Dynamics"

Hiroyuki Isobe, Kosuke Nakamura, Shunpei Hitosugi, Sota Sato, Hiroaki Tokoyama, Hideo Yamakado,
Koichi Ohno, and Hirohiko Kono
Chemical Science, in press, (2015), DOI: 10.1039/C5SC00335K
曲面同士が接触した分子系にどのような手法が適用で佐藤宗太（東北大学 WPI-AIMR・A02 計
画研究代表者）

きるか検討した。その結果、十種を越える密度汎関数（DFT）法の中から、LC-BLYP 法が最適であり、実験的な熱力学エネルギーを非常に精度良く再現することがわかった。この手法を用い，遷移状態計算と分子動筒状のカーボンナノチューブ(CNT)に球状のフラー

力学法計算を行い、フラーレンの回転運動を予測する

レンがとりこまれた、「さやえんどう」のような構造をことに成功し、「歳差運動」と「自転運動」という二種とる物質は、1998 年に電子顕微鏡観察によって発見さ類の異なる動きがあることを見いだした（図 1）。さられた。この物質中では、閉じ込められたフラーレンはに、温度が低い（低エネルギー状態）ときには「歳差固体状態であるにもかかわらず、自由に高速回転運動

運動」が主に起こっており、温度を高く（高エネルギーすることが報告され、その特異な構造と物性に興味を状態）するにつれ、「自転運動」が加わっていくことをもたれている。

見いだした。この二種類の運動の存在と、温度による

筆者の所属する研究グループでは、合成化学の手法を駆使することで、太さや長さまで精密制御した分子変化が、これまでの分光分析の解析を困難にしていた
ことがわかった。

性のカーボンナノチューブの合成を報告してきている。
このチューブ分子の内部にフラーレンを閉じ込めると、構造が厳密に制御された「さやえんどう」分子を構築できる。先日、放射光 X 線を用いた単結晶構造解析に成功した。解析の結果、チューブ分子内の変曲点が存在しない滑らかな sp2 炭素からなる内面が、フラーレ
ンの sp2 炭素からなる凸表面と相補的にかみあうことで、効率的なファンデルワールス相互作用が発現する
構造が、摩擦のない回転運動に重要であることを見いだした（ニュースレター第 11 号を参照）。
さやえんどう分子内におけるフラーレンの速い回転

図 1：精密構造をもつカーボンナノチューブ分子（赤）運動は NMR スペクトルの解析によってわかっていた内部で C60 フラーレン誘導体（灰）が軸（青）を中心が、その運動様式の詳細は解明できていなかった。今に軸回転する。上図が従来の NMR 分析からわかって

回、理論化学の手法を使うことで、「歳差運動」と「自いた大まかな回転運動。下図が今回の理論研究から解転運動」の 2 つの運動様式があることを見いだした。

明された回転運動の詳細。
「歳差運動（左）」と「自転理論計算を実施するにあたって、湾曲した

sp2 炭素運動（右）」の二種類の運動が明らかになった。

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April, 2015

業績紹介：金ナノロッドの高速配向イメージング法の開発と回転分子モーターの高速１分子計測への適用
Ump1 は天然変性タンパク質だった"High-speed Angle-resolved Imaging of Single Gold Nanorod with Microsecond Temporal
Resolution and One-degree Angle Precision"
Sawako Enoki, Ryota Iino, Yamato Niitani, Yoshihiro Minagawa, Michio Tomishige, and Hiroyuki NojiAnal. Chem. 87, 2079-2086, (2015), DOI: 10.1021/ac502408c

飯野亮太（自然科学研究機構 岡崎統合
バイオ・分子研、A02 公募研究代表者)
分子モーターの機能発現に重要な構造変化や中間構造を明らかにするには高速１分子計測が有用である。

だと結論した。そこで２）のデフォーカス法を適用し、回転分子モーターF1-ATPase の回転子に結合させた金ナノロッドの回転運動を 3.3 μ 秒の時間分解能でイ。さらに得られメージングすることに成功した（図２）
た画像を解析し、F1-ATPase の化学反応素過程の時定数やトルクを計測することに成功した。

しかし、我々が以前開発した金ナノ粒子をプローブに用いる高速１分子計測は、散乱像の重心の変位を計測する。この場合、重心の移動を伴わない構造変化の検出は困難である。一方、配向に依存して散乱像の強度や形状が変化する金ナノロッドをプローブに用いると、重心移動がなくても配向変化として構造変化を捉えることができる。我々は今回、金ナノロッドの高速配向
イメージング法を開発し、回転分子モーターF1-ATPaseの高速１分子計測に適用したので紹介する。
後方散乱型レーザー暗視野顕微鏡と高速度 CMOS
カメラを用い、金ナノロッドの配向をマイクロ秒の時
間分解能と 1°の角度分解能で決定する下記 2 種の手法を開発して評価した。１）金ナノロッドのフォーカ

図１：光学系．
（左）偏光分離．（右）デフォーカス．

ス像を直交する偏光 2 成分に分割して結像させその強度比から配向を求める方法（図１左、偏光分離）、２）
金ナノロッドのデフォーカス像の点像分布関数の形状から配向を求める方法の 2 種である（図１右、デフォー
カス）。ガラス基板に固定した金ナノロッドの方位角の決定精度（偶然誤差）
は 10 μ 秒の時間分解能で共に 1°程度であったが、正確さ（系統誤差）は２）の方が高
く 5°程度であった。また２）では、デフォーカス像
を計算像でフィットすることで方位角に加え極角も精度 1°程度で決定することが可能であった。
さらに原理的に、１）の偏光分離法では測定できる
方位角の範囲が 0-90°に限定されるのに対し、２）のデフォーカス法では 0-360°の範囲で決定することが

図２：デフォーカス法による F1 モーターの高速子１分可能である。これらより、１）よりも２）がより有用

子計測例．時間分解能 3.3 μ秒．

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April, 2015

業績紹介： 微小液滴内の急速潅流による液滴接触膜上でのイオンチャネル機能解析法を開発"Contact Bubble Bilayers with Flush Drainage"
Masayuki Iwamoto, and Shigetoshi Oiki
Sci. Rep., 5, 9110, (2015), DOI: 10.1038/srep09110

老木成稔（福井大学医学部 分子生
理学・A03 公募研究代表者）

きさに起因する物理的安定性の低さから、溶液置換は膜が破れないよう静穏に行う必要がある。
CBB ではそのような制約はなく、液滴に直接イン
ジェクションピペットを挿入して溶液を急速に置換しても膜は安定に保たれた。蛍光および電気生理学的測定から、CBB 近傍の溶液は 20 ms 以内に置換されるこ

脂質平面膜（PLB）法では、膜脂質組成や溶液条件など、厳密にコントロールされた環境下で膜タンパクとがわかり、CBB 法が急速投与実験にも応用可能であることが示された（図 2）。

質、特にイオンチャネルの機能解析を行うことができ以上から今回報告した CBB 法は、低ノイズ電流信号る。一方、PLB 法の脂質二重膜の面積・膜容量は大き記録、非対称脂質二重膜作成、急速溶液置換が行える

いため、電気的ノイズの増大やチェンバー内溶液潅流

など、従来法よりも汎用性が高い人工膜実験法である

効率の低さなどといった短所も存在する。

と言える。

今回の研究では、脂質単分子膜に囲まれた微小な油中液滴同士の接触で形成する液滴接触膜（CBB）をイ
オンチャネル機能解析の場として用いることで、上述の PLB 法の短所を克服した新しい人工膜実験法を開発した。
本法の特筆すべき点は、細く加工したガラスピペッ
ト先端に微小な油中液滴（約 300 pL）を形成させる点である（図 1）
。これにより、形成される CBB の面積
は従来法の PLB と比較して 1/100 程度となり、電気生
理測定時の特性を大きく向上させることができた。

図 1：CBB 法の模式図。パッチクランプ実験の装置をそのまま流用できる。

形成された CBB にチャネルタンパク質を挿入するにはリポソームを用いた。チャネルタンパク質を再構成したリポソーム懸濁液をピペット内に含ませて液滴を形成させれば、チャネルが CBB に移行し、単一チャ
ネル電流や巨視的電流を観測できた。またこの際、それぞれ異なる脂質組成のリポソームを含む油中液滴同士を接触させれば、非対称脂質二重膜を容易に形成させることができる。
パッチクランプ法では、アゴニストまたはブロッ
カー急速投与後の経時的チャネル電流変化の解析が一般的に行われている。これにはチャネル周囲の溶液を

図 2：急速潅流実験。液滴内の排液が保持ピペット内
へ流れるように内圧を調節する。蛍光色素置換の時定数は 14.4 ± 0.4 ms であった。

迅速に置換する必要があるが、PLB ではその面積の大4

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April, 2015

マイクロ波照射 NMR を用いた液晶のマイクロ波加熱現象の解明
The Microwave Heating Mechanism of N-(4-methoxybenzyliden)-4-butylaniline in Liquid
Crystalline and Isotropic Phases as Determined Using in Situ Microwave Irradiation NMR
Spectroscopy
Yugo Tasei, Fumikazu Tanigawa, Izuru Kawamura, Teruaki Fujito, Motoyasu Sato, and Akira Naito
Phys. Chem. Chem. Phys., 17, 9082-9089, (2015), DOI: 10.1039/c5cp00476d
マイクロ波加熱効果は有機化学反応や酵素反応の促進に広く用いられている。これらの効果はマイクロ波による溶媒の局所加熱効果によって生じていると考えられている。しかし、マイクロ波加熱が有機反応促進に働く分子論的な理解はまだ十分とはいえない。本研究では液晶物質の MBBA を用いて、液晶相および等方相におけるマ
イクロ波加熱現象を、マイクロ波照射 NMR 分光器を新たに開発して、1H NMR スペクトルから解析する試みを行った。この結果、液晶相にマイクロ波を照射した場合、液晶相の温度が相転移点より低い温度において、液晶相内にホットスポットができて等方相が生じた。このホットスポットは、非平衡局所加熱状態になっていることを示している。次に、等方相の状態になってから、さらに高出力のマイクロ波を照射した結果、分子内の極性基が他の部位より 100 C 以上高い温度になっている現象が観測された。ここで、分子温度は１H 核の化学シフト値の温度依存性から算出した。このように、マイクロ波加熱により、分子内で温度が異なるという新しい現象がこの実験で観測された。

（内藤新学術領域「動的秩序と機能」
1.

晶

横浜国立大学大学院工学研究院・A01 公募研究代表者）

今後の活動予定

平成 27 年度全体班会議

日時：2015 年 8 月 4 日（火）～6 日（木）会場：兵庫県立淡路夢舞台国際会議場

住所：兵庫県淡路市夢舞台１

電話: 0799-74-1020

http://www.yumebutai.org
宿泊：ウエスティンホテル淡路
2.

http://www.westin-awaji.com/

第 4 回国際シンポジウム

日時：2015 年 11 月 22 日（日）、23 日（祝）場所：西新プラザ 住所：福岡市早良区西新 2-16-23

電話：092-831-8104

http://www.kyushu-u.ac.jp/university/institution-use/nishijin/

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April, 2015

女子中高生のためのサイエンスカフェ
物理や化学で紐解く生命科学の魅力－女性研究者と考えよう－

会場は、21 KOMCEE という学生の主体的な学習を目指した新しい教育棟です。採光性に富んだとても明るい教室で、主催者、参加者ともに終始リラックスした雰囲気で進行しました。当日は、28 名の中高生と 9茶谷絵理（神戸大学大学院
理学研究科化学専攻
・A03 公募研究代表者）

名の保護者の方のご参加がありました。当初、高校生の方が多いのではと思っていましたが、意外にも中学生が全体の 4 分の 3 以上を占めました。中学 1 年生も2 名居り、非常に早い時期から将来のことを真面目に考える女子学生がたくさんいることに驚きました。筆者は、なぜ研究者の道に進んだのか？どのような研究

2015 年 3 月 21 日（祝）に、東京大学駒場キャンパをしているのか？中高生の頃はどんな学生だったのスにて、女子中高生向けのサイエンスカフェを開催しか？などについてかなり初歩向けの話をしましたが、ました。現在の女子学生の大学進学率は男子学生にほ衝撃的だったのは、この後の真行寺先生の研究の話のぼ並び、女性の社会進出も随分進んだ印象があります。

なかで、ウニ精子の鞭毛の動く動画データを見ながらしかしながら理系への進学や研究職への就職について説明を聞いている女子中高生の顔が真剣そのものだっは依然障壁が高いようで、日本は先進国のなかで女性たことです。こんなに若い頃からサイエンスの楽しさ

研究者の割合がもっとも低いという集計結果がありまというのは分かち合えるものなのだということを知り、す。そこで、当新学術領域の立場から女子中高生の理

驚きを覚えました。

系進路選択への支援として上記サイエンスカフェを企

また今回は、事前に参加者から質問を募り、集まっ

画し、自然科学カフェとの共催、日本糖質学会の協賛

た様々な質問に回答する時間も設けました。こちらののかたちで開催するはこびとなりました。

企画には、東京大学の現役の大学生・大学院生 7 名に新学術領域「動的秩序と機能」では、化学と物理学も参加していただきました。研究職はどんな仕事か、と生物学の研究者が分野横断的に一丸となって生命の研究職について良かったこと、大変だったこと、学生

不思議を解き明かすことを目指した魅力的な研究プロ

時代の部活動、中高生にしておけばよかったと思うこ

ジェクトです。そこで、本サイエンスカフェでは少しと、「科学の力で不老不死は可能か」という難しい質問でも多くの学生に生命科学の研究の面白さを知ってもも・・・。さまざまな質問がありましたが、中高生をらうために、班員である真行寺先生と筆者の 2 名が自差し置いて筆者自身がもっとゆっくり聞きたいと思う

己紹介を兼ねた講演を行うことから会がスタートしま

ほどさまざまな話や意見を聞くことができました。

した。

真行寺先生による講演の様子。参加者の中高生が熱心に話を聞いている様子がわかります。

参加者からの質問に回答する一場面。実にたくさんの質問が集まったので、これらをいくつかのカテゴ
リーに分類して回答しました。TA として参加した大学
生・大学院生も質問に答えてくださりました。

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April, 2015

生、山口先生、鈴木様、内藤様にこの場を借りて御礼
その後「お茶会」として交流スペースに場所を移し、を申し上げます。共催の自然科学カフェの後藤様、古数班に別れて懇談会を行いました。桜色の可愛らしい屋様も会に参加してくださり終始温かくサポートしてケーキとお茶を前に、どのテーブルも和気あいあいとくださりました。皆様方に心より感謝いたします。

した楽しい雰囲気でした。参加者からは「どうやった
ら理科が得意になりますか？」や「出会いはありますか？」など、素朴な疑問もたくさん出たようです。特に、大学生・大学院生の TA の皆さんとの交流は、参加者の中高生にとっては年齢も近く、自分の将来像を重ねやすかったのではないかと思います。
会の終わりにとったアンケートでは概ね好評で、先生方のお話がとてもおもしろかった／実際の経験をもとにした話を聞くことができて良かった／知らなかったことを色々知れた／お茶会の時、聞きたい事をたくさん聞けた／具体的な研究者の様子などがわかった／

会の終了後。右から神谷先生、矢木先生、真行寺研究を仕事にしている人の話を聞く機会があまりな

先生、筆者。

かったので参加してよかった／色々な考えを聞けてよ
かった／理系が苦手でも、研究者になることができるとわかった（理系教科が苦手だったが最終的に理系に進学したという大学生の TA さんの話を聞いての感想と思います）といった感想が挙がりました。
なかには、今まで文系を考えていたが、研究職も面白そうかなと思った、という声も聞くことができました。本会で生命科学研究に親しみを感じ、今後の進路を考えるうえでの参考になればと願っています。

お茶会の様子。保護者の方にも参加していただきました。TA さんや先生方を囲み、質問を交えて歓談する様子が見られました。
最後に、本会開催にあたりまして企画時からお力添えを賜りました平岡先生と加藤先生、また、事前の準備、当日の講演、司会、参加者からの質問への回答な
どお世話になりました真行寺先生、神谷先生、矢木先

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April, 2015

アウトリーチ活動報告には安堵しました。そして、「今まで、生物、物理、化山口拓実（自然科学研究機構 分子科学研究所・A03 計画研究分担者）

学の分野どうしのつながりについてよくわからなかったが、それぞれの分野をこえて研究を行っていくのが、これからの研究の流れであるとわかった」「これからの科学では、いろいろな分野をつなげる力が必要になる

愛知県立岡崎高等学校の理系 2 年生を対象としたアとわかった」といったコメントを多くもらうことがでウトリーチ活動を行いました。同校は文科省／JST のき、私も大変嬉しく思いました。懸命に耳を傾けてく

スーパーサイエンスハイスクール（SSH）に指定されださった多くの生徒さんの、いつか何かの一助になれており、今回、SSH 活動の一環として開かれた進路オ

たら幸いです。

リエンテーションに参加し「第 3 の生命分子鎖：揺らめく糖鎖のかたちとはたらき」と題した講演を行いました。岡崎高校のキャンパスは私の所属する分子科学
研究所のすぐ隣にあるため、同校の皆さんが高校生活に励む姿は日頃よく目にしているのですが、いざ 240
名を超える生徒さんを前に、果たして話に興味をもってもらえるだろうかと、若干の不安と期待を抱きながら壇上にあがりました。
会を準備してくださった先生からは、研究者としての生き方に触れることで進路選択の一助としたいという趣旨を説明されていたこともあり、講演では研究内
容の紹介はほどほどに、私自身の高校時代の様子（数講演の様子。著者が学部時代にはじめて合成した分子学と物理がとにかく嫌いだった）や、進学時の思い出についても紹介しました。

などを含めて話をしました。もともと私は、大学院在学中は超分子化学を専攻しており、後に現在の分野（糖鎖の構造解析など）へ研究テーマを展開していますので、創る学問としての化学の面白さや、生体分子へ興味をもったいきさつなども紹介しました。こうしたエピソードの甲斐もあってか、「大人になっても勉強し直すことも大いにあり得るのだと知った」「これもやりたい、あれもやりたいと思うときがあったが、将来、広い分野を学んでいけることに安心した」という感想をもらいました。
また最後に、本新学術領域についても紹介しつつ、現代そしてこれからの自然科学には分野の垣根がどん

講演後には多くの質問をもらうことができました。
「研

どんなくなっているという話をしました。そうした潮究者の生活はどのようですか？」という質問への回答

流の中で拠り所となる、自分の得意なことを幹として（毎日遅くまで研究に励んでいます！）に少し迷いま

育ててください、そうすれば葉や花はきっと増やしてしたが、アンケートには「企業に入ることを目標としいけますよとメッセージを贈りました。事後アンケーてきたが、研究所で自分の研究に励むこともいいと

トの結果を教えていただいたところ、内容を難しいと思った」という声もありました。

感じながらも理解できたという生徒さんが多かったの

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April, 2015

日本薬学会第 135 年会（神戸）シンポジウム「タンパク質の会合・凝集：計測、メカニズム
から制御まで」(2015 年 3 月 26 日開催)報告

た 4 量体を形成するのではなく、2 量体でプロトンチャ
ネルを形成するという新知見が紹介された。佐甲先生からは、上皮細胞増殖因子受容体(EGFR)の一分子観察による解析により、受容体の会合状態や可動範囲がリ

二木史朗（京都大学化学研究所・
A02 公募研究代表者）

ガンド添加により変化し、情報伝達へと至る過程が紹介された。二木はペプチドリンカーを用いた EGFR 等の膜タンパク質の会合制御法に関して紹介を行った。
茶谷先生からは、時分割小角Ｘ線散乱を用いたインス
リンのアミロイド形成過程の解析により、まず低毒性

タンパク質はその機能発現に会合体形成を必要とする場合が多い。一方、タンパク質が アミロイド形成など異常な凝集を引き起こした場合、神経変性疾患やアミロイドーシスなどの疾病につながる。本シンポジウ
ムは、種々の受容体やアミロイド形成タンパク質の会
合と凝集に焦点を当て、1)in-cell 蛍光分光法や一分子計測を用いた生細胞における膜タンパク質の会合・凝集の細胞膜上での計測、2)生物物理学的手法を駆使した会合・ 凝集のメカニズム解明、3)さらには疾病の治療を指向したケミカルバイオロジー的な会合・凝集制
御方策の樹立を念頭に、京都大学薬学研究科松崎勝巳
教授と私をオーガナイザーとして開催された。演者とタイトルは以下の通りであり、新学術領域研究「動的秩序と機能」の班員でもある佐甲靖志先生、茶谷絵理
先生にもご講演をお願いした。

の柱状中間体が形成され、seeding 能を有する高毒性の成熟体へと成長するという知見が紹介された。池田先生からは、アミロイド β タンパク質（Aβ）の構造形成
における糖脂質 GM1 ガングリオシドの重要性や膜曲率の影響、水中と膜存在下での β シート構造形成様式の違い等に関しての知見が紹介された。谷口先生からは、独自に開発したフラビン誘導体による Aβ の酸素化（酸素原子を化学的に分子内に導入）による凝集性や細胞毒性の軽減の試みと共に、触媒分子の分子内回転が Aβ 存在下で抑制されることを利用した、毒性型
凝集体の選択的酸素化のアプローチに関して紹介があった。それぞれの演者の方のバックグラウンドを活かした斬新で非常に興味ある話題が続き、約 200 人の聴衆を交え、所定の 2 時間半が瞬く間に過ぎ去ったシンポジウムであった。

コイルドコイル標識法と in-cell 蛍光測定法による生細胞膜上での膜タンパク質の会合計測（松崎勝巳・京大院薬）
細胞膜受容体の会合と機能の 1 分子イメージング（佐甲靖志・理研）
ペプチド相互認識を用いた膜タンパク質の会合制御（二木史朗・京大化研）
アミロイド線維形成における蛋白質初期集合メカニズ
ムの解明（茶谷絵理・神戸大院理）
脂質膜環境におけるアミロイド β タンパク質の構造変化と凝集（池田恵介・富山大院薬）
触媒的酸素化反応によるアミロイド形成の制御（谷口敦彦・東大院薬、JST-ERATO）
松崎先生の講演では、独自に開発したコイルドコイ
ル蛍光標識による FRET 観察により、インフルエンザ
M2 タンパク質は中性条件下ではこれまで言われてき会場にて（左から、谷口、佐甲、松崎、二木、池田、
茶谷）
（敬称略）
謝辞：本シンポジウムは、新学術領域研究「動的秩序と機能」協賛の形で開催させて頂きました。厚く御礼申し上げます。

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April, 2014

The 5th Yonsei-IMS Joint Workshop:“Multilateral approaches forinvestigating biomolecular structuresand functions”
報告

今回も始めは緊張した面持ちだったものの、泊まりがけで話し合いを続けることで、お互いにすっかり打ち
解けることができ、ディスカッションも弾んだようでした。また、セミナーの後は温泉と箱根観光を通じて、さらに交流を深めました。本セミナーを通じた意見交
換、および今後の共同研究の広がりによって、次世代を担う若手研究者がますます活発に相互交流し、大い矢木真穂（自然科学研究機構 岡崎統合バイ
オサイエンスセンター・A03 計画研
究分担者）
加藤晃一
（自然科学研究機構 岡崎統合バイ
オサイエンスセンター・A03 計画研
究代表者）に活躍してくれることを期待しています。

第 5 回 Yonsei-IMS 合同セミナーの参加者。

1 月 30 日から 2 月 1 日にかけて、韓国 Yonsei 大学の Weontae Lee 教授のグループとの合同セミナーを行いました。合同セミナーの開催は 5 回目になりますが、
今回は、韓国・日本の両国から、学部生と大学院生あわせて 8 名 を含む若手 メンバ ーが箱根に 集まり、
“ Multilateralapproaches

forinvestigating

biomolecular structure and functions”をテーマとして研究ディスカッションを行いました。
Lee 教授はタンパク質複合体の構造解析や、ユビキ
チン化やグリコシル化などの翻訳後修飾系に関する研セミナーの冒頭で挨拶をする Weontae Lee 教授。

究、分子レベルの構造情報に基づいた創薬研究などを精力的に行っています。特に核磁気共鳴（NMR）法を基軸にした構造生物学研究に造詣が深く、ご自身は韓国の磁気共鳴学会の会長も務めています。
私たちは、Lee 教授の研究グループとともに、高磁場 NMR 法や X 線結晶構造解析法をはじめとする生物物
理学的手法を基盤に、生命システムの秩序形成に関わるタンパク質の動的分子認識メカニズムの詳細を解明しようと共同研究を展開しています。本セミナーは、共同研究の進捗や今後の方針についての定例的な意見交換を行うこともさることながら、若手研究者同士の国際的な相互交流を促すことを主な目的として、日本と韓国で毎年交互に開催しています。これまでに参加

大湧谷より富士山を眺める。

した日韓両国の学生は、外国人研究者の前で発表を行なったり質問をする経験が初めてである場合も多く、

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April, 2015

活動報告

スペクトルを軽水中と重水中でそれぞれ測定し、同位体置換によるスペクトルの変化、すなわち H/D 同位体

立川仁典（横浜市立大学 大学院生命ナノシステム科学研究科
・A01 公募研究代表者）

シフトが生じることを発見しました。これは糖の CD
スペクトルの同位体効果を観測した初の事例であり、糖の微視的挙動を理解する上で有用な情報を含んでいることが期待されます。
測定結果の解釈を深めるには計算機を用いた理論解

神谷由紀子（名古屋大学
エコトピア科学研究所
・A02 公募研究代表者）

析が有効ですが、従来汎用されてきた計算手法である、通常の分子動力学法と密度汎関数法だけでは、今回対象としている分光物性に現れる同位体効果の解析を行うことは不可能です。そこで、同位体効果を直接考慮できる新規手法として、立川班員らが独自に開発した

加藤晃一（自然科学研究機構
岡崎統合バイオサイエンスセンター
・A03 計画研究代表者）

多 成 分 系 密 度 汎 関 数 法 （ multicomponent density
functional theory; MC_DFT）を用いた量子化学計算[2]によって、立川グループの兼松佑典博士がこの同位体シフトに関して精緻な理論解析を行いました。
当日は兼松氏が理論解析結果について報告し、報告

２月２４日、A01 班の立川班員のグループ、A02 班

内容を下地にして水溶液中の CD スペクトルの同位体の神谷班員、および A03 班の山口班員、加藤班員が分シフト発現に影響する諸要因の検討を行いました。そ子科学研究所にて会合し、A01～A03 三班連携によるの後、今後の展望や論文執筆の際のシナリオ構成につ共同研究に関するディスカッションを行いました。

いて協議し、大まかな方針を決定しました。半日程度

本研究は水溶液中の methyl-α-D-glucopyranosideの短い会合でしたが、A01～A03 三班間の活発な意見（図１）の円偏光二色性（CD）スペクトルに現れる

交換を通して実りの多い交流を持つことができました。

H/D 同位体シフトについて実験・理論の両面から解析

研究成果の詳細については、あらためて紹介いたしを行い、その発現機構の解明を目指すものです。

図１．Methyl-α-D-glucopyranoside

たいと思いますので、ご期待の程を。

研究打ち合わせ風景

右から２人目が兼松佑典博士

当該分子は市販の CD 装置では測定することが不可能な高エネルギー帯で固有の CD 活性を示します。加[1] N. Ojima, K. Sakai, T. Fukazawa, K. Gekko,

藤・神谷両班員らは広島大学放射光科学研究センター

Chem. Lett. 29, 832 (2000)に あ る 真 空 紫 外 円 二 色 性 （ vacuum ultraviolet[2] T. Udagawa and M. Tachikawa, J. Chem. Phys.

circular dichroism; VUVCD）分散計[1]を用いて、CD

125, 244105 (2006).

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“Dynamical Ordering & Integrated Functions”
Newsletter Vol. 20

April, 2015

内山グループの石井健太郎さんが平成 26 年度生物物理学会中部支部講演会にて優秀発表賞を受賞
内山進（大阪大学 大学院工学研究科、自然科学研究機構 岡崎統合バ
イオサイエンスセンター・A03
公募研究代表者）
加藤晃一（自然科学研究機構 岡崎統合
バイオサイエンスセンター・
A03 計画研究代表者）
2015 年 3 月 10 日、岡崎コンファレンスセンターにて開催された平成 26 年度生物物理学会中部支部講演会において、私たちの研究グループの石井健太郎さん

非共有結合性の相互作用で結合した複合体の質量を精度良く測定可能であり、従って、測定質量から組み込
まれたサブユニットの数と種類を決定できます。本研究において、別のサブユニットがα7 リングに組み込まれるときにα7 リングの解離が起きることが明らかになりました。
複雑なタンパク質複合体の形成では、新たに形成した相互作用とは別に、他の部位が構造変化する過程が重要であると考えられます。超分子質量分析はこのよ
うな会合と解離を伴いながら複合体を形成する系の解
析に力を発揮します。今後は 7 種類全てのサブユニットの単独での会合状態を明らかにするとともに、アッセンブリーシャペロンなども加えてαリングの複合体形成過程を解明することが期待されます。

（岡崎統合バイオサイエンスセンター研究員）が「プ
ロテアソームα7 サブユニットの多量体ダイナミクスの超分子質量解析」の研究発表によって、優秀発表賞を受賞いたしました。
私たちは複雑なタンパク質複合体の組み立てのルールを知るためにタンパク質分解装置プロテアソームの形成過程を研究しています。プロテアソームは 35 種類、67 個のサブユニットからなる巨大で複雑な超分子複合体です。興味深いのは、相同性の高いサブユニット
をいくつも持ち合わせているにも関わらず、決まった個数と配置でその構造が組み立てられていることです。
タンパク質分解活性を持つ部分はαリングとβリング

内山グループ研究員の石井博士と超分子質量分析装置

がαββαに積み重なった円筒状構造をしています。
βリングはαリング上にサブユニットが組み付けられていくことにより形成されるので、βサブユニットの配置はαリングが決めていると考えられます。αリン
グは 7 種類のサブユニットからなるヘテロ 7 量体です。
それぞれのサブユニットの一次構造の相同性は約 40%と高く、αリング中での立体構造にはほとんど違いが見られません。それぞれのサブユニットがどのようにして互いを見分け、ひとつずつリングに組み込まれるのか、また並び方の順序はどうやって決まっているのかは分かっていません。

中部支部会での授賞式の様子

石井さんは超分子質量分析を用いてαリングの複合体形成の解析に取り組みました。超分子質量分析では

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