“Dynamical Ordering & Integrated Functions”
Newsletter Vol. 15

November, 2014

業績紹介：黄色ブドウ球菌由来膜孔形成毒素蛋白質の膜孔形成機構"Molecular Basis of Transmembrane Beta-Barrel Formation of Staphylococcal Pore-Forming
Toxins"Daichi Yamashita, Takaki Sugawara, Miyu Takeshita, Jun Kaneko, Yoshiyuki Kamio, Isao Tanaka,
Yoshikazu Tanaka and Min Yao
Nature Communications, 5, 4897 (2014) DOI: 10.1038/ncomms5897

田中良和（北海道大学大学院先端生
命科学研究院・A01 公募研
究代表者）

た後、MPD を含むバッファー中で結晶化することにより、自発的に会合した膜孔中間体の結晶を得た。明らかになった膜孔中間体の構造は、膜孔と類似していたが、膜貫通領域がディスオーダーしている点で大きく異なっていた（図 1）。これにより膜孔中間体のモデル

院内感染の原因菌として知られる黄色ブドウ球菌は，構造において問題となっていたプロトマー間の立体障

血球細胞の細胞膜に孔を形成する種々の膜孔形成毒素

害は見事に回避されていた。膜貫通領域だけがディスを分泌する。膜孔形成毒素は単量体として分泌される

オーダーしていた事から、-バレルの上下半分ずつがが、ターゲット細胞の細胞膜上で多量体化して膜孔中別々に形成されるという機構が明らかになった。膜孔間体を形成した後、劇的な構造変化を起こし、-バレ形成毒素のβ—バレルは、強力な界面活性剤である SDS

ル型の膜貫通領域を細胞膜中に挿入して膜孔を形成すの存在下でも解離しない安定な構造であることが知らる（図 1）。単量体と膜孔の結晶構造は既に決定されてれているが、それが半分ずつ別々に形成されるといういたが、膜孔中間体については詳細な構造情報が得ら機構は大変興味深い。本研究により、単量体、膜孔中

れていなかったため、単量体の結晶構造を膜孔の結晶

間体、膜孔の全ての過程の原子レベルの構造が明らか構造に重ねることにより作成した膜孔中間体のモデルになり、新たな膜孔形成メカニズムの機構を提案する

構造をもとに、動的な膜孔形成機構が議論されてきた。

ことが出来た。

しかし、膜孔中間体のモデル構造には、プロトマー間に立体障害が存在するという致命的な問題が存在しており、これは提唱されている機構には少なからず不正確な部分が存在することを意味していた。正確な機構解明に向けて、膜孔中間体の結晶構造解析が切望されていたが、膜孔中間体は過渡的な不安定な会合体であるため、その結晶構造解析は長きに渡り達成されなかった。一方で、黄色ブドウ球菌の膜孔形成毒素の一種、γ−ヘモリジン（LukF と Hlg2 から構成される 2
成分性毒素）の LukF の Trp178/Arg197 に変異導入すると、安定な膜孔中間体が形成されるということが、過去の論文で報告されていた。そこで本研究では、γ−ヘモリジンの W178A/R197A 変異体を用いて膜孔中間

図 1：黄色ブドウ球菌由来 2 成分膜孔形成毒素の膜体の結晶構造を決定することに挑戦した（図 1）。LukF、

孔形成機構。本研究では、膜孔中間体の結晶構造を決Hlg2 の各成分を単量体として精製し、それらを混合し定し、一連の膜孔形成機構を明らかにした。

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November, 2014

業績紹介： 古細菌のプロテアソーム集合シャペロン様タンパク質
PbaA の立体構造解析
タンパク質"Crystal Structure of Archaeal Homolog of Proteasome-Assembly Chaperone PbaA"
Arunima Sikdar, Tadashi Satoh, Masato Kawasaki, and Koichi Kato
Biochem. Biophys. Res. Commun., in press, (2014), DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.09.114

佐藤匡史（名古屋市立大学 大学院薬学研究科・A03 計画研究分担者）

テアソームに結合し、その基質分解を促進する活性化因子として機能することを見出している（図 1 左）[1]。
今回新たに報告した論文では、X 線結晶構造解析によって、古細菌に存在するもう 1 つのアッセンブリー
シャペロン様タンパク質 PbaA の立体構造を明らかに加藤晃一（自然科学研究機構 岡崎統合
バ イオ サイ エン スセ ンタ ー・
A03 計画研究代表者）

した（図 1 右）。PbaA は PbaB とは異なりホモ 5 量体構造を形成していた。面白いことに、PbaB で見られた伸びた C 末端部分は折りたたまれて格納されていることが明らかになった。したがって、PbaA はこのままのかたちではプロテアソームと相互作用できそうにない。

細胞の中で合成されたタンパク質が、機能を持った

それでは、PbaA は古細菌においてどの様にして機能を超分子へと組み上げられる際には、分子集合を媒介す果たしているのであろうか？

本研究の成果は、プロるシャペロンの助けを必要とする場合がある。例えば、テアソーム系におけるアッセンブリーシャペロンと活

細胞中で不要になったタンパク質の解体を行う超分子性化因子の進化的関係について、また相同なタンパク

タンパク質分解酵素プロテアソームは、多種多様なタ質分子素子が異なったホモオリゴマー構造を造り出す

ンパク質から構成され、その複合体の形成過程には一デザインルールについて、洞察を深める糸口を提供す

過的に複合体に組み込まれては外れていくアッセンブ

るものと考える。

リーシャペロンがいくつも関わっている。これまで、
私たちのグループでは体系的な構造生物学的アプロー
チを通じて、アッセンブリーシャペロンによるプロテ
アソームの分子集合メカニズムを明らかにしてきた。
真核生物のプロテアソームは、よく似てはいるが相互に異なるサブユニットが一連のアッセンブリーシャ
ペロンの介助を受けて正しく配置した 4 次構造を形成する。一方、古細菌において、プロテアソームは同一のサブユニットから構成されており、それらは自発的に集合することが知られている。興味深いことに、アッセンブリーシャペロン PAC1 と PAC2 の古細菌の相同タンパク質として PbaA および PbaB が同定されている。
しかしながら、プロテアソームが自発的に集合する古図 1 古細菌のアッセンブリーシャペロン様タンパク

細菌において、アッセンブリーシャペロン様のタンパ

質 PbaB（左）および PbaA（右）の立体構造

ク質が存在する必然性は必ずしも明確ではない。最近、
私たちのグループは、PbaB はホモ 4 量体構造を形成し参考文献ており、触手のように伸びた C 末端部分を介してプロ[1] K. Kumoi et al. PLoS ONE, 8, e60294 (2013).

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November, 2014

第１回若手研究会

報告していただきました。また、3 名の博士課程の学生の方々からも、自ら産みだした研究成果を、苦労話を交
えてご紹介いただきました。ポスター発表では、実に佐藤宗太

参加者の 9 割にものぼるほとんどの方から成果発表を（東北大学 原子分子材料科学高等研していただき、研究討議を通じて領域にかかわる若手究機構（WPI-AIMR）
・A02 計画研究代表のみなさまの相互理解が大いにすすんだものと実感で

者）

きました。
本稿では、紙面スペースの都合上、若手研究会の全東北が本格的な寒さを迎える直前、2014 年 9 月 28
日から 30 日に、宮城県遠刈田郡蔵王町にあるラフォーてを紹介することができませんので、代わりにプログ
ラムを紹介させていただきます。

レ蔵王にて、新学術領域「生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現」第 1 回若手研究会が開プログラム催されました。3 日間にわたる本シンポジウムには、本領域の研究室に所属する学部・大学院学生をはじめ51 名もの若手参加者の皆様にお越しいただきました。

新学術領域「生命分子システムにおける動的秩序形成

初めての若手研究会開催の試みだったので、有意義なと高次機能発現」第 1 回若手研究会会にできるか不安もありましたが、ふたを開けてみれ2014 年 9 月 28～30 日

ば予想以上に熱い研究討論がかわされ、開催してよ【1 日目】

かったと喜んでおります。事務局を代表して、皆様に

15:00-15:15

この場を借りて深く御礼申し上げます。

ラフォーレ蔵王にて

開会の挨拶・趣旨説明
領域代表・加藤晃一（自然科学研究機構・教授）
15:15-16:15 「機能性タンパク質集合体の構築」
安部聡（東工大・助教）

16:40-17:20 「化学反応場としてのリポソーム脂質二重膜：高速時間分解分光法による評価」
野嶋優妃（学習院・D3）
19:30-21:30 ポスターセッション 1【2 日目】「お釜」で有名な蔵王で初めての若手研究会が開催されました。参加者からは、全く異なる研究分野の話は新鮮で、同年代の学生と密に話ができて楽しかったとの嬉しい声をいただきました。

9:30-10:30 「In vitro 再構成を使った酵母の小胞輸送機構の解明」
二井勇人（東北大・准教授）

本新学術では、動的秩序という切り口を同じくしな

10:50-11:30 「青色光受容タンパク質における DNA 修

がらも、生命現象から合成化学、理論計算、分光分析

復メカニズムの理論的研究」に携わる異分野の研究者が集まってきており、相乗効

佐藤竜馬（名古屋大・D3）

果による研究領域の活性化が期待されています。今回、本領域の実力を底上げするために、研究の最前線で活躍する学生や若手研究者の皆様の相互理解を深める企

11:30-12:30 「代謝経路における動的秩序」
松村浩由（阪大・准教授）
13:30-17:30

画として若手研究会を開催する運びとなりました。本

共同研究に向けた意見交換会

領域に関わる 4 名の先生方から最前線の研究を紹介し19:30-21:30 ポスターセッション 2ていただくとともに、講演者のご研究とは異なる分野の学生にもわかりやすいように、基礎的な事柄を講義

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November, 2014

【3 日目】
9:30-10:30 「アミロイドβの分子会合の精密構造解析」

講演の紹介

矢木-内海真穂（岡崎統合バイオ・特任助教）
10:50-11:30 「正八面体型中空錯体による特異的有機分子認識と構造・機能制御」

各講演につきまして、参加者の皆様からお寄せ頂いたレポートの形式で、内容を紹介させていただきます。

竹澤浩気（東大・D3）
11:30-12:00 閉会の挨拶・まとめ

東工大・助教の安部
（敬称略）

聡先生

複数のタンパク質サブユニットが秩序化して構築される、中空のタンパク質集合体を利用した化学についてご講演して頂きました。タンパク質集合体であるフェリチンは、様々な金属を精密に集積することができる内部空間を有しているため、新しい
機能性材料として注目されています。
今回のご講演では、その閉じた内部空間に複数の金属触加藤領域代表から本領域の概要と若手研究会の開催趣旨が説明されました．本領域では、生命現象の本質である、時間・空間的にうつろいゆく秩序構造をくまなく研究するために、さまざまな分野の研究者が一同に会し、それぞれ得意なアプローチ法をもちよって全く新しい研究領域を立ち上げています。研究の発見の現場にいる若手の方がこの新分野の理解を深め、思いもしなかったアプローチに気づいて研究を力強く展開することが期待されています。所属学会も違い、本領域以外ではおそらく出会うことのない人達が集まる今回の研究会を大切にして欲しいとのメッセージをいただきました。

媒を精密に集積し、単純な溶液系では実現しに
くい多段階の反応が時系列にしたがって進行（東大・M2・横山裕之筆）

するカスケード触媒反会場のラフォーレ蔵王前にて集合写真。紅葉が見頃を迎えていて東北の秋を満喫できた会でした。

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November, 2014

応を制御する研究について、興味深いお話を聞かせて定数は、液晶相の膜のものの方がゲル相の膜のものよ頂きました。特に、タンパク質のアミノ酸配列を変異りも大きく、このことから、水分子の分布が二つの相させることで、集積する金属の種類や数、位置等を自で異なることがわかってきました。また、蛍光減衰や在に制御できると伺い、得られた知見をフィードバッ

回転緩和の観測から溶媒の粘度が算出され、結晶相おクすることにより精密な反応制御を達成できる材料とよびゲル相のどちらにおいても、粘度が異なる二つのして大きく期待できると感じました。

環境が膜中に存在することが明らかになりました。こ
の結果は、単一成分から構成された膜でも不均一な環境を持つことを示唆しており、生体膜の流動的な構造の理解の観点から大変興味深いものです。質疑応答では trans-スチルベンの使用や、粘度の算出方法の妥当性など、研究の基礎部分についての疑問から、脂質ラフトの作製など今後の応用的研究についてのコメントなど、若手会に相応しい活発な議論が交わされました。

学習院・D3 の野嶋優妃さん
生体膜は、脂質二重膜で形成され、細胞や小器官の境界を作るとともに、光合成などの生化学反応が進行する場でもあります。野嶋さんは生体膜を化学反応の東北大・准教授の二井勇人先生場と捉え、生体膜環境を模したリポソーム脂質二重膜

二井先生のご講演では、2013 年にノーベル医学生理を作製し、化学反応の進行に重要なエネルギー移動特学賞を受賞された、Randy Schekman 博士の業績につい性や粘度を評価しています。本講演では、六種類のリて、主に小胞輸送のメカニズムに関連する概要を紹介

ン脂質を用いてそれぞれ作製したリポソーム脂質二重していただきました。特にコート小胞の発芽からコー

膜内部の微視的環境の評価について、封入した trans-

ト脱離までの過程を制御している蛋白質のそれぞれのスチルベンの化学反応速度とエネルギー移動速度の測役割と、段階的に時間展開・空間展開する現象が非常定結果から発表して下さいました。trans-スチルベンのに印象的でした。私の研究では 1 種類の蛋白質のみを

冷却過程の分光学的な観測結果から算出された熱拡散（東京農工大・D1・山本陽平 筆）（奈良先端大・D2・米澤健人 筆）

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対象としているので、細胞内にある複数の蛋白質が共が競合して電子移動が進行するモデルを新たに提唱さ同的に関わって発現する現象は、非常に新鮮で興味深れた。コンセンサスが得られていない CPD 光回復酵素

いものでした。また、本講演で紹介された Schekmanの電子移動反応機構について一石を投じる格好となっ博士にまつわる話からは多くの研究姿勢に対する熱いた。タンパク質の動的な振る舞いと電子が移動する経メッセージを受け取る事ができました。

路とを考慮した MD シミュレーションの必要性を強く感じた。ご講演・その後の質疑からは分野外の人間にもかみ砕いて説明しようとする、真摯かつ穏やかな佐藤さんの人となりが垣間見えた。

名古屋大・D3 の佐藤竜馬さん
名大・岡本研の佐藤竜馬さんは、紫外線で生じる
DNA 損傷のひとつであるシクロブタン型ピリミジン
二量体（CPD）を修復する CPD 光回復酵素の動作原理について、MD シミュレーションを駆使した解析結果を発表された。まず、CPD 光回復酵素の周りに水を配置して全原子計算を行い、タンパク質全体の揺らぎを考慮した構造スナップショットを多数取得された。補阪大・准教授の松村浩由先生因子である FADH–から酵素を介した CPD への電子移

松村先生からは、植物の光合成炭酸固定経路におけ動速度を（FADH–、CPD、酵素の活性中心近傍のアミる、CP12、GAPDH、PRK の三者複合体形成メカニズ

ノ酸残基の他は点電荷近似した）第一原理電子状態計

ムと機能についてご紹介いただいた。この複合体の形

算を用いて算出したところ、従来想定されていた電子

成は NADH/NADPH 比によって調節を受ける。

移動経路とは異なる経路の存在が示唆され、複数経路

NADH/NADPH 比が低いと CP12 から GAPDH、PRK が解離して活性化し、NADH/NADPH 比が高いと三者複合体が形成され GAPDH、PRK の機能が抑制される。

（北陸先端大・PD・福永圭佑

筆）（奈良先端大・D3・阿部幸喜筆）

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CP12 は一定の構造を持たないが、GAPDH と結合した【感想】私自身もペプチドを扱っているので、異分野

後で、負電荷領域が増大し、PRK と結合出来るようにといえども蛋白質の二次元 NMR の解析についてなど、なる。タンパク質分子の集合、解離のメカニズムを構大変勉強になりました。今回、先生は学生へのメッセー

造レベルで詳細に解析する事は、とても説得力がある

ジとして「粘り強く」といったサブタイトルを付けらと感じたし、一定の構造を持たない CP12 タンパク質

れていました。似たような研究の論文が先に出されての性質を知る事が出来て、大変勉強になった。

しまったり、NMR の解析、条件検討にかなりの時間を要したりと、研究成果をお聞きしただけでは想像できない苦労もあったということから、研究では期待通りの結果がすぐに得られることは稀で、諦めずに試行錯誤し続けるということがいかに大事かを学ぶことができました。まだ凝集メカニズムについて完全には解明されていないようなので、今後の研究にも注目した
いと思います。

岡崎統合バイオ・特任助教の矢木-内海真穂先生【ご講演の概要】アミロイド蛋白質(A)はアミロイ
ド繊維として凝集し、脳に蓄積されることでアルツハ
イマー病などを引き起こすことが知られている。糖脂質の一種である GM1 ガングリオシドが Aと結合する（阪大・M1・田尾知美 筆）とその凝集が促進されるが、多段階にわたる凝集過程の詳細なメカニズムはいまだ解明されていない。そこ

東大・D3 の竹澤浩気さん

で矢木-内海真穂先生らのグループでは高磁場 NMR の生体分子系において、ホスト分子によるゲスト分子活用をツールに使い、Aの凝集メカニズムを解明するの特異的分子認識は重要な役割を果たします。近年でことを目的とされた。実験の結果より、(1) GM1 が密は、精緻な分子設計が可能な合成ホスト分子を用いて集したクラスター上における凝集の開始段階において生体系の分子認識の模倣・解明が進められる一方、生は、Aは二箇所に-へリックス構造を持ち、C 末端側体にはない機能の発現を目指した研究も盛んに行われが GM1 クラスター界面において疎水性部分に配向しています。
「正八面体型中空錯体による特異的分子認識ていること、(2) 次のステップとして Aの C 末端部分
が分子間相互作用することでシート構造へと変化して凝集核が形成されていることを明らかにした。

（東北大・D3・松野太輔 筆）

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November, 2014と構造・機能制御」と題された東京大学藤田研・竹澤

光受容蛋白質の構造変化を分子レベルで追跡しておら浩気さんの研究は、自己組織化により組み上がる正八れました。動的に変化する緻密な構造とその機能に驚面体型錯体をホスト分子とする特異的分子認識とそのきつつ、別の視点から意見が飛び交う会場の雰囲気に機能に関するものです。今回の講演では、(1) これま

自身の見解を広げる良い刺激を受け、異分野交流の大で困難とされていた有機フッ素化合物の特異的分子認切さを実感することができました。最後になりますが、識、(2) 包接によるゲスト分子の構造変化と物性制御

若手会幹事の佐藤先生を初め、スタッフの皆様に、心という 2 つのトピックについてご紹介いただきました。

より感謝申しあげます。

いずれも中空錯体の空孔形状を有効に利用することで新たなホスト-ゲスト系を構築した成果です。ホスト分子の自己組織化、包接時のゲスト分子の大きな構造変化、ホスト内部でのゲスト分子の化学反応による構造
変化、といった構造展開する分子システムを巧みに利用することで、分子設計された機能を付与することに成功しています。超分子化学のみならず生化学や構造
化学・物性化学などの他分野にも大きなインパクトを与えうる意義深い研究であると感じました。

（信州大・D2・堀込幸司

筆）

ポスター発表 2 日目
2 日目のポスターセッションも、1 日目と同様に非常に盛り上がりを見せました。本新学術領域は、生物・化学・物理といったあらゆる分野の研究者が集まっていますが、参加者全員が自分の分野のみにとらわれることなく、熱いディスカッションが展開されていました。さらにポスターセッション後は、別室で２次懇談会がありましたが、予定の時間になっても何名もの方

ポスター発表の紹介

がポスターの前で白熱した議論を続けていたことが印象的でした。私の専参加者のほとんどが発表を行ったポスターセッショ

攻は生物ですが、化ンにつきまして、参加者からのレポートを紹介させて学や物理寄りの方といただきます。

も議論し、非常に興味が惹かれる内容もポスター発表 1 日目

ありました。参加者

若手研究会初日のポスター発表は、定刻より早い時全員にとって非常に間からすでに討論が行われ、活気ある雰囲気の中始ま有意義なポスターりました。全体の発表内容は、本領域の特徴が色濃く

セッションになった出ており、生物関連や無機材料、超分子、高分子といっのではないかと感じた多岐にわたる分野で構成されていました。同室だっました。

た奈良先端大の米澤さんは、片岡先生のもとで光情報（奈良先端大・M2・菅野泰功

筆）

伝達機構の分子システム解明に向け、光の吸収に伴う

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November, 2014

今回、ポスターセッションでは多くの興味深い研究た。今後の研究会を開催するにあたって改善を検討さが発表されていたが、中でも首都大学東京の鴨志田させていただきますので、今後とも忌憚のないご意見をんに説明頂いた In-cell NMR を用いた細胞内のタンパ

賜りますようお願い申し上げます。

ク質の構造解析がとても印象的だった。私は普段、神経細胞を扱っているが、細胞内でターゲット分子間の相互作用を構造レベルで解析出来たら良いなと思っておわりにいたので、有効な技術が出来つつ有る事を知る事が出来て良かった。

本若手研究会は、大自然に囲まれたラフォーレ蔵王（奈良先端大・D3・阿部幸喜 筆）を会場にさせていただき、幸いお天気にも恵まれて、
道すがら紅葉に色づく山々がとても印象的でした。参
加者の皆様には不便な点もあったとは思いますが、たまには喧噪をはなれ、色とりどりの研究にふれてリフ
レッシュになったことを願っております。

ポスターセッションでは参加者間の研究交流が活発に行われました。

アンケート
本若手研究会でご記載いただいたアンケートの結果についてご紹介いたします。参加者の内訳ですが、下図の円グラフのように、修士と博士・PD の比率が拮

熱気ある夜の懇談会よりワンショット

最後に、このニュースレターに使わせていただいた

抗していていました。この絶妙なバランスが、とても写真は、東大・M1 の森

優俊さんに主に撮影しても熱心な研究討議と活力の源であったのではないかと感らいました。また本会では、発表だけでなく、ニュー

じています。

スレターへのレポートや運営補助など、さまざまな側
面から参加者の皆さんに加わってもらい、積極的に盛り上げてもらいました。みんなで作り上げた本会での楽しい思い出が、今後の研究発展の原動力の一助となり、次回の若手研究会で大きく前進した皆様に再会できることを願っております。

講演やポスター発表、会場についてなど、満足度調査もさせていただきました。どの項目も、概ね 9 割程
度の満足度と評価していただきました。一方で、ポス
ター賞の選定を望む声や、会場設備的にインターネッ
トの接続環境が悪かったり研究討議の場が狭かったり等、運営上の改善点に関する声も挙げていただきまし（Photos by 東大・M1・森優俊）

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November, 2014

研究会参加報告

して機能へと迫るお話は聴衆の興味をひき、特に糖鎖修飾によるタンパク質に対する様々な制御機構の研究は多くの質問がありました。研究会のトリは、秋山班

杉山正明（京都大学 原子炉実験所・
A03 公募研究代表者）

員の時計タンパク質お話でした。SAXS によるタンパ
ク質複合体の全体構造の研究から時間制御機構の解明のために ATP 結合部位の詳細な構造研究に繋がっていく部分は非常にエキサイティングでした。

10 月 3 日に東京神田のエッサム神田ホールにて、満員の聴衆を集め「平成 26 年度第 1 回生物構造学研究会」が開催されました。この研究会は中性子産業利用推進協議会・茨城県中性子利用促進研究会・(一財)総合科学研究機構(CROSS 東海)・J-PARC/MLF 利用者懇談会が主催し、年 2 回ほど中性子を用いた生物構造研究の発展・普及を目指して開催しています。現在の研究会の主査は横浜市立大学の佐藤 衛先生が務められており、今回の研究会には領域代表の加藤晃一先生

加藤領域代表の講演：「NMR と SANS による生命分子のダイナミクス研究」の様子と A01 班の秋山修志先生が講師として参加されました。
プログラムの詳細は研究会のホームページ（http://www.j-neutron.com/society/cat30/post-23.html）
をご覧頂きたいと思いますが、前半はタンパク質の結晶構造解析、後半はタンパク質の重水素化と溶液散乱の話題が提供されました。前半の結晶構造解析のトピックスとしては、大強度陽子加速器施設 J-PARC の装置の現状、中性子を用いた結晶構造解析の最新の成

秋山班員の講演：「概日時計システム研究における
bioSANS への期待と展望」の様子

果、X 線を用いた精密構造解析の結果が紹介され、「水素を如何にして視ていくか？」について中性子・X 線からのアプローチが示され、測定技術・解析・水素輸送のサイエンスにおいて今後の発展が多いに期待されました。
後半は阪大蛋白研の児嶋長次郎先生のセグメンタル
重水素化のお話がありました。児嶋先生の手法では「簡易」に狙ったアミノ酸の配列部分の重水素化(他

懇親会の様子（左から秋山班員、児嶋先生、加藤領の同位体でも可)が可能であることを示されました。

域代表、筆者）

重水素と軽水素を識別する能力が高い中性子小角散乱を専門としている筆者としては、まさに「これを待っていた！」と言う手法であり、中性子溶液散乱に新たな可能性を付与するものとして大きな期待を抱かせるものでした。
（ちなみに児嶋先生ご自身の専門は
NMR です。
）次に、加藤領域代表から NMR と SANSを用いた生命分子ダイナミクスの講演がありました。
種々の手法を相補的に用いて構造からダイナミクスそ研究会の後は、近くのワインバーで懇親会がありました。様々な分野の研究者が参加している研究会の特徴を反映して、非常にためになり、かつ、人間関係も広がる実に有意義な懇親会でした。
追記：本年度の第 2 回研究会は来年の 3 月ごろに開催されると予告されております。正確に決まりました
らご連絡いたします。

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November, 2014

雑誌論文

最近の動き

1.

*Y.J.Lin, T. Ikeya, D.K. Kirchner, P. Güntert,“Influence of Incomplete NOESY Peaks of the

プレスリースInterface Residues on Structure Determinations

メディア報道

of Homodimeric Proteins”, J. Chin. Chem. Soc.,

2014/9/3

in press

A03 計画研究代表者の加藤晃一博士、A02 公募研究代
表者の神谷由紀子博士らの研究成果が中日新聞（9 月2.

E. Schmidt, T. Ikeya, M. Takeda, F. Löhr, L.
Buchner, Y. Ito, *M. Kainosho, *P. Güntert,

3 日）に掲載されました“Automated Resonance Assignment of the 21
2014/9/12

kDa Stereo-array Isotope Labeled Thioldisulfide

A02 計画研究代表者の佐藤宗太博士の錯体化学会研

Oxidoreductase DsbA”, J.Magn.Reson., in press.

究奨励賞の受賞が科学新聞（9 月 12 日）に掲載され10.1016/j.jmr.2014.10.005

ました

3.

S. Suzuki, K. Matsuura, K. Nakazono, *T.

2014/9/26

Takata, “Effect of a Side Chain Rotaxane

A03 計画研究代表者の加藤晃一博士と岡本祐幸博士

Structure on the Helix-Folding ofらの共同研究の成果が科学新聞（9 月 26 日）に掲載

Poly(m-phenylene diethynylene)”, Polym.J.,

されました

46(6), 355-365 (2014), 10.1038/pj.2014.4
4.

2014/10/8

D. Aoki, S. Uchida, *T. Takata, “Mechanically

A01 公募研究代表者の田中良和博士らの研究成果がLinkedBlock/Graft

日経産業新聞（10 月 8 日）に掲載されました

Synthesis

via

Copolymers:

Functional

Effective

Macromolecular[2]Rotaxanes”, ACS Macro Lett., 3(4), 324-328(2014), 10.1021/mz5001306
プレスリリース5.

2014/9/2

D. Aoki, S. Uchida, *T. Takata, “Synthesis and

構造異常糖タンパク質の分解に必須な糖鎖刈り込み

Characterization of A Mechanically Linked

機構を解明（自然科学研究機構

Transformable Polymer”, Polym. J., 46(9),加藤晃一班員、名古546-552 (2014), 10.1038/pj.2014.22

屋大学 神谷由紀子班員ら）

6.

2014/9/5

Y. Abe, H. Okamura, S. Uchida, *T. Takata,

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小門憲太、佐田和己“ゲルテクノロジーハンドブック —機能設計・評価。シミュレーションから製造プロセスまで
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of
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1-3-5「有機溶媒高吸収性親油性高分子電解質
ゲル」, pp.97-103, (2014), 中野義夫他編,（エヌ・ティー・エス出版, 東京、日本）

NMR-Validated Simulation,” Angew. Chem. Int. Ed.
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1-5-2「ATP 駆動型運動素子」,pp.167-172, (2014),
中野義夫他編,（エヌ・ティー・エス出版, 東京、

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た 新 し い 温 度 応 答 性 高 分 子 の 開 発 ”, 高 分 子 ,press, (2014), Rui Tamura, Mikiji Miyata, eds.

63(12), in press, (2014)(Springer, Germany)
7.

Kazuki Sada, Yuki Furukawa, Kenta Kokado

図書“Encyclopedia of Polymeric Nanomaterials”

1.

“Polyacrylonitrile”, in press, (2014),

新版ゲルテクノロジーハンドブック, 高田十志
和、曽川洋光（架橋点可動型）, (2014),（エヌ・ティー・エス出版、東京、日本）

8.

村田和義（共著）「超高圧電子顕微鏡による分析」

2.

小門憲太、佐田和己

マイクロビーム アナリシス・ハンドブック“クリックケミストリー —基礎から実まで—”
第１７章「多孔性配位高分子のクリック
ミストリー」, pp.161-173, (2014),
高田十志和、小山靖人、深瀬浩一編,（シーエム
シー出版, 東京、日本）

5.1.3, P.459-464, (2014）（オーム社, 東京, 日本）
9. 村田和義「電子顕微鏡によるバイオイメージング」 画像
ラボ Vol.25, No.4, P.6-13, (2014),(日本工業出版,
東京、日本)

3.

Shogo Amemori, Kenta Kokado, Kazuki Sada
“Synergy in Supramolecular Chemistry”
Chapter 5, “Chemo-sensitive Soft Matters
Based on Thermo-sensitive Polymers”,
in press, p.75- (2014),
T. Nabeshima, ed. (Taylor & Francis, USA)10. 塚崎智也“実験医学(増刊「構造生命科学で何がわかるのか，
何ができるのか」）”
第２章，第６節「２つの Sec モーター蛋白質による蛋白質膜透過のしくみ」

15

“Dynamical Ordering & Integrated Functions”
Newsletter Vol. 15

November, 2014

p113-117,(2014) 田中啓二，若槻壮市編,（羊土社,東京、日本）受賞報告
1. 佐藤宗太2014 年 9 月 19 日に、「巨大な中空球状錯体を骨格として構築した生体分子インターフェースの開発」に関して、平成 26 年度錯体化学会研究奨
励賞を受賞
2. 前田大光2014 年 9 月 9 日に、木下敬太（M1）（立命館大）
が第 25 回基礎有機化学討論会においてポスター賞を受賞
討論会 HP リンク：
http://www.orgchem2.chem.tohoku.ac.jp/poc25/（今月は 9 月 28 日から 10 月 31 日までに頂いたデー
タを掲載しています。）

16